CHR BP REF ALT NEW TS MAF MAF_allele Prop_missing_genotypes Prop_missing_alleles Allfreq_ref Allfreq_alt Genofreq_ref Genofreq_het Genofreq_alt Allcount_ref Allcount_alt Genocount_ref Genocount_het Genocount_alt 2 3004070 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3004135 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 3006324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3010440 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3010506 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3011010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3011992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3012632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3012790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3012935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3013884 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3015109 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3015144 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3020793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3024871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3029723 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3032265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3038662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3042226 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3042337 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3044402 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3044505 G C Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 3044516 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 3044523 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 3044538 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 3044554 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 3044600 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 3044719 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3044807 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3045087 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3046104 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3052109 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3052194 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3052993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3053705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3053955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3054223 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3060801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3060829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3061228 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3062146 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3062466 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3062747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3062765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3063067 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3063101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3063404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3063750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3063767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3064364 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 3065212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3065689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3066391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3068135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3070396 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3071087 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3073155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3074159 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 3074649 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3074660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3075164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3075584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3076491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3077254 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3078411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3078480 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3078630 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3079264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3079338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3081519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3081542 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3081972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3082115 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3085462 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3085492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3085585 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3086323 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3086425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3086940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3087721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3088306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3088705 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3089238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3089733 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 3090011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3090145 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3091010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3091344 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3091626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3091919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3092131 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3092869 C T Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 3092964 T A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 3093200 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 3093589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3093645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3093827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3093993 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3097815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3098101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3098737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3099917 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3100103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3102773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3108904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3109642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3111883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3112617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3112726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3113638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3114215 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3116606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3116994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3118178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3118193 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3118683 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3119785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3119845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3120143 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 3120966 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3121197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3121294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3122351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3122406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3122412 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3122521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3123556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3125222 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3130100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3130501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3131083 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3132222 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3132379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3132439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3133726 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3133993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3134566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3134716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3135099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3137387 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3137878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3138130 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3138245 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3138283 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3138291 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3138294 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3138438 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3138492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3141953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3142576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3147989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3148500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3148723 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3149251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3151235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3152714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3155475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3157110 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3160567 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3160717 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3161622 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3162588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3162685 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3162784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3162898 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 3162949 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3163316 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 3163429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3163527 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3163719 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3163971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3164618 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 3164847 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3164867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3164939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3164948 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3164976 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 3165016 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3165067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3165193 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 3165407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3165730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3166628 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 3166879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3167044 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3167088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3167269 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3167494 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3168422 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 3168553 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3169236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3169726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3169803 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3170714 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 3171406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3171596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3171836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3172354 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3172687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3174796 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3175152 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 3175155 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 3176180 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 3178189 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3178553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3178739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3178819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3179869 A T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 3180897 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 3181090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3181116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3181152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3181366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3181375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3183640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3184756 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3185904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3186539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3188625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3188656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3190444 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 3191269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3191514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3191543 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 3191986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3191995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3192191 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 3192214 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3192491 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3192536 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 3193613 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 3193782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3194040 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 3194257 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 3194435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3194967 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3195139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3196138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3196140 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 3196519 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 3196520 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 3196629 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3197450 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 3197452 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 3197475 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 3197697 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 3198050 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 3198171 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 3199653 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 3199977 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 3200117 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3200438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3200563 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 3202288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3202453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3202878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3207577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3207906 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3207913 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3210505 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3211213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3213388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3213439 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3215758 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3216244 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 3216295 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 3216302 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 3216762 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 3216793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3218151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3219550 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 3219781 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 3219887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3223223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3224069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3225270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3225272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3226074 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 3226915 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3227007 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3227128 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 3227136 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 3227349 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 3227444 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 3227545 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3227571 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 3227680 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3227864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3228502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3228503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3228585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3230641 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3230833 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3230842 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3231066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3231176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3231586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3231721 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3231735 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 3231846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3231849 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 3232149 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 3232825 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3233100 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3233769 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3233977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3234364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3235419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3235580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3236355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3236617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3236736 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3237168 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 3237550 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 3237992 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 3239061 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 3239532 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3239690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3240020 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3240099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3240992 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3241694 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3242352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3242697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3244479 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 3245019 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 3245390 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3247535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3247986 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 3248241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3250267 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 3250637 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3250655 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3250671 G T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 3250712 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 3250882 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3251738 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 3252800 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3253251 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 3253425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3253782 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 3253820 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 3253853 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 3254456 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 3254457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3255589 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 3256862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3257170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3257466 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3258056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3258210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3258345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3258358 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3258419 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3259526 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 3260390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3260583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3261397 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3261620 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 3261892 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3262097 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 3262729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3263174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3264304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3264386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3264805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3264831 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3265011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3265020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3265146 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3265317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3265658 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3265702 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 3265716 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 3265747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3266005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3266029 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 3266241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3266688 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 3267738 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 3268573 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 3269213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3269246 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 3269258 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3270163 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3270207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3270224 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3270560 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3270652 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 3270941 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 3271286 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 3271369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3271378 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3271984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3272973 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3272978 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3275634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3275637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3279248 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3279285 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3279307 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3280003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3280118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3281315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3282241 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3283423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3284256 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 3285529 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3285560 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3286328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3287066 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3287153 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 3289792 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 3290684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3293382 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 3298725 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 3319449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3323264 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3343862 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3365198 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3365623 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 3368706 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3369301 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3371295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3371345 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 3372479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3374522 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 3375828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3379629 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3379801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3380589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3380987 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 3382346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3383380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3384602 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3385446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3386462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3387642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3390558 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3390694 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3392350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3392448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3392488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3393300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3399655 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 3400455 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 3407963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3408772 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 3414974 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3415481 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3417040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3417370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3417639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3420340 G T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 3420423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3427932 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3464134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3471821 T A Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 3471830 A T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 3471844 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 3471855 A T Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 3488011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3488444 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3489950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3491140 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3491587 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 3491591 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 3491653 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 3491803 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 2 3492151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3492819 T G N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 3493136 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3494335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3496175 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 3496325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3498870 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3501351 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3502318 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3502855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3503413 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 3503978 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3505905 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3510924 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3512715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3514397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3517618 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 3519330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3521841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3523302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3523996 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 3524273 G C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 3526444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3527562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3527908 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 3527909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3528271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3535424 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3538179 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3539097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3539332 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3539488 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3539500 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 3539570 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 3539678 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 3539798 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 3539995 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 3540031 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 3540165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3540178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3540197 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 3540370 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3540613 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 3540716 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 3541060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3541084 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 3541166 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3541225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3541307 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3541455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3541461 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 3541568 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3541951 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 3541989 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 3542054 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 3542359 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3542814 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3542815 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3542838 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 3542855 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3542970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3543208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3543666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3543675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3543759 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3543763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3543790 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3543877 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 3543894 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 3543918 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3544068 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 3544144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3544315 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 3544402 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 3544407 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 3544486 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 3544577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3544799 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 3544816 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 3544829 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 3544960 G C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 3544962 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 3545104 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 3545357 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3545373 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3545392 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3545785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3545813 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 3545822 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3545837 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 3545856 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3545857 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3545993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3546167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3546851 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 3547185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3549798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3550110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3550427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3550434 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3551927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3557042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3557321 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3557637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3557861 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3558904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3561506 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3561812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3562075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3563110 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3563225 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3563415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3565586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3568807 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3570977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3572205 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 3573446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3573996 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3574399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3574590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3574850 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 3575043 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 3575162 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 3575557 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 3575736 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 3575846 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 3575847 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 3576006 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 3576123 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 3576207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3576219 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 3576246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3576297 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 3576445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3576456 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 3576669 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 3576730 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 3576854 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3577201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3577609 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 3577627 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 3577729 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 3577824 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 3577872 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3577911 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 3578058 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 3578213 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 3578240 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 3578263 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 3578692 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 3578773 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 3579045 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 3579054 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3579835 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 3579876 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 3579885 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 3579925 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3580049 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 3580474 G C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 3580519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3580626 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3580630 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3580651 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3580808 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 3580953 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 3580956 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 3581156 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 3581228 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 3581380 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3581392 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 3581393 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 3581407 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 3581414 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3581506 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3581636 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3581703 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3581830 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3581895 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 3582026 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 3582059 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3582147 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3582168 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3582253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3582313 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 3582534 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3582642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3582646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3582983 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 3583047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3583157 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3583181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3583195 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 3583213 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 3583221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3583366 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3583778 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3585044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3585114 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3585130 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3585165 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 3585577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3585693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3585758 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 3585954 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 3587111 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 3587713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3587818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3587836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3588078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3588339 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3588495 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 3588498 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 3588517 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3589038 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3589651 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3589688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3589740 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3589996 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 3590207 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 3590424 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 3590500 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 3590637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3590652 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3590653 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 3590684 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3592106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3592466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3592611 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 3592705 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 3593202 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 3593505 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3593511 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3593561 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3593915 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 3593946 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 3594073 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 3594090 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 3594273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3594353 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 3594407 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 3594549 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 3594675 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 3594809 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 3594880 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 3594909 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 3594947 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 3594994 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 3595128 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3595295 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 3595639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3595656 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 3595981 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 3596083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3596400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3596419 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3596427 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 3596442 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 3596471 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 3596472 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3596527 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 3596590 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3596682 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 3596696 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3596723 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3596756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3596802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3596870 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3596914 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 3597046 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 3597062 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 3597086 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 3597108 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 3597110 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 3597173 C G Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 3597181 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 3597199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3597215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3597368 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 3597388 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3597870 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 3598301 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 3598684 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 3599536 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 3599539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3599548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3599810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3600577 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 3602582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3604056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3605649 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3605806 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 3607358 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3607376 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3608403 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3609436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3609458 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3610575 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 3611125 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3611773 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3611791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3612739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3613370 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3613482 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 3613528 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 3613676 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 3614578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3614792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3615754 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 3617959 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 3617990 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3618050 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3618114 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 3618815 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3619380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3620197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3621278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3622357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3622715 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 3622718 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 3623338 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3623384 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3623429 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 3623543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3623713 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 3624824 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3625173 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 3625509 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3625821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3631255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3632664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3632792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3632832 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 3632973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3633826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3634150 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 3634391 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 3634394 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 3635023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3635296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3635802 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 3636070 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3636409 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3639668 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3640011 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 3640066 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 3640080 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 3640196 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 3640226 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 3640708 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 3640954 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3641711 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3641716 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3641836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3641851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3641857 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3641877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3641889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3641964 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3642046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3642112 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3642266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3642283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3642342 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 3642386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3642911 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3643091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3643228 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3643233 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3643242 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3643275 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 3643416 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 3643519 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 3643798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3643821 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3644513 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 3645254 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 3645385 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3645546 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3646067 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 3646145 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 3646146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3646242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3646245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3646256 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3646521 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3647301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3649273 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 3649419 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 3649514 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 3649563 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3649647 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 3650089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3650097 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 3650153 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 3650205 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 3650296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3650591 A G Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 3651511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3651646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3652033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3653980 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 3654112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3654172 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3654210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3654229 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 3654268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3655304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3655630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3657968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3658192 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3658578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3658613 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3661591 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 3661594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3662642 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 3662727 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 3664169 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3664176 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3665096 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3667068 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 3667571 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 3667623 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 3667884 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 3667992 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 3668105 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3668121 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 3668140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3668245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3668296 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3668325 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 3668738 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3668759 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3669319 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 3670600 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 3670637 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 3671203 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3671615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3671814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3671860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3671897 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 3671917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3671935 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 3671937 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3671986 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 3671999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3672008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3672036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3672114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3672124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3672185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3672269 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3672295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3672345 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3672841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3672976 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 3673014 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3673177 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 3673281 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 3673302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3673605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3673742 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 3673782 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3674985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3675002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3675055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3675114 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3675162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3676113 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 3676305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3676722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3677245 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3677321 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3677475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3677585 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 3677594 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 3678146 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3680546 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3680551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3680587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3680762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3681161 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3681329 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 3681339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3681375 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3681887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3681896 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 3683299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3684703 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 3687420 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3687910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3688223 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3689931 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 3689932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3691070 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 3691108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3692174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3693720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3693864 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 3693975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3694072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3694615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3694696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3694743 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3695503 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3696246 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 3696327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3696341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3696376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3696452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3696481 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 3696654 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3696668 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 3697159 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 3697206 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3697514 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3697583 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 3697591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3697710 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3697722 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 3697793 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3698292 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 3698405 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3698876 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 3698955 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3699017 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3699230 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 3699769 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 3699781 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 3699786 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 3699812 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3699821 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3699823 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3699927 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 3699948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3700275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3700560 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 3701062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3701282 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 3701611 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3701914 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3701924 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 3701990 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 3702026 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3702678 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 3702831 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3702894 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3704013 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3704633 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3704707 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 3704796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3705039 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 3705343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3705839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3706047 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3706478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3707214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3707603 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3708145 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3708193 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3708784 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 3708845 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3709733 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3709754 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3709795 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 3709829 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 3710129 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 3710231 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 3710263 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 3710353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3710583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3710681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3710750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3710802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3711203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3711268 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 3711381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3711468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3711508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3711977 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3712014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3712080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3712483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3713171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3713256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3713258 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3713347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3713604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3713767 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 3713917 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 3713980 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3714263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3714326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3714413 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3714645 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3714712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3715176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3715297 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 3715326 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 3715482 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3715632 C A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 3715720 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 3715723 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 3715753 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 3715859 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3715884 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 3715895 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3715990 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3716011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3716029 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3716035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3716085 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3716240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3716270 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3716329 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 3716461 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3716484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3716514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3716550 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3716843 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 3716930 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 3717059 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 3717333 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3717886 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3717958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3717966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3718064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3718195 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3718318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3718340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3718350 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3718617 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 3718667 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 3718728 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3718744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3718789 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 3718820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3720038 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3721356 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 3722476 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 3722494 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 3722701 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 3722838 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 3722964 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 3723234 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 3723371 G C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 3723441 G T N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 3724039 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 3724045 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 3724201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3724226 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 3724244 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3724331 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3724464 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 3724499 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 3724562 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 3724574 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 3724653 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3724933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3724945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3725030 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3725633 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 3725819 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 3726034 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 3726194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3726447 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3726456 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3726529 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 3726619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3726699 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3727310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3728556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3728999 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3729245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3729410 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 3729427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3729450 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 3729508 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 3729626 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 3729644 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 3729712 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 3729839 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 3729875 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 3729914 A T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 3730025 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 3730099 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3730162 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 3730194 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 3730582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3730605 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 3731143 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3731201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3731264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3731421 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 3731649 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3731692 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3731739 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 3731757 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3731874 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 3731961 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 3731972 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3732000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3732003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3732039 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3732053 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 3732096 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 3732155 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 3732287 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3732471 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3732565 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3732717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3732752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3733803 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 3733837 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3734152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3734248 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3734298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3734923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3735012 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 3735022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3735054 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3735095 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 3735497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3735523 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 3735652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3735764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3735869 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 3735880 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 3736029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3736063 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 3736382 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 3736668 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 3736755 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 3736977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3737196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3738100 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3739294 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 3739303 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 3739404 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3739452 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 3739573 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3739576 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 3739617 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3739644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3740225 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 3740689 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3740716 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3740932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3740994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3741162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3741192 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 3741225 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 3741904 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3741949 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 3742035 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 3742207 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 3742306 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 3742783 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 3742809 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 3742871 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3742998 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3743354 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 3743527 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 3744391 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 3744392 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3744533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3744544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3744788 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 3744825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3744885 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 3745169 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 3745854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3745876 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3747886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3748378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3749107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3751378 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 3751402 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 3752380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3756787 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 3769079 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 3769485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3769529 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3770097 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 3770845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3771745 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3772104 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 3772116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3772149 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 3772173 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 3772393 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 3772730 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 3773594 T C Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 3774552 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3774879 G T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 3774915 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 3774921 G C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 3774930 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 3775852 T C Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 3775853 T C Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 3775890 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3776302 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 3776517 G T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 3776573 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 3776646 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 3776954 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 3777027 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 3778157 T G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 3778538 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 3778795 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3778857 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3778962 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3779004 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3779068 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3779297 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 3779336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3779355 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 3779380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3779528 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 3779628 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 3779763 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3780563 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 3780862 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 3780872 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 3780904 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 3781477 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3781544 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 3781804 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3782034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3782108 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3782379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3782705 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 3783709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3783730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3785202 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3787135 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3787667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3787791 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.0666666666666667 15 15 1 13 1 2 3791249 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 3791261 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 3791293 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 3791597 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 3793855 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3799892 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3799992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3800024 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 3800032 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 3800051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3800077 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3800128 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3800154 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3800189 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 3800190 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3800744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3800828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3800848 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3800996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3801078 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3801079 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3801101 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 3801113 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 3801160 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 3801165 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 3801186 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 3801365 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3801460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3801616 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3801836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3801869 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 3801930 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3802006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3802053 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 3802275 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3802297 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 3802411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3802696 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 3803005 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3803008 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3803497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3804594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3806340 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 3806673 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 3806785 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3807033 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 3807073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3807476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3807532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3807626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3807738 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 3807885 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3808123 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 3808205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3808230 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3808245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3808322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3808445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3808555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3808778 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3808799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3808900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3809325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3809336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3809432 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 3809487 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 3809635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3809664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3809793 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 3810124 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 3810193 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 3810256 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3810440 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3810595 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 3810714 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 3810735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3810917 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 3811023 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 3812308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3812523 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 3813759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3813837 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 3814149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3814162 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3814932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3814994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3815606 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 3815699 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3816667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3816985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3818172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3818270 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 3819534 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 3819990 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3819991 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3820092 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 3820163 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 3820195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3820956 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3821200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3822693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3822864 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 3825153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3825660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3825796 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 3827338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3827819 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3829272 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3831998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3832128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3832164 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3832439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3832654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3834244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3834590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3834622 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3837051 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3837136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3837341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3838549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3838753 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 3839252 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 3839432 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3839681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3839860 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 3839868 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 3839871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3839918 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 3839950 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3840074 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 3840155 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 3840411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3840501 T G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 3841236 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3841608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3841656 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 3841673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3841678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3841779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3841912 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 3842072 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 3842207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3842227 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 3842281 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 3842477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3842532 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3842601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3842608 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3842615 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3845188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3845228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3845484 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3845619 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 3845654 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3845715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3845982 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3847350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3847577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3848259 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 3848984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3856765 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3857783 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3859146 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3859194 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3859809 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 3860189 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 3860299 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3860317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3861425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3861795 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3862537 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3864582 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3864625 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3864683 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3868750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3870247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3870637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3870692 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3871714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3872176 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3872323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3872573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3872705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3872727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3873296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3873715 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 3874216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3874217 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3874263 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 3874784 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3875017 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 3876069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3876758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3876874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3878814 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3879619 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3879751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3880017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3880095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3880186 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 3880288 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3880333 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 3880497 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3880703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3881420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3881432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3881514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3885658 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 3885747 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3885852 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 3885862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3885899 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3885981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3886051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3886077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3886313 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3886974 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3892000 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3892020 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3892115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3892260 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3892578 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 3892643 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3892735 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3892909 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 3893148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3893183 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 3893200 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 3893213 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 3893234 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 3894282 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3894454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3894555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3894660 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 3894877 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 3895457 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3895801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3895995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3896401 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 3896580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3896891 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3896900 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3896971 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3896982 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3896994 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3897225 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3897229 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3897253 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3897377 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3897412 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 3897423 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 3897499 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 3897559 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 3897562 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 3897931 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3897973 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3897999 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3898085 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3898139 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3898205 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3898237 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3898265 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3898634 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 3899013 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3899044 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3899189 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3899243 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3899245 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3899300 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3899318 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3899330 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3899679 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3899861 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 3900038 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3900103 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 3900215 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3900377 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 3900403 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 3900469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3900514 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 3900537 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 3900569 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 3900630 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3900703 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 3900750 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3900785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3900934 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3900941 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3900982 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3901045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3901395 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3901434 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3901435 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3901449 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3901487 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3901757 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3901788 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3901796 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3901803 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3901827 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 3901832 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 3901896 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3901916 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3902173 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3902307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3902375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3902681 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3902844 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3903264 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3903265 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3903318 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3903393 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 3903530 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3903608 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 3904059 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 3904201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3904300 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 3904307 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 3904361 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 3904377 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 3904405 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3904566 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3907549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3907980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3908644 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3909316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3910194 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 3910216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3910220 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 3910510 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3911045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3911327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3912029 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3912030 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3912083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3912114 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 3912158 G C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 3912166 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3912319 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3912342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3912424 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3912449 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 3912651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3912978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3912986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3913711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3914306 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3914786 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3914960 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3915480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3915582 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 3915643 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 3915655 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 3915686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3915724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3915758 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3915814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3915914 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3916356 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3916815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3916929 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3916940 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3917656 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3917673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3918885 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 3919072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3922024 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 3923060 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 3923426 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3924653 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3924836 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 3925690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3925722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3925753 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3925870 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3927139 C G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 3927175 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 3927217 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 3927894 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 3927965 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 3928668 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3928861 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3929157 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 3929797 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 3930070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3930817 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 3931189 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3931702 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 3931766 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3931925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3932135 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3932171 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3932243 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 3932306 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 3932373 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 3932653 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3932810 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 3932952 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 3933086 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 3933156 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 3933175 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3933290 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3933373 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3933599 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3934073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3934242 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 3934338 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3935505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3935747 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3936059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3936528 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3936572 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3936701 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3936825 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3936865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3936902 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3936914 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3937064 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3937073 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3937091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3937265 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3937286 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3937639 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 3937761 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3937796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3937802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3937837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3937912 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3938008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3938048 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3938096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3938164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3938193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3938198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3938212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3938229 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3938453 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3938584 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3939334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3939659 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3939715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3941513 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 3941573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3942217 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 3942234 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 3942306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3942400 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 3942457 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 3942473 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3942562 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 3942812 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3942932 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3942957 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3942978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3943079 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 3943284 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 3943376 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 3943522 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 3943694 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 3944080 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 3944170 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3944358 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3944570 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3945509 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3945881 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3946342 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 3946800 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 3947108 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3947253 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3947921 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3948205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3949204 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3949554 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3949889 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3950005 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3950037 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3950094 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3950109 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3950980 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 3951155 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3951181 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3951327 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3951525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3951574 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3951588 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3951693 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3951751 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 3951763 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 3951981 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3951984 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3952238 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3952324 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 3952766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3952938 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3953075 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3953202 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3953245 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3953330 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 3953398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3954061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3954095 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3954098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3954147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3954188 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3954206 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3954472 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3954536 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 3954686 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 3954802 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 3954831 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 3954972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3955107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3955452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3955685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3956659 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3957142 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 3957213 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3957361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3957572 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 3957665 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3957816 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3958057 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3958750 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3959047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3959188 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 3959353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3959412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3959429 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 3959454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3959583 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3959693 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 3959715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3959946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3960027 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3960043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3960147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3960792 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3960815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3960935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3960980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3961232 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3961983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3962021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3962068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3962103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3962113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3963024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3965040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3965211 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3965804 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3965806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3967135 C T Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 3968044 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3968067 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3968872 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3969011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3969392 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 3970217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3971480 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3971483 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 3971513 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 3971649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3971818 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3971901 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 3971912 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 3972029 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 3972319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3972371 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3972695 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3973672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3973880 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3973921 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 3974127 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 3974245 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 3974246 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 3974314 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3974496 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3974516 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3974553 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3974559 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3974621 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3974644 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3974724 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3974748 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 3974927 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3975121 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 3975567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3975570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3975707 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3975856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3975908 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3976056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3976072 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3976131 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3976293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3976482 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3976512 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3976764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3976963 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3977148 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3977361 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3977423 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3977524 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3978914 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 3979099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3979674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3979984 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3980229 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3980541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3980620 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3981056 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3981067 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3981088 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3981457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3981746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3981850 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3982784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3982837 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 3982873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3983003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3983078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3983293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3983456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3983705 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 3983775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 3984071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3984260 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3984332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3984352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3984478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3984576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3984751 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3984764 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3985364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3985793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3985794 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3985917 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3986006 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3986354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3986459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3986506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3986731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3986870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3986875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3986885 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3986913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 3987085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3987135 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3987308 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 3987324 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 3987692 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 3988019 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 3988187 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 3988188 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 3988325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3988435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3988511 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 3988641 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 3988649 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 3988738 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 3988781 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 3989068 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3989411 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 3990105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3990226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3990559 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3990651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3991018 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3992312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3992600 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3992695 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 3992728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3992750 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 3993733 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3993758 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3994033 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3994096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3994273 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3994305 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 3994445 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 3996576 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3996718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3997093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3997121 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3997174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3997200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3997203 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3997242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3997404 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 3997596 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 3997625 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 3997650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3997671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3998356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 3998900 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 3999060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4000826 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 4001384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4001631 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 4003518 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4003936 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 4003976 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 4004404 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 4007318 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4007345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4007469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4008760 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 4009053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4009148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4010664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4010787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4011601 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 4011728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4012310 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 4012388 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 4012425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4012446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4012559 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4012935 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 4013480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4014036 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 4014352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4015195 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 4015269 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 4015296 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 4015432 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4015506 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4015560 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4017362 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4017526 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4018053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4018858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4018907 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 4018967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4018995 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 4019340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4019389 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 4019551 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 4019557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4019690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4020049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4020059 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4020110 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 4020471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4020512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4020519 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 4020655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4020698 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4020767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4020859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4021126 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4021127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4021232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4021497 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4021911 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 4022122 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 4022320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4022402 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4023500 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4023906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4024199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4025232 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 4027507 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4027726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4029375 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4030067 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4030364 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4030881 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4032764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4032821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4034963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4037420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4037907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4038155 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4038395 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 4038519 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 4038647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4039035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4039128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4039483 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 4039676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4039935 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4039942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4040335 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 4040356 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 4040424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4040439 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4040682 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 4040684 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 4040853 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 4041697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4041764 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4041773 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 4041831 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 4041836 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4042245 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 4042253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4042427 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 4042666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4042958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4042963 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4043106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4043352 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4043736 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4043778 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 4043887 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 4043904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4043980 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 4044277 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4044417 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 4044465 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 4044478 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4044692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4045220 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 4045378 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4045483 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 4045604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4045699 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 4046417 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4046481 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 4046494 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 4046601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4046721 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 4046752 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 4046757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4046821 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 4046872 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 4047082 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 4047136 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 4047148 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4047166 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 4047247 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 4047963 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4048036 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4048390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4048501 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 4048710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4048769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4048884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4049274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4049400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4049816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4050343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4051991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4052442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4052472 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 4052567 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4052785 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 4052894 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 4053537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4054404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4054624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4054634 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 4054718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4054839 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4055116 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 4055266 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 4055321 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 4055354 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 4055433 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 4055501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4055711 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4055761 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4055875 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4055928 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 4056056 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 4056244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4056343 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4056425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4056593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4056674 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 4056694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4056796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4056896 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4056961 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 4057233 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4057275 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4057438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4057867 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4058299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4058356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4058439 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4058817 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 4058870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4058886 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4059024 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 4059056 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4059474 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 4059708 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 4059955 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 4060316 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 4060512 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 4060576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4061008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4061351 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 4061357 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 4061425 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 4061711 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 4063073 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4063084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4063135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4063152 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 4063370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4063638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4065231 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 4065504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4065682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4066085 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4066623 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4067641 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4067743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4068726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4068867 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4074231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4076332 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4076780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4076974 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4077988 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 4078485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4080327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4080341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4081220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4081307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4081340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4081558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4081733 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4082211 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4083656 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 4083660 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 4086121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4086205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4086802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4086909 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4087034 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 4087412 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 4087989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4088078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4088101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4089665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4093064 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4093131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4093171 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 4093702 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4093933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4094133 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4094219 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4094441 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 4094604 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 4094607 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 4094711 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 4094837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4094970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4095064 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4095375 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 4095388 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 4095411 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 4095412 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 4095474 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 4095484 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 4095567 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 4095700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4095829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4095890 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4096144 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 4096336 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4096427 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4096750 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4096899 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4096959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4096989 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 4097019 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4097248 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4097314 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4097356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4097969 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4097996 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4098463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4098488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4098609 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4100056 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 4100666 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4100828 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 4100843 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4101015 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 4101079 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 4101103 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 4101118 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4101123 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4101164 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 4101178 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4101410 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4101558 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 4101808 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 4102015 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 4102180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4102242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4103065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4103210 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4103216 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4103247 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4103250 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4103267 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4103416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4103419 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 4103489 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 4103610 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4103898 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 4104054 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 4104168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4104482 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 4104491 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4104505 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 4104586 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4105444 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4105675 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4105704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4105897 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 4105918 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 4106041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4106049 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4106065 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 4106066 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 4106129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4106151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4106847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4107027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4107071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4107118 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4107143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4107180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4107235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4107545 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4107631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4107675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4107683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4107787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4107836 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4107838 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4107994 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4108004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4108053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4108340 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4109185 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 4109525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4110175 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4110204 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4110235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4113129 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 4113355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4113968 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 4114026 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4114126 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4114173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4114560 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4114847 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4114885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4114910 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 4115039 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 4115058 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4115201 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4115216 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4115228 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4115250 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 4115257 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 4115315 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4115329 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4115363 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4115410 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4115456 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4115600 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 4115601 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 4115781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4115950 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4116165 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 4116330 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4116509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4116589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4116663 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4116801 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 4116937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4116983 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 4116995 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 4117033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4117052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4117268 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 4117487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4117554 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 4117731 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4117857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4118029 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4118034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4118149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4118371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4125379 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4125586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4126027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4126118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4126150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4126193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4126450 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4126467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4126470 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4126531 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4126559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4126945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4127268 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4127537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4128122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4128196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4128308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4128795 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4129053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4129153 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4129178 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4129352 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4129615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4130682 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4130777 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4130832 G A Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 4130870 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 4130955 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4131116 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 4131138 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 4131139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4131187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4131482 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 4131934 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4131937 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4131947 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 4132331 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 4132354 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 4132530 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4132619 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 4132747 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4132777 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4132852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4132913 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4133187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4133267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4133284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4133313 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 4133468 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 4133552 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4133630 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 4133718 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 4133903 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4134226 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4134250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4134306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4134400 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4134498 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4134856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4134893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4135044 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 4135392 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4135441 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 4135460 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4135525 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4135570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4135578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4135658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4135689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4135694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4135946 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 4135970 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 4136070 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4136084 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4136105 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4136136 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4136189 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4136293 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4136308 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4136324 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4136519 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4136558 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 4136582 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 4136635 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 4136775 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 4136821 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4136968 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4137711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4137833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4137907 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4137957 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4138040 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4138361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4138530 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 4138623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4138756 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 4139045 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 4139081 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 4139441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4139541 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 4139684 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 4139800 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 4140597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4143406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4146126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4146429 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4147116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4148086 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 4148276 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 4153125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4157051 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4157115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4157132 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 4157561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4157593 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 4158184 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4158297 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 4158329 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 4158606 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4159881 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 4159895 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4159959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4160179 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 4160248 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 4160586 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4161422 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4161497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4162982 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4164706 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4164994 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 4165041 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4165290 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4165632 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4165683 C G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 4165857 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4165945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4166125 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4166575 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 4167002 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4167027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4167188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4167223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4167585 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4167652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4167749 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4167979 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 4168878 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4169318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4169641 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 4169710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4169970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4169989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4170287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4170352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4170468 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4170506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4170525 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4170561 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4170715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4171048 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 4171056 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4171336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4171480 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 4171566 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4171611 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4171656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4171773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4171938 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4172500 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4172615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4173055 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4173120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4173193 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 4173233 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 4173268 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 4173291 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4173334 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 4173351 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 4173455 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4173473 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 4173530 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4173564 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 4173589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4173755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4174227 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4174621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4174677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4174796 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 4175283 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4175336 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4175586 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 4175587 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4175849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4175858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4176677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4176743 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4176867 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 4177001 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4177034 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4177220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4177286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4177343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4177387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4177394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4177427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4177439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4177548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4177664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4177920 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 4178221 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4178288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4178307 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4178325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4178407 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4178423 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4178482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4178526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4178548 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4178655 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 4178683 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 4178731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4179327 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 4179488 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4179810 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4180091 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4180577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4180633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4180960 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4181055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4181296 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4181804 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4182344 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 4182400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4182439 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 4183324 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4184186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4184322 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4184552 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4184735 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4184765 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4184783 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 4184852 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4185013 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 4185214 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4185236 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 4185238 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4186005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4186045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4186292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4186452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4186547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4186626 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 4186676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4186792 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4186898 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 4186907 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 4187181 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4187206 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 4187218 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4187379 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 4187548 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4187621 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4187823 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 4187844 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4187882 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 4188047 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4188050 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4188177 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4188251 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4188261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4188489 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 4188524 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4188673 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4188770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4188771 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 4188837 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4188987 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4189036 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4189124 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4189146 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4189197 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 4189253 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4189266 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4189305 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4189380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4189418 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4189431 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4189734 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4189831 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 4189912 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4189951 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 4189965 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4190449 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 4190585 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 4190625 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 4190641 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 4190646 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4190668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4191181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4191243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4191287 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 4191318 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4191335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4191347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4191586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4191595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4191654 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 4191803 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4198642 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4199861 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4200991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4201446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4202471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4202658 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4203554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4204530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4204911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4205498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4207247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4207824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4207830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4208073 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4208197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4211334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4211381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4211789 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4211841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4211885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4211886 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4211944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4212175 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4212214 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 4212351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4212569 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4212595 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 4212811 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4212830 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4213398 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4214120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4214189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4214869 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4214875 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4214903 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4215457 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4215564 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 4215960 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4216452 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 4216472 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 4216631 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4216649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4216977 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 4216985 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4217077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4217149 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 4217444 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 4217515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4217732 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 4217892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4218857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4221674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4222178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4222457 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 4222804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4223616 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4223622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4223806 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4223820 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4224041 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 4224083 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 4224122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4224186 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 4224195 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 4224216 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4224310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4224432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4224478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4224488 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 4224496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4224528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4224581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4225452 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4227520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4227611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4228710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4229810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4230096 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4230724 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 4231001 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4231049 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 4231256 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4231260 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4231333 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4231346 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4231360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4233212 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4234192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4234687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4236199 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4236380 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4237001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4237336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4237662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4238159 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4238290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4238943 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 4239017 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 4239026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4239459 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 4239580 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 4239583 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 4241816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4245745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4246408 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4246687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4247125 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 4247193 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 4247198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4247277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4247469 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 4248044 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4248417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4250598 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 4251477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4253352 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 4254392 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 4254493 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4254656 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 4254716 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 4254723 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4254730 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 4254747 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 4255727 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4256173 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 4256812 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4257717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4257894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4257927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4258325 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4260157 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 4260242 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 4261026 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4261156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4261688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4264988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4266979 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4267308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4268090 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4268144 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 4268220 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 4268436 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 4268465 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4268511 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4268526 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 4268528 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 4268616 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 4268781 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 4268808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4268838 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4269384 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 4269432 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 4269639 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4269645 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4269679 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 4269711 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 4269966 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4269990 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4270433 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 4270492 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4271371 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 4271388 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4271507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4271521 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 4271561 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4271594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4271627 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 4271644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4271887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4272122 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 4272165 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 4272219 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 4272231 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4272328 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 4272346 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 4272402 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 4272419 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 4272537 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 4272703 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 4272732 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4272798 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4272808 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4272927 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4272936 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4272946 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4272984 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4273172 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4273222 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4273521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4273894 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4274049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4274385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4274395 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4274436 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4275168 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 4275189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4275207 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 4275219 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 4275278 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 4275498 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 4275549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4275576 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 4275798 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 4275858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4275890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4275897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4276037 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 4276301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4276355 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 4276412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4276510 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 4278248 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 4278780 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 4279527 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 4279601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4279715 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4279734 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 4279798 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 4279997 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4281026 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 4281035 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 4281141 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 4281160 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 4281742 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4281743 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 4281755 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 4281893 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4281922 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 4282275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4282423 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 4282435 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 4282830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4282880 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4283505 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 4286362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4286737 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 4288607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4288676 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 4289016 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 4289063 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 4289393 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 4290525 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4290552 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4293074 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4293324 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 4293916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4295159 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4296624 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 4296828 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4297181 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 4297487 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 4297619 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 4297722 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 4297862 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 4298330 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 4298342 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 4299182 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 4299205 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 4300841 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 4301055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4301385 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 4301630 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 4301850 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 4302348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4302353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4302462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4302850 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 4304029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4304640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4304642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4305916 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4307406 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4308512 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4308553 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 4308676 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4308902 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4308934 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4311539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4311552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4311807 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 4313988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4317004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4317315 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4318207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4318356 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4318827 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 4318846 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 4319123 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 4319927 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4320596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4324103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4324295 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 4324351 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 4324870 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4325423 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 4325486 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4325558 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 4325560 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 4325576 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4325721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4325972 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4326076 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 4326088 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 4326146 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 4326335 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 4326796 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 4327099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4330129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4332651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4332654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4332898 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4333879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4334328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4334844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4334848 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4335093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4335472 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 4335574 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 4335809 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 4336040 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 4336102 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 4336155 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4336156 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 4336260 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 4336286 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4336455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4336925 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 4337333 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 4338426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4338519 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 4338618 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 4338664 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 4338739 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4339148 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4339431 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 4339592 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 4340056 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 4340101 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 4340712 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 4341407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4341467 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 4341492 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 4341493 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 4341518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4341542 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 4341620 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 4341951 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4341981 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 4342042 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 4342375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4342966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4343595 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 4344890 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 4344963 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 4345148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4346124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4346571 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4346712 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 4347251 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 4347385 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 4347396 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 4347409 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 4347458 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 4347482 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 4347533 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 4347575 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 4347790 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 4348359 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 4348488 A G Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 4349284 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 4349833 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 4350194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4350462 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4350585 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 4350651 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 4351052 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 4351169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4351239 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 4351340 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4351833 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 4352114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4352224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4355885 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 4356536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4356708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4356808 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 4357938 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4358064 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 4359272 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4359288 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 4359478 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4359619 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 4359770 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 4359784 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 4359868 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 4359875 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 4360097 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 4360121 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 4360247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4360418 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 4360467 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 4360573 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 4362228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4363560 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4364502 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4364528 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 4364535 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4364628 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4365502 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 4365700 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4367818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4369588 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4372363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4372462 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4372476 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4372617 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4374792 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 4374835 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 4376580 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 4376728 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 4377337 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 4378339 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4379516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4381028 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4381069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4381082 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 4381084 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4381096 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 4381215 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 4381241 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4381326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4381690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4381758 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 4381901 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 4382418 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 4382431 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 4382531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4383171 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4383217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4383356 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 4383625 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 4383690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4383806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4383828 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4383839 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4383920 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4383932 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 4384585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4384647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4386057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4386077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4386103 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4388826 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 4393470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4393525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4394874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4394941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4395311 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4397373 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4398704 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4400596 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4400739 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 4400819 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4400974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4401466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4401698 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 4401710 T C Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 4402169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4404278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4405717 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 4406188 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4406959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4407599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4407937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4408235 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 4408236 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 4408277 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4408472 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 4408775 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 4408776 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 4408945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4409359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4409362 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 4409734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4409886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4411482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4411608 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 4412480 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 4412717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4413088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4413126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4413199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4413579 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 4413995 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 4414035 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4414056 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 4414158 C G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 2 4414217 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 4414294 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4416049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4416873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4417221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4417685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4419393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4419669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4420918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4424642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4424668 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4424723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4425590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4425924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4425942 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4426110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4426120 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4426393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4426418 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 4426681 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4427001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4427028 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 4427218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4427416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4428219 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4428467 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 4428930 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4428935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4429004 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4429021 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4429209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4429451 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 4429719 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 4429722 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 4429754 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4429782 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 4429828 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4430770 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 4434220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4434796 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 4435183 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4435618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4435621 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4436627 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4437322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4437406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4437516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4438190 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 4438715 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 4439233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4439245 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4439283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4439300 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 4439807 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 4439837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4439866 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 4439944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4440199 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4440326 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 4440485 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 4440850 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 4440994 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4441998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4442055 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4442229 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 4442255 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4442314 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 4442472 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4442584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4442635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4442697 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 4442703 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 4442786 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4442978 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4443004 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 4443034 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 4443099 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 4443135 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 4443172 T A Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 4443227 G A Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 2 4443275 A T Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 2 4443296 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 2 4443497 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 4443655 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4443661 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 4443721 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 4443842 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 4444045 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4444052 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4444078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4444154 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 4444163 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4444170 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 4444344 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4444604 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 4445038 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 4445039 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4445258 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 4445314 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4445695 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4445740 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4445758 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4445772 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4445786 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 4445835 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 4445945 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 4445980 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 4446017 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4446032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4446194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4446326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4446398 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 4446702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4447155 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 4447475 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 4447518 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 4447534 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 4447764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4447892 A T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 4448079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4448181 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 4448220 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4448374 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4448576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4448596 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 4448816 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4448892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4449965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4449974 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 4449976 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4450111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4450559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4450728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4450877 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4451436 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4455389 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 4455444 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4455456 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4455727 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4455736 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4455753 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4456156 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4456276 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4456527 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 4456570 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 4457231 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 4457435 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4457958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4458152 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4458947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4460143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4461264 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 4461305 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4461393 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 4461441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4461445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4461495 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4461525 C G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 4461564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4461627 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4461714 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 4461727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4461746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4461791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4461819 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 4462052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4462165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4462209 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4462274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4462651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4462704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4462935 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4462987 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4463104 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 4463514 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 4464735 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 4465708 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 4465785 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4465972 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 4466026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4466065 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4466156 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4467640 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4467672 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4467684 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4467921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4468442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4468578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4469465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4469814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4471443 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4471602 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 4471980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4472178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4472242 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 4472267 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4473015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4473159 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4473358 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 4473720 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4473846 C T Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 4473870 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 4474081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4474283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4474573 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 4474672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4474845 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4475589 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4475830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4476539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4477136 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 4477140 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4477230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4477301 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4477346 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4477698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4478017 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4478079 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4478132 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4478242 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4478355 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4478589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4478825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4478915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4479100 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4479385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4479889 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4480166 T A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 4480768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4483334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4485873 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 4487449 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 4488015 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4488250 C G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 4490553 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4490569 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 4490636 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4490729 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 4495661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4497687 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4499052 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4499624 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 4502660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4504417 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 4504423 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 4505167 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 4505349 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4505530 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 4505941 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 4506528 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 4508110 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 4508181 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4508835 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 4508848 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 4509498 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 4509541 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 4509737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4509774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4509861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4510496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4510596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4511862 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4512359 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 4513417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4513524 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 4513835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4514484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4514720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4514738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4515401 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 4515711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4515883 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 4516441 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4516690 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4517791 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4518071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4518884 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 4519057 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 4519275 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 4519460 C G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 4519600 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 4519689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4521261 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4522948 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4523230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4524372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4525799 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 4525836 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4526139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4526513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4526549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4526698 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4526747 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 4526760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4526775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4527247 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4529284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4529570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4530705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4530882 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4531296 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4532372 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4533728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4535258 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 4535420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4535984 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4536222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4536579 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4536943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4537385 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4537386 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4537793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4538046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4538139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4538263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4541730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4541847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4542801 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4543080 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4543687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4543703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4543813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4543836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4544122 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4546101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4549189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4551045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4553560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4553752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4554831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4555432 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4557299 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4558825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4561243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4562663 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 4562753 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4563428 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 4563429 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 4563724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4563733 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4563975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4564686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4565583 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 4566509 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4567322 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4568439 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4570251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4570597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4571047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4573262 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4575839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4576036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4576072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4576073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4576089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4576368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4576736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4576761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4576814 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4576815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4576831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4576840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4576883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4576891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4577185 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4577206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4577262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4577277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4577371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4577383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4577391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4577431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4577478 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4578370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4578718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4579308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4579993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4580111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4580182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4580189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4580309 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4580374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4580454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4580952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4581243 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4581701 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4581915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4582222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4582267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4582462 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4584631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4585827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4585997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4586449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4586594 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4587976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4588192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4588978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4589216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4589864 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4590059 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4590172 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4590203 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4590253 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4590263 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4590275 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4590278 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4590425 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4590733 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4590928 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4590999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4591071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4591095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4591122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4591184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4591260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4591570 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4591815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4593133 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4593148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4593399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4593473 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4595030 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4595370 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4596495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4596609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4597452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4599315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4599835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4600072 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 4600289 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 4600292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4601485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4601838 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 4602742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4602859 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4603124 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 4603630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4603632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4603647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4603660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4603892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4603893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4604015 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4604988 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4604999 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4605236 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4605871 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4605998 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4606038 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4606834 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4607221 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4608815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4609972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4612894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4613258 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4615918 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4616192 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 4616862 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4616927 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4617930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4619126 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4619379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4619651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4619896 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4619955 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4619976 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4619979 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4620013 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 4620477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4620738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4621489 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4622413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4622508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4625291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4625475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4626029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4626795 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4630308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4630971 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4631290 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4631360 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4631982 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4632681 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4632835 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4633156 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4633170 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4633171 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4633188 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4634323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4635327 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4638204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4640276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4640464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4641216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4641465 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4642872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4642949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4643422 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4643458 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4643697 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4643732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4644132 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4644870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4646784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4647193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4649643 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4650459 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4654990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4655286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4655523 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 4656540 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4657215 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4658034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4658242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4659605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4660126 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 4660424 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4660468 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4660790 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4660809 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4661246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4661400 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4662158 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4662394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4662486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4662515 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4662578 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4662634 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4662856 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4663327 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4663335 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4663412 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4663642 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4663653 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4663831 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4663963 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4664105 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 4664807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4664939 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4665076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4665538 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4665610 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4665718 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4665743 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4667378 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4667403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4667443 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4667507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4667654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4667730 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4667909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4668131 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4668739 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4669197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4669260 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4670508 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4671205 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4671626 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 4671657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4671711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4671717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4671723 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4671949 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4672277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4672413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4672437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4672477 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4672478 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4672488 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4672501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4672518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4672569 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 4672594 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 4672665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4672923 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 4672984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4673082 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4673461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4673555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4673573 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 4673657 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 4673715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4673945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4674337 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 4674562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4675799 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 4678286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4678735 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 4678779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4679552 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 4679596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4680049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4680114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4680124 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4680358 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 4680363 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 4680372 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 4680400 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 4680572 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 4681318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4681884 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4682148 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4682183 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4682683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4682754 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4682917 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4683034 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 4683134 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4683259 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 4683294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4683295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4683334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4683616 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 4683780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4683987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4683993 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4684016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4684150 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4684368 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4684490 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4684497 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4684610 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 4684813 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4684883 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4685229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4685244 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4685250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4685516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4685564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4685691 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 4685756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4685791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4685846 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4685924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4686119 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4686133 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 4686150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4687180 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 4687215 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 4687296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4687995 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 4688060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4688405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4688526 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 4688649 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4688665 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 4688761 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 4688840 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 4688936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4689021 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4689057 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4689473 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4690083 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 4690509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4690744 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 4691060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4691095 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4691107 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 4691415 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4691818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4692105 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4692175 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 4692209 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4692248 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4692353 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4692368 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 4692473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4692796 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4692940 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4693495 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 4693725 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 4693732 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4694058 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 4694229 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 4694245 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 4694270 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4694294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4694297 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4694403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4694671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4694698 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 4694803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4694831 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4694927 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4695236 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 4695256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4695258 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4695269 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4695298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4695339 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4695377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4695460 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4695571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4695639 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4695664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4695674 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4695737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4695867 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4695957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4696011 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4696531 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4696595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4696618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4696737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4696746 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4696823 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4696865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4696890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4696904 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4696925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4696927 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4696955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4697112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4697121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4697234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4697313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4697458 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4697490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4697581 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4697595 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4697617 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4697678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4697699 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4697917 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4698167 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4698530 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4698572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4698586 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4698588 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4698601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4698658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4698904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4698983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4698985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4699082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4699170 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4699410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4699427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4700207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4700467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4700484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4700500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4701888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4702312 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4702992 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4703426 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4703652 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4704154 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 4705211 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4705357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4705839 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4707672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4709663 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4710299 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 4710510 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4710806 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 4711132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4711189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4711972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4712130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4715428 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4716727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4717742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4718259 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4719424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4719838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4720910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4720968 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4721191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4721206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4721209 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4724231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4724268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4724355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4724650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4724682 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4724701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4725041 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4725298 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4725445 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4725489 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4725616 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4726391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4726562 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4726582 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4726634 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 4726642 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 4726655 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 4726661 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4726803 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4726887 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4727121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4727189 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4727196 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 4727364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4727471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4727811 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 4727817 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4728002 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4728586 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4730437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4732535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4736126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4742689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4744235 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 4745317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4745936 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 4747113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4747481 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 4747529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4747832 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4747913 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4747947 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4747979 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 4747985 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 4748082 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4748126 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 4748440 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4748717 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4748888 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 4748935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4749107 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 4749175 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4749237 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4749254 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4749263 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 4749603 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 4749891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4749898 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4749912 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4749920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4750382 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4750917 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4751027 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4751472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4751709 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 4751795 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 4751927 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 4752231 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4752277 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4752287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4752359 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4752428 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4752442 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4752462 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 4752581 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4752668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4752739 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4755529 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 4755641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4756421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4757609 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 4758549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4758682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4758757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4758816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4758824 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4758903 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4758984 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4759014 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4759147 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4759151 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4759455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4759699 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 4759728 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4759789 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4759828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4759852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4759905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4759924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4760042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4760043 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4760252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4760284 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4760315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4760405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4760525 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4760543 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4760566 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4760574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4760720 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4760942 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4761062 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4761223 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4761348 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4762454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4768141 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4769674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4769680 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 4771136 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4771711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4772704 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4774551 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4775681 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4775696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4776209 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 4776252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4776569 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 4776890 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 4777272 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4777476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4777594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4777636 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4777776 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4777812 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4777838 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4777871 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4778015 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 4778058 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4778305 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4778439 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4778478 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4778841 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4778857 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4778996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4779312 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4779588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4779692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4779868 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 4779989 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 4780039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4780172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4780234 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4780868 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4781979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4782327 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4782824 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4783329 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4783406 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4783646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4783661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4784019 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4784041 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4784046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4784071 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4784090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4785101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4786444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4788059 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4788698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4791162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4793977 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 4795033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4799519 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4800649 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4801199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4801213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4801465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4802220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4805023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4806081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4806658 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4807925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4808526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4809026 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4811248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4815107 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 4816246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4816309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4818295 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 4818699 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4819082 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 4819334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4819805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4819814 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4819922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4820385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4820392 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 4821359 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4821544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4821560 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4821644 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4821826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4821914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4822815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4823502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4824176 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4825386 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4825725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4825972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4826981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4829471 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4829845 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 4829906 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4830953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4831280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4831465 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 4831658 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 4831682 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4833683 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4834230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4834573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4836833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4836884 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4836902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4836937 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 4837717 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4838022 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4838064 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4838518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4838867 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 4839350 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 4839997 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 4840083 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 4840473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4841308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4841366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4841583 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 4841638 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 4841660 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 4841745 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 4841775 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 4841820 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4842047 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 4842972 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 4843028 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 4843032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4843214 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 4843714 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4844478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4844490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4844510 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4845127 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 4845690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4845842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4845964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4847042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4847157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4847165 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 4847297 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4847308 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 4847518 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 4847522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4847575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4847678 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 4847910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4848277 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 4848310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4848953 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 4849022 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4849098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4850076 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4850125 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 4850202 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 4850362 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4850450 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 4851422 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 4852417 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 4853090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4853408 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 4855532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4856852 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 4856934 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4857568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4857695 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4858462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4858636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4858653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4859030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4861092 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 4861238 C G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 4861295 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 4861360 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 4861557 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 4861585 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 4861670 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 4861892 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 4862093 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4862101 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 4862110 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4862296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4862330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4862362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4862438 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 4862494 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 4862495 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 4862601 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 4862635 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 4862685 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 4862728 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 4862852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4863032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4863468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4864253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4864275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4866497 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 4867733 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4870419 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 4871310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4871622 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 4873679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4873749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4873760 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4874103 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 4874198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4874229 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4874302 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 4874328 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4874424 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 4874681 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 4874723 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 4874894 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 4876047 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 4876187 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 4876570 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 4876701 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 4876869 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4877184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4877354 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 4877355 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 4881250 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 4881305 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 4881418 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4883823 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 4884849 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 4884862 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 4885008 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4885047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4885370 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 4885599 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 4885616 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4885632 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 4885772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4886772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4886810 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 4887394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4887502 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 4887994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4888007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4888021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4888050 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 4888122 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 4888320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4888548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4889224 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4889225 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4890243 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 4890289 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 4890689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4890762 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 4890910 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 4892059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4893307 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 4902930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4904773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4905378 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4905434 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 4905539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4905929 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 4905942 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 4905974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4906195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4906230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4906242 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 4906327 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 4908172 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 4908210 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 4908614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4909409 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4909732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4911004 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4911085 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 4911226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4911481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4912030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4913627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4914826 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 4915334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4915722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4915765 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 4915812 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4915923 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 4915983 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 2 4916164 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 4916167 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 4916215 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 4916328 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 4916535 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 4917455 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4918421 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 4918437 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 4918540 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 4918661 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 4918683 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 4918717 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 4918952 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4919017 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 4919035 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 4919066 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 4919077 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4919434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4919499 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 4919555 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 4919654 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 4920323 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 4920840 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4921778 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 4921959 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 4921962 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 4922822 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4922825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4922887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4923352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4923398 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4923410 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4923509 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 4923520 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4923628 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4923734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4923841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4923987 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 4924039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4924070 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4924110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4924408 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 4924452 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 4925004 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4925087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4925146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4925249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4925270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4925286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4925299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4925383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4925388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4926223 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4926356 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4926386 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 4926709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4926731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4926768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4926859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4927132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4927201 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4927216 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 4927280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4927354 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 4927355 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 4927438 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4927446 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4927609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4927674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4927786 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 4927880 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 4927899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4927902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4928083 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 4928138 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 4928217 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 4928339 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 4928340 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 4928366 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 4928548 C A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 4928692 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 4928843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4928875 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 4929040 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4929129 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 4929285 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 4929296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4929491 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4929582 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 4929800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4929943 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 4930016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4930026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4930099 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 4930363 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4930450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4930560 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4930819 G A N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 4931410 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 4931417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4931527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4931536 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4931621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4932147 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 4932345 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4932390 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 4932427 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 4933056 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 4933170 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4933290 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4933640 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4933660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4934214 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 4934324 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4934343 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 4934421 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 4934485 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 4934793 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.466666666666667 0.133333333333333 0.4 16 14 7 2 6 2 4934957 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 4935267 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 4935826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4935939 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 4936096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4936152 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 4936344 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 4936685 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 4938283 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 4938615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4939058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4939837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4939980 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 4940122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4940565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4940648 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4940864 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 4941111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4941238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4941278 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 4941285 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 4941298 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 4941303 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 4941336 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 4941461 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 4941501 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 4941712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4941861 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 4941979 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 4942469 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 4942916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4942987 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 4943048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4943192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4943275 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 4944501 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4944588 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 4944661 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4944760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4944930 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 4944942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4944955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4945062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4945224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4945306 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 4945371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4945447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4945776 T A Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 4946354 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 2 4946425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4946500 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4946513 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 4946532 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4946601 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 2 4946933 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4947140 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 4947248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4947419 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 4947779 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4948016 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 4948096 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 4948753 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 4948755 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 4948977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4949088 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4949146 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 4949176 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 4949412 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 4949413 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 4949431 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 4949474 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 4949522 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 4949734 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 4949986 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 4950114 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 4950455 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 4950745 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 4950760 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 4950858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4950938 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4950968 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4951372 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 4951516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4951561 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 4951810 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 4951886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4951946 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 4952064 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4952106 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4952118 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4952294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4952393 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4952426 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 4952607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4952631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4952672 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 4952688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4952842 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4952843 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 4953278 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 4953317 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 4953353 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 4953443 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 4953511 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 4953513 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 4953646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4953671 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4953672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4953780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4953891 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 4953914 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 4954095 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 4954418 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4954813 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 4954826 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 4955544 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 4955607 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 4955622 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 4955707 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 4955729 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 4955832 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 4956621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4957354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4957433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4957921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4958223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4958623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4959566 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 4959585 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 4960114 G C Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 4960115 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 4960301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4960358 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 4960367 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 4960525 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 4960581 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 4961793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4961936 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 4962005 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4962557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4963775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4964509 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 4964933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4965323 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 4965383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4965431 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 4967468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4967517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4967536 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4967584 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4967699 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4967809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4967962 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4968204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4968495 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4968996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4969527 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 4969661 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4969714 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4969728 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4970055 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4970217 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 4970253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4970385 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4970435 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4970601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4974621 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4974647 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 4976086 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4976174 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 4976764 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4976861 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4976961 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4977055 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4977063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4977074 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4977087 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4977110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4977114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4977159 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 4977223 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4977346 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4977448 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4977500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4977807 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4977880 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4977908 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4977925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4977945 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4977954 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 4977957 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4978106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4978113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4978138 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4978320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4978369 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 4978466 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 4978530 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4978756 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4978768 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 4978950 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4978988 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 4979196 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4979654 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4979660 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4979790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4979817 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4979856 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 4979884 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4979986 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4980119 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4980126 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4980255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4980295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4980413 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4980789 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4981026 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4981355 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4981685 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4981804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4981897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4982458 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4982476 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4982481 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4982656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4982873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4982956 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 4982966 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 4982977 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 4983192 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 4983223 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4983260 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4983261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4983304 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4983373 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4983460 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4983500 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 4983665 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4983671 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4983815 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4983872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4983976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4984008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4984029 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4984476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4984616 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4984643 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4985905 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4986470 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 4988579 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4988748 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 4989096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4989134 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 4989311 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 4990449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4992291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4994888 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 4996147 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 4996606 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 4996683 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 4996701 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4996798 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 4997607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 4998161 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 4999050 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 4999981 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5000010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5000326 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 5000574 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5000591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5000635 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 5000651 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5000717 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5000863 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5000987 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5001200 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5001661 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 5001737 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5001756 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5001859 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 5001867 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 5001908 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 5001937 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5001956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5001993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5001997 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5002020 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5002031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5002038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5002053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5002055 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5002070 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5002090 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5002091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5002353 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5002593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5002804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5002839 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5003300 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5003327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5003355 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5003572 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5003633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5003731 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5003777 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5003815 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5003879 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5003901 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5003983 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 5003984 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 5004260 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 5004300 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5004328 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5004329 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5004430 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5005067 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5005308 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5005379 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5005386 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5005416 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 5005440 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5005468 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5005589 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5006119 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5006145 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5006283 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5006288 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5006324 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5006402 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5006573 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5006859 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5006926 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5006979 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5007012 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5007077 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5007129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5007167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5007343 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5007361 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5007434 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5007465 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5007756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5007775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5008097 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5008145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5008451 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5008556 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 5008744 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5008779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5008958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5008986 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5009318 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 5010531 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5010880 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5010938 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5011042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5011127 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5011209 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5011368 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5011424 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5011482 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5011502 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5011520 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5011601 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5011815 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5012128 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5012644 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5012706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5012994 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 5013120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5013151 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5014097 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5014212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5015229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5015336 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5015344 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5016078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5016467 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5016626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5016777 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5017150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5017755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5019316 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5019378 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5019598 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 5020265 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 5020364 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5020698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5020772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5021009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5021074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5021126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5021178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5021220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5021244 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5021489 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5021887 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 5021893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5022050 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5022071 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5022120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5022219 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5022755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5022767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5023049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5023112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5023291 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5023528 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5023656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5023664 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 5023814 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5023873 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5025026 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5025306 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5026539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5027273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5027402 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5027573 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5030267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5030280 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5030334 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5030349 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5030619 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5031206 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5031216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5032716 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 5034455 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5034482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5035819 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 5038446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5038717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5039040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5039262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5039426 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5039433 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5039512 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5039686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5039733 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5039793 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 5039807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5040421 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5040610 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5040611 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5040923 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5041386 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5041819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5041848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5041858 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5041873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5041901 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5041919 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5041967 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5042004 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5042226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5042237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5042250 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5042272 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5042398 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 5042399 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 5042423 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 5042668 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 5042696 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5042828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5042844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5043216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5043464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5043636 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5043805 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5043821 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 5043859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5043877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5043975 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5044030 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5044037 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5044041 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 5044122 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5044152 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 5044264 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5044348 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 5044354 G C Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 5044452 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 5044583 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 5044608 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 5044683 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 5044750 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5044868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5044956 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5045063 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5045135 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5045222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5045287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5045433 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 5045653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5045680 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 5045696 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 5045754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5045771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5045814 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5045844 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5046050 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5046395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5046526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5046590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5046641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5047107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5047121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5047142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5047201 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5047324 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5047390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5047761 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5047766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5048342 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 5048397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5048422 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5048508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5048522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5048541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5048557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5049139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5049172 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5049281 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5049634 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 5049681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5049719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5050057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5051259 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5051779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5052386 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5052502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5052600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5052614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5052749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5052780 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 5052879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5052954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5053235 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5053251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5053360 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5053412 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 5053523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5054075 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5055514 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5055583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5055591 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5055625 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5055688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5055701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5056068 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5056542 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5056544 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5056556 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5056583 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5056904 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 5057335 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5057802 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 5057828 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 5057848 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 5057910 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5057983 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5058049 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 5058124 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5058225 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 5058328 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5058597 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 5058704 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5058805 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5059460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5059533 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5059543 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5059736 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 5059737 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5060504 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5060900 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 5061001 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5061186 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 5061733 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 5065395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5065489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5065732 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 5066598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5067022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5067658 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 5068236 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 5068655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5069410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5070470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5071547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5072487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5072888 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5073135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5073218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5073224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5073341 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5073811 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 5074253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5074371 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 5074383 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5074502 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5074514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5074949 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 5075336 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 5077080 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 5077184 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 5077877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5078202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5078509 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5080294 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 5080984 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 5082263 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 5082293 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 5082413 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 5082446 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 5082539 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 5082631 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 5082850 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5083025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5083203 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 5083239 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5084350 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5084451 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 5084464 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5084554 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 5084617 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5084646 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 5084674 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 5084799 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5085018 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5085030 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 5085369 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 5085444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5085465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5085515 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 5085530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5085783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5086094 C G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 5086166 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5086284 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 5086476 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5086490 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 5086600 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5086643 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5086668 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5086816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5087082 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 5087406 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 5087754 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 5087779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5087856 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5087891 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5087968 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5088061 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 5088445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5089027 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 5089031 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 5089238 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5089258 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5089374 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5089884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5090254 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5090279 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 5091835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5092109 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5092266 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5093585 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 5094459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5094473 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 5094751 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 5095132 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5095848 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 5095981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5097586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5097959 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 5097994 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 5097997 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 5098536 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5098604 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5098725 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5098767 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 5098781 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5098786 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 5098868 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 5099003 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 5099449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5099999 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 5100006 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 5100143 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 5100284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5100545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5100840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5100868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5101153 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 5101414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5101707 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5102114 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 5102161 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5102291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5102464 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5102498 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5103158 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5103161 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5103217 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5103329 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5103330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5103488 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 5104392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5106774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5106992 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5107070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5108030 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5108039 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5108288 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5108428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5109242 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5109272 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5109302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5109434 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 5109582 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5109872 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 5109889 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5110031 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 5110561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5110664 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5110675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5110891 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5110922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5111086 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 5111134 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 5111236 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 5111251 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 5111417 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5111509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5111613 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5111654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5111681 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5111683 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 5111846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5111872 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5112089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5112113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5112149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5112158 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5112172 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5112238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5112287 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5112335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5112378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5112383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5113065 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 5113071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5113280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5113308 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5113327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5113341 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 5113357 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 5113624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5114137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5114145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5114153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5114283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5114391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5114854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5115526 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5115639 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5115737 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5115962 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 5116049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5116170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5116248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5116345 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5116365 T A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 5116464 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5116475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5116589 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5116687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5117123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5117323 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5117409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5117492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5117579 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5117765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5117785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5117835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5118054 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5118091 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5118128 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5118563 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5118839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5119012 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5119221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5119339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5119414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5119455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5119657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5119668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5119731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5119780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5120368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5120445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5120446 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5120902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5121162 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5121497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5122134 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5122545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5123606 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5123626 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5123714 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5124644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5124763 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 5124848 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 5125196 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5125290 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5125546 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5125702 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5126211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5126318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5126679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5126711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5127009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5127073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5127084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5127094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5127099 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5127109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5127163 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5127282 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5127294 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5127543 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 5127557 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 5127579 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 5127590 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 5127593 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 5127802 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5127894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5128001 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 5128037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5128148 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5128402 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5129037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5129351 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5130290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5131868 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5134548 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5134804 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5135315 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 5135566 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 5135844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5136006 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 5136172 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5136596 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 5137684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5137872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5137926 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5138740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5138918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5139048 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 5139094 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 5139188 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 5139353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5139528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5139610 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5139668 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5139693 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5139723 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5139758 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5139949 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 5140387 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 5140423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5140455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5140689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5140808 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5140837 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5140859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5140943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5140951 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 5140954 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 5141002 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 5141016 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5141311 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5141446 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5141619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5141828 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5141854 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5142077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5142194 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 5142286 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5142338 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5142471 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5143008 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5143091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5143210 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5143500 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5143516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5143720 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5143777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5143799 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 5143893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5143957 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 5144934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5145249 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5145255 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5145558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5145604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5145669 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5146400 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5147952 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5148095 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5148298 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5148331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5148432 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 5149057 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5149234 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5149238 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5149258 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5149421 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 5149452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5149460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5149466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5149597 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5149702 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5149790 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5150186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5150200 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5150272 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5150649 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 5150659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5150718 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5150751 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5150785 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5150832 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5150915 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5151106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5151184 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 5151284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5151349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5151421 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5151478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5151615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5151777 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 5152044 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5152071 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5152174 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5152396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5152659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5152693 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5153268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5153275 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 5153323 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5154072 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5154289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5154347 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5154505 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 5154511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5154639 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5154640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5154655 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5154808 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5154986 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5155019 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5155030 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5155203 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5155656 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5155664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5155764 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5155775 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5156143 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5156215 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5156245 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5156264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5156397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5156562 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5156701 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5156734 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5156937 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 5156976 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 5157113 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5157157 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5157214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5157242 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5157272 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5157273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5157335 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5157375 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5157404 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5157571 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 5157673 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 5157692 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 5157710 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 5159680 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5159714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5160796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5160973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5160999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5161003 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 5161048 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5161451 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 5161468 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5161524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5161843 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 5161879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5162076 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5162360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5162460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5162471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5163144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5163330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5163405 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 5163464 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 5163644 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 5163943 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 5164575 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 5164967 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 5165019 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 5165958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5166911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5166970 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5167089 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5167249 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5167260 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5167455 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5167821 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5168026 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5168109 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5168174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5168229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5168425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5168510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5168520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5168527 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5168569 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5168593 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5168677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5168679 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5168722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5168727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5168752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5168775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5168956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5169052 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5169091 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5169171 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5169187 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 5169527 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5169574 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5169587 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5169743 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 5169874 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5170342 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5171072 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 5171114 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5171253 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5171466 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5171475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5171736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5171797 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5171807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5171857 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 5171869 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5172031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5172377 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5172391 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5172615 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5172732 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5172779 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5173082 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5173104 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 5173174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5173242 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5173432 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 5173630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5174182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5174836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5174869 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5175084 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 5175111 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5175190 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5175200 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5175232 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5175813 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5175861 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5176059 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5176100 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5176612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5176837 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5176898 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5176916 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 5176917 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 5176979 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5177339 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 5177462 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5178094 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5178552 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 5178613 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5178691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5179549 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5179623 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 5179724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5179965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5180037 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5180447 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 5180457 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 5180508 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5180677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5180795 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5180848 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 5180909 T G Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 5180999 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 5181014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5181101 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5181157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5181311 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5181338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5182101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5182130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5182165 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5182167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5182226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5182595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5182606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5182772 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 5182840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5183022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5183047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5183481 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5183926 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5184173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5184186 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 5184634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5184684 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5184777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5184967 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5185696 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 5185724 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 5185882 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5186065 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5186283 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5186376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5186453 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5187196 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5187232 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5187414 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5187498 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5187571 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5187590 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5187854 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 5188221 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5188491 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5188513 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5188678 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 5188806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5189692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5189911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5189980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5190170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5190222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5190316 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5190345 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5190383 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5190392 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5190398 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5190554 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 5190614 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 5190652 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 5190793 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 5191055 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 5192137 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 5192164 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 5192190 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 5192237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5192447 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 5192634 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 5193061 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 5193241 G C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 5193270 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 5194019 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 5194223 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5194366 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 5194459 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5194519 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5194557 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5194687 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 5194744 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5194779 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 5194791 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 5194832 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5194879 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 5194946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5194978 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 5195189 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 5195222 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5195560 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 5195774 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5196033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5196048 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5196248 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5196433 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5196477 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5196551 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5196613 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5196674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5196936 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 5196994 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5197002 A C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 5197042 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 5197059 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 5197244 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 5197539 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 5197580 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 5197830 C G Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 5198169 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 5198200 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 5198473 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 5199304 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 5199346 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 5201346 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 5201358 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 5201387 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 5201400 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 5201584 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 5202607 C G Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 5202627 A T Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 5202628 C T Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 5202659 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 5202738 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 5202756 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 5202816 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5202879 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5203034 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 5203207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5203221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5203297 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5203299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5203350 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5203609 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5203686 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 5204167 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5206925 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5207427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5207453 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5207587 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5208135 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5208875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5209861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5209988 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5210117 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5210149 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5211066 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 5211117 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5212401 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5213004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5213216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5213546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5213685 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5214169 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5214548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5215919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5216538 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5216543 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5217231 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5217490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5219098 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5219549 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5220613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5220821 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5221031 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5221250 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 5221311 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 5221335 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5221507 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 5221654 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5221741 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 5221935 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5222035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5222125 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 5222160 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 5222292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5222480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5222519 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 5223188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5223202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5223396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5223421 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5226283 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5227851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5229081 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5229102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5229335 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5229859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5229885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5229887 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5229946 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5230635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5230862 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5231055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5231258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5231549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5232355 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5232528 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5232557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5233902 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 5233955 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 5233987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5234120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5237277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5237279 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5237712 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 5237779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5239292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5239324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5241684 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5241793 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5242598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5242786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5243091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5243303 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5244502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5244647 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5244818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5245003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5245605 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5245622 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5245641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5246120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5246439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5246740 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 5246824 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 5246871 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5246942 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5247648 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 5247843 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5248357 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 5248416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5248500 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 5248754 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5248825 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5249286 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 5249724 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 5250006 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 5250178 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 5250202 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 5250255 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 5250841 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 5251190 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 5251222 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5251257 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 5251352 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5251500 A C Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 5251597 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5251609 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5251733 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 5251791 A C Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 5251813 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 5251843 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 5252281 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 5252285 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 5252317 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 5252347 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 5252394 T A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 5252430 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5252529 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5252552 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 5252862 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5253595 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5254061 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 5254325 A C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 5254405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5254548 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5254552 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5254746 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 5254828 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5254910 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5255952 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5256214 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5257382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5257601 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5257701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5257935 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5257940 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 5258079 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5258167 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 5258264 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5258793 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5259219 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5259253 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 5259360 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5259371 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 5259448 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5259656 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5260047 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 5260132 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 5260316 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 5261127 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 5261262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5261786 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5262011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5262050 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5262066 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5262192 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5262332 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5262396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5262614 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5262648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5263240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5263823 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 5263845 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 5263936 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5263941 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5264069 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5264088 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5264164 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5264589 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 5264875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5264877 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5265056 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5265146 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5265160 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5265218 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5265330 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5265405 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5265524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5265575 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5265597 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5265816 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 5266007 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 5266048 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5266061 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 5266063 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 5266298 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 5266311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5266527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5266660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5266693 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5266701 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5266862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5266948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5267720 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5267733 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5267740 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5267808 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5267838 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5268060 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 5268187 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 5268251 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 5268320 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 5268328 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 5268331 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5268798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5268837 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5269358 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 5269399 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5269483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5269598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5269750 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5273481 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5273520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5273723 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5274303 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5274451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5274917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5275570 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5275676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5276584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5278294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5279191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5279543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5280548 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5280584 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 5281078 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5282117 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 5282466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5282803 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5283592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5283715 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 5283987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5285363 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 5285633 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 5286032 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5286090 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5286335 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5286418 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5286445 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5286527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5286584 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5286658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5286735 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5286908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5287062 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5287109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5287175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5287556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5287646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5287703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5287892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5287918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5287945 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5287972 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5288170 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 5288209 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5288217 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5288236 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5288264 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5288270 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5288285 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5288306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5288408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5288443 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 5288516 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 5288569 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 5288723 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 5288724 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 5288978 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 5289135 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 5289210 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5289355 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 5289393 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 5289485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5289571 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5289627 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 5289834 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 5289930 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 5290059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5290141 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5290180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5290238 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 5290242 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5290457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5290495 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5290508 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5290529 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5290606 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 5291016 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 5291323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5291630 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5291740 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 5291950 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 5292111 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5292230 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5292249 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5292255 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 5292269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5292319 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5292333 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5292334 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5292429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5292526 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5292640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5292701 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5292724 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5293010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5293017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5293049 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 5293331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5293368 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5293510 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5293524 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 5293684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5293731 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5293782 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5293838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5294012 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5294036 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5294266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5294480 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5294638 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 5294645 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 5294780 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 5294838 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 5294900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5294985 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5295135 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5295357 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 5295416 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5295525 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 5295801 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5295931 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 5296181 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 5296257 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 5296306 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5296374 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 5296407 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 5296457 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5296491 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 5296597 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 5296827 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5296899 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5296913 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 5296935 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5296978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5296982 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5297745 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 5297992 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5298178 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5298194 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5298230 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5298287 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5298356 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5298524 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5298717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5299130 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5299411 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5299705 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5299784 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5299791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5299827 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 5299940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5300479 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 5300575 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5300662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5300923 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5301098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5301214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5301590 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 5301595 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 5301621 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5301635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5302013 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5302029 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5302146 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5302243 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5302280 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5302425 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5303120 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5303182 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5303399 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 5303405 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 5303670 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5304071 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5304075 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5304207 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5304245 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 5304290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5304355 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 5304394 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 5304396 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 5304710 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 5304724 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5304930 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5304957 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 5304986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5305051 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 5305187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5305222 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5305318 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5305582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5305682 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5305725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5305781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5305948 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5305979 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 5306165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5306239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5306272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5306307 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5307309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5308176 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 5308397 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 5308500 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5308516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5308948 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5308990 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5309133 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5309424 C G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 5309425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5309782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5309906 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 5310172 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5310180 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 5310202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5310383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5310433 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 5310546 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5310571 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5310603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5311005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5311183 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 5311214 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 5311530 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 5312183 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 5312238 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 2 5312335 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5312353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5312421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5312891 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5313029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5313031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5313044 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5313149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5313320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5313328 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5313356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5313424 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5313440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5313510 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 5313516 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 5313727 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 5313864 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 5316020 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5316030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5316158 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5316472 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 5316529 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 5316592 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 5316992 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5317247 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5317288 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5317507 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5317754 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5317801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5317810 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5317838 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 5317922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5318686 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5318820 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5318969 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5318983 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5319006 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5319007 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5319306 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5319619 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5319625 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5319632 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5319916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5319922 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 5320039 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 5320574 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 5320675 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5320696 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 5320889 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5320901 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5320946 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5321278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5321403 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5321434 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5321459 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5321575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5321637 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5321790 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 5321809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5321900 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 5321901 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 5321931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5321941 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5322041 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5322063 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 5322065 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5322106 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5324656 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5324721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5324722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5325639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5325689 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5325718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5325933 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 5325958 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 5326022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5326126 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 5326413 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5326414 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5326462 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 5326467 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5326872 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 5326964 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 5327152 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5327505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5328156 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 5328355 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 5328454 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5328513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5328737 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5329146 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5330161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5330162 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5330659 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5330670 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5330703 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5331206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5332540 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 5332604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5332857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5333008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5333033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5335213 A T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 5336635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5337333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5340224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5341020 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 5341164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5341854 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 5342939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5343121 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5343677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5344662 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5345294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5345602 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5346674 G T N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 2 5348956 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 5349060 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5349069 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5349168 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 5349283 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5349474 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 5350698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5351290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5353505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5353571 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5353811 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5354184 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5354298 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5354344 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5354345 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5354686 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5354718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5354855 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5355522 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5355932 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 5356055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5356362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5356618 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 5356776 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 5356780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5356871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5357006 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5357017 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 5357018 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 5357032 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 5357355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5357370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5357580 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5358315 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5358554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5358640 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5358641 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5358761 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 5358971 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 5358991 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5359022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5359286 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5359656 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5359736 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5359808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5360110 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5360856 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5360962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5361702 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 5361955 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5362346 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5362619 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5362731 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 5362800 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5364643 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 5364698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5365668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5368283 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5370605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5370905 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5371003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5371249 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 5371373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5371522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5372039 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5372098 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 5372148 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 5372159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5372463 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5372580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5372927 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5372945 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5372964 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5372966 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5373068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5373102 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5373222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5373305 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5373313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5373332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5373527 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 5373543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5373708 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 5373808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5373862 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 5373884 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5373946 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 5373988 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 5374071 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 5374487 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5374560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5374643 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5374658 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5374662 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5374915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5374943 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5375033 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 5375195 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5375286 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 5375727 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 5375930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5376803 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5376809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5380856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5384291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5384299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5384323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5384476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5385335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5385569 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 5385671 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 5385673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5385747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5386043 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 5386168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5386188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5386245 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 5386350 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5386366 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 5386406 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 5386497 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 5386532 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 5387357 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 5387433 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 5387481 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 5389877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5390786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5392401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5392668 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 5393900 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5394564 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5394666 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5394877 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5395299 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 5395779 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 5395803 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5395882 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5395946 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 5395974 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 5396550 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 5398260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5399072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5399484 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5399535 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 5401495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5401974 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 5402321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5402906 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5402994 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5405926 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5405944 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5405972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5406834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5407215 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5407323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5407448 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 5407459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5408201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5408441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5408597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5409001 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5409577 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5409636 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5409642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5409723 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5409878 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5409949 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5410013 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 5410020 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 5410194 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 5410211 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 5410308 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5410463 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 5410536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5410667 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 5410675 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5411075 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 5411203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5411252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5411300 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5411388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5411573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5411735 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5412948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5413089 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5413343 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5413349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5413386 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 5413574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5413878 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 5413963 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 5414216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5414333 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5414653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5414764 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 5414851 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5414862 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5414875 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5414910 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5414913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5414945 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5414973 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 5415047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5415097 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5415108 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5415346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5415388 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5415588 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5415655 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5415670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5415764 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5415843 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5415879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5416031 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5416066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5416112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5416176 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 5416381 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 5416574 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5416764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5416809 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 5416829 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 5416959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5417174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5417306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5417551 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 5417627 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 5417649 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 5418697 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5418704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5418792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5418809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5418847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5418901 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5419262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5419899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5419936 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 5420173 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 5420202 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5420470 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 5420569 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5423930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5426595 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5426727 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5427254 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 5427646 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5429806 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5432347 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 5432841 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5433014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5433739 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5434155 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 5435285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5435865 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5436262 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5436888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5437263 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 2 5438330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5439340 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5439661 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 5440152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5441922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5443222 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5445537 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 5446463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5447552 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5447688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5448514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5451855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5452169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5452768 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 5455774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5456594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5456598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5457157 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5457247 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5457256 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5457358 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5457537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5457545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5457619 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 5457861 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 5457916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5457957 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5457984 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5457999 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5458124 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5458175 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5458459 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 5458475 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 5458487 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 5458577 A T Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 5458591 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 5458613 C T Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 5458712 G T Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 5458726 G T Y N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 5458851 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 5459029 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5459080 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5459626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5460135 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 5461207 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 5461248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5461302 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5461391 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5461709 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 5461724 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5461904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5462045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5462057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5462184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5462293 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 5462636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5462664 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5463651 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 5463674 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5463834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5463915 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 5464038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5464043 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 5464627 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5464709 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5464919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5465058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5465200 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 5465414 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 5465439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5465768 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 5466466 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 5466532 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 5466712 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 5469985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5469992 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 5470498 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 5470878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5470944 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 5471165 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 5471172 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 5471219 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 5471231 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 5471273 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 5471285 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 5471312 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 5471329 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 5471341 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 5471373 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 5471375 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 5471393 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 5471637 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 5471732 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 5471873 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5472002 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 5472113 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 5472133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5472209 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 5472763 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5473067 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 5474481 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5475278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5483222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5483285 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5483334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5483434 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5483494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5483600 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5483809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5483963 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5484052 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5484225 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5484288 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 5484393 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 5484615 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 5484832 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 5484918 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 5485314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5485865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5485893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5486105 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5486185 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 5486245 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5486417 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 5486445 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 5486463 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 5486591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5486871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5487193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5487974 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 5489183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5490310 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5490341 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5491565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5491654 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5492498 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5492881 A G Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 5494552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5494606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5494747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5494758 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5495445 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5495645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5495785 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 5495849 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5495867 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5496277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5496334 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5496571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5496648 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5497119 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5497192 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 5497219 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 5497340 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5497351 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 5497587 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5497617 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5497656 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5497784 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5497810 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5497813 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5498041 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 5500182 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5500316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5500836 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5501165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5504750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5504806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5505325 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 5505383 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 5505922 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5505947 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5506315 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5506761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5506823 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 5507380 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5507935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5508082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5508118 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 5509630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5509632 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 5509867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5510494 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 5510508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5510510 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5510587 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 5510701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5510727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5510798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5511080 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5511731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5511746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5511799 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 5511814 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5511833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5511915 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5511945 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5512058 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5512129 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 5512179 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5512200 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5512293 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5512319 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5512381 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5512448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5513073 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5513264 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 5513271 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5513377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5513467 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5513591 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5513710 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5513766 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5513857 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5513904 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5513987 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5514029 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5514034 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5514087 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5514117 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5514212 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5514293 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5514315 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5514368 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 5514399 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5514405 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5514419 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5514442 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 5514524 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 5514759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5514816 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 5514852 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 5514903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5514953 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 5514989 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5514990 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 5515038 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5515165 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 5515276 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5515277 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5515434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5516324 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5517153 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5517162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5517341 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 5517601 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5518340 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5518576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5519236 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 5519291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5520348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5520365 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5520762 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5521553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5522618 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 5523420 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5524048 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5524181 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5524501 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5524516 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5524524 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5524558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5524802 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 5524810 A C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 5524813 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 5525039 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 5525117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5525194 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5525254 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5525262 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5525270 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5525362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5525957 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5525963 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5526185 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5526256 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 5526269 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 5526608 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5526710 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5527001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5527091 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5527191 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5527260 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5527333 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5527780 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5527895 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5527905 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5529289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5530081 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 5530314 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5531306 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5532098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5532763 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5533549 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5533701 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5533745 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5533752 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5534040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5534340 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5534392 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5536408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5536427 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5536538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5536610 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5536623 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5536665 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5536682 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5538850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5539536 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 5540184 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 5540206 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 5540298 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5540364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5540464 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5540466 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5540550 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5540779 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 5540940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5540951 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5540990 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5541106 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5541737 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5541969 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5543841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5543995 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5544312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5544487 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5544952 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5545246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5545448 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 5545455 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 5545557 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5545732 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5546119 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5546125 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5547378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5547467 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5547512 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5547736 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5547740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5547760 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 5547779 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5547800 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5547846 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5547866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5548005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5548464 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5548750 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5551806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5555268 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 5556774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5556929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5557327 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5558443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5558997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5561968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5564011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5564244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5564523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5565063 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5565120 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 5565912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5565960 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5565992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5567484 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5570742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5572838 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5575214 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5575354 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 5577809 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 5579174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5581236 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5583501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5583617 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 5583850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5584110 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5585702 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5585941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5586881 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 5588448 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 5588706 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 5590200 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 5590717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5593472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5594466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5594555 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 5594728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5595249 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5596663 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 5596665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5597437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5597724 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5599325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5599801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5600178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5600282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5600888 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5603278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5614235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5614464 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5615449 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 5616440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5616813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5616884 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5616889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5617224 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5620829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5621539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5621721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5622894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5623658 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5625324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5625606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5625854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5630216 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5630851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5632037 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 5632607 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5633319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5633612 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5634229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5637797 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5638443 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5638947 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 5638978 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 5638998 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 5639056 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5639173 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5639508 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 5639509 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5639819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5640113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5640407 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 5640485 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5642078 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5642747 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5643008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5643230 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5643288 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 5643389 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5643451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5643531 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 5643627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5643639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5643819 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5643870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5643894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5643954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5644041 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5644095 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5644285 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5644362 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5644370 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5645553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5646489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5647101 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5648575 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5650702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5650959 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5650998 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 5651002 G C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 5651298 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5651550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5651712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5652380 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5652660 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 5652802 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5652936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5652968 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5653014 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 5653048 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5653155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5653800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5654361 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5654574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5655471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5655472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5655548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5655555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5655681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5655764 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5655790 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5656090 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 5656095 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 5656281 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5656292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5656299 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5656380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5656424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5656489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5656617 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5656715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5656754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5657009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5657050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5657174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5657225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5657387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5657859 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5658310 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5658313 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5658377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5658503 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5658701 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 5658732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5658982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5659336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5659385 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5659470 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5659478 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5659482 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5659502 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5659513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5660303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5660343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5661319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5661677 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5661842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5662232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5662309 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5662524 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 5662538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5662578 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5662660 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5662776 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5663245 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5663404 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5663506 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5663560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5663570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5663712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5664039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5664105 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5664194 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5664386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5664493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5664496 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5664511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5664642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5664724 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5664823 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5668446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5668634 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5668662 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5668709 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5668710 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5668748 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5668780 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5668949 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5669663 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5670866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5671062 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5671130 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5671361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5671436 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5671501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5671523 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5671533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5671603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5671663 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 5671717 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5671867 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5671913 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5672043 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5672084 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5672256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5672452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5672758 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5672765 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5672991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5673144 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5673167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5673224 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5673629 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5673799 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5674793 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5674805 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5674885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5674915 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5674982 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5675059 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5675202 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5675262 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5675263 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5675305 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5675341 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5675406 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5675442 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5675572 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5675751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5675776 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5675803 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5675859 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5675990 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5676522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5678108 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 5678338 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5678638 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 5679732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5679920 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5681517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5682058 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 5682530 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5684991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5685841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5686425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5687028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5688272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5688442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5688769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5689528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5689575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5691153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5692143 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5692345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5693237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5693298 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5693614 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5693895 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 5694093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5694110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5694180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5694303 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 5694946 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 5695042 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5695052 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 5695112 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 5695165 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5695233 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 5695250 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 5695311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5695373 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 5695399 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 5695956 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 5698957 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 5700257 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5701470 C A Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 5701512 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5701646 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 5701785 C T Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 2 5701859 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 5702069 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 5702129 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 5702139 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 5702162 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 5702591 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 5702707 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 5702785 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 5702834 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5702901 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 5702965 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 5703028 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 5703030 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 5703039 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5703169 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 5703358 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 5703468 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 5703718 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 5704206 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 5704226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5704289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5704329 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 5704347 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 5704393 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 5704402 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 5704593 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 5704628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5705419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5705501 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 5705522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5705597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5705770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5706032 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 5706037 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 5706080 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 5706184 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 5706230 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 5706250 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 5706260 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 5706613 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 5706615 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 5707056 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5707130 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 5707244 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 5707284 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 5707324 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 5707340 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 5707356 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 5707479 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5707500 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 5707508 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 5707553 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 5707617 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5707657 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 5707678 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 5707702 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 5707728 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 5707842 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 5708210 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 5708259 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 5708290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5708311 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 5708602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5709136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5709404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5709923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5710159 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 5712274 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 5712828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5713217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5713299 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5713377 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5713400 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 5713509 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 5714031 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 5714251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5714387 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5714460 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5714505 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 5714635 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 5714657 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 5714697 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 5714841 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5714920 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 5715091 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 5715152 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 5715826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5716162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5716324 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5716668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5716830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5717099 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 5717146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5717425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5717433 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5718808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5720733 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 5720853 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 5720913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5721136 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 5721606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5721916 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5722029 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5722320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5722977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5723337 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5723339 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5724223 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 5724692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5725344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5725396 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5726063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5726692 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 5727051 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 5727166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5728154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5729938 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 5730024 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 5730080 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 5731084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5731283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5732393 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5732974 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5733173 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 5733415 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5733500 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5734102 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5734177 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 5734272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5734290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5734375 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5734377 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5734504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5734551 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 5734610 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 5734955 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5734992 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5735061 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5735297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5735381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5735515 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 5735516 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 5735717 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 5735725 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 5736241 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 5736288 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 5736378 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5736563 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 5736620 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 5736918 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 5736948 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 5737134 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 5737175 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 5737261 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5737557 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 5737592 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 5737608 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 5737724 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5737725 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 5738140 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 5738420 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 5739201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5739663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5739833 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5741116 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 5741715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5741852 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5742145 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 5742736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5743083 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 5743553 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5743680 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5743961 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 5744315 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5744533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5744988 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5745320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5746090 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 5746134 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5746137 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5747998 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 5748042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5748292 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 5748756 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 5749021 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 5749135 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 5749174 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 5749956 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 5751206 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 5751257 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 5751308 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5751381 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 5751405 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 5751472 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 5751500 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 5751550 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 5751628 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 5751789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5751857 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 5751938 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 5751966 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5752062 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 5752112 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 5752219 A G Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 5752318 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5752340 T G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 5752346 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 5752375 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 5752413 G T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 5752876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5753099 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 5753840 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 5756435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5759969 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 5760078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5761382 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5762600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5763323 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5764448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5765656 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5765747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5765845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5765864 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5766881 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5769349 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 5769350 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 5771477 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5771902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5772166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5773830 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5776272 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5776738 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 5776934 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5777482 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5777617 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 5777680 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 5777957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5777986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5779255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5779574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5779645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5780164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5780904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5784107 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5786448 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 5788620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5789875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5790763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5794191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5795082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5795113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5795915 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5796111 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5797705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5799114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5803857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5805072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5814547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5815434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5816691 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 5818215 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 5818229 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5818238 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 5818412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5819003 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 5820137 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 5820724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5821454 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5821846 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5822574 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 5823905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5825840 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 5827060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5827094 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 5827770 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 5828058 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 5828356 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 5828658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5829556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5829690 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5830127 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5830426 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 5831208 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5833140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5833505 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 5833631 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 5833740 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 5833780 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 5833981 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 5834165 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 5834718 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5835488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5836162 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 5836205 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5836281 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 5837369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5838836 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 5841451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5842799 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 5842829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5842974 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5844068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5844446 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 5845505 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5847283 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 5848470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5848481 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 5848498 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 5849392 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5849400 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 5849581 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5849589 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 5850116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5850535 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5850571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5850843 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5850852 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5850894 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5850941 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5850976 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5850989 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5851014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5851137 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5851536 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 5852004 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 5852300 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5852357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5852461 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 5852463 A T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 5852499 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 5852529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5852531 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 5852541 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 5852547 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5852577 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 5852690 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5852815 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 5852839 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 5852897 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 5853093 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 5853605 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5853636 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 5853694 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 5853791 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5853804 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 5853873 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 5853945 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 5853990 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5854230 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 5854278 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 5854488 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5854496 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5854557 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 5854624 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 5855012 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 5855630 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 5855795 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 5856036 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 5856144 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5857180 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 5857443 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5857449 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5858303 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5858318 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 5860296 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5862061 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5862194 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5862239 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 5862294 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5862337 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 5862356 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 5862604 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5862641 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5862645 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 5863127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5864428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5868638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5873265 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 5874950 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5875187 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5875850 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5876307 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5880353 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 5880665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5881391 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 5881845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5881874 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5882015 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5882267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5882324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5882357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5882818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5883804 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5883816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5884695 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5885256 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5885262 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5885601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5885781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5885967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5886693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5886781 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5886845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5887025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5887036 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5887179 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 5887264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5887522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5887659 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5887991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5888615 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5888812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5889164 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 5889265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5889747 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5889941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5889955 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5890785 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5891193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5891501 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5891551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5892141 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5892369 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 5892475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5892555 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 5892616 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5892648 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5892677 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 5892818 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5893263 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5893328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5893373 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 5893655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5893762 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 5893818 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 5894225 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 5894338 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5894773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5895108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5895148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5896205 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5896503 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 5896521 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 5896699 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 5896703 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 5896756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5897839 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5897938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5898077 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5898280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5898411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5898546 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5898549 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5898721 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5898736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5899109 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5899187 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5899190 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5900202 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5900490 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 5900503 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 5900661 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5901096 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5901115 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 5901145 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 5901324 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5901393 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5901394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5901774 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 5901953 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 5902406 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 5903434 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5904217 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 5904249 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 5904252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5904992 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 5905393 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5905684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5905994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5906614 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 5906816 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 5906873 A T N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 5906940 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5907017 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5907490 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5907501 G C N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 2 5907513 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5907628 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 5907739 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 5908129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5908317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5908512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5908529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5908543 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 5908702 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 5908724 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 5909029 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 5909032 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 5909059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5909065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5909103 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5909273 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 5909377 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5909390 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5909807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5909812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5909828 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 5909848 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5909943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5910206 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5910510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5910549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5910594 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 5910609 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 5910874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5911120 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5911574 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 5911593 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 5911647 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 5912445 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 5913279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5913299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5913326 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5913352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5913720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5914913 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5915064 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 5915155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5915680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5915743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5915773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5915789 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5915935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5915947 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 5916013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5916503 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5916594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5917552 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 5917665 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5917666 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5918015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5918449 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5919472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5919692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5920003 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5920094 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 5921258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5921261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5921396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5921425 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5921479 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5921546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5921684 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5921813 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5921896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5921967 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5922206 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5922224 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5922315 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5922361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5922413 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5922588 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5924414 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5924524 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5926012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5926305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5926355 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 5926402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5926879 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 5928400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5928720 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5928843 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5928860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5928900 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5928914 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5928920 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 5928935 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 5930162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5930289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5931812 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 5932293 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5933612 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5934295 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 5934296 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 5935626 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 5936093 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 5936224 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 5936394 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5936412 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 5936467 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 5936504 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 5937335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5938702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5940273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5941934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5942777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5945463 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 5945763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5949872 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5950744 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 5951189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5951639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5953205 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5953862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5953975 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 5954676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5956940 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5957166 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 5957882 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5958243 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 5958289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5959872 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 5963078 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5963870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5964374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5967431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5967741 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5968157 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5968455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5968544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5968583 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5968592 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5968636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5968681 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5969523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5969819 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 5970741 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5971044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5972486 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 5972952 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5973021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5973303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5973562 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 5975420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 5975708 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5976999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5980861 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 5983567 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 5983603 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 5985347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5986571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5986632 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5986901 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5991451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5991646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5993772 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 5996282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5996919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5998368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5998450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 5999234 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 6001656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6001763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6001866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6002616 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6002649 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6002826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6003550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6005286 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 6005460 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6005524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6005693 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 6007385 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 6007489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6007693 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 6007769 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 6007847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6007948 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 6008306 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 6008500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6008703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6008984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6009253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6009416 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 6009492 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 6009979 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 6010632 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6011432 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 6011510 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 6012686 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6018432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6018796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6019300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6019616 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6019680 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 6020168 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6020400 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6020562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6020592 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 6020785 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 6020787 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 6020796 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 6022778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6023250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6023917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6027665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6028090 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6028680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6030676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6031097 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 6031467 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6031468 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6031497 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6033349 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 6033637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6033697 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6034668 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 6034672 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 6034715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6035039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6037058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6037804 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 6038727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6038829 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6038860 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 6040203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6043652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6043829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6044486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6044760 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 6045895 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6049781 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6049790 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6050353 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6053978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6054780 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 6055133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6055344 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6056003 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 6056466 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 6056467 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 6056514 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 6056924 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6057000 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 6057014 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6057065 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6057087 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 6057098 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 6058023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6058046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6058113 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6058169 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6058242 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6058279 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 6058324 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 6058381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6058394 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6058539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6058578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6058703 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 6058750 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 6058772 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 6058799 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 6058830 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 6059037 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 6059051 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 6059212 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 6059346 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6059419 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 6059457 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6059776 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6059815 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6059837 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6060176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6060699 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6060834 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6064351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6064504 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 6067162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6067420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6067467 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 6068052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6068054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6070746 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6070836 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6071332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6071491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6072339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6074455 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 6076110 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6077279 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6077432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6078508 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 6078650 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 6080088 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6080277 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6081424 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 6081456 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 6081458 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 6081507 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 6081682 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 6081691 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 6081727 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 6081732 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 6081787 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6081936 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6081970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6082186 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 6082222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6082436 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6082504 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 6082766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6082798 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 6082888 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 6083009 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6083405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6083552 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6083746 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6084671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6085065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6085466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6086813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6087897 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 6088202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6088460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6088688 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 6090772 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 6092693 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 6092703 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6092803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6092855 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6092879 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6092922 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6092923 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6092968 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 6094743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6096297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6096690 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 6097592 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6097765 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6098134 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 6098171 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 6098467 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6098581 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 6098864 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6099006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6100374 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 6100482 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 6101175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6101419 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 6101463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6104019 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6104265 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6105192 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6105615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6106026 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 6106052 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 6106081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6106373 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 6106480 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6106547 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6106589 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6106596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6106698 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 6106733 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6106743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6106937 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6106977 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6107000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6107021 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6107041 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6107109 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 6107119 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6107467 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 6107483 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 6107569 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6107786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6107849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6108010 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 6108036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6108056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6108073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6108122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6108147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6108174 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6108193 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6108744 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6108775 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6108792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6108805 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6108830 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6109004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6109384 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 6109456 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6109551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6109560 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6109640 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6109684 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6109786 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 6109831 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 6109943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6110082 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6110186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6110930 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 6111072 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6111296 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 6112115 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 6112245 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6112283 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6112309 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 6112383 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6112453 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 6112703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6112719 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 6112733 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6113018 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 6113047 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 6113064 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6113111 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6113149 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6113941 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 6113943 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 6114027 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6114139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6114143 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 6114353 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6114370 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6114377 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6114396 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 6114490 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 6114508 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6114629 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6114807 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6115185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6115249 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 6115258 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6115382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6115423 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6115469 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6115483 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6115525 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6115642 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 6115728 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 6115731 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 6116144 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6116162 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6116280 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 6116281 T G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 6116325 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6116404 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 6116410 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 6116436 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 6116450 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6116573 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6121778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6122067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6122116 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6122271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6122461 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 6122610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6122731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6122976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6123186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6123200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6123262 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 6123427 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 6123480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6123524 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 6123651 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 6123750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6123824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6124023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6124170 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6124182 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6124262 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 6124273 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6124366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6124377 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 6124465 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6124568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6124641 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 6124681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6124689 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6124768 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6124778 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 6124819 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 6125142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6125172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6125179 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 6125251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6125277 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 6125404 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 6125421 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 6125529 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 6125720 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6125731 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6125739 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6125800 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6125913 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6125916 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6125953 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6125983 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 6126023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6126031 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 6126106 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 6126127 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 6126154 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 6126215 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6126216 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6126297 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6126305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6126544 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 6126578 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 6126585 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 6126599 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 6126620 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 6126639 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 6126660 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 6126667 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6126771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6127129 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 6127161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6127172 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 6127186 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 6127315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6127389 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 6127512 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6127626 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 6127728 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 6127759 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6127760 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6127855 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6127881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6127935 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 6128131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6128222 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 6128245 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6128376 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 6128397 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 6128673 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 6128744 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 6128804 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 6128858 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 6128874 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 6130653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6131142 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6131785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6132350 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 6133007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6133331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6134218 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6134657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6135999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6137240 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6137799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6138012 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 6138016 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6138137 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 6138254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6138355 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 6139082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6139316 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 6140790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6140945 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 6141051 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 6141165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6141251 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 6141653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6142293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6142738 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 6143887 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 6144196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6144420 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6145125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6145215 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 6145705 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 6145709 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6146177 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6148902 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 6149002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6149204 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 6149316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6149749 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6151062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6151428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6152169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6152485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6152547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6153038 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 6153138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6153970 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6157251 C T Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 6157676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6159866 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6159887 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6161982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6163237 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 6165410 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 6165483 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 6165500 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 6165516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6165541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6165614 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 6165654 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 6165708 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 6165712 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 6165722 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 6165744 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 6165847 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6165870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6165912 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 6166255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6166721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6166814 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6167377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6168839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6169099 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 6169820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6170516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6170534 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 6171733 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6173244 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 6174755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6175514 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 6175663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6176181 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6176329 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6176467 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 6176476 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 6176490 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 6177298 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6178245 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 6178336 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 6178524 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6179031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6179246 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 6179579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6179621 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6179684 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6179709 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 6179715 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6179872 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6179917 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6179969 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6179988 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 6180329 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6180331 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6180351 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 6180497 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6180511 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6180539 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 6180564 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 6180611 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 6181006 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 6181114 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 6181131 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6181135 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6181199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6181203 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6181213 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6181620 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6181688 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 6181737 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6181870 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 6181920 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6182070 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6182154 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 2 6182455 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 6182498 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6182521 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 6182542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6182577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6182909 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 6182910 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 6182950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6183726 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6183861 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 6183880 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6183914 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 6184305 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 6184311 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 6184316 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 6184382 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6184385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6184393 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6184461 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 6184670 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6184831 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6184935 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6184965 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 6184976 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6185144 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6185223 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6185303 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6185331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6185376 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6185420 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6185466 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6185597 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6185717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6185718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6185839 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 6185920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6185958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6185976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6186031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6186085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6186281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6186310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6186493 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6186930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6187120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6187155 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 6187357 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6187539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6188494 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6188495 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6189089 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 6189366 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6189435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6189531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6189589 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6189713 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6189731 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6189878 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6190228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6190438 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 6190439 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6190490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6190542 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 6190551 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6190839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6191043 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6191171 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6191173 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6191247 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 6191301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6191340 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6191370 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6191458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6191531 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 6191801 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6192007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6192040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6192104 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6192174 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 6192259 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6192262 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6192296 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6192575 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 6193362 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6193656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6193712 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6194086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6194712 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6194834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6195122 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 6195419 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6196598 A C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 6196764 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6197044 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6197077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6197271 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 6197668 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 6197758 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6197763 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6198581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6199104 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 6199160 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6199937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6199951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6200180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6200250 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6200260 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6200278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6200325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6200395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6200597 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6200620 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6200624 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6200699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6200740 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6200791 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6200804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6200980 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 6201022 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 6201111 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 6201145 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 6201375 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6201407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6201536 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6201789 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 6201960 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6202105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6202119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6202161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6202527 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6202528 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6202550 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6202583 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6202594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6202595 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6202605 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6202635 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6202642 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6202781 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6202824 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6202880 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6202939 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6202996 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6203651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6203938 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6203967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6204089 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6204547 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6204622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6204847 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 6204852 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 6204908 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6205116 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 6205142 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6205552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6205563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6205992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6206304 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 6206497 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6206797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6207121 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6207206 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6207315 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6207361 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6207416 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6207593 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6207721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6207770 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 6208026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6208050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6208070 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6208578 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6208702 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6209096 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6209117 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6209160 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6209409 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6209893 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6210080 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6210149 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6210186 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6210204 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6210312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6210562 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 6210734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6211225 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6211394 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6211430 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6211453 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6211663 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 6211794 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 6213518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6213525 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6214439 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6215019 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6215059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6215099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6216081 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6216126 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6216141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6216191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6216192 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6216341 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6216499 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6216504 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 6216809 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6216908 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6217385 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6217597 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6220046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6220191 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6220277 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6220507 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6220707 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 6220770 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6220786 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6220887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6220896 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6220941 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6220983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6221014 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 6221251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6221298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6221747 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6221764 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6221869 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6221912 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 6222025 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6222525 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 6222809 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6223156 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 6223339 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6223441 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6223459 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6223558 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6223582 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6223678 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 6223715 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6223843 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 6223978 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 6224028 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 6224045 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 6224243 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 6224613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6224616 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6224697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6224711 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6224803 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6225145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6225184 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6225287 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6225439 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6225440 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6225472 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6225480 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6225517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6226081 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6226082 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 6228336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6228352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6228370 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6228442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6228548 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 6228571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6228764 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 6228877 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6228879 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6229494 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 6229613 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 6229707 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6230155 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 6230807 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 6231528 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 6231561 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 6231972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6232155 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 6232813 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 6232832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6232837 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6232951 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 6233278 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6233880 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6234062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6235013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6235156 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6235412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6235839 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6236098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6237183 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 6238211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6238275 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 6238289 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 6238366 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6238473 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 6238475 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 6238544 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 6238547 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 6238598 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 6238609 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6238665 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6238764 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 6238807 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6238837 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 6238923 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 6239177 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6239300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6239374 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 6239875 T G Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 6240139 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6240242 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 6240299 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 6240392 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 6241296 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 6242179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6242442 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 6242862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6243626 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 6250909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6255297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6256196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6256782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6258253 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6258359 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6260120 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6260921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6264983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6265728 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 6266636 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 6267305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6272294 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6273150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6273646 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6274552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6274758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6274905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6275167 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 6275302 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6275961 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 6276332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6276970 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 6279715 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6279996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6280243 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6280556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6281562 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 6281996 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6282866 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6282867 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 6283894 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6283936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6284535 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6284997 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6285471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6288635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6289958 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6290605 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6292074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6292898 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6293231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6293445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6294248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6294356 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6294544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6296229 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 6296239 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6296421 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6296784 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 6297304 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6297592 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6297708 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6297803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6297860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6298437 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6298593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6298679 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6298744 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6298965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6299945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6301765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6301993 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6304194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6305864 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6306042 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 6307436 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 6307597 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6308263 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6308304 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6309117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6309530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6310853 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6311989 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6315404 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6315476 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6317048 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 6318283 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6318563 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6318616 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6318748 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6319001 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6319230 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6319422 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6319500 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6323409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6324677 C T N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 6325863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6326090 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 6326706 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6330088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6330394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6330517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6330686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6330779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6330924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6331367 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 6331415 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 6331522 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 6331616 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 6331999 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6332025 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 6332125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6332299 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6332787 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6334724 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6334968 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6335463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6335691 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6335854 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6336395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6336816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6336859 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6338071 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6338354 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6339251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6339890 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6340262 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 6340988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6341462 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6341512 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6341592 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6341707 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 6341883 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6342493 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6342849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6343172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6343205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6343508 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6343514 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6343921 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6344082 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6344115 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6344249 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6344321 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6344329 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 6345099 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6345166 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6345478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6345523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6345799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6345813 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6346004 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6346361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6346376 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6346716 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6347069 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6347130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6347499 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6347764 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6348099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6348145 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6348167 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6348200 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6348391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6348403 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6348423 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6348489 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 6348490 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 6348660 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6348661 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6348685 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6348738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6348750 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6348974 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 6348978 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 6349021 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6349124 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6349178 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 6349373 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6349410 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 6349442 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6349907 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6349958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6350417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6350879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6351575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6352300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6354946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6355055 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6355382 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6356257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6356305 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6356629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6356745 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6358662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6359231 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6359539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6360899 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 6361304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6361832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6363024 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6363471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6364617 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 6365225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6365230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6365357 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6365433 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 6366008 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6369614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6369800 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6369803 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6370867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6372397 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6372452 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6372488 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6372524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6372635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6373786 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6373851 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6373917 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6373931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6373974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6374084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6374226 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6374373 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6374458 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6374489 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6374661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6374678 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6374709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6375550 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6375709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6375810 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6375928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6375939 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6375963 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6376030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6376298 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 6376587 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6376997 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 6377011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6377012 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 6377095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6377100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6377212 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6377287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6377541 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6377661 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6377701 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6377711 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6377747 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6377815 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 6378023 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 6378444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6379245 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6379446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6379684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6379891 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6379944 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 6380099 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6380208 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6381324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6383046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6383450 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6383526 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6384652 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 6385128 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6385438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6385702 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6386131 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6386238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6386299 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6386361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6387718 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6388164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6388447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6388662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6388836 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 6388838 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6388863 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6388984 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6389220 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6389279 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6389763 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6389813 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6390136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6390763 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6391956 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 6391958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6392079 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6392452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6392461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6392685 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6392947 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6393187 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6393259 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6393296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6393473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6393614 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6394308 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6394324 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6394444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6394458 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 6395077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6395565 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 6395683 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 6395698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6395927 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6396330 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6396899 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6397034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6397502 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6397719 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6397932 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6398087 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 6398102 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6398393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6398924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6399163 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 6399250 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6399340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6399889 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 6399949 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6400049 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6400304 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6400348 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 6400756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6400783 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 6400862 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6401553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6401684 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6401930 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 6402149 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 6402156 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6402192 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 6402198 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 6402247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6402316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6402351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6402370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6402385 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6402452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6402475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6402507 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6402513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6402630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6402715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6402788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6402795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6402807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6402882 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6403006 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 6403048 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6403111 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6403231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6403330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6403385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6403458 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 6403471 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 6403630 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 6403666 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 6403670 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 6403735 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 6404116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6404159 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6404186 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6404228 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6404594 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6407120 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6407237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6407621 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 6407967 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6408086 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6408963 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 6409852 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6410995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6411020 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6411103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6411762 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6411763 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6412081 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6412135 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6412634 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6412993 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6413081 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6413153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6413181 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 6413190 T G N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 6413263 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 6413424 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 6413425 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6415341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6415352 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6416280 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6416283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6417055 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 6417109 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 6417443 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 6417584 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 6417665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6417872 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 6417994 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 6418124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6418259 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6419640 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 6421706 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 6421786 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 6422159 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6422274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6422699 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 6424373 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6424440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6424707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6425973 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6427072 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6427392 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6428035 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6428583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6428763 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6429269 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 6429275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6429420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6429801 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6430194 C T Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 6431792 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 6431820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6432210 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6432238 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6432507 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6432884 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6433245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6433726 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 6433762 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 6433766 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 6433885 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 6433888 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 6433937 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 6433956 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 6435060 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6435351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6436641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6436816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6437337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6438590 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 6438891 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 6439153 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6439219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6439360 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6439388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6439576 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6439690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6439777 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6439814 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6439961 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6440321 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6440436 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6440464 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6440796 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6440888 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 6440892 G C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 6441191 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6441277 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6441322 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 6441328 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6441413 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6441876 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 6441945 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6442216 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 6443096 A T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 6443255 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 6443326 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 6443334 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 6443429 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 6443434 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 6443441 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6443462 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 6443471 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 6443545 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6443640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6444151 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 6444301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6444482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6444605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6444803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6445623 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 6445778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6446047 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 6446181 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 6446259 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 6446365 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6446389 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6448443 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 6448768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6448865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6449334 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 6449508 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6449718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6449897 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 6449993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6450089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6450100 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6450116 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6450149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6450190 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 6450220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6451562 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 6451584 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 6451665 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 6451755 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 6451769 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 6451915 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 6452007 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 6452506 T C Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 6452636 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 6452849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6452863 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 6452941 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6452966 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 6453052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6453375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6454107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6454131 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6454179 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 6454429 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 6454707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6455281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6455426 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 6455623 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 6455729 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6455773 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 6455998 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 6456067 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6456548 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 6456724 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6456983 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 6457103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6457198 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 6457471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6457504 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6457568 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6458594 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 6459441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6460543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6460693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6462054 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 6467904 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6468525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6468711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6468766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6469868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6471873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6471934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6472767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6472775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6472840 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6473490 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6473493 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6473976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6474158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6474309 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6474449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6474634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6474658 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 6475737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6475874 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6475881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6475910 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 6476200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6476213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6476679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6476910 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 6480278 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 6480478 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6480931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6481895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6481901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6481920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6482261 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6483485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6484025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6484592 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 6488797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6491529 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6491623 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 6492076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6492118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6492266 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 6492339 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6492366 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6492814 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6493076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6493408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6493832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6494485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6495494 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 6496739 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6497493 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6498321 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6499052 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6499279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6499337 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 6499359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6499368 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 6499564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6501850 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6504120 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 6504158 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6505901 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6507440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6508351 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6508389 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 6509195 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 6509223 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 6509297 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 6509838 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6511149 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6511836 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6512060 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 6512797 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6512914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6513616 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6514242 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6514886 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6516478 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6516507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6517223 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6518817 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6519107 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6519720 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6519943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6521824 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 6522067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6522103 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6524050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6524686 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6525478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6525746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6526251 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 6526787 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6526848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6528560 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6529646 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6530555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6530843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6531442 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 6532069 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6532459 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6533154 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 6533159 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6534441 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6534513 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6534692 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 6534745 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6534845 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 6534848 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 6534954 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6534955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6534983 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6535161 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 6535625 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6535757 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 6535774 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6536048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6536139 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6537006 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 6537041 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6537069 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 6537095 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 6537146 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 6537158 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 6537161 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 6537241 G T Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 2 6537245 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 6537260 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 6537594 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6537739 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6537758 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 6537777 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 6537822 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 6538143 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6538675 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6538760 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 6539042 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 6539046 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 6539076 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6539161 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 6539173 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 6539224 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6539249 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 6539854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6539941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6540062 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6540220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6540404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6540428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6540918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6541471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6542492 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6542609 A C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 6542777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6542799 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6544112 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6544871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6546157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6547047 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6549850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6552871 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 6553098 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6553180 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 6553344 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 6554433 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 6554867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6555075 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6556024 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6556193 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6557270 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 6557897 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 6557900 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 6557955 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 6558034 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 6558112 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 6558549 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 6558586 G T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 6558590 T A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 6558987 A C N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 6559124 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 6559392 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 6559708 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 6559766 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6559805 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6559856 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6559907 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 6559925 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6560146 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6560261 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 6560275 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 6560291 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 6560478 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6560528 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 6560596 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6560973 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6560986 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6561125 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6561129 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6561138 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6561150 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6561319 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 6561340 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6561375 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6561378 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6561419 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6561502 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6561616 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6561921 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 6561949 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 6562013 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 6562030 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6562056 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6562198 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 6562274 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 6562280 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 6562380 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6562395 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6562433 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6562533 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6562951 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6563028 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6563054 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6563074 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 6563483 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 6563490 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6563551 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6563649 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6563650 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6563901 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 6564277 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 6564483 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 6564501 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6565423 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 6565599 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6565667 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6565981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6566098 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6566149 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6566188 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 6566208 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6566425 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6566661 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6566744 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6566770 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6566907 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6566980 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6567004 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 6567058 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6567098 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 6567180 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6567237 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6567695 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 6567842 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6568311 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6568448 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 6568468 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 6568602 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 6568654 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 6568670 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 6568678 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 6568713 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 6568824 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 6568899 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6569004 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6569211 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6569227 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 6569293 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 6569424 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 6569455 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6569462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6569538 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6569617 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 6569632 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6569650 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6570122 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6570135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6570240 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6570323 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 6570327 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 6570644 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6570913 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6571057 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6571060 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6571115 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 6571193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6571224 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 6571348 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 6571379 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6571569 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6571604 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 6571678 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 6571686 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6571823 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 6571892 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 6571919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6572050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6572135 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 6572157 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6572364 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6572752 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 6572758 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 6572774 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 6572836 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 6572915 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6572948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6573005 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6573007 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6573485 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6573507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6573550 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 6573587 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6573633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6573823 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6573853 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 6573867 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 6573868 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 6574139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6574407 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6574439 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6574896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6574999 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 6575017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6575040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6575293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6575867 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6576637 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6576998 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 6577153 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 6577162 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6580780 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 6584275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6585064 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6585440 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6585443 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6585457 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6585474 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6585586 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 6586162 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 6586870 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 6587377 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6587657 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6587801 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6589047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6589353 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6591011 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 6592699 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6592878 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 6593149 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6593726 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 6594564 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6594759 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6596697 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6597914 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6599113 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6600026 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6600140 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6600697 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 6600991 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6602013 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6602119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6602359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6602622 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6602926 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 6603210 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 6603225 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 6604795 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 6605275 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 6605454 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 6606074 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 6606158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6606529 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 6606642 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 6606902 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 6607176 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 6607356 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 6607370 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 6607628 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 6608300 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6608960 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 6608982 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 6609075 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 6609431 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6609501 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6609937 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6610990 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6611009 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6611258 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 6611980 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6612311 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 6612596 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 6612608 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 6612637 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 6612810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6612954 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6613089 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6613548 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6613719 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6613969 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6614478 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6614632 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6614710 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6615216 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6615253 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6615293 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6615333 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6615368 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6615563 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6615579 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6615944 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6615991 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6616152 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 6616180 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 6616221 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 6616963 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 6617355 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6617650 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6617881 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6618433 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6618548 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6618602 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6618747 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6618824 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6618846 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6619405 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6620317 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 6620320 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 6621166 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 6621650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6621714 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 6621722 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6621730 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6621773 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 6623264 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 6623356 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6623963 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6626091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6626913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6627631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6628804 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6630096 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 6632928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6633306 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6633642 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6634544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6635310 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 6637020 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6637343 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6637476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6637859 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6637860 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6638015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6638282 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6638494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6639006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6640242 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6640314 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6642027 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6642126 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6643623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6644415 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6644556 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6644710 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6644711 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6645334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6645449 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 6645661 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 6645668 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 6645747 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 6645835 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6646036 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 6646458 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6647113 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6647962 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6648671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6649040 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6649391 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6649417 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 6649573 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 6650966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6651453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6651867 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6651967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6651988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6652705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6653650 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6653703 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6654172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6654275 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6654999 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 6655236 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 6655552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6656390 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6657001 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 6657012 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6657073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6657332 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6657377 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6657483 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6657563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6657574 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 6657762 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6657877 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6658130 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6658151 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6658923 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6658976 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6658983 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6659143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6659890 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6659992 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 6660020 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6660060 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6660119 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6660321 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 6660438 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 6660528 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 6660611 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 6660767 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 6661148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6661365 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 6661383 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6661406 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6661597 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6661646 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6661840 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 6661842 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 6662096 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6662123 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6662166 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 6662253 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6662280 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6662349 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6662487 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6662521 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6662607 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 6662648 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 6662743 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6663187 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6663209 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6663244 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6663263 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6663372 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6663586 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 6663624 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 6663643 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6663714 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6663764 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6663906 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 6663938 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6664000 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6664002 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6664114 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 6664176 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 6664245 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6664266 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6664564 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6664640 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6664662 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 6664988 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6665021 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6665139 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6665163 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6665301 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6665317 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6665327 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6665527 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6665560 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6665579 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6665794 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6665886 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6665981 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 6666058 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 6666070 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 6666197 A T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 6666485 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 6666486 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6666585 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6666796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6666809 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 6666856 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6667068 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6667195 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6667290 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6667332 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6667538 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6667720 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6667848 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6668008 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 2 6668013 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 6668041 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 6668072 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 6668095 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 6668432 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6668666 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 6668865 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6668891 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6669219 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6669258 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6669413 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 6669551 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6669586 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6670069 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 6670156 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6670313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6670413 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 6670476 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6670513 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6670523 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6670564 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6670571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6670713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6670720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6670738 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6670749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6671216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6671253 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6671551 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6671569 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6671698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6671737 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 6673185 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 6673449 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6673653 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6674117 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 6675616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6675698 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6676277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6677174 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6678488 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6679217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6679371 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6680298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6680755 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 6680810 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 6680833 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 6680842 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 6682506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6683208 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 6684279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6685778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6686918 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 6688502 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6688574 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6688582 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6688675 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6688789 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 6688808 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 6688809 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 6688971 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 6689115 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 6689287 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 6689292 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 6689307 T C Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 6689334 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 6689360 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 6689819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6690118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6690546 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 6690649 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 6690916 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 6691060 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 6691312 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6692467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6692564 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6692974 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6693028 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6693063 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 6693264 C T N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 2 6693588 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6698990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6699122 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 6699163 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6699369 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6699728 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6699752 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 6699776 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 6699864 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6699880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6699917 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 6700136 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6700205 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6700225 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 6700633 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 6700694 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 6700750 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6700813 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 6701000 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 6701097 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6701242 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6701666 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6701952 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6701995 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 6702037 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6703030 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6703197 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6703512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6704189 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 6704255 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 6704290 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 6704330 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 6704356 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 6704497 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6704610 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6704811 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 6704844 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6705101 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 6705169 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6705262 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6705822 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6706221 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 6706285 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 6706631 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 6707118 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6707149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6707216 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 6707242 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 6707458 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6707502 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 6707576 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 6708400 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 6708510 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 6708599 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 6708694 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 6708699 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 6708879 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 6708910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6708940 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 6708962 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6709200 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6709310 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 6709672 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 6709770 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 6709816 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 6710045 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 6710058 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 6710211 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 6710213 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 6710438 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 6710481 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 6710562 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6710646 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6710707 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 6710765 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 6710784 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6710807 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6710923 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 6710940 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 6711230 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6711837 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 6711935 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 6712062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6713109 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6713202 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 6713744 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6713974 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6714017 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 6715269 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 6715314 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 6715936 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6716315 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6716526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6717012 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6717888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6718007 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6718139 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6718140 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 6718189 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 6718195 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6718265 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6718331 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 6718414 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 6718782 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6718854 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 6718899 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 6719658 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6719659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6721376 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 6721491 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 6721772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6722294 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6722312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6722617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6723171 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 6723330 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6723375 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6723419 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6723793 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6724070 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 6724180 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 6724247 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 6731780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6734676 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6734835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6738103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6738502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6739302 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6741033 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6744802 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6745062 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 6745710 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6745760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6745792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6745808 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6750012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6751074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6751166 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 6752106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6752467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6756224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6759650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6760170 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6760177 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6768617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6770053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6770055 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6770980 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6772118 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6774058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6774355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6774466 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 6775075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6775101 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6779490 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6779771 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6780012 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 6780231 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6780825 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6780851 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 6781487 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6781824 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6781912 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 6781919 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 6782136 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 6784513 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6784533 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6784824 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6786184 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 6786237 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 6786299 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6786444 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 6786488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6786585 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 6786717 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 6786852 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6789301 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6789485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6789535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6790004 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6790227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6790274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6790565 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 6790784 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 6791273 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6791361 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6792403 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6796020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6796298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6797551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6798023 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6799182 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 6799410 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6800028 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6800337 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6800694 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6800720 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6800783 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 6800858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6801082 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6801268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6801343 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6802041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6802393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6802590 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6804498 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6804945 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 6805509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6805853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6806439 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6807042 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 6808088 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 6808962 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6809069 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6809179 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6809217 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 6809535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6814714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6814858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6817455 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6817502 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 6818553 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 6818713 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 6820291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6823536 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 6823679 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 6824558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6825213 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 6825292 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6825404 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6825440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6825473 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6825500 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6825644 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 6826102 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 6826119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6826192 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 6826351 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 6826356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6826389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6826430 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6826455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6826706 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 6826734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6826865 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 6826986 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 6830879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6831172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6831440 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 6831889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6832396 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 6833656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6834185 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6835578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6835865 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 6838347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6838674 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 6838890 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6839019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6840323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6843264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6844240 G T Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 6845118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6845610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6848218 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6850314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6854456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6857098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6859592 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6859594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6859703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6860545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6861195 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6862299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6862394 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6862440 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6864913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6868677 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6869283 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6870587 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6872822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6874968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6880693 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6880770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6881350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6881860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6881969 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6882319 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6882685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6882773 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6882810 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6882983 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6883288 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 6883305 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6883349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6883353 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6883453 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 6883590 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6883780 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6883791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6883803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6883804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6883819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6884028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6884034 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6884040 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6884052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6884060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6884206 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6884612 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6884649 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6884901 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6885015 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 6885340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6885609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6885715 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6885785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6886187 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 6886240 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 6886251 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6886726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6887001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6887139 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 6887316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6887855 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6888933 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6889386 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 6889505 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6890070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6890071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6890157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6891442 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6891732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6891874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6892055 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6892439 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6892633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6894937 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6895251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6895269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6895987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6896944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6897428 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6898719 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 6899245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6900998 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 6901194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6901589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6904259 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6904661 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6904771 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 6904908 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 6905050 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6905523 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6905567 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 6905633 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6905645 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6905699 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6907819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6908087 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6909079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6909220 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6909308 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6909424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6909998 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6910119 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6910505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6910528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6910556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6910678 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6911410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6911498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6911794 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 6911921 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 6912314 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6912755 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 6912818 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 6913131 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 6913243 T G Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 6914119 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 6914264 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6914514 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6914565 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6914641 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6914845 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6915103 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6915306 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 6915312 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 6915482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6916319 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6916659 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 6916724 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 6917828 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 6918095 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6918722 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 6918922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6919210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6919828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6920143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6920254 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6920319 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6920343 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6920454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6920461 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6920590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6920846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6921578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6922298 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6922597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6922700 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6922811 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6923195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6923227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6923741 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6923935 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 6924226 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6924497 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6924550 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 6924564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6924647 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 6924875 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6924977 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6925120 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6925364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6925470 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6925471 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6925603 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 6926028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6926736 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6927110 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6927186 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 6927353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6928005 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6928642 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6928932 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 6929036 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 6929337 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 6932415 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6933791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6934704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6934806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6934908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6935135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6935136 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 6936110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6936576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6937069 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6937858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6939726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6940434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6940922 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 6941127 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6941130 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6941881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6942610 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6942619 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6942690 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6943232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6943431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6943444 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6943449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6943535 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6943544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6943641 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 6944997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6945788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6946014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6946068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6947503 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6949224 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 6951112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6951593 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 6952077 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6952157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6952233 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6953253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6954094 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6954197 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6954426 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6954443 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6954476 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6954481 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6954553 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 6954632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6954803 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6954873 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6954927 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6955140 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6955691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6955779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6955871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6955961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6956021 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6956075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6956430 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6956435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6956445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6957317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6957570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6957596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6957632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6957780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6958776 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 6958789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6961322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6964146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6964223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6964231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6964669 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6965787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6966101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6966137 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6967366 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6967861 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6967905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6968292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6968303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6968318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6970366 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6970519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6970530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6971464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6971666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6971805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6971823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6972263 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6972282 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6972446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6972720 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 6972722 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 6972824 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 6972911 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 6973003 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 6973039 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 6973328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6973359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6973554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6973609 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6973622 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6973663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6974556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6974636 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6974641 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6974885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6975104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6975247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6975978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6976302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6977051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6977305 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6978774 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 6978983 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 6979135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6979348 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6979353 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 6980106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6980776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6980842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6980981 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 6981540 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6982914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6983089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 6983296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6983366 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6983442 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6984163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6984358 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 6984940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6984952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6985408 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6986669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6986757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6987288 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 6987475 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 6987567 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 6987872 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6987907 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6987929 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 6988181 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6988220 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6988350 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 6988353 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6988875 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6989563 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6990020 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6990423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6991823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6992579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6993061 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 6993943 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 6994955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6995229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6996667 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6996973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 6997891 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6997906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6997926 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6998123 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6998340 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 6998423 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 6998638 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 6998659 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 6998744 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 6998893 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6998940 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 6999338 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 6999376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 6999608 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 6999650 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 7000075 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 7000198 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 7000420 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7000844 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 7000893 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7001181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7001306 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 7001421 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7001485 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 7002322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7002578 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 7002732 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7002777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7003086 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7003613 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 7003614 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7003722 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 7003759 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 7003760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7003853 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7004138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7004479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7004639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7005171 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 7005563 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 7005789 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 7005883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7006058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7006341 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7006427 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 7006683 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 7006898 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 7006995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7007669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7007766 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 7007861 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7007862 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7007914 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7008091 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 7008418 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 7009084 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 7009341 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 7015570 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7015671 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7015722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7016136 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7016479 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7017472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7017676 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 7018334 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7018628 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7018736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7018753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7021193 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7022399 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7022571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7022618 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7022621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7022856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7022858 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7023345 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7023547 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7023601 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7023688 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7024478 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7024590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7026878 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 7027065 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 7027748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7032137 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7033835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7033836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7035384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7036169 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7037742 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 7039275 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7039679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7040390 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 7040464 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7040671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7040691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7041093 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7041181 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7041219 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7041225 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7041241 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7041257 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7041318 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7041575 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7041723 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7042843 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 7043360 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 7043869 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7043929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7050617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7052206 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7052284 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7052388 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7052811 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7053680 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7053968 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7054492 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7057297 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7057485 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7061061 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7061201 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7061391 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7061688 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7061717 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7062237 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7062357 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7062363 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7062488 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 7062769 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 7063024 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7063033 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7063176 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7063247 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7063346 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7063360 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7063875 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 7063888 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 7064012 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 7064013 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7064341 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 7065061 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7066061 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7067223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7067734 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 7067754 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 7067851 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 7068154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7072207 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7073143 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7073754 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7073944 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7074076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7074503 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7074673 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7074923 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 7075112 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 7075451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7075471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7075559 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7075602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7075605 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7075683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7075691 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7075996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7076095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7076197 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7076328 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7076339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7076546 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7076648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7076677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7076711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7076800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7076815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7076819 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7076893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7077081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7077113 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7077291 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7077326 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7077505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7077560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7077583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7078792 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7079488 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7079538 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7080209 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 7080297 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 7080692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7080746 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7081045 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 7081097 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7081437 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7081518 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7081830 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7081850 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7081859 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7082017 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7082088 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7082158 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7082224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7082295 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7082316 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7082460 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7082541 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7082544 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7082684 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7083079 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7083152 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7083256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7083356 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7083536 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7083537 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7083656 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7083721 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7083787 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7084051 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 7084061 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 7084086 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7084191 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 7084999 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7085060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7085062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7085907 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7086058 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 7086865 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7086881 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7087646 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 7088536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7090159 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7090663 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7091576 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7091822 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7091930 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7092100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7092108 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7092111 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7094665 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7094721 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7094745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7095222 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 7095233 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7095300 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7095534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7095607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7095699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7095775 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7095776 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7096301 G A Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 7096541 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 7096620 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7096652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7096840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7097128 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 7097288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7097402 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7097445 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7097674 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7097758 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7097829 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7097886 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7097997 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 7098410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7098439 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7098707 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7098708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7098930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7098983 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7099123 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7099167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7099175 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 7099367 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 7099370 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7099519 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 7099656 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7099846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7100498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7100605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7101203 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7101422 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7101519 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7101568 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7101584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7101910 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7101938 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7101966 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 7102225 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7102229 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7102247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7102329 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 7102765 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 7103216 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7103429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7103495 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7103622 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7104217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7104540 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7104838 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7105374 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7105850 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7106481 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 7106813 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 7106902 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7106917 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7107020 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 7107130 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 7107241 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7107256 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7107300 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 7107331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7107390 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7107481 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 7107513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7107647 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 7108153 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7108228 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 7108406 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 7108411 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7108481 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7108491 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7108492 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7108570 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7108758 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 7108875 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 7108938 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7109029 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 7109056 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 7109164 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7109206 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 7109397 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 7109497 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7109534 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 7109583 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 7109774 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7109871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7110081 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7110636 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 7110812 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7111765 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7111784 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7111806 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7112185 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 7112195 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7112422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7112455 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 7113517 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 7114051 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7115004 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7115028 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7115205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7115300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7115456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7115581 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7115867 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7115972 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7116046 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7116058 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7116446 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7116549 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 7116950 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7116963 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7116994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7117056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7117181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7117304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7117323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7117327 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7117347 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7117361 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7117385 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7118176 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7118241 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 7118350 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7118526 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7118591 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 7118606 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7118696 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7118755 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 7118959 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 7118969 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 7118992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7119078 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 7119095 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7119204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7119241 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7119284 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7119388 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7119452 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7119475 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7119598 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 7119655 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 7119669 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 7119873 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7119879 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7119917 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 7119980 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7120059 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7120098 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 7120111 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 7120119 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 7120974 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 7121175 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 7121367 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 7121806 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 7121888 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 7122056 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 7122070 G T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 2 7122078 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 7122087 A G N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 2 7122327 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 7122343 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 7122373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7122383 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 7122419 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7122643 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 7122708 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 7122868 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7122869 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7122881 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7122960 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7123171 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 7123245 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7123262 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7123312 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7123439 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 7123633 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 7123776 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 7124011 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7124025 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 7124215 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 7124247 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 7124824 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7124833 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 7126522 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 7126653 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7126663 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 7126718 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 7126793 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 7126939 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 7126957 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 7126979 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 7127506 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7127719 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 7127968 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 7127982 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 7128026 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7128067 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7128170 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7128251 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7128462 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7128466 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7128498 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7128514 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7128521 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7128548 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7128579 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7128589 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7128749 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7128768 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7128789 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7128832 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7128905 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7128912 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7129015 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7129027 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7129089 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7129165 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7129231 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7129238 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 7129335 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7129509 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7129992 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7130051 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7130076 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7130133 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 7130206 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7130305 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7130362 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7130373 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7130410 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7130420 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7130468 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7130497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7130537 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7130595 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 7130609 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7130878 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7130992 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7132055 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 7132726 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7133480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7133556 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7133607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7134013 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 7134120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7134123 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 7134172 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 7134181 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 7134186 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 7134200 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 7134217 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 7134262 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 7134265 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 7134360 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 7134531 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7134619 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 7135180 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7136519 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7136852 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7136973 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 7138992 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7140077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7141985 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 7142347 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7142443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7142612 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 7142807 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 7142808 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 7142835 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7142888 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7142896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7143078 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7143241 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7143538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7143849 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7143867 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 7144993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7145069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7145415 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7145682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7145736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7145740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7145961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7145970 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7146135 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7146230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7146296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7146311 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7146689 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 7147174 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 7147360 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 7147395 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 7147412 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7147681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7147691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7147827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7147932 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7147970 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 7148093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7148101 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7148337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7148798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7149302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7149308 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 7149337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7149367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7149463 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7149470 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 7149494 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 7149595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7149777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7151127 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7151191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7154791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7154810 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7154837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7155002 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7155094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7155296 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7155348 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7155449 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 7155796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7155797 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7155814 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 7156702 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7157369 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7159019 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7159035 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7159899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7161234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7165050 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 7165395 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 7165607 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 7165998 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7166115 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7166204 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7166272 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7166321 A G Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 7166360 T G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 7166416 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 7166500 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7166504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7166685 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7166689 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7167020 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7167188 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7167293 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7168012 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7168137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7168213 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7168314 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7169097 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7169379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7169507 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7169530 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7169551 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 7169642 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 7169994 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7170434 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7171535 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7171684 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7173437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7173584 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7175023 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7175651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7176415 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7176631 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 7176644 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 7176694 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 7176781 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7176935 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 7177337 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7177570 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7177702 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7178288 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 7178296 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7178333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7178436 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7178498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7179370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7180285 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7180980 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 7181385 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7181396 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7182785 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7182789 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7182868 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 7182936 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 7182947 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7182979 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7183039 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7183101 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 7183233 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7184075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7184265 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7184932 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 7185042 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7185882 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7185896 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7186041 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 7186658 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7187323 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7187503 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7187849 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 7188516 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 7188755 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7189076 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7189662 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 7189779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7189852 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7189856 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7190109 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 7190736 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7190834 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 7191740 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7191804 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7191818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7191907 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7192014 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7192083 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 7192189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7192230 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7192237 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7192269 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7192285 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7192286 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7192303 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7192445 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7192551 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 7192570 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7192605 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7192621 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7192665 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7192668 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7192680 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7192731 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7192784 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 7192801 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 7192868 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 7192881 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7192920 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 7193026 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 7193133 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7193225 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7193265 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7193274 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7193353 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7193365 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7193667 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7193727 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7194074 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7194075 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7194273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7194548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7194871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7194969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7195317 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 7195353 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7199183 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7199251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7199289 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 7199496 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7199528 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 7199532 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 7199547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7199554 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 7199558 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 7199612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7199785 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7199941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7200008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7200020 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7200090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7200275 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 7200315 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 7200409 G T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 7200494 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 7200641 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7200827 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 7200857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7201114 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7201355 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7201485 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7201631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7201685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7201742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7201832 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7201933 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7202300 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 7202433 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 7202570 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 7202597 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 7202789 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7203019 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7203032 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 7203094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7203280 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7203546 C T Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 7203547 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 7204013 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7204349 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7204418 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 7204547 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7204869 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 7205041 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7205137 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 7205262 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7205326 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7205345 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7205408 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7205453 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7205466 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7205489 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7205534 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7205735 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 7206490 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7206879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7207197 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7207382 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 7207457 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7207514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7208059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7209049 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7209084 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7209149 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7209617 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7209698 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 7209702 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7209723 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 7209743 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 7210595 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7210848 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7210873 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 7210901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7211030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7213515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7214601 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7214804 T G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 7215041 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7217025 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7217303 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7218126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7219133 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7220372 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7220437 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7222099 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7222248 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 2 7223379 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7223660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7224321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7225026 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7225647 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7225777 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7226275 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7226357 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7226991 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7227004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7227318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7227682 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 7230966 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7231104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7235829 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7235898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7236047 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7236505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7238083 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7238115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7238419 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 7238928 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7239142 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7239274 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 7240914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7241661 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7241747 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7241757 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7242169 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7243243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7245995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7246261 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7246836 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7247081 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7247699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7248061 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7249581 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 7249615 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7249631 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7249706 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7249715 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7250168 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7250304 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7250379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7252080 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7252748 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 7253075 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7253097 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7253132 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7253282 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7253308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7253450 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7253807 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7253959 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7254036 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 7254047 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 7254451 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 7254456 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 7254559 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 7254617 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 7254787 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7254788 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7254961 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7255049 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7255214 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7255361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7255390 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7255692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7255722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7255913 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7259990 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7260520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7261276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7262276 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 7263238 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7263245 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7266307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7266366 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7268504 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7270208 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7271032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7271343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7272557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7272851 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7272960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7273656 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7273772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7274027 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7274050 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7274770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7274782 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7274884 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7275590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7275641 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7276310 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7276470 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7276546 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7276805 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7276830 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7276916 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7277012 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7277428 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7277560 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7277968 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7278233 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7278285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7278571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7278586 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7278642 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7278684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7278711 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7279087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7279282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7280078 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7282613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7285879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7286930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7287683 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7289019 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7291327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7292158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7292605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7295563 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7297346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7300097 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7300803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7301562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7301645 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 7302842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7303507 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7304018 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7304339 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 7304594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7305229 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7305439 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 7306313 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7306380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7309031 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 7309386 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7309786 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 7309982 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7311688 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 7314137 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7315899 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7316591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7317207 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7318103 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7319939 C A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 7333802 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7333821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7343343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7343938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7344352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7345089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7346285 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7346373 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7346415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7346741 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7347050 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7348413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7348870 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7349099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7351859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7355779 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7356384 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7356589 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7357893 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 7358258 A T Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 7358470 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 7359651 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7360122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7362416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7362711 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7362750 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7363972 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7364851 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7365645 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 7366021 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 7366663 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7373125 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 7380170 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 7382315 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7383130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7383970 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 7385612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7386978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7387686 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7393932 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7395503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7396033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7399285 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7399324 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 7399337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7399858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7399872 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7399953 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7400396 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7400448 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 7400477 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7400490 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7401144 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 7401379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7402211 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 7404485 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 7407243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7407285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7410450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7410828 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7410969 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7411240 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7411296 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7411338 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7411371 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7411490 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7411849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7411901 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7411921 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7411993 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7411995 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7413463 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 7413828 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 7414058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7414125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7415604 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7416549 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 7416606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7416695 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 7416864 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 7417631 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 7417665 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 7418304 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7418975 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 7419230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7419659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7420018 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 7420078 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 7420079 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 7420527 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 7420591 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 7420609 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 7420724 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 7420737 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 7422117 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 7422252 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7422342 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7422387 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7422476 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7422511 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7422720 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7422828 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7423087 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 7423453 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 7423708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7424045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7424101 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7424141 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7424178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7424217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7424463 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7424485 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7424514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7424552 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7424568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7424755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7425016 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7425289 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7425366 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7425511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7425703 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7425773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7425848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7425874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7425932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7426243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7426249 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7426311 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7426380 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7426651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7427415 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7427590 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7427661 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7427702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7427843 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7427899 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 7427905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7428217 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7428221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7428246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7428250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7428307 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7428477 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7428704 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7430681 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 7430742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7431037 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7431733 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7431747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7431848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7432061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7432661 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7432796 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7432807 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7432921 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7432957 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 7433201 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7433226 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 7433251 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7433371 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7433409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7433540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7433668 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7433928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7434609 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 7434950 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7434971 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7435004 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 7435161 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 7435291 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7435399 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7435475 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7436106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7436175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7436668 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 7437645 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7437776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7438379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7438421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7439901 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7440840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7441222 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7441434 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7441544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7441855 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7441883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7442802 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7444203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7444293 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7444424 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 7444455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7444571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7444778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7445377 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7445379 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 7445420 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 7445589 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7445598 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7445630 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7445766 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7446057 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7446181 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7446296 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 7446297 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 7446502 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7447963 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 7448231 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 7448350 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 7448404 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 7448710 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7449244 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 7449924 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 7451370 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 7451710 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7452812 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7453442 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 7453462 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 7453602 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 7453647 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 7453652 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 7453685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7453715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7453737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7453763 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 7454271 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 7454544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7454559 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 7454621 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7454751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7454758 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7455010 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 7455227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7455393 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7455413 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7455504 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7455522 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7455572 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 7455583 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 7455781 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7455858 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7455943 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 7455981 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 7456023 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7456057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7456072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7456088 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7456089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7456112 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7456309 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 7456382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7456406 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 7456525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7456560 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7456661 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 7456879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7457347 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7457354 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7457367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7457470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7457508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7457536 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7457596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7457622 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7457623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7457766 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7457893 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7457991 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7458072 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7458080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7458139 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7458187 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7458240 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7458302 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7458321 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7458390 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 7458488 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 7458505 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 7458918 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 7459032 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 7459039 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 7459058 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 7459106 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7459209 A T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 7459235 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 7459294 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7459314 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7459370 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 7459379 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 7459417 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7459472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7459518 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 7459537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7459542 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7459584 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7459635 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7459746 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 7459897 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7460003 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7460040 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 7460079 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 7460102 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 7460226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7460352 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 7460417 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7460495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7460586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7460771 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7460788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7460816 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 7460954 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7460989 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 7461006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7461091 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7461101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7461102 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7461329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7461334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7461540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7461589 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 7461667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7461757 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 7461771 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 7461878 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7461898 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 7461961 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7462379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7462383 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 7462574 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7462606 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 7462748 C G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 7463212 G T N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 7463296 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 7463321 G A N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 7463492 A T N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 7465436 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 7465823 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 7465979 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7466765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7467167 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 7467335 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7469264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7469419 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 7469420 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7469620 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 7469799 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7469815 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7470017 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7470274 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 7470284 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7470530 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7470644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7470943 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 7470995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7471079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7471103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7471454 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 7471513 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 7473385 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 7474128 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7474854 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 7475980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7476097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7476803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7477380 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7478658 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7481007 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7481521 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7482470 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7482919 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7483428 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7483532 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7483588 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7483677 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7483688 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7484585 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7485157 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7486155 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7487938 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7488208 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7488698 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7490162 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7499386 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 7499405 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 7499431 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 7499498 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 7499501 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 7500424 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7501167 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7501192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7508933 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 7508934 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 7509332 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7509389 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7509410 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 7510143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7510175 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7510439 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 7522875 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7522912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7523237 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7524503 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7525434 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7526012 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 7528544 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7528780 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7528815 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 7529001 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7531136 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 2 7532826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7532940 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 7532957 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 7533015 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 7533112 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 7533122 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 7533363 T G Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 7533364 G C Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 7534000 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7534636 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7536033 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7537511 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7538368 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7539131 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7539284 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7540821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7540860 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7541848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7542441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7543177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7544523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7544793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7545095 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 7545409 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 7546616 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7546816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7547984 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7549336 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 7549960 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 7550140 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7550849 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 7551160 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7551161 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7551943 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7553234 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7553529 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7553728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7554016 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 7554439 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7554605 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 7554733 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7554789 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7555706 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 7555998 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 7557043 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7557333 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7557746 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 7558594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7559103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7559359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7559435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7559845 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7560235 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7560671 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7561113 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7561738 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7562441 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 7562455 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 7563044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7563629 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7563808 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7563961 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7565210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7565603 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 7566000 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 7566577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7567216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7567774 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7568764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7568928 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7569748 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 7569955 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 7571240 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7571781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7572157 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 7572704 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 7573507 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 7573640 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7574727 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7575234 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7575736 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7576011 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7580506 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 7580583 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 7580939 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 7581004 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7583890 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7584088 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7584170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7584427 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7584806 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 7585128 G C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 7585322 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7585501 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7585506 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7586281 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7586499 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7587202 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7587358 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7588064 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 7588278 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7588667 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7588772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7588811 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7589281 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7589284 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7589846 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7590685 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 7590767 T A Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 7590775 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 7590795 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 7590975 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 7591073 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 7591329 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7591485 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7592681 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7592705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7594723 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7595375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7596040 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7599666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7599819 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7600540 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7600946 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7601026 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7602027 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 7602250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7602521 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 7604929 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7605062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7605987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7606162 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 7607003 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 7607703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7608085 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 7608259 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 7608646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7609788 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7609831 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7611772 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 7612158 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 7612304 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 7614214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7615316 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7617443 A C N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 7617751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7617998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7619631 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7621982 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 7623706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7623995 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 7624327 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 7624355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7625780 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7626132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7626631 T G Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 7626725 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 7627613 A G Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 7627881 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7628490 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7628652 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 7629193 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7629423 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7630772 T G Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 7631008 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7631385 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7631420 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 7631611 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 7631739 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7632577 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 7632617 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 7634010 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7634252 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 7634486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7634995 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7636225 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 7636511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7636869 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7637325 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7637419 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7638428 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7638639 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7638958 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 7639362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7640299 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7640916 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7641291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7642740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7643111 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7643115 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7645601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7647476 T G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 7648895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7649492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7651022 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 7651970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7652753 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7653610 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 7653739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7653867 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7653885 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7654618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7654938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7655564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7657266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7657423 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7657654 A C Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 7659383 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7659792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7661863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7663324 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7664051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7665144 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 7665218 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7665259 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7665285 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7665357 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 7667421 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 7668878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7668973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7669432 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7669675 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7669779 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7669842 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7670084 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 7670249 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7670330 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 7670827 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 7671228 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 7671489 G C Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 7671591 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7672314 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 7672492 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 7672677 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 7672749 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 7672990 G C Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 2 7673125 T C Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 7673447 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 7673547 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 7674268 C G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 7674292 C A Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 7680613 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 7680624 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 7680762 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 7681086 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7681185 G T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 7681403 A C Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 7681655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7681688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7681981 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 7682582 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7683076 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 7683982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7685403 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 7685829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7686500 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 2 7687032 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7687830 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 7688154 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 7688860 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7689107 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 7689952 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 7690043 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7690169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7690365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7690475 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 7691345 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 7691765 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 7691937 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7692645 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 7692989 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 7693126 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 7693193 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 7694096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7694990 A T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 7696088 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7696218 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 7696624 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7696793 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7696854 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 7699202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7699411 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7700533 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7701684 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7702675 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 7703031 T G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 14 14 6 2 6 2 7704777 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7705759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7705859 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7705877 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7706576 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7706714 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7708525 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 7709019 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 7709275 T G Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 7709766 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 7710161 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 7712041 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 7712391 G C Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 7712851 A T Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 7712942 T C Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 2 7713059 A G Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 2 7713624 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 7714390 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7714983 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7715810 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7717507 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 7718715 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 7718725 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 7718733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7718878 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 7719076 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 7719227 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 7719335 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7719417 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 7719420 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7719916 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 7720192 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 7720274 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 7720436 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 7720549 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 7720735 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7720823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7720838 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7721308 C G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 7721320 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 7721379 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 7722173 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7722326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7722395 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 7723060 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7723408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7723420 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7723455 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7723790 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 7723933 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7724010 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 7724244 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 7724562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7724679 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 7724757 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7724758 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7725547 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7725586 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 7726391 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7726669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7726947 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 7727774 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 7727924 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7728449 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7728462 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 7728535 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7730170 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 7730265 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7730423 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7730607 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7730682 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7730869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7730981 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7731012 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7731192 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7731252 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7731491 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7731734 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7731886 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7732063 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 7732651 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7732774 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 7732913 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 7733107 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 7733143 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7733361 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7733429 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 7733495 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7733619 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7733671 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7733914 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 7734127 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 7734150 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7734274 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7734349 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7734455 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7734471 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7734550 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 7734749 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7734866 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7734894 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7734918 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7734971 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7735032 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7735188 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 7735221 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7735280 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7735487 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 7735568 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7735765 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7735772 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7735829 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7735836 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 7736222 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 7736313 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 7736370 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 7736428 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 7736443 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7736640 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7736651 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 7736692 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 7736718 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 7736970 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7737044 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7737045 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7737240 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7737250 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7737260 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7737312 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7737340 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7737480 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7737529 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7737557 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7737630 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7737728 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7737772 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7737874 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7737914 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7737930 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7738117 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7738161 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7738169 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7738200 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7738225 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7738304 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 7739060 A G Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 7739314 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 7739505 G T Y N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 7739610 C T Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 7739752 A T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 7739858 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 7739978 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7739993 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 7740115 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7740224 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7740291 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 2 7740375 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7740392 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 7740393 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7740422 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7740452 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7740513 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7740813 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 7740930 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 7741554 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 7741573 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 7742069 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7742079 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7742091 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 7742097 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7742110 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7742111 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7742173 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 7742237 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 7742249 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 7742711 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 7742816 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7742996 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7743012 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 7743053 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7743060 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7743066 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7743199 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 7743220 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 7743256 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 7743384 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7743401 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7743432 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 7743463 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 7743481 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7743681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7743741 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 7743905 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7744039 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 7744221 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 7744368 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 7744519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7744748 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 7744818 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 7744861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7745171 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7745192 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 7745229 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 7745239 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 7745240 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 7745310 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7745377 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 7745541 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7745554 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7745617 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7745667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7745781 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 7745863 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 7745904 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 7746628 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7747023 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7747058 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7747461 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7748871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7750270 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 7750467 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7750675 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7751487 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 7751584 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 7751644 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 7751700 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 7751712 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 7751891 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7751973 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 7752039 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 7752171 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 7752172 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 7752297 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 7752327 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 7752381 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7752498 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 7752561 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7752565 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7752607 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7752669 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7752932 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 7753102 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7753471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7753519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7753799 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 7753810 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 7753817 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 7753873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7754128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7754626 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7754761 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 7754811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7754865 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7754904 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 7754952 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 7754962 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 7755087 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7755607 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7756000 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 7756069 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7756236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7756289 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7756659 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 7756787 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7756940 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7757026 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7757082 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7757513 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7757572 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7757986 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7758065 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 7758210 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7758214 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7759040 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 7759156 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7759164 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7759353 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7759894 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 7759928 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7760172 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7760190 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 7760195 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7760237 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7760289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7760310 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7760333 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7760869 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 7760977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7761220 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7761873 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7761923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7761959 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7762622 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7762632 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7763678 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 7763730 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7763776 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 7763819 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 7763845 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 7763866 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 7763908 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 7763946 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 7764111 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 7764141 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 7764193 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 7764234 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 7764247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7764557 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 7765005 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7765058 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 7765090 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7765226 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7765278 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7765371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7765378 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7765396 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 7765498 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7765531 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7765533 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7765546 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7765634 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 7765848 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7765951 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7766080 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7766122 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7766141 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7766243 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7766248 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7766261 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7766282 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 7766297 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7766420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7766525 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 7766984 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7766986 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 7767045 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7767920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7768008 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7768202 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7768676 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 7769376 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7769718 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7769749 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7769772 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7770060 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 7770117 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7770118 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 7771654 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 7772075 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7774139 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 7774216 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 7774445 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 7776765 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 7778104 C A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 7778237 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7780416 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7780743 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7780881 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 7781545 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 7782551 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7782853 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7782986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7783194 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7783487 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 7783828 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7784123 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7784199 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7784602 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7784844 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7785153 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7785321 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7785420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7785939 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7786367 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7786482 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 7787992 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7788003 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7789031 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 7789130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7789513 G C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7791577 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 7792546 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 7792673 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 7793638 G C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 7794241 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7794284 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 7795385 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 7797409 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 2 7800837 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7802544 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 7803062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7803847 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 7804152 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7804680 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 7805533 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 7805572 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7805598 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7805828 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 7805946 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7806109 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7806916 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7807007 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7807023 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 7807603 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7807635 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7808060 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 7808248 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7808660 C G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 7810299 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 7810684 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7812539 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 7812949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7813271 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7813957 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7814517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7814549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7815495 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 7815537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7816033 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 7816381 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 7817266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7818215 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7819090 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7819595 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 7820666 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 7820831 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7820910 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 7820932 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 7821320 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 7821434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7821465 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 7821660 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 7821689 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 7821781 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 7821795 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 7821813 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 7821937 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 7822013 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7822068 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 7822220 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 7822361 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 7822396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7822401 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 7822416 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 7822424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7822557 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 7822660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7822670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7822672 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 7823019 A C Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 7823122 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 7823186 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 7823228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7823311 A T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 7823518 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 7823540 G T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 7823586 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 7823608 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 7823609 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 7823871 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7824217 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 7824218 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 7824264 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 7824284 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7824296 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 7824359 G C Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 7824444 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 7824843 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 7824976 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 7824989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7825636 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 7825700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7825889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7826050 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 7826087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7826211 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 7826470 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7827070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7827304 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7827358 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 7827704 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 7828097 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 7828286 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7828608 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 7828626 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 7828839 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7828844 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7829401 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 7829406 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 7829790 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 7829799 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 7830204 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 7830522 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7830960 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 7830993 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 7831152 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 7831154 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 7831351 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 7831423 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 7831439 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 7831457 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 7831493 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 7831531 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 7831560 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 7831572 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 7831655 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7831799 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 7831864 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 7832435 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 7832663 A T Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 7832887 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 7832946 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 7833091 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 7833394 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 7833718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7833747 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 7833916 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 7833962 G T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 7834042 A G Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.181818181818182 0.727272727272727 0.0909090909090909 12 10 2 8 1 2 7834255 A T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 7834358 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 7834706 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 7834711 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 7834845 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 7834917 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 7834948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7835008 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7835134 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7835305 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 7835316 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7835317 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7835459 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 7835785 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 7835836 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 7835902 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 7836402 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7836833 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 7837158 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 7837306 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7843924 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 7844377 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 7844387 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 7844474 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 7844568 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 7844638 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 7844837 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 7844939 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7845078 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 7845625 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 7845689 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7846020 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 7846145 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7846526 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 7846579 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 7846713 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 7846723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7846734 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 7846785 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 7846793 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 7846816 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 7847067 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 7847295 G C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 2 7847341 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 7847376 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7847468 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7847697 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7848129 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 7848436 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 7848510 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 7848600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7848647 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 7849082 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 7849139 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7849332 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7849948 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 7850111 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7850146 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 7850175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7850268 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 7850447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7850471 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 7850518 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 7851039 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 7851072 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 7851133 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 7851170 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 7851638 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7851739 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7851831 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7851868 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 7851892 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7851939 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 7852144 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7852204 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 7852232 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 7852406 C G Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 7853284 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7853290 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 7853351 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 7853464 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 7853509 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7853820 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 7854000 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 7854181 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 7854244 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 7854326 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7854333 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 7854352 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 7854468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7854504 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 7854812 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 7855117 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 7855165 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 7855244 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 7855398 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 7855453 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 7855568 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 7856135 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 7856272 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 7856286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7856437 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 7856441 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 7856622 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7856821 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7856946 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 7857008 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 7857174 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 7857213 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 7857353 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 7857748 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7858042 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 7858367 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 7858399 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 7858461 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 7858520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7858805 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 7858857 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 7858860 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 7858952 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 7859085 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7859374 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 7859380 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7859436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7859623 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 7859775 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 7859831 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 7859871 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7859903 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7859919 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7859943 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7859948 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 7860006 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 7860150 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7860207 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 7860355 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 7860401 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7860424 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7860578 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7860585 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7860617 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7860629 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7860644 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7860656 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 7860707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7860797 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7860813 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7860890 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 7860948 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7861012 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 7861054 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7861204 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 7861302 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 7861607 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7861618 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7861773 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7861798 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7861892 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 7861938 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 7861992 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7862022 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7862102 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 7862139 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7862248 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 7862275 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7862402 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7862410 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7862422 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 7862519 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7862581 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7862619 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7862654 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7862722 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 7862773 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7862829 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7862860 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 7862996 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7863023 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 7863084 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 7863130 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 7863165 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 7863257 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 7863466 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 7863505 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 7863516 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 7863539 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7863540 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7863553 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7863587 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7863595 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7863598 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 7863630 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 7863654 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 7863658 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7863682 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 7863716 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 7863740 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 7863804 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 7863818 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 7863822 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 7864000 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 7864015 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 7864089 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7864185 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7864238 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7864248 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 7864315 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7864470 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 7864476 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 7864494 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 7864511 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7864550 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7864570 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7864580 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 7864583 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 7864597 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7864674 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 7864689 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 7864702 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 7864822 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 7864897 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7864905 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 7864937 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7864961 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7865011 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 7865106 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 7865543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7865589 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 7865663 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7865723 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 7866032 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 7866101 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 7866457 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7866521 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7866545 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 7866615 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 7866645 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 7866666 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 7866767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7866858 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7866995 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7867075 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 7867544 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7867672 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7867794 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 7867846 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 7868039 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 7868120 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 7868153 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7868450 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 7868527 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 7868543 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 7868614 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7868628 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7868675 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 7868679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7868746 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 7868769 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7868777 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 7868791 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 7868838 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7868922 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 7869006 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 7869064 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7869123 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7869255 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 7869282 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7869308 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7869349 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 7869356 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 7869589 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7869599 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 7869621 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7869647 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7869685 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7869874 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7869878 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7869978 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 7870329 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 7870946 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 7870984 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 7871205 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 7871298 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 7871437 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 7871836 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7871843 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7871937 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7872023 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7872178 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7872334 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7872509 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 7873033 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 7873204 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 7873319 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 7874041 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7874853 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 7875020 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7875047 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7875333 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 7875418 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 7875457 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 7875478 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 7875602 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 7876024 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 7876349 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7876490 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7877114 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 7877451 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 7877464 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7877820 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 7878040 C A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 7878185 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 7878314 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 7878480 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 7878703 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7878918 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 7878919 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 7879087 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 7879171 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 7879200 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 7879611 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 7880031 G T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.153846153846154 0.692307692307692 0.153846153846154 13 13 2 9 2 2 7880201 G C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 7880788 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7880793 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7880820 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 7881098 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7881283 G C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 7881314 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 7881435 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 7881446 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 7881524 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 7881591 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 7881655 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 7881973 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7882162 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 7882291 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7883187 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 7883219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7883297 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7883479 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 7883606 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 7883613 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 7883768 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7883842 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 7884007 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 7884151 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 7884230 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 7884279 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7884518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7884732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7884735 A T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 7885146 G C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 7885180 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7885210 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7885264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7885342 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7885368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7885390 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7885429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7885492 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 7885549 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 7885583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7885647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7885701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7885833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7885955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7886015 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 7886204 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 7886313 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 7886329 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 7886353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7886383 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 7886477 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7886516 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 7886586 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7886693 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7886786 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7886820 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7886939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7886950 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7886960 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7887183 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7887521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7887566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7887782 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7887899 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 7887923 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7887945 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7887965 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7888061 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 7888214 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 7888432 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7888515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7888599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7888767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7888772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7888784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7888824 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7888838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7888842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7888849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7888855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7888994 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 7889088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7889174 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 7889260 A T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 7889408 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 7889442 A C Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 7889482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7889558 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 7889588 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 7889701 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 7889837 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 7889894 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 7889951 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7890009 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7890078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7890101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7890106 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 7890302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7890682 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 7890728 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 7890767 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 7890871 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7890893 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 7890994 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 7891002 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7891068 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 7891109 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 7891769 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 7891859 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 7891982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7891986 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 7892040 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7892072 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 7892294 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 7892376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7892417 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 7892436 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 7892554 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 7893332 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 7893660 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 7893892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7894027 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 7894082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7894127 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 7894128 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7894851 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7894914 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7895035 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 7895090 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 7895165 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7895357 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7895654 T A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 7895688 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 7895708 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 7895738 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 7895863 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 7895893 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 7896225 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 7896352 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 7896423 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7896867 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7898612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7899171 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 7899462 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 7899525 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 7899813 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 7899973 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 7900183 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7900765 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7901046 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7901283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7901367 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7901389 T A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 7901502 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 7902199 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 7902913 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 7903513 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7903589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7903665 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 7904715 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 7905077 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 7905385 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 7905656 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7905804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7906436 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7906624 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7908528 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 7909209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7909502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7909716 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7911616 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7911708 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 7911765 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 7912543 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 7914294 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 7915037 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 7915680 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7916196 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7916213 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 7917042 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 7917546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7917659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7917673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7918052 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7920670 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7920982 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7921094 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 7921185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7921496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7921962 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 7922117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7922521 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 7922727 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 7923480 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 7923629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7924708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7924991 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 7925340 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7926168 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 7926431 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 7926569 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 7932831 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 7933934 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 7934131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7934854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7935044 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 7935308 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 7936829 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7936884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7936910 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7936923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7936950 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 7936998 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 7937170 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 7938923 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 7940084 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 7940265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7940322 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 7940437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7941995 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 7942137 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 7942245 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 7942433 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 7946401 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 7946685 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 7947926 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 7948357 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7950353 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 7951277 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 7952226 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7952774 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7952884 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 7953078 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 7955210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7955489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7955625 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 7955689 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 7955704 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 7955753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7955830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7955977 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7956362 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 7958665 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 7967078 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 7970175 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 7970272 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 7970830 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 7970844 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 7971010 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 7971130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7971159 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 7971160 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 7971277 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 7971435 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 7971518 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 7971525 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 7971531 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 7971721 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 7971751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7971781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7972139 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 7972308 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 7972457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7972472 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 7972540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7972686 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 7972752 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7972784 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7972869 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 7973033 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 7973663 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 7974316 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 7974352 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 7974356 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 7974380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7974472 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 7974543 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 7974748 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 7974769 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 7975033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7975080 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 7975082 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7975140 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 7975187 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 7975506 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 7975725 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 7975926 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 7976111 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 7976113 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 7976214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7976253 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 7976260 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 7976281 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 7976312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7976469 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7976474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7976534 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 7976789 T A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 7976853 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 7976854 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 7976949 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 7977023 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7977309 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7977310 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 7977350 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7977599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7977678 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7977717 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7977929 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 7977934 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 7977957 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 7977979 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7978193 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7978243 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7978282 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 7978440 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 7978588 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 7978757 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7978791 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7978850 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7978867 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7978870 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7978983 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7979031 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 7979095 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 7979219 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7979235 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 7979236 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 7979272 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7979276 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 7979391 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 7980055 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 7980257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7980283 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7980308 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 7980838 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 7980839 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 7981491 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 7981676 A T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 7981939 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 7982180 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7982198 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7982214 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7982481 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 7982833 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 7982996 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 7983336 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 7983843 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7984258 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 7984370 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 7984911 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 7985099 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 7985183 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7985266 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 7985268 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7985298 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 7985625 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 7985675 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 7985709 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 7985718 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 7986017 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 7986057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7986915 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 7989798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7991482 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7992785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7993044 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7993048 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 7993530 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 7993609 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 7993981 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 7994965 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 7995597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7995620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7996447 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 7996501 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 7996988 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 7997046 C G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 7997404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 7998534 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 7998539 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 7998619 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 7998859 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 7998958 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 7999079 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 7999200 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 7999227 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 7999926 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8000120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8000743 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8000777 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 8000912 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8001027 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 8001921 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8002096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8002182 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8002385 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 8002496 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 8002551 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 8003170 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 8003329 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8003504 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8003839 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8003983 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 8004108 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 8004171 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 8005399 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 8005779 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 8005873 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8007598 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8007661 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8008611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8008751 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 8009320 T A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 8009866 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 8010339 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8011104 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8011354 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 8011362 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 8011663 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8011752 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8013357 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8014372 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8014857 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8015637 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 8016510 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8017154 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 8017173 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 8017418 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8017480 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 8017529 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 8017594 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 8017603 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8017625 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 8017679 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8017692 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8017714 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8017748 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 8017772 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 8017788 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 8017839 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 8017865 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8017976 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 8018088 G T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 8018193 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 8018310 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 8018313 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 8018451 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 8018460 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 8018683 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8018753 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 8018754 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 8018787 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 8018815 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 8018881 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 8018932 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 8019011 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8019044 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8019139 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8019217 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 8019265 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 8019283 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 8019332 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 8019372 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8019626 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 8019640 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 8019669 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 8019721 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8019756 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 8019780 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 8019793 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8019817 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 8019917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8019959 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8019979 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8020020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8020023 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8020034 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8020056 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8020087 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8020165 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8020284 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8020403 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 8020472 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8020489 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8020637 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8020738 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8020855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8021099 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8021126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8021389 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8021638 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8021649 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8021660 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8021717 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8021917 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 8021939 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 8023025 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 8023027 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 8023314 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8024222 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8024225 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8024385 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8026071 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8026660 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8027288 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8027339 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8027431 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 8027701 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8027728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8027873 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8028124 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8029001 A C N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 8029117 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8029316 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 8029803 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 8029821 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 8029953 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8030210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8030534 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8030568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8030928 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8030962 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8031774 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8032215 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8034089 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8035160 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 8035669 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8035946 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8036002 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 8036083 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8036386 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 8036565 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8036736 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8036823 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8037027 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8037050 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8037095 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8037207 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8037262 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8037321 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8037332 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 8037480 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8037545 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8037547 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8037697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8037790 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8037880 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8037923 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8038394 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8038569 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8038921 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8038932 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8040145 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8041263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8041448 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8041574 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8043035 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8043270 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 8043485 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8043516 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8043915 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8044237 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8044518 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 8044558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8044568 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 8044671 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 8044832 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8044900 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8044971 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8044972 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8045020 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8045022 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8045100 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8045171 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8045251 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8045308 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8045340 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8045349 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8045361 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8045383 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8045504 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8045534 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8045593 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8045721 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8045730 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8045785 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 8045786 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 8045820 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8045826 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8045929 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8045930 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8046499 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8046501 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8046518 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8046570 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8046585 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8046599 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8046629 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8046654 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8046878 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8046916 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 8047301 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8048370 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8048432 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8048434 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8048454 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8048463 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8048742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8048813 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 8048822 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8049322 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8049562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8049878 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 8050015 G A Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 8050021 C G Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 8056095 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8056107 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8056129 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8056138 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8056215 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 8056529 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8056725 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8057370 G C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 8057459 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 8057766 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 8057941 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8058104 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8058304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8058323 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 8059633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8059855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8059865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8059945 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8059980 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8060053 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8060209 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8060210 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8060323 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8060365 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8060451 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8060602 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 8060831 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 8061089 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8061244 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8061312 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8061462 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8061475 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8061676 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8061761 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 8061784 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8061823 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8061960 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8062145 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8062159 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8062217 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 8062272 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 8062377 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8062397 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8062550 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 8062574 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8062606 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8062750 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8062756 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8062829 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8063019 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 8063100 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8063113 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8063190 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8063194 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8063337 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8063586 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8063675 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8063716 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 8063736 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8063952 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8064293 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8064420 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 2 8064691 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8064715 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8064772 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 8064804 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8064844 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8064889 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8064953 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 8065010 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 8065017 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 8065032 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 8065115 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 8065116 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 8065203 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8065227 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8065236 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 8065329 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8065348 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 8065352 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8065398 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8065399 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8065515 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8065638 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 8065806 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8065826 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8065886 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 8065950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8066148 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8066241 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8066327 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8066377 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 8066388 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8066394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8066495 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8066534 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8066686 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 8066713 C A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 8067189 A C N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 8067253 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 8067329 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 8067444 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 8067556 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 8067584 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 8067602 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 8067670 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 8067672 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 8067684 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8067700 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 8067738 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 8067748 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8067752 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8067772 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8067855 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8067884 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8067930 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8067994 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8068013 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8068038 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8068098 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8068155 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8068193 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8068239 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8068306 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8068369 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8068453 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8068473 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8068508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8068561 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8068602 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8068629 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8068651 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8068664 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8068666 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8068698 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8068800 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8068831 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8068930 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8068959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8069086 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8069092 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8069419 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8069589 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8069768 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 8069871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8069957 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8070000 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8070331 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8070375 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8070424 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8070800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8071052 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8071395 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8071527 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 8071982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8072032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8072046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8072227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8072439 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 8072667 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8072758 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8072778 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8072808 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 8073079 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8073581 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8073598 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8073667 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8073703 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8073889 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8073934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8074153 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 8074310 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 8074311 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8074520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8074800 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 8074909 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8075065 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8075187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8075228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8075309 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8075495 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8075551 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8075623 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 8075633 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 8075655 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 8075868 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 8075892 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8076318 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8076353 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8076391 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8076548 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8076787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8076789 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8076888 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 8076939 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8077074 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 8077120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8077325 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8077370 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8077566 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8077681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8077695 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8077798 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8078004 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8078217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8078263 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8078319 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8078800 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8079117 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8079122 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8079276 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8079285 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8079421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8079436 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8079458 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8079483 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8079703 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8079713 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8079750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8079920 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8080023 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 8080212 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8080227 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 8080272 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 8080316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8080492 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 8080533 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 8080722 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 8080753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8080821 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 8080927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8080936 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8080980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8081185 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8081243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8081251 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 8081288 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8081400 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8081448 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 8081469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8081502 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8081572 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8081605 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 8081664 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8081680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8082072 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 8082314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8082418 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 8082595 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8082599 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8082663 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 8082690 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8082746 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8082794 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 8082840 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8082923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8082962 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 8083140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8083151 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 8083154 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8083322 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8083488 T A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 8083558 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 8083600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8083950 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8084082 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8084258 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8084352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8084468 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8084741 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8084781 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8084914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8084948 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8084981 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8085100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8085118 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8085324 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8085326 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8085681 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8085817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8085900 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8086024 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8086057 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 8086068 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8086149 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8086263 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 8086412 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8086523 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 8086557 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 8086673 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8086685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8086768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8087247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8087273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8087424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8087621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8087719 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8087818 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8087837 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8087937 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8088013 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8088335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8088354 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8088843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8088852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8089176 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8089613 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8089627 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8089707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8090038 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8090162 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8090220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8090505 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8090591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8091291 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 8092288 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8092338 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8092441 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 8092588 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8093092 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8093135 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 8093274 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8093707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8094021 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8094380 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8094382 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8094685 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8094814 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 8095215 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8095580 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8095878 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 8096039 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8096230 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8096237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8096276 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8096349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8096567 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8097256 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8097377 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8097417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8097926 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8098427 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8099432 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8099614 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8099852 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8099863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8100066 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8100123 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8100531 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8100751 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8100971 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 8101771 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 8101792 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 8101805 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 8101951 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8102245 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8103181 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 8103401 T G Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 8104200 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 8104258 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 8104625 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 8112375 G T Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 8112489 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 8112542 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 8112809 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8112844 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8120712 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8120972 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 8120996 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8122356 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8123070 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8123189 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 8126401 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8126423 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8126660 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 8127160 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8127374 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8127446 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8128519 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8129149 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8129633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8130510 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 8131237 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 8131432 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8132048 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 8132214 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 8132394 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 8132652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8133978 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 8134326 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8134751 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8135538 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8136766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8137012 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 8137328 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8138406 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8138640 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8139227 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8140034 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8140587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8140775 C T Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 8140860 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8141008 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8141617 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8141630 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8141805 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8142891 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8143717 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8143746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8144210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8145087 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8146145 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8148982 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8150218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8150536 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8150595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8150770 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8150856 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 8151598 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 8151718 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8151729 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8151779 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 8151929 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8151966 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8152311 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 8152408 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8152885 T A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 8152994 C A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 8153053 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8153172 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8153229 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8153320 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8153353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8153400 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8153420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8153592 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8153680 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8153794 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 8153866 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8154071 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8154295 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 8154709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8154845 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8155130 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8155237 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8155288 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8155331 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8155347 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8155409 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8155522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8155761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8155854 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8155961 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8155978 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8156021 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8156328 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8156337 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8156409 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8156436 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8156569 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8156682 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8156900 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8156959 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 8156998 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 8157035 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8157153 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 8157160 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 8157233 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8157372 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8157612 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8157747 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8158096 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8158196 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 8158574 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 8158599 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8158864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8158880 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8158912 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8158913 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8158948 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8158986 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8159395 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8159403 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8159925 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8160022 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8160060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8160154 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8160625 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8160641 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8160684 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8160695 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8160747 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8160750 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8161044 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8161130 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8161310 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8161446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8161784 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 8161875 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 8161985 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8161986 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8162172 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8162277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8162278 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8162291 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8162465 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8162497 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 8162705 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 8162855 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 8162879 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 8162904 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 8162970 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8163134 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8163251 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8163599 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8163754 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8163770 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8163776 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8163908 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8163949 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8163958 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8163981 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8163995 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8164146 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8164204 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8164242 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 8164271 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8164341 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8164426 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8164448 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8164567 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8164592 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 8164620 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8164791 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8164837 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8164857 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8164934 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8164935 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8164984 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8165013 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8165015 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8165026 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8165027 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8165069 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8165147 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8165180 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 8165194 T A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 8165263 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 8165406 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 8165423 G T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 8165482 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8165498 G C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 8165500 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 8165521 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 8165761 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 8165887 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8166011 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8166115 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 8166162 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8166285 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8166360 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8166485 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8167803 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8168814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8169039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8169160 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8169204 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8169254 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8169629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8170573 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8170694 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8171015 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8171016 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8171492 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8171735 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8172169 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8172187 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8172312 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8172385 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8172706 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8173260 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8173317 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8173493 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8173818 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8173995 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 8174086 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8174105 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8175129 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 8177652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8178698 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 8184538 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8184980 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8185666 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8186946 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 8187506 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8188013 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 8190022 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8191153 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 8198665 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8201298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8201548 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8202543 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8203718 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 8204377 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8204918 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8204982 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 8205895 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8206213 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8206227 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8206248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8206370 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8207028 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8207318 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8207650 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8207766 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8207915 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8207952 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8207987 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8208091 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8208104 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8208119 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8208201 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8208557 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8208648 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8208699 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8208781 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8208816 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8208934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8209090 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8209132 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8209172 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8209285 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8209318 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 8209346 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8209384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8209640 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8209806 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8209832 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8209872 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8210164 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 8210177 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8210416 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 8210450 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8210510 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 8210638 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 8210775 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8210896 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8211140 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 8211204 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 8211225 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 8211275 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 8211295 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 8211298 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 8211400 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8211441 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 8211608 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 8211777 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 8212046 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8212095 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8212892 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8212939 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 8213006 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8213016 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8213332 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8213564 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8213849 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8213985 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8214099 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8214286 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8214297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8214936 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8215337 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8215354 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8215392 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8215721 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8215882 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8215892 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8215906 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8215918 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8215978 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8215995 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8216083 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8216210 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 8216311 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 8216403 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 8216438 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8216480 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8216583 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8216707 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8217022 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8217189 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8217543 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 8217747 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8217887 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8217901 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8217949 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8217960 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8217997 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8218136 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8218418 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8218424 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8218646 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8218672 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8218726 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8218909 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 8219043 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 8219083 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 8219089 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 8219518 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8219628 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8219642 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8219720 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8219764 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 8220102 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8220660 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 8220689 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8220877 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8221340 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8221374 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8221397 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8221453 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8221632 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8221672 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8221690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8221805 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 8221863 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8222047 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8222086 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8222198 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 8222495 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8223209 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8223876 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8224106 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8225508 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8226374 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8227967 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8229007 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 8229811 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8230891 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8231142 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8231774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8231952 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8232096 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8232365 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 8232692 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 8232735 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 8233772 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8233946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8234063 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8234273 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8234321 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8234349 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 8234365 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 8234418 A T N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 8234581 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 8234711 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 8236697 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8236798 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8236810 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8236934 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8237124 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8237568 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8238119 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8238244 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8238800 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 8238934 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8239362 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8240646 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8240903 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8242907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8243150 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 8243730 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8243858 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8244113 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 8244153 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 8244491 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8244707 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8245205 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8245774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8245807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8246147 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8246910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8247020 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 8247376 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8247417 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8247513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8247817 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8248173 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8248199 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8248348 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8248397 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8248513 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8248638 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 8248851 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8248974 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8249154 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8249280 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 8249335 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8249430 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 8249452 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 8249534 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8249770 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 8250067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8250086 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8250369 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8250572 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 8251137 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8251308 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8251388 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8251731 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 8251788 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 8251828 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8251839 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 8251863 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 8251924 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 8251940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8251992 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8252039 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8252067 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 8252203 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8252259 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8252400 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8252418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8252446 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8252452 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8252502 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8252565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8252770 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8252839 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8252917 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8252955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8252999 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8253023 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8253085 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8253242 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8253484 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 8253519 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 8253662 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8253807 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 8253823 C A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 8253836 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 8253887 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 8253931 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8254047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8254082 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8254093 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 8254173 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8254422 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8254489 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8254569 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 8254583 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8254669 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8254737 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 8254833 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8254846 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 8254890 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 8255164 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8255200 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8255371 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8255643 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 8255678 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 8255692 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 8255697 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8255718 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8255809 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8255826 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8255838 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8255993 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 8255996 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 8256127 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8256151 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8256154 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8256250 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8256257 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8256274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8256292 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8256297 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8256328 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 8256392 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8256588 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8256680 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8256698 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8256709 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8256846 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 8257016 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8257053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8257213 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8257246 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8257274 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8257313 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8257366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8257368 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8257446 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8257500 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8257673 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8257716 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8257732 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8257743 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 8257744 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 8257792 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8257905 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8258108 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8258118 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8258200 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8258241 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8258730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8258985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8259187 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 8259271 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8259509 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8260967 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 8261017 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 8262283 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8262372 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8262692 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8263989 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8264920 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 8264956 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8264976 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8265333 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8265616 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8265719 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8265758 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 8265776 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8265940 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8266102 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 8266105 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 8266115 G T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 8266175 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8266361 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8266385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8266495 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8266921 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 8267176 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8267257 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8269100 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8269202 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8269287 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8270527 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8270986 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8271903 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8272007 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8272850 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8272907 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8272911 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8273337 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8273491 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8273533 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8273562 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8273570 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8273996 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8274192 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 8274289 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8274566 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8275453 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8276003 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8276336 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8276897 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8276921 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 8277318 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8277660 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8277689 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8277757 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8278122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8278240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8278298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8278508 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8278714 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8278937 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8279215 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8279339 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8279344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8279532 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 8279999 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8280120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8280242 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 8280379 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 8280397 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 8280415 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 8280434 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 8280483 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8280509 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8280596 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8280687 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 8280746 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8281041 C G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 8281163 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8281209 C G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 8281356 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 8281371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8281420 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8281638 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 8281850 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 8282037 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 8282146 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 8282343 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 8282919 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 8282979 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 8283261 G T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 8283447 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 8284183 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8284203 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8284248 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 8284525 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 8284538 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 8285773 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8286400 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8287080 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 8288556 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8289024 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 8289112 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 8289478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8290618 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8290660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8291167 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8291374 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8291509 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8292166 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8292244 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8292302 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8293552 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8295287 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8295600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8296537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8296678 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 8297530 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8297882 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8297898 A T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 8297919 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8298184 C T Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 8299553 T A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 8299581 A T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 8299582 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 8300169 T C Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 8300353 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8300675 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8301159 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8301375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8301416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8301971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8302136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8302148 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8302198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8303437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8304251 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8304279 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8305107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8305331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8305346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8305458 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8305884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8307185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8307684 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8307753 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8309279 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 8309450 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8311499 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8311786 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8312277 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 8312773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8313402 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8315314 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8315924 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8316259 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 8316416 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8316566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8317060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8317299 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8318759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8319330 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8321071 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8321512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8322563 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8323366 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8324949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8325011 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8325630 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8325796 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8327013 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8327134 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 8327499 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8328289 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 8328556 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8329632 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8330354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8330391 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8330646 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8330929 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8330996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8331889 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8332926 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 8332991 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 8333027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8333067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8333750 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8334602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8334706 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8335119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8335446 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8336540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8337558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8338175 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8339756 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8341150 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8341279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8341391 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 8341594 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8343296 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8344298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8346030 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8346219 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8348220 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8349079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8349665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8350510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8351151 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8352324 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 8353668 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8353717 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8354531 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8354762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8354870 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8355411 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8355821 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8356114 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8356587 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 8357018 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8357353 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8357529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8357724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8358072 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8358278 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8358518 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8358680 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8359070 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8359127 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8359198 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8359209 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8359296 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8359483 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8359621 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8359689 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8359952 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8360675 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 8362324 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8362339 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8362372 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 8362379 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8362385 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8362705 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8362943 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8362960 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 8363012 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8363548 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8363977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8364548 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 8364591 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8365169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8365373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8366427 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8366800 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8366875 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8366915 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8366972 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 8367129 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8367191 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 8367204 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 8367942 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8368614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8368698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8369019 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 8369032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8369049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8369944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8370067 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8370441 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8370741 T G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 8371192 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8371819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8373324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8373436 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 8374347 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8374727 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8374767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8374884 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8375061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8375298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8375452 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8375476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8378241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8379746 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8380312 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8381288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8382898 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8383071 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8383726 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8385783 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8386574 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8386683 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 8386807 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 8387564 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 8388162 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8390075 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8390434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8390929 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 8391111 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8391134 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8391264 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8391273 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8391442 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8391511 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8391516 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8391523 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8391653 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 8391655 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 8391687 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8391942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8391951 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8392028 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 8392243 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8392547 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 8392572 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8392594 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 8392604 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 8392759 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8393144 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 8393147 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 8393175 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8393181 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 8393214 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8393216 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 8393520 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8393537 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8393545 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8394184 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8394659 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 8394665 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 8395428 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8395809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8395832 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8398373 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8398390 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8398918 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8399283 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8400100 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8400943 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8401509 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 8405909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8406566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8407531 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 8413444 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8414597 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8415014 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8415198 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8416913 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8417009 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8419328 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 8419363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8419364 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 8419382 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 8419471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8420427 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8420569 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8420584 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8420604 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8420778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8421031 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8421304 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 8421343 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 8421620 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8421929 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8422084 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 2 8422323 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8422641 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8422653 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8423233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8423794 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8423989 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8424278 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 8424471 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 8424532 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 8424716 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 8424875 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8424923 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 8424951 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8424975 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8424995 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 8425039 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8425062 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 8425180 A C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 8425205 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8425300 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8425320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8425813 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 8426061 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 8426112 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 8426267 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8426721 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8426743 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8426749 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8426881 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 8427094 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 8427111 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 8427160 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8427202 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8427307 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 8427354 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8427381 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8427442 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 8427457 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8427552 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8427574 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8427616 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8427731 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8427819 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 8427911 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8427924 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8428072 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 8428175 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 8428189 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 8428207 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8428365 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8428459 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8428532 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8428540 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 8428639 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 8428704 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8428746 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8428823 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8428837 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8429058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8429095 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 8429123 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 8429128 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 8429358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8429627 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 8429927 T C N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 8429962 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 8430208 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8430248 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 8430377 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8430414 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8430755 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 8430827 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 8430862 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 8430922 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 8430997 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 8431871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8432831 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8433042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8433257 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 8433290 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 8433303 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8433333 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8433751 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8433847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8434045 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 8434643 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8434823 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 8434934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8435168 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 8435280 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8435428 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8435526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8435581 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8435614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8435705 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 8435940 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8435975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8435999 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8436647 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8436686 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 8436796 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 8436831 T C N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 8436842 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8436880 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8437117 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 8437147 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8437856 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8438066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8438211 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8438236 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8438282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8438516 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8438655 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 8438778 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8438849 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8438919 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8439104 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 8439414 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8439479 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8439600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8439654 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8439798 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 8440049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8440129 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8440539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8440646 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8440679 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8440892 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8441277 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8441316 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8441449 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8442027 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8442400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8442783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8443364 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8443668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8443902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8444423 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 8444971 T C Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 8447431 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8447761 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8449001 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 8449236 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8457834 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8457905 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 8458954 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 8459393 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8460346 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 8460788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8461638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8461975 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8462031 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8463710 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8464599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8464628 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8465055 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8466476 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8467686 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8468170 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 8468188 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 8468405 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 8468711 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 8468850 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 8469164 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 8471003 G A Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 8472025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8473359 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8474291 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8474924 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 8474926 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8475124 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8475140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8475226 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 8475728 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8476383 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 8476534 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 8476565 G A N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 8476822 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 8476912 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8477225 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 8477332 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 8477504 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8477505 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8477943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8479324 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 8479325 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 8480081 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 8480138 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8480339 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8480417 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8480461 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8480579 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 8480585 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8480598 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8480610 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 8480983 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8481053 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8481234 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 8481288 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 8481308 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8481316 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8481332 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8481480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8481486 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8481529 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8481536 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8481549 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8481572 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8481573 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8481672 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8481707 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8481857 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8481877 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8481943 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8482088 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8482108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8482172 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 8482174 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 8484028 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 8484261 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8484606 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8485484 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8485513 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8485616 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8485731 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8485831 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8485920 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8485989 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8486496 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8486903 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8487581 A C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 8487793 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 8489013 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8489751 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8489999 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8490066 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8490105 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8490587 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8490825 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8491281 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8492374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8493445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8493456 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8493540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8494862 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8495178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8496786 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8496858 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8497975 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 8498092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8498096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8498885 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 8499313 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 8500493 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8501219 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8501229 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8501366 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8501405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8501469 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8501870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8502579 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8502592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8502907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8503491 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8503763 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8504218 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8504287 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8504318 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8504509 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8504695 G T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 8504823 T A Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 8504841 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 8505092 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8505190 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8505593 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8506092 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 8506375 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8506826 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8508145 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8508220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8508270 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8508471 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8508477 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8509148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8509502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8510387 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8510561 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 8510831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8511462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8511799 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 8512985 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8513481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8513600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8513739 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8514278 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 8514593 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8514804 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8515108 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8515173 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8516105 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8516106 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8516194 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8516309 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8517047 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8517578 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8518423 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8518462 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8518732 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8519055 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8519548 A T Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 8519741 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 8520121 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8520558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8520850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8521314 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8521646 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8522457 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 8523029 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 8523429 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8523726 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8524026 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8524038 A C Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 8524128 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8524189 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 8524553 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8524942 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8524962 A T Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 8525894 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8526390 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8526881 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8527237 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8527849 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 8529013 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8529175 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8529435 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8529443 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8529673 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8529840 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 8529894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8529897 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8529959 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 8530615 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 8531206 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 8531297 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8531378 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8531526 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8531631 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8531794 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 8531966 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 8532660 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 8532905 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 8533370 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8533746 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8533785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8533944 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8534253 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 8534438 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 8534562 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 8534638 G C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 8534846 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 8534859 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8534865 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 8535313 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 8535741 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 8535767 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 8536079 G C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 8536409 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8536665 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 8536704 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8536832 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 8536952 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8537116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8537280 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 8537408 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8537445 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8537453 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8537594 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8537692 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8537721 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8537764 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8537833 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 8537880 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8537884 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8537993 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8538244 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8538550 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8538617 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 8538706 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8538727 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8538931 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 8539439 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 8539467 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8539886 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8539934 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 8540140 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 8540236 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8540251 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 8540338 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8540385 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8540448 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8540545 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 8540701 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8540788 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 8540901 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8541205 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8541633 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 8541770 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8542001 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8542005 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8542044 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8542057 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8542234 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8542747 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8543028 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8543191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8543222 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8543495 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8543515 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 8543581 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8544038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8544046 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8544334 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8544453 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8544734 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8544756 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8544854 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 8545067 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8545148 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8545211 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8545642 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 8545740 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8545755 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 8546210 T A Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 8546360 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 8546401 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 8546512 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8546559 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8546563 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 8546718 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8546788 A T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8546913 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8547039 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8547068 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 8547597 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8547695 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8547775 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8547877 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8548083 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8548088 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8548201 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8548349 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8548422 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8548437 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8548448 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8548481 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8548793 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8548891 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 8548940 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 8549059 G C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 8549066 T G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 8549139 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 8549177 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8549189 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8549200 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8549251 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 8549271 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 8549467 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 8549489 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8550189 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8550212 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 8550556 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8550579 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 8550799 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8550963 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8550988 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8551208 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 8551258 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 8551364 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8551408 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8551530 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8551704 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8551834 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8552585 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8552613 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8552954 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8553016 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 8553057 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8553508 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8553575 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8553651 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8553659 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8553715 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8553722 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8554245 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8554393 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8554634 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8554646 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8554654 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8554904 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 8555190 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8555212 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8555401 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8555470 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8555520 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8555605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8555842 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8555940 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8555956 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 8556945 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8556961 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8557036 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 8557147 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 8557955 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 8558162 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8559166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8559271 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8559297 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 8559365 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8559402 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8559455 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 8559470 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 8559526 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 8559687 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 8560924 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8561168 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 8561552 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8562611 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 8562659 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 8562704 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8562773 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 8562797 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8563043 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 8563096 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 8563285 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8563350 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8563426 T G Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 8563427 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 8563666 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8563676 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8563847 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 8563894 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 8564077 G T N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 8564194 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 8564203 A T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 8564214 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 8564345 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8564507 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 8564643 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8564649 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 8564708 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 8564989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8565006 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 8565065 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8565129 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8565159 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8565591 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 8565592 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8565605 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 8565639 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 8565711 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 8565731 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 8565782 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 8565802 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 8565989 A C N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 8566045 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 8566056 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 8566082 C A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 8566097 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 8566379 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8566438 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8566821 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8566837 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8566950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8567015 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 8567148 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 8567504 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8567834 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8568347 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 8568530 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 8568684 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 8568691 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 8568706 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 8568856 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 8569098 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 8569192 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 8569203 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 8569303 T G N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 8569361 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8569507 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 8569529 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 8569541 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8570115 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8570408 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8570570 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8570609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8571089 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8571135 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8571149 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8571445 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8573026 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8573071 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8574378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8574528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8574663 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8574664 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8574874 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 8575725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8576117 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8576567 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8576710 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8576768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8577073 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 8577296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8577363 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 8577398 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 8577628 T G N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 8578368 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 8578515 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8578758 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 8578815 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8578904 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8578981 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 8579038 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8579046 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8579265 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 8579535 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8579832 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8580478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8580693 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 8581882 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 8581966 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 8581969 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 8583079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8583278 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8583288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8583431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8583809 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8584458 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8585416 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 8585593 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8586000 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8586265 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 8586428 A C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 8586490 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 8586899 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8586935 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 8587029 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 8587124 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 8587145 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 8587153 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 8587212 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8587230 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 8587386 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 8587525 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8587864 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 8588156 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 8589307 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8589312 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 8589334 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 8592098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8592657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8593569 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 8594396 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 8594492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8595730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8596152 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 8596195 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 8596749 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8597117 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8597846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8599141 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8599301 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 8599358 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8599534 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8599608 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8599630 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8599731 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8599748 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8599768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8599805 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8599813 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8599868 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8600017 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8600019 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8600056 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8600102 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8600141 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8600191 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8601536 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8602370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8603242 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 8604011 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 8604560 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 8604574 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 8604716 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 8604761 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 8604993 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 8605217 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 8605282 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 8605762 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 8605873 A G N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 2 8605966 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 8605969 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 8606014 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8606053 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 8606064 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 8606200 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 8606299 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 8606765 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8606932 T G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 8607152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8607247 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8608097 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 8608416 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 8608689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8608766 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8608793 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 8609316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8609630 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8610919 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8611043 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8611052 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 8611653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8612023 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8612429 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8612690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8613070 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8613855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8613977 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8614210 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8614719 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8615025 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 8615149 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8615173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8615202 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 8615239 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8615257 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 8615260 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 8615317 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 8615318 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8615334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8615511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8615523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8615551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8615944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8616053 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8616254 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 8616258 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8616291 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8616397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8617066 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 8617378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8617391 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8617416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8617890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8617905 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8618048 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8618096 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 8618109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8618157 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 8619513 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8619637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8619800 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8620283 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8620447 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8620849 T C Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 8621945 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8622175 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8622299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8622598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8622613 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 8622679 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 8622778 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8622811 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8622915 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8623056 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8623073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8623222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8623325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8623690 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 8623826 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 8623910 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8623932 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8623969 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8624022 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8624178 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 8624441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8624594 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8624843 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 8624850 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8625126 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 8625159 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8625617 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8625685 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8625771 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8625845 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8625858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8625937 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8625947 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8625990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8626057 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8626067 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8626104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8626124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8626595 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 8626715 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8627483 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8627563 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8627589 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8627598 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8628138 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8628140 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8628255 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8628300 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8628737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8628903 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8629025 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8629119 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8629129 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8629209 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8629634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8630477 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8630793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8633157 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8633816 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8634646 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8636129 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8636913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8636920 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8636988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8637028 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8637040 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8637139 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8637330 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8637352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8637386 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8637466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8637696 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8637710 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8637797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8637901 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8637930 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8637932 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8637987 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8638009 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8638159 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8638179 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 8638198 G T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 8638229 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 8638278 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 8638525 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 8638641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8638936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8639269 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8639412 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8639977 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8640013 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8640024 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8640142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8640277 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8640393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8640460 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8640517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8640695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8640819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8640824 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8641119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8641165 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8641353 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8641940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8642246 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8642290 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8642395 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8642588 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8642613 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8642839 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8642948 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8642977 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 8642989 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 8643071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8643083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8643106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8643232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8643235 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8643712 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8643965 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8644111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8644155 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8644252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8644370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8644422 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8644483 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8644548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8644577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8644613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8644859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8644995 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 8647202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8647206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8647293 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8647972 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8648015 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 8648262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8648534 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8652652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8653322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8653412 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8653678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8654548 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8655295 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8655926 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8657677 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8657768 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 8657858 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 8659844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8660470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8661242 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8661243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8661800 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8661845 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8663279 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8664520 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8664632 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8664642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8664770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8664872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8664873 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8665850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8668085 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 8668092 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 8668115 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 8668158 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 8668257 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8668355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8669212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8669393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8669501 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8669572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8669629 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 8669977 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8670254 G T N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 8672198 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8672495 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8672508 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 8672521 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8672633 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 8672634 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 8672702 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 8672744 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 8672862 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8672874 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8672886 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8672925 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 8672946 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8673012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8673105 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8673533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8673656 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8674050 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8674278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8674474 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8674514 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8674918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8675152 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8675488 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8675534 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 8675809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8675949 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8676381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8676384 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8676414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8676766 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8676886 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8676919 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8677496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8677926 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8677941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8678175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8678208 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8678422 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 8678565 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 8678579 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 8678587 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 8678602 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 8678631 G C N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 8678643 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 8678653 T G N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 8679158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8679471 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8680402 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8680748 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 8681079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8681082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8681098 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8681301 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8682262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8685491 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8685823 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8685845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8686240 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 8687504 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8687669 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 8687699 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8687911 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8688073 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8688324 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8688613 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8688614 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8688788 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8689557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8689574 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8689751 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8690067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8691250 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8691433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8691606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8692055 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8692155 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8692495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8692635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8692658 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8692904 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8693070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8693106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8693156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8693353 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 8693737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8693972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8694064 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8694082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8694264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8694640 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8694889 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8694927 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8695114 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8695291 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8695369 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8695404 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 8695654 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 8696256 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8696276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8696553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8696555 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8696569 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8696637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8696919 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8697134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8697178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8697356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8697412 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8697467 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8697677 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8697880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8697959 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8699034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8699416 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8699641 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 8700112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8700473 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 8700713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8701093 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8701454 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8701559 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 8702663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8702687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8703001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8703186 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8703555 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 8703961 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8704690 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 8704978 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 8705001 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 8705269 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8705533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8705619 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8706433 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8706516 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 8706637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8706895 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 8707041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8707198 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8707843 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 8707992 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 8708122 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 2 8708143 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 8709647 G A Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 8709648 C T Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 8710047 G T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 8710287 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 8710505 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8710551 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 8714332 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 8714795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8715255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8715301 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8715350 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8715441 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 8715598 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 8715672 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8716390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8716475 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 8716789 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 8717321 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8717479 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 8717716 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 8717780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8717821 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8717954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8718045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8719055 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8722523 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 8723070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8725243 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8725249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8725438 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 8726066 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8726168 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 8726287 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8726425 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8726474 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8726532 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8726604 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8726698 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8726768 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8726780 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 8726804 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8726875 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 8727088 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8727291 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 8727357 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8727406 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8727449 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 8728205 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 8728249 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8728269 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8728310 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8728336 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8728348 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8728360 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8728366 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8728543 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 8728544 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 8728583 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8728584 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 8728655 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8728824 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8728854 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 8728873 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 8728936 T G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 8728988 A T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 8729071 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 8729086 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 8729123 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 8729161 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 8729185 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 8729215 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 8729404 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 8729473 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 8729489 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8729591 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8729615 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8729821 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8729886 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8729997 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 8730076 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 8730228 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 8730693 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 8730720 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8730745 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8730818 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 8730888 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8731031 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8731058 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8731160 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8731254 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 8731260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8732522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8732662 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8732764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8732819 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8732914 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8733000 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 8733435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8733461 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8733463 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8733510 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8733666 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8733696 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 8733709 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8733983 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8734071 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 8734079 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8734159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8734348 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8734523 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 8735115 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 8735158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8735159 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8735243 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 8735378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8735486 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8735606 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8735750 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8735913 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8736107 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8736310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8736693 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8736707 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8736758 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 8737158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8737252 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8737265 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8737378 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8737394 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8737400 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 8737687 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8737719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8737741 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8737768 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 8737798 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8737894 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8737897 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8738291 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8738659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8738814 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8738998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8739190 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8739381 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 8740126 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8740310 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 8741157 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 8741331 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8742255 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8742376 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8743659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8744022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8744588 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8744959 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8745265 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8745385 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8745604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8745698 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8745938 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8746227 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8746469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8747120 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 8747131 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8747319 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8747946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8748086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8748293 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 8748611 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8748708 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8749335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8750122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8752393 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8752531 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 8752533 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8753077 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 8755559 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8756014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8756379 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 8756534 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 8756538 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 8756965 C T Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 8757295 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8757625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8758567 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8758662 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8765897 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 8769139 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8769161 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 8769301 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 8769500 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 8769717 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8769833 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8769852 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8769859 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8769974 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8770084 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8770121 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8770203 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8770225 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8770269 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8770312 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8770478 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 8770499 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8770561 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8770719 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8770734 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8770820 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8771446 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8771512 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8771526 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8771576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8771588 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8771672 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 8771704 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 8771812 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8771877 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 8771975 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 8772019 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 8772023 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 8772056 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 8772224 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 8772277 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 8772419 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8772690 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8772851 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8773106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8773496 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8774438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8775087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8775102 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 8775228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8775453 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8775584 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 8776269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8777267 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 8777470 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 8778018 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8778111 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8779382 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 8779422 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8783412 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8783564 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8783936 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8783943 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 8784046 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 8784093 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 8784597 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 8784666 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8784919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8785157 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8785199 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8785303 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8785316 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8785466 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8785479 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8785727 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 8785896 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 8785972 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8786046 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 8786054 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 8786089 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 8786104 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 8786140 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8786151 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 8786208 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8786274 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8786356 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8787162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8787424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8787564 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8787589 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8787952 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 8788009 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 8788126 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8788290 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 8788551 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8788649 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 8788832 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8789010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8789359 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8789592 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8789799 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8791605 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8792057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8792247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8793291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8793510 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8793540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8793788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8793811 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8794156 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8794199 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8794447 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8795027 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 8795349 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8795833 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8795857 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 8795941 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8795993 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8796052 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8796257 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 8796766 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 8797175 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8797815 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8798116 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8798446 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8798705 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8800665 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8800669 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8800693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8800834 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8800903 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8800918 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8801128 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8801822 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8802088 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 8802119 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8802545 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8802554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8802629 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8803070 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 8803148 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 8803216 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8803330 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 8803534 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8803572 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 8803577 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 8803750 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8804091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8804715 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8804849 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 8805037 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8805057 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8805252 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8806009 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 8806557 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8807864 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8808522 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 8808566 T A Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 8808590 A C Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 8808715 A C N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 8808724 T C Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 8808874 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 8809040 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 8810079 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 8810083 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8810261 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8810439 G A Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 8810462 G A Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 8810609 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 8810697 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 8810710 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 8810819 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 8810850 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8811362 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8811395 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 8811643 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 8811925 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8812307 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 8812458 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8812679 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 8813025 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 8813035 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 8813068 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 8813094 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8813254 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 8813527 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 8813576 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 8813590 T A N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 8813593 T A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 8813613 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 8813621 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 8813626 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 8813637 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 8813661 G T N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 8813704 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 8813739 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 8813785 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8813911 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8814207 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8815220 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8815325 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8815481 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8815508 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 8815536 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 8815604 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8815637 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8815685 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8815794 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8815869 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8815888 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 8815895 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8815944 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 8815985 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8816095 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 8816107 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 8816122 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 8816144 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 8816160 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 8816252 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 8816266 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 8816389 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8816452 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8816457 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8816465 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8816494 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8816537 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8816545 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8816570 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 8816702 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 8816794 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 8816802 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8816890 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8817010 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8817087 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8817124 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8817166 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8817174 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8817206 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8817221 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8817277 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8817282 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8817297 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8817326 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8817428 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8817438 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8817505 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 8817551 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8817570 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 8817670 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8817764 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 8817786 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 8817826 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 8817839 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 8817857 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 8818038 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 8818247 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 8818355 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8818372 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 8818418 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 8818470 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 8818504 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 8818689 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8818705 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 8818858 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8818953 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 8818969 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 8818977 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 8819011 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 8819389 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 8819588 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8819740 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8820151 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8820369 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8820499 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 8820505 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 8820760 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8821334 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8821350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8821621 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 8821906 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 8822064 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 8822267 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 8822686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8822723 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8822750 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8824136 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 8824145 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8824350 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8824440 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8824462 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8825026 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 8825140 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8825293 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8825541 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8825773 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8825795 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8825804 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 8825847 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8825946 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8826279 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 8826819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8828687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8829383 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8829459 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8829478 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8829533 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 8829597 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8829775 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 8829794 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8829809 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 8830100 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 8830198 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 8830319 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8830439 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8830477 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8830663 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 8830777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8831013 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8831091 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8831128 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8831907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8832593 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 8832686 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8832895 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8832996 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8833053 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8833088 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8833424 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8833557 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8833626 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8833727 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8833729 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8833839 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8833885 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 8834137 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8834329 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8834777 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8835003 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 8835048 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8835116 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 8835132 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8835191 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8835209 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8835296 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8835379 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8835409 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 8835466 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 8835596 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8835643 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8835654 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8835753 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8835784 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8835885 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8835915 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 8835929 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8836016 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8836087 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8836095 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8836104 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8836125 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8836286 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8836560 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 8836683 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8836813 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8836866 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 8836894 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8837141 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8837152 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8837211 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8837343 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 8837484 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8837842 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8837885 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8837911 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8837915 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 8837989 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8838008 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8838016 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8838322 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8838405 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 8838426 C G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 8838553 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 8838783 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8838820 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 8838832 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8838882 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 8838902 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8839573 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 8839652 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8839818 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8839843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8839869 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 8839913 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8840052 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8840160 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8840388 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8840552 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8841726 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 8842352 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8842591 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8844211 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 8846235 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 8846597 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8846798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8846970 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8847403 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8847616 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 8848555 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8848763 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8849323 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8849447 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8849733 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8849883 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8850050 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8850158 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 8850385 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 8850516 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 8850517 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8850579 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8850621 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 8850628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8851181 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 8851210 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8851286 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8851603 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 8851644 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8851648 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 8851680 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 8851700 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8851701 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8851767 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 8851952 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 8852282 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 8852376 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8852486 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8852548 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8852620 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8852622 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8852724 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8852737 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8852764 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8852787 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8852832 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 8852952 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 8852961 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 8853020 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8853233 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 8853312 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8853349 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 8853425 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 8853596 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 8853651 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8853916 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 8853923 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 8854131 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 8854172 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 8854252 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 8855068 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 8855147 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 8855399 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 8855508 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8855660 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 8855875 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8856145 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 8856149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8856178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8856179 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 8856459 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 8856801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8856968 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8857082 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8858072 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8858447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8859003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8859174 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8859288 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 8859545 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 8859571 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 8859617 C A Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 8861113 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 8861410 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 8862200 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8862969 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8863141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8863143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8863493 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8863495 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8863653 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 8863665 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8863782 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8863816 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8863908 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8866120 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 8866556 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8867066 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8867184 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8867272 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8867453 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8867483 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8867530 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8867551 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8867555 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8867616 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8867781 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 8867878 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 8868625 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8868656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8869014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8869159 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8869299 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8870644 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8871187 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8871746 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8871981 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8872185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8872332 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8872748 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8872751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8872888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8873555 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 8874293 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8874384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8875306 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8875338 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 8875530 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8876010 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 8876093 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 8876108 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 8876433 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 8876797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8878607 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8878611 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8878786 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8879809 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8880167 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8880940 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8881450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8882271 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8884349 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8884422 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 8885000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8885912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8886217 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8887033 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8887501 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 8887534 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 8887608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8887610 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8887629 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8887632 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8887724 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8887833 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8887835 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8889234 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8892208 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 8892223 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 8892615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8895335 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 8895428 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8895754 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8896061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8897548 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8897892 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8897904 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8897958 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8898330 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 8898387 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 8901642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8902113 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8902549 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8904048 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8904064 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 8904073 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8904405 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8905244 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8906241 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 8906932 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8908058 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 8908565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8910034 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 8910185 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8910186 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8910473 A C Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 8911334 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8911971 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8912139 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 8912723 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 8913204 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 8913530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8913593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8913607 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 8913762 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 8913911 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 8914186 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 8914197 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 8914207 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 8914824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8914865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8914900 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 8914921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8915129 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 8915132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8915269 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 8915277 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8915295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8915356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8915418 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8915556 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8915779 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 8916440 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 8916457 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 8916471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8916521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8917131 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8917536 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 8917783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8917806 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8917884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8918086 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8918125 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8918143 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8918156 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8918240 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8918283 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 8918309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8918360 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 8918385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8918612 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8918659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8918807 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 8919147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8920323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8920748 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8920989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8921013 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 8922294 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8922415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8923247 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8923937 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8923950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8924166 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8925927 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8925959 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 8926260 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 8927564 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8929043 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8929053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8929938 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8930592 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8930757 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 8931989 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 8932181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8932803 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 8933741 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8934110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8934353 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8935574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8935737 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8936247 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 8936358 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8936382 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 8936464 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 8936489 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 8937237 G C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 8937492 T A Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 8937509 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 8937681 A G Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 8937903 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 8938945 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 8939557 A T Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 8941794 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 8944019 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8944723 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8945234 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8945849 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 8945936 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 8949165 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8949795 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8949926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8950118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8950164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8951030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8951119 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8952517 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8952920 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8953065 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8953344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8955675 C G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 8955763 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8956376 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 8956393 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 8956431 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8956723 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 8956800 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 8958020 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8958218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8958351 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8959168 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 8959461 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8964982 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8965474 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 8966022 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 8966115 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8966448 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 8966552 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8966658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8968047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8968206 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8968634 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8968970 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8968977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8969023 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8969027 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8969063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8969095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8969116 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8969171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8969191 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8969549 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8969600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8969812 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8970789 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 8970837 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8972397 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 8973297 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8973555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8974075 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8974102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8974293 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 8974929 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 8976275 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 8977165 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8977283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8977795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8977878 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 8978722 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 8978965 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 8979114 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 8979822 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 8979929 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 8979950 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 8980002 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 8980061 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 8980091 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 8980118 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 8980213 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 8980522 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 8980542 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 8980787 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 8981061 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 8982125 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 8982446 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 8982449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8982487 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 8982529 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8982671 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 8982722 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 8982768 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 8982829 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 8982878 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 8982951 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 8982975 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 8983346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8983447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8983473 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8983858 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8984228 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 8984443 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 8985014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8985072 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 8985246 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 8985665 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8985853 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8986522 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8986854 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 8987156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8987605 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8988061 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8988062 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 8988964 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 8989929 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 8990005 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 8991486 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 8991534 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 8992231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8992687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8992830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8993725 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 8993727 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 8993915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8994174 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8994406 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 8994419 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 8994587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 8994895 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 8995039 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 8995171 C G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 8995836 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 8996168 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 8996840 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 8997229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8997234 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 8997587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8997630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 8997679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8997905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 8999131 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 8999671 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9003412 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 9003723 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 9003754 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 9003793 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 9003807 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 9003893 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 9003899 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 9003970 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 9004010 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 9004040 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 9004055 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 9004093 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 9004131 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 9004145 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 9004206 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 9004248 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 9004319 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 9004461 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 2 9004477 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9004628 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 9004645 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 9004742 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 2 9004796 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 9005072 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 9005132 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 9005214 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 9005245 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 9007181 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 9007314 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 9007713 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 9007789 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9007814 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 9007831 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 9007884 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 2 9007924 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 9008508 A T Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 2 9008762 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 9008829 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 9008909 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 9008912 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 9009006 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 9009102 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 9009128 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 9009193 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 9009300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9009551 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 9009654 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 9009747 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 9009807 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 9009923 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 9009958 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 9010029 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 9010219 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 9010243 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 2 9010380 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 9010420 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 9010493 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 9010533 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 9010565 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 9010708 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 9010767 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 9010879 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 9010886 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 9010908 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 9010979 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 9011213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9011901 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 9012058 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9012069 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 9012440 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9012468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9012652 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9012701 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 9012747 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 9013183 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 9013204 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 9013215 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 9013828 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9014457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9015346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9016335 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9016491 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9017898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9019588 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9019616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9019623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9019809 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 9020364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9020782 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9020968 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9021273 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9021571 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 9021730 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9021903 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 9022198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9022321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9022423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9023081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9023222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9024117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9024363 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9025209 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9025237 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 9025268 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 9026630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9028187 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9028188 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9028410 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9028422 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9028594 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9028636 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9028764 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9028809 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9028812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9028953 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9029114 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9029206 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9029218 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9029502 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 9029506 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 9029591 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 9029731 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 9029769 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 9029995 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9030074 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9030218 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9030258 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9030310 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9030829 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 9030838 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 9030894 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 9031088 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9031132 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9031178 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9031192 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 9031209 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 9031301 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9031385 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 9031448 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9031500 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9031584 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9031766 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9031790 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9031994 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9032021 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9032136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9032181 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 9032183 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 9032199 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 9032226 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 9032369 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 9032520 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9032592 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9032595 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9032848 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9032864 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9032947 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 9032960 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9032965 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9032989 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9033048 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 9033105 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 9033309 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 9033373 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 9033487 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 9033601 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9033712 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9033735 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 9033791 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9033918 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 9034284 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9034379 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9034387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9034413 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9034416 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9034437 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9034723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9034752 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9035610 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 9035619 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9035676 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 9036096 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 9036181 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 9036401 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9037465 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9037606 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 9037765 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9037779 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9037820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9037933 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 9038021 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 9038045 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 9038073 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 9038114 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9038129 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9038260 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9039125 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9039881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9041499 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9041568 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 9041615 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9041659 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9041956 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 9042045 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9042871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9043015 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9043458 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 9044282 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9045390 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9045519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9045860 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9046242 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9046366 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9046578 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9046668 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 9046892 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9048396 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9048451 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9048668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9048961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9049065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9051573 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9052007 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9053992 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9054805 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 9055632 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 9055688 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 9056033 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 9056425 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 9057688 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9058895 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9060097 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 9060198 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9061791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9063335 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9066016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9066305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9066923 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9068919 A C Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 9069001 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 9069012 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 9069040 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 9069050 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9069058 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 9069062 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 9069360 T C Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 9069365 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 9069372 T G Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 2 9069394 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 9069597 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 9069734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9070287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9070724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9070983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9071160 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9071726 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9073873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9074234 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9074332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9074398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9075447 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 9075951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9077697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9078222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9078296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9079026 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9079530 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9079671 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 9081308 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9083045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9084150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9084151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9084614 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 9084617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9085563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9086059 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9087858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9091288 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9092940 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9092961 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9093464 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9093846 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 9093908 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 9093936 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9093960 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9093997 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9094003 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9094080 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 9094312 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9094320 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9094467 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9094705 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9094727 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9094749 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 9095029 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9095055 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9095309 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9095564 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9097154 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 9097163 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 9097252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9097283 C G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 9097508 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9097608 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9097735 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9097771 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9097814 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9097911 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9097918 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9097952 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9098022 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9098119 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9098133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9098365 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9098687 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 9098713 G C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 9098725 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 9098728 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 9098779 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 9099532 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 9099734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9099745 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9100094 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9100313 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9100876 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9101137 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9101561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9102008 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9102630 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9103010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9103750 A T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 2 9104052 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 9104055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9105111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9105137 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9107033 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 9107491 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9107632 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 9107793 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 9109361 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9109433 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9109577 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9109629 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 9109634 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 9109721 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 9110128 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9110304 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9110529 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9111132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9111952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9112205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9112513 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9112584 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9112595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9112644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9113503 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9113700 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9113720 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9113856 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9114043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9114321 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9114390 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 9114642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9114645 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9114739 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9114745 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 9114858 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9115151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9115778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9116074 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9116109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9116602 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 9117058 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9117086 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9117203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9117233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9117255 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9117363 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9117538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9117613 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9117660 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9117735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9118277 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9118838 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9118893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9119252 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 9119489 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9119699 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9119745 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9121724 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9121844 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9121896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9122135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9122197 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9122285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9122299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9122405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9122412 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9122507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9122559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9123363 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9123423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9124411 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 9124604 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9124856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9125247 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9125252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9125305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9125311 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9125385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9125547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9125642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9125799 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9126238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9126771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9126874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9126902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9126948 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9127743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9127863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9128029 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 9129938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9129948 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9129991 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 9130027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9130233 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9131703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9132030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9132041 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9132624 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9133942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9134162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9141104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9141717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9141734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9141868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9143427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9144857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9145892 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9146316 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 9152178 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9152734 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9152737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9152908 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9152909 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9152951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9152984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9153114 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9153166 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9154258 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9154271 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9154298 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 9154594 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9154679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9154692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9154693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9154881 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9155021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9155250 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9155404 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9155485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9155503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9155563 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9155681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9155682 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9155694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9155725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9156170 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9156231 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9156258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9156446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9156481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9156509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9158081 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 9158300 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 9158345 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 9158947 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 9158968 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 9159043 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9159045 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9159253 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9159304 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9159470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9159527 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9161473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9161516 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9161557 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9161570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9161794 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 9162573 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 9162876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9163191 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9163460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9163749 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9163958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9164039 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9164164 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9164379 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9164513 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 9164629 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 9164672 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 9164683 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 9164881 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9164982 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 9165099 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 9165670 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 9165780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9166980 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9167216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9167281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9167775 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9167842 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9167865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9167953 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9168030 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 9168169 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 9168173 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 9168240 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 9168377 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9168423 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9168486 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9168528 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9168545 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9168570 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9168633 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9168727 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9168748 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9168754 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9168846 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9168886 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9168962 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9169023 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9169098 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9169100 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9169123 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9169213 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 9169219 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 9169289 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 9169516 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9170199 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9170202 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9170212 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9170299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9170751 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 9171996 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9172792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9173106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9173119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9173716 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9173823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9174695 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9174735 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9174752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9174765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9175031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9175050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9175113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9175203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9175230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9175332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9175340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9175663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9176260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9176345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9176640 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 9176730 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9176748 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9176920 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9177029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9177519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9177800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9178444 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9179078 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9179253 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 9179316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9180446 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9180555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9180566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9180884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9181604 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9182111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9182268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9182347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9183004 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9183260 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9183282 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9183387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9183654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9183690 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9183714 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9184041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9184401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9184489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9184635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9184723 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9185538 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9185889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9186109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9187253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9188758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9189692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9189901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9190823 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 9190881 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 9191057 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9191154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9191155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9191169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9191197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9191270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9191394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9191416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9191427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9191697 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9191853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9191976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9191978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9192207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9192226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9192271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9192381 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9192840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9193259 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9193362 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9193440 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9193474 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9194375 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9194659 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9195139 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 9195227 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 9195332 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 9195391 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9195581 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9195656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9195672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9195724 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9195787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9195815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196043 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 9196095 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196115 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196147 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196150 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196173 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9196421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9196579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196956 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9196989 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9197105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9197142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9197239 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9197268 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9197280 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9198199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9198381 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9198528 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9198603 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9198628 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 9198691 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 9198724 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 9198950 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 9198971 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 9198975 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 9199047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9199063 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9199184 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9199246 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9199252 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9199375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9199543 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9199583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9199648 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9199702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9199800 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9199857 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 9200160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9200236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9200987 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9201313 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9201743 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9202062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9202463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9202631 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9202651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9202707 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9202892 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9203101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9203223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9203298 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9203352 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9203406 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9203456 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9203644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9204089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9204121 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9204207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9204214 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9204293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9204313 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9204486 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9204652 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 9204662 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9205077 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9205969 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9206463 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9206504 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9206979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9207237 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9207245 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9207262 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9207316 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 9207992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9208127 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9208227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9208873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9209205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9210890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9212778 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9213935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9214340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9214355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9214646 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9215184 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9219451 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 9220431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9221075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9222615 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9222644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9222823 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9223243 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 9223263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9223478 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 9223493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9223782 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 9224069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9224375 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 9224665 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 9224678 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 9224802 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 9224851 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9224872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9224875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9225142 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9225209 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9225227 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 9225232 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9225269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9225358 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 9225370 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 9225666 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9225742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9226138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9226651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9226795 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9226859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9226948 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9227232 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 9227384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9227746 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9228038 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9228347 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9228762 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9228832 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9228849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9228866 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9229027 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9229131 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9229155 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9229360 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 9230551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9231840 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 9231912 A C N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 2 9231916 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 2 9232262 C G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 9232644 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9232663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9232666 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9232691 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9232706 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 9232741 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 9232744 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9232760 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 9232763 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9232776 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9232972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9233000 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9233065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9233208 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 9233209 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 9233617 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 9233873 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9234036 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 9234079 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 9234091 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9234109 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9234161 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 9234231 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9234279 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 9234281 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 9234295 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 9234336 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 9234404 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 9234419 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 9234436 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 9234442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9234450 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 9234522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9234573 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 9234588 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9234682 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9236198 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9238403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9239075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9239528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9239943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9243253 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9243504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9244530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9247165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9247821 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 9250576 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9251013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9252085 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9252117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9252818 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 9253096 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 9253105 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9253254 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9253471 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 9254268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9263871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9265828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9265909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9267100 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9267207 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9267641 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 9267884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9268042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9268470 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9268701 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 9268749 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 9268797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9268910 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9269091 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 9269380 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9269384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9269467 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9269868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9270287 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 9271073 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 9272443 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9272454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9272822 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9272893 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9272930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9272946 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9273559 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 9273654 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9274350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9274885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9275521 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 9275557 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 9276525 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9276875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9277362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9277412 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 9277984 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9278068 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9278114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9278238 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 9278320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9278383 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9278397 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9278536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9279808 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 9280067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9281516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9281597 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9281964 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9282600 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9283528 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9284202 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9284245 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 9284964 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9285060 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9285094 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9285150 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9285208 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 9285223 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9285236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9285371 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 9285543 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 9285788 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 9286026 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 9286044 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 9286276 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 9286350 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9286547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9286592 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9286632 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9286657 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9286741 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9288122 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 9288249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9288292 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 9288398 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 9288487 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9288643 T A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 9289279 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 9289321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9289352 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 9289471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9289504 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 9289811 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9289870 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9289987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9290037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9290590 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9290670 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9290802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9291004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9291341 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9291418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9291880 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9291966 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9292105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9292144 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9292249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9292570 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 9292596 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 2 9292842 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9292891 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9292930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9292952 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9293014 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9293090 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293116 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9293135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293193 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293266 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9293277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9293457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9293489 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9293529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9293530 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9293633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293737 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 9293770 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293858 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9293918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9294100 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9294124 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9294142 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9294155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9294192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9294202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9294222 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9294292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9294299 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9294670 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 9294867 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9294873 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9294883 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9294884 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 9294963 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9295207 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9295244 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 9295371 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9295373 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9295391 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9295605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9295632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9295696 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9295706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9295824 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 9295848 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9295962 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9296597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9296677 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9296893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9296974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9299570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9301600 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9301750 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9301782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9301895 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9302280 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9302505 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9302523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9302594 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9302632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9302716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9302784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9302801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9302839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9302947 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9303093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9303118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9303164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9303166 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9303300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9303584 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9303758 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9303769 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9303929 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9303993 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9303994 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9304030 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9304052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9304303 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9304440 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9304503 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9304584 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9304687 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 9304709 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9304814 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9304871 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9304970 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 9305039 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 9305239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9305243 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9305300 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9305400 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9305495 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9305542 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9305560 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9306117 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 9306221 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9306273 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 9306495 A C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 9306512 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 9306734 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9306762 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9306789 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 9306953 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9306963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9306964 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9307003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9307095 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9307181 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9307227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9307242 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9307257 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9307318 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 9307341 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9307367 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9307387 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9307458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9307513 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9307585 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9307631 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9307636 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 9307916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9307999 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9308212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9308227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9308266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9308278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9308280 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9308310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9308321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9309012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9309255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9309437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9310342 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9310600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9311009 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9311059 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9311186 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9311215 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9311333 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9313139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9313460 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9314686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9314918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9318431 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9320275 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9322767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9323042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9324266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9324972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9326348 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9327041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9327050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9327082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9327125 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9327418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9327595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9327739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9328768 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 9329180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9329617 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9330302 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 9330751 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9330846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9332517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9332554 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9332558 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9332897 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 9333016 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9333174 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9333483 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9333493 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9334111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9334211 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9334322 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 9334941 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 9335143 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 9335147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9335431 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 9335542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9336011 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9336233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9336306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9336571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9336888 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 9337301 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 9337377 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 9337470 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9337529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9337836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9338194 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9338319 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9338530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9338929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9338946 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9339189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9339238 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9340059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9340974 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 9341660 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 9342208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9342241 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9342246 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9342254 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9342540 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9342929 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 9343038 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 9343099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9343100 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9343377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9343410 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9344059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9346223 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9346442 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 9346443 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 9346668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9346788 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9347996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9350080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9350835 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9354891 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 9355557 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9356105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9356659 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 9356913 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 9358460 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 9359207 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9362112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9362802 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 9362966 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9363237 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 9363418 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 9363591 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9363730 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9363802 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 9363838 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9364417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9365437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9365815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9367378 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 9367424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9368088 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9368885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9369022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9370878 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9372685 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9374613 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9375090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9375301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9375310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9376573 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9376736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9377604 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9378546 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 9379351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9381673 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 9381752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9381785 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 9382032 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 9382079 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 9382138 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 9382281 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9382442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9382461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9382482 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9382528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9382650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9382979 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 9382990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9384233 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9385843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9386113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9387057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9387129 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9388651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9390712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9392520 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9393722 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9394943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9395139 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9395611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9396630 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9398106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9398374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9398541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9399709 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9399917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9401679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9401680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9401938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9402187 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9403950 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 9405545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9406483 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 9407327 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9407380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9407415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9407903 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9408694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9408851 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9409055 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9409736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9409778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9410144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9410184 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9410483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9410736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9410854 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9410941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9411004 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9411020 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9411069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9411086 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9411119 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9411178 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 9411351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9411405 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 9411407 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 9411762 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9411785 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 9411910 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9412022 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9412126 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 9412127 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 9412330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9412597 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9412716 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9412818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9412836 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9412969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9413083 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9413114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9413127 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9413173 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9413203 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 9413214 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9413229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9413399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9413937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9414075 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9414372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9414827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9414937 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9415183 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9415219 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9415235 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9415370 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9415405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9415478 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9415880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9416022 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9416023 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9416139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9416183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9416203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9416289 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9416290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9416382 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9416429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9416676 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9416786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9416792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9416912 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9416989 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9417052 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9417414 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9417462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9417640 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 9418554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9418655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9418682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9418739 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9419143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9419184 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9419892 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 9420115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9420132 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9420257 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9420352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9420442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9420663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9421036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9421054 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 9421276 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9421327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9421753 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9421761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9421817 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9421905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9422135 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9422161 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9422854 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9422916 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9423045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9423117 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9423565 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9424233 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9424240 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9424273 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9424417 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 9424613 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9425068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9425142 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9425203 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9425329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9425389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9425460 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9425492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9425684 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9425936 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9425937 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 9426116 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9426147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9426190 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9426193 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9426339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9426366 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9426372 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9426388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9426574 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9426629 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9426715 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9426733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9426834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9426852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9426897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9426898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9427046 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9427048 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9427061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9427064 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9427092 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9427103 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9427133 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9427174 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9427180 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9427244 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9427290 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9427334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9427389 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9428605 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 9428708 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9428722 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9428925 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9429063 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9429329 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9429393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9429442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9429582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9429606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9429751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9436753 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9436778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9436907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9436950 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9436999 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9437045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9437169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9437200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9437328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9437381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9437390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9437475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9437509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9438670 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 9439266 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9440161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9440191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9440456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9441461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9441764 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 9442510 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9442551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9442704 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9442902 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9443025 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9443335 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9443469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9444704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9444729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9445134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9445653 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 9445745 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9446211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9446212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9446396 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 9446410 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 9446426 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 9446438 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 9446602 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 9447541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9447560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9447696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9447754 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9447756 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9447791 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9447794 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9447873 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9447888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9447905 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9447920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9447947 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 9447952 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9447964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9447981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9448027 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9448097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9448110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9448155 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9449210 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9453137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9453239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9453623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9456809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9457241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9457442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9459185 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9459815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9459819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9459974 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9463011 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 9466737 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 9466839 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9467134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9467198 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9467364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9468408 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9468848 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9469531 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9469881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9470141 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9470170 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9470219 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 9470470 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 9470484 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 9470505 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9470514 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9470525 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9470530 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9470629 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9470722 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9470744 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 9470791 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9470792 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9470837 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 9471037 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 9471076 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9471103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9471167 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9471333 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9471718 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 9471858 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9471862 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9471869 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9471904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9472223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9473560 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 9473572 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 9473884 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9474030 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 9474426 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9474441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9474860 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9474940 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9475098 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9475314 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 9475521 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9475540 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9475750 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 9475844 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9475872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9475877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9475910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9475987 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 9475996 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 9476096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9476294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9476334 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9476899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9476912 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9476913 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9477005 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 9477075 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 9477089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9478032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9478091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9478470 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 9479205 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9479602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9479866 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9479903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9480022 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9480185 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9481083 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9481240 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 9481327 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 9481551 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9481554 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 9481592 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 9481665 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 9481682 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9481739 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9481808 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9481889 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 9481960 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 9481993 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 9482154 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9482285 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9482293 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9482297 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9482457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9482742 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 9482930 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9483036 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 9483127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9483170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9483386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9483549 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9483777 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9483997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9484182 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9484205 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 9484268 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 9484294 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 9484328 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 9484422 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 9484594 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 9484723 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9484873 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 9485029 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 9485366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9485396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9485416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9485732 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 9486011 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 9486444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9486598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9487070 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9487164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9487680 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 9489525 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9490292 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9491697 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9492992 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 9493452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9494975 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9495440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9495600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9495904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9496056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9496363 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 9496907 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 9497012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9497307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9498564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9500477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9500745 T A N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 2 9500755 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 9501018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9501563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9501872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9504949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9506487 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9506617 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 9507377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9508626 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9509400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9510949 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9511724 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9512683 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 9517956 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9518262 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9519139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9519761 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9520098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9520417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9520474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9520948 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 9524588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9527440 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9528551 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 9529008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9530163 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 9530303 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9530721 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 9531118 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 9531621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9532415 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9532470 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 9532796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9532809 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9532999 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9533006 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9533098 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9533149 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 9533165 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9533221 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9533453 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9533576 G C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 9533577 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 9534122 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 9534137 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 9534144 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 9534163 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 9534277 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9534348 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9534428 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9534490 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 9534719 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 9534734 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 9534890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9535523 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 2 9535671 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 9535775 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9535782 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9535802 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9535828 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9535896 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 9536154 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 9536186 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9536288 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 9536437 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 9536475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9536855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9536879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9537081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9537237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9537285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9537388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9537574 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9537607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9537772 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9537818 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9537846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9538029 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 9538711 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9538816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9539350 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9539396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9539579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9539744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9539983 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9540036 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9540067 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9540154 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9540173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9540559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9540679 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 9540822 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9541333 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 9541406 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9541407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9541419 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9541941 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9541988 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9542015 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 9544350 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 9544368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9544381 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 9546953 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9547047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9547640 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 9547663 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 9547755 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 9547785 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9551022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9552095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9553344 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 9553939 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 9554036 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 9555257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9555283 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9555308 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9555948 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 9555956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9556108 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 9556320 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9556348 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9556464 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9556604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9556859 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9556871 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 9556879 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9556919 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 9557168 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9557206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9557342 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 9557387 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9557552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9557598 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9557679 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9557812 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 9558160 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 9558179 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9558228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9558349 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9558383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9558517 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9558557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9558564 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9558949 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9559014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9559085 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 9559089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9559117 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9559131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9559340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9559409 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9559452 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9559521 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9559531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9559777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9560711 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9564397 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9565214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9565227 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 9565291 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9565301 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 9565304 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 9565550 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9565584 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 9565922 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9566189 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 9566351 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9566638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9566898 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 9567060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9567120 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9567145 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9567242 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 9567250 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 9567598 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9568385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9569300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9574858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9575343 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 9577434 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 9577466 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9577471 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 9577783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9579202 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 9579559 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9579957 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 9579976 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 9580048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9580072 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9580081 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 9580867 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 9580870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9580900 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 9581013 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 9581474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9581960 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9582047 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9582177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9582368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9583061 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9583066 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9583175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9583732 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 9584367 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9584565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9584847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9585542 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9586156 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9586763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9587044 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 9587231 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9587965 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9588103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9588303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9589034 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9589463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9590050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9590809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9591009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9591048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9591684 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9592547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9592680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9595154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9596234 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9597256 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9597626 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 9597997 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9598031 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9598825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9598920 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9599148 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9599304 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9601379 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9602009 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9603311 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 9603376 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9603570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9603641 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9603797 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9605767 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9606393 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9606951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9607102 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9607113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9607421 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9608072 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9608165 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9608255 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 9608449 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9608501 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 9609140 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9609185 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9609613 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9609617 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9609788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9611138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9611160 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 9611183 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 9611452 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9611590 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 9611610 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 9612210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9612227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9612421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9612960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9613453 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9615657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9617848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9618075 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9618388 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 9618777 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9619436 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9619780 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9620501 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 9620838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9621292 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 9621869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9622143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9622720 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 9622730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9622773 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 9623257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9623393 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9623509 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9623644 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 9623881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9623894 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9623926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9623953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9624005 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9624030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9624075 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9624364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9624756 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9627464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9627678 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 9627848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9628059 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 9628248 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 9628334 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9628612 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9628642 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9630732 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 9632339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9632990 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9633064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9635469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9636117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9636165 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9637208 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9638894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9639117 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9639323 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 9639477 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9639501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9639715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9639944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9640290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9641463 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 9641627 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 9642159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9643250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9644531 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 9644654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9644770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9645738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9646178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9646208 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9646356 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9646877 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9647826 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9648010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9648166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9648396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9649868 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9650063 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9650186 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9650281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9651502 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 9652159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9652341 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 9653318 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9654986 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9657214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9657216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9657246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9657674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9659222 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9661587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9661985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9662705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9664719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9664865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9664948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9665187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9665491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9667070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9668596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9668831 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 9670130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9670516 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9670551 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 9672189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9673163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9674625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9674665 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 9674715 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9674858 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 9674978 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9675004 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 9675074 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9675424 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 9675469 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9675481 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9675845 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9676723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9676917 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9677835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9680797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9681516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9681608 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 9681897 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9681914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9681963 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9683405 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9684007 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9684036 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 9684065 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9684263 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 9684322 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 9684497 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 9684511 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9684614 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9684870 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9685035 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 9685044 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 9685141 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 9685296 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9686080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9686288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9686313 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9686811 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9687074 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 9688954 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9690259 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 9691947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9692264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9692473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9693131 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9693196 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9693328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9693338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9693877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9694079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9695920 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 9695933 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 9698545 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9698673 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9698727 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9698863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9699552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9699593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9703103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9703242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9703543 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 9704063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9704106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9704217 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9704413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9704655 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 9704794 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 9705057 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 9705091 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 9705229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9705490 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 9705503 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 9705610 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 9705611 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 9705724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9705916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9708050 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 9710190 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9713178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9713255 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9714481 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 9714726 C T Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 9714833 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9715700 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 9715932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9715942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9716192 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9716370 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 9716384 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 9716622 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9717044 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 9717174 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9717242 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 9717518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9717539 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9717766 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 9717780 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 9718165 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 9718257 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 9718371 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 9718429 A T Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 2 9718604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9718746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9719628 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 9719734 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 9719859 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 9719931 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 9720075 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 9720175 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 9720247 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9720254 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9720260 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9720288 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 9720295 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 9720689 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 9720695 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9720737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9721039 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 9721385 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9721508 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9721759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9721796 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9723142 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 9724193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9724439 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9724551 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 9724552 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 9724812 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 9724873 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 9724931 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 9725081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9725256 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 9725269 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 9725288 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 9725699 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9725797 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9725847 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 9726736 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9726737 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9726757 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9726945 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9726967 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 9727028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9727450 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9727522 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9727557 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9727932 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 9728048 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9728159 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9728323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9728363 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9728512 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9728894 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 9729002 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9729005 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 9729319 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9729388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9729574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9730128 T A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 9730137 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 9730143 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 9730247 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 9730335 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 9730426 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 9730508 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 9731113 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 9731122 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9731258 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9731401 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 9731432 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9731455 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 9731524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9731558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9731559 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 9731646 A T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 9731689 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9731697 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9731783 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 9731869 G T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 9732113 A G Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 9732185 G A Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 9732205 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 9732216 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 9732583 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 9732635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9732744 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9732973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9732998 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9733119 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9733598 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 9733741 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 9733795 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 9733947 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 9734206 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 9734401 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9734623 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 9734785 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 9734888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9735027 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 9735314 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9735717 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9736078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9736261 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9736372 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9736567 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 9737105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9737275 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9737422 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 9737609 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 9737811 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 9737844 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 9737872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9738130 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 9738156 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 2 9738208 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9738391 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 9738691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9738966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9739081 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 9739208 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 9739336 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 9739339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9739432 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 9739602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9739726 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 9739773 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 9740550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9740848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9741518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9741521 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 9741917 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 9741966 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9742146 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9743350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9743441 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 9743472 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 9743648 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9743704 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9743981 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9744123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9744149 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9744199 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9744692 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9744797 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 9745141 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9745626 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9745797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9746059 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9746294 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9746763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9748498 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9748860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9749133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9749367 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9749917 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 9750262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9752077 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 9753731 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 9755691 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 9756097 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9756477 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 9756663 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 9756818 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 9756825 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 9757160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9757309 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 9757322 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 9757361 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 9757421 T A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 2 9758000 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9758436 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9758604 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 9758605 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 9758631 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9759206 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 9759406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9759423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9759616 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9759945 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 9760182 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 9760329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9760399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9760525 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9760738 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9760800 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 9760976 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 9761020 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9761173 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9761379 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 9761854 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 9762007 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 9762185 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9762197 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9762362 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 9762391 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 9762430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9762788 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 9765883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9770778 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9771347 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9773271 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9774100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9774220 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9775214 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 9776041 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 9778086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9778479 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9779964 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 9780072 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 9780898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9780917 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 9781663 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9782008 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 9782025 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9782397 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 9783027 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9783030 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9783181 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 9783223 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 9783246 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 9783265 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 9783593 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9783736 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9783870 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9784091 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 9784211 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9784249 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9784363 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9785073 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9785191 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9785300 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 9785356 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 9785550 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 9785908 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 9786132 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9786167 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9786242 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9786246 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9788363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9789508 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9789648 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9789758 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9790708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9791682 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9791952 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9792437 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 9792478 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 9794340 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 9794439 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9794876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9795361 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9797108 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 9798519 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9798549 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 9798817 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 9798917 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 9799845 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9800982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9802438 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9803415 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9803875 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9804105 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 9805848 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 9806126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9806442 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 9807131 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9807140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9807654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9808666 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 9809124 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9809697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9809962 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9810438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9811604 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9811848 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 9814511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9815528 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 9816607 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9818252 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9819167 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9820200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9820480 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9821016 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9821327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9822731 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 9823095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9823968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9824649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9824778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9825432 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9825664 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9825757 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 9825811 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9825819 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9827019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9827885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9828588 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 9828836 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9829730 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 9830817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9834170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9834266 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9834294 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9834717 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 9835090 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9835242 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9835659 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 9836128 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9836393 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 9836398 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 9837569 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 9837766 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9837768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9838395 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 9838403 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 9838527 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 9838682 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 9838697 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 9838704 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 9838971 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9839365 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9839456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9839503 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 9839557 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 9839583 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9839679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9841445 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 9841638 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 9842385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9842497 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9842847 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9843511 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 9844114 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9844177 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9844300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9844594 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9844735 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9845014 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9845174 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9845311 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 9845510 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 9846272 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9848198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9848436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9848455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9849739 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9851398 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 9854446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9856780 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 9856808 C A Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 9858302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9859501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9859512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9860181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9861645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9863937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9864285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9865118 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9865164 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 9865235 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 9865308 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9865347 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9865616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9865964 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9866403 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 9866637 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9866913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9867413 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 9867814 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 9867971 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 9868101 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 9868270 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9870400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9870932 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9870985 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9873854 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9874369 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9874902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9875023 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9875264 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 9877702 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9880608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9881821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9885053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9885506 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9886323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9889901 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 9890993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9891044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9891139 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9895538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9895878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9896593 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9896605 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 9897525 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9902247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9905024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9908371 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9912998 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 2 9913838 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 9914991 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 9915206 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 9915410 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9915525 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9916970 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9919081 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 9919172 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9919317 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 9919320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9919433 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9919620 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9919769 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9919825 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9920499 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 9920799 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 9920810 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9921567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9921593 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9922512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9923535 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9924308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9924689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 9924895 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9925854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9927626 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9928153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9931021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9931858 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9932067 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9932332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9932363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9932403 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9932996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9933730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9934607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9935093 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9935169 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 9935436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9935793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9936238 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 9936384 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 9936503 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9936638 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9937774 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9938191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9938533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9938977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9939488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9942138 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 9942248 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 9942457 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9943289 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9943312 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 9943331 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9943463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9943468 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 9943488 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 9943565 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9944554 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 9944580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9944921 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9946121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9949124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9949243 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9949564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9951663 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 9951833 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 9953230 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 9953341 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 9953421 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9953444 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9953979 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9954062 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9954104 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9954227 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9954326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9954572 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 9954629 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 9954645 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 9954658 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 9955009 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9955341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9955344 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9955371 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9955680 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9955700 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9955821 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9956113 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 9956146 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9956202 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9956220 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9956249 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 9956359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9956427 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9956445 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9956484 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 9956509 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 9959693 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 9961567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9964624 C G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 9965763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9967687 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 9967691 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 9968210 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9969772 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 9978946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9979453 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 9979597 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9980121 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 9980232 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 9981461 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 2 9981567 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 9981678 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 9981779 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9981903 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9982041 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 9982198 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9982248 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 9982340 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9982402 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 9982507 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 9982511 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 9982544 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 9982597 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 9982638 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 9983010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9983374 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 9983401 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 9983407 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 9983413 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 9983423 T C Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 9983447 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 9983486 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 9983663 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 9983678 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 9983698 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 9983847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9983899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9983901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9983946 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 9984038 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9984089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9985481 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 9985518 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 9986256 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 9986677 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 9986708 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 9989641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9991516 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 9991665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9991775 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9991790 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 9992215 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 9992224 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 9992226 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 9992299 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 9992641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9992674 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9992740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 9993498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9993536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9993570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9994122 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9994306 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 9994358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9994430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9994631 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 9994685 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 9995150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9996548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9997719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 9999199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10000081 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 10001363 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 10001413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10001746 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 10002498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10002532 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10002587 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10002617 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10002663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10002685 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 10002754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10002851 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 10002954 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 10003458 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 10003503 A C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 10003687 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 2 10003702 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 10003792 T A Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 10003795 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 10003946 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 2 10004227 T G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 10004413 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10004708 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 10004717 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 10004975 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10005161 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 10005168 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 10005179 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 10005368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10005453 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10005457 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10005478 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 10005567 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10006561 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10006630 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 10006633 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 10006744 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10006763 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 10007059 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 10007219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10007241 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 10007657 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 10007666 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 10007668 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 10007958 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 10008808 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10008923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10008945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10008962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10009442 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 10009445 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 10009491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10009498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10009504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10009554 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 10009714 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 10009733 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 10010281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10010291 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 10010328 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 10010803 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 10011129 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 10011174 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 10011537 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10011650 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10011661 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 10011686 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 10011848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10011944 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 10012205 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 10013550 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10013739 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 10014193 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10014329 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10016114 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 10016201 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 10016204 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 10016350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10016763 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10016839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10016863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10017747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10018064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10018188 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10018294 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 10018423 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 10018429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10018440 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 10018523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10018900 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 10019198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10019383 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10019903 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10019946 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10020024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10020060 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10020313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10020349 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10020386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10020596 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 10020646 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 10020649 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 10020890 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10021148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10021355 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10021680 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10021948 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10022047 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10022052 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10022288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10022347 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 10022536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10022557 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10022677 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10023444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10023545 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10023568 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10023748 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10023906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10024030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10025253 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10025472 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10025609 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10025643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10026250 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10026301 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 10026507 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 10026994 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10028149 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10028744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10029174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10030190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10030291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10030580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10032561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10032610 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10033245 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10033252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10037027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10037075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10037561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10037925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10037985 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10041718 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 10042705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10042934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10043043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10043180 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10043647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10045289 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 10045819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10046847 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10047765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10047822 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 10048351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10048421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10048442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10048448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10048529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10048532 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10048872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10048912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10048928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10048959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10049001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10049019 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10049183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10049202 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10049702 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 10049753 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 10049789 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10049935 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 10050213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10050466 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 10051679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10052098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10053291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10054155 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10054268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10055053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10055220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10055470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10055622 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10055640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10055653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10056417 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10056713 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 10056744 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 10056779 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 10056814 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 10056817 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10056833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10056983 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 10057266 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 10057589 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10057820 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 10057973 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10057979 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10057984 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 10058111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10058116 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 10058213 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 10058232 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 10058257 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 10058426 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10058446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10058724 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10058735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10058762 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10058824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10058840 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 10058862 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10058881 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 10059146 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10059435 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10059440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10059581 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10059626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10059690 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10059692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10059725 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10059838 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10060001 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10060321 A T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 10060406 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 10060431 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 10060614 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10060657 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10060695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10060946 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10061049 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10061055 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10061082 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10061083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10061209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10061304 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10061467 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 10061529 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10061631 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10061769 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10061803 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10061813 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 10061933 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10061948 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10061987 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 10061988 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 10062006 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10062043 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 10062049 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 10062057 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10062068 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10062123 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10062134 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10062144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10062162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10062183 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 10062301 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 10062394 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10062458 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 10062460 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10062479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10062487 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 10062538 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 10062823 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 10062962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10062971 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10063038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10063133 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 10063192 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 10063353 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 10063368 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10063453 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10063479 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10063499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10063502 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 10063728 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10063746 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 10063797 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 10063824 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10063886 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10065250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10065529 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10065914 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 10066133 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10066592 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10067028 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10068563 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 10069372 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10069595 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 10071907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10071927 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10075230 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10076248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10077117 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10077182 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10077211 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 10077257 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 10077692 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 10077746 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 2 10077780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10077801 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 10077960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10078226 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10079202 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 10079794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10080844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10080941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10082658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10082729 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 10082878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10083505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10084380 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10084669 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10084784 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 10084835 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 10084869 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10085289 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 10085310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10085487 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10085892 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 10085966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10086255 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10086482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10087061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10088211 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 10088403 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 10088704 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 10088905 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 10088960 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10089010 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 10090866 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 10091191 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10091245 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 10091287 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 10091405 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 10091466 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 10091703 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10091751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10091848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10092015 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 10092131 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 10092230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10092340 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 10092367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10092393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10092443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10092559 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 10092570 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 10092661 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 10092737 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 10092756 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 10092819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10092824 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 10092855 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 10092970 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 10092976 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 10092994 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 10093063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10093100 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10093102 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10094938 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 10095557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10095565 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10095573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10095642 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 10095852 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10095858 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10095864 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 10095881 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10096010 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 10096020 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10096062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10096186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10096970 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 10097178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10097273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10097356 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 10097416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10097885 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10097948 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 10098008 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10098047 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10098176 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 10105122 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10105276 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10105471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10108654 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10109752 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 10109982 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 10110116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10110212 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10110253 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10110538 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 10110638 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 10110679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10110760 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 10110801 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 10110885 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 10110894 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 10110930 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 10111051 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 10111211 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 10111279 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 10111350 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 10111352 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 10111516 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 10111544 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10112960 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 10113016 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 10113086 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 10113226 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 10113514 C A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 10113591 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 10113615 A T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 10113635 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 10113658 T G N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 10114005 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10114021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10114306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10114310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10114332 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 10114492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10114527 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 10114529 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 10114567 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 10114570 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 10114650 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10114708 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 10114964 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10114999 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10115071 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 10115249 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10115353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10115417 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10115487 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10115507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10115572 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 10115686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10115857 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 10116410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10116931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10117033 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10117086 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 10117088 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10117452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10117469 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10117493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10117515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10117547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10117565 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10117603 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10117610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10117619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10117645 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 10117667 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 10117790 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10117896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10117958 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10118046 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 10118131 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 10118231 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 10118252 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10118327 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 10118413 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 10118445 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 10118583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10118633 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10118731 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 10118752 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 10118763 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 10118771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10119060 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 10119075 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 10119133 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 10119210 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 10119252 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 10119258 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 10119358 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 10119514 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 10119806 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 10119933 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 10119974 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10120030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10120052 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 10120077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10120177 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10120513 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10120935 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 10121338 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10121389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10121447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10121468 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 10121486 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 10121643 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 10121652 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10121698 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10121705 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10121746 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 10121748 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 10121863 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 10121882 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 10121990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10122008 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 10122313 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10122564 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10122582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10123040 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 10123412 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 10123413 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 10123621 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 10123687 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 10124036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10124064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10124290 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 10124301 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 10124372 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 10124646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10124647 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 10124809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10124825 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10125072 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 10125417 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10126215 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 10126281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10126302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10126836 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10127087 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 10127141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10127287 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 10127593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10127595 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 10127627 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10127679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10127685 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 10128220 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10128268 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 10128285 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10128386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10128462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10129377 A T Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 10129419 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 10130622 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10130883 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 10130916 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10131019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10132234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10132282 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 10132302 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 10133779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10133838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10135538 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 10135620 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10135684 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 10135814 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 10135833 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10135895 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10136134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10136203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10136328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10136542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10136545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10136620 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 10136625 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 10136831 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 10136907 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 10136940 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 10136966 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 10136988 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 10136990 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 10137115 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 10137312 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 10137508 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 10137945 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 10137972 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 10137997 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 10138021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10138036 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 10138050 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 10138070 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 10138188 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 10138275 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 10138432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10139580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10139717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10139826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10139843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10139898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10140050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10140104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10140864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10140878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10140919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10140925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10141009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10141096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10141303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10141342 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10142577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10142917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10145849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10145948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10145964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10146069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10146279 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10146285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10146298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10146409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10146981 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10147028 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10147656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10147703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10147843 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10147888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10148780 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10148813 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 10148949 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10148956 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 10148992 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10149091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10149258 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10149464 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10149555 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10149659 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10149739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10150038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10150124 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10150528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10150938 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10150966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10151121 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10151146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10151147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10151321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10151589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10151631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10151645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10151681 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10152118 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10152351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10152445 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 10152563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10152567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10152621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10152723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10152794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10152934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10153009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10153105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10153279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10153464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10153473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10153508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10153901 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10154041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10154232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10154872 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10154887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10155301 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10155330 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10155490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10155622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10155660 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10155696 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10155740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10155809 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10155822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10155853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10155892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10155939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10155960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10155971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10156084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10156143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10156168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10156398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10156399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10156443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10156485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10156524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10156820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10158009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10158017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10158210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10158462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10158696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10158812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10158840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10159243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10159406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10159853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10159900 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10160064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10160121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10160346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10160484 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10161287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10161513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10161686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10161751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10162025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10162044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10162693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10162845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10162885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10162892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10162954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10162980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10163078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10163110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10163170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10163171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10163210 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10163292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10163295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10163342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10163385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10163445 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10163463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10163511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10163543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10163933 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10163937 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10164283 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10164335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10164404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10164436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10164512 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10164598 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10165205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10165233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10165247 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10165766 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10165893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10166229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10166428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10166543 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10166620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10166659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10166844 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10166854 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10166865 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10166956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10166976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10167006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10167136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10167218 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10167242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10167415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10167460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10167465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10167583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10167645 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10167707 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 10167719 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10167720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10167740 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10167748 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10167815 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10168022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10168087 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10168113 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10168169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10168224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10168415 A T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 10168427 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10168473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10168521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10168555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10168636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10168865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10169012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10169022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10169106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10169143 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10169188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10169289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10169358 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10169689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10169696 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10169776 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10169846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10169884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10169933 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10170079 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10170162 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10170187 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10170209 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10170229 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10170256 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10170282 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10170303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10170351 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10170355 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10170372 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10170446 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10170543 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10170617 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10171161 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10171175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10171204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10171344 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10171386 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10171964 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10172044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10172172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10172200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10172232 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10172238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10172319 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10172687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10173272 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10173481 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10173522 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10173565 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10173596 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10173656 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10173665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10173688 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10173836 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10173936 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10174029 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 10174456 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10174565 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 10174653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10175115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10175407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10175915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10175990 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10176539 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 10176686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10176813 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10176816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10176855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10176907 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10176911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10176940 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10176942 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 10176982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10176985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10177009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10177048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10177053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10177166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10177173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10177245 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10177249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10177273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10177419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10177463 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10177484 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10177504 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10177704 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10178008 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 10178014 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 10178427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10178428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10178474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10178911 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10178974 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10178997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10179054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10179128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10179214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10179235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10179244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10179256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10179408 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10179559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10179861 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 10179973 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10180040 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10180047 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10180326 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10180376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10180419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10180447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10180454 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10180879 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 10180926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10181175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10181290 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10181312 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 10181427 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10181944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10181949 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 10182092 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10182104 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10182121 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10182288 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10182446 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10183428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10183434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10183440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10183538 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10183696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10183959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10183962 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10183977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10184035 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10184085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10184152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10184179 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10184202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10184828 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10184891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10185188 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10185332 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10185397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10185420 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10185438 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10185484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10185717 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10185726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10187040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10187196 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10187660 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10187833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10188747 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10189203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10190322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10190763 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 10190807 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 10190816 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 10190991 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 10191689 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10192327 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10192343 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10192490 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 10192817 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10192828 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10193205 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 10193225 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 10193235 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10193479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10193707 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10193734 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10193806 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10193819 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10193841 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10193907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10194041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10194443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10194569 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10194575 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10194767 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 10194881 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 10194914 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10195375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10195428 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10195692 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10195726 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10195802 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 10195847 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10195849 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 10195872 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10195873 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10195899 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10195951 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10196015 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 10196018 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 10196054 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 10196127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10196180 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10196212 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10196312 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10196320 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 10196329 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10196367 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10196511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10196631 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10196705 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10196714 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10196729 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 10196826 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10196869 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 10196895 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10197010 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10197056 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 10197074 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 10197135 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10197136 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10197199 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 10197247 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 10197312 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10197683 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 10197703 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 10198416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10198991 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10199037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10199515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10199546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10199923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10199938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10200516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10201013 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 10201097 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10201173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10201213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10201657 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10201946 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10202018 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10202032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10202491 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 10202520 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10202535 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 10202588 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10202589 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10202599 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10202644 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10202802 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10202810 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10203044 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 10203255 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 10203286 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 10203314 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 10203323 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 10204247 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10204563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10204569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10204580 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10204638 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10204738 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 10205150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10205176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10205196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10205395 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10205682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10206071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10206446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10209104 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 10210587 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10210681 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10210684 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10210746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10211036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10215612 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10217417 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10218079 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10218097 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10218336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10218354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10218415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10218496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10218515 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10218520 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10218555 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10218618 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10218772 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10218944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10219001 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10219110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10219158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10219370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10220064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10220251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10220300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10221351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10221598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10222295 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10222476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10223677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10223805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10223838 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10223935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10224096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10225954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10226798 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10227166 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10229505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10230695 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 10230812 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10231029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10231124 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10232733 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10232770 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10232894 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10232933 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10232951 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10232955 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10233134 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10233140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10233255 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10233701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10233999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10235685 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10236562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10237143 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10237461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10237465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10237561 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10237572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10237651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10237677 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10238384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10238387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10238439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10239204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10239267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10239826 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10239828 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10239837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10239912 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10239924 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 10239995 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10240027 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10240137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10240178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10240268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10240301 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 10240302 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10240336 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10240343 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10240552 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10240634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10240708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10240724 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10240845 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10241897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10242040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10242568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10243121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10243182 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10243282 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 10243619 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 10243663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10243848 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 10243865 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10244501 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10245749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10246032 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10246906 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 10247011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10247465 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 10248317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10248319 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 10248559 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 10248576 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10248577 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10248647 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 10248766 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10248863 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10248871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10248887 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10248954 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10249120 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 10249134 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10249159 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10249189 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10249207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10249210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10249258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10249263 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10249427 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10249441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10249535 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10249547 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10249551 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10249648 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10249654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10249672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10249772 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10249823 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10250073 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 10250124 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10250206 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10250274 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10250529 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10250793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10250805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10250837 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10250842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10250898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10251043 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 10251143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10251288 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10251369 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10251404 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10251455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10251475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10251560 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10251594 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10251598 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10251678 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10251697 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10251799 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10252725 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10253584 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10253627 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 10253639 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10253760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10254379 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 10255619 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 10255684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10255714 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 10255819 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10256046 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 10256191 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10256270 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10256329 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 10256864 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10256959 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10257179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10257474 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10257909 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 10257923 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 10258138 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 10258607 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10258715 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10259275 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10259351 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 10259362 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 10259521 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 10259532 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 10259552 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10259585 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 10259892 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10260025 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 10260059 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10260668 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10260799 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 10261648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10263221 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10263241 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10265449 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10266394 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 10267692 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 10267807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10267874 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 10268041 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10268047 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 10268059 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 10268140 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10268238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10268275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10268709 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10270137 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 10270911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10271301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10271767 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10272131 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 10272442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10273352 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10273621 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10274129 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10274165 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10274979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10275110 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10275154 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 10275312 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 10275456 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10276645 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10276732 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10276891 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 10276940 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10277077 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 10277086 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10277206 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 10277523 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 10277531 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 10277682 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 10277718 C A N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 10277756 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 10277792 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 10277874 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 10278171 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10278190 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10278252 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10278261 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10278650 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10278705 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 10278846 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 10278848 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 10279018 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 10279027 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10279054 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 10279379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10279448 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10279471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10279539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10279548 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 10279592 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10279700 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10279736 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10279856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10279956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10280143 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 10280201 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 10280369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10281141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10281519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10281853 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10283888 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10284052 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 10284056 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 10284065 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 10284125 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10284129 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 10284198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10284417 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10284463 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10284521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10284606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10284952 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10285218 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 10285606 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 10285714 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 10285789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10286463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10286644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10287888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10288373 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 10292348 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 10292898 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10299052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10300779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10302367 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 10303304 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 10303438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10305435 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 10305766 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 10305925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10306110 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10306139 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10306297 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 10306356 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 10306545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10306853 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 10306875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10306948 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 10307024 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10307028 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10314630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10315248 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 10317818 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 10317970 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 10317989 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 10318100 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 10318274 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 10318337 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10318344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10318375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10318441 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 10318525 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 10318614 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10318653 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10318698 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10318786 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 10318799 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 10318805 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 10318844 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 10318931 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 10318965 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 10319016 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 10319030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10319751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10320257 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 10320407 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10320458 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 10320551 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 10320720 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 10320786 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10321190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10321671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10321701 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 10322310 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 2 10322379 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 10322407 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 10322668 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10322809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10322825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10322849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10323025 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10323051 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 10323070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10323156 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10323159 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10323392 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 10323549 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10323550 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 10323720 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 10323736 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 10323954 C T Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 10323957 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 10324149 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 10324214 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10324228 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10324303 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 10324311 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10324447 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 10324505 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 10324536 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 10324582 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 10324702 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10324716 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10324904 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 10325206 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 10325259 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 10325541 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 10326747 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 10326803 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 10326895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10327417 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 10327433 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 10327612 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 10328077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10328203 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 10329166 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 10329658 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 10329756 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 10330104 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 10330618 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10330659 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10331025 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10332041 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 10332337 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10332513 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10332557 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10332575 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 10332654 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10332708 C G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 10334561 T A Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 10334617 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 10334619 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 10335129 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10335211 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10335289 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10335352 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10335382 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10335591 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10336080 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10336081 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10336429 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 2 10336465 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 10336471 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 10337015 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 10337314 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10337531 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 10337560 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 10337564 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 10337666 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 10337740 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 10337742 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 10337754 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 10337916 C A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 10337976 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 10338071 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 10338182 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 10338239 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 10338419 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 10338711 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 10338753 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 10338920 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 10339017 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 10339082 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 10339172 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10339485 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 10339738 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 10339778 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 10340074 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 10340206 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 10340216 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 10340267 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 10340278 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 10340342 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 10340361 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 10340384 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 10340484 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 10340667 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 10340691 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 10340723 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 10340745 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 10340781 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 10340793 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 10340827 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 10340833 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 10340925 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 10341230 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 10341232 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 10341414 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 10341417 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 10341446 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 10341467 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 10341491 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 10341522 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10341555 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 10341931 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10341977 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 10342208 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 10342589 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 10342766 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 10342831 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 10343189 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 10343232 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 10343253 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10343289 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 10343320 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 10343506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10343567 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 10343869 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 10344010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10344045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10344110 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 10344285 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10344315 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10344474 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 10344634 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 10344854 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 10344909 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 10345009 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 10345044 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 10345203 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 10345215 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 2 10345288 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10345374 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10345575 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 10345580 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10345588 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 10345605 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 10345622 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 10345666 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 10345730 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 10345731 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10345906 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 10346073 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 10346087 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 10346173 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 10346438 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 10346696 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 10346790 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 10346877 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 10346893 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10346920 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10347011 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 10347023 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 10347120 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 10347482 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 10347507 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 10347718 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10347886 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 10348041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10348056 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 10348057 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 10348152 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10348317 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 10348318 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 10348524 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 10348705 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 10349533 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 10350191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10350453 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10351129 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 10351136 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 10351193 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 10351338 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10351489 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 10351512 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 10351513 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 10351596 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 10351653 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 10351663 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 10351883 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10351961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10352013 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 10352220 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10352637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10352670 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 10354291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10355690 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 10355956 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 10356654 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 10356686 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10356688 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10356719 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 10356741 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10356768 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10356788 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10356794 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10356823 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10357245 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 10357246 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 10357356 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10357388 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10357397 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10357411 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 10357444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10358026 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10358177 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 10358202 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 10358227 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10358339 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10358340 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 10358411 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10358629 G A Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 10358892 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 10358894 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 10358906 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 10359045 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10359420 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 10360608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10361123 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10362743 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10363333 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10364898 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 10365309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10365509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10365586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10365666 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 10366129 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10366300 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 10366384 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10366407 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10366422 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10366794 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 10367171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10367193 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10367313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10367892 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 10368076 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 10368110 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 10368462 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 10368766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10368784 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10369042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10369046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10369194 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 10369207 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 10369826 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 10369882 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 10370321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10370357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10371365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10372022 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 10372045 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 10372136 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 10373058 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10373148 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 10373830 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10374064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10374575 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10374785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10375838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10376269 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10376461 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10376640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10376971 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 10377060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10377412 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 10377441 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 10378159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10378919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10379212 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 10379400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10379576 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10379672 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 10382515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10382809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10384888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10386177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10395370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10397878 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 10397968 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 10398195 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 10399997 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 10400104 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10404475 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10420989 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10421011 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 10425698 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10426950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10432157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10434632 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10440370 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10442367 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10445385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10447246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10447320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10449544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10451190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10452700 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10454179 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10454303 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 10456448 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10456517 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10456563 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10456576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10456633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10456661 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10457077 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 10457084 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10457243 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10458431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10459046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10459081 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10459201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10459243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10459311 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10459327 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10459436 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10459443 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10459585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10459595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10459611 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10460785 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10460792 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10460797 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10461037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10461042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10461096 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10461113 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 10461164 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10461185 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 10461203 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 10461269 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10461338 G T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 2 10461606 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10461633 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10461667 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10461726 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10461756 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10461799 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10461873 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10462018 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10462201 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10462579 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10462614 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10462623 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10462977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10463475 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10463959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10464040 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10464336 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10467017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10468087 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10468738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10468779 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10468783 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10476817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10476850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10477156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10477158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10477248 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 10477273 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10477445 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10478397 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10478454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10478622 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10478749 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10479683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10479696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10479817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10479988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10480008 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 10480010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10480021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10480023 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 10480336 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10480380 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10481301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10481405 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10481442 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10481452 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10481493 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10481536 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10481777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10481779 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10482630 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 10482652 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10482754 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10482801 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10482865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10483248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10483347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10483448 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10483456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10483460 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10483467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10484032 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10484086 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10484170 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 10484524 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10486612 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10486839 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10487296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10487339 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10487393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10487448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10487496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10487770 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10487919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10488014 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10488019 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10488545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10489498 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10489562 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10489742 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10490188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10491262 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10492048 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10492577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10493737 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10493912 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10493944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10494081 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10494270 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10494294 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10494335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10494904 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10494928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10495057 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10496325 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10496468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10496644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10497350 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10497516 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10497716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10498337 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10498525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10500297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10500354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10501914 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10504332 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10504356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10504549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10504716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10505999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10507387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10507472 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10507610 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10508891 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10508972 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10509020 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10509031 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10511432 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 10512553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10513189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10514286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10515241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10515859 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10516183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10516552 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10519900 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 10520694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10521698 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 10521813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10522135 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10522425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10523468 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10523967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10524181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10524424 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10526288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10528271 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10528327 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10529286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10529300 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10530523 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10530578 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 10532258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10532572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10532630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10533019 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10533167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10533494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10538102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10538318 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10538625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10538956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10540878 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 10541611 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10541743 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10542287 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 10542359 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10542725 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10542867 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 10542927 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 10543232 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10543757 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 10543971 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10544434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10544483 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10545574 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 10545671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10546215 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 10546236 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10546557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10548125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10548720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10549536 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10550186 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10550228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10550263 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10550268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10550856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10550858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10551071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10551740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10551934 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10552150 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10552213 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10552235 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10552303 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10552471 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 10552487 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 10552656 T C Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 10552704 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 10552842 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10552962 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10553148 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10553348 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10553357 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10553880 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 10553968 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10554600 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10554618 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10554737 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 10554749 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10554836 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 10555374 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 10555460 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10556482 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10556653 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10556925 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 10557010 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 10557082 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10557215 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 10557238 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10557279 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10557578 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10557893 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 10558566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10558685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10558827 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10558861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10558891 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10559115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10559576 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10559697 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 10559922 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10559935 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10560565 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 10560804 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10560985 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10561183 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10561393 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10561419 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10561420 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10561582 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10561583 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10561673 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10561703 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10561707 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10561946 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10562557 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10562661 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10563178 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10563230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10563561 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10563591 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 10563986 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10564139 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10564154 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10564698 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10564805 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10564960 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10565031 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10565059 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10566776 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 10566896 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 10566910 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 10566921 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10566952 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10567099 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10567515 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10567557 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10567587 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 10567629 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 10567690 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10567785 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 10567844 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10567855 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10568062 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10568077 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10568166 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10568203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10568249 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10568749 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 10572469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10572584 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10572702 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10572859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10573522 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 10574350 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10574401 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10574892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10575226 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10575527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10575832 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10576160 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10576385 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10576507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10576512 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10576555 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10576588 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10576614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10577132 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10577199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10577733 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10577800 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10578501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10578622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10579169 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10579408 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 10579545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10580533 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10580546 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10580802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10581920 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10582084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10582086 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10582281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10582296 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10582301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10582338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10582364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10582482 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10582537 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10582545 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10582887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10584141 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 10584177 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10585041 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10585227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10585288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10585836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10587479 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10590996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10591279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10591920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10591983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10592291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10593379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10593518 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10594073 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10594404 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10594442 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10594723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10595890 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10597877 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10598924 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10600112 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10600362 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 10603462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10603484 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10604346 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 10605830 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10606268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10607864 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10608074 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10609441 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10609818 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10610016 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10611104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10611281 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10611358 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10611841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10612601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10612611 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 10612777 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10619844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10620493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10621050 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10621578 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10622141 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10623827 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10624965 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10625714 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 10626158 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10626246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10626707 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10629175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10629385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10629896 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10630247 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 10631154 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 10631428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10631704 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 10633044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10634028 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10634152 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10634376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10634494 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10634630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10634652 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10634744 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10634830 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10635119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10635735 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10636260 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10636851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10638380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10638586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10639004 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10639621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10639676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10639782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10640381 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10641894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10643663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10643702 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10644217 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10644340 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10646856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10648439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10649393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10650324 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10651162 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10651567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10651816 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10652304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10652316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10654248 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10654897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10657825 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10660781 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10661010 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10661025 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10661048 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10661110 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10661142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10661427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10661491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10662134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10662289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10662365 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10662602 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10662605 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10662747 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10662889 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 10662901 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10663187 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10663324 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10663404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10663638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10663895 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10664098 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10664140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10664701 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10664742 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 10664774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10664780 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10664816 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10664821 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10665017 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10666271 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10666378 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10666535 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 10666541 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 10666648 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 10666771 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 10667282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10668641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10668691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10668815 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10669575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10669657 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10670355 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10670652 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10671255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10671641 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10671689 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 10671833 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10671891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10672168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10672180 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10672344 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10672444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10673129 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10673192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10673237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10673426 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10673465 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10673570 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10674097 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10674223 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10674290 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 10674358 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10674426 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 10674558 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 10674569 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 10674609 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 10674614 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 10674998 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 10675042 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 10675046 G T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 10675093 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 10675117 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10675136 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10675244 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10675298 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10675364 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10675369 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10675420 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10675494 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10675594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10675760 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10675830 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10675916 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10676015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10676403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10676590 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10676855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10676886 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10677314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10677609 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10678021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10678222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10678269 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10678532 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10678875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10678984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10678998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10679002 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10679127 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10680248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10680509 G C Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 10680706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10681475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10681479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10681497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10681571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10681859 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10683729 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10683762 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10683763 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10684059 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10684071 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10684239 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10684408 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10684804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10685123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10685376 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10685458 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10685633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10685666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10685670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10685802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10685813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10685888 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10686057 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10686095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10686127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10687247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10687393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10687511 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10687548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10687594 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10687595 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10687632 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10688703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10690739 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10691416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10692073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10692210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10692718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10693489 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10693548 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10693554 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10694307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10695057 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10695489 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10696166 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10697026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10697500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10697544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10697592 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10697630 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10697639 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10697688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10697707 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10697777 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10697816 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10697863 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10698151 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10698232 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10698385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10698848 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10699082 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10699158 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 10699394 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10699450 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10699515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10700135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10700555 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10700881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10701266 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10701588 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 10701653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10701937 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10701944 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10702065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10702079 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10702181 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10702581 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 10702595 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10702630 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10702763 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10703023 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 10703156 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10703603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10703689 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 10703992 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 2 10704021 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 10704137 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10704166 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10704300 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10705019 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10705217 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10705511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10705545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10705669 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10705694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10705700 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10705936 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 10706004 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 10706033 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 10706314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10707044 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 10707271 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 10707365 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 10707548 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 10707615 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 10707649 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 10707802 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10707926 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 10708158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10708382 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10708761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10708818 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10708879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10708961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10709091 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10709496 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10709863 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10709892 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10709952 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10709967 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10710024 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 10710187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10710188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10710264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10710319 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10710433 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10711905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10714641 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10714803 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10714982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10716011 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10718120 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10719647 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10720488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10720542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10720669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10720717 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10722183 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10722214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10724237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10724334 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 10724498 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 10725448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10725487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10725985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10727017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10730781 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10730877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10730955 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10731002 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10731361 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10731837 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 10731855 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10732134 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10732151 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 10732274 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10732599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10732687 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10734083 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10734474 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10734522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10734657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10735099 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10735604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10736465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10736586 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 10737802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10737832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10737925 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10738041 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10738056 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10738083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10738109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10738153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10738225 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10738451 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10738533 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10738623 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10738697 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10738763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10738765 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 10738782 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10738841 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10738871 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10738890 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10739216 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10739277 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10739519 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10739552 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 10739564 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 10739570 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 10745683 T C N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 2 10745684 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 2 10745764 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 10745776 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 10746159 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 10746163 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10746194 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10746223 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 10746541 G T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 10746548 T G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 10746559 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 10746929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10747576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10747788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10748133 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10748170 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10748468 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10748522 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 10748537 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10748582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10748761 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10749056 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10749103 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10749239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10749535 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10749567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10749733 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10749802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10749811 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10750178 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10750341 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10750431 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10750510 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 10750612 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10751070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10751394 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10751433 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10751458 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10751470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10751657 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 10751816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10751828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10751920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10751945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10751973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10752171 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 10752469 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 10752515 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10752541 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10752995 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10753240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10753339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10753358 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10753581 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10753919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10754016 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 10754304 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10754341 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10754724 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 10754839 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10754953 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10754966 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10754974 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10755198 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10755202 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10755504 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10756540 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10756558 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10756630 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10756695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10756797 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 10756859 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 10756981 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10757080 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 10757115 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10757216 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10757289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10757410 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10758514 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10758559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10758837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10759134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10759173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10759181 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10759292 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10759475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10759935 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 10759936 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 10760000 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10760462 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10760464 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10760499 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10760522 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10760721 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 10761192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10761316 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10761366 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 10761397 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10761433 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10761647 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 10761686 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10761772 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10761913 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10761926 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 10762851 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 10763174 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10763924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10763953 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10764056 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 10764057 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 10764227 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 10764272 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 10764752 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 10765373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10766436 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10766668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10767440 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10767870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10768628 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10768633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10768863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10770381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10770557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10770559 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10770707 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10770983 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 10770990 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10771036 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10771113 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10771114 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10771134 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10771140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10771207 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10771227 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10771258 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10771351 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10771364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10771371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10771465 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10771482 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10771516 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10771747 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10771777 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10771867 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10771931 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 10772336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10773617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10774298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10775099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10775493 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 10775837 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 2 10776478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10776904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10777083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10777085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10778698 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 10778727 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10778733 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 10778770 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 10778793 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 10778794 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 10778823 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 10778846 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 10778864 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 10778881 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10778898 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10778940 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10779213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10781920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10781970 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10783156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10783346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10787080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10787382 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10788395 G A Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 10788401 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 10790706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10790768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10790770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10790895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10791607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10791625 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 10792057 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 10792402 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10792467 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10792479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10792492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10792567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10792575 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10792838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10792924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10793118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10793408 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10793495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10794313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10794324 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10795634 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 10795655 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10795674 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10795696 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10795854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10797667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10797674 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10797804 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10797941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10798259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10798572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10798746 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10798836 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 10798846 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 10798870 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 10798891 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 10799250 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 10799273 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 10799296 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 10799348 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10799601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10799646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10799695 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 10799702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10799758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10799759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10799820 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10799856 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10800211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10800453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10800492 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10800621 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 10800722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10800847 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10800891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10801699 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10802048 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 10802502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10802645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10802859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10802962 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10803038 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10803130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10803257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10803493 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 10804309 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 10804561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10804716 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 10804884 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 10805653 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 10805958 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 10806357 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10806695 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 10806699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10806799 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 10807183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10807191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10807380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10807477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10807479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10807492 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 10807529 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 10807622 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 10807629 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10807657 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 10807664 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 10807696 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10807905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10807917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10807932 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10807946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10807990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10808000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10808117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10808231 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10808257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10808503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10808564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10811695 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10811725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10811901 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 10812000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10812096 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10812107 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 10812193 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10812419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10812539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10812562 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10812766 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 10812772 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 10812833 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10812936 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10812946 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10813178 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 10813211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10813232 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10813247 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 10813467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10813558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10813778 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 10813801 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 10813990 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10814001 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 10814149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10814178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10814280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10815565 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 10815594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10815616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10815648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10815680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10815786 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10815964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10816374 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 10816745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10816807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10816860 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 10816939 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10817038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10817167 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 10817252 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 10817300 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 10817948 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 10818720 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 10818965 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10819376 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10819403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10819916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10820376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10820978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10821293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10822338 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10823474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10823504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10823509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10823977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10824207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10824317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10824679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10824827 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10825365 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 10825386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10826106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10826261 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10826400 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10826608 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 10826690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10826807 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 10826991 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 10827065 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10828322 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 10831838 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 10832728 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 10832849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10832945 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10832959 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 10833090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10833152 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10833475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10833596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10834262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10834589 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10834784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10835135 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10835902 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 10836307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10836786 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10837215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10837283 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10837293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10837298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10837312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10837392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10837410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10837841 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10838815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10839143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10839327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10839473 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10839544 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10839834 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 10839840 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 10841340 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10841613 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10841673 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10841853 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 10841857 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10841872 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 10842715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10842819 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 10843132 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 10843178 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 10843754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10843793 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 10843853 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10844389 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 10844584 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 10844767 G C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 10844810 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 10845470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10845899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10846162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10846506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10846960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10847116 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10847790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10847937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10849197 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 10849602 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10849722 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10849734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10849944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10850034 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10850356 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10850385 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10850577 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10850588 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 10850873 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 10853234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10853791 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10853976 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10854198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10855419 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10858372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10858830 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10861852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10862892 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10863001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10864669 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10866471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10866474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10866643 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10866647 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10867176 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 10867496 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 10867614 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10867621 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10867638 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 10867639 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 10867692 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 10867770 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10867833 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10867954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10867975 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10867996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10868254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10868297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10868325 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 10868355 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10868579 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10869795 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 10871497 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 10872087 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 10877010 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 10877428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10878309 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10881928 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10883176 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10885455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10885506 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 10885661 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 10885874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10890677 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10891081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10892418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10892613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10893954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10895775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10896238 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 10896445 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 10896516 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10896533 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 10896542 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 10897174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10897417 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 10897611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10897806 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 10897816 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 10898064 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 10898129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10898135 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10898153 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 10898248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10898267 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 10899079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10899203 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10899461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10899679 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 10899743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10900065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10900885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10901051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10901312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10902058 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10903272 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10905188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10905989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10907227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10907628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10907679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10908107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10909932 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10910316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10910903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10913724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10917488 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 10918191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10919303 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10919646 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10919659 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10919663 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10919688 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10919784 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10919890 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 10920199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10921227 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10921391 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 10921432 G C N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 10922027 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10922050 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 10922056 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10922131 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10922136 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10922289 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10922682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10922744 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10922756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10922784 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10922880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10923262 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 10923360 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 10923389 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 10923431 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 10923474 T A N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 10923535 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 10923657 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 10923681 G T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 10923945 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10924005 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10924246 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10924247 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10924399 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10924742 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10924801 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10925736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10925763 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10925778 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 10926026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10926032 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 10926039 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 10926077 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 10926089 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 10926111 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 10926131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10926423 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 10926447 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 10926449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10926741 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 10927073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10927443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10927473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10927560 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 10927673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10927969 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10928290 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10928402 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10928550 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 10928646 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10928754 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10928826 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 10928966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10929055 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 10929338 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 10929449 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10929466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10929665 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10929678 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10929694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10930619 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10931018 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10931231 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 10931357 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 10931418 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10931611 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 10931651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10931841 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 10932604 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10933174 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10933401 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10933463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10933464 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10933601 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10933850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10933921 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 10933968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10934097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10934426 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 10934833 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 10936999 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 10938169 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 10940480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10942938 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 10944465 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10950132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10950273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10950758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10952009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10952519 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 10953163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10953253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10954098 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10954475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10954500 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10955045 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10955097 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 10955212 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 10955258 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 10955294 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 10955514 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 10955522 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 10955602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10955731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10955733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10955780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10956334 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10956697 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10956859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10957196 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10959879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10960792 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10961522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10963640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10964969 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 10965847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10966198 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 10966819 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 10967034 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10967451 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10968556 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 10968855 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10969381 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10969512 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10970505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10971943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10975186 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 10975224 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 10975458 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 10976256 A G Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 2 10979011 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 10979349 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10979537 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10979906 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 10980666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10980865 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 10980945 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 10980982 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 10981068 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 10981965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10982006 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 10982171 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 10982191 C T Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 10982372 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10982457 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 10982686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10982874 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10983603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10984725 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 10984929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10985033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10985221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10985825 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 10986780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10991167 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10993439 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 10996468 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 10997334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10997520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 10998273 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10998863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10999113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10999371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 10999589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 10999792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11001216 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11003015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11003663 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 11004163 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 11004220 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 11004250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11004471 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 11004571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11004599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11004721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11004806 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 11006200 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11006311 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11007122 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11007994 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 11008017 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 11008138 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 11008159 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 11008307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11008363 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 11008428 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11008612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11008743 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 11008758 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 11008849 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 11009104 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 11009173 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 11009189 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 11009226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11009266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11009287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11009293 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 11009327 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 11009441 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11009519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11009972 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11010020 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 11010238 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 11010378 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 11010487 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11010566 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 11010578 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 11010634 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11010645 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11010691 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11010708 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11010765 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11013924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11014154 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11015163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11017340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11017386 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11017436 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 11017505 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 11017508 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11017804 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 11017817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11017915 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 11018025 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11018038 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11018060 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 11018108 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 11022856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11031732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11032787 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11034292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11034294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11034309 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11034705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11034933 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11034939 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11035274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11036332 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11037326 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 11038266 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11038453 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 11039711 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11040058 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 11040877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11041394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11041636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11042333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11051610 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11051884 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11052899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11057702 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 11058025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11059468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11062262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11064884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11065631 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11065840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11066258 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11066370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11066916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11067005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11067052 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 11067150 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11067203 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11067225 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 11067384 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11067569 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 11067680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11068027 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 11068565 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 11068678 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 11068690 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11069074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11069218 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 11069769 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 11070120 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11070165 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11070367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11070597 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11070708 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11071067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11071096 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11071200 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11071505 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11071738 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11071755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11071841 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 11071920 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 11072025 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 11072438 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11072483 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11072581 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11072736 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11072979 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 11073011 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11073105 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 11073137 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11073140 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 11073205 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 11073206 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 11073246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11073251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11073289 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11073295 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11073312 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11073313 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11073382 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11073464 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11073468 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11073587 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11073733 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11073764 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11073788 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11073989 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11074126 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 11074200 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 11074264 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11074399 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 11074752 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 11075217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11075997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11076083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11076189 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11077487 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11078055 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11078339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11078450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11080042 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11080047 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11080336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11080356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11083360 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11083371 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11083613 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11083614 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 11083848 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11083861 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11084217 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 11084251 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11084268 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 11084284 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11084393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11084403 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 11084445 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 11084466 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 2 11084569 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 11084574 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 11084624 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 11084721 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11086934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11086957 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11086965 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11087000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11087231 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11087236 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11087277 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11087320 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11087435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11087498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11087714 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11087720 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11087968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11088442 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11088963 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11089174 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11089444 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 11089656 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 11089742 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11089853 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11090134 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11090158 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11090216 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11090284 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11090346 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11090353 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11090385 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11090492 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11090784 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11091056 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11092366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11092478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11092988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11093556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11094960 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 11095274 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11096060 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11096069 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 11098578 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11099332 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11100711 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11101145 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11101521 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 11101719 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 11103023 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11103086 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11103952 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11103968 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11103978 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11103980 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11104097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11104228 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11104364 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11105096 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 2 11105292 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11106007 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 11106186 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 11106199 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 11106204 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 11106546 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11106629 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11106681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11108052 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11108163 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11108243 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11108292 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11109180 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11109418 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11114008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11114993 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11116035 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11116743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11117239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11118752 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11119108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11120881 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11120960 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 11121960 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 11123501 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 11124695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11124710 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 11124754 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11124857 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11125008 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11125233 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 11125537 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 11125852 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11125968 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11126102 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 11126513 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11126576 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11126734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11126896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11126945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11126947 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11126964 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11126989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11127031 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11127059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11127137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11127184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11127318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11127334 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11127512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11128428 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11129247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11129337 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11129578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11129616 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11129637 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11129866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11130024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11130078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11131093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11131507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11132143 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11132200 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 11132455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11132690 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11133023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11133153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11133617 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11133627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11133742 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11133768 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11133777 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11133973 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11134198 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11134239 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11134241 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11134455 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11135226 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11135332 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11135453 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11135501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11135644 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11135664 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11135696 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11135757 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11135971 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11136032 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11136213 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 11136423 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 11136562 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11136772 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 11136805 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 11136900 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11137066 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11137160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11140190 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11140459 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11141206 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11141240 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 11141256 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11141471 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 11141581 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11143389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11144278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11144302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11144881 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11145706 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11146999 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11147397 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11147453 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11148633 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 11148677 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11149391 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 11151073 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11151256 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11151289 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11151554 C G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 11151959 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11152012 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11153295 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11154114 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11154164 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11154638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11154875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11154947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11155596 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11155904 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11156680 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11157873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11158038 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11159327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11159495 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11159576 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11159780 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11159815 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11161965 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 11162600 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11162788 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 11162927 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 11163695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11163877 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11164767 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11164823 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 11164847 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11164851 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11164876 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11164943 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 11164997 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 11165006 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 11165054 C T Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 11165113 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11165422 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11165611 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11165724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11166014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11166243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11166482 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11166699 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11166703 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11166773 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11167413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11167432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11167456 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 11167481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11167558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11167566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11167591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11167636 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11167684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11167698 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11167712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11167852 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11167908 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11167910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11167950 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11167971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11167983 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11168025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11168032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11168053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11168763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11169537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11170622 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11171336 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 11171876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11175198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11175243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11179032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11179852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11181319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11182291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11184405 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11186053 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11186271 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11186451 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11186559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11187457 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 11189042 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11189567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11189602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11190226 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 11191302 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11191733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11191965 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11191966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11192130 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 11192319 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11192416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11192979 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 11193041 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11193076 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11193295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11193322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11193648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11194444 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11194735 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 11194748 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 11195243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11195299 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 11195456 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 11195462 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11195470 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11195534 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11195566 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11195567 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11195603 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11195643 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11196508 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 11196847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11196991 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11197547 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 11198449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11198901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11199225 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11201188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11201200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11201537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11201600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11201808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11201826 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11201832 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11201895 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11202094 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11202134 A T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 2 11202270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11202735 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 11202780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11202826 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 11202886 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 11202891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11202917 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11203286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11203434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11203489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11203522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11203590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11203769 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11203801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11203998 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11204039 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11204040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11204510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11204536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11204763 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11204769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11204827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11204971 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 11205056 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11205063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11205274 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11205291 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 11205324 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11205343 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11205535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11205618 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 11205788 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11205912 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 11205965 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 11206203 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11206238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11206399 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 11206470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11206597 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11206989 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11207008 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11207084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11207131 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11207324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11207352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11207556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11207633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11207640 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11207729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11207741 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 11207763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11207906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11207960 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11208319 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11208696 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11208906 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11209026 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 11209046 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 11209081 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 11209214 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 11209345 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11209476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11210340 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11210488 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11210690 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 11211192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11211220 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11211364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11211454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11211505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11211539 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11211562 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11211567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11212326 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11213806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11213823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11213840 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11213887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11214211 T C Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 11214448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11214509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11214815 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 11214887 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11214913 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11214917 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11215182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11215703 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11215705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11215747 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 11216172 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 11216192 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 11216275 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 11216547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11216581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11217320 A C Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 11217336 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11217340 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11217356 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11217398 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11217411 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11217438 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11217865 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11217887 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11218025 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 11218162 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 11218336 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 11218779 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11218788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11219320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11219334 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11221529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11221970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11224301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11226941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11227195 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 11227221 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11227337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11227342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11227350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11227413 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11227423 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11227429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11227527 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 11227533 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11227599 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11227647 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 11227699 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11227730 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11227783 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11227812 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 11228022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11228081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11228168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11228180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11228508 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11228549 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11228625 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11228825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11229244 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11229709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11232254 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11232439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11234791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11235679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11235917 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11240780 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11243892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11244647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11246306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11246472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11246551 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11246659 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 11247089 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11248385 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11249035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11249094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11249109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11249185 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11249235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11249273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11249370 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 11249384 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11249631 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11249938 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 11250270 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11252065 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11253654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11253689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11254407 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11255729 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 11257626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11257660 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11258389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11258443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11261611 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 11261876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11261907 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11263588 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11266088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11268849 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11270161 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 2 11277359 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11277422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11277807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11278103 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11283932 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11286993 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11289875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11290823 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11294879 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11296395 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11300029 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11300457 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11304168 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11306304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11306663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11307138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11307408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11307898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11307965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11308047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11312526 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11312754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11318379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11321770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11322470 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 11323780 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 11324235 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 11324241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11327781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11328108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11329460 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 11334533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11335066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11335160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11335500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11337379 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11337631 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11337651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11337687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11337811 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 11337882 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11339422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11339864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11340583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11340971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11341118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11341310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11341322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11341338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11341430 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11341440 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11341457 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11341515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11341590 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11341615 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11341625 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 11341645 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11341648 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11342047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11342058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11342064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11342087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11342140 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11342789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11342810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11342816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11342850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11342871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11342973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11343380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11343606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11343717 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11343912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11344416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11344954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11344969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11345059 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11345061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11345403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11345594 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11347456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11347743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11347826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11350698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11350721 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11352174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11355501 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11355528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11355532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11356808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11357689 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11358939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11359020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11361019 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11361379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11361905 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 11362333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11365661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11366009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11366553 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11369251 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11371986 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11373311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11373442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11373454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11373509 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 11373794 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11377378 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 11380214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11380667 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 11381014 T G Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 11381255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11382355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11382464 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11382692 A G Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 11383269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11383844 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11385297 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11385365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11385373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11385376 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11385391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11385629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11385788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11387478 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11388823 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11394614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11395126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11396397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11396417 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11399325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11400880 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11402369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11402431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11403718 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11403757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11403829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11403921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11403935 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11404407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11404431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11404440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11404450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11404523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11404764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11404918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11404996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11405011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11405730 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11405758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11405812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11405952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11406530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11406572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11406619 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11406673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11406788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11407149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11408258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11408921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11409426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11409505 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11409697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11411004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11411521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11411523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11411566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11411610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11411641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11412963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11413331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11413518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11415402 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11417038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11417914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11418591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11420449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11420704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11421262 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11421731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11421881 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11422075 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 11422892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11423909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11424166 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11427375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11431444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11431528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11431735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11434259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11434389 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11434665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11436414 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11436666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11436971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11439825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11439930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11440088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11440463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11440480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11440683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11440718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11440719 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11440833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11440930 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11441081 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11441121 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11441676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11441703 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11441705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11442347 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11442520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11442521 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 11443385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11443393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11444952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11445520 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11445526 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11445553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11446433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11448183 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11448290 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11449494 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 11450241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11453324 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11453465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11453513 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11453519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11453661 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11454969 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11455145 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11455240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11455383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11455423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11455838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11455840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11455925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11455975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11456024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11456035 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11456046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11456286 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11456308 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 11456365 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11456406 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11456581 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11457605 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 11457749 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11457823 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11458937 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11459292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11459316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11459326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11459335 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11459401 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 11459423 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 11459680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11459681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11459918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11459922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11459991 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11460189 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 11460660 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11461066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11461559 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 11461731 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11461755 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11462464 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11464161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11464324 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11464671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11464712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11464714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11464893 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 11464905 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11464959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11464962 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11465060 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11465083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11465093 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11465272 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11465403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11465444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11465527 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11465573 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11465816 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11465843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11465953 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11466592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11466706 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11466766 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11466809 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11466841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11466907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11467143 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11467191 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11468071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11468716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11468993 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 11469875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11470220 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11470532 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11470807 G T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 11470811 G T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 11471015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11471166 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11471172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11471358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11471460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11471471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11471476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11471499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11471848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11472043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11472126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11472294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11472352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11472614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11472933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11473019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11473058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11474349 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11474627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11476048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11476169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11476272 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11477140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11477439 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11477526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11477555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11477840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11479038 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11479460 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11479584 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11480245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11480324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11480690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11480851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11480978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11481108 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11481597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11481813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11482022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11482036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11482666 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11484118 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11484272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11485057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11485698 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11485937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11486274 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11487215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11487748 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11488050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11488346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11488963 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11488980 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11489054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11489269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11489669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11490147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11490643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11490832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11490860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11490865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11491054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11491078 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11491089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11491112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11491303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11491314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11491464 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11491560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11491576 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11491594 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11491627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11492074 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11492160 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11492182 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 11492185 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11492990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11493333 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11493512 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11493571 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11493682 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11493683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11494114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11494361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11494426 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11494971 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11496273 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11496291 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11496590 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11496664 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11496734 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11496748 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11496981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11497441 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 11497454 A C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 11497606 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11497666 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 11498054 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11498209 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11498213 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11498533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11498543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11498566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11498768 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11498851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11498959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11499082 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11499446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11499507 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11499708 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11499735 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11499891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11499906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11500012 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11500159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11500213 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11500259 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11500566 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11500959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11501490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11501534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11501554 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11501588 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11501595 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11501920 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 11501953 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11502084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11502758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11502778 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11502816 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11502849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11502850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11502957 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11503547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11503704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11503952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11504069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11504110 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11504332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11504377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11504992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11505379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11505548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11505724 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11505792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11505826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11505904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11505963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11506234 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11506567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11506741 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11507010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11507715 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11507788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11508034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11508122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11508329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11508400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11508473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11508827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11508920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11511198 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11511422 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11511956 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11512755 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11513400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11513587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11514002 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11514271 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11514366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11514389 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11514886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11517514 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11517786 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11519060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11519192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11520018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11520588 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11520613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11520680 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11520699 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11520703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11520775 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 11520886 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11521824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11523317 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11523391 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11523432 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11523582 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 11523763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11524126 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11524276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11524487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11524665 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 11526213 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11528276 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11531713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11532200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11534576 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 11535623 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 11541705 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 11542654 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 11543363 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11543558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11544649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11544665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11544711 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 11546206 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11546860 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 11547556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11550490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11553321 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 11553529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11553534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11553753 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11554080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11554540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11556578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11556671 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11556893 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 11556894 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 11557002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11557189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11558071 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11558108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11558185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11559166 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11559488 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 11559602 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 11559710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11559745 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11559833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11563860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11564705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11565365 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11565601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11566440 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11569628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11572220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11573708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11574019 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11574030 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11574080 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 11574082 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 11574964 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11575110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11575115 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 11576288 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11577478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11578480 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11579208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11580221 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 11581371 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 11581396 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11581541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11581568 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 11581578 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11581623 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11581654 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11582156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11582343 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 11582410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11582640 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 11582656 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 11582736 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 11582760 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 11582773 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 11582783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11582867 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 11583060 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 11583120 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 11583278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11584586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11584846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11584880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11585009 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 11585187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11585255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11585950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11586270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11586479 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 11586533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11586582 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 11586831 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 11587058 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 11587096 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 11587161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11587507 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11588214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11588257 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11588664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11588711 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 11588973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11589018 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 11589666 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 11589754 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11589819 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11589824 T C Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 11589960 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 11589975 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 11590013 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11590041 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11590981 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11591092 T C Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.153846153846154 0.692307692307692 0.153846153846154 13 13 2 9 2 2 11591202 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11591362 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11591405 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11591870 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11592153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11592302 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 11592347 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 11592902 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 11592991 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 11593573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11595032 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11595364 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11597209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11598309 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 11598319 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 11598706 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11598934 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11599308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11599373 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 11599551 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11599697 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 11599810 T A N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 11600456 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 11600627 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 11600730 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 11600830 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 11600848 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11600868 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 11601036 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11601054 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11601079 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11601120 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 11601135 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11601138 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11601191 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11601604 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11602239 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 11604539 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11604622 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11604711 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11604734 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11604743 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11604900 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11605587 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 11605611 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11605618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11605658 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 11606320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11606404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11606572 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 11606823 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 11606913 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 11607783 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11608163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11608253 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 11608257 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11608385 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11608389 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11608439 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 11608459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11608479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11608665 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11608758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11609585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11609819 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 11609972 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11611345 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11611373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11611528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11611559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11611580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11611609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11611674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11611848 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11611849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11611860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11611978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11612002 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11612024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11612025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11612273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11612280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11612291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11612309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11612558 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11612588 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11612605 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11612738 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 11612754 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11612859 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 11612944 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 11613476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11613685 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11613905 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 11613970 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11615178 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11615335 T A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 11615380 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11615437 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 11615472 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 11615485 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 11615585 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 11615655 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11615985 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11616518 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11616537 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11616841 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11617033 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11617155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11617511 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11617572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11617658 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11617669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11617693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11617745 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11617790 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11617860 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11617954 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11618342 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11618543 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11618564 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 11618567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11618614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11618701 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 11618702 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 11618732 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 11618742 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 11618758 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 11618812 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11618845 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 11618868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11618896 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11618989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11619058 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11619099 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11619210 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11619266 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 11619279 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 11619290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11619523 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 11619555 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 11619569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11619580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11619694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11619720 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 11619758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11619822 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11619837 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11620040 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 11620090 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11620166 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11620230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11620382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11620400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11620562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11620568 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 11620601 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11620634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11620700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11621007 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 11621995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11622264 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11622367 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 11622410 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 11622417 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 11622499 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11622519 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11622556 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 11622560 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 11622577 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 2 11622630 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 2 11622859 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11622947 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 11623017 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11623068 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11623293 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 11623335 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 11623371 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 11623656 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 11623875 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 11623915 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 11624040 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 11624059 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11624109 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 11624198 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11624203 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11624226 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 11624233 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11624261 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 11624407 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11624464 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 11624736 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11624738 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11624748 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11624797 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11624799 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11624988 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 11625042 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 11625056 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11625085 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11625332 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 11625531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11626197 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11626588 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11626628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11627159 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11627392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11627624 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11627672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11627683 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11627866 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11627928 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11628141 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11628217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11628268 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11628299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11628428 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11628452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11628495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11628528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11628735 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 11628840 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11628853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11629076 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 11629154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11629158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11629240 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11629297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11629324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11629359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11629367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11629463 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11629492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11629507 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11629519 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 11629629 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11629713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11629728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11629751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11629769 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11629996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11630095 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11630607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11630682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11630734 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 11630848 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11630867 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11630990 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11631056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11631252 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11631259 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11631264 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11631276 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 11631767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11631867 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11632042 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11632067 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11632100 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11632279 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 11632300 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11632423 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 11632432 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 11632452 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11632496 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 11632658 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 11633067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11633303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11633321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11633842 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11634119 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11635388 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 11635930 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11636477 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 11636607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11637419 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 11637515 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 11638451 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11638460 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 11638501 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 11638560 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 11638575 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 11638633 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 11638702 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 11639096 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11639260 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 11639283 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 11639617 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 11639815 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 11640635 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11640838 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11640915 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11641100 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11641138 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11641251 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11641348 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 11641723 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 11641764 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 11642171 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 11642201 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 11642234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11642446 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 11642726 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11643103 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 11643150 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11643555 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11643728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11643927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11644380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11644399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11644478 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 11644516 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11646189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11646438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11649606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11652597 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11652700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11654468 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11655078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11656473 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 11657447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11658423 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11658854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11660208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11660574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11661156 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11661291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11661446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11663897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11666363 G C Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 11666505 A G Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 11666935 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 11670330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11672926 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 11673250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11675007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11675735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11675741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11676096 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 11676098 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 11676112 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 11676220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11676250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11676273 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11676274 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11677117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11677993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11678207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11678924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11681146 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11683406 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11684070 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11692747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11692991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11693177 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11696926 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11699168 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11700801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11701759 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11703479 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11704529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11704580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11704924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11705340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11705871 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11706076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11706274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11706338 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11706522 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 11706803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11709120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11709170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11709342 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 11709380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11709583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11709614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11709639 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11709648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11709680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11709736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11709742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11709936 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11709944 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11709957 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11709995 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11710062 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11710693 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 11710710 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 11710762 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11710777 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11711780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11712310 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 11712484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11712488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11712553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11712591 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 11712719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11712822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11712842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11712889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11712977 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 11713006 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11713040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11713379 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11713504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11713566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11714183 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 11714349 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 11714468 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 11715255 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 11715265 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 11715276 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 11715299 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 11715627 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11715794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11716197 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 11716212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11716276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11716419 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11716992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11717487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11717534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11717539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11717763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11717813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11717939 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11717976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11718246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11718407 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 11718424 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 11718509 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11718600 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 11718671 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 11718757 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 11718797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11718842 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 11719059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11719131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11719136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11719191 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 11719228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11719477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11720291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11720355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11720395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11720630 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11720673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11720736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11725979 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 11727428 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 11729736 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11732922 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11734554 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 11734558 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 11735238 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11744193 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 11745187 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11747469 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 11747756 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 11750275 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 11751739 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 11752508 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11753762 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11760961 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 11761479 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 11761885 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11764543 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11768739 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11769527 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 11769816 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 11771145 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11771252 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 11771697 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11772388 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 11774072 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11774340 C G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11774381 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11775287 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 11775993 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 11776519 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 11777275 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11777323 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 11779214 C T Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 11779403 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11780231 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11781205 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 11781299 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 11786676 G T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 11786747 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 11786815 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 11787495 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 11787742 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 11787750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11787898 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 11787945 A C N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 2 11787982 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 11787996 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 11791097 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11791451 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11791632 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 11791905 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 11791951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11792398 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 11792416 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11792436 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 11792439 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11792766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11794484 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11795557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11795769 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 11796752 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 11799539 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 11799912 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 11803087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11806143 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11807235 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 11807693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11808467 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11809144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11810048 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 11810080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11811489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11812101 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11812655 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11815526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11816117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11818190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11818420 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 11820081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11820255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11820495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11820566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11821138 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 11821141 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 11821542 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 11821591 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11821807 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 11821928 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 11821936 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11821970 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11821990 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 11822029 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11822083 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11822101 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 11822290 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11822320 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11822402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11822579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11822623 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11822714 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11822719 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11822767 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 11822794 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 11822999 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 11823000 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 11823037 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 11823051 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 11823067 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 11823096 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 11823225 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 11823286 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 11823290 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 11823403 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 11823516 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 11823538 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 11823823 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 11823912 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 11823958 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 11824131 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 11824635 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11824960 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 11824989 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11825010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11825016 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11825025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11825173 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 11825183 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11825190 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 11825420 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 11825436 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 11825452 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 11826064 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11826073 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11826153 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 11826221 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 11826227 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11826242 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 11826273 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 11826485 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11826486 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 11826698 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 11826712 T A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 11826858 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11828247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11828285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11828676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11828758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11828916 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11828990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11829153 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11829237 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 11829239 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 11829294 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 11829303 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 11829419 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 11829439 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 11829486 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 11829496 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 11829566 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 11829583 T G N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 2 11829606 G T N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 11829646 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 11829650 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 11829778 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 11829864 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 11829892 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 11829894 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 11829907 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 11829929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11830040 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 11830044 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 11830273 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 11830294 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11830309 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11830315 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11830344 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 11830357 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11830560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11830581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11831261 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 11831547 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11831555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11831583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11831688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11831752 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 11831762 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 11831854 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 11831862 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 11832175 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 11832324 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 11832359 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11832684 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 11832776 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11833116 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 11833463 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11833572 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 11833730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11833884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11833963 G T N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 11834029 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 11834157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11834187 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 11834191 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 11834258 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 11834265 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 11834367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11834435 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 11834656 C T Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 11834745 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 11835484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11835653 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 11835685 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11835726 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11835759 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11835801 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11835816 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11835826 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11836068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11836129 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 11836200 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 11836414 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 11836518 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 11836667 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 11836704 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 11836707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11836860 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 11836934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11836978 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 11837145 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 11837255 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11837291 A C N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 11837321 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 11837496 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11838171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11838211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11838218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11838325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11838542 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 11839479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11839581 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11839588 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11839623 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11839683 T G N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 11840701 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11840728 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11840735 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11840747 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11840763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11840845 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11840874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11840951 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 11840955 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11841014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11841026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11841093 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11841098 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11841122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11841127 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11841305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11841317 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11841421 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11841433 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11841435 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11841447 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11841455 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11841481 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11841532 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11841571 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11841621 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11841639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11841741 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11841777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11841845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11841901 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 11841907 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 11842320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11842674 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11842774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11842792 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 11842932 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11843391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11843411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11843491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11843813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11843912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11844062 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11844279 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 11844360 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11844428 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11844444 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11844511 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11844527 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11845560 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11845953 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11846401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11846677 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11847011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11848589 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11850034 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11851196 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 11852097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11852406 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11852620 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11852694 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 11853796 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11853905 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11854099 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 11854351 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 11854540 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 11854815 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11854908 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11854976 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 11855348 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11855399 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11855706 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 11855826 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11857576 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11858535 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 11858646 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 11865177 A G Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 11865816 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 11866129 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11866214 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11866617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11867620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11867993 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11868010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11868698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11869889 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 11869949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11871440 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 11872385 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11874533 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 11877063 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 11877156 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 11877169 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 11877191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11877294 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 11877430 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 11877463 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 11877549 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 11880978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11880981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11881022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11881059 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11881165 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11881294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11881379 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 11881390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11881496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11881540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11882063 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 11882127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11882146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11882183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11882198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11882289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11882466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11883174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11883340 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11883365 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11883502 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 11884466 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 11884997 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11885088 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 11885146 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 11885147 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 11885210 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 11885542 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 11885739 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 11886023 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 11886408 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 11886458 T A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 11886496 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 11886596 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 11886682 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 11886766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11886785 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 11886837 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 11886904 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 11886955 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11886980 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 11886988 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 11887044 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11887050 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 11887095 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 11887117 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 11887147 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 11887214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11887244 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 11887268 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 11887485 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11887524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11887584 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 11887846 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 11887874 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 11887983 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 11888290 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 11888296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11888368 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 11888427 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 11888510 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11888521 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 11888533 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 11888553 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 11888650 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 11888668 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 11888716 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 11888793 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 11888837 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 11888888 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 11888907 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 11888929 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 11889014 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 11889044 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 11889050 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 11889116 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 11889158 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 11889179 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 11889197 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 11889351 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 11889403 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 11889418 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 11889461 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 11889568 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 11889569 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 11889675 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11889695 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11889707 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 11889723 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 11889734 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11889735 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 11889815 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11889822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11889841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11889946 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 11889959 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11890077 A C N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 2 11890100 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 11890137 C A N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 2 11890155 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 2 11890311 G T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 11890319 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 2 11890426 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11890453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11890487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11890500 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11890529 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 11890540 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 11890550 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 11890589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11890729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11890784 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 11890796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11890812 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 11890834 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 11890871 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 11890891 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11891076 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 11891080 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 11891089 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 11891104 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 11891106 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 11891115 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 11891138 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 11891780 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 11891807 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 11891887 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11891895 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 11891913 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11891915 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11891927 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11891936 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 11891987 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11891996 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 11891999 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11892085 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11892246 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11892323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11892545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11892565 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11892821 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11892833 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11892839 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 11892961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11893201 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11893316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11893337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11893377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11893394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11893442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11893545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11893623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11893738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11893773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11893832 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11893988 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 11894000 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 11894022 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 11894128 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11894225 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11894289 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 11894486 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 11894487 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 11894521 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 11894551 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11894597 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 11894609 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 11894690 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11894700 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 11894802 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11894873 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 11895043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11895145 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11895249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11895328 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11895335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11895356 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11895369 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 11895376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11895416 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11895472 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 11895475 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 11895495 G T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 11895506 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 11895545 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11895837 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11896156 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11896157 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11896456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11896492 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11896519 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11896524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11896564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11896636 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11896639 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11896738 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11896805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11896816 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 11896858 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 11896859 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 11896884 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11896910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11896927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11896989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11897015 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11897049 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 11897231 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11897409 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11897462 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11898062 G T Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 11898106 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 11898171 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11898283 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11898333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11898506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11898578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11898629 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11898768 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11898849 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11898886 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11899095 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11899158 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11899235 G C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 11899315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11905886 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 11905962 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11905967 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 11906101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11906104 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11906117 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 11906166 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11906426 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11906513 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 11906564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11906891 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 11906945 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 11907037 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 11907049 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11907663 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 11907915 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 11908619 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11908864 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 11909009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11909064 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 11909519 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 11909743 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11910283 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11910297 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 11910449 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 11910521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11910655 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11910672 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11910689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11910698 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11910737 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11910768 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 11910941 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11911011 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11911154 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11911191 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11911922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11912095 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11912211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11912294 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11912418 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11912637 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11912707 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11912857 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11912964 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11913116 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 11913145 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 11913404 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11913465 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11913691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11913730 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11913774 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11913783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11913881 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11913999 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11914135 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11914145 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11914672 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 11914679 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 11914898 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 11915336 G A Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 11915373 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11915489 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11915663 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 11915744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11915899 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 11916239 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 11916247 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11916328 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11916346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11916382 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11916384 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11916623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11916645 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 11916702 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 11916725 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 11916728 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 11916787 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11916854 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11916900 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 11916991 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 11917125 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 11917182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11917349 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11917371 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11917385 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11917399 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11917458 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 11917712 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 11917744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11917761 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11917818 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 11920817 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11920941 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11920960 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 11921147 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11921227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11921252 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 11921360 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 11921454 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11921514 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11921563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11921793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11921904 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11921927 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 11921997 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 11921999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11922017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11922040 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 11922137 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11922226 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11922283 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11922293 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11922411 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 11922503 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 11922676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11922729 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 11922839 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11922840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11922934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11922963 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 11922981 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 11923281 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 11923307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11923378 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11923413 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11923605 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11923608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11923664 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 11923762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11923766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11924048 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11924067 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11924116 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11924289 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 11924392 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11924403 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 11924469 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11924552 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 11924555 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 11924677 C A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 11925068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11926395 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11926688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11927854 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 11927911 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 11927917 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 11927964 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11927982 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 11928016 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 11928099 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11928140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11928183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11928241 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 11928366 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 2 11928748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11928818 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 11928849 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11928929 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11928999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11929137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11929224 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 11929395 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11929462 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 11929587 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 11929666 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 11929706 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 11929892 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 11929967 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11929993 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11930220 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 11930288 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 11930379 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 11930431 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11930466 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 11930474 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11930494 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11930529 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11930598 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11930605 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11930845 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 11930855 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11930958 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 11931331 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 11931686 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 11932162 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 11932191 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 11932204 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 11932258 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11932392 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 11932404 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 11932924 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 11933119 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11933149 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11933258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11933868 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 11934096 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 11935043 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 11935053 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 11935388 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 11935429 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 11935512 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11935536 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11935576 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11935874 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 11936032 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11936663 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 11936703 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 11936897 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 11936962 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 11937011 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 11937149 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 11937241 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 11937257 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 11937385 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 11937414 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 11937455 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 11937473 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 11937511 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11937782 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 11937793 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 11937813 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11937964 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 11938374 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11938442 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11938483 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11938523 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 11938699 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 11939028 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 11939067 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 11939127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11939181 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 11939310 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11939391 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 11939588 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 11939598 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 11939614 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11939621 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 11939632 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11939645 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11939672 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 11939722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11939843 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 11939951 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 11940192 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 11940220 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 11940235 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 11940306 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 11940564 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 11940594 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 11940657 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 11940825 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 11940854 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 11940927 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 11940928 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 11941122 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 11941138 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11941274 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11941383 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 11941550 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 11941611 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 11941654 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 11941663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11941742 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 11941750 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 11941753 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 11941861 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 11941915 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11941916 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11941926 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 11942021 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11942128 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11942152 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 11942175 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11942280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11942294 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11942346 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11942480 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11942504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11942519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11942591 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 11942667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11942931 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 11942951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11945808 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11955399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11955685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11955809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11955814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11956617 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 11958632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11958819 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 11958961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11959264 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 11959395 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11959433 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11959597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11959767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11960721 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 11960880 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 11960895 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11960915 A T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 11960965 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11960997 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 11961013 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 11961043 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 11961059 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 11961203 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 11961380 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11961439 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11961573 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11961619 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11961635 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11961639 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11961700 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11961709 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11961768 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 11961824 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11961932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11962029 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11962045 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11962211 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11962222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11962257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11962260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11962279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11962286 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11962296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11962350 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11962412 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11962416 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11962651 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11962702 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11962715 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11962780 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 11962787 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 11962914 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11962938 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11963009 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 11963076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11963179 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 11963190 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 11963266 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 11963437 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 11963518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11963550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11963639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11963671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11963721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11963802 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11963838 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 11963928 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11963932 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 11964399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11964496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11964546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11964640 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11968206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11968241 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11968309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11968606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11968687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11968977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11969015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11969068 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 11969093 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 11969402 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 11969425 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 11969589 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 11970114 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 11970197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11970714 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 11970750 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11970751 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11970781 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 11970851 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11971956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11972811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11975550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11975770 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11976002 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11976084 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11976271 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11976354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11976471 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 20 20 2 16 2 2 11976516 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11976528 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 11976540 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 11976604 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 11976620 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 11976653 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 11976724 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 11976947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11976970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11976994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11977059 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 11977076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11977148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11977187 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11978004 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 11978046 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 11978360 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 11978744 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 11979585 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11979924 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11980044 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11980121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11980333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11980867 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 11980903 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 11981259 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 11981431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11981560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11981566 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11981852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11981887 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11982448 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11982466 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11983196 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 11983307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11983401 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 11983535 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 11983548 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11983614 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11983641 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 11983653 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 11983679 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 11983680 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11983812 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 11983816 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 11983831 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 11983878 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 11983928 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 11984204 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 11984310 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11984379 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 11984551 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 11984778 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 11984850 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 11984865 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 11984922 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11985339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 11985390 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11985427 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 11985607 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11985790 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 11985859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11985984 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11986355 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 11986656 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11986664 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 11986950 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11986951 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11987053 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11987715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11987780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11988380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11988388 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11988491 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11988990 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 11989226 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 11989697 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11989944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11990028 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 11990158 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 11990192 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 11990193 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 11990330 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11991497 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11991511 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11992055 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 11992591 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11992633 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11992786 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11992998 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11993146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 11993922 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 11994750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11994964 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11995080 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11995632 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11995693 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11995776 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 11995800 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 11995804 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 11995911 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11996027 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11996198 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11997056 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 11997263 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11997372 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11997400 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 11997751 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11998143 G C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 11998253 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 11998355 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11998388 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 11998516 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11998556 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 11998595 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11998961 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 11999229 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 11999384 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 11999493 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11999504 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11999573 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11999580 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11999646 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11999657 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11999658 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 11999777 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 11999878 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12000272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12000432 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12000912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12001131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12001168 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 12001210 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12001266 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12001426 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12001657 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12001739 T A N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.0769230769230769 13 13 1 11 1 2 12001740 C T N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0 0.909090909090909 0.0909090909090909 10 12 0 10 1 2 12002270 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 12002336 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12002492 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12002543 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12002954 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 12003113 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 12003169 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12003545 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12003614 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12003624 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12003635 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12003653 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12003835 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12004284 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 12004678 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 12005258 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12005715 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12005912 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12006455 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 12006741 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 12006769 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 12006889 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 12006898 T G N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 12006971 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12007070 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 12007120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12007124 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 12007143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12007304 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12007613 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12008031 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 12008586 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12008755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12008839 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12009434 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12009690 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12009749 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 12009764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12009777 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12009797 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12010020 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12010219 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12010337 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 12010350 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 12010352 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 12010423 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12010443 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12010456 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12010515 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12010612 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12010661 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12010714 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12010734 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12010814 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12010904 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12011132 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12011222 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12011289 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12011292 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12011598 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12011613 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12011650 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12011887 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12012256 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12012276 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12012344 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12012493 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12012602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12012603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12012635 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12012675 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12012727 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12013386 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12013727 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12014035 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12014057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12014564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12014789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12015515 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12015900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12017127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12017128 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12017482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12017631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12018148 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12020557 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12020978 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12021218 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12021495 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 12023043 T A Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 12025091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12025092 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12025517 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 12026827 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12026859 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12027417 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12027419 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12027428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12027453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12027755 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12027777 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12027799 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12028006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12028096 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12028137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12028155 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12028218 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12028754 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12028783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12028968 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12029241 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12029452 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 12029565 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12029847 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12030176 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12030184 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12030262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12030499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12030541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12030745 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12031406 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12031469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12031650 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 12032344 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 12034428 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12034561 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12035982 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12036659 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12036925 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 12036926 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12038066 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 12040522 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12040701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12041267 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12041814 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12042653 A T Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 12042899 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 12043572 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12043627 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12043756 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12044794 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12045045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12045174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12045706 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12045769 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12045857 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12045930 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12046559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12046784 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12047647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12047677 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12047832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12048552 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12048670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12048786 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12049046 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 12049062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12049355 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12049727 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12050363 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12050419 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12052458 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12052731 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12052774 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12052930 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12052931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12054629 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12054677 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12054720 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12054734 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12055058 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 12055059 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12055082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12055522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12055775 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12056507 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 12061491 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 12061504 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 12061616 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12061634 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12062157 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 12062168 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 12062296 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 12062647 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 12062654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12062712 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 12062971 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 12063028 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 12063246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12063668 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 12063786 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 12063796 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 12063964 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12064481 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 12064564 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 12064600 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 12064752 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 12064774 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12065328 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 12065574 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 12065720 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 12065854 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 12065915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12065919 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 12066086 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 12066095 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12066810 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 12066985 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12067004 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 12067129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12067135 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 12067229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12067256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12067555 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 12067914 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 12068088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12068149 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12068714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12069204 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12069298 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12069336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12069338 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 12069586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12069926 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 12070055 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12070408 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12070525 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12070598 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12070608 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 12070899 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 12071081 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12071177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12071193 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12071442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12071454 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12071472 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 12072091 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12072645 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 12073343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12073445 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12074336 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12074357 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12074410 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 12074444 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12074521 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 12074522 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 12074543 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 12074544 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 12074626 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12074628 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12074643 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 12074690 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 12074705 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12074792 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 12074847 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12074879 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 12074910 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 12074911 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 12074961 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 12075477 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 12076479 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12076919 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 12076989 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 12077039 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 12077167 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12077242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12077627 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12077905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12078003 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12078254 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12078261 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12078441 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12078588 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12078662 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12078773 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12078940 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12079031 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 12079088 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12079409 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 12079571 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 12079656 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 12079677 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 12079703 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 12079746 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 12079782 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 12079882 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 12079965 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 12080016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12080236 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 12080349 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12080559 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 12081097 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 12081206 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 12089431 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 12093286 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12095641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12096038 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 12096138 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 12096220 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12096222 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 12096233 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 12096243 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12096249 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12096266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12096290 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12096422 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12096556 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 12096735 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12096774 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12096883 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 12097089 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12097128 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12097393 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 12097667 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12098142 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 12098372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12098582 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 12098609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12098752 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 12098864 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 12098940 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 12098948 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 12099198 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 12099200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12099286 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12099291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12099324 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12099363 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12099392 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12099403 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12099458 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 12099492 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12099530 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12099691 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12099938 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 12099994 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 12100075 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12100107 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12101566 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12101620 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12101995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12102028 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12103231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12103281 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12103466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12105449 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12105462 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12105623 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12106624 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12107054 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 12112630 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12113002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12113500 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12114215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12118560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12118593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12118688 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 12118788 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 12119128 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12119843 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12119960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12119979 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12120018 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12120035 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12120149 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12120647 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12120707 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12120714 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12120748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12120825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12120830 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12121015 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 12121038 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 12121053 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12121128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12121177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12121300 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 12121342 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12121581 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 12122047 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 12122081 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12122131 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12122208 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 12122343 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 12122477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12122513 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12122515 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 12122524 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 12122542 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 12122544 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 12122744 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 12122800 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12122892 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12122911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12122920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12122982 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12122988 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12122996 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12123001 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12123021 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12123057 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12123080 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12123206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12123221 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12123239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12123275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12123292 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12123376 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12123405 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12123537 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12123597 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12123606 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12123615 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12123636 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 12123664 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12123675 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 12123744 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 12124011 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 12124126 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12124366 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12124465 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12124482 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12124561 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12124650 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12124694 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12124788 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12124800 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12124863 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12124880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12124892 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12125095 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 12125295 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 12125340 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 12125420 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 12126094 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12126126 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 12126137 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 12126240 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 12126258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12126295 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 12126341 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 12126387 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12126479 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12126584 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 12126740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12126808 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12126889 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12126987 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12126994 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12127003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12127018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12127143 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 12127201 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12127320 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12127370 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 12127460 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12127597 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12127783 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12127857 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12128135 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12128354 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12128417 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12128541 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 12128938 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12129107 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12129150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12129172 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12129256 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12129258 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12129594 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12129668 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12129695 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12130078 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12130171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12130416 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12130423 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12130783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12131242 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12131403 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12131485 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12131505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12131507 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12131625 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12131627 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 12131841 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12131984 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12132128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12132142 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12132256 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12132344 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12132397 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 12132503 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12132542 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12132678 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12132703 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12132826 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12132835 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12132862 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12132875 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12132882 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12132887 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 12133075 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12133178 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 12133376 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12133413 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12133432 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12133479 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 12133514 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12133567 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12133719 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12133794 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12133930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12133959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12134132 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 12134135 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12134301 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12135213 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12135546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12135588 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12135738 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 12135754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12135772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12135792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12135928 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12135935 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12136507 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12137552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12137653 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12138086 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12138607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12139198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12139428 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12139743 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12140233 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 12140406 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12141811 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12143197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12143640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12144074 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 12144335 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 12144374 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12144419 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12144500 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12144501 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12144547 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12144785 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 12144812 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 12145321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12145564 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12145674 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12145747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12146123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12146130 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12146190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12147028 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12147264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12147660 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12147661 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 12148403 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12148433 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12148524 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12148528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12148562 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12148650 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12148846 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 12148931 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 12148944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12149466 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12149487 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 12149614 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12149740 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12149855 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12149927 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12150124 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12150185 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12150286 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12150466 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12150683 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 12150757 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 12150889 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12150911 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12151039 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12151374 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12151664 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12152558 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12152560 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12152681 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12152799 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12153064 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12153182 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12153185 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12153445 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12153503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12153616 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12153835 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12154738 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12154757 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12154782 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12155290 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12155495 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12156526 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12157694 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12159976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12160105 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12160713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12161095 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 12161293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12165479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12165553 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12166296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12167549 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 12168842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12169697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12170352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12171811 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12172296 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 12172573 C A Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 12172819 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12172842 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12174133 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12174392 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12174777 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12174913 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 12174987 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12175241 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12175528 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12175641 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12175855 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12175876 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12176070 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12176561 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12176645 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 12176730 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 12177176 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12177188 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 12177580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12178173 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12178706 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12178925 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12179034 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12179144 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12179336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12179406 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 12179457 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 12179460 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 12179487 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12179838 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12179864 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12179913 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 12180274 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12180414 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12180438 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12180510 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12180564 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12180627 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 12180755 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 12180779 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 12180832 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 12180942 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 12181074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12181085 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 12181149 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12181270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12181392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12181405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12181417 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12181533 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12181973 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12182527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12182757 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12182782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12182863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12182927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12182932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12183122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12183172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12183234 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12183256 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12183262 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12183600 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 12183656 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 12183811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12183901 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 12183921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12183992 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12183995 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12184059 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12184066 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12184077 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12184081 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12184131 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12184159 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12184189 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 12184206 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12184263 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12184395 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12184479 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12184507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12184544 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12184545 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12184562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12184563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12184672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12184702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12184764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12184830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12184971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12185039 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12185140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12185365 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12185536 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12186447 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12186511 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12186591 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12186600 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12186726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12186742 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12186768 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12187004 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 12187138 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 12187377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12187459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12187498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12187518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12187527 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12187533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12187550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12187610 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12187650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12187723 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12187792 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12187794 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12187911 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12187952 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12187977 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 12188038 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12188389 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 12188521 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12188706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12188712 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12188884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12189044 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12189047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12189082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12189172 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12189209 A C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 12189365 T A Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 12189371 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 12189622 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 12190243 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12190270 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12190313 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 12190453 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12190488 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12190746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12190991 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12191547 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12191732 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12192345 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12192662 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12192923 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12193194 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12193496 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12193530 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12193602 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12193604 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12193797 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12193928 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12194011 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 12194149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12194201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12194522 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12194935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12195168 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12195738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12197499 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12197501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12197510 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 12197664 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12197907 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12198010 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 12198012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12199054 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 12199157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12199456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12199468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12199764 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12199952 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 12199999 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 12200113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12200207 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 12200332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12200477 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12200546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12200736 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12200764 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12200856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12201369 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12201396 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12201417 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12201494 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12201847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12201965 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 12201992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12202301 C T Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 12202377 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12202391 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12202447 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12202468 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12202556 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 12202635 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 12202694 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12203012 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 12203141 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12203148 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12203410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12203446 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12203460 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12203608 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12203633 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12203660 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12203705 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12203740 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12203993 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 12204000 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12204272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12204322 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12204362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12204496 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 12204681 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12204779 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 12204929 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 12205243 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12205256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12205288 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12205336 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 12205357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12205687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12205877 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 12206104 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 12206151 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 12206201 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12206299 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 12206335 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12206394 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 12206759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12206861 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 12207216 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 12207365 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 12207514 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12207522 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 12207525 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 12207576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12207592 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 12207636 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12207642 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12207789 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 12207796 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 12207811 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 12208043 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 12208044 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 12208242 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 12208507 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 12208533 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 12208560 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 12208644 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 12208726 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 12208784 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 12208790 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 12208821 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12208881 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 12208887 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 12208909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12208917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12209174 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12209243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12209876 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12210288 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12210510 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 12210540 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 12210648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12210940 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 12211090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12211357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12211389 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12211547 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 12211608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12211634 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 12211648 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 12211693 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 12212352 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 12212422 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 12212494 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 12212717 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 12212868 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 12212896 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 12212908 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 12212992 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 12213010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12213440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12213825 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 12213836 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12214129 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 12214166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12214185 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 12214226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12214381 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 12214426 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 12214689 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 12214873 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12215159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12215255 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12215350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12215674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12215970 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12216068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12216069 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12216153 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 12216554 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12216659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12216773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12216886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12216983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12217127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12217192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12217398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12217443 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12217557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12217560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12217578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12217631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12217685 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12217693 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12217820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12217901 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12217907 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12217923 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12217942 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12218001 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 12218010 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 12218012 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12218043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12218138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12218188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12218306 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12218562 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 12218563 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 12218713 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 12219369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12219858 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 12220182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12220262 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12220724 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 12220808 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12221016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12221029 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12221038 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12221046 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12221148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12221159 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 12221267 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 12221285 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 12221311 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 12221405 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 12221477 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 12221542 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 12221577 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 12221635 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12221675 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12221772 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 12221839 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 12221887 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 2 12221998 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 12222205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12222250 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12222276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12222354 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12222493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12222647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12222705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12222959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12223159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12223391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12223419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12223431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12223563 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12223698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12223906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12223916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12223919 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12223942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12223961 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12224018 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 12224032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12224191 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 12224314 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12224378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12224402 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12224552 T A Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 12224554 T A Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 12224957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12225495 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12225589 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 12225602 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 12225993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12226080 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12226254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12226323 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 12226333 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12226398 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12226467 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12226482 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 12226505 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12226507 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 12226570 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12226680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12226713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12226715 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12226725 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12226783 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12226794 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12226804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12226813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12227001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12227424 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 12227444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12227686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12227980 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12227982 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12228043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12228130 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12228396 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12228614 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12229429 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 12229790 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12229839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12229928 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12229954 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12230038 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12230048 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12230051 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12230210 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12230223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12230261 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 12230328 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 12230412 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12230471 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12230475 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12230493 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 12230509 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12231032 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 12231324 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 12231573 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 12231592 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12231623 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 12231742 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 12231815 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 12231935 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 12232150 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 12232284 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 12232305 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 12232999 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 12233076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12236054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12237034 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12237257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12237369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12237514 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 12237782 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 12237864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12239882 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12239905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12243207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12244600 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12244685 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12246127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12246446 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12246674 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12246863 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12246978 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12247375 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12247489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12247972 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12247985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12248116 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 12248334 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12248413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12248536 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12248546 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12248781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12249648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12250398 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 12250469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12250856 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12250873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12250932 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12251328 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12251662 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 12251680 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 12251731 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 12252251 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 12252711 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 12253307 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 12253699 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 12253917 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 12253968 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 12254065 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 12254144 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 12254151 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 12254170 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 12254258 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 12254279 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 12254288 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 12254332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12254925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12255988 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12256076 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12256647 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12257891 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12258752 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 12259130 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 12259269 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 12259465 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 12259601 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12259920 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12268053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12268770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12269226 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 12269863 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12269864 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12269882 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 12269927 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12270230 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 12270250 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 12270272 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 12270280 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 12270393 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12270588 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12270635 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12270700 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 12270707 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 12270714 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 12270724 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 12270807 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 12270838 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12271087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12272008 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12272091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12272161 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 12272842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12272944 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 12273040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12273226 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12273237 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 12273281 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 12273335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12275265 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12275481 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12275937 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12277750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12279015 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12279130 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12279496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12280361 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 12281146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12281943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12282001 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12282434 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 12282520 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12283284 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12283378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12283389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12283648 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12283723 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 12283835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12284628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12284722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12284827 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12284998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12285340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12285802 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 12285823 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12285870 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 12286037 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12286078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12286220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12286308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12286500 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 12286502 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 12286516 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 12287595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12287933 A T Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 12288291 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 12288413 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12288583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12288696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12288715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12289390 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 12289406 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12289430 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12289478 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 12289500 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12289602 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 12289615 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 12290042 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12290226 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 12290273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12290275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12290476 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12290750 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 12290891 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12291191 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 12291217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12291322 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 12291393 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12291404 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12291415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12291424 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 12291439 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 12291443 T G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 12291627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12291661 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12291750 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12291790 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12293645 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 12293657 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 12293666 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 12293702 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12294155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12294250 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12294254 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12294418 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 12294630 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12295067 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12296488 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 12296856 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 12296964 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 12296999 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 12297235 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 12297673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12297698 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 12298766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12299092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12300447 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 12300672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12300720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12302798 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 12303031 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12303162 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12303268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12303492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12303609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12303937 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12305579 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12306660 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12306767 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12308351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12310018 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12310117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12310380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12310677 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12310686 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12311711 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 12312634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12313487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12314205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12316081 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 12316109 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 12316219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12316273 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 12316367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12316439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12316765 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 12317244 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12317282 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12317413 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12317472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12317713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12318182 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 12323026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12326093 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12331331 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12338487 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12339036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12340917 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 12346074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12348186 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12348955 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 12349741 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12349913 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 12349949 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12349969 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12350044 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12350062 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12350065 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12350073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12350280 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12351007 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12351189 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12351510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12351889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12352092 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12352428 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12352536 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12353013 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12353184 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12353203 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12353214 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12353270 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12353416 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12353448 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12353508 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12353646 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12353722 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12353756 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12353871 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12354142 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 12354274 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 12354283 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 12354320 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 12354496 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 12354784 T C N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 12355650 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 12355773 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 12355834 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 12355858 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 12355877 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12356054 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 12356059 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 12356080 T A Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 12356085 C A Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 12356208 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 12356232 T A Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 12356234 A G Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 2 12356253 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 12356258 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 12356288 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12356306 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 12356321 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 12356371 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12356379 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12356400 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12356434 C T Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 12356543 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12356680 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12356695 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 12356734 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12357074 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12357097 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12357103 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12357589 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12357604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12357641 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12357862 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12357882 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12357941 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12357988 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12358002 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12358030 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12358123 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12358303 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12358492 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12358642 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 12358664 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 12359041 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12359070 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 12359198 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12359307 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 12359470 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12359541 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12359770 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 12359787 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12359800 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12359808 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12359985 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12360023 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12360092 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12360141 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12360304 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 12360319 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 12360344 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 12360377 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 12360507 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12360545 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12360610 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 12360630 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 12360660 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 12360792 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 12360893 T A Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 12360899 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 12361156 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 12361184 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12361243 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 12361344 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12361440 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12362859 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12362870 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12364546 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12364550 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12364820 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12365533 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12367779 C A Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 12368188 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12368199 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12368546 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12368769 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 12368847 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12369581 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12369762 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12369839 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12370476 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 12370882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12370933 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12371479 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 12372603 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12373255 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 12373313 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12373426 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12374551 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 12374605 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12374620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12374666 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12374758 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12374761 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12374951 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12374959 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12376284 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12376558 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12376658 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12376685 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12377058 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12377203 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12377231 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 12377237 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 12377275 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 12377405 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12377520 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 12377595 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12377894 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 12378508 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12379370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12379966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12380125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12381741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12383829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12386946 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12386970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12387438 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12387791 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 12387970 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12389026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12390114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12390524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12395576 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12395621 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12395765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12396881 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 12397081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12397157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12398862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12400251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12400461 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12400929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12401441 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12401681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12402249 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12404222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12404944 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 12405008 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12405299 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 12405348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12405498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12405615 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12405626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12405938 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12406214 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12406306 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 12406407 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12406437 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12406491 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 12406643 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12406671 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12408342 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12408654 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12410364 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 12410663 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12410673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12411599 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 12411634 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 12411695 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 12411838 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12411906 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12412098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12412151 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12412299 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12412306 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12412503 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12412513 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12412620 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12412676 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12412704 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12412798 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12412801 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12413376 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12413391 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 2 12413421 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12413524 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12413594 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12413714 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 12414848 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12415439 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12415457 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 12415492 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12415674 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 12416277 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12416434 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12417129 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 12417133 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12417188 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12417247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12417931 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12418866 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12425675 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12425914 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 12427073 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12427164 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12427236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12427343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12427569 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12427679 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 12427936 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 12429023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12429174 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12429824 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12429932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12430400 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12430629 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12431041 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 12431177 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 12431352 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 12431804 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12432685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12432899 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12432978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12433001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12433939 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12434049 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12434096 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12434639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12434859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12434863 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12435404 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12435460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12435550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12435584 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12436254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12436640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12436671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12436875 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12437267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12438594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12440988 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12444543 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12448912 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12448930 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12448942 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 12449043 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12450288 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12451598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12452775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12453927 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12454483 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12454874 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12454982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12455345 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12455373 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12455422 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12455513 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12455546 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12455584 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12455590 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12455610 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12456054 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12456667 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 12458508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12459041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12459627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12460946 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12461894 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12461924 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12462889 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12464275 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 12464310 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12464376 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12464395 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 12464399 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 12464440 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 12464460 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 12464475 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 12464522 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 12464669 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12464684 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12464688 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12464741 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 12464882 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 12466263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12468108 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12469373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12470595 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12470608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12470735 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12472265 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12472766 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12474985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12475097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12477339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12477836 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12478036 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12478256 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 12478257 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 12478469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12479050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12479396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12480100 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12480164 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12480572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12482008 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12482107 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12482203 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12482664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12482877 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12482996 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12483703 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12486016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12486923 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12488791 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12489523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12489650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12490555 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12491006 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12492112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12492439 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12493645 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 12493756 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12493906 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12493974 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12494272 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12494385 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12494520 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12498921 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12500296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12500730 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12501317 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12502048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12502238 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12504199 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12504400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12504813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12504927 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 12506294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12509410 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 12510083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12510754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12511252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12512330 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 12512898 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12513565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12513682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12514157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12516064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12516193 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12516649 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12516987 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 12518081 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12518229 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12519495 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12519605 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 12519983 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12521029 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12521870 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12522417 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 12522640 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 12523667 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12524252 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 12524295 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 12525680 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12525984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12530044 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 12530282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12532650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12532807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12533351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12533401 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12534477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12534543 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12535246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12543676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12543798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12544227 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 12545152 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12546134 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 12546579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12547080 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 12548482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12551512 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 12552189 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 12552902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12554089 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 12554179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12554991 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12555166 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12555593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12555943 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12556370 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12556794 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12556856 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12557242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12557341 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12557915 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12557958 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12558666 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12559008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12559095 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12559461 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12559864 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12559929 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12559930 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12559972 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12560135 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 12561685 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12573857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12574637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12575617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12575647 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 12576149 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12577379 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12578196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12579237 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12580262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12580742 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 12580951 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12581496 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12581828 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 12581911 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12583347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12583353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12583523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12583874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12585778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12585779 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12585794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12587002 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12587023 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12588276 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12588388 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12588405 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 12590919 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12591753 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 12592930 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 12592931 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12593304 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 12594403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12596896 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 12597330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12598974 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12599804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12601269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12601386 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 12601648 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12602962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12603753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12604010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12609303 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12610276 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12611456 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 12611950 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 12612454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12613494 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 12613737 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 12613750 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 12614143 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 12614291 C G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 12614362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12614517 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 12614542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12614577 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 12614683 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 12614940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12614946 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 12615045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12615105 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12615115 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 12615432 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12615550 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 12615743 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12615824 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 12615894 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 12616100 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12616114 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12616157 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 12616396 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12616467 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12616695 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 12617143 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 12617195 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 12617538 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 12617755 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 12617852 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 12617929 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 12617993 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12618444 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12618576 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 12618726 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 12618810 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12618815 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 12619370 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 12619720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12619818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12620427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12622248 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 12623029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12623370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12623453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12623475 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 12623501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12624095 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12624213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12624505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12627961 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12627983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12630340 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 12631421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12632153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12634030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12634743 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12636965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12638057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12640104 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12640143 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12640159 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 12640329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12641962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12643734 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 12644515 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 12644533 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 12644690 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12650181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12652484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12652688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12653685 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 12653892 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 12654052 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 12654067 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 12659035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12659141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12659191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12660656 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 12662615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12662643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12665778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12667208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12667597 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12668078 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12668799 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12668951 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12670499 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12670981 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 12671292 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12672100 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12672185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12672571 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12684927 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12684971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12687107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12692363 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12696580 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12697820 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12699076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12701037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12702464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12702480 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 12708874 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 12710337 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12711217 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12712014 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12712896 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12713034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12715667 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12715787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12716243 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12716761 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 12716879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12717376 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12717769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12721687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12723637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12723900 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 12726281 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 12727861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12730821 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 12731225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12732653 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12733261 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 12733388 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12734668 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 12734840 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 12734864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12735118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12735829 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 12737589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12738174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12738525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12739288 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12740467 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 12740747 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 12740795 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 12740840 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12741133 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12741140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12741288 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12741775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12742215 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12742504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12742925 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12742960 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12743729 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 12743754 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 12743845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12743939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12744160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12744354 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12744608 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12744746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12744818 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12746231 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12746784 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12748267 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 12748346 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 12748347 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 12748486 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 12748680 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 12748744 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 12748777 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12748792 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12748874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12748882 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 12748991 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12749039 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12749186 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 12749822 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12750080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12750196 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 12750437 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 12750472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12750528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12751380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12752243 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 12752278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12752736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12752884 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 12752976 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 12754105 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12754172 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12754249 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12754272 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12754434 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12754440 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12754533 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12754599 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 12754601 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 12754959 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 12755197 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12755416 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12755734 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 12755740 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12755791 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12755817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12755840 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 12755970 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 12756034 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12756233 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 12756271 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12756356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12756358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12756378 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12756517 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12756621 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12756709 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12756719 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12756962 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12757184 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 12757356 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 12757938 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12758026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12758333 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 12758464 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 12758890 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 12759134 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 12759375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12759676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12759758 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 12760361 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12762803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12763072 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 12763110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12763184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12763200 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12763302 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12763427 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 12763848 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 12764234 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12764245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12764276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12764598 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12764662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12765971 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12766099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12766181 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12766253 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 12766324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12766818 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12766879 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12767206 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 12768371 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12768420 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12768473 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12768666 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12768813 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12769297 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12769481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12769585 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 12769688 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 12770100 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12770977 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12771014 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 12771069 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 12771138 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12771258 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 12771543 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 12771578 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 12772906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12772907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12773089 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 12773343 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 12773723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12773806 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12773960 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 12773991 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 12773992 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 12774483 A T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 12774491 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 12774651 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 12774657 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 12774719 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 12774738 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12774787 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12775328 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12775363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12775399 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12775439 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12775480 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12775795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12775805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12776038 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 12776065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12776358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12776376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12776487 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 12779438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12779895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12780962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12781328 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12781519 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 12781684 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12781690 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 12781828 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12782133 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 12782520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12782530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12783283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12783400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12784316 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12784405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12787625 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12787726 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 12787861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12787942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12788128 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12788179 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12788220 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 12788450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12795431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12795803 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12795808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12795963 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12796373 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 12797137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12798346 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 12798419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12798492 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12798601 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 12798616 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12798749 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12798770 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 12798945 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 12799212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12799232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12799278 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12799310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12799494 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 12799726 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12799923 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12800054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12800160 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12800199 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 12800212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12800301 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12800319 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 12800881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12801195 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 12801541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12801570 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 12801766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12801869 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12801922 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 12802071 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 12802236 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 12802249 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12802379 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 12802492 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 12802494 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 12802505 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12802514 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12802533 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12802547 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12802554 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12802771 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 12802793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12802825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12802888 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12803038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12803046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12803192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12803214 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12803643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12803904 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12804787 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 12805354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12805838 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12806607 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12806681 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12806690 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12806738 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12806749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12806778 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12806966 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12806980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12807079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12807133 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12807238 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12807545 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12807665 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12808504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12809168 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12810025 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12810095 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12810369 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12810385 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12810597 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 12810895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12810982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12811009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12811404 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12811489 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 12811515 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 12811532 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12811676 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 12811795 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12811951 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12812101 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12812119 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12812414 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12812836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12813017 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12815360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12816450 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12816531 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12817973 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12818057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12818087 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12818183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12818556 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12818999 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12819532 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12819815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12820233 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 12820312 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12820641 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12820800 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12821913 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12821980 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12822226 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12822267 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 12822303 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12822405 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12822539 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 12822878 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12823029 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 12823061 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 12823191 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12823245 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 12823258 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12823273 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12823284 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12823287 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12823404 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12823502 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 12823551 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 12823602 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 12823633 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 12823682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12823818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12824021 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12824096 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12824097 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 12824787 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12825065 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12825088 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12826248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12826345 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12826384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12826427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12826650 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12826784 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 12826867 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12827654 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12827672 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12827822 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 12828181 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12829055 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12829672 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12829676 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 12829691 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12833604 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12833631 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12836635 C G Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 2 12836663 C A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 12836704 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 12836709 G A Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 12837431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12839438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12840725 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12840831 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12840846 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 12840934 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12841046 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12841160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12841194 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12841235 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12841288 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12841519 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12841549 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12841649 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12841698 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12841835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12842087 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12842266 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12842836 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12842857 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12843561 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12844137 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12844180 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12844384 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 12844418 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12844605 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12844622 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12844703 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 12844753 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12844923 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12845056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12845079 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12845219 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12845381 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12845530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12845689 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12846000 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12846160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12847634 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12847646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12847661 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12847685 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12847981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12848054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12848100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12848101 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12848173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12848232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12848298 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12848374 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 12848534 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12848910 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12849280 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12850519 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12850694 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12851343 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 12852050 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 12852096 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12852242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12852696 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 12852723 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 12853128 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12853401 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12853693 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 12853911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12854757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12854820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12855621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12855924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12856439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12856662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12856864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12856919 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12856946 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 12856947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12857997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12859411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12859927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12860017 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12860666 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12871663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12876845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12877993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12878099 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12879434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12879651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12880655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12882102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12884023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12884133 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12884404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12884524 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12884605 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12884620 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12884672 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12884782 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12884899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12884953 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 12884969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12885112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12885215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12885349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12886116 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 12886130 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12886185 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 12886196 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 12886230 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 12886243 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 12886256 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 12886389 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12886489 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 12886492 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12886536 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 12886563 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12887270 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12888111 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12888207 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12888213 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12892384 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12893332 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12893357 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12894095 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12894364 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12894429 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 12894651 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12894689 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12894861 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 12895126 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 12895577 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12895741 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 12895978 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 12896235 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 12896248 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12896424 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12896728 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12896868 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12896879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12897372 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 12897432 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12897634 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12897639 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12897665 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12898392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12898418 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 12898419 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 12898438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12898673 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12898764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12898849 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12898924 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12899301 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 12899949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12900404 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12900920 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12900953 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12900963 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 12901031 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12901038 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 12901275 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12901393 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12901627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12901693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12902034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12902123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12902328 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 12902598 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12902659 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12903368 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12903602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12903715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12904178 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12904339 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12904354 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 12905204 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12905442 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 12906208 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 12906406 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 12910176 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12910989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12911180 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12911623 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12911940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12912064 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12912402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12912466 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12912491 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12912793 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12913398 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 12913448 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 12913500 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 12913606 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12914307 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 12914394 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 12914663 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 12914706 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 12914719 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12915746 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12916633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12916781 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12917956 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12918455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12919059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12919343 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 12919380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12919541 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12919983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12920806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12920872 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 12920874 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 12920948 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 12921383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12921566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12921693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12921727 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12921904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12922018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12922248 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12922307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12923351 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 12923554 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12923558 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 12923786 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12924318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12924478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12924483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12924763 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12925219 T G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 12926616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12927191 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12927217 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12927750 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12927970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12929907 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12931394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12931974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12932850 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 12933816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12934792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12934931 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12934945 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12935222 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12935438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12937488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12938887 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12939212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12939522 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 12939614 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12940237 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12940469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12940998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12941025 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12941031 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12941093 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12941131 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12941132 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12941202 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12941487 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 12942253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12943067 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12943359 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12943946 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 12944575 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 12944685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12946659 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 12946777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12947540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12947797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12948012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12948076 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12948370 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12948743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12948910 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12948936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12949018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12949183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12949298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12949739 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 12949742 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 12949830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12950105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12950170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12950269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12950370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12950469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12950472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12950514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12950518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12950751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12950940 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12950996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12951018 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12951148 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12951182 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12951191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12951207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12951353 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12952114 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12952125 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12954592 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12954760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12954903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12957555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12959418 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12959670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12961257 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 12961260 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 12962471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12962938 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 12963663 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12964022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12965035 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12965266 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12965771 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 12966423 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 12966565 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12966669 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12967039 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12967073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12968041 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12968194 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 12968433 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 12968482 G A N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 12968787 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12968943 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12969000 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12969215 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12969221 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12969657 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 12969942 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12969980 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12970829 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 12970932 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12970943 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12971577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12971985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12972039 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 12972258 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12972724 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12972840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12973026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12973069 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12973220 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 12973650 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12973835 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12974287 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12974302 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 12974343 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 12975500 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12975506 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12975567 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12975568 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12976040 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12977415 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 12977526 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12977675 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12978361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12978367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12979184 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12979313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12980209 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 12980843 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12981844 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12981948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12982283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12982862 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 12983146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12983325 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12983665 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12983774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12984272 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12984330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12984353 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12984370 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12984592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12984709 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12984711 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12985233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12985248 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12985270 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12985429 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 12985545 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 12985590 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 12985822 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 12985828 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 12985933 T C Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 12985944 C T Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 12985960 G C Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 2 12985966 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 2 12986065 T A Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 12987272 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 12987312 T C Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 12987630 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 12987646 T G Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 12987736 C T Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 12987835 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12987856 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 12987881 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 12987950 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12988057 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12988199 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12988212 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12988412 T G Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 12988494 C T Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 12988513 T C Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 12988864 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 12989146 T G Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 12989522 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 12989525 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 12989700 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12989716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12989777 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12989902 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12990579 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12990872 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 12991348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12991608 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 12991637 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12992022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12992048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12992450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12992502 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12992503 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12992741 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 12992829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12992849 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12993003 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 12993028 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12993213 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 12993217 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 12993408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12993434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12993506 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 12993546 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12993635 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12993640 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12994302 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12994838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12994864 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12995026 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 12995056 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 12995304 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12995379 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12995402 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12995463 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12995493 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12995509 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 12995568 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12995591 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12995643 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12995649 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 12995673 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 12995707 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 12995813 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 12995858 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 12995893 T C Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 12996000 A G N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 12996190 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 12996558 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 12996897 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 12997021 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12997725 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 12997835 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 12997896 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 12998067 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 12998122 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12998182 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 12998191 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 12999317 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 12999741 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13000042 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13000248 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13000263 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13000275 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13000873 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13001227 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13001449 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13001498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13002168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13003299 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13003449 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13003902 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13003907 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 13004217 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13004659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13005013 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13005228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13005381 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13005813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13005849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13006259 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13006689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13007332 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13007681 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 13008601 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13009010 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13009388 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13009757 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13009848 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13010003 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13010293 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13010428 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13010494 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13010539 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13010567 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13010587 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 13010597 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 13010609 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13010622 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13010687 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13010743 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13010849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13011425 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13012322 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13012924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13013135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13013363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13013457 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13013575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13013608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13013657 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13013665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13013681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13013777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13013791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13013903 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13014483 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13014727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13014734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13014740 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13014757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13014798 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13015141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13015288 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 13015323 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13015343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13015370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13015380 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13015429 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13015474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13015717 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13015907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13016151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13016173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13016688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13016762 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13016867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13017290 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13017326 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13017439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13017466 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13017567 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13017613 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13017906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13018388 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13018876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13019394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13019448 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 13019502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13019524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13019673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13019786 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13019864 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13020005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13020568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13021129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13021436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13021550 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13021691 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 13022074 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13022243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13022821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13023031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13023174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13023198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13023924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13024175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13024602 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 13024697 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13025927 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 13025933 C T N Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 13026039 C T Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 13026135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13027807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13028481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13028737 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13028810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13030017 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13030344 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13030761 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13030888 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13030998 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13031448 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13032339 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 13032518 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 13032555 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13033447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13033467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13034016 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13036547 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13036880 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13036897 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13036969 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13037397 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 13037554 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 13037895 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13037966 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13039676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13041950 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13042791 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13042809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13042865 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13043031 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13043125 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13043139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13043268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13043296 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13043683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13043709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13043842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13043856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13044533 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13044718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13044729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13044935 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 13044967 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 13045021 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 13045125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13045859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13047103 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13047184 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13047276 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13047365 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13047377 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13047482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13047528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13047949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13047975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13047979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048017 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048068 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13048083 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13048152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048719 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13048799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13049003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13049015 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13049016 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13049597 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13049718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13049828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13050178 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13050350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13050897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13050971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13051517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13051763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13051978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13053038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13053878 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13053913 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13053988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13054125 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13054182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13054279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13054321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13054390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13054418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13054514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13054545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13054589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13054813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13054824 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13054828 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13055037 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13055070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13055315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13055426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13055459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13055559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13055687 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13055972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13056061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13056085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13056125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13056190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13056196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13056203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13056381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13056442 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13056540 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13056581 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13056586 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13056779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13056917 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13057037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13057103 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13057130 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13057243 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13057763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13057806 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 13058699 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13058731 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13059517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13059682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13059788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13059800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13060174 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13060968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13061908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13062136 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13062254 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13062388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13062485 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13062700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13062840 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 13062855 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13063098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13063132 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13063148 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13063183 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13063372 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13063378 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13063626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13063763 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13063786 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 13063809 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 13063834 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13063912 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13063959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13064168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13065408 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13065430 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13066199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13066265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13066650 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13066740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13067131 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 13067345 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13067556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13067756 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13067808 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13067838 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13067895 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13068002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13068361 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 13069054 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 13069055 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 13069065 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13069133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13069377 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 13069539 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13069654 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13069669 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13069714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13069760 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 13069822 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13070480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13070490 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13071331 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 13072130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13072734 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13072986 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13073436 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 13073484 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 13073496 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 13073700 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 13075528 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 13075776 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13078757 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13079002 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 13084769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13084865 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13089850 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13091660 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13093001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13093674 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13093676 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13095197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13095834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13097042 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13097093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13097620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13099064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13099567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13100849 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13100933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13105292 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13105324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13107258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13107873 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13108032 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13108036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13108576 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13108587 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13108674 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 13109011 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13109055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13110332 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 13111358 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13111588 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13112425 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 13112856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13113637 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13114969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13116311 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 13116776 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13116794 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 13117006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13117077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13117497 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 13117539 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 13118471 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 13120019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13120294 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 13120575 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 13120704 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 13120899 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 13121663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13121979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13122592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13124798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13125614 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 13127775 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 13127896 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 13128615 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13128775 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 13128851 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 13129199 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 13129220 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13130190 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 13130415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13130421 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13130684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13130821 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 13130832 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 13130931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13131012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13131319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13131383 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 13131437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13131750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13131862 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 13132055 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13132186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13132216 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13132291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13132503 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13132670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13132677 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 13132707 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 13132720 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 13132868 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 13132895 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 13132908 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 13132961 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 13132972 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13133004 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 13133055 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 13133101 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 13133113 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 2 13133154 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 13133250 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 13133255 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 2 13133293 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 13133732 G C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.4 0.0666666666666667 0.533333333333333 13 17 6 1 8 2 13133759 T G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.285714285714286 0.0714285714285714 0.642857142857143 9 19 4 1 9 2 13133766 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.307692307692308 0 0.692307692307692 8 18 4 0 9 2 13133782 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.454545454545455 0 0.545454545454545 10 12 5 0 6 2 13133786 A G N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.454545454545455 0 0.545454545454545 10 12 5 0 6 2 13134460 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.333333333333333 0.0666666666666667 0.6 11 19 5 1 9 2 13134579 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13134714 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13134874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13134878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13134913 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13135262 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 13135317 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 13135319 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 13135329 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 13135439 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 13135560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13135618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13135630 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 13135696 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 13136148 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 13136165 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 13136242 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 13136280 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13136302 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 13136333 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 13136375 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 13136581 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13136745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13136776 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 13136882 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 13136912 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 13136916 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 13136941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13137008 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 13137114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13137407 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 13137472 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13137478 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13137526 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 13137531 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 13137588 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 13137606 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 13137691 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 13137761 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13137786 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 13137806 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13137871 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 13137969 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13137978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13138190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13138398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13138646 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13139011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13139782 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 13139948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13140385 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13140386 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13140583 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13144813 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13144891 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13144940 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 13144949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13145124 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 13145500 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13145512 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13145553 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13145662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13145739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13145994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13146119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13146134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13146375 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13146594 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13146680 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13146746 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13146747 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13146850 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13147000 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13147581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13147623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13147738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13147988 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13148245 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 13148337 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 13149679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13150746 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 13151014 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13151115 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13151132 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13151244 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13151335 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13151367 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13151368 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13151612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13151645 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13151887 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 13152603 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13152708 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13152728 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 13152741 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13152771 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 13152920 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 13152981 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13152984 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13153022 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13153041 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13153046 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13153087 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13153986 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13154164 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 13154288 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13154444 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 13154512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13154595 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 13154679 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13154697 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13154808 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13154820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13155521 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13155550 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13155644 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 13155880 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13155926 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13156054 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 13156248 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 13156249 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 13156475 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13156568 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 13156629 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 13156669 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 13157157 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13157180 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13157290 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13157593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13158254 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 13158456 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 13158472 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13158507 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13158790 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 13159008 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13159024 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 13159491 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 13159538 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 13159624 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 13160065 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13160333 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 13160524 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 13160545 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 13160588 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 13160620 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 13160670 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 13160735 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 13160736 T G N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 13160874 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 13160895 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13160909 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 13161044 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13161256 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13161352 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 13161391 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13161457 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13161531 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13161805 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13161873 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13162039 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13162079 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13162147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13162551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13162585 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13162609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13162806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13162877 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 13163177 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13163190 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 13163265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13163298 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13163369 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13163924 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13163926 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13164001 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13164071 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13164146 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13164213 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 13164382 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 13165593 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 13166096 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13166151 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13166230 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13166257 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13166262 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13166329 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13166687 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13166920 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13167241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13167315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13167550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13167620 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13167835 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13167854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13167917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13167939 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 13168120 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13168544 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13168841 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13168984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13169209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13169682 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13169800 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13169824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13169917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13170157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13170228 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13170237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13170322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13170597 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 13170697 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13170754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13170757 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 13170841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13170848 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13170930 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 13170953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13170975 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13171238 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13171260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13174257 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13174504 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 13174517 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13174538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13174674 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13174690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13174716 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 13174794 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13174831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13174900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13174954 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13175171 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 13175181 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 13175370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13175551 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13175696 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13175709 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13175829 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 13175880 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 13175991 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 13176128 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13176697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13176753 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13176828 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 13176886 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 13176917 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13176950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13177215 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13177228 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13177229 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13177281 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13177299 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13177304 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13177358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13177413 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13177463 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13177525 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 13177542 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 13177600 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 13177706 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 13177710 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 13177728 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 13177792 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13177800 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 13177808 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13177948 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 13178031 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13178062 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 13178113 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 13178117 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13178127 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 13178253 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13178299 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 13178336 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13178384 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13178443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13178506 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 13178618 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 13178729 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 13178757 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 13178811 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 13178882 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 13178895 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 13178944 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13179006 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13179125 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 13179131 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 13179244 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 13179337 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13179363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13179389 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 13179454 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 13179756 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 13179803 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 13179819 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 13179984 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 13180043 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 13180077 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 13180131 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13180571 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13180697 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 13180769 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 13180786 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13180906 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 13180927 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13181406 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13181590 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 13181673 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 13181676 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 13181693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13181706 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 13181854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13181912 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13181956 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 13181982 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 13182056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13182107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13182110 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13182275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13182453 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13182761 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 13182767 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 13182822 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 13182828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13182895 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 13182991 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13183069 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13183085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13183170 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13183226 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13184033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13184063 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 13184074 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13184108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13184189 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 13184338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13184463 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13184541 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13184663 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13184766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13184907 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 13184991 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13185005 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13185112 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13185234 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 13185450 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 13185468 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 13185478 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 13185519 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 13185616 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13185833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13185854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13185922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13185971 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 13185972 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13186024 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13186422 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 13186424 C G Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 13186449 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 13186460 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 13186552 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 13186622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13186624 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13186974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13187104 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13187358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13187401 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 13187453 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 13187527 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 13187540 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 13187754 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 13187763 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 13187799 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 13187853 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 13188056 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 13188066 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 13188167 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 13188658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13188974 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13189046 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 13189063 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 13189157 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13189247 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13189460 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13189526 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13189541 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13189638 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 13189738 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13189752 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13189830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13189948 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 13190129 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13190167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13190407 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 13190416 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 13190426 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 13190944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13190966 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 13191031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13191049 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13191138 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13191153 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 13191165 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 13191316 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13191406 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 13191508 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13191510 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13191563 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 13191582 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13191599 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13191628 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13191687 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13191742 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13191755 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13191781 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 13191797 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13192427 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13195192 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 13195381 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 2 13196064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13196136 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 13196496 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 13196497 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 13197754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13199513 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13202190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13202274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13202359 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13202470 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 13202486 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 13202501 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13202977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13203087 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13203546 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13205214 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 13205298 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13205356 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 13205467 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13206236 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13207708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13208780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13209448 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13209622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13209721 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13210682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13212860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13213041 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13213759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13214121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13215572 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13216545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13216641 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 13216792 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13217559 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13217758 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13219191 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 13219305 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 13219343 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13219369 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13219388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13219480 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13219571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13219772 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 13219821 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 13219995 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 13220000 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 13220189 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13220198 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13220219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13220264 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13220284 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13220558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13220734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13222393 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 13224634 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 13225545 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13227242 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13228375 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13228982 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 13229243 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13229263 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13230643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13230739 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 13231085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13231436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13232188 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13234709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13236571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13237336 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13238992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13240473 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 13240739 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13241916 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13242838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13243783 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13244329 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 13244855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13246386 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 13246459 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13246747 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 13246748 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 13247547 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 13249426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13249698 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13249728 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13250680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13251428 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 13251447 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 13251582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13251843 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 13252001 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 13252052 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 13252093 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 13252156 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 13252157 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 13252217 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13252384 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 13252456 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 13252500 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13252564 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13252602 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13252639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13252821 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 13252890 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 13252901 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 13252934 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 13253498 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 13253689 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 13253707 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 13254198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13255380 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 13255404 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 13255466 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13256055 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13257054 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13257478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13257591 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13257961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13258282 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13258650 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13258796 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 13258924 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 13259145 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 13259560 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 13259980 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 13260054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13260185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13260319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13260373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13260409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13260411 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13260539 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 13260558 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13260596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13260633 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 13260807 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13261044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13261079 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 13261180 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 13261213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13261240 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13261427 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 13261601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13261751 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13261985 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13262001 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 13262014 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 13262106 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 13262271 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 13262401 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13262510 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 13264904 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13270031 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 13270172 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 13270185 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 13270200 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 13270262 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 13270357 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 13270430 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 13270557 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 13270603 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 13270662 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 13270668 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 13270762 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 13270913 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 13271000 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 13271042 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 13271212 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 13271313 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13271402 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13271622 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13271870 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13274950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13275036 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13275131 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 13275433 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13275518 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 13275664 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 13275713 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13275779 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 13275793 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13275807 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 13275896 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 13276483 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 13276535 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 13276588 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13276715 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13277094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13277174 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 13277259 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13277422 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 13277472 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13277556 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 13277626 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 13277650 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 13277657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13277722 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 13278016 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 13278039 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 13278505 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13278514 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 13279234 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13280024 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 13281465 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13281672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13282869 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 13283727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13285372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13286494 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 13286506 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 13287094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13288372 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13289294 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13289458 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13289627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13289647 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 13290573 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 13290622 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13290756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13290881 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 13291429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13292351 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13292359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13293000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13293501 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13293760 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 13294982 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 13295351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13295413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13296684 G C Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 13296690 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 13296866 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 13297514 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 13297780 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13299041 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13299092 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13299153 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13299221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13299543 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 13299718 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13299917 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 13299966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13300015 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13300071 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13300087 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 13300143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13301014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13302449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13302598 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 13302958 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 13303472 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 13303478 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 13303529 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13303567 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 13303571 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13303657 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 13303683 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 13303923 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 13303929 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13304057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13304105 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 13304182 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 13304253 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13304292 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 13304393 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 13304427 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13304443 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13304476 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13304509 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13304547 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 13304570 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 13304593 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 13304657 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13304696 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13304800 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13304924 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13304956 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13305133 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13305160 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 13305192 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 13305214 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 13305444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13305448 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13305483 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13305486 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13305657 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 13305822 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13305933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13306333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13306975 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 13307070 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13307321 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 13308507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13308653 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13308668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13308690 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13308725 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13308747 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13308769 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 13308773 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 13308901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13308905 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 13308928 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 13308944 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 13308967 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13308976 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 13309024 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 13309032 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13309038 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 13309190 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 13309196 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13309245 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13309300 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13309350 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13309351 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13309412 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13309506 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13309509 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13309561 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 13309582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13309618 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 13309688 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 13309768 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13309811 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 13309813 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 13309828 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13309835 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13309980 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 13310131 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 13310151 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13310171 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13310331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13310682 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13310704 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13310936 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 13311017 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 13311120 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13311172 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13311185 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13311606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13311653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13311897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13312208 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 13312454 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 13312480 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13312575 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 13312576 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 13312591 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 13312814 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 13313149 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 13313309 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 13313595 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 13313628 G T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 13314342 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13314363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13314415 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13314469 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 13314736 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13314741 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13314842 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 13315030 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13315152 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 13315233 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 13315438 T A N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 13315446 T A Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 13315474 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 13315475 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 13315526 C A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 13315538 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 13315555 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 13315618 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 13315925 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 13316092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13316440 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 13316488 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13316872 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13316944 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 13317046 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13317076 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13317115 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13317151 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13317155 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13317233 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 13317284 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 13317330 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 13317450 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 13317451 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 13317476 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 13317543 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 13317707 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13317788 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 13317952 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 13318029 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 13318081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13318265 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 13318341 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 13318435 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 13318472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13318748 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13318887 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13318927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13318970 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13319019 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13319062 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 13319079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13319125 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13319146 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13319155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13319172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13319315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13319318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13319364 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13319387 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13319481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13319484 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 13319639 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13319696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13319703 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13319722 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13319744 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13319770 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 13319785 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 13319922 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13320122 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 13320221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13320300 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 13320373 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13320662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13320882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13321019 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13321362 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13321723 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 13321837 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 13322001 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 13322006 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 13322087 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 13322162 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 13322177 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 13322204 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 13322216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13322430 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 13322436 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 13322488 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 13322803 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13322840 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 13322937 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13322948 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13322979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13322995 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 13323001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13323061 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13323077 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13323094 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13323103 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 13323121 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 13323144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13323167 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 13323385 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 13323513 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 13323599 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13323678 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13323767 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 13323864 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13324063 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 13324295 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13324461 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 13324548 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 13324802 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 13325046 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 13325154 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13325161 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13325166 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13325182 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13325223 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13325227 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13325234 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13325242 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13325246 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13325281 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13325294 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13325354 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13325481 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 13325540 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 13325546 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13325559 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 13325763 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 13325851 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13325863 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13325901 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13326144 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13326204 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13326272 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13326314 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13326371 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 13326420 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13326437 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 13326563 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 13326701 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 13326763 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 13326777 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13326865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13326867 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 13326881 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 13326976 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 13327136 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13327143 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 13327194 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 13327251 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13327444 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 13327541 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 13327617 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 13327674 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 13327766 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 13327827 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 13328069 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 13328104 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 13328178 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13328188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13328333 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 13328341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13328456 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13328515 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 13328521 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 13328570 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 13328626 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 13328795 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 13329062 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 13329239 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 13329244 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 13329576 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 13329649 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13329770 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13329834 T G N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 13329988 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 13330017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13330122 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 13330141 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 13330181 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 13330242 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 13330270 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 13330340 C A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 13330676 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13331939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13332669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13332935 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 13333004 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13333146 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 13333164 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 13333310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13334411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13334438 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13334458 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 13334482 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 13334521 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 13334545 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 13335115 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 13335126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13335491 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 13335500 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13335525 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 13335552 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 13335560 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13335735 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 13335777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13335858 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 13336319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13336502 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13337867 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13337879 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 13338131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13339686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13340876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13341657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13342370 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13342990 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 13343149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13343461 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 13343553 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 13343703 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 13343705 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 13343822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13344178 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 13344424 G C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 13344640 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13344838 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13344933 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 13345009 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13345502 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 13345505 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13345794 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 13345881 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 13346365 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13346410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13346873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13346882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13346975 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 13347156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13347224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13347953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13348164 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13349238 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13351093 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13351563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13351907 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13353136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13353675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13355210 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13355718 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13356334 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13356934 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13356974 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 13357845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13358015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13358265 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13359045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13359153 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13359280 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13359331 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13359410 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13359491 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13359515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13359568 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 13359586 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 13359672 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 2 13359750 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 13359751 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 13359774 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 13359784 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 13359806 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 13359811 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 13359836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13359877 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13359909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13359912 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13359959 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 13360151 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13360316 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 13360381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13360410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13360438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13360473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13360775 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 13360778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13360879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13360956 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13360968 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 13361079 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 13361109 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 13361118 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 13361124 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13361497 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 13361512 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 13361514 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 13361543 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 13361602 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 13361669 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 13361688 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 13361785 C T Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 13361853 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 13361900 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13361954 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 13361981 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13362027 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 13362219 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13362784 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13362905 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13362973 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 13363051 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 13363055 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 13363066 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 13363192 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 13363380 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 13363402 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 13363450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13363464 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 13363481 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 13363489 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 13363509 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 13363572 G C Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 13363710 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13363834 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13364098 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 13364144 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13364281 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13364637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13364643 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13364655 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 13368526 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13369043 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13369253 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 13369351 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 13369780 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13369864 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 13370145 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13370360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13371064 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13371621 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13373317 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 13373730 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13374639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13375041 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13375060 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13375371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13375418 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 13376545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13378598 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 13378853 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13379243 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13379805 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 13380900 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13381670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13382604 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13384910 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 13385870 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13385881 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 13386622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13386845 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 13386875 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 13387075 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13387237 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 13387483 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13387545 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13387912 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 13389835 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13390545 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 13391741 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 13392242 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 13392712 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13393340 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 13394727 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 13394875 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 13395003 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13395053 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13395129 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 13395193 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 13395300 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13395464 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13395550 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13396246 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 13396347 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13396361 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13396395 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13396466 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13396510 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13397196 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 13397228 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13397273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13397336 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 13397534 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 13397540 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 13397622 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 13397695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13397725 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 13397740 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13397927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13398123 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13398345 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 13398377 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 13398471 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 13398484 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 13398533 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 13398652 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 13398700 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13398716 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13398741 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13398764 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13398916 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13399101 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13399162 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13399165 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13399210 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 13399240 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 13401531 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13401671 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13402047 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13402048 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 13402856 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 13403346 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 13403557 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 13404033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13404219 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 13404230 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 13404253 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13405041 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 13405096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13405109 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 13405128 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 13405188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13405554 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 13405992 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13406066 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 13406175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13406717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13407414 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13410041 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13410042 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13410254 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13410402 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13410428 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13410628 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 13411011 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 13411124 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13411485 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13412523 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 13412554 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 13413152 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13414128 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13414233 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 13414659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13414928 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13415240 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13415304 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 13416353 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13416461 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13417616 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13418060 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13418248 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13418689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13419627 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13420885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13421865 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13421870 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 13421942 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13422122 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 13422230 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13422313 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13423237 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13423347 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13423364 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13423563 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 13423589 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 13423860 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 13423969 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 13424030 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13424113 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13424313 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13424382 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13424383 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13424423 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13424555 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 13424569 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 13424657 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13424748 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13424883 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13425180 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13425181 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13425332 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13425393 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13425416 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 13425495 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13425796 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13425800 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13425835 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 13427353 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13427507 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13427565 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 13427837 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13427899 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 13427958 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13427996 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 13428013 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 13428021 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 13428265 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13428295 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13428358 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 13428368 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 13428405 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 13428505 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 13429216 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 13429332 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 13429715 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13429957 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13430108 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13430159 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 13430162 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 13430195 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 13430196 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 13430406 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 13430699 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13430868 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13431069 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 13431129 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 13431144 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13431258 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 13431268 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13431347 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 13431355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13431439 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13431463 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13431818 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 13431846 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13431850 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13432045 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 13432502 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13432628 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13432951 A G Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 13433169 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13433458 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13433577 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 13433616 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13433683 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13433726 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 13433739 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13433793 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 13433899 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 13434038 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 13434071 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13434443 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 13434693 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13434751 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 13434784 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 13434829 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13434844 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13435084 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13435416 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13435872 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 13436009 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 13436164 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13436187 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 13436441 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 13436863 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13436972 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13437867 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 13438227 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13438290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13438827 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 13438832 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 13438887 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 13439067 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 13439209 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13439448 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13439461 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13439627 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13439675 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13439907 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 13439914 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 13441032 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 13442499 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13443837 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13444715 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 13445393 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13448027 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13450541 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13450973 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13451339 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 13451735 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13452192 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 13452296 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13452881 A C N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 2 13452893 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 2 13453318 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.384615384615385 0.153846153846154 0.461538461538462 12 14 5 2 6 2 13453327 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 2 13453580 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 13453619 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 13453657 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 13453803 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 13453934 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13454147 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13454492 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13454591 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13455032 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13455173 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13455249 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13455503 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 13455523 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13455628 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13455660 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13455692 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13455717 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13455751 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13455886 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13455917 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13456058 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 13456373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13459497 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13459684 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13459726 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13459839 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13460108 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13460447 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13460562 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13460581 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13460647 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13460717 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13460773 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 13460847 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13460881 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 13461365 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13461371 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13461691 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13461835 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13462120 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13462275 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 13462848 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 13463479 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13463693 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13464925 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 13466089 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 13470682 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13473190 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13476669 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 13476670 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13476685 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13476988 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13477112 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 13477146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13477334 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13479002 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13479468 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 13480746 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13480787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13480843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13481145 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13481350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13481637 C G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 13481689 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13481796 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 13481911 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 13482031 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 13482049 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 13482050 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 13482068 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 13482099 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 13482406 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 13482510 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 13482709 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 13482937 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 13482952 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13485426 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 13493086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13494038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13498268 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13499230 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 13499291 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 13499306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13499311 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 13499378 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 13499406 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 13499444 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 13499460 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 13499674 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 13499758 C A N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 2 13499782 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 13499847 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13499907 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13499967 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13500173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13500202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13500518 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13500634 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13501140 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13501182 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13501198 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13501486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13501947 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 13502516 T A N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 13502730 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 13502978 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 13503020 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13503036 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13503351 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 13503987 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13505108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13505152 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 13505536 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13505726 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 13505943 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 13505988 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13506059 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13506378 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13507988 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13508453 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13509131 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 13510446 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13510567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13511504 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13511529 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13511591 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 13511605 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13511795 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 13511818 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 13511860 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13512142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13512186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13512296 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 13512315 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 13512330 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13512421 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 13512424 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13512438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13512585 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 13512589 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13512635 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 13512648 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 13512662 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 13512672 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 13512694 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 13512758 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 13512766 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 13512781 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 13512839 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 13512934 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13512939 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 13513408 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13513484 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 13513506 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 13513510 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 13513526 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13513559 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 13513566 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 13513726 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 13513766 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 13513767 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 13513821 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 13514221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13514415 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 13514430 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13514470 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13514492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13516264 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13516309 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13518216 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13518391 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 13518432 G A Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 2 13518469 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 13518578 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 13518618 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 13518664 T G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 13518677 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 13518724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13518894 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 13518953 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13519023 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13519164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13519322 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13519431 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13519442 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13519502 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13519511 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 13519949 C G Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 13520232 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 13520571 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13520712 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13520758 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13520807 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13520845 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 13520929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13521027 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 13521043 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 13521127 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13521161 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 13521209 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13521384 T G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 13521476 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13521486 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13521491 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13521675 G C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13521735 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13521746 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 13521837 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 13522538 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 13522562 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 13522942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13523194 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 13523247 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13523585 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13523827 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13524013 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13524095 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 13524103 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 13524190 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 13524370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13524419 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13524906 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13525355 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 13526064 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 13526234 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 13526256 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 13526276 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 13526358 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 13526447 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13526659 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13526763 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13526792 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 13526796 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13527129 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13527186 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 13527336 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13527788 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 13528490 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13528535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13528541 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13528680 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13528700 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 13528774 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13528801 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13529150 C G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 13529221 C G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 13529252 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 13530315 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13530753 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13530756 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13530785 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13530893 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13531059 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13531119 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13531125 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13532203 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13532280 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13532474 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 13532646 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13532695 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13539534 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13539697 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13539998 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 13540125 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 13540241 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13540388 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 13540471 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 13540582 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 13540599 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 13540616 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 13540624 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 13540689 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 13540690 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 13540865 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 13542004 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13542005 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13542032 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13542220 C G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 13542231 C A Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 2 13542429 C T Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 2 13542558 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 2 13542909 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13542916 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13543067 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13543150 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13543206 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 13543559 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 13543646 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 13543851 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 13544055 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 13544626 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13544659 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13544996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13545042 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13545334 C T N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 13545636 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13545996 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 13546107 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 13546483 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13546499 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 13546744 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13547772 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13548030 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 13548098 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 13548674 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 13548904 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 13550931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13551632 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13551804 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 13551823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13552005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13552376 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13552747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13552823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13552849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13553668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13553864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13553950 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 13554019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13556395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13556880 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13557040 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 13557118 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 13557510 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13557651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13559608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13559679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13561337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13561825 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13563117 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 13563185 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13563687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13564007 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 13564032 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 13564270 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 13564514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13564545 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13564916 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13564955 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 13565132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13565173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13565732 G C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 13566444 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13566862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13567147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13567437 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 13567525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13567595 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 13567639 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 13567645 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 13568001 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 13568023 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 13568027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13568052 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 13568076 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13568095 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 13568126 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 13568605 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 13569136 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 13569173 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13569174 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13569256 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13569445 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 13569543 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13569574 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13569817 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13570853 G C N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 13570931 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 13571059 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13571088 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 13571090 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 13571347 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 13571912 T C Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 13572878 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 13573310 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13573733 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13574225 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13574448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13574779 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13574930 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 13575084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13575265 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 13575375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13575461 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 13575558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13575562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13575652 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13575986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13576049 A T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13576181 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 13576187 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 13576377 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 13576609 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 13576673 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 2 13576836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13576921 G C Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 13576950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13577018 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 13577020 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 13577030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13577069 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13577073 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 13577090 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 13577098 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 13577171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13577297 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13577310 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13577479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13577487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13577627 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13577663 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13577728 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 13577897 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 13578241 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13578246 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 13578288 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13578883 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 13579126 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 13579204 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 13579318 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 13579585 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 13586743 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 13586879 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13587857 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13588000 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13588004 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13588638 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13589272 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13590103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13590647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13590998 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 13591147 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13591307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13591529 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13591531 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13591843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13592909 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13594322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13595479 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 13595499 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 13595550 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13595557 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 13595633 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13596203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13596308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13596414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13596419 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13597047 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 13598271 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13599117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13599809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13599811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13600197 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13600214 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13602015 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13602023 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13602124 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13602357 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 13602424 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13602659 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 13602699 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13602851 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13602883 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13603025 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13603156 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 13606102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13606699 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 13609043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13609632 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13615010 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13615165 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13617068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13617683 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13620249 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13620461 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13620822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13621085 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13621093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13621097 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13621233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13621330 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13621604 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13621992 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13622089 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13622559 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13623061 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 13623355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13624087 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 13624240 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13624468 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13624753 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 13625157 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13625344 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13625594 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 13626095 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13626459 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13628602 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13628646 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13628689 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13628820 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 13628828 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 13628858 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 13629038 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13629141 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 13629201 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 13629479 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 13629602 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13629748 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 13630112 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 13630149 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 13630308 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13630484 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13630545 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13630645 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 13630688 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13630881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13631026 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13631090 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 13631127 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 13631425 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 13631550 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 13631602 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13631703 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 13631725 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 13631908 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13632851 C T Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 13633017 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 13633069 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13633217 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13633282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13633899 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 13633960 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13634484 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 13634677 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 13635072 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13635316 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13635409 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 13635463 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 13635864 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13636173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13636480 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13636572 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 13636623 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13636632 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13636663 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13637042 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13637289 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13637543 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 13637561 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13637577 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 13638119 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13638252 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 13638353 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 13638413 T G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13638447 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13638480 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13638507 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13638562 C A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13638579 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13638783 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13638804 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13638809 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13638894 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13638930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13639356 G T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 13639373 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 13639539 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13639604 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13639795 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13639823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13639888 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 13640159 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13640911 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 13641077 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 13641106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13641316 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 13641646 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13641965 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13642189 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13642498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13643150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13643276 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 13643339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13643743 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 13643891 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 13643987 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13644225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13644319 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 13644384 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13644474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13644535 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13644659 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13644786 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13644969 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13644974 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13644982 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13645111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13645558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13645588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13646034 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13646380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13646478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13646641 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13647354 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13647360 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 13647740 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13647966 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13648297 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13648517 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 13648558 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13649490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13650149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13650235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13650270 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 13650466 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13651766 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13652406 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13652941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13653007 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13655020 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 13657685 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 13660680 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13661541 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 13662359 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 13662361 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 13665481 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 13669078 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13669755 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 13672166 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13674708 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 13675443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13676902 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 13678388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13679518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13680223 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 13681203 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 13682289 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 13683313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13683722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13683831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13683961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13684538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13684697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13684769 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 13685020 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13685524 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13686082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13686188 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 13686189 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 13687243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13688285 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 13688682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13689427 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 13690009 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13690012 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 13690092 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13690199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13690315 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13691698 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 13692141 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 13692214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13694014 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13694401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13695128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13695145 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 13695969 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 13696205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13696571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13697051 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 13697367 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 13698277 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13698407 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13699023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13699212 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 13699643 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13700524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13700961 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 13701552 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13701553 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 13702743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13705978 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 13707040 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13707876 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13708049 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 13712176 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13712443 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13712990 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13713042 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13713140 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13713228 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13713367 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13713424 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13713437 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13713439 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 13713457 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13713540 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13713650 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13713916 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 13714002 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13715992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13716356 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13716945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13717456 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 13717921 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 13717967 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13718409 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 13719078 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13719754 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13726099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13727101 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 13727427 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 13727495 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 13728668 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 13729025 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13730340 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 13730441 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 13730470 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13730735 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 13730834 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13730989 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 13731264 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13731901 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13732521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13732949 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 13734086 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13734118 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13734139 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13734468 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13734604 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 13734792 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 13735052 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13735210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13735227 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13735824 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13736318 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 13736404 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 13736426 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 13738383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13738392 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 13738398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13738930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13740674 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13741203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13741285 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 13741301 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 13741396 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 13741398 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13741449 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 13741492 A C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 13741578 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 13741753 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13742126 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 13742399 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 13743037 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 13743894 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 13744012 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 13744168 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 13744323 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 13744682 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 13744693 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 13745248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13745253 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13745378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13745400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13745412 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13745466 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13755095 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 13755128 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 13755130 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13755298 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13755380 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13755436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13755524 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13755528 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 13755564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13755904 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 13755930 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 13756028 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 13756050 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13756052 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13756101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13756267 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13756270 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13756403 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13756533 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13756550 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 13756652 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 13756817 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13756909 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 13756954 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 13757373 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 13757551 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 13757671 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 13757821 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 13757847 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 13757883 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13757917 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 13758062 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 13758131 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13758163 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 13758315 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 13758373 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13758497 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 13758626 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13758876 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 13758906 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13758935 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13759013 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 13759060 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 13759153 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 13759277 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 13759422 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13759446 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13759508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13759582 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 13759637 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13759675 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 13759677 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13760053 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13760251 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13760459 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13760510 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13760693 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 13760800 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13760861 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13760938 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 13761066 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13761149 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13761266 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13761274 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13761287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13761412 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 13761944 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 13761945 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 13761989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13762039 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13762068 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13762082 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13762113 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 13762125 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 13762130 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13762248 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13762286 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13762296 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13762379 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13762462 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 13762582 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13762669 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13763120 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13763137 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13763151 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 13763230 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13763350 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 13763464 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13763593 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13763650 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 13763721 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 13763819 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13763848 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13764125 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13764273 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13764514 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 13764617 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13764714 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 13764739 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 13764799 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13764826 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13764852 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 13764893 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13764965 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13764969 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13765017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13765122 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 13765160 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 13765161 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13765243 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13765290 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13765311 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13765316 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 13765363 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13765453 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 13765496 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 13765565 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 13765628 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 13765651 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13765659 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 13765768 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 13765788 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13765793 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 13765868 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13765914 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 13765924 G C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 13765932 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 13765954 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 13765985 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 13765999 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13766004 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13766028 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 13766102 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13766140 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 13766306 T G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 13766367 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 13766411 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 13766437 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 13766470 T G Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 13766471 G C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 13766580 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 13766627 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13766715 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 13766770 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13766968 T C Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 13766990 T C Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 13767227 G A Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.3 0 0.7 6 14 3 0 7 2 13767249 G C Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 13767266 A G Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 2 13767280 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 13767390 T G Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 13767469 A G Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 13767522 C T Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 2 13767702 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13767749 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 13767805 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13767835 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13767920 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13768075 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13768163 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13768221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13768263 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13768648 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 13768718 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 13768827 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13768867 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 13768937 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13769116 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 13769133 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 13769153 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 13769229 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 13769354 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 13769363 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 13769448 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 13769469 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 13769568 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 13769603 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 13769616 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13769628 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 13769647 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 13769736 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 13769806 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 13771810 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13771855 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 13771945 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13772021 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13772056 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 13772097 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13772180 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 13772220 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 13772250 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13772289 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 13772596 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 13772735 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 13772747 A T Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 13772838 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 13772851 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13773072 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 13773151 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 13773309 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 13773351 A G Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 13773376 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 13773390 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 13773530 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 13773587 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 13773623 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13773656 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 13774528 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 13774703 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 13774730 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13774736 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 13774880 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13775492 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13775516 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 13775533 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 13775552 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13775752 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 13776438 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13778198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13778239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13778404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13778549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13778678 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13779173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13779253 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 13780339 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 13780359 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 13780396 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13780592 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13780717 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13780775 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 13780910 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13780952 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13780965 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13781022 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13781041 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13781291 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 13781316 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13781330 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13781422 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13781440 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13781497 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13781577 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13781704 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13781749 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13781931 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13782019 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13782063 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 13782103 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13782114 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13782176 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13782203 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13782235 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13782259 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13782267 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13782276 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 13782311 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 13782538 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13782552 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13782665 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 13782666 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 13782906 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13782963 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13782980 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 13783085 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 13783113 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 13783123 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 13783213 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13783268 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13783353 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13783447 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13783621 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13783660 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13783702 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 13783726 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 13784023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13784055 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 13784072 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 13784087 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13784125 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13784152 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13784332 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13784409 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 13784416 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 13784423 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 13784452 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13784487 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 13784493 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 13784501 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 13784520 G C Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 13784533 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 13784546 T G Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 13784615 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13784663 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 13789520 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13791152 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 13791178 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 13791269 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 13791291 T G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 13791294 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 13791312 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 13791354 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13791361 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13791410 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 13791411 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 13791485 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 13791518 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13791608 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13791644 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 13791711 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13791789 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 13791947 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13792121 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13792284 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13792293 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13792460 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 13792491 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13792696 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13792710 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13792768 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 13792780 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 13792835 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13793050 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13793223 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13793250 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13793273 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 13793284 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 13793306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13793312 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 13793380 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13793432 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 13793452 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13793463 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13793517 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13793531 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13793624 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13793681 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13793743 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13793795 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13793817 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13793952 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13793984 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13794014 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13794165 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 13794220 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 13794263 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13794442 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 13794450 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 13794870 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13795575 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 13795937 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13796013 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13796239 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13796277 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13796478 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13796497 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 13796571 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13796634 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13796700 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13796737 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13796901 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13796915 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13797024 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13797126 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 13797619 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13797628 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 13797640 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 13797642 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 13797720 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13797996 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 13798103 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 13798113 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 13798187 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13798214 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13798256 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 13798262 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 13798307 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 13798385 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13798520 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13798539 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13798728 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13798875 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13798890 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 13799028 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13799214 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 13799250 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13799288 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13799299 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13799329 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13799331 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13799479 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13799737 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13799758 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13799762 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13799786 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13799846 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13799863 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13799972 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13800094 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13800120 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13800222 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13800243 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 13800257 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 13800327 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 13800361 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13800395 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13800399 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13800512 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 13800528 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 13800877 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 13800885 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 13800891 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 13801100 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 13801135 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13801184 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 13801238 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13801253 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13801371 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13801405 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13801417 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 13801434 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13801446 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 13801520 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13801652 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 13801704 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 13801739 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13801764 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 13801769 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13801795 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 13801863 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13802417 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13802743 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13802749 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 13802798 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13802811 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13802909 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 13802910 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13802933 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13803104 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13803152 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13803328 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13803704 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 13803878 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 13804069 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13804085 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13804270 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13804280 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13804288 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13804363 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13804412 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13804428 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 13804438 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 13804486 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13804505 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13804583 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13804621 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 13804639 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13804650 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 13804665 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 13804686 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 13804764 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 13804785 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13804889 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13804895 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13804903 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13804914 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13804929 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13804936 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13804941 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13804972 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13804976 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13805073 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13805185 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13805221 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13805239 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13805254 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13805345 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 13805353 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 13805371 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 13805389 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13805481 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13805510 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13805539 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13805540 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13805628 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13805632 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13805645 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13805705 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13805716 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13805751 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13805763 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13805809 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13805811 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13805878 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 13805888 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13805966 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13805972 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13806022 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13806032 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13806084 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13806147 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13806203 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13806209 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13806225 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 13806229 A C Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 13806256 T G N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 2 13806626 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 13806691 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13806726 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13806727 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 13806785 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13806801 C A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 13806834 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13806894 C A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13806965 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13806970 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13807005 A G Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 13807021 T C Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 13807035 C G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 13807041 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 13807052 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13807074 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13807129 A T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 13807253 G A Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 13807340 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 13807358 A C N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 13807372 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 13807604 G C Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 13807626 C T Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 13807765 C G Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13807840 C G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 13807919 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 13808037 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13808056 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13808118 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13808163 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 13808165 G T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 13808205 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 13808216 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 13808337 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13808364 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13808521 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 13808593 C G Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 13808688 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 13808710 G C Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 13808719 G T Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 2 13808848 A G Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 2 13808913 A G Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 13808916 C G Y N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 13808925 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 13808927 C T Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 13808978 G A Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 2 13809152 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 13809191 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13809266 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13809278 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13809350 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13809353 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13809405 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13809415 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13809487 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13809489 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13809537 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13809575 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13809655 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 13809698 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13809772 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13809992 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13810039 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13810118 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13810144 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13810147 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 13810379 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13810446 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13810463 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13810489 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 13810561 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 13810655 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13810745 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13810863 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 13810876 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 13810910 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13811102 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13811120 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 13811216 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 13811226 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 0.0714285714285714 15 13 2 11 1 2 13811313 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13811325 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 13811384 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 13811387 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13811399 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13811442 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 13811555 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 13811665 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 13811670 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13811729 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13811730 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13811753 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13811997 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 13812018 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13812069 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 13812073 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13812217 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 13812289 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13812386 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13812422 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13812477 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13812519 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 13812524 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13812655 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13812690 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13812710 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13812766 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13812775 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13812856 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13812977 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13813237 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 13813264 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13813281 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 13813328 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13813408 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 13813678 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 13813696 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 13813794 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 13813821 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13813869 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 13813893 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 13813995 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13814014 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13814061 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13814547 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13814700 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13815498 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13816013 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13816019 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13816135 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13816149 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13816184 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13816206 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 13816221 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13816287 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13816335 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13816415 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13816435 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13816453 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13816472 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13816494 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13816547 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13816556 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13816655 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 13816776 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 13817759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13817891 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13818102 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 13818668 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13818727 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 13818905 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13819305 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 13819411 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 13819465 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13819538 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 13819541 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 13819612 C G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 13819621 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 13820622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13823808 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13823810 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13824255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13825473 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 13826158 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 13827263 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13827425 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 13827755 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13827865 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13828695 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13829081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13829317 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13829832 G C Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 13830611 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13830674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13831523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13832321 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13832325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13832591 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13833522 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 13834935 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13835136 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13835190 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13835416 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13835434 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13835550 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13836039 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13836053 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13836792 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 13836839 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 13837909 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 13838514 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13839175 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13839920 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 13840491 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 13840752 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 13841072 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13841445 T A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13842157 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13843514 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 13843601 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13843635 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13845674 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13847097 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13847194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13847644 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13847718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13847905 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13847984 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13848087 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 13848414 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13848877 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 13850396 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13852597 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13852598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13854789 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13856656 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13856856 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 13857218 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13859318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13859648 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13859878 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13860775 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13860797 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13860812 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 13860831 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 13860860 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13860871 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13861261 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13861435 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 13861467 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 13861562 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 13861571 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13861584 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13861617 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13861789 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13861807 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 13861890 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13861949 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 13862096 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13862134 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13862220 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13862367 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13862515 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 13862534 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 13862626 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 13862646 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 13862886 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13862918 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13863043 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 13863188 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 13863193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13863306 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13863334 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 13864008 A T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 13864052 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 13864115 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13864252 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13864314 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13864596 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 13864600 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 13864619 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 13864642 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 13864667 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 13864887 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13864917 A T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 13865019 A T Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 13865049 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 13865087 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13865119 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 13865121 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 13865137 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 13865168 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 13865175 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 13865451 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 13865521 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 13865589 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 13865675 G C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 13872410 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13872442 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 13872569 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13872620 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 13872625 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 13872805 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13872920 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13873331 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13873415 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13873420 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13873608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13873720 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13873821 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13873838 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 13873858 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 13873990 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 13874005 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13874036 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 13874094 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13874159 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 13874325 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13874334 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 13874642 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 13874866 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 13874907 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 13875036 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 13875193 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 13875203 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 13875292 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13875568 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13875581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13875840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13875873 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13875894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13876184 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 13876227 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 13876266 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 13876454 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13876630 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13876675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13876687 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13877902 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 13878051 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13878411 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 13878433 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13878618 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 13878814 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13878865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13878905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13878967 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13878992 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 13879003 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13879016 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13879080 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13879385 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 13879656 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13879674 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13879684 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 13879761 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13879841 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13879862 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 13879932 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 13880026 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 13880123 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 13880165 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 13880237 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 13880274 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 13880276 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 13880385 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 13880408 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13880429 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 13880507 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 13880522 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 13880812 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 13880893 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 13881164 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13881345 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 13881373 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 13881893 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13882049 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 13882198 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 13882485 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 13882505 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 13882518 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 13882573 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 13882596 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 13882598 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 13882656 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 13882697 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 13882812 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13882911 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 13883044 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 13883053 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 13883770 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13883775 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 13883805 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13883875 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13883900 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13883901 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13883925 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13883993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13884095 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 13884096 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 13884271 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 13884657 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 13884726 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 13885252 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13886089 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 13886580 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 13887996 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 13887997 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 13888706 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 13889146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13892796 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 13896491 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 13897158 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13897797 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 13898280 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13898338 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13898471 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 13898494 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 13899150 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13899207 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13899265 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13899322 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13899657 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13900049 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13900120 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13900142 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 13900318 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13900333 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13900335 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 13900357 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 13900813 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13900884 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13900919 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13901087 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 13901108 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13901162 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13901210 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13901426 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 13901469 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13901723 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13901897 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13901963 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13902041 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13902137 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 13902866 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 13902981 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 13903092 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 13903165 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 13903176 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 13903197 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 13903413 C T N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 13904106 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13904268 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 13904362 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13904869 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 13904878 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 13905193 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 13905333 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 13905495 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 13905799 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 13905808 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 13905931 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 13906902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13907128 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 2 13908686 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 13909361 A C N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 2 13910006 A C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 2 13910063 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 13910126 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 13910169 G C Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 13910177 T G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 13910187 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 13910410 G A Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 13910538 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 13911336 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 13911361 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 13911403 T A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 13911577 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 13911730 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 13911745 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 13911857 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 13911866 T A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 13911897 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 13912329 T A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 13912401 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 13912598 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 13912650 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 13913254 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 13913331 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 13913657 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13913695 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13914685 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 13914768 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13915101 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 13915168 A C Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 13915314 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13915505 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13915780 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 13915866 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13916806 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13917163 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 13917283 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13917435 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13917601 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 13917639 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13917660 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13917673 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13917721 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13917736 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 13917854 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13917989 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 13918017 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13918108 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 13918224 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13918319 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13918559 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13918835 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 13918890 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 13919070 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13919087 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 13919163 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13919194 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13919240 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 13919329 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13919410 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13919461 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13919489 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13919643 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13919714 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 13919721 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 2 13919828 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13919840 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13919852 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13919917 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13919939 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 13919959 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13919990 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13920071 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 13920116 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13920131 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 13920374 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 13920582 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 13920645 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13920659 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13920836 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13920892 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13921131 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13921160 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 13921175 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13921227 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13921326 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13921346 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 13921480 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 13921586 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 13921591 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 13921753 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13921792 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 13921874 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 13921991 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13922057 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13922107 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 13922170 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 13922185 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13922190 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13922299 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 13922341 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 13922432 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13922437 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13922491 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 13922514 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 13922633 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 13922655 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13922754 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13922918 C T Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 13922923 A C Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 13922929 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 2 13922965 T G Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 13923061 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 13923070 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 13923184 T G Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 13923273 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 13923410 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13923473 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 13923495 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 13923695 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13923758 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13923761 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13924059 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13924406 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13924480 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13924500 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13924685 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13924711 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13924721 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13925019 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 2 13925249 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 13925294 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 13925369 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13925410 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13925621 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 13925772 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 13925846 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13925886 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13925912 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13926008 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 13926050 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13926069 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 13926110 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 13926125 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13926181 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 13926193 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13926213 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 13926427 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13927098 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13927153 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 13927253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13927483 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 13927520 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 13928045 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13928407 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13928655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13928662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13928968 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 13929067 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 13929142 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13929656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13930390 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13931775 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13932056 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 13932710 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13932779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13932829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13933187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13934011 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 13934322 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13934685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13937567 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13937705 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13937764 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13938222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13938528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13938534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13938591 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13938610 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13939194 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 13939641 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13940360 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13940876 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13941161 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 13941560 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13943447 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 13943622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13943645 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 13943658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13943758 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 13944961 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13945022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13945755 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 13945788 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13947718 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 13949150 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13949710 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13949759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13949860 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 13950022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13950134 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13950145 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13950149 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 13950224 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13950289 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13950401 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 13950407 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 13950482 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 13957588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13957776 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 13960017 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13960349 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 13961395 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 13961609 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 13961801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13962681 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13963132 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 13963632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13963644 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13963716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13964220 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13964907 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13965905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13966552 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 13967026 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 13967530 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13969875 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 13969967 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13970008 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 13970086 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 13970362 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13970374 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13970397 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 13970467 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13970608 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13970610 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13970903 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 13970983 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 13971084 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 13971191 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 13971200 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 13971252 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 13971557 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 13971610 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13972022 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 13972172 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13972196 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13972783 T A Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 13973127 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 13973308 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 13973320 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 13973336 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 13973353 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 13973354 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 13973397 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 13973510 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13973644 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 13973646 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 13973686 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13973745 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 13973802 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 13973821 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 13973843 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 13973939 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 13973952 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13974055 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13974108 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 13974194 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13974227 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13974432 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 13974588 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13974632 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 13974672 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13974705 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 13974920 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 13974943 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 2 13975120 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 13975234 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13975302 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 13975681 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 13975811 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 13975820 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 13975899 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 13977773 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13977882 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 13978264 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13978562 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13978717 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 13978895 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13979146 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 13979204 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13979332 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 13979482 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13979734 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13979794 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13979812 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13979844 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13979881 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 13979883 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13979949 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 13980052 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 13980333 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 13980763 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 13981319 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 13981346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13981379 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 13981400 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 13981408 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 13981528 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13981540 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 13981550 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 13981563 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 13981619 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 13981624 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 13981639 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 13981712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13981748 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 13981783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13981815 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 13981831 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 13981857 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 13981907 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13981954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13982016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13982059 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 13982076 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13982139 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 13982184 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 13982208 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 13982336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13982396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13982524 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13982560 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 13982593 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13982605 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13982617 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 13982664 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 13982727 G C Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 13982758 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 13982836 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13982845 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 13982900 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 13982963 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13983051 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13983073 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 13983133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 13983265 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 13983280 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13983613 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 13983619 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 13983858 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 13983996 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13984109 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13984191 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 13984383 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13984803 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 13985014 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13985099 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13986357 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13986641 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 13986662 T G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 13986926 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13987794 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 13987857 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13987909 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13987980 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 13988051 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 13988183 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 13988925 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 13989094 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 13989277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13989305 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 13989726 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 13989732 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 13989815 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 13990213 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13990399 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13990478 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13990524 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 13990527 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13991197 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13991457 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 13991506 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 13991689 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 13991691 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 13991733 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13992150 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 13992411 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 13994389 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 13994526 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 13995118 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 13995480 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 13995611 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 13995619 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 13995815 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 13995864 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 13996336 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13996338 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13996355 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13996382 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 13996665 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13997259 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13997261 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13997648 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13997789 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13997865 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13997911 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13997969 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13998054 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 13998101 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13998180 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 13998183 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13998191 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 13998687 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 13998718 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 13999293 T A Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 14000495 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 14000658 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 2 14008179 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 14008205 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 14008285 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 14008321 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14008339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14008355 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14008465 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14008621 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14008665 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14008726 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14008774 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14008793 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14008921 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 14008940 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14008996 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14009051 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14009485 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14009966 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 14010424 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14010513 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14010665 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14010801 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14010812 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14010858 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14011157 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14011482 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 14011575 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 14011584 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 14011660 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14011949 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14011961 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 14012048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14012126 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 14012180 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 14012186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14012254 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 14012403 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 14012408 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 14012468 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14012922 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14012936 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 14013147 G A Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 14013218 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 14013605 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 14013617 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 14013668 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14013757 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 14013773 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14014319 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14015148 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14015517 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14015556 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14015576 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14015602 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 14015685 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 14015716 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 14015726 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14015740 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 14015795 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14015821 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14015928 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14016017 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 14016190 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14016338 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14016343 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14016377 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14016492 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 14016535 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14016554 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14016645 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 14016898 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14017093 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 14017210 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14017291 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 14017309 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 14017501 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 14017513 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14017536 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 14017614 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14017803 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 14017887 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 14018112 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14018129 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14018190 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 14018201 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14018392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14018738 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 14018800 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14019140 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14019221 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 14019292 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14019468 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14019610 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 14019611 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14019640 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14019978 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 14020111 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14020398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14020407 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 14020818 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14020829 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14021097 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 14021258 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 14021410 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14021751 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 14021758 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 14021804 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 14021903 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 14022135 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14022921 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 14022943 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 14023211 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 14023282 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14024308 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14024564 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14024808 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14024935 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14024951 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 14025359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14025594 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14025690 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 14025735 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14026280 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14026707 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 14026725 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 14026899 T A Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 14027060 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14027374 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14027417 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14027495 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 14028239 T A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14028281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14028966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14028986 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14029087 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 14029240 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14029426 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14029446 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14029722 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 14029802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14030152 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14030174 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14030181 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14030200 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 14030262 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14030555 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 14031039 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 14031535 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14031695 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14031771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14031855 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 14031933 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14032071 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 14032148 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 14033066 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 14033103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14033231 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14033846 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14034199 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14034369 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14034455 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 14034491 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 14034657 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 14034732 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 14035036 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14035585 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14035763 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 14035859 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14036012 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14036229 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 14036278 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14036885 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 14037101 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 14037203 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14037386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14037408 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14037783 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 14037844 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 14038047 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 14038059 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14038313 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14038413 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 14038544 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 14038550 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 14038927 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 14039380 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14039411 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14039453 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14039481 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 14039500 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 14039814 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14039839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14039951 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14040063 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14040072 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14040119 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14048671 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 14048954 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14049142 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14049303 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14049674 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 14050138 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 14050199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14050294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14050547 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14050916 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 14051239 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 14052541 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14053167 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14053400 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 14054012 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 14054014 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14054023 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 14054204 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 14054457 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14055137 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 14055617 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14055682 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 14055950 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 14057362 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14057433 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 14057851 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 14057895 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14058486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14058509 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 14058840 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 14059002 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 14059714 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 14060278 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 14060330 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 14060823 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14060903 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 14061022 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14061161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14061221 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14061318 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 14061396 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 14062089 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14062129 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14062197 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14062560 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 14062590 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14062894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14062947 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 14063105 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 14063195 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 14063325 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 14063463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14063658 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 14063876 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14064221 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 14064254 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 14064368 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14064532 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14064702 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 14064739 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 14064830 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 14065391 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14065493 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 14065688 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 14065989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14066038 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14066162 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 14066267 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 14066276 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 14066836 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 14066853 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 14067047 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14067130 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14067197 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 14067385 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14067390 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14067576 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 14067786 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14067910 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 14069651 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 14070192 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 14070247 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 14070300 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 14070312 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 14070372 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 14070432 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 14070826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14071468 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 14071637 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14071639 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14071732 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 14072101 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 14072259 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 14072333 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 14072717 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 14073922 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 14074005 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 14074137 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14074163 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14074272 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 14074387 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14074546 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 14074577 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 14074581 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 14074618 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 14074681 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 14074695 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 14074828 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 14074900 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 14075061 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 14075219 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 14075338 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 14075426 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14075454 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14075468 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14075473 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14075500 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14075521 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14075585 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14075636 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 14075711 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 14076180 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14076272 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14076279 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14076308 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14076680 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 14076947 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 14077132 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14077191 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 14077279 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14077325 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 14077604 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14077625 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 14077666 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14077882 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 14078114 T G N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.454545454545455 11 11 5 1 5 2 14078217 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 14078232 C T Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 14078467 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 14078477 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14078484 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 14078500 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14078608 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14078621 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 14078629 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 14078669 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 14078696 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14079043 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 14079091 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 14079246 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14079248 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 14079419 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 14079602 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 14079721 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 14079808 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 14080129 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 14080189 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14080427 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14080457 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14081035 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14081065 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 14081538 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 14081690 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14081691 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14082314 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 14082386 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 14082433 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 14082499 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 14082586 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14082718 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 14083583 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 14084137 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 14084522 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14084781 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 14084836 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 14085175 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 14085188 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 14086618 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 14086950 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 14087067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14088033 G T N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 14089520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14089637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14089697 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 14089804 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14089835 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 14090160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14090411 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14090541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14090572 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 14090594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14090913 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14090943 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14090952 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14090998 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 14091014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14091056 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14091063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14091344 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14091345 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 14091365 C A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 14091366 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 14091549 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14091819 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14091876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14091902 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14091904 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14091914 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14092013 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14092106 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14092121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14092306 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14092601 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14092613 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14092636 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14092759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14092841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14092921 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14093239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14093252 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14093509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14093520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14093566 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14093573 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14093978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14094103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14094182 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14094274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14094471 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 14094706 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14094803 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14095077 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14095301 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 14095426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14096405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14098424 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 14099603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14101288 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14101304 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 14101307 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 14101558 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14101909 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14102361 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14102458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14102494 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 14102979 T G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 14103269 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14103503 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14103781 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14104846 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14105111 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 14105212 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14105509 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14105555 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14105570 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14105832 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14106507 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14106573 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14106740 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 14106987 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 14107101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14107102 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14107275 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 14107326 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14107416 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 14107609 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 14107612 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 14107636 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 14107644 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 14107657 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 14107693 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 14107719 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14107723 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 14107739 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 14107772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14107879 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 14107904 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 14107957 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14107960 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14107981 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 14108098 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14108399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14108476 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14108532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14108558 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14108597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14108643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14108645 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14108669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14108729 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 14108785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14108905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14108927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14108930 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14108968 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14108997 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14109015 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 14109146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14109158 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14109176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14109256 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 14109263 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14109311 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14109358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14109423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14109450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14109476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14109654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14109698 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 14109812 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14109919 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 14109936 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14110045 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14110360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14110397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14110538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14110948 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 14110950 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 14110979 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14111006 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 14111075 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 14111581 G A N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 2 14111688 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14111732 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14111847 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14111904 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 14111969 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 14111994 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 14112991 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 14113050 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 14113182 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 14113252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14113391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14113455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14113566 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 14113649 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14113650 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14113824 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14113960 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14113976 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14114002 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14114043 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14114069 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14114376 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14114510 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14114640 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 14114719 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 14114750 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14114859 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 14114896 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 14114937 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 14114995 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 14115255 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14115277 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14115292 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14115304 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14115336 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 14115363 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14115574 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 14115591 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 14115598 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 14115737 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14115738 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14115776 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 14115814 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 14115859 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14115896 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14115910 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 14115973 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 14116030 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 14116046 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 14116068 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 14116116 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 14116220 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 14116328 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 14116394 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 14116425 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 14116445 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 14116516 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14116609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14116639 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14116689 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 14116736 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14116769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14116804 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 14116927 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14119898 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 14120822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14121120 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14121314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14121582 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14123142 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 14123848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14123881 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14124719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14125306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14125414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14125931 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 14126154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14127723 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 14127937 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14128459 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 14128648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14128675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14128808 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14129586 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14129819 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 14129840 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 14129935 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 14130166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14130192 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 14130210 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14130278 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14130300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14130339 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14130383 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14130784 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 14130933 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 14130934 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14130957 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 14130982 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 14131147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14131204 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 14131243 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14131256 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 14131264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14131276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14131302 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 14131324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14131361 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14131486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14131502 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 14131517 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 14131578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14131644 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 14131750 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14131755 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 14131761 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14131821 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 14131918 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 14131964 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14131970 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14132312 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14132428 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 14132508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14132576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14132992 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 14132995 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 14133043 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 14133128 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14133134 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 14133203 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 14133223 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 14133231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14133255 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 14133320 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 14133330 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 14133354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14133498 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 14133665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14133775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14133789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14133801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14133821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14133973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14134058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14134180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14134215 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14134469 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14134556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14134557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14134722 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 14134735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14134862 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14134979 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14134998 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14135028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14135029 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14135140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14135187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14135193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14135237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14135331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14135353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14135405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14135448 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14135496 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14135667 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14136025 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14136080 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 14136171 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14136175 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14136435 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14136489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14136638 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 14136960 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14136972 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 14137477 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 14137526 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14137574 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 14137687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14137699 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14137808 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14137815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14137981 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 14138125 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 14138272 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 14138712 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14138726 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 14138788 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14139047 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 14139099 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14139292 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14139393 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14139440 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14139865 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14139938 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 14140001 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14140172 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14140192 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14140438 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14140997 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 14141669 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14142446 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14142790 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14142874 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14143646 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 14143648 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 14143710 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14144214 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 14144310 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 14144538 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 14144580 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 14144597 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 14144638 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 14144733 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 14144753 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14144758 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 14144841 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 14144862 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14145676 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14145737 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 14145795 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14145811 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14145906 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14146520 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14146643 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14146872 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14146917 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14146923 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14146972 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14146991 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14147139 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 14147189 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 14147195 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14147256 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 14147465 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14147472 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 14147505 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 14147518 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14147532 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14147551 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14147563 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14147580 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14147695 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14147717 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 14147722 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14147742 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 14147778 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 14147808 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 14147839 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 14147999 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 14148005 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 14148135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14148302 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 14148317 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 14148333 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14148484 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 14148661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14148742 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 14148997 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 14149315 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 14149406 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 14149412 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 14149539 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14149791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14150184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14150246 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 14150284 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 14150376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14150628 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14150645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14150647 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 14150686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14150724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14150782 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14150806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151244 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14151322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151458 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 14151502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151548 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151570 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151600 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14151649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151658 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14151698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151710 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14151750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151811 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14151899 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14152000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14152050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14152103 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14152163 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14152166 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 14152219 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 14152226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14152293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14152299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14152359 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 14152384 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14152477 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14152677 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14152857 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 14152905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14152984 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14152985 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14153012 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 14153089 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14153136 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14153409 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14153647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14153684 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14153689 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14153719 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14153729 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 14154894 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14156169 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14156231 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 14156966 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 14157346 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 14159224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14159360 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14159482 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14159682 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 14160222 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14160442 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14160454 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14160658 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14161403 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 14161519 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14161564 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14161632 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14161746 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14161790 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 14161887 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14161892 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14161901 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14162014 T A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 14162496 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14162697 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14162871 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14162900 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14163084 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 14163309 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14163409 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14163790 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14163859 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 14163900 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14164051 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14164194 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14164249 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14164472 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 14164576 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14164625 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14164634 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 14164639 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 14164681 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14164690 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14164748 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14164796 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14164803 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14164833 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 14164840 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 14164846 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14164924 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14164928 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14165726 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14166075 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14166135 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 14166153 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 14166219 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14166291 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14166419 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14166510 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 14166626 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14166721 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14166758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14166820 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14166860 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14167538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14167573 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14167590 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14168362 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14168389 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14168423 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14168711 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 14168738 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 14168751 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 14168764 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 14168925 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 14168998 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 14169001 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14169035 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 14169040 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 14169151 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 14169163 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 14169192 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14169384 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 14169561 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 14169787 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 14171447 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 14171449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14171625 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 14171627 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14171772 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14172124 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 14172125 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 14172362 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14172664 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 14172695 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 14172865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14172954 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 14173060 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14173280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14173672 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14173676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14173856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14173877 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14173935 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14174424 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14174557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14174767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14174854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14175171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14175195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14175228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14175502 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14175530 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14175689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14175832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14175848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14175860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14175870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14175889 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14175915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14175949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14175952 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 14176076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14176169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14176227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14176239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14176267 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14176382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14176441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14176546 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14176556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14176603 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 14176652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14176771 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 14176780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14176835 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 14176843 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 14176876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14176944 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 14177106 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 14177229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14177298 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 14177578 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14177604 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 14177835 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 14177910 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 14177993 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 14177997 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14178099 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 14178120 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 14178399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14178404 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 14178418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14178454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14178460 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 14178547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14178608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14178691 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14178900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14178919 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14179037 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14179454 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 14179500 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14179583 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14179730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14179821 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 14179829 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14179916 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 14179963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14180021 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 14180049 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 14180052 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 14180241 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 14180296 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14180617 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 14180825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14180927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14181144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14181209 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 14181364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14181680 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 14181757 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14181932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14182064 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14182205 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14182290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14182319 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14182325 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14182364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14182393 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14182402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14182425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14182430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14182545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14182748 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14182749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14182835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14182983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14183063 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14183127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14183672 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14183674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14183807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14183866 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14183872 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14184376 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 14184377 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14184413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14184447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14184657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14184718 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 14184744 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 14184874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14185233 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14185248 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14185646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14185658 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14186692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14186774 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14187011 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14187044 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 14187078 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14187393 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 14187487 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14187586 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 14187633 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14187749 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 14188083 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 14188411 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14188611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14188872 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14189083 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 14189113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14190681 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 14190740 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 14190759 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 14190809 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 14190821 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 14190829 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14191016 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 14191033 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 14191446 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 14191492 C T N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 14191586 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 14192063 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14192279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14192284 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14192370 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14192480 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14194596 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 14194945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14195561 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14195591 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14196319 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14196440 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 14196468 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14196486 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14196557 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14196569 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14196625 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14196718 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14196730 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14196754 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14196842 A C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 14197079 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 14197085 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 14197099 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14197394 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14197519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14197621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14197688 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14197693 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14197787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14197997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14199134 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14199175 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 14200610 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 14200991 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 14201031 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14201125 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14201142 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 14201384 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14201391 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 14201650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14201749 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14201864 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14201918 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14201977 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14201995 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14202215 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14202240 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14202351 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14202444 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 14202548 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 14202723 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14203222 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14203333 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14203425 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14203507 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14203554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14203705 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14203708 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14203745 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14203763 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14210535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14210571 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14210886 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14210936 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14210957 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14211279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14211364 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14211684 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14211708 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14211899 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14211911 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14212070 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14212081 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14212262 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14212395 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14212404 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14212441 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14212465 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14212604 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14212673 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 14212792 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14213427 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14213464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14213486 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14213565 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14213730 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14214217 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14214295 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14214564 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14214812 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14214911 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14214928 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14214934 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14215160 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 14215227 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14215419 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14215469 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14215695 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14216273 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14216275 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14216830 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14217009 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14217015 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 14217030 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 14217084 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 14217202 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 14217293 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14225348 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14225567 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14225603 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14225692 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14225772 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 14225862 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14225868 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14225891 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14229207 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14229218 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14229249 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14229457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14229523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14229715 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14229987 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14230246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14230349 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14230570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14230796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14230822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14230848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14230864 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 14230881 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14231089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14231102 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14231117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14231131 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 14231287 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14231815 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 14232088 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14232190 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 14232242 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14232274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14232505 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 14232612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14233178 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 14233209 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 14233223 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 14233224 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 14233314 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 14233347 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 14233540 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 14233608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14233663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14233880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14233884 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 14233939 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 14234183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14234210 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14234897 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14234900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14234961 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14235012 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14235062 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 14235123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14235254 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14235546 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 14235548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14235623 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 14235779 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14235993 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14236070 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 14236722 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 14246030 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 14248609 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14250736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14254957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14255928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14257284 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 14257528 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14257858 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14260760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14260956 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14274750 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14274796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14275225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14275538 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14276775 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14277431 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 14278096 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 14278359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14278733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14279667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14287182 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14287296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14291521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14291619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14303031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14303252 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14303272 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 14303625 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 14303916 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14304038 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14304205 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14308484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14309488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14310615 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 14311287 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 14311302 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 14311605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14311654 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 14311904 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14312389 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 14313159 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 14313174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14313873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14314429 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 14314485 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14314559 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 14314650 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 14316100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14316670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14316678 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14318431 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14322038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14323651 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14323816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14327838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14328952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14329111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14330413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14330653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14331379 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14331460 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14333473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14333602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14334622 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 14334705 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14335180 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14336014 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14337059 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 14337308 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14337449 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14337478 C A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 14337502 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14337641 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14338009 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14338602 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 14338632 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14338840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14339030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14339399 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 14339456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14340018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14340501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14340596 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14340790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14342293 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14342311 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14343323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14345154 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14345343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14345855 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14345970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14349532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14358746 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 14358987 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 14363729 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14363892 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14364325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14364558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14366322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14367612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14369910 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 14370483 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14370501 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14370535 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 14370542 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14370584 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14370627 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 14370642 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 14370691 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14370716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14370773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14370807 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14371364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14372100 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14373292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14375025 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14376975 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 14378473 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14378893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14379727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14379881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14380557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14380893 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14381362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14381459 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14381690 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14381805 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14382087 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 14384355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14387665 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 14387710 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14387797 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14387803 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14387948 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14387982 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14388303 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14388906 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14388984 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14389099 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14389283 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 14389446 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 14389467 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 14389568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14389880 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 14389895 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 14389949 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 14390020 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14390156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14390180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14390189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14390232 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14390242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14390437 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 14390473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14390540 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14390606 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 14390655 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14390680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14390822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14390889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14390904 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14390936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14391000 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14391064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14391093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14391108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14391140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14391463 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14391677 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14391694 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14391825 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 14392256 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14392279 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 14392427 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 14392594 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14392684 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14392754 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 14392841 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14392842 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14392933 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 14392958 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14392997 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14393017 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14393036 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 14393100 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 14393211 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 14393249 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 14393254 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 14393469 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14393614 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 14393636 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 14393666 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 14393688 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14394385 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14395960 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 14396414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14397486 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 14397978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14398010 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14398029 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 2 14398461 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 14398558 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14399018 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14399192 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14399257 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 14399457 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 14399527 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 14400116 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14402677 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14402763 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14403576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14405788 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14405930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14406306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14407544 T G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 14408708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14411385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14411894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14411996 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14412346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14414841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14416504 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14417364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14417839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14419636 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 14419885 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 14419947 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14419955 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14419997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14420026 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14420073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14420129 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 14420338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14420345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14420430 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 14420539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14420729 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 14420731 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 14421098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14421608 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14422211 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 14422695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14423401 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14423836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14427395 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14428150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14428277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14428345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14428593 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 14428616 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 14428633 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 14428638 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 14428683 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14428705 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 14431251 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14431300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14431336 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14431361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14431980 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14432050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14432054 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 14432093 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14432133 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 14432176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14432217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14432262 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 14432357 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 14432824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14433275 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14433284 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14433976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14436273 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14440721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14449021 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 14450454 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 14452015 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14453262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14457382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14457998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14458346 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14459912 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14462057 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14462179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14462319 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14462410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14463088 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14463981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14466240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14468293 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14469091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14469167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14470116 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14470581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14470934 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14471824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14472156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14472565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14473517 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14474227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14476813 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14480349 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14483925 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 14484185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14484605 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14485064 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14486151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14488149 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14488150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14488900 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14489496 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14492644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14493612 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14494550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14496507 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14498622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14499487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14501111 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14504930 A T Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 14509016 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 14509858 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 14509892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14510679 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 14511050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14511373 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14512118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14512437 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14512732 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14513516 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14514870 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14520973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14521305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14522453 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 14522649 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14525520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14526404 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 14535738 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14547615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14550014 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14553564 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14554393 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14557103 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14560634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14560969 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14561757 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14563482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14564221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14567603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14571349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14571357 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 14571601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14572379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14574541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14574640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14576504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14584862 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14592266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14595018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14599004 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14599882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14613994 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 14615942 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14617751 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14620803 G C N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 14622145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14622186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14622204 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14622215 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14622250 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14622251 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14622294 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14622518 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14622662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14622744 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 14622787 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 14622889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14622954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14622955 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14622997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14623019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14623060 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14623367 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 14623395 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 14623431 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 14623770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14624607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14625540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14628210 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 14628745 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 14629361 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14629653 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 14629750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14629847 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 14630674 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14632746 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14632852 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 14633015 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 14633020 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 14633164 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 14633222 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 14633317 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14633495 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14633513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14633923 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14633947 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14633962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14633984 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14634022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14634053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14634068 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14634071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14634082 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14634179 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14634347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14634409 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 14634450 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14634510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14634780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14634825 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14635057 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14635058 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14635138 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 14635370 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14635374 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14635536 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 14635579 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 14635702 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14635726 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14635874 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14636073 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14636304 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14636328 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14636362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14636397 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14636442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14636516 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14636590 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14636606 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14636654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14636692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14636756 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 14636816 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 14636899 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 14637118 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14637240 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14637295 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14637379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14637485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14637591 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14638126 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 14638419 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 14638822 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14639130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14639172 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14639283 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14639445 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14639455 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 14639592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14639613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14639637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14639727 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14639747 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14639767 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 14639938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14640015 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14642159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14642457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14643685 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14645298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14646013 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14647677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14648237 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14655724 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14655918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14658335 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 14658897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14659533 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14660886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14662140 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 14662561 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 14662588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14663203 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 14663405 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14664891 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14664954 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14664960 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14664972 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14665018 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 14665096 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14665098 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14665109 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14665154 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14665206 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 14665326 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14665646 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 14665786 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14665866 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 14665927 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 14666032 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 14666312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14666370 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 14666493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14667272 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 14667295 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 14667319 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14667346 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 14667347 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 14667476 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14667489 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14667522 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14667547 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 14667588 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14667603 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14667820 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 14667904 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 14667923 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 14668232 A G N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 14668249 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 2 14668425 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14668450 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14668591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14668634 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14668656 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14668675 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14668691 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14668692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14668982 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14669099 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14669761 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 14670021 C T N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 2 14670228 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 14670356 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14670420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14670656 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 14670781 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 14670795 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 14671041 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 14671058 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14671143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14671775 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14672063 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14672254 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14672600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14672713 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 14672797 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14672835 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14672841 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14672994 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14672997 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14673043 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14673095 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 14673280 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 14673293 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14673360 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 14673613 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14673615 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14673677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14674037 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14674075 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14674174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14674178 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14674209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14674275 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14674295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14674325 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14674346 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14674401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14674503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14674554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14674564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14674582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14674640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14674802 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14674952 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14675137 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14675432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14675672 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14675694 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 14675981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14676132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14676175 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14676176 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14676229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14676268 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14676337 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14676518 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14676533 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14676534 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14676840 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14676861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14676868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14676885 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14676913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14676980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14677047 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14677089 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14677268 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14677406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14677531 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14677614 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14677820 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14677894 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 14678279 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14678283 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14678321 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 14678459 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14678479 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14678722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14678731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14678751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14678772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14678786 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14678820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14678870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14678877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14678881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14678954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14678967 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14679216 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14679227 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14679360 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 14679577 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14679581 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14680071 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14680122 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14680168 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14680169 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 14680213 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14680280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14680310 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14680330 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 14680332 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 14680352 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14680370 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14680483 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14680498 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14680852 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14680891 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14680918 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14680997 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14681303 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 14681412 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 14681508 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14681544 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 14681717 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 14681728 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14681745 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14682010 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 14682386 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14682406 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 14682528 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 14682560 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14682629 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14682719 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14682920 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14683205 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 14683216 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14683472 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 14683600 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 14683694 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 14683902 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 14683950 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14683961 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14684010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14684070 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 14685279 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14685479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14685527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14686051 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14686344 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 14686491 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14686599 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 14686666 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14686685 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 14686713 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14686734 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 14686765 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 14686785 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14686792 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14686875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14686921 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14686931 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 14686946 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 14686994 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 14687058 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14687155 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 14687252 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 14687276 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 14687319 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14687324 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14687709 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14687734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14687768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14687862 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14687870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14687881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14687901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14687948 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14687970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14687979 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14687984 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14688105 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14688134 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14688157 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14688195 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14688308 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14688429 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14688430 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14688942 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 14688967 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 14689030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14689157 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 14690148 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 14690269 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 14691820 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14691864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14692085 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 14692204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14692221 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 14692226 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 14692306 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 14692623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14692640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14693066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14693915 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14694327 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 14694362 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 14694750 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 14694909 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 14695121 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 14695162 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 14695404 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14697572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14697711 G C Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 14697864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14697900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14697951 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14698163 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14698171 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14698305 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14698381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14698400 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 14698526 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 14698650 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 14698742 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 14698771 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 14698792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14699424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14699628 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 14699696 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 14699724 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14699748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14699760 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 14699811 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14699856 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 14699908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14700023 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 14700210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14700338 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 14700501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14700544 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 14700561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14700588 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 14700679 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 14700819 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 14700825 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 14700967 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 14701232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14701410 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 14702235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14702451 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14703043 A G N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 14703637 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 14703952 C A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 14704657 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14706120 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 14706579 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14707752 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14707909 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 14711630 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 14711916 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14712973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14713515 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14714647 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14715151 T G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 14715295 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14718917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14720702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14722245 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14722333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14722445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14722930 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 14723690 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14723726 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 14723993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14724219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14725191 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14726515 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 14726839 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 14729685 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14730093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14731082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14731461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14734577 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 14735052 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14735791 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14737423 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14742369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14743576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14747224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14748621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14748927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14749417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14750214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14752058 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14753328 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 14754539 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 14755795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14756049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14756701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14759573 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14763547 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 14765645 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 14765832 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14767646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14767928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14768146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14768269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14769189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14770185 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 14770634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14771076 T A N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 2 14773168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14773485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14773796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14774607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14774965 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14775130 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 14775853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14776461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14777478 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14778512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14778560 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14778603 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 14778636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14778822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14778847 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14778979 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14779004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14779187 T C Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.0833333333333333 0.75 0.166666666666667 11 13 1 9 2 2 14779233 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 14779338 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 14779412 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14779422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14779473 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14779743 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 14779807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14779988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14780095 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14780366 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 14781031 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14782518 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14782970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14783781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14783833 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14785198 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14785323 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14785434 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 14785487 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 14785813 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14785881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14786389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14788161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14789363 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14791569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14792065 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14793005 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14793299 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14793310 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14793312 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14793390 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 14793423 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 14793534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14793535 A T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14793550 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14793853 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14793892 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14794041 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 14794064 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 14794076 T A Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 14794077 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 14794712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14794769 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 14794951 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 14795043 T A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 14795197 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14795647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14795920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14796006 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 14797101 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14798190 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14798609 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 14799167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14799932 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 14800216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14800726 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14801188 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 14801470 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 14801488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14801573 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 14801694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14801906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14801916 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 14801964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14802160 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14802217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14802377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14802413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14802459 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14802538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14802660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14802873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14802926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14803257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14803310 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14804019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14804034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14804117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14804144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14804322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14804480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14804617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14804640 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 14804713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14804845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14804855 A T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 14804901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14804950 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 14805002 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 14805201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14805209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14805303 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 14805415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14805423 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 14805448 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 14805865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14806066 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14806381 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 14806953 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 14806956 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 14806994 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14807080 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14807962 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 14808418 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14808564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14808690 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 14809471 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14809651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14810367 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14810543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14811690 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14811828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14811882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14811978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14812041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14812320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14812393 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14812477 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 14813057 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 14813661 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 14813669 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 14813978 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 14814169 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 14814179 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 14814180 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 14814200 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 14814258 A G Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 14814505 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 14814533 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 14814548 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14814593 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 14814704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14814709 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 14814885 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14815118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14815119 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14815176 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14815432 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14815485 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14815529 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14815654 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14815709 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14815924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14816087 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14816340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14816769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14817784 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14818125 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14818605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14818645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14819136 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 14819146 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 14819299 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14819439 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 14819824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14820028 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14820526 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14820609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14820692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14820913 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 14820980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14821464 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 14821493 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 14821507 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14821645 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14821736 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14821908 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14821973 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14821997 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14822106 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14822112 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14822172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14822254 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14822277 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14822419 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14822426 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 14822476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14822481 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14822590 C G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 14822619 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14822681 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14822979 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14822995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14823213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14823251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14823521 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14823522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14823571 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14823930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14823943 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14824033 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14824194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14824262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14824304 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14824405 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14824440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14824459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14824497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14824536 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14824622 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14824623 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14824844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14824873 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14825108 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14825414 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14825441 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14825811 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14826596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14826626 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14826668 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14826970 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 14827067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14827245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14827265 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14827443 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14827503 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 14827521 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14827536 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14827561 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14827576 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 14827700 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14827784 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 14827918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14828256 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 14828325 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14828396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14828452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14828558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14828591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14829014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14829169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14829510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14829755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14830800 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 14831683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14832233 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14833022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14833288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14833360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14833423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14836963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14839731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14846482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14846798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14847243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14848350 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14849300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14850664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14851130 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14853603 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14856428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14858670 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 14859541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14859723 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14859733 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14859756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14859793 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 14859986 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14860069 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 14860128 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 14860483 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14860640 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14860697 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14860837 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14860844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14860892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14860916 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14861136 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14861137 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14861772 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 14863039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14863568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14863721 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 14864522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14864646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14864911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14865349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14865654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14866226 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14866258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14867811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14868288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14869019 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14877496 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 14878004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14878591 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14878930 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 14879015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14880173 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14880461 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 14881881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14882198 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14882541 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14886457 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14886965 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 14886976 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 14892287 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14893344 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14893600 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 14893822 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14894074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14894995 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14895266 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14895294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14895442 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14896488 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14896953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14897135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14897174 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14897218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14898028 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14898053 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14899679 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 14899714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14899763 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 14899889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14902609 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 14902628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14902647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14902818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14903149 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14903203 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14903719 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14904098 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 14905191 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 14907415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14910023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14910651 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14910741 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14911046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14913433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14913885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14914140 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14914237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14915163 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14916613 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14918093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14919113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14921590 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14923355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14925364 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14934377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14934618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14935048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14937712 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 14938254 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 14938589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14940887 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 14941387 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 14949016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14949613 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 14949693 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 14950938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14952394 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14952821 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14953365 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14953485 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 14953869 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 14953923 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 14956157 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14956164 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 14956279 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 14957355 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14958021 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 14958446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14958504 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14958722 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 14959283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14959295 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14959369 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 14959392 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 14959491 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 14959664 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 14960593 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 14960618 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 14963781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14965147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14965825 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 14966332 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14966670 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 14967781 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 14968324 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 14972540 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 14973030 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 14973108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14973906 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 14974162 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 14974438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14976282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14977677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14978431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14979179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14979760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14982570 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 14983753 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 14984156 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14984375 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 14984676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14984903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14985300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14985420 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 14985543 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 14986658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14986659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14987956 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 14988592 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 14989974 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 14990326 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 14993325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14993880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 14993967 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 14994270 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14995664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14996048 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14996049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14996806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 14997325 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 14998937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15000366 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15000679 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15000699 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15001663 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 15003216 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15003477 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15003672 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 15004139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15004337 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15004381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15004622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15005233 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15005333 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 15006369 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15006482 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15006704 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15006903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15007214 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15008737 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15009188 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15009354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15010017 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15010099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15010261 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15010273 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 15010279 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15010444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15010467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15010471 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15011099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15011288 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15011644 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15011650 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15013225 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 15013869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15014409 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15014583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15015362 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 15015545 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 15015568 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 15015569 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15015608 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 15015721 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15016051 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 15016232 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 15016279 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15016286 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 15016347 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15016348 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15016364 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 15016395 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 15016467 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 15016488 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 15016570 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 15016589 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 15016692 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 15016702 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 15016710 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 15016785 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 15016806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15016930 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15017543 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 15017571 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15017599 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15017607 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15017626 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 15017646 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15018049 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15018122 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 15018307 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15018584 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15018636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15018834 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15019039 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15019062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15019122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15019184 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15019264 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15019276 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15019315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15019429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15019631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15019738 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 15019776 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 15019856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15019933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15020008 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15020080 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15020225 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15020245 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15020337 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15020348 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15020410 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15020441 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15020443 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15020544 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15020594 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15020624 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15020639 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15020661 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15020784 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15020791 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15020999 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15021000 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15021106 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15021146 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 15021167 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 15021190 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 15021298 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 15021326 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 15021417 G A N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 15021519 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 15021587 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 15021651 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 15021725 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 15021940 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15021972 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15021975 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 15022011 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15022022 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15022046 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15022053 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15022117 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15022139 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15022251 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15022256 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15022332 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 15022544 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 15022622 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 15022646 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 15022872 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15022950 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 15022976 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 15022985 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 15023024 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15023147 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 15023228 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 15023409 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15023514 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15023526 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15023547 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15023565 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15023612 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15023633 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 15023701 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15023726 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15024055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15024147 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15024305 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 15024335 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 15024360 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15024455 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15024506 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15024787 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15024813 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15024838 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15024960 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15024963 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15025016 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15025169 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15025221 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15025392 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15025471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15025518 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15025556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15025576 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15025613 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 15025654 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 15025961 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15025987 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15026053 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 15026099 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15026301 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15026565 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15027008 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15027068 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15027593 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15027635 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15027721 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 15027733 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 15027749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15027751 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15027867 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15027948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15028005 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15028308 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15028338 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15028359 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15028370 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 15028439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15028528 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 15028588 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 15028665 C A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 15028760 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 15028851 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15028991 G C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 15028997 A C Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 15029037 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 15029061 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 15029108 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15029244 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 15029262 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15029363 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15029381 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15029444 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15029481 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15029488 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 15029718 G T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 15029753 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 15029758 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 15030230 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15030389 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15030418 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 15030545 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15030557 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15030566 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 15030813 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15030821 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15030875 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 15031079 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 15031157 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 15031224 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15031316 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15031344 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 15031487 T A Y N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 15031517 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 15031567 T C Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 15031577 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 15031583 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 15031645 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 15031675 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 15031718 G A Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 15031924 A C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 15031942 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 15031951 T A Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 15031964 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 15032083 A T Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 15032101 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 15032204 C G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 15032214 C T Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 15032226 C T Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 15032251 T C Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 15032338 G T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 15032373 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15032517 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 15032550 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 15032581 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15032669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15032771 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 15032876 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15032882 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 15032952 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15033015 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15033289 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 15033326 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 15033400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15033466 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15033529 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15033531 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 15033576 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15033701 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15033786 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15033854 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15033858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15033868 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15033895 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15034058 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15034207 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15034274 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15034581 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15034592 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15034618 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15034658 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15034743 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15034826 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15035102 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15035108 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15035179 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 15043704 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15043921 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15044136 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15045124 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15045279 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15045367 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 15045395 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 15045785 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15046133 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15046262 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15046826 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15047254 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15049434 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 15049451 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 15049792 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15049965 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 15050287 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15050338 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 15050413 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15051183 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15051264 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15051611 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 15051680 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15052099 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15052177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15052448 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15052469 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15052486 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 15052525 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 15052678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15053103 G T Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 15053379 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 15053515 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15053533 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15053622 G T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 15053662 C T Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 15054006 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 15054082 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 15054117 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 15054192 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15054203 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15054307 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15054896 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 15054963 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15055243 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15055310 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15055475 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 15055754 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 15055876 A T Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 15055914 T A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15057311 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15057330 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15057537 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15057931 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15057968 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15058021 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15058418 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15058893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15059260 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15059840 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 15059916 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15061398 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15062214 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 15062405 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15062679 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15062690 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15063555 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 15063631 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 15063659 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15063707 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15064043 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15064057 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15064159 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15064193 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15064476 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15064607 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15064776 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15064840 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15064931 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15065172 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15065208 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15065232 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15065340 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15065362 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 15065397 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 15065505 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 15065599 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 15065780 T A N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.153846153846154 0.692307692307692 0.153846153846154 13 13 2 9 2 2 15066235 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 15066243 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 15066272 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15066277 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15066302 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15066564 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15066704 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15067019 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 15068694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15069085 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15070804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15072781 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15073635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15073851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15074578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15076182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15076349 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15077642 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15078839 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 15078842 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 15079061 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 15079464 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 15079961 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15080053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15080114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15080322 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15081396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15081865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15082021 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 15082660 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15083405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15084468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15084581 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 15085576 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 15085666 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 15086045 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 15087180 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15087438 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15089620 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 15089956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15089978 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15091431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15092588 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 15097669 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15099194 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15099308 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15101607 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 15102398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15105892 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15112597 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15114002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15127158 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15127480 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 15128678 G C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 15131668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15132118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15133266 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15139372 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15139449 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15141671 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 15141834 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15142009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15143069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15144820 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15145195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15147044 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15150225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15150853 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15154479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15154732 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15155534 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15155535 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15159223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15159708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15159710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15160192 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 15162154 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15164369 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 15173348 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15173820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15181518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15181737 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15182772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15182986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15183301 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 15185972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15188746 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 15189233 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15189309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15189426 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15190347 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 15190896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15192739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15195283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15198231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15198413 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15200381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15202502 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15206480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15208176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15208344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15210453 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 15212137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15213306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15213952 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15214491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15214898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15221848 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 15226452 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 15226506 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 15234360 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 15234379 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 15235659 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 15236730 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 15236983 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15246402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15246701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15247775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15251032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15251409 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15259873 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15260018 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15260810 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 15260865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15261012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15264831 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 15264946 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15265063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15265122 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 15265123 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 15265173 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15265508 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 15265534 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 15265587 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15265893 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 15265992 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15266120 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 15266311 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 15266386 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 15266499 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 15266527 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 15266719 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 15266724 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 15266829 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 15266840 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 15267141 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15267149 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 15267211 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15267477 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15267495 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 15267534 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 15267590 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15267695 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 15267711 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 15267736 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 15267834 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 15267856 A T N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 15268024 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 15268096 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 15268243 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 15268267 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 15268299 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 15268358 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 15268407 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 15268441 C A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 15268866 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 15269022 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15269043 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 15269142 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 15269182 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 15269229 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 15269290 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 15269372 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 15269435 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15269459 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15269557 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15269656 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15269770 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15269849 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15269897 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15269909 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 15269947 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15270131 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15270182 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 15270185 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 15270541 A C Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 15270653 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 15270730 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 15270827 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 15270843 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 15270920 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 15271125 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 15271152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15271260 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 15271353 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 15271381 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 15271407 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 15271454 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 15271470 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 15271685 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15271873 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 15271958 A T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 15271978 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 15272262 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 15272327 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15272558 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15272580 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 15272662 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 15272698 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 15272780 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15272835 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 15272974 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15272975 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 15273056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15273070 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 15273142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15273179 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 15273275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15273307 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 15273332 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 15273362 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 15273386 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 15273387 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 15273503 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 15273504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15273654 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 15273808 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15273810 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 15273857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15273985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15274041 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15274045 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15274095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15274114 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15274155 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15274205 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15274242 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15274243 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15274281 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15274295 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15274321 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15274383 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15274510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15275135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15275240 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15275279 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15275656 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 15276875 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 15277299 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15277310 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15277531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15278073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15278463 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15278729 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15280519 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15281551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15282408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15282447 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15283709 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15284136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15285054 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15285520 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 15285564 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 15285637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15285704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15285730 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15286496 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 15286508 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15286509 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15286529 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15286535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15286674 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15286763 C G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 15286771 C G Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 15286984 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 15286990 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 15287006 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15287054 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 15287128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15287160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15287203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15287211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15287322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15287469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15287513 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 15287642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15287763 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 15287813 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15287855 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15287868 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 15287914 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 15287939 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 15288033 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 15288065 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 15288077 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 15288090 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 15288139 C T Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 15288148 G A Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 15288155 C A Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 15288394 C A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 15288506 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 15288594 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 15288629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15288681 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15288705 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15288976 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 15289063 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15289067 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 15289215 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 15289251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15289264 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15289352 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15289522 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 15289551 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15289585 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15289604 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 15289618 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 15289626 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 15289723 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 15289747 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 15290025 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 15290042 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 15290105 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 15290163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15290298 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 15290321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15290341 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 15290355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15290469 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 15290479 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15290496 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 15290517 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 15290666 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 15290753 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15290816 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15290883 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15290946 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 15290957 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15290963 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 15291032 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15291196 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15291356 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 15291386 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 15291660 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 15291865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15292094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15292876 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 2 15293141 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 15293319 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 15293367 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15294211 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15295277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15296225 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15296496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15305588 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 15305657 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 15305957 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15306905 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 15307269 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15307364 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15307805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15307951 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15307965 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 15308380 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15308420 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15308502 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15308535 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 15308596 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15308611 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15308673 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 15308693 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 15308748 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15308771 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15308796 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15308911 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 15309497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15309710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15309883 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15309968 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15309988 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 15310017 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 15310030 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 15310189 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15310419 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15310468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15310625 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15310687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15310736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15310846 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 15310893 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15310908 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15311069 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15311072 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15311132 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 15311138 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 15311372 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15311380 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15311809 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 15311942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15311982 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 15312083 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15312181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 15312247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15312363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15312592 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 15312912 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15312916 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 15312952 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 15313058 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 15313228 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 15313230 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 15313242 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 15313260 C G N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 15313273 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 15313343 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 15313359 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 15313372 C A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 15313439 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 15313466 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 15313508 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 15313615 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 15313812 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 15313874 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 15313939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15313968 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 15314043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15314062 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 15314109 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 15314160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15314167 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 15314175 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 15314326 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15314399 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15314604 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15314842 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 15314962 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15315021 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 15315028 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 15315086 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15315116 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 15315411 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 15315543 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15315626 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15315676 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15315722 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15315838 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 15315856 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 15315899 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15315956 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15315962 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 15316031 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 15316034 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15316075 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 15316093 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 15316162 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 15316327 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15316350 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15316449 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 15316560 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 15316577 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15316580 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 15316973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15316979 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15317077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15317150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15317274 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 15317280 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15317396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15317528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15317585 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 15317663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15317699 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 15317879 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15318138 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 15318161 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 15318205 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 15318214 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15318303 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 15318319 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 15318363 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 15318431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15318464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15318508 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 15318840 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15319653 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 15319988 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 15320203 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 15320291 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15320472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15320512 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15320596 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 15320844 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 15320893 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 15321231 A T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 15321232 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 15321357 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 15321372 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15321515 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 15321771 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15321942 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15321943 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15321976 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15322081 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15322103 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15322282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15322342 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 15322832 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15323161 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15323711 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15324240 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 15324258 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 15324275 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15324603 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 15325640 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15325773 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15326036 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15326157 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15326604 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 15327847 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15328142 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 15328148 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15328305 A C Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 15328376 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15328954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15329510 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 15329577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15329953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15330110 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15330312 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15330333 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15330511 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 15331626 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15332706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15332729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15333870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15333934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15333944 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15334517 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 15334605 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 15334638 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15334691 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 15335200 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15335392 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 15335655 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15336004 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15336375 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15337073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15337549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15337673 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15338550 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15338961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15340832 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15340913 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15342847 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15343852 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15344614 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15344814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15347525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15350984 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 15358355 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15358472 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15359855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15360286 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15362505 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15364558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15365195 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15365806 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15367026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15367143 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15369123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15369246 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 15369282 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15369679 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15370509 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 15376780 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15382811 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15384630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15392268 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15400559 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 15400572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15400933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15401013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15402282 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15402871 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 15402905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15403289 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15403464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15403629 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 15404324 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15404786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15405176 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15405398 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15405486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15405744 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 15405746 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15405838 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15405925 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15406247 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15406737 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15407760 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 15408467 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15409531 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15409613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15410852 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15411786 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 15412027 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15412406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15412797 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 15412798 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 15412823 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 15414342 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15414404 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15414837 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15415017 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 15415289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15415295 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15415560 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15416327 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15416404 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 15416495 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15416559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15418029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15419805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15420267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15420798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15422463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15424715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15424769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15424856 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 15424893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15424927 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15425271 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15425425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15425495 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 15425510 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 15426393 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15426396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15429046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15429508 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15429624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15430856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15432003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15432410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15432816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15433674 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 15433810 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15435230 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 15435409 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 15435501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15436802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15436918 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15437215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15437282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15437615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15437898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15438114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15438173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15438246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15438308 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15438309 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15438936 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15439751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15440203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15440204 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15440345 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15440817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15441806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15442168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15442802 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 15442834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15442884 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 15443496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15445698 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15446101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15446584 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15446614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15447625 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15449204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15449235 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 15449352 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15450065 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15450792 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 15451097 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15452105 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15452554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15453711 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 15453792 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 15455888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15456822 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15456889 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15458312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15458344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15458636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15458755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15459377 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 15461115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15465641 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15466801 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15467677 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 15469266 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15470124 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 15470292 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15471865 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15471993 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 15472083 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15472503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15472808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15474342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15474365 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15474641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15475516 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 15475882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15475994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15477677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15477822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15478035 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15479203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15480084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15480378 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 15480666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15481451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15481623 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15482488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15483149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15483995 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15484024 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15485241 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15492774 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 15495442 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15496009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15496980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15497362 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15507022 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 15508510 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 15509198 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 15510267 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 15511420 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 15512053 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15513983 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15515969 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15518580 G T Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 15525516 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15525912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15526059 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15527189 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15527596 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15527874 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15528111 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15529127 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15529520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15530225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15531540 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15531937 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15535385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15535498 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15535758 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 15536120 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 15536187 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15536417 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 15536780 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15536934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15537007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15537016 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15537082 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 15537155 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 15537426 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15537451 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 15537485 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15537532 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15537640 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 15537726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15537863 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15537869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15538154 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 15538640 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15538828 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15538902 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15539320 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 15539330 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 15539362 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 15539502 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15539519 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15539596 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 15539754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15539933 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 15540201 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 15540253 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 15540261 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 15540450 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15540500 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15540578 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15540710 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 15540733 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 15540799 A C Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 15541003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15541225 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15541263 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 15541460 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 15541468 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15541535 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15541598 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 15541622 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15541814 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 15541986 C G Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 15542010 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 15542068 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15542093 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15542309 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 15542494 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 15542533 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 15542569 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15542620 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15542696 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 15542709 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 15542712 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15542721 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 15542723 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 15542793 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 15542811 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 15542929 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 15542937 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 15542949 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 15543026 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15543066 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15543091 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15543101 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15543117 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 15543139 T G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 15543147 G T Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 15543271 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 15543354 T C Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 2 15543367 A G Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 2 15543397 A C Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 15543429 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15543440 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 15543577 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 15543624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15543669 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15543772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15543935 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15543942 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15543959 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15544094 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15544241 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15544434 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15544592 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15544597 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15545025 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 15545458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15545482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15545557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15545616 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15545879 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15546523 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15546744 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15547095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15548394 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 15549412 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15549805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15549876 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 15549987 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 15550009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15550044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15550145 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 15550277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15550548 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15550729 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 15551210 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15551547 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15551620 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 15551770 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 15551812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15551984 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15552113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15552159 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15552193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15552241 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 15552323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15552351 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 15552358 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 15552719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15553148 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 15553227 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 15553256 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15553276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15553280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15553476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15553491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15553506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15553516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15553863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15554402 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 15555584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15555643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15555960 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15556036 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 15556055 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15556083 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 15556100 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 15556230 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15556257 T C Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 15556985 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15557405 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15557854 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 15557874 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 15558002 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 15559222 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15559697 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15560373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15560871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15561760 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15562138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15562152 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15562357 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 15562414 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15563016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15563024 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15563138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15563385 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15563433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15563500 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15563586 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15563677 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15563681 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15564155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15564267 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 15564363 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 15564590 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15564704 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 15564816 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 15565178 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 15565262 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15565579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15566575 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 15566625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15566639 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15566741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15566925 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15567691 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 15568013 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15568026 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15568123 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 15568169 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 15568178 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 15568540 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15568570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15568734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15568751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15568831 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15568878 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15568986 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 15569032 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 15569082 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 15569128 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15569518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15569549 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15569730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15569777 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15569778 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15569928 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15570136 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15570231 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15570303 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 15570309 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 15570682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15570972 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15571433 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15572018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15572246 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 15573101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15573121 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15573978 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15574222 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 15574447 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15574996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15575731 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15575763 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15576123 T C Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 2 15577138 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15577685 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15577768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15578055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15578063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15578565 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 15578799 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15579115 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15579290 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15588419 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 15588558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15588559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15590007 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15590148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15591073 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 15591197 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15591618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15591663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15592718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15593862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15594143 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15594386 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15595295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15595541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15597332 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 15597879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15599596 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 15599954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15600452 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15600630 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 15600811 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15601840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15602407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15602931 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15606849 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 15607012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15608427 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 15608513 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15608798 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 15608867 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 15609002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15609054 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 15609055 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 15609158 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 15609189 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 15609302 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 15609533 A C N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 15609709 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 15609989 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 15610309 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15610422 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 15610589 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 15610832 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 15610955 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15611007 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 15611051 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15611146 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15611329 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15611496 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15611717 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15611718 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15611793 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15611937 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15611964 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15612048 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15612414 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 15612487 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 15612527 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 15612613 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15612901 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15613105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15613534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15614295 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15614568 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15617300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15617447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15617631 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15620766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15620775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15621910 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 15622074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15624649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15625539 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15625746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15626548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15626592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15628358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15628806 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15630424 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15630735 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15630888 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15632607 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15633229 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15633539 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 15633918 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 15634115 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15635759 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15636801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15637433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15645112 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15645506 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 15645783 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15646629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15647668 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15648648 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15648722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15649771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15651780 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 15653015 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15655478 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15656349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15656628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15658671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15660802 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15662786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15663431 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 15665381 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15665480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15665484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15665653 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15665688 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 15666233 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15666353 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 15666448 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15666868 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15667767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15668151 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15668152 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15668163 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15668865 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15669025 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15669797 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15670049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15670104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15670702 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15671189 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 15671583 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15671750 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15671796 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15672089 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15672797 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 15672866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15673015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15673330 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15673461 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 15674127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15674282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15675348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15675563 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15678876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15679219 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15679282 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 15679582 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15679763 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 15680035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15681724 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15682114 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 15684189 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15684519 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15684586 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15685924 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15686536 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15686653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15687934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15688361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15688547 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15689080 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15689280 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 15690369 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 15692496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15693122 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15693801 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15694134 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 15694160 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15694232 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15694329 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 15694560 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15694644 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 15694788 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15694886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15694910 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15694924 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 15694932 C T Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 15695142 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15695191 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15695205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15695273 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 15695332 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15695361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15695417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15695502 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15695531 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15695576 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15695699 A G Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 15695836 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15695879 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15696036 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 15696125 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15696133 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15696257 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 15696281 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15696293 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15696401 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15696451 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 15696584 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15696658 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15696687 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15696756 C G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 15696876 C T Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 15697169 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15697284 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15697320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15697413 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15697414 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15697449 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15697564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15697788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15697832 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 15698130 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15698216 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15698381 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15698407 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 15698435 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 15698500 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15698627 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 15698762 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 15698790 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15699081 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15699093 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15699252 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15699318 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 15699422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15699658 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15699751 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15699764 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 15699837 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15699865 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 15699941 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15699976 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15699977 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15700026 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 15700266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15700596 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15700631 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15701077 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15701457 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 15701532 C G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 15701836 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15702009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15702080 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15702100 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15702108 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15702157 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 15702168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15702215 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15702264 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15702396 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15702443 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15702453 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15702699 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15702717 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15702814 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15702844 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15703015 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 15703318 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15703358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15703466 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15703490 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15703511 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15703581 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15703584 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15703643 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 15703709 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 15703857 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 15703928 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 15703973 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 15704047 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 15704068 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 15704075 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 15704203 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15704265 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 15704376 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 15704407 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 15704411 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 15704452 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 15704608 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15704703 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 15704737 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15704749 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15704780 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15704790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15704880 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15704929 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15704934 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15704971 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15704995 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15704997 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15705012 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15705052 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15705170 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15705269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15705310 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15705369 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15705391 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15705402 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15705473 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15705547 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15705615 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15705629 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15705734 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15705810 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 15705929 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 15705983 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15706068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15706119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15706232 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15706254 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 15706299 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 15706366 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15706445 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 15706586 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 15706627 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 15706632 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 15706773 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15706806 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15707149 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 15707237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15707320 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 15707321 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 15707357 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 15707560 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15707599 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15707692 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15707816 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15707900 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 15707925 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15707948 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15708055 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15708165 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15708229 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 15708626 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15708785 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 15708867 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 15709016 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15709263 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 15709331 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15709394 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15709461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15709494 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 15709601 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 15709611 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15709642 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15709661 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 15709674 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 15709768 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15709800 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15709813 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15709914 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15710070 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15710370 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 15710510 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 15710651 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15710719 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15710739 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15710787 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15710869 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 15710931 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15710962 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15710996 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15711250 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15711314 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15711320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15711346 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 15711485 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15711542 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15711602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15711616 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 15711636 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 15711687 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15711734 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15711737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15711747 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15711900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15711949 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 15712047 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15712096 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15712112 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15712150 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15712407 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15712639 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 15712684 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 15712876 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 15712913 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 15713053 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 15713175 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15713303 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 15713465 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 15713511 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15713897 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 15714014 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 15714473 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15714509 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 15714675 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 15714829 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15714834 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 15714992 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 15715089 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15715164 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 15715214 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15715358 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15715394 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15715454 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 15715501 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 15715505 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 15715536 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15715552 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15715595 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15715651 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15715897 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15715903 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15716039 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 15716046 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15716150 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 15716158 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 15716248 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 15716443 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15716547 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 15716890 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15716908 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 15716997 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15717009 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15717019 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15717046 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 15717047 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 15717058 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 15717080 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15717266 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 15717348 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 15717363 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15717375 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 15717437 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 15717470 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15717493 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 15717538 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 15717626 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 15717651 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 15717681 T A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 15717706 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 15717732 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 15717742 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 15717914 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 15718484 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 15718492 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 15718519 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 15718569 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 15718604 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15718737 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15718985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15719189 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15719197 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 15719512 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15719523 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15719548 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 15719676 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 15720124 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 15720179 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 15720253 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15720574 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 15720639 G C Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 15720727 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 15720952 T A Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 15721011 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15721042 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 15721044 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 15722415 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 15727268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15728460 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15733350 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 15733450 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 15733567 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15733632 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15733652 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15733660 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15733719 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15733941 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15733971 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15734016 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15734020 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15734125 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15734161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15735251 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15736025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15737680 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15738333 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15739407 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15740325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15740673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15742058 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15742722 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15742889 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15743268 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15743573 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15743671 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15744305 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15744455 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15744474 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15744748 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15744765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15744890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15745156 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15745202 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15745208 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15745248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15745266 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15745280 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15745296 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 15745654 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 15745657 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 15745685 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15745744 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 15745810 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 15745814 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15745855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15745870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15745941 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15746000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15746005 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15746145 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15746167 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15746175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15746189 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15746238 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15746308 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15746832 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 15747228 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15747351 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 15747396 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 15747458 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15747459 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 15747682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15747932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15747999 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15748142 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15748612 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 15748627 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15748632 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 15748682 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15748966 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15749107 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 15749397 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15749591 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15749668 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15749715 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 15749868 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15749937 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15749998 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 15750197 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15750351 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15750438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15750549 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15750575 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15750578 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15750749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15750766 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 15750832 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 15750960 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 15751045 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15751046 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15751266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15751326 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15751340 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 15751387 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 15751427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15751572 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15751602 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 15751727 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 15751749 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 15751964 G A N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 15752012 C A Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 2 15752051 G A Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 15752054 C A N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 15752065 C A N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 2 15752092 G T Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 15752112 A C N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 15752447 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 15752472 T A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15752738 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15752743 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 15752751 T G Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 15752772 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 15752878 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 15752879 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 15752925 G A Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 2 15752964 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15752973 T G Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 15753083 T G Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 15753117 A C Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 15753219 A T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 15753630 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 15753719 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 15753773 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 15753818 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15753911 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 15753923 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 15753962 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15754013 A C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15754105 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 15754162 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 15754192 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 15754271 A T Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 15754458 A G Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 15754470 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 15754625 A C Y N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 15754642 A G N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 15754663 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 15754681 A T Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 15754772 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15754787 A C Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.285714285714286 0.0714285714285714 0.642857142857143 9 19 4 1 9 2 15755101 C T Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 15755155 T C Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 15755218 T G Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 15755414 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 15755433 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 15755518 T G Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 15755707 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 15755723 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 15755787 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 15755809 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 15755835 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 15755836 T G Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 15755941 A G Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 15755959 T C Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 15755967 T G Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 15755980 C T Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 15755991 A G Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 15756036 T A Y N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 15756093 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 15756120 C T Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 15756200 A T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 15756289 G C Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 15756403 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15756568 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 15756584 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 15756631 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15756689 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 15756728 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 15756735 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 15756878 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 15756954 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 15756990 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 15757050 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 15757056 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 15757068 C A Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 15757096 G A Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 15757111 C A Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 15757165 T C Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 15757186 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 15757220 G C Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 15757370 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 15757386 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15757514 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 15757558 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 15757601 C T Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 15757669 G T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 15757783 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 15757789 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 15757823 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 15757843 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 15757856 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 15757926 G C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 15757928 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 15758043 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 15758144 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15758161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15758274 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 15758306 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 15758526 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15758693 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15758780 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15758899 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15759126 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15759284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15759292 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15759329 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15759356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15759414 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 15759517 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15759544 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 15759943 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 15759978 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 15760239 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 15760295 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15760307 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15760308 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 15760326 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15760360 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15760382 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 15760591 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 15760658 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 15760694 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 15760831 T G N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 15760872 T A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 15761396 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 15761452 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 15761483 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 15761797 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15762054 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 15762276 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 15762461 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 15762574 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15762706 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15762745 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15762759 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15762774 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15763165 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15763204 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15763234 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 15763353 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 15763514 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 15763586 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 15764374 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 15764434 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15764497 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15764518 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 15764585 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 15764638 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 15764642 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 15764811 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 15764989 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15765385 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 15766471 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 15767136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15767988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15768143 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15768351 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15768526 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15768612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15769111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15769650 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 15769941 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15769997 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15770415 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15771346 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15771455 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 15772020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15772673 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 15773236 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 15773284 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 15774149 G T Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 15774307 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 15774329 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15774807 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15775415 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15775435 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 15775801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15775892 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 15776014 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 15776232 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15776399 A C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 15776434 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 2 15776661 G C Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 15776689 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 15776711 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 15776718 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 15777128 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15777272 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15777321 G C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15777830 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 15778051 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15778469 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15778575 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15778605 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15778668 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15778696 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15778734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15778809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15778990 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 15779072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15779137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15779185 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15779327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15779368 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15779460 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15779525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15779549 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 15779685 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15779702 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 15779786 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15779802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15779932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15780269 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 15780309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15780362 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15780494 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15780543 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 15780661 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15780662 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 15780706 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 15780854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15780879 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15781156 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15781246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15781423 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15781512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15781580 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15781583 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15781613 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 15781657 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15781719 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15781799 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15781852 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15781955 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15781973 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 15782007 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15782022 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 15782088 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15782129 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 15782180 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 15782248 C G Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 15782328 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15782498 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 15782528 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15782540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15782613 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15782634 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15782740 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 15782874 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15783012 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15783433 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 15783509 G C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 15783512 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15783660 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15783715 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 15784922 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 15785234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15785243 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15785502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15785682 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15785711 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15785971 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15786010 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 15786088 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15786499 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15786514 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15786560 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15787060 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 15787066 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 15787148 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 15787212 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 15787370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15787626 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15787627 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15787776 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 15787817 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 15787942 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15787959 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 15788002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15788135 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15788238 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15788289 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15788624 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15789006 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 15789072 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 15789205 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 15789526 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 15789580 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 15789620 T A N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 15789712 C A N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 2 15789809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15790626 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15790754 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 15790760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15791010 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 15791386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15791500 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 15791994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15792425 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15792785 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 15792870 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15792929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15793340 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 15793389 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 15793492 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15793520 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 15793592 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 15793663 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 15793791 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 15793815 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15793838 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 15793850 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 15793882 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 15793976 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 15794110 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15794235 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 15794294 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15794565 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15794618 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 15794692 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 15794823 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15795053 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15795292 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 15795427 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15795462 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15795475 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15795511 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15795575 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15795855 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15795986 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15796078 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 15796162 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 15796177 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15796198 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 15796217 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 2 15796219 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 15796296 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 15796321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15796452 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15796506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15796564 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15796599 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15796626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15796806 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 15796894 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 2 15796895 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 2 15796944 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15796957 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15796964 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15796970 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 15796980 G T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 15797056 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 15797120 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15797175 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 15797176 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 15797298 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 15797328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15797716 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15798145 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15798286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15798307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15798565 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15798632 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 15798717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15798825 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15799141 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 15799559 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 15799889 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 15799894 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 15800100 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 15800457 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 15800727 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 2 15801162 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 15801343 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 15801615 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 15801735 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 15801827 G C N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 15801885 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 15802115 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 15802309 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15802841 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 15803023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15803152 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 15803190 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 15803349 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 15803823 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 15803856 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 15804010 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 15804238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15804451 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15804582 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15805310 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 15805359 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 15805671 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 15805724 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 15805979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15806025 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15806194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15806231 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15806377 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 15806606 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15806616 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15806712 A C Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15806796 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15807098 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 15807306 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 15807432 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15807459 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 15807917 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 15808601 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15808855 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 15809026 T G N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 2 15809547 A G Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 15809597 A T Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 15809658 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 15809676 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15809677 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 15809695 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15809698 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 15809769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15810241 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 15810330 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 15810429 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 15810431 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 15810482 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 15810610 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 15810678 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15811047 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 15811384 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15811418 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 15811443 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15812638 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15812700 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 15812963 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 15813084 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 15813246 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15813469 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 15813474 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15813704 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15813852 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 15813927 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15813971 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 15813995 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 15814078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15814182 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 15814729 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15814847 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 15815363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15815611 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15815796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15816281 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 15816334 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 15816558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15816626 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 15816701 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 15816751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15816850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15816869 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 15816873 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15817064 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 15817080 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15817158 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15817219 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15817283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15817399 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15817516 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15818228 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 15818237 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 15818263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15818679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15819358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15819771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15820246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15821938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15822006 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 15822077 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 15822098 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 15822100 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 15822208 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 15822421 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 15822498 C G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 15822556 A C Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 15822566 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 15822589 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 15822605 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 15822615 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15822620 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 15822754 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 15822762 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 15822973 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 15822974 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 15822984 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 15823018 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 15823025 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 15823229 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 15823366 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15823489 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 15823517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15823673 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 15823721 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 15823777 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15823980 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 15825024 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15825846 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15825916 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 15825988 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 15826659 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 15826688 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 15826839 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 15827524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15828657 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 15829412 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15829578 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 15829618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15829619 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15829721 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 15830011 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 15830027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15830499 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 15830933 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15831079 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15831262 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15831297 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15831426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15831847 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15831941 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 15831942 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 15832110 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15832342 C G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 15832978 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15833463 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 15833623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15833792 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 15833958 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 15834013 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15834164 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 15834370 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15834493 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 15834502 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15834688 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 15834760 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15834812 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 15834819 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 15834863 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 15834884 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 15834925 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 15834963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15835122 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 15835246 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 15835355 G A Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 15835676 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 15844663 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 15844699 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 15844916 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 15844986 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 15845038 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 15845088 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 15845156 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 15845311 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 15845341 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 15845404 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15845428 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15845443 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 15845506 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 15845522 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 15845525 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 15845694 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 15845721 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 15845756 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 15845835 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15845869 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15845970 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 15846021 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15846073 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 15846139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15846154 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15846388 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15846561 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 15846611 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 15846643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15847445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15849580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15850027 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15850252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15850296 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15850772 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15850810 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 15852127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15852136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15852679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15854284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15854416 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 15854599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15854664 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15854778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15854815 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15855232 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15855523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15855608 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15856291 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15856307 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15856318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15858564 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15858569 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 15858595 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15861068 G T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 15861201 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 15861379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15862459 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 15863392 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15865093 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15865550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15865616 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15865681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15865695 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 15865853 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 15866055 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 15866712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15866915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15866920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15867196 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 15867469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15867497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15867527 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15867529 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 15867610 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 15867629 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15867631 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 15867674 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15867780 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 15867795 G A N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 2 15867930 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15867934 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 15868009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15868553 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15868661 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15868733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15868875 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15868918 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 15868977 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15869183 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 15869314 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15869415 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15870060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15870070 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15870910 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 15870945 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15870996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15871162 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 15871272 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 15871337 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 15871418 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15871427 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15871475 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15871531 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15871603 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15871650 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15871696 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 15871791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15871873 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15871988 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15872036 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 15872055 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 15872237 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15872394 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15872662 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 15872706 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15872893 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15873004 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15873161 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15873269 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 15873452 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 15873499 T A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 2 15873514 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 15873787 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 15873798 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 15873809 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 15873943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15874150 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 15874315 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 15874365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15874400 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 15874453 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 15874504 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 15874597 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 15874690 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15875442 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 15875766 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15876227 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15876298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15876308 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15876330 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15876365 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15876366 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15876454 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15876648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15877032 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 15877040 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15877204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15877209 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15877267 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 15878006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15878085 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15878135 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15878221 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15878343 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15878449 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 15878482 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 15878554 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 15878591 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15878641 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15878731 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 15878798 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15878949 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15879019 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15879026 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 15879377 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 15879392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15879471 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15879500 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15879642 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15879692 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15879702 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15879813 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15879863 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15879917 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15879942 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15880001 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15880151 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 15880322 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 15880551 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15880552 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15880732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15880758 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 15880879 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 15880891 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15880907 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15880915 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15881011 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15881061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15881227 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 15881289 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 15881529 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15881640 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15882265 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15882310 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 15882335 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15882581 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 15882652 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 15882874 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 15882911 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15882972 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 15883185 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 15883633 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15883861 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15883882 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 15884432 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 15884473 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15885792 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 15885922 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15886146 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15886197 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15886206 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 15886293 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 15886350 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15886654 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 15886857 T G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 15886914 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15886915 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 15887581 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15887603 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 15887767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15887768 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15887783 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 15887946 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 15887949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15888015 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 15888030 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 15888060 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 15888380 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 15888487 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15888507 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15888625 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15888897 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15889208 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 15889273 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 15889278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15889476 G A Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 15889556 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15889566 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15889676 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 15889723 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15889870 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15889889 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 15889987 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 15890017 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 15890036 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 15890107 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15890883 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 15890976 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 15891010 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 15891332 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15891448 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15891487 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15891554 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15891569 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15891635 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 15891814 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 15891820 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 15891836 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 15891906 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 15892180 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 15892203 T C Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 15892235 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 15892673 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 15892713 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 15892714 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 15892831 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 15892946 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 15892961 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15892983 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15893126 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15893291 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15893293 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15893409 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 15893596 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15893809 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 15893867 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15893893 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 15894254 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15894412 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15894551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15894615 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15894634 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15894697 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15894702 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15894822 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15894918 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15894979 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15895312 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15895472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15895642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15895873 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 15895904 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 15895913 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 15895983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15896159 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15896377 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 15896479 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 15896610 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 15896634 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15896827 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 15896856 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 15896967 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 15897113 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 15897209 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 15897332 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 15897404 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 15897471 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 15897483 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15897513 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 15897790 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15897793 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15897822 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15897828 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15897861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15897887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15898344 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 15898393 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 15898637 G C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 15898671 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 15898883 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 15898915 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 15898959 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 15898984 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 15898985 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 15899000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15899036 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15899093 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 15899163 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 15899227 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 15899298 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 15899309 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 15900199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15900329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15900541 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 15900600 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 15900646 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 15900877 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15900992 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 15901153 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15901156 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15901170 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15901430 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15901477 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15901600 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15901605 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15901613 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 15901796 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 15901945 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15901996 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 15902075 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 15902393 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 15903204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15903470 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15903575 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15903660 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15903891 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15904480 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 15904521 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 15904703 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 15904809 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15905144 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 15905214 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 15905495 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15905571 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 15905636 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15905825 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 15905858 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15905897 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 15905933 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 15905972 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 15905979 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 15906033 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 15906086 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15906094 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15906132 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 15906153 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 15906240 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 15906438 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 15906505 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 15906609 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 15906639 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 15906836 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15906859 A T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 15906917 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15907100 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15908121 T G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 15908197 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 15908319 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15908466 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15908575 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 15908886 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 15908988 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15909073 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 15909158 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15909168 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 15909222 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 15909342 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15909419 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 15909556 A C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 15909589 T G Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 15909751 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15909756 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 15910114 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15910656 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 15910711 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 15910808 T C Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 15910822 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 15910854 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 15910978 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15911013 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15911293 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 15911490 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 15911504 G C Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 15911534 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 15911790 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 15911796 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 15911872 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 15911898 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 15912025 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15912044 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 15912133 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15912195 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 15912501 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15912517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15912589 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15912716 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 15912988 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15913064 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15913112 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 15914548 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 15914876 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 15914903 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 15915027 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 15915039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15915130 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 15915155 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 15915232 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 15915267 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 15915412 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 15915461 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15915807 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 15915940 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15916108 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 15916326 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15916349 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 15916391 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 15916519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15917282 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15917329 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15917428 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15917493 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15917604 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15917630 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15917692 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15917832 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15918036 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 15918242 G C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 15918247 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 15918265 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15918389 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15918395 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 15918415 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 15918629 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15918723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15918895 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15918976 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15919011 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 15919040 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 15919191 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15919262 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 15919309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15919477 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 15919633 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15919905 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15919919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15919943 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15920011 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15920070 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15920087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15920332 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15920590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15920600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15920623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15920872 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15920922 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15921581 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 15922393 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15922547 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 15922685 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 15922813 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 15923288 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15924110 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 15924473 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15924500 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 15924745 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15924838 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 15925155 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 15925297 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15925299 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 15925335 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15925410 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 15925434 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 15925707 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 15925769 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 15925938 A T N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 15925953 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 2 15926096 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 15926335 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15926390 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 15926434 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15926551 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15926639 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 15926717 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15926722 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15926779 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 15926946 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15926976 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15927341 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15927342 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 15927391 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 15927400 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 15927430 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 15927434 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 15927474 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15927497 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 15927522 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 15927818 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 15928005 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 15928095 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15928133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15928197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15928402 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15928416 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15928495 G C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15928590 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15928647 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15928686 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15928696 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15929206 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15929262 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15929282 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15929302 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15929315 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 15929381 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15929570 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15929592 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 15929642 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15929738 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 15929742 T A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15929798 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 15929940 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15930175 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15930395 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 15930432 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 15930519 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 15930541 A T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 15930811 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 15931634 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15932039 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 15932292 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 15932536 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15932845 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 15932947 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 15933505 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15933639 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 15933727 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 15933885 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 15933908 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 15934230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15934332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15935664 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 15935936 C G N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 15936700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15936921 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 15937017 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 15937303 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 15937638 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 15937751 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15937799 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15938039 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15938430 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 15938636 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 15938772 T G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 15938949 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15939113 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15939264 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15939511 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15940194 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 15940532 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15940743 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15940957 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 15941110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15941503 G T Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 2 15941522 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 15941565 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15941794 C A Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 15951669 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 15951993 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15952746 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 15953096 A G Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 15953224 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 15953482 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 15953725 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 15953796 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 15954131 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 15954401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15954472 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 15954952 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 15955388 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15955740 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15956547 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 15957447 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 15957482 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15957828 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 15957954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15958167 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15958331 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 15958368 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15958706 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 15958785 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 15959030 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15959663 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 15961015 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 15961837 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 15961950 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 15962068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15962193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15962219 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 15963503 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15964091 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15964430 T A N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 15964472 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 2 15964496 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 15964586 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 15964594 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 15964677 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 15964873 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 15965880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15966253 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 15966291 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 15966477 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15966663 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 15967035 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 15967530 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15967644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15967757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15967778 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15967924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15967995 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15968138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15968223 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 15968431 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15968515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15968532 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15968751 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 15968823 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 15969089 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15969134 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 15969169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15969247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15969671 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 15970193 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15970494 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 15970719 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 15970785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15970800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15970944 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 15971123 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15971258 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 15972763 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15973346 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 15973443 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15973740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15974339 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 15974568 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 15975170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15975259 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 15975862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15976700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15977039 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 15977263 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 15977420 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 15978481 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15978645 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 15978749 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15978828 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15979256 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15979322 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15979479 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15980354 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15980406 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 15980749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15980944 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 15981085 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15981447 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15981657 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15981929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15982117 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 15982272 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15982897 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15982924 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 15982987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15983116 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 15983535 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15983713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15984057 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 15984183 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15984253 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15984478 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15984976 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15984985 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 15985277 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 15985492 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15985688 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15985930 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 15986271 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 15987404 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 15988473 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15988698 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15988709 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15988736 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15991427 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 15991549 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 15991655 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 15992877 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 15993106 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15993143 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 15993270 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15993402 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 15993815 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 15993939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15994671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15994810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15995165 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 15995290 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 15995355 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 15995536 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15995687 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15995780 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15996101 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15996128 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15996191 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15996253 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15996263 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15996514 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15996540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15996543 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 15996583 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15996733 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15996861 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15996934 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15996988 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15997058 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 15997293 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 15997338 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 15997401 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15997490 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15997987 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15998237 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15998389 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15998417 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 15998455 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 15998478 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15998489 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 15998933 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 15999039 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 15999724 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 16000066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16000184 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16000338 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 16000952 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16001042 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16001046 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16001182 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 16001192 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 16001231 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 16001307 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 16001310 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 16001349 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 16001363 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 16001616 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 16001661 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 16001870 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16001883 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 16002046 G C Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 16002049 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 16002060 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 16002071 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 16002883 A C Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 16003620 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 16003622 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 16003711 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16003712 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16003742 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16003792 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 16003795 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16003830 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16003982 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 16003996 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 16004000 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 16004026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16004042 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 16004113 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16004188 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 16004287 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 16004435 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 16004566 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16004633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16004709 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16004736 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16004869 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 16005129 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16005190 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16005644 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 16005852 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 16007038 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16007445 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 16009578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16009926 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 16010145 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16011234 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 16011257 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16011409 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 16011549 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 16011553 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16011676 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 16011955 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 16012438 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 16012694 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16012733 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16012759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16012791 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16012822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16012862 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 16013273 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16013351 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16013428 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16013723 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 16013818 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16013877 A G Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 16013979 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 16014340 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 16014356 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16014382 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16014481 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 16014579 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 16014793 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 16015023 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 16015035 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 16015038 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 16015265 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16015462 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16015811 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 16015898 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 16015925 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 16016073 A T Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 16016204 G A Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 16016439 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16016555 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 16016690 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 16016694 A G Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 16016713 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16016897 A C Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 16017058 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 16017213 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 16017239 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 16017253 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16017792 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16017795 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 16017873 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16018339 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16018409 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16018576 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 16018682 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16018956 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16019077 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16019181 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 16019223 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 16019248 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 16019249 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 16019459 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 16019466 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 16019493 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 16019508 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16019887 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16019916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16020034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16020368 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16020936 T C Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 16021218 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 16021278 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16021482 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 16021624 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 16021837 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 16021997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16022038 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 16022161 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 16022219 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 16022333 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 16022468 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 16022641 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 16023159 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 16023182 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 16023347 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16023397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16023434 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 16030995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16031008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16031053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16031133 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 16031212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16031360 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16031425 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 16031697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16031704 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16031895 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16032033 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 16032152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16032153 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16032327 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 16032336 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 16032448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16032538 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 16032554 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16032607 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 16032740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16033050 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 16033893 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 16034403 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16034436 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16035270 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 16035346 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 16035417 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 16035458 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 16035495 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16035559 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16035598 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 16035812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16035887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16036341 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 16036427 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16036435 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16036526 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 16036573 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 16036662 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 16036672 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 16036803 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 16036833 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 16036864 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 16038293 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 16038931 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 16039275 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 16040058 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 16040194 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 16040560 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 16042226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16043095 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16044743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16045802 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 16047061 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 16049293 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16049352 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16050897 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 16050907 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16052007 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16052097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16052106 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16052406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16052411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16052442 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 16052471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16052675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16052801 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16052804 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16052915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16052943 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 16053021 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16053027 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 16053169 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16053177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16053597 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16053690 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16053726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16054057 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16054349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16054710 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16054744 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16054974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16055260 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16055274 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 16055317 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 16055368 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 16055562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16055816 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 16056179 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 16056254 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16056260 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16056343 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16056362 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16056497 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16056533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16056677 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 16056715 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 16056893 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 16057142 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16057311 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16058018 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16058030 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16059174 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 16059183 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 16059196 T A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 16059237 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 16059306 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 16059485 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 16059657 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 16059790 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 16059895 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16059963 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 16059970 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 16059990 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16060032 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 16060145 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16060352 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 16060702 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 16060854 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16060922 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16061023 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 16061115 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 16061194 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 16061403 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 16061848 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16061915 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 16062419 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16062588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16062657 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16063109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16063317 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16063787 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 16063828 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 16063948 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16066697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16066711 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 16068344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16072791 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16076370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16078570 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16078879 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16082142 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 16083582 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16084061 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16088397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16092023 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 16093160 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16098213 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16098532 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16102580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16103905 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16104309 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 16107905 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 16108281 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16108569 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16108675 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16108739 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 16108982 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 16109235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16109967 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 16110064 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 16110076 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 16110343 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 16110586 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 16110699 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 16110705 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 16110902 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 16111033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16111064 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 16111199 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 16111315 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 16111326 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 16111377 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16111471 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16111564 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 16111574 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16111941 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16112040 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 16112068 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 16112108 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 16112113 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16112236 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 16112259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16112271 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 16112272 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 16112448 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 16112455 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16112480 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 16112934 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.0909090909090909 11 11 1 9 1 2 16113221 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16113564 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 16120520 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 16120549 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 16120589 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 16120608 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 16120614 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 16120650 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16121939 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 16121980 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 16122189 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 16122635 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 16122757 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16123140 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 16123164 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16123867 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 16123872 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 16124114 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 16124290 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 16124408 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16124656 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 16124847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16124917 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16125068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16125343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16125656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16125776 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 16126134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16126150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16126364 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 16126381 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16126881 A T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 16126960 G A Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 16128460 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16129062 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16129265 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16130374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16130799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16131587 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 16131668 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 16131746 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 16131991 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16132026 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16132050 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 16132170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16132483 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 16133014 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 16135687 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16136041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16137683 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16138024 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16140261 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16142328 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 16144320 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16145592 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 16145619 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 16145677 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16145678 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16145704 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16146312 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 16146358 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 16146473 T G Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 16147518 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 16147725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16148153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16148542 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16149167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16150129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16151380 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16153337 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16154942 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16155327 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 16156006 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16156495 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16157810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16157862 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 16158335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16159179 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 16159302 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 16160510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16160688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16161212 A G Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 16161540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16161919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16162561 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16162859 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16162968 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16163001 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16163210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16163486 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16165906 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 16166002 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16166376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16168304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16169470 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16172505 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16173923 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16174147 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16175569 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16176992 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 16177073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16178859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16179230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16180600 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16180812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16181039 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16182040 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16189542 T G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 16189575 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 16189589 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 16189613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16189757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16189841 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 16190191 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 16190199 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16190323 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 16190372 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16190410 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 16190700 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16190720 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16190763 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 16190793 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 16190850 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16190856 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16190874 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16190876 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16190921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16190972 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 16191159 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16191195 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16192073 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16192428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16192568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16192577 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 16192672 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16192748 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16192986 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 16193046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16193060 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16193155 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 16193220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16193354 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 16193406 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 16193423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16193459 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16193473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16193508 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 16193537 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16193639 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16193766 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16194003 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16194046 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16194071 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16194159 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16194313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16194367 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16194735 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16194867 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16194877 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16194967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16194981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16195035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16195041 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 16195073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16195147 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16195173 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16195194 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16195318 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16195499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16195517 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 16195547 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16195559 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16195595 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16195614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16195661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16195691 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16195711 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16195746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16195752 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16195822 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16195884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16195916 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16195918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16195976 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16196027 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16196042 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16196078 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 16196092 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16196143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16196154 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16196206 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16196271 T G Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 16196326 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 16196336 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16196408 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16196426 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 16196489 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16196494 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16196554 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16196602 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16196608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16196660 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16196704 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 16197130 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 16197351 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16197442 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16197451 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16197568 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16197647 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16197657 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16197666 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16197771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16197817 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16197828 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16197829 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16197856 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16197935 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16197998 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16198010 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16198102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16198118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16198135 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16198252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16198518 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 16198554 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16198576 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16198609 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16198774 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16198840 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16198945 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 16199034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16199079 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16199154 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16199239 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 16199258 A G Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 16199287 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 16199366 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 16199418 C A Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 16199514 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16199640 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 16199734 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 16199759 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16199778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16199792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16200027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16200219 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16200227 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 16200234 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16200265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16200284 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16200345 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16200466 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16200478 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 16200537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16200680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16200697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16200720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16200771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16200827 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16201069 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16201086 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16201207 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16201329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16201370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16201446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16201455 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16201530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16201625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16201669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16201708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16201712 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16201782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16201827 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16201871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16201940 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16202004 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16202102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16202246 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 2 16202413 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16202483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16202543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16202598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16202686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16203008 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16203009 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16203076 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16203101 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16203336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16203451 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16203572 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16203596 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16203788 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16203851 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16203863 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16203917 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16203932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16203950 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16204162 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 16204253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16204324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16204409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16204509 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16204678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16204694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16204733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16204748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16204804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16204886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16204921 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16204929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16205010 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16205131 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16205260 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16205405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16205501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16205813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16205816 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16205897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16205903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16205973 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 16206068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16206079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16206096 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16206139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16206373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16206399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16206604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16206669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16206677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16206754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16206865 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 16206941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16206968 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16206989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16207020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16207072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16207263 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16207305 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16207343 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16207433 A C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 16207443 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 16207618 A C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 16207836 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 16207898 G A Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 2 16207936 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16208100 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 16208585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16208606 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16208660 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16208697 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16208740 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16208835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16209006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16209051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16209165 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 16209178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16209208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16209503 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16209532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16209544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16209547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16209757 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16209767 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16209815 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16209853 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16209940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16209968 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16210127 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16210141 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16210142 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16210376 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 16210618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16210660 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16210723 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16210740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16210996 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16211033 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16211617 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 16211671 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 16211822 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16211829 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16212098 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16212521 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16212557 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16212581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16212596 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16212711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16212712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16212744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16212801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16212930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16213312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16213373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16213453 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16213466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16213518 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16213827 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16213861 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16213936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16213939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16214088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16214183 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16214196 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16214256 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16214432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16214437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16214459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16214503 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16214540 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16214587 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16214626 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16214771 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 16214881 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16214908 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16214929 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16214939 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16214956 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16215106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16215145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16215287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16215489 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16215593 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16215637 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16215660 T A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 16215661 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 16215748 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16215773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16215850 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16215884 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16215920 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16215924 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16215949 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16216096 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 16216136 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16216165 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16216168 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16216258 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16216285 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16216350 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16216550 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16216769 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16216801 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16216824 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16216878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16216897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16216900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16216962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16217389 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 16217716 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 16217776 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16217937 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 16217964 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 16218177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16218194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16218533 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 16218535 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16218554 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 16218637 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 16218726 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 16218731 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 16218777 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 16218839 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 16218918 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 16219042 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16219142 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 16219173 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 16219309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16219419 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 16219526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16219600 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16219668 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 16219839 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 16220026 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 16220054 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 16220290 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 16220454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16220503 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 16220511 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 16220552 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16220703 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 16221088 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16221172 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 16221659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16222332 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 16222802 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 16222830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16222909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16223344 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16223741 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16227339 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16227409 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 16231882 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 16231998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16232466 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16232573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16233772 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 16233780 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16233837 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 16233856 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 16233871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16234062 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 16234087 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 16234122 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 2 16234260 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 16234272 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 16234481 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16234506 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16234605 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 16234615 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 16234790 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16234964 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 16235101 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 2 16235433 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 16235656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16236041 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 16236687 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 16236797 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 16236879 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 16236927 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 16236971 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 16237083 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 16237197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16237202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16237269 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16237282 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16237308 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 16237527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16237704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16237911 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 16237926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16237989 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 16238581 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 16238636 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 16238928 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16239304 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16239801 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16240080 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16240177 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16240332 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16240448 C A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 16240890 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16241038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16248319 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 16248398 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 16248401 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 16248416 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 16249163 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16250323 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16250714 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16250715 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 16251170 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16251246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16251368 C T Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 16251753 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 16252246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16252360 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 16252589 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 16252621 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16252876 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 16252934 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 16252967 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 16253082 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 16253122 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 16253123 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 16253326 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 16253506 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 16253580 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 16254039 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 16254054 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 16254139 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 16254502 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16254937 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 16255030 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 16255052 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 16255119 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 16255259 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 16255455 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 16255485 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16255516 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 16255538 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 16255631 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 16255709 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 16255838 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 16255914 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 16255976 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 16256306 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 16256524 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16257294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16258313 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16258390 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16258457 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 16258534 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 16258601 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16258725 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16258764 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 16259281 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 16259322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16259347 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16259492 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16259579 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16259593 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 16259597 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16259651 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 16259857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16259940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16260076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16260113 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 16260118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16260143 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16260294 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16260418 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16260509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16260574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16260753 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 16260990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16261020 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 16261157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16261165 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 16261211 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16261338 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 16261396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16261492 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16261565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16261589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16261594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16261915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16262058 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 16262059 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 16262183 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 16262300 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 16262876 G C Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 16262897 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 16262905 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 16262990 T C Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 2 16263253 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16263845 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 16263951 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16264127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16264187 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 16264281 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 16264337 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16264428 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16264448 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16264473 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16264810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16264955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16265004 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16265118 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16265141 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16265347 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 16265474 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16265667 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16265668 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 16266154 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 16266171 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16266182 G A Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 16266263 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 16266283 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16266443 G T N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 16266701 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 16266811 G T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 16266897 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 16266968 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16266977 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 16267136 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 16267344 A G Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 16267357 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 16267384 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 16267598 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16267623 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16267673 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 16267699 G A Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 16267925 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 16268058 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 16268146 T C Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 16268268 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 16268295 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 16268311 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 16268357 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16268426 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 16268513 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 16268563 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 16268599 A C Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 16268669 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 16269142 G T Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 16269184 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 16269282 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 16269362 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 16269421 G C N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 16269496 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 16269531 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 16269597 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 16269681 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16269685 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16269855 G A Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 16269911 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 16270005 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16270070 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 16270114 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16270235 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16270260 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16270261 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16270332 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 16270406 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16270543 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 16270648 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 16270685 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 16270852 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16270911 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16270964 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 16271052 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 16271068 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 16271086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16271139 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 16271212 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16271236 C G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 16271243 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 16271414 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 16271580 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16271596 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16271599 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 16272044 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 16272064 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 16272101 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16272107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16272238 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 16272403 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16272490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16272515 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 16272909 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16273005 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 16273042 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16273221 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 16273233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16273439 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 16273501 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16273788 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16273843 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 16273918 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16273960 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 16273962 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 16273988 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 16274129 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 16274421 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16274948 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16275043 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 16275361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16275619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16275659 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 16275691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16275747 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 16275811 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16276024 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16276173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16276963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16278501 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 16278567 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16278568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16278590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16278705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16279020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16279062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16279075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16279111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16279242 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 16279273 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 16279609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16280098 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16281034 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 16281190 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16281197 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 16281450 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 16281467 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16281623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16281658 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16282447 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 16282698 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 16283920 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16284172 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 16284174 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16284315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16284393 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16284495 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 16284516 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 16284591 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 16284807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16286138 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16287052 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16287984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16288022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16288105 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 16288243 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16288329 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16288582 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16288584 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16288749 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 16288887 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16288902 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16289271 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 16289288 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 16289466 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 16289601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16289722 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 16289836 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 16289930 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 16290185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16291876 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 16291952 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16292056 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 16292375 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 16292778 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 16293305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16293420 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 16293757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16293792 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 16293807 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 16293832 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16293833 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 16293847 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16293875 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 16293940 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 16294075 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16294094 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16294109 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16294219 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 16294232 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 16294285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16294304 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 16294334 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 16294349 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16294390 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16294551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16294562 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 16294604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16294627 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 16294645 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 16294700 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 16294800 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 16294846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16294900 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 16295027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16295079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16295179 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 16296401 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 16296515 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 16296523 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16296596 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 16296651 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 16296693 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 16296713 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 16296777 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 16296797 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16296812 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16296829 G A N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 16303994 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16303997 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16304059 C T N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 2 16304125 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 16304316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16304343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16304526 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 16304596 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 16304647 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 16304659 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16304819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16304854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16304937 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16304938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16305000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16305024 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 16305067 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 16305221 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16305303 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 16305392 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16305418 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 16305432 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16305478 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 16305513 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 16305669 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 16305702 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 16305829 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 2 16305866 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 16305875 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 16305924 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16306095 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 16306193 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 16306200 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 16306271 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16306447 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 16306492 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 16306598 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16306661 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 16306665 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16306799 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 16306800 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 16307020 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 16307373 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16307607 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 16307625 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16307705 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 16307744 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 16307758 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16308351 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16309835 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 16310080 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 16310090 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 16310111 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 16310155 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 16310158 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 16310166 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 16310836 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 16310953 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 16310995 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 16311627 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 16311645 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16311788 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 16311952 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16311993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16311999 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16312004 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16312287 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16312290 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16312324 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 16312433 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16312437 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 16312717 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 16312730 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16312800 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16312848 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 16312860 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 16313042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16313107 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 16317311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16317820 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 16318081 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16318771 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16318897 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16319056 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 16319465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16319538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16319564 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 16319629 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16319653 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16319677 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16319832 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16320018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16320176 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16320306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16320831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16320977 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16321108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16321391 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16321400 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16321403 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16321436 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 16321440 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 16321458 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 16321491 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 16321513 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 16321519 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 16321527 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 16321546 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 16321688 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 16321765 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16322001 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16322103 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16322104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16322152 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16322179 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16322276 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16322321 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16322332 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16322375 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16322399 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16322536 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16322596 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16322607 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16322633 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16322735 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16322759 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16322785 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16322916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16322934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16323088 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 16323231 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 16324827 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16325063 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16326198 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16326213 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16326702 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16326816 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16326829 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16327108 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16327150 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16327176 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16327208 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16327321 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16327335 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16327407 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 16327428 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16327470 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 16327497 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 16327690 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 16327713 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16327718 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16327873 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16328020 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16328027 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 16328039 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 16328206 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16328330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16328450 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16328540 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16328597 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16328923 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16329270 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16329298 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16329369 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16329512 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16329666 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16329677 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16329709 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 16330236 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16330280 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16330351 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16330370 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16330371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16330496 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16330535 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 16330755 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16330795 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 16331004 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16331139 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16331381 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16331407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16331429 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16331674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16331969 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16332011 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16332607 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16332981 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16333033 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16333223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16333268 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16333573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16333720 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16333761 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16333773 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16334045 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 16334127 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16334142 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16334230 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16334235 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16334448 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16334540 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 16334683 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16334685 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16334718 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 16334748 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 16334960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16335035 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 16335100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16335147 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16335359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16335371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16335383 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16335557 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16335939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16335981 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16336296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16336329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16336330 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16336438 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16336560 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16336602 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16337288 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16337315 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16337344 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16337593 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16337891 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16337986 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 16338120 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16338162 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16338412 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16338478 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16338522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16338776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16339139 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16339160 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 16339185 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 16339290 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16339560 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16339609 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16339640 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 16339659 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16339851 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 16339891 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 16339924 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 16339972 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 16340003 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16340123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16340349 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 16340468 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16340545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16340641 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 16340649 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 16340658 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16340707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16340716 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16340745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16340828 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 16340831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16340884 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 16340885 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 16340921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16340980 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 16340992 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 16341001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16341097 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 16341102 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 16341203 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 16341292 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16341397 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16341440 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 16341522 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 16341569 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16341586 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16341621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16341648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16341674 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 16341697 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 16341715 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16341918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16342078 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16342255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16342658 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 16342963 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16343143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16343171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16343228 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16343347 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16343352 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16343379 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16343443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16343455 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16343587 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16343729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16343897 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16343914 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16343976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16344028 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16344156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16344236 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16344238 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16344249 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 16344250 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16344444 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16345443 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16345820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16346221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16346615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16347569 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16348516 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 16348808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16349243 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16350132 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16350704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16350842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16351282 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 16351962 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 16352008 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 16352111 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 16352316 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 16352459 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 16352522 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16352625 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 16352866 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 16363317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16364944 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16364969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16365102 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 16365758 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 16365863 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16366680 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16366766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16366873 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 16367277 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 16367303 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16367369 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16367463 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16367464 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16367501 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16367517 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 16367566 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16367572 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 16367601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16367725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16367735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16367765 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16367847 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16367871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16368008 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16368408 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16368577 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 16368791 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 16368861 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16368891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16369181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16369271 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 16369395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16369410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16369671 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 16369727 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16369881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16370116 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16370260 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16370588 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16370867 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16370943 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16371337 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16371344 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16371421 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 16371423 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16371483 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16371551 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16371681 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16371722 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16371753 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16371850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16371960 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16372003 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 16372201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16372318 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 16373763 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 16374001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16374087 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16376031 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16376702 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 16376810 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 16376855 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 16376956 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 16379022 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16381241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16382384 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16382618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16382638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16383100 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16383164 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16383474 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16383672 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16384013 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16384067 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16384184 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16384670 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 16384677 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 16384706 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16384834 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16384910 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16385068 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 16385263 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 16385281 T A N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 16385410 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 16385414 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 16385526 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16385541 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16385609 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16386333 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16386447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16386990 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 16387021 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16387284 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 16387384 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16387607 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16387884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16388071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16389047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16389130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16389147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16389219 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16389221 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16389346 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16389458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16389528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16390083 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16390650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16390751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16390819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16390826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16390904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16390935 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16391484 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 2 16391581 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16391643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16391747 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16391924 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16391937 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16391953 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16391988 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 16391989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16392054 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16392081 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 16392203 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 16392240 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 16392270 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 16392291 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 16392378 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 16392480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16392497 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16392609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16392724 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16392953 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16393265 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16393375 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16393533 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16393602 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16393637 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16394115 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16394133 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16394288 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16394460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16394755 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16394947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16394988 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16395180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16395259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16395382 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16395449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16395488 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16395589 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16395593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16395995 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16396112 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16396159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16396370 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16396740 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16397372 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16397573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16397764 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 16397815 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16397985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16398007 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16398031 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16398451 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16398681 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16398707 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16398817 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16398917 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16399120 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16399388 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 16399549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16399574 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16399857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16399859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16399913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16400165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16400192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16400555 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16400673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16400892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16400943 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16401211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16401301 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16401423 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 16401496 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16401600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16401700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16401795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16401814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16401867 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 16402010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16402035 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16402117 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16402214 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16402258 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16402274 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16402370 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16402371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16402623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16402741 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16402789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16402844 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16402888 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16402949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16402992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16403093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16403138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16403222 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 16403230 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 16403236 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16403271 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 16403276 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 16403392 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 16403427 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 16403579 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16403597 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16403659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16403683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16403735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16403742 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16403748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16403782 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16403794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16403980 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16404132 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16404270 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16404471 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16404490 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 16404561 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 16404631 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16404670 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16404945 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16404981 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16404999 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16405047 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 16405160 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16405255 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 16405271 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 16405276 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 16405308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16405324 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16405398 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 16405520 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16405537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16405590 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16405592 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16405671 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 16405680 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 16405888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16405896 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16405907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16406077 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 16406234 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 16406331 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 16406332 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 16406366 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 16406483 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 16406547 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 16406562 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 2 16407058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16407152 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16407179 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16407211 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16407296 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16407382 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16407409 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16407427 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16407491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16407503 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16407546 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 16407547 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 16407579 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 16407619 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 16407638 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 16407649 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16407666 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16407758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16407989 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16408185 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16408244 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16408385 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16408389 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16408450 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16408567 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16408578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16408608 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16408756 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16409097 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 16409300 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 16409513 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16409832 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 16409932 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 16410039 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 16410183 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16410209 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 16410333 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16410446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16410458 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16410593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16410715 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16410863 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16411042 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16411081 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16411083 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16411237 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16411384 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16411469 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16411492 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16411502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16411506 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16411532 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 16411555 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16412067 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16412146 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16412308 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16412387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16412524 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 16412542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16412857 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 16413331 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16413464 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 16413672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16413746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16413787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16413839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16413975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16413991 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16414036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16414054 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16414170 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16414299 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 16414302 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 16414367 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16414431 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16414448 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 16415691 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16416958 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 16417014 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16417086 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16417471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16417624 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16417684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16418560 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 16418896 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 16418908 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16420188 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16420650 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16420677 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 16421165 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16422698 G C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 16423797 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16424080 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16427349 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16427830 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 16432995 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16433467 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16433655 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 16436359 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 16436410 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16436678 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 16437249 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 16438053 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 16438194 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 16438230 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16438373 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16438491 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 16438717 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 16439060 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 16439337 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 16439349 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16439413 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16439426 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 16439598 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16439688 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 16439701 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 16439830 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 16440130 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 16440229 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16440273 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 16440326 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 16440431 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 16440947 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 16441266 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16441614 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 16441666 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 16441692 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 16441700 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 16441772 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 16441817 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 16441824 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 16441871 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 16441875 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 16441942 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16441944 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 16441974 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 16441994 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 16442026 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 16442063 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 16442082 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 16442087 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 16442193 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 16442196 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 16442254 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16442347 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 16442355 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 16442372 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 16442418 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16442512 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 16442581 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 16442602 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 16442621 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16442652 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16442698 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 16442761 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 16442765 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 16442785 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 16442786 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 16442984 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 16442988 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 16443033 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 16443080 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 16443109 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 16443111 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 16443120 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16443179 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16443226 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 16443227 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16443423 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 16443630 G A Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 16443687 T G N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 16443758 C A N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 16443768 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 16443792 C A N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 16443797 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 16443878 G T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 16443909 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 16444004 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 16444024 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 16444025 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16444066 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 16444110 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 16444128 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 16444141 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 16444153 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 16444175 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 16444297 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 16444321 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 16444391 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 16444428 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 16444672 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 16444909 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 16444966 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 16445278 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 16445397 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 16445412 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 16445737 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 16445755 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16445859 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 16445869 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 16446110 T G N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 16446187 G C N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 2 16446249 C T N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 16446253 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 16446539 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 16446540 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 16446572 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 16446611 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 16447188 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 16447495 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 16447665 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 16448019 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 16448194 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 16448287 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 16448507 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16449567 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16449642 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 16449689 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16449843 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 16449926 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 2 16450080 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 16450983 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16451187 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16451232 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16451244 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 16451290 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16451355 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16451358 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 16452591 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16453254 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16453354 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16453521 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16453837 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 16454340 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16454949 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16454970 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 16455027 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 16455148 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16455170 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16455253 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 16458104 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16458364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16459293 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16459922 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16460637 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 16460692 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 16461893 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16462432 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16462443 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 16464377 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16465017 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 16465564 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 16465598 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 16466516 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16467769 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 16468434 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16468848 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 16470211 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 16470295 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 16470296 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 16470336 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 16471099 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 16471117 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 16471156 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 16471377 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16471401 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 16471449 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 16471527 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 16471541 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 16471571 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 16471667 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16471681 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 16471692 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 16471736 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 16471795 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 16472031 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 16472056 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 16472379 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 16472572 T G Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 16472599 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 16472611 C A Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 16472827 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 16472851 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 16472909 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 16472921 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 16473239 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 16473255 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 16473274 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 16473319 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 16473338 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 16473405 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 16473427 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 16473515 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 16473610 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 16473665 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 16473687 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 16473876 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 16474034 A C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 16474047 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 16474114 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 16474215 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 16474276 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 16474323 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 16474341 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 16474355 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 16474380 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 16474394 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 16474599 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 16474626 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 16474685 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 16474798 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 16474820 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 16474881 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 16474977 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 16475136 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 16475166 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 16475362 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 16475393 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 16475395 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 16475603 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 16475622 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 16475628 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 16475636 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 16475945 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 16475957 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16476831 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16477013 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16477357 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16477394 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16477490 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 16477520 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 16477716 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 16477724 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 16477822 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 16477945 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 16478009 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 16478017 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 16478028 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 16478096 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 16478167 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 16478182 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 16478505 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 16478624 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 16478631 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 16478699 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 16478723 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 16478730 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 16478739 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 16478749 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 16478752 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 16478825 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 16478862 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 16478880 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 16478891 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 16478905 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 16479074 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 16479077 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 16479169 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 16479235 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 16479299 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 16479375 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 16479382 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 16479392 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 16479405 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16479451 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16479493 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 16479503 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 16479509 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16479535 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 16479540 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 16479554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16479719 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 16479757 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 16479788 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 16479843 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 16480559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16480679 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16481734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16483780 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16483997 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16484445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16485940 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16487202 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 16487426 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 16487886 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16489392 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 16490172 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16490189 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 16490381 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16490467 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 16492494 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16492647 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16492817 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16492839 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16493012 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 16493099 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16493131 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16493228 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16493229 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16493347 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 16493384 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 16493393 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16493470 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16493473 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16493500 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16493503 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16493598 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16493718 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16493751 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 16493833 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 16493872 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 16493915 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 16493929 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 16493944 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 16493958 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 16493996 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 16494024 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 16494037 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 16494067 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 16494130 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 16494176 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 16494178 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 16494211 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 16494227 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 16494234 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 16494624 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 16494703 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 16494712 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 16494736 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 16494737 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 16494763 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 16494771 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 16494866 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 16494918 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 16495027 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 16495076 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16495084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16495130 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16495165 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16495202 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16495304 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 16495374 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 16497031 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 16497524 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 16498490 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 16498625 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16500772 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16500777 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16501283 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 16501860 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 16501892 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 16501993 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16507921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16508579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16508715 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 16510459 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 16510489 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16510505 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16510541 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 16510588 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 16510595 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 16510648 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 16510740 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 16510850 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16510971 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16510986 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16511096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16511119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16511162 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16511166 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16511187 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16511213 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16511229 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 16511348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16511680 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16511893 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16511910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16511988 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16512077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16512104 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16512221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16512243 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 16512432 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16512507 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 16512619 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16512636 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 16512726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16512727 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16512760 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 16512944 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 16513660 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16513914 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 16513922 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 16513987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16514059 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 16515699 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16516772 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16517443 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16517968 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 16518456 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 16519878 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16519984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16520904 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16521239 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 16521743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16523155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16523186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16523286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16523327 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16525716 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16525982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16526310 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16526406 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16526950 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16526989 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16527381 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16527455 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 16527807 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 16527853 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16528066 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 16528247 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 16528291 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16528298 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 16528478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16528581 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16528617 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 16528619 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 16528794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16529595 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16529743 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16530087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16530375 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16534242 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 16535304 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16535676 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 16535998 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 16536086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16536155 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16536560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16536588 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16537352 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 16538332 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16538857 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16538907 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 16538934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16539038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16539857 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 16539991 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 16540233 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16540365 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 16540423 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 16540992 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 16541013 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 16541207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16541618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16541646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16541683 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 16541754 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 16541828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16542205 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 16549368 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 16549861 G T Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 16550188 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 16550735 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16550754 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 16551276 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 16551406 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 16551686 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 16551874 G C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 16552197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16552321 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 16552347 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 16552483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16552499 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16552551 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16552588 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16552651 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 16552778 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16552840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16552940 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 16552946 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 16553012 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 16553016 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 16553027 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 16553186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16553188 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16553383 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 16553445 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16553594 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 16553999 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 16554067 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 16554951 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16555187 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 16555269 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 16555309 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 16555352 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 16555437 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16555481 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 16555535 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16555821 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 16555823 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 16555870 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16556012 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16556052 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 16556057 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16556188 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16556215 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16556397 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 16556469 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16556497 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16556585 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 16556622 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 16556725 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 16556953 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 16557124 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 16557171 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 16557211 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16557271 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16557317 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16557398 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16557457 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 16557625 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16557648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16557672 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 16558223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16558928 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16560666 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16560903 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16564247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16564856 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16565447 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 16566277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16566677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16567933 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16568132 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16568622 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 16571001 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 16573749 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 16574759 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16576629 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16577610 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 16577612 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 16578047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16579163 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 16581010 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 16582783 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 16583060 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16583297 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 16583448 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 16583452 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 2 16583555 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 16584373 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16584522 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16584635 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16585480 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16586912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16590177 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 16590196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16590461 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16590506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16590551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16590571 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16590592 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16590652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16590662 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16592019 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16592292 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 16592325 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 16592453 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 16592640 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16592668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16592726 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 16592878 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 16592892 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 16592963 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16593099 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16593102 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16593346 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 16593528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16593624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16593627 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 16593639 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 16593739 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16593740 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16593837 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16594002 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 16594084 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 16594811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16594909 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16594938 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16594957 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16595000 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16595006 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16595020 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16595024 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16595059 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 16595066 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 16595160 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16595185 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16595211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16595256 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16595264 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16595274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16595367 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16595420 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16595485 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16595501 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 16595562 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 16595607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16595648 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 16595657 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 16595668 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16595680 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16595725 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 16595788 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16595797 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 16595805 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 16596637 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 16597161 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 16598332 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 16599362 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 16599413 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 16600708 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16600758 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16601355 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16602768 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16602851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16603969 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16604298 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16605005 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16605162 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16605600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16605720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16605882 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 16605949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16606486 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16607458 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16608379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16610736 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16611006 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16611022 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 16611048 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16612292 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16612308 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16612656 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16613063 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16613064 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16614147 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 16614158 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 16614429 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16614681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16614733 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 16614749 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16614966 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16617025 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 16617302 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 16617587 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 16618202 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16618647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16618709 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 16618808 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16619004 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16620106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16620406 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16621874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16622715 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16623735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16623793 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 16624667 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16624800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16625270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16625283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16625788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16626136 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16627042 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 16628062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16629054 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 16629055 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 16629203 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16629213 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16629271 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16629344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16629465 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16629519 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16629795 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16629966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16630899 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16631058 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16632910 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16633036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16633750 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16634280 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16634676 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16635081 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16635885 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 16636001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16636860 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 16636936 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16636940 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16637728 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16640329 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16640415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16640810 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16640892 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16640925 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 16641202 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16641526 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16641929 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 16643246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16643808 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 16644421 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 16644456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16644916 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 16645672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16645839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16647104 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16647397 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16647524 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 16647528 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16648254 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16649026 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16649038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16650013 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16650395 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16653476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16655215 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 16657059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16657365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16659010 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16659792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16660796 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 16660945 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 16660978 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 16661081 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 16662100 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 16662616 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 16663161 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 16663163 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 16663235 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 16663757 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 16664212 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 16664454 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16664690 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16664691 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 16665466 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16665539 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16665562 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16666004 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 16666118 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16666473 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16666620 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16666660 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16666781 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16666802 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16667082 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16667287 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 16667466 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 16667677 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16667722 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16667784 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16667796 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16668664 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16670442 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 16670444 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16670993 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 16671010 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 16674152 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 16674183 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 16674303 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 16674370 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 16674535 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16674613 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 16674673 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 16674701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16674966 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 16675121 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 16675122 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 16675180 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 16675201 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16675309 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 16675392 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 16675395 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 16675421 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 16675445 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 16675477 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 16675876 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 16675879 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 16676011 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16676025 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16676065 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 16676820 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 16676929 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16677310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16677671 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 16677741 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16677782 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16677787 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16677857 T G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 16677915 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 16677917 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 16677984 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16678083 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 16678084 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16678162 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16678182 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16678198 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16678217 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 16678261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16678295 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16678381 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16678415 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16678425 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16678582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16678599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16678691 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16678899 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16679274 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16680171 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16680371 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 16680684 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16681126 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 16681127 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 16682190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16683786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16683793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16684188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16691336 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 16691539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16692301 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16692695 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16692862 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16693349 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16693686 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 16694152 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16695125 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 16695414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16698026 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16699195 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 16701663 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 16701728 T G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 16702070 A G Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 16705483 C T Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 16712850 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 16713455 T C Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 16713565 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 16715150 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16715161 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16715190 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16715234 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 16715333 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 16715440 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 16715531 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16715657 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 16715966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16716005 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16716041 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 16716084 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 16716147 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16716178 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16716238 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 16716258 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 16716280 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 16716292 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16716344 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 16716611 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16716840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16717314 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16718188 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16718226 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16718570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16720100 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16720212 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16721455 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 16721599 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 16721689 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 16721925 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16722034 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 16722238 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16722989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16724591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16725201 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 16725208 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 16725215 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 16728835 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 16728890 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16730777 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 16730805 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16732721 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 16733536 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16733976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16734280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16734315 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16734570 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16734675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16734815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16735597 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 16737252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16738672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16741161 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16743353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16744127 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16745010 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 16745138 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16745162 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 16745265 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16745319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16745344 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16745481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16745682 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 16745856 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 16745883 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16745931 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16745978 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16746010 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 16746081 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 16746266 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16746292 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16746480 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 16746683 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16746874 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 16746992 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 16747121 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16747145 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 16747220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16747358 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 16747675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16752193 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16752824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16753139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16753200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16753456 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 16753568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16753756 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16755766 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 16755968 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16755996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16756256 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 16756445 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 16757846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16758264 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 16758298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16758718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16758772 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16758930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16759049 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16759059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16759135 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16759321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16759330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16759538 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16759809 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 16759961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16759971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16759992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16760177 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16760220 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 16760281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16760438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16760495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16760901 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16762149 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 16764408 C G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 16764495 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16764518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16764531 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 16764646 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16764768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16764785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16764814 A T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 16764820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16764929 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16765113 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 16765211 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 16765358 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 16765400 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 16765716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16765861 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 16765876 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 16765994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16766051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16766060 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16766269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16766317 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 16766486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16773843 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16777602 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16783720 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 16785460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16788403 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16789987 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16790070 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16792769 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16793506 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 16794300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16797467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16801415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16802196 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16808425 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16810867 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16811877 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 16812700 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16812789 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 16814940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16815699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16816044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16816455 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16816524 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16822710 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16822752 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 16823164 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 16823317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16825600 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16827553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16827676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16828232 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16828700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16828723 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 16828991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16829311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16829841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16830332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16830342 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 16831082 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 16831083 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 16831102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16831556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16832074 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16832378 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 16832750 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 16832889 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16832970 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 16833151 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 16835061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16835729 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 16835968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16836484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16836856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16837043 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16837113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16837521 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 16837547 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 16837673 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16839952 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16841160 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16841429 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16841843 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 16844781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16846813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16847588 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 16849427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16850162 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16851770 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 16852449 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 16854035 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 16854556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16855715 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 16856463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16859198 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 16859827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16860348 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16861070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16861478 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16862145 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16862542 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16863084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16863506 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 16863607 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16863963 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16864389 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16864619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16864764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16864777 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16866053 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 16866064 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 16866077 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 16866142 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 16866282 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16866768 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 16866799 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 16866838 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 16866842 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16866871 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16866890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16866910 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 16867047 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 16872630 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 16872819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16874464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16875039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16877574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16878615 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16879254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16879591 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16879906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16882738 T G Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 16883849 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 16886612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16887628 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16887682 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16889591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16890345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16893577 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16893830 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16894088 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16894532 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 16894535 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 16894817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16897084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16898841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16899933 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16900237 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 16901797 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 16901941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16902292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16902505 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16902524 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16902895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16903075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16908242 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16912119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16912954 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16912997 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16913022 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16913030 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 16913060 T C Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 14 14 2 10 2 2 16913137 C G Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 16913224 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16913431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16913986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16914238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16914278 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 16915752 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16919020 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16919678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16920555 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16921154 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16922917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16925676 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16925934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16927334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16929641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16930867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16932648 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 16937081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16938434 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16938677 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 16938965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16940375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16941057 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16942204 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 16942206 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 16943529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16949614 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 16949691 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 16949834 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16949928 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 16949984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16950039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16950160 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16950171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16950203 A T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 16950248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16950272 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 16950440 T G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 16950459 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16950560 T A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 16950626 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 16950637 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 16950705 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 16951113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16951117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16951163 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 16951487 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16951700 T A Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 16951705 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 16951977 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16951992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16952435 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16952461 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16952630 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 16952715 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 16953039 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 16953083 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 16953084 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 16953110 C A Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 16953185 G C Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 16953241 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16953284 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 16953384 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 16953394 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 16953443 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16953479 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16953515 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 16953779 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 16953915 T G Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 16953968 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 16954299 T C Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 16954310 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 16954397 A T N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 16954398 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 16954410 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16954411 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 16954437 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16954450 A T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 16954511 C T Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 16954523 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16954538 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 16954539 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 16954559 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 16954633 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16954659 G T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 16954666 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 16954672 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 16954735 T A Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 16954747 C G Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 16954774 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16954921 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16957110 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16957661 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16958730 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16959021 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16959204 G C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 16959249 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16959339 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 16959424 A C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 16959461 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16959491 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16959509 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 16959541 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 16959574 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16959575 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16959653 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16959666 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 16959667 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16959744 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16959878 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16959941 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16959954 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16960136 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16960201 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16960338 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16960509 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16960565 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16960623 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16960724 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16960762 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 16960809 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16960879 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16960881 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16961231 T C Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 16961253 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 16961277 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16961378 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16961424 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16961503 G T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 16961553 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 16961802 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16961888 C A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 16961963 G T Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 16961997 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 16962019 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16962023 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16962212 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16962269 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16962307 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16962327 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16962476 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16962600 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16962838 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16963213 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16963261 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16963313 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16963389 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16963403 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16963412 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16963469 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16963566 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16963686 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16964106 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16971415 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16971830 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16972042 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16972116 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16972118 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16972371 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16972393 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 16972454 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16972498 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16972654 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16972746 G A Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 2 16972748 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 16972877 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 16972950 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16972978 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16973042 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16973057 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16973092 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16973109 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16973337 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16973369 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16973398 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16973406 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16973522 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16973532 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16973533 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16973569 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16973604 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16973611 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 16973617 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16973783 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16973784 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16974149 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16974362 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16974498 C T Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 16974652 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 16974670 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 16974709 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 16975006 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 16975102 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16975263 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16975304 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16975522 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 16976417 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 16977336 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 16977601 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 16977640 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 16977683 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16977728 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16977841 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 16978456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16978499 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 16978702 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16978838 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16979019 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16979173 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 16979353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16979584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16980670 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16980756 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 16981052 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 16981605 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16982217 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 16982260 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16982440 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16983221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16985316 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 16985459 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16985593 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16987406 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16987656 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16988397 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16988596 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16988761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16989360 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16989760 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16989806 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16989926 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 16990315 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 16990456 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16990561 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 16990849 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16990957 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 16991253 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16991715 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 16992155 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16992340 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16992341 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16992481 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 16992514 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16992532 A C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 16992629 A C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 16992717 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16992797 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16992846 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 16992904 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16993111 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16993136 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16993508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16993604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16994019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16994970 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 16995054 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 16995350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16996085 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 16996208 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 16996250 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16996403 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16996426 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16997211 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 16997255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16997421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16997669 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 16997835 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 16998027 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 16998124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16998162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16998919 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 16999072 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 16999234 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 16999509 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 16999898 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 16999899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17001718 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 17001953 A C Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 17002425 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 17002603 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 17002639 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 17002651 G T Y N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 17003518 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17003791 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17004695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17004754 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17004861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17005008 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17005397 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17005416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17005550 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 17005640 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 17006362 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 17006389 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 17006422 A T Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 17006550 C G Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 17006692 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 17006719 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 17006737 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 17006810 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 17006850 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 17007890 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 17007901 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 17008156 T C Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 17008205 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 17008338 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 17008731 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 17008920 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 17012776 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 17013203 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17013205 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17013381 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17013437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17013513 A T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 17013592 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17013769 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17013908 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17014272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17014319 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 17014364 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 17014577 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 17015118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17015123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17015439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17015818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17015889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17015969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17016173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17016264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17016578 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17016611 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17016617 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 17016683 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 17017312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17017436 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17017499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17018091 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17018123 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17018452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17018602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17018910 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 17018946 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 17020553 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 17020647 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 17022391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17022636 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17023612 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17023862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17024031 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17026068 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17027593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17027643 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17027684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17027731 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17028125 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 17028205 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 17028352 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17028664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17028918 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17029192 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17029201 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17029447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17029578 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 17029942 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17030113 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17030344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17030488 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 17030538 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17030598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17030798 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17030813 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17030916 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17031016 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17031441 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17031472 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17031814 G T Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 17031844 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17031940 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17031980 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17032173 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17032229 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17032296 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17032457 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 17032463 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17032565 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 17032955 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17033104 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 17033129 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17033241 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17033353 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17033671 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17033677 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17033744 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17033859 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17033861 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17033884 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17034141 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17034147 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17034794 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17034819 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17034882 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17034886 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17035284 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17035305 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17035627 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17035734 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17035864 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 17035867 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17036073 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17036112 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17036436 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17036459 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17036587 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17036850 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17036891 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17036925 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17037275 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17037288 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 17037489 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17037553 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17037580 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 17037617 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17037706 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17037889 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17037900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17037903 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17037915 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17037925 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17037953 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17037969 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17038042 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17038085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17038230 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17038237 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 17038244 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17038272 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17038812 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17038984 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17039152 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17039273 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17039275 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17039310 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 17039389 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17039406 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17039466 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 17039503 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 17039519 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17039669 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 17039683 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 17039774 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17039820 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17039834 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 17039962 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 17039984 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17040023 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17040052 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 17040151 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17040207 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17040217 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17040312 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17040323 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 17040347 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17040364 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17040375 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 17040397 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 17040404 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 17040570 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17040589 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17040593 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17040633 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17040702 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17040810 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 17040907 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17040951 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 17040991 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 17041010 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 17041050 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17041254 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17041267 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17041392 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 17041413 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17041612 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17041628 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 17041633 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 17041643 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17041647 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17041788 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17041812 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17041864 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17041946 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17041951 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17042057 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17042087 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17042138 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17042160 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17042240 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 17042269 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17042319 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17042438 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17042459 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17042534 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 17042700 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17042715 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 17042717 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17042870 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 17042876 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 17042935 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 17042970 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17043058 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17043074 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17043100 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 17043230 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17043415 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17043475 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17043492 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17043498 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 17043570 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17043586 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17043600 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17043633 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17043664 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17043681 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17043891 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 17043983 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 17044026 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17044239 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 17044598 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17044624 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17044652 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17044692 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 17044734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17044762 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17044774 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17044803 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17045010 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17045073 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 17045074 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 17045219 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17045295 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 17045334 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 17045346 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17045352 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 17045357 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 17053191 A T N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 17053220 A T Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 17053268 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 17053389 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17053411 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17053435 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17053482 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17053574 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17053582 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17053817 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17053892 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 17053945 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17054055 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 17054085 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 17054108 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 17054155 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17054368 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 17054384 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17054788 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 17054857 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 17054979 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 17055005 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17055035 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17055059 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17055127 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17055297 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17055558 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 17055610 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 17055710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17055712 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17055744 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17056302 C G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 17056413 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 17056765 T C Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 17056862 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17056892 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 17056908 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 17056987 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 17057037 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 17057064 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 17057104 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 17057624 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 17058231 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 17058241 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 17058269 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17058318 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17058574 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 17058628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17058654 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17058675 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17059374 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17059424 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17059458 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17059523 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17059635 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17059686 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17059962 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17060049 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17060065 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 17060196 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 17060552 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17060569 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17060710 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17060736 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17060750 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17061063 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17061075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17061150 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17061229 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17061319 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17061602 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17061613 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17061622 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17061806 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 17061928 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 17061945 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 17062184 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 17062185 A G N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 2 17063151 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 17063192 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 17063207 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17063208 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17063241 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17063247 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 17063265 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17063430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17063586 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17063596 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17063623 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17063766 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 17063828 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 17063834 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 17063853 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 17064124 A G Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 17064279 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 17064291 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17064495 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17064507 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17064561 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17064779 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 17064802 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17064947 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17065043 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17065182 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17065245 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17065315 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17065319 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 17065352 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17065361 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17065401 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 17065489 A T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 17065528 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 17065547 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17065672 C T Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 17065673 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 17066152 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 17066188 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17066409 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17066597 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17066627 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17066696 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17066748 C A Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 17066750 A C Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 17066832 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17066886 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17066970 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17067032 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 17067155 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17067249 A C Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 17067395 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 17067444 C A Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 17067479 T A Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 17067606 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 17067713 G C Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 17067846 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 17068365 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17068433 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17068526 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 17068774 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17068836 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 17068864 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17068943 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17069248 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 17069320 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 17069491 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17069578 T G Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 17069602 G T Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 17069661 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 17069786 C A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 17069802 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 17070081 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17070103 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17070136 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17070198 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 17070284 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 17070335 T A Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 17070342 A T Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 17070503 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 17070891 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17071030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17071107 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17071434 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17071597 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17071802 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 17071893 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 17071900 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 17072060 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17072138 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 17072324 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 17072431 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17072453 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 17072454 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17072687 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17072717 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 17072749 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 17072891 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17072934 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17072976 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 17073847 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 17073878 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17074278 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17075301 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17076071 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 17076163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17076407 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 17076542 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 17077294 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 17077459 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 17078351 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17078548 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17078897 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 17079027 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17079271 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17079708 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 17079817 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17080011 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17080189 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 17080507 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17081348 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 17082125 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17082126 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 17082565 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17083066 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17083162 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17083345 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17083639 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17084089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17084235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17085310 G C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 17085909 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17085945 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17086290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17086603 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17091229 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17091442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17092287 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 17093300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17093326 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 17093798 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17094817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17094936 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 17096145 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 17096511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17096937 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17098700 G C Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 17103728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17104679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17106880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17107069 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 17107110 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17107287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17107437 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17107959 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 17108008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17108419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17108690 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17109441 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17109696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17109697 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17109848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17109927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17109952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17110032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17110119 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17110181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17110644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17111105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17111349 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17112104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17112353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17112633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17113685 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17113753 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17114453 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17116125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17116192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17117230 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 17117396 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 17117446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17117505 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 17118246 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 17118378 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 17118457 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 17118728 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17118809 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17118828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17118970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17119018 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17119118 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17120907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17121109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17122638 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17122898 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 17123085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17123124 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 17123260 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 17123283 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 17123462 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 17124334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17125210 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 17125304 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 17126023 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17126550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17126877 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 17129766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17130770 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 17132506 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17132610 G A Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 17134643 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17134918 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17134965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17135758 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17135924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17139085 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17139350 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17140505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17140918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17143105 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 17147183 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17154681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17157189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17166743 A C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 17167317 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17167434 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 17167513 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17167617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17167674 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 17167730 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17167847 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17167928 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17168000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17168118 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17168121 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17168203 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17168232 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 17168260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17168266 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 17168340 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17168363 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 17168487 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 17168513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17168550 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17168553 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17168659 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 17169092 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 17169137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17169186 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 17169212 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 17169215 A T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 17169245 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 17169246 A T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 17169392 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17169429 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 17169551 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 17169648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17169679 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 17169703 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 17169823 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17169826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17169894 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17169966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17170040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17170132 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17170245 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17170993 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17171602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17173078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17173386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17174813 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 17174825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17175099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17175170 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17176500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17176825 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17178052 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 17179106 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 17179132 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17179885 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17180127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17181711 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17192289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17192601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17199859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17199954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17202626 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17203783 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17205749 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17208112 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17210203 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 17210391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17210432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17210441 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17210781 A C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 17210948 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17211205 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17211276 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 17211329 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17211586 T A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17211660 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 17211706 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17211760 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17212112 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17212118 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17212133 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17212264 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 17212589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17212664 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17212717 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17212769 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 17213049 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 17214774 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17220974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17221799 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17222038 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 17225545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17228564 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17231063 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 17232490 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17232547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17233915 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17234059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17234285 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 17234417 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17234593 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17234654 T G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17234680 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 17234901 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 17235153 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 17235202 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 17235290 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17235563 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 17235662 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17235703 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17235742 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 17236002 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17236195 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 17236370 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 17237061 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 17237146 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 17237906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17238015 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17238599 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 17238727 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17239089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17239101 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17239113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17239123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17239191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17239200 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17239253 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 17239354 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 17246186 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 17246262 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17246269 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17246533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17246580 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 17246606 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17246621 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17246634 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17246649 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17246696 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17246779 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17246833 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17246882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17246932 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 17246954 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17246989 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17247046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17247112 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17247135 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17247148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17247207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17247426 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17247765 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17247786 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17247804 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17247996 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17248065 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 17248088 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 17248097 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17248203 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 17248307 T A N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 17248367 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 17248371 G T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 17248465 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 17248653 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17248925 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 17248956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17249067 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 17249156 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 17249237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17249390 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17249508 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17249562 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17249653 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17249683 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17249693 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 17249700 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17249748 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 17249787 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 17249814 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 17249853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17249895 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17249937 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17250159 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 17250288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17250551 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 17250864 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 17250885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17250953 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 17251039 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 17251447 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 17251500 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 17251686 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 17251826 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17251856 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17251964 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 17252018 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 17252031 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 17252360 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 17252371 A T N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 17253382 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 17253452 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 17253582 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 17253598 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17253657 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 17253781 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17253898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17253945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17254208 C G Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 17254255 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17254386 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 17254479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17254546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17254810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17254815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17254860 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17254909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17254975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17255096 G C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 17255129 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 17255134 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 17255169 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 17255217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17255236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17255314 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 17255319 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 17255350 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 17255370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17255433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17255520 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17255628 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17255841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17255989 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17256005 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17256078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17256192 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 17256218 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 17256678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17256769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17256808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17257100 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17257110 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17257112 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17257126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17257519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17257538 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17257669 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17257730 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17257753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17257772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17257795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17257868 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 17257910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17257977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17257980 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17258106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17258153 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17258566 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17258602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17258627 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 17258778 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 17258831 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17258899 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17258907 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 17258991 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 17259065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17259354 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 17259384 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17259473 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 17259604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17259824 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17259848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17259907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17260622 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 17260626 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 17260636 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 17260646 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 17260670 C A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 17260819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17261109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17261225 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17261957 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17261989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17262191 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 17262224 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17262254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17263204 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 17263248 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 17264916 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17268917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17271486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17271881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17272189 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17272260 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 17272446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17272525 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17272579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17272667 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 17272670 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 17272775 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17276713 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17276790 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 17277171 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17278209 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17279098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17280394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17287611 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17291646 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 17291804 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17292279 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17292466 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17292519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17292544 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17292720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17292808 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17292851 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17292961 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17292981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17293232 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 17293905 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 17294618 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 17294638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17294734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17295017 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 17295092 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17295463 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17295512 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 17295550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17295556 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 17295614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17295673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17295909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17296080 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17296098 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 17296189 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17296390 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 17296443 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 17296725 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 17297089 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 17297154 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 17297212 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17297422 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 17298111 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 17298141 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 17298554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17298572 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 17298577 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 17298588 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 17299029 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17299663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17304003 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17304018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17304279 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17306822 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17306931 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 17306945 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 17307046 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 17307088 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17307182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17307280 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 17307305 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 17307507 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17307662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17307768 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 17307809 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 17307927 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 17308282 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 17309059 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17309229 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17309678 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17309733 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17309761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17310183 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 17310227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17310246 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17310376 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 17310621 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 17310889 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17310999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17311101 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17311202 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17311241 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17311896 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 17312022 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17312682 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 17312848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17312878 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 17312892 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 17313433 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17314268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17314479 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17315050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17315089 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17315139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17315288 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17315375 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 17315951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17316114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17316377 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 17316572 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 17316818 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 17317117 T C Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 17317196 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 17317211 A G Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 17317217 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17317260 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17317286 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17317496 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17317628 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17317693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17317800 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17317830 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17317901 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 17318018 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17318057 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 17318155 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17318163 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 17318180 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 17318405 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17318685 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17318807 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 17319192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17319660 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 17319671 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 17321545 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 17321577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17321580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17321844 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 17322090 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 17322962 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17323146 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 17323625 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17324520 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 17324550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17324648 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 17324693 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 17324929 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 17324941 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 17325491 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17325512 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 2 17325712 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 17325722 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17326110 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17326743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17326753 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17326856 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 17326872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17327006 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 17327144 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17327284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17327353 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 17327738 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 17328271 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17328294 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17328465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17328516 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 17328728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17328934 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 17329484 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 17330467 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 17330572 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17331057 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 17331105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17331154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17331336 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17331454 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17331456 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17331692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17331760 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17331815 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17331832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17332015 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17332052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17332105 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17332183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17332332 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17332350 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 17332362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17332406 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17332418 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17332424 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17332442 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 17332500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17332569 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17332654 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 17332853 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 17332942 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17333011 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 17333022 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 17333024 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 17333061 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 17333103 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 17333165 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 17333222 G T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 17333233 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 17333305 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 17333316 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 17333403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17333541 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17333695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17334433 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17334516 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 17334946 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 17335168 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 17335174 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 17335468 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 17335797 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17336076 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 17336209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17336432 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17336467 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 17336539 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 17336613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17336922 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17337040 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 17337208 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17337240 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17337341 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 17337443 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 17337690 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17337743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17338035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17338175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17338564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17339141 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17339357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17339425 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17339484 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17339643 A G Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 17339845 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 17339952 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17340096 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 17340154 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17340167 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 17340205 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 17340356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17340394 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17340403 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17340419 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 17340482 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17340492 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17340662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17340702 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 17341003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341211 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341471 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341531 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17341568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17341674 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17341967 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 17342308 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 17342320 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 17342396 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 17342398 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 17342421 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 17342426 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 17342578 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17342588 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17342863 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17342996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17343157 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17343160 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17343233 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 17343406 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17343409 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17343520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17343573 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17343671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17343689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17343734 T G N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 17343864 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 17343932 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 17343989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17344030 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17344080 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 17344236 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17344364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17344385 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17344404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17344427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17344439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17344445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17344550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17344614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17344726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17344780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17344781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17344801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17344887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17344976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17345262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17345263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17345278 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17345370 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17345387 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17345516 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17345697 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17345706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17346092 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 17346165 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17346287 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17346316 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17346321 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17346444 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 17346496 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17346558 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 17346621 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 17346726 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17346749 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17346801 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 17346812 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 17346853 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 17346923 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17347056 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17347155 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17347230 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17347312 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17347315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17347327 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17347405 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17347497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17347553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17347579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17347752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17347824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17347922 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17348094 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17348105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17348206 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17348236 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17348252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17348392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17348417 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17348451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17348481 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17348527 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17348602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17348671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17348720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17348773 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17348805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17348818 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17348978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17349033 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 17349241 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 17349243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17349268 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17349489 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 17350543 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17350614 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 17350694 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17351125 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17352384 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17352834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17353088 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17353370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17353806 G T N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 17353831 T G N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 17353863 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 17353873 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 17353932 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 17353958 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 17353974 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 17354007 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 17354277 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 17354292 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 17354320 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 17354841 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17354939 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17355576 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 17356344 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 17356705 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17357267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17357645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17358764 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17359370 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17359371 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17360019 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 17360222 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17361678 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17361963 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17362026 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17362109 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17363089 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17363730 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17364103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17364115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17365058 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17366068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17368253 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 17368447 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 17368514 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17368657 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17368777 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17368821 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17368857 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17368883 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 17368934 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17369019 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 17369033 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17369615 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 17369769 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 17369807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17369831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17370044 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 17370373 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17370525 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 17370532 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17370551 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 17370630 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 17370642 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 17370663 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 17370761 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 17370853 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 17370884 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 17370987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17371001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17371043 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 17371131 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17371237 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17371416 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 17371499 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17371650 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 17372226 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 17372309 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17372313 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 17372363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17372475 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 17372639 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 17372949 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17373405 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 17373522 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17373542 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 17373770 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17373777 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17373908 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 17374052 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17374095 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 17374144 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17374300 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17375286 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17375313 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 17376549 T G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 17376688 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 17376693 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17376848 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 17376941 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 17377246 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17377684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17377702 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17378591 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 17378641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17378912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17379119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17379382 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17380056 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17380263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17380433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17380574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17380890 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17381019 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 17381055 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 17381130 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17381182 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17381211 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 17381212 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 17381233 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17381250 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17381327 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17381351 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17381522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17381672 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17381717 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17381817 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 17382441 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17382959 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17383131 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 17383194 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 17383249 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 17383260 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 17383301 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 17383327 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 17383370 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 17383436 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17383555 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 17383691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17383958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17384062 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 17384165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17384170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17384676 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17384774 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17385182 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17385230 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17386190 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 17386944 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 17387145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17387182 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 17387414 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 17387437 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 17387449 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17387450 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17387520 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17387564 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 17387565 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 17387582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17387674 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17387763 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 17387820 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17388008 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 17388107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17388113 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17388118 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17388143 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17388235 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17388244 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17388317 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17388430 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17388453 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17388548 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 17388586 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17388601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17388809 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17389033 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 17389116 A C N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 17389125 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 17389145 A C N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 17389202 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17389428 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 17389432 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 17389445 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 17389535 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17389629 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17389755 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17389841 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 17389879 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17389933 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17389935 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17389948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17390180 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17390307 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17390330 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17390474 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17390488 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17390644 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 17390715 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17390785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17390865 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 17390960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17390974 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 17390998 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 17391042 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 17391120 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17391169 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 17391239 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 17391278 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 17391350 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 17391366 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 17391402 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 17391406 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 17391799 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 17391862 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 17391892 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 17392046 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17392432 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 17392451 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 17392490 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 17392704 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17392717 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17392890 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17392892 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 17392931 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 2 17394068 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 17394239 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17394641 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17394917 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17394992 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17398086 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 17398829 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17399453 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 17400319 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 17400554 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 17400787 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 17401563 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 17401708 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17401932 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17402557 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 17402668 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 17403280 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17403478 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17403502 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17403511 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17403635 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 17403642 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 17403654 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17403758 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 17403920 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17404035 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17404282 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17404504 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 17404645 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17404873 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17405143 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17405292 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17405463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17405532 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17405562 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17405899 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17405941 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17406133 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17406140 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17406170 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 17406251 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17406263 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 17406355 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17406421 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 17406439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17406511 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 17406759 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17406776 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 17407015 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17407061 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 17407073 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 17407099 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 17407107 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17407141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17407154 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17407164 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17407187 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17407272 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 17407299 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17407328 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17407479 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17407539 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17407544 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17407563 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17407565 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17407591 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17407624 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17407805 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17407812 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17407835 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17414200 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 17414290 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17414360 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17414378 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17414476 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17414582 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 17414801 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17414836 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 17415198 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 17415239 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17415269 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17415359 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17415411 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17415584 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 17416044 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 17416164 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 17416273 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17416354 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17416482 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 17416503 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17416520 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17416581 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17416588 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17416646 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17416726 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17416814 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17416880 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 17417185 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17417247 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 17417251 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 17417539 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17417914 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 17417939 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 17418008 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 17418060 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 17418166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17418192 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 17418343 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17418349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17418371 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17418410 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17418430 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17418448 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 17418498 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 17418607 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17418608 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17418719 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 17418732 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 17418759 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 17418824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17418990 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17419021 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 17419225 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17419498 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17419667 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 17419885 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 17419946 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 17419984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17420195 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 17420272 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17420276 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17420308 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 17420309 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 17420373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17420402 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 17420739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17420788 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 17420928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17422375 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 17422917 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17422966 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17423037 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17423104 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17423153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17423195 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17423215 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17423234 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17425607 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17425659 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 17427931 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17430225 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17430530 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 17430540 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 17430590 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 17430673 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 17431401 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 17431463 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 17432260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17435707 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17435764 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 17438302 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 17438487 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 17438548 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 17441251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17444720 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 17445728 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 17453847 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17454733 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17455211 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17455351 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17457343 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 17458537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17459082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17460091 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17463028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17465525 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 17467095 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 17467099 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 17468701 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17468760 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 17470600 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 17470952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17471458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17471583 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17472954 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17473755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17473945 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17475969 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17476074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17481959 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17484243 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17485479 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17486994 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 17487687 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17487878 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 17488165 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17488714 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17488766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17489257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17489745 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17490139 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 17490212 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17490643 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 17490909 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17492718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17493215 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17493618 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17493632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17494337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17494584 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17496072 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17496170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17497208 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17497497 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17497691 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17497728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17497768 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17499289 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17500956 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17501761 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 17502299 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17503174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17504508 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 17504528 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17504697 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17504980 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17505076 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 17505275 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17506179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17509853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17509854 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 17510420 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17510524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17510711 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 17510846 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 17511017 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 17512513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17512664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17514374 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17514673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17517790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17517803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17518023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17518579 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 17520428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17522054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17522420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17522900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17523959 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 17524155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17524394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17526041 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 17526046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17526107 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 17526108 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 17526262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17526315 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 17528039 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 17529520 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 17529914 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17530021 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 17530040 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17530767 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 17530949 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 17531026 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17531122 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 17531229 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 17531359 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17531374 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 17531455 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 17531782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17531980 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17531994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17532005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17532099 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 17532219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17532276 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 17532280 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 17532371 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 17532443 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 17532520 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 17532638 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 17533179 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 17533429 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 17534120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17539667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17539706 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 17539708 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 17539967 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 17540065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17540829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17541419 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 17541420 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 17541442 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 17541532 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 17541640 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 17542851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17543049 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 17543111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17543131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17543188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17543306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17543349 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17543423 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 17543485 A G Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 17543631 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17543829 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 17543841 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 17545692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17545705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17545730 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17545782 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17545887 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 17545934 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 17545935 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 17545962 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 17545965 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 17545979 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 17546044 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 17546116 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 17546300 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 17546970 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17546971 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17547086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17547145 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 17547167 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 17547226 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17547406 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17547410 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17547865 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 17547885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17548527 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17548639 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17548878 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17548970 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17549048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17549053 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17549272 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17549331 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17549506 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 17549573 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17549815 C A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 17549946 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 17550199 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17552185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17552233 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17554036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17558337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17559135 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17560613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17560724 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17561604 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17562945 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 17562953 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17563108 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 17563175 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 17563178 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 17563598 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17563609 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17563624 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17563772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17563918 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17563939 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17563953 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17564344 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 17564412 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 17564964 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17564971 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17564976 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17565122 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 17565221 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17565237 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 17565356 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 17565387 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17565431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17565485 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 17565527 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 17565565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17565581 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17565790 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 17566069 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 17566189 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 17566267 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17566319 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 17566330 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17566485 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17566894 G A Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 17567235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17567756 A T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 17568083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17568418 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 17568422 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17568548 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 17568784 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17569605 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17569676 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 17569878 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 17569994 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 17570119 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 2 17570158 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 17570444 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 17570464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17570508 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17570592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17571269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17571400 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17571506 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17571607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17571793 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 17571965 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17571975 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 17572938 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17576664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17577164 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17577403 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17578254 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17578329 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 17578336 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 17578409 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17578519 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17578533 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17578985 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17579051 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17579816 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 17580050 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 17580385 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 17580699 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17581100 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 17581128 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17581220 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 17581288 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17581360 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17581370 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17581498 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17581719 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17581761 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17581777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17581784 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17581848 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17581892 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17582000 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17582055 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 17582288 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17582350 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17582515 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 17582558 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17582634 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 17582673 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 17582793 T G Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 17583518 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 17583638 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 17583718 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 17583899 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17584148 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 17584172 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 17584221 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 17584340 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 17584398 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 17584401 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 17584748 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 17584756 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 17584985 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17585054 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17585146 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17585321 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 17585385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17585539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17585935 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 17586271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17586834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17587293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17587380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17587427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17587446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17587833 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 17587851 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 17587910 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 17588016 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 17588219 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 17588221 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 17588238 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 17588292 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 17588606 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 17588750 G C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 17589534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17589694 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17589957 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 17589965 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 17590028 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 17590455 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 17591112 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17591162 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 17591210 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 17591225 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 17591375 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17591450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17591452 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17591687 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17592067 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 17592284 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 17592312 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17592666 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17593106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17593859 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 17594371 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 17594731 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 17594806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17594815 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 17594865 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 17595036 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 17595038 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 17595226 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 17595285 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17595352 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 17595390 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 17596483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17597404 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 17597624 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17598217 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 17598230 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 17598486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17599267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17599470 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 17599547 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 17599693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17599868 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 17600248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17600490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17601257 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17601271 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17601591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17601947 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 17602539 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 17602582 C G N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.166666666666667 0.75 0.0833333333333333 13 11 2 9 1 2 17603059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17603163 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17603498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17603554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17603614 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 17604608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17604686 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 17604864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17604919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17605044 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 17605728 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17606045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17606936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17607044 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17607980 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17608296 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17608400 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 17608403 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 17608490 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 17608516 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 17608549 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 17608867 A T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 17608891 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 17609121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17609147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17609288 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 17609309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17609329 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 17609347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17609361 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 17609650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17610095 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17610946 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17611897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17612181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17612317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17612384 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17612966 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17613985 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 17614300 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17614324 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17614335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17614499 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17614594 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17614610 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17614696 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17614727 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17614803 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17614835 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17614846 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17614871 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17614895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17614902 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17615081 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17615118 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17615229 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17615461 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17615468 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17615475 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17615487 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17615524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17615552 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17615658 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17615694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17615768 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17615783 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17615877 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17615901 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17616006 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17616012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17616047 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17616441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17616498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17616545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17616705 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17616984 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17617426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17619989 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 17620254 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17620346 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17620545 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17621143 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17622584 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17622802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17623110 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17623630 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17625816 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 17625818 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 17625906 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 17626497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17628042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17628722 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17628778 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17628786 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17628845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17628846 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17628914 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 17629527 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 17629658 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17629826 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 17630043 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17630330 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17631565 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 17631571 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 17632037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17632613 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 17633277 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 17633302 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 17633347 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 17633354 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 17633429 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 17633630 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 17634115 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 17634159 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 17634791 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17634905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17635056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17635088 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 17635115 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17635248 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17635306 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17635307 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 17635331 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17635341 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17635342 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 17635359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17635367 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17635375 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 17635495 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17635509 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17635524 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17635577 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17635655 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17635656 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17636423 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17636470 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 17636829 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17636872 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17637297 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17637658 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 17639542 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17639555 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17639568 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17639577 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17639674 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 17639790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17639804 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17639834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17639893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17639945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17639976 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17639989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17640172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17640403 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 17640432 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 17640446 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 17640456 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 17640458 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 17640502 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 17640594 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 17640605 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17641678 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 17641896 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17641950 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 17642883 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17643361 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17643424 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 17643504 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17643507 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17643557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17643791 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17644057 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 17644214 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17644965 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 17645207 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 17645344 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17645520 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 17645524 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17646420 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 17646568 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 17646585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17646602 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17646619 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17646620 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17646681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17646745 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17646816 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17647481 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17647622 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17647784 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17648209 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17648609 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 17649950 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17650213 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17652148 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17652207 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17652529 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17653274 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 17653276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17654087 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17654353 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17654486 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17654566 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17656227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17658848 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 2 17659086 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17660444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17661403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17661930 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17662020 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17662021 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17662057 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17662060 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 17665870 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17666055 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 17666364 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 17667314 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17667473 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 17667673 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 17667726 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17667833 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 17667839 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 17667974 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 17667988 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 17668289 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17668311 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17668346 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17668459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17668874 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 17668919 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 17673946 T C Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 17675218 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 17675526 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 17676003 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17676074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17676091 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17676295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17677539 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17677545 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17677611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17678077 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 17678260 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 17678410 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 17678584 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 17678642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17678811 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 17678865 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 17678881 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 17679093 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17679143 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 17679183 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 17679193 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17679332 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17679645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17679757 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17679801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17679899 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17679914 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17679946 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17679985 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17679996 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 17680034 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17680055 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 17680077 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17680195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17680202 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17680354 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17680384 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17680405 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17680431 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17680478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17680876 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 17681303 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17681417 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17681515 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17681520 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17681909 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17681967 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17681984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17682011 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17682209 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 17682302 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17682344 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17682444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17682628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17682781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17683288 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17683798 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17683842 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17684054 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 17684136 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 17684137 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17684176 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17684631 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17684662 T A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17684668 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17684735 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17684882 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17685060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17685161 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17685341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17685613 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17686012 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 17686066 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17686353 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17686405 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17686447 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17686516 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 17686558 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17686566 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17686573 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17686589 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 17686609 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 17686772 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17686950 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17687073 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 17687402 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17687479 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17687541 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17687543 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17687572 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17687595 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17687608 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17687633 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17687644 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17687737 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17687777 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17687845 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17687885 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17687903 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17687992 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17688042 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17688069 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17688131 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17688145 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17688269 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 17688290 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 2 17688376 A T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 17688404 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 17688457 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 17688485 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 17688491 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 17688628 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 17688732 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 17688782 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 17689016 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17689034 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17689174 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17689333 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17689334 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17689426 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 17689430 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 17689514 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17689733 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17689794 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17689819 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17689845 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17689945 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 17689965 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 17690008 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 17690032 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17690043 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 17690045 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17690077 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17690285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17690611 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 17690673 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 17690787 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17690846 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 17690896 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 17690952 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 17690974 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 17691006 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17691041 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17691079 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17691293 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17691353 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17691431 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17691931 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 17692214 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 17692404 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17692635 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17692895 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 17692969 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 17693037 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 17693045 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17693060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17693072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17693077 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 17693336 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 17693502 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 17693690 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17693700 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17693725 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17693730 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17693740 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17693806 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17693819 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17693922 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 17693944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17694021 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17694024 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17694034 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17694092 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17694126 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 17694151 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17694247 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 17694373 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17694374 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17694702 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17694767 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17694789 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17695355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17695380 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17696193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17696219 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17696325 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17696351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17696404 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17696438 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17696439 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17696450 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17696462 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17696481 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17696483 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 17696517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17696524 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17696587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17696666 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17696698 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17696773 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17696811 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17696827 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17696845 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17696874 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17696876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17696907 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17696923 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17696950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17696993 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 17697062 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 17697063 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 17697074 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17697108 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17697280 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 17697288 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 17697292 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 17697351 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17697401 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17697443 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17697567 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17697681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17697961 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17698014 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17698054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17698082 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17698084 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17698104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17698120 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17698153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17698213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17699036 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17699056 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17699104 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17699115 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17699184 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17699284 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17699307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17699382 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17699407 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17699721 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17699786 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17699948 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17699966 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17700107 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17700136 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17700186 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17700193 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 17700238 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17700367 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17700404 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17700468 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17700611 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17700895 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 17701066 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 17701209 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17701228 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17701313 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17701315 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17701723 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17701784 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17701861 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 17701893 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 17701990 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17702285 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 17702295 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17702316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17702329 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 17702388 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17702508 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17703053 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 17703315 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 17704131 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 17704224 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 17704267 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 17704540 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17704854 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17705173 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17705617 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17706200 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17706257 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17706276 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17706283 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17706297 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17706327 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17706783 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17706803 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 17706896 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17706983 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17707018 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17707019 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17707073 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17707112 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17707117 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17707184 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17707231 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17707334 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17707340 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 17707368 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17707398 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17707450 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17707461 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 17707469 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 17707526 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17707534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17707634 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 17707696 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17707861 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17707872 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17707927 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17707934 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17708371 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17708830 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17708842 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 17708869 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17709140 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17709287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17709383 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17709390 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17710036 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17710083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17710244 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17710288 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17710956 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17710979 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17710980 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17711094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17711229 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 17711274 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17711462 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17711656 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 17711663 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17712153 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 17713017 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17713428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17713843 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17713864 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 17713876 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 17713883 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 17714063 A G Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 17714183 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17714400 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17714415 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 17714439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17714445 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17714455 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17714489 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17714506 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17714536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17714545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17714742 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17715342 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17716663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17717099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17717573 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17717805 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17718142 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17718300 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17718428 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17718499 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17719608 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17719620 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 17719884 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17719999 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17720416 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 17720456 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 17720887 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17721178 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17721335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17721503 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 17721876 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 17721910 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17722432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17722458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17722465 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17722609 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 17722656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17722703 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 17722735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17722741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17722777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17722977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17723091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17723107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17723222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17723366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17723410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17723923 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 17724078 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17724706 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17725250 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17725284 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 17725291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17725333 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 17733466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17734262 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 17734900 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 17734952 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 17734981 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17735001 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 17735025 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 17735043 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 17735149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17735200 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 17735287 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 17735860 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17736010 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17736193 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17736463 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 17736573 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 17736645 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17736665 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17736722 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17736729 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17736777 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17736882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17737064 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17737088 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17737328 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 17737379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17737770 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17737810 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 17737822 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17737973 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 17738284 C A Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 17738319 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 17738330 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 17738342 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 17738358 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 17738488 C T Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 2 17738544 G C Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 17738813 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17738818 C A Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 17739246 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 17739274 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 17739489 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17739524 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 17739715 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 17739876 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17740477 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 17742311 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 17742327 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 17742453 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 17742499 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 17742575 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 17742873 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17742909 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17743052 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17743534 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 17743728 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 17743729 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 17743859 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 17743913 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17743948 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 17744083 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 17744406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17744535 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17744548 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 17744583 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 17744600 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17745057 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 17745353 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17745357 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17745907 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 17745980 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17747067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17748732 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 17748770 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17749582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17749621 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17749635 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17749684 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 17749716 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 17749842 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 17749876 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 17750048 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 17750173 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 17750256 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 17750343 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 17750443 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 17750558 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 17750559 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 17750675 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 17750929 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 17750987 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 17751774 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17751796 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 17751880 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17752092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17752098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17752104 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17752248 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17752345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17752511 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 17752661 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17753050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17753194 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 17753317 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 17753355 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 17753359 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 17753512 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 17753522 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17753871 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 17754294 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17754460 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 17754616 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17754778 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17755411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17755701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17755712 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17756057 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 17756074 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 17756075 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 17756481 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 17756494 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 17756531 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 17756535 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17756546 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17756582 A C Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 17756667 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 17756764 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 17756796 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17756841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17756863 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17756909 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17756913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17756930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17756947 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17756948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17756971 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17757375 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 17757448 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 17757537 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17757556 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17757929 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17758412 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17758441 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17758612 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17759036 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 17759074 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17759218 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 17759269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17759275 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17759286 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17759326 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17759401 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 17760025 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17760028 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 17760503 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17760504 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 17760526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17762249 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17762265 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 17762266 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17762564 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17764024 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 17764209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17764366 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 17764416 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 17764679 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 17764742 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17764866 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17764872 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17764896 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 17765165 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17765726 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 17765778 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 17765939 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 17766319 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17766325 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17766383 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 17766413 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 17766436 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17766560 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17767021 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 17767570 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 17767805 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17767956 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17767970 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17768179 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17768223 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17768237 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17768279 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17768318 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17768419 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17768612 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17768974 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17769241 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17769299 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 17769452 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 17769535 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 17769544 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 17769572 G C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 17769681 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17769806 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 17769818 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 17769836 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 17769841 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 17769897 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 17769963 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 17769976 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 17770166 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 17770455 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 17770720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17771779 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17772022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17772548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17772573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17773438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17773563 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 17774102 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 17774215 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 17774360 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17774699 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17774709 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 17774939 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17774941 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17774983 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 17774998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17775147 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 17775219 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17775402 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 17775556 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17776079 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 17776406 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 17776420 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 17776440 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 17776465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17776502 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 17776590 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 17777025 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 17777082 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17777352 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17777648 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17778400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17779838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17782664 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 17783366 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 17783433 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 17784212 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17784615 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17784807 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 17784974 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 17785070 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 17785431 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 17786184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17786249 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17786260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17786425 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17786506 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 17786588 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17786714 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17787776 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 17787839 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 17787852 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 17788379 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17788410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17788466 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 17788478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17788739 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 17788921 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17788938 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 17789019 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17789093 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17789255 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17789313 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17789319 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 17789373 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 17789632 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 17790535 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 17790736 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 17790761 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17790861 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17791143 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17791145 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17791288 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 17791453 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17791593 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 17791673 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 17791677 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 17791910 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 17791948 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17792292 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17792303 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17792378 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 17794396 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 17794561 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17796332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17797223 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17797327 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 17797999 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 17798742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17799546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17800556 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17800678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17800748 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17800877 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17801004 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17801627 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 17802089 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 17802098 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17802109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17802173 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17802507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17802522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17802620 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17802647 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 17803277 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 17803619 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 17803705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17803854 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17804116 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 17804266 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 17804570 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 17804908 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 17804912 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 17804988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17805414 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 17805771 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 17805877 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 17806070 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 17806199 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 17806329 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 17806351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17806363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17806459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17806479 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 17806531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17806542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17806556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17806592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17806601 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 17806641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17806753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17807744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17808057 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 17808170 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17809706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17809963 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 17810271 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17811758 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 17814381 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17814961 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17815293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17815980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17816061 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17816243 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17816631 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17816647 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17818034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17819024 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17819172 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17819173 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17819340 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17819742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17819881 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17820423 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17820462 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17820532 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17820651 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17820665 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17820764 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17820841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17823658 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17827084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17827212 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17827330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17827871 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17829768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17829987 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17830962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17831524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17831587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17832979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17833206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17833485 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17833529 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17833706 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17833910 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 17833915 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 17833937 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 17834015 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17834051 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 17834076 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17834784 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17835121 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17835281 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17835321 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 17835381 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17835548 C G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 17835895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17836976 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 17837132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17837278 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17837440 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17837461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17837640 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17837671 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17837777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17837821 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17838326 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 17838608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17838633 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17838845 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17838949 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17838975 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17838983 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 17840828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17851301 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 17851445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17856377 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 17856463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17857726 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 17857915 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 17858127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17858654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17858758 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 17859688 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17859857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17860135 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 17860159 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17860819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17860845 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17861674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17861884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17862638 C T Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 2 17862946 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 17862949 A T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 17862970 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 17863491 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 17863553 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 17863755 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 17863824 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 17863827 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 17863842 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17864132 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17864223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17864277 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17864295 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17864412 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17864872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17865162 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17865920 T G Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 17865964 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17866101 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17866241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17867148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17867476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17867584 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17867695 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 17867718 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 17868807 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17869121 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17870347 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17870417 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17870594 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17870670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17870856 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17871002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17871010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17871040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17871082 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17871197 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17871586 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 17872445 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 17873260 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 17873348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17873380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17873427 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17873863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17873888 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17873896 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 17873926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17874207 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17874845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17875644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17875735 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 17875873 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17876046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17876052 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17876062 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17876333 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17876363 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17876404 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 17876495 G C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 17876506 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 17876509 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 17876647 G A Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 17876659 A G Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 17876723 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 17876738 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 17876739 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 17876877 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17877127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17878864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17878889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17881437 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17881492 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17881512 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17881552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17881571 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17882390 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17882637 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17884166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17885566 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17885827 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17891951 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 17893502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17893531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17895856 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 17895860 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 17896080 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17896126 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17896138 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17896170 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17896214 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17897124 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 17897199 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 17897300 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 17897430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17897501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17898037 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17898593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17898812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17899344 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 17899932 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17900430 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 17900480 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 17900486 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17901056 C G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 17901159 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17901190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17901382 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17901732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17901975 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17902023 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17902190 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17902536 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17904648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17905521 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 17905746 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 17905997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17906011 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17907847 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 17907857 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 17907883 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17907888 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 17907941 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 17908039 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 17908322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17908382 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 17908455 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17908474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17908484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17908545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17908792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17908924 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17908993 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17909006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17909018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17909043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17909067 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17909115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17909141 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17909276 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 17909678 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17909680 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17909841 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17909842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17909877 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17910094 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 17910114 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17910234 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 17910277 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17910286 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17910311 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17910396 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 17910521 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 17910529 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17910550 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17910559 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17910594 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17910743 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17910835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17910982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17911229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17915307 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17915586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17915621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17916086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17916281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17916548 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17917605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17917873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17921885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17922327 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 17922458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17922685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17924201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17924505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17925430 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17925649 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17926863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17926890 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17926940 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 17927055 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 17927507 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 17927540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17928623 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 17929017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17930218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17931547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17931657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17932118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17933115 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17933417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17935047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17935245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17935262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17936286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17937852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17937862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17964711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17966723 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 17969058 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 17980922 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 17981496 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17984054 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17984570 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 17989432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 17989462 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17990650 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17992261 T G Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 17992498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 17994241 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 17994395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17996320 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17997085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 17997588 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 18001388 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18002797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18005665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18007821 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 18007861 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 18010552 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18011775 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18016871 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18018853 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18019684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18021832 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18024291 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 18024568 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 18026430 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 18026847 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18027025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18027105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18027951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18029768 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18032339 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18032691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18033140 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 18036863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18037671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18038287 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18038685 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 18039216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18039436 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18043407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18044900 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18046506 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18047796 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18051000 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 18051606 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 18053207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18053212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18054666 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18054720 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18056457 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 18056811 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18057292 C T Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 2 18059352 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18062998 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18065229 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18065970 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 18066616 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 18067806 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18067980 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 18067985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18068091 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 18070133 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18071667 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18073348 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18073651 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 18073715 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18075977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18076425 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18077113 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18078346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18086280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18087676 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 18088456 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18088507 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18090625 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18090649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18090948 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 18091189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18091205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18091593 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18091749 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18092194 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18092241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18094827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18095004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18096796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18097393 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18100035 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18100291 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18100636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18100745 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18100805 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18101148 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18101898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18102359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18104330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18104817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18105504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18105664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18105694 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18105892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18108877 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 18108964 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 18109073 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18109351 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18110396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18110442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18111577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18112518 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 18113076 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 18115122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18117000 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 18118415 C G Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 18118825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18119180 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18121772 C A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 18122695 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18123477 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18123793 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 18126011 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 18126524 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18127010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18129146 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18131314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18131531 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18132694 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 18132733 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 18133105 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18133201 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 18133218 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 18133223 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18133759 A C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 18136299 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18137012 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18137775 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18138577 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18140308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18140538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18142361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18142683 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 18143721 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18144564 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18145125 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18145171 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18145383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18145432 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18146108 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18146354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18146467 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18148065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18148087 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18148322 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18151370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18152800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18154220 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18156061 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18158327 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18160464 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18161642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18165210 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 18165436 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18165956 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18167037 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 18170991 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 18171227 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18173673 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18176675 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18177229 C A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 18177242 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18177384 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18179351 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18179951 G T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18180888 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18180962 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18180977 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18181158 G T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18181217 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 18181222 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 18182422 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 18182433 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18182792 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 18185474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18185632 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18186206 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 18186624 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18186720 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18187541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18188977 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18190757 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 18191935 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18192689 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18194035 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18194188 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18194839 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 18194893 C G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 18195284 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18196429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18196757 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18197248 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18197345 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18197469 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18198263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18198685 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18199198 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18200896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18201760 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18201823 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18202686 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18204666 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18205781 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18206119 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18208854 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 18209450 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 18210889 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18211170 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18211202 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18211410 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18211495 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18211535 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18211563 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18217178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18217557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18217693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18223508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18225628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18228108 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 18228186 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 18228188 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 18235665 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18240147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18245821 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18246550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18253470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18259495 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 18259700 A C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 18261875 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18267649 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18267734 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18268145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18268154 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18268690 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18269910 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 18271167 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18273117 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18274794 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18275832 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18275950 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18276755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18277017 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18277282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18277628 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18278776 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 18280539 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 18280810 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 18280966 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 18281533 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18284743 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18285399 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18285521 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18285766 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18285785 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18285810 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18286132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18286384 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18287931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18287999 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 18288142 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18288490 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18288572 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18288665 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18289072 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18289107 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18289427 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 18289586 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 18289588 T A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 18289648 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 18289812 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18289887 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 18289949 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18289980 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 18289981 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 18290018 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18290050 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 18290214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18290223 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 18290245 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 18290405 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 18290449 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 18290642 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18290789 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 18290899 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 18290945 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 18291227 C G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 18291374 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 18291385 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 18291392 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 18291450 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 18291526 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 18291690 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 18291694 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 18291962 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18292642 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 18293160 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 18293370 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 18294246 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 18294296 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 18294597 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 18294677 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 18294709 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 18295090 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 18295205 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 18295999 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 18296232 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18296567 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 18296584 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18296812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18296845 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 18297041 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 18297316 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18297495 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18297902 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 18298064 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 18298138 A T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 2 18298372 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 18298462 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 18299144 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 18299238 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 18299311 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 18299590 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 18299647 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 18300012 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 18300204 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18300671 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 18300680 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18301254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18301333 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 18301393 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18301417 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 18301481 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 18301485 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 18301635 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 18301773 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 18301784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18301818 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18301943 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18301989 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 18302047 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18302326 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 18302534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18302575 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 18302638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18302646 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 18302675 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 18302978 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 18302981 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18303284 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 18303642 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 18303759 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 18304415 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 18304711 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18304735 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18304775 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18304790 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18304937 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 18305137 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 18305387 A T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 18305434 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 18305579 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 2 18305672 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18305841 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 18305946 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 18306112 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18306166 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 18306168 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 18306192 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 18306747 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18306794 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18307053 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 18307078 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 18307130 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 18307184 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 18307253 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 18307365 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 18307692 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18307789 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18307806 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18308007 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18308009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18308080 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 18308124 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18308172 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18308197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18308207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18308583 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18308829 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 18309228 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 18309257 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18309391 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18309428 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18309549 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18309738 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18310038 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 18310267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18310340 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 18310415 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18310588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18310842 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 18310876 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 2 18311087 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 18311104 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18311192 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18311272 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18311286 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18311392 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18311421 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18311953 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18311970 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18312077 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18312091 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18312149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18312539 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 18312756 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18312885 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 18312953 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 18313120 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18313153 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18313256 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18313323 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18313369 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18313389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18313433 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 18314351 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18314553 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18314664 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18314713 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 18314769 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18314977 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18314978 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18315273 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 18315357 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18315502 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 18315509 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 18315539 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18315655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18315664 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18315695 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18315790 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18315883 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18315893 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18315965 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18315973 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18316100 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 18316180 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18316270 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18316317 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18316447 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 18316545 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18316548 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18316859 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18317124 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18317147 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 18317171 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18317328 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 18317539 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18317692 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18317847 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18317986 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18318020 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18318200 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18318231 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 18318350 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 18318464 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18318540 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18318608 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 18318631 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 18318678 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18318750 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18318782 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18318896 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18318968 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18319267 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 18319359 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18319456 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18319464 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18319576 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18319612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18319793 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 18319830 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 18320330 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18320510 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18320585 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 18320699 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 18320814 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18320830 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 18320959 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18320978 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18321027 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18321168 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18321181 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18321279 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18321754 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18321905 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18321925 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 18321948 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 18322255 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 18322264 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 18322339 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 18322496 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18322500 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18322575 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18322674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18322747 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18322770 C A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 18322875 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18322955 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 18323795 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18323801 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18323881 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18324017 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18324096 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18324460 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18324526 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18324692 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18324694 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18325047 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18325279 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18325434 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18326555 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18326617 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18326645 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18326673 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18327504 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18327570 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 18327599 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18328054 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18328530 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18328609 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18328623 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18328922 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 18329324 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18329434 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18331377 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18332014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18332065 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18332066 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18332218 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 18332487 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18332832 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18332834 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18332847 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18333004 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18333021 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18333040 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18333177 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18333200 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18333332 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18333376 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18333405 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18333412 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18333435 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18333486 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18333586 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18333616 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18333640 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18333767 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18333825 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18333854 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 18333905 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 18333925 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18333970 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 18333990 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 18334417 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 18334456 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18334497 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18334554 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18334622 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18334632 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18334664 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18334737 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 18334844 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18334859 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18334875 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18335021 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18335062 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18335069 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18335124 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18335146 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18335170 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18335177 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18335187 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18335210 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18335242 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18335259 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18335289 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18335381 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18335454 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18335507 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18335754 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18335805 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18335835 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18336031 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18336101 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18336171 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18336254 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18336291 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18336350 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18336525 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18336598 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18336650 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18336670 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18336678 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18336749 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18336778 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18336813 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 18336854 T C Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 18336884 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18336913 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 18336954 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18337010 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18337022 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18337056 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18337080 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18337088 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18337100 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18337176 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18337276 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18337302 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18337344 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18337470 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 18337526 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 18337538 T G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 18337609 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18338034 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 18338069 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 18338109 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 18338280 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18338293 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18338299 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18338316 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18338320 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18338419 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18338513 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18338654 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 18338677 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 18338698 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 18338756 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 18338764 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 18338772 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 18338829 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18338866 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18338905 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18338997 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18339557 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18339850 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18339948 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18339953 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18339960 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 18339979 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 18340052 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 18340086 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 18340095 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 18340129 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 18340146 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 18340185 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 18340283 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 18340321 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 18340434 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18340446 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 18340450 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18340461 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18340501 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 18340540 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18340543 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18340557 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18340569 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 18340593 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18340601 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 18340749 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 18340798 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18340801 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18340849 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 18341034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18341143 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 18341259 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 18341571 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18341593 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18342396 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18343037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18343172 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18343349 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18343510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18344931 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18345030 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18345427 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18345476 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18345630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18345657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18345766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18345802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18345940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18346159 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18346509 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18346554 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18346919 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18347024 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18347093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18347179 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18347426 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 18347439 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 18347579 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 18347609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18347654 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18347724 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18347770 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 18347842 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18348000 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18348154 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18348232 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18348233 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 18348254 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 18348266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18348383 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18348391 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18348413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18348606 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 18348607 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 18348662 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18348665 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 18348676 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 18348684 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 18348722 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18348765 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 18348777 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18348840 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18348906 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18348962 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18348964 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18348997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18349204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18349281 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18349634 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18349793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18349938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18349971 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 18350097 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 18350461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18350616 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 18350658 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 18350748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18350904 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18352961 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18353643 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18354766 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 18355325 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18355351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18355879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18355882 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 18355962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18356217 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18356310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18356757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18358427 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18358859 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18359311 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 18359541 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 18359781 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18360066 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18360079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18360105 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18360330 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18360351 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18360392 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18360435 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 18360647 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18360664 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18360714 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18360734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18360779 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 18360845 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 18360885 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18360896 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 18361125 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 18361270 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 18361282 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 18361412 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 18361445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18361477 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18361500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18361517 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18361597 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18361609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18361638 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 18361654 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 18361710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18361718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18361957 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18362113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18362246 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18362379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18362544 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 18362585 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18362719 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 18362965 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18363023 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18363043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18363127 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18363139 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 18363313 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18363586 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 18363592 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18363605 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 18363882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18364121 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18364149 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18364224 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18364539 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18364744 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18364835 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18364916 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18364933 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18364946 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18365028 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18365032 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18365041 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18365099 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 18365223 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18365245 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 18365426 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 18365432 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 18365552 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 18365582 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18365724 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 18365997 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 18366221 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 18366416 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 18366459 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 18366502 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 18366584 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18366879 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 18367471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18367922 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 18367961 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18368720 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 18369049 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18369101 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 18369384 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 18369422 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 2 18369686 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 18369738 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 18369852 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 18369860 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18369958 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 18370050 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18370070 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18370076 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 18370131 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 18370176 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18370188 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 18370257 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18370310 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 18370573 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18370605 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 18370741 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 18370901 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 18371017 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18371067 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18371265 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18371316 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18371355 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 18371375 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 18371454 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18371573 T A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 18371666 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 18371699 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 18371726 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18371755 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18371824 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 18371858 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18371923 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18372107 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 18372119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18372198 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 18372201 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 18372232 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18372251 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18372506 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 18372519 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 18372589 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 18372613 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18372622 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18372634 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 18372654 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18372660 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18372739 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 18372761 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18372799 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 18372812 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18372829 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 18372871 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18372875 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 18372997 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 18373065 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 18373092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18373128 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 18373290 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18373425 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18373589 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 18373594 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 18373635 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 18373658 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 18373960 C A N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 18373979 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 18374119 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 18374209 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 18374246 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 18374303 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18374318 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18374439 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 18374443 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18374490 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18374576 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 18374657 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18375745 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18376060 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 18376667 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 18376993 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18377113 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 18377480 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 18377707 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18377896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18381894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18382488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18382508 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18383295 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18383921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18385525 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18389193 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18391957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18394764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18394874 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18395053 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 18395076 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18395838 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18395847 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18395947 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 18396048 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18396288 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 18396302 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18396311 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18396437 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 18396484 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18396487 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18396762 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18396787 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18396988 A C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 18397093 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18397106 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18397242 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 18397287 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18397606 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18397777 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18398052 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 18398115 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18398168 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18398496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18398500 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 18409453 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 18409605 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18409673 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18410319 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 18410503 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18410590 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18410694 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 18410919 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18411023 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18411104 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 18412359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18412662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18413144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18413145 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 18414953 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18415006 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18415030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18420034 C T Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 2 18421172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18421619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18423775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18423965 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18426083 T A Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 18427995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18428292 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18429200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18430170 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18430809 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18430919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18432169 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 18432252 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 18432426 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 18432485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18432546 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18432706 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 18432723 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 18432868 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 18432878 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 18432897 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 18433057 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 18433105 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 18433164 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 18433188 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 18433355 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18433399 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 18433837 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18433889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18434012 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18434036 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18434370 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18434703 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 18435058 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 18435151 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18435175 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18440287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18440342 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18440900 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18441255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18441294 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18441295 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18441544 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18441807 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18441955 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18442315 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 18442327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18442357 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18442436 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 18442457 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 18442536 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18442900 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 18443021 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18443195 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18443264 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 18443320 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18443322 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18443487 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18443648 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18443722 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18443738 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18443991 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 18444009 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 18444385 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18444501 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18444646 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18444820 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18444998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18445304 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18445426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18445465 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18445515 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18445592 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18445751 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18445782 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18446351 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 18446765 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18447490 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18447616 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18447657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18447790 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18447829 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18447831 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18447869 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18447979 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18448209 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18448246 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18448262 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18448438 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18448545 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18448560 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18448579 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18448603 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18448689 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18448801 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18448879 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18448884 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18448895 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18449158 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18449171 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18449188 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18449225 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18449263 A G Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 18449322 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 18450098 C T Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 18450415 A C Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 18450435 A C Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 18450440 A G Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 18450503 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 18450529 C G Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 18450707 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 18450804 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 18450816 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 18450855 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 18450924 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18450990 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18451057 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18451108 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 18451121 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18451134 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 18451194 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18451377 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18451668 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 18451690 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 18451707 A T Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 18451773 C T Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 18451800 C A Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 18451828 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 18451852 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 18451867 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 18451911 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 18452050 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18452056 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18452083 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18452204 G T Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 18452208 A G Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 18452219 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 18452233 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 18452236 T A Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 18452385 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 18452402 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 18452488 C G Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 18452496 C A Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 18452733 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 18452898 C T Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 18453221 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 18453265 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 18454353 C G Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.181818181818182 0.727272727272727 0.0909090909090909 12 10 2 8 1 2 18454358 T G Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 18454375 A G Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 2 18454447 T A Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 18454565 T G Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 18454803 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 18454878 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18455054 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18455056 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18455153 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18455238 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 18455313 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18455320 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18455543 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18455621 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18455765 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18455821 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18455877 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18455949 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 18456092 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18456098 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 18456248 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 18456339 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18456360 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 18456425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18456681 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18456682 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 18456738 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 18456795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18456865 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18456912 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18457059 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18457430 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 18457471 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18457534 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 18457698 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18457710 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18457720 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 18457828 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18457879 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18457890 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18457894 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18458064 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18458070 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18458128 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18458252 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 18458289 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 18458386 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18458398 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18458404 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18458426 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18458451 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18458567 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18458571 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18458609 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18458693 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18459541 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 18460053 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 18461506 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18461558 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 18461597 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 18461607 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 18461650 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 18461670 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 18461734 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 18461882 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18461902 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18461955 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18461987 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18462109 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18462160 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 18462194 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18462213 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18462229 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18462277 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18462315 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 18462437 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 18462493 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 18462574 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 18462583 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 18462626 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 18462631 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 18462737 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18462824 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 18462945 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18463422 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 18463480 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 18463496 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18463841 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18463865 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 18463885 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 18464047 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 18464054 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 18464406 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 18464543 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 18464622 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 18464802 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 18464832 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 18465253 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 18465605 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18465722 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18465891 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18465946 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 18465959 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18465988 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18466633 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18466984 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18467045 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18467122 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 18467261 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 18467271 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18467315 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18467349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18467389 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 18467398 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 18467435 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18467512 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 18467633 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18467666 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18467688 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 18467690 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 18467938 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 18467956 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18467994 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 18468111 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 18468155 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 18468180 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 18468228 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 18468421 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 18468459 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 18468568 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 18468775 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 18468848 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 18468869 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 18468887 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18468990 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 18469052 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 18469145 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18469245 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18469306 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 18469709 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 18469714 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 18469957 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 18470002 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 18470026 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18470371 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 18470497 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 18470539 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 18470635 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 18470842 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 18471036 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 18471306 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18471465 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 18471686 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 18471696 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 18471717 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 18478163 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 18478321 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 18478429 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18478513 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18478549 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18478554 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18478632 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18478700 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 18478802 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18478896 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18479117 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 18479129 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 18479425 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18479527 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18479742 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18479743 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18479827 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 18480217 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18481830 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18481936 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 18482676 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18482807 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18483779 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18483868 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18484306 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18484502 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18485073 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 18485779 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18485912 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18485939 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18486186 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 18486275 A G Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 18486365 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 18486669 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 18486776 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 18487029 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18487477 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 18487778 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 18487966 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18488026 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18488095 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18488125 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18488399 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18488416 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18488567 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18488607 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18488707 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 18488765 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18488891 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 18488976 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 18489088 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 18489233 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 18489376 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18489379 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18489392 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18489486 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18489548 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18489681 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18489715 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18489727 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 18489784 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18489830 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 18489833 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18489841 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18489845 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18489953 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 18490008 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18490016 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 18490045 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18490140 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 18490210 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18490508 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 18490614 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18491045 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18491171 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 18491402 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 18491442 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 2 18491850 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18491907 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18491985 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 18491994 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492012 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 18492021 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 18492036 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492071 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18492100 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492140 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492188 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 18492189 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 18492204 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492306 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492336 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492376 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492446 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492508 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492531 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 18492574 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 18492705 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 18492722 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 18492833 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492888 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 18492929 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492945 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18492952 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18493042 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 18493131 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18493152 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18493213 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18493222 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 18493237 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 18493270 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18493328 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 18493575 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 18493616 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18493687 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 18493727 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 18493886 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 18493896 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 18493917 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 18493953 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 18493960 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18494306 A C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 18494318 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 18494371 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18494400 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 18494463 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 18494501 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18494546 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 18494562 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18494581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18494762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18494879 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18494892 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 18495071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18495114 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18495130 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 18495191 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18495342 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 18495546 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18495938 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18496542 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 18496608 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 18496672 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18496752 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18496816 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18496886 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 18496939 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 18496960 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18496962 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18497023 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 18497090 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 18497114 G T N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 18497125 G T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 18497389 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18497414 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 18497483 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 18497597 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 18497686 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 18497700 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 18497740 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 18497742 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 18497904 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 18497909 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 18498007 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 18498025 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 18498060 A C N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 2 18498282 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 18498285 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 18498369 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18498386 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18498416 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18498616 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18498629 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18498659 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 18499071 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18499072 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18499092 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18499335 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18499340 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18499399 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18499411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18499466 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18499473 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18499524 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18499556 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18499712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18499833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18499842 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 18499876 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 18499926 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18499988 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18500106 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18500227 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18500298 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18500308 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18500326 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 18500347 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18500382 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18500395 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18500398 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18500417 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18500657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18500708 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 18500799 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18500902 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 18500933 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 18501015 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18501040 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18501077 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18501109 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18501174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18501290 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 18501643 T G N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 18501667 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 18502171 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18502252 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18502265 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18502537 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18502840 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18502845 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18503912 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 18503928 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 18504102 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18504112 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18504222 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 18504286 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18504319 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 18504407 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18504552 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 18504574 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18504581 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 18504597 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18504676 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18504744 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18504826 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18504876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18504970 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18504982 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18505098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18505327 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 18505360 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18505996 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18506073 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 18507509 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18507664 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18507944 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18508168 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18508202 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18508380 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18508568 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18509333 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18509858 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18511188 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 18511211 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 18511227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18511464 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18511704 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18511832 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18512973 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18513785 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18514366 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 18514446 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18514794 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 18515805 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18517285 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 18517605 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18517931 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18518037 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18518216 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 18518417 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18518906 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18519024 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18519053 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18519086 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18519285 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 18519402 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 18519457 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 18520098 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 18520209 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 18520259 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18520301 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18520442 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18521173 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18521344 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18521369 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18521587 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18521668 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 18522166 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 18523347 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18523582 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 18523742 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18523922 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18524047 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18524217 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 18524405 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 18524496 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 18524545 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 18524580 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18524596 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18524756 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 18524764 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 18524883 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 18524943 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 18525027 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 18525139 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 18525165 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18525291 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 18525297 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 18525399 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 18525415 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 18525701 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18526322 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18526396 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18527286 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 18527566 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 18527807 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 18528908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18529460 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18529744 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 18531217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18531296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18531360 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18532517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18534276 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18534997 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18539830 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18540274 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18541426 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18542720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18544570 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18546639 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18546824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18547002 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18547482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18547502 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18548121 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18548191 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 18548255 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18548271 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 18548294 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 18548339 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 18548387 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 18548447 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 18548467 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18548578 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 18548601 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18548623 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 18548769 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 18548931 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 18548946 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 18549006 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 18549036 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 18549317 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18549361 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 18549369 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 18550109 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 18552164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18552226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18553774 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 18554147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18554278 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 18554281 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 18554414 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 18554700 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18554878 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 18555062 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18555468 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18557906 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18558307 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 18558328 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18558410 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18559228 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 18559237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18559710 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 18559758 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 18559857 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 18559925 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 18560049 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 18560060 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18560082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18560132 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 18560141 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 18560390 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 18560518 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18561017 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 18561217 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18562974 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 18562994 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 18563293 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 18563369 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 18563573 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 18563609 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 18563629 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 18563646 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 18564043 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18564046 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18564079 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 18564264 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 18566895 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18567089 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18568904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18570944 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18571217 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 18571689 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18572016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18572495 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18572740 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18573090 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 18573210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18573261 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18573475 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18574812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18574952 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18578300 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18579826 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 18579944 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18579980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18580318 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18580396 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18580494 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18581587 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18582435 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18582834 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 18582889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18584078 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18584356 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18584573 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18584610 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 18584716 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 18584774 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18584975 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 18584982 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 18585247 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18585316 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 18585517 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 18585902 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18586007 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 18586010 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18586093 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 18586192 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18586401 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 18586416 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 18586499 T G N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 2 18586874 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 18586909 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 18587489 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 18587492 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 18587503 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 18588204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18589059 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 18590630 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18591169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18591395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18591836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18595643 T G Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 18597520 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18599846 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 18599884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18600839 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 18601290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18601401 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 18602072 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 18603191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18603326 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 18604227 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 18604325 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 18604386 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 18604936 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 18605657 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18605913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18608920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18608976 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 18609810 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 18609837 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18611063 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 18612064 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 18612150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18614355 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18614471 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 18614479 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 18617675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18618344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18619562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18621253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18621445 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18621858 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18622318 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18623031 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18626523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18627656 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 18627676 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 18628559 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 18628655 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 18628909 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 18630757 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18631074 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18631349 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 18632457 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18632813 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18633072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18633247 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 18633793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18633957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18633984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18633991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18634039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18634063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18634222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18634619 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 18635584 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 18637148 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18637495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18637829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18637961 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18638031 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18638142 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18638143 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18638191 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18638463 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18638468 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18638521 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18638522 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18638619 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18638788 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 18639022 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18639095 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18639108 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18639150 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18639170 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18639194 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18639267 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18639320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18639341 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18639346 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18639534 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18639575 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18639580 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18639882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18639884 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18639949 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18640084 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18640270 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18640435 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 18640765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18641155 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18641191 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 18641678 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18641758 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 18641852 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 18641907 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 18641922 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18641970 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 18641985 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 18642116 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 18642312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18642424 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 18642443 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18642460 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18642546 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18642726 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18642741 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18642800 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18642829 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18642966 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 18642989 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 18643019 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 18643123 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18643941 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 18644708 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 18644875 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18644912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18645888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18646212 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18646537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18648371 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18648433 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18648544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18649058 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 18650480 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18650626 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18651717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18651815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18651901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18652350 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18652735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18652757 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18652833 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18653084 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18653201 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18654362 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18654923 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18655169 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18655442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18655901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18656160 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18656248 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 18657563 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 18658064 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18658444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18658518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18658817 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18659731 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18659819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18660119 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 18660151 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18660230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18660628 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18660810 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18661194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18661248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18661911 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18663081 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18663114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18663136 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 18663461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18664278 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 18664347 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18664547 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 18664801 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 18665043 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18665113 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18665448 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18665537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18665747 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 18665793 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18665875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18665947 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18666014 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 18666173 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18666487 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18667631 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18668301 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18668870 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18669097 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18669283 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18669632 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 18669777 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18669982 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18670144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18670328 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 2 18670416 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 18670608 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18671035 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 18671162 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 18671173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18671407 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 18671671 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 18671735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18671868 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18671912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18672112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18672156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18672242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18672646 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18672700 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 18672758 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 18672885 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 18672986 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 18673102 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 18673223 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18673448 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 18673859 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 18673878 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 18674366 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18674575 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18674833 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18674909 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 18675080 C A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 18675177 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18675561 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18675623 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 18675632 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 18675813 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 18676137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18676501 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18676629 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18677061 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18677142 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18677441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18677650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18677870 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18677930 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18678538 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18679341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18679695 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 18679870 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 18680018 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 18680590 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 18680868 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18680903 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 18681207 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18681382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18683375 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 18683398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18684415 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 18684639 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 18684675 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 18684684 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 18684878 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 18684895 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 18685020 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 18685024 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 18685044 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 18685552 T A N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 18685631 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 18685632 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18685867 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18686158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18686275 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 18686401 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18686730 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 18686876 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18686973 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 18687196 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 18687287 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 18687290 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 18687366 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18688781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18688820 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18688856 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18688999 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 18689118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18689259 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 18689315 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 18689902 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 18689981 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 18690109 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 18690172 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18690224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18690363 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18690378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18690635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18690859 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 18690877 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 18690946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18691118 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 18691742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18691830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18691853 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18691877 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18691958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18692052 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 18692063 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 18692167 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18692187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18692210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18692296 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18692321 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18692354 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 18692876 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 18692882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18692897 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18692949 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 18692999 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 18693083 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 18693149 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 18693202 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 18693302 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 18693338 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 18693533 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 18693654 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 18693932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18694147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18694615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18696571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18696918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18697131 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18697336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18698097 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18698183 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 18698195 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18698211 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 18698302 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 18698329 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 18698622 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 18698645 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 18698716 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 18698735 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 18698798 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18698840 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18698847 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18699001 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18699283 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 18699345 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 18699382 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 18699513 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18699787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18699917 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18699921 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 18699959 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 18699999 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 18700293 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 18700746 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18701039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18701415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18701537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18701971 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 18702103 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 18702183 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18702365 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 18702369 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 18702376 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 18702386 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 18702433 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 18702466 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18702491 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18702553 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18702569 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18702608 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18702752 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 18702808 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18702964 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18702993 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18703030 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 18703434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18703439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18704388 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18704436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18704500 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18704526 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18704584 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18704603 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18704691 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18704740 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18704769 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18704823 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18704844 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 2 18704917 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18704958 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18705039 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18705068 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18705070 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18705101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18705133 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18705232 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18705255 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18705359 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 18705477 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 18707361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18707642 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18707825 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 18708382 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 18708590 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18708885 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18708921 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18709200 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18709241 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18709748 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 18710264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18710791 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18710830 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18712110 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 18712219 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 18712221 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 18712273 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 18712437 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18712511 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 18712616 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 2 18712669 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18712871 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18712957 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18712996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18713086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18713097 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18713127 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18713544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18713769 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 18713870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18713901 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18714001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18714005 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18714117 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18714126 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18714332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18714377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18714596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18714762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18714857 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18714915 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18714916 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18714960 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18714995 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18715007 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18715057 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18715073 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18715130 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18715320 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18715371 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18715390 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 18716172 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18716585 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 18716767 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18716868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18718729 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 18718906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18718922 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18718973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18719186 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18719543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18720011 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 18720380 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18721072 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 18721931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18721962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18722999 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 18724879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18725633 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18730426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18731743 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18732975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18733193 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 18735437 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18735945 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18736310 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 18736343 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 18737330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18737707 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 18737809 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 18738234 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 18738441 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 18738581 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18738863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18739062 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18739073 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18739085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18739873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18740550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18741409 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18744026 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 18744091 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18745102 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18745265 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 18745856 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 18745926 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18746063 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 18746088 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 18746528 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 18746544 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 18747438 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 18747464 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18747579 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 18747710 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 18747829 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18748094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18748830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18748998 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18749782 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 18749849 T C Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 18749892 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 18750399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18750413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18750437 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18750476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18750829 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18751650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18751836 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18751899 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 18751938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18752669 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18752690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18755209 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18758793 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18759464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18759813 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 18760055 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18761368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18762923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18762975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18763111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18763140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18763284 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 18763320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18763352 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 18763920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18766938 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18767586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18770059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18771293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18771335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18771825 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18771920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18771961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18772585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18772899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18774269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18774345 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18774414 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18775198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18776471 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 18776476 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 18778134 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18778481 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18778513 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18778518 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18778574 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18778605 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18778755 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 18778851 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18778901 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 18778941 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 18778964 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 18778986 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 18779051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18779071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18779372 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18779525 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18779592 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18779651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18780264 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 18780431 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18780641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18780673 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 18780701 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18780748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18780767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18780853 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18780895 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 18781061 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 18781152 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18781157 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18781193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18781353 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 18781496 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18781531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18781545 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18781642 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18781977 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18782159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18782302 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18782469 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18782773 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18783205 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18783213 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 18783360 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 18783370 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18783499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18783518 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18783523 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 18783552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18783609 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18783849 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18783897 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18783935 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 18783972 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 18784054 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 18784111 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 18784121 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 18785104 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18785292 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 18785334 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18785421 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18785423 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 18785518 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 18785577 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18785779 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18785814 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18785904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18785926 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18785934 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 18786171 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18786872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18787013 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18787039 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18787044 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 18787051 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18787081 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 18787089 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 18787117 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 18787119 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 18788822 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18790202 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18790895 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18791766 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 18791810 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18792250 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 18792388 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 18792948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18793102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18793151 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18793248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18793262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18793280 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18793296 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18793306 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18793307 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18793327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18793338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18793525 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18793577 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18793660 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 18793772 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18793956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18794097 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18794099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18794140 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18794223 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18794796 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18795273 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18795575 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18796096 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18796117 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18796118 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18796143 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18796202 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18796242 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18796335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18796402 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18796475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18796574 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18796603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18796899 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18796953 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18797918 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18798004 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18798005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18798055 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18798429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18798706 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18798881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18798898 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18798918 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18798920 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18799013 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18799159 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18799246 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18799294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18799327 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18799358 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18799418 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18799469 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18799520 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18799553 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18799568 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18799653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18799677 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18799770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18799773 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18799819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18799997 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18800018 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18800075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18800138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18800212 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18800322 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18800375 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 18800415 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 18800445 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 18800536 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18800577 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18800618 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18800619 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18800691 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18800738 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18800742 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18800797 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18800976 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 18801015 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18801061 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18801122 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 18801128 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18801153 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18801194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18801371 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 18802310 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 18802336 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 18802873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18802899 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18802929 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18803014 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18803018 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18803090 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 18803099 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18803162 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18803242 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18803322 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 18803346 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 18803385 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 18803439 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 18803522 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18803624 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 18803629 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 18804649 G C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 18804689 A G Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 18804723 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18804783 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18804919 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 18805010 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18805181 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 18805229 C G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 18805248 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 18805258 G T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18805330 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 18805338 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 18805401 A C Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 18805415 C T Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 18805437 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 18805550 A T Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 18805649 C T Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 18805670 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18805801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18805874 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18805953 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18806222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18806279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18806296 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18806320 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18806330 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18806343 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18806344 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18806435 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18806441 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18806490 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18806517 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18806574 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18806628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18806696 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18806733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18806740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18806808 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18806831 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18806864 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18806895 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18806988 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18807152 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18807382 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18807548 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18807629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18807642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18807672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18807702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18807795 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18807867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18807942 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18808061 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18808133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18808134 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18808158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18808252 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18808254 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18808322 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18808466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18808554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18808602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18808633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18808656 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18808732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18808785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18808815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18808978 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18809276 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18809278 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18809418 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18809588 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18810204 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18811099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18811114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18811251 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18812009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18812270 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18812608 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 18812949 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18812995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18813073 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18814247 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18814606 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18814614 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18814790 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18814792 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18814817 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18814819 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18814830 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18815784 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18815785 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18815866 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18815872 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 18815954 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18816108 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18816281 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18816290 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18816293 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18816426 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18816532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18816647 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18816689 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18816696 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18816700 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18816725 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18816841 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18816890 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18816922 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18817000 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18817052 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18817165 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18817199 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18817365 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18817516 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18817837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18817986 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18818289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18818912 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18818961 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18819031 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18819071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18819079 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18819091 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18819139 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18819587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18819801 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18820234 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18820290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18820363 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18823029 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18823312 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18823475 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18823984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18825441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18825511 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18826317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18829029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18829275 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18829844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18829926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18829965 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18829978 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18829987 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18829991 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18830095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18830145 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18830149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18830201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18830358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18830749 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18831614 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18831941 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18832666 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18832962 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18833215 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18833225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18833252 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18833503 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 18833561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18833704 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18833817 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18833951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18834879 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18834980 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18835009 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18835136 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18835144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18835214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18835314 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18835646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18835957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18836125 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18836187 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18836289 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18836517 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18836579 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18836580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18837140 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18837455 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18837970 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18838302 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18838331 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18838394 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18838472 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18838516 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18838542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18839367 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18840627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18841210 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18841822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18841961 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18842303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18842341 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18843329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18843677 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18845537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18846477 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18847102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18847145 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18847226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18847324 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18847325 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18847711 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18848464 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18848594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18848754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18848770 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18848801 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18848810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18848838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18848861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18848867 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18849047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18849098 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18849182 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18849502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18849521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18849538 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18849571 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18849666 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18849725 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 18849774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18849828 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18850005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18850014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18850094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18850104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18850110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18850336 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18850757 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18854178 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 18854239 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 18854853 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18855544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18856137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18857144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18857876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18858363 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18859714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18859902 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18860130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18860331 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18860340 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18860515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18860967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18860983 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18861346 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18861430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18861645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18861662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18862207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18862481 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18863009 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18866003 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18866172 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18866217 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18866515 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18866669 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18866672 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18866756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18866760 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18867324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18867400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18867648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18867784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18867787 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18867900 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18867905 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18867993 C G N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 2 18868348 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18868364 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18868455 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18868647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18868720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18868849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18869457 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18872974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18874451 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18875436 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18875596 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18875777 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18876205 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 18876298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18876373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18877008 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 18877022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18877246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18877327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18877396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18878377 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18879374 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18879487 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 18879599 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18879720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18879809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18880188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18880319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18880373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18881108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18881293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18882201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18884742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18886294 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18886451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18886642 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18889009 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 18889025 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 18889055 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18889961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18890010 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18890026 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18890033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18890082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18890182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18890449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18890469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18890542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18890850 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18890927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18891018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18891045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18891131 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18891154 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18891191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18891211 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18891300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18891417 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18891602 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18891731 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18891979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18892035 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18892041 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18892059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18892111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18892143 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18892262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18892436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18892451 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18892455 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18892471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18892472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18892488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18892497 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18892499 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18892662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18892687 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18892716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18892743 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18892755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18892855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18892933 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18892991 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18893112 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 18893267 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 18893338 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18893397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18893402 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18893412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18893431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18893490 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18893588 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18893613 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18893640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18893684 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18893722 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18893790 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18893828 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18893867 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18893998 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18894394 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18894556 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18894655 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18894784 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18895100 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18895114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18895142 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 18895330 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 18896811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18898292 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 18898535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18900532 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 18901308 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 18901944 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18902797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18904287 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18904416 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 18904508 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 18906567 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18907605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18908431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18909352 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18909919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18909994 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 18910132 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18910357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18910387 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 18910860 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18912753 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18912787 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 18912827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18913602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18913611 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 18913951 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18915382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18918296 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 18918643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18919369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18920035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18921258 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18921629 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18921658 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18921954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18922320 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 18922357 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 18922527 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18922620 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18922713 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18922918 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 18922945 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18922946 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18922963 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 18923001 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18923007 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18923038 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18923093 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18923096 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18923107 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 18923119 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 18923178 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 18923187 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18923243 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18923263 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18923329 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18923368 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18923383 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 18923416 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 18923470 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18923480 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 18923787 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 18924069 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 18924471 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18925100 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18925945 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 18926148 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 18926555 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18928079 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18928275 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18928370 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 18928372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18928489 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 18928508 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18928517 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18928541 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18928543 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 18929119 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18929175 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18929422 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18929472 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18929508 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18929617 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18930297 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18930804 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18930858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18931117 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18931570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18931947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18932190 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 18932688 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18932870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18934924 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18936394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18938210 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18938887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18938920 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18941052 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18941462 G A Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 18942426 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18942512 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 18942552 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 18942698 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18942723 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18942773 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18943057 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18943091 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 18943111 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18943143 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18943220 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 18943264 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18943338 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 18943356 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18943417 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18943449 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 18944272 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 18944436 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 18945193 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18945610 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18946061 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 18946079 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18947551 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18947573 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18947958 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 18948519 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 18948525 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 18948579 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18948673 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 18948733 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 18948753 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 18948807 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 18948891 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18949007 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 18949093 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 18949106 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 18949499 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 18949531 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 18949574 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18949602 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 18949722 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 18950243 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18950280 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18950305 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18950627 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18950652 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 18950667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18950869 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18950940 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18950993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18951008 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 18951036 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 18951088 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18951192 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18951240 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 18951331 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18951437 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 18951465 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18953240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18956033 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18956262 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18957683 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18958847 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18960117 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18960270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18960647 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 18961007 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18961056 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 18961102 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 18961313 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 18961688 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18961730 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 18961868 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 18961988 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18962767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18962957 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18963544 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 18963648 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18967710 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 18968043 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 18968450 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18968508 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18968762 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18968860 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 18969070 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 18969753 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18969991 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 18970014 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18970155 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18970509 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18970755 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18970781 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 18970783 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18970809 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18971482 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18971507 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18971509 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18971641 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18971740 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 18971757 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18971959 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 18972213 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 18972287 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 18972409 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 18972517 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 18972658 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 18972732 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 18972927 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 18972993 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 18973263 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 18973270 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 18973885 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 18975149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18975482 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 18975584 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 18975762 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 18976737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18978521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18978663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18978772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18978855 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 18978919 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 18979787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18981476 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 18981507 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 18981963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18982033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18982035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18982326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18982420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18983046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18983126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18983409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18983421 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 18983431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 18983628 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 18984050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18984073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18984865 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 18984920 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 18984965 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 18984979 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 18984990 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 18985107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18985146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18985252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18986002 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18986020 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18986149 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 18986326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18986327 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 18990054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18990058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18990275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18991338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 18991586 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 18991813 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19001324 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19001360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19004584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19005333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19006361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19008356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19008528 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 19010561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19011261 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19015807 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19016003 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19017530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19017545 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19018134 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19018987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19019276 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 19021913 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19023632 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 19023637 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 19025181 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19025339 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 19026201 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19026273 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 19026526 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 19026934 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 19026972 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 19027074 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 19027087 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 19027092 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 19027198 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19027226 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 19027347 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 19027445 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 19027582 C G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 19027641 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 19027668 C G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 19027691 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 19027707 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 19027816 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 19027827 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 19027852 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 19027887 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19027924 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19027943 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19027999 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 19028003 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 19028031 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19028088 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 19028095 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19028113 A C Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 19028130 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19028154 G T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 19028190 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19028245 A C Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 19028266 T G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 19028271 T C Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 19028309 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 19028386 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 19028397 A G Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 19028456 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19028479 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 19028497 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 19028504 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 19028541 T G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 19028843 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 19028856 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 19028870 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 19028875 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 19028918 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19028958 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 19028983 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 19028988 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 19029000 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 19029049 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 19029124 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029141 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029160 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029177 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029183 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029200 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19029238 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 19029263 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19029339 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029391 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 19029403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19029405 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 19029416 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 19029454 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029577 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19029613 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029625 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029629 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19029640 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029694 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19029707 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19029718 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19029734 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19029806 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029810 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029831 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029874 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029883 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029910 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029928 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029952 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19029996 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19030091 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19030278 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 19030292 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 19030372 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 19030385 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 19030396 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 19030406 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 19030460 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19030477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19030590 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19030620 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19030653 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19030654 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19030684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19030706 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 19030878 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 19030927 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19031084 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 19031211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19031264 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19031702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19032007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19032388 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 19032389 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 19032412 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19032431 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 19032447 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 19032561 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 19032575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19032649 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19032783 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19034859 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 19035318 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 19035404 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 19035600 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 19035659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19035765 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19035779 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 19035817 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 19036304 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 19036368 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19036388 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19036522 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 19036579 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19036627 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 19036637 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 19036735 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19036859 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19036952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19037562 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19037563 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 19037611 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 19037617 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19037651 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19037658 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19037678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19037827 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19037855 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 19038152 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 19038209 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 19038317 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19038321 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 19038329 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19038332 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19038383 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19038469 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 19038526 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 19038571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19038706 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19038711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19038727 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 19038758 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 19038850 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19038905 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 19038920 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19039035 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19039070 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 19039114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19039162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19039751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19040201 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 19040214 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 19040295 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 19040360 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 19040410 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 19040425 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 19040516 T G N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 19040603 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19040618 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 19040713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19040777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19040823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19040882 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 19040997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19041031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19041053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19041091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19041110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19041123 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19041267 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19041291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19041469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19041646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19041913 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19042226 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 19042248 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19042255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19042340 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19042373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19042419 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19042424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19042471 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 19042473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19042487 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 19042505 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19042608 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19042708 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19042736 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19042808 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19042952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19042965 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19043179 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19044137 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19044301 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 19044501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19044661 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19044726 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19044806 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 19044815 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 19044870 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19044911 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 19044926 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 19044982 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 19044984 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 19044993 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 19045722 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19045842 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19045850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19045874 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 19045951 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19046015 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 19046022 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 19046358 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 19046364 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19046488 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 19046508 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 19046509 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 19046606 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 19046614 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 19046955 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 19047219 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19047354 T C Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 19047369 A T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 19047736 C G Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 2 19047739 A G Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 19047750 A G Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 19047813 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 19047839 C A Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 19047840 G A Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 19047946 G T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 19048145 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 19048151 C T Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 19048182 C T Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 19048214 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 19048318 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19048392 C T Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 19048519 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.0666666666666667 0.8 0.133333333333333 14 16 1 12 2 2 19048993 A G Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 19049231 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 19049255 C T N Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 19049294 G A Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 2 19049553 A C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 19049652 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19049753 C G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 19049875 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 19049909 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 19049929 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19049930 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 19049958 T G Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 19050107 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 19050141 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 2 19051443 G A Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 19051472 T A Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 19051541 C T Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 19051661 A C Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 19051932 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19051937 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19051961 A C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 19052027 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 19052067 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 19052154 A T Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 19052162 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 19052224 A G Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 19052268 A G Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 19052282 T G Y N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 19052346 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 19052371 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 19052377 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 19052431 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 19052453 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 19052465 C G Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 19052476 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19052539 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19052551 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19052568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19052638 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19052660 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19052686 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 19052835 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19052982 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 19053032 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19053154 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 19053161 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 19053529 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 19053616 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19053636 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 19053637 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 19053804 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 19053993 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19054009 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19054133 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19054298 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 19054309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19054354 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19054386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19054462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19054576 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 19054825 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 19054837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19055049 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 19055054 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 19055143 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19055242 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19055274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19055360 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19055807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19055844 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19060406 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19062619 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19064481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19065654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19068228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19068491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19068675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19068745 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 19069679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19070904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19071627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19073080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19073143 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 19073692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19073768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19073848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19076481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19077447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19077834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19077865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19078376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19078753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19079977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19081294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19081479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19082070 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 19082772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19082887 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19082966 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 19082977 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 19083168 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 19083483 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 19083944 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 19083964 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 19084224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19084235 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19084257 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 19084300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19084305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19084610 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19084631 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19084928 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19085372 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19085526 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19085651 T C Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 19085660 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 2 19086886 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 19086934 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 19087073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19087742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19087846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19092878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19096413 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 19096528 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19096759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19097095 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19098341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19098660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19099313 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19100246 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19100513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19100679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19101136 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19101629 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19101915 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19102166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19103324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19104681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19104925 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19106660 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 19107566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19107995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19108027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19108374 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 19108412 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19108546 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 19109270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19110490 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 19111450 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 19113095 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 19114340 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19115644 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19118781 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 19118884 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19119116 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 19119122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19119196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19119310 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 19119611 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 19120281 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19120490 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19121376 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19121634 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19121691 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19122043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19122201 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 19122218 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19122765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19122866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19122898 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19123747 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 19123791 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 19123901 T G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 19124098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19124111 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 19124293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19124330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19124429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19124518 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 19124821 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 19124822 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19125003 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 19125034 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 19125060 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 19125125 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 19125143 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19125182 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19125220 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 19125229 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19125405 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 19125694 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 19125701 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 19125745 T G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19125979 C A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 19126233 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 19126245 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 19126250 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 19126301 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 19126368 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 19126448 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 19126478 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 19126495 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 19126522 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 19126613 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 19126641 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 19126662 A G Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 19126685 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 19126733 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19126761 A C Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 19126776 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 2 19127555 G A Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 19127634 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 19127663 A G Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 19127698 A C Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 19127716 T C Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 19127770 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 19127799 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 19127805 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 19127824 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19127883 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19127897 A G Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 19127933 T A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 19127981 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 19127991 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19128003 T A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 19128005 A C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 19128026 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 19128062 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 19128145 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 19128161 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 19128165 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19128194 C G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 19128203 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19128210 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19128246 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 19128566 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 19128646 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 19128883 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 19128968 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 19129039 G C Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 2 19129101 T C Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 2 19129134 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 19129302 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19129345 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 2 19129406 A G Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 19129436 C A Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 19129468 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 19129681 C T N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 2 19131998 C T Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 19135504 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 19135511 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 19136439 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 19136484 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 19136523 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 19136593 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 19136614 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 19136958 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 19136986 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 19137174 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 19137179 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 19137288 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 19137461 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 19137467 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 19137522 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 19137911 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 19137914 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 19138152 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 19138153 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 19138171 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 19138281 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 19138285 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 19138540 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19138796 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19138809 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19139335 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 19139559 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 19139572 T G Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 19139598 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 19139783 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19140039 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19140138 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19140426 C G Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 19140453 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19140533 C G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 19140540 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19140701 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19141104 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19141146 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19141295 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19141388 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19141593 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19141629 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19141789 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19141853 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19141961 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19141964 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19142039 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19142094 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19142111 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 19142166 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19142465 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19142500 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19142658 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19142832 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19142835 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19142909 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19143002 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 19143027 G C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 19143044 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 19143059 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 19143070 G C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 19143101 C G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 19143106 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 19143471 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19143726 G T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 19143831 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19143843 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19143932 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19144119 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19144240 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19144430 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19144530 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19144545 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19144806 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19144866 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19144923 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19144983 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19145000 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19145045 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19145097 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 19145162 G C Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 19145259 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19145340 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19145403 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19145441 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19145520 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19145693 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19146161 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19146231 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19146328 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19146430 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19146701 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19146744 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19146766 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19146859 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19146862 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19146981 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19147021 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19147154 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19147249 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19147337 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 19147367 C G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 19147371 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 19147418 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19147437 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19147449 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19147554 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 19147624 C A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 19147631 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 19147704 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19147865 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19147976 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 19148578 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19148584 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19148637 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19148704 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 19148712 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19148734 A T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 19148777 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 19152856 A G Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 19153022 G T Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 2 19153048 G A Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 19153070 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 19153122 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 19153203 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 19153274 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 19153285 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 19153304 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 19153376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19153380 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19153393 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 19153511 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19153558 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19153652 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 19153653 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 19153890 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19153941 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 19154007 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 19154065 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19154068 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19154082 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19154091 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19154100 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19154167 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19154180 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19154212 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 19154238 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 19154337 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19154380 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19154388 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19154412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19154450 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19154659 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 19154671 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 19154683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19154718 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19154740 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19154827 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 19154863 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 19154877 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19154913 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19154962 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 19155041 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19155076 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19155111 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 19155125 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19155152 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 19155163 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 19155169 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 19155346 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 19155353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19155366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19155374 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19155393 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19155398 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19155488 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19155502 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19156033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19156119 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19156201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19156282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19156392 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19156521 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19156548 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19156609 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 19156668 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19156675 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19156712 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19156883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19157994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19158630 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 19158819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19159076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19159530 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 19160097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19161108 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 19163011 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 19163627 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19164056 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19164361 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19165213 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 19165214 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19165619 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19167195 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19168528 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19168740 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 19168859 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 19169003 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 19169620 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19169623 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 19169672 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 19171056 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 19171062 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 19171192 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19171796 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19172133 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 19172562 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 19173197 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19173460 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 19174785 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 19174997 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 19175035 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19175077 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19175151 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 19175156 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 19175173 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 19175263 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 19175401 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19175604 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19175718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19175760 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19175917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19175977 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19176058 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19176406 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19176521 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19176742 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19176796 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19176880 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 19176974 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19177128 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 19177190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19177425 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 19177477 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 19177541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19177553 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 19177615 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19177725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19177728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19177736 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19177750 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19177772 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19177864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19178177 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 19178964 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19181201 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19182312 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 19182909 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19182946 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19183172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19183243 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19183245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19183555 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19184876 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19185251 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19185373 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19186310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19188745 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19188753 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19189199 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19189236 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19189362 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19189529 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19189947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19190128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19190190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19190239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19190634 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19191964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19191994 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19193052 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 19193953 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 19195631 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19195885 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19197011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19203420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19204071 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19205402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19206028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19208364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19210900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19213606 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19214535 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 19215397 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19215642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19218057 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19218817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19218818 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19218850 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19223292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19223502 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19223513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19223941 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19223972 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19224448 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19225866 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 19225925 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19226109 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19227044 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 19227497 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19228010 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19228011 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19228044 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 19228045 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 19228273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19228671 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19229293 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 19230251 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 19230953 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 19231452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19231799 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19232173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19232203 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 19232364 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 19232566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19232638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19232667 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19233048 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 19233297 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19236276 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19236449 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 19236467 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19236655 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19236660 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 19236790 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 19237668 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19237748 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19238634 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19238803 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 19239110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19239226 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19239324 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 19239800 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19240168 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 19240226 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19240427 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 19240438 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19240498 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19241153 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19241234 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19241246 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 19241373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19241449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19241514 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 19241659 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19241666 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19241733 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 19241768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19241782 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19241810 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19241811 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19241847 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19241994 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19242011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19242318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19242488 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19243259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19244145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19244558 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19244629 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19244638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19244696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19244810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19244945 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19245181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19245197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19245214 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19245253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19245289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19245291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19245371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19246130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19246213 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19246456 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19246789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19247129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19247182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19247203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19247247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19247291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19247497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19247737 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19247766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19248266 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19248285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19248738 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19249341 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19249400 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19249441 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19249621 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19249767 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19249784 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19249795 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19249797 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19249872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19250091 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19250101 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19250189 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19251148 A T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 19251211 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 19251465 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 19251710 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 19251888 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 19252004 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19252023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19252226 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19252264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19252311 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 19252324 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 19252347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19252428 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 19252616 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19252686 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19252736 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 19252919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19253101 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19253178 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19253277 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19253429 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19253638 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19253644 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19253669 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19253696 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19253922 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19253925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19253982 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19253999 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19254014 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19254031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19254067 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19254076 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19254281 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19254337 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19254356 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19254512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19254529 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19254755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19254925 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19254948 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 19255089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19255143 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19255571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19255736 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 19256312 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 19256745 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 19256759 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 19256816 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 19256824 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19257529 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19257654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19257891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19257957 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 19258031 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 19258075 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 19258149 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19258151 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19259309 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 19261159 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19261668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19262767 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19266138 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 19266270 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19266504 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 19267587 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19268503 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 19270365 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19270667 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 19270826 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19270935 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 19271008 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19271049 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19271118 C G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 19271149 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 2 19271188 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 19271463 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 19271488 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19271606 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 19271703 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19271714 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19271723 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19271740 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19271911 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 19271962 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19271966 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19272034 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19272046 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 19272077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19272094 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 19272112 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19272205 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19272724 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 19272824 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19272835 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 19272922 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 19272927 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 19273117 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 19273279 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 19273297 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 19273298 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 19273355 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 19273383 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 19273429 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 19273504 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 19273522 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 19273557 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 19273586 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 19273733 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 19273799 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 19273876 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 19273881 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 19273989 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 19274033 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 19274053 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 19274343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19275190 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 19275206 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19275322 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19275376 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 19275492 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19275707 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 19283329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19283333 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19283354 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19283815 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 19283831 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 19283832 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 19283899 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19284082 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19284155 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19284349 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19284437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19284574 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 19286729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19286936 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19287756 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19288193 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19288195 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19289832 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19289872 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19289964 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19290047 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19290110 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19290120 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19290121 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19290179 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19290193 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19290225 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 19290237 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19290952 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19291087 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 19291129 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19291307 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19291317 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 19291540 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19291717 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 19291934 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19292010 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19292326 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19293156 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19293217 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19293363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19294977 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 19294986 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19295025 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19295038 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19295093 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19295118 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19295123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19296828 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19299985 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19300315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19301323 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19301350 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19301352 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19301364 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 19301397 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19301730 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19303240 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19304578 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19304715 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19304738 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19304787 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19304817 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19305006 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19305031 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19305051 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19305089 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19305225 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 19305428 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19305437 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19305717 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19305770 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19305779 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19305787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19305847 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19306414 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 19306485 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19306524 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 19307090 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19307119 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19307535 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 19307541 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 19307639 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19307727 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19307728 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19307744 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 19307819 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 19307830 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19307913 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19307998 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 19308193 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19308208 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19308393 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 19308409 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 19308492 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 19308806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19308840 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 19308898 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 19309023 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 19309150 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 19309654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19309921 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19309957 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19310633 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 19310807 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 19310852 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 19310928 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19310952 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 19310960 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 19311012 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19311249 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19311262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19311335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19311594 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 19311931 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19312392 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19312594 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 19312740 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 19312751 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 19312820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19312925 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 19313009 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 19313792 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 19313985 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 19314237 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 19314400 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 19314479 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19314751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19315115 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19315209 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19315303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19315498 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 19315803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19316275 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 19316282 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 19316394 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 19316512 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19317002 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19317492 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 19317512 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 19317520 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 19317546 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19317622 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 19317754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19317830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19317938 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 19318007 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19318062 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19318082 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 19318241 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 19318249 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19318742 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 19318745 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 19319164 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 19319582 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19319736 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19319797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19320017 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19320454 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 19320592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19320861 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19320947 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 19321121 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19321220 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 19321274 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19321290 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19321326 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19321338 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 19321367 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19321391 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19321473 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 19321536 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 19321537 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 19321669 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19322247 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19322283 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19322391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19322544 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 19322680 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 19322745 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 19322835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19322867 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 19322895 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19323224 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19323290 C G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 19323293 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 19323301 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19323369 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 19323379 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 19323399 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 19323463 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19323602 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 19323678 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19323701 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19324204 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19324271 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19324282 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 19324466 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 19324737 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 19325012 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19325065 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19325066 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 19325134 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19325136 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19325253 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19325468 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19326590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19326673 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 19326772 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 19326807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19326809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19327051 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 19327186 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 19327328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19327859 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19327887 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19327911 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19328023 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19329284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19329527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19329539 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19330555 T G Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 19330572 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 19330834 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 19330853 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 19330899 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 19330925 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 19331130 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 19331276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19331972 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19332066 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 19332156 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 19332206 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19332207 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19332292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19332327 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 19332347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19332900 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 19333288 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19335034 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19335396 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19335549 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 19335556 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 19335563 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 19335756 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 19335798 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19335811 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 19335852 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 19336024 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19336046 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19336064 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 19336121 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 19336228 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19336242 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19336385 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19336413 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19336440 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 19336469 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 19336528 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19336551 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 19336582 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19338079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19338084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19338892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19339845 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 19339867 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 19339893 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 19341411 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19341434 G C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 19341478 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19341642 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 19342068 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 19342214 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19342301 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 19342416 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19342592 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19342695 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 19343184 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19343185 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19343307 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 19343345 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19343350 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 19343374 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19343438 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19343453 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 19343614 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 19343634 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 19343635 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 19343781 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19343808 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19343838 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19343933 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19343974 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 19344105 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19345483 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 19345884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19345928 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19346088 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19346540 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 19346670 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19346790 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19346894 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19347148 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19347235 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 19347302 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19347310 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19347441 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 19347536 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 19347620 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 19347666 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 19347742 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19347794 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19348187 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19348228 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19350641 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19351844 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19351874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19351973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19353586 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19354662 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 19354811 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19355024 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19355035 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 19355037 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 19355093 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 19355472 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19355497 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19355522 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19355614 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 19355706 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19356016 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19356106 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19356210 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 19356655 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19356862 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19358055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19358111 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19359462 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19359767 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19360139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19360241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19361817 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 19361851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19362054 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 19363395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19363397 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19363453 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 19363599 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19366429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19369446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19369966 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19374809 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19375511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19375757 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19378183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19378574 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19379273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19379509 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19379573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19380051 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19380752 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19380922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19381262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19381384 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19381556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19381632 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19382267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19383082 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19383168 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 19383334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19383368 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19383443 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19383618 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19383794 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 19383795 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19384554 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19387016 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 19387224 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 19389783 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19389801 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19389802 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19389882 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19390872 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19392401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19392785 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19394803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19395029 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19395053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19396328 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 19401094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19401525 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19402781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19403090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19403257 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19404288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19405225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19405503 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19405605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19406185 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19406221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19406498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19407286 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19407312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19407531 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 19408281 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19408742 A G Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 19408768 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 19409707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19410347 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 2 19410676 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19412026 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 19412679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19413894 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19414209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19414432 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 19414633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19416141 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19417891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19417993 C G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 19419047 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19419278 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 19419708 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19419866 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19419948 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19420259 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19420931 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19424486 T A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 19425285 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19425747 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19426140 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19428052 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19428183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19429327 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19430432 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19431130 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 19431596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19432417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19433629 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19434481 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19434954 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 19434996 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19435556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19435729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19435931 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19436876 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 19436881 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 19437236 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19437250 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19437286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19437578 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19438083 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19438700 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19439143 C A N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 19440353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19440402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19440589 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19440669 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 19440701 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19440799 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19441561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19441641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19441690 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 19441957 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19442120 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19442150 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 19442156 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 19442208 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19442686 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 19442697 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 19442703 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 19443038 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19443093 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19443418 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19443506 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19443528 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19443631 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 19443773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19443993 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19444765 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19445867 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19448300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19448835 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19449124 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19449132 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19449330 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19450152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19452610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19453177 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19454386 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19454456 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 19454987 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19455343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19455368 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19457085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19457175 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19457628 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19457837 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 19458276 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 19458524 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19458576 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19458907 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19460614 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19462276 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19462374 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19462381 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19462449 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19462552 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19462640 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19462863 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19462955 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19462964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19462985 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19463041 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19463083 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19463664 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19463882 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19464469 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19464574 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19465068 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19465457 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19465877 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 19466018 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19466054 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19466353 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19466355 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19467056 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19467061 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19467179 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19468351 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19468743 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19468744 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19468767 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19468874 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19468926 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19468989 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19469001 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19469105 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19469112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19469123 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19469307 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19469349 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19469350 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19469452 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19469463 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19469485 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19469505 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19469601 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19469723 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19469976 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19470004 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19471228 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19472665 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19473367 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19474044 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19474969 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19477207 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19477248 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19477278 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19477419 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19477475 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 19477665 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 19477681 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19477685 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19477981 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19478158 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19478178 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19478423 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19478539 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19478886 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19479264 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 19479300 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 19479394 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19479541 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19479723 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19479777 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19480076 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 19480187 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19480205 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19480514 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19480961 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 19481013 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 19481066 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 19481975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19481989 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19482081 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19482322 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19482459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19482885 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 19482958 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19484132 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19484238 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19485102 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19485105 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19485293 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19486248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19486318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19486378 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19486589 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19486646 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19487896 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19488390 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19488631 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19490485 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 19490531 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19491001 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 19491017 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 19491047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19491884 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 19491885 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19492707 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19493909 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19493993 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 19495301 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 19496564 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19497621 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19497866 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19498357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19498909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19499829 T G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 19500674 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19500924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19500984 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19501034 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19502270 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 19502413 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19510210 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19511031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19511913 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19514025 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 19514376 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19515793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19515812 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19516531 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19516728 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19516970 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 19517000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19517015 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 19517021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19517069 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 19517752 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19519269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19520057 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19520185 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19520330 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19520345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19520351 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19520581 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19521086 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19521308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19521340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19521551 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19521620 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19521724 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19521772 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19521797 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19521803 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19521960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19521974 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19522066 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 19522098 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19522156 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19522170 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19522187 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19522339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19522409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19522431 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19522490 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19522496 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19522649 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19522966 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19522979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19523001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19523014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19523066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19523324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19523852 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19524691 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 19524724 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 19524866 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19525342 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19526795 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 19527253 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19528721 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 19528741 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19528768 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 19528790 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 19529590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19529730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19529958 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19530106 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 19530820 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19531367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19531431 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 19531433 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 19531505 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19531533 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19531620 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19531622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19531756 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19531781 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19531789 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19531816 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19531873 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19532265 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 19532288 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19532372 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19532520 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19532686 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19532851 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19533097 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 19533570 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19533697 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 19534081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19534098 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19534121 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19534133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19534162 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 19534318 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19534335 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19534545 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19534668 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19535636 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19536009 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19536027 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19536227 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19537123 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19537199 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19537208 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19537222 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19537316 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19537321 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 19537548 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 19537549 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19537624 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19537707 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 19537850 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19538182 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19538359 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19538360 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19538437 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19540084 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19540175 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19541923 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19542131 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19542528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19542529 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19542699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19543866 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19544036 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19544121 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 19544259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19544323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19544394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19544452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19544763 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 19544927 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19545205 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19545382 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19545881 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 19545973 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19546104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19546286 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19546328 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19546364 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19546478 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19546669 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 19547755 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19547770 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19547866 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 19548119 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19548553 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 19548760 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19549559 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 19549618 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19549725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19549797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19550036 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19550041 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19550495 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19550549 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19550623 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 19550630 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 19550651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19551421 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19551896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19552153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19552161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19552609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19552701 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19552728 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19552987 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19553010 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19553058 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19553065 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 19553085 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19553091 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19553106 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19553234 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19553477 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 19553646 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 19553729 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19553789 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19553829 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19554456 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19554934 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 19555268 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19556104 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19557093 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19557157 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 19557195 T A Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 19557809 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 19558028 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 19558077 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19558142 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19558168 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19558327 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19558334 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19558452 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19558484 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19558519 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 19558563 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19558782 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19558961 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19559058 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19559074 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19559092 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19559132 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 19559179 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19559346 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19559464 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19559490 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19559582 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19559633 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19559639 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19559666 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19559711 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19559729 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19559752 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19559762 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19559891 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19559917 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19560052 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19560184 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 19560226 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 19560261 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 19560453 G C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 19560676 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 19560850 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19560858 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19560862 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19560887 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19560888 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19561071 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19561077 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19561143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19561228 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19561382 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19561559 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19562018 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 19562069 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19562111 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19562370 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19562638 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19562714 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19562762 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19562816 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19562865 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19562954 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19562962 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19563003 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19563073 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19563095 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19563333 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19563469 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19563615 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19563966 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 19564181 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19564253 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 19564269 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19564415 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 19564708 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19564720 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 19565844 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19567081 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19567960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19568721 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19569559 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19569657 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19570182 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19570573 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 19570872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19571305 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 19571444 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19571472 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 19571687 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19571814 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19571890 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 19573431 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19574776 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 19574917 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 19574933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19575095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19575182 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19575206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19575441 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19575621 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19575676 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19576402 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 19576428 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 19576490 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19576991 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19577053 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19577457 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19577972 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 19578107 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 19578582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19584378 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19586593 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19586875 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19587044 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19587113 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19587121 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19587261 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19587458 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19587470 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19587481 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19588286 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 19588731 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 19588750 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19588818 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 19589469 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19589630 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 19589719 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 19589914 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 19589926 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 19590094 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 19590235 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19590245 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 19590591 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 19590709 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19590845 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 19591033 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19591142 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 19591155 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19591609 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19591684 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 19591781 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19591802 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19591931 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 19591977 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 19592020 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 19592254 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 19592264 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 19592266 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 2 19592410 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 19592630 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19592844 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 19593021 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 19593034 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19593148 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 19593226 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 19593231 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 19593262 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 19593333 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 19593464 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 19593529 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 19593928 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 19593929 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 19593998 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 19594193 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 19594212 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 19594573 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19594662 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 19594702 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 19594834 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 19595777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19596263 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19596321 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19596370 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19596423 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19596468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19596553 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19596604 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 19596692 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19597132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19597204 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19597829 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 19597839 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19597907 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 19598077 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19598276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19598371 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19598397 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 19598491 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19598528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19598540 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19598560 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19598577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19598587 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19598802 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19598812 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19598836 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 19598985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19599008 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19599189 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19599412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19599555 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19599560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19599615 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19599667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19599710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19599723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19599731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19599896 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19600091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19600100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19600283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19601197 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19601199 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 19601256 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19601598 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19601632 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19601653 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 19601662 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 19601793 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 19601851 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19601872 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 19601890 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19602082 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19602088 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 19602134 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19602222 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 19602260 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19602285 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 19602488 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19602504 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 19602685 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 19602688 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 19603766 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 19603793 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 19603860 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19604211 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19605034 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 19605565 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 19606116 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19606157 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 19606179 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 19606815 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19606979 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19607347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19608506 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19609187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19610513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19610863 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19610865 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19610881 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19610995 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 19611184 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 19611191 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 19611325 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19611347 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19611809 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 19611884 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19611905 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19611977 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 19612036 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 19612349 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19612365 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19615996 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19617291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19620086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19620311 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19620441 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19620532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19621102 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19621799 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19621967 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19622582 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19622680 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19624179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19624241 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19625888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19626146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19626341 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19626378 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19626407 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19626416 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19626463 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19626539 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19626650 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19627580 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19627664 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 19627680 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 19627727 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19627796 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 19627825 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 19627941 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 19628009 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 19628037 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 19628086 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 19628116 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19628160 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19628284 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19628286 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19628686 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19628734 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19628929 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19629102 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19632295 C G Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 19635258 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 19635314 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 19635321 G A Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 19635391 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19635800 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19635868 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19636092 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 19636295 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 19636381 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 19636397 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 19636505 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 19636992 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19637012 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19637047 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 19637063 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 19637180 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 19637611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19637695 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19637728 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19637742 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 19638054 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19638151 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 19638203 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 19638264 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 19638279 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 19638308 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19638408 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 19638427 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19638484 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19638592 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 19638644 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19638741 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 19639187 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19639361 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 19640482 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19640653 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19640900 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 19642122 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19644613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19645906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19647459 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 19647503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19647523 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 19647546 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 19647619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19647646 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19647668 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19647866 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 19647882 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 19647896 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19647901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19647957 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19648014 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 19648156 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 19648359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19648382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19648415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19648420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19648585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19648591 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19649372 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 19649525 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 19649541 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 19649573 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 19649741 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 19649804 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 19650356 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 19650364 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19651485 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 19651512 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 19652051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19652490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19654903 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19656373 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19656697 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19657057 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19657134 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 19657155 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 19657204 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19657235 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19657279 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19657357 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19657472 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 19657563 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19657591 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19657754 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19657855 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 19658000 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19658127 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 19658200 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 19658254 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 19658358 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19658449 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19658597 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19658603 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19658791 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19658797 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19658830 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19658878 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19658884 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 19659141 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19659609 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 19660153 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 19660183 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19660223 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19660561 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19660646 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19661011 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19661023 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19661065 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19661178 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19661337 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 19661391 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 19661495 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 19661504 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 19661543 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19661576 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19661851 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19662062 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19662200 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19662465 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19662515 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 19662534 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 19662596 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19662656 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19662783 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19662967 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19663011 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19663082 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 19663151 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 19663175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19663268 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19663336 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19663391 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19663488 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 19663501 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 19663530 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 19664340 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19664655 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 19664686 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 19665041 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 19665143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19665207 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 19665418 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19665437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19665500 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19665538 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 19665586 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 19665595 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 19665659 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19665679 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19665684 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19666021 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19666054 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 19668331 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19668451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19668726 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 19669726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19670472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19670834 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19671974 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19673696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19674363 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 19675277 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 19675520 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 19675521 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 19675622 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19675744 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19675962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19676073 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 19676443 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19676566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19676796 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19678187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19678341 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 19678560 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 19679147 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 19679630 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19680101 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 19680125 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 19684099 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19684156 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 19684204 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19684283 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19684319 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 19684448 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19684490 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 19684621 T C Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 2 19684681 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 19684937 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 19685587 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19685711 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19685807 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19685946 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 19685998 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19686037 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 19686131 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 19686134 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 19686151 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 19686590 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19687868 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 19688544 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19688928 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 19689481 A C Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 19690644 T A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 19690663 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19690672 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 19691310 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 19692621 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 19692903 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19693483 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19693915 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 19697942 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 19698010 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 19698165 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 19698357 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 19698411 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19698564 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 19698621 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19698904 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19698920 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19699202 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 19699244 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 19699401 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19699561 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19699610 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19699690 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19699777 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19699798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19699840 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19700002 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19700143 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19700167 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19700186 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19700447 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19700503 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19700565 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19700917 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19700992 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19701013 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19701059 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19701113 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19701201 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19701262 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19701317 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19701357 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19701403 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19701546 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19701547 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19701577 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19701679 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19701682 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19701741 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 19701772 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19701829 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 19701923 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 19701949 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 19702138 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19702234 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 19702305 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19702332 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 19702349 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 19702466 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19702562 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19702682 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19702697 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19702841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19702858 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19703225 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19704203 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19704323 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19704347 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19704603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19704765 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19704978 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19704999 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19705015 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19705121 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19705138 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19705149 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19705176 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19705230 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19705281 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19705288 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19705876 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 19705936 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19706064 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19706124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19706256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19706359 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19706454 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19706670 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 19706682 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19706796 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19706826 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19707073 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19707240 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19707276 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19707302 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19707335 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19707360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19707552 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19707701 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19707733 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19708132 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 19708170 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19708284 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19708294 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19708540 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19708608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19708697 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19708780 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19708841 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 19708928 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19709092 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19709130 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19709206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19709213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19709281 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19709379 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 19709418 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19709452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19709663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19709705 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19709966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19710308 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 19710632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19711786 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 19711807 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 19711941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19712050 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 19712084 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19712185 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19712190 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19712207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19712292 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19712309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19712342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19712530 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19712598 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19712654 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19713081 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 19713149 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 19713250 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 19713257 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 19713265 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19713289 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19713328 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 19713335 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 19713369 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 19713502 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 19713753 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 19713759 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 19713784 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19713965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19714018 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19714079 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19714133 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19714190 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19714221 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19714241 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 19714538 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19714869 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 19714891 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 19714893 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 19716192 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 19716305 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 19716669 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19716970 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 19717065 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 19717211 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19717218 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 19717275 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19717510 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19717685 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19718274 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19718478 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19718569 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19718810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19718998 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19719005 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19719122 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19719194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19719898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19720073 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 19720091 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 19720227 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19720247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19720537 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19720570 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19720731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19721328 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19721383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19721599 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19721668 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19721674 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19721679 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19721695 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19721718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19721737 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19721770 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19721783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19721801 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19721832 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19721838 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 19721873 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19722032 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19722505 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19722533 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19722540 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19722590 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19722710 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19723085 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 19723106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19723323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19723377 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19723388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19723533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19723876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19723907 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 19723962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19724043 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 19724183 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 19724191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19724465 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 19724489 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 19724627 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19724727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19724746 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 19724752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19724791 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 19724904 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19724933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19724976 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19725052 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19725335 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19725373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19725516 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19725688 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 19725690 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 19725721 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19725723 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19725786 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19725840 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19725909 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19725954 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19725961 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19725991 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19726002 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19726029 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19726111 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19726158 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19726235 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19726262 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19726270 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 19726339 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19726355 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19726374 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19726456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19726539 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19726561 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 19726630 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19726651 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19726789 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19726891 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19727402 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 19728867 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 19728896 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19728898 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19729165 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19729551 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19729572 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 19729575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19729586 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19729613 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 19729690 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19730169 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 19730304 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 19730336 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 19730347 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 19730473 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 19730599 C T N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 19730610 G A N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 19730615 A G N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 19730971 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 19730984 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 19730997 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19731096 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 19731107 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 19731209 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 19731230 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 19731240 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19731509 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19731567 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19731617 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 19731819 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19731920 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 19732073 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19732187 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 19732286 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19732375 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19732401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19732505 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 19732545 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19732855 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 19732873 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 19732903 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 19732906 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 19732942 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 19732958 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19733010 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 19733012 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19733148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19733188 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19733200 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 19733349 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19733350 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19733803 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19734087 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19734255 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19734953 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 19735007 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19735026 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19735080 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19735093 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19735105 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19735122 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19735205 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 19735252 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19735395 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19735411 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19735450 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19735454 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 19735496 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19735560 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19735567 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19735579 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19735632 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19735882 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19735912 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19735923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19736207 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19736301 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19736331 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19736341 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 19736364 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19736368 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19736437 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19736452 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19736602 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19736836 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19736867 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19736970 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19737056 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19737193 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19737394 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 19737459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19737508 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19738153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19738836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19739323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19739750 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 19740079 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 19740106 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19740177 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 19740294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19740347 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 19740790 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 19740931 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19740935 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19741724 G A N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 19741770 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 19741777 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19742477 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19742984 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19743134 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 19743498 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19743693 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 19743793 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 19744456 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19744613 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 19744748 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19745074 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 19745547 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 19745566 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 19745910 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19746082 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19746419 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19746652 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19747244 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 19747383 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19747390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19747515 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19747823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19747961 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 19747993 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 19748059 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19748513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19748593 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19748689 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19748992 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 19749010 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19749167 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 19749360 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 19749508 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 19749509 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19749733 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19749936 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 19750156 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 19750203 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 19750249 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 19750353 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 19750419 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 19750655 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19750709 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19750757 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19750758 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19750830 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19750885 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19751100 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19751111 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19751364 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19751430 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19751477 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19751498 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19751508 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19751590 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19751754 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19751933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19752024 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19752543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19753103 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19753299 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 19753500 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 19753574 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19753615 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 19753633 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 19753685 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 19753692 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 19753717 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 19753760 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19753765 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19753799 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19753820 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19753847 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19753883 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19753889 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 19753898 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19753921 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19753940 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19753956 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19753971 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19753990 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19754269 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 19754306 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19754521 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19754529 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19754561 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19754573 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19754577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19754687 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19754774 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 19754776 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 19754788 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19754805 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19754849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19754968 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 19755013 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19755076 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19755092 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19755128 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19755132 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19755177 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19755228 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19755364 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19755388 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19755421 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19755433 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19755455 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19755470 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19755596 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 19755611 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19755713 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 19755859 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 19755893 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 19755983 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19756003 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19756208 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 19756391 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19756423 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19756465 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19756466 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 19756503 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19756583 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19756671 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19756689 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19756813 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19757131 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19757162 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19757213 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 19757292 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 19757299 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19757309 C G N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 19757313 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 19757360 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 19757370 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 19757378 A T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 19757441 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 19757702 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19758037 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19758233 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 19758247 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 19758251 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19758308 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19758429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19758467 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19758917 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 19758923 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19759038 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19759070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19759169 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19759269 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19759309 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19759341 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19759485 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19759588 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19759618 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19759658 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19760371 A C Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 19760467 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 19760890 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 19760919 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19760983 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 19761207 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 19761222 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 19761327 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 19761690 C A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 19761761 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19761817 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19761966 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19762116 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 19762165 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19762266 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19762425 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19762471 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19762709 A C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 19762725 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 19762827 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 19762966 A C Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 19763550 G A Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 19763700 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19764146 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19764382 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 19764433 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 19764497 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19764674 A T Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 19765086 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 19765263 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19765288 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 19765355 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 19765492 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 19765501 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 19766236 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19766571 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19766853 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19766975 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19767110 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19767815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19768798 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 19769644 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 19769775 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 19769822 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19769885 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 19770016 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19770021 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19770266 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 19770660 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 19770731 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 19770873 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19770899 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19771099 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19771315 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19771343 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19771371 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19771534 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 19771774 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 19771948 C A N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 19772128 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 19772162 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 19772200 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 19772251 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 19772540 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 19772687 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 19772716 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 19772765 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19772943 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19773043 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 19773070 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 19773150 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19773155 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19773165 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19773185 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19773285 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19773318 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 19773364 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19773408 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19773465 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19773478 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19773483 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19773588 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19773707 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19773788 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 19773864 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 19773870 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19773889 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19773903 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19773980 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 19774023 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19774132 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19774147 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19774205 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 19774309 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 19774395 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19774405 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19774409 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19774417 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19774494 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19774527 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19774534 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19774636 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19774648 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19774711 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19774979 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19775004 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19775125 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 19775134 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19775147 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 19775158 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 19775166 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 19775184 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 19775198 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19775227 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19775257 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19775292 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 19775519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19775702 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19775805 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19775811 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19776435 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19777304 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19777479 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19777673 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 19777771 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19778554 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19778693 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19778850 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19778982 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19779218 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19779255 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19779515 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19779519 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19779756 T C N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.307692307692308 17 9 8 1 4 2 19780026 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19780062 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 19780063 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 19780480 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 9 11 4 1 5 2 19780506 A C N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 19780515 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19780895 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19780916 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19781081 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19781146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19781172 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19781176 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19781183 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19781216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19781432 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 19781729 T C Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 19782054 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 19782280 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 19782510 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19782625 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19782659 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19782734 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 19782808 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19783185 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19783369 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19783485 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19783804 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19783883 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19784253 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 19784454 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19784599 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19784646 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19784727 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19784849 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19784911 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19784951 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19785238 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19785345 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19785982 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19786163 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 19786257 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 19786260 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19786384 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19786502 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 19786755 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 19786818 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 19786882 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19786991 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 19787043 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 19787090 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 19787202 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19787353 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19787374 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19787525 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19787538 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19787814 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19787820 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 19787957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19788182 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 19788352 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19788456 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 19788628 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19788730 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19789088 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19789243 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 19789246 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19789301 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19789349 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19789515 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 19789590 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19789838 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19789940 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 19789958 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19790228 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 19790798 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19790904 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 19791709 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19792101 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19792227 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19792250 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19792285 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 19792331 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19792369 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19793374 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19793907 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 19793975 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19794108 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 19794170 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 19794303 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 19794322 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 2 19794460 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 19794474 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 19794636 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 19794687 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 19794749 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19794805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19794894 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19794903 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19794912 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 19795104 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19795138 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19795156 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19795157 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19795207 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19795424 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 19795493 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 19795504 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 19795521 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19795570 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 19795631 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 19795681 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 19795819 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19795871 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19795925 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 19795943 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19795963 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 19796048 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19796057 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19796090 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19796210 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19796297 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19796316 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 19796401 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 19796498 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 19796543 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 19796638 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 19797082 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19797112 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19797150 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19797168 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19797169 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19797188 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19797220 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 19797244 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 19797374 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19797385 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 19797479 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 19797498 T G Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 19797573 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19797586 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 19797603 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19797612 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 19797648 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 19797716 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 19797758 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 19797875 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 19798026 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 19798030 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 19798094 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19798107 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19798233 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 19798238 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19798252 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19798280 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19798317 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 19798361 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19798405 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19798474 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19798648 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19798860 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 2 19798919 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 19799084 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19799351 C T Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 19799383 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 19799408 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 19799417 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 19799620 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 19799721 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 19799831 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19799864 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19799879 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19799911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19799968 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19800107 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 19800233 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19800315 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19800376 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19800411 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19800460 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 19800472 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 19800576 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19800674 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19800753 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19800837 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19800844 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19800862 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19800908 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19801056 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19801364 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19801497 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19801510 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19801572 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 19801591 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19801730 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19802095 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19802183 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 19802241 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19802266 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 19802704 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19802778 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19802827 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19802871 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 19802888 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19803011 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19803034 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19803062 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19803143 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19803178 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19803198 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19803214 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19803234 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19803649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19803650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19803687 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19803951 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 19803966 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 19804583 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 19804596 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19804658 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19804660 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 19804804 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19804823 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 19805042 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 19805242 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19805296 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 19805416 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19805442 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 19805763 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 19805860 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 19805903 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 19805908 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19806001 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19806027 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19806046 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19806104 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19806551 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 19806642 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19806767 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 19806804 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 19806807 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19806837 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 19806844 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19806887 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 19806917 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19806985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19807282 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19807330 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19807377 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 19807455 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19807458 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19807467 T A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 19807633 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 19807710 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 19807849 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19807928 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 19807969 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19808059 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19808086 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19808092 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 19808136 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19808141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19808208 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 19808224 G C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 19808226 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 19808259 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19808325 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19808368 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 19808393 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 19808416 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 19808463 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19808479 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 19808701 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19808909 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19808925 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19808981 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19809170 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19809204 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19809208 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19809243 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19809273 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19809284 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19809373 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19809382 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19809430 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19809478 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19809781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19809848 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19809976 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19809999 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19810008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19810218 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19810262 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 19810275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19810421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19810939 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19810940 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19810995 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19810998 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19811019 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19811030 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19811319 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19811476 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 19811506 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19811524 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 19811662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19811785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19811835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19812475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19812583 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19812659 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19812795 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19812798 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19812970 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 19813136 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19813219 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 19813415 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19813926 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19814003 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19814109 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 19814204 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 19814224 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 19814551 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19814679 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19814693 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19814781 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 19814903 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19814963 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 19815240 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 19815291 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19815304 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19815390 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19815425 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 19815436 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19815552 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19815562 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 19815587 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19815670 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19815735 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 19815807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19815818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19815855 A G Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 19815900 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 19815910 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 19815921 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19816109 A T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 19816133 T G Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 19816216 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 19816252 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19816269 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 19816517 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 19816659 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19816671 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 19816694 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 19816717 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 19816749 A G Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 2 19816786 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 19816805 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19816850 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 19816869 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 19817001 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19817095 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19817151 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19817208 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19817243 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 19817293 T G Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 19817519 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19817576 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19817602 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19817716 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19817725 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 19817741 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19817787 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19817849 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19817934 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19817944 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19818033 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19818108 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 19818195 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19818212 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19818233 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 19818243 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19818251 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19818391 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19818405 T G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 19818568 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19818574 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 19818821 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19819184 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19819187 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19819199 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19819229 A C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19819359 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19819372 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19819430 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19819470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19819515 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19819526 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19819677 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19819751 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19820025 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 19820158 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 19820380 T G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 2 19820394 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19820571 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 19820726 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 19821047 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19821218 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19821223 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19821231 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19821276 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 19821478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19821519 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19821584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19821614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19821623 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 19821770 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19821802 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19821873 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19821892 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19821990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19822023 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 19822102 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19822323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19822357 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 19822631 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19822757 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19822799 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19822851 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19822900 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19822906 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19822920 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19823727 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19823770 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19823882 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 19823898 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 19823923 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 19824006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19824134 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 19824534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19824659 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19824862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19825638 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19826406 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 19826741 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19826871 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 19826945 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19826952 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19827414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19827454 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 19827520 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 19827673 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19827786 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19828540 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19828567 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 19828769 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 19828807 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 19829142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19829952 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 19829970 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 19831150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19831324 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 19831975 T A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 19832107 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19832627 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 19832728 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 19832789 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19833687 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 19833725 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 19833932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19834307 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19834329 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19834522 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19834553 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19834567 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19834568 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19834600 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19834716 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19834748 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19834846 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19834854 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19834883 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19835111 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 19835195 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 19835229 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 19835274 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 19835339 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 19835411 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 19835413 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 19835813 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 19835838 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 19835869 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 19835947 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 19835964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19835985 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19836148 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 19836286 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19836330 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19836356 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19836411 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19836840 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 19836862 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19836867 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19836882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19836909 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 19836959 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 19836984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19837008 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19837026 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19837037 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19837133 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 19837164 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 19837183 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19837677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19837681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19837694 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19837835 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 19837873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19837878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19837895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19837937 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 19837964 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 19838061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19838065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19838224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19838261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19838424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19838466 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19838528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19838550 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 19838788 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19839366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19839378 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19839438 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19839539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19839728 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 19839753 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 19839840 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 19839878 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 19839960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19840078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19840105 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19840114 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 19840271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19840509 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19841035 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 19841231 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19841955 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 19842379 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19842673 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19842799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19842933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19843196 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19845325 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 19845418 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 19845831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19846030 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 19846067 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 19846447 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 19846555 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19846611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19846665 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19847026 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 19847139 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 19847441 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19847853 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19848137 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 19848208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19848609 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19848791 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 19849578 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19849658 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19849694 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19849723 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 19849842 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19850119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19850136 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19850145 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19850894 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19851206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19851410 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19851440 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 19851617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19851772 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19851782 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19852165 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 19852190 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19852291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19852547 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19852619 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19852962 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 19853984 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19854342 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19854769 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19854923 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19855067 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19855068 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19855180 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19855292 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19855303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19855407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19855516 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19855587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19855780 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19855866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19855911 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19856156 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 19856215 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 19856448 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 19856483 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 19856491 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19856507 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 19856514 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 19856605 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19856666 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19856912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19857137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19857170 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19857265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19857397 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19857458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19857555 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19857636 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19857655 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 19857656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19857720 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19857938 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 19858444 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19858453 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19858472 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 19858523 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19858975 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19859006 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19859032 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19859213 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19859282 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19859354 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19859416 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19859497 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19859585 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19859589 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19860199 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19860214 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 19860252 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19860288 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19860750 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19861052 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 19861090 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19861943 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19862288 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19862525 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19862841 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19862925 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 19862989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19863124 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19863176 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19863373 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 19863470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19863605 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19864602 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 19866938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19866971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19866982 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19867189 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19867775 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19868512 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19868946 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19870158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19870470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19871875 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19872714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19874162 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19875030 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19875113 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19875261 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 19875369 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19876280 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19883507 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19886156 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 19887430 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 19887495 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19887926 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19888750 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19889440 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19890300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19890636 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19891109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19892074 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19892075 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19892161 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19892178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19892365 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19894040 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19894165 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19894423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19897578 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 19897727 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19897902 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19897903 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 19897957 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19898054 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 19898116 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19898184 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 19898224 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 19898226 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 19898422 A C Y N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 19898423 C T Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 2 19898497 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19898624 G A Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 19898902 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 19899007 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 19899466 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 19899470 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19899598 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 19899637 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 19899783 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19899823 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19899892 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 19899989 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 19900092 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 19900182 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 19900436 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 19900437 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19900481 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 19900610 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 19900676 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19900703 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 19900823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19901038 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 19901048 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 19901215 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 19901250 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 19901342 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19901406 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19901704 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 19902005 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 19902196 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 19902589 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 19903030 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 19903327 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 19903545 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19903568 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 19903617 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 19903800 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19903820 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 19903874 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19903892 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19903956 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 19903973 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 19903974 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 19904063 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19904075 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 19904084 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 19904110 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 19904118 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 19904134 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19904141 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 19904152 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19904163 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 19904166 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 19904223 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19904235 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 19904364 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 19904629 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19904743 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 19904846 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 19905376 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 19905393 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 19905492 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19905600 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 19905670 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 19905800 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 19905912 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 19905957 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 19905963 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 19905987 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19906076 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 19906077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19906124 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 19906132 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 19906207 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 19906220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19906231 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 19906500 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 19906632 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 19906682 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19906847 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 19906939 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 19906955 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 19906959 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 19906985 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 19907095 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 19907266 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 19907337 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 19907645 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 19907709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19908072 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 19908100 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19908153 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19908632 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 19908673 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 19909203 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 19909239 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 19909300 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 19909320 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 19909990 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19910085 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 19910117 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 19910140 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 19910385 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 19910446 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19911004 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 19911071 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 19911173 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19911197 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 19911239 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19911280 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 19911288 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 19911299 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 19911307 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 19911569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19911618 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 19911752 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19912118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19916869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19917366 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 19918349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19919540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19920786 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19921027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19921130 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19922551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19932798 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 19932803 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 19932895 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 19933228 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19933283 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 19933324 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 19933524 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 19933613 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 19933697 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 19933778 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 19934485 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19934504 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 19934507 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19934786 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19934810 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19934853 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19934960 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19935007 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19935065 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19935251 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19935265 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19935275 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19935291 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19935330 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19935375 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19935384 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19935471 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19935584 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19935669 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19935717 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19935873 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19935893 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 19936040 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19936265 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 19936322 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 19936609 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 19936623 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19936779 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19937425 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 19937533 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 19937556 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 19937620 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 19937892 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 19937941 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 19937944 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 19937953 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19938051 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 19938057 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 19938118 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 19938119 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 19938221 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 19938236 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 19938281 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 19938309 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 19938372 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 19938398 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 19938497 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 19938549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19938676 A T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 19938751 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19938785 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19938935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19939392 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 19939504 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 19939608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19939665 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 19939706 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 19939863 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 19939876 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19939956 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19940163 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 19940248 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19940306 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19940422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19940556 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19940617 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19940699 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19940866 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 19940868 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 19940877 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19941170 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19941476 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 19941584 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19941955 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 19942082 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 19942125 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 19942139 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 19942243 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19942340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19942516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19942562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19942671 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19942813 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 19943074 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 19943118 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 19943133 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19943139 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19943554 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19943613 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19943740 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 19943915 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 19943981 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 19944539 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19944735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19944910 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19945336 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 19945362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19948076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19948141 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19948353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19948994 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19949007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19949129 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19949154 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 19949173 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 19949234 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 19949436 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 19949507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19949576 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 19949581 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 19949704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19949711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19949744 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19949786 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 19949815 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 19949819 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 19949917 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 19950073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19950194 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 19950232 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19950282 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19950632 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19950693 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19950696 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19950709 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 19950759 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 19950847 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 19950855 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19950930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19950953 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19951289 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 19951552 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 19951569 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 19951665 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 19951750 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19952240 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19952311 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19952370 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19952480 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 19952511 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 19952512 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 19952559 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 19952562 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 19952576 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 19952630 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19952754 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19952810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19952928 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19952932 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19952970 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19952975 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19953039 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19953228 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 19953244 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 19953272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19953447 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 19953698 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 19953815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19953825 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 19954027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19954034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19954149 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 19954172 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 19954186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19954638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19954681 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 19954781 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 19954798 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19954909 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 19954970 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19955052 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19955190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19955260 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19955303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19955315 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19955379 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19955418 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19955438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19955520 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19955544 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19955776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19956034 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 19956188 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19956231 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 19956296 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 19956355 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 19956376 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 19956483 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 19956580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19956743 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 19956808 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 19956825 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 19956957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19957035 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 19957072 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 19957451 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19957915 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 19958491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19959437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19959763 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19967664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19969840 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19976195 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 19976622 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19977664 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19978754 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19978780 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19978857 A C Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 19982103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19985182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19985462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19985920 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19987718 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 19988679 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 19988800 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 19988841 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 19988964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19989172 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19989181 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 19989280 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19989333 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19989374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19989474 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19989506 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19989570 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19989715 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 19989864 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19990050 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19990167 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19990641 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19990646 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19990685 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19990693 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19990840 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19990845 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19991503 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19991656 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19991660 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19991669 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19991763 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19991916 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19991927 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19991946 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 19991990 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19992011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19992483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19992513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19993138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19993145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19993544 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19993587 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 19993657 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19993754 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19993936 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19994032 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19994387 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19994917 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19994955 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19994991 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19994992 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 19995140 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19995210 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 19995229 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 19995231 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 19995243 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 19995247 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19995399 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19995452 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19995495 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19995525 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19995634 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19995640 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 19995687 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19995732 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19995779 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19995812 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 19995874 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 19995890 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 19995895 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 19996031 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 19996140 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 19996257 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 19996261 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 19996277 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 19996288 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 19996454 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 19996668 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19996747 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19996798 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 19996857 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19997125 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 19997152 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 19997238 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19997262 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 19997429 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19997460 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 19997583 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 19997738 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19997850 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 19997894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 19998099 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 19998259 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19998607 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19998751 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19999032 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19999036 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 19999253 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19999254 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 19999705 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 19999923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 19999928 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20000064 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20000599 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20000604 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20000615 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20000616 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20000642 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20000650 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20000689 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20000703 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20000710 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20000734 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20000765 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 20000767 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20000815 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20000873 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20000897 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20000962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20001018 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20001170 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20001230 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20001310 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20001321 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20001471 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20001501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20001561 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20001691 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20001722 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20001790 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20001794 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20002001 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20002242 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 20002680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20002770 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20002849 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20002955 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20005062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20007306 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20007324 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20007688 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20008195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20008234 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20009755 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20009757 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20010479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20010791 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20011930 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20012770 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20015372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20015661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20015741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20015902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20016335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20017325 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20018118 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20018360 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20018467 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20018560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20019656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20019800 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20020234 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20020361 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20020842 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20021092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20021121 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20021122 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20021184 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20021324 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20021329 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20021359 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 20021403 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20021469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20021926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20021992 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20022016 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20022061 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20022105 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20022142 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20022143 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20022179 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20022207 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20022209 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20022234 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20022237 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20022331 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20022348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20022448 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20022465 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20022468 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20022501 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20022577 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20022587 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20022652 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20022727 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20022734 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20022897 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20022997 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20023125 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20023135 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20023242 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20023254 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20023322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20023329 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20023351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20023392 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20023447 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20023475 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20023488 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20023489 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20023584 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20023960 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20023986 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20024032 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 20024089 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20024171 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20024177 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20024281 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20024344 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20024531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20024543 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20025182 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20025222 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20025511 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20025536 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20025552 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20025800 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20025917 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20026273 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20026440 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20026678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20026683 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20027049 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20027099 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 20027183 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 20027267 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20027299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20027800 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20027847 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20027903 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 20027914 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20028157 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20028165 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20028254 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20028283 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20028311 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20028415 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20028544 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20028553 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20028785 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20028875 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20028903 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20029128 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20029261 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20029809 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20029835 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 20030037 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20030201 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20030207 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20030232 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20030256 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20030350 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20030360 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20030383 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 20030403 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20030467 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20030522 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20030958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20031164 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20031508 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20032398 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20033113 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 20033560 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20033563 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20033798 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20033841 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20034292 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 20034943 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20034999 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 20035024 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 20035143 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20035221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20035317 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20035411 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20035445 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20035491 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20035554 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 20035555 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20035589 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20035660 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20035664 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20035679 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20035680 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20035727 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20035728 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20035965 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20036053 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20036293 C T Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 20036386 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 20036637 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20036657 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20036837 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20037091 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20037147 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20037464 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20037689 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20037787 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20038122 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20038365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20038777 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20038802 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20038931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20039065 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20039814 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20040427 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20040751 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20040834 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20041576 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20041834 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20042078 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20042555 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20042680 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20042765 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20042842 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 20042843 G T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 20042884 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20043086 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20043117 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20043156 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20043181 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20046581 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20046756 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20047882 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20047891 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20048384 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20048405 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20048415 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20048586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20048587 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20048619 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20048705 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20048713 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20048912 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20049168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20049448 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20049846 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20051249 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20051281 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20051436 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20051496 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 20051775 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20051863 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20051971 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20051980 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20052000 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20052142 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20052179 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20052224 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20052421 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20052537 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20052634 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20053472 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20053975 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 20054070 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 20054135 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 20054160 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20054275 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20054383 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20054467 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20054479 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20054628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20055061 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20055067 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20055390 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 20055665 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20055752 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 20055788 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 20056271 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20056623 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20056643 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20056665 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20056730 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20057095 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20057183 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 20057202 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20057207 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20057287 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20057371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20057422 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20057483 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20057645 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20057856 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 20057866 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20057887 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 20057900 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 20057921 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 20058525 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20058689 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20058690 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 20058753 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20058963 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20058972 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20058981 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20059225 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 20059232 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20059258 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 20059363 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 20059631 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 20059679 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 20059719 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20059742 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20059748 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20059773 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20059825 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20059868 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20060059 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20060221 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20060411 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20060555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20060558 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20060632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20060653 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20060777 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20060808 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20060876 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20060884 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20061081 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20061146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20061165 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20061321 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20061369 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20061382 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20061450 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20061901 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20061954 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20061973 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20062113 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20062148 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20062219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20062241 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20062424 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20062624 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20062647 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20062678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20062760 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20062868 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20062897 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20062947 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20062994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20063054 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20063058 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20063130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20063142 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20063210 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20063215 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20063246 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20063289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20063344 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20063358 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20063359 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20063403 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20063595 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20063724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20064006 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20064239 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20064315 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20064390 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20064396 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20064501 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20064525 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20064559 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20064596 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20064765 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20064982 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20065209 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20065244 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 20065261 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20065340 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20065429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20065674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20065814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20065876 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20065877 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20066051 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 20066114 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20066147 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20066275 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20067014 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20067065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20067087 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20067486 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20067538 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20067641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20067660 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20067744 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20067817 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 20067834 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20067877 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20068174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20068306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20075071 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20075400 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20075492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20075510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20075660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20075773 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20076264 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20076585 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20076694 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20077887 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20078871 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20079009 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20079021 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20079486 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20079675 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20079751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20080053 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20080176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20080582 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20081039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20081107 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20081136 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20081145 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20081341 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20082664 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20082683 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 20082699 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20082734 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 20082812 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20082950 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20083115 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 20083127 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 20083139 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 20083765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20084108 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 20084140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20084203 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20084364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20086462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20086782 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20088109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20088455 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20089492 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20089497 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20089513 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20089527 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20090339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20090753 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20091346 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20091595 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 20091683 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 20091684 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 20091735 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 20091788 T C N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 20091922 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 20092208 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20092875 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20093223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20094687 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20095400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20100566 G T Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 20100729 G A Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 20101886 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 20102481 A T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 20102511 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 20102714 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 20103168 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20103205 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20103263 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20104033 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20105107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20105633 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 20110463 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20110760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20112087 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20113005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20113558 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20114092 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20114364 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20114759 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20115119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20116098 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20116899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20117120 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20117197 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20117219 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 20117242 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 20117283 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20117439 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20117568 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20117661 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20117753 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20117773 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 20117807 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 20117950 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20118098 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 20118167 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 20118226 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20118314 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 20118344 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 20118407 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20118450 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20118676 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 20118852 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20119014 T A N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 20119187 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20119214 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20119256 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20119560 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20119700 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20119728 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20119845 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20119848 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20119857 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20119919 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 20119927 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 20119934 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 20120061 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 20120077 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20120116 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20120151 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20120152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20120175 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20120244 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 20120375 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 20120465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20120563 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20120701 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20120783 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 20120901 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 20120944 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 20120996 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20121121 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20121152 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20121210 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20121230 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20121312 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20121370 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 20121427 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 20121514 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 20121631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20122170 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20122196 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20122259 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 20122348 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 20122454 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 20122607 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 20122775 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20122783 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 20122871 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 20123261 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 20123302 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20123388 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20123563 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20124208 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20124250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20124316 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20124338 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20124548 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20124586 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20124587 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20124622 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20124709 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20124736 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20125038 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20125211 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 20125264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20125265 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20125400 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20125407 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20125651 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20125751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20125880 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 20125912 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20126198 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20126509 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20126582 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20126696 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20126722 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20126858 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 20126956 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 20126988 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 20127053 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 20127117 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 20127146 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 20127278 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 20127288 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 20127289 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 20127335 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 20127361 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 20127405 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 20127451 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 20127470 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 20127487 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 20127507 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 20127549 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 20127562 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 20127592 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 20127620 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 20127622 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 20127700 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 20127716 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 20127731 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 20127860 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 20127862 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 20127944 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 20127980 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20128034 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 20128195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20128323 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20128361 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 20128424 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 20128427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20128446 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 20128504 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20128525 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20128679 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 20128700 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 20128742 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 20128753 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 20128800 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 20128895 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 20128906 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 20128944 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 20129999 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 20130099 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20130358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20130828 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 20130845 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 20131015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20131070 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20131190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20131225 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 20131384 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20131399 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20131562 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20131740 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20131773 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20131826 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 20131835 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20131903 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20131917 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20131926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20131988 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20132009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20132143 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 20132190 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 20132213 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 20132307 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 20132419 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20132432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20132433 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20132448 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20132473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20132525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20132912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20132922 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20133271 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20133274 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20133366 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20133390 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20133491 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20133506 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20133599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20133736 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 20134052 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 20134238 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 20134533 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 20134616 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20134822 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20134842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20134922 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20134943 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20135016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20135268 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 20135387 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 20135448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20135479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20135606 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 20135666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20135741 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 20135803 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 20135856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20135927 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 20135939 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20136003 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20136405 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20136482 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20137133 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 20137180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20137337 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20137345 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20137365 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20137442 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 20137574 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20137773 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 20137788 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20138025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20138046 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20138675 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20138744 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 20138795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20139090 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20139423 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20139843 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20139925 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20140099 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20140349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20140373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20140912 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20141356 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20142344 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 20142973 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20143470 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 20143983 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20144080 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20144447 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20145846 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20146642 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20148029 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20148153 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 20148198 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20148777 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 20148831 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20148863 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20149026 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20149267 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20149331 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20149633 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20150004 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20150081 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20150265 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20150321 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20150424 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20150567 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20150714 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 20150798 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 20150827 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 20151133 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20151144 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20151148 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20151246 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20151367 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20151549 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20151638 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20151981 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20152155 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20152422 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20152650 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20152663 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20152770 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 20152784 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20152985 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 20153019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20153321 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20153560 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20153820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20154153 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20154160 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20154213 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20154255 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 20154567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20154637 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20154997 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20155178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20155352 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20155732 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20155767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20155778 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 20155932 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20155983 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20156273 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 20158211 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 20158264 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 20158379 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20158594 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20158606 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 20158983 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20159855 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20159951 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 20159981 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 20160464 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20160612 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20160695 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20160766 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20161216 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20161359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20162086 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20162089 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20162129 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20162207 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20162376 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20162391 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20162440 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20162825 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20162863 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20163058 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20163139 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20163197 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20163205 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20163280 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20163761 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20163770 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20163930 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 20164036 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 20164054 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20164179 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20164325 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 20164532 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20164543 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20164547 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20164607 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20164612 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20164783 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 20164798 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20164812 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20164936 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20164983 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20165009 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20165041 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20165049 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20165066 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20165108 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20165132 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20165181 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20165248 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20165401 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20165408 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20165416 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20165496 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20165511 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20165730 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 20165773 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20165958 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20166056 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 20166102 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20166317 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 20166618 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20166710 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 20166751 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20167195 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20167252 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20167294 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20167574 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20167578 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20167799 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20167823 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20167889 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20168124 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20168128 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20168149 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20168180 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20168191 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 20168222 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20168260 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20168276 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20168337 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20168513 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20168531 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20168567 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20169141 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 2 20169142 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 20169201 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 20169223 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 20169283 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 20169403 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 20169745 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20169754 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20169938 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20169946 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20169986 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20170011 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20170117 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20170384 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20170405 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20170441 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20170498 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20170508 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20170513 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 20170597 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20170733 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 20170788 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20170856 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20170962 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20170976 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20170999 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20171082 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20171321 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20171410 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 20171417 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20171638 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20171690 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20171796 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20171896 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20171996 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 20172030 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20172146 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20172290 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20172350 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20172435 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 20172572 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20172907 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20173018 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20173079 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20173302 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20173366 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20173406 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20173727 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20173738 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20174102 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20174120 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20174157 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 20174344 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20174426 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20174585 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20174639 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 20174658 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20174781 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20174798 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20175005 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20175027 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20175028 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20175078 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 20175257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20175262 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20175282 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20175348 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 20175387 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20175415 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20175431 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 20175433 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 20175449 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20180622 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20180643 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20180766 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20180862 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20180972 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20181143 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20181269 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20181520 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20181541 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20181889 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20182284 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 20182291 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20182317 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20182380 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 20182483 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20182906 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 20182942 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20182956 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 20182995 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 20183035 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20183043 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20183054 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20183074 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20183116 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 20183150 C G Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 20183216 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 20183217 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 20183230 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20183238 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20183250 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20183380 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20183482 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20183648 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20183679 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20183698 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20183713 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20183886 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20183893 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20183900 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20183918 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20184033 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20184089 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20184110 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20184142 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20184151 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20184245 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20184869 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 20184910 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20185066 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20185086 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 20185114 A T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 20185160 C A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 20185293 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20185371 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 20185383 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 20185419 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 20185435 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 20185597 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20185733 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20185863 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20185891 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20185918 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20185973 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20185982 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20185988 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20186011 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20186092 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20186164 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20186216 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20186274 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20186392 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20186411 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20186412 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20186853 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20186916 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20186990 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20187061 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20187084 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20187096 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20187657 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 20187722 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20187749 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20187770 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20187965 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20188120 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20188123 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20188288 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 20188291 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 20188309 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 20188330 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20188358 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20188364 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20188372 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 20188436 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20188450 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20188535 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20188551 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 20188628 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 20188649 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 20188690 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 20188928 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 20189136 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20189207 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 20189273 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 20189424 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 20189705 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 20189784 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 20189795 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 20189819 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20189836 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20190091 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20190125 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20190170 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20190173 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20190185 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20190188 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20190202 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20190415 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 20190470 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20190477 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 20190518 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20190959 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20191089 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 20191296 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20191436 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20191467 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20191525 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20191536 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20191583 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 20191598 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 20191825 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 20192000 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 20192141 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 20192292 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20192381 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 20192460 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20192478 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20192592 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20192734 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20192803 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20192940 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20193057 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20193085 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20193095 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 20193144 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20193366 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 20193391 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20193415 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20193476 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20193521 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20193569 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 20193619 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20193755 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20193993 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20194012 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20194046 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20194196 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20194214 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20194260 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20194321 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20194334 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20194342 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20194351 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20194423 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20194434 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20194502 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20194633 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20194647 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20194690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20194745 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20194761 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20194804 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20194935 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20194955 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 20194986 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20195067 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20195233 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20195246 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20195260 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20195323 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20195446 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20195448 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20195555 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20195652 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20195744 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20195774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20195830 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20195836 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20196532 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20196542 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 20196692 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20197265 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 20197396 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20197412 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20197647 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20197666 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20197675 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 20197833 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 20197985 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20198005 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20198128 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 20198196 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 20198228 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 20198297 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 20198322 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 20198374 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 20198434 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 20198760 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 20198984 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20199250 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 20199647 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20199687 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20200017 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20200771 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 20200972 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20201589 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 20201664 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 2 20201950 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 20201994 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20202083 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 20202095 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 20202116 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 20202123 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 20202299 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20202309 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20202377 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20202419 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 20202430 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 20202459 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 20202517 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20202785 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 20202825 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 20202833 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 20202886 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 20203114 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 20203287 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 20203300 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 20203333 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20203352 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 20203484 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 20203722 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 20203746 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20203769 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20203838 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20203967 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20203969 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20204169 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 20204188 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20204210 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20204269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20204286 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20204607 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20204683 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20204737 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20204796 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20204798 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20204827 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20204893 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20204920 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20204930 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20204955 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20205086 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20205147 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20205427 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 20205456 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 20205506 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20205521 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20205526 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20205545 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20205617 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 20206228 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20206659 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20206868 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20207727 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20207758 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20207766 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20207831 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 20208364 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20208442 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 20208452 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 20208501 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 20209183 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20209249 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20209285 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 20209342 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20209415 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20209490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20209903 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 20210011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20210036 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20210049 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20210056 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20210329 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20210730 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20210793 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20210807 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20210888 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20210926 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20210936 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20210956 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20210959 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20211022 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20211141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20211178 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20211225 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20211281 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20211419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20211607 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20211640 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20211743 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20211753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20211780 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20211806 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20211890 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20211897 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20211910 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20211938 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20212021 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20212098 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20212115 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20212158 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20212192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20212196 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20212235 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 20212253 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20212320 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20212326 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20212362 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 20212417 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20212677 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20212798 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20213477 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20213790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20213849 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 20215352 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20215470 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20215590 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20215716 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20215751 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20215984 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20216366 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20216563 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 20216606 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 20217027 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20217551 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20217591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20217865 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20218014 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 20218077 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 20218179 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20218302 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 20218384 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20218449 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20218473 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 20218732 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20219072 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 20219108 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20219237 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 20219259 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 20219491 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 20219504 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 20219533 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 20219548 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 20219719 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20219747 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20219753 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20219771 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20219863 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20220734 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20221063 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 20221368 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20221478 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20221619 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 20221874 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20222539 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20224111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20224815 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20225318 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 20225319 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 20225458 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20226030 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20226166 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20226179 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20226327 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20226675 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20226747 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20226834 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20226888 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20227390 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 20227495 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20227504 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20227508 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20227678 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20227692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20227790 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20227791 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20227831 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20227976 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20228150 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20228213 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20228373 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20228385 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20228606 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20228632 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 20228633 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 20228649 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 20228688 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20228853 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20229118 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 20229311 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20229319 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20229441 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20229470 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20229594 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20229606 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 20229643 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20229700 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20229706 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20229760 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20229804 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20229921 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20230009 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20230043 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20230174 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20230286 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20230647 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20230799 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20230866 G C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 2 20230921 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20230939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20231041 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20231089 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20232163 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 20232264 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20233182 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20233722 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20233750 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20234206 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20234269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20234309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20234378 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20234422 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20234426 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20234688 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20234708 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20234727 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20234794 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20235050 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20235291 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 20235369 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20235438 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20235513 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 20235694 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20235790 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20235909 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20236068 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20236146 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20236390 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20236483 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20236938 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20236973 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20237894 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20238850 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20238895 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20239389 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20239683 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20239777 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20239839 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20239859 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20240442 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20240496 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 20240545 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 20240610 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20240623 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20240857 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20240884 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20241063 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20241093 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20241153 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20241415 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20241608 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20241854 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20241858 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20242570 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 20242661 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20242784 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20242820 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20242822 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20242833 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20242877 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20242898 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20243041 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20243190 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20243193 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20243653 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20243654 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 20243738 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20243784 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 20243844 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 20243957 C A N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 20244169 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20244197 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20244281 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20244410 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20244449 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20244582 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20244610 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20244764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20244926 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20245027 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20245084 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20245146 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 20245287 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20245382 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20245451 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20245457 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20245728 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20245859 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20245914 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20245979 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20245999 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20246098 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20246116 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20246162 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20246166 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20246190 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20246249 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20246270 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20246316 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 20246321 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 20246327 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20246436 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20246888 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20247111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20247113 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20247201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20247274 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20247342 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20247351 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20247367 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20247555 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20247802 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20247863 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20247906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20247968 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 20247971 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 20247998 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20248023 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20248140 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20248205 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20248284 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20248755 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20248883 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20248917 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20248992 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20248998 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20249022 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20249055 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20249084 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20249109 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20249195 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20249305 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20249314 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20249344 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20249365 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20249378 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20249388 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20249451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20249564 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20249581 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20249617 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20249750 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20249979 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20250131 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20250170 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20250224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20250358 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20250463 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20250958 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20251200 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 20251210 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 20251250 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20251265 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20251326 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20251353 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 20251949 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20252006 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20252168 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20252187 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20252303 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20252328 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20252373 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20252503 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20252518 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20252587 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20252609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20252674 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20252693 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20252943 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20252994 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20253060 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20253157 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20253185 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20253327 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 20253648 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20253853 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20254004 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20254011 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 20254114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20254361 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20254390 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20254393 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20254799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20255086 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20255421 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 20256153 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20256286 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20256321 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20256772 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20256787 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20256798 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20256799 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20257023 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20257090 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20257168 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20257281 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20257282 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20257373 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20257379 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20257461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20257719 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20257724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20257734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20257794 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20258035 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20258354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20258540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20258592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20258697 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20258754 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 20258851 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20258878 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 20258912 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20259044 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 20259128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20259131 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20259402 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20259431 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20259689 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20259778 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20260141 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20260258 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20260270 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20260447 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20260482 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20261115 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20261296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20261383 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20261561 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20261693 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20261798 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20262525 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 20262622 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20263163 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20263245 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20263369 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20263901 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 20264288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20264444 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20264517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20264852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20265015 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20265224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20265326 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20265742 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20265870 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20266920 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20267039 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20267210 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20267268 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20267498 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20267610 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20267631 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20267995 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20268189 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20268217 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20269023 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20269079 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20269387 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20269441 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20269560 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20269571 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20270349 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 20270675 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 20270745 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20270936 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20271023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20271352 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 20271478 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20271698 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 2 20271751 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 20271936 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 20271953 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 20271964 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 20272076 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 20272079 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 20272147 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20272295 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20272412 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20272430 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20272627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20272693 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20272780 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20273020 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20273037 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20273463 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20273639 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20273737 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20273796 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20273917 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 20274239 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20274242 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20274358 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20274497 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20275865 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20275871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20275929 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20276059 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20276062 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20276801 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20276841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20276903 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20277074 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20277139 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20277221 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20277733 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20278053 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20278226 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20278298 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20278737 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20278761 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20279031 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20279066 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20279077 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20280734 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20280848 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20280857 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20281037 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20281380 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 20281441 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20281507 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 20281520 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 20281710 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20281755 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20281950 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20282294 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20282623 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20282770 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20282898 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20283587 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20283752 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20283754 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20284012 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20284317 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20284406 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20285043 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20285068 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 20285535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20285565 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20285706 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20285854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20286129 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20286326 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20286377 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20286382 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20286440 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20286446 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20286534 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20286545 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20286559 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20286649 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20286715 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20286731 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20286811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20286886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20286919 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20286935 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20286943 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20286958 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20286973 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20287020 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20287064 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20287265 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20287289 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20287295 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20287380 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20287616 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20287670 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20287983 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20288226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20288513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20288959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20289510 T G N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 20289590 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 20289796 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20289865 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20290186 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20290230 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20290301 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20290464 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 20290657 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 20290706 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 20290739 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 20290886 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 20291073 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20291434 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20291793 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20292196 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20292287 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20292307 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20292323 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20292356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20292386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20292392 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20292566 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20292605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20292852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20293009 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20293109 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20293364 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20293668 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20293753 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20293774 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20294653 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20295020 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20295281 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20295423 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20295635 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20295827 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20296445 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20296856 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20297252 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20297488 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20297669 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20297701 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20297755 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20297788 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20297920 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20297952 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20298077 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20298570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20298693 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20299013 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20299148 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20299589 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20299649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20299735 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20300427 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20300663 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20300684 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20300743 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20301065 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20301242 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20301281 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20301314 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 20301715 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20301753 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20301839 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20302095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20302163 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20302172 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20302359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20302490 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20311213 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20311552 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20311564 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20311570 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20311581 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20311582 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20311633 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20311912 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20311916 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20312058 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20312222 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20312226 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20312319 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20312457 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20312482 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20312514 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20312804 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20312844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20312904 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20313075 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20313147 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20313344 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20313591 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 20313658 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 20313684 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 20313710 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 20313910 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20314121 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20314152 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20314245 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20314261 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20314407 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20314446 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20314523 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20314560 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20314673 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20314835 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20314894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20314935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20314970 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20315120 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20315121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20315137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20315172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20315185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20315220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20315438 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20315524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20315862 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20316130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20316233 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 20316302 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 20316479 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 20316496 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 20316503 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20316874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20316892 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20316940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20317004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20317370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20317454 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20317712 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20319495 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20320735 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20321393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20321834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20321971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20322343 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20322401 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20323462 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 20323646 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 20323685 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20323789 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20324577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20324824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20325006 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20325021 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20325430 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20325456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20325505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20325569 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20325660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20325710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20325714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20325793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20325813 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20325899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20325924 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20325947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20326053 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20326063 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20326087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20326133 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20326350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20326701 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20326704 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20327092 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20327485 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20327687 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20327855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20328566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20328731 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20328732 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20329052 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20329449 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20330209 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20330298 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20330425 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 20330492 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20330532 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 20330752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20331112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20331170 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20331267 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20331277 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20331628 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20331736 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20331770 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20332021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20332166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20332388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20332493 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20332870 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20332875 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20333617 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 20333820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20333970 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 20334352 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20334434 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20334505 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 20334752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20334803 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20334947 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20335040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20335065 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20335264 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20335284 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20335368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20336102 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 20336184 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 20336420 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 20336510 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 20336708 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20336934 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20337110 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20337295 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 20337358 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 20337765 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20338125 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20338160 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 20338210 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20338219 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 20338291 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 20338421 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 20338959 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 20338970 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 20339090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20339203 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20339238 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20339521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20339551 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20339626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20339790 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20339791 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 20340148 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 20340173 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20340183 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 20340358 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 20340373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20340498 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20340681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20340853 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20341005 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20341071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20341096 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20341099 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20341398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20341513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20341724 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20341819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20342276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20342431 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20342745 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20342845 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20342906 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20343026 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20343051 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20343151 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20343175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20343249 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20343452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20343467 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20343525 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20343580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20343794 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 20343897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20343991 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20344262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20344338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20344404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20344739 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20344917 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 20345037 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 20346327 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20346419 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20346712 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20346769 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 20347471 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 20347526 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20347701 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 20347703 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 20347876 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20348323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20348353 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20354926 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20355081 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20355380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20355676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20355721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20355778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20355800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20355895 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20356350 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20356362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20356366 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20357226 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20357247 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20357259 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20357349 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20357443 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20357678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20357700 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20357769 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 20358216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20358250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20358306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20358314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20358333 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20358455 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20358691 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20358703 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20358772 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 20359112 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 20359129 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20359166 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20359276 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 20359725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20359915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20359970 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20360105 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20360171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20360207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20360221 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20360292 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20360392 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20360407 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 20360428 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 20360465 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20360510 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20360511 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20360653 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20360657 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20360707 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20360712 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20360736 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20360756 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 20360797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20360816 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20360825 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20360891 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 20360909 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20360918 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 20360961 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20361063 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20361097 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20361191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20361243 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20361324 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20361662 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20361689 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20362061 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20362125 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20362155 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20362220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20362311 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20362314 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20363393 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20363496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20364002 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20364013 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20364044 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20364050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20364066 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20364119 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20364143 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20364472 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20364501 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 20364561 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 20364572 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20364601 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 20364688 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 20364714 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 20364760 G T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 20364778 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 20364813 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 20364872 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 20364912 T A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 20364990 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 20365019 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20365330 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 20365458 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20365485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20365540 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20365830 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 20365863 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20366026 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20366089 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 20366215 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20366221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20366491 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20366562 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20366939 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20367045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20367188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20367639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20367643 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20367659 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20367793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20367822 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20367863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20367873 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 20368760 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20368978 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20369000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20369140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20369324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20369543 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20369660 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20369731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20369774 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20369945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20371230 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 20371325 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20372637 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20372773 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 20372905 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20373504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20373725 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20373937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20373940 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20374244 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 20374446 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20374579 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 20374734 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 20374777 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 20374848 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20374850 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20375105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20375168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20375354 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 20375467 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 20375503 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20375638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20375737 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 20375743 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 20375802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20375808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20375831 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20375916 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20376004 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20376021 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20376043 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20376045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20376139 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20376154 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20376211 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20376245 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20376254 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20376266 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20376270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20376328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20376370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20376379 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20376420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20376718 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 20376967 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 20377216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20377389 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20377449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20377503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20377537 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20377564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20377620 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20377621 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20377652 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20377779 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20377955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20377956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20378154 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20378176 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20378189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20378649 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20378650 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20378701 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20378887 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 20378959 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 20378965 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 20378992 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 20379096 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 20379351 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 20379386 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 20380058 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 20380184 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20380326 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20380360 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20380368 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20380885 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 20381070 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20381169 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20381270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20381595 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20381677 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20381682 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 20382211 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20382621 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 20384837 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20385501 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20386163 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20386956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20387212 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 20387272 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 20387329 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 20387664 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 20387675 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20387715 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20387876 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20388457 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20388568 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20388782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20388904 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20388955 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20388969 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20389045 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20389073 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20389114 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20389385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20389636 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 20389898 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20390044 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20390079 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20390090 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20390103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20390160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20390328 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 20390342 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 20391402 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20391562 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20391637 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20391673 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20391838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20391849 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20392201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20393440 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 20393501 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 20393589 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20393595 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20393696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20393702 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20393793 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20393990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20394157 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20394225 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 20394363 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20394435 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20394452 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20394479 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20394500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20394523 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 20394618 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 20394661 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20394761 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20394827 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20395237 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20395489 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 20395781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20395903 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20396132 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20396179 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20396260 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20396267 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20396311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20396527 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20396581 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20396623 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20396641 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20396670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20396681 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20396756 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 20397023 T C Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 2 20397078 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 20397131 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20397271 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20397326 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20397356 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20397393 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20397530 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20397608 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20397653 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20397817 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20398160 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20398189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20398223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20398508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20398683 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 20398815 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20399049 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 20399114 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 20399342 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 20399365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20399402 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20399539 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 20399568 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 20399598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20399632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20399665 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20399737 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20399744 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20399833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20400025 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20400135 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20400321 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20400408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20400671 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20400805 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20400830 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20401005 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20401080 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20401169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20402039 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 20402416 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20402681 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20403415 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20403521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20403696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20403735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20403822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20403858 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20403867 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20403880 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20403966 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 20403999 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20404001 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20404097 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 20404125 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 20404163 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20404269 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20404396 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20404446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20404526 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 20404546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20404559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20404637 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 20404660 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20404714 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20404812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20404908 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 20404923 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 20404957 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20405001 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 20405022 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20405039 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20405112 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 20405140 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20405183 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 20405184 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 20405205 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 20405367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20405507 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20405531 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20405603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20405629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20405668 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 20405673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20405679 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 20406634 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 20406700 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20406782 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20407110 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20407143 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 20407166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20407184 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20407255 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20407502 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20408277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20409130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20409586 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20409630 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 20410243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20410721 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20410971 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20411596 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20411609 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20411647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20412121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20413875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20414427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20414526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20414532 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20414724 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20415138 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20415498 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20415850 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20415895 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20416003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20416080 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20416235 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20416239 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20416277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20416401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20416572 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20416707 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20416774 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20416876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20417416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20422839 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 20424098 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20424110 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20424113 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20424184 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20424231 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 20424646 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20424667 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20424718 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20424831 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20424911 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20424937 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20424964 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20424984 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20425027 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20425076 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20425154 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20425295 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20425578 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20425655 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20425807 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20425833 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20425882 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20426031 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20426271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20426373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20426592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20426602 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20426661 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20426696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20426892 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20427097 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20427120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20427218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20427224 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20427532 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20427730 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20427769 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20428211 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20428376 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20428424 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20428503 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20428613 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20429102 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20429216 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20429286 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20429554 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20429560 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20429632 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20429819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20429938 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20430069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20430170 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20430307 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20430310 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20430467 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20430643 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20430667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20430739 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20430819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20430878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20430922 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20431013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20431201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20431811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20431867 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20432004 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20432081 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20432133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20432225 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20432231 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 20432458 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20432505 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20432523 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20432645 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20432875 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20433086 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 20433335 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20433365 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 20433984 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20434124 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20434148 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20434157 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20434455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20434662 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20434921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20434939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20435699 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20435790 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20435913 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20436305 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20436614 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20437496 T A Y N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 2 20437587 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20438293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20438575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20438581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20439156 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20439163 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20439306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20439836 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20441952 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20443277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20443726 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 20444044 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20445146 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20445650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20447450 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 20447970 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 20447980 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 20448505 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20449192 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20449725 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20450231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20450305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20451256 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 20452527 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20453074 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20453962 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20453966 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 20454001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20454068 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 20454090 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20454146 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 20454159 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 20454161 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 20454193 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 20454251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20454385 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20454492 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20454992 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20455032 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20455046 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20455071 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20455217 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20455725 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20455886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20455946 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20456187 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20456441 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20456482 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20456750 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 20457007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20457109 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20457160 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20457181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20457411 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20457462 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20457590 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20457697 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 20458617 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20458720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20458986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20459077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20459430 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20459518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20459558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20459592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20459941 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 20460167 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 20460395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20460435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20460562 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20460613 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 20460758 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20460827 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 20460905 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20461053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20461506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20461632 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20461780 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20461841 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20461853 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20461987 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20462000 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20462266 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20462321 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20462362 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20462409 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20462422 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20462423 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20462461 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20462586 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20462670 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20462834 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 20462904 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20462932 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20463099 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20463886 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 20463989 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20464218 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20464404 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 20464458 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 20464562 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 20464812 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 20465601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20465903 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20466213 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20467006 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20468000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20468393 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 20469452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20469692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20470187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20470218 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20470703 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 20470870 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 20470873 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 20470883 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 20470894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20470939 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 20470977 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 20471087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20471391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20471908 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20472003 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20472238 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20472823 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20472859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20472955 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 20473070 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20473127 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 20473402 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20473475 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20473632 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20473865 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 20473900 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20473948 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20474072 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20474166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20474198 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20474202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20474848 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 20475555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20475566 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20475582 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20475621 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20475676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20475678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20475737 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20475778 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20475867 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 20475921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20475966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20475993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20476243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20476253 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20476570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20476623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20476726 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 20476829 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20476875 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 20477451 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 20477534 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20477762 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20477965 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20478097 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 20478505 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20479030 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20479063 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20479066 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 20479140 A G Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 20479198 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 20479255 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 20479276 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 20479361 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 20479555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20479629 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20479811 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20480045 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 20480403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20480789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20482142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20482282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20482426 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20483372 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 20483379 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 20484035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20484279 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 20484973 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20486405 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20486427 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20487353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20487775 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20487808 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 20487931 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 20488510 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 20488533 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 20488615 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 20488626 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20488766 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20488774 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20489054 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 20489303 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20489351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20489760 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20490025 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20490076 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20490337 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20490594 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 20491089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20491363 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 20491375 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 20491444 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20491798 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20492243 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20492395 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20492414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20492477 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 20492619 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20493984 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20494014 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20494134 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 20494337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20494501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20495263 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 20495541 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20495644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20495717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20495768 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20495810 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 20495833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20495867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20495875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20495885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20496028 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20496031 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20496180 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20496254 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 20496514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20496694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20496833 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20496923 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 20496930 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20496988 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 20497098 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 20497101 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20498363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20498810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20499600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20499905 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20499949 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20500433 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20500884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20501464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20501572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20501579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20501963 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20502149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20502295 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 20502479 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 20502590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20502672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20502722 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20502972 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 20503077 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 20503078 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 20503150 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 20503189 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20503397 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 20503571 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 20503599 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20503611 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20504220 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20504261 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20504357 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20504398 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20504465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20504693 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 20505171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20506392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20506712 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 20507909 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 20507910 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20510247 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20511227 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20511472 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20512388 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20513642 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20514905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20514994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20515496 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 20516709 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 20516739 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 20516747 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 20516804 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 20516873 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 20517002 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20517275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20517720 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 20517885 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20517914 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 2 20518148 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 20518647 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 20518663 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 20518888 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 20519118 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20519228 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 20519258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20520169 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20520294 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 20520384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20520401 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20520681 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20520707 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 20520724 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20520773 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20521013 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20521321 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 20521377 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 20521558 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20521673 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 20522036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20522488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20522620 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20522704 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 20522969 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20522986 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20523043 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20523201 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20523251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20523372 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20523414 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20523726 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20523765 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20524020 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20524333 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 20525036 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20525202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20526657 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 20528085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20528120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20528160 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20528383 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20528531 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 20528739 C T Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 2 20530555 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20532989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20534575 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 20534972 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20535061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20535260 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20535963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20536191 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20536302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20537741 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20538302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20538856 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20539308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20540111 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20540215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20540230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20540631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20541546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20541970 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20541971 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20541981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20542517 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20542531 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20542556 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20542619 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20542630 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20542671 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 20542678 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20542793 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20542857 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20543041 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20543141 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 20543150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20543279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20543458 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20543689 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 20544898 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 20545180 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 20545321 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 20545383 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20545645 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 20545727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20545972 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 20546089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20546124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20546137 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20546362 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 20546425 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 20546512 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 20546794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20546847 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 20546970 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20547021 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 20547058 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 20547088 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 20547161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20547167 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 20547239 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 20547302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20547366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20547899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20547916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20548053 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 20548508 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 20548731 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 2 20548800 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 2 20548824 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 20548903 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20549021 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 20549131 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 2 20551293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20551579 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 20551900 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20552345 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20552620 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20553053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20553093 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20553119 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 20553420 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 20553425 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 20553450 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 20553451 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 20553514 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 20553532 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 20553543 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 20553549 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 20553741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20553758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20553768 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 20553775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20553793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20553884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20553983 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 20553991 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 20554439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20554455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20554477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20554592 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20554599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20554643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20554663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20554668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20554707 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20554786 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20554801 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20554806 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20554961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20554991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20555003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20555128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20555163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20555223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20555384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20555399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20555437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20555452 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20555462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20555467 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20555631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20555665 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 20555684 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 20555780 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 20555804 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 20556109 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 20556823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20557095 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20557135 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20557167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20557246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20557681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20557722 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20557734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20557936 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20558453 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20558469 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 20558507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20558550 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 20558901 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 20558926 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 20559067 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 20559068 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 20559282 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 20559337 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 20559375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20559479 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 20559595 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20559609 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 20559651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20560198 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20560482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20560699 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20560720 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20560749 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20560757 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20560771 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20560812 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20561094 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20561233 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20562160 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20562344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20562442 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20562527 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20562551 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20562559 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20562622 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20562932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20563187 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20563607 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20563792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20564241 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 20564289 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 20564353 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 20564870 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20565042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20565366 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20565522 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20565604 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20565823 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 20565836 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 20565900 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20565942 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20566064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20566110 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20566176 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20566181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20566199 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20566223 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20566271 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 20566331 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 20566630 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20566656 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 20566736 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 20566854 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 20566978 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 20567028 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 20567095 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 20567652 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 20567781 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20567828 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20567983 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20567993 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20568098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20568140 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20568206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20568323 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20568456 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20568601 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20568689 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20568839 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 20568923 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 20569278 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 20569380 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20569390 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 20569542 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 20569545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20569794 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20569851 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20570528 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20570556 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 20570572 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20570593 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 20570694 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20570962 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20571430 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20571632 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20571871 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20571976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20572234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20572305 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 20572540 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20572590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20572615 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 20572786 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 20573064 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20573346 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 20573628 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 20573633 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 20573651 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 20573669 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 20573723 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 20573765 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 20573988 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20574183 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20574195 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20574263 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20574282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20574500 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20574530 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20574548 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20574613 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20574632 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20574661 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20574971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20575015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20575106 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20575266 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 20575322 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20575364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20575371 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20575385 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20575912 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20575974 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20576113 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20576212 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 20576267 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20576319 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20576360 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 20576537 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20576571 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20576659 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20576685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20576736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20577004 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20577278 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20577601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20577631 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 20577704 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20577955 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20578060 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 20578192 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 20578368 G C Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.5 0 0.5 12 12 6 0 6 2 20578372 A G Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.5 0 0.5 12 12 6 0 6 2 20578386 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 20578411 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 20579675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20580036 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 20580356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20580455 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 20580697 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 20580928 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20580999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20581297 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 20581310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20581475 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 20581501 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 20581559 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20581783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20582952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20582991 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20583017 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20583086 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20583132 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 20583746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20584417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20584535 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 20584769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20584831 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20584892 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 20584994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20585080 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20585171 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 20585181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20585597 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20585779 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20585803 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20585804 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20585931 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20585980 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 20586184 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20586198 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20586418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20586422 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20586450 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20586451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20586495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20586557 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20586745 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20586874 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 20587180 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20587182 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 20587348 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 20587397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20587398 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 20587501 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 20587558 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 20587560 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 20587625 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 20587721 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20587750 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20587751 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20587833 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20587876 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 20587949 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20588004 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20588026 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20588211 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 20588355 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 20588411 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20588688 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 20588706 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20589681 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20590931 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20590989 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20590990 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20591014 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20591048 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 20591204 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 20591215 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 20591323 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 20591426 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20591482 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20591518 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20591528 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20591585 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20591678 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20591765 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20591774 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20591809 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 20591864 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 20591895 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20591909 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20592073 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 20592675 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20592773 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 20593183 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20593223 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 20593274 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20593322 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20593562 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 20593566 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 20593595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20593615 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20593628 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 20593976 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20594181 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20594253 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 20594527 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20594966 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 20595037 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20595117 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 20595169 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20595375 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20595422 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20595434 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20595478 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20595790 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 20595850 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20595873 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20596114 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 20596129 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20596159 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20596160 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20596173 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20596225 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20596267 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 20596278 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20596286 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20596476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20596477 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 20596759 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 20596791 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 20597717 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20597725 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 20598064 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20599435 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 20599446 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20599773 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20600604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20602250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20603808 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 20604196 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20604712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20605119 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 20608102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20608572 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20608869 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 20608884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20610257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20610484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20610619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20610624 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20610656 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20610765 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 20610842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20610876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20610999 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20611088 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 20611100 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 20611121 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 20611184 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20611185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20611223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20611243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20611461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20611555 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20611566 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20611590 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20611617 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20611728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20611887 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 20612097 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 20612265 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20612276 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20612299 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20612514 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20612543 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20612764 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20612854 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20612905 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20613554 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 20613623 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20613679 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20613727 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20613790 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20613801 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20613828 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20613880 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20614062 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20614521 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20614746 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20614816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20614882 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20614914 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20615524 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20615580 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20616045 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20616227 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20616286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20616349 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20616602 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20616603 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20616614 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20616971 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20616989 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20617437 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 20617516 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20618007 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 20618011 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 20618032 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 20618057 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 20618060 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 20618074 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 20618287 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 20618961 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 20619441 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 20619582 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20620315 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20620343 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20620382 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20620386 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20620862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20621557 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20621592 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 20621753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20623822 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20624089 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 20624906 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20625714 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20626409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20627062 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20627200 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 20627249 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 20627711 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20628402 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20628450 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 20628595 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 20628640 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20628674 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20628813 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 20628912 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20629014 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20629403 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 20629409 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 20629423 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 20629452 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 20629465 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 20629541 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20629609 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 20629719 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 20629816 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 20630104 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 20630124 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20630170 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 20630196 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 20630331 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 20630372 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 20630377 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 20630485 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 20630561 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20630696 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 20631324 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20631415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20631587 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20631682 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 20631854 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20631927 T G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 20631957 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 20632040 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20632066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20632229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20632239 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20632377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20632641 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 20632725 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20632785 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 20633050 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20633112 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20633132 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 20633554 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20633557 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 20633891 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 20634579 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 20634854 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 20634941 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20635556 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20636181 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20636545 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20636637 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20637323 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20637499 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20637510 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20637581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20637755 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20637774 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20637821 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20637839 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 20638108 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20638553 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20639001 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20639005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20639812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20639856 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 20639903 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20639956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20639965 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 20639981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20639984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20640041 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 20640188 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20640206 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 20640218 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20640322 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 20640454 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 20640521 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 20640615 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20640629 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20640827 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20641338 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20641375 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20641552 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 20641609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20641679 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 20641743 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 20641940 A C N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 2 20642727 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 20642829 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 20642976 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20643102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20643524 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 20643540 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20643638 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20643694 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20644102 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20644266 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20644366 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20644377 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 20645518 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20645603 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20645730 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20646488 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20647562 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20647880 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20648014 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20648058 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20648064 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20648356 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20648359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20648396 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20648640 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20648750 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 20648857 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20648870 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20648874 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20648893 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20648899 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20648918 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20648939 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20648941 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 20648951 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20649003 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20649019 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20649148 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20649334 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20649604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20649608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20649882 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20650621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20650635 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20650708 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20650769 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20651630 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 20651646 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 20651758 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20651982 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20651999 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20652043 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20652099 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 20652169 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20652202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20652210 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20652235 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20652325 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20652702 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20652895 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20652941 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20652954 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20653101 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20653122 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20653158 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20653183 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 20653210 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20653363 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20653517 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 20653527 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 20653729 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20653801 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 20653851 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 20653856 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 20654110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20654166 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 20654291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20654394 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20654395 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20654718 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20654752 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20654790 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 20654952 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20655406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20655411 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20655498 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20655604 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20655645 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20655687 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 20655688 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 20655718 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20655799 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 20655812 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 20655844 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20656204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20656684 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20657130 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20657364 C T Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 20657941 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20658308 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20658793 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20659078 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 20659104 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20659112 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20659561 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 20659740 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20659834 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20659980 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20660020 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20660502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20660716 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20660790 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20660848 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20660922 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20660925 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20661145 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20661325 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 20661496 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 20661611 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20662012 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 20662023 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 20662121 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 20662391 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20662489 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20662513 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20662573 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20662692 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 20662956 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20662987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20663014 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20663033 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20663046 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20663112 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20663236 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20663320 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20663323 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20663353 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20663747 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20664142 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 20664387 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20664583 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20664607 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 20664771 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20664822 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 20664864 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20665055 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20665889 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 20665890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20666147 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20666802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20666834 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20666843 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20667238 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20667411 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 20667418 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 20667423 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 20667430 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 20667445 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 20667958 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20667964 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20669205 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 20669265 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20669287 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20669306 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 20669795 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20670182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20670419 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20670714 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20670882 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20671030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20671088 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20671605 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20671634 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 20671870 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20671904 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20671928 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 20671947 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 20671969 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 20671985 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 20671998 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20672149 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20672153 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20672285 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 20672551 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 20672565 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 20672779 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 20672804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20672810 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 20672870 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20673387 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 20673523 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20673646 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20673810 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20673858 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20674004 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 20674116 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 20674241 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 20674250 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20674283 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20674345 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20674468 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20674687 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20674736 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 20675198 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20675724 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 20675840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20676305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20676328 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20676393 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20676425 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20676536 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20676558 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 20676657 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20676671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20676828 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20676910 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20676917 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 20676955 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20676968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20677101 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20677136 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 20677245 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20677329 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20677346 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20677544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20677745 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20677760 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20677959 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 20677979 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20677995 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 20678031 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20678043 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20678372 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20678454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20678473 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 20678531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20678594 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20679106 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 20679152 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20679184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20679245 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 20679611 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20679627 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20679982 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20680032 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20680270 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20680620 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20681687 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20681742 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20681752 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20681758 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20682012 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20682068 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20682101 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20682281 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20682296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20682307 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20682398 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20682532 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 20682892 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20683441 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20683478 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20683837 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 20683992 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 20684029 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 20684255 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20684285 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20684368 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20684710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20685018 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20685033 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20686008 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20687002 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20687332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20688465 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20688549 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 20688562 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20688661 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20689021 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20689091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20689200 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20689485 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20689854 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20689858 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20689880 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 20689977 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20690111 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20690176 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20690282 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20690326 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20690339 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20690365 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20690446 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20690509 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 20690537 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20690582 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20690616 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20690651 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20690677 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20690705 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20691042 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20691073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20691211 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 20691556 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20691653 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20691712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20692009 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20692068 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20692200 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 20692218 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 20692241 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 20692366 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20692400 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20692409 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20692483 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20692667 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20692679 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20692832 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 20692848 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 20692916 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20693068 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20693143 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20693152 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20693328 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20693600 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20693602 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20693878 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20694849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20695464 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20695755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20695840 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20696579 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20696682 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 20696780 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20697003 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20697147 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20697197 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20697429 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20697459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20697484 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20697485 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20698787 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20699468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20701796 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 20701797 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 20701851 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20701883 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20701896 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20701919 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20702022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20702129 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 20702187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20702215 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20702223 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20702314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20702341 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20702556 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20702748 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20702766 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20702876 A C Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 20703003 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20703011 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20703076 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20703155 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20703206 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20703316 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20703363 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 20703483 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20703649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20703694 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20703717 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20703769 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20703934 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 20703939 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20704123 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 20704239 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 20704271 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20704355 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20704697 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 20704966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20707630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20707631 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 20707757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20707863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20708154 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 20708402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20708450 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20708497 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20708552 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20709015 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20709206 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20709491 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20712431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20714363 G T Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 20714427 A C Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 2 20714529 A G Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 2 20714534 A G Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 2 20714576 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 20715738 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20717887 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20719035 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 20719088 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 20719373 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20719747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20722848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20723899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20723956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20724435 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20724438 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20724648 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20725572 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20725613 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20725857 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20726656 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 20726785 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 20726855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20726902 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20727046 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20727115 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20727195 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20727307 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20727467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20727692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20728279 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20728299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20728365 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20728403 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20728697 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20730243 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20730273 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20730274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20733786 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20734782 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20735258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20737567 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20739339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20739532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20739575 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20739664 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20739719 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20740274 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 20740358 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 20740405 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20740512 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 20740755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20740759 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20740850 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20740916 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20741088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20741158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20741169 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20741194 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20741242 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20741461 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20741468 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20741692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20741792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20741810 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 20741838 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 20742059 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20742432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20742470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20742490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20742505 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20742601 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20742608 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 20742731 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20742784 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20742812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20742948 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20742986 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 20742987 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 20743140 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20743215 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20743279 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20743311 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20743328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20743335 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20743347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20743495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20743746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20743754 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20744194 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20744202 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20744226 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20744371 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20744415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20744483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20744619 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 20745261 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 20745776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20746198 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20746256 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20746361 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 20746494 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 20746622 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20746754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20746762 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20746794 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20748814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20749360 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 20749453 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 20749529 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 20749563 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 20750594 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 20750618 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20750760 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20750779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20750917 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 20750930 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20750966 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20751042 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 20751099 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20751251 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 20751261 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20751321 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20751331 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20751334 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20751497 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 20751680 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 20751705 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20751722 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 20751733 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 20751835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20752007 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 20752606 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20752626 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 20752738 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 20752789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20752867 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20752902 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20753152 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20753239 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 20753328 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 20753339 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 20753359 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20753475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20753514 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 20753520 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 20753684 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 20753786 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 20753917 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 20753987 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 20754002 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 20754054 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 20754135 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 20754154 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 20754191 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20754203 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20754259 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20754270 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20754325 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 20754415 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 20754493 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 20754860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20754968 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20755386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20755387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20755569 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20755597 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20755650 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20755693 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20755881 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20756176 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20756186 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20756303 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20756362 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20756412 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20756427 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20756443 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 20756474 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20756512 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20756614 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20756658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20756772 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20756825 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20756838 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20757071 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20757180 G T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 20757331 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20757546 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 20757664 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 20757792 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20757858 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20758042 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20758059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20758125 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20758129 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20758277 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20758283 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20758556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20758592 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20758612 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20758614 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20758648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20758649 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20758828 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 20759035 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20759227 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 20759655 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 20760351 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20760563 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 20760582 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20760599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20760676 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20760725 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 20760727 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 20760739 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 20761073 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20761195 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20761344 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20761423 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20761464 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20761489 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 20761514 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20761555 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 20761927 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20762068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20762084 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 20762162 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 20762193 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20762282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20762287 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20762297 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20762313 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20762315 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20762484 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20762549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20762650 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20762667 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20762871 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20763350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20763491 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 20763566 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20763671 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20763693 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20763733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20763889 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20763892 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20763900 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20763910 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20763923 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20763927 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20763973 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 20764014 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20764100 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20764184 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20764260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20764528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20764602 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20764641 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20764664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20764970 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20765041 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20765098 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20765168 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20765299 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20765328 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 20765401 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20765506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20765625 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20765732 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20765764 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20765818 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20765867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20766032 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20766252 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20766272 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20766418 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20766438 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20766443 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20766552 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20766596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20766617 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 20766998 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20767361 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20767718 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 20767733 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20767805 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 20767885 G A Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 20768134 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 20768854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20768894 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 20769001 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20769309 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 20769387 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20769444 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 20769566 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20770065 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20770143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20770840 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20771038 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20771665 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20771720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20772023 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20772195 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 20772224 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20772633 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20773881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20779010 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 20779075 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 20779166 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20779179 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20779213 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20779238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20779275 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 20779309 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20779321 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20779332 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 20780126 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20780404 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20781058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20781892 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20782236 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20782248 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20782577 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20782922 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 20783254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20783309 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20783804 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20783915 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 20783991 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20784401 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20784557 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20784652 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20785006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20785157 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20785263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20785296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20785434 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20785445 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20785494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20785559 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20785625 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 20785735 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 20785739 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 20785750 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 20785762 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 20785778 G T Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 20785782 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 20785800 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 20785803 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 20785826 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 20785847 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 20785931 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20785936 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 20786135 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 20786156 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 20786185 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 20786352 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 20786404 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20786513 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20787012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20788304 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20788358 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20788410 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20788469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20789561 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 20789761 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 20789762 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 20789778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20789794 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20789876 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20789917 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20790037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20790218 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 20790516 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 20790699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20790703 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 20790854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20791312 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20791469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20792219 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 20792220 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 20792557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20792569 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 20792578 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 20792600 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20792678 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20792745 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20792860 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 20792905 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 20792951 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20793066 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20793160 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20793413 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20793504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20793773 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20793816 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 20793999 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20794089 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20794166 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20794192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20794205 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20794215 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20794309 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20794369 A T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 20794443 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 20794449 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 20794506 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 20794607 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 20794728 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 20794749 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20794812 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 20794828 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 20794842 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20794905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20794968 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20794979 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20795002 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20795013 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20795032 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20795051 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20795093 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20795134 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20795149 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20795217 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20795569 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 20795610 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20795833 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20796063 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20796101 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20796133 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20796277 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 20796336 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 20796363 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20796591 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20797054 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20797079 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20797195 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20797202 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20797314 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 20797418 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 20797420 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20797514 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20797668 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20798066 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20798079 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20798207 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20798474 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 20798490 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 20798771 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20798869 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 20798883 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 20799090 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20799097 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20799101 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20799163 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20799176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20799177 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20799219 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20799260 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20799261 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20799377 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 20799432 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20799444 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20799455 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20799502 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20799576 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20799581 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20799667 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20799824 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20799918 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20800021 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20800088 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20800113 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20800157 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20800159 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20800206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20800245 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20800549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20800573 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20800605 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20800673 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20800709 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20800834 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 20800846 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20800858 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20800912 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20800974 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20800989 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 20801001 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20801005 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 20801014 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 20801055 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20801124 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20801341 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20801348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20801364 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 20801604 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20801907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20801976 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20802558 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 20804055 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 20804081 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 20804481 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20804534 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20804546 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20805142 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20805358 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20805449 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20805570 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20805740 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20805750 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20805758 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20805844 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20806015 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 20806049 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 20806064 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 20806087 A T Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 20806209 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20806253 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20806344 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20806390 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20806596 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20806741 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 20806892 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20807243 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20807586 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20807686 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 20807810 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20807910 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20808150 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20808166 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20808339 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20808373 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20808432 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 20808650 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20808796 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20808938 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 20809250 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20809330 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20810050 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20810368 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 20810691 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 20810693 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 20810746 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20811077 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20811659 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 20811661 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 20812806 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 20813301 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 20813448 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 20813568 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20813951 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20814400 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 20814769 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20815673 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20815845 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20815905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20816146 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20816841 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 20820096 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20820332 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20820424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20821124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20823294 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20823607 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20824652 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20824683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20824857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20825146 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20825149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20825653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20825908 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 20825928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20826818 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 20826827 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20826874 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20826975 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20827100 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20827572 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20829477 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20830515 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 20830896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20831161 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 20831236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20832440 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20832529 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 20832787 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20833353 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20833959 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20834158 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20834624 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20834639 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20835138 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 20835183 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 20835233 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 20835373 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20835411 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20835610 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20835763 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20835906 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20835928 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 20835935 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20835971 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20836042 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20836083 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20836250 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20836466 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20836566 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20836620 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20836706 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20836721 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 20836790 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20836825 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20836847 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 20836885 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20837204 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20837248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20840524 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20841751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20842545 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 20842576 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 20842624 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 20842802 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20843356 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 20843955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20844325 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20844495 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20844870 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20845093 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 20845479 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 20845531 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 20845564 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 20845575 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20845585 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 20845726 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20845811 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20845839 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 20845881 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20845965 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20846144 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20846415 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20846458 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20846695 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20846763 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20846807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20846841 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20846931 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 20847063 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20847256 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20847600 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 20847642 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 20847719 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20847743 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20848019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20848478 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20848802 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 20848868 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 20848896 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 20849691 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 20849863 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 20850227 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 20851013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20851355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20851857 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20851872 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20852010 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20852833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20852858 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20853219 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20853694 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20853763 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20853813 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 20853815 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 20853827 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20853830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20853893 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 20853901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20853905 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 20853920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20854057 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20854343 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20854387 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20854928 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20854991 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20855597 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 20855659 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20855753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20855766 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20855854 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 20856438 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20856855 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 20857402 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 20857480 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20857577 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 20858050 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20858124 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20858161 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20858162 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20858216 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 20858305 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20858351 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 20858417 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20858485 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 20858556 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20858900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20858942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20859467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20860148 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 20860235 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 20860272 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 20860789 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 20861158 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20861640 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20861682 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 20861693 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 20861889 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 20861914 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 20861947 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 20862027 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 20862060 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 20862074 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20862102 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 20862118 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20862150 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 20862264 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 20862354 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20862865 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20862884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20862942 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 20863360 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 20863531 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20864219 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 20864245 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20864616 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 20865354 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 20865908 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 20866136 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20866274 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 20866584 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 20867003 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20867031 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 20867137 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 20867146 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20867210 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20867303 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20867494 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20867546 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20867587 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 20867614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20867724 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20867725 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 20867937 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20868030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20868169 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 20868211 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 20868362 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 20868400 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 20868687 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20868975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20869141 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20869156 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20869729 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 20869911 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 20870210 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20870362 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20870898 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20871136 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 20871205 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20871333 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20871895 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 20872082 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 20872163 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 20872166 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 20872248 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 20873631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20873992 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20874165 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20874247 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20875083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20877822 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20878199 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 20878378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20878419 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 20878427 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 20878432 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 20878469 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 20878524 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20878558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20878593 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 20878616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20878688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20878729 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 20880202 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 20880271 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20880574 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20881236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20881404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20881487 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20881528 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 20881773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20881903 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20882235 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20884237 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 20884275 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 20884399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20884610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20884882 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20884886 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20885054 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 20885067 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 20886217 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20886289 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20886351 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20886440 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 20886484 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 20886518 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 20886681 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 20886763 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 20886812 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 20886833 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 20887016 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 20887095 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 20887305 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 20887355 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 20887470 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 20887481 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 20887602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20887664 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 20887899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20888575 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20888576 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 20890934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20891219 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20892586 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 20892792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20893585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20893850 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20894935 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20895920 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 20895923 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20896152 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 20896222 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20896694 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 20896781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20896856 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20896988 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 20897091 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20897132 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 20898762 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 20900192 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 20900204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20900245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20900642 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 20901496 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 20901592 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 20901593 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 20901609 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 20901689 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20901700 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 20901744 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20901796 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 20901863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20901890 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20901916 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20901964 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20902039 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20902084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20902211 T G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 20902259 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20902859 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20902875 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20903140 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20903200 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20903290 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20903318 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20903572 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 20903601 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 20903606 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 20903711 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 20903713 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 20903824 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20903965 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20904216 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20904311 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20904391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20904430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20904511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20904537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20904870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20906429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20906603 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 20906778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20906781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20907096 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20907110 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20907113 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20907239 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 20907344 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 20907357 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 20907437 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20907439 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 20907489 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20907608 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20907666 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20908242 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20908323 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 20908623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20908695 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20908709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20909000 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 20909170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20909189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20909362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20911194 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 20911236 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 20912358 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20914207 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 20914725 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 20914851 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20916249 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 20916295 G T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 20916364 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20916904 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20917653 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 20917697 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20917934 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 20918062 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20918164 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20918197 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20918198 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20918274 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 20918379 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 20918510 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 20918712 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20918725 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 20918759 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 20918799 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 20918873 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 20918897 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20918941 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20919765 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 20920448 G T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 2 20920631 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 2 20921145 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20921216 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20921340 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20921370 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20921449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20921658 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 20922466 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20922483 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20922673 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 20922728 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20922772 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 20922785 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20922859 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20923128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20923333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20923349 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 20923374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20923377 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20923536 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 20923555 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20923605 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 20923666 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20923743 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 20923818 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20923986 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20923988 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20924070 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 20924097 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 20924109 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 20924191 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20924391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20924512 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 20924664 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 20924773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20925547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20927039 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 20927436 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 20927783 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20927901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20928698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20928882 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20929161 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 20931135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20933562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20933857 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 20933904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20934394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20939786 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20941197 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20942134 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 20942466 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 20942497 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 20942697 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 20942817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20942977 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20942997 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20943416 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20943839 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20944096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20944103 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20944123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20944224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20944298 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20944311 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20944329 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20944364 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 20944420 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 20944484 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 20944668 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 20944777 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20944793 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 20944845 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 20944913 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 20944970 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20945017 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20945034 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 20945156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20945229 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 20945248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20945324 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20945400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20945415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20945425 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 20945426 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 20945455 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 20945560 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20945669 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20945779 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20945849 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20946097 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 20946165 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 20946168 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20946248 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20946607 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 20946832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20946849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20946883 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 20946950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20947144 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 20947157 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 20947290 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20947367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20947450 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20947477 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20947513 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20947674 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 20947872 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 20947917 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20948099 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 20948213 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20948227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20948313 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20948333 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 20948554 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20948563 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20948608 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20948692 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20948943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20949013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20949117 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20949429 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20949639 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20949689 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20949932 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 20950002 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20950198 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20951102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20951566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20951761 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20951770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20951997 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 20952147 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 20952164 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20952302 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 20952324 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 20952724 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20953007 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20953066 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20953082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20953104 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 20953199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20953213 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 20953222 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20953242 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20953249 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20953263 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20953267 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20953296 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20953339 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20953346 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20953400 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20953403 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20953448 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20953493 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 20953644 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 20953717 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 20953785 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20953789 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20953809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20954055 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 20954161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20954180 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20954190 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20954238 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20954300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20954418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20954423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20954446 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20954547 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 20954574 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20954652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20954689 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20954774 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 20954805 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 20954997 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 20955001 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 20955030 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20955137 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20955246 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 20955399 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 20955517 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20955561 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20955642 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20955672 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20955916 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20955927 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20956076 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20956092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20956170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20956206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20956513 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20956605 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20956608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20956668 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20956683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20956685 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20956700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20956713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20957211 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20957301 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20957338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20957367 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20957375 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20957603 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20957667 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20957811 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20957874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20957915 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20958008 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20958138 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20958571 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 20958618 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 20958684 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20958801 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20958874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20958974 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20959093 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20959131 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20959135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20959152 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20959292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20959377 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20959459 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20959478 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20959865 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20959886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20959893 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20959912 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20959943 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20960068 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20960256 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20960275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20960954 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20961283 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20961330 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20962147 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 20962225 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 20962271 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20962455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20962562 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 20962604 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20962885 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20963238 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20963274 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 20963550 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 20963591 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 20963716 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20964697 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 20964965 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 20965082 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20965302 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20965846 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20966027 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20966053 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20966194 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20966592 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20966701 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20966809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20966875 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20966976 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 20966977 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 20967531 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20967625 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 20967707 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20967811 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20967837 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20967899 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 20967990 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20968901 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 20969131 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 20969670 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20971281 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20972310 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20973125 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20973675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20974357 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 20974373 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 20974661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20975701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20975979 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 20976417 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20976499 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20976529 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20976603 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20976644 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20976932 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 20977253 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20977369 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20977429 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 20977493 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 20977532 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20977555 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 20977661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20977825 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 20977840 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 20978068 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20978131 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 20978186 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20978275 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20978383 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20978592 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20978671 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 20978699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20979090 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20979152 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20979275 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20979839 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 20979916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20980076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20980285 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20980287 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20980389 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20980609 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20980621 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20980945 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20982574 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20982590 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20982609 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20982610 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 20982839 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20983078 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20983326 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 20983382 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20983389 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20983477 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20983536 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 20983586 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 20983698 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 20983877 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20983898 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 20984476 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 20984636 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20984731 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20984788 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 20984871 G C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 20985156 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20985242 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20985347 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20985359 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20985373 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20985457 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 20985565 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20985712 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 20985731 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 20986237 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 20986300 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 20986399 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20986459 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20986579 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 20986740 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20986752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20986848 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20986853 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20986935 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20986958 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20986972 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20986981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20987083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20987287 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20987291 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20987498 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20987542 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20987553 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20987573 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20987684 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20987885 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20988005 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20988007 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20988021 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20988066 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20988074 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20988140 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20988474 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20988483 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20988491 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20988495 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 20988551 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 20988586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20988623 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 20988684 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 20988841 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 20988868 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20989009 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20989265 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20989415 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 20989448 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 20989630 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 20989646 G C N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 20989657 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 20989716 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 20989720 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 20989740 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 20989791 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 20989808 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20989855 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 20989871 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 20989882 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20989908 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20989942 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20990112 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20990222 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20990246 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20990306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20990366 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20990403 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20990421 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 20990447 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20990521 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 20990648 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20990662 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20990742 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20990748 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 20990821 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20990932 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20990998 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 20991043 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20991128 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20991138 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20991149 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20991286 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20991449 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20991459 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20991528 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 20991582 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 20991615 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20991623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20991742 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 20991761 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 20991806 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20991989 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 20992275 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20992716 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20992745 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 20994394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 20995033 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 21003878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21004900 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 21004936 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 21005346 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21005411 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 21005457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21005467 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 21005624 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21005681 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21005691 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21005697 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21005794 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 21005807 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21005822 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 21006495 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21006760 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21007060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21007577 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21007620 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21007726 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21007788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21007873 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 21007893 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 21008027 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21008035 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21008080 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 21008126 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21008243 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21008280 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21008374 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21008382 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 21008520 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21008654 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21008965 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21008975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21009095 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21009188 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21009301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21009311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21009361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21009434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21009552 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 21009651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21009893 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21010027 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21010080 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21010127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21010130 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21010139 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21010261 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21010320 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21010414 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21010440 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21010467 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21010531 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 21010548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21010567 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21010723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21010734 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21010893 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 21010905 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21010939 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 21010953 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 21011009 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 21012919 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 21012997 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 21013026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21013027 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21013137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21013344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21013950 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21014231 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 21014620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21014624 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21014643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21014688 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 21014808 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21014858 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 21014931 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21014972 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21015007 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21015041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21015124 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21015150 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21015190 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21015263 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21015417 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21015453 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 21015497 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 21015536 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 21015743 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21015750 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21015765 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21015804 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21015812 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 21015833 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21015857 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21015884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21015923 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21015970 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21016039 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21016091 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 21016131 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 21016147 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 21016361 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21017542 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21017595 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 21017601 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 21017608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21017671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21017706 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21017765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21017792 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 21017853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21017922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21018083 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 21018172 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21018666 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21018738 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21018746 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21018805 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 21018820 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21018855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21018921 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21018945 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21019026 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21019032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21019072 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 21019111 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21019115 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21019169 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21019198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21019390 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21019425 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21019478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21019516 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21019527 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 21019647 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21019820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21019989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21020002 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 21020127 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21020190 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21020195 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21020332 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21020350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21020400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21020427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21020433 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21021728 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 21022769 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 21024150 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21025455 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21025500 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21026497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21026964 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 21027081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21027287 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 21027318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21027322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21027341 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21027510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21027565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21027972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21028057 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 21028360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21028735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21028817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21028820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21028968 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.133333333333333 0.8 0.0666666666666667 16 14 2 12 1 2 21030402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21033757 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21033832 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 21033849 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 21034856 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21034955 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 21036036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21036248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21036705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21036844 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21039369 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21039554 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21040139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21041139 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 21041171 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 21041577 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21041711 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21041713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21041805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21041943 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 21042135 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 21042354 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 21042441 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21042495 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21042519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21042532 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21042694 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21042697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21042899 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21042988 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21043210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21043567 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21043723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21044010 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21044041 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21044095 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 21044135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21045648 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21046173 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21046258 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21046267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21046658 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21046934 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21046996 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21047173 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21049366 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21049402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21049825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21050716 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21052969 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21052987 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21053302 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21053756 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21053823 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21053901 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21053942 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21053964 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21053999 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21054014 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21054015 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21054053 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21054060 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21054095 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21054111 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21054508 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 21054523 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21054530 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 21054563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21054771 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 21055045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21055146 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21055339 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21055349 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21055350 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21055404 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21055405 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21055795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21055821 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21056065 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 21056215 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21056307 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21056310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21056337 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21056489 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21056758 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21056853 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21056872 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21056876 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21056913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21057140 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21057379 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21057389 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 21057417 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21057448 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 21057581 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21057677 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21057753 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21057789 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 21057815 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21057843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21057907 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21058189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21058233 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21058283 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21058335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21058372 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21058394 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21058456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21058677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21059333 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21059342 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21059414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21059509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21059637 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21059662 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 21060292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21060371 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21060372 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21060455 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21060498 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21060513 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 21060608 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21060807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21060837 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21060901 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21060911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21060915 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21061034 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21061224 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21061371 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 21061398 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21061411 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21061412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21061481 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21061500 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21061566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21061620 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21061715 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21061804 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21062685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21062734 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21062977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21063034 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21063038 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21063280 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21063342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21063367 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21064355 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21064534 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21064927 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 21065163 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 21065183 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 21065338 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 21065388 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21065419 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 21065608 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 21065653 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 21065772 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 21065776 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 21065790 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21065904 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 21066185 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 21066257 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 21066318 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 21066327 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 21066359 G A Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 21066378 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 21066402 A T N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 21066477 G A Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 2 21066496 C T Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 21066550 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 21066616 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 21066651 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 21066660 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 21066698 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 21066764 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21066862 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 21066863 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 21066893 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 21067085 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 21067111 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 21067135 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21067313 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21067329 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 21067365 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 21067369 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 21067382 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 21067422 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21067499 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 21067520 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21067549 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21067591 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21067681 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 21068004 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 21068074 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 21068129 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21068249 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21068275 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 21068481 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21068528 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21068592 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21068608 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 21068718 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21068806 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 21068953 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21069095 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21069202 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21069219 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21069514 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 21069565 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21069587 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21069599 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21069603 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21069730 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21069731 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21069894 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21069899 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21069985 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 21070027 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 21070076 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21070231 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 21070452 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 21070646 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 21070682 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 21070734 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 21070951 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 21071173 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 21071189 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 21072439 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 21072535 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21072670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21072691 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 21072729 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 21072924 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 21073039 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 21073040 G T N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 21073061 C A N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 21073233 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 21073274 T G N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 21073302 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 21073333 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 21073409 A C N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 21073438 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 21073459 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 21073527 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 21073625 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 21073710 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21073829 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21074234 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21074263 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21074680 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 21076277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21076321 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 21076346 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 21076390 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21077004 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21077093 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 21077230 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21079073 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21079796 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21079823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21080328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21080352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21080797 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21081115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21082791 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21082931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21083156 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21083278 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 21083279 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 21084360 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 21084497 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21084562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21087059 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21087065 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21087103 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21087136 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21087349 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 21087361 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 21087396 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 21087481 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 21087835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21088056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21088946 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 21088998 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 21089052 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 21089122 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 21089633 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21089777 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21090810 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21090958 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21091074 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21091404 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 21092079 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21092774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21093723 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21093873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21093928 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21094276 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 21095427 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 21096180 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21096209 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21096266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21096940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21096996 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21097852 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21098255 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21099503 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21099565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21099660 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21099718 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21099751 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21099948 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21099969 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21099973 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21100072 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21100105 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21100363 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 21100387 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21100433 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21100535 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21100590 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 21100694 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 21100704 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 21100941 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21101018 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21101165 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21101179 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21101218 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 21101326 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21101446 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 21101649 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 21101804 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21101808 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 21101854 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21101929 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21101942 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21102044 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 21102060 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 21102133 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21102141 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21102336 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21102433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21102826 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21102855 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21102903 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21102931 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21102947 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21102965 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21102968 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21103013 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21103032 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21103126 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 21103374 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21103421 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21103462 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21103526 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 21103548 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21103685 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21103781 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21103854 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21103996 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21104073 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 21104271 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21104318 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21104424 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21105601 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21105805 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21106229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21106686 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 21107197 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 21107380 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21108997 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21108998 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21109021 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21109090 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21109094 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21109245 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 21109280 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21109281 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 21109323 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 21109384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21109447 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 21109460 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 21109519 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 21109531 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 21109616 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21109657 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 21109682 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21109712 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21109755 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 21109867 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21109972 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21110096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21110292 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 21110327 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 21110512 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 21110669 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 21110824 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21110848 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 21110926 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21111043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21111167 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21111708 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 21111835 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21111925 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21111986 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 21113511 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21114319 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21116873 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21116978 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 21117571 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21117807 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 2 21118249 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21118825 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21118852 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 21119027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21119806 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 21119848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21120360 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21120422 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21120425 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21120544 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21120762 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21121591 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 21121646 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21121652 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 21121856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21122086 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21122158 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 21122267 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21122451 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21122452 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21122523 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 21122648 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 21123089 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21123432 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 21123669 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21123857 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21124710 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21124978 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21125250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21125550 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 21126199 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21126395 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 21126588 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 21127159 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 21127299 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 21127308 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21127313 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21127410 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21127528 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21127603 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21127638 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21127747 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 21127783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21127854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21128124 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21128204 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 21128208 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21128231 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21128264 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21128298 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21128305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21128317 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 21128421 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21128460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21128525 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 21128596 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 21128762 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21128923 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 21128924 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 21128966 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 21129001 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 21129032 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 21129045 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 21129259 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 21129307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21129455 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21129470 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21129471 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21129490 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 21129907 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21130027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21130219 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21130248 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21130277 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 21130291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21130437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21130470 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21130471 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21130507 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 21130576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21130740 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21130858 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21131119 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21131215 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 21131270 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21131320 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 21131775 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 21131834 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21132324 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21132830 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 21132992 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21133054 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21133103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21133178 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 21133360 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21133939 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21134603 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21134608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21134911 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21135321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21135477 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21135546 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21136026 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21136029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21136147 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21136357 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21136799 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21137688 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21137944 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21141610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21141748 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21142274 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21143311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21144216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21144793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21145937 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21146799 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21147531 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 21148552 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 21148747 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21149410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21149648 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21149965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21150375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21150762 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21151063 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21151094 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 21152046 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21152751 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21152757 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21152818 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21152865 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21153135 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21153168 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21153218 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21153457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21153515 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21153542 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21153624 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21153636 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21153852 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21154098 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21154194 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21154339 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21154446 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21154519 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21154527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21154785 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21154876 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21155253 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 21155670 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 21155767 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 21155835 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21155930 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21156042 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21156468 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21156945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21157400 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21158008 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21158304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21158368 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21158384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21158429 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21158460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21158466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21158967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21158998 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21159033 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21159290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21159341 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 21159442 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21159555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21159734 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 21159742 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 21159884 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21159960 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 21159962 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 21160728 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21161095 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21161158 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21161488 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21161489 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21161861 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 21161900 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 21161947 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21162119 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21162129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21162227 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 21162433 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 21162460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21162474 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21162484 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 21162500 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 21162502 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 21162576 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 21162728 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21162813 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 21162879 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 21162882 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21162897 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21162967 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21163072 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21163084 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 21163085 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 21163256 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 21163257 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 21163278 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21163304 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21163332 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21163367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21163482 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 21163548 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21163589 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21163855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21163893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21163910 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 21163966 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 21164248 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 21164446 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 21164450 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 21166591 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 21167180 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 21167224 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 21167499 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 21167570 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 21167620 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 21167670 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 21167747 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 21167766 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 21167865 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 21167956 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 21167967 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 21168029 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 21174505 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 21174525 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 21174665 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 21174680 C G N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 2 21174702 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21175004 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21175207 T G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 21175246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21175260 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21175550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21175596 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 21175602 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21175759 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 21175983 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 21176205 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21176377 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 21176516 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 21176528 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 21177510 G T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 21178560 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21178648 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 21178711 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21178739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21178770 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 21179132 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 21179216 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21179514 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21179515 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21179669 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21179703 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 21179750 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 21179782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21179897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21180050 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 21180075 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 21180101 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 21180299 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 21180487 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 21180563 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 21180656 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 21180837 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21180851 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 21180891 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21181119 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 21181163 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21181165 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 21181204 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 21181342 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 21181352 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21181367 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 21181373 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 21181460 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 21181505 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21181507 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21181853 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21181879 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 21181904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21181908 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 21181917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21181926 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 21182053 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 21182065 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21182644 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21182818 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 21182944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21182971 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 21183017 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 21183056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21183057 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 21183081 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 21183125 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 21183211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21183334 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 21183354 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 21183459 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 21183539 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 21183602 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21183607 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 21183879 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 21184039 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 21184239 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 21184505 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21184543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21184825 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 21184829 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 21185138 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 21185168 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 21185176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21185247 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 21185349 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 21185393 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21185437 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 21185583 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 21185618 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21185720 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21186080 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 21186120 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 21186372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21186499 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21186533 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 21186720 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 21186821 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 21186839 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21186984 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21187481 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21187607 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 21187889 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21188061 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 21188121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21188254 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21188262 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 21188277 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 21188376 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 21188381 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 21188429 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 21188547 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 21188593 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 21188702 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 21188786 G C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 21188844 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21189047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21189096 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21189225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21189239 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21189258 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 21189531 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 21189578 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 21189676 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21189711 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 21189788 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 21189798 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21190139 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 21190252 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 21190271 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21190382 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 21190586 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21190696 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 21190786 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 21190788 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 21190853 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 21191252 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21191266 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21191392 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 21191479 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 21191532 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 21191638 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 21192088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21192105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21192106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21192239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21192369 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21192370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21192431 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21192514 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21192666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21192701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21194026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21194414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21194827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21196103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21196697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21196841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21196888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21196889 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21197549 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21197756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21197774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21197796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21197866 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21198114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21198149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21198162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21198196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21198206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21198213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21198284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21198379 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21198404 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 21198445 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 21198763 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 21198850 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 21198906 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 21198920 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 21198929 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 21199039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21199056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21199350 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 21199510 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 21199667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21199705 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 21199736 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21199785 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 21200191 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21200205 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21200233 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 21200243 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21200270 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21200435 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 21200488 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21200506 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21200533 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21200567 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21200798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21200825 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21200857 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 21200926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21200935 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21200939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21201033 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21201223 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 21201295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21201368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21202066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21202228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21202242 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 21202483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21202491 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21202737 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 21202831 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 21203298 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21203299 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 21203754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21203881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21205769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21209503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21209862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21209907 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21209936 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21209958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21209997 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21210409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21210637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21210701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21211216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21211236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21211269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21211270 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 21211299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21211401 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21211762 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 21211868 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21211899 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 21212491 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 21212497 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 21212540 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 21212605 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 21212623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21212652 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21212721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21212883 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 21213302 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21213359 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21213480 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21213612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21213629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21213985 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21215008 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21215434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21215749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21216897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21217157 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21218491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21219712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21220904 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21221319 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21221565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21228253 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21228411 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21237483 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21238159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21239107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21239497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21242061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21242134 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 21242799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21243503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21243750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21243893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21243918 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 21245796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21245856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21247046 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 21247149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21248947 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21250585 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 21252444 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 21259000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21261458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21264802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21265154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21265869 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 21265987 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 21267565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21267886 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21268065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21268221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21268265 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 21268704 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21269856 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21272689 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21274071 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21274492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21276106 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21277087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21279537 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 21280074 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21281954 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21282315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21284542 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 21284990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21285043 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21285052 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21285274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21285425 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21285478 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21285941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21286007 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21287923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21288548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21291902 G C Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 21295241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21302477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21302575 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 21302612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21303647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21304331 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21304896 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21305680 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21307145 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21309870 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21310284 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 21310797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21310882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21311162 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21311231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21312336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21312354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21312513 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21314204 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 21314897 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21315282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21315420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21315857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21316309 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21316434 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 21316821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21318855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21318993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21321405 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21321795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21322900 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21322909 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21323323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21324569 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 21324588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21324907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21326530 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 21328796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21328813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21328825 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21328826 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21328881 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21328916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21328971 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21329098 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21329130 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 21329371 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21329519 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21329560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21329871 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21330569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21332395 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21332594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21333175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21333393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21334975 A G Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 2 21335056 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21335243 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21336031 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21336795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21338539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21339275 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21340262 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21340365 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21340600 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21340827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21340839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21340858 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 21340891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21341189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21341590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21341842 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 21342818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21342835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21342999 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 21343510 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21344417 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21344862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21345209 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 21348440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21348533 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 21349630 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21350065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21351498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21353266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21353346 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21353918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21353995 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 21355114 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 21356517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21357363 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21358038 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21358498 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21358883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21359499 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21359568 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21359687 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21359702 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21359713 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21360215 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 21360243 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21360311 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21360807 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21360842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21360995 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 21361039 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21361670 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21361762 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21361817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21361846 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21361939 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21361965 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21361983 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21362007 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21362039 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21362040 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21362088 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21362520 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 21362599 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21362632 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21362654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21362666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21362672 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21362777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21362899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21362908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21362954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21363026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21363043 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21363054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21363076 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21363136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21363368 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21363431 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21363494 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21363502 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21363522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21363531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21363543 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 21363572 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21363668 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21363921 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21363933 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21363970 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 21363977 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 21364038 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 21364063 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 21364091 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 21364092 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 21364107 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 21364424 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21364479 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21364502 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21364504 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21364554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21364563 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21364682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21364755 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21364812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21365041 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21365108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21365590 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21365650 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21365746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21365788 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21365807 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21366034 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21366315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21366406 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21366574 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 21366712 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 21366829 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21367253 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 21367286 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 21367603 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 21367707 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21367760 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21367890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21367921 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 21367944 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21367955 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21367961 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21368240 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 21368301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21368453 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21368454 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21368590 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 21368647 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21368724 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21368733 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21368748 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21368764 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21369161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21369179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21369247 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21369270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21369283 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21369358 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21369430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21369533 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21369792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21370200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21370336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21371159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21371272 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21371359 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21371372 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21371872 C T Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 21371873 A T Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 21371884 A C Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 2 21371885 T A Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 2 21371930 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21372062 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 21372188 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 21372248 G A Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 21372348 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 21372353 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 21372611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21373415 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 21373466 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 21373501 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21373658 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 21373722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21373785 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21373820 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 21373914 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 21373926 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 21373934 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 21374065 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21374066 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21374201 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21374214 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21374223 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21374260 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21374333 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 21374707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21374718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21374823 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 21374956 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21374981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21374994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21375072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21375079 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 21375103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21375122 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 21375167 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21375196 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 21375220 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 21375246 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 21375329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21375714 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21375739 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21375766 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21375778 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21375787 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21375837 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21375895 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21375933 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21376003 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21376094 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 21376226 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 21376526 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21376789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21376795 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 21376829 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 21376946 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21377230 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21377635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21377674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21377770 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21377852 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21377863 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21377872 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21377982 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 21377991 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21378041 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21378046 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21378228 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21378391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21378393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21378492 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21378626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21378645 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21378724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21378740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21378869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21379056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21380008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21380013 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21380210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21380222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21380338 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21380390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21380397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21380410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21380420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21380549 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21380622 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21380829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21381204 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21381393 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21381441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21381470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21381581 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21381961 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21382218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21382360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21382841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21382936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21382989 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21382998 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21383322 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21383347 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21384059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21384354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21384562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21384829 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21385023 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21385076 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21385362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21385711 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21385882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21385996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21386380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21386990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21387045 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21387699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21387862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21388187 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21388188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21389333 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21389437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21389492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21390034 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21390083 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21390747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21390845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21391530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21392741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21392841 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21392874 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21393899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21394212 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21394295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21395389 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 21395661 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 21395795 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21395919 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21396261 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21396303 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21396413 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21396569 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21396844 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 21396879 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21396952 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21396992 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21397029 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 21397040 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 21397041 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 21397251 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21397405 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21397480 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21397516 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21399106 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21399635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21400055 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21400179 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21401192 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21401241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21404652 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21404699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21404775 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21405446 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 21405896 G T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 21405935 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 21406144 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 21406264 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 21406385 A G Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 21407618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21407876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21407930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21408498 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21415336 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21415589 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21415996 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 21416299 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 21417471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21417913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21418567 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21418848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21419140 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21419227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21420629 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21420634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21420656 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21420692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21420713 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21420825 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21421107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21421311 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21421512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21421596 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 21421611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21421685 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 21421714 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21421777 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21421790 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21421823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21421882 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21421892 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 21421974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21422107 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 21422152 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21422259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21422297 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21422457 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21422700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21422711 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21422894 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 21422983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21423053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21423836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21424187 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21424402 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21424495 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 21424869 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21424870 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21424898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21425288 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 21425395 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21425496 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21425518 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 21425532 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 21425547 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 21425556 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21425568 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21425576 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21425792 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 21425812 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 21425844 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21425954 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21425957 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21425977 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21425981 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 21426054 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21426119 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21426134 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21426139 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21426151 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 21426159 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 21426171 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21426687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21427065 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 21427309 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21427358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21427703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21428023 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21428288 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21429136 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21429212 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21430371 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21431152 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21431987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21432704 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 21432723 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21433220 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21433453 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21434215 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 21434497 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 21434950 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 21435358 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21435842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21436747 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 21437559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21437929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21437999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21438228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21440409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21440667 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21440731 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21440808 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21440842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21440956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21440962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21440974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21440987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21441169 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 21441199 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 21441230 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21441287 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21441328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21441775 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21443374 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21443429 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21445264 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21445566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21447065 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21447100 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21447798 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21448402 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21448593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21449380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21449738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21449776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21450715 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21451043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21451857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21452945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21454510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21455229 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21455327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21455452 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21455493 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 21455551 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21455750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21455805 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 21456217 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21456313 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 21456532 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 21456551 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 21456851 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21456865 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21456894 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21456944 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21457017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21457103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21457158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21457180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21457219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21457311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21457366 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21457385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21457414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21457426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21457492 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 21457494 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21457543 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21457559 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 21457583 C A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 21457622 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21457744 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21457788 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21457808 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21457841 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21457913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21457951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21458068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458151 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 21458212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458354 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21458369 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21458372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458461 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21458521 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21458531 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21458564 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21458584 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21458645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458794 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21458807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21458944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459156 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21459329 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21459453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459479 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459870 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21459946 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21460024 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21460060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21460167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21460169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21460272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21460280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21460361 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21460445 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21460479 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21460525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21460591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21460668 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21460683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21460755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21460842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21460912 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21461048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21461061 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21461100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21461110 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21461340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21461341 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21461378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21461387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21461406 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21461412 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21461451 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21461639 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21461660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21461670 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 21461679 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21461703 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21461759 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21461885 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21461931 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21462107 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21462190 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 21462253 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21462268 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21462327 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21462341 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 21462420 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 21462425 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21462600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21462627 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21462674 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21462679 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21462739 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21462831 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21462861 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 21462937 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21462959 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21463089 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21463115 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21463133 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 21463153 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21463162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21463166 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21463182 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21463257 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21463261 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21463311 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 21463377 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21463390 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21463418 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21463429 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21463527 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21463529 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21463545 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21463551 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 21463558 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21463600 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21463601 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21463656 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21463759 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21463765 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21463865 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 21463880 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21464035 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 21464051 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21464081 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21464102 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 21464115 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21464148 C G N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 21464181 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 21464258 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 21464340 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21464382 G A Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 21464388 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 21464393 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21464410 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 21464484 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 21464607 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 21464646 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21464733 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 21464749 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 21464783 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 21464790 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21464833 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21464988 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21465062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21465218 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21465246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21465279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21465367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21465380 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21465396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21465460 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21465474 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21465593 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21465674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21465696 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21465740 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21465876 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21465896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21465929 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 21466234 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21466235 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21466308 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21466309 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21466355 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21466386 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21466708 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21466899 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21467432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21467858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21468285 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21468380 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21468470 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21468680 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21468711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21468842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21468854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21468920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21468953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21468994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21469386 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21469538 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21469630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21469661 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 21469956 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21469995 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21470064 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21470173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21470183 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21470224 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21470270 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 21470751 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21470795 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21470902 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21471030 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 21471158 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 21471172 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21471194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21471204 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21471241 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21471319 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21471339 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21471361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21471382 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21471652 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21471658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21471725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21471778 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21472105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21472183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21472273 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21472451 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21472602 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 21472729 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21472797 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21472987 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21473501 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21475628 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 21475632 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 21475662 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 21475892 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 21476330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21476695 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21477029 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 21477098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21477162 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 21477270 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 21477711 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21477737 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 21477771 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 21477779 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 21477782 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 21477864 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 21477870 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 21477904 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 21477918 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21478009 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 21478074 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 21478114 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 21478260 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 21478339 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 21478449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21478658 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 21479442 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 21479652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21479711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21479803 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 21479804 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 21479848 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 21479854 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 21479905 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 21479975 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 21480568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21481018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21481066 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21481951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21483609 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 21484251 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21484313 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 21486434 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21487366 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 21487748 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 21488164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21488221 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21488336 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21488618 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21489059 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21490474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21490682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21491081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21492022 C A Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 21492301 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21492376 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21493647 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21493882 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 21494025 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 21494297 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 21494334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21494359 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21494911 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21495312 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21495421 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 21495585 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21496182 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21496398 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 21496725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21496787 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 21496832 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 21496914 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21496975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21497231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21497404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21497871 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 21497911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21497961 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 21498054 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 21498219 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21498315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21498316 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 21498553 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 21498583 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21498598 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21498723 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21498750 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21498902 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21498927 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21499383 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21499440 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21499447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21499786 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21499795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21499812 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21499845 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21499856 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21499885 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21499906 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21500018 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21500125 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21500134 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 21500157 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21500175 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21500389 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21500582 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21500654 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21500663 T G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 21500685 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21500787 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 21507910 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21507942 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21508016 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21508084 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21508125 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21508134 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21508236 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21508272 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 21508413 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 21508562 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21508607 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21508767 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21510074 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 21510135 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 21510208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21510209 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21510219 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21510222 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21510238 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21510306 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21510327 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21510416 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21510470 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 21510583 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 21510721 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21510746 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 21510758 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 21510761 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21510806 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 21511435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21511492 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21511509 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21511577 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21511683 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21511808 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21512148 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21513459 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 21513739 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 21513774 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21513791 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 21513825 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21513881 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 21513908 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21513935 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21513940 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21513968 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21513975 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21514016 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21514094 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21514098 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21514169 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21514253 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21514588 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21514615 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21514779 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21514912 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21514961 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21515000 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21515030 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21515149 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21515183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21515643 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21517528 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21518284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21524936 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21525230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21525587 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21525616 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21526013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21526202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21526334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21526369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21526410 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21526413 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21526428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21527109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21527180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21527223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21527327 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21527335 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21527385 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21527400 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21527497 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 21527554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21527882 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21528199 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21528212 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21528323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21528333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21528580 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21528732 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21528799 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21529230 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21529422 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21530808 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21531221 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21531601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21531614 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21532488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21532909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21532916 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21533229 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 21533293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21533431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21533983 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 21534474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21534526 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21534778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21534793 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21534888 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21535072 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21535157 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21535315 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21535351 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21535488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21535512 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21535625 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21535770 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21535848 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 21536109 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 21536163 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 21536181 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21536216 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 21536405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21536598 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21536737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21536841 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21536846 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21536917 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21536993 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21537078 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21537194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21537765 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21537846 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21537894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21538114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21540327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21540974 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21542756 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 21553815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21555330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21557112 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 21557378 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 21557643 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 2 21559037 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 21559451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21559467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21559718 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21559729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21559860 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21559875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21559932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21560037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21560102 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 21560227 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 21560255 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 21560273 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21560283 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21560364 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21560402 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21560524 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21560536 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 21560571 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21560624 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 21560765 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 21560972 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21560985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21561070 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21561109 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21561132 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21561218 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21561284 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21561356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21562030 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21563457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21564105 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 21566034 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21566091 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21569971 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21570679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21570867 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21571641 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21571789 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21572548 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21574841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21574921 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 21579332 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21579567 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21584037 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21586771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21586796 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21587744 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21588129 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21588152 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21588622 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21588633 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21588638 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21588651 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21588761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21589134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21589319 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21589387 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21589401 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21589436 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21589448 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21589487 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21589504 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21589764 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21589771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21589837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21589852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21589876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21590071 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21590179 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21590355 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21590496 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21590550 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21590685 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21590851 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 21591171 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21591225 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 21591476 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 21591649 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21591712 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21591727 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21591823 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21591869 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21591971 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21592096 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21592215 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 21592320 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21592370 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21592445 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21592544 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21592552 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21592695 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21592748 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21592825 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21592845 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21592967 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21593015 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21593064 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21593077 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21593087 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21593276 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21593357 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21593700 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21593759 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 21593770 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21593782 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21593868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21593877 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21593913 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21593958 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21593978 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21594000 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21594018 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21594044 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 21594059 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 21594095 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 21594363 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21594388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21594603 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21594711 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21594858 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21595601 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21595815 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21596116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21596155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21596195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21596229 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21596250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21596309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21596453 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21596528 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21596581 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21596675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21596746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21596766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21596812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21596993 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 21597039 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 21597245 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 21597278 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21597348 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 21597646 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21597825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21598150 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21598332 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21598883 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21599521 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21599549 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21599595 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21599687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21599709 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21599742 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21599772 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21600319 G A N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 21600593 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21600780 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 21600903 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 21600975 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21601107 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21601157 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21601261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21601262 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21601520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21601980 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 21602210 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21602671 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21602827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21603381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21603398 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21603535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21605118 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21606683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21606897 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21607630 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21609044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21609367 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21613297 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 21613679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21614346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21614588 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21614628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21614716 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 21615449 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21615511 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 21615720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21616303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21616345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21617153 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21617343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21618057 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21618109 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21620159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21620412 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21622039 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21622092 A T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 21622281 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 21622467 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 21623401 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21623742 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21625440 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21626533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21627991 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21628078 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 21629610 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21631396 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21631743 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 21633469 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21633508 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21636018 G A Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 2 21636087 T G Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 21636175 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 21636517 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21636894 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21645319 A T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21647544 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21648655 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21648685 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21648687 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21650759 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21651119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21651344 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21651977 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21652010 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21652046 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21652092 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21652148 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21652370 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21652409 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21652694 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21653040 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 21653073 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 21653210 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21653278 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21653902 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 21657796 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 21658063 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21658141 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 21658669 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21658828 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21658896 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21658897 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21659022 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21659340 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21659630 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21659640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21659966 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21661160 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 21661305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21661433 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 21661697 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21661795 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21661819 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21661875 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21661948 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 21661999 C G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 21662483 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21662502 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 21664590 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 21665511 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21666650 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 21666667 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 21666783 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 21667402 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21667406 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21667458 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21667680 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21667689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21667747 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21667851 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21667873 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21667883 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 21668108 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21668149 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21668823 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21669607 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21669616 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21669715 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21670105 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21670126 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21670152 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21670720 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21670889 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21670979 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21671128 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21671147 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21671369 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21671452 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21671523 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21671893 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 21671959 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21672530 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 21672682 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21672702 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21672738 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21672815 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21673090 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21673315 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21673395 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21673820 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21674127 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21674309 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21674349 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21674643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21674663 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 21674808 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21675054 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21675080 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21675205 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21675345 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21675472 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21675520 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21675562 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21675790 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21675809 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21675873 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21675949 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21675967 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21675968 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21676029 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21676074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21676136 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21676141 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21676208 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21676223 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21676352 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21676604 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21676679 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21676764 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21676793 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21676823 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21677002 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21677015 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21677056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21677062 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21677206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21677212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21677347 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21677520 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21677540 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21677660 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21677756 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21677825 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21678066 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21685291 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21685358 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21685534 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21685725 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21685827 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21685899 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 21685923 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21685925 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21686444 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 21687169 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21687525 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21687782 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21687839 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21687876 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 21687904 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 21688443 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21688470 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21688662 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 21688795 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 21689112 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 21689204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21689272 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21689382 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21689493 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 21689744 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 21689809 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21689919 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21689945 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21690406 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 21690964 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21690975 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21691092 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21691101 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 21691139 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21691278 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 21692188 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 21692572 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21692575 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21692585 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21692643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21692659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21693709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21693778 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21693833 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 21693892 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21693898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21694060 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 21694287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21694431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21694561 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21694597 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21695059 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 21695070 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21695318 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21695688 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21695728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21695850 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21695906 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21695919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21696000 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21696117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21696151 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 21696212 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21696267 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21696307 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21696481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21696491 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21696580 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21696615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21696680 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21696740 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21696900 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21697128 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21697226 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21697227 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21697329 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21697334 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 21697518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21697592 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21697770 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21697866 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21697914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21698036 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21698041 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 21698049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21698098 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21698217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21698303 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21698370 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21698716 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 21698801 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21699076 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21699323 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21699819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21699948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21700030 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21700034 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 21700549 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21700764 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21700935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21700972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21700978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21700994 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21701016 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21701036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701105 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21701191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701259 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21701276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701510 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701530 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701570 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21701580 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21701605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701649 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21701834 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21701842 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21701858 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21701890 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21702051 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21702114 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21702259 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21702281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21702381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21702401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21702436 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 21702584 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21702756 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21703116 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21703236 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21703265 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21703391 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21703423 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21703479 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 21703565 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21703810 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21703921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21703963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21704031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21704036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21704089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21704217 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 21704382 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21704390 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21704571 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 21704942 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21705003 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21705006 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21705864 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21706006 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21706026 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21706185 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 21706232 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21706605 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21706696 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21707073 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 21707129 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 21707145 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21707266 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 21707289 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21707378 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21707547 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21707657 C A Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 21707891 A T Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 21707915 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 21708028 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 21708205 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21708464 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21708644 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 21708810 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 21708921 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21708948 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 21709110 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 21709375 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 21709487 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 21709605 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 21709905 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 21709925 G C Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 21710144 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21710462 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 21710466 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 21710478 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 21710652 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21710938 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 21710963 A C Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 21710979 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 21710980 A G Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 21711255 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 21711275 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21711318 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 21711545 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21711550 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21711556 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21711602 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 21711798 T G Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 21711820 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 21711916 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 21712011 A T Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 21712014 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 21712028 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 21712053 G T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 21712157 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21712230 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21712362 G T Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 21712365 C G Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 21712520 A G Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 21712623 A G Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 21712753 C G Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 21712763 T A Y N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 21712768 A G Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 21712876 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21713061 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 21713169 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 21713237 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 21713313 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 21713336 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 21713344 A G Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 21713386 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 21713467 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 21713813 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21713841 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21714039 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21714468 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21714472 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21714630 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 21714748 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21714889 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21714943 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21714959 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21715070 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21715092 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21715198 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21715243 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21716329 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21716377 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21716411 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21716426 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21716459 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21716706 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 21716750 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21716839 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21716869 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21717392 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 21717642 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 21717789 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21717834 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21717894 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 21718400 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21718449 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21718627 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21719025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21719137 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21719292 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 21719889 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21720057 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21720220 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 21721336 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 21721511 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21721918 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21722088 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21722214 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21722230 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21722665 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21722692 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21722757 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21722843 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21722860 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21722949 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 21725374 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 21725425 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21725467 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21725513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21725556 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21725674 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21725702 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21725708 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21725845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21725938 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21726016 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21726033 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21726088 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21726117 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21726144 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21726149 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 21726155 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21726163 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726297 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726321 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726401 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21726420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21726456 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21726541 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21726589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21726625 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 21726628 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 21726651 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21726670 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726697 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726709 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726715 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21726729 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726748 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21726815 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726841 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726843 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726928 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726941 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21726948 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21726976 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21727080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21727126 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21727205 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21727225 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21727292 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21727349 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21727389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21727400 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21727480 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21727669 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21727843 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21728007 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21728047 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21728073 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21728114 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21728176 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21728198 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21728224 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21728392 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21728422 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21728433 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 21728475 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21728482 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21728564 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 21728579 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21728611 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21728628 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 21728669 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 21728706 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21728722 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21728723 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21728791 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21729128 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21729158 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21729200 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21729227 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21729250 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21729253 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21729267 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21729475 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 21729499 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 21729503 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21729763 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21730223 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21731846 T A Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 21732688 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21733041 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21733202 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21733227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21733229 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21733296 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21733561 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21733602 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 21733655 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21733670 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21733705 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21733756 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 21733818 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21733882 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21734393 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21734396 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21734412 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21734494 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21734755 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21735245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21735766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21735874 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21735898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21735918 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21736322 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 21736350 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21736371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21736844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21737573 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21737613 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21737692 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21738429 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21738467 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21738607 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21738636 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21738743 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21738752 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21739208 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21739843 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21740195 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21740291 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21740339 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21740361 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21740403 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21740541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21740699 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21740847 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21741025 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21741417 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21741733 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21742517 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21742729 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21743040 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21743728 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21744327 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21744468 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21745267 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21745328 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21745355 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21745370 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21745442 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21745580 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 21745993 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21746017 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21746370 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21746378 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21746863 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21747369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21747859 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21748060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21748378 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21751688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21752524 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21753276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21753547 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21759436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21759692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21760034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21760077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21760425 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21760450 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21761086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21761349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21762140 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21762476 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21762862 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21763941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21764452 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21764492 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21764530 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 21764596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21764928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21765398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21767400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21771109 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21771377 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21773091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21773136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21773853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21774165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21774540 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21774968 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 21775058 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21775608 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 21777114 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21777490 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21777497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21777863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21778817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21778843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21779611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21780414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21781705 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21782147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21783215 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 21783772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21784163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21784398 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21784575 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21784813 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21785526 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21785647 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21786338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21787898 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21789377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21789721 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21789765 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21789946 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21790047 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21790172 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21790398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21795226 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21795292 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21795497 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21796242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21796423 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21798679 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 21798808 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21799070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21799554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21800566 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21802528 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 21804076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21804173 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21804998 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21805297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21806385 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21806949 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21807357 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21807771 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21807962 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21808014 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 21808294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21808361 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 21809474 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 21810384 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 21810526 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 21811088 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 21811137 A G Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 21813214 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21813408 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 21813495 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 21815466 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 21816077 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21816136 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21816203 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21817217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21817440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21819187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21820320 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 21821088 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21821123 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21821197 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 21823454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21825376 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 21828078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21828767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21829185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21830982 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21832098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21833803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21836389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21836530 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21836993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21838225 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21838264 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21838503 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 21838621 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21838694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21839033 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 21839099 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 21839122 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 21839220 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21839296 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 21839425 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 21839542 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21839580 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21839696 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21839819 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21839870 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21840371 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21840455 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21840983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21844298 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21845046 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21845445 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 21845447 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 21845471 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 21845480 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 21846600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21846814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21846926 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21847141 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21847216 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21848746 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21848753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21848787 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21849206 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21849292 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21849314 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21849947 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21850034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21850121 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21850243 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21850448 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21850451 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21850577 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21850622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21850777 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21850788 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21850955 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21851155 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21851317 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21851391 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21851647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21851701 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21851884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21851920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21851967 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21852259 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21852307 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21852620 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21852874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21852911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21852922 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21852928 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21852982 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21853078 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21853105 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21853335 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21853440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21853552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21853576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21853599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21853622 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21853687 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21853915 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21854315 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21859302 G A Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 21859307 A C Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 21859401 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21859410 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21859423 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21859513 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21859563 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21859697 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21859785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21859918 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21859941 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21860028 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21860029 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21861219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21861252 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21861268 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21862657 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 21862743 T A Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 21863106 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21863218 G C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 21863702 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21863803 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21863946 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21863968 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21864128 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21864149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21864536 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21864601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21864801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21864812 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21864836 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21864896 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21864952 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21865216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21865432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21865438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21865664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21865665 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21865969 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21865980 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21866155 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21866203 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21866572 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21866842 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21866873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21867487 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21867540 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21867755 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21868039 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21868491 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21868499 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21868682 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21868838 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21868915 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21868937 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21868977 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21868982 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21870081 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 21870098 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 21870195 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21870284 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 21871526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21871618 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21871631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21871632 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21871810 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 21871831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21871850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21871899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21871912 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21872086 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21872130 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 21872162 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21872295 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21872296 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21872317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21872324 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21872369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21872412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21872430 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21872495 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21872594 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21872607 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21872617 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21872640 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21872655 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21872735 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21872757 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21872802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21872813 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21872833 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21872843 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21872844 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21872856 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21872882 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21872894 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 21873027 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873200 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873251 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21873350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873475 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21873587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21873802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21875237 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21875256 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21875259 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21875297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21875304 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21875418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21875474 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21875505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21875619 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21875797 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21875859 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21875873 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21875921 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21875963 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21876063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21876111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21876184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21876188 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21876279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21876375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21876505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21876530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21876568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21876710 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21876963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21878032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21878071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21878145 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21878400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21879788 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21880858 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21881089 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21881102 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21882000 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21882205 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21883512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21884578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21884594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21885334 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 21887101 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21888627 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21888932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21889565 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21889765 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21890011 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21890118 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21890168 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21890441 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21890657 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21891363 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21891382 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21892032 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 21892912 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 21893224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21893335 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21893510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21893645 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21893722 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21894132 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 21895702 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 21896284 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21898153 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 21898258 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21898827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21899416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21900353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21900710 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21900752 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21900809 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21901108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21901245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21901254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21901304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21901631 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21901653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21901873 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21902007 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21902096 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21902320 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21902398 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21902416 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21902419 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21902508 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21902516 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21902617 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21902677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21902687 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21902758 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21902845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21902860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21902927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21902933 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21902950 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21903109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21903235 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21903412 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21903453 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21903456 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21903482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21903486 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21903564 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21903606 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21903656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21903696 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21903709 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21903789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21903852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21904049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21904067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21904164 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21904209 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21904230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21904240 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21904243 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21904257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21904293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21904373 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21904390 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21904431 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21904534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21904572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21904589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21904646 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21904662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21904711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21904713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21904733 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21905128 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21905134 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21905141 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21905210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21905253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21905269 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21905275 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21905295 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21905326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21905460 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21905474 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21905487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21905489 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21905615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21905649 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21905827 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21905933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21905970 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21906132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906244 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906272 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21906588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906610 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906661 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21906915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21907017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21907076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21907099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21907203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21907224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21907252 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21907262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21907269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21907273 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21907385 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21907424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21907436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21907553 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 21907568 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21907659 A T Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 21907830 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21907912 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21907952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21908559 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21908594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21908686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21908748 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21908766 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21908801 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21908824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21908899 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21908969 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 21909028 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21909257 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21909274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21909322 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21909394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21909517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21909636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21909641 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21909740 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21909815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21910081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21910582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21910670 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21910797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21910805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21910979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21911154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21911269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21911353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21911495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21911882 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21912023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21912077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21912152 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21912171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21912485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21912927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21913000 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21913944 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21914033 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21914197 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 21914243 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21914249 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 21914427 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21915064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21915315 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21915413 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21915480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21915530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21915813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21916842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21916921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21916953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21916976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21917037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21917053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21917336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21929245 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21929545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21930083 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21930100 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21930258 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21930688 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21931364 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21931571 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 21931681 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21931761 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21931794 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21932357 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 21932685 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 21932897 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21933536 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21933615 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21934097 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21934323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21934626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21935174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21935690 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21936252 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21937005 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 21937469 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21937805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21937955 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21938257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21939496 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21939712 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21940022 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21940240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21940626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21940796 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21940857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21941021 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21941238 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21941242 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21941480 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21941591 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21941703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21941749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21941785 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21941848 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 21941866 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21941938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21941951 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21942029 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21942044 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21942056 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21942075 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21942132 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 21942205 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21942206 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21942258 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 21942384 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21942458 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21942544 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21942564 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21942623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21942849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21942891 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21942898 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21942926 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21942950 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21943051 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21943081 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21943099 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21943188 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21943204 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 21943215 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21943307 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21943344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21943439 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21943465 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21943557 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21943560 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 21943571 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21943662 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 21943668 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 21943680 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 21943757 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21943774 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21943813 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21943928 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21943934 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21944003 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21944187 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21944326 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21944398 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21944407 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21944413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21944433 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21944443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21944470 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21944485 C T Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 21944586 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 21944663 C T Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 21944755 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 2 21944850 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 21944873 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21944896 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21945015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21945188 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21945224 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21945424 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21945426 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21945446 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21945531 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21945701 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21945716 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21945756 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21945955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21946044 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21946295 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21946307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21946385 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 21946401 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 21946493 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21946660 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21946666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21946731 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21946846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21946848 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21946885 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21947036 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21947038 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21947067 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21947182 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 21947206 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 21947251 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21947283 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 21947286 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21947443 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21947505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21947548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21947576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21947628 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21947897 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21947909 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21947978 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21948236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21948410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21948722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21948723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21949066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21949446 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21949453 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21949471 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21949684 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21949731 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21949746 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21950464 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21950577 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21950850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21950904 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21951192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21951221 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21952080 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 21952338 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21952445 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21952488 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21952567 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21952699 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21952814 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21952991 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21953256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21953376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21953459 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21953535 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21953998 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21954092 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21954207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21954271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21954358 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21954670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21954714 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21954808 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21955033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21955140 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21955221 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21955358 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 21955494 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21955520 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21955534 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21955545 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21955574 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21955594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21955605 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 21955703 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21956489 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 21956555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21956634 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21956686 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21958050 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21959161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21959721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21960298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21960817 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21963411 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 21963491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21963929 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21964557 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21964735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21965055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21965266 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21966081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21966745 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21966779 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21966821 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21966883 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21967087 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21967125 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21967433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21967447 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 21967704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21967848 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 21967884 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 21967889 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 21968640 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 21968776 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21969306 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21969432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21970073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21970506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21971064 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21971169 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 21977856 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 21977880 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 21977942 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 21977979 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 21978004 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 21978014 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 21978057 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 21978140 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21978212 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21978218 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21978271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21978280 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 21978289 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21978364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21978377 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21978390 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21978554 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21978619 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 21978620 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 21978757 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21978898 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21979306 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21979979 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21980013 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21980098 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 21980299 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21980428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21980647 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21980673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21980701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21980762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21980934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21980951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21981131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21981230 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21981553 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 21981623 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 21981653 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 21981724 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 21981741 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21981857 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21982038 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21982200 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21982238 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21982486 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 21982612 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21982780 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21982850 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21982859 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21982927 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21983029 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 21983165 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 21983707 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21983952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21983997 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21984246 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21984407 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21984418 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21984433 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21984445 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21984472 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21984473 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 21984498 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21984503 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21984509 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21984531 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21984535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21984543 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21984597 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21984641 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21984839 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21985131 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21985159 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 21985390 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 21985473 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21985977 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 21986011 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 21986012 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 21986056 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21986153 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21986169 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21986203 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21986205 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21986336 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21987118 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 21987143 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21987226 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 21987348 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 21987439 T A N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 21987442 A T N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 21987469 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 21987493 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 21987533 C G N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 21987593 C A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 21987627 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 21987650 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 21987764 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 21987776 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 21987938 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 21988023 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21988859 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 21988873 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 21989011 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21989082 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21989123 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21989890 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 21989994 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 21990096 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 21990122 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 21990876 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21990911 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21990918 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21990953 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21990969 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21991016 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21991091 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21991106 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 21991110 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21991228 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21991345 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21991403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21991433 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21991436 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 21991631 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21996479 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 21996512 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 21996526 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 21996586 T A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 21996858 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 21996929 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 21997083 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 21997107 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 21997115 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 21997133 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 21997236 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 21997250 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 21997326 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21997430 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 21997567 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21997618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21997695 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21997707 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21997713 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21997767 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21997877 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21997922 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21997947 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21997958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 21997969 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21998099 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21998122 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 21998125 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 21998145 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 21998178 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22005020 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22005142 T C N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 22005149 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 22005323 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 22005608 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 22005686 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22005787 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22005908 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22005984 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22006076 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22006102 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22006159 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22006204 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22006211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22006226 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22006246 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 22006305 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22006368 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22006384 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22006461 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22006468 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22006512 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 22006516 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 22006620 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22006668 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22006682 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22006741 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22006878 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22006920 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22007011 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22007019 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22007029 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22007050 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22012872 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22012935 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22013006 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22013042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22013046 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22013060 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22013156 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22013164 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22013207 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 22013266 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 22013281 G C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 22013307 G T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 22013462 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 22013596 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22013605 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22013686 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22013732 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22015657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22015695 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22015787 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 22016021 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22016082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22016090 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22016098 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22016124 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22016135 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22016259 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22016418 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22016436 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22016457 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22016497 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22016569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22016616 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22016641 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 22016803 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 22016852 A C N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 22017010 A C N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 22017075 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 22017148 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 22017159 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 22017205 T G Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 22017233 A C Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 22017420 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 22017438 T G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 22017545 T A Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 22017551 A T Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 22017561 A C Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 22017580 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 22017615 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22017757 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 22017769 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22017933 G A N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 22017956 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 22017972 T A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 22017980 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 22017983 G A Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 22018059 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 22018077 G C N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 22018643 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22018723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22018848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22020519 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22020537 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22021930 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22022149 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22022710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22022886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22023042 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 22025358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22025960 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22026062 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22026112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22026214 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22028130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22029182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22029348 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22029864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22030987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22031813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22034760 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22034991 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22035180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22035672 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22035739 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22036002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22036141 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22036142 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22038167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22038375 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22040493 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22042560 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22046564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22048683 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22051068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22051272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22052745 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22053696 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22053732 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22053893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22054004 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22054012 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22054033 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22054037 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22054146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22054181 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22054201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22054744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22055143 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22055264 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22055345 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22055813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22055842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22055848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22055901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22056184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22056186 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 22056312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22056359 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22056406 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22056460 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22056571 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 22056649 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 22056652 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22056731 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22056746 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22056823 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 22056834 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22056860 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22057042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22057218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22057336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22057419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22057644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22057668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22057681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22057802 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22057834 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22057878 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22057932 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22057950 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22058116 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22058125 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22058186 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22058268 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 22058563 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 22058566 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 22065033 G A Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 22065038 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 22065125 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22065235 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22065302 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22065445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22065587 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22065650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22065921 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22065958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22066012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22066335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22066513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22066585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22066633 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22066660 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22066688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22066792 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22066958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22067127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22067179 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22067226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22067231 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22067277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22067298 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22067477 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22067486 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22067581 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22067609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22067704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22067764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22067777 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22067961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22068039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22068092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22068181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22068189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22068219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22068240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22068441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22068475 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22068559 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22068707 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22068912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22068931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22068998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22069077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22069124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22069145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22069175 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22069188 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22069191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22069209 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22069282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22069327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22069608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22069703 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22069772 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22070131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22070152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22070160 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22070236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22070276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22070388 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22070543 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22070660 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22070661 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22070694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22070702 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22070882 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22070947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22070989 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22070996 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22071016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22071171 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22071214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22071297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22071454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22071495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22071511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22071912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22071914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22072197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22072321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22072439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22072512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22072628 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22072859 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22072909 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22072913 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22073181 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22073186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22073578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22073593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22073596 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22073652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22073673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22073959 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22073962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22073981 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22074006 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22074016 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22074097 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22074125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22074162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22074176 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22074180 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22074194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22074276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22074306 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22074577 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22074629 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22074972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22077622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22077899 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22078043 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22078316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22078668 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22078681 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22079321 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22080022 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22087537 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22088355 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22088700 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22089116 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 22089124 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22089302 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22089735 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22089856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22090132 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22090603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22091297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22091771 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22091813 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22091821 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22091869 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22091963 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22092060 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22092213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22092261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22092398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22092426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22092459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22092465 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22092498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22092544 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22092595 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22092597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22092615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22092626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22092642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22092752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22092777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22092840 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22092870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22092883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22092887 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22092915 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22092999 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22093018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22093042 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22093069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22093377 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22093430 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22093514 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22093515 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22093599 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 22093759 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22093771 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22093901 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22094001 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22094018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22094078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22094176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22094238 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22094274 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22094311 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22094317 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22094329 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22094441 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22094472 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22094473 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22094492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22094529 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22094552 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22094557 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22094775 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 22094826 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22094951 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 22095241 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 22095263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22095309 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 22095353 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 22095358 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 22095598 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 22095679 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 22095757 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 22095875 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 22095889 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 22095892 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 22095917 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 22095922 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22095973 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22095994 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22096038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22096097 A T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22096199 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22096296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22096310 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22096323 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22096337 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22096367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22096409 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 22096419 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22096454 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 22096464 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22096662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22096738 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22096759 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22096804 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22097328 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22097469 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22097510 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 22097533 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 22097613 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 22097929 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22097940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22097965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22098062 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22098091 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22098094 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22098186 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22098377 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22098547 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22098581 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22098638 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22098655 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22098680 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22098697 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22098734 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22098737 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22098755 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22098774 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22098859 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22098930 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22098966 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22099130 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 22099131 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22099189 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22099371 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22099452 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22099469 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22099486 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22099791 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22099825 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22099873 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22099929 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22099977 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 22099996 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22100006 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22100014 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22100069 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 22100073 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 22100092 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22100094 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 22100103 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 22100110 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 22100211 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22100344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22100365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22100418 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22100627 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22100689 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22100780 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22100820 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22100845 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22101090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22101313 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22101436 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22101696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22102372 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22102954 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22102958 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22103097 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22103290 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22103472 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 22103750 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22104106 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22104803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22105291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22106370 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22106724 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22107135 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22107166 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22107168 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22107603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22107740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22108115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22108385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22108415 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22108887 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22109581 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 22109605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22111240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22111773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22112067 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 22112681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22112901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22112995 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22113369 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22113739 G A Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 22113783 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22113849 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22114149 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 22115162 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 22116470 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22116567 A T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 22116735 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 22116860 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22117907 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22118036 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22118264 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22118296 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22118438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22118654 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22119350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22119423 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22119690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22119730 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22119766 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22120253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22120527 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22121048 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22121213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22121874 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 22122048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22122366 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 22122449 G C Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 22122532 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22122541 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22122705 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 22122769 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 22122793 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22122873 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22122890 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22123356 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 22123685 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22124055 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22124159 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22124554 G C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 22124578 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22124666 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22124690 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22125289 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22125359 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 22125446 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22125552 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22125597 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22125919 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22125975 G C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 22126308 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22126464 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22126650 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 22126651 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22126739 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22126806 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22126839 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 22126940 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22130011 G A Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 22130028 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 22130046 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 22130100 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 22130107 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 22130119 C G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 22130120 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 22130203 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22130294 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22130305 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 22131266 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22133204 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 22133268 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22133279 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22133528 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22133633 G C Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 22133735 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22133940 G T Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 22134407 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22134517 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22134548 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22134558 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22134587 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22134839 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22135008 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22135191 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22135201 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22135319 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22135486 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22135552 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22135785 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22135849 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 22135984 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22136029 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22136303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22136368 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22136429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22136709 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22136719 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22136749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22137039 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22137070 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 22137142 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22137355 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22137458 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22137466 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22137577 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22137625 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22138234 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22138246 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22138382 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22138457 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22138465 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22138507 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22138674 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22138770 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22139005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22139104 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22139152 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22139159 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22139341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22139350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22139368 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22139389 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22139412 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 22139438 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22139492 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22139525 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22139535 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22139566 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22139643 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22139654 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22139659 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22139677 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22139756 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22139770 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22139782 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22139816 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22139876 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22140067 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22140257 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22140277 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22140297 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22140391 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22140409 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22140509 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22140529 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22140648 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 22140729 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22140747 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 22140782 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22140792 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22140898 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22140980 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22141032 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 22141072 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22141075 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22141096 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22141113 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 22141116 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 22141227 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22141243 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22141264 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22141288 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22141323 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22141348 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 22143773 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22143815 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22143890 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22143907 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22143953 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144016 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144065 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144104 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144151 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22144175 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144178 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144189 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22144191 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22144204 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22144254 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144320 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144343 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144474 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144489 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22144587 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22144597 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22144610 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22144625 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144685 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144717 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144856 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144888 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144893 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22144980 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22145073 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22145290 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 22145303 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22145349 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22145353 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22145425 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22145527 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22145616 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22145643 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22145699 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22145708 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22145740 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22145801 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22145824 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22145912 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22146062 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22146129 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22146209 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22146357 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22146374 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 22146538 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22146708 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22146966 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22146980 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22147035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22147322 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22147353 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22147568 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22147971 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22148252 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 22148531 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22148574 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 2 22149146 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 22149178 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 22149180 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22149249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22149294 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 22149355 A G Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 22149357 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22149423 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22149445 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22149547 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22149582 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22149653 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22149686 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22149857 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 22149886 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22149922 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22149948 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22149973 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22150077 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22150154 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22150184 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22150240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22150249 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 22150271 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22150470 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 22150485 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22150647 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22150650 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22150667 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22150729 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 22150768 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22150796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22150845 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 22150877 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22150886 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22150893 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22150907 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22150967 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22151017 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 22151074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22151076 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22151150 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22151172 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 22151265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22151366 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22151825 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 22151878 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22151927 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 22151940 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 22152151 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22152571 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22152585 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22152642 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22152683 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22152847 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22154572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22154692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22155318 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22155643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22155677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22155801 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22156028 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22156241 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 22156287 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22156985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22158299 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22159007 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 22159991 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22160694 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22161083 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 22161529 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 22162617 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 22162930 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 22162963 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 22162984 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 22162987 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 22162996 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22163004 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 22163009 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 22163062 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22163262 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 22163324 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22163354 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22163590 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 22163654 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22163664 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 22163670 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 22163713 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22164006 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 22164015 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 22164069 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 22164101 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 22164218 C G N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 22164260 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 22164352 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 22164366 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22164422 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 22164480 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22164563 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 22164569 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 22164879 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 22164935 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 22165155 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22165174 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 22165264 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 22165269 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22165484 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22165596 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 22165755 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22165935 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 22166002 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 22166110 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22166764 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 22167138 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 22167139 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 22167515 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22168261 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 22168423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22168619 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 22168780 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 22168862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22168980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22169251 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22169306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22169508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22169530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22169547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22169559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22169735 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22169821 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22169874 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22169930 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22169950 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22170004 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22170034 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 22170063 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 22170146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22170217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22170259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22170302 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22170514 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22170542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22170658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22170681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22170720 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22170782 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 22170910 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22170938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22170944 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22170985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22171346 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22171423 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22171425 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22171487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22171569 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 22171578 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22171633 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 22171760 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 22171904 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 22172045 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22172054 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22172345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22172533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22172844 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 22172903 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 22173189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22173643 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22173657 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22173914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22174109 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 22174187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22174188 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22174429 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 22175259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22175355 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22175386 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 22175716 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 22175859 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 22175860 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 22176485 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 22176557 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22176718 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22176839 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 22177081 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22177180 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22177203 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 22177233 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22177782 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22177826 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22177858 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22177957 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 22178052 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 22178519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22178558 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22178589 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 22178819 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22178912 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22179447 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 22179589 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22179909 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 22181560 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22181660 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22181844 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22181915 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22182210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22182561 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 22182675 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22182901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22184918 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22185781 G C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 22185809 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 22185842 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 22185930 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 22186104 C A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 22186274 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 22186302 C G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 22186373 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 22186912 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22187436 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 22187499 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22187501 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22187545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22187582 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 22187632 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22187922 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 22187989 G T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 22188052 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 22188069 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 2 22188087 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 22188159 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 22188165 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 22188366 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 22188397 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 22188405 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 22188454 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22188541 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22188745 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22188856 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22188985 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 22189243 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 22189876 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 22189944 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22190003 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22191043 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22191279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22192042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22192169 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22194090 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22195523 G C Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 22196406 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22196693 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22197606 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22197716 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22197730 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22197872 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22198874 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22199049 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 22199391 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22199825 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22200681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22201457 T A Y N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 22201937 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 22202327 G A Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 22202789 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 22203377 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22203382 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 22203395 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 22206333 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22207273 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22208182 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22208193 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22208800 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22209210 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 22210571 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22210726 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22210762 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22211792 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22211805 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22212506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22213718 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22214111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22214395 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22214428 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22215422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22216369 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22216450 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22216492 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22217377 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22219043 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22219668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22219867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22220106 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22220240 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22220260 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 22220284 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22220397 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 22220484 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 22226844 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 22227057 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22227103 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22227143 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22227428 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22227455 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22227678 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22228080 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22228153 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22228179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22228368 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22228543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22228612 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22228703 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22228867 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22228984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22229012 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22229078 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22229159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22229209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22229249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22229270 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22229374 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22229544 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22229637 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22229954 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22230226 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22230249 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22231736 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22231794 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22233076 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22234104 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 22234244 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 22234506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22234744 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22235887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22235957 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22236032 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22236627 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22237518 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 22237677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22238206 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22238690 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 22239376 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22240601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22241040 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22241924 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22242208 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22242793 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22242808 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22243175 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22243589 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22245181 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22247294 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 22248504 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22248875 G A Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 22249146 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 22250162 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 22251811 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22252835 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22255023 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 22255944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22256927 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22256969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22257141 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22259882 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 22259911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22259949 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22259999 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22260116 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22260314 C G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 22260324 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 22260332 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 22260340 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 22260409 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22260423 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22260460 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22260761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22261446 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 22261809 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 2 22262936 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22263305 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22263532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22263686 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22263904 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22264545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22264606 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22265741 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22265818 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 22266606 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22266837 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 22266868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22268390 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22268547 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22269295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22269708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22270370 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22270889 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22270893 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22270995 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 22271109 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 22271152 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 22271363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22271420 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 22271731 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22271807 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22273364 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22274190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22274484 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22275207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22275308 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22275327 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22275567 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22275702 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22275755 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22276222 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22276539 C A Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 22276562 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22277447 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22277563 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 22277939 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22278337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22278385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22278694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22279645 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 22280115 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22280158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22280355 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22280555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22281212 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22282440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22282507 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22283091 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22283117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22283150 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22283588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22283611 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 22283646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22283743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22283925 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 22284063 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22284116 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 22284132 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 22284142 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 22284162 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 2 22284178 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 22284381 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22284441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22284451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22284474 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22284476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22284496 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22284710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22284880 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 22291157 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22291191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22291200 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22291228 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22291261 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22291296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22291339 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22291347 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22291428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22291429 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 22291460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22291461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22291506 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 22291633 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22291673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22291696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22291762 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 22291814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22291901 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22291981 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22291986 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22292000 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22292059 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22292067 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22292107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22292137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22292279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22292343 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22292354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22292398 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22292523 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22292533 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22292629 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22292639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22292728 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22292812 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 22292821 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22292903 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 22292998 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22293042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22293057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22293062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22293080 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22293102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22293123 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22293151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22293170 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22293206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22293217 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22293226 T G Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 22293414 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22293516 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 22293692 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22293821 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 22293887 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22293937 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 22294761 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22294779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22294807 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22294811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22294839 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22294935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22295062 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22295092 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22295116 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22295121 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22295179 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22295211 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22295212 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22295264 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22295286 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 22295291 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22295309 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 22295396 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22295476 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 22295478 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22295503 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 22295561 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22295593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22295673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22295721 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22295723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22295735 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22295762 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22295766 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22295910 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22295919 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 22295942 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 22295961 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22298014 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 22298045 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 22302050 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22302119 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 22302132 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 22302165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22302218 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22302317 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22302405 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 22302575 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 22302666 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22302720 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22302736 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22302745 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22302751 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22302795 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22303235 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22303290 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22303516 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 22303527 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 22303575 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22304045 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 22304177 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22304475 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22304515 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22305386 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22305811 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 22305922 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 22305933 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 22306097 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 22306401 C T N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 22306568 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 2 22306584 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 22306683 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 22306690 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 22307003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22307050 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 22307160 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22307344 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 22307390 C G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 22307407 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 22307441 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 22307461 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 22307462 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22307742 G A Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 2 22307833 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 22307860 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 22307978 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 22308091 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 22308148 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 22308209 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 22308992 A G Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 2 22309107 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22309156 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 22309218 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22309334 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22309452 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 22309487 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 22309552 T G Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 22310977 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 22311077 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 22311139 T C Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 22311141 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 22311800 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 22311971 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22312013 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 22312040 C G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 22312060 G C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 22312184 T C Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 22312278 C A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 22313486 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 22313506 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 22313544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22313577 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 22313582 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 22313706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22313707 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 22313820 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22314276 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22314408 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22314460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22314565 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22314566 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22314580 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22314763 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22314764 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22314928 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22315003 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 22315022 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 22315570 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22315649 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22315800 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22315930 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 22316151 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 22316204 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22316708 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22316762 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 22317010 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22317022 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 22317072 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22317128 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 22317160 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 22317271 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22317459 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22317554 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 22317721 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22317950 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 22318160 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 22318365 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 22318426 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 22318475 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 22318659 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 22318773 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 22318912 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 22319117 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22319224 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 22319243 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22319282 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22319327 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 22319483 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22319536 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 22319608 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 22319609 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 22319672 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 22319700 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22319751 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 22319790 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22319796 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 22319866 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 22319886 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22320017 T C Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 22320029 T C Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 22320179 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 22320232 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 22320286 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22320384 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 22320405 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22320450 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22320493 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 22320580 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 22320607 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22320627 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22320756 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22320836 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22320887 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22320953 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22321031 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 22321057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22321060 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 22321117 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22321180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22321224 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22321241 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22321261 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22321380 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 22321423 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 22321474 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22321483 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22321597 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22321712 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 22321721 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 22321724 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22321733 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22321803 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22321819 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22321847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22321861 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22321863 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 22321885 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22321912 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22321986 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22322054 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 22322125 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 22322167 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 22327196 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22327217 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 22327241 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22327302 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 22327431 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 22327490 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 22327611 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 22327613 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 22327622 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22327723 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 22328023 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 22328178 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 22328201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22328210 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 22328212 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 22328263 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 22328287 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 22328387 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22328590 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 22328612 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22328710 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 22328744 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 22328775 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 22328786 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 22328844 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22328852 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22328868 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22328890 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22328894 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22328905 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22329161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22329254 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22329281 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 22329342 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 22329358 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22329445 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 22329470 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 22329509 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 22329569 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 22329697 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 22329781 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 2 22329890 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 22329938 G T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 2 22329965 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 2 22329972 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22330026 C A N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 2 22330097 C G N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 22330132 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 22330156 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 2 22330170 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 22330227 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 2 22330384 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 2 22330545 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22330561 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 22330610 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 22330958 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 22331039 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22331096 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 22331169 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 22331182 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 22331219 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 22331240 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 22331258 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 22331334 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 22331338 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 22331387 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22331431 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 22331582 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 22331602 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22331610 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22331634 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22331860 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22331900 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22332456 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22332470 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 22332525 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22332530 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22332570 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22332689 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22332724 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22332729 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22332752 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22332756 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22332763 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22332781 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22332857 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 22332899 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22333106 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22333187 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 22333446 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 22333650 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22333800 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 22333997 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 22334049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22334148 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22334655 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22334824 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 22334859 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22334964 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22334996 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22335135 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22335220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22335620 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 22335626 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 22336189 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22336568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22336709 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22337739 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 22337814 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22337838 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22337904 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22338071 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22338140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22338167 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22338384 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 22338404 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22338573 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22338702 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 22338714 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22338981 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22339218 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22339420 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22339449 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22339462 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22339465 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22339476 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22339538 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22339550 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22340130 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22340243 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22340245 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22340314 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22340323 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22340373 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22340378 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22340434 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22340506 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22340649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22340676 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 22340679 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22340688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22340715 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 22340753 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22340808 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22340925 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22340964 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22340967 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22341067 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22341092 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 22341164 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22341208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22341219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22341257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22341275 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22341292 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22341313 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22341315 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22341405 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22341413 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22341490 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22341580 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22341616 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22341653 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22341667 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22341668 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22341844 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22341871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22342026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22342089 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22342219 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 22342471 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22342525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22342755 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22342811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22342845 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22342857 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22342872 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22342969 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 22343013 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22343017 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22343059 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22343114 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 22343195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22343223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22343239 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 22343257 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 22343354 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22343409 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22343458 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 22343531 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 22343613 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 22343906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22344004 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 22344030 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22344120 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 22344144 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 22344201 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22344206 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22344273 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22344363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22344429 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22344616 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 22344695 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 22344716 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 22344723 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 22344730 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 22344736 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 22344796 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 22344841 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 22344845 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 22344956 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 22345001 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 22345048 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 22345074 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 22345103 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 22345167 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22345197 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 22345198 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 22345210 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22345217 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 22345257 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22345296 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 22345297 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22345320 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 22345332 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 22345397 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22345410 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22345431 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22345568 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 22345583 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22345644 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 22345649 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 22345663 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 22345670 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22345675 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22345720 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22345724 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 22345815 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22345820 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22345834 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22345912 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22345962 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22345973 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22346031 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22346066 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22346075 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22346145 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22346204 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22346210 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22346244 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22346260 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 22346324 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 22346346 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 22346371 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22346406 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 22346427 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 22346456 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 22346466 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 22346559 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 22346603 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 22346634 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 22346635 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 22346710 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 22346722 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22346747 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 22346772 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22346802 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 22346814 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 22346848 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 22346849 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22346868 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 22346925 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 22346958 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22346987 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 22347021 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 22347035 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 22347054 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 22347143 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 22347170 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22347181 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 22397316 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22397383 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22397620 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22397814 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22398610 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 22398637 T A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 22399054 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22399213 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22399249 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22399253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22399260 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22399308 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22399417 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22399634 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22399644 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22400043 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22400217 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22400442 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22400718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22400772 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22400874 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22400970 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22400979 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22401211 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22401222 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 22401254 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 22401330 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22401447 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22401504 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22401658 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 22401768 A C Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 22401946 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22402056 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 22402119 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 22402265 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22402694 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 22402704 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22402791 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 22402821 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22403158 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 22403557 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 22403569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22403613 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 22403706 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22404025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22404081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22404094 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22404157 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22404354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22404368 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 22404395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22404400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22404704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22404815 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22404922 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22404996 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22409023 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22409184 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 22409263 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 22409330 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 22409338 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 22409401 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 22409471 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22409519 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 22409522 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22409576 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 22409760 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22410024 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 22410202 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 22410228 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22410253 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22410313 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22410657 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22410769 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 22410980 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22411083 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22411137 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 22411263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22411372 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22411521 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 22411578 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22411841 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 22412219 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22412367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22412981 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22413548 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 22413938 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22414079 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22414130 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22414232 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22414355 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 22414391 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22414400 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22420278 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22420309 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22420392 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 22420414 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 22420619 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 22420813 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22420933 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22420962 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 22420970 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22421107 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 22421185 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22421279 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 22421338 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 22421714 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22421782 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22421936 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22422386 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 22422706 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 22422838 T G N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 22424135 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22424270 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22424355 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22424509 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22424620 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22424631 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22424648 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22424697 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22424746 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22424750 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 22424854 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22426165 G A Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 22426241 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 22426244 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 22426269 G A Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 22426299 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 22427211 T G Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 22427322 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22427323 A C Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 22427380 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22427513 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22427717 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22427746 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22427841 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22428079 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22428080 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22428159 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22428278 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 22428433 T G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 22428472 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 22428921 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22429124 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 22429172 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 22429437 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 22429513 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 22429610 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22429671 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 22429703 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 22429721 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22429735 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22429883 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 22430069 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 22430234 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22430317 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22430328 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22431308 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 22431435 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 22431454 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22431620 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 22431640 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 22431734 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 22431877 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22432240 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 22432508 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22432526 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22432820 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 22432841 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22432902 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22433080 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22433082 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22433328 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22433492 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 22433604 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 22433735 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22434106 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22434119 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22434194 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 22434214 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22434237 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 22434370 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22434437 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 22434512 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22434593 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22434639 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22434669 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22434691 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22434788 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22434815 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22434843 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22434868 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22434871 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22435096 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22435171 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22435196 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 22435203 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 22435353 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22435472 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22435479 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22435698 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22435724 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22435751 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22435814 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22435922 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22435979 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22436227 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22436481 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22436568 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22436580 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22437132 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22437542 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22437744 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22437927 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22438052 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22438098 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22438158 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 22438182 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22438188 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22438242 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 22438246 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 22438257 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 22438397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22438410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22438422 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22438443 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22438458 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22438469 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22438564 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22438789 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22438827 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22439143 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22439185 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 22439284 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22439394 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22439462 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22439491 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22439663 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22439789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22439796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22440249 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22440333 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22440360 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22440361 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22440381 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22440570 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22440766 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22441056 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 22441186 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22441415 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22441436 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22441541 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22441714 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22442433 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22442468 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22442552 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22442718 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22442763 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22446102 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22446193 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 22446306 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 22446375 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 22446890 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 22446944 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 22446965 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22447041 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 22447143 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22447325 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22447369 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22447664 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 22447708 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22447761 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22447911 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 22448004 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22448038 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22448207 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22448562 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22448689 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22448710 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22449045 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22449119 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22449136 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 22449149 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 22449194 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22449204 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22449213 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22449228 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22449248 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22449271 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22449336 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 22449361 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22449527 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 22449598 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22449681 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22449691 T A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 22449706 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22449809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22449946 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 22450004 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22450029 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22450179 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22450225 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22450274 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22450344 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22450443 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22450471 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22450478 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22450500 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 22450753 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22450830 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22450992 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22450997 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22451044 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22451275 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 22451391 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22451426 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22451557 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22451592 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22451661 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22451680 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22451842 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22451936 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22451938 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22452116 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22452184 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 22452240 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22452289 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22452399 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22452502 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22452515 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22452649 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22452718 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22452754 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22452806 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22452903 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 22453023 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22453194 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22453258 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 22453290 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22453306 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22453318 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22453336 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22453373 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22453413 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22453939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22453967 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22454197 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22454259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22454391 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22454434 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 22454436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22454543 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22454715 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22455230 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 22455572 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22455743 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22455784 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22455922 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 22456217 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22456219 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 22456229 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22456342 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22456525 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22456547 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22456867 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 22457764 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22458287 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22458298 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22458338 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22458345 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22458422 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22458466 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22458750 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22458752 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22459038 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 22459202 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22459215 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22459280 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22459461 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22459525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22459660 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22459796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22459837 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22459839 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22459934 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22459989 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22460301 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22460337 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22460392 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22460455 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22460521 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22460525 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22460543 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22460582 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 22460676 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 22460702 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 22460724 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 22464091 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 22464272 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22464493 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22464661 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22464789 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22464969 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22465058 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 22465120 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 22465207 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22465219 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22465656 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22465675 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22465720 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22465736 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22465823 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22465866 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22465969 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 22465974 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22466007 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22466025 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22466079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22466140 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22466230 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22466784 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 22466799 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 22467827 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 22468593 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22468845 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 22469025 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 22469240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22469303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22469530 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22469543 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22469767 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 22469865 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 22469975 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22470203 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 22470228 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22470304 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 22470583 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 22470791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22472383 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22472394 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22472668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22472683 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22472765 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22472858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22473144 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22473170 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22473200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22473492 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22475224 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22475298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22475543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22475895 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22476497 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22476696 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22476812 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22476910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22477056 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22477116 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 22478832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22478999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22479086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22479167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22479452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22480084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22480137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22480155 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22480867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22481078 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22481264 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22481373 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22481537 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22482506 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 22483068 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 22483086 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 22483572 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22483841 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22483985 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22484021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22484129 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22484200 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22484210 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22486871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22487397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22487850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22488014 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22488102 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22488612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22488672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22488673 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22488882 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 22488885 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22488894 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 22488898 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22488957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22489001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22489059 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22489076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22489227 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22489449 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22489468 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22489587 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22489598 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22489621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22489810 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22489869 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22490112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22490606 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22491124 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 22491248 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 22491336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22491342 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 22491359 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 22491373 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 22491438 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22491931 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22491983 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 22492040 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 22492296 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 22492495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22493741 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22494049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22494439 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22495051 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22495117 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22495137 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22495256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22495292 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 22495301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22495409 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22495476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22495673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22495793 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22495873 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 22495937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22495962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22495976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22495979 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22495988 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22496097 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22496245 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22496393 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22496479 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22496480 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22496535 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22496659 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22496681 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22496766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22496868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22497115 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 22497252 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22497266 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22497296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22497327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22497379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22497412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22497475 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22497478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22497651 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22497660 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22497669 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22497676 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22497732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22497796 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 22497847 A C Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 22497943 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22497986 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22498065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22498103 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22498273 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22498280 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22498319 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22498325 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22498470 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22498726 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22499909 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22500100 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22500155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22500216 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22500217 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 22500236 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22500434 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22500762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22500915 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22500916 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22501005 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22501013 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22501041 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22501062 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22501105 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22501111 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22501122 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22501160 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22501386 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22501428 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22501972 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22502103 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22502157 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 22502351 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 22502868 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22502884 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22503149 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 22503517 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22503546 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22503795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22503915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22503974 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 22504097 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22504143 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22504179 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 22504529 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22504569 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22504779 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22504813 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22504855 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 22504897 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 22504996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22505013 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 22505017 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 22505238 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22505269 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22505337 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 22505538 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 22505636 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 22505647 G A Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 22505866 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22505871 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 22505909 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 22505924 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 22506026 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 22506036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22506112 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22506365 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22506463 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22506564 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22506575 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22506579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22506790 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22506917 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22506932 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22507323 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22507391 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22508151 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22508254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22508422 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22508530 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22509121 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 22509383 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22509436 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22509452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22509482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22509565 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22509594 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22509624 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22509636 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22509826 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22509843 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22509894 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22509982 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22510043 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22510095 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22510166 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22510256 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22510305 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22510329 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22510352 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 22510453 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 22510485 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 22510511 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 22510513 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 22510653 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22510813 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22510848 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22510873 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22511710 G C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 22512225 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 22512350 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 22512378 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22512392 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22512513 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22512768 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22512847 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22512910 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22512934 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22512952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22512957 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22513077 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22513172 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22513293 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22513340 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22513381 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22513492 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 22513506 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 22513703 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22513752 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22513781 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22513811 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22513839 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22513846 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22513876 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22513941 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22513979 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 22514017 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22514067 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22514083 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22514145 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22514147 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22514182 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22514318 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22514339 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22514411 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22514412 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22514461 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22514472 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22514493 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 22514495 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22514715 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22514854 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22514903 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22515045 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22515088 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 22515093 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22515348 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 22515354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22515384 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 22515610 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 22515624 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 22515679 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22515689 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 22515803 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 22515832 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22516761 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22516773 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22517186 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22517267 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 22518070 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 22518587 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 22518588 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 22518880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22519298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22519604 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 22519701 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 22519766 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 22519842 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22520012 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22520045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22520139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22520298 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22520309 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22520333 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 22520367 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 22520375 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 22520526 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 22520679 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22520760 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22520783 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 22520946 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22521137 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22521263 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22521349 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 22521366 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 22521374 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22521388 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22521427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22521525 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22521540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22521622 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22521666 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22522011 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22522020 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22522156 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22522433 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22522719 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22523429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22523478 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22523574 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 22523763 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 22523808 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 22523921 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 22523940 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 22523944 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22524107 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22524830 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 22524901 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 22525083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22526028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22526082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22526256 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22526257 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22526323 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22526332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22526478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22526513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22526755 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22526863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22526931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22526984 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22527009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22527062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22527143 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 22527162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22527179 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22527306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22527361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22527523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22527728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22527751 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22527939 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22527977 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 22528473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528490 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22528532 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528895 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528897 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22528920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22529022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22529037 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22529074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22529082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22529100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22529612 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 22529639 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22529651 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 22529652 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 22529752 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 22529940 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22530288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22530473 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22530542 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22531046 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22532014 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22532459 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22532486 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22533048 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22533471 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 22537196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22537588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22538080 T A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 22538880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22538926 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 22539060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22539714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22540621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22541766 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22541846 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22541864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22542751 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22542869 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 22543070 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 22543196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22543261 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22543783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22543784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22543824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22543889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22544036 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22544217 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22544788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22544938 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 22545340 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22546034 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22546841 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22547317 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 22547895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22547918 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22548196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22548266 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 22549507 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22549560 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22549568 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22549623 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22549654 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 22549661 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 22549722 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 22549778 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22549790 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22549850 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22549927 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22549983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22550029 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 22550328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22551171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22551187 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22554051 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22554098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22554361 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 22554397 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22554554 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 22555320 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22555357 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22555895 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 22555983 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22556058 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22556071 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 22556252 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 22556318 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 22556358 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 22556374 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22556497 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 22556912 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22557324 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22557664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22558174 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22558750 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22559355 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22561233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22561308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22566280 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22567462 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22567511 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22567748 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 22567761 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22567850 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22568065 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 22568417 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22568460 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22568472 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 22568641 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22568658 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22568683 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22568733 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 22568774 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 22568781 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 22568785 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 22568902 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 22568950 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22568957 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22569123 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22569140 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22569175 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22569210 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22569247 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22569470 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 22569490 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22569665 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22569696 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22569761 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22569775 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 22569817 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22569830 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22569869 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22569925 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22570060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22570096 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22570145 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22570196 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22570206 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22570298 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22570589 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 22570639 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 22570666 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 22570735 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 22570857 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22571027 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22571053 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 22571085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22571107 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22571108 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22571167 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22571229 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 22571465 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22571703 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22571960 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 22572494 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 22572508 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 22572601 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22572649 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 22572687 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 22572711 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 22572959 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22572985 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22573072 A G Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 22573083 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 22573086 A G Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 22573126 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 22573128 A T Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 22573511 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 22573640 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 22573984 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 22574019 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 22574041 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22574102 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 22574339 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 22574580 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22574613 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22574671 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 22574673 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 22574808 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 22574810 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 22575071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22575121 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 22575143 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 22575178 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 22575182 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 22575685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22575748 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 22575820 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 22575864 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 22575940 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22576367 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22577393 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 22577685 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 22578433 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22578482 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22578487 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22578847 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22578852 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22578922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22579208 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 22579254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22579307 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22579367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22580775 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22581260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22581584 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22581656 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22581727 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22581765 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22581784 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22581816 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22581839 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22581901 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22581906 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22581931 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22582000 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 22582035 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22582063 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22582072 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22582086 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22582091 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22582111 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22582157 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22582159 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22582211 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22582212 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22582420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22583007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22583245 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 22583698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22583736 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22583738 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22583766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22583798 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22584074 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 22584563 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22584719 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22584784 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22584845 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22584987 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22585021 A C Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 22585262 T A Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 22585324 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 22585408 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 22585412 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 22585486 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22585759 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22585813 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 22585921 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 22585960 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22586072 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 22586168 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22586222 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 22586263 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22586398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22586514 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 22586526 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22586538 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22586567 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 22586568 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 22586613 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 22586645 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22586701 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22587081 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 22587149 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 22587179 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 22587212 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 22587406 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 22587440 T C Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 22587549 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 22587665 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 22587994 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 22587996 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 22588029 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22588178 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 22588185 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 22588320 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 22588503 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 22588635 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 22588761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22588789 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 22588908 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22589408 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22589704 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22590240 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22590279 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 22590330 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 22590396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22590433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22590446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22590495 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22590503 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22590531 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22590808 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22590821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22590826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22590863 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22590957 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22591085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22591092 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22591153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22591327 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22591330 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22591390 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22591579 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22591587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22591603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22591718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22591815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22592011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22592128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22592151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22592164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22592176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22592219 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22592222 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22592369 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22592531 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22592539 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 22592575 T A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 22592681 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 22593195 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22593201 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22593247 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22593313 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 22593330 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22594031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22596329 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22596598 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22596623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22596646 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 22596866 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22596874 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22597052 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22597084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22597170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22597577 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22597596 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22597644 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 22597716 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22597730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22597736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22597779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22597790 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 22597869 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22597913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22597994 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22598020 A T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 22598024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22598144 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 22598499 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 22598504 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 22598645 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 22599040 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 22599054 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 22600173 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 22600912 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22600967 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22601140 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22601169 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22601200 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 22601261 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 22601277 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 22601290 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22601378 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 22601402 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 22601468 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 22601514 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22601553 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 22601564 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 22601569 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 22601600 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22601739 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22601813 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22601925 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 22601991 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22602001 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22602003 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22602027 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 22602063 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 22602072 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 22602296 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 22602309 G T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 22602312 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 22602502 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 22602652 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22602705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22602820 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22603044 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 22603385 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22603398 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22603402 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22603439 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 22603552 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 22603643 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 22603744 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 22603983 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 22604159 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22604400 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22604439 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 22604632 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22604788 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22604853 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22605052 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22605398 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 22605915 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22605929 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22605944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22607101 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22607277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22607320 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22607826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22608249 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22608424 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22608972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22609203 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 22609409 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 22609436 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 22609571 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22609601 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22609726 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22609758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22609765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22609774 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22609780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22609957 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 22610256 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22610335 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 22610554 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22610621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22610648 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22610743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22610912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22610951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22610994 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 22611010 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22611025 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22611694 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22611758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22611806 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22611847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22612220 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 22612668 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22612752 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22612763 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 22612815 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 22612902 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22613146 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 22613184 T G Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 22613197 T A Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 22613249 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 22613342 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22613358 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 22613384 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 22613390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22613507 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22613518 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22613579 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22613622 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 22613746 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22613847 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22614038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22615578 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22616130 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 22617271 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22617947 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22618632 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22619992 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22621474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22622440 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 22624600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22624662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22624666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22625176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22625465 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22625576 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22625662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22625677 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22625814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22625875 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22626389 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22626461 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22626473 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22626601 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 22626646 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22626762 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 22626833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22626856 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 22627196 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 22627791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22627815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22627948 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 22628059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22628197 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 22628381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22628948 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22629661 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 22630835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22632436 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22633128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22633247 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 22633263 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22633628 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 22633919 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 22633921 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 22633988 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 22634722 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 22634984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22635058 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 22635163 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22635182 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 22635326 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 22635586 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22635594 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 22635634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22637689 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 22637823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22639085 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22639124 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 22639223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22639357 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 22639470 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 22639691 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 22639737 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 22639752 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22639995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22640098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22640163 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 22640322 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22640353 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22640587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22641892 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22642000 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 22642314 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22642345 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22642361 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 22642681 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22642687 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 22642712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22642715 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22642726 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22642727 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 22642819 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 22642948 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 22642964 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 22643003 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22643114 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 22643217 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 22643254 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22643296 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 22643331 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 22643353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22643404 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 22643435 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 22643443 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 22643485 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22643540 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22643568 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22644194 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 22644305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22644456 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 22644661 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 22644676 C G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 22644682 G C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 22644752 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 22644762 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 22644826 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 22644837 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22644873 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22644907 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22644920 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 22644946 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22644969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22645061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22645079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22645098 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 22645195 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 22645196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22645247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22645298 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 22645309 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 22645371 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 22645388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22645486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22645494 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 22645499 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 22645553 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 22645570 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 22645605 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 22645648 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 22645737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22645765 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 22645774 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 22645805 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22645828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22645838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22646122 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 22646297 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 22646363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22646378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22646427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22646439 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22646449 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22646468 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22646546 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22646557 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22646612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22646688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22646710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22646720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22646743 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22646754 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22646855 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22646895 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22646940 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22647088 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22647168 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22647188 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 22647189 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 22647255 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22647275 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22647390 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22647419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22647464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22647533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22647566 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22647653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22647658 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22647685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22648774 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22649403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22650771 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 22650932 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 22650953 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 22650982 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 22651123 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22651198 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22651251 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22651252 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22651302 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22651342 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 22651462 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 22651487 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 22651506 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 22651553 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 22651641 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22651651 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22651704 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22651714 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22651765 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 22651771 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 22651776 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22651794 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22651801 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22651806 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22651897 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22651909 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22652171 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 22652330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22652531 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22652533 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22652818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22652867 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22653627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22653970 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 22653974 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 22654017 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 22654409 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22654425 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22654844 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 22654851 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 22654862 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 22654961 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22655000 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 22655074 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 22655306 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 22655409 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22655437 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22655459 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22655495 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 22655553 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 22655649 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 22655744 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 22655886 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22655905 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 22655991 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22656071 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22656085 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22656220 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 22656836 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22657103 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 22657135 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 22657215 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 22657444 C A Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 22657716 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 22657721 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 22657954 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22658013 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22658021 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22658079 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 22658081 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 22658530 T A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 22658890 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 22658956 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 22659431 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 22659506 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22659848 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22659859 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22659875 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22660045 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22660105 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 22660946 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 22660993 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 22661069 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 22661188 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22661414 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 22662062 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22662127 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22662460 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 22662907 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22663177 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22663189 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 22663479 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 22663510 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 22663545 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 22663674 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 22663680 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22663764 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 22663837 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22663845 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 22664083 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 22664304 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 22664563 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 22664774 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 22664831 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 22664945 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 22664955 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 22665004 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 22665024 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 22665164 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 22665337 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 22665790 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 22665974 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 22666009 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 22666056 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 22666206 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 22666344 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 22666378 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 22666865 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 22667117 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22667193 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 22667359 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 22667377 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 22667402 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 22667431 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 22667463 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22667473 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 22667476 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 22667548 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 22667696 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 22667699 C G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 22667718 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 22667805 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 22668028 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22668111 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 22668252 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 22668393 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22668534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22668702 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22669135 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22669141 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22669255 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 22669279 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22669317 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22669346 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22669357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22669445 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 22669457 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 22669550 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 22669625 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 22669657 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22669928 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 22670010 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 22670015 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 22670125 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 22670359 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 22670551 C G N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 22670660 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 22670803 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 22671106 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 22671129 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 22671188 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 22671307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22671310 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 22671356 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 22671369 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 22671394 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 22671453 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 22671490 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 22671578 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 22671628 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 22671644 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 22671709 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 22671858 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 22671941 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 22671993 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 22672039 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 22672376 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22672593 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22672679 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 22674604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22674830 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22674908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22675767 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 22677352 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22677921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22678000 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22681693 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22681741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22682316 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 22682414 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 22682712 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 22683161 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22683250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22683270 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22683347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22684350 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 22684920 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22686408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22687275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22687935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22688285 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22689130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22689659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22691692 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22696630 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22698552 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22698671 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22698757 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22698850 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22699008 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22699014 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22699305 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22699500 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 22699542 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22699580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22699762 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22699891 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22699926 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22700092 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22700376 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 22700449 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 22700557 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22701341 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 22701359 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22701375 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22701441 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22701655 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 22701799 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 22701890 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22701918 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 22702030 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 22702037 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 22702086 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 22702099 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 22702122 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 22702146 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22702161 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22702212 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22702374 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 22702851 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22702853 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22702901 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22703675 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 22703726 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 22703798 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 22703815 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 22703893 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 22703894 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 22704175 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22704314 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22704330 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 22704386 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22704448 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22704461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22704501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22704619 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22704664 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 22704690 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22704695 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22704789 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 22704869 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22704872 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22705014 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22705035 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 22705122 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22705214 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22705330 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22705386 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22705392 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 22705570 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22705594 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22705616 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 22705666 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 22705682 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 22705683 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 22705700 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 22705709 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 22705749 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22705807 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 22705831 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 22705863 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22706362 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22706376 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22706382 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22706411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22706519 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 22706542 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 22706591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22706609 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22706654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22706657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22706704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22706783 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 22707155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22707773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22707920 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22708014 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22708037 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 22708085 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22708107 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22708502 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 22708792 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 22708802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22708912 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 22708971 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 22709165 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22709171 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 22709357 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 22709426 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 22709570 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 22709659 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 22709911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22710357 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22710359 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 22710371 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 22710573 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22710975 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22710984 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22710992 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 22711201 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22711377 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 22711389 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 22711437 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 22711529 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 22711790 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22711934 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22711948 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 22712071 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22712199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22712335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22712351 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22712440 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22713198 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22713409 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 22713536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22713581 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 22713953 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22714049 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22714431 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22714497 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22714550 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 22714785 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 22714830 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 22715126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22715244 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 22715296 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22715469 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 22715507 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22715538 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22715561 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22715564 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22715577 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22715585 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22715666 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22715708 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22715767 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22715776 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 22715816 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 22715817 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 22715886 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 22715917 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22715929 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 22716101 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22716167 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22716261 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22716269 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22716340 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22716750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22716761 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22716995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22717028 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 22717315 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 22717392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22717435 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 22717629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22717871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22718720 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 22718805 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 22718843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22718846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22718910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22718923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22719174 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 22719422 C T Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 22720063 A C N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 22720248 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22720997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22721046 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 22721106 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 22721446 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22721483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22721794 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22721913 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 22721941 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22722097 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22722106 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 22722324 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 22722335 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22722364 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 22722667 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22723247 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 22723286 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 22723395 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 22723620 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 22723782 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22723845 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 22724002 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22724104 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 22724155 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22724409 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 22725264 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 22725268 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 22725306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22725425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22725432 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 22725536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22725649 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22725666 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 22725865 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 22726066 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22726193 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22726300 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 22726320 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22726556 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 22726568 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22726813 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 22726971 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22727654 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22729059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22729396 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22729623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22730013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22730416 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 22730474 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22730904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22731511 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22732828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22734432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22735334 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22735970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22736151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22736249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22736578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22737025 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22737162 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22738388 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22738780 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 22739854 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22743482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22743596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22744309 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22744658 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22745691 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22747220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22748109 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 22749285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22750613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22751954 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 22752290 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22753251 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22754271 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22754288 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22756492 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22760672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22767671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22767784 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22769606 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22770391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22771624 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22771765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22772404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22772624 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 22774190 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22774895 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 22776937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22778392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22779173 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22779489 G A Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 22780317 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 22781398 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22782592 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22782614 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22782755 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22784166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22789487 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22790190 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 22790329 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 22790431 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22792172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22794652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22794839 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 22798842 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 22799505 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 22800480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22801998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22804709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22804900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22805217 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22806228 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22807607 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22807616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22807682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22809015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22809022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22810035 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22814363 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22817536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22818060 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22819055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22821246 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22822055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22822056 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22823270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22824399 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22826023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22833645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22835367 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22839600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22844267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22847681 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22849410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22850948 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22854827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22856008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22857086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22857685 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 22858852 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22863767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22863982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22864329 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22872173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22874967 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22875833 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22876625 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 22876807 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22877262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22877448 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22878233 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 22878244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22878320 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 22878794 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 22879331 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22880122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22880196 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 22880231 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22880342 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 22880790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22880957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22880969 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22882841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22884571 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 22885250 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22886576 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 22888228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22889005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22892048 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 22892057 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22892137 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 22893127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22893171 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 22893487 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 22893655 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 22893988 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 22894628 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22894863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22895004 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22895941 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22896199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22896272 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22896939 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22897044 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 22897046 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 22897176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22897263 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 22897273 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22897280 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 22897325 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 22897365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22897410 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 22897501 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 22897749 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22897766 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 22897823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22898663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22898666 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22899123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22899192 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 22899292 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 22899311 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22899344 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22899392 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22899583 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 22899605 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 22899696 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 22899704 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22899815 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22899842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22899881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22900146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22900353 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 22900644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22900681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22900719 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22900721 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22900912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22901046 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 22901135 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 22901180 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 22901425 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22901508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22901510 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22901597 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 22901598 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 22901621 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 22901633 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 22901790 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 22901794 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 22901842 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 22901843 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 22901879 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 22901901 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 22902148 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 22902181 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22902187 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22902193 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22902198 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22902205 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22902274 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 22902316 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 22902330 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22902374 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22902406 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 22902475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22902524 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 22902600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22902629 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 22902636 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 22902801 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 22902856 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 22902948 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 22903035 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22903227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22903233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22903352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22903453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22903480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22903527 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 22903636 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 22903717 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 22904387 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 22904460 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 22904556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22904625 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22904681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22904707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22904762 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22904787 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 22904840 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 22904875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22904985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22905123 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 22905707 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 22905837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22905916 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 22906036 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 22906812 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 22907275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22907647 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 22907681 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 22907731 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 22907785 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 22908320 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 22908331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22908413 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22908475 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 22908590 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22908593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22908660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22908680 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 22908718 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 22908759 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 22908875 G A Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 22908901 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 22908928 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 2 22908942 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 22909112 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 22909262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22909515 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 22909516 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 22909980 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 22910076 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 22910185 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 22910316 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 22910513 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 22910612 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 22910651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22910753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22910888 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 22911300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22911448 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 22911565 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 22911943 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22912080 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 22912205 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22912317 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22912680 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 22912705 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22912998 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 22913028 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 22913237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22915408 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 22919349 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22919354 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 22919436 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 22919753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22920485 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22920661 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22921539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22921964 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 22922215 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 22922636 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22922777 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 22922789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22923532 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 22924285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22924457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22926692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22927187 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 22927302 T A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 22927306 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 22927515 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22927797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22928029 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22928066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22928971 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22928972 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 22929091 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 22929328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22929372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22929462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22929520 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22929599 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22929712 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22929985 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 22930027 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22930121 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22930410 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 22930708 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22931251 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 22931373 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 22931573 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22931856 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 22932006 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22932249 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22932593 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22932792 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 22933393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22933503 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 22933637 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 22934118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22934989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22935655 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22936098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22937040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22937327 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 22937982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22938244 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 22938347 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 22939075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22939693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22940053 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 22941871 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 22944010 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22944455 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 22949307 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 22952739 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22953852 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 22953879 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 22955095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22955114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22956005 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22957786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22958587 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22959401 T A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 22959408 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 22959455 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22959470 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22959474 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22960332 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22962701 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22963986 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22964150 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22968506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22968508 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 22968574 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 22968585 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22968665 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 22968708 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22968884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22971166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22971266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22972176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22972334 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22973518 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 22974728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22975190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22976226 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22976735 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 22976937 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22976946 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 22976950 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 22977715 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 22978254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22978773 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 22981101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22982253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22982970 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 22983913 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 22983917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22983966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22983971 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22984000 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 22984013 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 22984251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22984399 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 22984964 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 22985102 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 22985346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22985447 C T Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 22985698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22985950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22985980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22986048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22986217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22986240 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 22986462 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 22986799 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 22986845 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 22986969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22987091 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 22987162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22987164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22987387 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22987391 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 22987401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22987429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22987447 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 22987503 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 22987539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22987546 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22987577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22987667 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 22987718 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22988099 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22988265 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 22988271 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 22988386 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 22988839 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 22989115 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22989162 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 22989782 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 22989805 T A N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 22990051 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 22990097 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 22990262 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 22990517 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22990556 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 22990660 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 22990843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22991277 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 22991402 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 22991417 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 22991481 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 22991541 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 22991616 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 22991650 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 22991651 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 22991956 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 22992356 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 22992370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22992836 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 22992961 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 22992997 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22993036 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22993595 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 22993826 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22993831 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22993988 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 22994270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22994428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22994550 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 22994668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22994772 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 22995131 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 22995653 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 22995688 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22995700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22996484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 22997286 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 22997316 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 22997531 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 22997819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22998271 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22998306 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 22998388 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 22998400 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 22998452 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 22998743 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 22998874 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 22998946 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22998966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22999135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22999278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22999346 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 22999416 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22999453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22999636 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 22999690 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22999816 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 22999942 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 22999982 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23000109 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 23000173 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 2 23000313 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 23000316 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 23000390 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23000396 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 23000434 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 23000627 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23000675 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 23000680 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 23000704 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 23000727 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23000744 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 23000858 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23000875 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 23001051 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23001065 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 23001141 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 23001220 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 23001232 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 23001377 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 23001511 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 23001755 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 23001828 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23001854 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 23001873 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 23001874 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 23001991 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 23002532 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 23002654 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 23002718 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 23002822 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23002844 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23003006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23003049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23003214 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 23003218 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 23003240 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23003346 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 23003401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23003521 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23003551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23003585 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23004070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23004071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23004459 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 23004518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23004683 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23004827 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 23004913 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23005019 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23005040 T C Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 23005347 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23005586 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23005637 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23005905 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23006160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23006188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23006269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23006410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23006427 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23006499 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23006753 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 23006890 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 23007222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23007250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23007321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23007354 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 23007756 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23007807 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 23007883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23007985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008095 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 23008101 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 23008131 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23008332 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 23008375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008495 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23008584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008625 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23008627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008721 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 23008733 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 23008737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008787 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 23008806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008874 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23008899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23009012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23009013 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23009090 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23009118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23009170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23009229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23009257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23009439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23009456 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 23009596 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23009655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23009729 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 23009736 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23010005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23010021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23010191 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23010193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23010311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23010344 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23010441 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23011053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23011112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23011836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23012000 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23014632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23014655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23014973 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23015162 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23016691 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23016981 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23017017 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 23017046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23017283 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23017412 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 23017532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23017535 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23017827 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23017972 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23018300 T G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 23018430 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 23018698 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 23018829 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 23018937 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23018938 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23019183 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23019237 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 23019238 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 23019349 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 23019372 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 23019560 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23019583 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23019623 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23019690 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 23019722 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 23019784 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 23020251 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 23020258 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23020298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23020466 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 23020824 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 23020826 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 23020976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23021354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23021439 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 23021808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23022091 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23022115 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23022244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23022942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23022954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23023056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23023920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23024036 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23024069 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23024143 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23024670 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23024706 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23026094 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23026417 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23026517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23026657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23026709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23027043 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 23027628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23027630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23028781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23028955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23029037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23029046 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23029211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23029287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23029297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23029569 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23029696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23029814 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 23029830 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23029834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23029993 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23029999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23030164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23030300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23030402 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23030816 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23031078 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 23031153 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 23031208 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 23032042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23032177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23032372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23032957 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 23032968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23033126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23033458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23033732 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 23033759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23033880 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23033984 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 23034189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23034555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23034668 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23034682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23034859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23034954 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23035039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23035047 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 23035228 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23035346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23035375 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23035565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23035724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23035927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23035942 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 23036072 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23036210 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 23036216 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 23036410 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23036447 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23036453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23036526 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23036553 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23036654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23036728 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23036743 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23037005 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23037186 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 23037190 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 23037250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23037331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23037480 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 23037748 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 23037770 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 23037781 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 23038315 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 23038376 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 23038471 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23038935 A T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 23039006 A G Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 23039014 C A Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 23039231 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 23039275 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 23039981 A C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 23040201 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 23040364 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 23040528 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 23040782 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 23040820 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 23041010 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 23041155 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23041301 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 23041424 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 23041446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23041471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23041516 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23041584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23041595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23041623 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23041674 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 23041771 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23042056 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 23042139 T G Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 2 23042680 A T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 23042836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23042859 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23042907 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23043238 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 23043563 G A Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 2 23043860 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23043928 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23044093 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23044260 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 23044277 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23044278 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23044968 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23044971 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23045389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23045492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23047556 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23048100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23049003 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23049042 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23050566 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23051151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23051713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23051727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23051907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23052530 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23053799 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23054006 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23054714 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23054963 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23055532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23055777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23056399 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23057390 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23058406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23058538 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23058715 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23058726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23059101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23059537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23059571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23059918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23060068 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23061062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23061063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23061762 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 23062528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23062638 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23062695 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 23063191 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23063466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23063653 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23063737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23066660 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23067622 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23067979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23069670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23069691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23070510 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23071029 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23071137 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23072144 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23074510 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23076209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23076393 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 23076419 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 23076432 T G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 23076446 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 23076454 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 23076458 T A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 23076559 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23076949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23077024 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23077051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23077179 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23077277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23077306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23077445 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23077472 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23079387 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23080398 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23080438 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23082051 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23082622 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23083832 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23085917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23086675 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23089382 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23090261 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23091595 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 23093879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23095558 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23095681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23097258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23099455 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 23099488 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23099542 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23099718 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23099804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23099882 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23100044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23100545 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23100568 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23100803 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23100872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23101389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23101412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23102093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23104675 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23106295 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 23107803 A G Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 23107892 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 23109617 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23111267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23113241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23119736 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23120561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23124569 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23126706 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 23127007 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23127829 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23135957 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23143751 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23144693 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23144695 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 23146227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23146561 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23148649 A T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 23148655 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 23149934 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23156241 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23163670 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23167661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23169923 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 23170857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23171416 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23172228 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 23172445 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 23172491 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 23173638 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23178710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23179155 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23183389 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 23185207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23185403 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23185623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23186769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23186842 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23186845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23187229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23187380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23187491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23188062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23188765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23189120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23189132 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23189150 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23189156 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23189934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23190002 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23190010 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23190036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23190465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23190497 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23190770 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23190971 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 23191013 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23191028 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23191275 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23191289 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23191333 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23191567 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23191607 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23191663 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23191767 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 23192091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23192263 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23192344 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23192394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23192743 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23192754 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23192847 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23192948 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23193159 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23193202 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23193319 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23193611 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23193806 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23193908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23194181 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23194332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23194375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23194784 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23194885 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23197047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23197177 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23197178 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23197780 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23197895 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23198157 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23198246 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23199301 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23199582 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 23199596 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 23199864 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23199927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23200000 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23200200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23200258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23200448 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23200470 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23200853 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 23210543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23210603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23211290 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23214531 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23225590 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 23229220 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23231206 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23232732 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 23233105 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23233371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23233533 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23233945 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23234049 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 23234305 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23234717 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23235661 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23236031 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23236096 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23236519 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23236713 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23237280 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 23237327 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23237852 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23238364 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23238712 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23238948 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 23239047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23239084 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23239322 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23239461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23240065 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23240150 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23240262 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23240302 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23240811 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23241050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23241116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23241640 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23242405 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23243190 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 23243322 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 23243438 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23243514 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23243563 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23243570 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23243619 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23243681 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23243852 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23243911 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 23244237 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23244486 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23244673 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23244773 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23244855 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23245093 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23245452 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23245857 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23246221 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23246721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23246796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23248502 A C Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 23250858 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23252267 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 23252402 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23254429 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23254925 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 23255748 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 23257150 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 23257302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23257366 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23258187 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23258523 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23259578 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23260981 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23261324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23261569 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23261731 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23261867 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 23262182 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23262194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23263236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23263526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23263804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23264212 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23264266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23264344 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23264345 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23264364 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23264386 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23264393 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23264411 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23264420 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23264674 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23264705 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23264711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23264913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23264951 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23264982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23265211 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23265251 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23265264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23265592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23265668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23265694 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23265734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23265839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23265939 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23265989 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23266014 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23266060 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23266065 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23266106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23266378 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23266419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23266453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23266454 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23266466 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23266527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23266547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23266637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23266655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23266676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23266771 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23266850 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23266912 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23266959 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23266963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23266990 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23267052 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23267145 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23267264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23267282 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23267419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23267554 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23267574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23267581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23267595 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23267617 G T Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 23267635 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23267658 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23267669 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23267672 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23267743 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 23268068 T G Y N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 23268132 T G N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 23268133 A T N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 23268222 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23268328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23268389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23268451 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23268717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23268823 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23268879 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23268892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23268919 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23268928 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23269059 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23269069 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23269157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23269181 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23269222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23269263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23269300 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23269343 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23269355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23269363 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 23269400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23269422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23269426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23269433 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23269456 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23269467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23269579 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23269647 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23269731 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23269756 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23269768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23269771 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23269870 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23269880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23269900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23269902 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23269915 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23269926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23269951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23269996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23270008 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23270069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23270079 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23270114 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23270118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23270225 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23270272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23270322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23270334 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23270367 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23270402 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23270443 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23270566 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23270673 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23270676 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23270802 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23270824 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23270832 A T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 23270843 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23270874 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23270891 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23270904 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 23270939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23270961 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23270976 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23270994 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23271085 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23271203 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23271234 C A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 23271277 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23271482 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23271516 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23271524 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23271528 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23271546 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23271558 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23271595 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23271629 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23271646 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23271669 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 23271674 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 23271747 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 23271764 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23271814 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23271865 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23271890 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 23271984 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 23272027 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23272059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272067 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23272109 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23272141 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23272162 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23272205 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23272269 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23272307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272320 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23272326 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272366 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23272390 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23272394 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23272457 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272461 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272563 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23272568 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23272586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272591 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272656 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23272668 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272717 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272755 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272786 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272790 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23272834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23272841 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23272854 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23272878 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23272891 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23272977 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 23272985 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23273050 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23273070 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23273108 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23273146 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 23273168 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 23273175 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 23273358 T A Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 23273473 C T Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 23273724 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 23273768 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 23273834 G T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 23273870 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 23273962 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 23273964 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 23273980 T C Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 23274004 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 23274045 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 23274131 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23274168 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23274184 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23274197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274331 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274487 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274560 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 23274580 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274625 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274777 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274809 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274815 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274824 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 23274845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23274987 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275035 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23275084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275232 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23275235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23275314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275500 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23275507 T G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 23275574 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23275589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23275625 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23275719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275935 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23275949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23276012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23276063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23276068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23276235 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23276246 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23276301 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 23289506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23289801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23289806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23289950 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 23290122 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23290220 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 23290277 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 23290291 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 23291105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23291115 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23291186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23291791 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23291870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23291871 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23291906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23291997 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23292111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23292320 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23292418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23292439 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 23292604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23292641 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23292744 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23292818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23292893 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23293022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23293025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23293047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23293122 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23293180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23293207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23293216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23293302 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23293322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23293368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23293562 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23293590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23293612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23293642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23293679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23293704 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23293734 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23293770 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23293820 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23294086 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 23294132 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 23294979 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23295677 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23296205 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23297136 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23297398 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23297444 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23297563 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23297676 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23297681 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23297714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23297784 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23297805 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23297928 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23298028 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23298043 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23298086 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23298153 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23298249 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23298285 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23298286 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23298363 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23298381 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23298401 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23298426 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23298488 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23298503 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23298531 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23298591 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 23298647 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23298656 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23298665 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23298729 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23298867 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 23299045 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 23299193 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 23299260 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 2 23299612 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23299643 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23299846 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23299879 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23299912 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23299914 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23299974 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 23299975 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 23299991 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23300032 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 23300090 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23300266 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 23300318 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 23300381 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23300504 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23300561 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 23300671 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23300696 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 23300828 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23300911 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23300985 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23301029 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23301139 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23301140 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23301164 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23301279 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23301389 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 23301391 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23301460 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23301526 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 23301690 T G Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 23301836 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23301889 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23301890 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 23301908 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 23301946 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23302015 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23302090 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23302309 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23302389 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23302390 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23302539 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 23302618 T G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 23302636 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 23302751 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 23302816 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23302891 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23302957 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23303023 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23303060 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23303196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23304196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23304960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23304961 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23305003 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23305345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23305385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23305790 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23305806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23306111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23306349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23307005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23307624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23307712 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 23307734 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23307948 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23307954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23307962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23308156 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23308295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23308429 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23309508 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 23309560 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23309581 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23310064 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23310224 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 23310362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23310399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23310480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23318719 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23318720 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23318750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23319087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23319135 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 23319247 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 23319302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23319303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23319352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23319364 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23319429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23319468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23319470 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23319560 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23319617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23319786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23319864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23319866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23319945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23320130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23320183 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23320262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23320306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23320351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23320371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23320425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23320442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23320551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23320563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23320584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23320608 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23320708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23320720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23320805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23320954 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23321075 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23321101 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23321143 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23321149 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23321354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23321467 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23321482 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23321534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23321579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23321669 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23321722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23321759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23321793 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 23321831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23322113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23322130 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23322169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23322281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23322288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23322305 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23322340 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23322342 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23322406 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23322428 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23322487 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23322549 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 23322671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23322752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23322768 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 23322786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23322815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23322934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23322944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23322976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23323179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23323274 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 23323308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23323314 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 23323806 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23323865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23323908 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23323969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23324006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23324047 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23324137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23324156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23324179 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23324202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23324233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23324280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23324282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23324299 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23324451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23324512 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23324591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23324669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23324837 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23324996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23325587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23325665 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 23325666 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 23325849 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23326320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23326562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23326571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23326768 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23327044 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23327210 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23327492 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23327494 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23327718 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 23327806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23327867 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 23328144 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 23328151 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 23328546 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 23329049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23329202 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 23329290 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 23329535 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23329701 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 23329712 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 23329717 C G Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 23329735 G C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 23329736 T A Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 23329776 C A Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.166666666666667 0.75 0.0833333333333333 13 11 2 9 1 2 23329798 G T Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 23329812 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 23330696 A T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 23330930 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23331174 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23331770 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 23331929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23332012 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23332124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23332222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23333248 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23333959 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 23334064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23334395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23334703 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23334946 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23335167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23335238 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23335499 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 23335784 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23335832 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 23336002 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 23336006 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 23336311 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 23336477 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 23336831 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23337005 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 23337548 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23337571 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23337905 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 23337914 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 23337942 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 23337980 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 23338146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23338526 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23338691 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 23338831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23339030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23339091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23339184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23342903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23343532 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 23343834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23345472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23346579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23346759 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 23347414 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23347503 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23347667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23347693 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23348319 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23348903 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23350174 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23350506 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 23351239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23351711 T A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 23351725 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23352213 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23353073 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23353176 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23353360 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23353368 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23353410 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 23353516 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23353557 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23353816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23354459 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 23354592 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 23354878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23354895 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23355064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23355339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23355922 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23356396 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23357346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23357577 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23358017 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 23358364 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23358493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23359081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23359126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23359973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23360589 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 23360798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23360849 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23361177 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23361324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23361432 A C Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 23361453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23362001 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 23362374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23362387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23364626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23364843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23364940 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 23365089 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23365151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23366320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23366393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23367112 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23367179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23367390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23367411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23367723 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23368180 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23368372 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23368476 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23368674 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23368745 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23368755 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23368763 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23368939 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23368941 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23368977 G C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 23369595 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23369642 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 23370013 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23370015 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23370073 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23370435 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23370466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23370660 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23370868 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23370896 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23370914 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 23371199 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23371584 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23371621 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23371847 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23371871 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 23372038 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23372135 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23372256 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23372730 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 23373026 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 23373049 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23373050 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 23373195 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 23373273 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 23373280 G C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 23373312 T G N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 23373394 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 23373436 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 23373539 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 23373550 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 23373563 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23373638 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23373653 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 23373753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23374071 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23374143 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23374409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23374435 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23374492 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 23374652 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23374707 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23374834 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23374872 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23375209 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23375347 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23375463 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23375511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23375518 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23375550 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23375654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23375737 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 23375871 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23376101 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23376129 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23376304 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23376722 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23376821 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23377639 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23377680 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 23377742 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23377854 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 23379654 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 23379674 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 23379678 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 23379810 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23379839 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23379855 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23380026 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23380149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23380193 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23380195 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23380206 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23380247 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23380435 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23380476 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23380500 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23380738 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23381607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23381979 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 23382643 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23382800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23383111 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23383130 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23383570 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23383660 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23383709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23383741 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23383782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23383783 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 23383870 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 23384004 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23384015 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 23384083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23384393 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23384620 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23384627 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23384793 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23384844 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23385097 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23385134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23385138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23385581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23385598 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23385831 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 23385894 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23386278 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23386494 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23386621 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23386919 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23387005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23387059 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23387125 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23387379 C A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 23387798 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23388073 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23388098 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23388457 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23388508 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23388543 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23388678 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23388692 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23388897 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23389220 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 23389351 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 23390351 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23390394 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23390559 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23390638 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23390680 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23390746 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23390958 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23390959 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23391288 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 23392031 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23392052 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23392369 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23392396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23392448 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 23392811 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 23393411 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 23393529 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 23393627 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23393963 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23394045 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23394071 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23394240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23394291 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23394435 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23394463 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23394686 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23395283 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 23395854 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23395857 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23395876 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23395953 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23395998 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23396063 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23396109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23397619 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 23397685 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 23397724 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23397743 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23397887 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23398010 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 23398029 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 23398105 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 2 23398114 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 23398317 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23398336 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23399043 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23399046 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23399393 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 23399447 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 23399471 A C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 23399569 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 23399713 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23399953 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23399987 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 23399994 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 23400208 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23400439 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 23401327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23401361 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23401716 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23401745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23401776 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23402327 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 23402591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23402879 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23403269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23403777 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23404060 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23404126 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23404170 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23404538 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 23404602 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23405243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23405561 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23405956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23406011 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23406189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23406221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23406727 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23407137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23407415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23407555 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23408021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23408134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23408240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23408272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23408367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23408603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23408621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23408635 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23408803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23408900 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 23409075 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 23410020 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23410919 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 2 23410991 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 23411053 G T Y N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 23412451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23412483 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23413227 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23413436 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23413612 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23413807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23414005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23414071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23414510 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23415171 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23415419 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 23416264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23416431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23417082 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23417125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23417220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23417332 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 23417725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23417753 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23417774 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23418219 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 23418730 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23419142 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23419347 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23419425 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23419510 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 23419743 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23419796 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23420169 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 23420202 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23420269 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 23421039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23421294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23421890 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 23422384 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23422643 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23422773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23422800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23423453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23423606 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23423743 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23424025 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23424068 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23424624 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23424754 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23424771 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23424831 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23424842 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23424955 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 23424960 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 23424973 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 23424982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23425186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23425270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23425322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23425335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23425401 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23425513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23425748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23426321 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23429437 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23429637 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23430067 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23430535 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23434319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23434522 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23437593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23437601 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23439015 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23440500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23449873 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 23451584 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23453429 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23454372 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23455247 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23455346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23455688 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 23455703 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 23457003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23457070 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23457473 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23457554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23458443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23458741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23459328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23459827 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23460713 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23461357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23461384 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23461683 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23461963 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23462495 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23462727 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23462829 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23462949 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 23462970 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 23463656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23463897 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23464022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23464124 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23464400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23464558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23465278 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23465375 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23468071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23468644 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 23468698 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 23468704 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 23468872 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 23468932 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23469220 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 23469294 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 23469405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23469406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23469440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23469460 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 23469472 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 23469618 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23469731 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23469808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23470245 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 23470301 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23470396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23470411 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23470486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23470507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23470509 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23470678 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23470725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23470800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23470884 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23470903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23470925 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23470951 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23471031 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23471076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23471185 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23471255 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23471267 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23471315 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23471319 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23471398 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23471459 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23471679 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23472266 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 23472308 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23472322 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23472323 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23472408 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 23472432 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 23472470 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23472613 A C N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 23472687 A G Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 23473026 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23473091 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23473613 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 23473803 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23474041 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 23474194 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23474401 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23474416 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23474518 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23474580 C T Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 23474844 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23475104 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23475524 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23475533 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23475745 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23475800 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23475969 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23476253 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23476506 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 23476510 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 23476670 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 23476683 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 23476765 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 23476829 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 23476875 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 23477030 A C Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 23477265 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23477357 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 23477390 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 23477470 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23477872 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23477873 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23477898 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23478277 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 23478288 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 23478342 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23478413 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 23478571 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23478880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23479083 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23479198 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 23479216 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 23479228 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23479378 T G Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 23480125 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23480891 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23481238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23481373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23481578 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23481665 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 23481767 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23481777 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23481932 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23482031 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 23482039 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23482162 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23482286 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 23482427 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 23482593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23482618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23482679 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23482712 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23482810 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23482850 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23483045 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 23483054 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 23483123 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23483148 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23483188 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23483227 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23483334 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23483639 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 23483884 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23484280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23484505 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23484508 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23484579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23485073 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23485293 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23485486 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23485602 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 23485736 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23485737 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23485825 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23486239 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23486392 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23486543 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 23486743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23488183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23488209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23488266 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23488352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23488602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23488672 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23488751 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23488762 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23488895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23489099 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23489269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23489326 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23489330 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23489511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23489530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23489600 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23489839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23489992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23489993 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23490015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23490083 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23490117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23490144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23490170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23490215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23490332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23490427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23490491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23490564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23490579 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23490596 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23490692 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23490809 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23490924 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23490966 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23491048 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23491335 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23491339 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23491399 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23491445 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23491460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23491472 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 23491661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23491666 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23491792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23491802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23491850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23491868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23491912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23492019 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23492083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23492128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23492138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23492149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23492218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23492280 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23492283 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23492292 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23492298 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23492311 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 23492333 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23492362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23492375 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23492410 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23492413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23492464 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23492490 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23492507 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 23492531 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 23492647 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 23492689 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23492748 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 23492791 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23492846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23492901 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23493033 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 23493040 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 23493095 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23493097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23493320 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23493347 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23493405 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 23493428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23493459 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23493572 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 23493596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23493711 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 23493811 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23493829 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23493830 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 23493858 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 23493873 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23493886 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23493962 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 23494052 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 23494203 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23494220 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23494333 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 23494337 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 23494460 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23494541 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23494566 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23494596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23494671 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23494728 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23494760 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23494778 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23494784 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23494826 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23494834 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23494875 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23494904 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23494979 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23495030 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23495035 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23495209 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23495242 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23495293 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23495340 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23495454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23495538 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23495661 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23495747 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 23495757 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23495796 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23495876 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 23495969 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 23496008 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 23496245 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 23496387 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23496395 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23496451 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 23496455 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 23496565 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23496579 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23496600 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23496604 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23496614 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 23496624 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23496742 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23496783 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 23496789 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 23496819 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23496829 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23496863 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23496874 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23496918 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23497010 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23497030 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23497036 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23497091 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 23497101 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 23497104 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23497113 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 23497134 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23497197 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23497235 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23497269 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 23497289 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23497357 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 23497365 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 23497469 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23497503 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23497506 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23497515 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23497548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23497553 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23497616 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23497618 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23497642 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23497665 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23497670 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 23497693 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23497724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23497779 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23497858 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23497889 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23498035 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 2 23498064 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 2 23498353 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23498450 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23498547 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23498625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23498851 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 23499056 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 23499107 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23499113 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23499353 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23499372 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23499546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23499555 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23499559 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23499773 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23499791 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23499804 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23499853 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23499874 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23500083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23500209 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23500267 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23500409 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23500522 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23500541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23500639 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23500655 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23500770 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23500875 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23500882 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 23500929 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 23500999 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 23501307 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23501338 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23501391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23501454 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23501661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23501714 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23501792 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23501793 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23501829 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23501870 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23501912 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23501979 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23502016 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23502415 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 23502501 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 23502528 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23502558 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23502589 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23502629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23502826 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 23502863 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23502864 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23502882 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 23503005 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23503278 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23503311 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23503317 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23503363 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23503433 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23503598 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23503803 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 23503847 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 23503858 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 23503890 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 23503948 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 23503949 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 23503979 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23504076 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 23504088 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 23504139 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 23504167 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23504251 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23504357 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23504443 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 23504494 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23504512 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 23504553 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 23504626 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23504695 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23504698 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23504749 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23504764 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23504867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23504876 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23504939 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23505044 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23505072 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23505081 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23505123 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23505217 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23505368 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23505373 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23505382 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23505408 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23505421 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23505447 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23505477 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23505488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23505523 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23505563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23505629 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23505660 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23505677 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23505696 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 23505705 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 23505711 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 23505719 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23505731 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23505769 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23505886 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23505913 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23505962 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23506052 G C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 23506111 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 2 23506118 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 23506143 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 23506152 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 23506231 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23506247 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23506256 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23506383 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23506405 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23506469 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23506470 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23506511 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23506521 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23506545 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23506552 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23506621 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 23506660 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23506689 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23506695 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23506814 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23506849 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 23506893 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23506951 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 23506988 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23507008 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23507061 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23507314 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23507326 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23507396 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 23507421 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23507460 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23507466 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23507487 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 23507548 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 23507590 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23507728 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23507823 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23508273 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23508319 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23508392 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23508395 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23508413 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23508587 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 23508610 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 23508751 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 23508789 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 23508908 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 23508922 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 23508955 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23508964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23508967 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23508995 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23509019 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23509086 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23509277 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 23509402 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 23509433 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 23509692 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 23509694 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 23509787 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23509789 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23509828 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23510011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23510018 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23510040 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23510231 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23510251 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23510309 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23510372 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23510405 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23510411 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23510439 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23510509 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23510570 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 23510593 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23510603 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23510611 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 23510703 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23510770 A C Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23510898 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 23510968 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 23510999 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23511079 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 23511131 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23511195 G C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23511236 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23511247 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23511404 C G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 23511508 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23511657 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 23511803 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23511899 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23511989 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23512019 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23512214 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23512248 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 23512249 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23512271 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23512334 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23512579 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23512818 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23512877 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23512903 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23512952 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23512995 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23513154 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23513246 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 23513265 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23513377 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23513412 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23513417 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23513514 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23513569 A T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23513613 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23513619 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23513658 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23513709 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23513762 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23513772 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23513937 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23514070 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23514102 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23514196 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 23514291 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23514356 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 23514376 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 23514471 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23514486 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 23514580 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23514733 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23514736 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23514808 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23514819 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23514875 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23514947 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23515041 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23515074 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23515076 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23515186 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23515192 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23515205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23515311 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23515343 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23515350 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23515386 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23515630 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23515643 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23515659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23515672 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23515673 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23515740 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23515757 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23515795 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23515796 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23515837 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23515842 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23516171 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 23516314 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23516341 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 23516444 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 23516461 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23516572 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23516623 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23516745 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23516788 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 23516813 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 23516828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23516848 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23516877 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23516920 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23516957 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23517050 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 23517129 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23517172 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 23517444 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 23517505 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 23517589 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23517658 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 23517720 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23517733 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23517777 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23517811 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23517817 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 23517841 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23517909 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 23517984 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 23518106 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23518159 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23518176 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23518177 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23518342 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 23518366 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 23518373 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23518380 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 23518404 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23518412 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23518500 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 23518552 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 23518633 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23518659 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23518662 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23518707 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23518757 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23518765 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23518844 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23518960 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23518974 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 23519078 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23519091 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23519171 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 23519172 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23519258 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 23519621 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23519807 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23519989 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23520029 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23520287 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23520382 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23520479 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23520512 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23520542 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23520545 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23520853 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23520894 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 23520909 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23520951 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 23520961 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23520962 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23521009 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23521033 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23521375 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 23521388 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 23521477 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23521554 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23521760 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23521782 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23521818 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23521849 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23521882 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23521890 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23521925 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23522021 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23522173 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23522240 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23522283 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23522299 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 23522326 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23522384 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23522449 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23522512 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23522689 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23522709 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23522715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23522877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23522970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23523050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23523124 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23523144 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23523195 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 23523294 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 23523300 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 23523382 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 23523397 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 23523493 A G Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 9 9 1 7 1 2 23523531 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 2 23523697 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23523767 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23523907 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23523950 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23523969 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23523990 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23524014 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23524033 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 23524062 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23524083 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23524107 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23524112 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23524199 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 23524304 A C N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 23524468 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 23524876 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 23525251 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 23525361 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 23525514 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 2 23525519 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23525609 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 23525814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23525979 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23526069 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23526088 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23526459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23526571 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23527381 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23527431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23529279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23529287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23529349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23529711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23529826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23529904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23530356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23530449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23530471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23530897 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23531048 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 23531073 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23531157 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23531379 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 23531587 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23531890 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 23532835 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23532854 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23533400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23533836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23534798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23534846 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23534905 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23535761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23536896 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23537008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23537342 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23537371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23537558 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23538111 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 23538623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23538701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23538795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23538905 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23539160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23539237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23539250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23539310 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23539319 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23539899 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23540157 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23540238 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 23540400 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23541176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23542869 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23544348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23544911 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23545025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23545114 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23545167 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 23545267 C A Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 23545646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23546681 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23547292 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23548042 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 23548276 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23548382 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23548606 T C Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 23549073 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23551984 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23553456 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23553660 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23554110 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 23554131 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 23554222 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23554428 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 23554478 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 23555108 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 23555307 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 23555312 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 23555424 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 23555432 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23555487 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23555559 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 23555669 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23555794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23555836 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 23556050 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 23556082 T A Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 23556120 A T Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 23556122 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 23556131 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 23556245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23556626 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 23556666 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23556677 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23556980 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 23557014 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 23557018 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 23557139 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23557155 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23557186 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23557278 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 23557294 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 23557490 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 23557746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23557861 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23557975 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 23558119 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 23558218 G T Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 23564632 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 23564825 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 23564963 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 23565081 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 23565355 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23565455 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 23565481 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 23566015 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 23566442 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 23566573 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 23566828 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23566851 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 23566928 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23567187 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 23568031 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 23568032 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23568101 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 23568637 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 23568671 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 23568740 G T N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 23569295 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23569364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23569653 T G N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 23569717 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 23569725 A G Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 2 23569779 A T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 23570020 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23570053 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 23571096 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 23571168 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 23571296 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 23571426 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 23571938 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 23572105 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23572500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23573771 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23574685 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23574985 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23576016 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 23576513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23577107 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23577336 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23577945 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23578250 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 23578779 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23579073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23579521 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23579673 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23580314 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 23580569 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 23580818 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 23581019 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 23581185 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23581203 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23581305 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 23581313 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 23581603 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23581670 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23581794 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23581972 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 23582154 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23582220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23582247 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23582257 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23582376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23582878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23583165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23583851 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23583924 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23583986 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 23583992 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 23583997 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 23584048 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 23584137 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 23584227 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 2 23584352 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23584412 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23584555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23584604 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23584605 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23584704 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23584723 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 23584769 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 23584850 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 23584861 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 23585510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23585532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23585577 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23585780 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23585800 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23585928 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23586158 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23586245 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 23586801 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23586843 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 23586950 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 23587350 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23587422 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 23587824 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 23588034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23588124 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23588530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23588682 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 23588702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23588732 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 23589052 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 23589417 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23589935 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23590104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23590152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23590251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23590262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23590296 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23590523 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23590750 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23590757 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23590762 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23591041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23591230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23591367 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23591753 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23591806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23592253 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23593034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23593123 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 23593301 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23593409 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23593445 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23593954 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 23594043 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23594363 G C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 23594510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23594600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23594645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23594727 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23594990 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23595672 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23595684 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23595713 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23595722 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23595876 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 23595922 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23596166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23596283 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23597261 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23597358 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23597401 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23597729 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23597799 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 23597891 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23597955 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23598634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23598676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23598993 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23599480 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23600237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23600493 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23600584 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23600719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23601540 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23601637 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23601654 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23601910 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23601946 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23602309 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23602389 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23602398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23602464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23602468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23602515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23603022 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 23603128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23603140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23603173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23603191 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23603448 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23603699 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23603981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23604133 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23604259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23604878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23605190 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23605327 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23605645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23605814 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23606029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23606340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23606500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23606536 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23606687 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23607149 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 23607203 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23607406 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 23608111 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23608262 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23608598 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23608727 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23609225 C T Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 23609240 C T Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 23609276 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 23609515 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23609803 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 23610187 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 23610734 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 23611682 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 23612109 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 23612443 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 23612474 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 23613920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23614615 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23615177 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23615222 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23615284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23615426 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23615491 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 23615500 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 23615524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23615585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23615913 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23616154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23616273 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23616288 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23616337 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23616375 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23616397 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 23616449 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 23616955 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23616987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23617192 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23617329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23617390 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23617487 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23617570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23617713 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23617715 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23617771 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23617903 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23617960 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23618171 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23618307 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23618321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23618331 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23618542 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23618555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23618585 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23618613 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23618763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23618773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23618818 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23618912 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23618965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23619150 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23619588 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23619597 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23619607 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23619621 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23619912 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 23619926 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23620018 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23620129 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23620658 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23620914 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23621902 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23622074 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 23623722 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 23624433 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23624490 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23624865 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23624867 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23624993 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23625046 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23625200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23625280 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23625765 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23625803 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23626085 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23626174 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23626352 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23626353 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23626374 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23626611 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23626665 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23627461 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23627624 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23627645 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23627673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23628318 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23628483 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23628608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23628809 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23629079 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23629080 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23629507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23629572 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23629594 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23629638 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23629641 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23629753 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23629942 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23629960 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23630434 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23630447 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23630565 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23630608 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 23630829 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23631180 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 23631250 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23631254 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23631359 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23631535 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23631606 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 23631889 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 23631894 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23631998 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23632246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23632412 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23632511 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23632530 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23632575 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23632604 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23632779 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23632793 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23632876 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23632921 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 23633263 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 23633292 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23633302 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23633422 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23633562 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23633592 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23633598 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23633620 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23633676 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23633692 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23633808 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23633811 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23633827 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23633839 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23633955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23633965 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23634225 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23634421 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23635183 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23636411 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 23636614 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 23636788 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 23637023 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 23637035 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23637710 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23637796 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 23637841 G T Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 23638724 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23638867 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23638948 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 23639285 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 23639599 C A Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 23644828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23644935 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 23645009 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23646087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23646206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23646232 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 23646451 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23647368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23647454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23647489 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23648049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23648242 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23648334 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 23648543 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23648643 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23649002 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 23649006 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 23649014 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 23649158 G T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 23650706 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23657963 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23658164 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 23658194 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23658434 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23658490 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23658496 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23658540 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 23658558 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23658671 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23658682 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23658719 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23658794 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23658801 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23658819 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23658874 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23658881 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23658963 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23658975 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23659030 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23659081 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 23659116 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23659130 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23659188 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23659218 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23659252 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23659521 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23659611 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 23659700 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23659784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23659818 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23659843 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23660140 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 23660178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23660212 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23660213 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23660237 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23660267 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23660299 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23660565 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23660638 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 23660866 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23661007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23661116 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23661169 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23661362 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 23661368 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23661414 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 23661522 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 23661545 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 23661643 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23661728 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23661796 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 23661975 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23662183 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 23662252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23662329 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 23662346 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 23662430 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23662608 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23662642 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23662766 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23662891 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23663000 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23663571 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23663642 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23663700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23663795 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23663796 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23663806 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23664006 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23664017 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23664027 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23664051 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23664373 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 23664425 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23664519 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23664655 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23664739 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23664758 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23665241 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23665280 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 23665281 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23665304 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 23665358 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 23665433 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23665594 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23665865 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23665987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23666003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23666157 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23666254 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23666403 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23666591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23666631 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23667050 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 23667274 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 23667358 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23667384 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23667436 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 23667456 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 23667605 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 23667681 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 23667754 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23667769 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23667953 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23668032 A C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 23668070 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23668102 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23668152 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 23668221 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23668249 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23668302 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23668371 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 23668443 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23668550 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23668599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23668625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23668656 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23668666 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23668794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23668804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23668868 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23668875 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 23668885 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23668917 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23669010 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23669087 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23669091 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23669208 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 23669227 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23669301 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 23669311 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 23669448 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23669468 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23669537 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 23669547 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 23671712 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 23671774 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23671798 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23671966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23672032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23672257 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23672266 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23672374 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23672516 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23672535 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23672591 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23672763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23672928 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23672929 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23673389 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23673540 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23673700 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23673735 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 23673944 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 23673958 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 23674191 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23674204 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 23674224 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23674418 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23674626 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23674629 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 23674697 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 23674987 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23675059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23675091 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23675108 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 23675226 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23675258 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23675300 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23675318 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 23675521 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23675529 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23675618 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 23675653 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23675718 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23675730 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 23675850 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23675880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23676129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23676149 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23676229 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23676271 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23676322 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23676484 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23676501 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23676505 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23676729 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23676828 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 23676896 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23677119 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23677243 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23677320 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23677322 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 23677585 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 23677669 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23677710 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 23677750 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 23677808 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 23677862 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23678014 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23678127 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 2 23678253 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 23678274 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 23678350 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23678379 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23678400 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23678476 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23678486 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23678510 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23678516 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23678557 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 23678603 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 23678672 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 23678751 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23678815 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 23678826 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 23678846 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 23678875 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 2 23678888 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 23678925 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.0833333333333333 12 12 1 10 1 2 23678942 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 2 23679002 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 2 23679070 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 2 23679096 A G N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 2 23679148 G T N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 23679469 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 23679549 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 23679647 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 23679720 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 23679893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23680041 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 23680049 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 23680314 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 23680412 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 23680465 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 23680646 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 23680732 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 23680815 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 23680878 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 2 23681026 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23681027 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 23681161 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 23681196 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 23681341 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23681358 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 23681368 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23681402 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 23681437 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 23681479 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 23681541 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23681549 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 23681553 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 23681680 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 23681726 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 23681806 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 23681870 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23681878 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 23681922 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 23681970 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 23681987 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23682029 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 23682038 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 23682152 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 23682194 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23682364 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 23682365 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 23682511 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 23682525 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23682570 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23682576 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23682589 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 23682601 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23682674 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23682688 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23682813 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 23682921 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23682947 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23682985 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23683109 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 23683397 C A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 23683610 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 23683656 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 23683706 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23683722 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 23683762 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23683861 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23683888 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23684125 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23684192 C A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23684218 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23684503 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23684526 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23684590 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 23684617 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23684693 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23684707 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 23684766 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23684788 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23684920 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23684937 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23684976 T A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 23685101 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 23685182 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23685199 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23685222 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23685247 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23685273 A T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 23685329 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23685356 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23685461 C A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 23685507 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23685553 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 23685625 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 23685713 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23685775 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23685800 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 23685827 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 23685881 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 23685893 A G Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 23685943 C A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 23685959 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23686019 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23686052 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 23686122 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 23686145 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23686200 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23686202 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23686234 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23686235 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23686300 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23686354 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 23686414 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23686430 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23686433 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23686467 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23686477 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23686520 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23686521 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23686534 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23686583 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23686642 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23686646 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23686707 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23686850 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23686888 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23686899 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23687053 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 23687074 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 23687212 C A N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 23687296 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 23687379 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 23687410 A G Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 23687419 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 23687473 C T Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 23687652 A C Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 23687697 A G Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 23687717 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 23687805 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 23687829 G A Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 23687834 C G Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 23687846 C T Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 23687915 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 23687941 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 23687971 G A Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 23688020 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 23688743 G A Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 23688805 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 23688868 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23688910 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23688978 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23689007 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23689017 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23689048 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23689076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23689083 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23689114 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23689143 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23689191 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23689201 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23689203 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23689227 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23689232 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23689290 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23689315 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23689336 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23689402 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23689413 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23689462 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23689546 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23689619 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23689727 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23689734 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23689775 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23689792 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23689830 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23689843 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23689883 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23689949 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 23690013 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 23690036 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 23690123 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23690142 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23690376 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23690390 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 23690611 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 23690674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23690749 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 23690799 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 23690934 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 23690936 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 23690958 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 23690994 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23691011 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 23691069 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 23691109 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 23691252 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23691261 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23691320 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23691384 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23691432 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23691466 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23691497 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23691532 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 23691557 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 23691572 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23691759 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23691792 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23692524 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23692563 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23692608 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 23692907 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23692979 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23693018 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23693086 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 23693133 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23693143 T G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23693145 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23693157 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 23693170 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23693184 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23693269 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 23693299 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23693331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23693345 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 23693359 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23693395 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 23693459 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 23693509 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 23693537 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23693778 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 23694037 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23694069 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 23694080 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 23694264 G C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 23694460 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23694505 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23694528 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23694541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23694581 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23694638 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23694829 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 23694848 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23694936 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 23694946 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 23694984 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 23695067 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 23695106 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23695129 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 23695160 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23695175 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23695354 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23695715 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 23695907 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 23696058 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23696420 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23697614 A C Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 23697630 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 23697706 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23697937 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23697958 A T Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 23698465 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 23698546 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23698630 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23698962 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23699104 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23699220 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23699271 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23699310 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23699446 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23699687 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23700130 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23700251 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23700331 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23700363 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23700418 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23700485 C A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 23700490 C A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 23700655 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 23700855 C T Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 23700898 T C Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 23701067 A C Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 23701353 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 23701690 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23701764 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23701780 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23701987 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23702118 G T Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 2 23702160 C G Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 2 23702247 C T Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 23702260 C T Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 23702283 G T Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 23702285 C A Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 23702302 A T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 23702631 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23702673 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23702751 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23702797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23702853 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23703201 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 23703212 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 23703213 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 23703254 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23703306 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23703328 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23703366 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23703502 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23703641 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23704173 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 23704208 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 23704234 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 23704408 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23704409 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 23704772 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 23705111 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23706589 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23706598 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23706835 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23706885 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23707118 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23707461 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23708011 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 23708718 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23709008 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23709142 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 23709159 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23709461 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23709524 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 23709554 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23709727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23709820 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23709939 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23709967 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23710096 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23710135 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23710148 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 23710164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23710244 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23710284 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23710326 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23710420 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 23710580 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23710674 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23710734 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23711010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23711013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23711397 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23711732 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 23711778 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23712404 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23712561 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23712565 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 23712622 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23712912 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23712956 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23713148 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23713155 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23713223 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23713248 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23713267 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23713324 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23713345 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23713385 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23713411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23713428 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23713495 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23713554 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23713584 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23713622 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23713748 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23713786 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 23713867 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23713900 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23714168 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23714592 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 23714887 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 23715092 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23715151 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23715190 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23715226 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23715231 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23715247 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23715444 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23715496 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23715568 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 23715715 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 23715832 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23715944 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23715972 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23715982 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23716107 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23716114 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23716181 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23716477 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 23716776 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23716779 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23716803 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23716854 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23716883 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23716959 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23717344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23717379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23717649 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23717824 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23717981 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23718073 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 23718084 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23718866 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23718881 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23719093 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23719108 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23719139 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23719176 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23719472 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23719491 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 23719835 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23720390 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23720929 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23721062 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 23721155 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23721192 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23721210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23721276 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23721892 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23721968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23722027 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23723042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23723519 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 23723610 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23723747 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23723766 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 23723787 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23723825 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23723945 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23724417 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23724673 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23724726 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23724848 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23725059 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23725157 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 23725247 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23725303 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 23725382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23725409 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23725465 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 23725532 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 23725686 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 23725762 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 2 23725888 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 23725982 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23725989 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23726016 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23726048 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 23726050 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 23726081 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 23726121 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23726260 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 23726334 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23726370 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23726387 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 23726412 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 23726495 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 23726546 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23726586 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 23726717 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 23726987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23727080 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 23727119 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23727163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23727257 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23727264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23727476 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23727512 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23727520 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23727615 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23727657 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23727950 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23727954 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23727968 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23728074 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23728111 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23728325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23728460 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23728474 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23728534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23728587 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23728589 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23728691 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23728707 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23728767 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23728782 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23728875 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23728957 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23728993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23729042 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23729070 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23729108 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23729139 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23729166 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23729215 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23729217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23729287 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 23729437 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23729580 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23729650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23729767 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23729919 C G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 23729934 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23729946 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23730436 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 23730683 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23730762 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23730776 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23730812 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23730861 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23730938 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23731045 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23731382 A T N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 23731390 A C N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 23731437 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 23731574 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23731611 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23731651 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23731652 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23731682 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23731800 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23731815 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23731841 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23731942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23731961 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23731999 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23732011 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23732033 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23732193 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23732504 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23732543 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23732585 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23732586 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23732840 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23733096 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23733103 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23733128 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23733219 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23733260 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23733356 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23733484 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23733617 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23733733 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23733790 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23733842 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23733972 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23733988 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23734080 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23734108 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23734130 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 23734251 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23734392 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23734430 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23734464 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23734491 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23734997 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23735076 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23735114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23735139 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23735146 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23735154 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23735173 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23735200 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23735747 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23735786 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23735925 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23735940 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23735943 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23735967 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23735976 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23736053 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23736123 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23736208 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23736286 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23736562 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 23736710 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23736711 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23736721 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23736722 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23736771 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23736850 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23737154 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23737204 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23737231 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23737369 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23737425 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23737472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23737494 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 23737519 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23737570 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23737610 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23737678 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23737710 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23737750 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23737869 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23738132 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23738245 G T Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 23738557 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23738567 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23738570 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23738732 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23738813 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23738817 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23738844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23738854 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23738978 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23739497 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23740992 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 23742586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23742643 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 23744102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23744882 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23745961 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23747374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23747983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23748155 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23748407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23748747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23749519 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 23751123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23752736 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23753284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23755206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23755385 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23755565 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23757130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23761002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23762417 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23763530 G T Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 23763881 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23764866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23765623 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23766278 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 23766397 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23767421 C A Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 23770764 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 23772000 G C Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 23782240 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 23782563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23783583 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23783584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23783835 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23784215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23784711 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23785839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23785919 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23787252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23787649 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 23788648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23788699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23790763 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23791364 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23791644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23791682 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23792993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23813184 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23813666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23815527 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23816224 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23816849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23817805 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 23817964 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23818624 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 23818657 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 23819062 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23819155 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23819165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23819262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23819267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23819364 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23819367 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23820165 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23820775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23820912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23820949 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23820968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23820998 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23821034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23821075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23821076 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23821199 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23821233 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23821318 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23821636 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23821650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23821704 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23821743 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23821900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23822352 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 23822395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23822403 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23822678 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23823136 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23823425 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23823697 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23823798 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23823981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23824819 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23824840 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 23824950 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23825002 T A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 23825767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23825771 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 23825831 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23825838 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 23825860 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23825954 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 23826112 A T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 23826239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23826422 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 23826640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23826987 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 23827355 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 23827433 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 23827770 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 23828000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23828028 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 23828483 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 23828543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23829518 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 23829520 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 23830670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23833230 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 23833256 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 23834118 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23834152 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23834304 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 23834708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23835302 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23835525 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23835597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23835743 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 23835811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23835821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23835982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23836036 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23836314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23836452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23836467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23837260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23837348 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23837479 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23838142 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23838305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23839032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23839150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23839415 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23839711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23840014 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23840354 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23840378 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23840406 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23840558 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23840605 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23840607 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23840635 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23840688 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23840804 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23840933 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23841398 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 23841528 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 23841653 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23841767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23841770 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23841788 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23841867 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23841896 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23841923 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23842247 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23842543 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23842839 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23842851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23843027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23843144 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23843214 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23843247 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23843260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23843265 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23843302 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23843392 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23843431 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23843536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23843893 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23843916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23843925 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23844013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23844163 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23844611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23844699 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23844777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23844882 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 23844907 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23845367 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23845411 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23845440 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23845531 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23845807 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23845963 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23845967 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23845988 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23846173 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23846324 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23846441 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23846578 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 23846627 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 23846732 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 23846736 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 23846880 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23846891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23847027 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23847116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23847444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23847451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23847558 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23847660 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23847950 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23848680 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 23849130 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23849572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23849963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23849978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23850430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23850830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23851001 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23851074 A C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 23851480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23851526 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 23851569 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 23851590 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23851595 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23851627 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23852019 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23852323 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23852341 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 23852532 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 23852615 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 23852850 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 23852860 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 23853067 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23853306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23853448 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23853484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23854187 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 23854801 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23854809 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23854845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23854981 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 23857101 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 23857202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23857670 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 23859823 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 23860159 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 23860314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23860535 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 23860583 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23860839 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23861316 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 23861346 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 23861363 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 23861370 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 23861603 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 23861700 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 23861891 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23862055 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 23862113 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23862423 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23862652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23863550 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23863758 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 23863888 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 23863965 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23863981 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 23863989 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 23864011 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 23864076 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 23864171 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 23864230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23864446 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 23864490 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 23864558 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 23864581 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23864608 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23864626 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 23864704 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23864733 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 23864746 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 23865042 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 23865269 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23865301 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 23865413 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 23865482 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23865717 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 23865762 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 23865878 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23865920 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 23866030 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23866348 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 23867586 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 23867771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23868579 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 23869998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23871611 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23875394 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 23876145 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 23878176 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23878628 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 23884499 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23884671 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23886643 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 2 23888916 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23889406 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 23890007 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 23891949 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23893071 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23896915 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23897097 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23897666 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23898902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23900579 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 23901730 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23902198 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23903416 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 23903420 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 23903570 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 23903594 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 23903990 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 23904117 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23904156 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23904172 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23904286 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23904309 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23904357 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 23905435 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23905504 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23905612 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23905687 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23905761 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23906329 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 23906830 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 23906930 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 23907353 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 23907536 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 23907573 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23907650 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23907736 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23907866 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23907945 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23908022 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23908051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23908211 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 23908238 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23908840 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23909048 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23909246 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23910429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23910474 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23910699 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23910701 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23910722 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23910878 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23910917 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23910963 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23911076 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23911126 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23911142 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23911333 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23911373 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23911386 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 23911407 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23911614 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23911638 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23911735 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23911751 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23911948 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23912057 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 23912058 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23912157 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23912339 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23912662 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23912683 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23912708 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23912714 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23912743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23912768 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23912812 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23912827 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23912958 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23913138 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23913185 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23913231 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23913333 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23913414 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23913540 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23913640 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 23913702 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23913740 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23913910 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23913928 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23913979 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23914091 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23914117 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23914711 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23914751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23915047 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23915145 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23915160 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23915201 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23915840 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23915987 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23915999 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 23916059 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23916211 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23916269 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23916283 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23916308 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23916457 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 23916519 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23916937 T C Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 23916999 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 23917001 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 23917016 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 23917080 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 23917155 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 23917234 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23917344 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 23917415 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23917497 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23917561 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23917570 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23917666 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23917725 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23917750 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23917751 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23917806 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23917876 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23917930 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918022 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918035 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918049 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918058 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918063 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918093 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918102 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918152 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918153 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918180 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918196 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918202 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918256 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23918258 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23918424 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23918459 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23918532 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23918711 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 23918786 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23918864 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23918867 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23918905 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23918911 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23918964 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 23918992 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 23919059 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23919187 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23919213 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23919225 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23919243 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23919331 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23919368 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23919384 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23919452 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23919841 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23919872 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23919909 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23919989 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 23920059 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 23920115 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 23920135 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 23920167 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 23920194 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23920224 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23920242 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23920263 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23920366 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 23920373 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 23920455 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23920580 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 23920587 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 23920597 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 23920626 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 23920664 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 23920667 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 23920689 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 23920722 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 23920755 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 23920766 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23920840 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 23920874 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 23920989 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 23921073 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23921111 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 23921133 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 23921137 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 23921224 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 23921245 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 23921248 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 2 23921440 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23921635 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 23921787 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 23921888 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 23921924 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 23921946 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 23921990 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23922063 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 23922097 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23922202 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23922203 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23922243 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23922249 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23922360 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 23922507 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 23922536 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 23922853 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23923008 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23923015 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 23923087 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23923109 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23923312 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 23923490 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23923543 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23923748 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23923757 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 23923940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23923953 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 23923955 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 23924015 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23924027 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 23924108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23924126 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 23924356 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 23924607 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 23924954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23926173 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 23926548 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23926745 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 23927899 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23928493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23928542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23928625 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23928990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23930047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23931718 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 23932010 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 23932489 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 23933351 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23939084 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 23939588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23941801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23942184 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23942349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23944648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23946918 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23946967 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23947159 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 23948386 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 23949433 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 23949749 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23950242 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23950619 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 23951019 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 23951025 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 23951160 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 23951169 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 23951262 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 23951309 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23951355 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 23951382 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 23951425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23951451 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 23951467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23951624 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 23951629 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 23951762 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 23951838 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 23951851 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 23951887 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 23951905 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 23954736 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23954764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23955471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23956413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23959540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23959986 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23960392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23961195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23961658 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 23963490 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 23965180 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23965470 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23965518 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23966450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23967432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23969237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23971165 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 23979998 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 23981505 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23982626 C A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 23982638 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 23982645 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 23982673 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 23982688 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 23982697 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 23983437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23983979 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23984869 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 23985042 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 23985111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23985654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23987488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23988643 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23989441 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 23989521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23990369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23990710 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 23990961 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 23991066 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 23991984 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23994244 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23994863 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23995403 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23995499 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 23996395 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23996986 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 23997995 T C Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 23998952 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 24000128 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 24000239 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 24004345 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24004420 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24005048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24005233 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24006329 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 24007898 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 2 24008121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24008670 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24009896 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 24010545 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24010692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24010828 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 24010908 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 24011000 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24014061 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 24014515 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24014683 T A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 24014915 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 2 24015008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24015057 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 24015069 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 24015108 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24015160 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24017597 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24017939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24018842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24019114 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 24019857 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24024627 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24025388 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 24026921 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 24028201 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24028779 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24028872 G T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 24029420 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24029505 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24030226 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 24030326 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24030353 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 24030483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24030561 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 24030625 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24030967 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 24031035 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24031064 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24031068 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24031343 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24031456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24031600 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24031691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24031815 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 24031890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24031935 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24031968 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24031976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24031991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24032021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24032408 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24032440 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24032467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24032520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24032566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24032574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24032630 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24032680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24032714 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 24032854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24032930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24032950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24032957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24032972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24032988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24033078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24033117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24033230 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24033272 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 24033374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24033382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24033424 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24033970 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24034019 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 24034288 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 24034395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24035200 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24035344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24035423 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24035479 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 24035506 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24035535 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 24035565 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 24035568 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24035595 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24035665 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 24035712 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24035770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24035810 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24035893 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24036018 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 24036075 G T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 24036125 T A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 24036198 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 24036410 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 24036513 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24036593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24036594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24036620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24036636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24036678 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24036877 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 24037284 A C N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 24037317 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24037381 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24037459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24037468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24037482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24037530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24037533 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24037641 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 24037694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24037700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24037710 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24037872 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24037906 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24038019 G A N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 24038234 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 24038535 G C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 24038582 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 24038589 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 24038603 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 24038653 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 24038961 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 24039228 G C Y N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 24039474 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 24039726 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 24039744 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24039749 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24039996 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24040471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24040607 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24040652 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24040853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24040924 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 24041162 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 24041165 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24041324 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24041690 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24042148 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 24042164 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 24042239 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 24042277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24042397 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24042796 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 24043017 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24043035 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 24043043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24043124 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 24043142 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 24043170 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24043210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24043805 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24044145 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24044147 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 24044266 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24044427 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 24044462 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 24044623 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24044985 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24046355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24046500 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24046742 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24046769 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24047352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24047505 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 24047507 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 24047522 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24047734 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 24047798 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 24047987 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24048387 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24048487 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24048515 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24048538 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24048593 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24048722 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24048750 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24054819 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24054920 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24055446 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24055580 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24055674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24055696 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 24055962 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24056065 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24056257 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24056265 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24056278 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24056302 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24056305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24056368 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24056436 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24056638 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 24056886 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 24056958 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 24057168 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 24057225 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 24057599 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24057921 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24058209 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24058836 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24058837 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24059014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24059064 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 24059120 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 24059204 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 24059410 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 24059476 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 24059566 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24059570 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24059645 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24059718 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24059981 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24059993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24060347 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24060414 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24060481 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 24060500 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24060544 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24060557 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24060587 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24060593 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24060598 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24060643 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24060670 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24060705 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24060783 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 24060889 T A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 2 24060912 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 24061314 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 2 24061332 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 24061570 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 2 24061572 C A N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 2 24061692 C T Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 24062196 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.461538461538462 0.153846153846154 0.384615384615385 14 12 6 2 5 2 24062227 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 2 24062269 T G N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 2 24062426 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 2 24062463 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 2 24062466 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 2 24062520 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 2 24063119 C T N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 24063413 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 24064025 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 24064305 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 24064725 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24064828 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 24065369 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 24065387 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 24065395 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 24065538 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 24065701 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 24066089 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 24066269 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 2 24066313 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 24066341 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 24066486 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 2 24066628 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 20 20 2 16 2 2 24066664 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 2 24066713 T C Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 24067107 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24067188 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 24067213 A G Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 24067414 T C Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 2 24067423 T C Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 2 24067446 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 24067453 G T Y N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 2 24067482 G A Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 24067657 A C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 24067695 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 24067710 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 24067798 G C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 24067800 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 24068127 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 24068129 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24069261 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24069269 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 24069322 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24069323 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24069584 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24069630 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 24070633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24070729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24070815 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24071455 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24071791 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24071814 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24072717 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24072893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24072903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24072917 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 24073073 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24073078 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24073105 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24073490 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24074405 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 24074639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24074872 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24075053 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24075798 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24075832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24076007 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24076354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24076499 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24076822 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24077246 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24077499 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24077710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24078351 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24078369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24078646 A T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 24078841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24079006 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24079896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24080245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24080707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24080853 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24080963 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 24080982 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 24081024 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 24081046 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24081113 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 24081380 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 24081435 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 24081557 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24081635 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24081701 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24081705 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24081760 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24081829 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24081855 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24081877 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24081924 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24082025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24082067 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24082100 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24082102 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24082171 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24082221 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24082313 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24082319 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24082337 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24082366 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24082519 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24082630 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 24082678 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 24082705 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24082823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24082828 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24082847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24082929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24082968 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24083008 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24083041 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24083048 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24083053 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24083072 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24083086 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24083087 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24083098 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24083115 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24083160 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24083172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24083306 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24083429 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 24083461 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 24083469 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 24083508 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 24083664 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 24083770 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 24083772 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 24083864 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24083879 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24083916 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 24083973 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24084099 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 24084151 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 24084188 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 24084281 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 24084300 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 24084311 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 24084384 T G Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 24084765 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 24084775 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24084818 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24084840 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24084851 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24084883 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 24084943 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 24084991 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 24085002 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 24085046 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24085094 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24085103 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 24085161 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 24085286 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24085306 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24085320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24085339 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24085344 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24085361 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24085478 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24085484 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24085511 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24085531 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 24085567 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24085633 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24085709 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24085729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24085742 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24085840 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24085873 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24085949 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24085977 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24085995 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24086014 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24086024 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24086125 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24086327 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 24086358 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 24086400 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24086420 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24086452 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24086513 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24086534 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24086589 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24086590 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24086680 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24086760 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24086868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24086986 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24087042 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24087044 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24087066 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24087109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24087221 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24087370 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24087380 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24087430 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24087661 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24087687 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24087694 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24087790 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 24087799 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 24087810 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24087836 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 24087880 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24087888 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24087914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24087921 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24087952 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24087966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24087997 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 24088105 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24088114 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24088201 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24088232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24088258 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 24088291 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24088346 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24088395 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24088456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24088487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24088501 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24088607 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24088703 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24088721 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24088776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24088784 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24088790 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24088837 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24088843 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24088867 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24088885 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24088913 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24088933 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24089016 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24089464 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 24089482 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 24089511 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24089582 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 24089604 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24089616 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24089668 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24089778 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24089863 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24089904 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24090006 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24090087 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24090116 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24090162 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24090174 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24090209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24090210 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24090252 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24090257 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24090422 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24090430 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 24090616 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24090656 C G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 24090714 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 24090836 C G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 24090891 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 24090911 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24090956 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 24091131 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 24091146 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 24091185 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24091228 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 24091311 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24091376 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24091399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24091622 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24091691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24091708 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24091752 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24091880 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24091900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24092178 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24092273 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24092322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24092425 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24092669 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24092702 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24093062 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24093068 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24093122 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 24093150 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24093184 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 24093218 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 24093276 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 24099751 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24099897 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24100362 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24100456 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24100460 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24100601 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24100651 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24100680 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24100838 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24101014 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24101136 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 24101198 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24101443 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24101686 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24101884 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24101946 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24101954 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24101979 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24102027 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24102032 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24102045 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24102076 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 24102091 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 24102186 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24102206 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24102232 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24102248 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24102280 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24102376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24102405 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24102496 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 24102582 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24102598 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24102684 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24102699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24102705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24102735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24102755 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24102913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24102929 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24103001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24103093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24103152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24103153 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 24103176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24103257 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24103282 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24103474 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24103661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24104213 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24104234 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24104271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24104394 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24104452 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 24104508 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24104557 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 24104564 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24104568 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24104587 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24104591 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 24104642 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 24104674 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24104695 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24104760 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24104944 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24104980 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24105028 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24105118 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24105195 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24105197 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24105362 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 24105378 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 24105387 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24105417 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 24105459 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 24105485 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24105682 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24105710 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24105802 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24105832 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24106019 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 24106094 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 24106186 C G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 24106187 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 24106245 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24106317 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 24106350 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24106370 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24106501 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24106538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24106596 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 24106755 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24106862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24106970 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24107084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24107099 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24107155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24107173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24107269 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24107335 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24107337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24107428 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24107431 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24107445 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24107450 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24107481 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24107548 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24107608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24107629 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24107755 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24107863 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24107897 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 24107923 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24107934 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108301 A C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108312 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108313 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108505 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108560 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108586 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108651 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108655 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108670 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108710 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108734 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108735 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24108765 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108865 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24108944 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 24109025 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24109035 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24109044 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 24109054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24109104 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24109155 C A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 24109259 A T Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 24109844 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 24109846 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 24109890 C G Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 24109939 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 24109963 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 24110144 T A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 24110192 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 24110246 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 24110259 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 24110391 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 24110468 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 24110480 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24110569 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24110592 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 24110652 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24110674 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 24110776 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24110875 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24110880 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24110918 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 24110920 A C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24110996 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 2 24110997 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 24111184 G T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 24111261 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 24111344 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24111431 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 24111492 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 24111532 A G Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 24111635 T C Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 24111833 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 24111912 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 24111969 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24112069 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 24112106 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24112186 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 24112217 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 24112224 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24112338 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24112352 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24112412 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 24112548 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 24112563 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 24112680 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 24112770 A T Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 24112878 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 24112944 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 24113018 G A Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 24113107 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 24113120 C A Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 24113142 A C Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 24113412 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 24113532 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 24113536 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 2 24113790 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 24113853 C A Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 24113889 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 24113898 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 24113956 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 24114020 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 24114169 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 24114194 G T Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 2 24114200 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 24114229 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 24114235 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24114700 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 24114729 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24114731 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 24114935 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 24115073 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24115854 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 24115900 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24115975 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24116070 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24116101 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24116222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24116243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24116464 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24116518 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24116532 G C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 24116723 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 24116791 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24116925 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 24117116 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 24117449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24117580 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24117618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24117619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24117647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24117856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24117875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24118046 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24118106 A T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 24118181 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24118207 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24118273 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 24118286 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24118591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24118697 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24118732 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24118768 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24118798 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 24118995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24119276 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 24119353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24119390 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24119487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24119553 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 24119634 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24120255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24120877 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 24121031 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 24121867 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 24122140 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 2 24123152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24124234 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24125773 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24125845 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24126129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24126359 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24126442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24126667 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24126704 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24126795 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24126869 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24127297 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24127334 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 24127372 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24127413 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 24127607 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24128877 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 24129079 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24129471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24129935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24130480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24130530 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 24130604 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 24131069 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24131088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24131176 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24131183 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24131228 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24131244 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24131327 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 24131465 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24131471 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24131501 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24131585 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 24131703 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 24131827 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 24131837 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 24131858 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 24131863 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 24131904 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 24132236 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24133101 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 24133866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24134534 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 24134577 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 24134666 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24134757 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 24135525 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24135559 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24135741 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24135752 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24135766 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24136005 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 24136111 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 24136153 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 24136161 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24136202 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24136288 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24136461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24136621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24136679 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24137113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24137114 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 24137333 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 24137388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24137764 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 24137787 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 24138766 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 24138836 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24138845 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 24138928 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 24138938 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 24139153 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 24139168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24139296 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 24139535 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 24139685 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24139708 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 24139731 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24139779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24140313 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 24140421 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 24140511 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24140546 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 24140548 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24140571 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 24140665 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 24140846 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24140897 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 24140926 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 24140939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24140973 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 24140983 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 24141040 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 24141075 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 24141226 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24141285 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 24141297 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 24141387 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 24141391 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 24141406 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 24141538 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24141614 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24141644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24141712 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24141779 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24141787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24141798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24141838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24141851 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24141887 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24141892 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24141963 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 24141995 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24142071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24142210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24142308 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24142318 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 24142482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24142589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24142632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24142796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24142836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24142942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24142962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24142975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24143034 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 24143171 C G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 24143303 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 24143322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24143849 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24143955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24143976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24143988 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24144104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24144166 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24144232 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 24144294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24144415 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 24144479 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24144560 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 24144963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24144980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24145010 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24145020 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24145091 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 24145183 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24145289 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24145514 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24145573 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24145592 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 24145627 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 24145629 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 24145676 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 24145731 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 24145797 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 24145801 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 24145820 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 24145828 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 24145873 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 24145912 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24145918 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 24145945 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 24145956 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 24145971 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24145990 C A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 24146073 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 24146095 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 24146207 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 24146249 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 24146280 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 24146313 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 24146884 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24146890 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 24146987 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 24147028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24147077 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 24147295 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24147346 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 24147472 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24147507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24147549 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 24147569 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 24147594 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 24147611 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 24147626 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24147773 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 24147873 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24147917 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24147929 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 2 24147999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24148066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24148208 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24148234 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24148538 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24148583 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24148588 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24149290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24149497 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 24149507 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 24149508 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 24149555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24149707 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24149716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24149765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24149790 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 24149791 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 24149999 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 24150186 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 24150387 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24150435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24150536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24150637 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24150901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24151003 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24151018 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24151073 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 24151143 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 24151208 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 24151266 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24151284 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 24151348 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24151376 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 24151415 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 24151495 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24151524 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24151529 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24151601 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 24151639 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 24152024 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24152025 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24152038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24152053 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24152088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24152104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24152147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24152158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24152204 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 24152218 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24152222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24152241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24152276 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24152301 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24152344 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24152348 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24152406 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24152409 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24152495 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24152519 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 24152522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24152535 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24152537 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 24152562 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24152604 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 24152607 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24152652 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24152807 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24152909 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24152926 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 24152984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24153026 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24153029 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24153096 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24153212 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24153248 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24153307 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24153349 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24153399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24153437 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24153446 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 24153459 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24153499 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24153532 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 24153534 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 24153568 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24153646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24153712 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24153739 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 24154960 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24155046 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 24155122 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24155148 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 24155261 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 24155619 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 24155688 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24155703 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24155710 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24155879 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 24156085 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24156140 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 24156452 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 24156502 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 24156616 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 24156737 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 24158328 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 24159023 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 24159046 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24159532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24159557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24159659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24160046 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24160272 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24160401 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24160410 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24160446 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24160459 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 24160467 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 24160591 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24160683 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24160709 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24160772 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24160885 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 24160900 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 24160901 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 24160957 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24161000 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24161098 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24161106 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 24161228 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 24161255 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24161484 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 24161943 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 24161984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24162216 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24162256 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 24162282 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 24162585 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24162597 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 24162798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24163084 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 24163275 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 24163308 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24163734 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24163751 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24164129 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 24164152 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24164156 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24164214 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24164257 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 24164268 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 24164277 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 24164651 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24165113 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24165802 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24166454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24166685 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24166782 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24166984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24167233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24167590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24168756 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24168791 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 24168941 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24169457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24169641 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24169718 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24169824 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 24169951 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24170077 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24170256 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 24170260 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 24170328 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24170365 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24170460 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 24170500 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 24170936 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24171243 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24171534 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24171715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24171745 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24171801 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24171846 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 24171934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24171942 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24171993 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24172000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24172201 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24172277 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24172542 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24172768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24172877 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24172920 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24173084 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24173108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24173182 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24173186 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24173214 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24173227 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24173246 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24173256 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24173317 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24173467 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24174059 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 24174130 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24175184 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24175292 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24175408 C T N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 24175629 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24175693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24176148 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24178317 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24178723 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 24179358 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 24179630 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24179717 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 24179726 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 24180232 G C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 24181469 T G Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 24181725 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 24181741 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 24182076 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 24182848 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24183182 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24183588 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24183835 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24183870 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 24183950 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 24183954 G T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 24184358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24184435 A T Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 24184494 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24184588 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 24184857 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24185005 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24185168 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24185223 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24185589 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24185752 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24185843 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 24185849 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 24185869 C T N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 2 24186128 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 24186146 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 24186214 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 24186374 G T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 24187007 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 24187791 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24187807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24187951 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24187997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24188121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24188450 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24188476 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 24188788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24188976 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 24189624 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24189647 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24189704 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 24189706 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24189899 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24189981 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24190597 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24190786 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24190848 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 24190882 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 24191120 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24191811 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 24191919 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 24192060 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24192125 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24192190 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24192312 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24192500 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24192561 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24192589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24192590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24192938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24193072 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 24193579 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 24195632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24196261 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24197438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24197847 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24198579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24202526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24206317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24207929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24208425 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24208653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24208676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24212600 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24214284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24214813 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 24215977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24217684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24222944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24227780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24228952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24230535 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24231417 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24232158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24232215 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24237912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24239933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24240037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24240146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24240252 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24240253 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 24240289 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24240342 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24240390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24240989 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 24241235 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 24241589 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 24241958 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 24242332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24242675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24243372 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24243476 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24243496 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24243600 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24243657 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 2 24244002 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 24244511 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 24245244 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24245266 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24245293 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24245380 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24245401 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24245491 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24245620 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 24245641 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24245675 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 24245784 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24245800 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24245836 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24245868 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24245991 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24245995 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24246014 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24246044 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24246057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24246126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24246179 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24246272 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24246408 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24246424 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24246768 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 24246818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24246832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24246849 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24246883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24246899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24247196 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24247292 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 24247738 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 24248004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24248013 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24248436 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 24249877 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24250873 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24250916 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 2 24251188 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24251226 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24251247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24251300 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24251325 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24251360 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24251382 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24251385 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24251569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24252100 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24252199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24252258 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24252437 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 24252457 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 24252489 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 24252616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24252626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24253187 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24253483 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24253609 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 24253663 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 24253697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24253869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24253962 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 24253982 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24254002 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24254009 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24254017 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 24254205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24254218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24254610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24257589 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 24257590 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 24258547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24262457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24264212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24264395 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24264433 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 2 24264625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24264685 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 24264799 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 24264906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24264984 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24264992 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24265006 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24265044 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 24265163 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 24265198 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24265307 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24265349 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24265395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24265409 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24265411 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24265420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24265422 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24265434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24265485 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24265519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24265574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24265591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24266055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24266569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24267137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24267482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24267846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24268046 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 24268159 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24268473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24268827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24269055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24269500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24271266 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 24272928 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 24274119 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24275121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24276379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24277344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24277507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24277538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24277951 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 24278535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24279148 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 2 24279690 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 24280040 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24280892 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 24281058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24281480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24281636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24282313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24283078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24283096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24285197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24285508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24285770 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24286696 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24287875 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24288062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24288160 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24288258 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24288319 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24292671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24294165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24294613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24295164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24302223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24305737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24305967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24307474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24308629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24308665 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 24309850 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24310999 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24311000 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24312047 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 24312057 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24312350 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24312732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24313574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24314225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24314646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24315288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24315456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24318869 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 24318946 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 24321293 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 24321661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24321663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24326766 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24326976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24328073 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24334407 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 24334417 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 24334896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24336236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24336419 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24339169 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 24339597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24339704 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 24339789 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 24339857 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 24340164 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24340386 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24340410 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 24340453 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 24340496 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 24340566 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24340828 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24340841 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24340862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24340893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24340928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24341142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24341233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24341372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24345605 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 24346286 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24346399 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24347559 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 24347617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24347644 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 24347695 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 24347726 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 24347755 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 24347946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24349724 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24349757 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24349828 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24350313 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24350409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24350447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24350463 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 24350480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24350516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24350577 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24351039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24351095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24351413 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 24351534 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 24351639 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 24352710 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 24352775 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24352819 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 24353051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24353078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24353188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24353226 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 24353350 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 24353464 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24353466 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24353568 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 24353574 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24353605 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 24353619 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 24353748 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24353806 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24353833 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 24354006 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24354008 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 24354018 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 24354071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24354117 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 24354218 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24354236 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24354518 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24354556 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24354571 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 24354578 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24354620 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24354671 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24354682 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24354924 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24354954 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24354988 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 24355113 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24355122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355134 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355278 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355375 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24355392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355451 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355598 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 24355643 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24355749 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24355822 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24355918 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24356050 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24356115 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24356260 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24356269 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24356324 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24356386 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24356403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24356404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24356612 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24356790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24357686 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24357825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24358480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24360904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24360999 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24361210 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24361472 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24361487 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24362135 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24363618 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24363908 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24363912 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24363980 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24364001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24364284 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24364302 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24364324 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24364334 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24364388 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24364672 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24364964 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24365028 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24365218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24365286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24365344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24365505 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24365763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24366855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24367659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24368817 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24369028 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24369054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24369277 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24369495 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24370060 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24370727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24370969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24370973 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24371017 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24371145 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24371245 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24371330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24371338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24371346 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24371474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24371506 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24371552 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24371675 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24371820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24372038 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 24372057 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 24372130 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24372284 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 24372388 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 24372760 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24372824 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24373276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24373295 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24373491 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24373763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24373889 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24373905 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24373919 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24373936 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24374000 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24374003 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24374289 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 2 24374684 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 24374999 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24375356 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24375357 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24375639 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24375699 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24375880 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 24376847 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24377782 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 24377987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24377988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24378281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24378456 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 24379389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24379425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24380016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24380870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24380980 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24381019 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24381361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24381395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24381457 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24381616 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24381720 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24381732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24381737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24382003 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 24382602 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 24382700 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 24382724 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 24383050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24383139 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 24383471 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24383976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24384045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24385741 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24385761 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24385771 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24385796 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24385847 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24385975 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24386190 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24386213 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24386260 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24386313 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24386373 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24386421 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24386434 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24386532 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24386660 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 24387067 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24387175 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 24387220 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 24387238 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24387583 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24387880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24387959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24388041 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24388205 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 24388224 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 24388233 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24388429 A G N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 24388902 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 24388989 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 24389100 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24389296 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24389383 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24389414 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24389426 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24389479 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24390673 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24392065 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 24392213 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 24392242 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 24394368 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 24394394 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 24395645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24395847 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 24395970 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 24395982 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 24395998 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 24396053 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24396116 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 24396203 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 24396570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24396574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24396862 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 24396868 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 24397065 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24397208 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 24397543 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24397610 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24397681 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24397684 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 24397770 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 24397820 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24397860 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24397959 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 24398046 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 24398125 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 24398190 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 24398361 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24398447 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24399107 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24399300 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 24399529 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24400378 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24402065 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 24404688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24404768 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24405122 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24405559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24405817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24408062 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 24408444 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 24408912 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 24408952 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 24408955 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 24408974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24409275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24410254 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24411293 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24411859 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24412418 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 24412487 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 24413864 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24414219 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24414590 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 24415399 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24415569 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24416182 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 24416600 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 24416679 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24416856 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24416905 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 24416927 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 24417227 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 24417306 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 24417712 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 24417748 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 24417839 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 24417842 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 24418268 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 24418402 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24418476 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 24418586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24419039 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24419173 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 24419249 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24419974 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 24420205 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24420325 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 24421121 T C Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 24421139 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 24421146 C T Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 2 24421216 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 24421266 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 24421450 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24421490 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24421606 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 24423158 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 24423816 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 24423837 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 24423840 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 24423978 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 24424039 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24424300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24424879 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 24425029 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 24425131 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 24425201 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 24425621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24426515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24426517 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24426582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24426823 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 24426912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24426968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24426996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24427030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24427031 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24427042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24427086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24427312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24427320 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24427446 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 24427559 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 24427619 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 24427684 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24427756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24427767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24428025 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 24428157 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24428165 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24428235 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24428291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24428496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24429210 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24429460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24429526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24429685 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24429761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24429921 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24429930 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24430028 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24430107 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24430158 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24430316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24430425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24430474 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 24430863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24431207 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24431254 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24431327 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24431373 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24431416 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24431450 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24431571 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 24431594 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24431877 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24431933 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24431969 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24432051 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24432252 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24432558 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24432967 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24432968 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24432998 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24433061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24433064 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24433209 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 24433815 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24433871 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24433909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24434191 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24434415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24434457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24434770 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24435068 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24435267 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 24435330 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24435595 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24436327 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 24436333 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24436341 A T Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 24436348 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 24436369 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 24436643 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24436644 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24436664 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24436800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24436836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24436883 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24437283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24437350 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24437536 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24437915 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 24437983 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 24438060 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 24438082 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24438269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24438624 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 24438680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24438785 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24438803 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24438818 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24439675 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 24440181 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24440183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24440211 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 24440271 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24440342 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24440343 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24440515 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 24440518 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 24440528 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24440540 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24440550 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 24440588 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24440946 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 24441017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24441598 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24441718 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 24441722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24441957 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24442819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24442899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24443117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24449833 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24450360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24450475 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24450485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24451054 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24453788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24454966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24457796 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24460846 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24461133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24464451 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24466969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24467335 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24468925 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 24473098 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 24473591 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24473649 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24474126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24474696 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24475242 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 24475781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24479053 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24479065 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24479116 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24479607 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24481857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24482726 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 24482870 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 24484134 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 24486488 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24486723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24486950 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24487597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24487918 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24487947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24487968 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24488255 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 24488290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24489467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24490856 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 24491041 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 24493267 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 24493409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24493519 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 24495047 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 24495975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24498518 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24502032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24502057 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24502071 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24502685 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24502697 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24502919 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24503222 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 24503456 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24503591 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 24503611 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 24503621 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 24503640 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24503672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24503866 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 24503981 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 24503985 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 24504002 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 24504059 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 24504144 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24504576 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 24504631 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 24504817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24504993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24505006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24506519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24506857 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24506891 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 24506899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24506910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24506929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24507195 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 24507870 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 24507904 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 24508107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24509393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24510092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24511286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24512725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24513923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24514948 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 24515258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24516084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24517621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24517854 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 24518456 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 24520846 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 24522334 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 24523172 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 24523196 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 24523331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24523426 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 24523428 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 24523458 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 24523474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24530307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24530684 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24530694 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 24530769 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 24531313 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24531371 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24532159 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 24532268 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 24532341 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 24532387 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 24532397 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 24532435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24532522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24533130 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 24533270 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 24534129 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 24534145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24534333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24535698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24536275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24538849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24540036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24540183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24540378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24540380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24540843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24543687 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24545515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24545940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24546450 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 24548893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24549324 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 24549365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24549817 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 24550297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24550586 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 24550827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24551838 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 2 24551947 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24552035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24553050 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 24553253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24553288 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 24553310 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 24553415 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 24553548 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 24553565 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 24553566 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 24553611 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 24553655 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24553886 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 24553940 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 24553941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24554035 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 24554165 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24554181 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24554190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24554441 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 24554871 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24554873 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24554895 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 24554922 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24555998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24556025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24556034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24556302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24556667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24556698 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 24556817 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24556866 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 24557032 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 24558321 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 24558982 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 24559047 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24559099 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24559113 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24559498 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24559501 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 24559515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24559590 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 24560154 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 24560755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24560952 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24561013 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24561135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24561310 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 24561393 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 24561500 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 24561613 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24561904 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24561934 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 24561952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24562007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24562047 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 24562091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24562268 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24562275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24562285 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24562388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24562440 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24562460 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 24562461 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24562498 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24562531 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 24562581 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24562603 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24562637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24562722 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24562727 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24562778 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24562841 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24562894 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24562940 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24562976 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24563067 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24563735 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24571667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24571978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24572369 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24572387 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 24572629 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24572691 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 24572848 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 24572854 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 24572960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24573514 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 24573896 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 24573984 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 24574054 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24574072 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 24574107 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 24574208 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 24574246 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24574250 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24574291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24574340 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24574557 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24574693 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24574695 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24574831 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24575104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24575126 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24575207 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24575211 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24575304 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24576992 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24576999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24577023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24577048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24577060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24577128 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 24577131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24577187 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 24577202 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24577205 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24577306 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 24577319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24577354 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 24577356 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24577377 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24577391 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24577419 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24577433 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24577439 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24577620 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 24577664 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24577939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24578056 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24578139 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24578198 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24578267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24578464 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24578519 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24578554 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 24578625 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 24578733 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 24578778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24578919 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24578949 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24578980 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24579458 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24579474 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 24579479 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24579609 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24579979 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 24580463 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24580509 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24580527 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24580532 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24580546 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 24580633 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 24580659 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24580707 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 24580768 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24580981 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 24580986 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24581004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24581156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24581216 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24581352 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 24581484 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24581504 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 24581616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24581893 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24582055 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24582099 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 24582180 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24582195 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24582218 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24582467 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 24582718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24582719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24582794 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24582827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24584197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24584365 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 24584368 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 24584378 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 24584666 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24584969 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24585141 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24585188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24585568 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24585593 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24585607 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24585674 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24585683 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24585689 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24585711 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24585942 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24586791 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24586832 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24586860 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24586904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24586914 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24586935 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24586956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24587043 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 24587103 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24587221 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 24587356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24587476 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 24587477 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 24587502 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 24587536 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 24587591 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 24587594 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 24587666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24587679 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24587762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24587959 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 24588173 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 24588175 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 24588317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24588589 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24588592 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 24588606 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24588733 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 24588786 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 24589080 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24589231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24589422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24589723 A C Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 2 24591355 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24591444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24591611 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24591638 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 24591660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24591838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24592363 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24592370 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 24592438 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 24592507 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 24592548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24592569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24592733 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 24592758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24592802 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 24592855 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24592942 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24593005 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24593041 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 24593170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24593297 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 24593488 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24594023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24594493 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 24594513 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 24595178 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 24595250 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 24595312 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 24595588 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24595603 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 24595772 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24595776 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 24595883 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 24595896 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 24595952 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 24596131 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 24596152 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24596276 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24596285 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24596439 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 24596467 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24596601 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24596736 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24596792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24596901 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 24596914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24596942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24597153 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 24597433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24597439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24597470 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 24597508 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24597532 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24597758 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24598111 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24598262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24598327 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 24598799 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 24598830 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24598855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24598874 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24599007 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24599030 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24599127 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 24599128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24599355 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 24599464 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 24599614 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 24599704 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24599717 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 24599718 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 24599742 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24599753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24599902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24600059 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 24600069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24600096 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 24600202 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 24600333 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24600569 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 24600588 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 24600782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24600868 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 24601317 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24601879 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 2 24601958 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 24601967 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 24602146 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 24602191 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24602597 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 24602701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24602742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24602933 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24602956 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 24603091 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 24603463 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 2 24603590 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24603693 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24603716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24603860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24603902 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 24604162 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24604233 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24604267 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 24604434 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 24605039 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 24605057 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 24605110 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 24605138 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 24605150 C G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 24605157 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 24605674 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24605686 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24606429 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24606526 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 24606603 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 24606897 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 24607029 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24607257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24607788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24607955 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 24607972 C G N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 2 24607973 C A N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 2 24608036 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24609017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24610639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24610716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24610813 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24612398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24616133 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24616692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24617120 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24619255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24619362 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24619777 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 24619787 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 24619798 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 24620191 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24620223 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24620240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24620649 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24620835 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24621169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24621540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24621734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24621751 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24621979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24622042 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24622145 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24622263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24622339 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24622489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24622509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24622522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24624880 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 24624889 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24625217 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24625292 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24625311 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24625476 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24625544 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24625623 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24625671 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24625675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24625743 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24625750 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24625869 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24625917 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24625920 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24625929 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24626237 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 24626294 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24626346 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24626386 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24626474 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24626626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24626727 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24626728 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24626891 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 24626938 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24626956 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24626981 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 24627147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24627184 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24627274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24627543 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 24627939 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24628025 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 24628070 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24628081 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24628098 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 24628114 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24628296 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 24628470 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 24628527 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 24628586 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 24628791 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 2 24628831 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 24628850 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 24629135 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 24629237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24629606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24629743 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 24630151 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24630239 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 24630346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24630747 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24631219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24633648 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 24633699 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 24633786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24635332 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 24635631 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24635972 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 24636117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24636234 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24636459 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 24636790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24637180 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 24637252 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 24637818 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24638397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24638416 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 24638475 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 24638611 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 24638645 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24639230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24639472 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24640057 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24640540 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 2 24640655 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 2 24640688 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 24640746 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 14 14 2 10 2 2 24641046 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24641189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24641402 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 24641477 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 24641578 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 24641709 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 24641744 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 24641762 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 24641803 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 24641811 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 24643868 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 24644371 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24645647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24646910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24648261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24649108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24649266 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 24650096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24650631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24652588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24653500 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24653755 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24654372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24654409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24656102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24657702 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 24659004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24659978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24659982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24663604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24663647 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 24663660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24663710 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 24663860 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 24664135 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24664239 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 24664803 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 24664880 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 24665396 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 24665492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24665796 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 24665891 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24667101 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24667288 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 24667346 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 24667397 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 24667861 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 24668503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24668703 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24668728 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 24671495 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24671752 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 24671764 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 24672125 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24673322 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24673416 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24673430 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24673669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24673733 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 24673766 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 24673826 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 24675186 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24675208 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24675393 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 24675544 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 24675894 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24676194 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 24676736 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 24676745 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 24676769 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 24677287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24677581 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 24677735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24678870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24679079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24679200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24679432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24679488 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 24680189 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 24680387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24681199 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 24681313 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 24681380 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24682569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24682824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24682833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24682940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24683292 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24683345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24683746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24684104 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24684355 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24684531 G T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 24684787 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 24685178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24685364 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 24685524 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 24685564 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24685570 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24685575 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24685587 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24685588 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24686141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24686253 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24686727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24687307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24687807 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24691704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24691806 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24692338 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 24692344 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 24692404 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 24692498 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 24692554 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24692772 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 24693059 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24693267 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 24693595 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 24693710 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24693963 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24695784 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24697716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24697996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24698144 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24698660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24699631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24700912 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24700998 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24701341 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 24701431 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 24701466 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24701644 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24701876 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24702257 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 24702508 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 24702559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24702598 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 24702646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24702650 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24702746 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24702820 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24704210 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24704212 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 24704341 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 24704717 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24704761 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 24704829 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 24705344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24705606 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 24705767 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24705803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24705843 C A N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 24705941 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 24705973 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 24706005 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24706032 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 24706190 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 24706619 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24706621 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 24706631 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 24706710 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 24706749 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 24706935 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24706998 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 24707146 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24707163 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 24707183 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 24707195 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 24707454 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 24707816 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 24708407 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24708449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24708505 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 24708791 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 24708800 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 24708802 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 24708821 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 24708933 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 24709001 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24709310 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 24710660 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 24710673 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 24710691 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 24710700 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24710731 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 24710860 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 24710940 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 24711056 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24711201 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24711248 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24711274 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 24711729 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 24711759 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 24711912 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 24712196 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 24712241 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24712304 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 24713035 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 24713097 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24713155 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 24713230 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 24714302 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 24715698 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 24716773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24726328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24727074 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 24727122 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 24727160 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 24727212 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 24727954 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 24727956 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 24728084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24729086 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 24729861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24730274 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24730860 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 24731488 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 24731751 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 24731789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24731988 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 24734265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24736136 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 24736846 G A Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 2 24737486 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24737614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24740448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24741723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24741846 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24742238 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24744753 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24745354 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 24745420 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24745442 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24745661 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 24747887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24748212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24750075 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24750322 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24750407 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 2 24750972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24752120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24753253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24753438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24754999 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 24755030 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 24755144 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 24755373 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 24755668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24755973 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 24756072 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 24756073 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 24756141 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 24756574 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 24756606 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 24756712 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 24756761 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 24756891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24757004 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 24757248 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24757304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24757332 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 24757405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24757619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24757634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24757707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24757711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24757767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24757825 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24757844 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 24757902 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24758074 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24758094 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24758136 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24758169 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24758255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24758272 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 24758329 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24758342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24758481 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24758827 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24758894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24759418 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24759445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24759788 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 24759826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24759990 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24760073 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 24760168 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 24760180 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 24760252 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 24760395 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 24760403 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24760967 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 24760990 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 24761026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24761068 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24761145 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24764518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24764530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24764971 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24765130 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 24765589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24765744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24765894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24768275 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24768701 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24769455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24770504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24772403 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24775528 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 24776936 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 24777030 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 24777649 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24780476 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24780565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24780618 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24780661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24780668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24780734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24780947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24781620 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24782869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24783126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24783409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24784340 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 24784725 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 24784753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24784862 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 24784865 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 24784921 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 24785098 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 24785321 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 24785351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24785599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24785741 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 24785821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24785952 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24786334 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 24786513 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24786519 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24786785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24787093 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24787576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24787815 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 24788626 A C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 24788686 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24789222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24789273 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 24790585 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24790587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24790699 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24791736 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 24791782 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 24791816 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 24791942 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 24791967 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 24791983 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 24791985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24792125 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 24792175 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 24792256 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 24792377 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 24792381 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 24792421 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 24792423 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 24792593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24792700 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 24793318 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 24793372 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24793392 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 24793659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24793779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24794019 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 24795078 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24795171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24796350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24796677 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24796780 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24798240 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24799335 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 24802569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24802680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24802991 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24803273 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 24803315 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 24803598 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 24804041 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24804313 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 24804692 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 24804723 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 24806032 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 24806213 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 24806231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24806364 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24806394 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 24808458 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 24808527 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24808569 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24808682 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24808711 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24808912 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 24809011 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24809023 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24809053 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24809578 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 24809584 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24809703 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 24809712 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 24809916 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 8 10 0 8 1 2 24809960 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 10 8 2 6 1 2 24809995 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 24810071 T C Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 24810091 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24810126 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24810157 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 24810212 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24810218 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24810277 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24810287 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24810355 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24810521 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 24810532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24811015 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24811099 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24811419 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 24811498 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 24811536 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 24811879 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 24812456 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24812463 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24812591 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24812665 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 24812712 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24812865 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24813066 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 24813357 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24813919 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24813946 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 24813963 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 24814223 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24814257 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24815085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24815147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24815348 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 24815365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24815401 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 24815455 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 24815647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24816060 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 24816276 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 24816317 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 24816366 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 24816377 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 24816428 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 24816446 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 24816464 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 24816494 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 24816555 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 24816666 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24816990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24817131 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 24817258 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 24817340 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24817441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24817655 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24817783 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 24818372 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24818449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24818650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24818731 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 24818826 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24819420 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24819531 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 24819786 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24819800 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24819892 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 24819978 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24820021 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 24820207 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24820657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24820827 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 24820893 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24820942 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24821116 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24821197 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24821328 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 24821351 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24821554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24821634 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24821754 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24822590 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 24823511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24823555 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 24823665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24823716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24823728 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 24823906 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 24824230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24825608 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24825659 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 24825755 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 24825838 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24825881 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 24825886 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 24825935 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 24825937 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 24826017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24827888 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 24828326 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24828430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24828510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24828634 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 24828664 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 24828771 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 24828886 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 24828901 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 24828956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24828984 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 24829091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24829118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24829537 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 24829703 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 24829724 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24829754 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24830134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24830371 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24830517 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24832664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24834278 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24834403 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24834853 A G N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 24835178 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 24835282 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 24835428 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 24836099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24836634 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 24836658 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 24836704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24836751 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 24836870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24837186 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24837192 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24837380 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 24837907 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 24838080 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 24838219 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 24838232 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 24838270 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24838414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24838838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24839388 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24839493 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 24839504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24839608 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 24839747 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 24840101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24840585 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 24840659 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24840752 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 24840753 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24840856 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24841059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24841246 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24841270 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24842272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24842338 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24842352 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24842408 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24842581 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24842650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24842756 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 24842778 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24842810 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24842821 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 24842940 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24842965 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24843023 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 24843043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24843439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24843470 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24843915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24843984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24844448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24844482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24844897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24847197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24849935 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 24850644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24850713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24851929 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24851946 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24852057 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24852403 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 24852496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24852755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24852846 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24855550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24856692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24858579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24858587 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24858721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24859558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24859848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24861578 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 24863177 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 24863855 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 24863927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24864115 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 24864399 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 24864637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24864848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24865511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24866202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24866389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24866414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24866431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24866467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24866891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24866996 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24867873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24870155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24872453 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 24872637 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24872738 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24872857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24872909 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24873056 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 24873100 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 24873161 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24873704 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 24873735 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 24873783 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24873798 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 24873801 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24874442 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 24874586 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24874632 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 24874642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24874790 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 24875234 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 24875347 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24875637 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24875941 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24876142 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 24876370 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24877865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24878301 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 24878455 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24879533 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24879905 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24881017 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24881530 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 24881863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24885313 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24885348 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 24885374 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24886207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24886674 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24887468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24888370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24890075 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24890157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24890764 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 24891708 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 24892205 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 24897095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24899279 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24912286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24912780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24915976 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24917705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24918089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24919151 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 24919253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24920987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24921201 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 24921433 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 24924017 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 24924098 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 24924102 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 24924144 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 24924233 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 24924258 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 24924267 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 24924290 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 24924840 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 24925101 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 24925208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24925336 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 24925339 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 24925936 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 24926219 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 24926318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24926917 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 24927054 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 24930483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24930830 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24930848 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 24930884 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24930965 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 24931204 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 24931441 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 24931587 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 24931730 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 24931732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24931779 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 24932034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24932141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24932210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24932387 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 24933008 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 24933011 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 24933047 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 24933515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24933560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24933823 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 24934401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24940115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24940120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24940190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24941110 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24941298 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24941666 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24945696 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 24947430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24951041 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 24951174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24954372 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 24954402 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 24960139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24960802 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24961909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24961991 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24962603 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24962700 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24962787 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 24962851 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24962863 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 24963051 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24963319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24963473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24963576 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 24963600 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 24963618 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 24964201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24966361 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 24967504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24967724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24967954 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 24968199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24968241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24968251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24968267 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24968269 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24968376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24968435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24968452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24968458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24968766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24968834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24968922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24968931 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24968967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24969136 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 24969161 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 24969377 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 24969743 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24969780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24969834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24969867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24970003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24970019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24970043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24970095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24970170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24970173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24970352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24970471 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 24970661 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 24970673 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 24970820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24970924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24971912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24971959 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 24972135 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24972242 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 24972249 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 24972266 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 24972299 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24972405 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 24972433 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 24972438 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 24972618 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 24972695 C A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 24972979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24972992 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24973329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24973332 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24973576 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 24973615 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 24973825 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 24973957 G T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 24974189 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 24974394 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 24974435 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24974464 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 24974697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24974710 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 24974734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24974819 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 24974917 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 24975010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24975124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24975351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24975480 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 24975616 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 24975626 A G N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 24975863 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 24976012 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 24976170 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 24978078 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24978312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24978850 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 24983762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24984364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24984414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24984426 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24984466 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24984511 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 24984565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24985339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24985358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24985537 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 24987685 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24987716 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24987909 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24988075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24988146 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 24988420 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 24988434 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 24988601 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 24988664 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24988787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24988932 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24989100 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24989226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24990456 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24991121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24991617 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24991777 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 24991803 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24992023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24992934 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 24993081 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 24993209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24993337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24993355 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24993374 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 24993608 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 24993674 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 24993900 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 24993947 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24993961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24994061 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 24994067 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 24994083 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 24994097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24994144 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 24994190 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 24994401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24994686 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 24994784 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24994790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24994940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24994981 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 24995137 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 24995350 A T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 24995373 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 24995387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24995437 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24995498 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24995588 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 24995892 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24995899 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 24995914 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 24995925 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 24995970 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 24995988 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 24996206 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24996211 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 24996254 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24996321 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 24996344 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 24996362 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 24996578 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24996667 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 24996728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24997473 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 24998295 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24998331 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 24998448 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 24998662 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24998667 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24998699 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 24998700 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 24998962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 24999092 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 24999357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25002749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25003222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25003524 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 25003529 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25003954 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 25004662 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 25005581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25005715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25005895 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25005922 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 25006022 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 25006042 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25006043 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 25006300 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 25006339 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25006360 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 25006371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25006523 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 25006561 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 25006649 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25006689 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25006690 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25006771 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 25006857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25006867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25006927 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 25006941 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 25006948 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 25007043 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 25007189 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25007635 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25008343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25011772 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 25013626 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25013893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25014946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25015898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25015983 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 25017079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25017245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25017886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25018937 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 25019473 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25019485 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25019511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25019518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25019525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25020039 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25020053 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 25024236 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 25027745 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 25032002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25032597 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 25033840 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25034427 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 25034460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25035122 C T Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 25035142 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25035153 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25035173 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25035912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25036032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25036067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25056900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25057548 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25057617 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25057645 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25057675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25060209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25060510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25060599 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 25063403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25064027 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25064042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25065361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25069996 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25070000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25074966 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25075545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25076565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25079153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25080911 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25081245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25081274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25083683 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 25084837 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 25085653 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25085698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25085717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25085739 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25085778 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25087862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25088246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25088254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25088402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25088531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25089651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25089957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25090107 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25090366 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25092082 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25092331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25092657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25092715 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 25092780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25093699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25094114 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25094127 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25095381 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25096276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25097018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25097067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25097273 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25098216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25100102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25100174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25100395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25100452 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25102354 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25105502 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25110504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25110948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25117210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25120582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25121303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25123244 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25123299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25123577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25124450 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25130167 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25130905 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25136488 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25145613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25146773 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25148720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25155315 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25157025 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 2 25157271 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25161557 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25161780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25161851 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25162719 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25162812 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25162828 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25162877 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25162921 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25162954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25163335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25163831 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25164643 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25164780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25164934 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25164938 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25164997 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25165556 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 25165874 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25166106 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 25167285 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25167853 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25167905 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25167979 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25169686 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 25169866 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25170209 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25170220 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25170444 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25170463 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25170487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25170492 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25170526 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25170545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25170737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25170807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25170940 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25170975 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25171471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25172313 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25175049 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25175208 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25176876 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25177429 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25177484 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25177747 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25178336 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25178349 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25180820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25181668 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25182265 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25182307 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25182352 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25183769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25183919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25183946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25184438 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 25185863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25186294 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 25190371 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25190402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25190737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25190738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25190768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25191327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25194819 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 25195323 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25195324 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25196159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25196463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25196655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25196664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25196997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25197325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25197843 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 25199414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25200405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25201715 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 25202806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25203032 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25204075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25206222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25207217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25207448 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25208552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25209456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25211945 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25211979 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25212035 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25212093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25212258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25212279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25212284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25212331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25212378 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25212396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25212447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25212902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25212987 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25212999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25213505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25213625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25213698 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25214007 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 25214067 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25214117 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 25214170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25214291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25214364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25214565 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25214568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25214626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25214690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25214800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25217099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25217101 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25218424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25218436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25218448 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25218496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25218522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25220699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25220808 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25220835 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25220931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25221239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25221292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25221722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25221833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25222149 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25222351 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25222368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25222971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25223670 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25224473 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 25224484 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 25224892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25224921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25224925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25224984 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 25224985 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25225026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25225112 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 25225113 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 25225300 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 25225530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25225547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25225793 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25226129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25226347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25226656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25226716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25226794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25229180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25229692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25230058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25230162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25230271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25230645 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25230844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25232992 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 25235215 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25238755 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25238878 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25239313 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25239634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25241327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25241708 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25243124 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25243154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25244012 G C N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 2 25244425 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25249081 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25249121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25249186 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 25249283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25249345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25249825 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 25249866 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25249946 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25250123 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25250182 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25250201 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25251756 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25251857 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25251885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25251897 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25252376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25252409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25253175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25255638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25255732 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25255735 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25255828 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25255830 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25256007 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25256061 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25260085 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25260543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25260578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25260607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25260668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25260874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25261465 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25261534 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25261684 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25261903 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25262367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25262386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25262405 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25262460 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25262522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25262527 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25262584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25262683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25262754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25262761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25262767 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25262809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25262819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25263656 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25264303 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25264330 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25264449 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25264473 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25264503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25265114 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25265889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25265922 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25265936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25266155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25266493 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 25266986 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25267103 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25267326 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25267382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25267446 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25267661 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25267682 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25267706 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 25267752 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 25267849 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 25267885 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 25267912 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 25267916 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 25268243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25268306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25269559 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25269874 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25269910 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 25269911 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 25269975 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25270202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25270554 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25270666 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25270848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25270933 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25270952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25270959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25271306 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 2 25271329 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 25271353 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25271442 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 25271458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25274481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25275413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25280316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25281446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25281461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25281562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25282463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25282587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25282829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25282896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25283347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25283477 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25283527 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25285525 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25285647 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25289607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25289650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25289676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25291724 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25295222 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25305145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25305212 A C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 25305214 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 25306345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25308778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25309149 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25309241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25309261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25310510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25312459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25314707 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25314785 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25315002 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25319047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25319118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25321524 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25321581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25321687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25321712 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25322359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25322939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25323697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25324651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25324759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25325070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25325438 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25326538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25326685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25326996 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25327149 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25327752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25327754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25327885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25328609 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25328660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25328886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25329020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25329346 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25329387 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25329474 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25329480 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25329491 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25329533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25329613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25329627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25329795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25329912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25329962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25329966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25330250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25330332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25330379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25330473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25330627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25330756 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25330759 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25335625 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25335826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25335854 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25336160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25336322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25336813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25336868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25337224 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25338302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25338360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25338618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25340577 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25340732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25340949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25341026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25344149 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 25344330 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 25344456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25344515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25344631 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 25345404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25345466 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25345567 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 25345701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25345980 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 25346544 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25346604 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 25347197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25347221 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 25347932 A C N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 25348323 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 25349281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25349349 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 25349380 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 25349400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25349509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25349565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25349689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25349772 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 25351301 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 25351412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25351531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25351642 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 25352064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25353178 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 25354489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25356283 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 25362220 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 25362339 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 25362777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25362779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25363691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25365297 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 25365308 G A Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 25365313 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 25365945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25366993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25367151 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25367284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25367376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25367415 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 25367435 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 25367441 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 25367446 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 25367495 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 25367607 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25367630 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 25367710 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25367745 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 25367798 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 25367799 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 25367824 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 25367842 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 25367924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25367931 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 25367942 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 25367963 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 25368261 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25368275 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 25368433 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 25368445 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 25368544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25368548 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 25369000 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25369337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25370076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25370088 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25370103 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25370130 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25370160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25376050 T A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 25376098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25381783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25384223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25385517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25386197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25387524 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25394772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25397822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25404295 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25407815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25408117 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 25408202 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25408533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25409237 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 25409304 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25409492 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 25409509 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 25409561 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25409573 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 25409603 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 25410160 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 25410214 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 25410342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25412139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25412587 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25413453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25414432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25416662 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 25416852 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 25421190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25422888 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 25423793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25426124 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25426434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25427041 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25439448 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25446808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25447367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25447391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25448918 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25450541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25454053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25455048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25455516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25456041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25456447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25457452 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 25457714 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 25458237 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 25458247 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 25458850 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 25459067 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 25459088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25459429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25459470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25459478 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25459563 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25459932 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 25461847 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25464567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25465889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25466249 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25467560 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 25468487 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 25468495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25468556 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25470166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25470505 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25470525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25470663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25471156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25472661 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25472827 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 25473407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25473416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25473436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25474014 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25474020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25474354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25474852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25474901 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 25474924 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25474961 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25475044 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25475156 C A Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 25475341 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 25475350 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 25475520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25475526 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 25475716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25476116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25476415 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 25476561 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 25476593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25476954 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25477074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25477363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25477412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25477415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25477430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25477554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25478014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25478091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25480988 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 25481189 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 25481281 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 25482423 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 25482433 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 25484015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25485248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25485301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25485345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25485849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25486340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25486460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25486806 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25486909 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25487010 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 25487541 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 25487604 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 25488181 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 25488348 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 25488596 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 25488785 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 25489485 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25489654 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25489741 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 25489743 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 25490009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25490033 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 25490130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25490167 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 25490653 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25490807 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 25490978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25491106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25491160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25491205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25491476 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 25491581 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 25491812 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 25491822 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25491955 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25492200 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 25492394 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25492916 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25493193 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25493339 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25493681 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25493729 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 25493859 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 25493927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25493949 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 25494021 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 25494054 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 25494724 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 25494794 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 25494850 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 25494864 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 25495150 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 25495547 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25495629 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25495743 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 25495841 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 25495858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25495873 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 25495898 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 25495907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25495993 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 25496010 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25496123 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 25496209 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 25496232 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 25496254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25496291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25496554 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 25496617 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 25496767 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25496927 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25496965 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25496971 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 25496997 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 25496998 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 25497072 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25497073 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25497174 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 25497737 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25497788 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 25497943 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 25498338 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 25498356 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 25498421 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 25498557 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25498566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25498778 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 25500060 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25500141 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25500201 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 25500409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25501103 T A Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 25504190 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 25504475 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25504522 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25504550 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 25504551 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25504592 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25504610 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25504645 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 25505075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25505831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25506025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25506059 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 25506070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25506091 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 25506129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25506159 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25506756 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25507674 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25508380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25508476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25509013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25509156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25509248 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 25509521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25509626 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 25510407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25510421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25510748 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25511555 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 25511569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25511594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25511674 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25511760 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25511892 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25511893 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25512033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25512063 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25512084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25512226 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 25512468 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 25512584 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25513251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25513327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25515978 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 25516023 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 25516071 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25516751 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 25516823 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 25516952 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25517276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25517514 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25517614 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 25517647 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25517786 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 25517795 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25517821 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 25517822 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 25517871 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 25517919 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25517966 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25518385 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 25518591 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 25518628 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25518706 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 25518749 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25518824 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25518897 A C Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 25518990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25519022 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25519045 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25519413 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 25519625 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 25519635 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 25519879 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25519897 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 25519913 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 25519979 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 25519981 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 25520302 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 25520439 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 25520546 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25520712 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25520782 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25520793 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25520861 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 25520957 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 25520978 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 25521053 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 25521572 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 25521579 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 25521608 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 25521611 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 25521621 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25521623 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25521667 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 25521808 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 25521826 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 25522120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25522239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25522257 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25522322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25522396 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 25522413 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25523074 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25524606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25524898 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25524922 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 25525367 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25526066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25526749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25527286 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 25531319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25531394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25531411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25531616 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25532954 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 25533111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25533658 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25533695 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 25533719 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 25533954 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25534002 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25534024 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 25534093 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25534118 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 25534122 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 25534158 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 25534292 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 25534322 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 25534437 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 25534438 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 25534540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25534599 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 25534600 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 25534732 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25534793 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25534839 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25535055 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25535091 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 25535136 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 25535209 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25535213 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25535222 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25535242 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25535243 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 25535310 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 25535314 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 25535324 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 25535337 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 25535436 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 25535456 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25535467 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25535471 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 25535500 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25535501 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 25535515 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 25535527 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25535721 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 25535745 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 25535904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25537284 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 25538041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25538152 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 25538218 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 25538259 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 25538327 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25538416 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 25538431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25538542 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 25538674 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 25538876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25538955 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 25539199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25539415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25541610 T A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 25541715 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 25541989 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 25541994 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25542026 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 25542108 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 25542198 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 25542257 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 25542364 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25542806 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 25542839 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 25542967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25543043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25543380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25543413 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25543429 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 25543633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25543715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25543855 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 25544288 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 25544588 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 25544899 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 25545266 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 25545411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25545728 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 25545830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25546689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25547121 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 25548039 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 25548044 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 25548051 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 25549674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25550446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25551002 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25551005 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25551048 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 25551049 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 25551617 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25551661 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 25551751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25552159 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 25552475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25552559 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25552680 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 25552972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25552977 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25553140 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 25553174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25555108 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25555234 T G Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 25555355 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 25555378 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 25555404 G A Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 25556023 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 25556084 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25556113 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25556273 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25556341 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25556655 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25557267 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25557327 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25557445 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25557446 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25557475 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25557506 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 25557520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25557795 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 25557835 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 25557918 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 25559007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25559026 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25559111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25559194 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25559264 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 25559314 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 25559351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25559423 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 25559466 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 25559468 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 25559534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25559690 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 25560051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25560111 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 25560128 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25560307 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25560358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25560372 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 25560400 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 25560452 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 25560542 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 25560597 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 25560602 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25560733 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 25560744 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 25560765 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25560806 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 25560851 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 25561095 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 25561115 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 25561187 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 25561219 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 25561550 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 25561648 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25561662 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 25563289 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 25563513 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 25563721 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 25564953 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 25565450 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 25565700 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 25565971 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25565987 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 25566470 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 25566994 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 25567049 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 25567110 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25567172 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25567957 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 25568029 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25568041 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25568144 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 25568152 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 25568159 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 25568226 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 25568242 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 25568344 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 25568467 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25568509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25568675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25568768 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25568844 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 25568848 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25569009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25569085 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 25569121 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 25569166 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 25569539 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25569595 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25569668 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 25569746 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 25569776 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 25569800 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25569888 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 25569931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25570084 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 25570119 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 25570332 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25570527 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 25570665 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 25570765 C A N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 25570972 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25571045 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 25571296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25572060 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25572420 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 25572423 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 25572679 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 25572764 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25572768 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25572861 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 25573092 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 25573098 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 25573570 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 25573736 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 25573904 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25573925 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25573948 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 25574048 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25574057 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25574102 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 25574120 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25574156 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25574211 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25574319 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 25574377 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25583344 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 25583815 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 25583921 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25583957 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 25584027 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 25584029 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 25584104 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 25584157 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 25584223 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 25584420 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 25584473 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 25584492 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 25584517 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 25584602 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25584752 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25584817 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25584819 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25584871 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25584895 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25584936 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25585385 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25585396 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 25585401 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 25585544 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 25585727 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 25585846 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 25586175 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 25586432 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 25586602 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25587050 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25587369 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25587690 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 25588165 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25588171 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 25588948 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 25589790 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25589791 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25589823 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25590033 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 25590101 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25590275 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25590344 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25590402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25591075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25591808 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 25592778 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25592935 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 25593213 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 25593964 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 25594361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25594362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25594584 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 25594721 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 25595730 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 25595776 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25595815 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 25596014 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 25596037 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 25596113 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 25596234 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 25597444 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25597591 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 25597647 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25597661 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25597916 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 25597944 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 25598170 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 25598350 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25598370 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25598405 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25598430 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 25603836 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25603979 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25604104 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25604113 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25604249 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 25604292 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 25604874 C G Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 25604877 T C N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 25605024 T C N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 25605222 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 25605277 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 25606040 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 25606229 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 25607566 C G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 25607803 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25608393 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25608440 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 25608580 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25608670 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25608748 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 25609173 C A N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 25609205 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 25609224 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 25609277 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 25609474 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25609542 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25609563 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25609566 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25609641 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25609667 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25609690 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25609804 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25609901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25609953 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25610189 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25610207 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25610220 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25610272 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25610306 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25610353 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 25610360 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25610386 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25610450 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 25610586 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 25610599 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 25610600 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 25610692 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 25610778 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 25610811 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25610934 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25610944 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25610948 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25610985 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25610996 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25611014 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25611017 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25611266 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25611290 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25611312 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25611405 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 25611566 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 25611582 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 25611623 A G N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 25611688 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 25611761 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 25611767 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 25611986 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25612096 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25612149 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25612164 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 25612520 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25612573 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25612650 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25612654 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25612661 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25612922 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25613160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25613341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25613392 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 25613410 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25613770 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 25613789 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 25614739 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 25614761 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25614839 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 25614850 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 25614853 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 25614906 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 25615038 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 25615113 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 25615197 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 25615429 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 25615475 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 25615510 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 25615540 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25615763 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 25615773 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 25615812 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25615867 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 25616017 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25616087 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25616100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25616196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25616381 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25616553 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 25616960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25618180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25618817 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25620395 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25622798 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25622805 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25622871 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25623371 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25624168 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 25624303 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25624331 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25624365 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25624481 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25624754 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25625399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25625673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25625710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25625875 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25625878 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25627093 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25627220 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 25627530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25627540 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25628064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25628073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25628194 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25628319 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 25628333 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25628371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25628402 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25628495 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 25628596 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25628639 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25628693 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25628695 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25628778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25628969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25629111 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25629179 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 25629675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25629679 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25629736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25629812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25630093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25630134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25630168 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25630413 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25630429 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25630456 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 25630502 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25630573 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25630706 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25631079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25631088 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25631124 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 25631573 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 25631832 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 25631836 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 25631845 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 25631913 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25632716 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 25632720 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 25632756 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 25632812 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25632941 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25632946 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25633039 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25633060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25633175 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25633500 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 25633524 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 25633625 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25633645 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25633737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25633778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25633814 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25633841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25633866 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 25633929 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25633960 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 25633972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25634301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25634310 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 25634492 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25634600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25634671 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 25634701 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 25634878 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25634885 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 25634900 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 25634934 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25635552 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25635875 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 25636565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25636597 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 25636886 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 25637185 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 25637286 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25637293 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25637824 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25637838 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 25637950 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 25638044 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25639390 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25639533 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25639556 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 25639559 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 25639622 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 25639624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25640217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25640324 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 25640345 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 25640792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25640804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25640922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25641140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25641196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25641222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25641436 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25641515 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25641539 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25641561 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25641731 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 25642160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25642335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25642374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25642399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25642425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25642440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25642457 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25642607 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 25642612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25642642 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25642646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25642725 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 25642756 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 25642770 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 25642978 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25643017 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 25643174 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 25643293 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 25643299 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 25643370 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 25644762 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25645058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25645503 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 25646277 T C Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 25646300 T G Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 2 25647148 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 25647535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25648159 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25651369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25651477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25653257 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 25653348 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25653958 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 25654047 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25654129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25654190 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 25654219 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 25654266 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 25660264 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 25662164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25662449 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25665688 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25665872 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 25666694 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 25666711 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25666808 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25666937 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25667145 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 25667204 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 25667290 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 25667473 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 25667503 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 25668014 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 25668234 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 25668271 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25668307 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 25668452 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 25668715 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25668867 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25669000 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 25669131 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 25669171 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25669284 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25669395 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 25669476 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 25671348 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25671349 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25671648 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25671677 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25671678 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25671770 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25671826 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25671850 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25672579 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25673761 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 25673778 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 25673779 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 25673857 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25674499 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 25676442 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 25676568 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25679127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25679682 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 25680518 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 25680830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25681484 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 25682128 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 25682188 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 25682339 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 25682413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25682417 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25682427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25682472 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 25682553 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 25682558 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 25682567 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 25682636 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 25683240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25683814 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 25683916 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25683962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25683968 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 25684841 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 25684879 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 25684931 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 25686175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25686865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25686929 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 25687232 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 25687276 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 25687292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25688546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25688703 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 25688816 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 25688869 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 25688888 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 25689009 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 25689261 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 25689275 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25689286 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25689367 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 25689373 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 25689771 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25690005 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 25690135 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 25690294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25690406 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25690536 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25690543 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 25690726 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 25690759 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25690772 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 25690801 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25690966 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25691065 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25691067 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25691103 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 25691158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25691185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25691485 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25691614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25692275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25692359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25692374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25692382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25692390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25692409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25693541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25693556 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25693635 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 25695061 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25695099 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 25695104 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 25695533 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25695551 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25695904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25696431 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25698011 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 25700629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25700986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25703365 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25703393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25703415 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25703442 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 25703469 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 25703493 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 25703590 A G N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 9 11 1 7 2 2 25703662 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25703968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25704931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25705099 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25705281 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 25705287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25705346 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 25705850 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 25705899 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 25705979 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25706274 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 25706302 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 25706313 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 25706387 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25707127 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25707710 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 25707988 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 25708694 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25708724 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 25708916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25710538 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 25710569 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25710906 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25711131 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 25711206 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 25711292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25711310 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25711394 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 25711456 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25711706 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25711731 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25711897 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25711970 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 25712282 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25712453 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 25712518 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 25712582 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 25712674 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 25712692 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 25714545 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25714589 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25715163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25715191 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 25715291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25715720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25716395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25716924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25716934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25718621 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 25719930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25723435 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25724088 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 25725088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25725097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25725595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25725791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25726697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25727280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25729004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25729446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25730838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25732641 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25732793 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 25732808 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 25734499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25736396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25736710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25739439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25743885 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 25743887 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 25744800 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 25748976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25748997 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 25749510 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 25750270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25750397 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 25750533 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 25750536 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 25750580 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 25750619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25750731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25750743 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 25750884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25751174 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 25751364 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 25751499 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 25751770 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25751854 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25751987 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 25751988 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 25752038 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 25752288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25752342 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 25752367 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 25752379 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 25752400 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 25752451 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 25753194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25754103 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 25754107 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 25754591 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 25754607 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 25754688 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25754905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25757525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25757631 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 25758013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25758080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25758263 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 25758269 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 25758389 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 25758487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25758627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25760670 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 25761630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25761718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25762458 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25762698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25765900 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25770105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25773869 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 25773883 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 25773905 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 25773931 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 25774159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25774796 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 25775001 A C Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 25775012 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 25775340 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25775424 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 25777286 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25777298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25777391 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25778910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25779055 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 25779091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25780163 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25780196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25780386 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25780401 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 25780877 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25783261 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 25787124 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25787592 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25788730 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25789624 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 25789921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25790275 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25790508 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25790625 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25790654 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25790729 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25790867 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25790888 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25790908 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25790931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25791248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25792715 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 25793621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25796180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25797450 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 25797778 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 25798177 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 25798729 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25799791 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25800418 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25801794 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 25802655 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25803230 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25804967 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 25804969 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25805099 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 25806117 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25806612 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25807237 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25810323 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25812215 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25815995 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 25816095 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 25816524 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 25816889 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25816928 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 25816987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25817225 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 25818308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25818376 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25819342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25819445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25819930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25820012 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25820694 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 25820775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25821459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25821527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25821608 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25821744 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25821770 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25822010 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 25822072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25823198 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25823214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25823616 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25823962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25823969 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 25824027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25824149 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25824164 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 25824908 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25824984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25825200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25825426 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25825543 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25825647 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25825809 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25825891 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25826522 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25826554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25827642 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 25827787 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25827797 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 25827845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25828067 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25828454 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 25828587 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25828640 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25828770 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25828870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25828968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25829062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25829621 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 25829741 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 25829778 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25829817 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25830152 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25830300 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25830418 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 25830719 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25831003 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25831212 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 25831405 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 25831526 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 25832101 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 25832473 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25832919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25832957 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25833079 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25833125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25833130 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 25833651 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 25834463 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25834679 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25836092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25836095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25836525 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 25836926 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25839208 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25840405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25840754 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 25841031 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25841182 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25841762 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 25841814 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25841875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25841996 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 25842509 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25844868 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25845862 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25846096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25846152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25847058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25847276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25848867 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25849904 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25849929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25850038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25850159 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25850173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25850185 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25851564 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25855194 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 25856272 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 25856453 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 25856739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25857903 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25857919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25857933 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25858054 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 25859129 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25859655 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25859799 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25860648 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 25861061 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25861578 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 25862233 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 25863728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25864085 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 25864632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25865201 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 25865664 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25865968 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 25865981 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25866181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25867319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25867962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25868664 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25869177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25869230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25869242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25869732 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25870883 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 25871170 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 25871623 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 25871921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25872460 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25873496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25873687 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25874248 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25875058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25875385 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25876206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25876639 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25877571 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 25878457 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 25878879 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 25880400 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25880455 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 25880553 A T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 2 25880636 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 25880743 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 25880816 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 25880833 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25880914 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 25880936 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25881056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25881099 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 25881109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25881200 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 25881204 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 25881240 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 25881383 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 25881438 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25881834 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25881932 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 25881941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25881952 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25882204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25882210 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 25882360 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25882456 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 25882504 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25882524 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25882579 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25882771 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 25882988 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 25883037 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 25883046 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25883089 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 25883259 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25883261 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25883318 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25883426 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25883609 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 25883695 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25883725 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25883763 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25883787 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25883802 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25883805 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25883869 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25883890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25884073 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 25884126 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 25884147 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 25884251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25884290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25884358 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 25884437 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 25884474 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 25884559 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 25884569 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 25884581 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 25884692 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 25884849 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25884851 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 25884918 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 25884946 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25885062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25885173 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25885175 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 25885197 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 25885507 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25886052 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 25886214 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25886273 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 25886712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25887109 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 25887760 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25888600 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 25889506 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 25889549 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 25890029 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25890748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25890778 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25890871 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25890989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25891075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25891083 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25891135 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25891176 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25891353 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 25892140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25892262 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25892329 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 25892739 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25893083 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 25894908 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25894919 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25894998 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25895225 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25895978 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25895991 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25896071 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 25896190 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25896237 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25896241 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25896289 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 25897111 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25897300 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25897515 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 25897654 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 25897858 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25897916 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25897924 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25898563 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25898564 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25898594 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25899101 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25901139 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 25901183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25901802 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25901843 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 25901886 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25901898 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25901917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25901952 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25901972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25902084 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 25902111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25902186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25902266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25902338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25902351 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 25902364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25902459 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25902558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25902707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25902742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25902754 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 25902798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25902903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25903023 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25903991 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25904475 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25904515 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25904600 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25904892 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25904919 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25905068 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25905307 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25905392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25905415 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25905464 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25907261 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 25907272 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 25907298 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 25907357 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25907396 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 25907568 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25907612 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25907677 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25907848 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 25907889 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 2 25907934 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25908174 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25908279 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 25908327 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25908449 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 25908473 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 25908978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25909510 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25909581 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25909789 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25909839 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 25909853 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 25909882 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 25909897 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 25909934 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25909960 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25909970 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 25910666 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25910695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25910750 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25910813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25911024 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25911174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25911388 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25911546 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25911646 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 25911721 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 25912588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25912798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25913792 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25915054 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25916316 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 25916372 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25917380 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25917986 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25918535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25918675 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25918908 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 25919561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25919602 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 25921898 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25923409 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25923431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25923511 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25924612 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 25924678 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25925295 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25926560 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 25926589 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25927545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25928281 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 25928682 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 25929514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25931032 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 25932563 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 25933047 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 25933571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25933956 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 25934442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25934660 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 25935123 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 25935141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25935485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25937365 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25937459 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 25937581 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 25939512 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 25940133 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 25940270 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 25940362 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 25940390 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 25940409 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 25940537 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 25940551 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 25940614 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 25940818 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 25940875 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 25940986 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 25941007 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 25941094 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 25941138 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 25942821 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25944812 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25944853 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 25944881 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25946697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25947148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25947881 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25947934 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 25947943 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25947984 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 25948088 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25948140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25948749 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25950714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25951041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25953296 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 25954431 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 25957768 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25958108 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 25958598 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 25958602 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 25958822 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25959633 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 25959705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25961312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25961504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25961783 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25963136 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25964330 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 25964378 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25965404 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25965885 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 25965896 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25966176 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 25966298 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 25966830 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25967078 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 25969906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25970155 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 25970225 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25971413 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 25971621 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 25972353 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 25972366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25972829 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 25972892 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 25973133 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 25973606 C G N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 25973809 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 25973847 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 25973868 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 25974397 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25974478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25975036 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 25975198 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 25977887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25979117 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25979126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25979903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25980066 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 25980112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25982054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25983199 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25983344 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25983673 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 25985362 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 25985848 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25988316 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 25989328 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 25989445 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 25989720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25990650 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 25990750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25990845 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25990883 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25991161 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 25991604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25991880 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25992733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25992984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25993031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25993066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25993282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25994694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25994981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25995205 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25995213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25995530 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 25995733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25995828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25997196 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 25997580 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 25997983 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 25998088 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 25998092 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 25998460 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 25998576 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 26000522 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 26000599 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 26000808 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26001300 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 26001530 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 26001841 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 2 26001894 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 26001995 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 26002245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26002320 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26003117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26003207 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 26003235 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 26003248 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 26003392 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26003473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26003524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26003563 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26003685 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26003809 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 26003847 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 26003866 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26003962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26004169 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26004193 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26004334 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26004449 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26004463 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26004535 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 26004774 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26004969 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26005251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26005638 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 26005668 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 26005853 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 26005932 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 26006084 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 26006122 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26006193 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 26006235 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 26007093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26007192 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 26007207 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 26007209 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 26007293 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26007538 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26007605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26007656 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 26007716 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 26007767 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 26007783 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26007784 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 26007923 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26007941 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26007943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26008014 G T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 26008015 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 26008026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26008037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26008045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26008144 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 26008549 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 26008834 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 26008857 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 26009010 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 26009020 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 26009054 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 26009404 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26009676 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26009692 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 26009871 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 26010683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26010692 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 26010785 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 26010851 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26010949 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26010980 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 26011003 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 26011010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26011127 A C N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 26011311 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26011320 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26011348 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26011437 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26011759 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26011791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26011829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26011856 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 26011880 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 26012014 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 26012048 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 26012831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26012862 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26012907 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 26012910 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26012978 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26012982 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26013010 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 26013020 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 26013032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26013086 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26013592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26014403 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26014411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26014461 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26014782 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26014843 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 26014946 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26014980 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26015046 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26015286 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26015335 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26015382 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26015385 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26015393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26015420 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26015591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26015596 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26015608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26015669 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26015703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26015753 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 26015831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26015887 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26015905 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 26016001 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26016057 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 26016144 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26016244 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 26016280 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26016315 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26016657 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26016854 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 26016895 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 26016926 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26016937 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 26016956 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26017425 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 26017486 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 26017528 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26017602 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 26017664 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 26017675 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 26017751 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26017777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26017840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26018778 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26018785 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26018898 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26019105 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26019164 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26019323 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26019453 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26019742 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 26019807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26019858 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26020031 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26020757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26020758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26021141 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 26021330 C T Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 26021719 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 26022508 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26022716 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26022768 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26023444 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 26023607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26023682 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26023806 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26023854 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26023898 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26023923 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26024126 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26024305 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 26024559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26024591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26025149 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26025197 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26025277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26025285 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26025307 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26025334 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26025348 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26025371 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26025382 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26025447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26025938 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26026035 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26026358 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26026418 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26026889 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26026980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26027039 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26027077 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26027272 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26027341 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26027380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26027747 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26027783 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26029464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26029974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26030139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26030215 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26030389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26030396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26030424 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26030582 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26031089 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26031257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26031683 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 26031722 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26031980 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26032624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26032646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26032804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26032829 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26032889 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26032892 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26032946 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26033069 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 26033340 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26033387 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26033400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26033421 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26033515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26033680 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26034326 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26034328 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26034376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26034756 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26034929 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26034955 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26034980 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26035019 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26035801 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26035838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26035912 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26036004 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26036043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26036107 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26036134 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26036179 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26036436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26036457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26036522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26036644 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 26036663 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26037271 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26037471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26037916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26037984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26038404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26038820 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26038841 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26038864 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26038884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26039099 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26039233 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26039258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26039374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26039911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26040144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26040376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26040908 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26042508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26043658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26044655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26047646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26047746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26049081 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26049285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26050784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26051509 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 26051659 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26051829 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26051863 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26052227 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26053435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26054522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26054613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26055126 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26055250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26055361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26056131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26056339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26057409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26058065 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26058973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26059391 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26064894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26065059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26065473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26065968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26069381 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26069420 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26069792 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26071461 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 26071676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26071809 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26073939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26073941 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26074436 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 26074557 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26074587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26076613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26078651 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26082266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26083028 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 26084375 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26084798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26085155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26085989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26091824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26092950 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26093245 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 26093418 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26093450 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26093561 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26093565 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26093604 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26093667 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26093732 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26093746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26093770 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26093888 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26093895 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26093902 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26093917 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26093939 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26094177 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 26094244 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26094306 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26094460 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 26094474 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26094479 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26094505 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 26094531 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26094546 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26094827 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26094858 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26094859 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26095038 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26095244 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26095912 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26096039 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26096327 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26096440 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26096517 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26096535 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26096705 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26096828 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26097985 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26098026 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26098961 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26099011 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 26099051 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 26099337 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26099415 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26100170 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26100195 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26100236 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26100374 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26100431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26100494 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26100807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26100982 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 26100983 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26101131 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 26101639 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26102048 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 26102165 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 26102245 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 26102874 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26103140 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26105003 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26105494 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26105550 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26106094 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26106548 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26107277 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 26107281 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 26107320 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 26107448 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26107646 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 26107655 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 26107794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26107880 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 26107905 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 26107949 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 26108013 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26108087 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 26108136 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 26108656 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26110182 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 26110241 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 26110253 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26110396 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26110445 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 26110483 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 26110551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26110953 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26111397 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26111664 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26111678 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 26111950 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 26111973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26111999 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26112028 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 26112085 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 26112663 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26113635 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26113697 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26113867 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26113886 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26113896 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26114173 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26114176 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26114270 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 26114291 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26115023 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26115029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26115083 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26116219 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 26116335 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 26117835 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 26120902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26121055 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26121065 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26121440 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26121470 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26121472 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26121611 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 26121635 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26121809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26121916 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 26121956 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26122411 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 26122520 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26122888 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26123307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26123786 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26124081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26124089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26124480 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 26124878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26124884 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26124924 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 26125055 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26125259 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26125403 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26125421 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26125442 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26125574 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26125640 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26126100 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26126120 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26126134 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26126417 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26126545 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26127087 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26127448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26128582 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26128682 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26129101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26130214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26130581 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 26130651 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 26130662 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26130680 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26130701 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 26130721 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26130727 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26130733 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26133053 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26133965 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26137474 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26137583 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26137639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26139769 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 26139849 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 26140027 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26140913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26141467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26141611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26143349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26143653 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 26143683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26143723 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26143733 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 26143774 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 26144902 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26144992 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 26145325 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26145402 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 26145511 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 26145521 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26145715 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26145919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26146046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26146131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26146158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26146264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26146375 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 26146402 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 26146405 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 26146421 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 26146509 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 26146748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26146834 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 26146968 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26147486 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26147512 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26148322 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 26148716 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26150279 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26150425 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26151444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26151789 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 26152118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26155365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26157517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26157885 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 26158567 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26161767 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 26163575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26163588 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26164041 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26164185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26164213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26164235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26164240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26164247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26164373 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26164384 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26164398 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26164467 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26164483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26164497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26164854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26165136 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 26165423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26167888 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26167969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26168645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26168752 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26170285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26172911 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26174047 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 26174203 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26174460 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 26174469 G C N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 26174574 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26174949 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26175041 T C Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 26175816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26176811 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26177339 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26181752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26185566 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 26185627 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 26185657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26185740 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 26185751 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26185778 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 26186582 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 26186648 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 26186651 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 26186806 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 26186819 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 26187015 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26187025 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 26187034 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 26187352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26187455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26187460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26187857 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26188140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26188329 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26188331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26188366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26188407 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26188410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26188425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26188432 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26188501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26194751 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 26195525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26195546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26195567 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26195601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26196483 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26196971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26197211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26197484 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26198163 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26198492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26198563 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26198657 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26198681 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26198684 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26199011 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26199155 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26199267 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 26199425 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26199461 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26199507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26199607 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26200450 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26200600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26201147 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26201191 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26202066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26202798 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26202873 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26203222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26203230 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26203240 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26203313 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26203368 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 26204099 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26204246 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26207462 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26207829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26207962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26208573 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26209085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26209385 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26209474 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26211145 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26211530 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 26211684 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26219353 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26220326 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26222316 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26223824 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26228439 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26228656 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26228661 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26229130 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26229204 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26229383 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 26229715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26230969 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26231031 C T Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 26232594 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26232876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26233964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26239889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26242055 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26242056 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26242263 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26245174 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 26247875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26247892 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 26251645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26254244 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 26254398 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26257563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26261319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26264547 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26266367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26270521 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26271130 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26271389 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26271549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26273758 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26274831 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 26275252 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 26275535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26276709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26277103 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 26277207 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 26279564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26280559 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 26280875 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26280937 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 26280940 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 26281898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26283504 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26283613 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 26284541 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26284682 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26285239 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26285255 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26285289 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26287309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26287490 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26287612 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26287936 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26288235 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26288981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26289041 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26289703 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26290630 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26292408 G C Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 26292471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26292643 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 26292772 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 26293306 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 26293772 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 26293842 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 26294444 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 26295385 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26295494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26295540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26296351 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26298128 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26298188 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 26299030 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26306959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26308489 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26308514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26308804 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26311816 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26321875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26322421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26324367 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 26324450 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 26324462 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 26324464 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 26324977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26325065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26325788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26327140 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 26327205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26327344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26327361 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 26327815 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 26327854 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 26327912 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 26327918 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 26327972 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 26328937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26331021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26337694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26339130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26345498 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26345630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26348954 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26349311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26349319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26349418 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26349431 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26349745 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 26350800 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 26351120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26351132 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26351300 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26351348 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26353169 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26353195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26353398 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26353576 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26353619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26354321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26354557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26354905 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26354972 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26355019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26355028 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 26355072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26355145 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26355198 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 26355268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26355876 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 26356139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26357974 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26358053 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26358211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26358551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26358556 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26358584 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26358969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26359569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26360657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26360999 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26361193 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26361906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26361964 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 26362124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26362130 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26362177 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26362420 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 26362713 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26363096 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26364159 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 26364230 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 26364301 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 26364401 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26364468 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 26365224 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 26365880 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 26367140 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26370826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26371366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26371379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26371556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26371558 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 26372419 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 26372445 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 26372527 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 26372599 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 26372610 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 26372995 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 26373155 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 26373196 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 26373209 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 26373217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26373329 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 26373392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26373529 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 26373593 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 26373904 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 26374174 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 26374481 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 26374860 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 26374917 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26374957 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26375006 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 26375019 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26375481 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26375659 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 26375867 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26375877 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 26375932 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26375954 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 26376181 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 26376220 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26376239 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26376313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26376374 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26376379 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26376424 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26376528 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26376562 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 26376599 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 26376644 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 26376715 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 26376844 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 26376971 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26376982 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26377386 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26377472 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26377586 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26377604 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26377661 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26377710 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26377714 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26377769 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26377823 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 26377946 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26377986 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 26378579 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26378747 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26378918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26378923 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26378935 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26379058 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26379094 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26379401 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26379630 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 26380489 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 26381881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26381995 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 26382930 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 26383140 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 26383402 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 26383429 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 26383438 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 26383585 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26383728 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 26383918 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26383928 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26383980 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26383996 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 26384854 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26385128 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26385485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26385853 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26386003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26386263 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26387124 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26387184 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 26387224 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 26387292 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26387354 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 26389210 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 26389290 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 26389302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26389312 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26389742 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26391395 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 26391555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26392329 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26392342 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 26392343 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 26392783 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26392804 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 26392863 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26392869 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26392924 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26393016 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26393191 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 26393681 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 26393763 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26393817 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 26393841 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26393897 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 26394120 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26394267 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 26395470 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26395700 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 26395730 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26395861 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26395879 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 26396549 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26396679 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26396917 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26397249 A T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 26397430 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26397679 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 26397685 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26397819 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 26398425 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26398512 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 26398593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26398691 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26398699 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26398713 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26401102 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26401121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26401469 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26401495 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26401500 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26401624 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26401637 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26401748 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 26402013 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26402023 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 26402093 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26402117 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26402404 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26402431 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 26402562 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26402638 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26402653 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 26402951 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26403151 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26403248 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 26403341 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 26403463 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 26403472 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 26403476 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 26403489 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 26403783 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 26404137 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26404138 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26404557 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26404591 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26404812 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26404824 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26404864 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26405123 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26405281 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26407952 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26407959 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 26408983 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26409042 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26409101 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 26409806 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26409835 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26410154 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26410220 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 26410235 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26410249 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26410361 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 26410600 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26410664 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26411131 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 26413065 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 26413585 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26413808 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 26413830 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26413839 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26413882 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26414335 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 26415866 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26415939 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26417781 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 26417870 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 26417917 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 26417929 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 26418061 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26418065 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 26418157 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 26418163 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 26418173 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 26418227 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 26418283 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 26418289 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 26418338 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 26418414 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 26418430 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 26418548 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 26418562 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 26418596 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 26418962 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 26419233 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 26419739 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 26420037 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26420069 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26420105 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26420129 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26420166 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26420281 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26420409 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26420562 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 26420647 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26420657 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26420682 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26421009 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 26421081 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26421097 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 26421311 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26421391 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26421411 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26421451 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 26421528 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26421547 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 26421665 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 26422381 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 26422827 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26422940 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26422988 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26423131 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26423324 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26423371 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26423442 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26423964 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26424046 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 26424147 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26424239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26424246 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26424409 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 26424551 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 26424567 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26424580 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 26424582 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 26424624 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 26424677 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 26424915 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26425116 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 26425177 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 26425236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26425349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26425456 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 26425463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26425512 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26425532 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26425619 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26425637 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26425839 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26426018 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 26426084 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 26426123 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26426519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26426546 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 26426561 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 26426585 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26426606 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26426671 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26426739 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26426958 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26426991 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 26427120 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26427156 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26427844 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26430016 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 26430046 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26430143 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26430226 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26430548 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 26430736 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26431173 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 26431242 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 26431513 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26431775 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 26431796 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26431847 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26431879 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26432503 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26432910 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 26432986 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26433035 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 26433081 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26433793 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 26434408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26434436 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 26436046 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26436078 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26436112 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 26436113 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 26436139 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 26436257 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 26436746 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 26436822 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26437200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26437218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26438735 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26440811 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26441146 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26441902 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26443670 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26444588 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26444615 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26446732 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26447488 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26447981 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26447986 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26448027 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 26448137 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 26448359 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26448453 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26450794 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26452541 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 26452558 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 26452600 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 26453096 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26453341 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 26453383 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26453729 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26453740 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26453749 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26454521 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26454579 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 26455685 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26456022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26456777 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 26458607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26458698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26460572 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26461274 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26461376 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 26461477 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 26462823 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 26463446 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 26463554 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 26464049 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 26464126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26465565 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26465630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26465633 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26465826 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 26466069 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 26466239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26466264 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26466915 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26467172 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 26467229 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26467275 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26467297 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26467298 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26467322 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26467388 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26467392 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26467434 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26467474 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 26467706 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26467713 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26467855 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 26468054 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26468475 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 26468480 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26469255 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26470034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26470267 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26470733 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26470755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26470898 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26471797 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26471866 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 26471882 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26471944 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26472000 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26472071 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26472124 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26472317 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26472747 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 26475406 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 26475867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26476794 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 26476931 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26477036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26481077 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26481653 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 26481905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26482387 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26482421 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26482507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26482854 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26482924 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26483000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26483636 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26485841 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 26486058 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 26488321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26488368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26489417 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26489535 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 26493167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26495229 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26497514 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 26499287 G T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 26499655 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 26499704 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 26500350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26500449 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26501704 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 26502178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26505670 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26505722 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26505737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26505853 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26505916 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26505968 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 26506037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26506096 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 26506354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26506728 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 26506746 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26506922 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 26506933 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 26507016 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 26507040 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26507217 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 26507750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26507812 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 26507861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26508005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26508249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26508685 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26508709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26509640 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26510918 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26511346 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 26511799 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 26511975 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26511988 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26511989 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26512031 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26512631 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26512725 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26512730 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26512743 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26512770 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26512868 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26512871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26512881 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26513374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26513451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26513493 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 26513860 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 26514214 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 26514426 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 2 26514428 T C Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 2 26514622 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 26514631 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26514662 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26515143 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 26515230 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 26515253 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 26515461 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26515565 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26516206 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26518703 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26518834 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26519534 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26519600 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 26519640 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26519664 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26519716 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 26519731 A G N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 26519751 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 26519785 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 26519871 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 26519898 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 26519959 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 26520002 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 26520311 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 2 26520465 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 26520890 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26520954 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 26521081 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 26521117 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 26521131 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 26521150 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 26521152 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 26521183 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 26521253 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 26521283 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 26521406 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26521515 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26521530 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26521546 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 26521549 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 26521604 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26521653 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26522299 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26522546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26522894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26523259 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 26523371 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26523392 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26523432 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26523457 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26523969 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26525104 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26525271 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26525574 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26525745 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 26525874 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26525913 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26526105 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26526394 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26526441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26527000 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26527050 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26527088 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 26527091 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 26527115 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26527194 C A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 26527358 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 26527724 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26527766 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26527796 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26527985 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26528110 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26528150 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26528314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26528327 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26528442 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 26528475 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26528486 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26529222 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26529652 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26529829 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26530079 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 26530349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26530787 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26531182 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26531232 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26531339 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26533521 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26534074 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26535103 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26535951 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26536191 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 26536204 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 26537468 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26537524 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26537796 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26538183 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26538214 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26538252 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 26539199 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26539800 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26539801 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26539964 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26540672 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26540794 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26541153 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26541206 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26542979 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26543286 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26543291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26543464 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26544572 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 26545995 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 26546229 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26546600 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26547325 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26547461 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26547662 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 26548001 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 26548838 G C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26548842 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26548966 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26548967 G C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 26549233 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26549636 A G Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 26549655 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 26550233 A T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 26550311 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 26550678 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26550715 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26550862 C A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 26550976 G T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 26551414 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 26552482 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 26552986 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26553092 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26553513 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 26553538 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 26553548 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26559021 T C Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 2 26559034 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 26561494 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 26561593 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26561606 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26561615 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26561674 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26561698 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26561779 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26561852 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26561894 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26562077 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26562130 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 26562132 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 26562170 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26562193 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26562310 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 26562321 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26562326 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26562363 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 26562383 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26562478 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26562538 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 26562565 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 26562577 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 26562608 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 26562621 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 26562685 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26562824 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26562850 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26563006 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26563072 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 26563104 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26563190 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26563191 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26563210 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26563562 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26563566 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 26563905 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26563942 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 26563997 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 26564007 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 26564086 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 26564112 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26564113 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26564139 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26564232 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26564429 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 26564860 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26565418 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 26565510 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 26565512 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26565523 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 26565824 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 26566150 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26566151 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26566189 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26566192 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26566204 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 26566241 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26566442 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26566473 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26572716 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26572823 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26573025 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 26573032 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 26573135 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26573183 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26573235 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 26573569 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26573594 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 26573968 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 26574027 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 26574085 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 26574229 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26574290 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26574315 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26574610 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26574982 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 26575043 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 26575143 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 26575301 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26575520 A C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 26575594 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 26575595 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 26575769 G C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 26575785 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 26576057 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 26576133 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26576200 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 26576336 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26576766 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 26576860 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 26577203 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26577535 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 26577537 T A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 26577561 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 26577740 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 26577764 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 26577787 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 26577892 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26578467 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26578626 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26579370 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26582593 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 26583399 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 26583641 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 26583872 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 26583889 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26584638 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26584755 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 26584847 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 2 26585740 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 26586067 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26586081 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26586168 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26586265 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 26586777 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26586854 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26586930 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26586946 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26587009 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26587027 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26587060 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26587085 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26587169 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26587428 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26587511 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26587701 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26587786 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 26588380 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26588397 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26588457 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 26588775 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26588820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26588834 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 26588851 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26589726 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 26589763 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26589764 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26589853 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 26589963 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26590247 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 26591114 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26591172 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26591281 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26591769 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 26591849 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26592269 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26592282 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26592640 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26592797 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26592989 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26593059 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26593082 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26593165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26593385 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26593411 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26593449 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26593622 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26593972 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26593979 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26594414 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26594420 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 26594434 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26594464 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26594516 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26594534 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26595090 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26595155 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26595181 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26595190 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26595231 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26595235 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26595242 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26595289 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26595447 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26595473 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26595526 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26595571 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26595617 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26595650 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 26595850 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26596216 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26596393 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26596434 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 26596439 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 26596850 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26596877 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26597043 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26597148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26597186 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26597210 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26597321 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26597738 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26597780 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26597824 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26597984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26598142 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26598198 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26598425 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26598528 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26598589 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26598823 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26598885 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 26599125 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26599210 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26599302 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26599603 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26599790 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26599862 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26600195 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26600566 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 26601311 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26601673 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26601675 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26601801 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26601911 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26602287 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26602299 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26602446 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26602449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26602541 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26602721 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26602761 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26603811 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 26603925 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 26604063 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26604315 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26604341 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26604437 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26604546 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 26604571 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26605370 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26606529 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26608186 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26608321 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26608513 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26608523 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26608557 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26608600 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26608936 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26609128 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 26609145 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26609153 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 26609173 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26609219 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26609344 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26609356 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26609358 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26609429 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26610163 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26610171 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26610328 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26610420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26610587 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26610588 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26610602 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26610737 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26610761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26610814 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26610851 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 26610871 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 26610950 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26610995 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26610998 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26611093 C G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 26611185 C A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 26611263 C T Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 26611409 A G Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 2 26611501 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 26611571 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 26611658 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26611864 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26611919 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 26611949 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26612003 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26612087 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26612166 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 26612212 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26612243 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 26612269 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 26612327 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 26612343 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 26612373 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26612374 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26612398 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26612416 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26612417 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 26612474 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26612554 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26612614 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26612646 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26612655 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26612829 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 26619506 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26619596 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 26619612 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26619659 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26619728 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26619748 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26619758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26619769 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26619800 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26620162 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 26620304 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26620699 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26620707 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26620748 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26620917 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26621053 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 26621170 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26621298 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26621362 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26621408 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26621423 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26621481 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26621566 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26621575 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26621620 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26621640 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26621699 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26621705 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26621799 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 26621854 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 26621871 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 26621882 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 26621944 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 26622012 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 26622075 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26622138 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 26622157 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26622244 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26622360 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 26622414 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26622560 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26622565 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26622576 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26622643 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26622654 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26622691 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26622760 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26622920 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26622980 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26623061 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26623100 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26623188 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26623309 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26623342 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26623397 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26623430 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26623504 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26623622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26623713 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26623795 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26623832 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26623865 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26623904 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26623965 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26624236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26624352 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26624419 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 26624525 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 26624542 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 26624549 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26624630 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26624748 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26624774 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 26624782 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 26624828 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 26625016 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 26625521 A C Y N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 26625617 G A Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 26625621 C T Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 26625640 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 26625661 G A Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 26625666 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 26625737 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 26625831 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 26625917 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26625935 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 26626045 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 26626124 A T Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 26626261 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26626314 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26626356 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26626383 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26626447 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26626483 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26626556 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26626569 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26626571 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26626770 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 26626787 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 26626802 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 26626805 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 26626818 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26626870 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26626893 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26626937 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26627219 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 26627237 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 26627478 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 26627664 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26627822 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26627842 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26627863 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 26627933 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 26628064 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 26628096 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26628376 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 26628761 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 26628938 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26628968 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26629318 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26629798 C A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 26629947 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26629971 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 26630049 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26630086 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26630127 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 26630160 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 2 26630185 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 26630195 A G Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 26630274 A C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 26630319 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 26630354 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 26630414 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26630469 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 26630515 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 26630543 T G Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 26630629 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26630638 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26630651 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26630690 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 26630707 C A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 26630755 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 26630797 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 26630838 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 26630846 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 26630855 C A Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 26630888 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 26631137 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 26631147 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 26631219 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26631398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26631404 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26631458 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26631555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26631629 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26631892 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26631898 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26632002 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 26632087 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26632118 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26632134 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26632146 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26632187 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26632218 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26632270 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26632375 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26632402 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26632415 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26632466 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26632467 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26632481 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 26632505 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26632519 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26632527 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26632545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26632920 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26632949 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26633063 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26633070 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26633101 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26633119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26633410 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26633414 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26633441 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 26633450 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26633544 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26633593 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26633810 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26633825 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26633834 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26633969 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26634026 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26634047 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26636517 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 26636534 G C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 26636566 G T Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 26636616 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26636672 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 26636843 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26636939 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26637070 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26637088 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26637111 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26637118 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26637192 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26637208 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26638171 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26638283 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26638342 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26638343 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26638365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26638431 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26638437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26638467 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26638724 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26639108 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26639130 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26639137 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26639175 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26639189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26639609 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26639636 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 26639734 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26640042 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 26640096 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26640100 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26640346 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26640654 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26641632 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26641756 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26641778 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26642917 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26643514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26644763 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26644887 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26645915 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26647507 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26647753 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26654579 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26655233 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26656213 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26656460 G T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 26656465 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 26656857 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 26657089 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26657688 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 26659096 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26659099 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26659512 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26659688 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26659841 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 26659978 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26660089 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26660705 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26660827 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26661418 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26661760 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26661826 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 26661883 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26662165 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26662332 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26662368 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26662628 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26662938 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26663359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26663416 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26663445 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26663571 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26663648 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26664075 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26664137 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26664345 C G Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 26664471 A C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 26664472 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26664600 C G Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 26664899 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 26665296 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26665893 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26666401 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26666564 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26666689 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26666776 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 26666930 G T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 26666940 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 26666952 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 26666960 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 26667211 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 26667315 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26667882 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26668213 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26668982 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26669134 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26669173 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26669393 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26669494 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26669508 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26669644 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26669863 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26669920 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26670038 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26670446 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 26670501 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26670507 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26670558 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26670601 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26670842 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 26671003 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 26671083 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26671131 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 26671219 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26671234 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26671408 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26671508 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 26671660 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26671680 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26672172 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26672191 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26672212 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26672276 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26672285 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26672334 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26672363 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 26672378 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26672459 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26672478 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26672529 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26672537 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26672574 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26678159 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 26678175 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26678540 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26679683 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26680776 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26681855 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26682110 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26683260 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 26683415 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 26683576 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 26683589 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 26683760 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 26684117 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26684343 A T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 26684952 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 26684982 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26685055 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 26685145 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26685431 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26685695 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 26685754 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 26685957 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26685974 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 26686122 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26686225 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26686281 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 26686370 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26686470 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26686507 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26686666 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26686673 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26686709 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26687044 C G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 26687081 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 26687213 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 26687238 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26687453 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26688033 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26688678 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 26689219 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 26689240 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 26689405 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26689443 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26689513 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26689654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26689682 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26689988 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 26690051 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26690075 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26691055 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26691421 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26692952 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 26693433 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26693643 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26694579 A C Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 26694847 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 26694895 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26695175 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 26695485 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26696118 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26696303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26698155 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26698443 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26700066 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26700087 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26701081 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26701618 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26701695 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26701834 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26701835 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26705794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26707357 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26707402 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26707842 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26708358 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26708420 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26708515 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26708544 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26708581 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26708681 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26708858 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26709622 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 26709696 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26710809 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26710862 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26711425 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 26711528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26711625 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26711654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26711684 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26711703 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26711815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26711845 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26712005 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26712006 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26712125 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26712189 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26712923 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26713024 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26713056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26713691 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 26714093 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 26715392 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 26716061 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26716192 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26716337 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26717522 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26717660 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 26717709 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26717824 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 26717853 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26718103 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26718170 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26718533 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 26718636 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 26718892 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 26719044 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26719090 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26719101 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26719120 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26719231 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26719405 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26719420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26719421 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26719438 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 26719546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26719559 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26719622 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26719655 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26719662 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26720089 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26720253 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26720339 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26720349 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26721170 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 26721469 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26721512 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26721829 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26721843 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26721893 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26721944 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26722114 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26722184 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26722219 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 26722244 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26722272 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 26722301 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 26722319 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26722362 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 26722401 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 26722614 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26723239 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26723963 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 26724240 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26724407 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26724665 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26724908 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26725077 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26725468 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26730257 T G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 26731380 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26731680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26731859 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26732451 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26732517 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 26732574 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26732686 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26732711 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26732758 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26732760 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26732953 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 26732990 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 26733183 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26733256 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26733384 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26733410 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26733414 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26733628 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 26734236 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26734272 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26734332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26734356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26734435 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26735571 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 26735596 G T Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 26736449 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 26736504 G C Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 26736578 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 26737091 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26737428 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 26737528 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 26738138 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26738264 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26738336 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26738619 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26739524 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26739941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26740276 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26740554 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 26740642 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 26740818 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26740847 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26740877 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26740927 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 26740936 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26741678 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26741703 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26741783 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26741799 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 26741958 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26742048 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26742085 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26742121 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26742149 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26742161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26742560 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26742743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26742912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26742937 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26742984 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26743121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26743132 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26743148 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 26743162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26743228 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26743248 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26743280 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26743300 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26743338 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26743576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26743797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26743800 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26743823 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26743844 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26744025 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26744222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26744244 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 26744245 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26744669 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26744718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26744824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26744877 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26744887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26744973 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26745058 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 26745276 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 26745327 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 26745348 G C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 26745360 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 26745394 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 26745461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26745635 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26745703 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 26745841 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 26746136 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26746172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26746194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26746199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26746262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26746320 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 26746653 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26747132 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26748546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26748633 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26748656 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26748822 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26749084 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26749757 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26751576 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 26751598 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 26751900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26752018 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26752038 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 26752781 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26753611 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26753764 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26760479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26760757 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26761181 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 26761725 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26761744 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 26762435 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26762466 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26763336 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26763396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26765302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26765698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26765758 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 26765776 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26765986 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26766001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26766460 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26766486 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26767110 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 26767149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26767223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26767226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26767250 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26767251 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26767459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26767508 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26768010 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 26768477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26768574 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26768587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26768593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26768735 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26768799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26768812 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26768836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26768844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26768961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26769191 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26769232 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26769237 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26769268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26769318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26769328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26769360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26769383 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 26769614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26769618 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26769671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26769707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26769770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26769773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26769885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26769962 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26769987 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 26770088 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 26770134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26770352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26770902 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 26770989 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 26771063 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 26771163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26771778 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 26772739 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 26772793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26773949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26774835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26775283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26776228 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26776345 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26776873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26777557 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26777644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26777745 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26777748 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26777764 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26778104 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26778126 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26778406 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 26778444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26778655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26778681 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26778708 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 26778787 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26778933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26778947 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 26779329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26780338 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 26781598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26782118 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26782152 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26782798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26783034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26784470 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26785644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26785790 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26787082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26787395 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26791425 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26792545 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26793030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26794425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26794744 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 26794830 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 26795076 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26795235 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 26795243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26795256 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26795261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26795950 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 26796159 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26796248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26796332 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 26796339 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 26797032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26797644 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26797667 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26799172 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26799231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26799389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26799623 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26800013 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26800443 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26800963 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26801413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26802823 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26803070 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26803114 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26803184 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26803260 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 26803270 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26803291 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26803786 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 26803948 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 26803991 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 26805217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26805334 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 26805355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26805368 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26805451 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26806249 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26806601 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26808072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26808729 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26808944 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 26811743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26812085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26814278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26814678 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26815113 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 26817300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26817471 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26817892 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 26817911 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 26818136 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26819020 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26819125 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26819133 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 26819418 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26820062 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26820229 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26820713 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 26820745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26820807 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 26821900 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26822900 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 26823239 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26823587 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26824836 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26826171 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 26826232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26826572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26826575 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26826945 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26827726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26827902 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 26828326 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26828814 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26830673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26830802 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26831014 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 26831128 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26831483 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26831845 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26832150 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26832516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26833164 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26833312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26833368 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 26833385 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26835534 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 26835874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26836335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26837837 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26838197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26838558 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 26840373 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 26843635 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 26844662 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26844807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26845367 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26851633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26852808 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 26860794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26861047 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26861371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26861581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26862806 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 26864401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26864655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26864666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26864690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26864760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26864891 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26864908 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26865147 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26865159 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 26865226 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 26865504 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 26865540 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 26865612 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26866773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26866834 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26866908 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26867179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26867427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26867544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26868160 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 26868525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26868945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26869034 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 26869218 G T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 26869457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26870480 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26870995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26871323 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26872687 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26876275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26878024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26879478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26881124 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 26882162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26882935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26883632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26884488 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 26884861 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 26884930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26884996 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 26885483 T A Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 2 26885900 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 26886046 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 26886165 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26886483 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26886611 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 26886719 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 26887181 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 26887260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26887386 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 26887424 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 26887613 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 26887822 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26887883 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26887919 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26888245 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26888321 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26888418 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 26888443 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 26888456 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 26888476 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26888527 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 26888562 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26888905 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26889116 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 26889216 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26889324 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26889412 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 26889538 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26890023 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 26890079 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26890320 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 26891035 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 26891134 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26891339 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26891420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26891461 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26891487 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26892036 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 26892333 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26892511 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26893180 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 26893189 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26893466 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26894366 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26894462 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 26894466 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26894475 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 26894488 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 26894536 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 26894683 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 26894764 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 26894865 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26894899 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 26895068 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 26895117 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26895262 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26895323 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26895460 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 26895467 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 26895561 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26895567 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 26895572 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26895963 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 26896148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26896226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26896248 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26896299 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26896398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26896402 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26896516 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 26896549 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 26896580 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 26896622 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26896625 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 26896636 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 26896719 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 26896755 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 26897063 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26897142 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 26897259 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 26897292 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26897368 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 26897448 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 26897486 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 26897813 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26897881 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26897916 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26897971 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 26897998 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26898131 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26898301 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 26898820 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 26898859 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 26898900 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 26899288 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 26899348 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26899380 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26899443 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 26899883 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 26900458 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26900690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26900770 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26900981 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 26901312 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26901356 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26901479 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26901514 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26901717 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26902469 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26902484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26902779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26902825 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26902836 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26902998 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26903316 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 26903515 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26903623 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 26904459 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26904698 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26904756 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26904847 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 26905003 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 26905615 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 26907283 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26907656 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26907658 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26907695 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26907710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26907777 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 26907859 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26907933 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26907956 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 26908350 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26908389 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26908679 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26908759 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26908864 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 26908877 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26908884 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26909031 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26909271 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 26909351 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 26909359 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 26909444 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 26909456 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 26909685 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26911247 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 26911429 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26913048 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 26915401 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26916070 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26916091 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 26916134 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26917268 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26919421 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26919743 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26921789 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26922820 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26923153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26924110 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 26924180 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26925728 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26928788 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26928827 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26930773 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26939319 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 26940281 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26940993 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26941213 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26941362 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26941371 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26941556 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26941973 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26942044 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26942232 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26942243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26942280 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26943637 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26944281 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26944947 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26945735 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 26946396 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26946486 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26946895 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 26947836 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26948652 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 26948736 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26948915 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 26949509 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 26949662 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26949791 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 26949882 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 26949983 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 26950169 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 26950564 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 26950609 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26950692 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 26951039 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 26951399 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26953592 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26953907 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26954471 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26954549 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 26954646 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 26955861 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 26956109 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 26956145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26956373 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 26956412 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 26956968 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 26957854 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26959028 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26959646 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26960116 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26960472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26960600 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26961126 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 26961575 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 26961598 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 26961919 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 26963527 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26963603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26963704 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 26963722 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 26963756 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 26964520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26965271 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26965835 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26966016 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26966259 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26967491 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 26967513 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 26968944 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 26968983 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26968984 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26969095 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26969445 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26970097 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 26970111 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 26970240 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 26970242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26970269 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 26970275 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26970930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26971238 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26971666 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26971811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26971815 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26971847 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26971975 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 26972001 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26972061 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 26972063 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 26972283 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26972329 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 26972330 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 26972581 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 26972662 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26972683 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26972795 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26972809 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 26973430 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26973557 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26973611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26973620 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26973635 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26973789 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 26973819 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 26974111 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26974190 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26974197 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26974514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26974570 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26974893 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26974912 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26975100 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26975156 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26976513 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 26976566 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 26976604 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 26976716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26976790 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26976835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26976864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26976968 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 26977031 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26977057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26977065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26977386 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 26977455 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 26980020 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26980715 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26981443 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26981946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26982109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 26983546 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26983745 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 26986425 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 26988150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 26993049 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 26993399 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 26993453 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 26995293 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26995344 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 26995424 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 26995575 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 26995680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26995843 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26996084 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 26996231 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26996256 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 26996299 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26996637 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26996655 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26996852 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 26997016 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 26997973 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 26997991 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 26998646 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 26998815 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 26999219 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 26999770 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27000111 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27000130 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27000142 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27000398 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27000404 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27000920 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27001330 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27001523 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27002268 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27002524 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27002846 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27002983 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27003389 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27003441 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27003457 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27004543 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27004667 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27004684 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27004829 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27004865 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27004874 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27004931 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27006522 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27007372 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27007395 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27008481 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27009025 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27009086 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27009093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27009362 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27010001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27010709 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27011842 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27012636 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27012759 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27013201 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27013846 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27016808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27017874 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27017889 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27017919 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 27017929 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 27017969 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27017978 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27020083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27022136 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27022209 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27022216 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 27022221 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 27022237 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27022878 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27022991 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27023214 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27023259 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27023543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27023604 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27023815 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27024017 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 27024368 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27024569 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27024689 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27024761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27024914 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27024923 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27025066 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27025336 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27025801 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27026366 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 27027218 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27027684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27028831 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27029513 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27029946 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27030774 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27031568 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27031591 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27031605 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27031685 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27031687 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27031871 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27032047 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27032569 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27033895 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27033899 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 27034022 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27034060 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27034083 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27035059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27035185 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 27035255 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 27035373 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27035879 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 27036505 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27036615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27036616 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 27037201 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27038664 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 27038872 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27038975 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27040510 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 27042854 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 27046352 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27046651 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27047210 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 27047212 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 27047251 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 27047252 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 27047335 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27047633 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 27047638 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 27047685 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27047752 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 27047761 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27047825 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 27047955 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27047976 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 27047988 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 27048112 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 27048228 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27048363 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27048446 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 27048472 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 27048567 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27048660 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27048679 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 27048685 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27048762 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 27048793 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 27048836 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 27048852 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 27048983 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27049140 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 27049161 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27049254 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27049316 T A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 27049455 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 27049488 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 27049492 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 27049510 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 27049531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27049535 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 27049606 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27049956 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27050003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27050071 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 27050238 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 27050253 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 27050293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27050348 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 27050367 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 27050470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27050629 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27050632 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27050710 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 27050754 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 27050755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27050895 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 27051049 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 27051132 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27051309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27051320 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27051385 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27051559 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27051743 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 27051863 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 27051980 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27052007 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27052096 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 27052252 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 27052455 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 27052509 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27052635 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 27052791 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27052796 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27053001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27053137 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 27053178 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 27053225 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 27053232 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 27053323 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 27053348 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27053487 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 27053553 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27053595 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27053630 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 27053724 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27053762 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27053846 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27053897 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27053994 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27055237 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27055289 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27055331 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27055441 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27055462 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 27055598 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27055642 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27055757 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27055758 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27055804 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27055829 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 27055843 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 27055883 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 27055903 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27056073 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27057479 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 27058201 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 27058255 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27058483 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27058545 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27058566 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27059031 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27059057 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27059259 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27059406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27059663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27059729 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27059818 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27061522 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27063198 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27063286 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27063321 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27063346 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27063362 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27063398 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27063399 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27063443 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27063586 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27063598 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27063679 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27065413 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27065448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27066213 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 27067563 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27067681 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 27068076 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 27068142 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27068208 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 27068380 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27068394 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27068410 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27068421 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27068446 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 27068894 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 27069059 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27069068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27069080 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27069101 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 27069126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27069141 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27069238 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 27069606 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 27069808 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 27069868 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27069919 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 27070174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27070330 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27070444 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27070521 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27070552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27071223 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27071571 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27071746 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 27073214 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27073238 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 27073298 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 27073496 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 27074799 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27076055 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27076502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27077873 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27078322 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27083576 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27083618 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27083698 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27083711 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 27083721 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 27084167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27084197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27084369 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 27084399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27084582 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 27084746 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 27084801 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 27084838 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27085014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27085076 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 27085124 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 27085132 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27085304 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 27086331 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 27086406 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 27086486 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 27086491 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 27087004 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 27087069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27087645 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27087658 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27087683 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27087784 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 27087825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27088799 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27089017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27089312 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27089382 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 27089592 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27089716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27090164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27090782 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 27090796 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 27090949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27091079 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 27091148 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 27091158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27091270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27091427 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 27091964 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 27092014 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 27092015 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 27092030 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 27092041 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 27092117 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 27092201 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 27092223 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 27092235 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 27092274 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 27092716 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 27092768 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27093006 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 27093025 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 27093124 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27093141 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 27093215 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27093327 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27093349 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27093509 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27093834 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27094689 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27095322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27095573 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27095728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27095969 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 27096486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27097711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27099624 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27101078 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27101160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27101565 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27101790 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 27101814 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 27101831 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27101836 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27102575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27103498 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27104268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27105229 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27105271 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27105458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27105603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27105656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27106396 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27106534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27106560 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27106598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27106644 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27106645 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 27106656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27106672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27106673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27106709 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 27106762 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27106884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27106988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27107291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27107382 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 27107409 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27107430 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 27107527 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27107558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27107652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27107667 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27107681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27107760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27107761 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27107885 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27107902 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27107913 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27108508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27108835 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 27108922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27109044 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27109119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27109200 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27109211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27109248 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27109971 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 27109976 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 27110028 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 27110043 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 27110052 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27110069 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27110172 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27110278 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27110364 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27110380 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 27110427 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 27110433 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 27110484 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27110555 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27110588 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27110660 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27110665 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 27110684 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 27110711 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 27110731 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 27110795 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 27110799 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 27110823 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 27110863 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27110896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27110900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27110996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27111387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27111487 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27111619 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 27111803 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27112526 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27112626 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27112658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27112675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27112726 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27113145 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27113146 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27113901 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 27113941 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27114103 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 27114184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27114410 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 27114781 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27114995 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 27115066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27115378 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27115946 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27116249 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27116318 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27116329 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 27116355 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 27116397 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27116477 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 27116493 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 27118748 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 27118749 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 27118963 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 27120087 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27120209 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27120221 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 27120510 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27120626 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 27120943 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 27120982 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 27121282 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 27121329 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 27121382 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 27121422 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27121501 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 27121802 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27125773 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27128219 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 27129803 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27133740 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27134056 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27136135 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27136288 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27136612 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27138188 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27138400 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27138494 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 27138515 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27138536 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27139749 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27139804 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27139903 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27140436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27140467 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 27140486 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27140514 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 27140520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27140657 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 27140916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27140976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27141625 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 27141634 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 27141636 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 27142208 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27142254 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27142284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27142539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27143665 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 27145057 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27145189 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 27145242 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27145484 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27146353 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27149475 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27150417 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27150751 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27150798 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27152021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27152636 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27152723 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27152791 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27153662 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27153717 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27154214 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27154405 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27154408 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27154445 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27154572 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27154587 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27154701 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27154757 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 27154792 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 27154839 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27154846 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 27156459 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27156468 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 27156472 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 27156790 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27156999 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27157971 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27159168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27159518 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27160263 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 27160304 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 27160475 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27160562 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27160901 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27161729 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27161998 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27162242 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 27162266 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27162348 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27162403 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 27162478 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27162484 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27162592 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27162637 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 27162684 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27162721 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27162898 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 27162938 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 27163106 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 27163392 G T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 27164059 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27164111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27164250 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27164270 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27164828 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27164919 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 27165630 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27165729 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27165742 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27165802 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27165897 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27166004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27168166 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 27168227 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27168248 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27168347 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27168592 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 27168750 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27169052 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27169079 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27169397 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27169777 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 27169784 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 27172071 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27172081 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27172083 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27172092 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27172166 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27172201 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27172209 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27172248 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27172665 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27172688 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27172728 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27172766 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27172821 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27172849 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27172917 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27173287 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 27173362 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27173665 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27173675 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27173694 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27173830 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27173855 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27173871 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27173879 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27174002 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 27174595 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27176140 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27176215 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27176348 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27176357 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27176371 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27176641 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27176655 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27176707 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27176795 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27177013 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27177452 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27177512 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27177583 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 27177704 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27177726 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 27177770 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27178252 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 27178258 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27178554 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27178835 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27179032 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27179046 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27179242 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27180024 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27180359 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 27180375 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27180567 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27181075 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27182183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27182475 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27183163 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27183269 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27183278 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27183281 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27183467 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27183545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27185913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27186434 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27186435 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27186642 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27187428 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 27187624 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 27188015 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27188072 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27188182 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27188204 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27188478 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 27188522 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27188639 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27188944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27189337 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27189481 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 27189579 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27189658 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27189686 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27189891 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27189898 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 27189957 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27189993 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27190075 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27190316 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 27190338 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 27190341 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 27190900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27191331 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27191339 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27191356 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27191414 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27191419 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27191481 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27191673 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27191774 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27191822 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27191858 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27191860 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27191880 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27192490 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27192607 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 27192695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27193023 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 27193577 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27193662 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27194628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27197795 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 27199037 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27201417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27202089 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27203265 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27204297 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27205555 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27207717 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 27207764 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 27207877 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27207939 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27208747 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27208785 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27209249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27211335 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 27212004 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27212458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27212550 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 27212612 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 27212729 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 27212750 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 27212801 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 27212823 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 27212841 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 27212910 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 27212915 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 27212926 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 27212933 T A Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 27213317 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 27213800 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27213915 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27214652 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27214719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27214850 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 27214862 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 27214900 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27214956 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 27215042 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 27215056 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 27215456 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27215504 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27215519 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27215813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27215897 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 27215922 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 27215929 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27215975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27216189 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27216205 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 27216209 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27216269 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 27216281 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 27216328 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27216442 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27216744 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 27216993 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27217100 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 27217185 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27217186 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27217204 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 27217219 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 27217241 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27217271 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27217310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27217340 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27217342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27217378 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27217515 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27217520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27217563 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27217581 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27217599 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 27217676 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27217677 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 27218078 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 27218079 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 27218102 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27218167 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27218415 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 27218497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27218504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27218583 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27218638 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 27218677 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 27218729 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 27219013 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27219090 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 27219121 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 27219214 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27219226 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 27219281 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 27219296 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 27219303 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 27220121 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 27220163 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 27220724 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 27220781 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27220822 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 27220992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27221003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27221045 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 27221501 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 27221513 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 27221727 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 27221742 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 27221745 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27221766 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 27221789 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 27221827 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27221894 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27221916 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27221935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27222129 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27222159 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 27222414 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27223913 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27223971 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 27225195 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27228017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27231380 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 27232612 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27232800 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27235302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27235450 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27235475 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27235852 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27235874 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27235882 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27235912 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27235916 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27235954 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 27235982 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 27235996 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27236013 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27236069 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 27236070 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27236148 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27236210 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27236232 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27236236 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27236275 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27236391 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27236484 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27236587 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27236601 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27236606 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27237535 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27237585 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27239265 C A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 27239266 C T Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 27239387 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27239406 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27239514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27239516 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27240121 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27240143 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27240353 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27240364 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27240367 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27240392 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27240448 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27240482 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27240506 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27240534 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27240805 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27240819 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27240829 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27240861 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27240884 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27240909 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27240915 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27240947 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27240992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27241047 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27241191 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27241244 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27241258 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27241321 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27241406 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27241553 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27241567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27241725 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27241752 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27241836 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27242064 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27242136 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 27242171 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27243101 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27243186 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27243724 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27243823 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27243851 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27243860 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27244599 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27244668 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27245140 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27245165 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27245205 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27245329 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27246182 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27246886 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27247011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27247396 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27247576 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27247630 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27248524 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27250331 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27251598 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 27252033 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27252205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27254289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27256096 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27256100 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27256768 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27258035 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27260228 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27261256 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 27261463 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27264346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27264465 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27265505 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27265635 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27265786 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27265787 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27265802 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27266024 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 27266041 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 27266113 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27266307 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27267401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27267693 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27268103 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27269126 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 27269378 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27272165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27272284 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27272337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27272533 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27273048 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27273159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27275054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27275207 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27277304 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27277318 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27278118 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27278354 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27279436 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27280471 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27280702 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27282795 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27284675 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27287377 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27287607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27287780 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27287825 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27288577 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27288940 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27289211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27289564 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27290543 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27291499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27291704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27292338 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27292410 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27293431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27294252 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27295120 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27295180 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27295359 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27295460 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 27295916 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27296256 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27296360 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27297439 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27299210 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27299573 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27300214 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27301070 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27303083 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 27303666 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27309817 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27311958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27312693 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27314072 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27316713 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27318151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27320496 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27320635 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27320645 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27322262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27324431 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27325432 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 27326002 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 27330039 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 27332539 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 27334462 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27334954 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 27335028 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 27335607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27335830 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27336207 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27337283 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27338204 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27339530 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 27339642 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 27340627 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27340659 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27340678 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 27341122 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 27341231 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 27341250 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 27341707 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 27342101 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 27342300 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27342550 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27342816 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 27342963 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27342967 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27343592 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 27344374 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27345389 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27345704 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27345773 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 27345892 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 27346087 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 27346114 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27346348 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27346419 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27346969 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27347499 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 27348918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27350796 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 27351052 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 27353632 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 27353690 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 27353710 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 27354050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27354062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27354083 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 2 27354086 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 2 27354113 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 27354225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27354933 C T Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 27355147 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 27357959 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 27358602 G T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 27359041 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27360387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27364372 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27365539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27366012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27366059 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27366128 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27366781 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27367273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27367444 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27368001 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27368789 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27372266 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27372383 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27373202 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27373650 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27374411 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27374546 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27374586 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27376024 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27376039 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27377271 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 27377887 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27378009 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27378189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27378445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27378578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27378831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27379329 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27379435 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27379512 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27380705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27380766 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27380779 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27381389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27381455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27381515 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27381539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27381621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27381687 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27381722 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27381841 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27382095 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27382252 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 27382562 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27382704 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27382743 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27382746 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27382871 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27382934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27383024 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27383308 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27383436 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27383543 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27383549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27383739 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27384703 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27384819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27385045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27385998 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27386017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27386194 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27386340 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27386549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27388333 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27389393 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27389502 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27389861 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27392227 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27392390 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27392393 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27392558 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27392776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27392782 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27392809 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27392845 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27392846 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27392889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27392994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27393026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27394044 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27394839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27395493 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27395521 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27395569 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 27395619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27395845 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27396628 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27396630 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27396708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27396776 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27396893 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27397043 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27397162 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27397187 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27397674 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27398065 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 27398268 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27398310 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27398396 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27398436 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27398609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27398759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27398855 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27398988 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27399024 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27399028 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27399076 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27399116 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27399169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27399389 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27399432 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27399496 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27399508 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27399554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27399689 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27399698 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27399743 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27399812 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27400186 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27400273 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27400280 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27400316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27400347 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27400438 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27400476 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27400498 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27400523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27400537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27400624 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27400721 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 27401203 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27401709 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27401871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27401926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27401977 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27402087 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27402220 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27402334 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27402378 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27402431 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27403031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27403637 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27403765 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 27404229 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27405088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27405551 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 27405646 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 27405913 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27406032 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27406069 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27406260 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27406328 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27406807 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 27406904 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27406924 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27407039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27407265 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27407373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27407383 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27407546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27407783 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27407790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27407962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27408168 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27408180 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27408269 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27408390 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27408423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27408436 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27408437 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27408466 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27408577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27408691 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27408966 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27409262 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27409706 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27410588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27410745 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27411455 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27411529 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27412162 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27412380 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27412877 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27413539 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 27413596 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27413739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27414051 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27414087 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27414137 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27414154 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27414172 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27414173 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27414219 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27414375 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27414422 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27414649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27414678 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27414684 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27414831 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27414836 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27414889 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27415374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27415601 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27416309 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27418095 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27418291 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27423377 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27423406 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 27423899 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 27423940 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 27424074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27424133 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 27424394 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27424474 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 27424517 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27425550 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27425603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27425885 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 27426000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27426178 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 27426243 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27426247 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27426333 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27426381 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 27426539 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27426587 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27426603 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27426834 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 27426913 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27427158 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27427269 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27427274 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27428758 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 27429531 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 27429955 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27430066 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27430136 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 27430137 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 27430652 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 27430716 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 27430721 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 27431261 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 27431907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27432488 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 27432572 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 27432586 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 27432774 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27433491 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27433498 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27433530 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27433552 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27433607 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 27433766 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 27433819 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 27433948 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27433954 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27433967 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27434192 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27434244 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27434349 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 27434367 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27434429 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27434591 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27435356 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27435746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27437155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27437208 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27437219 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27437279 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27437286 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27437396 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27439738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27439858 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 27439887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27439954 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27439961 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27440235 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27440477 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 27440604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27440717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27440863 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27440898 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 27441188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27442100 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27443193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27443195 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27443746 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27443774 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27443889 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27443943 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27443957 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27443996 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27444004 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27444086 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27444123 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27444535 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27444658 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27444867 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27444874 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27444971 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27445026 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27445045 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27445957 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27446132 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 27446242 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 27446337 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 27446440 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27446631 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 27446765 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 27446980 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 27447035 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27447412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27447505 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27448959 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27450037 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27450491 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27451392 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 27451472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27451527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27451552 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27451554 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27451606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27452461 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 27452509 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 27453898 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27455218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27455389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27458316 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27459326 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 27459496 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27459779 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 27459780 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 27459863 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27459866 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27459898 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27459968 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27460090 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27460136 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27460155 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27460176 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27460351 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 27460914 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 27460976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27461034 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27461112 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27461121 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27461131 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27461422 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 27461471 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27461483 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27461487 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27461635 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27461859 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 27461889 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 27462048 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 27462058 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 27462540 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 27462551 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27462744 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27462779 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27462861 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 27462873 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 27462886 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 27462908 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27463106 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27463110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27463119 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 27463564 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27463868 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 27464158 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 27464188 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27464271 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27464278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27467116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27467158 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27467610 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27469151 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 27469353 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27469794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27469916 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27470453 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 27470665 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 27471022 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 27471291 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27472379 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27472875 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 27473586 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 27473603 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27473647 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 27474002 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27474146 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27474207 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27474243 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27474249 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27474371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27474621 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27474901 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27475063 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27475154 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27475198 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27475507 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 27475523 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27475552 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27476105 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27476496 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 27476723 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27476821 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 27476847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27476909 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27476962 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27477040 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27477050 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 27477078 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27477084 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27477967 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27478122 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27478418 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27478419 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27478480 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27478945 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27478974 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27478999 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27479146 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27479170 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27479201 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 27479242 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 27479271 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 27479309 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27479335 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27479392 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27481127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27481319 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27482292 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27482311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27482313 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27482370 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27482484 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27484794 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27484918 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27484923 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27484937 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27486191 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27486404 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27486472 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 27486553 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27487011 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27487074 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 27487128 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 27487599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27488042 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27488126 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27488177 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27488348 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27488359 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27488537 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 27488749 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27488911 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 27488972 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27489315 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27489329 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27489424 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27489457 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 27489545 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 27489753 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27489886 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27489919 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27490282 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27490391 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27490470 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27490477 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27491488 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27491540 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 27491600 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 27491706 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 27491769 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 27491840 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 27491846 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 27491990 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27492009 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 27492086 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 27492107 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 27492132 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 27492160 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 27492169 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 27492197 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 27492261 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 27492387 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27492632 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27493614 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27493729 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 27493745 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27494060 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27494211 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27494421 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 27494776 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27494894 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 27495029 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 27495058 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 27495266 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27495464 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27495536 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 27495667 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 27495905 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 27495957 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 27495991 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 27496114 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27496118 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27496146 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27496181 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 27496969 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27497029 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 27497289 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 27497593 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 27497694 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 27497708 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 27497780 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27497837 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 27497863 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 27497875 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 27497876 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 27497903 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 27497998 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 27498023 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 27498105 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 2 27498960 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27498961 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27499266 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 27500189 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27500391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27500511 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27503870 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 27504675 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27504732 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27505844 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 27506353 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 27507142 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 27507597 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27507704 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27507759 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 27507762 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 27507961 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27508014 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27508423 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27508438 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27508740 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 27508873 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27508923 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27509038 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 27509503 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 27510130 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27511173 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 27511226 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 27511414 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 27511742 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27511897 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27511991 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 27512400 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27512442 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 27512444 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 27512485 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27512676 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27512845 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27513564 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 27513698 T A Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.0666666666666667 15 15 1 13 1 2 27513701 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 27513899 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27514551 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27515271 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 27516123 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 27516207 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27516261 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27516271 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27516298 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27516472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27516475 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27516551 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27516699 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27518537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27518580 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 27518958 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27518974 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27519076 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27519472 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27519624 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 27521273 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27521776 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27522222 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 27522519 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27522676 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27523828 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27524014 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27525527 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27525546 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 27525592 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 27525616 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 27525619 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 27525732 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 27525961 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27525988 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 27526219 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 27526312 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 27526327 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27527538 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 27528581 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 27529554 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27530189 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 27530704 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27531497 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27532298 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 27533361 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27539022 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27546665 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27547999 C G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 27555806 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27556396 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27556518 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 27557106 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27558096 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27560699 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27564436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27568731 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27569874 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27579553 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 27579582 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 27582005 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 27582026 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 27582029 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 27582038 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 27582045 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 27582053 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 27582104 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 27582751 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27582993 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27583724 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 27583980 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 27584021 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 27584033 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 27584292 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 27584465 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 27585125 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27585244 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 27587003 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27587437 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27587855 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27588441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27595033 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27595178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27595452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27595513 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27600185 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27600230 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27600307 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 27600961 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 27600978 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27601482 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 27602119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27602127 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27602411 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 27602788 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 27602818 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 27603903 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 27603914 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27604024 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27604999 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 27607933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27608075 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27608083 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 27609013 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27611097 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 27614118 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27614349 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27614431 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27618087 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27618097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27618346 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27618574 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27618645 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27619146 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27620793 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27621161 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 27621187 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27621425 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27621601 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27621703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27622475 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27622788 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27622868 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27623237 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27623264 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27623323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27623485 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 27623486 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 27623817 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 27623847 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 27623913 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 27623993 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 27624277 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 27624594 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27625009 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 27625108 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 27625168 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 27625200 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27625523 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 27625638 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 27625686 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 27625722 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 27625879 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 27626021 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 27626076 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27626265 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 27626924 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27626978 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27627066 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27627648 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27630275 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27630343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27631152 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 27631217 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 27631449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27631457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27631477 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27631494 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 27631576 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 27631744 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27631774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27631800 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 27631843 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 27631870 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27631874 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27631979 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 27632067 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 27632204 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 27632318 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27632420 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27632468 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 27632499 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27633860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27633894 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 27633985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27634033 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 27634054 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 27634108 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27634132 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 27634264 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 27634268 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27634327 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 27634403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27634414 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 27634506 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 27634956 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 27634960 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27635347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27636078 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27636266 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27636576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27637705 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27637712 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 27637800 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27640544 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27641013 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27641071 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27641262 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27642207 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27642587 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 27644259 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27644716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27644841 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 27645766 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 27646086 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 27646239 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27646240 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27646613 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 27648561 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 27648899 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 27649475 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27649681 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27650761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27650995 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27651153 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27651565 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27651762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27651772 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27651889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27651973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27652060 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 27652180 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27652457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27652505 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27652911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27653485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27655662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27656636 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 27656687 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27656874 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 27657005 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27657109 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 27657185 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27657379 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27658359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27658391 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27658400 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27658415 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27658425 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 27658488 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27658509 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27658523 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 27659113 G C Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 27659180 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 27659386 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27659390 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 27659439 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27659467 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27659522 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27659539 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27659711 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27659763 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27659806 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 27659922 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 27659938 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 27659977 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27659978 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 27659988 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 27660025 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 27660170 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27660223 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 27660368 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 27660426 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 27660652 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 27661090 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27661233 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27661506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27661780 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27662042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27662824 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27662933 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27663427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27663543 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27663571 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27663869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27664278 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27664344 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27664374 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27664425 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27664448 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27664463 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27664619 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27664626 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27664791 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 27664807 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27664927 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27665025 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 27665351 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27665361 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27665475 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27665637 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27665780 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27665831 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27665954 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27665956 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27666396 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27666417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27666643 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27666695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27667027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27668455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27668536 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27668795 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 27669692 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27669784 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27669868 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 27670049 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27670110 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27670381 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 27670473 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27670576 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27670587 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27671710 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27671720 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27671820 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27671845 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27672292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27672395 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27672426 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27673612 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27673697 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27673900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27673966 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27674020 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27674436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27674476 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27674564 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 27674656 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 27674684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27675007 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27675123 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 27675282 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 27675365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27675819 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27675893 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27676677 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27676700 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 27676720 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 27676858 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27676940 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27677000 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27677130 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27677190 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27677201 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27677259 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27677396 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27677423 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27677524 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 27677567 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 27677621 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27677627 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27677679 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27677705 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 27677782 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 27677787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27677830 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27677842 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 27677898 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27678047 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 27678255 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27678798 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27678799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27679069 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27679120 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27679148 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27679230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27679262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27679276 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27679285 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 27679287 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 27679322 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 27679413 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 27679454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27679501 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 27679535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27679543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27679563 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 27679579 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 27679584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27679606 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27679657 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 27679673 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 27679688 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27679795 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27679824 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27679875 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27679924 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 27679987 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 27680093 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 27680273 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27680295 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 27680556 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27680566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27680886 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 27680989 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 27680990 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 27681054 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 27681136 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 27681204 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27681227 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 27681240 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 27681306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27681348 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27681393 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 27681585 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27681636 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27681819 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27681833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27681871 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 27681928 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27682234 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 27682256 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27682303 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 27682702 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27682809 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27684068 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27684198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27684324 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27684908 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27685014 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 27685018 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 27685094 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27685141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27685378 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27685566 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27685667 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27685951 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27686039 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27686062 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27686098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27686111 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 27686431 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27686438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27686477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27686581 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27686598 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27686607 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27686667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27686770 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27686820 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27686872 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27686886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27686897 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27686919 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27686938 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 27687159 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27687191 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27687285 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27687324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27688776 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27688954 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27689615 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27690199 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27690876 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27690939 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27691009 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27691204 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 2 27691426 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27691534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27692158 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27692198 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27692210 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27692793 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27693064 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27693082 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27693184 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 27693261 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 27693361 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 27693402 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27693485 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27693486 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 27693555 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 27693556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27693605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27694435 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27694436 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27694486 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27694498 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27695768 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27695980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27696374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27696785 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 27697183 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27697249 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27697281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27697510 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 27697992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27698861 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27698950 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27699084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27700017 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 27700044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27701501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27702323 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 27702797 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27703769 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27703792 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27703830 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27703925 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27704406 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 27704436 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 27704914 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27705288 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 27705587 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 27707688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27708265 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 27712521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27713018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27713555 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 27714020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27715102 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27715144 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 27716840 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 27717023 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27717353 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27718312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27718551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27718773 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27718841 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27718879 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27718915 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 27718932 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 27719106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27719139 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27719192 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 27719368 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27719384 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27719395 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 27719617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27720137 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27720495 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 27720841 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 27721084 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27721158 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27721212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27721223 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27721243 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27721392 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27721413 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27721454 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27721461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27722918 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27723196 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 27723270 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27723277 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27723495 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 27723615 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 27725081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27725149 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27725486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27725815 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27725889 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27725996 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27726087 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27726178 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27726188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27726554 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27726599 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27726602 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27726721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27726723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27726883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27726900 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 27726944 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 27726964 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 27727046 C T Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 27727087 G A Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 27727552 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 27728560 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27729111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27729116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27729142 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27729143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27729251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27729584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27729795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27730676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27730842 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27731129 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27731130 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27731199 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27731221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27731277 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27731401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27731620 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27731856 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27732377 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27732998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27733006 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27733189 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 27733442 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 27733916 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27734575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27735277 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27735873 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27736138 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 27736271 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27736469 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27736472 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27736819 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27737466 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 27737622 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27737672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27737765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27737830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27737899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27737924 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27738002 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27738022 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27738220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27738823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27738825 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 27738861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27739005 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27739092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27740977 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27741022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27741045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27741090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27741271 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 27741288 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 27741422 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27741427 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27741436 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 27741602 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 27741671 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 27741676 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 27741720 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 27741794 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 27741822 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 27742173 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 27742186 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 27742742 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 27743096 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27743719 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27743806 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27743874 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27745121 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 27745294 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27745302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27745374 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27745465 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27745560 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27745599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27745636 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27745709 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27745857 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27745995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27746368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27747024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27747061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27747181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27747208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27747233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27747416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27747441 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27747449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27747584 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27747589 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27747639 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27747669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27747725 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 27747895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27748319 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 27748337 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27748361 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27748375 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27748379 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27748403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27749088 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27749099 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 27749123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27749453 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 27751737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27752419 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27752582 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27752628 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27752690 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27752740 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27752853 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27753248 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27753337 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 27753348 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27753366 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27753413 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27753431 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 27753435 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27753525 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27753589 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27753710 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27753721 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27753749 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27753772 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27753808 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27753915 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27753968 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 27754061 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 27754124 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 27754255 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27754277 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27754315 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27754367 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27754368 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27754407 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 27754644 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27754946 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27754956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27754967 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27754977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27755071 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 27755323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27755677 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 27755892 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 27756294 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 27757610 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 27760704 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 27761049 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27761134 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 27761190 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 27764122 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27764913 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27766511 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27766711 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27766887 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27766929 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 27767166 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27768173 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27769377 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27769528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27769595 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27769647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27769651 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27770061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27770103 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 27770636 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27770757 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27770778 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27771040 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 27771127 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27771136 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27771140 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27771253 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27771552 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27772200 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27772478 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 27772509 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27772588 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 27772618 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 27772647 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 27772662 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 27772691 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 27772730 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 27772757 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 27772827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27772910 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27772972 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27773034 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27773036 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27773175 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27773203 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27773207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27773240 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27773315 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 27773402 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27773442 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 27773508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 27773534 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27773549 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27773592 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27773610 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27773627 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27773657 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27774811 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27774917 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27775019 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27776247 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27776306 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 27776369 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27776758 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27776866 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27776954 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27777056 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27777143 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27777348 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27777356 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27777712 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 27777812 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27777971 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27777989 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 27778417 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27778426 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27778652 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27778943 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 27779278 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 27779297 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 27779503 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27779603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27779662 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27779725 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27779838 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27780207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27780336 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 27780362 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 27780546 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 27780727 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27780750 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27780772 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 27780915 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27781043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27781154 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27781358 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27781549 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27782524 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27782742 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 27782774 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27782799 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 27782953 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 27783106 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 27783177 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 27783178 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 27783207 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 27783743 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27783746 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27783794 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27783842 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 27783920 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 27783976 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27785370 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27785944 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27786570 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 27786830 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 27786887 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 27787917 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27787979 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27787988 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27788833 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27788868 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27789460 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 27790189 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 27790464 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27790505 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27791897 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 27792030 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27792919 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 27793056 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27793548 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27793749 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27793796 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27796801 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27797326 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27797523 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27797922 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 27798144 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27798162 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 27798266 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27798437 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27798444 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27798539 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27799533 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27799643 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27799722 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 27799750 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27800459 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27800800 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27802370 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27802673 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27802738 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27802872 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27802900 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27802942 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 27802973 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27802982 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27803003 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 27803834 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 27804017 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 27804325 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 27804685 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27804716 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27804778 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27804995 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27805067 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 27805149 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27805167 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27805194 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27805389 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27805412 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 27805572 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 27805604 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 27805632 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27805770 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27805956 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27806823 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27806865 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27807079 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27807531 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27808030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27808220 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27808282 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27808426 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 27808691 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 27808766 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27808959 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27809483 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27809533 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27809986 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27810057 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27810114 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 27810135 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 27810223 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27810693 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 27810772 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27810783 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27812713 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27812803 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 27812902 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27813478 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27813520 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27813562 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27813861 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 27813889 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 27813968 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27814298 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27814334 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27814361 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27814478 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27814510 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 27814866 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27814954 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27815149 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27815421 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 27815496 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27815532 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27815683 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27815719 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27816384 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 27817440 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27817445 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27817470 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 27817758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27817788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27817838 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27817859 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 27818084 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27818269 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27818317 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27818373 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27818595 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27818612 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 27818748 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27818808 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27818880 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 27819178 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 27819180 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 27819574 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27819775 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27819922 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27820109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27820112 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27820186 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27820222 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27821768 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27821901 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27822960 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 27822994 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 27823005 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 2 27823019 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27823103 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27823118 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 27823322 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27823344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27823774 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 27823976 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 27824049 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 27825214 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27825341 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 2 27825482 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 27825852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27828200 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27829942 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27830472 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27830959 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27831806 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 27832113 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 27832201 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27832216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27832540 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27833119 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27833231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27833688 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27833699 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27833790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27833811 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27833883 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27834180 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 27834243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27834783 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27835160 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27835257 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27835270 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27835286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27835287 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 27835390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27835885 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 27835910 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27835937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27836415 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27836520 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 27837334 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27837444 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27837589 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27837592 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27837604 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27837621 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27837635 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27837647 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27837669 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27837802 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27837810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27837868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27837911 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27837988 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27838074 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27838744 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27838771 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27838867 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27839531 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27839684 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 27839827 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27840305 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27840353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27840817 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 27841139 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27841215 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27841277 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27841332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27841541 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27841646 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27841675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27841768 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27841805 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27841812 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27841836 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27841908 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27841924 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27841925 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27841967 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27842039 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27842073 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27842075 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27842116 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27842233 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 27842337 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27842363 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27842373 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27842415 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27842510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27842760 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27843038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27843049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27843063 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27843094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27843238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27843412 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27843507 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27843722 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27843752 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27843802 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27843805 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27843864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27843895 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27844078 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27844080 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 27844132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27844258 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27844282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27844286 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27844294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27844297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27844346 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27844376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27844472 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27844480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27844562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27844664 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27845258 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27845269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27845276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27845284 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27845296 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27845320 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 27845506 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 27845750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27846571 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27846602 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27846938 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27846948 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27847015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27847122 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 27847218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27847300 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27847616 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27847687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27847849 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27847902 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27848727 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 27848834 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27849588 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27849617 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 27850595 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 27850794 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27850986 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 27851022 T G N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 27851047 T G N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 27851081 G T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 27851103 C G N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 27851286 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 27851328 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27851386 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27851425 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27851446 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27851448 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27851536 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27851554 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27851584 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 27851688 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 27851721 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 27851817 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 27851884 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27851956 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 27851999 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27852023 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 27852046 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27852065 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 27852354 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27852418 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27852485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27852506 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27852517 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27852521 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27852583 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 27852597 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 27852634 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 27852683 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 27852731 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 27852866 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 27852916 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 27852991 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27852995 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27853002 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27853027 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27853033 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 27853051 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 27853058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27853253 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 27853339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27853489 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27853492 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27853509 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 27853654 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27853697 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27853962 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 27853990 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 27854034 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 27854044 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 27854068 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27854230 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 27854491 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 27854650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27854719 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27854797 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27855504 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27855532 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27855737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27855746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27855797 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 27857048 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27857176 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27857204 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27857287 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27857374 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27857467 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27857476 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27858139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27858584 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27858825 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27858943 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27859125 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 27859301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27859327 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 27859347 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 27859350 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 27859461 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 27859626 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 27859704 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 27859728 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 27859818 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27859844 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27860234 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 27860296 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 27860308 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27860322 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27860409 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27860569 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 27860614 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27860634 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27860638 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27860647 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27860692 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27861093 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27861132 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 27861135 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27861774 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 27861800 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 27861813 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27861856 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27863401 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27863689 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 27863704 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 27864075 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27864115 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27864304 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27865516 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27865646 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 27866087 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27866102 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27866205 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27866224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27866323 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 27866574 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27867071 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27867073 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 27867620 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 27867889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27867982 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27867991 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27868006 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27868868 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 27868943 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27869650 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27870060 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27870247 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 27870394 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 27870607 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 27870763 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27870780 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 27870867 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 27870869 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 27870880 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27870907 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27871321 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27871466 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27871731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27871844 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27871913 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 27872022 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 27872391 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27872486 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 27872907 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27872913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27872937 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27873373 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27873389 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27873401 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 27873580 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 27873636 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 27873716 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 27874099 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27874153 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 27874264 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27874384 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27874598 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 27874618 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 27874630 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27874660 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 27874680 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 27874734 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 27874742 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 27874765 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27874773 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27874776 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27874799 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27874856 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 27874888 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27874902 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 27874905 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 27874997 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27875285 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27875362 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27875391 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27875414 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27875429 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 27875993 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 27876072 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 27876169 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27876232 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 27876275 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27876314 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 27876342 T A Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 2 27876488 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 27876609 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 27876675 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 27876702 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 27876810 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 27876961 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 27876978 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 27877089 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 27877091 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27877621 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27877821 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27877903 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 27877955 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27878006 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 27878405 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27878666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27878696 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27879048 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27879062 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27879073 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 27879128 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27879141 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 27879160 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 27879165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27879253 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 27879279 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 27879308 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27879384 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 27879440 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27879485 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27879497 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 27879524 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 27879600 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27879693 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27879758 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27879829 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27879903 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 27879912 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 27879984 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 27879996 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27880039 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27880513 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 27880542 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27880575 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27880621 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 27880657 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 27880682 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 27880708 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 27880767 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 27880778 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 27880832 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 27881331 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 27881338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27881353 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27881454 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27881461 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27881516 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 27881614 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27881769 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 27881819 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27881857 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27881916 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27881965 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 27882019 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 27882077 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 27882089 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 27882131 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 27882179 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27882284 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 27882291 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 27882327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27882785 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27882823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27882854 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27882889 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27882941 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27882973 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 27883110 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 27883185 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27883235 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27883263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27883398 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 27883592 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 27883654 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27883756 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 27883906 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 27883993 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 27884343 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27884372 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27884379 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 27885241 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27885367 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27885373 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27885963 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27886159 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27886169 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27886191 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 27886206 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27886208 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27886274 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27886293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27886690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27886832 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 27886964 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 27886965 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 27887971 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 27888573 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 27888835 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 27888965 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27889483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27889910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27890501 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27890514 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27890662 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 27890884 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27890934 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27891140 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27891270 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27891410 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27891412 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27891424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27891440 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27891561 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27891562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27891814 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 27891945 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 27891991 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 27892010 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 27892034 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27892054 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 27892090 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 27892112 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 27892119 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 27892145 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 27892338 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 27892371 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 27892860 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27893722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27893769 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27893825 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 27894178 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27894413 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27894485 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27894531 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27894579 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 27894883 C T Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 2 27895912 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27896319 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 27896354 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 27896407 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27896430 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27896606 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27896625 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 27896636 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27896640 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27897023 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27897052 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27897105 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27897297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27898236 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 27898450 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 27898497 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27898499 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 27898596 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27899631 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27899873 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27900272 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27900691 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27900720 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27901830 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27902495 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27903758 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 27903819 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 27904705 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27904779 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27904841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27904954 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27904971 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27905073 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 27905126 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 27905134 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27905195 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27905202 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 27905230 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 27905242 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 27905247 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27905300 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27905347 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 27905400 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27905453 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27907289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27907326 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27907388 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27907534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27907611 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27907665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27907761 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 27907975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27908024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27908479 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27910071 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 27910072 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27910307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27910542 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27910562 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27910623 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27910794 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 27910922 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 27911039 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 27911044 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 27911070 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 27911083 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 27911093 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27911164 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 27913292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27913462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27913554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27913555 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27914102 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 27914264 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27914445 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27914605 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27914775 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27914942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27914963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27914970 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27914980 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27915060 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 27915101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27915124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27915206 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27915261 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 27915310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27915341 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 27915459 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27915531 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 27915942 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 27916041 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 27916443 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27916456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27916560 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 27916652 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27916877 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27916880 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27917244 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 27917290 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 27917363 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 27917384 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 27917393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27917867 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 27918837 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 27919534 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 27919741 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27919810 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27920020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27920293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27920348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27920364 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27920520 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 27920532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27920662 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 27921019 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27921036 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27921446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27921575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27922325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27922367 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 27922397 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27922478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27922571 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27922628 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27922728 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 27924054 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27925061 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27925072 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27925092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27925098 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27925192 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27925563 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 27925603 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27925647 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27925738 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27925881 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27925901 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 27925986 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27926048 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 27926431 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27926589 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 27926686 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 27926744 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27926852 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 27926880 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 27927253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27927259 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27927327 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 27927345 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 27927514 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27927517 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27927608 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 27927711 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 27927742 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 27927925 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27927942 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27928053 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 27928175 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27928179 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27928189 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27928373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27928411 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27928439 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27928503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27928532 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27928590 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27928721 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27928896 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27928916 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 27929024 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27929067 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27929162 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27929333 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 27929345 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 27929373 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 27929389 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27929402 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 27929415 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27929427 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27929456 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27929509 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 27929581 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27929651 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27929677 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27929691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27929760 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27929775 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27929899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27929935 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27929947 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 27929986 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27930042 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27930086 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27930218 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27930270 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27930280 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27930299 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27930379 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27930442 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27930473 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 27930597 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 27930651 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 27930678 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 27930742 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 27930837 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27930853 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27930871 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27931086 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 27931090 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 27931101 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27931104 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27931160 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27931168 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27931964 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27932934 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 27933039 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27933144 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27933931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27934066 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 27934283 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27934504 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27934512 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27934658 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27934751 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27935045 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27935081 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27935395 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 27935408 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27936125 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27936226 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27936324 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27936481 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27936974 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27936986 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27937013 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 27937073 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 27937224 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27937549 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27938045 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27938057 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27938071 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27938998 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 27939153 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27939257 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27939273 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27939426 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 27939510 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 27939577 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 27939684 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27939837 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27939884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27939990 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27940150 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27940244 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27940289 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 27940358 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 27940420 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27940543 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27940614 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27940629 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27940663 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 27940756 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27940798 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27940865 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 27941297 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27941348 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27941443 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27941568 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 27941728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27941765 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 27941766 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 27941779 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27941802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27941835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27942263 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27942278 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27942752 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 27942758 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 27942834 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 27942897 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27943038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27943040 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27943058 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 27943069 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27943206 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27943326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27943364 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27943378 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 27943397 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 27943407 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27943546 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27943581 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27943627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27943693 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 27943718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27943763 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27943927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27943931 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 27944059 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 27944126 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27944140 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 2 27944302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27944420 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 27944449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27944501 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 27944679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27944824 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27944825 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27944853 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27944916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27945019 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 27945076 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27945092 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27945412 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27945417 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27945623 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27945676 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27945720 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 27945749 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27945778 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 27945912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27946043 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27946061 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 27946068 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27946073 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 27946173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27946234 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27946301 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27946431 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27946478 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27946493 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27946643 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27946671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27946811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27946970 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27947224 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27947249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27947353 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27947401 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27947528 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 27947662 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27947926 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 27948023 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27948226 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 27948391 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27948711 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 27948722 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27948790 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27948924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27949068 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 27949197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27949240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27949585 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 27949602 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27949625 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 27949709 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 27949755 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 27949805 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27949842 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 27949855 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 27949933 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27950391 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27950639 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 27950651 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27950656 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 27950739 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 27950741 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 27950773 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 27950800 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27950831 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 27950882 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 27951597 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 27951622 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 27951653 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27951889 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 27951904 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27951905 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 27951921 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 27951947 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27951968 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 27952040 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27952066 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27952071 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 27952218 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27952223 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27952259 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27952456 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27952665 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27952893 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 27953067 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 27953207 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27953291 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27953326 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27953614 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27953624 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27953630 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27953637 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27953656 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27953698 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27953835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27953973 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27954868 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 27954879 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 27954911 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 27955065 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27955416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27955552 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 27955627 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 27956754 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27957613 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27957627 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 27958162 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 27958775 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27959684 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 27960003 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 27960757 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27960931 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 27960968 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27962343 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27962556 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 27964062 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27964358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27964546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27965340 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27966990 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27967102 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27967123 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 27967184 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 27967202 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 27967310 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27967323 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 27967840 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27967886 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 27967905 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 27967947 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 27968022 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 27968049 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27969008 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27969032 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27970168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27970813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27970867 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27971972 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27972174 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 27973325 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27974108 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27974479 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27974810 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 27975059 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27975151 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27975180 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27975327 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27975345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27975459 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27975533 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27975694 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 27976304 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27976323 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27976386 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27976419 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 27976573 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 27976775 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27977171 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27977241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27977344 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27977844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27977881 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27977909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27979096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27981172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 27981808 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27982574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27982840 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 27982933 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27983009 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27983020 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 27983059 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27983119 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27983195 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27983206 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27983216 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 27983267 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 27983450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27983494 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27983718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27983821 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27983853 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 27983867 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27984153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27984210 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 27984253 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 27984419 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 27984422 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27985128 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 27987795 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 27988309 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27988358 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 27988847 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27988848 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27989763 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27990781 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 27993038 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 27993203 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 27993499 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27993543 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27993545 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 27993620 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27993827 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 27993939 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27993944 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 27993991 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27994927 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 27994928 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27994970 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 27995000 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 27995051 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 27995120 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 27995427 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 27995457 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 27995537 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 27995546 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27995610 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 27995617 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 27996010 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 27996089 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 27996140 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 27996305 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 27997192 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27997444 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27997697 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27998312 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 27998336 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28000409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28000708 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28000823 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28001284 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28003531 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28005068 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28005530 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28008767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28009276 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28009904 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28009965 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28010965 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28011022 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28011094 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28011252 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28011297 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28011361 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28011444 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28011764 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28011818 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28011847 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28011930 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28011996 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28012079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28012097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28012111 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28012121 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28012203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28012247 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28012259 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28012273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28012357 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28012449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28012628 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28012637 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28012679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28012737 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28012829 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28012846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28012847 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28013197 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28013365 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28018698 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28018894 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 28019041 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28019075 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28019375 C A N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 28019549 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 28019568 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 28019623 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28019641 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28019727 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28020316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28020367 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28020375 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28020408 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28020460 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28020468 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28020655 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28020670 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28020683 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28020709 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28020742 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28021427 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28021455 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28021476 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 28021510 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28021679 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28022193 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28022657 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28022658 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28022716 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28022948 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28022954 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28023028 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28023110 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28023174 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28023333 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28023889 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 28025855 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28026803 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28027053 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28027081 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28029405 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 28029499 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28029636 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28029757 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28029987 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28030458 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28031082 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28031089 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28031184 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28031482 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 28031496 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28031813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28032306 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28032444 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28032577 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28032642 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28032646 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28032659 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28032795 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28033008 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28033092 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 28033174 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 28033209 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 28033371 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28033606 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 28033641 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28033663 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28033782 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28033842 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28033849 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28034136 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28034789 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28035004 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28035222 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28035282 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28035631 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28035659 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28035956 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28036490 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28036594 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28037622 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28037686 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28037696 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28037748 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28038037 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28038077 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28038295 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28038362 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28038391 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28038471 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28038487 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28038520 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28039056 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28039089 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28039142 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28039170 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28039207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28039391 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28039394 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28039444 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28040318 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28041195 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28041641 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28041652 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28041722 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28041923 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28041964 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28041966 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28042028 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28042947 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28043475 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28045513 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28045633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28045838 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28046234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28046246 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28046335 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28046927 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28046930 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28050078 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28050659 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28051157 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28051540 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28053423 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28054781 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28055341 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28055490 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28055528 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28055540 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28055631 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28057451 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28057556 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28058395 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28058768 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28058826 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28059054 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28059113 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28059116 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28059280 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28059299 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28059331 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28059338 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28059347 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28059349 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28059622 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28059677 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28059701 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28059915 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28059999 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28060013 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28060112 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28060200 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28060336 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28061929 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28062915 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28062942 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28062986 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28063010 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28063052 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28063118 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28063409 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28063675 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28064369 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28064441 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28064482 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28065639 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28065816 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28066128 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28066713 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28067011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28067069 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28067425 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28068248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28068943 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28068966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28068971 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28069052 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28069142 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28069154 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28069354 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28069358 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28069433 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28069457 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28069467 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28070814 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28070815 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28070834 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28070851 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28071345 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 28071404 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28071482 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28071543 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28071666 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28071713 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 28071753 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28071795 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28071934 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28071972 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28072011 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28072047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28072049 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28074078 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28078203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28079474 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28080848 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28080885 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28081128 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28081957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28083546 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28088315 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28088791 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28090694 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28092060 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28092341 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28092648 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28093544 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28094046 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28094520 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28095211 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28095266 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28095353 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28095644 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28096378 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28097777 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28097894 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28099095 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28099991 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28100055 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28103734 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28104747 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28105872 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28105941 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28105985 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28105986 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28105996 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28106339 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28106489 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28106512 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28106568 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 28107338 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28107664 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28107774 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28107776 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28108420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28108457 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 28108669 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 28108673 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 28108681 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 28108739 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28108741 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28108832 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28108890 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 28108891 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 28108992 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28109050 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28109172 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 28109267 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28109274 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28109296 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28109332 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 28109479 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28109691 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28110106 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28110563 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28110663 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28110665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28110699 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28112498 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28112516 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28112633 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28112697 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28113286 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 28113325 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28114847 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28114892 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 28114911 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28115093 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 28115342 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28115462 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28116168 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28116571 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28116580 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28116587 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28116631 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28116684 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28116739 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28117015 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28117668 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28117731 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28117766 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28117788 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28117906 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28118031 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28118045 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28118092 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28118138 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 28118206 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 28118324 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28118373 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28118518 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 28118563 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28118616 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28118619 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28118708 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 28121304 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28123753 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28123841 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28123922 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28125081 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 28125772 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 28125823 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28125835 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28127216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28127302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28127918 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28127968 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28129097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28131404 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28133325 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28133999 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 28134004 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 28134300 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 28134329 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 28134352 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28134391 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 28134413 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 28134426 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28134433 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28134437 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28134455 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 28134748 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 28134819 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 28134850 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28134867 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28134900 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 28134971 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 28135068 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28135109 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 28135451 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28136157 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 28136196 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 28136262 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 28136272 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28136401 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28136412 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28136498 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 28136635 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28136681 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28137338 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28137607 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28137648 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28137814 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28137819 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28137830 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28137849 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28137856 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28137877 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28137903 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28138031 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 28138066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28138799 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28138810 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28138821 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28138933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28139346 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 28139372 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 28139838 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28139899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28139969 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28140600 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28140767 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 28140795 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28140869 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 28140921 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28141110 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28141197 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28141405 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28141440 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28141463 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 28141500 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28141505 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28142054 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28142103 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28142104 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28142121 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28142136 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28142183 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28142250 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 28142330 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28142413 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28142475 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28142520 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28142569 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28142646 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28142904 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28143432 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28144086 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28144188 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28144485 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28144569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28144658 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28144673 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28145885 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28146436 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28147102 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28147171 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28147520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28147743 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28147822 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28148131 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28148132 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28148281 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28149867 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28149992 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28150672 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28150741 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28150757 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 28150768 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28150792 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28150801 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 28150814 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28150826 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28150929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28150935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28150968 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28151003 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28151309 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 28151601 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28151612 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28151770 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28153015 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28153593 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28153765 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28153836 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28153872 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28153898 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28153998 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28154089 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 28154149 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 28154152 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28154269 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28154570 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28154693 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28154838 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 28154892 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28154935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28154989 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28155179 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28155218 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28155266 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28155276 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28155281 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28155375 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28155378 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28156407 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28156479 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28156485 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28156557 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28156585 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28156775 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28156802 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28156882 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28156897 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28157455 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28157751 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28158212 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28160229 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28164788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28166100 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28166112 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28166187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28166477 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28167031 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28170062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28170387 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28170398 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 28170455 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28170479 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28170501 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28170542 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28170618 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 28170713 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28170797 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28171050 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 28171959 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28172034 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 28172054 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28172272 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 28172394 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 28172496 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 28172659 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28172869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28173018 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28173041 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 28173257 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 28173398 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28173428 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 28173448 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28173476 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 28174658 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28174789 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28175046 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28175293 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28175888 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28176258 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 28176301 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28176442 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28176836 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28177137 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28177160 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28177245 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28178272 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 28178289 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28178829 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28178974 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28179012 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28179125 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28179139 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28179184 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28179322 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28179332 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28179951 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28179971 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28179978 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28180005 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28180019 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28180069 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28180121 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 28180147 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 28180400 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28180455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28180466 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28181020 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28181042 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28181080 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28181517 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28181571 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28181601 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28181666 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28181673 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28181961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28182525 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28182627 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28182779 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28182793 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28182827 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28182831 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28184518 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28186465 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28186561 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28186747 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28186838 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28186913 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28186963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28187516 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28187706 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28187760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28187827 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28187828 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28188123 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28188819 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28188891 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28189365 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28189374 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28189884 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28189909 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28189921 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28189933 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28189968 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28189971 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28189997 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28190010 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28190056 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28190074 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28190082 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28190107 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28190112 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28190249 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28190265 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28190347 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28190897 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28190914 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28191194 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28192093 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28192160 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28192168 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28192674 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28194246 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28194313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28196630 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28197357 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 28197701 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 28201041 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28201072 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28203819 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28203820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28203839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28203910 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28203953 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 28204111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28204190 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28204284 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28204347 G C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 28204813 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28205191 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28205302 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28206534 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28206545 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28207274 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28207312 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28207398 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28207476 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28207477 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28207550 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 28207587 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 28207670 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 28207828 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28207840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28207870 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28208766 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28208871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28208996 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28209148 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28209225 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28209306 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28209309 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28209327 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28209643 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 28209737 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28209813 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28209920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28210012 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28210080 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28210183 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28210585 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28210641 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28210863 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28210895 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 28210897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28210947 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 28210965 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 28211065 T A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 28211084 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 28211180 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28211280 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28211721 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 28211787 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28212008 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28212145 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28212177 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28212224 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28212264 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28212301 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 28212312 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28212337 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 28212348 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28212376 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28212439 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28212492 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28212509 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 28212515 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28212587 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 28212601 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 28212616 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 28212632 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 28212677 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 28212703 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 28212736 A G Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 28212841 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 28212901 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28212959 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 28212988 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 28213104 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 28213155 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 28213282 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 28213296 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 28213312 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28213354 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 28213416 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28213465 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28213484 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28213542 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 28213556 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 28213570 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 28213589 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28213592 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28213605 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 28213685 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 28213726 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28213755 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28213815 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 28213923 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28213975 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 28214127 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 28214180 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28214281 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 28214289 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 28214332 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 28214386 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 28214392 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 28214439 A G Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 28214483 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28214741 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 28214761 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28214800 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 28214808 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 28214812 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 28214837 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 28214918 C A Y N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 2 28214964 G A N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 2 28214969 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 28215021 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28215039 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 28215066 C G Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 28215201 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28215248 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 28215252 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28215298 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 28215331 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28215394 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28215471 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28215552 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 28215567 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28215584 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28215651 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 28215671 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28215695 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 28215800 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28215925 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 28215950 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28215954 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28216128 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 28216279 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 28216284 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 28216337 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28216340 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28216450 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28216490 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28216499 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28216502 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28216533 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28216563 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28216578 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28216661 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28216721 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28216746 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28216885 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28216891 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28216917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28217043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28217150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28217201 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 28217265 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28217361 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28217470 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28217638 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28217643 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 28217749 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28217809 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28218055 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28218521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28218531 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28218661 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28218693 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 28218708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28218824 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 28219835 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 28219850 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 28219852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28220780 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28221130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28221160 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28221263 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28222526 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28222867 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 28222955 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28223120 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28223864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28224043 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28224056 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28224147 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28224173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28224185 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28224337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28224388 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28224631 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28225482 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28225535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28225733 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28225838 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28226368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28226392 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28226665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28226757 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28227227 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 28228193 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 2 28228323 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 28229038 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28229180 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 28229295 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28229303 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28229379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28229416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28229703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28229710 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28229760 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28229786 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28230569 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28230581 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28230718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28230771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28230827 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28231523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28231556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28232999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28233238 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 28233402 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 28233418 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 28233429 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 28233538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28234588 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28234823 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28234842 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28234953 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 28234970 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 28235009 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28235019 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28235558 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28235582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28235643 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28235712 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28235743 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28236183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28236234 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28236240 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28236337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28236551 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28236747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28236928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28237085 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28237179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28237193 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28237382 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 28237547 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28237551 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 28237590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28237637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28237699 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 28237830 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28238142 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28238156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28238376 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28238454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28238600 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28238633 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 28239285 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 28239430 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28239513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28241328 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28241658 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28241787 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28241950 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28241951 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 28241983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28244596 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 28244830 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28245601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28246278 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28247060 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 28247970 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28248018 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28248021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28248041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28248089 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28248120 T G Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 28248228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28248260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28248272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28248306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28248444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28248453 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28248656 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28248836 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28249698 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28250091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28250175 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28250386 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28250796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28250887 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28250905 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28250927 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28251007 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28251014 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28251037 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28251105 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28251158 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28251171 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28251281 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28251320 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28251340 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28251379 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28251390 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28251415 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28252590 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28252627 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28253731 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28254222 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28254486 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28255471 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28256073 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 28256560 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28256597 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28261015 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28261474 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28261847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28262607 C A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 28262621 C G Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 28262631 T G Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 28262632 C G Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 28262673 C G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 28263684 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28265159 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28268210 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28268233 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28268245 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28268254 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28269045 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28269106 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28269992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28274293 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28274359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28275050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28275148 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28275195 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28275589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28275658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28275703 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28276005 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28276034 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28276035 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28276110 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28276112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28276308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28277362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28277487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28277841 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28277909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28278530 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28279109 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28279935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28280657 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28280909 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28280910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28281639 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28281902 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28283027 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28283497 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28283732 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28284080 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28284461 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28284526 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28284586 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28284646 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28287733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28288575 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28290186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28290440 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28290831 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28291435 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28291829 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28292427 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28292430 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28293754 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28296334 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28297045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28297555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28298934 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28299347 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 28299355 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28299402 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28299850 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28300514 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28300822 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28301434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28301499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28301512 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28301552 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28302849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28304233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28304604 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28305496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28305619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28307014 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28309644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28310122 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28310831 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28310893 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28311057 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28311175 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28312178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28313163 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28314745 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 28317230 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 28318717 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28319901 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28320330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28321149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28321515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28321682 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 28323140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28324322 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28324634 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28324652 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28325967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28326200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28326662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28326851 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28327229 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28327649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28329447 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28329488 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28329594 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28329669 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 28330292 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28330563 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 28330927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28331253 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28331322 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 28331456 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 28332091 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28332279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28332309 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28332415 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 28332506 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 28333963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28334996 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28335598 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28335600 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28339756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28340273 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28340355 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28340518 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28340595 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28340596 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28340934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28341233 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28341580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28349309 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28349560 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28349972 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28350303 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 28350511 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28350528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28350597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28351167 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28351229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28351345 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28351649 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28351815 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28353980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28354198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28354599 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28355246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28355604 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28355849 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28357303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28357311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28357456 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28357457 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28358426 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28361514 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28362054 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28362402 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28362503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28363721 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28363724 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28364188 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28364241 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28364255 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28365662 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28366250 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28367504 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28367813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28368042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28369681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28369746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28369992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28370025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28370379 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28370613 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28371288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28371404 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 28371552 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28374067 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28374575 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28374922 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28374927 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28375157 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28376909 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28377312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28378398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28378866 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28378869 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28379019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28380100 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28380161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28382165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28382355 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28382774 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28384664 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28384688 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28384909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28385155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28385396 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28385736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28386717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28386914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28386956 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28387030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28387046 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28387066 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28387145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28387183 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28387416 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28387554 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28388309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28388346 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28388391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28388868 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28388883 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28389615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28389720 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28390253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28390415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28390897 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28391050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28391390 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28391431 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28391521 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28392118 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28392193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28392328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28392359 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28392661 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28393434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28395435 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28395505 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28396329 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28396338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28396472 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28396515 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28396593 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28396646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28397124 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28397343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28400008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28400077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28400714 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28401287 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28401712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28402269 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28402577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28403465 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28403611 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 28403620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28403626 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 28403691 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28403723 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28403873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28406119 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28406282 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28406327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28406989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28409412 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28409658 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28409694 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28409710 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28409905 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28409907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28409921 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28409945 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28410222 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28410409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28410494 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28410545 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28411136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28411241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28411242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28411390 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28411952 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28412513 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28413110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28414533 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28414737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28415175 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28415594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28415665 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28416364 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28417002 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28417067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28417530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28417591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28417618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28417635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28417821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28417853 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 28417937 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28419641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28419706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28419773 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28420949 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28421030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28421059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28421082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28421225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28421383 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28421388 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28421396 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28421438 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28421457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28422050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28422065 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28422144 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28422685 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28422913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28422943 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28423267 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28423331 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28423371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28423420 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28423523 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28423530 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28423564 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28423613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28423767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28423846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28423853 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28423921 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28423927 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28423944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28424081 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28424208 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28424265 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28424312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28424335 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28424421 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28424455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28424469 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28424474 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28424553 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28424661 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28424776 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28424991 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28425053 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28425083 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28425163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28425217 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28425278 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28425345 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28425359 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28425436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28425458 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28425714 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28425872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28426387 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28426408 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28426464 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28426468 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28426634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28426794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28426809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28426930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28427025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28427090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28427244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28427257 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28427975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28428282 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28428431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28428721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28428814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28429651 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28430402 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28430415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28430460 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28430851 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28431084 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28431217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28431333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28431336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28431376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28431445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28431462 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28431478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28432127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28432134 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28432374 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28432403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28432414 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28432479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28432491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28432764 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28432829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28433384 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28433859 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28434030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28434038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28434471 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28434692 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28434754 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28434761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28434797 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28434898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28434931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28434939 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28435001 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28435012 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28435186 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28435204 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28435243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28435279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28435350 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28435422 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28435797 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28435898 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28435981 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28436070 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28436146 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28436147 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28436327 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28436363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28436478 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28436516 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28436526 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28436531 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28436584 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28436740 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28436803 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28436833 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28437019 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28437059 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28437110 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28437212 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28437219 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28437399 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28437424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28437845 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 28438048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28438234 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28438952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28439007 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28440992 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28441089 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28441225 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28441233 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28441572 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28441768 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28441857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28441891 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28441901 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28441937 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28441986 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28441992 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28442068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28442080 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28442120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28442419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28442486 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28442491 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28442951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28443113 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28443155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28443319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28443320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28443352 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28443498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28443520 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28443538 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28443544 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28443669 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28443771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28443779 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28443782 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28443793 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28443799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28443851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28443910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28443919 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28444077 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28444235 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 28444300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28444366 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28444369 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28444398 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 28444399 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 28444610 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28444904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28445013 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28445015 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28445050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28445190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28445341 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28446425 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28446588 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28446629 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28447220 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28447860 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28447919 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28447970 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28448099 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28448169 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28448426 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28448547 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28448692 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28448711 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28448760 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28448832 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28448858 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28448964 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28448967 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28448985 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28448994 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28449003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28449253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28449320 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28449546 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28449549 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28449698 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28449740 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28449785 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28449914 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28450138 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28450273 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28450460 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28450509 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28450540 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28450544 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28450581 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28450583 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28450628 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28450794 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28450795 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28450814 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28450815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28451560 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28451578 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28451580 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28451594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28451603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28451652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28451719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28451780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28451937 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28451952 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28451991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28452167 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28452350 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28452495 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28452725 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28452850 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28453364 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28453387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28453579 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28455272 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28455574 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28456113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28456844 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28457725 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28457726 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28459394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28459920 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28460219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28460228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28460307 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28463236 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28464256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28464850 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28466200 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28466366 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28467060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28467358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28467469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28467813 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28469143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28469605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28469761 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28469828 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28470154 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28470184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28470209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28470443 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28470642 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28471101 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28471133 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28471142 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28471187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28471279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28471284 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28471327 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28471358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28471385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28471455 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28471465 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28471476 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28471595 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28471596 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28471634 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28471680 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28471852 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 28471875 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28471969 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 28471976 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 28472069 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28472105 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28472258 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28472412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28472796 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28472999 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28473931 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28473933 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28474076 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28474291 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28474333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28474350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28474404 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28474722 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28475322 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28475784 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28476550 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28477165 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28477170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28477917 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28478039 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 28478198 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28478721 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 28478724 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 28478776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28479270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28479998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28481177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28481929 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28481990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28482001 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28482305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28483142 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28483171 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28483258 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28483264 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28483389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28483675 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28483677 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28483729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28483992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28484319 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28485190 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28485482 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28486144 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28486178 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28486578 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28486601 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28486717 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28486733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28486832 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28487017 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28487554 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28487937 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28488250 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28489853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28490399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28490467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28491017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28491129 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28491215 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28491359 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28491479 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28491493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28491572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28491615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28491714 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28491808 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28491923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28493219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28493223 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28493266 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28493484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28493766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28494008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28494260 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28494285 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28494292 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28494582 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28494623 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28495246 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 28495916 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28495968 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28496056 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28497222 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 28497298 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28497336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28497425 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28497623 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 28498054 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 28498156 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28499006 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28499106 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28499580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28500180 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28500481 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28500904 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28500993 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28501005 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 28501101 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 28501138 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28501342 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28501497 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28501999 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28502188 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28502232 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28502257 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28502308 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28502322 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28502420 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28502661 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28502689 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28502714 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28502740 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28502864 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28502954 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28503842 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28503898 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28503904 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28503986 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28504093 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28504101 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28504231 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28504235 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28504249 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28504867 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28504964 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28505085 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28505093 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28505469 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28505627 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28505745 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28505746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28505840 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28505893 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28506113 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28506722 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28506819 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28506823 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28506858 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28507262 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28507527 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28507547 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28507582 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28507652 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28507657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28507709 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28507816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28508109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28508208 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 28508374 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28508528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28508609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28508620 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28508622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28508819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28509668 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28509823 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28510015 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28510740 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28510743 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28511197 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28511359 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 28511431 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 28511449 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 28511471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28511507 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28511648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28511682 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28511777 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28512094 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28512601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28512823 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28512936 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28513021 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28513615 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28513811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28513965 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28515868 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28515924 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28516166 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28516167 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28516234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28516494 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28516506 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28516536 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28516654 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28516983 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28517573 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28517635 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28517677 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28517705 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28518317 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28518327 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 28518694 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28518716 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28518741 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28519677 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28519698 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28519790 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28520308 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28520725 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28521574 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28521633 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28522472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28522646 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28522762 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28522875 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28523129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28523132 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28524361 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28524378 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28524388 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28524540 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28524578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28524580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28524947 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28524955 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28525541 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28525611 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28525640 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28525709 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28525879 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28525898 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28526310 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28526672 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28526752 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28527175 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28527465 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28527481 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28527593 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28527705 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28527734 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28528503 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28528505 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28528574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28528774 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28529361 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28529402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28529519 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28529795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28529853 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28529973 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28529992 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28530811 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 28530884 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28532401 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28532709 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28533114 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28534388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28536164 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28536403 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28536415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28539334 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28539811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28540609 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 28541163 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28542243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28542388 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28545417 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28545955 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28546316 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28546375 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28546432 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28547958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28548723 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28548877 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28548919 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28549227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28549582 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28549634 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28549769 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28549776 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28549826 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 28550012 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28550160 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28550161 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28550457 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28551403 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28552795 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28552980 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28553092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28553100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28554188 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28554301 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28554395 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28554586 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28555535 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28556094 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28556200 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28556261 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28558863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28559201 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28559218 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28559262 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 28559511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28559527 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28559614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28559945 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28560198 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28560226 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28561213 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28561243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28561261 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 28561309 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28561722 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28564475 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28564784 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28564805 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28565733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28565775 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28565798 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28566393 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28566562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28568055 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28569719 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28569885 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28570447 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28574023 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 28574647 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28575120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28575189 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28576747 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 28576781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28576797 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28577585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28578401 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28578848 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28579080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28579394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28580038 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28580049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28580056 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28580131 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28580213 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28581096 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28581103 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28581109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28581669 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28581837 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28581846 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28582061 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28582196 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28582265 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28582504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28582551 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28582636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28582701 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28582762 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28582801 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28582828 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28582848 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28583007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28583224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28583259 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28584042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28584401 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28584576 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 28584934 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 28585280 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28585389 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28585397 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28585444 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28585556 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28585697 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28585835 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 28585842 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28586493 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 28586650 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 28586723 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 28586724 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 28586957 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28586963 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 28587145 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28587237 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28587331 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28587368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28587403 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28587522 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28587770 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28587775 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28587794 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28587921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28588162 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 28588516 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28589511 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 28589578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28589692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28589846 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28590038 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28590043 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28590255 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 28590256 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 28590382 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28590467 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28590630 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28590713 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28590714 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28591258 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28591666 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 28591678 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 28591963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28592097 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 28592584 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28592827 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28593139 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 28593428 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28596138 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28597099 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28597225 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28597593 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28598441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28598454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28598621 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28598739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28599015 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28599124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28599918 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28600109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28600190 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28600418 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28600624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28600755 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28601538 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28601870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28601881 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28603097 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28603291 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 28603384 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 28603452 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28604169 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 28604314 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28604383 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 28604452 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28604480 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28605248 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28605267 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28605275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28605493 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28605530 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28605623 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28605643 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28605654 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 28605828 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28605953 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28606246 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28606320 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 28606430 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28606632 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28606659 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28606858 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 28607481 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 28607635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28608081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28608202 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28608247 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28608531 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 28608534 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28609075 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 28609867 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 28609941 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 28609962 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 28610003 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 28610050 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28610098 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 28610216 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28610234 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28610303 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28610318 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28610414 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28610436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28610451 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28610528 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 28610860 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28610863 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 28610915 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28610956 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28611027 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28611096 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28611644 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 28611649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28611960 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 28612598 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 28612654 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 28612758 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28612846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28612965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28613160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28613536 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28613826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28614170 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 28614443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28614669 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28614890 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 28614940 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 28614968 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 28615743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28615832 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 28615990 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28616132 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28616941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28616964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28617390 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28617484 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 28617531 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28617604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28617688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28617991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28618083 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28618132 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28618183 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28618189 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 28618213 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28618387 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 28618525 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 28618613 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 28618653 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28618689 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 28618706 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 28618723 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 28618793 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28619186 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28619635 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 28619758 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28619986 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28620028 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 28620080 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 28620126 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 28620159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28620214 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 28620223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28620232 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28620235 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28620282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28620284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28620319 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 28620405 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 28620455 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 28620470 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28620505 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 28620516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28620537 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 28620572 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 28620595 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 28621810 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28621814 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 28621866 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 28621946 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 28621964 T G Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 28622018 T G N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 28622040 T G Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 28622144 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 28622241 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 28622550 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 28622584 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28622586 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28623024 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 28623448 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 28623553 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28623826 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 28623841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28623933 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 28623982 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 28624357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28624408 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 28624451 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28624629 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 28624818 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28625343 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 28628270 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28628907 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28629047 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 28629074 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 28629099 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 28629127 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 28629394 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28629481 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 28629863 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28629923 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28629961 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28630734 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28630750 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28631375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28631414 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 28631437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28631662 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28631783 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28631926 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28632021 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28632096 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 28632242 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 28632308 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 28632327 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 28632328 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 28632775 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28632778 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28633144 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28633153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28633371 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 28633470 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28633754 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28634399 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 28634538 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28634961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28635789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28635916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28636067 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28636070 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 28636436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28637108 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 28637245 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 28637286 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28637544 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28637554 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28637561 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 28637623 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28637827 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28637943 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 28638060 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28638115 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28638120 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28638412 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28638451 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 28638515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28638589 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28638841 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28638945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28638999 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28639020 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28639440 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28639477 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28639621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28639778 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 28639790 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 28639892 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28639913 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 28639934 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 28640001 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 28640007 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28640051 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28640075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28640451 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28640454 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 28640501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28640514 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28640583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28640668 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28640674 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28640687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28640967 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28641033 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28641183 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28641551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28641566 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 28641616 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28641690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28641735 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28641849 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28643444 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28643464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28643706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28643735 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28643971 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28643982 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28644242 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28644329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28644426 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28644430 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28644539 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28644568 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28644603 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28645313 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28645416 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28645510 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 28645610 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28645764 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28646055 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28646133 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28646156 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 28646188 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 28646348 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 28646405 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 28646428 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 28646557 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 28647097 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28647233 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28647234 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28647857 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28648030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28648035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28648351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28648750 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 28649067 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28649141 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 28649398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28649605 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 28649635 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 28649637 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 28649706 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28649758 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 28649761 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28649809 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28649851 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28650208 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28650248 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 28650540 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 28650690 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 28650721 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28651842 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28652395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28652432 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28652446 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28652715 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28652923 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28652933 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28653055 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 28653058 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28653499 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 28654094 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28654149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28655361 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28657449 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28657459 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28657581 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28657717 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28657723 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28657886 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28657958 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28658262 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28658609 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 28658797 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 28658839 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28658854 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28658890 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28658909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28658920 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28658933 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28659245 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28659414 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 28659418 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28659434 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 28659478 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 28659484 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 28659496 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 28659536 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 28659578 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28660057 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28660129 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28661673 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28661717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28661734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28661758 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28661865 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28661920 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28662028 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28662045 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 28662112 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28662125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28662190 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28662261 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28662289 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 28662332 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28662368 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28662397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28662449 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28662454 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28662496 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28662511 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28662525 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28662536 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 28662581 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28662617 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28662667 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28662734 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28662796 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 28662845 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28663037 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28663106 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28663285 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28663384 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28663399 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28663722 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28663726 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28663733 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28663750 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 28663751 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 28663769 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28663861 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28663922 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28663925 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28663967 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28663990 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28664007 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28664020 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28664026 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28664157 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28664173 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 28664395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28664467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28664479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28664579 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28664684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28664722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28664758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28664759 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28664783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28664801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28664802 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28664838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28664863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28664885 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28664887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28665068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28665128 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 28665154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28665160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28667347 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28667412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28667998 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28668233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28668328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28668691 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28668712 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28668878 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28669290 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28670344 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 28670536 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28670549 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28670553 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28670604 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28670664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28670794 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28670906 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28671223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28671280 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28671336 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28671462 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28671944 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28671992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28672402 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28672765 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28672773 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 28673676 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28676856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28678677 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28679681 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28679767 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28681264 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28684323 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28687020 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28687623 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28687873 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28694657 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28701390 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28701739 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28702000 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28702738 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28702747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28704439 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28705070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28705491 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28705694 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28706189 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28706969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28709447 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28712058 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28712898 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28713026 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28713196 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28714411 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28714742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28714788 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28717805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28717938 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28718220 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28720545 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28721961 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28723509 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28723523 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28723918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28725495 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28726453 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28726912 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28727154 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28727185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28727668 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28727707 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 28728091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28728330 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28728400 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 28728854 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28729232 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28729414 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 28729998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28730212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28731119 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28731142 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28731162 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28731599 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28731793 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28731966 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28732532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28732602 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28732603 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28732671 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28732825 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28733188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28733212 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28733375 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28733641 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28733698 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 28733718 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 28733858 A C Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 28734075 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 28734136 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 28734362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28734381 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28734589 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28735117 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28735464 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28735680 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28735787 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28735913 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28735933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28736088 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28736482 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28736524 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28736615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28736841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28737574 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28737579 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28737643 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28738969 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28738978 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28739295 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28739681 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 28741596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28745646 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28747466 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28747621 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28747672 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28747772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28749043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28751607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28751790 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28751816 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28754036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28755375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28757405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28757617 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28757832 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28757989 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28758582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28759288 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28759620 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28760389 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28761006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28761126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28761272 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28762874 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 28763781 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28764178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28764195 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28764392 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28765902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28768007 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 28768264 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28768541 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28769052 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28769868 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28769880 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28770312 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28771188 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 28771531 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28771552 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28771719 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28772218 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28772635 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28772673 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28772771 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28772885 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28773056 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28773268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28773754 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28773784 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28773800 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28773917 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28773953 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28773959 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28773997 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28774027 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28774036 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28774147 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28774295 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28774478 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 28774726 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 28775452 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28775595 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28775964 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 28776682 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 28777115 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28777128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28777425 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28777718 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28777982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28778005 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28778122 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28778433 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28779358 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28780273 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28780356 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 28780758 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 28780789 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28780882 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28780946 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28781095 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28781191 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28782174 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28782882 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28784985 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28785335 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28785598 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 28785646 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28785736 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28786003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28786064 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28786128 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 28786213 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28786253 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28786358 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28786485 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28787299 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28791316 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28791675 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28792325 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 28792823 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28792966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28793247 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28793286 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 28793387 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28793413 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28793487 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28793966 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28794045 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28794159 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28794263 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28794310 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28794326 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28794346 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28794348 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28794359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28794372 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28794384 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28794441 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28794462 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28794514 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28794575 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28794619 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 28794728 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28794731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28794777 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 28794935 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 28795851 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28795856 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28796375 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28796498 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28796574 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28796923 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28796951 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28797117 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28797281 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 28797376 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28797634 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28797692 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28797781 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28797806 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28797881 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28798315 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28798338 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28798400 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28798482 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28798486 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28798651 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28799240 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28799547 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28800061 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28800102 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28800389 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28800789 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28801076 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 28801476 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28801481 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28801547 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28801680 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28802122 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 28802300 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28802855 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28802905 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28802930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28802947 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28803041 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28803097 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28803203 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28803219 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28803257 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28803265 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28803292 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28803363 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28803385 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28803552 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28803626 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28803923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28803937 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28804342 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28804625 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28805122 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 28805148 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 28805245 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28805539 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28805634 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28805671 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28805672 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28805824 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28805825 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28806156 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28806199 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28806440 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28807757 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28807800 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28808230 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 28808312 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 28808315 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28808413 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28808487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28808500 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28808515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28808594 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28808721 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28808798 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28809224 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28809791 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28812140 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28812322 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28812814 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28813139 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28813712 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28813763 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28814543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28814620 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 28815417 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28815590 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28815738 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28815740 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28815854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28815866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28816053 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28816128 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 28816463 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28816592 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28816637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28816867 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28817009 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 28817030 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28817273 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 28817347 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28817348 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28817380 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28818075 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28818484 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28819006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28819038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28819069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28819098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28819104 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28819123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28819710 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 28819845 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28820474 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28820628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28820744 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28821098 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28821651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28821714 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 28822389 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28822470 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28822472 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28822520 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28822978 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 28823116 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28823240 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 28823319 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28823404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28823434 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 28823470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28823482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28824040 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28824106 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 28824306 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28824342 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28824348 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28824460 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28824705 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28824775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28824886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28824999 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 28825160 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 28825440 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28825857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28825867 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28826166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28827774 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28828212 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28828382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28828601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28830124 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28830358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28830461 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28830670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28830868 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28831956 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28835671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28836624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28837627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28838188 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 28838316 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 28838663 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28838864 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28838937 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 28838983 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28838989 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28839065 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28839168 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28839446 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28839504 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28839649 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28840107 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28840118 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28840722 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28840775 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28841389 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28841930 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28842101 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28842112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28842127 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28842204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28842265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28842359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28842417 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28842635 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28842861 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28842945 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28843013 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28843023 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28843059 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28843087 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28843134 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28843180 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28843213 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 28843238 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28843243 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28843385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28843394 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28843542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28843559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28843573 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28843574 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 28843975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28843994 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28844055 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28844068 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28844471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28844534 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 28844579 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28844769 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 28844797 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 28844812 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 28844822 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 28844882 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 28844927 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 28844961 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28845596 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28845606 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28845667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28845669 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28845701 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28845785 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28845819 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28845829 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28845928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28845977 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 28846018 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 28846037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28846115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28846173 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28846189 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28846219 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28846282 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28846472 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28846622 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28846637 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 28846736 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28846819 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28846871 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28847259 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28847426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28847469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28847563 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 28847603 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 28847621 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 28847642 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 28847847 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28847870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28847875 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28848028 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28848040 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28848074 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28848167 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28848178 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28848297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28848492 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28848575 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 28848587 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28848614 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 28848633 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28848689 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28849040 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28849181 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28849548 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28849556 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28850051 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28850055 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 28850119 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28850197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28850564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28850701 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28850726 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28850754 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28850788 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 28851088 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 28851117 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28851381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28851897 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28851900 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28851924 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28852396 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28852509 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28852552 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28852704 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28853268 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28853482 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 28854114 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28854174 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 28854242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28854541 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28854553 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 28854686 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28854826 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 28854912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28854942 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 28855003 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28855085 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 28855308 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 28855310 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28855325 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28856275 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 28856321 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28856432 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28856636 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28856849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28856861 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28857290 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28857340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28857364 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28857458 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28857513 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 28857518 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 28857760 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 28858027 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28858112 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28858392 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28860287 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28860327 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 28860376 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 28860385 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 28860531 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28860675 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28860687 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 28860712 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 28861349 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28861698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28861861 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28861967 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28862047 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 28862403 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28862416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28862539 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28862603 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28862661 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 28862802 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28863040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28863148 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28863213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28863906 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28863960 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28864125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28864696 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28864728 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28864788 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28864799 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28864898 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28865129 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28865654 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 28865773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28867259 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28867377 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28868053 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28868381 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28868675 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28868797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28869071 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 28869095 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 28869183 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28869224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28869235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28869239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28871618 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28872496 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28873078 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28873097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28873118 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28873170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28873184 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28873225 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28873532 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 28873621 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 28873742 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28873777 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28874029 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 28874289 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28874359 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 28874479 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28874486 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28874529 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28874551 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 28874681 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28874716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28875043 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28875046 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28875085 T G Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 28876893 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28877106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28877151 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 28877258 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28877873 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28878110 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28878341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28879158 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28880250 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28880660 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 28882184 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28882238 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28882285 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28882416 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 28883205 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28883260 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28885143 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28885164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28885948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28886134 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28886655 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28889360 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28889762 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28889997 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28890036 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28890088 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28890712 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28890786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28891204 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28891448 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28891460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28891556 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28891876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28892498 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28892786 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28893362 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28893501 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 28894408 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28894622 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 28894676 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28894680 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28894711 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28895324 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28895429 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28895444 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28895594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28895679 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28895970 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 28896546 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 28896754 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 28897090 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28897102 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28897363 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28897396 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28897705 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28898139 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 28898214 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 28898283 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 28898312 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28898347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28898481 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28898723 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28898883 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 28898981 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 28899001 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 28899166 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 28899262 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28899281 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28899298 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 28899332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28899348 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28899530 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28899572 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 28899699 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28899971 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 28899982 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 28900346 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 28900410 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 28900427 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28900430 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28900467 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 28900488 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28900505 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28901702 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28902217 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28902323 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 28902422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28902608 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28902609 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28902745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28903129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28903340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28903493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28904618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28905018 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28906126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28906802 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28908005 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28910507 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28912422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28912479 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28913760 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28915837 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28915889 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28917029 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 28917043 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 28917361 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 28917414 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 28917862 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 28918153 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 28918275 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 28918284 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 28918577 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28919540 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28919725 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 28919924 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28920402 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 28920467 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28920554 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28920568 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28920616 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28920639 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28921318 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28922138 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28922411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28923782 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28924727 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28924826 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28924869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28925036 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28925097 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28925941 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28927321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28929335 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28929708 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 28931789 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28932742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28932902 C A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 28933685 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28933701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28933831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28933842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28934258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28937601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28937880 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28938101 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 28938104 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 28938275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28938352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28938522 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 28938574 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 28939704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28939748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28940759 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28940851 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28944100 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 28944714 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 28944905 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 28944913 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 28945297 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 28947935 C T Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 28949393 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 28950228 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 28950945 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 28951174 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28951240 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28951245 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28951285 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 28951319 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28951606 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 28951647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28951711 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 28951838 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 28951877 C T Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 28952036 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 28952062 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 28952110 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 28952226 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 28952527 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28952575 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 28952603 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 28952681 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28952771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28952786 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 28952824 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 28952955 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 28953109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28953397 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 28953598 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28953754 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 28954232 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28954235 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 28954555 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28954781 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 28954810 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 28955079 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 28955165 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 28955383 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 28955396 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 28955439 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 28955479 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28955482 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28955541 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28955545 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 28955598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28955836 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28955884 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 28955964 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 28956195 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28956217 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 28956223 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 28956345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28956489 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28956509 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28956578 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28956627 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 28956657 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28956784 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 28956867 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 28957224 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28957479 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 28958172 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 28958200 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 28958370 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 28958487 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 28958849 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 28958940 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 28959020 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28959441 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28959609 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28959967 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 28960004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 28960204 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 28960509 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28960594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28960698 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 28960709 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 28961102 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28961210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28961273 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 28961689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28961722 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 28961813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 28962535 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28962608 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 28962624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28962909 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 28963173 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28963192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28963623 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 28963825 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 28963826 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 28963921 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 28964038 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28964102 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28964837 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28965049 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28965313 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28965501 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28965634 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28966535 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28966762 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28967347 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28968136 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 28969002 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28970352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 28974029 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28976406 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28977324 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28977710 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28977754 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28978988 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 28980309 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28980447 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 28980570 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28985158 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28985962 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28986412 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 28988107 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 28988404 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28989808 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 28989844 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28990032 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 28990468 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 28990557 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 28992391 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 28993504 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 28993902 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 28994586 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28996444 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 28996532 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 28996625 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 28998862 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 29000950 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29002546 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29003169 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29006065 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29006376 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29007121 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29008298 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29010082 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 29010370 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29010993 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 29011119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29011211 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29011406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29011525 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29012042 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29013366 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 29014841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29015214 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 29015632 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 29015653 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 29015654 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 29015828 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29016295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29016729 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29018226 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29019876 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29022134 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29023403 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 29024985 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29025803 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29025941 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29026905 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29026972 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29027145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29027223 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29028008 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29028371 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29028479 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29029356 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29032310 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29033352 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 29033740 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 29034778 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 29034983 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29038168 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29038222 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29038571 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 29038648 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29038860 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29039326 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29039341 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 29039379 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29039522 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29039619 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29039690 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29040119 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29040250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29040327 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29040352 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29040688 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29040742 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29041086 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29041187 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29041427 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29041705 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29042233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29042481 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29042546 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29042635 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29042637 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29042678 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29042918 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29043017 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29043396 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29043586 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29044865 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29045227 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29045456 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 29046212 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29048291 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29048386 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29049944 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29054963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29055496 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29055516 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 29055543 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 29055777 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 29057006 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29057539 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29058145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29058778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29059952 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29060068 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29060295 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29060579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29060800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29060895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29061374 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29062299 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29062426 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29062579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29062632 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29062640 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29063501 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29063624 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29063661 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 29063818 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 29063975 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29064160 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29064246 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29064250 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29064296 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29064719 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29065002 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29065150 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29065339 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29065410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29065528 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29065963 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29065972 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29065987 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 29066087 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29066107 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29066377 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29066634 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29066800 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29066852 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29067013 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 29067448 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29067457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29067516 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 29067533 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29067544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29067573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29067879 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 29067882 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 29067993 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 29068070 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29068146 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29068231 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29069290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29069657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29069793 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29069998 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29070084 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29070145 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29070353 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29070419 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29070442 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 29070533 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 29070637 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29070946 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 29070988 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29071042 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 29071206 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29071253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29071362 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29071374 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29071397 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29071439 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29071876 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29071989 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29071993 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 29072029 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29072058 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 29072101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29072280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29072366 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29072367 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29072663 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 29072697 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29072905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29072967 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 29073001 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29073095 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29073131 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29073138 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29073144 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29073158 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29073825 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29073837 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29073871 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29073908 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29073917 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29074141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29074446 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 29074487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29074580 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29074709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29074740 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29074853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29075242 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 29075248 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 29075453 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29075571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29075576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29075909 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 29076011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29076048 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29076086 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29076124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29076239 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29076255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29076306 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29076479 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 29076525 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29076661 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29076677 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29076678 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29077016 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 29077068 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29077090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29077094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29077355 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29077514 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29077536 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29077561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29077619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29077637 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 29077638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29077798 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 29077881 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 29077930 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29078116 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29078161 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 29078211 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 29078436 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29078438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29078501 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 29078567 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 29078569 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 29078704 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29078802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29078929 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29078979 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29078992 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29079186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29079290 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29079479 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29079497 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29079569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29079596 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29080057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29080082 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29080094 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29080735 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29080811 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29080861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29081187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29081434 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 29081438 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 29081448 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29081533 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29081966 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 29082326 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 29083883 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29085306 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29085429 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29085548 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29086872 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29087121 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29087442 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 29087509 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 29087679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29087681 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29087811 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29087829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29088013 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29088223 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29088274 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29088311 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29088330 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29088368 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29088388 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29088391 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29088404 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29088508 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29089235 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29089346 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29089386 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29089422 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29089446 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29090412 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29091329 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29091967 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29092560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29093363 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 29095932 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29096048 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29096049 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29096071 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29096559 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29097012 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 29097151 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29097225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29097332 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29097596 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 29097988 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29098406 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29098438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29098587 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29099650 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29099802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29099985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29100141 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29100305 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29100327 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29100350 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29100515 C A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 29100542 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 29100563 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 29100686 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29100772 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29100809 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29100823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29101288 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29101358 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29101438 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29101523 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29101727 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29101824 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29102665 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29103153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29103339 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29103708 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29104078 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29104280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29104550 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29104608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29104647 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29104810 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29105378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29105800 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29105944 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29106830 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 29107942 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 29108123 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 29108682 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29109072 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29109936 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29110185 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29110192 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29110213 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29110570 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29110945 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 29110984 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 29111358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29111406 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29111459 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29112260 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29112621 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29112797 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29113673 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 29115538 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29116187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29116745 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29116777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29118412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29118472 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29118781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29119000 C T Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 29119006 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 29119012 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 29119134 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29119310 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29119433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29119848 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29119853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29120088 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29120132 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29120274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29120474 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 29120589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29120675 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 29120765 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29120834 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29120835 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 29120872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29120976 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 29123437 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29123645 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29124077 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29124348 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29124484 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29124881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29124935 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29125207 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 29125309 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 29125345 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29125346 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 29125362 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29125435 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 29125457 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29125474 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 29125489 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29125943 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29126028 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29126065 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29126102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29126111 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29126217 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29126293 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29126318 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29126472 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29126549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29128401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29128429 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29128506 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29128686 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29128688 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29128794 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29128880 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29128901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29128924 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29128999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29129025 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29129062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29129232 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29129389 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29129392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29129407 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29129408 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29129433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29130197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29130228 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29130231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29130313 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 29130343 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 29130657 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 29130663 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 29130795 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29130930 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 29131007 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29131011 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29131149 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 29131182 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29131369 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 29131374 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 29131893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29132086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29132291 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29132793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29134151 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29134172 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29134222 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29134320 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29134629 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29135130 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 29135257 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29135266 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29135380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29135388 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 29135476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29135617 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 29135767 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 29135978 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29135996 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29136077 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29136717 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29136966 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29137084 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 29137554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29137903 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29137974 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29138145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29138221 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 29138253 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 29138408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29138547 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 29138818 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29139524 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29139840 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 29140079 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29141043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29141186 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 29141792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29142191 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 29142207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29142444 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 29142489 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29143185 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29143538 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 29143569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29143610 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29143657 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 29144396 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29144445 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 29144513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29144568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29144756 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29144920 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29144942 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29145117 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 29145135 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 29145141 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 29145470 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29145770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29146020 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29146185 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29146309 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29146471 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29147080 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29147526 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 29147770 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 29147922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29148138 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29148222 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29148229 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29148301 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29148358 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29148512 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29148714 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 29148737 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29148753 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29148769 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 29148810 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29148872 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 29148916 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29148954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29148988 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29148995 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29149087 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 29149282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29149328 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 29149517 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29150038 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29150361 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29150375 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29150394 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29150420 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29150433 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29150500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29150542 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29150690 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29150784 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29151072 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29151235 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29151276 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29151414 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29151478 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29151807 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29151838 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29151865 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29152919 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29153670 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29153678 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 29162883 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29163300 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29164759 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29165765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29168508 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29168668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29168698 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29168948 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29169032 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 29169059 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29169235 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29170226 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29170256 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29170443 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29172056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29173180 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29174342 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29175730 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29176634 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29176797 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 29176799 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 29177104 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29177198 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29177235 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29177620 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29177627 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29178222 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29178262 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29178443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29178540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29178889 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29178928 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 29179113 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29179246 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 29179312 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29179886 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29179971 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29180034 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29180076 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 29180080 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29180320 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29180664 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29180803 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29180900 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 29180906 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 29181245 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 29181255 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 29181264 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 29181296 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 29181300 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 29181750 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29181792 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29181839 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29181931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29182100 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29182558 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29182606 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29182650 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29182902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29183047 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29183085 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29183798 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 29185512 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29185551 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29185727 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29186000 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29186217 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 29186222 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29186464 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29186611 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29186625 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29186971 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29187097 T A Y N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 2 29189706 A G Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 29189725 C T Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.0833333333333333 0.75 0.166666666666667 11 13 1 9 2 2 29190635 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 29190711 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 29190831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29190893 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29191035 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29191505 C T Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 29191584 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 29191619 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 29191909 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 29192516 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29192732 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 29192838 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 29192864 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 29192962 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29192973 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 29193001 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29193004 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29193017 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29193129 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29193477 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29193493 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29193496 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29193511 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 29193553 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 29193561 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 29193710 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 29193731 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29193784 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29193848 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29194220 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29194514 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29194593 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 29194884 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 29195110 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29195432 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29195501 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29195663 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29195866 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 29195868 C T N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 29195884 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 29195915 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 29195971 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 29196040 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 29196109 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29196528 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29196979 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29197459 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29197507 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29198265 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 29198281 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29198429 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 29198712 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 29198791 G A Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 2 29198896 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 29199153 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 29199178 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 29199277 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29199331 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 29200146 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29201545 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29203299 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29203473 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 29203499 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29204339 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 29207472 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29210821 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29215956 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29217692 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29217843 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29218162 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29218791 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29220026 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29226308 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29226571 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29227759 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29228916 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29230217 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29234232 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29235805 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29236925 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29237324 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29237722 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29237963 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 29238324 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29239145 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 2 29244233 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29245084 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 29245123 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29245924 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29246513 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29247716 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29247820 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29248142 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 29248174 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29248385 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 29248428 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29248547 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 29248600 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 29248610 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29249345 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 29249545 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 29249956 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 29250165 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 29250436 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29251609 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29252378 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29252379 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29253187 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29253192 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29253461 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29254569 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 29256407 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29256738 A T N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 29257906 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 29257967 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29258027 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29259267 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29259661 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 29260141 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 29261598 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29263593 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29269586 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29269726 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 29271028 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 29271809 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29272058 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 29272779 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29274030 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29274736 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29276307 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29277980 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 29278362 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29279020 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29279283 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29279682 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29280883 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29281195 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 29281402 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 29281722 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 29281808 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29282244 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 29285136 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29285349 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29285777 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29286816 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29286888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29288068 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29288306 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 29290145 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 29290377 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 29291487 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29293376 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 29293408 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 29293416 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 29294967 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29295727 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29296242 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 29296755 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 29296819 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29298274 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29298877 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29299849 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 29299895 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29299916 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 29299983 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 29300133 G C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 29300985 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29301711 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29302033 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29302067 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29302345 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29302370 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29302542 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29302862 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29302873 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29303497 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29303609 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29303741 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 29303749 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 29303843 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 29304137 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 29304146 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 29305190 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 29305608 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 29305699 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29306119 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29308688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29310060 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29311473 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29311756 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29311841 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29312142 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 29312237 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29312613 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29314403 A T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 29314995 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29315063 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 29315543 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29316652 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 29317299 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29318110 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29319239 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29319444 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 29319565 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29319954 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29321657 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 29322611 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 29322663 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 29322693 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29322698 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 29322797 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29323068 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 29323134 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 29323156 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 29323187 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29323453 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 29323457 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 29323724 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29323986 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29324031 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 29324404 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 29324833 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 29324848 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 29325807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29327978 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29328203 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29329459 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29329524 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29329567 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29329764 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29329778 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29329819 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29330430 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 29330461 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 29331448 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29331657 A C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 29332584 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29332608 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29332615 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29332813 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29333545 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29333783 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29334257 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29334317 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 29334503 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29334647 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29334764 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29334798 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 29334831 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 29334892 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 29334955 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29335120 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29335157 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 29335278 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 29335330 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29335352 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 29335357 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 29335371 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29335440 A C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 29335526 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 29335571 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29335717 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 29335751 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 29335815 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 29335848 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29335867 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29335880 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 29335909 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 29335959 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29336097 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29336176 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 29336362 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29336363 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29336396 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 29336541 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29336656 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29336961 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29337112 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29337261 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29338070 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29338234 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29338244 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29338345 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29338456 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29338478 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29338601 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29339310 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 29339607 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29340771 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29340824 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29340826 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29340905 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29340970 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29341168 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29341313 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29341403 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29341428 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29341493 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 29341634 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29341641 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29341694 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29341824 C G Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 29341963 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 29341967 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 29342276 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29342518 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29342766 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29342800 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29342875 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29343013 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29343489 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 29343588 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29343690 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29343847 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 29345604 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29345909 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29347915 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 29347991 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 29348114 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 29348259 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29352045 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 29352466 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29356174 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29356318 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29356490 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29359353 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 29361163 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29362512 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 29362576 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 29369027 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29369338 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 29369462 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 29370577 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29372513 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29372884 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29373147 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29373447 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 29379664 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29380983 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29381299 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29383785 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29385603 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 29386258 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29387995 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29390201 C T Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 2 29390315 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 29391027 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29391352 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29392621 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29394469 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29394505 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29394974 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29395031 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29399650 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 29399678 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29400102 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29400251 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29400390 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 29400481 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29400519 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 29400577 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 29400660 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 29400704 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 29400722 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 29400835 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 29400947 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 29401003 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29401066 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 29401239 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 29401267 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29401321 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29401390 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 29401395 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29401407 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29401452 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29401473 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29401602 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 29401641 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 29401656 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29401806 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29401987 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29402222 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29402248 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29402738 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29402862 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29402863 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29402989 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 29403165 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 29403183 G T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 29403691 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 29403830 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 29403931 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29403951 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 29404478 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29404489 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 29404519 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29404525 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 29404562 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 29404581 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 29404625 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 29404984 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 29405082 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29405109 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29405136 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29405356 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29405371 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29405447 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29405480 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 29405536 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29405753 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29405963 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29405988 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 29406079 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29406165 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29406218 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 29406220 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29406235 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29406262 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 29406298 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 29406300 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29406322 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29406391 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 29406797 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 29406815 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 29407033 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29407098 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29407253 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29407425 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 29407493 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 29407684 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 29407712 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29407962 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29411164 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29411542 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29411579 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29411849 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 29413229 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29413230 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29414001 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 29415181 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 29415382 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 29415414 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 29416618 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29416695 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 29416697 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 29416742 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29417479 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 29418096 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29418126 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 29418136 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 29418285 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29420927 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 29421151 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 29421556 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29421987 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29422031 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 29422046 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 29422149 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 29422162 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 29422234 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 29422297 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29422307 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29422346 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29422453 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29422515 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 29422586 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29422735 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29422867 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29422888 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 29422889 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 29423009 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29423066 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 29423590 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 29423797 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29424024 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29425650 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29425913 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29428064 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29429125 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29429130 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29429196 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29429592 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29429805 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 29430499 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 29430757 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 29431436 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29432123 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 29432184 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29432391 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29432769 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29432877 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29434088 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29434291 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 29434515 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29434641 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29434716 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29434755 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29434762 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29435399 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 29436147 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29436166 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29436213 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29436219 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 29436648 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29436651 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29436951 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 29436991 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 29437114 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 29437141 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 29437444 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 29438190 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29438366 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29438576 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29438680 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29438701 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29438710 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29438846 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 29439331 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29439666 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29439964 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29440000 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 29440001 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 29440050 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 29440216 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29440422 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 29440492 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29440545 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29440668 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29440951 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29441593 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29441686 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29441701 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29441738 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29442248 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 29442276 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 29442382 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29442771 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29442851 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29442919 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29442953 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29443008 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29443040 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29443045 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29443082 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29443103 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 29443133 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 29443226 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29443244 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29443271 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29443401 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29443515 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29443539 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29443567 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29443590 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29443650 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29443700 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29443785 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29443992 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 29443995 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 29444024 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 29444298 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29444798 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29444837 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29444870 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 29445135 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 29445144 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 29445304 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29445449 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29445641 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29445694 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29445724 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29445889 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29446476 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 29446726 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29446750 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29446893 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29446959 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29446964 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29446992 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29447645 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29447663 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29447668 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29447863 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29447871 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29448267 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29448315 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 29448319 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29448443 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 29448459 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29448467 A C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 29449996 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 29450051 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 29450644 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 29451258 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29451273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29451493 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 29451542 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29451957 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29452188 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 29452432 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 29452586 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 2 29452632 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.272727272727273 0.0909090909090909 0.636363636363636 7 15 3 1 7 2 29453594 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 2 29453676 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 2 29453698 A G Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 2 29453742 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 29453888 A T N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 2 29454332 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 29454782 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29455197 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29455327 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29455348 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 29455351 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 29455427 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29455578 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29455764 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29455930 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 29455939 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29456020 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29456067 A C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 29456120 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 29456185 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29456190 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29456209 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29456673 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29456752 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 29456778 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 29457730 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29457926 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29457985 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29458468 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 29459982 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29460895 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29460913 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29462086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29463237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29463489 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29463663 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29464669 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29467401 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29468420 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29470179 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29470250 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29470339 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 29470347 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 29470498 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29471326 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29471368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29471886 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 29471952 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 29472219 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 29472348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29473290 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 29473449 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29473998 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29474603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29474825 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29475013 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 29475163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29475180 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 29475662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29476584 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29477141 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29477430 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29477462 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 29477760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29478010 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29478179 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29481683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29483325 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29483431 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29483444 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29483581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29483754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29486041 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29486816 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29486877 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29487102 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29487119 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29487174 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29487203 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29487497 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 29487500 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 29487583 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 29487603 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 29487642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29487725 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29487859 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29487923 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29488342 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 29488389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29488643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29488678 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29488944 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29489020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29489106 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29489867 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29490331 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29490600 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29490601 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29490965 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 29491827 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29492303 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29492510 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29492621 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 29492927 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29496288 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29497689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29498025 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29498483 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 29498688 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29498760 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29498882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29498904 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29499248 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29499450 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29499549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29500080 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29500104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29501006 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29501277 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29502590 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29502967 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29503828 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29505008 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29505590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29505894 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29506306 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29506347 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29506609 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29507038 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29507298 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29509574 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29512083 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29512875 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29513925 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29514620 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29515021 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29516210 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29516214 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29516302 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29517283 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29517488 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29520178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29520302 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29525974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29526196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29526838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29527565 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29527685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29527694 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29527823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29532168 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29532294 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29532563 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29533866 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29539449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29539537 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29542775 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29543087 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29545056 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29545143 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29547978 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29548191 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29548526 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29549300 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29550265 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29551184 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29552100 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29555677 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29555900 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29562500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29566546 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 29570508 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29572846 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 29573039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29573345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29574337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29578279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29579904 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29580473 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29582432 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29583707 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29585299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29585856 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29587657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29588682 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29588853 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29593020 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29594591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29599568 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29602340 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 29603098 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29603961 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 29604104 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29605674 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 29605713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29608569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29609050 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29609384 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 29609439 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29609484 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29609533 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 29609582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29609726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29609764 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29609789 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29609805 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29609868 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29609943 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 29609997 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 29610008 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 29610054 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29610189 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 29610201 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 29610211 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 29610795 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 29611088 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29611098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29611139 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29611243 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29611583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29611650 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29612671 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 29614413 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 29614522 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 29616231 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29616807 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29616865 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29616970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29617143 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29617258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29617493 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29617620 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29622868 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29624690 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 29624707 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29624907 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29624971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29625352 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 29626054 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29626374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29626521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29626700 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 29626827 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29626949 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29627575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29627819 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29628001 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29628213 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29628368 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29628428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29628504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29629114 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29629229 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29629833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29629849 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29629859 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29630131 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29630431 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 29630869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29631469 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29632130 T C Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0 0.909090909090909 0.0909090909090909 10 12 0 10 1 2 29634460 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29634671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29635563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29635764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29635794 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 29636741 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 29637986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29641153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29641171 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29641703 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 29642025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29642216 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29642225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29643149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29643151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29643694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29647163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29652359 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29652529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29654231 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29655178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29656470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29656471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29657649 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29658159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29662246 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 29662281 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 29662285 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 29662366 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 29663313 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29663432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29664183 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 29664210 C T Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 29664243 T C Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 29664244 G A Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 29664268 A G Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 29664297 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 29667496 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29667577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29668873 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 29668879 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 29668914 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29669395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29669459 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 29669461 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29669505 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 29669537 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 29670393 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29671481 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29672150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29672687 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 29673622 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29674056 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 29675733 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 29675734 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 29676484 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29677445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29677534 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 29678735 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 29678922 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 29679431 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 29679459 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29679499 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 29679991 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 29680897 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29681851 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 29681905 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29682105 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29682942 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29683424 T G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 29683652 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29685731 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29687543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29688208 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29688514 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29689196 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 29689309 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29691709 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 29692049 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29692115 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29694313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29695179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29695336 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29695803 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29696313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29697340 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 29698966 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29700100 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29700574 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 29702237 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 29702491 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29702580 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29702910 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29703002 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29703183 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29703253 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 29704292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29704387 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 29704958 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 29706801 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29706886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29706964 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29710455 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 29710633 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29710730 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 29710760 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 29710771 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 29710983 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29711092 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 29711452 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 29711500 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29712239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29712664 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29712988 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29713109 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 29713132 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 29713282 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29713318 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29713572 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29714029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29714209 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 29714222 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 29714367 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 29714886 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 29714920 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 29714933 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 29714952 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 29714956 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 29715174 G A N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 29715191 C A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 29715235 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 29715491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29715811 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 29715854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29716034 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29716155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29718314 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 29718614 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 29718724 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29718822 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 29718829 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29718870 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29718872 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 29718890 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 29718895 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 29718919 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29718925 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 29719028 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 29719229 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29719304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29720067 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 29721454 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29721911 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29722067 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 29722643 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29722667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29723532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29725481 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29726807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29727475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29730325 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29730512 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29731674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29731755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29732271 A G Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 29736761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29737024 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29737150 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29737339 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29737947 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29738863 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29740369 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 29740726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29741963 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29743035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29743286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29743451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29745192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29747420 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29750275 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29750441 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 29752578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29754724 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29755739 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29756081 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29756190 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29756579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29756922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29758375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29762327 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29762365 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 29762820 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29763621 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 29763739 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29764003 C T Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 29764004 A G Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 29764023 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 29764044 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29764185 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29764374 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29765408 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29765918 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29766486 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29768740 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29769002 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 29771831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29772262 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29772511 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29774842 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 29776713 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29778618 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29778888 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29779154 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29779430 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29780149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29780949 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29783643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29784274 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29785578 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29787136 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29788572 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 29788671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29788845 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29789203 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29789345 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 29791435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29791763 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29793238 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29796984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29797477 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29800440 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29802566 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29802615 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29806567 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 29808116 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29808879 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29808979 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29809991 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29810797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29815614 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29815675 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29816180 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 29816641 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29817256 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29817295 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 29818067 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29818122 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29819941 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29820196 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29823422 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29824460 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29826424 T A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 29830752 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29831865 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29833477 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29836407 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29838835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29839826 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 29842447 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 29843364 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29844292 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 29844332 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 29844367 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 29844628 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 29844824 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 29845661 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 29845787 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 29845878 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29845879 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29845938 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29845954 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 29846046 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29846194 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 29846196 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 29846213 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 29846239 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 29846326 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 29846371 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 29846831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29847108 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29847536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29847976 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29848640 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29848678 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29848685 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 29848760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29848795 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29849888 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29850007 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29850558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29851344 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 29852888 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29852953 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29853373 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29853442 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29853466 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 29853576 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 29853579 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 29853601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29853811 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29854400 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29854443 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29854574 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29855238 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 29855535 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29855751 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29855983 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 29859171 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29859472 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 29859875 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29860498 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 29861198 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29861459 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29861971 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 29862236 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 29862644 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29862746 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29863927 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29864378 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29864634 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29864991 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 29866144 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29870571 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29876659 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29877007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29883847 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29887910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29889715 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29892086 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29894704 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29894908 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29895803 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29896076 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29898503 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29899776 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 29899885 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 29900301 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29900990 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29903492 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 29903514 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29903815 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29904033 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29904099 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29904547 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29904822 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 29905198 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 29905709 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 29906022 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29906070 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29906135 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 29906190 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 29907317 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 29907528 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 29907811 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29907878 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 29907922 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29907954 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29908001 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 29908192 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 29908369 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 29908483 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 29908536 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 29908711 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 29908781 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 29908804 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 29908912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29909069 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29909084 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29909913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29910085 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29910140 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29910152 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29910218 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29911102 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 29911259 C G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 29911314 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 29911583 C A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 29911631 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 29911723 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 29911733 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 29911758 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 29911797 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 29911850 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 29911900 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 29912136 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 29912296 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29912353 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29914098 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29914644 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 29914987 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29915274 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 29915794 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 29916414 A G N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 29918081 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29918914 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29918971 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29919788 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29924020 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29924096 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29924100 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 29924152 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29925594 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29926251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29928510 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29928569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29930655 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 29931628 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 29934232 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29934234 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29936782 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29937187 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29938648 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29939070 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29939304 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 29939589 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29940469 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29940501 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 29940502 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29940530 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29940565 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29940644 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29940658 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 29941833 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29941861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29944361 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29944731 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 29944823 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29945230 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29945260 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 29945946 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29946273 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29946386 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29948604 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29949289 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 29949826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29951393 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29952593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29955247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29955744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29956334 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29956398 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 29956641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29958373 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29961434 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29967284 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 29967454 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29967674 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 29967859 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 29967897 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 29967927 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29968004 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 29968008 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29968145 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 29968153 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 29969169 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 29969194 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29969280 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29969342 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 29969416 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 29969496 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 29969544 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29969566 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 29969599 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 29969624 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 29969895 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 29969977 C T N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.181818181818182 0.727272727272727 0.0909090909090909 12 10 2 8 1 2 29970108 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 29970125 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 29971108 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29971166 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 29971220 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29971310 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 29971550 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29971686 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 29972411 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29974684 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29974758 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29975133 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29975855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29977069 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 29977809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29978019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29979094 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29979690 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29979874 G C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 29980131 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29980602 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29980627 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 29980763 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29981331 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29981356 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 29981446 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 29981582 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 29981913 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29981938 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 29982231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29982747 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 29982784 C A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 29983059 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29983069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29983070 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 29983255 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29983338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29983468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29983536 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 29983747 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29983772 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 29983834 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29983887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29983927 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29983974 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29983979 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29984031 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29984065 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29984199 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29984233 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29984266 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29984351 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29984367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29984391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29984408 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 29984617 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29984634 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29984640 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29984711 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29984807 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 29985390 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 29985570 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29985645 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29985679 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 29985691 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29985940 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29985988 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29986006 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29986011 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 29986093 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 29986249 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 29986331 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 29986428 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 29986450 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 29986725 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 29986847 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29987031 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 29987100 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29987186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29987326 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29987332 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29987422 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29987484 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 29987608 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 29987969 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 29988229 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 29988266 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29988352 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29988364 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29988393 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 29988553 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29988569 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29988701 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29988731 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29988855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 29988954 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29989130 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 29989131 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 29989158 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 29989200 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 29989226 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 29992262 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 29992485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29995428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29997117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29997431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 29999924 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30000362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30000655 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30000740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30001431 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 30001612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30004101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30006224 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30006312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30008192 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 30008392 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30009234 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30009567 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30010008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30010046 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 30010154 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 30010229 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 30010513 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 30010553 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 30010644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30010791 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 30010864 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 30010911 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 30011359 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 30011513 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30011583 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 30011646 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 30011800 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 30012099 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 30012266 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 30012360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30012416 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30012621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30012671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30012735 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30012785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30012825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30013070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30013325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30013331 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30013382 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 30013636 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 30013783 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30016650 G A Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 30017160 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 30017211 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30017432 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 30017477 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30017813 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30017853 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30017881 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30017882 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30017904 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30017975 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30018023 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 30018175 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 30018176 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30018253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30018303 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30018329 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 30018348 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 30018618 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30019001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30019348 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30019581 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30019585 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30019750 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30020798 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30020824 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30021070 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30021133 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 30021164 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30021269 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 30021471 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30021595 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30021684 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30021859 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30022427 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30022479 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30022708 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30022749 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30022778 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30022850 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30022941 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30022983 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30023068 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30023225 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30023227 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30023302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30023416 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30023425 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30023436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30023545 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30023589 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30023695 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30023714 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30024448 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30024544 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30024556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30024638 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30024652 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30024737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30024955 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30024987 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30025216 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30026807 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30026842 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30026851 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30026853 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30026895 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30026998 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30027037 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30027069 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 30027343 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30027361 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30027850 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30027918 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30028009 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 30028109 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30028157 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30028163 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 30028198 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30028242 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30029676 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30030703 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30033537 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30034316 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30035083 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30035460 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30035466 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30035675 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30038167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30038702 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30039608 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30040582 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30045352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30046219 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30046743 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30050728 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 30051891 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 30051995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30052678 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30052875 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30053074 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30054148 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 30054285 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30054948 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30055713 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30055740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30055842 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30056192 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30057018 G A Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 2 30057374 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30058356 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30058707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30059347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30059358 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30059619 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30059925 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30064592 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30065428 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30065574 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 30065775 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30065780 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30065943 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30066277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30066448 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30068343 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30069264 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 2 30070346 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30070639 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30072339 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30081398 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30081432 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30082544 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30084248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30084431 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 30084493 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30084667 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30084790 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30085025 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 30085057 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 30085100 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 30085121 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 30085292 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30086308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30086325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30086334 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30086520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30086591 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30087237 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 30088060 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30088105 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30088699 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30088910 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 30089054 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 30089080 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30089238 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30089405 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30090240 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 30090454 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30090639 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30091112 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30091333 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 30091345 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 30091347 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 30091595 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30091715 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30092448 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30092558 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 30093057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30095878 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30097287 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30097638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30100934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30101545 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30101588 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30101927 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30103369 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30105769 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30105934 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30106576 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30106717 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30106730 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30106763 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30106848 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30106905 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30107909 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30108863 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30109967 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30110094 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30110453 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30110511 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30112807 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30113758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30114404 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30116590 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30116939 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30118848 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30119676 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30119870 G C Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 30120067 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30120430 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30121125 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30121443 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30122471 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30122561 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30124277 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30125355 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30125543 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30125598 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30126328 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30126409 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30126479 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 30126488 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 30126739 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 30126745 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 30127088 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30127109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30127794 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30127839 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30127842 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30127978 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30128069 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30128299 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30128323 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30128359 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30128894 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30129062 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30129513 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 30129549 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 30129687 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30129733 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30129766 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30129773 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30129866 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30129968 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30129982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30130277 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30130310 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30130371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30130380 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30130492 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30130578 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30130996 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30131855 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30132071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30132109 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30132251 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30132252 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30132308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30132331 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30133240 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30133596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30136807 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30137105 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30137172 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30137360 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30137382 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30137475 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30137510 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30137582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30137710 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30137811 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30137925 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30137983 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30138186 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30138488 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30138507 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30138571 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30138687 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30138749 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30138897 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30139137 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30139307 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30139584 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30140007 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30140010 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30140700 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30140966 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30141075 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30141584 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30142251 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30143040 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30143422 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30143478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30143513 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30144302 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 30144315 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 30144320 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 30144507 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 30144524 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30144791 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30144794 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30145331 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30145678 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 30145815 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30146145 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30146179 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30146192 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30148525 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30149313 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 30149640 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30150155 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30151497 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30151630 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30152378 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 30152393 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 30154054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30154670 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30154955 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30155067 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30158213 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30158328 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 30159663 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30161063 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30161446 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30162060 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 30162219 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30163762 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30163983 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30164275 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30165115 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30166150 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30166559 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30167047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30167707 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30167724 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30167793 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 30167927 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30168407 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30168612 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30168787 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30168802 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 30168823 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30168981 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30169002 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30169113 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30169121 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30169146 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30169213 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30169403 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30169437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30169619 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30169775 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30169781 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30170135 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30170239 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30170259 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30170400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30170423 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30171220 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30171765 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30171951 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30172028 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30172547 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30173091 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30173099 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30173119 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30173136 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30173196 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 30173717 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30173887 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30173936 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 30174002 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30174029 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30174112 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30174267 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 30174272 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30174475 G C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 30174487 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 30174528 G A Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 30174532 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 30174612 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30174827 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30174931 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30175129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30175151 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30175859 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30176424 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30176437 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30176477 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30176805 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30176981 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30177059 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30177248 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30178966 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30178968 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30178999 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30179633 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30179849 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30179852 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30179901 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30181062 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30181592 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30181662 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30181910 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30182737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30182886 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30184146 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 30184361 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30185151 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30185313 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30185414 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30185540 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30185880 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30185992 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30186002 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30186783 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30186874 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 30186995 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30189655 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30191031 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30192635 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30193522 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 30195519 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30196296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30198400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30199687 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30201697 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30206613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30211799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30213489 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30213513 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30214546 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30217563 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30218556 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30218748 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30221852 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30224362 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30224378 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30224943 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30225378 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30227044 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30227253 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30227258 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30227827 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30227869 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30227899 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30227936 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30227973 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30227998 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30228090 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30228379 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30228400 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30228408 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30228619 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30228637 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30228745 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30228752 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30229397 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30230662 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30231270 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30231651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30232381 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30232918 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 30232942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30232966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30234617 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30234826 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30234832 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30234946 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30235054 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 30235767 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30236387 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 30237975 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30239995 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30241886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30242383 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30243091 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30243189 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30244014 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30244151 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30244398 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30246587 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30246924 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30247257 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30249186 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30249259 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30249332 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30250038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30250352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30254995 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30255108 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30255681 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30256145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30256514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30256532 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30256733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30259913 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30274756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30274855 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30275947 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 30279489 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 30279620 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30280193 T G N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 30281231 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 30281296 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 30286047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30286443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30289499 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 30290081 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 30290227 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30290254 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 30290452 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 30290459 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30290580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30290618 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30290724 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 30290791 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30291001 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 30291458 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30291487 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30291674 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 30291847 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 30291880 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 30292109 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 30292235 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 30292311 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 30292757 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 30293036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30294134 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 30294162 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 30294235 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30295343 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30295400 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 30295601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30295849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30298042 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30299078 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30299112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30299509 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 30300151 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30300441 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30300561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30301838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30302389 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 30302632 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30302732 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 30302897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30306645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30307427 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 30308322 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30308328 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 30308464 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30308742 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30309045 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30309053 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30309464 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 30309484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30309918 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30310235 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30310305 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 30311193 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 30311592 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 30312748 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30312753 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 30313419 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30313449 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30313516 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30313519 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 30313838 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30314144 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30315016 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 30315530 G T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 30315594 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 30315631 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 2 30316488 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30316545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30316598 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30316725 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30316740 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30316760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30317125 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30317126 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30317288 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 30317530 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 30317664 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 30317721 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 30317723 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 30317817 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30317833 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30318152 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 30318651 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30318802 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 30318837 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30318869 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 30319499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30319541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30319580 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30319957 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 30320629 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 30321483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30329748 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30336877 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30337514 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30341708 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30351733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30353939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30355013 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30357817 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30359138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30368894 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 30369130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30369931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30370076 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30370799 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30370871 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30373679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30375324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30377468 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30377476 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30377651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30377670 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30377889 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30378094 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30378177 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30378417 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30378418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30378537 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30378538 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30379744 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 30380053 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 30380978 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 30381922 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30382915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30383268 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30383393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30383407 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30383432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30383663 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30383913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30383937 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30383966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30383980 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30384059 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30384063 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30384098 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30384120 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 30384124 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30384162 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30384174 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30385263 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30385462 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30385509 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 30385560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30385579 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30385838 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30385848 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30385870 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30385903 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30385917 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30385949 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30386104 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30386139 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30386231 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30386430 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30386509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30386585 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30386725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30386867 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30386903 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 30386931 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30386945 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30387272 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30387273 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30387299 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30387860 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30387992 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30388001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30388063 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 30388087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30388337 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30388457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30388714 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 30388862 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30388928 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30388929 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30390045 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30390064 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30390446 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30390493 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30393345 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30397002 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30397566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30397949 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 30398088 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 30398313 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 30398326 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30398394 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 30398963 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30399188 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30399534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30399784 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30399794 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30399810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30399919 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 30399963 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30399975 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30399976 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 30400990 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30401153 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30401230 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30401271 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30401421 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30402069 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 30403122 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 30403810 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30404441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30404497 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 30404659 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30405468 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 30407423 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30409209 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 30410438 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30410758 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30410798 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30410885 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30410905 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30410933 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30411088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30411104 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30411107 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30411143 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 30411290 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30411303 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30411304 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30411443 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30411489 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30411545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30411571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30413032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30413209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30413260 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30413294 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30413359 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 30413374 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30413443 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30413550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30413568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30413610 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30413639 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 30413684 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30413740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30413786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30413795 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30413847 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 30414362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30414417 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 30414440 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30414476 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30414749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30414799 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30414882 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 30414964 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30414973 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 30415074 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30415097 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30415206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30415491 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30415670 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 30415786 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30415834 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 30415910 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30416543 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30416710 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 30416843 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30416870 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 30416908 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 30417091 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30417394 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 30417463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30417464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30417539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30417799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30417944 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30417962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30418023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30418032 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30418067 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30418072 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30418122 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30418148 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30418217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30418474 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30418550 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 30419001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30419313 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 30419931 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 30420852 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30421738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30422959 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30423179 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30423776 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30424207 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30424288 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30424290 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30424360 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30424432 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30424603 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30424847 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30424871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30425546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30425757 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30426391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30426544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30427870 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 30427928 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 30427977 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 30428046 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30428544 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30428834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30429025 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30429044 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 30429080 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30429191 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 30429236 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 30429287 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 30429337 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 30429348 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 30429400 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 30429513 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 30429525 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 30429756 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 30429819 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 2 30429836 G T N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 30430058 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 30430086 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 2 30430092 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 30430106 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 30430146 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 30430208 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 30430242 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30430311 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 30430323 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 30430341 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 30430391 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 30430540 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30430565 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 30430627 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30430941 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30431015 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30431021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30432501 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30433105 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 30433494 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30433513 T A Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 30433532 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 30433668 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 30433707 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30433714 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 30433787 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30433896 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30434027 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 30434045 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 30434169 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 30434275 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30434334 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30434560 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30434766 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 30434778 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 30434876 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30434890 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 30434929 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30435023 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 30435291 C T Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 30435318 T C Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 30435439 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30435452 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 30435471 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 30435483 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 30435634 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 30435689 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30435704 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30435717 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30435735 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30435768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30435812 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30435817 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30436060 A G Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 30436064 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 30436125 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 30436133 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 30436309 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 30436376 T C Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 30436377 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 30436433 A C Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 30436505 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 30436825 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30436866 T A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 30436870 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 30436929 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30436931 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30436981 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30437073 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30437186 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30437274 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30437339 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 30437481 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 30437585 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30438006 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 30438138 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30438158 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30438170 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 30438179 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30438433 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30438466 C G Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 30438479 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 30438498 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30438517 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30438538 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30438585 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 30438591 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 30438602 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 30438629 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30438673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30438679 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 30438702 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 30438936 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30439035 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 30439090 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30439119 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30439404 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30439716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30439758 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 30439804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30439894 T G Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 30440006 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 30440147 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30440156 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30440242 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 30440304 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30440349 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30440386 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30440398 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30440436 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30440552 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30440754 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 30440837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30440845 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30441157 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30441188 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30441197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30443238 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30443312 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30443445 G T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 30443499 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30443502 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30443545 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30444240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30444317 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30444401 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30444631 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30444661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30444759 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30444783 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30444826 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30444943 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30445049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30445050 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30445133 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 30445497 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 30445498 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 30445609 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 30445663 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30445836 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 30446763 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30447722 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30448016 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30448142 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30448904 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30449217 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 30449463 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 30451210 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30452827 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 30455283 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 30456137 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30458820 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 30459729 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 30460346 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30464530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30465006 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30465101 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30465125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30465128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30465142 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30465152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30465157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30465219 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30465311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30465407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30465417 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30465445 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30465463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30466100 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30466224 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30466389 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30466812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30466851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30467261 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 30467403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30467416 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30467667 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30468276 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30468306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30468396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30468429 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30468509 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30468551 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30469368 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30469545 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30469827 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30470306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30470445 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30470622 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30470862 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 30471094 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30471572 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30471601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30471626 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 30472806 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30473228 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30473350 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30474344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30475119 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30475150 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30475225 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30475965 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30476123 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30476900 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 30477321 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30477333 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30477439 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 30477650 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 30478010 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30478763 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 30479505 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30479896 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 30480104 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 30480143 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30480401 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30480536 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 30480563 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 30480713 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 30481396 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30481405 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30481437 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 30481453 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 30481568 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30482090 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 30482278 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 30482370 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 30482492 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30482660 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30482680 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 30482746 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30482951 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30483017 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30483057 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30483071 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30483678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30483929 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30484385 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30486193 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30486416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30486482 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30486611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30486723 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30486831 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30487344 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30487671 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30488262 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30489398 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30490037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30490065 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30490092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30490613 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30490644 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30490934 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 30492005 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30492302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30492361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30492377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30492430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30492876 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 30493009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30493118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30493139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30493238 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30493342 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30493345 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30493363 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30493395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30493406 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30493415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30494052 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30494098 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 30494469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30494489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30494494 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30494941 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 30494955 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30495158 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 30495368 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 30495370 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 30495941 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30496982 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30497128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30497689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30497757 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30498499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30498849 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30498930 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 30498931 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 30499032 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30500315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30500418 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30501641 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30502170 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30502285 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 30502885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30505125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30505139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30505140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30508776 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30509322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30512397 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 30512414 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30512524 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30512656 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30512712 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 30512804 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 30513472 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30513738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30514026 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 30514176 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 30515592 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30516384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30516548 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30516597 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 30516880 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30517736 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 30517828 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 30518691 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30520287 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30520776 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30521174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30521429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30521604 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30522212 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30522295 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30522711 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30522740 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30522788 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30523192 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 30523704 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30525019 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30525034 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30525090 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 30525583 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30526237 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 30526424 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 30526793 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 30526801 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 30528518 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 30528754 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 30528911 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 30529282 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30529298 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 30529302 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30530415 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30531028 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30531117 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30531170 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30531597 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30531644 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 30532057 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 30532920 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 30533084 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30533528 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30534115 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30534164 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30534186 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30534194 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30534502 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 30534589 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 30534846 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 30535244 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 30535520 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30536533 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30537870 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 30538837 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30538882 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30539205 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 30539863 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 30540036 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30540074 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 30540829 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 30541112 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 30541466 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30541853 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 30542512 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 30543094 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 30543247 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 30543267 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30543877 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 30546192 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 30547677 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30548076 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 30548300 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 30548314 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 30548434 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 30549643 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30549675 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 30549793 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 30550235 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30550270 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 30550300 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30550303 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30550366 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30550434 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30550536 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30550540 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30550678 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 30551407 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30551489 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30551648 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30551675 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 30554801 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30555073 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30555205 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30555211 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30555324 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30555653 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30555751 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30555823 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30556658 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30558018 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30558982 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30559069 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30559203 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 30559340 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 30559426 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 30560079 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 30560099 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 30560655 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30562476 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30562640 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30563151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30564884 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30564899 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30565313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30567188 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30572230 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30574644 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30574645 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30575552 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30575870 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30576074 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30576410 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30576811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30576827 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30577125 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 30577527 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30577966 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 30577969 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 30578126 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30578170 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30578171 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 30578218 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 30578219 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 30578756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30578919 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30579279 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30580142 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 30580269 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30580277 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30581072 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30581106 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30582802 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30583760 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30584262 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30584280 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30584304 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30584321 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30584424 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30584436 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30584514 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 30584720 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30584723 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30585136 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30585173 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30585331 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30585499 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 30585544 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30585558 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30587358 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30587895 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30587904 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30588002 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30588072 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30588213 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30588344 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30588541 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30588602 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30588710 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30589585 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30589684 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30589694 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30589792 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30590092 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30590189 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 30590317 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30590448 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30590992 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30591205 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30591227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30591247 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30591365 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30591453 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30591486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30591825 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30591977 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30591978 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30592130 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30592150 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30592250 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30592299 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30592348 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30592461 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30592519 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30592577 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30592734 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30592758 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30592798 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30592813 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30592916 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30592958 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 30593037 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30593251 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30593254 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30593381 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30593645 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30593646 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30593694 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30593701 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30593710 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30593840 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30593907 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30594049 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30594202 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30594272 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30594301 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30594547 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30594588 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30594669 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 30594721 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30594738 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30594798 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30594881 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30594972 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 30595038 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30595077 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30595097 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30595198 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30595614 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30595808 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 30595898 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 30595971 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 30596066 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 30596219 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30596711 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30597822 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30598077 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 30598088 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 30598350 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30598466 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30599531 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 30599859 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30599907 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30600211 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30600342 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30600636 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30601156 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30601555 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30601816 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30601873 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30601922 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30602088 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 30602420 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30602432 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 30602536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30602595 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30602699 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30603311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30603623 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30603675 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30603779 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30603819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30603926 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30603984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30604104 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30604112 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30604115 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30606773 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30606834 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30606874 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30607364 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30607365 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 30607422 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30607425 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30607536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30607659 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30607840 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30608080 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30608198 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30608214 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 30608292 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 30608297 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 30608305 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 30608383 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 30608932 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30610548 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30611242 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 30611304 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30611320 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30611329 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30611341 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30611349 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30611460 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30611877 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30612019 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30612351 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30612410 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30612426 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30612482 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30613267 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30613383 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30613404 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30613734 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30613822 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30613928 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30613936 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30613996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30614027 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30614514 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30617954 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30617999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30619496 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30619636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30619687 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30626418 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30627404 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30627415 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30627418 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30627615 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30627647 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30627663 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30627671 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30627752 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30628193 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30628281 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30628350 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30629078 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30629287 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30629837 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30629943 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30630437 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30630522 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30631203 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30631551 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30631578 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30631670 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30631698 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30631783 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30631791 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30631854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30631942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30632036 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30632084 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30632414 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30633279 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 30633328 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30633551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30633576 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30633862 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30634025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30634584 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30635706 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30635929 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30635930 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30636669 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30636693 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30637124 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30637128 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30637256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30637721 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30637859 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30637883 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30637937 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30638082 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30638111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30638282 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30640921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30641022 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30645129 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30645314 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30645391 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30645656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30645658 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30645737 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30645832 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30645884 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 30645931 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30646019 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30646179 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 30646200 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30646672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30646679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30646712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30646772 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 30646983 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30647019 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30649690 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 30652483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30653577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30654507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30654877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30656177 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30656204 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30658706 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30659087 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30659466 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30659479 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30659604 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30659618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30659723 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 30659830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30662192 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30662454 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30662923 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30662946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30662957 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30663144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30663206 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 30663241 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 30663311 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30663336 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30664706 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 30664968 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30665165 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30665216 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 30665268 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30665370 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30665546 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30665563 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 30665609 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30665614 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 30665700 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30665854 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30665858 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 30666044 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30666061 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30666249 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30666265 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 30666398 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 30666488 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30666495 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 30666514 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30666811 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30666866 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30667209 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30667240 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30667265 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 30667314 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30667339 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30668253 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30668834 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30668948 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 30669023 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30673475 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30675546 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30675578 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30675589 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30675606 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30675612 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30675629 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30675677 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30675804 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30676349 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30676362 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 30676381 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30676474 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30676553 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30676758 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30676785 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30676898 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30676902 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 30678812 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30679125 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 30679349 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 30680133 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 30680186 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 30680210 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 30680490 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30680492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30680838 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30680870 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30680928 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30681150 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 30681665 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 30681735 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30681744 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 30681758 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 30681761 G C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 30681832 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 30681951 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 30682130 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30682251 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30682309 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 30682375 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 30683063 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 30683982 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30684104 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30684232 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30684235 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30684274 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30684294 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 30684322 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30684327 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30684449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30684577 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30686336 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 30686427 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30686534 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30686670 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30686813 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 30687073 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30688482 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30688675 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30688998 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 30689529 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30689794 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30689822 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30689837 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 30689933 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30690000 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30690045 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30690117 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30690158 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30690184 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 30690329 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30690691 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30691111 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 30692120 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30692311 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30692412 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30692528 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 30692677 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30693026 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30693081 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30693245 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30693277 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30693488 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 30693609 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30693638 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 30693794 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30693856 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 30693862 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 30693920 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 30693953 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30694070 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30694117 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30694587 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30694632 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 30694633 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 30694652 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 30694778 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30694859 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30695069 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30695164 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30695350 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 30695455 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30695473 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 30695569 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30695761 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30695823 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30695833 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 30695845 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30696039 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30696071 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30696106 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30696161 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30696273 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30696367 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 30696370 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30696640 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 30696679 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30696704 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30696711 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30696789 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30696804 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30696838 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 30696851 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30696900 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30697018 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30697025 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30697127 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 30697148 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 30697244 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 30697302 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 30697327 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30697360 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30697449 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 30697467 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 30697542 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 30698046 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30698272 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 30698361 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30698475 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30698508 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30698795 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30698837 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30698839 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30698946 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 30699365 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 30700111 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 30700185 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 30700219 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30700235 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30700376 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 30700393 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30700421 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30700503 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30700557 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30700906 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 30702477 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30702672 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30703272 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30703329 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30704159 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 30704595 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30704736 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30706475 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30706762 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30707459 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30710320 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30711957 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30712777 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 30713713 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 30713753 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30714104 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30714123 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30714347 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 30714374 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 30714979 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 30714994 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 30715249 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30715270 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 30715459 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30715466 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30715558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30715753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30716373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30716389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30718438 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30718701 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30718709 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 30718732 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30718853 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 30718856 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 30718866 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 30719372 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 30720349 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30720414 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30720496 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30720767 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30720936 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30722324 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30722335 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30722351 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 30722794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30723541 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30723662 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30723878 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30724825 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 30725421 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30725498 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 30725719 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30725720 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30726021 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30726128 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30726164 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30726308 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 30726332 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 30726368 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30726420 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30726437 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 30726782 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30726823 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30727044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30727108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30727149 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 30727283 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 30727451 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30727546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30727609 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30727746 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30727798 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 30727932 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30728085 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30728215 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30728228 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30728254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30728291 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30728468 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30728832 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30728855 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 30728996 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 30729005 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 30729368 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 30729488 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 30729678 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30730280 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 30730425 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30730466 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 30730696 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30730787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30730921 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30730971 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30731192 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30731232 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30731233 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30731525 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30734445 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30736077 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30737515 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30740775 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30743100 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30743557 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 30743705 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30743788 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 30743971 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 30744018 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 30744055 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30744151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30744802 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 30744863 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30744880 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30744894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30744962 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30745019 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 30746071 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 30746663 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30748488 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 30749973 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 30753255 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30753842 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 30753934 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30753956 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 30754345 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 30755197 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30758006 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 30758022 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 30758038 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 30758045 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30758335 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30758425 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30758435 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30758448 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30758537 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 30759033 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30759694 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 30760086 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 30760219 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 30760270 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 30760443 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 30760483 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 30761726 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30763352 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 30763360 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 30763853 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30764053 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30764233 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 30764852 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 30765207 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30765878 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 30766214 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30766525 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30766603 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30766853 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 30767807 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30767980 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 30768154 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 30768519 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 30768526 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30768634 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 30768695 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30768721 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30768757 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30768814 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30768884 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30768913 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30769487 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30769595 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30769653 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 30770390 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 30770731 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 30770758 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 30771041 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 30771068 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 30771251 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30771285 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 30771371 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 30771537 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 30771546 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 30771563 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 30771712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30771718 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30774321 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 30774653 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 30775404 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30775532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30775748 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30775753 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30775914 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30776567 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 30776764 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 30777526 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 30777587 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 30777779 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30778436 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 2 30778555 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30778792 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 30779682 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 30781018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30781055 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30781877 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30782544 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 30782837 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 30783087 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30784122 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30784320 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30784653 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 30784974 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30785544 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30785557 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30786097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30787372 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30787877 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30787883 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30787931 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30787935 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30788192 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30788679 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30788779 G C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 30788848 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30788860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30789082 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30789388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30789472 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30789627 A T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 30789642 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30790045 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 30790374 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30790397 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30790513 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 30790821 A C N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 30790825 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 30791109 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30791329 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30791412 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30791430 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30791615 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30791617 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30791637 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30791649 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30791652 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30792914 C T Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 30792983 T C Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 30793092 G A Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 2 30793232 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30793273 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30793288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30793452 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 30793498 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30793602 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30793661 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30793795 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30793968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30794333 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30794362 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30794363 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30794458 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30794483 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30794486 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30794541 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30794550 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 30794652 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.0526315789473684 19 19 1 17 1 2 30794764 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 30794837 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 30794866 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 30794882 T A N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 30794948 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 30794980 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30795009 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30795027 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30795050 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30795065 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30795066 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30795732 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 30795788 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 30796144 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 30796677 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30797305 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30797373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30799776 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30804255 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30804263 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30804290 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 30804316 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 30804361 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30804374 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 30804543 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 30804585 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 30804659 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30804821 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30804874 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30805629 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30806090 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 30806198 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30806215 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30806287 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 30806504 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30806730 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 30806902 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30807026 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30807694 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30807777 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 30808219 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30808416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30808877 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 30809725 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 30809865 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30810102 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30810524 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30810667 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30810721 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30811080 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30811493 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30811725 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 30811835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30811880 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 30812139 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30812299 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30812537 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30812581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30812598 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30812707 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30813634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30813690 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30813697 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30813748 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30813838 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30815631 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30815679 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30815711 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 30815820 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30816448 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30817579 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 30817624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30817787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30819430 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30819451 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 30819544 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30819559 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30819586 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30820500 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30820848 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30820929 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30821847 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30821946 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30822099 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 30822239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30822253 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30822292 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30822302 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 30822344 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30822377 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30822378 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30822405 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30822497 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 30822570 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30822617 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30822816 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30822967 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30822995 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30823094 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30823851 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30824330 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 30824932 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30825328 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 30825405 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30825542 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 30825948 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30826181 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 30826337 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30826613 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30826707 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30827078 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30828282 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 30828685 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30830001 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 30830136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30830568 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30831303 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30831730 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30831867 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30831908 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30831926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30832091 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 30832241 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30832266 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30832333 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30832355 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30832554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30832657 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30833007 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30833061 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 30833096 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30833127 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 30833172 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30833699 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30834143 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30834194 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 30834343 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 30834991 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30836346 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 30836348 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 30836664 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30838034 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30838481 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 30838651 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 30839245 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30839436 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 30839469 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 30839691 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 30839908 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30840624 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30840626 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 30841147 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 30842410 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30842422 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30842859 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30843813 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 30843958 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30844070 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30844709 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30844776 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30844804 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 30844949 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30845133 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30845198 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30845258 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30845262 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 30845273 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30845283 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30845408 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30845415 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30845591 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 30845741 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 30845847 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 30846046 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30846060 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30846146 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 30846257 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30846372 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30846396 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 30846443 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30846641 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 30846699 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30846772 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 30846787 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30846790 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30846847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30847061 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 30847065 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 30847164 A G Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 2 30847191 T C Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 30847201 G A Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 30847210 T C Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 30847236 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 30847261 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 30847265 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 30847273 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30847280 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 30847296 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 30847309 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30847318 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30847335 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30847374 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 30847392 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30847486 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30847512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30847531 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30847605 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30847705 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30847997 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 30848261 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30848315 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30848408 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 30848560 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 30848561 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 30848574 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 30848579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30848677 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30848780 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30848829 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 30848900 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 30848927 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30848954 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 30848975 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 30849005 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30849018 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30849024 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 30849066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30849153 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 30849243 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 30849301 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30849307 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30849357 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30849368 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30849549 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30849560 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30849638 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 30849650 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 30849817 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30849829 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30849863 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30849934 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30849977 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30849992 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30850040 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30850153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30850167 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30850172 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30850178 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30850268 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30850279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30850312 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30850344 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30850367 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30850409 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30850433 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 30850511 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30850706 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30850756 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 30850845 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30850934 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30852440 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30852508 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 30852645 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30852743 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 30852898 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 30852901 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 30852940 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 30852984 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 30853462 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 30853564 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 30853597 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30853840 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 30853942 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 30855412 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30856232 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30856402 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 30856445 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 30856457 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 30856901 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 30856993 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 30857314 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30857792 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30861308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30862211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30862893 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30862908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30867957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30868309 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30868322 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 30868328 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30869365 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 30869441 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30870035 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 30870553 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 30870595 G C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 30871001 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30871773 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30873782 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30877226 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 30877506 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 30877790 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 30878429 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30878431 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 30878700 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 30878754 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 30878842 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30878857 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 30878858 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 30878884 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 30879900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30880249 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 30881429 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30881779 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30883763 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30884479 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 30884627 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30884897 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30885463 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 30885911 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 30886187 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30886334 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30886388 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 30886456 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 30886495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30886632 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30886772 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 30886774 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 30886967 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30887094 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 30887113 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 30887169 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30887287 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 30887420 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 30887459 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30887756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30887893 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30889364 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 30891675 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30892216 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30893450 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30894117 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30894136 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30894337 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30894429 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30895123 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 30895999 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30899021 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30902721 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30902916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30904000 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 30904507 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 30904579 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30904719 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30904871 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30904898 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 30905029 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 30905090 A C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 30905254 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 30905518 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 30905601 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 30905622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30906085 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 30906235 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 30906276 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 30906343 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30906549 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30906612 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 30906669 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 30907956 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 30908006 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30910592 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30910882 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30911554 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30911882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30912367 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 30912674 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30913065 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 30913184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30913217 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 30913248 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 30913322 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30913345 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30913350 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30913372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30913437 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30913487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30913682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30913746 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 30913785 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30913786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30913804 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30913858 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30913881 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30913984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30914578 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30914918 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30914967 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 30914971 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 30915075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30915089 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30915093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30915241 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30915641 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 30915649 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 30915661 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 30915678 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 30915695 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 30915710 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 30915796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30916002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30916053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30916107 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30916149 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30916167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30916193 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30916211 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30916252 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30916364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30916438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30916685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30916709 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30916796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30916843 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30917107 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30917191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30917382 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30917476 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30917483 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30917552 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 30917787 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 30917805 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 30917832 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30917995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30918234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30918412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30918433 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30918459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30918460 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30918480 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30918554 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30918685 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30918715 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30918775 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30918816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30919035 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 30919068 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 30919111 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 30919220 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 30919294 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 30919299 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 30919487 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30919545 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30919577 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30919625 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 30919652 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30919702 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30919709 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30919722 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30919738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30919780 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30919783 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 30919800 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30920036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30920430 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 30920461 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 30920600 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30921293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30921539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30921907 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 30922528 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 30922599 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30922698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30922699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30922728 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30922772 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30923176 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 30923264 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30923376 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30923717 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 30923724 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 30923732 C T N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 2 30923752 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 30924192 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 30924416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30926128 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30926195 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 30926212 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 30926213 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 30926233 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 30926318 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30926328 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30926347 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30926362 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 30926550 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30926582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30927426 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 30929809 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30930361 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 30930707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30931146 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30932151 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 30932853 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30935002 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30935437 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 30935533 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30935698 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 30935699 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30935962 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30936061 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30936071 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 30936338 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30936457 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 30936497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30936539 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 30937179 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 30937234 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30937313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30937325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30937337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30937403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30938195 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30939119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30939259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30939298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30939543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30939567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30939597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30939661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30940073 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30940847 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30943013 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 30943136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30943203 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 30943845 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30943919 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30943938 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30944253 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30944769 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30944792 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30946221 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30946304 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30946404 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30946630 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30946651 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 30946677 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30947484 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30948027 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30948858 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30949710 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30949875 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 30951127 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30951148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30951195 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30951210 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30951236 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30951855 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 30952158 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 30952203 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30952863 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 30952886 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 30953026 C G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 30953319 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 30953829 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 30955564 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 30956066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30956111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30959240 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30961721 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 30962090 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 30962107 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 30962127 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 30962187 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 30963843 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30964679 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30964731 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30964744 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30964758 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30964795 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30964812 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30964854 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 30964900 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 30964989 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 30966992 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30967097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30967782 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30969320 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30969471 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30970695 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30971356 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30971519 T G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 30971796 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 30972008 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 30972054 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30972143 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30972281 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 30972576 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30974865 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 30976436 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 30977203 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30977998 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30978801 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30979386 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30979458 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30982191 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 30983294 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 30983683 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30984215 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30985572 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30989175 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 30989532 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 30989689 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 2 30992040 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 30992203 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 30992320 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 30992429 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30992449 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30992454 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30992462 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30992521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30992528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 30992619 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30992827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30993049 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30993050 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30993269 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 30993409 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 30993410 A C N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 30993437 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 30993517 A C N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 30993726 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 30993899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30994013 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 30994082 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 30994283 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 30994285 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 30994421 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30994524 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30995132 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 30996718 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30997532 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 30997651 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30997674 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30997681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30998505 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30998781 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 30998838 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30999191 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 30999251 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 30999338 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 30999462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30999680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 30999746 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 30999950 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31000026 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 31000045 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 31000288 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 31000325 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 31000339 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 31000442 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31000489 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31001026 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 31001879 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31002426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31002843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31002921 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 31003119 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 31003306 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 31003357 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 31003456 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 31003472 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 31004209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31004873 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 31004999 C G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 31005004 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31005716 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31005771 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 31005844 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31005971 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 31006171 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 31006219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31006235 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31006734 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31007122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31007128 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31007260 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31007357 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 31007475 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 31007763 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31008224 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31009427 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31009558 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31009834 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31009848 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 31010157 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 31010201 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 31010387 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31010843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31011177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31011193 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31011264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31011377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31011570 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31011853 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31012007 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 31012050 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 31012054 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 31012172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31013207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31013307 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 31013741 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 31013821 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 31013854 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31014623 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31014802 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 31015107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31015230 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 31015839 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 31015918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31016292 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31016424 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 31016582 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 31016649 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 31017026 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31017092 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31017122 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31018089 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31018099 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31018113 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31018122 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31018347 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 31018660 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31018929 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31019110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31020353 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31020430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31020781 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31020801 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31020818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31020832 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31020874 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31021265 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31021498 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 31021626 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 31021952 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 31022445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31023220 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31023254 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31023780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31023828 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31023876 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31024922 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31025118 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 31025471 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31025543 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31025545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31026116 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31026276 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 31027397 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31027398 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31027411 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31027542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31028317 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31028791 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 31028834 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 31028948 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31029284 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31029332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31029338 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31029592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31030115 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31030410 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31030461 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31030506 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31031202 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31031292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31031358 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 31031503 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31031591 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31031734 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31031868 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 31032500 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 31032522 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 31032524 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 31033188 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31033714 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 31033753 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 31033954 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 31034118 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 31034327 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 31034721 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31035376 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31035413 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31035430 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31035505 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31035710 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31035839 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31035953 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 31035988 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 31035989 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 31036141 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31036223 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31036269 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 31036388 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 31036503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31036762 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31036866 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 31036873 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 31036953 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 31037344 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 31037392 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 31037473 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 31037540 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31037672 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 31037676 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 31037728 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 31037826 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 31037896 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 31038034 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 31038866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31038927 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 31039047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31039060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31039460 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31039514 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31039708 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 31039740 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 31039806 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31039947 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 31040018 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 31040093 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31040208 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31040238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31040502 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31040872 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31041200 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31041224 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31041245 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31041296 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31041332 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31041451 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31041500 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31041898 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31042106 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31042405 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31042506 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31042517 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31042652 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31042697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31042912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31043085 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31043128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31043168 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31043224 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31043291 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31043387 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 31043503 C T N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 2 31043577 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 31043740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31043795 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 31043842 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31043908 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31043928 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31043982 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31043988 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31045941 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31046144 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31046226 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31046401 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 31046438 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31046614 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 31046651 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 31046904 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31047156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31047505 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31047506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31047559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31047678 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 31047699 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31047809 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 31047828 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31048198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31048401 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31048481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31048702 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31048745 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 31048822 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 31049049 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 31049086 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 31049228 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31049240 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31049257 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31049276 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31049372 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 31049423 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 31049425 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31049468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31049534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31049923 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 31050065 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 31050219 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31050397 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31050646 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31050686 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31050994 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31051507 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31051520 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31051708 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 31054352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31054449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31054471 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31054490 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31054614 C A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 31054834 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 31054930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31054994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31055256 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 31055372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31055473 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31056109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31056122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31056139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31056217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31056253 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 31056254 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 31056527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31056586 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31056588 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31056599 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 31056666 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 31056777 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31056948 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31057043 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31057063 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 31057066 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31057107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31057126 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31057319 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31060751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31062332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31062654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31062730 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31062753 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31066293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31067834 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31068160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31068825 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31071818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31071965 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31072069 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 31072174 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 31072606 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 31072711 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 31073079 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31073760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31073962 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 31073981 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31074210 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31075436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31075503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31077711 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31077882 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31077883 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31077946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31077975 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31078102 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31078243 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31079748 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 31080059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31080780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31080791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31081278 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31081280 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 31081424 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 31081476 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31081698 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31082048 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31082148 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31082385 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 31082530 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 31082587 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 31082815 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 31082908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31083395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31083566 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31083706 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 31083744 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31084433 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31085039 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31086828 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 31087229 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31087469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31087877 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 31088839 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31089068 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31089256 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31089304 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 31089309 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 31089338 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31089570 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31089601 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31089795 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 31090161 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 31090181 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31090215 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31090217 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31090234 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31092205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31092897 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 31093014 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 31093373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31093400 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31093408 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31093616 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31093651 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31093781 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31093792 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31093799 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31093840 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31093897 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31093947 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31094055 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31094581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31094647 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31094691 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31094735 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31094768 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31094953 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 31095150 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 31095202 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31095425 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31095755 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31095756 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31096160 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 31097083 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31098400 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 31098722 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31098926 C G Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 31099476 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31099700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31099930 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 31099999 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 31100472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31100604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31100719 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 31101130 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31101153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31101190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31102538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31102582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31102646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31103482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31103920 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 31103982 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 31103996 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31104231 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 31104245 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 31105160 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31105215 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 31105253 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31105643 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31106165 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31106169 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31106203 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31106337 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31106467 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31106511 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 31106748 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31107053 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31107304 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31107531 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 31108354 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31108842 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31108843 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 31110320 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31111535 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31111642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31111913 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31111964 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31112330 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31113158 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31114735 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31115874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31117001 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31117007 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31117248 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31117689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31117966 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31118163 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31118706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31118762 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31118774 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31119035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31119044 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31119219 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31119635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31119648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31119837 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 31119854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31120049 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 31120158 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31120205 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 2 31120462 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31120780 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 31120797 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 31120807 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 31120828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31120977 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31121134 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 31121174 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 31121198 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 31121370 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31121382 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 31121701 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 31121749 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31121907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31121969 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 31122021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31122313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31122442 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 31122549 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 31122579 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31122584 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31122597 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31122637 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31122721 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31122872 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 31122964 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31123130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31123924 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31124281 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31124459 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 31124514 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 31124750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31124790 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 31124884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31124920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31124983 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31125033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31125046 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 31125086 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31125356 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31125377 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 31125433 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31125570 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31125577 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31125772 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31125785 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31125880 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31125908 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31125959 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31126018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31126068 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 31126113 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31126115 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31126142 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31126214 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31126627 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 31126636 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31126642 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 31126660 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31126669 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31126782 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 31126889 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 31127157 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31127540 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31127783 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 31127923 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31128024 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31128229 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31128244 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31128389 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31128406 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31128719 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 31128821 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 31128971 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 31129904 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31129959 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 31129971 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31130010 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31130013 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31130045 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31130245 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 31130591 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 31130603 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31130689 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 31130747 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 31131081 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31131103 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31131112 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31131195 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31131207 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31131221 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 31131341 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31131385 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31131402 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31131495 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31131501 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 31131516 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31131590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31131605 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 31131708 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 31131835 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 31132496 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 31132726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31132921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31133773 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31133979 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31134011 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31134061 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31134132 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31134267 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 31134429 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 31134460 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 31134557 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31134715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31135308 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31135472 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31135685 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 31135788 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 31136068 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 31136932 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31137005 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31137095 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 31137108 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 31137138 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 31137533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31138715 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31140491 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31140511 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 31140577 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 31141167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31141241 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31141265 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31141309 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31141749 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31141868 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31142133 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31142857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31142860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31142893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31143505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31143957 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31144136 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31144141 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31145916 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31146922 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 31147100 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31147529 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31149130 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 31149355 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31150207 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 31150769 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 31151226 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 31151291 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31151321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31151509 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31151673 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31152996 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31153020 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31153025 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31153238 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31153787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31154338 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 31154539 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31154579 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 31154700 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 31155240 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 31155325 A G Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 2 31155424 A T Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 2 31155469 T C Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 2 31155509 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 2 31156084 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31156167 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31156870 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31156935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31156949 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31157249 T A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 31157631 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 31158139 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31158650 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 31158692 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31158821 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 31158857 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31158876 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31159237 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 31159243 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 31159272 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 31159284 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 31159306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31159948 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 31160481 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31160603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31160712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31160946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31161320 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31161416 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 31161455 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 31161852 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 31161947 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31162070 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31162351 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31162446 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 31162700 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31162911 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31163174 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31163175 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 31163423 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31163516 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31163622 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31163694 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31163886 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31163920 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31164098 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31164685 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31165587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31165693 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 31165824 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 31165830 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 31166431 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 31166649 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31166675 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31166761 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31166795 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31166904 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31167096 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31167244 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31167255 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31167499 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31167504 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31167792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31167842 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 31167900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31168024 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 31168038 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 31168056 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 31168074 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 31168080 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 31168297 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 31168543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31168759 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31170475 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31170594 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31170648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31170693 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31170707 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 31170879 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 31170998 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 31171794 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31171833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31172252 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31173131 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31173204 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31176790 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31177849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31178266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31182629 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31186570 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 31187365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31187410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31189666 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31189689 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31191844 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 31192373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31193457 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 31193645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31194350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31194590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31194832 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31195115 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 31195155 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 31195262 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 31195405 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 31195450 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 31195469 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31195564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31195832 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 31196181 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31196677 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 31196857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31197884 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31197935 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 31197949 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31197967 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31198338 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31199079 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31199514 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31199515 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31199663 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31199665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31200314 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31200694 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31200722 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31200743 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31200753 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31200961 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31200986 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31200987 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31201470 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31201503 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31202112 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31202208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31203395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31203673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31203863 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31204282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31204298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31204513 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31206595 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31206795 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31206807 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31206848 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 31207102 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31207175 A T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31207368 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 31208746 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31208808 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31208824 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31208836 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31208971 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 31208990 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 31209127 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31209273 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31209339 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 31209446 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 31209458 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 31209471 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31209484 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31209486 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31209511 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 2 31209522 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31209906 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31210009 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 31210046 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 31210048 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31210075 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31211784 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31213743 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31213906 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 31214966 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 31215275 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31215417 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31215626 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31216263 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31216299 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31216975 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31216989 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31217024 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31217399 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 31217470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31217524 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31217555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31218822 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31218934 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31219031 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 31220836 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 31220838 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 31220877 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 31222217 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 31222750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31222905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31222988 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 31223119 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 31223143 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 31223221 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 31223653 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 31223704 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31223775 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 31223811 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 31223944 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31224124 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31224401 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 31224505 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 31224876 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31224974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31224994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31225040 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31225746 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 31225774 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 31225789 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 31226978 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 31226984 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 31227629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31227637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31227663 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31228091 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 31228182 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31228212 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31228413 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 31228440 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31228520 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 31228554 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31228818 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 31228874 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 31229085 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 31229225 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31229257 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 31229490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31229921 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31229943 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31229954 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31229976 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31230013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31230061 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 31230367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31230387 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31230408 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 31230426 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31230506 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31230591 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 31230653 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31230901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31230926 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31231022 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31231130 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 31231156 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31231174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31231195 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 31231218 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31231374 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31231405 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31231563 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31231611 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31231710 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31231937 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 31231954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31232016 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31232018 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31232094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31232189 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31232224 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31232228 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31232245 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31232263 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31232313 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31232415 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 31232444 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 31232451 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 31232494 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 31232496 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31232507 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 31232558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31232560 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31232573 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31232594 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31232595 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31232724 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31232768 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31232977 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31232992 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31233026 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31233322 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 31233386 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 31233402 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 31233458 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31233691 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31233829 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 31233973 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31234236 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 31234865 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31234896 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31235040 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31235688 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31235697 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31235708 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31235764 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31236261 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 31236441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31236738 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31236739 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31236761 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31236776 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 31236799 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 31236818 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31238063 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31238519 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 31238552 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 31238690 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 31238775 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 31238821 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31238849 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 31238957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31239119 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31239352 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31239438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31239479 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31239485 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31239772 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 31240050 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31240115 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31240468 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31240637 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 31241183 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31242424 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 31242494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31242663 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31243374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31243454 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31243565 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31244263 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31244392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31245107 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31245396 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31246515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31246638 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31246683 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 31247306 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 31247617 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31247683 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31247686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31247874 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31248003 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31248127 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31248295 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31248315 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31248399 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31248582 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31248736 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31249304 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31249425 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 31250353 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31251131 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31251195 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31251280 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31251317 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31251490 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31252012 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 31252688 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31252767 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31252930 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31253138 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31253158 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31253534 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 31253560 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 31253582 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 31253705 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31253729 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 31253745 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 31254200 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31254311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31254784 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31255876 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 31255889 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31255942 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31255946 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31255997 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31256007 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31256223 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31256722 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 31257072 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31257229 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31257305 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 31257487 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31257848 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31258053 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 31258073 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 31258101 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 31258123 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31258220 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 31258367 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31258423 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31260441 G C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 31260522 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 31260585 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 31261532 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31261893 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 31262364 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31262859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31263865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31263907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31264685 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 31264736 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 31264752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31264804 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31264873 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 31265394 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 31265535 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 31265729 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31265915 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31266355 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 31266411 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 31266487 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 31266706 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 31267140 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 31267440 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31267551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31267799 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 31267807 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31267868 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31267890 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31268257 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31268358 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 31269485 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 31269503 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 31269521 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 31269551 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 31269823 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 31269939 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31270069 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 31270090 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 31270095 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 31270452 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 31271068 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 31271105 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 31271118 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31271176 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 31271238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31271256 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31271298 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 31271346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31271502 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31271594 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31271606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31271653 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31271654 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 31271666 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31271751 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 31272174 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31272177 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 31272188 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31272269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31272956 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31273082 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31273306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31273436 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31273527 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 31273593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31273620 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31273626 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 31273645 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 31273695 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31274000 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 31274025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31274148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31274151 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31274165 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31274194 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 31274214 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31274255 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31274293 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31274642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31274718 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31275160 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31276045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31276084 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31276775 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 31276856 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 31276882 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 31276941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31276947 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31276983 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 31277008 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31277136 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 31277261 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 31277418 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31277858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31277929 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31277942 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31277949 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 31277966 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31277977 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31278044 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 31278065 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 31278288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31278437 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31278478 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31278517 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31278541 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 31278604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31278994 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 31279051 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31279168 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 31279348 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 31279497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31279667 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 31279874 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31280335 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31280508 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31280550 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31281461 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31281489 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 31281567 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 31281791 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 31281805 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31281814 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 31282979 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31283011 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31283093 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 31283103 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 31283104 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31283127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31283132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31283275 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31285127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31286093 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31289149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31289201 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 31289720 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31289819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31290041 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31290049 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31290124 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 31290463 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 31290667 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31291245 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31291436 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 31291692 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31291943 T C Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 2 31294146 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 31294195 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 31295041 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 31295042 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 31295756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31296141 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31296250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31296300 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 31296382 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31298392 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31298531 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31298607 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31298770 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31298799 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31298882 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 31298957 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 31299326 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31299342 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31299393 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31299497 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31299597 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 31299707 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31299715 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 31299785 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 31299957 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31299990 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31300210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31300338 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31300345 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31300350 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31300357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31301338 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31301393 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31301417 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31301424 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31301476 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31301596 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31301604 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31301616 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31301617 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31301872 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 31301973 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31302106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31302137 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31302503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31302514 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31302525 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31302546 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31302585 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31302609 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31302763 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31302908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31303023 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31303048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31303065 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31303161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31303263 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31303369 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31303944 T A Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 31304275 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31304493 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31304566 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31306043 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31306218 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31306260 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31306461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31306520 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31306614 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31306707 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31306773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31306845 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31307225 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31307364 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31307414 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31307425 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31307438 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31307509 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31307627 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31307644 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31307711 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31307760 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31307796 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31308570 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31309182 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31309234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31309653 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31309707 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31309800 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31310026 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 31310386 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31310469 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31311690 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31311842 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31311981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31312037 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31312196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31312998 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31313828 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31315149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31315174 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31315256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31316233 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31316434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31316583 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31317145 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31317154 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31317752 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31318704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31319803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31320957 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31321019 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 31321053 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 31321547 A C Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 31321567 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 31322041 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31322421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31322607 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31323204 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31323384 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31323618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31323777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31323801 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31324084 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 31324085 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31324162 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31324188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31324659 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31324779 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31325019 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31325434 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31325660 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31326111 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31326186 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31326389 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31326441 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31326532 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31327767 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31327890 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31328026 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31328047 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31328258 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 31329302 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 31329692 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31329775 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31329895 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31329945 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31329988 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 31330015 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31330874 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31331002 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31331715 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31331743 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31331817 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31332069 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 31332452 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31332455 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 31332647 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 31332657 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31333288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31333591 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31334532 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31335085 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31335089 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31335240 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31335395 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 31335601 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31335714 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31338265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31338641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31338726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31342545 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31343077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31344846 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31345444 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31345524 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31345864 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 31346448 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31346707 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 31346752 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 31347490 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 31347633 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 31348945 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31350470 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31351803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31359213 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 31363453 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31363681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31364168 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31364652 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31366263 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31367565 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 31370475 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31370762 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31371810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31372769 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31373044 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31373734 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31374484 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31374648 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31376119 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 31376708 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31377229 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31377258 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31377843 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31378979 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31379697 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31381584 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31383668 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31383815 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31383834 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31384895 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31386155 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31386408 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31386576 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31386618 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 31387381 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31387482 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31387545 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31387773 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31387877 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31388150 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 31388266 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 2 31389395 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 31389502 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 31389704 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31389988 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31390018 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31390057 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31390165 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 31390223 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31397650 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31399061 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31399379 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31399409 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31399791 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 31399886 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 31399889 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 31399932 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31399999 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31400029 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31400161 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 31400167 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 31400196 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31400348 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 31401851 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31402046 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31402050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31402137 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31402653 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31403550 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31403727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31404757 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31405084 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 31405661 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31406246 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31406495 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31406529 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31406643 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31406644 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31406788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31407028 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31407530 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31407935 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31408305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31408667 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 31408963 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31408982 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31409089 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31409171 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 31409321 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 31409519 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31409541 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31410363 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31410383 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 31410400 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31410551 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31410566 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31410577 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 31410606 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31410741 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31410775 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31410776 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 31410790 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31410792 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 31410835 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 31410907 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 31410933 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31410945 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31411060 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 31411074 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 31411162 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 31411328 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 31411448 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 31411505 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 31411828 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 31411859 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 31411925 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31411973 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31412035 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31412101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31412861 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 31412873 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 31412972 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31413285 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 31413480 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 31413594 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31414984 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 31415597 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31415648 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31415764 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31415960 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31416324 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 31417782 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 31417802 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31418280 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 31418881 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31419230 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31419234 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 31420203 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31420602 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31421113 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31421304 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31421914 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31422452 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31422560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31422852 T C N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 31423207 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 31423816 T A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 31424705 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31424845 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 31424850 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31424956 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31425529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31425593 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 31427780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31428215 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 31429340 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31429549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31430080 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31435394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31435696 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31435901 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31437232 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31437727 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31438312 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31438892 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31439540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31439840 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 31440165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31440781 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31441541 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31442307 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31442556 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31443395 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 31443614 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31444401 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31444899 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 31446185 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 31446564 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31446586 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31446885 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31447077 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31447087 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31447100 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31448485 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31448696 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31448728 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31449986 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 31450065 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 31450184 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31451015 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31451324 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31451428 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31451909 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31453100 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31454166 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31454298 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31454462 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31454502 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31454649 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31455133 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31455708 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31456523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31456648 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31456776 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31456890 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31457164 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31457220 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31457336 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31457434 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31457463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31457500 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31457598 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31457694 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 31457947 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31458063 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31459046 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31460131 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31460973 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31461288 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31462086 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31463094 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31464747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31465385 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31465960 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31467008 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31468796 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31468841 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31471599 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31471661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31473155 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 31473431 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 31473616 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31474592 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31476414 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31476552 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31476644 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31476646 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31477131 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 31477151 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 31477179 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31477180 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31477715 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31477917 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 31477939 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 31478411 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 31478539 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31479215 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 31479224 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 31479649 C G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 31479724 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31480540 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31480670 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31480742 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31480785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31481126 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31482255 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31482672 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 31484081 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31485078 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 31485108 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31485343 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31485423 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 31485549 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 31485569 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 31486039 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31486236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31486278 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31486288 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31488357 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 31488639 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 31488886 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31488913 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31489588 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 31491017 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31492776 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31493716 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31494018 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31494402 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31494458 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31494539 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31495205 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31495270 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31495436 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31496093 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31497025 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 31497224 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31497395 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31501448 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 31502349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31502831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31502979 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 31503254 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31503314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31503631 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 31503637 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31503665 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31503679 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31503784 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31503923 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31504053 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31504100 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31504106 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 31504151 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31504455 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31504773 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 31505077 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31505258 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31505778 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31506241 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31506314 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31506380 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31506520 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31506531 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 31506765 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 31506781 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 31506807 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 31507287 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31507957 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31507977 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31509286 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 31510060 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 31510083 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 31510089 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 31510780 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 31510814 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 31510869 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31511057 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 31511066 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 31511082 A T Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 31511169 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31511520 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 31511578 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 31511598 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31511611 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 31511636 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 31511640 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 31511684 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31511726 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31511732 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 31511822 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31511976 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 31513052 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 31513285 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 31513291 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 31515105 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31515351 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 31516171 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31516283 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 31516451 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31516570 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 31516588 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31516590 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 31516723 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 31516877 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31517275 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31517620 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 31518038 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31518113 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31519408 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 31519419 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 31521179 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31521567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31523464 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 31524597 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31525458 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 31525467 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31526581 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31527183 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 31527606 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31529957 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31530289 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31530505 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31530576 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31530864 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31533264 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 31533634 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 31534313 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31535902 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 31535928 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31536332 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31537054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31537785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31538190 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31539964 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 31540224 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31541694 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31543208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31543324 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31544162 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 31544163 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 31544903 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 31545857 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 31546167 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31546365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31546549 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31547106 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31551136 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31553152 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31554425 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 31555246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31555725 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31556282 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31558144 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 31560898 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31561055 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31562391 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31564131 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31564652 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 31567814 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31568415 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31568591 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.0526315789473684 19 19 1 17 1 2 31569356 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31570106 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31573979 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31575563 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31576269 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31576684 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31577459 A C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 31578005 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31578489 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31579826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31581045 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31581532 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31581792 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31581803 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31581813 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 31581945 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 31581975 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 31582114 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 31582400 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31584010 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31588474 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 31589270 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 31591244 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31594511 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31594703 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31595211 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31598097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31599138 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31603445 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31604833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31605796 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31607827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31613840 G T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 31614739 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 31615234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31616572 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31617552 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31617729 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 31617924 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31618048 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31618586 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31619095 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31619886 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31623731 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31629244 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31629654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31629812 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 31634137 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31637120 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31639573 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31641794 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 31641940 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31641944 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31643606 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 31643607 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 31645392 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31647935 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31651557 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 31651563 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31652239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31652892 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 31653035 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 31655204 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 31655886 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31656413 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31656423 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 31656447 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 31656550 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31656572 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31656824 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31656981 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31657502 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 31657533 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31659118 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 31659206 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31659700 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31659962 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 31659969 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 31659976 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31659994 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31661879 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31663669 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31663878 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 31664613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31665603 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 31665711 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31665808 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 31668478 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31668621 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31668623 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 31669023 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31669035 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31669036 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31670864 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 31672309 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 31672984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31675455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31676393 T G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 31676518 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 31676534 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 31676550 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 31676733 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 31677071 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 31678179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31678959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31679644 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31679781 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 31680480 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31680952 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31681530 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31681551 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 31681702 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31681779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31682309 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31682366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31682848 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31682866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31683079 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31683229 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31683372 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31683442 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31684053 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31684098 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31684882 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 31685001 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31685011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31685156 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31685479 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31685615 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31685972 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31686278 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31686409 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31686766 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31686872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31688141 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31688145 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31688161 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31688222 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31688232 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31688463 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31688508 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31688594 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31688693 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31688797 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31689534 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31689553 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31689567 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31689825 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31690090 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31690214 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31690293 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31690331 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31690916 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31691862 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31692971 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31693296 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 31693297 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 31694861 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31695093 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31695371 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31697598 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31699985 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31702701 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31702943 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31703022 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31703095 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31704068 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31704262 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 31704430 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 31704446 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 31704523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31704653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31704654 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31704728 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31706464 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31706512 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31706521 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31713123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31713514 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31713972 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31715314 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31715787 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31716483 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31717369 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31717385 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31717488 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31717535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31717569 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31717608 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31717776 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31717891 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31717944 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31718105 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31718277 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31718424 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31718741 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31718870 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 31718871 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31719297 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31719364 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31719529 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31720290 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 31720536 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31720719 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31720728 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31720735 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31720799 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31720856 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31720914 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31721057 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31721463 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 31721492 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 31721745 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31721940 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31722034 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31723324 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31723456 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31723564 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31723837 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31723877 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 31723901 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31724099 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31724260 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31726175 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31727296 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31727459 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31728682 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31728696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31728705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31729538 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31730482 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 31730553 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 31730581 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31731012 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31732033 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31732216 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31732406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31732777 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31732810 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31732967 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31736480 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31738608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31739568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31739909 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31741804 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 31743506 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31745529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31747214 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31749533 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31755471 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31757156 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31767520 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31768848 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31769676 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31769804 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31771416 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31773208 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 31776252 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31780784 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31781781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31782342 A C Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 31783076 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31783079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31783723 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31784027 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31784703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31785332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31786756 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31787483 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31788965 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 31789344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31790381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31791100 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31793113 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31793301 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31793660 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31794645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31795684 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31796316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31796756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31797864 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 31797926 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31798911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31799415 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 31800111 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31800267 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31802050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31802407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31802535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31802599 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31802640 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31803501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31804273 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31804667 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31804717 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31805926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31806095 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31806807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31808478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31808559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31811120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31811298 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31811369 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31811824 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31811946 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31812145 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31812408 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 31812526 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31812563 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31812996 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31813176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31813180 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31813355 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31813429 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31813571 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 31813620 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 31813731 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 31813792 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 31813878 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31813904 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31813908 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31814046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31814190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31814231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31815285 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31815319 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31815320 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31815336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31815434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31816587 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31816631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31816680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31816803 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31817085 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31817710 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31819494 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31819715 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31819747 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31819885 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31819991 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31819996 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31820065 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31820305 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31820747 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31820777 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31820782 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31820878 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31820891 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31820903 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31820926 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31820934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31820985 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31821967 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31822094 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31822095 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31822175 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31822308 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31822533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31822553 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31822562 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31822664 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31822728 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31823104 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31823135 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31823196 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31823508 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31823929 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31824041 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31824162 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31827334 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31829086 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31831322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31831487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31833102 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31834212 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31834458 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31834746 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 31835474 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31835717 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31836221 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31837167 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31837580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31837966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31838009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31838521 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31838525 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31838614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31839399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31839862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31842373 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31842724 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31842843 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31844961 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31846583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31846612 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31846772 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31847121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31847767 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31847851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31847901 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31848489 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31848584 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31848697 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31848756 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31848984 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31849137 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31849203 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31849218 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31849542 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31849606 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31849615 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31849622 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31849835 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31849934 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31850628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31850807 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31850930 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31851177 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31851214 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31852098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31852167 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31852179 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31852565 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31852579 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31852641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31852661 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31852828 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31852872 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31852874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31852885 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31853217 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31853268 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31853976 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31854187 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 31854687 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31854800 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31854829 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 31854965 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31855466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31855467 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31855492 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31855892 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31856149 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31856216 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31856244 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31856300 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31856351 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31856934 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 31857031 T C Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 31857365 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 31857380 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31858363 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31858849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31859258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31860519 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31862991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31863811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31863921 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31864092 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31864913 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 31864922 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 31864940 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31865020 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 31865288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31865418 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31868782 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31869219 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31869612 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31871323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31871714 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31873437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31874233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31874793 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31875540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31878700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31879039 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31879555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31880056 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31880070 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31880769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31882026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31882493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31885641 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31885929 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31887481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31890865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31891280 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31892891 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31892987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31893453 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31894463 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31895233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31896273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31896571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31896851 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31897396 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31897885 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31897962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31898098 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31898173 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31898205 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31898366 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31898525 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31898973 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31899800 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31899917 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31900061 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 31900299 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31901272 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31902186 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31904620 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31904962 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31905385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31905530 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31906716 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31909130 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31909208 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31909327 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31909434 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31909444 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 31909834 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 31909892 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31910662 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31910913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31911278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31912098 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31912119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31912826 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31914280 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31914967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31916133 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31916167 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31916410 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31916841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31917067 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31917339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31917507 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31917637 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31917670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31917750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31917907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31917910 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31918187 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31918195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31918226 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31918346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31918580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31919531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31919869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31919880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31920436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31920582 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31921636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31921681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31921807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31922361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31922577 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31923343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31923534 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31923632 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31924210 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31924627 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31925221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31928034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31928123 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31928164 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31928258 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31928840 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31929128 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31929216 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31929237 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31930769 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31930777 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31930841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31931684 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31932744 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31933314 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 31933383 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31933406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31933930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31934436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31935840 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31936307 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31936355 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31936658 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31937412 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31937887 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31938449 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31940538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31940659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31941825 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31944292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31947923 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31948056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31949239 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31950070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31952272 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31953637 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31954455 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31954486 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31954842 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31954932 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31954984 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31955023 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31955060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31955224 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31955515 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31955951 C T Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 2 31958484 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31958568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31958569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31959196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31962123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31962170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31963118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31964515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 31966638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31970699 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 31977021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31978684 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31978896 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31982162 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 31982522 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31983040 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31983425 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31983455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31983506 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31984673 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31985209 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31985364 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31985445 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31985509 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31985539 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 31985680 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 31985711 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31985743 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 31985745 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31985933 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31985945 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31985977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31985983 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31986214 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31986318 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31986450 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31986535 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31986769 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31986873 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31987353 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31987394 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31987556 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31987634 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31988589 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31989219 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31989345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31989374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31989383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31989519 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31989686 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31989818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31989856 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31989941 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 31989961 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31989979 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31990030 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31990054 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31990063 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31990140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31990185 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31990300 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31990301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31990369 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 31990418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31990736 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31990817 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31991151 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31991263 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31991376 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31991553 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31991556 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31991937 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31992239 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31992281 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31992391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31992415 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31992608 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31992629 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31992637 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31992842 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31992973 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31993001 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31993006 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31993040 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31993148 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31993232 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31993272 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31993445 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31993459 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31993470 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31993473 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 31993674 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 31993707 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 31993736 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 31993740 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 31993750 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 31993906 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 31993934 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31993939 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31993973 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 31994135 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 31994196 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 31994260 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31994487 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31994742 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31994757 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31994917 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31994926 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31995492 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31995710 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31995802 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31996493 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31996624 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31996775 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31996795 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 31997112 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31997224 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 31997226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 31997672 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31998417 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 31999082 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31999306 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 31999347 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 31999638 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 31999743 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32000205 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32000221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32000304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32000465 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32000512 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32000555 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32000615 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32000617 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32000637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32000649 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32000829 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32000895 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32000954 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32001070 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32001206 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32001925 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32002338 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32002366 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32002438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32002511 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32002573 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32002586 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32002609 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32002618 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32002649 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32002688 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32002773 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32002793 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32002833 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32002872 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32002935 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 32003001 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32003140 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32003230 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32003243 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32003254 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32003466 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32003501 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32003520 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32003723 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32003769 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32003844 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32003934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32004251 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32004461 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32005145 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 32005349 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32005724 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32006137 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32006316 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32007369 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32007602 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32008385 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32008455 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32008530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32008569 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32009117 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 32009835 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32009848 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32010683 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32010886 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32011170 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 32011192 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32011211 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32011386 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32011523 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32011596 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32011746 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32012803 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32013113 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 32013165 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 32015093 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32015502 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32015551 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32015565 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32015599 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32018048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32018586 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32019220 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 32019850 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32021974 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32022388 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32022685 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32023726 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32024905 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32027014 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32027019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32027637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32027728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32028216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32028671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32029158 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32029380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32030614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32030932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32033673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32033867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32033956 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 32034286 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32034341 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32034346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32034354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32034425 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32034460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32034498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32034681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32034797 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32035236 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32035376 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32035552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32035735 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32035861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32035906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32036139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32036591 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32037722 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32037791 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32038828 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32038863 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32039067 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32039218 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32039245 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32039250 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32039542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32040295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32040411 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 32040497 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32041602 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32042084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32042155 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32042461 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32043190 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32043220 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32043834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32044750 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32044755 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32045634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32045878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32046201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32048012 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32048032 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32048062 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32048084 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32048215 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 32048511 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32049077 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32049400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32049796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32050441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32051959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32052305 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32052392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32052655 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32054343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32054364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32055240 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32055815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32055819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32055994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32057218 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32057757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32057926 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32057947 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32059151 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32059828 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32059976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32060329 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32060568 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32060598 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32060693 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32060989 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32061020 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32061705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32061709 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32062025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32062171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32062605 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32062658 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32062890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32062996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32064558 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32064587 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32064593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32064678 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 32064685 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32064695 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32064705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32064958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32065190 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32065447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32065511 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32065547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32065637 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32065775 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32066759 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32068917 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32071126 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32071312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32072235 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32072325 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32072336 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32072779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32072804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32072844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32072979 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32073027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32073033 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32073184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32074133 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32075362 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32075395 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32076071 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32076159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32076242 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32076246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32076525 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32077434 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32077470 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32078607 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32082430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32084368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32086306 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32087016 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32087022 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32087443 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32087571 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32087834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32088025 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32090197 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32091059 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32091189 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32091278 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32092241 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32092341 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32092520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32092673 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32093282 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32093583 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32093627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32093734 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32093741 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32093764 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32093834 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32093863 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32093994 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 32094048 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 32094076 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32094129 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32094156 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 32094195 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32094219 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32094255 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32094259 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32094434 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32094537 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32094605 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32094729 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32094739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32094755 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32094776 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32095364 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32095409 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32095586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32095589 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32095606 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32096091 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32096464 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32097150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32097598 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32097743 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32098028 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32098352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32098483 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32098858 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32099172 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32099252 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32099266 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32099385 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32099553 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 32099613 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32100348 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32100383 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32100464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32100471 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32100494 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32100551 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32100553 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32100579 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32100580 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 32101002 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32101335 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32101379 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32101440 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32101714 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32102979 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32104277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32104354 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32104387 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32107783 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32113580 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32114652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32114679 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32114750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32115048 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32115184 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32116171 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32116662 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32116761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32117016 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32117219 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32117566 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32117766 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32118085 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32118301 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32118464 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32118741 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32118984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32119028 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32119076 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32119116 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32119376 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32119493 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32119808 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 32120765 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32120876 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32122872 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32122986 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32123044 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32123047 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32123138 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 32123655 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32124245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32124719 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32124851 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 32125759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32126988 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32127064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32127922 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32128370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32131860 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32131888 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32132642 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32133869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32134045 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32134499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32134875 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 32135087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32137160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32137641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32138685 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32138915 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32139214 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32140513 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32141235 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32143033 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32143261 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32144722 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32145665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32147174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32149596 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32150557 T A Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 32155384 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 32155724 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 32156606 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 32157309 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 32160680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32163230 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32165491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32174253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32174262 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32174387 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32175242 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32177055 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 32177274 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 32177415 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 32178414 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32179755 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 32181573 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 32181585 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32181612 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 32181613 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 32181729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32183258 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32183628 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32183782 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 32184593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32184643 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32184832 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 32184967 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32185434 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32186679 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32186704 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32186705 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32186848 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 32187029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32187041 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32187872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32194807 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32194928 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 32194940 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32194967 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 32197260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32200207 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32200399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32201152 A T Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 2 32201608 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32203593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32203725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32205879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32206110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32206472 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32207233 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 32208460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32209087 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 32209176 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 32209283 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 32209299 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 32209390 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 32209620 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 32209942 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32210005 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32210034 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 32210185 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 32210484 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32210511 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32210544 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32211365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32211473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32211669 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 32211686 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 32211739 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 32212739 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 32212807 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 32212829 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32212833 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32212957 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 32213000 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32213480 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 32213487 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 32213735 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32214275 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32214304 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 32216180 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32216408 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32217380 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32217651 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 32217787 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32218466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32218744 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32219508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32220205 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32220663 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32220761 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32221210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32222793 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 32222932 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 32222938 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 32223157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32223223 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 32223241 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 32223261 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 32223469 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 32223499 T G N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 2 32223604 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 32223633 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 32223679 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 32223712 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 32223816 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 32223840 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 32224010 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 32224969 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 32225276 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32225295 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32226105 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 32227495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32227931 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32228083 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32228190 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 32230077 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32230538 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 32230687 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32231194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32232163 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32232176 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32232235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32232269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32232285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32232368 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32232387 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32232394 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32232595 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32232632 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32232675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32232687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32232806 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32232807 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32233002 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32233066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32233160 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 32233408 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32233861 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 32233862 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 32234124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32234133 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32234187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32234458 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32234481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32236365 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32236413 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32238708 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32238718 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32238807 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32238840 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32239310 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32239734 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32240031 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32240037 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32240137 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32240498 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32240513 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32240541 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32240628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32240697 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32241084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32241438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32241803 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32242053 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32242186 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32242376 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32242415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32242701 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32242966 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32243009 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32243018 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32243025 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32243587 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 32244107 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32244114 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32244137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32244671 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32245152 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32245542 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 32245823 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32245992 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32246056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32246165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32246619 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32246629 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32246747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32248718 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32249523 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32249955 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32250616 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32250756 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32250828 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32250912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32251017 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32251130 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32251179 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32251300 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32251813 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32252462 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32252870 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32252892 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32253339 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32253360 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32253694 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32253706 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32253708 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32253721 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32253743 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32253762 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32253889 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32253920 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32254088 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32254425 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32254427 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32254608 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32254634 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32254675 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32254726 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32254734 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32255035 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32255066 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32255211 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32255377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32255439 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32255558 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32257168 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32257412 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32257469 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32258743 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32258938 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32258989 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32259941 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32260054 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32261666 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32262075 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 32262801 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32262851 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32263357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32263429 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32263503 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32263513 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32263540 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32263584 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 32264178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32264252 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32264323 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32264415 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32264505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32264540 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32264625 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32264631 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32264650 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32264756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32264830 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32264841 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32266655 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32266984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32270429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32275482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32276309 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32278078 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32279022 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32279051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32279680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32279926 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32280329 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32280375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32280529 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32280919 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32281372 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32281487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32281902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32282328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32282552 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32282580 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32282679 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32282832 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32283106 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32283591 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32283822 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32283850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32284358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32284361 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32284831 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32285080 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32285297 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32285790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32285985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32286190 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32286274 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32286974 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32287181 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32287423 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32287581 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32288525 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32289910 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32290064 G C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 32290091 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32290163 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32290204 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32290233 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32290669 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32290854 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32291151 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 32291192 A T N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 32291503 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 32291544 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32291592 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32292147 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 32292625 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32292864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32295572 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32296587 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32296636 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32296781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32297103 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32297178 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32297367 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32297866 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32297935 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32298146 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32298491 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32298492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32298664 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32298733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32298769 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32298849 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32298930 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32299076 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32299348 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32299435 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32299810 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32299839 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32299976 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32300119 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32300629 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32300633 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32300699 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32300749 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32300917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32300933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32301217 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32302043 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32304321 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32306308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32307879 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32309459 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32310710 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32311734 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32312369 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32312474 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32312671 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32312743 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32312817 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32312894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32313191 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32313760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32313774 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32313926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32314263 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 32314280 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 32314439 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32314800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32314979 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 32314988 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 32315191 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 32315217 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32315271 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32315453 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32315465 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32315680 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32315694 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32315736 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32315772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32315878 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32316034 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32317155 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32318027 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 32318098 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32318168 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 32318689 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32318793 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32318903 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32318989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32319000 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32319128 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32319145 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32319319 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32320132 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32320809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32321055 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32321079 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32322316 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32322889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32324850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32333441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32336889 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32336995 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32337011 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32337626 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32337921 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32338252 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32338331 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32338629 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32338705 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 32339040 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32339094 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32339190 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32339199 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32339226 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32339292 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 32339312 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 32339345 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 32339348 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 32339361 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32339571 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32339581 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32339653 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32339836 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32340451 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32340734 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32340867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32340965 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32341037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32341135 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32341151 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32341201 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32341308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32341419 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32341521 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 32341612 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32341739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32341768 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32341813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32341901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32342252 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32342263 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32342305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32342329 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32342389 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32342448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32342457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32342487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32342588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32342607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32342701 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32343339 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32343402 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 32343515 A T Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 32343712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32344038 G T Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 32344185 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32344302 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 32344459 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32344468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32344618 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32344633 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32344828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32344831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32345086 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32345583 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32345609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32345652 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32345777 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32346057 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32346066 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32346300 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 32346346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32346584 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 32346600 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32346617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32346640 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 32346688 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 32346765 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 32346779 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 32346788 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 32346821 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 32347256 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 32347301 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 32347339 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 32347415 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32347419 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32347516 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32347525 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32347572 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32347659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32347661 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32347721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32347745 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32347875 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32347995 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32348079 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32348171 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 32348369 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 32348449 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32348494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32348542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32348560 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32348619 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32348647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32348798 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32348850 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32348854 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32348957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32348987 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32350931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32350996 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32351439 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 32351971 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32352045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32355715 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32355756 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32355799 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32355867 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32355990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32356026 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32356128 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32357626 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32357648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32358893 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32359422 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32359459 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32359598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32359994 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 32360338 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 32361213 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32361454 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32361510 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32361536 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32361546 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32361567 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32361757 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32362051 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32363206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32363670 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32363786 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32363790 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32364040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32364069 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32364730 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32364866 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32365489 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32369839 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32369935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32378293 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32378850 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32379134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32379665 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32381023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32381106 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32381199 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32381347 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32381737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32382093 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32382109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32383613 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32385753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32385994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32386245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32386526 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32386662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32387315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32388301 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32388630 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32392040 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32392709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32393155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32393293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32395961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32396324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32398167 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32400088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32400123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32402701 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32403779 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32403801 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32404808 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32404840 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32404885 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32404918 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32405343 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32406413 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32406493 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32406643 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32407627 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32408195 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32409008 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32409061 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32409072 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32409515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32410230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32410355 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32410359 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32410503 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32412116 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32412199 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32412229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32412765 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32414271 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32414310 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32414481 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32414489 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32414667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32415580 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32415814 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32415818 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32415835 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32415940 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32416233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32416258 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32416703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32417064 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32417425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32417521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32417601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32417689 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32417811 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32418515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32419035 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32419990 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32420194 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32421362 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32425170 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32426453 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32427729 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32428066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32428205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32428458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32428559 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32428560 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32428722 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32429461 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32429992 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32430027 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32430392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32432888 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32432961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32433996 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32434093 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 32434427 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32435271 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32435760 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32437829 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32438531 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32439462 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32439547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32440220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32440520 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32442270 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32442508 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32442520 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32442521 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32443278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32443960 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32445212 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32446474 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32446631 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 32447463 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32447464 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32447501 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32448278 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32450813 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32451440 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32451591 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32453779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32453814 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32454247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32455385 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32456302 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32456800 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 32457414 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32457422 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32457954 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32457998 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32458009 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32458020 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32458064 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32458271 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 32458312 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32458387 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32458430 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 32458474 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32458901 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 32459115 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 32459119 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 32459164 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32459254 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32459353 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32459475 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32459504 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32459580 G C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 32459632 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32459712 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32459753 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32459789 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32459812 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32459817 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32459851 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32459901 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32459913 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32459989 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32459993 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32460004 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32460100 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32460180 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32460240 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32460327 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32460335 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32460343 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32460442 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32460461 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32460606 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32460620 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32460652 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32460670 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 32461088 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 32461139 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32461208 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32461254 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 32461271 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32461283 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32461296 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32461402 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32461673 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32462454 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 32466815 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32467174 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32468175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32468363 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32468850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32468920 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32471492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32471552 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32471575 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32471766 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 32471797 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 32471837 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32472051 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32472190 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32473244 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32473428 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32473666 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32474182 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32475119 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32475917 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32476276 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32477318 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32482965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32483870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32484491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32486126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32488104 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32490118 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32490473 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32490874 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 32490896 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 32490927 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 32490992 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 32491027 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 32491127 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 32491265 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 32491340 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 32491382 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32491390 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 32491464 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 32491509 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32491692 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32491696 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32491802 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32491830 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32491945 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32491984 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 32491995 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 32492571 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32492730 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32494014 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32494218 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 32494252 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 32494375 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 32495926 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32497573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32499458 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32499761 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32499822 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32500116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32500341 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32501136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32501235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32502781 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32502817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32502840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32503165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32503453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32503748 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32505947 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 32507120 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32507320 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32508442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32508823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32508897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32508918 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32510277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32510798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32511254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32512693 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32513024 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32515743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32515808 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32515874 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32517963 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32517980 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 32518048 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32518136 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 32518137 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 32518716 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32518730 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32519139 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32519493 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32519741 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32519861 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32519871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32520335 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 32520590 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32521439 G A N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 32521479 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 32521617 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 32521805 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 32521864 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 32521899 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 32521965 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 32521995 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32522606 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 32523349 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 32523534 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 32523537 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 32523548 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32523587 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 32523602 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32523693 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 32523765 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32523820 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32524247 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 32524275 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 32524528 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32524607 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 32524778 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32524859 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 32524869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32524891 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 32524932 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32525942 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 32528534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32529661 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 32529751 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 32530259 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 32530349 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 32530456 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 32530650 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32530734 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 32532214 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32532273 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 32532283 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 32532627 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 32532982 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32533914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32535834 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32536493 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32536570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32540956 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 32543588 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32546486 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 32546622 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32547229 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 32547397 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 32547600 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 32547663 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 32547668 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 32547760 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 32547772 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 32548725 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32550029 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32550927 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32551044 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32551323 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32551389 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32552127 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32552425 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32552502 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32553361 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32553376 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 32553611 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 32553794 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 32553801 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 32554110 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 32554604 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32554885 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32555011 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 32555064 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 32555725 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32555980 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32556131 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32556146 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32556204 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 32556263 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 32556356 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 32556464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32556512 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32556600 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32556605 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 32556831 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 32557161 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32560334 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 32560688 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32561415 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32561602 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32561733 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32561799 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32561871 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32561934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32561972 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 32562042 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32562232 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 32562395 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 32562708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32564303 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 32564477 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32564756 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32564790 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 32565850 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32569360 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32570885 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32573040 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32579779 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32579937 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32580272 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 32583396 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32585196 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32585225 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32585553 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32585574 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32588395 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32589915 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32590702 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32590923 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32591478 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32591710 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32594847 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 32595444 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32595451 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32595556 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 32598883 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 32599664 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32599665 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32599691 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32600736 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32600798 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32602333 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32602344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32602999 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32603141 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32603232 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32603531 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32603547 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32603656 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32603868 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32603916 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32604024 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32604053 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32604162 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32604268 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 32604375 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32604397 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32604530 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32604578 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32604658 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32604686 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32605788 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32606024 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32606105 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32606164 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32606211 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32608410 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32608434 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32610824 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 32612315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32613998 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32617321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32617753 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32618282 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32618870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32619005 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32620945 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32621569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32622489 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 32624977 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32625343 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32629062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32629642 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32629813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32629940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32632978 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32633226 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32638279 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32638980 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32641043 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32641424 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32642777 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32642865 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32643168 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32643336 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32643726 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32644804 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32646233 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32646351 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 32646503 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32646732 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32646949 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32647023 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32647054 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32647224 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32647268 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32647322 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32647447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32647544 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32647585 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32648121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32648656 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32648685 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32648779 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32648921 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32648957 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32648958 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32649015 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 32649178 A T Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 2 32649304 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 32649338 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32649818 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32649962 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32650664 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32650675 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32650797 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 32650935 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32651163 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32651496 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32651612 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32651636 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32651818 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32652300 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32652359 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32652461 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 32652661 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 32652720 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 32652914 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 32652925 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 32653096 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32653099 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32653112 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 32654037 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 32654038 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 32654055 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 32654084 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 32654205 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32655641 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 32655658 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32655744 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32656038 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32656213 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32656661 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 32656664 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32656704 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32656788 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32656891 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32656900 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 32657944 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 32658774 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32659417 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32659579 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 32660167 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 32660179 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 32660795 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 32660969 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32661545 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32661744 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32661796 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32661956 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32661985 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 32661999 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32662025 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32662237 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 32662373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32662423 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32662553 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32662585 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32662966 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 32663003 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32663007 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32663024 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32663026 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32663086 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 32663236 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32663263 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 32663287 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32663304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32663346 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 32663646 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32663703 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32663724 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32663732 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32663761 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32663993 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32664240 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32665006 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32665100 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32665150 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32665204 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32665267 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 32665368 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32665458 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 32665513 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32665550 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32665575 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32665580 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 32665600 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32665679 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32665702 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 32665890 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32666081 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32666130 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32666307 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32666360 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32666427 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32666521 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32666551 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32666657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32666842 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32667153 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32667164 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32667318 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 32667746 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32667804 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32667879 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 32667934 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 32667939 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 32667946 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 32668068 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32668086 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 32668091 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 32668221 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32668317 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32669077 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 32669126 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 32669191 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 32669355 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 32669851 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 32670307 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32670641 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32671795 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32671865 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32671941 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32671957 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32672263 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32672550 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32673006 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32673052 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32673246 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32673327 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 32673405 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32673913 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32673966 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32674116 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32674151 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 32674368 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 32674388 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 32674569 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32674990 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 32675304 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32675399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32675503 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32675605 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32675606 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32676114 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32676120 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 32676165 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32676238 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 32676255 T A Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 32676271 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32676375 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 32676388 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 32676484 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32676594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32676742 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32676839 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32678051 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32678102 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32678115 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32678374 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 32679511 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32679585 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32679603 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32679660 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32679829 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32679954 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32680019 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 32680080 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32680119 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 32680174 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 32680210 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32680319 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 32680355 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 32680412 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 32680642 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 32680806 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32680859 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 32680898 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 32680978 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 32680989 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 32681019 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32681042 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32681125 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 32681158 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32681184 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32681198 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32681392 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32681449 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32681524 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32681610 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32681779 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 32681816 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 32681828 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 32681902 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 32682049 C T Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 32682192 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32682202 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 32682332 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32682360 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 32682363 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 32682386 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 32682398 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32682403 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32682497 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32682526 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32682548 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32682579 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32682732 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32683019 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32683063 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 32683083 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32683117 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32683130 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 32683186 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 32683226 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32683312 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32683483 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 32683489 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 32683498 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32683526 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32683535 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 32683556 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32683574 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 32683595 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 32683634 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 2 32683636 C A N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 2 32683764 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32683869 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 32683887 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 32684016 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 32684020 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32684063 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 32684080 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32684108 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32684124 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32684133 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32684174 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32684202 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32684233 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32684310 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 32684320 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32684344 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32684357 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32684460 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32684639 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 32684786 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 32684835 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 32685209 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32685264 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32685861 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 32686562 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32688049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32688533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32688598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32689108 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 32689118 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 32689421 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32689823 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32689886 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32689896 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32689961 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32690057 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 32690192 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32690198 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 32690320 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32690419 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 32690521 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 32690627 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 32690660 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 32690885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32690895 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32690935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32690998 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 32691575 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32691912 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 32693437 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32693599 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32695007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32695053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32695142 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32695318 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32695519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32695571 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32695856 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32695911 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32695957 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32695958 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32695998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32696053 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32696106 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32696123 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32696145 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32696151 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 32696344 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 32696636 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32696805 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32696818 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32697397 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32697528 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32697543 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32697633 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32697645 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32697755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32698086 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32698104 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32698226 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 32698269 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 32698294 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32698311 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32698344 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32698424 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32698455 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32698811 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32698868 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32698987 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32699147 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32699177 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32699532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32699643 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32699666 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 32699699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32699707 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32699771 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32699827 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32699962 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32700079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32700186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32700191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32700577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32700613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32700682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32700702 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32700743 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32701114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32701487 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 32701525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32701544 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 32701616 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 32701875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32702461 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32705529 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32706015 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32706084 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32706264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32706269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32706308 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 32706319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32706397 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 32706431 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 32706885 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 32706915 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 32707063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32707129 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 32707196 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 32707289 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 32707306 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 32707423 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32707430 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32708021 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 32708049 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 32708159 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32708162 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32708201 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32708211 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32708222 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32708243 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32708268 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32708447 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32708682 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 32708752 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 32708755 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 32708809 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 32709109 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32709113 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 32709160 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 32709179 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32709198 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 32709316 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32709391 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32709437 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32709493 G C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 32709548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32709628 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32709683 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32709694 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32709712 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32709732 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32709758 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 32709835 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32710068 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32710082 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 32710092 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32710155 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 32710175 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32710304 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32710473 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 32710489 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 32710509 A T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 32710534 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 32710537 C A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 32710546 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 32710603 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 32710705 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32710792 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 32710815 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 32710843 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32711084 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32711194 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32711233 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32711461 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32711609 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32711859 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32712351 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 32712566 C T Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 32712589 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 32712602 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 32712606 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 32713322 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32714545 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32715260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32715359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32715485 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32715556 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 32715585 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32716351 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32716509 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32717252 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32718662 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32718780 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32720273 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32721055 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32721282 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32721430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32721661 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32722529 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32723417 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32723430 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32723453 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32723504 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32723528 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32723544 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32723645 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32723652 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32723782 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32723903 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32724378 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32724405 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 32724779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32725016 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 32725304 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 32725310 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 32725323 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32726042 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 32726052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32726073 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 32726437 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 32726451 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32726509 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32726637 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32726641 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32726735 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32727385 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 32727398 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32727763 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32727772 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32727775 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32727872 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32727902 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32728372 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32728579 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 32728720 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 32728738 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 32729077 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 32729079 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 32729114 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 32731308 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32731328 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32731825 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32732162 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32733623 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32733736 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32733775 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32734063 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32734263 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32734288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32734747 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 32734808 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32734961 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 32735043 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32735054 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32735077 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32735428 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32735682 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 32735693 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32737113 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32738970 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32739049 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32739330 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 32739398 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32740047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32740139 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32740149 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32740383 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32741512 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32742167 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32742458 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32743974 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32744361 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32744793 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32744810 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32745122 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32745231 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 32745390 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32746049 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32746154 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32746409 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32746470 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32746529 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32746543 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32748856 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32748973 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32749032 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 32749066 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 32749170 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 32749360 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 32749537 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32749932 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32750172 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32750282 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32750312 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32750388 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32750450 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 32750494 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32750733 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 32750775 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32750851 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32751017 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32751042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32751061 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32751181 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32751325 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 32751367 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32751735 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 32751797 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32751939 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32752116 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 32752118 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 32752264 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 32752786 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32752805 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32752812 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 32752988 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32753417 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32753708 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32753727 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32754108 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32754554 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32755576 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32756497 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 32757120 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32757184 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32757236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32757575 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 32757632 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 32757947 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32759367 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32759463 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32760818 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 32761156 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32761555 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32761566 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32761650 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32761803 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32762288 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32762340 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32762522 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 32762592 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32762712 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 32762718 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 32762785 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 32763414 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32763435 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32763521 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 32763571 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 32763840 G T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 32764331 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32764363 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32764562 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 32764688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32764809 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 32764908 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 32765079 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 32765091 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 32765571 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32765726 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32765761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32765767 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32765804 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 32765975 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32766326 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 32766404 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32766754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32766794 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32767044 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32767068 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32767455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32767477 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32767478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32767587 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32767656 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32769494 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32772729 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32772818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32772819 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32772866 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32773176 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32773654 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32773881 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 32776172 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32776896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32777128 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32782500 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32783865 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32784332 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32785618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32786132 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 32786177 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 32791912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32791942 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32792759 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32793726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32795090 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32795646 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32795658 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32795864 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32796432 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 32797471 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32797673 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32800546 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32800610 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32800724 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32803370 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32803742 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32803753 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32803829 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32803917 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 32803918 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 32803964 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32803969 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32803985 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32804099 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 32804232 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 32804254 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 32804296 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32804415 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32804526 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32805182 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32805283 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32805313 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32805339 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32805436 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32805637 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32805989 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32806051 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32806089 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32806101 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32807147 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32807553 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 2 32807803 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 32808149 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32808156 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32808405 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 32808487 T G N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 32808504 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 32808601 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32808670 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 32809819 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32809987 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32810010 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32810379 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32810495 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32810505 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32810520 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32810612 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32810675 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32810919 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32810954 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32810999 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32811165 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32811283 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32811786 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32811787 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32811834 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32811841 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32811939 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32812643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32812713 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32813203 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32813277 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32813285 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32813374 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32813386 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32813411 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32813511 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32813539 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32813570 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32813976 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32814095 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32814150 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32814426 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32814437 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32814544 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32814551 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32814933 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32814981 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32814983 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32815492 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32815561 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32816862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32816903 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32817428 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32817883 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32818144 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32818231 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32818294 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32818302 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32818311 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32818325 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32818419 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32818519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32818623 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32818929 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32819006 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 32819085 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32819128 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32819172 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32819536 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32819667 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32819900 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32820028 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32820536 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32820608 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32820626 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32820627 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32821234 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32821802 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32821935 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32823325 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32824845 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 32825359 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32826977 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 32827024 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 32827750 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 32832373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32832498 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32832599 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32832655 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32833161 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32833303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32833323 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32833405 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32833494 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32833527 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32833555 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32833710 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32833711 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32833920 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32834062 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32834135 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32834167 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32834309 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32834317 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32834382 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32834477 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32835035 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32835131 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32835136 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 32835145 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32835215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32835233 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32835276 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32835311 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32835436 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32835636 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 32835891 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32835905 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32836062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32836240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 32836283 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32836304 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32836402 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32836474 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32836585 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32836591 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32836660 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32837260 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32837465 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32837588 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32837608 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32838308 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 32838419 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32838420 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32840018 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32840032 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32840276 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 32840417 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32841559 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32842932 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32851750 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32852582 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 32852791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32853303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32856186 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32857730 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32857741 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32857868 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32860399 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32860496 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32863040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32863663 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32863887 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32864829 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32864892 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32865006 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32865055 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32865390 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32865391 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32865762 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32865809 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32865900 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 32865918 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32866110 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32866207 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32866423 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32866738 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 32867600 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32868016 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32868098 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32868511 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32868522 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32868570 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32868607 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32868677 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32868901 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32869005 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32869062 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32869208 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32869264 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32869445 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32869517 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 32869789 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32870012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32870211 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 32870915 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32872983 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32873757 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32876152 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32876314 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32876444 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32876812 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32878295 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32879574 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32880117 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32880147 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32880262 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32881212 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 32881317 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32882203 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32882615 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 32884053 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32884462 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32884524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32884566 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32884646 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32884712 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32884980 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32884982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32885160 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32885171 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32885215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32885308 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32885364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 32885381 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32885412 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32885428 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32885576 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32885658 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32886217 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32886953 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32887745 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32888170 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32888268 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 32888291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32888625 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32889408 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 32889422 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32893653 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32894567 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 32895099 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32895802 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32899589 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32902078 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32902963 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32903938 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32906285 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32906457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32906968 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32908547 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 32909296 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32909935 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32911157 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32913198 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32915425 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32917178 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32919363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32920166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32920913 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32921555 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32922789 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32924354 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32924452 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32927785 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32928116 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32930773 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 32931062 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32933186 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32936355 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32937337 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32937823 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32940644 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32948484 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32950879 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32951263 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 32951483 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32951735 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32952428 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32953898 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32956456 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 32957174 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32957288 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32958121 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32958522 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32958670 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32958905 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32958956 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32959438 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 32959772 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32962223 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32962332 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32962390 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 32970256 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32972785 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32976534 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 32976758 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32979240 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32979361 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32979482 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32980956 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32981693 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32983031 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32983074 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 32986248 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 32989400 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 32989997 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 32991208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 32996462 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33000512 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33002315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33007605 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33008579 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 33010737 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33017288 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33017334 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33018722 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33020054 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33020388 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 33020394 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33020630 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33020915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33021437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33021635 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33021706 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33021965 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33022044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33022496 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33022516 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 33023800 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33024752 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 33025086 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 33025373 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33025394 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33025496 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33026916 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33026931 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33027432 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 33027595 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33029578 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33030692 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33030841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33030926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33032236 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33032655 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33033079 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33033263 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33035828 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33036068 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33036185 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33036413 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33036521 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 33037310 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33037364 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 33037811 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33037976 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33038538 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33038711 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33038832 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 33039699 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33040439 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33040945 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33041927 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 33042118 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33042261 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 33043205 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 33043590 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 33045820 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 33046015 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33046971 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33052266 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33052299 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33056392 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33056778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33057043 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 33057284 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33057326 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33057394 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 33058561 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33059092 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33059598 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33063218 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33063493 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33064675 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 33065988 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 33067416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33067547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33067985 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33068592 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33068790 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33072732 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33072987 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 33073161 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33073264 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 33073305 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33075081 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33075195 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33075266 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33075269 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33075572 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 33076389 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 33079124 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33080993 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33081076 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33081130 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33081958 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 33082302 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33082685 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 33082935 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 33083388 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33084678 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33084991 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33085055 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33085064 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33085394 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33085419 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33086821 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33088473 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33089274 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33089596 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33089630 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33089842 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33090373 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33091975 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33094675 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33095628 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33095674 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33096376 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33096535 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33096673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33097009 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33097260 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 33097615 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 33097688 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33098514 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33100455 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33100561 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33100649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33101400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33101544 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33103660 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33104575 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33105323 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 33108303 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33108511 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33108657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33109965 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33113408 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33114390 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33114438 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 33115624 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 33116250 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33116356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33116525 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33117409 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33117492 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33121904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33122447 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33122475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33123538 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 33125586 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33125993 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33126154 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33126316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33127505 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33128060 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 33128196 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33128259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33128283 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 33128397 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 33128416 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 33128827 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33133207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33133436 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 33134201 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 33134363 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 33134783 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 33135146 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 2 33135309 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 2 33138430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33138491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33139078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33139457 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33139538 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 33140878 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33141064 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33142016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33143501 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33144914 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 33146636 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 33146868 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 33147987 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 33148618 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33150585 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33151156 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33151162 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 33151543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33151732 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33153270 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33153862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33154456 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33156965 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33157047 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33157240 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33157604 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33158727 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33161841 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33163468 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33164678 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 33164870 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33165340 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 33165427 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 33165618 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33165819 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33166626 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 33166647 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33166666 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33166762 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33166860 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33166927 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33167153 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 33167161 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 33169207 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33171997 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33172248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33174154 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33175050 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33175186 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33175203 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33175228 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33175244 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33175260 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33175270 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33177779 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33177848 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33177893 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 33180866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33181553 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33183972 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33184808 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33184994 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33185101 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33187475 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 33187581 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 33187718 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 33188296 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 33188336 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33189150 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33189294 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33190039 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33193525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33194642 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33194653 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33195435 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33195833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33197488 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 33197676 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33198099 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33198406 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 33198941 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 33199126 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33199457 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33201502 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33201726 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33203554 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33203558 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33203712 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33206188 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33206273 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33207286 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33208564 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33210058 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33210179 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33210681 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33210970 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33210972 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33210993 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33211080 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33211499 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33211538 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33212365 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33212492 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33212519 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33212589 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33213220 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33213682 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33213921 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 33214141 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 33214265 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33214388 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 33214606 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 33214712 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 33214946 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 33214950 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 33214957 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33216555 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33216642 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 33217501 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33217667 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 33217872 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33218904 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33219869 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 33219907 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33220024 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 33220375 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33221399 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 33221596 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33222785 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33223231 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33223239 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33223359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33223528 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33223595 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33223724 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33223747 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33223749 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 33223892 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33224666 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33224687 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33224801 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33227952 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33228536 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33232176 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33236057 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 33236104 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 33236188 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 33236218 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33236414 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 33236484 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 33236581 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33236969 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33237248 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 33237266 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 33237312 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33237347 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33237359 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33237493 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 33237506 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 33238548 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33238719 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33238762 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33238783 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 33238931 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 33239096 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 33239154 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 2 33239289 G A N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 33239687 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33239690 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 33239699 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 33239740 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 33239781 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33239878 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 33239927 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 33239980 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 33240119 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 33240611 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33240752 G C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 33240958 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 33241278 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 33241293 T A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 33241332 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 33241369 T G Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 33241423 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33241548 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 33241612 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33241665 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 33241751 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33241876 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 33242204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33242238 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 33242312 G C Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 33242315 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 33242804 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 33243022 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33243033 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 33243255 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33243762 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 33243772 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 33243796 A C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 33244117 A G Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 2 33244202 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 33244261 A C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 33244332 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 33244411 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 33244421 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 33244427 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 33247784 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33249415 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33249558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33252340 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33252598 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 33252727 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 33252844 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 33253004 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33253117 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 33253198 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33253391 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 33253504 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33253742 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 33253857 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33254322 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33255910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33256438 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33256717 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33257454 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33258175 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33258603 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 33258630 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 33259148 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 33259676 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33264507 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33268698 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33268705 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33268931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33269034 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33269510 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33271071 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33272824 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 33273395 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33274793 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 33275715 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33275933 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 33275996 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 33280547 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33283994 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33286991 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 33287833 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 33292277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33292362 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33292762 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 33293594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33293670 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33294599 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33296975 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33297552 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33298850 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33299979 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33301333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33303186 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33303684 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 33303764 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33303879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33303880 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33304067 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 33305733 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33306623 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33307607 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33308638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33312559 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33315164 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33317171 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33323040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33323216 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 33328083 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33329690 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33331002 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 33331596 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 33331647 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33332131 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33332445 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33334559 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 33334899 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 33334998 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 33335061 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33335467 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 33335799 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33335831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33336429 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 33336512 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 33336630 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 33336709 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 33336869 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 33336888 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33336893 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 33336911 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 33337038 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 33337083 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33337114 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33337735 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33338957 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33339016 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 33339099 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33340701 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33341027 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 33341732 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 33341826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33341891 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33343197 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 33343462 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 33344503 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 33344612 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 33344613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33345721 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 33345878 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33347195 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33347823 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33347880 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 33348014 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33348077 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 33348235 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 33348236 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 33348439 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33348729 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 33348879 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 33348895 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 33348972 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33348973 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 33349049 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 33349055 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 33349126 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 33349170 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 33349175 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 33349221 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 33349299 A T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 33349308 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 33349348 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 2 33349568 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 33349952 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33350779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33351050 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33351064 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 33351590 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 33351819 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 33351897 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 33351920 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33352004 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33352413 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 33352453 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 33352459 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 33352488 A T Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 33352503 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 33352531 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 33352939 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 33353002 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 33353661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33353786 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 33354131 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 33354336 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33354356 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33354381 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33354417 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33354423 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33354691 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33354835 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33354841 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33354995 G T Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 33355004 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 33355017 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 33355034 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 33355125 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33355154 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 33355165 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 33355177 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 33355348 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33355527 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 33355534 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 33355589 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 33355592 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 33355660 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 33355703 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 33355843 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 33355878 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 33355901 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 33355974 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 33356972 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33357020 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 33357546 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 33357571 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 33357745 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33357763 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 33357815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33357851 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 33358059 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33358539 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33358772 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 33360711 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 33360793 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33360884 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33360950 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33362693 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33362798 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33363089 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33363705 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 33364047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33364650 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33364651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33364691 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33364952 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33365484 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 33365642 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33366861 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 33367006 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 33367042 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 33367047 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 33367270 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 33367330 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 33367953 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 33367964 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 33367970 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 33368345 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 33368367 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 33368373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33368518 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33368561 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 33368651 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33368653 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33369126 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33369161 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33369433 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 33369462 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 33369618 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 33370097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33370129 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33370171 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 33370542 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33370808 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33371279 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 33371639 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 33371908 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33372024 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33372161 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 33372167 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 33372472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33372552 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33372561 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 33373239 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33373549 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 33373586 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33373743 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33374647 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33375052 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33375101 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33375268 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 33375301 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 33375857 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33376074 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 33376717 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33376791 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 33376926 C T Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 2 33376969 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 33376993 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 33377033 A C N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 33377925 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 33378582 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 33382201 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33384208 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33384273 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33384277 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33384358 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33384450 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33384458 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33384599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33384682 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33384714 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33384801 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33384844 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33384905 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 33384913 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 33385046 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33387572 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33388218 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33388279 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 33388661 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33391114 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33391259 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33391388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33391844 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33391852 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33391885 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33392461 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33392665 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33393361 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33394105 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33394302 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 33394746 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33394949 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33396299 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33396600 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33396654 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33396900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33396959 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33397397 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33397780 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33397870 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33398335 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33398855 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33398955 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33400502 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33400845 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33401486 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33401820 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 33401863 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33402062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33402240 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33402951 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 33403702 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33406441 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 33406576 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33407801 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 33407911 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 33408116 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33409840 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 33410575 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 33413505 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 33413915 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33415948 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33419541 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33420237 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33420910 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33421658 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33421900 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33421950 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 33421984 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33422261 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33425034 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 33425052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33425054 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 33425853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33426142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33426169 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33426252 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33426313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33426380 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33426476 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33426583 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33426598 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33426611 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33426616 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33426629 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33426631 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33426753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33426813 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33426852 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33428232 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 33429282 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 33429640 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 33429799 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 33429838 G T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 33429869 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 33430022 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 33430272 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 33430799 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33430844 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 33431954 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 33433511 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 33435343 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33435427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33436827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33437883 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33438722 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33438831 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33438897 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33439831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33439878 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33441187 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33446026 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33447025 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 33447712 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 33447714 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 33448198 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 33451013 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33455764 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33456407 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33457956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33458732 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33459937 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 33460909 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33461882 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 33462313 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33462478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33464343 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 33464546 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33464602 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33464627 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33466206 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 33466333 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33466353 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33466839 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33467886 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33467923 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33467980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33468103 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33468182 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33468542 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 33468746 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33469151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33469376 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33469819 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 33470212 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33470297 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33470496 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33470791 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33472836 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33472903 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33474593 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 33474992 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33475898 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33477225 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33477729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33477778 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33477820 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33477854 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33477976 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 33478085 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 33478109 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 33478158 A C N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 33478227 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33478256 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33478447 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33478747 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33480208 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33481454 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33482715 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33483335 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33483854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33485025 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33487170 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33488017 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33488313 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33489639 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33490354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33493803 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33494973 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33499965 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33500720 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33500737 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33502802 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33509368 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33511081 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 33511144 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33512403 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 33512695 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33513396 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33513734 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 33513968 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33514868 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33514885 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33516462 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33516811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33517311 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 33518019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33518037 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 33518324 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 33518403 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33518495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33518506 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33518509 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33518543 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 33518682 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33518750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33518853 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33519154 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33519378 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33520141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33520864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33525221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33525629 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33526302 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33526760 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33527304 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33527981 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33528126 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 33528385 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 33529011 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 33529147 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 2 33530374 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 33530515 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 33530772 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 33530847 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 33531384 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33531407 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33531535 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33531610 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33532034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33532149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33532164 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33532245 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33533177 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33533243 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33533249 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33533276 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33533381 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33533382 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33533427 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33533460 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33533485 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33533506 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33533543 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33533663 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33533836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33534365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33534383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33534403 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33534873 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33535005 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 33535028 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33535041 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33535130 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33535220 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 33535297 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33535305 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 33535583 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 33535607 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33535791 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33537025 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33537219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33537379 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33537590 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 33538588 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33538594 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33538725 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33539123 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33539320 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 33539504 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 33539921 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33540053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33540153 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 33540211 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 33540514 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 33541663 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 33541682 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 33541709 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 33541743 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 33541755 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 33541790 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 33541863 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 33541891 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 33542173 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 33542270 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 33542308 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 33542316 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 33542368 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33542520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33542534 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 33542549 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 33542581 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 33542613 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 33542846 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33543397 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 33543866 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33544369 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33545875 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 33546596 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33546820 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 33547013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33547157 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33547187 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33547279 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 33547353 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33548115 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33548299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33548317 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 33548640 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33548652 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 33548670 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 33548847 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33548899 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 33548921 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 33549014 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 33549153 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 33549295 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 10 8 2 6 1 2 33549452 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 33549498 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 33549525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33549531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33550407 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33551106 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33551897 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 33552298 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33552739 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 33553391 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 33553492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33553507 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 33553519 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33553629 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 33553788 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 33553871 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33553927 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 33553967 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33554084 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 33554110 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33554133 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33554148 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33554170 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33554308 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33554324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33554377 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 33554454 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33554480 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33554491 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33554964 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 33555090 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 33555106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33555150 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33555434 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33555813 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33556834 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 33556936 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33557264 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33557709 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33557781 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 33557861 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 33557968 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 33557990 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33557997 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33558058 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33558103 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 33558872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33559324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33559327 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 33559376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33560177 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 33560278 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33560288 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33560540 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 33560912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33561377 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33561394 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33562011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33562306 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33564100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33564428 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 33565316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33566181 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 33566309 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33566344 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33566396 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33566496 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33566716 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 33566740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33566890 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33566896 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 33567142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33567183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33567260 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 33567507 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 33567516 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 33567578 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 33567630 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33567636 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33567647 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33567932 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 33568015 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33568126 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 33568211 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33568265 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 33568395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33568437 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33568488 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33568533 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 33569130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33570477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33573438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33573466 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33575445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33575738 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 33576827 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33579517 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 33579561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33579792 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 33579883 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33581881 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33581921 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33582208 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33582210 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 33583065 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33583839 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33584775 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 33585069 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33585286 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 33585386 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 33585785 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 33586008 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 33586011 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 33586112 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33586235 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33586281 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33586298 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 33586594 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33587095 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 33587142 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 33587232 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 33587272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33587483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33587496 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 33588543 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 33589031 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33589361 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33589396 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 33589408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33589422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33589577 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 33589608 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 33589716 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 33589924 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33590126 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33590600 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33590842 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 33590850 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 33591194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33591197 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 33591634 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33591639 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33594013 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33595548 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 33596583 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 33597232 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33597500 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33597879 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33598148 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33598238 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33598484 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 33598531 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33598562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33598630 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33598703 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 33599262 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 33599917 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33599997 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 33600673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33600710 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 33601133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33601257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33601468 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33601483 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33601560 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33601713 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33601738 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 33601785 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33601804 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33601817 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33601896 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33601901 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33601938 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 33601973 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33601991 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33602336 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33602428 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33603127 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33603217 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33603537 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 33604018 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33604154 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33604192 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33605510 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33605512 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33605639 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33605764 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33605881 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33605921 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33605938 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33606381 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33606400 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 33606474 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33606578 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33606810 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33607110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33607708 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33607844 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 33609216 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33609243 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 33610929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33611189 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 33612495 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 33613705 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 33613972 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 33614870 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33614914 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 33615589 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33615772 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33616653 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 33616995 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33617172 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33617475 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33617485 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 33617690 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33617737 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33617828 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33617883 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33617917 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33618091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33618591 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33618667 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33618766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33618780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33618793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33618843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33618888 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33618979 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33619068 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33619168 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33619743 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 33624396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33625686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33625819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33627468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33629007 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33629421 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33630004 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33630029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33630476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33631373 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33632507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33632983 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33633337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33634533 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33636619 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33637971 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33638308 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33638362 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33638561 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33638744 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33639588 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33639616 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33639916 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33640113 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 33640406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33640631 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33641029 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 33641050 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33641211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33641598 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33641715 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33641770 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 33641788 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33641868 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33642219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33642686 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 33642892 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33643048 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33643167 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33643268 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 33643313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33643343 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33643500 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 33643591 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 33643614 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33643643 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33643662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33644001 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 33644462 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33645414 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33645567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33646212 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33646271 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33646274 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33646335 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 33647327 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33648724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33648822 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 33649475 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33649597 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33649716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33649836 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 33650037 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33650129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33650392 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33650516 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33650657 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33653086 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33653148 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33654400 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 33654431 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 33654570 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33654695 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33655850 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33656441 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33657261 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33657594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33659020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33659134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33659310 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 33659445 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 33659504 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 33660260 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 33660543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33660712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33660769 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 33660936 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33660965 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 33662080 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33662273 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33662304 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33662450 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33662451 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33662972 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 33663855 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33667025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33667505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33667551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33669030 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33669040 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33669279 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 33669292 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 33669561 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33669586 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 33669861 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33669876 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 33669926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33670006 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33670369 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33671349 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33671760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33671817 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33671911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33671921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33672126 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33672157 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33672174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33672183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33672238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33672262 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 33672276 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 33672293 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 33672617 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33674073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33675195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33675559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33678030 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 33678198 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33678759 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33679470 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33679517 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33680101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33680139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33680180 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 33680533 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 33680591 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 33680615 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33680783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33681291 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33681379 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33681392 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33681412 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 33681548 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33681575 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 33681951 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 33681968 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 33682017 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 33682103 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 33682166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33682292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33683355 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33683913 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33683916 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 33684781 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33685620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33686281 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33688113 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33688142 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33688161 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33688283 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33688599 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 33688812 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 33690546 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 33690624 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33690762 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 33691001 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33691067 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33691091 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33691528 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33691546 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33691814 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33691943 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33692024 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 33692031 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 33692206 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33692301 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 33692334 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 33692494 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33692730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33693202 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33693230 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33694511 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 33695250 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 33696392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33698046 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 33699846 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33701456 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33701644 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 33702150 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33702926 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 33703629 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33703739 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 33703753 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33703836 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33704268 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 33704338 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 33704392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33704502 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 33704886 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33705064 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 33705195 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 33705212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33705243 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33705259 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33705311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33705313 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33705528 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 33705551 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 33705554 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33705588 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 33705615 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 33705663 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 33705736 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33705873 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 33706066 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 33706083 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 33706185 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 33706290 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 33706370 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 33706385 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 33706391 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 33706481 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 33706530 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 33706592 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 33706602 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 33707268 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 33707353 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 33707546 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 33707652 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 33707677 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 33707813 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 33707834 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 33707939 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 33707973 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 33708321 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33708338 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33708558 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 33709581 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 33709690 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33709724 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 33709783 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 33709858 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33710072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33710085 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 33710252 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 33710315 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 33710327 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 33710372 G A N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 33710399 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 33710550 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 33710591 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33710682 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33710887 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 33710918 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 33710924 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33711092 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 33711137 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 33711167 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 33711209 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 33711283 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 33711372 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 33711493 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33712093 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 33712462 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 33712649 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 33713021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33713993 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33714326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33714813 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 33715894 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33715911 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33716336 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33716379 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 33718562 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 33718710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33718715 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33718843 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33718872 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33718881 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33719007 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 33719096 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 33719359 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 2 33719429 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 33719444 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 33719566 C T N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 33719588 T C N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 33719800 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33719828 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 33720098 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33720113 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33720137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33720180 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33720224 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 33720252 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33720326 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33720486 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33720676 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 33720739 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33720740 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33720976 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 33721076 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 33721506 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33721527 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33721551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33721639 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33721653 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33721681 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33721704 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 33721746 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33721831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33722008 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 33722268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33722302 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33722567 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33722640 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33722773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33722800 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33722931 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 33723187 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 33723265 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 33723286 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 33723414 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33724474 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33726068 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33726967 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33727667 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33728124 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33728142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33729023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33729044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33729065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33729128 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33729228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33729250 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 33729436 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 33729458 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33729696 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33729728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33729832 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 33729845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33729903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33730057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33730431 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 33730608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33730638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33730805 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 33730898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33731435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33731448 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33731461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33731836 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 33731917 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33732014 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 33732135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33732351 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33732459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33732778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33733112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33734156 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33735132 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33735207 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33735682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33735897 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33736111 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33736140 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 33736160 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 33736164 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 33736334 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33736742 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33737075 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 33737110 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 33738147 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33738284 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33738680 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33738830 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 33739089 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 33739316 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33739392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33739408 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33739802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33739915 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 33739953 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33740200 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33740352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33740373 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33741237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33741766 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 33743352 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 33743764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33744035 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33744565 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33744764 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 33745733 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33746764 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33747310 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 33747840 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33751130 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33751178 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33751311 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33752255 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33753393 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 33754138 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 33754206 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 33754537 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33754724 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 33754736 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 33754830 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 33754858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33755077 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33755368 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 33755461 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33755739 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33756077 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33756144 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33756194 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 33756258 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 33756316 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33756331 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 33756365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33757120 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 33757363 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33757590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33758945 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 33759323 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33759424 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 33759702 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33759724 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 33759812 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33759825 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33759891 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 33759996 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 33759997 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 33760030 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 33760039 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 33760053 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33760159 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 33760224 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 33760239 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33760313 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 33760423 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 33760439 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 33760451 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 33760525 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 33760582 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 33760608 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 33760642 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 33760819 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 33760856 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 33760971 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33762036 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33762559 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33762791 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 33763363 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33763436 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 33763825 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33767276 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 33767570 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33770052 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33770984 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33771156 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33772204 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 33773811 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33774907 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33774913 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33775354 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33775619 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33775783 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33777403 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 33777710 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 33777786 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33778486 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 33778665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33778830 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 33779977 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 33780274 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33780316 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33780365 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 33780409 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33780857 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 33782006 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33783169 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 33783646 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33784294 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 33784295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33784947 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 33785083 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 33785086 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33785106 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33785112 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 33785185 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 33785214 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 33785217 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 33785236 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33785242 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 33785448 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33785902 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 33786183 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 33786488 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33786542 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33786646 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 33786775 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 33786894 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 33786929 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 33787864 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 33788025 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 33788029 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 33788238 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 33788348 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 33788357 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 33788864 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 33789222 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 33789286 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 33790457 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33790555 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 33790716 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33790781 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33791859 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 33792126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33792298 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33792587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33793614 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 33794317 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 33797705 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 33798061 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 33798398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33801370 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 33802109 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 33802153 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 33802157 G T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 33802207 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 33802374 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33802392 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 33803123 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33803272 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 33803749 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33805163 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33805299 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33805443 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 33808951 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 33809392 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33810454 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33810626 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 33810672 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 33810784 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 33811120 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 33811254 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 33811746 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33811850 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 33811851 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 33812309 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33812687 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 33812763 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 33812867 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33813116 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 33813614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33813746 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33813884 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 33813926 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 33813930 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 33814091 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33814173 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 33814295 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 33815023 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 33815036 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 33815071 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 33815084 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 33815121 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 33815239 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 33815934 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 33816161 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 33816457 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 33816529 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 33816664 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 33816979 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 33816991 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 33817001 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 33817050 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 33817202 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 33817509 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33817707 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33817783 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 33818232 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 33818286 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 33818357 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 33819086 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33819234 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 33819260 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 33819271 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 33819606 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33819801 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33819965 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 33820072 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 33820141 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 33820280 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 33820389 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 33820403 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 33820796 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 33820799 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 33820893 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 33821148 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33823338 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 33823943 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 33824241 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 33824275 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 33824283 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 33824297 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 33824359 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 33824375 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 33824586 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 33827046 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33827184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33827729 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33829472 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33830127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33830162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33830566 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33831044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33831327 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 33831807 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 33832312 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33832950 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 33833418 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 33834823 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33834852 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33835269 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33836053 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33836131 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 33836154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33836308 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33836410 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33837210 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33837917 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33839381 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 33839739 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 33841427 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33841442 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33842236 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33842380 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33842473 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33842685 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33842786 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 33842806 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 33842807 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 33842840 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 33842867 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 33843111 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 33843176 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 33843209 C A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 33843427 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 33843467 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33843602 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 33843613 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33843614 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 33843796 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 33843800 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 33843964 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 33843989 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33843994 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 33844105 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 33844112 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 33844185 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33844287 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 33844324 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 33844339 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 33844801 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 33844807 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33845592 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33845666 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 33845862 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 33845867 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 33845944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33847396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33847974 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 33848275 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33848960 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33848988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33850139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33850307 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33850564 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33852390 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33857461 A T Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 33858516 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 33858681 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 33859821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33861797 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 33861906 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 33863767 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 33864448 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33867725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33868737 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33869148 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33869867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33870522 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33871254 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33872371 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33873415 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33873539 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33873736 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 33874585 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33876087 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33877863 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 33881068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33881954 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33882019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33882501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33883552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33883812 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33883893 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33884168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33884832 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 33886384 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33886389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33886833 C G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 33886843 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 33887272 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 33887508 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 33887693 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33887911 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33888004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33889137 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33889819 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33889935 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33889938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33889966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33890104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33890133 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33890495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33891095 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33891098 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33891174 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 33891224 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 33891289 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 33891342 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33891368 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 33891488 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 33891511 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33892858 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33892863 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33892919 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33893046 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 33893100 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 33893133 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 33893252 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 33893611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33893640 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 33893669 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33894212 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33894474 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33894554 G C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 33895409 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33896775 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33896790 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33896805 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33897025 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33897026 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 33897082 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33897105 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33899420 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33900052 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33900254 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 33900326 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 33900429 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 33900530 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 33900653 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 33901022 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33901150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33901447 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 33901914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33902127 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 33902421 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 33902603 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 33902659 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 33903219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33909082 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 33909204 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33910106 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33910306 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33910341 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33910865 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33911728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33912345 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 33912798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33913506 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33915739 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33915893 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 33916065 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 33923652 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33925879 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 33926416 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 33926419 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 33926536 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33926674 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 33926876 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33928511 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33928518 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33928715 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33928756 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33928761 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 33928781 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33928788 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33928815 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 33928866 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 33928925 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 33929009 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33929206 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 33929283 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33929284 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33929295 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33931156 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33932480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33934588 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33934692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33935383 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 33936737 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 33936781 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33943034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33946374 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 33947037 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 33947181 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 33947259 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 33947330 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 33947333 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 33947411 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 33947459 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 33947566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33947581 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 33947798 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 33948387 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33948388 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33948493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33948502 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33948698 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 33948710 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 33948723 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 33948760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33949220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33949259 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33949968 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 33950456 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 33950481 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33951884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33951889 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33951917 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33951951 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33951973 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 33952255 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33952268 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33952689 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33953261 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33953269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33953326 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33954714 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33955698 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 33955931 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33955999 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 33956682 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 33957909 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33958086 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 33958926 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 33959069 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33960237 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33960446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33961718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33962505 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 33963885 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 33964350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33964888 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 33965468 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33966415 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 33967445 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 33967667 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33969562 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 33969997 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33970046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33970361 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 33970380 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 33970861 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 33971076 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 33971154 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 33971198 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 33971528 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 33971616 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33971643 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33971656 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33971662 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 33971740 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 33971750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33971850 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 33972385 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 33972653 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 33972666 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 33972773 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 33973599 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 33973645 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 33973652 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33973665 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 33973729 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 33974029 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 33974139 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 33974212 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 33974358 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 33974412 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 33974448 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 33974809 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33976213 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 33977768 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33977826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33980440 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33980506 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33984597 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33985145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33985353 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33985369 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33985374 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33985515 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33985730 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33985747 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33985891 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 33985950 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33987250 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33988415 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 33989578 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 33990050 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33990287 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 33990444 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 33990451 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 33990455 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 33990585 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33990626 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 33990653 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 33990719 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33990893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33991310 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 33991370 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 33991385 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 33992248 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 33992284 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 33993262 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 33993524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33993713 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 33994221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33995555 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33995883 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 33996373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33996492 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33996681 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33996913 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 33997597 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 33997615 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 33997658 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 33997705 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 33997810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 33997892 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 33999608 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34000545 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34002533 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34004324 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34004528 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 34005835 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 34007118 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34008070 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 34008139 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 34008189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34008213 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 34008356 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 34008820 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34008986 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34009248 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34009730 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 34009833 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 34010133 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 34010597 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34010637 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34011282 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34011626 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34012310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34012337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34012645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34013030 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 34013301 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34013426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34013487 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34013603 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 34013719 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34013863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34013916 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 34014096 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34014168 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 34014255 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 34014511 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34015798 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34016176 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34016400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34016440 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34016448 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34016620 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 34016643 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 34016648 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 34016707 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34016832 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 34017594 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34017618 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34017620 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34017817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34017820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34017898 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34017929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34017949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34017963 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34018124 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 34018338 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 34018389 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 34018406 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 34018572 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 34018693 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 34018793 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 34018894 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 34018966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34019165 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 34019184 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 34019330 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 34019331 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 34019808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34019817 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 34019833 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 34019858 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34019873 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 34019889 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 34020363 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34020782 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 34020882 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34021563 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34021585 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 34021671 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 34021682 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 34021747 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34021774 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 34021889 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34022099 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34023120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34023211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34023937 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34024015 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34024029 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34024108 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 34024139 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 34024331 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 34024492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34024561 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34025029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34025082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34025233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34025479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34025536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34025776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34025814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34026200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34026357 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34026441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34026575 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34026798 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34027735 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 34027969 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34028849 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34029470 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34029622 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 34031835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34032196 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34033436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34034156 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34035196 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34035283 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34035592 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34035666 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34036108 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34036262 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34036295 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34036378 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 34036392 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34036445 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34036451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34036459 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34036613 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 34036856 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34037067 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34037714 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 34038359 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34038514 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 34038818 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34038830 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 34038926 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 34039017 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34039053 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 34039239 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34039482 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34040133 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 34040172 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 34040281 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34041018 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 34041046 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 34041387 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 34041601 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 34041626 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 34041722 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34043905 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34043935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34043940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34044072 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34048022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34048051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34048061 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34049076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34049419 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34049592 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34049761 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 34050601 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34051124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34051371 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34052089 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34057306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34057996 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34058243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34059530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34059985 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34060016 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34060061 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 34063029 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34064470 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 34065370 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34065667 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 34066168 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34066820 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34069015 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34069181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34069247 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 34069497 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 34069648 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 34069673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34069761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34069900 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 34069939 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34069977 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34070078 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34070754 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34071393 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34072383 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 34074775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34076177 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34076224 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 34076250 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 34076276 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 34076593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34076622 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 34076771 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34076821 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34076905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34076954 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34077653 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34077700 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 34078166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34078475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34078613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34078691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34078768 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 34078818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34078854 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 34079381 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34079689 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 34080304 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 34080775 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 34081287 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34082773 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34082778 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34083545 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34084489 G T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 34084849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34088338 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34089447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34089856 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34090725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34090817 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34092148 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34092258 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34092935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34093052 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34093672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34095849 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34097305 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34101006 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 34101019 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34101873 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34102200 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34102686 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 34103154 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 34103466 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 34104779 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34105957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34105982 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 34108040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34109186 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34110418 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34111223 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34115396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34115492 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34116720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34117012 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34117401 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34117523 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34118054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34118933 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34120323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34121047 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34121997 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34122198 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34123977 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34129409 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34130609 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34132829 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34135175 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34137602 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34137728 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34137858 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34139408 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34140243 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 34141242 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34141366 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34141535 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34141667 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34142055 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34143018 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34147317 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34148530 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34149253 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34149690 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34150534 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34152815 A T N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 2 34153196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34153688 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34154823 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34155622 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34155643 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34156283 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 34156896 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 34157242 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34157507 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34158153 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34160011 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34161515 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34161791 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34162630 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 34163287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34166499 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 34168686 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34169955 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34170387 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34170936 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 34172666 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 34174830 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34175916 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34176585 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34178841 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34179464 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34181045 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 34181173 G A N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 34182605 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34185318 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34193030 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34195053 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 34195184 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34198480 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34200344 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34201845 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34205163 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34209397 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34213935 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34216351 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34218794 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34220484 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34223667 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 34223864 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34224628 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34224947 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34225147 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34226316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34226785 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34226793 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34229435 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34229928 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 34231137 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 34231298 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34231575 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34232752 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 34236106 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34236993 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34237330 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34237882 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34238171 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34238874 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34239074 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34240706 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34241090 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 34241091 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34241195 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34242618 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34242810 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34243800 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34243918 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34244886 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 34244996 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34245578 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 34246718 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 34246854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34247052 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 34247357 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34247692 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 34247699 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 34247710 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34247729 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 34248194 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 34248228 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 34248244 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 34248324 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 34248856 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 34248882 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 34248933 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 34248963 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 34248964 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 34248999 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 34249023 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 34249040 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 34249075 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 34249082 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 34249098 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 34249169 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 34249183 A T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 34249242 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 34249422 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 34249459 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34249671 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 34249753 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34250117 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 34250177 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34251576 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 34252532 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34252965 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34253007 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34253273 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34253591 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 34253766 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34253803 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34253814 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34253822 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34253845 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34253882 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34253950 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 34254147 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34254201 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34254240 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34254326 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34254552 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34254578 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34254714 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 34254863 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 34255106 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 34255165 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 34255231 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34255876 C A N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 2 34256121 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34256186 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 34256448 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34256475 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 34256485 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34256497 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34256705 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 34256727 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 34256748 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 34256752 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34256777 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 34256828 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34256973 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34257048 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34258379 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34258460 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 34258817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34261985 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34263672 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 34265194 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 34266150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34269523 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34275190 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34276140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34276371 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 34278264 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34281173 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34281453 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34281584 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 34286111 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34293924 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34295337 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34297128 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 34299042 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34299072 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34299514 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34299680 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 34300190 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 34300480 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 34301035 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34301202 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 34301762 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 34303110 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34303840 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34305637 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34306004 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34306026 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34306269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34306819 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 34306988 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34307846 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 34308539 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34308664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34309486 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34309533 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34309834 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34310286 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34310845 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34310866 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34310929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34310950 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 34314331 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34314463 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34314524 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34316205 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34316280 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34316294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34316434 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34316498 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34316594 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34316620 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 34316970 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34317293 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34317483 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34317535 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 34317670 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34318874 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34319477 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34320516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34320548 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34321817 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34322140 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34322590 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34323464 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34323785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34324282 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34325267 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34325608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34326112 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34326141 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34327980 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34328265 G T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 2 34328772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34328893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34328953 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 34330330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34330331 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34330576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34330614 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34330747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34331125 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34331254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34333324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34333393 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34333498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34333704 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34333874 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34334252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34335023 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34335044 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34335756 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34335810 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34336911 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34337364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34339742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34340033 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34340727 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34340775 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34340879 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 34341729 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34341831 G A Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 34342417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34342516 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34342654 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34343137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34345118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34346178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34346219 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34346221 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34347412 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34347644 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34349679 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34350689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34351471 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34351516 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34352417 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34352665 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34353542 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34354471 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34355439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34359160 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34359163 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 34359175 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34359199 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34359652 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 34359700 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34360122 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34360143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34360749 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34361005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34361218 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34361525 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34362464 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34363718 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34366188 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34369148 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 34369294 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34370614 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34370952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34371401 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34371728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34372444 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34372727 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34372978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34373247 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34373380 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34373519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34373523 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34373714 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34373764 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 34373828 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34375287 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34375702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34376329 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34378323 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 34378768 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34378783 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 34378804 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34379076 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34379535 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 34379618 G T Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 34379880 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34380237 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34380382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34382105 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34382309 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34382994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34383302 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34383901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34384265 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34384557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34385003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34392129 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34392715 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34393667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34396553 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34397028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34398233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34398289 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34398856 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34399032 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34400464 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34400479 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34401208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34401250 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34401955 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34402284 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34402382 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34402517 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34402760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34403325 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 34403411 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34403553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34403561 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34404123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34404930 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34405094 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 34405944 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34407062 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 34407741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34408749 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34408977 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34409271 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34409646 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34412159 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34413512 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34413695 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34413754 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34413959 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34414016 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34414162 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34414256 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34414391 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 34414431 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34414522 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 34415443 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34415557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34417321 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 34417773 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34417818 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34417916 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34417992 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34418088 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 34418271 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34418272 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34421250 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34421767 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34423452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34423536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34424255 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34425087 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34425539 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34425545 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34425963 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34426197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34426213 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34428388 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34428494 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34429697 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34429702 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34429988 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 34430949 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34432749 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34432771 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34432904 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34433921 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 34433926 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 34433936 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 34433957 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34434232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34434535 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34434754 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 34434979 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34435121 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34435126 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34435149 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34435228 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34437324 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34438413 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34438740 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34439773 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34439877 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 34439984 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34440007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34440411 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34440754 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34440849 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34440904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34440939 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 34440940 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 34441362 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 34442031 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 34442120 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34442175 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34442195 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34442939 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34443711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34443748 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34444079 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 34444114 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34444151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34445019 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34445376 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 34445534 T C Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 34445848 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34446251 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34446301 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34446457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34446585 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 34446630 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34446885 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 34446905 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 34446954 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34447626 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 34447787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34447790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34447801 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34447873 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34447889 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 34448105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34448293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34448331 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34448345 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 34448561 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 34448570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34448587 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 34448605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34448642 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34448691 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34449048 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34449149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34449372 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34450304 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34451625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34451784 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 34451953 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 34452106 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34453019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34453121 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34453158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34453298 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34453983 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 34455078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34455424 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34455452 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 34455480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34455495 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 34456182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34456384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34456402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34456671 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 34456871 C T N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 34456943 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 34456984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34457059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34458120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34458478 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34458770 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 34458949 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34459018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34459461 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34459641 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34460409 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34460795 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34461013 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34461623 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34462313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34462394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34462469 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 34462803 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 34462826 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 34463087 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 34463467 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 34463489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34463528 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34463627 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34463635 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34463927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34464124 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34464137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34464445 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34464581 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 34465220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34465394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34465590 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34465655 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 34467067 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34467228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34467546 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34468182 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34468460 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34468626 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 34468750 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 34468777 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 34469024 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34469202 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34469275 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34469297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34469682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34470088 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34470386 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34470838 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34470847 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34470867 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34471629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34473693 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34476226 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34476241 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34477352 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34477542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34478176 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 34478284 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34478824 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34478981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34480536 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34481319 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34481646 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34481958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34482728 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34483132 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34483455 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34484182 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34484311 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34484641 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34487088 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 34487094 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34488003 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34488128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34488569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34488706 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 34488933 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34490051 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34490494 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34491039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34491500 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34491948 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 34492011 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34493254 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34493330 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 34493419 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34493542 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34493637 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 34493668 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34493772 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 34493828 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 34493873 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 34493897 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 34494039 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 34494062 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34494231 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 34494265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34494378 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34494876 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34495049 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34495293 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34495307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34495316 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34495406 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34495780 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34496434 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34497115 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34498252 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34498588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34499896 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34503114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34503544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34504079 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34504253 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 34506389 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 34506411 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34506808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34507412 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34508029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34508558 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34508561 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 34508765 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34508981 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34509216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34509298 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 34509305 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 34509505 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34509611 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34509649 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 34509670 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 34509844 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 34509938 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 34509958 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34510007 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 34510287 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 34510405 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 34510460 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34510540 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 34510560 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 34510618 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 34510723 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 34510746 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 34510973 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 34511100 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34511415 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34512515 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 34512576 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 34512587 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 34512647 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 34512706 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 34512732 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34512941 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 34512977 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 34513033 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 34513325 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 34513415 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 34513435 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 34513512 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 34513591 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34513592 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34513630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34513658 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 34513670 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 34513690 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 34513731 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34513735 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34513765 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 34513798 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34513823 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 34513879 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 34514068 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34514069 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34514165 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 34514597 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 34514599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34514705 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 34514713 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 34514767 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 34514787 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 34514838 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 34514911 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 34515257 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 34515328 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 34515385 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 34515441 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 34515799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34515801 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34516058 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34516066 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34516091 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34516101 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34516147 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34516272 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34516450 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34516484 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34516493 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34516519 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34516645 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34516666 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34516696 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34516714 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34516747 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34516752 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34516876 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 34516982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34517017 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34517041 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 34517059 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34517068 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34517073 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 34517389 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34517499 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 34517514 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 34517539 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 34517614 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 34517654 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 34517656 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 34517696 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 34517882 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 34518014 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 34518444 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34518648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34518664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34518693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34519140 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34519205 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 34519481 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34519790 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 34519846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34520403 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 34520525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34520693 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34520742 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34521549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34521969 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34521979 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34522038 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 34522199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34522216 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34522525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34522785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34523000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34523002 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34523458 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34523882 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34524018 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 34524186 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34524194 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34524250 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 34524434 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 34524477 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34525007 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 34526362 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34526441 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 34526546 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 34527130 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 34527481 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34527826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34528773 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34528803 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34529692 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34529774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34530068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34530952 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34531008 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34531531 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34532864 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34533536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34537060 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 34538036 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34538092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34538137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34538144 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34538406 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34540421 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34540794 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34541343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34541476 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34542976 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34544722 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 34546007 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34546296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34547796 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34550368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34550381 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34550573 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34551696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34551993 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34552366 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34552554 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34553064 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 34553305 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 34554047 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34555795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34556559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34557508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34557896 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34557897 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34558408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34558628 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34559179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34560140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34560278 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34561530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34561820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34561961 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 34561986 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34562565 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34562928 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34564834 C G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 34567389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34568942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34569119 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34570828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34572515 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34572546 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34572627 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34575445 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34577765 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 34578075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34578468 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 34578608 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34579046 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34579279 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 34580360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34580539 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 34581699 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34582494 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34585080 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34585531 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 34585864 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34586864 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 34587191 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 34589055 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34589264 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34589785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34589950 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34590607 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34591557 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34591865 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34592069 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34592735 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34594399 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34594886 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34595286 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 34595798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34596402 A T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 34598275 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34598590 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 34598916 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34599031 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34599132 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 34599587 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34599656 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 34600227 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34600285 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34602153 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34602540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34604220 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34604610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34604966 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 34605451 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 34607916 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34610785 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34612024 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34612234 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34613531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34613623 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 34617404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34617445 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34617586 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 34617804 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 34618023 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 34618033 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 34618108 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 34618204 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 34618702 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 34618735 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 34618796 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34618798 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 34619273 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 34619620 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34621354 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 34621369 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34621599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34621793 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34622020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34622049 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 34623716 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34624789 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34624861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34625106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34625229 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34625485 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34625696 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34626071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34626423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34626466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34627401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34628358 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34628627 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34628651 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34628842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34629065 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34629181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34629336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34629391 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34629747 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34630022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34630333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34630343 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34630710 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34630764 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34630871 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34631246 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34631378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34632073 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34632162 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 34632307 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34632549 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 34632698 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 34632881 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34632913 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 34632927 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 34633205 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34633236 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34633399 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34633518 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 34633675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34633800 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34633896 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34634299 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34634387 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34634522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34634942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34635095 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34635286 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34635525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34635531 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34636092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34636342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34636355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34636469 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34636618 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 34636945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34636960 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34637037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34637288 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34637579 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34637629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34637747 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34637773 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34638003 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 34638215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34638251 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34638295 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 34638326 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 34638380 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 34638494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34638514 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 34638638 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34638689 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34638713 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34638750 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34638812 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34638921 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34638969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34639044 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34639047 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34639285 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 34639349 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34639350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34639501 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34639556 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 34639682 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34639912 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34639921 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34640196 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 34640245 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 34640256 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 34640347 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34640368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34640381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34640401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34640415 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34640836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34640907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34641164 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34641289 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 34641299 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 34641759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34641883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34641934 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 34642010 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34642082 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34642084 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34642097 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34642384 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34642432 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34642522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34642529 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34642548 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34642552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34642621 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34642665 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34642714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34642759 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34642760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34642891 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34642936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34643063 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 34643073 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 34643151 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34643352 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34643592 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34643917 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34643969 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34643994 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34644078 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34646513 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34646754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34647636 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 34650901 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34651190 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 34652938 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34653463 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34653775 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 34653879 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34653880 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34653919 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34654208 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34654400 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34655192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34655347 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34655392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34656492 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34656518 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34656565 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34657396 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34657472 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34657756 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34658060 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34658203 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 34658678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34658742 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34659904 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34660120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34660155 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 34660457 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34662317 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34662786 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34663274 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34663343 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34664002 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34665076 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 34665328 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 34665446 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34665467 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34665715 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34666362 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34667363 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 34667814 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34668766 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34668779 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34669407 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34669409 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 34670092 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34670106 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34670426 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34670456 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34670717 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34670988 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 34671239 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 34671266 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34671795 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34672014 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34672115 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 34672134 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 34672639 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34672801 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34673046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34673187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34674077 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34674395 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34674676 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 34674949 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34675014 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34675180 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34675233 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 34675263 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34675650 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34675950 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 34677081 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34677392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34677910 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34679347 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34679513 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34679629 C A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 34679683 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34679702 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34679755 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34679758 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34679936 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34680084 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34680095 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34680125 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34681858 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34681912 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34681938 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34682824 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34683046 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34683765 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34683812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34684391 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34684557 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 34685017 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 34685189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34685366 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 34685611 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 34685762 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 34685987 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34686336 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 34689136 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34689364 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 34689425 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34689431 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 34689494 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 34690394 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 34693029 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34693204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34693659 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 34693669 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 34693894 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34694073 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 34694229 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 34694355 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 34694376 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 34694452 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34694798 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34694812 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 34695094 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34695223 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 34695287 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34695303 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34695309 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34695354 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34695364 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34695385 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34695412 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34695439 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34695470 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34695579 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34695862 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 34695867 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 34695947 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 34696036 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34696039 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34696071 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 34696250 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34696283 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34696294 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34696305 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34696530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34696550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34696762 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34696771 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34696884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34696941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34696972 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 34697026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34697059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34697206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34697235 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 34697323 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 34697412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34697453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34697500 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34697563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34697730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34697814 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 34697882 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34697902 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34698061 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 34698156 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34698569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34698613 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 34698630 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34698699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34698705 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 34698738 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 34698745 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 34698811 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34698838 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34698887 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34699219 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34699698 C A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 34699775 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34699794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34699814 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 34699830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34700008 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34700052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34700163 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34700319 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34700578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34700582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34700891 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 34700911 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34700978 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 34701087 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34701174 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34701211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34701296 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34701327 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 34701687 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 34701809 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34701933 T G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 34701965 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34705250 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34705486 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34705988 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34706006 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34706446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34706450 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34706464 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34706844 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34706985 A G Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 2 34707267 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34707530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34708056 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 34708593 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34709127 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 34709316 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 34709325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34709335 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34709337 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 34709393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34709459 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34709830 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34709835 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 34710562 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 34710630 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34710642 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34710677 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34711147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34711784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34711881 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34711910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34712455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34712523 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 34712524 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 34712954 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34714373 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 34714510 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34714675 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34714741 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34714753 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34715101 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 34715232 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34715556 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34715572 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 34715681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34717874 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 34718225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34718244 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34719807 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34719833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34721694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34722014 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 34722059 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 34722179 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 34722382 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34722597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34722642 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34722818 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34722925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34723101 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34723218 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 34723221 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 34723236 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 34723238 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 34723327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34723339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34723435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34723474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34723571 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 34723877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34723910 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34723933 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 34723988 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34724273 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 34724324 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 34724742 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 34724773 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34724823 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 34725522 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34725580 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 34725605 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 34726565 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 34726672 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34726890 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34727213 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34727417 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34727516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34727766 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 34727906 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 34728086 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 34728087 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34728310 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34728533 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34728954 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34729015 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34729271 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34729328 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 34729500 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 34729541 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34729844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34729857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34729908 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34729933 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34729936 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34729949 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34730009 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34730102 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34730359 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34730425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34730536 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34730538 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34730803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34730912 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 34730921 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 34731668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34731726 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34731732 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34731739 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34731764 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34731769 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34731967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34732024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34732096 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34732147 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 34732150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34732232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34732263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34732266 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34732275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34732883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34732891 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 34732906 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 34733081 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 34733160 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34733321 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34733348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34733480 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34733629 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 34733651 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34733996 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34734095 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34734096 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 34734399 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 34734537 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 34736032 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34737132 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34737181 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 34737477 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34737541 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34737831 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 34737885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34737984 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34737985 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 34738011 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 34738068 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 34738095 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34738096 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34738215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34738263 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 34738307 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 34738489 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 34738573 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34739143 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34739171 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34739185 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34739315 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 34739538 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34739548 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34739571 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34739654 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34739859 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34739861 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34739873 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34740029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34740054 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34740136 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34740271 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34740275 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34740377 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34740503 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34740596 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34740648 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 34740649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34740739 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34740794 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34740809 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34741074 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34741244 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 34741579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34741671 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34742004 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34742006 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34742106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34742775 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 34742894 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34742971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34743048 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34743080 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 34743404 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34743463 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34743489 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34743553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34743618 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34743859 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34743962 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34746295 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34746417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34747088 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34747332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34748186 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34748433 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34750578 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34751023 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34751320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34751743 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34751771 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34752150 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 34752172 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 34752189 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34752496 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34752624 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34752630 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34753254 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34753393 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34753422 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34753469 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34753560 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 34753750 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34753761 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34753876 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34753966 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34754077 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34754112 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 34754249 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34754895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34754963 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 34755036 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 34756372 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34756732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34756870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34756977 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34757209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34757857 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34759011 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34759352 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34760183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34761449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34763004 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34763344 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34763615 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 34764603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34765837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34766000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34766075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34766412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34766899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34768062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34774538 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34774617 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 34775984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34775992 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34776046 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34776054 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 34777054 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34777104 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 34777337 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34777363 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 34777484 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 34777534 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 34777657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34777784 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34777837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34777851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34777955 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 34778027 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34778223 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34778512 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34778604 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 34778652 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 34778754 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 34778859 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 34778980 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34779007 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34779082 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34779090 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34779305 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34779318 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34779319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34779478 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 34779520 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 34779552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34779556 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 34779598 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34779628 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 34779711 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34779765 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34779862 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34779899 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 34780337 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34780354 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 34780397 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34780477 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 34780689 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 34780690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34781491 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 34781681 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 34782001 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 34782054 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 34782066 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 34782087 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 34782287 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 34783690 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34783756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34783885 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34784289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34791473 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34791718 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34792222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34792344 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 34792882 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34792887 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34792929 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34793263 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34793342 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34793456 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34793506 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34793605 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 34793644 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34793651 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34793680 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 34794291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34794349 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 34794602 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34794763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34794799 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34796534 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 34796890 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 34796899 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 34797028 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 34797251 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 34797263 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34797386 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34798825 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34799004 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34799007 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34799036 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34800002 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 34800168 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 34800169 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 34800211 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 34800232 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 34800281 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 34800670 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 34800715 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 34800734 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34800902 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34801238 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 34801328 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 34801434 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34801439 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34801545 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34801567 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34801654 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 34801873 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34801891 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34801962 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34802445 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34802679 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34802729 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34802771 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34802907 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 34803303 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34803424 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34803430 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 34804827 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34804916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34805121 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34805259 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34806120 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34806457 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34806872 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34807267 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34807314 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34807382 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34807383 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34807426 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34807435 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34807445 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34808130 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34808789 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 34808843 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 34809838 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34812717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34814268 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34814368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34815010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34816562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34817713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34818319 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34818418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34819273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34819935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34820230 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34820556 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34821152 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34821198 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34821395 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34821437 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34821548 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34821643 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34821673 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34821675 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34821830 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34822009 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34822357 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34822553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34822819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34823373 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34823601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34823724 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34823950 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34824019 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 34824046 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34824078 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 34824097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34824116 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 34824479 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 34824488 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 34826119 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 34826369 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 34826466 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 34826469 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 34826479 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 34826543 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34826621 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 34826716 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 34826870 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34826944 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 34826993 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 34827282 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 34827304 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 34827316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34827509 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34827538 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 34827577 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34828178 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34828179 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 34828240 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34828241 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34828329 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 34828357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34828412 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 34828476 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34828509 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34828552 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34828630 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 34828842 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34829218 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 34829290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34829428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34829628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34829813 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34829826 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34829924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34830902 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34833746 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34833861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34833889 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 34834052 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34834345 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 34834507 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34835044 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34836164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34836263 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 34837314 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34837449 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 34838581 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34838874 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34838968 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34838969 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34839018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34839155 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34839379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34839684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34840119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34840133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34840521 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 34840586 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34840737 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 34840765 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34841209 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34841214 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34841489 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34841772 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34841793 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34841895 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34841907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34842097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34842121 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 34842369 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34842375 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 34842420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34842502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34842509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34842707 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 34842753 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 2 34842772 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 34842776 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 34842791 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 34843037 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 34843087 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34843279 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 34843784 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34843991 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 34844143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34844153 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34844173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34844224 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 34844250 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34844393 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34844499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34844730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34844770 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 34845733 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34846231 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34846287 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34846486 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34846682 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34846700 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34846708 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 34846957 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 34847074 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34847644 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 34848606 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34849545 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34849802 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 34850476 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34850749 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 34850768 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 34850947 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 34851095 C T N Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 34851324 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 34852262 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34852589 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 34852828 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34852846 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34853004 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 34853039 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34853061 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 34853117 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34853128 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34853383 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 34853439 G T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 34854142 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 34854186 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34854196 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34854233 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34854318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34854432 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 34854884 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 34854903 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34854963 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34854999 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34855123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34855207 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34855415 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 2 34855421 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 2 34855756 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34856099 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34856547 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 34857973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34861909 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 34862178 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34862349 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 34862425 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34862431 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34862446 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34862678 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 34862816 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34862893 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 34863544 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34864734 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34869157 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34869429 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 34869504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34869833 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34870281 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34870290 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34870419 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34871500 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 34871576 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 34871742 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 34871840 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34871856 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34871892 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34872078 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34873156 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34873809 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 34873927 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34874063 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 34874496 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34874719 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 34874798 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 34874881 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34874943 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34875171 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34875183 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34875655 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 34875678 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34876156 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34876423 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34876529 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34876636 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 34876965 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34877097 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34877133 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34877527 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34877549 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34878554 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34878560 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34878580 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34878635 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34878636 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34878652 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34878667 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34878706 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34878801 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34878849 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 34878863 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34878868 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34878962 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34879000 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34879116 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 34879131 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34879518 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0 0.85 0.15 17 23 0 17 3 2 34879519 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 34879938 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 34880155 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 2 34880184 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 34880589 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34881421 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34881468 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34882867 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34883037 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34883694 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 34884051 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34884159 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 34884262 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 34884266 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 34884629 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 34884650 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 34884734 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 34884778 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 34885007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34885187 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34885244 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34885336 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34885479 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 34885492 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 34885502 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 34885613 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 34885624 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 34885979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34885994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34886000 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34886684 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 34886721 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34886858 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 34886872 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 34887629 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 34887683 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34887981 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 34888204 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 34888437 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 34888505 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 34888513 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 34888529 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 34888599 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 34888769 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 34888800 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 34888811 A C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 34888967 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 34888984 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 34889008 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 34889115 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 34889206 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 34889226 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 34889304 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 34889400 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 34889482 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 34889521 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34889629 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 34889914 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 34891136 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34891438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34891453 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34891489 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34891497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34891542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34891820 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 34892006 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 34892097 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34892421 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 34892722 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 34892832 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34893224 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34893450 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34894594 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34894654 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 34894683 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 34894998 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34895060 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34895062 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 34895214 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 34895363 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34895406 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 34895449 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 34895604 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 34895659 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34895723 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 34895786 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 34895910 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 34896014 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 34896074 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 34896080 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 34896093 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 34896171 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 34896317 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 34896471 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 34896484 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 34896691 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34896730 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 34896926 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34896978 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34896982 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 34897025 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 34897057 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34897096 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 34897101 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 34897271 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34897391 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 34897455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34897837 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34898375 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 34898415 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 34898496 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 34898571 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 34898587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34898603 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 34898606 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34898905 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 34898928 T A N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 34899052 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 34899053 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 34899096 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 34899109 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 34899387 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 34899422 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 34899590 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34899610 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 34899611 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 34899621 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 34899626 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 34899921 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34900026 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34900053 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34900157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34900367 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34900584 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34900653 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34900654 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34900720 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34900730 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34900845 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34900939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34901074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34901202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34901300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34901315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34901338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34901353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34901357 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34901432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34901509 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34901538 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 34901744 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34901760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34901781 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34901802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34901880 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34901932 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 34902198 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 34902252 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 34902543 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34902547 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34902683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34902718 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 34902746 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 34902757 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 34902765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34902970 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34902991 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34903061 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34903092 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 34903163 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34903178 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34903357 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34903362 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34903454 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34903490 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34903519 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 34903750 T A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 34903764 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34903866 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 34903884 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34904068 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 34904102 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 34904168 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34904214 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 34904408 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34904425 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34904541 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34904552 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 34904561 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 34904616 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 34904625 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 34905081 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34905153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34905353 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34905399 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 34905432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34905466 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34906245 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34906332 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34908040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34908118 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 34908149 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34908158 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34908175 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 34908333 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 2 34908377 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 34908471 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 34908870 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 34908973 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34909308 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 34909345 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 34909356 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 34909454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34909518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34909647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34910000 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 34910141 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 34910195 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34910251 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 34910259 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 34910442 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34910698 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34911159 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 2 34911183 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 34911208 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 34911215 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 34911229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34911255 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 34911622 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34911646 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34911671 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34911685 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34911751 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 34911826 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 34912013 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 34912104 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 34912125 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 34912262 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 34912368 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 34912380 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 34912512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34912532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34912540 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34912563 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 34912632 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 34912701 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 34912705 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34912729 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 34912916 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 34913431 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 34913496 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34913671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34913759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34914150 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34914242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34914718 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 34914835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34914984 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 34915137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34915820 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34916710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34917820 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34919186 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34919336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34919931 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34919939 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34920233 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 34920307 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34920337 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34920412 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34920493 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 34920494 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 34920782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34920811 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34920865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34920869 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34921430 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34921990 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 34922142 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 34922238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34922510 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34922995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34923020 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34923505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34923702 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34923757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34923932 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34924115 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34924180 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34924855 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34925081 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34925681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34927686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34927707 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34927722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34927729 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34927759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34927786 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34927793 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34927894 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34928090 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34928245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34928587 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34928964 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34929188 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 34929319 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 34929349 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 34929350 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 34929400 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 34929665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34929693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34930051 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34930089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34930113 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 34930198 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34930211 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 34930252 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34930277 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34930602 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 34930678 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 34930699 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34930929 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 34931210 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 34931296 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34931379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34931470 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 34931529 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34931896 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34931948 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34932175 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34932332 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34932361 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34932393 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34932702 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34932747 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34932829 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34932955 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34933007 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 34933012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34933204 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34933223 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34933235 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34933272 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34933299 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34933309 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34933405 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34933493 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34933703 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34933710 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34933773 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34933814 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34933820 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34933873 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34933923 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34934316 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 34934377 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 34935061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34935769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34935982 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34936126 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 34936992 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34937733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34937796 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 34938574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34940146 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34940832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34943843 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34944466 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34944528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34944567 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34944638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34944873 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 34945397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34945860 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34945933 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34949533 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34951641 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34953656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34953923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34954931 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34955088 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 34955106 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34957148 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34957461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34957955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34959037 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34959156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34959283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34959608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34961641 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34961725 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 34961753 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 34961754 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 34962486 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34962976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34963481 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34966567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34966977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34972380 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34973572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34974146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34974203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34974476 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34974602 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34976326 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34977675 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 2 34977740 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 34978706 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 34978744 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 34979696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34980484 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34981280 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 34981387 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34981595 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 34981654 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34981921 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 34981943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34982001 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34982053 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 34982705 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34982962 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 34983135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34983170 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 34983281 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 34983655 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34983693 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 34983802 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 34983907 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 34983928 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34984681 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34984716 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 34985205 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 34985739 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 34986060 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34986209 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 34986278 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34986279 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34986552 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 34987222 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34987575 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34987710 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34988053 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34988600 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 34988641 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34988664 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34988805 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34988811 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34988956 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 34989878 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34989978 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 34990032 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34990046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34990068 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34990249 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34990980 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 34991179 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34991526 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34991603 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34992430 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 34992537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34992732 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34992778 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34992957 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34994526 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34994555 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34994589 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 34994713 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34994741 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 34994983 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 34995946 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34996225 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34996480 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 34997115 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34997182 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 34997744 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34997875 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34998088 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 34998170 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 34998227 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34998246 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 34998859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 34999187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 34999574 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 34999668 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35000040 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35000153 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35000364 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35000996 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35001064 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35001139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35001141 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35001680 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35001912 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 35001919 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 35002120 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35002269 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35002698 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 35003128 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35005973 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35006794 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35007095 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35007493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35008593 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35009282 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35009468 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35009564 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35009802 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35010069 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35010148 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 35010345 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 35010346 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 35010524 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35011988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35013736 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35013745 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35014116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35014230 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 35014348 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35014391 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 35014430 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 35014532 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35014556 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 35014559 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35014631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35014745 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35014767 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35014855 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35014965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35015026 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35015192 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 35015311 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35015339 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35015356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35015398 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35015422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35015424 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35015477 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 35015481 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 35015736 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 2 35015788 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 35016042 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 35016304 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35016499 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 35016708 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35016985 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35016995 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35017006 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35017025 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35017063 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 35017206 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 35017624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35018039 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35018058 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 35018652 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35018688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35019518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35019562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35020022 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35020245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35020246 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35020299 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35020388 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 35020924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35020931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35021879 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35022180 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35022186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35022249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35022291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35022432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35022447 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35022713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35022961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35022972 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35022987 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35022996 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35023022 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 35023068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35023155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35023299 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 35023548 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35023553 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35023571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35023587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35023809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35023833 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35023850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35023882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35023952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35023969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35024071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35024130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35024330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35024380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35024914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35025007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35025217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35025570 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 35025672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35026191 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35026198 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35026205 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35026306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35031949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35032112 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35032452 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35032627 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35032943 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35032985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35036916 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35038186 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35038202 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35039265 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35039277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35039429 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35040894 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35043478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35044167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35044351 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35044554 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35045545 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35045654 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35045769 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35048234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35048521 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 35048751 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35049012 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35049500 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35049829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35050418 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35051187 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35051905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35052342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35052605 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35053516 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35054873 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35055138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35055605 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35055718 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35055889 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 35057307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35057406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35058369 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35058702 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35058760 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 35058863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35059357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35059588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35059668 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35059796 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35061205 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35061734 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 35061908 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35061909 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 35061948 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35061995 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35062082 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35062148 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35062238 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35062763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35064080 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 35064920 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 35065104 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 35065126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35065188 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 35065328 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 35065358 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35066214 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35066343 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35066384 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 35066435 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35067163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35067849 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35067893 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35068040 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 35068050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35068275 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35068374 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 35068379 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35069123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35069148 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35069951 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35070116 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35070183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35070308 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35070321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35070980 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 35071274 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35071431 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35071562 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35072353 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 35072401 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 35072628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35072760 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 35072894 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35072998 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35073133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35073289 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 35073314 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 35073411 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 35073430 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35073468 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35073688 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 35073824 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 35073887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35074040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35074271 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35074694 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35075162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35075182 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35075200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35075448 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35075631 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 35075652 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 35075667 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35076109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35076160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35076171 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 2 35076233 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35077135 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 35077719 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35077748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35078870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35080663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35080979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35082463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35082948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35083164 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 35083428 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35084014 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 35084615 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 35084616 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 35084644 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 35084661 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 35084676 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35084683 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35084828 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 35084855 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 35084872 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 35084884 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 35084930 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35084963 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 35085592 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 35086448 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 35087355 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 35087405 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35087687 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35088055 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35088129 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35088139 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35088152 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35088249 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35088250 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35088280 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35088450 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35088451 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35088468 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35088528 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35088563 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35088613 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35088628 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35088650 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 35088771 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35088801 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 35088899 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35088969 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35089019 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35089173 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 35089876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35089972 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 35090339 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35090444 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35090631 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35090911 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35091083 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35091106 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35091119 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35091214 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 35091238 T A N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 2 35091314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35091357 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35091661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35091880 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35092148 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35092203 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 35092376 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 35092416 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 35092708 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 35092854 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 35092889 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 35093010 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 35093021 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 35093146 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35093388 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 35093895 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 35093900 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 35094027 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 35094283 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35094342 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35094408 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35094436 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35094485 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 35094495 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 35094506 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 35094690 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 35094713 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35094716 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35094861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35094960 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 35095121 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35095565 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 35095581 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35095587 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35095614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35095619 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35095702 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 35095743 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 35095791 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 35095807 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 35095837 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 35095883 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35095985 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 35096025 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35096261 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35096448 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35096498 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 35096517 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35096533 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35096882 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 35096958 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 35096981 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 35097016 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 35097036 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 35097105 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 35097147 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 35097229 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 35097269 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35097271 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35097290 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 35097380 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 35097399 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 35097611 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 35097660 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35097662 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 35097679 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 35097740 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35097754 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35098046 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 35098397 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 35098665 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35098984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35100016 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35100345 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35100357 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 35100390 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 35100434 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35100468 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 35100475 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35100479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35100529 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 35100550 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35100589 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35100606 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 35100623 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35100638 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35100655 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 35100917 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35101193 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35101337 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 35102055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35102126 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35103397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35103449 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35103804 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 2 35104015 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35105070 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35106454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35106680 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 35106907 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35107760 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35107956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35108648 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 2 35110893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35111385 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35111441 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35112329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35112397 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35112518 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35112554 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35112581 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35112809 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 35112846 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35112913 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35112916 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35113013 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35113035 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 35113106 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35113153 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35113300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35113340 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 35113438 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35113551 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 35113568 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35114005 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 35114072 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 35114090 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35114130 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35114581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35114713 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 35114733 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35114896 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 35114973 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 35114983 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35115324 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 35115586 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35115631 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35115640 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 2 35115870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35116023 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35116139 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 35118024 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 35118212 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 35118442 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 35118449 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 35118568 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 35118585 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 35118617 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35119255 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 35119531 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 35119596 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 35119877 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 35119899 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 35120103 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 35120798 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35121111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35121121 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35121311 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35121346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35121379 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 35121648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35121714 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 35121951 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 35122798 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35123526 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 35123698 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 35124259 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 35124462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35125306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35125368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35125408 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35125527 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35125616 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35126345 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35126394 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 35126493 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35126846 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35127107 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 35127428 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35129266 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35129287 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35129395 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35129413 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35129439 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35129636 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35129740 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35129757 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 35129764 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35129869 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35130189 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35130207 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35130254 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35130291 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35130307 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35130319 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35130782 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 2 35130827 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35130833 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35130854 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35130919 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35130970 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35131006 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 2 35131012 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 2 35131037 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 2 35131048 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 35131570 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 35131808 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 35132227 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 35132315 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35132471 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35132692 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 35132855 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 35132900 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 35133021 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 35133027 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 35133054 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 35133055 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 35133105 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 35133175 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35133249 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35133261 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35133634 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35133636 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 35133887 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35133901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35133925 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 35133946 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 35134045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35135377 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35135407 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35135689 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 35135713 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35135748 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 35135857 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 35136094 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35136113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35136877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35136951 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 35137267 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 35137355 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 35137426 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 35137495 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35137572 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 35137666 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 2 35137802 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 35137918 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 35139105 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 35139116 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 35139202 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35139211 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 35139246 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 35139595 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 35139679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35139701 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 35139850 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 35139938 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35140462 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 35140541 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 35140569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35140604 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35140818 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35142679 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 35142693 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 2 35142704 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 2 35142812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35142850 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35142873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35143024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35143163 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35143375 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 35143397 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 35143398 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 35143440 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 35143485 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35145534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35145541 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35146736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35146878 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 35146883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35146932 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35147414 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35148075 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 35148264 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35148555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35148678 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35149141 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 35149658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35150081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35150740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35150853 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 35151495 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35152182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35153003 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35153429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35153979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35156529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35158677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35160031 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35160323 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35160589 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35160634 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35160698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35160766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35160868 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35160891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35161039 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 35161930 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 35162008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35162010 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35162063 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35162145 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 35162154 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 35162361 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35162473 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35162658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35163312 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35163558 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35163594 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 35163812 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35163995 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35164169 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35164192 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35164453 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35164488 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 35164828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35164863 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 35165217 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 35165572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35165712 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 35166823 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35167026 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 35167138 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 35167684 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35167793 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 35167805 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 35169718 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 35169894 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35170288 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35170735 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 35170896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35171164 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 35172251 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35172344 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35173721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35173827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35174175 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35174503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35174662 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35175068 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35175279 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35175707 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 35175822 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35176515 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 35176570 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 35176759 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35176802 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 35176893 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 35177494 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35178061 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35178305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35178324 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35179868 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35180428 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35180448 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35180768 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 35180862 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 35181466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35181793 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35182717 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35182721 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35182987 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35183121 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35183400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35184158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35184688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35185057 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35185147 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35185841 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 35185935 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35185957 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 35185962 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35185989 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35185999 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35186021 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35186142 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 35186155 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35186218 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35186343 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35186346 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35186360 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35186373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35186424 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35186480 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35187259 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35188071 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 35188811 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35189739 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35190442 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35190846 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35191263 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35191364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35191853 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35191858 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35192613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35193540 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 35193665 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 35193925 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35194242 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 35194273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35194645 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35194963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35194996 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35195013 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35195066 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35195100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35195298 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 35197214 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35197218 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 35197295 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35197359 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35197488 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35197497 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 35197676 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 35197805 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 35198029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35198087 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 35198550 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 35198593 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 35198611 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35198673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35198688 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 35198783 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35198814 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 35198874 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 35198915 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35198959 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 35199120 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 35199157 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 35199218 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 35199304 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 35199495 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 35199618 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 35199665 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35199767 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 35199847 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 35199894 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35200386 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35200742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35200769 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 35200839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35200853 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 35200906 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35200938 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35200940 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35200955 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 35201069 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 35201079 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35201085 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35201136 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 35201138 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35201221 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35201275 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 35201276 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 35201303 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35201310 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 35201638 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35201689 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35201727 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35201844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35201940 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35202376 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35202458 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 35202603 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 35202634 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 35202652 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 35202671 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 35202881 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35203070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35203087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35203775 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 35204127 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 35204167 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 35204319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35204340 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35204462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35204654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35204761 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 35205105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35205908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35206740 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 35206754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35206795 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 35206835 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 35207391 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35207414 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35207436 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 35207510 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 35207590 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 35207605 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35207636 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35207647 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 35207674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35209298 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 35209401 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 35209475 C T Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 35209728 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 35209887 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35210053 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 35210199 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35212664 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 35212764 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35212902 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 35213022 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35213144 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 35213199 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35213463 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 35213539 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 35214157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35214334 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35214645 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 35214681 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35214785 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 35215823 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35217172 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 35217186 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35217306 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 35217341 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 35217350 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 35217425 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35217497 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 35217576 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 35217591 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 35217766 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 35218214 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35218234 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35218263 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35218337 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35218460 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 35218546 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35218567 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 35218575 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35218653 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 35218693 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 35218873 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35218979 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35218990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35219060 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 35219071 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 35219666 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 35219678 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 35219802 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 35219986 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 35220114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35220242 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35220366 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 35220420 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 35220456 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35220575 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 35220607 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 35220770 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 35221141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35221145 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 35221183 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 35221245 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 35221298 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 35221376 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 35221578 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 35221874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35221939 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35222059 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 35222079 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35222659 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 35222768 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35223038 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35223059 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35223078 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35223194 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 35223308 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 35223326 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 35223414 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 35223478 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 35223882 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 35223989 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35224686 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 35224750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35224774 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 35224872 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 35224897 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 35224917 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 35225033 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35225123 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35225162 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35225395 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 35225441 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35225463 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35225603 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35225715 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35225856 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35225878 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35226404 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35226420 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35226991 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 35227319 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 35227947 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 35227980 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35228163 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 35229006 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35229027 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35229034 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35229117 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 35229522 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35229546 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35229566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35231495 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 35231565 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 35231896 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 35232165 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 35232269 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35232317 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 35232335 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 35232418 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35232562 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 35232630 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35232710 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35232878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35232886 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 35233111 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35233310 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35233311 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35233363 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35233406 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35233419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35234283 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 35234297 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 35234318 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 35234336 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 35234354 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 35235616 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 35235950 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 35236129 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 35236177 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 35236392 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 35237044 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 35237131 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 35237152 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 35237210 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 35237271 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35237420 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35237523 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 35237527 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35237546 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35237564 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 35237569 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 35237588 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 35237644 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 35237646 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 35237849 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 35237869 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 35237874 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35238043 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 35238064 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 35238156 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35238162 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 35238246 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 35238252 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 35238479 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35238500 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 35238520 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 35238563 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35238573 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35238620 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35238748 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 35238781 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 35238865 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35239074 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 35239113 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 35239177 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 35239676 A T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 2 35239718 T G Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 35240318 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 35240926 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35240951 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 35241144 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 35241415 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 35241681 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35242332 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35242509 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35243278 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 35243952 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35244245 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 35244400 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 35244406 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 35244550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35244610 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 35244749 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35245293 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 35245376 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35245416 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 35245615 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35245637 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35246281 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35246470 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35246516 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35246821 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 35246954 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35246959 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 35247153 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35247401 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35247513 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35247702 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35247779 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 35247996 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 35248309 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 35248831 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 35249655 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 35249677 C T Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 35249695 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 35249895 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 2 35249905 C A Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 35249940 T C Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 35250027 A T Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 35250065 A C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 35250075 T G Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 35250103 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 2 35250158 C T Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 35250175 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 35250265 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 35250790 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 35250933 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 35251212 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 35251696 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 35252273 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35252324 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 35252547 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35252574 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35252627 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35252740 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35253053 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35254632 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35254654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35255291 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35255572 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 35255608 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 35255654 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 35256315 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35256752 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 35257408 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35257896 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 35259483 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35259709 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 35260264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35260309 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 35260488 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35260490 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 35260722 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 35261182 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 35261379 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35261487 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 35261495 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35261526 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35261811 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35262272 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35262314 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 35262752 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35263125 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35263723 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35263852 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 35263853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35264098 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 35264194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35264229 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35264255 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 35264564 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35264832 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 35264937 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35265933 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35266948 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35267214 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35268705 T C Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 35268721 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 35268740 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 35272157 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35272357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35272387 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 35272464 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 35273213 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35273504 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 35273534 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35273560 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35274129 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 35274283 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 35274369 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35274375 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 35274415 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35274425 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35274573 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35274732 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35274924 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35274975 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35275171 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 35275199 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35275355 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35275660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35275795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35275809 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 35275968 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35276005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35276049 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35276196 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35276852 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35277614 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35277640 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35277899 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35278095 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35278161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35278364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35278532 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 35278728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35278746 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35278870 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35279132 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 35279265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35279298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35279638 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35279662 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 35279841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35280002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35280010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35280016 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35280147 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35280223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35280229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35280456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35280459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35280528 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35280549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35280700 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35280865 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35280899 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 35281183 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35281601 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 35281637 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 35281744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35282026 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 35282368 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 35282410 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35282416 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35282543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35282552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35282566 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 35282654 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 35282936 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 35282963 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 35282980 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35283296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35284485 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 35284608 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 35284889 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 35285117 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35285156 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35285346 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35285884 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 35286107 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35286173 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35286333 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35286592 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35286797 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 35286810 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 35287208 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35288104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35289740 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35290196 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35290247 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35290325 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35291260 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35291436 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 35291484 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35291510 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35291532 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 35291790 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35291865 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 35291876 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 35291890 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 35291928 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35291937 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 35291954 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35292093 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 35292281 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35292382 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35292393 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35292522 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35292852 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 35293301 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35293380 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35294437 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35296753 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35296762 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35296875 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35297022 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35297080 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35297154 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 35297612 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35297951 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35299250 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35299618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35300351 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35300747 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35300842 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35301827 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 35301868 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 35302728 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35302978 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 35302989 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 35302997 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35303054 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35303260 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35303316 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35303403 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 35303486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35303508 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 35303565 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35304601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35305247 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35305497 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35305800 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35306420 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35307014 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35307063 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35307132 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35308224 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 35308297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35308355 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35308471 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 35308993 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35309279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35309308 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35309439 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 35309502 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35309533 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35309822 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35310002 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35310180 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35310315 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 35310347 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 35310384 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35310512 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35311126 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 35311172 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35311510 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35312048 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35312341 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35312410 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 35313342 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 35313364 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 35314258 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 35315218 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35315219 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35315668 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35315706 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35315834 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35316057 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35316219 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 35316334 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35316469 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35316472 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35316486 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 35316623 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35317411 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35318486 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 35319925 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35320141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35320172 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35320194 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35320271 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35320303 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35320397 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35320450 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35320468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35320506 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35321279 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35321691 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35321710 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35321778 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35321992 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35322030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35322122 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35322152 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35322401 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35322455 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35322467 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35322684 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35322903 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 35323153 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 35323210 A T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 35323349 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 35324383 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35325939 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35326079 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35327066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35327664 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35327937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35328852 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35329011 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35329138 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35329370 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35329611 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35329684 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 35329899 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 35330085 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 35330646 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35330716 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35330768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35331170 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 35331443 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35331449 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35331501 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 35331612 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35332431 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 35332555 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 35332964 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 35333207 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35333246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35333365 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35333373 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35333418 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35333842 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35333873 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35334040 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35334832 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35334952 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35335051 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35335495 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 35335535 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 35335581 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 35335591 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 35335633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35335665 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 35335667 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35335701 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35335802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35335843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35335861 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35336007 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 35336034 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35336585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35336688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35337271 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35337594 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 35337601 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 35337616 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 35337872 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35337887 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35337981 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35337982 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35338034 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35338698 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35338886 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35339161 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35339203 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35339205 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35339256 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 35339431 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35339433 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 35339576 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 35340598 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35340662 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35340664 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35340976 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 35341022 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35341026 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 35341102 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 35341126 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 35341216 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35341313 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35341394 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 35341413 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 35341474 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35341532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35341544 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35341561 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35341804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35341922 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 35341928 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 35342078 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35342196 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35342334 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 35342359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35342517 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35342660 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35343327 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35344071 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 35344543 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35344590 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 35344677 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 35344817 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 35344870 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 35344879 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 35345212 G T Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 35345316 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 35345339 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35345340 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35345479 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 35345569 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35345707 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35345745 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35345808 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 35345813 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35345850 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 35345964 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 35346061 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 35346072 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 35346136 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 35346424 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35346568 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35346630 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35346636 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35346656 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35346937 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35346961 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35347080 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35347100 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35347112 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35347113 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35347240 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 35347266 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35347468 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 35347790 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35348027 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35348103 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35348114 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35349411 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35349416 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35349498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35349999 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35350055 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35350077 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35351880 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35351965 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35352125 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35352199 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35352919 A T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 35353093 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35353368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35355912 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 35355914 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 35355943 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35355944 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35356070 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35356186 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35356632 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35356663 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35357826 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35358220 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35358448 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35358453 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35358837 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35359059 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35359250 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 35359295 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35359927 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35360465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35360715 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35361259 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35361445 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35361611 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 35361725 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 35361747 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 35361850 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35361896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35362020 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35362057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35362127 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35362184 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35362664 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35363680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35364074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35368066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35370112 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35370373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35370508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35370707 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35371953 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35372014 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35372369 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 35372979 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35373000 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 35373042 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35373180 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35374824 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35382700 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35383015 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35383458 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35383511 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35383784 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35383791 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35383814 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 35383862 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35383940 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35384135 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 35384156 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 35384469 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35384545 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 35384562 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 35384611 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35384652 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35384933 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 35385470 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 35385960 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 35386361 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35386431 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 35386772 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 35389195 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35389568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35389733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35389924 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35390061 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35390092 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35390406 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 35390438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35390454 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35390458 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35390472 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35390584 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 35391223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35391335 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35391897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35393322 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35393621 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35393634 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35393658 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35393743 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35393842 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35394023 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394045 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394067 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394082 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394143 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394184 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394188 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394225 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394253 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35394260 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394348 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394351 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394511 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394528 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35394843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35394948 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 35394990 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35395296 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 35395776 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35395827 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35396130 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 35396709 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35396764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35397104 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35398221 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35398310 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 35399061 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35401713 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35401777 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35403258 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35403594 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35403696 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35403746 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35403860 A C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 35404028 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35404221 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 35404376 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 35404491 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 35404583 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35404610 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 35404704 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 35404753 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35404762 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35404766 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35404880 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35405152 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35406140 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 35406142 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 35406383 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35406395 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35406976 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 35407308 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35407343 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 35407902 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35408072 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35408089 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35408236 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35408260 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35408419 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35408437 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35408497 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35408526 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35409328 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 35409370 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 35409382 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 35409403 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35409497 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 35409518 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35409616 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35409634 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 35409802 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35409858 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 35409973 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 35410167 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 35410243 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35410998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35411211 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35411233 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35411335 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 35411358 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 35411512 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35411688 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35412974 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 35413414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35413603 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35413863 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 35414202 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35414994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35415573 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35415987 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35418568 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35418764 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35418904 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35419262 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35420246 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35420270 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35420282 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35420546 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35420669 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35420678 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35420749 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35422195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35422435 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35423197 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35423242 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35423327 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35423421 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 35423449 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35423548 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 35423973 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35424715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35424873 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35425736 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 35425929 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35425969 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35426457 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35426481 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 35426612 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35426778 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35426852 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35426950 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 35426961 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 35427087 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35427318 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 35427847 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 35428074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35428250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35428409 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 35428431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35428446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35428538 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 35428643 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35428956 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35428989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35429062 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35429067 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 35429105 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35429152 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35429171 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35429358 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 35429559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35429947 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35430307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35430322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35430615 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35430792 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 35431177 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35431359 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35431572 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 35431578 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35431624 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 35431795 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35431847 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35431898 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 35432028 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35436089 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35436953 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35437171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35438170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35439711 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35442460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35442681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35443807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35443841 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35445778 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 35447029 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35448071 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35450373 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35450378 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35450387 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35450432 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35450647 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 35451408 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35451423 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35451630 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35451662 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35452079 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 35452160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35452182 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35452716 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35452754 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35452899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35453183 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35453243 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 35453422 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35453507 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35453555 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35453634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35453664 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 35453898 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35453899 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35454043 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35454201 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35454391 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35454431 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35454441 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35454471 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35454476 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35454789 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 35454853 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 35455074 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 35455213 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35455397 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35455544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35455728 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35456173 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35456258 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 35456269 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 35456275 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35456298 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35456316 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35456341 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35456420 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35456617 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35456652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35456730 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 35457560 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 35458086 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 35458228 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35458229 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 35458483 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 35458613 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35458646 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 35458819 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 35458905 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 35458907 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 35459109 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35459271 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 35459479 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 35460640 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35460978 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35461442 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35462257 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 35462485 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 35462619 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 35462625 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35462687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35462719 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 35462799 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 35462850 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 35462946 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35463075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35463076 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 35463239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35463380 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35463407 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35463475 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35463495 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35463919 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35463974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35464117 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35464130 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35464152 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35464269 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 35464443 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35464708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35464747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35465631 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35466250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35466661 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35468333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35468697 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35469428 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35470164 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35470271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35470370 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35470504 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 35470555 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 35470593 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35470712 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35470723 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 35470741 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 35470748 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35470753 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35471051 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35471161 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35471370 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35472011 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35472131 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 35472183 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35472185 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 35472296 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 35472327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35472597 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35473775 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 35473987 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35474152 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35474706 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35477326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35478004 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 35478032 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35478176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35478232 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35478356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35478455 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 35478572 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35478890 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35479076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35479240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35481055 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35481706 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35482291 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35482806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35482835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35482858 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35483436 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35483618 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35483872 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 35484733 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 35484858 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35484883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35485221 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35485744 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35488250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35488495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35488931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35488954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35489020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35489484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35490841 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 35491401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35492167 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35492322 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35494047 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35494167 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35494255 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 35494368 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35494456 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35494540 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35494571 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35494607 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 35494767 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35494806 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35495780 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 35495802 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 35495808 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35495817 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 35495835 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 35496181 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35496224 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35497554 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35498265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35499891 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 35500064 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 35500689 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35501164 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 35501695 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 35501740 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 35501753 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 35502619 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 35502769 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 35503354 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 35503383 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35503384 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35503761 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35503836 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35503890 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35503992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35504307 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 35504400 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35504428 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35504858 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 35504924 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35505085 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35505125 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 35505152 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35505221 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35505267 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35505306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35505419 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35505422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35505448 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35505668 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35505712 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 35505734 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35505768 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 35505800 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35505840 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35505914 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35507143 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 35512058 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35514807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35517213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35520712 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35520910 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35521029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35521181 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35521337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35521391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35521468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35521585 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35521625 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35521637 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 35521686 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 35521871 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35522085 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 35522796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35523072 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35523508 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 35525366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35525632 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 35525739 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 35527954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35528652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35529898 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35529955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35530070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35530924 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 35531033 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 35531199 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35531206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35531679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35531854 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35531919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35532003 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 35532111 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 35532139 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 35532234 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 35532408 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 35532483 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35532852 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 35532853 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 35533092 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35533139 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35533213 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 35533401 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35533454 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 35534223 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35534418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35534661 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 35534894 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 35535622 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 35535665 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35535906 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35536025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35536519 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35536534 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35537059 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35537131 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35537793 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35537934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35538189 C T Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 35538688 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 35539229 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35539230 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35539955 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35540681 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35540885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35540945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35541414 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35547222 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 35548417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35548879 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35550352 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35550693 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 35550704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35550737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35550759 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35550818 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35550821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35550833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35550962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35551184 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35551626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35551681 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 35551861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35552365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35552636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35553182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35553198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35553424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35554380 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 35555406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35555675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35556137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35557814 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 35557926 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35559312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35559506 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35561209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35561234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35561715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35561729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35562134 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35562240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35562460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35563549 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35563567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35563594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35563913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35563941 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35564596 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 35564691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35567256 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 35567502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35568892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35569270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35570097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35570322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35571389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35571508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35571821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35572747 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 35572854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35572918 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35574694 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35574856 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35574941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35574956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35578198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35578882 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 35580118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35581477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35581895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35582932 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 35587099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35589715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35590091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35593071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35593577 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 35593814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35594345 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35595424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35595716 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 35596069 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35596119 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 35596120 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 35596837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35596998 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35597156 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35597957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35598120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35598524 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 35598616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35598966 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 35598971 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35599333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35599423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35599433 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35599842 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35599871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35599877 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35601021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35601059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35601106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35601119 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35601128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35601165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35601166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35601276 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 35601330 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35601738 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35601788 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35601861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35601897 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 35602661 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 35603340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35603355 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35603455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35603468 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 35603513 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35603652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35603680 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35603689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35604283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35604294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35604328 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35604369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35604412 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 35604469 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 35604508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35604645 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 35604656 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 35604659 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 35604982 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 35605006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35605119 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 35605353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35605366 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35605555 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35605647 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 35605651 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 35605762 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35605763 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35605812 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 35605813 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 35605862 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 35605890 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35607183 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35608047 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 35608304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35609367 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 35609505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35610016 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35610690 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 35611233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35611698 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35611703 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35612287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35612288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35612389 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 35612443 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 35612448 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35612543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35612729 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 35612900 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35613062 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 35613213 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35613441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35613621 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 35613644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35613753 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 35614634 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35615217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35615695 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 35615843 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 35615882 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 35616158 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 35616560 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 35616621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35616850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35616914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35616920 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 35616930 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35617012 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 35617023 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 35617132 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 35617250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35617617 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 35617713 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 35617824 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 35618195 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 35618352 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35618405 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 35618506 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 35618556 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 35618599 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 35618633 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35618663 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35619043 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35619156 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35619343 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 35619371 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35619521 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 35619637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35619672 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 35619772 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 35619782 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 35619803 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 35619816 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 35619843 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35619860 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 35620383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35620496 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35620578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35620759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35621579 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 35621625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35621696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35621930 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 35622650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35622661 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35623753 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 35623921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35624350 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35625068 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 35625409 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 35625440 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35625560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35625701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35625749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35626053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35626118 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35628193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35628472 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35628681 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35628698 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35628799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35629036 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 35630291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35630749 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 35630761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35630934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35631051 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35631129 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35631662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35631686 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35631699 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35631706 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35631772 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35632126 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35632247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35632289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35632361 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35632910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35633480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35634458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35635165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35635203 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35636759 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35636919 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35637526 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35638041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35638665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35639882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35640062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35640201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35640747 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35641688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35642433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35642438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35642475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35643442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35643607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35643723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35643889 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35644320 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 35644351 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 35644396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35644570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35644628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35644644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35644658 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35644693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35644760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35644837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35644857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35644932 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35644978 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 35644990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35645023 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35645352 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35645780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35645888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35646797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35647641 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35648119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35648322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35648757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35649765 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35650035 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 35651243 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 35651327 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35651518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35651730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35653661 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35653665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35653697 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 35654180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35654191 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35654344 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 35654397 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 35654406 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 35654662 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 35654671 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 35654776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35654796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35654863 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35655336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35655454 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35655535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35655972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35656093 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35656142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35656155 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35656175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35656234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35656537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35656545 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35656674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35656805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35657058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35657095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35657112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35657392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35657398 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35657973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35658126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35658160 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35658438 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 35658502 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35658532 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35658815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35658846 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35658867 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35660928 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35661197 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 35661226 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35661252 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35661442 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35661754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35661777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35662144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35662166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35662276 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35662279 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35662822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35662828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35662941 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35662970 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35663041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35663136 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35663321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35663390 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35663481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35663548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35663868 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 35663888 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35664297 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 35664306 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 35664323 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35664586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35664794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35664807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35664946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35665517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35666901 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35668490 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35668536 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35669618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35670038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35670290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35670670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35670897 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35671044 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35672091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35672361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35672379 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35672751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35672758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35672961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35673523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35673721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35673910 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35673972 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35673990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35674098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35674109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35674307 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35674360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35674452 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 35674453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35674500 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35674679 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 35675001 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35675388 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35675401 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35675406 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 35675910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35675920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35675941 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35677155 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35677338 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35677339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35677412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35677495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35677509 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35677634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35677653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35677657 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35677688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35677732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35677740 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35677907 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35677921 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35678000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35678003 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35678023 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35678239 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35678957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35679436 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35679445 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35679447 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35679508 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35679599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35679643 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35680369 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35680376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35680552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35680564 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35680584 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35681946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35682798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35683080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35685760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35686108 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 35686136 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35686154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35686184 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35686262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35686744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35686788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35686915 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 35686942 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 35687017 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 35687117 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35687286 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35687389 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35687555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35687795 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35688273 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35688680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35688728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35690181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35690391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35690548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35690717 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35690723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35690743 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35690766 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35691057 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35691144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35691172 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35691554 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35691799 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 35692102 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35692109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35692427 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35692635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35692692 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35692784 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35692892 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35692956 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35693206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35693270 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35693287 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35693302 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35693383 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35693397 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35693476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35693505 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35693507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35693620 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 35693814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35693911 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 35694097 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 35694499 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35694689 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35694695 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35694805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35694852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35694871 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35695171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35695344 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35695402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35695429 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35695459 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35695487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35695990 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 35696594 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 35696772 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35696989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35697034 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35697088 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 35697121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35697149 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 35697289 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35697302 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35697314 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35697569 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35697613 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35697719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35697810 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35697953 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35697970 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35697994 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35698038 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35698525 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35698658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35698849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35699031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35699353 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35699355 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35699407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35699651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35699664 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35700020 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35700697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35701590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35701729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35703005 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35703265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35703402 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35703518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35703607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35704908 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 35706718 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35707578 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35707618 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35707809 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35708983 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 35708985 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35709132 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35709169 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35710464 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35710507 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35710594 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35710619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35710773 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35710948 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35711052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35711663 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35711714 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35711736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35712405 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35713657 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35714598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35714743 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 35714919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35715771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35715847 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35716281 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35716288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35717051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35717273 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35717442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35718264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35718345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35718597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35719510 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35719686 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35719744 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 35720321 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35720322 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 35720608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35720660 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 35720742 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35720749 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35721522 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35721742 C A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 35722212 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35722668 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35722693 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35723464 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 35723754 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 35724897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35725025 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 35725734 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35725882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35726184 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 35726191 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 35726240 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 35726301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35726333 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 35726428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35726622 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35726772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35726833 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35726858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35727027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35727147 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35727429 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 35727473 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35727641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35727680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35727845 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35728622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35729631 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 35729654 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35729966 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 35729980 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35729991 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35730429 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35731063 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35731135 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 35731163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35731389 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35731614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35732352 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35732750 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35732765 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 35732802 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35733192 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35733345 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 35733408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35733737 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35733805 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35734492 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 35734983 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35735374 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 35736362 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35736427 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 35736880 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35736946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35737246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35737461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35739075 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35739673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35739735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35740024 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35740045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35740247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35741077 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35741378 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35742020 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35742073 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 35742327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35742733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35742815 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35742819 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 35742843 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35742899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35742965 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 35742982 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35743013 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 35743187 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35743364 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35743400 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 35743486 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35743504 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 35743520 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 35743610 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 35743622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35743631 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35744431 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35744481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35744522 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35744548 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35744638 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35744687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35744978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35745121 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 35745398 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 35745635 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35745707 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35745778 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 35745795 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 35745910 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35745923 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35746008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35746116 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35746199 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35746212 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35746314 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35746720 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35746752 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35747048 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35747049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35747069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35747194 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35747551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35747647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35747657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35747771 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35748162 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 35748725 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35748810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35749147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35749182 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35750039 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 35750119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35750603 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 35750809 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35752059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35752068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35752508 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 35752663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35753785 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 35754021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35754150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35757263 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35758777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35758799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35759120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35760786 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35762743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35762771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35762837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35762854 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35762955 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 35764379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35764388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35766711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35766714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35766843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35767555 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 35767902 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35768712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35769504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35770195 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 35770244 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35770413 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35771772 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 35772409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35772410 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 35772436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35772464 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35772472 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35772525 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35772660 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 35772985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35773037 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 35773102 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 35773115 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 35773384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35773543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35773562 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 35773655 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 35773778 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 35773825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35773894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35774422 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35774452 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35774497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35774681 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 35774750 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35774829 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 35775028 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 35775063 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35775090 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35775118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35775257 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 35775263 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 35775333 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35775509 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35775584 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35775657 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35775701 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35775703 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35775951 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35776012 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35776088 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35776170 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35776206 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35776320 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35776407 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 35776447 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 35776507 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35776543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35776669 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 35776719 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 35776836 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35776866 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35777023 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 35777144 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 35777186 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35777225 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35777268 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35777892 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 35777902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35777912 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 35777932 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35778076 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 35778111 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35778418 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35778642 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 35778824 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35778918 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35778942 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35779312 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 35779337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35779435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35779498 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35779509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35779547 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35779559 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35779584 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35779595 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35779598 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35779659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35779702 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 35779762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35779827 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 35779848 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 35780048 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 35780114 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 35780217 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 35780300 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 35780446 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35780537 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 35780697 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 35780742 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 35780969 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 35781029 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 35781044 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 35781097 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 35781178 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35781247 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 35781580 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 35781783 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35781817 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35782090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35782141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35782244 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35782598 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35782787 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 35782819 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35784113 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35784120 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35784418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35784549 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35784610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35785037 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35785141 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 35785482 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35785547 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35785556 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 35785746 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35785862 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 35786735 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35787098 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35787169 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35787172 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 35787329 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35787419 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35787820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35787830 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35787904 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35788228 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 35788244 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 35788367 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 35789224 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35789246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35789302 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35789344 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35789381 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35789772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35790142 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35790213 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35790263 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35790333 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35790383 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 35790427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35790544 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 35790603 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 35790622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35790640 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35790780 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35790803 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 35790833 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 35790932 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 35791190 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 35791211 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 35791217 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 35791313 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 35791497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35791598 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35791903 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 35792163 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 35792527 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35792532 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35792621 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 35792634 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 35792724 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35793412 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 35793582 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 35793699 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 35793720 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 35793728 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 35793801 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35793953 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35794080 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 35794304 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35794316 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 35794777 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 35794783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35794793 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35794885 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35795257 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 35795295 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 35795486 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 35795526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35795747 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35795763 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35795782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35795930 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 35795937 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 35795956 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35796164 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35796260 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35796287 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35796435 C T N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 35796595 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35796655 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 35796680 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 35796681 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 35796899 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35796929 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 35797594 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 35797616 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 35797650 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35797682 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35797689 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35797730 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35798137 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35798155 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35798457 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35798471 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35798551 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 35798574 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35798593 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35798811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35798851 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35798873 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 35799063 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35799082 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35799096 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35799139 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 35799177 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 35799293 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 35799507 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35799875 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35799941 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 35800279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35800314 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35800333 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35800432 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35800524 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35800622 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 35800684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35800712 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 35800742 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 35801270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35801331 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35801364 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 35801470 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35801567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35801743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35801887 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35801891 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 35802166 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35802604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35802990 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 35802991 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 35803062 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 35803230 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 35803249 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 35803290 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 35803293 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 35803338 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 35803350 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 35803409 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 35803417 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 35803485 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35803638 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 35803744 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35803811 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 35803959 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35804130 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 35804197 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 35804211 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35804271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35804320 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35804344 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35804422 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35804566 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35804591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35804702 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 35804704 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35804850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35804997 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35805312 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 35805319 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 35805402 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 35805427 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 35805467 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 35805471 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35805559 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 35805607 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 35808311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35808374 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35811656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35812196 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 35812229 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35814738 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 35815187 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35815224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35815259 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35815425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35816509 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 35817341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35817419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35817453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35817477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35817486 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35817621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35817752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35817868 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 35818021 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 35818440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35819446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35819450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35819960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35820189 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35820197 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35820409 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35821140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35823204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35826050 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35826957 C T Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 35827915 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35828371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35828661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35831763 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35831958 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 35832594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35833445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35833463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35834295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35834336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35837046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35837880 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35838113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35838935 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35838955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35839065 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35839098 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35839501 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35839508 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35839606 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35839701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35839798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35840222 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 35840267 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 35840316 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 35841953 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35842042 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35844569 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 35845573 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35845857 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 35846991 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 35847045 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35847167 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35847184 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35847297 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35847676 G C Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 35847780 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35848000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35848017 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35848352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35848375 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35848745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35850073 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35850492 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 35850691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35850829 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35850857 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 35850911 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35850933 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35851080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35851130 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35851203 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35851237 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35851248 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35851251 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35851436 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35851455 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 35851671 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 35851862 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35851879 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35852938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35853066 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35853140 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35853711 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35853947 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 35854041 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35854091 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35854092 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 35854602 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35854618 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 35855060 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 35855291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35855958 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 35856476 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35856617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35856852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35857027 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35857129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35857935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35858296 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 35859261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35859492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35860882 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35863660 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35864379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35864897 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35865758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35867868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35869480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35874822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35876330 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35876594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35877522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35878792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35879582 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35880372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35881068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35885507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35886379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35887110 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 35887137 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 35887153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35887823 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 35888194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35890338 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35890559 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35890840 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35891303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35891312 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35891383 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 35891575 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 35891622 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35891663 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35891774 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 35891827 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35892283 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 35892330 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 35892435 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35892443 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 35892477 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35892509 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 35893050 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35893086 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 35893133 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 35893361 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35893409 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35893422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35893479 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 35893911 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 35893925 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 35893973 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 35894123 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 35894171 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 35894226 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 35894611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35894708 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35894739 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35894747 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35894849 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 35894865 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35894925 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 35894938 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35895198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35895247 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 35895668 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 35895841 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 35895964 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35896162 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35896502 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35896954 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 35897189 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 35897226 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 35897555 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35897653 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 35897808 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35897988 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35898056 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 35898289 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 35898578 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 35898700 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35899045 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35899046 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35899152 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35899169 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35899695 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35900321 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35900327 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35900354 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35900606 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35900672 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35900777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35901061 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35901089 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35901106 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35901263 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 35901339 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35901639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35901882 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 35901972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35902009 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 35902030 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35902078 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35902121 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35902192 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35902474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35902486 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35902543 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35902725 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 35902770 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 35902791 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 35903139 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 35903268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35903308 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 35903558 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 35903758 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35903826 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 35904003 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35904121 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35904204 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35904946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35905233 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 35905288 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 35905372 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35905486 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 35905505 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 35905825 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35905835 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35905950 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35906079 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35906302 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35906457 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35906618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35906837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35906968 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35906996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35907158 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35907399 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35907486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35907572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35907602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35907698 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 35907982 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 35908307 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35908363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35909127 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 35909721 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 35909909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35910031 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35910166 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35910182 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35910234 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35910246 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35910252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35910261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35910276 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35910297 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35910377 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35910433 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 35910664 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35910671 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35910740 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 35911151 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 35911232 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35911318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35912086 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 35916196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35916304 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 35916460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35916657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35916813 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 35916863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35920308 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 35920363 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 35920582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35921130 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 35921463 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 35921559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35921560 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 35921809 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 35921850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35921908 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 35921922 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35922077 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35922133 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35922140 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 35922229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35922241 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 35922326 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 35923074 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35923578 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35923954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35924343 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 35924404 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35925051 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 35925354 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 35925557 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 35925607 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 35925929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35925971 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 35926005 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 35926194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35928763 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35928870 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35931871 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 35933518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35934399 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 35935524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35935723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35936387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35936881 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35937342 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35937910 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35938467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35938482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35938544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35939272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35940455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35940857 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35941610 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35942354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35943855 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35943956 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 35947466 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 35947731 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 35948001 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 35948020 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35948531 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 35948808 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35948817 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35948886 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35949289 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35949491 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35949511 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 35950028 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35950197 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 35950732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35953160 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 35953394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35954343 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 35954856 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35954974 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 35955159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35955789 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 35955886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35956729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35962473 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 35962625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35963399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35964080 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35964762 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 35964931 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 35965055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35965122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35965822 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 35967296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35969783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35970497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35972021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35974230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35976173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35977470 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35977575 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 35981411 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 35982534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35982702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 35984296 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 35985169 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 35985219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35985544 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 35986517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35986635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35986958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35990582 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 35991708 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 35991815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35993583 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 35993658 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 35993740 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 35993917 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 35994122 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 35995012 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35995196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35995254 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 35995943 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35996238 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 35996245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35996253 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 35996520 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 35996584 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 35996649 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 35996656 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 35996702 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 35996858 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 35997316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35997528 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 35998237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35998649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35998891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35998942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35999622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 35999742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35999976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 35999980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36000157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36000325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36000797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36001043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36001109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36001579 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36004882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36006015 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 36006640 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 36006858 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 36006996 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 36007151 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 36007167 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 36007348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36007404 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 36007450 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 36007470 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 36007974 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 36007975 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 36008741 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36008785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36008789 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 36008993 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 36009059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36009064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36009457 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36009467 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36009482 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36009664 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 36009819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36009821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36009857 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 36009912 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36009913 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36009962 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 36009983 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36010071 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 36010105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36010155 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36010763 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36010901 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 36010944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36011247 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 36011265 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 36011898 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36012040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36012135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36012528 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36012532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36012640 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 36012659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36012905 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36013011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36013071 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 36013088 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 36013119 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 36013138 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 36013143 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 36013149 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 36013184 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 36013199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36013278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36013423 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 36013736 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 36013758 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 36013821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36013910 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 36013946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36014082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36014101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36014308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36014334 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 36014487 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 36014508 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36014533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36014555 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 36014567 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 36014591 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36014608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36014634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36014918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36016257 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36016576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36016608 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 36016623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36016750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36016806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36016905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36016953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36017733 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 36017759 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36017874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36018767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36019367 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 36019496 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36019817 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 36020551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36021840 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36022987 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 36023700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36024334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36024692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36026883 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36028297 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36029321 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 36033985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36035000 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 36037028 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36037318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36037905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36039112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36039345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36040106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36041652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36043160 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 36045885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36047314 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36049259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36049901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36051241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36052381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36052664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36054535 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 36055131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36057598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36058339 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 36059168 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 36059869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36060307 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 36060370 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 36061094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36062618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36066421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36067094 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 36067395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36068280 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 36069051 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 36071156 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 36072766 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 36073046 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 36076454 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36078087 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36078330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36078450 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 36079693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36080388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36080389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36080487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36080711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36082524 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36083361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36083533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36084857 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 36087343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36087890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36088468 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 36090329 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 36094442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36101640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36101834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36101958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36103586 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36110723 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36110798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36111149 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 36111387 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 36111507 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 36111589 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 36111613 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36111904 G A Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 36111920 C T Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 36112188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36112284 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 36112302 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 36112687 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 36112766 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 36112824 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 36112838 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 36112914 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 36112991 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36113008 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 36115730 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 36115859 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 36115891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36116050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36116856 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 36117013 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 36119386 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36119587 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 36119672 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 36120223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36121643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36127008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36127962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36128169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36128217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36130030 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 36130543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36130776 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36130982 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36130993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36132303 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36132317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36132327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36132509 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 36132563 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 36132583 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 36132596 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 36132729 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36132794 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36132843 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36132881 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 36132898 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 36132941 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 2 36132972 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36133003 G A Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 36133014 G A Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 36133045 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 36133203 G T Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 36133219 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 36133236 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 36133241 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 36133275 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 36133571 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 36133590 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36133617 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36133993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36135220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36135544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36135931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36136008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36136124 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36136227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36136231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36136420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36136489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36136503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36136647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36136655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36137307 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36137458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36137482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36137525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36138040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36138501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36138514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36138820 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36138846 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36138967 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36139032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36139340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36139358 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36139436 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36140179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36140287 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 36140299 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 36140381 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 36140544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36140864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36141712 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 36141725 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 36141836 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36142141 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36142375 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36142815 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 36143225 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36143287 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36143309 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36143434 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36143462 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36143573 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36144087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36144162 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 36144163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36144305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36144778 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36144816 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36145171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36145374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36145486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36145773 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36145941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36145994 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 36146096 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 36147257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36147323 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36147735 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36147763 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36147823 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36147898 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 36147932 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36147947 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36147962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36147993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36148526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36157061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36158303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36159821 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36160018 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 36160065 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 36161110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36161114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36161377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36161435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36161763 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36162288 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36163440 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36164163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36164369 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36164853 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36165481 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36165494 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36165823 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 36166942 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36167753 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36168206 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 36168629 C G Y N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 2 36168862 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 36169131 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 36169477 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36169934 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36171601 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 36172536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36172565 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36173407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36173457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36173458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36174697 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36174731 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36174801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36175378 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36176551 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36177238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36178186 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36181012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36182299 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36182365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36187728 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36187756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36188072 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 36190761 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 36195430 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 36195487 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 36197299 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36199481 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36200170 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 36213435 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36215743 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36219446 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36219462 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 36219558 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 36219722 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 36219825 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 36220325 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 36220863 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 36220899 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 36222540 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36222550 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36226154 A T Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 36226432 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 36226917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36227311 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36230728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36231235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36231809 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36231810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36233733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36235148 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36235254 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36235474 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36239342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36242113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36242793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36242910 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 36243078 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36243755 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36245595 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36247470 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 36249384 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36250611 C A Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 36253865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36254107 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36254872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36257149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36257220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36257275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36265556 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36267061 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36267248 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 36268196 G T Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 36269200 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36269336 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36269337 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36270028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36270049 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36270127 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 36270989 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36271439 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36273066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36278764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36278864 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36280552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36280645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36284345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36285506 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 2 36287188 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36289552 C A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 36290372 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 36290789 A C Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 36300915 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 36300916 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 36302608 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 36306203 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36307263 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36308039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36312091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36313222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36315692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36316007 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36318007 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36318460 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36320848 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 36325928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36327234 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36328671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36330344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36330930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36336847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36338010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36338981 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 36340385 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36341888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36345299 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36349983 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36353930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36354866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36355040 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 36356411 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 36356850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36356901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36358015 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 36363052 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36373256 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36373257 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36374798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36376254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36376281 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36376465 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36377278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36384579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36384768 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36386133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36386517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36387662 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36394607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36395335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36395800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36396116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36396837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36405086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36405716 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36407278 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36410930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36413049 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 36451278 C T Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 36451332 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 36453330 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 36456453 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 36482395 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36482453 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36482816 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 36482960 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 36483063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36483830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36486202 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36488924 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36490883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36492901 G A Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 36495730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36506254 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 36523268 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 36525441 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 36540624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36548778 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36548868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36548936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36550735 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 2 36552301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36562849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36574453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36575928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36578153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36578459 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36578759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36579615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36579692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36579700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36582857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36583141 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36583315 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36587232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36587243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36588131 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36588826 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36589671 C A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 36592032 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36592821 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 36593492 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36596486 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36598861 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 36602342 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 36605765 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36605982 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 36608987 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 36614979 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 36615551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36622198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36623095 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36623096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36625581 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36625705 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36625919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36626429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36628898 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 36630071 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36630904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36631426 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 36631972 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36634092 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 36635238 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 36637063 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 36637305 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36638219 T A Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 36639820 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36642489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36643659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36644045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36644439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36647991 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 36649217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36650559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36651517 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36652264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36654495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36655307 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36655559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36657205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36658895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36660677 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36662908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36663923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36663980 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36664114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36666515 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36669644 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36671488 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36672824 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36672988 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36673284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36673903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36674204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36674663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36675393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36675948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36677818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36678184 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36678258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36679615 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36680483 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 36680636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36680935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36682213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36682572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36683010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36683435 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 36683811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36687514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36689348 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36689737 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36690263 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 36690884 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36691579 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 36692115 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 36693028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36693766 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 36694453 C A Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 36695713 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 36695740 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36696444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36700417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36700562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36701155 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36702564 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36704358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36706985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36707227 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36710021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36710783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36710848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36710940 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36711663 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36711704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36711789 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36713618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36714826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36716428 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36717364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36719770 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 36722824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36723528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36723606 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 36724387 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36729191 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36730131 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36731406 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36731922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36733447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36737786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36737908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36739578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36741421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36742002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36742166 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36742422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36742961 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36743972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36747640 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36748024 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 36749473 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36751318 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36752093 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36754314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36754553 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36754660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36758777 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36761589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36763232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36764080 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 36766481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36768454 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36768719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36769801 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 36769879 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36769989 A T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 36771876 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36773626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36773639 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 36774654 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36776610 C G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 36777392 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36778383 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36779044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36779493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36780275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36783760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36785878 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 36787533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36788159 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36788528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36789327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36789502 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36791278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36793886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36793914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36800602 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36802457 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36802489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36804450 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36804660 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36804921 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36806161 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36806265 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36806343 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36830187 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36832655 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36832891 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36839706 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36840157 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 36840160 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 36840168 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 36840193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36840425 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36842000 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 36842352 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36844356 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36845639 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36846078 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36847598 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 36848593 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 36848709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36848769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36849858 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 36851096 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 36853253 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36855409 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36856117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36858526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36859542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36859878 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36859916 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36860347 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 36862830 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36863419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36864383 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36864896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36867424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36867487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36867654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36867798 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 36868362 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36868438 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 36868697 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 36869313 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36870108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36871020 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36872155 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 36873272 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36873412 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36874216 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36875306 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36875384 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36875525 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36875791 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 36876061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36876159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36876933 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36878202 T G Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 36878323 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 36879503 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 36879837 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36880370 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 36880868 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 36880884 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 36881324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36883775 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 36886791 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36887284 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 36892320 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 36892501 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36894236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36896360 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36896714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36897868 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36899755 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36900352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36900400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36900769 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 36902433 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36903376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36904703 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36905214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36906934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36907402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36910308 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 36912077 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36912078 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36912903 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36913394 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36913651 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 36914099 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 36914830 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 36916204 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36921575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36922395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 36922713 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36923200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36923434 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 36923982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36926573 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36927599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36927976 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36928764 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 36929178 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36929958 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36930699 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36931364 G T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 36931434 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 36933813 A T Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 36935813 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 36936544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36937223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36938334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36939688 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 36940216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36940639 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36941884 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 36949675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36950777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36952735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36955860 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 36956536 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 36957959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36958104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36958175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36961169 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36962180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36962788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36972612 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 36973291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36975771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36976546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36978120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36978177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36978568 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 36980101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36981425 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 36984645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36985079 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 36986273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36987781 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36989520 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 36989727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36989760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36990066 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36990546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36990675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36991674 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 36991694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 36992949 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 36994470 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 36994501 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 36994670 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 36994991 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 36995127 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 36995325 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 36995441 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 36995566 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 36996007 T C Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 36996167 G T Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 2 36996734 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36997472 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 36997749 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 2 36998724 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 36998809 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 36998824 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 36999302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37000014 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37000083 A T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 37001205 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 37001244 C A Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 37001366 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 37002383 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37003313 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 37003384 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37003677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37003977 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 37004108 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 37004142 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 37004284 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 37005004 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 37005017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37005058 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37005068 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 37005087 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 37005441 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37005552 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 37005759 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 37005910 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 37006139 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 37006192 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37007037 C A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 2 37007133 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 37007394 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 2 37007431 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 2 37007848 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 6 12 3 0 6 2 37007975 A T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 37008737 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 37008945 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37009070 T C Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 37009279 G C Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 37009307 A T Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 37009325 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 37009409 A C Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 37009441 G A Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 37009461 G A Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 37009599 C G Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 37009939 C G Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 37010216 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 37010230 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 37010239 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 37010479 A T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 37010849 C G Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 37010878 G T Y N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 37010974 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 37011160 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 37011404 G A Y Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 2 37011405 A C Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 2 37011420 G C Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 37011807 C A Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 37017303 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 37017330 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 37017500 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 37017577 C G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 37017602 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 37017610 G T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 37017757 T G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 37017858 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 37017962 A C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 37018155 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 37018253 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 37018320 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 37018334 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 37018349 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 37018401 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37018574 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 37018697 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37018720 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37018849 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 37019060 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37019069 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 37019140 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37019186 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 37019280 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37019314 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37019325 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37019360 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 37019438 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37019442 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37019500 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 37019764 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37019775 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37019835 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37020008 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37020187 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37020197 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37020247 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37021745 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37021928 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37022337 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 37022370 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 37023159 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37023187 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37023528 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 37023795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37023855 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 37023876 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37024118 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37024144 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37024226 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37024334 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 37024777 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 37025190 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37031677 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 37031700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37031998 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37032196 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 37032453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37032582 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 37032741 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 37032842 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 37032930 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37033075 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 37033110 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 37033826 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 37034165 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37034318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37034763 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37035008 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37035034 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37035122 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37035260 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37035730 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37036129 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 37036196 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 37036340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37036405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37036424 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37036638 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37036849 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37037347 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 37037577 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 37037581 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 37037594 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 37037734 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37037847 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37038825 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37038898 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37039077 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37039206 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37039776 G C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 37039841 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 37039846 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37039965 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 37039996 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 37040184 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 37040256 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 37040292 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 37040555 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 37040689 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37041090 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 37041202 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 37041296 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 37041393 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 37042614 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 37042839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37043360 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37043404 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37043881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37043884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37043912 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37043946 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37043957 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37044291 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37044363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37044372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37044397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37044697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37044819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37045829 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 37045960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37046041 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37046064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37046186 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 37046695 C T N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 37046718 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 37046772 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 37047162 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 37047268 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37047995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37048216 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 37048332 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37048416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37048651 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37048992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37049228 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 37049425 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 37049636 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 37050345 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 37050356 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 37050433 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37050551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37050706 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37051006 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 37051209 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 37051214 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 37051573 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 37051601 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 37051602 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 37052155 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 37052180 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 37053165 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37053166 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37053223 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 37053324 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37053465 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37053663 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 37054300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37054575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37054861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37054951 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 37055086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37055655 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 37055663 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37055891 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37055913 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 37056262 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 37056280 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 37056633 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 37056645 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 37056689 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 37059458 A G Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 37064029 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37069478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37070026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37071811 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 37076650 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 37076860 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 37077063 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 37078780 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37078852 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 37079439 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37080104 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37080310 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 37081933 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37082319 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 37082354 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37082588 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 37082808 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 37082810 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 37082993 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37084385 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37085010 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37087598 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 37090272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37090461 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37090649 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 37092255 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37092596 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37092883 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37101219 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 37101915 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 37104396 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 37107127 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 37108253 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 37109295 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 37112268 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 37114646 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37115959 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 37116081 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 37116139 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37116168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37120908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37121387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37128489 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 37128809 A G Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 37128843 A C Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 37128848 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 37128861 T C Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 37128893 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 37128944 C G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 37128973 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 37128994 G T Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 37129031 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 37129317 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 37129530 C G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 37129628 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 37129675 T A Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 37129690 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 37129702 G T Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 2 37129705 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 37129750 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 37129823 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37130123 T C Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 37130188 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 37131422 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 37131568 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 37131673 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 37131755 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37131805 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 37131835 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 37131886 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 37131982 T G N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 37132063 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 37132427 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 37132588 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37133136 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 37133156 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 37133280 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 37133365 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 37133366 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 37133399 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 37134141 A T Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 37134157 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37134180 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 37134215 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 37134757 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 37136550 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 37137602 G T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 37144974 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 37146759 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 37148348 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 37148647 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 37152067 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 37152442 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 37154506 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 37155369 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 37158252 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 37160454 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 37160645 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 37161536 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 37162497 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 37163267 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 37163652 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37164066 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 37164159 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 37164878 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 37165221 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 37165326 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 37165465 A C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 37165755 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37165831 G T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 37166003 A G Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 37166060 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 37166102 C G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 37166291 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37166624 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37166810 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 37166863 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 37167100 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 37167111 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 2 37167125 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 37167233 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 37167574 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 37168291 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 37168296 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 37168805 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 37169014 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 37169310 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 37169470 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 37169726 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 37169996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37170293 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 37170304 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37170696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37170853 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 37171039 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 37171051 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37171304 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37171490 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 37171729 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 37172283 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37172418 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 37172578 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37172735 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37172983 A G Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 2 37173153 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37173341 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 37173358 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 37173370 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 37173375 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 37173384 A T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 37173664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37173873 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 37174274 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37174338 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 37174443 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 37174628 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 37174655 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 37174660 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 37174728 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 37174759 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 37174880 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 37174922 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 37175141 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 37175192 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37175207 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 37175266 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 37175422 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37175513 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37175522 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37175560 T C Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 37176064 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 37176162 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 37176190 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37176274 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 37176285 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 37176306 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 37176447 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 37176462 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 37176511 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 37176532 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 37176534 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 37176551 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 37176568 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 37176597 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 37176688 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 37176700 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 37176877 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 37176879 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 37177028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37177083 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 37177510 C A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 37177515 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 37177558 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 37177595 T C Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 37177663 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 37177686 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37177725 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37177802 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 37178166 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 37178208 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37178287 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37178291 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 37178322 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 37178323 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37178408 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 37178469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37178521 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 37178543 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37178551 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 37178711 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 37178754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37178763 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 37178821 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37178883 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37179103 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 37179213 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37179240 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37179348 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 37179375 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 37179393 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 37179468 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 37179540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37179565 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37179584 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 37179846 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 37179985 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 37180164 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37180215 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37180273 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 37180685 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 37180709 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 37180730 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37180952 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 37181055 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 37181175 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 37181345 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37181381 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37181389 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37181392 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37181478 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37181505 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 37181750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37182137 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 37182193 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 37182204 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 37182479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37182850 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 37183214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37183239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37183285 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37183320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37183322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37183341 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 37183372 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 37183377 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 37183468 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 37183473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37183488 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 37184133 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 37184384 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 37184910 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 37186034 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 37187290 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 37191262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37192580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37206521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37209233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37211908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37215072 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37215367 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37220320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37220392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37222433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37224141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37224609 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37226039 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37226402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37227018 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37237209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37241029 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 37243459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37243620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37244601 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 37249778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37251762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37251916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37257995 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37259649 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37259879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37261615 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37263160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37263354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37265489 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 37265830 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37272696 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 37272819 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 37273423 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37277430 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37278232 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 37280681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37281038 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37281862 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37281863 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37282812 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37283567 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37285191 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37285590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37286303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37286954 T C Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 37289478 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 37289573 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 37292684 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37294311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37294885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37296375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37302255 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37303408 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37306208 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37309538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37309610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37309832 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37310718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37310790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37310945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37311239 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 37314765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37318031 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 37325678 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37327181 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 37327538 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37328547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37328804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37330689 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 37333093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37333558 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 37334031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37334436 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37335956 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37336127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37336664 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37337456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37337823 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 37337828 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 37338076 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 37339082 G C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 37339788 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37341034 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37341967 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37344270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37344826 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37345165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37346319 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37346525 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37348482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37350726 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 37351844 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 37351872 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 37351895 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 37351896 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 2 37351913 C G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 37352761 A T N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 37353363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37354094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37360619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37360818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37362564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37363489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37364259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37364393 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37365882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37367563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37369688 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37371472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37371794 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 37372037 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 37374813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37377159 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37380734 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37380891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37382894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37390071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37390506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37391933 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37394810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37395146 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 37396822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37398742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37405344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37405876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37406084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37406568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37407337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37407344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37409862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37411709 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37416154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37416405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37420508 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37421462 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 37423684 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37423729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37425461 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37427832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37435522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37435910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37449544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37450282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37453609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37454158 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37454479 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 37457271 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37457272 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37457998 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 37461144 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37462072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37463974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37464656 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37465591 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37471758 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37472069 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 37472376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37474302 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37475485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37475727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37475728 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37476340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37478843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37479321 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37479540 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37480333 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37481704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37482949 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 37486266 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 37491354 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37496049 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37501741 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37503767 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37504756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37505178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37513601 T C Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 37515245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37519566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37520427 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 37521317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37521620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37521656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37521761 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37525190 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 37527401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37529465 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37530803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37532237 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37533275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37535501 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37535584 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37536688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37537185 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37542069 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37543260 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 37544143 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 37544531 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37545738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37546135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37546414 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37547576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37549702 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 37549799 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37551761 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 37552228 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37552601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37553194 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37567405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37567406 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 37567937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37568349 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 37568665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37569568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37570285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37570287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37570299 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 37570300 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 37571988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37575307 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37576283 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 37576581 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 37579774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37583544 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 37586975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37588099 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 37590648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37592824 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 37595280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37595284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37595407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37595455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37595659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37597223 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37600077 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 37600709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37600797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37600864 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 37600992 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37601434 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 37601518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37602754 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 37602827 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 37603300 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37603361 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37603584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37603799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37603819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37603909 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 37604065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37604229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37604424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37604544 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 37604647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37605131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37606195 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 37606296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37606485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37606770 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37606920 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 37607205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37607342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37607468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37607652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37607852 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 37607856 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 37607875 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 37607889 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 37608306 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 37608343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37608373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37608552 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37608707 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 37613239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37613770 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 37615054 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 37617080 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 37617605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37617722 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 37619017 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 37619063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37619322 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 37619549 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 37619698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37620275 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 37622005 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 37622092 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 37622102 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37622787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37622847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37623006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37623154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37623238 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 37623254 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 37623688 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37623777 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 37623941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37625587 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37625717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37627530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37628150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37628181 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 37628984 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37629433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37629874 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 37630073 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37630562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37630782 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37630816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37630872 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 37630976 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37630977 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 37631078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37631125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37631903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37633365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37633492 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 37633676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37634014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37634123 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 37634168 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37634259 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 37634299 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 37634544 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 37634615 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 37634618 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 37634672 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 37634752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37634823 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 37635005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37635050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37635075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37635128 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 37635369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37635428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37636112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37636244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37636447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37636505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37636532 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 37636553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37636577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37636683 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37636700 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 37636883 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37636906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37637332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37637865 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37637879 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 37637986 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 37638089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37638100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37638107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37638204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37638208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37638260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37638405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37638422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37638483 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37638537 A T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 37638731 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 37640170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37640662 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37641264 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37643020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37644459 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 37645024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37645184 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37645334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37645366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37649558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37649561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37649757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37653261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37656567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37656984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37657179 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37657247 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37657282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37657359 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37657419 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37657448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37657458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37657509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37657905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37657929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37658037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37658381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37658395 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37658892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37659116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37660104 A G Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 37660248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37660393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37660847 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37661342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37661625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37662660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37663154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37663589 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 37663592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37665769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37668901 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37669264 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 37670864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37671136 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37671137 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37674168 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37674703 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 37675667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37676349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37676476 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37676526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37677263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37677418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37677745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37679845 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 37679895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37680688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37682556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37683671 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37683937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37684771 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37687976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37689129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37689210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37690798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37690810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37691009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37691787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37691975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37693524 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37696929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37697118 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 2 37698043 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37698897 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37700527 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37705597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37707331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37707640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37714285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37714768 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 37717041 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37717213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37723033 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37723040 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37723217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37723331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37723604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37723745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37724140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37724396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37724677 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37724697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37725260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37725665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37726605 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37727797 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37728112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37728924 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37728971 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37729058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37729518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37729813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37732264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37736829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37737578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37737921 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37740715 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37741129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37742655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37742738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37743754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37744713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37744815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37744974 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 37744982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37745296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37745329 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37746794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37747707 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37748082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37748458 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37749018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37749329 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37749555 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37749708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37751524 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37751525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37751546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37751593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37751748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37751851 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 37751975 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 37753124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37753199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37753428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37753939 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 37754627 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 37754926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37754974 T A Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 37755208 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 37755779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37756816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37759951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37759982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37760489 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37761264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37761951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37762585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37763104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37763463 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37763809 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37765418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37767486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37768608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37769633 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 37775408 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37775773 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37776365 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 37780150 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37780886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37782109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37782619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37782865 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 37784883 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37790796 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 37790875 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37791176 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37791882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37793090 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37794086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37794919 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37795208 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37796472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37796560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37797138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37797407 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37797681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37798310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37798730 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 37800690 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 37801478 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37801539 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37802062 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37804398 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37804564 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37804791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37805147 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37805988 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 37806197 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37807011 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37807992 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37808336 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 37808575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37808615 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37809317 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 37809691 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37810210 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37810255 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 37810907 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 37811357 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37811392 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37812239 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 37812259 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 37812776 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37813347 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 37813797 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37813824 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37814875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37815560 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37818151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37820396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37822074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37822128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37822413 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37823444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37824712 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37824750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37826358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37827021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37830452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37831396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37833934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37836186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37838209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37842495 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 37847460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37848275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37849558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37852579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37853862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37855189 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37855801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37855894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37857834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37858112 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37858116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37859364 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 37859644 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37860767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37861863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37862164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37862528 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 37863181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37864279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37864297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37865101 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37868775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37870157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37871865 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 37872271 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37872765 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37873351 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37873430 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37873678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37876222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37876425 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37878925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37879959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37880576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37880824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37881369 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37881603 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37881666 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37882338 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37882656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37882726 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37883138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37883291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37883300 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 37883940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37884050 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37885925 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37886035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37886049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37888254 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37888614 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37890107 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37891557 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37891610 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 37893069 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37893287 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37894049 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 37895044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37895817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37896525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37897267 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 37897780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37898816 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37900724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37900807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37901219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37901620 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37902073 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37902084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37902266 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37902365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37902884 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37903003 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 37903748 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 37904325 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 37905651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37906147 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37907328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37907669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37908258 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37908378 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37908459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37908494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37908583 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37908766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37909209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37917615 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37917765 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37918245 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 37918338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37919340 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37919480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37919651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37919681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37919685 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 37919941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37920185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37921567 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37921770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37922896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37923040 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 37923196 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37923218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37923539 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37923740 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 37924109 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37924130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37924182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37924998 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 37925328 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 37925721 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 37925967 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 37926051 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 37926348 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 37927557 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37928097 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37928894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37929696 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 37929704 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 37930487 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37931196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37932161 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 37932365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37932414 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 37932471 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 37932931 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37934563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37934798 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37935508 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 37935629 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37935979 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37937101 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 37937192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37937299 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37937641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37937891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37938225 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37938291 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37938329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37938525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37940361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37940633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37941022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37941276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37941302 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 37941499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37942139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37942283 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37944004 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37944564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37944615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37944896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37945493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37945715 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37945764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37945906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37946477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37947264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37947276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37947909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37948896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37950290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37950463 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37950918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37951129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37951316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37951465 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37952621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37952625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37953627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37954453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37955214 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37955752 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37955846 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37956464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37957092 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37957246 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37960151 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37960325 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37960925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37961127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37961499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37962601 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37962962 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37962964 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37963117 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 37963608 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37963806 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 37963884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37966210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37966638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37966939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37969792 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 37970024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37971496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37973164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37974479 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 37976632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37977291 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37977292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37978137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37978360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37979220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37979885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37980438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37980444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37984169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37986017 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37986330 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37986819 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37987669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37988466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37993195 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37993253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37993293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37993323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37993337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37994510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 37996257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 37997440 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 37998919 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38001188 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38002432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38002649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38002790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38007607 T G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 38008581 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 38011117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38018324 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38021384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38024239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38025106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38025845 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38026785 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38027657 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38032321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38036280 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38036287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38037752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38038124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38038471 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38040922 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 38041547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38042875 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38046650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38050103 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 38050677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38052063 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38053023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38060894 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38062931 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38063239 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38065954 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 38072334 G A Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 38078283 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38081934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38084372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38091223 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38099913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38100763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38103393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38106897 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 38112862 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 38116121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38118320 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38120757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38121097 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 38123548 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38127257 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 38130066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38133956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38134470 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38134876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38135530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38138852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38140168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38140298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38140714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38142125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38144341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38145501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38146379 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 38148089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38148718 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 38150145 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38151988 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38153558 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 38153877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38154154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38154212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38154799 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 38154904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38156143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38157660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38157942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38159734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38160331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38160402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38160587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38161513 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38161536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38161830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38162470 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38163253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38164697 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38167535 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 38167976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38167988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38168111 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 38168166 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 38168793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38168801 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38168824 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38169181 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 38169308 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 38169385 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 38169581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38169822 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 38170092 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 38170357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38170376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38170401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38170405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38170414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38170445 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 38170631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38170720 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 38170741 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 38170785 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 38171314 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 38171540 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38171557 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 38171577 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 38171755 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 38171995 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 38172048 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 38172282 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 38172573 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 38172584 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 38172600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38172660 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 38172861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38172936 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38172950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38173050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38173433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38173870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38175485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38175723 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 38175877 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 38176592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38176622 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38177161 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 38177539 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 38177671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38178011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38180302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38180339 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38181287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38181987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38182146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38184557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38186712 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 38197333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38198057 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 38198595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38199739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38200607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38201627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38206339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38208734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38209058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38216641 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38216820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38220485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38223077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38225395 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 38225510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38225540 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 38225597 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 38225878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38226740 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38229082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38229474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38232824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38233155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38234624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38235181 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 38235803 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 38236485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38238087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38238138 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38238150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38240245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38240609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38240649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38240680 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38240712 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38240746 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38240812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38241026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38241035 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 38241109 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 38242134 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 38242217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38242247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38244238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38244480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38244952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38245208 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38245328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38245404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38245595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38245644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38245661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38246131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38246388 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 38246391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38246612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38246623 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38247335 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 38247865 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 38248031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38248210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38248288 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38248330 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 38248469 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 38248479 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38248507 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 38248516 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 38248602 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 38248719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38248867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38248881 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 38248991 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 38249034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38249233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38249716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38251983 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 38253016 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38253228 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 38253265 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 38253322 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38253525 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 38253585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38253735 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 38253971 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 38254046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38254563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38254576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38254696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38254908 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38255023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38255090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38256732 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 38256853 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 38256854 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 38256951 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 38256952 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38257027 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 38257105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38257198 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38257271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38257403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38259050 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38259523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38259720 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38260290 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38260497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38260587 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38264252 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 38264285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38264289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38264357 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 38264388 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 38264633 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 38264818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38266668 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38266761 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 38266774 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 38266799 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38266849 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 38267105 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 38267546 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38267970 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38267998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38268137 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 38268204 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 38268312 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 38268598 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 38268678 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38268829 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38268958 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 38269000 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38269038 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 38269045 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 38269112 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38269165 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 38269245 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 38269278 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38269289 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38269299 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 38269333 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 38269345 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38269392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38269400 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 38269465 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 38269552 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38269630 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38269711 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38269734 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38269921 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 38270053 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38270210 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 38270245 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 38270494 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 38270532 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 38270563 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38270806 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 38270847 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38270852 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 38270962 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 38271200 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38271294 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38271324 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38271633 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 38272071 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38272129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38272230 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38272280 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38272310 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 38272423 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38272468 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 38272564 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 38272620 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 38272707 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 38272829 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38272864 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38272924 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38272961 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38273070 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 38273223 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 38273269 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38273369 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38273371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38273484 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38273519 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38273533 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38273550 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38273588 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38273596 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38273623 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38273626 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38273641 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38273668 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38273732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38273800 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38273815 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38273817 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38274113 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 38274313 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 38274348 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38274443 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38274620 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 38274727 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 38274762 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38275025 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 38275057 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 38275124 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 38275368 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 38275475 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 38275534 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 38275535 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 38275640 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38275849 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38276728 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38276896 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38277105 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38277275 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38277292 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38277320 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 38277358 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 38277401 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38277410 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 38277586 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38278262 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 38278418 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38278422 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38278454 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 38278471 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38278485 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 38278500 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 38278579 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 38278587 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 38278628 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 38278701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38278800 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 38278838 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 38279003 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38279060 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38279175 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 38279180 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 38279225 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 38279269 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38279299 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38279304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38279319 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38279398 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 38279474 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38279659 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 38279717 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38279772 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 38279824 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 38279832 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38280760 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 38280997 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38281045 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 38281122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38281241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38281374 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 38281452 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 38281635 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 38281645 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 38281647 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 38281662 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38281691 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 38281719 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 38281746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38281786 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38281913 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 38282073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38282221 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38282433 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38282434 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38282476 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 38282507 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 38282512 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 38282551 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 38282658 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38282799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38282876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38282987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38283009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38283186 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 38283260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38283279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38283302 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 38283329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38283386 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 38283455 A G Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 38283540 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 38283545 G C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 38283559 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 38283651 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 38283760 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 38283789 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 38283850 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 38283866 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 38283989 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 38284006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38284018 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 38284359 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38284415 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38284421 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38285068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38285125 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 38285550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38285584 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 38285906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38285961 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38286027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38286177 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 38286180 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 38286220 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 38286260 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38286264 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38286317 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38286365 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 38286432 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38286551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38286567 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 38286747 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 38287206 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 38287251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38287570 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 38287642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38287974 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38288945 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 38289299 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38289504 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38289549 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 38289778 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38289991 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 38290515 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 38291089 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 38291155 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 38292131 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38292390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38292501 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 38292600 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38292615 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 38292649 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 38292722 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 38292746 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 38292780 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 38293040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38293103 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 38293245 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 38293436 G A Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 38293507 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 38294475 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 38294896 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 38294985 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38295086 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 38295091 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 38295166 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 38295214 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38295279 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38295522 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 38296251 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38296272 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 38296444 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 38296542 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 38296678 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 2 38296919 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 38296969 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 38297037 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 38297122 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38297144 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38297414 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38297723 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 38297791 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 38298969 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 38299834 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 38300368 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 38300593 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38300802 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38302139 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38302202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38303698 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 38303779 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 38303909 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 38304456 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 38304592 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 38304612 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 38305164 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38306049 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 38306239 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38306247 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38306504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38306801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38307026 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 38307529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38307554 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38307671 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38308068 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38308885 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 38308990 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 38309068 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38309209 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38310843 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 38311160 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38311254 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 38312465 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38312579 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 38312584 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38312755 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38313175 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38313378 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 38313576 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38313600 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38313675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38313691 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 38313790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38314079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38314220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38314279 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 38314346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38314399 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 38314503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38315704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38315723 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38315889 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38316156 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 38316430 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38316753 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 38316863 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38317125 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 38317361 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 38317395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38317413 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 38317516 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 38317859 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 38318470 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38319061 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 38319572 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 38319847 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 38320146 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38320291 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38320450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38320534 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38320632 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 38320703 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 38320833 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 38320988 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38321042 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38321064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38321095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38321443 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 38321472 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38321616 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 38321754 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38322000 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 38322042 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 38322661 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38322802 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38322856 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 38322998 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38323092 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38323111 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38323161 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 38323222 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 38323246 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38323277 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38323528 C T Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 38323529 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 38323638 T G Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 38324333 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 38324545 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38325240 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 38325309 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 38325432 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 38325462 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38325476 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38325923 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 38325968 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 38326441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38327128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38329007 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38329048 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 38329084 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38329088 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 38329193 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38329335 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 38329355 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 38329754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38329788 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38329836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38330027 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38330126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38330228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38330280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38330422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38330424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38330824 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 38330986 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38331295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38331356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38331385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38331607 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38331661 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38331967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38332315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38332331 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38332341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38332383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38332410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38332418 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38332421 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38332463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38332479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38332513 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38332841 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38335346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38336826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38336963 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 38336996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38337011 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 38337906 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 38337935 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 38337993 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 38338024 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38338073 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 38338298 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38338351 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38339457 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 38339465 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 38339890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38340284 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 38340299 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38340302 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38340641 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 38340693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38341648 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38341743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38342683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38343146 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 38343262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38344350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38344393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38344801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38344810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38345278 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 38345353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38345369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38345380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38346232 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38347281 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 38348775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38348798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38348840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38348868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38348902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38349114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38349177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38349220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38349575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38349747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38349955 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38350179 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38350314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38350323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38350398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38350451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38350703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38351048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38351291 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38351328 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38351340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38351395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38351459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38351492 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 38351655 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38351689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38351744 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 38351758 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 38352128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38352256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38352285 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38352316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38352404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38352562 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38352607 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38352631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38352639 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38353001 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 38353136 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38353208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38353350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38353372 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38353384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38353478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38353540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38353584 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38356149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38356400 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 38357572 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 38357664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38357671 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38358171 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 38358184 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 38358232 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 38358358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38358438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38360209 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 38360247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38360983 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 38360990 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 38361095 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 38361234 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 38361277 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 38361314 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 38361390 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 38361710 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 38361788 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 38361793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38362253 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 38362705 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 38362727 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 38362815 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 38363166 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 38363220 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 38363259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38363313 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 38363764 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 38363811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38363906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38363958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38364113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38364287 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 38364661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38364935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38365094 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 38365324 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 38365363 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38368197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38368416 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 38368920 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38370010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38370867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38373348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38374821 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38375409 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38375852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38379123 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 38382387 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38382535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38383541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38383545 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38383726 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38384984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38385037 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38385275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38386085 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38386291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38386422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38386519 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38387286 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38388107 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 38388463 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38389793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38390077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38390101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38390103 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38392244 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 38395345 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 38398977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38399483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38407010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38407122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38407305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38407444 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 38419738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38424835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38425884 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38426569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38426817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38428398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38429175 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38429181 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38429568 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 38429766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38429838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38429843 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38429897 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38430019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38430033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38430292 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38430669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38430780 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 38430974 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 38431300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38431381 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 38431443 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 38431448 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 38431809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38432049 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38432594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38433307 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 38433473 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38433483 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38433920 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 38434038 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 38434478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38435137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38435464 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 38435581 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 38435725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38435735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38435762 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38435791 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 38435942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38437127 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 38438761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38439244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38439891 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 38440289 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 38440683 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38441519 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38442150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38442482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38443085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38443101 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 38443911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38444043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38445924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38445976 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 38446192 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 38446723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38447395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38447672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38448313 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38449278 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 38451973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38453208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38453332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38453657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38453772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38454415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38455382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38455644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38455809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38456369 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 38459101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38459496 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38459646 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38460481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38460491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38460727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38460992 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38461738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38463005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38463013 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38463254 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38463281 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 38463441 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38463446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38465991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38466163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38466656 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 38466831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38468312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38468318 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 38468916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38469428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38473179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38473637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38474231 T C Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 38476280 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 38477440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38478967 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38480019 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38481202 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38487315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38487568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38487968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38489042 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38491093 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 38491795 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 38492770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38494113 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38494330 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38496522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38499053 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38499366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38499993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38500909 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38501850 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38501879 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38503578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38503627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38504662 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38506711 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 38506734 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 38506888 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 38507051 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38507488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38507649 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38508044 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38508084 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 38508148 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 38508827 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38509125 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38509920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38510014 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 38510096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38510130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38510132 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38510202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38510221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38510229 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38510240 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38510402 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 38510409 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38510468 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38510910 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 38511392 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 38511660 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 38511663 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 38511674 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38511803 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38511828 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38511897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38511924 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38511960 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38512060 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 38512126 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38512152 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38512522 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38512635 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38512678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38512829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38512949 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38513073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38513272 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 38513475 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38513528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38513576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38513809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38514359 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38514644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38514661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38514805 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 38514833 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 38514960 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38515013 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 38515522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38515582 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38515705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38515747 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38515778 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 38515848 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 38515891 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38516074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38516187 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38516330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38516369 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38516554 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38516655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38516973 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38517074 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 38517147 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 38517334 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 38517445 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 38517529 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 38517617 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38517631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38517730 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 38517732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38517811 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 38517996 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38518063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38518610 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 38518777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38519660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38519713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38519762 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38519788 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 38519874 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38519885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38520297 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38520440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38520468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38522378 G T Y N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 2 38522609 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38522614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38522765 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 38523415 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38523448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38523698 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 38523914 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38524027 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38524409 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38524497 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 38524558 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38524776 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38524815 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 38525098 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38525275 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 38525290 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 38525325 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 38525536 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38525542 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38525562 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 38525576 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 38525799 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 38525812 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 38525995 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38526006 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38526070 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 38526464 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38526480 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38526489 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38526583 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38526601 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38526648 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38526655 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38526659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38526676 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 38526724 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 38526741 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 38526768 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 38526777 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 38526829 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 38526848 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 38527036 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 38527152 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38527180 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38527319 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38527437 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38527460 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38528012 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38528022 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38528025 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38528095 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38528109 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38528527 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38528541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38528662 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38528978 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38528986 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38529043 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38529151 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 38529179 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 38530173 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38530273 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38531239 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38531240 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38531324 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 38531363 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38531662 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38531854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38533950 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 38534139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38535346 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38535378 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38535416 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38535577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38536167 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38536189 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38536309 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 38536322 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38536371 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38536380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38536408 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38536929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38537280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38537455 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 38537485 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38538833 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38539201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38539243 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38541201 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38541630 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38541658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38541693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38541772 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38541926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38543860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38544724 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 38545519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38545526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38547454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38548005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38548688 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38550539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38551244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38551450 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38552464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38553085 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38557211 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38558320 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38559302 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38562332 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38565765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38568088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38568529 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 38568847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38569214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38569953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38570312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38574994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38575479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38579860 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38580868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38581798 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38581903 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38582770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38583978 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 38585727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38588010 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38590133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38590178 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38590234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38592360 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38598086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38605624 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 38605656 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 38607716 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38610520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38614086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38616434 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 38621931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38627887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38630010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38632120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38633926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38636008 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 38637299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38639196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38640311 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38641370 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38643474 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38644034 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38644360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38645280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38647770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38650928 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38651214 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 38651481 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38653931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38653962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38653965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38654538 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 38656658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38659133 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38659435 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38662249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38662266 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38664289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38665799 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38665968 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38666070 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 38667788 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38669557 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 38670608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38672545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38674000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38674708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38681168 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38684144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38684269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38684891 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 38688385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38689390 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 38689569 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38690089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38690262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38690483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38692604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38694372 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38696135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38697802 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 38698692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38698798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38699036 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38699119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38699124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38709973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38711322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38712914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38713043 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38714484 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38718752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38719966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38721875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38722437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38724644 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38727040 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38727327 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 38729872 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38731416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38732612 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38733554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38733753 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38737336 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38737470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38738649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38739575 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38743155 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38744970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38746741 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38748136 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 38748510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38748745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38750639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38751052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38751338 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38751651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38752317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38752646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38752737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38753174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38759360 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 38759648 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 38761086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38764845 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38766179 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38767214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38771503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38772274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38772798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38780140 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38782858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38783924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38784090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38784246 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38785660 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38785977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38786140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38786264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38788955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38789102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38791026 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38791055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38791292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38791349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38792323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38793541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38794708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38795266 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38795691 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 38795769 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 38796418 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38796450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38796534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38797204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38797851 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38798134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38798454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38798606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38799065 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38799094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38799124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38799297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38799357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38799381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38800359 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38801315 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 38802083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38802132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38802543 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38802592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38806699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38806975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38807593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38808076 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38809581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38809819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38810558 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 38811473 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38812003 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38814401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38814740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38814777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38814857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38814868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38814884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38814887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38816566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38816588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38816626 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38816761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38817086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38817384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38817632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38817801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38819052 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 38821568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38821726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38821736 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 38821952 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38822268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38822410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38822690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38823017 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38823692 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 38824193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38824366 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38824978 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38825350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38825447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38827600 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38827763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38828197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38828434 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38829034 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38829344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38829515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38829587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38829601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38829852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38831952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38832659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38833051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38833331 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38834211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38834255 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38834571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38835622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38837309 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 38837389 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 38837466 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 38837480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38838737 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 38838930 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38839761 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 38839813 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38840423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38840652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38840732 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38841449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38844042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38844226 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 38844538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38844583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38844802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38844825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38844989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38844996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38845381 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38845417 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38845593 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 38845710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38846039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38846137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38846232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38846875 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38847191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38847323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38847571 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38847675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38847858 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38848026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38848371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38848389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38848415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38848422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38848460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38848501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38848520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38848539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38848574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38848773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38848868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38848889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38848989 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38850023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38850084 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38850491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38850865 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38851726 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38851919 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 38852058 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38852800 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 38853747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38854464 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 38854614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38854725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38854781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38857501 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 38857527 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 38858446 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 38858566 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 38858687 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 38858703 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 38858834 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38859062 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 38859456 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38860596 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38861332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38863674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38863978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38864074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38865331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38865410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38865860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38867181 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38869187 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38870216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38871966 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38871994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38873621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38874227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38875206 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 38875515 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 38875561 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 38875936 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 38876236 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38876820 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38878199 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38878290 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38878494 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38878630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38878777 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 38878828 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 38879033 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38879034 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38879235 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38879400 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38879656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38879870 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 38879890 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38879904 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38880181 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38880213 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38880345 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38880365 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 38880376 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38880540 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38880618 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38880656 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38881002 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38881032 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38881232 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38881361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38881876 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38881909 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38882107 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38882271 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38882333 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38882389 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38882496 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38882707 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38883099 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 38883292 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 38883303 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 38883833 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38883863 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 38883927 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38884013 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38884195 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 38884470 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38884520 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38884543 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38884635 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38884914 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38884923 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38885030 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 38885064 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38885074 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 38885083 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 38885403 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 38885723 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38885886 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38886025 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 38886138 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 38886154 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38886204 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 38886748 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 38887273 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 38887289 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38887690 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 38887752 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 38887945 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 38888002 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38888083 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 38888140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38888258 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 38888522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38889070 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38889076 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38889084 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 38890034 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 38890215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38890770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38892169 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 38892741 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38893971 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 38894075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38894491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38895497 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38895789 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38895860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38895910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38896201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38896209 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38896487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38897801 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 38897813 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 38899107 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38899596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38899698 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38899938 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 38900208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38900503 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38900514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38900904 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38900931 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 38901059 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38901249 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38901534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38903137 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38903592 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 38903748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38904256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38905298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38906101 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38906267 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38906351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38906778 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 38908960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38909005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38909918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38910147 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38911029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38911938 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 38912394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38912702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38914379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38914823 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 38914864 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38915286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38915509 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38915607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38915691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38915877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38916062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38916516 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38916758 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38916838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38917504 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38918271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38918370 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38918582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38918729 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 38919037 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38920223 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 38920363 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38920785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38921350 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 38930479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38931820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 38933571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38941524 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38945199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38949782 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38950170 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38950183 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 38950620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38950978 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38952408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38955106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38955172 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 38957118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38957123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38958762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38959790 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38960639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38961521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38962096 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38962267 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 38964496 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38966085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38966379 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 38966695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38967517 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38969883 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38970601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38971191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38972351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38974099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 38974249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38975055 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 38976024 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38977875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38979222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38980252 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 38980441 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38980873 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 38980951 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 38981339 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 38981365 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 38981371 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 38981474 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 38982478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38983309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38990911 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 38992396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 38998675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39003132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39005710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39010812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39012497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39016589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39020249 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39020771 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 39020777 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 39020808 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 39020934 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39020936 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39021000 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 39021137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39021174 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39021229 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39021750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39021755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39022037 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39022402 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39022885 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39024144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39025115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39025172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39025781 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39025923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39026114 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 39026180 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39026262 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 39026423 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39026690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39028869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39031358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39031830 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 39032319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39033274 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 39033492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39034950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39037051 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39039285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39039479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39039561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39039803 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39041026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39041691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39042226 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39042485 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39042703 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 39043099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39044947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39045109 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39045747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39046097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39046267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39046365 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 39046744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39047809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39048300 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39048658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39049078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39049430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39050063 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39051256 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39053338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39053386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39053495 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39054129 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 39054577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39054798 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39055661 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39056564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39058432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39058448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39058468 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 39058472 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39058910 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 39059564 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39059612 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 39063026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39063426 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 39063976 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39065993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39066673 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39066842 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39067243 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39068014 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39069466 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39069914 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39070412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39070696 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39071029 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 39071207 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39071876 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 39072155 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39072189 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 39072604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39072894 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 39072949 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39073280 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 39073723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39075356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39075473 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39075573 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39077070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39077135 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39077285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39077542 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39077663 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 39077867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39078181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39078280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39079300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39079426 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 39079760 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 39080312 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39080375 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 39080838 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39080958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39081086 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 39081156 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39081277 A T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 2 39081554 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 39081878 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39081913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39082011 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39082439 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 39082704 C G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 39082739 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 39082771 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39082791 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 39082901 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 39083016 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 39083252 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39083857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39083929 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39083934 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 39083994 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 39084504 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39084696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39084911 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 39086297 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39086520 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39086660 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39086917 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39088297 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39088946 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39088959 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39088964 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39089669 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 39089886 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39089936 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39090023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39090109 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39090129 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39090238 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 39090338 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 39090651 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39090929 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39090940 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39091063 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39091208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39091561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39092199 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39092247 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39092304 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39092323 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39092330 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39092353 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39092496 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39092530 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39092542 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39092573 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 39092689 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39092797 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39092898 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39092984 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39095283 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39095865 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 39103207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39103707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39103854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39105322 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39106802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39106907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39108341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39109024 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 39109060 G A Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 39110364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39110847 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39114802 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 39114862 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 39114874 G T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 39114878 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 39114894 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 39115689 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 39117737 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 39117759 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 39117763 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 39118492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39124342 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39124930 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39129198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39129893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39133755 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39135033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39135630 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 39135672 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39135928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39135937 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39135984 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39136104 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39136695 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39137274 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39139545 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39139788 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39139885 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39140256 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 39141577 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39141872 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39141939 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39142120 T G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 39151077 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 39151146 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39151438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39152117 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 39152186 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 39152680 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39152790 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 39152805 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39152838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39152878 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39152921 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 39152975 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39152978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39153021 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153041 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39153157 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153169 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153171 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153238 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153316 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153332 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153411 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153423 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 39153454 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153523 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153539 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153575 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 39153581 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 39153607 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 39153756 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39153836 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39154015 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 39154027 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39154091 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39154357 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39154430 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39154480 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39154598 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39154637 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 39154644 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 39154701 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39154724 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 39154807 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39154813 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39154822 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39154858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39154891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39154911 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39157036 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39157428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39157697 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39159241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39159323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39159344 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39161115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39161126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39161374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39164317 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39165714 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39165803 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 39171347 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39172068 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 39172120 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39172181 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39172623 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 39172742 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39172906 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 39172915 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 39172920 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 39173251 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39173299 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39173308 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39173345 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39173386 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39173456 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 39173466 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39173597 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39173792 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39173810 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39173895 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39174001 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39174037 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39174099 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 39174103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39174180 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39174469 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 39174584 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 39174884 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39175617 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39175937 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39175972 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 39176032 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 39176052 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 39176127 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39176153 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39176343 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 39176354 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39176381 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39176470 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39176480 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39176598 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 39176656 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 39176709 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 39176728 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39176763 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 39176787 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 39176971 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39177032 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39177043 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39177057 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39177163 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39177211 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39177329 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39177366 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39177423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39177523 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39177567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39177719 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39177721 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39177734 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39177769 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 39177770 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39178657 T G N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 39178810 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 39179089 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39179100 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39179110 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39179161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39179175 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 2 39179265 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39179298 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39179342 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39179490 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39179503 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39179576 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39179613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39179663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39180271 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39180344 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 39180659 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39180705 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39180735 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 39180736 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 39180759 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 39180895 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 39180982 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 39181009 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 39181476 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 39181792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39181969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39182020 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39182081 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39182115 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 39182330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39182375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39182451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39182459 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 39182470 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39182481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39182551 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 39182630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39182670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39182822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39182961 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 39185495 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 12 6 6 0 3 2 39186707 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 39186856 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39186891 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39186906 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 39187076 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39187132 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 2 39187140 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 2 39187217 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39187219 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 39187384 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 39187497 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 39187561 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 39187620 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 39187803 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39187804 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39187871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39187941 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39187972 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39188015 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 39188016 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 39188043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39188057 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39188258 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 39188385 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 39188422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39188647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39188662 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39188762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39188863 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39188866 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39188930 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 39188965 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 39189000 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 39189200 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 39189201 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 39189216 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 39189314 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 39189428 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 39189482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39189483 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 39189520 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39189979 T A Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 39189983 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 39191300 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 39191358 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 39191388 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 39191501 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 39191661 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 39191881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39192091 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39192139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39192306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39192535 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 39192550 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 39192742 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39193210 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 39193561 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39193586 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 39193681 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39193928 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39193998 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39194097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39194298 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39194331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39194411 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39194600 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39194713 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 39195205 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 39195420 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39196092 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39196094 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39196425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39196431 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39196669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39197430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39197494 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39197497 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 39198253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39198625 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39198748 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 39198784 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39199297 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 39199340 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39199429 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 39199455 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39199461 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39199488 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39199491 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39199521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39199693 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39199752 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39199779 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39200142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39200247 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 39200640 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39200675 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 39200853 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 39201001 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 39201271 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 39201330 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 39201457 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 39201811 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 39202272 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 39202913 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39203174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39203795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39204134 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39204936 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39205026 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39205074 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39205616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39206257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39207026 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39207057 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 39207331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39207770 C G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39207771 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39207840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39208201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39208444 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39208659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39208688 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 39208689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39208740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39208750 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39208880 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 39208904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39208975 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 39209127 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39209392 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 39209477 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 39209585 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 39209586 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39209604 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 39209605 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 39209661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39209691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39209858 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39211195 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39211210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39211244 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39211285 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39211577 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39211759 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 39211856 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39212570 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39212788 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 39213764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39215820 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 39223777 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 39224937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39224938 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39226137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39226462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39226556 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39226590 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 39226652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39227816 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 39232547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39233851 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39235741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39236155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39236735 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39238327 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39238591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39238901 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 39239016 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39239024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39239071 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 39239104 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39239428 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39239626 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 39240449 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39240475 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39240541 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 39240705 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39240743 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 39240769 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39240785 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39240793 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39240813 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39240837 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39240995 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39241054 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39241131 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 39241186 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39241203 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 39241574 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 39241674 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 39242830 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 39243041 T A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 39245323 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 39245649 T G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 39247165 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 39247186 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 39247249 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 39247322 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 39247358 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 39247371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39247376 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 39247541 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39247560 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39247605 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 39247638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39247808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39247844 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39247855 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39247879 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39247890 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 39248012 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 39248021 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 39248025 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 39248052 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 39248225 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39248250 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 39248352 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39248427 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39248497 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39248630 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39250537 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39250565 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39250723 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39250781 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39250832 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39250869 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39251105 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 39251134 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 39251148 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39251227 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 39251291 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 39251398 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 39254141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39256614 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39257200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39259305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39259928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39263143 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39263551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39268790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39269346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39269378 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39270132 A C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 39271041 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 39271056 C T Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 39271299 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 2 39271312 G C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 39271603 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 39271637 T G Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 39271703 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 39272291 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39272469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39273628 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 39274106 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 39275217 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 39276096 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 39278414 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39280074 C T Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 39282233 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39283475 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 39283980 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39284910 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39293485 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39293679 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39293819 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 39293866 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39295860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39296349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39298725 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39299142 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 39299403 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 39299430 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39299539 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 39299593 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39299662 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39299670 G C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 39299825 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 39299892 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 39299935 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 39300038 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39300337 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 39300552 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39300578 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39300587 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39300635 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39300738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39300851 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39301402 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 39301466 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 39301472 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 39301582 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39301627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39301840 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 39302319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39302515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39302648 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 39303361 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 39303518 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 39303601 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39303605 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39303737 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 39303892 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39303945 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 39304158 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 39304368 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 39304463 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 39304541 T G N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 39304571 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 39304806 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 39304882 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 39305126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39305134 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 39305162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39305520 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 2 39305576 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 39305684 C T Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 2 39305784 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 39305808 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 39305934 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 39305950 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 39305997 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 39306345 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 39306760 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 39306774 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 39306945 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 39307128 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 39307547 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 39307665 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 39307702 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39307790 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39307920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39308040 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39308131 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39308132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39308142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39308176 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39308327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39308459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39308828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39308944 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 39309026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39309038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39309108 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 39309383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39309401 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39309691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39309692 G C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 39309795 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39309827 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39309829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39309866 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39309910 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39310024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39310049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39310113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39310116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39310195 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 39310304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39310499 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 39310503 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 39310640 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39310785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39310948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39311115 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39311125 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39311158 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39311437 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39311476 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 39311669 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39311943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39312106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39312338 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39312368 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39312732 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 39313363 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39313518 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39313539 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39313756 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39313928 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 39313993 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 39313999 G T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 39314057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39314058 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 39314068 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 39314079 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 39314111 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 39314186 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 39314187 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 39314237 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 39314398 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 39314414 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 39314418 A C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 39314519 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 39314689 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 39314694 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 39314913 C A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 39315000 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 39315022 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 39315223 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 39315227 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 39315285 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 39315375 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39315541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39315949 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39315973 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 39316277 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39316300 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 39316306 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39316317 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 39316336 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 39316339 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 39316367 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 39316393 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39316419 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 39316517 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39316784 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 39316792 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 39317046 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 39317075 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39317088 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39317093 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39317129 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39317175 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 39317209 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39317226 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39317272 A T Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 39317273 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39317313 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 39317333 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39317985 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39318084 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39318584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39318807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39318972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39318994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39318999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39319219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39319737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39319769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39319890 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 39319907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39319957 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39319992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39320129 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39320161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39320172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39320200 G C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 39320250 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 39321730 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39321764 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39321807 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 39322063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39322091 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39322199 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39322320 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39322370 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 39322483 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 39322712 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39322720 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39322878 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 39322929 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 39322991 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39323001 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39323059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39323096 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 39323134 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39323169 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39323200 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39323335 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39323456 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39323464 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39323484 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39323539 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39323600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39323626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39324793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39324810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39324887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39325427 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39325529 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 39325559 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 39325578 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 39325748 C T Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 39325807 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 39325912 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 39325965 T C Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 39326051 G T Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 39326321 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 39326382 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39326590 T C Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 39326909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39326970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39327005 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 39327125 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 39327182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39327696 C A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 39327815 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 39327905 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 39327961 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39327977 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 39328082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39328156 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 39328554 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 39329142 G A Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 39329209 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 39329545 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 39329794 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 39329962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39329969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39330005 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 39330339 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 39330386 T G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 39330480 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 39330701 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 39330792 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 39331067 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39331079 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 39331341 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 39331608 G T Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 39331844 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39332308 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 39332455 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39333268 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 39333404 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39334206 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 39334408 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 39334539 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 39334714 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 39335678 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 39335951 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39335965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39336327 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39336403 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39336772 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39337029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39337484 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 39338223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39339500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39339848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39340108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39340391 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 39340707 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 39340787 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 39341254 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 39341345 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 39341655 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 39341663 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 39341690 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 39341698 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 39341729 A T Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 39341797 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 39341824 A G Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 39342010 G A Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 39342427 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39342450 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39342476 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39342576 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 39342855 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 39342960 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 39343033 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 39343168 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 39344409 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39344618 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 39344670 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 39344891 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 39345001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39345076 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39345507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39345840 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 39346034 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 39346156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39346214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39346298 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39346425 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39346556 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39346990 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39347059 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39347124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39347149 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39347229 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 39347262 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39347447 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39347560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39347750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39347862 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39348160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39348176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39348657 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39348751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39348834 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39349037 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 39349320 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39349399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39349735 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 39349787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39349863 T G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 39349973 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 39350101 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 39350102 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39350113 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 39350158 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 39350159 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 39350278 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 39350284 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39350317 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39350320 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39350347 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 39350380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39350440 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 39350506 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39350572 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 39350767 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39350922 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39350925 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39350996 G T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 39351118 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39351434 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 39351572 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 39351589 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 39351702 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39352277 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39353248 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39353902 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 39354278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39354415 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39354458 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39354476 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39354551 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 39354742 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 39354840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39355302 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 39355697 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39355781 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39356044 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 39356084 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39356424 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39356848 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39356934 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39357209 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39357451 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39357913 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39358152 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39358274 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39358477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39358497 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39358787 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 39358893 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39359202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39359412 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39360056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39360421 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 39360701 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39360789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39360830 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39360963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39361281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39361372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39361380 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39361714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39361889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39362560 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 39362782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39362862 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39363734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39363815 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39363908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39364021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39364122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39364160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39364523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39364711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39364908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39365123 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39365546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39365684 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39366140 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39366194 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39366476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39366591 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39367424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39367436 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39367905 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39367933 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39368056 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 39368141 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39368152 A C N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 39368157 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39368435 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 39368536 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39368578 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39368604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39368615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39368629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39368676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39368734 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39368738 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39369831 G C Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 39370050 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 39370802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39370891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39370906 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39371031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39371156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39371161 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39371180 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39371192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39371490 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39371809 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39371833 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39371835 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39371855 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39371889 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 39372020 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39372186 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39372312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39373213 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39380905 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39386863 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 39386957 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39387002 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39387229 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39387409 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 39390820 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 39391032 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39391085 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39391097 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39391132 G C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39391935 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 39392357 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39392382 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39392429 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39392780 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39393397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39393574 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39393624 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39393963 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39394152 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39394384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39394452 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 39394495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39394528 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39394568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39394858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39394878 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39394938 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39395083 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39395098 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39395260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39395319 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 2 39395320 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 39396618 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39396845 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39396911 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 39396941 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39397016 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39397149 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39397218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39397315 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39397387 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 39397463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39397606 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39397751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39398005 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 39398266 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 39398284 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 39398330 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 39398903 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 39399292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39399343 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 39400035 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39400189 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 39403411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39403589 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39406450 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39409402 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39410438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39411956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39412636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39412848 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39413729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39415280 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39416245 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39417942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39418170 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39418326 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39418476 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39418696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39419760 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 39420297 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39420556 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39420699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39420915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39421008 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39421167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39421211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39421597 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39421983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39422632 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 39422687 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 2 39423244 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39423473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39423603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39423937 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 39424014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39424710 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39424877 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39424941 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39425634 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39426167 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39426187 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 39426624 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39427254 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39427481 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39427852 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 39428234 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39428874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39428953 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39430052 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 39430164 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39430383 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 39431112 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39431489 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39431512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39431739 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39431850 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 39431917 A C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 14 14 2 10 2 2 39431927 C G N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 2 39432093 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 39432101 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 39432154 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 39432165 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 39432294 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 39432430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39432547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39432865 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 39432884 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39432952 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39432955 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39433964 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39434098 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 39434135 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 39434206 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 39434242 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 39434432 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39434499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39434586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39434588 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39434794 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39435147 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39435251 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39435296 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 39435300 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 2 39435310 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 39435453 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39435591 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 39435681 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 39435694 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 39435745 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 39435818 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39435857 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 39435882 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 39435889 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 39435905 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39435945 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39435947 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39436046 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39436096 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 39436178 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 39436302 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 39436379 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39436511 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39436517 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39436624 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39436630 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 39436672 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39436710 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39436748 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39436754 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 39436835 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39436881 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39437026 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39437037 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 39437042 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39437070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39437195 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39437242 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39437338 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39437358 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39437365 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39437403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39437492 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39437502 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39437516 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39437531 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 39437563 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39437756 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 39437775 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 39437908 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39437959 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 39437975 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 39438065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39438094 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39438169 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 39438186 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 39438461 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39438509 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39438549 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39438575 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39438588 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39438634 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39438649 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39438652 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39438898 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 39438996 A G Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 39439014 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39439305 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 39439363 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 39439424 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 39439427 A G Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 39439459 T C Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 39439515 G T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 39439517 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 39439528 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39439534 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 39439841 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39439861 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39439883 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39440131 G A Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 39440189 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39440375 A G Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 2 39440391 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 39440464 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39440478 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 39440624 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39441176 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 39441192 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39441193 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39441328 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 39441357 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 39441406 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39441577 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 39441586 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 39441649 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 39441857 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39442115 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39442166 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39442197 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39442229 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39442264 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39442365 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39442383 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39442407 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39442550 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39442557 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39442745 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39442888 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39442999 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39443143 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39443144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39443255 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39443304 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39443337 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39443363 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39443378 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39443388 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39443423 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39443435 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39443441 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39443478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39443557 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39443652 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39443735 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39443745 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39443833 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39443924 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 39443947 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39444164 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 39444167 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 39444214 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 39444237 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 39444313 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 39444329 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 39444396 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39444607 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 39444653 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39444772 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39444822 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39444990 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39445051 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39445097 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39445138 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39445139 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 39445219 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 39445234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39445275 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 39445355 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39445415 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 39445479 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39445613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39445659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39445743 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39445760 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39445882 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39446016 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 39446115 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39446245 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39446252 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39446257 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39446326 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 39446367 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 39446407 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 39446538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39446548 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39446826 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39446919 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 39446938 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39446969 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39447006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39447037 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39447071 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39447311 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39447369 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39447605 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39447700 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 39447749 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39447759 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39447825 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39447917 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 39447991 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39448090 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39448166 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 39448293 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39448294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39448533 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39448712 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39448782 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 39448967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39448969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39448991 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39449524 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39449568 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39449731 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39449896 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39450028 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39450817 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39451475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39452322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39452593 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 39452651 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39452708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39452853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39452932 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 39453072 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 39454456 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39454752 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39455088 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39455562 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39456147 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39456836 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 39456899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39457397 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39457876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39458021 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39458152 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 39458724 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39458759 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 39458804 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39458875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39459150 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39459244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39459299 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39459915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39460759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39461936 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 39463137 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39463805 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39463891 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39464083 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39464254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39464271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39464438 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 39464583 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 39465079 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39465542 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39466023 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 39466413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39466546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39466662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39466755 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39467105 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39467167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39467201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39467292 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39467308 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39467316 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39467328 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39467455 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 39467516 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39467617 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39467749 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39468022 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 39468061 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 39468189 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39468225 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39468295 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39468404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39468410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39468775 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39468877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39468955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39468961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39468976 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39469252 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 39469390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39469591 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 39469610 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 39469707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39469872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39469948 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39470005 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470312 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39470839 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 39470852 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39471203 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39471534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39471602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39472512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39472774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39472902 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39472994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39473712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39473876 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 39474004 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39474005 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39474075 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 39474272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39474345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39474441 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 39474662 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 39475188 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 39475227 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39475561 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39475622 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 39476081 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39476193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39476964 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39477229 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 39477237 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 39477755 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39477827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39478088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39478149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39478320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39478381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39478448 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 39478607 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39478884 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39478912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39478989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39479232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39479854 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39479908 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39479912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39480071 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39480124 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39480206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39480214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39480531 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 39480568 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39480817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39480886 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 39480887 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 39480957 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39481570 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39482046 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39482151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39482334 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39483023 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39483214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39483939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39484072 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39484099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39484226 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39484342 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39484503 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39488296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39488361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39488705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39488861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39488888 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39488898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39488969 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39488974 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39489021 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39489120 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39489290 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39489349 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39489496 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39489950 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39489970 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39490039 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39490193 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39490195 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39490233 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 39490239 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 39490620 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39491014 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 39491116 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 39491593 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39491653 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 39491712 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 39491831 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39491858 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39491890 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39492660 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39492706 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39493090 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39493251 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39493464 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39493480 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39493527 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39493575 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39493606 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 39493609 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39493701 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39494249 T A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 39494309 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39501402 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39501717 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 39501722 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 39501752 C T Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 39502483 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 39502822 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 39503015 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39503046 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39503085 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39503403 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39503442 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39503459 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39503594 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39503628 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39503641 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39503691 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39503810 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39503941 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39503957 C G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 39504052 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39504088 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39504090 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39504119 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39504140 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39504157 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39504168 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39504214 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 39504331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39504455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39504565 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 39504606 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39504613 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39504674 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39504808 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39504919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39505148 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39505172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39505199 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39505231 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39505489 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39505800 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39505804 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39506101 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39506295 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39506361 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39506433 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39506494 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39506568 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 39506615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39506766 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 39506977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39507173 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 39507269 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 39507319 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 39507525 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39507541 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39507671 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39507684 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39507779 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 39511565 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 39511820 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39511825 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 39511884 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39511964 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39511971 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39512108 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39512476 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39512519 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39512555 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39512655 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 39513071 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39513078 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39513541 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 39513584 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39514026 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39514607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39514735 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 39514749 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 39515020 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 39515167 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39515285 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39515347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39515386 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 39515486 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39515780 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 39515855 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 39515907 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 39516224 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 39517330 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39517370 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39519910 C A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 39520039 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39521404 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39521439 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39521967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39522222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39523484 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39524163 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39524776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39525730 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 39525830 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39526217 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 39526381 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39526400 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 39526546 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 39526578 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 39526603 G C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 39526655 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 39526675 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 39526678 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 39526869 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 39527121 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 39527156 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 39527191 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 39527245 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 39527290 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 39527321 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 39527358 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 39528067 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39528463 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 39528986 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39529820 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 39530154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39531038 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39531252 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39531722 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39531854 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39531869 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 39532275 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39533073 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39534011 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39534034 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39534092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39534449 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 39534835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39534959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39535286 A G Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 39535360 C A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 39535591 G T Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 39535869 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 39535941 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39535954 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39536120 T G Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 2 39536211 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 39536217 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 39536249 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 2 39536284 T C Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 39536433 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 39536445 A G Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 2 39536566 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 39536809 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39536850 G T Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 39536911 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 39537102 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39537791 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 39538003 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39538033 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 39538334 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39538355 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39538687 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39538965 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 39538978 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 39538993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39539021 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 39539232 A T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39539547 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39539590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39540119 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 39540375 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 39540526 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 39540931 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 39541031 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39547791 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39547825 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39547865 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39548079 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 39548252 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39548812 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39548828 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39548872 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39549100 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39549347 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 39549485 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 39549637 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39549686 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 39549693 G T Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 39549828 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 39549932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39550138 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 39550141 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39550455 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 39550880 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 39550899 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 39551304 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 39551470 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39552110 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39552168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39552176 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 39552501 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 39552505 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 39552586 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 39552591 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 39552727 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 39552748 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 39552789 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 39552910 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 39552948 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39553038 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 39553082 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 39553148 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 39553205 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 39553303 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 39553346 T C Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 39553441 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 39553521 A C Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 39553597 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 39553924 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 39553936 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 39553968 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39554067 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39554074 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39554111 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 39554158 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 39554195 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39554357 T C Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 2 39554489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39554511 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39554550 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39554844 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39554920 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 39555000 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39555001 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39555045 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 39555227 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 39555321 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 39555600 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39555675 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 39555721 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 39555941 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 39555954 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 39556079 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39556104 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 39556185 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 39556213 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 39556236 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 39556343 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39556349 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39556411 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39556450 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39556465 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 39556471 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 39556549 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 39556612 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 2 39556651 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 39556666 T C Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 39556675 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 39556721 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 39556790 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39557187 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39557247 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 39557376 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 39557460 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 39557584 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 39557598 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 39557610 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 39557618 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 39557640 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 39557681 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39557715 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 39557790 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39557792 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 39557814 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39557822 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39558175 G C Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 39558198 T A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 39558335 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 39558345 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39558460 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 39558574 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39558595 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 39558606 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39558612 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39558618 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 39558632 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 39558659 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39558726 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 39558811 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39558822 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39558828 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 39558928 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39559093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39559094 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39559132 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39559195 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39559269 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 39559297 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 39559307 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 39559319 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 39559404 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39559504 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 39559511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39559561 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39559642 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 39559701 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 39559706 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 39560071 G C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39562390 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39562417 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 39562446 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39562456 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39562484 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39562498 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39562499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39562601 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39562856 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39562900 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39562990 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 39563013 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39563034 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39563045 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39563178 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39563179 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39563204 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 39563250 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39563251 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39563300 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39563357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39563375 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39563534 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39563548 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39563611 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39563733 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39563850 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 39563871 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 39563886 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 39563913 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 39563923 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39564027 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39564275 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39564350 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39564358 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39564448 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39564454 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39564494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39564503 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39564510 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39564583 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39564586 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 39564622 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39564658 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 39564726 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 39564771 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39564847 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 39564896 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39564905 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39565022 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 39565086 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39565099 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 39565144 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 39565172 A T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 39565181 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 39565193 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 39565252 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 39565558 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39565567 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39565570 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39565674 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 39566019 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 39566134 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39566186 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39566290 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39566445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39566456 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 39566461 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 39566562 A C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 39566674 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 39566755 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39566761 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39566977 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 39567037 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 39567052 G C Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 39567200 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 39567450 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39567462 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39567571 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39567711 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 39567743 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 39568029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39568034 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 39568111 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39568112 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39568178 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39568207 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 39568273 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39568282 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39568414 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 39568694 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39568720 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 39568851 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 39568919 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 39569129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39569157 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39569181 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 39569421 A G Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 39569526 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 39570423 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39570862 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 39570962 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39571394 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39572102 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39572180 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39572192 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39572272 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39572276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39572324 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39572674 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39572784 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39572861 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 39572862 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 39572907 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 39572929 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 39573048 G C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 39573099 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 39573449 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39573655 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 39573900 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39574035 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39574134 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39574928 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 39575148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39575214 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39575403 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39575448 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39576134 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 39576250 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39576310 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39576345 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39576534 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39576567 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39576839 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39576883 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 39576981 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39577241 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39577285 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39577379 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39577502 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39577557 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39577827 G T Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 39578045 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39578115 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 39578361 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 39578412 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 39578866 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 39578976 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 39579190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39579230 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 39579739 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39579921 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39580093 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 39580158 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 39580183 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 39580363 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 39580538 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 39580576 A C Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 39580736 C A Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 39580752 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 39580768 A C Y N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 39581098 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 39581110 T C Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 39581200 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 39581248 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 39581449 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39581473 G C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 39581512 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 39581514 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 39581568 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39581599 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 39581903 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39581939 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39582038 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 39582043 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 39582136 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39582192 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39582199 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 39582321 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39582357 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39582372 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39583943 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 39584120 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 39584229 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 39584251 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39584252 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39584274 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 39584312 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 39584427 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 39584650 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39584727 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 39584801 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 39584827 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 39584876 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39585185 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39585489 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39585662 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 39586382 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 39586450 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 39586458 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 39586665 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 39586774 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39587109 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 39587355 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 39587553 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 39587635 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 39587646 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 39587764 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 39587979 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 39587991 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 39588049 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 39588233 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 39588392 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 39588558 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 39588608 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 39588651 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39588655 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39588927 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 39588948 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 39589141 A C Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 39589219 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 39589406 C A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 39589600 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 39589730 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39589968 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 39589981 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 39590104 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 39590216 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 39590221 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 39590333 G A Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 2 39590510 C A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 39590707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39590708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39590977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39591147 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39591266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39591321 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 39591809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39592033 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 39592155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39592277 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39592344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39592425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39592662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39593140 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 39593854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39594052 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39594610 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39595279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39595484 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 39596801 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 39597215 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 39598421 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 39598621 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39599289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39599352 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 39599535 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 39599610 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 39601021 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 39601910 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 39602496 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39602659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39604965 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 39605110 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39605537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39606724 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 39606769 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39609419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39609635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39609742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39610405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39611491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39614188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39615862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39616079 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39616425 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39616450 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 39616517 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39616615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39616695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39618069 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 39618543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39620351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39621649 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 39621929 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39622964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39622968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39623007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39623694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39624215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39624648 G T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 39625322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39625376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39625443 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39625780 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39627044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39627061 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39627155 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39627215 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39627373 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39628076 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39628969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39629465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39629743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39630561 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 39630735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39631031 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39631110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39632249 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 39632311 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39632788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39632908 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 39632983 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39633591 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 39633846 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39642066 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39645783 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39645871 T A Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 39645941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39646985 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 39647165 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 39647458 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 39648071 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39648112 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39648983 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39649415 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39650023 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39650316 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 39652207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39653565 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39653800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39654004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39654109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39654236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39654631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39655502 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 39657221 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39658338 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39660219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39661524 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39665614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39666191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39667310 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39667392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39667969 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 39668481 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39668926 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39669770 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39671183 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 39671704 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39672650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39673096 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39673631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39674512 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39674695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39675553 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 39677379 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39677944 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 39677951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39679379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39679546 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39681664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39683507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39684110 C G Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 39684190 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39684814 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39684832 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39685592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39685935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39685990 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39686175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39686429 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 39686783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39687201 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39687582 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39687863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39687910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39688110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39688884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39689184 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39689474 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 39689923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39690097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39690120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39690551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39690774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39691281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39691390 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 39692546 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 39692586 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39692824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39693989 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39694295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39695104 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 39695251 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39695351 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39696069 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 39696129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39696498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39696542 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39696823 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39696914 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 39696915 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 39697189 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39697861 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 39698224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39698948 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 39699494 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 39699706 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39701192 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39702353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39704097 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 39704316 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39704514 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 39704611 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39704811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39704817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39704899 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39705393 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 39705440 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 39705956 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 39706518 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39707426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39707808 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39707882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39708970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39709919 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 39710109 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39710646 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39711041 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39711419 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 39711687 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39712112 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39714468 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39714879 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39714982 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 39715296 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39715348 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 39715543 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39715582 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39715628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39715786 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39716041 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 39717151 C T Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 39717168 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 2 39717325 A T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 39717757 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39718379 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 39718658 A T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 39719650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39719995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39720033 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 39720067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39720280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39720349 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 39720445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39720542 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 39720640 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 39720681 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39720770 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39720830 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 39721037 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 2 39721391 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39721607 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39721809 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 39722303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39722308 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39722713 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 39723256 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39723460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39723878 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 39723914 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39724145 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 39724672 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39724737 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39724748 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 39725740 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39725889 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39726143 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39726508 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39727281 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39727595 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39727687 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 39729900 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39730077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39730958 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 39731909 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39732970 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39732974 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39733071 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 39733486 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39734042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39734274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39736976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39737341 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39737933 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39738287 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 39738706 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39739238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39739303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39739325 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39739579 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39739921 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39740154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39740248 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39741134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39741875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39742058 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39742325 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39742820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39742954 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39744408 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39744470 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39744853 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39745270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39745371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39745671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39745732 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39746010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39746328 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 39746623 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39746643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39746789 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39747201 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39748230 A G Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 39754925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39754940 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39755049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39756251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39756710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39756834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39757382 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39757543 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 39757625 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39757708 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39757774 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39757797 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39757820 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39757834 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39758006 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39758031 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 39758081 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39758126 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39758175 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39758215 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39758228 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39758271 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39758478 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 39758479 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 39758498 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39758514 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39758548 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39758772 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39758774 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39758783 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39758920 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759027 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39759056 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39759099 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39759181 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39759205 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759243 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759311 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39759376 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39759400 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759413 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759455 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759462 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759525 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759552 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759571 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759676 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759687 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39759762 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39760170 C G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 39760273 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 39760514 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 39760658 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39760667 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39760681 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39760758 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39760812 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39760839 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39760857 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39760882 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39760966 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39760987 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39761194 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39761342 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 39761395 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39761516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39761576 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39761593 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39761594 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39761620 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39761622 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39761740 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39762007 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 39762049 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 39762078 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39762260 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39762275 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39762371 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39762381 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39762385 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39762406 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39762412 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39762419 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 39762429 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 39762450 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39762768 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39762804 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39762812 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39762840 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 39762967 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39762990 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 39763077 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 39763161 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39763162 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39763327 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 39763347 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 39763370 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 39763412 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 39763414 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 39763468 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 39763476 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 39763493 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39763494 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39764537 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 39764570 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39765855 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39766495 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 39772015 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39772647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39772650 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 39772665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39772732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39772741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39772912 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39773086 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39773090 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39773152 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39773359 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39773433 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 39773537 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39773590 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39773622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39774375 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 39774389 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 39774425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39774520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39774552 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 39774569 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 39774575 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 39774648 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39774801 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 39774823 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 39774830 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 39775075 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 39775115 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 39775116 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39775131 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 39775218 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39775544 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 39775578 A T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 39775628 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39775866 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39776522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39776760 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39776926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39776936 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39776944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39777048 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 39777408 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 39780004 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39780423 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 39780661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39780711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39780786 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39781118 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 39781148 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39782129 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39782330 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39782487 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39782809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39784556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39784695 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39785279 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39785603 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 39786306 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39786841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39786888 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 39787063 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39787271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39788439 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 39788874 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39789246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39789288 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39789354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39789461 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 39789477 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 39789526 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39789722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39790206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39790357 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 39790402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39790548 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39790577 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39790977 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 39791209 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39791332 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39792059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39792070 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39792853 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39793150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39793790 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 39793806 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 39793837 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 39794396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39794434 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 39794518 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 39794761 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39795316 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 39795908 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 39795999 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39796160 G T Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 39796181 T A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 39796640 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 39796687 C A Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 39796994 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 39797641 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39798107 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 39798262 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39798469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39798529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39798595 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39798657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39798722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39798801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39799375 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 39799512 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39800230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39800976 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39801327 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39801905 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 39801916 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 39802879 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 39803930 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39804379 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 39804822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39805342 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 39805690 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 39806081 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39806289 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 39806541 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 39806750 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 39806937 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39807100 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39807724 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39807727 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 39807849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39807906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39808128 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39808164 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 39808353 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 39808442 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 39808898 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39809221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39809253 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 39809273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39809456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39809874 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39810061 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39810121 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39810495 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 39811146 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 39811303 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 39811511 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39811639 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39811707 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 39812178 G T Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 39812310 A C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 39812339 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 39812350 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39812391 C T Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 39812487 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 39813069 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 39813124 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39814001 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39814148 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39814459 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 39814790 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 39815012 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 39815180 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 39815367 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39815512 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 39816067 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39816076 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39816729 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 39817008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39817355 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 39817438 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39817469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39817627 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39818020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39818199 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39820182 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 39820390 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39820432 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 39820599 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 39820688 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 39820762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39820814 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 39820857 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 39820875 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 39821218 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 39821235 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 39821286 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 39821353 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 39821358 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 39821454 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 39821471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39821621 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 39821654 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 39821701 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39821980 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 39822166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39822464 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 39822823 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 39823035 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 39823046 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 39823088 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 39823218 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 39823259 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 39823552 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 39823668 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 39823770 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 39823852 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 39823891 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 39824238 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39824341 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 39824388 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39824451 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39824466 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 39824527 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39824558 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39824652 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39824736 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39824816 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 39824852 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 39825025 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 39825105 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 39825332 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 39825458 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 39825507 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 39825804 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 39825918 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 39826087 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 39826369 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 39826536 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 39826850 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39826875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39827375 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39827417 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39827745 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 39827895 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 39827899 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39827957 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 39827995 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 39828707 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39828791 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 39828929 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 39829013 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39829499 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 39829514 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 39829717 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39829816 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39829849 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 39830100 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 39830112 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 39830154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39830306 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 39830333 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39830353 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39830640 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39830675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39830915 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39830935 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39831005 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 39831022 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 39831627 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 39831636 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 39831668 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 39831683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39831732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39831752 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39831768 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 39831778 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 39831854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39831888 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39831922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39832021 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 39832067 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 39832093 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39832132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39832150 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 39832199 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39832277 C G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 39832292 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39832348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39832425 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39832442 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39832482 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39832501 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 39832581 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 39832635 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39832674 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 39832677 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 39832728 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 39832753 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39832759 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39832778 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 39832873 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39832874 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 39833022 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 39833123 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 39833235 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 39833364 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 39833687 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39834055 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39834539 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39834558 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 39834577 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39834584 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 39834639 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39834653 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 39834706 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 39834873 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39834931 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39834988 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39835031 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39835099 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39835107 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39835131 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39835196 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39835220 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39835323 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 39835516 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39835577 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39835606 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39835697 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39835752 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39835760 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39835937 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39836010 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39836122 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 39836185 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39836289 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 39836392 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39836514 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39836529 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39836602 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39836646 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39836715 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39836747 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39836801 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39836891 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39836925 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39836946 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39836982 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39837019 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39837048 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39837096 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39837099 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39837112 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39837200 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 39837288 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39837290 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39837433 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39837475 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39838043 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 39838155 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39838407 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39838481 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39838547 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39838639 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39838709 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39838720 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39838768 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39838792 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39838803 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39838843 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39838883 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39838928 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39838944 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39838977 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39839111 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39839140 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39839193 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39839232 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 39839455 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39839473 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39839539 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39839549 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39839631 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39839795 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39839812 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39839929 T C Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 39840070 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 39840105 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 39840361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39840375 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39840394 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39840521 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39840534 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39840565 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39840674 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39840789 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39840804 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 39841028 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 39841043 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 39841131 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39841184 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39841226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39841252 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39841369 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39841389 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39841481 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39841596 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39841610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39841632 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39841680 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39841702 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39841889 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39841933 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39841952 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 39842080 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39842091 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39842113 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39842153 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39842163 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39842419 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39842555 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 39842662 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 39842728 A C N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 39843015 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39843143 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39843190 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39843249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39843269 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39843289 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39843300 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39843375 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39843387 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39843474 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39843573 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39843595 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39843596 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39843657 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39843670 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39843690 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39843692 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39843734 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39843891 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39843908 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 39843976 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 39844087 T G N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 39844365 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39844390 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 39844988 A T Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 39845793 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39846352 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39846438 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 39847045 C A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 39847458 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 39847667 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 39847734 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 39847801 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 39847983 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 39848040 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 39848255 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 39848282 G A Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 39848346 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39848374 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39848386 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39848423 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39848482 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39853874 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 39854248 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39854259 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39854351 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39854919 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39854947 C A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 39855194 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39855215 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 39855217 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39855700 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39855996 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39856058 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39856159 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39856290 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 39856338 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39856447 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 39856634 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 39856724 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 39856749 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39856756 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 39856811 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39857176 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39857227 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 39857300 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 39857371 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39857488 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 39857592 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 39857676 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 39857718 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 39857773 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 39857806 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 39857811 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 39857827 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 39857856 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39857918 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 39857988 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39858110 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 39858339 A C Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 39858578 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39858598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39859073 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39859087 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39859133 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 39859139 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 39859424 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 39859425 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 39859460 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 39859511 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 39859571 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39860222 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 39860440 A T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 39860450 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39860503 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39860619 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 39860758 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 39860848 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39860871 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39860902 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39860906 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39860924 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 39861187 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39861285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39861352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39861575 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39861623 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39861865 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39861896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39862358 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39862405 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39862483 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39862594 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39862603 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 39862613 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39862662 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39863249 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39863407 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39863445 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39864208 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 39864264 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 39864492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39864503 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39864681 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 39864926 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39864974 C A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 39865157 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39865425 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39865453 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 39865557 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 39866279 G C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 39866297 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 39866298 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 39866496 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 39866625 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39866638 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 39866759 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39866810 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 39866930 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 39867274 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 39867446 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39867525 T C N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 39870932 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39871127 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39871977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39872981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39876774 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39877239 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39877246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39877340 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39877380 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39877629 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39877651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39877666 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39877754 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39877773 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39877936 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39878107 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 39878136 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39878220 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 39878235 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 39878283 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39878295 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39878424 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39878545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39878615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39878647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39878759 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39878817 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39878911 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39878935 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39878945 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39878985 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 39879030 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 39879040 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39879377 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 39879410 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 39879422 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39879436 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39879511 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39879580 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39879596 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 39879641 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39879740 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39879782 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39879813 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39879854 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 39879959 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 39879960 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 39880223 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39880267 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39880288 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39880292 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39880309 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39880382 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39880462 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 39880966 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39881229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39881388 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39881735 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 39881992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39882143 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39882535 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39882612 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 39882624 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39882714 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 39883060 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39883153 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 39886244 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39887033 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 39888075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39888772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39888974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39889558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39889991 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39890249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39890961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39890985 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 39891472 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39893082 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39893151 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39893198 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39893989 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39895041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39895263 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39895279 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39895546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39895704 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39896002 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39896067 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 39896328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39896782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39896991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39897081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39897146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39897168 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 39897475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39898030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39898265 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39898432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39898442 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 39898533 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 39898534 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 39898794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39898994 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 39899063 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 39899364 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 39899377 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 39899393 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 39899404 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 39899633 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39899722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39900205 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39900254 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39900940 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 39901078 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 39901174 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 39901211 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 39901541 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 39901578 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 39901597 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39901876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39901940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39902065 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 39902283 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 39902438 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 39902476 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39902523 G T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39902575 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39902726 G C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 39902824 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 39902866 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 39903030 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 39903031 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 39903136 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39903193 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 39903219 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39903265 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39903407 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 39903453 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39903462 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39903494 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39903530 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39903647 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 39903677 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 39903699 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 39903784 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39903940 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 39903963 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39904101 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39904163 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39904200 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39904241 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 39904526 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39904568 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 39904916 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 39904957 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 39905208 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 39905266 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39905383 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 39905396 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 39905698 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39905699 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39905782 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39905893 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39905971 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39906473 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39906501 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39906515 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 39906520 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39906634 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39906635 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39906719 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39906795 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39906807 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39906837 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39906983 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39907015 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39907061 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39907252 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39907276 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39907298 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39907301 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39907365 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 39907467 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39907677 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 39907731 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 39908202 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 39908232 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 39908317 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39908618 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39908623 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39909139 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39909211 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39909367 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 39909412 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39909415 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 39909490 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39909540 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39909569 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 39909579 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 39909653 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39909875 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39909903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39909964 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 39909981 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 39910017 C G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 39910075 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39910119 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39910228 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39910253 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39910275 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39910308 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39910360 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39910372 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39910403 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39910432 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39910503 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 39910516 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39910520 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39910681 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39910749 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39910757 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39910776 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 39910850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39910868 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39910928 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 39911136 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39911137 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 39912243 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 39912257 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39915317 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39915385 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39917448 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39920338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39921695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39922004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39923253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39923488 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39925517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39925811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39926994 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39927393 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39927659 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39929172 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39929202 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39929461 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 39929545 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39929932 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 39931620 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 39931643 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39931654 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39932504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39932536 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39933774 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 39936930 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 39937834 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 39938642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39939505 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39939641 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 39940859 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39941884 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39943110 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39944146 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39944889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39945238 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39945766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39945879 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39945905 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39946620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39946825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39946836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39946920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39947035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39947714 G C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 39947795 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 39947986 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 39948001 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 39948021 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 39948177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39948279 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39948281 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39948290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39949358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39949437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39949441 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 39949458 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 39949503 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 39949590 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39949670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39949695 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 39949744 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 39949746 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 39949912 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 39950016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39951445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39952766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39957847 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39958734 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39958940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39959641 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39960611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39960852 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 39962654 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39964342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39964730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39965801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39966023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39968259 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39970157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39970988 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 39971039 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39971089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39971415 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 39971459 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 39971517 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39971751 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 39971858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39972437 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39972485 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39972778 A C Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 39973044 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 39973110 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39973238 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39973405 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 39973757 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 39973926 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 39974027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39974095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39974140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39974822 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39974966 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39975759 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39976377 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 39976710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39976745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39977482 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39977543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39977549 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39977620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39978384 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 39978646 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39978798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39979514 G T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 39979742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39980335 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 39980390 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39980789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39981365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39981739 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39981894 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39981932 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39981974 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39982008 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39982228 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39983513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39983851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39984517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39984820 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 39984960 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39986015 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 39986027 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39988234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39988430 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39988547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39989259 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39990084 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39990132 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39990800 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 39991145 A C Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 39991431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39991604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39992349 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39992412 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39992504 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 39992843 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39992921 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39993045 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 39994252 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39994744 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39994804 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39994946 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 39995140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39995216 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39995331 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39995486 C A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 39996491 G C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 39997200 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 39997375 C A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 39997377 T G N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 39997391 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 39997397 C G Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 39997680 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39997735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39997884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39997954 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 39998661 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 39998924 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39999089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39999147 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 39999318 T G Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 39999558 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39999689 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39999701 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 39999754 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 39999841 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40000096 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40000368 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 40000383 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 40000470 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40001011 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 40001057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40001163 G T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40001324 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40001504 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40001509 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40001550 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40001561 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40001570 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40001659 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40001663 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 40001685 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40001811 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 40002031 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 40002053 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40002183 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 40002388 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 40002531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40002908 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 40004472 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40004503 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40004549 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40004568 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40004572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40004722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40010070 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40010907 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40012204 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40013420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40013460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40013534 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40013591 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40013605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40013629 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 40013700 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 40013807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40013815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40013836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40013852 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40013932 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40014002 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40014531 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 40014645 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40014654 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 40014715 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40015710 G T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 40015731 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40015760 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40015778 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40016058 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40016123 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40016129 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40016249 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40016629 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40017282 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40017582 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40017649 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40018407 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40019587 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40019700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40019790 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40020060 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 40021098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40021303 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 40021354 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 40021443 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 40021605 C A Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 40021785 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 40022122 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 40022723 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 40022807 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 40023018 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40023265 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40023451 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40023474 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 40023518 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40023985 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40024035 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 40024720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40024961 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40025154 C A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 40025168 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 40025172 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 40031672 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40031771 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 40031958 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40032174 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40032225 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 40032292 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 40033028 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40033076 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40033333 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 40033572 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40033637 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 40033682 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40033763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40033881 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 40033915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40034077 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40034137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40034164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40034180 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 40034372 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 40034979 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40034991 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40035051 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40035178 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 40035185 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40035415 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40035430 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40035464 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 40035576 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40035586 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40035628 A C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 40035865 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40036109 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 40036220 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 40036410 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 40036458 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40036479 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 40036493 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40036558 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40036754 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 40036835 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40036856 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 40036915 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40036939 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40037039 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40037088 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40037214 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 40037234 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40037397 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 40037506 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40037564 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40037587 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40037674 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40037871 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40038156 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40038904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40039332 G C Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 40039343 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 40039553 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 40039579 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 40039604 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40039638 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40039679 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 40039843 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40039853 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40039888 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40039943 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40039953 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40040110 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 40040151 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40040239 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40040258 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 40040478 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40040491 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40040538 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40040620 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 40041166 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40041309 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 40041513 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 40041595 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40041713 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40041714 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40041772 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40041825 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40041831 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40042008 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40042043 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40042079 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 40042130 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 40042159 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 40042374 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40042572 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 40042870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40043163 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 40043300 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 40043317 T A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 40043388 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 40043480 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 40043671 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 40043713 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 40043797 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 40043948 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 40044078 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 40044103 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 40044108 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 40044137 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 40044140 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40044245 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 40044254 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 40044612 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 40044670 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40045592 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 40046862 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 40048077 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 40049447 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 40049509 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40050147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40051735 T G Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 40053612 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40054481 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40054644 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40055024 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40055937 G A Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 40055979 C T Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 40056357 A G Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 40063467 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 40064198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40065414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40066996 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40069674 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 40069761 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 40069819 A T Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 2 40070714 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 40073083 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40078429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40078430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40078488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40079964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40080382 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40080920 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40083805 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40084302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40084719 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 40085310 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 40085467 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40086403 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 40086523 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40086605 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 40088740 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40089802 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40090204 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40090782 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40096477 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40096551 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 40096713 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40097139 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40097923 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 40098249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40099035 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40100085 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40100325 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40100908 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40101205 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40104645 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 40104730 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 40105294 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40106492 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40107439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40108017 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 40108090 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40108117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40109193 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40109276 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40109397 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40109627 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40109741 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40110291 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40110445 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40111333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40111604 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40112438 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40112686 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40113294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40114058 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40114168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40114323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40114529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40114556 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40116641 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40117903 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40117940 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40124536 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40125676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40126096 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40126568 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40128681 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40129103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40129463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40130324 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40130566 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 40130990 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 40131437 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 40132030 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40132186 C G Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 40132902 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40133231 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40133784 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40135402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40135659 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40139911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40139938 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40140695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40141397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40141500 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40147549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40153088 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 40154287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40156467 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40156676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40157332 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40159886 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40160216 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40160699 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40161620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40161621 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40163342 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40164702 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 40166230 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40166521 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40168308 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40170365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40170706 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40172647 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40172964 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 40173659 C A N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 2 40173660 A G N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 2 40174152 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 40174158 T A Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 40174189 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 40174580 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40175794 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40175904 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40176483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40180275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40181527 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 40183199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40183261 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40184108 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 40184585 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 40184872 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 40186284 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40186409 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40187314 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40187456 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40187581 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40187592 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40188001 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40188615 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40189348 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 40189977 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40190318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40190536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40190840 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40191726 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40192398 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40192438 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 40193813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40194008 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40195101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40195367 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40195978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40196435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40197543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40198035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40198118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40198142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40198926 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40199324 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40199444 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40199562 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40199637 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40199877 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 40200063 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40200178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40200381 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40200714 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40201163 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40201593 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40201677 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 40201684 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 40201708 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 40201732 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40201753 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 40201755 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 40201798 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 40201807 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 40201902 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 40201925 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 40202134 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40202145 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40202300 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 40202375 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 40202449 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 40202475 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 40202523 G T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 40203003 A C N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 40203281 T A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 40203284 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 40203311 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40203374 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 40203438 G T N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 2 40203509 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 40203575 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 40203634 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 40203874 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40204351 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 40204369 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 40204400 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 2 40204669 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40204778 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 40204888 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 40204905 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 40204932 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 40204954 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 40205083 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 40205113 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 40205138 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 40205190 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 40205250 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 40205418 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 40205421 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40205485 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40205496 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 40205634 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 40205704 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 40205900 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 40205937 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 40205940 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 40205958 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 40205960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40205994 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 40206031 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 40206121 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 40206140 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 40206152 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 40206239 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 40206261 A G N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 40206650 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 40207042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40207640 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 40207904 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 40208242 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 40208249 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40208724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40209019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40209303 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40210115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40210642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40210728 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40218687 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40218839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40219401 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40219975 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40220715 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40220885 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40220931 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40221273 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40221615 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40221825 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40222098 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40222276 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40222371 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40222394 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40222403 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 2 40222450 C G N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 40222475 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 40222523 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40222541 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40222734 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40222881 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40222919 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40222960 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40223008 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40223081 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40223192 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40223208 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40223211 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40223358 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40223367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40223388 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40223473 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40223509 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40223539 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40223613 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40223652 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40223743 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40223762 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40223790 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 40230296 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40230473 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40230539 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40230577 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 40230617 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40230626 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40230667 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40230783 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40230809 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40230819 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40230840 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 40230845 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40230996 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40231030 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40231154 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 40231187 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 40231239 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40231327 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40231705 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40231730 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40231836 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40231907 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40231920 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40232189 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40232320 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40232825 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 40233071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40233310 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40233399 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 40233450 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40233531 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40233586 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40233627 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40233699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40233700 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40233762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40233793 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40233799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40233876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40233927 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40233992 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40234083 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40234084 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40234186 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40234321 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 40234360 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40234450 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 40234901 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40235035 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40235136 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40235144 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40235153 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40235193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40235249 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40235255 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40235441 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40235554 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40235586 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40235756 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40236085 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40236185 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 40236204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40236271 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40236382 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 40236485 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 40236497 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 40236879 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 40237031 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40237296 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 40237311 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 40237388 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40237495 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 40237541 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40237610 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 40237802 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 40237816 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 40237940 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 40238126 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 40238132 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40238282 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 40238501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40238673 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40238792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40238814 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40239055 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40239087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40239106 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40239391 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 40239457 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40239519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40239682 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 40239746 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40239999 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40240055 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40240132 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40240364 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40240549 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40240746 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40241038 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40241312 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40241498 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 40241603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40241669 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 40241940 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40242340 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40242421 A C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 40242673 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40242915 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40242971 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40242991 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40243027 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 40243258 G T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 40243317 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 40243668 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40243793 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40244223 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40244272 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40244320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40244470 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40244513 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40244959 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40245390 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 40245480 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 40245619 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40245671 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40245675 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40245901 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 40246476 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 40246594 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40246768 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40246877 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40246997 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40247040 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40247071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40247256 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 40247415 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40247566 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40247716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40247870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40247931 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 40247950 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 40248383 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 40248505 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40248513 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40248651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40248901 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 40248939 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40248959 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 40248967 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40249083 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 40249109 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40249228 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40249255 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40249359 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40249391 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40249447 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40249554 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40249637 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40249730 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40249741 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40249833 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40249881 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 40249926 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 40249936 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 40250124 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40250158 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 40250229 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40250242 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40250300 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40250358 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40250526 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40250618 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40250682 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40250733 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40250773 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40250790 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40250869 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40250943 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40251008 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40251042 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40251044 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40251111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40251201 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40251397 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40251426 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40251499 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 40251510 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40251590 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40251604 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40251622 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40251648 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40251706 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40251725 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40251834 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40251848 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40251994 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40252063 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40252108 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40252337 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40252470 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40252503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40252548 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40252565 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40252619 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40252644 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40252784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40253023 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40253052 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40253084 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40253088 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 40253136 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40253175 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40253291 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40253306 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40253313 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40253360 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40253414 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40253521 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40253657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40253691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40253734 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40253763 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40254073 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40254117 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40254143 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40254168 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40254184 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40254194 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40254241 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40254276 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40254380 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40254484 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40254506 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40254879 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 40254927 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 40255168 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40255190 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40255258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40255301 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 40255363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40255453 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40255466 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40255475 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40255504 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40255646 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40255863 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40255883 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40256136 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40256141 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40256257 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40256296 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 40256345 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40256429 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40256512 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40256554 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40256580 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40256641 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 40256699 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40256819 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 40256873 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40256882 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40257117 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40257179 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40257202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40257236 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40257275 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40257368 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40257390 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40257434 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40257552 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40257648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40257659 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 40257682 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 40257729 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40257830 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40257881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40257886 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40257897 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40257898 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40257909 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 40257982 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40257998 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40258045 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40258060 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 40258083 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40258097 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40258171 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40258266 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40258306 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40258314 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40258326 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40258466 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40258652 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40258722 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40258762 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 40258841 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 40259341 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40259348 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40259429 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40259484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40259698 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40259824 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40260049 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40260211 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 40260213 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40260448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40260499 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40260602 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 40260652 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40260654 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 40260958 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40260987 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40261029 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40261462 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40261681 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 40261841 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 40261862 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40262198 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40262229 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40262238 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40262245 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 40262392 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 40262603 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 40262691 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40263036 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 40263091 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 40263397 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 40263405 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 40263503 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 40263545 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 40263654 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 40263665 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 40263822 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 40264016 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 40264065 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 40264077 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 40264229 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40264319 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 40264354 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 40264386 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40264409 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40264660 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40264714 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40264826 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40265084 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 40265505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40265536 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 40265733 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 40265820 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40266129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40266320 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 40266453 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 40266504 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 40266508 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 40266574 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 40266608 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 40266836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40267050 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 40267386 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 40268257 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40268477 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40268575 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40268693 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 40268761 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 40268870 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 40268949 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40269061 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40269070 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 40269190 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 40269293 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40269387 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40269389 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40269399 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 40269484 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40269513 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 40269620 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 40269691 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40269728 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40269933 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40270197 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 40270203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40270255 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40270306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40270382 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40270539 A C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 40270641 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40270895 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40270961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40270990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40271025 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40271394 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40272040 G T Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 40272122 C G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 40272131 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40272143 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 40272191 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40272291 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40272360 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40272471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40272539 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40272589 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40272801 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40272893 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 40272936 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 40273086 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40273243 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40273388 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40273459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40273562 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 40273649 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 40273753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40273755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40273764 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40273797 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40273846 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40273856 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40273916 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40273966 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40274011 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40274054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40274098 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40274105 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 40274178 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40274408 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 40274459 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40274676 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 40274705 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40274738 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 40274906 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40275038 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 40275151 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 40275550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40275596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40275745 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 40275807 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40275813 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40275823 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40276245 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40276372 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40276614 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 40276618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40276690 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40276847 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40276986 T A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 2 40277257 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40277267 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40277288 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40277414 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 40277429 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 40277595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40277630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40277674 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40277685 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40277688 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40277718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40277774 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40277855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40277908 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40278097 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 40278121 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40278145 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40278154 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40278199 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40278221 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 40278370 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40278387 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40278504 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40278519 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40278537 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40278573 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40278590 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40278603 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 40278769 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 40278781 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40278801 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 40278899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40278922 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40278969 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40279043 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 40279054 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40279062 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 40279090 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40279181 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40279333 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40279461 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40279536 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40279539 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40279578 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40279646 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40279791 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 40279951 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40279983 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40279997 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40280032 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40280195 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40280290 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40280293 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40280319 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40280368 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40280544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40280565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40280809 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40280888 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40281151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40281193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40281202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40281324 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40281408 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40281600 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40281769 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40281797 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40281842 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40281915 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 40282071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40282075 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40282101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40282152 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40282163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40282201 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40282240 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40282466 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40285600 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40285621 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40285717 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40286163 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40286294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40286331 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 40286342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40286362 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40286470 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40286472 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40286501 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40286677 A T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 2 40286906 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40286930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40287064 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40287209 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40287248 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40287287 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40287461 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 40287646 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 40287668 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40287767 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40287894 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 40287910 A C N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 40287981 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 40288094 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40288135 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40288192 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 40288200 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 40288207 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40288211 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40288257 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40288274 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40288310 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40288407 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 40288444 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40288519 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 40288561 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40288580 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40288582 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40288592 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40288658 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40288677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40288917 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40288920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40289067 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40289118 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40289227 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40289291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40289304 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40289450 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 40289492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40289525 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40289645 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40289972 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40290046 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40290108 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40290172 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40290403 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40290501 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40290515 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40290706 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 40290807 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 40291028 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40291080 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40291158 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40291212 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 40291335 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40291484 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40291515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40291551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40291605 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40291606 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 40291796 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40291808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40291827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40291892 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 40292068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40292070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40292600 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 40293440 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40293536 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 40293571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40294158 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40294176 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40294207 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 40294327 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40294421 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 40294473 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 40294574 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40294602 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40294755 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40294884 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40294944 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40295023 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40295370 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 40295405 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40295494 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40295743 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40295811 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40295859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40295983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40296104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40296139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40296166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40296185 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40296206 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40296273 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40296380 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40296478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40296506 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 40296609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40296686 A T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 40296707 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40296949 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40297075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40297109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40297121 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 40297271 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40297404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40297460 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40297469 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40297488 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40297514 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 40297627 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40297649 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40297650 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40297697 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40297719 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40297906 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 40299557 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40300035 G C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 40300171 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 40300296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40300797 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40301532 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40301973 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40301999 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40302037 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40302100 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40302686 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40304755 A C N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 40305184 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40305469 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40305537 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40305546 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40305794 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40306430 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40306694 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40307353 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40307501 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 40308056 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 40308110 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40308279 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40308532 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40308766 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40309318 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40310440 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 40310711 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40311035 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40311370 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40311430 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40311460 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40311893 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40312114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40312138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40312186 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 40312254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40312358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40312385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40312434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40312443 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40312498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40312615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40312656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40312841 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40312850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40312883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40312927 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40313095 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40313096 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 40313128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40313224 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40313236 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40313402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40313405 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40313462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40313514 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40313567 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40313661 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40313716 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 40313808 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40313858 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40313978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40314141 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 40314217 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 2 40314238 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40314241 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 40314378 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40314467 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40314522 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40314569 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40314581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40314659 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40314722 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40314840 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40314854 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40314880 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 40314962 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 40315033 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 40315045 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 40315216 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40315228 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40315294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40315638 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40315697 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40315721 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40315736 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40315755 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40315756 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40315915 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40315931 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40315948 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40316314 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40316372 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40316383 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40316384 C T Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 40316484 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40316496 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40323052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40323080 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40323087 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 40323120 A C Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40323152 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40323158 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40323253 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40323380 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40323429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40323464 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40323594 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40323653 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40323720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40323738 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40323929 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40324063 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40324079 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40324121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40324148 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 40324180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40324205 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40324251 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40324309 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40324322 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40324438 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40324550 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 40324613 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 40324792 C A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 40324816 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 40324870 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 40324871 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 40324895 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 40324949 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 40326755 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 40326759 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 40326794 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40328029 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 40328046 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 40328067 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 40328270 T A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 40328294 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 40330301 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40330439 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 40330615 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 40330729 A C Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 40331175 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40331216 T C Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 40331278 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40331329 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40331586 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40331603 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40331622 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40331669 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40331682 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 40331844 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40331871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40331876 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 40331938 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40331941 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40331995 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40332045 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40332100 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40332208 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40332407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40332411 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40332429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40332523 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40332542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40332609 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40332672 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40332767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40332919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40333085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40333192 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40333401 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 40333508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40333653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40333659 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40333666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40333825 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40333836 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40333921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40333931 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40333934 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 40333972 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40334040 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40334176 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40334391 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40334452 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 40334473 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40334478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40334538 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 40334668 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 40335234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40335300 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 40335425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40335525 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 40335577 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 40335654 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40335675 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40336099 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40336183 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40336209 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 40336313 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 40336350 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40336354 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 40336441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40336523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40336698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40336838 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 40336986 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40337121 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 40337132 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40337162 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40337284 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40337298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40337382 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40337598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40337766 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40338035 T G Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 40338118 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 2 40338132 C G N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 2 40338135 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 40338144 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 40338172 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 40338252 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40338289 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40338309 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40338610 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40338712 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40338726 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40338754 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40339034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40339310 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40339466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40339516 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40339546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40339578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40339621 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40339660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40339672 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40340022 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40340362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40340637 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40340821 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40340822 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 40341001 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 40341029 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 40341277 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40341466 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40341575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40341603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40341648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40341663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40341824 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 40341894 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40342000 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40342001 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 40342359 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40342389 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 40342908 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 40342973 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 40343078 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 40343138 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 40343146 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40343160 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 40343252 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40343292 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40343320 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40343321 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40343457 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40343484 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40343558 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40343574 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40343593 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40343674 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40343675 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40343695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40343705 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 40343761 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40343769 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40343835 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40343905 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40343914 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40344128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40344185 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40344239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40344280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40344359 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 40344574 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40344768 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 40344806 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40344880 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40344921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40344961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40344995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40345020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40345029 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40345079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40345168 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40345287 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40345510 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40345560 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40345606 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 40346238 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 40346310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40346348 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40346488 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40346557 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40346563 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 40346596 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40346602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40346699 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40346733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40346807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40346847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40346872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40346913 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40346937 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40347389 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40347490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40347515 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40347538 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40347577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40347594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40347801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40347900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40347918 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40347943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40347984 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40348010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40348034 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40348037 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40348140 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40348221 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40348276 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40348328 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 40348362 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40348397 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40348490 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 40348522 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40348698 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40348705 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40348894 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 2 40349147 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 40349325 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40349513 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40349696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40349881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40349912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40350111 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 40350136 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40350304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40350320 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40350334 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40350481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40350544 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40350562 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40350573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40350613 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40350786 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40350804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40350805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40350855 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40350942 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40350946 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40350962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40350970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40351063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40351094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40351147 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40351285 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40351294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40351596 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40351693 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 40351766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40351775 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40351872 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 40351997 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 40352034 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 40352041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40352079 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 40352140 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40352229 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 40352366 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40352722 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40352738 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40352828 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 40352885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40352909 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 40352917 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 40352934 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 40352965 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40353072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40353089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40353091 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40353144 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40353364 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40353517 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40353541 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40353682 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40353711 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 40353813 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40353825 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40353854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40353920 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 40354082 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 40354102 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40354129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40354156 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 40354272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40354444 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40354472 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 40354484 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40354508 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 40354509 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40354544 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 40354641 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40354812 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 40354948 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 40354963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40355035 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40355098 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40355263 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 40355540 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40355580 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 40355660 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 40355681 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40355691 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 40355712 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40355969 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40356068 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40356109 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40356128 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 40356277 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40356332 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40356381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40356529 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40356600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40356674 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40356786 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40357002 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40357096 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40357153 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40357314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40357339 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40357374 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40357546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40357677 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40357742 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40357797 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40357871 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40357922 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40357950 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40357998 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40358015 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40358053 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40358141 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40358171 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40358181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40358222 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40358494 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40358652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40358819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40359079 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40359367 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40359390 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40359429 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40359466 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40359731 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40359929 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40359934 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40360073 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40360141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40360166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40360465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40360529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40360648 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40360687 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40360692 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40360764 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40360774 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40360852 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40360864 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40360890 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40360917 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 40360928 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40360984 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40360988 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40361182 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40361206 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40361236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361376 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40361423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361461 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361500 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361513 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40361533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361572 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361648 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361652 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361728 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40361807 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40361840 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40361847 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40361940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40361958 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40362005 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40362008 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40362022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40362090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40362109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40362124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40362193 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40362228 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40362238 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40362359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40362390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40362423 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40362426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40362482 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40362488 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40362557 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40362716 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40362803 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40362807 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40362857 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40362869 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40363055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40363143 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40363188 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40363191 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40363259 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40363271 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40363292 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 40363300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40363320 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40363411 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40363453 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40363471 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40363538 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40363601 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40363684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40363727 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40363756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40363799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40363823 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40363858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40363862 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40364038 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40364172 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40364229 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40364375 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40364622 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40364716 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40364728 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40364751 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40364823 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40364875 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40364962 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40365128 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40365150 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40365667 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40366166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40366383 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40366408 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 40366585 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40366931 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 40366956 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40366974 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40367117 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40367125 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40367193 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40367374 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40367742 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40367884 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40368084 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40368160 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40368200 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 40368227 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40368474 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40368514 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40368594 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40368633 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40368696 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40368914 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40369217 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40369221 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40369352 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40369872 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40370158 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40370421 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40370561 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40370805 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40370840 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40370905 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40371238 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40371289 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40371763 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40371896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40372148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40372690 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40372766 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40372795 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40372916 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40372934 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40373497 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40373973 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40374307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40377146 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40377205 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40377542 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40378789 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40378831 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 40378896 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40378917 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 40378933 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40379021 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 40379122 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40379140 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40379163 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 40379251 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 40379313 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40379401 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40379560 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 40379767 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40379887 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40380040 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40380046 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40380096 G T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 40380136 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 40380203 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40380248 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40381250 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 40381260 A T Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 40381305 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 40381325 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 40381335 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 40381338 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 40381349 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 40381411 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 40381523 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 40381540 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40381558 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 40381647 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 40384937 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40385086 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40385188 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 40385198 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40385249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40385256 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40385306 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40385729 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40386699 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 2 40386793 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40387725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40388389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40389254 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40389723 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40389975 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40389982 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40390017 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40390072 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40390134 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40390166 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40390272 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40390292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40390314 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40390371 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40390373 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40390410 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40390522 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40390552 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40390558 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40390567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40390653 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40390682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40390698 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40390750 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 40390787 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 40390829 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40390849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40390881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40390935 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 40390945 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40390954 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40391074 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40391145 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 40391147 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40391177 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 40391211 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 40391349 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40391390 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 40391427 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 40391546 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40391598 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40391605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40391660 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40391718 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40391768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40391790 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40391907 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40391923 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40391981 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40392283 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40392397 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 40392407 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 40392463 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40392521 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40392781 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 40392805 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 40392911 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40392922 C A Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 40392996 T A Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 40393071 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 40393089 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40393149 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40393150 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40393206 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40393213 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40393224 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40393278 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40393350 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40393371 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 40393384 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40393406 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40393565 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40393594 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40393629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40393674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40393692 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40393770 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 40393788 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40393842 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40393864 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40393905 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40393985 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40393993 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40394001 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40394093 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 2 40394112 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40394169 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 40394217 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40394310 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40394385 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40394465 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40394505 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 40394529 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 40394592 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 40394647 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40394666 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40394719 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40394724 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 40394806 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40394829 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40394927 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 40395024 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40395097 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 40395141 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 40395231 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 40395308 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40395444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40395487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40395587 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40395896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40395917 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40395943 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 40396082 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 40396515 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40396750 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40396888 C A Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 40396935 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 2 40396939 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40397023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40397052 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 40397258 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 40397299 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40397334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40397364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40397532 G T Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 40397574 C A Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 40397958 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 40398404 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40398474 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40398645 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40398657 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40398684 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40398987 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40399043 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40399197 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40399260 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40399743 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 40399776 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 40399791 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 40399812 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40399855 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 40399914 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40400020 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 40400036 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40400044 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40400062 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40400101 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40400239 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40400267 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 40400308 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 40400399 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 40400400 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 40400448 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 40400463 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40400469 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 40400506 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 40402132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40402611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40402693 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 40404546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40405795 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40405876 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40408278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40408713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40408845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40409171 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 40410075 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40413217 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40413412 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40413422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40413432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40413761 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40413769 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40414163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40415172 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40416264 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 40416497 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40416553 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 40416650 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40416656 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40418516 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40418640 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40419546 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40419570 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40420178 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40420355 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40420407 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40420539 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40420559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40420757 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40420822 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40420992 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40421070 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40421230 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40421509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40421678 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40421996 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40421998 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40422155 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40422240 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40422557 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 40422793 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40422835 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 40423275 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40423504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40424039 A T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 40424274 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 40424543 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 40424648 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40424742 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 40424790 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 40424825 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 40424880 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40424893 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40425365 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40425531 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40425559 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40426822 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40427588 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40427723 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40427951 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 40428311 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40428784 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40428819 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40428931 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40429241 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40429306 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40430140 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 40430296 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 40430701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40431283 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 40431401 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40431410 C A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 40431472 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40431875 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 40431984 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40432111 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40432164 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40432221 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40432250 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40432338 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 40432348 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40432357 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 40432413 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40432538 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40432541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40432656 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40432805 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40432806 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40432823 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40432824 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40432847 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40432892 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40432933 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40433055 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40433145 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 40433149 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 40433181 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40433188 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40433192 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40433368 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 40433397 T C Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 40433408 A C Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 2 40433448 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 2 40433570 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40433572 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40433707 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 40433721 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40433730 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 40433736 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 40433781 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40433864 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 40433888 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 40433902 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40433906 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 40433917 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 40434011 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40434064 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 40434090 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 40434161 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40434189 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 40434307 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40434370 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40434373 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40434423 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40434438 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40434455 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40434470 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40434554 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40434555 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40434575 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40434635 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40434642 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40434651 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40434828 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40435146 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40435220 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40435295 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40435374 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 40435450 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40435472 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40435550 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40435658 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40435683 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40435689 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40435728 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 40435751 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 40435767 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40435782 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40435798 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 40435868 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 40435912 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 40435982 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40436070 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40436123 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40436126 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40436159 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40436172 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40436199 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40436218 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40436265 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40436355 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40436408 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437070 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40437149 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40437154 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437296 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437297 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437330 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437350 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437385 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437389 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437423 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437526 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437571 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40437579 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437588 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437593 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40437709 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40437731 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40438033 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40438042 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40438079 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40438089 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40438100 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 40438110 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 40438138 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 40438145 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40438354 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40438357 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40438439 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40445235 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40445292 A C Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 40445521 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40445603 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40445610 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40445632 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40445668 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 40445674 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 40445689 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40445700 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40445727 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40445805 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40445807 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40445826 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40446092 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40446568 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 40446569 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 40446611 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 40446629 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 40447028 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40447093 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40447159 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40447243 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40447619 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40447746 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 40447944 A G Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 40448151 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 40448456 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40448494 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40448508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40448557 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40448784 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 40448795 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 40449052 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40449166 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40449284 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 40449307 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40449450 T C Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 40449664 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 40449754 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 40449903 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40449933 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 40450291 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40450382 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 40450427 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40450429 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40450505 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 40450519 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40450574 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40450732 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 40451288 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40451352 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40451440 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40451549 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40451932 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40452319 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40452912 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40453555 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40454174 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40454289 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40454931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40455113 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40456034 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40456173 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40456613 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40456637 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40456885 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40457351 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40457552 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40457669 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40458165 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 40458167 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 40458280 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40458291 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 40458543 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40458547 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40458602 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 40458609 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 40458645 A T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 40458692 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 40458714 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 40458786 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 40458907 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 40459478 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 40459713 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40459836 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40460004 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40460062 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40460111 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40460253 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 40460334 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40460643 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40460657 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 40460692 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 40461081 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40461384 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40461624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40461707 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40461768 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 40461920 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40461976 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462057 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462086 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40462092 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40462136 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40462143 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40462170 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462316 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40462353 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40462408 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40462528 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462529 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462548 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462563 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462643 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462741 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40462750 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462798 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462845 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462940 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462941 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462976 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40462980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40463001 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40463004 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40463268 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 40463375 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 40463403 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40463495 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40464344 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40464532 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 40464587 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40464621 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40464628 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40464829 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40465037 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40465237 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40465306 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40465521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40465981 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40466413 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 40466773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40466886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40467291 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40467292 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40467444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40467733 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40467888 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40468812 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40468876 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40469436 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40469475 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40470218 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40470567 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40470784 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40472978 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40473528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40473685 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 40473841 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40473893 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40473925 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40474075 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40474105 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40474216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40474340 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 40474411 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40474458 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 40474470 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 2 40474580 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 40474628 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 40474832 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 2 40474833 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 40474917 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 40475092 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40475116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40475134 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40475169 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40475181 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40475210 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40475231 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40475355 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40475651 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40475757 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40475801 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40476076 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40476093 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40476206 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40476211 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40476246 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40476356 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40477499 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40477800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40478954 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 40479246 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40479383 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40479737 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40479744 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40479785 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40479855 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40479940 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40480181 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40480414 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40480453 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40480471 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40480594 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40480664 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40480765 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40480975 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40481141 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40481298 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40481405 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40481457 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40481489 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40481559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40481587 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40481631 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 40481662 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40481688 G C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40481752 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40481765 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 40481785 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40482078 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40482106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40482164 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40482424 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40483282 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40483366 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40483397 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40483417 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40483520 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40483523 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40483543 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40483619 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40483660 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40483665 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40483784 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40483898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40483917 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40484474 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40484504 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40484523 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40484620 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40484714 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40484721 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40484762 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40484777 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40484784 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40484894 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40484925 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40484927 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40484938 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40484946 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40485101 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40485437 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40486171 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 40486221 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40486278 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40486291 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40486395 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 40486398 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40486414 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40486479 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40486573 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40486616 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 40486662 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40486716 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40486725 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40486735 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40486869 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40486871 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40486889 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40486940 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40486995 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 40486999 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 40487093 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40487105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40487151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40487291 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 40487311 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40487327 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40487673 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40487783 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40487910 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40487974 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40488001 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 40488100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40488244 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40488324 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40488486 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40488541 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40488669 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40488685 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40488786 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 40488874 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40488980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40491493 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40491552 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40491555 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40491785 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 40491881 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40491939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40492008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40492032 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40492235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40492236 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40492272 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40492302 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40492507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40492626 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 40492718 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40492794 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40492848 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40492962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40493082 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40493166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40493431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40493452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40493674 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40493675 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 40493711 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40493713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40493722 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 40493753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40494013 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40494033 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40494349 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 40494363 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 40494390 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40494607 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40494623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40494646 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40494693 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40494703 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40494705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40494778 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40494833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40494839 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40494917 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40494920 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40494929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40494979 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40495003 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40495023 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40495040 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40495110 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40495164 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40495171 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40495246 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40495270 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40495271 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40495405 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40495460 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40495501 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40495623 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40495968 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 40496019 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 40496137 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40496212 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40496287 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 40496333 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 40496544 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 40496855 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40497312 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40498045 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40498158 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40498203 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40498369 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 40498601 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40498665 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40498718 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40498746 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 40498795 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40498900 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40498952 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40498963 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 40498990 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40499015 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40499018 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40499066 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40499096 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40499152 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 40499192 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40499194 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40499424 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40499508 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40499678 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40499698 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 40499706 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 40499821 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40500231 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40500300 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 40500469 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40500536 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40500713 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40500745 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 40500779 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40500827 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40500854 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40500988 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 40501568 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 40501578 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40501643 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40502190 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40502420 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40502487 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40502512 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40502526 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40502792 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40502793 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40502861 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40502970 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40502972 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40503138 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40503205 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40503214 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40503282 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40503407 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40503466 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40503491 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40503812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40503977 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40504366 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40504463 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40504531 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40504709 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40504775 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40505186 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40505515 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40505780 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 40506100 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40506215 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40506382 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 40507356 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 40508416 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40508989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40509630 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 40510063 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40510282 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 40510841 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40510973 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40511004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40511221 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40511910 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40512936 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40513200 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 40513675 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 40514457 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40514583 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40515848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40517470 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 40517483 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40517516 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 40517606 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 40517698 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 40517725 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 40518092 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 40518504 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 40518536 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40518582 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40518866 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40519369 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40519471 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40519592 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40519623 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40519729 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40520061 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40520091 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40520104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40520112 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40520125 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40520131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40520189 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40520259 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40520322 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40520359 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40520439 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40520544 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40520547 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40520778 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 40520797 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 40520872 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40520931 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40521035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40521102 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40521134 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40521145 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40521204 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40521251 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40521300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40521496 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40521499 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40521593 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40521615 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40521659 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40521718 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40521788 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40521799 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40522222 C A N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 40522394 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 40522502 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 40522579 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40522760 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40522778 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40522792 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40522829 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40522860 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40522922 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40522955 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40522974 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40522999 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40523088 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40523143 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40523455 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40523480 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40523485 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40523510 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 40523512 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40523623 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40523766 A T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 2 40523767 A T N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 2 40523777 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 40523809 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 40523834 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40523840 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40524027 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40524151 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40524230 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 40524257 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40524310 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40524378 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40524563 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40524604 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 40524624 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40524683 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40524689 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 40524765 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 40524810 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40524869 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40524896 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40524921 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40525028 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40525041 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40525291 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40525292 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40525445 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40525565 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 40525638 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 40525867 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 40525911 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 40525982 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40526035 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40526075 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40526314 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40526484 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 40526489 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40526627 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40526642 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40526774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40526803 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40526871 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40526874 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40526883 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 40527000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40527026 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40527044 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40527214 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 40527226 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40527246 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40527465 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40527485 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40527802 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 40528141 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40528148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40528445 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40528521 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40528687 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40528858 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40529392 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40529458 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40529494 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40529521 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40529619 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40529808 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 40529929 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40530032 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40530093 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40530143 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40530308 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40530416 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40530570 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40530580 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40530611 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40530630 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40530685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40530789 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40531021 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40531151 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40531352 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40531620 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40531667 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 40531669 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 40531923 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 40531986 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40532041 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40532066 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 40532084 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40532129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40532207 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40532247 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40532271 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40532363 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40532378 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 40532391 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 40532409 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40532562 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40532596 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40532603 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40532623 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40532740 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40532794 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40533075 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40533102 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40533177 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40533296 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40533311 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40533317 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 40533383 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40533387 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 40533395 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 40533433 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 40533625 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40533657 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 40533701 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40533826 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40533871 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40533964 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40533978 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 40534011 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40534248 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40534336 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40534443 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40534587 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 40534697 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40534748 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40534759 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 40534787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40534804 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40535008 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40535037 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40535051 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40535056 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40535115 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40535204 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40535247 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40535326 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 40535334 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40535373 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40535427 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 40535442 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40535491 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40535561 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 40535602 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40535604 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40535691 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40535732 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40535733 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 40535756 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40535817 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40535989 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40536094 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40536179 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40536374 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40536404 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40536437 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40536471 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 40536602 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 40536688 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40536695 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40536834 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40536840 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40536928 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40536943 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40536954 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40536963 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40537063 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 40537108 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40537141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40537154 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40537173 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40537227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40537321 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40537357 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40537361 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 40537422 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40537764 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40537773 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 40537816 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 40537946 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 40537958 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40538109 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40538138 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40538163 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40538247 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40538322 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40538393 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 40538475 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40538537 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 40538676 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40538699 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40538731 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 40538873 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 40538897 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 40538917 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40538950 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 40539100 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40539187 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 40539209 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 40539213 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40539246 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 40539379 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40539435 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 40541002 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 40541031 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40541151 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40541181 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 40541277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40541366 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 40541703 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40541811 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40542050 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40542133 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 40542154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40542506 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 40542632 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40542687 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 40543211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40543305 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40543397 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40543415 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 40543416 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40543504 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 40543540 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 40543545 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 40543609 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40543638 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 40543711 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40544008 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40544019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40544149 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40544205 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40544208 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40544221 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40544281 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 40544285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40544352 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 40544365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40544547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40544672 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 40544733 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40544794 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 40544817 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 40544899 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 40544937 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40545026 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 40545330 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 40545356 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 40545440 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 40545470 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 40545482 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 40545487 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40545493 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 40545504 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 40545507 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 40545582 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 40545690 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40545747 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 40545783 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 40545868 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 40545885 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 2 40545905 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 40545906 C A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 40546070 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 40546116 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 40546127 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 40546144 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 40546223 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 40546323 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 40546334 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 40546345 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 40546359 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 40546440 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 40546555 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 40546567 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 40546572 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 40546581 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 40546693 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 40546756 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40546758 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 40546828 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 40546963 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40546966 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 40547037 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 40547051 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 40547115 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 40547283 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 40547295 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 40547302 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 40547372 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 40547450 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 40547451 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 40547542 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40547576 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 40547810 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 40548095 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40548172 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40548214 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40548278 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40548306 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40548453 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40548477 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40548495 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40548568 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40548849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40548873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40549273 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 40549295 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40549462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40550488 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 40550531 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 40550628 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 40550648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40550929 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40551388 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 40551390 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 40551834 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40551859 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40551966 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 40552024 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 40552067 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40552133 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40552192 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 40552283 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40552370 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40552412 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 40552426 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 40552514 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 40552600 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40552738 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40552747 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 40553161 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40553230 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40553255 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40554182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40554204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40554310 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40554311 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40554535 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 40554542 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40554572 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40554617 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 40554633 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 40554705 T A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40554828 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40555002 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40555016 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40555114 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40555337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40555377 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40555441 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40555729 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40555840 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40556090 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 40556094 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 40556118 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40556371 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 40556423 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 40556452 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 40556508 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 40556545 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 40556573 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 40556585 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40556589 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 40556600 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40556620 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 40556684 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 40556687 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40556744 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40556881 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 40557118 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40557242 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40557404 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40557597 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40557663 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40557686 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40557705 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40557946 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 40558279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40558688 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40558693 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40558850 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40559054 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40559103 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 40559264 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 40559574 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 40559637 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40559887 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40560271 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 40560307 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 40560325 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 40560522 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40560588 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 40560715 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40560730 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40560814 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40560825 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40560960 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40560995 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40561139 C G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 40561157 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 40561309 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 40561311 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40561357 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40561587 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 40561643 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 40561793 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40562174 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 40562207 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 40562292 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40562442 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40562594 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 40562655 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 40562925 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40562976 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 40563014 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 40563025 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40563036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40563173 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 40563183 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40563205 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40563227 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40563243 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 40563245 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40563488 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40563650 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 40563656 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40563707 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 40564156 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 40564277 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 40564547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40564869 T A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 40564872 T A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 40564949 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 40565235 G A N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 40565247 C G N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 40565252 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 40565539 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40565759 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40565785 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 40565880 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40566012 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 40566143 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 40566180 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40566265 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40566274 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40566400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40566423 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40566539 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 40566557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40566570 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40566702 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40567053 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40567258 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40567294 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40567404 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40567686 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40567914 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40568078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40568311 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40568545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40568572 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40568611 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40568629 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 40568667 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40568975 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40569329 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40569467 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40570071 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40570108 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 40570301 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40570563 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40570830 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40570886 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40571072 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40572127 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40573424 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40573543 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40573852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40574050 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 40574059 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 40574327 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 40574541 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 40574663 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 40574862 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 40574940 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 40574944 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 40575011 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 40575086 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 40575105 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 40575419 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 40575436 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 40575462 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40575484 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40575487 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40575700 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 40575847 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 40575894 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 40575922 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 40575971 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 40576059 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40576076 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 40576120 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40576139 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40576241 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 40576301 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40576312 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 40576444 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40576498 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40576499 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 40576544 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40576577 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40576585 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 40576628 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 40576643 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40576655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40576784 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40576801 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40576836 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40576843 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40576874 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40576936 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 40576971 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 40577027 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 40577104 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40577126 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40577136 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40577160 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40577237 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40577244 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40577265 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40577305 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40577311 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40577362 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40577420 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 40577441 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40577508 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40577533 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40577569 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 40577570 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 40577594 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40577635 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40577679 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 40577690 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40577710 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40577761 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40577773 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40577826 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 40577846 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 40577847 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 40577911 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40577922 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 40577932 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40577941 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40577951 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40577968 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40577997 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 40578011 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 40578036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40578158 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40578203 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40578208 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 40578239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40578350 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40578471 T A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 40578537 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40578559 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 40578595 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 40578664 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40578910 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 40578967 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40579033 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40579061 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 40579149 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40579249 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 40579351 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40579398 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40579439 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40579470 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40579494 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 40579527 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 40579572 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40579808 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40579810 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 40579861 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40579866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40579880 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 40580002 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 7 13 3 1 6 2 40580018 G T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 2 40580110 G T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 40580119 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 40580136 T A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 40580142 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40580179 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 40580259 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 40580450 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 40580571 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40580572 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40580669 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 40580679 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 40580698 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 40580737 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 40580798 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40580807 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40580852 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40581050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40581082 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40581233 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40581290 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40581303 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40581341 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40581346 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40581361 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40581416 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40581695 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40581729 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40581841 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40582235 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40582293 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40582304 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40582310 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40582337 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40582357 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40582429 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40582477 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 40582515 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40582549 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40582581 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40582585 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40582619 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40582650 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40582704 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40582720 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40582734 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40582754 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40582773 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40582789 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 40582802 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40582815 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 40582876 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40582904 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40582996 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40583024 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40583050 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40583107 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 40583134 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40583222 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40583227 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40583241 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40583274 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40583301 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40583303 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40583449 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 40583473 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40583577 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40583772 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40583795 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40583812 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40583822 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40583830 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40583903 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40583975 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40584010 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40584025 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40584027 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 40584039 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40584040 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40584069 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40584074 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40584174 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40584228 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40584234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40584276 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40584311 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40584339 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40584358 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40584359 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40584374 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 40584407 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 40584484 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40584514 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40584751 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40584764 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40584871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40585051 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40585126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40585129 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40585142 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40585191 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40585201 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40585207 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40585296 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40585565 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40585604 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 40585724 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40585740 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40585746 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40585756 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40585831 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40585839 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 40585871 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40585927 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40585987 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 40586003 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40586016 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40586020 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40586034 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40586058 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40586381 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 40586452 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 40586569 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 40586593 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40586912 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40587013 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 40587220 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40587274 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40587294 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40587324 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40587628 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40587697 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40587815 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40587866 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 40587877 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40587893 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40587992 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 40588058 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 40588180 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40588197 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40588301 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40588515 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 40588631 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 40588643 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 40588659 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40589144 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40589321 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 40589369 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 40589373 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40589417 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40589426 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40589431 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40589557 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40590022 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40590025 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40590058 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40590090 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40590209 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40590380 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40590949 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40591954 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 40592003 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40592214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40592728 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 40592752 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 40592917 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40593359 G A N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 2 40593383 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40593424 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 40593472 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 40593711 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 40593735 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40593749 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40593842 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 40594127 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 40594248 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 40594356 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40594400 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40594480 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40594565 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40594649 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40594669 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 40595015 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40595350 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40595677 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 40595988 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40596043 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40596115 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 40596157 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40596243 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40596275 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40596323 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 40596655 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 40596797 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40596908 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40596919 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 40597018 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40597049 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40597060 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 40597175 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40597204 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40597237 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 40597290 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 40597313 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40597467 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40597537 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40597583 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40597747 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40597787 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 40597802 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40597875 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40597885 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40597918 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40597961 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 40598056 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40598093 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 40598432 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40598433 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40598463 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40598485 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40598685 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 40598739 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40598768 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40598879 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40598916 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40598929 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40598955 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40599053 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40599108 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 40599122 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 40599125 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40599256 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40599268 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40599300 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40599354 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40599366 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40599438 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40599445 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40599571 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 40599614 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 40599626 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40599631 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40599664 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40599693 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 40600097 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 40600262 T A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 40600420 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40600462 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 40600717 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40601128 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40601193 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40601575 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 40601677 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 40601718 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40601749 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 40601773 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 40601788 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 40602002 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 40602146 T C Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 40602148 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 40602163 A G Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 40602299 T C Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 40602724 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40602986 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40603043 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 40603129 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 40603241 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 40603277 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40603641 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 40603657 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 40603701 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 40603764 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 40603813 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 40603984 T A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 40604539 A C Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 40604590 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 40604968 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 40605032 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 40605185 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 40605197 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 40605699 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40606157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40607369 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40607703 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 40607863 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40608214 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 40608416 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40608446 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40608725 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 40608854 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40609011 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40609609 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40609782 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40610288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40610483 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 40610504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40610560 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40611205 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40611223 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40611421 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40611507 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40611698 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40612662 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40612857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40613165 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40613183 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40613203 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40613216 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40613238 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40613255 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40613327 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40613409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40613482 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40613838 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40614149 G C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40614256 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40614375 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40614887 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 40614921 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40615108 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40616009 T G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 40616390 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40616462 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40616579 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40617103 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40617271 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40617379 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40617398 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40617487 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40617960 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40618224 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40618720 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40619391 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40619403 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 40619434 T G Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 2 40619449 C G Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 40625602 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40625682 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40625780 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40625802 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40626077 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40626114 T A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40626970 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 40627193 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40627326 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40627394 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40627431 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 40627511 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 40627606 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40627660 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40627677 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40627702 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40627741 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 40627911 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40628030 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40628196 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40628216 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40628443 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40628761 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40628832 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40628873 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40629114 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40629158 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40629263 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 40629518 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40629610 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40629611 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40629669 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40629701 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40629703 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40629961 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40630080 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40630260 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40630419 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40630439 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40630627 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40630651 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40630690 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40630729 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40630814 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40630842 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40631005 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40631024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40631037 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40631150 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40631154 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40631161 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40631269 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40631298 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40631299 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40631593 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40631650 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40631669 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 40631975 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 40631980 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 40632150 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40632216 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40632279 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40632979 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 40633085 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40633673 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40633715 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40633759 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40633777 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40633822 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40634300 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40635224 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40635288 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40635571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40635674 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40635703 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40635787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40636404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40636467 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40636509 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40636593 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40636616 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40636687 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40636777 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40636856 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40636887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40637087 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40637115 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40637255 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40637608 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40637839 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40637858 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40638051 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40638122 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40638136 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40638190 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40638518 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40638536 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40638565 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40638633 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40638873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40638975 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40638987 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40638991 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40639007 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40639078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40639305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40639320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40639352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40639677 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40639695 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40639930 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40640153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40640274 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40640421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40640576 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40640854 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40641085 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40641211 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 40641256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40641342 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40641468 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40641486 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40641505 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40641508 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40641570 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40641579 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40641602 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40641686 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40641735 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40641963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40641965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642136 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642207 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40642216 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40642229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642273 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642318 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40642435 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 40642477 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40642540 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40642569 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40642610 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40642750 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40642805 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40642845 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40642860 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40643022 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40643105 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40643223 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40643245 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40643261 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40649624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40649720 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40649803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40649811 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40649865 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 40649951 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40649991 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40650069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40650164 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40650308 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40650334 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40650389 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40650392 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40650624 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40650813 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40650833 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40650976 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40651045 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40651250 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 40651598 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 40651772 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40651793 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40651927 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40651967 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40651969 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40651988 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40652016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40652275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40652303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40652307 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40652323 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40652330 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40652454 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40652503 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40652556 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40652566 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40652578 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40652657 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40652741 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40652816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40652979 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40652992 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40653257 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40653274 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40653690 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40654170 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40655059 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 40655610 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40655974 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40656019 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 40656471 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40656506 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40657522 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40657598 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40657672 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40657735 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 40657751 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 40657859 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40658436 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40658864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40658927 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40659044 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40659060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40659064 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40659134 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40659326 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40659466 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 40659601 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40659647 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40659682 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40659876 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40660077 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40660094 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40660110 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40660336 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40661148 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40661213 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 40661282 A T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 40661283 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 40661435 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 40661847 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40661866 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40661893 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40661975 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40662004 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40662104 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40662198 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40662250 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40662832 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 40663202 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40663213 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40663796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40663824 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40663841 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40663881 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40663883 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40663904 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40663922 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40664243 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40664769 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40664826 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40664914 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40665006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40665083 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40665126 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40665166 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40665184 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40665229 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40665241 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40665562 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40665637 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40665768 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40665769 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40665830 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40665835 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40666180 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40666761 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40667025 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 40667129 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40667330 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40667454 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40667888 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40668138 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40668451 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 40668557 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 40668872 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40669226 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40669804 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 40670913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40670950 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40671009 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40671141 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40671415 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40671431 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40672886 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40673078 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40673530 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40673889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40673972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40674076 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40674112 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40674169 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40674196 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40674269 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40674372 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40674418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40674450 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40674517 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40674820 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 40674835 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40674843 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40674857 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40674979 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40675092 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40675174 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40675175 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40675373 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40675388 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40675483 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40675522 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40675576 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40675594 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40675596 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40675609 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40675780 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40675895 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40676088 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40676313 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40676562 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40676824 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 40676836 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40677127 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 40677478 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40677597 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40677662 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40677722 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40678181 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40678564 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40678790 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40679498 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40679811 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40679971 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40680051 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40680114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40680135 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40680202 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40680282 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40680694 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40680798 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40680905 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40681344 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40681374 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40681966 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40682509 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40682611 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40682626 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40682641 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40682874 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40682953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40683314 G C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40683444 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40683701 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40683729 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40684112 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40684315 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40684483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40684548 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40684575 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 40684642 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 40684669 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40684917 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40685100 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 40685362 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40685374 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 40685518 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40685575 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40685623 G T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 40685650 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40685668 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40685841 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40685871 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40685873 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40685899 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40685910 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40685941 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40686056 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40686142 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40686269 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40686386 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40686410 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40686412 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40686542 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40686604 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40687140 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40687409 T G Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 40687475 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40687717 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40687807 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40687865 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40687991 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40688193 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40688372 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40688431 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40688435 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40688754 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40689116 T A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40689266 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40689702 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40689713 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40689746 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40689772 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40689784 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40689850 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40689934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40689947 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 40689994 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40690013 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40690319 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40690363 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40690439 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40690561 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40690606 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40690689 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40690804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40690813 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40690815 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40691411 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40691598 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40691804 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40691904 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40692050 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40692051 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40692091 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40692148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40692159 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40692184 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40692320 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40692340 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40692457 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40692516 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40692521 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40693175 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40693181 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40693238 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40693317 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40693336 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40693373 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40693758 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40693784 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40693948 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40693977 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40694011 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40694055 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 40694446 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 40694472 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40694852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40694883 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 40695208 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40695388 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40695443 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40695454 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40695490 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40695533 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40695788 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40695914 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40696127 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40696566 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 40696956 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40697240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40697269 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40697527 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40697597 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40697636 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40697843 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40697995 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40698043 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40698168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40698178 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40698285 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40698304 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40698410 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40698476 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40698528 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40698638 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40698695 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40698697 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40698794 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40698826 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40698838 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40698876 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40698886 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40698961 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40698981 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40698993 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40699027 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40699067 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40699086 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40699090 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40699109 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40699146 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40699178 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40699279 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40699351 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40699514 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40699600 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40699653 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40699700 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40699774 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40699822 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40699886 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40699939 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40699972 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40700093 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40700101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40700190 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 40700245 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 40700285 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40700355 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40700466 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40700570 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40700646 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40700769 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40700821 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40700958 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40700970 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40701076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40701623 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40701663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40701707 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40701800 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40702048 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40702129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40702152 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40702322 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40702921 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40703037 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40703877 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40704037 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40704194 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40705396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40705572 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 40708024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40708027 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40708166 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40708258 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40708765 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40708860 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40708961 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40709941 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40710208 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 40710281 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40711017 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40711497 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40712268 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40712308 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 40712313 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40712346 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40712476 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 40712520 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 40712559 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40712562 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40712622 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40712639 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 40712716 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 40712809 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40713183 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 40713376 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40713483 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40713554 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40713702 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40713787 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40714428 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 40714623 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40714782 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 40714832 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40714867 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40714909 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40714918 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40715109 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40715261 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40715537 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40715561 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40715838 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40716875 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40716897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40717418 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40717567 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40717590 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40717882 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40718119 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40718634 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40718701 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40718777 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40718814 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40719371 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40719822 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40720691 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40721231 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40722526 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40723323 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 40723833 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40723836 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40724501 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40724558 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40724698 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40724821 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40724930 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40725056 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40725111 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40725156 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40725219 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40725271 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40725280 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40725283 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40725309 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40725311 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40725338 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40725384 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40725398 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40725410 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40725420 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40725437 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40725445 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40725497 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40725554 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40725596 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40725795 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40725800 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40725922 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40725962 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40726156 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40726216 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 2 40726276 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40726285 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40726343 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40726387 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40726390 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40726433 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40726543 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40726709 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40726774 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40726777 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40726866 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40726886 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40726900 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40726935 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40726994 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40727091 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40727105 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40727118 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40727153 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40727202 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40727335 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40727352 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40727378 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40727573 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40727658 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40727677 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40727700 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 40727730 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40727788 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 40728066 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40728152 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40728157 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 40728325 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 40728615 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40728697 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40728969 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40729052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40729399 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40729403 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40729640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40729761 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40730153 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40730302 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40730424 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40730445 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40730804 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40730824 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40730834 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40731008 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40731293 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40731324 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40731409 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 40731425 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 40731575 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 40731582 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40731647 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 40731649 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 40731762 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40731823 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40731866 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40732218 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40732440 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40732525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40732849 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40732912 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40733039 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40733096 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40733400 C T N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 40733405 A T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 40733413 T C N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 40733438 T C N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 40733579 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40733831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40733937 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40734354 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40734550 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40734767 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40735182 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40735492 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40735532 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40735611 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40735868 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40735882 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40735928 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40736010 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40736291 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40736754 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40736814 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40736878 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40738367 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 40739312 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40739353 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40739356 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40740279 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40740585 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 40740620 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 40740675 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40740697 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40741783 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 40741976 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 40742242 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 40742558 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 40742786 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40743010 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 40743062 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 40743064 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 40743550 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40743579 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 40743620 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40743761 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40743821 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40744078 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 40744455 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40744561 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40744571 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40744621 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40744667 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40744715 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40744724 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40744730 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40744903 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40744912 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40744921 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40744924 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40744933 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40745017 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40745032 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40745058 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40745086 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40745101 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40745103 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40745150 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40745353 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40745468 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 40751188 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 40751210 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 40751272 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 40751459 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40751466 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40751491 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40751553 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40751567 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40751592 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40751599 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40751613 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40751617 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40751717 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 40751729 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 40751745 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 40751772 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 40751802 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40751818 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40752183 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40752193 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40752430 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40752444 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40752466 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40752531 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40752731 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40752814 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40752874 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40753012 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40753019 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40753066 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40753077 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40753100 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40753273 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40753357 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40753407 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40753419 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 40753502 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40753514 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40753520 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40753582 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 40753585 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 40753702 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40753721 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40753729 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40753749 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40753761 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40753832 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40753871 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40753881 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40753919 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40753936 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40754114 T A Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 40754121 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 40754125 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 40754193 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 40754224 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 40754241 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 40754244 G A Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 40754255 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40754352 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40754379 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 40754380 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 40754609 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 40754991 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40755050 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 40755256 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 40755287 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40755644 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40755920 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40756196 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40756219 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40756275 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40756288 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 40756291 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40756312 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40756395 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40756400 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40756459 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40756463 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40756726 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 40756794 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40757212 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40758718 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40758863 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40758875 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40759103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40759191 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40759472 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40759727 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 40759754 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 40759775 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 40760093 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 40760532 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 40760628 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 40760692 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 40760707 T A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 40760748 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 40760803 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 40760852 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40760873 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 40760889 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 2 40760937 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 40761106 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40761330 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40761516 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 40761754 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 40761818 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 40761831 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40761920 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40762007 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40762015 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40762210 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40762270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40762454 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40762554 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40762565 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40762704 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40762776 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40762785 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40762879 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40763437 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40763504 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40763749 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40763780 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40763901 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 40763957 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40764020 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 40764361 G C N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 40764708 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 40764741 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 40764846 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40764858 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40764981 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 40765029 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40765062 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40765116 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40765127 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40765139 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40765214 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40766037 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40766119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40766416 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40767032 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40768657 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 40769211 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 40769562 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40769789 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40769893 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40769938 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40769950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40770003 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40770207 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40770215 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40770256 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40770334 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40770357 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40770374 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40770448 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40770560 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40770564 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40770573 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 40770773 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40770812 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40770855 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40770857 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40770964 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40771073 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 40771074 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 40771161 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40771197 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 40771198 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 40771217 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40771242 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 40771248 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40771273 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40771291 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40771320 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 40771378 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40771397 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40771471 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40771482 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 40771519 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 40771561 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40771691 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 40771706 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40771763 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40771847 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40771899 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 40772108 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 40772213 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 40772239 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40772382 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40772509 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40772527 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40772646 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 40772680 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40772685 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 40772771 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40773058 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 40773121 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40773250 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40773386 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40773400 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 40773432 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40773474 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40773490 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40773495 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40773504 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40773511 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40773560 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40773715 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40773864 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40773926 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40773990 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 40774032 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40774047 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40774146 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 40774191 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40774527 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 40775047 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40775094 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 40775116 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 40775162 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40775176 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 40775188 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 40775497 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 40775534 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 40775636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40775701 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40775710 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40775776 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 40776532 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 40776538 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 40776710 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40776807 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 40776978 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 40776992 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 40776996 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40777231 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40777282 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40777424 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 40777547 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40777571 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40777762 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40777769 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40778001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40778296 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 40778345 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40778692 T G Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 40779066 T A N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 40779150 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 40779271 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 40779281 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 40779304 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 40779305 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 40779445 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40779547 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40779553 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40779663 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40779766 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40779790 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 40779860 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 40779893 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 40780042 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40780060 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 40780112 G T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 40780185 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 40780206 G C N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 40780417 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 40780596 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 40780639 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 40780676 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 40780686 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40780729 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40780885 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40780891 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 40780899 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40781111 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 40781138 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 40781153 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 40781268 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 40781290 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 40781309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40781352 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 40781372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40781665 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40781671 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40781837 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40782036 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40782263 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40782315 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40782555 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40782620 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40782857 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40782987 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40783087 G T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 40783124 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 40783490 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40783622 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 40783664 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 40783702 G T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 40784007 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 40784192 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40784359 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 40784411 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40784539 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40791698 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 40791929 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40791970 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40792111 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40792248 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40792273 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40792326 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40792438 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40792444 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40792490 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40792520 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40792536 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40792605 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40792665 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40792945 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40792948 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40792957 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40793109 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 40793201 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40793246 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40793300 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40793327 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40793329 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40793382 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40793460 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40793484 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 40793549 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 40793566 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 40793675 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 40793685 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 40793696 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40793705 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 40793773 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 40793838 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40793855 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40793864 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40793955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40794063 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40794163 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40794399 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 40794481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40794537 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40794670 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40795077 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40795155 T C N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 40795200 T A Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 40795412 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 40795474 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 40795564 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40795842 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40795855 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40795949 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40795950 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40795961 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40795970 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40796002 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40796111 C A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 40796115 G C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 40796376 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40796603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40796744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40796899 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40797038 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40797205 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 40797271 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40797345 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40797361 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40797434 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40797443 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40797567 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 40797622 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40797718 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40797744 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 40797894 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 40798055 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40798180 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40798259 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 40798282 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40798309 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 40798314 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 40798426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40798469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40798488 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 40798604 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 40798909 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40798973 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 40799019 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 40799061 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 40799142 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40799149 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40799164 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 40799194 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 40799220 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40799321 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 2 40799354 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40799479 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 40799693 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 40799956 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40800024 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40800082 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40800110 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40800254 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40800311 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40800317 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40800390 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40800571 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40800853 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40800883 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40800892 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40800897 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40800992 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40801663 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 40801782 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40801815 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40801851 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40801863 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 40801917 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40801987 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40801989 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40802104 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40802111 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40802131 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40802223 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40802348 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40802380 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40802385 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40802679 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 40802738 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40802755 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40802826 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40802893 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 40803070 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40803363 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 40803458 C A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 40803463 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 40803566 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 40803626 T G N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 40803876 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40803879 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40803936 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40803969 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 40804062 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40804259 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40804335 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40804460 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 40804549 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 40804678 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 40804790 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 40805124 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40805127 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40805237 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40805256 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40805283 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40805332 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40805367 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40805398 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40805739 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 40805765 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 40805766 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40805896 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40805897 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40805947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40805965 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40806033 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 40806071 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 40806112 G C N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 40806155 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 40806305 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 40806308 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 40806387 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 40806486 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40806498 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40806538 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40806581 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40806662 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40806671 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40806685 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40806747 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40806748 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40807094 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40807121 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40807205 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40807322 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40807323 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40807356 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40807367 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40807381 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40807400 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40807468 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40807541 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 40807580 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40807587 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 40807634 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40807637 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40807712 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 40807716 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 40807723 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 40807733 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40807748 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40807753 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40807772 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40807784 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40807794 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40807825 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 40807854 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40807925 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40807975 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 40808005 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40808015 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40808051 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 40808172 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40808173 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40808266 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40808310 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 40808323 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40808328 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 40808549 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40808586 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40808661 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40808683 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 40808700 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40808708 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40808727 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40808772 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40808845 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 40808866 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40808898 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40808957 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 40809092 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 40809202 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 40809308 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 40809353 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 40809401 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40809471 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40809509 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40809623 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40809642 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 40810009 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 40810993 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 40811009 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 40811213 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40811558 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40811765 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40811802 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40811833 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40811886 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40812153 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40812165 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40812503 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40813820 T G N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 40813851 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40813996 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40814042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40814167 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40814235 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40814305 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40814618 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40814689 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40814762 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40814834 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40814958 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40814985 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40814997 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40815013 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40815024 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40815072 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40815079 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 40815116 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40815468 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40815535 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40815640 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40815766 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 40815885 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40816003 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 2 40816013 G C N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 40816027 G T N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 40816031 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 40816169 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 40816203 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 40816289 G C N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 40816320 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 40816409 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 40816449 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 40816453 T G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 40816515 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 40816524 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 40816644 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 40816649 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 40816670 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 40816949 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 40816998 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 40817002 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 40817127 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 40817151 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 2 40817160 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 40817194 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 40817224 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 40817227 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 40817246 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 40817273 G T N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 40817326 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 40817380 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 40817661 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 40817697 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 2 40817743 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 40817839 C G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 40817881 G C N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 40817908 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 40818002 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 40818091 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40818129 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 40818184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40818190 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40818248 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40818273 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40818317 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40818338 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40818368 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40818481 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40818495 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40818554 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40818614 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40818787 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 40818802 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 40819032 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 40819064 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 40819174 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40819196 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40819278 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 40819285 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40819413 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40819466 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40819515 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40819589 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40819598 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40819715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40819788 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40819794 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40819890 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40820032 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40820091 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40820224 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40820244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40820625 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40820685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40820805 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40820860 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40820922 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40821213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40821244 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40821302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40821324 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40821545 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 40821647 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 40822036 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40822047 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40822144 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40822305 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40822339 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40822371 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40822463 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40822495 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40822544 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40822555 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 40822620 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40822635 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 40822771 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40822832 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 40822915 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 40823009 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40823119 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 40823222 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40823228 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40823305 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40823851 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40823872 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40824102 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40824362 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40824445 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 40824664 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40824801 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40824834 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 40824881 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40824995 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40825161 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 40825296 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40825518 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40825567 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40825594 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40825667 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40825675 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40825686 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40825722 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40825861 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40825926 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40825988 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40826004 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40826084 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40826144 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 40826287 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40826334 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40826393 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40826418 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40826538 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 40826601 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 40826671 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 40826677 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 40826744 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40826941 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40826974 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40827111 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40827249 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40827264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40827285 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40827331 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40827333 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 40827383 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40827485 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40827777 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 40827926 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 40828031 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40828275 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 40828401 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40828452 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40828479 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40828608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40828627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40828660 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40828830 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40828845 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40829137 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 40829214 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40829254 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40829295 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40829415 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40829718 G C N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 40830177 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40830263 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 40830491 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40830607 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40830657 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40830846 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40831266 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40831295 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40831322 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40831327 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40831349 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40831392 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40831504 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40831559 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40831717 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40831874 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40832022 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40832097 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40832098 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40832127 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40832203 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40832280 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40832335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40832449 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40832463 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40832769 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40832831 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40832922 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40833034 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40833093 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 40833115 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 40833219 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40833235 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40833273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40833286 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 40833336 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40833366 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40833373 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40833396 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40833399 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 40833429 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 40833479 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40833498 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40833625 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40833740 T C Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 40833884 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40833915 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40833921 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40834071 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40834195 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 40834198 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40834207 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 40834282 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 40834647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40834766 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40834985 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 40835658 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40836068 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 40836155 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 40836304 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40836325 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40836402 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40836446 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40836469 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40836480 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 40836532 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40836561 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40836641 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 40836697 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40836823 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 40836835 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 40836991 A T Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 40837305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40837839 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40838184 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40838257 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 40838274 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40838436 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40838646 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40838696 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 40838787 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 40839033 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 40839089 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 40839204 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 40839564 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40840531 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40840672 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40840846 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40840960 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 40841073 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40841211 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40841286 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40841374 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 40841420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40841458 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40841487 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 40841635 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 40842768 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40842799 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40842964 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 40843180 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40843192 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 40843201 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 40843286 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 2 40843339 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 40843365 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40843380 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40843464 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 40843480 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40843482 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40843498 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40843562 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40843819 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40843843 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 40843869 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40843906 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40843921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40843965 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40844021 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 40844122 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40844131 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40844149 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40844151 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40844199 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 40844253 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40844309 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40844440 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40844491 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40844524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40844629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40844657 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40844687 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 40844772 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40844784 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40844845 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40844852 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40844871 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 40845169 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 40845192 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40845304 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 40845415 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40845661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40845673 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40845733 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40845819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40845855 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40845878 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40846235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40846243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40846260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40846290 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40846323 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40846541 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 40846571 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 40846769 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40846971 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40846976 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40846989 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40847043 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40847105 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40847144 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 40847162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40847169 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40847198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40847205 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40847294 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40847381 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40847413 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40847528 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40847568 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40847569 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40847625 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40847633 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40848180 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40848448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40848645 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 40848648 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40848739 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40848781 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 40848809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40848899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40848918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40848974 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40849301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40849342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40849355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40849369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40849387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40849412 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40849517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40849553 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 40849594 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40849895 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40849947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40849977 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40850062 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40850070 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40850121 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40850127 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40850223 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40850346 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 40850413 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40850650 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40850847 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 40851367 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40851409 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40851527 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40851645 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40851660 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40851666 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40851680 A C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40851692 C G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40851719 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40851818 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40851867 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 40851868 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 40851938 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40851950 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 40851967 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40852211 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 40852351 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40852376 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40852478 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40852517 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40852577 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40852592 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40852612 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40852651 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40852708 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40852747 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40852769 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40852858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40852908 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40852925 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40852935 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40852946 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40852955 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40852969 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40852987 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40853055 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40853120 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 40853232 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40853241 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40853342 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 40854002 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 40854162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40854207 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 40854425 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40854667 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40854678 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40854764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40854983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40854999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40855154 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40855580 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 40855742 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 40855932 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40855953 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 40855985 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40855995 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40856110 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40856129 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40856337 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40856484 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40856573 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40856607 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40856668 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40856705 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40856747 C G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 40856809 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 40856827 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40856879 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40856906 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40856967 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40859350 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 40861832 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40861833 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40861849 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40861907 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 40862726 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 40862764 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 40862963 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 40863064 G A N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 40864694 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40864919 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40864944 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 40865989 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 40866628 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40868513 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40868620 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 40868762 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 40870370 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40871182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40871370 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 40871530 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40871652 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 40871974 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40872375 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 40872728 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 40872899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40873130 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 40873423 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 40873429 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 40873485 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40873651 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40873956 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40873969 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40874252 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40874839 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 40875029 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 40875218 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40875219 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40875379 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40875578 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40875636 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40875738 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40875813 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40875826 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40875876 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40875907 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40875908 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40876032 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40876228 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40876454 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 40876548 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40876642 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40876763 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 40876765 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40876900 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 40876983 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40877015 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40877171 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40877220 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 40877229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40877236 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40877243 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40877306 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40877318 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40877369 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40877398 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40877449 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40877619 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40877641 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 40877745 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 40877837 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 40877974 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40878022 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40878287 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40878299 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40878317 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40878360 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 40878491 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40878696 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40878768 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40878816 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40878881 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40878961 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40878997 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40879057 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 40879087 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 40879172 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 40879208 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 40879256 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 40879257 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40879277 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 40879280 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40879302 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 40879334 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 40879349 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 40879387 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40879490 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 40879519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40879532 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 40879564 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 40879617 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 40879713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40879729 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40879815 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40879838 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 40879839 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 40879863 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 40879878 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 40879933 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40880306 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40880334 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40880365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40880512 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40880544 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40880612 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40880670 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40880783 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40880815 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40880834 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40880844 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40880866 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40880963 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40881011 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40881192 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 40881254 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 40881367 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40881534 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40881627 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40881702 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40881711 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40881782 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40881853 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 40881913 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 40882175 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40882308 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40882675 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40882678 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40882802 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40883005 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40883061 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40883257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40883440 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40883472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40883533 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40883541 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40883695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40883749 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40883772 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40884031 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40884085 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40884087 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40884336 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40884347 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40884388 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40884403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40884424 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40884541 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40884573 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40884619 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40884624 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40884653 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40884701 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40885065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40885104 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40885111 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40885184 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40885189 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40885338 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40885417 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40885462 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40885597 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40885680 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40885745 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40885754 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40886093 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40886166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40886191 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40886234 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40886311 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 40886655 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40886668 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40886776 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40886820 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40887128 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40887237 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40887275 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40887321 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 40887375 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40887538 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 40887583 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40887727 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 40887729 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 40887802 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40887999 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 40888130 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 40888311 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 40888379 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 40888555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40888594 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40888636 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 40888661 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 40888689 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40888743 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 40888777 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 40888795 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 40889007 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40889021 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40889075 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 40889091 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40889125 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 40889154 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40889316 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 40889610 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 40889638 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 40889664 A T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 40889915 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 40890030 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 40890033 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40890058 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40890289 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40890315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40890466 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 40890476 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 40890499 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40890538 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40890586 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 40890742 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 40890843 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40890892 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40891544 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 40891690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40891725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40892017 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 40892161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40892274 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40892285 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40892309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40892326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40892334 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40892403 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40892414 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40892419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40892461 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 40892525 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40892567 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40892604 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 40892616 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40892619 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 40892741 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 40892847 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40892931 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40892947 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 40892991 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 40893015 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40893026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40893110 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40893146 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40893189 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40893223 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40893229 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40893291 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40893378 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40893484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40893525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40893543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40893679 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40893721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40893775 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40893810 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40893829 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40893849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40893880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40893893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40893915 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40894014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40894043 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40894128 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40894241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40894242 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40894320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40894350 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 40894355 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40894368 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40894375 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40894387 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40894400 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40894469 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40894514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40894590 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40894681 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40894787 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40894871 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40894875 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40894977 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 40895025 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40895032 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 40895036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40895101 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40895134 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40895160 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40895219 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40895249 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 40895260 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40895308 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 40895344 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40895351 A T Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 40895359 A G N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 40895479 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40895570 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 40895584 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 40895625 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40895722 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 40895723 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40895748 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 40895758 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 40895759 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 40895771 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 40895843 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 40895857 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 40895870 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 40895949 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 40895973 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40896172 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 40896201 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 40896263 C T Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 2 40896496 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40896601 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 40896692 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 40896809 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 40896872 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40896908 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40897007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40897114 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40897180 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40897259 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40897375 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40897613 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40897618 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 40897627 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 40897669 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40897718 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 40897728 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 40897825 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40897846 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 40897892 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40897920 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40897963 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40897971 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40897994 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 40897998 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 40898105 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40898106 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40898264 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40898308 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 40898402 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 40898414 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40898534 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40898584 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 40898586 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 40898664 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 40898673 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 40898787 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 40898848 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 40898869 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 40898893 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 40898921 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 40898980 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 40899019 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 40899168 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40899179 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40899366 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 40899369 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40899471 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40899568 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40899599 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40899734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40899879 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40899899 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40899911 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 40899984 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40900035 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 40900038 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40900071 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 40900152 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40900175 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40900193 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40900206 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40900215 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40900310 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40900368 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40900482 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40900551 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40900726 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40900738 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40900770 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40900834 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 40901053 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 40901085 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 40901244 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40901312 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40901555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40901604 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40901607 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40901688 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 40901841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40901877 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 40902306 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40902329 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 40902568 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 40902925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40903327 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40903426 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 40903439 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 40903450 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 40903460 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40904098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40904170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40905709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40905786 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 40907149 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 2 40908113 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40909023 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40909283 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40909543 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40909839 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 40909895 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 40910082 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 40910092 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 40910121 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 40910132 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 40910185 A G Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 2 40910189 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 2 40910197 G C N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 2 40910328 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 40910329 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 40910351 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 40910403 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40910753 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 40910895 G A Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 40911183 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 40911313 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 40911330 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 40911333 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 40911343 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 40911376 T G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 40911380 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 40911432 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 40911464 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 40911678 T A Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 40911699 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 40911783 A T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 40911814 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 40911905 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40911949 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 40912069 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 40912197 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40912228 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40912657 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 40912772 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40912901 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40912984 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40912997 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40913194 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40913209 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40913210 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40913333 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40913605 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 40913705 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40913717 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40913767 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40913802 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40913966 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40913997 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40914015 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40914167 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40914193 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40914208 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40914286 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40914296 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40914318 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40914387 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40914452 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 40914468 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40914591 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40914602 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40914668 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 40914730 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 40914785 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 40914800 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 40914812 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 40916287 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 40916296 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 40916298 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 40916313 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 40916438 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 40916639 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40916708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40916737 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 40916784 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 40916880 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 40916902 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40916916 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40916927 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40917210 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40917223 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40917296 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40917334 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40917337 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40917388 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40917559 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40917633 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 40917659 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 40917801 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 40917813 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 40917836 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40917934 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 40918059 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 40918122 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 40918154 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40918215 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 40918216 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 40918235 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40918264 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40918276 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40918424 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 40918438 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 40918515 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40918586 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 40918615 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40918719 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 40918851 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 40918868 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 40918895 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40919079 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 40919083 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 40925677 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40925684 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40925776 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40925805 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 40925863 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40925912 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40926013 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40926035 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 40926147 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40926208 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 40926231 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40926259 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40926286 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40926323 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40926373 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40926458 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 40926518 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40926552 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40926594 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40926664 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 40926709 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 40926717 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 40926726 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40926769 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40926794 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 40926916 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 40927254 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40927361 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 40927424 A C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 40927561 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40927593 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40927625 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 40927656 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40928050 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40928160 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40928237 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 40928239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40928249 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40928325 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 40928328 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 40928339 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 40928528 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40928616 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40928838 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40928862 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 40928917 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40929046 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 40929105 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 40929149 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 40929191 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 40929387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40929531 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 40929582 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40929599 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40929878 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 40930236 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40930283 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40930352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40930429 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40930430 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40930450 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40930495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40930533 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40930543 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40930569 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40930659 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40930682 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40930683 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40930758 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40930892 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40930904 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40931092 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 40931105 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 40931274 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40931431 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 40931437 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40931463 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40931468 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40931496 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40931632 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40931693 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40931696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40931711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40931796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40931827 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40931841 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40931845 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40931996 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40932002 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40932151 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40932176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40932188 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 40932200 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40932227 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 40932246 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40932255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40932258 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40932321 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40932374 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40932402 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40932409 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40932419 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40932422 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40932559 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40932619 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40932665 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40932759 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40932781 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40932807 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40932849 C G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 40932885 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40933039 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40933233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40933325 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 40933375 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40933385 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40933400 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40933444 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40933583 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40933697 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40933761 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40933767 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40933799 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 40933832 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40933846 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 40933852 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 40933919 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 40933928 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40933930 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40933984 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 40934108 T C Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 40934122 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40934167 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40934225 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 40934406 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 40934467 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40934545 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40934597 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40934676 T G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 40934677 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40934734 A C Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 40934775 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 40934899 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 40934990 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 40935064 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 40935146 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 40935205 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40935367 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40935385 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 40935390 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40935410 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 40935476 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40935530 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40935558 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40935594 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40935613 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40935660 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40935670 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40935719 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40935758 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40935777 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 40935899 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40935949 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40936088 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40936173 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40936555 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 40936598 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 40936683 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40937173 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 40937585 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40937668 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 40937689 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40937733 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40937791 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40937864 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40937936 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40937987 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40937993 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40938181 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40938248 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40938347 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40938356 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40938368 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40938382 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40938526 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40938640 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40938701 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40938791 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40938848 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40938900 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40938983 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40939055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40939151 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40939209 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40939281 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40939297 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40939305 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40939382 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40939576 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40939582 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40939656 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40939725 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40939853 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 40939985 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 40940139 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 40940194 T G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 40940266 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40940316 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40940352 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 40940394 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 40940429 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 40940472 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 40940495 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40940644 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 40940657 G C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 40941293 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 40941339 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 40941340 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 40941357 G T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 40941375 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40941633 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 40941657 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 40941752 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 40941793 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40941899 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40941935 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40941950 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40942007 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 40942091 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40942107 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40942191 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 40942243 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 40942258 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 40942376 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40942463 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 40942581 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40942654 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40942661 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40942677 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40942809 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40942916 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40943080 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40943127 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40943414 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40943499 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 40943606 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40943623 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 40943637 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40943690 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40943785 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40944148 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40944159 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40944548 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 40944571 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 40944603 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 40944641 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 40944708 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40944733 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40944808 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40944943 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40944961 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40945023 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40945095 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 40945163 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 40945292 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40945370 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40945375 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40945432 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40945513 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40945600 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40945686 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40945716 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40945778 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 40945829 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40945971 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40946020 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40946055 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40946056 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40946075 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40946218 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40946241 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40946373 A T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40946411 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40946440 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 40946471 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40946614 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40946665 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 40946679 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40946692 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40946857 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 40946887 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 40946897 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40946901 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 40946937 G A Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 40946945 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 40946983 T A N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 40947001 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 40947050 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 40947063 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 40947250 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 40947327 T C Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 40947360 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 40947443 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40947472 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40947511 G T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 40947643 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40947662 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 40947667 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40947887 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40947927 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 40947958 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 40948066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40948103 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40948134 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40948554 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40948564 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40948606 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40948629 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40948673 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40948683 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40948696 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 40948813 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40948910 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 40949051 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40949297 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40949371 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40949372 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 40949414 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40949444 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40950009 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40950279 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 40950284 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 40950316 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 40950403 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 40950545 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 40950584 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40950596 A G Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 40950653 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 40950937 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40950968 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40950985 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40951062 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40951156 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40951264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40951291 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40951366 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40951371 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40951818 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40951933 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40952067 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952069 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952123 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952184 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952236 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952257 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952260 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952355 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40952395 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952447 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952487 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952525 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952612 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40952697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40952703 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40952712 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 40952732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40952790 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40952803 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 40952805 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40952823 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40952872 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952888 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40952916 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952938 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40952961 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40953140 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40953152 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40953180 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40953187 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40953217 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40953240 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40953283 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40953387 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 40953484 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40953540 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40953554 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40953704 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40953813 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 40953864 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40953897 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40953943 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40953951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40953984 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 40953986 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40954027 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40954186 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40954215 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40954229 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40954236 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40954243 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40954296 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40954360 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40954397 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40954405 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40954443 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40954456 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40954484 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40955825 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 40956525 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40956935 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40957098 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40957105 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40957245 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40957683 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 40957894 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 40957951 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 40958176 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 40958292 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 40958387 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 40958613 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 40958644 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 40958755 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40958886 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40959606 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40959989 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40960156 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 40960278 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40960403 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40960478 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 40960512 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40960540 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40964205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40964368 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 40964383 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 40964431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40964543 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 40964670 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 40964729 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 40964790 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 40964850 A T Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 40965116 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 40965436 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 40965468 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 40965574 G T Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 40965577 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 40965980 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40966142 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40966563 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 40966730 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40967187 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40967316 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 40967439 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 40967453 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40967888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40967922 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40968414 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40968419 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 40968732 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40968747 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 40969101 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40969258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40969675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40969706 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40969995 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40970017 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40970137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40970603 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40970714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40971177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40971248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40971295 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40971333 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 40971354 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 40971371 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40971550 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40971551 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40971608 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 40971956 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40972054 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40972242 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40972244 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40972380 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40972518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40972725 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40972837 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 40972842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40972924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40973584 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 40973734 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 40973859 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 40973885 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40975125 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 40975181 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 40975246 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 40975295 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40975604 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40976098 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 40976283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40976292 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 40976324 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40976376 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40976399 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40976841 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40977425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40977656 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40977683 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40979573 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40979612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40979714 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40979874 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40980016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40980264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40980396 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40980404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40981758 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 40982094 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40982118 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 40982143 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 40982241 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 40982329 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 40982469 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 40982480 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 40982507 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40982569 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 40982673 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40982763 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40982790 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40982865 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40982893 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40982952 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 40983035 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 40983046 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40983240 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 40983357 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40983364 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 40983395 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40983589 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 40983624 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 40983886 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 40984030 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 40984064 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 40984069 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 40984109 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 40984170 C A Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 40984208 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 40984300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40984401 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40984529 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40984554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40984596 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 40984644 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 40984665 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40984670 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40984727 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 40984739 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40984804 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 40984807 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 40984921 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40984929 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 40984942 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 40985068 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 40985187 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 40985239 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 40985362 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 40985424 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 40987322 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40989534 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40989949 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 40990471 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 40990936 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 40990952 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 40991474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40991740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 40991770 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 40991774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40992004 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40992101 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 40992169 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40992816 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 40992824 T A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 40992956 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 40993007 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 40993033 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40993080 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 40993128 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 40993188 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 40993845 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 40993925 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 40993969 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40994157 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40994230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40994538 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 40994544 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 40994618 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 40994936 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40994953 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40994975 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40995044 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40995511 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 40995743 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 40995792 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 40995812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 40996020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 40996364 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 40997327 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40997635 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 40997790 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 40998696 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 40998780 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 40999134 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 40999139 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 40999180 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 40999371 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 40999719 A C N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 40999731 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 40999735 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 41000183 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41000715 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41000881 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41000911 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41000987 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41001065 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41001125 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41001560 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41002009 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 41002130 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41002152 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41002358 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41002492 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41002949 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41003105 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41004785 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41004861 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41004881 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 41004916 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41005244 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41005367 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41005515 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41005773 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41006129 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41006321 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41007031 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41007216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41007677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41007747 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41008061 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41008216 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41008594 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41008646 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41009198 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 41009445 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41009522 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41009628 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41009641 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41009662 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41009671 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41009739 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 41009742 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41009920 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41009991 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41010064 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 41010116 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41010936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41011029 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41011456 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41011671 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 41011972 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 41012194 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41012821 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41012869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41013036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41013926 A G N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 2 41014253 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41014268 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41014578 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41014900 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41015234 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41015479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41015520 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 41015533 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41015811 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41015969 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41016002 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41016111 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41016112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41016881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41017119 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 41017229 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 41017272 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41017761 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41017998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41018105 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41018467 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41019038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41019167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41019395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41020163 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41020298 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41020524 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41021780 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41021934 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 41022034 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 41022634 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 41022814 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41023824 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41024137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41027406 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 41027411 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41027486 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 41027516 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41027548 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 41027587 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 41027588 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 41027676 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 41027744 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 41027767 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 41028022 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 41028340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41028611 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 41028845 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 41028937 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 41028975 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41029018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41029118 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 41029122 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 41029174 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 41029188 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 41029316 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 41029330 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 41029340 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 41029379 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41029501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41029641 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 41029732 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 41029809 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 41029964 C T N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 41030283 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 41030339 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 41030414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41030418 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41030491 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41030546 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41030623 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41030630 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41030684 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41030703 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41030981 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41031035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41031036 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41031506 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 41031589 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 41031746 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41032008 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41032512 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41032521 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41032549 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41032582 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 41032713 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41032729 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41032752 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41033245 G T Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 41033525 G A Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 41033607 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 41033693 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41033927 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41033962 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 41034014 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 2 41034035 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 2 41034191 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41034214 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41034312 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 41034331 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41034375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41034556 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41034884 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41035084 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 41035364 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 41035519 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41035623 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41035677 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41035688 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 41035769 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41036251 A G Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 41036283 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 41036534 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 41036557 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41036804 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 41036898 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41037250 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 41037264 T C Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 41037269 A C Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 41037434 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 41037614 A T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 41037887 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 41037894 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 41038030 G T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 41038251 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41038287 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41038296 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41038346 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41038370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41038377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41038408 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 41038421 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 41038461 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 41038606 C A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 41038673 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 41038703 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 41038748 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41038792 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41038843 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41038864 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41038897 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 41038909 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 41038989 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41039052 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41039072 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 41039110 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 41039212 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 41039252 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 41039325 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 41039437 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 41039487 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 41039556 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 41039722 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 41039836 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41039844 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 41039912 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41039940 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41039955 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41039974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41040019 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41040086 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 41040187 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41040398 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 41040422 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 41040535 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 41040607 T G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 41040719 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41040768 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41040908 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 41041069 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41041188 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 41041451 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41041484 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 41041596 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41041636 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41041807 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41041809 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41041902 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41041916 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41041952 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41041970 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41042110 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 41042187 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 41042352 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 41042360 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 41042381 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 41042516 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 41042538 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 41042549 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 41042562 A C N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 41042567 C T Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 41042578 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 41042611 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 41042621 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 41042712 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41042757 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 41042758 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41042775 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 41042777 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41042890 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 41042980 C G Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 41043021 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 41043029 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 41043205 G A Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 41043239 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 41043292 G A Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 41043435 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41043522 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41043702 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41043750 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41043957 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41043974 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41044003 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41044127 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41044256 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 41044477 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41044545 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41044554 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41044663 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41044699 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41044701 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41044917 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41044924 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41045002 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41045119 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41045515 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41045775 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41045808 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41045890 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41045938 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41046000 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41046126 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41046159 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41046165 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41046210 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41046237 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41046505 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41046814 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41046888 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41047007 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41047009 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41047125 C A Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 41047161 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41047243 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 41047312 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41047317 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41047518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41047592 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41047684 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41047713 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41047774 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41047794 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41047818 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41047850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41047861 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 41047921 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41047931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41047969 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41048053 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41048082 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41048113 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41048160 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41048197 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41048276 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41048365 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41048366 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41048418 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41048425 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41048437 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 41048447 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41048464 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 41048490 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41048496 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41048528 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41048529 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41048645 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41048689 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41048804 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41048844 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41048845 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 41048950 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41048959 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41049006 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41049044 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41049220 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 41049295 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41049371 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 41049374 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 41049541 C T N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 41049611 C A Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 41049665 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 41049688 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 41049692 C A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 41049699 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 41049805 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41049819 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41049828 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41049880 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41050042 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41050117 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41050195 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41050210 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41050230 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41050258 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41050270 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41050328 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41050378 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41050397 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41050405 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41050459 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41050516 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41050543 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41050696 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 41050710 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41050758 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 41051036 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41051091 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41051114 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 41051162 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 41051168 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41051404 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41051621 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41051632 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41051641 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41051693 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41051783 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41051824 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 41051906 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41051936 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41051976 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41052103 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41052281 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41052339 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41052357 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41052369 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41052433 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41052918 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 41053079 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41053230 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41053681 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41053815 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41053974 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 41054084 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 41054160 C T Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 41054200 T A Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 41054748 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 2 41054765 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41054929 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 41055012 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 41055020 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 41055050 T C Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 41055073 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 2 41055109 A C Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 2 41055536 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 41055614 A G Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 41055837 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41055882 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41055928 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 41055990 T G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41055999 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 41056027 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 41056503 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41056508 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 41056529 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41056675 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41056843 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 41056878 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41057657 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41057948 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 41058198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41058386 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41058535 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41058604 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41058793 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41058830 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41058844 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41058865 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41059010 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41059331 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41059543 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41059793 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41060013 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41060059 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41060127 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41060436 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41060535 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 41060571 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41060576 C A Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 41060596 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41060733 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 41060747 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41060893 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41060931 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41061015 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41061063 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 41061084 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 41061109 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41061121 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41061180 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41061217 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41061228 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41061232 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41061259 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41061302 A T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41061435 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41061446 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41061547 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41061630 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41061780 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41061790 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41061806 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41061834 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41061891 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41061893 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 41061974 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41062081 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41062149 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41062285 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41062594 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 41062659 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41062766 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 41062806 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 41062871 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41063054 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41063173 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 41063204 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 41063325 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41063365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41063844 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41063943 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41064016 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41064099 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41064168 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41064209 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41064273 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41064338 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41064396 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41064397 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41064409 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41064410 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41064557 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41064624 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 41064626 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 41064648 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41064980 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 41065050 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 41065096 G T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 41065131 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 41065169 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41065211 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 41065321 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41065370 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41065381 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41065434 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41065558 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41065619 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41065622 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41065636 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41065645 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41065726 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41065813 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41065842 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41065903 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41065909 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41065927 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41066136 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 41066150 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 41066523 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41066537 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41067392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41067837 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41076877 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41076889 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41077023 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41077048 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41077513 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41077584 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 41077770 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41077801 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41078116 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 41078210 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 41078248 A T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 41078276 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 41078321 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 41078412 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 41078424 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 41078492 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 41078738 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41078749 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41078776 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 41078861 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 41079035 G A Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 41079077 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 41079097 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 41079112 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 41079648 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41079952 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41080043 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41080092 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 41080272 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 41080397 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41080482 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41080568 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41080751 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41080766 T A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 41080781 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41080819 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41080829 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41080866 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41080916 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 41080962 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 41080971 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 41081025 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41081034 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41081061 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41081076 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41081084 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 41081176 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41081209 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41081474 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41081476 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41081495 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41081532 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41081534 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41081626 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41081686 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41081705 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41081717 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41082056 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41082139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41082149 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 41082191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41082232 G C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41082275 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41082648 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 41082787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41082856 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41082871 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41083248 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41083461 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41083779 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41083867 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41083888 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41083933 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41083940 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41084003 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 41084258 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 41084269 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41084446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41084461 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 41084508 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41084574 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41084594 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41084605 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41084831 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41084842 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41084982 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41085060 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 41085069 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41085133 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41085145 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41085273 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41085421 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41085422 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41085459 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41085501 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41085548 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41085609 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41085621 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41085754 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 41085814 C T Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 41085845 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 41085988 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 41086530 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 41086580 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 41086728 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41087355 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41087519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41087608 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41087755 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41087990 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41088148 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41088394 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41088479 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 41088598 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41088813 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 41088925 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 41088950 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 41088990 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 41089066 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 41089200 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 41089266 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 41089322 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41089351 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 41089379 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 41089404 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 41089448 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41090049 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 41090673 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41090831 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41091169 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41091897 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 41092662 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41092747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41093258 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41093544 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41093724 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41093757 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41093909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41094274 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 41094315 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41094630 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41097176 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41100072 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 41100402 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 41106661 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41107178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41109601 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41109997 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41111070 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41112630 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41115831 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41117454 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41118502 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41119606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41123735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41124824 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41124910 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41125758 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41125772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41125780 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41125792 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41125890 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41125972 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41126124 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41126140 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41126143 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41126165 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41126358 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41126380 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 41126407 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41126595 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41126617 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 41126715 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41126832 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41126924 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41126933 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41126948 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41126949 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 41127022 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41127034 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41127158 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 41127168 G C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 41127169 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 41127269 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 41127277 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 41127495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41127530 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41127722 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41128546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41129123 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41129248 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41129485 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41131001 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41131042 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41131068 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41131554 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41131621 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41131692 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41132234 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 41132339 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41132407 T A Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 41132652 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 41133634 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41133849 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41134205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41134211 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41134313 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41134316 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41134410 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41134527 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 41134576 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41134665 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41134815 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41134821 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 41134836 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41135329 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 41135535 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 41135630 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41135634 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41135646 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41136019 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41136144 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41136210 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41136289 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41136296 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41136335 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41136423 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41136468 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41136550 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 41136574 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41136580 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 41136601 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 41136620 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 41136621 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 41136653 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41136734 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41136808 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 41136962 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41137237 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41137251 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41137322 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41137516 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41137541 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41137582 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41137627 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41137648 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41137720 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41137795 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41137809 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41138087 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41138090 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41138179 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41138211 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 41138292 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41138516 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 41138568 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41138586 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41138616 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41138849 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41138894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41138924 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 41138940 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 41138952 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 41139056 A C N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 41139089 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 41139330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41139501 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41139542 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41139673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41139827 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41139966 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41140145 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41140146 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41140174 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41140194 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 41140216 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41140230 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41140239 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41140580 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41140672 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 41140744 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41140746 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41140814 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41140857 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41141049 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41141397 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41141627 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41141649 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 41141954 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41142059 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 41142574 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41142957 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41143068 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41143091 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41143337 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41143482 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41143516 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41143722 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 41143787 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41143890 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41143946 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41143951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41144250 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 41144335 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 41144437 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41144902 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41145037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41145178 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41145380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41145786 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41146038 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41146079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41146224 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 41146414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41147260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41147706 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41148355 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41148413 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 41149138 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41149213 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41150085 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 41150218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41150703 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41150710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41152035 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41152489 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41152904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41153354 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41154375 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41154463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41154589 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41155705 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41155909 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41156405 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41156426 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41157337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41157811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41157898 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41158162 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 41158214 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41158253 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 41158471 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41159197 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41159348 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41159508 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41160088 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41160372 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41160824 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41160997 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41161195 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41161901 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 41162267 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41162797 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41163317 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41163341 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41163752 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41166659 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41168657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41169094 A G N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 41169728 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 41170828 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41171779 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41173433 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41173888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41174267 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 41175997 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41176496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41176939 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41177098 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41177286 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41177829 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41177972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41178133 T A Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 41178456 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 41179234 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 41179283 G C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 41179538 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41179626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41179641 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41179730 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41179780 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41179854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41179913 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41180012 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 41180045 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 41180176 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 41180235 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 41180259 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41180266 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 41180303 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 41180396 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41180426 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41180466 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 41180753 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41181136 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41181298 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41181950 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41181987 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41185784 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41187114 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41189135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41190288 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41191008 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41191362 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41191802 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41195586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41195758 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41196641 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41197192 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41197344 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41197473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41197746 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 41198065 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41198552 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41199639 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41199640 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41200260 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41201071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41201285 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 41201324 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 41201388 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 41201668 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 41202507 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41204055 A C Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 41204292 G T N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 2 41204571 C A Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 41204592 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41205633 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41206180 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 41206561 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41206672 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41207203 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41208465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41209468 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41209493 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41210630 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41210669 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 41210838 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41210940 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 41211024 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 41212376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41212543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41215109 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41219065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41219151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41220742 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41221503 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41221513 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41221706 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41222272 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 41223070 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41223480 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41224799 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41228938 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 41229228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41229460 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 41229865 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41230117 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41231095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41231430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41231491 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 41232380 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41232394 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41232729 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 41232790 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41234080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41234125 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41234919 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 41235781 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 41237087 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41237315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41238043 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41238066 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 41238118 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41238187 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41238229 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41238266 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41238689 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41238825 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41239061 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41240075 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41240076 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41240600 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 41241070 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41241099 T G Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 41241297 G T Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 41241372 T A Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 2 41242697 T A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 41242715 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 41243720 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41244597 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41244664 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41244950 C A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 41245248 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 41245440 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41246141 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41246147 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41246699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41246959 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41247048 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41247080 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41247086 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41247318 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41247556 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 41247581 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41247816 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41247939 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41248017 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41248459 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41248881 A G Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 41249287 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41249308 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41249389 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41249428 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41249540 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41249592 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41249724 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41249734 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41249754 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41249802 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 41249889 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41249930 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41249989 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41250064 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41250091 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41250185 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41250267 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41250270 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41250281 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41250293 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41250303 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41250371 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41250376 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41250394 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41250493 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41250504 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41250514 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41250571 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41250605 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41250616 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41250710 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41250826 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41250928 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41250996 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 41250997 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41251083 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41251191 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41251295 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41251503 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41251509 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41251564 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41251708 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41251795 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41251829 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41251844 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41251980 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41252067 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41252084 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41252101 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41252105 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41252131 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 41252143 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41252158 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41252208 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41252217 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41252245 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41252291 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41252308 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41252356 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 41252372 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41252439 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41252462 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41252524 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41252553 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41252609 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41252628 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41252652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41252718 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41252746 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41252753 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41252769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41252793 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41252826 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41252842 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41252857 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 41252934 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 41252944 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 41253074 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41253090 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41253097 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41253142 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41253157 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41253312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41253380 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41253397 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41253423 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41253464 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41253476 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41253599 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41253692 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41253705 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41253733 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 41253734 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41253935 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41253966 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41254001 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41254050 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41254104 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41254136 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41254160 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41254180 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41254209 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41254223 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41254292 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41254293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41254362 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41254381 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41254414 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41254417 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41254499 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 41254557 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41254584 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41254784 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41254806 G T Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 41254868 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 41254924 A C Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 41254929 G T Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 41255039 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41255134 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41255175 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 41255200 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 41255301 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41255366 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41255395 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41255403 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41255428 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 41255434 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 41255491 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41255496 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41255519 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41255554 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41255631 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41255656 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41255739 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41255814 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41255829 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41255862 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 41256231 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 41256422 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41256783 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 41256901 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41258287 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41258409 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41258912 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41258921 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41258932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41258943 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41258998 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41259314 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41259498 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41259503 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41259798 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 41260337 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 41261349 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41261672 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 41261974 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41262315 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 41263401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41264201 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 41265834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41265987 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41266151 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 41266192 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 41266268 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41266669 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41266831 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41266907 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 41267096 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41267453 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41267691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41267804 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41270305 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41271574 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41272437 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 41272735 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41273627 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41273750 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41273867 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41273869 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 41274082 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41276555 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41278777 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41279034 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41279927 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 41280234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41280374 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41281717 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41281733 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41283280 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41283513 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41283554 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41283768 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41284470 T C Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 41285461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41285950 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 41286013 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41286211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41286245 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41286558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41289823 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41290223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41291597 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 41293525 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41294417 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41295326 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 41295574 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41296670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41297724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41298439 C G Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 41299634 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41299717 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41301686 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41301796 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41303141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41303443 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41304755 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 41304913 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41304933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41305057 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 41306020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41307036 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41307795 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41308214 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41308635 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 41308696 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41308947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41309077 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 41309144 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 41309425 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 41309466 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 41309559 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 41309583 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41309603 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 41309721 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41309767 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41309786 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 41309796 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 41309819 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 41309831 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 41309929 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41309950 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 41310032 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 41310153 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41310173 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41310255 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41310294 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41310352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41310585 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41310594 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41310656 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 41310684 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41310734 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41310789 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 41310950 A T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 41310965 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 41311071 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 41311077 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 41311328 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41311340 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41311482 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41311627 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 41311920 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41311984 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 41311991 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 41312004 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 41312016 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 41312252 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41312351 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 41312398 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 41312429 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 41312475 G C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 41312608 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 41312701 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 41312948 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41312978 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41312983 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 41313042 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41313210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41313235 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41313435 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41313670 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41313785 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 41313803 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 41313821 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 41314001 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41314002 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41314131 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 41314335 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41314549 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 41316984 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41317985 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41319628 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41322396 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41326841 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41327208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41327308 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41329442 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41330627 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41330820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41333094 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 41333170 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41333173 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 41333242 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 41333255 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 41333281 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41333323 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 41333380 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 41333405 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41333510 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41333511 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41333592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41333704 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41333887 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 2 41334062 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41334105 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41334131 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41334143 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41334303 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41334534 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41334586 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41334623 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41334796 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41334870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41334977 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 41335042 T G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 41335059 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 41335091 A T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 41335095 G A N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 41335111 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 41335184 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 41335210 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 41335765 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 41335841 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41335888 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 41336129 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 41336301 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41336427 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41336611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41336636 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41336666 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41336698 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41337042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41337163 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41338173 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41338209 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41338213 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 41338410 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41339632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41340395 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 41340456 G C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 41340557 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 41341779 C G Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 41341791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41341807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41342665 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 41342756 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 41343074 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41343267 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 41343535 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41343558 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 41343730 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41343862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41343950 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 41344148 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41345026 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41345033 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41345580 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41345626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41345944 T A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 41346234 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41346431 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41346460 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41346553 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 41346754 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41346985 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41347037 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41347478 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41347521 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41347678 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41347909 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41348059 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41348276 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 41348464 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41348563 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41348602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41348617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41348755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41348854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41348900 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41348901 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41348948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41349051 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41349070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41349202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41349245 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41349474 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 41349525 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41349668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41350051 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41350445 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41350460 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41350493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41350626 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41350776 T G Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 41351215 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41351310 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41351347 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41351628 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 41351632 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 41351835 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41351851 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41352098 C G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 41352308 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 41352354 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 41352471 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 41352568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41352601 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41352625 C A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 41352645 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 41352725 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41352826 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 41352845 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41352915 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41353001 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 41353070 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 41353071 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 41353109 T G Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 41353161 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 41353207 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41353210 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 41353271 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41353453 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 41353518 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 41353539 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 41353636 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41353824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41354304 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41354987 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41355197 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41355295 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41355464 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 41355624 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 41355662 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41355790 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 41355913 C G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 41355997 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41356142 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41356392 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41356451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41356598 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41356660 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 41356917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41357008 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41357334 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 41357342 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 41357385 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41357406 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 41357414 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 41357666 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 41357712 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41357747 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 41357852 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 41358066 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 41358142 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41358466 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 41358494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41358556 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41358563 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41358582 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41358990 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 41359265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41359308 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41359748 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 41359780 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41359800 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41359855 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41359881 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41359904 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41359991 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41360003 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 41360010 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 41360244 C A Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 41360272 A C N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 41360485 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 41360619 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41360659 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41360695 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41360696 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41360733 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41360795 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41360850 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41360854 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41360899 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41361001 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 41361035 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41361067 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 41361084 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 41361191 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 41361209 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 41361211 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41361245 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 41361305 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41361513 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 41361525 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 41361587 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41361598 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 41361720 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41361982 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41362039 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41362271 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41362340 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41362516 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41362852 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41362917 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41362977 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 41363032 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41363042 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41363051 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41363183 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41363285 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 41363745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41363857 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41363922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41364519 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41364542 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41364618 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41364750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41364770 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41365005 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 41365247 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41365262 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41365265 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41365288 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41365563 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 41365852 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41366075 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 41366234 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41366430 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 41366528 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 41366754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41366949 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41367087 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41367224 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 41368403 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41368553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41368664 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41368906 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41368907 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41369059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41369162 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 41369543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41370117 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 41370258 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 41370279 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41370464 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41370529 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41370610 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41370644 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41370668 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41370714 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41370862 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 41370998 A T Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 41371292 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 41371793 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 41371801 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41371811 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 41371973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41372129 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41372196 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41372243 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 41372257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41372447 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41372553 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 41372567 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 41372650 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 41372689 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41372811 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41372860 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 41372923 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 41372932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41373008 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 41373094 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 41373421 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41373529 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 41373882 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41373991 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41374107 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41374331 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41374564 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 41374786 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 41374802 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 41374806 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 41374977 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 41374992 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 41375025 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41375080 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 41375146 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41375154 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41375351 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 41375853 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41375931 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41376042 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41376236 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41376280 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 41376392 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 41376406 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 41376460 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41376513 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 41376556 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 41377462 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 41377524 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41377673 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41377776 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41377918 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41377989 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 41378038 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 41378133 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 41378438 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41379417 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41379713 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41379993 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41380229 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 41380703 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 41380785 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41380906 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41381322 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41381536 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41381638 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41382066 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41382257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41382325 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41382547 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41382855 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41383014 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41383102 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41383399 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 41384285 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 41384571 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 41384572 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 41385140 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41385548 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 41385746 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41385886 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41385966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41386272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41386675 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41386710 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41386969 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 41387039 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 41387424 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 41387633 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41388317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41388334 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41388411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41388776 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41388860 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 41388910 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41388947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41389031 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41389400 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41389507 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41389595 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41389805 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41390155 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41390405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41390409 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41390475 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41390505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41390541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41390554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41390657 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41390944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41391491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41391975 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 41393174 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41393203 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 41393921 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 41394189 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41394872 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41394944 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41395036 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41395168 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41395174 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41395480 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41395493 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41395523 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41395551 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41395677 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41395743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41395821 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41395902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41395915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41395961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41395975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41395979 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41396046 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41396049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41396070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41396113 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41397684 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41397790 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41397793 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41397945 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 41398073 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41398107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41398148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41398174 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41398287 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41398386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41398493 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41398496 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41398587 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41398603 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41398636 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41398641 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41398674 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41398789 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41398830 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41398868 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41398934 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 41398961 T C Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 41398973 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 41399166 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41399181 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 41399312 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41399666 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41399742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41399922 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41399923 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41400243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400261 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400430 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400603 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400674 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41400733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41400862 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41400958 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41401115 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 41401123 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 41401165 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41401588 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41401665 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41401879 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 41401994 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41402757 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41402784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41403100 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41403492 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41403596 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 41404293 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41404372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41404373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41404383 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41404501 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41404649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41405740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41406030 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 41406036 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 41406125 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 41406135 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 41406155 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 41406219 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 41406252 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41406405 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 41406446 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 41406469 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 41406736 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 41406784 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 41406891 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 41407111 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 41407156 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 41407412 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 41407413 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41407700 T C N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 41407845 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 41408110 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41408349 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 41410125 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41410165 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41410175 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41410221 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41410309 C G Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 41410451 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 41410464 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 41410890 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 41411071 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 41411567 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41411640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41411643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41411689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41411801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41411822 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41411843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41411922 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41411934 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41411948 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41412079 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 41412841 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 41412901 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41412943 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41412967 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41413023 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41413161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41413230 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41413319 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41413567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41414444 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41414692 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41415465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41415842 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41415938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41415948 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41416025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41416135 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41416595 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41417164 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41417180 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41417386 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41417466 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41417656 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41417709 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41417797 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41417850 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41418308 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41418516 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41419211 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41419686 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41420387 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41420808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41420844 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41421162 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41421315 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41421717 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41421735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41421898 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 41422368 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 41422554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41422931 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41423299 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 41423346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41424057 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41424106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41424273 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 41424289 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 41424318 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41424401 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 41424580 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 41424638 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 41424655 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 41424746 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41424874 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41424895 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 41425080 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41425474 A G Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 41425491 T C Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 41425605 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 41425724 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 41425777 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 41425864 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41427376 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 41427848 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 41428099 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 41428129 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 41428369 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41428684 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 41428842 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 41428909 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 41429039 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 41429115 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41429373 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 41429393 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41429448 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41429950 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 2 41429953 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 2 41430002 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 41430011 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 41430014 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 41430187 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41430414 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41430449 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 41430519 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41430633 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 41430718 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 41430879 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 41431722 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 41431744 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41431871 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41432059 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 41432073 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 41432193 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41432194 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41432284 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41432341 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41432418 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 41432535 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41432716 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41432885 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41432985 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 41433973 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41434006 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41434021 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 41434111 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 41434161 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41434286 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 41434336 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 41434337 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 41434364 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 41434602 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41434612 C G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 41434644 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 41434758 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 41434769 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41434799 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 41434849 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 41434947 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 41434965 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 41435024 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41435442 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 41436187 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41436190 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41436270 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 41436360 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 41436400 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 41437028 T A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 41437132 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 41437158 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41437183 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 41437212 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41437254 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41437288 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 41437289 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 41437454 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 41437494 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 41437630 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41437661 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41437678 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 41437719 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41437828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41438152 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41438185 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41438299 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41438411 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41438430 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 41438432 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41438526 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 41438609 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41438712 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 41438995 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41439159 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41439193 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41440201 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41440389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41440678 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41440717 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41441291 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41441311 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 41441329 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41441462 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41441578 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41441627 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41441675 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 41441754 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41441908 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41441923 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41441952 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41442032 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 41442072 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 41442157 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 41442245 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41442280 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41442331 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41442412 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41442428 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41442642 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41442760 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41442880 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41443199 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41443282 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41443402 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41443458 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 41443572 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41443727 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41443791 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 41443820 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41443822 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 41443932 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 41443972 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41444078 G C N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 41444411 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41444496 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41444512 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41444546 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41444603 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41444746 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41444762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41444840 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41444882 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41445045 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41445184 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41445338 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 41445458 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41445484 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41445610 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41445625 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41445875 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41446018 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41446234 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41446439 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41446784 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41446810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41446812 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41446845 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41446872 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41446930 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41446971 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41446990 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41446994 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41447017 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41447021 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41447028 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41447267 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 41447286 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 41447288 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 41447328 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 41447722 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 41447826 G T N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 41447868 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 41447918 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 41447951 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 41447981 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 41448051 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41448058 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 41448150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41448235 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41448251 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41449130 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41449145 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41449238 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41449265 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41449397 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41449408 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 41449509 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41449542 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41449732 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41450023 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41450287 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41450408 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41450453 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41450620 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41451383 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 41451749 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 41451778 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41451898 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 41451963 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 41451990 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41452118 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41452204 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41452245 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41452639 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 41452647 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 41452653 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41452665 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 41452668 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41452698 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 41452713 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41452911 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41452914 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 41452924 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 41453315 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 2 41454114 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 41454170 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 41454386 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 41454931 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 2 41455268 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 41455334 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 41455449 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 41455629 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 41456177 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 41456289 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 41456461 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 41456678 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 41456952 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41456963 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 41457274 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41457332 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 41457394 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41457483 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 41457610 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 41457718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41457849 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 41458272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41458316 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41459633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41460148 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41460393 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 41460614 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 41460994 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 41461713 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41461751 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41461776 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41461790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41462216 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41462228 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41462635 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41462881 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41463224 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41463437 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41465166 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41465957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41466110 T C Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 41466112 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41466321 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41466382 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41466665 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41466741 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41467069 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 41467158 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 41467205 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41468060 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41468290 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 41468302 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 41468330 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41468485 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41468639 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41469071 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41469121 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41469446 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41469451 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41469826 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 41469996 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 41470008 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 41470179 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 41470805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41470824 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41470921 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41471029 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41471039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41471065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41471164 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41471289 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41471450 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41471646 T A Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41471667 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41471728 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41471763 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41471966 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 2 41471967 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 2 41472102 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41472125 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41472126 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41472157 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41472476 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41472550 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41472579 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41472896 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 41472921 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41472964 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41473015 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41473026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41473034 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41473045 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41473170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41473228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41473314 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 41473351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41473403 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41473435 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41473535 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 41473539 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 41473998 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41474041 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 41474048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41474091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41474147 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41474218 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41474342 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41474494 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41474604 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41474630 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41474923 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 41474951 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 41474966 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 41474983 G T Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 41475193 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41475405 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 41475451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41475602 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41475780 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41475822 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 41475880 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 41475926 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41475975 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41475997 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 41476067 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 41476081 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41476101 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41476205 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 41476402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41476457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41476517 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41476587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41476721 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41476750 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 41476815 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41477125 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41477227 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41477584 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41477741 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41478106 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41478151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41478241 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41478271 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41478283 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 41478943 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 41479000 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41479040 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 41479055 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41479146 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41479195 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 41479241 C G N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 41479481 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 41479525 G A Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 41479843 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41480051 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41480243 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41480498 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 41481475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41481479 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41481624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41481776 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41481899 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41482041 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41482053 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41482084 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41482237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41482353 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41482640 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41482843 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41482868 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41483053 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41483151 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41483222 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41483332 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41483410 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41483640 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41483687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41483745 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41484000 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 41487104 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 41487258 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41487615 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 41487755 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41488780 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 41488924 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41489304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41489424 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 41489435 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41490013 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 41490210 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41490530 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 41490696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41490880 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 41491198 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 41491596 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41491710 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41491743 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41491786 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 41492030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41492044 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 41492341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41492861 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41493014 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41493245 A G Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 41493281 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 41493462 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 41493938 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 41494332 T C Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 41494347 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 41494570 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 41494852 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 41495063 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41495204 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 41495314 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 41495352 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 41495414 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 41495559 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 41495604 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 41495609 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 41495623 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 41495658 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41495740 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 41495816 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 41495847 C A N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 41495969 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41496030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41496035 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 41496149 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 41496289 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41496319 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41496339 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 41496368 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 41496371 A C Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 41496387 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41496420 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41496526 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 41496559 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41496816 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41496882 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41496906 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41496999 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41497004 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 41497067 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41497201 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41497237 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41497261 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41497319 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41497338 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41497339 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41497671 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41497890 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41498120 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 41498303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41498336 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41498400 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41498463 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41498581 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41498640 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41498652 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 41498705 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41498806 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41498823 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41498870 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41498923 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 41498939 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 41499026 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41499085 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 41499118 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 41499170 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41499182 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41499208 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41499218 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 41499479 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 41499674 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 41500229 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 41500270 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 41500282 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41500312 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 41500361 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 41500386 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41500478 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41500520 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41500835 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41500911 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41501358 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41501439 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41501525 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41501558 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41501805 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41501927 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41502016 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41502052 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41502057 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41502064 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41502086 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41502096 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41502194 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41502211 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41502544 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41502665 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41502763 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41502778 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41502855 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 41502897 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41502950 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41503218 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 41503254 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41503338 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41503766 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41503807 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41503883 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41503895 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41504140 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 41504391 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41504578 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41504890 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41504893 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41505057 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41505146 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41505202 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41505424 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41505460 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41505471 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41505610 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41505631 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41505657 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 41505710 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41505732 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41505985 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41506309 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41506377 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41506529 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41506535 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41506702 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41506715 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41506738 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 41506903 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41506953 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41507025 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41507208 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41507449 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 41507510 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41507535 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41507594 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41507988 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41508015 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 41508058 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41508064 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41508100 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41508166 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41508349 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41508389 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41509286 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41509427 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41509455 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41509547 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41509650 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41509683 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41509703 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41509844 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 41509961 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41509985 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41510023 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41510175 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41510217 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41510279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41510323 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41510340 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41510473 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 41510486 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41510499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41510541 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41510570 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41510571 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41510585 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41510918 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41511043 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41511435 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 41511513 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 41511668 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41511745 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41511761 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41511989 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41512368 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 41512469 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 41512551 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41513171 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41513414 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 41514320 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41514349 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41514370 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41514383 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41514490 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41514601 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41514608 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 41514705 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41514774 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41514816 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41516275 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 41516652 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41517091 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41517180 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41517311 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41517385 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41517458 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41517531 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 41517568 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41517604 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41517796 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41517874 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41517970 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 41518348 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 41518371 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 41518405 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 41518677 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41518760 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41518766 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41518893 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41519045 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41519172 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41519276 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 41519281 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 41519461 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41519462 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41519479 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41519702 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41519764 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41519840 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41519849 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41519870 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41519877 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41519964 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41519967 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41520015 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41520058 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41520122 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41520651 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41520683 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41520685 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41520742 T A N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 41520808 G C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 41520837 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41520857 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 41520964 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41520965 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41521008 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41521070 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 41521081 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 41521109 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41521194 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41521251 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 41521271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41521273 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41521282 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41521300 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41521302 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41521511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41521522 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 41521621 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41521644 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 41521665 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 41521724 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41521839 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41521873 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41521890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41521900 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41521993 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41522330 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41522528 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41522534 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41522541 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41522547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41522554 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41522567 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 41522672 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41522735 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41522779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41523732 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 41523965 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41524124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41524451 C A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 41524543 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41524544 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 41524684 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41524856 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41524972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41525033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41525773 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41526000 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 41526354 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41526400 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41526566 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 41526613 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41526740 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 41526752 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 41526768 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 41526868 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41526903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41527008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41527257 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 41527266 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 41527360 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41528188 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 41528209 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41528218 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41528283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41528466 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41528524 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41528681 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41528698 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41528758 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41528776 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41528816 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41528880 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41528956 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41528968 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41529076 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41529213 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41529308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41529408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41529897 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41529930 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41529972 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41530212 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41531549 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41531593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41531738 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41531750 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41531786 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 41531873 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41532966 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 41533039 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 41533444 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41533579 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 41534087 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 41534209 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 41534845 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41535590 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41535619 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41535801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41536329 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 41537692 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41538710 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 41539728 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41539957 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41540531 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41540581 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41541759 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41542029 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 41542915 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41543048 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41543180 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41543192 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41543220 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 41543261 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41543938 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41544036 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41544062 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 41544087 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41544211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41544503 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41545850 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 41545925 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41546195 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41546288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41546580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41546843 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41550595 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41550985 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41553504 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41554917 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 41554954 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41555268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41556653 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 2 41557055 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41557300 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41558075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41558109 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41558284 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41558633 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41558784 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41559048 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 41559118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41559180 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41559426 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41559463 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41559605 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41559857 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41559938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41559969 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41559985 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 41560234 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41560354 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41560605 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41560820 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41561475 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41561782 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41561848 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 41561918 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 41562162 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41562346 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41562386 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41562427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41562471 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41562572 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41562648 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 41562655 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 41562732 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 41562921 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41562946 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41562951 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41562958 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41562998 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 41563117 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 41563178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41563279 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41563286 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41563309 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 41563334 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41563342 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41563472 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41563532 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 41563782 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41564010 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41564022 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41564033 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41564065 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 41564102 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 41564317 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41564368 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 41564436 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41564482 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41564520 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 41564586 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 41564591 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41564636 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 41564670 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41564676 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41564819 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41565248 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 41565568 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 41566778 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 41566782 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 41566835 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 41566862 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 41566907 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41567334 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41567649 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 41567767 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 41567863 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 41567884 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 41568091 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41568171 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41568227 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 41568456 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41568854 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 41569011 C G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 41570346 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41571590 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 41571640 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41572270 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41572947 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41573661 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41573760 A C N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 2 41575365 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 41575380 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41575523 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41575697 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41576117 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41576669 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41577697 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41577808 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41578407 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41579413 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41579826 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41580323 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41580893 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41581342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41581614 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41581618 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41582571 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41582741 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41583899 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 41584063 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41585038 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41585609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41585765 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 41586388 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41587448 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41587980 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 41588542 C G N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 41588709 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41588962 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41589234 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41589376 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41589719 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41589732 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41591209 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41591278 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41591710 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41592933 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41593059 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 41593250 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41595334 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41597390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41597768 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41598502 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41598637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41598645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41598844 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41599448 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41608749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41609167 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41609645 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41611053 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41611486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41611597 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41612792 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41616165 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41616441 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 41616994 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41617065 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41618374 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41619620 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 41619682 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41619730 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41620321 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 41620387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41620514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41620588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41620629 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 41620660 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41620900 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 41621060 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41621357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41622675 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41623218 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41623258 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41624020 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 41625172 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41627688 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 41628267 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 41628793 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 41628980 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 41629438 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41637404 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41637503 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41638906 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 41639618 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41640726 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41641031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41641140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41641554 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41641994 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41642813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41644036 A T Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 41644991 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41646288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41646489 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41646732 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41647624 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 41649011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41649042 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41649138 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 41649496 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41649696 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41649990 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41650242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41650389 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 41650415 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 41650706 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 41651053 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 41651733 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 41651992 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41652030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41652608 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 41653914 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41654721 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41656301 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41656438 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41658266 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 41659196 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41660287 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 41661117 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41661403 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41661537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41661592 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 41661640 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41661692 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41661716 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41661730 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41661736 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41661764 A T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 41661799 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 41661834 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41661836 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41661893 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41661958 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41662077 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 41662171 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 41662177 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41662390 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41662445 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41662473 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41662493 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41662571 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 41662778 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41662819 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41662820 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41662935 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41662985 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41663077 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41663181 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41663203 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41663300 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41663327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41663355 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41663395 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41663496 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 41663583 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41663633 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 41663649 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 41663660 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 41663678 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 41663704 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 41663727 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 41663772 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 41663801 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 41664380 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41664452 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41664551 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41664601 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 41664712 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41664759 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41664786 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41664803 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 41664806 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41664940 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 41665048 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 41665147 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 41665209 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41665220 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41665351 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41665357 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41665377 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 41665425 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41665453 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 41665464 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41665504 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41665548 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41665710 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41665895 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41665925 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 41665960 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41666012 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 41666069 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 41666302 A T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 2 41666464 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 41666505 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41666653 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 41666743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41666762 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 41666837 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 41666850 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 41666863 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 41667154 G T N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 41667229 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 41667266 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 41667276 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 41667310 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 41667413 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 41667434 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 41667456 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 41667468 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 41667527 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41667546 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41667610 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41667758 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 41667769 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41667788 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 41667872 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41667889 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 41667967 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 41668050 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41668072 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41668186 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41668368 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41668399 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41668424 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41668486 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41668511 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41668582 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41668698 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 41668725 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41668753 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 41668872 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 41669031 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 41669154 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 2 41669183 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41669184 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41669259 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41669279 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 41669381 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41669682 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 41669732 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 41670039 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 41670093 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 41670113 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 41670200 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 41670262 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41670413 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 41670487 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41670556 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 41670566 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41670598 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41670869 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 41671147 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41671205 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41671209 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 41671280 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41671284 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41671420 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 41671565 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41671658 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41671667 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 41672060 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41672114 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 41672287 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 41672389 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 41672441 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 41672672 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 41672695 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 41672696 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 41672724 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 41673005 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 41673040 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41673285 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41673286 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 41673385 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41673411 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41673700 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 41674415 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 41674721 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41675345 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41675435 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41675517 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41675518 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41675553 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41675569 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41675700 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41675778 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 41676056 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 41676145 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 41676282 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 41676398 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41676542 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41676558 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 41677023 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 41677154 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 41677260 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 41677264 T A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 41677661 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41678167 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41678496 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41679041 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41679184 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41679386 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41679735 C A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 41680286 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41681644 G T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 41682753 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41683229 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41683303 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 41683483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41684903 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41685014 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41685103 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41685749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41686439 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 41686541 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41686969 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 41687572 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41688057 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41688171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41688369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41688609 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 41688813 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41689177 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41689291 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41689417 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 41689711 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41689894 G C Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 41689991 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41690127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41690153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41690171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41690297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41690861 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41691467 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41691539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41691703 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41691986 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41692450 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41692498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41692780 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41693308 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41693969 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41694136 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41694937 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41695289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41695495 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41696127 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41696371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41696400 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41696419 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41696459 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41696605 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 41696651 G C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 41696923 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41697505 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41697626 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 41698137 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41698232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41698307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41698559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41699153 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 41700267 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41701273 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41702024 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 41702343 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41702352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41702962 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41702978 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 41703265 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41704661 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41704722 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41705618 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41705822 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 41706142 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 41706331 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 41706657 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41706694 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41706800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41706843 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41707050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41707103 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41707177 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41707435 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41707746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41707843 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41707896 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 41708417 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41708472 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41708566 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41708667 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41708734 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 41708753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41708777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41708936 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41708978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41709016 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41709048 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41709133 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41709221 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41709517 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 41709557 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 41709696 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 41709903 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41709979 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41710092 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 41710164 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41710185 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41710193 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41710298 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41710442 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41710452 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41710550 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41710650 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41710676 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 41710703 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41710811 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 41711230 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41711310 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41712921 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41714355 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41714491 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41714591 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41714711 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41714872 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 41714954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41714958 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41715088 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 41715325 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 41715345 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41715503 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 41715519 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41715663 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 41715968 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41716039 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 41716040 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 41716211 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 41716228 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 41716255 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41716280 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41716301 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41716340 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 41716558 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 41716643 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 41716646 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 41716665 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 41716683 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 41716767 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 41716775 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 41716933 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41717002 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 41717088 A T Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 41717124 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 41717149 T G Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 41717199 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 41717385 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 41717413 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 41717416 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 41717477 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 41717587 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 41717659 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 41717722 G T Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 41717885 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 41717943 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 41718039 G C Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 41718052 A C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 41718081 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 41718167 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 41718191 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 41718225 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41718231 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41718311 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41718745 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41718809 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 41718947 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41719344 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41719461 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 41719476 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 41719479 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 41719749 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 41719979 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 41720377 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 41720399 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 41720544 A G Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 41720590 A C Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 2 41720656 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 2 41720701 G C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 41720809 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41720923 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 2 41720990 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 41721008 A C Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 41721158 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 41721161 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41721184 G C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 41721425 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41721442 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 41721520 A C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 41721646 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 41721823 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 41722009 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 41722013 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 41722044 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 41722055 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41722072 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 2 41722083 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41722157 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 41722221 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 41722293 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 41722339 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 41722368 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 41722423 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 41722486 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 41722584 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41722651 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 41722691 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 41722709 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41722847 T A N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 41722909 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 41722929 G T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 41723121 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 41723224 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 41723249 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 41723278 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41723482 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41723896 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 41724033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41724285 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 41724557 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 41724588 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 41724702 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41724714 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 41724866 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41724885 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 41724898 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41724975 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 41725041 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 41725070 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 41725084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41725286 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41725300 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41725374 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 41725528 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41725548 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 41725747 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41725750 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 41726011 C A N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 41726069 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 41726220 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 41726221 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41726272 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41726764 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41726827 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41726989 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41727012 A C Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 41727194 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41727408 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41727578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41727622 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 41728134 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41728910 C A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 41728926 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 41729237 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41729771 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41729937 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 41729943 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41729964 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41730034 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 41730279 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 41730327 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 41730332 T A Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 2 41730599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41730650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41730871 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41731091 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 41731200 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 41731310 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41731766 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 41731773 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 41731970 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 41731980 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 41732028 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 41732152 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41732184 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 41732273 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 41732426 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41732921 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 41733237 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41733291 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41733404 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41733611 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 41733612 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41733693 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 41733775 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41733947 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41734047 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41734593 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41735293 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 41735521 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41735798 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41735955 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41737363 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41737380 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41737847 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 41737886 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 41737918 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 41738033 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 41738318 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41738381 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41739038 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41739219 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41739371 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 41739418 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41739503 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41739504 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41739575 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 41739597 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41739608 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41739648 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 41739748 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41739762 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41739834 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41739907 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 41739920 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 41740834 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41741022 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41741479 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41741488 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 41741729 A T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 2 41741739 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41741837 C G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 41741862 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 41742084 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 41742116 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41742172 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 41742401 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 41742446 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41742531 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41744347 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 41744365 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 41744428 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 41744467 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 41744479 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41744755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41744864 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41744872 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41744896 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41745002 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41745005 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41745200 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41745282 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41745336 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41745359 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41745360 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41745384 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41745385 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41745405 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41745500 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41745502 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41745576 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41745654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41745751 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 41746017 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41746662 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41746762 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41746811 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41746848 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41746867 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41746930 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41746961 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 41746978 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 41747143 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 41747436 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 41747570 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 41747586 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 41747634 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 41747763 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41747844 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 41747864 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41747969 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41747984 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 41748161 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 41748482 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41748486 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41748643 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41748733 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41748763 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 41748778 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 41749033 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41749130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41749154 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41749198 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41749306 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41749315 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41749366 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41749466 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41749528 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41749530 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41749570 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41749582 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41749595 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 41749708 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 41749875 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 41749878 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41750027 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 41750094 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 41750157 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 41750174 T A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 41750199 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 41750253 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 41750273 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 41750341 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41750600 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 41750640 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 41750766 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 2 41750873 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 41750988 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 41751131 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 41751142 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 41751151 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 41751156 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 41751265 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41751361 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 41751389 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41751553 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 41751604 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41751618 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41751876 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41752026 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 41752039 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 41752054 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 41752115 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41752124 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 41752180 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41752213 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 41752299 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 41752335 G C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 41752365 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41752383 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41752432 C A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 41752685 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41752731 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41752767 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 41752781 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 41752828 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 41752897 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41752995 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41752998 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41753097 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41753125 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 41753133 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41753152 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 41753225 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41753247 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41753308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41753375 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41753442 G C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41753582 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 41753638 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41753786 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41753795 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 41753832 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 41753852 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 41753963 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41754207 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 41754421 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 41754569 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 41754584 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41754610 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41754740 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41754832 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41755477 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41755529 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 41755660 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 41755728 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41755755 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41755815 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 41755833 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 41755878 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 41756019 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 41756065 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41756134 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 41756192 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 41756352 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 41756389 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 41756570 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 41756585 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 41756634 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 41756689 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 41756805 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41756832 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41756841 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 41756852 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 41757002 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 41757400 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 41757558 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 41757582 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 41757703 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 41757725 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 41758037 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 41758217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41758328 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41758444 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 41759756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41759908 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41760109 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 41761066 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41761074 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 41761900 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41762767 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41763415 T C Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 41763451 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41764097 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 41764270 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 41764583 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 41764584 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41764639 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41764833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41764844 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41765309 T G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 2 41765374 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 41765578 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 41765589 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 41765852 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 41765889 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 41765896 C G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 41766030 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 41766064 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 41766374 A C Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 41766487 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 41766552 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 41766950 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41767036 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41767100 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 41767195 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 41767275 T A Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 41767294 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 41767504 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 41767591 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 41767596 T A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 41768326 C A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 41768950 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 41768987 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41769134 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 41769196 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 41769237 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 41769244 A T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 41769363 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 41769386 G T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 2 41769416 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 41769427 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 41769430 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 41769462 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 41769485 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 41769539 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 41769594 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 41769723 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 41769736 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 41769803 C A Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 14 18 6 2 8 2 41769883 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 41769922 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41770045 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 41770058 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 41770099 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 41770124 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 41770245 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41770259 C G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 41770552 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 41770916 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 41770994 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 41771053 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 41771433 C T Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 41771708 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 41771850 A T Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 2 41771853 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 41772005 C A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 41772182 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 41772233 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 41772282 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 41772510 T G N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 41772720 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 41772739 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 41773074 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41773399 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 41773415 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41774058 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41774511 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41774512 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41774591 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 41775231 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41775412 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41775460 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41775496 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41775665 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41775750 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41775818 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41775829 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41775902 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41776014 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41776028 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41776064 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 41776216 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41776269 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41776347 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 41776417 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41776479 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41776615 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41776817 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41777340 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41777742 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 41777978 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41778084 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41778508 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 41778618 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41779319 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41779473 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41779938 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41780002 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41780230 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41780395 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41780523 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41780611 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 41781361 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41781487 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41781901 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41782355 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41782512 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41782516 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41782539 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41782591 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41782615 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41782683 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41782747 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41782763 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 41782784 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41782964 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41783089 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41783097 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41783121 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41783597 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41783606 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 41783645 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41783909 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41783961 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41784088 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41784218 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 41784222 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 41784361 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 41784416 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 41784427 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 41784468 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41784524 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 41785324 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 41785781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41787038 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41787307 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 41788469 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41789145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41789390 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41789393 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 41789627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41789650 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41790176 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 41790300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41790373 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41790477 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41790554 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41791041 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 41791230 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41791270 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41791273 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41791314 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41791549 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41791630 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 41791667 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41791886 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 41792458 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 41792784 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41792907 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41793889 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41793907 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 41794151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41794219 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41794592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41794955 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41795284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41795897 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41796286 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41796525 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41796732 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41797296 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41797451 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41797517 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41798035 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41798736 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 41798806 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 41798914 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41799009 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 41799125 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 41799482 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 41799550 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 41799642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41799669 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41799773 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41799826 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41799832 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41799837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41800075 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41800333 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41800769 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41800832 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41801034 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41801230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41801613 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41801645 T G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41801875 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 41801900 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 41801915 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 41801957 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 41802370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41802595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41802878 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 41803188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41803828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41804619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41804967 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41804988 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 41805132 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 41805284 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41805505 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41805679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41805716 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41805876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41806189 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41806190 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41806638 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41806644 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41807269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41807429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41807439 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41807714 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41807793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41807830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41807840 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41808237 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41808332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41808795 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41809082 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41809287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41809560 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41810159 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41810654 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41810869 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 41810919 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41811005 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41811026 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41811049 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41811051 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 41811101 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41811159 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41811219 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 41811269 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41811401 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41811463 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 41811544 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41811583 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41811652 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 41811855 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41812127 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 41812382 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41812384 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41812580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41812919 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 41813023 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41813557 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41814372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41815220 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41816436 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41816440 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41816704 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41816954 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 41817119 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41817297 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41817332 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41817682 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41817895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41818208 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41818373 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41819783 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41819818 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41819827 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41820065 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41821357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41821551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41821618 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41824311 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41824535 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41825081 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41826067 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 41826302 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41826304 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41828046 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 41828803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41828899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41829561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41829614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41829793 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41830075 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 41830105 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41830259 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41830357 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41830578 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 41830600 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41830895 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41831007 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41831027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41831067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41831144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41831180 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41831225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41831245 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 41831298 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41831471 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 41831515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41831541 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 41831959 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 41832004 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 41832027 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 41832087 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41832141 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 41832209 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41832212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41832346 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 41832369 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41832438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41835345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41835557 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41836238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41836273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41836390 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41836392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41836464 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 41836572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41836733 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 41836773 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41836808 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41836812 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41837011 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41837037 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41837124 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41837140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41837167 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41837183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41837450 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41837576 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41837656 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41837670 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41837710 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41837738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41837757 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41837763 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41837962 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 41838233 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41838402 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 41838490 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41838598 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 41838617 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 41838624 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 41838671 G C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 41838776 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 41838779 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 41838922 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 41838947 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 41838955 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 41838959 C T Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 41839071 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 41839101 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 41839110 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 41839224 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 41839274 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 41839372 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 41839398 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 41839400 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 41839480 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 41839485 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 41839491 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 41839530 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 41839570 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 41839572 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 41839592 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 41839729 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 41839905 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 41839908 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 41839963 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41840142 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 41840173 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 41840187 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41840202 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 41840212 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 41840247 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41840296 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 41840299 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 41840384 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 41840416 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 41840491 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 41840538 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 41840592 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 41840630 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 41840734 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 41840743 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 41840805 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41840823 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 41840846 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41840905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41840941 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 41841118 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 41841471 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 41844264 C T N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 2 41844336 C T Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 2 41844482 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41844516 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 41844520 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 41844540 C G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 41844571 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 41844611 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 41844805 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 41844814 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 41844841 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41844851 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41844863 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41844928 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 41844982 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 41845066 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 41845090 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 41845098 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 41845111 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 41845200 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41845229 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 41845321 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41845380 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41845395 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41845405 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41845440 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 41845474 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41845509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41845658 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 41845676 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 41845728 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 41845758 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 41845766 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 41845965 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 41846007 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41846098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41846164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41846317 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 41846379 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41846453 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41846542 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 41846582 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41846688 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 41846812 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41846921 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41847003 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 41847258 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41847328 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41847350 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41847472 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 41847573 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 41847642 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 41847775 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 41847926 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 41848248 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41848309 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41848320 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 41848322 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 41848367 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41848429 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 41848479 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 41848589 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 41848663 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 41848693 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 41848703 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 41848829 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 41848889 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 41848899 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 41849150 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 41849204 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41849269 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 41849444 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 41849537 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 41849564 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 41849640 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 41849657 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 41849662 A T Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 41850247 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 41850294 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 41850361 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41851150 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 41851209 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41851210 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 41851228 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 41851329 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 41851352 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 41851385 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 41851405 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41851412 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 41851418 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 41851490 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41851684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41851697 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41851768 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41851816 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41851817 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41851861 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 41851989 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41852031 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 41852060 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41852105 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41852351 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41852553 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 41852581 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41852610 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 41852854 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 41853431 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41853780 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 41853825 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 41853898 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 41854050 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 41854118 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41854127 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41854162 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 41854259 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 41854282 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 41854444 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 41854484 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41854586 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41854604 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 41854625 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 41854746 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41854852 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41854948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41855022 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 41855029 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 41855157 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 41855297 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 41855552 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41855986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41856045 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 41856225 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41856256 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41856492 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41856615 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 41856662 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 41856700 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41856766 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41857063 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41857198 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41857330 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 41857578 G T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 41857807 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41857819 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41858056 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 41858316 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 41858602 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 41858639 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41858641 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 41858675 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41858700 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 41858722 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 41858733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41858865 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41858871 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 41858877 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 41858921 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41858935 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 41859057 C G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 41859069 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41859079 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 41859115 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41859117 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41859129 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 41859141 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 41859485 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41859529 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 41859548 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 41859665 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41859671 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 41859729 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 41859733 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41859756 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 41859938 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 41859983 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 41860069 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41860196 C G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 41860228 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 41860268 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41860287 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41860604 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41860885 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41861055 C G Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41861082 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 41861241 G A Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 2 41861405 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 41861428 C T Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 41861457 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 41861509 T G N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 41861606 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41861777 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41861783 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 41861868 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41861881 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41861891 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 41861991 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41862008 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 41862019 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 41862071 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 41862098 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41862101 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 41862214 T A Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 41862253 A G Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 2 41862264 G C N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 41862447 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 41862470 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 41862504 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 41862524 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 41862721 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41862938 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 41862996 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 41863001 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 41863155 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41863199 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41863449 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41863457 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41863543 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 41863547 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 41863584 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41863663 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 41863745 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41863751 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41863756 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41863837 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 41863859 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41863870 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 41863873 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 41864171 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41864209 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41864294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41864362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41864674 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41864719 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41864761 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41865194 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41865352 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 41865558 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41865632 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41865664 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41865725 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 41865753 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41865825 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41865863 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 41866028 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 41866047 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 41866065 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41866105 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41866455 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 41866512 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41866585 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 41866632 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 41866658 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 41866804 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 41866934 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 41867179 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 41867180 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 41867206 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 41867337 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41867376 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41867695 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41867696 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 41867927 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41868142 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 41868293 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41868561 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41868656 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 41868676 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41869273 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41869390 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41869556 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 41869729 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 41869806 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 41870026 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41870085 A T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 41870231 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 41871250 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 41871367 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41871721 G C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 41871748 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41871797 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 41871963 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 41872306 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 41873378 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 41873432 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 41874046 C A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 41874201 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 41874220 G T N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 41874255 A C N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 41874498 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 41874621 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41875312 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 41875465 G C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 41875556 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 41875722 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 41876539 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41876702 G T Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 41876703 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 41876803 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41877117 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41878551 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41879672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41879934 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41880281 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41880299 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41880410 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 41880583 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41881269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41881752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41883197 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41885260 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 41885455 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41885470 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41885490 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41885611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41885682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41885709 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41885831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41885996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41886097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41886286 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 41886378 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41886413 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 41886420 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41886519 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 41886645 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41886744 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41886827 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 41886933 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 41886975 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41887042 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 41887081 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 41887085 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41887131 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 41887241 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41887257 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41887348 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41887387 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41887411 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41887656 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41887790 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 41887822 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 41887833 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 41887867 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41887928 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 41887993 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41888055 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 41888076 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 41888184 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 41888275 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 41888277 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 41888341 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41888471 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 41888523 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 41888549 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 41888568 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 41888590 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 41888608 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 41888612 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 41888674 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41888742 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41888748 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41888889 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41888903 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41888913 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 41888922 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 41889425 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 41889429 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41890857 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41891265 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41891554 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41891675 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 41892685 C G Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 41894165 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 41895892 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41896410 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41896819 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41896830 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41897128 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41897137 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41897201 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41897514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41898446 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41899777 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41907425 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 41907963 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41908039 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 41910944 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41911502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41912207 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41912454 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41912821 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41913293 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 41913406 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 41913826 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 41914575 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41915123 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41916458 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41916586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41918576 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41919362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41919860 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 41919901 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41919932 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 41919954 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41920155 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 41920173 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 41920633 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 41920988 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 41921208 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 41921335 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41922301 C G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 41922887 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 41922954 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41923579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41923623 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41923903 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41924233 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 41924512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41924543 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41924696 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41924794 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41924850 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41925246 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41926612 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41926964 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 41927080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41927422 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41927538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41927724 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41927963 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41928087 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 41928114 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 41928249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41935344 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 41935466 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41935702 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41935781 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41936040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41936717 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41936792 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41937514 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41938556 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41938887 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41938932 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41946037 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41946523 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 41946823 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41946860 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41946873 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41947062 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41947929 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41948011 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41948073 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 41948114 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41948601 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41948603 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41948865 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41949005 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 41949108 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41949126 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 41949161 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41949186 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41949204 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41949515 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41949534 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 41949870 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41949953 A T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41950920 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41951129 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41951409 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 41951937 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 41952009 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41952186 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 41952234 T G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41952469 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41952819 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41952995 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41953090 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41953160 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 41953171 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41953176 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41953187 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41953229 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41953267 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41953482 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 41953500 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 41953570 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41953593 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41953608 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41953630 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41953718 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41953840 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41953848 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41953963 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41954035 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41954090 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 41954103 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41954112 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41954128 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41954153 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41954174 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41954246 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41954400 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 41954450 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 41954470 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 41954798 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41954881 C G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 41954896 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 41955010 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41955062 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 41955129 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41955329 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41955330 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41955348 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41955353 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41955401 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41955452 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41955691 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41955771 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 41955881 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41955895 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 41956265 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41956706 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41956764 G T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 41956766 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41956845 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 41956886 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41956933 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41956936 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41956977 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41956988 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 41957026 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41957128 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41957132 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41957180 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 41957203 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 41957228 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 41957256 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41957361 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41957452 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41957502 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 41957506 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 41957540 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41957541 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41957748 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41957761 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41957827 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41957913 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 41957944 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41957958 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41957967 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41958005 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41958037 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41958043 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41958052 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41958126 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41958142 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41958145 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41958158 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41958193 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41958247 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41958320 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41958321 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41958478 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 41958535 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 41958678 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41958816 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 41958852 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41958915 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 41958978 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41959064 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41959202 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41959373 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41959493 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 41959514 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41959595 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41959643 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41959708 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41959723 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41959953 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 41960041 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 41960049 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 41960122 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 41960152 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 41960308 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41960323 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41960372 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 41960596 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41960625 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41960770 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41960833 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41960874 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41960980 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41961009 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 41961053 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41961374 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41961533 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41961557 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41961578 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41961670 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41961931 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 41961937 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 41962080 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41962100 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 41962165 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41962169 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 41962257 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 41962416 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41962506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41962552 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 41962724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41962800 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 41962815 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41962828 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 41962841 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 41963102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 41963146 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 41963893 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 41964533 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 41964878 A T N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 41964940 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 41965253 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41965266 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41965531 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 41965550 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41965636 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 41967337 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 41967343 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 41967352 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 41967448 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41967467 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41968080 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41968145 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41968242 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41968435 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41968658 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 41968669 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 41968931 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41968943 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41968952 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41969068 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41969155 G C Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 41969641 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41969894 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41969982 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41970086 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 41970248 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41970300 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41970461 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41970532 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41970556 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41970767 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41970807 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41970816 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41971102 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 41971571 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41971579 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 41971693 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 41971946 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 41971966 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41971994 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41972038 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 41972390 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 41972423 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41972539 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41972638 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 41972732 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41972949 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41973132 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41973307 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41973384 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 41973645 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41973667 G T Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 41973907 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 41973940 A G Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 41973961 A G Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 41973977 A G Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 41974032 T A Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 41974078 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 2 41974095 G C Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 41974340 A G Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 41974455 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 41974461 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 41974496 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 41974597 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 41974677 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 41974756 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 41974805 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41974846 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 41975007 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41975066 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 41975208 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 41975222 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 41975359 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 41976033 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 41976095 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 41976117 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 41976178 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 41976446 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 41976452 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 41976542 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 41976625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41976644 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 41976712 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41976839 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41976884 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 41977009 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41977101 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 41977108 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 41977567 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 41978084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41978088 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 41978538 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 41980606 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41980783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41983469 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41984305 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 41984968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41985114 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41985383 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41985435 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41985481 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41985557 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41985638 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41985641 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41985758 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41985913 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41985935 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41985994 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41986243 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 41986255 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41986316 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41986391 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41986404 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41986451 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41986522 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41986627 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41986759 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41986813 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41986846 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 41986873 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41986919 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41987131 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41987185 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41987208 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41987348 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41987396 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41987462 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41987766 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41988232 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41988470 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 41988545 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 41988576 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 41989203 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 41989274 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41989344 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 41989386 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41989467 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 41989528 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 41989647 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 41989903 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41989931 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41990270 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 41990359 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41990474 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41990487 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41990534 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41990767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41990894 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 41990923 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41990949 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41991316 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41991318 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41991360 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41991378 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41991423 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41991787 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41991898 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41991960 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41991978 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 41991987 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41992122 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 41992164 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 41992180 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 41992228 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41992241 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 41992383 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 41992443 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41992551 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 41992631 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41992751 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 41992871 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 41992967 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 41992974 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41993004 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 41993096 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 41993250 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41993330 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 41993385 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 41993952 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 41994566 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 41994713 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 41995199 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 41995232 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 41995796 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 41995877 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 41995959 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 41996155 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 41997169 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 41997585 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41998049 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 41998723 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 41998818 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 41999082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 41999140 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 42000153 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 42000780 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 42001020 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 42001214 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42001215 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42001317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42001808 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42001819 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42001925 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 42002101 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42002138 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42002142 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42002156 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42002206 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 42002302 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42002304 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42002326 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42002571 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42002714 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 42002779 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 42002843 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 42004652 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42005043 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42005115 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 42005396 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 42005429 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42005889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42006189 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42006552 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 42007573 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42007726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42008010 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42008846 A G Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 42010117 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42010397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42010428 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 42010741 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42011378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42011860 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 42011879 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42012481 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 42013423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42014470 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 42015551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42015830 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42016003 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42016012 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42016027 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42016036 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42016042 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42016052 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42016104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42016109 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42016115 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42016188 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42016215 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42016329 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 42016334 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 42016387 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 42016660 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 42018140 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42018830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42018992 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 42019105 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42019199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42019806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42019839 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 42019923 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42020538 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 42020736 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42020897 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 42020907 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42021012 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42021040 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42021149 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 42021681 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42021707 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 42021967 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42021995 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42022053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42022170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42022199 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42022221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42022279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42022434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42022447 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 42022460 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42022461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42022585 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42022735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42022827 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42023318 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 42023361 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 42023511 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 42023622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42023647 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42023708 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 42023724 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 42023753 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 42023757 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 42023766 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 42023801 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 42023847 C A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 42023896 T G N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 42024081 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 42024110 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 42024270 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 42024311 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42024325 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 42024417 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42024537 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 42024571 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42024572 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42024712 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42024730 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42024828 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 42024924 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42024941 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42025048 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 42025075 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42025085 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 42025147 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 42025539 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42025734 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42025739 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 42025795 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 42025909 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42025989 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42026010 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 42026183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42026682 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 42026685 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42026785 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 42026857 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 42026950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42027019 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42027179 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 42027184 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 42027217 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 42027351 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 42027536 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42027603 T A N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 42027621 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 42027642 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42027689 C T N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 2 42027806 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42027824 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 42027845 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 42028018 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 42028176 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42028276 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42028304 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42028410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42028541 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 42028600 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42028637 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 42028724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42028755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42028818 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42028916 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42029246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42029250 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42029800 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42029806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42029824 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42030459 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42030460 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42030634 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42030676 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42030684 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 42030740 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 42030793 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42030827 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42030850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42030859 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42030884 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 42031253 G C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 42031256 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42031277 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 42031466 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 42031607 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 42031801 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42031810 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42031822 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42031871 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42031924 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 42032202 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 42032310 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 42032657 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42032938 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42033041 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42033500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42033584 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42033728 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42033757 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42033920 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 42033935 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 42034065 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42034140 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42034526 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42034616 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 42034820 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 42034875 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42035059 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42035206 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 42035365 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42035429 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42035897 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42035931 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42035933 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42035988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42036024 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42036312 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42036327 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42036351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42036506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42036629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42036802 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42036820 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42037031 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 42037150 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 42037814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42037910 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42039194 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42040086 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42040183 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42040184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42040980 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 42046581 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 42048894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42051044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42051504 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 42052048 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42052528 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 42052546 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 42053369 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 42053976 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42053997 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42055226 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42058974 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42059602 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42060529 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42060824 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42060970 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42061833 G A Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 42063667 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 42071053 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42071668 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 42071709 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 42071802 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42071970 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 42072043 G C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 42072123 A T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 42072540 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42072792 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 42073454 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 42073943 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42073997 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 42074072 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 42074544 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42074550 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 42074647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42075328 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 42075335 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42076172 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 42076262 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42076387 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 42076486 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 42076613 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 42076686 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 42076738 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42076755 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 42076774 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42076934 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42076950 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 42077362 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42077427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42077924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42078850 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42079410 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 42080770 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 42081212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42081340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42081521 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 42082074 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42082857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42082954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42083134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42083556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42084113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42084130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42084450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42088335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42090024 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42090384 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42090891 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42091290 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42091904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42092350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42092728 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 42092916 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 42093257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42093394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42093448 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 42093476 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42094626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42098025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42098516 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 42098517 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 42099354 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 42099483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42099957 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 42100237 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42100645 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42100656 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 42100757 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 42100873 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 42101105 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42101115 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42101117 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42101529 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42102876 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 42102882 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 42102947 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 42103305 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 42103359 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42103489 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42103751 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 42103775 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 42103838 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 42104147 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42104370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42105569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42105665 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42105679 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 42106301 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42106340 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 42106572 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 42106573 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 42107067 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42107183 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 42107333 G C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 42107533 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 42108106 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42108107 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42108402 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 42108498 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42108521 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42108542 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42108705 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 42109361 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42109677 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 42110011 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 42111037 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42111129 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 42111620 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42111918 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 42111927 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 42112541 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 42113643 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 42114398 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 42114410 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 42114648 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 42114689 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 42114707 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 42114790 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 42114819 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 42114942 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 42115028 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42115081 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 42115190 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42115240 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42115247 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42115301 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42115303 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42115314 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42115316 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42115491 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42115620 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42115656 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42115664 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 42115850 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42115911 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 42116164 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 42116262 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 42116277 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 42116290 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 42116295 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 42116392 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 42116541 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 42116615 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 42116617 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 42116682 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42116884 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 42117003 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 42117004 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 42117015 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 42117031 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 42117160 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 42117235 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 42117301 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 42117390 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 42117447 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42117726 C A N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 42118039 A T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 42118096 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 42118344 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 42118471 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42118484 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 42118498 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 42119251 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42119264 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 42119497 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42123770 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42123780 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 42124525 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42124994 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42125352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42125368 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42125635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42125720 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42126048 T A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 42126823 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42127039 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 42127484 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 42127492 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 42127582 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42127922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42127993 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 42128061 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 42128090 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42128178 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42128293 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 42128372 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42129153 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 42129276 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 42131559 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 42132005 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 42132149 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 42132648 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 42133308 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 42133640 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 42135011 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 42135039 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 42135143 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42137378 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42138379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42139216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42142529 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42144218 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 42144487 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 42145401 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 42146668 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42147854 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42149887 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 42152307 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42152580 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 42152606 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 42153140 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 42153749 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 42154279 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 42154372 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 42154462 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42154564 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42154644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42154790 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 42154824 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 42154868 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 42154912 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42154946 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 42155198 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42155295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42155314 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42155365 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42155496 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42155543 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42155573 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42155636 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 42155668 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42155785 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 42155831 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42155864 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42156029 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 42156078 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 42156121 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42156170 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42156726 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 42156957 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42157217 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 42157227 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 42157228 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 42157258 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 42157846 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42157856 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 42157872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42157941 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42158040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42158156 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 42158177 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42158237 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42158382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42158406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42158484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42158546 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42158550 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 42158565 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 42158600 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42158630 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42158727 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42158792 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 42158954 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42158993 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 42159065 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 42159141 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 42159172 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42159181 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 42159309 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42159490 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 42159533 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42159609 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 42159792 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 42159890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42159892 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 42159910 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42159921 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42160071 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 42160237 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42160728 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42160970 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42161091 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 42161144 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 42161231 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42161255 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 42161266 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 42161336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42161382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42161860 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42161861 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42161900 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 42161969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42162020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42162152 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42162184 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42162281 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42162288 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 42162320 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42162342 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42162343 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 42162417 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42162445 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42162466 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42162490 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 42162507 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42162605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42162612 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42162659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42162704 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42162709 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42162754 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42162816 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42162876 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42162877 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42162906 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42162926 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42163014 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 42163021 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42163289 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 42164332 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 42164515 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42164640 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42164711 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42164767 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42164795 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42164860 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 42164866 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42164872 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42164899 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 42164929 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42164976 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42165243 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 42165256 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42165619 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42165760 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 2 42165803 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 42165845 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 42165861 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 42165901 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42165977 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 42166085 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42166118 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42166314 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 42166434 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 42166472 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 42166624 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42167175 A C N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 42168114 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 42168115 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 42168152 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 42168181 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 42168215 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42168232 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42168241 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42168265 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 42168295 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42168375 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42168418 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42168520 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 42168531 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 42168669 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 42168706 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 42168989 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 42169067 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42169124 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 42169167 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42169278 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 42169381 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42169394 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42169410 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42169440 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 42169515 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 42169558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42169569 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 42169624 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42169704 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42169738 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 42169855 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 42170087 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42170115 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 42170174 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42170378 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42170605 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 42170638 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 42170651 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 42170665 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42170693 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 42170737 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42170743 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42170799 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42170835 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42171004 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42171040 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42171137 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42171159 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42171303 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42171462 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 42171567 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 42171661 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42171670 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42171803 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 42171866 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 42172033 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 42172096 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 42172138 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42172140 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42172304 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 42172468 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 42172513 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42172892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42172919 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 42172961 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42173048 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 42173180 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42173190 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 42173228 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 42173229 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 42173288 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 42173372 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 42173750 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 42173787 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 42173793 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 42174533 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 42174549 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42174836 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 42174877 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 42175011 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 42175068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42175173 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 42175243 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42175262 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 42175339 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 42175516 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 42175594 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 42175948 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42176105 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42176123 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42176135 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42176210 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 42176242 T A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 42176244 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 42176278 G C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 42176319 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42176333 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42176459 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42176467 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 42176495 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 42176504 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42176536 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42176538 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 42176624 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 42176635 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 42176726 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 42176889 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 42176915 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42176993 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42177176 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42177491 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42177570 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42177598 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42177649 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 42177685 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 42178002 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42178291 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42179351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42179540 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 42179559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42179630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42179680 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 42180030 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42180101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42180828 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42180843 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 42181034 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 42181398 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 42181528 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 42181588 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 42181609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42181758 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42181853 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42181904 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 42182067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42182597 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42182851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42183157 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42183996 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 42184825 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 42185027 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 42185052 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 42185089 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42185281 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42185497 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 42185553 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42185870 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 42186074 C A Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 42186435 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42186620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42186704 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42187046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42187368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42187385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42187638 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 42187669 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 42187787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42188239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42188325 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42188333 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42188360 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42188420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42188458 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42188587 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 42188608 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42188738 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 42188846 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42188889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42188909 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42189120 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42189314 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42189427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42189806 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42190174 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42190385 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42190444 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42190544 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42190551 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42190727 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42190810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42190905 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42191021 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42191097 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42191199 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42191228 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42191239 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42191337 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 42191354 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42191355 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42191419 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42191476 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 42191603 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42191620 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42191682 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42191735 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 42191999 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42192041 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42192098 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42192107 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42192132 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42192181 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42192397 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42192778 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 42192837 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42192858 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42192920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42193097 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42193122 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42193158 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42193166 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42193250 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42193261 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42193281 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42193304 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42193314 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42193381 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 42193643 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42194499 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42194571 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42194610 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42194957 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42195035 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42195645 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42195678 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42195687 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42195872 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 42195944 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42195948 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42196026 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42196445 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 42196498 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42196520 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42196524 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42196542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42196553 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42196626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42196659 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42196814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42196817 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42197001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42197123 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42197126 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42197134 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42197158 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42197169 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42197212 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 42197216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42197264 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42197326 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42197375 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42197465 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42197535 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42197694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42197735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42197811 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42197875 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42197948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42197983 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42197992 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42198000 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42198135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42198150 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42198157 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42198220 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42198335 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42198412 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 42198448 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42198456 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42198528 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42198545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42198546 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42198558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42198663 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42198676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42198896 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42198925 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42198957 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42198970 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42199110 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42199132 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42199302 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42199350 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199362 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42199366 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42199386 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199421 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42199424 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199438 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199443 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199455 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199531 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199542 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199561 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42199594 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42199670 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42199684 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42199735 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199766 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199778 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42199799 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199803 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42199911 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42199963 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42199995 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42199998 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42200033 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 42200150 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42200358 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42200386 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42200423 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42200430 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42200471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42200497 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42200522 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42200619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42200629 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42200639 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42200660 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42200798 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42200813 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 42200844 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42200849 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42200911 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 42200936 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 42201227 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 42201228 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 42201342 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42201401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42201468 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42201481 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42201661 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 42201866 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42201957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42202012 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42202016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42202032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42202117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42202202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42202265 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42202289 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42202371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42202487 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 42202699 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42202784 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42202909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42202915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42202927 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42202952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42202978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42202987 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 42202999 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 42203022 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42203042 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42203145 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42203170 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42203179 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42203207 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42203239 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42203276 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42203308 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42203404 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42203451 C A Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 42203457 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42203478 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42203492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42203532 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42203573 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42203696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42203831 T C Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 42203867 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42203929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42203935 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42203997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42204019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42204040 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42204041 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42204159 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42204160 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42204283 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42204394 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42204439 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 42204595 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42204678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42204727 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42204736 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42204786 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42204814 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42204865 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 42205322 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42205585 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42205721 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42205748 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42205761 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 42205769 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42205902 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42205924 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42205939 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42205980 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42206279 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42206342 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42206499 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 42207078 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42207334 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 42207387 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 42207455 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 42207516 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 42207554 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 42207619 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42207813 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 42207849 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42207965 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 42207993 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 42207998 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42208043 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 42208107 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42208113 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42208134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42208166 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 42208202 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42208234 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 42208262 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42208417 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42208478 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42208479 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42208674 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42208744 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42208816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42209021 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 42209022 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42209055 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42209123 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42209140 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42209145 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42209294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42209571 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42209637 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42209784 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42209832 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42209892 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42209969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42209970 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42210407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42210423 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42210610 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42210690 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42210854 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42210914 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42210940 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42210941 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42211025 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42211056 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42211166 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42211311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42211312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42211561 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 42212001 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 42212017 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42212073 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42212101 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42212112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42212143 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42212401 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42212482 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 42212594 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42212780 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42212847 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42213250 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42213323 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42213353 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42213749 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 42213879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42213989 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42214021 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42214109 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42214177 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42214278 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42214452 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42214562 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42214841 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42214943 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42214956 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 42214968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42215001 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42215030 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42215115 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42215204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42215409 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42215560 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42215578 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 42215591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42215665 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42216147 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 42216154 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42216255 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42216321 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 42216333 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 42216500 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 42216523 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42216588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42216603 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 42216698 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42216787 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 42216870 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 42216890 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42216915 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42216944 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42216946 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 42216958 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 42216992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42217035 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42217155 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42217337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42217494 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42217662 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42217673 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 42217720 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42217835 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42217853 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42217887 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42217952 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42218086 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42218107 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42218111 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42218184 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42218225 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42218255 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42218332 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42218362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42218466 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42218579 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42218604 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42218632 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42218645 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42218682 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42218728 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42218737 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42218751 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42218815 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42218871 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42218953 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42218969 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42219029 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42219285 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42219341 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42219431 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42219504 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42219667 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42219668 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42219775 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42219798 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42219833 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 42220033 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42220187 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42220415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42220466 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42220593 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 42220802 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42220858 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 42221004 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 42221017 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 42221131 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42221133 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42221210 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42221243 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42221332 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 42221534 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42221545 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42221570 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42221579 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42221780 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42221844 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42221950 T A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 42222002 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 42222238 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 42222440 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42223096 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42223176 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42223760 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42223882 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42223889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42223975 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 42224041 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 42224261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42224422 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42224564 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 42224805 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42224974 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42225086 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42225379 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42226560 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42226591 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42226623 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42226648 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42226682 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42226718 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42226830 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 42226964 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42227019 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42227971 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 42227979 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42228156 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42228245 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42228333 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42228350 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42229276 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42229804 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42229880 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42230331 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 42230659 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 42230714 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42230789 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42230932 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 42231340 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 42231354 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 42231371 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 42231461 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42231572 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42232213 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42232260 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42232355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42232404 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42232553 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42232737 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42233238 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42233265 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42233292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42233697 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42233703 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42233731 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42233978 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42234170 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42234375 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42234459 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42234502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42234532 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42234544 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42234608 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42234674 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 42234757 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 42234763 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 42234841 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42234875 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42234912 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42234924 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 42234946 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42234971 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42234988 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42235008 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42235012 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42235047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42235251 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42235294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42235335 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42235432 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 42235555 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 42235588 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42235696 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 42235742 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 42235828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42235863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42235878 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42236013 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 42236099 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42236123 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 42236128 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42236467 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42236772 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42237645 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42238834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42238968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42239157 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42240333 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42240609 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 42240643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42240815 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 42240818 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 42240939 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 42241031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42241237 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42241646 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 42241714 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 42241858 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 42242121 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 42242394 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42242501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42242793 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42243291 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42243314 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 42243375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42243623 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42243625 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42243853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42243881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42243937 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42244042 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42244600 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42244704 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42245505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42245619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42245796 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 42245840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42245969 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42246082 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 42246340 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42246756 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42246923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42246973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42246974 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42247454 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42247465 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42247644 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42247788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42248308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42248558 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42249133 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42249143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42249419 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42249420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42249466 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 42249474 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42249587 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 42249673 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 42249691 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 42249780 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 42249782 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 42249844 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42249867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42249877 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42249883 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42249894 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 42249923 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42249974 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 42249984 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 42250034 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42250105 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42250124 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 42250136 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 42250140 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 42250278 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 42250311 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 42250359 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 42250462 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42250497 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42250663 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 42250755 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 42250802 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 42250916 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 42250922 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 42250965 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 42250988 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 42251141 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 42251250 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42251299 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42251359 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 42251368 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 42251475 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42251925 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42252370 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 42252541 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42252624 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 42252692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42252954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42252990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42253162 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42253211 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42253258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42253705 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 42253928 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 42254807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42254877 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42255043 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 42255056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42255113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42255211 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 42255763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42256632 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42257170 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42257735 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42258338 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42258751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42258978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42259491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42259648 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42260555 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 42261050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42261719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42261926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42262800 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42262809 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42262823 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42262827 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42262844 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42263252 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 42263504 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42263885 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 42264303 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42264381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42264678 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42264695 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42265094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42265259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42265284 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42265286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42265316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42265369 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42265558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42265770 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42265771 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42265852 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 42265886 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 42266106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42266142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42266375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42266530 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42266870 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42267243 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42267347 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 42267539 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42267565 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42267637 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42267689 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42267796 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42268075 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 42268495 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42268588 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 42268825 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42268858 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42268886 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42269046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42269133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42269204 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42269231 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42269347 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42269360 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42269641 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 42270157 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42270913 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 42271036 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42271265 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42271432 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42271495 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42272151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42272452 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42272562 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 42273254 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42273332 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 42273344 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42273371 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42273632 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42274031 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42274063 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42274188 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42274369 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42274371 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42274530 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42274916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42274995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42275040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42275094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42275717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42275730 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42275846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42275863 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42275922 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42275989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42276004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42276153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42276200 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 42276204 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42276344 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42276364 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42276415 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42276440 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42276521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42276568 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42276814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42276913 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 42276918 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 42277000 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 42277047 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42277097 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 42277345 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 42277355 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42277376 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42277453 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42277474 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42277493 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42277507 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 42277530 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 42277546 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42277599 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42277801 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42277898 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42278002 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 42278004 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 42278089 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42278195 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42278271 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42278286 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42278340 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42278367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42278496 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 42278537 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42278554 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 42278651 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42278666 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42278681 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42278712 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42278751 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42278826 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42278841 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42278921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42279062 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42279109 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42279113 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 42279137 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42279226 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 42279273 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42279304 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42279305 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42279426 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42279443 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42279656 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 42279816 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 42279825 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 42279885 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42279906 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42280038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42280228 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 42280233 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 42280245 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42280256 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42280308 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 42280325 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 42280344 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 42280363 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42280465 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 42280555 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 42280667 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 42280797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42280868 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42280904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42280928 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42281230 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42281252 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42281372 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42281516 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42281656 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 42281961 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42281962 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42281998 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42282053 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42282262 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 42282394 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42282428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42282585 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42283125 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42284460 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42284539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42285365 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42286874 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42286906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42287061 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42287228 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 42288158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42288195 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42288214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42288991 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 42289038 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 42289104 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42289180 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 42289193 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 42289247 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 42289260 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 42289304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42289333 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42289375 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42289405 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42289458 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42289547 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 42289562 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42289635 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42289641 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42289869 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42290415 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 42290458 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 42290559 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42290925 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 42290936 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 42290954 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42291047 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 42291093 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 42291137 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 42291529 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 42291559 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 42291692 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 42292106 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 42292112 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 42292246 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 42292307 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42292334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42292361 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42292413 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42292440 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42292466 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42292574 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 42292619 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42292666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42292760 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 42293092 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42293133 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42293462 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42293559 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42293715 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42293924 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42294234 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42294760 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42294958 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42294989 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42295286 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42295458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42295620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42295840 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42296168 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 42296426 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42297075 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42297375 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42298077 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42298191 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42298317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42298537 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42298538 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42298556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42298708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42298929 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42299211 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42299359 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42299366 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42299856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42299886 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42302973 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42304596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42304623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42304933 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 42305234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42305282 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42305353 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42305461 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42305758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42305872 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42306378 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 2 42306806 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42306903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42307141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42307250 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42307580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42307592 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42307655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42307924 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 42308111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42311417 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 42311539 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 42311809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42312420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42312875 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42313974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42314995 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42315150 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42315529 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42315811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42317628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42318652 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42318724 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42318951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42319167 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42319211 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42319250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42319387 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42319566 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42319651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42319694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42319805 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42320073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42320128 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42320183 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42320441 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42320467 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42320561 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 42320886 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42321163 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42321301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42321337 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42321765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42322214 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42322351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42322696 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42322788 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42322820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42323067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42323411 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42323421 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42323470 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 42323539 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42323760 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42323814 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 42323956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42324029 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42324091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42324504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42324526 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42324962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42325245 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42325507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42325508 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42326285 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42326398 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 42327056 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42327128 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42327446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42327469 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42327681 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42328022 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42328168 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42328322 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42328427 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42328556 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42328664 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42328890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42329001 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42329034 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42329120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42329265 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42329557 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 42329786 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 42329947 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 42329967 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 42330323 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 42330377 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 42330415 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 42330461 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 42330498 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 42330760 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42330820 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42330839 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42330858 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42330928 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42331014 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 42331053 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 2 42331055 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.133333333333333 0.8 0.0666666666666667 16 14 2 12 1 2 42331464 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42331689 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42331924 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 42331966 C A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 42331995 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 42332017 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 42332227 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42332281 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42332370 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 42332448 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42332488 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42332677 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42332725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42332748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42332987 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42333004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42333287 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42333363 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42333368 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 42333403 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 42333600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42333880 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42333893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42333986 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42333993 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42334091 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42334254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42334506 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42335237 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42335311 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42335352 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42335370 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42335475 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42335487 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42335510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42335567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42335590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42335685 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42335818 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42335899 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42335914 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42335939 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42335951 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42335970 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42336099 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42336119 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42336154 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42336544 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42336582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42336667 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42336748 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42336820 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42337069 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42337135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42337279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42337526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42337579 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42337733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42337761 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42337820 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42337918 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42338323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42338395 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42338530 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42338535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42338904 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42340367 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42342472 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42342765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42343609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42343918 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42345228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42347744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42350039 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 42352647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42353581 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 42353682 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42353714 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 42354111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42354134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42355561 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42355662 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42356114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42356698 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 42357351 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42357943 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 42357952 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42358483 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42358751 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42358825 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42359030 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42359334 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42359703 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42360117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42360193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42361631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42361791 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42361798 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42361862 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42362010 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42362104 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42362150 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42362155 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42362195 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42362207 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42362228 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42362247 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42362303 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42362406 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42362445 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42362448 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42362648 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 42362683 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42362694 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 42363130 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42363457 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42363470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42363639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42363729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42363732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42364045 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 42364058 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42364126 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42364218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42364363 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42364435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42364453 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 42364492 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42364513 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 42364601 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 42364713 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 42364919 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42364923 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42365640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42365663 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42365827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42365918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42366488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42366564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42366652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42366676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42366743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42366844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42367238 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42367241 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42367267 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42367318 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42367358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42367526 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42367647 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42367654 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42367750 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42367790 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42367804 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42367805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42368718 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42368774 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42368938 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42368971 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 42368996 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42369009 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 42369024 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 42369305 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 42369362 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 42369539 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 42369582 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42369596 T A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 42370195 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42370203 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42370467 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42370482 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42370900 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42370963 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42371031 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 42371641 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42371740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42371775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42372132 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 42372181 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42372249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42372322 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42372450 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42372850 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42372879 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42373264 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42373299 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42373564 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42375747 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42377120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42377353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42377475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42377736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42377759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42377811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42378019 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42378228 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42378248 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42378331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42378440 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42378635 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42378686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42378966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42379166 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42379185 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 42379287 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42379638 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42379659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42379691 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42379796 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42379915 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42379966 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42380098 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 42380353 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42380431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42380443 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42380492 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42380497 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42380531 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42380532 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42380602 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42380751 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42380911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42380912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42381015 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42381032 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 42381113 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42381170 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42381228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42381248 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42381261 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42381303 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 42381339 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 42381352 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 42381360 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42381769 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 42381804 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 42381907 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 42382017 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42382061 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 42382098 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42382274 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 42382810 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42385155 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42385208 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 42386466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42386735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42386992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42387852 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42387982 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42388088 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42388187 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 42388464 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 42389325 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42389927 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42390568 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 42390642 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42390687 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42391015 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42391093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42391239 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42391346 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42391395 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 42391778 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42391913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42392387 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42392396 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42392415 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42392462 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 42393026 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42393332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42394170 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42394196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42394400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42394456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42395560 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42395600 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42395786 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42395820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42395866 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42395897 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42395977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42396220 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42396240 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42396251 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42396436 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42397628 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42398468 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42398534 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42398638 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42398791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42399085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42399287 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42399347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42399868 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42400104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42403221 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42404460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42405721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42408230 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42408336 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42408377 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42408399 G C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42408442 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42408501 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42409494 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42409508 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 42409602 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42409906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42410051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42412838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42413014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42413093 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42413180 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42413450 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42413484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42416225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42416394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42416513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42416774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42417158 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 42417642 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42417756 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42417825 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 42418221 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 42418235 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 42418245 T G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 42418293 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 42418391 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42418437 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 42418624 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42418749 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42418785 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 42418816 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42418826 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42418842 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42418966 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42418970 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42418978 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42419008 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 2 42419018 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42419062 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42419273 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 42419450 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 2 42419465 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 42419654 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 42419697 G T Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 42419720 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42419928 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42419979 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42420056 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42420827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42420905 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42421037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42421187 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42421350 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42421367 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42421393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42421450 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 42421511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42421559 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42421662 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42421663 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42421825 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 42421882 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 42421984 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42422106 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 42422120 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42422222 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42422413 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42422452 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 42422723 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 42422804 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42422931 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 42422966 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42423044 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42423052 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42423181 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42423199 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42423330 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42423585 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 42424017 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 42424059 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42424136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42424396 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 42424450 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42424518 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42424562 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42424589 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42424609 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42424911 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 42425117 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42425121 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42431608 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 42432041 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42432129 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42432144 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42432256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42432442 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42433288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42433849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42433877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42434065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42435701 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42436397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42437099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42438242 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42439635 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42439974 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42440141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42440777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42442112 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 42442444 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42442468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42443186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42447157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42447499 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 42447671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42448266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42448633 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42448838 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42449135 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42449627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42450510 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42450975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42451135 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42451514 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 42452370 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42452656 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42455863 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42458331 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42458819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42460551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42460978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42461386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42461418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42462223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42462443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42464519 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42465258 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42465773 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42466563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42466995 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42468739 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 42469700 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42470534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42471897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42472003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42472602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42473441 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42473535 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42473771 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42473775 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42474061 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42474222 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 42474244 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 42474256 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 42474269 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 42474625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42474688 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 42474765 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 42475953 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42475975 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 42476068 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 42476238 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 42476686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42476738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42476897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42476919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42477026 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 42477190 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42477462 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42477701 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42477791 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42477811 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42478157 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42479029 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 42479047 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42479124 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42479720 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 42479910 T A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 42479960 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42479970 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42479987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42480116 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42480150 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42480199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42480791 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42480909 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 42480933 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42481061 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42481323 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42481347 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 42481458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42481489 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 42481625 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42481694 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42481780 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42481824 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42481825 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42481982 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 42482028 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 42482191 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 42482444 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 42482484 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 42482529 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42482617 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42482680 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42482734 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42482962 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42482979 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42483003 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42483036 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42483085 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42483193 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 42483219 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42483390 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42483401 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42483440 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42483526 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 42483534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42483664 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42483732 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42483848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42483862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42483870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42483966 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42484001 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42484081 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42484140 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42484250 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 42484282 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 42484422 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 42484590 G A N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 2 42484759 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 42488075 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 42490099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42490136 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42491143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42492467 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42493334 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42493516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42493550 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42495370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42495543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42495572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42495709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42497977 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42499616 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42499943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42500353 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42501421 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42501985 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42502108 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 42502254 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42502300 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42502839 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 42502937 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 42503016 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 42503098 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42503194 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 42503206 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 42503330 G C Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 42503339 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 42503364 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 42503409 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42503559 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 42503886 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42504432 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 42505119 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42505332 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42505435 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42505667 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42505938 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42506015 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 42506108 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42506121 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42506183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42507006 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42507066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42507145 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42507413 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42507626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42507711 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 42508097 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42508736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42509329 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42509498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42509833 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42509954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42510142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42510161 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42510167 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42510346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42510357 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42510493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42510731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42511031 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 42511191 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42511343 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42511358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42511549 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42511631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42511649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42511768 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42511795 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 42511850 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42511963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42512048 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 42512240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42512251 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42512262 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42512292 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 42512304 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42512315 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42512908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42512963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42513009 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 42513088 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42513214 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42513217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42513321 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42513325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42513350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42513403 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42513414 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42513500 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42513607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42513644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42513802 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42513980 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42514132 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42514216 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42514296 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42514334 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 42514538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42514756 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42514796 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42514803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42514943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42514999 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42515620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42515974 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42516004 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 42516039 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 42516108 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 42516122 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 42516178 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 42516249 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 42516509 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42516532 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42516543 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 42516546 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 42516555 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 42516557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42516717 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 42517045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42517119 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42517243 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42517372 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 42517377 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42517475 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42517579 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42517673 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 42517731 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42517764 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 42517766 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 42517794 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 42517935 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 42517997 T G N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 42518000 T C Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 42518133 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 42518153 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 42518476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42518492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42518502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42518651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42519177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42519761 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42519794 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42519898 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 42519905 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 42519914 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 42519934 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 42520062 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 42520155 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42520426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42520930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42521213 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42522902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42522959 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42523000 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42523070 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42523325 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 42523543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42523952 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42524165 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42524298 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42524361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42524462 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42524754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42525186 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42525256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42525271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42525917 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42526291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42526321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42526432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42526779 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42527005 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42527489 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42527611 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42528736 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42528975 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42529090 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42533304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42533438 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42533455 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42534684 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42534908 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42535836 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42536112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42536368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42536588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42536732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42536734 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42537007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42537389 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42537432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42537446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42537568 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42537818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42537984 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42538374 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42538542 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42538569 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42538667 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42538789 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42538793 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42538809 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42539014 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 42539042 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 42539083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42539086 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 42539145 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 42539165 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42539202 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42539206 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42539259 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42539314 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42539538 C G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42539854 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 42539956 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 42540014 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42540031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42540239 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42540255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42540330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42540528 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42540655 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42540707 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42540774 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 42540789 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 42540867 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42540940 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 42541528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42541728 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42541810 G C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42542104 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42542333 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 42542511 A C Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 42543266 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42543389 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 42543533 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 42543885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42544197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42544353 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 42544517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42544592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42544856 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42545182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42545298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42545312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42545452 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42545543 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 42545546 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42545570 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 42545651 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42545704 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42545742 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42545813 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42545821 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42545853 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42545880 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42545904 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42545939 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42545954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42545983 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42545990 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42546015 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42546037 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 42546042 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42546073 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 42546074 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 42546150 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 42546159 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 42546285 A G Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 42546325 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 42546359 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 42546396 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 42546397 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 42546411 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 42546423 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 42546841 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 42546876 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42547346 T G N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 2 42547669 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42547849 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42547887 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42548124 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42548139 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42548208 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42548221 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 42548234 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 42548279 C G Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 42548311 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42548338 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42548340 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42548353 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42548396 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42548422 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 42548424 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42548580 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 42548584 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 42548616 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42548713 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42549163 G C Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 42549281 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42549329 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42549375 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42549450 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42549492 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 42549690 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 42549824 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 42549863 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 42549939 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42550019 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42550040 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42550168 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42550279 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 42550405 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42550620 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 42551007 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42551627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42551881 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 42551898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42552103 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42552697 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 42552765 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42552839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42553445 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 2 42553490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42553507 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42553511 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42553545 C A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 42553547 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 42553576 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 42553600 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42553616 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 42553963 G A Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 42553966 A G Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 42554022 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 42554159 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42554234 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42554315 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42554405 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42554427 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 42554526 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 42554611 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42554655 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42554694 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 42554851 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42554872 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 42554892 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 42554923 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42554927 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42554936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42554943 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 42554966 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42555041 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 42555245 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42555263 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42555337 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42555539 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42555805 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42555982 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42555984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42556175 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 42556506 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 42557076 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42557144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42557149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42557158 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 42557499 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 42557502 A T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 42557536 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 42557727 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 42557755 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 42557770 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 42557905 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 42558021 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 42558221 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 42558299 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 42558479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42558721 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 42558780 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42558805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42558860 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 42559087 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42559100 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 42559202 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42559242 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42559297 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42559301 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42559309 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 42559324 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42559372 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42559378 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42559398 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42559468 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 42559493 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42559666 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 42559681 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 42559752 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 42559850 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 42559865 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42560036 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42560082 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42560397 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42560437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42560802 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42560858 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42560977 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42561026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42561166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42561301 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42561447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42561468 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42561622 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42561749 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42561770 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42561819 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42562276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42562491 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42562859 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42563047 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42564250 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42564317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42564329 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42564859 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42564958 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42565055 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42565307 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 42565647 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 42565894 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42566020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42566409 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42566702 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42567019 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 42567159 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 42567190 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 42567592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42567751 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 42567912 T A Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 42568665 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42568690 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42568741 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 42568784 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42568787 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42568956 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 42569388 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42569746 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 42569751 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42569848 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42570133 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42570315 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42570547 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42570555 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 42570653 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 42571118 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 42571361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42571376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42571886 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 42571984 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 42572256 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42572653 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42572879 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 42573068 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42573084 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 42573256 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 42573292 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 42573297 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42573337 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 42573350 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 42573412 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42573645 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 42573649 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 42573672 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42573738 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42573766 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42573772 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42573781 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42573809 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42573902 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 42574180 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 42574246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42574441 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 42574452 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 42574513 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 42574572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42574609 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42574665 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 42574918 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 42575043 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 42575167 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 42575241 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 42575282 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42575350 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 42575364 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42575434 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42575494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42575550 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42575562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42575589 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42575649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42575665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42575695 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 42575739 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42575769 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42575821 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42575848 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 42575879 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 42575892 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42575905 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42575960 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42576094 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 42577166 T G N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 42577237 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 42577254 C G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 42577347 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42577350 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42577368 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42577390 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 42577407 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42577446 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42577482 A G N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 2 42577556 T G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 42577622 G C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 42577715 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42577839 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 42577865 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 42577884 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 42577901 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 42577902 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42577944 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42577954 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 42578068 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 42578186 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42578245 T G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 42578273 C G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 42578295 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 42578347 T G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 42578373 C A N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 42578810 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 42578936 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 42578940 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 42579147 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42579256 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 42579365 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42579573 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42579593 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 42579666 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 42579712 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 42579829 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42579841 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42579872 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42579889 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42579895 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42579967 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42580019 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 42580059 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42580063 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 42580092 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 42580100 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 42580125 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 42580199 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42580256 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42580326 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42580334 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42580397 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42580423 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 42580431 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 42580446 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42580550 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 42580590 T G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 42580614 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42580632 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 42580702 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 42580707 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 42580851 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42580862 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 42580975 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42581078 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 42581109 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42581121 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 42581135 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 42581195 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42581266 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 42581321 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 42581350 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42581369 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42581381 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 42581382 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 42581435 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42581467 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42581472 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42581484 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42581491 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42581525 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42581570 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42581688 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 42581747 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42581763 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42581851 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42581864 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42581884 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42581886 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 42581899 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42581900 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 42581919 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 42581976 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 42581985 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 42582010 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42582036 T G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42582145 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42582300 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42582311 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42582351 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42582420 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42582685 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 42582706 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42582720 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 42582728 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 42582758 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42582850 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 42582852 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 42582896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42582968 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 42582997 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 42583009 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42583029 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 42583033 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 42583131 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42583192 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 42583201 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 42583232 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 42583277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42583541 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42583578 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 42583604 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 42583670 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 42583700 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42583841 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42583945 C T N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 42584160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42584198 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42584229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42584407 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 42584587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42584819 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42585076 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42585456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42585545 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 42585587 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 42585959 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42586015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42586115 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 42586612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42586793 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42587308 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42587350 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 42587460 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 42587477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42587694 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 42587792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42588005 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42588152 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42588338 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42588369 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42588400 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42588411 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42588855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42589420 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42589816 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 42590139 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 42591303 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42591493 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42592323 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42593395 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42594063 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42594113 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 42594583 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42595144 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 42595173 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 42596621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42599011 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 42599109 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42599146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42599547 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 42599670 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 42599870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42600272 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42600652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42601282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42601515 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 42602087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42602211 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 42602268 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 42602351 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 42602353 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 42602387 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 42602433 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 42602464 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 42602465 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 42602493 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 42602609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42602699 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 42602770 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 42602851 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 42602995 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42603245 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 42603350 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 42603429 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 42603476 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 42603524 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 42603628 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 42603961 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 42604495 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42604646 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 42604679 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42604965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42605029 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 42605037 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 42605060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42605215 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42605302 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 42605335 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 42605363 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 42605401 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 42605925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42606714 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42607663 G T Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 42608137 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42608475 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 42608553 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 42608581 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 42608709 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42608756 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42608823 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42608829 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42609173 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42609358 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 42610118 C A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 42610233 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42610347 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 42610390 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 42610391 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 42610442 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42610532 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42611227 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42611604 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42611704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42611821 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42611976 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42612087 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42612159 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 42612250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42612345 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42612399 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42612408 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42612618 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42612946 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42613498 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42613552 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42613680 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42613754 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42613807 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42613833 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42613872 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42613951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42614110 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42614213 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 42614274 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42614288 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 42614298 G C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 42614327 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 42614382 G A N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 2 42614537 T A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 42614705 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42614717 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 42614723 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 42614857 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 42614914 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42615118 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 42615391 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 42615597 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 42615602 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 42615807 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42615895 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42615900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42615963 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 42615970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42615993 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 42616009 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 42616053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42616142 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42616168 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 42616216 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 42616284 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42616298 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42616307 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 42616345 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 42616358 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 42616370 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 42616479 C G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 42616584 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 42616590 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 42616686 G T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 42616716 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 42616722 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 42616766 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 42616847 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 42616854 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42616866 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42616917 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42616940 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 42616956 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42616964 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 42616998 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42617072 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 42617075 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 42617195 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 42617197 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 42617232 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 42617266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42617326 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42617343 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 42617360 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 42617486 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 42617569 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 42617572 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 42617662 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 42617720 T A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 42617879 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 42617956 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 42618006 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 42618022 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42618058 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42618361 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 42618470 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 42618516 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42618560 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 42618736 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 42618741 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 42618866 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 42618916 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 42618930 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 42619171 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 42619233 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 42619240 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 42619290 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42619379 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42619405 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42619415 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42619628 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42619644 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 42619762 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 42620006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42620301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42620366 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 42624642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42624800 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42625057 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42625344 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42625541 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 42625879 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42626214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42626454 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 42626958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42627421 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42629333 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42631074 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42631540 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42631746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42632047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42632535 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42633009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42635076 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42635649 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 42635795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42635809 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42635848 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42636311 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42638087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42638575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42640537 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42642095 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42642429 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 42642909 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 42642982 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 42643479 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42644787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42646150 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42646715 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 42647603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42647910 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42648226 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42648700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42648814 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 42648917 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 42649141 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 42649146 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 42649492 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 42649954 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 42650225 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 42650267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42650349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42651085 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 42653225 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42653310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42653615 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 42654777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42656726 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42656750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42657061 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42657095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42657499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42657537 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 42657913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42658011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42658269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42658669 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 42658833 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42658979 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42659330 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42659416 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42659671 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42659715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42659753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42659791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42659850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42659874 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42659937 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42660009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42660038 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 42660073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42660074 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 42660226 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42660250 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 42660315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42660321 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 42660338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42660450 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42660511 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42660518 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42660575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42660593 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 42660644 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42660690 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42660754 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 42660808 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42660847 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42660868 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42661046 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42661244 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42661302 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42661320 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42661336 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42661346 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42661363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42661368 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42661375 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42661387 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 42661396 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42661492 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 42661741 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 42661862 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 42662008 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 42662096 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 42662119 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 42662125 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 42662139 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 42662312 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 42662351 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 42662506 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 42662522 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 42662568 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 42662613 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 42662803 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42662983 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42662991 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 42663248 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 42663437 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 42663653 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42663914 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 42664716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42664762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42664817 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 42665150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42665174 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42665931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42666024 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42666046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42666078 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 42666217 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 42666384 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42666428 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42667123 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42667551 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 42668004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42668386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42668657 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42669409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42669675 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 42674012 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42676799 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42677187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42677378 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42677701 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 42678137 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 42678867 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42679253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42681375 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 42681422 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 42681924 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 42682080 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 42682149 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 42683368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42685771 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42689205 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42689448 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42690457 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42690537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42691202 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42691622 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42693350 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42694623 A C N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 42696544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42696826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42697330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42697383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42697387 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42697408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42697518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42697657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42697703 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42697747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42698433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42698446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42698535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42698959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42698970 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42698999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42699025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42699124 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 42699151 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42699178 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42699269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42699307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42699386 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42699481 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42699506 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42699513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42699526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42699560 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42699759 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42699799 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42699823 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42699829 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 42699844 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42699880 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42699887 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 42699923 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42699960 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 42700001 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42700221 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 42700248 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42700364 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42700450 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42700481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42700597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42700608 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42700674 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42700887 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 42701250 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42701470 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42701603 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 42701662 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 42701690 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 42701691 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42701701 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42701933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42702144 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42702165 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42702511 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42702602 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42702660 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42702729 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42702748 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 42702801 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42702840 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42702850 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42703083 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42703134 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 42703232 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 42703235 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 42703260 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 42703277 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 42703526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42703553 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42703582 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42703646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42703663 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42703720 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42703741 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42703981 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42703982 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 42704027 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42704171 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 42704265 A T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 42705458 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 42705667 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 42706045 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 42706239 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 42706587 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42706735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42707100 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42707265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42707335 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 42707554 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 42707970 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42708004 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42708104 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 42708362 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 42708371 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 42708620 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 42708868 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42708974 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42709110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42709321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42709461 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 42709637 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 42709724 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42709765 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42709796 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42709805 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42709844 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42709852 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42709987 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 42710029 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42710069 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42710222 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 42710227 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42710244 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42710358 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42710425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42710505 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42710624 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 42710676 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 42710774 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 42710793 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 42710810 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 42711389 C G N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 42711625 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 42711781 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 42711874 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 42712030 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 42712132 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 42712266 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 42712267 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 42712339 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 2 42712498 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 42712708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42712875 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42712993 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 42713349 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 42714101 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42715286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42715717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42716817 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42716867 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42719324 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42719561 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 42719795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42721198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42721766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42721902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42723683 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42723966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42724343 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42725878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42725879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42725912 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42725993 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42726880 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 42727348 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 42727958 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42727996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42728179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42728252 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42729024 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42729192 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42729594 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 42729893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42730403 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42731482 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42732023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42732230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42732862 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42733181 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42733646 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42738065 T G Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 42738473 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 42739976 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 42740961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42743409 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42745156 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 42745492 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42747419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42747853 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42748218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42748926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42749122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42749277 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 42749301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42750694 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 42751159 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 42751306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42751325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42751341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42751631 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42753530 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42755681 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42755701 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42755702 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42755729 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42755765 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42755771 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42755925 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 42755954 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42756304 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 42756518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42756529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42756532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42756567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42756820 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42756887 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 42756937 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42757003 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 42757027 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 42757041 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 42757147 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42757329 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 42757358 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 42757409 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42757441 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42757943 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42758114 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 42758338 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42758350 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42758392 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42758738 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42758749 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42758894 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 42758911 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 42759060 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 42759064 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 42759113 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42759152 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42759330 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42759479 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42759531 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42759631 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42759657 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42759896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42761664 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42761872 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42762164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42762919 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 42763080 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 42763794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42763805 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42763905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42763968 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42764137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42764173 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42764253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42764569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42764879 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42765219 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42765930 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42765948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42766136 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42766143 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42766441 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42766448 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42766467 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 42766654 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 42766678 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42766734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42766746 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42766849 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42766875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42766889 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42766915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42766919 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42766932 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42766939 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42767035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42767057 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42767065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42767142 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42767163 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42767228 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42767848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42767920 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42768062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42768159 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 42768201 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 42768412 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 42768531 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42768683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42768763 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 42768772 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 42768783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42768870 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42768895 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42768990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42769023 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 42769187 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42769344 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42769354 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42769384 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 42769448 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 42769528 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42769777 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 42769784 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 42769841 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 42769874 A T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 42769937 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 42769988 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 42770005 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 42770092 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 42770293 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42771581 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42771762 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 42772539 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42772563 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 42772730 A G Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 42773111 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 42773225 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 42773343 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42773682 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 42773683 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 42773969 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 42774246 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 42774252 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42774457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42774513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42774571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42774583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42774700 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42774707 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 42774854 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42774895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775013 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 42775069 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42775082 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42775087 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42775116 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42775124 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42775152 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42775251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775254 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775284 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42775320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775405 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42775415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775443 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775484 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 42775501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775505 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775533 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42775534 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775544 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42775610 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42775618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775650 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775844 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 42775877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775889 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42775980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42776057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42776313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42776373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42776392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42776414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42776429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42776518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42776575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42776762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42776840 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42776974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42777305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42777317 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42777436 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42777562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42777596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42777655 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42777747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42777791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42777841 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42777971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42777973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42777983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42777996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42778000 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42778158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42778195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42778327 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42778373 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42778375 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42778462 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42778499 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42778505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42778568 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42778589 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42779081 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779258 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779311 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779318 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779377 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779926 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42779993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42780068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42780494 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42780509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42780632 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42780693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42781273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42781281 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42781463 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42781513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42781780 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 42781888 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 42782003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42782134 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 42782287 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42782684 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 42782778 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 42782992 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42783153 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42783158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42783239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42783346 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 42783411 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42783824 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 42783861 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 42783894 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 42783911 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 42783968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42784066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42784187 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42786166 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42787309 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 42787458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42788174 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42788505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42788528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42788976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42789222 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42789237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42789363 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42789383 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42789452 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42789638 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42789836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42789890 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42789914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42789930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42789961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42789966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42789974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42790434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42790527 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42790528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42790700 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42790959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42791159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42791838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42791961 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 42792005 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42792087 A G N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 42792571 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42792760 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42792763 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42792874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42792918 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42792969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42793011 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 42793013 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 42793057 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42793061 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 42793294 G A N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 42793338 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 42793463 A T N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 42793483 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 42793712 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42793861 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42794037 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42794073 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42794108 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42794324 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42794458 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 42794588 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42794765 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42794868 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42794937 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 42794966 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42795040 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 42795084 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 42795113 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42795195 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 42795220 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 42795221 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 42795291 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42795375 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 42795447 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 42795503 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42795542 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42795708 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42795789 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42795823 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42795969 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42796057 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42796119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42796127 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42796139 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42796305 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 42796508 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42796536 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42796578 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 42796731 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 42796794 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42796825 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 42796889 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 42796905 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 42796917 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 42796951 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42796961 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 42797101 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42797107 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42797119 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42797174 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 42797218 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 42797227 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 42797297 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 42797320 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 42797819 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 42797842 C A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 42797886 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 42797922 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 42797931 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 42797937 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 42797975 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 42797978 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 42798057 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42798061 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42798071 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 42798092 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42798116 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 42798136 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 42798259 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42798276 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42798294 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42798304 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42798335 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 42798378 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42798382 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42798414 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42798420 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42798436 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42798443 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 42798457 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42798474 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42798484 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42798622 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42798701 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42798719 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42798750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42798757 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42798871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42798954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42799009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42799050 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 42799082 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42799096 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 42799104 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42799107 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42799118 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42799222 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42799263 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42799279 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42799301 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42799309 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 42799350 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 42799352 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 42799425 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42799426 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42799826 G A N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 42799878 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 42799884 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 42799923 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 42799952 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 42800039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42800052 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42800107 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42800154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42800168 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42800190 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42800203 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42800298 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42800402 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42800446 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42800450 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42800481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42800521 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42800534 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42800584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42800648 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42800663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42800711 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42800720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42800729 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42800765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42800794 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42800896 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42800934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42800939 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42800982 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42800988 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42801027 A T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42801093 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42801287 T C Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 42801418 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42801464 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 42801477 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 42801480 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42801550 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42801610 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42801642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42801661 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42801734 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42801745 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42801771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42801843 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42801881 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42801975 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42802086 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42802214 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 42802239 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 42802290 C T Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 42802296 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42802322 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 42802376 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 42802380 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 42802425 G A N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 42802434 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42802442 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42802519 C A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 42802620 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42802633 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42802666 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42802777 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42802908 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42802911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42802922 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42802924 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42803000 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42803030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42803032 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42803046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42803282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42803381 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42803398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42803400 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42803417 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42803439 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42803445 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42803458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42803622 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42803785 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42803805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42803828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42803877 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42803910 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42803929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42803992 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42804003 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42804026 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42804031 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42804155 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 42804245 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 42804289 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 42804417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42804425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42804460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42804491 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42804523 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42804537 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 42804566 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42804833 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 42805056 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42805063 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42805453 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42805564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42805623 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42812360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42812456 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42812508 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42812556 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42812719 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42812742 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42813229 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42813305 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42813607 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42813731 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42813975 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 42813980 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 42814017 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 42814081 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 42814082 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 42814154 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42814229 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42814452 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 42814775 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 42814910 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 42814998 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42815107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42815203 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42815273 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 42815313 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 42815455 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 42815476 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 42815668 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42815787 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42815852 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 42816007 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42816014 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 42816095 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 42816110 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 42816120 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 42816130 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 42816346 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 42816390 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 42816425 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42816482 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42816616 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 42816619 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42816671 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 42816836 G T Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 42816849 G C Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 42816852 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 42816873 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 42816887 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 42816888 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42816919 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 42817044 C T Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 42817047 T G Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 42817100 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 42817103 G T Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 2 42817123 T C Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 42817228 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42817554 T C Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 42817781 A T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 42817849 A T Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 42817933 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42818041 T C Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 42818064 G C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 42818197 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42818424 T C N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 42819080 A G N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 42819133 G T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 42819255 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 42819303 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 42819353 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 42819382 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42819552 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 42819590 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 42819634 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42819717 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42819779 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42819808 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42819992 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42820066 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42820113 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42820151 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42820155 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42820195 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42820297 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42820333 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42820506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42820682 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42820813 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42821063 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 42821125 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42821156 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42821174 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 42821234 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 42821485 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 42821535 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 42821911 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42822023 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42822162 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42822172 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42822179 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42822239 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 42822264 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42822274 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42822389 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42822407 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 42822503 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42822553 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42822760 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 42822772 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42822851 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 42822923 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 42822959 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 42823008 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 42823043 G C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 42823055 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 42823090 G C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 42823123 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 42823141 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42823197 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 42823205 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 42823301 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 42823367 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 42823577 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 42823595 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 42823633 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 42824121 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42824189 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 42824201 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42824307 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42824519 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42824623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42824680 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42824695 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 42824816 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42824858 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 42824867 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 42824875 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 42824937 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 42825039 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 42825238 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 42825264 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42825267 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42825329 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42825341 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42825375 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 42825414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42825415 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42825481 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42825563 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42825575 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42825599 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42825608 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42825658 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42825685 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42825721 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42825768 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42825805 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 42825906 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42825908 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42825917 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42825958 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 42825976 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 42825986 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 42826076 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42826103 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42826105 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 42826240 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 42826289 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 42826299 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 42826345 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 42826386 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42826399 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42826407 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42826416 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42826426 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42826449 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42826507 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 42826513 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 42826540 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 42826669 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 42826746 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 42826761 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 42826773 C T N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 42827125 A C N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 42827186 G T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 42827190 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 42827242 T G N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 2 42827296 G T N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 2 42827310 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 42827370 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42827430 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 42827509 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 42827511 C G N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 42827568 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42827610 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 42827961 T G N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 42828318 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 42828352 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 42828368 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 42828394 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 42828437 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 42828504 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 42828510 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 42828522 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 42828539 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 42828577 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 42828602 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 42828621 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 42828630 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 42828652 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 42828668 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 42828881 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 42828962 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 42829025 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42829037 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42829067 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42829110 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42829120 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42829279 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 42829346 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 42830034 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 42830047 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 42830068 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42830314 T G Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 42830394 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 42830409 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 42830419 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 42830449 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42830520 G A Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 42830708 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 42830791 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 42830892 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 42830933 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 42831007 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 42831008 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 42831035 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 42831126 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 42831157 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 42831185 T C Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 42831299 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 42831438 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 42831496 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 42831509 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 42831669 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42831680 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 42831775 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 42831791 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 42831854 G T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 42831879 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 42831902 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42831957 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 42832082 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 42832103 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 42832116 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42832193 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 42832283 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 42832449 C T N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 2 42832461 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 42832655 A T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 42832662 C A N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 42832674 G C N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 42832675 A C N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 42832768 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42832801 G C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 42832834 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 42832993 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 42833013 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42833055 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 42833066 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 42833121 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 42833340 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 42833383 C T Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 2 42833422 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42833434 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 42833478 G C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 42833548 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 42833566 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 42833602 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42833609 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 42833635 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 42833653 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 42833728 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42833821 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 42833829 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 42833842 T A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 42834007 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 42834099 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 42834141 C A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 42834172 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 42834234 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 42834248 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42834261 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42834272 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 42834409 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42834538 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 42834545 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42834575 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 42834627 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 42834672 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42834678 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42834689 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42834857 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42834888 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42834896 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 42834976 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 42835043 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42835087 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42835092 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42835106 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42835164 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 42835177 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42835199 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42835370 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42835481 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42835491 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42835493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42835518 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42835600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42835612 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42835728 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42835739 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 42835749 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42835805 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 42835907 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42836058 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42836078 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 42836151 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42836165 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 42836375 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 42836418 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 42836498 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 42836541 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 42836559 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42836910 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42836941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42836971 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 42837061 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 42837062 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42837089 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 42837100 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42837188 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 42837329 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42837335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42837348 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 42837354 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 42837361 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42837398 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 42837450 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 42837496 A T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 42837574 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42837774 C T Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 42837843 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42838189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42838315 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42838461 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42838489 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42838565 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42838592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42838660 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42838757 G T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 42838889 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42838977 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 42839004 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42839021 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42839139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42839288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42839359 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42839381 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42839599 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 42839652 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 42839687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42839722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42839867 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42840373 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42840460 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42840711 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42840747 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 42840904 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42840945 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 42841974 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42842080 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42842837 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 42842964 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 42843458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42843528 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42844011 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42844388 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42844535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42844964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42845081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42845382 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42845754 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42845776 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42846143 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 42846627 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42847865 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42849886 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42849951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42850136 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 42850296 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 42850599 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42850628 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 42850646 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42850699 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 42850727 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42850762 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42850834 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 42850901 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42850988 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 42850999 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 42851111 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 42851147 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 42851288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42851314 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 42851405 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42851543 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 42851557 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 42851605 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42851737 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42851757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42851859 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 42851970 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42852045 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 42852096 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 42852111 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42852169 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42852770 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42852807 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42852823 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 42852908 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42853047 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 42853050 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 42853064 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42853334 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42853449 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 42853777 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 42853863 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42853878 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 42853891 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 42853915 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 42853934 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 42853962 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 42854052 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42854294 G T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 42854399 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 42854671 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42855122 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42855140 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42855188 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42855298 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42855598 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42855725 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42855760 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42855771 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42855826 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42855828 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42855976 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 42855988 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 42856128 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 42856219 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42856260 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 42856436 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 42856476 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42856527 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 42856572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42856712 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42856768 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 42856787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42856901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42856949 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42857000 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 42857181 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42857884 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42857920 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 42857941 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 42858177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42858222 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 42858251 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 42858368 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 42858433 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42858774 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42858805 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42858907 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42859057 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 42859162 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42859231 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42859513 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42859599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42859989 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42860251 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 42861662 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 42861997 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 42862020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42862116 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 42862133 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 42862299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42862372 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42862562 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42862593 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42862711 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 42863231 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42863530 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42864197 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42864219 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42864244 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42864282 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42864358 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42864385 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 42864423 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 42864453 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42864639 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 42864800 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 42865104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42865208 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42865365 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 42865412 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42865462 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42865477 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42865490 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42865508 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42865520 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42865526 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42865576 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42865593 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42865622 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42865626 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42865802 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42865846 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42865868 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42865922 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42865930 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42865947 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42865972 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42866017 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42866067 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42866071 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42866445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42866545 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 42866601 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 42866639 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 42866641 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 42866705 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 42866713 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 42866803 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 42867051 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 42867089 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 42867145 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 42867262 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 42867279 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 42867300 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 42867301 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 42867344 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 42867374 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 42867407 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 42867424 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 42867489 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 42867494 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 42867508 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 42867616 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 42867812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42867821 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 42867891 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 42867931 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 42868008 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 42868087 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 42868088 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 42868107 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 42868277 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42868284 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42868358 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 42868473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42868511 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 42868633 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42868782 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42868796 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 42868880 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42869000 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 42869032 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42869092 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42869255 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42869296 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 42869302 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 42869437 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42870981 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42871074 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42871157 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42871254 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42871299 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42871467 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42871475 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42871566 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42871582 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 42871664 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42871716 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42871848 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42872126 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42872404 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42872424 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42872463 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42872903 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42872985 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 42873091 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 42873279 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 42873287 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 42873688 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 42873911 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 42873941 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 42873961 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 42874138 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42874240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42874241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42874337 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 42874355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42874615 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42875275 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 42875285 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42875723 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42875816 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 42875864 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42875951 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42875953 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42875972 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42875990 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42876331 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42876699 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42876723 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42876775 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 42876817 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 42876889 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 42876952 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42876964 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42877067 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 42877107 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 42877294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42877345 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42877397 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42877422 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42877792 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42877885 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42878053 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 42878065 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 42878277 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42878285 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 42878375 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 42878395 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 42878578 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 42878616 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 42878697 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 42878789 G C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 42878861 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42878923 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42878983 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 42879100 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 42879120 A T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 42879227 C T N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 42879481 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 42879582 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 42879689 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 42879851 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42879857 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42879933 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42880035 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42880069 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42880110 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42880265 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42880269 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42880278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42880504 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 42880512 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 42880520 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 42880525 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 42880599 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 42880772 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42880773 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 42880882 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 42880928 A C N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 42880988 G C N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 42881014 C A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 42881045 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 42881133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42881179 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42881379 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42881410 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42881506 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 42881595 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 42881762 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 42882245 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 42882277 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 42882284 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42882344 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 42882430 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42882585 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42882589 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42882831 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 42882881 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42882963 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42882984 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42883010 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 42883107 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 42883138 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42883754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42884034 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42884375 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42884380 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42884451 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42884514 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 42884616 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42884888 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42884902 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42885161 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 42885227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42885318 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42885770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42886075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42886191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42886293 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42886308 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42887355 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42887441 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42887512 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 42887834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42887919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42888209 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42888313 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42888341 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42888342 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 42888373 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42888536 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42888619 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 42888632 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 42888633 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42888663 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42888718 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42888786 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42888812 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42888847 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42888967 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42888977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42889040 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42889056 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889069 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889135 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889157 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42889165 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42889222 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889231 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42889339 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889364 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42889369 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 42889399 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42889423 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889499 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42889509 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889526 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889572 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42889638 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889693 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42889702 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889763 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 42889828 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889831 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889899 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889905 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889938 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42889960 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42890030 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42890075 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42890138 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 42890209 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42890277 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42890410 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 42890610 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42890747 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42891005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42891150 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 42891193 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42891212 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42891224 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 42891225 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42891416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42891529 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42891534 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 42892507 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42892520 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42892684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42892716 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42892874 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42893011 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 42893172 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42893229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42893344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42893420 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42893424 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42893542 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42893606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42893778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42893857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42893860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42894695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42894749 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42895088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42895149 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42895668 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 42895746 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42896071 G A Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 2 42896137 C A Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 42896162 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42896212 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 42896241 G T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 42896635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42896918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42897144 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 42897168 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42897253 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42897546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42897618 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42897773 C A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 42898032 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 42898096 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42898168 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42898326 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42898442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42898461 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42898486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42898775 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42899050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42899069 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42899074 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42899174 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42899202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42899299 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42899475 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 42899877 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42899895 C G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 42900394 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42900410 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42900599 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 42900624 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42900690 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42900718 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42900730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42900932 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 42900963 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42901049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42901367 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42901477 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42901490 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42901525 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42901531 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42901777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42901782 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 42901932 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42902158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42902175 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42902254 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 42902322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42902812 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42902863 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42902890 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42902999 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42903102 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42903282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42903308 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42903673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42903704 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 42903892 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42903908 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42904125 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 42904143 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 42904162 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42904250 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42904415 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42904511 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 42904665 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 42904703 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42904771 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 42904958 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 42905086 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 42905146 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42905363 G T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 42905370 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42905664 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42906254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42906295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42907614 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 42909438 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42909575 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42910679 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42910838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42910884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42910898 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42910912 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42910986 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42911011 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42911160 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42911303 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42911477 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 42911494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42911526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42911653 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 42911728 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42911774 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42912008 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42912135 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42912174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42912237 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42912354 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 42912417 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42912418 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42912540 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42912590 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42912820 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 42913002 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42913239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42913254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42913261 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42913397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42913438 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 42913668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42913839 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 42913862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42913870 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 2 42913918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42913991 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 42914118 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42914140 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42914246 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42914263 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 42914265 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42914317 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42914613 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42914704 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42914721 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42914825 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42914925 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42915068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42915099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42915143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42915164 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42915257 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42915402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42915495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42915513 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42915577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42915591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42915594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42915723 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42915839 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42916566 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42916643 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 42917328 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 42917460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42917524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42917676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42917709 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42917872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42917977 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42918255 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42918477 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 42918805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42918825 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 42918937 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42918967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42918980 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42919004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42919040 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42919090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42919187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42919231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42919245 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42919357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42919385 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42919387 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42919412 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42919510 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 42919526 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42919558 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 42919612 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42919626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42919695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42919730 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42919748 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42919753 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 42919776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42919851 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42920033 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 42920189 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 42920225 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 42920469 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 42920492 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 2 42920619 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 42920642 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 42920716 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 42920893 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42920963 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42921021 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 42921030 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42921060 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42921072 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42921170 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42921285 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 42921286 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 42921321 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 42921333 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42921591 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42921611 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 42921755 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 42921766 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 42921807 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42921844 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 42921973 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 42922013 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 42922039 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 42922079 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42922129 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 42922316 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 42922478 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42922518 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 42922631 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42922762 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42922770 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 42922821 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 42923049 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42923131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42923155 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42923163 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42923255 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42923343 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 42923360 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42923392 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 42923440 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 42923469 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 42923500 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42923705 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42923716 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42923768 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42923777 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42924188 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924240 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924245 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924298 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924315 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924328 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924332 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924352 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924448 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924451 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924468 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 42924494 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 42924529 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42924531 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 42924553 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924556 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924574 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924619 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42924758 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 42924893 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 42924945 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 42925006 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42925007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42925026 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42925036 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 42925194 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42925237 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42925244 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42925333 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 42925418 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42925620 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42925636 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42925766 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42925775 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 42926931 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 42927260 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 42928021 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42928553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42929480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42930308 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42931296 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42931470 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 42931576 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42931914 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42932964 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42933674 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42934087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42936417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42936796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42936834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42937186 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42937913 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42938502 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42938693 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42939549 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 42939637 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42939781 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42940904 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42941214 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42941609 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 42942924 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 42943351 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42943440 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42943467 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 42943950 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 42944047 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42944248 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42944304 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42944331 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42944422 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 42944424 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 42944549 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42944712 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42944731 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 42944761 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 42944766 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 42945486 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 42945502 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42946608 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42946746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42946837 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 42946952 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42948146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42948604 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42948615 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42948990 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42950811 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42950933 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42951253 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42951369 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42951778 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 42952032 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 42952152 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42952181 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 42952588 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 42952803 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42954709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42955561 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42955818 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42957208 A C Y N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 42958816 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 42959164 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42959295 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 42959402 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 42959540 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 42959543 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 42959551 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 42960023 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42960056 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42960109 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 42960147 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 42960479 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 42960498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42960609 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 42960847 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 42960934 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 42961205 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42961282 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42961337 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 42961824 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42962124 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 42962162 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 42962181 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42962290 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 42962377 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 42962379 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 42962422 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42962484 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 42962490 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 42962630 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42962688 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 42962946 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42963044 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42963608 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 42963616 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42963858 A T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 42963953 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 42964179 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 42964250 A C N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 42964273 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 42964374 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 42964388 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 42964460 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 42964639 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 42964730 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42964865 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 42965049 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42965166 C G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 42965446 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 42965758 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 42966140 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 42966318 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 42966450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42967134 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42967475 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 42967672 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42968261 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42968265 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42968499 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42968739 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42968758 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 42969076 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 42969101 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42969193 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 42969231 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 42969255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42969259 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42969349 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42969509 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42969778 T C Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 42970037 A G Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 2 42970096 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 42970283 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 42970287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42970406 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 42970553 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 42971012 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42971066 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 42971381 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 42971569 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42971612 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42972152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42972404 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 42972412 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42972448 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 42972681 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42972721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42972778 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42972909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42973029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42973210 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 42973752 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42973834 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42973847 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 42973854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42973874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42973934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42973972 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42974058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42974169 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42974200 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 42974210 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42974238 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 42974440 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42974487 A C N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 2 42974955 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 42974996 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42975131 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42975223 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 42975875 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 42975889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42976019 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42976437 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42976554 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42976566 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42976597 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42976954 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42976972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42977048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42977131 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42977154 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42977176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42977643 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42977789 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42978161 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 42978198 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 42978234 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 42978376 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 42978404 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 42978430 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 42978532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42978686 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 42979112 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 42979218 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42979286 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 42979340 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42979409 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 42979414 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42979485 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 42979502 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 42979539 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 42979554 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42979586 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 42979694 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42979704 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42979705 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 42979744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42979760 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42979974 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42980302 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42980569 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42980838 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 42980859 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 42980944 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42980971 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 42981066 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42981120 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 42981255 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42981524 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 42981556 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 42981693 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 42981722 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 42982380 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42982389 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 42982625 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 42982725 G C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 42982743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42983292 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42983498 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 42984485 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 42985157 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42985178 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 42986673 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42987168 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42987533 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 42987723 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 42987996 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 42988354 A G N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 2 42988636 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 42989859 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42990468 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 42991092 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42991755 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 42991821 A G Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 42992784 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42994382 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42995216 A T N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 42996169 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 42996232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42996429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42996430 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42996577 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 42996748 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 42996767 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42996782 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 42997018 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 42997129 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 42997485 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42997538 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 42997569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42997775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 42997865 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42997907 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42997924 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 42997955 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 42997976 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 42998359 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 42998432 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 42998440 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 42998467 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 42998499 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 42998540 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 42998629 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 42998645 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42998709 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 42998805 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 42998838 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 42999176 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 42999361 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 42999401 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 42999436 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 42999699 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 42999745 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 42999778 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 42999782 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 42999860 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 42999877 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 42999949 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 42999970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43000014 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43000055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43000293 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43000313 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43000453 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 43000500 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 43000628 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43000679 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 43000700 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 43000752 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 43000842 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43000891 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 43000899 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43000934 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 43000979 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 43001009 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 43001097 G T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 43001143 T G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 43001157 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 43001177 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 43001179 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43001207 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43001430 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 43001453 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 43001466 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43001477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43001532 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 43001565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43001617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43001653 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 43001737 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 43001809 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43001892 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 43001989 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 43002156 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 43002173 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 2 43002233 A T N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 2 43002353 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43002424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43002712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43002722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43002735 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 43002822 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 43002854 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43002887 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 43002898 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43002926 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 43002963 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 43002964 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 43003073 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 43003107 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 43003154 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43003316 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 43003432 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43003695 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 43003696 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 43003757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43003793 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43003915 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 43003958 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 43003971 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43004020 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 43004040 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 43004053 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 43004070 G T N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 2 43004083 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 43004085 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 43004116 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43004152 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 43004218 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43004237 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 43004251 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 43004363 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 43004375 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 43004434 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 2 43004465 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 43004488 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 43004499 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 43004548 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 43004614 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 43004717 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43004842 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 43004876 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 43004977 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 43005317 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43005357 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 43005404 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 43005721 C A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 43007343 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 43008485 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 43008941 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 43008948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43010033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43010067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43010200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43010445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43010733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43010832 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43010941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43010952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43011208 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43011250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43011773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43012009 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 43012293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43012721 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43015346 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43015348 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43015452 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43015673 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 43016076 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 43016273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43016454 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 43016469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43017390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43018304 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43018357 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43018721 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43018975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43019543 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 43020022 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43022524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43024553 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43024589 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43024609 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43025129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43025384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43026061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43029624 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43029657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43029673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43029684 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 43029685 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 43029724 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 43030079 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43030268 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43030417 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43030466 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43030474 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43030478 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43030491 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43030703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43030923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43030982 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43031700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43031716 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43031980 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 43032121 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 43032515 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 43032578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43032593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43032742 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43032743 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43032756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43032794 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43032873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43032913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43033216 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43033300 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43033339 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43033348 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43033398 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43033413 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43033446 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43033449 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43033519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43033622 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43033669 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43033688 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43033701 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43033717 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43033794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43033848 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43033898 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43034109 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43034843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43034947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43035101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43035258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43035358 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43035370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43035389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43035424 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43035426 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43035463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43035501 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43035524 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43035579 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43035721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43035758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43036185 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43036236 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43036280 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43036356 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43036357 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43036584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43036723 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43036929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43037013 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43037348 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43037462 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43037500 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43037532 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43037589 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 43037627 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43037743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43037838 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43037998 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43038086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43038131 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43038199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43038270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43038293 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43038295 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43038311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43038398 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43038541 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43038548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43038948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43038972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43039037 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43039289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43039588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43039624 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43039634 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43039783 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 43039814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43039905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43039944 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 43039980 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 43040028 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 43040053 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43040404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43040631 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43040979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041017 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43041149 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43041165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041172 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43041177 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43041188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041237 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43041245 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 43041260 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43041273 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43041310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041484 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041656 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43041904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042206 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042216 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042415 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042479 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042503 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 43042530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43042680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43042944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43042977 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 43043210 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43043359 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43043613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43043861 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43043928 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43043985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43044226 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43044828 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43044840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43045166 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43045649 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43046006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43046698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43046831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43046918 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43046985 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 43047265 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 43047619 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 43047836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43047986 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43048044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43048053 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43048271 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43050327 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43050628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43051123 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 43052199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43052308 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43052887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43053131 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 43053238 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 43053241 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 43053371 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 43053464 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 43053511 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43053542 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43053769 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 43053816 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 43053817 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 43053922 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43054031 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43054032 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 43054245 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43054420 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 43054538 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43054554 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43054650 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43054661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43054677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43054758 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43054855 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43054945 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43054971 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 43054998 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43055022 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43055080 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 43056794 A G Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 43056895 C T Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 43056920 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 43056977 T A Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 43057110 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43057171 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43057249 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 43057257 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 43057298 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43057360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43057378 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43057502 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43057593 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43057745 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43057893 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43058008 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 43058038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43058192 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 43058213 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 43058415 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43058428 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43058435 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43058751 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43058797 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43058803 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43058893 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43058925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43058929 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43058971 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43058979 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43058989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43058996 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43059043 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43059109 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43059111 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43059162 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43059261 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43059458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43059483 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43059521 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43059575 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43059601 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43059605 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43059617 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 43059652 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 43059723 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 43059728 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 43059739 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 43059753 C A Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 43059854 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 43059897 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43059903 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43059909 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43059919 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 43059969 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43059976 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43059992 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43060009 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 43060019 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43060053 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43060096 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 43060115 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43060123 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43060141 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43060209 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43060292 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43060355 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43060361 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43060394 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43060435 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43060447 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43060459 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43060467 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43060493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43060498 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43060517 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 43060700 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 43060730 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43060741 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 43060821 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43060827 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43060867 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43060921 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 43060974 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 43060992 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 43060993 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43061035 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43061104 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 43061174 T A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 43061405 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 43061428 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 43061599 C G N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 43061666 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 43061667 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 43062032 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 43062090 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 43062114 A C N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 2 43062126 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 43062141 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 43062399 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 43062400 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 43062430 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 43063079 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 43063107 G T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 43063143 G T N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 43063159 C A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 43063168 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 43063197 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 43063199 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 43063208 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 43063258 C A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 43063259 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 43063309 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43063393 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43063397 G C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 43063430 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 43063526 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 43063537 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 43063603 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 43064089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43064389 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43064402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43065256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43065369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43065394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43066877 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43067191 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43068390 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43068598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43068782 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 43069511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43069608 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43069731 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43069772 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 43069828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43070017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43070158 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43070167 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43070176 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43070235 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43070684 A C N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 43070688 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 43072517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43073648 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 43073797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43073823 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 43074740 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 43074775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43075293 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43075904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43075984 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 43076026 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 43076043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43076074 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43076152 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43076785 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43076800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43076843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43077328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43077804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43078187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43078302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43078349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43078402 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43078490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43078683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43078956 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43079047 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43079404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43080049 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 43080913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43081861 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43081990 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43082169 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43083106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43083297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43083373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43083785 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 43083815 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43084066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43084073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43084168 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43084182 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43084307 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43084658 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43085116 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 43085260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43085663 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43086064 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43086283 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43086544 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 43086788 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 43087290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43087376 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 43087586 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 43087613 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43087614 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43087650 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 43087653 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 43087865 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 43087928 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43087939 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 43088089 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 43088116 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 43088129 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 43088202 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43089038 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43089519 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43089580 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43089696 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43089908 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43089912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43089931 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43089956 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 43089990 A C Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 43090043 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 43090117 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43090233 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43090454 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 43090506 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43090614 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 43090623 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43090630 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 43090705 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 43090852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43090978 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 43091144 T A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 43091451 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 43091477 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 43091520 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 43091623 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43091707 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 43091712 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43091724 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43091791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43091845 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43091880 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43092056 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43092065 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43092087 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43092121 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43092165 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43092177 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43092198 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43092465 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 43092471 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 43092652 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 43092729 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43092789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43092900 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43092914 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43093102 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43093135 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43093234 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43093295 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 43093460 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43093574 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 43093870 C G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 43094188 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 43094265 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 43094365 T G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 43094636 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43094651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43094772 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43094967 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43095026 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43095115 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43095253 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43095294 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 43095301 C T Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 43095521 C G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 43095727 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 43096103 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43096509 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 43096551 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 43096561 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43096569 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43096858 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43096994 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 43097003 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43097008 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43097066 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 43097099 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 43097132 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43097238 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43097305 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 43097353 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43097378 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43097481 T A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 43097482 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 43097539 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43097632 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 43097723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43097769 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43097807 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 43097833 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 43098152 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43098252 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43098271 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43098335 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 43098643 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43098662 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 43098730 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43098788 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43098901 A T Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 43098959 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43099303 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 43099345 T A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 43099360 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43099398 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 43099406 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 43099749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43100190 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43100284 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 43100423 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43100662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43100780 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 43100808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43101214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43101330 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43101501 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43101812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43101924 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43102453 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43102823 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 43102999 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 43103601 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43103759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43104175 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 43104191 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 43104944 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43105136 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43105162 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43105259 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 43105710 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43105718 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43105731 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43105773 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43105786 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43105787 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43105871 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43105895 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43105918 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43105955 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43106015 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43106036 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43106092 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43106156 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43106185 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43106198 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43106220 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 43106260 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43106380 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43106557 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43106576 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43106609 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43106820 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 43106848 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43106913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43107075 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43107389 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 43107408 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 43107529 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 43107999 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 20 4 10 0 2 2 43108086 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.75 0 0.25 18 6 9 0 3 2 43108200 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43108220 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43108489 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43108501 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43108505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43108559 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43108930 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43109282 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 43109458 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 43109462 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 43109795 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 43109805 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 43109869 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 43109927 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 43110034 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 43110153 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 43110154 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43110169 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43110170 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 43110190 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43110199 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 43110440 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 43110509 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43110637 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43110919 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 43110959 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43111129 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 43111182 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 43111247 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43111324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43111344 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43111452 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43111493 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43111503 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43111623 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43111652 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 43111723 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43111755 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43111793 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43111908 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43111941 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 43111989 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 43112001 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43112025 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43112043 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43112346 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 43112381 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43112761 C T N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 43112893 G A N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 2 43112898 A T N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 43112952 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 43113106 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 43113296 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 43113745 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43113794 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 43113971 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43114017 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43114073 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43114255 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 43114290 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43114307 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43114312 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43114418 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 43114468 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 43114510 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 43114582 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43114585 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 43114803 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 43114918 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 43114954 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 43115050 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43115082 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43115334 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43115351 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43115389 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 43115480 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 43115521 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43115590 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43115638 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43115652 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43115896 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43115955 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43115997 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43116057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43116074 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43116221 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43116266 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43116293 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43116313 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43116356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43116408 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43116433 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43116516 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43116549 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43116603 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43116654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43116676 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43116729 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43117364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43117397 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 43117427 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 43117497 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43117542 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43117613 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 43117625 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 43117632 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 43117643 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 43117659 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 43117681 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43117719 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43117764 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43118110 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 43118167 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 43118182 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 43118218 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 43118298 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 43118344 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43118515 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 43118522 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 43118527 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 43118552 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43118599 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43118684 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43118869 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 43119094 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 43119161 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 43119164 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43119475 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 43119525 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 43119706 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 43119851 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 43119894 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43120346 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43120405 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43120451 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43120452 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43120557 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43120702 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 43120738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43120945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43121016 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43121232 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43121320 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43121355 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 43121370 C A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 43121651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43121662 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43121676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43121765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43121775 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 43121814 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 43121846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43121909 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 43121953 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43122206 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43122238 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 43122266 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43122328 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43122367 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43122398 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43122414 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 43122537 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 43122558 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 43122560 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 43122585 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43122604 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43122615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43122702 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43122747 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 43122788 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43122853 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43122948 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43122954 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43122993 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43123198 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43123215 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43123352 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43123359 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43123416 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 43123565 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 43123579 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43123667 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 43123752 G A N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 2 43123897 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 2 43123965 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 43124006 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 43124058 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43124151 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43124186 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43124187 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43124200 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 43124216 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43124229 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43124325 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43124336 C A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 43124345 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43124361 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43124399 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 43124506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43124587 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43124720 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 43124756 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 43124870 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 43125074 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 43125094 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 43125147 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 43125185 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 43125201 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43125207 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43125265 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43125279 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43125281 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43125305 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43125308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43125396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43125550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43125652 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 43125706 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 2 43125749 C A N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 43125755 C T N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 43126007 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43126030 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 43126424 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 43126469 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 43126705 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43126724 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43126760 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43126897 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 43126899 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43126923 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43126927 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 43127456 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43127506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43128343 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43128494 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43128567 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 43129043 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43130440 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 43130477 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43130510 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43130696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43130795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43130987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43130989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43131085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43131240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43132007 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43132021 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43132298 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 43132922 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 43132987 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43133030 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43133740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43133782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43133859 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43133984 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 43134074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43134245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43134370 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 43134392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43134414 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 43134511 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 43134574 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 43134577 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 43134586 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 43134631 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 43134632 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 43134682 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 43134692 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 43134709 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 43134713 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43134769 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 43134778 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 43134820 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 43134859 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 43134872 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 43135210 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 43135217 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 43135281 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 2 43135282 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 2 43135301 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 43135374 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 43135380 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 43135452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43135538 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 43135665 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43135700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43135770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43135808 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 43135844 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43135901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43135937 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43135943 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43135954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43135990 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43136005 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 43136006 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43136125 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 43136180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43136204 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43136265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43136273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43136297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43136467 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 43136506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43136533 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43136577 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 43136639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43136654 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 43136683 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43136961 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43136990 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 43137089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43137170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43137208 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43137246 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43137295 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 43137326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43137347 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43137458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43137503 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 43137566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43137627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43138255 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 43138675 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43138749 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 43138904 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43138963 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43138994 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 43139037 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 43139937 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43140125 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 43140343 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 43140396 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43140634 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 43140706 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43140750 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43140808 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43140931 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43141015 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43141150 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 43141255 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43141307 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43141339 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43141491 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 43141718 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43141818 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43141862 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43141867 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43141952 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 43141981 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 43141998 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43142039 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43142082 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43142241 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43142252 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43142321 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43142334 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43142336 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43142412 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43142495 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43142499 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43142582 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43142619 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43142625 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43142830 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43143010 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 43143079 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 43143084 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43143101 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43143102 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43143122 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43143123 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43143150 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43143168 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43143211 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43143323 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43143396 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 43143405 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43143460 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 43143493 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43143559 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43143991 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43144060 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43144178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43144235 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43145141 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43146073 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43146074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43146266 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43147753 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43149040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43149220 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 43149562 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 43149722 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 43149955 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 43150018 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43150056 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43150152 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43150209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43150283 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43150407 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43150522 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 43150547 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 43150573 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43150697 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43150748 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 43150786 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 43150799 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43150828 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43150836 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43150840 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43150868 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43150899 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43151078 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43151159 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43151192 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43151204 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43151225 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 43151234 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43151256 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43151259 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 43151311 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43151375 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 43151401 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 43151410 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 43151543 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 43151562 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 43151572 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 43151646 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 43151689 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43151712 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 43151782 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 43152015 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 43152034 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 43152136 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43152201 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 43152274 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43152725 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 43152775 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 43152781 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43152874 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 43152922 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43152923 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43152965 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 43152986 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43153006 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43153059 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43153073 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 43153160 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 43153162 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 43153517 C A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 43153551 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 43153677 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 43153720 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 43153790 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 43153872 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43153935 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 43153959 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 43153980 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 43154469 A G Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 43154516 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 43154558 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 43154629 A C Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 43154642 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 43154752 G T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 43154970 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43154980 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43154983 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43155022 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43155028 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43155085 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 43155235 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 43155246 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43155384 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 2 43155461 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 43155466 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43155498 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 43155623 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 43155822 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 43155878 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 43155900 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 43155916 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43155948 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 43156029 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43156109 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43156159 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 43156168 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 43156273 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 43156274 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 43156377 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 43162913 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 43163064 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43163261 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 43163273 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 2 43163374 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43163494 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 43163594 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43163623 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43163883 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43163990 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 43164111 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43164454 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43164496 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43164523 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43164538 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43164580 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43164630 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43164638 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43164645 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43164836 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43165057 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43165080 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43165136 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43165206 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43165443 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43165781 C T N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 43166253 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 43166502 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 43166575 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43166716 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43166821 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43166885 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43166978 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43167037 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 43167213 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43167229 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43167264 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 43167310 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43167447 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43167471 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43167659 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 43167681 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 43167871 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 43167880 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 43167897 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 43167947 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 43167967 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43168002 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 43168088 G C Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 43168105 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43168350 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 43168432 T A Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 43168468 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43168494 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 43168519 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43168569 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 43168621 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 43168635 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 43168686 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43168780 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 43168996 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 43169220 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 43169335 G C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 43169575 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 43170015 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 43170384 T G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 43170501 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 43170531 G C Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 43170583 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43170606 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43170614 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 43170757 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 43170948 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43170979 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43171092 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 43171214 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43171230 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43171280 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43171290 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43171298 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 43171301 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 43171325 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 43171343 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43171357 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43171395 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43171515 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 43171531 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 43171695 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43171700 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43171790 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43171879 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43172109 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43172249 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 43172260 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43172698 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43172835 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43172855 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43172905 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43172938 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43172986 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 43173881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43173977 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43174033 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43174262 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43174324 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43174391 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 43174621 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 43174624 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 43174772 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 43174963 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43175388 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43175760 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43175798 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43175911 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43176073 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43176080 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43176100 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43176116 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43176122 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43176171 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43176277 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43176403 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 43176500 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 43176503 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 43176551 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43176563 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43177059 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43177195 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43177290 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43177610 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 43177626 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 43177632 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43177711 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 43177714 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43177727 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43177848 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 43177951 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 43178006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43178229 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 43178435 C A Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 43178493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43178709 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43179103 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 43179149 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 43179156 C T Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 43179583 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 43179952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43179954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43180055 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43180183 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 43180184 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43180228 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43180682 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 43180736 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43181316 T A N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 43181510 C G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 43181932 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 43182504 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43182529 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43182608 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43182891 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 43182930 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 43182956 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 43182960 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43183004 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43183021 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 43183078 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43183122 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43183154 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43183236 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43183394 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 43183443 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 43183449 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 43183496 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 43183632 T C Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 43183909 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 43183923 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43183956 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 43184083 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 43184209 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43184313 A G Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 43184490 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 43184525 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 43184624 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43184645 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 43184660 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43184720 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 43184769 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 43184777 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43184841 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43184924 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43185501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43185654 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43185733 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 43185871 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43185935 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43185985 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 43186013 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43186081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43186668 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43186734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43186768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43186821 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43187216 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43187235 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43187413 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43187558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43187833 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43188727 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43189029 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43189187 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43189403 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43189446 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43189546 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43189563 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 43189659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43189774 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43189937 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43190486 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43190735 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43190884 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43192073 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43193396 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 43194051 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 43195421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43196062 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43196440 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43196523 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43196647 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43196710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43196720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43196776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43196967 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 43197064 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43197208 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43197397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43197937 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 43197982 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 43198086 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 43198784 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43198985 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43199401 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43199879 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43200111 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 43200184 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43200253 C G N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 43200305 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43200662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43200761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43201140 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43201214 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43202252 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 43202525 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43203146 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 43203163 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 43203244 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43203252 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 43203392 G C N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 43204034 A G Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 43206940 T G Y N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 43208239 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 43211324 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 43211380 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43211383 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43212346 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43212392 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43212739 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43213250 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 43213342 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43213582 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43213756 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43214913 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43215235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43215297 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43216381 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43218960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43219408 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43219543 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 43219581 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 43219938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43220392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43220586 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43220737 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43221523 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 43221583 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43221688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43222679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43226534 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43227154 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43227458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43227828 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 43227992 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 43228033 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43228133 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 43228254 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43228394 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43228548 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 43228652 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43229232 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43229304 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43229422 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 43229766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43230196 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43230363 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 43230376 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43230680 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 43230825 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43231253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43231302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43231394 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43231875 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43231961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43232563 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 43232564 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 43232729 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 43232942 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 43232979 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43233020 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 43233136 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43233197 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 43233219 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43233251 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43233344 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43233392 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 43233393 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43233445 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 43233501 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43233522 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43233783 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43233814 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 43234245 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 43234269 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 43234677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43235260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43235725 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 43236290 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43236376 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43236411 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43236626 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43237395 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43238054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43238197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43239549 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43240791 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43242994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43244275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43245318 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 43247061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43247408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43247704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43247863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43247899 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 43249281 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43249348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43249730 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 43250355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43250776 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43251544 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43251605 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43253102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43253496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43253591 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43253641 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 43254154 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43255284 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43255383 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 43259527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43259636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43259879 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43261237 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43261279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43262562 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43263361 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43264103 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 43271713 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43271795 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43272633 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43273405 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 43273528 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43273577 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43273778 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43273883 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43274208 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43274247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43274434 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43274471 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43274601 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43274905 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 43275045 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 43275067 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43275197 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 43275213 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 43275609 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 43275939 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 43275945 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 43276026 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 43276316 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43276326 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43276337 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 43276352 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 43276353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43276432 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43276897 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43276911 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43277001 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43277011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43277077 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43277152 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 43277234 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 43277258 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 43277294 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43277712 C G N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 43277719 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 43277813 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 43277819 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43277908 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43278038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43278130 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 43278145 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 43278176 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 43278386 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43278559 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43278792 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 43278864 T C Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 43278958 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 43278969 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 43279589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43279794 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43280039 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43280847 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43280898 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 43281015 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43281193 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43281205 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 43282429 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43282700 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43282817 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43283149 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43283828 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43284930 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43284946 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 43285063 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43285348 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 43286186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43286664 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43286904 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43287350 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43287745 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 43287860 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43287903 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43288801 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43289122 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 43290489 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43290568 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43291091 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 43291134 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 43291168 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43291430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43292385 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43292688 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 43292714 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 43293587 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 43294070 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43294170 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 43294544 A C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 43294622 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 43294656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43294857 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 43294890 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 43295042 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 43295045 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 43295287 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43295641 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43296422 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43296753 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43297521 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 43297586 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43297689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43297748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43297813 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43298029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43298238 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43298278 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43298346 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43298403 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43298524 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43298593 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43298664 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43298703 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43298889 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43298953 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 43299065 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 43299851 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 43300235 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43300338 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 43300587 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 43300621 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 43300632 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 43300738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43300791 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 43300808 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43301613 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 43301870 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43301882 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43302169 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 43302285 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 43302390 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43302504 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 43302660 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43302756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43302832 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43302864 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43302915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43303220 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43303243 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43303321 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43303401 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43303471 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43303524 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43303597 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43303928 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43304063 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43304181 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 43304266 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43304317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43304352 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43304495 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43304607 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43304619 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43304847 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43304959 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43305275 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43305320 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43305990 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43306953 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43308375 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 43308392 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43308687 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43309156 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 43309678 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43309917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43309991 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43310701 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 43313818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43313996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43314003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43314261 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43314424 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43314466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43314580 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43315248 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43315375 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43315523 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43318673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43318743 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 43318783 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43319149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43319258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43319595 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43322628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43322737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43323520 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43324228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43324457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43325009 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43325063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43325118 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43325272 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43325576 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43326104 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 43326155 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43326394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43326840 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43326943 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43327186 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43327271 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43327364 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43327419 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43327546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43327689 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43327758 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43327867 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43327930 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43327950 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43328177 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43328208 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43328220 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43328344 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43328409 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43328700 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43328793 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43329108 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 43329126 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 43329131 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 43329311 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43333998 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43334365 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 43334905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43334961 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43340250 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43340601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43341210 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43341540 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43341573 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43342179 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43342344 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 43342435 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43342534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43342719 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43342751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43342794 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43343470 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 43343680 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 43343813 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43343916 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43343985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43344826 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43345703 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 43346147 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43346294 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43346315 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43346621 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43346679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43346785 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43346846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43348477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43349330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43349933 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43350077 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43351163 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43351904 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 43352054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43352141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43352586 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 43354143 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43354966 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43363348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43363524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43364519 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 2 43365040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43366587 T C Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 43366744 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43366966 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43367028 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43367537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43368094 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 43368140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43368155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43368218 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 43368266 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43368461 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 43368467 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43368646 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43369012 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43369287 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43369518 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43369530 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43369588 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 43369677 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43369756 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43369796 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43369822 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43369859 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43369872 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43369887 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43369913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43369921 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43369930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43369961 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43370131 G C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 43370146 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43370487 A T Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 43370719 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 43370758 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 43370795 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43371058 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 43371495 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 43372995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43373590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43375937 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43376119 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 43376134 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 43376136 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 43376861 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43378000 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43383275 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43383603 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43383837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43383883 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43384228 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43384901 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43385298 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43386288 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43388152 C T Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 43388976 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43389559 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43390286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43390317 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43391176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43391431 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43392017 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43392823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43393112 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 43393208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43393619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43393677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43393779 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43394514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43394664 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43394999 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43395349 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43397567 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 43397635 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43397773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43398223 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43398373 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 43398758 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 43398865 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 43398867 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 43398900 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43398934 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 43398965 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43399040 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 43399437 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 43399484 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 43399539 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 43400321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43401310 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 43401604 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43401882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43402629 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43402868 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 43403555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43404543 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 43406071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43406896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43406906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43407081 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43407512 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 43410046 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43410124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43410958 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43411171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43412898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43414945 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43415730 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43415870 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 43415892 G C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 43415987 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43416027 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43416091 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 43416551 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43417002 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 43417004 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 43417016 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 43417044 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 43417530 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43417543 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43417557 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43417631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43417750 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43417761 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43417973 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43418037 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43418077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43418091 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43418145 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 43418633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43418735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43419132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43420528 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43421038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43421216 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 43421352 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43421534 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43421548 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43421735 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 43421849 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43422113 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43422830 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43423177 T G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 43424073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43425149 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 43425359 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43425683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43427108 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43427865 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43427993 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43428070 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 43428531 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 43428561 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43428758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43429040 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 43429382 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43429785 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43429857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43429976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43430668 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43433008 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43433250 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 43433350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43433639 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43433887 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43434204 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 43435511 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43436115 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43437622 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43439033 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43439211 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43439735 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43439855 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43440167 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43440207 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43440241 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43440243 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43440393 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43440500 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 43440526 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43440530 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43440594 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43440639 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43440647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43440897 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43441060 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43441187 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43441235 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43441269 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 43441274 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43441334 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43441429 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43441710 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 43441742 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 43441805 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43441892 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 43441897 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 43441938 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 43441948 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43442413 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 43442417 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43442600 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 43443903 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 43444223 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43444442 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43445519 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43446118 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 43446350 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43446966 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 43447125 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 43447251 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43447300 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43447522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43447561 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 43447577 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 43447625 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43447639 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 43447702 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 43447955 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43448148 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 43448189 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43448206 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43448365 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 43448590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43448617 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 43448755 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 43448756 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43448770 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43448838 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43448910 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43449158 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43449268 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43449420 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 43449502 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43449595 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 43449664 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 43449665 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 43449743 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43449752 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 43449881 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 43450008 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 43450157 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43450220 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43450328 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 43450427 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 43450532 C A Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 43450562 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 43450665 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43450667 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 43450804 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43451045 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 43451078 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43451238 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 43451501 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 43452122 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 43452517 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 43452574 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 43452704 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43453269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43453386 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 43453777 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 43454133 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 43454408 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43454477 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 43454602 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 43454827 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43455240 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 43455482 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43455509 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43455660 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 43456090 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43456546 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 43456830 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 43457483 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43457938 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43458380 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43458457 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43458524 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43458619 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 43458730 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 43458757 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 43458867 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43458939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43458959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43459506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43459724 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43459727 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 43459896 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43460390 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43460771 A T Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 43461221 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43461241 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 43461284 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43461409 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 43461462 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43461526 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43461528 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43461857 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43463460 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43465202 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43465338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43465482 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 43465568 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43465569 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 43465601 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43465655 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 43465993 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43466019 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43466037 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43466105 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43466193 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 43466419 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43466446 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 43466544 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 43466690 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 43467035 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43467146 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 2 43467152 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43467213 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43467288 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43467650 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43467871 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43467891 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43467957 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 43467963 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43467984 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43468206 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 43468218 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43468227 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43468240 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43468344 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43468471 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43468530 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43468631 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43469026 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 43469226 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43469239 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 43469277 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43469298 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 43469317 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 43469337 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43469438 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 43469455 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43469538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43469551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43469719 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 43469865 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43469884 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 43469944 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43469959 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43470168 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43470217 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43470327 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43470411 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43470493 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43470494 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43470540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43470598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43470627 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 43470859 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43470927 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 43470995 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43471007 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43471097 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43471210 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43471303 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43471632 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43471643 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43471797 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43471828 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43471876 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43471941 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43471944 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43472062 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43472087 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43472453 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43472827 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 43472854 T A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 43473291 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43473506 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43473533 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43473660 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43473840 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43473842 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43473882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43474031 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 43474121 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 43474426 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 43474474 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43474479 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43474652 T C Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 43474653 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 43474672 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43475065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43475100 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43475154 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43475156 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43475493 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43475614 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43475716 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 43476342 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43476381 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43476541 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 43476570 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43476696 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43476811 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43476970 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43477088 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43477117 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43477146 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43477189 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43477530 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 43477561 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 43478125 T A N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 43478961 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 43479091 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43479580 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43479609 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43479873 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43480665 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43481347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43481820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43481959 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43482268 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43482533 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43482733 C A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 43483519 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43484128 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43484131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43484179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43485954 T A N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 2 43486124 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43486554 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43487104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43487110 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43487159 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43487746 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 43488191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43488227 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43488760 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43489050 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 43489123 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43489206 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43489257 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43489351 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 43489362 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 43489865 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43489893 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43489953 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43489980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43489990 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43490006 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43490080 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43490112 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43490505 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43490534 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43490544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43490637 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43490644 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43490652 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43490672 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43490681 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43490830 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43490902 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43490954 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43491103 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 43491149 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43491179 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 43491309 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 43491369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43491422 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43491664 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 43491709 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43491737 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43491956 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43492239 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43492264 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43492272 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43492292 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43492322 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43492356 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43492543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43492580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43492753 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43492771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43492855 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43492965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43493036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43493112 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43493195 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43493252 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43493408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43493623 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43493655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43493684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43494041 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43494166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43494443 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43494824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43494885 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43494936 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 43495003 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43495021 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 43495121 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 43495123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43495145 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43495357 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43495402 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 43495648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43495649 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 43495692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43495724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43495739 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43495790 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43495832 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 43495859 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 43495920 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 43495974 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 43495998 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43496068 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 43496111 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43496113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43496161 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 43496170 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 43496231 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 43496242 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43496783 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 43496891 G T N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 43497048 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 43497085 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43497209 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 43497215 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 43497348 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43497361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43497453 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43497858 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43499353 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43499382 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43503092 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43503757 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43504605 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 43505551 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43507015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43507167 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43507231 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43507591 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43507623 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 43507652 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 43507821 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43507858 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 43507875 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 43507879 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 43507908 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 43507924 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43507942 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43507966 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43507979 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43508001 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43508005 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43508047 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43508108 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43508199 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43508304 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43508375 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43508402 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43508523 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43508538 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43508555 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43508628 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43508956 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 43509418 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43509424 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43509633 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43509809 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43509960 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 43509973 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43510338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43510420 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 43510547 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 43510561 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 43510724 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 43512042 A C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 43512098 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 43512521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43512798 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 43512834 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 43512972 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 43513167 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 43513181 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 43513204 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 43513227 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 43513280 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 43513390 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 43513468 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43513469 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43514599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43514699 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43514792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43514854 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43515232 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43515506 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43515562 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43515704 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43515777 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 43515778 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 43516542 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43516567 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 43516746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43517068 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43517256 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43517303 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 43518224 T A N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 43518549 A C N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 43518967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43519609 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43519744 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 43519870 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 43519876 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43520249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43520290 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 43520606 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43520872 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43522256 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 43522274 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 43522558 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43522608 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43522686 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43522710 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43523539 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 43523787 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 43523798 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 43523858 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43523983 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43524024 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43524281 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43524485 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43524670 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 43524751 C A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 43524940 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 43524979 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 43525638 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43525660 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43525735 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 43525994 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43526106 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 43526336 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 43526357 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 43526375 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 2 43526507 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43526716 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43526722 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 43526953 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43526994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43527049 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43527235 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43527778 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 43527784 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 43527812 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 43527815 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 43527861 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43527949 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 43527953 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 43527963 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 43528000 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43528019 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 43528069 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 43528315 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 43528437 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 43528635 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43528818 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 43529009 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 43529206 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 43529214 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 43529431 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 43529523 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 43529695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43529821 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 43530098 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 43530142 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 43530246 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 43530411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43530528 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43530780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43530859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43530908 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43530933 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 43530964 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43531054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43531590 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43532237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43533296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43533500 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 43533503 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 43533636 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43534162 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 43534178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43534282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43534412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43534471 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43534574 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43534881 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43534886 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43534907 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43534923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43534936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43535025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43535027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43535060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43535086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43535142 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43535161 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 43535385 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 43535442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43535499 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 43535735 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 43535782 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 43535906 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 43535956 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 43535968 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43536760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43536898 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43537305 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43537537 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 43537869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43538532 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43539399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43539851 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43541830 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 43541835 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43542028 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43542055 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43542068 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43542696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43542967 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43543364 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 43543641 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 43543693 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 43543699 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 43543707 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 43543799 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43543848 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 43543867 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 43543984 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43544028 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 43544102 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 43544372 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 43544393 A T Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 43544467 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 43544505 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 43544520 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 43544528 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43544782 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43544792 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 43545039 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43545061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43545152 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43545162 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43545216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43545322 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43545504 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 43545597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43545627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43545635 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 43545681 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43545865 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43545947 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 43546362 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43546396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43546568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43546650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43546671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43546695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43546705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43546770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43546781 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43547130 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 43547212 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43547280 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43547360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43547508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43547643 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43547854 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43548029 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 43548040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43548143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43548232 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 43548238 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 43548277 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 43548312 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43548451 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43548525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43548582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43548678 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 43548796 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43548991 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43549269 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 43549384 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 43549436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43549489 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43549980 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43550072 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 43550085 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 43550116 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 43550135 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 43550232 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43550326 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 43550337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43550409 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 43551352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43551830 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43552268 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 43552848 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43552874 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 43552928 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 43553100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43553250 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 43553354 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 43553492 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 43553530 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 43553601 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43553606 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 43553627 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 43553692 C G N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 2 43553712 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 43553717 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43553936 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43554058 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 43554311 G A N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 43556005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43556277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43556371 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43556521 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43556536 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43556706 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 43556736 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43556746 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43558070 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 43558221 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 43558562 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 43558786 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 43558985 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 43558996 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 43559918 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 43560166 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 43560227 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 43560347 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 43560378 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43560512 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 43560535 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43560572 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43560618 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43560718 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 43560789 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 43560850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43560860 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43560886 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43560924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43560950 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43560984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43561044 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 43561153 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 43561287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43561537 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 43562313 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 43562439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43562795 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 43562925 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 43563654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43564205 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43564581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43564634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43564882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43564899 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43565074 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 43565860 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43565905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43565916 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43565962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43566230 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43566331 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 43566504 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 43567010 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43567276 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 43567347 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43567545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43567952 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 43568062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43568276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43568653 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43568672 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43568676 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 43568803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43569168 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 43569222 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43569270 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43569433 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43570846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43570947 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 43571015 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 43571441 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43571766 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43571797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43571915 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 43572676 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43572805 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 43572806 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 43573231 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 43573236 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 43573251 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43573286 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 43573353 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 43573425 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43573504 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 43574118 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43574313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43575247 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43576093 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43576178 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43576777 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 43576906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43577274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43577297 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43577340 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43577588 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 43577651 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 43577683 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 43578246 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 43578296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43579337 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 43579801 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 43579856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43579879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43579917 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43580011 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43580017 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 43580180 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43580286 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43580353 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43580501 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43580547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43580732 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43582366 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43583472 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 43584244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43584447 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43584881 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43584912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43585301 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 43585367 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 43585385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43585457 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43585468 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 43585483 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 43585595 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43585984 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43586039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43586202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43586258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43586572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43586604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43586821 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43586927 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 43586984 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43587038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43587135 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 43588144 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 43588150 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 43588190 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 43589128 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 43589168 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43589315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43589512 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43589730 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 43589818 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43590137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43590238 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43590893 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43591034 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 43591416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43591617 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 43592026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43592535 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43592672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43592753 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43592923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43593286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43593352 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43593590 T C Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 43594113 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 43594571 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 43595555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43595625 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43595751 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43595753 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43595785 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43595832 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43596469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43596550 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43597204 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 43597205 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 43597376 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43597418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43597619 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 43597709 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43597760 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 43597821 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 43597901 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43598118 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43598121 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43598970 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43599025 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43599042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43599090 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43599111 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43599189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43599345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43600055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43600084 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43600219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43600381 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43600411 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43600608 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 43600659 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43600667 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43600698 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43600727 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43600763 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43600908 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43600912 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43601096 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43601163 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43601226 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43601240 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 43601277 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 43601333 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 43601342 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 43601353 G C Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 43601494 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43601599 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 43601651 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43601696 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 43601702 G A N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 43602106 T C Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 43602107 T C Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 2 43602287 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 43602326 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 43602426 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43602463 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43602657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43602659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43602696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43602766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43602829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43602838 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43602840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43602887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43603188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43603858 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 43603963 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 43604250 G C Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 43605515 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 43605708 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43606077 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 43606127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43606164 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 43606373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43606374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43606405 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 43606416 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 43606544 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43606569 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 43606573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43606661 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43606817 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 43607003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43607141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43607600 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43607902 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 43607936 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43608512 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43608567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43608847 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 43608877 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43609013 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43609040 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 43609225 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43609238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43609268 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43609315 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43609336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43609343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43609464 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 43609530 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 43609580 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43609583 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 43609692 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43610065 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 43610078 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 43610105 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 43610140 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 43610454 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43610531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43610638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43610825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43611183 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43611239 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43612384 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 43612416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43612677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43612723 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 43612942 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 43613133 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 43613137 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 43613165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43613183 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 43613470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43613943 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 43614013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43614031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43614241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43614312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43614445 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 43614612 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 43614693 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 43615507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43616069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43616487 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 43616879 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 43617066 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 43617250 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 43617840 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 43618093 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43618116 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43619854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43620686 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 43620779 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43620939 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43621357 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 43621649 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 43622031 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 43622253 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43622582 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43622618 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 43623009 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43623451 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 43623483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43623665 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 43623698 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 43623812 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43623835 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 43623945 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 43624058 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 43624117 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 43624605 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 43624980 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43624985 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43625051 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43625082 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43625113 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43625220 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43625475 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43625517 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 43625531 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43625976 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43625985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43626165 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43626337 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43626818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43626914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43627473 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 43627474 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 43627547 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 43627576 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 43627837 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 43627853 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 43627993 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43628365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43628627 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43628671 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43628681 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43628728 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43628798 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 43628801 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 43628843 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 43629057 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 43629093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43629277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43629318 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43629406 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 43629655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43630001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43630082 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 43630092 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 43630106 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 43630253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43630302 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 43630307 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 43630353 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43630806 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 43630896 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 43631001 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 43631044 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43631241 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43631281 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43631334 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43631638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43631687 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43631753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43631821 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43631885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43631890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43631941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43632015 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 43632340 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43632351 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43632431 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43632488 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43632548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43632607 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43632630 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43632649 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 43632691 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43632747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43632855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43632883 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43632973 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 43632975 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 43633003 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43633077 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 43633093 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43633140 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 43633205 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43633279 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 43633412 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 43633600 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 43633703 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 43633727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43633763 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43633828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43634000 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43634015 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 43634857 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 43634882 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43634936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43634994 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43635132 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 43635481 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 43637393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43638630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43638921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43639004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43639045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43639221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43639490 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 43639717 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 43640076 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43640554 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43640947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43641246 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43641459 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43642159 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43642161 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43642321 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43642540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43642541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43644811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43646750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43647823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43648065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43648150 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 43648672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43649496 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 43649508 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 43649515 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 43649571 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 43649589 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 43649658 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 43649803 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 43649879 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 43649883 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 43649935 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 43649949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43649971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43649995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43650091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43650109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43650138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43650218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43650254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43650411 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 43650419 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 43650431 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43650435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43650447 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 43650511 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43650557 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43650596 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43650656 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 43650787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43650812 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 43650820 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43650832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43650952 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 43651030 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43651553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43651697 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43651733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43651926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43652182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43656423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43657113 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 43659677 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43660359 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43660555 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 43660999 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 43662915 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43663111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43663389 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43663791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43665663 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43666792 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43666805 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43666899 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43667625 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 43668660 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 43668665 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 43668937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43669237 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 43669494 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 43669671 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 43670451 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43671030 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43672441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43673416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43673463 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43673582 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43673897 G A N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 2 43673925 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 43673973 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 43673997 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 43674076 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 43674080 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43674378 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43674655 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43674688 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43674710 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43674773 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43674796 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43674819 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 43674872 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 43674897 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 43674978 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 43675641 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43675942 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 43676625 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 43676888 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43676956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43677687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43678028 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43678097 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 43678117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43678149 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43678370 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43678410 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43678540 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 43678566 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 43678572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43678641 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43678652 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43678732 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 43678734 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 43679128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43679311 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 43679721 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 43680268 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 43680586 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43681134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43681279 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43681304 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 43681437 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43681849 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 43682779 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43683165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43683455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43683858 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 43683928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43684009 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43685034 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 43685351 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43685405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43685711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43685880 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43686031 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43686721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43686868 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43688121 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43688650 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43689005 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43689395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43692269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43692702 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 43693378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43694501 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 43695639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43697081 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 43697261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43697824 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 43698162 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 43698351 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 43698611 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 43698951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43700069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43700457 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43701445 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43701761 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 43701769 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 43701828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43701830 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 43701849 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 43701895 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 43701977 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43701982 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43702231 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 43702678 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43702839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43702848 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 43702897 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 43703395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43703405 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 43703457 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 43703515 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 43703532 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 43703840 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 43703909 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43704021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43704304 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 43704462 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 43704501 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 43704701 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43704772 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 43704826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43704977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43705056 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43706031 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 43706535 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 43706847 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 43706952 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 43708794 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43709254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43709426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43710244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43710853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43710858 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 43711049 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 43711345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43711554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43712249 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 43712401 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 43712999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43713152 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43713493 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 43713522 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43713544 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43714195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43715307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43715498 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43715936 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 43717257 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43718956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43719374 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 43719559 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 43722304 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 43722313 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 43722437 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 43722576 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 43722933 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 43723085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43723428 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 43723443 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 43723444 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 43723491 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 43723661 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 43723694 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 43723776 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 43723780 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 43724177 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 43724376 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 43724594 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 43724622 T G N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 43725599 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 43725625 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 43725661 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 43725671 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 43725677 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 43725748 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 43725760 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 43725779 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 43725851 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 43726036 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 43726176 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 43726203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43726398 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 43726495 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 43726575 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 43726594 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 43726598 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 43726643 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 43726713 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 43728356 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43728580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43728700 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 43728794 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 43729097 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 43729312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43729398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43729486 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43729487 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43729503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43729712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43729742 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 43729750 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43729907 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 43729923 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43729928 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43729960 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43730110 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 43730161 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 43730179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43730280 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 43730421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43730551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43730562 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 43730575 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 43730591 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 43730634 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43731024 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43731251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43731358 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 43731735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43731787 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43731831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43731951 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 43731961 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 43732024 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 43732561 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43732646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43732791 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43733426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43733480 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 43733668 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 43733989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43734027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43734272 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43734569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43735223 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 43735377 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 43735409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43735443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43735517 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 43735530 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 43735552 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 43735680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43735691 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43735730 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43735861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43735903 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 43735937 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 43736017 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 43736032 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 43736403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43736409 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 43737190 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 43737191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43737313 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 43737329 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 43737392 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 43737419 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 43737435 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 43737490 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 43737543 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 43737704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43737873 A T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 43738200 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 43738220 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 43738647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43738664 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43738668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43738681 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 43738718 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 43738736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43738742 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 43738760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43738838 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43738855 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 43738867 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43738872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43738913 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43738914 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 43738928 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43744654 G T Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 43744664 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 43745056 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 43745062 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 43745311 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 43745694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43745814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43746176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43746194 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 43746311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43746487 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 43746508 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 43746531 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 43746949 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 43746961 T G Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 43747187 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 43747188 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 43747365 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 43747538 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 43747557 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 43747584 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43747610 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 43747763 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 43747764 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 43747820 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 43747828 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 43747942 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 43747982 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 43748051 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 43748068 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 43748145 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 43748191 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 43748214 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 43748231 A T Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 43748301 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 43748362 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 43748383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43748406 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 43748413 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 43748425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43748738 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 43749159 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 43749341 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 43749351 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 43749360 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 43749416 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 43749420 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 43749504 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 43749525 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 43749576 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 43749854 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 43750337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43750593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43752833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43753069 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43753107 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 43753386 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 43753612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43753774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43753791 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43753794 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43753837 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43754102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43754545 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 43754592 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 43754749 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 43754777 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43754791 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 43754849 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 43755108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43755355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43755399 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 43755434 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 43755598 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43756349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43756816 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 43756939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43756971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43757185 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43757195 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43757557 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43757583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43757697 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 43757777 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 43758035 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 43759744 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 43759805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43759931 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 43759972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43760950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43760971 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43765158 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43767426 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43768841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43770572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43773307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43773493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43777103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43778301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43778582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43778942 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43779016 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43779294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43780004 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 43780183 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43780303 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 43780410 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43781354 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43781367 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43781839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43782041 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43782091 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43782134 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43782394 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 43782406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43782414 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43782562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43783098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43783600 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 43783908 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43785525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43785758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43785917 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 43785995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43786221 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 43786327 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 43786417 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 43786420 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 43786449 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 43786485 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 43787735 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43789663 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 43791488 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 43793123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43793418 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43793829 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43794049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43794403 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43794445 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43794486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43795776 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43797398 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43801090 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43801371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43802224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43802593 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43802747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43804804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43804830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43806988 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43807226 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43807366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43807832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43808767 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43809044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43809146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43809277 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43810268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43810578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43812586 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43814321 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43817126 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43817273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43817689 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43817743 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43819038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43820906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43821430 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43822134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43822321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43822806 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43825477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43825996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43826387 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43826388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43826897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43827325 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43827485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43827813 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43827885 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43827994 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43828402 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43828425 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43828451 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43828466 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43828811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43828841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43828936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43829491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43830384 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43830546 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43832257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43832654 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43833238 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 43833515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43835308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43835315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43835634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43835868 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 43836956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43838477 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43839438 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43840351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43845371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43845988 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43846122 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43846467 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 43846913 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43846940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43847464 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43847566 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43847878 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43848225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43848863 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43848867 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43848990 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 43849038 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43849290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43849300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43849733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43849844 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43850002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43850076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43850278 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 43850484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43850543 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43850567 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43850596 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43850638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43850678 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43851084 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43851206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43851222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43851233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43851745 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43851825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43851850 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43852068 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43852335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43852616 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43852880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43852893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43854093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43854648 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 43854833 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 43854887 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 43854996 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43855292 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43855497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43855622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43855986 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43856051 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43856752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43856812 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43856914 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43856990 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43857474 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 43858287 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43858937 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43858977 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 43859187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43859204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43859479 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43860791 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43860804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43860821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43860882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43860886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43860970 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43861024 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43861106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43865154 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43867238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43868573 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43870028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43870039 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 43870043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43871436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43871566 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43872234 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43873492 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43873745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43874044 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43874668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43876491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43876788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43877036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43877054 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43877058 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43877542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43877596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43877715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43877883 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43878060 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 2 43878212 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43878236 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43878554 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43878565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43878652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43878749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43878864 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43878891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43878935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43878940 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43878960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43879016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43879025 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43879108 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43879339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43879393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43879675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43881679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43881980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43884091 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 43884217 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43884325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43888300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43888458 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43888478 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43889050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43889119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43891485 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43893897 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43894149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43894207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43897139 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 43897323 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 43903064 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43903566 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43904576 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43905120 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43905316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43905535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43905848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43907330 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 43908371 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 43908545 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 43908641 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43908748 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43908832 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43909027 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43911553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43914264 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 43914867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43915502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43915769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43915812 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 43916520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43916710 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43916907 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 43917404 C A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 43917471 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43917697 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43918156 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43918984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43925306 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43925699 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 43926157 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 43926239 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 43926707 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 43926772 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 43926856 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43926866 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 43926967 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 43927075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43927098 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 43927454 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 43927548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43927855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43928017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43928088 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43928112 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 43928227 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 43928313 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43928317 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43928335 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43928381 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43928445 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 43928459 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43928596 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43928642 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43928663 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 43928931 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43929018 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43929250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43930070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43930137 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 43930319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43930601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43930839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43930913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43931850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43932809 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43934075 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 43935325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43936488 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 43937263 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43937648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43938425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43939452 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43940400 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 43942120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43942784 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 43943150 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43946984 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 43948102 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43950225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43952314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43952844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43953000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43953886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43954421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43959751 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 43961958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43963746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43963859 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43964024 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 43968074 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 43968161 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 43968242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43968328 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 43968791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43970647 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43970723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43972369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43972765 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43973071 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43973105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43973117 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43973236 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43973262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43973819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43973905 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43973992 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43975627 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43976387 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43976410 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 43976518 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 43976595 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43976691 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 43977001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43977562 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 43977675 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 43977714 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 43977742 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43977856 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 43978459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43978781 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 43978936 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43979196 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 43980141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43980223 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43980264 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43980430 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43981098 G C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 43981260 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 43982298 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43982299 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 43982575 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 43982580 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 43982648 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 43983083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43983107 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43983508 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 43983653 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 43983738 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 43983765 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 43984176 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 43984949 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 43986291 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43986431 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43986456 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 43986741 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43986898 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43987291 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43987734 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 43988553 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 43989412 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43989977 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 43991256 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43991283 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 43992763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43992838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43992842 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43993213 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 43993283 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43993396 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43993584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43993656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43994164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43994332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43994348 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43994356 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43994402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43994427 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 43994433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43994468 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 43994532 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 43994567 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 43994616 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 43995039 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43995055 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 43995469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43995497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43995509 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 43995724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 43996108 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44000074 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 44000208 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 44001953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44002862 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44003871 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44005632 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44011326 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44011405 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44015519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44016164 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44016176 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44016593 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 44018127 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 44020032 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 44020326 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 44021736 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44023128 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 44023165 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 44023215 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 44030591 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44031052 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44031108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44031545 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 44031573 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 44031988 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 44033362 T G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 44033877 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 44034118 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44034319 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44034364 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44034407 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 44034820 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44034885 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44035077 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 44035935 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44036848 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 44037644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44037818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44037875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44037987 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 44038067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44038357 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44039096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44039674 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44039879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44039937 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44039958 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44040986 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44041419 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44041578 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44042035 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44042601 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 44042689 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 44042774 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 44042891 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44043144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44043145 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 44043235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44043289 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 44043373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44043563 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 44043628 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 44043738 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 44043822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44044006 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 44044020 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 44044109 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 44044126 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44044313 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 44044953 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 44045030 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44045041 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44045315 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 44045376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44045447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44045467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44045542 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44045580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44045639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44045860 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44045894 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44046394 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 44046667 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44046856 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 44046942 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44047814 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 44048109 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 44048415 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44048549 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44048550 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44048892 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44049820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44050363 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44051560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44051792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44052411 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 44052433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44052891 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44053088 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 44053547 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44053577 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44053855 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44053859 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44054075 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 44055629 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 44056176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44056811 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 44057112 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44057229 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44057723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44057748 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44057848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44058177 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44058421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44058815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44058961 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 44059231 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 44059382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44059489 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44059518 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44059931 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 44060002 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 44060080 T G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 44060275 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 44060407 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 44060995 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 44061025 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 44061083 T G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 44061465 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 44061719 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 44061749 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44062145 G C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 44062151 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 44062204 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 44062286 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 44063973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44064412 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44066850 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44067085 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44067482 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44067932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44068231 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44071522 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44071878 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44072251 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44072370 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44072815 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 44073427 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44073730 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44074517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44075881 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44076058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44076247 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44077935 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44078393 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44078497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44078867 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44078876 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 44081496 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44081675 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44082048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44082113 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 44082121 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44082134 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 44082195 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44082348 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 44082380 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44082893 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44083274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44083559 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44083564 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 44083589 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 44083636 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 44084054 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 44084532 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 44084560 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 44085668 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 44086008 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 44086053 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44086097 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44086164 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44086193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44086288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44086325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44086361 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44086472 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44086499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44087397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44087501 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 44087531 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 44087537 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 44087615 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44087735 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 44087792 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 44087809 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 44087828 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 44087872 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44087893 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 44087968 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 44088018 A T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 44088102 T G N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 44088106 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 44088207 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 44088229 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 44088308 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 44088322 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 44088347 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 44088413 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 44088430 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 44088478 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 44088485 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 44088597 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44088681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44088688 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44088778 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44088791 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44088812 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 44088846 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44089034 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 44089132 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44089176 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 44089208 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44089216 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 44089242 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 44089305 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 44089320 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 44089321 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 44089340 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 44089367 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 44089634 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44089706 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44090089 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44090361 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44090397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44090760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44090801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44091005 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44091022 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44091076 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44091083 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44091158 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44091285 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 44091339 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 44091700 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44091724 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44091730 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44091905 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44092007 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44092008 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44092027 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44092157 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44092164 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44092188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44092393 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44092469 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44092718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44092900 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44093053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44093155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44093469 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44093736 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44093823 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44094021 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44094066 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44094118 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44094347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44094434 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44094436 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44094567 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44094613 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44094616 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44094752 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44094755 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44095170 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44095346 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44095907 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 44096052 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 44100126 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 44100418 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 44100782 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44100962 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 44100998 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 44101280 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44101321 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44101453 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44101485 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44101523 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44101601 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44101652 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44101677 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44101679 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44101693 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44102062 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44102151 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44102265 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44102287 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44102340 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44102410 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44102429 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44102438 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44102576 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44103021 T A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 44103219 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44103258 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44103271 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44103322 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44103405 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 44103408 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 44103465 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44103533 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44103582 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 44103603 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 44103751 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 44103764 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 44103935 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44104361 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 44104523 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44104530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44104683 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44104868 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44105007 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44105944 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44106405 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 44106416 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 44106425 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 44106468 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 44106473 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44106507 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44106512 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44106558 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 44106723 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 44106791 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44106896 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44106918 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44107015 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44107025 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 44107046 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 44107199 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44107349 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 44107511 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 44107899 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44107906 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44107960 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44108438 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44108763 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 44108776 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 44108835 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 44108971 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 44108980 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 44109095 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 44109142 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 44109407 G T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 44109563 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 44109654 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44109666 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44110421 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 44111846 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44112341 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44113352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44113501 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44114018 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44114052 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44114112 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44114228 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44114698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44115881 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 44116146 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44116262 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44116618 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 44117154 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 44117756 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 44117786 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44118850 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 44119258 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44119295 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44119491 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44119540 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 44119597 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 44119758 C A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 44119889 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 44119929 A T Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 44119946 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 44120015 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 44120069 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 44120105 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44120191 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44120247 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44120266 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44120272 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44120304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44120393 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44120468 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44120469 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 44120550 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44120626 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44120645 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44120649 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44120668 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44120683 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 44120840 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44120841 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44120880 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44121187 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44121245 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44121252 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44121340 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44121370 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44121391 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44121635 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44121841 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 44122173 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 44122177 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 44122208 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 44122369 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 44122389 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 44122502 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44122538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44122597 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 44122608 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 44122651 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44122672 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44122689 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44122699 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 44122740 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44122759 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 44123099 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44123130 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 44123182 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 44123257 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44123260 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 44123537 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44123640 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 44123996 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44124380 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44124386 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44124560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44124637 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44124725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44124749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44125145 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44125639 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 44125768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44126116 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 44126254 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44126595 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 44126597 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 44126676 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 44126694 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 44126772 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 44126780 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44126871 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44126909 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 44127119 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44127215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44127809 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44128153 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 44128208 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 44128219 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44128465 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44128794 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44128843 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44128950 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44129021 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44129087 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 44129123 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 44129276 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44129295 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 44129298 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 44129681 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44129703 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44129735 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44129756 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44130203 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44130213 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44130789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44130836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44130936 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44131269 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44131351 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44131567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44138457 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44138618 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 44138631 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 2 44138773 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44138780 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44138915 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 44139204 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 44139407 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 44139435 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44139596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44139897 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 44140411 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44140580 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 44140589 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 44140644 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 44140793 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 44140819 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 44140882 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 44140897 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 44141102 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44141118 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 44141168 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44141214 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44141226 C G Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 2 44141544 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44141918 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44142456 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44142758 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44142970 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 44142989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44143012 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 44143170 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 44143387 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44143441 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44143464 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44144096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44144622 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44144772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44145355 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 44145799 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44146368 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 44146496 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 44147330 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 44147676 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44148941 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 44150420 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 44150594 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 44150613 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44150621 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 44150640 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44150828 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44150928 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 44151151 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44151306 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44152036 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44152442 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44152611 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44152638 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 44152838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44152896 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 44152911 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44152922 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44153125 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 44153774 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44153817 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44155111 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 44155626 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44158656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44160821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44162604 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44163389 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44163422 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44163531 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44163866 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44163890 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 44164953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44164968 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44166536 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 44167396 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 44167524 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44167785 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 44167837 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 44168123 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44168548 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 44168552 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 44168563 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 44169267 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44169571 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 44170271 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 44170796 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 44170855 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44170976 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 44171401 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 44171402 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 44171531 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 44171872 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 44171973 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 44173152 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 44173246 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 44173342 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 44173615 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 44173950 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 44174056 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 44174161 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44174383 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44174486 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44174685 A C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 44174693 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 44174713 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44175582 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44175700 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 44175737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44175778 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 44176024 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44176036 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44176048 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 44176074 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44176164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44176209 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 44176242 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 44176324 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 44176340 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 44176350 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 44176420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44176449 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 44176465 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44176507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44176511 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 44176979 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 44177000 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44177010 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44177072 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44177294 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 44177296 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 44177310 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 44177334 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 44177377 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 44177399 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 44177583 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 44177648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44177678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44177844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44177961 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 44178055 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44178065 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44178151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44178152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44178180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44178378 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44178396 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44178475 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 44178527 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 44178704 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 44178729 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 44178785 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44178852 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44178889 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 44178968 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44179055 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 44179071 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 44179090 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 44179144 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 44179170 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 44179173 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 44179369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44179745 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44180034 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44180357 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 44180544 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 44180650 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 44180771 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 44180996 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 44181069 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 44181312 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44181412 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 44181456 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44181498 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 44181599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44181641 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44181927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44182085 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 44182135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44182165 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44182485 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 44183167 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44183205 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 44183464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44183549 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44183731 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44183805 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 44184171 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 44184730 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 44184817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44185396 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44185453 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44185495 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 44185545 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44185798 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44185856 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44185902 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44185925 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44185965 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44186085 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44186156 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44186159 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44186394 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 44186453 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44186454 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44186612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44186895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44186940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44187157 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44187983 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 44188099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44188171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44189389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44189512 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 44190823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44190879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44190919 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44191331 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 44191379 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 44191439 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 44191462 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 44192480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44192841 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44192860 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44192937 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 44192977 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 44193078 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 44193110 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44193131 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44193132 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44193272 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44193278 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44193461 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44193522 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 44193549 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44193979 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44194119 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 44194135 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44195889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44197906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44198102 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44198665 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 44198728 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44198737 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 44198949 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 44199235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44199561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44199613 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 44199854 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 44200120 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 44200176 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 44200289 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 44200315 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 44200481 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 44200591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44200605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44201493 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 44201949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44202724 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44202835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44202872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44203890 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 44204120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44205723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44207225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44208834 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44209337 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44209523 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 44209541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44209583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44210798 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44211894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44212964 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44213513 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44213542 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 44214047 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44214056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44214126 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 44214177 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44214362 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44214407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44214489 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44214490 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44221147 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 44221401 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44222186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44222743 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44223962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44225455 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 44225469 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 44225473 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 44225653 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 44225738 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 44225749 C G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 44225818 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 44225822 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 44225848 A C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 44225983 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 44226136 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 44226548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44226562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44226743 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 44227126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44227594 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 44227666 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 44227673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44227719 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 44227791 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 44227873 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 44228125 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 44228237 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 44228253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44228315 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 44228682 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 44228684 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44228775 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 44228794 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 44228871 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 44228872 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 44228930 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 44228984 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 44229232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44229287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44229317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44229737 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44229802 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44230971 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 44231946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44232984 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44233661 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 44233958 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 44235669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44241917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44242385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44242597 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 44244133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44244639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44245240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44246984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44246999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44247062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44247153 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44247964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44248022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44248298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44250015 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 44252540 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 44252975 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 44253077 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 44254087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44254267 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 44256192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44257526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44258154 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44259195 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 44259881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44260075 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 44260334 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44260417 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44260581 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44260785 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 44260867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44260971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44261029 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44261373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44261697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44261936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44261984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44262244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44262274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44262514 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44262520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44262526 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44262635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44262675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44262882 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44263181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44263194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44263445 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44263612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44263699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44263985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44264432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44264630 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44264876 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44264960 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 44265210 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 44266657 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44267945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44268094 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 44268438 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44268844 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 44268945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44269156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44269301 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 44269449 G C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 44270017 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 44270240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44270753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44271034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44271891 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44272005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44272292 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 44272405 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 44272706 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44272889 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 44272964 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44273176 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 44273257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44273703 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 44273752 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 44273758 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 44273927 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 44273977 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 44274059 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 44274077 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 44274123 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 44274187 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 44274522 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44274625 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 44274720 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 44274780 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 44276944 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 44276952 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 44277131 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44277443 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 44277950 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44278175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44278449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44280438 A C Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 44280679 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 44280710 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 44281390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44282220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44283354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44285390 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 44286771 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 44287459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44291456 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 44292008 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 44293333 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 44293915 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44293981 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44294138 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44295146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44295153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44295437 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 44295475 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44295550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44295560 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44295562 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44295573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44295672 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44295699 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44295750 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44295914 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44296101 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44296468 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44296535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44296651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44296674 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44296773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44296827 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44297023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44297268 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44297725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44297825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44297826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44297853 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44298119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44298133 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44298218 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44298238 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44298392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44298405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44298761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44298856 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 44299000 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 44299087 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44299211 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44299222 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 44299302 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 44299304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44299334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44299338 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44299380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44299598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44299639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44299656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44299712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44299775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44299885 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44299982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44300024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44300200 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 44300746 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44300836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44300973 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44301063 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44301323 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 44301448 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 44301513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44301583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44301671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44301786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44301797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44301801 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44301836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44301857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44301869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44301886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44301961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44301971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44302057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44302349 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44302480 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44302582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44302683 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44303013 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44303357 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44303361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44303881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44304058 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44304105 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44304488 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44304525 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44304575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44304694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44304787 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44305316 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44305488 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44305570 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44305632 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44305713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44305823 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44305885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44305931 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44306383 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44309280 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44309358 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44310004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44310077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44310138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44310196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44310242 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44310375 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 44310531 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44310565 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 44310591 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 44310750 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44310771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44311134 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44311139 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44311150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44311416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44311928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44312347 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 44312424 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 44312823 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44312877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44313139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44313276 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44313288 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44313311 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 44313348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44313495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44313550 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44313807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44314484 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44314512 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44314536 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 44314847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44314861 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44314889 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44314907 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44314912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44314937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44315108 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44315299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44315307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44315353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44315458 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44315940 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44316013 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 44316275 A T Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 44316415 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 44316420 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 44316436 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44316537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44316579 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 44316815 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 44316976 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 44317036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44317332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44317718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44319047 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44319217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44319516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44319526 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 44319843 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44320434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44320742 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 44320862 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 44321057 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 44321078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44321176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44321179 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44321494 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44321509 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44321550 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44321575 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44321690 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 44321820 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44321897 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44321911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44322434 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44322715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44323379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44323702 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44324313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44325336 A G Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 44325585 A T Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 44325670 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 44325707 G T N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 2 44325785 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 44325947 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44326082 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 44326643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44326656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44326657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44326743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44327169 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 44327317 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 44327391 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44327544 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44327712 G T Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 44327812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44327869 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44327881 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 44327885 G C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 44327893 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 44328115 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 44328237 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 44328282 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 44328309 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 44328325 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 44328482 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 44328519 G C Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 44328527 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 44328567 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 44328571 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 44328663 T G Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 44328800 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 44328990 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44329132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44329244 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 44329516 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44329538 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44329549 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44329700 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 44329714 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 44329799 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 44329863 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44330053 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 44330117 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 44330125 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 44330181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44330629 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44331447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44331608 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44332134 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 44332889 G C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 44333039 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44333234 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 44333291 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 44333939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44333982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44333995 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44334008 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44334044 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44334120 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44334150 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 44334228 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44334491 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 44334790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44334905 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 44334947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44335122 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 44335175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44335384 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44335550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44335683 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 44335706 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 44335711 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 44335759 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 44336001 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44336004 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 44336077 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44336223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44337015 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 44337039 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44337518 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44337539 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 44337708 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 44337745 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44338737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44338749 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 44338799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44339093 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 44339289 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 44339471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44339522 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 44339778 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44339902 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44340496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44340519 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 44340543 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 44340549 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 44340703 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44340866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44341138 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44341174 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 44341206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44341575 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 44341608 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44342479 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 44342650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44342761 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44342791 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44343213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44343285 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44343321 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 44343351 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44343354 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44343497 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44343652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44343711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44343714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44343732 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 44343769 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 44343890 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 44343944 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 44344018 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44344094 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 44344141 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 44344158 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44344185 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 44344296 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 44344388 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 44344463 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44344464 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 44344477 C T Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 44344503 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 44344594 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44344653 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44344699 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44344730 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44344735 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44345218 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 44345219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44345263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44345291 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44345334 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 44345339 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44345520 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44345543 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44345544 G T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 44345579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44345584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44345719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44345733 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44345773 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44345901 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44345974 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44346007 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 44346013 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 44346144 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 44346228 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 44346283 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44346370 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 44346373 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 44346597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44346816 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 44346823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44346961 T C Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 44346964 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 44347053 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 44347066 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44347122 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44347128 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44347166 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44347197 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 44347198 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 44347219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44347227 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 44347291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44347303 G C Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 44347315 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 44347341 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 44347419 G C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 44347584 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 44347670 C A N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 44347734 C A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 44347737 A T Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 44347945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44347961 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44348068 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44348076 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 44348081 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 44348172 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 44348278 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 44348606 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 44348662 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 44348760 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 44348762 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 44348920 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 44348971 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44349003 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44349137 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 44349200 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44349247 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 44349390 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 44349471 A T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 44349523 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 44349721 A T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 44349748 G C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 44349756 G T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 44349914 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44349934 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44350079 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 44350145 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 44350362 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 44350370 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 44350405 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 44350650 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 44350761 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44350817 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 44351070 T G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 44352924 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44353167 G C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 44353215 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 44353700 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 44353768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44353900 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44354054 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 44354195 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44354673 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 44354940 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44355103 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44355770 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 44356355 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 44356957 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44357565 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 2 44357579 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44357668 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 44358684 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 44358738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44358815 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 44358877 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44358967 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44359331 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 44359741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44359808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44360091 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44360312 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 44360378 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 44361658 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 44361912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44362304 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44362365 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44362909 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44363341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44363597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44363642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44363668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44363938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44363992 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44364085 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44364840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44364950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44365629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44365838 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44366422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44366526 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44368418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44369438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44369651 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 44369662 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 44369889 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44370130 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 44370270 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 44370300 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 44370446 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 44370490 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 44370724 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 44370778 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 44370805 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44370920 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44370921 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44371184 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 44371221 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44371315 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44371322 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44371334 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44371407 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44371643 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 44371730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44371868 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 44371947 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44372011 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 44372125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44372147 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 44372270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44372382 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 44372409 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 44373291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44373400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44373465 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44373502 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 44374124 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 44374216 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 44374315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44374343 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 44374493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44375125 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44375219 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 44375302 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44375440 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 44375683 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 44375715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44375766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44375881 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44375965 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 44376115 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 44376306 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 44376337 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 44376410 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44376506 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 44376567 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 44376592 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 44376720 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 44376858 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 44376885 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 44376966 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 44377018 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44377207 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 44377439 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 44377449 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 44377577 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 44377658 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 44377782 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 44377791 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 44377967 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 44378042 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 44378067 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 44378487 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 44378517 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 44378540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44378701 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 44378709 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 44378726 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 44378794 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 44379004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44379010 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44379031 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 44379324 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44379385 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 44380088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44380633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44380654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44381293 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 44381457 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 44381493 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 44381494 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 44382032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44382731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44383978 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44384118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44384199 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44384261 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44384289 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 44384366 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44384385 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44385161 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44385506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44386053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44386094 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44386551 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 44386561 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 44386757 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 44386779 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 44387044 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 44387045 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 44387126 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44387194 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44387199 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44387322 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44387327 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44387363 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44387501 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44387521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44387724 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 44388277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44388799 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 44389191 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 44389202 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 44389259 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44389611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44389702 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44391239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44391276 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 44393701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44394612 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 44395225 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44396314 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 44396379 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 44396565 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 44396731 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44396843 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44396979 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44397927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44398701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44398762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44398921 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44398999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44399327 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 44399515 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44399601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44399655 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44400046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44400485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44401179 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44401242 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44401253 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44401258 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44402433 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 44402434 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 44402445 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44402470 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 44402504 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 44402559 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44402766 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 44403234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44403292 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 44403386 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44403428 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44403437 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44403440 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44404294 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44404605 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44405256 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44405435 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44405507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44405559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44405581 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44406201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44406776 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 44406814 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44408243 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44408867 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 44408920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44409037 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 44409106 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 44409112 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 44409129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44409139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44409149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44409397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44409543 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44409657 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44409659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44409838 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44409976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44410859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44411591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44412847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44413392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44415773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44417364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44417461 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44418366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44418569 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44418870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44419474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44423483 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44423655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44424015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44424748 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44431755 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44432299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44432486 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 44432489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44434751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44438418 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 44438822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44442263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44442341 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44443550 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44443579 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44444599 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44447592 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44448374 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 44450378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44450390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44450661 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44452463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44453055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44454502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44456553 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 44458340 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44459210 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44461019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44462274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44464150 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44464557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44466258 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44473585 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44475597 G C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 44475629 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 44475723 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44475951 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44476554 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44476971 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44477044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44477136 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 44479338 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44479544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44479554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44479567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44479664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44479677 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44479771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44479969 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44480265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44482428 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44484501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44485164 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 44486332 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 44487279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44488041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44488919 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44490109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44490149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44491549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44491582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44492974 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44493027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44496589 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 44497928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44497969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44498740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44500910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44502615 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44504171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44504457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44505014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44505280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44505370 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44505690 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 44506124 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 44506126 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 44506355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44506438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44506837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44507671 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44509969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44511125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44512418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44514869 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 44516554 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44518285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44520110 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44521656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44522231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44523816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44524796 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44529339 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44530719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44531447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44532404 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44534224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44535567 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 44535966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44537624 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 44538860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44539090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44551085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44555076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44555424 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44557852 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44558968 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 44559409 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44560856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44564412 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 44564746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44564900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44566588 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44567735 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 44568641 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44571695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44572470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44573729 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44573850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44574064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44576036 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 44576273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44586867 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 44587903 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44590083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44590102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44591985 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44595131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44595213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44596720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44596778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44600958 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44602138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44605176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44605510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44606473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44606492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44607241 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44610223 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44613327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44615026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44618951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44619105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44621905 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44627053 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 44627478 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 44628324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44629837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44631181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44631651 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44631719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44633846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44635575 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 44636068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44636442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44636776 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44638540 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 44641141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44644976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44645476 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 44646184 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44651024 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 44652009 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44655189 T G Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 44655618 C G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 44655644 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 44660700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44661140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44663106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44663741 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44665431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44665716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44665718 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44667563 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44667850 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44668477 G A Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 44668600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44669644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44669740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44672697 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44673354 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 44673886 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 44675468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44676209 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44676538 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44677383 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 44677448 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 44677607 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 44678136 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 44678159 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44678214 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 44678293 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44678428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44679155 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 44679233 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44679251 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 44679553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44679557 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 44679717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44679873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44680320 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 44680630 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44680663 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 44681123 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44682699 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 44682709 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 44682877 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44682952 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 44683080 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 44683126 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44683163 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 44684509 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44684539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44685225 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 44685960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44686229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44686286 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 44686314 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 44686521 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 44686921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44686987 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 44688147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44688368 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44688463 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 44689780 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44691627 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 44691666 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44692468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44694526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44694960 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44695075 C A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 44695712 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44695856 C G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 44697225 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 44698432 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 44698526 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 44699204 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44700108 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 44702849 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 44702997 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 44705187 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44705643 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 44706370 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44706371 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44708535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44709444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44710004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44712766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44717475 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 44719946 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 44722387 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 44723923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44727032 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 44729438 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44730164 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44731610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44731867 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 44732446 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 44733968 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44734073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44735109 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 44735374 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44736395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44737366 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 44737452 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 44737598 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 44737673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44741663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44742777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44743350 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44745709 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 44747422 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 44748528 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 44751563 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44751921 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44753856 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 44753896 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 44753992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44754000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44754003 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 44760980 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44762665 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44763853 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44765328 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 44767206 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 44770394 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44771576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44772333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44777098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44779403 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 44779904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44780461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44781036 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44783980 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 44784131 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 44784237 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44784690 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44784771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44785652 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 44786471 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44786833 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44787142 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44788745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44791613 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 44791625 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 44798561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44798855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44798930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44799936 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44800695 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 44800699 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 44800789 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 44800808 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 44801066 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 44801132 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 44801150 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 44803199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44803996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44804125 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 44804134 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 44804145 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 44805012 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 44805017 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 44805031 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 44805452 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44805525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44808408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44808592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44809375 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44809676 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44809946 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44816808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44817907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44819519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44823634 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44824499 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 44826692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44827639 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 44828211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44829990 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44830005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44830537 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 44830594 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 44831000 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44831218 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44831306 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44831309 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44831321 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 44831357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44831678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44831725 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 44831729 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 44831968 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 44831985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44833323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44833345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44834261 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 44834270 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 44835756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44835905 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44835916 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44837100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44837649 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 44837689 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 44838018 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 44838059 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 44839788 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44840975 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44844800 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 44845186 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 44845686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44846197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44846443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44846552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44848670 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44849276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44849745 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 44849930 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44850320 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 44851171 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 44851385 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44851947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44853656 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44853688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44854582 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44855251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44856111 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44856264 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 44858275 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 44858347 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 44858370 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 44858383 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44858386 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44858481 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 44858536 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 44858662 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44858684 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 44858875 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 44858963 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 44859375 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44859385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44859591 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 44859945 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44860049 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 44860235 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 44860298 G A Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 44860710 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 44860942 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 44861123 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44861251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44862156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44862646 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 44862651 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 44863094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44863729 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 44864053 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 44864320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44866577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44866677 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 44867717 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 44868192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44868238 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 44868611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44868812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44869213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44869231 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44869425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44869557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44869640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44870683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44870775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44871083 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 44871436 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 44871602 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44872006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44872304 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 44872575 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 44872713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44873352 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44873362 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 44873387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44873433 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 44873490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44873564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44873806 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44874301 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44875227 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44877586 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 44877622 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 44877927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44878858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44880792 C G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 44880939 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44881773 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44882764 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44884564 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 44889414 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 44889961 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44890552 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 44890581 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 44890634 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 44890777 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 44890987 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 44891026 C G N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 44891236 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 44892867 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 44893543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44893625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44894409 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 44896596 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44896793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44896794 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 44896987 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 44897159 G T Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 44897410 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44897503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44897566 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 44898177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44898455 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 44898513 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 44898592 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 44899387 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 44899518 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44900931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44902016 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44902095 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 44902263 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 44902524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44902951 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44904279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44905171 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44905535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44905701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44905770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44906123 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 44906196 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 44906350 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 44906353 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 44906420 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 44906432 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 44906683 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 44906695 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 44906743 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 44906745 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 44906960 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 44907029 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 44907034 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 44907343 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 44907476 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 44907616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44907922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44908110 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44908267 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44908685 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44908868 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44909542 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 44911507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44912064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44912282 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 44912343 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 44912399 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44914338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44915746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44915789 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44915955 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 44921529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44921740 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 44921906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44921936 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 44921947 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 44921961 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44922016 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 44922085 A C N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 44922374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44922465 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 44922728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44923186 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44923216 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44923424 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44924088 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44926818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44926981 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44927046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44927523 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44927631 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 44928217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44928991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44929308 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44929320 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44929867 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 44930298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44931023 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44931494 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44931569 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 44931678 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44931708 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44931755 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44932083 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 44932298 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44932498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44932786 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44932817 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44933196 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44933450 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 44933866 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44933874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44933967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44934015 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 44934865 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 44935036 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44936377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44936682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44937200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44937402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44937606 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44939137 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 44939153 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 44939170 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 44939401 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 44939538 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 44939896 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44940077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44940606 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44943942 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44945356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44946932 T G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 44949236 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44949268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44949608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44950015 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44950998 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 44951086 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 44951194 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 44951877 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 44952228 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 44952282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44953606 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 44954134 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 44955190 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 44955947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44956642 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 44956805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44957816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44960758 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44961445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44964356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44968078 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 44971764 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 44974218 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44975770 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 44976542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44976850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44976967 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 44977634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44977909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44979388 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 44979986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44980036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44980384 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44980755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44981889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44982094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44982126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44982185 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44983456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44984391 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 44984755 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 44984882 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 44985125 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 44985130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44986262 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 44986611 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44987459 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44987461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44987934 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44989104 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 44989566 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 44989855 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44990152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 44991976 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44993132 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 44993885 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 44994156 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 44996909 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 44997215 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 44997503 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 44998528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45000152 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45001986 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 45003995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45004176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45005725 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45006186 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45007673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45008060 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 45013128 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45013761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45015244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45016144 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45016697 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 45017059 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45017203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45017270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45017397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45017415 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 45017499 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 45017657 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 45017725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45018199 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 45018224 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 45018331 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 45018387 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 45018461 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 45018774 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 45018780 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 45018832 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45018908 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 45019115 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 45019271 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 45019288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45019683 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 45019731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45020000 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 45020137 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 45020273 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 45020438 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 45020585 G A N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 2 45020806 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 45020840 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 45021139 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 45021178 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45021415 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 45021947 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45022498 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45022582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45022633 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 45024805 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 45026586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45028035 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45028048 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 45028107 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45030358 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45030617 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45030964 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 45031257 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 45031435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45031583 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 45032252 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 45032275 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 45032276 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 45032697 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 45032706 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 45033436 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 45033808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45034840 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45034885 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45038420 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45039813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45041697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45046103 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 45047719 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45047745 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45047811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45049589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45050327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45050358 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45050709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45050938 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 45050985 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 45051035 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 45051146 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 45051219 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 45051910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45052444 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45053568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45054527 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45054752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45055746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45057187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45059220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45059439 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45060231 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45060425 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45062886 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 45064166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45064539 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 45064687 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 45065988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45066560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45066738 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45067249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45068942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45069060 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45069072 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 45069268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45070386 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45071276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45071474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45072125 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45072169 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 45072389 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45072757 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45073980 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45074197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45074638 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 45074647 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 45074660 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 45074776 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 45074869 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45074955 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45075007 A T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 45075091 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 45075109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45075141 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 45076226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45076494 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45078773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45079273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45079651 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45080172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45081014 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45082088 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 45083802 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 45083983 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 45084500 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 45084635 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 45084947 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 45084949 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 45085015 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 45085034 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 45085062 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 45085161 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 45085166 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 45085388 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45085681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45085753 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 45085791 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 45086919 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 45088271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45088480 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 45088725 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 45088763 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 45088816 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 45089172 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 45089835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45089911 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45089932 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45089954 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 45090020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45090045 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 45090070 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45090088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45090136 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45090182 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 45090308 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45090903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45091193 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45091424 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 45091600 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45091637 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 45091656 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 45092081 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45092496 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45092603 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 45092629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45092711 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45092879 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 45093081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45093825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45093880 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45093951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45094338 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45094665 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45094779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45094822 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 45094870 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45095008 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 45095168 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 45095216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45095288 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45095797 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 45096408 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 45096628 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45096723 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45097886 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45098053 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 45098235 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 45098316 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45098685 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45098743 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45098750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45099262 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45099388 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45100061 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45100169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45100493 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45100505 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45100579 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45101134 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 45101533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45102533 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45103952 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45104185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45104839 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45106289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45106446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45106869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45107185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45107821 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45108992 C A Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 2 45111340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45112060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45112392 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45112420 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45112505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45112850 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 45112919 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45112940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45113008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45113269 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45113315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45113763 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45113932 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45113936 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45116100 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45117056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45117770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45118342 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45118492 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45119075 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45120908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45120923 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45120941 T A Y N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 45120953 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 45121608 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45121655 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45122581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45123409 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45124085 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45124398 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45124475 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45125134 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45126562 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45127717 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45127851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45127893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45128198 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45128249 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45128433 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45128477 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 45128531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45128668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45128722 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45128832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45128895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45128942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45128964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45129089 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45129096 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45130146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45130340 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45131399 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45132848 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45133274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45133529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45134506 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 45134525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45136898 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45137164 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45137403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45139528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45139921 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 45140779 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45141416 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 45141749 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 45141859 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45143212 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 45143588 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 45143917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45144007 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45146109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45146799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45148000 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45149080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45149546 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45150890 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45150909 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 45152234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45153821 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45155848 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45157236 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 45157949 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 45158346 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45160421 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 45161495 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45161534 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45162324 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 45162547 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45163661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45165556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45165945 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45166329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45167232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45170092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45170388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45170559 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45171801 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 45172923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45173437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45173560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45174000 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 45175417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45176859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45177390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45180138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45180673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45180827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45180959 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 45180994 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 45181442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45181784 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45182886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45184229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45184306 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45184708 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 45185177 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 45185759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45185831 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45185861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45186620 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45187651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45187829 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45188153 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 45189239 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 45189700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45189964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45190011 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 45191800 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45191824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45191983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45192826 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 45193052 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 45194731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45194939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45196003 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45198950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45199018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45210945 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45223716 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45228177 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 45232561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45234813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45236790 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 45236839 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 45236840 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 45237560 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45237717 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 45242748 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45248821 C G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 45249190 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45249553 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45251383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45251455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45252020 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45252324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45252442 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45252587 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45252684 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45252719 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 45252882 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45253096 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45253229 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45253294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45253524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45253699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45253732 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45253810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45254480 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 45254601 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45254624 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 45254709 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 45254821 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45254867 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45255844 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 45256349 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45257033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45257160 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 45258788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45259240 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45259329 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45259811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45260496 G C N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 45260928 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 45262790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45263464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45266615 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45267296 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45272008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45272477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45278469 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 45278573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45279057 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45279178 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45279413 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 45279784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45280146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45280980 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 45281285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45282113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45282221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45282302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45282396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45282597 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45282816 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45283170 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 45283758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45284141 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45284222 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 45284364 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 45284886 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 45284889 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 45285684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45285799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45286682 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45287485 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45287519 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45287723 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45288138 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45289075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45289305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45289719 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45291552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45293772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45293991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45294382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45295666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45295774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45295881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45296188 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 2 45297222 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45305559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45305761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45308196 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 45311040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45311455 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 45312154 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 45313409 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 45313588 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 45313672 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 45314142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45314288 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 45314346 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 45314426 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 45314477 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 45315469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45315520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45315580 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 45315933 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 45316144 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 45316179 G A N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 45316299 C G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 45316324 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45316352 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45316461 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45318659 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45318777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45321436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45322414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45322565 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45322851 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 45323039 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 45323145 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45327839 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45327963 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45327966 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45329272 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45329521 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45331001 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45331092 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45333149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45333417 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45333438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45333987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45334942 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45336631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45338122 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 45338266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45338628 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 45338670 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 45338718 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 45338745 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 45338766 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 45338872 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 45339216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45339302 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 45339339 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 45339611 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 45339670 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 45339737 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45339979 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 45340097 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 45340282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45340883 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45341455 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 45341468 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 45341470 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 45341494 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45341506 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45341563 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45341616 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45341636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45341675 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 45341677 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 45342512 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 45342690 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 45342910 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 45343152 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 45343155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45343199 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 45343242 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 45343247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45343444 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45343686 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45343803 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45343915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45344120 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 45344139 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 45344450 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 45344482 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45345098 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45345564 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 45346236 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45346262 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 45346380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45346464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45347043 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 45347498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45348277 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45348595 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45349003 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45351570 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45351687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45353436 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 45353630 C T Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 2 45356073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45356495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45356646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45357826 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45359663 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45361496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45362033 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45363135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45363903 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45365162 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45365774 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 45365847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45366627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45366711 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45367181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45367560 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45368635 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45369262 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 45369679 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45370259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45370922 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 45370960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45370982 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45371182 A C N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 45371314 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45371510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45371860 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45371901 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45371983 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45372310 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45372318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45372401 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45372534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45372645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45372777 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45372876 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 45372909 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 45373523 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 45373584 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 45373837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45373856 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 45373887 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45374179 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 45374288 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45374374 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45374498 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45374695 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45374714 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45375704 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 45375847 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 45375873 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45376039 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 45376095 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 45376109 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45376735 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 45377420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45377422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45377896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45378011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45378045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45379196 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45379231 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45379422 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45379482 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45379777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45379802 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45379842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45380099 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45380149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45380194 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45380324 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45380340 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 45380359 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45380416 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45380533 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45380561 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45380874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45381072 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45381670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45383244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45383563 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 45383995 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45384415 T G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 45384507 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 45384541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45384679 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45385229 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45385346 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45385469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45385767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45385917 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 45386031 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 45386176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45386964 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45388286 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45389525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45391007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45394231 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45395947 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45398335 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 45399462 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45401715 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45402325 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 45402959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45405398 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 45409430 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45410379 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 45412235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45413467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45413637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45413649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45415385 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45418532 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45419185 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45419747 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45419904 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 45420387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45420413 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45421148 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45424171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45426990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45427859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45429646 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45430588 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 45430947 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 45431888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45432258 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 45432732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45432741 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45433847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45433863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45434540 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45434721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45434768 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45434803 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45435829 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45435879 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45436763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45436866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45437136 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45437212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45437547 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45437554 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45437851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45437878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45437936 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45438297 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 45439108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45439132 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 45439281 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 45439379 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 45439381 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45439477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45439648 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45439719 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45440521 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45440595 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 45440641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45441020 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 45441035 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 45441323 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 45441327 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 45441908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45442231 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45442888 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 45442893 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 45442915 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 45443028 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45443210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45443359 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45443530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45443631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45444226 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 45444543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45445050 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 45445115 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45445221 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 45445769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45446428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45446641 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45446829 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45446958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45447253 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 45447593 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 45447747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45448023 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 45448251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45448555 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 45448638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45448717 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 45448737 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45448782 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 45448783 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45448867 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45448940 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45448985 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45449017 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 45449366 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 45449373 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45449645 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45450528 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 45450552 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45450570 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 45450886 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 45451400 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 45451608 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45451664 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 45452535 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 45452886 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45453090 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 45453318 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 45453587 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 45453612 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 45454680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45454715 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 45454776 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 45454859 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 45454919 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 45454977 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 45455232 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 45455443 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 45455532 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 45456026 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 45456120 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 45457083 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 45457658 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 45457851 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 45458002 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 45459040 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 45459307 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 45459632 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45459843 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 45460311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45460574 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45460628 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 45461244 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45461879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45462635 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45462877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45462912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45463432 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45463721 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 45463748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45464180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45464484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45464664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45464919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45465409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45465786 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45466785 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 45467969 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 45468700 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 45468768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45469180 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 45469209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45469347 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 45469476 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 45469487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45469572 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45469649 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 45469836 T G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 45470113 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 45470116 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 45470220 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 45470357 A T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 45470768 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 45471080 G C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 45471089 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 45471737 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 45471807 T C Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 45473120 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45473369 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45473543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45473608 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45473828 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45474412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45474869 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45474890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45476914 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 45477515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45480530 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45482509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45482540 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45482542 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45482632 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45482643 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45482662 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45482682 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45482717 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45482735 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45482804 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45482816 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45482841 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45482897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45482905 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45482914 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45482928 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45482938 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45482939 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45483013 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45483034 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45483047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45483106 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45483197 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45483418 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45483439 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 45483473 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45483482 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45483509 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 45483730 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 45483732 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 45483827 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 45483847 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 45483908 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 45483912 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 45483932 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 45483938 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 45484209 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45484220 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45484294 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45484322 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45484362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45484401 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45484641 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45484675 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 45484692 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 45484716 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 45484741 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 45484843 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 45484878 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 45484973 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 45485591 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 45486127 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 45486187 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 45486212 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 45486304 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 45486341 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 45486349 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45486633 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45486992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45487346 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45487617 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 45487641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45488898 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 45489220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45490098 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 45490195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45490231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45490244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45490262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45490296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45490350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45490362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45490567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45491182 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 45491390 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 45491697 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 45492747 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 45493592 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45493770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45493804 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 45493884 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 45493919 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 45493966 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 45494024 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 45494400 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 45494432 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45494541 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 45494562 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 45494569 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 45494583 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 45494660 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 45495050 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45495141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45495151 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 45495231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45495314 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45495447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45495520 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 45495615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45495679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45496024 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45496423 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45496462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45496589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45496606 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45496690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45496753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45496934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45497055 G C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 45497114 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 45497161 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 45497862 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45497863 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45498034 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 45498196 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 45498324 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 45498336 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 45498793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45498990 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45499011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45499104 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45499125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45499272 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45499366 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45499397 T G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 45499432 C G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 45499549 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 45499712 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45499724 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45499772 T A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45499795 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45499813 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 45499891 G T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 45500149 C G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 45500168 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 45500173 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45500184 A C Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 45500287 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45500325 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45500326 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45500444 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45500475 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45500526 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45500725 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45500753 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45500826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45500874 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45500885 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45500932 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45500937 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45500962 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45500986 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45501005 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45501065 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45501124 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45501210 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45501489 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45501495 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45501528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45501543 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45501551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45501601 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45501615 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45501702 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45501858 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45501866 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45501892 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45501905 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45501986 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45502040 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45502087 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45502140 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45502166 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45502581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45502859 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 45502871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45502948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45503224 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 45503273 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45503491 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45503523 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45503596 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45503624 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45503632 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45503713 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45503906 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45503937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45503967 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45504022 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45504043 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45504143 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45504158 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45504351 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45504355 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45504665 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45504670 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45505187 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 45505299 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 45505389 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 45505586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45505888 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45506614 G C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 45506617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45506720 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 45506752 G C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 45506777 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 45506800 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45506836 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 45507173 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 45507179 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 45507355 A T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 45508044 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 45508285 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 45508289 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45508440 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45508538 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45508549 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 45508611 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 45508651 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 45508653 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 45508711 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45508765 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45508878 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45508928 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45509043 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 45509246 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45509283 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 45509561 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45509566 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 45510464 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 45510718 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45512797 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45512894 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45512975 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 45513003 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45513014 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 45513071 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45513105 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45513112 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 45513126 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 45513350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45513376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45513504 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45513537 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45513577 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45513743 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45513854 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 45514476 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 45514803 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 45514903 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 45514933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45515174 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 45515569 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 45515606 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45515924 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45516174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45516806 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 45516967 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 45517119 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45517167 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45517305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45517347 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 45517962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45519023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45521249 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 45521281 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45521675 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 45521729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45521920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45522124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45522408 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45522523 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 45522550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45522711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45523452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45523572 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 45523688 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45523802 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 45524086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45524484 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 45525955 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45526316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45528727 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45529133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45529297 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45530097 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 45530389 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 45530741 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45530943 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 45531498 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 45531537 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 45531560 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45531648 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 45531806 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 45531999 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 45532141 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 45532531 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45533039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45533050 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 45533065 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45533126 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 45533130 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 45533183 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 45533187 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 45533241 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 45533311 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 45533351 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45533383 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 45533618 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 45533945 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 45533959 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 45535367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45535861 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45540362 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45541570 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45543310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45543768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45544126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45544776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45545214 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 45545502 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45546071 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 2 45546896 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 45546900 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 45547000 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 45547011 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45547259 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 45547305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45547336 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 45547363 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 45547510 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45547655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45547681 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45547827 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45547885 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45547998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45548035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45548055 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 45548206 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45548361 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45548365 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 45548516 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45548587 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 45549022 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45550864 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45551517 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 45551734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45551867 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45552319 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 45552360 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45552394 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45552400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45552508 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45552548 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45552619 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45552680 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 45552711 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 45553105 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 45553247 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45553411 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 45554783 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45555217 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 45555321 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 45555432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45556538 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45556594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45557083 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45557203 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45557506 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 45558031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45559138 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45559829 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45560572 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45560620 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 45560816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45563039 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 45563775 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 45563904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45564162 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 45566165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45567509 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 45567793 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45567815 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 45568701 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45568705 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45569873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45570135 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45570375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45573174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45573710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45574780 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 45575960 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 45579387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45580776 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45581285 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45583507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45583696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45584556 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 45584865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45586823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45587365 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 45588169 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45588772 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45588855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45589079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45589237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45589246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45589668 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45589674 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 45590057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45590892 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45591934 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45591936 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45592478 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45593042 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45594062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45594065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45595012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45595173 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45595386 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 45599369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45600464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45602931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45604424 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 45605095 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 45605737 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45608042 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45610236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45611116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45612573 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 45613976 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45613978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45615154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45619242 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45619392 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 45620800 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45621231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45621980 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45622012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45623766 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 45623865 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 45624122 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45625162 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 45625238 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 45625755 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45626609 T G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 45626651 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 45627298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45628283 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45630622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45630645 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45632524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45633242 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45633832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45633950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45634887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45634934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45636351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45636578 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45637087 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 45637841 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45638051 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45638920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45640234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45640698 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45644614 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 45644709 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45646268 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45646874 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45646885 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45647872 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 45648090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45648412 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45649012 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 45649110 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 45649481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45649809 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45649820 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45650108 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45650901 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45651363 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45653426 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45654136 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 45654335 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45654398 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 45654423 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45654467 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 45654656 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45654756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45654760 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 45655164 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45655230 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 45655334 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 45655709 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45655772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45655802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45655911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45655917 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45655975 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45656003 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45656023 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45656686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45657901 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45658277 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 45658460 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 45658847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45660921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45661158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45661212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45661417 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45661461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45661488 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45661519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45661610 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 45662321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45663098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45664397 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 45664913 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 45664951 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 45664953 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 45666046 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 45666456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45666546 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45666714 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45666909 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45666961 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45667085 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45667148 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45667594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45667964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45668013 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 45668022 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45668029 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 45668970 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45668974 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45669284 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 45669576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45670493 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45670706 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 45671751 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 45672272 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 45672487 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 45672515 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 45672560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45673036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45674485 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45675168 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 45675538 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45675870 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 45676460 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 45676485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45676765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45677138 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 45678065 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 45678989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45679373 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45681087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45682983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45683059 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45683472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45683869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45683932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45683950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45685344 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 45687633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45687859 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 45688054 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 45688277 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 45688435 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45688481 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 45688610 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45688668 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45688705 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 45688877 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 45689581 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 45690063 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 45690179 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 45690223 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45690299 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45691092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45691157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45691226 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 45691336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45691583 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45693135 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45693315 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 45693521 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 45693565 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 45695352 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 45695447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45695709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45696064 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45696079 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45696572 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 45697068 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45697840 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 45697953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45698379 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45698676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45698928 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 45699972 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 45699996 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45700051 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 45700161 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 45700184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45700198 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 45700263 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 45700301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45700471 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 45700738 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 45700848 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 45700927 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 45701083 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 45701095 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 45701284 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 45701342 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 45701367 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 45701555 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 45701585 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 45701676 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 45701738 C T N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 45701985 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 45702110 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 45702148 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 45702154 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 45702333 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 45702383 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 45702672 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 45702676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45702706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45702739 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 45702742 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 45703005 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 45703532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45703569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45703589 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45703590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45703655 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45703681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45703683 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45704333 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 45704550 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 45705570 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45707217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45710152 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45710405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45710435 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45710440 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45710600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45710669 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45710677 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45710702 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45710718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45710757 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45710836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45710888 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 45710967 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 45711038 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 45712550 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 45712717 G C Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 45712786 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 45712972 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 45713458 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 45713622 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 45713680 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 45713845 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 45713864 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 45714763 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 45715088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45717004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45717751 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 45718630 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45718813 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 45720127 A T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 45721474 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45721857 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45724542 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45725044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45726089 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45726191 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 45727180 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45728903 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 45729434 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 45731044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45732906 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 45733288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45733711 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45738711 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 45739439 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45744744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45745430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45746395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45746466 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 45748136 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45748554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45748641 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 45749206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45751696 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45751890 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45752415 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 45752949 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45755512 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45755679 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45756658 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 45759160 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45759477 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 45759594 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 45759949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45760204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45760654 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 45760812 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45761093 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45761277 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45761460 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 45762050 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 45762221 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 45762274 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 45762402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45762465 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 45762951 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 45762956 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 45763208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45763349 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 45763394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45763768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45763799 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45763847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45764064 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 45764809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45764812 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 45764872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45764944 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45765044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45765062 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45765284 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 45765322 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45765427 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 45765525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45765707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45765722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45765792 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45766080 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45766356 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 45766365 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 45766387 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 45766400 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 45766413 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 45766433 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45766462 G T Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 45766506 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 45766587 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45766664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45766742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45766818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45766902 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45766931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45767066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45767129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45767152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45767344 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 45767438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45767503 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45767584 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45767648 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45767820 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45767830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45768152 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45768282 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 45768297 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 45768319 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 45768338 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 45768341 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45768789 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 45768811 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 45769075 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 45769115 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45769984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45770268 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 45770793 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 45771016 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45771422 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 45771462 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 45771494 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 45771554 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 45771646 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45772661 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 45772745 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 45772891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45772897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45772903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45772970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45772994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45773083 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45773210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45773503 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45773540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45773558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45773584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45773601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45773800 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45773882 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45774127 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 45774693 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45775067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45775222 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 45775425 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45775613 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 45776293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45776308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45776427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45776466 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 45776477 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 45776513 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45776610 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 45776641 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 45776868 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 45776950 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45776993 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 45777078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45777202 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45777207 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45777426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45778462 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 45778669 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 45778842 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45779864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45780292 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 45780629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45780631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45780920 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45781392 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 45781449 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 45781452 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 45781540 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 45781546 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 45781569 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 45781570 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 45781916 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 45781943 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 45782250 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 45782283 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 45782309 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 45782384 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 45782499 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 45782780 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 45782788 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 45782806 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 45782843 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 45782882 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 45782910 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 45782947 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 45782963 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 45783069 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 45783165 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 45783212 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45783237 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 45783265 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 45783301 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 45783309 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 45783324 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 45783342 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 45783352 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 45783415 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45783483 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 45783768 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 45783927 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 45783990 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 45783997 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 45784028 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 45784249 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 45784285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45784410 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 45784468 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45785046 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45785067 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45785427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45785606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45786871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45787172 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 45787413 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 45787605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45787730 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 45788126 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45788231 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45788577 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 45795611 T C Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 45795612 G A Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 45795630 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 45795942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45796165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45796229 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 45796578 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45797529 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45797653 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45797899 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 45797910 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 45797936 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45797971 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 45798022 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 45798175 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 45798182 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 45798387 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 45798572 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 45799068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45799170 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45799276 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 45799471 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45799525 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45799554 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45799810 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45799904 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 45799978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45800033 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45800118 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 45800126 C A Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 45800191 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 45800201 A T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 45800206 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45800316 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 45800373 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45800413 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45800436 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45800500 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45800601 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45800677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45800689 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45800724 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45800732 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45800823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45800927 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45800942 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 45800946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45801874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45801917 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45802222 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 45802231 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45802306 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 45802484 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 45802520 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45802599 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 45802680 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45802735 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45802821 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45802842 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 45803030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45803093 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45803217 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45803268 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45803315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45803440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45803846 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45803938 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45804166 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45804391 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45804935 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45805161 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45805340 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45806386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45806660 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 45807532 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 45807907 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 45808205 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 45808257 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 45808260 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 45808320 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45808357 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 45808467 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 45808507 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 45808699 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 45808736 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 45808768 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 45808806 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45808808 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45808900 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45809187 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45809191 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45809370 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45809514 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45809566 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45809567 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45809578 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45809597 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45809701 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45809763 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 45809899 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 45809905 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 45810137 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 45810162 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45812330 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45814532 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45814842 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45815576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45817732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45819045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45820184 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45820483 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45820652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45822519 T C Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 45822641 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45822956 A T N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 45823417 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45823461 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45826214 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 45827559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45828501 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 45828858 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45832204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45832728 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45836769 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45837553 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 45841711 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45842447 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 45843387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45850116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45854264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45854269 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45855535 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45855712 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45855857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45856155 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45857284 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45859042 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45862602 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45863990 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45864232 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 45865455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45866213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45867733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45870805 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45872953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45874397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45875404 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45875576 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45875928 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 45876174 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 45876426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45876548 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45876722 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45877728 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 45878199 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 45878292 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 45878874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45879021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45879641 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45880498 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 45880577 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 45880766 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45880879 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45881001 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 45881083 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45881183 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 45881186 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45881263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45881281 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45881470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45881709 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 45882471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45882532 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 45882570 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 45882575 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 45883458 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 45884625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45886179 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45887100 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 45887515 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45887824 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45888360 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45888605 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45889171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45889835 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45891023 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45892899 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45893848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45894313 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45894359 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45894793 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 45895524 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 45895544 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 45895673 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 45896685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45898881 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45900816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45900966 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45901017 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45901377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45903428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45904270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45906239 A C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 45906729 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45907563 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45907575 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 45909196 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 45909953 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 45911894 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45912748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45913202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45913520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45916500 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45917012 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45917643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45918011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45918346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45919987 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45921053 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 45921204 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 45921459 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 45921543 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 45922566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45922808 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 45922921 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45922935 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 45923581 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 45923656 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 45923760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45923762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45924061 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45924842 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 45924939 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 45925105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45925472 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45925579 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45925748 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 45925786 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45926013 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 45926114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45926841 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 45927010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45927404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45928149 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45928309 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 45928869 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45929297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45929345 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45929829 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 45929881 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45931288 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45931475 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45931998 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45932536 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 45933233 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 45933360 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 45933430 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 45933960 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45934247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45934633 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 45934732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45934792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45934819 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45934871 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 45935187 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45935652 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 45936775 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 45937642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45938023 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 45939266 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 45939548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45939765 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 45942312 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45942332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45942387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45943340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45943405 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 45944548 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45946902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45947522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45947872 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45950929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45951399 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45951777 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45952655 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 45954868 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45956273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45956327 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45956834 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45957271 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45957672 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 45957702 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 45958721 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 45959367 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45959500 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 45959520 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 45959592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45959652 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45959682 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45959745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45959764 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 45959773 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 45959799 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45959834 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45959886 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 45959971 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 45960389 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 45960475 C G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 45960734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45960759 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45960794 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45960866 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 45960905 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 45960927 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 45960940 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 45961115 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45961172 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45961357 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45961523 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45961710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45961773 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45961790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45962239 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45962260 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 45962456 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45962545 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45963623 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45964050 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 45964079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45965138 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45965200 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45965219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45966146 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45966553 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45966639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45967525 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45968541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45968836 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45969567 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45971157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45972573 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45973180 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45973248 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 45973468 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45974835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45975514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45975733 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45976328 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45976337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45976838 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45976905 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45978477 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45978533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45980194 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45980691 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45980903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45980986 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45981903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45981923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45982082 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45982829 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 45982856 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45982884 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45983125 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45983182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45983244 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 45983259 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45983394 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 45983415 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45983459 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 45983548 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 45983610 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45983645 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 45983691 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45983699 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45983769 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45983772 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45983788 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45983893 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45983897 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45983977 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 45984031 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 45984034 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 45984052 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 45984060 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 45984085 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 45984128 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45984279 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 45984314 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 45984334 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 45984347 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45984432 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 45984467 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45984520 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 45984610 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 45984624 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 45984635 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45984664 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45984679 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 45984772 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 45984871 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 45984968 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45984999 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 45985067 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 45985093 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 45985119 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 45985172 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 45985251 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45985276 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 45985468 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 45985679 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45985789 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 45985867 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 45985999 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45987172 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 45987195 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 45987231 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 45987425 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45988610 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 45989270 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 45989661 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45989680 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 45990075 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 45990636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45990757 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45991049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45991319 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45991594 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45991732 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45991791 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45991848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45991849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45991861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45992137 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45992360 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 45992622 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 45992730 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 45992822 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 45992968 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45993036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45993052 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45994152 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 45994262 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45994313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45994317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45994333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45994347 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45994533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45995697 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 45997348 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45997591 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 45997773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45997829 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 45997841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45997942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45997975 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 45998146 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 45998220 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 45998380 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45998390 C G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 45998563 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 45998583 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 45998607 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 45998670 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 45998709 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 45998812 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 45998915 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 45998981 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45999229 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.0666666666666667 0.8 0.133333333333333 14 16 1 12 2 2 45999277 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 45999381 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 45999500 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 45999514 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 45999708 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 45999777 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45999792 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45999799 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 45999886 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 45999920 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 45999940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 45999963 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 45999964 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46000030 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46000069 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 46000154 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46000293 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46000305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46000328 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46000452 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 46000573 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46001057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46001065 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 46001501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46001528 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46001663 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46001701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46001816 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46001915 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46002564 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 46002699 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 46002712 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 46002749 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 46002757 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 46003302 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 46003684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46004149 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46004879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46005233 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46005580 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 46006446 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 46006872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46007849 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 46008085 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46008563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46008853 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 46010222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46010399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46010510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46011411 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46012827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46014591 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46014913 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46015471 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 46016317 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46018540 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46019110 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46019755 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46019793 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46020080 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46020570 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46020958 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46021085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46021149 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 46021248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46021266 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46021394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46021422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46021586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46021836 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 46021855 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 46022197 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46022203 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46022401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46022433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46022664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46023834 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46024036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46024464 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46025215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46025445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46027042 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 46028733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46029845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46030147 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 46033266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46033376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46036350 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46036543 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46037125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46037667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46039001 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46039033 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46039877 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 46040163 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46040994 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46041379 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46041850 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46043526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46043682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46043751 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 46044152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46044618 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 46044620 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 46045097 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 46047808 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 46049464 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46049807 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46050062 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46050694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46051336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46051785 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46051880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46051886 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 46052162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46052241 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46052413 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46052834 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 46053019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46053882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46054175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46054279 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46054341 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 46054665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46054901 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 46054968 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46056296 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46056603 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46056940 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46057371 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 46057486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46057661 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 46058307 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46059757 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 46059775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46059911 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46060282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46061445 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 46062514 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46064822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46066392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46066930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46068132 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 46069020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46069126 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46069184 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46069259 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46069281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46069532 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46069552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46069559 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46069607 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46069616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46069705 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46069753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46069766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46069840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46069850 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46069853 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46069982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070148 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46070164 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46070253 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070298 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070455 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070496 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46070567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070598 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070791 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070877 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46070941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46071038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46071182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46071211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46071241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46071288 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 46071351 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46071468 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 46071481 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46071566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46071597 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46071702 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46071747 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 46071766 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 46071777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46071786 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46071806 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46071855 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46071868 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46071968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46072424 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 46072428 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46072489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46072578 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46072642 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46072675 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 46072676 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 46072729 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46072862 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46072879 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46073028 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 46073034 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 46074455 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 46075656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46078230 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46079161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46079274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46079445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46079489 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46080239 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46083140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46083477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46083901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46086022 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46086547 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46087461 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 46089112 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46090355 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 46090763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46090814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46090994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46091944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46092308 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46092457 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46092520 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46092727 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46093381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46093995 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46094209 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46094514 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 46095558 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46095924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46096389 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 46096649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46096719 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46096887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46096888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46097911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46099408 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 46099831 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46100004 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 46100099 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46100772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46101106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46101148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46102487 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46103793 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 46105125 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46105298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46105956 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 46107297 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 46109200 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 46109258 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 46109285 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46110147 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46110488 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46110524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46110599 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46110819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46111726 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 46111763 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46112039 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 46112102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46112132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46112529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46113234 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46115911 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 46117347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46117896 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46118225 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 46118554 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 46128842 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46129866 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46130525 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 46130877 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 46131199 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 46131342 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46131921 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 46132284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46132577 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46133434 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 46133625 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46133792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46134279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46134281 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46134352 T C Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 46134611 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 46134620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46134831 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46134999 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46135901 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46136221 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 46136494 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46136827 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46137057 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46138112 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 46138136 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46138189 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 46138633 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 46139968 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46140054 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46140207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46140724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46140787 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 46141457 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 46142664 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46144129 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46144848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46144962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46145507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46146196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46153592 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46154564 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46154655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46155075 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 46156493 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 46156992 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 2 46157264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46157422 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46157714 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46157849 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46161900 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46162827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46168363 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46168949 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46169568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46169719 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46169824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46173089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46174743 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46175843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46175924 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46176516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46177175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46177774 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 46178210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46178639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46179306 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46179871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46179886 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 46181434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46185135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46185216 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 46187490 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46187683 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 46188185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46188438 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 46188536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46189522 A C Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 46189667 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46190207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46190258 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 46190660 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46190882 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 46191002 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 46191033 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 46191316 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 46191540 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 46191674 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 46191727 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 46192064 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 46192254 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 46192674 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 46193565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46193672 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46193929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46194280 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46195921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46204178 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 46204196 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46204340 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46204387 C G N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 46204441 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46204450 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46204680 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 46204993 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46205560 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46206502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46206690 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 46206723 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 46206799 C A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 46206862 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46206879 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46207080 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 46207311 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 46207505 A G Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 46207538 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46207543 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46207923 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46208540 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 2 46209034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46209361 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46209579 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 46209603 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46209627 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 46209656 C A Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 46210100 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 46210213 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46210626 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46211582 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46212399 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46212827 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 46212855 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 46212923 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46213050 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46214004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46214063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46214119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46214421 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 46214621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46214962 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 46215038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46215201 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46215688 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 46215700 G T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 46215829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46215860 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 46216227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46216598 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 46216638 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 46216715 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46216793 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 46217250 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 46217790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46217991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46218191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46218674 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46218819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46218955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46218961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46219195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46219313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46219372 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46219413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46219671 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46219934 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 46220444 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 46220583 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 46222348 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 46223090 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 46224101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46224639 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46224863 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 46225375 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 46225516 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 46226888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46227335 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 46227719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46227806 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 46227883 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 46227978 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46228002 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 46228038 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 46229110 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 46229430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46230212 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46230310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46232002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46233789 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46235172 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 46235797 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 46235801 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 46235935 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 46236271 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 46236450 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 46236860 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46237088 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 46237105 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 46237148 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 46244717 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 46245250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46246314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46246354 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 46246483 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 46246529 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46246638 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 46246676 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 46246705 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 46246972 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 46247143 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 46247319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46247369 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 46247460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46248380 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 46248383 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46249164 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46251309 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 46251593 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46254274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46254795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46254819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46257356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46257392 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46257561 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46258553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46260379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46261939 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 46262452 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 46263700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46264068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46264223 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 46264325 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 46264654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46264861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46265369 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46265684 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46266137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46266357 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 46266430 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46267910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46268639 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46268952 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 46269826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46270058 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 46270096 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46270442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46270815 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 46270901 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46270947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46272333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46272384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46272960 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 46272976 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 46273235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46273315 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 46274550 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46275167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46276708 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 46276801 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 46277938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46278871 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46279194 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 46284686 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46284732 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46285330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46285341 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 46286027 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 46287183 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 46288150 C G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 46288351 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 46288901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46289463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46289700 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46290273 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 46290894 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46291333 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 46291949 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46293012 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46293031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46293036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46293493 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46294265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46294571 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46294637 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46294868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46294926 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46295634 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 46295772 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 46295822 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 46296458 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 46296477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46296481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46296489 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 46296495 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 46296557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46296568 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 46296636 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 46296720 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 46296767 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 46296810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46297161 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 46297683 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 46298032 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 46298470 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46298908 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46299362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46300778 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 46300976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46301483 A T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 46301787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46301840 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 46301907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46302077 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 46302557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46302819 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 46302877 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 46303481 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46303487 T A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 46303904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46304100 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 46304136 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 46304780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46304857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46304968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46304973 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 46305063 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46305284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46307518 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46308543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46309672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46309883 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46310144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46310229 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46310383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46310402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46310561 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46310795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46311140 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46311683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46311738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46311872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46312216 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 46312450 A C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 46312467 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46312485 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 46312621 T G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 46312706 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46312915 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46313319 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 46313378 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46313379 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46314013 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46314252 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46314435 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46314580 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46314619 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46314732 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 46314845 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 46315228 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 46315305 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 46315399 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46315522 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46315786 A T Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 46316229 T C Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 46316248 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 46316480 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46316795 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46316796 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46316840 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46316900 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46317111 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46317669 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 46317691 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 46317737 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 46317834 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 46318050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46318073 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 46318219 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 46318288 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 46318400 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46318479 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 46318499 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 46318560 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 46318578 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 46318579 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 46318747 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 46318773 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 46318950 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 46319381 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 46319383 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46319453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46319482 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 46319531 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46319781 G C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 46319833 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 46319852 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46319882 C G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 46319913 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 46320128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46320144 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 46320399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46320502 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 46320524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46320551 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 46320646 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 46320673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46321405 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46321454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46321643 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 46321944 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 46322179 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46322944 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 46323344 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 46324091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46324257 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46324370 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46324921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46325112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46325573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46325667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46326261 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46327024 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46327043 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 46327169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46327201 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 46327269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46327451 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 46327537 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 46327688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46327814 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46327836 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46327881 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 46327918 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46327939 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 46328005 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 46328062 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 46328109 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 46328276 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 46328380 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 46328442 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 46328967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46329035 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 46329203 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46329241 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46329679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46329951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46329962 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 46330188 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46330377 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 46330390 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 46330407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46330711 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 46330759 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46330870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46330972 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 46331715 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 46331764 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 46331821 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 46331837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46331886 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 46332017 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 46332023 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 46332071 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 46332101 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 46332189 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 46332250 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46332304 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46332549 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 46332751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46332938 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 46333030 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 46333064 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46333079 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 46333091 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 46333113 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 46333392 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46333512 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46333529 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46333558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46333603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46333626 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46333790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46333833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46333853 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 46333948 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46334054 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 46334089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46334152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46334229 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 46334919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46334973 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46334984 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46335306 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 46335936 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46336140 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46336180 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46336711 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 46336970 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 46336989 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 46337032 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46337033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46337065 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 46337332 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46337375 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46337395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46337434 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46337457 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 46337468 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 46337635 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 46337653 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 46337686 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 46337712 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 46337741 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 46337940 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 46338215 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46338249 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46338273 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46338287 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46338310 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46338425 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46338516 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46338517 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46338586 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46338588 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46338751 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46338760 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46338767 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46338830 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 46338916 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 46339072 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46339234 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46339545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46339843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46339971 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 46340859 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46340923 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46340975 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46341107 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 46341402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46341482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46341515 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46341539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46341651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46341703 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46341788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46341924 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46341928 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46341954 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 46341956 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 46342137 C A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 46342293 A C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 46342444 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46342721 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 46342789 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46342980 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 46343267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46343292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46343385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46343432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46343489 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46343712 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46343942 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 46343978 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 46343983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46344073 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 46344115 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 46344126 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46344221 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46344254 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 46344335 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46344945 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46345027 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46345153 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46345181 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 46345341 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46346982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46347035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46347144 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46347148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46347329 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 46349076 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 46349104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46349189 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46349941 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46349952 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46349981 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46350094 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46350131 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 46350403 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 46351310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46351511 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46352646 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46353061 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46353427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46354332 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 46354406 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46354492 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46354580 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 46354696 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46354814 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46354867 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46354966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46355069 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46355218 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46355418 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46355458 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46355539 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46355566 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46355791 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46355907 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 46356166 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46356276 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46356493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46356584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46356664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46356680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46356799 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46357184 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46357308 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46357601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46358534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46358801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46359268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46359361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46360173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46360296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46360661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46361034 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46361257 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46361669 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46362825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46363142 T A N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 46364637 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46365153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46365501 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46365760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46366100 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46367244 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46369071 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46369685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46370488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46371495 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46373419 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46373563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46373998 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46374117 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46376047 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 46377186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46377659 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46377789 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 46378017 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 46378129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46378184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46378193 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46378199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46378446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46378760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46379359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46379362 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46380781 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 46381753 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 46382435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46389488 T A Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 46391995 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46392998 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46393728 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 46393860 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46393863 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 46394656 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46397044 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46397067 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 46397078 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 46397201 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46398106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46398617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46398983 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 46399105 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 46400004 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46400015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46400030 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46400071 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46400109 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46400116 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46400195 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46400301 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46400317 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46400321 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46400331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46400346 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46400680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46400688 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46400803 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46401096 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46401125 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46401160 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46401237 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 46402004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46402404 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46402435 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46402484 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46402501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46402681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46402703 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46402982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46403673 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46404507 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46405181 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46405275 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46407144 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46407488 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46408700 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46409542 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46409597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46410664 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46410716 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46412818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46413506 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46413520 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 46414509 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 46414510 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 46414854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46414922 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 46415235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46415421 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 46415669 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46415859 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 46416068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46416119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46417440 T A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 46417880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46418126 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46418295 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46418355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46418658 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46418787 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 46418946 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46419359 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46419409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46419504 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46419519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46419581 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46419685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46419689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46419773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46419853 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46419925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46419951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46420074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46420080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46420175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46420194 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46420216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46420349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46420488 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46420528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46420596 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46420602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46420696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46420794 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46420874 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46421059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46421385 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46422006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46422087 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46422208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46422345 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46422425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46422482 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46422819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46422821 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46422980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46423262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46423326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46423720 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46423849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46423878 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46423879 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46423889 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46424412 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46424556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46424612 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46424618 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46424635 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46425330 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46426084 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46426677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46427869 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46428495 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46428578 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 46429630 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46436045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46436059 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46436243 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46436403 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46436459 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46436630 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46437069 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46438163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46439597 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46440361 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46440633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46440881 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46441782 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46442995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46443427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46445601 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46446116 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46446371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46447084 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46447342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46447424 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46448045 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46449354 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 46449873 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46452607 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46455830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46458280 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46458525 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46459381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46461832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46462973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46463345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46463617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46463931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46464332 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46464646 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46465203 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46465216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46465430 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46465455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46468016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46468143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46468233 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46469005 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 46469283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46469636 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 46470066 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 46471502 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46471788 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46472040 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46472056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46472088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46472180 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 46472595 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46472826 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46473839 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46473941 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 46474094 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46474097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46474210 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46474610 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 46474658 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46474754 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 46474789 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 46475080 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 46475210 C A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 46475259 C A N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 46475282 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 46475441 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 46475448 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 46475512 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 46475600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46475772 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 46475886 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 46476084 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46477221 A G N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 46478740 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46479665 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 46479770 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 46479885 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46479907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46479917 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 46480011 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 46480398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46480548 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46480803 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46480817 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46481028 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46481071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46481209 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46481690 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46482007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46482320 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 46482324 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46482547 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 46482601 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46482619 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 46482648 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 46482660 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 46482689 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46483129 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 46483288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46483760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46483768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46484352 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 46484681 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 46484824 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46484930 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 46485051 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 46485055 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46485182 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46485509 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 46485543 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 46485561 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 46485618 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46485655 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46485675 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46485799 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 46485807 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46485814 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46485855 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46486079 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 46486080 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 46486108 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 46486115 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 46486128 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46486164 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 46486379 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46486410 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46486428 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46486499 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46486553 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46486558 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 46486597 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 46486734 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 46486751 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46486767 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46486858 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 46486909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46486946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46487084 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 46487137 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 46487157 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 46487361 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 46487419 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 46487564 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46487591 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46487672 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 46487696 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 46487700 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46487780 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 46487837 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 2 46487838 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 2 46487855 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 46488133 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46488141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46488263 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 46497062 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46497930 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46500277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46507087 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 46507954 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 46508835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46509129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46509668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46509878 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46511264 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46511537 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46512036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46513510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46516198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46517982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46518737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46518789 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46519298 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46526740 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46527436 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46533052 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 46533903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46534940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46537166 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 46537850 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46537909 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46537911 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46538003 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46538230 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46538243 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46538244 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46538386 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46538399 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 46538428 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46538436 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46538514 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46538530 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46538555 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46538563 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46538610 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46538664 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46538739 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46538805 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46538834 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46538964 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46539069 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46539107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46539139 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 46539158 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46539167 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 46539188 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46539225 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46539236 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46539325 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46539332 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46539341 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46539400 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 46539418 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46539430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46539461 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46539510 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46539531 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46539553 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46539592 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46547207 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46547227 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46547306 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 46547497 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46547516 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46547524 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46547534 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46547567 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46547569 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46547645 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46547859 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46547873 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 46547944 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46548004 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46548082 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46548096 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46548133 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46548227 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46548452 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46548741 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46548859 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 46549082 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46549173 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 46549202 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 46549217 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 46549235 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 46549249 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46549610 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46549695 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46549757 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 46549834 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46549879 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46549920 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46550611 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46550920 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 46551083 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 46551342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46551410 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 46551428 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 46551756 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46554861 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 46555287 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46555365 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46555386 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46555614 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46555968 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46556015 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46556274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46556510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46556519 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46556642 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 46556932 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46557233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46557366 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 46557406 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 46557410 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 46557533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46557646 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46557661 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46557703 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46557768 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46557932 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46557958 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46558091 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46558118 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46558132 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46558301 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 46558338 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 46558351 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46558390 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 46558502 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 46558725 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46558867 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46558874 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 46558932 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46558955 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 46559110 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46559170 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 46559385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46559397 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 46559955 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 46560073 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46560187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46560316 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 46560328 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 46560383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46560456 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46560719 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46560822 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 46561091 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 46561242 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46561561 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46561571 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46561902 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 46561921 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46562054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46562093 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46562410 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46562783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46562965 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46563014 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46563942 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 46564387 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 46564607 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 46564650 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46564772 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 46564931 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 46564951 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 46564983 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 46565013 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46565097 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 46565123 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 46565223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46565226 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46565421 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46565578 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46565595 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46565638 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 46565642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46565704 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46565721 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 46565786 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46565798 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 46565918 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 46565982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46566326 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 46566614 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46566618 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46566686 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 46566751 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46566768 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46566856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46567007 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46567143 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 46567298 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46567358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46567362 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 46567369 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 46567635 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46567662 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46567787 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46567839 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 46568050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46568068 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46568088 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46568115 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46568118 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46568142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46568162 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46568459 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46568467 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46568656 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46568671 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 46568707 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 46568829 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46568895 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 46568958 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 46569035 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46569112 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46569120 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46569137 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46569237 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46569251 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46569287 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46569382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46569440 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46569578 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46569645 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46569713 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46569716 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46569768 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46569832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46569854 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46569855 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46569899 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46569943 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46569977 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 46570082 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 46570167 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46570217 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46570406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46570426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46570529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46570633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46570744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46570747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46570829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46570945 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46571009 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46571054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46571082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46571111 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46571360 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46571368 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46571402 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46571451 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 46571544 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46571597 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46571731 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 46571928 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46571937 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46571953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46572015 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46572016 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46572076 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46572118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46572289 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46572295 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46572317 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46572398 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 46572482 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 46572490 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46572502 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46572516 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46572528 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 46572550 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 46572599 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 46572715 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 46572744 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 46572872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46573436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46573604 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 46573752 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46574018 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46574347 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46574693 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 46574707 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 46574825 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46574866 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46574909 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46575001 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 46575083 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575094 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575168 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575205 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575237 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575258 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575313 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575317 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575377 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46575515 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575533 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575603 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575621 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46575668 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46575741 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 46575804 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 46575921 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 46576032 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46576234 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46576298 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46576320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46576462 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46576489 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46576499 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46576601 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46576618 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46576628 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46576702 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46576746 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 46576761 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46576841 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 46576977 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 46577033 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 46577039 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 46577103 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 46577115 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46577209 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46577257 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46577430 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46577700 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 46577730 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 46578030 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46578096 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 46578265 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 46578281 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 46578313 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 46578361 T G Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 46578460 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46578763 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46578793 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46586283 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 46586412 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46586555 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46586587 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 46586619 A C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 46587167 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46587352 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 46587608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46587876 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46587913 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46588777 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46590430 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 46590449 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46590583 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46591003 G A Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 46591135 T C Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 46591394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46591994 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46592066 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46592106 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 46592150 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 46592548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46592960 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 46593021 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46593289 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 46593382 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46593801 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 46593882 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46593965 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46594309 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46594697 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46594790 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 46594824 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 46595078 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 46595103 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 46595143 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 46595164 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 46595526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46595534 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46595538 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46595570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46595592 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46595676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46596120 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46596128 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46596840 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46596884 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46597000 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 46597035 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 46597526 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46597641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46597773 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 46597798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46598188 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46598468 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46598583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46599088 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 46599122 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 46599138 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46599175 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46599350 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46599367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46599491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46599595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46599705 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46599986 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 46600206 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 46600244 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 46600268 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 46600312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46600491 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 46600507 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 46600514 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 46600551 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 46600573 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46601287 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46601305 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46601327 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46601419 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46601680 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46601681 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46601760 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 46602210 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46602246 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46602367 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46602667 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 46602687 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 46602786 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 46602839 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 46602889 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 46602965 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 46603229 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 46603242 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46603256 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46603345 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 46603375 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 46603585 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 46603591 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 46603795 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 46603832 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 46604021 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 46604072 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 46604122 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46604167 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46604748 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46604888 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46604986 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 46605216 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46605526 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46605616 C A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 46605722 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 46606061 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46606160 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 46606181 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 46606231 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46606295 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 46606549 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46606550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46606607 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 46606619 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46606732 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46606779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46606871 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 46606875 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46606884 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46606919 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46607076 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46607083 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46607098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46607271 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46607278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46607308 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46607319 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46607382 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46607421 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46607487 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46607526 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46607530 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46607544 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46607780 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46607781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46607801 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46607869 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 46607928 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46608195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46608255 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46608333 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46608348 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46608564 T A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 46608565 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 46608791 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 46608931 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 46609089 T A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 46609115 G T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 46609207 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 46609261 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 46609321 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 46609399 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46609418 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46609532 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 46609535 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46609546 G T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 46609619 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46609627 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 46609674 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46609708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46609724 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46609760 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46609914 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 46609927 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 46609936 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 46609991 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 46610005 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46610008 T G Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 46610074 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 46610083 C A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 46610123 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46610189 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46610284 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 46610293 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 46610389 A T Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 46610704 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 46610765 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 46610788 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46610826 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46610848 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46610852 C G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46610873 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 46610992 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46611002 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46611021 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46611033 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46611238 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46611290 A C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 46611338 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 46611461 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46611555 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 46611577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46611887 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46611964 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46611966 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46612004 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46612056 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 46612104 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46612140 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46612230 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 46612345 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 46612380 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46612667 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46613272 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 46613275 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 46613869 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46613883 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46614011 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46614094 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 46614136 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 46614141 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 46614168 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 46614219 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 46614268 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 46614294 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46614313 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46614317 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46614324 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46614347 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46614354 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 46614908 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46615155 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46615163 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46615170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46615186 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46615286 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46615311 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 46615402 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46615418 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46615559 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46616332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46616350 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46616568 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 46616598 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 46616603 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 46617406 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46619034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46619272 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 46619760 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46620346 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46622450 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46622782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46625247 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 46625653 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46626067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46626236 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 46626257 A T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 46627098 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 46627201 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 46627219 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 46627248 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 46627493 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 46627771 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46628176 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46628851 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46628900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46628983 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46629159 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 46629183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46629290 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 46629385 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 46629403 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 46631336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46631443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46632172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46632433 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 46634261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46634401 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46634482 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46635504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46635987 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46636401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46636908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46637874 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46638175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46641444 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46644489 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46645392 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46645973 T C Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 46646585 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46648415 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46648684 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46651870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46652392 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46652397 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46652610 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46652695 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 46652756 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46652864 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46652908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46653202 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46653510 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46654903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46655595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46655824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46655989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46656621 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46658450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46660143 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46660693 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46661226 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46661232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46663432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46664918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46665289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46665607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46666816 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46667069 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46669277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46669559 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46669565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46670323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46671091 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 46671255 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46671994 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 46672074 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46672502 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46672777 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46672785 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46672877 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46673855 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46674730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46675247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46675408 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46675867 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 46675947 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46675981 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 46676589 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46676604 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46676665 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46677147 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46677407 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46677541 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46677665 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46677699 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46678315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46678429 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46678565 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 46678639 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46678720 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46678732 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46678827 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46678838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46678989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46679142 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46679181 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46679204 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46679218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46679423 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46679432 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 46680512 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 46680589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46681281 T G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 46684328 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 46684520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46685071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46685313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46685431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46685490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46685641 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46686124 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46687270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46687996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46689525 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46689948 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46690077 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 46690176 C G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 46690921 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 46697383 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46697867 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 46698588 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46698618 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 46698740 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46698747 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 46698884 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46699949 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 46699952 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 46700024 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 46700205 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46700234 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 46700395 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 46700547 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46700610 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 46700731 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 46700755 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46700894 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 46700939 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 46700948 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46701086 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 46701333 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 46701369 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46701534 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 46701863 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46701894 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 46701969 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46702003 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 46702039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46702077 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46702109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46702388 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 46702484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46702510 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46702575 G T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 46702667 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46702705 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46702716 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46702917 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46702945 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46702976 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46703223 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 46703365 A C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 46703598 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46703653 A C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46703680 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 46703911 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 46703964 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 46704494 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46704579 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 46704623 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 46704814 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46705103 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46705328 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46705445 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46705466 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46705470 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46705521 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46705595 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46705678 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46705701 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 46705779 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 46705834 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46706238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46706271 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46706354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46706478 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 46706497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46706556 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46706629 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 46706896 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 46706903 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 46707228 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 46707300 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46707384 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46707494 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 46707604 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 46707727 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 46708059 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46708072 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46708138 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46708197 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46708215 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46708270 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 46708384 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 46708519 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 46708843 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46708973 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46708990 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46709021 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 46709112 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 46711392 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46711732 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46711840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46712657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46713028 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46713451 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46713876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46714290 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46714684 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 46714705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46715160 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46715516 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46715686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46715918 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 46715940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46716006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46716782 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 46716783 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 46717086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46717212 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46717242 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 46717379 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 46717978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46719824 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46719864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46719976 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46720798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46721168 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46722173 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46722246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46722417 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 46722587 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46722606 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46723073 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46723176 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 46723178 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 46723323 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46723705 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 46723777 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 46723947 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 46724454 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46724979 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46725200 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46725653 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 46725654 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46725905 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 46726057 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46727477 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46727610 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46727695 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 46728313 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 46728375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46729175 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46729464 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46729477 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46729733 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46730110 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46730412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46731246 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46731595 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 46732014 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46732294 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46733056 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 46733562 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46733991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46734096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46734145 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46734399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46734625 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46734756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46734775 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46736094 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46736100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46736264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46736356 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46736483 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 46736544 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46737017 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46737029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46737032 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46737114 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46737196 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46737210 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46737313 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46737338 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46737377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46737395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46737474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46737588 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46737607 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46737685 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46737695 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46737710 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46737739 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46737758 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46737766 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46737774 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46737863 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46737918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46737952 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46738152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46738176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46738239 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46738289 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46738358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46738412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46738449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46738510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46738531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46738544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46738578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46738797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46738843 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46738988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46739013 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46739139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46739195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46739254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46739267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46739341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46739428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46739469 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46739556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46739582 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46739869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46739984 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 46740048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46740274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46740285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46740465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46740612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46740711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46740715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46740816 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46740879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46741386 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46741570 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 46741638 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46741646 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 46741701 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46741833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46742018 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 46742045 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 46742106 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46742235 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46742495 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46742507 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 46742578 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 46742591 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 46742775 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46742788 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46742832 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46742875 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46743036 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46743141 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46743152 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46743171 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46743194 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46743210 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46743227 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 46743286 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46743295 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46743343 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46743359 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46743391 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46743422 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46743529 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 46743531 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46743561 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46743779 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46743789 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46743830 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46744397 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46744419 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46744422 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46744503 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46744664 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 46744683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46744700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46744837 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46744914 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46744972 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46745869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46745946 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 46745995 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46746200 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46746547 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46746787 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 46747239 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 46747402 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 46748212 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 46748309 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 46748317 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 46748736 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46749167 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 46749597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46749941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46750772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46751542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46752015 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46752452 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46753348 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46753443 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 46753519 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46753616 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 46753778 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46753890 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46753948 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46754281 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46754544 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46754676 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46754761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46754764 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46755162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46755502 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 46756008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46756009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46756378 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46756597 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46756943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46757199 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46757267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46757978 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 46758038 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 46758223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46758298 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 46758633 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 46758902 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 46759150 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46759186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46759204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46759230 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46759325 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 46759642 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 46759698 T G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 46759791 G T Y N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 46759893 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46759977 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 46760042 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 46760051 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46760057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46760591 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46760644 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 46761787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46762527 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46763128 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 46763532 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46764145 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46764745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46765517 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46765535 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46766766 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46767545 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 46769898 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46770366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46771285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46771507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46772381 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 46773056 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 46773300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46774129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46774191 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 46774470 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46775059 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46775087 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46775356 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46775674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46776145 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 46777146 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46777825 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46777885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46778130 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46778321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46778369 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46778683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46779921 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46780553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46780591 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 46780657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46780704 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46780714 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46780732 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 46780742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46780809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46780818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46780832 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46780946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46780951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46780988 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46780993 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46781150 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46781167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46781196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46781256 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46781310 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46781376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46781385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46781388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46781427 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46781618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46781621 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 46781811 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46781882 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46782132 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46782147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46782342 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46782375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46784013 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 46784154 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46784194 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46784227 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46784252 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46784287 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46784336 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46784469 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46784704 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46784760 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46784845 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46784895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46784938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46784945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46784955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46785047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46785051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46785151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46785161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46785222 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46785279 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 46785545 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 46785724 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46785910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46785973 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 46786038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46786046 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 46786172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46786200 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46786203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46786217 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46786270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46786320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46786389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46786414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46786651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46786755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46786919 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 46787275 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 46787333 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46787454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46787504 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 46788176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46788392 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46788452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46788467 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46788716 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46788847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46788852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46788862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46789036 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46789096 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46789162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46789275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46789330 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46789392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46789412 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46789497 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46789521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46789568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46789803 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46789964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46789967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46790217 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46790257 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46790329 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46790499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46790527 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46790657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46790774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46790820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46790823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46790861 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46790869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46790885 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46790900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46790950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46790973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46791013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46791029 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46791077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46791089 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 46791182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46791183 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46791311 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 46791312 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 46791326 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46791427 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46791468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46791591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46791634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46791729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46791732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46791973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46792036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46792056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46792067 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46792111 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46792453 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46792541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46792660 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 46792749 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 46792768 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 46792816 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 46792827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46792941 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 46792948 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 46793144 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46793159 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46793210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46793323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46793521 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46793568 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46793728 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 46794268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46794341 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46794401 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46794485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46794625 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46794737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46794785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46794814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46794956 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46795086 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46795301 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46795624 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 46795772 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46795810 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46795912 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46795945 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46795960 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46795987 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46796010 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46796018 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46796087 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46796091 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46796144 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46796151 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46796935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46797038 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 46797518 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46798263 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46798305 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46799495 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 46799706 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 46800048 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46800205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46800370 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 46800523 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46800543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46800760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46800937 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46801260 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 46801556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46801690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46802316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46802325 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46802423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46802495 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46802571 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46802613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46802837 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46803016 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46803172 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46803224 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46803227 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46803246 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46803256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46803293 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46803412 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46803494 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46803620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46803740 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46803772 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 46803895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46803917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46803930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46803939 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46804058 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46804062 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46804375 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46804579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46804583 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46804703 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46804739 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46804741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46804870 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46804935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46805005 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 46805043 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46805047 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46805088 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46805109 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46805347 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46805372 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46805467 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46805481 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46805501 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46806009 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46806181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46806252 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46806478 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46806716 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46806799 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 46806849 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 46806899 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 46807013 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 46807150 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 46807166 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 46807274 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 46807325 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 2 46807436 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46807440 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 2 46807542 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 46807566 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 46807867 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 46807906 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 46807914 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 46807990 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46808028 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 46808205 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46808292 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46808424 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46808559 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 46808626 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 46809134 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 46809173 G A Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 46809210 G T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 46809213 G T Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 46809232 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46809249 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46809253 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46810682 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 46810684 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 46810759 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 46810774 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46810809 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46810819 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46810838 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46810905 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46810985 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 46811145 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 46811230 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 46811321 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 46811491 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46811501 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46811550 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46811607 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46811737 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46811755 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 46811780 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46811785 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46811875 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46811888 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46811998 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46812061 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46812066 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46812275 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46812277 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 46812293 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 46812354 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 46812375 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 46812395 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 46812507 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 46812559 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 46812566 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 46812642 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46812979 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 46813030 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46813089 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 46813165 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46813745 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46813831 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 46814019 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 46814267 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 46814286 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 46814712 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46815198 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 46815355 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 46815705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46815851 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46816058 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46816170 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 46816185 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46816352 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 46816439 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 46816650 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46816783 G C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 46817146 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 46817190 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 46817603 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 46817626 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 46817720 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46817856 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46817858 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46818095 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 46818184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46818204 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46818240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46818379 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 46818465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46818898 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 46819064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46819075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46819480 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 46819681 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 46819712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46819741 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 46820215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46820288 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46820627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46821245 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46821431 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 46821611 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 46821926 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46822082 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46822149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46822526 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 46823077 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 46823231 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 46823253 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46823292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46823548 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46823575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46823716 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46823738 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46823838 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46823917 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46824162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46824272 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46824356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46824524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46824703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46824742 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46824762 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46824842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46824857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46824939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46824990 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46825108 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46825251 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46825319 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46825340 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46825376 T C N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 2 46825458 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46825481 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46825553 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46825630 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46825631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46825716 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46825842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46825913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46825999 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46826010 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46826026 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46826306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46826448 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46826564 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46826673 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 46826749 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 46826762 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 46826931 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 46826985 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 46827049 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 46827086 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46827168 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 46827305 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46827330 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 46827356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46827484 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46827501 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46827754 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46827765 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46827896 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46827912 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46828017 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46828384 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46828412 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 46828518 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 46828583 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 46828631 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 46828702 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46828736 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 46828869 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 46828902 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 46829246 C T N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 46829273 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 46829404 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 46829874 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46829876 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46830647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46830880 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46830899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46830959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46831317 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46831370 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46831419 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46831489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46831573 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 46831623 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46831744 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46831916 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46831927 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46832104 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46832171 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 46834608 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46834646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46834760 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46835253 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46835324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46835354 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46835457 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46835495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46835496 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46835517 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46835765 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46835847 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46835972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46836041 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46836048 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46836203 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 46836327 C A Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 46836410 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 46836419 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 46836700 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 46836877 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 46836979 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 46837110 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46837176 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46837415 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46837577 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46837595 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46837620 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46837777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46837837 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46837949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46838272 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46838288 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46838470 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46838496 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46839047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46839354 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46839373 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46839408 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46839723 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 46839763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46839797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46839816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46839969 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46840139 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 46840275 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 46840419 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46840932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46840953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46840971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46841424 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46841440 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 46841505 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46841506 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46841519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46841969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46841995 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46842068 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46842151 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46842252 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46842264 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 46842341 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 46842345 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 46842456 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46842611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46842675 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46842676 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46842775 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46843231 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46843280 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46843327 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 46843391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46843640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46844616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46844902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46845451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46845519 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46845921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46845932 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46846143 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46846625 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46846754 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46847494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46847693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46848357 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46850001 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46850086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46850281 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46850551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46850880 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46852504 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46852684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46853035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46853838 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46853850 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46853972 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46854221 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46855397 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46855586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46856908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46857248 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46857672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46858045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46859048 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46859501 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46860993 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46861004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46861042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46861829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46861874 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46862229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46863005 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46863428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46863834 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46863915 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 46864103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46871850 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46872141 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 46880008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46880580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46880785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46880999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46881022 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46882125 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46882425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46883231 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 46884238 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46884630 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46884894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46885569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46885748 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46886426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46886621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46888868 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46889692 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46890885 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 46891120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46892730 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46894758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46896078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46896635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46896773 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46896874 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 46896886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46896892 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 46897174 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 46897212 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 46897593 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 46897625 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46897637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46897681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46898054 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 46898076 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 46898100 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46898357 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46898411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46898421 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46898439 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46898469 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46898489 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46898808 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46898841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46898852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46898868 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46898885 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 46898913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46898998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46899006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46899170 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46899171 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 46899266 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46899295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46899439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46899513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46899525 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46899644 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46899737 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46899801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46899876 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 46899903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46900085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46900179 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 46900319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46900495 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46901152 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46901328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46901389 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46901544 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 46901911 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46902048 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46902113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46902285 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46902565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46902634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46902758 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46902962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46903063 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46903094 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 46903229 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 46903277 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 46903344 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46903412 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46903662 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46903702 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 46903730 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46903928 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 46904227 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 46904383 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46904430 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46904438 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46904539 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46904566 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46904648 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46904722 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46904773 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46904781 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46904902 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 46905385 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 46905500 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46905575 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46905804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46905815 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46905945 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46906055 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46906133 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46906177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46906214 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 46906716 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 46906843 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 46906876 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 46906946 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 46906994 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46907264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46907295 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46907394 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46907486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46907561 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46907687 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46907783 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46908093 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46908173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46908306 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46908374 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46908443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46908678 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46908726 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46908774 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46908806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46909272 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46909282 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 46909447 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 46909628 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46910174 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 46910231 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 46910406 A T Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 2 46910439 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46910534 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46910583 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46910912 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46911025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46911325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46911406 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46911540 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46911846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46911878 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46912270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46912390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46912554 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46912649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46912738 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46913075 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46913090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46913105 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46913153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46913154 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46913304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46913662 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 2 46913773 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46914134 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46914252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46914444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46914806 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46914932 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 46915186 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46915260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46915320 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 46915346 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 46915379 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 46915423 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46915463 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46915650 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46915675 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46915687 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 46915753 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 46915918 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 46915977 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 46916007 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46916159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46916250 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 46916505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46916579 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46916580 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46916651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46916659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46916695 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46916711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46916725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46916734 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46916749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46916858 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46916927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46917105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46917183 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46917193 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46917194 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46917211 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46919004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46919608 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46919738 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46919961 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46920169 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46920594 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46920617 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 46921639 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46922112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46922395 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 46923053 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 46923258 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 46923639 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46923717 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 46923801 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46923807 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46924440 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46924821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46925455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46926374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46926455 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 46926728 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46926951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46927375 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 46927640 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46927907 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46928137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46929014 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46929181 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46930464 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46930649 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 46930821 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46931901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46932367 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 46934015 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 46934236 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46934447 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46935179 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46935262 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46936254 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46936546 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46937892 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46938126 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46938177 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46938263 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46938273 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46938356 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46938728 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46939270 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46940840 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 46941023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46941086 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46941087 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 46941295 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46941358 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 46943411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46943768 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46943794 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 46943873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46943909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46944025 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46944058 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 46944083 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46946936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46947134 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 46947519 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46947965 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46948461 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46948520 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46956404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46956640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46958456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46961464 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 46961657 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46963950 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46965663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46966015 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 46967467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46968110 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 46968770 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46969732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46973089 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46973423 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 46973905 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 46973937 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 46973981 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 46974440 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 46974815 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46975063 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 46976455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 46976494 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 46986603 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46987156 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46987699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46990090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46991236 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 46992303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46992591 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46994504 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 46995690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 46995717 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 46995799 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 46995915 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 46995947 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46997551 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 46999461 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 46999925 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47000466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47002778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47002857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47003191 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47003655 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47004309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47005454 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47005692 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47006482 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47014607 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 47014707 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47014794 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47015252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47015901 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47017271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47017637 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 47019117 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 2 47020132 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47020534 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 47020583 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 47020597 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 47021129 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 47021509 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 47021772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47022004 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 47022091 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 47022468 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47022521 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 47023123 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47023246 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 47023247 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 47023363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47023648 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47023742 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 47023868 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47023978 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 47024147 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 47024153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47024166 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 47024257 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47024285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47024327 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47024351 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 47024367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47024380 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 47024404 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 47024466 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 47024493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47024557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47024795 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 47024883 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 47024913 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47024959 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47024986 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 47025215 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47025657 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 47025738 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 47025798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47025817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47025998 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 47026078 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 47026251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47026271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47026572 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47026637 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 47027196 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47027213 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47027237 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47027380 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47027384 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47027422 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 47027549 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 47027743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47027761 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47027791 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47027828 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47028026 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 47028040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47028044 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 47028059 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47028121 C A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 47028131 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 47028147 C G Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 47028154 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 47028253 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 47028471 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47028513 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47028719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47028791 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47029017 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 47029180 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 47029217 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 47029320 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 47029653 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47029680 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47029696 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 47029709 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 47029799 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47029962 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47029964 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47030037 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47030379 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 47030405 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 47030448 T C N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 47030472 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 47030549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47030616 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47030771 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 47030795 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47030928 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47031076 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47031233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47031380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47031406 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 47031407 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47031483 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 47031512 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47031523 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47031761 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47031887 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47031941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47032049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47032095 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 47032171 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47032235 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47032295 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47032397 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 47032554 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47032580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47032581 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47032613 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 47032661 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47032763 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 47032788 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47032827 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 47033012 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47033024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47033054 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47033182 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47033227 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 47033384 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47033449 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47033500 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47033521 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47033615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47033678 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47033736 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47033806 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47033833 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47033851 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47033874 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47033882 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47034258 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47034373 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47034378 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47034394 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47034637 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 47034722 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 47034726 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47034773 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 47034869 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47035120 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 47035132 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47035522 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47035544 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47035651 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47035762 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 47035795 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47035876 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47035882 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47035915 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47035943 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 47035953 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 47035967 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 47035982 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 47035992 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 47036035 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 47036037 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47036084 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 47036145 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 47036174 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47036227 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47036257 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47036318 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 47036383 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 47036463 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47036464 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47036507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47036510 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 47036560 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 47036565 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 47036616 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 47036651 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47036704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47036799 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47036824 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47036839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47036890 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47036930 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 47037158 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 47037181 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 47037196 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 47037218 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 47037253 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 47037318 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 47037781 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47037810 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 47037898 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 47038114 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 47038357 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 47038627 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47038865 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47039483 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47040291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47040316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47041471 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 47041724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47041725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47041813 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47041892 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47042066 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 47042205 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47042312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47042427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47042445 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47042801 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47042802 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47042868 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 47042987 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 47043010 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47043098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47043191 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 47043394 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 47043562 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47043588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47043842 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47044151 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47044264 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47044590 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 47045045 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47045310 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47046468 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47046789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47046846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47046873 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47046898 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47046943 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 47049062 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 47049078 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 47050051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47055997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47056214 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47057739 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 47058916 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47059128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47059203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47060084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47060112 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47060537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47060645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47061252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47063495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47065311 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47065452 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47067166 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47068228 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47070337 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47071042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47071075 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47071701 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47071835 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47071977 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 47072383 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47072480 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47072617 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47073169 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 47073783 C G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47073941 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47074077 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47075234 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47075270 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47075308 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47075483 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47076900 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 47078279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47080604 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47080668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47080681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47081273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47087261 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 47087566 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47087700 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47088034 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47088947 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47090482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47091396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47093129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47093828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47094159 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47101997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47102190 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47103448 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47105428 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47105459 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 47105725 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 47106196 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47106444 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47107244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47107963 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 47108063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47108597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47108916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47110656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47111409 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47111436 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47112051 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 47112557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47113865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47114625 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47115737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47116909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47118327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47118394 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47119338 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 47121025 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47122003 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 47123428 T A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 47123946 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47124104 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 47124942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47125196 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47125319 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47125832 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 47127670 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47128158 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47128962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47130221 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47130895 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47131473 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47136145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47136715 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47136886 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 47137239 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47137445 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47138263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47138730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47139600 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 47139892 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47140105 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47140387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47141942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47144029 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47144430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47144974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47145136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47145668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47148586 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47153054 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47154586 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 47156472 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47158628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47158630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47158822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47159371 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 47161482 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 47162706 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47163017 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47163151 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47163239 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47163710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47165895 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47165921 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47166365 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47167082 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47167515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47168978 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 47169138 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47169640 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47172702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47174155 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 47174161 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 47174167 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 47174173 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 47174179 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 47174185 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 47174191 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 47175332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47176168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47176353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47176415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47178768 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 47182880 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 47185637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47188388 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 47191877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47192402 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47193217 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 47193445 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 47193535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47194288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47195203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47195520 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 47197209 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47197439 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47198163 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47199080 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47199185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47200130 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47201780 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47201988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47202684 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 47203196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47203477 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 47203796 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47204784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47204943 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47205211 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 47205541 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47206418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47206517 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47206691 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 47209857 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 47210030 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47210079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47210439 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47211201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47211649 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 47212400 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47213699 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47213702 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47213953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47215052 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47215233 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 47215542 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 47215823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47215849 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 47215859 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 47215934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47215961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47216109 T G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 47216134 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 47216160 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 47216197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47216227 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 47216368 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 47216428 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 47216459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47216490 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 47217224 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 47217251 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 47217411 T G Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 47217454 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 47217455 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 47217997 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 47218326 A G Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 47218330 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 47218954 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 47218969 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 47219094 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47219268 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 47219429 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 47219529 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 47219907 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 47220275 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47220292 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 47220300 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 47220313 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 47221179 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47223981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47231118 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47231385 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47237810 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47240154 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 47241473 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 47243022 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 47243047 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 47243232 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 47244199 G C Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 47244216 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47246563 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47248210 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47248636 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 47253486 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47253857 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47254357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47255250 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47256326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47256834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47257399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47257884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47258931 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47259065 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 47259067 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47259922 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47262458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47264719 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 47265509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47265922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47266024 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 47266103 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47268812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47273904 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47274116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47275212 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 47276699 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 47276763 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47277370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47277987 C A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 47278523 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47278582 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 47278749 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 47278851 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47279007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47279938 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 47280457 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47280736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47281126 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47281306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47281653 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 47282024 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 47282331 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47282365 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47282466 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 47282479 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47282812 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 47282827 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 47282853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47283017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47283148 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47283337 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 47283350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47283376 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 47283437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47283614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47283812 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 47283854 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47283911 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47283949 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47284252 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 47284293 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 47284505 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 47284553 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47284698 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47284937 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 47285681 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47286024 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 47286051 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 47286506 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 47286514 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47286532 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 47286536 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 47286548 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47286627 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47286773 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 47286852 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 47287080 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 47287133 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 47287190 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47287320 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47287348 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 47287428 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 47287456 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 47287615 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 47287623 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 47287979 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 47288479 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47288639 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47288697 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 47288717 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 47288901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47288931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47288963 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 47288986 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 47289166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47289433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47289745 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47290145 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47290169 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47290261 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47290277 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 47290298 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47290592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47290772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47291118 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 47291290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47291469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47291573 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47291594 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47291676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47291926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47292365 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47292392 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47292441 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47292667 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 47292929 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47293063 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 47293092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47293831 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 47294750 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 47294934 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47295875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47296121 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47296600 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 47297426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47297595 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 47297689 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 47297705 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 47297722 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 47297767 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 47297860 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 47298131 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 47298221 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 47298530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47298606 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47298965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47299783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47300685 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47301306 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 47301867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47302066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47302101 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47302923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47302935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47303900 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 47304205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47305512 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47305933 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47305972 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47306908 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 47309287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47309507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47310535 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47311117 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 47311192 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47311430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47311720 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47311728 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47311887 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47311913 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47311973 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47313041 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 47313603 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47313908 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 47313998 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47314049 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47314412 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47314515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47314788 A G Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 47314889 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 47315243 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47315318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47315468 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47315728 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47315965 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 47315993 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 47316349 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 47316449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47316814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47318175 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 47319892 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47320377 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47320427 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 47320648 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 47320697 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47321387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47321549 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47321662 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 47322033 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 47322136 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47323019 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 47323156 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47323218 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47323373 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47323377 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47323413 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47323423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47323600 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 47324152 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 47324155 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 47324443 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 47324835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47325429 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 47325515 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 47325811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47326107 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47326529 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 47326865 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 47326956 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 47326957 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47327079 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 47327342 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 47327408 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 47327412 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 47327471 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47327516 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 47327785 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 47329197 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47329248 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47329624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47330090 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47330421 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 47330691 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 47331140 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 47331176 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 47331217 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47331243 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47331440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47331648 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 47332303 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47332370 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 47332699 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 47332827 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47333326 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47333944 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 47333953 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 47334342 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 47335387 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 47335489 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47335657 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 47335827 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 47335902 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 47335985 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47336570 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47337209 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 47337287 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47337493 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 47337822 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 47338001 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 47338238 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 47338434 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 47338577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47338902 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47339458 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47340230 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47340235 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47340665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47340818 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47341137 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 47341335 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47341675 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 47341767 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47342058 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 47342183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47342184 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 47342389 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 47342390 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 47342505 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 47342583 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 47342639 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 47342646 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 47342922 C A N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 47342955 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 47343027 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 47343065 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 47343484 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 47343486 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 47343730 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 47343741 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 47343751 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 47343898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47343922 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 47343976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47344227 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47344335 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 47344523 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 47344550 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 47344595 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 47344664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47344762 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 47344778 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 47344795 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 47344941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47344988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47345027 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 47345109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47345173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47345292 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47345327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47345411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47345435 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47345593 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47345660 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47345692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47345693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47345799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47346029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47346208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47346262 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47346321 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47346461 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47346495 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47346555 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47346596 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47346669 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47346675 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47346700 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47346755 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47346823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47346939 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47346984 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47347059 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47347145 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47347178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47347190 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47347334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47347339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47347354 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47347363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47347423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47347492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47347500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47347518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47347604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47347624 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47347654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47347787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47347826 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47347894 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47347910 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 47347915 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47347927 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47347935 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47347939 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47347948 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 47347955 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47347982 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 47347983 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 47348036 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47349054 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47349271 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47349293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47349389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47349456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47349539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47349560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47349578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47349622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47349653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47349774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47349831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47349930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47350125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47350542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47350662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47350794 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47350908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47350947 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47350975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47351038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47351089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47351095 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47351100 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47351126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47351195 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47351362 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47351385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47351395 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47351465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47351468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47351555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47351569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47351614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47351629 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47351657 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47351776 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 47351803 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47351944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47352031 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47352043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47352088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47352422 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47352480 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 47352555 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47352662 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 47353225 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47353325 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47353358 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47353449 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47353450 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47353973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47354150 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 47354256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47354450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47354607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47354713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47354927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47355037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47355050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47355062 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 47355169 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47355292 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47355773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47356470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47356523 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47357739 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47358007 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47358088 G C Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 47358155 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 47358223 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 47358232 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 47358393 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 47358415 T A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 47359042 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47359532 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47359782 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47359892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47360213 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47360359 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 47360756 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47362640 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 47362892 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47363453 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47363807 C T Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 47363964 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 47363999 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 47364285 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47364447 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 47364458 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47364491 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 47364602 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 47364647 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47365214 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 47365507 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47366065 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 47366117 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47366498 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 47366620 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 47366699 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 47367201 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 47367558 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 47368217 C G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 47368244 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 47368485 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47369489 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47369591 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47370034 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47370292 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 47370450 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47370533 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47370758 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 47370875 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 47370899 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 47370963 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 47371238 A C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 47371623 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 47371633 C T Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 47371748 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 47371935 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47371958 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 47372194 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47372320 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 47372648 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 47372921 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 47373347 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 47373365 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 47373441 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 47373855 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 47374376 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 47374677 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47374827 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47375090 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 47375671 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 47375968 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 47376112 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 47376130 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47376309 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47376580 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 47376702 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47377135 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 47377196 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 47377380 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 47377534 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 47377547 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 47377551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47377644 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47377651 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 47377730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47377857 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 47377909 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47378084 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 47378137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47378166 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 47378257 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 47378496 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 47378555 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47378585 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47378814 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47378919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47380258 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 47380425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47380524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47380590 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47380667 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47380679 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47380830 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 47380858 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47381062 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 47381109 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47381485 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47381938 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 47382440 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47382651 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 47382847 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 47382970 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47383067 T A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 47383098 A C N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 47383133 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47383192 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47383204 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47383245 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47383313 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 47383349 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 47383457 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47383475 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47383530 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47383616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47383656 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47383684 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47383843 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47383939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47384064 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47384122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47384198 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 47384273 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47384356 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47384394 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47384471 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47384472 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47384508 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47384528 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47384541 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47384588 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47384591 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47384615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47384681 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47384746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47385281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47385346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47385379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47385419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47385494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47385530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47385648 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47390917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47390938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47390958 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 47390985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47391043 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47391072 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47391091 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47391100 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47391116 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47391120 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47391148 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47391162 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 47391191 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47391197 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47391228 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47391253 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 47391269 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47391278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47391294 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47391297 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47391317 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 47391399 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47391409 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47391577 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47391588 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47391607 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 47391652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47391664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47391674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47391699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47391729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47391740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47391744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47391773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47391803 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47391820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47391843 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47391859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47391880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47391968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47392057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47392061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47392072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47392123 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47392146 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47392176 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47392197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47392227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47392255 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47392290 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47392312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47392431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47392530 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 47392569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47392570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47392727 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47392757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47392796 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 47392807 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 47392879 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47393000 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 47393417 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47393422 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 47394705 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47394931 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47395970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47396074 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 47396122 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47396285 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47396314 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47396526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47396577 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47396683 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47396697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47396774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47396962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47397029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47397306 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 47397954 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47398107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47398130 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47398174 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47398251 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47399535 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47399801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47401286 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47408778 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47409464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47409746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47410049 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47412033 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47412083 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47412697 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 47413217 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47413271 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47414046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47414150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47415020 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 47415321 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47415430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47415871 G A Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 47415984 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47416188 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47416207 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47416664 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 47416671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47416752 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47416995 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 47417259 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 47417349 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47417756 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 47417973 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 47417988 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47418182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47418956 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47419149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47419227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47419288 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 47421141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47421803 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47423570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47424213 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47424737 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47424821 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47424832 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47424841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47424895 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47424985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47426303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47431129 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47431579 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47431584 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47431806 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47431978 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47432099 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47432313 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47432351 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47433452 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47433528 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47433555 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47433570 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47434417 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47438737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47440826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47441995 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 47442494 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47443656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47444240 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47446087 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47446659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47446866 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47447602 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 47448300 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 47448487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47451410 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47455267 C G Y N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 47456039 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 47457824 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47458845 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 47462171 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 47462608 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47462846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47462853 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47463190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47463598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47463889 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 47464407 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 47464571 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47465100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47465368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47465571 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 47465991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47466392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47466734 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47467244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47467458 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 47468034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47468237 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 47468324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47469026 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 47469400 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47469793 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47474416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47474774 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47475288 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 47477233 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47477259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47477314 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47477631 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 47477671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47477774 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47477944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47478525 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47478732 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47478748 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 47478907 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 47479329 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 47479410 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47479562 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 47479593 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47480004 T G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 47480317 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47480331 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47480798 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 47481423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47481849 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47481906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47481908 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47481949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47482029 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47482070 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47482151 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47482221 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47482226 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47482303 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47482327 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47482358 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47482391 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47482417 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47482454 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47482494 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 47482538 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47482658 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47482669 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47482684 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47482685 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 47482869 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 47482912 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47482923 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47482943 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 47482972 C G Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 47482995 A C N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 47483566 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 47484121 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 47484137 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 47484203 T A Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 47484206 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 47484252 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47484292 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 47484791 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 47484940 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 47484945 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 47485281 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 47485318 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47485373 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 47485385 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 47485726 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47485843 T G Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 47485862 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 47486062 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 47486306 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47487506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47488589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47488591 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47488904 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47490649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47499113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47499409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47500017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47500096 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47500121 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47501931 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47503287 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47503505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47503680 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47504074 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47504995 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 47507873 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47507912 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47508227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47508407 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47509117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47510296 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47510515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47511286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47511933 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 47512364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47512742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47512962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47513411 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 47514532 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47514938 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47515561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47516250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47516350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47517329 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47517703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47518035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47518296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47518445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47518694 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 47525909 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 47526460 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47526551 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 47526658 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47526934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47527389 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47527460 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 47527475 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 47527588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47527639 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47527668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47527844 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 47527872 T A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 47527985 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47527989 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47527998 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 47528073 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47528214 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47528391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47528580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47528627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47528635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47528819 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47528925 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47528935 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 47529002 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 47530199 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47530243 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 47530289 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47530378 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47531415 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 47531466 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 47531768 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47532362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47532382 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 47532923 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 47533037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47533111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47533322 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47534217 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47534378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47534489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47534616 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47534886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47535664 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47535844 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 47536580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47536656 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47537177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47537631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47537679 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47538062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47538845 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 47539071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47539253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47539330 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 47539949 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47540170 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 47540234 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 47540435 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 47540440 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47540706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47540956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47540969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47541770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47541794 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 47541798 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 47542508 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 47542532 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47542547 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 47542731 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 47542799 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 47542971 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 47542972 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 47543007 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 47543029 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 47543055 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 47543100 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 47543122 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 47543246 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 47543272 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47543357 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 47543363 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 47543420 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 47543426 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 47543547 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 47543843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47545124 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 47545282 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47545782 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47545787 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 47545860 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47545957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47546392 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 47547197 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 47547963 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47548037 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 47548907 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 47548982 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 47549250 C G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 47550414 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47550466 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 47555752 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47558066 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47559404 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47559533 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47560242 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47561037 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47565116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47565888 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47566956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47567135 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47567142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47568021 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47568089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47569327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47569740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47570208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47570522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47570577 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47571226 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47571948 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 47572137 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47572440 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47572532 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47572925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47573260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47573781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47573865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47574281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47574503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47575947 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47576313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47576506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47577088 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 47577925 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47578707 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47578867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47579137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47579558 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47579566 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47579608 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47579820 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47580533 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 47586917 C G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47587848 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47588272 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 47588400 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47588584 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47588645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47589124 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47589280 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47589333 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47590445 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 47591927 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47594375 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47594492 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47595811 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47596974 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47597873 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 47597987 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 47597996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47598064 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 47598080 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 47598170 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 47598230 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 47598309 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 47598330 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 47598359 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 47598385 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 47598392 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 47598400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47598671 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 47598802 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 47598901 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 47599010 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 47599062 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 47599088 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 47599228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47599602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47599644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47599722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47599780 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47600480 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47600502 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47600547 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 47600985 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 47601066 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 47602248 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47602368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47602441 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47602836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47602850 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47602957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47603172 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47603378 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47603424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47603523 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 47603575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47603937 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47604120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47604258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47604985 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47605078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47606333 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47606422 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47607131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47607476 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47607794 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47608451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47608472 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47608473 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47608760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47608779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47608975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47609059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47609069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47609354 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47609524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47609743 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 47609840 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47609981 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 47612454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47614757 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 47615858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47616387 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47616804 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 47616822 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47617521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47617608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47618884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47619139 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47621539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47623391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47623623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47623926 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 47625697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47625698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47628309 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47629611 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47631208 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47633140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47633650 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 47634361 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 47634809 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47636633 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47638768 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47638813 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47638986 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47639788 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47639808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47640436 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47640814 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47641910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47643741 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47643956 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47647688 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47653821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47655193 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47655266 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 47656132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47659458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47659854 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47660656 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47660798 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47661807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47663206 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 47663496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47664759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47666759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47666971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47667818 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47669321 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47669724 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47669907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47674422 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47674789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47674831 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47676529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47676608 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47677200 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47677493 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47678508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47678991 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 47679351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47679877 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47682256 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47682693 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47683055 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47684531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47685583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47685738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47686479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47688723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47690678 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47691826 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47692032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47692269 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47692287 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47692335 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47694011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47694907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47694916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47694973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47695830 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 47697203 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47697589 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 47697602 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47699627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47701421 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47702941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47703117 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47703517 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47704476 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47705406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47707354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47708307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47709048 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47709692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47712423 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 47713145 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47713802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47715844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47716703 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47719349 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47719350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47719473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47719628 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 47720904 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47721819 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 47721841 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47722799 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 47725334 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47725987 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 47727172 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47727425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47731032 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47733141 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47733513 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47734149 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47735192 G C Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 47735512 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47736095 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 47736159 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47736532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47736591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47736642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47736645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47738423 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47739356 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47743266 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47744899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47745002 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47745337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47745343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47746251 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47746417 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47746983 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47749582 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47751553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47752264 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47752856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47753274 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47755329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47755559 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47764192 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 47766299 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47770255 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 47770704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47771282 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47772298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47773733 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 47774192 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 47774856 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47775986 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47776136 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47778216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47779415 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47780387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47781205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47781284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47781637 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 47781673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47782215 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 47782696 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47784936 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47785143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47785347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47785976 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47786369 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47786736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47787307 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47787936 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47791073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47793486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47793694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47794104 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47795152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47795887 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 47797317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47797748 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 47797845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47800073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47800917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47801861 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47801893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47801908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47801943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47802403 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47802461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47802517 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 47802561 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 47802638 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47802681 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 47803527 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 47803642 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 47804077 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 47804407 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 47804802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47804863 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47805692 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47805697 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47806804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47806847 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 47810406 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 47811520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47812508 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47813043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47813390 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47815697 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 47818240 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47819519 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47820151 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47822448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47822615 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 47822993 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 47823795 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47823916 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47826997 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 47828210 C A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 47828806 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47830464 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 47831144 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 47831459 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 47831541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47832008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47832121 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47832889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47835094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47835526 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47837476 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47838324 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47841924 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 47841957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47844355 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47845860 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47846284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47846401 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 47847090 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47848364 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 47848670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47849474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47851294 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47851295 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47852066 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47852092 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47852184 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 47852622 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47853173 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 47853334 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47853642 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47854248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47854380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47854494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47854619 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47854830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47854833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47854875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47854935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47854997 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47855449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47855521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47855906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47856483 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47856700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47856899 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47857052 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 47857119 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47857154 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47857324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47857580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47857634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47858808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47858822 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 47858943 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 47858992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47859424 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 47859451 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 47859463 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 47859468 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 47859499 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 47860020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47860834 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 47861381 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 47863324 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47863355 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47863428 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 47863668 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 47863981 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 47864065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47864128 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 47864325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47864442 A C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 47864466 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 47864475 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 47864786 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 47865432 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 47865446 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 47865756 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 47865943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47866343 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 47866775 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 47866822 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 47866930 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 47866974 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 47867151 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 47867747 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 47867988 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 47868082 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 47868315 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 47868961 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 47868967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47869038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47869050 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 47869056 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47869064 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47869139 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47869219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47869318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47869437 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47869890 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 47869947 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47870023 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 47870054 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 47870839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47870874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47870992 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47871434 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 47871503 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47871524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47871771 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 47871964 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 47872255 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 47872466 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 47872512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47872693 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 47872718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47872735 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47872815 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 47873070 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 47873191 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47873218 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47873496 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 47873568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47873594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47873638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47873654 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47873835 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 47873849 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47873900 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47873913 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 47873914 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47873973 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 47874059 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47874165 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 47874353 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 47874415 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 47874708 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 47874760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47874845 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 47874966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47875081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47875234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47875464 T C Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 47875465 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 47875492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47875581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47875620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47875675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47875859 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47876117 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47876589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47876793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47876923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47876929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47877108 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 47877153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47877253 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47877415 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 47877425 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 47877467 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 47877667 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 47877735 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 47877990 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 47878238 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 47878282 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 47879215 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 47879427 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47879702 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47880052 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 47880097 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 47880114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47880116 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 47880839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47880967 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 47881071 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 47881450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47881570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47881579 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 47881609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47881695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47881719 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 47881938 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47881971 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47882156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47882160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47882168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47882216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47882452 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 47882634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47882836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47882876 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 47883453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47884049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47884274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47884355 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 47884436 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47884496 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47884712 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47884756 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47884777 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 47884880 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47884986 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47885044 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47885325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47885417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47885653 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47885657 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47885668 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47885726 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47885795 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47885801 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47885945 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47885958 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47885995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47886012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47886020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47886095 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 47886142 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 47886145 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 47886311 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 47886322 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 47886331 G A Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 47886673 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47886740 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47886816 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47886880 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47886904 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47887013 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47887096 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47887148 A C Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 47887277 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47887439 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47887723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47887762 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 47887821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47887858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47888090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47888135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47888233 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47888243 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47888263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47888264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47888310 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47888462 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47888539 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47889035 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 47889067 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 47889129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47889307 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 47889388 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47889674 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 47890666 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47890744 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 47890787 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 47890823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47891042 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47891523 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 47891909 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47891955 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47892018 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 2 47892029 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 2 47892040 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 2 47892105 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 47893261 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47893333 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47894604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47896278 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47898110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47899003 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47899040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47899147 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 47901375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47902033 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 47902293 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47902349 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 47905394 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47905623 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47906775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47907322 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 47908912 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47909014 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 47909113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47912271 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 47912337 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47912849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47913160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47913259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47913277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47913707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47913847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47913926 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47916028 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47916145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47916880 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 47916997 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47917085 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 47917096 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47917996 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 47918646 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 47918848 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 47918870 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 47919501 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 47919608 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 47919692 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 47919825 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 47919925 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 47919956 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47920186 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47920231 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47920362 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47920409 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 47920456 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 47920469 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47920506 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 47920544 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 47920721 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47920829 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47921013 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 47921050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47921159 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 47921449 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 47921784 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47921898 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 47922403 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 47922621 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 47922687 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 47922723 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 47922772 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 47922802 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 47922850 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 47923044 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 47923070 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47923104 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 47923395 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 47923648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47924172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47924208 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47924525 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 47924667 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 47924788 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47924810 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 47924864 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 47924878 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 47924894 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 47924985 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 47925008 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 47925009 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 47925343 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 47931301 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 47931363 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 47931415 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 47931536 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 47931726 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47931970 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 47932261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47932601 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 47932681 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 47932800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47933040 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 47933648 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 47933724 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 47933856 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 47934577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47934760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47934981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47935240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47935409 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 47936104 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47936233 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47937119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47937234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47937612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47937673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47938101 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47939608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47940855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47940931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47940966 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 47941017 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 47941446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47941551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47942815 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 47943017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47943027 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 47943063 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 47943442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47945438 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 47946060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47946774 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47948971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47951840 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47952234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47952590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47955003 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47959459 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 47960084 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47960093 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47962610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47963503 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47963613 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 47964457 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 47964554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47964876 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47980065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47981228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47982768 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47986293 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47986507 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47987273 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 47990256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47990338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47990584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47990631 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47990822 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 47990837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47990983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47991249 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 47991308 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 47991361 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 47991429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47991621 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47991688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47991728 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 47991746 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 47991849 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47992034 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 47992314 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47992368 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47992523 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 47992545 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47992760 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 47992830 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 47992867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47993043 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 47993070 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 47993076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47993265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47993303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47993333 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 47994191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 47994370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 47995759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48001093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48002723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48004267 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48006857 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48012067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48012377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48016852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48017069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48017936 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48017960 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48017989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48019121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48019304 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 48019852 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 48021069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48023242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48025819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48026705 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48028520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48029737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48030417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48032107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48036612 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48038174 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48039258 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 48039585 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48041775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48043846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48044295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48044729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48044765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48047743 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48048407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48049448 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48049607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48049824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48050159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48051315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48051612 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 48052223 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 48052285 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 48054604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48057563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48059035 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 48060559 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48061905 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48062374 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48062687 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48063324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48063483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48064593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48065627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48067620 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48071879 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 48073424 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 48075701 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48076096 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48076237 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48077147 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48077715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48078101 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48080849 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 48081727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48082236 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48082415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48082985 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 48089022 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 48089412 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48089496 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48091218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48091642 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48093745 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48094349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48094715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48094887 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 48094913 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 48095230 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 48095236 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48095328 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 48095340 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 48095473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48095994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48096995 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48097016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48097646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48097671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48098005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48098796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48098985 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48099774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48100018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48100019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48100091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48100381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48100561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48100902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48102876 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 48104339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48104980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48106071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48107008 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 48107089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48108667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48108728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48108773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48108855 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 48108862 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 48109303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48109669 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 48110268 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48110416 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 48110692 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 48110888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48111189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48111884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48111998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48112050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48112439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48112509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48114287 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 48114407 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48114611 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48114661 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 48115093 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48115263 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48115592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48116319 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48118820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48119354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48121734 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 48122293 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48123308 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 48125306 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 48126253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48126504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48127962 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 48128381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48129306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48129826 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48130347 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 48130665 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48132686 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48132727 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48132742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48132851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48132903 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 48133145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48133990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48134415 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48134638 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 48134849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48134875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48135538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48135898 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48137578 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48137794 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 48137984 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 2 48138381 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48139574 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48139832 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 48140220 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48140480 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48140542 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48142057 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48142058 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48142241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48144167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48144327 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48147468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48148004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48149033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48149384 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48151114 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 48151834 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48152696 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 48153503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48154763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48154767 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48155479 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48156521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48157943 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 48158360 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48159374 T A N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 48159672 G T Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 48159774 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 48161999 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 48162534 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 48162830 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 48162843 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 48163863 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 48165678 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48165735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48165884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48166239 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48166255 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48166379 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48167315 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48169216 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48169242 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48169772 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48170137 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48172005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48172239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48172421 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48172507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48173892 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 48177121 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48178688 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48178831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48179252 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 48179312 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 48179320 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 48179846 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 48179931 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 48179937 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 48179963 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 48180498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48180593 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 48180601 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 48180610 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 48180635 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48181038 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48181175 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 48181354 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 48181479 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 48181895 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48182065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48182350 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 2 48182935 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 2 48183065 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 2 48183346 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 48183453 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 48183692 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 48183808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48184168 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 48184605 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48184721 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 48184983 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 48185504 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 48185772 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 48185852 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 48185940 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 48185948 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 48186083 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 48186631 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 48186702 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 48187682 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 48188004 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 48188040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48188189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48188505 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48188567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48188810 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 48188885 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48189012 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 48189061 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 48189142 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 48189222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48189359 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 48190366 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 48190518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48190555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48191744 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 48192187 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48192391 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 48192426 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48192554 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48192594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48193151 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48193160 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 48193239 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48193324 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 48193380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48193564 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 48194435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48194632 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 48194686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48194829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48194830 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 48194855 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 48195214 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48195815 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 48196455 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48196727 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 48197435 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 48197663 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48197864 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 48197926 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48198070 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48198599 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 48198754 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48198867 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 48198875 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 48199040 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48199979 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 48199997 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48200329 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 48201049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48201341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48201619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48201712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48202437 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 48202739 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 48203057 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48203097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48203200 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 48203277 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 48204055 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48204074 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 48204297 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 48204445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48204489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48205045 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48205582 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48205644 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48205706 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48205894 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 48206068 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 48206077 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 48206308 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 48206309 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 48206697 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 48206849 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48206948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48206949 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48206997 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48207121 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48207167 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48207681 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 48207950 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48208481 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 48208679 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48208729 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 48208828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48208936 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48208983 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48209676 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48211631 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 48211695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48211727 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 48211870 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 48211892 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48212121 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 48212210 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 48212373 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48212870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48212954 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48214299 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48215940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48215965 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48217571 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48219082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48220062 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 48220249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48221219 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 48221988 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 48222592 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48222712 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48222766 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48223200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48223599 A T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 2 48225750 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48225987 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 48226173 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 48226595 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 48226667 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48226801 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 48226871 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48226884 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 48226888 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 48226908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48227139 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48227152 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 48227171 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 48227434 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 48227573 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48227574 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48227593 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48227637 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 48227649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48227747 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 48227808 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48227852 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 48228209 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48228359 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 48228367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48228428 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 48228463 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 48228485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48228488 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48228577 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 48228585 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 48228736 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48229077 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 48229317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48229344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48229430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48229478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48229667 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 48229694 C T Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 2 48229722 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 48229748 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 48229843 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48229893 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 48230027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48230053 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48230103 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48230115 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 48230148 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48230287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48230349 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48230366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48230596 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48230841 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 48230861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48231008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48231467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48231525 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48231601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48231722 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 48235567 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 48235761 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48236148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48236403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48236706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48237515 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48237598 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48237609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48237616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48237643 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48237657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48237798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48238895 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 48239289 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 48239293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48240055 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48240246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48240477 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48241753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48244551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48245596 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 48245646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48245659 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 48247609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48248144 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48248672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48249396 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 48250028 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 48250050 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 48250235 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 48250371 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 48250484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48250494 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 48250531 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 48250600 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 48250649 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 48250650 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 48250712 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 48250717 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 48250764 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 48250785 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 48250791 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 48250863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48250909 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48250910 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 48250939 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 48250997 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 48251051 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 48251154 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 48251197 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 48251198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48251328 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 48251341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48251613 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 48251744 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 48251759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48251847 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 48251855 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 48251937 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 48252168 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 48252494 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 48252508 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 48253196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48253294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48253347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48253844 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48255663 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 48255876 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 48257663 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48257815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48259024 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48259244 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 48259776 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 48259780 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 48259810 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 48259878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48260550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48260658 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 48262424 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48262575 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 48265794 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48266969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48267383 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 48267395 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 48267711 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48271068 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 48271245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48271412 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 48271855 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 48272734 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 48272911 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 48273353 A G Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 48274036 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48274041 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48274293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48274497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48274585 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48275641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48276441 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48276517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48276643 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48277759 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 48277835 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48278517 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 48278817 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 48278872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48279062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48279546 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48280770 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 48281041 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 48281264 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 48281405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48282019 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 48282811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48283271 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 48283538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48284172 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48284480 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 48284903 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 48285422 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48287380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48288250 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48290316 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48293030 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 48294406 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48296334 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 48297832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48297840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48298467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48300156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48301237 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48302805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48303034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48303054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48304214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48304383 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48304541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48304622 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 48304659 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 48304837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48304858 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48304859 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48304910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48305103 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 48305112 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 48305574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48305906 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48305907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48306549 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 48306575 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 48306639 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 48306673 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48306868 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 48306939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48307014 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 48307272 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48307371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48307924 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48308453 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48309045 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 48309993 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 48310209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48310290 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48311667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48312404 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48312424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48312972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48314652 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 48315551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48316816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48317174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48317759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48318844 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48318912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48319805 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 48320073 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48320363 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48320643 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 48321017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48321036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48321070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48321083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48321155 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 48321198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48322480 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 48322838 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 48323693 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 48323826 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48324032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48324298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48324525 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 48325955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48326031 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48327177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48327418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48327552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48328323 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 48328752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48329504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48329575 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48330031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48330065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48331171 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48331615 A T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 48332297 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48332747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48333134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48333391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48333877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48333919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48334376 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 48334822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48334979 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48335072 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 48335205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48335937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48336265 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 48337018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48337125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48337312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48338570 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 48346484 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48346707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48347134 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 48347720 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 48347753 T A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 48347784 C G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 48347794 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 48347808 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 48347815 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 48347885 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 48347911 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 48348029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48348067 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48348170 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 48348213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48348255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48348280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48348338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48348343 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48348390 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 48348477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48348528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48348535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48348832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48348843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48348876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48348976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48349055 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48349920 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48349950 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 48350043 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 48350051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48350462 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48351264 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 48351498 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48352801 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 48352938 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 48353237 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 48353594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48353741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48354133 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 48354247 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 48354721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48354754 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 48354957 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 48355198 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 48355436 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 48355483 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 48355544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48355584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48356847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48356873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48357654 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48358279 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 48359158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48359825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48360155 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 48361314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48361482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48361704 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48362273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48362331 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48362372 T C Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 48362374 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 2 48363996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48364970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48365353 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48365447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48368534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48370588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48372497 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48373252 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48373785 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48373933 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48374167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48375474 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 48375659 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 48375674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48375914 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48376283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48376313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48376938 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 48377273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48378095 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 48378292 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 48380104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48380749 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 48380763 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 48381347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48382577 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 48383472 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48383734 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 48383766 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 48383986 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 48383994 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48384886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48386079 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 48387131 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48387425 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 48389965 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48391477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48392268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48393003 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48393866 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 48393889 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 48393898 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 48394090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48394793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48394919 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 48394924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48394952 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 48395462 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48395841 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 48395987 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48396163 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48397126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48400261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48401088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48401149 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 48402315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48403206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48404668 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48405376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48405532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48405989 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48407191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48407413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48408837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48410148 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 48410232 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 48410239 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 48410269 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 48410309 C T Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 48410376 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 48410433 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 48410475 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 48410484 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 48410526 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 48410531 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 48410577 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 48410591 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 48410625 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48410647 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 48410686 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 48410806 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 48410940 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 48411084 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 48411086 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 48412033 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 48412123 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 48412125 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 48412285 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 48412324 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48412337 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48412426 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 48412516 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 48412582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48412599 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48412613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48413294 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48413815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48413916 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 48413966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48414162 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48414435 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 48414511 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 48414867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48415341 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48415347 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 48415918 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 48416257 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 48416319 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 48417348 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 48417444 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 48417852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48418138 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 48418301 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 48418437 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 48418446 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 48418467 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 48418596 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 48418662 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 48418717 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 48418719 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 48419008 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 48419389 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48419398 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 48420134 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 48420236 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 48420770 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 48421968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48422585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48423105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48424038 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48424281 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 48424703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48424704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48425179 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 48425485 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48425615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48425775 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 48425823 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 48426840 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48426901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48426942 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 48427053 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 48427753 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48428062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48428346 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48428461 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 48428792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48429133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48430165 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48430172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48431622 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 48431685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48433870 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48434247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48434271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48441318 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48441681 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 48441700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48441795 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48441987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48441995 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 48442030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48442078 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48442084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48442173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48442258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48442260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48442455 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48442507 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 48442635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48442836 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48443001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48443085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48443089 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 48443316 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 48443923 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 48444573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48444813 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48445449 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 48445860 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 48445939 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48446251 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48447706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48452902 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48452966 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48453141 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48453905 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 48454504 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 48454674 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48454929 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 48455036 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 48455473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48456979 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 48457033 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48457744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48457774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48457939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48457963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48458401 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 48458475 G T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 48458510 C A Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 48461397 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48461523 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 48461524 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 48461766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48462023 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 48462082 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 48462152 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 48462203 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 48462296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48462313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48462396 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 48462398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48462462 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48462463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48463147 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 48463152 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48463202 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 48463411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48463446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48463457 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48463498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48463723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48463739 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 48463942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48463943 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 48464246 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 48465032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48465847 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 48465848 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 48466331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48466333 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48466502 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 48467814 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 48467909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48470962 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48470983 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48471024 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48471429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48475047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48475498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48476045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48476344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48477486 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48478739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48479407 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 48480171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48483206 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48483457 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 48483883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48485182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48485591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48487152 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48487506 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 48487713 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48488121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48488328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48488420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48488429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48488526 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48488698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48489075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48489140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48489547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48489640 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 48489651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48489653 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48490216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48490219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48490381 G T N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 2 48490443 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 48490544 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 48490760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48491041 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48492162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48492531 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48494009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48494437 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 48494810 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 48494991 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 48495048 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 48496374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48496762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48499728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48502137 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48502214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48502810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48503138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48503324 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 48503986 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48504556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48504758 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48506439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48507058 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48512624 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48514173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48515261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48515754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48518268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48518365 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 48518570 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 48518717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48518895 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48518953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48519793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48520144 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 48520976 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48521649 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48523685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48527396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48527655 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 48527656 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 48528223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48530512 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 48531283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48531688 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 48533695 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48535601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48536124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48537106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48537851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48538127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48538683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48539767 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48541180 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48541772 T A Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 48543493 T G Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 48544388 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 48546235 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48547091 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48547278 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 48548200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48549017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48549523 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48550495 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 48550542 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 48550563 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 48550966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48551222 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 48551321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48551414 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48551887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48552557 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 48552596 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 48552782 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 48552795 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 48552811 G T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 48552888 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 48553070 A T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 48553186 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 48553664 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48553735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48553798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48553804 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 48553891 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 48554013 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 48554097 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 48554106 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48554229 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48554273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48554461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48554463 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48554484 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48554513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48554565 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 48554592 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 48554739 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48554776 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48554816 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48554877 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48554888 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48554901 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48554956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48554994 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48555254 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 48555807 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48556494 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48556877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48556887 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48556898 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48556906 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48558054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48558323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48562297 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 48562607 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 48564274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48568339 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48568797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48571583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48578050 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 48579389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48580943 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48581831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48582199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48582224 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 48582589 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48582760 A T Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 48583412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48583492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48583548 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 48583582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48583645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48583743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48583771 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 48584051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48584215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48584638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585359 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585397 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48585878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48585970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48588199 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 48590122 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 48590317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48590376 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48590625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48590961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48591846 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 48592510 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48592519 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 48592543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48593254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48593358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48594283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48595082 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 48600087 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48602088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48602529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48603054 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48607730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48611824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48612712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48616327 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 48617013 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48617081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48617648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48617654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48617818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48618080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48619885 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48620450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48621992 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48622963 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48623395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48627716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48627983 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48628120 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 48629696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48630064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48630739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48633634 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48635006 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 48635167 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 48635392 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 48635513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48635966 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48636184 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48637240 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 48637323 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 48643465 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48643703 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48647107 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48647984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48648725 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 48650949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48654119 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48655368 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48657659 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48659606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48662488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48664558 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48664772 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 48664815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48667250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48667293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48667721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48669821 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48670643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48673811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48674078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48674880 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 48675353 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 48676221 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 48676298 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 48676358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48677077 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48677965 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 48678368 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 48678741 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 48678771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48679993 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48680183 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 48682226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48682537 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 48682729 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48682869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48684323 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48686061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48686163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48686616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48686678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48686747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48687376 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48687382 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48687396 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48687514 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 48687631 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48690728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48691265 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48691928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48692726 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48693560 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48695579 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 48696096 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48697076 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48697881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48699382 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48699934 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48701804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48706458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48709161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48711814 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48712520 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48717025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48717132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48718261 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48718323 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48720098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48720451 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48721641 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48725071 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 48726472 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48734647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48736065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48736351 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48738193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48738862 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48739939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48741562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48742873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48743979 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48749686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48750399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48763122 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48765967 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 48767149 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 48767874 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48768659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48769192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48771744 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 48772130 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48774017 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48774233 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48774782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48775030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48775043 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48775118 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 48778108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48778196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48779244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48779665 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48780679 C A Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 48781495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48781994 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48783534 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 48783947 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48784780 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48784933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48785645 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48787309 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48788808 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48789631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48790596 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 48792559 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48793224 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 48793605 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 48793779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48795326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48801178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48801633 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48802185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48803280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48803281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48804802 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48805526 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 48809075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48811219 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 48813801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48814944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48815342 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48817674 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48818618 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48818666 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48821287 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 48826072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48835994 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48839484 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 48841066 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48841544 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48843384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48844207 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 48849065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48851012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48851283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48851489 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48852353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48853943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48855957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48859688 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48865073 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 48866491 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 48867514 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 48867515 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 48869053 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48870148 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 48872491 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 48872845 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48873133 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48874825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48875111 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 48879724 A T Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 48879736 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 48883156 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48886946 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48892823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48902215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48903158 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 48904020 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 48904022 G C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 48906209 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48907143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48907186 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48907506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48915404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48915464 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48916568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48916673 A T Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 48917449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48917489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48924898 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48927871 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48928181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48928538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48930315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48935657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48935930 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48940548 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 48940725 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48943539 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48946099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48947696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48947881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48948247 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48950711 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 48953720 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48954112 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48958556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48962022 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 48962510 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48964103 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 48964128 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 48964338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48964386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48964559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48964629 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48970804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48970822 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 48977121 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 48979223 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48983594 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 48984887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48988101 G T Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 48989079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48994404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48995141 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 48995183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 48995694 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 48996768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48997711 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 48997981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48998996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 48999203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49000050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49002939 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49007936 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49009697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49009892 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49010225 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49013053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49016311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49016928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49017205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49017985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49018050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49020265 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49023343 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49025001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49025546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49027758 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49027858 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49029084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49029794 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49030538 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49033152 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 49033206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49033347 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 49033897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49036010 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 49036502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49039614 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 49040188 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49040261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49044138 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49048019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49049023 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49049125 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 49051760 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 49051857 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 49052471 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49053233 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49054744 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49054907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49055377 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49055754 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 49055810 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 49056281 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49056289 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49057404 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 49057470 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 49058089 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49058124 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49058398 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49058454 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49058893 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49059289 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 49059517 T G Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 49059518 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 49060092 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 49060537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49060568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49060761 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 49060824 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 49061318 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 49061421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49061466 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 49061492 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 49061506 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49061865 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 49062018 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49063177 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 49064408 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 49064427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49064926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49065250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49066217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49066260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49066658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49067185 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49067841 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 49069912 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 49069975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49070010 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 49070210 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 49070239 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 49070433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49070497 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49070527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49070720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49070764 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49071724 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 49072880 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 49073260 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 49073312 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49074197 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49075234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49075244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49075608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49077206 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 49077391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49077715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49078022 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49078142 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49078962 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 49080311 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49080616 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49081818 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49081952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49082050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49083719 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49083746 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 49084496 C A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 49084555 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 49084610 C T Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 49085319 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49085666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49087489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49092310 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49092656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49093566 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 49093619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49095107 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49095794 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 49096196 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 49096506 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49099899 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49102070 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49106573 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 49115626 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49116078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49118095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49118779 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49118962 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49119906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49120657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49122487 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 49122634 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 49126057 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49139329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49140622 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49141935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49143387 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49144909 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49145629 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 49146699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49148090 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49149946 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49150119 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49150409 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49153258 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49155178 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 49155630 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 49157514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49159578 A T N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 49160765 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49161440 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49162337 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 49162726 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49167010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49167922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49168003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49168547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49170145 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 49170280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49175064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49175438 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49178113 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 49178288 C A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 49179011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49179795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49180827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49181014 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 49181283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49183488 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 49185779 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 49185989 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49187579 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 49190015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49190136 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49191032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49193256 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 49193514 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49194940 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49195052 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 49196091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49196701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49197725 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 49199494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49199984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49201538 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49202704 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49202826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49206351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49207044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49207604 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 49207647 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49207694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49207726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49208001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49208082 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 49208120 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49209446 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49209875 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49210276 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 49210282 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 49210388 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 49210405 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 49210411 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 49210454 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 49210464 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 49210467 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 49210535 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 49210598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49210615 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49210725 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 49210896 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49210978 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49211117 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49211133 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49211172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49211175 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49211201 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49211202 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49211220 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49211311 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 49211440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49211838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49211852 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49211889 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49211898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49211934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49212636 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49212750 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 49212755 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 49212820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49212830 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 49212886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49213115 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49213149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49213396 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49213462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49213466 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49213642 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49213662 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49213718 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49213759 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49213789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49213796 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49213805 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49214176 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 49214341 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 49214348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49214564 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49214899 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49215035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49215068 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49215119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49215122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49215192 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 49215274 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49215327 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 49215332 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 49215357 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 49215421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49216806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49221368 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49221408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49222620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49223260 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49223311 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 49227728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49229109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49230112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49236019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49236516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49236527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49236910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49238398 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49238399 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 49238900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49239106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49239219 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49239227 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49239251 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49239275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49239326 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49239330 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49239377 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49239404 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49239510 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49239570 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49239677 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49239686 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49239814 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49239913 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49240229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49240260 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49240389 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 49240390 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 49241561 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49241856 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 49241897 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 49241958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49242259 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49242347 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49242360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49242483 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49242670 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49242727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49242749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49244166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49244455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49244729 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49244737 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49244784 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 49244903 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 49244972 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 49244980 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 49245140 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 49245402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49245437 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49245636 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49245644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49245695 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49245718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49245726 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49246075 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49246233 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 49246430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49246438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49246561 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49246682 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49246776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49246969 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49247076 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49247331 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49247945 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49247995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49248037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49248041 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49248113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49248187 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49248532 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49248655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49249139 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49249368 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 49249385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49250123 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49250180 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49250195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49250246 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49250287 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49250321 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49250332 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49250387 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49250430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49250450 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49250454 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49250499 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 49250530 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49250541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49250569 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49250616 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49250645 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49250680 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 49250739 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 49250822 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49250870 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49250935 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49251046 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 49251064 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 49251505 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49251608 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49251609 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49251792 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49251916 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49252084 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49254029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49254030 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49255326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49255473 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49255496 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49256299 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49257241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49257496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49260258 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49261937 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49262861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49263906 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 49264081 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 49264498 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49265036 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 49265271 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49265497 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 49265918 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 49266230 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49266292 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49266499 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49267329 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 49267413 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 49268637 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49268734 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49268762 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 49268791 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49268830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49269004 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 49269225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49269298 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 49269406 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49269687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49269745 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 49269760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49269985 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49270349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49270362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49270378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49270415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49270424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49270436 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49270735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49270746 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49270824 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49270853 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49270945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49270991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49272513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49272520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49272663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49272761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49273164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49273175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49273358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49273447 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49273585 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 49273709 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49274219 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49274302 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49274371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49274458 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 49274632 G C Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 49274680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49274771 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49274853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49274857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49274969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49275074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49275137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49275180 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49275220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49275223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49275290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49275332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49275343 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49275529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49275666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49275737 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49275804 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 49275846 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 49275978 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 49276312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49276598 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49276760 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 49277895 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49280600 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49283049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49283363 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49283432 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49284522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49285998 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49286261 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 49286341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49287006 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 49287591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49287998 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49288015 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 49289277 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49289425 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49289468 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49289509 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49290395 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49292547 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49292648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49297734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49299347 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 49299460 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49299809 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49301961 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49302297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49306672 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 49308162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49308691 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 49309630 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49309694 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49309831 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 49309872 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49310169 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 49310292 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 49310623 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49310634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49310788 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 49310981 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49310993 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49310997 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49311048 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49311102 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49311105 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49311175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49311197 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49311359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49311365 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49311744 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49311767 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49311771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49311910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49311927 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 49311996 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 49312150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49312213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49312304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49312309 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 49312384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49312423 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 49312537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49312621 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49312913 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 49313292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49313309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49313619 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 49314113 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 49314373 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 49314435 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49314490 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49314537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49314680 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 49314709 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 49315186 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49315291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49315609 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49315663 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 49316239 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49316483 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49316528 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49316677 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49316954 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49317938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49318199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49318203 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49318905 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49319592 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 49319599 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 49319631 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 49320018 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49320351 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49321619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49321875 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49321877 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49321912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49322006 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49322382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49322484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49324188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49324282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49324515 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49324547 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49326342 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49326393 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 49327535 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49327782 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 49327861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49329521 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49329662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49337772 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 49338103 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 49338201 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 49338919 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 49338946 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49339052 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 49339900 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49339966 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 49340222 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 49340225 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 49340391 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49340494 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 49340730 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49340986 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49341115 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 49341313 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49341755 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49341762 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49341772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49341861 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49341903 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49341978 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 49342324 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 49342645 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49342693 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49342833 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49343017 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 49343071 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 49343139 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 49343320 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 49343575 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 49343694 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 49343937 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 49344085 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 49344139 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 49344383 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 49344444 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 49344446 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49344630 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 49344669 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 49344788 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49344913 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 49345108 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 49345438 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 49345545 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 49345851 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 49345988 T A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 49346489 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49346659 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 49347076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49347434 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49347447 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 49347483 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49347498 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49347520 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 49347589 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 49347852 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49347937 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49348084 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 49348180 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 49348592 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49348798 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49349026 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49349130 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49349358 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49349375 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49349390 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49349528 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49349598 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49349741 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49349874 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 49350054 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 49350832 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49351132 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49351160 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49351173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49351377 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49351407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49351460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49351699 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49351716 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 49351761 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 49351795 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 49351838 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49352412 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 49353059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49353574 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 49353592 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49353622 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 49353664 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49353923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49354421 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49354434 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 49354843 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 49355086 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 49356093 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 49356216 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 49356218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49356361 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 49356407 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49356715 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49357500 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 49357621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49357788 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 49358178 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49358226 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 49359124 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49359160 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49359635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49360079 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49361090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49361094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49361222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49361653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49361940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49362252 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49362338 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49362487 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49363152 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49363193 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49363513 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 49363560 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 49364185 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49364188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49364258 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49364349 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 49364356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49365429 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 49365930 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49365959 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49366043 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49366301 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49366451 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49366583 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49366585 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49367111 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49367808 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 49370367 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 49371856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49373131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49373185 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49373239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49373306 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49375839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49376275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49376515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49376633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49378773 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49379204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49379212 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49379380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49379477 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49379901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49380770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49381897 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 49382182 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 49383169 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49384537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49385089 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49385102 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49386869 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49387155 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49390779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49391475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49391491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49392965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49394781 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49394807 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49394968 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49395268 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49395690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49396242 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49396319 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 49396751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49396788 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49397662 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49398166 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49398300 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49398309 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49398609 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49398750 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49398775 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49398811 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49398846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49398981 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 49399491 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49399689 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49399739 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49399854 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49399871 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49399885 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49400733 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49400764 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49400912 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49401201 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49401517 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49401898 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 49401937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49402105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49402345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49402354 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49402605 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49402730 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49402754 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49402909 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49402910 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49403270 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49403548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49404292 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49404325 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49404428 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49404652 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 49404763 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49404770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49404776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49405111 G T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 49405242 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 49405422 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49405425 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49405443 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49406548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49407649 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 49407744 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49408472 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49408488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49408545 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49408602 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49408689 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 49408698 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 49408727 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49408755 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49408943 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 49408991 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 49409044 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 49409130 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49409209 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49409242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49409311 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49409352 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 49409366 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 49409375 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49409514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49409585 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 49409668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49409723 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 49409724 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49410008 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49410139 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49410408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49411110 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 49411377 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49411425 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49411637 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 49411672 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49411713 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49411733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49411739 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49411804 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 49411880 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49411913 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49411951 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49411952 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49411989 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49412230 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 49412302 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 49412318 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 49412333 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 49412496 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49413035 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 49413350 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49414041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49414263 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49414341 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49414544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49414561 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 49414577 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 49414613 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 49414684 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 49415856 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 49415911 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 49416001 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49416200 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 49416208 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 49417174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49417860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49418128 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 49418433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49418517 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49418559 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 49418831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49418955 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49418989 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49419005 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 49419146 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49419310 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49419477 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 49419531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49419607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49419734 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49419961 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 2 49420207 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 49420241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49420251 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 49420266 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 49420315 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 49420353 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 49420440 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 49420461 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 49420542 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49420712 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 49420714 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49420728 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49420771 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 49420786 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49421050 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 49421082 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 49421326 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49421365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49421428 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49421477 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49421872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49421939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49422431 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 49422501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49422566 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 49422590 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49422598 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49422680 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 49422867 T C Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 2 49422878 A C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 2 49422896 T G N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 49422921 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 49422967 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 49423029 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 49423157 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 49423177 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49423212 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 49423312 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 49423313 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 49423505 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 49423709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49423826 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 49423904 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 49423939 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49424293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49425006 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49425089 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49425332 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 49425725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49425797 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49425826 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49425929 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 49426007 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49426136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49426516 A T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 49426517 G T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 49427294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49428109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49429261 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49429471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49429532 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49429654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49429980 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49430171 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 49430225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49430259 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 49430449 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49430485 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49430560 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 49430668 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 49430700 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 49430716 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 49430738 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 49431154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49431201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49431373 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49431390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49431697 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49431709 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49431904 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49432010 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 49432225 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49432611 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 49432678 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 49432753 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 49432785 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 49433035 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49433098 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 49433188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49433241 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49433356 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 49433360 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49433414 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49433465 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49433486 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49433870 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49433885 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 49433898 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49434059 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49434531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49434626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49434656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49434663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49434848 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49434970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49434979 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49434998 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49435004 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49435013 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49435016 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49435043 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 49435151 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49435271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49435375 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 49435445 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49435461 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 49435556 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 49435606 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49435657 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49435746 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49435853 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49435900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49435969 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 49436091 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49436141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49436178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49436672 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49436678 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49436688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49436987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49437037 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49437054 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 49437134 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 49437401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49437410 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49437817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49438518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49439175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49439516 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49439573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49439578 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49439631 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49439725 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49439912 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 49440348 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49440357 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49440459 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 49440586 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 49440981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49441055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49441552 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49441840 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49441870 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 49442467 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 49442488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49442505 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49442515 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49442749 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49442865 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 49442968 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49443150 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49443199 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49443500 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 49443570 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 49443689 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 49443947 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 49444023 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49444168 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49444201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49444203 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49444223 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49444264 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 49444265 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49444290 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49444301 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49444392 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 49444397 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 49444456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49444599 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49444612 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49444925 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49445585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49445812 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49445828 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49445853 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49445897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49445910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49445929 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49446068 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 49446125 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 49446129 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 49446154 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 49446204 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 49446219 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49446307 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49446364 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49446427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49446503 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49446528 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 49446543 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49446553 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49446576 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49446615 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49446654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49446742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49446761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49446772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49447027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49447087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49447109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49447429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49447476 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 49447499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49447552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49447574 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49447693 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49447722 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49447737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49447763 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49447929 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49448024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49448038 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49448056 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49448067 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 49448216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49448288 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49448408 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49448442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49448457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49448556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49448562 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 49448645 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 49448682 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49448688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49448723 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49448776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49448808 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49448822 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49448892 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49448962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49449025 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 49449061 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49449097 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49449152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49449484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49449506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49449517 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49449558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49449575 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49449669 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49449738 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49449897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49450173 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49450186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49450509 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49450642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49450715 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49450923 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49450950 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49450973 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49451114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49451563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49451799 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49451835 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 49451892 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 49452160 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49452361 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 49452403 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 49452652 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49452809 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 49452931 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 49452953 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49453058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49453075 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49453104 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 49453145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49453152 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49453160 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49453379 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49453583 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 49453584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49453956 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 49453980 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 49454033 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 49454348 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49454393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49455239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49455337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49455542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49455666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49455705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49456731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49456741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49456823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49456845 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49457128 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49457259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49457636 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49458459 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49458777 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49459010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49459026 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49459040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49459061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49459095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49461706 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 49461808 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 49461810 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 49462056 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49462264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49462523 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49462591 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49462649 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 49462655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49462687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49462876 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 49462990 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 49464534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49464552 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49464595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49464691 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 49465008 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49465057 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49465061 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49465243 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49465479 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49465514 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49465596 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49465611 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49465699 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 49465706 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 49465742 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49466156 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 49466291 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49466563 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49466581 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49466653 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49466656 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49466811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49467095 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49467191 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49467227 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49467241 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 49467249 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49467288 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 49467447 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 49467688 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 49467804 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49467937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49467968 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49468226 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 49468236 A C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 49468254 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 49468335 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49468338 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49468346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49468373 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49468378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49468417 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49468425 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49468508 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 49468600 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 49468836 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 49468838 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 49468958 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 49469036 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 49469270 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49469298 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49469329 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 49469336 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 49469497 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 49470060 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49470117 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 49470177 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 49470193 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 49470359 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49470450 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49470461 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49470495 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 49470649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49470674 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49470776 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49471159 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 49471174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49471219 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 49471253 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 49471397 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 49471907 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49471911 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49472256 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49472331 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 49472414 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49472574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49472708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49473000 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49473284 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49473337 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49473710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49473848 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49474361 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 49474678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49475036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49475171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49475405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49475718 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49476121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49476830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49478099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49478130 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 49478483 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49478554 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 49478580 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49478690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49479366 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 49479694 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49480377 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49483216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49483325 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 49483610 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49483912 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49485421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49486482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49489329 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 49489764 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 49489852 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49489901 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 49490016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49490078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49490193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49490369 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 49490893 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49490972 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 49491643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49492517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49493180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49494082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49495080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49495092 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49495564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49495743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49497026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49498180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49498898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49499302 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49500458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49501204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49501230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49501921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49502352 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 49503794 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49503834 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 49503900 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 49504285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49504527 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 49505002 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 49505003 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 49505295 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 49505409 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 49505514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49505520 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49505875 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 49505942 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49505993 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 49506016 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49506060 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 49506113 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49506193 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 49506206 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 49506222 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49506384 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 49506438 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 49506641 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 49506735 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 2 49506816 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 49506851 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 49507032 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 49508977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49508982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49509200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49509284 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 49509308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49509386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49509415 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49509585 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 49509670 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 49509676 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49509743 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49509768 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49509861 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49509954 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 49510061 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49510069 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49510078 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49510080 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49510527 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49511112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49511173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49511343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49511875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49512083 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 49512158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49512387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49512465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49512517 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49512620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49512703 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49512718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49512755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49512850 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49513093 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 49513274 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 49513758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49513774 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49513814 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 49514163 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49514219 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 49514318 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49514322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49514390 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 49514397 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49514461 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49514927 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49514976 T A Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 49515367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49515394 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49515438 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49515459 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49515488 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49515560 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49515604 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 49515617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49515683 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49515937 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 49515967 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 49516080 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 49516300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49516441 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 49516501 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 49516520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49516596 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 49516648 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 49516764 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49516796 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 49516821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49516885 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 49516943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49516953 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 49517150 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 49517174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49517352 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 49517426 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 49517547 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49517610 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49517697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49517813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49517861 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49518467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49519027 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49519149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49519211 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 49519555 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49519560 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49519654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49519760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49519773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49519915 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 49520016 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 49520049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49520150 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49520287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49520455 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 49520528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49520541 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49520700 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49520782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49520898 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 49520925 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 49521392 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 49521478 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49521821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49522172 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 49522259 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49522414 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 49522733 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 49523034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49524212 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 49524812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49525252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49525384 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49525471 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49525530 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49525536 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49525925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49526074 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49526798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49526903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49527626 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49527640 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49527677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49527770 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49527834 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 49527865 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49528105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49528108 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49528171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49528385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49528447 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49528536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49528774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49528895 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49529091 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49529190 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49529248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49529380 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49529585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49530737 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 49530881 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49530931 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49531055 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 49531117 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49531142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49531145 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 49531371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49532171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49532255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49533102 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 49533139 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 49533564 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49534676 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 49534821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49535365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49537353 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 49537497 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49537701 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49538375 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 49539524 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49541555 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 49543125 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49546102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49546604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49546659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49547287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49547806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49548519 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49548789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49549021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49549039 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49549061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49549109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49549403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49549609 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49549918 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49549935 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49550063 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49550173 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49550711 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 49550734 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 49550811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49551775 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49551935 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 49552031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49552114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49552211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49552361 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 49552769 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 49552788 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 49553027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49553115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49553438 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 49553457 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 49553656 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49553735 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49553740 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49553796 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 49553806 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49553826 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49553984 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49554067 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49554098 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 49554192 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 49554927 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 49555143 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 49555272 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49555368 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49555384 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49555449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49555717 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49555725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49555876 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 49555909 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49555961 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 49556104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49556330 C A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 49556380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49556806 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49557792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49558005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49558303 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49558304 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49558764 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49559592 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49559945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49560242 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 49560796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49560831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49561101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49561153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49561343 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 49561474 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49561999 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 49562572 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49562958 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 49563037 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 49563122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49563383 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49563795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49563948 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49564001 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49564075 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49564602 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49564886 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 49565607 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49565802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49565872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49565875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49566003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49566092 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49566096 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 49566300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49566416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49566436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49567701 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49567937 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49568114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49568618 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49568754 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 49568892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49569208 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 49569241 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 49569369 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 49569419 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 49570241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49570412 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49571125 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49571499 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49572480 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49573035 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 49573360 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 49573372 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 49574713 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 49575506 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 49575510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49575819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49575958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49576193 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 49576225 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 49576396 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 49576936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49577044 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 49577391 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 49577756 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 49578131 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 49578268 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 49578931 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 49578999 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49579139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49579158 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49579197 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 49579268 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 49579297 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 49579401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49579478 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49579614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49580069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49580545 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49580657 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 49580747 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 49581066 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49581339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49582081 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 49582248 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 49582275 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 49582588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49582913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49583500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49584048 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 49584077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49584093 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 49584145 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 49584284 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 49584403 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 49584488 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 49584917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49585043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49585504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49586820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49586895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49587050 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49588817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49589086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49589606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49589697 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 49590600 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 49591224 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 49591437 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49591527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49591528 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49592984 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49592986 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 49595111 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 49596128 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 49596132 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49597291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49598601 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 49598655 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 49598721 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 49599185 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 49599217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49599331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49600413 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49600955 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 49602167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49602332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49602471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49603450 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49603837 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 49604105 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 49604170 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 49604207 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 49604245 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49604588 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 49604798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49605054 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 49605324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49605793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49605971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49605984 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49607716 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 49607932 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 49607966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49608117 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 49608544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49608591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49608630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49609413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49609508 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49609551 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 49609658 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 49609767 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 49609776 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 49609782 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 49609978 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 49610089 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 49610908 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 49611155 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 49611301 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49611341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49611346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49611406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49611411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49611546 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49611896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49612111 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 49612117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49612326 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49613773 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 49614195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49614209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49614529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49614633 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 49614638 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 49614726 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 49614866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49614963 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49615018 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49615045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49615137 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 49615469 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 49615685 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 49615760 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 49615833 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 49616221 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 49616527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49616729 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 49616738 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 49616743 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 49616755 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 49617295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49617464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49617528 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49617561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49617593 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49617871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49617910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49617921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49617925 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49617997 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49618041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49618080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49618154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49618167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49618286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49618317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49618320 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 49618553 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 49618587 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 49618725 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49618880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49618912 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 49619205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49619222 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 49619224 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 49619317 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 49619477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49620258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49620304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49620796 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 49620833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49620920 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 49621162 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49621694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49621783 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 49621827 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 49622892 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49623451 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 49624618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49624750 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 49625210 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49625461 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 49625528 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 49627332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49628047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49628048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49628166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49629077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49629280 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49629385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49629760 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49630047 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 49631015 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 49631901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49634618 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 49635013 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49637068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49639620 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 49639644 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 49639706 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49639707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49639886 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49639996 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49640061 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49640114 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 49640178 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49640247 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49640297 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49640310 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49640318 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49640820 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49641211 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 49641874 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 49641895 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49641962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49642001 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 49642085 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49642130 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 49642193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49642341 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49642680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49642749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49642933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49643017 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 49643399 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49644132 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 49647472 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49647549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49648882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49649939 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 49650073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49650753 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49650792 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49650815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49650936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49652727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49653406 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49654554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49654590 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49654617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49654639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49654799 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49654831 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 49654918 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 49655084 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49655098 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49655172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49655184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49655782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49655783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49655810 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 49656203 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 49656444 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49656451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49656995 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 49658328 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49658422 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49658938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49659750 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49660084 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49660228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49660657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49660903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49660958 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 49661083 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 49661086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49661184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49661333 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49661529 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49662021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49662025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49662054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49662096 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 49662272 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 49662777 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49662991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49664088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49664653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49665305 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49665628 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49665797 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49666157 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49666459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49666706 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49667262 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49667439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49667761 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49668482 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49668673 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49668730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49669155 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 49669651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49670590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49671031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49671290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49671371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49671903 A T N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 49672783 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49672847 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49672926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49673603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49673682 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 49673702 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 49673748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49673792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49673895 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49674110 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49674235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49674377 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49675265 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49680341 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 49680847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49681597 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 49683273 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 49683570 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49683582 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49685666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49685937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49686012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49686907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49687847 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 2 49693515 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 49702029 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49707891 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49707914 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 49707981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49707997 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 49708051 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 49708306 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 49708549 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 49708553 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 49709278 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 49710346 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 49711156 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 49712435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49712679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49712795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49713059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49713537 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49713808 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49713817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49713852 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 49714036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49714064 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 49714125 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49714159 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49714178 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49714182 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49714195 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49714210 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49714771 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 49715175 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 49715579 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 49715650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49715951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49715976 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49716020 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49716032 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49716047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49716259 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49717309 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49717486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49717716 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 49718225 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49718294 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 49718344 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 49720071 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 49721676 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 49722015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49722881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49723365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49723424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49723432 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 49725944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49726728 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49727874 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49727980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49728105 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49728350 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49729443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49731938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49731939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49731951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49732072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49732077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49732100 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49732178 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49732216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49732248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49732253 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 49732365 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49732388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49732505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49732603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49732782 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 49732815 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49732856 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49732886 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49732889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49732992 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49733108 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49733111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49733393 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49733574 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 49733585 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 49733611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49734169 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 49734648 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49736133 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49736169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49736492 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 49736597 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 49736965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49737573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49737614 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49737650 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49737679 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 49737750 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 49737780 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 49737849 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49737948 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49738141 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49738302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49738582 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49738589 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49738657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49739138 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49739314 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 49739357 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 49739429 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 49739615 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49739623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49739810 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49739821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49739829 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49740031 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 49740068 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 49740244 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49740337 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 49740480 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 49740501 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 49740693 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 49740933 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 49740995 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49741048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49741099 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49741407 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49741485 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 49741592 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 49741626 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 49741720 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 49742540 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49742988 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49743020 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 49743126 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 49743774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49744562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49744804 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49745292 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 49746047 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 49746130 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 49746208 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 2 49746278 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 49746331 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 49746350 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 49746374 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 49746402 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 49746496 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 49746530 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 49746658 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 49746681 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 49746984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49747257 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 49747314 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 49747416 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 49747853 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49747888 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 49747952 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 49747994 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 49748080 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 49748136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49748515 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 49748625 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49748735 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49748745 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49748788 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 49749006 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 49749121 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 49749140 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 49749216 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49749612 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 49749762 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 49749780 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 49749859 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 49749956 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49749958 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49749992 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 49750038 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49750084 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 49750251 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 49750268 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 49750472 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49750923 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49751063 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49751134 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 49751418 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49752275 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49752277 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49752305 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49752505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49752601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49752620 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49752624 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49752720 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49752751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49752967 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 49753122 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49753328 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49753510 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49753522 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49753555 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49753601 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49753609 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49753695 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49753734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49754404 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49754407 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49754588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49754791 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49754887 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49754932 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49754976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49754983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49754987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49755151 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49755240 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49755272 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 49755332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49755468 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49755716 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49756078 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49756479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49756565 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49756667 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49756679 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49756723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49758784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49758908 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49759099 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49759250 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49759320 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49759355 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49759356 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49759533 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49759769 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49759832 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49759833 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49760003 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49760117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49760155 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49760287 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 49760351 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 49760530 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49760628 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49760689 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49760747 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49760793 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49760795 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49760957 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49761031 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49761439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49761447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49761476 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 49761492 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 49761509 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 49761572 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 49761695 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 49761699 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 2 49761811 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 49761957 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49762019 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49762382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49762625 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49762678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49762836 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49762866 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49762888 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49762939 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49763605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49763773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49765865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49766150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49767392 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49767532 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 49767596 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 49767687 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 49767854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49768190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49768316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49768581 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49768627 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49769042 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49769507 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49769512 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 49769602 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49769771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49769993 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49770090 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49770211 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49770274 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49770343 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 49770540 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49770627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49770675 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49770897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49770928 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 49770945 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49770989 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 49771270 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49771284 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49771419 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 49771425 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49771514 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49771657 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 49771796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49771819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49771975 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49772027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49772223 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 49772450 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 49774249 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 49774447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49776035 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49776256 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 49776774 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 49777164 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49777968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49778297 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 49780522 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 49780933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49782004 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 49782395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49782558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49782668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49782704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49782728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49785543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49786142 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49786253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49786604 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49787047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49787164 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49787185 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49787203 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49787215 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49787342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49787355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49787363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49787371 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49787376 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49787490 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 49787514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49787530 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49787542 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49787577 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49787586 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49787735 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49787780 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49787856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49787931 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49787981 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49788353 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 49788368 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 49788476 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 49788840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49789340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49789772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49790041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49791451 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 49791563 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 49791658 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49792172 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 49792369 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49792490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49792564 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49792626 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 49792711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49792774 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49792929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49793030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49793078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49793083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49793096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49793125 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 49793160 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 49793168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49793208 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 49793353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49793991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49794479 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49797188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49797559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49797789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49798966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49799245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49799396 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 49800050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49800769 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49801380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49802634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49802819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49804243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49807294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49807495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49808122 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49808234 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49808253 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49809145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49809649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49810438 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49810646 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 49810662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49811221 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49811603 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49811703 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49811711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49812006 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 49812041 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 49812061 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 49812091 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 49812152 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49812185 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49812279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49812556 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49812644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49812761 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49813291 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49815937 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49815980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49816537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49817660 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 49817693 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49817727 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 49817779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49817864 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49817912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49818022 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 49818219 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 49818439 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49818463 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49818467 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49818559 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49818560 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49818739 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49818761 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49818843 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49818905 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49818944 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49819008 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49819034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49819142 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49819301 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 49819441 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 49819531 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 49819590 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 49819637 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49819655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49819751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49819812 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49819881 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 49819990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49820158 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 49820232 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49820336 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49820381 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49820453 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49820505 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49820781 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49820793 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49820862 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49820899 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 49820992 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 49821195 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49821211 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49821277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49821381 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49822086 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 49822142 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49822195 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49822565 A C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 49822642 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49822869 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49823056 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 49823118 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49823298 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 49823358 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49823378 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49823505 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 49823847 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 49823894 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 49823897 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 49824134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49824328 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49824342 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 49824400 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 49824411 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49824836 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49825040 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 49825068 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49825602 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 49826253 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49826691 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49827499 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49827630 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49827783 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49827986 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49827995 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49828037 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49828092 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49828402 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49828437 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49828483 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49828979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49829022 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 49829088 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 49829092 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 49829115 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 49829501 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 49829506 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 49829558 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 49829639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49829660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49829725 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49829834 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49829920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49829948 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 49830088 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49830305 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49830394 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49830517 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49830546 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49830561 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 49830577 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49831372 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49831387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49831427 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49831619 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49831960 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49832114 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 49832218 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49832272 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 49832293 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49832790 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49833359 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 49833361 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 49833960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49834021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49834022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49834248 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49834324 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49834378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49834398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49834402 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49834456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49834729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49834981 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49835044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49835626 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49835654 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49835749 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 49835932 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49835942 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49835959 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49835972 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49836103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49836132 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49836189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49836264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49836388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49836574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49836596 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49836678 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49836680 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49836696 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49836767 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49836773 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49836782 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49836960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49836981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49837000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49837002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49837179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49837207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49837268 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49837328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49837332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49837362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49837604 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49837674 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49837749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49837930 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49837968 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49837969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49837991 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 49838231 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 49838262 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 49838382 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49838471 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 49838481 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 49838483 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 49838494 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 49838572 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49838598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49838639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49838696 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49838718 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49838756 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49838894 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 49839380 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49839381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49839432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49839487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49839713 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49839953 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49840135 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49840222 A T Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 49840428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49840541 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49840564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49840697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49840747 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49840781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49840886 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49840911 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 49840922 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 49841015 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49841056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49841111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49841146 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49841230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49841241 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49841296 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49841305 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49841449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49841503 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49841539 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 49841553 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49841829 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 49841927 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49841990 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 49842062 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 49842118 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 49842119 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 49842281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49842282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49842433 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49842769 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 49842792 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49842932 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 49843347 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 49843380 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49843595 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49843700 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 49843735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49843884 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49844303 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 49844304 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 49844436 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 49844883 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49844949 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49845064 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 49845150 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 49845162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49845176 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 49845637 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 49845774 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49845812 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49845850 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49845922 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49845975 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 49846057 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49846096 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 49846523 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49846579 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49846586 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49846611 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49846657 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49846684 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49846698 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49846764 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49846784 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49846798 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49846934 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49846948 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49846990 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 49847075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49847085 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49847175 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 49847232 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49847420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49847433 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 49847504 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49847803 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49847867 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49847958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49848001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49848016 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49848244 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 49848262 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49848345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49849453 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49849762 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 49849921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49850116 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 49850124 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 49850199 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49850232 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 49850248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49850318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49850402 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49850467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49850504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49850987 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49851756 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 49853009 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 49853458 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49853460 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49853836 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 49855083 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 49855731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49856218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49857791 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49857819 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49857906 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49858009 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49858090 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49858425 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49858452 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49858539 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49858549 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49858575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49858671 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49858706 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 49858711 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49858798 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49858845 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 49858916 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49858944 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49858957 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 49858990 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 49859046 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 49859105 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49859168 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 49859198 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 49859214 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 49859271 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49859456 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49859612 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49859803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49859807 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 49859977 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 49859987 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49860057 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 49860066 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 49860198 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 49860760 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49861730 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 49861992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49862891 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49863740 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 49864504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49864572 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 49864785 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 49864923 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 49865146 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 49865172 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 49865190 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 49865215 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 49865288 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 49865700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49865705 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49865780 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49865875 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49865878 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49866381 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49866390 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49866660 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 49867138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49867453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49867466 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49867568 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49868366 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49869636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49869730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49869831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49870650 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49871839 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49871983 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49873203 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49874240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49874546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49874789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49875613 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 49876453 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 49876850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49877226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49878705 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49878920 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49879938 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 49879963 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49880178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49880181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49880698 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49880703 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49880779 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49880961 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49880979 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49881067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49881104 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49881128 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49881138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49881297 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 49881487 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 49881512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49881529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49882016 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49882028 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49882102 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 49882116 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49882202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49882289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49882530 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 49882548 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 49882619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49882779 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49882852 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49882952 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49882959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49883481 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 49883673 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49884017 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49884089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49884156 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49884204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49884230 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49884427 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49884587 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49884662 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49884917 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49885474 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 49886283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49886615 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49887213 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49887283 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49887522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49887992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49888036 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49888052 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49888148 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49888296 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49888362 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49888534 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49888710 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 49888753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49888798 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49888846 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49889116 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49889141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49889751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49890127 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49890172 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49890240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49890282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49890654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49891474 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49891634 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 49891693 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 49892386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49892643 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49892888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49894864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49895404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49895568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49895857 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49896294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49896819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49897214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49898067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49899846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49899985 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49901028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49901774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49901852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49904168 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49905636 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49905765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49905816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49906040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49906226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49906242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49906271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49906329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49906710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49907181 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49907264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49907318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49907499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49907506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49907849 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49908141 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49908195 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49908439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49908464 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49908575 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49908661 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49908770 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49908787 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49908865 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49908884 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49908895 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49909132 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49909300 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49909404 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49909901 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 49910088 T C Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 49910454 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 49910574 A T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 49912471 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 49912891 A G Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 49913034 T C Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 49915987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49916503 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49918377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49918792 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 49921649 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49922226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49923899 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49923949 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49923951 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49924025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49924038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49924101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49924260 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49924276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49924317 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49924336 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49924364 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49924404 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49924652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49924684 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49924737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49924802 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49924950 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49925052 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49925078 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49925500 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 49925864 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49926016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49926375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49927351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49928910 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49929252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49929460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49931509 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49932449 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 2 49933483 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49933909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49934738 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49936475 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 49936513 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 49936516 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 49936831 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 49938546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49938584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49938609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49938621 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49938644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49939926 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49940022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49940721 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 49940723 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 49940939 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49941259 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49941295 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49941868 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49942017 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49942159 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49942208 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49942239 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49942342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49942421 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49942444 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49942488 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49942510 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49942522 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 49942527 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49942578 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49942642 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49942648 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49942701 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49942714 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49942852 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49942907 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49942912 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49942958 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49943092 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49943630 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49943939 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49944034 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49944047 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49944183 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49944226 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49944235 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49944242 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49944291 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49944411 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49944639 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49944674 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49944683 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49945247 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49945358 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49945466 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49946462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49947067 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49947094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49947424 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49947459 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49947776 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49947923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49948074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49948171 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49948890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49948978 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49949182 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49949838 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49950260 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 49950409 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49950802 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49951335 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49951368 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49951453 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49951697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49951708 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49952042 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49952098 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49952115 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49952143 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49952207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49952466 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49952624 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49952751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49952753 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49952827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49953071 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49953596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49953701 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 49954097 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 49954322 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49954337 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49954506 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49954817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49955163 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49955164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49955237 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49955518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49955746 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 49955796 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49955965 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 49955994 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49956164 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49956340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49956502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49956631 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49956632 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49956642 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49956666 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49956697 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49956824 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49956832 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 49956880 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49957152 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49957160 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49957372 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49957376 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 49957396 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49957478 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49957488 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49957501 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49957598 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49957629 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49957665 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49957691 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49957731 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49957735 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49957748 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49957791 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49957936 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 49958049 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 49958561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49958825 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 49958972 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49959088 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49959230 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49959240 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49959265 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 49959334 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49959536 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 49959991 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 49960535 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49960731 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 49961077 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49961839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49963015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49964479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49964704 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49964788 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49964847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49964857 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 49964934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49965094 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 49965146 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 49965245 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49965389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49965737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49965807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49966824 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 49967406 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49968460 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49968947 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49969081 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49969098 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49969150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 49969191 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 49969213 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 49969262 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 49969272 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49969291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49969337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49969403 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 49969544 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49969686 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49969704 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49969865 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49970075 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49970414 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 49970441 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 49970451 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 49970518 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49970802 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 49970894 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49970924 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49970948 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 49970976 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 49971011 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 49971056 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49971086 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49971117 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49971152 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49971213 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 49971246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49971295 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 49971343 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 49971386 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 49971389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49971489 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49971491 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49971586 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49971610 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 49971934 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 49971992 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 49972006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49972166 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 49972179 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 49972184 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 49972224 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 49972334 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 49972485 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 49972715 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 49972716 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 49972837 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 49972969 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 49973555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49973622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49974056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49974143 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49974628 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 49974682 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 49975594 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49975787 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 49976016 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 49976850 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49976983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49976999 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49977167 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 49977343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49977440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49977466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49977747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49977818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49978060 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 49978098 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49978344 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 49978398 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49978456 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49978584 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49978611 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49979893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49980036 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49980069 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49980274 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49980377 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49980635 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 49980796 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 49980935 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 49981075 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 49981109 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 49981182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49981407 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 49981536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49982205 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 49982324 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49982365 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 49982471 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 49982761 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49982809 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 49983016 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 49983388 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 49984008 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49984790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49984892 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 49985061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49985189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49985346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49985422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49985434 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49985487 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49985493 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 49985631 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49985698 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49985839 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 49985885 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49985979 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49986175 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49986266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49986310 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49986350 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49986453 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49986528 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 49986547 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 49986913 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 49987075 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 49987086 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 49987136 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 49987182 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 49987217 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 49987306 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 49987320 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 49987565 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 49987601 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49987625 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 49987626 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 49987642 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 49987644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49987876 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 49988714 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49988725 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49988732 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 49988912 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 49989395 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49989396 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49989486 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 49989509 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 49989582 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 49990057 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 49990103 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 49990260 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 49990328 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 49990392 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 49990453 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 49990647 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 49990671 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 49990682 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 49991089 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 49991429 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 49992109 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 49992172 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 49992260 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 49992865 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 49992896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49993135 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 49993191 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 49993986 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49994094 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 49994167 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 49995161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49996851 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 49997895 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49998277 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 49998395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49998835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 49999387 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 49999697 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 49999832 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 49999848 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 49999934 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 49999945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 49999982 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 50000092 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 50000413 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 50001082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50001098 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50001168 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 50001184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50001201 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 50001762 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 50001958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50002215 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50002913 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50003030 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50003114 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 50003169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50003321 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50003661 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 50003699 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50003782 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 50003845 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 50003907 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 50004035 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50004237 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 50004331 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50004499 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50004500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50004642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50004762 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50004772 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50004785 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50004832 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50004866 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50004896 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50004900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50004918 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50004925 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50004966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50004973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50005035 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50005086 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50006033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50006372 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 50006609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50006717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50006787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50006818 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50006821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50007178 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50007420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50007569 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 50007572 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50007648 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 50007660 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 50007671 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 50007701 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50007779 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 50009065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50009635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50009715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50010564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50012595 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 50012800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50012804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50012853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50012869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50012880 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 50013565 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50013637 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50013647 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50013673 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50013713 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 50014386 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50014460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50014741 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50014905 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50014906 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50014945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50014955 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50014989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50015002 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50015068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50015101 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50015122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50015185 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50015861 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 50015889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50016506 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50017049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50017782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50017832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50017863 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 50018791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50018824 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50018862 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50018902 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50018929 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50019566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50019648 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50019678 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50019703 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50019991 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 50020881 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 50021278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50021456 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50021540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50021619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50021620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50024388 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 50024416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50024613 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 50024615 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 50024989 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50025010 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 50025346 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 50025407 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50025692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50025982 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50026162 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 50026176 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 50026214 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 50026327 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 50026385 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 50026462 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 50026924 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50027250 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 50027758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50028544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50028550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50028796 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50029066 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50029433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50029744 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50030122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50031115 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 50031140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50031221 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 50031906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50032870 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 50032972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50033402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50033435 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 50033485 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 50033498 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 50033563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50033647 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50033891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50033948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50033978 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50034010 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 50034079 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 50034376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50034493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50034563 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50034677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50034762 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 50034826 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 50034889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50035211 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 50035217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50035809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50035941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50036131 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50036132 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50036268 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 50036386 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50036488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50036800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50037063 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50037091 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 50037101 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50037176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50037287 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 50037361 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50037591 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 50037643 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 50037801 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50037935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50038309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50038335 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 50038364 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 50038369 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50038633 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 50039023 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50039132 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 50039158 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50039174 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50039257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50039314 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50039794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50039826 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 50040158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50040170 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 50040234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50041042 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 50041116 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 50041117 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 50041873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50041917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50042058 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50042062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50042157 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50042168 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50042172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50042390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50042572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50042625 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 50042642 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 50043426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50043606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50043652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50044621 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50044662 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50044785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50044943 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50045191 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50045203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50045285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50045530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50045533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50045713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50045741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50045742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50045756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50045806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50046162 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50046436 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50046843 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50047042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50047427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50047844 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50047845 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50048331 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50048541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50048654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50048773 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50049224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50049853 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50049974 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 50050416 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50050748 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50050890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50051079 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50051080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50051266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50051310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50051330 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50051354 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50051518 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50051606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50051651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50051712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50051764 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50051773 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50051843 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50051847 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50051966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50051988 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50052001 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50052022 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50052069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50052108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50052220 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50052577 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50052596 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50052597 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50052685 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50052854 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50053099 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50053100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50053144 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50053185 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50053271 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50053306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50053788 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50054572 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50054597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50054685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50055050 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50055074 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50055087 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50055137 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50055316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50055536 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50055749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50056175 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50057147 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50058867 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50059262 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50059652 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 50060039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50060383 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50060516 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50061029 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50061754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50062452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50064138 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50064509 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50064965 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50065137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50065730 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50065834 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50066232 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50066572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50066795 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50067138 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50067269 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 50067323 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 50067661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50067743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50068133 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 50068267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50068406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50068735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50068853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50069403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50069437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50069537 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50070387 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50070783 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50070810 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50071291 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50071313 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50071377 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50071383 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50071461 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50071539 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50071833 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50071869 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50071966 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50071996 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 50072054 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50072107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50072177 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50072218 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50072364 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50072409 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50072451 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50072473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50072614 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50072633 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50072682 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50072701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50072929 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50073041 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50073255 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50073322 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50073435 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50073463 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50073524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50073679 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50073705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50073777 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50073856 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50074942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50075073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50075088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50075714 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50075923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50076837 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 50077082 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 50077210 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50078103 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 50078119 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50078202 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 50078372 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 50078381 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50078405 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 50078562 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 50078689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50078724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50079271 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 50079359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50079676 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 50079691 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50079903 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50079948 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 50080015 C G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 50080108 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 50080229 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 50080759 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50080796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50080827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50080999 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50081164 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 50081205 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50081248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50081261 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 50081340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50081482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50081483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50081929 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50081934 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50081983 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50084290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50084773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50085936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50088050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50088411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50088524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50088799 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50088849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50089043 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50089126 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50089416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50089557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50089657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50089678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50089692 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50089706 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50089709 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50089720 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50089751 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50089786 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50089794 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50089921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50089992 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50090011 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50090042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50090149 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50090158 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50090272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50090312 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50090580 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50090720 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50091990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50093342 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50093858 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 50095037 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50096458 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50096998 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50098309 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50098367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50098382 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50098919 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50098944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50099002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50099005 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50099362 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50099883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50099899 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50103028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50103120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50103394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50103863 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 50104018 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 50104023 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 50104191 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50104425 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 50105022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50105593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50105668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50106507 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50106536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50107643 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50107658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50107663 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50107682 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50107780 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50107809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50108200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50108260 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50108270 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 50108281 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50108349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50108436 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 50108704 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50108924 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50109449 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 50109547 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50109941 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50110148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50110459 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50111095 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50111483 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50111890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50111919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50111978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50112207 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50112520 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50112823 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50113150 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50113209 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50113312 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50115784 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50115795 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50115799 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50115806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50115948 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50116260 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50116288 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50116300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50116486 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50116986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50117083 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50117213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50117426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50117549 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 50117637 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50117701 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50117702 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50117794 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50117836 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50117870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50117874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50118019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50118159 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50118588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50118870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50118906 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50118930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50119022 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50119213 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50119257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50119260 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50119277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50119355 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 50119402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50119958 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50120175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50120642 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50120954 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50121082 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50121291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50121484 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50122247 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 50122327 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50122345 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50122386 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50122532 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 50122576 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50122585 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50122591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50122807 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 50123442 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 50123510 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 50123899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50123966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50124875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50125820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50125857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50127576 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50127584 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50127860 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 50128008 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50128364 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 50128718 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 50128917 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 50129520 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50129558 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50129694 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50129733 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50130264 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50130710 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50130774 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 50130888 T G N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 50131383 C A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 50131467 A T Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 50131507 T C Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 50131540 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 50131601 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 50132051 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 50132077 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 50132302 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 50132373 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 50132455 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50132568 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50132571 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50132686 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 50132748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50132795 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50132879 T G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 50133261 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 50133492 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 50134267 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 50134700 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 50134756 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 50134945 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 50135006 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 50135017 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 2 50135068 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50135086 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50135091 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50135205 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 50135542 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 50135711 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50136051 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50136058 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50136472 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50136493 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 50136578 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 50136579 G T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 50136718 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 50136764 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50136995 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50137461 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 50137608 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50138097 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50138107 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50138363 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50138451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50138726 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50138742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50138749 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50138942 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50139056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50139275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50139309 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50139512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50139773 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 50139802 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50139861 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50139867 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50139919 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50139981 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50140066 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50140157 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50140223 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50140345 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50140648 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50140670 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50140799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50140902 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 50140992 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50141046 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 50141239 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 50141429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50141436 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50141530 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 50141531 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 50141547 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 50141614 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 50141847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50141920 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50142008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50142057 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50142106 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50142185 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 50142222 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50142478 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 50142537 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50142636 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50142931 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50143405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50143598 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50143630 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50143642 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50143655 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 50143750 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50143896 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50144141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50144308 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50144347 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50144365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50144558 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50144656 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50144764 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 50145309 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50145522 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50146069 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50146121 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50146252 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50146264 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50146404 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50146428 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50146557 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50146733 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50147148 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 50147616 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50147652 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50147672 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50147759 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50147814 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50147870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50148781 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50148942 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50149014 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 50150083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50150161 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50150421 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50150487 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50150585 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50150795 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50150881 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50150912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50151041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50151073 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50151496 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50151642 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 50152423 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50152927 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 50153059 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 50153499 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50153738 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50153796 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50153878 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 50154200 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50154482 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 50154527 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 50154899 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 50155015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50155145 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 50155317 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50155331 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 50155353 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 50155772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50155815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50155830 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50156450 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50156989 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50157082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50157108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50157279 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50157704 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50157782 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50157830 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50158177 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50158178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50158199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50158222 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50158277 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50158283 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50158373 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50158432 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 50158463 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 50158707 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50158822 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 50159378 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50159381 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50159461 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50159474 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50159560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50159617 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50159762 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50159924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50160023 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50160160 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50160279 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50160406 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50160447 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50160470 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50160515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50160526 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50160557 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50160767 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 50160788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50160954 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50160966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50161228 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50161245 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50161273 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50161319 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50161758 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50161915 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50162002 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50162010 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50162021 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 50162038 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 50162162 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50162225 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50162250 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50162261 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50162268 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 50162300 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50162395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50162754 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50162787 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50162874 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50162888 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50163058 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50163084 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50163122 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50163136 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50163344 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50163358 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50163407 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50163460 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50163562 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50163602 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50163705 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50163775 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 50163835 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50163910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50163960 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50163963 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50164120 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50164173 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50164525 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50164944 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 50164948 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50165167 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50165254 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50165273 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 50165444 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50165509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50165661 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50166124 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50166191 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 50166456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50166606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50166735 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50167156 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50167188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50167206 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 50167707 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50167734 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50169131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50169903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50170067 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50170228 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50170441 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 50170880 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 50170940 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 50170956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50171365 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 50171402 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50171427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50171483 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 50171503 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50171610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50171690 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 50171766 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50171925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50172001 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 50172201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50172254 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50172565 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 50172738 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 50172763 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50172855 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50172899 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 50172911 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50173138 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50173150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50173192 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50173610 A G N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 50173699 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 50173743 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 50173899 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50173950 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 50174014 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 50174026 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50174334 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50174350 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 50174410 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50174843 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50174944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50174951 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 50175087 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 50175194 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50175234 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 50175334 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50175385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50175472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50175503 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50175853 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50175905 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50175958 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50175962 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 50176026 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50176091 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50176185 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 50176203 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 50176476 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50176520 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50176885 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50177091 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 2 50177285 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 50177327 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50177791 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50178196 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 50178210 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 50178245 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50178278 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 50178334 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50178889 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50181376 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50183863 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 50184576 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 50184596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50184612 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 50184660 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50184923 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50185076 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 50185137 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 50185260 T C Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 50185331 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 50185414 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 50185435 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50185895 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50185911 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50186154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50186409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50189050 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50189644 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50189681 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50189842 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50189926 C A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 50190017 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 50190454 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 50191038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50191200 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50191769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50194165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50194354 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 50194905 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50194914 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 50195558 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 50196081 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50196234 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50198311 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50198995 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 50199469 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50199471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50199485 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50199878 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50200274 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 50200292 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 50200406 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50200407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50201141 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 50201183 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 50201772 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50201795 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50201838 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50202117 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50202239 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 50202253 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50202471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50202524 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 50202704 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 50203040 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50203051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50203437 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 50203506 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 50203597 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 50203605 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 50203664 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 50203721 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 50203772 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50203773 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50204035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50204039 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50204165 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 50204325 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50204493 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 50204514 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 50204593 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50204646 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 50204658 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 50204885 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50204918 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50205034 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 50205079 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50205087 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50205192 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50205230 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50205315 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50205616 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 50205738 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50205741 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50205803 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50205838 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 50205969 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50206069 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50206108 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50206123 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50206146 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50206286 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 50206340 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 50206382 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 50206714 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 50207477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50208318 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 50208413 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 50208438 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 50208470 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 50208473 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50208558 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50209295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50209576 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 50209764 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 50209809 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50209976 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50210081 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50210863 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50210882 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50211077 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50211260 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50211602 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50211833 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50212020 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 50212198 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50212208 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50212253 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50212254 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 50212441 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50212499 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50212555 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50212597 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50212622 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50212653 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50212996 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 50213094 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50213287 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50213330 T G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 50213670 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50213729 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50213737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50213780 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 50213838 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 50214134 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50214200 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 50214369 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50214380 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50214400 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 50214523 G T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 50214546 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50214677 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50214926 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50214947 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50215043 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50215169 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50215188 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 50215401 A C Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 50215437 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 50215444 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 50215463 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 50215491 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 50215504 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 50215591 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 50215759 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 50215815 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50215842 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50215880 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 50216214 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50216252 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50216561 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50216605 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50216895 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50217496 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50217620 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50217621 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50217635 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50217686 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50217881 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 50217893 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 50217902 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 50217960 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50217980 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50217982 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50218002 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 50218158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50218390 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50219566 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50220776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50220859 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50221520 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50221557 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 2 50221938 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50222028 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50222295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50222595 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50222874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50222894 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 50222946 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 50223028 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 50223052 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50223094 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 50223132 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 50223175 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 50223345 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 50223414 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 50224363 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50224483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50224570 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50224604 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 50224787 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50224814 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50224945 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50225009 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 50225049 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 50225272 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50225300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50225475 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 50225496 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 50226345 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50226407 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50226474 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50226501 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50226512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50226606 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50226681 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50226760 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 2 50227110 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50227127 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50227259 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50227309 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 50227360 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50227365 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50227417 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50227430 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50227439 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50227492 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50227505 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50227511 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 50227592 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50227753 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50227785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50227868 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50227870 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50227948 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50227994 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50228010 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50228150 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50228201 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50228714 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50228850 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50228952 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50228954 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50228969 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50229147 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50229372 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50229419 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50230068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50230101 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 2 50230146 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50230208 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 50230353 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 50230425 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 50230672 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50230783 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50230806 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50230968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50231353 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50231379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50231420 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50231499 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50231501 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50231569 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50231625 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50231856 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 50231873 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 50232053 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50232064 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50232115 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50232373 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50232457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50232886 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50233300 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50234187 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50234480 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50234696 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50235677 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50237236 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50237325 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50239656 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50239657 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 50239731 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 50240722 G T Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 2 50241478 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50243339 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 50247339 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 50249007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50249056 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 50249792 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 50249957 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 50249982 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 50250294 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50250473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50251055 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50251139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50251172 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 50251356 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 50251358 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50251824 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 50251854 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 50251985 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50252002 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50252089 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50252162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50252243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50252725 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50252865 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50252945 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50252971 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 50252981 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50252988 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50253179 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50253412 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50253590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50253651 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50253658 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50254085 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50254217 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50254290 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50254326 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50254592 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50255445 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 50255717 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 50255811 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50255869 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 50255891 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50255902 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50255910 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50255968 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50256268 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50256287 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50256501 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50256527 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50256591 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 50256658 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 50256743 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50256826 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50256890 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50256904 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50256915 A C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50256981 T C Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 50257116 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 50257132 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 50257137 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 50257365 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 50257424 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50257530 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50257639 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50257646 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50257657 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50257832 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50257860 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50257896 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50258045 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 50258253 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 50258268 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 50258332 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50258378 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 50258449 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 50258488 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 50258610 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 50258664 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50258768 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50258888 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50258927 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50259131 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50259250 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50259311 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50259314 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50259424 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50259425 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50259469 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50259540 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50259557 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 50259642 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50259782 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 50259909 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 50259978 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 50260109 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 50260118 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 50260184 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 50260199 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 50260262 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 50260319 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 50260367 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 50260384 G C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 50260404 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 50260435 G A Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 50260442 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 50260446 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 50260514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50260547 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 50260739 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50260762 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50260836 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50261372 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50261824 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50261946 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50262013 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50262401 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50262592 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50262718 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50262836 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50263142 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50263213 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50263272 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50263381 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50263487 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50263612 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50263713 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 50264083 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50264123 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50264139 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50264319 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50264435 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50264644 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50264663 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50264684 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50264700 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50264729 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50264761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50265447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50265462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50265521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50265553 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 50265576 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 50265625 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50265938 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50266035 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 50267085 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50268220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50268605 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 50271404 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 50272705 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 50272862 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50273727 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50277572 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50279702 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 50282549 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50282565 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50282751 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50282853 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 50282897 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50282934 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50283269 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50283565 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50283567 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50283776 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50283805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50283820 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50283888 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 50283987 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 50284291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50287366 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 50287612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50288253 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50288512 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50288547 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50288562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50288688 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50288690 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50288731 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50288855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50288872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50288976 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50289021 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 50289041 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 50289088 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50289128 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50289198 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50289272 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50289416 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50289730 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50289801 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50289933 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50289943 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 50289980 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 50290102 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50290127 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50290197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50290206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50290220 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50290348 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50290538 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50290678 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50290746 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50290769 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50290849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50290914 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50290946 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50290957 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50290976 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50291085 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50291105 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50291108 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50291323 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50291345 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50291346 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 50291423 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50291436 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50291444 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 50291502 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50291578 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50291581 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50291698 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50291701 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50291770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50291865 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50291955 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50291973 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50292135 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50292156 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50292159 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50292341 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50292370 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50292453 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50292597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50292620 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50292824 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50292874 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50292927 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50292942 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50292948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50292966 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50293019 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50293031 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50293069 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50293099 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50293522 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50293586 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50293588 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50293790 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50293803 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50294156 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50294161 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50294258 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50294287 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50294354 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50294395 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50294465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50294518 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50294557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50294992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50295105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50295262 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50295283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50295465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50295634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50295636 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50295722 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50295725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50295737 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50295803 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50295840 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50295861 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50295966 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50296139 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50296204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50296315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50296409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50296450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50296722 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50296734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50296979 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50297365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50297457 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50297509 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50297640 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50297868 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50297875 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50297890 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50297939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50297969 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 50298066 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50298093 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 50298117 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 50298154 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50298344 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50298769 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50299176 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50299294 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50299322 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50299325 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50299555 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50299768 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50299904 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50300109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50300190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50300210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50300379 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50300611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50300661 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 50300671 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50300935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50301048 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50301159 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50302546 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50302592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50302865 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50302913 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50303023 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50303357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50303542 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50303795 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50303889 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50303921 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50304048 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50304196 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50304607 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50304679 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50304895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50304896 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50305074 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50305251 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50305598 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50305625 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50305950 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50306040 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50306061 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50306180 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50306646 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50306679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50306756 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50307456 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50307557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50307737 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50307909 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50307945 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50307946 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50308727 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50308820 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50308956 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50309080 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50309203 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50309246 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50309316 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50309661 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 50310036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50310151 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50310281 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50310294 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50310325 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50310339 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50310423 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50310476 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50310974 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50311078 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50311289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50311471 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50312511 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50312982 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 50313625 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50313632 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50314257 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50314408 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50315711 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50316401 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50316823 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50316912 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50316929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50316971 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50317091 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50317159 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50317174 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50317195 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50317673 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50317716 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50317769 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50317959 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50318312 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50318503 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50318655 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50318656 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50318812 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50318863 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50319065 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50319691 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50320029 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 50320235 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 50320775 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 50321247 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50321760 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50321765 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50322312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50322460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50322694 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50322695 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50322868 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50322902 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50323073 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50323185 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50323190 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50323234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50323428 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50323503 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 50323545 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 50324082 A C Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 50324168 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 50324284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50324829 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50325048 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50325130 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50326670 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50326768 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50326826 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50326891 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 50326982 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 50327220 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50327259 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50327260 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50327444 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 50327460 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50327533 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50327766 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50327780 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 50327924 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 50329104 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 50329679 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50329860 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 50330044 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50330076 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 50330093 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50330106 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 50330204 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50330313 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50330430 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50330565 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 50330704 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 50330889 G C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 50331253 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50331431 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50331591 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50331635 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50331703 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50331815 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50331897 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50331918 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50331977 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50332381 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50332435 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50332436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50332590 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50332959 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50333180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50333452 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50333613 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50333726 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50333910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50333971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50334096 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50334358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50334447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50334463 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50334656 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 50334853 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50335093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50335132 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50335275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50335307 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50335536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50335960 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50335989 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50336036 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50336546 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50336596 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50336636 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50336774 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50336802 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50336864 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50336869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50336962 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50337007 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50337228 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50337265 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50337277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50337543 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50337563 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50337643 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50337670 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 50337679 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50337704 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50337748 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50337974 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50338035 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50338147 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 50338150 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 50338334 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50338365 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50338435 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50338487 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50338503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50338583 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50338601 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50338605 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50338653 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50338665 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50338769 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50338776 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50338836 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50338872 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50339044 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50339095 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50339141 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50339188 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50339289 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50339542 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50339554 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50339589 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50339689 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50339796 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50339898 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50339931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50339963 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50340105 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50340132 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50340835 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 50340940 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 50340996 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 50341017 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 50341074 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 50341093 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 50341103 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 50341314 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50341511 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50341546 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50341723 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50341756 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50341813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50341846 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50342075 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50342153 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50342375 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50342551 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 50342580 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 50342718 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50342842 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50342862 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 50342896 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 50345293 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50345572 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50345785 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50345901 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50345956 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50346139 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50346219 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 50346623 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50346902 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 50347023 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50347238 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50347276 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50347353 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50347371 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50347862 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50347925 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 50348397 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50348448 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50349231 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 50349475 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50349513 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50349664 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50350251 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50350423 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50350571 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50351288 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 50351438 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50351463 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50351791 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50351912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50351943 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50352002 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50352836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50354142 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50354216 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50354339 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50354692 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50355063 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50357351 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50357893 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 50358787 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50359738 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50360122 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50360183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50361193 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 50362409 T A Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 50363474 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 50364540 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50364827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50365104 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50365315 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50365590 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50365605 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50365631 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50365767 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 50365896 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50366160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50366363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50366482 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50366488 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50366567 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50366617 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50366647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50366731 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50366732 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50366993 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50367008 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50367132 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 50367415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50367479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50367525 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50367682 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50367815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50368124 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50368140 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50368319 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50368339 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50368352 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50368536 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50368564 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50368685 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50368698 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50368740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50368808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50369276 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50369281 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50369365 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50369425 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50369731 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 50369865 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 50370492 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 50370642 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50371465 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50371604 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50371644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50371954 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50372371 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 50372373 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 50372402 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50372710 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50372770 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50372908 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50373054 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50373077 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50373240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50373477 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50373539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50373616 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50373954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50374371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50374378 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50374838 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50374879 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50374988 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50375000 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50375446 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 50375448 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50375472 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 50375887 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50375909 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50375994 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50378543 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50378956 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50378962 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50379002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50379049 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50379209 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50379212 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50379231 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50379261 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50379280 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50379300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50379348 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 50379770 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50379771 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50380527 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 50381946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50383000 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50388222 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50388912 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50389145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50389231 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50389394 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50389396 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50389412 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50389432 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50389805 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50389999 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50390252 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50391488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50391648 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50391787 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50391857 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50391923 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50392202 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50392386 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50392917 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50393027 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50393153 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50393162 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50393207 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 50393240 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50393318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50393528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50393570 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50393798 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50394008 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 50394242 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 50395806 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50395915 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50396163 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50396467 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50397363 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 50397641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50397874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50398098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50400028 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 50400822 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50400878 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 50403257 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50406614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50406910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50407074 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50407228 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50407306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50407370 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50407475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50407947 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50408234 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50408389 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50408391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50408694 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50408995 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50409064 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50409230 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50409400 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50409462 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50409564 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50409625 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50409641 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50409696 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50409711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50409798 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50410000 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50410047 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50410123 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50410178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50410198 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50410396 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50410442 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 50410443 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50410481 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50410513 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50410542 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50411192 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50411216 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50411278 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50411403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50411501 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50411596 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50411726 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50411799 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50411877 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50411903 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50411904 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50412045 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 50412220 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50412512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50412546 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50412574 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50412618 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50412636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50412648 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50412766 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50412775 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50413271 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 50413272 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50413476 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50413611 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50413913 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50414156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50414305 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50414334 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50414381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50414383 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50414468 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50414863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50415319 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50415436 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50415579 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50416167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50416249 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50416498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50416610 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50416658 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50416782 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50417289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50417300 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50417485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50417515 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50417550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50417603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50417610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50417671 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50417733 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50417770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50417853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50417990 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50418221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50418289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50418386 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50418391 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50418445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50419334 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50419382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50419482 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50419895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50419898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50419959 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50420026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50420237 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50420376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50420747 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50421586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50421636 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50421650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50421712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50421751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50421757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50421772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50421773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50421788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50421934 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50421936 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50421985 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50422028 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50422062 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50422111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50422233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50422382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50422507 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50422622 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 50422838 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50423516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50423874 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 50423879 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 50423916 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 50423947 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 50424027 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 50424220 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 50424630 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50424707 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50424898 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50424919 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50425027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50425166 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50425538 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50425593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50425812 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50425906 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50425959 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50425967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50426002 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50426003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50426033 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50426056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50426081 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50426088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50426111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50426228 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50426509 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50426520 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50426565 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50426726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50426729 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50426897 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50427036 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50427068 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50427069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50427125 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50427310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50427476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50427525 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50427613 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50427623 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50427740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50427746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50427781 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50427796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50427815 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50427829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50427835 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50427852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50427944 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50427953 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50428059 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50428140 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50428177 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50428234 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50428277 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50428278 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50428374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50428601 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50428607 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50428908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50428933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50428949 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50428950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50429001 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50429345 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 50429373 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50429604 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50429793 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50429887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50430112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50430160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50430216 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50430482 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50430510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50430561 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50431260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50431629 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50431650 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50431662 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50431670 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50431931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50431942 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50432395 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50432509 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50432622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50432847 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50433161 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50433163 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50433198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50434116 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 50434119 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 50434146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50434272 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 50434446 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 50435249 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 50435578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50435584 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50435608 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50435635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50435787 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50435945 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50436046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50436070 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50436199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50436224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50436272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50436286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50436317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50436320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50436387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50436449 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50436756 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50436794 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50437219 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 50437386 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 50437448 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 50437453 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 50437473 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 50437516 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 50437534 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 50437588 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 50437632 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50437713 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 50437736 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50437973 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 50438035 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 50438299 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 50438354 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50438363 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 50438512 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 50438729 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 50438889 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 50438904 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 50439112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50439200 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 50439357 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 50439441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50439461 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 50439491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50439697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50439831 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50439939 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50440048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50440049 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50440060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50440404 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50440422 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50440457 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50440575 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50440750 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50440770 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50440925 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50440941 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 50440984 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50440998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50441037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50441295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50441313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50441647 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50441678 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50441740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50441767 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50441778 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 50441935 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50442512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50442562 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50442725 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50442740 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50442845 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50443482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50443539 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 50443594 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 50444029 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50444495 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50445087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50445140 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 50445299 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50445343 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50445511 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50445564 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 50445665 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50445698 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 50445711 A G Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 50445738 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 50445954 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 50446161 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50446963 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50446965 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50447043 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50447097 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50447131 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50447143 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50447179 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50447198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50447249 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 50447254 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 50447481 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50447972 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50448245 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50448634 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50448699 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 50448727 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50448755 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 50448937 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50449069 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50449081 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50449203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50449217 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50449276 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 50449301 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 50449310 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50449341 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50449342 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50449418 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 50449487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50449507 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 50449846 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50449967 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50450043 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50450054 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50450100 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50450117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50450135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50450162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50450189 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50450363 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50450405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50450602 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50450609 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 50450854 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50451120 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50451251 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50451311 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50451453 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50451494 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50451588 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50451634 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 50451651 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50451707 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 50451715 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 50451720 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50452005 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50452154 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 50452221 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 50452253 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 50452568 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 50452666 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 50452698 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50453014 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 50453685 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50453922 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 50454116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50454166 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50454197 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50454199 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50454234 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50454321 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50454532 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50454537 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50454605 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50454642 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50454686 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50454797 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50454812 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50454932 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50454998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50455018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50455064 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50455087 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50455129 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50455408 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50455513 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50464121 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50464128 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50464198 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50464301 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50464352 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50464387 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50464436 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50464453 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50464540 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50464676 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50464724 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50465023 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50465033 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50465055 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50465070 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50465198 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50465203 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 50465271 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 50465329 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50465352 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50465754 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50466032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50466351 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50466646 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50466750 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50467043 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 50467272 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50467797 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50467836 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50467995 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50468081 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 50468126 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 50468130 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 50468160 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 50468208 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 50468209 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 50468316 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 50468344 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 50468359 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50468371 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50468443 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50468514 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50468560 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50468784 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50468908 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50468989 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50469014 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50469029 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50469169 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50469177 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50469180 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50469206 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50469293 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 50469380 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 50469567 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50469795 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50469851 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50470143 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 50470287 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50470312 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50470329 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50470355 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50470611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50470655 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50470720 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50470732 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50470763 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50470778 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50471254 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50471287 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50471290 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 50471325 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 50471408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50471725 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50472115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50472163 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50472405 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 50472425 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50472763 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50472797 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50472844 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50473076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50473090 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50473116 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50473187 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50473267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50473402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50473479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50473626 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50473641 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50473651 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 50473698 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50473700 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50473783 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50473957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50474032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50474054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50474090 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50474203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50474307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50474319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50474328 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50474393 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50474404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50474466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50474525 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50474549 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50474575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50475526 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50475755 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50475849 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50475935 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 50476179 C G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 50476563 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 50476933 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 50477001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50477030 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50477065 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50477330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50477541 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50477546 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50477962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50477991 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50478243 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50478377 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50478451 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50478506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50478593 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50478800 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 50478847 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 50479173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50479738 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50479770 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50479788 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50479805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50479882 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50480090 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50480091 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50480157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50480295 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50480505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50480546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50480606 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50480642 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50480647 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50480676 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50480721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50480903 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50481460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50481472 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50481857 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50482195 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50482319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50482333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50482378 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50482608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50482653 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 50482811 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 50482915 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 50482920 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 50482926 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50482935 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50482978 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50483193 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50483206 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50483302 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50483357 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50483370 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50483390 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 50483435 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 50483472 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 50483478 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 50485352 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 50486348 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50486771 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50487219 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50487291 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50487473 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50487843 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50488182 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50488409 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50488518 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 50488743 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50489122 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 50489288 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 50489313 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50489441 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50490092 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 50490164 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50490460 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50490677 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50491275 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 50491455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50491987 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 50491988 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 50492381 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50492408 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 50492538 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50492588 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 50492615 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50492654 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50492868 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 50493332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50493377 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50493398 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50493583 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 50493686 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50493693 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50493875 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50494105 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50494124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50494196 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50494209 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50494212 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50494253 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50494427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50494518 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50494520 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50494581 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50494653 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50494678 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50494916 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50494929 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50494963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50495006 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50495024 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50495665 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 50496327 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50496422 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50496520 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 50496557 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50496573 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50496710 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 50496986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50497073 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50497079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50497105 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 50497219 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50497384 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50497588 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50497617 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50497668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50497825 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50497868 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50498338 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50498349 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 50499192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50499200 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50499467 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 50499542 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50499620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50499931 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 50500159 G T Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 50500480 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 50500582 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50501596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50502087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50502414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50503055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50503076 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50504071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50504859 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50505791 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 50506035 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 50506625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50507294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50509438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50509499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50511739 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50512253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50514699 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 50514845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50514943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50515102 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 50515177 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 50517062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50517154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50518618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50518770 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50519306 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50520061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50521022 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50521034 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50521955 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50522211 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50523347 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50523800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50525909 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50526836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50526851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50526873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50526929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50527010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50527111 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50527372 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50527402 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50527439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50527445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50527529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50527589 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50527596 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50527614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50527652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50527656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50527699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50527754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50527878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50528013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50528044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50528077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50528088 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50528211 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50528319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50528376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50528382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50528387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50528436 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50528535 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50528570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50528921 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50528985 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50529040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50529069 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50529085 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50529091 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50529206 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50529212 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50529290 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50529294 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50529304 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50529447 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50529554 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50529693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50529779 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50529799 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50529863 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50530039 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50530054 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50530125 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50530166 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50530182 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50530196 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50530203 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50530606 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50530838 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50530949 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50531102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50531128 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50531313 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50531632 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50531679 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50531692 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50532060 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50532077 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50532086 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50532090 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50532099 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50532181 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50532187 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50532196 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50532254 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50532262 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50532382 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50532432 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50532515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50532589 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 50532640 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 50532646 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50532810 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50532827 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50533184 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50533240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50533696 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50533805 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50534196 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50534550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50534651 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50534865 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50534869 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50534970 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50535045 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50542445 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50542509 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50542535 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50542564 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50542573 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 50542575 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 50542593 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50542596 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 50542670 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50542934 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50542942 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50543168 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50543203 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 50543639 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50543892 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 50543937 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50544361 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50544497 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50544566 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50544644 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50544726 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50544757 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50544763 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50544877 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50544902 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50544952 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50545112 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50545115 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50545203 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50545246 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50545312 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50545347 G T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 50545777 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50545906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50546459 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50546606 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50546708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50546814 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50546865 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 50546868 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 50547104 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 50547124 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50547206 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50547426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50547737 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50547757 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 50547838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50547856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50547870 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50548311 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 50548350 T A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 50548482 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50548552 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50548576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50548633 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50548686 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50548780 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50548784 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50549420 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50549695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50549774 C A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 50549938 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50549962 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 50550055 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 50550119 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50550170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50550215 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 50550223 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 50550788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50551668 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 50551926 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50552057 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50552173 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50552208 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 50552306 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 50552374 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50552390 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50552601 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50552920 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 50553057 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50553160 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50553182 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50553537 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50553569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50553570 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50553760 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 50553774 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50553899 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 50553989 C T Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 50554119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50554219 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50554505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50554508 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 50555042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50555227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50555432 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 50555437 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 50555446 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 50555517 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 50555571 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50555583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50555586 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 50556078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50556100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50556439 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50556498 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50556542 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50556692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50556755 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 50556878 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50556905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50556962 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50556973 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 50557110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50557119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50557196 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50557197 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 50557226 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50557246 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50557365 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50557476 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50557494 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 50557537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50557549 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 50557582 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 50557657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50557720 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 50557728 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 50557858 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 50557968 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 50558154 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50558452 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 50558482 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50558484 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50558528 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50558598 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 50558606 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 50559296 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 50559345 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 50559392 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 50559419 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 50559424 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 50560054 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50560161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50560164 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50560206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50560435 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50560444 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50560756 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 50560977 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 50561819 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50561848 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50561871 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50561990 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50562059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50562168 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50562185 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 50562749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50562754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50562830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50562931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50562991 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50563202 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 50563222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50563251 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50563252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50564015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50564101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50564199 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50564528 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 50565058 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 50565061 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50565862 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50566778 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 50567028 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50567584 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50568185 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 50568574 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 50569733 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50570043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50570279 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50570327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50570981 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 50571067 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50571151 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50572776 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50573155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50573159 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 50573374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50574018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50574319 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50574596 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50576068 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 50577731 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 50577745 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 50577795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50577991 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50578071 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 50578107 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 50578516 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 50578546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50578571 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 50578687 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 50578696 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50578699 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50578711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50578727 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 50578855 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 50579225 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 50579385 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50579467 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 50579526 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 50579555 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50579714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50579794 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50579811 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50579830 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50579836 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50580050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50580876 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 50580897 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 50581449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50581616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50581628 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50582456 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 50582702 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 50582857 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 50582951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50582988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50582990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50583029 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 50583078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50583202 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 50583429 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 50583598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50583731 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50583961 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50583995 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 50584063 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 50584104 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 50584107 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 50584266 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50584534 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 50584694 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 50585013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50585073 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 50585146 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 50585273 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50585579 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 50585850 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 50585946 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 50586025 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 50586354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50586442 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50586479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50586510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50586610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50586807 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50586933 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50587129 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50587152 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50587170 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50587231 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 50587324 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50587346 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50588119 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 50588169 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 50588203 A T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 50588210 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 50588247 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 50588549 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 50588582 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 50588583 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 50588642 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 50588749 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 50588887 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 50588959 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 50589112 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 50589186 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 50589248 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50589340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50589369 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50589504 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 50589543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50589639 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 50589817 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 50589940 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 50590077 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 50590124 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50590132 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 50590187 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50590318 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50590574 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50591056 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50591105 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50591276 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 50591326 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 50591430 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 50591549 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50591655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50591785 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50592052 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50592056 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50592235 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50592360 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 50592362 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 50592503 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50592644 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 50592703 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 50592709 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 50592822 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 50592831 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 50592856 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 50592905 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 50592948 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50593125 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 50593518 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50593521 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50593598 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 50593670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50593716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50594158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50594196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50594604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50594616 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 50595133 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 50595840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50595997 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50596029 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50596156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50598309 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50598325 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50598671 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50598683 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50598806 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50598932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50598981 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50599122 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50599194 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50600163 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50600193 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50600197 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50600653 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50600824 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50600903 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 50601074 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50601419 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 50601644 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 50601689 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 50601721 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 50601846 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 50601952 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 50602033 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50602067 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50602105 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50602173 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 50602255 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50602342 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50602515 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50602591 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50605179 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 50605639 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50605809 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 50605833 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 50605837 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50606127 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50606250 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50606260 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50606379 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50606462 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50606478 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50606549 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 50606589 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50606681 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50606753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50606785 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50606813 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50607042 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50607073 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 50607295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50607525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50607580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50607663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50607800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50607891 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50607907 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50607948 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50607959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50608072 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50608081 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 50608553 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 50609077 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50609160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50609368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50609762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50609923 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50609956 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50609966 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50609973 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 50610133 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50610175 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50610223 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 50610229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50610329 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 50610348 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50610469 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 50610529 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50610530 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50610603 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 50610655 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50610737 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50610881 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50610911 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 50610963 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 50611064 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50611073 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50611120 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50611322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50611457 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50611611 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50611680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50611902 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50612391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50612766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50612820 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50612901 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50612920 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50612921 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50613188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50613191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50613239 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50613281 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50613471 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50613852 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 50613882 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 50613913 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 50614008 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 50614035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50614349 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 50614392 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 50614458 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 50614460 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50614592 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 50615404 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50615452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50615461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50615544 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50616623 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50616695 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50616728 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50616809 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50617087 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50617119 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 50617139 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 50617251 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 50617302 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 50617356 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50617494 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50617507 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50617705 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 50617868 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50617893 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50617933 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50618182 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50618192 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50618220 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50618236 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50618312 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 50618369 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 50618377 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 50618403 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 50618457 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 50618651 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 50618652 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 50618693 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 50618755 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 50618757 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 50618796 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 50618841 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50618884 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 50618919 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 50618920 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 50618950 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50619062 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50619200 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50619281 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50619514 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50619559 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 50619590 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 50619655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50626254 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50626277 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 50626534 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 50626564 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 50626566 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 50626627 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50626700 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50626781 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50626811 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50626985 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 50627180 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50627478 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50627561 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50627982 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50628044 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 50628465 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50628867 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50629112 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50629430 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50630074 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50630625 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 50631252 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50631295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50631818 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 50632179 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 50632423 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50632509 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 50632781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50632937 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50633213 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 50633361 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 50633541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50633784 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 50633806 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 50633884 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 50633965 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50633973 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50634134 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50634431 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50634515 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50634745 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50634769 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50634793 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50634923 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50635376 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 50635623 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50635626 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50635732 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50635817 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50635836 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50635862 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50636241 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 50636252 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50636352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50636403 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50636569 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50636617 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50636789 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50636897 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50636986 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50637045 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50637067 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50637084 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 50637096 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 50637111 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 50637162 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50637299 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50637440 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50637485 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 50637601 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 50637915 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50637954 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50638055 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50638165 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50638189 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50638218 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50638378 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50638404 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 50638405 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 50638625 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 50638747 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 50638915 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50638917 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 50639054 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50639086 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50639327 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50639651 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50639715 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50639871 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50640014 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 50640046 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 50640049 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50640151 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50640228 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50640309 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50640311 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50640590 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 50640766 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 50640828 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 50640925 G A N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 50641015 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50641038 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 50641062 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50641159 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 50641180 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50641222 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 50642101 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50642339 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 50642394 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 50642578 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 50642797 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50643051 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 50643103 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 50643217 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 50643389 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50643438 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 50643563 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 50643857 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 50644303 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 50644392 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 50644421 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 50644829 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50645033 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50645386 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 50645712 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 50645755 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 50646571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50646658 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50646778 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50647168 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50647476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50647673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50648086 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50648452 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50648538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50648539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50648615 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50649455 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50650087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50650142 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50650646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50650651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50650739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50650938 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50651210 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 50651256 C G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 50651415 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 50651432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50651550 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 50651732 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 50652136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50653656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50654281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50654296 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50654317 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50654813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50655007 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50655760 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50655813 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50655900 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50656019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50657635 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50658386 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 50658398 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 50658453 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50658543 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50658561 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50658620 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 50658840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50658874 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50659013 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 50659028 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 50659088 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 50659127 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50659206 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50659229 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50659343 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 50659351 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50659522 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50659633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50659972 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50659987 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50660116 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50660163 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50660179 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50660182 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50660310 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 50660497 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50660562 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50660677 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 50660995 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50661126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50661348 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50661519 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 50661587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50661593 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50661621 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50661622 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50661726 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50661983 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 50662053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50662144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50662304 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50662362 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50662413 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50662510 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50662532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50662742 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 50662768 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50662781 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 50662797 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 50662800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50662808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50662919 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50663530 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 50663720 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 50664068 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50664087 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 50664090 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50664119 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 50664731 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50664810 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50665287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50665381 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50666382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50666822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50666882 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50667941 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 50668104 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50669117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50669311 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50669415 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50669462 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50671303 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50671407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50672524 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50672700 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 50672734 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50672833 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50673212 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50673252 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50673269 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50673348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50673532 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50673541 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50673718 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50673862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50674004 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50674048 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50674393 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50674498 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50674662 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50674854 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50674898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50674959 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 50675000 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50675223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50675239 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50675369 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50675400 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50675867 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50676014 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 50676399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50676439 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 50676486 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 50676592 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 50677159 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50677195 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50677196 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50677212 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 50677398 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50677622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50678035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50678053 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50678090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50678109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50678110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50678120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50678245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50678340 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50678373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50678571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50678574 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50678651 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50678876 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50678877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50679233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50679528 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 50679718 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50679742 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50679877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50680339 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50680606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50680619 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50680630 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50680688 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50680957 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50680972 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50680996 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50680997 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50681036 A C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50681091 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 50681111 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 50681179 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50681294 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50681701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50682130 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 50682158 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 50682269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50682347 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50682400 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50682413 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50682595 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50682600 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 50682621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50682640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50682714 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50682744 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 50682843 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50683311 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50683337 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50683506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50683560 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50683567 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50683779 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50683821 C T Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 50683857 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50683983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50684051 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50684841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50684944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50685372 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 50685427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50685487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50686153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50686221 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50686461 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50686466 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 50686492 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 50686866 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 50686874 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50686890 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50687393 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50687422 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 50687486 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 50687518 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 50687536 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 50687614 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 50687619 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 50687648 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 50687759 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 50687789 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50687820 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50687926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50688205 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50688327 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50688376 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50688462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50688485 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50688528 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50688537 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50688641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50688867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50688877 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50688892 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50688904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50688906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50689107 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50689189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50689261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50689478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50689653 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50689708 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50690045 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 50690063 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50690107 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50690390 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50690397 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50690487 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50690533 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50690543 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50690619 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50690707 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50690750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50690941 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 50690949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50691013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50691092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50691211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50691906 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 50691961 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 50692019 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 50692205 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50692684 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50692717 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50692835 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50692861 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50693242 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50693251 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50693410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50693429 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 50693447 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50693506 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50693545 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50693633 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 50693732 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 50693740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50693801 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 50693832 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50693909 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 50693916 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 50694011 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 50694154 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 50694229 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50694331 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 50694853 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50694862 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50695024 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50695242 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 50695432 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 50695460 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 50695500 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50695585 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50695607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50695614 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50695641 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50695649 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 50695664 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50695763 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50695785 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50695928 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50696069 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50696086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50696123 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50696169 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50696179 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50696215 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50696667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50696702 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50696838 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50696839 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50696938 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 50697017 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50697061 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50697383 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 50697442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50697455 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 50697462 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50697584 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 50697708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50697814 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50697823 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 50698083 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 50698100 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 50698504 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50698606 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50698757 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50698798 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50699414 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 50699474 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 50699504 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50699531 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 2 50699583 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 50699799 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 50699878 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50700003 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50700098 C A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 50700107 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 50700124 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 50700393 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50700413 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 50700493 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50700522 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50700974 C A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 50701454 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 50701663 C A Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 50701676 C A Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 50701686 T C Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 50701708 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 50701835 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 50701889 G T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 50702170 T C Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 50702364 A G Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 50702482 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 50702647 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 50702693 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 50702813 C T Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 50703044 T G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 50703109 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 50703466 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 50703503 C T Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 50703533 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 50703561 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 50703738 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 50703776 C A Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 50703919 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 50703949 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 50704311 G A N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 2 50704656 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50704714 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50704754 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50704759 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50704800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50704922 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50704940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50705045 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50705189 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 50705345 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50705611 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50705637 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50706161 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50706676 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50706775 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50707259 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50707449 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 50707468 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50707498 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 50707525 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50707598 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 50707732 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 50707787 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 50707793 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 50707834 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50708012 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50708051 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 50708303 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50708548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50708632 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50708659 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50709036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50709508 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50709605 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50709653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50709714 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50709730 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 50709778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50709890 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50709923 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50710336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50710394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50710477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50710554 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 50710605 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50710620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50711017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50711070 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50711072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50711355 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 50711399 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 50711732 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50712707 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50712799 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50712895 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50713212 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50713561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50713926 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50714158 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50714577 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50714593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50715000 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50715069 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50715255 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50715346 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50715550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50715593 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50715772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50715985 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 50716102 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 50716205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50716364 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50716439 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50716494 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 50716498 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 50716807 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 50716926 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50716949 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50717094 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 50717189 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 50717240 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 50717246 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 50717353 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50717359 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50717592 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50718018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50718587 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50718969 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50718987 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 50718988 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 50719165 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 50719213 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 50719333 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50719525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50719585 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50719610 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50719849 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 50720997 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50722314 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50722551 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50722640 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50722655 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50722716 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 50722917 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50722932 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 50722945 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 50723243 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50723327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50723462 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 50723505 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50723531 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50723614 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 50723706 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 50723752 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 50723770 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 50723784 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 50723791 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 50723808 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50723825 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50723859 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 50723886 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 50723930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50723975 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 50724083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50724100 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50724102 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50724175 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 50724317 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50724337 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 50724394 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50724395 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50724585 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50724594 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50724601 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50724611 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50724613 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50724776 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 50724800 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 50725059 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50725075 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50725092 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50725125 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50725238 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50725257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50725432 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50725493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50725547 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50725726 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50725743 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50725889 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 50725925 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 50725932 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 50725950 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 50725959 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50725972 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50726081 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50726167 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 50726302 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 50726312 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 50726380 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 50726870 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50727006 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50727051 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50727137 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50727256 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 50727270 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 50727331 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50727366 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 50727397 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 50727862 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50728107 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 50728124 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 50728177 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50728203 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 50728365 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50728811 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50728814 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50728825 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50728972 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 50728993 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 50729004 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 50729025 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50729041 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 50729055 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50729165 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50729332 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 50729374 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 50729381 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 50729569 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50729842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50730015 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 50730290 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 50730331 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50730556 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50730854 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 50730971 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50731055 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50731126 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50731163 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 50731179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50731200 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50731208 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50731323 G T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 50731330 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 50731357 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50731358 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50731374 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 50731391 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 50731399 T A Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 50731476 T G Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 50731496 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 50731562 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50731813 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50732125 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 50732262 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50732284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50732392 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50732397 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 50732462 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 50732580 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 50732631 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50732858 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50732977 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 50733008 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 50733040 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 50733157 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 50733567 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 50733892 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50733993 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 50734042 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50734050 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50734076 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50734141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50734370 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50734422 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50734448 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50734476 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50734572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50734618 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50734673 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 50734710 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 50734833 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 50734837 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50734951 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50734969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50734975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50735006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50735111 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50735114 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50735159 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50735171 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 50735223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50735452 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50735555 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 50735792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50735867 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 50736216 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50736220 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736228 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736236 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736245 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736247 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736266 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50736269 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736352 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736362 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736398 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50736414 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736437 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736440 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736450 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50736492 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736503 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736619 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736696 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736700 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50736735 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736762 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50736803 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50736854 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 50736884 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 50736896 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50736907 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 50737062 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50737350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50737418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50737601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50737638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50737651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50737711 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50737757 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50737776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50737782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50737829 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50737990 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50738087 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50738174 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50738301 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50738306 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50738358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50738388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50738411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50738481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50738485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50738547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50738595 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50738616 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50738663 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50738695 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50738780 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50738782 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50738962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50738969 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50739056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50739087 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50739134 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 50739175 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50739257 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 50739287 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 50739295 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50739447 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50739549 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 50739678 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 50739739 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 50739842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50739900 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50739901 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50739990 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 50740015 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 50740079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50741367 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50741473 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50741515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50741520 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50741564 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50741597 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50741852 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 50742116 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 50742303 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 50742428 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 50742445 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 50742547 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 50742634 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 50742639 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 50742733 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 50742734 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 50743056 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 50743157 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 50743471 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 50743804 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 50744484 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50745418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50745505 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 50746031 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50746772 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50746814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50746904 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 50747007 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50747081 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 50747121 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 50747282 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 50747310 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50747331 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50747367 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 50747368 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 50747410 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 50747434 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 50747439 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 50747458 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50747564 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 50747662 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 50747733 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 50747806 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50747904 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 50747940 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 50747984 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 50748064 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50748086 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 50748094 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 50748161 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 50748280 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 50748355 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 50748363 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 50748387 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 50748844 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50749000 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50749088 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50749099 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50749571 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 50749676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50749719 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50749800 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50749817 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 50749916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50750048 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 50750059 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50750094 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 50750095 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 50750117 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50750127 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 50750214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50750298 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50750432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50750448 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50750615 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 50750861 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 50751015 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 50751354 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 50751359 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 50751728 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50751743 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50752030 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50752041 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 50752094 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 50752207 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50752618 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50752634 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50752836 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 50752894 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.266666666666667 22 8 11 0 4 2 50753076 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.357142857142857 17 11 8 1 5 2 50753959 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 50754057 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50755519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50755617 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50755663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50755859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50756026 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50756167 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50756175 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50756223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50756226 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50756237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50756259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50756271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50756352 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50756382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50756400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50756575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50756764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50756800 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50757114 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50757622 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50757712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50757762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50757814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50757955 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50758065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50758423 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50758751 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 50759007 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 50759229 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50760651 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50761200 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50761206 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50761227 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50761297 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50761325 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 50761336 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 50761346 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 50761376 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 50761400 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 50761440 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 50761446 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 50761451 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 50761491 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 50761583 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 50761690 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50762403 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 50762693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50762853 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50763078 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50763470 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50763499 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50763515 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50763557 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50763778 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50763839 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50764216 C A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 50764247 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 50764258 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 50764356 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50764392 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 50764404 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50764454 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50764489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50764621 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50764661 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 50764676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50764700 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50764747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50764871 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50764916 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50764917 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50765020 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 50765034 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50765085 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50765123 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50765181 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 50765190 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50765237 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50765251 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50765278 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50765389 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 50765558 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50766276 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50766607 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50766615 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50767189 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50767200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50767314 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50767329 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50767504 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 50767611 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50767639 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50767841 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50767941 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50768048 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 50768119 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50768146 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50768373 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50769396 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 50769405 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 50769456 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50769544 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 50769595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50769597 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 50770235 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 50770376 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 50770380 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 50770765 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 50770947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50770962 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50770963 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50771017 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50771162 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50771166 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50771378 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 50771539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50771836 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50772230 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50772438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50773116 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50773136 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 50773250 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50773270 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50773397 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 50773545 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50773552 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50773599 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50773628 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50773765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50774556 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 50774650 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 50774753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50774926 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50775269 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50775452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50775497 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 50776111 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50776158 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50776222 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50776340 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50776790 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50776869 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50776926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50777381 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 50777616 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 50778007 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 50778310 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50778368 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50778466 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50778504 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 50779746 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50780387 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50780565 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 50781628 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 50781672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50781749 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50782136 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50782145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50782216 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50782264 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50782282 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 50782594 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50782606 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 50782631 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50782639 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50782835 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50782848 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 50783033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50783088 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50783112 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50783215 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50783513 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50783577 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50783592 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50783614 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50783764 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50783874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50783885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50784069 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50784450 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50784588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50784740 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50785155 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50785434 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 50785446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50785501 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50785670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50786134 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50786238 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 50786700 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50786887 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 50786976 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50787150 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50787160 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50787255 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 50787256 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 50787483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50787676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50787926 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50787936 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 50787943 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 50788019 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 50788069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50788086 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 50788208 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50788823 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50788872 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50789540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50789935 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 50789945 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 50789962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50790007 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 50790072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50790331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50790359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50790387 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50790794 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 50790801 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 50791176 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 50791236 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50791239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50791262 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 50791320 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 50791357 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 50791394 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50791403 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 50791424 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 50791516 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 50791537 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 50791559 T A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 50791655 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 50791666 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50792178 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50792331 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 50792667 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50792783 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 50792879 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50792935 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50793466 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50793531 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50793764 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 50793876 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 50794198 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50794253 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 50794368 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 50794463 C G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 50794499 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 50794774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50795998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50796196 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50796280 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50796606 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50796632 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50796649 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50796686 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50796703 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50796808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50797075 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50797108 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50797137 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50797186 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50797274 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50797323 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50797340 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50797572 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50797573 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50797612 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50797635 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50797645 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50797744 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50797850 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50797968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50798064 G C Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 50798174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50798207 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50798384 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50798386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50798871 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50799199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50799354 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 50799689 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50799820 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50799859 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50799883 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 50799917 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50799932 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50800009 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50800160 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50800171 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50800460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50800697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50801026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50801643 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 50801769 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50802032 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 50802150 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 50802262 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50802361 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 50802984 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50803007 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50803063 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50803149 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50803175 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50803224 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50803419 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 50803420 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 50803505 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50803741 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 50803860 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50804149 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 50804823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50804916 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 50805428 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50805477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50805499 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 50805570 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50805763 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50805791 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 50805798 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50805937 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50806156 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 50806170 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 50806323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50807096 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 50807503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50807524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50808130 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50808418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50808442 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 50808488 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 50809263 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50809432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50809597 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 50810315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50810809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50810930 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 50810971 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50810974 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50811025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50811087 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 50811136 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 50811185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50811314 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50811803 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50811817 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 50811859 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50812534 T G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 50812594 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 50812604 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 50812649 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 50812912 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 50813000 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50813106 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 50813143 T A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50813445 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 50813484 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 50813618 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 2 50814046 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 50814420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50814455 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50814522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50815239 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 50816096 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50816125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50816290 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50816296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50816301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50816321 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50816354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50816404 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50816416 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50816446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50816544 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50816602 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50816610 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50816644 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50816659 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50816684 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50816716 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50816750 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50816760 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50816768 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50816771 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50816853 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 50816861 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 50816965 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50816972 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 50817047 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50817080 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 50817085 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 50817154 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50817198 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 50817428 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50817429 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50817463 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50817464 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 50817535 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50817546 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50817565 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50817582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50817697 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50817791 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50818005 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50818113 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50818118 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50818148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50818152 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50818215 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50818230 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50818262 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50818279 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50818284 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50818339 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50818348 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50818351 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50818378 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50818432 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50818452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50818565 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50818576 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50818615 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50818706 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50818880 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50818956 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50819135 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50819207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50819298 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50819721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50819829 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50819946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50819969 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50820044 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50820107 C G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 50820123 T G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 50820272 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50820276 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50820352 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50820393 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50820486 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50820534 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 50820551 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50820713 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 50820788 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50820803 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50820911 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50820923 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50820944 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 50820956 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50821595 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 50821621 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50821667 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50821695 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50821946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50821966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50822053 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 50822057 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50822513 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 50822534 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50822907 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50823344 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50823393 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 50823423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50823457 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50823812 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 50823966 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50824326 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50824382 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50824583 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50824700 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 50824844 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50824858 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50824864 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50825404 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50825578 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50825670 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50825782 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50825859 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 50826172 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50826192 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 50826619 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50826660 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50826681 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50827482 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 50827486 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 50827586 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 50827612 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 50827947 A T N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 9 11 1 7 2 2 50827986 G C N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 8 10 1 6 2 2 50828316 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 50828377 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 50828431 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50828463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50828681 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50828732 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50828785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50828985 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50829149 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 50829338 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50829348 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50829433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50829463 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50829493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50829898 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 50829905 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50829937 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50830065 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 50830242 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 50830288 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 2 50830292 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50830332 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50830375 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 50830402 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 50830463 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50830513 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 50830520 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50830547 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 50830558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50830634 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 50830637 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 50830646 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 50830800 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50831020 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50831408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50831503 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50831560 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 50831690 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50831772 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50831802 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50831805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50831894 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50831988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50832016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50832025 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 50832056 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50832114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50832124 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50832178 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50832349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50832401 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50832475 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50832681 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50832700 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50832736 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50832757 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50832808 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50832813 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50833345 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50833520 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50833553 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50833637 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50833862 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 50834025 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50834117 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50834141 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50834243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50834307 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 50834420 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50834455 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 50834467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50834514 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 50834541 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 50834548 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 50834557 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 50834674 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50834704 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50834798 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50835030 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50835045 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 50835060 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50835061 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 50835257 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50835292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50835515 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 50835586 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 50835592 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 50835660 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 50835662 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 50835720 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 50835764 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 50835786 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50835802 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 50835815 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 50835822 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 50835882 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 50835940 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 50835969 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50836155 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 50836163 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 50836168 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 50836174 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 50836187 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 50836232 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50836277 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50836291 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 50836400 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50836422 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50836468 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50836494 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 50836526 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50836546 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 50836564 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50836576 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50836585 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50836642 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50836654 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50836709 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50836718 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50836721 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50836872 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50837100 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 50837166 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 50837310 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50837319 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50837330 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 50837342 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50837465 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50837643 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50837693 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50837697 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 50837713 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50837773 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50837835 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50837884 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50837912 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 50837922 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 50837957 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50837987 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50838090 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50838172 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 50838198 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50838536 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 50838537 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50838554 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 50838629 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50838644 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 50838657 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 50838758 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50838876 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50838888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50838898 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50838910 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50839004 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50839041 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50839047 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50839070 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50839071 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50839092 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50839336 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50839374 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50839519 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50839533 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 50839535 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 50839587 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50839734 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50839786 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50839842 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 50839873 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50839911 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50840014 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50840094 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50840338 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50840439 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 50840480 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 50840696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50840726 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50840799 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50840831 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50840907 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50841086 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50841120 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50841171 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50841194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50841219 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 50841280 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 50841307 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50841360 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50841484 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50841517 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50841527 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50841571 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 50841580 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50841703 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50841871 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50842003 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50842015 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50842187 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50842238 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 50842353 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 50842368 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 50842404 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 50842408 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50842416 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 50842430 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50842442 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 50842483 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 50842558 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50842646 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50842721 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 50842733 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 50842785 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 50842802 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 50842847 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 50842891 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 50842899 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50842905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50842910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50842925 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 50842956 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50843003 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50843007 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50843072 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 50843081 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50843242 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50843287 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50843291 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50843301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50843430 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 50843441 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50843469 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50843471 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 50843509 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 50843588 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50843616 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50843739 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50843771 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 50843825 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 50843996 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 50843998 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 50844065 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50844069 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 50844219 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50844263 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50844362 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50844495 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50844663 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50844685 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 50844811 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50844870 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 50844963 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 50845010 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50845098 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 50845111 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50845157 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50845368 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 50845505 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 50845519 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50845610 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 50845699 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50845806 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50845916 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 50845950 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 50845967 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 50856293 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50856334 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 50856371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50856476 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50856574 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 50856624 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50856644 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 50856659 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 50856802 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 50856903 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50857104 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 50857272 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50857381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50857617 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 50857619 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50857780 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 50858446 A C N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 50858484 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 50858694 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50858753 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50858764 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50859014 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50859059 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 50859083 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 50859314 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 50859557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50859679 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50859704 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50859732 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 50859734 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50859744 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50859767 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 50860071 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 50860202 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 50860242 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 50860995 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50861005 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50861090 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50861398 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50861512 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50861524 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 50861753 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 50861776 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50861792 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 50861999 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50862040 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 50862047 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 50862111 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50862218 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50862409 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50862444 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 50862486 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50862507 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50862590 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50862602 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50862658 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 50862668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50862888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50862941 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50863188 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 50863330 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 50863383 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 50863685 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 50863738 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 50863756 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50864714 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 50864735 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 50864751 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 50864793 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 50865113 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50865145 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50865146 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50865193 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 50865213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50865257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50865481 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 50865819 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50865922 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 50866177 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50866342 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50866382 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50866395 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50866460 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50866474 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50866484 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50866909 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50866962 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 50867058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50867284 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50867341 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50867384 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50867402 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50867422 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50867448 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50867501 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50867658 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50867798 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50868188 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 50868256 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 50868824 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 50868977 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 50869004 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 50869075 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50869134 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 50869240 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50869287 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50869323 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50869326 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50869340 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50869373 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 50869388 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 50869446 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50869471 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 50869667 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 50869674 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50869751 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 50869787 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 50869899 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 50869919 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 50869947 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 50870138 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50870142 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 50870288 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 50870292 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50870324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50870415 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50870424 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50870493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50870550 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 50870581 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50870622 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50870878 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50870910 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 50871260 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50871274 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50871284 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50871311 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50871336 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50871457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50871458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50871732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50871888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50871898 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50872520 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50872568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50872581 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 50872603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50872624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50872625 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50872887 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 50873254 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 50873267 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50873509 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 50873537 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 50873597 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 50873730 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 50873838 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 50874001 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50874002 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50874131 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50874166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50874475 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 50874514 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50874569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50874648 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50874737 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50874764 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50874794 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50874821 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50874825 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50874846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50874912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50874967 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 50875099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50875119 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50875143 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 50875203 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50875302 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 50875457 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50875592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50875808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50875989 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50876254 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50876581 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 50876640 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50876673 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 50876767 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 50876777 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 50877196 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 50877556 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50877670 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50877740 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 50877755 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50878088 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 50878144 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50878159 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 50878196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50878417 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50878500 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50878537 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 50878551 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50878559 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50878611 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50878660 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50878754 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50878755 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50878779 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 50878813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50878846 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 50878857 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50878902 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 50878905 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 50878951 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 50879046 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 50879130 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 50879155 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 50879281 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50879591 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50880211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50880212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50880368 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 50880379 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50880580 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50880754 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 50880774 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 50881188 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50881211 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 50881426 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 50888352 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 50888363 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 50888449 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 50888459 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 50888475 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 50888513 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 50888617 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 50888703 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50888724 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50888731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50888847 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50889086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50889928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50890260 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50890810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50891219 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 50892333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50892489 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50892551 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50892565 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50892568 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50892728 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50892946 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50893051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50893248 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 50893367 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 50893381 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 50893416 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50893575 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 50893745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50894653 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50894921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50895638 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50895956 C A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 50896026 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 50896061 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50896084 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 50896130 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 50896192 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50896455 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 50896526 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 50896645 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50896657 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 50896914 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50896926 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50896953 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50897014 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 50897066 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50897116 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50897512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50897596 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 50898213 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50898277 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 50898333 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50898362 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50898446 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 50898488 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50898508 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50898512 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50898551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50898621 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50898640 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50898739 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50898803 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50898896 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 50898963 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50898991 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50899007 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50899026 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50899063 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50899071 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50899083 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50899234 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50899237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50899290 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 50899300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50899566 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50899585 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50899619 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50899690 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50899833 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50899968 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50900010 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50900033 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50900200 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50900220 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50900280 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 50900294 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 50900344 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50900441 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50900550 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50900647 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 50900671 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50900742 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50900763 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50900782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50900793 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50900827 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50900980 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50901054 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50901082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50901117 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50901119 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50901137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50901350 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50901435 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50901514 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 50901586 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50901893 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 50902001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50902027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50902223 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50903023 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 50903211 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 50903340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50903482 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50903507 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 50903735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50904455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50904463 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 50904566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50904750 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 50904914 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 50904987 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 50905019 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 50905040 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 50905197 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 50905262 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50905270 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50905375 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50905441 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 50905493 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50905545 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 50905674 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50905798 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 50908016 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50908063 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 50908128 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50908274 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50908750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50908772 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50909082 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50909140 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50909192 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50909332 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 50909504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50909824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50910001 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50910043 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50910066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50910125 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50910212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50910215 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50910509 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50910687 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50910700 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 50910722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50911292 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 50911744 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 50912112 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50912116 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 50912157 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 50912162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50912405 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50912430 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50912445 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50912468 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50912501 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50912526 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50912686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50912719 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50912727 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50912743 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50912845 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50912936 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 50912962 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50912990 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50913031 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 50913038 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 50913118 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 50913152 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50913227 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 50913283 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 50913341 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 50913356 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 50913473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50913685 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50913726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50913881 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50913926 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50913985 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50913991 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50914000 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50914054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50914349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50914405 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 50914468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50914482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50914750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50914840 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50915034 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50915077 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50915079 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50915170 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50915247 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50915910 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50915954 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 50915965 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50916015 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 50916069 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50916121 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50916274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50916333 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50916442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50916582 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50916593 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50916603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50916982 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 50917033 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 50917242 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 50917301 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 50917305 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 50917319 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 50917360 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 50917700 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50917798 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50917838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50918075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50918295 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 50918506 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 50918621 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50918713 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50918774 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 50918896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50919120 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 50919148 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50919208 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 50919217 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 50919234 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 50919360 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50919435 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 50919437 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 50919560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50919656 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50919859 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 50919904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50920318 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 50920650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50920676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50921444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50922446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50923157 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50923312 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50923379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50923615 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50923689 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 50923766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50923905 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50923909 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50923917 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50924028 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 50924035 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50924232 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50924479 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50924740 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 50924970 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50925037 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 50925345 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50925586 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 50925610 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 50925654 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 50925703 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 50925741 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 50925807 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 50925847 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50926119 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 50926189 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50926202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50926349 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50926380 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50926394 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50926413 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50926424 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50926491 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 50926601 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50926715 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50926723 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50926733 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50926951 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 50926995 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50927073 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50927074 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50927137 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50927214 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 50927235 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50927261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50927668 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 50927791 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50927965 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50928070 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 50928093 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50928104 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 50928160 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 50928164 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 50928512 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50928527 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50928615 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 50929200 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50929222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50929381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50929763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50930379 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 50930763 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 50930839 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50930860 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50930913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50930998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50931002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50931134 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50931220 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 50931304 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 50931459 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50931571 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50931585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50931708 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 50931729 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 50931863 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50931922 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 50932202 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50932234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50932584 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50932908 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50933002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50933024 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50933164 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50933179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50933197 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50933279 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50933459 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 50933601 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50933720 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50934987 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 50935263 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50935735 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50935781 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 50935853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50936016 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50936097 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50936432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50937710 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50938201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50938474 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 50938539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50938710 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50938884 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50939042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50939086 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50939103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50939187 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50939267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50939315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50939638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50939696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50939833 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 50940014 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 2 50940395 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 50940865 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50941128 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50941341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50941384 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50941904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50941965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50942036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50942522 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50942574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50943099 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50943753 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50943755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50943781 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50943789 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50943932 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 50944362 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50944658 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50944679 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50944708 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50944808 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50944818 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50944827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50944859 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50944864 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50945040 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50945114 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50945369 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50945410 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50945632 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50947572 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 50947615 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50947773 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 50948730 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 50948841 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50949116 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50950075 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50950134 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50950248 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50950346 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50950922 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50951177 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50951485 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 50951890 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50951920 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50952041 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50952075 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50952134 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50952277 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 50952298 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 50952467 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 50952475 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50952807 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 50953130 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50954040 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50954297 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 50954831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50955338 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 50955375 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 50955423 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50955442 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50955465 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 50955609 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50955842 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 50956237 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50957103 A T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 50957870 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50957964 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50958361 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 50958594 A C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 50960338 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50960685 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 50960786 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 50960931 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50961280 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50961289 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50961376 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50961419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50961449 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50961517 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 50961615 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 50961687 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50961903 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50961964 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 50963465 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 50963855 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 50963913 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50964253 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50964275 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50964825 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50964950 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50965017 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50965062 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 50965594 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 50965729 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 50966339 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 50966433 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50966450 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50966629 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 50966720 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 50967655 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50967974 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 50968011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50968630 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50968830 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50969226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50969240 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 50969445 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 50969450 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50969695 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50969945 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50970224 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50970281 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50970388 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 50970497 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 50970506 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 50970528 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 50970565 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 50970652 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 50970654 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 50970695 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 50970713 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50970842 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 50970874 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50971039 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 50971156 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 50971223 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 50971260 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 50971630 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 50971769 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 50971894 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 50972015 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50972168 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 50972292 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50972316 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50972606 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 50972633 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 50972651 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 50972824 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 50973005 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 50973227 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50973232 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 50973255 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 50973788 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 50974162 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 50974346 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50974418 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50974477 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 50974537 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50974567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50974624 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 50974691 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50974813 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50974927 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 50974936 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 50975000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50975804 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50975871 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50975890 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50975976 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 50976225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50976625 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 50977170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50977332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 50977618 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 50977631 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 50977640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50979792 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 50979805 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50979809 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 50979871 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 50979899 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 50979979 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 50979998 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50979999 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50980049 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 50980061 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 50980089 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 50980092 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 50980103 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 50980185 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 50980338 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 50980341 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 50980462 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50980475 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 50980486 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 50980850 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 50980963 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50981003 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 50981032 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 50981076 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50981152 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 50981425 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50981900 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50982136 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 50982211 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50982246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50982415 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 50983228 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 50983921 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 50983981 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 50983982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50984062 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 50984089 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50984220 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50984241 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 50984286 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 50984317 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 50984599 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50984676 A T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 2 50985045 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50985260 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 50985370 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 50985730 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 50986313 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50986386 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 50986652 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 50986877 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50986920 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 50986986 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 50987349 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50987374 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 50987511 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 50987518 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 50987741 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 50987743 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 50988470 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 50988663 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 50988682 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 50988708 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50988760 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 50989086 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 50989257 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 50989261 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 2 50989293 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 18 18 2 14 2 2 50989726 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 50990054 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 50990320 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50990467 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50990477 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50990602 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50990617 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50990782 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 50991027 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 50991167 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 50991222 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 50991252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 50991420 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 2 50991708 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 50991907 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50992287 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50992639 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50992846 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50992944 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50993012 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 50993115 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 50993170 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 50993377 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50994484 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50994942 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 50995022 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 50995068 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 50995369 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50996312 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 50996550 G C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 50996674 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 50996704 C A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 50996732 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 50996772 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 50997021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50997131 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 50997457 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 50997515 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 50997615 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 50997661 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 50997750 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 2 50998199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 50998797 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 2 50999285 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 50999382 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 50999547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 50999924 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 2 50999993 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 51000197 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51000637 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51000860 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 51001775 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51002376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51003945 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 51004185 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51005420 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51005565 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 18 18 2 14 2 2 51005578 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51005715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51005842 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 51005867 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51005899 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51006091 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51006189 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51006195 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51006269 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51006349 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51006382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51006462 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51007180 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 51007991 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51008273 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51008303 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51008375 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51008601 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51008669 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51008992 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51009041 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51009311 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 51009342 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51009363 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51009395 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51009760 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51009792 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51009947 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51010099 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51010134 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51010259 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51010891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51011236 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51011239 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 51011830 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51012060 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51012332 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 51012495 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 51012694 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51012735 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51012748 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51012753 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51012810 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51012831 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51012841 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 51012955 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51013344 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 51013458 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 51013756 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 51013776 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 51013822 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 51013888 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51013983 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51014081 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 51014094 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 51014101 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 51014275 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51014354 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51014837 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51014839 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51014872 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51014878 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51014883 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51014949 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51015072 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 51015073 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 51015428 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 51015598 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 51015682 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51015709 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 51015782 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 51015842 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51015926 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51016441 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51016498 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 51016676 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51016733 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51016798 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51016856 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51016933 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51017519 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 51017581 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51017598 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 51017644 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 51017777 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51018167 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51018357 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51018394 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51018478 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51018490 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51018732 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 51018738 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 51019417 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 51019760 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51019816 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51019834 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51020036 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 51020118 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51020126 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51020165 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51020270 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 51020405 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51020513 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 51020803 G T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 51020887 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 51020942 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 51020992 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 51021024 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 51021047 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 51021081 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 51021101 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 51021135 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 51021356 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 51021397 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 51021398 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 51021441 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51021523 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 51021568 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51021572 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51021600 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 51021742 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 51021752 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 51021778 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51021814 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51021908 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 51021960 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51021981 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51022466 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51022988 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51024001 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 51024235 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51024451 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51024803 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 51025121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51025228 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51025926 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51026201 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51026295 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51026722 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51026766 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51026775 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51027296 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51027593 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51027659 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 51027933 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51027959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51028064 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51028155 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51028164 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51028543 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51028551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51028607 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51028608 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51028743 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51028759 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51028798 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51028835 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51029132 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51029161 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51029171 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51029192 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51030618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51030914 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51031815 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51031986 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51032184 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51032522 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51032610 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51032624 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51033082 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51033135 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51033479 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51033615 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 51033923 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51034344 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 51034566 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51034648 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 51034664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51035076 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51035078 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51035095 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51035172 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51035175 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51035214 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51035431 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51035547 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51035821 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 51035954 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 51035986 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51036050 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51036206 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51036383 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51036399 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51036484 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51036614 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51036617 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 51036645 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 51036735 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51036959 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 51037347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51037830 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 51037857 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51038333 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51038407 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51039225 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 51040034 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51040269 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 51040329 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 51040337 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51040614 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 51040688 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 51040728 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 51040979 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 51041250 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 51041379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51041539 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51041558 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 51041715 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 51041906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51042446 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51042491 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 51043222 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51043246 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51043254 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 51044744 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51044845 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 51044966 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51045602 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51045818 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51045906 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51046380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51046744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51046983 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51047642 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51047846 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51048198 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51048407 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 51048553 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51048569 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51048607 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51048632 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51048770 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51048789 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51048841 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51048852 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51048867 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51048911 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51049036 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 51049062 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51049107 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 51049242 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51049247 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51049396 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51049534 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51049709 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 51049774 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 51049975 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51049990 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51049993 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51050066 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51050240 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51050262 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51050389 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 51050446 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51050729 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 51050870 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51050910 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 51050997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51051211 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51051264 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 2 51051728 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 51052519 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 51052541 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 51052901 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 51052955 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 51053465 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 51053873 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 51054116 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51054632 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 51054772 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 51054788 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51054805 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51054819 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 51054948 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51054972 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51055307 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51055361 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51055586 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51055853 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51056127 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51056215 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51056223 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51056251 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51056262 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51056273 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51056427 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51056697 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51056891 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51057218 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51057219 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51057749 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51057912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51057938 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51058265 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51058455 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51058647 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51058773 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51058807 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51059015 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51059193 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51059402 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 51059447 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51059452 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51059704 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 51059716 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 51059824 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 51060118 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51060262 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51060583 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51061101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51061457 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51061750 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 51061857 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51062097 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 51062210 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51062388 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51062534 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51062745 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51062901 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51063023 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51063193 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51063551 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51063738 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51064316 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 51065335 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51065927 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 51066217 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51066286 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51066390 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51066394 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51066835 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51067567 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51067591 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51067631 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51067690 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 51067757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51067808 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 51067809 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51067841 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 51068032 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 51068078 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51068094 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51068136 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 2 51068137 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51068247 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 51068278 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 51068330 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51068377 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51068530 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 2 51068642 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51068784 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 2 51068915 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 51068927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51068965 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51069016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51069048 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 51069067 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 51069081 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 51069084 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51069132 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51069140 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 51069151 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51069155 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51069201 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 51069205 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 51069219 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 2 51069252 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 51069337 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51069378 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 2 51069419 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 51069425 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51069457 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 51069511 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51069595 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51069664 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 51069666 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51069688 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51069778 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51069945 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51069954 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51070011 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51070021 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51070206 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51070307 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 51070480 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51070604 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51070633 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 51070921 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51071119 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 51071191 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51071238 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 51071388 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51071485 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51071496 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51071542 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51071554 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51071569 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51071676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51071925 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51072600 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51073280 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51073411 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51073815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51074145 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51074303 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51074543 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 51074578 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 51074865 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 51074957 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51075083 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 51075261 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51075544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51075604 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 51076122 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51076134 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51076196 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51076203 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51076270 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 51076281 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51076383 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 51076387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51076424 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51076644 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 51076653 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51076656 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51076673 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51076813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51076976 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 51077353 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51077483 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51077583 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51077595 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51078268 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51078385 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51078425 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51078518 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51078590 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51078711 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51078765 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51079071 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51079360 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51079596 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51079939 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 51079999 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 51080255 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51080381 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51080888 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 51080894 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 51081145 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 2 51081146 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 51081315 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51081348 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51081374 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51081385 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51081489 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51082187 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51082354 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51082944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51083080 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51083170 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 51083442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51084026 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51084363 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51084611 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 51084889 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 51084894 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 51085767 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51086596 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51086601 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51086613 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51086622 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51086751 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51086910 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 51087007 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 51088407 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 51088427 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51088441 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51088469 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51088665 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 51088847 C T N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 2 51089351 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51089485 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51089640 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51089671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51089782 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51089812 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51089929 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51090191 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51090700 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51090835 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51090845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51090903 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51090952 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51091043 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51091056 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51091261 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51091449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51091495 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51091609 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51091660 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 51092180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51092187 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51092341 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51092420 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 51092432 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 51092433 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51092470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51093051 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51093864 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 51094344 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 51094739 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51094889 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51094954 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51095078 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51095145 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 51095585 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 51095676 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51095690 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51095735 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 51096068 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51096113 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51096183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51096252 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51096272 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51096452 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51096595 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51096653 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51097181 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51097612 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 51097793 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51097820 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51098015 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51098085 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51098108 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 51098213 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 51098276 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 2 51098619 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 51098634 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51098688 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51098694 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51098725 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 51098794 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51098860 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51098934 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51099092 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51099239 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 51099273 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51099278 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51099414 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51099430 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51099459 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51099668 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 2 51099778 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51099803 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51099898 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51099902 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51100076 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51100134 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51100163 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 51100183 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51100352 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51100361 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51100654 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51100778 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51101044 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51101192 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51101321 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51101399 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51101519 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51101621 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51101703 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 51101738 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 51101782 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51101894 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51101950 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51102124 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51102359 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51102388 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51102423 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51102434 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51102449 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51102473 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51102513 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51102518 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 51102591 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51102707 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51102723 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51102733 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51102734 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51102833 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51102872 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51102883 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51102897 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51102910 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51102930 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51102941 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51102996 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51103369 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 51103689 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 51103705 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 51104419 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51104462 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51104570 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51104618 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51105041 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51105263 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 51105729 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51105804 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 51106657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51106816 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51106838 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51106862 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51106899 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51106988 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 51107076 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51107440 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 51107505 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 51107584 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 51108113 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51108964 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51109017 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51109584 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51109731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51109742 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 51110347 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 51110414 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51111316 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51111511 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51112852 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 51113224 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51113556 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51113838 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51115126 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 51116052 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51116485 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51117048 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51117312 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51117446 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51117608 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51118530 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 51118968 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 51119530 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 51119889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51120283 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51120366 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51120692 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 51120749 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51120875 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51120893 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51120912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51120918 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51120979 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121022 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51121108 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121144 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121181 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51121201 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 51121239 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51121258 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51121386 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 51121399 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121572 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121583 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121584 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121596 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121607 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121609 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121631 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121634 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121692 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121703 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121731 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121749 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121790 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121823 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51121899 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51121982 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51121983 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51122007 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51122039 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51122140 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51122153 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51122267 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51122365 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51122881 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51123063 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51123572 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51123810 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51123904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51124066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51124803 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 51125286 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 51125447 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51126225 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51126387 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51126405 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51126555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51126722 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51127395 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51128312 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51128459 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51128482 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51128571 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51128635 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51128854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51128969 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51128988 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51128990 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51129084 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 51129447 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51129541 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51129548 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51129601 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51129646 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51129647 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51129742 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51129979 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51130033 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51130046 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51130143 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51130278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51130296 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51130304 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51132050 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51132138 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51132336 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51132379 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51132435 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51132469 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51132507 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51133043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51133199 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51133240 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51133365 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51133957 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 51134095 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51134150 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 51134325 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51134385 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51134788 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51134933 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51135319 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 51135452 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51135726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51135752 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51135892 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 51136200 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51136214 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51136216 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51136233 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 51136246 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 51136357 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 51136426 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 51136465 A C N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 2 51136724 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.153846153846154 0.692307692307692 0.153846153846154 13 13 2 9 2 2 51136741 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51137000 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51137408 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51137523 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51137823 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51137893 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51137945 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51138119 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 51138150 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51138177 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 51138256 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51138367 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51138419 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51138542 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51138590 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51138607 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51138610 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51138621 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 51138964 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51139043 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51139191 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 51139250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51139297 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51139566 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51139632 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51139638 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 51139807 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51139838 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51139865 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 2 51139869 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 51139877 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51139886 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51139908 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51139931 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 51139935 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 51139955 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51139967 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51139997 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51140024 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51140092 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51140113 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51140192 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51140232 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 2 51140235 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51140269 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51140506 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51140604 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51141358 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51141668 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51141728 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51141769 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51141926 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51141965 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51142119 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51142255 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51142275 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51142322 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51142326 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51142427 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51142552 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51142701 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51142731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51142740 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51142750 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51142752 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51142779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51142845 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51143194 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 51143212 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51143391 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51143448 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51143623 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51143665 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51143808 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51143937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51144004 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51144011 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51144126 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51144207 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51144270 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51144441 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 51144480 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 51144773 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 51144830 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51144856 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51144905 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51144933 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 51144960 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51145240 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51145323 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51145345 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51145635 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51145996 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 51146294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51146489 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51146534 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51146682 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51146863 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 2 51146874 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 51146910 C T N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 51146933 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 51147192 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51147461 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51147798 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51147876 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51147966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51147977 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51148136 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51148185 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51148213 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51148280 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51148296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51148406 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51148497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51148510 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51148842 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51148845 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51148925 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51148926 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51149178 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51149274 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 51149366 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51149428 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51149455 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51149541 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51149645 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51149656 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51149773 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51149809 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51149870 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51150078 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51150435 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51150444 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51150459 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51150590 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51150910 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51151040 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.0666666666666667 0.8 0.133333333333333 14 16 1 12 2 2 51151100 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 51151234 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 51151337 T G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 51151419 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 51151529 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51151641 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 51151755 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51151861 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51151898 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51151919 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51152004 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 51152118 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51152176 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51152525 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51152575 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51152698 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51152839 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 2 51153282 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51153484 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 51153810 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 51153834 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 51153968 A T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 51154016 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 51154288 G C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51154515 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51154516 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51154825 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51155236 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51155243 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 51155455 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51155926 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51156359 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51156803 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51157335 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51157495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51157676 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51158157 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 51158729 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51158801 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51159136 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 51160442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51160492 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 51160547 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51160550 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51160643 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 51160867 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 51161639 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 51161710 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51161712 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 51161725 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51161837 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51161838 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51161872 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51161884 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 51161907 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51162076 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 51162143 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51162171 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51162201 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 51162440 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51162564 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51162585 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51162588 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51162604 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51162822 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51163260 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51163272 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 51163329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51163369 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 51163798 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51163883 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 51163977 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51164225 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51164235 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51164427 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51164462 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 51164756 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 51164804 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51164844 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 51165094 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51165141 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51165146 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 51165170 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 51165318 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51165437 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51168241 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51168484 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51168635 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51168636 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51168682 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 51168827 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51169045 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51169073 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51169227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51169249 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51169494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51169796 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51170546 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51170607 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 51170669 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51170682 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 51170782 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51170830 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 51170882 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 51171245 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51171315 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 51171329 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 51171427 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51171482 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 51171519 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 51171665 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51171726 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51171760 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51172032 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51172070 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51172219 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51172244 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 51172266 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51172368 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51172424 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51172521 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51172591 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51172666 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51172887 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51172899 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51173009 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51173146 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 51173304 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51173312 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51173368 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51173383 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51173388 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51173413 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 51173437 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 51173555 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 51173584 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 51173585 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 51173625 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 51173667 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51173688 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51173718 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51173734 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 51173747 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51173753 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51173785 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51173839 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51173898 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 51173908 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51173944 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 51173982 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51174048 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51174085 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51174299 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51174317 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51174340 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 51174349 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51174363 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51174364 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51174380 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51174474 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 51174560 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 51174585 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 51174783 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51174840 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51174868 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 51175062 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51175124 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 51175252 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51175384 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 51175440 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 51175456 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51175503 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 51175515 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51175539 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 51175667 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 51175688 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 51175901 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51175994 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51176068 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51176173 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51176292 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 51176338 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51176387 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51176388 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51176481 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51176853 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 51177421 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51177602 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 51177814 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51177987 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51178009 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51178325 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 51178352 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51178421 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51178559 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51178657 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51178678 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51178691 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51178700 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51178807 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 51178842 T G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51178860 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51179171 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51179381 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 51179389 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51179450 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51179652 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51179718 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51179993 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 51180103 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 51180402 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 51180522 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51180529 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51180674 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51181003 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51181439 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51181621 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51181680 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51181709 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51181750 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51181766 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51181818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51181822 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 51181832 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51181911 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 51182533 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51182778 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51182884 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51183071 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 51183143 G T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 51183954 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51184314 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51184329 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51184566 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51184592 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51184597 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51184640 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51184686 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51184840 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51184858 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51185023 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51185319 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51185566 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51185925 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51186295 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51186431 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51186479 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51186533 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51186635 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51186741 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51186794 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51186847 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 51186878 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51187243 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 51187388 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 51187507 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51187845 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51188005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51188195 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51188526 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51188592 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51188617 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51188993 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51189303 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51189418 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51189861 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51190212 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51190338 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51191339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51191351 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 51191433 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51191434 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51191560 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51191572 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51191609 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51191997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51192054 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51192271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51192300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51192334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51192457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51192470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51192537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51192654 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51192707 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51192854 A C Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 51192879 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51192880 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51192908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51193183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193284 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193398 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51193407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193494 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51193495 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 51193544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51193981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51194042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51194121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51194167 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51194450 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51194474 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51194545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51194629 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51194837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51194997 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 51195144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51195416 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51195461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51195594 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 51195654 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51195705 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 51195711 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 51196049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51196102 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51196106 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 51196213 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51196320 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51196459 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 51197031 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51197118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51197225 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 51197278 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51197284 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 51197385 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51197386 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51197406 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51197493 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51197517 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51197521 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51197567 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51197594 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51197638 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51197644 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51197737 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51197778 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 51197935 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51197971 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 51198036 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51199082 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51199101 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51199178 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51199267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51199333 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51199899 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 51199976 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 51200518 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 51200889 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51200934 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51201071 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51201201 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51201207 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51201307 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 51201421 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51201973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51202585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51202689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51203128 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51203899 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51204598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51204731 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 51204870 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 51205526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51205564 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 51205646 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51205770 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 51205960 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 51206578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51206718 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51206728 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 51206787 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51207444 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 51207897 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51207944 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 51208065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51208077 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 51208384 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51208903 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 51208926 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 51208955 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 51208967 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 51209463 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51209491 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51209627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51209944 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51210600 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 51210800 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51210808 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 51211177 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51211828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51212217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51212370 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51212416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51212852 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51213017 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51213427 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51213461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51213462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51213742 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51213759 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 51213955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51214415 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 51214576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51214727 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 51214740 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 51214890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51214987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51215194 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51215295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51215353 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51215375 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 51215454 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 51215675 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 51215772 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 51215833 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51215899 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51216123 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51216247 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51216271 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51216492 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 51216620 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 51216849 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51216855 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51217022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51217290 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 51217583 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 51218190 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51218422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51218437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51218782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51218904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51218952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51219034 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51219052 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51219161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51219468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51219473 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 51219543 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51219547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51219978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51220307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51220480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51220509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51220548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51220615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51220722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51220926 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51220979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51221600 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51221698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51221706 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51221749 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 51221790 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 51222206 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51222498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51222571 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51222741 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 51222748 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 51222830 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51222834 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51223098 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51223220 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51223476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51223575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51224311 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51224358 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 51224535 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 51224748 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 51224756 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51224773 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51224879 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51225458 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 51225688 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 51225947 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51226273 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51226625 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51226902 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 51227085 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51227369 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51227855 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 51227918 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51228325 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51228362 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 51228521 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51228556 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51228843 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51228975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51229264 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51229438 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 51229459 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51229565 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51229676 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51229789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51229800 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51229914 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 51230068 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51230367 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51230381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51230464 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51230534 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51231796 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 51232184 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51234059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51234478 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 51235356 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 51235587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51236110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51237261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51237900 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51237968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51238410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51238705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51239818 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51240814 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51241013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51241109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51241185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51241662 G C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 51241856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51241981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51241997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51242075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51242401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51242478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51242622 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51243347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51243379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51243491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51243586 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51244295 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51244560 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51244725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51245131 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 51245246 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51245469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51245493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51245565 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 51245585 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51245939 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 51245995 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 51246004 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 51246139 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 51246288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51246500 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51246701 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51247465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51247490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51247947 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51248075 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51248278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51248392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51248731 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51248788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51249128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51249502 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51249544 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51249566 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 51249614 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 51249665 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 51249912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51250187 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 51250192 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 51250200 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 51250222 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 51250257 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 51250396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51250452 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 51250601 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 51250681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51250721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51250782 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51250951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51251834 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51251852 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 51251862 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 51251873 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 51251878 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 51251903 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 51251997 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 2 51252230 T A N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 51252235 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 51252270 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 51252308 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 51252352 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 51252417 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 51252591 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 51252600 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 51252639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51252745 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 51252789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51252824 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 51252900 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 51252948 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51253134 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 51254131 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 51254279 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 51254552 A T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 51254574 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 51254921 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 51255028 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 51255092 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 51255096 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 51255139 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 51255200 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 51255203 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 51255259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51255275 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 51255424 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 51255427 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 51255603 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 51255604 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51255645 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 51255742 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 51255931 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 51255949 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 2 51255965 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51256326 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51256359 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 51256743 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51256769 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51257135 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 51257209 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 51257236 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 51257259 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 51257349 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 51257586 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 51257691 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51258069 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 51258115 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 51258202 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 51258331 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 51258569 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 51258593 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51258626 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 51259428 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 51259607 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 51259636 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 51259650 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 51259666 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 2 51259835 T C Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 51260758 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 51260870 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 51260939 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 51261048 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 51261137 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51261150 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 51261162 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51261212 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 51261361 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 51261520 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 51261661 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 51261664 C G N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 51261717 C T N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 51261735 A T N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 51262007 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51262046 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 51262489 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 51263144 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 51263387 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51263536 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51263630 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51264471 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 51264889 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51265445 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51265799 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 51265927 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51266212 T A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 51266434 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 2 51266455 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51266495 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 51266496 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 51266987 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 51267027 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51267170 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51267171 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51267182 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 51267454 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 51267674 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 51267951 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 51268013 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 51268051 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 51268139 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 51268725 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 51269199 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 51269435 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51270109 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51270140 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 51270568 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 51271398 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51271426 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51271445 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 51271468 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51271827 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51271857 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51271873 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51272012 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51272020 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 51272206 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51272744 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 51272801 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51272970 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51273089 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51273104 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 51273172 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 51273206 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51273561 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51273774 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 51274627 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51274628 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51274673 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51275269 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51275645 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51275722 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 51275827 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 51276147 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 51276500 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51276798 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51276835 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51277129 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51277149 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 51277183 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51277262 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 51277317 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51277398 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51277407 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51277421 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 51277493 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51278051 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51278321 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51278350 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51278462 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 51278488 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51278516 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 51278596 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 51278613 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 51278633 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 51278637 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 51278668 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 51278683 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51278764 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 51278804 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51278852 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51278875 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51278919 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51278994 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51279081 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51279142 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51279152 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51279347 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 51279363 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 51279365 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51279443 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 51279569 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 51279624 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 51279668 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51279701 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51279711 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 51279727 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51279741 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51279766 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51279829 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51279852 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 51279930 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 51279942 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51280066 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51280076 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 51280129 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 51280143 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51280233 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 51280270 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 51280276 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 51280331 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 51280361 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 51280379 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 51280384 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 51280555 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 51280825 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51280847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51281085 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51281205 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 51281227 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51281228 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 51281389 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 51281451 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 51281480 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 51281656 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 51281679 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51281710 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51282198 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51282236 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51282250 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51282267 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51282299 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51282311 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51282389 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51282574 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51282575 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51282758 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51283244 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 51283371 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51283526 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51283717 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51284212 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51284427 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 51284670 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51285285 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51285578 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51285671 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51286016 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51286538 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51286676 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 51286930 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51286938 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 51287901 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51287910 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51288038 T G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 51288446 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51288855 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51289388 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 51289603 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 51289712 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 51289830 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 51289842 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 51289903 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 51289914 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51290108 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51290143 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 51290202 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51290347 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51290518 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 51290599 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 51290799 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51290857 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 51290994 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51291037 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 51291048 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51291231 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 51291336 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 51291346 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 51291628 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51291921 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51292256 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51292808 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 51292827 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 51292828 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 51292877 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51294671 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51294722 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51294766 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51294807 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51295107 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51295108 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51295125 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51295194 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 51295493 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 51295955 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51296233 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51296253 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 51296271 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51296579 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51296729 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51296847 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51298099 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 51298406 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51298415 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51298419 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51298430 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51298511 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51298894 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51299037 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51299134 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51299220 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 51299274 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51299993 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51300158 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 51300182 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51300185 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51300410 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51300769 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 51300781 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51300812 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51301300 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51301408 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51301481 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51301485 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51301508 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51301524 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51301648 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51301762 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 51301766 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51302189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51302601 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51302957 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51302971 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51303147 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51303163 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51303188 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51303439 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51303583 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 51303597 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 51303690 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51303694 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51303832 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51303858 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51303886 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51303895 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51304021 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51304061 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51304072 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51304086 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51304119 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51304169 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 51304218 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51304228 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51304254 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51304285 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51304304 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51304323 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 51304380 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51304389 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51304393 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51304436 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51304457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51304542 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51304664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51304704 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51304750 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51304815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51304865 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51304926 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51304972 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51305067 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 51305402 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 51305658 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 51305702 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51305710 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51305743 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51305938 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51306191 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 51306283 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 51306350 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 51306557 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 51306568 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 51306629 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 51306709 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 51306925 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51306926 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51307094 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 51307132 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51307137 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51307172 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51307190 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51307192 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51307307 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51307317 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 51307441 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 51307461 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51307521 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51307535 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51307631 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51307877 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51307960 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51307988 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51308101 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51308227 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51308516 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51308584 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51308620 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51309078 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51309146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51309542 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51309772 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51309805 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51309933 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51309979 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51310106 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51310382 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 51310491 G A Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 51310871 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51311836 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51312011 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51312027 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51312029 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51312055 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51312122 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51312201 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51312277 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51312313 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51312356 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51312383 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51312404 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51312580 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51312641 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51312646 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51312665 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51312694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51312701 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51312750 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51312773 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51313143 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51313239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51313298 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51313300 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51313588 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51313611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51313711 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51313719 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51313729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51313883 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51313949 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51314052 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51314115 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51314120 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51314161 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51314268 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51314339 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51314524 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51314562 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51314710 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 51314737 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51314838 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 51315036 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51315308 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51315351 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51315489 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51315597 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51315616 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51315712 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 51315762 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51316250 A T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 51316270 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 51316296 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 51316432 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 51316502 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51316507 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51316536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51316668 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51317122 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 51317190 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51317208 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51317494 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51317609 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51317762 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51317785 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51317795 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51317837 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51318215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51318619 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51319231 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51319355 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51319417 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 51319459 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51319678 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 51319688 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51319764 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51320186 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51320324 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51321215 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51321353 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51321717 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51321720 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 51321898 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51322087 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51322174 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51322237 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51322536 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 51323049 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51323447 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51323633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51323775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51323964 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51324714 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51324864 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51325184 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51325190 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51325197 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51325236 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51325386 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 51325571 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 51325648 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51325792 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51325908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51325956 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51326347 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51326707 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 51326722 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 51326916 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 51327084 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51327086 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51327357 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51327374 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51327587 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51327611 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51327702 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51327792 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51328266 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51328274 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51328335 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51328380 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51328583 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51328708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51328946 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51328975 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51329079 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51329107 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51329186 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51329227 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51329258 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51329342 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51330185 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51330345 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51330774 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51331138 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51331389 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51331509 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51332284 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51332539 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51332760 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51332910 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51332920 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51332998 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51333146 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51333177 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51333581 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51334017 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51334112 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51334165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51334334 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51334380 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51334394 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51334607 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51334703 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51334801 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51334820 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51335003 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51335060 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51335066 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51335107 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51335115 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51335179 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51335339 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 51335578 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 51336067 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51336076 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51336088 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51336136 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51336230 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 51336723 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51336731 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51337060 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51337486 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51337719 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51337875 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51337889 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51338516 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51338633 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51338674 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51338712 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51338735 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51338761 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51338770 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51338790 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51338926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51339071 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51339079 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51339138 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51339205 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51339250 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 51345658 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 51345669 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 51345686 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 51346003 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51346004 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51346095 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 51346382 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51346398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51346424 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51346497 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51346648 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51347315 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51347323 C A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51347579 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51347855 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51349897 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 51349951 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51350153 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 51350162 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51350418 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 51350424 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 51350436 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 51350595 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 51350939 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51350979 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 51350998 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51351256 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51351317 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51351405 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 51351408 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 51351453 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 51351473 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 51351502 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 51351508 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 51351567 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51351663 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51352011 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51352115 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51352455 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51352647 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51352901 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51353099 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51353134 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51353189 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51353365 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51353437 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51353485 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51353550 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51353866 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51353897 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51354071 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51354210 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51355043 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51355131 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51355277 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51356530 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 51357534 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51358516 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51359114 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51359528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51359544 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 51359597 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51359778 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51360262 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51360726 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51361303 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51362707 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51364416 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51364731 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51365058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51365100 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51365135 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51365177 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51365396 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51365421 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51365643 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51365734 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51365829 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 51365866 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 51365936 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 51365939 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51366103 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51366107 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51366141 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51366228 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51366435 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51366769 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51366771 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51366803 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51366887 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51366944 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51366960 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51367069 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51367144 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51367266 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51367275 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51367405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51367479 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51367484 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51367575 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51367772 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51367870 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51367929 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51367934 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51367978 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368074 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368149 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368402 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368570 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368574 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368612 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51368626 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51368653 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368674 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368709 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368743 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368752 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368805 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368889 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368895 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368964 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51368999 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51369003 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51369148 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51369218 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51369295 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51369317 G C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 51369322 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 51369361 C A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51369375 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51369458 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51369589 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51369619 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51369677 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 51369700 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 51370345 T C Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 51370400 A C Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 51370577 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 51370599 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 51370646 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51370693 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51370769 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51370869 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51370927 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51371098 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51371251 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51371392 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 51371606 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 51372059 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51372077 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51372340 G A Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 51372370 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 51372417 T A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 51372585 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 51372605 A C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 51372700 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 51372725 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 51372788 G C Y N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 51372814 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 51372897 A G Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 51372946 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 51373017 G C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 51373055 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 51373383 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 51373391 C A Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 51373402 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 51373422 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 51373453 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 51373706 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 51373784 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51373854 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51373892 T C Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 2 51373941 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 51373953 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 2 51373981 T A Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.166666666666667 0.75 0.0833333333333333 13 11 2 9 1 2 51374008 C A Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 14 14 2 10 2 2 51374028 C T Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 0.0714285714285714 15 13 2 11 1 2 51374083 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 51374104 C G Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 2 51374278 T C Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 2 51374292 T A Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 2 51374345 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 2 51374532 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 51374542 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 51374712 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 51374761 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 51374810 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51374818 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 51374966 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51374981 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51375132 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51375146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51375205 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51375261 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51375370 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51375426 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51375708 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 51375725 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 51375848 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 51376100 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51376312 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 51376327 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 51376343 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 51376496 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 51376595 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 51376748 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51377048 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51377084 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51377211 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51377261 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51377420 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51377430 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51377455 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51377518 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51377577 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51377603 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51377611 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51377709 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51377784 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51378117 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51378128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51378181 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 51378372 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51378383 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51378468 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51378531 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51378568 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51378620 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51378877 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51378884 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51378971 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51378993 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51379046 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 51379159 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51379191 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51379207 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51379237 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51379256 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51379271 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51379306 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51379336 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51379396 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51379412 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51379492 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51379503 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51379518 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51379544 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51379622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51379649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51379868 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51379909 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51379917 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51379990 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51380032 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51380116 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51380131 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51380452 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51380467 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51380485 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 51380574 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51380759 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51380829 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51380929 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 51381153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51381196 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51381256 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51381324 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51381429 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51381550 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51381642 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 51381697 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 51381718 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 51381721 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 51381758 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 51382019 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51382081 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51382097 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51382114 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51382594 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51382641 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51382650 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51382698 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51382701 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51382783 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51382791 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51382865 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51382900 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51382926 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51382969 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51383442 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51383484 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51383506 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51383614 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51383666 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51383670 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51383856 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51383902 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51383957 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51384048 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51384126 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51384145 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 51384492 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51384655 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51384818 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51384943 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51384959 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51385009 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51385329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51385444 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51385719 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51385890 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51387381 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51387463 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51387517 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51387556 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51387579 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51387778 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51387917 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51387937 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51388015 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51388329 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51388360 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51388362 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51388371 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51388691 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51388692 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51388973 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51389010 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51389065 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 51390085 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 51390149 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 51390212 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 51390422 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51390581 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51390695 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51390790 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51390861 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51391074 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51391287 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51391450 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51392214 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51393156 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51393855 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51393859 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51393883 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51393925 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51393960 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51393961 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51394175 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51394262 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51394959 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51395037 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51395053 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51395337 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51395529 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51395578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51395651 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 51395727 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51395755 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51396426 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51396659 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51396745 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51397034 G C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 51397305 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51397318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51397475 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51397491 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51397572 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51397662 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51398011 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51398032 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51398107 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51398132 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51398486 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51399797 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51399887 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51399923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51400044 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51400143 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51400244 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51400471 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51400603 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51400608 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51400923 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51400938 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51400972 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51401309 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51401349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51401365 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51401423 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51401515 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51401574 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 51401619 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51401626 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 51401638 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51401656 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51401661 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 51401682 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 51401794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51401813 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51401835 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 51401842 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 51401903 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51401962 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51402084 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51402221 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51402280 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51402338 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51402507 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 51402576 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51402581 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51402642 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 51402661 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 51402703 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 51402770 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 51402920 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51403115 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 51403173 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51403351 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51403387 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51403389 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51403465 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51403605 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51403657 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51403754 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51403824 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51403877 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51403903 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51403934 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51403958 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51404126 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51404253 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51404300 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51404527 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51404535 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51404569 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51404574 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51404635 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51404652 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51404672 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51404746 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51404752 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51404802 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51404870 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51404872 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51404882 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51404919 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 51404928 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51404954 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51405027 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51405034 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51405090 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51405098 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51405400 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 51405795 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 51405807 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 51405970 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 51405986 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 51407248 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51407914 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51410886 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51411671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51412619 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51412621 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51415064 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51415789 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51416060 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51418085 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51418144 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51419248 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51419677 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51419782 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51419783 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51419824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51420031 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51420191 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51420375 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51420404 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51420425 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51420478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51420492 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51420605 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51420890 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51420912 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51421399 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51421430 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51421436 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51421998 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51422006 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51422100 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 51423051 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51423090 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51423123 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51423166 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51423193 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51423350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51423477 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51423762 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51423780 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51424154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51424170 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51424233 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51424267 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51424331 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51424431 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51424521 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51424698 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51424815 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51424880 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51424983 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51425065 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51425072 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51425096 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51425153 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51425357 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51425408 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51425612 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51425675 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51425810 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51425815 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51426027 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51426080 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51426207 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51426238 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51426287 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51426324 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51426347 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51426373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51426668 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51426834 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51426891 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51426955 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51426960 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51427056 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51427079 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51427094 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51427232 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51427326 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51427381 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51427440 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51427488 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51427489 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51427545 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51427619 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51427627 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51427798 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51427823 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51427872 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51427895 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51427947 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51428161 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51428575 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51428636 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51428743 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51429084 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51429168 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51429176 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51429728 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51429845 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51429856 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51429913 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51430113 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51430185 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51430356 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51430589 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51430626 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51431034 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51431157 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51431229 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51431311 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51431327 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51431413 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51431421 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51431427 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51431606 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51431675 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51431704 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51431841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51431857 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51431872 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51431897 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51431943 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51432099 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51432383 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 51432719 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51432784 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 51432896 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51432929 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51433029 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51433149 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51433207 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51433245 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 51433272 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51433295 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 51433380 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 51433422 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 51433474 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 51433639 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51434394 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 51434822 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51434916 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51434926 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51435115 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51435313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51435317 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51435351 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51435375 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51435486 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51435500 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51435533 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51435672 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51435677 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51435685 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51435699 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51435817 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 51435900 C T N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 51435940 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 51435958 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 51436184 T C N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 51436282 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 51436346 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 51436382 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51436461 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51436518 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51436578 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51436666 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51437262 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51437669 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51437716 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51437834 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51437922 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51438156 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51438575 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51438626 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51438785 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51438845 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 51439253 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51439291 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51439481 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51439678 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51439720 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51439748 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51439758 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51439760 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51439778 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51439779 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51440006 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51440262 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51440621 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51440731 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51440764 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51440787 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51440994 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51441428 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51441431 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51441514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51441867 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 51441874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51441880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51441899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51441923 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51441925 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51441966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51441977 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51442129 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51442980 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51443006 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51443062 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51443289 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 51443468 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 51443614 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51443730 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51444242 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51444272 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 51444362 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 51445023 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51445193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51445216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51445251 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51445310 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51445314 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51445505 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51445512 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51445665 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51445686 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51445816 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 51445929 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51446148 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51446692 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51446765 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51446907 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 51446917 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 51447260 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 51447295 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 51447305 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 51447339 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 51447490 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51447611 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51447682 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51447723 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51447847 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51447863 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51447871 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51447925 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 51448129 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51448179 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51448265 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 51448271 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 51448302 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51448324 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51448339 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51448355 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51448403 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51448405 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51448619 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 51448696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51448757 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51448958 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 51449049 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51449156 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51449254 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51449275 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51449324 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51449378 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51449415 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51449660 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51449749 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 51449950 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51450094 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51450158 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 51450167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51450208 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51450259 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51450425 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51450439 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 51450577 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51450688 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51450718 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51450785 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51450842 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51450972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51451267 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51451268 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51451292 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51451322 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51451474 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51451480 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51451486 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51451496 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51451511 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51451526 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51451560 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51451609 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 51451709 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 51451851 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51451852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51451934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51451951 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51451984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51452060 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51452143 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51452158 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 51452175 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51452207 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51452285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51452294 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 51452660 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51452692 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51453059 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51453800 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51453817 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51454300 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51454459 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51454563 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51454718 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51454727 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51454732 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51454803 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51454896 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51455048 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51455117 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51455147 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51455172 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51455288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51455579 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51455678 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51455679 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51456019 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51456024 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51456160 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51456169 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51456280 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 51456354 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 51456717 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51458593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51459325 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51459500 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51459520 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51459524 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51459803 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51460701 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 51461233 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 51461485 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 51461511 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51461541 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51461650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51461723 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51462522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51462819 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51463037 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51463057 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51463522 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51463759 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 51463987 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 51465241 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51465556 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 51467824 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51468273 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51468363 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51468395 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51468650 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51468859 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51469072 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51469297 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51469349 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51477893 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 51478018 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 51478963 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51478973 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 51479307 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51479464 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51479503 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 51479606 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51479682 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 51479715 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 51480127 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 51480323 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 51480345 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51480357 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 51480381 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51480596 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 51480735 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 51480754 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 51480830 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51480843 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51480913 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51481222 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 51481260 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 51481294 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 51481323 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 51481626 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51481730 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51481744 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 51481863 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51481903 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51481933 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51482131 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51482532 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51483231 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51483524 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51483534 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51483948 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 51483979 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51484031 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51484076 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 51484099 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51484118 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51484163 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51484369 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51484465 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51484492 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51484687 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51485429 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 51485662 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 51486187 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51486266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51486412 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 51486485 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 51486690 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51486762 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 51487439 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51487576 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51487749 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51487945 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 51488007 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 51488032 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 51488043 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 51488052 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 51488137 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 51488261 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 51488287 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51488606 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51488744 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51488903 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51489195 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51489266 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 51489302 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 51489397 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51489540 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 51489660 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51489679 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51489721 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 51489772 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51489791 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51489878 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51489955 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51489985 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 51490030 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51490120 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51490160 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51490315 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 51490319 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 51490462 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51490543 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 51490729 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51490985 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51490999 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51491030 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51491216 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51491254 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51491302 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51491334 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51491407 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51491435 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51491444 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51491449 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51491520 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51491566 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51491589 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51491681 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51492343 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51492358 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51492376 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51492506 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51492626 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51492646 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51492681 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51492722 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51492793 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51492794 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51492805 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51492807 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51493070 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51493231 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51493237 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51493262 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51493290 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51493550 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51493556 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51493585 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51493649 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51493655 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51493775 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51493786 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51493811 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51494005 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51494116 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51494157 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51494160 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51494206 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51494212 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51494221 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51494257 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51494305 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51494324 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51494336 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51494429 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51494548 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51494608 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51494623 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51494699 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51494736 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51494751 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51494766 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51494770 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51494841 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 51494981 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 51495309 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 51495350 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 51495431 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51495436 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51495498 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 51495793 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 51495797 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51495829 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51495854 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 51495919 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 51495983 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51496001 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51496058 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 51496171 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 51496199 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51496230 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51496233 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51496450 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51496466 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51496485 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 51496514 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51496581 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51496683 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51496704 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 51496779 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51496839 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51496848 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51496867 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51496886 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 51496991 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51497498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51497570 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51497640 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51497671 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51498080 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51498145 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 51498307 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 51498376 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 51498385 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 51498530 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51498585 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51498781 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 51498811 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51499283 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51499301 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51499362 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51499476 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51499607 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51499624 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51499685 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 51499970 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 51499976 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 51500128 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 51500208 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 51500328 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51500496 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51500499 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 51500546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51500693 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51500727 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51500829 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51500838 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 51500899 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 51500918 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51500919 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 51501144 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 51501151 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 51501202 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51501221 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51501548 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 51501664 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 51501807 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51501863 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51501909 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 51501942 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 51501967 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51501974 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51502096 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51502226 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 51502294 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51502351 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 51502375 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 51502459 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 51502523 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 51503016 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51503038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51503334 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51503772 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 51504221 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51504258 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51504437 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51505202 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 51505267 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51505525 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51505739 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 51505771 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51505856 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51505916 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 51505932 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51506022 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51506091 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51506112 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51506711 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51506758 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51506760 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 51506828 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51506831 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51506861 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51507487 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 51507515 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 51507545 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 51507663 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51507790 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 51507849 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 51507866 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51508238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51508300 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51508563 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 51508573 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 51508721 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 51508770 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 51508985 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 51509372 A C N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 51509376 G T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 51509572 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51509587 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51509606 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51509829 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51510083 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51510174 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51510175 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51510205 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51510265 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51510307 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51510341 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51510525 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51510636 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51510868 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51510927 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51510955 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51511198 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51511204 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51511214 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 51511259 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51511296 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51511525 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 51511635 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51511747 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51511826 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51511852 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51512080 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 51512091 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 51512117 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 51512145 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51512370 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 51512378 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 51512526 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51512549 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51512608 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51512639 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51512757 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51512921 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 51512958 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51512983 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51512998 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51513017 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51513101 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51513109 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51513134 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51513487 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 51513652 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 51513677 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 51513838 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51513879 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51513919 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51514225 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51514554 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51515062 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51515392 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51516002 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51516881 G A Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 51517354 T G Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 51518692 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 51518784 T A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 51520967 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 51522861 A G Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 2 51522946 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 51522961 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 51523078 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 51523362 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 51523831 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51524033 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51525670 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51525793 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 51526388 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 51526596 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51526696 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51526879 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51527712 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51527801 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51528026 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51528151 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51528171 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51528216 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 51528242 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 51528313 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 51528314 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 51528414 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 51528563 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51528589 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51528644 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 51528679 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51528686 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 51528816 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51528929 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51529626 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51529678 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51529864 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51529873 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51529933 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51529934 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51529960 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51529977 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51530008 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51530213 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51530235 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51530277 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 51530435 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51530448 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51530457 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51530581 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 51530587 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 51530636 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51530665 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51530694 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 51530712 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51530760 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 51530788 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 51530865 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 51530901 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51530918 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51530995 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51531027 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51531219 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 51531231 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 51531243 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 51531704 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 51531861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51531925 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51531987 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 51532236 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51532378 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 51532414 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51532430 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 51532452 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 51532503 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 51532570 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51532610 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 51532766 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 51533072 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51533474 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51533811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51534221 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 51534329 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51534358 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 51534463 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51534494 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 51534535 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51534537 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 51534620 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51534829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51534846 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 51535086 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51535381 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51535743 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51535752 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 51536012 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51536450 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51536519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51536653 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51536684 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51536779 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51536786 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51536816 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51537402 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51537422 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51537492 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51537501 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51537599 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 51537612 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 51537646 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51537659 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 51537665 A T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 51537671 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51537736 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51537796 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51537847 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 51538025 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 51538046 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 51538099 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51538265 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51538394 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51538454 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 51538642 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 51538691 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 51538699 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51538709 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51538819 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 51538850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51538891 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51538899 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51538952 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51538968 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 51539039 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51539065 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51539088 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51539180 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 51539339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51539384 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 51539706 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51540226 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51540337 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51541076 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51541361 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51541395 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51541540 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51541611 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51541629 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51541640 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51541686 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51541703 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51541754 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51541805 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51541806 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51542028 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51542050 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51542076 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51542089 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51542133 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 51542237 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51542336 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 51542403 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 51542437 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 51542503 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51542513 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 51542534 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 51542535 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 51542592 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51542750 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51542942 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51543240 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51543303 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51543402 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51543454 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51543455 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51543539 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51543558 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51543644 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51543710 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51543802 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 51543895 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51543902 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51543931 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 51543948 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51544073 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51544197 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51544235 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51544518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51544595 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51544598 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51544606 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51544627 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51544632 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51544708 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51544998 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51545078 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51545753 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 51545929 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51545936 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51545952 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51545994 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51546010 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51546160 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51546177 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 51546255 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 51546272 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51546500 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51546617 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51547427 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 51547482 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 51547549 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51547836 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51547851 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51547896 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51547916 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51547928 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51547994 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51548031 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51548133 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51548256 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51548285 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51548398 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51548554 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 51548628 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51548768 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51548856 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 51548871 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51548893 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51548985 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51549028 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51549059 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 51549417 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51549512 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51549623 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51549637 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51549661 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51549755 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51549946 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51549960 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51550028 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51550035 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51551133 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51552018 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51552248 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 51552442 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 51552641 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51552728 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51552731 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51553332 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51553582 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51553594 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51553853 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51554155 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 51554194 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51554287 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 51554350 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 51554615 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51554746 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51554753 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51554770 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51554839 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51554984 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 51554998 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 51555213 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 51555230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51555355 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51555395 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51555434 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51555498 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51555554 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51555825 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51555969 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51556225 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51556292 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51556410 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51556420 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51556684 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51557271 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51557329 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51557483 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51557787 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51557993 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51558048 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51558176 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51558388 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51558440 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51558654 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 51558657 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51558665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51558709 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51558730 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51558999 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51559158 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51559622 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51559706 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51559725 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51559809 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51559917 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51560184 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51560346 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 51560639 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 51560894 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51560971 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51560981 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51560982 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51561005 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51561090 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51561209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51561308 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51561322 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51561364 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51561589 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51562108 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 51562116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51562701 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 51562748 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51562832 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51562904 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 51563342 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 51563459 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51563741 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 51564024 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51564031 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51564125 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51564146 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51564211 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51564264 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51564466 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51564479 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 51564945 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 51564973 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51565023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51565128 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51565290 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51565339 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51565450 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51565545 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51565547 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51565587 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 51565758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51565783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51565796 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51565926 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 51565951 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51566089 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51566090 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51566100 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51566113 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51566198 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51566640 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51566695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51566920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51567005 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 51567012 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51567190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51567257 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51567262 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 51567294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51567367 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51567416 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 51567551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51567621 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 51567635 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51567688 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51567712 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51567762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51567915 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 51568014 A G N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 51568227 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51568369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51568425 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 51568459 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 51568949 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 51569137 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51569441 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51569452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51569597 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51569601 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51569610 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51569662 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51569890 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 51569907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51569973 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 51569988 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51570644 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51570729 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 51570968 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51571091 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51571436 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 51571504 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51571568 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51571884 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51572189 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51572215 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51572269 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51572308 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 51572322 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51572483 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51572562 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51572800 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51572817 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51572874 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51572952 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51573089 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51573221 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 51573261 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 51573349 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51573447 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51573605 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51573619 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 51573775 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 51573799 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51573827 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 51573890 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51574096 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 51574273 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 51574310 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 51574368 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51574521 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51574642 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 51574648 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 51574697 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 51574733 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51574811 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 51574831 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 51574901 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 51574957 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 51575027 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51575192 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 51575200 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 51575547 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51575567 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 51575617 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 51575699 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51575719 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51575829 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51575898 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 51576167 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51576353 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 51576435 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 51576457 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51576861 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51576938 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51577073 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51577094 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51577166 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 51577188 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51577201 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 51577302 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 51577336 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51577407 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51577415 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51577426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51577517 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51577668 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51577688 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51577717 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51577869 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51578403 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51578445 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51578478 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 51578480 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 51578598 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51578665 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51578750 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51578803 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51578807 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51578911 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 51579049 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51579313 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51579399 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51579452 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51579470 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 51579534 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 51579627 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 51579764 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 51579849 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51579979 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51579992 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 51580066 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51580184 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 51580233 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 51580556 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51580625 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 51580732 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 51580811 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 51580856 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51580889 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51580905 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 51580959 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51581056 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51581119 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51581120 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51581161 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51581213 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51581287 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51581365 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51581433 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51581716 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 51581758 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 51581789 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 51581795 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51581948 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51582021 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51582339 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 51582432 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 51582526 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 51582572 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51582673 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51582676 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 51582880 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51582892 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51583003 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51583013 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51583045 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51583333 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51583342 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51583555 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51583616 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51583669 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51583913 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51584097 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51584180 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51584232 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51584753 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 51584914 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 51585025 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51585079 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51585117 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51585166 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51585195 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 51585499 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51585954 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51586413 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51586829 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 51586908 A C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 51586950 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 51586967 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 51586999 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 51587162 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 51587280 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51587301 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51587442 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51587921 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51587961 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 51588065 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51588343 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51588346 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51588404 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51588433 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51588526 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51588686 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51589017 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51589823 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 51589870 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 51591165 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 51592229 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51592331 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 51592430 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51592449 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51592642 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51592904 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51592911 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51593336 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51593545 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51594137 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 51594168 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51594445 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 51594773 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 51594818 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51595077 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 51595275 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51595285 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51595348 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51595387 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51595455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51595666 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51595705 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51595933 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 51596178 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51596608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51596657 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 51596670 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51596769 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 51596801 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51596900 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51597097 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51597123 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 51597252 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 51597420 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51597583 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51597606 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 51597782 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51597835 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51597887 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 51597891 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51597940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51597996 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51598035 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51598120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51598202 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51598266 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51598277 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51598327 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51598478 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 51598484 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51598671 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51598820 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51598937 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51598987 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51599006 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51599091 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 51599218 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51599230 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 51599486 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51599510 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 51599744 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51600325 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 51600664 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51600764 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51600852 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51600908 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 51600915 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 51601040 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51601114 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51601192 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51601236 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 51601327 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 51601507 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51601524 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51601672 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51601679 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51601779 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51601799 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51601873 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51601933 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51602081 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 51602106 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51602168 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51602290 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51602341 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 51602370 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51602452 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 51602466 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 51602646 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 51602898 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 51603001 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51603428 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51603534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51603827 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 51604390 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 51604460 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51604818 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 51604826 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 51604846 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 51605050 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51605161 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51605450 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51605620 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51606544 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51606586 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 51606645 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 51606716 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51607129 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 51607759 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51607965 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51608193 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51608449 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51608981 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51609087 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51609361 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51609634 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51609635 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51609674 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51609897 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51609925 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 51609954 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51610007 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 51610049 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51610097 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51610178 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51610260 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51611532 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 51611760 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51611778 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51611782 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51611836 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51611987 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51612001 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51612044 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51612089 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 51612092 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 51612294 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51612366 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51612394 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 51612427 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 51612721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51613024 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 51613099 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 51613100 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 51613128 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51613237 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51613245 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51613255 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 51613312 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 51613667 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 51613754 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 51613772 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 51613875 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51613906 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51613952 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 51614097 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51614105 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51614404 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 51614434 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 51614452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51614475 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 51614511 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51614604 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 51614673 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 51615464 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 51616164 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 51616336 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 51616365 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 51616523 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51616692 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 51617267 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 51617341 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51617651 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51617751 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51617772 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 51617934 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51618247 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51618284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51618325 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51618474 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51618518 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51618570 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51618586 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51618596 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51618605 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51618612 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51618716 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51618729 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 51618769 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51618787 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 51619317 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51619404 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51619428 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 51619511 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51619541 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 51619816 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51620065 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51620215 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 51620267 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 51620311 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 51620496 T C N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 51620546 G A N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 51620598 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 51620726 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 51620730 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 51620799 C G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 51620848 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 51621048 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51621049 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51621066 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51621069 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51621090 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51621333 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51621336 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 51621679 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 51621733 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51622149 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 51622240 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51622346 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51622354 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51622544 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51622873 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51623084 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51623267 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51623285 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51623298 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51623375 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 51623584 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 51623898 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51623955 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 51624018 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51625232 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51625747 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51626187 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51627221 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51627248 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 51627268 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51627329 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51627558 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 51627733 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51627788 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51627994 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51628014 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51628123 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 51628153 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 51628155 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51628191 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51628224 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51628329 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51628331 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51628377 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 51628381 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51628390 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51628458 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 51628477 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51628648 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 51628702 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 51628709 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 51628733 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 51628766 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 51628892 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51628912 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51628994 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51629013 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51629108 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 51629162 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51629232 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51629265 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 51629529 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51629555 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51629640 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51629658 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51629685 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51629741 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51630023 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51630112 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51630160 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51630358 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 51630389 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 51630412 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 51630509 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 51630525 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 51630545 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 51630699 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51631115 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51631118 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 51631275 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 51631377 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 51631430 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51631540 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 51631590 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 51631591 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 51631648 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 51631651 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 51631729 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 51631781 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51631792 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51631805 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 51631849 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51632050 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51632066 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51632111 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51632140 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51632150 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51632153 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51632194 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51632398 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51632495 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51632618 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 51632708 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51632776 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51632809 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51633082 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51633217 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51633223 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51633229 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51633235 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 51633297 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51633343 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51633443 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51633504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51633682 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51633697 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 51633702 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 51633710 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 51633717 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 51633807 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51633826 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51633837 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51633852 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51633867 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51634731 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51634796 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 51634810 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 51634834 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51634916 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51634965 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51635177 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 51635484 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 51635651 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 51635856 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 51635857 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 51635955 A T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 2 51635984 C G N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 51636001 C A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 51636024 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 51636136 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 51636138 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 51636165 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 51636169 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 51636241 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 51636422 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51636489 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51636538 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51636547 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51636677 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 51636693 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 51636920 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 51637049 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51637104 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51637132 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51637135 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51637213 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51637334 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51637484 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 51637560 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 51637625 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 51637669 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 51637727 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51637820 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 51637837 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 51637911 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 51637913 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 51637996 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 51638006 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 51638059 T A N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 51638075 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 51638086 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 51638122 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 51638322 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 51638373 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 51638465 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51638516 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51638634 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51638635 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51638669 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51638764 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51639308 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51639505 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51639567 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51639652 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51639701 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51639770 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 51639773 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51639938 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 51639952 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 51640123 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 51640211 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51640359 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51640536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51641106 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51641377 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 51641463 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 51641546 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 51641594 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 51641610 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51641635 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 51641705 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51641779 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 51641794 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51641820 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51642238 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51642817 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51643027 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51643290 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51643470 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51643646 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51643821 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 51643822 C A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 51643931 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51644274 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 51644444 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 51644454 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 51644593 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51644804 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 51644872 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51644915 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51644919 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51645605 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51645813 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51646913 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 51647359 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 51647715 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51647936 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51648089 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51648265 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51648570 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 51648583 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 51648672 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 51648786 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 51648862 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 51648888 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 51648899 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 51648931 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51649817 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 51650312 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51650932 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 51651729 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51651958 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51652247 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 51652259 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 51652288 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 51652696 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51652857 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51653316 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 51653414 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 51653616 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51654744 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 51654755 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 51655170 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 51655319 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51655747 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51656015 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51656180 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51656294 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51656300 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51656370 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51656391 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51656395 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 51656478 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51656589 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 51656656 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 51656690 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 51656855 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51656943 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51657075 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51657187 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51657219 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51657221 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51657316 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51657400 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51657411 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51657474 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51657586 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51657599 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51657630 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51657706 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51657748 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51657814 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51657816 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51657835 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51657836 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51657895 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51657966 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51657967 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51658570 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51658755 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51658823 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51659005 A T N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 51659018 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 2 51659510 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51659873 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 51659963 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51660360 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 51660521 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 51660873 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 51661139 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 51661321 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 51661322 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 2 51661428 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 51661515 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 51661797 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 51661823 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 51662370 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 51662473 A C Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 51662518 T G Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 51662688 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 51662698 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 51662764 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 51662980 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 51663322 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 51663532 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51663600 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51664114 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51664124 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51667262 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51667762 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51667990 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 51668144 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51668426 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 51668892 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 51669175 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51669266 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 51669759 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51670034 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51670040 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51670155 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 51670607 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51671454 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51671669 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 51672336 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 51672760 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 51672812 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51673125 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51673323 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51673817 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51673972 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 51674107 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51674257 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 51674425 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 51674436 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 51674554 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 51675130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51675141 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 51675322 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 51676347 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 51676446 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51676489 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51676609 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51676723 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 51676755 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51676870 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51676970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51676999 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 51677015 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 51677031 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51677168 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 51677244 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51677255 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51677259 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51677281 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 51677342 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51677425 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51677461 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51677635 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 51677786 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 51678203 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 51678222 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 51678228 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 51678235 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 51678306 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51678441 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 51678581 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 51678656 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51678696 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 51678702 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51679030 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 51679310 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 51679427 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51679637 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51680092 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 51680371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51680374 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51680401 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51680592 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51680941 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51681162 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51681209 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51681531 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 51681786 A T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 51681845 T C Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 51681889 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51682022 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51682269 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 51682273 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 51682296 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51682297 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 51682541 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51682879 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51683019 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 51683083 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51683745 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51683747 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51683912 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 51684531 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51684600 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 51685090 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51685181 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51685265 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 51685291 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 51685318 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 51685668 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 51685713 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51685886 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51685939 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51686058 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51686116 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 51686241 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51686518 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51686519 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51686820 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 51686941 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51687453 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 51687574 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 51687857 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51688221 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51688439 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51688850 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51689050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51689358 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51689359 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51689810 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51690114 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51690240 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 51690639 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 51691098 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51691821 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51691931 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51692112 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 51692206 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 51692311 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 51692565 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 51693176 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 51693563 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51693586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51694201 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51694284 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51694390 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51694401 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51694427 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51694428 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 51694462 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51694588 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51695109 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51695140 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51695161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51695171 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51695206 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51695215 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51695430 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51695592 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 51695598 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 2 51695874 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51695890 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51695894 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51695957 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51696047 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 51696733 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51696958 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51697236 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51697514 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51697556 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51697579 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51697582 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51697590 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51697675 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51697773 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51697791 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51697924 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51697974 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 51698021 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51698129 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51698147 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51698204 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 2 51698218 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 51698489 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 51698528 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51698557 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 51698596 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51698705 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51698765 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51698856 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51698875 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51698989 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51699000 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51699001 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51699107 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51699141 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51699217 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51699263 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51699285 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51699378 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51699399 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51699606 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51699620 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51699689 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51699691 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51699771 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 51699784 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 51699856 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 51699911 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 51699926 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 51699953 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51699974 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 51700157 C A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 51700202 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 51701285 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 51701938 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51702248 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51702292 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 51702313 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51702572 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 51702617 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51702925 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51702935 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51702944 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51702959 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51704035 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51704215 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51704586 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 51704732 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 51704879 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 51704911 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 51705289 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51705339 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51707185 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51707609 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 51707753 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51707754 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51708525 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 51708811 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51708889 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 51708899 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 51709238 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 51709289 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 51709432 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 51709569 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51709870 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 51710006 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 51710059 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 51710101 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 51710209 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51710259 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51710347 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51710394 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 51710805 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51710899 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51710972 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51711097 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51711119 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51711163 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51711410 G C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 51711467 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 51711535 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 51711546 G T N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 51711658 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 51711840 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51711859 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51711904 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 51712028 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 51712045 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 51712155 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 51712189 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 51712287 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51712386 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51712398 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51712410 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 51712460 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 51712870 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51713020 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51713115 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51713215 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 51713258 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 51713346 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 51713414 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 51713427 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 51713443 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 51713939 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 51714193 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51714292 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51714293 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51714363 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51714376 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51714393 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51714918 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51715002 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51715284 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51715507 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51715621 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51715842 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51716273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51716394 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51717592 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51718010 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 51718167 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51718859 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 51720244 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51720245 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51720819 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51720908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51720966 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51721147 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 51721256 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 51721302 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 51721352 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 51721665 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51721678 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51722242 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 51722453 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 51722603 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51722802 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51722852 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51722865 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51722875 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51722913 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 51722964 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 51723019 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51723038 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51723124 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51723239 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51723268 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51723332 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51723335 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51723366 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51723405 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51723485 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51723535 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51723621 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51723941 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 51724373 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 51724382 T G N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 51724564 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 51724956 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51725135 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51725220 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51725223 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51725313 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51725392 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51725443 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51725498 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51725583 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51725627 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51725792 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51725818 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51725886 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51725891 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51725901 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51725905 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51725930 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 51725971 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51725979 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 51726017 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51726351 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51727314 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51727357 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51727370 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51727397 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51727599 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51727696 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51727824 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 51727825 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51728019 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51728032 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51728038 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51728043 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51728303 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51728333 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51728459 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 51728480 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 51728640 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 51728657 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 51728725 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 51728751 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 51728844 T A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 51728918 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 51729077 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 51729079 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 51729103 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 51729113 T G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 51729147 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 51729160 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 51729359 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51729391 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51729667 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51729753 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51729909 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 51730003 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 51730218 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 51730257 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 51731460 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51731544 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51731685 G C Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 51731799 C A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 51732182 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51732207 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51732321 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51732411 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51732506 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51732932 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51733060 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51733086 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51733499 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51733741 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51734121 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51734649 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 51734679 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 51734700 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 51734803 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51734849 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51734883 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 51734885 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 51734952 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51734969 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51735125 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51735138 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51735163 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51735219 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 51735259 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51735334 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 51735408 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51735449 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51735450 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51735482 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51735502 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51735514 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51735522 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51735587 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51735594 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51735685 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51735699 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51735769 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 51736408 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51736432 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51736433 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51736546 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51736550 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51736562 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51736690 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51736691 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51736716 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51736738 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51736760 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51736805 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51736815 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 51736836 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51736837 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 51736910 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51736958 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51737020 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51737069 A C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 51738716 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 51738720 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51738927 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51738944 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51738973 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51738978 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51738991 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51739141 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51739164 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 51739230 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 51739231 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 51739273 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51739559 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51739673 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51739679 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51739704 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51739770 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51739797 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51739857 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51739860 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51739872 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51739901 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51740062 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51740103 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51740162 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51740307 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51740424 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 51740498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51740560 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 51740687 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 51740695 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 51740770 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51740806 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51740931 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51740933 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51740986 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51741048 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 51741274 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51741373 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51741442 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 51741526 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 51746149 G C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 51746227 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51746291 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 51746358 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51746379 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51746460 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 51746495 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51746698 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 51746717 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 51746718 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 51746728 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 51746761 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51746778 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51746788 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51746835 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51746903 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51746937 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 51747095 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 51747147 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51747223 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51747256 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51747377 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51747411 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51747433 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 51747448 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51747601 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 51747690 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51747796 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51747802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51747847 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51747883 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51747898 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51747992 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51748091 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51748100 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51748225 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51748300 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51748322 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51748398 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51748416 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 51748453 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 51748702 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 51748760 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 51748774 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 51748789 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 51748815 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 51749495 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 51749526 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 51749536 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 51749584 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51749927 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 51750182 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 51750183 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 51750335 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51750524 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51750529 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51750883 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51751795 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51751820 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 51751961 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51752022 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51752029 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51752097 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51752221 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 51752227 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 51752285 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51752296 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51752318 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51752322 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 51752393 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51752525 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 51752545 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51752983 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51753417 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 51753419 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 51753571 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 51753592 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 51753827 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51753874 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51753955 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51754050 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51754058 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51754215 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51754237 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 51754358 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 51754428 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 51754491 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 51754746 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51754750 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51754968 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 51755044 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51755052 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 51755273 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51755372 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51755376 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51755436 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51755815 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 51755956 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51756039 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51756094 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51756169 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51756273 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51756274 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51756373 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51756382 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51756513 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 51756587 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51756645 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51756734 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51756919 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51757147 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51757395 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51757475 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51757564 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51757701 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51757761 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 51757839 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 51757902 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 51757942 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51757979 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51758075 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51758104 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51758153 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51758199 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 51758243 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51758307 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51758356 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51758402 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51758407 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 51758426 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51758483 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 51758559 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51758617 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 51758637 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51758688 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 51758696 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 51759370 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 51759380 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 51759388 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 51759701 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 51759947 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 51759997 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51760087 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 51760232 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 51760234 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 51760243 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 51760302 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 51760345 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51760379 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51760473 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51760570 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 51760584 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 51760772 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 51761596 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 51761604 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 51761635 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51761663 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51761745 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 51762121 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51762480 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51762615 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51763079 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51763409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51763798 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51764202 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51764875 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 51765048 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 51765056 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 51765785 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51765790 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 51766102 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 51766203 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 51766224 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 51766237 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 51766273 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 51766986 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51767138 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51767233 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51767308 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51767360 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 51767388 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51767436 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51767439 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51768117 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51768214 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51768270 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51768447 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 51769171 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 51769414 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 51770722 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51770806 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51771293 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 51771356 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 51771360 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51771433 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 51771493 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 51771869 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51771880 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51772071 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51772120 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51772159 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51772414 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 51772692 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51772723 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51772993 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 51773148 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51773248 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51773304 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51773381 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51773514 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51773576 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 51773631 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 51773640 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 51773948 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 51774007 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 51774488 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 51774849 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51774894 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51774942 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51774994 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51775072 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51775086 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51775126 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51775196 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51775203 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51775300 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51775334 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51775588 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51775711 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51775784 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 51775791 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 51775799 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51775974 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 51776050 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51776131 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51776183 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51776219 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51776227 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51776299 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51776339 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 51776441 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51776495 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51776595 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51776672 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51776732 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51776733 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51776772 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51776984 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51777165 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51777338 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51777500 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51777578 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51777591 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51777597 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51777613 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51777704 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51777716 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51777747 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51777827 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51777861 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51777864 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51777977 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51777978 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 51778679 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51778710 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51778740 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51778779 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51778968 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51778973 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51779249 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51779321 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 51779324 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 51779333 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51779478 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 51779532 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 51779715 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 51779837 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 51779918 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51780265 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51780330 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51780382 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 51780415 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51780443 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51780594 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51780887 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51781152 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51781497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51783101 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51783224 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51783325 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51783391 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51783521 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51783522 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51783592 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51783618 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 51783631 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51784552 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51784565 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 51784602 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51785976 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51786027 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51786093 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51786246 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51787231 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51787333 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51788114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51788328 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51788579 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51788621 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51793170 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51793700 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51794200 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51794772 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51795738 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51796422 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51796626 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51796996 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51798436 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51798866 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51800552 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51800929 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 51801380 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 51804241 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51805178 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51805470 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51805521 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51805792 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51805816 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 51806606 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 51806703 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 51806880 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51807043 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51807080 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 51807088 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 51807112 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 51807135 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 51807422 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 51808517 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51808613 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 51809221 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51809281 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51809422 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51809521 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51809713 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 51809962 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 51810023 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 51811482 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51811554 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51811687 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51811785 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51812287 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51812317 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51812323 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51812502 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51812684 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 51812801 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 51812872 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 2 51812934 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51812961 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51812991 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51813011 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51813117 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51813126 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51813132 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51813184 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51813218 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51813263 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51813278 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51813288 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51813299 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 51813398 T G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 51813577 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51813692 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 51813777 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51813779 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51813819 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51813837 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51813877 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51813969 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51813975 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51814043 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 51814084 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51814337 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51814363 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51814610 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51814618 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51814683 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 51814703 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51814710 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 51815124 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51815336 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51815376 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51815650 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 51815723 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 51815955 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51816305 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51816758 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51816801 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 51816879 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 51817196 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 51817219 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 51817626 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 51817795 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 51817896 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 51817936 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 51817953 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51818199 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51818405 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 51818414 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 51818435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51818470 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51818515 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51818549 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51818574 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 51818907 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 51819169 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 51819233 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51819285 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 51819339 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51819353 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 51819474 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 51819622 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51819754 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 51820077 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 51820103 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 51820280 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51820436 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51820469 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51820608 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51820836 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 51820838 C A N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 51820888 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 2 51821075 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51821308 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51821505 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 51821683 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 51821687 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51821700 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 51821883 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 51821968 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51821994 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 51822038 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 51822120 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 51822122 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 51822135 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 51822159 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51822206 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51822409 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 51822473 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 51822494 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 51822502 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51822510 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51822560 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51822581 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 51822595 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 51822609 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51822655 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 51822766 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 51822951 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 51823285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51823363 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51823432 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51823577 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 51823627 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51823628 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51823730 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51823786 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 51823815 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 51823823 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51823843 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 51823908 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 51824149 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51824185 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51824344 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51824419 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51824423 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 51824441 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 51824695 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 51824787 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 51824940 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 51825042 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51825066 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51825090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51825326 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51826542 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51827176 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 51827308 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 51827332 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51827520 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 51827521 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 51827555 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51827594 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51827992 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51828007 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51828261 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51828332 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51828348 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 51828371 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51828437 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51828522 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 51828631 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51828678 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51828691 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 51828728 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51828740 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51828924 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 2 51829076 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51829159 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 51829308 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51829445 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 51829545 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 51829554 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 51829568 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 51829866 A T N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 51829877 G C N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 2 51829929 A G N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 2 51829964 T C N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 51830206 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 51830302 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51830492 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 51830940 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51831473 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51832151 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 51832271 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51832278 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51832315 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51832321 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51832374 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51832391 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51832397 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 51832649 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51832749 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51832811 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51832903 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51832964 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51832984 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51833611 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51833734 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 51833829 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 51834027 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51834859 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51834966 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51835587 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51835650 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51835658 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51835723 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51836200 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 51836227 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 51836228 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51836348 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51836352 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51836408 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 51836550 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 51836762 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 51836859 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 51837081 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 51837083 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 51837138 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 51837489 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51837640 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 51837853 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51837857 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 51837896 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 51837908 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 51837955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51838062 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51838064 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 51838082 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51838178 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 51838185 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 51838226 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 51838458 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 51838690 T A N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 8 10 1 6 2 2 51838912 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 51838935 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 51838941 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 51838997 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51839054 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51839092 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51839104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51839115 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51839244 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51839484 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51840343 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51840364 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51840464 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51840820 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 51841033 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 51841116 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 51847509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51847626 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51847671 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51847931 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51848386 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51849023 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51849269 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 51849473 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 51849588 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 51849732 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 51849751 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 51849806 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 51849817 A C N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 51849863 A G N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 9 11 1 7 2 2 51849900 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 2 51850081 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 51850924 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 51851011 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51851026 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 51851208 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51851432 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 51851514 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51851728 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 51851775 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 51852197 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 51852465 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 51852645 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 51852714 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 51853050 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51853111 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 51853180 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51853475 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51853626 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51853739 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51853848 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51853902 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51853907 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51854106 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51854166 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51854229 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51854267 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51854331 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51854419 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51854429 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 51854434 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 51854449 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 51854454 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 51854524 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 51854547 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 51854601 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 51854635 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 51854664 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51854720 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51854725 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51854732 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51854739 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51854772 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 51855677 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 51855942 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51856087 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 51856088 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 51856271 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 51856600 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 51856604 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51857096 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 51857106 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 51857134 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 51857309 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 51857314 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 51857329 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51857427 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51857476 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51857527 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51857610 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 51857635 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 51857684 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51857691 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51857719 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51857725 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51857798 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51857809 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 51857857 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51857873 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51857886 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51857933 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 51858029 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51858090 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51858132 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51858159 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51858369 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 51858767 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 51858805 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 51858999 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 51859321 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 51859619 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51859680 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51859709 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 51859729 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51859764 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51859877 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51859917 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51859927 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51859952 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51859960 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51859978 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51860002 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51860137 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51860462 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51860474 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51860498 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51860597 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51860599 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51860659 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51860677 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 51860759 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51860762 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51860917 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51860954 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 51861135 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51861211 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51861281 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51861381 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51861534 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51861581 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51861679 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 51861708 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 51861775 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51861799 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51862379 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51862667 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 51863490 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51866257 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 51866363 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 51867533 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51867637 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51868265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51868535 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51868771 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 51869171 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 51869633 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 51869788 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51870273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51870543 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 51871798 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51871814 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 51871887 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 51871959 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 51871969 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 51872102 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 51872149 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51872153 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51872177 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51872260 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 51872335 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51872436 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51873296 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51873921 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51874730 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 51874744 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 2 51874811 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51874826 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 51874865 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51875047 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51875506 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51875645 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51876133 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51876138 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51876286 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51876548 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51876632 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51877921 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51878233 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51878242 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51878439 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51878863 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51878890 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51879025 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51879365 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51879366 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51879379 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51879431 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51879502 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51879620 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51879798 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51880019 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 51880095 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 51880109 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51880125 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51880185 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 51880380 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51880392 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51880531 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51880608 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 51881162 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51881219 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51881389 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51881453 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51881492 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51881511 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51881526 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51881859 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51882356 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 51882361 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51882407 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 51882428 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 51882456 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 51882544 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51882667 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51882672 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51882695 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51882734 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51882768 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51882792 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51882796 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51882825 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 51882890 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51882931 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 51882959 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51883003 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 51883015 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51883063 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 51883082 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51883102 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51883169 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51883180 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51883315 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51883347 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51883413 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51883483 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51883655 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51883681 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51883810 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51884507 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 51884587 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 51884589 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 51884945 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51885373 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 51885512 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51885937 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51886141 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 51886559 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 51886797 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 51887223 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 51888614 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 51889550 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51889587 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51889985 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51890253 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 51890646 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51891257 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 51891283 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 51891478 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 51891520 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51891536 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51891630 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51891785 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51892017 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51892682 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 51892852 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 51892930 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 51892936 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 51893362 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 51893462 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51894135 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51894460 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51895043 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51895181 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51895344 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51896159 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51896218 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 51896402 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51896405 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 51896414 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51896430 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51896437 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51896460 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51896469 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51896486 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51896524 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 51896529 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 51896738 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 51896795 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 51896807 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 51897406 G T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 51897433 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 51897538 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 51897551 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 51897553 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 51897576 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 51897577 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 51897629 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 51897876 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51897984 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51898101 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51898342 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51898349 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51898500 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51898601 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 51898838 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51899398 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51899538 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51899669 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51899728 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51899740 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51900302 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51900445 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51900487 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51900581 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51900620 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51900711 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51900776 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51901088 T G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 51901345 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51901392 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51901462 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51901616 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51901647 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51901829 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51902399 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 51902733 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51902768 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51902824 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51902846 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51902902 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51903111 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 51903198 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51903267 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51903318 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51903380 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51903398 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51903436 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51903450 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51904069 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51904189 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51904191 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51904289 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51904298 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51904347 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51904410 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51905046 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 51905101 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51905119 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51905325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51905616 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51905819 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 51906042 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 51906087 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 51906236 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 51906599 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51906608 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51906739 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51906829 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51906968 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 51906996 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51907017 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51907041 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51907223 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51907322 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51907366 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 51907408 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 51907415 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 51907489 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 51907645 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51907679 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 51907966 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51908164 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51908338 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51908380 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 51908643 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 51908749 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 51908807 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 51909082 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 51909137 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 51909404 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 51909541 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 51909906 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 51909944 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 51909953 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 51910069 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 51910171 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51910178 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51910334 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51910810 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51911135 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51911150 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51911162 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51911165 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51911176 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51911263 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51911272 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51911497 T A N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 51911985 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 51912356 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51912738 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 51912935 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51913104 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51913234 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51913282 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51913294 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51913436 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51913763 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51913779 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 51913839 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51914044 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51915044 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 51915734 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51916692 T A N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 51917285 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51918566 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51918746 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51919737 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51920078 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51921096 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51921130 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51922210 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51922259 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 51922378 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51922394 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 51922395 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 51922479 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 51922496 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51922660 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51922672 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 51922684 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51922752 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 51923196 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 51923221 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51923233 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51923478 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 51925882 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51925885 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 51925903 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51929434 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 51929500 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51930589 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51931049 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51931774 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51931810 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51931823 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51932951 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51933011 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51933025 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51933386 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51933525 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51933684 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51934372 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51934441 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51934637 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51934825 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51934857 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51934941 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51935087 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51935711 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51935752 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 51936018 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51936042 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51936646 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51937401 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51937664 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 51937686 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51937767 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51937870 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51938391 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51938523 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51938717 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51940133 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51941250 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 51942387 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51943391 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51945351 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51947540 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51948112 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51948342 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51948845 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 51949264 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51949513 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 51949864 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51950486 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51950593 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51950937 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51951169 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51951240 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51951253 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 51951335 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51951765 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 51952272 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51952283 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51952519 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51952721 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51953189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51953331 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51953940 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51954019 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51954766 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51955708 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 51955810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51956051 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51956099 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51956216 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51957304 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51957653 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 51957931 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 51958055 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 51958174 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 51959877 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51959896 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51960168 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51960832 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51962004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51962336 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51962493 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51962764 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 51963615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51963712 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51963721 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51964103 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 51965199 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51965214 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51965226 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 51965369 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 51965611 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51965790 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51966384 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51967088 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51967365 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51967390 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51967468 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51967932 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51968065 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51968147 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51968355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51969053 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 51969564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51970118 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 51970388 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51970446 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51970454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51970507 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51972293 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 51972303 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 51973104 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 51973461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51973878 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 51974296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51975392 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 51975866 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51976817 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 2 51978069 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 51978371 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 51978436 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51979285 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 51979571 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51980084 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 51981392 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51984760 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51984892 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 51987068 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51987209 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51987232 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51987711 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 51987744 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 51988108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51988426 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 51989560 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51990745 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51990932 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 51991222 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51991936 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51992104 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51992246 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 51992263 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51992287 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 51992409 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51992528 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51992681 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 51992922 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51993000 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51993589 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51993700 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51993763 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51994005 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51994007 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51994405 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51994564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 51994966 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51994989 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 51995156 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51996011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 51996127 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 51996156 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 51996408 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 51996567 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 51996664 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 51996697 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 51996727 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 51996732 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 51996765 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 51996797 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 51996854 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 51996879 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 51996908 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 51997100 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51997108 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51997150 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51997170 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51997203 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 51997299 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51997343 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51997416 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51997483 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51997521 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51997537 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51997629 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51997661 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51997678 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 51997703 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 51997787 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51997831 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 51997884 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51998022 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998051 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998098 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998104 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998121 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51998128 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 51998166 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51998364 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998374 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 51998415 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998478 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998503 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998510 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51998516 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51998531 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 51998546 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 51998570 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998688 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998744 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998784 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998813 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51998845 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 51998883 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 51999029 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51999037 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51999124 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 51999179 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51999264 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 51999371 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51999554 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51999559 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51999654 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51999693 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51999702 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 51999714 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 51999762 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 51999792 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51999817 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 51999877 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51999907 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 51999950 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52000023 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52000185 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52000216 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52000336 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52000358 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52000543 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 52000560 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 52000628 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 52000674 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 52000692 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 52000750 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 52000763 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 52000899 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 52001046 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52001056 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52001068 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52001135 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52001146 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52001229 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52001273 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52001295 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52001316 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52001354 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52001545 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 2 52001779 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 52001803 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 52001811 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 52001883 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52002268 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52002299 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52002383 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 52002479 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 52002501 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 2 52002610 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52003007 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52003314 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52003354 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52003356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52003369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52004021 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52004125 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52004386 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52004499 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52004520 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52004566 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52004979 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52005042 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52005363 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52005759 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52006469 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52007659 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52007704 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52008251 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52008255 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52008363 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 52008847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52008964 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52008984 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52009147 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52009449 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52009728 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 52009898 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52010068 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52010112 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52010255 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52010561 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52011271 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52011314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52011679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52011682 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 52013872 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 52014206 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52014412 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 52014413 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 52014723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52014867 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52014966 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52016008 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52017047 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 52017969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52018370 C A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 2 52018391 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 52018767 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52018785 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52018848 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52018960 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52019196 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52019616 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52020626 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52021371 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 52021624 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52021732 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52022090 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 52022394 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52022689 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52022702 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52022834 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 52023083 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52023579 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 52023588 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 52023774 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52023853 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52023941 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52024767 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52024902 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 52024939 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52024973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52025104 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52025531 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52025541 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52025692 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52025825 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52026075 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 52026202 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 52026217 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 52026245 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 52026652 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 52026993 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52027078 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52027081 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52027092 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52027355 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 52027493 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52027651 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 52027654 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 52027667 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 52027922 T G N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 2 52027925 T G N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 52028602 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52028802 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 52028843 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 52029149 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 52029380 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52029829 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52030003 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52030095 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52030292 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52030448 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52030571 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52031242 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52031408 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 52031472 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 52031840 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52031849 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52031862 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52031865 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52031950 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 52032000 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52032008 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52032046 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52032066 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52032662 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52032668 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52032809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52032869 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52032879 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52032976 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52033438 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52033453 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52033716 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52034138 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52034171 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52036111 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52037369 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52039363 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52039385 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52039417 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52040050 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52040778 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52041282 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52042470 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52042593 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52042621 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52043151 T G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 52043191 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 52043260 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 52043267 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 52043533 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52043671 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52043786 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52043790 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52043852 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 52043911 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52044544 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 52044704 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 52044859 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 52044890 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52045007 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52045934 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52045946 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52046071 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52046275 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52046276 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52046442 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52047096 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52047336 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52047518 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52048262 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52048583 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52049164 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52049963 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52050001 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52051460 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 52051523 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 52051561 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 52051579 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52051762 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52051949 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52052122 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 52052333 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52052499 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 52052515 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 52052568 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52052730 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52053213 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52053571 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52053736 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52053795 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52053869 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52054177 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52054194 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52054255 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52054457 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52054458 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52054698 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52054716 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52054945 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52055070 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52055096 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52055100 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52055122 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52055306 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52055329 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52055553 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52055625 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52055665 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52055667 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52056283 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52056402 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52056405 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52056415 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52056732 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52057587 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52057974 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52058282 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52058369 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52058445 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52058510 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52058640 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52058897 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52058913 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52058927 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52058931 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 52059030 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 52059104 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52059115 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52059219 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52059715 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52059950 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52059978 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52060589 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52060722 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52060755 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52060775 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52060941 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52061020 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52061026 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52061275 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52061302 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52061303 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52062019 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52062111 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52062127 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52062287 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52062471 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52062575 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52062627 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52062656 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52063392 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52063926 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52063968 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52064403 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52064790 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52065184 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52065490 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52065530 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52065642 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52065723 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52065741 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52065762 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52065811 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52065854 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52065899 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52066034 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52066040 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52066211 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52066246 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52066269 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52066286 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52066327 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52066354 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52066584 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 52066655 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 52066665 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 52066724 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 52066790 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 52066810 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52066862 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52066871 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52066880 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52066884 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52066916 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52066954 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52066973 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52066993 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52066994 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52067186 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52067211 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52067284 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 52067307 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52067308 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52067321 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52067339 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 52067357 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 52067646 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 52067687 C A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 52068367 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52068388 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52068769 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 52068806 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52069123 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52069172 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52069305 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 52069707 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52069779 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52069976 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52070010 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52070080 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52070143 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52070169 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52070175 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52070236 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52070722 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52070820 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52070838 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52071122 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52071272 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52071350 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 52071364 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 52071449 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52071464 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52071676 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52072348 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52072364 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52072504 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52072968 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52073029 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52073138 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52073149 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52073154 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52073166 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52073171 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52073191 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52073226 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52073249 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52073328 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52073684 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52073892 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52073958 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52073992 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52074176 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52074206 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52074251 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 52075038 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52075135 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52075175 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52075208 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52075216 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 52075358 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 52075631 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52075796 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52075820 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52076225 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 52076323 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52076374 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52076380 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52076460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52076620 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 52077071 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52077130 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52078082 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52079012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52079051 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 52079071 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52079278 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52079316 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52079450 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52079471 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52080298 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 52081323 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52081453 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52081570 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 52081612 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52081852 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52082430 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52082540 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 52082619 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52082696 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 52082845 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52082847 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52082893 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52083134 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52083188 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52083259 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52083322 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52083354 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 52083391 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52083805 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 52083923 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52083924 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52083992 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52084202 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52084364 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52084631 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 52084672 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52084935 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52085611 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52086183 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52086497 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 52086499 A T N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 52086772 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52086925 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 52087124 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 52087844 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52088068 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52088247 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 52088486 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52088708 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52088809 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52088901 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52088976 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52089043 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52089084 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52089601 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52089694 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52089695 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52089705 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52090069 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52090227 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52091354 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 52091565 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 52091698 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52091808 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 52091825 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 52092034 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52092222 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52092293 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 52092405 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52092618 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52092728 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52092802 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52092882 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52092911 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52093102 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 52093133 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52093231 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 52093375 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52094748 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52095069 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52095468 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52095517 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52095725 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52096243 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 52096699 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 52096738 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 52096893 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 52097088 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52097163 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52097893 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 52098297 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52098395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52098505 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52098666 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52098968 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52100625 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52100691 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52100810 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52101084 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52101257 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 52101439 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 52101446 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 52101606 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52101671 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52101901 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52101966 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52101989 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52102009 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52102052 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52102186 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52102234 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 52102444 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52102445 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52102524 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52102832 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52102931 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52102965 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52103013 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52103014 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52103037 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52103102 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52103139 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52103399 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52103450 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 52103519 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52103604 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52103626 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52103650 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52103659 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52104069 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52104104 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52104151 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52104252 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52104287 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52104381 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 52104413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52104435 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 52104450 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52104511 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 52104513 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 52105079 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52105128 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52105353 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52105444 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52105671 A C N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 52105721 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 52105865 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 52106176 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52106302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52106340 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 52106478 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52106896 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52106929 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52106989 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52107051 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52107165 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52107227 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52107512 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52107694 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52107726 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52108149 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52108175 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52108403 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 52108421 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 52108543 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 52108565 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 52108768 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 52109316 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52109638 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52110184 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 52110341 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52110447 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52111222 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 52111254 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 52112806 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 52113210 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52113542 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52113557 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52113888 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52114052 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 52114601 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 52114646 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 52114697 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52114751 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 52114766 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 52115284 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 52115350 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 52115513 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 52115587 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 52115686 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52115735 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52115823 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52115864 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52116580 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 52116608 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 52116625 T A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 2 52116753 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 52116798 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52116827 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 52116828 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 52116893 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52116896 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52116917 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 52116985 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52117012 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 52117033 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 52117035 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 52117125 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52117539 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52117553 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52117798 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52118000 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 52118049 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52118108 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52118110 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52118191 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52118275 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52118710 G C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 52119341 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52119664 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52119856 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52119923 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52119973 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52120079 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 52120202 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 52120221 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 52120263 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52120316 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 52120753 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52120781 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52121456 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 52121576 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52122390 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52122466 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 52122508 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 52122706 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52123546 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 52123648 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 52123779 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 52123786 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 52123836 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52123956 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 52124010 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52124095 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 52124200 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52124218 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 52124325 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52124377 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 52125570 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52125602 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 52125916 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 52127210 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 52127326 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52127352 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52127356 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52127473 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52127856 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 52127999 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52128322 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52128335 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52128686 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 52129053 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 52129097 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 52129237 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 52129300 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52129420 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 52130222 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 52130248 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 52130321 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 52130330 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 52130391 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 52130549 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 52131153 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 52131790 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 52131983 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 52133304 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52133697 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 52134030 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 52134219 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52135026 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 52135225 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52135657 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 52135815 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 52135834 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 52135851 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 52135918 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 52135922 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 52136091 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 52136208 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 52136321 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 52136377 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 52136489 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 52136754 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 52136758 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 52138061 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52138624 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52139226 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52139274 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 52139275 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 52139505 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 52139585 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52139747 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52140042 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52140058 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52140096 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52140123 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52140144 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52140168 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52140227 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52140548 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 52140608 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52140776 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 52140879 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 52141243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52141304 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52141309 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52141895 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52142062 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 52142136 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52142192 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52142260 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52142290 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52142990 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52143145 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 52143158 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 52143290 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52143364 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52143460 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 52143505 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52143890 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 52144008 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52144079 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52144272 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52144282 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52144751 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 52144802 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52144862 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52144876 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52145263 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52145360 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52146888 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 52146913 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 52147390 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52147673 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 52147728 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 52147878 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 52148025 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52148502 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52148605 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 52148645 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52148724 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 52148798 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 52148810 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 52148825 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 52148874 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52148896 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 52149444 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 52149484 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 52149641 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52149944 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52150146 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52150309 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52150338 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 52150442 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 52150446 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 52150652 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52150760 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52150832 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52151313 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 52151370 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 52151511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52151687 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52152099 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 52152204 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 52152478 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52152792 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52152898 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52153415 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52153470 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52153517 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 52153562 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52153596 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 52153606 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 52153610 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 52153689 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 52153755 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 52153804 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 52153874 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 52154035 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52154166 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52154530 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 52154728 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 52154845 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52154895 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52154912 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52154913 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52154923 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52155042 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52155081 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52155157 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52155266 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52155363 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52155366 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52155461 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 52156142 A T N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 52156493 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 52156535 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 52156602 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52156886 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 52157226 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 52157227 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 52157404 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52157570 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52157926 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 52158004 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52158013 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52158095 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52158302 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52158730 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52158978 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 52159005 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 52159118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52159180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52159389 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52159577 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52159589 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52159659 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 52159685 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52159723 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52159806 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52159876 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52160039 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52160349 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52160387 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 52160537 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 52160927 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 52160974 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 52161041 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 52161066 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 52161087 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 52161131 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 52161450 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52161572 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 52161791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52162295 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 52162389 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52162873 T C Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 52163379 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 52163439 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 52163574 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 52163721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52164689 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52165712 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 52166745 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 52167995 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 52168832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52169064 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52170511 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 52170543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52170743 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52171674 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52171681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52171797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52171801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52171823 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52171825 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52172104 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 52172273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52172295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52172447 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 52172679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52172731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52172783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52173105 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 52173134 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52173585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52173593 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 52174067 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52178143 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 52179615 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 52179732 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 52179863 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 52180025 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 52180087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52180234 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 52180279 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52180576 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52180970 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 52184453 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 52184965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52185266 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 52185351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52196258 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 52196489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52196587 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 52196766 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 52196772 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52196813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52197596 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 52197957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52197960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52198202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52198275 T C Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 52198465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52198711 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52199411 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 52199729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52199951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52201260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52201321 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52201500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52201560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52201700 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52201712 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52201760 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52201773 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 52201774 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 52201865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52201870 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52201939 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 52202033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52202089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52202093 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52202372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52202490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52202741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52202754 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52202764 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52202834 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 52202890 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 52202954 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 52202992 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 52203282 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 52203460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52203515 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52203578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52203631 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 52203740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52203753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52203789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52203922 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52203940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52203950 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52205695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52205709 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 52205802 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 52205849 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 52205868 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52205878 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52205905 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52206027 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52206047 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52206085 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52206186 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 52206215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52206285 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 52207048 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52207079 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52207128 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52207215 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52207328 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52207572 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52207711 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 52207732 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52207796 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 52207862 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 52207871 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 52207889 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 52207922 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 52207944 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52207997 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 52208331 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 52208552 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52208645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52208720 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52208793 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52208794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52208885 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 52209268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52209608 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 52209776 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 52209920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52209954 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 52210205 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 52210273 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 52210346 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52210455 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 52210483 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 52210615 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52210633 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52210696 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 52210729 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 52210788 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 52210851 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 52210901 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 52210934 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52210942 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52210951 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 52210970 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52211010 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 52211028 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 52211045 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 52211059 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 52211082 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52211364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52212010 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 52212175 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 52212251 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 52212295 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 52212299 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 52212315 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 52212340 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52212360 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 52212361 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 52212390 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 52212430 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 52212434 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52212488 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52212649 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52212653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52212674 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52212884 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52213064 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 52213193 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 52213282 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 52213352 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52213460 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52213485 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52213487 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52213508 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52213537 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52214189 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 52214253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52214328 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 52214462 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 52214555 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52214850 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52214869 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52214882 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52214913 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52215463 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 52215631 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 52215925 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52216555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52216916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52216925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52217093 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 52217110 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52217273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52217345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52217677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52217687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52217782 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 52218618 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52218997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52219923 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 52220010 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52220165 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 52220186 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 52220249 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 52222889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52226651 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 52226843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52226874 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 52226902 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52226983 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52227173 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52227265 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 52227272 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52227299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52227471 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52227930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52228722 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52228825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52228901 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 52229351 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 52230254 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52231103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52231437 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 52231628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52231717 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52231777 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 52231799 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 52232319 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 52232394 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52232461 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52232935 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52233418 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52233826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52234527 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52235091 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 52235190 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 52235220 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 52235589 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52235615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52237335 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 52237779 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52238266 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 52239292 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52239356 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52239562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52239794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52240081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52240123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52240153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52240166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52241069 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52241126 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52241127 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 52241765 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 52242028 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52242032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52242065 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 52242181 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52242190 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 52242477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52242966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52243837 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52244269 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52246665 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52246678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52246797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52247835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52248804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52254762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52256303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52260028 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52262277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52263938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52266127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52266405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52267390 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 52268254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52268893 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52269187 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52269754 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52270942 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 52271455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52271942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52273759 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52274122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52274345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52275665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52276154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52277817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52277828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52279544 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52279647 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 52280642 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52281648 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 52281674 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 52281699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52281765 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52281917 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52282303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52282529 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 52282540 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 52282819 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 52282869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52283410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52283595 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52284619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52286343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52287233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52288399 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52289519 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52292309 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 52293433 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52293602 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 52294714 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 52294751 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 52295069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52295309 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52295389 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52295786 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 52295798 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 52295951 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 52295987 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52296198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52296286 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52296366 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52296373 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52296965 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52296981 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52297023 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52297063 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52297068 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52297134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52297316 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52297446 T G Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 52297534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52297673 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 52297674 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 52297757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52297877 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 52298004 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 52298082 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52298110 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52298144 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 52298897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52299255 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52300090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52300422 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 52300438 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 52300458 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 52300495 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 52300595 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 52300610 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 52300618 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52300625 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 52300655 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52300680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52300789 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 52300881 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 52300886 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 52301806 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52302033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52302083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52302612 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 52302675 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52303122 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 52303272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52303278 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52303372 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52303508 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 52303623 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 52303690 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52303709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52303784 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52303861 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52304038 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52304057 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52304163 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 52304217 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 52304260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52304273 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 52304352 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 52304528 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 52304548 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 52304555 A C N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 52304797 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 52305604 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52305795 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 52305809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52305818 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 52306085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52306245 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 52306279 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52306300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52306312 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52306338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52306481 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52306485 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 52307356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52307670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52307683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52307733 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52307755 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52307909 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52307918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52308084 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52308201 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 52308233 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52308254 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52308310 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52308359 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52308360 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52308466 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 52308562 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 52308570 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 52308609 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52308665 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 52308670 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52308708 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52308860 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 52308873 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52308985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52309050 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52309113 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52309117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52309181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52309296 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 52310445 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52310533 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52310572 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 52310590 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 52311341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52311530 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 52311798 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 52312030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52312065 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 52312402 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 52312415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52312459 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 52312464 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 52312488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52312504 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 52312697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52312719 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 52312765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52313008 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52313079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52313226 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 52313256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52313276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52313412 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52313492 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52313592 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 52313629 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52313691 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52313706 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52313788 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 52313959 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52314035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52314054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52314092 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52314110 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 52314335 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 52314345 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52314348 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52314364 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 52314388 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 52314405 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 52314445 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 52314450 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 52314571 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 52314614 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 52315049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52315163 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 52315408 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52315439 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52315468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52315745 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 52315898 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 52316052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52316351 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 52316394 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 52316414 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52316540 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 52316541 T A N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 52316585 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 52316634 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52316651 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52316679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52316752 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 52316754 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 52316848 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52316869 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52316956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52316967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52317486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52317659 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 52317677 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 52317834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52318108 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 52319086 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 52319501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52319674 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 52319782 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 52319787 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 52319798 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 52319838 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 52319913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52320070 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52320696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52322831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52323867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52329777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52330574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52330775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52330899 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 52330945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52330949 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 52331313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52331689 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 52331812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52331904 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 52332102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52332449 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 52332641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52334668 C G N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 2 52334898 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 52334992 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 52335318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52335861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52335940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52335997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52336010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52336023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52336324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52337095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52339181 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 52342476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52343549 C A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 52343554 C A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 52343697 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 52343714 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 52344031 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 52344096 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52344491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52344600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52344602 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 52345053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52345107 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 52345155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52345691 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 52348007 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52349137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52349470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52354664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52356139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52356591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52356652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52357671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52358108 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 52358187 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52358197 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 52358526 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 52358632 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 52358662 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52358663 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52358674 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52358890 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52359083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52359159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52359415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52359535 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 52360275 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52360416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52360560 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52360675 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52361267 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 52361399 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52361435 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52361625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52362098 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52362612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52362627 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 52363002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52363366 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52363367 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 52363901 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52363909 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52363926 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 52363989 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 52364233 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 52364426 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 52364822 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 52364907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52364967 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 52365406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52368235 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52368560 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52368674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52368870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52368976 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 52369529 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52369553 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 52369616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52369706 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52369820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52369958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52369963 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52369972 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52370133 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52370158 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 52370226 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52370307 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52370313 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52370383 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 52370852 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 52371892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52372572 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 52373152 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 52373183 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 52373334 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52373361 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 52373651 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52373923 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52374382 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52374548 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52374815 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 52375982 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 52376007 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 52376022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52376210 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 52376261 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 52376294 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52376322 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 52376638 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 52376821 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 52376826 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 52376859 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 52377015 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 52377165 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52377321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52377371 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 52377448 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 52377463 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 52377536 G C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 52377547 C A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 52377713 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 52377762 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 52377774 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 52377979 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52378172 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 52378463 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 52378480 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 52378510 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52378542 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52378712 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52378770 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 52378795 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 52378809 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 52378872 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 52378897 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 52378912 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 52379298 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52379331 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 52379696 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 52379956 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 52379970 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 52380080 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 52380149 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 52380239 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 52380275 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 52380332 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 52380367 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 52380462 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 52380501 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 52380942 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 52381101 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 52381131 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52381199 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52381335 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52381379 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52381408 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 52381419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52381441 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 52381514 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 52381879 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52381927 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 52382051 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52382512 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52382787 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 52383370 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52383469 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52383595 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 52383749 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 52386009 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 52387402 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52387548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52387756 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52388122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52389121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52389347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52391963 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52392579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52392915 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52392931 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 52393011 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 52393148 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 52393153 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 52393496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52393595 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52393656 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 52393778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52393829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52393895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52393896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52393929 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52393943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52394053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52394151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52394752 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 52394838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52394883 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 52394980 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 52395074 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52395273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52395295 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52395427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52395447 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 52395809 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52396110 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52396352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52396404 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 52396681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52396797 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52399067 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 52399135 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 52399509 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52400124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52400196 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52400919 A C Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 52401330 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 52401457 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 52401904 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52402142 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 52404003 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52405051 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 52405391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52405450 A T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 52405451 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 52406327 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52408003 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52408415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52408535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52408536 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52408752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52410507 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 52411087 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52414848 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 52415827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52416724 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52417344 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52418354 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 52418654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52419468 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52421193 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 52421199 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52421388 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52421525 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52422477 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 52422494 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 52423216 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 52423850 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 52424084 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 52424198 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 52424210 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52424308 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52425215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52426622 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52428945 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 52428949 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 52429006 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 52429034 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 52429056 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 52429071 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 52429091 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 52429171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52429325 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 52429736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52429838 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 52429920 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 52430700 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52431050 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 52431091 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 52431094 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 52431406 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 52431675 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52431808 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 52431868 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 52432064 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 52432679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52432685 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52432926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52433253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52433520 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52433862 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 52434071 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 52434078 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52434803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52435414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52436707 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 52436946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52437499 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52438195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52438791 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 52438932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52439256 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52441071 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 52441081 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 52441262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52444091 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52444378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52444622 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52445615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52445642 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 52445889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52446235 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52447822 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 52447964 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52448224 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52448323 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52448560 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52448561 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 52449304 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52449491 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 52449674 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52449679 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 52449699 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52450634 T G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 2 52450915 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52450973 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 52451039 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52451045 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 52451074 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 52451135 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 52451207 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 52451212 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 52451376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52451379 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52452221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52453084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52453547 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52453596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52453852 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52453907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52454065 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52454090 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 52454114 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.235294117647059 26 8 13 0 4 2 52454195 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 52454298 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 52454320 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 52454371 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 52454420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52454422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52454459 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52454519 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 52454611 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52454613 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52454744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52454783 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52455011 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 52455043 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 52455051 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 52455115 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52455161 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 52455248 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52455379 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 52455527 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 52456213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52456223 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52456424 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52456539 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 52456950 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 52456987 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 52456998 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 52457021 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 52457141 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52457197 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52457233 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 52457243 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 52457305 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52457313 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 52457346 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 52457515 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52457541 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 52457559 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 52457584 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52457768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52457829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52458344 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 52459122 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 52459237 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 52459267 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 52459289 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 52459331 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 52459757 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52459766 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52459937 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52460070 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52460118 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 52460193 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 52460286 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52460547 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52460736 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 52460753 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 52461066 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52461524 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 52461715 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 52461721 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52462021 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 52462088 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 52462171 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52462174 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52462349 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 52462468 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52462473 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 52462915 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 52463257 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 52463277 G C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 52463558 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52463613 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52464271 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 52464312 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 52464334 A C Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 2 52464433 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.625 0.0625 0.3125 21 11 10 1 5 2 52464790 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 52464802 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 52464819 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52464846 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 52465205 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 52465251 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 52465263 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 52465294 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 52466185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52466528 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52466929 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52467302 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 52467386 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 52467485 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52467634 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 52467726 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 52467877 T C Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 52467893 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 52467942 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 52468049 A T N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 2 52468531 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52468552 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 52468569 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 52468585 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 52468588 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 52468720 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 52468728 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 52468858 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 52469038 G T Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 52469090 T G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 52469154 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 52469161 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52469315 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52469369 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 52469436 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 52469649 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52469704 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 52469730 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 52469749 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52469819 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 52470254 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 52470424 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 52470425 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 52470461 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52470540 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52470710 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 52470711 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 52470785 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52471570 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52471594 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 52472083 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 52472865 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52472874 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52472927 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 52473133 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 52473626 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52473815 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52474249 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52474323 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 52474366 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 52474368 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 52474379 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52474380 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 52474456 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52474496 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 52474510 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52474553 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 52474582 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52474663 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 52474716 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 52474725 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 52474758 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 52474801 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 52474981 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 52475157 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 52475400 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 52475768 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 52476226 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 52476264 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 52476409 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 52476484 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 52476872 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 52476889 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 52476908 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 52477029 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 52477041 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 52477180 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52477190 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52477215 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 52477403 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52477549 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52477581 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52477672 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 52477701 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 52477741 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52477752 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 52477791 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 52477988 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52478000 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 52478034 C G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 52478155 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52478164 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 52478228 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52478670 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 52478821 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52478935 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52479051 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 52479105 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 52479161 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52479213 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52479223 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52479439 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52480487 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52480502 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52480587 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52480746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52481079 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52481146 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52481176 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52481178 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52481212 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 52481257 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52481259 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 52481514 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 52481643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52481903 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 52481960 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 52482002 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 52482012 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 52482054 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52482065 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52482072 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 52482082 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 52482342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52482344 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52482372 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52483237 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 52483319 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52483331 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 52483357 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 52483390 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 52483398 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52483423 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52483429 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52483629 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 52483864 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52484438 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 52484448 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 52484662 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 52484672 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 52484733 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52485103 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 52485104 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 52485868 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 52485923 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 52485927 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 52486124 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 52486289 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52486423 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 52486495 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 52486697 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 52487328 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 52487402 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 52487577 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 52488344 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52488560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52488643 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 52488664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52488671 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52488787 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 52490121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52493091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52493354 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52494439 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 52494629 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 52494695 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 52494811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52494828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52494897 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 52494936 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52495093 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52495165 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 52495298 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52495438 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 52495503 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 52495567 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 52495742 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 52495859 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 52496254 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 52496274 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 52496302 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 52496438 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52496447 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52496777 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52496994 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52497224 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 52498015 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 52498043 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 52498071 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 52498087 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 52498133 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 52498249 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 52498379 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52498444 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52498890 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 52499022 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 52499053 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52499054 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52499301 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52499544 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52499780 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52499983 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52500172 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52500350 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 52501325 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 52501378 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52501690 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52501766 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52501792 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52502031 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52502060 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52502176 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 52502262 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52502331 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 52502381 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52502447 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52502455 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52502559 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52502849 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 52503027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52503191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52503568 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 52503990 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52504290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52504917 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52505094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52505368 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52505425 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52505426 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52505565 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52505756 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52505832 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52505838 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52506270 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52506425 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52506459 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52506619 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52506756 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52506799 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52506805 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52506870 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52506975 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 52507014 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52507048 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52507098 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52507136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52507147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52507249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52507313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52507483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52507492 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 52507703 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 52507739 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 52507746 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 52507784 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 52507999 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52508018 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52508079 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 52508083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52508098 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52508409 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52508512 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 52508920 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 52509122 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52509126 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52509352 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 52509353 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 52509521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52509644 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52509682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52509701 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52509734 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52509812 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52509889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52510077 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 52510087 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 52510297 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 52510393 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 52510551 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52510834 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52510891 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 52511119 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52511652 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52511731 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52512182 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 52512188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52512223 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52512289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52512770 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 52512824 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52512861 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52512862 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52513023 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52513080 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 52513160 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52513248 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52513337 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52513359 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 52513450 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 52513457 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 52513664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52513684 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52513751 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 52513812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52513909 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52513931 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52513932 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 52513949 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52514058 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52514075 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52514117 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52514179 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52514199 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 52514253 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 52514319 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52514534 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 52514587 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 52514649 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 52515451 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 52515486 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52515498 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52515549 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52515586 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52515740 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 52515849 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 52515910 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52515946 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52515952 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52516042 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52516150 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52516220 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52516221 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52516426 G T N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 2 52516499 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 52516686 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 52516771 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52516912 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52517082 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52517089 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52517107 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52517138 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52517204 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 52517295 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52517569 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52517661 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52517902 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52518304 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 52518305 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 52518398 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52518420 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 52518442 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52518458 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52518495 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 52518539 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52518580 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 52519039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52519138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52519397 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 52519775 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 52520013 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52520104 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52520506 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 52521862 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52521969 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52522381 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 52522473 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 52522775 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 52522985 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52523430 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 52523502 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52523566 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 52523857 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 52524023 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 52524379 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52524462 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52524961 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52525016 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52526707 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 52526882 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52526913 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52526924 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52526931 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52527125 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 52528090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52528154 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52528782 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52530573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52532527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52534905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52535363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52536683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52539874 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52545341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52546254 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52550366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52551334 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52551740 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52558140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52559486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52561671 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52561692 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52564933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52565281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52565943 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 52565944 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 52567047 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52567457 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52570875 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52571137 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 52571970 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52572004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52572295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52572809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52574144 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52574149 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52574177 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52574572 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52574645 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52574992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52574997 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52576007 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 52576020 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 52576199 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 52576274 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 52576324 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 52578005 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 52578032 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 52578078 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 52578296 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 52578568 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 52579061 A T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 52579277 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52579315 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 52579362 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52579382 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 52579401 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52579500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52579545 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 52579726 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52579737 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 52579785 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 52579938 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 52579977 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 52580603 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52580631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52580670 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52581092 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 52581140 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52581509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52583690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52585219 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52587356 T G N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 52587798 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 52587851 A G Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 2 52587911 T G N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 2 52589139 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 52589216 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52589315 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 52589322 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 52589484 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 52589608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52589682 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 52590027 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52590186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52590277 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52590279 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52590289 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 52590303 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52591413 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 52591442 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52591596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52592200 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52592538 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52592567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52592607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52592914 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 52593032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52593135 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52594178 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52595211 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52595456 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52595458 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52595532 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 52595651 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 52595812 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52595823 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 52595846 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52595868 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52595870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52595905 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 52595921 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52596000 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52596116 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52596852 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52597745 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52597749 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52597808 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 52597977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52599030 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52599306 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 52599386 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 52599533 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 52599542 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 52599868 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 52600042 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52600051 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52600289 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52600371 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 52600713 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52600944 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52601286 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 52601310 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 52601468 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 52601737 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52601756 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52601841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52601870 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52602127 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52602189 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52602211 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 52602400 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52602404 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52602434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52604462 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52604489 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52604703 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52604736 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52605388 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52605784 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52605922 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 52606056 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52606097 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 52606867 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52607373 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52607393 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52607954 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52608315 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52608872 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52610542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52610922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52611250 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52611318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52611319 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52611745 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52611853 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52611886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52612001 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 52612179 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52612519 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52612553 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52613260 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52614498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52614572 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52614600 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52614651 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52614863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52614918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52615738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52615985 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52616422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52616468 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52616922 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52617634 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52617636 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52617854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52617870 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52617871 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 52618131 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52618143 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 52618255 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52618275 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52618335 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 52618458 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 52618527 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 52618713 A C Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 52618726 G C Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 52618739 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 52618756 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 52618779 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 52618788 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52618869 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 52619169 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52619196 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52619237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52619390 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 52619410 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 52619428 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52619519 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 52619712 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 52619715 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 52619847 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 52620407 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 52620419 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52620462 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 52620476 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52620692 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52620732 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 52620753 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 52620756 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52620788 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52620959 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52620972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52621017 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52621095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52621100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52621109 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 52621238 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 52621586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52621606 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 52621714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52621848 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52621894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52621970 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52622104 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52622166 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52622266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52622446 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 52622538 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52622594 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 52622738 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 52622740 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 52622780 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 52622941 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52623208 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52623258 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 52623402 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52623592 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52623710 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52623740 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52623881 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52624177 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 52624331 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52624397 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52624409 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52624528 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 52624552 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 52624579 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52624602 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52624637 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 52624659 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52624670 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 52624697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52624741 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52624838 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 52624864 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 52624878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52625063 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52625126 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 52625127 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 52625195 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 52625565 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52625655 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52625662 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52625690 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 52625796 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52625873 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 52625894 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52626021 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52626046 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52626048 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52626063 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52626064 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52626099 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52626142 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52626220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52626325 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52626388 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52626398 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 52626564 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 52626597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52626605 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52626726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52626970 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52627038 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 52628153 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 52628534 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52628737 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 52628752 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 52628784 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 52629315 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52629343 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52629368 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52629773 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 52630065 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52630174 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 52630465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52630693 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 52631046 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 52631136 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 52631593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52631623 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52631635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52631997 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 52632331 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 52632347 A T N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 2 52632398 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 52632487 T C N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 52632675 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 52632898 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52632987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52633008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52633170 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52633357 A C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 2 52633388 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 52633470 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52633549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52633784 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 52633936 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52634345 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52634411 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52634471 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52634488 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 52634584 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52634619 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52634717 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52634727 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52634756 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 52634854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52635089 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 52635438 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52635441 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52635592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52635622 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 52635762 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52635782 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52636139 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52636235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52636273 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 52636309 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 52636320 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52636513 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 52637326 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 52637334 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 52637495 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52637735 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52638165 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52638289 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52638344 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52638880 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52638885 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52639137 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 52639410 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 52639770 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52640185 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52640713 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52640737 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 52640773 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 52641225 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52641255 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 52641323 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52641560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52641712 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 2 52641984 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52642088 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52642268 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52642922 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52643035 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 52643426 T A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 52643428 G C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 52643523 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 52643580 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 52643649 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52643676 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52643888 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 52643940 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 52643959 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52644240 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 52644418 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52644458 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52644645 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52645027 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52645512 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52645630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52645675 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52646644 C A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 52647843 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 52648183 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 52648401 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52648606 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52648625 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 52648757 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 52648761 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 52648836 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52648837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52648895 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52648992 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52649006 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52649070 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 52649356 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52649792 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52650053 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52650393 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52650406 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52651612 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52651701 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52651781 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 52652068 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52652362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52652655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52652956 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 52653016 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52653124 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52653145 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52653146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52653551 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52653563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52653648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52653688 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52653804 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 52655437 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 52655457 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 52655817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52656107 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52656938 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 52656960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52657028 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52657034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52657076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52657115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52657144 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52657230 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52657288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52657356 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52657488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52658041 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52658091 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52658142 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 52658186 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52658188 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52658240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52658286 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 52658439 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52658495 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52658528 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52658790 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52658854 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52658861 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52659008 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52659029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52659046 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 52659184 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52659352 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52659378 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52659466 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52659655 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52659782 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 52659811 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52659840 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52659883 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 52659936 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52659940 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52659984 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52659995 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52660006 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52660041 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 52660218 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 52660293 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52660430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52660448 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 52660451 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52660615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52660712 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 52660721 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 52660779 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 52660823 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 52660944 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 52660960 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 52660965 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 52661014 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 52661030 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 52661037 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 52661072 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 52661165 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52661180 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52661201 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 52661280 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 52661389 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 52661397 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 52661625 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 52661682 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 52661895 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52661951 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52661965 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52662076 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52662092 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 52662205 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52662258 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 52662311 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52662340 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52662345 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52662362 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52662367 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 52662624 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52663129 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 52663159 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52663326 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52663636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52663683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52663755 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52664132 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52664169 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52664201 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52664344 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 52664458 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52664688 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 52664695 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 52664700 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52664792 A G Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 52665419 A G N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 52665539 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 52665547 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52665605 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 52665610 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 52665859 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52665872 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52665890 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52665949 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52666023 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52666035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52666101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52666160 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52666173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52666239 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52666246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52666275 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52666276 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 52666299 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52666363 T G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 52666373 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 52666374 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 52666414 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52666425 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 52666437 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 52666459 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52666485 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52666512 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 52666513 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 52666622 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 52666770 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 52666850 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 52666883 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 52666899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52666943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52667007 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 52667118 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52667151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52667627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52667633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52667669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52667706 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52667734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52667821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52667866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52667899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52667906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52667933 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52668002 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52668085 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52668096 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52668132 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52668190 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 52668347 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52668467 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52668473 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52668493 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52668498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52668530 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52668541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52668546 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52668574 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52668575 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52668650 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52668659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52668705 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52668898 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52668930 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52668936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52669037 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52669048 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52669053 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52669115 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52669203 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 52669208 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 52669256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52669288 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52669343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52669365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52669375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52669417 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52669455 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52669493 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52669544 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 52669623 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 52669673 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 52669732 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 52669739 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 52669781 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 52669786 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52669898 A C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 52669900 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 52670071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52670143 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 52670146 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 52670155 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 52670158 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 52670182 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 52670184 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 52670212 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 52670226 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52670234 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52670246 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52670259 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 52670260 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52670404 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52670542 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52670674 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 52671228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52671230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52671372 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 52671446 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52671471 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52671745 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52671776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52671987 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 52672125 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52672131 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52672165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52672220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52672241 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 52672243 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 52672342 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52672346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52672411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52672432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52672433 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52672464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52672527 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52672636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52672700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52672734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52672751 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52672847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52672920 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52673521 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52673752 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52673761 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52673848 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52673944 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52674127 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52674130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52674143 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52674240 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52674247 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 52674453 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 52674542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52674589 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52674676 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52674678 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52674751 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52674755 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52674774 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52674789 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52674803 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52675066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52675270 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 52675508 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52675545 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52675552 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 52675585 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52675684 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52675901 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52675908 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 52675958 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 52675968 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 52675987 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52676083 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52676132 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52676140 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52676144 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52676174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52676239 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 52676276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52676559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52676668 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 52676675 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52676763 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 52676767 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 52676782 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 52676920 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 52676957 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 52677063 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 52677116 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 52677142 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 52677154 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 52677158 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 52677179 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 52678124 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52678170 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52678542 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52678655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52678660 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 52679055 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 52679182 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52680439 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52680606 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52680623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52680733 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52680815 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52681052 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52681422 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52681687 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52681750 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52682383 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52682554 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52682694 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52682704 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52682728 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52682786 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52682947 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52682962 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 52682981 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52683097 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52683105 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52683547 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52683750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52683887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52683906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52684042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52684914 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52684929 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52684960 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 52685454 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 52685475 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 52685484 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 52686116 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 52686283 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 52686321 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52686351 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52686500 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52686763 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52686793 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52686800 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52686901 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52686986 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52686990 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 52687015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52687153 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 52687162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52687167 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 52687177 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 52687415 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 52687644 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52687658 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 52687686 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52687753 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 52687954 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 52688504 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 52688512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52688526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52688569 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52688570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52688694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52688703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52688727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52688809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52688865 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52688872 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52688889 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 52688996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52689013 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 52689019 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 52689052 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52689057 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 52689125 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 52689340 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 52689617 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 52689621 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 52689646 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 52689788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52689897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52691209 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 52691298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52691775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52692121 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 52692206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52692997 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 52693623 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52693690 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52695613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52695723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52695746 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 52695894 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 52696042 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 52696079 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 52696092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52696183 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 52696186 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 52696746 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 52697365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52697594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52698373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52698558 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 52698581 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 52698635 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 52698670 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 52698674 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 52698739 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52698751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52698787 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52698843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52698844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52698881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52698888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52698916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52699067 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52699249 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 52699279 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 52699316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52699493 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 52700919 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52700929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52700948 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52701110 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 52701152 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 52701383 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 52701544 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 52702286 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 52702327 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 52702436 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 52702452 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52702455 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52703399 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 52703494 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 52704695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52704765 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52704780 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52708510 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 52709249 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52709336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52709496 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 52709500 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52709544 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 52709695 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 52709713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52709755 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52709976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52710005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52710036 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 52710102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52710148 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 52710304 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 52710399 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52711022 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 52711173 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 52711397 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 52711628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52711638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52711931 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52712701 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52712895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52713159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52713329 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52713334 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 52713348 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 52713460 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 52713630 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 52713738 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 52713746 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 52713797 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 52713936 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 52714133 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52714296 C T N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 52714388 C G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 52714561 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 52714573 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 52714583 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 52714731 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 52714879 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52715056 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 52715302 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 52715394 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52715409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52715619 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52715661 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52715769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52715852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52715874 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 52715913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52715928 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52716033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52716064 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52716161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52716335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52716409 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52716551 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 52716555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52716596 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52717363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52717370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52718669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52719296 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 52719908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52723163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52723976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52724907 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52725498 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 52725932 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52727915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52727944 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 52728021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52728098 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 52728201 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 52728211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52728222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52729490 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52729933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52730355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52730966 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 52731068 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 52731992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52732636 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 52733748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52734409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52734732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52734905 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 52735235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52736619 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 52736623 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52737087 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 52737210 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 52737290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52737793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52738788 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52739929 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52740117 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52740600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52740678 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52741166 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 52741462 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 52741464 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 52741519 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52741551 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 52741555 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 52741592 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 52741751 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52741847 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52741891 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52741931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52742113 C A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 52742198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52742202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52742266 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 52742387 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52742515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52742644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52742732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52742978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52743056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52743062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52743110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52743166 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 52743414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52743478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52743748 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 52743811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52744025 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 52744061 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 52744117 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 52744195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52744294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52744538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52744674 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 52744746 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 52744797 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 52745043 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 52745158 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 52745236 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52745336 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 52745387 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 52745505 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52745510 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 52745710 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 52745898 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 52746014 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 52746042 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 52746426 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52746762 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52746794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52746796 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52746897 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 52747036 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 52747056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52747096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52747104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52747115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52747146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52747224 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52747451 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 52747728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52747876 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 52747878 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52747944 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52748520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52749111 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 52749478 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 52749646 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52749720 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52749732 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52749865 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52749946 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52749969 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52750069 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52750683 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52751364 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52751601 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 52752208 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52752220 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 52752234 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52752256 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52752532 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 52752536 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52752550 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52752555 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 52752583 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52752882 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52752885 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52753281 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 52753499 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52755518 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52756065 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 52756482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52756603 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 52756677 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 52756726 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 52757741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52758369 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52758723 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 52759169 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52759260 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52759278 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52759314 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52759455 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 52759611 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52759688 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52760077 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 52760225 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 52760236 A C N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 52760395 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 52760504 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 52761242 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 52761462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52762496 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52763025 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 52763027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52763051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52763065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52763087 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 52763098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52763316 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 52763990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52764117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52765018 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52766799 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52767531 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52768221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52768288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52768782 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 52768822 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 52768896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52768926 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52769166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52769510 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 52769881 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 52770100 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 52770163 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 52770714 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52771024 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52771064 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 52771148 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52771208 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52771369 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 52771492 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 52771587 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 52771648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52771780 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52772019 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52772175 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 52772267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52772322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52772592 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52772656 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 52772669 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52772762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52772844 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52773105 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52773165 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52773168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52773269 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52773632 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52773723 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52773742 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52773751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52773812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52773816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52773875 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52774065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52774089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52774177 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52774457 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52774491 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 52774528 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 52774536 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 52774553 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52774623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52774715 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52774780 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52774970 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52774982 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52775016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52775144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52775353 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52775612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52775656 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52775733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52775759 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52775989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52775990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52776409 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52776428 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 52776848 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52776899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52777116 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52777129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52777141 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52777172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52777488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52777604 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 52777826 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 52777890 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 52777950 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 52778064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52778277 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 52779671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52779817 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52780050 C T N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 52780300 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52784121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52784349 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 52784667 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 52784687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52784770 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 52785021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52785226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52785227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52785321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52786632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52787787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52789092 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52789949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52791176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52791323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52792115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52792158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52792309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52792381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52792849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52793468 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 52793928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52794153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52794155 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52794165 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52794184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52794197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52794386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52794715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52794765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52795713 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 52795745 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52795932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52796065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52797745 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52798020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52798609 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52798840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52799056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52800650 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 52801113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52801726 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52802048 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52802337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52802447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52802706 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52802795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52803020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52803352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52803397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52803438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52803445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52803519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52803859 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52803891 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52804357 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52804484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52804867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52805632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52805742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52806192 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52807790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52808219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52809143 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52811113 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52811146 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52811199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52811296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52811400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52811733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52811742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52812000 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52812013 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 52812329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52812459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52813063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52813478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52813650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52813733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52815344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52816138 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 52816744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52817242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52817484 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52817487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52817847 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52817926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52818383 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52818796 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52819141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52819152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52819324 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52819965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52820235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52820580 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52821253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52824965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52828061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52828423 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52829737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52830002 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 52830021 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 52830120 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 52830374 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52830478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52830524 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52830587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52831227 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52831245 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52831294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52831734 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52832002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52832108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52833354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52833831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52834115 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52834744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52835228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52835247 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52835382 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 52835384 C G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 52835505 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 52836106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52836747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52839500 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52840777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52841474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52842855 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 52844376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52844898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52845545 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52846147 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52846711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52846757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52846794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52848098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52848509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52848529 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52848835 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52848840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52848887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52848991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52849192 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52849400 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52849710 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52850079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52850307 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52850961 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 52851144 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 52851268 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 52851411 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52851456 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52851518 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52851723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52851813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52851871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52851923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52852382 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52852636 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52852712 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 52852789 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 52852856 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 52852993 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52853214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52853343 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52853497 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52853836 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 52854191 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52854294 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 52854301 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52854321 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52854486 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52854508 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52854509 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52854542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52854607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52854678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52854681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52854862 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52855666 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 52856198 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52856226 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52856275 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52856475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52856556 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52856560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52856792 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52856975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52857012 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52857586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52857701 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 52857813 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 52857885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52857926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52858021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52858073 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 52858096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52858398 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52859172 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 52860921 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52861251 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52861719 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52861749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52861803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52862584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52863209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52863310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52864167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52866996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52867198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52868078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52868465 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52868500 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52868654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52869186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52869889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52869906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52869943 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52870001 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52870297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52870341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52870369 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52870375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52870434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52870602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52870618 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52870750 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52870883 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 52871061 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52871092 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52871099 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52871254 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52871413 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 52871558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52871596 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52871612 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52871639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52871710 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52872023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52872066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52872411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52872909 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52872974 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52873084 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52873236 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52873304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52874155 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52874317 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52874318 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52874551 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 52874604 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 52875026 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 52876240 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52877930 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52878418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52880853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52882269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52882440 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52882456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52882531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52882720 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 52882730 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 52882757 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 52882771 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 52882897 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 52883017 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 52883045 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 52883104 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 52883419 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 52883518 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52883632 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52883722 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52883969 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 52884024 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 52884027 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52884176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52884358 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52885283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52885382 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52885408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52885421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52885546 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52885759 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 52885781 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 52885785 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 52886133 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 52886139 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52886279 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52886411 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52886482 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52886533 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52886684 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52886698 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52886764 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52886815 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52887571 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52887584 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52887594 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52887635 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52887668 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52887780 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 52887809 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52888178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52888954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52888996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52889906 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 52890046 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52890097 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52890145 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52890533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52890628 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52891474 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 52891480 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 52891750 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 52892164 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52892175 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52892219 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52892380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52892551 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52892806 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 52892829 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52892834 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52893057 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 52893472 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52893665 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 52893668 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 52893685 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52893754 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52893914 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52894062 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52894373 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 52894410 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52894458 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 52894462 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 52894479 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 52895078 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52895177 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52895198 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 52895207 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52895251 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52895331 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52895376 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52895377 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52895675 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52895867 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52895876 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52896052 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 52896319 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52897253 G T N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 52897567 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52898349 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 52899280 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52899308 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 52899355 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52899424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52899461 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 52899482 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 52899509 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 52899511 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 52899576 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52899584 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 52899723 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 52899820 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 52899915 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 52899987 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52900191 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 52903779 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52904879 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52906833 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 52911515 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 52911543 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 52911800 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52911898 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52913516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52914599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52914678 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52914742 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52914817 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52915014 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52915028 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 52915460 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52916851 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52916853 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52916988 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52917013 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52917064 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52917636 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52917642 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52918891 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52918915 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52919081 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52919161 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52919320 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 52919366 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 52919610 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52919630 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52919746 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 52919941 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 52919975 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 52920029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52920249 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52920281 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52920449 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52920554 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52920717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52920771 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52920959 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52921100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52921196 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52921308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52921344 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 52921521 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 52921522 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 52921562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52921578 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52921589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52921690 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 52922246 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52922320 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52922450 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52922642 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52922842 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 52922944 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52922965 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 52923034 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 52923068 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 52923100 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 52923170 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 52923239 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 52923357 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 52923377 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 52923410 T A Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 52923491 T C Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 52923539 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 52923559 C G Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 52923739 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 52923889 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52923909 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52924023 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 52924090 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 52924232 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 52924655 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52924675 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52924777 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 52924788 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 52924813 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 52924858 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 52924865 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 52925025 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 52925033 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52925076 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 52925148 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 52925151 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52925254 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52925586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52925639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52925663 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52925670 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52925760 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 52925832 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 52925858 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 52925884 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52925915 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52925974 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 52926021 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 52926050 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 52926124 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52926167 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52926427 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52926510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52926638 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52926643 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52927090 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52927201 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 52927708 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52928071 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52928111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52928123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52928297 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52928421 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52928514 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52928526 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52928541 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52928562 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52928572 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52928717 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52928753 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 52928834 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 52929027 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52929118 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 52929477 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52929498 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52929675 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 52929755 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 52930005 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52930228 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 52930241 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 52930373 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52930558 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52930640 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52930670 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 52930772 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 52930928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52931312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52931588 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52931761 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52932038 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52932407 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 52932560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52932635 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 52932978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52933162 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52933212 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 52933512 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52933593 C G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 52933861 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52934212 G T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 52934492 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 52935012 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52935187 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52935469 T A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 52935501 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 52935517 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 52935518 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52935592 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52935677 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 52935693 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 52935729 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 52936040 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52936201 T C Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 2 52936333 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 52936452 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 52936549 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 52936658 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 52936691 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 52937491 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52937496 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52937517 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 52937695 T G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52937698 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 52937756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52937828 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52937924 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52937929 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 52938020 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52938073 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 52938099 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 52938102 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52938116 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52938129 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52938301 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52938456 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 52938536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52938633 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52938695 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52938696 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52939263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52939844 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52939930 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52940252 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52940297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52940494 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52940594 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52940713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52940715 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52940765 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52940845 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52940976 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52941113 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 52941185 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52941233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52941295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52941339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52941350 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52941417 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52941499 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52941503 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52941519 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52941570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52942145 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 52942745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52943030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52943128 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52943355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52943381 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 52943383 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 52943798 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 52943808 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52944047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52944098 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 52944141 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 52944158 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 52944712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52944717 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52944812 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 52944823 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52944842 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52944856 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52944906 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52944977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52944988 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52945297 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52945421 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52945502 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52945618 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 52945624 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52945633 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 52945908 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 52946540 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 52946673 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 52946955 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52947817 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52948013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52948191 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 52948557 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52948953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52949432 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52950189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52950570 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 52950799 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 52952279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52953089 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52954841 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52955643 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 52955664 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 52955841 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 52956293 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 52956976 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 52957001 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 52957338 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52957430 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 52957527 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 52957529 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 52957580 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 52957635 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52957831 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52957838 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52957898 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 52957965 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52958443 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52958550 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52958617 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 52958621 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52958940 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 52960433 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 52960862 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 52961030 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52961639 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52961656 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52962079 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 52962508 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52962637 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 52963215 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 52963426 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 52963590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52963719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52963729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52963790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52963955 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52964017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52964026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52964028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52964099 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52964129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52964169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52964190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52964203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52964231 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52964278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52964348 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52964357 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52964690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52964749 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52964750 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52964844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52964865 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52964896 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52965040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52965042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52965684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52965736 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52965753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52965892 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 52965910 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 52966156 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52966256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52967145 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52967298 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 52967299 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 52967502 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 52967518 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 52967664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52967780 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52967890 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 52968033 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 52968060 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52968750 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52969012 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 52969348 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 52969564 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 52969779 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52970564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52971453 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52971823 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 52972172 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 52972226 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 52972333 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 52972456 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52972488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52972593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52972998 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52976463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52976545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52976633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52977345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52977357 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 52978079 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 52978693 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52978907 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52978930 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 52979157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52979833 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 52980148 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52980190 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 52980289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52980574 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52980615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52980643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52980771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52980844 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52981127 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52981384 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52981749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52982529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52982622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52982649 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52984920 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52987137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52989011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52990760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52991093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52993311 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52993322 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 52993904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52994088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52995322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52995784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 52996957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52997057 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 52998637 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52998692 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 52999228 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 52999747 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53000609 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53000859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53001505 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53003969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53007177 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 53007490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53008171 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53008258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53008873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53008994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53009402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53010396 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 53010946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53011203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53011865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53012616 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53013459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53013583 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53014147 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53019388 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53020092 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53020096 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53021519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53022005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53023595 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53024251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53024317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53024355 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53024388 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53024492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53024549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53024753 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53025303 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 53025695 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53026801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53026938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53028644 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53028766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53029845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53030468 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53031422 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 53034609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53035294 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53036524 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53036583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53036946 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53038278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53039025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53039556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53039866 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53043675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53044162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53045369 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53045384 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53045446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53048219 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53048888 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 53049494 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53050812 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53050942 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 53051519 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53051838 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53051916 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 53054376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53054414 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53055534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53055913 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53056039 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53056259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53056451 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53056498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53056502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53056519 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 53056522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53056744 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53056840 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53057030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53057348 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53057388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53057690 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53057984 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53058076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53058187 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53058539 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53058873 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53059605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53059797 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53060053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53060104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53060280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53060361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53060377 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53060602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53060874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53061090 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53061450 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53061471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53061476 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53061716 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53061847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53061899 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53063248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53063377 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53063804 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53063947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53064259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53064406 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53065050 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53065433 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 53066321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53066326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53066465 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53066508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53066676 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53066758 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53066790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53066802 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53066842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53066988 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53067018 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53067436 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53067637 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 53068626 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53068674 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53068688 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53069270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53069969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53070421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53070537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53070642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53071518 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53071571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53071704 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53072609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53073112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53073301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53074020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53076066 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53076384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53077546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53078274 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53078697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53078774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53078838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53078944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53079015 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53079141 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53079177 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53079455 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53079611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53079661 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53079673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53079717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53079969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53079984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53080001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53080151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53080191 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 53080267 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53080285 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53080418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53080435 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53080448 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53080523 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53080663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53080756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53080811 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53080818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53080973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53081009 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53081096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53081117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53081193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53081208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53081374 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53081459 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53081491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53081513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53081550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53081589 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53081658 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53081726 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53081755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53081775 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 53081857 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53081871 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53081889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53081970 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53082043 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 53082084 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53082189 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 53082238 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 53082393 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53082468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53082490 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53082536 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 53082578 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53082605 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53082831 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53082861 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53082926 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53082959 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53083240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53083442 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53083488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53083558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53083742 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53083750 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53083792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53083870 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53083968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53084004 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53084038 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53084088 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53084154 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53084169 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53084175 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53084201 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 53084281 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 53084301 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 53084312 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53084322 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53084358 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53084366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53084389 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53084533 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53084572 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53084671 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53084808 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53085001 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53085088 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53085114 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53085162 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53085176 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53085258 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53085263 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53085427 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53085554 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53085595 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53085611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53085620 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53085635 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53085664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53085681 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53085833 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53085849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53085857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53085917 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53085979 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 53086054 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53086112 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53086184 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53086188 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53086221 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53086419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53086474 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53086510 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53086517 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53086668 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 53086813 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53086817 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53086921 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53086933 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 53087044 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 53087050 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 53087215 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53087261 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 53087286 T A Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 53087414 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 53087467 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53087569 A T Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 53087585 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 53087639 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 53087899 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 53090073 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 53090099 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53090177 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53090478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53090553 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53090625 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53090662 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53090676 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53090838 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 53090925 C A Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 53091019 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53091022 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53091073 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 53091083 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 53091180 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 53091219 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 53091256 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 53091295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53091335 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53091346 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 53091379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53091389 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53091439 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53091655 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 53091967 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 53092004 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 53092043 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53092067 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 53092099 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 53092113 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 53092335 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53092353 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 53092726 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53092746 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53092771 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53092776 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 53092795 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 53092919 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 53093029 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53093073 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53093173 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 53093207 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 53093208 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 53093373 C T Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 53093423 C G Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 53093452 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 53093493 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 53093513 A T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 53093565 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 53093574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53093603 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53093626 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53093640 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53093700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53093702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53093716 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53093950 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53094081 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53094451 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53094513 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53094561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53094723 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 53095085 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 53095122 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53095273 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 53095662 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 53095850 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 53096152 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53096224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53096289 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53096494 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53096823 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53096940 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53097006 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53097143 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 53097215 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53097248 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 53097427 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53097627 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 53097628 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 53097666 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 53098402 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53098406 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53098633 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53098673 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53098765 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53099151 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53099604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53099762 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53099911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53099924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53100085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53100132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53100143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53100207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53100213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53100482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53100488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53100594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53100713 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53100725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53100765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53100810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53101099 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 53101140 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53101306 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 53101343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53101363 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53101368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53101436 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53101461 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53101500 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53101503 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53101637 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53101652 A T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 53101654 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53101669 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53101719 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53101743 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 53101828 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53101840 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53101933 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53102019 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53102132 C A Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 53102168 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 53104468 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 53104617 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 53106411 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 53106805 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 53107050 G A N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 53107260 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 53107289 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 53107323 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 53107335 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 53107379 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 53107419 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 53108655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53108733 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53108841 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 53109050 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 53109111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53109180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53109404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53109411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53109480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53109487 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53109596 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53109716 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53109844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53109954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53110006 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53110035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53110147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53110252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53110263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53110345 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 53110381 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53110393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53110489 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53110497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53110532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53110554 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53110655 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 53110717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53110723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53110857 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 53110996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53111047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53111537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53111623 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53111628 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53111725 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 53111789 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 53111866 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 53111918 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 53111978 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53112095 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 53112124 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53112175 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53112207 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 53112341 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53112445 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53112517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53112601 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53112623 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53112630 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53112652 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53112716 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 53112723 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53112862 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53112896 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53112936 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53112990 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 53113225 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53113297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53113383 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53113609 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 53113836 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53114038 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53114120 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53114143 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53114192 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 53114329 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 53114357 A G N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 53114685 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 53114956 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53115064 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53115100 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53115212 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53115228 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53115671 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53115825 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 53115921 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53116218 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 53116281 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53116370 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53116406 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53116645 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53116764 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53116920 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53117179 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53117284 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53117466 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 53117696 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53118015 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 53118108 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 53118157 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 53118168 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 53118280 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 53118296 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53118402 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53118426 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53118669 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53118691 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53118878 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53118967 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53118995 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53119399 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53119450 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53119476 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53119642 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 53119887 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 53119957 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53120171 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53120213 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53120234 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53120258 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53120368 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53120370 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53120402 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53120447 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53120573 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53120663 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 53121847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53122548 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53122877 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53123107 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 53123112 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 53123243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 53123315 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 53123379 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 53123400 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53123403 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53123424 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53123471 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53123616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53123668 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53123828 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53123861 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53124178 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53124265 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53124395 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53124456 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53124458 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53124468 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53124469 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53124481 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53124504 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53124506 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53124579 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53124920 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53125178 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53125254 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53125269 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53125270 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53125329 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53125360 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53125388 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53125476 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 53125502 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 53125523 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 53125561 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53125565 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53125662 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53125700 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53125705 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53125739 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53125781 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 53125795 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53125832 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53125917 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53126052 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53126099 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53126111 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53126137 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53126201 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53126205 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53126232 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53126262 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53126296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53126297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53126679 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 53126896 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53126973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53126987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53127319 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 53127347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53127544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53127578 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 53127586 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53128064 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53128354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53128395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53128553 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53128660 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53128691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53129470 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 53129494 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 53129622 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53129957 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53129984 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53130008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53130190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53130587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53130653 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53130847 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53131258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53131312 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53131445 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53131612 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53131864 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 53132414 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53132579 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53133005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53133518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53133666 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53133840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53135765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53135854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53136654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53137096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53137588 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53138549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53139911 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53140435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53141314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53141537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53141697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53141757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53141839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53141977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53142022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53142038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53143720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53143942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53144350 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53145633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53146173 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53146270 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 53147005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53149634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53150211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53150730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53152525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53152797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53153368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53156710 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53156867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53157153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53157484 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53158809 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 53158930 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53158937 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53159912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53160351 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 53160531 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53160532 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53160648 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 53160974 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53161604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53161698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53162636 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 53162880 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53165165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53165770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53169743 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 53170063 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 53170156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53170717 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53171247 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53171810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53172140 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 53172789 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53173679 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 53175853 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53176609 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53184213 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53185239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53185712 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53186122 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 53186130 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 53186697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53186788 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 53186795 C G N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 53186856 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53186944 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 53187128 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53187140 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53187141 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53187427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53187691 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 53187749 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 53187770 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 53187970 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 53188559 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 53189600 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53189636 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53189643 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53189891 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53190036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53190132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53190257 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53190333 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53190371 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 53190422 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53190652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53191084 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53191098 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53191315 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53191331 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53191449 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53191558 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 53191573 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 53191602 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53191701 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53191748 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 53191759 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 53191961 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 53191975 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53192081 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53192124 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 53192317 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53192463 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53192480 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53192508 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53192547 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53192611 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53192643 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53192698 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53192771 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53192808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53192966 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 53193208 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 53193252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53193339 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 53193348 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 53193489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53194955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53195021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53195398 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53195507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53195820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53196004 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53196202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53196656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53196659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53196683 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 53196777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53196930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53197535 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 53197697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53197838 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53197930 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53198003 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 53198931 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53200108 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 53202051 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53202138 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 53202836 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53202897 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53203584 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53203601 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53204208 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53204370 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53205665 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53206079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53206583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53206661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53213871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53213948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53213984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53214736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53215578 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 53215603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53215793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53215903 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 53216330 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53216857 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53216899 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 53216997 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 53217007 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 53217008 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53217036 T G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 53217088 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 53217093 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 53217102 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 53217115 C A Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 53217168 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 53217191 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53217260 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53217299 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53217318 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 53217360 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 53217651 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 53217757 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 53217787 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 53217854 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 53217884 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53217936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53218022 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 53218049 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53218067 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 53218081 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53218166 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53218190 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53218202 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 53218301 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53218318 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53218336 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53218347 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53218386 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53218415 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53218445 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53218506 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53218530 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53218709 C G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 53218782 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 53218822 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 53218880 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53218894 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 53218901 A T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 53218996 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 53219122 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 53219246 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 53219273 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 53219593 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 53219679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53219687 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53219819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53219916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53219934 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53219950 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53220060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53220164 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 53220194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53220292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53226692 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 53226708 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53226709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53226722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53226737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53226742 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53226804 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53226857 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53226894 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53226902 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53226909 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53226926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53226956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53226968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53226971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53227054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53227275 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53227332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53227378 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53227396 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53227470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53227512 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53227590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53227622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53227882 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53227917 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 53228046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53228133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53228184 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53228370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53228569 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 53228712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53228999 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53229221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53229304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53229344 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53229461 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 53229516 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53229587 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53229592 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53230011 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 53230107 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53230196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53230204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53230210 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53230294 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 53230318 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53230348 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 53230501 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53230634 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 53230683 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 53231746 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53231774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53232521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53232832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53233523 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 53233544 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 53233551 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 53233607 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 53233636 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 53233673 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53233759 G T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 53233775 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 53233829 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 53233872 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53234282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53234567 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 53235033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53235100 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53235171 A T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53235173 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53235847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53235892 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53235949 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53237010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53238125 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53238191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53238340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53238351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53238429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53238444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53238451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53238608 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 53238977 A C Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 53238993 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 53239072 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 53239138 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53239173 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 53239224 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 53239278 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53239291 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53239335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53239360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53239585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53239957 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 53240005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53240208 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 53240561 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53241406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53242208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53242318 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 53242358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53242474 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 53242630 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53242631 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 53243069 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53243589 A T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 53245328 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53245470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53245571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53245739 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53245830 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53245831 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53245921 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 53245995 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53246026 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53246040 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53246058 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 53246065 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 53246090 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 53246526 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 53246536 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 53246555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53246719 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 53247138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53247193 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53247220 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53247277 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 53247295 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53247327 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 53247364 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 53248419 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53248625 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 53248751 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 53248755 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53248904 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53248905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53249042 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 53249224 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53249575 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 53250196 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 53250504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53250534 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53250692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53250743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53250888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53251084 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53251178 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53251181 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53251479 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 53251801 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 53251812 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 53252247 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 53252314 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53252319 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 53252335 A G Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 53252353 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53252453 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 53252457 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 53252550 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 53252585 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 53252738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53252785 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53252828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53253266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53253372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53253437 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 53254166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53254547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53255180 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53255476 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53255492 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53256274 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 53256303 C G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 53256380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53256448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53257480 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53257491 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53257661 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53257801 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53257820 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53258085 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 53258135 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53258188 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53258280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53258292 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 53258349 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53258485 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 53258550 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 53258581 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 53258584 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 53258725 T G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53258865 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53258877 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53259140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53259221 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 53259238 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 53259691 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53259819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53260306 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 53260352 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 53260490 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 53260514 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53260606 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 53260676 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53260979 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 53261275 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53261294 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53261499 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53261568 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 53261662 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 53261725 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 53262082 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53262174 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 53262256 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53262264 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53262279 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53262280 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53262292 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 53262304 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53262343 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 53262447 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 53262603 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53262824 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53262871 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 53263038 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53263048 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53263296 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53263367 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53263396 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 53263426 T G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 53263482 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 53263543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53263546 A T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 53263573 C A Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 53263629 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53263703 A T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 53263975 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 53264277 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 53264297 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 53264640 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53265385 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53265709 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 53265794 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53265913 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 53265992 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 53266009 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 2 53266060 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 53266092 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 53266139 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53266174 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53266316 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 53266425 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53266495 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53266642 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53266745 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 53266757 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 53266910 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 53267094 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 53267145 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53267280 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53267298 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 53267314 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 53267426 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53267427 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53267480 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 53267499 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53267572 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 53267658 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53267808 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 53267832 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 53267847 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 53267923 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53267938 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53268021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53268045 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53268122 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53268134 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53268223 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 53268323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53269488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53269489 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53269670 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 53269841 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53270017 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53270416 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53270682 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53271754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53271765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53271993 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53272002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53272282 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53272336 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53272419 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53272624 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 53272677 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 53272887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53273109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53273131 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 53273303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53273660 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 53273704 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53273765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53273777 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 53273955 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53274002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53274035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53274050 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53274137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53274751 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53275487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53275621 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 53275678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53275724 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53275744 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 53275916 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 53275952 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 53276122 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 53276341 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 53276530 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53276641 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 53276807 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 53277733 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 53277852 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 53278026 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53278194 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 53278489 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 53278531 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 53282752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53283581 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 53283642 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53283947 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 53284218 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53284266 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 53285324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53287594 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 53287847 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53288601 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 53288627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53288632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53290515 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53291507 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53292272 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 53293555 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53294966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53295215 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53295358 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 53295732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53297976 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53299601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53300046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53300128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53300198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53305504 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 53306212 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53307727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53308189 T A N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 53315849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53317814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53318022 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 53318426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53319261 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53319804 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53319864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53319865 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53322055 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53322223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53322239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53322312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53323096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53323114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53323115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53323173 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53323421 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53323430 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53323473 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53323702 T C Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 53323989 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 53324023 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 53324364 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 53324396 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 53324429 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 53324623 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 53324648 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53324673 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53324729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53324763 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53324776 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53324908 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53325774 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53325790 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53325802 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 53325946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53326091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53326214 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53326462 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 53327026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53327151 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53327434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53327612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53327715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53328336 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53328459 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53328590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53328592 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53328623 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53328664 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53328683 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53328688 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53328797 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53329776 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53329787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53330007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53330110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53330332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53330893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53330901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53331321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53331429 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53331449 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 53331462 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 53331483 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 53331567 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 53331708 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 53331960 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 53332104 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 53332129 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 53332162 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 53332432 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53332521 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 53332593 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 53332727 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 53332832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53333209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53333677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53334283 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 53334350 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 53334673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53334785 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53335823 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53335877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53335911 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53336126 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 53336257 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53336372 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 53336425 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53336526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53336830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53338941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53339027 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 53340182 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53340236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53340324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53340630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53340707 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53341066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53341092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53341183 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 53341260 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 53341424 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53341505 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53341551 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53342249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53342351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53342365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53342700 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 53342801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53343180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53343615 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53344836 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53346010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53346252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53346620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53347020 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 53347410 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53348371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53348931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53348932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53349180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53349185 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 53349243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53351444 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 53351773 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 53352816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53354366 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53357242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53358144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53359233 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53359453 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53361502 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53361759 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53361961 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53362331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53368865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53368879 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 53369216 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 53369971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53370043 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53370250 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 53370688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53370946 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53370955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53370957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53371316 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53371431 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53371484 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 53371572 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 53372004 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53372576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53373663 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 53374268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53374865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53374875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53375161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53375259 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53375309 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53375455 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53375465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53375545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53375559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53376061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53380922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53382356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53384493 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53384904 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53388818 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 53389143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53389859 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53392138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53396197 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53396199 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53396352 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53397058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53398119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53401848 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 53401874 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53401929 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53403059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53404247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53405820 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 53407155 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 18 18 2 14 2 2 53408151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53408174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53408379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53408461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53408601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53408671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53409068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53409286 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 53409694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53410320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53410343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53410463 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53411220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53411645 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53411873 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53411996 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53412122 C G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 53412133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53412249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53412634 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 53412804 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 53412817 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53412840 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53420075 T A N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 53421095 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53421149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53421304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53421856 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 53421947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53422096 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53422322 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53422418 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53422577 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53422578 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53422611 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 53423011 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 53423065 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 53423083 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53423591 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 53423615 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53423849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53424076 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53424175 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53425073 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 53425482 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53425546 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53425699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53425987 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53425995 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53426020 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53426278 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53426323 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53426336 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53426338 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53426545 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 53426605 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53426724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53426813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53426814 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53426891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53426901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53427015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53427245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53427905 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53427949 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53428033 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 53428431 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53428461 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53428560 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53428673 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 53428792 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53429468 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53429692 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 53430123 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53430170 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53430954 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53431388 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 53431824 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53431970 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 53432014 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 53432395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53432399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53432458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53432466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53432687 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53432726 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 53432774 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 53432846 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53432985 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53433617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53435069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53436537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53436538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53436951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53436992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53437761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53439546 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53440295 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 53440542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53442386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53445728 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53447229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53448044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53448210 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53450351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53450931 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53450982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53451903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53452606 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 53452773 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53452908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53452985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53453038 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53453065 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 53453129 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53453271 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 53453287 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53454194 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 53454199 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 53454205 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53454215 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 53454274 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 53454818 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53454868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53454908 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53455126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53455142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53455225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53455275 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53455435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53455577 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53456059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53456207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53456270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53456643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53456948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53457338 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53460911 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53461358 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53461403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53461450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53462385 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53462729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53462910 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53462915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53463204 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53463362 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 53463765 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53463903 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53463915 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 53464007 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 53467681 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 53469667 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53470199 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53470343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53472041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53472357 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53472376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53472731 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53472893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53472914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53473079 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53473856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53474130 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53474134 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 53475707 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 53475759 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53477638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53477827 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53477901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53478315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53478665 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 53478745 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53479022 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53479121 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53479467 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 53479649 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 53479742 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 53479793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53479948 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53480249 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 53480295 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53480532 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53480876 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 53481292 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53481310 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 53481382 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 53481436 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53481461 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53481543 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53481671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53481719 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53481763 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 53481951 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 53482052 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 53482121 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53482153 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 53482179 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 53482285 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53482321 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 53482340 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 53482341 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 53482570 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 53482610 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53482632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53482703 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 53482813 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 53482817 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 53482843 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 53482871 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 53482892 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 53483400 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 53483501 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53483601 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53483618 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 53483619 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 53483636 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 53483684 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 53483693 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 53483750 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 53483777 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 53483805 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 53483872 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53483923 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53483964 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53483985 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53483996 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 53484056 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 53484206 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 53484274 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53484416 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53484448 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53484515 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53484570 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 53484599 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 53484646 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53484711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53484756 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53484944 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53485013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53485265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53485426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53485452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53485487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53485746 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53486031 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53486196 T A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 53486358 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53486528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53486580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53486637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53486709 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53486764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53486785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53486799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53486974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53487005 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53487017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53487044 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53487055 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53487278 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53487431 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 53487439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53487442 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53487500 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53487506 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53487650 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 53487664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53487828 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53487845 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 53487846 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 53487859 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53488121 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53488967 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53490110 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53491517 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53491600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53495967 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53496734 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53496876 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53497105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53504626 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53505393 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53505939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53506104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53506159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53506972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53509944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53511051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53511545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53513379 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53514478 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 53515869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53515981 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53518569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53518749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53520222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53521563 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53521847 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53522638 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53523465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53526140 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53526653 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 53528704 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53528958 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53532023 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53533711 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 53534275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53536721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53537234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53537675 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53538289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53538350 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53539027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53541103 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53541642 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 53542739 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53544813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53545355 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53545534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53548836 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53551073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53551111 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53551335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53551359 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53551531 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53551687 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53551776 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53552071 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 53552446 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 53552924 T A Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 53556474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53556644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53556771 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53557709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53557717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53557792 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 53558295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53558649 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 53558682 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 53559267 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 53559273 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 53559480 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 53559701 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53559803 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53559842 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53559853 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53559938 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53559965 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53560019 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 53560049 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53560100 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53560195 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53560247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53560419 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53560705 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53560820 T A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 53560852 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 53560916 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53561081 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 53561126 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53561223 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53561342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53561366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53561700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53562911 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 53563249 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53563693 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 53563711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53563972 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 53564030 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 53564130 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53564499 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 53564724 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53564819 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 53564925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53565119 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53565368 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 53565775 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53565895 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 53566182 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 53566605 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53566956 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53567013 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53567130 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53567241 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53567560 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 53567580 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53567592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53567848 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53568153 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 53568376 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53568559 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53568842 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 53569686 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53570620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53570790 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53570804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53570904 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53570996 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53571019 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53571540 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53572038 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53572149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53572194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53572501 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53572899 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 53573085 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53573120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53574098 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 53574331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53574512 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53574622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53574641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53574692 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53576769 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53576821 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 53577845 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53579054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53580317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53581197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53581647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53581773 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53582076 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 53583949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53584213 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53584460 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 53584470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53584582 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53584612 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53584718 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53584956 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53584967 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53584995 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53585008 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 53585321 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53585364 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53585473 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53585649 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53585679 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53585826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53586855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53587100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53587802 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53589331 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53590753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53591249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53591296 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53591652 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53593802 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 53594141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53595724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53596064 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 53596117 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 53596173 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 53596772 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53597245 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53597393 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53597665 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53597668 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53597738 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53598426 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53598774 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 53598793 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 53599651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53599818 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53600412 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 53600466 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 53600814 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 53601209 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53601231 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53601375 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53601880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53601935 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53602136 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 53602524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53602608 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 53602635 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 53602652 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53602717 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 53602745 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 53602772 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 53603229 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53603299 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53603401 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53603493 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53603519 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 53603705 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53603764 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 53603765 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 53603899 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 53610116 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 53610136 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53610144 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 53610298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53610468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53610534 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53610700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53610840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53610860 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 53610971 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53610997 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53611129 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53611178 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53611313 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53611553 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53611624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53612514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53612540 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53613460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53613484 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53613917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53614862 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53622599 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53623384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53624310 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53625317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53625978 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53627021 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53627818 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53627920 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 53629029 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53629250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53629386 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53629930 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 53631083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53631261 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53631579 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53633078 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53633466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53634347 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 53634688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53634853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53634885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53641458 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53641566 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53649160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53649641 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53650034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53650752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53650954 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53651056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53651067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53652790 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53653620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53654643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53654690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53655023 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53656296 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53657706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53658734 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53659431 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53659447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53659887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53660049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53660993 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53661046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53664138 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 53664490 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53665733 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53667139 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53669399 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53669480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53669806 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53670016 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53671059 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 53671152 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53671378 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 53671448 C A Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 53671486 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 53671967 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53672416 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 53672452 C A Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 53672470 G C Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 53672471 G A Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 53672504 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 53672903 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53672933 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53673493 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53673530 C G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 53673904 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53674281 C G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 53674468 G C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 53674469 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53674659 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 53675229 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 53676527 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 53676539 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 53676702 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53676780 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53676844 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53676846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53677167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53677262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53677408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53677594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53677917 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 53678094 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53678156 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53678542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53678865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53679331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53680228 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53680236 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53680465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53680505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53680510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53680872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53680904 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53682231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53683433 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53683449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53683529 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53683942 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53684147 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 53684261 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53684342 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 53684379 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 53684580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53684691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53684812 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53684977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53685765 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53686343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53686690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53686779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53687676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53687929 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 53688396 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53688463 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53688750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53689054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53689109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53689254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53689972 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53690022 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53690087 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53690403 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53690416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53690558 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53690754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53691097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53692101 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 53692221 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 53692292 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53692306 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53692491 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53693695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53694017 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53694375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53694416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53694698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53694731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53694801 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 53695166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53695289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53695302 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53695688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53695693 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53695749 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53695966 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53696290 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 53696325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53696418 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 53696753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53696759 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53697057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53697189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53697301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53697318 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 53697476 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53697495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53697543 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 53697587 C A Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 53697622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53697626 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53697675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53697684 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53697714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53697741 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 53697841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53698203 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53698262 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53698385 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53698430 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53698583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53698679 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53698707 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 53698747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53698756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53698784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53698790 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53698814 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53698853 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53698918 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 53698952 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53699352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53699410 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53699427 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53699442 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53699469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53699470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53699484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53699547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53699785 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53699902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53699977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53700055 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53700075 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53700095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53700133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53700141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53700244 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 53700316 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 53700364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53700431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53700799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53700904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53700974 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53700987 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 53701073 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 53701133 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 53701483 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53701707 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 53704768 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53705022 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53706414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53706527 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53706621 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 53707272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53708434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53709543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53710686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53711985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53712443 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53712444 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53713233 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53715832 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53715839 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 53715937 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 53715941 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53716060 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53716609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53716726 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53717270 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53718355 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 53718697 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53719963 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53720132 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53720401 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53720921 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 53721529 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 53721825 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 53721990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53722005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53722729 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 53722980 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 53724342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53724953 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 53725580 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 53725825 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53725839 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53725972 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 53726041 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 53726052 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 53726579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53726983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53727152 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 53727565 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53727979 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53728001 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53729146 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 53730562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53731091 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 53731206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53731246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53731296 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53731320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53731857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53732435 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53735109 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53735278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53736193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53736865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53737959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53738953 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53739046 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53741230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53743892 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53744379 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 53744709 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53745505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53747216 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53749618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53749647 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 53749831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53750268 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53751797 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53752418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53752567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53752796 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 53753395 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 53754683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53758210 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 53758382 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53758407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53758854 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 53758938 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 53758940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53759063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53759180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53759567 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 53759576 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 53759583 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 53759605 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 53759738 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 53759824 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 53759841 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53759861 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 53759962 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 53760225 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 53760503 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 53760585 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53762508 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 53762541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53762573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53762589 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 53762600 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 53762682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53762742 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 53762946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53763088 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53763103 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 53763171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53763770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53763845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53764411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53764488 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53764576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53765063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53765312 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53765826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53766122 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 53766652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53767000 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53767272 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 53767326 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 53767396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53767559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53767700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53767799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53767831 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 53767852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53767881 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53767942 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 53768034 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53768325 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 53768505 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53768573 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 53768588 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 53768680 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 53768731 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53768837 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 53768988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53768995 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 53769003 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 53769095 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 53769120 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 53769167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53769365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53769481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53769603 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 53769853 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 53770121 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 53770898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53770907 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 53771019 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 53771040 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 53771179 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 53771373 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 53771464 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 53771465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53778439 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 53778684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53778811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53779381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53779847 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 53780326 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 53780752 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 53780822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53780842 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53780892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53780972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53781023 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53781074 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 53781081 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 53781089 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 53781193 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53781377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53781460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53781800 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53781909 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53782152 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53782229 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 53782360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53783605 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 53783998 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53784027 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53784091 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 53785454 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 53786100 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53786120 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53787738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53788461 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53788583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53788618 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53789105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53791696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53793182 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53793905 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53793931 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 53793980 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 53793998 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53794813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53795216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53795462 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53800419 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53800529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53801849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53802676 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 53803340 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 53803423 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53803428 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53803565 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53803643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53803805 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53803813 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53804224 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53805953 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53805972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53808302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53808673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53808943 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53810284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53810475 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53810926 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 53811932 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53812032 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53812834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53813109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53814185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53814488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53815303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53815402 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53815843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53817331 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53818352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53820883 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53822913 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 53823857 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53824976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53827296 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53828613 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53828929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53829161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53829689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53831679 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 53831983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53832268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53832638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53833952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53834984 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 53835666 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 53836005 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 53836677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53837027 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 53837459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53838455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53839457 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 53839746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53840161 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 53840278 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53841260 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53843252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53850068 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.0714285714285714 14 14 1 12 1 2 53850315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53850363 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53850551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53851027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53852151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53853291 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53856254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53856473 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 53857170 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53857575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53859445 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 53859592 A G Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 53860772 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 53866869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53866917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53871204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53871212 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 53871238 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 53873811 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53873885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53875879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53876069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53876417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53876434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53877002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53877666 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 53880862 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53881358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53881369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53882218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53893592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53893600 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 53893649 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 53893859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53893879 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 53893949 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 53894014 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 53894131 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 53894720 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53894756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53894874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53894896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53894964 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53895005 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 53895098 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 53895111 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53895154 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 53895231 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 53895555 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 53895568 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 53896644 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 53896841 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 53896884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53896893 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 53897466 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 53897892 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 53897896 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 53898427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53899245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53901517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53903137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53903261 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53904691 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 53905322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53905942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53906624 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53906905 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53907184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53909473 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53911701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53912289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53913984 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 53914565 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 53914983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53915865 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53915867 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53916054 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 53916095 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 53916326 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 53916333 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 53916460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53924058 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 53924075 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53925149 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 53925745 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 53926080 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 53926081 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 53926283 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 53926610 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53926938 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 53927774 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 53927875 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 53928197 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53928722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53928932 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 53929144 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 53929344 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 53929470 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 53929511 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 53929513 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 53929579 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 53929615 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 53929667 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 53929910 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 53930343 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 53930551 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 53930565 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 53930686 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 53930904 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 53930942 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53931199 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 53931342 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 53931390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53932254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53932568 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 53932702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53933077 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 53933308 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53933556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 53933568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53933571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53933588 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53933606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53934287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53934458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53934495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53934514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53934833 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53935981 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53937164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53938680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53939662 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 53939673 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 53939678 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53939687 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 53939825 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 53939929 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 53940026 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 53940064 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 53940177 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 53940347 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 53940487 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 53940550 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 53940713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53941048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53941068 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53941080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53941089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53941111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53941236 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 53941272 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 53941389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53941418 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53941462 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53941505 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53941607 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53942517 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53942600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53942690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53942718 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53943664 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53945749 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53945771 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53946442 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53948716 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53949076 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53949221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53950491 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 53950652 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53950694 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 53950784 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53950814 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53951062 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 53951073 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 53952104 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53952381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53952460 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53954649 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53955064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53955435 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 53955625 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 53955725 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 53955766 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 53955773 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53955789 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 53955805 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 53955867 G C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 53955922 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 53956077 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53956391 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 53956599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53956728 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 53956806 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 53956862 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53956868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53956969 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53957022 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53957033 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53957193 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53957653 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 53957970 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 53958049 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53958153 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53958161 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53958174 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53958230 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53958260 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53958318 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53958320 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53958330 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53958376 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53958446 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53958466 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53958488 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53958497 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 53958612 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53958624 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53958636 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 53958647 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53958661 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53958787 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53958817 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53958820 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53958858 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53958908 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53958911 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 53959004 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53959052 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 53959552 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53960171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53961087 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 53961107 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 53961424 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53961475 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 53961524 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 53961744 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53962160 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 53962187 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53962194 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 53962572 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 53962597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53962598 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53962614 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53963264 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53963932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53964714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53965013 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53965186 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 53965434 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53965720 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53967823 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53968653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53968877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53968885 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53969661 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 53969685 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 53970426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53970888 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 53971651 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53971738 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53971843 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53971988 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53972559 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53973723 T C N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 53973752 A G Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 2 53974027 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 53974100 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 53974277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53974693 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 53975503 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 53975553 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53975724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53976364 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 53976472 T G Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 53976655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53976670 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 53976700 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53976768 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53976960 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 53977101 G C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 53977221 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53977240 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 53977262 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 53977276 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 53977285 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 53977318 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53977370 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53977432 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 53977437 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 53977478 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53977561 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 53977564 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 53977634 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53977884 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 53977901 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 53977934 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 53977958 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 53977993 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53977995 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53978015 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 53978154 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 53978172 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53978174 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 53978185 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53978192 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53978310 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53978416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53978539 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 53978553 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53978611 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 53978785 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 53978838 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 53978869 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53978879 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53978932 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 53978954 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53979004 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 53979014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53979062 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 53979102 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53979125 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53979135 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53979214 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 53979502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53979655 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 53979722 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 53979869 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 53979904 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 53980025 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 53980053 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 53980113 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 53980131 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 53980153 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 53980164 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 53980167 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 53980175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53980273 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 53980492 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53980564 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53980603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53980632 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 53980638 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53980652 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 53980741 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 53980763 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53980769 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53980786 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 53980839 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 53980861 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53980874 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 53980881 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 53980924 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 53980929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53980959 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 53981000 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 53981044 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 53981067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53981175 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53981230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53981423 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 53981514 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 53981530 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 53981682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53981759 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53981791 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53981793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53981802 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53981944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53982091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53982183 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 53982252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53982259 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 53982376 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53982472 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 53982479 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 53982509 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 53982634 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 53982788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53982863 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53982929 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 53982943 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53982951 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53982954 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53982967 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53982976 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53982992 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 53983037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53983078 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53983103 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53983201 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53983232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53983258 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53983276 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53983309 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53983320 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53983440 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53983472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53983524 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 53983542 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 53983617 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53983654 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53983665 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53983696 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 53983700 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 53983723 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53983820 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53983839 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53983854 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 53983885 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53983886 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53983908 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53983970 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 53984087 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53984088 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53984124 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53984150 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53984185 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 53984208 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53984303 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 53984329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53984330 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53984357 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 53984559 C G N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 53984652 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 53984735 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 53984858 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53984919 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 53984954 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53984999 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53985051 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53985055 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53985120 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 53985148 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53985184 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 53985209 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53985237 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53985521 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 53985542 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53985624 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53985800 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53985910 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 53986042 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53986050 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53986075 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53986121 G A Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 53986245 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 53986292 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53986314 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 53986332 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 53986346 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 53986429 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 53986523 A C N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 53986596 G C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 53986597 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 53986622 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 53986670 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 53986728 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 53986732 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 53986785 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 53986845 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 53986869 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 53987084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53987098 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 53987120 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53987150 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 53987423 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 53987938 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 53989339 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 53989347 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 53990425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53990837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53991294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53991763 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 53991816 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53992068 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53992094 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53992251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53992293 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 53992324 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 53994683 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53994805 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 53995258 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53995324 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 53995408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53995516 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53996077 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 53996811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 53997273 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 53997343 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 53997492 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53997724 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 53998628 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53999008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 53999378 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 53999550 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 53999846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54000413 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 54000839 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54000914 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54001141 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54001142 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54001743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54001904 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54003656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54004857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54005116 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54005288 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 54005477 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54005498 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 54005517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54005623 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 54005638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54005652 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 54005695 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54005895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54006375 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 54006402 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 54006407 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 54006462 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 54006557 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 54006638 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 54006639 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 54006657 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 54006673 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 54006848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54007002 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 54007020 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54007269 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 54007278 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54007339 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 54007349 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 54007373 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 54007399 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 54007506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54007538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54007597 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 54007613 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 54007651 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 54007917 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 54008278 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54008342 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 54008348 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 54008396 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54008418 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 54008440 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54008484 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54008627 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54008949 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 54009069 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 54009073 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 54009085 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 54009129 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 54009173 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 54009178 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 54009203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54009353 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54009457 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 54009523 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54009823 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54010122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54010595 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 54011307 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54011451 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54011518 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 54011560 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 54011616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54011725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54011883 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 54011897 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 54011931 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54011949 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 54012055 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 54012383 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 54012409 A C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 54012429 T G N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 54012521 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 54012577 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 54012611 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54012648 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54012687 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 54012709 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54012751 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54012764 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54012795 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54012825 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54012871 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 54012911 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 54012939 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 54012950 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 54012955 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 54012966 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 54013051 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 54013134 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 54013507 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 54013534 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 54013567 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 54013680 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 54013711 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 54013906 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 54013929 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 54013968 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 54014090 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 54014221 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54014300 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54014369 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54014376 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54014510 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54014572 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54014669 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54014692 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54014817 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54014891 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 54014944 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54015152 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 54015173 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54015214 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 54015243 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 54015358 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 54015420 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 54015492 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54015609 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 54015647 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54015707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54015921 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 54015941 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 54016079 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 54016130 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 54016183 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 54016206 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54016229 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 54016273 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 54016334 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54016349 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54016365 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 54016418 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54016463 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 54016511 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 54016585 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 54016677 G A Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 54016691 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 54016693 G A Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 2 54016719 T A N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 54016723 G T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 54016748 T A N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 2 54016794 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 54016809 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 54016880 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 54016938 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 54016972 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 54017039 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54017161 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54017170 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 54017267 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 54017289 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 54017365 A T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 54017457 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54017464 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54017474 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 54017477 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54017514 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54017552 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 54017658 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54017685 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54017703 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 54017801 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 54017839 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 54018222 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 54018274 T A N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 54018364 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 54018496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54018516 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 54018544 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 54018595 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 54018746 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54018857 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 54018861 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 54018900 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 54018986 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 54019120 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 54019131 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54019204 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 54019357 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 54019380 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54019412 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54019461 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 54019483 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 54019485 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 54019535 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54019594 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54019773 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 54019806 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54019820 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54019934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54020048 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54020169 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 54020203 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 54020211 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54020314 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54020631 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54021272 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 54021417 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54021568 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54021845 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54022617 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54022682 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54022694 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54022719 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 54023552 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 54023613 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54023792 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54024517 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54024581 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 54024727 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 54024761 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 54024825 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 54024853 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54024875 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54024983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54025112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54025272 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54025277 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54025323 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54025324 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54025424 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54025638 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54025696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54025792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54026022 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54026141 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54026145 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54026154 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54026404 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54026420 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 54026544 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54026743 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54026761 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54026766 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54026775 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 54026829 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54026959 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54027076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54027354 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54027405 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54027445 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54027603 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54027903 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54027919 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54028047 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54028153 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 54028412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54028614 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54028652 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 54028677 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 54029046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54029140 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 54029384 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54029469 G C Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 54029791 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 54029921 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54030080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54030250 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 54030350 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 54030872 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54031186 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 54031281 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 54031402 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 54031826 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 54032028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54032236 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54032270 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54032310 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54032318 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54033400 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54033557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54034079 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54034631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54035068 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54035189 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 54035233 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54035418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54035648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54035777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54036032 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54036404 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54036553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54037158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54037284 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54037559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54037942 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 54037978 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54038003 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54038290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54038962 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54040129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54040403 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54040452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54040556 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 54040601 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 54040652 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54040869 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 54041067 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54041221 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 54042380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54042499 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54042700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54042958 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54043616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54043729 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54043744 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 54043781 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54043902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54044398 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54044427 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54044641 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54044683 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54044989 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54045110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54045203 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54046105 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54046217 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 54046385 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 54046528 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 54046894 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 54047403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54047420 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54047421 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54047633 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54047669 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54047682 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54047833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54047860 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54047943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54048203 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54048358 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54048415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54048424 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54048497 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54048498 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54048508 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54048668 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54048736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54048797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54048814 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54048835 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54048858 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54048870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54048930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54049097 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54049129 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54049296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54049702 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 54049872 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54050606 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54050703 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54050755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54050904 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54051145 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54051300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54051301 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54051362 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54051390 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54051400 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54051432 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54051460 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 54051531 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54051621 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54051764 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54051943 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54052974 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54053054 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54053094 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54053132 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 54053860 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54053905 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54053990 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54054053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54054054 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54054082 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54054106 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54054215 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54054372 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54054854 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54055078 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54055314 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54055359 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54055806 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54055810 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54055838 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54056056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54056304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54057079 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 54057110 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 54057266 G T Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 54057493 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54057494 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54057638 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 54057818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54058012 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54058620 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54058769 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54058998 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54059059 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54059154 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54059227 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54059254 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54059335 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54059412 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54059420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54059549 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54059582 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 54059586 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54059626 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54059632 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54059737 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 54059809 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 54060124 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54060134 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54060264 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54060324 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54060410 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54060439 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54060496 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54060503 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54060787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54060824 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54060854 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54060873 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54060883 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54060952 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54061009 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54061074 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54061176 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54061198 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54061407 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54061535 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54061715 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54061740 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54061744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54061797 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54061812 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54061852 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54061927 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54062004 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54062041 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54062145 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54062210 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54062276 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54062353 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54062544 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54063945 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54064768 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 54064787 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 54064817 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54064925 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54065228 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54065274 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 54065355 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54065356 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54065585 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 54065675 C G N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 54065753 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 54065899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54066146 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54066240 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54066276 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 54066715 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54066869 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54067047 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 54067264 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 54067283 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54067478 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54067495 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54067506 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54067613 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54067760 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54067768 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54067831 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 54067951 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 54068219 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54068273 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 54068306 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 54068328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54068368 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54068388 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54068392 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54068411 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54068514 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54068566 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54068657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54068763 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54068817 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54068990 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54069062 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54069128 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54069149 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54069161 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54069200 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54069215 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54069223 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54069275 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54069435 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54069521 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54069606 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54069646 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54069664 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54069726 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54069747 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54069768 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54069830 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54069831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54069913 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54070027 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54070039 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54070052 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54070118 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54070151 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54070263 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54070335 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54070349 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54070382 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54070391 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54070470 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54070485 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54070500 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54070559 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54070569 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54070616 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54070622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54070689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54070712 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54070726 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 54070732 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54070803 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54070896 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54070903 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54070933 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54070946 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54070951 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54070961 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54070990 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54070994 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 54071043 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54071061 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54071085 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54071577 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54071666 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54071683 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54071741 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 54071744 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54071870 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54071873 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54071883 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 54072069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54072319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54072534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54072651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54072770 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54072903 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54072931 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54073175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54073300 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54073333 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54073437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54073582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54073790 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54073817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54074106 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54074338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54074928 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 54075012 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54075190 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 54075265 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54075294 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54075401 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54075550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54075733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54075744 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 54075790 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54075804 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54075823 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54075857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54075958 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54076011 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54076133 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 54076207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54076266 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54076326 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54076381 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54076488 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54076542 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54076589 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54076639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54076667 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54076683 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54076704 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54076725 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54076738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54076746 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54076763 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54076827 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54077164 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 54077443 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 54077489 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 54077493 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 54077740 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 54077846 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 54077946 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 54078063 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54078136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54078187 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 54078205 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54078255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54078298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54078564 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54078997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54079041 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54079515 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 54079622 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54079628 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54079675 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54079739 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54079754 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54079787 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54080135 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54080173 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54080203 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54080251 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 54080266 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 54080351 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54080469 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54080541 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54080595 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54080633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54080686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54080843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54080925 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54080926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54081149 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54081311 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54081417 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54081694 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54082092 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54082121 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54082174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54082465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54082512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54083873 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54084091 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 54084092 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54084536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54084871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54084939 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54085056 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54085344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54085636 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54086617 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54086952 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54087715 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54088112 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54088231 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54088313 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54088533 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54088679 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54088876 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54088970 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54089074 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54089205 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54089342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54089468 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54089474 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54089755 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54089879 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54089945 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54090038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54090123 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54090192 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54090231 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54090348 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54090364 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54090453 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54090478 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54090479 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54090573 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54091263 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54092103 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54092211 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 54092665 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54092698 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54092871 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54092909 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54092987 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54093059 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54093066 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54093088 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54093135 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54093199 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54093558 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54093559 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54093592 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54093613 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54093727 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54093740 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54093752 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54093803 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54093829 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54093878 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54093928 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54094102 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54094163 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54094304 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54094625 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54094640 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54094676 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54094731 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54094934 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54094955 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54094982 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54095029 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54095046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54095058 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54095517 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54095559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54095734 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54095795 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54096062 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 54096549 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54096576 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54096708 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54096824 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 54097190 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 54097293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54097395 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54097486 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54097519 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54097586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54097632 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54097647 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54098025 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54098100 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54098165 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54098231 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54098321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54098323 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54098417 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54098564 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54098903 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54098983 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54099050 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54099077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54099237 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54099266 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54099402 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 54099468 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54099986 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54100109 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54100277 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54100442 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 54100472 T C Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 54100727 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 54100788 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 54100840 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54100865 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54100923 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54100949 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54100994 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54101054 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54101055 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54101146 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54101156 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54101193 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54101364 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54101503 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54101515 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54101531 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54101784 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54101939 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54102430 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 54102635 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 54102691 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54102992 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54103329 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54103351 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54103559 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54103657 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54103845 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54104100 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 54104247 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54104249 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54104495 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54104705 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54104721 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54104741 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54110946 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 54111243 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54111310 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54111356 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54111756 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54111815 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54112911 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54113333 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54113460 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54113893 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54113902 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54114176 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54114434 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 54114868 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54115014 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 54115480 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54115520 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54115522 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54115568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54115717 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54116077 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54116096 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54116154 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 54116445 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54116564 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54116640 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54116710 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54116863 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54116912 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54117422 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54117603 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54117949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54117951 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54118283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54118685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54119035 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54119228 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54119311 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54120860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54121834 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 54121835 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 54122536 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54122559 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54122778 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54122816 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54122821 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54122884 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54122910 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 54122953 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54122962 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 54123114 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54123124 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54123211 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54123616 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54123864 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54123998 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54124027 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54124099 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54124116 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54124165 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54124214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54124228 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54124244 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 54124254 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54124256 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 54124281 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54124332 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 54124463 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 54124555 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 54124649 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 54124655 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54124744 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54124786 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54124794 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54124801 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54124818 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54124872 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54125001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54125095 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54125116 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54125164 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54125307 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54125324 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54125366 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54125391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54125394 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54125435 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54125439 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54125519 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54125611 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54125617 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54125728 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54125761 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54125783 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54125883 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54125948 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54125992 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54126170 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54126359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54126424 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54126434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54126483 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54126522 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54126533 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54126542 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54126597 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54126700 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54127032 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54127046 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54127727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54127777 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54128498 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54128519 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54128600 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54128963 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54129057 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54129081 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54129146 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54129230 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54129293 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54129344 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54129455 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54129603 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54129637 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54129683 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54129841 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54129896 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 54129971 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54130061 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54130241 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54130251 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54130368 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54130408 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54130458 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54130587 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54130665 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54130762 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54130907 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54131111 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54131244 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54131736 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54131803 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54132071 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54132366 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54132506 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54132541 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54132663 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54132671 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54132868 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54132887 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54133566 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54133904 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54134043 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54134211 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54134360 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54134934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54135308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54135381 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54135815 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 54136234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54136319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54137660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54137727 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54137934 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54138026 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 54138249 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 2 54138463 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54138725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54138783 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 54139878 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 54139993 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 54140548 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54140557 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54140816 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54140945 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54141143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54141166 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54142366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54143840 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54144742 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54145097 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54145221 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54146099 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54147260 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54148196 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54149677 C G Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 54149737 A T Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 2 54150998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54152245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54157410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54157479 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54157730 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54158521 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54158826 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54159227 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54159522 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54160214 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 54160554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54168053 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54172369 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 54174782 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54175022 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54176985 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54177292 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54178127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54180580 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54181217 G C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54185100 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54186473 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54186558 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54186685 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54186765 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54186803 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54186824 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54186840 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 54186920 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 54187011 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 54187050 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54187100 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54187157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54187255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54187392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54187541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54187554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54187571 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54187636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54187735 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54187748 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54187781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54187798 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54187830 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54187947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54187959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54187967 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54188047 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 54188048 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 54188114 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54188378 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54188681 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54188682 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54188881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54189070 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54189112 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54189320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54189323 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54189396 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54189587 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54189786 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54189796 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54189899 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54189902 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54189913 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54189914 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54190550 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54190699 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 54190796 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54191176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54191229 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 54191399 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54191446 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54191672 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 54191696 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54191951 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54191967 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54191976 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54192035 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54192126 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54192271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54192295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54192320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54192379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54192620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54192720 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54192762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54193180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54193525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54193575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54195009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54195034 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54195260 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54195632 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54195687 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54195895 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54196207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54196363 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 54196812 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54196960 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54197046 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54197103 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54197105 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54197206 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54197240 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 54197262 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54197283 T A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 54197329 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 54198196 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 54198221 G T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 54199127 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 54199141 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54199327 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54199396 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 54199527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54199644 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54199696 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54200360 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 54200415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54200505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54200522 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54200624 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54200661 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 54200846 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 54200955 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 54201260 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 54201293 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54201353 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 54201382 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 54201430 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 54201499 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 54201574 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54201590 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54201641 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54201657 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54201702 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54201721 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54201722 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54201742 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54201764 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54201768 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54201775 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54201807 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54201825 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54201832 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54201885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54201906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54201917 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54201956 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54202006 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54202014 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54202062 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54202112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54202118 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54202201 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54202249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54202257 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54202388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54202415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54202500 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54202523 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54202564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54202600 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 54202623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54202716 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54202813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54202882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54202964 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54202973 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54202996 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 54203180 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 54203217 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54203345 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 54203371 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54203393 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54203395 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54203482 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54203592 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54203600 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54203747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54203771 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 54203884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54203917 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54204192 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54204273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54204326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54204336 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54204438 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54204485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54204564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54204649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54204701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54204730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54204759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54204773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54205132 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54205189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54205211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54205311 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54205369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54205875 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54206094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54206111 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54206279 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54206287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54206311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54206340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54206401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54206428 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54206478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54206492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54206777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54206780 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54207070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54207147 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54207196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54207332 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54207334 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54207470 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54207566 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54207602 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54207704 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54207901 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54208069 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 54208174 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54208245 C A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54208268 C G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54208293 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54208351 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54208381 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54208460 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54208480 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54208565 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54208765 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54208813 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 54208885 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54208905 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54208928 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54208956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54209115 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54209247 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54209285 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54209343 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54209426 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54209500 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54209525 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54209601 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54209690 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54209711 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54209753 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54209787 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54209919 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54209932 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54209954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54210012 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54210013 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54210156 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54210198 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 54210237 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 54210382 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54210427 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54210443 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54210494 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54210669 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54210773 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54210909 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 54210924 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 54210943 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 54211029 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 54211065 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 54211342 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54211377 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 54211426 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54211548 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54211560 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54211567 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54211638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54211659 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54211743 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 54211782 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54211835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54211957 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54212047 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54212099 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54212105 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54212114 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54212186 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 54212210 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 54212239 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 54212489 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54212545 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54212606 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54212687 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54212702 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54212711 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54212744 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54212783 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54212837 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54213071 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54213246 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 54213621 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54213672 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54213766 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54213839 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54213992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54213997 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54214182 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54214263 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54214269 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54214276 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54214297 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54214424 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54214439 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54214532 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54214557 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54214746 C G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 54214747 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54214834 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54214967 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54215106 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54215148 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54215280 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54215487 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54215503 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54215635 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54215700 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54215736 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54215870 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54215922 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54215940 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54216020 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54216090 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54216106 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54216185 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54216230 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54216330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54216523 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54216630 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54216906 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 54216987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54217020 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54217106 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54217308 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54217619 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54217638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54217644 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54217674 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54217917 A T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 54217987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54217995 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54219885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54219913 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54220529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54220839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54221240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54221945 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54223286 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54224321 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54224757 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54226083 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54226133 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54226367 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54227552 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54227610 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54228050 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54230019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54230046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54230842 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54231172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54232283 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54232357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54233024 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54233754 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54234083 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54235230 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54236970 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54244579 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54244835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54244841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54244854 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 54244958 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54245433 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 54245447 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54245644 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54245935 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54246175 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54246235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54246250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54246276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54246307 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54246377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54246385 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54246411 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54246528 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54246536 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54246732 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54246771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54246817 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54246884 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54246936 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54246996 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54247332 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54247594 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54247616 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54247652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54247692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54247708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54247713 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54247842 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54247864 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54247997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54248013 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54248080 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54248100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54248105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54248228 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54248342 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 54248617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54248635 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54248741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54248850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54248959 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54249292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54249393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54249531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54249533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54249632 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54249855 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 54249896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54249990 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54249992 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54250020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54250068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54250100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54250181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54250239 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54250298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54250339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54250359 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54250364 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54250466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54250522 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 54250610 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 54251922 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54251964 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54252071 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54252112 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54252263 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54252300 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54254152 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54254195 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54254303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54254348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54254377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54254425 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54254550 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54254623 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54254734 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54254994 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54255118 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54255295 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54255299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54255484 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54255528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54255532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54255580 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54255624 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54255731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54255801 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54255936 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54256010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54256068 A G Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 54256107 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54256116 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54256119 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 54256130 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54256161 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54256313 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54256470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54256478 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54256743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54257004 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 54257527 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54257727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54258412 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 54259222 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54259918 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 54259929 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 54260722 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54261363 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54263656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54263748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54263762 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54263834 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54263835 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54263904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54263961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54263994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54264015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54264063 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54264091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54264201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54264277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54264321 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54264413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54264433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54264469 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54264533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54264599 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 54264625 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54264711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54264726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54265025 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54265027 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54265060 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54265195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54265460 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54265664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54265707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54265776 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54265955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54266057 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 54266140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54266158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54266182 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54266208 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54266209 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54266254 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54266326 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54266377 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54266445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54266784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54266810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54266834 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54267052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54267084 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54267123 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54267134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54267230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54267277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54267374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54267410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54267477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54267511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54267561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54267562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54267599 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54267668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54267684 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54267687 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54267710 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54267802 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54267951 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54268238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54268240 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54268305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54268334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54268369 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54268385 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54268409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54268414 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54268448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54268540 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54268570 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54268729 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54268772 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54268773 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54268828 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54268872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54268890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54268911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54268955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54269138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54269188 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54269201 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54269275 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54269354 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54269495 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 54269508 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 54269548 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54269555 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54269573 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54269656 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54269703 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54269732 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54269773 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54269776 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54269793 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54269873 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54269910 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54270323 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54270619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54270760 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54270784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54270799 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 54270936 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54270977 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54271005 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54271187 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54271246 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54271280 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54271299 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54271300 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54272744 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54272769 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54272916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54273022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54273032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54273061 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54273112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54273228 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54273335 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54273479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54273485 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54273493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54273512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54273593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54273604 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 54273618 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 54273620 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 54273638 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54273666 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 54273825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54273954 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 54273972 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 54274115 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54274138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54274194 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54274267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54274268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54274287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54274466 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54274478 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54274490 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54274640 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54274670 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54274976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54275092 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54275101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54275128 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54275424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54275551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54275559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54275672 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54275709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54275737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54275748 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54275782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54275802 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54275860 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54275879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54275895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54275923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54275990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54275992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54276025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54276069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54276098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54276215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54277096 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 54277120 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 54277464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54278512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54279348 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54279422 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 54281548 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54282102 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54282106 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54283077 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54283523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54284797 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54285537 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54286036 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 54287147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54288360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54288440 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54289655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54291263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54291674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54292139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54292704 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54294157 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54294283 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54295503 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54295660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54296433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54297550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54298359 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54300069 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 54300280 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 54302586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54304068 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54304132 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54304541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54304786 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54305038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54306192 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54306699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54308042 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54308143 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54309008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54309865 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54310074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54310175 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54310241 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54312364 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54313158 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54313167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54313262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54313302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54313312 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54313801 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54313833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54313900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54313930 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54313973 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54314015 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54314051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54314168 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54314181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54314228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54314609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54314990 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 54315068 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 54315077 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 54315124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54315127 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54315162 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54315525 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54315833 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54315911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54316126 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54317099 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 54324365 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54324818 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54326177 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54327445 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54328075 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 54331869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54335711 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 54335913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54341965 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 54342794 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54345661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54346860 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54349028 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54349525 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54357539 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 54357926 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54359009 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54359405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54360146 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 54360362 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54362714 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54363172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54363598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54364546 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54364807 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54364823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54365600 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54366046 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54367020 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54368763 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 54369497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54370337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54370381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54370463 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54370701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54371385 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54373945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54374478 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54374615 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54374714 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54375382 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54375439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54376264 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54376633 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54377110 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54377333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54377357 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54378255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54378488 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54378752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54379043 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54379478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54380397 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54380471 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 54382525 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 54383622 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54383713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54384143 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54384662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54385348 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54385400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54386870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54387406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54387680 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54387764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54387852 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54387957 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54388100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54388252 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54388487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54388870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54389223 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 54389877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54390215 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 54391850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54392140 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54392479 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54392483 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54392943 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54393478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54394587 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54394635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54394909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54396280 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54396330 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54396646 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54396657 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54397269 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54397907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54397999 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54398544 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54398633 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54399459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54401624 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54401761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54401912 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54402127 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 54402196 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 54402208 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 54402223 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 54402254 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 54402361 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 54402532 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 54403503 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54403519 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54404099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54404179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54404366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54405077 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54405146 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 54405164 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54405177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54405267 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54405380 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54405878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54405985 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54406137 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54406150 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54406312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54406337 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54406436 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 54406630 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54406778 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 54406974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54406986 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 54407163 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54407342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54407728 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54407975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54408091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54409087 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54409372 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 54409901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54410085 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 54410130 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 54410136 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54410189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54410624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54410699 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 54410743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54410778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54410800 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 54411173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54411209 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54411323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54411487 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 54411876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54411883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54413891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54414503 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 54414670 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54414702 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54415081 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 54415269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54415328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54415401 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 54415416 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54415525 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 54415928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54416180 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 54416257 G T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 54416298 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 2 54417008 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54417116 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 54417361 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54417440 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 54418946 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54418968 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54419038 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54419087 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54419106 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54419167 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54419191 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 54419618 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 54419681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54419945 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54420064 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54420434 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54420469 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 54420601 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 54420820 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 54420872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54420909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54421055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54421077 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54421099 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 54427517 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54427799 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 54427866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54427987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54428116 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54428263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54428291 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 54428397 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 54428630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54428777 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 54428854 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 54428988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54429111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54429392 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 54429429 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 54429547 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 54429638 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 54429967 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 54430010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54430109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54430170 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 54430184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54430613 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 54430952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54431069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54431147 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54431321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54431501 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 54431554 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54431652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54431875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54431943 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54432008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54433123 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54434932 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54436455 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54438025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54438246 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 54438424 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54439952 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54440132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54440313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54440376 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54443362 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 54445115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54445752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54453166 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54457752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54457957 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54458631 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54458653 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54458698 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54458879 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54458972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54459289 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 54459544 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 54459562 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54459591 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54459643 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 54459666 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 54459673 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 54460292 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54460641 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54461039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54461121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54461594 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54461652 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54462053 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54462205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54462256 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54462903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54463435 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 54463540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54463716 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54464010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54464111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54465599 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54466060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54466485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54466702 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54467743 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 54467989 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54468000 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54468061 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 54468292 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 54469350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54469698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54469707 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54470327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54470526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54470612 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 54470697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54470868 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 54470956 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54471056 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 54471285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54471566 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 54472994 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54473018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54473150 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 54473213 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54473281 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54473809 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 54474140 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 54474859 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54475922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54476382 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 54476603 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 54476824 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54477506 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54477704 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 54477788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54478040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54478058 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54478340 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 54478355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54478382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54478408 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54478469 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54478492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54478661 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 54478924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54479463 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54479715 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54480764 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54481060 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54481142 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 54481187 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54481574 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54481665 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 54481724 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54481808 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 54481841 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 54482066 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 54482125 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54482169 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54482230 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 54482391 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 54482495 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 54482642 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 54482768 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 54482814 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 54483197 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54483291 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 54483300 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 54483432 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 54483510 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 54483624 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54483635 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54483690 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54483758 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 54483804 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 54483809 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54483905 A C N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 54483948 A C N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 54483985 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 54484048 G T N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 54484169 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 54484307 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 54484314 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 54484371 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 54484651 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 54484814 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 54484853 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 54484892 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 54484946 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54484948 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54485029 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54485084 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54485140 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54485160 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54485365 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54485446 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54485457 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 54485797 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 54486213 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54486230 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 54486231 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 54486345 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54486518 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54486564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54486683 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 54487139 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54487216 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54487370 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 54487696 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 54487812 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 54487854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54487913 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 54488079 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 54488553 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54488816 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 54489012 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 54489251 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 54489401 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54489412 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54489448 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 54489461 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 54489717 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 54489938 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54490116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54490428 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54491294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54491333 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54491643 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 54491644 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 54491657 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54491790 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 54492123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54492296 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 54492572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54493344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54493592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54493948 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54494810 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54496598 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54497380 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54497670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54497800 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54500372 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54501166 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54503764 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54504867 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54506117 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54507170 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54507207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54507216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54507412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54507416 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54507463 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54508120 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54508330 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54508399 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 54508545 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54508690 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54508856 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54509061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54509142 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54509143 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54509205 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54509230 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54509245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54509250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54510282 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54510869 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54513084 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54513920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54514048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54515137 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54515453 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54515709 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 54515713 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 54515754 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 54515922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54515935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54515982 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 54516134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54516580 G C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 54516585 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 54517446 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 54517518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54517678 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 54517766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54517803 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54517817 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54518240 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 54518506 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54518620 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54519595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54519784 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54519810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54519815 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54519859 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54519926 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54519964 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 54520034 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54520103 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54520306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54520377 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54520438 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 54520760 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54521204 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54521668 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54521693 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54521797 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54521870 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54522504 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54522881 C A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 54522903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54522974 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 54523246 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54523329 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54523968 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54524068 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 54524114 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54524333 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54524351 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54524916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54524985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54525267 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 54525525 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 54525877 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54525896 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 54526225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54526414 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54526469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54526895 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54527080 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54527093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54527201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54527256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54527291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54527326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54527341 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54527413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54527425 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54527431 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54527491 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54527558 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54527565 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54527612 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54527630 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54527698 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54527728 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54527745 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54527770 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 54527787 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54527803 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 54528399 A G Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 54528510 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 54528656 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54528687 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54528728 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54528813 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54528890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54528943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54528990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529221 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54529939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54530055 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54530146 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54530191 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54530360 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54530403 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54530439 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54530584 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54530590 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 54530853 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54531135 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54531139 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54531165 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54531171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54531247 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54531289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54531331 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54531338 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54531652 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 54531771 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54531849 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54531903 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54532024 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54532062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54532221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54532254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54532366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54532530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54532618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54533040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54533167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54533212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54533306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54533329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54533440 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54533585 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54533614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54533740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54533792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54533872 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54534074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54534113 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54534513 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54534581 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54534926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54535316 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54535494 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54535504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54535938 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54536095 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54536176 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54536736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54537402 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54537484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54537917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54538439 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54538591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54539445 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54539548 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54540824 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54541197 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54541513 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54544430 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54546397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54547407 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54548099 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54549971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54578636 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54582258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54584582 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54584880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54585660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54587523 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 54589583 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 54589623 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 54589690 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54589849 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 54589951 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 54590480 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 54590657 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 54590681 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 54591511 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54591565 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54591914 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 54592223 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54592406 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54592753 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54592799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54593263 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54593301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54593319 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 54593440 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54600349 A T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 2 54600600 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54601119 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54601120 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54602669 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 54603789 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54605040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54606625 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54606843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54607310 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54607959 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54608445 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 54608490 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 54608576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54608582 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54608802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54608838 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54608870 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 54608872 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 54608925 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54608970 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 54609039 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54609066 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54609069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54609323 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 54609391 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 54609392 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54609452 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 54609504 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54609628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54609643 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54609878 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54610353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54610612 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 54610766 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 54610793 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54611041 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 54611234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54617935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54617948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54617997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54618148 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54618214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54618217 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54619924 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 54620394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54621716 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54623562 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54623770 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54625772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54626210 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54628242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54629689 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54630171 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54630660 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54631139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54631427 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 54631517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54631529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54631632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54631674 C A Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 54631715 G T Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 54631882 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 54631909 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 54631948 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 54632385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54632396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54632466 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54632858 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54632928 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54633444 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54633576 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54633597 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54633856 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54634010 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 54634140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54634143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54634452 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54634540 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54634613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54635032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54635085 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54635261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54635588 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54635681 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54636170 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 54636402 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54636476 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54636558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54636572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54636833 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54636855 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54636880 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54637731 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 54638094 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54638105 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54638487 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54638732 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54638887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54638983 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54639220 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54639243 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54639375 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54639410 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54639494 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 54639712 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 54639740 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 54639772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54639784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54639892 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54640111 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54641129 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54641597 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54642166 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54642249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54642813 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54643179 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54643849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54644547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54645048 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54645179 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54645334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54645750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54646290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54646333 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54646686 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54647980 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54648591 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54649135 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 54649406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54649449 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54649512 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54649577 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54649623 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54650799 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54651590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54651823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54652834 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54653037 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54653797 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54655576 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54655740 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 54656759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54658045 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54658415 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54659166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54659774 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 54661429 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 54661808 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54662248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54662274 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54662288 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54662299 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54662382 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54665005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54666303 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54666759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54666994 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54667827 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 54670253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54670888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54672883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54673195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54673800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54674033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54674245 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54674902 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54675337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54675453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54675516 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54676662 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54676900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54676942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54676973 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54678380 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54679652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54680024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54681160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54681191 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54683319 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54684103 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54684104 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54685434 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54685804 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54689233 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54690535 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54691006 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54691275 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54691421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54691995 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54692011 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54692166 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54692202 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54692300 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54693407 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54693464 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54693482 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54693593 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54693806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54694216 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54694287 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54694316 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54694343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54694521 A C N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 54694524 A G N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 54694544 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 54694763 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54695092 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54695491 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54695569 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54695790 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54696378 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 54696454 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54696467 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54696595 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54696690 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54696719 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54696765 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54696801 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54696802 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54696999 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54697008 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54697051 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54697085 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54697325 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54697386 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54697424 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54697463 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54697577 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54697600 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54697650 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 54697781 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 54697953 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 54697973 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 54698057 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54698060 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54698106 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54698139 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54698339 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54698352 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54698397 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 54698551 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54698655 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54698750 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54698788 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54698824 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54698891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54699286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54699881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54706450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54707258 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54707369 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54707754 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54708311 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54709274 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54709411 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54709764 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54711553 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 54711641 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54711658 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54712495 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54712853 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54712986 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54713072 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54713145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54713169 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54713171 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54713276 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54713362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54713369 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54713374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54713478 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54713505 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54713557 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54713774 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54714157 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 54714244 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54714315 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54714322 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54714737 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 54719006 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54719125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54719163 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54719173 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54719580 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54719582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54719646 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54719668 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54719674 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54719712 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54719775 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 54719801 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54719808 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54719896 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54720072 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54720076 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54720122 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54720170 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 54720818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54720860 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54720872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54721064 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54721278 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54723358 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54723429 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54723753 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 54725251 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 54725559 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54726024 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54726075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54726196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54726237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54726250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54727597 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54727926 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54728077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54728096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54728101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54728169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54728221 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54728277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54728282 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54728313 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54728421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54728681 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54728763 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54728795 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54728801 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54731332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54731390 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54731611 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 54732145 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 54732338 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54732898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54734800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54734839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54735331 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54735949 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54736068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54737265 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54749161 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54749297 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54749676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54750577 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54751215 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54751919 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54752019 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54752054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54752429 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54752517 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 54753776 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54754341 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54754749 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54755630 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54755875 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54758111 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54758575 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54758719 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54759014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54760646 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54761905 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54762078 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54762329 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54762343 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54762398 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54762445 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54762447 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54762473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54762650 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54762766 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 54762775 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 54762807 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54762828 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54762834 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54762860 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54762960 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54763057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54763068 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54763072 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54763233 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54763253 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54763388 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54763645 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54763783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54763896 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54764077 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54764089 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54764171 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54764179 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54764202 T C Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 2 54764238 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54764581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54764666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54764681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54764746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54764818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54764900 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54764921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54764945 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54764946 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54764966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54764970 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54764995 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54765035 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54765052 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54765078 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54765112 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54765211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54765305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54765350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54765374 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54765476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54765814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54765905 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54765939 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54765943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54766039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54766040 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54766093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54766148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54766206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54766218 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54766228 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54766237 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54766259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54766331 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54766485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54766566 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54766618 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54766654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54766693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54766716 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54767161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54767516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54768518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54768853 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 54768865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54768900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54768972 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54768997 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54769013 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54769056 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54769200 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54769282 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54769360 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54769387 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54769418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54769466 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54769560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54769655 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54769757 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54769831 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54770056 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54770481 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54770535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54770754 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54771049 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54771076 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54771103 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54771218 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54771426 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54771441 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54771457 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 54771671 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54771703 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54771747 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54771794 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54771853 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54772367 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 54772375 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 54773273 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 54773384 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54773636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54773768 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54773770 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54773826 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 54773827 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 54773845 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54773894 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54773937 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54774000 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 54774044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54774045 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54774071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54774163 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54774185 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54774186 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54774233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54774299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54774331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54774341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54774400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54774407 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54774481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54774494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54774527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54774545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54774599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54774649 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54774673 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54774779 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54774859 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54774967 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54774971 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54775105 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54775111 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 54775165 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54775308 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54775694 A T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 54775754 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 54775897 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54776104 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54776141 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 54776237 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54776269 G T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 54776351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54776431 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54776450 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54776597 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54776665 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54776717 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54776829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54776830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54776909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54777139 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54777151 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54780108 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 54780115 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54780250 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 54780267 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54780434 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54780747 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54780793 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54781070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54781267 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54781298 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 54781339 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 54781341 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 54781360 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 54781401 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 54781564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54781687 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54781818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54781937 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54781971 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54782089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54782201 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54782213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54782261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54782271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54782295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54782471 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54782590 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54782641 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54782734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54782787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54782850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54782959 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54782978 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54782988 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54783015 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54783032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54783061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54783062 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54783114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54783176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54783199 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54783249 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 54783450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54783607 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54783764 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54783808 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54783852 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54784208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54784277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54784286 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 54784302 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54784338 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54784345 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54784367 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54784491 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 54784505 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 54784522 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54784672 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54784679 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54784710 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54784830 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54784850 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54784911 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54784968 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54784970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54784983 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 54784999 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 54785020 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54785028 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54785119 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 54785120 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 54785152 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 54785203 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 54785285 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 54785428 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 54785479 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 54785566 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54785575 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54785681 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54786063 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54786222 T A N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 54786347 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 54786897 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 54786954 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 54786962 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 54787255 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 54787261 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 54787289 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54787394 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54787415 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54787458 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54787534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54787548 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54787570 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54787872 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54787876 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54788015 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 54788089 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 54788127 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 54788147 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 54788183 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 54788185 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 54788204 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 54788211 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 54788224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54788242 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 54788254 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 54788288 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54788301 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 54788326 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 54788347 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 54788469 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 54788502 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54788504 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 54788623 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 54788643 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 54788681 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 54788708 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 54788739 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54788741 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54788765 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54788832 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 54788947 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54788973 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 54789058 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54789071 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54789146 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54789216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54789250 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 54789291 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 54789319 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 54789378 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 54789390 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 54789395 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 54789428 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 54789442 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 54789453 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 54789470 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 54789549 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 54789554 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 54789562 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 54789594 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 54789697 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 54789738 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 54789800 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 54789848 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 54789957 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54790012 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54790025 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 54790070 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 54790118 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 54790134 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 54790168 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 54790323 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 54790360 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 54790372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54790392 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 54790412 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 54790481 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54790518 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54790532 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54790566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54790614 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54790634 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54790712 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54790715 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54790744 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54790749 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54790772 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54790799 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54790887 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54790899 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54790903 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54791024 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54791897 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 54792019 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 54792033 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54792057 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 54792175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54792242 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 54792379 C A Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 54792437 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54792548 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 54792856 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 54792860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54793008 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 54793162 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 54793184 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 54793257 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 54793394 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 54793646 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 54793673 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 54793685 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 54793725 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 54793809 G C N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 54793814 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 54793835 T G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 54793855 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 54793919 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54794049 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54794107 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 54794166 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 54794174 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 54794225 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 54794270 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 54794399 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 54794554 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 54794577 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 54794693 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 54794876 T A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 54794988 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 54795020 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 54795027 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 54795055 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 54795099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54795138 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 54795171 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 54795179 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 54795192 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54795345 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 54795353 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 54795471 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 54795543 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 54795694 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54795699 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 54795768 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54795838 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 54795872 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54796221 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54796233 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54796306 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 54796431 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 54796458 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 54796473 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 2 54796480 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 54796540 T G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 54796828 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54796985 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54797052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54797058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54797090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54797145 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 54797158 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54797174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54797235 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54797316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54797413 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 54797426 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54797510 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54797807 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 54798073 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54798200 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54798597 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 54798941 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 54799503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54799787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54799788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54801107 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 54801509 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54802078 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 54802374 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54802379 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54802567 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 54802586 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 54802668 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 54802697 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 54802883 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54802928 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 54803078 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54803158 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 54803260 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54803302 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54803911 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 54804043 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 54804104 T G N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 54804140 G C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 54804232 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 54804325 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 54804385 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54804528 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 54804788 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54804803 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54804838 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54804850 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54805182 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54805332 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54805639 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 54810805 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54811672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54812113 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 54812169 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54812244 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54812254 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54812313 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 54812331 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54812472 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 54812575 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 54812576 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 54812588 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 54812639 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 54812651 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 54812788 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54813071 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 54813173 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54814115 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 54814327 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 54814339 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 54814360 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 54814405 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 54814412 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 54814705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54814806 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54815244 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54815583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54816095 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54816193 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54816486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54816694 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 54817013 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54818079 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54818141 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54818189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54818216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54818296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54818318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54818322 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54818439 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54818440 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54818474 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54818492 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54818646 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 54818659 C A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 54818838 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 54818843 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 54818906 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54818909 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54818925 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 54819075 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 54819076 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 54819121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54819132 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54819205 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54819207 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54819223 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54819226 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54819274 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54819379 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54819382 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54819402 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54819452 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54819480 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54819496 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54819604 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54819722 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54819731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54819773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54819826 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54819889 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54819892 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54819907 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54820003 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 54820064 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 54820131 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54820334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54820388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54820506 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54820606 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54820691 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54820714 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54820737 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54820749 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54820764 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54820775 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54820831 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 2 54820842 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 54820934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54821070 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54821159 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54821226 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54821268 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54821385 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54821573 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54821804 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54821915 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54821922 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54821928 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 54821991 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54822004 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 54822032 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 54822172 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 54822243 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 54822250 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 54822341 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54822368 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54822455 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 54822575 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 54822582 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 54822678 C G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 54822727 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 54822897 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 54822926 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 54823070 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 54823303 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54823412 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54823425 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54823441 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54823470 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54823524 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54823529 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54823631 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54823677 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54823698 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54824082 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 54824171 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 54824198 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 54824317 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 54824498 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 54824615 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 54824700 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54824730 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54824791 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 54824880 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54824941 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 54825024 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54825133 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54825244 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54825270 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54825281 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54825297 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 54825325 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54825404 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 54825469 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54825579 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 54825745 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 54825968 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54826131 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54826313 G T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 54826588 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 54826791 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54827166 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 54827230 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 54827240 G C N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 54827338 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54827389 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 54827462 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 54827579 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 54827648 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 54827708 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 54827728 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 54827734 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54827769 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54827816 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54828004 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54828315 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54828582 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54828600 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54828767 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54828817 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54828839 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54828876 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54828905 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54829004 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 54829267 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54829423 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 54829468 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 54829502 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54829559 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54829835 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54829852 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 54829983 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54830008 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54830051 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 54830053 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 54830201 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54830208 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54830224 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54830328 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54830366 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54830509 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54830585 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54830594 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54830685 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54830948 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 54831342 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 54831506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54831533 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54831643 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54831724 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54831790 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54831938 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54832025 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 54832233 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54832237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54832268 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 54832275 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 54832395 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54832496 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54832503 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54832543 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54832579 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 54832623 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54832660 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54832687 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54832722 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54832723 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54832786 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54832834 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54832851 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54832856 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54832877 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 54832931 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 54832988 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 54833128 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 54833189 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54833204 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 54833219 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54833290 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 54833396 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54833413 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54833417 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54833521 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 54833804 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54833839 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 54833866 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 54833870 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 54833921 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54833979 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54833997 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54834027 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54834045 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54834061 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54834074 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 54834088 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 54834098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54834128 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54834142 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54834241 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54834250 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54834308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54834444 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54834468 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54834546 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54834576 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54834596 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54834646 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 54834724 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54834737 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54834818 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 54834981 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 54835015 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54835031 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54835223 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54835253 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54835270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54835285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54835375 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54837190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54837469 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54838118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54838200 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54838493 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54838643 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54839147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54840483 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54841023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54841298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54841723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54841791 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54841834 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54842628 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54842803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54843763 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54843867 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54843902 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54844077 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54844115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54844406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54844445 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54845493 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54845544 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54845789 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54845948 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54846733 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 54846792 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54847924 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54848386 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54848923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54849406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54849413 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54849564 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54849646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54849961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54850757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54850910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54852029 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54852780 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54853075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54853231 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54853783 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54854590 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54854679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54854887 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54855097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54855789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54855944 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54856757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54857430 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54857516 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54857584 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54857641 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54858209 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54858394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54872782 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54875770 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 54885947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54886357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54886639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54887656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54887659 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54887752 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54888633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54888680 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54889260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54889810 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54890157 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54890722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54890814 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54891451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54891604 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54893486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54894898 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54895062 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 54895716 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54895831 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54897241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54897393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54899031 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54900095 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54900184 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54901270 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54902582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54902867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54903703 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54905228 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54906243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54906277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54907039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54907118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54907677 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 54907747 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 54908035 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54908152 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54908650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54908660 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54908671 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54909142 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 54909271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54909894 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54910327 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54910505 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 54910558 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 54910721 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54910745 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54910787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54910933 A C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54911052 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54911099 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 54911205 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54911226 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54911312 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 54911384 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54911398 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54911559 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54911671 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54911890 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 54911924 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 54911925 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54912176 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 54912208 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54912625 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54912685 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 54913705 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54914246 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54914410 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 54914582 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 54914618 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 54914619 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 54914728 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 54914780 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 54914837 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54914875 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 54914977 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 54914981 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54914999 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54915252 C A Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 54915348 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54915412 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 54915451 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 54915518 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54915535 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 54916108 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 54916209 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 54916316 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54916407 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54916410 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54916481 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54916547 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54916611 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54916643 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54916877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54916919 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 54917111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54917203 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54917389 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54917404 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54917504 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54917747 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 54917898 A T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 54918077 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 54918580 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54918625 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 54918629 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54918732 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54918852 T G N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 54919884 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 54919972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54920093 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54920539 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 54921434 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54921569 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54921592 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54921783 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54922249 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54922507 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54922799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54923824 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54924023 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54925160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54925245 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54926154 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54926157 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54926253 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54926488 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 54926540 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54926631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54926992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54927183 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54927184 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54927500 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 54927586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54927613 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54927626 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54927657 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54927796 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54927839 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54927864 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54927935 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54927949 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54927993 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 54927994 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 54928016 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54928076 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54928157 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 54928586 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54928813 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54928964 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 54929107 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54929123 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54929192 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54929193 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54929299 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54929346 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54929358 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54929371 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54929469 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54929504 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54929608 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54929883 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54929923 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54930155 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54930163 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54930441 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54930529 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54930555 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54930645 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54930671 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54930710 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54930783 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54930821 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54930957 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 54931006 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 54931064 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 54931070 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 54931164 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 54931186 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 54931195 C T N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 54931385 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 54931468 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 54931553 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54931642 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54931796 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54931813 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 54931861 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54932009 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54932072 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54932135 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54932152 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54932158 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54932302 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54932312 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54932375 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54932405 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54932411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54932431 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54932482 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54932519 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54932640 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54932804 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54932826 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54932892 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 54933006 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54933084 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54933088 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54933344 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54933396 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54933556 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54933622 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54933721 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54933737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54933764 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 54933912 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54934158 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54934220 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54934341 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54934371 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54934450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54934506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54934531 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 54934723 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54934753 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 54934923 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54934976 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54935140 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 54935192 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54935333 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54935351 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54935376 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54935427 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54935441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54935477 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54935564 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54935584 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54935608 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54935636 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54935699 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54935717 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54935718 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54935735 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54935774 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54935841 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54935857 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54935893 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54935946 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54936010 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54936483 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54936487 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54936497 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54936518 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54936554 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54936665 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54936736 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54936737 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54936874 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54936880 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54936911 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54936983 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54937029 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54937074 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54937096 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54937120 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54937232 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54937261 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54937307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54937329 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54937376 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54937477 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54937528 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54937694 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 54937784 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54937921 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 54937967 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 54938119 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54938156 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54938178 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54938190 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 54938204 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 54938231 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 54938254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54938262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54938316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54938367 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54938380 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54938480 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54938501 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54938748 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54938855 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54938896 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54938948 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54938959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54938963 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54939121 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54939853 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 54939987 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 54940121 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 54940140 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 54940149 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 54940160 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 54940198 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 54940240 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 54940298 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 54940410 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54940439 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 54940453 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54940502 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54940512 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54940529 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54940644 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54940887 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54940997 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54941018 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54941019 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 54941203 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 54941228 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 54941302 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 54941403 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 54941410 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 54941495 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54941591 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54941641 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 54941732 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54941822 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54941901 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54942088 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 54942137 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 54942294 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54942310 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54943908 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 54943911 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 54944091 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54944295 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 54944325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54944831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54944858 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 54944894 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 54945081 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 54945210 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 54945236 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54945366 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 54945409 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 54945562 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 54945641 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 54945900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54946106 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54946291 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54946370 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 54946741 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 54946810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54947031 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 54947130 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 54947185 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 54947667 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54948200 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 54948340 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 54948437 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 54948732 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 54949106 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 54949195 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54949324 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 54949550 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 54949932 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 54950408 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 54950421 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 54950785 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 54950891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54950931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54951595 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54951997 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54952468 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54952994 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 54953836 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 54954014 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 54954365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54954425 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54954754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54956396 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54956455 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54957139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54958215 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 54958824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54958833 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 54959186 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 54959648 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54960115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54961518 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54961693 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54961948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54962279 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 54963713 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54966478 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54967113 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54967196 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 54968858 A T Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 54968915 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 54973456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54975761 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54976326 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54976595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54976797 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54976853 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 54976988 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 54977529 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54977608 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54977661 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54977703 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 54977722 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 54977749 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54977760 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 54977784 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 54977868 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 54977916 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 54977927 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 54978150 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54978410 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54978508 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54978596 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54978722 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54978776 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 54978920 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54978957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54979093 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54979173 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54979198 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54979348 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54979364 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54979460 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54979651 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54979779 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54979810 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54979913 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54979986 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 54980019 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54980041 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54980118 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 54980188 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54980234 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 54980307 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 54980431 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 54980546 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54980592 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54980898 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54981039 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 54981182 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54981243 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 54981290 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54981339 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 54981359 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54981491 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 54981534 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54981547 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54981704 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 54981711 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54981827 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54981904 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54981926 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54981938 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54982194 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 54982378 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54982583 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 54982638 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 54982700 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 54982727 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54982840 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 54982866 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54983177 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 54983435 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 54984076 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54984376 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 54984478 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54984498 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 54984603 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 54984673 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 54984719 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 54984802 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 54984835 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 54985032 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 54985157 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 54985363 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 54985513 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 54985525 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54985547 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 54985692 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 54985707 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 54985783 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 54986177 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 54986257 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 54986261 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 54986294 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 54986451 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 54986457 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 54986695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54986966 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 54987664 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 54989119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54989377 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 54989743 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 54989959 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 54990085 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54990096 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54990099 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54990128 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54990129 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 54990176 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 54990225 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 54990363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54990367 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 54990435 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 54990471 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 54990547 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 54990638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54990690 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54990704 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54990930 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 54991072 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 54991186 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54991187 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 54991387 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54991463 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 54991513 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54991558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54991961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54992183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54992277 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54992479 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 54993026 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 54993077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54993137 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54993163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54993270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54993427 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54993545 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54993624 C T Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 54993711 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 54994250 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54994280 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54994302 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54994659 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54994668 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54994766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54994771 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54994787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54994856 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54994999 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54995062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54995120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54995132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54995176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54995441 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54995627 A T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 54995680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54995835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54995875 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54995876 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 54995893 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54996002 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54996010 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54996213 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54996289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54996438 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54996456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 54996700 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54996703 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 54996907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54996928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54996955 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 54997076 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 54997083 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 54997129 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 55000405 C A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 55000452 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55000523 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55000526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55000682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55000822 T A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 55000895 A C Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 55001420 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55001422 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55001447 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55001479 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 55001597 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55001835 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55002243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55002477 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 55002519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55002668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55002888 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 55002912 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 55002972 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 55002995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55003097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55003099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55003252 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55003541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55003675 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55003784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55004177 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55004243 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55004299 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55004339 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55004527 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 55004615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55004643 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55004717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55004791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55004998 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55005034 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55005097 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55005108 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55005145 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55005224 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 55005366 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 55005387 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55005422 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 55005431 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 55005568 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 55005594 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55005642 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55005673 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 55005691 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 55005831 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 55006037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55006162 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 55006249 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 55006356 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 55006370 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 55006383 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 55006435 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 55006462 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 55006466 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 55006506 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55006517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55006535 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 55006573 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 55006730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55006860 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 55007177 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55007211 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 55007234 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 55007281 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55007284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55007294 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 55007300 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 55007381 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55007397 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 55007502 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 55007595 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 55007641 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 55007810 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 55007858 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 55007863 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 55008298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55008355 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55008741 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 55008964 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55009270 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55009448 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55009716 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55009889 A C Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 55009913 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 55010017 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 55010197 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55010274 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55010297 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 55010339 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55010371 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55010474 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55010943 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 55010990 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55011070 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55011244 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 55011315 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55011327 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55011590 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 55011931 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 55012062 G A Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 55012073 C T Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 55012240 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 55012275 G T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 55013132 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 55013135 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55014037 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 55014089 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 55014285 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 55014628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55014832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55014904 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55014987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55015095 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 55015428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55016247 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55016428 G C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 55017070 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 55017097 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55017581 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 55017691 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 55017814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55018446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55018797 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55020648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55021269 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55021305 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55022225 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55022839 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55024560 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55025687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55025921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55026174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55027692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55028378 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 55028379 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 55028675 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55028918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55029078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55030962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55031308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55031545 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55031942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55032432 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55033121 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55034534 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55035471 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55035936 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55036631 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55037245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55037892 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55039208 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 55041371 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55041944 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 55042611 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 55043139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55044185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55045049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55045245 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55045527 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55046046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55046157 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55047799 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55048024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55048564 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55048651 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55048735 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 55059547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55060117 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 55061271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55061571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55063513 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 55063898 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55065250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55069231 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 55070072 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55070757 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55072790 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55073824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55074091 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55075554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55076722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55078034 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55078659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55079019 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55079824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55079851 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55079890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55080345 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55080543 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 55082520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55083880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55084126 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55084496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55087919 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55089600 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55091383 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55098869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55102126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55103386 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55103749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55104912 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 55107745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55108106 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55116618 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 55118958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55120737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55125059 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55126830 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 55126960 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 55129503 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55129608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55130194 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 55132677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55132711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55133543 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 55134150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55136556 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 55136584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55136700 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55136868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55138094 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55141371 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55141917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55141932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55142868 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 55142929 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 55143382 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 55143418 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 55143485 C G Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 55143700 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 55143733 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55143769 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55143781 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 55143857 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 55143887 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 55143901 C A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 55143999 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 55144074 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 55144086 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 55144090 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 55144213 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55144290 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 55144896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55145034 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55145054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55145146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55145269 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55145295 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55145461 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 55145612 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55146003 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55146023 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 55146122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55146156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55146196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55146446 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 55146553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55146636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55146877 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55146918 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55146942 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55146981 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55147234 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 55147284 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 55147441 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55147565 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 55147700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55147758 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 55147791 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 55147960 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 55148107 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 55148158 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 55148191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55148240 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 55148339 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 55148455 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 55148514 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55148518 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55148650 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 55148666 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55148834 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 55148894 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55148902 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55148922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55149285 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55149336 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55152518 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55153352 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55153599 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55153680 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 55153907 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55153916 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 55153921 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 55153933 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 55154279 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 55154326 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 2 55154629 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55155167 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55155397 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 55155490 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 55155731 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55155813 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 55155854 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 55155939 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 55156434 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55156467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55156560 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 55156584 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55156926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55156945 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 55158560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55158564 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 55159141 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55159253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55159444 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 55159610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55159778 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 55160253 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 55160326 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55160680 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 55162144 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 55162254 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55163005 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 55166542 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55168089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55169480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55169907 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55170202 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55170290 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 55178554 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55179258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55179353 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55179701 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 55180070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55180765 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55180836 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55181078 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55181788 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55182161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55182998 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55183099 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55185580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55186188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55186815 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55187627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55188122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55189222 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55189223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55189570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55190468 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55191158 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55192047 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 55194098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55194238 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 55194464 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55194533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55195031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55195641 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55196113 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55196693 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55197081 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55198998 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55199056 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55199267 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 55206305 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55206658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55207356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55207574 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55209012 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55209698 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 55209722 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55209924 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55209944 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 55210043 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55210784 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 2 55210890 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 55211991 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55212152 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 55212289 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 55212305 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55212327 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55212456 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55212563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55213042 C A N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.444444444444444 0 0.555555555555556 8 10 4 0 5 2 55213220 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 55213750 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 2 55214458 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 55214701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55214724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55214884 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 55214990 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 55215102 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 55215113 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55215220 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55215567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55215726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55215832 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 55216628 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55216738 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55217143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55217252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55217640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55217882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55218059 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55218074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55218429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55218577 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 55218802 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55218946 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55218973 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 55219321 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55220049 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55220054 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 55220711 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55220851 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55220964 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 55221763 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 55223187 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55224231 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55224509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55224560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55224869 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 55225991 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55226358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55226815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55227495 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 55227937 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55227956 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 55229438 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55230399 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 55230551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55230553 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55230792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55231084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55231282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55232007 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 55232588 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 55232945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55235345 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55235402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55237075 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 55242734 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55242941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55242977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55243034 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 55246291 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55246532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55247438 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 55247455 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55248838 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55248874 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55249593 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55253011 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 55253177 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55253536 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55254178 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55254670 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 55254771 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 55254793 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 55255899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55256327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55256606 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 55256989 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 55258476 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55259315 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55259786 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55261017 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 55262000 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55263121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55263436 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55264451 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55264720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55265873 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55266139 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55266332 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55267801 G C Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 55268172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55269029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55270906 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55271032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55275646 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55277335 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55279400 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 55281380 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 55283333 A G Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 55284703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55287151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55291112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55291932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55293221 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 55296084 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 55296126 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 55297328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55298443 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55301718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55302294 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55302886 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55305642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55306309 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 55309269 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55309861 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55310591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55312184 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55315013 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55315602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55317039 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55318615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55318992 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55320377 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55320749 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 55321185 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 55323507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55323727 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55324989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55326002 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55327019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55327677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55330218 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55333790 C A Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 55335820 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55336510 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 55336628 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55337517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55338136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55339665 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 55343841 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55343879 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55351176 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55352073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55356632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55356678 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55356715 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55358943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55359384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55359648 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55360250 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 55360262 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 55362655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55362868 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55363857 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55364517 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55366543 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55366644 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55368007 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55368650 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55369503 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55372250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55373790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55374599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55376277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55379866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55383270 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 55383728 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55383817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55384405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55385442 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 55386441 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55386723 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 55389682 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 55389970 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 55391547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55391677 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55391764 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55396099 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 55396110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55400242 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 55401661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55402872 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 55408371 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 55409900 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 55413890 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 55415735 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55421020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55422414 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 55423522 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 55427287 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55427456 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 55428877 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55432190 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55433266 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55440838 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55442317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55442359 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55447355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55450119 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 55450429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55452623 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55457157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55458576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55461805 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55462601 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55464334 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 55464501 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55465457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55466246 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55466553 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55466695 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 55467040 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55468134 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55468570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55469457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55473069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55473754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55473856 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 55474521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55481559 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 55481940 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 55482476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55482751 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55484189 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 55484211 C T Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 55484217 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 55484689 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55485568 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55485818 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55486143 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55486183 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55486627 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55486636 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 55486766 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 55488121 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55488715 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55488716 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55489121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55489222 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55489594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55489872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55490237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55491246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55492357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55492619 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55493085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55493174 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55494445 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55495305 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55495808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55496316 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55496366 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55496608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55497058 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55497635 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55499863 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 55500209 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55501067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55501453 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55501558 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55501905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55502385 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55502783 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55503189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55503217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55503480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55504621 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 55506588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55506781 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 55506954 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 55507017 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55507094 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 55507121 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 55507131 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55507150 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 55507209 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 55507267 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 55507318 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 55507322 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 55507402 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 55507481 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 55507574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55507764 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 55507965 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55508243 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55508468 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55508696 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55508973 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55509096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55509141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55510432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55511027 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55513486 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55513708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55514262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55514689 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55515430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55516232 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 55516967 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 55516977 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55517002 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55517035 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55518019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55518230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55518846 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55520885 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 55522347 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 55531063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55531884 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55532324 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55533279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55534475 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55536808 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 55537024 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55538158 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55538195 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55538241 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 55538252 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 55538287 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 55538647 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55538879 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 55539589 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 55539616 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 55539652 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 55539700 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 55539758 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55539768 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55539770 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55539785 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55539798 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55539918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55539986 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 55540100 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 55542224 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 55543049 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55543409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55544009 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55546266 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55546362 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55546843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55548342 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55550994 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 55551042 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 55551336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55551487 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 55552815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55552850 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 55552966 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 55553302 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 55553420 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 55553446 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55553465 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55553915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55554033 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 55554115 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55554565 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 55554940 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 55554942 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 55555039 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 55555048 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 55555406 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55555427 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 55555441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55555475 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 55555489 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 55555575 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55555588 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 55555597 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 55555732 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 55555766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55555821 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 55555844 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 55555892 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 55555961 A C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 55555975 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 55555984 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 55556029 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 55556057 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 55556222 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 55556423 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 55556426 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 55556436 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 55556654 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55556744 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 55556770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55556849 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 55556860 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 55556870 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 55557010 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 55557038 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 55557793 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 55557868 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 55558035 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 55558178 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 55558218 C G N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 55558226 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 55558262 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55558324 G C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 55558328 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 55558359 G T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 55558393 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 55558457 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 55558477 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 55558509 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 55558527 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 55558602 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 55558622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55558625 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 55558634 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 55558686 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 55558761 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 55558935 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55559104 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 55559193 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 55559244 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 55559281 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 55559296 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 55559348 G T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 55559390 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 55559424 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 55559429 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 55559442 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 55559471 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 55559573 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 55559594 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 55559620 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 55559646 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 55559740 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 55559817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55559898 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 55559952 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 55560175 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 55560187 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 55560270 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 55560352 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 55560405 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 55560434 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 55560443 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 55560466 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 55560511 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 55560527 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 55560561 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 55560630 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 55560707 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 55560724 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 55560765 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 55560769 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 55560854 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 55560914 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 55560940 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 55560958 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 55561004 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 55561039 C G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 55561050 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 55561213 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 2 55561236 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 55561252 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 55561282 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 55561330 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 55561337 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 55561396 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 55561577 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 55561601 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 55561607 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 55561621 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 55561631 G C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 55561680 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55561693 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55561701 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 55561720 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 55561740 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 55561791 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 55561843 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 55561855 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 55561942 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 55561972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55562017 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55562030 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 55562060 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 55562148 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 55562208 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 55562247 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55562257 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 55562462 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 55562534 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 55562568 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 55562574 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 55562605 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 55562606 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 55562637 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 55562702 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 55562861 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 55562878 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 55562957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55563033 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 55563070 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 55563073 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 55563554 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 55563650 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 55563655 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 55563663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55563694 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 55563728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55563801 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 55563867 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 55564075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55564101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55564313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55564319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55564382 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 55564425 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55564556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55564750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55564955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55565573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55566066 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55566080 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 55566241 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 55566316 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 55566388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55567162 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 55567583 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 55568892 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 55569169 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 55569563 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 55570979 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55571135 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 55571604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55572028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55572284 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 55573135 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55573175 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55573352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55573575 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 55573883 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 55575795 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55576028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55576223 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55577540 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55577839 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 55578133 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 55580000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55580151 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 55580275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55580545 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 55580929 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55581655 T G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 55582537 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55582855 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55584033 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55584198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55584442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55585313 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55588083 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55588585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55588663 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 55588813 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 55590062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55590802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55591671 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55591672 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55593677 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 55593708 G T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 55596626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55596724 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 55597021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55597678 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55597843 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55601755 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55601818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55602308 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 55603495 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 55605043 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 55606006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55607472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55607547 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55607563 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55607589 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 55607973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55609373 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55609393 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55609641 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55610758 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55611762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55613184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55613313 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55613586 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55615480 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 55616152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55617863 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55618109 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 55619171 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55620026 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 55620045 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 55620091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55620739 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 55620768 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 55620951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55620970 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 55621128 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55621422 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 55621532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55621806 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 55622331 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 55622405 G C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 55622459 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 55622619 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 55622620 A T Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 55623847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55624569 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55625756 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55626143 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 55627149 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 55628652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55629046 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 55629457 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 55630361 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55630999 T C Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 55631436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55633241 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55634253 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 55645177 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 55645370 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55645810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55646045 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55646858 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55646942 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55647196 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 55647996 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55648098 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 55648690 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55648786 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55649208 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55650272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55650348 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 55650436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55650679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55650688 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55650697 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55650744 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 55651017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55652907 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55653617 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55654923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55655814 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55656370 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55657722 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 55657944 A C Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 55660588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55661112 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 55661233 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 2 55662935 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55662948 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 55663664 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55663734 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55665319 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55666067 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 55668666 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 55668939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55669850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55671081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55671249 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55672300 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 55672309 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 55672313 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 55672379 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 55672413 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 55674226 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 55674571 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 55675317 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55675701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55675942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55682693 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55682841 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55683553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55683724 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 55685050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55685377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55686847 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55687301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55689030 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55689157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55689490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55691990 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55692174 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55692547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55693965 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55696093 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 55697184 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55698126 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 55698816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55699101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55701192 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55705588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55707388 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55708072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55708521 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55709929 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 55711551 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55711552 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 55714083 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55714332 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55714706 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55714949 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 55715211 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 55716416 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 55717017 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 55727864 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 55729336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55729781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55730626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55730631 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 55730711 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 55730763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55730904 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 55731047 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 55731063 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 55731222 T G Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 55731479 C A Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 55731482 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 55731524 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 55731586 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55731890 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 55731891 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 55732099 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 55732143 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 55732182 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 55732284 A T N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 2 55732316 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 55732506 A T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 55732671 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 55732690 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 55733820 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 55734469 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 55734730 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 55734850 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 55734869 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 55734928 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 55735487 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 55735501 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 55735691 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 55735808 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 55735812 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55736026 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 55736224 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 55736314 A G N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 55736645 G T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 55736656 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 55736837 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 2 55736855 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 55736874 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 55736907 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 55736944 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 55737211 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 55737227 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 55737229 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 55737325 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 55737438 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55737595 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 55737646 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 55737707 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 55737727 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 55737738 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 55737820 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 55737842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55737856 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 55737898 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 55738217 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 55738242 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 55738267 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 55738268 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 55738306 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 55738377 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 55738396 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 55738496 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 55738604 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 55738612 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 55739007 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 55739222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55739328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55739377 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 55739407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55739457 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 55739636 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 55739644 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 55739879 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55740646 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 55741473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55741540 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 55741551 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55742932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55742956 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 55743123 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55744358 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55744789 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55746570 G T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 55746927 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 55747268 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 55747550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55747593 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55747681 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 55747739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55747847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55748706 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 55749292 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 55749648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55749887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55750464 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 55751230 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55751329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55751532 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 55752102 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 55752135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55752142 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 55752609 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55752841 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55753137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55753322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55754134 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 55754335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55754376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55754618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55754963 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 55755066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55755204 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 55756052 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55756219 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55756396 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 55756432 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55757172 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55757174 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 55757561 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55757802 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55758045 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55758879 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 55759094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55759100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55759105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55760026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55760050 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 55760910 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55760921 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 55762116 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55762166 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 55762198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55762341 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55763859 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 55764235 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 55766159 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 55766323 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 55766331 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55766518 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55767170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55767385 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 55767802 G T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 55768500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55768683 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55768904 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 55769331 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55769544 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 55769619 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 55769788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55770136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55770284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55770429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55771197 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 55771203 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 55771406 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55771947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55772424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55773904 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 55774549 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55775602 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 55775872 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55776159 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 55778855 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55778925 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 55779133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55779518 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55780034 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 55780699 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55780789 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 55781001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55781450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55783171 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 55784270 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 55784545 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55785166 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 55785564 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55785888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55786231 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55786319 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 55786942 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 55787245 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55787900 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 55788190 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 55788537 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55788815 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 55788889 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 55789247 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 55789446 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55789661 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 55789805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55789806 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55789966 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 55790364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55790445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55790618 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 55790888 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 55790993 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55791005 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 55791296 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 55791673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55791996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55793700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55800728 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55801354 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 55803677 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 55804821 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55804855 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55805074 A C N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 55806455 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 55806516 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 55806532 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 55806545 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 55806761 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 55806783 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 55806788 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 55807236 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55807297 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55807418 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 55807551 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55812174 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 55812548 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55812612 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55812699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55813458 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 55814380 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55815559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55816316 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 55819684 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55820155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55821901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55822946 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55824358 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55824972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55825311 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 55825581 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55826406 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55826831 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 55827503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55827776 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 55828094 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 55828704 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 55828918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55829034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55829040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55829183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55831385 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55831532 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55831694 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55832322 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 55832343 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 2 55832344 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 55832646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55832673 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55832721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55833719 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55834319 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55834436 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 55835320 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 55835871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55836678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55837202 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55837470 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55837908 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55838085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55838137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55838666 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55838921 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55840624 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 55841367 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55841953 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55842798 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 55842925 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 55843445 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 55843719 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 55844238 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 55844240 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 55844606 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 55845649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55846137 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55846414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55846845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55847358 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55847752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55847907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55848186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55848679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55848741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55850060 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 55850118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55850518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55850556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55851898 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 55852577 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55852734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55853495 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 55853530 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 55854563 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55854645 C A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 55855717 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55856529 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55856609 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 55856806 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55856897 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55857180 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 55857487 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 55857850 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 55858256 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55858596 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55858851 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55859177 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55859427 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55859728 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55859994 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 55860456 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55860815 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55860829 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55860894 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 55860987 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55861309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55863181 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55863804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55863925 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 55865925 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 55866156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55866739 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55866753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55867224 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55868382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55868589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55869779 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55870074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55870323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55871011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55872390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55873504 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 55873651 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55875415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55876069 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 55878077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55878255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55878752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55878756 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 55879752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55880469 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 55881079 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55881603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55882121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55883028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55884830 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55885572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55885916 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55885927 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55886420 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55886926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55887240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55887344 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 55888140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55888370 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 55888393 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 55889394 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55889614 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 55890051 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55891752 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 55891809 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55891940 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 55892590 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55893119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55893277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55894007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55894421 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 55895093 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 55895596 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 55895836 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 55896830 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55897092 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 55897282 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 55897388 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55900559 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 55905334 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 55906327 T G Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 2 55908247 A C Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 55908282 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 55908411 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 55908657 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55908943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55909998 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 55910743 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55910912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55911164 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55914205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55915973 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55921999 G C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 55922127 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55922242 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 55922272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55923774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55925396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55925836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55925852 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 55925870 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 55925899 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 55926046 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 55926047 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 55926086 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 55926328 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 55926542 C A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 55926883 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55926943 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55926987 A C Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 55926991 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 55926999 A C Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 55927047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55927054 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 55927080 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 55927211 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 55927368 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 55927424 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 55927458 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 55927500 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55927582 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55927801 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 55927803 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55927843 G T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 55927904 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 55927957 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 55928186 G C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 55928293 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55928310 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 55928318 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55928355 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 55928437 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 55928500 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 55928962 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 55929186 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 55929269 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 55929284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55929319 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 55929351 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 55929568 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 55929591 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 55929640 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 55930026 C A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 55930084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55930300 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 55930305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55930347 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55931489 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55931573 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55931625 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55931775 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 55931857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55931901 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55931945 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55932019 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55932034 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55932327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55932392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55932571 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55933093 T C N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 55933161 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55933202 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 55933345 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55933544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55933600 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55933719 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55933745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55933755 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 55933757 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 55933814 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 55933990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55933993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55934095 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 55934103 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55934153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55934397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55934471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55934492 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55934925 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55934960 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55935365 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 55935422 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55935478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55935711 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 55935730 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55935768 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 55935931 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 55936029 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55936055 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 55936075 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 55936185 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 55936328 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 55936633 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 55937187 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 55937256 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 55937331 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 55937369 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 55937574 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 55937666 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 55937689 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 55937722 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 55937769 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 55937807 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 55937831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55937905 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 55938061 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 55938181 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 55938194 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 55938273 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 55938344 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 55938404 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 55938490 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 55938548 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 55938727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55938753 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 55939464 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 55939638 A C N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 55939916 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55939965 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 55939987 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 55940033 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 55940069 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 55940279 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 55940417 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 55940511 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 55940912 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 55940972 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 55941076 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 55941367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55941398 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 55941421 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 55941539 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 55941544 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 55941779 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 55941789 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 55941820 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 55942052 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 55942075 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 55942095 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 55942675 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 55942768 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55942843 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55942997 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55943080 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 55943157 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 55943249 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 55943388 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 55943392 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 55943444 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55943526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55943669 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 55943785 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 55943906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55943913 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55944023 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 55944025 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 55944066 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 55944086 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 55944099 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 55944117 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 55944294 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55944352 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55944401 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55944471 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 55944536 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55944562 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 55944607 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 55944913 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 55944947 C G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 55944963 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 55945018 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55945031 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55945049 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55945069 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 55945166 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 55945299 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 55945333 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55945349 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55945399 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 55945456 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55945478 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55945548 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55945587 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55945816 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 55945837 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 55945840 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 55946015 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55946098 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55946453 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55946478 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55946660 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 55946694 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55946723 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55946779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55946805 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 55946817 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 55946923 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 55946988 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 55947041 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 55947136 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55947144 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55947257 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 55947262 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 55947348 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 55947383 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 55947436 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 55947466 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 55947500 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 55948264 C G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 55950354 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 55951815 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55952519 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55952603 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 55952641 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 55953666 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 55953899 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 55953972 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55954270 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 55954327 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 55954355 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 55954428 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 55954549 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 55954577 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55954882 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55954954 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 55954977 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 55955081 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 55955111 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 55955230 C G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 55955290 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 55955370 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 55955383 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 55955390 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 55955457 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55955476 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 55955548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55955583 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55955640 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 55955826 G C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 55955971 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 55956154 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55956187 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55956216 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55956233 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55956388 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 55956445 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 55956590 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 55956746 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55956991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55957024 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55957275 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55957314 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55957327 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 55957453 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 55957814 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 55957833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55957899 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 55958079 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 55958386 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55958801 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55958838 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55958918 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55959062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55959092 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55959254 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55959394 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55959849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55960682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55961030 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 55961051 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 55961203 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 55961315 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 55961590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55961845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55961923 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 55962769 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55963120 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 55963310 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 55963768 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55964098 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 55964372 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 55964788 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55964989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55965187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55965637 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55965803 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55966882 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55967835 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 55968112 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55968797 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 55969006 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 55969663 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 55971185 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 55971269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55971989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55972954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55973209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55974398 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 55974548 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 55974638 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55974741 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55975011 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 55975311 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 55975981 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55979517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55979882 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55980104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55980513 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 55980801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55981551 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 55982344 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55983164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55984011 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 55987017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 55989823 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 55997652 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56001518 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56001809 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56001891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56001936 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 56002510 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 56002840 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 56004925 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56005511 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56006733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56008709 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 56011005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56014776 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56015587 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56015998 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56016070 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 56016106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56016180 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56018797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56019601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56023889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56025005 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56027340 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56027872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56029186 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 56030121 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56030487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56030877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56030946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56031910 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56033150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56033256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56034463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56035300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56036057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56040732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56041074 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56045170 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56048264 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 56048876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56050011 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56050438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56050473 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56050751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56050775 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 56050787 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 56051069 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56051216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56051290 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 56051560 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56051599 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56051677 G A N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 56051739 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 56052140 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56052537 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 56052900 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 56053041 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 56053244 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 56053660 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 56054135 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 56054137 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 56054268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56054845 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56054869 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56055035 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 56055040 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 56055154 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 56055890 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 56055898 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56056095 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 56056138 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56056415 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 56056459 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 56056507 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 56056512 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 56056536 A C Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 56056646 C G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 56056886 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56056888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56056963 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 56056969 C G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 56057109 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 56057305 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 56057306 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 56057363 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 56057394 C G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 56057426 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 56057515 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 56057537 T A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 56057592 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 56057596 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 56057749 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 56057752 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 56057822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56057835 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 56057867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56057958 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 56058227 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 56058244 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 56058248 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56058263 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 56058497 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 56058600 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 56058687 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 56058690 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 56058760 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 56059000 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 56059208 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 56059219 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 56059252 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 56059342 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 56059343 C A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 56059774 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 56059948 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 56059997 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 56060007 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 56060088 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 56060134 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56060211 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 56060328 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 56060485 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56060503 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 56060563 G C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 56060572 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 56060574 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 56060586 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 56060608 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 56060646 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 56060647 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 56060689 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56060867 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 56060896 A T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 56060914 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 56060941 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 56060942 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 56061013 G T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 2 56061049 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 56061051 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 56061182 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 56061200 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 56061346 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 56061447 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 56061534 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 56061608 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 56061658 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 56061755 A C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 56061797 T G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 56061829 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56061995 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 56062049 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 56062194 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 56062396 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 56062399 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 56062409 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 56062559 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 56062636 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 56062723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56062763 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 56062777 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 56062793 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 56063238 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 56063259 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 56063275 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56063301 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 56063340 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 56063407 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 56063601 T A N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 56063624 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 56063836 T A N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 56063867 G A N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 56063893 C A N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 56064023 T G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 56064063 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 56064071 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 56064347 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56064425 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56064462 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56064551 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56064576 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56064581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56065122 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 56065888 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 56067059 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 56067100 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 56067109 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56067459 C G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 56067493 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 56067995 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56068354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56068389 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 56075180 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 56075776 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 2 56076071 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 56076103 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 56076122 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 56076151 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 56076170 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 56076209 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 56076212 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 56076230 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 56076285 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 56076324 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 56076385 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 56076414 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 56076459 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 56076532 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56076575 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 56076592 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 56076601 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 56076619 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 56076657 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 56076677 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 56076702 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 56076726 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56076838 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 56076860 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 56076947 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 56076995 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56077009 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 56077159 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 56077324 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 56077403 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 56077413 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56077578 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56077889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56078064 G C N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 2 56078252 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56078336 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 56078929 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 56079604 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 56079636 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 56079732 A C N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 2 56080357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56080715 G C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 56080736 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 56080807 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 56080891 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 56081145 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 56081506 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 56081696 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 56082468 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 56082486 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56082519 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 56082591 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 56082623 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 56082667 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 56083407 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 56083415 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 56083646 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 56083696 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 56083728 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 56083785 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 56083922 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 56084190 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 56084409 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 56084522 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 56084551 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 56084568 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 56086488 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 56086859 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56087403 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56087840 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56088129 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56088234 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 56088397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56088520 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56088554 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56089075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56089168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56089503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56090288 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56090929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56091269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56094247 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 56094490 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56094645 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56096058 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56096097 G T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 56097244 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56098011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56099454 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 56099919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56100230 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56100482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56100577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56100865 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 56101060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56101341 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56101530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56105427 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56106472 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56106477 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56108301 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 56108407 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56108570 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 56108899 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 56108972 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 56109364 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 56110632 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 56110709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56110798 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56110831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56111009 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56111423 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 56111514 G T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 56111642 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56111848 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56111919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56112052 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56112203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56112261 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 56112391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56112519 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 56112576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56112581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56112719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56112885 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56113397 A T N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 56113602 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 56115120 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 56115150 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 56115352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56115382 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 56115515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56115529 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56115553 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56115677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56115806 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56115818 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56115822 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 56115875 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56116027 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 56116170 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56118128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56118521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56119636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56121930 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56122450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56122729 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 56123035 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 56123164 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 56123364 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 56123767 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56124538 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 56124626 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56125671 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 56125798 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 56125960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56125996 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56126088 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 56127267 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 56127813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56128353 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56128505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56128805 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 56129128 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56129533 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56129839 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56129896 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56129920 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56129953 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 56130000 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56130081 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56130115 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 56130219 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 56130257 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56130520 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56130552 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56130570 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56130577 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56130668 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 56130677 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 56130739 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56130756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56130836 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 56130900 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 56131069 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56131090 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56131135 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56131145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56131166 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 56131178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56131205 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56131292 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 56131395 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56131422 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 56131426 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 56131536 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 56131597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56131600 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 56131650 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 56131777 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 56131782 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 56131806 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 56131986 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 56131989 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56132087 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56132105 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56132351 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56132444 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 56132562 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 56132665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56132666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56132836 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 56132941 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56132965 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56133264 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 56133278 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 56133407 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56133455 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56133459 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56133487 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56133520 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56133535 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56133614 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56133701 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56133706 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56133738 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56133750 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 56133933 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56134037 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 56134284 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 56134312 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 56134596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56134712 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56134954 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 56134994 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 56135154 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56135242 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56135268 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 56135394 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 56135520 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 56135528 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 56135543 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 56135548 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 56135699 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 56135745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56135748 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 56135939 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 56135999 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 56136000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56136081 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56136094 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56136145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56136580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56136649 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 56136664 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56137502 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56137568 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 56137758 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56137790 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 56138105 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56138136 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 56138144 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 56138165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56138178 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 56138217 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 56138508 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 56138574 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 56138633 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 56138683 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56138782 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 56138874 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56139132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56139244 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56139557 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56139716 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 56140010 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56140018 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56140086 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 56140128 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56140135 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 56140536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56140541 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56140634 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56140768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56140986 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56141039 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56141049 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56141089 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 56141191 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56141234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56141677 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56142491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56143095 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56143122 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 56143367 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 2 56143585 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 56143818 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56143910 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 56144023 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 56144336 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 56144866 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 56145018 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 56145136 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 56145264 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 56145527 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 56145804 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 56145826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56146280 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 56146922 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 56147391 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56147797 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 56147987 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56148658 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 56149581 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56149587 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 56149865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56149912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56149931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56150509 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 56150765 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56150773 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 56157449 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 56157515 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56157586 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 56157696 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 56157865 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56157977 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56158091 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 56158506 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56158539 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 56158566 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 56158877 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 56159017 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56159033 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56159041 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56159313 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 56159366 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56159391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56159808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56160061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56160123 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56160532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56161015 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 56161065 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 56161340 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 56161693 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56161773 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 56162014 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 56162213 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 56162286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56162361 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 56162464 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 56162579 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 56162599 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 56162982 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 56165518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56166649 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 56166849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56166879 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 56166960 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 56166965 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 56167079 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 56167298 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 56167373 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 56167386 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 56167447 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 56167481 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 56167639 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 56167796 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 56167970 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56168008 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 56168132 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 56168322 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 56168569 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 56168592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56169512 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56169652 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56169736 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56170356 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 56171437 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 56172363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56174208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56175876 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56177767 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56178821 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 56178847 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56182083 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56183604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56184458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56186165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56186554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56187989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56188213 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56189032 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56189129 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56189722 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56190107 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 56190271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56190773 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 56191062 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56191089 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 56191195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56191543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56191582 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 56192515 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 56192811 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 56193476 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 56193990 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 56194454 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 56194736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56195186 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 56195877 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 56195928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56196210 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56196968 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 56197010 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 56197213 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 56198079 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 56198408 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 56198525 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 56198952 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56200204 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 56200279 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 56200773 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56200827 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 56201529 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 56201632 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 56202178 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56202325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56203033 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56203872 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 56204310 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 56204397 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 56204666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56204888 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56204931 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 56205023 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56206227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56206907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56208267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56209230 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56209635 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 56211075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56211746 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56212653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56213157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56214337 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56218372 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56219482 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56220050 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56222677 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56225506 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56227379 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 56230317 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 56236124 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 56237620 G T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 56238469 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56238486 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56242578 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 56242602 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 56242679 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56243013 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56243309 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56243604 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 56244184 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56244282 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56244287 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 56244672 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56245424 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56245494 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56245593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56245761 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 56245832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56245992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56246151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56246220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56246482 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56246823 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56246907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56247020 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56247485 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 56247504 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 56247516 C G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 56247753 T C Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 56248184 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 56248336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56248721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56248815 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 56248996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56249129 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56249415 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56249416 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56249446 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 56249769 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56249780 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56249850 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56249862 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56249934 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56249939 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56249945 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56249965 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56249973 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56249990 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56250035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56250039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56250058 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 56250086 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56250115 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56250127 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56250268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56250320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56250332 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56250402 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56250414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56250529 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56250533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56250583 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56250763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56250811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56251032 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56251044 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56251045 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 56251063 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 56251107 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56251175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56251226 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56251333 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 56251479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56251752 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 56251924 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56252361 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56252448 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56252473 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56252541 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56252590 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56252652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56252655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56252712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56252753 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56252905 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56252915 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56253029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56253139 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56253142 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 56253162 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 56253176 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56253270 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56253292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56253377 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 56253394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56253470 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56253477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56253491 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56253664 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56253693 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56253780 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56253852 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56253892 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56254028 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56254038 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56254190 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 56254195 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56254312 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56254319 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56254581 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56255556 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 56256107 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56256222 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 56256519 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 56256555 G C N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 56257128 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56257576 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56257845 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56257900 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 56258072 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56258531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56258895 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 56259595 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56259743 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 56260010 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 56260599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56261173 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56261590 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56262283 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56264838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56266002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56266577 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56266612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56269075 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 56270060 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56270811 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56273945 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56277057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56277730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56277796 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56279389 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56280542 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56281990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56282196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56282361 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56282582 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56283331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56285881 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56285885 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56285894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56288389 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 56290759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56291398 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 56291997 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 56292122 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 56292273 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 56295210 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56295943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56297151 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56297580 A G N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 56300041 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56301638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56301850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56301962 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56302222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56302385 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 56304012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56304977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56307172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56307331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56307997 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56308845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56309337 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56309390 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 56309403 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 56309597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56309835 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 56310523 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 56311308 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56311658 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 56312476 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 56312667 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 56313793 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 56314225 T A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 56315089 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 56316312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56317356 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56324802 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56324956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56325764 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 56326117 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 56326319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56326320 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56326579 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56326991 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56327313 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 56327862 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 56327958 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56328126 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 56328467 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56328513 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 56328765 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 56328963 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56329104 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 56329825 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 56329857 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 56329869 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 56329997 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56330417 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 56330570 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 56330610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56330716 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 56330808 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 56331351 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 56332269 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 56332656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56333200 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 56333439 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 56333685 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 56334339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56334526 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56335192 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56335263 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56335335 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 56336040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56336156 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56337562 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 56337813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56337872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56338002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56338064 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 56338273 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 56338274 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56338588 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56338887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56340064 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56341049 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56341051 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56342395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56342789 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 56343109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56344238 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56344681 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 56344857 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56344951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56345178 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 56345302 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56345393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56345506 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 56345774 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 56346293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56346964 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56348737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56350374 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 56351680 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56352130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56352307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56357907 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 56359392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56361548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56361641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56361714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56363252 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56369633 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56370517 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 56376548 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56377283 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56377868 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56378200 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 56379011 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 56379036 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 56379143 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 56379155 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 56379200 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 56379214 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 56379247 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 56379409 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 56379454 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 56380988 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 56382695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56382965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56384089 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 56386520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56388502 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56388503 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56389700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56390146 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 56390169 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 56391649 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56391674 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56391853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56392042 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56392798 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 56392799 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 56392816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56392821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56393529 C T N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 56393628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56393760 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 56394071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56394206 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 56394534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56394571 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 56394789 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 56394815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56394816 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 56395635 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 56395793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56395946 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 56396303 C G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 56398204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56398968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56399004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56399571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56399872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56400252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56401413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56401765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56401901 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56402395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56403683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56405126 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56405127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56407214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56407483 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 56408122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56408416 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56409433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56410396 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 56411504 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56412378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56412840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56413139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56413404 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56413561 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56413771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56414095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56414112 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56414703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56414993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56417647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56417724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56418293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56418374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56419693 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56419948 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56420223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56420941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56421119 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56421454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56421778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56421866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56423062 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56423087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56424379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56424447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56424536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56424570 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56424621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56426411 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56426704 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56427972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56428827 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56430396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56431594 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 56431965 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 56432074 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 56432106 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 56432269 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 56432313 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 56432476 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56432535 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 56432922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56434346 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56436290 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 56436640 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56437770 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 56440425 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 56441560 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 56441795 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56441961 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56442820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56444127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56445196 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 56445207 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56445259 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56445379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56446129 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56446413 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 56446434 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 56447748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56448040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56448596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56450265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56450335 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56450421 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56450946 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 56452684 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56452792 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56454394 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56454997 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56455211 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 56457552 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56458059 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56458171 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56458261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56458318 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56458689 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56458782 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56459143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56460217 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56461400 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56463152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56463242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56463419 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 56463600 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56463669 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 56464704 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56465005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56465338 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 56465773 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56466100 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56466505 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56467165 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 56467170 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56467355 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56467415 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 56467431 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56467549 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 56467559 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 56467798 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56468408 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56469157 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56469366 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56469605 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56470171 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56470522 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56470712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56470857 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 56471389 C A Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 56471391 T G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 56471879 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56472007 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 56472035 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56472084 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56472138 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56472346 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56472347 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56472365 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56472437 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56472616 G C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 56473497 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56473518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56473532 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56473615 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56473643 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 56473834 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56474044 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56474098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56474524 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56475097 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 56475828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56475899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56476056 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 56476177 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56476253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56476767 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56477731 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56478602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56478939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56479121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56479476 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 56479774 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 56480361 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56481145 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 56481207 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56481237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56481817 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56481993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56482607 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 56483355 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56483434 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 56483709 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 56483714 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 56483731 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56483796 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56483835 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 56483976 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 56484129 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 56484251 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 56484289 T A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 56484365 G C N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 56484391 T G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 56484485 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 56484490 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 56484590 A G Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 56484745 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56484819 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 56484889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56484963 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 56484987 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56485225 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 56485262 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 56485263 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 56485298 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 56485332 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56485334 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 56485411 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 56485439 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 56485456 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56485599 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 56485669 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 56485852 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 56485857 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 56486097 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56486168 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 56486244 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56486341 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 56486387 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56486436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56486486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56486489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56486630 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 56486699 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56487907 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 56488404 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56489895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56490018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56490247 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56490989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56491217 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56491654 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56492081 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56492549 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56492970 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56493235 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56493635 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 56493674 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56494033 C T Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 56494158 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 56494315 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56494670 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56494703 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56496287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56496345 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56496521 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 56496659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56496839 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56496938 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 56497019 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56497025 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56497085 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 56497273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56497305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56497418 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 56497596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56497868 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 56497899 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 56498097 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56498124 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56498172 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 56498488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56498494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56498511 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56498538 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56498680 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 56498768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56498792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56498869 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 56498884 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 56499126 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56499147 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 56499262 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 56499312 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 56500107 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 56500559 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56500651 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56500912 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56501142 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 56501760 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 56501824 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 56502166 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 56503006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56503220 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 56503233 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 56503324 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 56503549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56503704 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 56503737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56504023 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 56504081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56504168 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 56504357 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 56504427 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 56504618 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 56504658 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 56505209 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 56505293 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 56505357 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 56505557 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 56505577 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 56505797 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 56505912 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 56505928 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56506003 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 56506326 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 56506489 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 56506670 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56506844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56507357 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 56507388 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 56507453 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 56507596 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 56507609 C T Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 56507761 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 56507785 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56507877 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56508005 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56508067 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 56508301 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 56508355 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 56508387 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 56508403 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 56508456 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 56509357 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 2 56509384 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 56509385 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 56509868 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56509877 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56510131 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56510469 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 56510769 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 56510800 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 56511244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56511298 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56511363 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56511978 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 56511986 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56511997 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56512112 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56512289 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 56512467 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56512481 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 56512665 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 56512781 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 56513266 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 56513413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56513494 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56513520 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 56513521 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 56513675 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56513948 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56515550 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56515561 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56515578 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56515627 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56515664 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56515889 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56516056 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56516108 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 2 56516158 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56516933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56517587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56518264 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 56518268 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 56518374 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 56518614 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 2 56518900 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56519303 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56519963 A C Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 2 56520246 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 56520604 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 56520767 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56520883 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 56522748 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 56522943 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56523120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56523146 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 56523329 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 56523864 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 56524120 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 56524269 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56524283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56524433 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 56524508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56525772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56527032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56527844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56527922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56527972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56528389 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 56529351 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 56529358 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 56529457 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 56529792 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 56529911 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 56529998 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 56530032 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 56530061 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 56530294 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56530384 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 56530499 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 56530763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56531135 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 56531142 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 56531643 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 56531767 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 56531816 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 56531923 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 56531926 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 56531943 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56532010 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 56532101 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 56532132 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 56532158 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56532359 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 56532748 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56532762 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 56533951 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56534492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56535197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56535283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56536609 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56536830 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56537104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56538071 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 56538694 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56538773 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56538978 T A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 56539152 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56539197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56539392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56539541 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 56540301 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56540842 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56542454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56542809 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56543287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56543416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56543617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56543710 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56543727 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56544189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56544262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56544399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56544449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56544557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56544685 G C Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 56544688 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 2 56544780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56544862 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56544882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56544921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56544985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56545257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56545697 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 56545820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56545948 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56545956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56546299 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56546407 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56546725 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56546840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56547108 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56547212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56547230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56547459 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56547508 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56547519 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56547545 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 56547552 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 56547597 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56547818 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 56547843 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 56548031 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 56548054 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 56548288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56548372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56548425 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56548687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56548900 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56549023 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56549242 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56549287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56549432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56549465 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 56549531 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 56549711 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 56550351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56550374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56550408 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 56550513 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56550561 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56550630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56550634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56550641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56550659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56550793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56550916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56550993 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56551015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56551030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56551135 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56551178 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 56551283 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56551309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56551403 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56551516 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56551691 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56551876 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56551941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56551968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56552015 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56552217 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 56552239 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 56552680 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 56552762 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56553552 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56553692 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 56553938 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56553945 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56554052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56554104 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56554157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56554203 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 56554488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56555001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56555201 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 56555286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56555309 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56555608 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 56556370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56556785 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56556966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56557267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56557617 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56557893 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56558458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56559834 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56560271 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 56563173 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 56563226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56564237 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56564653 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 56564753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56565020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56565022 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 56565237 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 56565573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56565905 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56565944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56566090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56566271 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 56566364 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56566619 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56566769 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 56567171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56567765 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56568007 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 56568083 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 56568119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56568282 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 56568368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56568680 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56569057 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56569314 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 56570779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56571782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56571834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56571961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56572095 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56572685 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56572751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56572835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56573060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56573369 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 56573386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56573438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56573610 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56573774 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56573841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56573867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56573972 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 56574059 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56574418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56574428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56574473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56574689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56574701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56574726 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56575167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56575382 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56575713 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 56575964 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 56576057 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 56577514 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56577540 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56578483 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 56579006 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 56579763 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 56580161 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 56583046 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 56583101 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56584605 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56585132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56586640 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56586910 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56587249 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56587467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56588520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56588587 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 56588639 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 56588803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56589047 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56589800 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 56590649 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 56593613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56593774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56594348 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 56594438 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 56594687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56594692 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56594732 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 56595220 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 56595408 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 56595470 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 56595489 G C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 56595817 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 56595988 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 56596058 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56596084 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 56596133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56596142 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56596324 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 56596394 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 56596662 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 56596749 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 56596808 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56596813 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56596879 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56596906 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 56597021 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56597034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56597059 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56597108 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56597110 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56597163 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56597169 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56597258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56597280 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56597378 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 56597497 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 56597500 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56597672 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56597687 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 56597876 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56597924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56597926 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 56598067 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56598087 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56598125 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 56598286 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56598289 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56598338 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56598435 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 56598448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56598455 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 56598483 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56598514 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 56598578 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56598630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56598660 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56599003 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56599061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56599086 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 56599288 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 56599500 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 56599511 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 56599554 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 56599600 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56599621 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56599644 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56599804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56599871 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56599881 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 56600231 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 56600324 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56600909 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56601006 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56601253 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 56601479 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 56601672 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 56601941 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56601974 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56602315 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56603337 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 56603393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56603835 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56603951 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56604278 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56604284 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56604300 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56604383 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56604633 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 56604783 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 56604793 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 56605329 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56605492 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 56605635 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 56605653 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 56605673 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 56605834 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 56606157 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56606426 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 56606905 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 56607034 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56607317 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 56607377 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 56607401 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 56607442 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 56608101 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 56608190 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 56608214 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56608356 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 56608531 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56608819 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 56609186 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 56609201 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56609287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56609310 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 56609339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56609621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56609627 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 56609665 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 56609671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56609736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56609910 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 56611316 C A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 56611659 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 56612656 G A N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 2 56612958 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 56613026 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 56613990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56617767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56617820 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 56618693 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 56618697 C G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 56623159 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 56624357 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 56626446 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 56626589 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 56626653 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 56626911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56629247 T G Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 56629390 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 56629511 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 56629632 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 56629643 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 56629944 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 56630032 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 56630080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56630185 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 56630191 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 56630200 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 56630245 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 56630307 C G Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 56630396 G A Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 2 56630597 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 56630640 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 56631056 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56631067 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 56631110 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56631586 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56631715 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 56631840 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 56632110 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56632387 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 56632611 A C N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 2 56632895 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 56632919 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 56633005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56633293 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56633516 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56633545 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 56633665 C G N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 56633800 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 56633846 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 56633970 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 56634008 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 56634180 T C N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 56634229 A G N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 56634231 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 56634305 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 56634400 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56634489 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56634527 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 56634652 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 56634674 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 56634683 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56634800 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 56634812 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 56634889 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 56635040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56636326 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56636421 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56636679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56636849 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 56637010 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56637317 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56638045 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 56638078 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 56638754 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 56638933 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56639029 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56639373 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 56639376 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 56639589 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56640026 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 56640092 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 56640149 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 56640700 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56641158 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56644563 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56644821 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56653810 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56656135 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 56656622 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56656740 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56656855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56658539 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56660241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56662212 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 56662220 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 56662816 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 56663562 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56663609 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56663776 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56663867 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 56664320 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 56665760 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56665765 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56665917 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56666065 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 56669512 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56670889 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56671925 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56672781 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 56675037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56675079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56678048 G A Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 56679008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56680851 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56681188 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 56682249 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56682339 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56682560 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56682630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56684674 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56685416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56685448 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56686318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56686736 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56688084 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 56688282 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56688577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56688703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56690085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56691553 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 56691865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56699127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56699410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56699887 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 56700057 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56700101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56700362 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 56700588 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56700949 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56701545 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 56701616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56701778 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56702980 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 56703433 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 56703505 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56703611 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56704118 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56704172 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56704357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56704370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56704465 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 56707949 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 56708483 C A Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 56708978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56708992 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56709523 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56710131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56710410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56711292 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 56711812 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56711883 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56711906 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56712305 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56712323 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56712357 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56713066 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56713258 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 56713281 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 56713477 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 56713780 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56713829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56713942 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56714004 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56714028 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56714078 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 56714177 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 56714257 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56714268 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56714604 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 56714638 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 56714666 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 56714717 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56714809 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 56715334 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 56715603 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 56715831 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56716108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56716328 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 56716611 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 56716914 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 56716932 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 56716994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56717440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56717769 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 56718406 A T Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 56718429 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 56718525 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56718562 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 56719012 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 56719338 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 56719339 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 56719461 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 56719539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56719825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56720355 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 56720568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56720861 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 56721175 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 56721300 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56721510 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 56721650 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56721651 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 56721826 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 56722018 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 56722192 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 56722322 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 56722382 C G Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 56722524 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 56722821 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56723352 A T Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 56723534 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 56723761 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 56724211 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 56724302 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56724371 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 56724530 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 56724737 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 56724841 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56725061 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 56725114 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56732557 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 56732572 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 56732620 G T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 56732826 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 56733039 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 56733046 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 56733053 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 56733065 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 56733141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56733199 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56733663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56733773 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 56733843 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56733868 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56735244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56735274 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 56735394 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56735446 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56735549 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56735621 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56735682 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56735686 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56735711 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56735712 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56735724 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56735795 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56735858 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56735954 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56735975 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56736082 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 56736167 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 56736453 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 56736526 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56736549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56736584 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 56737178 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56737196 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56737211 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56737223 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56737252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56737451 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 56737468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56737665 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 56737667 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 56737707 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 56737919 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 56738319 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 56738916 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 56739102 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56739114 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56740104 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 56740651 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 56741136 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56742140 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56742333 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 56742415 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56743081 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 56743559 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 56744202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56744209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56745916 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 56746234 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56746970 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 56747475 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 56747898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56748672 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 56749109 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 56749257 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 56749279 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56750534 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 56750819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56751253 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 56752080 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 56752618 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56752951 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 56753005 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 56753061 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 56753068 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 56753330 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56754079 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56754259 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56754278 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56755379 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 56755462 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 56755654 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 56755821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56756416 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56756821 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56756848 G T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 56756951 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56757664 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56757853 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56759326 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 56759331 T G Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 56759975 T G Y N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 56760656 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56762277 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 56762888 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 56763191 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56763789 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 56764014 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 56764228 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 56764358 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56764490 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56764703 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 56764921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56765646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56765742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56766210 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 56766500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56766610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56766897 G A Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 56767366 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56767529 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 56767532 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56767587 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 56767657 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56767688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56767754 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 56767765 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 56767787 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56767804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56768315 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56768598 G C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 56768662 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56769175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56769573 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56769800 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56769958 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 56770449 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 56770450 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 56770676 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 56770735 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56770954 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56771127 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56771148 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 56771235 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56771264 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56771438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56771602 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 56771654 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 56771659 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 56772042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56772254 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 56772790 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56773520 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 56774098 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 56774184 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 56774262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56774388 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 56774557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56774602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56774718 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 56776213 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56777622 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56778658 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56778921 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 56779178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56779791 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 56780512 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 56780607 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 56780776 A T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 56780977 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 56781196 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 56781300 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 56781517 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 56782606 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 56782693 C A Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 56782696 C A Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 56783113 T A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 56783364 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 56783406 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56783525 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56783802 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 56783818 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 56783865 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56785665 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 56786559 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 56786689 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 56787660 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 56788513 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 56788589 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56789191 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 56789208 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 56789429 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 56789447 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56789523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56790230 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56790635 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56790937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56792516 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56799418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56800405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56800571 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 56800870 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56801529 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56801950 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56802520 T A Y N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 56802825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56803351 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 56803418 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 56805013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56805102 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56805882 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56807204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56807815 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56810171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56810274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56810304 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 56810554 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 56810970 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 56811019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56811468 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56813054 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56813644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56813717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56814832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56815275 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56817116 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56817307 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 56818792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56819266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56819375 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56819775 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56820386 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 56820505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56820580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56821219 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56821341 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56821823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56822926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56823322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56823584 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 56824376 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 56825105 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 56825190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56825527 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56826492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56827218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56827525 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56827554 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56827690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56827827 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 56828110 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 56828708 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56828727 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56829011 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 56829282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56829462 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 56829524 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56829755 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 56829844 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56829920 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 56829928 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 56829936 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 56829943 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 56829966 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 56830246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56830375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56830486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56831176 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 56831406 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56831932 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 56832168 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56832834 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 56833279 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56833348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56833462 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 56833819 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56833873 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 56833956 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 56834235 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56834277 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56834278 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56834346 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56834838 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56834840 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56834985 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56835005 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 56835244 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 56835540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56835620 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56835648 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 56835757 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56835938 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 56837618 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56840146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56843177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56843415 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56843589 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56843714 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 56845556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56845954 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56847933 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 2 56847946 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 56850160 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56850431 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 56851694 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56853126 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 56853188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56853801 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 56855145 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56856562 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56856716 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56859257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56860196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56860700 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56860858 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 56861036 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56861168 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 56861205 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 56861585 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 56863029 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 56863263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56863323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56863335 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 56863457 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 56863475 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 56864095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56864181 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 56864847 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 56864868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56865091 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 56865122 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 56865140 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56865263 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56865454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56865935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56865966 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 56865977 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 56866330 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56866517 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56866571 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56866653 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56866745 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 56866753 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 56866806 G A Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 56866866 C A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 56866926 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56866955 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56866957 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56867073 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56867218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56867231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56867325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56867387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56867693 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 56867918 G C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 56868211 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56868259 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 56868274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56868285 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56868302 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56868328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56868380 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56868685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56868787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56869024 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56869576 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56869590 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 56869621 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56869857 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56869923 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56870117 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 56870591 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56870619 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 56870722 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 56870797 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 56870800 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 56870814 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56870855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56870953 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56871017 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 56871044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56871057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56871348 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56871379 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 56871437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56871445 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 56871666 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 56871695 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 56871728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56871815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56872061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56872394 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 56879095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56879213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56879311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56879437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56879495 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 56879548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56879566 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 56879663 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56879679 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 56879720 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 56879858 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 56879891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56879964 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56880013 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56880025 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56880102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56880138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56880245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56880523 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56880726 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 56880920 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 56881075 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 56881271 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 56881364 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 56881385 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 56881406 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 56881411 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56881450 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 56881482 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56881497 C G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 56881568 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 56881600 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 56881713 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 56881790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56881829 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 56881866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56882055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56882440 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 56882688 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 56882708 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 56882731 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 56882818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56882857 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 56882967 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 56882992 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 56883059 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 56883150 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 56883276 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 56883333 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 56883376 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 56883450 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 56883458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56883517 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56883677 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 56883721 G A Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 56883735 A C Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 2 56883793 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 56883886 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56883899 A G Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 56883958 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 56884142 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 56884172 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 56884255 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56884323 A T Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 56884388 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 56884924 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 56885609 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 56885786 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 56888036 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56888069 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56888184 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56889129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56889173 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56889211 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56889536 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 56889604 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 56889637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56889757 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56889776 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 56889961 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56889963 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56892089 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 56892092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56893081 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56893270 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56893480 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56893496 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 56893584 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56893745 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 56894011 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56894412 C G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 56894816 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 56894925 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 56895162 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 56895193 G C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 56895220 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56895274 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 56895284 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56895295 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 56895307 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 56895322 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 56895460 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56895548 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 56895601 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 56895653 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56895659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56895689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56895772 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56896001 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 56896012 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 56896529 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 56896721 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56896763 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56896833 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56897036 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56897049 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56897088 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56897106 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56897364 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 56897397 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 56897540 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 56897589 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 56897626 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 56897638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56897716 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56897730 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56897744 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56897783 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56897823 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 56897867 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56897885 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56897993 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56898020 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56898025 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56898069 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56898086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56898139 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 56898151 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 56898184 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 56898233 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 56898403 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56898622 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56898799 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 56898863 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56899000 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56899009 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56899042 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56899095 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 56899132 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 56899288 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 56899369 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 56900106 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 56900115 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 56900186 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56900556 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 56900593 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 56900659 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 56900695 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 56900732 C A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 2 56900790 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 56901247 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 56901336 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 56901367 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56901403 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 56901469 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 56901524 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 56901752 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 56902052 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56902156 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 56902214 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 56902376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56902414 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 56902433 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 56902445 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 56902453 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 56902696 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 56902705 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 56902865 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 56902895 G C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 2 56902944 T A N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 56903016 G C N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 56903074 A T N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 2 56903109 G A N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 2 56903116 C T N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 2 56903176 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 2 56903211 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56903235 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 2 56903569 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 56903722 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 56904078 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 56904164 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 56904393 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 56904487 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 56904580 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 56904709 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56904786 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56904804 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 56904920 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56905283 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 56905416 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56905422 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56905429 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56905439 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56905924 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 56906194 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56906223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56906820 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56906895 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 56906914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56907327 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 56907809 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 56908368 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 56908500 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 56908647 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 56909858 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 56909914 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 56910033 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56910061 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 56911410 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 56911693 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56911714 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 56911751 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 56912281 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 56912383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56912658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56912681 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 56912842 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 56912947 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 56913118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56913815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56913841 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 56914401 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 56914453 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56914888 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 56914931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56914948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56915414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56916251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56916568 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56917483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56917568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56918538 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56920012 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56921404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56922018 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56922409 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 56922630 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 56922712 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56922727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56923181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56924110 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 56925289 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56925442 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 56928990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56929010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56929054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56929210 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56929291 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56929373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56929443 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56929526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56929942 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56930177 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 56930604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56930630 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56930800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56930900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56930973 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56930998 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56931129 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56931135 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56931292 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56931304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56931465 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56931658 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56931691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56931804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56931844 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56931878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56932016 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56932094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56932104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56932111 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56932329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56932414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56932770 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56932825 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56932851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56932853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56932870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56932907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56935404 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56936672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56938612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56938884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56939888 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56940155 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56943128 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 56943255 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 56943500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56946035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56948856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56950058 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 56952663 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 56953468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56953567 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 56953882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56954481 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 56954532 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56954748 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56954989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56957450 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 56957867 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 56958310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56958723 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 56959456 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 56960462 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 56961992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56962402 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56966484 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56968863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56971440 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 56972134 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56973372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56973615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56973760 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 56973769 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56974232 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56974266 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56974353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56975634 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 56975993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56977641 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 56980676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56984137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56984794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56985525 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 56986591 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 56987147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56987215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56987236 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 56987798 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 56988087 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 56988113 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 56988154 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 56988496 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 56988555 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 56988666 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 56990229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56990298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56992167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56993928 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56994090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56996436 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 56997054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56998923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 56999084 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56999718 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 56999833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57002620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57002767 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57004436 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57009672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57011862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57012287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57012701 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 57012738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57014812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57015379 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57015899 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57017511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57026089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57026206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57027086 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 57028933 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57034183 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 57034298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57034379 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 57034394 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 57034921 A C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 57034953 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 2 57035646 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 57035973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57036089 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57036311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57036340 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 57036388 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 57036462 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 57040938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57042221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57042287 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 57042541 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57042868 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 57042954 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57043030 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57043031 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57043128 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57043136 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57043170 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57043194 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57043213 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57043223 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57043296 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57043349 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57043360 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57043642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57043683 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57043702 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 57043721 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 57045193 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 57045526 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 57045712 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 57045774 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 57045873 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 57045944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57045974 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57046847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57047505 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57047887 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 57048155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57048827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57049303 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57049423 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 57049463 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57050219 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57050364 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57050524 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 57050703 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57051071 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57051306 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57051431 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 57051581 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57051733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57051804 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 57051860 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 57051887 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 57051940 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57052310 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 57052500 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57052604 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 57052620 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 57052634 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 57052709 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57052710 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57052753 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57052810 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57052917 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57053036 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 57053066 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 57053141 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57053280 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 57053426 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 57053561 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 2 57054130 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 57054152 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 57054215 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57054260 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57054269 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 57054452 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57054508 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57054554 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57054560 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57054566 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57054626 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 57054629 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 57054650 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57054678 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57054702 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57054728 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 57054729 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 57054759 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57054768 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57054774 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57055078 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57055139 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 57055167 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 57055245 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57055735 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 57055836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57056102 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57056544 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57057148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57057354 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 57057729 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 57058063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57058350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57058766 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 57059058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57059067 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57059274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57059296 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57059689 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57059746 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57060337 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57063406 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 57063678 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 57063909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57063927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57064101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57064276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57065260 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 57065618 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57065737 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 57066443 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57066639 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 57066768 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 57066792 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 57076222 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 57076567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57076680 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57076714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57076785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57076810 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 57076819 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57076875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57076919 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57076944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57076955 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57077095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57077125 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 57077256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57077617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57077760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57078123 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 57078139 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57078203 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 57078828 A T N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 57078894 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 57079358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57079470 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 57079557 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57080545 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57080601 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 57080635 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 57080755 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 57080772 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57080785 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 57080799 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 57080802 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 57080819 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57080859 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57080921 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 57081000 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57081216 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 57081222 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57081242 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 57081252 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 57081366 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57081389 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57081471 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57083257 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57085169 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57085445 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57085502 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 57085793 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 57086778 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57086885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57086896 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57087078 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 57087118 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 57087474 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57087527 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57088170 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 57088186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57088274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57088320 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 57088724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57088752 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 57088762 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 57088763 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 57089171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57089210 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57089238 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 57089241 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 57089286 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 57089554 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 57089975 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 57090001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57090344 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 57090748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57091276 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57091415 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57091604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57091698 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57091770 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57091788 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57091952 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57091985 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57092055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57092348 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57092384 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 57092554 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 57092561 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 57092765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57092808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57092980 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57093157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57093255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57093296 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57093323 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57093401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57093444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57093448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57093548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57093740 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57093748 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57093905 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57093943 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57094061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57094084 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57094106 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57094222 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 57094452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57095300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57095862 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57095901 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 57096399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57096576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57100736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57101403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57102082 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57104774 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57104962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57107509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57107802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57107865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57110787 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57110810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57111592 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 57111632 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 57111788 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 57112096 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 57112464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57112487 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 57112704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57112825 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 57113142 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57113377 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 57113434 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 57113524 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57113971 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 57114032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57115002 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 57115898 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57117299 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57117304 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57119379 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57120303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57120468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57121108 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57122237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57122509 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57122674 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 57122812 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 57122817 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 57122837 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 57123090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57123282 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57123530 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57123662 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 57123668 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 57123711 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 57123736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57123792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57123983 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 57124054 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 57124060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57124194 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 57124313 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 57124347 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 57124357 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 57124378 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 57124397 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57124542 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 57124576 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 57124589 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 57124735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57124784 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 57124926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57124951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57125014 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 57125058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57125145 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57125261 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57125286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57125368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57125373 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57125384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57125482 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57125503 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57125522 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57125974 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57125977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57126656 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 57126672 C T Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 57126845 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 57127092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57127129 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 57127318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57127334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57127742 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57127770 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 57127835 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 57128068 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57128077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57128084 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57128190 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57128335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57129557 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57129771 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57131841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57131854 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 57131933 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 57131946 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 57131974 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 57132004 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 57132009 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 57132068 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 57132084 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 57132117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57132198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57132451 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57132686 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57132877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57133139 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 57133445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57133513 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57133536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57133542 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57133570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57134385 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57134423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57135201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57135749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57136198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57137101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57137148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57137576 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 2 57137952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57138234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57138489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57139282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57140181 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 57141733 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 57143372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57143395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57144026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57147842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57148265 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57148691 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 57148716 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 57148731 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 57149091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57150010 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 57150058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57152730 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 57152889 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 57153925 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57154264 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57155888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57156515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57157532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57157609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57157732 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 57158540 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 57159141 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57159299 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 57159629 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57161537 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 57161664 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 57161742 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 57161766 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 57161809 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 57162421 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57163618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57163787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57164389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57164390 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57164405 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 57165319 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57165359 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57165430 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 57165450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57167489 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57167542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57167607 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 57167673 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 57167744 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 57168051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57168292 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 57168324 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57168499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57168535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57168690 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57168739 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 57168761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57168915 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57169204 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57169481 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 57169642 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 57169729 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 57169960 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57170342 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 57170372 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 57170382 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 57170431 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57170432 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 57170718 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 57171037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57171684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57172526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57172611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57173266 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57174951 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57175081 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57175479 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57176962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57181257 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57187226 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 57188646 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57190841 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57190844 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57190879 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57192155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57193891 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 57194086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57194941 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 57197510 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 57197522 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 57197523 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 57198418 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57199178 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 57199705 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 57199710 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 57199774 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 57200029 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 57200062 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 57200073 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57200140 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 57200372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57201097 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 57201112 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 57201119 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 57201155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57201316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57201600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57201834 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 57201926 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 57202248 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 57203064 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 57203170 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 57203530 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 57203531 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 57203845 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 57203949 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 57203950 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 57203992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57204004 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57204028 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57204122 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 57204171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57204386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57204403 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 57204458 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 57205100 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57205154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57205302 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57205471 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 57206158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57206481 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57206575 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 57206597 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 57206639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57206684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57206920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57206984 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57207228 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57207271 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57207445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57207866 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 57208715 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57208855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57208872 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 57208971 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 57209242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57209375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57209499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57209561 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 57209842 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 57209883 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 57209889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57209916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57209929 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 57210045 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 57210587 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 57210616 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 57210676 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57210800 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 57210821 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 57211077 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 57211144 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 57211251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57211320 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 57211332 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 57211835 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 57211865 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 57211880 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 57211881 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 57212025 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 57212182 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 57212333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57212637 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 57212661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57212680 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 57212786 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 57212798 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 57212821 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 57212894 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 57213023 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57213093 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57213118 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57213122 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 57213169 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 57213340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57213736 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 57213853 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 57214055 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 57214341 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57214459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57214676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57214809 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57215308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57216210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57216679 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 57216767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57216817 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 57216851 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 57217430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57217539 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 57218341 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57218604 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 57218828 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 57218881 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 57218907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57219008 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57219010 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 57219349 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 57220336 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 57220838 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 57221014 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 57221142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57221153 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57221516 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57222997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57228520 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57228641 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57229317 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 57231498 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57231688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57232100 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 57232344 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 57232581 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 57232964 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 57233686 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57233688 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 57233759 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 57233779 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57233981 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 57234181 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 57234198 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 57234263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57234495 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 57234556 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 57234614 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 57234923 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 57235098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57235198 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 57235240 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 57235253 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 57237878 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57238060 A G N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 57238161 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 57238217 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 57238225 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 57238230 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 57238261 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 57238279 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 57238372 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 57238403 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 57239048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57239417 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 57240478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57240731 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 57242137 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57242553 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 57244462 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57244644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57245053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57245244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57245743 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 57246878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57247166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57247608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57248548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57248642 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 57249033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57249062 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 57249388 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 57249950 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 57250532 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 57250789 G C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 57251086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57251208 C A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 57251279 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 57251902 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57252250 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 57252276 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 57252362 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 57253058 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 57253435 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 57253511 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 57253632 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 57253636 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57254852 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 57254956 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57259411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57263320 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 57266067 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57266861 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 57267011 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57267505 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57267976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57269116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57269150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57269231 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57269720 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 57269831 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 2 57272748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57273796 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 57273976 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 57274123 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 57274149 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 57274222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57274934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57275243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57275244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57275809 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57275976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57276835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57277072 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57277077 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57277308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57277593 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57277604 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57277642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57277721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57277758 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57277761 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57277772 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57277805 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57277846 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57277946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57278095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57278148 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57278189 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 57278869 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57279131 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 57279192 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 57279224 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 57279433 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57279480 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 57279481 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 57279513 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57279631 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 57279652 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 57279680 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 57279691 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 57279878 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57279890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57279906 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57280041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57280098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57280166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57280174 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57280281 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57280332 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57280336 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57280577 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57280804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57280928 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57280991 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 57281111 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57281115 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57281524 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57281779 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 57281926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57282192 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 57284390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57284423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57284539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57284576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57285015 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57285531 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57285590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57285715 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57285865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57285946 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57286271 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57286464 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57286503 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57286569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57287263 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57287410 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 57287411 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 57287469 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57287496 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57287547 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57287566 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57287757 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57287762 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57287787 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57287853 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57288302 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57288333 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57288817 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57288972 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 57288986 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 57290376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57290536 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 57291990 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57292522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57292615 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57292704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57292806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57293427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57293460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57293520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57294914 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57296750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57299674 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57299713 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57299910 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57300687 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57300732 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 57301181 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 57301443 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57301505 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57301557 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57301658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57302268 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57302284 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57302627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57302759 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57302760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57302801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57302810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57303162 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57303167 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57303384 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57303891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57304034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57304113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57304480 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57305864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57307372 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 57308194 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57309941 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57311412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57311597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57311629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57314227 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57316746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57319840 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 57321626 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57321754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57322882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57323020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57323293 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57324319 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57324909 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57324933 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57325437 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57325470 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57325628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57326573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57327089 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 57327271 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 57327455 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 57327950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57328317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57328350 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57328450 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57328583 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57328681 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 57328955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57329382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57329710 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57329783 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 57329833 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 57329845 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 57331165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57331407 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57331476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57331570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57331825 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57332611 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57332905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57332935 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57332961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57333042 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 57333125 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57334075 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57334100 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57334123 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57334139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57335078 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57335428 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57335649 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 57335712 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 57336185 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 57336562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57337230 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57338263 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57341229 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57343917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57344303 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57344578 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 57346342 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57346431 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57346897 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57348123 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57348283 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 57348541 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57349555 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57349588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57350055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57350303 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57350571 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 57350600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57351546 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57351762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57351956 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57351958 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57352050 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 57352088 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 57352435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57352461 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57352583 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57352619 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57352644 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57352823 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 57353107 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57353170 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57353231 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57356833 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57356908 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57357073 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57357077 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57357138 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 57357139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57357395 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57357420 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57357451 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57357476 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57357681 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57357741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57357751 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57357822 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57357828 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57357893 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57357951 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57357962 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57358013 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57358015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57358035 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 57358229 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 57358361 C A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 57358711 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57359244 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57360238 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57360634 G T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 57360952 T A Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 57360954 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 57361736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57362082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57362940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57363019 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57363094 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 57363137 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 57363311 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 57363540 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 57363560 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 57363761 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57364049 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 57364183 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57364276 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 57364784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57364852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57365396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57365690 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57365835 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57365837 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57365861 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57366073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57366221 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57366297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57366459 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 57367309 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57367410 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57367618 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 57368227 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57369763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57371465 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57372950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57374236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57374694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57374893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57374997 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57375852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57377780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57379933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57380430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57380879 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57381246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57381339 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57381592 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 57381792 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 57382272 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 57383752 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57384117 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57384125 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57384140 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57384377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57384666 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57385043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57385271 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57385762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57385862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57386091 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57386343 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 57387358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57387523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57388157 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57388757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57389387 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 57390035 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57390273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57390287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57390329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57390425 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57391033 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57391413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57391429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57392019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57392123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57392137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57392307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57392766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57392812 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57393229 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57393271 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 57393300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57393897 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 57397154 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57397302 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57397443 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 57398505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57398610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57398774 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57399022 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57399038 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 57399166 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57399951 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 57400176 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57400387 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 57400555 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57401999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57402422 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 57403358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57403673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57404216 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 57404825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57404980 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57413383 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57414428 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57414485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57414549 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57415720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57415976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57416414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57416962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57417094 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 57417421 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 57419020 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57419784 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57420813 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 57424516 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 57428703 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57428729 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57429470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57429494 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57429596 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57429611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57429701 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57430134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57430141 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57430305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57430403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57430559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57432555 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57433107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57433259 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57433921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57433940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57434678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57435977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57436266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57436638 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 57436831 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57437549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57440969 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 57441076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57443415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57443909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57447163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57448989 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57449703 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 57453054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57453428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57453500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57454306 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57455419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57455457 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57457496 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57457774 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57458379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57458789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57460541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57460774 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57461372 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 57461545 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57462198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57464642 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57464791 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 57464986 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 57465773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57468689 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57469054 A C Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 57469069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57470162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57470273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57470301 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57470336 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57470430 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57470792 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 57470914 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 57471137 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 57471162 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57471193 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57471212 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57471362 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57471425 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 57471455 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57471482 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57471572 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57471704 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57471744 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57471807 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57471848 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57472214 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57472241 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57472242 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57472273 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57472321 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57472406 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57474804 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 57475474 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57475713 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57477184 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57477210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57477344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57477362 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57477425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57479921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57481096 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57481390 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57487776 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 57489182 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57489950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57490727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57490955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57492535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57493941 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57494428 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57494471 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57495793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57496669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57496755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57496772 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57496774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57496942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57497447 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57497769 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57498363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57500214 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 57500894 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57502543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57502734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57502888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57502965 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57503695 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57504161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57505055 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57509014 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57509315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57510490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57511264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57511928 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 57511995 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57512229 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 57512265 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 57512453 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57512630 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 57512893 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57512980 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57512994 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57513035 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57513100 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57513131 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 57513183 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57513532 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57513552 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57513772 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57513850 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57514445 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57514461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57514508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57514667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57514776 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57514816 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57515171 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57515317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57515497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57515615 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57515659 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57515680 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57515882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57516119 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57516288 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 57516362 T A Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 57516500 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57516681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57516911 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 57517232 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 57517308 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 57517317 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 57517414 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 57517446 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57517452 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 57517653 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57518003 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57518353 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57518361 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57518455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57518492 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57518589 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 57518597 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57518652 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 57518660 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 57518920 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57518981 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 57519024 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57519051 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 57519399 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 57519477 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57519515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57519555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57519628 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57519725 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57520096 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 57520557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57521304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57521320 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57521531 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57521740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57521958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57521975 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 57522004 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57522043 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57522333 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57522334 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57522407 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57522555 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57523037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57523431 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 57523731 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57523739 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57523861 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57523958 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57524973 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57525214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57525540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57526658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57526685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57526819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57526991 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57527474 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57527962 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 57528195 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 57528239 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57528386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57528406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57528521 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57528558 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57528584 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57528585 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57528656 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57528989 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 57529197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57529426 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57529517 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 57529577 C A N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 57529610 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 57529626 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 57529703 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 57530074 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57530107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57530217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57530653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57530693 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57530714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57530930 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57530997 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57531025 T G Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 57531073 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 57531141 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57531183 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57531213 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 57531311 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57531313 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57531658 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57532177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57532567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57532574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57532795 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 57533422 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57533487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57533550 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57533624 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 57533801 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57533985 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57534087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57534213 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57534265 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57534344 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57534402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57535067 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57535487 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57535578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57535625 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57535643 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 57536045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57536297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57536513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57536624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57536701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57536722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57536744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57536752 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57536758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57536772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57536922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57536950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537105 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537282 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57537349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57537400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57537629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537891 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57537962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57538015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57538038 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57538059 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57538275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57538280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57538298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57538308 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57538346 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 57538410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57538452 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57538532 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57538538 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 57538893 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 57539292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57540043 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 57540056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57540131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57540778 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57541303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57541477 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57541704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57542414 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 57542671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57542778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57542952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57543472 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57543586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57543808 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57543875 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57544000 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 57544106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57544600 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57544714 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 57544786 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 57544814 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 57544824 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 57547238 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57547365 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57548197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57550028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57550401 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57551780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57553066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57555499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57557274 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 57557362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57557645 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57558128 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57558154 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 57559166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57561183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57561639 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57561750 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57561809 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57561814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57562166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57562172 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57563343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57564066 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57564815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57565749 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57567502 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57569014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57569094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57569733 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57569995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57570601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57570657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57571086 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57571152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57571392 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57571445 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57572195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57573606 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 57573684 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57574085 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57576700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57577565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57577693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57578076 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 57578425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57581701 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57582088 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57582449 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57582924 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 57585903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57586609 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57587973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57589536 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57589921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57590248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57592323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57592893 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57593292 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57593308 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 57593628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57593652 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57594423 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57595088 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 57595997 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 57596628 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57596823 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57597220 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 57597313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57598292 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57599370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57599590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57600417 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57600572 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57601074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57601221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57601935 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57602562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57602778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57604429 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57604696 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57605037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57605453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57605967 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57606310 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57606354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57606717 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 57607274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57607575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57607980 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 57609007 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57609425 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57609546 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 57611262 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57611328 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57611348 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 57611595 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57612504 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57614332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57616947 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 57617037 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 57617066 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 57617288 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 57617462 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 57617478 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 57617574 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 57617630 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 57617657 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 57618076 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 57618176 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 57618320 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 57618420 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 57618464 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 57618679 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 57618689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57618697 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 57619134 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57619146 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57619240 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57619274 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57619557 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57619774 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 57619793 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 57620117 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 57620201 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 57620271 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 57620588 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57620646 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57620816 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57621118 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57621166 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57621223 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57621294 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 57621418 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 57621827 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57621860 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57624669 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 57624690 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 57624816 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57624863 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57625096 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 57625189 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 57625243 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 57625311 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 57625341 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57625394 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57625455 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57625490 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 57625586 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57625886 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 57626111 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57626156 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57626157 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57626171 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57626382 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 57626590 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57626622 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57626928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57626933 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57627002 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57627012 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57627013 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57627031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57627280 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57627343 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57627540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57627580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57627594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57627690 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57627802 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 57628157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57628237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57628290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57628329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57628356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57628377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57628386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57628543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57629346 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57629474 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 57629588 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57629665 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 57629747 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 57629881 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 57630126 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57630276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57630419 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57630679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57630941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57631237 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57631401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57631445 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57631607 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 57631864 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57631924 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57632100 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57632145 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 57632255 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 57632404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57632415 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 57632448 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 57632462 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 57632608 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57632696 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57632698 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57632810 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57632843 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 57632849 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57632900 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57633362 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57633573 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57633581 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57633596 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57633774 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 57633813 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 57633935 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57633937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57634035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57634101 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57634134 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57634170 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57634172 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57634337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57634445 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57634580 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57634652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57635102 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 57635126 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 57635423 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 57635465 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 57635644 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57635773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57636496 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 57636510 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57636592 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 57636825 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57636887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57636934 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 57637112 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 57637172 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57637278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57637315 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57637329 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57637393 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 57637705 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57637723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57638092 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 57638370 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57638409 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57638475 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 57638528 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 57638582 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57638789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57639448 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57640078 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57641089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57641098 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57641186 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57641387 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 57641517 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 57641707 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 57641873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57641909 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57642467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57642577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57642657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57643033 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57643039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57643862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57644460 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57648306 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57651239 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57651396 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57653153 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 57653860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57654871 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57658555 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57659343 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 57660096 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 57665961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57666351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57666737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57669833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57670591 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57670872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57671058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57674100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57674103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57674778 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57675207 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57676258 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57676401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57676426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57676919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57676928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57677115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57677118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57677247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57677429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57677467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57677468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57677508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57677676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57677718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57677780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57677801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57677828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57677876 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 57678123 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 57678420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57678920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57679139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57679771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57680438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57680963 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 57681072 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 57681099 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 57681137 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57681143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57681222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57681368 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57681484 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 57681772 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 57681891 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57681987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57682132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57682905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57683057 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 57683160 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 57683800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57683896 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 57684047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57684065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57684122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57684318 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 57684905 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57686039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57686120 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57686177 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57686284 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57686852 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57686893 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57687243 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 57687309 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 57687325 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 57687371 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 57687397 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57687407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57687469 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57687538 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57687576 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57687668 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57687831 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57687900 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57687926 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 57687971 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 57688003 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 57688006 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 57688070 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57688182 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57688207 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57688209 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 57688407 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57688412 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 57688519 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 57688898 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 57689034 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 57689043 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 57689080 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 57689932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57689994 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 57690022 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57690050 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 57690078 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57690345 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57690667 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 57690853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57690993 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57691010 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57691302 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 57691330 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 57691344 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 57691480 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57691545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57691646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57691647 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57691799 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57692037 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 57693649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57695405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57696056 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57696501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57696833 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57697232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57697561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57699041 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57701790 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57704277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57704532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57704634 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57705403 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57708391 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57708479 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57709799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57710901 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 57710939 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 57710942 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 57711367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57711724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57711972 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 57712007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57712057 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 57712079 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 57712115 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 57712295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57713029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57713050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57713147 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 57713163 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 57713337 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57713706 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57714608 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57714729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57714876 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57714994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57715212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57715420 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57715650 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57715780 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57716002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57716018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57716102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57716217 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 57716550 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57716640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57717491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57717714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57717823 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 57717860 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0 0.85 0.15 17 23 0 17 3 2 57718063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57718376 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 57718540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57718592 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57718851 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57719723 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57719786 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 57720273 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 57720461 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 57721251 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57721479 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 57721828 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 57722500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57722607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57722657 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 57722771 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 57723277 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57723309 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 57724118 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57724148 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 57724665 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 57724702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57725133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57726434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57727155 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57727268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57727816 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57728118 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57728352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57728537 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 57728577 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57728639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57729022 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57729431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57729553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57730035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57730289 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57731180 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57733652 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57733654 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57734847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57735979 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57735999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57736445 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57738790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57739228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57739411 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57740259 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 57741657 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 57743326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57744335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57744615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57746019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57746618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57747921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57748588 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57750010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57751296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57751528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57751598 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57751927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57752178 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57752562 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57752850 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57756109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57756932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57757095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57760074 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57760094 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 57760416 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57760810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57760971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57760983 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 57761254 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57761356 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 57761764 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57763157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57763211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57763548 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 57764012 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57764116 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57764158 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57764439 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 57764524 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57764589 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 57764610 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57764855 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 57765341 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57765566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57765580 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 57766536 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 57766862 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 57766955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57767231 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57767348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57767383 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 57767447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57768352 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57768431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57768617 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57769306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57769310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57769405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57769578 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57769641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57769741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57770731 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57770811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57771184 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57771851 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57773715 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 57774919 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57774993 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57775134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57775940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57778070 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 57778086 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 57778472 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 57779693 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57783470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57783607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57783611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57786250 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57786409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57786505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57786977 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 57789407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57790705 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 57790911 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57791040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57791747 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57793773 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57793945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57794133 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 57794454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57794705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57794958 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 57795083 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 57795358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57795701 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57796029 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57796986 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57800297 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 57801122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57801192 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 57802260 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57802336 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57802400 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57802642 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57804666 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 57804823 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57806595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57807132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57808811 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57810674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57811073 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57811485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57811486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57811995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57812209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57812231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57812324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57813076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57813486 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57813631 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57814391 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57814592 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57814711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57815247 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57815425 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57815673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57815703 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57818805 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57818843 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57818967 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57819169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57819304 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57819321 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 57819341 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 57819444 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 57819445 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 57819662 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57819851 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57819918 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 57820050 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57820104 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 57820129 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 57820184 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 57820210 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57820214 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57820241 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 57820413 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57820417 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57820473 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 57820540 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57820550 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57820551 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57820760 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57820885 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57820897 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57820911 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57820917 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57821059 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 57821309 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57821358 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 57821400 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 57821479 T G N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 57821601 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57821619 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 57821656 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 57821740 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57821763 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57821812 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57821882 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 57821895 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 57821953 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57822009 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57822044 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57822084 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57822138 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57822181 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57822230 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57822246 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 57822381 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 57822475 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57822498 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 57822546 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 57822653 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57822673 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 57822702 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57822738 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57822763 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57822773 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 57822817 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57822866 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57822876 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57822886 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 57822986 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 57823033 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57823051 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57823063 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 57823074 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57823075 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57823151 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57823153 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57823213 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57823228 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57823386 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 57823477 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57823520 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57823585 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57823675 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57823724 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57823748 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57823881 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57823933 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57823976 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57824228 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57824255 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57824259 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57824276 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57824283 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57824417 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57824459 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57824488 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57824697 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 57824786 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 57824789 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57824895 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 57824908 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 57825003 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57825125 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 57825127 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57825187 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57825210 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 57825212 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57825314 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57825321 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57825487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57825501 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 57825587 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 57825668 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57825736 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57825756 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 57825879 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57825883 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57826028 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 57826093 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 57826621 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 57826935 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57826972 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 57827061 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 57827077 T G Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 57827143 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 57827259 A C Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 57827318 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 57827320 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 57827402 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 57827532 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 57827692 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 57827935 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 57828046 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 57828251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57828449 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 57828684 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 57828693 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 57828701 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 57828711 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 57828847 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57829409 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 57829574 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 57829748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57829774 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57830032 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 57830048 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57830060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57830414 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57830704 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57831166 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 57831378 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 57831400 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 57831563 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57832120 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 57832139 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57832205 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 57832302 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57832303 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57832443 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 57832557 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 57832694 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57832761 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57833075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57833093 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 57833269 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 57833418 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 57833595 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 57833759 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57833910 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 57833913 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 57833943 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57834042 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 57834043 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 57834098 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57834099 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57834258 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57834301 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 57834365 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57834402 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 57834505 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57834516 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57834659 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57834660 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57834677 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57834921 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57835001 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57835107 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57835125 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57835480 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 57835733 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 57835810 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 57835862 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57836055 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 57836074 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 57836128 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57836205 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57836338 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 57836349 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 57836352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57836401 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 57836427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57836521 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57836778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57838562 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 57839725 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57839790 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 57840099 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 57840482 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57840637 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 57840669 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 57840856 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 57841180 C G N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 57841257 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 57841384 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 57841429 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57841527 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 57841625 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57841633 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 57841722 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 57841865 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 57841900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57841990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57842261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57842382 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57842818 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 57843693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57844224 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57844239 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57844431 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 57845026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57845174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57845358 A T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 57845923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57847619 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57848935 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 57849132 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57849233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57849361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57849399 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57849443 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57849475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57849501 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57849954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57850008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57850158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57851440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57851476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57854268 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 57856583 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 2 57856817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57857644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57857992 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57858491 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 57858919 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57858934 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 57859224 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57859363 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57859435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57859829 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57860290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57860346 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57860370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57860388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57860390 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57860409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57860459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57860492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57860561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57860639 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57860644 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 57860659 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57860664 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57860679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57860693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57860694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57861651 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57861773 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 57861796 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 57861808 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57861960 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57862037 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 57862181 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 57862202 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 57864970 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57864979 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57865096 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57865171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57865490 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 57865578 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 57865928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57865961 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 57865962 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 57866204 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57866236 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 57866254 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 57866297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57866309 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57866331 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57866343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57866918 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 57867225 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 57867570 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 57867692 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57867714 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57867757 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57867771 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57867837 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57867845 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57867863 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57867938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57868331 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57868351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57868366 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57868411 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 57868433 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 57868585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57868640 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57868799 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 57868825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57868906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57868937 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57869001 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57869089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57869256 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57869376 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57869407 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57869482 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57869944 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 57870100 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 57870130 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 57871082 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57871513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57871638 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57871807 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 57872149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57872812 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 57872813 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 57872925 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57873242 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 57873670 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57873895 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 57874096 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57876577 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57876701 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57876986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57877242 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57877415 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57877674 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57878140 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 57878286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57878407 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57878518 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57879342 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57879575 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 57879601 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 57879965 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 57880143 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 57880454 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57881035 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 57881077 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 57881470 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 57881907 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 57881983 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 57882070 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57882085 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57882107 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 57882139 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 57882171 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 57882244 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 57882283 C G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 57882448 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 57882681 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57882817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57883079 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57883101 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 57883126 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57883199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57883261 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 57883342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57883525 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 57883560 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57883629 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 57883668 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 57883705 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57883865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57883882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57884157 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 57884158 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 57884634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57884884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57884997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57885288 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57885475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57885578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57885582 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57885604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57885648 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 57886124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57886161 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 57886222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57886386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57886419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57886426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57886475 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57886481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57886510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57886618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57886680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57886799 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57886820 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 57886821 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57886886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57887086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57887177 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 57887567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57887762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57887887 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 57888127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57890048 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57894313 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 57894754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57894878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57895436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57895917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57896770 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 57897312 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57898015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57899244 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 57899520 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57900087 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57900103 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 57900128 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57900142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57900315 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57901022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57901035 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 57901172 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57901777 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57901785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57901842 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57901880 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 57901890 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 57901934 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 57902181 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 57902185 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 57902201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57902231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57902274 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57902651 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57902699 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 57902953 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57902958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57904100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57905429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57906246 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57908880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57909904 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57910181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57910293 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57911017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57911067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57911196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57911659 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57912293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57912340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57912571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57913202 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 57913237 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 57913287 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 57913775 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57914260 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57914334 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 57914491 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 57914510 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 57914620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57914806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57914902 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57914957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57915214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57916440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57917081 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57917591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57917623 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 57917850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57918727 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57918951 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57919072 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57919378 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57919679 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57919794 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 57919795 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 57919871 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57919992 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 57920005 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57920250 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 57922604 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57922656 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57922777 C T Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 57925809 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 57926080 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57926142 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57926219 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 57926286 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 57926302 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 57926313 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57926665 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 57927034 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 57927188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57927662 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57927793 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57927844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57928410 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 57928683 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57928704 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 57928997 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 57929113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57929253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57930248 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 57930322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57930337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57930620 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 57930851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57930990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57931016 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 57931097 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 57931122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57931176 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 57931180 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57931209 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 57931256 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 57931460 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57931515 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57931785 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 57933192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57933407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57933553 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57933575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57934299 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57934571 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 57934742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57935149 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 57935207 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 57935287 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 57935576 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 57935596 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 57935597 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 57935629 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 57935645 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 57935778 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 57935986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57936000 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 57936165 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 57936317 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 57936401 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 57936609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57936874 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 57936897 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 57936915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57937108 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 57937171 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 57937192 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 57937361 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 57937417 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 57937632 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 57937691 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 57937993 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57938015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57938133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57938760 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 57938761 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 57939231 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 57939328 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 57939512 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 57939584 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 57939668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57939780 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57940191 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57940234 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 57940268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57940439 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57940666 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 57940705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57940725 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 57940809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57940892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57941020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57941046 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 57941106 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 57941347 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 57941470 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 57941550 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57941765 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 57941794 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57942179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57942183 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57942216 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 57942230 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 57942300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57942308 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57942334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57942369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57942516 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57942570 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 57942609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57942654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57942842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57942876 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57942928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57942964 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57943124 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57943675 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57943774 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 57943816 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 57943851 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 57943924 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 57943977 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57944022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57944072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57944232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57944343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57944406 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 57944551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57944618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57944659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57944704 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57948866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57950821 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 57950845 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 57952206 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 57954412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57955190 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 57957959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57959758 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 57960103 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 57960212 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 57964399 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 57964572 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 57966318 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57967860 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 57967917 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57969181 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 57970490 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 57975105 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57976626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57976733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57976790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57976877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57976937 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57977248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57977846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57977987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57978768 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 57978769 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 57979177 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57979458 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57979592 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 57979618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57979658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57979659 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57979738 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57979913 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 57979983 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57980064 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 57980180 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 57980193 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 57980263 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57980274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57980834 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 57981149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57981665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57981862 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57981866 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 57982372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57983437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57984927 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57984928 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57985268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57985573 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57985902 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 57986213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57986561 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 57986763 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 57987003 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57987045 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 57987300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57987380 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 57987429 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57987493 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 57987793 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57987980 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57987986 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 57988098 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 57988701 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 57988702 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 57989098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57989146 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 57989465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57989537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57989602 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 57989637 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57989887 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 57990145 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 57990444 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57990576 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57990577 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57990647 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57990744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57991436 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 57991474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57991490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57991704 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 57991851 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57992067 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 57992308 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 57992391 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 57992427 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57992459 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57992560 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 57992763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57992849 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 57992910 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57993005 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57993029 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 57993057 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 57993488 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 57998969 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 57999008 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 57999381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 57999765 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58001677 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 58004169 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 58004384 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58008758 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58009828 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58010200 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58010405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58010415 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58010846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58010991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58010992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58011112 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58011717 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58011720 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58012231 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 58012262 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 58012986 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 58013786 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 58013978 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58014464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58014947 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 58014958 C A N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 58014983 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 58015015 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 58015045 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 58015095 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 58015096 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 58015120 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 58015203 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 58015327 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58015472 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58015764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58015912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58017208 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 58017445 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58017667 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 58017773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58017992 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58018260 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58018329 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58018875 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 58019394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58020555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58020600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58021086 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58023530 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58023872 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58023901 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58024076 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58024142 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58024167 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58024405 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58024464 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 58024498 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58024530 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 58024614 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58024857 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58024947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58025451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58025789 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58026273 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58026474 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58026520 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58026591 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 58026676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58026678 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58027400 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58027807 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 58027994 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58028399 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58028629 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58028744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58028862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58029952 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 58029987 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 58030103 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 58030155 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 58030265 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58030403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58030449 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58030502 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 58030510 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58030724 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58031000 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58031097 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58031135 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58031234 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58031695 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58032458 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58032657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58033328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58033864 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58034986 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58035009 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58035364 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58035390 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58035495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58038020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58040067 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58040881 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 58041513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58041981 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58042562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58044102 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58046276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58048595 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58048773 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58049976 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58050149 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58051613 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 58053136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58053634 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 58054183 T G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 58054184 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 58054225 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 58055146 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 58055839 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 58056246 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58058669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58059922 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58060974 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58061111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58061786 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58061883 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58062032 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 58062292 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58062524 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58062740 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 58062761 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 58062806 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 58063017 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 2 58063092 C A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 2 58063125 C T N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 2 58063158 G A N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.272727272727273 0.0909090909090909 0.636363636363636 7 15 3 1 7 2 58063289 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58063443 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 58063529 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58063530 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58063650 A C N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 58063933 A T Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 58063987 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 58064945 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 58065075 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 58067529 G C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 58067601 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 58068019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58068471 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 58068738 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 58069117 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 58069139 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 58069245 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58069294 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 58069371 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58069892 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 58069916 C A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 58070027 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58070220 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58070263 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58070791 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58071227 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58071521 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 58071959 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 58072157 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58072290 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58072303 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58072323 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58072584 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58072779 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58073186 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58073278 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 58073285 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 58073701 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58073708 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58073858 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 58073868 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 58074063 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 58074389 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 58074408 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 58074732 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58074814 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 58075155 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 58075269 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 58075298 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 58075331 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58075333 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58075353 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58075356 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58075376 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58075381 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58075507 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58075643 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58075657 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58075690 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58075842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58075921 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 58075984 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58076164 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58076773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58076978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58077235 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 58078023 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58078071 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58078087 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58078306 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58078344 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 58079119 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 58079273 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 58080116 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 58080442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58081176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58081356 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 58081517 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58081550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58081554 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58088836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58089131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58089445 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 58089496 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 58090252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58090371 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58090498 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 58090867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58091323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58092634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58094052 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58094370 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 58094508 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 58095091 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 58097803 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 58098471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58099071 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58099554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58100830 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58101162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58102017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58107446 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58108520 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 58116899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58117006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58117137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58117415 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 58118194 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 58125037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58127177 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58127522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58127649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58128380 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 58128412 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58128523 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 58129449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58130306 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 58130521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58134142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58136609 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58136857 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58137537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58137592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58143041 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 58143563 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 58144028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58144124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58144134 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58146522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58146527 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58146872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58147080 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58148220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58148237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58148590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58149398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58149790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58151343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58154340 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58154713 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58155493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58155540 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58155667 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58157756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58158832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58160997 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58162102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58164643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58168528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58168587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58169441 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58169669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58170477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58170967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58172081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58173056 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58173556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58173636 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 58174455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58175243 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58176547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58176758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58178252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58178769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58181619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58183235 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58183332 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58184012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58184253 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58184452 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58184928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58186735 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58186995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58190275 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 58190342 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 58190733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58191952 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58192064 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58192470 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58192736 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58192821 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58192993 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 58193019 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 58198290 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58201195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58203549 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58203647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58203771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58204113 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58206323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58207067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58209500 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 58212770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58212880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58214544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58214930 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58217347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58217623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58220292 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58220797 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58221016 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 58221716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58223719 A G Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 2 58223883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58224024 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58224772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58224925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58225467 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 58225632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58225837 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58225947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58226992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58227228 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 58227258 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58227259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58227404 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58227509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58228189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58228233 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 58228774 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58228839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58229211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58229333 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58229356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58229447 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58229641 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 58229828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58230008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58230018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58230247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58230679 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58230681 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58230839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58230889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58231419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58232268 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58232669 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 58232693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58233319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58233332 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58233429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58233723 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58233742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58233840 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58234140 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58234220 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58234393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58234452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58234536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58234571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58234599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58234612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58234766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58234799 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58234867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58234882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58234919 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58234957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58234994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58235164 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58235279 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58235393 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58235665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58236494 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 58236890 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58236952 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58236961 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58237008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58237068 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 58237487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58237565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58238011 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58238617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58238645 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58238841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58239397 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58240642 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 58240938 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58240947 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58240993 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58240999 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58241005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58241230 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 58241946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58241968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58242348 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58242977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58243083 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58243090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58243398 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 58243411 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 58243413 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 58243457 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 58243575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58243789 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58243791 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58244004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58244010 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58244609 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 58244939 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58245059 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 58245118 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 58245201 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58245241 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58245267 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 58245268 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 58245365 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58245474 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58245521 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 58245527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58245809 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58245911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58246033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58246084 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58246244 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58246314 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58246475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58246587 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58246676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58246745 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58246898 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58246951 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58246987 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58248319 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58248360 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58248645 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 58248973 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 58248977 G C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 58249138 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58249238 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58249248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58249683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58249699 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58249757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58249846 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58250528 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 58251606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58251637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58251664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58251728 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58251836 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58252194 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58252205 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58252274 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58252320 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58252508 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 58252531 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58252588 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 58252675 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58252776 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58253051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58253449 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58253644 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58255019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58255357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58257372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58259683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58260069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58262725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58262881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58263174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58263361 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 58263493 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 58263777 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 58264021 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 58264170 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58264422 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58264451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58264517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58265178 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 58265187 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 58265231 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 58265247 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 58265297 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 58265319 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 58265348 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 58265601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58266630 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58267236 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 58267527 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58267876 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 58268556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58269126 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 58269281 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58269337 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 58269957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58270109 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58270326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58270375 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 58270415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58271315 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 58271338 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 58271679 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 58271850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58271950 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 58271983 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58272428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58272675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58272722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58272733 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 58272768 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58272964 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 58273125 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 58273153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58273261 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58273291 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58273355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58273419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58273604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58273625 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 58273648 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58273781 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58273915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58273979 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 58274029 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 58274117 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 58274133 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 58274181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58274219 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 58274359 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 58274550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58274566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58274605 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 58274615 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58274667 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58274795 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 58274882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58274978 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58275097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58275201 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58275216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58275291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58275403 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 58275428 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 58275450 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 58275543 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 58275706 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 58275817 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 58275873 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 58275887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58275920 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58275955 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 58276017 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 58276023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58276111 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 58276218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58276282 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 58276321 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 58276406 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58276431 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58276441 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58276480 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58276517 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58276551 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 58276559 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 58276582 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 58276607 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 58276609 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 58276664 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58276668 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58276777 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 58276787 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 58276851 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 58277092 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58277181 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 58277243 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 58277314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58277429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58277742 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 58277809 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 58277889 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 58278080 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 58278228 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 58279362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58279430 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 58279846 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58279916 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 58279927 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 58280541 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 58281392 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 58281569 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58281609 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 58282712 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 58282799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58283140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58283718 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58283897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58284011 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 58284043 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58284067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58284072 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 58284430 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 58288451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58288617 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 58288867 G A N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 58289595 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58289666 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 58289721 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 58289813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58289996 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 58290683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58290759 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 58291117 A T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 58291230 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 2 58291875 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58292198 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58293275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58293321 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 58293342 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 58293600 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 58294745 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 58294763 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58294871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58295000 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 58295176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58295203 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 58295435 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58295497 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58295766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58296021 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 58296383 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58296391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58296478 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 58296804 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 58296822 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58296849 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 58296916 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 58297188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58297300 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 58297342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58297348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58297378 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58297379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58297390 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 58297695 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58297748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58297800 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 58298287 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58298494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58298546 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58298698 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58298791 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 58298803 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 58299662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58300535 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 58300545 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 58300684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58300882 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 58300963 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58301032 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 58301136 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 58301229 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 58301404 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58301416 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 58301489 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 58301524 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 58301986 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58302260 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 58302391 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 58302407 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 58302509 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 58302700 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 58302720 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58302762 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58302840 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 58302940 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 58302990 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 58303184 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 58303332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58303446 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 58303474 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 58303511 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 58303755 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 58303899 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 58303900 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 58303915 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 58304178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58304564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58304764 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 58305201 G A Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 58305878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58306407 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58306610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58306628 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 58306645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58306659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58306784 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58307034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58307110 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 58307179 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 58307339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58307470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58307520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58307607 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 58307654 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 58307797 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 58307997 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 58308044 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 58308057 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 58308060 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 58308076 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58308094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58308434 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58308682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58308686 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 58308730 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 58308817 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 58308856 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58308866 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 58308905 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 58309234 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58309475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58309558 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 58309659 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 58309756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58309960 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 58309983 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58310033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58310096 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 58310178 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 58310301 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 58311227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58311712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58311896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58312002 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 58312085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58312169 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58312536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58312766 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58312938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58313614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58313766 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58314214 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 58314566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58314830 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 58315431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58316384 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 58317535 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58319009 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 58319257 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 58319369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58319496 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 58319509 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 58320030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58321243 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58321512 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58322193 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58322273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58322444 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58323172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58325260 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 58327573 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 58327695 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 58328304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58329148 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58329406 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 58329525 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58329567 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 58329646 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58329723 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 58329821 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 58330500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58330823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58331290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58331538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58332358 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58332361 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 58332473 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 58332506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58332538 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58332677 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58332783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58332908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58333466 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58335169 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58335708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58335710 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 58335790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58335852 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58336081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58336120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58336558 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58336576 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58337182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58338471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58338542 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58338957 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 58339515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58339642 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 58339791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58339921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58340765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58340798 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 58341046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58341133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58341651 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58342075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58343001 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58343102 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58343199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58343231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58343304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58343753 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 58343969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58344047 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 58344335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58345140 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 58345165 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58345419 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58345680 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58345755 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 58345997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58346133 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 58347130 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 58347131 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 58348075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58348430 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58349443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58349656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58349669 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58351359 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 58351390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58351717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58351784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58352414 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58352456 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 58352507 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 58352597 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 58353343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58353385 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58353515 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 58353803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58353805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58353836 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 58353863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58354093 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58354110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58354143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58354225 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58354227 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58354345 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58354352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58354554 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58354581 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58354698 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58354713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58354878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58355023 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58355254 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 58355258 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 58355271 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58355281 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58355409 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58355438 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58355461 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 58355498 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58355580 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 58355698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58355763 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58355839 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58355926 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58356016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58356020 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 58356049 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 58356123 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58356148 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58356165 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58356171 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58356192 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58356214 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58356244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58356388 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58356465 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58356549 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58356640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58356894 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58357027 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58357114 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58357314 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 58357380 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58357403 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58357445 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58357485 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 58357629 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 58357723 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58357766 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 58357786 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 58357839 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58357883 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 58357996 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58358476 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 58358719 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 58358880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58359116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58359141 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58359153 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58359201 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58359238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58359245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58359259 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58359292 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58359375 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58359451 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58360221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58360525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58360536 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 58360693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58361280 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 58361518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58361675 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58362204 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 58362336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58362467 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 58362489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58362848 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 58362918 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 58362941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58363120 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 58363485 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58363527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58363710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58364172 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 58365651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58365672 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58365882 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58366137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58366138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58367680 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 58367694 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58367905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58367941 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 58368637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58368732 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 58368755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58370141 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 58370193 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58370316 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58370416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58371404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58371873 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58372571 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58375153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58377896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58380997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58382149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58384450 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58384615 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 58384773 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58385039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58385077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58385595 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58385993 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58386565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58387276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58388162 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 58388290 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58388878 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 58390149 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58390228 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 58390414 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 58390462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58390705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58390906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58390929 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 58391022 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 58391137 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 58391148 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 58392283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58392521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58393207 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58393429 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 58393453 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 58394509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58394527 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 58394826 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58394844 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 58394917 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58395143 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58395164 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 58395171 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 58395216 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 58395243 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 58395250 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 58395275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58395282 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58395568 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 58395664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58395770 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58396250 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 58396283 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 58396415 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58396586 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 58396702 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 58396738 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 58396800 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 58396802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58396813 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 58396870 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58397048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58397260 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 58397537 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 58397563 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58397567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58398352 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58398400 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58398565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58398662 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58398841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58399184 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58399334 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58399457 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58399681 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 58399730 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58399741 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58399803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58399972 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58400107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58400984 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58401303 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58401541 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58401585 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58401650 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58406587 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58406782 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58406855 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58407130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58407544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58407619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58408088 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58408158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58408369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58409468 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58410895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58411618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58412046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58412513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58413961 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 58414236 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58415575 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58415684 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58415991 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58416657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58416928 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58418934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58422709 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58422714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58423209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58425390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58428259 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58428700 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58428741 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58430509 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58433565 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 58436724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58439481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58440998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58441142 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58441423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58441596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58441979 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58442308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58443965 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58445978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58446116 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58446369 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58447217 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58448546 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58449969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58450460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58450470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58450594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58450662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58451160 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58451207 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58451883 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 58451947 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58451996 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58452010 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58452179 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58452195 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58452209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58452768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58452890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58452929 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58453224 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58453981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58457228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58458365 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58458424 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58458695 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58459228 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58459386 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58459574 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58460242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58461238 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 58461378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58461849 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58461876 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58461997 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 58462197 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 58462209 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 58462312 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 58462463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58462473 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 58462667 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58462741 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58464847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58464941 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58464957 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58465192 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58465207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58465254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58465340 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58465408 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58465555 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58465593 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58465595 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58465697 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58465729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58465841 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58466096 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58466379 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 58466503 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58466519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58466713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58466754 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58466778 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58466803 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58467263 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58467697 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 58468014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58468592 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58468640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58468726 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58469107 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 58469124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58469176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58469181 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58469414 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58471280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58471330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58471350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58471616 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58471688 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 58471889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58471900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58472019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58472051 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58472057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58472064 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58472496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58472596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58472599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58472829 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 58472843 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 58473016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58473890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58474019 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 58474147 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 58474167 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 58474232 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 58474569 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58474571 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58474585 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58474730 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58474737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58474798 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58474898 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58475215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58475255 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58475256 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58475312 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58475431 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58475455 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58475463 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58475585 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58475682 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58475695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58475730 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58475780 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58475878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58476010 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58476043 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 58476063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58476115 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 58476679 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58476739 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58476806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58476897 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58477096 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 58477145 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 58477379 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58477439 A C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 58477534 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 58477636 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58477799 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58477867 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58477959 C G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 58477974 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 58478273 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 58478805 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58478843 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 58479039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58479141 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58479254 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58479300 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58479346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58479389 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 58479426 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 58479655 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58479680 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58479681 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58479847 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58480095 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58480149 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58480264 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 58480287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58480452 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58480456 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58480639 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 58480802 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58480917 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58481031 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58481056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58481445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58481771 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58481979 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58482240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58482394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58482542 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58482708 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 58483102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58483515 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58483516 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58484329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58484443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58484983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58485973 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58488130 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58488148 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 58489312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58489952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58491843 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58494110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58495483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58496869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58496870 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 58496951 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58497043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58497179 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58497228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58497327 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 58497350 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58497373 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58497451 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58497674 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58497687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58497748 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58497827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58498074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58498429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58498701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58498857 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58498982 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58499037 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58500066 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 58500412 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 58500558 C G Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 58500588 T C Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 58505423 G A Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 58506693 G T N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 2 58506901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58507378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58507570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58508503 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58508778 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 58510740 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58511810 A G Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 58512949 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58513063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58514527 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58515384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58516648 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58517913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58518406 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58518674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58519983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58520519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58522388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58523690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58525173 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58525208 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58525272 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 58525273 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 58525486 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58525494 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58525510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58525802 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 58525850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58526086 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 58526191 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 58526281 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 58526363 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 58526389 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 58530647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58530907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58531193 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58531212 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 58531230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58532140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58535312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58537818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58545284 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58549457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58549608 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58550409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58551213 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58551216 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58551599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58552710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58553320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58554856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58555842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58556739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58560025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58560229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58563906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58564546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58564770 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58565949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58567941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58568385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58571709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58572086 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 58581349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58581593 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58581697 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58581728 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58581732 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58581952 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58581970 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58581987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58582082 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58582148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58582153 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58582168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58582202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58582235 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58582255 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58582282 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58582322 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58582375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58583496 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58583540 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58585581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58587025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58589247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58590104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58590447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58590724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58591299 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58591782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58592103 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58592290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58593682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58593729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58594469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58595163 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58595246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58595592 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58595677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58595702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58595770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58595806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58596049 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58596195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58596253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58596282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58596652 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58596887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58596904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58597087 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58597146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58597161 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58597237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58597363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58597446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58597657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58597872 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58598833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58598975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58599045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58599058 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58599569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58599578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58599796 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58599848 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58599862 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58600148 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58600413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58600595 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58600671 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58600683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58600728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58600741 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58600746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58600803 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58600825 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58600853 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58600885 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58600943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58601002 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58601092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58601118 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 58601134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58601165 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58601199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58601262 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58601291 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58601566 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58602163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58602164 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58602287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58602374 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58602448 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58602593 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58602594 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58603040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58603146 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58603450 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58603509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58603575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58603936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58603958 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58604329 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58604625 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58604656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58604681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58604682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58604699 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58604789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58604907 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 58604944 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58605140 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 58605224 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 58605364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58605605 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58607701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58608436 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58608526 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58608530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58608903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58609196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58609279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58609280 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58609417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58609445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58609447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58609581 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58609585 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58609647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58609679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58609771 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58609866 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 58609887 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58609985 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58610090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58610288 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58610332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58610739 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58610903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58611181 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58611349 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58611362 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58611371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58611541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58611573 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58611714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58611743 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58612101 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58612224 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58612248 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58612275 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58612876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58613094 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58613106 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613231 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613242 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613305 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58613317 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613333 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613347 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613410 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613443 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613550 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613603 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613611 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613654 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613667 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613740 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613826 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58613827 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58614034 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 58614041 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 58614707 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58615011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58615164 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58615176 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 58615185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58615191 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58615226 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58615308 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58615329 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58615340 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58615353 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58615700 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58615922 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58616306 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58616402 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58616485 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58616532 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58616696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58616844 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58616912 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 58616954 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 58616956 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58617717 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58617919 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58617992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58618008 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58618029 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58618200 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58618365 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58618653 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58619091 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58619465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58619469 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58620081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58620308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58621180 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58624927 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58624983 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58625152 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58625165 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58625814 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58625862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58625927 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58625985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58626038 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58626175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58626429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58626594 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58626955 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58627099 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58627223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58627804 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58629584 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58630816 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58630933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58630940 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58630945 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58632260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58632315 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58632721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58633144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58634168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58634352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58634384 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58634460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58635008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58635083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58635196 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58635314 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58635322 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58635519 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58635546 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58635812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58636332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58636355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58636358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58637512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58637753 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58637824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58638313 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58638806 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58639866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58641169 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58642016 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58642608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58643337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58643417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58644239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58644452 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58644636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58644792 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58644861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58645002 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58645335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58645493 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58645900 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58646063 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58646303 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58646434 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 58646480 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58646671 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58646947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58647458 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58647552 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58647554 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58647583 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58647593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58647627 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58647705 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58647779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58647921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58648043 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58648223 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58648279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58648571 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58648739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58648814 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58648875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58649066 G C Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 58649083 T G Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 58649094 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58649180 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58649201 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58649296 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58649365 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58649572 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58649760 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58649784 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58650113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58650230 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58650245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58650839 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58650888 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58651000 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58651043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58651057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58651096 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58651344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58651679 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58651881 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58652095 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58652565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58652734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58652907 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58653249 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58653420 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58653487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58653587 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 58653663 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58653788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58654618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58654914 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58655577 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58655628 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58656023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58656124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58656188 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58656208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58656251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58656311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58656367 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58656418 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58656734 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58657464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58657842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58657883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58657911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58657947 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58658677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58659228 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58659497 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58659513 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58659524 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58663697 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58663902 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58663957 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58664365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58664969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58665014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58665065 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58665174 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58665413 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58665785 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58665963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58666145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58666815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58667178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58667449 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58667634 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58667668 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58667738 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58667916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58668185 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58668240 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58669752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58669822 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58670049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58670112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58670244 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58670369 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58670393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58670567 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 58670627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58670699 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58671421 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58671476 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58671600 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58671628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58672658 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58673261 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58673444 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58673715 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58674016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58674042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58674094 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58674199 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58674354 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58674485 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58674548 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58674553 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58674620 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58674721 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58674739 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58674895 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58674953 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58675166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58675189 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58675346 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58675547 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58675676 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58675701 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 58675742 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58675759 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58676190 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58676255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58676514 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 58676689 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58676833 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58676836 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58676981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58676995 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58676997 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58677238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58677401 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58677800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58678016 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58678345 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58678750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58678852 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58679927 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58680390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58680614 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58680726 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58680868 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58680926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58680930 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58681024 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58681448 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58681758 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58681759 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58682090 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58682454 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58682513 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58683322 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 58683656 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58685293 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58685318 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58685360 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58685458 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 58685459 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 58685477 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 58686920 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58686939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58687100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58687373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58687385 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58687584 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58687805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58687958 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58688309 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58688392 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58688873 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58689341 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58689822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58689940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58690067 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58690199 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58690527 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58690783 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58691208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58691241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58691280 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58691357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58691389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58691527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58691534 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58691561 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58691574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58691608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58691636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58691644 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58691685 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58691694 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58691779 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58691932 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58691976 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 58692046 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 58692058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58692248 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58692249 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58692610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58692688 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58692920 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58692936 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58692950 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58693213 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58694165 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58694345 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58694845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58694858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58695000 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58695045 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 58695059 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58695080 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58695116 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58695630 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58695669 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58695896 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58695900 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58696115 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58696119 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58696134 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58696511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58696643 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58697101 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58697354 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58697393 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 58697421 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 58698064 A T Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 58698195 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 58698449 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58698703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58698835 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58698866 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58698885 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58698925 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58699198 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58699321 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58699826 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58699828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58699870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58700245 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58700258 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58700684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58701252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58701468 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58701601 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58701850 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58701857 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58701874 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58702519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58704287 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58704487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58706416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58708456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58713409 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 58715092 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58716213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58718408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58718414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58718741 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58718856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58718957 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 58718977 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 58719041 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 58719046 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 58719093 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58719248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58719271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58719336 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58719380 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58719487 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58719505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58719605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58719700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58719896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58719950 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58720119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58720272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58720309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58720343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58720352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58720525 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58720568 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58720671 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58720691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58720776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58720857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58720881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58720884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58720925 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58721072 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58721081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58721130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58721162 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58721338 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 58721532 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 58721533 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 58721760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58721808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58721872 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58722134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58722151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58722164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58722217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58722530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58722737 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58722888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58722896 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58723018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58723033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58723112 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58723167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58723355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58723679 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58723844 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58723868 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58724022 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58724027 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 58724041 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 58724300 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 58724402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58724661 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58724752 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58724779 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58724804 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58724899 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58724910 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58724944 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58725108 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 58725223 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58725275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58725489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58725630 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 58725684 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58725699 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58725708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58725772 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58725833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58725847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58725893 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58726134 G C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 58726629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58727106 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58727107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58727346 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 58727382 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58727397 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58727443 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 58727460 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58727465 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58727561 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58727657 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58727666 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58727669 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58728119 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58729852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58729976 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58730456 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58731202 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 58732095 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58732248 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58732274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58732304 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58732464 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58732638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58740663 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 58740779 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 58741251 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58741262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58741271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58741580 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58741919 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 58742024 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58742408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58742554 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58742674 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58742866 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 58742878 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 58743030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58743097 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 58743469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58743620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58743979 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 58744375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58744480 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58744509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58744523 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 58744550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58744702 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58745108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58745394 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58745518 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58745775 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 58745822 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 58745941 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 58746323 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 58746503 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 58746648 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 58746726 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 58746819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58746881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58747372 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 58747805 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 58747932 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 58747939 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58747961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58747966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58747972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58748400 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 58748461 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58748536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58748580 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 58748627 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58748644 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 58748696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58748721 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58748751 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58748777 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 58748817 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58755005 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 58755010 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 58755159 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 58755571 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58755730 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58755893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58756077 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58756218 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 58756544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58757053 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58757256 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 58757378 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 58757937 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 58759105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58759345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58759520 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58760493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58760599 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58760951 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58761341 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 58763010 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58764662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58765358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58765732 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58766028 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 58766489 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58769767 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58771060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58774104 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 58774191 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58777175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58779503 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58779553 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58780486 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58782850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58782888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58783535 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58783543 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58784234 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58784427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58784711 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58785170 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58785277 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 58785324 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 58785332 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 58785372 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 58785455 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 58785529 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58785568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58785573 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58785630 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 58786044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58786179 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 58786351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58786494 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58786529 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58786960 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58787004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58787057 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58787098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58787108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58787126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58787172 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58787275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58787313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58787387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58787735 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 58787954 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 58788157 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58788871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58789058 T A Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 58789066 T C Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 58789263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58790779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58792414 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 58792507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58792786 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58793296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58794251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58796144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58797605 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58799021 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58799079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58799843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58800328 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58800330 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58800553 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 58800772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58800782 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58801130 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 58801528 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 58801564 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 58801656 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58803038 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58803175 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 58803371 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58803382 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58803988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58804064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58804113 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58805196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58806558 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58806758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58806955 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58807919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58807968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58808264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58808451 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 58808749 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 58809259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58811123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58811519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58814566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58815302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58815314 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 58816927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58817780 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58819385 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58821282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58821373 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58821493 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58821878 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58825485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58825729 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 58825750 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 58825764 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58826645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58826917 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58826923 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58827104 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 58827115 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 58830446 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 58832038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58833161 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58833201 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58833839 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 58833896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58833928 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 58834124 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 58834535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58834830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58834871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58834997 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 58835265 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 58835509 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 58835564 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58835667 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58836320 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 58836354 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58836373 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58836380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58836398 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 58836518 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58836812 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58836998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58837715 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 58838084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58838920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58839562 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58841024 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58841085 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58841350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58841655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58841902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58842366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58842397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58842533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58842556 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 58842839 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58843081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58843103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58843119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58843449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58843505 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58843527 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58843532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58843594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58843752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58843847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58844066 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58844077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58844267 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 58844369 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 58844393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58844526 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58844693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58844793 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 58844958 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58845116 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58846058 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58846229 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58846243 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58846445 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 58846736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58847287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58847391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58847433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58847539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58847631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58848385 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 58848390 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 58848463 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 58848632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58848996 T G N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 2 58849225 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58849514 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58849633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58849666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58849754 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 58850099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58850158 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58850290 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 58850297 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 58850322 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58850360 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58850636 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58850687 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 58850711 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58850725 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58850861 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58850915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58851150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58851196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58851655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58851706 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58853447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58853508 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58854323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58854815 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58855833 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58857744 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 58858035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58858869 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58858958 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 58859059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58859179 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58859247 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58862136 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58862634 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 58862806 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 58862938 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58863365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58863757 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58863887 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58864778 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58865332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58865930 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58866496 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58868636 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 58870162 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 58870273 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58870326 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58870631 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 58870720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58870863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58871339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58871608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58871639 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58872059 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58872074 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58872123 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 58872354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58872355 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 58872383 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 58872487 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 58872523 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58872527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58872552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58872704 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 58872789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58872790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58872999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58873009 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 58873053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58873068 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 58873091 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 58873116 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58873173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58873248 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 58873312 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58873340 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 58873364 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 58873467 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58873751 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 58873840 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58873996 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58874062 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58874236 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58874291 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 58874464 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 58874676 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58874679 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 58874805 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 58874835 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 58875038 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 58875133 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 58875144 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 58875246 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 58875269 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 58875320 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 58875398 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 58875684 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 58875861 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 58875934 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58876026 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 58876148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58876403 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58876472 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 58876541 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 58876614 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58876747 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 58876894 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58877368 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 58877457 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 58877621 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58878394 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58878400 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58878505 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 58878618 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 58878623 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 58878685 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58878735 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 58878824 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 58878836 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58878882 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58879108 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 58879379 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 58879568 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 58879741 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58879748 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 58879764 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 58879843 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 58879873 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58880037 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 58880089 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 58880386 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 58880425 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 58880427 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 58880595 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 58881201 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 58881275 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58881327 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 58881749 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 58881769 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58881942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58882168 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58882169 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58882214 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58882229 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58882273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58882312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58882768 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 58882815 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 58882827 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58882866 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58882873 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58882923 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 58882959 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58882983 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58883028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58883117 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58883143 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 58883171 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58883173 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58883450 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 58883591 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 58883763 G C N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 58883883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58884039 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 58884054 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58884079 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 58884233 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58884288 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58884588 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58884612 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58884702 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 58885304 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 58885387 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58885524 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 58885560 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58885624 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 58885702 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58885809 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 58886118 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 58886420 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 58886531 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 58886559 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 58886610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58886739 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58886757 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58886810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58886874 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 58886932 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 58886948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58886995 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58887035 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 58887085 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 58887273 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 58887342 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58887509 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 58887563 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 58887624 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58887711 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 58887930 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58887943 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58887952 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58888058 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58888193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58888198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58888312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58888574 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58888891 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58889335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58890121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58890133 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58890171 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58890306 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 58890357 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58890625 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58890889 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 58890956 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 58891022 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 58891153 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58891255 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 58891573 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58891808 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 58891820 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58891879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58892064 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 58892068 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 58892107 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 58892237 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 58892671 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58892707 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 58893087 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58893299 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 58893987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58894201 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 58894245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58894347 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 58894621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58894812 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 58894829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58894924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58895022 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 58895033 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58895350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58895379 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58895535 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58895901 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58895909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58895962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58896117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58896432 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58896607 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 58896855 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 58897080 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 58897149 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 58897315 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58897483 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 58897556 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 58897590 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58897591 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58897616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58898429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58900045 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 58901061 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 58901317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58901884 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58901954 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 58902431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58902506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58903339 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58903838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58904788 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 58904806 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 58905015 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 58905091 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 58905172 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 58905666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58906260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58906292 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 58906746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58906948 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58907150 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 58907678 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 58907874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58908372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58908490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58959073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58959119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58959316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58959363 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58960139 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58960205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58960352 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58960659 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 58960968 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 58960981 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 58961004 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58961036 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 58961312 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58961333 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58961411 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58961502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58961503 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58961660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58961663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58961687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58961785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58961909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58962051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58962068 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58962081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58962144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58962189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58962336 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58962696 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 58962987 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 58963011 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58963167 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58963223 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58963588 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 58963791 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58963889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58963954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58964012 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58964343 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58964400 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58964420 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 58964474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58964477 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 58964499 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58964534 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58964727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58965059 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 58965223 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 58965224 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 58965258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58965514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58965745 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58965897 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 58966065 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58966151 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58966159 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58966425 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 58966628 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 58966999 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 58967058 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 58967136 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 58967182 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 58967258 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 58967291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58967366 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58967943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58968045 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 58968256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58968591 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 58968614 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 58969590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58969718 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 58969958 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58970712 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58970925 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58971226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58971733 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58971759 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58971854 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58971860 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58971894 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58972112 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 58972130 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58972155 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58972167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58972400 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58972496 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58972531 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58973017 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 58973443 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58973688 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58973828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58973860 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58973876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58973893 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 58974204 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58974403 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58974767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58975044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58975104 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58976301 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 58976414 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 58976416 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 58976580 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 58976713 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 58977075 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 58977262 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58977495 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 58977502 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 58977583 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 58977820 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 58977893 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58978064 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 58978169 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 58978570 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 58979562 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 58979639 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58979985 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 58980388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58980654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58980698 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58980718 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 58980859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58980893 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58980966 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58981027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58981063 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58981391 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 58981411 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 58981742 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 58981758 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 58982075 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 58982884 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 58982962 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58982971 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58983027 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 58983323 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 58983533 T C N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 58983741 A T Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 58983745 T A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 2 58983794 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 58984049 T G Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 2 58984066 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 58984094 A T Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 58984107 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 58984420 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 58984436 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 2 58984456 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 58984524 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 2 58984586 A G Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 58985124 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 58985167 T C Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 2 58985213 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 58985282 G A Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 58985340 G A Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 58985700 A T N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 2 58985738 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 2 58986219 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 58986255 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 58986309 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 58986340 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 58986388 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 58986559 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 58988418 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 58988520 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58989683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58990870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58991425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58991474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58993668 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 58994007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 58994267 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 58994276 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 58994405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58994449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58994875 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 58996954 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 58997515 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 58999512 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 58999513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59003262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59003336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59004739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59005547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59007658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59008242 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 59009114 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59009185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59009237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59009942 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59010417 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 59012494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59012582 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59012651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59013569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59013797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59013941 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 59014027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59014619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59015027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59015852 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59016058 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 59016326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59016830 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59016992 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59017100 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 59017309 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59017456 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59017606 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 59017723 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59018117 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 59018223 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 59018306 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 59018338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59018375 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 59018411 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 59018518 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 59018624 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 59018975 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59019124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59019144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59019396 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 59019469 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59019747 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 59020000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59020047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59020231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59020485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59020544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59020601 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59020666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59020706 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59020821 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 59020916 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59020917 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59020963 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59021041 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59021275 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59021385 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59021434 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 59021440 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59021486 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59021502 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 59021651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59021823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59021922 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59022069 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59022311 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59022513 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59022607 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 59022661 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59022674 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59022726 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59022754 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59022798 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59022837 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59022896 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 59023054 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59023106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59023378 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 59023505 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59023686 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 59023762 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 59023805 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 59023811 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 59024136 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59024345 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59024360 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 59024505 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 59024567 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 59024593 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 59024686 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 59024705 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 59024760 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 59024775 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 59024854 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 59024872 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 59024935 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 59024957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59024984 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025073 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025100 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025123 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025291 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025355 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59025443 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025470 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025561 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025617 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025659 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025663 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025751 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025754 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59025828 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 59025840 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 59025959 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 59026316 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 59026360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59026369 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59026452 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59027149 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 59028029 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59028285 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 59029045 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 59029446 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 59029576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59030554 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59030712 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59031357 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59031447 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59031542 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 59031812 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59031975 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59032150 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 59032289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59032293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59032408 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59032426 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 59032491 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59032492 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 59033649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59034127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59034315 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59035167 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59035251 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59035282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59035397 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59035411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59035686 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 59035694 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59037250 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 59037251 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 59037755 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59038505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59039897 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59040346 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59041646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59043327 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59043411 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 59043595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59046965 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59047697 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59049863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59049965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59052172 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59054751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59055705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59056108 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59056327 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59056835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59057758 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59057794 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59057839 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59057843 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59061416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59064471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59064607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59064658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59064724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59065485 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59065530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59065691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59065854 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59065913 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59065918 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59065938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59066113 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59066173 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 59066285 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59066301 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59066322 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59066389 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59066487 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59066561 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59066792 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59066896 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 59067157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59067340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59067398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59067399 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59067453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59067870 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59067915 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59068351 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 59068409 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59068589 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59068677 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59068680 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 59068918 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 59069102 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59069176 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59069201 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59069222 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 59069259 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59069261 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59069314 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59069398 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59069625 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59070732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59070751 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59071016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59071381 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 59071426 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 59071691 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 59072494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59072768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59073249 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 59073557 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 59073790 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 59073907 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 59073966 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 59074160 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 59074163 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 59075122 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59075162 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 59075262 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 59075540 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 59075610 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 59077674 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59077731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59077771 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 59077897 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 59078066 C G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 59078162 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59078245 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 59078521 C T N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 59078684 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59078719 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59079052 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59079287 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 59079406 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 59079409 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 59079482 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 59079607 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 59079644 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59079649 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59079679 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59079831 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 59079869 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59079883 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 59079908 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59079915 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59080467 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 59080469 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 59080483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59080818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59081018 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59081189 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59081248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59081277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59081283 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59081298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59081324 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 59081357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59081509 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59081510 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59081648 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59081658 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59082468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59082473 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59082640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59082675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59082826 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59082833 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59083345 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59083363 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59083482 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59083568 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59083674 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59083779 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59083799 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 59083970 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 59084162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59084380 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59084637 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59085219 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59085413 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59085639 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 59086419 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59086614 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59086667 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59086721 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59086740 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59086903 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59086941 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59086963 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59087005 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59087223 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59087307 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59087318 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59087330 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59087345 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59087608 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 59087682 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 59087746 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 59087753 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 59088054 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 59088077 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 59088081 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 59088403 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59088747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59088890 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 59088930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59089011 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59089281 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59089342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59089424 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 59089520 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 59089685 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59089836 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59089969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59089979 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59090223 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59090311 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59090319 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59090343 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59090658 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59090696 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 59090721 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 59090748 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 59091039 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 59091150 A G Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 2 59091392 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59091470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59091638 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 59091744 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 59091950 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 59092022 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59092044 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 59092242 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59092506 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59092767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59093035 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 59093177 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59093189 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 59093201 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 59093224 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59093229 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 59093298 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59093396 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 59093566 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59093610 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 59093788 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 59093811 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 59093819 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 59093939 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 59094150 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59094201 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59094434 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59094515 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 59094712 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59094797 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59094957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59094962 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59095182 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59095308 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59095313 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59095384 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 59095461 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59095577 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59095643 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59095655 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59095741 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59095790 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59095851 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59096024 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59096322 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 59096354 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59096623 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59096826 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 59096833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59097312 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 59097529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59097644 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59097655 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59097685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59097914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59098187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59098384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59098560 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59098634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59098695 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59098961 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59100845 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 59105227 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59107056 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 59107567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59108848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59109132 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 59111640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59114083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59114472 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59115312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59115911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59116621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59116650 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 59117083 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59117332 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 59117738 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 59117835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59118193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59118249 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 59118917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59120556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59124728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59124843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59125100 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59125112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59125122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59128266 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59133755 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59139202 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59141016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59141196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59141983 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59143489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59147020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59148873 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59151520 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 59156833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59167058 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59169081 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 59169435 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 59169527 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 59171996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59173269 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59173370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59173381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59174037 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59174138 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59174932 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59174956 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59175008 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59175038 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59175145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59175175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59175186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59175202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59175242 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59175244 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59176430 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59176907 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59176925 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59177012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59177041 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59177043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59177206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59177519 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59177662 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59177679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59177695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59177698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59177776 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59177808 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59177822 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59177901 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59177935 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59178054 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59178551 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59178568 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59178590 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59178620 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59178650 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59178757 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59178805 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59178948 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 59179082 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 59179100 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 59179160 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 59179407 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59179437 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 59179459 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59179480 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59179540 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59179569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59179605 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 59179946 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59179953 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59179959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59179986 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 59181239 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 59181924 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59183537 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59183790 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59183842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59183953 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59184206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59184514 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59184535 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59184540 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59185646 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 59186347 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 59186443 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59186844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59187112 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59187281 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 59187305 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 59187908 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59188787 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 59188875 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59188961 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59189145 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59189272 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 59189424 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59190032 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59190067 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 59190194 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59190265 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59190830 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 59190839 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59191143 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 59191454 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59191754 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59191858 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59191992 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 59192012 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59192051 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59192824 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59193350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59193461 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59193593 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 59193857 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59194094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59195086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59195274 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59195618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59196152 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59196399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59196741 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 59196793 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59196816 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59196922 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59197234 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 59197258 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 59197647 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59197768 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59197803 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59198210 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59198453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59198482 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 59198534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59198535 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59198557 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 59198903 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 59198961 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 59199050 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 59199074 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 59199212 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 59199224 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59199230 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 59199266 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 59201964 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 59207039 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 59208263 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59208706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59209941 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59210329 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59210588 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 59210610 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59212131 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59212312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59213079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59213604 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 59213772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59215336 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59216835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59217389 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 59217406 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 59217423 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 59217434 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 59217439 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 59220083 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 59220701 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 59221499 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 59221687 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59221706 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59221764 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 59221770 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59221775 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 59221819 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 59222075 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59222150 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59222366 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 59222418 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 59222420 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 59222430 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 59222567 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59222576 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 59223466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59223826 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59224090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59224127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59224625 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59224709 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 59225023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59225168 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59226203 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 59226235 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 59226296 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 59226476 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 59226504 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 59226515 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59226571 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 59226695 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 59226920 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59226991 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 59227050 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59227065 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59227159 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59227258 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59227300 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 59227356 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 59227458 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59228193 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 59228234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59229623 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 59229843 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59230279 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59230339 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59230342 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59230367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59230483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59231041 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59231230 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59231402 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 59231670 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 59231969 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59232446 A G N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 59232491 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 59232641 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 59232891 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59232966 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59233369 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59233643 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59233717 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59233955 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59233958 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59234125 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59234238 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59234938 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 59235009 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59235757 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59236156 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 59236232 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 59236331 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 59236432 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 59236600 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 59236872 T C Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 59236934 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 59236944 A C Y N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 2 59237011 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 59237120 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59237576 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 59237618 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 59237623 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 59238178 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59238284 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 59238836 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 59239057 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 59239443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59239918 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59239982 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59240358 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59240789 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59240796 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59240879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59240924 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59241153 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 59241275 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 59241435 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59241596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59241607 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59241751 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59241775 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59241970 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59242683 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 59242734 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 59242814 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 59242899 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59243009 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59243480 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 59243506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59243859 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59244086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59247542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59250630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59250942 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59252615 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59253063 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59253269 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 59253281 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59256007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59256839 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 59256857 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59256876 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59256883 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59256977 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 59257022 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 59257482 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59257502 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59257509 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59257764 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 59257771 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59257788 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59257813 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59257839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59257854 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59257862 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59258058 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59258110 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59258158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59258178 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59258673 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59259344 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 59259407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59259410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59259547 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59259587 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59259830 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 59260057 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59260189 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59260215 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59260490 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 59260777 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59260786 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59260878 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59261131 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59262730 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59262909 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59262923 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59262958 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59263903 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 59263935 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 59263962 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59263970 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59263975 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59263990 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 59263992 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59264061 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 59264082 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 59264729 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 59264780 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59265023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59265211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59265333 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 59265339 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 59265351 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 59265424 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 59265563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59265633 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59265777 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 59265778 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 59265822 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59266535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59266733 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59266737 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59266816 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 59266834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59267050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59267152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59267247 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59267362 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 59267377 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 59268049 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59268059 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 59268129 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 59268356 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 59268443 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 59268454 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59268462 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 59268480 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 59268489 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 59268547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59268628 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 59268669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59268932 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 59268962 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59271446 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 59271834 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 59271897 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59272211 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 59272404 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 59272669 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59272712 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 59274128 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59274522 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59274840 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 59274900 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 59276728 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59277427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59279061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59279402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59287753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59288692 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 59288735 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59288972 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 59290656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59290718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59290960 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59290961 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59291064 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 59291097 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 59291472 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 59291637 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 59291750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59291808 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 59291950 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 59292969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59293142 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 59294933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59295582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59297281 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59297310 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 59297476 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 59297580 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59297634 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 59297649 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 59297770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59297932 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 59298150 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59298164 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 59298206 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 59298279 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 59298314 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 59298356 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 59298458 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 59298745 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 59298830 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 59299006 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 59299191 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 59299814 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59299824 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59299927 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59300220 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 59300222 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 59300283 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 59300495 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59300961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59300978 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59301068 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 59301373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59301447 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 59301670 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 59301873 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 59302027 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59302124 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 59303510 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59303930 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59303966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59303974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59304043 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59304101 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 59304426 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 59304503 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59304538 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 59304997 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 59305067 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 59305136 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59305888 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59305906 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 59305960 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 59306769 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 59306840 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 59306849 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 59306929 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 59307251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59307299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59307367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59308142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59308153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59308305 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 59308376 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59308487 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 59308512 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59308574 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 59308644 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59308884 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59310945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59311371 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 59314820 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59315708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59316512 A G N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 2 59316968 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 59316976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59317749 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 59317763 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 59317782 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 59317801 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59317839 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 59317880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59317894 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 59319121 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59319136 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59319603 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 59319751 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59320068 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 59320832 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59320865 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59320958 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 59321228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59321313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59321887 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59321893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59321963 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 59322096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59322304 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59323116 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 59323310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59323504 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 2 59323582 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 59323609 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59323614 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 59323657 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 59323680 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59324389 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 59324464 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 59324685 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59324821 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59325002 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 59325047 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 59325067 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 59325454 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59325499 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 59325610 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 59325685 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 59325972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59327738 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 59327878 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 59328053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59328210 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 59328212 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 59328242 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59328431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59328636 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 59329035 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 59329634 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 59329873 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 59329996 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 59330099 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 59330120 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 59330367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59330403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59330423 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 59330845 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59330849 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59331547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59331588 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 59331615 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 59331692 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 59331693 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 59331709 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 59331822 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 59331937 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 59332103 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 59332221 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59332222 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59332775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59332820 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 59333144 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 59333236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59333273 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 59333439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59334174 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 59334193 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59334283 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 59334841 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59335001 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59335091 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59335185 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59335194 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 59335290 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59335298 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59335302 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59335364 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 59335385 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59335519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59335520 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 59335543 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59335549 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59335737 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 59335746 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 59335903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59336130 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59336148 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 59336221 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59336289 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 59336886 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 59336913 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 59336927 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59336948 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 59337026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59337144 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 59337513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59338504 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 59338505 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59338585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59338950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59339024 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59339057 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59339106 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59339119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59339552 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 59341129 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59341616 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 59342080 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 59342221 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 59342345 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 59342360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59342609 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 59343486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59343548 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59343576 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59343837 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59343852 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59343865 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59343928 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59343948 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59344000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59344049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59344125 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59344194 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59344231 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59344303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59344363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59344959 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59345035 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 59345124 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 59345136 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59345155 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59345160 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59345176 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59345178 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59345636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59345709 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59346499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59346609 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 59346805 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 59347075 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 59347089 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 59347090 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 59347127 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 59347135 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 59347200 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 59347388 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59347776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59347880 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 59348714 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 59348985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59349055 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 59349083 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 59349133 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 59349182 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 59349325 C G N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 2 59349618 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 59349646 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 59349650 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 59349723 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 59349755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59349803 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 59349881 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 59350103 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 59350627 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 59351327 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59351399 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59351412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59351526 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 59351554 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 59351735 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 59351885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59351960 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59352098 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59352214 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59352233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59352248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59352322 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59352514 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59352588 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 59352611 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59352623 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59352653 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 59352791 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 59352882 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59352897 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59352958 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59353199 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 59353284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59353358 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 59353420 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59353421 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59353456 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59353491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59353612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59353768 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59354061 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59354681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59355260 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 59355263 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 59355523 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 59355535 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 59355564 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 59355604 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59355631 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 59355658 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 59355693 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 59355939 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 59355981 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 59356186 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 59356227 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 59356334 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59356605 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 59356650 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 59356676 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 59356705 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 59357189 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 59357229 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 59357999 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59359332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59359611 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59360755 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 59360886 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59360923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59360957 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59361014 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 59361067 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 59361131 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 59361168 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 59361206 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 59361216 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 59361217 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 59361372 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 59361377 A T N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 59361451 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 59361695 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 59361826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59361999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59362059 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59362060 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59362104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59362109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59362722 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59362785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59362802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59362917 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59362959 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59362961 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 59362987 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59363226 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59363441 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 59363553 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59363702 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59363738 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59363747 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59364400 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59365108 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59365360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59366041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59366144 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59366147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59366860 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59366917 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59367072 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59367543 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59367956 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59369553 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59369634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59369699 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59369891 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59369959 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59370784 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59371420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59371441 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59371870 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59372359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59372428 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59372460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59374749 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 59375155 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59376008 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59376545 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59376729 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59376939 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59376945 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59377275 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 59377467 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59377534 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59377627 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59377736 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 59377908 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59377962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59378101 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59378115 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 59378344 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59378647 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59378697 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 59378788 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 59378945 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 59379006 C A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 59379009 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 59379035 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 59379089 A C Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 2 59379319 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 59379654 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59379682 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 59379787 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59379839 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 59379925 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 59379970 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59380420 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 59380458 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 59380520 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59380578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59380583 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59380589 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59380631 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 59380653 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59380656 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59380684 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 59380695 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59380842 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59380885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59380993 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59381198 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59381250 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59381261 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59381311 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59381434 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59381446 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59381964 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59382001 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59382076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59382262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59382533 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 59382767 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59383428 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59383974 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 59383976 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 59384761 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59386514 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59387072 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59387073 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59388498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59390939 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59391178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59393456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59394427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59398397 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59398405 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 59401068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59404758 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59406938 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59407533 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59407542 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59407919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59408016 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59408132 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59408190 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 59408418 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 59408613 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 59408735 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59408753 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59408788 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59409092 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 59409269 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59409392 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59409433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59409823 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 59409835 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 59409846 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 59409876 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59410041 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59410061 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59410370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59410671 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 59410761 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59411296 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 59411424 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 59411558 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 59411571 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 59411766 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59411782 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 59411784 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 59412105 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 59412256 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 59412412 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59412587 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 59412629 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 59412657 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 59412670 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 59412698 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 59412769 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 59412834 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 59412862 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59412975 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 59413250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59413366 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 59413594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59413621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59414381 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59414638 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 59414724 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 59414770 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 59415056 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 59415568 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 59415612 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59415817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59415954 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59416034 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59416046 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59416047 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59416275 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 59416323 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59416327 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59416397 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 59416575 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59416777 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 59416928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59416948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59417002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59417051 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59417085 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 59417123 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 59417377 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 59417411 A T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 59417458 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59417564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59417644 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 59417730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59417799 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 59417927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59418032 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59418092 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59418155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59418172 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59418252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59418259 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59418293 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59418362 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59418401 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59418473 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 59418579 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59418594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59418645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59418658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59418896 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59418977 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59419045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59419065 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 59419164 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 59419177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59419216 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 59419224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59419773 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59419862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59419878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59419946 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59419967 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59420010 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59420099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59420121 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 59420170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59420171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59420182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59420230 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59420287 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59420436 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59420474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59420508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59420569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59420610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59420620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59420947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59420984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59421023 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59421038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59421203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59421236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59421289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59421365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59421368 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59421401 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59421445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59421550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59421626 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 59421642 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59421643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59421698 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59421730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59421792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59421987 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59422018 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 59422071 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59422096 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59422340 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 59422559 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59422914 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 59423220 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59423254 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 59423321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59423369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59423403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59423453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59423483 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59423526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59423592 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59423635 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59423643 C A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 59423697 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 59423735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59423981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59424202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59424498 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59424590 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59424634 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59424680 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59424709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59426748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59428075 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59428144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59428178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59430083 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59430447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59433771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59434751 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 59436439 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 59438812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59441695 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59441873 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59443552 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59447743 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 59448578 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 59448917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59449865 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59450843 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59451040 G C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 59454027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59461394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59462095 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59462652 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59463669 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59465406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59465600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59467015 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59468078 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59468167 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 59468177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59468284 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59468357 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 59468457 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 59468582 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59468655 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 2 59468659 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59468695 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 59468809 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59468812 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59469835 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59469847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59471349 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59472248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59472857 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59473794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59474044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59474049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59474306 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59474395 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59474487 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59474503 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59474638 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59474645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59474734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59474780 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 59475171 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 59475257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59475278 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 59475424 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 59475434 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59475744 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59476133 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 59476267 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 2 59476597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59476598 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 59476636 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59476675 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59476705 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59476722 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 59476753 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 59476880 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 59476942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59477245 G C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 59477267 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59477304 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59477314 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.266666666666667 21 9 10 1 4 2 59477346 C G Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 59477356 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 59477479 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 59477487 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 59477626 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59477714 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59477793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59478437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59478438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59478486 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59478633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59478907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59479327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59479711 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 59479742 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 59479757 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59479790 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 59479807 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 59479814 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 59479822 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 59479832 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 59479961 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 59480002 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59480085 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 59480359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59480411 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 59480445 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59480563 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 59481109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59481209 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59481623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59482961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59483863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59483868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59484397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59484411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59484471 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 59484483 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 59485747 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 59486023 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59486077 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 59486113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59486131 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59486156 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59486191 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 59486195 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59486423 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59486844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59487192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59487502 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 59487611 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 59487658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59488367 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59488921 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59491919 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59494202 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59495284 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59495418 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59496634 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 59497124 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59498838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59501326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59502492 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59503996 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59505270 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 59505304 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59505315 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59505366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59505664 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 59505665 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59508268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59508396 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59508729 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59509888 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 59510008 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59510052 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59510459 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 59510470 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 59510501 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 59510770 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59511237 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 59511728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59511753 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59512355 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59512365 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59512376 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59512815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59512945 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59512966 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59513026 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 59513114 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 59513233 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 59513245 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 59513253 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59513305 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 59513339 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 59514315 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 59514412 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59515115 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59515143 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59515258 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59516047 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59516472 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59516540 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 59516617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59516801 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 59516897 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 59516944 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59517175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59517221 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59517381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59517586 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 59517590 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 59517981 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59519443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59519613 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59519744 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59520332 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59520796 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59521463 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 59521553 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59522050 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 59522107 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 59522130 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 59522182 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 59522264 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59522306 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 59522446 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 59522469 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 59522520 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59522551 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59522618 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 59522787 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 59522968 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59523161 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59523432 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 59524502 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59524557 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 59524807 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59525030 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59525034 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59525165 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59525255 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59525257 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59525268 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59525331 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59525771 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59526180 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59526572 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59526868 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59526973 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59527138 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 59527188 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59527528 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 59527529 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 59527869 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 59528371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59528644 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59528713 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 59529034 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59529888 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 59529896 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59529941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59530158 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59530162 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59530180 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59530807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59530921 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59530955 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 59531266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59531289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59531484 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59531735 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59531741 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59531974 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 59532023 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59532025 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59532481 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 59533579 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59533599 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 59533628 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59533674 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59533726 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 59533792 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 59533819 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59534101 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59534179 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 59534265 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59534673 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 59534971 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 59535060 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 59535066 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 59535497 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59535500 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59535735 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59536139 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 59536150 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59536833 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59536914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59537364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59538822 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59539328 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59540100 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 59540163 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59540199 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 59540291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59540683 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 59540889 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 59540960 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 59541214 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 59541224 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 59541307 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59542258 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 59542274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59542840 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 59543013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59543219 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 59543276 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 59543338 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 59543347 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 59543417 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 59543476 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59543752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59543760 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59543822 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59543915 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 59544270 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 59544294 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 59544302 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59544379 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 59544432 T G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 59544635 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 59544891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59545206 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 59545238 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 59545308 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59545515 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 59545780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59545807 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59545809 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 59545973 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 59546026 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 59546145 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 59546232 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 59546276 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 59546430 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 59546581 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 59547501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59547805 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 59547829 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 59547902 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 59547951 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 59547970 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 59547994 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 59548083 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 59548125 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 59548277 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 59548364 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 59548439 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 59548459 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 59548605 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 59548682 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 59548722 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59548732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59548827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59549161 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59549181 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 59549344 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59549355 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59549377 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59549545 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 59550731 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 59551186 A T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 59551199 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 59551218 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 59551365 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 59551501 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59551546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59551676 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59552276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59552506 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 59552566 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59552641 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 59552658 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 59552824 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 59553647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59553712 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59553719 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59553858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59553927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59553933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59553963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59554632 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59554682 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 59554795 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59555028 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 59555102 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59555189 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 59555217 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 59555253 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59555566 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 59555594 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59556450 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59557023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59557230 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 59557787 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 59558273 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 59558425 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 59558579 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 59559041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59559117 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 59559259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59559316 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59559565 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59559659 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 59559695 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59559703 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 59559729 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59560313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59560838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59560846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59560856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59560888 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59560937 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59560963 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59560973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59561013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59561041 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 59561391 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59561392 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59561487 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59561704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59561775 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 59562154 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59562313 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 59562420 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 59562430 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 59562505 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59562521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59562540 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 59562659 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 59562800 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 59562899 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 59562919 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 59562928 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 59563098 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 59563171 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59563515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59563649 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59563911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59564114 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59564191 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59564203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59564332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59564391 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59564532 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 59564845 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 59564866 C G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 59564951 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59564963 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59564969 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 59564985 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 59565113 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59565209 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59565253 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 59565411 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 59565439 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 59565565 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 59565719 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 59565732 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 59565901 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 59566089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59566281 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 59566326 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 59566341 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 59566647 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 59566669 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 59567167 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 59567177 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 59567304 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 59567406 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 59567445 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 59567465 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 59567501 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59567505 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59567535 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 59567557 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 59567617 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 59567998 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 59568009 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 59568129 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 59568268 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 59568357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59568430 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59568896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59569197 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59569338 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 59569406 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 59569411 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 59570405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59570956 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59571200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59571689 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 59572709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59574841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59575663 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 59575765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59575897 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 59576006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59576019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59576026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59576157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59576171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59577492 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 59577523 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 59578059 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59578252 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59579722 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59579858 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 59579889 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 59579934 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 59579989 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59580005 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 59580214 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 59580372 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59580516 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 59581112 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 59581162 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59581168 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 59581371 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 59581542 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59581599 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 59581621 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 59581899 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 59581973 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59582222 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59582270 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59582470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59582517 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 59582540 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 59582554 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 59582583 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 59582820 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 59582968 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59583000 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 59583046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59583411 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 59583445 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 59583628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59583643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59583901 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 59584622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59585092 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59585641 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 59587825 G T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 59588179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59588379 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 59588520 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 59588533 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 59588751 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 59589242 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 59589608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59589651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59589787 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 59589983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59590644 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 59590673 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 59590759 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 59590810 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 59590884 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59590974 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59591068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59591080 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 59591132 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 59591135 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 59591328 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 59591364 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 59591379 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 59591445 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 59591453 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 59591460 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 59591493 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 59591696 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 59591999 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 59592010 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59592125 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 59592135 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59592264 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59592271 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 59592287 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 59592296 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59592300 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 59592313 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 59592391 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 59592417 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 59592445 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 59592485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59592532 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 59592624 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59592686 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 59592760 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59592788 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 59592860 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59592894 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 59592933 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 59592935 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59592978 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 59592983 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 59593053 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 59593055 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 59593098 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 59593204 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 59593220 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 59593375 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 59593399 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 59593475 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 59593773 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 59593789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59593913 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59594038 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59594073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59594202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59594296 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 59594444 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 59594470 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 59594539 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 59594706 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 59594714 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 59594881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59594897 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59594959 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 59594965 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59595210 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 59595665 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59595675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59595884 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59595886 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59595926 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59595935 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59596297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59596788 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 59597070 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 59597144 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 59597188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59597300 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59597343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59597407 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59597417 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 59597519 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59597737 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59597789 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59597795 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59597820 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59597877 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 59597914 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59597921 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59598224 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 59598303 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 59598459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59598526 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 59598681 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 59598826 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 59598985 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 59599100 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 59599161 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 59599551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59599566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59599776 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 59599836 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59600153 G T N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 2 59600265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59600365 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 59600601 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59600677 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59601286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59601367 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59601565 T G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59601622 T A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 59601860 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59601989 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59602252 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59602410 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 59602482 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59602615 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 59602653 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59602833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59602874 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59602944 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59603642 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 59603643 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59603728 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 59603733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59604120 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59604217 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 59604271 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 59604285 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59604302 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59604444 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 59604542 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 59604569 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 59604641 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59605100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59605562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59606635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59607761 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59608281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59608292 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59608548 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59609298 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59609310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59609361 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59609482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59609630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59609907 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59610890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59611261 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 59611272 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 59611277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59611478 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59611554 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59611817 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 59612461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59612476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59612496 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 59612519 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 59612663 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 59614039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59614045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59614267 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 59614365 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 59614438 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 59615253 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 59615490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59616322 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 59616539 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 59616702 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 59616736 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 59616945 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 59616997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59617048 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59617115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59617261 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 59617306 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 59619017 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59620428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59620634 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 59621801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59621844 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 59621914 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 59622092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59622111 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59622310 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 59622512 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 59622805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59622832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59622835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59623098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59623803 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 59624641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59625512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59625998 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59626033 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59626221 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59626656 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59627059 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 59627096 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 59627138 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59627194 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59627285 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59627575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59627722 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 59628470 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 59628993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59629098 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59629392 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 59629471 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 59629508 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59629540 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 59629947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59630657 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59630864 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59631110 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59631333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59631632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59631663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59631733 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59631770 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 59631788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59631819 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 59631911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59631980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59632054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59632075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59632136 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59632173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59632822 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 59632839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59635370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59635563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59635767 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 59639391 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59639938 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 59639939 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 59639957 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59640208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59640410 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 59640888 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 59640903 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 59642151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59642202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59642331 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59643672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59644620 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 59644750 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59645161 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59645427 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59645847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59645880 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59646202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59647072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59647113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59647236 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59647497 G T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 59649176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59649200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59649399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59649456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59651028 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59651174 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59651317 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59651506 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 59652091 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 59652366 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 59652394 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 59652461 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 59652829 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 59652894 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 59652938 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 59654293 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 59654391 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 59654416 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 59654420 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 59654470 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59654654 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 59654753 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 59654803 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 59654874 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 59654902 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59655026 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 59655232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59655840 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59655868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59655988 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59656040 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 59656092 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59656193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59656325 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 59656426 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 59656452 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 59656459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59657357 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59657497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59657720 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59657735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59657802 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59658460 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 59658508 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 59658612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59658649 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59658672 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 59658741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59658787 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59658808 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 59658895 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59658983 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 59659192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59659418 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 59659476 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 59659605 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 59659606 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 59659695 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59659710 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 59659738 G T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 59659786 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59659814 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59659854 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 59660035 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59660464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59660487 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59660565 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59660982 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59661106 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59661139 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59661220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59661235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59661320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59661512 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59661557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59661627 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59662007 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59662835 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59663762 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59664202 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 59664423 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 59664617 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 59665185 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 59665264 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 59665397 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59665403 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 59665621 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59665726 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 59665823 T A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 59665836 A T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 59666022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59666026 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 59666037 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 59666544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59666611 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59666787 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 59666832 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 59666846 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 59666892 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 59666969 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59667070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59667161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59667177 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 59667227 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 59667282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59667420 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59667511 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59667543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59667606 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 59667621 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 59667662 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59667732 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 59667734 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59667891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59667892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59667981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59673486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59674282 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59676958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59678463 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59678768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59678824 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59679375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59679871 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 59680075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59681301 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59682553 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59683107 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59685594 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 59685684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59687826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59688304 T A Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 59688367 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59688394 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59688898 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59689084 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 59689318 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59689396 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59690179 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 59690452 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 59691274 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59691452 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59692318 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59693767 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59696027 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59698843 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 59699951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59700379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59700500 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59701602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59701808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59703559 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 59704110 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59704126 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 59704140 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59704195 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59704262 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59704316 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59704453 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 59704483 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59704488 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59704627 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 59704789 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59704908 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59705113 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59705434 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 2 59705491 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 59705595 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 59705596 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59705702 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59705878 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59705975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59706020 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59706438 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59706491 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59706611 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 59706905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59706939 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59706959 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59706983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59707118 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 59707239 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 59707240 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 59707366 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 59707377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59707400 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59707417 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59707895 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59707955 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 59708005 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 59708020 C T Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 59708021 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 59708038 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 59708391 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59708622 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59708639 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59708804 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 59708806 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59708865 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 2 59708953 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59709038 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59709354 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59709551 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 59709835 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59710003 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 59710238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59710506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59710821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59710933 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59710990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59711139 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59711204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59711444 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 59711589 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59712813 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59712857 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 59713064 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59713101 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59713189 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59713240 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59714230 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 59714495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59714613 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59715641 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59720635 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59721530 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59721840 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59722227 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 59722591 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59722755 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59722828 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 59722969 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59722991 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59723044 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59723079 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59723140 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 59723192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59723444 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 59723539 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59723658 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 59723890 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59724016 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 59724138 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59724226 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 59724265 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 59724315 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 59724381 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 59724503 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 59724666 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59724906 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59724941 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59725539 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59725802 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 59726119 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 59726351 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 59726483 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 2 59730656 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 59731545 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59731615 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59731622 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 59731626 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59731704 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59731824 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 59732373 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 59732499 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59732565 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 59732828 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 59732843 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59732895 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59732901 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59732912 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59732925 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 59733101 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59733102 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59733135 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59733295 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59733341 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59733482 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 59733542 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59733770 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 59733786 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 59733936 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59734005 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59734056 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59734086 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 59734115 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59734148 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59734160 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59734189 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59734299 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 59734332 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 59734346 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 59734363 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 59734364 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59734432 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59734530 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59734590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59734665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59734716 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59734790 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59735427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59735439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59736147 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59737341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 59739838 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59739961 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 59741164 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 59744413 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 59744882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59746533 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59747661 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 59748962 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59749282 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 59750158 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59751870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59752047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59753548 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59754657 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59754695 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59755726 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59756076 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59758553 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59759374 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 59759483 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59759867 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59761551 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 59761946 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 59762315 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59762342 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59762484 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59764862 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59765535 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59766010 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59766290 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59766390 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59767866 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 59771934 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59772819 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59774010 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59775876 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 59777329 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59777507 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 59778028 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59778472 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59784377 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59789301 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 59789351 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 59789745 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 59790018 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 59790697 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59790837 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59790842 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 59791150 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59791416 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 59791473 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 59791664 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 59791995 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 59792246 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 59792275 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 59792428 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 59792484 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59792511 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 59792525 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 59793007 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59793019 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59793020 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59793240 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 59793287 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 2 59793315 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 59793423 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 59793437 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 59793663 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 59793829 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 59793890 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 59793972 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 59794147 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59794477 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59794501 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59794510 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59794560 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59795585 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59795668 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 59797310 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 59798968 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 59799132 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59799260 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 59799274 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 59799283 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 59799419 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59799434 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59799473 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59799502 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59799544 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59799616 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 59799657 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59799785 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 59799944 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59799961 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59800007 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59800009 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59800803 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59800976 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59801078 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 59801475 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59801557 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59801664 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59802236 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59802869 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59802876 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59803125 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59803868 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 59804704 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59804725 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59805001 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59806599 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59808315 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59812094 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59813781 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59816508 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59818107 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 59823500 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59825648 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 59826788 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 59829602 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59831945 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 59834568 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 59835377 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59836355 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59836638 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59840140 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 59841500 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59842008 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 59843421 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 59843688 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59844672 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59844777 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59844854 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59845453 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59846179 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 59846202 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 59846274 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 59846288 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 59846297 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 59846403 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 59846421 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 59846487 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 59846578 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59846618 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59846673 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 59846703 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 59846800 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59846817 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59846833 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59846872 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59847620 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 59847624 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 59847721 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59847757 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59847811 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 59847843 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 59847844 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 59847991 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 59848064 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 59848256 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 59848398 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 59848444 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 59848604 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 59848814 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59848888 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59848941 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59849090 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 59849261 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59849383 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59849387 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59849543 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59849595 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 59849645 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 59849771 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59849793 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59849824 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59849881 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 59849884 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59850034 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 59850735 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 59852057 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 59852396 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59852639 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59852903 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 59853067 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 59853358 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59854094 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59854670 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59854696 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 59854727 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59856103 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 59856293 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59856515 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59856542 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59856672 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59856694 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 59857695 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59857734 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 59857818 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 59859448 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 59861981 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59862355 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 59862376 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59867345 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59869264 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59869414 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 59870099 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 59870477 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59870728 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59870746 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59870840 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 59870923 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59872619 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59873733 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59874060 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 59874165 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 59874265 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 59876473 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 59876955 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59878978 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 59880316 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 59882206 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59884916 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59885759 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 59886104 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 59886586 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59889294 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59890400 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 59892128 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 59893064 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59896221 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 59900121 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59901973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59901995 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59902298 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 59902433 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59902439 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59902459 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59902483 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 59902559 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59902810 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 59902846 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 59902906 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59902989 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 59903309 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59903312 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59903341 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59903509 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 59903984 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59904185 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59904186 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59904220 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59904777 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59905059 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59905533 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59905566 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59905600 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59905617 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 59906214 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59908054 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59910752 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59911067 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59911398 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59911694 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59912008 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 59912170 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59912540 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59912690 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59912861 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59913482 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59913542 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59913871 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59914436 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 59914654 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 59916523 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59916700 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59916770 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 59916784 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 59916803 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 59916906 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 59917206 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59918178 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59918652 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59919821 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59921241 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59927467 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 59927468 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 59928394 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59928973 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59928988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59929432 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59931275 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 59932213 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59932240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59933152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59933649 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59934737 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59934847 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59935170 C T Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 59935479 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 59936828 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59936967 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59938513 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59939355 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59939368 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59939381 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59939408 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59940913 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 59940931 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 59941496 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 59942971 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59943404 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59943537 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59944044 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59944387 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 59944398 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 59945961 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59946566 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59946904 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59948287 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 59948507 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 59949613 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59949722 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59950550 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59952803 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59953293 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59955580 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59956403 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59957852 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 59958233 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59958949 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59959114 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59960591 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59964497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59965901 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59968471 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 59969822 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59970064 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59970712 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59971115 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59971872 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 59975187 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 59975369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 59975931 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 59977229 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 59978692 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59978979 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 59979072 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 59979073 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 59980258 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59980866 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59980885 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 59980929 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 59980949 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 59981017 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59981123 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 59981126 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 59982637 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59982866 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59983211 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59984073 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 59986397 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59987249 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59987573 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59987852 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 59988720 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59988935 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 59988990 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 59989099 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59989119 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59989159 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59989555 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59989929 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59990339 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 59990396 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 59990442 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 59990680 T G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 59990722 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 59990747 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 59990937 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 59991086 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59991093 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59991322 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 59991344 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59991428 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59991584 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59991604 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59991775 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59991776 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59991921 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59991982 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59991994 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59992173 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59992218 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 59992246 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 59992326 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 59992357 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59992374 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 59992461 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 59993170 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 59993180 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 59993244 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59993279 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59993394 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 59993609 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 59993699 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59994503 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59994506 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59994583 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59994810 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59994852 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59994961 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59995138 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 59995139 C G Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 59995485 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 59995509 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 59995770 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59995781 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59995808 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59995826 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59995906 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59995942 A T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 59996077 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 59996125 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 59996130 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 59996393 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 59997002 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59997054 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59997186 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 59997260 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 59997351 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 59997361 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 59997432 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59997490 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 59997693 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59997891 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 59998022 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 59998236 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 59998346 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 59998350 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 59998359 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 59998606 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 59998748 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59998759 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59998773 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59998797 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59998798 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59999051 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 59999064 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 59999141 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 59999195 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 59999312 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 59999460 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 59999674 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 59999689 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60000729 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60000978 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60000998 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60001427 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 60001661 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60001676 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60001736 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60001868 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 60001966 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60002124 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60002138 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60002145 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60002485 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60002664 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 60002836 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60003197 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 60003364 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 60003382 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 60003409 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 60003446 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 60003471 T G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 60003806 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60003837 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 60003847 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 60003898 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60003926 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60003930 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60003978 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 60004091 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60004124 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 60004150 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60004189 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60004208 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60004213 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60004283 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60004302 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60004310 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60004364 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60004388 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 60004554 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60004649 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60004660 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60005227 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 60005270 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60005292 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60005882 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60007226 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60009016 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60010498 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60014138 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60014479 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60016163 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60016266 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60016734 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60016935 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60017169 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60018648 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60019608 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 60020201 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60020504 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 60020532 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60020909 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60021012 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60021086 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60021353 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 60021433 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 60021462 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 60021464 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60021842 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60021978 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 60021996 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60022363 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60022364 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60022527 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60022598 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60022630 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 60022633 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60022721 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 60022883 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60023869 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60023876 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60023887 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60023893 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 60023978 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60024007 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60024553 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 60024820 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60024824 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60024959 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60025067 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60025222 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60025288 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60025424 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60025491 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 60025572 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60025628 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60025648 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60025692 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60025777 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60025869 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 60025951 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60026046 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60026068 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60026118 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60026119 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60026141 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60026229 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60026339 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60026485 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60026609 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60026728 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60026732 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60026753 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 60026816 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 60027128 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 60027231 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 60027370 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60027378 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60027383 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60027392 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60027399 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60027410 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60027444 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60027629 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60027632 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60027657 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 60027660 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 60027672 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 60027720 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 60027787 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 60028358 T A Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 60028546 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60028643 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60028664 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60028673 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60028837 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60028875 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60028889 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60028912 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 60028937 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60028980 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60029003 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60029114 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60029129 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60029173 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60029261 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60029294 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60029417 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60029474 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60029638 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60030037 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60030119 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60030160 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 60030300 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60030827 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 60030849 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60030878 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 60030896 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60031160 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60031445 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60031616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60031884 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 60031913 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60032277 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60032911 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 60033114 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60033263 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60033525 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 60033561 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60034919 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60036324 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 60037074 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 60037269 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 60037322 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 60037350 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 60037355 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 60037372 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 60037384 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 60037424 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 60037472 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 60037579 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 60037712 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 60037740 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 60037779 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 60038021 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 60038038 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 60038066 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 60038107 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 60038153 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 60038165 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 60038880 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 60039290 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60039332 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60039398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60039559 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 60039868 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60039985 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60041065 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60042274 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60043300 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60044072 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60044143 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60048314 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 60049064 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 60049247 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60051367 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60053100 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60053565 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60055489 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 60057201 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60059328 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60059585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60060349 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 60060712 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60061996 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60064261 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60064756 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60064759 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60064939 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60065840 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60072605 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60075121 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 60075168 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60075333 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 60075350 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60075360 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60076192 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60076324 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60076866 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60078553 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60079512 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60080086 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 60080137 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60081759 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60083739 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60086865 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60087550 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 60087620 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 60088172 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60088186 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 60088690 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60088959 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60089055 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60090233 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 60091157 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60091353 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60091499 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60091514 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 60092845 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60093856 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60094825 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60095596 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 60096830 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60101516 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 60101564 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60101834 C T N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 60101925 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60102083 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 60102108 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60102423 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 60102473 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 60102578 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 60102601 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60102647 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 60102671 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60102693 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 60103146 G A Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.0909090909090909 11 11 1 9 1 2 60103154 T C Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 9 11 1 7 2 2 60103280 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 60103348 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 60103439 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 60103464 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 60103536 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60103789 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60103886 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60104003 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60104040 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60104055 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60104147 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60104182 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 60104294 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60104338 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60104746 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60104806 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60105050 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60105389 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60105893 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60105969 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60105979 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60106295 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 60106484 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 60106504 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 60106523 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 60107170 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 60107376 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60107394 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60107430 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60107455 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60107900 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60109134 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 60109268 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60109291 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60109293 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60109503 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60109521 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 60109534 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 60109662 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 60109807 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60110627 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 60110650 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 60110706 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 60112497 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 60115601 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60115606 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60115927 A C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 60116571 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60116582 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60116678 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60116884 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60118309 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 60118482 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60118677 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60118692 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60118721 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60118760 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 60118788 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 60118799 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60119107 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60119140 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60119369 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60119426 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60119830 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60120029 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60120221 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 60120264 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60120268 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 60120285 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60120293 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60120370 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60120386 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60120402 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60120437 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60120525 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60120548 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60120612 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 60120686 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60120787 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60120971 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60121017 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60121018 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60121086 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 60121456 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 60121881 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60122325 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 60122344 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60122445 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60122683 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60123052 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60123454 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60123507 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60123849 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60123878 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60123890 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60124181 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60124657 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 60124679 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60124766 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60124869 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60124892 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60124929 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60125061 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 60125072 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60125142 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 60126218 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60126998 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60127036 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60127149 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60127190 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60127211 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60127247 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60127517 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60128255 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60128352 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60128364 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 60128401 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60128409 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60128555 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60129059 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 60129136 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60129367 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60129477 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60129499 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60129533 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 60129651 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60129667 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60129752 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60129928 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60130215 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60130315 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60130347 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60130463 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60130698 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60130892 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60131009 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60131300 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60131408 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 60131513 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60132205 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 60132362 C G N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 60133675 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 60133966 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 60134160 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60134161 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60134567 G A Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 60134622 T C Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 60136189 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60136269 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60136317 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 60136654 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60136671 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60136965 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 60137826 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60140509 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60141290 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60141404 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60142591 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60143187 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60143329 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60144362 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60149535 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60151205 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60152024 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 60152064 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 60152128 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 60152349 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60152533 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60152597 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 60152634 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 60152762 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 60152765 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 60153029 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 60153187 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 60153188 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 60153269 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60153415 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 60153419 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 60153484 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 60153587 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60153599 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60155041 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60155422 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60155712 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 60155995 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 60157717 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60158555 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60158836 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60159947 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 60160009 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60160281 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60161123 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 60161324 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60161678 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60161764 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60162071 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60162694 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60162850 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 60162864 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 60163357 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60163686 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60164076 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60164102 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60164112 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60164213 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60164285 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60164759 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60164899 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60164946 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60164976 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60165595 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60165598 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60165673 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60165701 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60165937 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60166040 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60166228 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60166233 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60166256 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60166321 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60166364 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60166608 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60166784 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60166797 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60166838 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60166886 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60167138 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60167148 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60167173 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60167547 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60167576 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60167659 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60168600 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60168622 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60171281 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60171681 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60172726 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60173257 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60174864 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60177626 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60178501 T A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 60180570 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60180857 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60180982 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60181790 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60181810 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60182434 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 60183255 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60183262 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60184831 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60184968 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60184981 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60185586 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60186196 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60186238 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60186930 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60186983 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60187309 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60187409 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60187452 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60187477 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60187478 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60187490 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60187505 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 60187564 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60187746 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60187785 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60187993 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60188591 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60188745 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60188762 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60188927 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60189152 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60189200 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60189223 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60189433 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60189563 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60189711 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60190008 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60190012 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60190022 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60190025 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60190449 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60190508 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60190549 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60190646 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60190761 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60190767 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60190772 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60190868 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60190947 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 60190982 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60191045 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60191214 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 60191236 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 60191261 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 60191294 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 60191303 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60191315 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 60191807 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60192209 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60192434 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60192588 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60192702 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60196788 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60196814 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60197328 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 60197560 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 60198680 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 60198753 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 60198775 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 60198913 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 60199101 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 60199246 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 60199541 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60199850 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 60199934 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 60200309 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 60200310 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 60200333 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 60200344 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 60200509 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 60200542 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 60200558 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 60200649 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 60201927 C A N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 60202176 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60202293 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 60202402 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 60202464 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 60202743 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 60202764 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60202801 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60202811 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60202817 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 60202866 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 60202899 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60202922 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 60202987 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60203035 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60204050 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60204468 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 60205035 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 60205161 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 60205230 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 60207727 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60209324 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 60211361 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60212580 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 60213163 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 60213703 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 60213718 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 60213832 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60215000 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 60215238 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 60215323 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60215871 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60217164 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60221371 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60221535 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60223857 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 60224269 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 60224469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60224974 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60225169 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 60225280 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60225370 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 60225447 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 60225793 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 60228986 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 60230592 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60230913 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60232345 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 60233077 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60233638 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 60233835 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60233876 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 60234497 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 60234540 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60235072 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 60235288 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 60235296 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 60235486 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60235626 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 60235686 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60235930 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60236400 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 60236650 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 60237324 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 2 60237352 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60237403 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60237438 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60237506 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60237634 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60237647 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60237738 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 60237889 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 2 60237956 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 60237993 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 2 60238068 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 60238097 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 2 60238305 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60238326 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 60238338 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 2 60239731 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60239740 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 60239813 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60239901 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60240087 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 60240092 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 60240112 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60240409 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60240581 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60240632 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 60240722 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60240724 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60240738 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60240745 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60240780 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 60240802 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60240958 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60241046 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 60241081 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60241460 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 60241570 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 60241618 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60241825 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60241846 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60241938 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 60241998 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60242179 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60242352 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 60242369 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 60242423 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60243313 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60243385 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60243574 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60243657 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60243681 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60243834 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 60243847 C G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 60243869 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 60243877 C T Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 60243882 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 60243973 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 60243975 C T Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 60244093 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 60244153 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60244167 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60244187 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60244385 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 60244447 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60244466 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60244496 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 60244506 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 60244517 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 60244626 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60244659 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60244911 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60244922 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60245429 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60245441 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60245676 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60245759 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 60245785 T C Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 60245894 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60245906 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60246009 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 60246037 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 60246119 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 60246123 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 60246137 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 60246186 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 60246219 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 60246316 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60246416 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 60246454 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60246482 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60246588 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 60246631 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60246672 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60246749 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 60246765 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 60246921 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60247158 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60247174 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 60247213 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60247245 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60247251 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 60247267 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 60247272 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60247295 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 60248021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60248300 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60249411 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 60250194 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 60250353 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60250725 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60250872 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60251406 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60251676 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60251746 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 60251774 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60252527 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60253115 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60253151 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60253218 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60253931 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 60255140 T G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 60256394 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60256529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60256838 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60257876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60259173 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60259253 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 60259409 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 60259544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60260101 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 60260781 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60260795 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 60261941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60262289 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 60262913 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60263263 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 60263270 T G N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 2 60263917 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 60263918 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 60265383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60265599 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 60265817 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60265874 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 60265911 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60265916 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 60265931 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 60266076 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60266262 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 60266293 A T Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 60266344 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 60266356 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 60266376 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 60266434 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 60266500 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 60266523 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 60266998 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 60267012 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 60267028 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 60267095 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 60267200 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60267231 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 60267394 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 60268033 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60268130 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60268138 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60268205 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60268263 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60268284 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60268335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60268402 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60268427 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60268438 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60268440 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60268453 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60268633 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60268678 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 60268744 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 60268760 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60268787 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60268899 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 60268936 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60268973 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 60268987 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60269072 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 60269238 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 60269548 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60269700 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60269894 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60269908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60270208 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60270892 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60270946 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60270959 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60271115 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60271408 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60271956 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60272558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60272952 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60273210 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60273993 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 60274011 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 60274125 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60274381 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60275135 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60275870 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60276090 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60276205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60276422 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60276450 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60276635 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60276872 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60277352 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60277849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60278200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60278227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60279176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60279816 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60279991 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60280525 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60281172 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60281264 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60281380 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 60281499 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 60281610 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 60281957 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60282268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60282291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60282561 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60282630 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60282798 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60283525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60283541 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60283692 C G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 60283768 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60283796 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 60283847 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60283891 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 60283936 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60283987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60283988 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60284004 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 60284097 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 60284249 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60284382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60284396 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 60284437 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60284454 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60284467 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 60284489 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 60284514 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60284549 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60284599 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 60284610 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 60284664 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 60284694 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 60284743 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60284773 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60284802 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60284893 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 60284927 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60284948 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60284957 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 60285126 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60285137 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60285368 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 60285415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60285494 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60285496 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60285626 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 60285641 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60285710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60285770 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60285814 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60285911 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60285945 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60286029 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60286030 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60286044 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60286200 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 60286208 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 60286276 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 60286431 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 60286432 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 60286459 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 60286735 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60286786 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60287348 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60287399 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60287454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60287480 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60287664 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60287755 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60287870 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60288032 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60288157 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60288254 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 60288263 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 60288270 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60288316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60288331 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60288348 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 60288811 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 60289021 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60289025 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60289695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60290123 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60290133 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60290216 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 60290346 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 60290519 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 60290781 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60290837 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60291241 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60291425 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60291544 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60291676 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60291764 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60291818 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60291867 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60291949 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 60291968 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60292007 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60292055 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60292083 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60292102 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60292106 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60292225 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 60292516 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60292681 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 60292823 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60292824 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60292943 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60292949 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60293012 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60293115 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 60293339 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 60293349 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60293383 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 60293455 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 60293459 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 60293614 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 60294253 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60294477 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60294487 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60294555 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60294731 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 60294812 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60294836 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 60294977 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60295010 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60295067 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 60295115 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 60295504 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60295571 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60295902 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60295903 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60296295 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60296487 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60297323 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60297352 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 60297486 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60297740 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60297842 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60297947 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60298071 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60298182 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 60298461 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 60298465 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60298947 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60298999 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60299175 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60299241 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60299381 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60299640 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 60299699 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 60299781 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 60299790 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60299896 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60299897 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 60300034 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 60300081 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60300886 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60300951 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60300984 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60301079 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 60301205 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60301213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60301346 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60301721 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60301929 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60301944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60301982 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60302020 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60302022 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60302207 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60302240 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60302386 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60302418 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60302526 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60302529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60302566 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60302775 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60302811 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 60302838 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60302856 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60302885 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60303078 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60303694 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60303753 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 60303757 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60303976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60304278 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 60304334 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 60304346 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 60305149 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60305500 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60306771 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 60308853 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 60308911 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60309123 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60309508 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60309509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60309687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60309876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60311107 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60311731 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60311739 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60311977 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60312773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60312860 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60313830 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60313918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60314010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60315648 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60315912 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60316148 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 60316175 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60316580 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60316591 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60317471 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 60317856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60317981 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60318087 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60318509 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60318510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60318604 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60319122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60319397 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60319436 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60320213 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 60320265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60320397 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60320509 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 60320602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60320810 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60321085 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60321963 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60322555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60322797 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 60323782 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 60324361 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60324594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60325097 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60325632 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60327650 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 60328044 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60328519 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60328645 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60328788 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60329614 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60329832 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60329977 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60330606 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 60330633 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 60330653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60330812 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60331662 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60331665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60332045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60332500 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 60333264 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 60333409 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 60333719 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 60334198 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 60334259 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60334287 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60334639 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60334700 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 60334723 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 60334737 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60334826 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60335193 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 60335202 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 60335404 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 60335408 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60335457 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60336060 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 60336547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60336602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60338708 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60338865 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60339704 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60339922 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60340168 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60340457 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60341032 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 60341292 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 60341342 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 60341408 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60341445 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60341460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60341524 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 60341532 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60341658 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60341685 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 60342891 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60342913 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60343085 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60343119 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60343272 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60343689 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60343780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60343809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60343898 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 60343938 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60343953 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 60344000 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 60344032 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60344038 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 60344133 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 60344184 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 60344201 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 60344251 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60344412 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 60344425 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 60344513 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 60344629 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60344652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60344785 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 60344901 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60344945 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 60345115 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 60345235 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 60345255 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 60345280 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 60345291 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 60345324 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60345702 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60345706 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60345779 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60345817 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60345877 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60345891 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 60345952 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60346001 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60346110 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 60346219 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 60346274 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60346392 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 60346429 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60346455 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60346501 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 60346563 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 60346589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60346669 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 60346735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60346770 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 60346811 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60346815 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60346834 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60346837 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 60346847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60346883 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60346899 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60346903 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60346912 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60346921 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60346947 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60347023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60347037 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60347091 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 60347107 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 60347111 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 60347119 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 60347144 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 60347151 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 60347159 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 60347177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60347213 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 60347223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60347229 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 60347251 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 60347308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60347312 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60347323 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 60347435 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 60347436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60347447 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60347468 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 60347624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60347674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60347685 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 60347764 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 60347793 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60348177 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 60348192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60348307 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 60348395 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60348467 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 60348528 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 60348737 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 60348752 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 60349018 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 60349066 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 60349491 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60349656 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 60350015 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60350314 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 60350733 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60351092 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 60351679 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 60351722 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 60351804 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 60351851 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 60351879 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60351915 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 60351993 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60352117 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60352159 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 60352396 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 60352424 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 60352526 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 60352637 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60352720 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 60352725 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60352758 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 60352819 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 60352845 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 60352914 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 60353052 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60353315 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 60353587 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 60353606 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60353635 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60353770 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 60354086 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 60354137 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60354342 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 60354361 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 60354422 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 60354497 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 60354508 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60354887 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60355109 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 60355112 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 60355171 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 60355178 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 60355436 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 60355439 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 60355598 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 60355926 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60355928 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 60356000 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 60356171 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 60356296 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60356759 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60356940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60357299 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 60357569 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 60357866 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60358044 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 60358288 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 60358300 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 60358398 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60358414 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 60358455 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 60358477 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 60358478 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 60358517 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 60358532 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 60358535 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 60358908 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60358957 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60359030 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 60359108 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 60359488 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60359556 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60361194 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 60361260 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 60361282 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 60361658 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60361852 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 60362125 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60364319 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60364727 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 2 60365507 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 60365981 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60366706 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60366870 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 60366941 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 60367104 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60367556 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 60367693 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 60367698 C A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 60367705 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 60367868 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 60370191 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60370430 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60370553 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60371544 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60372767 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60373432 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60373678 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60374007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60374325 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 60374451 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60376029 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 60376055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60376312 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60376870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60377032 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60377269 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 60377331 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60377363 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 60377515 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60377555 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 60377561 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 60377628 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60377680 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 60377788 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60377847 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60377879 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 60377935 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 60377981 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60377984 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 60378003 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 60378197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60378255 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 60378269 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 60378388 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 60378678 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60378682 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 60378810 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60378834 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 60379260 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 60379698 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60382970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60383575 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 60383822 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 60396346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60397341 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60397688 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60400403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60400468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60402381 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60405863 A G Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 60406050 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 60407804 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 60408462 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 60409016 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60409038 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 60409504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60409527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60410178 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60412215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60412390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60414121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60414456 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 60415027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60415207 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 60415493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60415900 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60416051 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 60416643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60417451 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 60417549 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 60417563 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 60419324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60419466 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60420096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60420293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60420324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60422651 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60423010 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 60433194 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60435145 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60435151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60435489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60436406 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60437654 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60438055 A C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 60438310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60442315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60443092 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 60444128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60444848 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60445534 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 60446135 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 60446398 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 60446478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60446553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60446758 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 60446788 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60446809 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 60446939 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 60446941 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 60447288 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 60447686 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60447687 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 60447724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60447725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60448830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60449491 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60449647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60450039 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 60450115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60450552 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 60451403 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 60451741 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 60451811 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60453015 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60453031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60453133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60453501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60454354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60454805 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60454843 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 60455210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60456806 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 60457054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60458537 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 60459171 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60459188 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60459506 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60460414 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 60461431 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 60461499 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 60461557 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 60461592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60461694 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 60462114 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60462491 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60462495 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60462549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60462680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60462868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60462893 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 60462938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60463098 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 60463817 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 60463830 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 60463867 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 60464157 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 60464162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60464234 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 60464277 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 60464287 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 60464296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60464298 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 60464363 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 60464391 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 60464393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60464482 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 60464485 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 60464495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60464505 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 60464601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60464700 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60464707 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60464748 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60464767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60464773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60464977 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60465412 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60465413 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60465443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60465481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60465644 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 60466284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60466885 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 60467037 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60467498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60467521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60467641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60467699 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60467717 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60467728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60467746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60467749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60467785 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60467907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60468273 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60468310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60468369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60468624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60468633 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60468789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60468817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60468856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60468910 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 60469122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60469196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60470938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60470985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60471244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60471400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60471493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60471523 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60471543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60471565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60471691 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 60471699 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 60471704 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60471712 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60471870 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60472109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60472362 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 60472395 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 60472475 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 60472508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60472529 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60473408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60474681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60475642 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60476956 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 60476999 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 60477004 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60477053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60477064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60477150 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 60477171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60477196 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 60477354 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 60477717 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60477782 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60477936 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 60478559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60478562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60480840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60481299 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 60482058 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 60482346 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 60482347 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 60482578 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 60482779 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60483006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60483266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60483484 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 60483636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60483642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60483650 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 60483693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60483868 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60484164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60484184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60484498 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 60484515 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 60484545 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60484592 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 60484813 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 60486033 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 60486215 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 60486384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60486688 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60487054 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 60487304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60487587 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 60487641 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 60487862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60488134 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60488159 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 60488400 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 60488509 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 60488571 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 60488758 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 60488913 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 60488957 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60489075 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 60489190 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 60489326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60489347 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 60489377 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60489423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60489424 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 60489452 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60489476 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 60489576 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 60489676 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60489706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60489718 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 60489729 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 60489750 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 60489768 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 60489954 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 60489993 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 60490283 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60490407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60490780 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60490781 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 60490832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60490875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60490886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60490912 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60490921 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60490980 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60491096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60491098 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60491340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60491386 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60491603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60491686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60491804 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 60492028 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 60492141 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 60492167 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 60492221 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 60492442 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 60492575 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 2 60492614 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 2 60492744 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 60492807 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 60492870 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 60492964 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 60493091 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60493128 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60493152 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60493222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60493235 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60493475 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 60493507 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 2 60493534 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 2 60493535 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 60493652 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 60493678 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 60493700 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 60494161 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60494332 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 60495323 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60495458 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 60495486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60495521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60495854 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60496021 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60496035 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60496058 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60496073 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60496098 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60496108 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60496121 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 60496201 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 60496615 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60496640 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 60496897 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60496905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60499011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60501424 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60502193 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60506032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60506848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60509503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60509760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60512242 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60516471 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60517275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60518493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60518655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60518774 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 2 60519004 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 60519139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60519542 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60519786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60519932 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 60520082 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 60520117 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 60520296 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 60520430 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 60520467 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 60520525 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60520529 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 60520552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60520708 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 60520732 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60520808 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 60520809 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 60520838 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 60520937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60521040 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 60521067 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 60521104 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 60521275 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 60521299 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 60521944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60522152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60522336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60522339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60522409 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 60522438 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 60522482 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 60522637 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 60522638 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 60523001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60523062 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 60523111 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 60523258 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 60523553 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 60523624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60523664 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60523728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60523730 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 60523805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60523994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60524031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60524115 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 60524504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60524660 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 60524755 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60524803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60524935 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 60525116 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 60525141 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60525143 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60525236 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 60525315 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 60525384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60525466 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 60525512 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60526070 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 60526499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60526762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60526787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60526814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60527041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60527084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60527107 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60527581 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60527664 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60527724 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60527769 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 60527957 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 60528021 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 60528086 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 60528180 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 60528259 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60529195 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60529247 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60529421 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60529436 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60529559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60529564 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60529690 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 60529932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60530026 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60530105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60530179 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60530206 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60530690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60531098 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60531117 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 2 60531167 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60531185 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60531544 T C Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 60532144 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60532370 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60533650 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60535734 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60536474 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 2 60536585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60536749 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60537124 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 60537248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60537334 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 60537562 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60537609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60537692 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 60537713 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60537851 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60537975 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60538129 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60538149 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60538291 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60538347 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60538422 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60539105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60539244 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 60539327 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60539347 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60539685 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 60539845 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 60539924 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60539978 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60540168 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60540181 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60540216 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60540389 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 60540393 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 60546027 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 60546737 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 60546838 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 60546938 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 60547258 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 60547276 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 60548175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60548388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60549959 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 60550024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60550365 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 60550867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60550881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60550932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60551252 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60551672 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60551679 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 60553480 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60553590 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 60553842 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60554000 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60554052 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60554067 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60554183 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60554188 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 60554273 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 60554291 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 60554310 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60554376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60554996 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60555019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60555020 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 60555217 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 60555295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60555309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60555513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60555820 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60555837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60555843 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60556057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60556098 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60556187 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60556925 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 60557002 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 60557008 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 60557025 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 60557033 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60557640 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 60557721 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 60557847 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60558576 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60559573 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60560690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60561694 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 60562165 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60566155 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60567126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60567282 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60567331 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60567421 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 60567435 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 60567479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60567729 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60567915 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60568287 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60571470 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60574261 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 60575169 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 60577451 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60577833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60577874 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60578475 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 60578480 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60578669 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 60578765 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60578841 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 60578979 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 60578981 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 60579009 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 60579074 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60579322 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60579473 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60579528 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60579566 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 60579618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60582932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60583484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60584213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60586267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60587472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60588211 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60588739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60591216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60591662 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60592494 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60594489 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 60596007 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60596586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60597662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60599069 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 60599311 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60599504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60601088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60601094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60602511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60602848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60603281 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 60604636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60610375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60611690 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60611754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60611839 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 60611896 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60611933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60612555 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60612665 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 60612788 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60614881 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 60616822 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60616847 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 60618183 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60618184 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60619267 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 60619374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60619572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60619583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60619699 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 60619734 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 60619861 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 60620013 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60620195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60620554 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60620557 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60620727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60621040 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60621858 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 60623057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60623297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60624443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60625324 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 60625661 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60625671 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60625767 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60625794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60627432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60627505 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 60628014 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60628135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60628288 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60628289 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 60628644 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60628750 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 60629319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60629464 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60629625 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60629677 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60629779 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60630035 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 60630252 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60630292 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60630354 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 60632092 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60633822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60634175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60634392 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60634504 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60635498 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60635628 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 60635729 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 60635778 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 60636105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60636769 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60636954 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60637109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60637323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60639642 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60640259 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60640353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60641024 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 60642529 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60643161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60643201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60643213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60643239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60643240 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 60643577 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 60643848 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60643859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60643921 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 60644043 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 60644101 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 60644172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60644189 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60644269 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60644800 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 60644814 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60644890 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60645242 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 60645243 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 60645336 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 60645476 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 60645941 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 60645981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60646323 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 60646335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60646520 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60646773 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60646783 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60647103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60647325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60647744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60648141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60648197 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 60648626 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60649293 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 60649307 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60649633 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60650014 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 60651332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60653825 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 60654728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60654729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60655279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60656556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60657576 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60657670 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 60657680 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 60658130 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 60658140 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 60658831 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 60659785 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60660968 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 60662161 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60663820 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 60665761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60665821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60665970 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60666094 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60666232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60666506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60666623 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 60667785 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60667810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60668052 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 60668134 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60669073 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 60669100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60669151 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 60669171 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 60669202 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 60669249 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 60669360 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 60669580 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 60669634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60669662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60669769 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60669888 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 60670176 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60670204 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60670297 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60670526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60670567 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 60674398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60675083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60676252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60676728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60677384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60677693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60677700 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 60677769 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 60677860 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 2 60678010 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 60678335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60679973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60679990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60680190 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60681790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60682963 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 60684593 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60685328 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60686298 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60686474 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60687565 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 60688117 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60688296 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60688425 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60689025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60689249 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60689472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60689621 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 60689670 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60689698 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60689807 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60689867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60689868 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60690129 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60690188 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 60690199 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 60690201 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 60690253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60690265 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60690475 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 60690479 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 60690586 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 60690590 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60690642 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60690704 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60690717 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60690820 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60690968 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 60691045 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60691050 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60691066 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60691328 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60691424 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60691550 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60691749 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60691963 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 60691979 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60692007 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 60692063 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60692155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60692186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60692219 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60692285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60692461 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60692540 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 60692609 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60692612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60692631 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60692736 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 60692815 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 60692840 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 60692963 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60693673 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60693716 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60693924 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60694116 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60694128 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 60694161 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60694250 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60694609 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 60694644 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 60694708 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60694820 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 60694868 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60695041 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60695317 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 60695489 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 60695651 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60695988 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60696060 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60696090 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60696106 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60696139 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 60696762 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60696769 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 60696853 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 60696946 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60696950 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60697059 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60697094 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60697140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60697187 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 60697265 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60697447 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60697518 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60698217 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 60700104 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60700649 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 60701620 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60702911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60704692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60704960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60705172 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60705175 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60706057 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60706109 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60706161 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60706604 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60706718 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60707700 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60708847 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60709529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60709549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60709805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60709806 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60709952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60710164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60710182 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 60710284 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 60710329 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60710420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60710436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60710523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60711042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60711101 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60711266 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 60711340 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 60711461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60711593 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 60711654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60711659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60711940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60712023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60712096 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60712147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60712335 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60712337 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 60712747 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 60712750 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 60712782 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 60712834 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 60712862 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 60712931 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 60713146 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 60713250 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60713370 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 60713371 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60713540 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 60713620 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 60713683 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 2 60713784 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 60714409 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60715348 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60715376 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 60715382 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 60715590 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60715664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60715773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60717058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60717366 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60718158 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 60718306 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60718349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60718936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60719073 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 60719761 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60719782 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60721196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60721391 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 60722352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60722516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60722885 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 60722953 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60723547 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60723647 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60723664 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60723919 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 60723963 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 60724002 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 60724238 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60724347 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60724400 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 60724466 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60724503 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60724544 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60724568 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 60724647 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60724658 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60724779 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 60725448 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60725469 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60725964 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60726597 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60726647 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 60726669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60726740 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60726869 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60727092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60727213 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60727467 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 60728016 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60728273 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60728440 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60728487 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60729048 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 60729387 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60729547 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60729609 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60729643 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 60729794 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60730078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60730165 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 60730455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60730551 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60732041 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60732409 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60732751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60733340 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 60734341 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60734744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60735173 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 60735254 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60736240 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 60736823 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60736936 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60737100 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60737297 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 60737331 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60738147 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60738388 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 60739585 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60740645 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 60741382 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 60741527 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 60741545 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 60741713 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 60741808 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 60742893 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60743043 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60743634 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60746196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60746401 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 60750264 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 60752653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60756206 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 60756255 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60756382 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 60756682 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60756920 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60757000 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60757195 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60757326 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 60757390 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 60757396 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 60757644 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 60757704 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 60758533 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 60758784 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 60758825 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 60758938 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60759289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60760075 C A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 60760106 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 60760164 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60760402 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 60760631 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 60760878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60760909 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 60760970 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 60761189 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 60761251 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 60761257 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60761895 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 60761901 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 60762112 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60762445 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 60762516 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 60762766 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 60762973 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 60763088 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60763124 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60763235 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60763247 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 60763275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60763544 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60763546 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60763592 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60763768 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 60765666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60766475 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 60767464 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60767716 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60767861 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60768545 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 60768766 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 60768798 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 60768913 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 60769036 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60769077 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60769460 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 60769786 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 60770520 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 60770711 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60770880 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60771495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60772658 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60772697 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 60774676 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60775008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60775084 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 60776739 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 60776758 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60777187 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 60777271 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60779859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60780437 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60781077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60783347 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 60784899 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 60785992 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60786040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60786266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60786267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60788136 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60788538 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 60788800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60788887 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60789032 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 60789211 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 60789476 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 60789501 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60789706 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 60790067 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 60790081 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 60790141 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 60790212 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60790375 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60790376 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60790392 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60790645 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60790995 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60791140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60791188 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 60791538 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60791564 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60791581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60791603 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60791657 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60791723 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60791788 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60791824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60791842 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60791848 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60791888 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60792458 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60792475 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 60792718 A T Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 60792766 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 60792848 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60793368 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60793565 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60793605 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60793693 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60793719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60793896 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 60794027 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 60794107 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 60794144 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60794149 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60794159 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 60794215 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 60794226 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 60794257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60794266 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60794275 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60794308 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60794392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60794412 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60794607 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 60794618 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 60794629 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60794660 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 60794842 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 60794860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60794931 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60794952 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 60795040 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 60795132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60795396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60796150 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 60799412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60804395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60804681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60805743 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 60806151 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60806204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60807259 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60807439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60807761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60809736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60809936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60810889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60812928 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 60813216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60813660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60813738 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60813913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60813929 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60813985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60814007 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60814161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60815054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60815512 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60815830 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60816057 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60817195 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60817305 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60817831 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60818236 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60818407 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60818752 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 60818971 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 60818974 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60819007 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60820510 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 60821514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60822716 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60823198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60823325 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60823875 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 60824440 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 60824579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60825294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60826008 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60826713 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 60827042 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 60827191 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60827604 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 60827713 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60827757 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60827911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60827913 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60828134 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60831774 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 60833117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60834461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60834507 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60834991 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 60835675 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60835695 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60835859 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60836333 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 60836512 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60836648 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 60837235 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60837298 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60837473 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60837870 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 60837935 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60838316 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 60838912 T A Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 60839520 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 60839664 A T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60840193 C A Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 60841015 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60841406 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60841675 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60841754 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60841898 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60841948 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60842042 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60842087 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60842201 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60842210 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60842450 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60842476 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60842676 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60843164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60843179 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60843337 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60843355 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60843395 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60843411 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60843425 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60843485 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 2 60843505 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60843602 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60843656 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60843691 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60843722 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 60843823 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60843828 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60843837 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60843910 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60843915 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60844117 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60844168 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60844221 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 60844348 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60844386 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 60844421 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 60844438 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60844488 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60844523 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60844654 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60844672 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60845151 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60848470 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 60849064 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60849400 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60849700 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60853204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60855393 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 60855829 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60855962 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 60856728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60858521 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60858652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60859308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60859902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60860576 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60861053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60861763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60861871 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60864604 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 60866564 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60866600 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 2 60866708 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60866841 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60866860 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 60866951 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60867028 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60867380 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 60867409 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 60867484 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 60867487 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 60867496 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 60867514 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 60867518 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 60867564 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 60867565 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 60867612 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 60867763 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 60868598 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 60868642 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 60868828 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60868899 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 60869212 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 60869794 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60870166 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60870839 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 60874476 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60875715 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 60881725 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 60882732 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60883338 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60883347 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60883361 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60883579 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 60883780 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 60884312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60884816 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 60885268 T G Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 60886779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60886903 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 60889603 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 60891075 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60891502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60891883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60892127 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60892684 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 60892720 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 60893070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60893120 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 60893133 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 60893372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60893512 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 60893784 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 2 60893922 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.466666666666667 0.133333333333333 0.4 16 14 7 2 6 2 60894016 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 60894077 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60894110 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 60894165 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60894219 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 2 60894309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60894383 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 60894462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60894540 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 60894542 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60894691 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 60894841 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60894842 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 60894855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60895118 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 60895196 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 60895202 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 60895214 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 60895257 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 60895320 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 60895369 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 60895378 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 60895520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60895528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60895558 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 60895564 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60895950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60896014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60896209 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60896619 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 60896637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60896851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60897471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60897582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60897897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60899519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60899937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60904485 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 60906578 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 60909134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60909441 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 60910701 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 60910821 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60912697 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60914198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60914699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60914804 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 60915301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60916676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60917172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60917236 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60917457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60919047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60919931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60920033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60920163 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60922212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60923415 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 60924538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60924669 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 60924998 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60925276 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 60925509 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 60926013 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60927467 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 60929706 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 60929729 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 60930309 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60933588 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 60934533 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60935692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60935693 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60935706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60935835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60937177 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60937809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60938087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60940953 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60940964 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 60941046 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 60941136 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60941164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60941215 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 60941248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60941380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60941714 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 60942182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60942328 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 60943037 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 60943685 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 60943696 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 60943849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60943860 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 60943879 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 60943940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60943964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60943980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60944027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60944250 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60944439 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 60945399 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60945658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60947123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60947347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60950139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60950475 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 60950541 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 60950842 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60951211 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60952020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60952812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60952816 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60952870 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 60953522 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 60953536 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 60953808 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 60953833 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 60954424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60954439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60954455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60954910 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60954923 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60955505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60955675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60955687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60955997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60956002 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 60956040 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 60956482 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 60956491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60956513 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 60956531 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 60956544 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 60956576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60956834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60957094 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 60958039 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 60958048 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60958070 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 60958071 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 60958724 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60962511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60962719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60963657 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60966416 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60966615 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 60968181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60968289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60968716 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60968773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60968797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60969461 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60971570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60972160 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60972195 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 60972389 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60972451 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 60972630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60972670 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60972683 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60972727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60972787 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60972992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60973018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60973064 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 60973332 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60973685 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 60974061 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 60974208 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 60974249 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 60974530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60974844 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 60974899 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 60975728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60975789 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 60975827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60976029 C A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 60976077 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 60976445 T C N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 60976573 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 60976689 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 60976726 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 60977169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60977215 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60977230 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 60977617 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 60977727 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60978127 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60978136 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 60978305 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 60978720 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60979233 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60979290 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60979524 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60979595 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60979853 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 60979983 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 60980038 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 60980127 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 60980322 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 60980347 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 60980613 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 60980646 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 60980838 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 60980983 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 60981246 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 60981335 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 60981358 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 60981407 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60981438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60981452 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 60981534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60981655 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60981695 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60981712 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60981778 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60981789 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 60981802 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60981827 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 60981895 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 60981933 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60981959 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60981979 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60982028 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60982054 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 60982092 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 60982184 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 60982207 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 60982312 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60982328 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60982343 G C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 60982391 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60982424 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60982464 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60982520 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60982538 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60982600 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60982885 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60982903 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60982923 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60983017 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60983029 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60983097 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60983140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60983195 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 60983253 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60983291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60983827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60983841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60983870 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60983930 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 60983968 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 60984028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60984063 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 60984185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60984194 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60984390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60984644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60984929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60985087 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60985173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60985380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60985685 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 60985806 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 60985874 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60985887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60986296 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 60986836 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60986852 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60987074 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60987423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60987492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60987529 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60987591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60987679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60987705 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60987748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60987773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60987844 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60987953 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60988100 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60988140 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 60988232 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60988233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60988406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60988420 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60988685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60988788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60988789 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60988936 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60989014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60989019 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 60989120 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 60989184 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 60989281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60989893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60992115 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60992656 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 60992675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60992770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60993017 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 60993113 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60993330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60993593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60994027 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 60994045 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 60994151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60994228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60994279 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 60994332 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 60994518 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 60994551 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 60994702 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 60994752 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 60994769 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 60994827 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 60994841 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 60994928 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 60995040 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 60995045 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 60995054 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 60995099 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 60995183 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 60995258 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60995300 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60995303 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60995371 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 60995387 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 60995436 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60995440 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 60995466 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 60995470 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 60995485 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 60995634 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 60995638 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 60995655 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 60995680 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 60995819 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 60995893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60995894 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60995939 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60995948 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 60996000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60996019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60996056 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60996074 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60996222 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 60996300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60996449 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60996540 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 60996625 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60996632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60996662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60996707 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 60996836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60996848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60997543 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 60997550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60997562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60997611 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 60997684 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 60997707 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 60997718 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 60997779 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 60998426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60998954 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 60999069 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60999104 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 60999141 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60999167 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 60999181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60999199 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60999304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60999319 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 60999367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 60999403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60999408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60999436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60999472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60999473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60999511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60999632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 60999706 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 60999842 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 60999847 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 60999859 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 60999924 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 61000101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61000179 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61000389 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 61000477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61001204 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61002806 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61002910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61003231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61003378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61003575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61004374 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61006232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61006845 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 61006985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61010637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61011342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61011604 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61011634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61013647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61013735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61015409 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61015923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61016271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61017126 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61017571 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61018103 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 61018622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61022702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61025750 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61027671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61027983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61028175 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61028242 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61028414 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 61028525 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 61028527 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 61028742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61028810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61029017 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 61029115 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61030500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61031018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61031799 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61031866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61031912 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61032303 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61032868 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 61032994 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 61033129 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 61033223 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 61033868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61034052 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 61034128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61035633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61036753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61036887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61038499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61038567 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61038651 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 61038784 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 61038888 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61039055 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61039070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61040154 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 61040185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61040261 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61041725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61041761 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61041848 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 61041957 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61041983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61042225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61042300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61042406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61042726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61043269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61043427 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 61043497 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61044356 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61044404 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61044707 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 61044764 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 61044809 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 61044845 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 61044857 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61044936 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61045097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61045519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61045770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61045808 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 61046369 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 61046910 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 61046973 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 61047093 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 61047522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61047766 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 61048121 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 61048201 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61048411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61049444 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 61052783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61052941 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61052962 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61052979 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61053003 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61053489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61053518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61053775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61054520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61054685 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61055049 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61055630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61056882 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61057464 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61057647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61058467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61059167 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 61059178 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 61059187 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 61059237 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 61059550 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 61059566 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 61059598 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 61059635 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 61059903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61059994 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61060027 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61060078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61060095 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61060126 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61060214 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61060224 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61060254 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61060278 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 61060313 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61060361 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 61060492 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 61060525 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 61060716 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61061392 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 61062040 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61062221 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61062307 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 61062311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61062346 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 61062606 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 61062765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61062775 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 61062955 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61063026 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 61063031 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 61063084 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61063202 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 61063253 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 61063380 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61063410 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61063420 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 61063422 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 61063964 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 61064036 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 61064139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61064372 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61064384 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61064439 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61064500 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61064503 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61064766 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 61064829 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 61064857 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 61064879 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61064991 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61065387 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 61065772 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61065976 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 61066159 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 61066175 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 61066527 A T Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 61066594 A C Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 61066598 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61066692 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 61066734 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61066867 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 61067110 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 61067486 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 61067586 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 61068007 A G Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 61068047 C T Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 61068084 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 61068271 G T Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 61069412 A G Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 2 61069661 T C Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 61069701 T G Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 61069772 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 61069945 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 61069970 G A Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 61069979 A T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 61070061 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 61071551 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 61071577 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 61071692 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 61071778 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 61072367 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 61072805 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61072875 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61072941 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61073247 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 61073383 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 61073524 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61074220 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 61074369 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 61074444 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 61074847 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61075014 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61075026 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61075355 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61075356 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61075560 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61075961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61076097 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61076127 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61076148 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 61076166 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 61076838 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 61077065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61077115 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61077190 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61077209 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61077222 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61077912 A G N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 61078066 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61078974 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61079957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61080017 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61080157 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61080572 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61080694 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61080711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61081004 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61081372 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61081513 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61081589 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61081765 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61081840 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61081856 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61081870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61081902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61082050 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61082059 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61082128 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61082553 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61082555 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 61082593 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61082932 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61083120 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 61083204 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 61083272 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61083288 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61083976 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61084139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61084327 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61085078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61085857 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 61086080 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61086104 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61086470 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61086478 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61086514 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61086719 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61086892 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61087095 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61087151 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 61087172 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 61087312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61087405 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 61087409 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61087450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61087488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61087513 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61087538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61087578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61087585 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61087760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61087915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61087926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61088156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61088282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61088308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61088571 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61088781 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61088850 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61089001 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61089086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61089117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61089168 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61089463 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61089511 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 61089574 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 61089744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61089847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61090443 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61090532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61090760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61090884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61091006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61091034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61091066 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61091119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61091450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61092023 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61092039 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61092060 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61092317 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61092461 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61092654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61092731 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61092762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61092937 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61093115 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61093132 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61094065 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61094262 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61094775 A C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 61094796 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 61095762 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 61097554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61097559 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61099294 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61100237 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61100421 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61100470 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61100556 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 61100614 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61100673 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61100766 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 61100805 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61101014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61101076 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61101278 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61101302 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 61101318 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61101328 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61101429 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61101573 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61101606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61102043 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61102303 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 61102551 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61102574 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61102604 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61102864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61102999 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 61103064 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 61103077 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 61103193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61103481 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61103508 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61103755 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61103903 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 61103927 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 61104062 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61104177 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61104435 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61104501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61104514 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61104668 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 61104673 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 61104716 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61104744 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 61104841 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 61104956 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 61104979 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 61104992 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61105017 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 61105069 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 61105080 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 61105229 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 61105505 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 61105621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61105677 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61105680 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61105689 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61106096 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 61106570 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 61106656 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61106663 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 61106704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61106794 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61107037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61107211 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61107259 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61107260 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61107277 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61107326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61107394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61107482 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 61107501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61107675 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61108120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61108344 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61109656 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61109805 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 61109905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61110069 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61110128 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 61110388 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61110596 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61110839 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61111124 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 61111735 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61111841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61111897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61112077 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61112776 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 61113049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61113084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61113135 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61113192 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61113240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61113256 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61113423 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61113440 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61113476 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61113637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61113683 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61113696 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61113714 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61113761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61113817 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 61113819 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61113919 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 61114195 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61114384 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61114468 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61114551 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61114988 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61115021 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61115102 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 61115175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61115323 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61115326 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 61115344 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 61115353 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 61115501 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61115949 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 61116210 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 61116262 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61116480 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 61116759 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 61116760 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 61116773 A C N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 61116826 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 61117392 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 61117396 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61117841 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61117860 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61118143 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61118224 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61118437 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61118492 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 61118970 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 61119071 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61119971 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61120006 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61120720 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 61120796 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61120948 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61120973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61120977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61120986 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61121069 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61121163 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 61121259 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 61121341 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 61121364 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 61121412 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 61121491 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 61121598 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 61121930 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61122094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61122234 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61122336 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61122346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61122430 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 61122478 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61122748 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61123734 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 61123737 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61123791 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61123795 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61124428 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61124829 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 61125564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61125712 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61126636 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61126956 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61127121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61127338 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61127499 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 61127500 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 61127646 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 61127776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61127858 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 61128030 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 61128320 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61128374 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61128540 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61128677 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61129351 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 61129725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61129750 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 61129870 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 61130519 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61130940 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61131333 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61131456 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61131819 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61131956 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61131983 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 61132106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61133212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61133390 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61133987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61134111 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61134657 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61134828 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61134981 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 61135133 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 61135405 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61135457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61136030 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 61136056 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61136534 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61138062 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 61138098 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61138171 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61138185 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61138232 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 61138387 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61138397 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 61138403 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 61138469 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 61138479 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 61138485 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 61138514 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61138530 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61139311 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61139317 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61139366 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61139443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61139501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61139879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61140510 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 61140620 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 61140756 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 61140981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61141037 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 61141148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61141186 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 61141215 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61141222 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61141624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61142095 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61142222 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61143869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61144979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61145193 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61146087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61146902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61147249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61147302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61147438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61148399 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 61149456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61149676 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 61150630 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 61150653 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61150783 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 61151297 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 61151340 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61151379 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61151381 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61151422 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61151469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61151490 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 61151789 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 61151810 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 61151905 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 61151907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61151923 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 61151963 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61152027 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61152086 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 61152153 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61152360 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 61152411 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61152485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61152582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61152648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61152693 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61152764 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 61152829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61152943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61153313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61153411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61153459 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 61153542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61154092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61154209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61154254 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 61154561 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61155190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61156330 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61156335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61158008 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 61158514 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 61158700 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 61158769 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 61159157 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 61159225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61159274 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 61159575 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 61160399 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 61160648 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61160752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61160793 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61160826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61160884 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61160946 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 61160999 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61161229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61161289 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 61162039 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61162702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61162996 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61163201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61163337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61163651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61164021 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 61164481 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 61164496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61165878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61166247 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 61166255 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 61168236 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 61169060 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61169297 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61169442 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61169608 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61170027 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 61170058 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61170096 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 61170158 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61170687 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61171999 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61172074 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61172870 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 61173969 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 61174174 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61175901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61176802 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61176942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61177018 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61177656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61178071 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61178789 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61181026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61181047 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61182283 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 61183256 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61184525 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61184534 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61184743 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 61186486 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 61187714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61188450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61189206 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 61189422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61191167 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 61191374 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 61191419 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 61191682 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 61191851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61192196 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 61192233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61192699 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 61193522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61193571 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61193892 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61193906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61193937 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61194643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61195216 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 61195535 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 61195705 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 61195815 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61196175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61196207 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 61196395 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 61196455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61196545 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61196589 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61196611 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61196640 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61196656 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61196699 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 61196755 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61196912 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61196923 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61197119 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 61197148 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 61197157 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 61197165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61197174 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61197178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61197272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61197307 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 61197319 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 61197336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61197367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61197429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61197461 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61197499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61197766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61197862 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 61198241 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 61198268 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 61198422 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 61198450 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61198646 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61198809 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61198925 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 61199112 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 61199238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61199296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61199308 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61199391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61199452 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 61199474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61199511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61199539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61199556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61199578 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 61199585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61199594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61199616 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61199645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61199668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61199680 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61199683 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61199814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61200058 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 61200162 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 61200185 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 61200189 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 61200217 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 61200370 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 61200423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61200467 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61200478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61200561 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 61200564 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 61200625 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 61200688 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61200715 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61200920 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 61201082 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 61201095 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 61201187 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 61201289 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 61201295 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 61201563 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 61201717 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 61201719 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 61201956 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 61201974 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61202033 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 61202944 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 61202987 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 61203007 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 61203074 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 61203122 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 61203224 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 61203238 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 61203251 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 61203402 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 61203601 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 61203624 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 61203684 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 61203685 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 61203847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61204288 C A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 2 61204554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61204723 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 61204784 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 61204852 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61204892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61205007 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 61205038 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 61205095 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 61205114 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 61205166 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 61205307 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 61205327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61205336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61205370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61205400 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61205444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61205613 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61205729 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 61205884 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61205956 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61206012 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 61206081 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61206143 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61206514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61206730 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61207310 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 61207442 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61207473 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61207507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61207538 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 61207542 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 61207585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61207988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61208233 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 61208255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61208260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61208296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61208336 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61208470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61208477 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61208493 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61208581 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61208632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61208638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61208895 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61208922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61209113 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 61209277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61209311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61209317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61209384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61209534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61209556 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61209626 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61209745 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61210081 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61210212 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61211224 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 61211289 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 61211290 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61211376 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 61211558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61211631 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 61211669 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 61211853 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 61212031 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 61212149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61212160 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61212241 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 61212319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61212347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61212573 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61212655 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61212927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61212938 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61213136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61213268 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61213648 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 61213697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61213749 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 61213845 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61213849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61213870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61213927 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 61213963 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61213980 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 61214013 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61214014 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61214053 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61214137 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 61215324 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 61215349 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 61215407 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 61215431 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 61215537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61215722 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 61215728 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 61215860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61215938 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 61216737 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 61216789 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 61216955 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 61217129 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 61217139 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61217163 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 61217181 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 61217297 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 61217302 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 61217335 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 61217908 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61218128 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 61218217 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 61219159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61219726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61219784 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61219785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61219951 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61220745 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61220862 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61220925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61221241 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61221300 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 61221373 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 61221408 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 61221442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61221445 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 61221458 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61221472 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 61221474 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 61221527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61221530 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 61221541 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 61221612 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 61221641 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61221820 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 61222082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61222551 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 61222758 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 61222899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61222965 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 61223561 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61223568 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61223846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61223886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61223985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61224018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61224067 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61224085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61224097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61224166 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61224228 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61224310 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61225212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61225224 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61226286 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 61226852 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 61226865 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 61226876 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 61226965 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 61226972 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 61227023 T C Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 61227458 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61227459 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61227593 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61227751 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 61227900 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61228120 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61228562 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61229002 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61229084 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 61229106 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 61229307 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 61229370 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 61230026 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 61230255 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 61230345 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 61230505 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 61230643 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 61230654 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 61230709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61230820 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 61230995 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 61231001 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 61231013 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 61231014 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 61231062 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61231675 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 61231793 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 61231973 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 61232020 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 61232104 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 61232106 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 61232599 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 61232706 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 61232763 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 61233234 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 61233545 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 61233583 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 61233609 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 61233932 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 61234172 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 61234280 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61234827 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 61235002 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61235086 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61235208 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 61235426 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61235963 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 61236252 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 61236799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61236964 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 61237320 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 61239012 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 61239275 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 61239320 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61239367 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61239461 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61239737 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 61240270 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61240683 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61240846 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 61242421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61243172 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61243305 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61243934 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 61243936 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 61244075 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61244179 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 61244218 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61244389 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61244749 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61244947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61244959 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 61245060 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 61245194 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 61246436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61246901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61248631 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61249522 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61249831 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61250635 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61250661 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61250747 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61252285 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61252759 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 61253701 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 61253847 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61256883 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 61260808 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61261970 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61262286 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61262336 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61264414 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61264429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61264875 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 61267849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61267903 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61268161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61268470 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 61268897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61269367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61269445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61269446 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61269929 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61270005 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 61270076 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61272908 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61272941 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61274234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61274364 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61274691 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61275166 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61275170 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61275486 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 61276014 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61276631 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61276674 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61276874 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61284095 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61284167 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61284246 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 61284313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61284502 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61284669 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61284707 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61284714 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61284926 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61284955 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61284988 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 61284997 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61285141 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61285326 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61285394 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 61285469 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61285832 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 61285950 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 61285992 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 61286028 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 61286060 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 61286125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61286197 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 61286303 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 61286722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61286780 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 61287281 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 61287295 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 61287411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61287465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61288057 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 61288180 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61288355 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 61288467 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 61288841 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61288856 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61288885 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61288957 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 61289037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61289157 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61289322 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61289468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61289501 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 61289869 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 61291342 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61291361 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61291430 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61291494 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 61291524 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 61291530 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61291544 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 61291631 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61291636 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61291707 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61291824 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61292077 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61292269 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61292319 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 61292442 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 61292790 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 61292828 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 61292920 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 61293090 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 61293123 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 61293231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61293368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61293418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61293431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61293440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61293495 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61293706 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 61293771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61294039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61294098 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61294226 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 61294227 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 61294520 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 61294703 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61295144 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 61295147 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61295726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61296323 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 61296571 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61296961 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61297159 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 61297161 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61297180 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 61297196 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61297414 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 61297713 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 61297852 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 61298491 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 61298577 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 61298926 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 61298939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61298995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61299007 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 61299017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61299051 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 61299136 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 61299158 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 61299243 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61299308 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 61299390 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 61299395 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 61299502 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61299519 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61299535 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61299536 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61299625 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 61299685 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61299705 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 61299719 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 61299766 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61299769 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61299868 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61299978 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61300031 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 61300100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61300153 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61300222 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61300228 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61300304 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61300437 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61300473 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61300504 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61300506 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61300544 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61300640 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61300721 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61300820 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61300893 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 61300915 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61301105 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61301221 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61301303 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61301318 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 61301329 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61301442 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 61301453 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 61302346 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 61303012 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 61303047 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61303985 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61304017 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61304031 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61304126 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61304463 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 61304703 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 61304726 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61304769 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 61304802 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 61304849 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 61304890 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 61305250 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 61305322 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 61305556 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 61305557 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 61305599 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 61305865 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 61306128 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61306164 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 61306268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61306605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61307303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61307413 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 61307523 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61307652 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61307658 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61307745 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 61307767 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 61307779 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 61307896 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 61307999 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61308190 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61308192 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61308280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61308304 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61308375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61308432 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61308552 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 61308584 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 61308591 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 61308599 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 61308790 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61309229 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 61309933 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61310872 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61313283 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61313586 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 61314634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61315214 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 61315703 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 61315811 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61315891 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61316187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61316363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61316696 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61317345 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61318123 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61318194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61318457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61318934 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 61318963 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61319053 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61319350 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 61320365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61320373 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61320462 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61321939 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 61322020 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61322825 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61322870 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61323502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61323808 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61323818 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61323980 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 61324380 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 61325075 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 61325111 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61325182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61325312 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61325338 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61325527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61325581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61325604 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61325633 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61326181 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61326256 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61326444 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61328004 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61328145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61328567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61328766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61328989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61329047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61329191 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61329374 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61329597 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61329601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61330067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61330227 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61330431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61330512 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61330559 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 61330569 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 61330581 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 61330628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61330674 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61330851 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 61331007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61331019 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 61331173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61331202 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 61331251 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 61331285 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 61331352 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 61331410 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 61331496 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 61331637 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 61331649 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 61331665 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 61331678 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 61331795 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 61331826 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61331874 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61332663 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61332681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61332732 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 61332778 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 61332808 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 61332835 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 61332877 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 61333037 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 61333106 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 61333217 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 61333236 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61333541 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 61333604 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 61333716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61333717 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 61333792 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 61333890 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61333897 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61334676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61334807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61335526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61335536 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61335687 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61336828 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 61338782 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61339490 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61339514 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 61339528 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 61339795 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 61339912 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 61340326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61340333 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 61340346 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 61340453 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 61340457 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61340498 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 61340538 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61340742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61340825 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 61340884 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 61340912 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 61340952 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 61341040 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 61341057 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 61341372 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 61341758 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 61341862 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61341994 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 61342075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61342167 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 61342252 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61342532 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 61342549 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61342627 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61342694 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61342793 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 61342862 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61342875 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 61342881 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 61342897 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 61342954 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61342968 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61342972 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61343122 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61343193 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61343248 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 61343340 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 61343379 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 61343420 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61343457 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 61343600 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 61343725 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 61343849 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 61343853 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 61343922 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 61343923 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61343990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61344129 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 61344147 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 61344343 T C Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 61344380 G C Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 2 61344490 C T Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 61344512 A T Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 61344532 T G Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 2 61344566 G C Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 61344588 G A Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 61344594 G A Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 2 61344599 T C Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 61344621 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 61344737 A G Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 61344750 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 61344751 G A Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 61344769 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 61344777 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 61344824 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61344886 G C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 61344895 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 61344898 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61345015 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61345143 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61345198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61345216 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61345408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61345436 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61345551 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61350456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61351591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61351621 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61351964 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 61352161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61352907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61353093 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61353492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61353640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61353960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61354183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61354208 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61354216 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61354576 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61354649 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61354722 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61354808 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61354809 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61354867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61355001 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61355082 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61355127 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61355163 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 61355189 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 61355333 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 61355651 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61355684 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61355685 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61355751 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 61355766 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 61355801 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 61355807 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 61355883 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 61355922 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61356061 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 61356090 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61356147 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 61356157 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 61356158 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 61356219 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61356557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61356778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61356886 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61356939 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61357298 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61357362 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 61357392 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 61357418 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 61357470 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 61357562 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 61357590 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 61357640 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 61357641 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 61357652 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 61357763 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61357765 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 61357797 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61357878 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 61357897 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 61357973 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 61358059 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 61358137 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61358145 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 61358174 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61358269 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 61358345 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 61358349 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61358428 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61358476 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61358489 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 61358548 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 61358641 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 61358744 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61358777 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 61358786 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 61358957 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 61359127 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 61359154 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 61359252 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 61359267 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 61359439 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 61359548 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 61359622 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 61359727 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 61359741 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 61359754 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 61359778 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 61359783 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 61360201 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61360211 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61360308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61360716 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61360899 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 61360905 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 61360938 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61360977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61361093 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 61361332 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 61361387 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 61361427 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 61361496 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 61361840 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 61362181 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61362421 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61362535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61362847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61363957 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61364892 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 61364938 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61365761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61369231 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61371719 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 61372079 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61372741 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 61372793 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 61373014 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 61373023 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 61373070 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 61373074 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 61373131 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 61373622 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61373629 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61373668 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61373946 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61374561 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61376238 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61378130 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61380196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61381521 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 61382925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61385288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61385994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61388402 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61388543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61388927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61389086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61389391 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 61391264 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61392073 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 61394322 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61394462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61394648 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61394735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61394787 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61397130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61399611 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61399617 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61400252 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61401016 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61401901 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 61402407 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61402597 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 61402908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61403857 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61404256 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 61404474 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 61404781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61404818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61405809 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61408002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61408427 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 61408740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61409809 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61412175 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 61413627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61414525 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61414775 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61415515 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61415764 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 61416884 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61417155 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61417646 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61418305 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61418765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61419167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61419230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61420683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61420911 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61421152 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61422113 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 61423136 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61423744 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61426032 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61426320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61426941 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61427177 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61427182 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61427402 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61428079 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61429665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61430332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61430754 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61431641 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 61431689 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 61432123 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 61432135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61432139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61432217 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61432251 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 61432366 G C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 61432471 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 61432556 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61432571 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61432963 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61432978 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 61433126 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61433169 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61433625 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61433720 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 61434101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61434197 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 61434851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61435251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61435389 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61435613 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61435651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61435812 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61436342 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 61436531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61436686 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 61436808 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61436810 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61436825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61437092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61437296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61437297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61437368 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61437564 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 61437596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61437707 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 61437890 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 61437954 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 61437965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61438231 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61438626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61438637 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61438920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61438949 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61438976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61439049 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61439559 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 61439703 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 61440001 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 61441247 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 61443718 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61443916 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61444921 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61445654 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61446286 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61447063 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61447574 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61447619 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 61447688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61447738 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61448231 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 61448352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61448353 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61448614 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 61448676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61448842 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61449149 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61449418 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61449779 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61449942 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 61450416 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61450542 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61450778 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 61450945 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 61451076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61451153 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 61451155 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 61451605 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 61452339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61452693 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61452698 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61452801 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61452837 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61452975 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 61453051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61453280 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61453674 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61454813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61454885 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61455264 G T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 61455793 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 61455813 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 61457663 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61457957 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 61458800 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61459073 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61459351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61459735 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61459746 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61459880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61460034 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61461083 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 61461300 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61461401 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 61461683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61461685 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61461827 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61462459 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 61462615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61462616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61462696 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 61462759 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 61462783 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61462847 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 61462959 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61463000 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61463818 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 61463824 T A N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 2 61464275 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 61464624 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 61465078 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61465257 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61466510 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 61466715 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61467076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61467161 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61467423 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61468711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61469329 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61469362 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 61469870 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61470076 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 61470085 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61470099 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 61470282 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61470311 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61470870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61471353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61471539 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61472292 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61474220 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61474264 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61474891 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61476901 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61477348 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61478944 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61478983 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61481499 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61482577 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 61482833 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61483000 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61483415 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61485488 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61485998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61488223 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61489203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61489731 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 61489759 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 61490700 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 61490762 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 61490810 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 61491876 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 61491884 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 61491919 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61492365 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 61492468 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61492666 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61494986 A G Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 61495735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61498025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61498121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61499442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61499561 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61501468 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61505318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61505374 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61505469 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61507761 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61508708 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61510334 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61511704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61515393 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61515567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61516400 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61517495 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 61517837 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61518036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61518699 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 61519559 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61519939 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 61519974 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 61519981 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 61520279 T G Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 61520783 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61521310 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61522045 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61522153 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 61522329 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 61522357 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 61523127 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61523351 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 61524756 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 61525480 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 61525481 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61525551 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61525574 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61525845 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61526014 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61526227 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 61526259 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61526879 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 61526938 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 61527110 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 61527167 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61527479 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61527987 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 61528092 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61528166 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61528245 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 61528667 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 61529026 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61530017 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 61530283 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 61536257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61539241 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61544068 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61546257 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 61546747 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 61547226 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61550594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61552189 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 61552318 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61553115 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61553434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61555857 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61556593 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61557074 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61558912 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61559020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61559682 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61560791 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61565374 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 61573370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61577061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61578241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61579628 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61580012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61587142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61587542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61593182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61593573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61598509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61600918 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61603542 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61605225 T A Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 61605488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61618382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61619391 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61624412 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61624947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61625432 A T Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 61625895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61627693 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 61628230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61635183 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 61635188 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 61635747 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61635801 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61638140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61639489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61651615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61654097 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 61654196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61654572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61655246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61655673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61655934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61657157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61659639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61660165 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 61660604 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 61661380 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61662428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61665069 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61667044 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61668750 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61671755 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61672361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61673338 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61674956 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61675142 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 61675157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61675321 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61676651 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 61676802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61677188 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61678145 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 61678733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61681945 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61682611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61693560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61695152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61697268 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 61697594 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 61697638 T G N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 61697650 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 61700811 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 61700870 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61702592 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 61706586 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 61708822 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61708860 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 61709848 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61711009 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61711078 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 61712836 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61712883 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 61713487 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61714703 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 61715004 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 61721966 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61727252 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61727253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61727810 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 61727971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61729427 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 61729579 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 61729720 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61729788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61730423 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61731075 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 61732359 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61736516 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61737913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61739047 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61739471 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61740009 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61740327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61740895 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 61741070 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 61742163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61742809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61743101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61746393 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61749663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61750701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61751313 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 61759462 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61760008 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61760189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61761344 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61765817 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 61766010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61767973 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61768248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61771054 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61775373 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61777193 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61778206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61782156 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61789118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61789759 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 61804531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61809416 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 61809695 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61809959 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61810960 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61811990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61812001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61813665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61814073 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 61816943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61816994 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61818282 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61818740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61818976 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61820347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61820461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61821805 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 61822496 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61822757 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 61825533 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61827283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61827325 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 61828140 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61828202 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 61829786 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61829861 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61832700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61836343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61837294 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 61837531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61837572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61837662 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 61837952 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 61837981 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 61838819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61840458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61842116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61842731 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61843617 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 61845712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61847610 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 61848413 A C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 61850170 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 61851515 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 61851950 G A Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 61852918 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 61857876 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 61888543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61895530 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61896076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61896508 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 61897721 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61897797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61900373 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61900572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61901284 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61901618 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 61901655 A C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 61901660 T A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 61902019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61902405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61903565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61904543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61904623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61907208 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 61909770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61910339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61910435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61910521 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 61911673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61911735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61912948 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61913198 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61914588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61917453 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 61919229 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 61919249 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 61919674 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61919753 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61920302 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61921012 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 61922019 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 61922208 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 61922238 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61922261 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 61922270 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 61922341 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61922690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61922843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61923083 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 61923151 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 61923361 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 61923402 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61923640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61923764 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 61924084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61924101 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61924269 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 61924381 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 61924559 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 61924748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61924750 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61924788 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 61924794 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61924813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61924863 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61924871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61924967 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 61925001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61925071 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 61925211 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61925255 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61926751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61927325 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 61928327 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 61928642 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 61928725 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 61928749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61928763 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 61928870 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 61929566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61930133 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61934484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61934782 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 61936781 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 61936815 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 61939315 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 61940007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61944115 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61947139 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61950680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61952212 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 61952998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61956857 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 61957371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61957431 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61958357 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61959529 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61960262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61961752 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61963201 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61963325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61964069 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 61964099 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 61965862 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 61967636 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 61967781 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 61967979 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61969208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61969539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61971425 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61971533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61971552 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61973983 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 61975213 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 61975215 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 61976375 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61976400 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 61976560 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 61978079 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61979642 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61984115 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 61984317 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61985378 A T N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 61985970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61988451 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.0666666666666667 0.8 0.133333333333333 14 16 1 12 2 2 61988737 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61992789 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 61993185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61995711 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 61996396 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 61996843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61998251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 61998535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62000423 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62001007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62001055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62001391 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62002037 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62002085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62003025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62003089 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62005941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62006722 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62006745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62006885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62014190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62014864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62016651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62017161 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62019581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62020505 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62020537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62021765 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62023446 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 62023763 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62024112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62024208 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62024729 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62025964 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62026019 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62026020 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62026038 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62028055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62030092 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62030362 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62030972 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 62039051 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62039652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62039877 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62040435 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62040990 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62041888 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62041997 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62043561 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62044292 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62044533 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62044898 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62044969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62048580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62048853 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62050375 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 62050544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62050559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62050617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62050877 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62051082 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62052973 G C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 62054982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62055058 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62055873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62056499 T C Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 62056637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62056841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62058044 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 2 62058072 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 62058673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62059332 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62059653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62060794 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 62062385 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 62062562 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62064114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62064656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62064745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62064810 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62065197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62065843 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62069380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62069786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62069921 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 62070515 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62071206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62072547 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62073945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62074059 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62074110 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62074836 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62078909 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 62080390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62083439 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62084109 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62089655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62091816 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 62093173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62094452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62094624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62094714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62097212 T A N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 62098867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62101931 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62104183 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62104530 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62107439 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62107960 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62109595 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62109704 G C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 62110313 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 62111582 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62115768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62116890 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62117015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62119001 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 62119886 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62120569 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62121704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62122236 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 62122514 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 62124604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62125362 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62125771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62125934 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62128582 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62129292 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62130736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62131302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62133439 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 2 62134744 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62138383 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62138976 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 62139057 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 62139150 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 62140656 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 62140781 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 62141572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62142180 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 62143098 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 62144466 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62144473 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62144530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62144732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62145304 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62145947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62147351 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62147922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62148328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62148410 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62148578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62149616 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62152437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62153106 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62154157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62154330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62155247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62155996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62156260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62159140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62160125 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62162186 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62164826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62165141 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62165394 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62165821 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62166250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62166295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62171029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62171458 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62171742 T G N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 62171870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62171879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62171902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62172331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62173427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62173666 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62173751 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62173861 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62173915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62174234 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62174257 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62174288 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62174618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62174670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62174826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62174901 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62174920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62174939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62175119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62175163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62175273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62178532 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62180617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62182110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62187034 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62187720 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62187724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62189734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62193504 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62194521 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62194647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62195893 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62199316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62201003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62202451 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62202493 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 62203671 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62204173 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 62204476 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 62204478 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 62204562 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 62204592 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 62204603 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 62204606 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 62206212 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 62206241 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 62206356 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 62206614 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 62206693 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 62206833 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 62206868 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 62207800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62209371 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 62209386 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 62210639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62212071 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62212729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62214284 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 62217903 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62219362 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62220817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62222045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62222915 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62223625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62225090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62225105 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 62227279 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 62227282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62228135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62228389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62228396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62228403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62228648 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62228778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62228785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62228938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62228997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62229015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62229036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62229290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62229565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62229706 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 62229708 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 62229736 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 62229865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62230060 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 62230446 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 62230630 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 62230953 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 62231122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62231680 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62231747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62231880 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62231917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62231924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62231934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62231995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62232138 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 62232481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62233019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62233164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62233613 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62233635 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62234003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62234479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62234641 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 62234714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62234990 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 62238313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62238417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62240234 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 62241791 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62242132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62242881 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62243481 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62246200 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62250415 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62250439 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 62250752 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 62251047 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 62251108 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 62251178 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62251488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62252170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62252202 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 62252331 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 62252339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62252401 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 62252534 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 62252541 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 62252604 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 62252613 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 62255203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62258494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62259541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62261683 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 62261918 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 62263279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62263873 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 62265366 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62266213 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 62267806 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62270172 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 62270774 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 62270960 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62271934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62272078 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 62272135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62272368 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 62272386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62272387 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 62272399 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62272655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62272659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62272668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62272755 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62272783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62272997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62273144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62273178 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 62273264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62273294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62273318 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62273324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62273618 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 62273689 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 62273690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62273908 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 62273977 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 62274023 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 62274092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62274107 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 62274124 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 62274225 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 62274251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62274455 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 62274470 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 62274645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62274782 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 62274838 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 62274880 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 62274949 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 62274962 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 62275020 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 62275127 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 62275195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62275201 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 62275321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62275637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62275698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62275744 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 62275800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62275803 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 62275885 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62275941 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 62275949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62276398 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 62278297 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62280297 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 62281358 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 62281406 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 62281465 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 62281541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62281598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62281715 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 62281728 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 62281793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62285167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62285211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62285327 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 62286190 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62286200 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 62286258 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 62286385 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 62287229 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62287317 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62288553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62289334 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62289382 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62289466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62290708 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62290711 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62290732 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62290946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62290967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62290986 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62291042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62291065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62291091 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 62291116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62291131 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62291133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62291144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62291154 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 62291631 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62291872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62291912 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 62293813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62293891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62297741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62298138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62298880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62298885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62302379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62306436 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62306853 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62307133 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62307428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62307959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62307985 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 62308398 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 62308416 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 62311523 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 62311575 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 62313539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62314269 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62314426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62315441 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62315568 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62315797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62316560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62317906 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62317978 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62318486 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62319095 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62319312 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62319565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62319701 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62319714 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 62320020 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 62320182 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62320194 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62320226 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 62320239 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62320251 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62320834 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62320866 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 62321223 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62321409 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 62321502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62321972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62322594 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62324061 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62324146 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62324237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62324682 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 62325013 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62325046 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 62326767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62327951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62328771 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 62328805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62329226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62329290 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62329352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62329376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62329501 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 62330139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62331913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62332478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62332621 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 62332669 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 62332734 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62332978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62333226 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 62333362 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 62333388 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 62333683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62333813 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 62333974 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 62334079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62334378 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62334379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62334445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62334544 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62334561 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 62335184 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62336771 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62337678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62337932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62342109 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 62342922 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 62346799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62346919 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 62347109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62348626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62349930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62350239 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62353619 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62354658 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62354755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62354784 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62355206 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 62355214 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 62355487 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 62355537 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 62356351 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62357895 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 62359602 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62359774 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 62359795 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 62359865 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 62359941 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 62359962 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 62360016 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 62360050 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62360340 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62360788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62360907 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62361565 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62362211 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 62362305 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62362833 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62362931 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62362938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62362959 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 62363520 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62363667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62363889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62363988 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 62364046 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 62364058 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 62364544 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62364571 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 62364754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62365416 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62365750 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62365758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62365863 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 62366353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62366371 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 62366439 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62367166 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 62367471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62367580 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 62367606 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 62367901 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62368557 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62369231 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 62369588 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62369606 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 62369617 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62369622 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62369829 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 62370104 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 62370392 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 62370565 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62370661 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 62370840 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62370958 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 62371394 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 62371794 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62373158 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62373318 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62374027 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 62374065 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 62374723 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62375421 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62375600 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62377425 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 62377605 A G Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 62378328 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62379112 C A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 62379936 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 62379952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62380045 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62381816 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 62381822 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 62385093 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 62385261 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 62385458 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62385511 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62386887 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62387009 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 62387078 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 62387403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62387549 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 62387772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62387847 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62388103 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62388128 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 62388182 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 62388205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62388273 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 62388310 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 62388495 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 62388498 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 62388546 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 62388576 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 62388872 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 62388884 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 62388937 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 62389086 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 62389129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62389131 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 62389198 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 62389257 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 62389542 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 62389634 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 62389660 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 62389689 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 62389702 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62389921 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 62390071 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 62390097 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 62390118 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62390204 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 62390324 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 62390392 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 62390459 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 62390505 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 62390577 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 62390623 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 62390642 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 62390661 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 62390678 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 62391107 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 62391183 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 62391267 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 62391271 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 62391303 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 62391352 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 62391463 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 62391469 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 62391535 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 62391559 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 62391597 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 62391689 A G N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 2 62391755 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 2 62391802 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 62391929 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 62391938 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 62392141 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 62392208 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 62392296 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 62392349 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 62392350 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 62392408 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 62392514 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 62392657 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62392960 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 62392974 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 62393267 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 62393976 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62393979 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62394232 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62394349 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 62394551 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 62394763 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 62395212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62395331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62396314 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 62396324 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62396398 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62397217 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 62397469 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 62397585 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 62397604 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 62397647 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 62397671 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 62397726 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 62397781 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62398008 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62399439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62399692 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 62399892 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 62399970 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62400233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62400256 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 62400627 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 62401119 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 62401603 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 62401745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62402267 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62402434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62402866 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 62402942 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 62402995 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 62403155 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 62403352 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 62403441 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 62403492 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 62403627 T A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 62403882 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 62403894 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 62403992 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 62404156 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 62404198 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62404581 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62404889 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62404945 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 62405466 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 62405811 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 62405814 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 62405859 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 62406027 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 62406120 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 62406126 G T Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 62406170 T C Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 62406347 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 62406423 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 62406527 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 62406587 A T Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 62406618 A G Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 62406724 A G Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 2 62406738 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62407747 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 62407808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62407862 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 62408097 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 62408227 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 62408272 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 62408354 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 62412453 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 62413178 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62413270 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62413707 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 62413710 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62414230 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62414444 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62415297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62415423 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 62416274 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62418004 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 62418355 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62421753 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 62421786 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62422135 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62423274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62423362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62423377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62423391 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 62423394 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 62423417 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 62423476 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 62424151 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 62424158 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 62425606 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 62425699 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62426040 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62426171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62426839 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62426875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62427138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62427994 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 62428043 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 62428229 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 62428339 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62428370 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 62428373 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62428395 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 62428569 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62428792 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62428950 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62429156 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62429193 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62429297 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62429315 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62429425 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 62429592 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 62429649 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 62429766 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 62429817 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 62429967 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 62430181 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 62430222 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 62430259 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 62430375 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62430385 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 62430443 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62430549 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62430905 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 62430921 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 62431074 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 62431088 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 62431157 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 62431193 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 62431478 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62431714 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 62431744 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62431928 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62432078 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62432204 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62432401 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 62433313 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62434621 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62435046 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62435085 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 62435125 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62435260 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62435264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62435358 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62435441 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 62435634 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 62437345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62437356 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62437993 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 62438142 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 62439726 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62439728 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 62439778 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 62439912 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62439934 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 62440063 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62440161 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 62440340 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 62440412 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 62440417 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 62440581 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 62441042 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62441057 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 62441094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62441193 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 62441205 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62441293 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62441381 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62441455 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62441495 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 62442087 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 62442128 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 62442188 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62442435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62442485 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62442634 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 62442643 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 62442752 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 62442763 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 62442937 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62443021 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 62443097 A C Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 62443107 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 62443119 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 62443188 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62443279 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62443459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62443468 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62443492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62443597 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62443630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62444117 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 62444143 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 62444272 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62444343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62444353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62444365 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 62444413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62444715 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62444727 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62444827 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 62445133 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 62445181 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 62445240 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62445341 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 62445370 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 62445382 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 62445407 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 62445531 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 62445543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62445544 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 62445590 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 62445672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62445701 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 62445702 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 62445814 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 62445902 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62445951 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 62445983 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 62446015 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 62446044 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 62446103 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 62446104 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 62446140 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 62446296 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 62446365 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 62446433 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 62446434 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 62446552 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 62446596 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 62446639 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 62446661 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 62446756 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 62446872 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 62446911 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 62446923 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 62446980 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 62447072 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 62447251 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 62447406 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 62447410 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 62447460 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 62447799 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 62448315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62448440 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62448731 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 62448814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62448829 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 62449616 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 62450552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62450710 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 62450764 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 62450791 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 62450986 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 62451009 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 62451038 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 62451105 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 62451194 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 62451213 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 62451761 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62451887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62452222 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 62452373 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 62452462 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 62452481 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 62452581 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 62452609 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 62452610 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 62452867 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62452911 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 62452959 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 62453024 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62453041 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62453055 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62453081 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62453819 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 62454205 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 62454702 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62455571 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 62456592 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62456655 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62456691 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 62456753 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 62456820 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 62456837 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 62456843 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 62456927 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 62457265 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62458113 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 62458116 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 62458581 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62458858 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 62459024 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 62459040 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 62459065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62459624 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62460502 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62461136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62461194 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 62461245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62462877 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 62464234 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 62464343 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 62464402 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 62464422 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 62464482 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 62464779 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 62465339 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 62465374 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 62466145 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 62466230 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 62466423 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 62466913 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 62467125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62467321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62467455 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62467507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62467539 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62467609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62467726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62467859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62468253 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62468558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62468839 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62468876 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 62468886 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62468923 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 62469166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62469194 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 62469394 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62469591 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 62469935 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 62470159 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 62470254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62470309 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62470330 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 62470480 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 62470668 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 62470878 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 62471096 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62471639 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62471818 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62471895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62471897 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62473075 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 62473179 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62473234 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62474749 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62474879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62474992 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 62475116 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 62475437 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 62475565 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 62475586 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 62475636 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 62475724 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 62475811 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 62475863 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 62475868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62476016 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 62476152 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 62476189 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 62476197 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 62476246 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 62476334 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 62476370 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62476611 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 62477030 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 62477369 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 62477376 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 62477571 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 62477603 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 62477756 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 62477763 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 62477807 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 62477819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62477875 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 62478027 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62478048 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62478312 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62478491 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 62478582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62478589 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 62478616 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 62478717 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 62478782 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 62478797 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 62478802 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62479011 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 62479096 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 62479281 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 62479310 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 62479314 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 62479455 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 62479487 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 62479536 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 62479693 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 62479699 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 62479734 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 62479807 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 62479809 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 62479831 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 62479832 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 62479845 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 62479871 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 62479883 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 62479925 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 62480049 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 62480064 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 62480113 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 62480392 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 62480678 G T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 62480726 A T N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 62480749 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 62480918 G C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 62481488 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 62481541 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 62481546 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 62481560 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 62481603 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 62481612 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 62482186 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 62482227 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62482301 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 62482410 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 62482496 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 62482543 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62482676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62482811 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62482917 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62483077 A T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 62483188 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 62483235 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62483547 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 62483559 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62483689 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 62483778 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62484082 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 62484197 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 62484325 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62484360 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 62484363 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62484378 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 62484392 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 62484553 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 62484714 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 62484735 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 62484759 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62484788 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 62485058 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62485238 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62485427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62485847 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 62485884 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 62485921 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 62485960 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62486096 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 62486179 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 62486605 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 62486620 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 62486647 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62486771 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 62486844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62486893 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62486905 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62487091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62487143 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62487228 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 62487232 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 62487374 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62487416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62487453 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62487532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62487548 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62487776 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62487867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62487904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62487983 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62488001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62488074 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62488183 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62488194 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62488223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62488285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62488386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62488499 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62488709 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62488736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62488783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62488790 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62488804 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62488856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62488898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62488952 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62488958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62488972 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62488983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62489033 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62489048 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 62489052 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 62489060 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 62489080 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62489227 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 2 62489229 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 62489324 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 62489382 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62489398 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62489450 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62489461 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62489465 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62489504 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62489561 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62489578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62489714 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62489991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62490222 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62490365 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62490431 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62490495 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 62491004 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62491390 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 62491549 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62491799 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62492272 T A N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 2 62492318 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 62492456 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 62492997 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62493036 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62493214 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62493439 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62493489 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62493555 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62493576 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62493593 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62493820 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62493880 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62493975 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62494102 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62494108 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62494275 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62494790 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62494814 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62494993 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62495055 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62495294 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62495435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62495767 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62495948 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62496489 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62496516 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62496598 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62496837 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62496848 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62496918 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62497016 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62497129 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62497641 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 62498105 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 62498294 G T Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 62498395 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 62498737 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62498752 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62498844 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62498861 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62498876 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62498902 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62499031 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62499110 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 62499131 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 62499344 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 62499414 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62499455 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 62499472 C G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 62499821 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62499869 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 62499874 C G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 62499897 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 62500347 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62500389 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62500957 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62501068 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 62501135 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62501332 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62501374 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 62501482 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62501554 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62501584 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62502039 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62502230 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 62502314 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 62502623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62502638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62502819 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62502942 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62502997 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62504325 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62505120 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62506579 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 62506688 T G Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 2 62506959 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62507100 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62507134 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62507236 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62508215 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62508516 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62508535 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62508721 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62508832 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62509018 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62509058 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62509169 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62509491 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62509603 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 62509662 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62509754 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62509772 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62510534 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62511228 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62511426 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 62511647 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62511719 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62511738 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62511819 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62511822 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62511836 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62511849 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62512074 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62512464 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62512479 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62512540 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 62512634 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62513351 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 62513493 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 62513588 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 62513597 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 62513710 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 62513915 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 62514290 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62514353 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62514511 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 62514572 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 62514847 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 62514850 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 62514865 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 62514874 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 62514889 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 62515243 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 62515302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62515445 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 62515545 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 62515616 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62515622 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62515704 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62515722 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62515811 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 62515914 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 62516208 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 62516460 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 62516510 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 62516871 A C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 62516919 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 62517603 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 62517738 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 62517847 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 62518573 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62518929 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 62518982 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 62519008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62519080 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62519137 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 62519149 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 62519391 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 62519558 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62519589 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 62519628 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62519689 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62519805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62520082 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 62520649 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 62520673 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 62521248 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62522033 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 62522108 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 62522807 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62522814 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62522834 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62522858 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 62522882 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62523251 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62523297 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62523400 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62523412 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62523462 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62523546 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62523549 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 62523620 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62523632 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 62524269 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62524330 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 62524441 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 62524498 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62524852 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 62525193 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 62526456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62527402 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62527594 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62528540 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62529912 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62530925 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 62532560 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 62532595 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62532874 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62532901 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62533014 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62533109 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62533192 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 62533202 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 62533265 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62533412 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62533444 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62533445 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62533488 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62533629 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 62533671 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 62533682 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 62533691 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 62533719 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 62534823 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62535028 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 62535242 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62535623 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 62535740 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 62536026 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62536215 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62536227 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62536414 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 62536455 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62536622 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 62536666 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62536668 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62537062 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 62537452 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 62537717 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 62537795 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62538550 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62538663 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62538850 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62539884 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62540153 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 62540210 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62540315 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 62540361 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 62540392 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62540405 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 62540496 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 62540601 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 62540618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62541280 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62541396 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 62541683 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 62541949 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 62542002 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 62542122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62542194 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62542221 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 62542254 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 62542301 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 62542337 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62542925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62542933 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 62543435 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 62543451 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62543454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62543795 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62543800 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 62543876 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 62544733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62544943 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 62545115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62545441 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62545457 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 62545467 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 62545705 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62545709 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 62545723 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62545763 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 62545802 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62545810 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62546059 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62546085 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62547117 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 62547459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62547461 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62547507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62547686 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62547863 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62548576 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 62548638 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62548784 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 62549275 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 62549472 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 62549620 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 62549879 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62550119 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 62550492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62550514 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62550550 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62550775 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 62550791 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62550813 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62551018 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62551859 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62551860 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62552332 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 62552431 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62552456 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 62552615 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62552702 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62552752 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62552755 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62552789 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62552809 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 62552869 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 62552884 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 62552964 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 62553003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62553274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62553301 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62553317 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 62553334 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 62553354 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62553391 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 62553441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62554446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62554610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62554952 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 62555762 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62555816 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 62557693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62558120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62558350 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62558930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62559702 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62560140 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 62560582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62561731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62561935 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62562573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62562824 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 62563619 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62566580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62567245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62567437 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62568950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62570333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62571047 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62573145 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62573157 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62573257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62575014 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62576846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62576859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62579394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62580086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62581031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62581648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62584069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62584623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62585515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62586810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62591206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62592101 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62593193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62593411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62593521 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62593723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62593825 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62594128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62595190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62596997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62598323 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62598529 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62599460 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62599813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62601252 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62601903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62607986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62608961 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62609037 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62611555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62612214 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62613552 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62616026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62616342 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62616492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62616963 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62617129 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62617164 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62617482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62617603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62617614 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62617733 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62618006 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62618040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62619111 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62619504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62619544 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62620189 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62620359 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62620625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62620729 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 62620839 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62620853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62620913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62621003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62621195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62621230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62621354 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62621939 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62622080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62622081 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62622101 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62622138 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62622261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62622506 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62622573 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62622700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62622766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62622941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62623025 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62623094 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62623117 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62623453 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62624042 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62624054 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62624197 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62624286 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62624467 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62624487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62624523 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62624556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62624575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62624583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62624775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62624782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62624897 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 62624934 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 62624955 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 62625021 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 62625173 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62625899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62625989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62626093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62626147 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62626273 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62626292 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62626420 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62626934 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62627004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62627012 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62627131 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62627457 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 62627524 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62627632 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62627838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62627840 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62627861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62627921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62627933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62627961 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62627971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62627996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62627999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62628040 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62628126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62628189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62628233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62628676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62629034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62629133 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62629236 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62629893 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62630505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62630829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62632325 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62632460 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62633559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62633690 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62634417 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62634534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62634550 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62635338 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62635353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62635855 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62635934 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62636590 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62636619 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62637118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62637158 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62637659 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62639238 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 62639908 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62639920 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62640603 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62640649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62640809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62641224 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62641245 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62641416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62641439 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62641467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62641700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62641742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62642076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62642194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62642346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62642382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62642495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62642523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62642543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62642571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62642618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62642641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62642937 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62643000 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62643240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62643568 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62643978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62644120 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62644345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62644387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62644443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62644604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62644628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62644801 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62644866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62645066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62645070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62645234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62646265 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 62646594 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62647451 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62649420 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62649540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62649951 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62650108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62650203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62651580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62651759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62653699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62653855 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62655814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62656076 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62656193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62665374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62667402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62667951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62668400 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62668835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62669021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62673313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62673314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62673518 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62673919 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62674790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62674810 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62674820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62674827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62674838 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62676035 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62676060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62676282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62676929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62679062 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62679187 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62679193 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62679249 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62679303 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62679394 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62679597 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62679613 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62679651 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62679716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62679725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62679779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62679782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62680107 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62680339 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62680579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62682672 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62684125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62684274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62684296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62684401 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62685639 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 62685817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62685938 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62686155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62686349 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62687573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62689328 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62689936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62689988 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62690126 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62690918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62691685 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62691970 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62692146 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62692157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62692199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62692279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62692293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62692314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62692484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62692657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62692686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62692996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62693012 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62693605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62693643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62693766 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62694775 C G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 62695007 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62695025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62695077 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62696532 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62696918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62697123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62697150 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62697673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62698217 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62698406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62698774 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62698835 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62705875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62706954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62707777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62709156 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62709264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62710495 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 62712188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62712700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62712761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62713119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62713327 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62713946 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62714003 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62714052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62714335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62714471 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62714720 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62714733 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62715920 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62716065 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62716670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62717125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62717695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62718672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62719006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62719292 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62719867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62720319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62720407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62720479 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62720638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62721412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62722436 T C Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 62726799 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62727666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62732610 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62732719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62733927 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62734198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62734293 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62734298 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62734379 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62734436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62734484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62735043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62735045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62735381 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62735690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62737870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62740810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62744886 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62748120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62749283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62749399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62751663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62753724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62757531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62759929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62759947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62760200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62760217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62761101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62761909 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62762175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62762801 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62763854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62764094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62764238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62764301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62764391 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62764436 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62764548 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 62765164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62765172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62765201 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62765206 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62766584 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62767148 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62769187 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62769372 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62769679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62770004 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62770048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62770139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62770276 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62771191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62771715 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62771775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62771910 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62771913 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62772286 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62773965 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62774696 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62775062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62775642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62775966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62776172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62776457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62776668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62777524 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 62777940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62779115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62779179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62780014 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62782842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62783531 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62784644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62785557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62788479 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62788631 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62789719 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62790067 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62790071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62790489 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62790678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62791615 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62792959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62793167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62793177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62794445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62796769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62797522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62798438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62799934 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62800383 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62801800 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62802355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62803800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62805408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62805721 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62805737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62805797 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62806436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62806442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62806704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62807294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62807611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62807768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62807984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62808366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62808639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62808980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62809063 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62809079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62809135 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62809334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62809460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62809861 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62809920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62810095 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 62810247 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62810282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62810399 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62810400 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62811063 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62811396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62811557 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62811887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62812694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62812707 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62812816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62812890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62812904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62813434 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62813654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62813805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62814249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62814252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62814607 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62814651 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62814675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62814801 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62814950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62814975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62815010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62815056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62815082 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62815156 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62815160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62815267 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62815441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62815864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62815895 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62816088 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62816284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62816359 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62816361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62816558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62816703 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62817945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62818284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62818477 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62818633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62819529 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62819820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62820122 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62820271 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62821281 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 62821296 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 62821554 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 62821688 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62822288 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 62822321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62822348 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62822354 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62822371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62822383 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62822411 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62822657 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62822857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62822957 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62823165 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62823588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62823622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62823677 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 62824132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62824179 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 62825001 G A N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 2 62825158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62825375 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62825770 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 62825856 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62825927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62825928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62826238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62826626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62826665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62826944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62827015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62827147 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62827217 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62827650 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62828225 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62828394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62828437 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62828458 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62828578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62828656 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 62828925 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 62829123 A T Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 62829222 G T Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 62829450 C G Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 62829465 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 62829534 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62829550 T G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62829586 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62829679 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 62829711 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 62829797 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 62829801 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62829823 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62829971 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62829981 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62830124 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 62830151 T G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62830215 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62830956 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62830974 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62831094 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62831099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62831124 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 62831159 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 62831172 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62831361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62831515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62831639 A C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 62831697 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 62831756 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 62831793 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62831829 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62831975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62832212 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62832427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62833167 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62833481 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 62833784 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62833847 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62833930 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62834002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62834373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62834827 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62834883 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62835166 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62835221 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62835233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62836223 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 62836283 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62836331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62836495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62836860 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 62837185 A C N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 62838237 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62838668 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 62838897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62839323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62839426 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 62840422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62841369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62841509 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62842197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62843103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62843804 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 62843824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62844192 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 62844275 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 62844296 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 62844334 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62844376 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 62844414 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62845128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62845992 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62846726 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 62846776 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62848160 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62848223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62848731 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62849208 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 62849505 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62849627 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62849790 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62849973 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62850723 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 62851256 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62851534 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62852320 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62852696 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62853108 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62854714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62855264 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62855463 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62856340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62856667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62857159 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62857344 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 62858202 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62859596 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 62860031 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62860292 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 62860552 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62860618 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 62863519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62867238 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 62867977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62868028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62868070 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62868572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62868577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62869299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62870523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62871646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62871896 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62872399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62874083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62876332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62876736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62876913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62877378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62877403 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62877502 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62878160 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 62878505 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 62878567 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 62878589 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 62879190 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 62879204 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62879212 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62879478 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 62879536 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 62879548 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 62879736 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 62880096 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 62880105 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62880130 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 62880304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62880423 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 62880428 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 62880438 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 62880489 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 62880704 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 62880706 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 62880756 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 62880773 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 62880788 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 62880979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62881074 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62881157 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 62881218 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 62881248 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 62881348 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 62881364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62881630 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 62881700 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 62881701 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 62881723 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 62881726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62881752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62881777 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 62881791 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 62881799 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 62881839 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 62881899 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 62881938 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 62882098 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 62882231 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62882264 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 62883137 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62883691 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 62884189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62884289 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 62884523 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 62884543 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 62884995 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62885776 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62885819 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62886137 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62886142 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 62886161 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62886267 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62886362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62886527 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62886612 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 62886677 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62886830 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 62886842 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62886871 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 62886989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62887072 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62887087 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62887162 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62887801 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62887959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62887982 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62888039 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62888052 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 62888132 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62888248 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 62888328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62888345 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 62888346 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 62888563 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62888649 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62888942 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62889550 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 62889677 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62889678 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62890128 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 62890692 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 62891177 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62891286 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62892225 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 62892262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62892329 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 62892354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62892563 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 62892569 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 62893819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62893833 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62893905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62894112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62894746 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62894910 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 62895611 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 62895907 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62895937 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 62896108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62896886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62896969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62897056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62897093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62897108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62897190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62897216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62897316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62897379 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62897787 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62897837 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62897863 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 62897909 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 62898244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62898251 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62898315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62898354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62898390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62898422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62898504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62899142 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62899272 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62899727 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 62899832 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 62900484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62900495 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 62900556 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 62900559 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62901396 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62902553 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62902560 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62902573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62902603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62902665 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62902895 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 62902903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62904139 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62904902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62905180 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 62905192 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 62905298 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62905371 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62905586 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62905589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62905601 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62905737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62905751 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62905904 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62906439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62906519 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62906800 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 62907400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62907612 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62909592 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 62910222 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62910693 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62910897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62918346 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62918722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62918984 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62919058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62919530 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62919855 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62919867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62920019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62920917 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62920964 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62920999 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62921033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62921322 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62921596 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 62921718 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62922078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62922347 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 62922409 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62922708 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62922726 G T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 62922767 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 62922912 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 62923014 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62923376 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 62923377 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 62924062 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62924999 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 62925266 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 62925432 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 62925501 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 2 62925818 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 62925898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62925959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62925960 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 62926367 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 62926482 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 62926682 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62926825 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62926835 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 62926923 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 62927401 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 62927426 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 62927580 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 62927686 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 62927695 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 62927918 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 62927922 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 62927955 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 62927977 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 62928138 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 62928179 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 62928234 C G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 62928352 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62928423 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 62928635 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 62928759 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 62928803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62929232 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 62929271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62930670 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62931215 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 62931470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62932312 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 62932458 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62932546 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 62932700 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62932767 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62933054 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62933125 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62933180 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 62933252 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 62933357 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62933523 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 62933776 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62933991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62934000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62934136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62934158 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62934196 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62934217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62934610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62936319 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62937046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62937995 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62939289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62942468 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 62943738 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62944225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62946124 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62950998 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 62952043 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 62952233 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62953124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62953551 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 62953594 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62953997 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62954001 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62954248 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 62954856 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 62955490 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62957359 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62957554 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62959470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62959737 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 62960685 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 62961521 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62962971 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62963144 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62963424 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62963425 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62963825 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62965098 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 62966093 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62966573 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62967501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62967963 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62968273 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62968968 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62969374 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 62970330 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62971159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62971491 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62971729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62971769 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62972338 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62972397 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62972526 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62974524 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62975455 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62975690 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62975830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62975905 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62975923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62976088 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62976159 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 62976679 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62976759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62977561 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 62981106 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62981658 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62982005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62983762 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 62984472 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 62986126 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62986441 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 62987276 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62987708 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62987757 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 62988142 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62989364 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 62989834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62990177 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 62990795 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 62991012 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 62991537 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62992755 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 62994756 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62995306 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 62995922 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 62996534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 62996597 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62997369 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 62997759 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 62998745 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63000069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63000109 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 63000113 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 63000151 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 63000315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63001674 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 63001965 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63002319 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63003679 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63004164 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63004246 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63004439 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63005477 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63005781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63006879 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63006989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63007436 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63007540 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63008881 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 63009429 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63009847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63010269 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 63012564 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63013704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63018656 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63019070 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63020363 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63020873 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63020884 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63021389 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63021471 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63023045 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63023190 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63023222 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63023652 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63023656 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63024055 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63025853 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 63026208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63027131 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63027262 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63027636 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63027899 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63028216 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63028771 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63029271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63029668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63030101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63030763 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63030847 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63032981 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63033333 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63034338 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63035080 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63035268 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63037418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63038098 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63038695 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63040216 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63040247 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63040289 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63040963 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63041258 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63041541 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63042414 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63042575 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63043124 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63043912 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63044073 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63045190 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63045295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63045571 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63045679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63046909 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63047031 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63047648 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63047760 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 63049856 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63050621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63050871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63051722 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63054531 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63056958 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63058109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63060084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63060580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63062007 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63062077 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63062934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63062996 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63063644 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63063977 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63064023 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63064137 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63064201 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63064233 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63064259 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63064332 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63064358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63064614 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63064750 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63064842 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63064939 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63064973 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 63065432 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63065936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63065969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63066287 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63066831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63066929 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63067016 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63067085 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63067408 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63067492 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63067679 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63067741 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63067955 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63067996 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63068063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63068168 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63068207 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63068233 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63068357 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63068413 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63068496 C G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 63068532 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 63068709 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63068766 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63068878 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63068978 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63068991 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069010 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069061 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069113 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63069219 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069229 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63069241 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63069292 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63069297 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63069309 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069314 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63069331 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63069333 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069399 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069421 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069531 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069579 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069631 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63069782 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069831 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069912 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069928 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63069943 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63069950 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63070057 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63070069 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 63070114 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63070145 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63070165 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63070210 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63070225 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63070262 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63070300 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63070302 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63070318 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63070325 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63070361 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63070389 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63070559 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63070670 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63070679 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63070816 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63070828 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63070917 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63071094 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63071140 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63071172 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63071360 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63071377 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63071397 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63071578 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63072012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63072071 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63072131 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63072710 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63072847 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63073627 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63074016 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63074530 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63074552 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63074714 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63075102 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63075531 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63076100 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63076781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63077745 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63077927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63078026 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63078030 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63078061 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63078093 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63078111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63078132 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63078524 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 63078531 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 63078545 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 63078625 A C Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 63078658 A T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 2 63078760 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63078965 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63079033 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63079541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63079581 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63079874 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63080197 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63080239 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63080256 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63080280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63080308 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63080440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63080500 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63080589 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63080602 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63080980 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63081049 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63081379 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63081454 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 63081506 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63081564 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63081565 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63081675 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63081701 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63081766 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63081837 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63083032 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63083342 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63083411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63083564 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 63083848 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63084000 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63084303 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63084441 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63085358 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63085384 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63085668 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63085901 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63086026 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63086356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63086839 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63086993 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63087179 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63088059 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63088393 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63088699 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63089668 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63089959 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63090787 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 63091143 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63092103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63092213 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63092218 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63092353 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63092364 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63092372 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63092418 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63092421 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63092453 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63092519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63092558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63092868 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63092874 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63093110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63093270 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63093352 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63093405 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63093448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63093523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63093571 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63093945 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63094100 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63094120 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63094121 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63094411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63094473 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 63094570 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 63094666 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 63094780 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 63095454 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63098723 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63098749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63100256 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63101963 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63102057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63102643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63103008 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63103367 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63103746 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 63104470 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63104938 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 63105028 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63105675 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63105826 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63106410 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 63106647 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63106703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63107049 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63107197 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63107226 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63109125 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63109222 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 63109738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63111354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63111424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63111433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63111774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63111852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63112307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63112698 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63113537 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63113591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63113928 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63114065 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63114149 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63114208 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63114248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63114258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63114283 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63114378 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63114431 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63114582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63114841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63115141 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63115168 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63115174 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63115308 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63115318 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63115351 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63115429 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 63115477 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 63115591 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 63115690 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63115741 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63115814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63115826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63115869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63115945 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63116004 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63116240 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63116461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63116560 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63116602 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63116651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63116654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63116733 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63116791 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63116859 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63116994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63117058 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63117068 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63117100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63117205 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63117216 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63117232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63117458 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63117533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63117756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63117763 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63117914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63118039 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63118046 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63118061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63118062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63118096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63118136 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63118302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63118432 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63118632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63118637 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63118662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63118921 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63118948 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63119003 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63119058 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63119101 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63119540 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63119606 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63119627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63119794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63119820 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63119828 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63119860 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63119925 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63119936 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63120087 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63120117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63120228 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63120338 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63120370 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63120396 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63120482 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63120516 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63120594 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63120612 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63120711 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63120750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63120763 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63120855 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63120924 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 63121047 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 63121056 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 63121189 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63121257 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63121343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63121379 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63121416 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63121512 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63121530 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63121852 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63121876 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63121912 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63121920 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63122148 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63122224 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63122249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63122305 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63122319 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63122352 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63122427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63122466 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63122508 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63122529 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63123197 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63123405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63123503 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63123631 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 63123636 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63123648 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63123679 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63123722 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63123981 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63124011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63124079 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63124105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63124132 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63124155 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63124158 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63124247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63124280 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63124369 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63124371 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63124691 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63124957 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63125017 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63125214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63125274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63125298 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63125750 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63125766 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63125809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63125920 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63126140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63126141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63126404 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63126484 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63126848 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63127038 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 63127065 A G Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 63127670 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63127888 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63127951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63128925 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63129900 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63130033 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63130077 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63130142 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63130181 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63130229 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63130280 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63130370 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63130383 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63130455 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63130485 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63130491 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63130617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63130932 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63131649 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63131879 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63132140 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63132441 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63132442 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63132526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63132646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63132864 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63132939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63133273 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63133587 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63133810 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63134744 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63134952 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63135160 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63135217 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63135224 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63141109 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63141187 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63141238 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 63142905 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63143292 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63143574 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63143817 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63144117 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63144458 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63144483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63144501 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63144503 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63144536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63144650 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63144818 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63144871 T A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 63144872 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 63145036 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63145120 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63145134 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63145157 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63145519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63145520 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63145594 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63146085 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63146369 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63146412 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63146635 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63146647 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63146742 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63146778 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63146891 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63147151 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63147408 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63147798 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63147812 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63147853 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63147925 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63148004 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63148288 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63148423 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63148466 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63148556 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63148957 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63149036 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63149043 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63149169 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63149188 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63149299 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63149509 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63149723 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63149749 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63149862 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63150362 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63150554 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63150675 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63150794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63151182 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63151196 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63151356 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63151469 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63151601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63151627 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63151853 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63151897 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63151906 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63152294 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 63152343 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63152661 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63153538 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63153564 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63153573 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63153755 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63153786 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63154123 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63154322 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63154408 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63154446 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63154506 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63154586 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 63154721 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 63154800 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63154819 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63154827 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63154848 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63154887 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63154893 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63155019 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63155053 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63155112 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63155138 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63155197 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63155325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63155332 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63155425 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63155430 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63155615 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63155623 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63155673 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63155674 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63155859 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63155994 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63156020 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63156046 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63156150 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63156161 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63156167 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63156227 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 63156273 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63156371 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63156826 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63156849 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63156964 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63157021 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63157463 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63157478 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63157781 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63158661 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63158957 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63159188 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63159192 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63159457 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63159621 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63159800 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63160377 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63160890 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63161456 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63162769 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63163094 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63163095 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63163469 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63163480 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63163508 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63163595 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63163606 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63163616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63163647 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63163659 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63163779 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63163814 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63163817 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63163913 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63164025 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63164035 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63164173 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63164176 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63164194 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63164254 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63164413 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63164481 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63165077 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63165087 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63165152 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63165153 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63165770 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63165786 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63165811 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63165824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63166106 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63166319 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63166892 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63166946 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63167293 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63167513 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63167528 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63167536 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63167606 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63167880 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63168297 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63168435 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63168472 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63168601 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63169147 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63169266 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63169563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63169714 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63169809 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63169853 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63170290 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 63170350 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63170622 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63170721 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63170788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63170968 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63170981 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63171016 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63171340 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63171347 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63171397 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63171509 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63171538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63171629 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63171631 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63171660 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63171667 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63171679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63171700 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63171762 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63171926 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63171934 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63172452 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63172672 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63172804 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63172859 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63172970 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63173701 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63174279 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63174762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63175089 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63175980 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 63176810 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 63177373 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63177720 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63178706 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63180152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63181942 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63182735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63182968 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63183213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63183969 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63184949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63185885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63186196 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63187749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63187783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63187941 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63187990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63190186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63190415 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63190877 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63191033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63191289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63192336 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63192560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63193459 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63195248 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63196559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63198788 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63200200 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63201713 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63202046 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63202634 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63203558 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63204596 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63213145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63215514 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63217974 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63219897 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63220060 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63220183 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63221616 C A N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 63221891 C G N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 63222315 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 63222803 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63223165 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63223938 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63224300 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63224363 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63224662 T A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 63224903 T C Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 63225176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63225252 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63225300 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63225312 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 63225323 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63225497 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63225537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63225721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63225807 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 63225947 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 63225997 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 63226554 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63226635 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 63227273 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63227413 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 63227516 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63227580 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63227643 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63227695 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63227709 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 63227741 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63227753 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63227758 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63227777 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63227815 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63227845 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63227885 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63228081 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63228140 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63228146 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63228411 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 63228413 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63228437 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63228449 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63228934 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63228973 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63229028 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63229030 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63229217 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63229322 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63229350 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63229491 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63229502 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63229986 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63230061 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63230109 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63230112 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63230151 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63230176 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63230193 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63230197 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63230372 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63230463 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63230499 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63230587 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63230706 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63230724 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63230766 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63230801 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63230812 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63230986 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63231124 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63231151 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63231186 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63231221 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63231423 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63231453 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63231504 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63231521 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63231549 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63231773 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63231774 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63231997 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63232015 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63232019 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63232166 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63232172 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63232207 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63232314 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63232400 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63232483 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63232561 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63232650 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63232696 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63232722 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63232809 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63232930 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63233017 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63233018 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63233079 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63233479 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63233480 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 63233535 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63233859 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63233980 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 63234060 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63234172 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63234243 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63234257 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63234337 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63234398 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63234932 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 63234938 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 63234976 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63235110 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63242048 A C N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 63242217 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 63242247 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63242376 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63242483 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63242636 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63242853 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63243095 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63243503 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63243616 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63244181 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63244352 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63244417 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63244759 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63244909 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63245120 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63245725 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63246186 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 63246266 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 63247539 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63247726 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63248315 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63249047 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63249239 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63249271 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63249278 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63249469 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63249811 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63249828 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 63249913 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63249966 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63250245 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63251015 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63251390 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63251911 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63253339 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63253615 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63254310 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63254654 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 63254713 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63254749 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63254888 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63255178 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63255563 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63256112 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63256770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63257020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63259280 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63260397 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63260502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63260597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63260618 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63261152 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63261497 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63261732 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63262087 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63262180 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63262405 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63262778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63264435 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63264917 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63265511 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63266010 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63266094 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63266381 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63267989 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63268035 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63268121 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 63269251 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63269645 C G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 63269683 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 63269799 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63270210 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63270698 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63270743 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63270848 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 63272310 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63272353 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63272972 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63275500 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 63275557 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 63276255 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63277957 T G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 63278031 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 63278328 T G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 63278722 T G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 63279318 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63282513 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 63282723 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63282990 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63283289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63283341 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63283366 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63283514 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63283617 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63283658 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63283701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63284119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63284384 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63284481 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63284773 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63285047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63285050 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63285537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63285578 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 63285716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63285872 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63285926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63286070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63286099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63286254 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63286463 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63286810 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63287147 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 63287149 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 63287754 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63288385 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63288427 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63288496 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63289023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63289752 A T N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 63289775 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63289801 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63289811 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63289931 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63290000 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63290010 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63290041 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63290162 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63290176 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63290264 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63290340 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63290419 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63290609 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63290624 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63290972 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63291425 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63291447 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63291483 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63291571 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63291686 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 63291718 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 63291822 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63291921 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 63291962 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 2 63291991 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63292052 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 63292063 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 63292287 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63292300 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 63292326 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 63292448 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63292522 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63292758 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63293008 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 63293064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63293128 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 63293201 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63294189 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63294344 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63294346 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 63294484 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 63294967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63295061 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63295213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63295903 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63296657 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63297648 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 63297886 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63297926 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 63298275 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63299563 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 63300084 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 63300282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63300285 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63300410 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 63301472 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63301755 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63301862 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63301911 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63301931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63302079 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63302155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63302221 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63302404 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63302690 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63302868 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63303061 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63303085 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63303453 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63303490 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63303526 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63303803 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63304133 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63304161 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63304189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63305272 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63305435 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63305479 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63305609 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63305666 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63305866 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63306841 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63306865 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63306969 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63307071 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63307154 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63307171 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63307194 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63307280 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63307319 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63307355 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63307490 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63307790 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63307878 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 63307944 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63308513 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 63308729 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63309215 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 63309307 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63309381 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 63309466 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 63309525 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 63309665 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 63309741 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 63309864 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63309866 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 63309885 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63309937 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63309967 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63310068 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63310087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63310088 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 63310108 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63310138 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63310170 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63310238 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63310317 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63310346 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63310800 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 63310848 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 63311125 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63311462 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63311504 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63311568 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63311712 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63312194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63312421 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63312490 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63312544 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63312584 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63312781 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63312860 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63312885 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63312980 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 63313194 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63313259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63313329 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63313520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63314287 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63314332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63314589 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63314646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63314659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63315026 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63315170 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63316122 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63316180 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63316366 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63316628 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63316655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63316679 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63323598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63323686 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63323749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63323822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63323875 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63324461 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63324588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63324635 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63324680 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63326151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63326704 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63327312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63327356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63327380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63327513 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63327577 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63327598 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63327766 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63327791 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63327976 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63328017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63328390 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63328433 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63328896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63329058 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63329107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63329691 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 63329836 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63329904 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63329979 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63330127 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63330275 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63330625 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63331524 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63332284 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63332900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63333639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63333726 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63334726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63334775 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 63335531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63336064 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63338054 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63338854 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 63339171 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 63340572 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 63340715 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 63340809 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63341197 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 63341226 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 63341382 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63341617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63341872 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63342327 C A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 63342400 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 63342425 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 63342712 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 63342752 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 63342827 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 63342858 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63342893 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63342979 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 63343010 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63343037 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63343184 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 63343190 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 63343293 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 63343389 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63343390 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63343414 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 63343477 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63343533 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63343566 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63343615 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63343622 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 63343696 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 63343972 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 63344110 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 63344135 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 63344204 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 63344297 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63344413 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63344422 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63344466 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63344496 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63344559 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63344590 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63344610 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63344662 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 63344730 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63344762 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63344784 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63345005 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 63345011 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63345049 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 63345429 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 63345602 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63345794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63345946 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 63346008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63346247 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63346497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63346680 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63346787 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63346892 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63346982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63347270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63347297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63347708 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63348050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63348204 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63348601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63352709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63353164 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 63353287 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63353298 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63353371 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 63353376 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 63353383 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63353415 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 63353466 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63353523 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63353708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63353773 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63353974 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63354003 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 63355365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63356299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63357736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63358143 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63360019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63361204 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63361448 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63361759 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63364434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63364891 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63365229 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63365775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63365784 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63366044 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63366442 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 63366507 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63366561 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 63366869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63367582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63368030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63369163 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63369372 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63370376 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63370469 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63371388 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 63371390 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 63371676 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63372073 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63373243 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 63374886 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 63374965 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63374990 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63375041 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 63375084 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63375284 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63375291 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63375424 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63375486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63375524 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63375554 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63375556 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 63375749 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63375760 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63375818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63375904 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63376244 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63376257 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 63376321 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 63376552 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 63376589 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 63376953 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63376979 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 63376998 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 63377048 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63377087 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 63377106 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63377381 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 63377439 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63377544 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63377585 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63377656 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 63377778 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63377793 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63377897 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63377913 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 63377964 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63378017 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63378131 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 63378225 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 63378574 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63379682 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63379731 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63379873 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 63380008 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 63380238 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63380371 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63380416 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 63380562 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 63380694 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63380701 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63380788 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63380958 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 63381008 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 63381059 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63381061 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 63381074 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63381155 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63381289 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63381453 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 63381482 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 63381486 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63381497 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 63381504 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 63381542 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63381546 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63381658 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 63381672 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63382036 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 63382106 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 63382141 T G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 63382155 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 63382170 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 63382258 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 63382365 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63382382 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 63382503 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63382506 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63382724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63382758 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 63382817 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 63382867 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63383032 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 63383050 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 63383075 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63383244 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 63383284 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 63383353 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63383435 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 63383653 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 63383723 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63383792 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 63383802 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 63383856 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 63383873 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63384017 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 63384037 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 63384142 C A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 63384224 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 63384349 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 63384957 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63385613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63385675 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 63385724 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 63385942 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 63385953 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 63386031 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63386055 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63386058 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63386094 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 63386115 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63386121 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 63386167 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63386174 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63386227 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 63386325 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 63386337 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63386344 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 63386382 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63386383 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63386394 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63386631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63386683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63386690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63386714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63386763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63386770 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 63386840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63386882 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63386900 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63386953 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63387038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63387054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63387085 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63387115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63387191 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63387439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63387476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63387514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63387577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63387700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63387713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63387715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63387776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63387829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63387926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63388016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63388378 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63388423 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 63388446 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63388611 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 63388783 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63388854 C T Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 2 63388863 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 63389074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63389988 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63390144 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 63390381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63391056 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63391134 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63392168 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 63393420 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63393426 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63393732 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 63393963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63395994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63397300 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 63397301 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 63397625 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 63398057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63398835 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 63398844 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 63398857 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63398939 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63399045 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 63399260 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63399313 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 63399456 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 63399470 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 63399511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63399592 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63399716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63399817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63399851 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63400033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63400163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63400363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63400538 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63400810 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63400924 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 63400985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63401180 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 63401227 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63401347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63401375 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63401464 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63401490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63401536 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63401732 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63401737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63401879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63401950 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 63402058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63402249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63402341 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63402504 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63402521 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63403126 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63403149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63403171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63403179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63403256 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63403353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63403373 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63403638 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63403643 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63403703 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63403795 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63404342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63405139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63405354 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63405356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63405598 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 63405891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63405949 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63407477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63407545 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63408609 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 63409833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63409846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63409903 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63410739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63410910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63415615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63416077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63416245 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63416837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63417172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63418099 T A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 63418112 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 63418883 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63418982 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63419958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63420052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63420712 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63422738 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63423632 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63423780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63424235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63424287 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63424687 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63425224 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63425669 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63426833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63427044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63427089 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63427170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63429074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63429385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63429435 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 63429517 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63429650 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63429680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63431051 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 63433260 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63433372 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63433435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63434544 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63434658 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 63434687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63434991 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63435112 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63435200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63435222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63435279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63436381 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63436566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63436819 G A Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 63437593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63437689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63438242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63438351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63438372 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63438513 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 63438721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63438832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63438846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63438861 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63438994 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63439298 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63439524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63439655 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63439953 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63439966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63440135 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63440306 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 63440311 A C N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 2 63440529 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 63440616 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 63440777 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63440861 C G Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 63440982 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63441068 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63441169 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63441174 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63441260 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63441318 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63441401 C A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 63441477 C G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 63441643 T G Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 63441654 T G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 63442325 G T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 63442373 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 63443095 G T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 63443162 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 63444376 G A Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 63452324 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 63452350 C G Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 2 63452473 A G Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 63452531 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63452561 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63453124 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 63453152 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 63453181 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63453190 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63453199 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 63453229 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63453277 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 63453284 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63453666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63453928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63454117 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63454145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63454155 G C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 63454244 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 63454305 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 63454320 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 63454455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63454457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63454584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63454655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63454706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63454747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63454813 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 63454836 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 63454908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63455038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63455160 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63455220 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63455283 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63455298 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63455415 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63455510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63456072 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63456081 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63456216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63456446 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63456608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63456620 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63456667 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 63456689 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 63456854 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 63456883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63457065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63457113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63457212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63457271 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63457352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63457355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63457441 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63457513 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63457629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63457710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63457955 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63458070 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63458143 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63458228 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 63458419 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63458431 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 63458810 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 63459284 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63459407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63459561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63459737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63459848 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 63459893 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 63460066 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63460101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63460128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63460204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63460218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63460280 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63460336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63460371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63460509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63460517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63460620 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63460692 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63460826 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 63460923 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 63460926 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 63461241 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 63461404 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63461432 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 63461448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63461549 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 63461593 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 63461623 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63461874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63461910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63462002 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 63462191 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 63462245 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 63462392 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63462414 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 63462457 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 63462556 A G N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 63462679 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 63462689 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 63462699 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63462753 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 63462776 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 63463216 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 63463266 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 63463370 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 63463398 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63463640 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 63463691 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 63464256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63464643 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63464648 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63464870 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63465122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63465437 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63466316 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 63466370 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63466384 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63466823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63466947 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63467192 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 63467237 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 63467255 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 63467271 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63467401 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 63467405 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 63467504 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 63467512 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 63467585 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 63467588 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 63467635 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63467679 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 63467777 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 63467837 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 63467883 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63467916 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 63467944 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63467954 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63468005 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63468051 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63468082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63468117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63468970 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 63468999 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63469038 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 63469178 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63469326 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 63469378 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63469495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63469553 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 63469604 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 63469639 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63469666 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63469817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63469826 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63469989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63470012 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63470064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63470079 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 63470429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63470533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63470637 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63472528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63472788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63472934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63473236 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 63473623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63474748 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63476421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63476593 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63476695 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63476700 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63477246 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63478843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63479146 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63484691 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 63484800 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63484931 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63485193 G A Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 63485207 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 63494771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63495429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63495976 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63496886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63497215 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63499246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63499545 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63499888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63500793 T G N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 63500818 G T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 9 9 1 7 1 2 63501007 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 63503262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63507443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63508962 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63509022 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 63509040 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 63509296 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 63509488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63510695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63510710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63512090 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63512293 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63512902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63513126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63514100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63514293 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63514690 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 63514896 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63516354 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63517036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63518489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63518936 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63519296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63519875 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63521504 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 63521558 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 63522503 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 63523515 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63523548 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63523710 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 63524044 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63524307 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 63524336 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 63524445 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63524465 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 63524575 T A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 2 63524738 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 63524845 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 63524905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63524919 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63525051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63525078 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 63525181 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 63525194 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 63525539 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 63525789 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 63526152 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63526166 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 63526283 T A N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 2 63526501 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 63526591 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 63526911 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 63526923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63526962 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 63526973 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 63527002 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 63527005 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 63527141 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 63527215 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 63527301 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 63527333 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 63527446 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 63527631 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63527740 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 63527773 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 63527867 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63528104 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 63528257 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 63528461 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 63528471 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 63528580 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 63528617 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 63528620 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 63528656 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63528680 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63528714 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 63528729 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 63528816 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63528823 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63528905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63528951 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 63528977 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63528984 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63529036 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63529054 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63529080 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 63529195 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 63529238 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 63529323 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 63529329 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 63529457 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 63529533 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 63529543 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 63529567 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63529593 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63529602 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63529624 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 63529734 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63529752 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63529823 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63529876 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63529949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63530168 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 63530225 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 63530376 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 63530620 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63531222 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63531557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63531993 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63532336 A C N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 63532611 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 2 63533254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63533551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63533762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63534420 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 63534666 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63534784 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63535831 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63536332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63536603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63537693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63540274 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63540477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63542035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63543047 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 63544228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63544733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63545422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63546274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63546782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63547566 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63549380 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63549452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63551782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63552176 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 63552834 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63554684 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63555039 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63555098 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63564254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63564696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63564905 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63564946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63564948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63564965 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63565027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63565028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63565681 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 63565982 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63566541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63566641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63566741 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63567411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63568291 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 63568973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63570556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63570947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63571011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63571768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63573722 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63575964 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63576689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63578582 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63586517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63586546 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 63587902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63590340 C A Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 63591631 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63595856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63597078 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 63597230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63597260 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63597337 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63597369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63597430 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63597549 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63597655 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63597761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63597885 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63599035 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63599118 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63600511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63600830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63600927 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63601092 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63601111 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 63601228 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 63601317 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63604103 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63605881 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63607909 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63608386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63609153 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63609640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63609680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63610800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63612374 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63612735 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63613490 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63613771 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 63615372 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63618953 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63618959 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63619677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63621717 A C Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 63623007 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63624536 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63626285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63627002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63628411 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63628697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63628978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63629651 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 63629894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63630330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63634611 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63634708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63634816 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63635511 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63635998 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63636155 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63636568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63638184 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63638346 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63639265 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63639694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63640647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63640672 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63641027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63643061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63643258 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63644253 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63645911 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 63646379 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63647930 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 63647959 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 63648589 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 63650165 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 63652254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63656168 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63657530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63657712 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63657770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63657785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63657858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63659271 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63659568 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63660387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63662020 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63662163 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63662298 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 63662351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63662881 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63662916 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63663072 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63663440 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63663547 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63664007 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63664170 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63664234 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63664830 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63664893 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63665069 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63665079 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63665090 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63665227 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63665232 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63665305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63665318 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63665329 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63665382 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63665504 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63665669 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63665670 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63666001 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 63666084 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 63666303 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63667024 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 63667280 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63667641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63667850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63668361 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63669395 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63671339 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63672317 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63672851 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63672868 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63672951 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63673408 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63673718 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63674445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63674770 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63683658 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63685551 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63686367 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 63686984 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 63687116 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63687213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63687486 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63687976 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63688601 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63689409 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63689508 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 63690161 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63691499 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63691620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63691933 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63693577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63693694 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63694207 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63694899 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 63695298 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63696071 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63696094 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 63696132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63696744 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63696992 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63697005 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 63697075 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63697618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63697648 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63697685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63697986 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63698154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63698304 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63698325 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63698492 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 63698493 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 63698509 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 63698586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63698753 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 63698763 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63699330 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63699766 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63700836 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63701628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63701629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63702651 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63702692 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63705606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63706175 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63708625 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63709981 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63711093 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63711792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63711800 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63711846 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 63714323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63714519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63715805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63718933 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63719884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63722994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63726515 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 63727938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63727973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63728461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63729214 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63729501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63729666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63729818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63730509 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63731106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63732425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63732637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63734957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63737325 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63737983 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 63742953 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63743668 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63746520 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63746817 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63747437 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63751163 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63755269 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63755347 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 63759520 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63760756 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63761876 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 63765240 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 63768553 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 63768655 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 63768694 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63768912 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63769014 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63769038 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 63769215 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63769434 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63769919 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63770878 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63777907 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63778381 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63779199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63779508 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63782562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63782685 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63782880 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63783082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63784230 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63784761 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63784892 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63784902 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63785259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63785363 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63785472 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63785502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63785528 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63785568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63785620 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 63785808 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 63785886 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 63786140 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63786214 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 63786218 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63786240 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63786274 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 63786279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63786301 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 63786373 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 63786377 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63786401 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 63786474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63786483 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 63786610 T C N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 63786700 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 63786878 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 63786899 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 63786905 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 63787107 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 63787113 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 63787202 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 63787269 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 63787319 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 63787605 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63787698 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63787702 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63787730 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 63787737 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 63787841 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 63787875 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63787997 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63788071 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 63788077 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63788287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63788325 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 63788375 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63788424 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 63788461 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 63788469 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 63788485 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63788544 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 63788577 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 63788684 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 63788774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63788926 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 63788932 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 63789117 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63789722 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 63789726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63789768 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 63789852 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63790624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63790796 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63790913 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 63790934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63790984 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 63791262 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63791370 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63791444 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 63791811 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63792274 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63793577 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63794165 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63794542 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 63794571 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63796066 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 63797253 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63797652 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 63798694 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 63798705 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63798769 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 63798931 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63798982 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63799079 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63799273 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 63799441 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 63799448 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 63799491 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 63800699 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63802005 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 63802304 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63802325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63803148 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63803578 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63804568 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63804693 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63806084 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 63807130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63807355 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63813204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63813427 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63813877 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63814122 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63814298 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63814309 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63815129 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63815150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63815587 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 63818046 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63818115 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63819354 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63819821 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63819949 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63820245 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63820262 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 63823659 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63824004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63824110 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63824518 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63824902 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 63825110 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 63825400 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63825769 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 63827088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63827161 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63827619 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63827718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63828057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63828256 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63828263 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63828270 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63828321 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63828323 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63828334 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63828338 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63828390 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 63828466 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63828594 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63828666 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63828949 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63828977 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63828982 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63829035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63829062 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63829222 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 63829329 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63829357 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63829379 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63829497 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63829575 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63829638 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63829652 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63829653 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63830070 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63830185 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 63830492 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63830667 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 63830729 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63830741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63830945 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 63831023 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 63831189 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 63832063 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63832235 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63834189 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63834656 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 63835258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63836366 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63836516 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 63836752 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63838028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63841169 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63841335 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 63841375 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 63841441 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 63841481 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 63841553 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63841827 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 63841862 A C N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 63841900 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 63841909 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 63841945 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 63842218 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63842269 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63842302 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 63842467 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63842493 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63842642 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 63842729 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 63843191 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63843221 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 63843516 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 63843530 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63843594 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63843965 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63844099 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 63844123 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63844597 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63845405 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63845694 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63845841 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63845846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63845859 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 63845867 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63845944 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 63845964 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63846067 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63846174 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 63846205 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 63846207 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63846636 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 63846835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63847627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63849571 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63850463 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63850993 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63851577 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63854567 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 63857336 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63858459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63858997 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63859035 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63859134 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63860597 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63860758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63860943 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63861478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63862139 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63862691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63862803 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63863471 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63864288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63864566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63865758 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 63866608 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63867423 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63868139 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63868304 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63868913 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63869015 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63869212 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63869390 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63869921 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63869981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63870833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63871072 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63871621 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63871631 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 63871832 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63872176 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63872297 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63872469 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63872607 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63872769 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63873003 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 63873349 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63873582 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 63873917 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 63874161 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 63874170 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63874177 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 63874587 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63874678 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 63875224 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 63875991 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 63876045 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63878363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63879000 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63879015 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 63879094 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63881457 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63883608 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63883733 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63883757 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63883929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63884239 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63884274 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63884815 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63886011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63887432 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63888527 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63888892 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 63888945 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63888950 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 63889085 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 63889728 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63890352 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63893743 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63894013 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63894561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63894718 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63894983 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63895951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63896044 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 63896085 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 63896215 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 63896642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63896750 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 63896930 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 63896936 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 63897236 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 63897277 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 63897282 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63898120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63898582 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63898583 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63898740 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63898828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63899149 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63899261 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 63899263 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 63899320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63899416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63899460 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 63899551 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63899623 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 63899706 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 63899771 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 63899888 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 63899891 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63899997 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63900013 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 63900106 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63900114 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63900215 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 63900333 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63900440 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63900741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63900885 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63901791 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 63902547 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63906072 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 63909815 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63911153 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63911325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63912433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63912473 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 63913263 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 63913367 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63913368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63913818 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 63916373 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 63918183 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 63918881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63919606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63920629 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 63921647 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63922055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63922543 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63923450 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63923761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63923957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63924547 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 63927081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63927614 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 63927631 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63927770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63927857 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63928120 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63928265 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 63928289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63928427 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63928638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63928958 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 63929251 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 63929376 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63929377 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63929787 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63930523 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63931015 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63933137 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63933827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63934335 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63934378 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63936812 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63936988 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63937068 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 63937689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63937938 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63939415 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63940014 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63940764 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63941130 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63943013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63943795 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 63944118 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63945176 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 63946833 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63947484 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63947756 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 63947932 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 63947987 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 63948006 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63948409 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 63948656 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 63948721 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 63948769 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 63948841 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 63948862 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63948877 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63949161 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63949249 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 63949373 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63949417 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63949640 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 63949701 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 63949805 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 63950215 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63950634 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63950670 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 63950900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63950969 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63951022 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63951045 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 63951099 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63951144 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 63951699 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 63951773 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 63951860 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 63951981 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 63952537 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63952796 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63953133 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 63953255 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63953420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63953500 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63953525 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63953536 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63953566 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63953620 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 63953640 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 63955752 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 63956166 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63956671 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63956851 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 63957503 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63958746 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63960230 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 63960317 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63960360 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 63960730 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63960962 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 63961280 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 63961464 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63961755 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 63961962 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63962476 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 63964366 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 63964578 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 63964966 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 63965312 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 63965376 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 63965615 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63965730 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63965902 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63966161 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63966170 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63966180 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63966181 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 63966420 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63966618 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63966721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63966813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63967358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63967612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63967729 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 63967780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63968301 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 63968729 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 63969403 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 63970653 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 63970745 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63970760 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 63970896 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 63971134 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 63973074 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 63973739 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 63974052 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 63975633 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 63975644 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 63975731 C A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 63981124 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 63981319 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 63981403 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 63981834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63981899 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 63982673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63989599 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63990678 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 63991928 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 63992159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63992310 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63992403 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 63992859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63993181 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 63993376 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63994779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63994781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63994872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63995030 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 63995673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63995802 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 63996215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63996238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63996928 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 63997427 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 63997690 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 63997737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63998045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 63998634 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 63998969 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 63999814 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64000103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64000248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64000448 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64000946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64001012 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64001203 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64001286 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 64002158 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 64002174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64002915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64003386 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 64004273 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64004451 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64004597 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 64005348 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 64005683 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64006325 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 64006665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64006723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64006804 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64006996 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 64007305 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64007402 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64007667 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 64007688 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64008248 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 64008426 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 64008550 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 64008556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64011520 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 64011851 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64011922 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64012307 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64012368 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 64012427 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64013136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64015470 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64016635 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 64017130 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64017216 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64017584 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64017792 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64019512 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64019692 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 64020454 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64020908 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64021330 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64021699 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64021939 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 64022356 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64022385 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64022775 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64023624 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 64024777 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64025024 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64026754 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 64027224 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64028711 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64028746 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64028824 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64029960 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64029983 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 64030246 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64030311 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64030312 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64030953 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64030991 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64031657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64031764 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64039161 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64039477 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 64040035 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64040663 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64041952 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64042253 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 64042358 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64045335 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 64046203 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64046439 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64047228 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64047486 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 64047554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64047683 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 64048183 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64048329 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64048633 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64048992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64049248 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 64049296 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64050255 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64050938 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64051088 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 64052051 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64052413 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64052658 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64053880 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 64053967 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64054138 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 64054704 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64055044 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64055460 A C Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 64056393 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64057224 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64057737 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64057739 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 64058835 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 64060106 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64060227 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 64060726 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 64061819 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64061982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64062259 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 64063248 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 64064134 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64064527 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64065072 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64065175 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64065293 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64065328 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64066199 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64066431 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 64066561 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 64066584 T C Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 64067523 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 64070547 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64070567 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64070964 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64071419 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 64072073 G T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 64072545 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64072663 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64072675 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64072971 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 64073180 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64073243 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 64073397 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64073426 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64074422 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64074593 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64074616 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64075049 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64075224 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64075664 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64076309 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 64076373 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 64076596 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 64077419 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64077642 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64077754 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64078033 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 64078217 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64078489 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64078717 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 64078892 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 64079047 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64079550 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64080013 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64080077 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64080110 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64080166 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64080648 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64080934 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 64081024 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64081508 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64082237 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64082991 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64083341 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64087508 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64087631 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64087755 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64087976 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64088146 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64088261 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64090070 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 64090275 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64090333 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64091948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64092451 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 64092566 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 64093315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64093596 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64095010 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64095128 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64095197 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 64095823 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 64096489 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64098137 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 64098257 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64099125 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64099443 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64099848 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64100076 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 64100321 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64101485 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 64101696 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 64101824 G T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 64102151 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 64102237 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 64103024 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64103924 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64103982 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 64104014 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 64104070 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64104298 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64104348 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64104680 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64104681 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64104934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64105165 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64105797 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64106184 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 64106517 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64106747 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64106752 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64107278 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64107327 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64107362 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64108066 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64108117 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64108288 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 64108503 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 64108830 G C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 64108935 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 64108948 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 64109052 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 64109373 T G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 64109510 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64111239 T G Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 64111796 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64111846 G C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 64112231 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 64112588 C T Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 64112870 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64113045 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 64114332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64114426 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64115060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64116154 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 64116523 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64116618 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64116868 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64117332 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64117689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64118662 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64118896 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 64119583 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64119920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64119936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64119948 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64120327 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64122182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64122262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64124320 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 64124433 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64124667 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64124922 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 64125468 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 64125645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64125809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64125853 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64125974 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64125997 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64126328 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64127093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64127654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64127669 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64127730 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 64127781 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64128463 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64128663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64128947 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64129611 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64129638 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 64130337 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64131061 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64131390 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64131503 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64132235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64132740 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 64133022 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64133192 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64133579 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 64133761 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 64133861 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 64134115 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 64134250 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 64134387 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64134517 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 64135110 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 64135618 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 64137985 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64138166 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64139195 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64139411 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64139704 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 64139828 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64141431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64141637 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 64141644 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64141928 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64144083 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 64144264 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64144439 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64145505 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64146141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64148957 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 64149007 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 64149045 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64149164 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64149218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64149368 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 64149439 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 64149661 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 64149833 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 64149980 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64150036 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64150133 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 64150310 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 64150348 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64158152 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 64158286 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 64158378 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64158418 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64158428 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64159064 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64159261 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 64159275 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64160317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64160610 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 64160660 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64161075 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 64161127 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64161240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64161731 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64161978 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64163533 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64163545 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64163828 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 64164246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64165989 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64166007 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 64166297 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 64166657 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64167069 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 64167133 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 64167676 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 64167780 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64169679 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64170533 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64171276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64171613 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64171666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64171955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64172633 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64173592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64173709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64173947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64174657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64174720 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 64176845 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 64176871 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 64177002 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 64177241 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 64180045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64180479 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64182084 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64182782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64183015 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64183193 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 64183469 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 2 64183906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64183922 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64187102 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64187451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64189463 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64190633 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64192742 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64193084 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 64193395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64195508 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64196419 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 64197012 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64197554 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 64198492 T C Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 64198547 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 64199035 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64199782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64199875 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 64199981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64200736 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 64201652 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64203497 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64205608 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 64206185 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 64208619 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64209926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64210918 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64211155 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 64211906 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64212193 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 64212844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64214033 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 64214325 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64214787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64215335 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 64215737 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64215769 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 64216057 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 64216242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64217299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64217888 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 64218591 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 64218787 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64219223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64221437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64221518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64222264 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64223187 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 64223232 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64223578 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64226257 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 64226418 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 64226694 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64226920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64227158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64227292 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64227372 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64228431 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 64228598 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 64228780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64229673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64230198 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 64231175 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64232562 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64232993 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64234291 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64234983 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64235313 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 64235792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64236551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64238274 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 64239562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64241097 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64241342 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64242145 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64242347 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 64242905 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64243600 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 64246073 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64246499 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64247062 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 2 64247505 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 64249676 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64250121 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64250260 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64255312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64255688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64255779 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 64256422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64256440 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64256924 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64257844 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 64258055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64258616 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64260056 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64261885 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 64265181 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64266073 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64266735 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 64269130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64269658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64270541 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64271246 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64271391 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64272712 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64273210 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64273642 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64273938 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 64274872 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64274922 G C Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 64275864 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64276486 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64279434 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 64279459 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64279737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64279818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64280212 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 64280769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64281057 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64282292 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64282704 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64282754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64282938 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 64283107 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 64283986 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64284111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64284197 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64284376 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 64284696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64284835 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64284891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64285279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64285500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64285611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64285861 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64286325 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 64286785 T A Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 64286918 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 64287061 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64287318 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64287347 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64287509 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64287695 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64287715 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64287995 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64288115 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 64288140 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64288345 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64291009 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64291351 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64291882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64293641 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64293882 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64293910 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 64295160 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64295872 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64297924 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64300037 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64300271 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64301291 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 64301619 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64305067 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64305184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64305692 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64305865 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64306342 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64306777 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 64307098 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 64308813 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64308976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64309241 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64309513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64310031 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64310835 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64313581 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64314393 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64314847 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64316143 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64318211 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 64321391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64324096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64324575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64324848 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 64325204 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 64326329 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64326900 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 64327080 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64327463 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64327535 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64327536 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64327771 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 64327844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64327964 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 64328358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64328574 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64328596 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 64328736 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 64328768 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64328893 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 64329437 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 64329563 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 64329631 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 64329860 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64329899 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64330011 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 64330179 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 64330221 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 64330229 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64330233 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64330641 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64330796 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64330813 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64330848 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 64330870 T A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 64330893 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 64331007 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64331536 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64331605 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64331649 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 64332203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64332438 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 64332601 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 64332614 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 64332659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64333161 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64333459 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 64333807 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 64335315 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 64335364 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64335438 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64335480 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64335571 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64335591 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64335608 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64335648 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 64335884 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64335923 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 64336363 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64336393 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64336476 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 64336623 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 64336715 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64336796 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 64336851 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 64337036 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64337319 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64337518 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 64337538 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 64337693 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64338576 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64339534 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 64339962 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64340081 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64340438 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64340625 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64340829 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 64340974 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64341018 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 64341934 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 64341950 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64342091 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 64343548 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64346125 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64346632 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64347153 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64348572 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64348943 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64349130 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64349602 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64351562 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 64351569 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 64351593 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 64351771 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 64351772 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64351782 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 64351796 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64352006 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 64352978 A C Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 64353649 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 64354388 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 64354879 A C Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 64355046 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64355055 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64355076 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 64355174 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64355210 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64356107 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 64357703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64358018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64358774 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64362794 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 64362798 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 64362988 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 64363447 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64363561 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64364287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64364697 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 64366438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64368665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64371376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64371440 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64372430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64372980 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64374013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64374398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64374752 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64375765 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64376034 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64376821 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 64377839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64378980 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64379145 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 64380850 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 64381038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64381041 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 64382285 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64383486 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64383756 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64383781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64384129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64388724 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 64388871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64389185 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64389244 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 64389844 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64390743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64390820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64391634 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64395191 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 64397200 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64399182 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64399679 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64399826 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 64400019 G A Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 64400558 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64402450 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64402826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64404889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64405029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64405755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64406224 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 64406240 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 64406243 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 64406628 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64406846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64406950 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 64407011 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 64407087 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64407287 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 64407291 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 64407315 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 64407341 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 64407349 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 64407418 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64407607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64407610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64407686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64408942 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 64409517 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 64409571 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64409665 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64409933 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 64409937 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64410032 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 64410053 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64410090 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64410147 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 64410267 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 64411740 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64412827 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64414918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64416427 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 64416520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64416569 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64416570 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64417107 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 64417637 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64417658 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64417735 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64417753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64417766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64417780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64417802 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64417899 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64417918 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 64418217 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64418244 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64418273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64418467 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64418477 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 64418479 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 64418514 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64418526 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64418539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64418580 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 64418597 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 64418647 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64418725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64418746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64418756 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64418797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64418923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64419052 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64419106 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64419200 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64419302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64419310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64419379 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 64419481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64419774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64419788 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64419815 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64419891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64419926 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64420034 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 64420046 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64420102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64420112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64420180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64420201 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64420237 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64420320 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 64420344 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 64420407 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64420420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64420526 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 64420546 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 64420655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64420679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64420693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64420726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64420780 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64420814 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64421308 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 64421333 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 64421503 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64421601 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64421756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64422015 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64422098 C G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 64422291 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 64422292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64423092 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 64423302 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 64423408 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 64424045 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 64424748 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 64425461 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64425619 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 64425758 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 64425951 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64426076 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64426282 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64427631 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 64427656 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64427747 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64427917 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64427946 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64427960 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64428122 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64428133 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64428460 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64428596 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64428626 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64429064 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 64429167 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 64429213 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 64429249 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64429271 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64429411 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 64429438 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 64429716 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 64429786 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64429795 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64429998 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64431311 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64432127 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64433174 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 64433213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64433382 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64433973 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64434712 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 64435379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64435510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64436376 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 64436459 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 64436564 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 64436859 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 64436982 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64436990 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64437092 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64437141 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64437216 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 64437229 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64437299 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 64437350 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64437364 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64437451 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 64437562 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 64437683 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 64437737 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64438433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64438634 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 64438699 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64438834 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 64438967 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64439114 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 64439171 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64439182 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 64439243 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 64439653 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64439688 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64439714 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64439962 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64440203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64440299 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64440882 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64441066 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64441078 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64441090 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64441118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64441695 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64441914 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64442172 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64442194 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64442215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64443100 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64443138 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64443359 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64443380 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64443396 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64443480 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64443544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64443619 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64443752 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64443823 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64444022 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64444042 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64444093 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64444101 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64444182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64444240 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64444319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64445995 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64446056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64448417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64448855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64449379 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64449772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64450424 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64454655 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 64455245 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64457820 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64461859 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 64462051 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64462182 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 64462631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64471805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64471919 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64472296 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64472310 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 64472688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64472865 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64473070 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 64473834 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64473854 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64473900 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64474491 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64474678 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64474752 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64474780 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64474790 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64474791 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64474809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64474814 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 64474852 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64475061 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 64475515 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64475786 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 64476035 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 64476116 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64476164 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 64476718 T C Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 64476747 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 64476978 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 64477079 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 64477362 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64477372 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64477456 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 64477506 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64477683 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64478438 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64478505 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64478506 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64478948 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64479260 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64479278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64479464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64479758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64480026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64480384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64480394 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64480543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64480678 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64480764 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64481416 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64482452 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64482981 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64484203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64484334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64485591 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64485906 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64485934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64487373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64489031 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64489218 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64489603 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64489942 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64490423 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64491160 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64493585 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64493831 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64493898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64494118 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64494171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64495484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64495583 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64495693 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64495714 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64496042 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64496536 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64499293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64501438 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64502020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64502949 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64505698 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 64508331 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 64508849 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 64508961 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64508989 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64509421 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 64509592 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64510192 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64510660 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 64511510 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64511654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64512116 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64512718 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64513370 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 64513844 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64513939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64514057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64515925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64516033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64518400 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64520387 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 64520508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64520542 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 64520611 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 64520748 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 64520812 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 64521089 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 64521868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64521896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64522229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64522368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64523225 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64523300 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 64523548 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 64523724 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 64524287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64524439 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64524725 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64524733 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64525595 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64525619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64526453 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64526476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64526799 A C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 2 64527502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64527754 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64528266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64528306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64528922 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64528954 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 64529394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64529664 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64530692 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64530769 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64530882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64531041 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64531079 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64531701 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64532306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64532479 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64532555 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64532885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64533425 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64533449 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64534488 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64535644 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64535845 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64541653 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 64542140 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64542215 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64542294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64542585 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 64542674 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 64542689 A T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 64542822 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 64542900 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 64542953 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 64542989 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 64543047 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64543064 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 64543096 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64543120 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 64543140 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 64543362 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 64543416 T C N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 64543431 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 64543443 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 64543459 G A Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 64543468 A G Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 2 64543508 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 64543512 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 64543531 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 64543542 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 64543567 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 64543579 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64543607 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 64543652 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 64543696 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 64543712 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 64543789 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64543922 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 64543927 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 64544044 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 64544121 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 64544148 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 64544215 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 64544382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64544429 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64545021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64545618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64545849 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 64545986 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 64546008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64546074 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 64546107 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 64546137 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 64546161 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 64546174 C G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 64546369 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 64546372 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 64546490 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 64546751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64546812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64546851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64546963 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64546964 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64547062 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 64547195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64547274 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64547887 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 64548914 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 64549272 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 64550194 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64550524 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64550561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64551008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64551071 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 64553949 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64554612 C G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 64554759 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 64555022 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64555040 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 64556284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64556419 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64557052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64559371 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64560120 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 64563769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64566566 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64566692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64566849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64569237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64571058 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 64571704 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 64572000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64572831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64572990 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64573169 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64573193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64573774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64574795 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64574861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64574896 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64574918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64574921 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64575074 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64575481 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 64575561 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64575600 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 64575771 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64576324 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 64576398 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64576597 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 64576721 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 64576844 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 64577070 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 64577143 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 64577154 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 64577968 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64578658 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64578828 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64579464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64579709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64579808 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64579921 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64580035 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64580709 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 64580752 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 64581423 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 64587776 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 64588671 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 64589237 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 64590005 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 64590335 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 64590673 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64590828 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64591124 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64591307 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64591574 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64592065 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 2 64592727 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64592735 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64592888 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64593789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64593860 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64593878 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 64593959 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 64594207 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 64594264 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 64594273 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 64594324 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 64594348 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 64594573 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64594655 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 64595001 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 64595445 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64597639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64597723 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 64597931 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64600527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64601553 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64601741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64601812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64601979 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64603292 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64603589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64603706 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 64604723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64606530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64607372 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 64608411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64609733 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 64610639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64610687 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64612125 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64613373 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64613388 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64615443 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 64615959 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64616563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64616632 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 64616796 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64617083 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64618253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64619110 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 64620054 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64621549 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64622262 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64622457 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 64624286 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 64624303 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64624412 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 64625833 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64626437 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 64626480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64626508 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64626730 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 64634318 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64635537 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64635770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64636190 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 64637483 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 64637826 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64638394 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 64641139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64642941 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 64645018 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64645562 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 64645678 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64645726 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 64645745 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 64645854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64646044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64646439 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64646678 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64646850 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 64648940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64648997 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64650086 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64651793 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64654192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64655268 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64657712 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64661582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64664429 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64665009 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64665773 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64666381 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64666412 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64668397 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 64669783 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 64670166 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64671464 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64671487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64672340 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 64672501 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64672997 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64673037 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64673038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64673112 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64673193 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64673210 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64673263 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 64673389 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 64673481 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 64673561 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64673587 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 64673682 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64673738 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64673877 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 64674074 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 64674086 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 64674114 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64674202 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 64674319 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 64674505 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 64674550 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64674551 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64674634 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 64674737 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64674801 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64674898 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64674935 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 64675160 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64675197 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 64675464 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 64675471 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 64675502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64675528 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 64675638 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64675642 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64675674 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 64675754 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 64675867 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 64675884 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 64676003 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 64676408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64676553 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 64676771 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64677040 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 64677409 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64677592 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 64677682 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 64677855 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64678283 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64679356 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64679527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64679604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64679688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64679884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64680250 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64680849 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64682055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64682068 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64682738 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 64682811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64682960 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 64683346 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 64683375 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 64683500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64683545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64683664 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 64683667 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 64684252 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64684330 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 64684384 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 64684519 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64684524 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64684733 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64685071 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 64685275 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 64685323 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 64685486 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 64685506 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 64685690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64685733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64686089 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64687505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64688042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64688052 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64689124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64690213 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64695126 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 64696136 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 64696731 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64696747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64696821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64697178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64698806 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 64699712 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64699723 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 64700843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64700925 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 64700936 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 64700941 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 64701212 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 64701240 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 64702428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64702503 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 64702731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64702951 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 64703169 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64703253 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 64703311 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64704147 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64706297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64711194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64712405 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64712738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64714138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64718580 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64719553 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64721649 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64721882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64722060 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 64722200 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 64722269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64722744 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64722746 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 64722810 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64722975 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64723357 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64723711 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 64723872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64724023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64724087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64724227 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 64724524 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64724708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64724808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64724899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64725144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64725635 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64725879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64726095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64726449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64726605 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64726768 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64726828 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 64727214 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64727237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64727488 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64727530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64727580 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64727591 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 64727713 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 64727772 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 64729349 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64729375 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64729547 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 64729848 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64729917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64729996 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64729998 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 64730032 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64730057 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 64730106 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 64730159 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 64730190 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 64730219 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 64730238 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 64730286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64730299 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 64731406 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64731469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64731470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64731626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64731775 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64731828 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64732323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64732575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64732894 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64733256 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64733351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64733389 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64733558 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64734646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64734900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64735192 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64737447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64737615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64738370 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64740358 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64743126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64743226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64745264 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64745415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64745565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64747221 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64747811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64750908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64753523 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64753524 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64753763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64753896 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64754221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64754621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64755069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64756439 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64759409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64759527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64760107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64760517 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64761145 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64764271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64764532 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64766160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64767770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64767870 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64769920 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64770195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64771619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64772011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64773222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64773568 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64774892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64774900 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64774952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64775390 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64775948 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64776999 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64777357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64777889 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64777968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64778010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64778060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64778136 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64778227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64778651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64778674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64778756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64779038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64779152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64779253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64779402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64779484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64779614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64779643 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64780499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64781775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64782074 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64782918 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 64783406 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64784433 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 64785156 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64785169 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64785176 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 64785413 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64785750 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64786418 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 64786420 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 64786523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64787144 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 64787154 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 64787178 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64787187 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 64787474 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 64787787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64787962 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 64788015 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 64788025 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 64788142 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 2 64788160 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 64788485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64788537 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 64788562 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 64791026 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64791377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64791406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64791954 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64792495 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64792752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64792920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64794119 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64794280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64794561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64794602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64795396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64796017 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64796552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64796956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64798822 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 64799956 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64799981 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64801479 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64801914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64803158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64803192 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64803629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64803655 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64803759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64804227 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 64804240 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64804328 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 64805967 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64806205 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64806924 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64807140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64807193 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64807249 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64807575 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64807654 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64807658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64807669 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64807682 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64808098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64808102 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64808474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64808532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64808555 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64808651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64808676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64808933 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64810289 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64810819 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64811017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64811747 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 64811755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64812885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64813444 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64813749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64814344 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64814731 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64814814 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64814854 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64815139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64815483 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64815541 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64817655 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64817974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64818407 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64819653 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 64820255 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64820506 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 64821524 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 64824417 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64825547 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64825683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64825890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64826500 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 64826566 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 64826826 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 64826978 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 64827308 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 64827559 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 64827927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64828032 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 64828956 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64829209 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64829414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64829654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64829749 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64829965 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 64830603 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 64830688 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 64831965 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 64832689 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64832717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64832931 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64832958 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64833057 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 64833374 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 64833380 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 64833971 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 64834087 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64834416 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 64834517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64835885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64836013 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64836364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64836581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64837067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64839493 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 64839691 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64840817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64841160 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64841296 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64841816 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64841836 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64842835 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64842991 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 64843362 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64843743 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64844257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64844416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64844564 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 64844684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64844818 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64845126 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64846305 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64847248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64847527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64847747 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 64849011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64849133 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 64849188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64849982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64852149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64853174 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 64854810 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 64855007 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64855155 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 64855163 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 64855480 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 64855900 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 64856158 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64857477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64858938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64860772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64862416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64862476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64862494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64863012 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863046 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863086 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863127 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863153 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863182 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863230 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863247 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863271 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863281 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863301 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863436 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64863499 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863554 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64863571 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64863581 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64863614 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 64863632 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64863651 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 64863671 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 64863723 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64863725 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64863767 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 64863776 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64863974 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64864000 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64864017 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64864099 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64864122 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64864132 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64864138 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64864209 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64864517 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64864518 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64864534 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64864605 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64864743 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64864765 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64864784 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64864843 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 64864960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64866196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64866259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64866261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64866366 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 64866409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64866422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64866728 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64866744 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64866794 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64866840 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 64866971 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 64866973 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 64867091 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64867098 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64867189 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64867376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64867411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64867419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64867427 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64867431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64867525 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64867544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64867609 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64867685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64867755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64867861 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64867921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64868071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64868100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64868148 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64868279 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64868431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64868508 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64868509 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64868971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64869042 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64869064 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64869065 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 64869092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64869143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64869148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64869198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64869230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64869331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64869337 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64869362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64869508 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64869526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64869632 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64869730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64869735 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64869776 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64869804 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64869830 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64869974 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64870009 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64870020 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64870166 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64870349 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 64870444 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 64870595 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64870607 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 64870624 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 64870756 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64870764 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 64870859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64870879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64870897 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 64870965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64871095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64871194 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64871247 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64871318 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64871337 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64871367 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 64871454 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 64871493 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 64871560 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 64871650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64871694 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 64871717 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64871836 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64871849 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64871862 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64871886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64871901 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 64872035 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 64872070 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64872199 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 64872237 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 64872439 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64872441 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64872613 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64872683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64873632 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64874817 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64875833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64877711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64878072 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64878093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64878350 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64878471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64878495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64879363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64879956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64880037 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 64880722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64880974 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64881083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64882377 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 64885794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64885896 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64886346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64886961 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 64886999 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64887423 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64888103 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64888353 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64890789 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64892057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64892657 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64895403 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64896164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64897571 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64897925 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 64899274 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 64899354 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 64899648 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64900878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64902985 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64903087 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64903249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64904108 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64904246 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64904262 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64904273 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64904444 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64904579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64904746 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 64904756 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64904798 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 64904825 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64904919 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 64905213 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64905223 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64905280 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64905319 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64905344 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64905662 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64905770 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64905833 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64905998 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 64906051 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64906200 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 64906661 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64906702 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64906768 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64906798 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 64906849 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 64906951 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 64907027 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 64907075 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 64907086 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 64907389 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 64907421 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 64907461 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 64907486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64907597 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64908103 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64908124 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64908531 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64908561 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 64908574 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 64908586 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64908605 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64908616 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64908780 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64908802 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64908812 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64908824 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64908995 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 64909112 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64909189 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64909213 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64909456 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64909602 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64909603 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64909667 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64909797 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64909808 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64909830 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64909836 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64909887 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64909966 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64910073 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64910076 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64910105 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 64910162 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64910536 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 64910797 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64910851 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64911082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64912235 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64914605 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64919011 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 64920380 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64922704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64922830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64922935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64923355 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 64923440 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64923490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64923889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64923920 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 64924106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64924804 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64924816 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 64925577 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64925892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64926516 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64926676 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64927292 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64927433 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64928766 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64928901 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64929157 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64929851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64929879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64930021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64930341 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64930440 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 64930508 C G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 64930603 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64930688 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64930997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64931576 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64931662 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64931788 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64931832 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 64931844 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64931948 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 64932036 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64932082 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64932516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64933188 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64933190 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64933361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64933538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64934753 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64934864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64934966 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 64934988 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64935729 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64936526 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64937057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64937250 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64937287 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64938741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64938760 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64938826 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 64938862 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 64938994 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 64939067 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64939212 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64939831 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64940030 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64940201 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64940761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64940884 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64941003 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64941004 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64941095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64941246 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64941641 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64941671 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 64941962 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 64942063 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64942102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64942447 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64942608 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64942653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64942764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64942775 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64942792 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64942835 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 64942846 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 64942883 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 64942927 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64943049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64943093 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 64943269 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 64943274 C G N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 64943529 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 64943569 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64943686 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64943793 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64943829 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 64943961 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64943993 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64944025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64944031 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64944061 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64944071 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64944164 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64944303 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64944312 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64944318 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 64944415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64944465 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64944476 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64944477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64944538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64944550 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64944556 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64944682 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 64944687 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 64944761 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64944781 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 20 8 10 0 4 2 64944841 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 64944852 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 64944963 T G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 64944990 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64945170 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 64945286 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64945338 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64945411 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 64945544 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 64945552 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 64945556 G C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 64945658 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 64945892 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64945921 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64945933 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64946229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64946248 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64946261 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64946321 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 64946617 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64946692 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64946747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64946768 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64946786 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64946815 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64947212 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64947728 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64947739 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64947791 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 64947792 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 64948000 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 64948022 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 64948100 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64948141 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 64948144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64948257 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 64948270 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 64948336 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 64948476 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 64948730 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 64948872 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 64948961 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 64948997 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 64949035 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64949597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64949617 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64949687 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 64949790 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64950487 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64951434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64951964 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 64952003 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64953978 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64953992 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64953993 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64954013 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64954104 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64954105 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64954456 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64954574 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64954584 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64954689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64954781 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64954876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64954975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64955198 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64955222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64955450 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64955859 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64955899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64956021 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64956027 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64956154 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64956278 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64956368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64956709 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64956828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64956925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64957000 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64957006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64957047 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64957642 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 64957805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64957845 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64958031 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64958120 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 64958297 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64958334 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64958351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64958427 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 64958545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64958625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64958683 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64958771 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64958810 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64958862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64958870 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 64958922 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64958965 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64959086 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64959505 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 64959785 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64959835 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 64959913 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64959918 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64959935 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64959953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64959983 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64960026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64960296 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 64960323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64960380 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64960381 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64960525 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64960596 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64960662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64960687 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64960773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64960840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64960889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64960891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64960915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64961045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64961104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64961120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64961133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64961153 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64961241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64961288 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64961311 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 64961365 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 64961450 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 64961486 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 64961512 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 64961644 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64961666 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64961723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64961749 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64961769 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64962128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64962213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64962267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64962366 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64962427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64962473 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64962655 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64962776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64962785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64962833 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64962947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64963010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64963026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64963173 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64963292 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 64963421 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64963445 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64963457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64963481 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64963675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64963680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64963730 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64963748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64963764 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64963799 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64963923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64963934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64963941 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64964554 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64964764 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64964794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64964804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64964827 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64964849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64965421 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64965951 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64965961 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64966085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64966294 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 64966306 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 64966346 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64966516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64966539 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64967243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64967476 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64967495 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64967628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64968376 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64968509 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 64968666 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64968874 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 64969688 C G N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 64969799 T C N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 64969859 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 64969888 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 2 64969997 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 64970001 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 64970048 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64970079 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 64970135 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64970148 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64970149 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64970164 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64970183 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64970186 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64970231 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64970849 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 64971018 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 64971091 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64971198 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 64971220 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 64971378 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64971438 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 64971495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64971537 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64971679 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64971784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64971880 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64971938 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64972024 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64972104 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 64972129 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64972133 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 64972231 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 64972295 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 64972454 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64972562 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 64972564 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 64972638 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64972677 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64972856 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 64972941 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64972943 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64972955 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64972972 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64973077 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64973118 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64973244 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64973408 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 64973438 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64973614 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64973642 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64973662 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64973823 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64973843 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64973958 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64974026 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64974034 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 64974075 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64974102 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 64974152 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64974396 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64974537 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64974621 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 64974626 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 64975695 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64975768 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64975782 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64975938 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64976253 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64976297 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64976359 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64976454 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64976671 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 64976735 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64976751 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 64977141 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64977211 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64977260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64977291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64977301 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64977527 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64977577 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64978363 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64978816 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64978860 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64978957 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 64978979 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 64979112 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64979251 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64979829 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 64980106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64980164 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 64980339 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64980561 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 64980722 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 64981387 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64982543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64982686 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 64982894 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64982937 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64983100 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64983248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64983259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64983270 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64983285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64983302 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64983307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64983335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64983348 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64983407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64983474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64983498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64983522 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64983548 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64983556 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64983587 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64983595 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64983621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64983623 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64983687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64983698 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64983813 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64983839 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 64983851 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64983857 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64983877 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64983889 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 64983917 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64984199 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 64984234 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64984328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64984331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64984398 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 64984499 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64984550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64984557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64984575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64984625 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64984654 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64984666 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64984691 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64984783 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64984785 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64984810 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64984860 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64984862 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64985216 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 64985319 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 64985354 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 64985446 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64985481 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64985546 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64985604 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64985631 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64985638 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64985822 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64985861 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 64987039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64988879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64989684 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64991990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64992181 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 64994368 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 64994508 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 64994564 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 64994632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64994683 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64994837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64995067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64995096 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64995408 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 64995464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64995650 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64995679 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64995773 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64995784 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64995954 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 64996020 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 64996151 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 64996159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64996264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64996843 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 64996948 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 64997025 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 64997044 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 64997186 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 64997203 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 64997439 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 64997508 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64998245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 64998680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65000321 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65000426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65000914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65001302 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65001409 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65001873 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65002284 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 65002657 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65002739 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65003177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65003873 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65004239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65004618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65004731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65004939 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65004943 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65006259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65006797 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65007111 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65007489 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65007494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65007585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65007802 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 65007967 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 65008100 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.333333333333333 0.133333333333333 0.533333333333333 12 18 5 2 8 2 65008245 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 2 65008370 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 65008440 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65008458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65008470 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65008495 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 65008581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65008682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65008684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65008718 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 65008724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65008805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65008838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65008868 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65008913 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 65009108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65009303 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 65010058 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 65011022 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65011028 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65011544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65011552 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 65011625 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 65011666 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65011681 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65011753 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65011792 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65011834 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65011843 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65011885 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 65012102 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 65012117 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 65012202 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 65012400 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 65012409 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 65012580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65012827 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65012896 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65012908 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65012966 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 65013018 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 65013103 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65013138 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65013151 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65013437 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65013514 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65013861 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65013862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65014016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65014041 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65014068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65014135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65014154 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65014161 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65014429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65014514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65014615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65014828 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65014906 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65014974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65014991 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65015128 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65015215 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65015334 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65015543 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65015629 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65015747 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 65015788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65015796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65015803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65016109 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 65016140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65016384 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65016454 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 65016608 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 65016651 T A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 65017048 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65017169 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 65017217 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65017348 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65017368 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65017603 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 65017657 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65017712 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65017731 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65017832 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 65018166 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65018471 G A Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 65018485 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 65018582 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 65018687 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65018792 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 65018794 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 65018908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65018926 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65018993 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 65018998 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65019006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65019159 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65019168 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65019316 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65019328 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65019349 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65019371 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 65019464 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65019720 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65019733 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65019743 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65019894 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 65019912 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 65019946 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 65019957 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 65019967 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 65019985 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 65020072 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 65020252 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65020488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65020546 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65020598 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65020606 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65021144 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 65021281 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 65021394 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65021456 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 65021533 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65021571 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 65021646 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65021898 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65022088 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65022090 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65022118 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65022147 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 65022159 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 65022163 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 65022202 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 65022255 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 65022258 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 65022497 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65022672 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 65022676 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 65022733 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 65022811 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 65022897 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65023010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65023136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65023461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65023740 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65024093 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65024257 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 65024575 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65025183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65025470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65025902 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65025945 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 65026026 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65026128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65026169 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65026592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65026727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65026751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65028625 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65030065 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 65030148 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65030256 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65030392 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 65030476 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 65030756 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 2 65030898 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65031446 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65032595 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65033235 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65033776 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65033947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65034111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65034770 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65034909 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 65035004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65035850 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65036471 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 65036498 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65036609 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65036653 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 65036676 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65036702 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65036878 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65036916 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 65036987 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 65037042 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 65037144 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65037226 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65037258 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 65037514 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 65037650 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65037879 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65037887 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65037933 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65037967 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65038056 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 65038189 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 65038210 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 65038229 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 65038246 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 65038316 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65038467 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 65038590 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 65038681 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 65038693 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 65039644 T A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 65039672 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 65039710 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 65039930 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 65039976 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 65040020 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 65040111 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 65040224 A T Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 65040260 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 65040275 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 65040313 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 65040475 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 65040540 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65040605 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 65040667 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65040803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65040899 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65040970 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 65041013 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 65041101 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 65041269 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 65041596 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 65041849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65041917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65041983 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65045281 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 2 65046336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65047412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65047614 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65048381 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 65048650 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 65048657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65048895 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 65049364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65049465 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65049469 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65049575 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65050250 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 2 65051549 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65051676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65051693 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65052041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65052398 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65053154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65053391 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65054534 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 65054760 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65055202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65055545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65055565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65056352 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65056531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65056668 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65056813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65056886 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65057123 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 65057275 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65057282 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65057459 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 65057478 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 65057529 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65057766 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65058383 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 65058769 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 65058849 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 2 65058988 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 2 65059001 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 65059802 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.214285714285714 0 0.785714285714286 6 22 3 0 11 2 65059810 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 2 65060067 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65060125 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65060204 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 2 65060593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65060640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65060731 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65060842 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 65061037 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65061205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65061454 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 65061539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65061608 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 65061609 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 65061775 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 65061832 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 65061908 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 65062071 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65062224 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65062334 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65062357 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 65062538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65062736 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65062772 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 65062796 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 65063465 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65063477 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65063490 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65063741 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 65063767 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 65063810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65063895 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 65063902 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 65064162 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65064336 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65064412 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65064465 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65064597 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65064638 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 65064674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65064691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65064983 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 65064984 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 65065054 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 65065077 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65065092 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 65065375 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 65065604 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65065794 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65066616 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65067041 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65067047 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65067053 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65067207 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 65067232 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65067305 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 65067484 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 65067770 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65067779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65067980 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 65068059 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 65068231 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 65068237 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 65068246 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 65068258 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 65068538 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65068771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65068932 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 65068997 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 65069161 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 65069275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65069289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65069306 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 65069308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65069373 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 65069395 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65069411 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65069478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65069533 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65069594 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 65070078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65070333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65070384 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 65070518 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 65070647 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65070904 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 65070914 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 65070976 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 65071102 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 65071159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65071203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65071527 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 65071609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65071880 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 65071912 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 65071938 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 65071972 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65072239 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65072348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65072473 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65072544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65072670 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65073243 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 65073244 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 65073373 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 65073382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65073412 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 65073673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65073692 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 65073748 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 65073773 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 65073779 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 65073887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65074023 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 65074561 C T Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 65075010 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 65075036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65075107 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 65075129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65075267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65075596 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65075637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65075993 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 65076160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65077230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65077244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65077306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65077329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65077571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65077588 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 65077819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65078124 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 65078180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65078192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65078209 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65078391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65078399 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65078493 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 65078730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65078851 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65079045 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 65079242 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65079391 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65079497 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 65079558 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 65079563 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65079627 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65079631 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65079722 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65079760 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65079804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65079846 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65079898 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65079964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65080031 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65080163 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65080378 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65080520 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65080595 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65080603 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65080608 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65080718 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65080724 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65080776 C T Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 65080843 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65080876 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65080887 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65080934 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 65080999 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 65081184 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 65081209 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 65081282 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65081324 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65081390 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 65081500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65081550 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65081557 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65081567 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65081623 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 65081756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65081777 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 65081779 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 65081929 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 65082000 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 65082112 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 65082212 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 65082515 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 65082516 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 65082593 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 65082617 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 65082623 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 65082633 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 65082658 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 65082660 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 65082973 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 65083110 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 65083158 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 65083173 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 65083279 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65083283 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65083297 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65083306 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65083639 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65083799 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65083884 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65083996 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65084926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65085047 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65085294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65085423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65086135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65087718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65088082 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 65088096 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 65088101 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 65088512 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65088552 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 65088902 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 65089943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65092704 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 65093840 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65094576 T A N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 65095156 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65095771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65097983 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65101263 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 65101907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65102054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65102313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65102445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65102455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65102548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65102820 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65103095 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65103135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65103139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65103181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65104052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65104282 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65104403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65104507 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65104764 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 65104859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65105129 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 65105155 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 65105231 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 65105232 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 65105374 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65105396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65105397 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65105519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65105819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65105883 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 65105945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65106314 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 65106501 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 65106519 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 65106590 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65107087 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65107442 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65107443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65107666 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 65107708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65107720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65107755 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 65107769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65107853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65107930 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 65108133 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65108140 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 65108252 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 65108298 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 65108559 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 65108652 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 65108913 G C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 65108922 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 65109316 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 65109326 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65109507 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65109605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65109741 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 65109836 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 65110145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65110168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65110185 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 65110210 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 65110315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65110320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65110361 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 65110583 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 65110743 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65111158 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 65111279 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 65112260 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 65112520 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 65112629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65112632 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65112869 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65113040 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 65113486 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65114004 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65114079 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65114127 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 65114146 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 65114233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65114467 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65114523 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 65115375 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65116518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65117641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65118170 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65119495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65119686 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65120521 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65121377 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65122298 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65122826 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65122870 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65122881 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 65123006 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65123135 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65123153 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 65123185 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65123210 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 65123454 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 65123757 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 65124092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65124358 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65124396 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 65124481 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 65124527 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 65124976 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 65125263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65125392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65125666 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65125740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65125802 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65126304 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 65126323 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 65126456 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65126541 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 65126664 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65126772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65126917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65126965 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65127272 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65127377 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65127545 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 65127557 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65127571 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65127582 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 65127609 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65127650 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 65127709 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 65127744 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 65127888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65128277 G C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 65128356 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 65128596 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65128605 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65128633 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 65128655 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65128664 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65128690 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65128883 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65128933 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 65128991 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 65129017 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 65129172 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 65129284 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65129307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65129338 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65129345 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 65129574 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 65129623 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 65129625 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 65129678 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 65129771 A G Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 65129793 A G Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 65129814 C G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 65129828 T A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 65129830 A C N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 2 65129879 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 65130077 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65130089 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65130109 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 65130120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65130155 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65130252 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65130280 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65130302 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 65130313 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65130439 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65130444 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 65130462 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65130545 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65130653 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 65130767 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 65130781 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65130794 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65130849 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65130888 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65130977 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65131083 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65131313 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65131377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65134809 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 65134922 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 65137415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65137843 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 65139411 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 65140376 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65140521 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 65140893 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 65141206 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65141213 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65141386 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65141448 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65141550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65141622 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65141716 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65141753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65141789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65141880 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65142217 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 65142299 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65142635 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65142807 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65143056 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65143199 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65143264 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65143335 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65143456 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65143526 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65143570 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65143652 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65143722 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65143745 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65143916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65144028 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 65144100 C G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 65144165 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 65144170 A T N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 65144180 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 65144245 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 65144878 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65145225 G C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 65145228 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 65145541 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65145865 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65146956 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 65147046 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 65147061 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 65147082 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 65147175 C A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 65147241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65147256 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65147291 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65147310 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65147611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65147663 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65147667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65147678 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65147887 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65148023 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65148387 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65148841 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 65149394 T C N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 65149938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65150205 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65150444 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 65150562 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 65151020 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65151106 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 65151162 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65151203 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65151775 A T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 65151958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65151966 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65152224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65152262 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65152394 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65152502 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65152877 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 65152878 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 65152915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65152974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65153035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65153180 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65153196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65153221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65153269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65153277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65153285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65153299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65153329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65153373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65153437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65153439 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65153487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65153514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65153521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65153536 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65154465 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 65155432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65155877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65156636 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65159238 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65160188 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65160211 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 65160212 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65160489 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65160799 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 65161029 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65161131 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65161162 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65161166 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 65161202 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 65161210 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 65161259 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65161345 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65161431 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 65161609 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65161700 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65161706 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65161775 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 65162143 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 65162227 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 65162269 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 65162326 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 65162335 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 65162341 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 65162370 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 65162498 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 65162512 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 65162602 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65162622 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 65162637 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 65162820 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65162863 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 65162922 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 65163009 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 65163099 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 65163149 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65163369 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65163377 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65163402 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65163466 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65163490 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65163576 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65163593 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65163678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65163691 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65163884 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65164119 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65164157 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65164178 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 65164211 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 65164264 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65164383 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 65164398 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65164487 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 65164521 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65164618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65164744 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 65164786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65164979 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 65165539 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 65166380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65166507 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65166944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65168001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65168165 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65169032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65169874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65169923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65171612 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 65172169 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 65173229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65175089 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 65175094 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65175102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65175583 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65175695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65175731 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65175942 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65176070 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 65176219 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 65176232 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 65176254 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 65176319 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 65176324 A C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 65176350 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 65176352 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 65176407 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65176448 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 65176536 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65176553 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65176565 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 65176570 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 65176625 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 65176670 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 65176676 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65176738 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 65176799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65176831 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 65176835 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 65176900 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 65177219 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 65177476 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 65177536 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 65177589 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 65177591 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 65178431 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 65179634 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65179916 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 65180332 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65181431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65181815 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 65182070 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 65182094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65182197 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65182216 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 65182439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65182811 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65183072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65183180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65183225 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 65183498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65183623 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 65183905 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65184004 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 65184016 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 65184067 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 65184209 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 65184386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65184391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65184408 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 65184499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65184607 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65184645 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 65184764 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 65184779 G T N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 2 65184796 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 2 65184925 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 65186055 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65186187 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 65186491 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65186526 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65186569 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65186670 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 65186778 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 65187247 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 65187274 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 65187464 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65187825 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65187865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65187870 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65187929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65188049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65188079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65188254 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65188372 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 65188562 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65188696 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65188913 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65189114 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65189477 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65189643 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 65190056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65190135 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65192420 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65192814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65193093 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65193160 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65193251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65193260 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 65193271 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65193712 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 65193716 C G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 65194344 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65194446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65194524 C A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 65195868 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65196911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65197292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65197792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65200686 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65201179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65201891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65201962 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 65201983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65202028 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65202055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65202499 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65202578 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 65202726 A T N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 2 65203693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65203809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65205190 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 65205200 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 65207844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65208608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65208884 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 65209628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65209702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65209746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65213155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65213443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65216692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65219859 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 65220774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65221901 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65222222 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 65223725 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 65223808 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 65223977 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 65223981 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 65226009 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65228039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65229217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65231528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65231773 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 65231774 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 65232437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65232490 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 2 65232864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65234533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65235269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65235447 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65237068 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 65237521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65238383 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65238437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65240046 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65240060 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65240534 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65240685 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65242074 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 65243038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65243104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65243648 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65243649 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65243924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65244144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65248822 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65249098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65249130 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 65249189 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 65249241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65249368 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 65249472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65249595 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 65250131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65250178 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 65250477 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 65250547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65250732 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 65251362 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65251617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65251881 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 2 65251932 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65252130 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 65252487 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 65252722 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65253036 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 65253685 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 65254666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65254866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65255025 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 65255063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65255190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65255217 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 65255298 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 65255383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65255401 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 65255513 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 65255596 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 65255659 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 65256211 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 65256305 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 65256323 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 65256347 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 65256427 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 65256430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65256453 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 65256483 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 65256524 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 65257233 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 65257455 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 65257499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65257674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65258590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65258657 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 65258883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65258921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65258943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65260177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65260373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65261043 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 65263209 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 65263583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65264395 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65264451 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 65265606 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65267102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65267368 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 65267534 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 65267549 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 65267785 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 65267926 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 65268741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65268817 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 65269557 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 65269839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65270459 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 65272899 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65273155 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 65273179 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65273395 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 65273505 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 65273515 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 65273534 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 65273552 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 65273585 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 65273675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65275031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65275171 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 65275172 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 65275285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65275855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65276472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65279226 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65279283 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65279299 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 65279786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65280187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65280263 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 65280591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65281493 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 65281512 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 65281936 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 65282138 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 65282166 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 65282471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65282488 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65282521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65282813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65283257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65283638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65283696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65283786 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65283803 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 65284052 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 65284179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65284181 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 65284216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65284218 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65284410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65284456 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65284473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65284512 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65284576 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 65284752 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65284763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65284817 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65284875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65285032 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 65285119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65285162 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65285188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65285249 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65285473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65285492 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65285501 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65285539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65285599 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 65285656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65285677 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 65285683 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 65285763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65285779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65286050 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 65286103 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 65286183 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 65286189 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 65286269 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65286311 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65286465 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 65286535 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65286536 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65286694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65286912 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 65287063 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65287163 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 65287342 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65287375 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65287421 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 65287434 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65287448 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65287486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65287527 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65287594 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65287606 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65287620 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65287639 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 65287967 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 65288604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65288755 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 65289129 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 65290190 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 65290889 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65291897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65293081 T G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 65294608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65295004 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65295169 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 65295687 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65296515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65300298 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65300773 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 65302338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65302388 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65302389 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65302512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65302625 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 65303476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65303711 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 65303786 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65303798 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65303831 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65303890 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65303917 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65303944 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65304021 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 65304082 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65304125 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 65304466 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 65305368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65306002 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65306103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65306670 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 65306702 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 65307239 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65307259 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 65307823 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 65308439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65309484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65309663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65309686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65309785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65309797 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65309923 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 65310187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65310223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65310242 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 65310257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65310782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65311134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65312031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65312072 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 65312241 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 65312252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65312845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65314659 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65314961 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 65315082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65315823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65316919 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65318624 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 65320893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65323890 C A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 65324014 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 65324160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65326221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65327214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65329817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65330818 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65330830 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65331093 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 65331283 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65331303 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 65331427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65331440 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 65331480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65331655 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65331694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65331805 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65331808 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65331982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65332189 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 65332275 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65332408 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65332431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65332615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65332726 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65332777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65332845 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65332959 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65333289 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65333412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65333442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65333566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65333588 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65333638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65333731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65334071 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65334164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65334231 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 65334269 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65334303 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 65334461 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 65334559 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65334603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65334867 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 65335148 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 65335213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65335250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65335583 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 65335601 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 65335613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65335843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65335873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65335906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65335968 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65335985 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65336008 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 65336051 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65336052 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65336514 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65336560 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65336660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65336960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65337053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65337089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65337171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65337354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65337460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65337505 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 65337506 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65337680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65337755 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65337814 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65337832 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65337891 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65337987 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65338032 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 65338057 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65338512 C A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 65338591 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65338630 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65338858 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 65338947 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 65339148 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65339500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65339512 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65339678 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65339870 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65339985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65340003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65340027 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65340037 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65340053 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 65340227 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 65340259 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65340289 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65340313 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65340376 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65340505 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65340560 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65340610 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65340637 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65340653 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65340915 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65341048 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65341308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65341560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65341593 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65342275 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65342520 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65342636 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 65342833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65342854 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65343380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65343493 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 65343840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65344080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65344914 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65345685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65347128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65347129 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 65347411 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 65347569 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 65347588 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 65347637 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 65349070 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 65349252 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65350196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65350436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65351382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65352757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65353162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65353343 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65353545 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 65353661 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 65353789 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 65353809 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 65353885 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 65353887 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 65353968 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 65354133 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 65354300 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 65354384 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 65354950 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65355514 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65355675 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 65355685 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 65355876 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 65356129 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65356182 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 2 65356272 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 65356455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65357166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65357290 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65357314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65357521 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65357678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65359690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65362471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65363409 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65364153 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65364405 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65364541 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 65364622 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65364694 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65364716 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 65364784 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 65364883 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 65365042 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 65365279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65365309 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 65365379 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 65365403 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 65365420 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 65365461 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65365577 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 65365645 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65365712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65365799 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65365853 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 65365958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65366108 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65366150 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 65366295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65366336 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 65366418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65366434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65366562 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65366832 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 65367206 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65367579 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65367684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65367807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65368045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65368066 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65368067 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65368080 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65368161 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65368192 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65368301 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65368356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65368555 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 65368610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65368617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65368658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65368721 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 65368935 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 65369058 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 65369316 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65369452 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65369457 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 65369676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65369848 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65369910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65370080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65370191 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 65370249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65370514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65370617 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65370892 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65371128 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 65371147 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 65371234 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 65371271 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 65371464 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65371489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65371508 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65371550 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65371569 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65371576 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65371628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65372175 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 65372178 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 65372607 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65372788 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 65372883 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65372976 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 65372990 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 65373085 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 65373193 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65373544 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 65373877 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 65374075 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 65374176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65374968 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65375034 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 65375040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65375561 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65375799 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65375933 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65375997 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65376047 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65376112 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65376141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65376289 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65377040 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65377174 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65377237 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65377287 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65377551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65377709 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65377942 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65378123 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65378190 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 65378258 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65378267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65378289 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65378400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65378864 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65378893 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65378920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65378943 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65378979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65379289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65379342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65379356 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65379392 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65379539 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65379546 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65379585 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65379854 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65380070 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 65380854 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 65380884 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 65381388 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65381407 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65381463 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 65381498 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 65381718 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65381737 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65381740 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65381957 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 65381980 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 65382065 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 65382162 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65382163 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65382256 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65382265 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65382290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65382347 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65382501 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 65382515 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 65382530 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 65382680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65382725 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65382782 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65382825 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 65382858 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 65382926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65382949 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 65383018 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 65383047 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 65383112 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 65383159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65383478 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 65383731 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65384091 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65384303 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65385285 G T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 65385313 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 65385402 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65385825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65385854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65385902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65386032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65386345 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65386410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65386662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65387012 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 65387021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65387284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65387329 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65387769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65388215 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65388441 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65388795 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 65389699 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65389896 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 65390111 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 65390150 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65390248 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65390265 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65390391 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 65390397 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 65390656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65390971 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65391304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65391305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65391444 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65391651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65391864 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 65391930 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 65392001 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 65392055 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 65392147 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65392221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65392565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65392574 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65392766 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65392783 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 65392817 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 65392995 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 65393162 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 65393227 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 65393298 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 65393586 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65393818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65394338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65394371 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 65394709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65394726 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 65394961 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 65395011 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 65395045 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 65395092 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 65395207 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 65395211 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65395227 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 65395235 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65395242 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65395389 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65395457 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65395517 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65395579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65395630 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 65395675 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65395692 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65395861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65395938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65396084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65396104 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65396107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65397677 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65397927 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65397968 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65398052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65398111 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65398352 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 65398755 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65399084 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65399281 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 65400225 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65400445 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 65400575 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 65400659 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 65400927 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 65400991 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65401242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65401288 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 65401301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65401487 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65401755 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 65401839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65402552 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 65402699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65402830 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 65402897 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 65403266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65404814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65405399 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65406757 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65407503 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65408073 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 65408121 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 65408125 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 65408153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65412104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65415125 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65415509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65416633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65416832 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65416868 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65417700 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65422278 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65424531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65425131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65426467 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65428557 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65428789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65428961 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 65429161 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 65430151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65430182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65430258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65436517 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 65436969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65437203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65439493 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 65440728 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65441362 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65441399 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65442142 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65443126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65443628 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65445372 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65446490 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65446700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65449146 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 65449889 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65451152 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65452177 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65453363 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65453408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65456210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65457648 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 65460966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65461169 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 65461308 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65461351 A C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 65461367 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 65461483 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 65462709 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 65463427 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 65463485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65463536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65463680 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 65463758 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 65463789 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 65463931 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 65464034 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 65464056 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 65465951 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 65466135 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65468059 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 65468523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65468705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65468833 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 65468840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65468899 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 65469013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65469054 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 65469065 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 65469211 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65469274 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 65469412 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 65469501 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65469602 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 65469657 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65469710 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 65470191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65471656 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 65471925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65472315 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65472687 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 65472718 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 65472728 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 65472736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65472806 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 65472953 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 65472964 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 65472971 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 65473033 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 65473136 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 65473137 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 65473213 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 65473280 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 65473362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65473688 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 65473689 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65473891 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 65473969 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 65474110 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 65474165 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 65474317 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65474914 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 65474989 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 65475012 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 65475030 A C N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 65475235 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 65475258 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 65475299 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 65475324 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 65476339 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 65476691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65476985 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 65477190 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65477232 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65477474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65477628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65478102 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 65478436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65478505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65478592 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65478756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65478826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65478830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65478888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65478929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65478934 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65479407 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 65479750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65480375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65480420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65480567 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65480706 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65480794 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65481138 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 65481264 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65481408 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 65481409 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 65481557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65481618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65481642 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65481669 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65481962 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65481966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65481975 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65482156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65482177 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65482233 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 65482489 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 65482552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65482561 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65482754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65482819 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 65482879 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 65483256 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 65483260 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65483293 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65483398 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 65483489 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 65483497 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 65483552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65483761 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65483840 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 65483854 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65484033 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65484074 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65484154 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65484219 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65484242 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65484259 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65484332 T G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 65484367 T C Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 65484472 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 65484504 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 65484528 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 65484534 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 65484541 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 65484607 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 65484640 G A Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 65484642 T A Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 65484707 C A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 65484709 T A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 65484750 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 65484768 G C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 65484776 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 65484811 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 65484815 A T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 65488720 T C Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 65491057 C T N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 2 65491078 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 65491087 G T N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 65491096 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 65491129 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65491143 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 65491152 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 65491157 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65491249 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 65491283 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65491341 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65491375 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65491398 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 65491426 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65491440 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 65491468 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 65491498 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65491529 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 65491536 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65491547 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 65491592 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 65491656 C G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 65491745 T G N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 65491768 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 65491810 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 65491839 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 2 65491908 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 65491970 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65492005 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65492062 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 65492063 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65492080 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 65492210 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65492242 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 65492243 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 65492480 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65492536 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65492552 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65492573 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65492599 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65492604 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65492722 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65492803 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65492805 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 65492959 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65493023 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65493079 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65493185 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65493186 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65493479 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65493573 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65493581 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65493721 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 65493762 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 65493797 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 65493993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65494127 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 65494452 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 65494530 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65494544 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65495302 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65495647 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 65496013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65496551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65496807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65497596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65501200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65501355 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65503084 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 65503476 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 65504322 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65505591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65507005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65507062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65510057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65512471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65512883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65514243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65514872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65516136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65516605 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65516734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65520446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65522180 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65522315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65522602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65525357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65525925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65525960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65527279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65527423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65527888 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65527958 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65527970 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65528004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65528073 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65528152 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65528185 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65528257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65528290 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65528475 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65528529 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65528567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65528615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65528637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65528677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65530273 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65530508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65530566 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 65532051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65533100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65535512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65537620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65539274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65539645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65539746 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65540088 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65540436 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65540913 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65540917 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65540945 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65540986 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65541117 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 65541402 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65541821 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65542107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65542999 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 65543142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65543779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65544443 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65545495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65545704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65548894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65548956 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65548965 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65549960 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65550606 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65551966 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65552474 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65555973 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65556089 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 65556176 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 65556337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65557638 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65557647 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65562794 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65564865 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65565749 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65570190 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65570920 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65571171 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 65572365 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 65574127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65574557 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65575374 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65576393 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65579778 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65581082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65582329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65582761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65584528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65586559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65586933 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65587222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65587239 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65587240 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65587379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65587403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65587726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65587823 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65588257 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 65588712 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 65590891 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 65590912 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65590975 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 65591210 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65591482 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 65591485 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 65591493 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65592614 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65595026 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65595383 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65595681 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65596005 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 65596078 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65597168 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65597304 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65597666 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65597852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65598083 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65598450 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 65598511 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65598527 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 65599314 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65599329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65599540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65600213 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65600484 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65600925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65601044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65601503 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65601667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65601851 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65602079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65605594 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 65605829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65606087 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65606178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65606882 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65607070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65607263 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 65608185 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 65610108 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65610284 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 65610468 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65610615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65610728 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 65610873 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 65610887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65610904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65610942 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 65610994 A G Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 65611152 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 65611178 C G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 65611289 A G Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 65611413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65611452 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 65611541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65611553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65611632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65611768 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65611790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65611851 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65611905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65611993 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 65612048 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 65612237 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65612382 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65612415 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 65612451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65612462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65612504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65612638 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 65612642 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65612999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65619629 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 65619801 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 65619889 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 65620094 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65620104 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65620194 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 65620501 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 65620554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65620575 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 65620651 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65620652 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65620712 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 65620770 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 65620826 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 65620833 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65620871 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65620970 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 65621021 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 65621301 G A N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 65621325 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 65621328 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 65621338 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 65621397 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 65621824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65622231 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65622275 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65622314 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65622598 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 65623195 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65623258 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 65623264 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 65623501 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 65623520 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65623529 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65623629 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65623635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65623669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65623692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65623799 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65623809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65623821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65623973 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65624472 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65625044 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65625167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65625343 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 65625416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65625465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65625588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65625717 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65625786 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65625835 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65625889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65625927 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 65625973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65626002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65626184 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 65626206 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 65626213 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65626263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65626276 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65626329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65626340 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 65626438 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 65626452 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 65626547 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 65626551 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 65626587 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65626801 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65626829 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 65626949 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65627031 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65627260 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65628105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65628456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65630774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65631464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65637462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65638321 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 65638615 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65638824 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 65639077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65639383 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65639516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65640839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65641831 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65641837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65641862 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 65642190 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65642544 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 65643338 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 65643398 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 65643871 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 65643913 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65643934 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65643986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65644043 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65644081 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 65644087 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 65644156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65644215 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 65644252 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 65644264 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 65644365 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 65644367 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65644477 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 65644511 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 65644587 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 65644610 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 65644672 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 65645576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65645797 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65645884 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65646052 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65646241 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65646260 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65646286 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65646322 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65646558 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 65646630 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 65646812 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 65646848 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 65647999 C A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 65648396 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 65648905 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65649117 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65649304 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65650833 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65651096 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 65651858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65651864 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65651872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65651980 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65652373 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65652648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65652868 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65653139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65653207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65654754 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65655754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65656802 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 65656853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65657071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65657073 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65657170 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65658590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65659355 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 65660193 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65661942 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 65662528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65662871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65663274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65663767 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 65666719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65667174 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65667980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65668452 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65669421 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 65671651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65673075 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 65673092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65673118 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 65673210 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65673445 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 65673868 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 65673901 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65675894 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 65676430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65676664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65678316 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 65679346 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 65679414 C T N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 2 65682325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65682740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65682827 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65684542 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65685469 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65686794 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65687144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65691900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65692053 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65692988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65694617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65695368 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65695869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65696096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65696270 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 65696322 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 65696513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65696931 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65697156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65697175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65697440 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65697638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65698803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65701084 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65701393 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65701461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65702103 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65703982 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65704273 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65704406 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65705203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65706197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65707208 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65708150 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 65708266 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 65708277 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 65708526 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 65708759 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 65708795 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65708871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65708927 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 65708949 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65709000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65709100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65709299 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65709490 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65709590 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 65709607 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 65709623 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 65709708 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 65709778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65709929 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 65711787 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 65711994 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 65712301 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 65712429 C G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 65712533 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 65712771 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 65712787 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 65712898 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 65712955 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65712979 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 65713021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65713044 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 65713048 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 65713110 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65713133 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 65713220 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 65713296 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 65713305 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 65713466 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 65713799 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 65713925 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 65714036 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65714083 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65714121 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 65714144 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 65714156 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65714393 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65714401 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65714443 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 65714877 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 65715099 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 65715108 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 65715156 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65715200 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 65715263 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 65715332 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 65715563 G C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 65715571 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 65715637 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65715787 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65716115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65716163 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 65716229 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65716254 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 65716271 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65716396 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 65716415 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65716421 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 65716429 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65716456 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65716723 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65716743 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65716791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65716956 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65717242 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65717268 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 65717377 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65717437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65717479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65718360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65718385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65718671 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 65718690 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65718828 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65718983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65719005 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 65719268 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65719497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65719769 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65720145 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65720206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65720291 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65720377 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65720475 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65720487 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65720496 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 65720519 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65720532 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65720699 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65720720 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65721055 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65721108 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65721149 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65721191 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65721236 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 65721293 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65721306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65721341 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65721353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65721410 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65721422 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65721435 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65721448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65721481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65721557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65721579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65721834 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65721906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65721971 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 65722077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65722146 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 65722248 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 65722473 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 65722476 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65722528 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65722559 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 65722598 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65722847 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 65723695 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65723907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65723945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65724000 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 65724024 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 65724251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65724272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65724273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65724307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65724425 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65724621 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65724751 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65724766 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65724972 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65725137 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 65725181 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 65725256 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 65725308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65725393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65725441 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 65725557 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 65725703 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65725776 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 65725896 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 65726125 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65726185 T G N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 65726348 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 65726654 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 65726734 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 65726944 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 65727230 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 65727425 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 65727688 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 65727701 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 65727778 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65727849 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65727876 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 65727956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65728008 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 65728227 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 65728261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65728273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65728296 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65728340 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 65728445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65728446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65728508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65728612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65728736 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65728768 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65728793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65728794 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65728813 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65728815 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65728967 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 65729153 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 65729163 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 65729352 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65729487 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65730029 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65730774 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65730992 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 65731045 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65731084 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65731143 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 65731321 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 65731371 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 65731648 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 65731678 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 65731916 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65731923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65731940 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65731968 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 65732063 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 65732294 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 65732385 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65732398 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65732479 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65732573 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 65732580 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 65732865 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 65732918 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65732970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65733046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65733168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65733479 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 65733582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65733646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65733677 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 65733813 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 65733910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65733912 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 65734288 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 65734380 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 65734486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65734532 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65734584 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65734587 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65734715 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65735092 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65735139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65735391 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65735398 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65735710 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 65735851 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 65736413 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65736473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65736654 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65736703 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65736872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65736994 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65737033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65737191 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65737248 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 65737316 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65737382 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65737413 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65737476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65737541 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65737649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65737818 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 65737832 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 65738024 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65738110 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 65738178 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 65738256 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 65738282 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 65738379 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 65738468 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 65738482 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 65738483 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 65738494 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 65738523 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 65738535 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 65738545 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 65738661 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 65738875 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 65738876 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 65738993 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 65739006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65739009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65739333 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65739356 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 65739659 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 65739675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65739775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65739799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65739811 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 65739878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65740031 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 65740058 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 65740081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65740091 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65740213 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 65740393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65740428 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 65740469 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65740730 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 65740756 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 65740797 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65740821 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 65740875 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 65740909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65740977 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 65740999 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 65741012 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 65741126 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 65741297 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65741313 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 65741484 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 65741496 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 65741616 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 65741625 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 65741854 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 65741859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65741914 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 65741926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65742051 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 65742057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65742090 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 65742276 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 65742313 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65742415 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65742580 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 65742600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65742840 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65742973 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65743019 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65743479 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 65743556 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 65743588 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65743809 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 65743970 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65744099 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 65744267 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65744706 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 65744747 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 65744821 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 65745073 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65745422 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 65745662 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65745670 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 65745696 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 65745709 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 65745859 T G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 65745860 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 65746076 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 65746145 C G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 65746243 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 65746303 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 65746480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65746630 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 65746775 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 65746836 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 65746897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65747099 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 65747742 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 65747769 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65747934 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 65748032 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65748073 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 65748142 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 65748579 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65748587 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65748656 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 65748678 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 65748794 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65748982 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65749084 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 65749127 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 65749166 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65749245 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65749339 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65749427 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 65749471 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65749508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65749629 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65749718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65749789 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 65750069 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 65750117 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 65750207 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 65750228 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 65750268 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 65750328 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 65750504 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65750593 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 65750707 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65751219 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 65751260 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 65751305 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 65751446 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65752483 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65752492 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65752690 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 65752695 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 65752706 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 65752707 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 65752727 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 65752778 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 65752801 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 65752812 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 65752892 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 65753023 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 65753055 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65753132 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65753390 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65753465 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65753510 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 65753571 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 65753888 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 65754052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65754399 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65754404 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 65754577 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 65754589 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 65754602 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 65754777 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 65754797 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 65754798 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65754935 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 65754936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65754956 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 65754974 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65755029 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 65755115 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 65755140 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 65755289 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65755415 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 65755519 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 65755594 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65755720 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 65755995 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 65756255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65756347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65756364 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65756465 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 65756557 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 65756652 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 65756962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65758088 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 65758142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65758158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65758301 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65758349 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 65758546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65758652 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 65758953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65758957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65758995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65759546 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 65759567 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65760499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65760995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65761949 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 65762293 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 65763105 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65763348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65763397 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65763483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65763663 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 65764593 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65764648 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 65765165 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 65765214 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 65765736 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 65765879 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 65766164 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 65766244 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 65767017 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 65767415 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 65769091 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65769564 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65771164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65771175 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 65771233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65773321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65774357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65774575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65775028 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 65775069 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 65775494 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 65776150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65776584 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65776633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65776704 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65777088 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 65777277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65777312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65777565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65778324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65778356 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65778802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65779669 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 65781876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65782131 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 65782297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65783080 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65783297 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65783347 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65783480 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65783518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65783581 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65783656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65783830 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 65784089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65784155 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65784249 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 65784299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65784486 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 65784636 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 65785180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65785987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65786023 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 65786043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65786291 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 65786388 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 65786542 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65789589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65790216 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 65791595 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 65793954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65795600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65795863 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 65797870 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65798703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65799492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65799598 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65799797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65800832 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 65800864 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65800883 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65801064 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 65801109 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65801335 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 65801373 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65801607 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 65801612 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 65802323 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65802409 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 65802472 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 65802542 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 65803337 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65803967 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65804031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65804134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65804285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65804665 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65805657 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 65805891 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65805922 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65806065 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 65807720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65808796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65809064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65809109 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65809714 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 65809771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65810319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65810736 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65810808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65811022 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 65811045 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 65811057 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 65811126 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 65811157 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 65811757 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 65811809 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65811937 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 65812236 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65812239 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 65812647 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 65812661 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 65812824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65812894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65812900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65812928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65813285 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 65813469 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65813486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65814290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65814712 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65815019 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65815580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65815597 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65815606 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65816867 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 65817153 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 65817283 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 65817858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65817859 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65818158 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 65818183 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 65818339 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 65818439 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 65818501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65818635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65818669 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 65819113 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 65819262 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 65819529 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65819701 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 65819762 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 65819958 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 65819973 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 65819974 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 65820157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65820256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65820388 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65820513 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 65820702 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 65820708 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 65821094 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 65821210 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 65821326 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 65821360 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 65821399 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 65821449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65821658 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65821677 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65821859 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65821970 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 65822090 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 65822097 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65822131 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65822170 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65822180 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65822205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65822211 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 65822273 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65822788 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65822805 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 65822880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65823194 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65823418 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 65823427 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65823857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65824011 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65825331 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65825869 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 65825964 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65826443 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65828595 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 65829585 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 65829620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65830282 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65830659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65830953 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65832105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65832159 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 65832176 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 65832190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65833975 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65834090 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 65834270 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 65834302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65834591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65835242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65836152 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 65837792 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 65837958 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65838745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65838940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65839040 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 65839654 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 65840556 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 65840733 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65841255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65843762 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65846318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65847075 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 65848448 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 65849185 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65850064 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65850749 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 65851052 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65854907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65855567 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 65855840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65859736 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65859898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65863327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65866967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65867366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65867375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65867856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65870650 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 65871817 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65872558 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65873851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65873944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65876457 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 65876584 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65877332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65879199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65879701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65879763 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65880489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65881010 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65882858 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65883284 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65884460 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 65884497 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 65885378 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 65887915 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65887947 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65887994 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65887995 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65888028 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 65888036 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 65888102 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65888263 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 65888307 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 65888317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65888613 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 65888906 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65889211 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 65889872 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65890606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65890614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65890622 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 65890718 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 65891065 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 65891076 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65891216 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 65891515 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 65891605 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 65891815 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65892075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65893182 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 65893742 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65893985 C T Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 65900256 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65900784 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 65900977 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65901047 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 65901344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65901354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65901381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65901603 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65901974 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65902007 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 65902210 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 65902273 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 65902317 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 65902333 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 65902339 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 65902372 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 65902392 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 65902416 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 65903014 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 65903107 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 65903150 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 65903187 G C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 65903481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65903483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65903493 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 65903959 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65904707 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65904828 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 65904879 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 65904950 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65904975 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 65904977 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 65905061 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 65905069 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 65905101 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65905161 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 65905233 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65905422 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65905525 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 65905868 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65906200 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65906269 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 65906281 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 65906353 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65906402 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65906403 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65906422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65906682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65906691 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 65907034 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 65907052 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 65907145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65907256 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 65907343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65907363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65907549 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65907559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65907578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65907645 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65907676 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65907685 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65907734 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65907743 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65907836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65907991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65908004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65908084 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65908160 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65908444 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65908557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65908651 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65908652 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65909142 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 65909222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65909464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65909528 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 65909762 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 65909831 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65909868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65909876 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 65909956 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65910118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65910161 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65910201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65910207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65910284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65910582 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 65910634 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 65910852 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 65910920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65910974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65911149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65911961 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65912681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65912832 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65912908 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 65913340 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65913641 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65914069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65914083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65914261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65914448 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 65914483 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 65914504 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65914531 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 65914927 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 65915353 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65915382 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65915448 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65915472 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65915591 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65915617 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65915684 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65915699 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65915711 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 65915750 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 65915856 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 65916010 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 65916082 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65916131 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65916174 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65916186 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65916195 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65916238 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65916439 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65916452 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 65916460 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65916557 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65916612 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65916627 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65916710 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65916770 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65916795 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65916878 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65916992 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65917017 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 65917107 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 65917246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65917333 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 65917351 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 65917513 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65917548 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65917634 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65917728 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65917793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65917806 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 65917897 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65917923 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 65917965 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65918201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65918202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65918301 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 65918325 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 65918422 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65918514 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65918822 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65919100 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65919139 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65919242 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65919433 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 65919587 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 65920224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65921760 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 65921799 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 65922230 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65922413 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65922422 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65923482 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65923519 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65923540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65923542 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 65923576 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 65923619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65923665 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 65923708 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65924114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65924196 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65924569 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65925233 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 65925373 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 65925449 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 65925528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65925560 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65925627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65926028 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 65926867 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65926920 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65927632 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 65927806 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65928047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65928071 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65928109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65928766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65928899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65929415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65929598 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65929599 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65929827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65930016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65930250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65930638 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65932487 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65932521 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65932835 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 65933044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65933116 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65933195 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65933680 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 65934434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65934541 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65934602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65934661 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65934665 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65936097 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 65936169 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 65936170 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 65936206 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 65936350 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 65936389 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 65936460 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65936562 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 65936574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65936633 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65936724 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65936741 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65936834 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65936842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65937023 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65937077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65937236 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65937251 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65937335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65937538 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 65937598 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 65937662 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65937748 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65937792 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65937892 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65937902 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65937924 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65937964 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65938207 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 65938405 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65938717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65939082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65939265 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 65939589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65939613 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 65939657 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 65939739 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65939818 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 65939832 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 65939912 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65940190 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65940214 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 65940805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65940901 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65941178 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65941184 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 65941203 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 65941220 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 65941265 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 65941317 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65941337 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65941529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65941578 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 65941847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65941851 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65942077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65942204 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65942282 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65942634 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 65942672 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 65942751 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 65942753 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65943018 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 65943537 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 65943571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65943699 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 65943952 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65944501 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 65944839 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 65944865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65944882 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65944898 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 65945589 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65948015 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 65948082 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 65948118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65948157 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65948662 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 65948732 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65948752 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 65948782 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 65948796 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 65948997 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65949051 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65949219 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65949321 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 65949333 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 65949376 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 65949395 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 65949421 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65949528 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65949742 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65949768 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65949964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65949998 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 65950033 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 65950204 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65950767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65950842 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 65950880 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 65950920 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 65950989 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 65951080 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65951138 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 65951601 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65951603 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65951655 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 65951684 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 65951748 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 65952003 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 65952022 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 65952182 C G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 65952427 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65952618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65952637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65952798 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65952951 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65952952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65953078 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65953146 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65953159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65953239 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65953321 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 65953410 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 65953566 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 65953667 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65954128 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 65954203 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 65954407 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65954672 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65955000 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 65955220 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65955301 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65955560 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65955973 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65956126 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 65956463 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65956889 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 65956903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65957125 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 65957243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65957268 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 65957490 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 65957496 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 65958224 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 65958799 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65960494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65960612 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 65960755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65963493 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 65964342 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65964364 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65964451 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65964518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65964628 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65964763 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 65964892 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 65965029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65965039 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 65965051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65965071 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 65965977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65966514 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 65966721 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 65967330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65967884 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65967927 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 65968035 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 65969127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65969137 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65969193 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 65969216 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 65969282 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 65969287 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 65969349 A T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 65969470 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 65970086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65970235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65970308 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 65970334 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 65970501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65971151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65971152 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 65971245 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 65971246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65971356 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 65971405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65971494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65971505 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 65972008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65972566 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65972895 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65974996 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65975022 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65975801 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65976503 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 65977057 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65979893 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 65980674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65981055 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 65981777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65981942 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65983576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65985323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65985325 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65986130 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65986569 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 65986706 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65987030 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65987225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65988314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65988728 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 65988859 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 65989524 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65989606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65989705 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 65990455 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65990511 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 65990812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65990947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65991330 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65991816 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65992311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65993061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65993450 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65993532 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 65993533 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65993619 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65993653 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 65993989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65994012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65994162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65994877 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 65994937 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 65994958 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65995230 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65995293 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 65995433 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 65995464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65995817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65996023 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65996091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65996239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 65996408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65996440 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65996450 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 65996520 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65996648 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 65997021 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 65997763 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 65997864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65998129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65998163 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 65998528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65998703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65998926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 65999024 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 65999335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 65999355 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 65999440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66000626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66002123 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66002530 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 66002572 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 66002848 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 66002926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66003009 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 66003028 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 66003796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66004028 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 66004063 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 66004152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66004266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66004293 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 66004334 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 66004478 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 66004527 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66004567 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66004744 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 66004778 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 66004781 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 66004855 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 66004886 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66004898 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66004981 A T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 66005009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66005156 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66005183 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66005269 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66005298 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66005308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66005312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66005334 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66005347 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66005374 A T Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 66005533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66005679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66006219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66006321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66006735 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66006800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66008436 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 66008565 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66008632 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 66009475 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 66009977 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66010181 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 66010420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66010889 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 66010934 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66010942 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 66011802 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 66011848 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 66012104 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 66012118 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 66012221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66013164 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66015144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66016011 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66016063 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66016588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66017399 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66017437 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 66017935 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 66017979 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 66017990 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 66017998 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66018491 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 66018594 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66018858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66019092 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 66020094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66020224 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66020560 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 66020734 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 66020933 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66021008 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 66021058 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 66021277 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66022081 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 66022548 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 66023410 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66023554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66023576 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 66023687 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 66023886 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 66023904 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66023997 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 66024993 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66025817 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 66025849 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 66025872 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 66026009 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 66026063 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 66026084 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 66026092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66026198 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 66026550 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66026585 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 66026613 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 66026631 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 66026634 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 66026756 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 66027011 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 66027037 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 66027061 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 66027076 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 66027158 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 66027657 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 66027660 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 66027802 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 66027838 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66027873 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66028020 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 66028118 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 66028168 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 66028208 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66028339 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 66028399 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 66028462 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 66028647 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 66028672 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 66028706 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 66028720 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 66028723 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 66028735 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 66028860 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66028887 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66029029 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 66029248 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 66029272 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 66029401 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 66029557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66029884 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 66029897 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66029905 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66029909 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66029957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66030379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66030455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66030485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66030520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66030642 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66030820 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 66031398 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 66032103 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66032298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66032382 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 66032780 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 66032832 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 66032852 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 66032970 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 66033177 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 66033201 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 66033432 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 66033833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66034000 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 66034013 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 66034054 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 66034204 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 66034212 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66034358 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 66034366 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 66034465 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 66034483 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 66034539 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 66034900 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 66034971 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66035012 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 66035045 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 66035142 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 66035208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66035304 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 66035305 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 66035329 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 66035556 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 66035690 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 66035697 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66036341 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 66036356 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 66036434 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 66036674 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 66036676 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66036847 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 66036874 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 66037692 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 66037696 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66037900 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66037906 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 66037976 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66038576 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 66038798 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 66039070 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 66039147 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 66039197 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66039378 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 66039839 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 66039855 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 66039988 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 66039998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66040024 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 66040244 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 66040265 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 66040732 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66040795 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 66040943 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 66041012 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 66041127 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 66041373 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 66041603 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 66042232 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 66042345 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 66042410 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 66042468 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 66042485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66044018 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66044070 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66044083 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 66045103 C A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 66046627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66047882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66049333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66049708 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 66049709 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 66052409 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66054226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66055698 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 66056243 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 66056504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66057571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66058364 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 66059255 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 66059488 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 66059596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66060730 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 66060985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66061012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66061109 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 66061520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66061835 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 66061921 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66062136 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 66062243 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 66062558 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 66062571 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66062666 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 66063128 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 66063173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66063285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66063355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66063543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66063562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66063676 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 66063687 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66063729 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66063741 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66063793 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66064055 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66064199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66064309 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66064348 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66064384 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66064398 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 66064506 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66064730 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66065059 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 66065082 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 66065089 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 66065121 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66065147 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 66065201 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 66065328 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 66065369 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66065388 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 66065390 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66065574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66065625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66065702 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 66065903 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66066589 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 66066718 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 66066744 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 66066785 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 66066792 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66066876 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 66066949 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 66066967 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 66067220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66067534 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 66067577 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 66067609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66067629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66067630 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66067733 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 66067742 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66067762 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 66067913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66068198 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 66068210 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66068449 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66068473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66068971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66069140 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 66069143 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 66069773 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 66069903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66069929 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 66069931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66069969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66070098 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 66070115 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 66070117 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 66070217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66070321 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66070484 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66070738 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66070927 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66071076 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 66071099 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 66071274 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66071336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66071398 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66071583 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 66071593 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66071677 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66071683 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66071713 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 66071719 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66071767 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66071892 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66071910 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66072007 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66072009 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66072213 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66072225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66072715 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66072744 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66072782 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66072784 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66072813 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66072826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66072886 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66072955 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 66072999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66073032 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 66073092 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 66073214 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 66073506 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66073934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66073969 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66074339 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66074695 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66074702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66075068 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66075445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66075733 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66075765 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66075799 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66076082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66076382 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 66076477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66076543 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 66076598 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 66076614 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 66076622 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 66076778 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 66076807 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 66076888 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 66077029 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 66077222 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 66077237 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 66077270 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 66077522 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 66077588 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 66077631 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 66077704 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 66077920 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 66078428 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66079727 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66079959 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66080372 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66080471 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66080894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66080961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66081459 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66081567 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66081674 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66081853 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66082840 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66082844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66082882 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66082913 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66083785 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66083973 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 66083997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66084325 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66084425 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66085250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66085503 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66085525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66085845 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66085868 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66085872 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66085908 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66085949 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66086103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66086308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66086892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66086925 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 66087512 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 66088177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66089317 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66089680 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 66089705 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66089724 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66089791 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66089805 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66090299 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66090329 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 66090498 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66090549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66090583 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66091286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66091537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66091806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66092329 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66092381 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66092595 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66092660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66092958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66093705 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66093758 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 66094688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66095517 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66095596 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66095658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66095749 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66095785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66096853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66097424 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66097709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66097760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66098353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66099174 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66102343 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66102460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66103330 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 66104580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66104907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66104937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66105349 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66113129 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66113322 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66113643 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 66113784 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66113801 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66114575 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66117458 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66119657 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66120738 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66122446 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66125295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66126228 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 66129172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66130029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66130995 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66132044 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66132304 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 66132662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66133571 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 66134203 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66134253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66135128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66137343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66139175 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66141074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66143517 C T Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 66143558 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 2 66143835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66144024 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66144057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66146248 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 66150901 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66151313 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66151640 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 66152609 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66152646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66152710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66153193 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66153702 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66153812 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66153831 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66154021 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 66154128 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66154150 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66154241 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66154258 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66154281 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66154634 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 66156171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66156340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66156941 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66157013 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 66157021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66158162 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66158333 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 66159121 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 66159364 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 66159578 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 66159660 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66160164 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 66160898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66161212 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 66161306 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66161668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66165119 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 66165291 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66165414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66166806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66167639 A T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 66167732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66168570 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66169158 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 66169327 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 66169357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66169698 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66169715 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66169754 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66169787 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66169802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66169832 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66169937 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66169940 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66169949 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66170033 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66170044 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66170052 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66170060 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66170063 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66170166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66170373 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66170377 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66170389 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66170442 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66170452 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66170498 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66170546 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66170639 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66170649 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66170656 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66170847 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66170863 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66170928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66170969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66171026 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66171042 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66171072 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66171073 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66171122 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66171200 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66171221 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66171236 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66171256 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66171287 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66171289 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66171662 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66171848 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66171998 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66172025 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66172123 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66172142 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66172714 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66172753 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66172881 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66173630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66173666 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66173862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66174335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66174730 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66175300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66176136 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66176140 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66176561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66176690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66177453 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66177568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66177846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66178073 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66178212 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66178361 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66178383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66178544 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66179117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66179496 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66179800 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66179851 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66180184 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66180377 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66180485 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66180522 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66180615 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 66180623 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66180639 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66180681 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66180686 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66180780 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66180880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66180913 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66180945 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66180965 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66181021 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66181040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66181080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66181315 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66181365 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66181410 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66181550 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 66181573 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 66181636 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66181651 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66181721 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66181735 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66181747 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66181770 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66181808 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66181869 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66181906 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66182018 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66182300 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66182326 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66182347 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66182453 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66182543 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66182567 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66182573 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66182630 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66182631 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66182643 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66182685 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66182713 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66182764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66182851 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66182852 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66183053 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66183267 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66183324 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66183362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66183599 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66184693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66185377 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66185659 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66185666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66185728 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66185735 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66185820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66186341 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66186440 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66186823 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66186997 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 66187031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66187038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66187101 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66187285 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66187291 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66187319 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66187421 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66187605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66187812 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66187847 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66188083 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66188085 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66188283 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66188321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66188593 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 66188894 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66189328 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 66189395 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66189527 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66189557 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66189583 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66189767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66189820 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66189867 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66189946 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66189963 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66190018 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66190035 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66190126 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66190139 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66190144 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66190211 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66190534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66190557 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66190850 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66191102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66191250 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66191715 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66192551 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66192941 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 66193077 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66193082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66193098 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66193146 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 66193153 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66193177 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66193419 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 66193501 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66193562 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 66193636 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66193845 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66193868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66193877 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66193915 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66193927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66193974 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66194037 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66194057 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66194286 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 66194458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66194470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66194475 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66194578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66194613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66194629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66194673 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 66194705 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66194746 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66194768 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66194794 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66194816 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66194928 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 66194941 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 66195010 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66195031 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66195037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66195215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66195286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66195305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66195338 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66195354 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66195379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66195630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66195688 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66195692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66195763 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66195771 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66195797 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66195798 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66195911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66195963 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66196003 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 66196008 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 66197996 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66198023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66198031 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66198103 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66198337 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66198366 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66198391 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66198412 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66198558 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66198580 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66198593 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66198627 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66198673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66198674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66198727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66198728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66198860 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66198937 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66198999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66199025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66199441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66199618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66199637 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66199650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66199732 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66200170 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 66200207 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 66200262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66200305 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 66200391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66200855 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66200906 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66201348 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66201354 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66201526 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66201625 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66201793 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66201920 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66201988 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 66202002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66202010 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66202047 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66202106 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66202264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66202285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66202537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66202828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66202850 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66202907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66203091 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66203106 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66203185 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66203282 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66203422 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66203445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66203964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66204098 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66204104 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66204481 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66204482 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66204532 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66204649 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66205038 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66205062 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66205117 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66205173 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66205238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66205535 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 66205540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66205613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66205646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66206198 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66206400 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66206496 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66206501 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66206776 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66206810 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66206952 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66207024 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66207367 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66207425 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66207466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66207514 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66207932 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66208048 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 66208282 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66208356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66208511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66208778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66208972 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66209004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66209059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66209732 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 2 66209819 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66210186 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66210193 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66210375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66210482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66210488 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66210710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66210752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66210842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66210929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66211033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66211038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66211122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66211171 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66211187 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66211207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66211379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66211403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66211469 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66211479 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66211692 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66211699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66211738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66211756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66211785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66211821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66211841 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66211887 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66212013 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66212128 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 66212455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66212514 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66212619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66212704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66213562 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66213757 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66216057 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66216941 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66217222 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66217311 A T Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 66217491 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 66217566 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66219862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66219995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66220056 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66220395 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66220449 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66220452 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66220511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66220524 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66220822 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66220938 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66221459 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66221747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66223192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66226270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66226563 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66226819 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66226925 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66227074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66227096 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66227108 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66227157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66227377 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66227387 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66227527 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66227574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66227622 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66227647 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 66227687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66227709 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66227729 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66227738 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 66227819 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66227821 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66227901 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66229687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66229724 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66229837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66229929 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66230041 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66230141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66230298 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 66230618 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66230733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66230906 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 66231050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66231127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66231509 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66232704 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66233179 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66233195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66233411 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66233533 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66233948 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 66234309 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 66234472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66234487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66234599 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66234692 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 66234696 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 66234718 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66234754 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 66234773 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66234844 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66235028 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 66235175 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66235189 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66235191 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66235291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66235373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66235412 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66235445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66235490 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66235641 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 66235659 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66235879 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66235904 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66235929 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 66235990 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 66236054 T G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 66236068 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 66236099 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 66236125 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 66236182 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66236204 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66236225 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66236474 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66236580 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66236605 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66236857 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66236975 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66237040 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66237094 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 66237727 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66238268 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66238275 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66238349 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 66238462 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66238488 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66238510 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66238676 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66238705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66238841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66238887 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66239027 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66239190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66239213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66242796 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66243758 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 66243775 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 66244902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66245327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66245865 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66247566 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66247719 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 66248805 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66251541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66254302 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66258066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66259438 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66259574 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66261130 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66261520 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 66261777 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66263285 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 66266130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66266199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66266959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66277427 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66277557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66279177 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66279656 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 66282057 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66283468 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 66290867 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66292095 C T Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 66292586 A G Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 66294008 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 66294980 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66295190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66296094 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66296184 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66296439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66297392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66297697 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66297699 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66297814 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 66297836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66297878 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66297910 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66297915 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66297923 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66297943 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66297986 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66298007 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66298028 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66298167 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66298183 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66298227 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66298254 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66298312 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 66298668 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66298761 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66298861 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66298959 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66299582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66299595 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66300798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66300806 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66301573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66301714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66303439 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66305171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66305451 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66306128 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 66306483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66306624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66307694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66307982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66308436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66308672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66309475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66309880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66311901 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66312593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66312851 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66313317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66313436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66313468 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 66313492 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 66313507 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 66313522 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 66313573 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 66313639 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66313647 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 66313727 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 66314103 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66314254 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66315241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66315696 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 66315796 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 66316369 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66316421 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66316596 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66316931 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 66317291 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66317310 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66317385 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66317388 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66319093 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66319226 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 66319286 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66319797 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 66320101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66320957 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 66321268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66322084 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66322501 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 66322765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66323103 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 66323425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66323692 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 66325138 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66325423 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 66326226 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66326818 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66327015 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 66327091 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 66327392 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66327433 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66327539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66327764 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66327767 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66327822 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66327857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66327893 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66328078 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 66328142 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66328159 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 66328217 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66328282 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66328414 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66328440 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66328562 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66328576 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66328607 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66328710 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66328796 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66328818 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66328845 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66328873 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66328877 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66328954 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66328969 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66329124 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66329135 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66329151 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66329169 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 66329504 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 66329516 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66329583 A G Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 66329731 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 66329737 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 66329778 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 66329810 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 66329840 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66330005 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66330092 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66330124 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66330126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66330247 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66330259 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66330330 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66330345 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66330360 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66330363 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66330372 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66330374 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66330383 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66330386 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66330429 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66330474 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66330496 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66330635 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66330774 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66330996 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 66331009 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 66331096 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 66331245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66331326 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331371 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331383 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331396 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66331400 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331426 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331487 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66331552 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331558 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331592 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331608 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66331614 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66331624 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331661 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331852 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66331875 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66332071 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66332084 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66332124 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66332210 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66332296 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 66332327 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66332358 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66332413 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66332418 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66332487 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66332572 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66333067 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66333229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66333297 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66333317 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66333503 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66333511 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66333521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66333559 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66333568 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66333577 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66333678 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66334237 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66334249 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66334431 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66334503 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66334516 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66334793 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66334829 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66335206 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66335297 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66335340 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66335362 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66335387 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66335562 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66335638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66335655 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66335769 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66335944 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66336078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66336107 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66336145 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66336213 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66336332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66336414 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66336564 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66336625 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66336639 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66337192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66337197 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66337692 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 66337933 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66338174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66338208 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 66338227 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66338795 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66339586 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66339936 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 66339982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66340254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66340869 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66340876 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 66340914 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66341176 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66341585 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66341932 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 66341990 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 66342052 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66342062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66342066 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 66342219 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 66342298 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 66342314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66342408 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 66342443 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66342464 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66342488 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66342508 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66342824 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66343103 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66343204 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66343260 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66343440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66343447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66343483 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66343580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66343738 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 66343841 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 66343892 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66343912 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66343919 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66344150 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66344170 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66344347 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66344368 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66344428 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66344484 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 66344633 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 66344700 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 66344708 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66344735 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 66344776 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66344867 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 66344909 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66344959 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66345017 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 66345042 T G N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 66345047 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 66345082 C T N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 66345086 T C N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 66345101 T C N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 66345117 C T Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 66345126 C T Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 66345173 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 66345177 C A Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 66345429 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 66345436 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 66345560 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 66345649 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66345805 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 66345902 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66345903 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66345942 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66345977 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66346181 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66346723 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66347223 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66347394 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66347842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66348525 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66348689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66348707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66348872 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66348903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66348946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66348986 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66349188 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66349259 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66349302 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66349442 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66349690 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66350426 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66350517 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66350969 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66350991 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 66351012 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 66351015 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 66351025 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 66351028 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 66351356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66353104 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66353209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66353214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66353313 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66353339 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66353382 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66353647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66353770 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66353787 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66353791 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66353970 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66354048 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66354133 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66354186 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66355144 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66355194 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66355346 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66355418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66355492 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66355534 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66355570 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66355580 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66355631 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66355635 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66355668 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66355728 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66356631 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66356789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66356933 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66356981 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66357189 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66357367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66357385 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66357598 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66357830 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66358123 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66358155 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66358206 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66359645 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66360016 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66360145 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66360226 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 66360424 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66360598 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66360627 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66360718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66360821 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66360914 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66361242 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66361263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66361398 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 66361532 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66361543 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66361561 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66361626 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 66361664 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66361702 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66361746 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66362864 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66363619 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 66363998 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66365313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66365791 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66366013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66367580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66368622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66369133 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 66369324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66369448 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66369917 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66373431 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 66373555 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 66374049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66374086 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66374191 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66374502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66374568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66374575 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66374896 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66374979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66375037 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66375281 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66375740 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66375935 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66376791 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 66376861 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66376876 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66377059 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66377091 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66377139 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66377780 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66377781 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66377918 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66378690 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66379136 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66379575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66379687 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66379822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66380304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66380603 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66380728 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66380940 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66380983 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66381030 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66381059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66381121 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66381206 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66381401 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 66381424 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 66381501 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66381532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66381561 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66381608 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 66381656 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 66381748 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 66381755 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66381808 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 66381931 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 66381941 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66382009 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 66382021 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66382148 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66382221 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66382285 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66382300 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66382331 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66382349 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 66382368 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66382376 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66382412 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 66382416 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66382534 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66382547 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66382558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66382563 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66382579 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66382592 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66382747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66382806 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66382849 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66382936 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 66382971 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66382978 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66382998 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 66383055 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66383061 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66383075 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66383109 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66383177 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66383345 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66383347 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66383434 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66383549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66383580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66383936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66384018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66384366 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66384434 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66384471 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66384506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66384514 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66384638 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66384905 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66385179 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66385284 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66385335 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66386038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66388268 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66388297 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66388570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66389146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66389797 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66389964 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66390428 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66391643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66391745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66391963 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66395109 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66396187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66396536 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66396665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66397080 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66397182 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66397199 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66398432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66398743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66398820 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66400658 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66402725 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 66402852 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66403306 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66403976 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66404029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66404043 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66404061 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66404097 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 66405336 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 66405408 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66405474 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 66405711 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66405944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66406020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66406358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66406547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66406815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66407018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66407693 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 66407749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66407771 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66408521 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66408542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66408815 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 66408875 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66408977 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66409117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66409125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66409252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66409368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66409402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66409501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66409697 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 66410125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66410200 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66410403 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66410758 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66411108 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66411112 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66411467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66411503 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66411518 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66411538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66411606 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66411679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66411715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66411786 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 66411848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66411863 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66411898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66411954 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 66412001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66412169 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66412190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66412229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66412232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66412346 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66412396 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66412448 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66412505 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66412508 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66412534 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 66412573 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 66412755 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 66412807 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 66412887 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 66412913 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 66412926 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 66412958 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 66412999 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66413022 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66413033 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66413062 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66413104 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66413141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66413184 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66413220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66413222 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66413232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66413307 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66413333 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66413373 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66413394 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66413444 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66413455 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 66413500 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66413504 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66413581 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66413655 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66413710 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66413733 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66413809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66413903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66413919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414152 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414163 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66414222 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66414235 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414264 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66414311 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 66414320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66414498 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414595 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66414632 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414649 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414728 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414817 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66414868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66414952 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66414982 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66414995 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66415042 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66415046 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66415067 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66415075 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66415089 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66415323 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66415405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66415533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66415550 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66415578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66415601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66415640 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66415757 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66415833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66415933 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66415938 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66416010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66416810 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66416855 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 66416999 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 66417022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66417123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66417142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66417433 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 66417941 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 2 66418143 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 66418460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66418485 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66418549 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 66418550 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 66418777 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 66418801 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66418884 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 66419005 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 66419199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66419218 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 66419230 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 66419272 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 66419293 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 66419587 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 66419607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66419621 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 66420959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66421118 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66421351 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 66421745 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 66421787 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 2 66421992 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66422150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66423430 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66423867 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 66424475 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66430270 T G Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 66430715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66434499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66435132 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66435144 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66435155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66435175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66435228 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 66436056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66436422 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66436592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66437338 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66437348 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66437608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66441180 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 66442750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66442901 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66443190 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66443239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66443382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66443555 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66445364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66447662 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66449502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66449617 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66449637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66449674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66450080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66450122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66451390 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66451561 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66452277 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 66452698 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66452767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66452944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66453003 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66453046 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 66453233 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 66453619 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66453905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66454010 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66454060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66454066 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66454744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66455475 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66455584 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66456008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66456356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66456738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66456778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66456795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66456901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66457187 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 66457445 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66457454 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66457719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66457750 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 66457907 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66457911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66458443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66458680 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66459926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66460673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66461236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66461256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66461304 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66462601 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 66462613 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 66462620 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 66462626 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 66462637 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66463244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66463782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66464599 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66465466 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66465940 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66466059 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66466107 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66467162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66467650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66467747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66467915 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 66468571 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66468691 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66468716 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66468734 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66468922 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66468987 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 66469021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66469047 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66469306 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66469311 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66469971 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 66470446 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66470499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66471154 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66471457 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66471896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66472024 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 66472542 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66473516 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 66474005 T G N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 66474111 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 66474454 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66474556 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66474574 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66474789 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66475464 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66475465 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66475555 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66475829 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66476973 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66477015 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66477077 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66477167 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66477249 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66477274 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 66477355 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66477581 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66477896 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66478099 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 66480685 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66480696 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66481606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66481712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66481943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66482646 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66483035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66483057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66483250 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 66483272 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66483457 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 66483477 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 66483498 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66483544 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66483554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66483613 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66483642 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 66483714 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66483962 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66483968 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 66483976 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 66484283 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66484832 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 66484939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66485327 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66485721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66485776 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66486129 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66486724 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 66486880 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 66487121 A C N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 66487173 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 66487182 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 66487212 A G Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 66487568 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66488084 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 66488456 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66488556 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66489005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66489081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66489504 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66489945 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 66490003 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 66490020 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66492577 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 66492612 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 66492623 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 66492968 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66492977 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 66492994 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 66493317 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 66493338 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 66493369 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 66493380 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 66493592 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 66494813 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 66494858 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 66494906 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66495068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66495224 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66495342 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 66495461 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66495502 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 66495690 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66495777 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 66495805 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66496028 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 66496073 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66496095 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66496096 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66496120 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66496145 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66496475 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 66496479 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 66496520 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 66496547 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 66496620 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 66496632 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66496662 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 66496718 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66496819 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 66496948 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66496965 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66496998 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 66497069 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66497100 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66497213 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 66497485 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 66497656 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66497674 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66497731 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 66497773 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66497882 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 66497994 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66497998 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66498089 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66498108 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66498121 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66498151 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66498190 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 66498191 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 66498222 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66498248 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66498257 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66498265 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66498299 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 66498464 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 66498572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66498801 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66498841 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66498842 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66499050 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66499137 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66500478 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66500675 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66500800 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66500904 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66500908 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66501179 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66501300 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66501339 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66501381 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 66501410 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66501464 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66501597 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 66501750 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66501794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66501882 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66501926 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66501929 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 66502017 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 66502155 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66502253 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66502321 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66502349 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66502389 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66502395 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66502424 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 66502596 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66502601 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 66502816 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 66503293 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 66503331 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 66503528 A T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 66503588 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66503749 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66504081 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66504698 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66505185 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66506780 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66506958 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66507979 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66508584 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66508805 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66508897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66509068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66509829 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 66510857 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66511179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66511817 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66511883 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66512887 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66513195 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66513312 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66514180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66515745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66515830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66517180 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 66517659 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66518273 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66519786 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66519975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66521585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66521597 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66521706 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66522321 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66522842 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66522893 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66522904 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66522980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66523310 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 66524649 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66525045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66526782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66526973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66527448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66527999 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66529230 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66529701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66531500 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66532266 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66533415 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 66533507 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66533513 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66533579 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66533617 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 66533652 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66533845 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 66534141 T A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 66534162 A C N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 66534172 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 66534202 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 66534316 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 66534342 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 66534343 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 66534411 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 66534426 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 66534490 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 66534492 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 66534585 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66534742 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66534800 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66534823 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 66534874 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66534888 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 66534914 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 66534961 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 66534971 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 66535014 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 66535034 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 66535176 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 66535249 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 66535251 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 66535370 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 66535373 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66535474 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 66535479 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 66535539 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66535682 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 66535733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66535766 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 66535811 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 66535835 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66535909 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66535921 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66535923 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66535990 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66536130 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66536272 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 66536381 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 66536434 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 66536461 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 66536549 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 66536595 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66536605 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 66536642 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 66536686 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66536694 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66536950 G T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 66537030 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 66537605 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 66538196 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 66538377 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66538801 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 66538847 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66539103 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66539158 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66539276 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66539499 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 66539542 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66539889 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66539916 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66540127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66540218 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66540338 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66540339 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66540352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66540358 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66540377 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66540445 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66540555 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66540606 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 66540620 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66540676 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66540697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66540762 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66540981 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66540999 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66541003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66541119 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 66541147 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66541187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66541212 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66541356 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66541390 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 66541416 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66541525 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66541536 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66541575 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66541589 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66541707 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66541727 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66541761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66541769 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66541967 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66542010 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 66542075 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 66542117 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66542257 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66542290 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66542338 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66542339 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66542380 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66542434 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66542445 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66542499 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66542764 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66542888 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66542907 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66542929 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66542971 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66543086 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66543193 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66543220 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66543223 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66543561 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 66543570 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66543575 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66543616 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66543646 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 66543705 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66543798 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66543806 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 66544008 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66544030 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 66544061 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66544062 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 66544135 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66544136 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 66544148 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66546303 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66546355 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66546387 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 66546484 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66546531 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 66546587 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 66546617 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66546659 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66546779 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66546781 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66546806 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 66546878 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66546904 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66546909 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 66546919 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 66546992 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66547160 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66547169 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66547216 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66547219 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 66547283 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66547382 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66547427 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66547439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66547486 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66547537 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66547642 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66547859 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66547887 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66547899 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66547950 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66548228 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 66548834 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 66549480 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 66549744 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 66549770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66550306 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66551682 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66552047 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66552445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66552724 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66552921 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66553052 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 66553139 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 66553797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66554231 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66554354 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66554656 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66554846 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 66555014 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66555066 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66555109 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 66555171 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66555429 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66555446 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66555808 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66556012 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 66556037 T A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 66556449 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66556529 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66556685 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 66556904 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 66557084 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66557200 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 66557354 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66557718 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66558509 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66558550 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 66558951 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 66559050 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 66559385 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 66559573 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66559893 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66561389 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66561559 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 66561782 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66561909 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66562623 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 66562655 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66562844 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66562904 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66563261 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 66563933 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66565601 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66565882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66566745 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 66566999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66567784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66568091 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66568387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66575370 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 66575749 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66576066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66576373 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66578953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66580264 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66580400 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66580628 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 66582130 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66582133 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66588535 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 66590233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66590426 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 66590427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66590521 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 66590837 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 66590838 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 66590880 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 66590922 A C N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 66590996 C T N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 66591039 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 66591145 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 66591163 T G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 66591194 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 66591203 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 66591262 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 66591404 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 66591640 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 66591853 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66591981 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66591984 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66592166 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 66592316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66592399 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 66592419 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 66592572 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66592583 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 66592607 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 66592613 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66592619 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 66592642 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66592655 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 66592656 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66592681 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 66592699 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 66592793 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 66593062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66593132 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66593305 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66593340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66593355 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66593641 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66593664 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66593755 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 66593768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66593823 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66593904 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 66593943 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66593964 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66593974 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66594082 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66594125 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 66594132 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 66594144 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 66594168 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66594411 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66594453 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 66594496 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66594513 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66594531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66594536 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 66594683 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 66594834 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 66594998 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66595136 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66595164 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66595241 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 66595319 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66595419 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66595578 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66595693 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66596329 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66596445 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66596529 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66596544 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66596554 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66596646 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66596717 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66596727 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66596774 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66596809 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66596818 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66596839 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66596849 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66596873 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66596917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66597065 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66597080 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66597123 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66597146 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66597166 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66597200 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66597208 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66597250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66597426 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66597436 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66597611 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66597658 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66597762 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66597928 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 66598078 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 66598080 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 66599407 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66599627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66600047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66603335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66605433 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66608100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66609985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66610160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66610786 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66611076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66611524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66611571 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66611712 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66611740 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66611806 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66611845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66611979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66612013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66612097 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66612170 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66612241 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66612262 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66612263 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66612500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66612569 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66612586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66612616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66612659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66612761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66612893 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 66612897 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 66612917 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 66612972 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66613037 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66613045 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66613154 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 66613191 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 66613246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66613264 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66613341 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 66613342 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 66613375 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66613651 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 66613939 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66614117 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 66614201 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 66614367 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 66614512 A C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 66614624 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 66614686 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66614778 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 66615008 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 66615246 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66615333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66615514 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66616747 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66617164 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66617229 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66617312 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 66617417 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66617455 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 66617866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66618085 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66618232 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66618327 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66618367 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66618383 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66618401 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 66618434 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66618451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66618475 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66618486 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 66618530 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66618608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66618710 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66618746 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66618754 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66618766 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66618775 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66618848 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66618880 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66618901 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66618939 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66618944 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66618993 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 66619082 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66619448 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 66619860 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66619946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66620006 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66620036 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66620186 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66620244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66620326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66620607 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66620651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66620661 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66620715 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66620737 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66620987 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66621206 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66621245 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66621310 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66621379 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66621407 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66621485 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66621498 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66621668 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66621822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66621843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66621926 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66622051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66622217 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66622494 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66622585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66622734 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66622896 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66623553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66624897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66625042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66625309 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66625356 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66625789 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 66625832 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66625845 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66626728 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 66626771 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66626798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66626813 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 66627089 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66627499 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66627696 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 66628066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66628515 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66628541 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66628852 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66628877 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66629003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66629192 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66629255 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66629328 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66629345 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 66629410 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 66629562 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 66629846 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66630018 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 66630060 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 66630222 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66630273 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66630513 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66630669 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66631035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66631042 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66631106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66631113 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66631285 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66631756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66632728 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66632762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66632837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66633473 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66633601 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66634850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66637803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66638415 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66641729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66642485 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66643165 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66643214 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 66643220 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66643281 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 66643283 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 66643298 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 66643306 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 66643389 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 66643443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66643452 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66643667 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 66644116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66644317 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66644684 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66646504 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 66647068 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 66647819 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 66648617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66648947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66649320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66650212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66650751 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66650767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66650892 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66651082 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66651124 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66651353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66651358 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66651372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66651648 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66652092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66654614 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66655354 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 66655442 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66659305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66659455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66659840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66660709 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66660759 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66663415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66665482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66667168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66669599 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66670123 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66670830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66671199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66671517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66671738 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66671988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66672092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66672294 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66672440 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 66672651 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 66673020 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66673277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66673304 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66673530 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66673584 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66673656 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66673675 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66673769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66673781 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66673921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66673985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66674409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66674941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66674958 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66675032 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66675086 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66675149 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66675170 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66675237 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66675451 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66675535 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66675578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66675600 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66675736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66675898 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66676185 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66676187 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66676243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66676325 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66677099 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66677210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66677375 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66677454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66677545 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66677547 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66677580 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66677678 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66677696 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66677729 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66677956 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 66677988 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66678048 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66678430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66678506 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66678546 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66678685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66678687 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66678755 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66678846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66678847 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66678918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66678970 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66679021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66679032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66679194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66679292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66679329 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66679330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66679393 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66679395 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66679658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66679681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66679695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66679970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66679984 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66679996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66680057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66680138 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66680199 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66680233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66680255 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66680347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66680359 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 66680600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66680611 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66680710 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66681546 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66681565 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 66681792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66681894 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66681971 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66682042 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 66682047 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 66682096 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 66682181 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 66682216 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66682271 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 66682412 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66682563 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66682665 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66682682 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66682855 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66690794 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66690808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66690819 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 66690881 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66691100 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66691147 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66691242 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66691335 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 66691414 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66691716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66691742 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 66692066 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66692140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66692247 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66692405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66692772 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 66692798 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66692804 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 66692848 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66692939 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 66693045 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66694870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66694946 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66695552 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66695588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66697843 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66698141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66698438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66698700 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66698962 A T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 66698995 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 66699264 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 66699369 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66699687 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66700154 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66700182 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 66700217 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 66700346 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66700568 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 66700579 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66700651 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 66700666 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 66700823 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 66701242 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 66701286 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66701479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66701699 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66701888 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 66701967 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66701968 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66701998 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 66702137 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 66702184 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 66702228 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66702286 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66702365 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66702469 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66702490 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66702504 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 66702539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66702575 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 66702736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66702826 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 66703058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66703094 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66703095 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66703114 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 66703123 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 66703181 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66703197 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66703223 T G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 66703277 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 66703366 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 66703666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66703779 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66703924 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66703960 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 66703995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66704208 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 66704233 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66704265 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66704334 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66704355 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66704615 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 66704639 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 66704650 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 66704672 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 66704773 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 66704810 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 66704925 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66705007 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 66705263 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66705280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66705314 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 66705376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66705517 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66705562 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66705972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66706275 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66706287 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66706518 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66706562 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66707013 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66707068 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66708568 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66708695 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66708854 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66708909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66709031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66709065 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 66709181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66709188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66709237 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66709258 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66709532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66709536 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66709547 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66709634 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66713735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66713784 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 66714339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66714509 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66714518 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66714635 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 66714724 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66714847 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66714860 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 66715303 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 66715318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66715993 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66716405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66716777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66717306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66719054 T A Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 2 66719403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66720009 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66720948 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66721055 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66721614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66722247 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66722462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66722622 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66723044 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66723094 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66723328 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66723755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66724095 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 66724124 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66724512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66724664 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66725098 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66725139 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66725559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66725741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66725896 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66725976 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66726243 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66727191 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66727264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66727567 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66727699 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66728023 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66728142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66728216 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66728312 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66728384 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66728391 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66728526 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66728558 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 66728662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66728681 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66728871 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66728883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66729050 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66729129 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66729168 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66729223 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66729265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66729451 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66729488 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66729575 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66729666 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66729733 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66729775 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66729795 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66729819 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66730046 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66730048 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66730133 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66730210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66730280 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 66730356 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66730511 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66731400 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66731410 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66731654 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66733870 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66733938 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66733998 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66734158 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66734204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66734312 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66734333 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66734385 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66734411 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66734431 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66734432 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66734467 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66734517 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66734526 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66734535 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 66734537 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66734549 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66734580 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66734597 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66734695 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66734704 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66734742 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66734750 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66734800 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66734818 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66735003 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 66735046 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 66735150 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66735319 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 66735336 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66735422 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66735544 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66735567 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66735574 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66735608 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66735721 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66735922 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66736025 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66736034 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66736282 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66736285 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66736349 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66736368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66736679 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66736787 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66736796 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66736798 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66736874 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66736945 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 66736966 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66736992 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66737093 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66737140 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66737153 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66737154 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66737238 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66737244 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66737259 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66737268 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 66737378 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66737441 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66737736 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66737955 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66738002 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66738098 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66738409 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 66738496 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66738526 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66738573 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66738694 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66738822 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66738852 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66738880 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66738985 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66739224 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66739362 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 66739430 A C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 66739433 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 66739940 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 66739999 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 66740039 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66740085 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66740212 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66740324 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 66740336 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 66740531 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66740535 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66740823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66740859 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66740895 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 66740896 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 66740915 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 66740945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66741222 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66741591 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66741600 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66741918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66741965 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 66742139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66743608 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66745712 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66745723 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66745963 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66745971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66746020 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 66746237 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 66746366 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66746479 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66746737 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 66747019 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 66747194 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66747501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66747559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66747753 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66747922 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66747981 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 66748246 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66749030 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66749063 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 66749274 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66749345 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66750380 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 66750731 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66751460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66752556 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66752592 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66753129 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66753396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66756013 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66756324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66757129 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 66757181 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66758293 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66758642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66759214 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66759358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66760184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66760484 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66761358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66761520 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66761836 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66762615 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 66762954 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66762955 C G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 66763030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66763399 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66763414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66763523 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66763572 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66763693 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66763732 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66764172 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 66764586 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66764642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66764656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66764785 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66764874 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 66764894 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66764934 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66764965 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 66765669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66765972 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66766077 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66766312 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66766397 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66766446 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66766705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66766891 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66767012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66767591 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66768418 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 66768518 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66768794 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66768797 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66769027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66769030 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66769124 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66769355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66769396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66769434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66769483 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66769757 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66770407 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66770656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66770695 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66771063 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66771138 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66771357 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 66771604 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66771978 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 66771995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66772006 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 66772025 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 66772112 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 66772133 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 66772236 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66772267 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 66772355 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66772380 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66772429 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 66772759 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 66772902 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 66772936 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 66772981 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66773024 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66773100 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66773184 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66773213 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66773252 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 66773594 G A Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 66773617 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 66773662 A G Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 66774513 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66774651 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66774894 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 66775502 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66775558 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 66775643 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66775801 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66776190 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66776270 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66776302 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 66776673 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 66776864 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66776876 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66777080 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66777089 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66777183 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66777236 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66777274 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66777331 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66777415 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66777439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66777478 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66777544 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66777574 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66777665 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 66777771 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66777793 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66777857 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66777862 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66778108 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66778119 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 66778215 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 66778238 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66778427 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66778456 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66778510 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66778615 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66778632 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 66778759 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 66778801 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66778820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66779006 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66779065 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66779141 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66779295 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66779376 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66779448 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66779457 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66779621 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66779683 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66779730 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 66779811 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66779891 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66779930 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66780048 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66780071 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66780178 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66780685 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66780800 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66780987 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66781036 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66781112 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66781158 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66781260 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66781279 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66781293 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 66781370 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 66781515 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 66781519 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 66781527 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 66781576 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 66781702 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 66781755 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 66781907 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 66781974 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66782169 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66782318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66782453 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66783905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66784062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66784278 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66786784 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66788000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66788071 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 66788317 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66788489 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66788755 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66789008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66789107 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66789108 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66789333 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 66789425 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66789529 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66790142 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66790165 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66790307 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66790668 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66791680 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66792345 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 66792773 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66793127 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66793610 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66794148 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 66794360 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66794950 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66795012 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66795327 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66795810 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66795972 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66796113 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66796243 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66796365 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66796586 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66796611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66797558 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 66797600 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66797607 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 66797626 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66797799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66797917 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66798141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66798157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66798208 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66798430 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66798970 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66799827 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66799952 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66800050 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66800360 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66801182 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66801255 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66801764 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66802322 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66802346 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66802497 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66802515 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66802815 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66802816 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 66802970 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66803238 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 66804069 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66804587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66804840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66805394 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66805958 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66806252 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66807492 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 66807686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66807867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66807949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66808060 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66808949 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66809303 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66809375 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66809413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66809561 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66810007 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66810283 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66810805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66810919 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66811596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66811938 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66813972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66817140 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 66817183 G C Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 66818068 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66818838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66819265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66819867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66822552 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66822704 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66822805 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66822819 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66824221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66824284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66825414 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66826590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66827576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66829544 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 66830240 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 66830476 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66830770 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66831090 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66831803 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66833181 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66833492 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 66833668 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66833934 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66834149 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66835809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66836149 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66836178 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66836245 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66836249 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66836263 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66836395 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66836569 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66836846 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66837155 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66837357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66837375 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66837473 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 66837480 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66837550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66838076 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66838395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66838445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66838713 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66839134 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66839165 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66839321 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66839598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66840283 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66840406 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 66840728 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66840909 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66840974 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66840992 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66841013 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66841030 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66841248 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66841345 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66841681 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66841931 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66842637 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66842863 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66842879 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66842944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66842964 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66843124 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66843147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66843152 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66843195 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66843305 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66843322 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 66843341 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 66843343 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 66843359 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66843383 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66843492 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 66843500 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 66843664 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 66843694 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 66843825 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 66843980 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 66844214 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 66844296 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66850829 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 66850847 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 66850931 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 66851048 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 66851385 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66851729 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 66851756 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 66851780 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66852487 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 66853514 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66853751 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66853971 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66854333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66854599 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66854779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66854967 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66855236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66855243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66858895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66860664 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66862420 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 66863676 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66864363 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66865843 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66866628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66868463 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66868781 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66870265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66870542 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66871030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66872911 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66872972 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66873989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66874345 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66874515 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66874858 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 66874999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66876011 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66876086 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66876537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66876640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66876992 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66878309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66878729 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66878986 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 66879181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66879345 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66880148 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66880351 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66880353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66880420 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66880498 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66880633 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66880655 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66880758 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66880771 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66880775 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66880794 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 66880857 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 66880889 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 66880980 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66881015 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66881073 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66881142 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66881316 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66881319 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66881333 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66881344 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66881558 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66881729 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66881905 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 66881968 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 66881993 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66882053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66882172 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66882187 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66882359 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66882372 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66882493 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66882626 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66882678 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66882893 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66882997 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66883107 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66883120 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66883199 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66883342 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66883651 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66883693 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66883763 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 66883806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66884002 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66884014 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66884161 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 66884183 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66884267 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66884274 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66884315 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 66884373 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66884541 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66884591 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66884610 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66884615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66884795 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66884922 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66885005 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 66885147 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 66885422 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 66885461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66885482 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66885640 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66885735 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66885801 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66885840 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66885906 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66885940 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 66886059 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66886195 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66886201 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66886224 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 66886366 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66886457 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66886461 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66886485 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66886497 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66886540 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66886604 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66886622 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66886738 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66886842 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66886916 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66887092 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66887203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66887264 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66887388 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 66887574 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 66887621 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66887633 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66887698 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 66887713 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66887788 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66887857 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66887934 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66888173 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66888202 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66888430 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66888453 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66888526 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66888637 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66888662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66888690 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66888735 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66888837 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66888913 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66889153 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66889177 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 66889338 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66889572 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66889846 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66890048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66890326 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66890842 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 66890851 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66891118 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66891155 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66891829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66891864 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66891930 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 66892165 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66892308 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66892583 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66892607 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66892649 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 66892989 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66893250 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 66893359 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66893479 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66893544 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66893567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66894102 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66895163 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 66895748 C G Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 66895989 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66897408 T C Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 66897458 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66897764 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66897795 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66897940 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66898398 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 66898513 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 66899574 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 66899597 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66899744 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66899841 C G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 66900103 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 66900531 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66900543 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66900805 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66900876 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66901754 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66903047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66903131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66904058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66904419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66904421 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66904979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66905033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66905158 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66906532 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66906874 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 66907401 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66907903 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66908290 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66908314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66908466 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66908912 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66909230 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 66909306 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 66909452 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 66909591 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 66909597 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 66909785 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66909788 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66909949 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 66910005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66910021 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 66910027 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66910081 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66910273 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 66910501 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66910515 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 66910573 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66910612 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66910930 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 66911104 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66911206 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 66911211 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66911285 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 66911303 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 66911394 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66911445 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66911505 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66911528 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66911716 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66911739 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 66911944 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 66912074 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 66912107 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 66912134 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 66912178 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66912285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66912298 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66912308 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 66912310 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66912360 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66912424 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66912458 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66912493 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66912504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66912511 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66912605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66912649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66912705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66912745 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66912764 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66912777 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66912787 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66912889 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66912923 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66913016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66913043 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66913094 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66913101 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66913130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66913179 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66913225 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66913312 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66913390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66913436 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 66913645 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66913692 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66913827 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66913880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66913909 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66913954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66914040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66914071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66914128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66914179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66914338 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66914385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66914565 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 66914587 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 66914888 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 66914928 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66914980 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 66915001 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 66915495 A T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 66915603 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66915647 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66915776 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66915833 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66916126 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 66916135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66916144 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66916161 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66916204 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 66916278 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66916320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66916373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66916403 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66916468 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66916521 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 66916643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66916682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66916686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66916730 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66916858 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66916859 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 66916906 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66916909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66916959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66916997 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66917129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66917146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66917256 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66917262 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66917867 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66918197 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66918311 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66918322 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66918564 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66918644 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66918697 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66918737 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66918759 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 66918909 G T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 66919038 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66919040 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66919099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66919125 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66919171 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 66919377 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66919458 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66919738 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 66919841 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66919958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66920068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66920107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66920207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66920325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66920396 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66920423 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66920431 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66920527 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 66920564 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66920689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66920742 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 66920764 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66920832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66921095 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66921096 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66921183 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66921228 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66921318 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66921365 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66921511 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66921643 T A N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 66921644 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 66928780 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 66928795 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 66928812 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66928897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66929127 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66929354 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66929357 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66929542 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66929547 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66929605 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 66929897 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 66930153 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66930291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66930378 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66930482 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 66930609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66930676 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66930724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66930738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66930762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66930920 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66931083 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 66931167 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66931180 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66931202 G C N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 66931323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66931393 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66931457 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 66931483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66931492 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66931539 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66931587 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 66931632 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66931651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66931701 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 66931755 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66931760 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66931779 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66931934 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 66931964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66932002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66932084 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66932153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66932488 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66932606 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 66932609 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66932835 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66933277 C T Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 66933278 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 66933415 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66941791 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66942076 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 66942901 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 66943060 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 66943983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66944132 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66944814 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66945628 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66945678 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 66945679 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 66945860 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66945905 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66946102 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66946127 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66946162 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66946480 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66946500 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66946940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66947129 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 66947204 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 66947217 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 66947254 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 66947315 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66947453 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 66947555 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 66947763 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 66947859 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 66947973 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 66948007 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66948011 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66948094 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66948206 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 66948283 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 66948297 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66948310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66948777 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 66948779 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66949234 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 66949718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66949786 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66950116 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66950173 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66950264 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 66950909 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66951054 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66951090 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66951153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66951284 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 66951365 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 66951593 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 66951875 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66952153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66952289 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66952586 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66952609 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66952780 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 66952786 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 66953656 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66953992 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66954034 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66954107 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 66954111 G T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 66954351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66954400 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66954672 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 66954729 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66954856 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66954986 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 66955698 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 66955727 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66955802 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66955919 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 66956494 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 66956555 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66956674 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66956718 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66957122 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66957125 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66957272 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66957437 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 66958088 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66958118 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 66958124 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 66958618 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66959043 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66959221 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66959387 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66960099 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66960348 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66960936 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66961928 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66962024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66962089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66962258 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66962364 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 66962519 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 66962586 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 66963098 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66963345 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66963982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66964089 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66964363 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 2 66965395 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 66965470 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 66965727 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 66965827 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66965843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66966519 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66966827 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 66969974 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66971247 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66971393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66971920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66972147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66972303 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 66972929 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66972950 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66973824 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 66974712 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 66975408 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66976811 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 66977097 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 66980231 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66981691 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 66981775 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 66983322 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66984923 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66985257 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 66989905 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 66990371 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 66993191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66993324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66993655 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 66995020 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 66995346 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 66995766 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 66995865 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 66996328 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 66996462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66996953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66997148 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 66997473 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 66997513 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66997657 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 66997718 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 66997719 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 66997962 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66998037 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 66998182 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 66998259 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66998287 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66998318 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 66998452 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66998457 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 66998489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66998664 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66998673 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 66999073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66999165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 66999172 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 66999254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 66999681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67000006 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 67000186 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 67000214 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 67000716 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 67000725 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 67000732 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 67000788 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 67000792 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 67001084 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 67001166 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67001214 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67001332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67001347 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67001389 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 67001518 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67001536 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 67001542 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 67001576 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 67001713 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 67001730 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67001767 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 67002614 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 67002617 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 67002844 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 67002982 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 67002992 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 67003060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67003132 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 67003163 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67003291 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67003338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67003553 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 67004198 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67005199 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 67005715 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 67005864 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 67006051 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 67006137 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 67006168 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 67006357 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 67006786 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 67006879 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 67007296 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 67007383 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67007409 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 67007529 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 67007903 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 67007918 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 67008014 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67009041 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 67009047 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67009088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67009250 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 67009521 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 67009554 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 67009750 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67009754 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 67009948 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67010272 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67010651 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67011007 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 67011319 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 67011444 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 67011464 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 67011647 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 67012594 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67012612 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67012780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67012803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67013030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67013092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67013095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67013169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67013178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67013409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67013626 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67013744 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67014062 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 67014180 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67014640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67014659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67014894 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 67014911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67015441 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67016389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67016400 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67016494 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67016550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67016638 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 67017015 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67017591 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 67017653 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67017759 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67017784 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67017968 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67017998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67018085 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67019548 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67021516 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67022562 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67022579 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67022583 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67023032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67023890 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67024080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67024533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67025058 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 67025387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67025582 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67026357 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 67026382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67027711 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67028902 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67028920 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67029152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67029520 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67029814 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67029815 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 67030237 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67030493 C G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 67030625 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67030919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67031876 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67032222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67032255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67033850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67034885 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67036055 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67037166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67037167 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67038265 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67038341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67039075 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67039375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67039859 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67039863 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67040272 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67041052 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 67041322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67041341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67041514 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 67041815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67041844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67041953 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67042364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67042452 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67042844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67043251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67044288 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67044633 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67044676 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67044791 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67044800 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67044956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67045131 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67047171 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67047176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67047248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67047937 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67048487 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67049763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67050044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67050858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67050954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67051152 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 67051678 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 67051837 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67054472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67056826 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 67057445 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 67057475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67057665 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67057676 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67059039 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67059306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67059429 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67059707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67060086 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67061166 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67062170 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67065156 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67065327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67065928 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67066837 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67067045 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 67067066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67067133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67067303 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 67067890 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67069541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67069773 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67071118 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67073247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67073891 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67074116 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 67074131 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 67074308 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 67074361 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 67074364 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 67074503 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 67075413 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67075885 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67076089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67076243 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 67076317 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 67077035 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67077279 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67077508 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67078691 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 67078696 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 67078898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67079233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67079254 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67079407 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67079499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67079500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67079959 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 67080003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67080225 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67080320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67080431 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67080623 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67080710 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67081360 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 67081614 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67082289 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 67082489 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67082681 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67082827 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 67082889 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67083049 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67083111 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67083134 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 67083190 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67083304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67083316 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 67083385 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67083740 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67083923 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67084087 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67084139 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67084227 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67084509 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67084514 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67084572 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 67084590 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67085772 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 67085776 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67086108 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67086454 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67086754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67087275 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67088052 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 67088064 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 67088172 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67088218 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67088233 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67088393 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 2 67088536 G T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 2 67089014 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 67089031 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 67089046 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 67089084 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 67089205 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 67089364 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 67089428 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 2 67089459 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 67089483 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 67089702 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 67089916 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 67089950 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 67090021 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67090060 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 67090111 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 67090112 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 67090305 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67090437 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 67090647 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 67090703 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 67090983 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 67091189 T G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 67091345 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 67091459 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 67091585 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 67092037 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67092215 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 67092230 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 67092541 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 67092714 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 67092734 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 67092948 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 67093057 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 67093093 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67093174 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67093241 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67093264 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67093273 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 67093275 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 67093313 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67093438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67093745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67093797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67093846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67093852 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 67093886 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67093945 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67094002 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67094028 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 67094044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67094166 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67094222 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67094228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67094253 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 67094256 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67094356 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67094516 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67094554 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67094722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67094725 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67094842 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67094928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67095001 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 67095040 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67095157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67095183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67095214 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67095302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67095362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67095369 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67095635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67095762 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 67096127 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 67096173 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67096307 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67096622 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 67096652 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 67096653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67096897 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 67096923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67096953 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 67097049 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 67097083 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67097168 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 67097299 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 67097334 T G N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 2 67097464 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 67097555 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67097606 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 67097617 G T Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 67097879 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67097928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67098243 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 67098247 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 67098261 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 67098290 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 67098333 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 67098511 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 67098608 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 67098733 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67098984 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 67099107 G C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 67099130 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 67099157 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 67099166 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 67099262 A C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 67099331 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67099345 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 67099447 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 67099540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67099600 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 67099773 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67099778 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 67099854 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 67099953 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67099965 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67099982 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67100051 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 67100196 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67100383 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67100406 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67100412 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67100445 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67100451 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 67100456 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 67100521 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 67100531 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67100670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67100719 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67100751 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67100807 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67100883 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67100889 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 67101065 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67101074 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 67101090 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67101105 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 67101162 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67101181 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67101711 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 67101852 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 67102305 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67102332 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 67102374 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 67102778 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 67102883 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 67102887 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 67102928 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 67102956 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 67103606 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 67103901 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 67104621 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67105766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67105860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67106473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67106853 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67107053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67113611 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 67114037 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 67114647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67114711 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 67114807 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67115142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67115833 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67115957 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67116116 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 67116143 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 67116287 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67116630 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67116794 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 2 67116798 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 67117117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67117180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67117577 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67117666 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 67117812 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 67118008 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67118032 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67118300 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 67118597 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 67119100 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67119653 A C Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 67119680 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67119711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67119793 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67119861 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67120014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67120121 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67120200 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 67120325 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67120546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67120925 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 67120970 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67121796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67121844 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 67121962 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67122035 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 67122250 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67122395 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67122512 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 67122632 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 67122731 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 67123010 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67123239 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 67123343 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 67123345 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 67123520 T G Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 67123588 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 67123648 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 67123839 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 67124701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67124855 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67125102 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 2 67125159 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 67125231 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 67125445 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 67125908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67126015 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 67127090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67128462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67128642 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 67128709 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67129150 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67129357 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67129442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67129818 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 67129831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67130447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67130588 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 67131676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67132247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67132290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67132598 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67132753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67132832 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67132889 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67133869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67134113 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67134833 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67135034 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 67135465 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67135486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67135718 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67135731 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 67136067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67136342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67136584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67136680 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 67136814 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67136929 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 67136952 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 67136954 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 67137063 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 67137294 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 67137350 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 67137494 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 67137554 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 67137622 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 67137651 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 67137674 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 67137703 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 67137719 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 67137784 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 67137912 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67138004 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67138095 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67138205 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 67138324 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67138337 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67138344 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 67138356 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 67138373 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 67138384 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 67138391 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67138396 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67138503 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67138504 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67138528 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67138544 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67138574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67138657 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67138809 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 67138985 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67139008 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67139145 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 67139148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67139300 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 67139384 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 67139649 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 67139802 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 67139899 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 67139903 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 67139951 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 67139952 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 67140071 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 67140192 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 67140308 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 67140370 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 67140421 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 67140479 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 67140523 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 67140525 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 67140539 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 67140618 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67140684 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 67140700 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 67140701 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 67140747 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 67140760 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67140839 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 67140882 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67140942 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 67140963 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 67140993 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 67141113 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67141156 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 67141293 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 67141297 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 67141314 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67141352 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 67141413 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 67141433 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 67141441 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 67141769 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 67141847 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 67142167 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67142199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67142200 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 67142313 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67142446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67142965 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67143099 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 67143329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67145278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67146084 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 67147581 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67148141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67148350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67148468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67149096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67149355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67149709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67149815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67149893 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67151842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67152614 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67153169 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67154228 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 67154639 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67155725 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67156080 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67163830 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67164236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67165866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67166712 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 67167541 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67168659 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 67169275 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67169465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67169807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67170127 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67170528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67170883 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 67170963 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67173134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67173145 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67174475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67174482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67175424 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67175536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67176295 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67176390 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67176801 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67177328 G T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 67177762 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 67177848 T A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 67178477 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67178510 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67178558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67178607 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67178663 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67179812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67179919 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 67179952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67180222 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67180375 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67180462 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 67180578 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67180586 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 67180765 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 67181127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67181194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67181528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67181529 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 67181646 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67181686 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 67181726 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67181808 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 67182083 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 67182222 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 67182407 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 67182524 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67182772 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 67183097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67183350 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67183467 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67183507 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67183632 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67183663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67183689 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 67183770 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 67183843 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 67183985 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67184122 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 67184267 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 67184316 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67184419 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67184474 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67184640 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67184681 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67184687 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67184780 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67184901 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 67184932 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67184950 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 67185036 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67185094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67185132 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67185154 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67185189 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67185703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67185736 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67185758 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67185809 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67185934 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67185978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67185994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67186109 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 67186148 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67186162 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67186475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67186497 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67186696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67186733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67187199 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67187285 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 67187492 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 67187587 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 67187593 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 67187675 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67187677 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67187690 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67187764 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67187835 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67187856 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67187882 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67187899 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67187901 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67187911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67188158 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 67188281 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 67188294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67188357 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67188490 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67188535 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67188556 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67188776 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 67189030 C A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 67189178 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67189300 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 67189439 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67189474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67189605 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 67189608 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67192647 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 67192670 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67192813 A G Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 67192840 A G Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 67193242 C T Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 67195644 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 67195728 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67195756 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 67195871 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67195908 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67196053 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 67196074 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 67196133 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 67196165 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67196277 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 67196316 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67196482 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 67196617 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67196708 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67196919 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 67196930 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67197096 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67197127 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 67197139 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 67197142 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 67197262 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 67197329 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 67197735 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 67198095 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 67199432 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 67199437 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 67199499 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 67199937 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 67200245 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67200596 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 67201268 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67201488 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67201565 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 67201586 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 67201678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67202578 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 67202672 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67202810 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 67204747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67205409 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 67206095 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67206202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67206330 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67206815 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67208161 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 67208335 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 67208407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67208713 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 67208981 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 67209080 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 67209313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67209429 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 67209471 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67210346 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 67210475 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 67211046 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67211326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67211522 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 67212349 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 67212406 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 67212564 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 67212651 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 67212676 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 67212888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67213004 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67213081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67213110 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 67213201 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 67213419 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 67213924 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 67213963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67213980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67214031 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 67214049 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67214261 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 67214274 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 67214434 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67214881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67215009 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67215065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67215110 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67215500 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67215668 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67215953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67216323 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 67217223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67217279 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 67218246 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 67218249 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 67218471 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67218644 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67218705 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 67219185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67219238 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 67219465 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 67219958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67222815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67223461 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67224259 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67224523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67224939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67225012 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 67225268 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 67225360 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 67226109 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 67226184 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 67226393 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 67226416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67226566 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67226619 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 67226738 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 67226916 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 67227033 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 67227074 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67227105 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67227308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67227521 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 67227670 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 67227742 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 67227889 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67227936 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 67228163 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 67228222 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 67229120 C T N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 2 67229135 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 2 67229634 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 67229711 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67229846 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 67230257 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67230720 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 67230853 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 67230857 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 67230918 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 67230939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67232123 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 67232337 C A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 67233011 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 67233942 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 67233979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67234157 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 67234218 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 67234230 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 67234302 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 67234458 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67234495 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 67234725 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67234931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67235062 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 67235274 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67235431 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 67235476 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67235639 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67236089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67237745 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67237770 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67238017 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67238170 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67238190 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67238529 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67240027 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67240260 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 67240580 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67241444 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 67241652 C A Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 67242462 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67242677 T G Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 67242702 C A Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 67242733 A T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 67243081 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 67243755 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67243832 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 67244057 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67244583 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67244903 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67245754 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67246360 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67252308 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 67252534 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 2 67252729 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67252940 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67254212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67255061 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67256639 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 67257209 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 67260147 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67260686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67260777 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67260915 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67261375 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67261982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67262768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67265743 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67265894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67266710 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67267170 T G N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 67267444 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67267464 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 67267542 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67268308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67268466 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67268877 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 67268976 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 67269055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67269144 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 67269282 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67269366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67269402 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67269449 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67269463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67269558 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67270426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67271103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67271269 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67271317 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67271503 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67271786 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67271944 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 67273009 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67273137 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67273157 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67273182 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67273186 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67273202 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67273211 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67273246 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67273278 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67273856 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67273895 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67274052 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67274255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67274267 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67274388 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 67275039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67275059 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67275382 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67275383 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 67275447 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67275607 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67275622 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67276435 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67276505 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67277039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67277089 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 67277548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67277797 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67278387 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 67278554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67278889 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 67279564 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67280068 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 67280562 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67280587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67281047 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67281863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67282745 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67282760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67283767 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67283786 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67283904 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67284230 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 67284231 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 67284586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67284630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67284964 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67284996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67285488 C G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 67286971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67289701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67290781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67290856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67291853 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 67291999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67292250 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 67292262 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67292283 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 67292353 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 67292359 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 67292387 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 67292437 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67292517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67292570 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 67292623 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 67292628 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 67292698 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67292756 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 67292964 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67293000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67293099 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 67293361 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67294455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67294473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67294852 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67295012 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 67295246 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 67295285 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67295640 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 67295700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67296022 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67296090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67296415 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67296790 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 67297221 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 67300213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67300384 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67300446 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 67305278 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 67306141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67306318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67306706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67308042 T A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 67308083 A C N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 67308315 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67308593 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 67308725 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 67309167 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 67309373 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67309913 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67314116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67314346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67314488 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 67314515 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67314577 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67314678 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67314842 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67314848 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67314903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67315160 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 67315919 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67316190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67316200 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 67316432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67316477 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 67316555 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 67316561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67316677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67316863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67317068 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67317149 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 67317551 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67318309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67318326 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 67318950 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 67318999 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67319713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67319837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67320216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67320375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67321558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67321701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67321989 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 67322194 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 67322311 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67322557 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67322585 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67322721 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 67322722 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 67322781 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67323145 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 67323598 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67323613 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67323664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67323771 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67323797 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67323812 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67323909 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67323937 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67323982 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67324008 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67324337 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67324412 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 67324413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67324531 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 67324588 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67324728 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 67324750 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67324809 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67324925 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67325143 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 67325157 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 67325214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67325244 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 67325353 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67326869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67328248 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 67330597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67333082 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67334791 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 67336197 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67338096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67338580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67338914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67339110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67339115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67339597 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67340067 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67340351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67340437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67340447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67340449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67341193 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67342217 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67342353 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67344084 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67344540 A G Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 67347672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67348914 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67348926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67349169 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 67349343 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67349391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67349439 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67349520 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67350534 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67352026 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67352778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67352857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67353340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67353837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67354362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67355862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67355880 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67355922 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 67355989 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67356430 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67356456 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67356516 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67356738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67356778 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67356934 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67357021 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67357109 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67357148 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67357168 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67357263 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 67357776 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67358128 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67358219 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 67358597 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67358616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67358654 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67358745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67358992 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 67359060 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67359090 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67359102 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 67359117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67359206 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67359346 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67359722 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67359845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67359989 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67359999 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67360583 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 67360787 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 67360909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67361291 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67361473 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67361550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67362128 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67362739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67363240 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67363529 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67363537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67363618 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67364240 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67364583 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67364600 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 67365031 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 67365177 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 67365362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67365458 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 67365719 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 67366261 A G N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 67366372 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 67366387 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 67366399 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 67366607 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67366801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67367310 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67367678 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67367731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67367820 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 67368203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67368928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67369238 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67369807 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67369844 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67370118 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 2 67370181 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 67370228 G T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 67370312 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 67370366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67370504 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 67370509 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 67370532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67370566 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67370585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67370835 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67370853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67371284 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67372332 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 67373340 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67373996 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 67374124 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67374293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67374379 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67374388 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67374659 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67374690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67374691 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67374778 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 67374819 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67374868 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67374885 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67374949 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67375083 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67375133 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 67375479 G C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 67375529 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 67375549 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 67375550 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 67375586 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67375683 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67375729 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67375736 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67375752 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 67375753 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 67375842 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 67375870 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 67375990 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67376009 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 67376021 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67376113 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 67376217 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67376224 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 67376297 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 67376324 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 67376360 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67376408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67376479 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 67376592 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 67376776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67377551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67377951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67378407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67378771 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 67378780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67378982 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 67379177 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67379199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67379236 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67379266 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67379344 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 67380194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67380211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67380252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67381048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67381249 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67381459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67381486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67382137 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67382400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67382404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67383259 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67383478 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67383577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67383661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67383936 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67383956 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67384402 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67384425 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67384623 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67386082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67386435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67386473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67386589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67386718 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67386810 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67386923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67387221 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 67387226 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 67387581 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67387878 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67388237 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 67388765 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 67389072 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 67389283 C A Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 67389316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67389498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67389541 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 67389801 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 67390122 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 67390351 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67391561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67394879 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67395174 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67395744 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67396741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67396858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67398841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67400036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67402287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67402888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67403504 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67405590 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 67405748 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67405755 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67406251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67408387 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67409321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67411105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67412405 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67412980 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 67413112 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 67413143 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 67413312 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67413346 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67413382 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67413578 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67413663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67413782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67413975 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 67414600 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67414732 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 67414763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67414781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67414844 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67415002 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67416300 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67417714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67418284 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67419612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67420446 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 67420808 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 67420930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67422193 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 67422284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67422316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67423023 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 67423711 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67423759 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67423977 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67426553 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 67426787 A T N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 67427213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67427297 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 67427538 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 67427587 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 67428207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67428345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67429038 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67429311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67429362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67433214 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67433569 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67433577 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67434717 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 67436024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67436101 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67436408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67436447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67437543 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67437914 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67438430 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67438580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67438819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67438948 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67439274 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 67439327 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67439376 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67439447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67439777 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 67440810 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67441476 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67442598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67442822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67443016 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 67443294 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67443379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67444012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67444098 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 67444120 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67444179 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67444456 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67444789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67445205 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 67445476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67445685 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67445695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67445747 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 67445954 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67445960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67446193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67446194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67446264 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 67446368 G T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 67447717 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67448238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67449081 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67449527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67449800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67450288 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67450457 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67450512 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67450574 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67450791 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 67450881 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 67450883 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67450952 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67451196 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 67451239 T G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 67452798 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 67452809 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67452829 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67452863 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67453183 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67453261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67453488 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67453752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67453966 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 67453974 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67453988 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 67454003 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 67454008 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 67454028 G C N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 67454187 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 67454274 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 67454393 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 67454674 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 67454852 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 67455347 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 67455425 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 67455460 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 67455476 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 67455741 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67455985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67456505 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67456521 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67456666 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 67456773 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 67456809 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67456835 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67456879 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67456904 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67457196 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 67457400 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67457476 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 67457577 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67457590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67457853 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67457976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67458002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67458028 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67458089 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 67458117 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67458125 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 67458147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67458327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67458390 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 67458597 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 67458722 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 67459090 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67459197 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 67459344 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67459453 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67459925 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 67460076 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67460155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67460325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67460580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67460717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67460854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67461154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67461205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67461275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67461378 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 67461488 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 67461558 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67461600 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67461622 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67461695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67461934 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67461947 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67461954 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67462034 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67462042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67462116 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67462553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67462558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67462742 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 67462790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67463497 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67463537 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 67463653 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67463701 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 67463758 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 67464098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67464200 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67464361 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 67464560 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 67464561 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 67464610 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67464716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67464849 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67464871 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67464879 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67464988 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67465339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67465491 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 67465592 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67465647 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67465743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67465744 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67465762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67465779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67465804 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67465824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67466033 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67466272 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67466282 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67466287 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67466295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67466370 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 67466511 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 67466556 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67466588 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 67466600 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 67466608 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 67466611 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 67466935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67467191 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67467232 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67467430 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 67467471 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67467744 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 67467992 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 67468889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67469283 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67469394 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 67469531 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 67469565 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 67469770 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67469803 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67469859 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67469925 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67469967 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 67470143 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67470249 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 67470363 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67470376 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67470735 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 67470874 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67471010 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67471106 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 67471157 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 67471181 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 67471202 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 67471267 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 67471306 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 67471316 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 67471403 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 67471471 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 67471506 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67471517 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 67471518 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 67471543 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 67471636 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 67471703 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 67471715 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 67471745 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 67471822 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 67471843 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 67471893 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67471929 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67471947 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67472060 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67472105 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 67472119 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 67472154 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 67472163 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 67472204 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 67472262 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 67472284 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67472368 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 67472389 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 67472501 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67475748 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 67476034 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67476035 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67476105 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67476122 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67476173 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 67476278 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67476297 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 67476404 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 67476462 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 67476571 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67476758 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67476886 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 67476913 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67476941 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 67476963 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 67477031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67477053 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 67477132 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67477303 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67477361 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67477366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67477425 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67477468 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67477503 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 67477652 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 67477767 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67477785 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 67477963 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 67478362 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67478379 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 67478391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67478453 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 67478494 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 67478498 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 67478519 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 67478545 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67478655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67478728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67478744 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 67478793 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67478904 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 67479039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67479067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67479150 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 67479196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67479349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67479655 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67479712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67479824 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 67479892 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 67481463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67481652 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 67482368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67482839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67483228 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 67483261 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67483393 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67483394 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67483453 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 67484002 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 67484149 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67484249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67484323 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67484397 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67484407 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67484456 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67484573 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67484659 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67484683 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67484897 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67485102 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67485311 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 67485438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67485540 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67485548 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67485559 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67485578 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67485594 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67485602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67485664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67485674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67485756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67485949 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67485962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67485975 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 67486041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67486046 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67487174 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67487759 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67487948 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67488294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67488360 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67488833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67489068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67489100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67489198 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67489399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67490234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67490289 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67490493 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67491511 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67491523 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 67491569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67491755 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67491999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67493018 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67494153 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 67494183 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 67494254 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67494298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67494704 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67499200 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 67499539 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67500759 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67502099 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67502326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67502667 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67503001 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67503584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67504538 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67505587 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 67506389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67506816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67507176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67507405 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67507611 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 67508648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67508757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67509667 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67510138 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67513336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67514678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67515026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67516466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67516749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67517358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67519368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67519777 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 67520423 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67525005 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67526206 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 67529103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67529311 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67531044 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67531292 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67532412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67532804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67533792 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67533823 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67533985 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 67534036 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 67534161 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67534572 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 67534580 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 67534789 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67534871 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67535022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67535050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67535100 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67535130 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67535131 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67535251 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67535257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67535285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67535410 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67535442 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67535644 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67535692 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67535788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67535918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67536553 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 67536983 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67537117 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67537155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67537196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67537241 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67537410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67537447 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67537730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67538069 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67538118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67538170 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67538707 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67538709 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67538739 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67538785 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 67538982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67539059 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67539123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67539508 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67539837 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67539851 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 67540167 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67540209 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67540286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67540289 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67540328 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67540346 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67540482 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 67540675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67540751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67540845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67540913 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67541244 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 67541278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67541313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67541402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67541455 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67541481 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67541499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67541610 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67541890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67541981 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67542612 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67543032 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67543033 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67543677 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67544478 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 67544513 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 67544642 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 67544719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67545347 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67545551 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67546075 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67546354 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67546804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67546806 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67548304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67548400 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67549246 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67553005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67555488 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67555497 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67556543 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67558910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67559257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67559544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67559782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67561289 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 67561528 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67561581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67561627 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 67562327 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67562548 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 67562774 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 67562776 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 67563177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67563569 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67563797 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67563903 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67563978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67564092 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67564288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67565085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67565539 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 67565697 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67565813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67565848 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67565918 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67565919 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67566003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67566296 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67566352 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67566364 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67566403 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 67566431 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67566531 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 67566596 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 67566694 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67566742 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 67566828 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 67566876 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 67567246 A G N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 67567418 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 67567530 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 67567687 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 67567818 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67568322 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67568498 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67569097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67569353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67570097 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67571214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67571244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67571702 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67572330 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67572491 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67572946 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67574170 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67574258 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67576028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67576263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67576279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67576595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67578264 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67578717 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67579163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67579257 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67579476 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67579710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67579920 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67579930 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67579937 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67581114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67582107 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67582113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67583064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67583298 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67584160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67584393 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67585105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67585876 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67586730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67587057 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67588089 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67589418 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67590316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67590557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67590609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67591108 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67591133 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67592364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67594627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67595693 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67596639 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 67596696 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 67597124 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 67597821 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 67598293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67598819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67600539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67600627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67601450 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67601952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67602024 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67602094 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67602203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67602331 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67602344 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67602816 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67602817 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67602845 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67602854 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67602910 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67602979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67602990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67603095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67603742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67603779 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67604018 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67604093 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67604484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67604559 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67604573 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67604586 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67604604 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67604741 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67605106 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67605487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67605685 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67607030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67607514 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67607567 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67608005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67608085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67609224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67609846 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67611513 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67611701 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67611717 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67611759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67612722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67613203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67613956 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67615945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67616871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67618247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67619008 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67619726 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 67620566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67620782 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67620799 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67621144 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67621469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67623333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67624622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67628097 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67628249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67628262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67628349 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67628474 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67628571 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67628724 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67628891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67628902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67628979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67629166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67629377 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67629770 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67629872 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67630145 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67630263 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67630264 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67630291 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67630309 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67630327 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67630339 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67630404 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67630465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67630496 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67630744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67630748 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67630772 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67630781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67630790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67630819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67630860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67630867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67630894 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67630985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67631037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67631079 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67631170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67631448 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67631524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67636041 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67638083 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67638319 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67642800 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67643676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67644119 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67652430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67653585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67653621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67660589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67661983 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67662603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67666107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67666612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67667289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67667370 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67667796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67668885 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67670149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67670165 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67670191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67671273 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67671789 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67671814 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67671995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67672314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67672784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67673724 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67673896 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67673976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67674130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67674150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67674166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67674285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67674487 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67674595 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67674627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67674634 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67674828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67674861 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67674869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67674932 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 67674933 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67674970 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67674979 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67674986 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67675025 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67680576 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 67680605 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 67680666 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67680863 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67680876 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67681003 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67681189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67681211 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67681398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67682326 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67682645 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 67682842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67683133 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67683358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67683656 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67684548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67684655 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67684828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67685215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67686041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67686170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67686439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67686514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67686528 T A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 67686529 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 67686978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67687147 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 67687288 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 67687289 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 67687412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67687805 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 67687853 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67688113 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67688159 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67688332 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67688570 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67688801 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67688852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67688925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67689121 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67689728 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67689845 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 67689866 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 67689911 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 67690194 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 67690226 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 67690934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67690944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67691407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67691790 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67691972 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 67691999 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 67692220 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67692241 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67694904 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 67695054 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67695081 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 67695100 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 67695167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67695270 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67695480 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 67695898 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 67696301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67696366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67696393 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 67696458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67696611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67696985 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67697315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67697462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67697731 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67697742 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 67697767 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 67697831 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 67697886 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67697947 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 67698024 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 67698297 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 67698324 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 67698356 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 67698366 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 67698436 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67698860 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67699155 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67700056 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67701491 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67702070 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67702094 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 67702538 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 67702586 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 67702863 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67704863 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67704906 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67705331 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 67705404 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 67705434 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 67705446 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 67705463 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 67705524 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 67705682 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 67705695 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 67705838 C A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 67705928 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 67705929 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 67706011 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 67706174 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 67706336 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 67706595 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 67706625 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 67706742 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 67706776 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 67706794 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 67707039 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67707254 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 67707320 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 67707711 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 67707816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67708050 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 67708191 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 67708514 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67709386 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67712304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67713800 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 67715087 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 67715396 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67717915 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67719130 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 67720029 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 67720640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67720671 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67723256 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67723420 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 67723670 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67724406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67725995 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67726989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67727274 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67729034 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67729080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67729180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67730234 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67731370 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67733496 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 67734065 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 67734397 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 67734513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67734740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67736123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67736741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67737365 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67738007 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67738034 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67738989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67739063 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67740235 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67740693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67740980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67741154 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 67741238 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 67741582 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67741606 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 67741654 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 67741665 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 67741932 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67742056 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67742097 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 67742490 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 67742743 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67742800 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67743072 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 67743489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67743572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67744706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67744729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67745401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67745834 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67746533 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67746590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67747067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67747185 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67748637 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67748803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67749106 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 67749137 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 67749331 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67749543 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 67749558 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67750652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67750817 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 67751194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67751200 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 67751648 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 67751780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67751885 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 67752223 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67752299 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 67752359 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 67752371 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 67752372 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 67752514 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 67753004 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 67753175 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 67753362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67753423 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 67753511 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67753671 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 67753696 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 67754651 C A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 67755214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67755557 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67756828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67756885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67756976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67757096 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 67757113 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 67757114 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 67757127 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 67757178 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 67757387 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 67757455 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 67757467 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 67757578 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67757620 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67757663 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 67757855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67757933 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 67757963 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 67758070 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 67758072 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 67758083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67758111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67758154 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67758302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67758407 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67758694 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 67758883 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67759233 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 67760197 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67760503 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 67760777 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 67760923 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 67760946 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 67761012 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 67761061 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 67761231 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67761313 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 67761314 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 67761393 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 67761466 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 67761478 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 67761546 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 67761574 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 67761634 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 67761744 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 67761759 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 67761920 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 67762162 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 67762232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67762261 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 67762409 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 67762422 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 67762481 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 67762575 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 67762748 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 67762779 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 67762838 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67762978 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 67762996 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 67763038 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 67763093 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 67763441 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 67763543 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 67763564 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67763674 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 67763691 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 67763875 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 67763894 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 67763960 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67764028 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67764260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67764294 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 67764324 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67764393 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 67764451 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67764563 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 67764764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67764804 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67764854 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67764879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67764964 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67764972 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67765045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67765476 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67765902 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 67766728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67766895 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67766918 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67766978 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67767010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67767055 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 67767118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67767161 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67767224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67767263 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67767345 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 67767346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67767514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67767665 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67767679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67767762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67767774 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67767885 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67768005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67768203 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67768204 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67768222 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67768264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67768366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67768388 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67768408 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67768461 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67768475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67768637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67768739 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67768798 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 67768888 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 67768952 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 67769014 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 67769135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67769337 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67769435 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 67769574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67769641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67769765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67769793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67769891 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67769917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67770109 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 67770118 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 67770524 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 67771154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67771200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67771207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67771475 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67771512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67771555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67771860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67772714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67772725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67772728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67772745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67773519 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67773635 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 67774039 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 67774159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67774286 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67774311 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 67774353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67774357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67774448 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67774474 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67774609 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67774786 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67774815 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67774859 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 67775013 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67775278 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 67775473 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67775742 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 67775783 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 67775945 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 67775949 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67775991 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67776005 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 67776023 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 67776130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67776147 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67776209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67776322 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 67776375 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 67776402 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 67776423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67776432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67776585 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 67776598 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 2 67776699 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 67776708 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 67776773 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 67776915 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 67777024 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67784267 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67784294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67784362 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67784485 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67784556 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67784569 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67784615 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67784671 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67784761 C T Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 67784810 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 67784867 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67784963 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67785002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67785023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67785039 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67785080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67785121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67785168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67785224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67785335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67785370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67785386 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67785427 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67785428 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67785471 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67785501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67785535 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67785599 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 67785864 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 67786100 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67786668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67786727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67786819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67786965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67787083 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67787195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67787331 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67787366 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67787536 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67787622 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67787708 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67787745 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67787858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67788189 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 67788489 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 67788548 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 67788736 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 67788817 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67788850 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 67788982 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 67788986 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 67789083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67789105 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 67789126 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 67789288 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 67789325 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 67789520 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 67789667 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 67789784 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 67789810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67789836 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67789903 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 67789921 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 67790390 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67790412 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 67790570 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67790654 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 67791015 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67791024 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67791108 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67791128 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67791133 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67791227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67791371 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 67791383 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67791418 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 67791419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67791450 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67791476 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67791494 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67791520 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67791531 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67791563 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67791664 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67791693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67791738 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67791800 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67791811 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67791854 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 67791901 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 67791917 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 67792002 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67792038 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67792198 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67792417 T A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 67792436 C T Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 67792585 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67792693 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67792726 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67792766 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67792911 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67793113 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 67793193 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67793257 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 67793279 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 67793301 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67793400 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67793429 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67793440 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67793490 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67793513 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 67793519 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 67793588 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 67793606 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67793634 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 67793873 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67794085 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67794123 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67794139 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 67794191 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67794198 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 67794282 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 67794366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67794383 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67794607 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 67794782 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 67795071 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 67795125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67795645 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 67796202 G C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 67796302 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 67796695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67797149 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67797221 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 67797685 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67797704 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67798349 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67798590 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 67798805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67799083 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67800103 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 67800161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67800234 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67800291 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67800448 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67800496 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67800656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67803908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67805858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67808604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67808772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67809182 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 67810116 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67812400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67813853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67815124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67817558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67817583 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67818269 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67818588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67819613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67820408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67821142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67821561 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 67821901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67823541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67823597 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67823647 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67823756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67824063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67824484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67824511 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 67825097 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 67825740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67826844 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67827027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67827175 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 67827286 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 67827352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67827410 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 67827434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67828700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67830140 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 67832350 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67833243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67834315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67835018 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 67835211 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 67835523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67835533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67836655 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 67837755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67838779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67839238 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 67843190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67843448 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67845310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67845930 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67845944 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 67846151 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 67846268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67846321 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67846324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67846608 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67846656 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 67846686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67846725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67846764 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 67846927 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 67846948 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 67847040 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 67847064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67847107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67847125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67847369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67847552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67847660 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 67847810 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 67848365 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 67848400 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67848943 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67848999 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67849655 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 67850084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67850531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67850952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67851000 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 67851228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67851234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67852117 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 67852264 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 67853616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67853703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67853741 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 67853960 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67854605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67854723 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 67855044 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 67856019 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 67856031 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 67856045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67856294 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 67856376 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67856400 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67856405 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67856506 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 67856948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67857129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67859624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67860380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67861463 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 67861958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67861981 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 67862156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67862167 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67862235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67863038 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 67863164 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 67865888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67867107 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67868613 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67870377 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 67870871 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67870998 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67871559 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67871737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67871861 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 67871980 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 67871983 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 67872068 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 67872081 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 67872157 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 67873954 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67875121 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 67875281 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67875304 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67875578 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 67876078 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67876143 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67876510 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67876523 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67876614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67876633 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67876834 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 67877083 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 67878106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67878168 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67878564 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 67879440 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67879893 A C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 67879897 A C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 67880008 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67880012 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67880024 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 67880034 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67880206 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67880272 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67880282 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67880283 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67880296 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67880308 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67880333 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67880422 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67881019 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 67881133 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 67881142 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67881237 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 67881265 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 67881528 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 67881670 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 67881860 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 67881943 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 67882009 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67882028 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 67882125 A T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 67882161 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 67882193 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67882441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67883075 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 67883285 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67883372 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67883385 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 67883492 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 67883660 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67883670 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67883767 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 67883801 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67884194 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 67884645 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67885497 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 67885508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67885619 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 67886327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67886853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67887660 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67887667 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 67887788 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67888006 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 67888098 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67888183 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 67888321 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67888382 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 67889320 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67889411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67889492 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67889507 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67890621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67890659 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67890827 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 67890841 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67890926 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67891628 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67891642 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67891708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67891771 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67891812 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 67891838 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 67891839 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 67891961 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67892106 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67892228 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 67892238 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 67892478 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 67892513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67892580 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67892943 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 67893229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67893331 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67893383 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 67893448 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 67893583 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 67893680 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67894158 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 67894329 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67894338 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67894378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67894555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67894665 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 67894886 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 67895001 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 67895035 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67895092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67895238 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 67895260 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 67895262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67895356 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 67895390 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 67895577 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 67895623 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 67895695 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 67895711 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 67895796 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 67895861 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67896182 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67896334 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67896431 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 67896459 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 67896568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67896572 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67896851 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 67896859 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 67896885 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67896911 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 67897279 G A Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 67897626 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 67897999 C G N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 67898193 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 67898199 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 67898384 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 67899048 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 67899556 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 67899719 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67899772 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67900072 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 67900189 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 67900650 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 67900654 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 67900689 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 67900699 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 67900819 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 67900992 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67901306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67901362 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 67901489 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 67901551 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 67901552 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 67902290 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 67902478 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 67902691 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67902727 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 67902739 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 67902772 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 67902781 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67902837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67902857 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67903082 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67903167 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67903230 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 67903347 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 67903359 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67903368 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67903388 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67903424 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67903425 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 67903461 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67903524 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 67903544 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67903548 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67903846 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67903908 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 67904116 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 67904267 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 67904301 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 67904334 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67904345 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 67904583 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67904750 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 67904873 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67905257 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67905560 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 67905845 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67905881 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67906235 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67906248 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 67906282 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 67906910 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 67908561 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67909550 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 67911041 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 67911051 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 67911254 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 67911411 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 67911574 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 67911589 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 67911743 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67911770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67912169 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67912277 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67912353 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 67913522 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67913549 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 67913726 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67913872 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 67914056 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67914238 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 67914577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67914901 T C Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 67914975 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67915362 A C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 67915888 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 67916345 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 67916438 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 67917171 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 67917394 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67917489 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67917845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67918904 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 67919171 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67919212 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 67920165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67920205 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 67920482 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67920586 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67920700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67920972 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67923384 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 67923386 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 67923450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67923453 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67923490 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 67923515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67923998 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 67924304 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 67924357 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 67924361 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67924379 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 67924394 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 67924540 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 67924550 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 67924748 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 67924808 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 67924966 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 67925101 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67925280 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 67925456 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 67925463 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 67925473 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67925550 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 67925638 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67925833 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67925942 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 67926008 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 67926078 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67926132 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 67926141 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 67926220 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67926253 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 67926269 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67926359 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67926367 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 67926449 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 67926470 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67926490 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67926524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67926660 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67926751 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 67926944 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 67927276 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67927299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67927324 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 67927414 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 67927427 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67927490 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67927514 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67927645 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67927670 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67927701 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 67927716 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 67927761 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67927814 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67928054 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 67928479 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 67928609 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 67928665 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 67928818 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 67928859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67928937 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 67928982 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67929048 T G Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 67929061 A C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 67929141 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67929174 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 67929212 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 67929247 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 67929393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67929479 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 67929611 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 67930169 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67930644 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 67930973 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 67931182 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 67931222 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 67931272 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 67931280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67931339 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 67931562 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 67931703 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 67931773 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 67932007 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 67932027 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 67932039 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 67932122 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 67932173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67932190 C G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 67932544 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 67932635 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 67933134 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 67933219 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 67933220 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67933727 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 67933783 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 67933788 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 67933812 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 67933903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67933944 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 67934228 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 67934310 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 67934714 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 67934722 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 67934733 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 67934736 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67934764 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 67934779 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 67934887 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 67935076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67935477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67935607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67935726 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 67936458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67936644 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 67936752 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 67936937 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67936994 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 67937250 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67937268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67937491 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 67937573 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 67937609 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67937650 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 67938070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67938175 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 67938292 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67938426 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 67938471 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67938491 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 67938737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67938778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67938915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67938946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67939029 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 67939284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67939386 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 67939425 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 67939429 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 67939489 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 67939588 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67939678 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 67939744 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 67939773 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 67939799 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 67939801 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 67939841 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 67939844 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 67939852 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 67939899 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 67939953 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 67939956 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 67939990 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 67940013 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 67940082 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 67940083 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 67940114 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67940122 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 67940144 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 67940189 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 67940390 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 67940703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67941136 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67941172 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 67942108 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67942123 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67942183 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67942701 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67942890 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67943121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67943314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67943577 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 67945963 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67946081 A T Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 67946165 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 67946174 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 67946182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67946233 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 67946274 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 67946332 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 67946511 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 67946540 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 67946575 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67946582 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 67946634 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 67946653 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 67946689 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67946717 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 67946915 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 67946931 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 67947005 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67947025 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 67947600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67947640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67947999 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 67948195 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67948249 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67948348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67949667 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67950141 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67950334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67951660 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67952285 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67953952 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67954195 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67954523 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 67954648 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67955335 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67957727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67958523 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67958526 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 67958935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67959030 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 67959074 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67960392 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67960735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67961392 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67961451 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67961624 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67961651 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67961653 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67962694 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 67963106 G T Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 67963154 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 67963160 A T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67963191 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67963334 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67963360 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 67963770 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67963862 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67963994 C G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 67964320 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 67964388 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 67964393 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 67964410 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 67964477 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 67964545 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 67964574 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67964591 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 67964605 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 67965105 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 67965141 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 67965144 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67965179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67965195 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67965237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67965261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67965288 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 67965344 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67965379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67965416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67965521 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67965564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67965610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67965623 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 67965719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67965748 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67965749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67965777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67965891 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 67966067 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67966114 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67966156 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67966160 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67966269 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 67966285 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67966288 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67966304 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67966311 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67966410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67966607 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 67966665 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 67966732 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 67966866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67967046 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67967334 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67967371 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67967731 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67976638 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67976688 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67976690 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67976995 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 67977129 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 67977159 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67977160 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67977269 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 67977350 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 67977414 C G N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 2 67977459 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 67977463 C A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 67977496 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 67977519 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67977574 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 67977580 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 67977839 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67977909 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67978049 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67978070 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67978144 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 67978368 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67978423 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67978435 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67978489 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 67978536 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67978570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67978600 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 67978769 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67978956 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67979113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67979178 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67979497 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67979608 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 67979701 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 67979918 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67979941 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 67980117 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67980127 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67980129 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67980145 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 67980385 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 67980389 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 67980429 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67980514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67980561 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67980603 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 67981135 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 67981339 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 67981493 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67981495 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67981539 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 67981867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67981963 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67982196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67982324 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67983143 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 67983159 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67983280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67984097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67984119 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67984142 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 67984187 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67984250 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 67984252 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67984343 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 67984369 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 67985031 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67985331 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67985366 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67985699 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67986014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67986294 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 67986560 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 67986692 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 67987522 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 67988458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67988702 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 67988766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67988967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67989152 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 67989167 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 67989168 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 67989272 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 67989309 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 67989314 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 67989494 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 67989545 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67989719 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67989792 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 67989832 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 67989898 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 67989965 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 67989994 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67990001 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67990045 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 67990133 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 67990262 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 67990389 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 67990408 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 67990472 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 67990503 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 67990563 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 67990609 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 67990625 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 67990636 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 67990670 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 67990691 T G N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 67990696 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 67993248 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 67993259 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 67993413 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 67994006 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 67994369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67994447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67994465 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67994884 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 67994981 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 67995096 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 67995351 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 67995476 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 67995531 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 67995617 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67995646 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 67996006 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 67996233 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 67996476 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 67996575 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 67996715 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 67996771 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67997369 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67997376 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 67997402 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67997413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67997468 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67997535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67997752 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67997809 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67997896 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67998364 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 67998373 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67998748 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 67998914 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67998952 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 67999033 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 67999113 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 67999714 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 67999718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 67999864 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68002086 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68003012 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68003094 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 68003342 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68003574 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 68003840 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68003846 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 68004022 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68004148 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68004274 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68004672 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 68004722 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 68005042 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 68005160 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 68005225 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 68005362 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 68005509 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68005605 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68005635 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 68005746 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 68005783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68005819 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 68005840 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 68005856 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 68005880 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68005975 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 68006155 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68006305 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 68006350 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 68006400 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68006455 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68006509 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68006545 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68006569 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68006791 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68006930 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68006983 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68007121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68007325 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68007746 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 68008052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68008589 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68008808 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68008845 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 68009232 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 68009288 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 68010088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68010238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68010242 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 68010371 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 68010676 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 68010883 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 68011125 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 68011500 C G Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 68012705 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 68012804 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 68012881 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 68013377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68013897 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 68013922 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68014205 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 68014372 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68014485 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68014589 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68014612 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68014664 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 68014712 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 68014813 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 68014961 G A N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 68015392 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 68015394 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 68015666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68023413 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 68023592 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68025495 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68026371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68026580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68028436 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 68029067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68029384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68029942 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68030248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68030581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68031938 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68033299 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68033525 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68037777 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68038392 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68038486 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68039184 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68042660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68045101 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 68046047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68047225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68047611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68047850 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68049941 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68050358 A C Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 68050533 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 68050598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68050619 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 68050678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68051104 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68051251 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 68051334 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 68052102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68053797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68053892 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 68054624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68054652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68054835 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 68054839 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68054892 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 68054934 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 68055183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68055395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68057243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68057283 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 68057576 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 68057807 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 68058075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68058296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68058511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68058609 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68058764 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68058832 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 68058875 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68059205 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 68059272 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68059670 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 68059682 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 68059770 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 68059772 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 68059859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68059896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68060012 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68060298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68060344 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 68060392 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 68060469 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 68060549 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 68060564 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 68060599 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 68060663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68060884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68060950 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 68061482 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 68061498 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68061783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68061833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68062050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68062625 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 68062649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68062650 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 68062791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68062822 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68062909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68063030 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 68063318 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68063343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68063611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68064225 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68064263 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68064304 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 68065446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68068440 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68068471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68068594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68071232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68071950 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68074662 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68074768 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68075554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68075737 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68075897 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68076040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68076100 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68076375 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68076431 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 68076600 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68076672 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 68076709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68076825 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 68076905 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68076914 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 68076952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68077062 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68077069 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68077098 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 68077109 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68077143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68077256 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68077259 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68077311 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68077458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68077525 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68077539 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 68077541 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 68077552 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 68077584 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 68077854 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 68078098 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68078674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68080156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68080190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68080481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68082214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68082446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68083126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68083729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68084089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68084561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68085878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68086000 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 68086008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68086166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68086448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68086620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68087795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68088711 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68089090 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 68089297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68090778 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 68091255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68092171 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 68092868 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 68093108 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 68093502 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68093704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68093713 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68093950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68094368 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 68094792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68095239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68095349 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 68096918 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68097010 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68097901 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 68097924 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 68098008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68098029 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 68098243 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 68099273 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 68100083 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68100159 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 68102738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68104186 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68104530 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 68104754 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 68105071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68106085 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 68110282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68110910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68112682 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68113049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68113103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68113253 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 68114122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68114551 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 68114619 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 68115781 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68116288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68117153 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 68117864 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 68118038 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 68118057 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 68118071 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68118254 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 68118520 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68118828 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 68119134 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68119140 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 68119252 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68119286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68120200 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 68120230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68120383 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 68122093 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68122165 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68124350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68125155 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68125796 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 68126317 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 68126343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68126390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68126522 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 68126618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68126691 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 68126924 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 68126967 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 68127247 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 68127268 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 68127400 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 68127421 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 68127498 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 68127526 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68127969 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68128110 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 68128202 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 68128272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68128328 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 68128443 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 68128467 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 68128725 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 68129251 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 68129297 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 68129398 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 68129452 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68130108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68130223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68130352 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 68130395 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68130505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68130624 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 68130669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68130705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68130726 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 68130973 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 68131058 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 68131394 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 68131420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68131716 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68131729 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 68131736 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 68131762 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 68131769 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 68131786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68132101 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68132109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68132113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68132123 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68132158 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68132548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68132612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68132902 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68133025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68133044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68133278 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 68133288 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68133350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68133368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68133407 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68133472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68133542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68133954 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 68133994 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 68134040 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 68134131 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 68134218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68134296 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 68134349 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 68134374 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 68134431 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68134595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68134610 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 68134948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68135225 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68135287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68135296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68135301 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68135463 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68135467 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68135573 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68135589 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68135821 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68135868 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68135884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68135891 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68135916 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68135993 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 68136040 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68136122 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68136357 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 68136405 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 68136437 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 68136553 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68136811 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68137709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68138342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68138543 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 68139029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68139242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68139497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68139498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68139660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68140171 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68140639 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 68140716 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68140823 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68140936 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68141043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68141270 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 68141274 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 68141465 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 68141688 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 68141704 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 68142092 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 68142102 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68142144 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 68142157 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68142180 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 68142317 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 68142640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68142723 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 68143234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68143260 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 68143262 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 68143406 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 68143418 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 68143516 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68143775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68143819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68144430 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 68144529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68145391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68145830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68145967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68146103 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 68146154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68146208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68146229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68146261 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 68146366 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 68146553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68146692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68146707 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68146782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68146837 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 68146865 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68146924 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68147100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68147148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68147274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68147488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68147812 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 68147981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68148075 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68148476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68149137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68151238 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68151298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68151475 G C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 68151480 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 68151579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68152134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68152206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68152284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68152817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68153009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68153054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68153700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68153966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68154284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68155042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68155505 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68156224 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 68156596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68157071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68157121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68157172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68157237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68157482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68157527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68158071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68158153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68159208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68159257 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68159319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68159483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68159491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68159656 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 68160131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68160193 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68160212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68160550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68160581 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68160730 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 68160833 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 68161125 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 68161237 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 68161300 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 68161461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68161650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68161679 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 68161701 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68161745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68162054 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68162106 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68162876 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68164538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68164667 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 68164709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68167341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68167504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68168012 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68168217 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68168450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68169141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68169305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68169361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68170090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68170451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68170686 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68170753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68171097 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68171171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68171606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68172063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68172967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68174296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68174329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68174528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68174581 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 68174846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68175238 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 68175526 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 68175534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68175915 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 68176105 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68176655 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 68176670 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68176727 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68176728 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68176776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68176817 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68176883 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 68176915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68176938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68177015 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 68177047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68177105 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68177197 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68177387 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 68177684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68177764 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 68177789 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 68177841 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68177881 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68177959 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68178192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68178239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68178274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68178519 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 68178589 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68178636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68178691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68178857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68178896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68178904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68178923 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 68178955 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68179021 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 68179082 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 68179083 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 68179193 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68179287 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68179509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68179592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68179605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68179614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68179632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68179711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68179761 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 68179787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68179841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68179921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68180129 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68180357 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 68180363 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 68180422 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 68180450 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68180489 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 68180511 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 68180961 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 68181030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68181121 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 68181230 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 68181238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68181279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68181304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68181333 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 68181572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68182168 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68182216 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68182280 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68182385 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 68182404 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 68182406 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 68182497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68182505 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 68182747 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 68182752 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 68182789 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 68182791 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 68183072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68183333 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 68183573 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 68183630 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 68183658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68184324 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 68184343 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 68184345 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 68184356 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 68184375 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 68184639 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 68184727 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 68184735 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68184947 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68185076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68185087 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 68185267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68185268 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 68185395 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 68185462 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68185521 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 68185563 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68185681 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68185779 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 68186002 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68186264 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 68186292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68186508 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68186539 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 68186590 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68186764 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68188384 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 68189885 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 68191139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68191412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68193859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68193875 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 68194661 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68194859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68195059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68195638 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 68195651 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68197905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68199193 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68199230 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68199419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68199692 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68200614 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 68200934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68201091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68201798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68203687 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 68204099 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 68204118 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68204120 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68205740 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68207793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68207817 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 68208168 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68208421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68210674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68211210 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 68211267 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 68211395 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 68211797 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68212013 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 68212037 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68212368 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 68212703 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68212859 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 68212860 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 68213096 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 68213439 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68213936 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 68214013 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 68214141 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68214199 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68214578 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68214607 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68214812 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68214824 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 68214916 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68214917 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68215067 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68215145 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68215150 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68215221 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68215256 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68215548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68216104 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68216134 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68216159 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68216206 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68216252 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68217405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68217413 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68217474 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68217488 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68218075 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68219075 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68219098 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 68219122 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 68219965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68220120 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68220150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68220211 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 68220364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68220365 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 68220561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68220564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68221064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68221272 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 68221347 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68221481 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 68221508 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68221653 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 68221667 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 68221723 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68221758 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 68221839 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68222016 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68222054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68222104 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 68222120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68222126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68222277 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 68222547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68222559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68222702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68222724 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68222737 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68222917 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68223128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68223291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68223316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68223344 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 68223731 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68223773 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 68223799 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 68223812 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 68223850 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 68224520 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 68224872 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68224884 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68225147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68225249 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 68225250 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 68225279 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 68225314 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 68225655 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68225711 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 68225752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68225894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68226091 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68226249 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 68226257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68226291 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 68226387 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 68226447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68226476 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68226508 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68226544 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 68226561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68226571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68226610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68226614 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 68226677 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 68226678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68226971 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68226985 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68227023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68227097 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 68227252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68227320 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 68227366 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68227386 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 68227398 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68227504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68227725 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68227770 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 68227851 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 68227948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68227968 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 68228210 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68228245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68228324 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 68228368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68228496 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 68228513 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68228542 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68228832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68228914 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68228950 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68229208 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 68229689 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68229735 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68229748 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 68229911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68229923 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 68229975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68230018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68230146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68230340 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68230564 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68230666 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 68231157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68231322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68231382 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 68231521 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68231958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68232296 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68232362 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68232387 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 68232397 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 68232416 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68233029 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68233073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68233075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68233220 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68233256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68233432 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 68233493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68233505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68233563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68233662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68233793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68234525 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68234604 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68234737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68235519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68235521 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68236157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68236803 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68236805 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68236828 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 68237476 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68237525 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68237793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68237820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68237860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68237910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68239572 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68239645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68239687 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 68239861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68239908 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 68239989 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68240052 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68240201 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68241519 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68241522 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68241585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68241622 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68241673 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68241677 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68241691 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68241711 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68241912 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 68242094 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68242147 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 68242186 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 68242215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68242229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68242775 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 68243003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68243079 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 68243478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68243515 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68244061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68244537 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68244599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68244601 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68244613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68244901 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 68246385 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 68246533 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 68246896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68247044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68247891 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 68247981 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 68248043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68248060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68248274 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 68248332 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 68248516 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 68249181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68249766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68249865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68250022 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68250436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68250716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68250759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68251234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68251661 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68251729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68252930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68254876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68254989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68255196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68255216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68255559 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 68255706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68258083 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68259940 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68259945 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68261308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68261889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68262546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68262955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68263675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68263779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68263788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68263911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68263951 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 68264377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68264425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68265047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68265568 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68266178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68267090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68267190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68267729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68269126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68269265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68269748 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68270048 A G Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 68270939 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68270981 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68271670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68275400 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 68275827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68275846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68275866 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 68276329 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 68276775 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 68276847 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68276985 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 68277135 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 68277243 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68277600 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 68277708 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 68278162 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 68278361 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68278755 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 68278756 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 68278819 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 68278898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68279255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68279596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68280753 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68280955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68281020 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68281242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68281306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68281317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68281448 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68281719 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68281810 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68281924 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 68281928 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 68282061 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 68282273 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68282294 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 68282394 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68282481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68282666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68282868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68282872 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 68282949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68283104 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 68283198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68283214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68283217 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68283343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68283457 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68283477 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 68283625 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 68283669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68283707 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68283897 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 68284014 C T Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 2 68284080 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 68284449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68284545 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 68284946 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 68284981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68284986 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 68285014 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 68285501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68285557 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 68285559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68285703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68285790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68285824 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 68285987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68286049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68286125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68286158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68286207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68286220 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68286222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68287126 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 68287186 G A Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 2 68287206 A G N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 68287216 A G Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 68287322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68287487 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 68287644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68288262 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 68288362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68288716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68288825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68288906 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68289173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68289369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68289668 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68289830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68294155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68294273 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68294357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68294861 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 68294872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68296155 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68296437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68296833 A T Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 68297030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68297042 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 68297266 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 68297869 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 68298112 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 68298222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68298638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68299554 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68299661 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68299926 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 68300339 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68300350 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 68300444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68301051 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 68301162 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 68301237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68301323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68301453 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 68301502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68301604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68301619 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68301620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68301864 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68301890 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68301901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68302868 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68302876 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68303379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68304962 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68305060 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68305784 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68305909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68306460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68307198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68310593 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68310780 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68311436 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68311478 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68311783 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68312165 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68312876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68313489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68315341 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68315562 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68316608 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68317479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68317935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68318800 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68319385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68319517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68320854 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68320859 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68320903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68321903 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68322117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68322161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68322202 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68322244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68322253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68322306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68322319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68322336 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68322383 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68322387 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68322540 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68322567 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68322574 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68322585 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68322602 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68322631 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68322747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68322759 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68323180 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68325844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68325870 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68326092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68326116 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68326362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68326505 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68326506 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68326666 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68326852 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68326881 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68326959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68327047 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68327116 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68328252 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68328691 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68328801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68329271 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 68333852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68335609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68336649 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68337095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68337764 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68338681 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 68338703 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 68338772 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68339059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68339119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68340213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68340411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68340509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68340861 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68341451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68341807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68341862 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68341946 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68342210 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68344578 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68344631 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68345189 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 68345198 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 68345875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68346333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68346365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68346757 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68346946 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68346949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68346974 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68346989 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68347101 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68347986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68348376 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68348399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68348981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68349146 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68349573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68350386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68350884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68350972 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68351307 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68351410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68351649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68352887 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 68353486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68353700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68354254 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68354268 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68354274 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 68357304 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68357432 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68357456 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68357495 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68357558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68357580 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68357626 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68357756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68357765 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68357785 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68357885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68357892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68357903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68357968 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68357982 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68357987 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68358007 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68358038 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68358060 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68358383 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68358455 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68358460 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68358497 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68359908 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 68359954 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 68360052 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 68360205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68360287 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68360311 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68360786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68360889 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68360911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68360967 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68361226 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68361297 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68361335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68361370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68361466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68361468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68361501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68361538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68361539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68361561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68361591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68361615 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68361623 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 68361761 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68361859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68361909 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68361924 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68361934 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68361942 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68362130 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68362204 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68362220 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68362328 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68362387 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68362418 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68362427 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68362445 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68362451 T G Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 68362660 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68362798 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68362831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68362914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68362921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68362933 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68363121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68363391 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68363396 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 68363428 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68363885 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68363928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68364157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68364182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68364358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68364442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68364475 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68364685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68365532 G C Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 68365587 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 68365640 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68365659 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68365763 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68365765 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68365792 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68365875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68365891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68365918 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68365957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68365967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68366082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68366107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68366428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68366589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68367458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68368921 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68369086 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68369100 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68369111 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68369174 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68369588 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68369792 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68369923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68370028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68370326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68370386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68370458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68370645 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68370654 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68370796 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68372571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68373284 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68374071 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68374475 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68375127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68375354 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68375746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68376922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68378723 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68378823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68379592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68380109 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68392604 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68392770 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 68392779 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 68393077 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 68395651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68396646 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68398323 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68398622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68399815 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68399817 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68400032 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68402811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68403837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68403880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68407792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68408662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68408901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68409281 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 68411378 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68413214 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68413272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68414898 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68418214 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68419041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68419082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68419197 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68419992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68420002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68426563 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68426906 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68426908 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68427166 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68429044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68430312 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68430833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68432344 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 68432406 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68432807 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68433414 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68433702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68433737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68435182 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 68436491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68436558 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 68436570 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 68436780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68437296 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 68437410 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68438660 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68438759 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 68439316 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 68440319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68440383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68442152 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 68442841 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68442880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68442884 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68443413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68443834 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68444005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68444398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68445488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68446631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68447608 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68448854 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68451077 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68451557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68451827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68452041 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68452929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68453043 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68453745 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 68453801 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68454142 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 68454268 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 68454274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68454673 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68454930 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 68456277 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 68457402 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 68458419 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 68459721 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68460079 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68460170 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 68460259 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68460382 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68460393 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68460420 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 68460724 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 68461630 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68461899 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 68462188 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 68462246 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68462410 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68462502 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68462569 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68462843 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 68462969 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68463000 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68463123 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68463373 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 68464118 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 68464365 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68464461 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68465011 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68465023 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68465301 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68465317 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68465485 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68465716 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 68465734 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68466178 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 68466391 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 68466546 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68466906 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 68467083 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 68467297 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68467677 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 68467885 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68468198 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68468247 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68468516 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 68468562 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 68468613 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 68468633 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68469079 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 68469346 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68469762 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68470053 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 68470577 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68470878 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 68471161 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68471310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68471496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68472155 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68472581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68472620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68472896 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 68472959 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 68473006 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 68473309 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 68473317 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68473615 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 68473714 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68473978 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 68474090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68475002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68475079 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68475222 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68475320 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68475355 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 68476171 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 68476604 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 68476892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68477005 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 68477141 A C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 68477477 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 68477765 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68477780 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68478951 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68479033 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68479789 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68481038 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 68481211 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68481433 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68481699 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68482018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68484049 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68487167 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68488870 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68488879 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68488919 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 68489343 A T Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 68490598 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68490637 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68491907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68492109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68492614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68494673 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 68495667 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68497468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68497625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68499378 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68499835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68501311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68502451 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68503247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68503397 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68503709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68503954 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68503987 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68504262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68505891 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68506107 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 68506187 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68506289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68506618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68506978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68507123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68507434 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68507644 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68507716 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68507726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68507938 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68508290 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 68508394 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 68508852 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 68509455 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68509475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68509727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68509798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68509842 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68510510 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68510655 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68510729 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68510775 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 68510779 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68510789 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68510874 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68511189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68511237 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68511298 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 68511301 G T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 68511396 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 68511463 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68511567 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68511719 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68511794 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68511827 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 68511884 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 68511891 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 68512330 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68512628 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68512948 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 68516588 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 68516630 A T Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 68519013 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 68519110 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 68519287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68519430 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68519561 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68519697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68519868 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68519890 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68520187 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68520238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68520330 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68520379 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68520414 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 68520447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68520470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68520708 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68520942 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68521062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68521141 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68521278 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 68521303 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68521345 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68521777 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68522071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68522183 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68522591 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 68522901 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68523218 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68523249 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68523544 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68523793 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68524513 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 68525474 A T Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 2 68525475 C T Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 2 68525556 G A Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 68525594 C T Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 68525879 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 68526104 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68526160 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68526170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68526649 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 68527347 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 68527404 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 68527608 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68527691 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 68529695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68530859 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68531453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68531458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68532241 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68532858 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68532859 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68532873 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68533003 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68533015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68533020 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 68533112 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68533136 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68533324 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68533511 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68533522 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68533549 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 68533620 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 68533838 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 68533839 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 68533875 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68533922 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68534009 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68534211 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68534253 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68534270 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 68534358 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68534615 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68535413 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68535975 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68535995 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68536117 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68536284 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 68542773 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68542933 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68543135 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68543873 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68544479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68544573 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68546741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68548593 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68549676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68549710 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68551075 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68551224 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68551274 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68553012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68553057 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68555686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68556609 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68559898 A T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 68561091 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68563671 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68563870 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68564119 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 68564135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68564821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68564836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68566559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68566965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68568171 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 68568240 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68568278 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 68568404 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 68568442 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 68568589 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68568623 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68568731 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68568802 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68568813 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68568852 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68568880 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 2 68568935 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68569092 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68569354 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 68569466 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 68569467 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 68569511 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 68569559 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 68569588 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 68569598 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 68569602 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68569626 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 68569682 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 68569697 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 68569713 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 68569806 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68569822 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 68569823 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68569929 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 68570015 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 68570036 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68570041 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68570182 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68570717 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 68570754 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 68570857 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68571067 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68571233 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68571606 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 68571629 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68572187 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 68572717 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 68573039 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 68573213 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68573227 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 68573470 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 68573488 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68573639 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68574071 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68574342 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 68574492 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 68574838 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 68575351 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 68575785 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68576072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68576180 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68576363 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 68576793 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 68576826 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 68576853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68577495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68578097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68578633 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 68578669 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68578705 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68578765 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68578949 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68579108 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68579539 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68580115 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68581805 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68581890 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68581966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68582351 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68582597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68582994 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68583374 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68583725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68583979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68584458 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 68585783 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 68585837 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68586886 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68586918 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68586936 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68586971 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 68587008 C A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68587160 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68587661 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68587770 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68587794 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68587850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68588053 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68588158 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68588343 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 68588857 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 68588888 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 68589479 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68589625 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 68589653 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68589753 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68589794 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68590074 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68590208 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68590383 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 68590507 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68590918 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68591126 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68591130 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68591248 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68591482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68591830 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68592568 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68592691 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68592728 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68593235 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68593551 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68594097 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68594107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68594336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68594629 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68594777 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 68594906 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68594963 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68595087 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68595116 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68595140 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68595412 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68595466 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68595578 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68595595 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68595750 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68595855 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68595986 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68596029 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 68596312 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68596392 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68596409 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68596560 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68596637 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68596674 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68596772 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68596938 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68596948 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68596976 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68597190 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68597377 G C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 68597408 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 68598042 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68598130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68598152 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 68598179 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68598213 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68598610 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68598744 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68599024 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 68599136 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 68599155 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68599238 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 68599303 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68599319 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68599321 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68599377 A T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 68599599 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68599888 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 68600027 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68600097 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68600131 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68600148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68600327 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68600410 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68600455 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68600469 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68600552 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68600559 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68600642 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68600791 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68601057 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68601079 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68601151 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68601159 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68601402 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68601419 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68601621 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 68601640 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68601654 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68601663 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 68601668 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68601684 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68601762 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68601795 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68601833 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68601865 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68601952 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68602001 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68602016 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68602032 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68602078 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68602204 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68602295 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68602348 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68602375 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68602416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68602437 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68602501 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68602503 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68602513 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68602613 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68602705 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 68602854 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68603083 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68603138 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68603265 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68603287 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68603439 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68603514 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68603648 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68603683 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68603747 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68603773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68603799 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68603828 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68603854 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68603908 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68603992 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68604118 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68604119 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68604130 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 68604349 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68604396 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68604535 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68604538 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68604588 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68604788 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 68604817 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 68604877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68604937 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68604990 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68605036 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68605139 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68605428 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68605639 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 68605881 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68605889 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68606267 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 68606419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68607590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68607942 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68607974 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 68615514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68616548 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68617151 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68617640 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68619736 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68619829 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68619953 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68620099 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68620179 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68620185 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 68620520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68620797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68620932 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68620971 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 68621115 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68621126 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68621144 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68621196 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68621397 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68621580 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68621589 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68621690 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68621846 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 68621960 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68622001 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68622051 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68622213 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68622250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68622251 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68622471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68622860 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 68623928 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68623952 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68623963 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68625547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68626044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68626162 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68626343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68626895 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68628571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68628686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68629877 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68630385 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68630530 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68631056 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68632774 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68633317 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68636092 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 68637082 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68637389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68638213 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68639405 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68639744 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68640695 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68642094 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68642823 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68642888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68642987 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 68643103 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 68643175 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68646078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68649176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68652600 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68653153 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68657630 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68657776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68658888 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 68659392 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68659640 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68659928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68660011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68661160 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 68661242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68661299 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68661479 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68661909 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68661939 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68662083 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68662157 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68662195 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68662385 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68662571 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68662626 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68662698 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68662770 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68662788 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68662936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68663163 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68663363 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68663782 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68663783 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68663886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68663909 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68663933 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68664232 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68664721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68664888 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 68665080 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 2 68665357 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68665462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68665591 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 68665676 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 68665822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68665913 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68666145 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 2 68666167 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68666250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68666964 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 68667009 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68667178 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68667354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68667365 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 68667517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68667651 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 68667764 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 68667775 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 68667809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68668417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68668606 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68668758 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 68668845 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68668872 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68668906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68668975 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 68669007 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 68669029 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 68669039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68669042 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 68669070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68669265 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 68669375 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 68669586 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 68669662 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68670301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68670809 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68671163 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68671292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68671404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68671418 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68671647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68671776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68671785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68671943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68672014 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68672653 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68675283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68675584 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68675706 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68675730 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 68676216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68676374 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68676406 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68676711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68676715 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68676726 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68676755 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68676939 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68677221 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68677272 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68677565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68677736 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68677763 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68677829 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68677837 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68677881 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 68677914 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68678070 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68678223 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68678310 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68678372 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68678497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68678712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68678963 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 68679010 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68679118 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68679180 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68679236 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68679400 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68679404 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68679418 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68679574 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68679636 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68679681 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68679721 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68679879 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68679884 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68679931 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68679976 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68680035 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68680101 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 68680111 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68680165 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 68680169 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 68680178 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68680266 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68680289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68680394 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68680537 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68680625 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 68680769 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68680802 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68680811 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68680830 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68680958 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68680959 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68681006 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68681217 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 68681280 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68681315 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68681373 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68681453 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 68681454 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68681466 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 68681553 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68681554 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68681566 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 68681576 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68681577 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68681594 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 68681648 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 68681756 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68681996 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68682128 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68682190 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68682434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68682546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68683105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68683462 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68683511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68683777 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68684200 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68686301 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68686738 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68686935 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68687082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68687852 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68688134 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68691493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68694129 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 68696097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68696563 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68697829 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68697852 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68697957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68700615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68704095 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 68704159 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 68705413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68705467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68705474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68705589 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 68706197 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68706663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68706844 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68707458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68707702 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 68708280 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 68708283 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68708503 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 68708504 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 68709568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68709738 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68709899 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 68710075 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68710204 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68711635 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68711650 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 68712792 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 68718251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68719334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68720291 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68720338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68720804 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68721031 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 68721650 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68722281 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68722594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68722618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68723218 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68723979 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68725460 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68727674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68728557 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68728606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68729479 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 68729892 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68730201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68731377 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68731629 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68731757 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 68732403 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68732946 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68732954 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 68733198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68733283 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68733321 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68733431 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 68733508 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68733511 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 68733847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68733863 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68733870 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68733879 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68734039 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 68734097 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 68734130 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 68734151 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68734235 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68734773 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68734862 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68734931 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68735084 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 68735409 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 68735429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68735472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68735522 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68735831 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68735863 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68736068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68736432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68736441 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68736463 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68737394 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 68737582 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68737688 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68737697 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68737750 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 68738079 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 68738187 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68738462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68738670 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68739391 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68740643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68741694 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68741747 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68741983 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68743951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68744710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68745814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68746316 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 68746336 G T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 68746357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68746429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68746456 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68746509 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68746642 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68746686 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68746724 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68746755 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68746887 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68747050 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 68747105 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 68747167 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 68747239 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 68747503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68748053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68748091 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 68748436 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68748580 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68748709 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68748747 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68748831 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 68749222 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 68749351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68749661 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68751303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68751322 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68753060 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 68753185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68753919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68753944 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 68754376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68762880 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 68762907 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68765133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68765210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68765375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68767502 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68768596 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68768603 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 68768687 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 68768715 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 68768893 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 68769127 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68769194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68769239 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 68769360 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 68769479 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68769551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68769576 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68769584 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 2 68769653 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 68770044 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 68770091 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 68770132 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 68770250 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 68770267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68770820 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68771166 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68771770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68773372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68776377 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68777171 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68777303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68777332 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68777363 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68777737 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68778063 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68778085 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 68778097 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68778436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68778556 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68778702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68778946 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68779923 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68780828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68781689 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 68782762 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 68784192 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68784217 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68784237 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 68784293 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68784294 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68784737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68785442 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68785476 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 68786925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68787852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68787864 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68787986 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68788029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68788054 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68788175 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 68788291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68788571 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68788598 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68788631 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 68788662 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68788906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68789178 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68789458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68789515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68789602 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68789748 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 68790207 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 68790383 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68790647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68790660 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 68791092 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68791197 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 68791257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68791267 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 68791470 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68791486 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68791560 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68791575 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68791584 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68791625 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 68791643 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68791658 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 68791670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68791974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68792181 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68792366 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68792486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68792809 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68792925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68792951 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68794699 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 68794784 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 68795053 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 68795160 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 68795173 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 68795225 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 68795269 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 68795271 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 68795288 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 68795300 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 68795976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68796088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68796298 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68796820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68797205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68797790 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68797961 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 68798321 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 68798705 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68798756 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 68798806 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68798864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68799264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68799602 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68799611 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 68799688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68799871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68799895 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68800302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68800313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68800693 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 68800727 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 68801186 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 68801701 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 68802061 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68803523 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 68803541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68803710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68804813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68805128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68807479 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68807910 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 68808132 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 68808146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68808209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68808226 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68810527 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 68811007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68811046 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 68811061 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68811081 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68811162 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 68811396 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 68811813 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 68811829 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 68811953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68812189 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68812658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68812743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68812928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68813171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68813211 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 68813308 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 68813324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68813894 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 68814426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68814583 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 68814659 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 68814805 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 68815646 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68815980 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68816023 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 68816272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68816310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68816640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68818224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68818258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68818945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68818948 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 68818970 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68819001 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 68819004 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 68819309 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 68819355 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 68819356 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 68820679 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 68821707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68821711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68822025 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68822139 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 68822549 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 68822809 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 68822906 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 68822909 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 68823039 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68823153 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68823215 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68823309 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 68823363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68823634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68823669 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68823734 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 68824051 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68824230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68824842 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68824844 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68824992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68825111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68825114 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 68825430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68826249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68826256 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68826279 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68826731 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68827103 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68827233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68827237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68827420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68828297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68828403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68828598 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 68828613 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 68828824 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 68828829 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 68828950 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 68829000 A T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 68830493 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 68831334 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68831446 A C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 68831464 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 68831501 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 68831723 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 68831824 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 68831912 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 68831970 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68832055 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 68832080 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 68832207 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68832411 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 68832453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68832565 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 68833706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68833794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68834074 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 68834325 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 68834844 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 68834857 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 68834901 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 68834938 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 68835059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68835466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68836703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68837708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68838806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68840431 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68840768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68841380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68841595 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68842322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68845121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68847400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68848107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68848286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68848652 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 68848699 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 68848723 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68848875 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 68848894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68849117 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 68849255 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68849266 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 68849765 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 68851293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68853946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68854416 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68854502 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 68854528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68854646 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68854864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68856058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68856643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68857845 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68858173 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 68858295 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 68858310 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 68858317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68858516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68858802 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68858820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68858830 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 68858866 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 68858876 G A Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 68859045 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 68859679 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68860790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68861055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68861382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68861455 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 68861539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68861678 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 68861732 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 68861837 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 68861897 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 68862038 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 68862129 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 68862139 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 68862204 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 68862416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68862447 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 68862458 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 68862715 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 68862853 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 68863304 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 68863327 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 68863788 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 68863879 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 68863995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68863998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68864144 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 68864186 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 68864267 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68864375 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68864431 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 68864570 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68864665 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68864871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68864882 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68864890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68864904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68865687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68865741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68865767 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 68867974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68868148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68868260 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 68868341 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68868641 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 68869211 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 68869558 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 68869974 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 68870139 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 68870411 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 68870508 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 68870555 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 68870698 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 68871867 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 68872273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68872336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68872700 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 68872736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68872982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68873191 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 68873390 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 68873396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68873486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68873522 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 68873607 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 68873636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68873666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68873723 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 68873763 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 68873822 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 68873854 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 68873936 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68874002 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 68874350 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 68875171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68875214 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 68875246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68875279 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68875335 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68875492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68875770 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 68875975 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 68876152 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68876326 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 68876396 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 68876564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68876682 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68876685 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68877866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68878023 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68879753 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 68879818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68879978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68880069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68880158 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68880175 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 68880223 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68880273 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68880363 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 68880430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68880431 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 68880527 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68881020 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 68881077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68881144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68881202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68881497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68881737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68881965 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 68882001 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 68882003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68882032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68882431 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68883000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68884009 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 68885328 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 68886320 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68887005 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 68887042 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 2 68887847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68888015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68888802 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 68889121 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68889315 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68890832 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68891438 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 68891762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68892346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68892449 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 68892502 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 68892536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68892719 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 68892784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68892881 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 68892901 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68893295 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 68893437 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 68893969 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 68893991 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 68894008 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 68894343 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 68894452 C T N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 68894516 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 68894700 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 68896193 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 68898498 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68899161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68900405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68900857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68900926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68901003 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 68901027 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 68901029 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 68901055 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68901062 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 68901097 A C N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 2 68901237 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 68901280 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 68901417 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68902380 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 68902383 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 68905520 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68906539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68908043 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68910559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68915300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68915516 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 68915860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68916170 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68917810 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 68918907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68919410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68920829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68921191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68921450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68921912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68923668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68923940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68924609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68924767 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68925014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68927719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68928155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68930481 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68931377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68931538 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68931554 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 68931595 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 68931616 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68932243 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68932265 G C Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 68932426 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68932599 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68933951 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68934050 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 68934098 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68934516 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68934521 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 68935364 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68935517 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68935569 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68935862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68936055 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68936069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68936315 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68936379 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 68936423 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68936770 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 68936875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68936904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68938689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68939534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68940139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68941863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68942174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68942586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68943535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68943607 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68944291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68947075 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 68947164 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 68947173 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68947269 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 68947322 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 68947424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68947705 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 68947792 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 68947973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68948008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68948069 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 68948447 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 68948510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68948518 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 68948575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 68949045 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 68949251 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68950164 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68950992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68951280 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 68955278 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 68959716 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68960584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68961347 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 68962658 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 68967964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68968114 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 68968176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68968185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68968692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68969092 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 68969873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68970683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68972067 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 68972300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68972421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68974316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68977905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68978922 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68982045 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68982174 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68983609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68983639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68984232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68984513 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 68984935 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 68985205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68985295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68986136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68988022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68988111 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68988487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 68988734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68989507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68989624 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68989633 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68989656 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68989681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68989746 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68990597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68990617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68990797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68991055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68991058 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68991192 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 68991745 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 68991778 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 68992666 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 68993303 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 68993312 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 68993420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68994262 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68994469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68995066 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 68995335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 68997069 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 68997679 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 68997850 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 68997917 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68997947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68998322 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 68998653 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 68998685 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 68999089 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 68999228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68999271 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 68999300 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 68999897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 68999974 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 69000058 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69000093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69000221 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 69000240 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 69000265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69000367 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 69000373 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69000725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69002616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69003135 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69003425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69003706 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 69004076 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 69004085 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 69004099 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69004387 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 69004517 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 69004792 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 69004827 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 69004956 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 69005099 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 69005219 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 69005297 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 69005349 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 69005420 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 69005421 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 69005501 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 69005752 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 69005917 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 69006141 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 69006284 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69006292 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69006356 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 69006494 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 69006648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69006769 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69007008 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69007327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69007404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69007606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69007876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69007942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69007962 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 69008040 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69008126 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 69008272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69008306 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 69008346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69008402 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69008475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69008524 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69008620 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 69008679 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69009012 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 69009040 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 69009065 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69009435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69010065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69010250 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 69010264 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 69010368 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69010371 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 69010406 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69010486 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69011784 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69014173 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69014210 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 69014891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69016821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69018234 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 69018238 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69018311 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 69018421 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 69018465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69018730 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69018825 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 69018883 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69018890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69019071 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 69019548 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 69019836 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 69019874 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69019886 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 69020089 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 69020093 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69020240 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 69020393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69020481 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 69020586 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 69021137 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 69021189 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69021407 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 69021606 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69021746 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 2 69021832 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 69022021 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69022239 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 69022290 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69022490 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 69022613 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 69023160 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 69024102 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69024145 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 69024360 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69024385 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 69025237 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69025287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69026785 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 69026791 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 69027241 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 69028708 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69029976 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69030470 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69030638 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69030718 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 69030801 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69030882 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 69030940 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 69031365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69031982 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 69031990 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69032203 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69032293 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 69032359 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 69032526 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 69032665 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 69033025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69033470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69033565 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69033705 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69033922 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 69034223 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69035430 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 69036369 G T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 69036543 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 69037222 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 69037271 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 69037273 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 69037389 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 69037554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69038179 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69038255 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 69038656 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 69039029 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69039427 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69039656 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 69039836 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 69040634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69041622 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 69041733 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69042667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69042789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69042899 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 69042993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69043057 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 69043114 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 69043905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69044070 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69045945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69049083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69050624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69050908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69051998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69052402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69053089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69055513 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69056566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69057079 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 69058636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69059770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69060264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69060652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69061140 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 69061401 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69061626 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69061632 A T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 69062442 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 69062595 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 69062668 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 69062800 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69062858 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69062887 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 69062938 C G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 69063440 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 69063483 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 69063494 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 69064117 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 69064152 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 69064170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69064187 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 69064218 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69064394 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 69064516 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69064930 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69065091 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69065157 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 69065189 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 69065240 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69065353 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 69065376 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69065439 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69065509 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 69065645 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 69065652 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 69065679 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69065833 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 69065887 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 69066482 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 69066575 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 69066845 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 69066927 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 69066950 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 69067230 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69067412 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 69067440 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 69067730 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 69067732 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 69067821 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 69067880 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 69067898 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 69067904 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 69067913 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 69067967 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 69068187 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 69068240 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 69068256 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 69068258 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69068312 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69068320 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69068354 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69068891 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69068892 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69068944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69068982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69069066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69069111 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69069180 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69069316 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69069339 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69069352 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69069396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69069426 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 69069433 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 69069468 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 69069496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69069510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69069527 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69069586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69069629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69069630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69069679 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69069683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69069719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69069793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69069797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69070011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69070023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69070117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69070380 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69070531 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69070549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69070773 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69070829 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 69070934 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 69071358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69073104 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 69073120 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 69074010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69074410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69074486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69076189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69076938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69078535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69079040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69079234 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69079864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69080268 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69080691 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 69081120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69082036 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69082045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69082184 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 69082711 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69082826 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69082912 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 69083037 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69083043 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69083279 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 69083411 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 69083418 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 69083465 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 69083486 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 69083536 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 69083603 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69083629 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69083646 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69083659 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 69083664 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69083733 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 69083856 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69084102 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69084158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69084235 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69084241 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69084332 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69084351 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69084403 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 69084816 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 69084837 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 69085060 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 69085063 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 69085126 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69085272 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69085278 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69085348 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 69085362 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69085614 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69085732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69085838 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69085975 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69086119 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 69086188 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 69086199 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 69086266 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69086281 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69086292 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69086595 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 69086625 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69086885 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69086903 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69087076 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69087235 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 69087441 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69087555 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69087630 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 69087865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69087983 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 69088333 T G Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 69088810 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69088839 G C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 69088878 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 69089152 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 69089353 T C Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 69089422 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 69089445 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69090139 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 69090418 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 69090792 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69090996 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 69091187 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 69091209 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 69091330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69091347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69091433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69091460 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 69091690 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 69091827 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 69092084 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69092192 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 69092232 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 69092333 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 69093300 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69093317 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 69093373 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 69093527 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 69093556 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 69094329 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 69094332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69094554 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69094790 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 69094824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69094852 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 69095088 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 69095597 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 69095761 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 69096158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69096160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69096172 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69096312 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 69096587 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 69096594 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 69096642 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 69096737 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69096740 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 69096799 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 69096887 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69097138 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 69097178 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 69097186 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 69097204 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 69097251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69097275 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 69097335 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 69097386 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69097387 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69097422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69097464 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 69097617 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69097641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69097814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69097843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69098067 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 69098390 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 69099048 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69099903 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 69099980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69100461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69100827 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69101160 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69102063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69103481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69104426 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69105534 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69105581 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69105650 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 69107254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69107595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69110248 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 69110843 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 69111601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69112026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69112532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69112666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69115364 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69117200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69117620 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69118711 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 69121177 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69122407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69124283 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 69125402 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 69128046 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 69128464 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 69128850 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 69129269 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69131451 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69131540 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 69132527 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69134632 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 69137219 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 69137967 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69140781 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69141219 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69141678 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 69142295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69143339 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69144289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69144541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69144591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69146265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69146401 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69146917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69148383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69148475 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 69148486 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69148595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69149348 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 69150676 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69151474 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69152620 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69152862 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69152969 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69153624 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69155075 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69155276 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 69155724 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 69155917 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69156478 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 69156618 G T Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 2 69156620 C A Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 2 69158246 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69158250 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 69158284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69158413 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69158804 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 69159772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69160882 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69160985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69161533 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 69161642 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69161706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69161967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69162300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69162457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69162568 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69163047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69163085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69163167 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 69163544 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 69164060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69164135 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69164196 G C N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 2 69164356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69164459 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69164538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69164550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69164659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69164796 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69164906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69164919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69164926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69164932 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69164957 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69165109 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 69165122 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 69165150 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 69165174 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 69165214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69165289 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69165304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69165320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69165341 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69165353 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69165413 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 69165435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69165481 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69165578 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 69165632 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 69165752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69165868 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69167531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69168480 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69168547 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 69168607 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69168665 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 69168705 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 69168890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69168993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69169094 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 69169863 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 69169963 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 69170122 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 69170139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69170161 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 69170214 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 69170660 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 69170851 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69170868 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69170914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69170950 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69170965 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69171080 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69171108 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 69171187 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 69171476 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 69171679 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69171715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69171851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69172675 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 69172693 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 69173069 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69173425 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 69173524 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 69173773 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 69173921 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 69173998 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 69174039 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 69174046 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 69174056 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 69174134 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69174289 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 69174300 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69174406 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 69174621 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 69174642 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 69174756 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 69174761 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 69174823 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 69174977 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 69175075 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 69175142 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 69175181 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69175308 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 69175322 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69175336 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 69175366 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 69175368 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69175394 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69175551 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69175575 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 69175640 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 69175910 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69175916 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69175950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69176106 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69176236 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69176281 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 69176309 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 69176372 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69176780 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 69176830 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 69177074 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 69177264 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69177527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69177736 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 69177748 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 69177762 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 69177781 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 69177787 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 69178116 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 69178130 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 69178240 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 69178271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69178290 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 69178298 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 69178361 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 69178394 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69178406 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 69178655 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 69178895 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 69178970 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 69178989 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69179028 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69179113 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69179114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69179168 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69179316 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69179341 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 69179396 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69179409 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 69179434 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 69179447 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 69179912 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69180180 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 69180221 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 69180240 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 69180817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69180818 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 69180890 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 69180907 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69181254 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69181668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69181868 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 69182198 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69182421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69182575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69182610 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69182614 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69182625 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69182652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69182662 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69182678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69182682 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69182812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69182851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69182890 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69183083 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69183282 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 69183676 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69183700 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69183716 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69183785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69183833 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69183987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69184112 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 69184136 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69184151 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69184200 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 69184401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69184425 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 69184488 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 69184603 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69185026 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 69185251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69185383 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69185760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69186653 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 69187208 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69187353 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 69187393 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 69187412 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 69187483 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69187642 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 69187671 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 69187784 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 69187792 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 69187831 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 69187907 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 69187909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69187945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69188041 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 69188128 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69188200 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 69188249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69188301 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69188443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69188601 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69189615 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69189735 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69189792 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69189841 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 69189869 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69189892 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69189921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69189970 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69190154 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69190263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69190730 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69191095 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69191238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69191409 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 69191415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69191615 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 69191783 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 69191891 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69192560 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69194334 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 69194475 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 69194834 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 69195015 C G Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 69195878 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 69196935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69196936 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69196953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69197592 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 69197812 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 69198580 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69199219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69199849 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69200227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69201546 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69201625 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69203936 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 69204051 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69204192 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69204405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69204977 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69205038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69205281 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69206104 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69206200 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 69206366 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 69206729 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 69206733 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 69206755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69206862 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 69206887 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69206909 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 69206989 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69207086 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69207225 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 69207327 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69207675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69208149 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69209163 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69209448 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69209514 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 2 69210542 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 69210662 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 69210671 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69210715 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69210735 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69210882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69210948 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 69211114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69211216 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69211359 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69211363 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 69211375 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 69211719 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69211942 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69213312 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69213600 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 69213629 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69213703 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69213747 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69213756 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69213797 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 69213977 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 69214218 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69214508 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69214595 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69214647 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 69214770 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69214919 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 69215115 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69215247 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 69215358 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 69215534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69215542 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69215966 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69216104 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69216268 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69216337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69216746 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69216828 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 69217578 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 69217643 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 69217734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69217769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69217973 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 69218146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69218509 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69219112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69219373 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 69219655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69221513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69224152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69224273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69224558 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69227073 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69228858 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 69229142 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 69229349 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 69229399 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69229524 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 69229525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69229570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69230289 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 69230914 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69230924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69231002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69231045 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 69231047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69231295 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 69231776 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69231957 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 69231982 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 69232022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69232862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69232956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69233225 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 69233468 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 69233558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69233723 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69233816 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 69233851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69234269 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 69234388 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 69234402 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 69235142 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 69235447 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 69235763 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 69236044 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69236095 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 69236166 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69236181 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69236289 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69236978 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 69237057 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69237082 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69237101 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69237107 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69237131 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69237828 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 69237931 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69238220 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69238222 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69238288 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 69238296 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69238377 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 69238839 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 69238846 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 69238852 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69238876 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69238961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69239002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69240762 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69240922 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69240957 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69241446 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69241510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69241694 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69241784 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69241855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69241866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69244910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69245000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69245050 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69245282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69245461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69246630 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69247260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69250591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69251011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69252398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69254498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69254580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69255355 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69256148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69256519 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69256636 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69256832 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 69260901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69264085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69264813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69265130 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69265201 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 69265255 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69265271 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69266310 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 69266475 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 69267340 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69267754 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69267958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69268452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69268460 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 69268781 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69268971 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69269057 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69269477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69269638 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 69269695 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69269778 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 69269990 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69270109 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 69270122 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 69271481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69272159 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 69272181 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 69272234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69272452 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 69272469 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 69272473 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69272609 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69272623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69274279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69277229 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 69277232 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 69277420 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 69277553 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69277670 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69278640 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 69279530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69281266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69283535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69283928 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69284875 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 69285432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69285841 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 69285872 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69285969 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 69286048 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 69287254 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69288855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69289878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69290800 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69291233 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69291356 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69291370 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 69291425 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69291453 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69291459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69291658 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69291696 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69294239 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69296684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69297832 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 69298582 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 69298653 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 69298689 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 69299096 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 69299163 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 69299659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69299879 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 69300432 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 69300930 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 69301051 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 69301131 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 69301160 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 69301191 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 69301250 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 69301256 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 69301294 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 69301400 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 69301595 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 69301669 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 69301887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69302344 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 69302536 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 69302918 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 69303092 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 69303271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69303842 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 69304158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69304251 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 69304470 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 69304885 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 69306340 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69306384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69306441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69306632 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69306880 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69309927 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69311322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69314593 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 69314651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69316580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69316621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69316783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69316786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69316843 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69316875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69316877 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69316913 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69316914 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69316991 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 69317098 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 69317205 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 69317229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69317574 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69317604 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 69317656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69317695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69317740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69317771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69317820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69317834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69318019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69318028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69318035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69318070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69318341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69318347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69318485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69318530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69318547 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69318554 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69318699 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69318706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69318741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69318753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69318787 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69318926 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69318998 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69319080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69319106 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 69319137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69319635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69319742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69319895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69319992 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69320067 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69320116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69320262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69320458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69320478 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69320552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69320691 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69320810 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 69321044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69321132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69321181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69321350 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 69322085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69322758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69324372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69324441 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69324476 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 69326132 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 69326469 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69326559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69326589 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69326733 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 69327052 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69327121 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 69327147 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 69327480 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 69327506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69327527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69327653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69327967 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 69328394 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69328561 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 69328610 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 69328700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69328714 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69328875 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69330018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69330191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69330560 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69330685 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69330709 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69330854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69331128 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69331210 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69331212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69331222 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 69331435 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 69331466 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69331484 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69331596 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69331683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69331802 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69331992 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69332034 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69332314 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 69332357 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 69332374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69332426 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69332532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69332617 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69332734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69332864 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 69333091 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69333300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69333308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69333436 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69333446 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69333467 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 69333642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69333693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69334009 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 69334503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69334644 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69335171 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 69335211 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69335230 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 69335384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69335415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69335481 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69335673 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 69335700 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 69335729 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69336027 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69336079 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69336113 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 69336169 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 69336261 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 69336346 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 69336654 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69336718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69336735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69336736 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69336787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69336800 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69336858 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69336889 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69337118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69337156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69337409 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69337505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69338897 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69339177 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69339392 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69339511 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69339527 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69340255 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 69340425 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69340543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69341379 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 69341661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69341813 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69341906 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69341952 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69342211 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69348175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69348701 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 69348717 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 69349169 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69349842 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69349963 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69349966 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69350116 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69350146 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69350299 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69350697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69350888 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 69351086 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69351699 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 69351752 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69351794 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69352007 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69352015 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69352031 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69352079 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69352086 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69352387 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 69352495 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69352525 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69352531 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69353937 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 69356604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69357210 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69357694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69358074 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69358203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69358651 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 69358766 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69359035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69359405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69359409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69359426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69359579 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69359623 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69359674 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69359693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69360045 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69360069 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69360114 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69360156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69360202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69360572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69360611 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69360640 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69360829 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69360841 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 69360860 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 69361080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69362274 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 69362285 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 69362419 C A Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 69362499 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 69362707 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69363320 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 69363395 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69363404 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69363435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69363453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69363571 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69363897 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 69364038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69365132 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69365205 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69365298 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69365707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69366081 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69366117 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69366909 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69367471 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69370009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69370063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69370355 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69370472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69370578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69371124 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69371394 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 69372052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69372145 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69372507 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69373164 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69373385 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69373399 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69373455 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69373507 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 69373842 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 69374005 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 69374007 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 69374335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69374667 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69375045 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69375132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69375761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69377344 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 69378294 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 69379074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69379148 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 69379174 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69379267 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 69379671 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 69380574 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 69381207 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69381493 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 69381578 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 69382144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69382152 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69382330 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69382360 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 69383176 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 69383793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69384193 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 69384257 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 69384509 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69385221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69385610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69386210 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 69387301 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 69387449 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69388032 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69388106 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 69388295 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 69388307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69388360 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69388427 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69388503 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 69388551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69388643 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 69388710 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 69388856 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 69388880 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69388954 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69388996 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 69389050 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69389051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69389512 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 69389626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69389740 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 69390033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69390140 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 69390241 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69390320 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 69390742 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 69390798 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 69390799 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 69390961 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 69391031 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 69391050 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 69391112 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 69391140 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 69391339 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69391612 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69391738 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 69391744 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 69391909 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 69391911 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69392123 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 69392420 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 69392458 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 69392655 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 69392788 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 69392817 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 69393049 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 69393071 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 69393412 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 69393964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69394134 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69394280 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 69394850 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 69394895 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69395238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69397222 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69397993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69397994 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69398908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69400292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69400449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69400584 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 69400673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69400760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69400950 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69401184 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 69401257 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 69401554 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69401917 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 69402007 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69402530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69402576 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 69402810 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69403194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69403411 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 69404570 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69404613 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 69404727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69404745 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69404812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69404858 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69405012 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69405642 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69405698 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 69406042 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69406860 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 69406951 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 69406957 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69407297 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 69407588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69407628 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69408179 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69408488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69408590 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69408750 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 69408762 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69408779 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 69409078 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69409160 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69409454 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 69409468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69409470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69409510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69409881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69409968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69410193 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 69410344 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69410447 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 69410477 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69410521 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69410584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69410650 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 69410676 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 69410701 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 69411347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69412243 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69412248 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69412458 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 69412537 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 69412541 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69412580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69412780 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69412783 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69412829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69412842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69412902 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 69412912 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 69413052 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69413156 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69413188 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69413191 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69413212 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 69413285 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69413303 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69413311 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 69413324 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 69413493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69413508 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69413800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69413894 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 69413902 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69413977 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 69414620 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69414690 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69414697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69415195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69416143 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69416453 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69416635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69417171 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 69417346 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 69417376 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69417422 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 69417424 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 69417482 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69418305 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 69419286 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 69419605 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69420222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69421319 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69422137 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 69423027 C T Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 9 11 1 7 2 2 69423419 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69426370 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 69426763 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69427083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69427117 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69427124 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69427173 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69427187 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69427319 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69427509 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 69427600 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 69427615 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 69427621 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 69427639 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69427771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69428050 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69428145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69428175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69428330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69428350 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69428451 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69429047 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69429262 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 69429750 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69429898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69430524 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69430953 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 69430964 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69431216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69431673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69432008 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 69432238 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 69432249 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69432669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69433530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69433541 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69433627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69433854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69434959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69434996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69435097 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69435104 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69435374 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69435435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69436355 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69436611 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69437131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69437203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69437486 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69437578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69438344 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 69438372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69438575 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 69439192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69440699 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69442588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69443486 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 69444026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69444766 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69446607 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 69447535 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69449655 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69451016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69451749 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 69451841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69451936 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 69451978 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 69452240 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 69452345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69452933 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69453049 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69453103 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 69453125 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69453177 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 69453862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69454498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69454617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69454719 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69454767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69454889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69454946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69455188 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69455643 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 69455781 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 69456221 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 69456254 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 69456512 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 69456685 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 69456945 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 69457011 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 69457253 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 69457438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69457464 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69457472 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69457744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69457894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69458519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69458777 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69458842 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 69459048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69459089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69460206 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69460653 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 69461690 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 69462701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69463166 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69463868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69465905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69466257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69466514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69467078 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69467573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69468070 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69468193 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69468725 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 69468791 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69469026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69469045 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69469046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69469172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69469203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69469225 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69469276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69469321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69471531 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 69471542 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 69471569 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 69471651 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 69471654 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 69471709 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69471942 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69472421 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69472498 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69472568 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 69472626 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 69472631 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 69472672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69472756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69472864 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69472903 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 69473057 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69473096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69473101 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69475705 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69476165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69477837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69477854 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69478504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69479440 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 69481264 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69481537 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 69481653 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69481710 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 69481711 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 69482047 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69482596 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69482648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69482677 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69482734 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 69482816 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69482851 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 69482989 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 69483021 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 69483037 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 69483052 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69483056 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69483069 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69483313 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69483314 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69483340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69483495 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 69483637 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69483647 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69483670 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69483752 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 69484056 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69484075 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69484283 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69484325 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69484356 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 69484897 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 69484899 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69484945 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69487274 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69488275 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69488395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69488548 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69490672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69494718 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 69495254 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 69495298 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 69496180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69496268 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69496310 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 69498249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69499740 C A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 69500665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69503200 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 69503964 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 69504107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69504767 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69505432 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 69505675 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 69507084 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69507127 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 69507187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69507197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69507256 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69507264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69507416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69508126 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 69508478 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69508511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69509276 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 69509755 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 69510178 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69510208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69510865 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 69510884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69510892 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69510921 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69510942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69511087 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69511571 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69513183 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 69513255 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 69513323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69513619 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69513727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69513729 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69513762 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69513808 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69513836 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69513865 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 69513931 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69513947 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69513955 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69514068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69514072 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69514108 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 69514193 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69514284 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 69514309 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 69514317 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69514492 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 69514597 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 69514719 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 69514903 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 69515090 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 69515365 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 69515369 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 69515499 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 69515896 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 69516333 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69516440 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69516533 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69516984 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 69516997 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 69517094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69517361 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 69517925 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 69518282 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 69518297 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69518487 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 69518646 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 69518834 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 2 69518875 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 69519570 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 69519638 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69519732 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69519762 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69520083 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 69520108 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 69520163 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 69520450 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69520569 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69520577 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69520618 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69520666 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 69520801 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69520809 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69520861 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69520906 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 69521096 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69521138 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69521162 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69521183 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 69521190 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 69521276 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 69521347 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 69521489 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 69521514 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 69521809 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69522658 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 69522706 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 69522756 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69522767 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 69522856 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 69522901 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69522917 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69523083 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 69523144 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 69523163 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 69523229 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69523309 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 69523632 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69523648 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69523904 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69524174 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 69524231 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 69524344 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 69524835 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 69524850 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 69524975 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 69525118 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69525367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69525498 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69525655 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 69525717 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69525818 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69525857 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 69525928 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 69525931 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 69526032 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 69526088 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 69526218 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 69526293 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 69526313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69527013 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69527065 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 69527109 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 69527142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69527498 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69528112 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69528708 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69530093 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 69530296 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 69530408 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 69530589 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 69530607 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69530612 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69531691 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 69532329 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 69532354 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 69532832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69533383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69533852 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 69534101 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69534546 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 69534628 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69534665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69535237 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 69535389 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69536268 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 69536474 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69536531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69537041 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 69537046 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69537259 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69537281 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 69537423 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69537605 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 69537702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69537710 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 69537788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69537878 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 69538633 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69538682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69538957 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69539086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69539317 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 69539728 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69540072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69540318 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69540385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69540437 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69540666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69540751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69541461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69543596 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 69543878 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 69545068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69545286 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69545695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69545971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69546045 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69546774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69548853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69549481 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69550470 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69550654 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69550803 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69551640 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69551693 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69551727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69552226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69554894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69555613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69558367 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69558374 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69558778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69559245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69561219 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69561634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69562661 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69563529 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 69565386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69565588 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69566759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69568327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69570260 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 69570300 T G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 69570961 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 69577024 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69577692 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69578054 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69578162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69578674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69579634 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 69579652 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 69582577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69582826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69584567 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69584611 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69585173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69585194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69585920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69586048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69586179 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69587348 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69590760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69592708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69592929 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69593650 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69598805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69599302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69603157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69604409 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69605129 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69606088 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69610808 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69610815 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69613324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69614091 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69614100 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69619481 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69620992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69622225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69625119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69625793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69627674 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69629681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69629935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69630489 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 69630804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69631042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69631722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69631820 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69632381 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69637803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69638414 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69641578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69642098 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69642105 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69642250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69642256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69642292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69642327 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69642346 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69642424 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69642605 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69642750 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69642796 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 69642808 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 69643337 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69643356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69643373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69643746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69643836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69643864 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69643932 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69644353 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 69644525 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 69644526 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 69644603 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 69644731 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 69644820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69644982 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 69645017 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 69645550 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69645570 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 69645590 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69645592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69645610 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69645701 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 69645924 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 69646005 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69648566 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 69649632 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69649711 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69649897 G T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 69652929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69654645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69657789 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 69659572 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 69660158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69660735 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 69661460 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 69662966 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69663222 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69665586 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69671190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69672571 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69672709 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69672782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69672823 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69673011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69673018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69675404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69675587 C T Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 2 69675601 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 69678028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69678849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69679125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69679364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69679481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69679729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69679860 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69681323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69681630 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69681637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69681793 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69681836 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69681859 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 69681912 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69682323 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69682370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69682421 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69682615 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 69682715 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69682762 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69682833 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69682839 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69683109 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 69683168 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 69683580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69683615 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 69683858 G T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 69683890 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 69684000 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 69684836 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69684946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69685771 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69685847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69685870 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69686150 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69686852 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69687021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69687424 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69687517 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69688317 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69688421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69688438 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69688463 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69688627 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69691425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69692528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69693754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69694375 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69695169 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 69695383 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 69695867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69696137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69696526 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69698033 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69700677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69700998 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69702158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69702948 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 69703148 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 69703247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69703860 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69704188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69704620 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69704807 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 69704832 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 69705240 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 69706215 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 69706216 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69706486 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 69711126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69711184 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 69713389 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69713722 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69715362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69717514 A T Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 69717665 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69717957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69717977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69718348 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69718430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69718431 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69718710 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69718900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69719032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69719163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69719176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69719346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69720246 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69721164 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 69721233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69725717 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 69725839 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 69726807 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 69726931 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 69726958 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 69727197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69727274 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 69727846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69728067 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69728359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69728491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69728506 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69728509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69728631 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69728806 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69728827 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69729120 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69729121 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69730026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69731000 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69731455 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 69731698 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 69732121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69732518 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 69733631 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 69736706 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69738880 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69739749 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69740693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69744165 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 69744929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69746282 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 69747889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69748056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69748662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69750872 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 69750984 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69751191 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 69753111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69754208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69754435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69755318 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69756721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69756771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69756923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69758062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69758224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69758416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69759518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69760717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69760895 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69761250 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 69761732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69762528 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 69763137 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 69763140 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 69763247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69763799 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 69763850 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69764396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69764450 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 69765148 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69765564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69766827 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 69767646 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 69767748 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 69767952 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 69771547 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69773578 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69779595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69780131 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 69781895 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69783716 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69785986 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69786354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69787083 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69787246 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 69787536 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 69790083 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69792100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69794754 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 69796843 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 69799426 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69801948 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 69802489 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69802605 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 69802943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69805415 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 69805607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69805743 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 69806136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69806702 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 69807333 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 69807447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69807458 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69808323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69808356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69808395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69808438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69814053 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69814077 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69815044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69818049 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69818179 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69818483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69818849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69819433 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69819641 G C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 69819838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69820578 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 69821473 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69821519 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 69824184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69825095 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 69825512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69826248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69826619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69831234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69832837 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69838873 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 69839318 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69840893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69842622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69843171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69843806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69845254 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69845431 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69846025 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69846323 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69846579 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 69846867 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69848338 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69848339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69848476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69848899 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 69851945 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69852848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69854599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69861104 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69867818 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 69868112 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69869712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69869953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69870688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69871601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69872457 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 69872675 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 69872820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69872938 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 69873299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69873698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69874168 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 69874174 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69874254 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69874287 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69874361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69874449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69874450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69874682 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 69874930 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69875053 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69875153 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69875167 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69875418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69875647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69875681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69875721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69875755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69875757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69875906 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69876083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69876206 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69876325 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69876384 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69876490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69877359 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 69877362 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 69877821 T G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 69878297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69878354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69878577 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69878630 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69878633 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69878866 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69878931 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69879066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69879094 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 69880006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69880066 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 69880078 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 69880657 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69880743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69883594 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 69883647 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 69883745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69883904 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69884111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69884234 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69884240 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69884290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69884377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69884421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69884443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69884598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69884709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69884721 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69884803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69884825 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69884935 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 69884945 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69884991 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 69885079 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 69885083 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 69885355 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 69885368 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 69885374 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69885442 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69885480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69885527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69885570 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69885593 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69885599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69885678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69885823 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 69885855 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 69885860 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 69886367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69887028 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69887053 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69887086 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69887128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69887137 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69887147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69887252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69887475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69887493 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69888011 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 69888166 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 69888236 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69888737 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69888810 G C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 69888811 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 69889006 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69889877 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69890619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69890634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69890659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69890786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69890863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69890912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69890950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69891061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69891102 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69891166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69891282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69891452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69891504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69891663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69891690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69891870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69892256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69892305 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 69892713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69892910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69893416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69894490 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 69894492 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 69894573 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 69894585 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 69894800 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69894845 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69895608 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 69895617 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 69895625 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69895655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69895734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69895859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69895873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69895998 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 69896672 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 69896799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69896847 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69896905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69897012 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69897026 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69897050 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69897276 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69897421 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 69897486 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69897505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69897724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69897811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69897877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69897928 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69897932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69898020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69898118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69898256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69898836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69898841 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69898909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69899814 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69899931 G C Y N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 2 69900139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69900359 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 69900400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69900443 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69900475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69900497 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69900531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69900534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69900627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69900664 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69900703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69900871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69900951 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69901079 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 69901108 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 69901111 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 69901127 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 69901135 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69901145 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69901150 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69901163 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69901173 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69901176 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69901417 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69901494 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 69901704 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69902367 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69902376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69902630 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 69902636 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69902649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69903865 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69904163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69904505 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69904527 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69904551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69904587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69904819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69904831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69905647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69906160 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69907220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69907539 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 69909504 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69920724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69921144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69922766 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69923418 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69923611 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69924557 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69924576 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69924642 A T Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 69924663 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69924693 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69924791 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 69925039 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 69925303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69925378 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69925416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69925431 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69925547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69925554 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 69925621 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69926651 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69927126 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 69927129 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 69927945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69928284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69928300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69928309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69928315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69928324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69928407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69928530 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69928539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69928572 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69928655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69928869 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69928946 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69928950 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69928964 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 69929077 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69930251 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69930382 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69930785 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69930795 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69931128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69931406 G C N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 69932184 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 69932265 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69932391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69932466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69933823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69933989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69934217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69934630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69934850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69934912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69934955 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69934981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69935349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69936651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69937665 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69937708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69937857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69941063 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 69941072 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 69942257 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 69942333 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69942684 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69944693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69944991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69945014 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 69945022 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69945057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69945089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69945112 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69945128 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 69945148 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69945183 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69945230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69945310 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 69945330 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 69945454 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69945477 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69945971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69945989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69946252 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 69946811 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69947188 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69947190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69947201 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69947261 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69947489 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69947580 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 69947657 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69947699 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 69947910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69947913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69947929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69947932 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 69947943 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 69947948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69948152 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 69948334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69948651 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 69951891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69951908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69952139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69952551 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69956826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69957000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69957274 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69957335 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 69957339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69957896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69958030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69959706 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69960282 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69961506 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69962561 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69962634 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 69963277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69964371 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 69965244 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69965562 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 69968881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69974314 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 69975343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69975444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69975902 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 69975981 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 69976000 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 69976235 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 69976374 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 69976407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69977031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69977365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69977728 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 69977959 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 69978030 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 69978078 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 69978113 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 69978168 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 69978201 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 69978297 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 69978318 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 69978327 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 69978346 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 69978408 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 69978489 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 69978594 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 69978600 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 69978653 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 69978996 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 69979016 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 69980056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69980974 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 69981032 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 69981094 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 69981159 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 69981160 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 69981177 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 69981315 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 69981344 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 69981414 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 69981475 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 69981489 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 69982538 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 69982644 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 69982645 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 69982689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69982898 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 69982934 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69983109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69983164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69983326 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 69983432 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 69983622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69983872 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 69983899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69984125 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 69984155 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 69984556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69984876 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 69984907 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 69984915 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 69984961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69985111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69985182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69985210 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 69985219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69985419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69985505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69985916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69986038 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 69986505 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 69986520 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 69986623 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69988259 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 69988955 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 69989157 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69989327 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69994901 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 69995460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69996970 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 69997553 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 69997747 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 69997817 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 69999226 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 70000186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70000289 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70000859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70001206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70001852 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 70002070 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 70002381 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 70002731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70006585 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 70006654 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70007623 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70007724 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 70009354 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 70012670 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70015187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70015210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70015757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70016037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70016964 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70017211 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70017796 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70017810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70017910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70018127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70018298 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 70018376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70018476 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70018499 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70018524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70018582 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70018643 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 70018664 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 70018738 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70018819 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 70018904 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 70018906 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 70018951 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 70018985 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 70019053 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 70019180 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70019429 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 70019479 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70019666 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 70019699 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 70019721 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 70019813 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70019894 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70019934 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70019935 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70019956 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70023671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70023716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70025887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70026208 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70026654 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 70026662 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 70026736 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 70027010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70027034 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 70027104 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 70027108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70027984 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70028002 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70028030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70028256 T C Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 70028270 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 70028293 A G Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 2 70028452 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70028629 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 70028710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70028839 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70028904 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 70028916 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70028949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70029198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70029206 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70029345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70030037 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 70030314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70030340 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70031362 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70031393 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 70031558 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70032172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70033330 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70033917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70034044 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70034117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70034842 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70034984 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70035024 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70035124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70035158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70035616 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 70036673 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 70036708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70036753 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 70037078 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70037140 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70037159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70038103 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 70038334 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70039019 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 70039055 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 70039269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70039278 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 70039293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70039323 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 70039346 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 70039546 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 70040026 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 70040030 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 70040110 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 70040134 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70040201 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70040274 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 70040671 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70041246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70041253 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 70041332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70041354 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 70041651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70041684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70041879 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 70041970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70042614 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 70042615 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 70043080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70046204 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 70046483 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70046604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70047189 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 70047422 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 70047423 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 70047469 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 70047532 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 70047541 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 70047543 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 70047567 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 70047829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70048318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70048492 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 70048511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70049343 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70049394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70049649 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 70049652 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 70050454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70050628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70050766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70050783 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70050895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70050906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70050974 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 70050978 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 70051113 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70051520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70052155 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 70052284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70052285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70052310 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70052311 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70052392 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70052417 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 70052487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70053085 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70053492 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 70053636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70053978 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 70053979 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70054123 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 70054576 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 70054589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70054593 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 70054690 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 2 70054693 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 70054883 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70054949 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 70054950 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 70055002 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 70055011 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 70055057 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 70055423 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 70055622 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 70055635 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 70055722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70055793 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70055927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70056209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70056845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70056887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70057959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70059684 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 2 70060397 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 70061478 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 70062335 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70062672 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70063137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70063478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70064250 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 70066020 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 70067768 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 70067815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70067964 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 70068381 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 70068755 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70068817 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70068919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70069017 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70069079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70069171 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 70069229 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 70069242 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 70069252 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 70073431 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 70073477 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70073523 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70073665 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 70073752 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 70073923 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 70073938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70074414 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 70074566 A C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 70074684 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 70074867 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 70074869 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70074993 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 70075075 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 70075087 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 70075088 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 70075123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70075233 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 70075242 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 70075296 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 70075316 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 70075340 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 70075520 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 70075530 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 70075776 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 70076321 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70076551 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 70076834 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 70077024 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 70077087 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 70077113 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70077335 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70077363 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 70078005 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 70078036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70078075 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 70078117 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 70078145 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 70078223 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 70078224 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 70078236 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 70078249 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 70078324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70078333 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70078429 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70078788 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 70078862 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70078897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70078921 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 70079038 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70079336 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 70079805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70079860 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 70079861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70079926 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70080482 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70080487 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70080705 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 70080734 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70081167 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70081450 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70081824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70081964 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 70082006 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 70082104 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70082176 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70082187 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 70082474 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 70082482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70083787 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 70083802 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 70083808 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 70084060 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70084378 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 70084392 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 70084421 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 70084968 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70084977 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70085960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70086368 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 70087837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70088632 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70088970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70089898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70090159 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70091458 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 70091498 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 70091656 C G N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 70092151 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 2 70092329 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 70092414 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 70092436 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 70093275 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 70093281 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 70093339 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70093518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70094918 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70095391 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70096247 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 70097743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70098437 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 70098554 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70098953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70099307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70100851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70101123 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70109917 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 70111147 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 70112874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70113267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70113268 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 70113297 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 70113485 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 70113591 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 70113673 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 70113799 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 70113956 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 70114060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70114131 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70114192 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 70114273 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 70114542 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70114653 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 70114753 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 70114885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70114970 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 70115013 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 70115126 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70116502 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 70117377 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 70117704 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70117713 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 70117876 T G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 70117933 T C Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 70117945 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 70118519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70118624 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 70118715 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 70118743 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 70118775 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 70118791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70119096 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 70119117 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 70119138 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 70119171 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 70119176 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 70119185 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70119323 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 70119369 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 70119540 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 70119762 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 70119801 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 70119811 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 70119836 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 70119843 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70119993 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 70121455 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70121545 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70121628 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 70121686 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 70121712 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 70121729 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 70121782 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 70121893 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70122109 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 70122204 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 70122431 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 70122632 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70122660 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70122883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70122886 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70122907 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70123270 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 70123296 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70123403 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70123484 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70123512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70123992 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70124188 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70124518 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70125117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70125239 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 70125737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70125800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70125830 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70125866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70125889 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70125972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70126109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70126110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70126227 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70126480 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 70126727 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 70126930 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70127610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70127751 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70127806 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 70129240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70129485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70129507 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 70130220 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70130500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70130572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70130738 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70130800 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70130814 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70130822 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70131010 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 70131012 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 70131070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70131083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70131124 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 70131183 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70131297 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 70131517 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 70131789 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70131877 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70131921 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 70132065 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70132069 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70132095 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70132108 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70132125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70132163 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 70132174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70132175 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 70132214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70132431 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70132657 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 70132666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70132805 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70132884 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 70132934 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70132953 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 70132965 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 70133016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70133155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70133176 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70133198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70133230 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 70133256 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 70133329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70133363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70133403 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70133433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70133535 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 70133603 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 70133767 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 70133781 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70133829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70134031 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70134054 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70134412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70134441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70134591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70134688 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 70134734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70134761 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70134903 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 70134922 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70134954 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 70135117 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70135139 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 70135263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70135272 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70135350 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70135370 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 70135523 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 70135531 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70135846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70135918 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 70135983 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 70136191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70136382 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 70136629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70136794 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 70136807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70137012 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 70137071 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 70137111 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 70137185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70137581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70138030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70139077 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70139287 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70139297 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70139336 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70139347 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70139372 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70139376 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70139388 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70139432 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 70139496 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70139514 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70139518 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 70139614 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 70139681 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 70139702 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70139709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70139803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70140185 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 70140222 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70140233 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70142367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70142485 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 70142490 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 70142510 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 70142521 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 70142527 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 70142561 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 70142594 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 70142603 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 70142679 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 70142762 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 70142780 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 70142784 C A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 70143094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70143108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70144045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70144098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70144168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70144245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70144350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70144720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70146006 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70146209 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 70146217 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 70146845 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 70148059 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 70148424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70148831 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70148993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70149449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70149672 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70149679 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70149683 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70150363 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 70150367 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 70151001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70151522 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 70155858 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70156166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70157488 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 70157659 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70157664 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70157704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70157835 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 70158111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70158135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70158232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70158314 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 70158338 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70158543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70158638 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70158672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70158704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70159011 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 70159154 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 70159535 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70159554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70159564 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 70159755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70159805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70159824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70159834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70159864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70159870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70159929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70159943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70159946 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70159967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70159976 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70160197 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 70160217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70160218 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 70161015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70163178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70166118 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70166446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70166585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70166727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70167594 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 70168947 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70170282 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70171697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70171791 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70174765 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70175909 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 70176165 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70178697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70179908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70181028 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70181071 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 70181295 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70182037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70182224 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 70182985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70182986 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70183298 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70184006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70184245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70184261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70184288 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70184442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70184668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70184835 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70184964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70185313 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70185718 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70185764 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 70185823 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70185843 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 70185874 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70185910 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 70186141 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 70186264 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 70186760 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70186777 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70187013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70187905 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 70188609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70188854 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70188860 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70188928 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 70189185 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 70189219 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70189420 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 70189481 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 70189894 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70190020 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70190027 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 70190047 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 70190051 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 70190239 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70191500 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 70191513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70191610 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 70191630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70191631 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 70192630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70194584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70195190 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 70195238 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 70195282 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70195298 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 70195307 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70195328 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70195351 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 70196117 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 70196140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70196342 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 70196393 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70196504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70196522 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 70196576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70196639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70196796 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 70196877 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 70197064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70197247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70197286 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 70197319 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 70197563 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 70197767 G C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 70197897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70197940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70198045 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 70198405 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 70198450 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 70198520 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 70198535 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 70198633 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70198696 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70198709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70198917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70198973 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 70198974 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 70199049 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 70199096 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 70199304 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 70200492 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 70200600 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70200623 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70200980 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 70201953 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70202167 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70202380 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70202388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70202631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70203746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70203931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70204894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70204922 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 70204927 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 70204934 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 70204939 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 70205083 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 70205115 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 70205266 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 70205488 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 70205489 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 70205692 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70205714 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70205772 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 70205837 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 70205843 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 70205907 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 70206232 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70206316 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70206341 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70206606 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 70206614 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 70206827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70206845 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70207155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70207201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70207596 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 70207601 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 70207661 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 70207681 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 70207759 T G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 70208123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70208288 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70208429 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 70208599 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70208694 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 70208874 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70208959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70208981 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70209024 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70209285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70209315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70209411 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70209495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70209537 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 70209981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70210043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70210215 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70210233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70211080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70211460 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70214451 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70215133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70216058 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70216239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70216712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70217593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70217753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70218291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70220635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70220866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70221281 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70221413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70223940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70224500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70224694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70225055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70226015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70228950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70229183 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 70232479 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70233208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70233234 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 70233283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70233497 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70233608 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 70233913 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 70233928 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70234050 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 70234485 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 70234971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70235261 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 70235342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70235369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70235522 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 70235648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70235725 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70236069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70237017 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 70237473 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 70237967 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 70238058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70238144 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70238219 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 70238587 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70238599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70238620 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 70238862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70239060 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 70239074 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 70239089 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 70239193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70239269 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 70239288 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70239369 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 70239428 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 70239507 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 70239709 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70239859 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70240588 G C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 70240589 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 70240905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70241002 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70241015 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70241245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70241835 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70242112 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70242136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70242146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70242625 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 70242676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70242988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70242995 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70242999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70243181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70243220 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70243298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70243332 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70243544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70243582 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 70243677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70243837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70243884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70244042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70246335 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 70246465 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70246828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70247250 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70247299 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 70247302 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 70247385 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 70247440 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70247452 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70247457 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70247471 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70247547 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 70247557 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 70247597 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70247635 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 70247993 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 70248461 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 70248598 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 70248774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70248915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70248976 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70249005 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70249332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70249761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70249820 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70249821 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70249894 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70249995 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 70250109 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70250121 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70250183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70250329 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 70250749 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 70250767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70250806 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 70250815 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 70251748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70252932 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 70253997 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 70254919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70256555 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 70256816 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 70256835 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70256917 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 70257010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70257034 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 70257067 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70257134 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70257707 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70257948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70258020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70259047 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 70259124 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70259979 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 70260393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70260440 C A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 70260617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70260821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70262341 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70262466 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 70262612 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70263475 T G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 70264254 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70264511 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70264638 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 70264661 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70264667 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 70265705 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 70268673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70268838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70269503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70270988 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 70271020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70271216 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70271266 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70271346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70272858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70274572 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70275321 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70275400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70277918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70279995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70281208 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 70283760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70284647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70287434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70287536 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70288991 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70290642 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 70290878 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70292261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70292753 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 70294056 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70295693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70296284 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70297785 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 70297837 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 70297855 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 70298486 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70298653 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 70298753 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70298864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70298884 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70298975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70299210 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 2 70299217 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 70299228 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 70299354 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70299600 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 70299871 T G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 70299924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70300030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70300136 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 70300137 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 70300164 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 70300203 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70300216 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 70300258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70300460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70300587 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 70300809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70300811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70300876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70300929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70301061 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 70301084 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70301095 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70301141 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 70301280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70301569 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 70301652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70301725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70301975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70302268 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 70302615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70302638 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 70302768 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 70302801 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70302813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70302833 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 70302925 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70302990 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70303820 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70303863 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 70303907 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70304002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70304224 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70304243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70304285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70304363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70304399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70304864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70304875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70304901 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 70305031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70305299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70305644 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 70305773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70306115 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70306125 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70308612 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70309241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70310398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70310828 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 70312573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70313389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70315645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70316244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70317011 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70318428 G A Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 70318675 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70318807 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 70318956 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70319158 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70319219 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70319242 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70319251 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70319271 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70319362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70319365 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70319396 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70319489 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 70319550 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70319657 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 70319715 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 70319723 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 70319740 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 70320203 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70320310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70320445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70320532 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 70320604 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 70321108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70321184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70321359 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 70321569 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 70321764 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 70321806 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 70321820 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 70322176 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70322197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70322372 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70322466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70323424 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 70323688 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 70323841 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 70325672 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 70325733 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 70325791 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 70325892 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70325955 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70326003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70326150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70326355 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70326484 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 70326995 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70327367 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 70327397 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 70327562 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70327662 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 70327857 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70327944 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 70328273 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 70328417 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 70328427 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 70328467 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 70328676 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 70328892 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70328939 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 70329002 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 70329027 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70329093 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70329150 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70329996 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70330034 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70330050 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70330087 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70330098 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 70330184 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 70330212 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 70330301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70330392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70330618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70332913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70333002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70333757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70334046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70334720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70335118 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70336042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70336849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70339135 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 70340051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70340066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70340612 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70343115 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70345453 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70346317 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 70346456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70347722 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 70347968 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 70348225 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70348273 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70348336 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 70348445 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70348558 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 70348804 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 70348805 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 70349105 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 70349129 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 70349166 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 70349177 G T N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 70349353 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 70349492 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 70349757 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 70350120 T A N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 70350139 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 70350184 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 70350243 A C N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 70350379 A G N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 70350498 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 70350556 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 70350672 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 70350885 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 70351045 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70351107 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70351179 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70351198 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 70351221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70351255 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 70351256 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 70351292 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 70351347 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 70351413 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 70351496 C G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 70351621 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 70351765 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 70351809 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 70351912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70352060 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 70352450 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 70352474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70352510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70352553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70352618 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 70352643 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 70352708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70352813 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70352873 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 70352973 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70353032 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70353033 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70353112 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70353152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70353223 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70353267 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70353419 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70353475 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 70353643 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70353645 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70353661 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70353710 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70353797 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70353819 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 70354083 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70354209 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70354640 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70354687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70354892 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70354897 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70355016 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 70355237 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70355641 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 70355671 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70356016 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70356170 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70356181 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70356195 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70356316 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70356733 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 70356777 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 70356807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70356851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70357009 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70357025 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 70357067 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70357096 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70357250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70357361 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 70357440 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 70357452 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 70357465 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 70357480 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 70357519 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70357657 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 70357662 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 70357698 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 70357747 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 70357758 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 70357817 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 70357928 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70357985 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 70358059 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 70358182 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70358223 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70358239 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70358265 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70358459 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 70358715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70358770 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70358799 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 70358812 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 70358889 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 70359071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70359370 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70359412 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 70359570 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 70359571 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 70359650 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 70359730 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70359806 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 70359903 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 70360043 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 70360360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70360408 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 70360418 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 70360421 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 70360508 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 70360609 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 70360672 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 70361505 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 70361624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70361920 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 70361940 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 70362116 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 70362120 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 70362146 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 70362175 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 70362387 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 70362403 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 70362736 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 70362838 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 70363073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70363155 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70363187 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70363207 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70363420 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 70363581 C G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 70363665 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 70363716 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 70363763 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 70363789 C A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 70363810 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 70363921 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 70363968 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 70364091 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70364278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70365511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70365656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70365677 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 70365832 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70365996 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 70366400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70366678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70367136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70367509 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 70367807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70367848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70368072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70368426 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70369369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70369447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70370836 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70371707 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70373690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70374562 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70376011 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 70376162 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70376201 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 70376770 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70381623 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70383117 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 70384776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70385429 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 70385686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70385752 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 70387727 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70388230 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70388758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70388795 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70389876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70390411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70390681 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70391603 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70392834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70393111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70394310 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70394536 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70395941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70396870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70398441 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70398654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70398784 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70399830 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70403256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70403991 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70404620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70408087 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70408331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70408736 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70409248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70410389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70414073 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 70416473 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 70417362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70417430 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 70417878 G C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 70418658 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 70418883 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70419242 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 70419621 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70419748 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 70420503 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 70422205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70422266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70422736 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 70423231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70423939 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70424622 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 70424809 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70424819 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70424999 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 70425099 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 70425220 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70425313 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70425471 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 70425475 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 70425840 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70425880 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70426103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70426138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70426330 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 70426391 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70426415 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70426457 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70426607 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70426686 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70427005 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70427009 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70427042 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70427065 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70427066 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 70427096 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70427141 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70427163 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70427349 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70427350 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70427372 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70427464 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70427481 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70427535 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70427548 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70427575 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70427661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70427713 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70428042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70428115 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 70428342 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 70428407 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 70428443 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 70428620 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 70428794 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 70428806 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 70428896 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 70429010 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 70429311 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70429443 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 70429483 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 70429856 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70429880 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70429986 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70430098 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 70430312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70430422 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70430505 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70430890 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 70431002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70431050 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70431110 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70431132 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70431814 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 70432406 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70432502 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 70432619 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 70432641 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 70433108 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70433356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70433645 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70433979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70433996 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70434391 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 70434618 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 70434674 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 70434753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70434854 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70434936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70434949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70434958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70435102 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 70435159 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 70435376 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70435418 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70435453 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70435487 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 70435511 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 70435689 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 70436130 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70436306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70436316 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 70436364 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 70436381 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 70436403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70436651 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 70436688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70436901 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 70437291 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 70437556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70437647 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 70437906 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 70437990 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 70438210 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 70438498 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 70438581 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 70438646 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 70439015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70439019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70439309 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 70439339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70439609 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 70439684 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 70439729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70440516 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 70440646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70440657 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 70440685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70441336 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 70441353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70441431 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 70441607 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 70441628 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 70441683 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 70441758 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 70441822 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 70441868 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 70441958 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 70441994 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 70442048 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 70442396 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 70442764 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 70443035 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 70443152 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 70443430 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 70443506 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70443623 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 70443626 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70443649 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 70443652 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70443697 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70444588 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 70444691 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 70444715 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 70445013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70445057 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70445248 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 70445348 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70445577 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 70445581 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70445590 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 70445679 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70445754 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 70445755 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 70445784 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 70445851 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 70445952 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70446048 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 70446101 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 70446125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70446316 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 70446493 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 70446601 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70446622 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 70446656 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 70446672 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 70446687 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 70446720 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 70446801 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 70446934 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 70446937 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 70447060 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 70447108 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 70447183 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70447203 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 70447380 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70447491 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 70447540 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 70447667 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 70447796 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 70447934 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70448267 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70448457 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 70448714 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 70449402 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 70449945 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 70450144 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 70450585 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 70450828 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70450978 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 70451244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70451403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70451487 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70451639 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 70451854 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 70451996 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70452037 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 70452404 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 70452435 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70452458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70452479 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 70452494 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 70452572 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 70452749 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 70452828 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70453201 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70453764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70453930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70456536 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70456775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70457619 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 70459824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70461187 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70461247 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 70461351 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70461405 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70461418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70461420 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70461491 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 70461799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70462636 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70462689 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70464327 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70464367 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70464732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70464757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70464801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70464832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70464840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70464887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70464895 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70464950 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 70464972 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 70465003 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 70465029 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 70465191 T A Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 70465208 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 70465236 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 70465281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70465420 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70465421 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 70465476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70465580 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70466572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70466635 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 70467150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70467488 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 70467868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70468147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70468531 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 70469326 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 70469364 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 70469366 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70469465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70469684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70469712 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70470453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70470455 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70470587 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 70471512 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70471591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70471676 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70471776 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 70471879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70471892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70471928 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70471986 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 70471989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70471998 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 70472056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70472148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70472149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70472201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70472214 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 70472226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70472239 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70472260 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 70472308 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 70472337 G C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 70472440 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 70472811 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 70472854 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 70472970 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70473006 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 70473065 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 70473084 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 70473093 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 70473160 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 70473260 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70473380 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 70473490 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 70473573 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70473668 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 70473716 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70473718 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70473799 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 70473983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70474059 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 70474062 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70474076 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 70474268 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70474406 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 70474449 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 70474548 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 70474655 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 70474756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70474766 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 70474824 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 70474952 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 70476312 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 70476322 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70476364 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70476375 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 70476422 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 70476479 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70476556 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 70476595 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70476921 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70477254 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 70477434 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 70477490 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 70477502 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70477671 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 70477737 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 70477816 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70477989 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 70478187 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 70478240 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 70478292 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 70478387 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 70478913 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 70478948 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 70479544 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70479565 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70479626 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70479694 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70479697 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70479856 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70479859 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70479867 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 70479884 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70480063 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70480520 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 70480545 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 70480588 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 70480844 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70480845 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70480880 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 70480897 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 70480941 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70481688 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70481852 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70481909 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70481926 G T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 70481932 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 70481946 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70481999 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 70482006 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 70482157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70482213 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 70482244 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 70482247 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 70482291 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 70482374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70482448 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 70482451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70482487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70482686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70482764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70482797 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70482851 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70482880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70482895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70483142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70483425 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 70483538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70483686 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 70483979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70484041 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70484103 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70484372 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 70484382 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 70484465 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 70484470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70484533 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 70484605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70484688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70484738 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 70485069 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 70485353 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70485354 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 70485381 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 70485419 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70485458 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70485503 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70485541 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70485555 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70485749 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 70485768 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 70485774 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 70485831 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70485997 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70486014 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 70486018 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 70486098 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70486130 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 70486232 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70486460 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70486483 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70486623 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 70486627 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70486680 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70486693 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70486740 A T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 70486769 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70486770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70486785 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70486977 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70487004 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 70487197 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70487218 A T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 70487479 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 70487536 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 70487760 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 70487794 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 70487826 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 70487856 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70487874 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 70488045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70488065 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 70488107 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 70488266 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 70488286 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 70488289 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 70488357 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 70488444 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 70488500 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70488541 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70488701 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70488754 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 70488760 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 70488788 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 70488846 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70489126 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 70489239 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 70489921 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 70490072 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70490088 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70490169 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70490348 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70490952 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 70491030 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70491828 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70491865 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 70491987 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 70492407 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70492417 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 70492592 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 70492638 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 70492730 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 70492877 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 70492907 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 2 70493469 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70493523 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70493530 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70493654 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70493664 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70493685 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70493910 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 70493968 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 70494091 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 70494228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70494807 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70495675 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70495698 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70495845 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 70495991 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 70496072 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 70496819 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70497361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70497362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70497378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70497447 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70498487 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70498666 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 70499460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70500769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70501208 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 70501655 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70501840 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70501957 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 70503359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70503884 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 70504003 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70505271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70505659 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70506305 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70506800 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70508263 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70508601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70508973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70509586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70510856 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70510998 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70511499 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70512041 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70513829 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70513833 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70513902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70515860 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70517461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70518209 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 70519429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70520336 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70520432 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 70520460 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 70520582 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70520839 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70521195 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70521253 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70521257 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 70521403 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 70521469 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 70521598 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70521628 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 70521743 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 70521814 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70521909 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 70522290 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 70522291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70522678 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 70522873 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70523055 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 2 70523131 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70523305 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70523323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70523622 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70523655 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70523760 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70523983 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70524120 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70524221 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70524373 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70524732 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70524787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70525018 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 70525033 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 70525215 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 70525313 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70525352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70525896 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70525983 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70526081 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70526083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70526144 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70526496 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70526721 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70526727 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70526732 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70526759 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70526762 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70526783 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70527559 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70527579 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70527592 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 70527608 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70527639 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70527648 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70527867 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70527977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70528367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70528368 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70528582 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 70529325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70529486 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70530095 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 70530622 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70531589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70532041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70532105 C G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 70532106 T G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 70532148 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70532789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70533016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70533342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70534133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70534553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70534753 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 70535180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70538278 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70541598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70541614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70541786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70543677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70545386 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 70546016 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70547278 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 70547638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70551605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70552808 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70553113 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70553341 A C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 2 70554588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70557292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70561207 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70561921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70562637 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70563759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70564217 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70566184 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70566563 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 70566700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70568110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70573912 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70577926 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 70578542 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70579659 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70580082 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 70580113 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 70580743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70581263 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70589051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70589280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70590871 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 70592834 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70596590 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70596656 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70596707 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70596738 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70597054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70597337 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 70598282 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70598948 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70608680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70614250 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70614311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70614744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70615590 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70618044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70621007 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70622443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70622503 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70622515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70624748 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70624997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70625676 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70627690 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70627733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70627766 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 70627871 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 70627908 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70628364 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70629325 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70629491 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70630693 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 70631020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70632952 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70633695 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70634443 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 70638935 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70640062 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70641394 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70643272 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70644414 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70644441 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70644554 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70645649 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70648600 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 70648986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70651413 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70652229 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 2 70652406 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 70654588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70654617 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70656167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70656665 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70658113 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70658704 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70658712 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 70658716 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 70658908 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70660155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70664153 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 70665135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70666801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70671199 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70672353 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70673842 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 70675748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70677558 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70679277 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70680829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70680962 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 70681188 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70681392 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 70682323 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70682331 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70682334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70682469 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70684363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70684868 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70685555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70685825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70686346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70687044 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 70687615 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70687621 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70687629 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70688792 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70689006 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70689454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70690017 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 70690027 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70690934 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70691723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70691985 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 70693431 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70697108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70697256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70697530 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 70699038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70699097 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 70699111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70699153 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70699193 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 70699266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70703271 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70704519 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70705849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70706765 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70707022 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 70707047 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 70707156 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70707167 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70707227 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70707278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70707631 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70707663 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 70707717 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 70707780 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 70707847 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 70707934 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70708180 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70708218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70708245 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70708589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70709159 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 70709357 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 70709375 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70709541 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70709563 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 70709809 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70710040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70710063 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70710194 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70710252 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 70710281 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70710495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70710692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70710781 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70710896 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 70710942 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 70711233 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 70711363 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 70711402 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70711465 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 70711670 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70711691 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70711776 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70712857 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70713348 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70713481 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70713578 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 70713671 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70713783 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70713867 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70714039 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 70714181 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 70714202 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 70714400 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 70714403 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 70714816 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 70714997 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70715014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70715099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70715106 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 70715153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70716854 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70716935 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 70717022 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70717090 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70722895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70723487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70724371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70726065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70727381 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 70728425 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70729233 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70731281 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 70731631 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 70731934 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 70732103 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 70732268 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70732438 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 70732443 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 70732669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70733170 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 70733293 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70734590 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70734650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70735106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70735166 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70735393 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 70736044 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 70736114 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 70736660 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70736700 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70736719 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70736863 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 70736947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70737062 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70737089 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 70737110 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70737150 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 70737217 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 70737347 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 70737461 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 70737597 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 70737938 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 70737998 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 70738002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70738036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70738136 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70738252 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 70738299 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70738460 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 70738475 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 70738525 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70738839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70739122 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 70739198 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70739265 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70739349 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70740077 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70740155 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70740269 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70740360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70740416 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70740654 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70740744 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70740855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70740916 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70741113 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70741436 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 70741440 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70742008 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70742334 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 70742518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70743270 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70743272 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 70743298 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70743850 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70744044 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 70744192 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 70744431 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70744506 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70745266 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 70745272 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70745317 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70745410 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 70745427 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70745513 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 70745566 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70745651 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 70745734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70745748 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70745750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70745869 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70745989 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70746322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70746377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70746430 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70746523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70746574 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70746711 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70746923 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 70747089 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70747104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70747161 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70747256 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70747259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70747323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70747368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70747490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70747493 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70747605 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 70747663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70747968 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70748499 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 70748699 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 70748714 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 70748723 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 70748797 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 70748996 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70749034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70749297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70749363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70749367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70749473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70749524 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70749971 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 70750247 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70750559 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70751013 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70751525 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70751636 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70751835 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 70751871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70751957 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70752163 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70752168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70752239 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70752254 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70752330 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70752504 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70753372 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70753404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70753428 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70753431 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70753673 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70753724 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70753841 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70754502 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70754516 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70754650 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70755524 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70755555 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 70757617 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70757805 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 70757965 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70758448 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 70758858 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 70759046 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 70759155 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70759246 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70759307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70759312 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70759420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70759706 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70759836 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70759978 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70760011 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70760063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70760118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70760306 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70760343 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70761201 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 70762156 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 70762291 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 70762673 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 70763373 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 70763484 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 70763671 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 70763786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70763983 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70764027 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70764130 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70764134 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70764237 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70764279 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 70765053 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70765097 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70765730 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70765844 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70765878 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70765918 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70766007 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 70766227 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 70766417 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70766460 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70766462 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70766530 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70766631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70766677 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70766733 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70766749 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70766803 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70766945 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 70767342 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70767556 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70767629 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70767663 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70767706 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70767879 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70768016 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 70768164 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 70768902 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70768970 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70769062 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70769349 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 70769538 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 70769627 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 70770197 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70770362 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 70770363 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70770673 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70771016 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 70771076 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70771154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70771681 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70771794 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70771805 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70771974 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70772072 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70772428 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70772599 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70772673 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 70772766 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70772822 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70772858 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70772876 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70772966 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70773496 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70774343 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 70774422 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 70774500 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70774579 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70774580 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 70775020 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70775047 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70776207 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70778133 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70778494 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70778527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70778663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70780040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70780337 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 70780376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70780388 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 70780546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70780746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70781409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70781482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70781638 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70781732 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70781871 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70782169 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70782537 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70782658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70783552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70783683 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70783840 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70783963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70784074 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70784266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70784801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70784821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70784970 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70784980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70785239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70785254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70785606 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70785828 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70786023 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 70786312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70786675 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 70786683 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 70787523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70787678 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 70787708 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70788061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70788410 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70788675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70788746 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 70788898 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70788918 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 70788931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70789152 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70789330 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70789549 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70789961 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70790078 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70790189 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70790242 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70790285 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 70790332 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70790546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70790799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70790878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70791001 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 70791175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70791660 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70791702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70792022 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70792053 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70792122 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70792156 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 70792263 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70792284 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70792455 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70792528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70792588 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70792611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70792682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70793104 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 70793338 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 70793568 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 70793586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70793635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70793648 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70793668 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70793724 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70793966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70794256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70794298 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 70794353 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 70794368 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 70794407 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 70794431 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70794600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70794677 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 70794848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70794886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70794898 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 70794939 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 70794997 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70795033 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 70795061 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 70795163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70795182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70795259 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 70795441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70795480 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 70795492 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 70795983 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 70796009 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 70796391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70796406 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70796663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70796682 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70796790 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 70797177 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 70797320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70797794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70797963 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70798642 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70798654 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 70799008 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70799193 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70799780 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 70799895 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 70799901 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 70800025 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70800038 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70800510 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 70800523 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70800561 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 70800644 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70800711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70800937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70800986 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70801107 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 70801246 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 70801363 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 70801368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70801484 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 70801566 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70802620 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70802837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70803019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70804501 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 70804910 A T N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 70805073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70805243 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 70805343 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 70805386 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 70805715 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70805833 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 70806029 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 70806161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70806311 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 70806390 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 70806446 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70807026 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70807827 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70807883 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70808100 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70809906 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 70810363 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70810926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70811428 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70812507 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 70812530 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 70813943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70813983 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70813987 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70814036 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 70814042 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70814047 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70814060 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 70814080 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70814283 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70816682 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70816795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70817381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70817595 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70818425 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70818716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70819091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70819131 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70819151 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70819815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70820068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70820216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70820337 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 70820696 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70820758 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 70821304 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 70821504 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70821677 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70821711 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 70821725 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 70821741 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 70821826 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70821829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70821976 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70823137 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70823591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70823920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70824010 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 70824055 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70824407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70824650 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70824651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70825051 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70825186 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70825453 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 70825481 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70825504 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 70826281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70826851 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70826888 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70827467 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70827541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70827724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70827930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70828485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70828649 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70828698 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70828889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70829996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70830194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70830389 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70830506 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70830932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70832433 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 70832601 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 70832658 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 70833424 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70833496 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 70833639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70834098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70834879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70835229 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 70835248 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 70835249 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 70835268 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 70835349 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 70835481 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 70835635 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 70835648 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 70835666 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 2 70836317 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70836466 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70836476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70836478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70836568 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70836585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70836652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70836790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70836972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70837183 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70837234 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70837304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70837377 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 70838146 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 70838301 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 70838446 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70838535 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 70839063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70839093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70839359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70839574 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 70839762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70839774 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70840117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70840136 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70840306 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70841054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70841203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70841239 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70841409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70841438 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70841483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70841667 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70841712 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70841919 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70842091 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 70842130 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 70842136 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 70842492 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70842659 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70842814 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 70842846 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70842988 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70843013 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 70843165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70843259 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70843310 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70843644 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 70843711 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70843755 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70843961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70844011 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70844336 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70844497 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70844498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70844689 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70844800 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70844940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70845069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70845202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70845348 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70845355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70845528 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70845541 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 70845593 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70845640 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70845677 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70847175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70847698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70851959 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70853101 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 70853122 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70853248 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 70853347 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 70853410 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 70853445 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 70853497 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 70853650 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 70853729 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 70853882 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 70853987 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 70854076 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70854149 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70854156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70854273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70854293 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70854712 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70855315 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 70855385 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70855395 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70855552 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70855580 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70856003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70856134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70856327 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70856803 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 70856848 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 70856982 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70857049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70857282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70857284 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70857495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70857624 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70859250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70859306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70859310 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70859499 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70859571 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70859584 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70860106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70860115 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 70860153 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 70860190 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70860584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70860625 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70861049 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70861178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70861195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70861402 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 70861475 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 70861547 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70861564 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70861721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70861772 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70861969 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70861996 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 70862014 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70862035 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70862044 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 70862553 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70862636 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70862656 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70862869 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 70862978 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70863046 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 70863067 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70863105 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 70863116 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 70863124 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 70863129 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 70863138 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 70863701 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70863779 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70864111 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 70864138 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 70864245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70864565 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70865745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70866163 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70867864 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70868474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70870510 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70872231 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70872316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70872979 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70873592 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70873808 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 70873841 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70873901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70874211 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 70874351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70874802 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 70875025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70875462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70875730 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70876421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70878783 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 70879460 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70880204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70880461 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70881045 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70881083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70881248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70882082 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70882264 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70882354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70882445 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70883463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70883661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70883711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70883720 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 70883731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70884094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70884101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70884153 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70884162 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70884320 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70884969 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70885135 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70885169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70885180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70885511 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70885515 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 70885977 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 70886433 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70886449 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 70886451 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 70886483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70886940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70887023 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70887265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70887454 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70887694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70887708 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70887726 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70887919 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70887945 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 70888051 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 70888235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70888261 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70888268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70888285 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 70888288 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 70888392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70890279 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70890306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70890509 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70890948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70891001 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70891335 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70892267 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70892619 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 70892715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70892836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70892911 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 70893149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70893766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70893814 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70893897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70893923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70893968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70894410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70894511 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70894959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70895244 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70896094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70896114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70896325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70896490 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 70896819 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70897230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70897529 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70897816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70898295 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70898596 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 70898853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70899288 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70899562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70899576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70899594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70899651 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 70899678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70899746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70900516 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70900572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70900704 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70900714 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70900833 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70900870 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 70901391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70901658 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70901683 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 70901761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70901973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70902636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70902658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70902846 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70909545 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 70909567 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 70909581 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 70909595 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 70909647 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 70909666 A C Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 70909913 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 70910122 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 70910128 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 70910288 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 70910356 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70910371 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70910429 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70910596 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70910650 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70910948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70910975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70911242 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70911431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70911877 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70911950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70912109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70912207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70912377 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70912378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70912544 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70913306 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70913730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70913782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70914142 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70914335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70914380 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70914490 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70914785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70915164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70915561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70915786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70915808 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70915850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70915858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70916261 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70916908 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 70916971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70916990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70917148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70917275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70917291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70917345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70917388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70917414 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 70917506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70917530 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70917643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70917685 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70917718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70917792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70917796 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70918031 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70918130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70918214 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70918231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70918271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70918544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70918762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70918784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70918986 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70919180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70919184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70919206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70919400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70919534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70919539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70919551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70919578 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70919606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70919613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70919661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70919854 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70919876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70920050 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70920107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70920320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70920344 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70920690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70920869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70920938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70921096 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70921393 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 70921760 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70921762 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 70921771 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70921809 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70921872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70921977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70922262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70922297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70922319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70922387 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70922645 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70922911 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70924100 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70924243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70935509 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70936251 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70937164 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70937165 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70945800 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70946756 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70946802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70948189 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70948201 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70948219 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70948220 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70948281 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70948347 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70948439 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70948596 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70948744 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70948750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70948911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70948920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70948999 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70949244 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70949262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70949444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70949685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70949773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70949859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70949980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70950139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70950147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70950219 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70950284 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70950380 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 70950463 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70950614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70950869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70951165 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70951173 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70951179 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70951292 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70951747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70951810 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70952828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70952887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70952932 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 70952937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70953776 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70954012 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70954383 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 70955271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70955287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70955532 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70955624 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 70955659 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70955760 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 70955852 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 70955920 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 70956044 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 70956110 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70956121 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 70956136 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 70956261 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 70956523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70956587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70956591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70956717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70957728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70957805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70957841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70957938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70958288 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 70958868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70959397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70959418 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70959750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70960188 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 70960377 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70960464 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70961474 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 70961976 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 70962413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70962657 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70962923 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 70963052 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70963214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70963453 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70963914 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70963931 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 70963971 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70964185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70964517 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 70964548 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70964716 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 70964752 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70965233 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 70965238 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 70965615 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 70966006 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70966179 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70966365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70968553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70968705 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 70968750 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70968883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70968895 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70968909 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 70968946 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 70969085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70969286 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 70969474 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 70969722 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 70969877 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 70969939 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 70970002 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 2 70970034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70970111 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70970178 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70970574 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70970592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70970877 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70970896 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 70970993 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70971150 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70971157 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70971321 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70971332 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70971409 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70971515 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70971560 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70971563 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 70971690 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70971718 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70971739 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70972017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70972105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70972337 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70972339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70972570 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70972686 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 70972742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70972757 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 70972891 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 70972905 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70973134 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 70973502 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70973556 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70973576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70973684 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70973724 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70973828 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70973846 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 70973851 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 70973865 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70973923 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70973946 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70973996 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70974021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70974068 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 70974103 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 70974138 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 70974324 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 70974567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70974592 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70974678 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70974693 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70974786 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 70974885 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70974950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70975077 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 70975290 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 2 70975295 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 70975451 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70975718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70975842 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 70975876 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 70976038 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 70976055 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 70976076 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 70976154 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 70976180 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 70976350 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 70976374 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 70976507 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70976525 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 70976563 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 70976567 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 70976883 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70976885 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70977028 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70977215 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 70977239 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 70977253 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 70977262 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70977345 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70977354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70977545 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 70977612 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 70977757 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 70978016 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 70978033 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70978268 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70978296 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70978358 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70978368 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70978399 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70978451 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 70978463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70978627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70978915 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70980213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70981560 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 70981671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70981850 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 70981895 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70981937 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70981979 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 70982005 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 70982049 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 70982064 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 70982418 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70982997 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 70983010 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70983340 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 70983409 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 70983424 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 70983459 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 70983463 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 70983705 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 70984332 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 70984333 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70984639 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 70984675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70984855 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 70984969 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70986361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70986823 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 70987232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70987510 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70988431 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 70988660 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 70988862 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 70988887 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 70988913 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70989014 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 70989250 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 70989296 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70989845 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 70990239 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70990430 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 70990608 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 70990814 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 70990875 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 70990990 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 70990998 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 70991153 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 70991355 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 70991376 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 70991550 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 70991556 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 70991575 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 70991583 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 70991821 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 70991839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70992440 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70992616 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 70993000 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70993064 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 70993447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70993640 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70993721 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70993794 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 70993899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70993925 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70993928 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 70993992 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 70994008 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 70994134 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 70994210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70994255 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 70994490 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 70994503 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 70994547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70994550 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 70994715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70994727 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70994742 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 70994813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70994815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70994878 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 70994893 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 70995308 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 70995355 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 70995943 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 70996220 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 70996422 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 70997547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70997655 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 70997835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70998522 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 70998754 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 70998780 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 70998989 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 70999118 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 70999186 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 70999188 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 70999424 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 70999432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70999448 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 70999562 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 70999587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 70999625 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71000105 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71000258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71000369 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 71000496 C T Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 71000524 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 71000616 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 71000623 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71000708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71000861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71000880 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 71000893 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 71000900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71000955 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71000982 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 71000997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71001069 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 71001074 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71001134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71001331 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 71001452 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 71001800 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71001819 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71001960 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71002204 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 71002506 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 71002537 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71002548 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71004446 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 71005024 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71005516 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 71006021 A C Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 71006548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71007131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71008335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71014920 C G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 71016171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71017098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71017492 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71017544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71018536 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71019273 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 71019358 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 71020241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71020608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71021014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71021303 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 71021982 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71022375 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 71022923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71023187 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71023837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71026189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71028316 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71028633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71032903 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71033431 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71033615 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71033775 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71033866 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71033902 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 71034213 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71034274 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71034327 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 71034391 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71034480 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 71034818 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 71035297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71035389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71035548 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71035763 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 71035890 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71037447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71037745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71038019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71038576 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 71040411 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 71040580 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71040875 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71040899 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 71040948 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 71040964 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71040971 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 71041264 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 71041402 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 71041488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71041592 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 71041661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71041871 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71041970 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 71042098 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71042249 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 71042380 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 71042513 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71042536 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71042707 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 71043619 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 71043638 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 71043812 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71043842 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71043851 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71043871 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71043909 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71044372 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71044375 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71044401 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71044644 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 71045210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71045683 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 71045694 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 71045930 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71046202 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 71046321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71046419 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71046566 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 71047263 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 71047566 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71047891 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 71048576 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 71048796 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 71048831 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71048897 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 71048941 T A N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 71049375 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71049782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71050676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71050986 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 71051216 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71051282 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71051464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71053779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71054863 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71054980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71055118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71055687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71056678 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71058276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71058700 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 71058812 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71059224 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71059498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71059755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71060044 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 71060292 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71060359 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71060935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71062520 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 71062532 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 71063988 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71064000 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 71064022 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 71064259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71064656 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71065528 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71065650 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 71065820 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 71065822 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 71065847 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71066569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71066970 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71067685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71068362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71069097 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71069150 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71069420 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 71069668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71070019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71070175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71070904 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 71071152 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 71071236 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 71071300 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71071362 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 71071431 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71072110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71072168 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 71072583 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71072589 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 71072715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71072896 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 71072938 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 71072999 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 71073027 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 71073146 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 71073589 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 71073727 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71073793 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71075098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71075637 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 71076770 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 71076774 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 71077348 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71077636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71077776 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71078383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71078468 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 71078632 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 71078807 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 71079314 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 71079369 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 71079457 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 71079528 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71079593 T G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 71079655 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 71079858 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71079959 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 71080032 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 71080075 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 71080091 C A Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 71080221 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 71080334 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 71080373 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 71080382 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 71080549 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71080561 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71080831 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 71080845 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 71081320 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 71081492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71081493 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 71081620 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71081642 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 71082454 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 71083967 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 71086107 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 71087320 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71087611 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 71088095 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 71089327 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 71090358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71090565 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71090879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71090949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71091154 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71091483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71091643 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 71091690 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 71092462 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 71092630 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 71092709 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71092806 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 71092928 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71093038 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71093294 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 71093392 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 71093509 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 71094033 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 71094050 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 71094102 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 71094135 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 71094189 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71094262 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 71094348 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71094421 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71094476 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 71094634 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 71095251 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 71095299 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 71096066 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 71096611 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 71099237 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 71100440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71101224 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 71103682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71104340 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 71105422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71105754 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 71105771 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 71105842 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 71105894 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 71106122 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71106881 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71106907 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71106918 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 71107183 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71107238 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71107660 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71107683 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71107706 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 71107782 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71107874 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 71107949 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 71107967 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 71108338 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 71108862 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71109056 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71109426 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71109501 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 71109708 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71110555 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71111123 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71111239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71111296 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71111960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71112045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71112087 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71112145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71112760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71113347 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 71113452 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 71113711 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 71113907 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71113951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71114085 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 71114309 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 71114344 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 71114400 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 71114608 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 71114610 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71114630 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 71114789 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 71114981 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 71115077 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71115118 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 71115704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71116059 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71116602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71116745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71118020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71118080 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 71118081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71118147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71118648 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71118664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71118678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71118858 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 71118870 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 71118899 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71119056 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 71119334 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71119447 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 71120017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71120937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71121027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71121081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71121190 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 71121399 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 71122092 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 71122289 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71122570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71122740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71122835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71122905 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 71123555 C A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 71124169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71126078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71126585 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 71126596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71127368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71128672 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71129964 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71130622 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 71134508 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 71135326 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 71135361 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 71135425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71135460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71136454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71137809 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71138830 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 71139926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71140212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71141338 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71141979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71149017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71149752 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71150828 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71151665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71151891 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71152446 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 71152541 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 71152544 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 71153643 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 71153665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71153696 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 71153783 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 71153860 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 71154179 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 71157587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71158476 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71158717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71159107 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 71160227 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71160597 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71160653 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 71162253 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71164495 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 71165132 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71165720 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71167109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71167284 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71167809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71168456 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 71170980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71171247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71171522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71171784 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 71172652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71173265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71173331 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71174147 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 71175018 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 71175093 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71175278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71175550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71175600 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 71175662 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 71175695 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 71175745 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71175955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71176021 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 71178767 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71180126 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71181712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71183180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71184923 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71184935 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 71185063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71185162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71185232 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71185263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71185302 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71185315 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71185556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71185618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71185782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71185837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71185908 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71185938 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71186155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71186415 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71186429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71186478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71186490 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71186798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71186815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71187089 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 71187115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71187249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71187459 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 71187510 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71187511 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71187654 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71187684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71189732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71190125 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71190644 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 71191268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71191380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71193040 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71194468 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71194770 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 71194911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71194994 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71195389 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71195506 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 71195528 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 71195551 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 71197012 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71201106 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71201382 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71202547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71204959 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71206236 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 71206431 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71207286 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71208064 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 71208078 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 2 71208081 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71208100 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 71208191 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 2 71208374 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 71208386 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 71208392 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 71208405 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 71208418 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 71208613 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 71208666 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 71208679 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 71208681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71208690 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 71208730 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 71208867 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 71208930 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 71209051 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 71209063 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71209088 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 71209431 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71209442 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71209619 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 71209837 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 71209856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71210128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71210156 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 71210191 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 71210397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71210473 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 71210508 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 71210593 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71210833 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 71210848 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 71210904 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 71210906 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 71210995 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 71211118 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 71211149 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 71211214 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 71211303 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 71211320 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 71211345 C T N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 71211398 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 71211504 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 71211517 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 71211704 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 71212136 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 71212257 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 71212711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71214243 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71214316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71214384 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 71214559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71215259 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 71215756 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71215804 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71215806 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71216019 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 71216197 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 71216526 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 71216628 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71217042 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71217143 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71217345 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71217365 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71217762 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71217952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71218773 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 71219111 G A N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 71219711 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 71220588 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 71220843 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 71220864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71221286 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 71221551 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 71221572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71221589 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71221727 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71221817 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 71221915 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 71223167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71223538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71224171 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 71224200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71224227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71224300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71225592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71225863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71226169 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71226384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71227082 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71228493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71232560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71237562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71239368 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 71242420 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71245706 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71249531 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71250838 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71250859 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 71264846 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71265329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71267914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71269299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71270267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71271633 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71275142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71275533 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 71280291 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71282576 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71282972 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71284598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71285520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71285955 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71286075 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71286581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71286766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71287231 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71292112 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71293756 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 71295726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71295918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71298801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71299308 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 71300502 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71301710 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71301802 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 71304291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71305918 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 71306092 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 71306127 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 71306189 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 71306421 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 71306617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71306652 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 71306817 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 71308031 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 71308096 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 71308258 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 71308369 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 71308453 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71308618 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 71309056 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 71309094 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 71312147 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71313364 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 71313500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71313884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71314051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71314539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71314653 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71314895 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71315414 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71315879 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 71320130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71326024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71326154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71326999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71327673 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71327814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71328214 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71328395 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71328410 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71328446 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71328758 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71328781 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71328803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71328839 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71328985 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71329045 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71329136 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71329162 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71329170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71329324 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 71329457 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 71329693 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71329761 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71329826 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71330007 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 71330008 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 71330397 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71330431 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71330558 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71330569 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 71330636 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71330642 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71330877 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 71330881 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 71331067 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71331123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71331232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71332187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71332857 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 71332901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71333233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71333249 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71333568 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71333952 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 71334056 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 71334088 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 71334107 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 71334155 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 71334270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71334430 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 71334435 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 71334500 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71334501 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 71334866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71334891 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71334896 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 71335130 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71335378 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71335396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71335440 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71335653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71335833 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 71335855 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 71335919 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 71336085 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 71336144 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 71336229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71336270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71336399 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 71336481 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 71336580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71336694 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 71336711 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 71336714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71336925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71336976 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 71337949 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71338158 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 71338249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71338793 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 71339535 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 71339632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71339664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71340324 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71340590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71341157 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 71341187 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 71341402 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71341413 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 71341574 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 71341747 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 71341899 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 71341912 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 71341953 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 71341976 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 71342048 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 71342202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71342272 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 71342307 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71342551 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 71342674 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 71342679 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 71342789 C G N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 2 71343075 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 71343090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71343408 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71343537 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71343604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71343790 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71343914 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71344205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71344279 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 71344543 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 71345092 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 71345373 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71346056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71346385 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 71346410 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71346568 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 71346702 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 71346710 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 71346809 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71346854 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71348018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71349812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71350067 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 71350069 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 71350304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71350950 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71351045 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71351474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71352601 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 71353174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71353414 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 71353868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71357918 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71357924 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71358042 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71358155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71359279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71359465 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 71359634 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71359875 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71360229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71360746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71360993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71362724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71363115 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71363199 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 71365230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71366658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71367127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71369562 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71369899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71370518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71370915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71372433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71373021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71374396 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71378918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71380229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71381110 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71384540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71386551 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71386771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71387653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71387697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71387879 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71389321 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 71389457 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 71389755 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71389767 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71390066 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 71391570 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 71391583 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 71391618 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 71392388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71392958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71393248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71393470 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71394013 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 71394051 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 71394058 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 71394465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71394531 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71394532 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71396115 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 71396283 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 71396351 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 71396870 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71397808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71397860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71398263 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 71398305 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 71398364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71398376 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 71398425 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 71398513 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 71399340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71400908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71404340 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 71404730 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 71404749 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 71404760 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 71404787 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 71404823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71405030 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 71405073 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 71405242 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 71405335 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 71405682 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 71405720 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 71405721 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 71405848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71405863 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 71405969 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71405989 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 71406061 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 71406107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71406108 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71406123 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 71406168 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71406289 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71406300 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71406333 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71406463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71406518 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71406811 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71406894 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71407028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71407192 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 71407336 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 71407418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71407419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71407479 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71407488 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71407541 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71407545 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71407559 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71407619 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71407620 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71407732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71408198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71408261 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 71408344 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71408357 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71408404 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 71409112 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 71409761 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71410468 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71410474 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 71415396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71415461 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 71416466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71417439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71418122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71418339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71419147 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71420699 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71425633 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71425700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71426977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71427396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71427775 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71427812 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 71428148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71428178 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71428311 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71428996 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 71429710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71429801 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 71430182 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71430368 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71430501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71430502 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71430589 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71430600 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 71430647 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 71430768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71431294 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71432230 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 71432786 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 71432938 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71432942 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71433278 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 71433423 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 71433477 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 71433501 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 71433571 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 71433971 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 71434161 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 71434267 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 71434396 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 71434497 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71434498 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71434526 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71434602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71434877 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 71434931 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71434986 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71435147 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71435170 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71435203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71435214 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 71435321 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71435436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71435484 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71436288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71436521 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71436620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71437011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71437335 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 71437461 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 71437582 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71438087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71438541 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 71438595 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 71438745 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 71438754 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 71438782 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 71438793 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 71438823 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 71438845 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71438896 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 71438912 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 71438980 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 71439234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71439271 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 71439333 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 71439506 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 71440451 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 71440732 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71441015 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 71441100 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 71441110 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 71441207 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 71441366 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 71441454 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 71442093 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71442117 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 71442298 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 71442374 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 71443076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71443188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71443517 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71443544 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71443569 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71443657 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 71443873 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 71443918 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71443943 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 71444692 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 71444725 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 71444749 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 71444757 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 71444938 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 71445541 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71445557 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71445581 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71445916 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 71445932 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 71445937 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 71445952 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 71447246 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 71447305 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 71448443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71450799 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 71451511 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 71451517 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 71456324 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71458709 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 71458757 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 71460429 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 71460434 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 71460580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71460728 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 71460750 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71460841 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 71461104 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 71461251 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71461344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71461731 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 71462030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71462322 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71462430 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 71462482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71462488 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71462512 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71462561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71462584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71463286 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 71463496 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 71463508 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71464437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71464717 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71464836 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 71465068 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 71465076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71465079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71465858 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71467393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71471828 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71475667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71476089 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 71476467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71480453 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71484808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71486154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71486890 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71487520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71490444 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71490599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71490653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71494490 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 71495409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71496258 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 71496355 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 71496508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71496706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71496735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71496793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71497240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71497370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71497506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71497708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71497716 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71497808 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 71497868 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 71498050 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 71498063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71498471 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 71498558 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 71498640 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 71498703 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 71498832 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 71498919 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 71499761 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 71499800 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 71499839 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 71499843 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 71499993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71500189 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71500193 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71500549 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71500803 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71501151 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71501166 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71501371 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71501400 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 71501476 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 71501647 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 71502322 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 71502395 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 71502421 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 71502703 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 71502709 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 71502743 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 71502877 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 71502884 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 71502909 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 71502949 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 71503017 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 71503204 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 71503259 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71503538 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 71503907 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 71504014 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71504192 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 71504248 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 71504268 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71504300 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71504342 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 71504470 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71504504 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 71504804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71505238 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 71505247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71505318 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71505329 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71505384 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 71505418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71505420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71505754 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71506581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71506622 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 71506793 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71506837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71506865 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71507013 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71507046 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71507141 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71507588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71508086 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71508087 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71508413 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 71508700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71508792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71508803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71508845 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71508902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71509188 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71509671 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 71509852 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71509861 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 71510096 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 71510146 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 71510224 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71510230 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71510327 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 71510335 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 71510339 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 71510439 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71510505 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 71510569 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71510620 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 71510644 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 71510675 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 71510727 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 71510935 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 71510957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71511107 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 71511280 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 71511302 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 71511576 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 71511584 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 71511596 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 71511608 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 71511791 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 71512013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71512190 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 71512361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71512448 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71512460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71512688 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71512712 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 71512754 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 71512800 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71512830 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 71512865 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71513608 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71514270 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 71514318 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71514371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71514948 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 71515053 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71515055 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 71515130 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 71515220 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 71515228 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71515241 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71515342 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 71515788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71515942 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 71516271 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 71516383 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 71516422 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71516462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71516488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71516556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71516590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71516611 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71516930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71517631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71517783 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71518669 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 71519127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71519229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71519339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71519374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71519412 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71519476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71519972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71520032 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 71520057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71520822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71521064 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71521110 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71521183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71521210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71521281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71522211 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 71522215 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 71522325 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 71522422 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 71522434 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71522592 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 71522638 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 71522718 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71522819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71523054 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71523183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71523364 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 71523484 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71523562 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 71523802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71523843 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 71523914 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71524699 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 71524744 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 71524932 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 71525112 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71525411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71525440 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 71526039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71526728 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71526933 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 71526934 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 71527104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71527196 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 71527222 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 71527237 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 71528540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71528612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71528974 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 71529032 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71529502 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71530579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71530583 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71531651 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71532923 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 71533556 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 71533668 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 71533805 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 71533879 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 71534287 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71534427 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 71534456 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71534490 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 71534604 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71534760 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 71534826 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71534831 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71534851 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 71534936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71535343 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 71535739 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 71535746 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71536327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71536525 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71536535 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71536819 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71536841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71537080 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 71537163 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71537349 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71537405 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71537432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71537677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71537836 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71537982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71538001 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71538280 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 71538299 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 71538437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71538913 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71539135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71540243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71540408 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71540814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71541115 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71541296 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71541337 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71541352 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71543046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71543912 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 71544197 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 71545066 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 71545183 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 2 71545555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71545613 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 71545742 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 71545911 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71545920 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71546045 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 71546082 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 71546109 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 71546150 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 71546206 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 71546233 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71546242 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71546400 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71546406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71546429 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 71546432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71546587 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71546835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71546889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71546897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71546901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71546990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71547061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71547065 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71547089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71547144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71547287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71547855 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 71547914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71548010 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71548448 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 71548538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71548642 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 71548741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71548891 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71549481 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 71549517 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71549538 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 71549666 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 71549819 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 71549898 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71549918 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 71550114 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 71550177 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 71550186 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 71550213 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71550230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71550277 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 71550287 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 71550713 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 71550742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71550822 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71550836 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71550855 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71550969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71551094 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 71551204 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 71551383 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 71551426 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71551615 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71551781 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71551931 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 71551956 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71552103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71552180 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 71552190 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 71552222 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 71552225 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 71552291 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 71552327 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 71552349 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 71552518 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71552713 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 71552736 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71552745 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71552994 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 71553005 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 71553524 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 71553528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71553586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71553675 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71553686 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71553798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71554002 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 71554399 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 71554528 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 71554667 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 71554846 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 71554880 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71555085 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 71555527 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 71555829 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71556153 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 71556413 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 71556933 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 71557134 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 71557137 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 71557260 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 71557262 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 71557306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71557315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71557318 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71557739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71557834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71557867 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71557885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71558180 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71559024 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71559180 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71559575 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71559589 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71560071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71561398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71561500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71561509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71561738 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71561766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71561892 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71562487 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 71562762 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71562767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71562863 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 71563001 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71563025 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71563160 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 71563310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71563390 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71563635 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 71563648 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71563696 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71563813 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 71563881 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 71563895 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 71564187 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 71564479 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 71564496 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 71565947 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71566209 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 71566334 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 71566346 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 71566368 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 71566412 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 71566671 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71566673 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71567393 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 71567599 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 71567786 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71568099 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 71568195 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71568304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71568430 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 71568542 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71569559 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71569578 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71569839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71570145 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 71570236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71570668 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 71570671 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 71570692 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 71571093 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71571296 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 71571393 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 71571492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71571560 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71571568 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 71571612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71572036 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 71572055 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71572180 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71572269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71573269 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71573291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71573304 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71573315 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71573526 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71574344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71574375 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 71574468 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 71574589 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71574686 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71574736 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 71574793 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71574951 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71575270 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 71575951 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71575954 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71576103 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71576938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71578061 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 71578713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71578732 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71578798 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 71580181 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 71581658 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71581697 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71581743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71581803 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 71582154 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 71582177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71582459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71582613 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 71582968 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71583008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71583405 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71584295 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 71584366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71586759 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 71586788 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 71587397 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71587822 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 71588624 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 71589114 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71589273 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 71589812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71590606 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71590682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71591172 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71591340 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71591390 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 71591440 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71591600 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71591616 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 71591624 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71591715 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 71591796 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71591807 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71591845 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71591867 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71591887 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71591976 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 71592306 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 71592319 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 71592379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71592393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71592515 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 71592518 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 71592540 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 71592669 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 71592755 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 71593146 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 71593367 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 71593414 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 71593461 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 71593642 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 71593979 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71594170 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 71594443 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71594462 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 71594832 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 71594893 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 71594993 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 71595626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71596367 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 71596450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71597538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71597698 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 71598117 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 71598169 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 71598203 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 71598374 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 71598992 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 71599031 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71599034 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71600322 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71600472 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71600473 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 71600764 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 71601068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71601119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71601291 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 71601310 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 71601335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71601791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71603468 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71603568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71603605 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71603699 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 71603757 G C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 71604765 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71605007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71605009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71605070 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71605150 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71605476 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71605519 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 71605895 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 71606048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71606291 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71606456 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 71606742 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 71606921 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 71606932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71607163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71607176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71607233 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 71607561 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71607637 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71607729 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71607921 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71607960 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71607980 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71608007 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 71608058 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 71608282 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71608612 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71608803 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71608907 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 71609045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71609079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71609144 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 71609206 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 71609233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71609529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71609654 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71609716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71610056 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 71610058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71610203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71610238 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 71610345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71610428 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71610467 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 71610505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71610515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71610763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71610829 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 71610842 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71611475 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71611487 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71611512 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 71612397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71612815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71612977 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71613149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71613297 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71614466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71616083 A C Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 71616805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71618017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71618917 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 71621489 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71621555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71621616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71621630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71621841 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 71621857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71621882 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71621955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71622633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71623208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71623248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71623362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71623598 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 71624705 C G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 71625205 G T Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 71625433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71625821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71627355 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 71631699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71631700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71634025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71641009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71642647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71642660 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 71643199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71644796 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71644941 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 71645036 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 71645113 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 71645275 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 71645356 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71645565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71645607 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71645989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71646060 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 71646254 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 71646441 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71647311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71647785 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 71650072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71650618 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 71653235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71653416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71656018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71656362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71656474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71657029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71657031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71657566 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 71657662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71657993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71660097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71660167 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71660288 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 71660346 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 71660383 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 71661172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71661551 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71661693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71662336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71662634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71664258 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 71665425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71665701 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71667222 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71667836 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 71668267 T C N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 71669662 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71669684 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 71669743 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 71669834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71669835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71669860 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 71669898 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71670069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71670109 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71670267 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71670356 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71670364 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71670416 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 71670450 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 71670470 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 71670622 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 71670709 A C N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 71670781 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 71671104 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 71671142 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 71671276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71671287 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 71671354 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71671355 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71671546 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71671568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71671622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71672005 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71672448 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71672792 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 71672812 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 71672952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71673014 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71673064 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 71673591 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 71673694 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71673718 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 71673768 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71673894 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71673932 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71674172 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71674511 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 71674580 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 71674825 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 71674860 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 71674881 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71675010 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 71675075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71675085 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 71675096 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 71675106 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 71675212 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 71675358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71675378 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 71675418 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 71675609 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71675974 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71676049 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71676577 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71677238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71677357 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 71677659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71678534 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71680251 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71680964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71682051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71682719 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 71682745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71683064 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71683113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71684366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71685093 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71686478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71686519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71686689 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71686928 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71687366 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 71688739 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 71689326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71689464 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 71689471 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 71689502 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 71689644 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 71689972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71690066 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71690260 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 71690839 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 71690954 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 71691172 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71691279 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 71691418 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71691477 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71692056 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 71692130 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71692166 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71692414 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71692648 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71692655 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 71693086 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 71693535 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 71693687 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71693691 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71697065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71699110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71699434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71699621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71700637 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 71700737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71701141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71701306 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 71702587 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71702903 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71702921 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71702965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71702976 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 71703048 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 71703548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71703616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71703713 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71703732 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71703761 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 71703790 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 71703826 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 71704184 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 71704748 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 71704751 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 71704889 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 71704965 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71704995 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71705629 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 71705800 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 71706069 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71706172 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 71706175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71706353 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71706357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71706436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71706499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71706824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71706905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71707317 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71707652 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71708156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71708303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71708365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71708472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71708479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71708825 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71708873 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71710152 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71710720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71711637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71712309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71713061 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71713214 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 71713819 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 71713966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71713996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71714086 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71714144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71714263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71714703 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71714710 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 71714890 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 71714921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71715251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71715357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71715382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71715442 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71715478 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71715500 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71715833 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 71715889 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71716411 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71716413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71716974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71716977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71716996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71717025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71717254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71717260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71717675 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71717918 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 71718293 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71718402 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71718405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71718554 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71718570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71718581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71719164 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71719381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71719384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71719690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71720046 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 71720572 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71720630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71720918 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 71721012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71721408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71721800 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 71722062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71722258 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71722469 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 71724141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71724154 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71724162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71724268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71724458 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71724516 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71724800 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 71724913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71725055 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71725168 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71725224 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 71725310 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 71725650 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71725841 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71725998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71726039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71726314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71726325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71727304 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 71727502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71728143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71728299 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 71728608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71728678 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 71728698 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 71728725 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71728951 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 71729000 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 71729030 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71729082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71729138 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 71729193 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 71729561 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 71729629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71729661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71729740 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 71729893 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 71730258 G C N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 2 71730371 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 71730415 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 71731097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71731316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71731369 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 71731504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71731530 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 71731633 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 71731686 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 71731746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71731756 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 71731768 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 71731772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71731826 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 71731845 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 71732066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71732099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71732100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71732158 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71732178 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71732230 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 71732285 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 71732306 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 71732335 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 71732402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71732778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71733119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71733135 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 71733225 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 71733352 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 71733435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71733620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71733864 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71733948 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 71733987 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71734329 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 71734674 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 71734832 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 71735068 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 71735180 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 71735198 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 71735314 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71735395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71735524 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 71735647 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 71735694 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 71736132 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 71736168 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 71736470 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 71736555 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 71736629 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71736669 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 71736980 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 71737020 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 71738189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71738989 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 71739159 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 71740524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71740902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71741479 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 71741651 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 71742184 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71742540 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 71742543 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 71742956 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 71742998 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 71743048 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 71743105 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 71743249 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 71743293 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 71743302 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 71743316 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 71743318 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 71743403 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71743419 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71743478 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71743484 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 71743534 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 71743551 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71743891 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71744309 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71744835 A C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 71744985 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71745086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71745268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71745368 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71745827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71745904 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71746023 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 71746577 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71746589 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 71747210 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 71747350 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 71747564 A C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 71747680 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 71747700 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 71748125 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 71748268 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 71748377 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 71748573 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 71749164 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 71749565 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71749727 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71749740 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71749788 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71750025 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71750063 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71750099 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71750100 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71750124 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71750169 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71750297 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 71750314 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 71750397 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71750407 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71750504 T C Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 2 71750530 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 71750696 G T Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 71750729 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 71750779 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 71750783 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 71750837 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71751116 T G N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 71751298 G C Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 2 71751300 T C Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 71751316 G C Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 71751418 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71751562 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71751636 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71751686 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71751761 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71751910 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71752022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71752097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71752292 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71752504 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71752574 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 71752575 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71752587 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71752668 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71752731 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71752870 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71753050 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71753200 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71753290 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 71753293 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 71753314 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71753324 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71753387 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71753408 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71753467 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71753479 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71753945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71754005 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71754048 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71754103 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71754179 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71754254 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71755422 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71755556 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71755776 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71755784 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71756256 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71756257 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71756311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71756767 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71757131 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71757499 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71757550 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71757651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71757742 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71757743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71757753 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71757879 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71757880 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71758003 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71758116 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71758211 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71758221 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71758356 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 71758358 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 71758423 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71758433 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 71758461 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71758498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71758652 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71758868 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71758878 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71758891 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71758950 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71758960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71758964 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71758979 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71759265 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71759266 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71759311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71759547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71759579 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71759691 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 71759763 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71759784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71759829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71759920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71759953 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71760114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71760160 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71760177 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71760181 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 71760629 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 71760659 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71760788 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71760868 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71760953 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 71761436 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 71761478 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 71761621 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 71761676 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 71761740 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71762057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71762600 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71762709 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 71762774 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71763500 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71764211 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71764582 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71764807 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 71765064 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71765135 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71765515 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71765614 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71766585 G T Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 71766587 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 71766844 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71766848 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71766871 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71767076 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71767636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71767870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71768035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71768071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71768153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71768202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71768311 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71768334 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71768528 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 71768534 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 71768552 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 71769217 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71769263 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71769300 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 71769734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71769814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71769946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71770003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71770317 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71770334 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71770340 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 71770346 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71770496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71770620 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 71770652 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 71770661 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 71770716 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71770757 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71770796 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71770896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71771487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71771536 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71771573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71771682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71771882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71772060 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71772071 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71772272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71772305 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71772316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71772553 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71772572 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71772599 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 71772601 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 71772624 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 71772638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71772658 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 71772667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71772681 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 71772833 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71772995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71773062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71773073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71773121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71773128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71773145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71773210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71773272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71773354 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 71773423 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71773429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71773437 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71773481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71773537 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71773676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71773756 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71774102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71774112 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71774128 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 71774163 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 71774172 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 71774216 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71774283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71774395 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71774562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71774625 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71774672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71775090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71775156 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71775320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71775489 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 71775581 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 71775592 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71775601 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71775606 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 71775620 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 71775632 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71775855 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71775872 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71775958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71776194 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 71776226 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 71776242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71776419 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71776430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71776489 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 71776497 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 71776511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71776527 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71776650 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 71776688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71776689 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 71776919 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 71777049 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 71777155 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71777541 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 71777838 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 71777911 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71777921 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71778228 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71778367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71778512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71778632 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 71778670 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 71778794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71779003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71779121 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71779448 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71779716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71779735 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71779777 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71779835 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71779851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71779897 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71779930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71779974 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 71780052 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71780103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71780182 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 71780186 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 71787433 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71787586 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 71787655 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 71787667 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71787692 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 71787951 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 71788021 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71788022 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71788034 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71788039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71788063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71788169 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71788176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71788217 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71788245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71788273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71788281 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71788347 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71788463 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71788671 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71788726 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71788885 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71789018 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71789029 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71789034 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71789098 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71789160 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71789225 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71789239 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71789257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71789289 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71789372 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71789989 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71790132 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71790274 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 71790277 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71790390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71790480 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 71790574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71790816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71790839 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71791121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71791145 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 71791324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71791424 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 71791485 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71791891 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71791937 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71792029 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71792253 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71792254 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71792373 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 71792498 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 71792512 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71792592 G C Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 71792602 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71792788 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 71792827 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 71792873 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 71792973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71792975 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71793063 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71793215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71793599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71793604 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71793816 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71794009 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 71794285 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71794552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71794577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71794600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71794629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71794909 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71794980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71795112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71795161 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 71795229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71795353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71795362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71795469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71795626 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71795678 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 71795780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71795878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71796045 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71796904 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71796907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71798401 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71798434 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 71798613 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71798706 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 71798748 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71798765 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71798766 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 71798795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71798855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71798859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71799064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71801181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71801209 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71801265 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71803268 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71804558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71806552 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71806852 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 71806913 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 71807011 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 71807012 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 71807396 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 71807522 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71807590 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71807653 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71807658 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 71807732 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 71807926 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 71808206 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 71808368 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 71808369 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 71808379 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 71808502 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 71808555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71808741 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 71808910 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71809071 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 71809255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71809338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71809381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71809485 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71809502 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71809620 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71809681 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 71809693 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71809723 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 71809979 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 71809999 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71810191 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71810250 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71810281 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71810302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71810318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71810333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71810389 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71810464 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71810465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71810558 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 71810612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71810777 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71810789 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71810801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71810816 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 71810853 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 71810878 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71810917 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71810948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71811588 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71811616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71811789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71811853 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 71811893 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 71812238 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 71812636 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 71813041 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71813340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71813344 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71814300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71814418 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 71814531 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 71815685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71815814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71815826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71816192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71816405 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 71816421 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 71816425 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 71816527 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 71816678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71816689 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71816753 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 71816860 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 71816933 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71816954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71816964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71817049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71817079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71817246 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71817346 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71817392 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 71817441 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 71817442 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71817455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71817567 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71818037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71818275 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71818414 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71818653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71819737 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71819790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71820398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71820846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71821422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71821582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71821983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71824363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71824708 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71825305 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71825389 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 71825469 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 71825608 T A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 71825647 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 71825652 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71826080 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 71826086 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71826197 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71826217 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71827574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71828435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71830311 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 71831598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71834787 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 71837037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71838334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71838427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71838499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71839704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71839803 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71840122 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 71840263 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71840387 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 71840479 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 71840514 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 71840605 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71840638 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 71840715 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71840729 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71840736 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71840846 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71841023 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 71841098 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 71841145 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 71841233 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 71841755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71842277 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 71842353 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71842520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71842705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71842717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71842740 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 71843404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71843900 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 71844001 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71844091 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71844101 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 71844210 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 71844214 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71844324 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71844461 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71844799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71844909 T G N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 71845355 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 71845489 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71845650 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71845681 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71845857 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 71845960 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 71845991 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 71846454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71846745 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 71847008 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 71847040 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 71847132 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 71847144 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 71847237 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71847262 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 71847388 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 71847668 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71848028 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71848092 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 71848115 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71848585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71848898 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 71848962 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 71849067 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 71849220 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 71849231 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 71849293 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 71849439 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 71849473 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 71849599 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 71849619 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 71849646 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 71849874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71849923 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 71849988 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 71850017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71850028 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71850046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71850108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71850198 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 71850224 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 71850249 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 71850405 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 71850410 T A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 71850487 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 71850491 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 71850535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71850544 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 71850598 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 71850603 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 71850668 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 71850749 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 71850879 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 71851169 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 71851241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71851255 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71851322 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 71851345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71851439 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 71851477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71851635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71851659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71851672 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71851687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71851702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71851706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71851731 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 71851733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71851769 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71851800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71851835 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71851923 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 71851924 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71851955 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71851958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71851980 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71852129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71852161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71852255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71852350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71852361 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71852475 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71852572 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71852600 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71852646 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71852760 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71852965 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71853108 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71853350 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 71853870 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71853880 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71853889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71853907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71854127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71854218 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71854285 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71855349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71855612 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71855679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71856640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71857796 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 71858365 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 71859243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71860844 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71860950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71861695 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71862869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71863510 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 71865388 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 71866259 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71867110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71868763 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 71870198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71870638 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71872720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71873400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71875221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71875254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71876032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71876168 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 71876220 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 71877261 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 71877601 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 71878320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71878331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71880522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71880610 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71880695 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 71880706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71880745 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71880766 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71881523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71881540 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71881960 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71882204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71882514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71883918 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71884432 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 71884605 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 71884894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71885033 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71885140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71885607 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71885708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71886935 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 71887626 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71887692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71887719 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71888007 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 71888022 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71888063 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71888064 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71888263 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 71889276 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 71890288 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 71893825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71894093 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71894142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71894221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71897861 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71899204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71900951 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71901063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71901782 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71902527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71902622 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71902808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71903379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71903766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71904875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71905420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71905435 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 71905476 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71905502 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71908223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71908238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71908412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71908711 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71909022 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71909079 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71909128 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 71910141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71910189 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71910497 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 71910514 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 71910520 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 71910612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71910872 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 71911658 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 71911985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71912052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71912188 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71912246 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 71912624 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 71912661 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71912768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71913078 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71913099 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71913512 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 71915311 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 71916739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71917772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71919134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71919855 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 71920378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71920558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71920654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71920697 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71921184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71921241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71921588 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 71921875 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 71922223 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 71922262 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 71922428 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71922441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71922514 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71922516 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71922541 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 71922588 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 71922770 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 71922834 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71922937 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71923449 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71923636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71923649 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71923680 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71924394 A T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 71925385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71925733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71928589 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 71929123 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 71929142 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 71929206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71929394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71929876 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 71929982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71930275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71930316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71931521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71933445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71933461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71933809 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 71933946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71934102 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 71934121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71934151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71934656 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 71934823 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 71935191 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 71936618 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 71936733 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 71937505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71938750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71939834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71940551 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71940866 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71940942 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71942400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71943386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71944958 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71946253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71946368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71946920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71947099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71947157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71947380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71948360 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 71950660 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71950666 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 71950680 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 71950687 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71950924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71951400 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71952396 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 71954169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71954620 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71956213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71956256 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 71956799 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 71956828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71957710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71957755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71957792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71957867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71957881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71957955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71958032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71958033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71958096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71958142 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71958327 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 71958428 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 71958886 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 71958960 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 71958980 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 71958986 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 71959056 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 71959880 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 71960856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71962108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71962504 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 71963322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71965546 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71965657 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71965792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71966163 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 2 71966213 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71966277 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71966318 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71967011 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 71967043 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 71967152 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 71967187 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 71967205 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 71967222 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71967331 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71967438 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71967651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71967751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71968247 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71968417 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71968488 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 71968504 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 71968606 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 71968620 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 71968673 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 71969101 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71969193 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71969219 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 71969314 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71969335 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 71969368 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71969376 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71969780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71970117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71971714 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71972130 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 71972131 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 71972511 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 71973059 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 71973078 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 71973079 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 71973115 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 71973127 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 71973612 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 71973668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71973702 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 71973752 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 71973779 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71973809 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 71973866 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 71973871 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 71973976 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 71974057 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 71974147 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 71974435 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71974453 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71974603 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71974667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71975023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71975547 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 71975567 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71975587 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 71975642 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 71975847 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 71975911 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 71976362 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 71976453 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 71976829 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71977065 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71977081 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 71977097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71977117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71977255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71977315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71977578 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 71977656 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 71977672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71977689 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71977781 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71978060 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71978074 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71978171 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71978190 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71978193 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71978356 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 71978360 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 71978529 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71979014 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 71979027 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 71979330 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 71979490 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 71979575 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 71979588 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 71979693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71979743 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 71979744 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 71979797 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71979813 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71979845 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71979853 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71980046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71980121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71980214 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71980265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71980435 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 71980459 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71980542 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 71980644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71981060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71981142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71981225 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 71981346 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 71981727 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71981808 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71981816 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71981846 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71982206 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71982540 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 71982634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71982669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71982725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71982810 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 71983060 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71983093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71983346 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 71983912 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71983965 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71983999 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 71984384 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71984433 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 71984732 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 71985227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71985384 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 71985509 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 71985596 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71985660 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 71985838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71986139 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71986140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71986375 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 71986955 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71987172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71988341 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71989848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71991287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71991999 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71992494 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71992512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71993408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71994002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71994294 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 71994384 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71994429 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 71994959 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 71995267 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 71995328 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 71995617 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 71995693 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 71995789 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71995925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71995975 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 71995978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71996002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71996149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71996182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71996447 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 71996472 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 71996522 A G Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 71996697 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 71996737 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 71996800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71996821 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 71997330 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 71997347 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 71997352 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 71997396 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71997421 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 71997436 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 71997561 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71997781 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 71998006 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 71998149 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 71998347 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71998487 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 71998551 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 71998661 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 71999000 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71999018 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 71999157 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 71999201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71999288 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 71999475 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71999610 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71999620 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 71999626 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 71999635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71999661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 71999798 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 71999880 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 71999905 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72000368 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72001899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72001999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72002882 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 72002891 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72002898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72003718 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 72004267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72004295 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 72004309 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 72004329 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 72004378 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 72004445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72004711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72004743 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 72004905 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72004985 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 72005043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72005051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72005063 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 72005106 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 72005121 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72005164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72005217 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72005339 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 72005357 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 72005358 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 72005405 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 72005475 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72005526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72005690 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72005848 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 72005870 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 72005904 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72005905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72005955 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 72005980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72005984 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 72006057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72006102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72006151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72006199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72006216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72006364 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 72006459 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 72006504 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 72006534 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 72006598 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 72006768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72006786 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72006886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72006951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72006959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72007012 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72007050 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72007073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72007080 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72007392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72007640 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 72007757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72007876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72008587 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 72009157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72009561 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 72009632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72009691 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 72009879 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72010903 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 72011584 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 72012076 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 72012148 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72012194 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 72012237 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72012586 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72012671 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72012691 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72012976 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72013138 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72013372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72013439 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 72013833 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72013838 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72014247 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72014281 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72014534 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 72015317 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 72015341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72015677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72016433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72017343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72017638 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72018291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72018730 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 72020367 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72020431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72020657 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72022205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72022237 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 72022273 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72022388 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72022522 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72022527 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72023089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72023431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72023442 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72023719 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72023761 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72023822 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 72023968 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 72024130 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72024447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72025078 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72025161 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72025172 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72025193 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72025217 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72025378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72025426 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 72025438 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72025544 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72025704 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 72025738 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 72025826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72025920 T A N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 2 72025986 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 72026203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72026293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72026366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72026806 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72027047 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72027178 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72027215 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 72027429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72027720 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 72027929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72031646 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 72032080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72032362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72033624 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 72033682 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 72033954 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72035047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72035126 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72035605 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 72035618 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 72036802 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72037035 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 72037300 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 72037458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72037574 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 72037631 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 72037819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72037840 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72037902 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72038061 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 72038144 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 72038359 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 72038607 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 72039342 C G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 72039533 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 72039680 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72039714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72039776 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 72039802 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 72039888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72040009 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72040433 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 72040437 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 72040446 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 72040462 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 72040480 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 72040568 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72040767 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 72040791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72040801 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72040876 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 72041060 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 72041212 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 72041320 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 72041365 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72041371 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72041744 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72043267 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72043817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72044039 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 72044221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72044310 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 72044473 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 72044534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72044714 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 72044718 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 72044759 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 72044827 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72044896 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72044948 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72045300 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 72045622 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72046266 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 72047581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72047912 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72048136 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72049109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72049254 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 72049378 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72049520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72049566 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 72049579 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 72049597 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 72050403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72050677 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 72050786 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 72050832 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 72050903 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 72050942 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72051055 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 72051067 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72051130 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72051182 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 72051305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72051709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72051747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72051748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72051983 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72052157 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72052603 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72052667 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72052718 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72052832 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 72052847 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72053034 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72053082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72053151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72053172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72053444 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 72053640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72053703 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 72053793 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 72054189 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 72054963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72055363 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72055425 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 72055509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72055607 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72055716 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72055811 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 72055816 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 72055852 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 72055917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72056350 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 72056593 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72056646 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72056683 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72056853 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 72057115 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 72057139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72057388 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72057400 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72057432 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 72057461 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 72057641 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72057678 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 72057679 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 72057743 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72058281 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 72058300 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 72058386 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 72058419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72058587 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 72058702 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72058704 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72058787 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72058800 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72058853 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 72058956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72058980 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72059137 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 72059215 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 72059248 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72059258 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72059417 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 72059563 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 72060167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72060218 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72060219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72060287 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72061543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72061614 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 72062845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72062860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72062923 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72062926 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72063357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72065303 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72065361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72067369 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72067786 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 72068203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72069518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72070837 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 72071538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72071584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72072505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72072866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72073747 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72074182 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72074211 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72074264 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72074858 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72074920 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 72075026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72075616 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72075633 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72075645 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72078482 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72078770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72078783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72078882 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72079914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72080683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72082174 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72082833 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 72083508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72084058 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72085156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72087353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72087437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72088059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72088275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72089177 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 72089279 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72089337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72089477 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72089561 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 72089664 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72089869 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 72090485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72090557 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72091141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72091218 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 72091340 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 72091976 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72093310 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72093957 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72097181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72097366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72098877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72099753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72099925 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 72100124 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 72100589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72102772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72103391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72103461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72103509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72103681 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 72103787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72104071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72104142 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72104367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72104736 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 72107086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72108211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72114411 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72114455 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 72116155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72116826 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 72116860 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72116955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72120066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72120402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72121101 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 72122420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72123356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72125874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72126099 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 72127242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72127312 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 72128177 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 72128188 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 72128588 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 72128928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72129033 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 72129175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72129733 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72129823 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 72129899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72130191 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72130270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72130376 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72130630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72130789 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72130794 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72130812 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 72130830 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 72133583 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72134336 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 72134350 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 72134868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72136142 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72137474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72137688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72137736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72138366 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72140127 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72141181 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 72141230 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 72142337 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72146067 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 72146271 A T N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 72146527 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 72146674 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72146768 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72146997 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72147127 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72147524 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72147586 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 72147796 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72147805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72148024 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72148284 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72148329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72148338 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72148410 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72148483 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72148518 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 72148535 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 72148615 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 72148725 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 72148728 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 72148816 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72148824 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 72148949 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72149111 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 72149431 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 72149530 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 72149626 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 72149648 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 72149722 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 72149776 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72149805 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72150945 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 72153005 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 72154169 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 72155515 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 72155527 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 72155552 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72155748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72155749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72157215 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72157357 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 72158112 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 72159310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72159405 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 72161714 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 72161754 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 72162554 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 72163870 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72165375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72166917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72168596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72168680 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72168811 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 72170163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72171525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72173257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72175058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72176224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72176773 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72177743 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72178162 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72180120 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 72180208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72180322 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 72180384 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72180454 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72180861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72181044 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 72181053 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 72181091 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 72181247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72181408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72181575 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72181641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72182748 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 72183014 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 72183214 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72183242 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 72183286 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72183538 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72183742 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72183925 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 72184009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72184047 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72184078 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 72184399 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72184579 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72184583 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72184607 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72184743 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72184756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72184769 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72184809 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 72184890 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 72184966 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72185011 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72185012 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72185026 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72185061 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72185201 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 72185326 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72185343 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 72185345 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 72185590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72185708 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 72185710 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 72190965 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 72191588 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 72191750 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72193071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72193295 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72193561 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 72194697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72194699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72195475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72195534 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 72195754 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72196039 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 72196397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72196475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72196513 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 72196768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72197079 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72198636 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72200719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72202056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72202773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72202856 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72203461 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 72203488 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72203759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72204339 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 72204369 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72204556 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 72204885 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72205135 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 72205365 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 72205399 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 72205501 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 72205789 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 72206634 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72206964 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 72206975 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72206981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72207009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72207013 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 72208336 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72208686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72208716 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 72208727 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 72209493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72209514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72209553 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 72210331 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72210917 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 72211220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72211474 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72211673 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72213575 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72213608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72215215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72215257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72218147 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72218245 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 72218481 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72218585 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 72218604 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 72218816 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 72218847 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 72219354 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72219433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72219834 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 72220384 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72221326 A C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 72221586 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 72221699 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 72222585 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 72223045 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 72223113 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72223410 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 72223473 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 72223824 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 72223927 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 72224014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72224096 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 72224157 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 72224222 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 72224231 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 72224289 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 72224393 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 72224445 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72224520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72224559 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 72224605 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 72224785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72224884 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 72224970 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 72225008 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 72225560 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 72226016 T C N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 72226027 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 72226028 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 72226207 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 72226224 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 72226247 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 72226559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72227059 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 72228367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72228583 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 72228653 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 72228941 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 72229776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72230935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72231421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72231502 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72231688 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 72231743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72232412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72233562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72233588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72233738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72233745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72234224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72235573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72235581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72236262 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72236298 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72236850 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72237058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72237529 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 72237612 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 72237886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72237895 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 72238610 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72238672 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 72238798 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 72238799 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72239258 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 72239884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72241485 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72241517 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72241991 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72243943 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72250081 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 72252571 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72253370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72253454 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 72255143 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72255423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72256605 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72258246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72259311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72259327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72259463 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72259556 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72260354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72260576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72260863 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72261770 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72261910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72262346 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 72262956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72265661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72266213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72266806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72267062 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 72267110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72267401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72267454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72268470 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72268772 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 72268778 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 72268876 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 72269630 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72270901 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72271086 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 72272428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72273267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72273431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72273690 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 72274098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72274293 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72275467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72275475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72275910 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 72275911 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 72275935 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 72275978 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 72276088 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72276218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72276260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72276845 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72277611 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 72277777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72277964 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 72278011 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 72278511 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 72278603 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 72279965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72279989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72280995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72281393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72281430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72281487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72281523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72281524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72281767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72281768 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 72282553 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 72282740 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72282917 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72283319 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 72283468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72283483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72283504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72283567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72283655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72283666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72283821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72283870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72283972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72284111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72285066 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72286368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72291585 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 72295113 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72295395 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 72295577 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 72295590 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 72295734 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 72295773 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 72295825 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 72296072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72296073 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72296463 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72296753 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72297741 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72298051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72300751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72300766 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 72300837 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 72300924 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 72301095 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 72301188 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 72301229 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 72301246 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 72301459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72302176 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 72302229 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72302268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72302415 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72302443 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72302620 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 72303097 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72303149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72303408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72303439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72304132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72304168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72305094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72305118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72305171 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72305194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72305226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72305734 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 72305793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72305884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72305925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72306025 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72306192 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72306345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72307082 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 72307769 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 72308206 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 72308325 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72308525 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 72308874 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 72308883 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72308959 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 72309049 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72309070 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 72309077 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 72309194 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 72309206 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72309233 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 72309326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72309397 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 72309403 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 72309432 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 72309647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72309655 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72309658 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72309719 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72309752 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 72309814 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72309932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72309996 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72310184 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72310193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72310289 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72310315 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 72310504 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 72310727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72310745 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 72310934 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 72311020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72311632 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72311704 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72311713 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72312194 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72312404 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 72313070 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72313629 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 72314168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72315009 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 72315038 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 72316619 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 72316640 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 72316808 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 72317857 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 72318585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72318654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72318718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72319331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72319416 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72319579 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 72319759 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72319975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72320153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72320256 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 72320274 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 72320340 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 72321168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72321240 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 72321779 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72322104 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 72322458 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 72322520 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72322559 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72322829 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 72322968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72323116 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72323126 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 72325289 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 72325655 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 72325717 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 72326691 A C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 72326781 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72326897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72327219 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72328379 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72328488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72328595 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 72328665 C T Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 72328871 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 72328880 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72328893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72329082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72329644 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 72329877 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72329961 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 72330020 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 72330042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72330078 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72330125 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72330142 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72330234 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72330936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72331374 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72331520 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 72331706 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72331709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72331763 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 72331905 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 72331934 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 72332019 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 72332338 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 72332450 T C Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 2 72332720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72333034 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72333132 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72333164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72333181 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72333188 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72333275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72333285 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72333299 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72333328 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72333385 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72333400 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72333461 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72333465 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72333505 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72333897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72334082 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72334205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72334261 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72334385 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72334438 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72334469 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72334520 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72334534 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72334540 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72334585 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72334587 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72334616 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72334650 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72334676 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72334744 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72334754 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72334783 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72334854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72334984 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72335075 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72335250 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72335316 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72335407 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 72336014 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72336029 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 72336031 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72336057 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 72336190 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 72336252 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 72336414 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72336519 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72336569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72336599 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72336634 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 72336677 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72336776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72336848 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 72336922 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 72336944 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 72337331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72337561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72337885 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 72338095 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 72338165 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72338200 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 72338202 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 72338244 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 72338367 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 72338410 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72338683 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72338731 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72338769 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72338784 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72338967 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 72339198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72339402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72339808 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72339942 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 72339976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72339984 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 72340243 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 72340272 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72340288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72340720 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72341486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72342590 T C N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 72342609 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 72342623 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 72342803 A C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 72342988 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 72343372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72343968 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 72344102 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 72344184 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72344266 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72344297 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 72344323 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72344377 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72344447 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72344449 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 72344656 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 72344676 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 72345013 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72345035 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72345116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72345166 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72345284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72345399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72345650 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72345833 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72346180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72346318 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72346909 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72347001 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72347050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72347608 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72347948 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72347993 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72348078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72348485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72348500 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72348503 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72348534 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72349198 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 72349717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72350902 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72351214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72352208 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 72352752 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72352973 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 72353865 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 72353997 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 72354223 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 72354401 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 72355512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72357152 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 72357229 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 72357256 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 72357846 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72357847 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72357858 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72357969 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72357988 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72358409 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 72358822 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72358942 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 72358948 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72358958 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72359043 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 72359204 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72359219 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72359330 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 72359477 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 72359490 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 72359519 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 72359905 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72359960 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 72359983 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72360334 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72360388 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 72360582 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 72360663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72360688 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72360801 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72360916 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 72361041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72361110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72361118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72361169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72362853 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 72363048 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 72363361 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72363410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72363771 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72363787 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72363804 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72363816 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72363858 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72363875 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 72363886 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 72363911 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 72363936 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72364120 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 72364210 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 72364211 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72364464 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 72364789 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 72364838 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 72364993 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 72365216 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 72365359 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 72365411 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72365450 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72365461 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72365483 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 72365508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72365655 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72365911 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 72366116 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72366181 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 72366616 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 72366618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72366650 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 72366748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72366784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72366804 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 72366826 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 72366984 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72367570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72368222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72368314 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72368622 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72369490 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72369673 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 72369677 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 72369734 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 72369750 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 72369758 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 2 72370067 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 72370103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72370275 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 72370568 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 72370582 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 72370686 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 72370742 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 72370968 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 72371252 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72371543 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 72372768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72373333 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 72373352 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72373359 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72373444 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72373672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72373779 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 72373821 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 72373876 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 72373985 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 72374004 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72374036 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 2 72374037 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 2 72374324 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72374449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72374557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72374970 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 72375191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72375377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72375884 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 72376273 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72376379 A T N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 72376380 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 72376395 T A Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 72376640 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 72376833 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72376869 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72376938 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72377029 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72377221 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72377799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72377983 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 72377998 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 72378015 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 72378027 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72378252 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72378324 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72378468 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 72378983 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72379003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72379030 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72379184 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 72380189 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 72380378 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 72380405 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 72380507 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 72380597 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 72380834 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 72380844 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 72380860 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 72380945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72380989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72381560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72381643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72381743 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 72383075 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72383425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72383914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72385170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72385225 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72386872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72387674 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 72388201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72388834 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 72389090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72390506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72391477 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 72393614 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 72394369 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 72394549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72395634 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72395636 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 72395766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72395901 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 72395991 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 72397590 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 72397860 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 72398757 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 72400309 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 72400444 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 72400523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72400524 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 72400643 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 72400677 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72400678 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 72401320 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72401435 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 72401448 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 72401461 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 72401804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72401814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72401868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72402190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72402226 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 72402367 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 72402417 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 72402597 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 72402869 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 72402996 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 72403235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72403271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72403493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72403548 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72403566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72403618 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72403772 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72403849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72403894 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 72403903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72404661 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 72404761 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 72405074 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 72405194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72405376 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 72405431 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 72405443 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 72405665 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 72405926 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 72405943 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 72406312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72406452 A C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 72406480 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 72406535 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 72406963 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 72407109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72407157 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 72407179 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 72407254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72407347 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 72407371 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 72407444 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 72407451 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 72407699 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 72407968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72408068 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 72408116 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 72408767 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 72408791 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72408801 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 72408885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72409900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72409924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72410176 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 72410249 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 72410293 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 72410318 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72410379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72410478 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72410581 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 72410708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72411101 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 72411114 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72411154 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72411254 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 72411371 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72411439 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 72411464 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 72411620 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 72411633 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 72411677 A T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 72411701 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 72411757 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 72411788 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 72412584 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72412672 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72414406 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72415011 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72415462 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 72415473 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72415671 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72415820 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 72415872 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72415985 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72416112 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72416137 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72416144 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72416190 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72416220 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72416225 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72416246 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72416252 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72416284 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72416285 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72416352 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72416374 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72416400 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72416449 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72416599 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72416667 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72416670 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72416807 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 72416825 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 72416894 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 72416950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72417148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72417467 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 72417493 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 72417529 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 72417697 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72417841 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 72417878 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72417912 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 72418097 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 72418201 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 72418211 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 72418253 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 72418311 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 72418348 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 72418447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72418794 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 72418805 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 72418840 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 72419107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72419144 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 72419492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72420014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72420264 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 72420382 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 72420395 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 72420539 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 72420551 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 72420676 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72420851 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 72420921 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 72421072 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 72421717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72422123 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 72423320 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 72423349 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 72423544 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 72423778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72424149 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72424237 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72424765 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72424947 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72425017 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 72425042 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 72425226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72425391 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72425575 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 72425696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72425901 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 72425950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72425995 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 72426139 C G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 72426171 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 72426256 A C N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 72426374 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 72426560 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 72427524 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 72427811 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72427864 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72428019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72429220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72429336 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72429447 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72429958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72430063 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72430093 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72430820 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72430917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72430996 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72431466 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 72431505 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72432265 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 72432450 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72432743 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 72433621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72433987 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 72434169 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72434305 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72434394 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72436563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72436797 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72437075 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 72437076 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 72437130 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 72437191 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72437269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72437281 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72437570 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72437597 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 72438119 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72438478 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72438484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72438594 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 72439363 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 72441330 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72442047 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72442125 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 72443135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72443675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72444948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72445211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72445329 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72445765 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72447377 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 72448291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72449928 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 72451387 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72451812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72453628 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 72453878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72454498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72454792 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 72454857 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 72454949 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 72455396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72455565 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72455753 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 72456118 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72456812 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72457040 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72457330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72457632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72460431 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72460559 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72460839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72461083 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72461496 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 72461757 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 72461789 A T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 72462000 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 72462029 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 72462076 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 72462252 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 72462601 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72463936 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72463988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72464012 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72464221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72465094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72465625 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72465797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72465894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72466025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72466498 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 72466586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72467187 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72467339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72467454 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72467593 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72467765 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72467772 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72468526 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 72468797 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 72468818 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 72468879 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 72468984 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 72469038 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 72469183 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 72469318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72469976 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 72470043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72470761 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72470773 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72470962 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 72471034 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72471101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72471130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72471136 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72471147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72471197 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72471219 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72471239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72471791 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 72473604 A C N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 72473691 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 72474698 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72474755 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72474762 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72474789 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72474953 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72474973 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 72474984 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 72475868 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 72476630 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72477104 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 72478017 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 72478065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72478098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72478205 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 72478711 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72478724 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 72478727 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 72479025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72479375 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 72479460 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72479768 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72479773 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72479836 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72479907 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72480009 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72481978 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72482015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72482793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72483164 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72483662 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72483833 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 72486297 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 72486394 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 72487069 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 72488200 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72488257 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 72488402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72489167 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72492627 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 72492915 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72493397 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72493529 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 72493728 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72494920 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 72494951 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72495026 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72495080 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72499610 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 72499637 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 72499750 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 72499759 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 72499791 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 72499934 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72500047 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 72500773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72501801 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72501806 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72502202 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 72502403 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 72502460 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 72503900 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72504176 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 72504505 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72504669 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 72504670 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 72504724 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72504739 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 72504873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72504897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72504969 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 72505149 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72505199 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 72505200 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 72505379 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72505463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72505505 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 72505608 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72506288 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72506406 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72508615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72508806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72509135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72511295 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72511328 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72512736 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72512826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72513553 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 72515205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72515211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72516171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72516432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72516642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72516756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72516974 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 72517067 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 72517159 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 72517206 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72517841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72519036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72519065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72519715 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72519859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72522783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72523068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72523108 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72524063 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 72524172 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72524590 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72526446 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72527291 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72527365 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72527708 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72528082 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72528975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72529402 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72529826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72530296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72530373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72530420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72531685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72531690 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72531865 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72531960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72532171 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 72532243 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72532265 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 72532720 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 72532769 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 72532821 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72533080 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 72533100 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72533261 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72533330 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72533469 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72533582 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72533602 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 72533750 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 72533867 C T N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 72533899 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 72533905 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 72534008 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 72534019 A C N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 72534038 T A Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 72534041 C T Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 72534057 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 72534128 C T Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 72534851 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 72534883 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 72534898 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 72534917 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 72534995 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 72535094 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72535118 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 72535178 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 72535230 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 72535270 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 72535311 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72536096 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 72536559 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 2 72536939 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 72537074 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72537157 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 72537261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72537262 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72537565 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72537580 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 72537608 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 72537987 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 72538020 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 72538179 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 72538188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72538213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72538272 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72538416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72538456 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 72538734 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72538750 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72538857 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 72539040 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 72539372 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 72539482 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 72539556 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72539854 A C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 72539937 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 72539971 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72539989 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72540098 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72540628 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 72541628 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 72541863 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 72542085 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 72542473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72543950 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 72544180 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 72544181 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 72544332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72544403 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 72544440 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 72544447 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72544731 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72544782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72547416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72547893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72551872 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 72552412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72554388 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 72554431 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72554988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72555674 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 72555680 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72559542 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 72560515 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 72560525 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 72560679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72560722 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 72560724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72561018 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 72561158 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 72561407 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 72561668 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 72561793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72562004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72562049 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 72563065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72564012 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 72564251 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72567157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72572450 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 72575294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72576332 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72576774 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 72576797 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 72577510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72577735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72577905 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72578095 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 72578132 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 72578240 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 72578265 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 72578592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72579319 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 72579344 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 72579398 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72579439 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 72580122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72580380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72580917 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 72581004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72581041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72581284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72581317 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72581349 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 72581629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72581762 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72581777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72581950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72582179 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 72582648 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 72582727 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 72583190 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 72583293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72583326 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 72583338 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 72583471 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 72583490 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72583535 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72583622 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 72583682 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 72583735 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72583737 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72583752 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 72583825 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 72583958 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 72584284 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 72584302 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 72584530 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 72584560 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72585292 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 72585419 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72585423 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 72587650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72589383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72589504 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72589523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72589619 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 72589715 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72590231 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72590953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72591275 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 72591314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72591336 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 72591497 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72591712 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72591789 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 72591863 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 72592053 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72592094 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 72592446 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 72592587 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 72592639 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 72592876 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 72593447 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 72593793 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 72593840 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72594094 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72594326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72594329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72594614 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72594630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72594811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72594918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72595047 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72595070 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72595487 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 72595719 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72595787 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72595841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72595849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72596116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72596389 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 72596648 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 72596716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72596742 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 72596982 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 72598019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72598726 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 72599200 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72599585 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72599809 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 72600559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72600566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72600587 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 72600597 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72600842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72601751 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 72602292 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72602491 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 72603477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72603787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72604042 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 72604044 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 72604174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72604175 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 72605669 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 72605983 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 72606012 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 72606167 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 72606198 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 72606267 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72606280 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 72606316 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72606430 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 72606486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72606496 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 72606552 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 72606656 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 72606837 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 72606849 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 72606917 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 72607111 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 72607663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72607697 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72607698 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72607709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72607713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72607922 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72608010 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 72608033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72608037 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 72608369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72608531 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 72608533 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 72608638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72608720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72608788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72608829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72608842 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 72609024 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 72609044 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 72609053 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 72612989 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72613018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72613029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72613099 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 72613129 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 72613139 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72613161 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 72613321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72613480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72613575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72613650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72614379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72615302 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72615963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72616194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72616345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72616899 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 72616905 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72617387 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 72617721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72618091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72618102 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72618130 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72618174 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72621428 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 72621430 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72622307 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 72622630 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72623511 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 72624376 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 72624726 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 72624838 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72625115 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72625204 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 72626015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72626051 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72626435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72626533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72627807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72629622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72630232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72631474 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 72631559 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72631887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72632542 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72633130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72633160 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72633469 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 72634713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72634715 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 72634742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72635038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72635101 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 72635148 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 72635358 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 72635514 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 72635560 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 72635644 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 72635666 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72635805 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 72635955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72636188 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 72636242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72636345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72636401 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72636506 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72636508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72636635 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72636805 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 72637044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72639247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72646302 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72646530 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72646700 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 72646915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72647036 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 72647475 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 72648087 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 72648098 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72648118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72648142 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 72648151 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 72648187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72648284 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72648314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72648360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72648527 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 72648621 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 72648669 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 72648710 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 72648718 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 72648797 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 72648823 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 72648949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72649022 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 72649378 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 72649508 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 72649524 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 72649843 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 72649963 C A N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 72650101 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72650145 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72650280 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 72650339 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 72650348 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 72650371 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72650480 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72650590 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 72650665 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72650740 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 72650752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72651055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72653312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72654605 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72654731 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72655757 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72657764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72658245 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72659105 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 2 72659751 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72662860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72663409 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 72663800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72664041 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 72664064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72664972 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72667315 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 72667354 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 72667537 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72670333 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72670601 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72670727 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72674315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72679510 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 72683777 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 72684715 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72685855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72686990 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 72688008 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 72688226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72688772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72689030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72689071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72689198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72689295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72689345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72689743 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72689828 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72689873 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 72689887 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 72690048 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 72690109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72690288 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 72690305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72690361 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 72690676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72690733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72691165 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 72691511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72691538 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72691539 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 72691565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72692133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72692590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72693065 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72695845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72696528 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72696648 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 72697103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72697327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72698543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72699566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72701721 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72702914 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72702915 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72706701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72706760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72707431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72709083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72711245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72711488 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72711758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72711859 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 72712069 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 72712079 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 72712105 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 72712153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72712292 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72712645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72713174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72713308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72713584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72714230 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 72714443 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 72714714 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72715054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72715145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72715471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72716725 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72717246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72718598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72718871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72719010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72720086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72721326 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72721406 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 72722850 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72724580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72724817 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 72724833 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 72724949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72725002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72725005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72725388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72725435 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 72725517 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72725629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72726128 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72729095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72729187 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 72729868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72730101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72732823 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 72733015 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 72733055 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 72733365 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72734169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72734462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72736301 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 72737029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72737553 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72739819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72742835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72743718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72743735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72743846 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 72744029 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72744069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72744094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72744110 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72744231 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72744274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72744307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72744315 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 72744320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72744362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72744397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72744400 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72744463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72744649 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72744667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72745358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72745795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72748091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72749551 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 72749810 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 72749879 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 72751393 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 72751394 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 72752383 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72753147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72753165 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 72753634 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 72753669 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72755107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72755184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72756155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72757306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72757604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72758926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72759497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72759527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72762560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72764211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72764352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72764760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72765114 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72766143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72768208 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 72768276 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 72770194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72773709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72773906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72778691 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72780477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72783761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72785666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72786795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72789572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72790638 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 72791646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72792302 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72794879 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 72796926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72802410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72802473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72807608 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 72808429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72810159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72811592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72815371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72816515 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72820563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72820960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72821983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72822504 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 72825687 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 72827102 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 72827321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72829637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72830601 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72830875 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 72831194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72832280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72835499 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72836371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72839569 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 72839983 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 72840053 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72840873 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 72841832 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 72841971 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 72842013 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72842548 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72842715 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 72842931 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72842997 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72843358 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72843484 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 72843525 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 72843790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72844624 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 72844669 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72844737 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72845048 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72845200 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72845605 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72845727 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 72846142 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 72846242 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72846352 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72846519 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72846635 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 72846668 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 72846816 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 72847049 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 72847337 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 72847425 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72847457 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72847919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72848104 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 72848135 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 72848190 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 72848204 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 72848486 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 72848519 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 72848528 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 72848551 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 72848629 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72848639 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 72848648 A T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 72848699 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 72848781 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 72848788 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 72848887 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 72848954 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 72848966 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 72849100 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 72849213 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 72850976 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 72851492 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72852658 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72853612 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 72855254 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72856880 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72857071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72858701 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72860827 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72861305 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 72861312 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72861554 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 72861563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72861624 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72861836 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72861877 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72861909 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 72861991 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 72862872 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 72862925 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72863342 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 72863368 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72863406 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72863609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72863664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72864814 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 72865194 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 72865568 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72865926 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 72866010 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 72866249 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 72866273 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 72866284 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 72866314 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 72866439 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72866562 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72866602 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 72867054 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 72867346 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72867778 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 72867792 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 72869193 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 72869299 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72869300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72869537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72869575 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72869607 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72869867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72869875 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72869878 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72869894 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72869895 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72869970 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 72870192 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 72870211 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 72870299 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 72870310 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 72870403 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 72870407 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 72870500 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 72870628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72870670 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72871036 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 72871249 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72871252 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72871318 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72871544 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 72871709 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 72872522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72872530 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72873309 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 72874693 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 72876324 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72876411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72880460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72881436 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72881566 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72882014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72882620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72882847 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72884072 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72884076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72884455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72884665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72885129 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 72886855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72887538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72887550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72887947 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 72888697 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 72888867 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 72888943 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 72888993 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 72891609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72891875 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72892047 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72892072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72892392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72892643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72892659 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 72892666 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 72892731 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 72892803 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72893071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72893537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72893763 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72893854 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 72893940 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72893948 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 72893994 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 72894783 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72895036 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72895077 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72895238 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 72895288 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 72903366 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72905181 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72905905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72905999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72906578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72906790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72907577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72908126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72909731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72910030 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 72910266 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 72910288 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 72913606 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 72913700 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 72913904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72914137 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 72915164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72918093 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72918269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72918504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72919437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72919537 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72919553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72919626 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72920058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72920077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72920205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72920929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72922044 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 72922803 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 72925856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72927414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72927933 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72927937 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72928975 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72929289 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72929442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72930248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72931815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72932646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72933612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72935929 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72935997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72938751 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 72939007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72939229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72939334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72939720 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 72939930 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 72943120 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 72943147 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 72943443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72943826 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 72943961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72944536 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 72944571 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 72944802 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 72945029 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72945273 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72945402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72945407 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72945422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72945787 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 72946640 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72947154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72947156 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72947247 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 72947898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72948037 G T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 72948042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72948139 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72948600 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 72949024 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72949086 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 72949156 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72949176 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 72949390 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72949394 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72949832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72949894 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72950020 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72950164 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72950421 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72950848 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 72951483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72952099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72952251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72953289 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72953761 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72954109 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 72955131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72956783 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72956953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72958187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72959861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72961355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72969536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72975684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72981086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72982494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72982543 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 72982589 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72982605 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 72984170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72986334 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 72986372 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72986678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72986690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72986730 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72987332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72987815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72990443 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 72991628 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 72991660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72992813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72994942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72996678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 72999515 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73004046 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73008725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73011390 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 73011394 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 73011405 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73012502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73012638 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73013146 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73017762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73019219 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 73023970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73024620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73024759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73029566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73029584 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73030557 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73031025 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73031993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73032897 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73035442 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73036620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73038873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73040939 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73042801 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73042946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73045730 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73049565 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73049641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73050507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73050648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73052048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73052664 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73052700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73052728 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73052736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73052797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73052927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73052940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73053023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73053273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73053474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73053479 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 73053506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73053808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73053872 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73053973 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73054045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73054092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73054194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73054333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73054372 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73054526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73054625 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73054633 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73054663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73054955 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73054991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73055158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73055502 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73055738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73055807 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73056109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73056291 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73056298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73056394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73056436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73056742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73056949 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73056995 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73057074 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73058012 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73058434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73058690 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73059270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73060652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73060664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73060717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73060877 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73060929 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73061135 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 73061145 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73061155 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 73061241 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73061315 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73061723 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 73061879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73061950 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73062328 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73062339 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73062346 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 73062367 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 73062368 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 73062409 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73062579 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73062647 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 73062681 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73062832 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73062887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73062916 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73062920 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73063065 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73063281 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73063457 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73063593 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73063626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73063640 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73064938 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73064946 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73065251 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73065380 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73065442 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73065526 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73065543 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73065611 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 73065687 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73065961 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73066013 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73066413 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73066479 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73066480 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73066505 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73066513 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73066518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73066526 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73066682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73066959 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73067117 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73067209 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73067265 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73067290 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73067831 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73067832 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73068417 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73068666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73069496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73071369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73072782 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 73073037 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73074321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73075778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73076084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73076085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73076213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73076273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73076392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73077271 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73078206 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 73078934 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73078955 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73078985 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 73079184 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73080007 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73080027 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73080217 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73080325 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73080844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73081027 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73081133 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73081136 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73081172 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73081320 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73081410 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73081449 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73081509 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73081601 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73081931 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73082159 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73082174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73082188 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73082216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73082305 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73082337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73082553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73082569 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73082585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73082697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73083431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73083672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73083732 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73085444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73086516 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73087837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73088000 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73089284 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73089633 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73091082 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73093412 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 73096911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73097097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73099427 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73099451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73099482 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 73099531 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73099656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73100269 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73100317 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73100593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73100963 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 73102078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73102455 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73104635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73104988 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 73105837 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73106493 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73107480 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 73108218 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73115351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73118746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73118774 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73120243 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73123474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73123770 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 73124315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73124427 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73124595 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73126053 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73131017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73131201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73131311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73133786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73135223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73136311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73136312 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73137655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73138526 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 73138527 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 73138628 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73143235 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 73143592 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73143744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73143890 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73144174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73144527 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73145135 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 73145349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73145376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73145655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73145716 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73146424 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73146924 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73147169 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73147723 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73148067 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73148113 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73148183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73148201 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73148381 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73148643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73149209 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73149280 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 73149473 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 73149648 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73150784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73158278 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73161606 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73162355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73162983 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 73162989 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 73163429 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 73163455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73163488 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73163494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73163518 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73163598 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73163625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73163720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73163754 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73163954 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73164108 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73164212 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73164213 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73164334 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 73164351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73164364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73164524 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 73164525 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 73164574 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73164614 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 73164638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73164803 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 73164950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73164978 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 73165047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73165048 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 73165188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73165290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73165348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73165443 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73165473 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73165484 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73165507 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 73165508 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73165628 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73165690 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73165775 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 73165833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73165856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73165878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73165998 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73166176 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73166219 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 73166253 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 73166440 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 73167655 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 73168040 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73168267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73169003 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 73169768 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 73170121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73170533 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 73170820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73171001 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 73171814 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 73171992 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73172457 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 73172489 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 73172650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73172933 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 73172995 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73173187 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73173237 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73173818 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 73173848 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 73173871 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 73174726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73174757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73174890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73175795 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73176153 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73176185 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73176565 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 73176593 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 73176751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73179269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73180772 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73183001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73183400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73185408 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 73185449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73186078 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73186396 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 73186436 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 73186650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73186665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73186727 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 73186898 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 73186950 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 73186960 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 73186999 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 73187002 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 73187024 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 73187044 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 73187057 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 73187250 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 73187301 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 73187400 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73187518 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 73188277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73188341 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 73188378 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73188545 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73188577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73188657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73190445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73191434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73192101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73192153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73192398 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 73192482 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 73192548 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 73192637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73192701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73192709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73192715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73192774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73192784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73192825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73192829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73192888 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 73193018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73193021 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73193039 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73193057 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 73193138 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73193177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73193290 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73193426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73193442 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73193470 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 73193474 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 73193533 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73193594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73193769 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73193794 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73193914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73193931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73194140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73194212 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73194238 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73194955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73195171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73195186 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 73195434 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 73195450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73195641 A T Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 73195806 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 73195852 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73195939 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 73195970 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 73196015 A C Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 2 73196064 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 73196099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73196126 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 73196157 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 73196167 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 73196317 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 73196452 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 73196487 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73196618 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 73196635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73196818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73196904 A T Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 73197112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73197164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73197228 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73197255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73197278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73197562 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 73197626 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 73197741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73198501 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 73199047 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 73200038 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73200078 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 73200902 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73201259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73201268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73201273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73201282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73202617 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 73202641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73202981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73203916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73207264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73208327 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 73208340 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73209364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73209760 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73213475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73214601 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 73215498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73219255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73219365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73219437 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 73220227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73222675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73228705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73228977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73229031 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73229628 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 73229945 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 73231918 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 73233977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73234122 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73236525 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 73240502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73240812 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 73242755 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 73243268 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 73243802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73243957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73245277 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73245345 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 73245360 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 73245404 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73245505 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 73245661 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 73245691 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 73245936 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73245943 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 73246000 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 73246058 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 73246169 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 73246239 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 73246403 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 73246530 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 73246624 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73246710 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73246723 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73246731 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73246807 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 73246907 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 73246916 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 73246971 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 73247021 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73247034 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73247100 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73247119 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73247207 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73247325 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73247352 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73247608 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73247642 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73247844 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73248177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73248179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73248297 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73248778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73248792 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73249177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73249735 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 73250119 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 73250228 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 73250234 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73250252 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 73250339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73250349 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 73250531 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 73250842 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 73251119 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 73251548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73251830 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 73251968 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73252359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73252432 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 73252450 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 73252452 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 73252470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73252589 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 73252892 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73253011 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73253070 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73253712 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73254459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73254798 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73254813 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73254869 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73254969 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73255047 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73255930 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 73256163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73256533 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73256543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73256547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73256565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73256584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73257211 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 73257426 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 73257437 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 73257447 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 73257485 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73258674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73259863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73262373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73262630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73264206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73264461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73265156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73265796 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73269769 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73270607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73272326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73272671 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73274602 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73274842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73275459 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 73276286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73278232 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73278322 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73278538 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73278811 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 73278938 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 73278949 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73279002 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 73279390 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 73279425 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 73279496 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 73279509 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 73279636 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73279782 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73280215 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73280478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73280525 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73280537 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73280565 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73280746 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73280809 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73280896 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73280903 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73280933 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73280957 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73281007 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73281135 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73281274 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73281326 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73281617 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73281618 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73281653 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73281655 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73281768 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73281769 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73281801 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73281849 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 73281902 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73282199 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73282226 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 73282324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73282659 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73283118 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 73283252 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73283409 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73283697 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73283700 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73283843 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73283860 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73283927 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73283983 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 73284053 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73284167 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 73284271 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 73284273 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 73284503 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73284710 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73284733 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73284855 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 73285217 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 73285231 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 73285383 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 73285402 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 73285511 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 73285512 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 73285559 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73285671 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 73285771 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73285822 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73286077 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 73286144 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 73286334 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73286522 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73286542 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 73286545 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 73286673 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 73287157 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73287212 T G Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 73287406 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 73287427 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 73287463 A G Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 73287580 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73288014 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73288023 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 73288172 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73288429 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73288492 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 73288778 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73288801 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73288871 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 73289084 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73289154 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73289159 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73289197 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 73289239 C G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 73289462 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73289590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73289601 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73289653 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73289819 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 73290521 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 73290676 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73290746 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 73290767 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 73290935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73291119 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 73291336 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73292267 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73292371 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73293235 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73293823 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 73294070 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 73294151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73295678 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 73296640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73296673 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73297142 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73298724 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73298770 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73299668 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73300412 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73302249 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73303135 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73303534 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73303625 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73304318 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73305217 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73306733 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73307616 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73308540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73308574 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73308608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73311400 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73311955 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 73312281 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 73312786 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73313706 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 73314367 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73314538 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73315248 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 73315821 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73315882 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73316113 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73316207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73317373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73317514 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 73317775 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73317929 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73317957 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73317962 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73318081 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73318204 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73318798 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73320464 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73320704 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73320734 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73320752 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73320774 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73320874 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 73323236 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73324372 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73331963 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73333863 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73333944 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73334154 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73334419 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73334734 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73334758 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73336731 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73338757 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 73338940 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73340077 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73341695 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73341724 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73341729 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73341763 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 73341772 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 73341780 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 73341971 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73342014 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73342016 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73342042 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73342056 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 73342057 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 73342115 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73342241 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73342431 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73342457 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73343015 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 73343101 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73343436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73343533 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 73343778 T A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 73343872 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 73344019 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 73344141 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73344219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73344235 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73344253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73344291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73344312 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73344634 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73344701 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73344841 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73345008 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73345662 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 73345671 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 73345774 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 73345785 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 73346014 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 73346267 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73346303 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 73346341 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 73346349 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 73346379 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73348043 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73348207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73348631 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73349419 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73349752 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73350775 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 73350850 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 10 8 2 6 1 2 73350863 C A Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 73350876 A C Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 2 73351425 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73351766 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73351882 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 73353109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73354649 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73354659 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 73354728 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 73355221 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73355349 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 73355636 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73355652 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 73355665 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 73355679 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73355786 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 73355810 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 73356214 A C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 73356603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73356644 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73356662 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 73356710 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 73356943 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73357729 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 73357969 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73358090 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73358096 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73358588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73358958 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 73358974 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 73359001 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 73359101 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 73359137 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 73359601 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73360417 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 73361206 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73362049 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 73362135 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73362150 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73362651 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73362930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73362981 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73363187 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73364309 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73364471 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 73364509 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73364740 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73365100 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73365129 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73365180 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73365199 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73365351 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73365447 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73365496 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73365556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73365635 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73365901 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73366061 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73366394 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 73366492 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 73366814 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 73366984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73367037 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 73367117 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73367200 C A Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 73367540 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 73367710 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 73367930 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73368205 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73374630 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73375482 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73376915 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73376926 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73379887 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73380276 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73381258 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73381266 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73381389 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73381702 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 73381767 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73382609 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73382748 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73382814 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73382871 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73383981 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73384909 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 73384966 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73385016 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73385135 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73385312 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 73386351 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73386400 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73387572 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 73388065 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73388208 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73392486 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73393521 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73393666 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73393826 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 73395954 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73395986 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73396021 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73396031 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73396042 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73396070 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 73396074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73396721 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73396724 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73396877 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73397128 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73397313 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 73397444 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73397620 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 73397668 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73398036 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73398358 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73398605 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73398685 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 73398733 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73398739 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73398751 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73398773 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73398802 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 73398807 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 73398989 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 73399041 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 73399072 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 73400102 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73400549 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73400618 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73400666 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 73400673 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 73400681 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73401065 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73401813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73401877 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73401915 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73401994 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73402036 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73402049 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73402052 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73402977 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73403022 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 73403040 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73403083 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73403095 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73403237 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 73403274 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73403284 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73403326 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73403336 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73403595 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73403672 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73403741 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 73403845 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 73403897 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73403984 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 73404012 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73404025 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73404637 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73404648 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73404759 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73405302 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 73405329 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73405396 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73405468 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73405602 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 73405921 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73405923 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73405932 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73405990 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73405996 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73406828 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73406846 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73407182 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73407243 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 73407312 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73407899 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 73408048 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 73408690 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73408721 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 73408730 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 73408745 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73408873 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73410344 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 73410457 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73410486 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 73410542 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 73410561 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 73410596 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 73410617 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 73411102 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 73411494 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73411728 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73412015 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 2 73412112 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73412351 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73412393 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73412425 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73413062 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73413124 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73413128 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73413158 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73413212 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73413235 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73413254 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73413308 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73413320 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73413420 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73413866 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73414119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73414146 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 73414228 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73414241 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73414495 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73414827 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73414845 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73415228 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 73416254 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73418579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73420028 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73420174 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73421530 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73421561 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73421871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73421923 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73422207 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73422359 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73422360 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 73422371 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 73422379 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 73422482 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 73422524 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 73422652 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 73422680 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 73422753 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 73422754 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 73422877 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 73422945 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 73422946 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 73423058 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 73423120 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 73423130 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73423157 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 73423234 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73423253 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73423254 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 73423321 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73423330 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73423334 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73423414 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 73423489 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 73423542 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 73423556 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 73423598 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73423600 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73423724 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 73423937 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73424273 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73424383 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73424450 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73425422 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73425765 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73425810 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 73425852 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 73426227 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73426649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73426702 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73427015 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73429814 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73430024 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73430744 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73430756 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 73431881 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 73432033 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73432145 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73432214 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73432236 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73433394 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 73433468 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73433503 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73433964 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73434119 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73434249 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73434524 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 73434665 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 73434806 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 73435362 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 73435523 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 73435853 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 73435897 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73436043 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 73436882 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 73436942 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73437042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73437149 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73437184 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 73437192 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73439111 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73439221 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73439726 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 73439849 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73440419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73440644 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73440671 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73440715 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 73441086 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 73441117 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73441177 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73441297 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73441679 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73441762 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73441789 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73441797 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73441861 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73442884 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73443405 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73443614 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73443996 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73444111 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73444303 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73444462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73444541 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73445270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73445773 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73447199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73447374 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73448509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73449347 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73449437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73450050 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73450259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73450533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73451241 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73451331 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 73451364 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73452868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73452959 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73453573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73453656 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73453703 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73453761 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73453781 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73453803 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73453805 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73454297 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73454392 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73455156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73455246 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73455262 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73455424 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73455561 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 73455683 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 73455684 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73455786 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73455844 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73455895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73455937 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73456141 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73456306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73456521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73456549 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73456578 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73456731 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73456812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73456847 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73456888 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73457042 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73457043 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73457124 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73457224 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73457288 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73457350 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73457737 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73457872 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73457887 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 73457913 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 73458125 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 73458139 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 73458192 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 73458231 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 73458308 T A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 73458373 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 73458588 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 73459188 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73459232 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73459287 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73459319 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73459323 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73459424 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73459521 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 73459559 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73459805 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73460054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73460060 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73460123 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73460161 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73460188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73460246 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73460286 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73460312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73460884 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73460917 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73460933 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73461152 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73461362 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73461405 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73461450 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73461465 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73461541 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73461611 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73461709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73461755 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73461888 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73461916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73461948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73461950 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73461982 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73462052 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73462057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73462071 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73462288 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73462435 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73462516 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73462540 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 73462619 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73462927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73463212 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 73463332 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73463461 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73463618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73463673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73463779 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73463930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73464019 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73464033 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73464364 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73464455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73464565 G A N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 73464583 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 73464611 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73464620 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73464662 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73464681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73464971 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73465259 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73465356 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 73465957 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 73466158 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73466369 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73466429 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73466442 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73466490 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73466494 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73466557 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73466612 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73466784 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73466882 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 73466966 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 73467032 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 73467202 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 73467325 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 73467355 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 73467400 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73467409 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73467465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73467499 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73467575 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73467875 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73467897 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73467991 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73468104 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73468184 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73468243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73468281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73468565 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73468701 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73468746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73468864 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73469362 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73470161 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73471519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73472472 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73473385 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73473934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73474381 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73475520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73475625 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73475879 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73476887 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73476984 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73477327 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73478113 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73479458 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 73479492 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73479741 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73484264 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73485873 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 73486260 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73487273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73487437 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73487449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73488203 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 73488992 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73489007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73489229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73489855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73491938 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73493366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73494072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73494424 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73495074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73495112 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73495375 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73495722 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73496851 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73497451 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73498009 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73498279 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73498305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73499487 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73499904 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73500863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73501313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73503963 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73504380 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73504602 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73504609 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73504648 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 73504679 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 73504688 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 73504691 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 73505027 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73506036 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 73506315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73509787 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 73510510 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 2 73511317 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73511649 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73511731 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73511816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73512498 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73512548 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73512793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73512929 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73513310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73515101 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73515602 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73516356 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 73517096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73521226 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73523380 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73523919 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73525633 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73526744 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73526793 A C Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 73526797 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 73527264 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73527472 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73527989 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73528775 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73529166 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73529296 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 73531020 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73531930 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73533550 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 73533790 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73535062 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73540056 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73540057 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73540078 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73541368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73542701 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73543122 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73543702 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73544055 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73544255 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73544275 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73544825 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73546815 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73560846 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 73561368 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 73562065 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73563020 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 73563064 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73563590 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73563937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73564735 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73565276 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73565708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73565752 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73565846 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73566236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73566601 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73566699 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 73566728 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73566802 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 73567408 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 73568598 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73568637 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73568701 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73568831 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73568998 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73569591 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73570118 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73570129 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73570427 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73570769 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 73570904 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 73571094 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73571138 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73571287 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73571440 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 73571824 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73572015 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73572018 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73572233 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 73572667 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73572770 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 73572800 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73572823 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73573075 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73573327 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 73573647 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73574123 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73574205 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73574252 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73574281 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73574401 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73574405 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73574424 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73574802 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73574866 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73574882 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73575022 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73575295 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 73576642 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73576714 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 73578603 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 73578607 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73579233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73579522 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73579629 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73579984 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 73579991 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 73580329 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73581149 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 73581180 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 73581325 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 73581524 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 73582046 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 73582306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73582668 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73582673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73582690 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73583483 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73583927 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73584057 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73584622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73595121 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73596471 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73596780 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 73596959 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 73597346 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73597555 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73597577 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 73597578 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 73597740 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73597817 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73597855 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73597999 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73598068 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73599394 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73599553 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 73599662 C T Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 73599842 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 73599851 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 73599937 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 73600107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73600114 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 73600124 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73600201 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 73600334 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73601168 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73601598 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 73602657 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73602995 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73603018 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73603269 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73603448 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73603463 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73603485 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73603486 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73603786 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 73604073 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 73604085 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 73604166 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 73604195 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 73604397 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73604474 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73604575 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73604621 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73604687 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 73604754 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 73604772 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 73604780 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 73604799 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 73604903 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 73604923 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73604933 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73604955 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73605075 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73605129 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 73605457 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73605468 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73605651 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 73605659 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 73605782 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73605823 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 73605868 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 73606161 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73606190 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73606237 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 73606292 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 73606341 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73606413 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73606488 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73606676 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73606831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73607047 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73607222 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73607236 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73607279 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73607366 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73607549 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73607607 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73607689 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73607871 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73608185 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73608270 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73608319 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73608421 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73608654 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 73608766 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73608880 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73609112 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73609271 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 73609328 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73609376 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73609435 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 73609452 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 73609549 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 73609622 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 73609625 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 73609646 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 73609663 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 73609696 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 73610124 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 73610442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73613551 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 73614453 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 73614709 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 73614852 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 73614963 T A N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 73615279 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 73615404 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73615453 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 73616729 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 73616922 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73617977 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73620755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73622735 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 73623442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73628641 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 73629680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73631511 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 73632203 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73633190 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73634716 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73634779 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73635036 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73635420 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73636852 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73637785 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73639556 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 73639607 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 73639908 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 73641086 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73641585 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73643852 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73645934 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73646348 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73649113 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73653496 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73653836 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73654190 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73658965 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73659727 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73661591 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73663784 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73663920 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73663940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73664040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73665058 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 73665123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73665439 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73666390 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73666394 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73667665 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73669050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73669189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73669380 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73669718 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73670222 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73671124 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73671788 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73672079 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73672649 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73673368 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 73674476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73679247 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 73679275 G T N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 73679329 C G Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 73681383 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73682866 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73683012 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73683344 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73684236 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73690057 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 73701739 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73704276 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73705921 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73707669 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73711365 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73715506 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73715532 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73717016 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73717183 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73718665 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73718939 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73721346 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73724871 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73726180 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 73726327 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73726618 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73727091 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73728973 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 73730259 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73739104 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73739745 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73741808 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73746966 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73746983 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73746987 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73747075 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73747165 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 73747193 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73747583 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 73747657 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 73747871 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73750492 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73754265 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73755071 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73755585 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73756360 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 73756689 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73757906 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73759183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73759437 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73761217 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73761272 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73761841 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 73763592 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73763676 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73764044 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73764099 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73764898 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73764956 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 73765291 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73765533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73766210 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73766582 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 73770236 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 73770428 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73770499 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73771262 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73771668 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73771695 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 73771755 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73771909 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73772253 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73772745 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73772746 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73773037 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 73773128 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 73773204 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 73773226 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 73773269 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73773503 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73773606 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73773647 T G Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 73773651 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 2 73773857 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73773869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73773934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73774223 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73774241 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73774306 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 73774518 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73774550 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 73775029 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 73775047 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 73775191 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73775228 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73775251 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 73775360 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 73775456 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73775624 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73775806 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 73775884 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73776961 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 73776984 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 73776995 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 73777021 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 73777031 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 73777035 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 73777045 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 73777049 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 73777408 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73777461 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73777684 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73778273 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73778346 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73778810 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73778823 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73778900 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73779104 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73779134 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73779504 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73779615 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73779710 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73779724 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73779963 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73780052 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73780561 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 73780572 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 73780615 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73780638 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 73780744 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 73780783 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73780829 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73780865 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 73780939 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 73781047 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73781171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73781184 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73781204 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 73781267 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 73781402 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 73781592 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 73781598 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 73781640 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 73781663 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73781678 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73781722 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73781755 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73781757 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73781772 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73781817 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73781826 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73781861 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73781987 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73782033 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73782058 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73782130 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73782147 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73782176 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73782236 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73782326 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73782335 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73782355 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73782377 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73782405 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 73782407 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 73782439 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73782542 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73782554 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73782618 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73782647 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 73782700 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73782797 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73782815 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73782876 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 73782912 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 73782922 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 73783031 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 73783044 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 73783186 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 73783327 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73783405 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73783407 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73783542 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73783647 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73783648 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73783699 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73783705 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 73783761 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73783795 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 73783899 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 73784055 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73784085 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73784575 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 73784694 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 73784750 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 73784855 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73784923 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 73784926 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 73785109 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73785292 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 73785347 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 73785502 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 73785558 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 73785655 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 73785658 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 73785733 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 73785797 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 73786054 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73786325 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73786351 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73786352 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73786381 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 73786733 G C N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 73786807 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 73786808 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 73786836 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 73786885 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 73787039 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73787042 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73787355 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73787411 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73787479 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73787497 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73787515 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73787554 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 73787593 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73787679 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 73787764 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73787881 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73787971 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73788006 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73788011 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73788147 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73788164 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73788268 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73788274 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73788287 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73788324 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73788335 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 73788346 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73788361 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 73788375 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73788392 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 73788533 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 73788547 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 73788700 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 73788742 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73788752 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73788770 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73788819 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73789079 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 73789295 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 73789304 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 73789360 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 73789372 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73789421 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73789510 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 73789638 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73789644 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 73789768 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73789909 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73790007 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 73790048 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73791001 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 73791959 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73792373 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73792820 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 73792945 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 73793188 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 73793199 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 73793218 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 73793379 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 73793903 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 73794149 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 73794709 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73794959 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 73795027 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 73795086 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73795228 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73795333 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 73795336 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 73795466 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 73795656 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73795691 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73795782 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73795810 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 73796119 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73796138 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73796293 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73796496 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 73796885 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 73796897 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 73796929 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 73797080 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 73797149 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 73797215 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 73797302 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 73797303 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 73797319 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73797361 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73797370 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73797391 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73797417 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73797520 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73797548 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73797612 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73799406 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 73799628 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73800022 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73800281 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 73800286 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 73800307 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 73800464 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 73800484 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73800492 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73800516 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73800610 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 73800667 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73800704 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 73800982 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73801003 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73801019 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73801022 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73801030 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73801085 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73801131 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73801139 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73801186 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73801417 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73801752 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 73801864 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 73801867 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 73802086 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 73802249 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73802369 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73803506 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73809680 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73810413 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73811145 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73811163 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73811308 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73811321 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73811638 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73812648 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73812678 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73813629 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 73813943 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 73814028 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73814432 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73816060 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 73816831 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73816885 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73816938 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73817190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73817205 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73817601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73818401 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73819594 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73819886 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73820022 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 73820817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73821069 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73821640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73821725 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73821867 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73822634 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 73822848 C G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 73824134 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73824161 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73824214 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73824671 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73824703 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73824754 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 73824788 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73825032 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73825554 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73825574 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73825901 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73826051 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 73826318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73827243 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 73827376 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73827390 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73827452 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73827877 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73827954 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73827955 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73828013 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73828014 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 73828045 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73828083 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73828139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73828299 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73828304 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73828403 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 73828603 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73828668 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73828760 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 73829107 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 73829170 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73830644 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 73831040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73831064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73831078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73831122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73831204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73831322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73831652 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 73832827 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 73833755 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 73834735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73835398 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73835548 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73837237 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73837574 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73837928 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73837982 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73838360 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73840803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73841326 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 73841398 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73841688 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73842045 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 73842076 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 73842096 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73842398 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 73842780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73842848 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 73843525 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 73843774 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 73843934 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 73844032 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 73844163 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73844331 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 73844337 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 73844344 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 73844359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73844373 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 73844390 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 73844401 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 73844416 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 73844442 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 73844608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73844760 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73844867 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73844877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73844992 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 73844993 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 73845296 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 73845418 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 73845688 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 73846110 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73846144 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73846192 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 73846330 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73846363 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73846373 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73846473 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73846563 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73846610 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73846622 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73846758 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 73846800 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 73846877 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73846939 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73847018 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 73847085 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 73847162 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 73847245 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 73847253 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 73847288 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73847341 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 73847399 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73848309 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 73848644 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73848717 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73848740 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73848824 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73848876 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 73848899 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73848926 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 73849206 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 73849384 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73849443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73849497 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73849630 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73849641 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 73849667 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73850146 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73850178 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73850185 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73850247 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73850401 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73850427 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 73850433 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73850877 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73851042 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73851090 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73851186 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73851315 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73851341 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73851395 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73851750 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 73851763 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73852270 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73852845 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73852934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73853001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73853111 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73853657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73853663 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73853848 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 73854004 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73854317 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73854331 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73854774 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73855444 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73855945 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73856528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73856853 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73856912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73857121 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73857189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73857216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73858008 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73861258 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73861999 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 73862044 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 73862262 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73862343 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73862378 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 73862609 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73862650 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73862667 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73862743 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73866040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73866551 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73866606 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 73866660 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73866661 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73866913 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73868564 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 73868624 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73869269 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73871414 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73871454 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73871499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73871708 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73871992 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73872048 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73872207 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 73872539 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 73872665 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 73872836 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73872940 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73873019 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73873037 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73873655 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73873835 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 73874045 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73874463 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73874521 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73874546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73875165 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 73875528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73875589 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 73875922 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73875946 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73876034 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73876037 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73876123 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 73876263 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73876983 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 73876991 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 73877008 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73877093 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73877152 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73877288 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73877397 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73877413 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73877431 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73877448 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73877542 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73877687 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73877751 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73878415 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 73878681 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 73878694 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73878701 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73878930 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 73878979 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 73879168 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73879279 C A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 73879628 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 73879711 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 73880388 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 73880410 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73881147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73882109 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73882438 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 73882488 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 73884265 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 2 73884275 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 73884394 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73884399 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73884429 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73884559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73884643 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73884874 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73884912 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 73885007 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73885029 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73885124 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73885147 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73885302 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 73885472 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 73885519 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 73885540 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 73885588 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 2 73885747 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 73885805 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 73885926 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73886322 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73886418 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 73886438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73886503 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73886823 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73886919 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73886999 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73887015 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73887064 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73887248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73887249 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 73887301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73887435 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 73887449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73887459 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73887518 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73887557 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73887558 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73887580 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73887628 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 73888143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73888385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73888810 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 73888945 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73889023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73889098 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73889167 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 73889169 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73889213 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73889239 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 73889609 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73889631 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73889728 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73889788 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73889800 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73889835 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73889865 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73889973 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73890012 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73890061 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73890126 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73890200 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73890257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73890274 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73890275 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73890317 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 73890374 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73890399 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 73890412 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73890608 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73890611 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73890708 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73890723 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73890726 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73890763 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73890774 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73890781 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73890792 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73890839 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73890856 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73890945 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 73890968 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73891081 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73891178 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73891219 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73891231 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 73891292 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73891380 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 73891514 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 73891780 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 73891790 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 73892622 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 73892660 A C N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 2 73892785 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 73892797 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73892820 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73892910 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 73892977 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73893010 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 73893042 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73893128 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73893143 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73893147 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73893168 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 73893296 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73893530 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73894041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73894139 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 73894417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73894529 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 73894791 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73895296 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73895302 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 73895313 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73895435 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73895488 T A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 73895784 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73895796 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 73896157 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 73896174 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73896284 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73896309 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 73896374 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 73896408 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 73896643 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 73896697 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 73896736 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 73896737 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 73896796 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73896960 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73896972 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 73897331 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 73897342 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 73897437 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 73897568 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 73897699 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 73897767 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 73897842 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 73897934 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73897946 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 73897982 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 73897996 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 73898011 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73898052 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73898095 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 73898104 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73898166 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73898221 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 73898231 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 73898252 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 73898317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73898384 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 73899037 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 73899080 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 73899170 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 73899188 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 73899199 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 73899212 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 73899248 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 73899288 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 73899345 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73899546 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73899717 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73900020 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73900231 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73901173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73901276 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 73901316 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 73901925 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 73902033 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73902296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73902378 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 73902383 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 73902427 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 73902657 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73902741 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73902800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73902873 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 73902917 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73902980 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73902993 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73903176 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73903637 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73903638 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 73903696 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73903723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73903960 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73904082 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73904168 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 73904440 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 73904502 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 73904554 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 73904621 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 73904694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73904749 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 73904917 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 73904926 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73904967 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 73905116 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73905449 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 73905611 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73905851 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 73905881 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73905920 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73905921 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73906673 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73906792 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 73906808 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73906823 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 73907034 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73907246 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73907356 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 73907532 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73907575 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 73907587 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73907622 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 73907659 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73907677 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 73907687 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73907724 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73907938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73908619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73908768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73909671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73909672 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73909700 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73909960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73910166 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73912337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73912813 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 73913139 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73913177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73913224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73913281 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73913657 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 73913919 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73914279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73915382 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73915459 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73916160 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73916973 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73917018 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73917283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73917288 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73917530 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73917561 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73920420 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73920501 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73920588 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 73921152 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73921476 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 73922471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73922531 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73922613 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73922772 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73922885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73922911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73923376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73924435 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73925242 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73927458 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73930469 T G N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 73931372 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73931556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73932676 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73934451 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73936742 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73937012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73937448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73937740 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73938025 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 73938098 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73938515 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73938656 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73941137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73941444 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73941554 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 73941567 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73941655 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73942410 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 73942431 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 73942769 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73943416 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73944036 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73944046 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73945014 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73945403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73945475 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 73945559 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 73945571 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73945722 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73946300 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73946512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73946703 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 73947084 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 73947224 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 73947250 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 73947435 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73947825 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73948010 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73948484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73948505 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73948593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73948685 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 73948792 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73950061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73950201 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73950288 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 73950587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73951679 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73951721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73952321 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73952466 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 73954204 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 73955903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73957067 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73957619 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73958777 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73958784 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73958829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73958838 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73958863 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73958874 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 73958961 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 73959048 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 73959054 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 73959060 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 73959192 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73959193 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73959316 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73959319 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73959421 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 73959549 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 73959688 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 73960331 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73960582 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73960659 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73960693 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 73960735 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 73960872 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73960918 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 73960983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73961239 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 73961397 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 73961841 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 73963402 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 73964720 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73965373 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 73965537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73965672 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73967677 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 73968106 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73968971 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73969548 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73969708 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73969771 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73969837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73969973 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73970141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73970478 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73970709 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73970872 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73971392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73971681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73972377 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73972514 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 73972593 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 73972882 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73972933 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 73972994 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73973120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73973228 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73973255 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 73973520 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73975594 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 73975722 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73976265 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73977032 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73977470 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73977971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73978028 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73978054 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73978868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73979421 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73979784 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 73979969 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73980180 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 73980412 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73980541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73980751 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 73980994 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 73980996 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 73981068 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 73981234 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73981921 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73981933 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 73982532 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 73985440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 73986470 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 73986491 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73987050 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73987079 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73989439 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73989848 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73991112 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 73991153 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 73991848 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 73992932 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 73994483 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 73994569 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 73994667 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 73994968 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 73998507 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 73999145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74001378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74001617 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74002445 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 74004217 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74005183 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74006380 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74006665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74008910 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74009616 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 74010116 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74011116 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74012065 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74012196 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74012927 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74013688 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74014856 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 74014864 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74014922 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74015194 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74015233 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74015234 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74016225 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74016685 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74017063 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74017133 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74017239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74018010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74018644 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74019046 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74019055 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 74019594 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74020097 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74020239 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74020643 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 74020677 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74020721 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 74020787 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 74020815 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 74021212 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74021263 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74021530 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74021558 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74021826 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74022163 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74022210 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 74024083 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74024618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74024870 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74026180 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74027307 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74029518 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74029836 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74030012 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74030912 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74031651 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74031652 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74033493 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74033659 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74033739 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74033975 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74034140 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74034616 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74035596 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74038876 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 74038946 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 74039000 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 74039103 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 74039178 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74039338 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74039484 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 74039487 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74039497 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74039783 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74039829 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74040427 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74040523 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74040594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74041210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74041784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74041867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74042152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74042160 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74042171 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74042269 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74042290 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 74042532 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74042569 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74042617 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74042632 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74042858 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74042879 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74042928 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74043576 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74043686 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74043754 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 74044035 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 74044073 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74044090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74044092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74044301 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74044320 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74044477 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74044600 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74044651 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74045223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74045322 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 74045349 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74045487 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74045527 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74045843 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74046312 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74046329 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74046354 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74046609 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74046647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74046732 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 74046825 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74046948 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 74047073 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74047723 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74048673 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74048674 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74048709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74049032 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 74049202 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74049206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74049354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74049355 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 74049390 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74049398 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 74049636 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74049699 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 74049870 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 74052286 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 74052724 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74054771 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 74055107 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 74055310 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74056860 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74057871 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74058034 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74058126 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74058152 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74058367 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74059922 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74060060 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74060372 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 74060941 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 74061320 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 74061824 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74062168 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74062421 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74062788 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74063109 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 74065349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74065855 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 74065909 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 74066040 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 74066110 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 74066614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74067231 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 74068364 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 74069419 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74069761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74070573 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74072273 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 74073595 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74073903 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 74073904 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 74074172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74075498 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74076293 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 74077087 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74078289 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74079587 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74079753 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 74080185 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74080212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74080546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74080699 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74080923 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74081272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74081553 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74081652 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 74081821 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74082746 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74082892 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 74082925 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74082950 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 74083939 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74084047 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 74084308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74084470 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74084599 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 74085308 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74085398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74087160 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74087587 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74088018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74089294 C A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 74089568 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 74091493 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74091562 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74093275 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74093740 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74094275 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74094631 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 74094881 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 74095099 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 74095215 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74096600 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74098272 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74099377 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74099605 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74099627 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74099773 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 74100959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74101800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74101867 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74102079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74102209 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74103030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74103189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74104212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74105492 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74105632 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 2 74106683 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74107628 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 74108994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74109097 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74109374 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74109611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74109793 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74109949 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74109986 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74110207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74110342 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74110436 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74110504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74110812 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74110937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74110959 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74111100 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 74111379 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74111392 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74111497 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74111580 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74111657 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74111793 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74112010 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74112152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74112240 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74112390 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 74112557 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 74112722 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74112802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74112896 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74113036 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74113086 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74113265 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74113276 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74113277 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74113302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74113314 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74113435 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74113450 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74113512 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74113716 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 74113736 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 74113781 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 74113782 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 74113854 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74114021 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74114065 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74114228 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74114539 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 74114709 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74114751 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74114815 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 74114906 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74114911 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74114925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74114978 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74115043 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74115218 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 74115698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74115740 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74116752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74117903 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74118179 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 74118457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74119869 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 74119892 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74120043 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74120162 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74120440 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 74120769 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74121225 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74121405 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74121645 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74121688 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74121937 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74121973 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74121984 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74122427 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74122591 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74122694 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 74123009 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74123031 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74123332 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 74123375 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74123401 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74124621 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74124631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74125177 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74125433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74125457 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74126244 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74126497 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74126507 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74126673 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74126681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74126757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74127089 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74127248 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74127575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74127877 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74127889 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74127993 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74128051 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74128093 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74128146 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74128193 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74128212 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74128446 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74128592 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74128944 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74129040 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74129071 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74129078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74129164 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74129373 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74129395 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74129505 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74129854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74130646 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74130886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74130978 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74130983 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74131614 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74132582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74135409 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74136029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74139358 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74139797 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 74139927 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74140392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74140541 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74140724 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74140748 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74140805 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74140837 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74141126 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74141152 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74141231 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74141262 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74141292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74141380 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74141573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74141702 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74142106 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74142345 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74142673 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74143040 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74143217 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74144737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74145005 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74146242 T G Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 74146529 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74147343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74147735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74147747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74147902 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74148175 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74148348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74149792 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74149872 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74151726 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74152024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74152148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74152848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74154027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74154106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74155168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74156506 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74156528 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74157950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74158254 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74158288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74158467 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74158511 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74159978 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74162575 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74162586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74162883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74163874 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74164371 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74165067 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74165080 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74165315 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 74166355 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74166673 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74167382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74168199 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74170012 G T N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 74171024 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 74171082 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74171460 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74171772 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74173365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74173525 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74173611 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74173669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74174342 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74176163 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74177152 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74177927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74180012 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 74180108 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74180302 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74180359 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74182175 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74182419 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 74182425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74183003 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 74184404 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74184459 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74186267 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74186272 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74186442 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 74186576 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74186773 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74187054 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 74187213 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74187320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74187865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74187945 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74187971 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74187977 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74188172 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74188227 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74188280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74188329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74188331 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74188485 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74188493 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74188540 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74188546 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74188605 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74188699 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74188860 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74188899 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74188934 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74189189 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 74189263 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 74189375 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 74189501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74189678 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74189915 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 74189969 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74190045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74190065 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74190127 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74190154 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74190430 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74190442 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74190621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74190965 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74191683 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 74191702 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74192352 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74192360 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74192494 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74192898 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74193060 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74193390 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 74193594 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 74193841 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 74193916 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 74193952 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74193957 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74193987 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74193989 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74194071 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74194130 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74194257 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74194855 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74195050 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 74195601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74197328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74197754 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74198759 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74198994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74199025 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74199247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74199357 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74199604 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 74199646 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74199752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74199939 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74200151 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74200199 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74200347 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74202102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74202112 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74210108 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74210109 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 74210544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74211074 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74212188 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74212288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74212415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74212937 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74213059 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74213146 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74213262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74215802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74216360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74216628 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74216676 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74216728 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74217229 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74218428 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74218471 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74219423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74221376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74221590 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74222264 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 74223582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74223754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74224657 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74225654 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74225677 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74225822 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74226694 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74227106 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74227923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74228688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74228881 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74229214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74229233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74229609 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74230124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74230468 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74230965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74231791 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74232251 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74232549 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74233309 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74233714 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74233718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74233881 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74233918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74234299 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 74234333 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 74240737 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74241215 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74241318 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74242547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74243703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74243886 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74244706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74244899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74245182 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74246290 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74246350 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74246650 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74246809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74248289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74248297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74248946 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74249534 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74249581 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74250537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74252245 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74252676 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74253101 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74253124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74254022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74254106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74254148 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74254914 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 74254922 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74254959 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74254967 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74254978 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74254982 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74255121 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74255137 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74255243 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74255315 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74255329 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74255355 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74255380 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74255387 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74255459 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 74255474 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74255580 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74255947 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74256011 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 74256038 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74256235 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74256299 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74256300 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74256370 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 74256371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74256384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74256402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74256504 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74256544 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74256558 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74256733 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74256760 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74256902 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74257081 A G Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 74257242 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 74258054 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74258190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74258592 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74259265 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74259739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74259809 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74260091 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 74260224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74260296 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74260329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74260333 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 74260416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74260418 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74260502 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 74260551 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74260609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74260726 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74260797 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 74260837 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74260912 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74260959 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74261018 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74261081 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74261102 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74261150 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74261169 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74261270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74261371 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74261416 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74261481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74261496 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74261537 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74261543 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74261613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74261909 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74261954 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74262037 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74262040 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74262066 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74262099 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74262476 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74262484 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74262503 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74262592 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74262625 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74262660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74262710 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74262828 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74262940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74262992 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 74263299 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74263491 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 74263799 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74263802 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74264756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74267515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74269385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74271659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74273711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74274884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74275146 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74283650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74284550 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74285775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74286094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74286131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74287367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74288682 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 74289927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74292259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74292671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74293258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74293340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74293451 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74293808 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74293823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74294201 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74294212 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74294260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74294284 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74294382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74294421 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 74294628 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 74294666 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 74294717 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 74295975 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74296110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74296152 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74296158 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74296211 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74296227 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74296532 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74296549 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74296595 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74296606 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74296701 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74296737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74297033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74297270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74297578 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74297633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74298059 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 74298344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74298412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74298534 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74299006 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74299449 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74299450 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74299515 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74299720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74300005 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 74300610 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 74301350 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 74301631 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74301666 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74301811 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 74301946 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 74302068 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 74302377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74302597 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74303253 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 74303811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74304654 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74304965 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 74304986 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74304992 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74305024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74305064 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 74305179 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 74305266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74305385 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 74305524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74305707 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 74305762 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74305821 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 74305877 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 74305920 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74306068 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74306072 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74306151 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74306171 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74306218 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74306325 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74306671 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 74306729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74306746 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 74306824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74306983 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74307000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74307070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74307262 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 74307406 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74307417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74307576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74307604 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74307619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74307761 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 74307880 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 74307894 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 74307895 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 74307912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74307985 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 74308053 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 74308069 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 74308330 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 74308391 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74308808 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74309152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74309183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74309186 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 74309363 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74309394 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 74309590 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74309597 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74310041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74310089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74310102 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 74311003 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74311515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74311588 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74311619 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 74311992 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74312047 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 74314049 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74314179 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74314184 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74314387 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74314500 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 74314518 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 74314536 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74314566 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 74314890 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 74314899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74314914 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 74315047 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74315063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74315211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74315292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74315589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74315606 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74315659 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74315764 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74316086 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 74316306 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74316380 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74316413 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74316458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74316582 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74316701 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74316727 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74316799 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74316899 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74316910 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74316945 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74316962 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74317025 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 74317083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74318014 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 74318034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74318276 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 74318325 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74318377 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74318779 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74318780 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74318892 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74319174 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 74319505 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 74319804 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 74319856 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 74320527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74320674 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 74320770 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 74321143 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74321168 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74321258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74321290 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74321313 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74321916 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74322023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74322675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74322693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74322729 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74322810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74322817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74322916 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74322933 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74323097 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74323113 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74323170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74323327 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 74323466 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74323775 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 74323783 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 74323907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74324310 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74324683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74325013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74325219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74325905 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 74325971 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74326084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74326267 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 74326268 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 74326421 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 74326473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74326622 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 74326903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74327635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74331276 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 74336422 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74339703 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 74340462 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 74341862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74342898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74343503 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 74347044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74347917 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74348254 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 74349103 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74350922 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 74351274 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74351309 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74351747 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74352039 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 74352220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74352610 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74352728 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 74353020 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 74353795 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 74354282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74354318 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74354881 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74354890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74354985 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74355433 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 74355937 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74355975 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74356214 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74356229 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74356451 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74357145 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 74357819 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 74357882 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74359354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74359836 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74364272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74364328 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 74365238 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74365620 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74365692 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74368178 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 74368352 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74368555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74369109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74369472 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74370264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74371558 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74376700 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74376726 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74377437 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 74377652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74379899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74382341 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74383658 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74389060 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 74389424 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 74389590 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 74392339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74395616 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74400243 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 74400708 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 74402012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74402339 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 74405365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74407676 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74408460 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74408715 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74409113 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74413188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74413570 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74415782 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74416629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74416695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74416804 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74416902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74416903 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74417573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74419957 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 74420054 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74420189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74420979 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74421066 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 74421101 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 74421327 C A N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 74421429 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 74421481 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 74421525 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 74421538 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 74421550 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 74421972 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 74422147 T G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 74422205 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 74422242 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 74422341 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 74422361 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 74422505 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 74422750 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 74422813 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 74422815 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74422910 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 74423079 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 74423128 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 74423234 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 74423352 G T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 2 74423436 A C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 74423445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74423504 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 74423515 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 74423775 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 74423834 A G Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 2 74423883 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74424172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74424433 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 74424444 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 74424456 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 2 74424819 A C Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 74425107 C T Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.0769230769230769 13 13 1 11 1 2 74425305 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74425694 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74425733 C G Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 74425824 T G Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 2 74425843 A T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 2 74426239 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 74426469 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74426729 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 74426733 G C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 74427401 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 74427493 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 74427522 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 74428019 A G Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 2 74428060 T G Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 2 74428076 C G Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 74428212 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 74428225 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 74428254 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 74428269 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 74428352 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 74428477 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 74428478 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 74428537 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74428587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74428674 T G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 74429071 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 8 10 1 6 2 2 74429166 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 74429336 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 74429367 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 74430228 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74430399 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 74430407 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 74430636 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 74431090 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 74431450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74431500 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 74431640 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 74431648 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 74431737 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 74431740 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 74431748 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74431764 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 74432471 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 74434429 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74434433 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74434740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74436049 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74436689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74437082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74439612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74440485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74441433 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 74441504 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 74441574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74441647 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 74441688 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 74441721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74441839 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 2 74442016 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74443722 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74443876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74443983 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 74444778 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74445321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74445748 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74445762 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 74445774 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 74445931 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74446014 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 74446114 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 74446596 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74446739 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 74446774 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 74446791 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74446820 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 74447225 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74447492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74447572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74447773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74448460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74448628 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74449286 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 74449441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74449854 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 74450201 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74450207 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74450229 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 74450260 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 74450330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74450612 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 74450664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74450816 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74450850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74451576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74451694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74452124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74452394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74452774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74455050 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74456794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74457723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74457856 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74458235 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 74458263 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 74459408 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 74459414 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 74459432 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 74459762 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 74459824 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 74459888 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 74459911 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 74460193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74460348 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 74462056 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 74462824 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 74463413 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74463470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74463534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74463733 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 74463734 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 74463764 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74463814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74463846 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 74463901 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 74464048 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74464207 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74464243 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 74464568 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 74465704 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 74465737 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 74465993 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 74466016 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 74466082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74466104 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 74466150 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 74466354 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 74466594 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 74466602 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74466619 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 74466669 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74466677 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74466685 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74466763 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74466776 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74467391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74467650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74469506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74471810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74472530 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 74472831 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74473075 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74473896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74475124 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74476390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74477200 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74477241 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74477244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74478989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74479165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74479356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74479562 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 74480233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74480368 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74480720 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74480928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74480936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74480998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74481024 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 74481161 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74482095 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74483538 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74483835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74484765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74486226 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74487090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74487517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74488424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74488911 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 74490393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74491076 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74491708 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 74492915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74492997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74493179 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 74493440 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 74493448 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 74494760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74495818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74496412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74496431 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74496640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74497384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74498288 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 74499453 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74501534 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74501585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74501634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74501641 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74503290 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 74504144 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74504286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74512527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74512573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74515016 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 74516034 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74517336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74519408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74524840 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74528459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74537900 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74538014 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74542759 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74546820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74548558 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74550176 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74553134 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74553237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74554078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74554725 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74555875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74558928 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74559125 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74559362 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74562073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74565619 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74567459 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74568991 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74569513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74572304 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 74572909 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 74577291 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74577916 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 74578801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74583007 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74583071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74583500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74585773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74586606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74586814 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74588349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74589022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74590800 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74592145 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74592894 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74593221 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74595162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74597496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74599225 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74599519 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74599684 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74600333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74601167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74602780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74602974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74604789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74605254 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74606721 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74606916 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 74607228 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74607258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74607526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74608457 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 74608830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74608846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74608856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74608861 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74608900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74608952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74608953 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 74609436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74609757 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74609894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74610777 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74611283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74611684 C A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 74611767 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 74611796 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 74612062 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 74612639 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 74612688 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 74612812 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 74612983 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 74613068 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 74614221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74614232 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 74614639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74614815 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 74614920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74614932 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 74615054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74615150 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74615455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74615811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74616120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74616139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74616328 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74616759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74616764 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 74617430 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74618428 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74618534 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74618626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74619156 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 74619453 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 74620361 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 74620379 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74621606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74621654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74621768 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74621811 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74621833 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74621913 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74622650 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74622773 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74623371 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74624798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74625337 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74625741 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74627107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74627308 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 74628013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74628055 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 74628128 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74629267 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 74629845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74630694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74631258 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74631271 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74631488 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74631489 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74631504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74631561 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74631841 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74631859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74633095 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 74633271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74634779 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74634787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74634877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74634878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74636631 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74641725 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 74641903 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 74641998 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 74642545 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74643070 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74643579 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74644917 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74644977 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 74644989 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 74645082 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74645138 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74645172 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74645254 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74645743 G C Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 74646100 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74646308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74646413 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74646421 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74646487 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74646673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74646996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74647237 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74647353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74647770 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74648677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74648678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74648959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74648963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74649066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74649120 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74649253 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74649837 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 74649903 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 74649920 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74650125 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74650183 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74650294 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74650304 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74650396 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74650448 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74650929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74651223 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74651284 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74651312 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74651313 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74651429 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74651431 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74651463 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74651488 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74651576 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74651595 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74651873 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74651880 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74651885 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74651904 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74651994 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74651999 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74652028 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74652084 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74652140 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74652170 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74652272 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74652304 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74652316 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74652321 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74652344 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74652351 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74652416 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74652463 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 74652492 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 74652540 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74652555 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74652558 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74652670 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74652774 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74652805 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74652838 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74652849 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74652981 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74653471 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74655863 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 74656525 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 74659274 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74659733 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74661194 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 74661258 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74661259 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74661296 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 74661391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74661835 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74661841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74661874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74661904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74661930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74662129 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74662170 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74662588 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74662705 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 74663155 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74663481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74663633 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74667612 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74671358 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74672083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74673867 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74677059 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74677282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74678534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74678776 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74679695 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74679847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74680578 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74680755 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 74680870 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74681097 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74681229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74681394 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74683133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74683466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74685182 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74685418 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 74686858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74688169 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74689280 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 74689934 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 74690007 G A N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 74690313 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 74690334 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 74690554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74691571 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74691677 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74700624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74701020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74701601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74701685 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74704495 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 74704689 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74706354 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 74708122 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74709566 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74711038 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74711615 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 74712243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74712501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74712814 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74714508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74715062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74715291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74716010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74716292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74716738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74718401 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 74718478 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 74718516 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 74718607 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 74719027 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74719067 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74719218 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74719247 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74719448 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74719739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74719810 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74720105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74720183 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74720192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74720232 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74720649 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74721283 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74721376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74721407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74721579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74721769 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74721782 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74722077 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74723861 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74724018 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74724159 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74724271 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74724518 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74724585 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74724629 T G Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 74724658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74725029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74725033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74725094 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74725109 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74725125 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74725159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74725181 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74725301 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74725479 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74725536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74725833 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74725842 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74725897 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74726000 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74726161 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74726231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74726280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74726297 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74726539 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74726597 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74726656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74726753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74726925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74727389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74727613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74727817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74728722 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74729008 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74729088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74729201 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74729304 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74729594 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74729596 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74729686 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74730018 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74730152 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74730178 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74730263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74730443 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 74730561 A T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 74730651 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 74730655 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 74730664 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 74730692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74730705 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74730996 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74731220 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74731502 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74731559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74731640 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 74732503 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74732679 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74733026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74733925 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74734072 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74734301 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74734306 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74734368 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74734638 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74734788 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74734972 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74735176 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74735258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74735643 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74737290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74740760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74742641 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 74743229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74745280 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74747908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74749024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74750325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74750383 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74750423 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 74751764 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74752244 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74753304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74753609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74753914 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74754078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74754251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74754526 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74754565 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74754814 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 74755551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74755986 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74756033 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74756140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74756159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74757172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74757227 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74757467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74757483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74757540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74757555 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74757648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74757772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74758053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74758099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74758118 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74758353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74758378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74758639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74758976 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74759764 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 74759941 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74760051 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 74760073 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74760255 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74760292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74760349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74760358 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74760387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74760403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74760538 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74760843 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74761503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74762033 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 74762115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74762175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74763824 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74764478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74764739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74764833 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74764916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74765323 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74765507 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74765858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74766374 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74766440 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74766705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74766803 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74766810 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74766876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74767084 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74767138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74767828 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74768113 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 74768149 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74768666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74769197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74769215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74769525 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74769644 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74769744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74770368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74770439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74770650 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74771389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74771861 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74771864 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74771893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74772596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74773507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74773585 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74773593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74773610 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74773668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74773711 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74773712 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74773855 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74773862 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74773903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74774081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74774413 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74774613 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74774615 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74774648 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74775109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74775973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74776149 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74778096 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74783432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74784440 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74784749 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74785212 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74785953 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74786067 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74786110 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74786510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74786586 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 74786748 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 74786764 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 74786814 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 74786817 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 74787007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74787032 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74787102 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74787123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74787495 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74787507 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74787562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74787900 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 74788037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74788118 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74788126 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74788148 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 74788342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74788525 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74788752 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74789052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74789058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74789141 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74789257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74789514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74790364 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74790370 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74790967 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74791044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74791327 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 74791970 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74792691 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 74792715 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 74793161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74793567 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74793585 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74793641 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74794399 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74794421 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 74795871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74795919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74795965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74796001 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74796075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74797389 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74798933 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74799255 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74799425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74799475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74799574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74799709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74800023 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74800402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74800419 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74800559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74800594 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74800860 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74800939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74801014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74801054 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74801086 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 74801157 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74801284 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 74801507 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74801528 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 74801538 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74801549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74801865 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 74801899 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 74801970 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74801975 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74801995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74802011 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74802279 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74802762 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74802878 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74803454 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74804090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74804536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74804951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74805117 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74805443 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 74805752 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74805875 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74806099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74806200 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 74806400 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74806954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74806996 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74807433 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 74807535 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74807630 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74807849 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 74807904 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 74807932 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 74807964 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74808305 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74808324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74808443 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 74808464 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74808508 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74808547 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74808639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74808806 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74809071 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74809228 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74810452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74811020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74811265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74811270 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74812073 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74813069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74813127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74813799 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74814587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74814783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74814806 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74814807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74816269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74816366 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 74816551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74816735 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74817051 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74817260 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74817406 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74817678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74817775 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74817806 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74817890 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74818042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74818079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74821047 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 74821422 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74822136 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 74822485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74823299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74824796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74825782 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74826080 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74827816 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 74827962 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74828297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74829890 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74829892 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74830334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74830372 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74831350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74831618 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74831672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74831698 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74831823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74831839 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74831841 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74832457 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74832498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74832523 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74832578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74832650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74832706 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74832740 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74832769 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74832842 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74832973 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 74833106 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74833363 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74833375 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74833387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74833402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74833594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74833619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74833734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74833780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74833788 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74833913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74834022 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74834031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74834309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74834468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74834904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74835084 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 74835161 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 74835440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74835672 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74835762 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 74835782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74835837 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74835867 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74835868 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74835880 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74835913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74835923 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74836008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74836443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74836524 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74836542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74836703 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74836715 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74836824 A T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 74836995 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74837201 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 74837567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74837614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74837708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74838085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74838215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74838230 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 74838838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74838895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74839164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74839360 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74839460 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74839475 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74839566 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74839596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74839767 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74840019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74840092 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74840207 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 74840213 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 74840611 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74843294 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74843688 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74844505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74844768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74845190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74845939 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74846132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74846877 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74847997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74848571 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74848885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74849433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74849872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74849991 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74849997 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74850151 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 74850187 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74851281 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74852516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74852635 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74852783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74855151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74855195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74856647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74856956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74857238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74862410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74864430 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74865869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74868004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74868009 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74868316 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 74869652 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74869905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74870215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74872239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74872490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74873203 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74876586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74877481 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74877679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74877798 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 74877807 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 74877822 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 74877907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74877931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74877988 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 74877993 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74878202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74878258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74878315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74878407 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74878424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74878458 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74878501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74878556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74878634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74878713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74878801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74878877 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74879090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74879092 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74879190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74879201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74879343 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74879627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74879881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74880016 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 74880032 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 74880407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74880516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74880660 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74880762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74880808 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 74880889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74880985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74881050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74881216 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74881620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74881652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74882029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74882153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74882376 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74882404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74882476 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74882615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74882740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74882885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74882989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74882991 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74883050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74883138 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74883167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74883224 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74883312 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 74883516 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74883631 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74883634 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74883674 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74883880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74883923 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74884134 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 74884148 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 74884382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74884405 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74885185 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74885360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74885409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74885453 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 74885463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74885481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74885515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74885525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74886044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74886200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74886437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74886784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74886837 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74886967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74887062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74887270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74887558 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74887572 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74887749 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 74887869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74887962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74888500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74888560 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74888647 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 74888700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74888843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74888868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74889113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74889219 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74889890 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74889893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74889930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74889953 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74890217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74890244 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 74890292 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74890689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74890876 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74891190 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 74891677 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 74891947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74891995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74892079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74894672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74895003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74897039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74897056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74897218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74897367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74898330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74898665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74899346 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 74899585 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 2 74900046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74900624 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 74900634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74900687 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 74900692 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 74900952 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 74901270 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 74901653 A T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 74902225 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 74902720 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 74902778 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 74903326 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 74903825 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 74903920 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74904314 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 74904375 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 74904427 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 74904514 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 74904754 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 74904810 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74904865 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 74904981 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74905604 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 74905747 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 74906110 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 74906844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 74906918 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 74907086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74907262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74907314 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 74907388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74908870 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 74910692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74911074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74911522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74912429 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74912531 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 74912584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74912633 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74912693 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74912716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74912749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74912810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74912978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74913142 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 74913759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74915729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74916784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74916897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74916994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74917912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74919967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74920588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74920827 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 74920915 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 74920962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74920985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74921000 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 74921707 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 74922241 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 74922777 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74922838 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 74923031 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74923138 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 74923433 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 74923455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74923497 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 74923741 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 74924485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74924738 C A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 2 74925012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74925118 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 74925166 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 74926426 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 74926528 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 74926768 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 74927178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74927270 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 74927345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74927554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74927572 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 74927674 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 74927704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74928049 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74928429 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 74928826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74928957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74929078 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74929082 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 74929347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74929438 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74929451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74929462 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74929463 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 74930083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74930604 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 74930634 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 74930839 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 74931351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74931370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74931517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74936467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74936468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74939666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74944620 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 74944747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74945433 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 74945930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74946153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74946579 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 74946727 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 74947064 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74948305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74948444 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 74948598 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 74948767 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 74948814 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 74948919 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 74948980 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 74949056 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 74949163 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 74949180 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 74949386 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 74949559 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 74949708 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 74949792 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 74950035 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74950099 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 74950114 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 74950188 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 74950415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74950555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74951279 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 74951472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74951577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74952404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74965257 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 74965316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74966247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74967483 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74970071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74970514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74971046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74972399 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 74975773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74977095 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74978519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74979703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74980081 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 74980476 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74980836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74981080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74981170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74981871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74982012 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 74982157 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 74983148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74983347 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 74984490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74985750 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 74986077 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74986621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74986724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74986736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74987550 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 74988520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74990600 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74991416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74993092 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74994368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74995464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74995562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 74997249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75002042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75002977 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 75003001 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 75003223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75004340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75004702 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 75004714 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75006020 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 75006050 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 75006359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75007110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75007272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75007380 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 75007686 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75008375 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 75008438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75008632 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 75008669 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 75008842 C A Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 75009351 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 75009452 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 75009646 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 75009708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75009761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75009802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75010508 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75010678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75010787 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 75010846 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75010864 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75010938 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 75011146 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75011369 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75011400 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 75011689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75011847 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 75011869 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 75011921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75012184 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 75012783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75012863 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 75012922 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75013037 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 75013240 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 75013687 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 75013738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75013759 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 75013879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75013941 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75013973 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 75014061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75014184 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75014365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75015315 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75015338 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75016251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75017359 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 75017429 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 75017695 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 75018076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75018914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75018982 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 75019449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75020970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75021940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75023320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75023388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75023466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75024427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75024493 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75025013 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75025020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75025538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75025579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75026962 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75028013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75028085 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 75032084 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75033514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75033716 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 75033718 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 75034096 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75038245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75038580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75038871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75039956 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75041018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75041634 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 75042391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75042858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75043101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75043483 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 75043957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75045479 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75047382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75047504 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 75047930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75048450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75048589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75048635 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 75048963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75049022 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 75049130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75049138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75049212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75049229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75049244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75049354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75049622 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 75049759 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 75050319 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 75050367 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 75050718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75050743 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75051125 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 75051263 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 75051701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75051802 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 75052035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75052049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75052646 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 75052722 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 75052746 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 75053119 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 75053722 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 75053778 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 75054312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75054692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75054791 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75054960 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 75055855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75057190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75058735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75059234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75059958 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 75060188 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 75060652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75060677 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 75060986 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75061065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75061243 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 75061297 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 75061409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75061705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75061884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75061924 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 75062029 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75062042 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 75062233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75062243 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 75062423 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 75062424 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 75062894 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75063052 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 75063084 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75063123 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 75063910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75063953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75064086 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75064103 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 75064276 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75064384 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 75072432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75073005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75073574 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 75073693 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 75074678 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75076908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75077006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75077832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75078056 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75078344 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75080305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75081508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75081875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75083871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75083945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75084124 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75084727 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 75085473 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75086054 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75086225 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75086367 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 75086660 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 75086704 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75086799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75087161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75087200 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 75087522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75087628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75087837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75088544 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75088594 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75088726 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 75089192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75089220 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 75089927 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 75090110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75091441 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75091627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75091628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75091724 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 75092077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75092613 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 75093016 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75093549 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 75093974 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75094668 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75094964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75095077 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 75096871 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75100429 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75101830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75104971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75106678 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75107509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75110522 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75110992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75111072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75111184 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 75111525 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75112338 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75112595 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 75113264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75118289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75120083 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75121926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75122287 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75122744 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 75123319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75123753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75125474 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75128239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75128646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75130021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75130412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75131538 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 75132192 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75132914 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75132954 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75132975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75133046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75133083 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 75134147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75135750 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 75136299 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 75136356 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 75137612 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 75137730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75139475 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75139990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75140552 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 75140920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75141058 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75144739 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75145059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75145093 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75145192 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75145301 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75145481 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75146416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75146986 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 75147226 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75147353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75147708 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75148268 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75151360 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75151808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75154981 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 75157398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75158678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75159145 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 75159438 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 75159544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75160003 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 75160138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75160705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75161343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75163978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75164762 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 75165004 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 75165030 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 75166015 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75166676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75166805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75166986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75167302 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75168016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75169135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75169272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75169289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75170555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75172319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75172522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75175314 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75176850 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 75177402 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 75178069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75178646 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 75179158 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75179260 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 75179428 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 75179456 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 75179537 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 75179548 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 75179563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75179579 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75179676 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 75179753 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75179807 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 75179860 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75179872 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75180238 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 75180282 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75180421 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 75180422 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 75180503 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75180664 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 75181172 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 75181266 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75181933 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 75182108 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75183290 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 75183431 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 75184001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75184125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75184335 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 75184417 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 75184464 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 75184483 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 75184526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75184812 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 75185992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75186698 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 75186946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75187232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75189097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75191626 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 75191648 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 75191689 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 75193161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75194403 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75195275 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75195643 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 75195786 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75195793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75195928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75196941 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 75197517 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 75197644 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 75197718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75198215 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 75198332 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 75198905 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75199160 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 75199319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75200239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75202266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75205594 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 75206073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75207123 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75207670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75207765 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75207870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75207897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75207933 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75208199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75208200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75208424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75208465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75208533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75208674 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75208676 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 75209407 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 75209676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75209788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75210052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75210222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75210302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75210453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75210889 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75210946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75210947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75210991 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75210993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75211051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75211167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75211182 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75211202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75211325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75211405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75211425 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75211584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75211615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75211661 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75212037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75212077 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 75212503 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 75212632 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 75212750 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 75212940 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75212946 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75213185 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75213559 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75214620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75214965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75215964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75216001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75216385 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75216395 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75216439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75216451 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 75216709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75216770 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 75216859 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 75217059 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 75217072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75217401 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 75217447 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 75217461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75217498 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75217533 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 75217576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75217589 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75217595 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 75217741 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 75217837 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 75218218 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 75218264 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 75218268 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 75218591 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75218891 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75219064 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75219065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75219125 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 75219133 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 75219230 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 75219293 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75219653 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 75219710 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 75219725 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75219759 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75219763 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75219815 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 75219819 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 75219890 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 75219950 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 2 75219978 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 75220089 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 75220176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75220241 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75220504 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 75224270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75224769 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 75224781 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75224816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75225072 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 75225277 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75226114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75226593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75227224 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 75228138 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 75228179 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 75228245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75228375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75228716 G C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 75228770 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75228855 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75228927 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75229135 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 75229164 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 75229221 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 75229371 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75229424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75229684 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 75229853 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75229919 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75230060 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 75230678 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 75230889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75231336 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 75231534 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75231710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75231751 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 75231861 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75231870 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 75231932 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 75231978 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 75232011 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75232333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75232362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75232428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75232913 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75234566 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 75234608 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 75234624 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 75234704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75234707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75234750 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 75235298 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 75235384 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 75235628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75236019 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 75236035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75236064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75236336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75236394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75237454 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 75237794 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 75237825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75238029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75238094 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75238120 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 75238123 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 75238191 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75238201 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 75238458 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75238487 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75238756 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75238788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75239022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75239263 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75239272 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 75239302 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 75239439 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75239488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75239496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75239556 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 75239616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75240036 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 75240991 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 75241056 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 75241196 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 75241303 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 75241571 A T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 75241627 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 75241891 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75242267 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75242324 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 75242435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75242506 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 75242530 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 75242819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75242936 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75242986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75243023 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75243042 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75243167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75243176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75243212 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75243235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75243527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75243592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75243678 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 75243751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75244291 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75244559 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 75244731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75245135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75245221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75245249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75245284 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 75251031 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 75251171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75251203 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 75251227 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75251568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75251614 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 75252259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75252308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75252882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75252956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75253426 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 75253452 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 75253742 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 75254183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75254513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75254562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75255153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75255262 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 75255541 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 75255872 G C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 75255946 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 75256074 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 75256119 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 75256178 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 75256256 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 75256282 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 75256921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75257107 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 75257502 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 75257785 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 75257847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75259073 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 75260211 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75260818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75261080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75262543 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75262856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75264184 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75266494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75268104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75269498 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 75270230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75272634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75273955 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 75275516 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75275518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75275547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75275553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75275728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75276103 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75276235 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 75276365 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 75276435 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 75276481 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 75276547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75276618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75276655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75276725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75276748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75276916 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 75277001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75277114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75277209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75277386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75277396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75277493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75277500 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75277512 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 75277609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75278481 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 75278735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75279370 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 75279407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75279583 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 75279635 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 75279816 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75279860 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 75281198 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75281264 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75281550 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75282966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75284063 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75284808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75285710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75285842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75286716 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75286896 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 75286956 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75287038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75287130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75287172 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75287186 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 75287702 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75287707 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75288110 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 75288194 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 75288247 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 75288264 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75288357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75288460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75288559 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75289312 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75289316 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75289484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75289602 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75289691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75289705 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75290257 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75290282 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 75290396 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75290567 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75290628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75290745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75290762 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75290778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75290809 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75290825 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75290917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75290922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75290954 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75291008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75291036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75291445 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 75291537 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 75291615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75291845 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75291852 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75291904 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 75292042 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75292135 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75292194 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75292223 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75292226 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75292264 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75292340 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 75292485 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 75292519 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75292523 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 75292542 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75292575 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 75292602 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 75292618 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 75292745 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 75292799 C G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 75292820 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 75293047 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75293093 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75293266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75293392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75293462 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75293492 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 75293540 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 75293549 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75293577 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 75293606 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 75293617 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 75293840 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75293952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75293953 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 75294006 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 75294045 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 75294049 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75294086 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75294123 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 75294150 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75294209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75294226 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75294244 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75294248 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75294280 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75294318 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75294402 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 75294423 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75294424 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75294485 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75294494 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75294593 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75294628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75294671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75294684 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75294836 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75294889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75295003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75295039 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 75295366 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75295558 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75295575 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75295607 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 75295637 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 75295834 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 75295851 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75295959 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75296148 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75296527 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75296639 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75296777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75296879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75297800 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 75298092 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75298129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75298165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75299543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75300705 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75300897 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75300968 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 75301266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75302361 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 75302362 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 75302480 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 75302676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75303845 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 75303911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75304261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75304997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75305011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75305535 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 75305748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75306140 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75306294 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75306397 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75306429 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75306518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75306544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75306836 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 75307042 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75307043 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75307089 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75307102 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75307114 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75307174 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75307326 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75307439 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 75307499 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75307541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75307659 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 75307699 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 75307706 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75307987 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 75307994 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 75308049 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 75308105 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75308161 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 75308163 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 75308227 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75308275 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 75308286 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 75308325 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75308330 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75308352 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75308403 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 75310044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75310373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75312305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75312359 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 75312792 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 75312958 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75312988 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 75313002 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 75313004 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 75313122 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75313158 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75313559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75315014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75315493 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75315551 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75315645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75317527 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75321525 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 75322534 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75324473 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 75324814 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 75324945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75325445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75325450 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 75325477 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75326183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75326397 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75326660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75326895 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75327260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75327396 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 75327397 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 75327704 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 75327798 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 75327809 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 75328060 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 75328128 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 75329178 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 75329192 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 75330188 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75330378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75330410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75330515 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 75331075 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75331875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75333120 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 75333127 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75333257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75333857 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 75334086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75334472 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 75334645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75334677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75334798 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 75334862 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 75334926 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 75335081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75335188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75335605 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75335683 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 75335791 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75335857 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75336246 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75336561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75336639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75336669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75336698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75337655 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 75337764 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75340518 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 75340555 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 75342183 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 75343572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75344243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75344639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75344673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75344937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75345534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75345667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75345934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75346086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75346232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75346337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75346378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75347192 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 75347532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75347638 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75348488 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 75348584 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 75348765 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 75348850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75349363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75350045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75350184 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 75350208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75350565 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 75350685 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75350862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75350880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75350972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75352359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75352644 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 75352801 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 75352859 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 75353364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75353447 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 75353560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75353621 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 75353628 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 75353668 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 75353673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75353704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75354605 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 75354668 T A N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 75354924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75355885 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75359246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75360306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75361013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75361089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75361489 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75361766 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75362306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75362785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75363819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75364862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75366255 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 75367430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75368132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75368227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75368349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75368863 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 75368913 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75369070 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 75369619 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 75370032 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 75370836 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75372089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75375527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75375798 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75376595 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 75376640 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75376928 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75376932 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75377698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75377770 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 75377954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75378498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75379410 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 75379419 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 75379462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75379751 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75380468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75381504 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 75382990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75384056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75384873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75385073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75386007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75387145 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75389481 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75392509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75394318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75394510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75394916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75396004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75396074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75396509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75396982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75398536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75398707 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75398739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75398889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75398915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75398963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75398979 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75399038 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75399053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75399114 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 75399201 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 75399212 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 75399271 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 75399346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75399360 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 75399364 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 75399583 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 75399682 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75399699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75399714 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 75399839 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 75399887 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 75400005 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 75400091 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 75400137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75400190 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 75400195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75400241 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 75400394 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75400433 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 75400497 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 75400543 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 75400715 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 75400717 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 75400744 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 75400770 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 75400814 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 75400873 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 75400914 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75401032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75401134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75401252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75401471 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75401564 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 75401652 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 75401771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75401971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75402009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75402185 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 75402210 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 75402535 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75402649 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75402674 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75404435 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75404617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75404705 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 75404833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75405854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75405971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75406352 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 75407109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75407245 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75407266 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75407303 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75408190 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 75408202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75408207 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 75408239 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 75408263 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 75408320 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 75408333 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 75408351 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 75408381 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 75408435 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 75408452 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 75408513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75408538 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 75408563 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 75408693 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 75409059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75409644 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 75409719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75409848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75411167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75411309 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75411354 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75411970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75412360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75412623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75413622 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 75414186 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75414189 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75414202 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75414367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75415148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75415236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75415333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75415516 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 75415968 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75416470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75416781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75416893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75419599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75419989 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75420454 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 75420518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75420527 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 75420550 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 75420594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75420652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75420761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75420792 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 75420836 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75420837 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75420865 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75420934 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 75420957 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 75421034 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 75421669 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 75421742 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 75421824 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 75421915 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 75422018 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 2 75422126 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 75422728 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 75422729 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 75422940 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 75422962 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 75422965 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 75423327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75423508 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 75423717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75423774 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75424073 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75424109 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75424118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75424412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75424517 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 75424519 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75424529 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75424713 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75424767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75424798 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75424812 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75424833 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75424932 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 75424961 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 75425013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75425035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75425293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75425335 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75425338 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75425357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75425400 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75425429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75425450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75425470 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75426097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75426144 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 75426197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75426206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75426234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75426395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75426438 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 75426463 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75426475 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75426727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75427600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75427651 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75427766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75427835 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 75427983 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 75428052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75428196 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 75428382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75428700 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 75428888 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 75428978 C G N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 7 13 3 1 6 2 75429426 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75429649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75429665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75429951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75430136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75430328 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 75430697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75430725 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 75430726 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 75430849 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 75431268 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 75431574 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75431807 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 75432386 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 75432567 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75432980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75433971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75434700 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75435392 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75435710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75437054 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75439571 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 75440506 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 75440571 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75441401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75441784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75441836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75442673 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 75442794 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 75442796 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 75442985 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 75443009 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 75443011 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 75443046 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 75443096 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 75443180 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 75443426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75443728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75443846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75443877 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75444035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75444062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75444185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75444260 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75444515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75444734 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 75444845 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 75444849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75444942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75444947 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75445347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75445712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75446229 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 75446674 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75446879 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75447030 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75447093 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75447221 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 75447243 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 75447471 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 75447558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75448334 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75448643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75449754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75449834 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75449846 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75449859 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75450022 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 75450072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75451800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75451990 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 75452836 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 75452928 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 75453197 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 75453280 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 75453837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75453852 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 75453985 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 75454054 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 75454073 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75454171 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 75454245 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 75454425 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75454447 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 75454474 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 75454621 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 75454711 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 75455129 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 75455205 G A Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 2 75457260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75457553 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 75457845 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 75458865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75458927 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 75458970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75459541 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 75459973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75459980 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75460045 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 75460074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75460294 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 75461349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75462138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75462343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75463077 A T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 2 75463660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75465961 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75466186 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 75467053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75467232 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 75467400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75467837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75468330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75468681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75468703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75468974 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75469697 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75469805 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 75469972 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 75469998 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 75470815 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75472721 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75472742 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75473461 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 75474170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75474708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75475675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75475925 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 75481300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75481722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75482737 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75483170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75483578 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 75483593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75485177 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 75485818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75485959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75489707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75489768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75490513 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75493638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75493919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75495470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75495714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75496033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75496307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75496763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75499686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75500706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75502691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75502840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75502939 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75508167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75508173 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75509810 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 75509815 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75511511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75512148 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75512155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75513360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75515827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75516883 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 75517022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75517319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75518436 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75520248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75520639 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75522390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75524413 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 75524420 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 75526263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75526293 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 75527202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75528115 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75528940 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75529275 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 75529579 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 75530160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75532308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75532623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75532751 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 75532786 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 75533048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75533423 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75533474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75533506 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75533602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75533976 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75533986 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 75533999 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75534200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75535046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75535495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75535917 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 75535954 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 75536171 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75536390 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75536756 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75536995 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 75537058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75537101 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75537108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75537313 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 75537360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75537371 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 75537454 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 75537591 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 75537621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75537638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75537765 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 75537793 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 75538021 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 75538121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75538382 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 75538475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75538659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75538767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75541938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75541939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75542944 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75543555 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 75543569 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75543585 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 75543597 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 75543619 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75544444 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 75544512 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75544778 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 75544796 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 75545288 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 75545461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75545535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75545629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75546507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75547069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75547477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75548309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75548336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75548393 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 75548530 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 75548611 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75549086 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75549607 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75549695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75549784 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75549832 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75550747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75551122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75551382 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 75551385 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 75553215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75553279 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75554645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75554685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75554717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75556219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75557436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75557575 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75559176 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 75559701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75559784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75561679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75561917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75562022 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75562278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75564082 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75565889 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 75566796 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75567014 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75567272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75567319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75568766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75569189 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75569251 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 75569302 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75569376 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75569502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75569928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75570740 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 75571218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75571364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75571604 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 75571864 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75572293 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 75572326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75573083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75574478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75575172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75575267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75575519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75575940 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 75576077 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 75576134 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 75576382 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 75576383 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 75576522 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75576525 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75576610 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 75576624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75576635 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75576701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75576812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75576829 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 75576911 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 75577112 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 75577354 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75577472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75577969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75578111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75578149 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75578380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75578443 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 75578466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75578501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75578580 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75578794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75578858 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 75579060 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 75579295 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75579324 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75579569 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 75579945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75580143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75580700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75580717 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75580757 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75580811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75581046 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75581093 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75581313 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75581453 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75581803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75581896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75581943 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 75582081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75582914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75584847 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75584892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75585549 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 75587207 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 75587655 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75587664 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75587989 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75588584 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 75588623 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 75588628 T A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 75588638 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 75588981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75588983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75589020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75589310 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75589370 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 75589512 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 75589756 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 75589971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75589985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75589999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75590185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75590266 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75590340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75591313 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75592158 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75592252 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75592349 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 75592396 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75592399 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 75592440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75592507 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75592588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75592644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75593215 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75593270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75593419 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 75593540 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 75593624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75593688 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 75593827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75594212 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75594312 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 75594313 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 75594346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75594362 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75594502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75594843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75595130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75601746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75602192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75602219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75602387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75602537 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75603531 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75604031 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 75604124 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75604341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75604786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75604870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75605134 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75605150 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75605668 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 75605718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75605786 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75605846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75605899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75606019 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 75606281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75606313 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 75606386 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75606973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75607809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75607964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75608146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75608184 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 75608571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75608625 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75608959 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75609265 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75609308 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75609312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75609377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75609474 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 75609722 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75610214 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 75610323 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 75610339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75610390 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 75610685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75610981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75610997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75611017 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75611071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75611137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75611591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75611868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75612004 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75615833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75617069 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75619271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75619331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75619501 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75622403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75622910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75624031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75627730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75628535 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 75628906 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75630764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75632504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75632521 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75632985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75635149 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 75635718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75635777 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75636045 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75636242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75636332 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75636675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75639021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75639208 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 75639379 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75640138 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 75640195 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75640494 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75640555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75640578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75640837 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 75641146 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 75641278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75642243 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 75642276 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75642660 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75642866 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75643133 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 75644501 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 75644583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75644892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75644903 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 75645014 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 75646462 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75648001 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 75648669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75648736 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 75648845 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75649193 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 75649195 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 75649661 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75649711 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 75649963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75650167 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75650196 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75650402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75650520 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75650631 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75650916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75650991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75651013 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75651051 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75651199 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75651257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75651539 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 75651548 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 75651639 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 75651991 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 75652009 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75652058 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 75652196 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75652575 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75652665 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 75653345 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 75653420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75653885 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 75653920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75654084 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 75654147 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75654273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75654516 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75655006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75655079 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 75655724 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 75655770 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75655820 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75656605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75660619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75661796 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75662265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75664962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75665616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75667111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75667306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75667744 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75667765 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 75668344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75668628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75668802 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75671780 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75671970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75672916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75673034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75674853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75675248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75675584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75675795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75678593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75679816 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75680067 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 75680225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75681416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75682116 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75682888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75683363 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75684454 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 75684709 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 75685184 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 75685770 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 75685771 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 75685824 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75686410 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 75686979 A G Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 75686992 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 75687715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75688205 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75688556 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75689697 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 75690201 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 75691708 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75691867 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75691895 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75691896 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75692670 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75692868 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75692910 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75693351 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75693498 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75693737 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75693793 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75693961 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 75694105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75694288 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75694468 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75694490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75694935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75695232 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75695416 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75695858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75695861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75695909 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 75695914 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75695922 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75695930 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75695943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75695949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75695972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75695982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75696095 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75696188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75696192 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 75696531 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75696729 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75696891 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75697282 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75697325 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75697502 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75697560 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 75697674 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 75697772 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75697858 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75698201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75698541 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75698546 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75698624 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75698727 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 75698821 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 75698823 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 75699167 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75699326 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75699532 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 75699688 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75699698 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75699903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75699941 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75700730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75701864 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75701873 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75701879 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 75702412 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75703677 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75703730 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75704080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75704416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75704563 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 75704738 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 75704975 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75705164 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75705878 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 75705990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75706579 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75706708 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75706900 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 75707871 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75708070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75708226 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 75708417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75708868 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75709110 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 75709385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75710178 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75710781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75710851 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 75710941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75712638 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 75713620 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75713772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75714279 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75715032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75715400 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 75716045 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 75716079 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 75716378 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 75716626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75716711 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 75716873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75717067 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 75717941 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75718900 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75719070 C T N Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 75719095 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 75720578 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 75720684 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75720826 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75721203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75721457 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75721713 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75721870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75723119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75723343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75723453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75723491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75724345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75727297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75727520 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75727839 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75727860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75728788 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 75728978 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 75729466 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75729801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75730719 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75730759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75731340 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 2 75731525 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 75731530 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 75733228 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 75733760 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 75734447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75734538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75734644 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 75735010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75735207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75735225 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75735478 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75735978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75736405 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75736553 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 75736567 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75736619 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75737056 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75737916 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75739242 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75739263 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 75740512 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75743252 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75744013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75745917 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75747085 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75747739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75748829 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75748858 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75749195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75749590 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 75750303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75751474 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 75752529 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75752563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75752611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75753294 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75753905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75754367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75756094 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 75756783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75757294 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75757843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75759276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75759493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75764407 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75771814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75773450 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 75775514 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 75777180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75777920 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 75777939 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 75777949 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 75778001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75778324 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75778436 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75778442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75778455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75778461 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75778478 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75778611 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 75778627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75779306 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 75779352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75779583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75779648 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75779776 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75779816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75779857 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75779862 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75779999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75780070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75780157 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75780160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75780198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75780311 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75780414 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75780843 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75780950 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 75781101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75781323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75781660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75781718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75782147 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 75782192 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 75782477 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75782643 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 75782721 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75782831 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 75782881 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75782906 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75782986 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75783106 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75783272 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75783328 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75783420 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75783448 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75783483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75783542 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75783614 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75784179 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 75784496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75784514 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 75784650 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 75784659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75784683 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75784798 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75784801 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75784814 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75784824 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75784845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75784932 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75785006 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75785143 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75785413 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75785584 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75785632 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 75785762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75786014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75786094 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75786257 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75786260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75786287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75786441 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75786855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75787242 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75787288 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75787358 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 75787368 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 75787440 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 75787530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75787568 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 75787612 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75787627 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75787659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75787683 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75787699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75787723 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 75787805 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 75787915 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75788200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75788508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75788804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75789210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75789231 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 75789711 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75789750 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75789751 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75789784 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75789801 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75789820 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75789872 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75789875 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75789899 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 75789941 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75789996 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75790008 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75790061 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75790093 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75790155 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75790182 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75790228 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75790293 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75790296 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75790358 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75790376 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75790545 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75790856 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75790925 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 75791015 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75791107 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 75791245 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75791251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75791281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75791474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75791642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75791675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75791770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75791787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75792045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75792050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75792082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75792202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75792519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75792540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75792602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75792811 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75792822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75793049 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75793403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75793706 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75794356 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75794482 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75795195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75795335 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75795355 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75795356 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75795470 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 75795485 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75796174 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75796235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75796320 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 75796331 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 75796451 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75796560 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75796569 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75799694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75801458 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75802574 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75803204 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75803441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75803726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75804443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75804471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75804559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75804746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75806427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75806812 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 75808548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75808914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75808927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75809152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75809164 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 75809813 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75809962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75809969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75810011 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 75810481 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75810551 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 75810577 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75810594 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 75810628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75810641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75810647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75810735 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75810845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75810964 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75812035 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 75812238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75813930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75814202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75814388 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75815960 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 75816104 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 75816576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75817095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75817189 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75818583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75818751 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 75819747 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 75820553 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75821334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75822939 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 75823954 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75824547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75824725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75824856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75824975 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75825070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75825156 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75825388 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75825398 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75825500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75825594 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75825691 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75826030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75826031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75826050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75826133 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 75826384 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75826547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75827042 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75827699 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75828714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75828773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75829453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75831404 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 75831613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75832231 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 75832472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75832541 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 75832617 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 75833498 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 75833643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75833687 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75833689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75833721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75833963 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75834181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75834281 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75834288 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75834423 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75834428 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75834467 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75834475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75834734 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75834741 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75834819 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75834841 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75834853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75834896 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75834905 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75834922 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75835056 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75835086 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75835123 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75835265 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75835287 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75835293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75835303 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75835376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75835383 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75835474 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 75835745 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75835929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75835937 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75836539 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75836563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75836607 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75836636 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75836777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75836779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75837366 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75837428 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75837776 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 75837888 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 75837961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75837991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75838100 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 75838666 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 75838861 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75838897 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 75838910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75839416 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75839440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75839526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75839561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75839575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75839598 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75839843 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75839897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75839962 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 75840290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75840388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75840526 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75840572 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75840930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75841604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75841631 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 75841702 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75841704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75842175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75842296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75842297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75842348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75842352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75842532 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75842867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75842877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75842941 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75842975 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75843557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75844005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75844015 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75844714 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 75845292 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75845880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75845957 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75845983 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75846031 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75846045 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75846101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75846214 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75846448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75846549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75846551 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75846569 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75846583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75846648 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75846665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75846865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75846997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75847014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75847538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75847543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75847569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75847629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75847641 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75847649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75847692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75847697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75847703 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75847723 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75847750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75847870 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75847877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75847908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75847911 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75848115 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75848170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75848528 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75848891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75849055 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75849147 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75849333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75849412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75849437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75849457 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75849466 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75849476 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75849632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75850055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75850067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75850081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75850086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75850096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75850120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75850155 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75850213 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75850230 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 75850322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75853174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75853608 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75853719 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75853925 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75853933 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75854098 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75855211 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75855482 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 75855805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75855833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75856062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75856641 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75856675 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 75856733 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75856800 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75856928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75856942 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75856958 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75856961 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75857097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75857140 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 75857201 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75857441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75857534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75857745 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 75857815 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 75857842 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 75857990 A T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 75857995 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 75858333 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75858498 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75858620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75859319 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75859401 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 75859697 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 75859704 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75859960 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75859994 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75860015 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75860029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75860051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75860173 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 75860301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75860567 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75861095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75861602 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 75861640 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75861703 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75861741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75861768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75861784 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75861815 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75861832 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75862018 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 75862355 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75862361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75862496 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 75862509 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 75862628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75862684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75863073 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75863202 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75863591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75863979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75863980 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75866505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75868596 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 75869356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75870257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75871004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75871133 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 75871541 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 75873561 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 75876018 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75880927 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 75885120 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75885349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75885398 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 75885454 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 75885490 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 75885600 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 75885743 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 75885941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75886157 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 75886340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75886402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75886514 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 75886549 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 75886708 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 75887084 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75887225 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75887710 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 75887771 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 75888887 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 75888894 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 75888992 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 75889342 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 75889601 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75890112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75890267 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 75890655 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 75890682 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 75890693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75890721 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 75890772 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75890797 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 75890801 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 75890831 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 75890960 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 75891350 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75891382 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75891384 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75892562 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 75892837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75893669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75893935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75893951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75894469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75895096 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75895602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75895710 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 75895890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75896232 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 75896377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75896538 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75896555 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75896703 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 75897323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75897433 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75897438 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75898192 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 75898313 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75898429 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75898523 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75898856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75899013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75899035 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 75899181 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 75899261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75899548 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 75900091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75900246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75900439 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 75901074 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75901470 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75901680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75901781 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75901970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75902015 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75902096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75902325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75902373 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75902395 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75902435 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 75902945 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 75903075 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 75903320 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 75903656 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75905271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75905304 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75906056 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75906619 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 75906632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75906964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75907482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75907748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75909512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75910206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75910472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75910981 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75911409 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 75911805 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75911806 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75911916 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75912562 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 75912641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75912831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75912995 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 75913039 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 75913040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75913093 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 75913636 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 75913851 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 75914817 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 75917752 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 75917927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75918242 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 75918265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75918302 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 75918887 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75918925 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75919240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75919970 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75920215 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 75920216 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 75920407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75920468 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75920825 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 75921164 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 75921165 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 75921236 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75921247 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75921420 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 75921450 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75921516 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75921546 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 75921641 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 75921673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75922006 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 75922121 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75922241 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 75922336 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 75922349 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 75922456 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75922459 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 75922512 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75922559 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 75922671 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 75922737 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 75922940 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 75922942 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 75922988 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 75923079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75923122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75923150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75923255 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 75923265 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 75923347 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 75923364 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 75923397 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75923408 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75923622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75923981 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 75924056 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75924081 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75924089 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75924699 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 75924701 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 75924748 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 75924800 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 75924914 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 75924920 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75924945 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 75924998 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 75925071 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 75925307 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 75925580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75926046 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 75926059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75926153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75926185 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 75926491 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 75927165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75927236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75927819 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 75927971 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 75928188 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75928192 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75928303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75928360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75928445 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75928516 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 75928530 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75928541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75928650 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75928785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75929376 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 75929521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75929655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75929835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75931110 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 75931492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75932408 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 75932487 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 75932551 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 75932781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75932800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75932941 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75933088 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75933186 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75933383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75933433 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75933785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75934262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75934368 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 75934426 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75934486 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 75934573 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75934837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75934883 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75934912 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75934927 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75934962 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75935054 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75935781 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75935851 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75936283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75936328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75936634 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 75936663 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 75937826 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75937886 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 75937938 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 75937941 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 75937987 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75938082 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75938105 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75938588 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 75938792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75938832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75939054 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 75939324 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 75939390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75939531 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 75939895 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75939928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75939955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75940075 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75940138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75940288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75940336 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75940680 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75940710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75940714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75941402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75941527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75941639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75941803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75942392 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75943026 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 75943057 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 75943696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75944083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75944305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75944338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75944882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75944991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75945261 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75945310 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75945468 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 75945497 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75945625 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 75945714 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75945728 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75945777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75946134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75946332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75946661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75949938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75950371 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 75950417 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 75950580 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 75950611 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75950709 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 75950762 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75951056 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 75951098 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75951201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75951333 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75951359 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 75951547 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75952146 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 75952211 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75952222 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75952252 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 75952440 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75953185 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 75953381 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 75953413 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 75953464 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 75953491 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75953508 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75953542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75953705 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 75953725 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 75953760 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 75953803 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 75953995 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 75954006 G C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 75954055 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 75954117 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 75954127 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 75954200 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 75954298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75954430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75954441 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 75954588 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 75954951 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 75954971 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75955312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75955467 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 75955599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75955766 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75955809 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 75955893 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75956018 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75956296 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75956812 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 75956916 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 75957174 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75957931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75957937 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75957944 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 75957986 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 75957991 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 75958102 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 75958148 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75958446 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75958501 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75958531 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75958972 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75960863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75961592 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 75961906 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75961935 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75961954 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 75962089 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 75962140 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75962671 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 75962792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75962977 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 75963297 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75963308 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 75963316 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75963354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75963365 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75963489 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75965433 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 75965547 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75965571 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75965627 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 75965710 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 75965927 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 75966140 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 75966172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75966200 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 75966675 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75966772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75967035 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 75967663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75967664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75967680 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 75967904 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75968112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75968241 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75968705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75968838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75968851 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75968856 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75968954 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 75968997 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75969002 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75969050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75969077 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75969233 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75969513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75970057 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75970096 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75970100 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 75970651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75970668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75970831 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75971009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75971015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75971610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75971708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75971874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75971884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75972437 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 75972712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75972819 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 75972889 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75972984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75973872 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75973903 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75973977 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 75974005 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75974329 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 75974430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75974938 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75974960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75975085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75975184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75975185 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75975338 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 75975432 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75975788 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 75976745 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 75976759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75976814 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 75977050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75977181 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 75977331 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 75977626 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 75977665 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 75977741 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 75977974 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 75977983 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 75977989 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 75978001 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75978022 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75978186 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 75978263 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75978308 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 75978373 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75978420 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 75978496 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75978504 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 75978521 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 75978557 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75978709 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 75979197 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 75979235 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75979346 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75979440 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 75979592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75979671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75979704 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 75979720 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 75980076 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 75980202 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75980317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75980323 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 75980331 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 75980348 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 75980663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75980775 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 75980823 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 75980935 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 75980946 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 75981040 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75981145 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75981348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75981395 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 75981413 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 75981806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75981972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75982001 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 75982008 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 75982036 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 75982112 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 75982274 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 75982415 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 75982536 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 75982692 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75982819 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 75982847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75982914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75983156 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 75983211 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 75983243 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 75983292 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 75983314 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 75983410 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 75983445 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 75983505 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 75983621 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 75983718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75983758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75983799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75984135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75984137 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 75984151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75984165 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 75984176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75984241 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 75984592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75984626 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75984843 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75984856 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75984858 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75984933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75985056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75985062 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75985074 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 75985271 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 75985832 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 75985840 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 75985920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75985950 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 75985973 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 75985987 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 75986214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75986241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75986282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75986293 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 75986389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75986390 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 75986692 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 75986728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75986792 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75986798 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75986825 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75986841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75986860 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75987069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75987183 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 75987208 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 75987261 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75987262 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 75987277 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75987339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75987371 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75987460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75987547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75987548 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 75987785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75987792 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 75987829 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 75987868 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 75987879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75988028 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 75988068 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 75988089 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 75988587 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 75988907 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 75988986 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 75989259 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75989726 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 75989818 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 75989868 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 75990166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75990188 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 75990239 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 75990304 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 75990322 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 75990370 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 75990384 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 75990407 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 75990424 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 75990860 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 75991109 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 75991376 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75991458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75991578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75991611 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 75991697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75991759 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 75991770 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75991776 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75991849 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 75991864 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75991910 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 75991919 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 75991968 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 75991996 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 75992006 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 75992084 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75992128 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 75992172 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 75992211 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 75992246 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75992309 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 75992437 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 75992590 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 75992674 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75992777 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75992966 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 75993555 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 75994425 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 75994831 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 75994993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75995044 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 75995056 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75995069 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75995090 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 75995137 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 75995142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75995247 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75995271 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75995292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75995320 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 75995330 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75995403 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 75995464 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 75995561 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75995564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75995653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75996027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75996049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75996053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75996545 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75996589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75996718 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75996984 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75997120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75997447 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 75997490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75997492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75997502 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75997525 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 75997530 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 75997620 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 75997651 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 75997697 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 75997711 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 75998050 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 75998072 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 75998081 T A N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 2 75998211 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 75998217 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 75998236 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 75998265 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 75998277 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 75998282 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 75998297 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 75998360 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 75998462 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 75998700 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 75998716 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 75998820 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 75998842 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 75998881 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 75998911 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 75998935 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 75998953 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 75998960 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 75999030 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 75999031 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 75999049 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 75999055 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 75999069 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 75999107 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 75999211 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 75999352 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 75999359 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 75999365 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 75999370 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 75999387 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 75999403 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 75999408 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 75999491 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 75999492 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 75999502 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 75999557 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 75999562 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 75999594 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 75999610 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 75999622 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 75999624 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 75999651 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 75999663 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 75999679 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 75999690 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 75999739 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 75999813 A C N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 2 75999849 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 75999930 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 75999947 T A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 76000008 T A N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 76000498 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76000582 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76000766 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76000842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76000856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76000884 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76000927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76000935 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 76001044 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76001051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76001199 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76001298 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 76001321 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 76001322 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 76001406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76001443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76001453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76001520 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 76001521 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 76001707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76001722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76001975 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 76002050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76002065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76002203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76002314 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 76002449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76002941 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 76002972 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76003003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76003051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76003084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76003280 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 76003319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76003459 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 76004023 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76004558 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76004593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76004635 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76004798 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 76005289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76006286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76008067 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 76008656 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 76008884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76009037 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76009062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76009291 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 76009492 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76009642 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 76010238 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 76011224 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 76011404 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76011987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76012300 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 76012437 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76012586 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76012950 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 76013043 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 76013127 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 76013129 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 76013159 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 76013215 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 76013281 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 76014188 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76014201 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76014370 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 76014395 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 76014805 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 76014864 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 76015008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76015021 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76015070 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 76015195 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76015215 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76015231 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 76015344 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76015496 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76016043 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 76016060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76016404 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76016652 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76016725 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 76016942 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76017065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76017351 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76017496 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76017923 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 76018129 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 76018325 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76018374 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 76018543 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76018566 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76018824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76019003 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 76019211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76019252 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 76019422 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 76019446 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 76019621 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 76019679 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 76020308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76020930 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 76021176 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 76021178 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 76021739 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76022026 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 76022057 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 76022122 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 76022165 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76022232 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 76022242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76022267 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 76022269 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 76022309 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 76022340 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76022404 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76022416 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76022695 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 76023317 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 76023682 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 76023906 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 76024236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76025916 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 76026138 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76027154 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 76027626 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 76027650 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 76027658 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 76027669 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 76028553 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 76029027 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 76029144 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 76029187 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76029218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76029338 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 76030116 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 76030192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76030406 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 76030512 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 76030561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76030614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76030824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76031169 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76031312 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 76031493 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76031517 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 76032089 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 76032108 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 76032597 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 76032754 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76032803 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76032922 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 76032932 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76032935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76033159 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 76033476 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76033485 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76033491 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76033536 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 76033595 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76033600 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76033746 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 76033796 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 76033889 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 76033922 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 76033990 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 76034115 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 76034313 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 76034315 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 76034599 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76034687 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 76035037 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 76035071 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 76035126 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 76035182 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 76035265 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 76035266 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 76035545 G C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 76035562 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 76035586 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 76035599 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 76035632 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 76035643 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 76035909 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 76035976 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76036018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76036093 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 76036116 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 76036242 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 76036244 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 76036274 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 2 76036280 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 76036381 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 76036425 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 76036519 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 76036541 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 76036647 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 76036726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76036812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76036844 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76036936 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76036949 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 76036985 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 76037053 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 76037070 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 76037075 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 76037354 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76037420 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76037720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76037735 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 76037756 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 76037994 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76038139 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 76038266 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76038274 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 76038348 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76038379 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76038386 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 76038401 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76038479 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 76038549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76038580 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76038663 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 76038709 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76038764 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 76039145 C A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 76039612 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 76039769 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 76040013 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 76040049 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 76040291 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 76041140 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 76041159 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 76041240 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 76041253 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 76041366 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76041516 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76041527 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76041533 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76041772 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 76042159 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76042213 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 76042303 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76042474 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 76042498 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 76042621 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76042925 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 76042947 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 76042958 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 76042995 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 76043039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76043085 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 76043173 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 76043512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76043534 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 76043778 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 76043962 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 76044075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76044100 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76044139 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 76044165 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76044209 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 76044270 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 76044378 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 76044532 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76044574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76044906 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76045115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76045646 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 76045761 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 76045781 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76045873 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 76046010 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 76046185 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76046245 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 76046251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76046260 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 76046272 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 76046333 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76046349 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 76046422 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 76046582 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 76046831 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76046901 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 76046904 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76046969 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76046990 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76047287 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76047320 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76047399 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 76047666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76047780 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 76047795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76047828 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 76047985 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 76048104 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 76048119 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 76048132 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 76048135 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 76048160 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 76048275 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 76048580 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76048647 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 76048668 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 76048708 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 76048720 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 76048772 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 76048811 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 76048991 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 76048998 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 76049039 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 76049060 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 76049264 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 76049324 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 76049866 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 76049979 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 76050081 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 76050136 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 76050214 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 76050251 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76050308 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 76050573 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 76050731 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 76051212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76051274 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76051583 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 76051658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76051684 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76051689 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76051759 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76051827 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 76051889 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76052089 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 76052236 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76052353 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 76052405 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 76052672 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76053103 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 76053226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76053420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76053456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76053504 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 76053515 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 76053668 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76053842 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76053938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76054054 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76054084 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76054270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76054283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76054325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76054339 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76054442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76054496 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 76054542 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 76054595 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 76054687 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 76054703 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 76054841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76054926 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 76055035 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76055071 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 76055099 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 76055280 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 76055339 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76055350 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 76055352 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76055376 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 76055421 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 76055448 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76055458 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 76055603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76055827 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76055916 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76056144 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 76056210 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76056316 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76056385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76056417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76056435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76056441 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 76056504 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76056601 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 76056609 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 76056915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76056963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76056984 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 76057067 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76057145 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76057200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76057438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76057572 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 76057636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76057661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76057672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76057775 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 76057835 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 76058120 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 76058129 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76058772 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 76058782 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 76059079 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76059817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76059960 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 76060260 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 76060559 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 76060717 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76060748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76061003 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 76061266 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76062028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76062818 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 76063137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76065096 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76066099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76066701 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 76068624 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76069751 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76069752 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76073107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76074086 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 76075136 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 76075175 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 76075339 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 76075346 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76075527 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 76075713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76075755 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 76075769 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 76075967 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76076611 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76076664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76076942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76076990 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76078405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76080128 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76080146 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76080702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76082807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76082976 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 76088450 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76089816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76089976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76094691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76094790 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 76094820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76094863 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76095007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76095142 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 76095305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76095317 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 76095364 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 76095512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76095610 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 76095654 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76096002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76096170 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76096181 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 76096191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76096386 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 76096849 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76096850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76097203 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 76097296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76097318 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 76098164 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 76098325 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 76098850 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 76099481 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 76099562 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 76099577 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 76099719 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 76099779 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 76099953 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 76100018 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 76100246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76100292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76100294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76100477 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76100514 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 76100516 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 76101225 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 76102171 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 76102345 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 76102454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76102654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76102974 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 76103097 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76103118 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76103143 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76103265 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76103401 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 76103464 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 76103468 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 76103775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76104159 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 76104412 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 76104440 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 76105168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76105317 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76105353 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 76106260 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76106276 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 76106371 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 76106649 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 76106688 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76107386 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 76107545 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 76107636 A C Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 76108578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76108671 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76108746 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76109652 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 2 76109677 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 76109893 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76109918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76109985 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 76109993 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 76110036 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 76110051 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 76110130 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 76110180 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 76110185 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 76110308 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 76110347 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 76110619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76112061 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 76112753 T G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 76112756 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 76115245 A C Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 76120050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76121420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76123569 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 76123640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76124101 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 76124128 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 76124132 A T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 76124167 A C Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 76124222 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76124234 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 2 76124253 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76124265 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76124356 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76124427 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 76124536 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76124621 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76124640 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76124657 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76124729 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76124788 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76124813 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76124815 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76124827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76124857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76124939 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76124941 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 76124954 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76124986 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76125023 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76125044 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76125154 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76125164 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76125280 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 76125606 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76125670 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 76125832 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76125969 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76125979 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 76126255 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76126323 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76126359 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 76126440 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 76126664 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 76126723 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 76126729 T C Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 76126909 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76126947 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76126995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76126997 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 76127085 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 76127113 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 76127127 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 76127143 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 76127161 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 76127193 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76127213 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 76127238 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76127242 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76127260 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76127277 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76127401 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 76127412 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 76127437 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 76127587 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76127659 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 76128721 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76131084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76132713 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76132807 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76133241 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76133469 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 2 76133709 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 76133776 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 76133794 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 76133805 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 76133863 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 76134205 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76134509 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 76134998 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 2 76135014 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 76135270 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 76135340 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 76135599 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 76136409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76136713 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 76136898 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 76136927 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 76136948 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 76136949 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 76137358 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76137407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76137443 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76137493 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76137496 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76137516 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76137541 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76137576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76137638 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 76137708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76137740 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 2 76137795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76137800 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 76137846 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 76137854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76138024 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 76138030 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 76138082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76138109 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76138157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76138161 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76138202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76138268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76138437 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76138455 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 76138611 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76138624 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76138660 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76138670 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76138687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76138720 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76138747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76138802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76138872 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 2 76138964 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 76138996 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76139007 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76139026 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 2 76139068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76139130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76139229 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 76139254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76139295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76139366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76139467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76139613 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 76139618 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 76139687 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76139829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76140158 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 2 76140321 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 76140442 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 76140515 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 76140581 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76140648 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 76140699 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76140807 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 76140826 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76140844 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 76141160 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76141175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76141394 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76141409 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76141477 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76141489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76141498 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 2 76141504 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 76141641 T A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76141674 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 2 76141686 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 2 76141705 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 2 76141744 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 2 76141855 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 2 76141901 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 76141911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76141992 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 2 76142098 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 76142139 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 76142156 G T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 2 76142389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76142454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76142502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76142513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76142630 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 76142680 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76142689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76142715 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76142744 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76142768 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76142769 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 2 76142838 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 76142862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76142951 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 76142959 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 76144446 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 76149365 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76149405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76149618 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 76149619 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 76149722 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76149726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76149744 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76149745 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76149780 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76149805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76149836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76150392 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76150406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76150458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76150518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76150523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76150806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150815 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150860 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 76150922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76150928 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76150958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76151046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76151091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76151156 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 76151273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76151281 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 76151318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76151479 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 76151680 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 2 76151695 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 2 76151765 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 76151780 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 76151823 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76152252 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76152258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76152348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76152446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76152455 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 76152460 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 76152522 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 76152531 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 76152756 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76152867 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76152892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76153052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76153071 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76153072 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76153870 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76153924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76154084 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76154087 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 76154162 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76154296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76154318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76154385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76154567 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76154608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76154701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76154779 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 76154883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76154907 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76154911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76154918 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76154954 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76154984 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76155149 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 76155174 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 76155180 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 76155546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76155718 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76155842 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76155887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76156066 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76156224 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76156678 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76156826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76157054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76157065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76157885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76157942 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76158216 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 76158312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76159209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76159352 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 76159667 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76159672 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76159679 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76162188 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76162440 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76163215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76163608 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 76163975 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76164246 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76168639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76169995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76170937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76171427 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76172258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76172297 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76172814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76173252 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 76173630 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 76173692 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 76173697 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 76173746 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76173837 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76174105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76174151 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76174396 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76174549 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76174562 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76174848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76174937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76175386 C T Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 76177191 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 76177645 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76177677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76177687 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76177698 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76177731 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76178289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76178324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76178367 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 76178521 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 76178524 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76178617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76179238 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 76179243 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 76179250 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 76179316 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76179337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76179395 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 76179508 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 76179631 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 76179693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76179938 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76180023 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 76180224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76180226 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 76180303 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 76181053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76181097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76181130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76181239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76181440 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 76181800 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 76181823 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 2 76181835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76181886 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 76181890 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 76181906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76182042 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76182046 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 76182066 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 76182076 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76182093 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76182121 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76182386 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 76182773 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76183170 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76183354 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76183462 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 76183553 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76184029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76184100 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76184212 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76184333 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76184391 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76184425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76184470 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 76184489 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 76185056 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 76185233 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76185272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76185344 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76185896 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 76186040 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76186514 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76186516 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 76186585 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76186603 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76186653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76186714 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76186767 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76186834 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 76186971 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 76187129 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76187130 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76187285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76187294 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76187427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76187465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76187694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76187734 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76187761 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 76187762 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 76187834 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 76187841 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 76188644 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 76188725 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 76188815 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 2 76188962 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 76188992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76189012 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 76189021 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 76189073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76189100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76189133 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76189193 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 2 76189307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76189368 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 76189595 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 76189612 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 76189646 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 76189761 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 76189778 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 76189871 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 76189872 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 2 76190141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76190156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76190191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76190236 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 76190376 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 76190483 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76190557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76190994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76191339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76191453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76191575 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76191789 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76191902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76193714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76194027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76194501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76194543 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 76194667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76195031 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76195791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76195897 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76196092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76196128 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 76196930 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76197463 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 76197998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76198078 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76198144 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 76198170 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76198431 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76198458 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76198582 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76198921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76198930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76199210 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76199268 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76199319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76199329 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 76199367 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 76199489 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 76199542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76199720 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 76199866 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76200140 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76200300 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76200360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76200376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76200500 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76200706 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 76200978 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 76201011 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 76201025 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 76201055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76201094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76201203 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 76201227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76201233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76201239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76201292 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 76201334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76201352 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76201483 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76201484 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76201507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76201555 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 76201883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76204257 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76204310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76204391 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 76205160 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76205340 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 76205486 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76205569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76205741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76205743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76205871 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 76205905 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76206042 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 76206084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76206189 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 76206270 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 2 76206433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76206452 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 76206467 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76206497 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76206595 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 76206636 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 76206644 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 76207022 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 76207031 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 76207054 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76207070 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 76207430 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76207432 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76207485 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76208145 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 76208147 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76208169 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76208820 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76209000 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 76209082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76209115 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 76209138 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 2 76209169 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76209207 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76209282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76209324 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 2 76209332 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 2 76209374 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76209401 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 76209527 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 76209539 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 76209550 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 76209598 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 76209690 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 76209780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76209828 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 76209973 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76209986 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76210432 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 76210696 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 76211054 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76211205 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76211248 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 76211417 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 76211544 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 76211854 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 76212023 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76212034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76212161 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 76212174 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76212183 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 76212340 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 76212439 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 2 76212497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76212581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76212636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76212990 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76213091 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76213092 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 76213157 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 76213247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76213396 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 76213734 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76213786 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 76214252 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 76214619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76214840 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 76215046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76215244 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76215301 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 76215328 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 76215345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76215558 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 76215651 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 76215764 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 76215843 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 76215973 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 76216203 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 76216286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76216290 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 76216367 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76216391 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76216647 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76216855 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76216858 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76216872 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76217067 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76217396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76217432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76217598 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76217679 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 76217735 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 76217769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76217994 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 76218174 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76218178 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76218221 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76218557 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 76218719 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76218856 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 76219023 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76219100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76219254 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 76219628 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 76220374 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76220551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76220593 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76220987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76221012 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76221337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76221448 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76221741 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76221794 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 76221796 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 76221878 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76221915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76222088 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 76222137 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76222182 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 76222427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76222434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76222446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76222817 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 76222840 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 76223177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76223289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76223305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76223324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76223465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76224869 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 76225202 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76225365 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76225436 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76225464 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 76225502 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 76225632 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 76225678 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 76225738 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 76226056 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76226179 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 76226332 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 76226344 C T Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 76226350 C T Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 76226368 T C Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 76226375 G T Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 76226383 A T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 76226415 C A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 76226422 T G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 76226533 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76226715 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 76227598 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 76227801 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 76227822 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 76227828 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76229274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76229557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76230185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76230665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76230909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76232122 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76232182 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76233457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76233518 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 76233532 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 76233699 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76233841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76233845 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76234150 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 76234181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76234189 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76234278 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 76234348 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 76234417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76234504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76234509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76234550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76234893 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76234959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76235021 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 76235155 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 76235438 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 76235493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76235497 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 76235508 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76235558 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76235940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76236348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76236468 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 76239001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76239008 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 76240028 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76240102 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 76240303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76242356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76244723 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76246078 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 76246079 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 76246379 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76246490 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76246607 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76246797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76246831 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 76247093 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 76248534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76249018 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76249037 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76249112 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76249118 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76249584 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 76249715 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76249937 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76250009 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 76250335 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76250422 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 76250467 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76250567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76250581 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76250603 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 76250850 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 76250871 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 76250872 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 76250890 A C N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 76250922 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 76250957 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 76251259 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 76251549 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 76251746 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76251818 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76251914 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 76252387 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76252406 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76252571 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76252604 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76252808 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76252851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76252985 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76252994 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76253009 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76253012 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76253063 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76253242 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76253251 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76253300 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76253362 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 76253393 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 76253422 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 76253448 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76253532 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 76253560 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76253570 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76253610 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 76253620 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 76253642 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 76253771 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76253811 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 76253812 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76253875 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 76253978 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 76253979 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 76253990 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76254017 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76254028 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76254240 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 76254256 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 76254571 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 76254588 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 76254600 G T N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 76254963 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76255011 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76255064 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76255080 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 76255106 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 76255274 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 76255297 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 76255486 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76255558 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 76255845 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76255846 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76255856 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76255888 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76256029 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76256201 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76256211 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76256217 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76256254 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76256288 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76256314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76256321 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76256340 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76256389 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76256400 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76256491 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 76256513 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 76256549 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76256599 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76256641 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76256673 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76256766 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76256830 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 76256861 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 76256983 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76257105 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 76257294 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 76257488 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 76257503 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 76257562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76257573 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 76257753 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76257771 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 76257805 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 76257822 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76257823 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76257880 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76258010 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76258105 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 76258192 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76258261 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76258292 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76258371 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 76258473 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76258534 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 76258726 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76258727 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 76258748 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 76258797 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 76258842 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 76258906 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 76258916 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 76259034 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76259511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76259561 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 76259578 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76259589 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76259600 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76259654 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76259661 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76259780 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 76259942 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 76260000 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76260128 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 76260200 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76260289 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 76260356 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76260357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76260367 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76260414 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76260524 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 76260541 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 76260564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76260632 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 76261419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76261543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76262122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76262180 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76262539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76262575 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 76262599 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 76262746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76262797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76262957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76263041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76263095 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76263121 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76263291 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 76263292 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 76263304 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76263330 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76263430 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 76263520 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76263574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76263734 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76263892 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 76264297 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 76264382 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76264676 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76264735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76264940 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 76265272 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 76265439 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76265497 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76265563 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76265963 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76265986 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76266347 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76267044 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76267045 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76267926 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76268009 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76268052 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76268112 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76268150 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76268164 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76268461 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 76268631 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76268678 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 76269024 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 76269025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76269058 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 76269097 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76269177 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 76269210 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76269292 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76269310 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 76269311 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76269336 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 76269414 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76269482 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76269506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76269516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76269544 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 76269553 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76269681 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76269859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76269972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76270169 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76270535 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76270695 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 76270775 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76270789 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76270923 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 76270959 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76270973 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76271699 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76271742 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76271848 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76271890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76271959 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76272010 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 76272133 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 76272293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76272402 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76272442 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76272443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76272541 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76272542 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76272711 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76272901 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 76272930 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 76273011 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76273012 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76273057 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 76273216 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 76273331 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 76273370 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 76273659 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76273748 G C Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 76273858 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76273872 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76274598 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76274903 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76274904 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76275169 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76275234 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 76275255 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 76275274 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 76275453 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 76275502 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76276005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76276244 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76276347 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76276386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76276399 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76276521 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76276526 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76276678 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 76276693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76276697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76276775 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76276904 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76276922 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76277011 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76277165 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 76277189 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76277485 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76277603 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76277784 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 76277986 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 76278057 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76278083 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 76278093 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 76278340 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76278352 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76278541 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 76278619 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76278663 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 76278681 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76278870 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 76279101 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 76279258 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76279694 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76279741 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 76279789 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 76279790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76279869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76280177 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76280577 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76280623 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76280664 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76280709 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 76280722 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76280742 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76280915 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76280927 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 76280934 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76280955 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 76281310 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 76281384 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 76281578 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 76281685 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76281776 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76281787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76281971 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76282218 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76282394 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76282432 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 76282445 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76282574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76282747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76282771 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 76282863 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76283024 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 76283258 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 76283266 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 76283336 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 76283344 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 76283419 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 76283494 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76283603 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76283811 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 76283819 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 76283864 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 76283868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76283886 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 76283923 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 76283937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76283952 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 76284046 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 76284077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76284264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76284618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76284759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76284848 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 76284875 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76285624 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76285761 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76285904 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 76285961 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76285977 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76285993 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76286002 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76286072 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76286417 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76286693 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76286811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76286827 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76286857 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76286906 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 76286909 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 76286920 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 76286932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76287088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76287120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76287251 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76287366 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76287397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76288095 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76288156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76288179 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 76288416 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76288464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76288557 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76288568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76288619 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 2 76295209 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 76295214 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 76295348 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 76296154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76296428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76296446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76296507 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 76297076 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 76297145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76297889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76298246 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76298730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76298758 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 76298799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76299141 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 76299232 C T N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 76299260 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 76299667 A C N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 76299856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76300038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76300270 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76300978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76301042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76301434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76301641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76301689 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76301849 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 76301956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76302142 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76302153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76302535 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 76302875 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76302969 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76303173 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76303193 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 76303510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76303847 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 76304002 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 76304399 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76304516 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76304693 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 76304754 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 76304786 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76305004 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 76305008 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 76305202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76305252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76305281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76305448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76305467 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 76305768 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76305958 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 76305959 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 76306298 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76306321 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76306539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76306587 T A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 76306714 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 76307118 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 76307265 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 76307297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76307357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76307455 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76307583 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 76307626 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 76307784 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76307826 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 76307949 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76308065 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76308127 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76308406 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76308433 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76308800 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 76308833 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76308916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76308917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76309294 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 76309339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76309386 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 76310050 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 76310061 A C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 76310092 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 76310171 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 76310188 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 76310194 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 76310209 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 76310256 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 76310455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76311428 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 76311488 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76311524 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76311533 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76311804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76311948 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76313024 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76313061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76313149 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 76313158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76313198 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76313201 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 76313253 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76313425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76313491 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76313586 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76313956 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 76313957 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 76314559 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76316044 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76316598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76317572 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76317751 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 76317967 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76318266 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 76318349 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 76318926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76319326 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 76319838 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.272727272727273 0.0909090909090909 0.636363636363636 7 15 3 1 7 2 76319975 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 2 76320513 C A N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 76320528 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 76320595 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 2 76320789 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 2 76321034 T G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 2 76321698 A T N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 76322024 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 76322036 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 76322190 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 76322369 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 76322709 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 76322715 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 76322744 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 76322824 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 76322998 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76323999 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 76324137 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 76324289 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 76329075 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76329103 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 76329296 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 76329433 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 76329439 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 76330108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76330249 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 76331182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76331881 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 76332654 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 76332729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76332799 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76334508 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 76334951 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 76335230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76335263 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76335392 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76335427 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76335441 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 76335478 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76335573 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76335698 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 76335727 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 76335876 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76335904 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76336011 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76336098 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76336118 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 76336480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76336522 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76337821 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76337839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76338080 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 76338103 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 76338205 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 76338397 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 76338446 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76338648 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 76339035 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 76339489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76339582 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 76339637 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 76339655 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 76340200 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 76340372 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 76340537 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 2 76340561 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 76340574 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 76340617 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76340859 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76341268 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 2 76342102 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 76342245 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 76342834 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76342875 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 76343246 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 76343605 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 76343719 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 76343854 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 76344025 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76344128 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76344329 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 76344859 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 76344954 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76344981 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76345099 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76345141 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76345328 T A N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 76345398 C A N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 76345560 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 76345572 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76345729 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76345924 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 76345962 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 76346109 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 76346126 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76346139 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 76346177 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 76346242 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 76346470 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 76346483 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 76346863 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76347519 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76347599 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76347731 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76348068 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76348225 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 76348281 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 76348297 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 76348489 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76348742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76349100 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76349340 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76350045 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 2 76350268 G C Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 76350310 C A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.230769230769231 20 6 10 0 3 2 76350617 G C N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.461538461538462 0.153846153846154 0.384615384615385 14 12 6 2 5 2 76350830 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.230769230769231 0 0.769230769230769 6 20 3 0 10 2 76351016 G C Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 2 76351031 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 2 76351134 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 2 76351152 T C Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 2 76351353 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 2 76351853 G A N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 2 76351984 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 76352024 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 76352428 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76352479 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76352569 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 76352670 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 76352885 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76352993 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 76353138 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 76353475 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 76353556 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 76353565 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 76353735 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 76353775 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 76353791 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 76353958 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 76354450 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 76354491 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76354550 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 76354556 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 76354587 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 76356489 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 76357062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76359577 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76360061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76360405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76360758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76364721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76364804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76364989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76365307 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 76365324 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 76365439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76365451 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 76365759 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 76366008 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76366495 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76366505 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76366822 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 76367091 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76367148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76367272 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 76367324 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76367330 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76367382 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 2 76367661 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 76368068 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76368079 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 76368102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76368135 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76368182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76368312 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 76368331 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 76368471 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76368548 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 76369333 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 76369996 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76370044 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76370099 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76370101 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76370168 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76370187 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76370239 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 76370311 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 76370335 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76370437 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 76370501 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76370525 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76371001 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76371198 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76371209 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 76371255 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 76371331 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 76371618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76371643 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 76371664 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76371898 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 76372173 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 76372827 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76372836 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76372891 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76373097 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 76373107 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76373130 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76373310 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76373357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76373653 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 76373656 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 76373897 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76374244 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 76374261 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76374464 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76374965 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76378029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76378570 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 76379047 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76379063 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 76379140 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 76379200 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 76379252 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76379313 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 76379373 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 76379445 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 76379623 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 76379879 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 76380310 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 76380446 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 76380727 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76380756 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 76381129 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 76381361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76381567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76382145 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 76382436 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76382569 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76382611 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 76382625 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76382816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76382826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76382909 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 76382931 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 76383077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76383208 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76383338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76383623 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 76383654 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 76383808 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 76384183 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76384257 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76384497 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76384639 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76384797 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76384865 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 76384866 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 76384900 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 76384916 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 76384951 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 76384959 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 76385134 T A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 76385193 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 76385321 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 76385401 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 76385428 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76385511 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76385692 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 76385720 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 76385791 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 76386123 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 76386171 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 76386178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76386282 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76386287 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76386612 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76386709 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76386774 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 76386841 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76387013 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 76387050 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76387080 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 76387109 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 76387171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76387191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76387342 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76387389 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76387622 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76387655 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76387858 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76387931 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76388028 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 76388041 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76388161 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 76388239 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76388290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76388873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76388919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76389135 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 76389442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76389491 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 76389599 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 76389652 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76389789 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76389997 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 76390006 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76390137 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76390356 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 76390407 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76390461 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 76390507 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76390809 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 76390867 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 76390871 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 76390896 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76390959 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76391040 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 76391049 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76391079 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 76391526 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 76391533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76391592 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76391651 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 76391731 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76391853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76391977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76392229 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 76392363 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76392706 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 76392730 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 76393066 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76393215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76393281 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 76393380 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76393433 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 76393541 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 76393645 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 76393654 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 76393657 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 76393713 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 76393716 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76393783 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76394222 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76394233 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 76394302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76394617 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 76394699 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 76394810 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 76394834 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 76395166 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76395255 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76395348 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76395430 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 76395443 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 76395461 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76395502 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76395568 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76395705 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76395876 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76395889 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76396073 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76396088 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76396230 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76396453 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76396779 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76397496 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 76398121 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 76398535 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76398996 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76399155 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76399430 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 76399521 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76399526 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76399534 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76399573 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76399601 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 76399607 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 76399699 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76399724 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76399874 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76399988 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76400142 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 76400252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76400269 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 76400469 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76400503 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 76400681 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76400702 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76400850 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76400870 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 76401018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76401162 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 76401168 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76401182 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 76401204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76401339 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76401382 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 76401439 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76401578 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76401733 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 76401829 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76402124 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76402135 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76402183 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76402235 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76402268 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76402317 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76402486 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76402552 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 76402717 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 76402728 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76402834 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76402903 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 76403080 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 76403135 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 76403243 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76403311 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76403512 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76403702 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76404332 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76404363 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 76404418 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 76404419 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 76404528 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76404533 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76404663 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 76404703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76404825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76405041 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 76405252 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 76405327 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 76405439 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76405441 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 76405503 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76405530 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76405548 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 76405747 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76405750 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 76405791 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 76406028 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 76406638 A C N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 76406746 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76406765 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76406797 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 76406808 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76406882 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 76406939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76407817 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76407954 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76407997 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76408102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76408124 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76408203 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76408205 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76408312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76408487 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76408504 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 76408573 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76408619 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76408647 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76408851 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76408977 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76409051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76409127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76409321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76409347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76409373 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76409375 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76409395 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76409800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76410287 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 76410311 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 76410460 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 76410470 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 76410493 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76410554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76411507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76411611 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76411623 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76411914 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76412522 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76412937 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76413081 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76413108 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76413190 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76413243 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 76413245 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 76413433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76413460 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76413495 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 76413622 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 76413678 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 76413722 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 76413760 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76413767 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 76414096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76415016 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76415685 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76416199 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 76417316 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76417352 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 76417371 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 76417375 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 76417390 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76418018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76418400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76418406 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76418592 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76418628 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76418769 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76418792 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76418879 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76419022 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76419044 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76419094 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76419098 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76419122 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76419162 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76419195 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76419218 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76419309 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76419534 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76419537 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76419550 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 76419579 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76419934 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76419936 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76420037 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76420089 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 76420101 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76420658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76420674 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76420764 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76421296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76421438 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76422523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76422708 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76422713 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76422852 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76423018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76423134 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 76423347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76423548 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76423586 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76424302 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76424334 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76424345 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76424366 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76424411 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 76424412 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76424491 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 76424523 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 76424645 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76424698 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 76424707 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 76424719 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76424969 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76425347 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76425399 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76425408 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76425413 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76425552 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 76425616 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76425763 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76426022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76426071 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 76426259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76426261 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76426465 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 76426658 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 76426670 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76426691 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 76426710 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76427236 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76427732 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76427848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76428077 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76428099 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76428187 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76428278 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76428297 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76428341 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76428547 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76428570 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 76428572 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76428658 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76428675 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76428715 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76428762 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 76428862 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 76429101 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 76429115 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 76429118 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 76429221 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76429295 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76429321 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76429325 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76429378 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76429509 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76429702 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76430011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76430083 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76430271 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76430324 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 76430842 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76430864 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76431052 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76431267 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 76431532 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76431858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76431884 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 76431998 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76432047 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76432560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76432675 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 76432702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76432722 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76432737 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76433082 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76433122 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 76433252 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76433520 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 76433768 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76434405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76434447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76435049 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76435076 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76435226 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 2 76435246 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 76435248 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 76435260 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 76435272 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 76435369 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 76435382 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 76435411 A T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 76435583 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 76435622 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 76435706 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 76435791 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 76435862 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76436058 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76436094 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76436319 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 76436435 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 76436442 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 76436547 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 76436549 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 76436645 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 76436764 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 76436872 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76436883 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76437095 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76437124 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76437161 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76437404 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76437473 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76437665 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 76437711 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 76437763 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76437925 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76438195 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76438198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76438233 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76438290 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76438325 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76438354 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76438390 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 76438558 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76438776 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 76438793 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 76439074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76439264 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76439615 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 76439715 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 76439858 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76439979 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76440062 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76440067 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76440098 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76440294 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76440341 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76440365 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76440387 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76440584 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76440630 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76440677 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76440768 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 76440882 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 76440916 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 76441477 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 76441654 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 76441693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76441741 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 76441842 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 76442294 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 76442351 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76442497 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76442585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76442736 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76442816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76442844 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76442939 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 76442943 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 76443252 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 76443312 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 76443432 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76443451 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 76443460 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76443556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76443698 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76443923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76443942 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 76443963 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76443964 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76444031 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76444067 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 76444089 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76444104 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76444112 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76444211 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76444226 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76444261 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76444337 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76444648 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76445210 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 76445515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76445533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76445984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76446093 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76446480 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 76446498 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 76446838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76448129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76449044 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76449057 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76449170 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76449269 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 76449359 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 76449405 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 76449668 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 76449916 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 76449967 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76450062 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 76450277 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76450512 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76450559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76450613 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76450626 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76450696 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76450935 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76450941 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76451072 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76451130 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76451137 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76451143 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76451266 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76451271 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76451337 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76451868 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 76452223 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76452446 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76452453 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76453083 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 76453097 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 2 76453259 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 76453496 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76453596 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 2 76453623 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 76453821 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76453923 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76453935 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 76454164 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76454653 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76454667 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76454826 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76454834 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76454874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76454899 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76454964 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76455033 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76455060 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76455068 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76455166 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76455286 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76455289 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76455302 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76455313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76455322 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76455443 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 76455444 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 76455496 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 76455561 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76455575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76455634 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76455747 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 76455781 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76455861 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 76455970 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 76456281 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 76456289 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76456404 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76456472 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76456505 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76456566 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 76456627 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 76456705 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76456802 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 76457000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76457009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76457275 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76457434 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76457516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76457614 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76457773 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76457793 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 76457831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76457832 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76459807 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 76460258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76460933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76461144 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76461412 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76461444 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 76461461 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76461466 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76461479 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76461539 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 76461585 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76461659 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76461749 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76461773 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76461795 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76461796 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76461914 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76461944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76462035 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76462047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76462154 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76462197 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76462210 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76462327 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 76462398 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76462415 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 76462432 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76462663 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76462725 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76462741 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76462752 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76462774 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76462876 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76462888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76462953 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76463079 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76463100 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76463170 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76463172 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76463212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76463213 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76463273 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76463280 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76463311 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76463403 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 76463423 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 76463491 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76463496 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76463519 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76463520 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76463542 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 76463586 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 76463603 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 76463667 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76463756 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76463813 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76463884 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 76463983 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76464015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76464225 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76464256 T C Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 76464661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76464669 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76464682 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76464722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76464739 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76464830 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76464863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76464867 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76464960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76464977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76464983 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76465202 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76465290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76465291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76465416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76465526 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76465742 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76465792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76465832 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76466116 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76466218 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 76466267 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76466395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76466420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76466428 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76466946 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76467011 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76467050 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76467453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76467519 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 76467561 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76467697 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76467720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76467837 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76467955 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76468202 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76468438 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76468954 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76469009 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76469237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76469947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76470620 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 76471877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76473497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76474438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76475333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76475940 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76476246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76477484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76477833 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 76478225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76478411 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76478438 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76478542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76478547 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76478695 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76478892 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76478989 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76478991 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76480466 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76480692 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76480784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76481351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76481444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76481695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76481696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76482353 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76485105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76485789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76486685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76487152 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76487622 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76487654 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76487942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76488143 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76491554 A G N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 2 76491740 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76493438 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76493447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76496745 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76497917 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 76498284 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76498296 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76500973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76501100 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76501847 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76502410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76502420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76502502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76502885 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76503567 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76503671 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 76504310 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76504433 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76505862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76506032 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76506335 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76506383 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76506415 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 76507047 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 76507545 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 76507566 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76507808 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76507809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76507824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76507886 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76507990 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 76507998 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 76508046 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76508313 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 76508366 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 76508389 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 76508420 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 76508431 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 76508481 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 76508497 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 76508534 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76508543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76508843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76508871 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76508890 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76508925 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76509014 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76509024 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76509079 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76509190 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 76509226 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76509255 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76509343 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76509356 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 76509612 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76509695 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76509755 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76509779 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76509785 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76510146 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 76510220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76510304 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 76510308 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 76510416 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76512917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76514028 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 76514105 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76514140 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76514311 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 76514322 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 76514441 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 76514459 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 76514547 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76514611 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76514652 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76514727 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76514856 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76514881 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76514955 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76514965 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76515306 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 76515361 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 76515510 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 76515513 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 76515535 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76515583 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 76515589 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76515600 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 76515616 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 76515676 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76515758 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76515816 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76517315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76517345 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76517396 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 76517405 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 76517483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76519893 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 76520209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76520488 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76521547 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76521919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76522578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76522644 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 76522747 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 76522924 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76523311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76523686 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 76525308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76525330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76525662 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 76525719 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76525742 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76525743 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76525767 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 76526374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76527194 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 76527378 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76528126 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 76528276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76528611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76528634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76529248 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 76529311 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76529389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76529460 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76529679 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 76529723 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 76530499 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76531287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76531728 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76531734 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76531952 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76531955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76532060 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76532384 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76532537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76532539 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76533196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76534828 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76535310 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 76535478 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76535956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76536090 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 76536150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76536341 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76536427 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76536433 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76536550 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76536623 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76536692 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76536819 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 76536875 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76536911 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 76536995 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76537022 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76537281 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 76537407 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76537412 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 76537426 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 76537740 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 76538491 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 76538518 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76538986 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 76539043 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 76539093 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 76539140 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 76539249 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76539267 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76539272 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76539387 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76539412 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76539465 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76539497 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76539500 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76539576 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76539854 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76539872 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76540024 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76540108 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76540505 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76540738 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76540869 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76540893 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76540934 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 76541010 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 76541112 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76541117 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 76541135 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76541415 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76541441 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76541550 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76541594 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76541924 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 76542767 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76543169 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76544346 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76544744 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76546856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76547198 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76549112 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76551507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76553736 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76554632 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 76554912 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76557040 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76559484 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76562893 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 76562941 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76564939 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76564966 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76565063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76565775 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76565881 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 76565899 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 76566153 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 76566315 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 76566826 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 76567033 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76568192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76568399 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76568963 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 76568978 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 76569058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76569234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76569822 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76570280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76570360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76570388 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76570584 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 76570599 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76570608 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76570632 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76570736 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76570758 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76570851 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76571005 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76571119 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76571125 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76571139 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76571260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76571334 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76571365 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 76571424 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76571486 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 76571537 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76571569 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76571587 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76571616 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 76571732 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76571733 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76571758 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76572376 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76572491 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76573218 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 76573867 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 76573887 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76574914 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76575133 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76575199 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76575832 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 76577560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76580626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76580665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76581203 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76581223 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76581876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76582549 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76584157 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76584592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76585087 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76586581 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76587715 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 76592295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76593050 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 76596038 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76596551 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76597530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76597845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76598037 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76598422 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 76600835 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76602148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76603018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76605393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76605717 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76609939 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 76610244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76610376 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 76610943 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 76611072 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 76611521 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76612545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76613840 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 76614026 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76614230 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 76614418 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 76614720 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 76617138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76618735 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 76618747 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76619095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76619106 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76619125 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 76619389 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 76620287 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 76621033 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76621688 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 76621744 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 76621826 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 76623298 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 76623747 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76623831 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76624163 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 76624851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76626013 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 76628183 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76628273 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 76628591 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76628745 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 76629190 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76629823 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76629871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76629876 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76630118 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76630128 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 76630397 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76630447 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76630457 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 76630982 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76631078 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76631894 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 76632347 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76632482 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76633433 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 76633456 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76634403 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76635881 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 76636721 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76638073 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 76639615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76641033 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76641771 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 76642537 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 76643896 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 76644605 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 76645876 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76646643 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76647704 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76647870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76648645 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 76650136 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76651816 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76653911 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76654932 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76656532 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76658898 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76660790 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76663392 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 76664094 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 76664565 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76669654 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76670224 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 76672392 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 76675463 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76676047 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 76679789 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76680065 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76683323 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 76684033 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76685056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76685778 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76685961 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76686482 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76689295 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76689697 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 76690525 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76690712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76693277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76695328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76696545 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76696651 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 76701836 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76702246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76703182 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76703615 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 76703826 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76704621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76704772 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 76705552 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 76705761 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 76705919 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 76706186 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76706202 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76706744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76706810 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 76706869 G A N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 76707007 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 76707165 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 76707186 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 76707188 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 76707218 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 76707488 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76707872 G A N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 76708139 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 76708181 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 76708424 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 76709406 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76709584 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 76709786 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76709787 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76709978 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 76710379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76710634 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 76710650 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 76710661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76712015 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76712935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76712964 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76712981 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76713860 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76714286 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76714397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76714600 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76714832 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76714930 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76715074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76715144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76715254 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 76715362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76715446 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 76715463 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76715495 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76715594 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 76715907 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 76715967 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76716108 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76716129 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76716292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76716474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76716548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76717465 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 76717507 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 76717715 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76717810 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76717819 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76717835 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76718123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76718685 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 76718736 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 76718811 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 76718842 A G Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 76718844 A G N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 2 76718958 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 76719435 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 76719533 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76719559 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 76719580 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76719595 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 76720070 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76720412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76720427 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76720828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76720867 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76721063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76721175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76721293 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 76721411 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 76721565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76721799 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76723183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76724329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76724561 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76724564 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 76724576 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 76724600 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76724855 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76725008 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76725112 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 76725124 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76725459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76725758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76725783 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76726255 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 76726409 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 76726470 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76726802 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76726905 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76726918 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 76727258 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76727602 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 76728437 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 76728663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76729394 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76729633 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76729668 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76730222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76730412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76730901 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76730993 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76731205 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76731347 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76731493 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 76731644 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76731666 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76731667 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76731763 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76731857 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 76732124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76732284 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76732535 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76733362 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 76733825 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 76733934 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76734252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76734352 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76734546 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76734672 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76735089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76735103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76735209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76735521 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 76735633 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76735945 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76735996 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 76737461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76737642 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76739118 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 76739157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76739490 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 76740034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76740118 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76740789 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 76742468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76742518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76743641 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76744668 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76746537 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76746623 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76746692 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76747261 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 76748582 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76749235 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76749315 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76749369 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76749398 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76749452 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76749605 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 76750109 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 76750284 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76750359 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76750933 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76750982 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76751043 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 76751090 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76751176 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76751642 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 76751771 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 76751795 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 76751978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76752045 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76753377 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76753639 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76754281 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76754681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76754876 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76755174 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76755377 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 76755532 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76755620 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76756422 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 76756727 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 76756832 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76757356 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 76757559 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76757635 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 76758201 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 76758217 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76758323 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 76758409 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 76758459 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 76758495 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 76758936 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 76760359 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 76760499 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 76760846 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76761597 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76761601 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76762009 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76762721 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76763043 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76763272 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76763993 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 76764801 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76764841 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 76764899 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76765533 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 76766438 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76768165 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 76768168 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 76768268 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76768464 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 76768647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76768662 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 76769271 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76769384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76769480 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76771550 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76772126 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76773296 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76776479 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76776503 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 76777016 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76777090 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76777669 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 76777763 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76777845 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 76778197 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76778209 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76778227 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76778678 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76779240 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76779620 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76780618 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76780659 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76781639 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76783477 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76784453 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76784930 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76785178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76785754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76786671 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 76787088 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 76787647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76787693 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76788631 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76788727 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76789076 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 76789118 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76789319 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76789876 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 76790349 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76790387 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76790474 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76790552 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76790586 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76790744 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76791403 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76791404 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 76791450 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 76791537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76791722 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76791939 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76792368 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 76792380 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 76792448 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76792981 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76792983 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 76793083 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76799781 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 76799936 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76799995 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 76803288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76803549 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 76803610 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76804378 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76804624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76805313 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76805375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76805434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76805549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76807019 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 76807142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76807162 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 76808005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76808036 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76808110 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76808113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76808127 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76808299 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 76808347 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 76808654 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 76808671 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 76808809 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76809025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76809190 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76809278 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76809287 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 76809336 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76809402 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 76809419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76810070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76810297 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76810559 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76810705 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 76811009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76811455 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76811472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76811560 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76811876 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76811906 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 76812023 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76812090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76812120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76815368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76817177 A G Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 76817405 C T Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 76818000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76818220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76818594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76818886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76819002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76821464 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76822352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76824083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76824173 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76824478 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 76825156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76825630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76826099 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76826727 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76829005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76830138 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 76830420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76830542 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76831594 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 76831612 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 76831643 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 76832628 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76833003 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76835710 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 76836585 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76838006 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76838175 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76838373 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 76838899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76839284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76842500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76842747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76845300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76845558 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 76845592 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76845666 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 76847897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76849448 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 76851033 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76851884 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76852605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76854321 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76854737 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 76855831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76857068 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 76857400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76857445 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76857511 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76857700 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76857877 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 76857942 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 76857944 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 76858158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76858774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76858876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76858887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76859058 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 76859085 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76859481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76859616 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76859674 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76859680 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76859760 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76859772 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76859780 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76859797 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76859839 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76859842 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76859865 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76859886 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 76860016 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 76860065 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76860092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76860361 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76860418 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 76860572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76860702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76860711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76860770 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76861109 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 76861123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76861144 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 76861154 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 76861905 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76861911 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76861919 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76862018 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 76862253 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 76862325 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 76863352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76863548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76863568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76863574 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76863592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76863677 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 76863984 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 76864106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76864143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76864361 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 76864464 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76864509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76864704 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 76864908 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 76864956 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 76865118 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76865140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76865287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76865546 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76865716 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76865889 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76866077 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76866171 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 76866858 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 76866879 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76866944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76866973 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76868584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76869113 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76869536 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76869632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76870040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76870075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76870625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76871500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76872044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76872131 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76872477 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76872518 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76872761 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76872800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76872900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76873169 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76873282 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76873567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76873605 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76873615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76873769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76874151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76874245 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76874394 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76874421 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76874591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76874640 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76874903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76875277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76875428 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76875762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76875778 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76876132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76876145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76876567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76876604 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76876657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76876927 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76878347 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76878373 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 76878591 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76878664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76878680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76878843 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 76879070 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 76879103 G T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 76879104 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 76879153 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76879186 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 76879269 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76879272 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76879288 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76879406 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76879407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76879621 C G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76879698 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76879731 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76879736 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76880071 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76880098 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76880222 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76880253 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76880372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76880495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76880977 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76882667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76883454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76887730 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 76889003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76891828 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76892191 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76892457 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 76892855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76892902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76893084 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 76893677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76893685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76893689 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76893860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76893874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76894330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76894466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76895640 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 76896833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76896837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76896929 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 76896968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76897024 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76897114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76897145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76897162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76897180 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76897284 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76897287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76897385 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 76897425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76898336 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76898338 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 76898353 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76898652 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 76898878 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76899102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76899107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76899137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76899179 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 76899204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76899232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76899234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76899271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76899301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76899365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76899886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76899909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76900384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76900392 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 76900482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76900485 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76900493 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76900514 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76900585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76900610 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76900629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76900667 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76900737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76900791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76900835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76900846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76900962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76901022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76901049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76901067 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76901072 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76901085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76901090 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76901198 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76901278 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 76901389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76901471 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76901536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76901544 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 76901777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76902147 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 76902303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76902333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76902915 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 76903035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76903602 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76904246 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76904378 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76904727 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76904917 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 76905098 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76905101 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 76905126 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76905209 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76905288 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76905571 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 76905615 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 76906000 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76906045 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76906095 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76906143 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 76906240 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76906396 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76906592 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76906639 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 76906640 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76906651 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76906788 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76906830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76906836 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76906874 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76906903 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76906904 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76907397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76907456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76907765 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76908732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76909136 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 76909375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76909491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76909840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76911328 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76911652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76911696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76911770 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76911842 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76912353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76912747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76913048 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 76914639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76914665 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76914852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76915668 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76916239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76916386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76916500 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76917900 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 76917905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76918269 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 76919269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 76919758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76920781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76923923 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76923924 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76924015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76924620 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76926713 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 76926970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76927072 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76927270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76927640 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 76927717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76927809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76928385 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76928441 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76928650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76928699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76928946 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76928997 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76929120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76929143 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76929229 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76929428 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76931163 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76931533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76931717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76931926 A C N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 76932062 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 76932473 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76932528 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 76932845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76932886 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 76933579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76933641 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76933674 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76933677 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76933706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76933915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76933932 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76933987 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76934162 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76934734 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 76934928 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 76934947 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 76934951 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 76935169 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 76935341 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76935649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76935662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76936361 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76936416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76936744 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76936854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76937031 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76937232 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76937236 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76937287 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76938123 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76938916 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76939144 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76939951 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76939954 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76944337 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76944470 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76944493 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76944575 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76944594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76944670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76944740 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 76945257 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76945291 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 76945405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76945721 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76945748 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76946043 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 76946044 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 76946147 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 76946184 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76946413 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76946653 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 76946910 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76947397 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76947888 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76948038 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76948094 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76948321 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 76948419 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76948430 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76948574 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 76948659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76948712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76948900 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76949035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76949050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76949265 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76949306 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76949425 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76949667 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76949713 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76949762 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76949766 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76949939 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 76950021 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 76950036 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 76950285 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 76950415 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 76950541 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76950582 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 76950695 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 76950697 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 76950746 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76950823 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76950856 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76950992 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76950999 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76951076 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 76951079 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76951092 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76951094 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76951152 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76951164 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76951167 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76951189 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76951334 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76951769 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76952349 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76952350 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 76952370 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76952425 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 76952873 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76953129 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76953291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76954194 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 76954207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76954579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76954581 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 76955011 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 76955204 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 76955630 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76955944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76956161 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76956235 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76956287 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76956315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76956750 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 76958844 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 76962411 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76962506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76962575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76962647 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 76962809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76963478 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76963933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76964215 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76964704 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76964999 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76965141 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76965384 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 76965623 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 76965848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76965864 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76966646 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 76967726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76967824 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76968243 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76968529 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 76968551 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76968798 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76969697 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76970260 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76970266 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76970481 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76970492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76970505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76970515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76970798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76970830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76970872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76970875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76970981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76971112 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76971139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76971651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76971848 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76972055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76972078 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76972091 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76972276 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76972430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76972756 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 76972964 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76973053 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 76973069 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76973124 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76973139 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76973318 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76973478 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 76973479 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 76973722 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 76973941 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76974046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76974063 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76974598 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 76975100 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76975214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76976695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76976938 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76976973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76977163 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76977833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76978243 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76978268 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76978402 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76978661 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76978670 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76978685 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76978731 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 76978732 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 76978751 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76978783 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76978884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76978919 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76979088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76979123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76979228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76979396 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76979444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76979446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76979494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76979697 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 76979732 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 76979740 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 76979996 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 76980070 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 76980238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76980245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76980357 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76980451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76980453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76980466 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76980489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76980610 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76980656 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76980729 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76981000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76981101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76981247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76981263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76981271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76981320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76981334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76981341 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 76981464 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76981473 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76981932 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 76982060 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76982335 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76982358 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76982442 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76982482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76982499 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76983199 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 76983273 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 76983431 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 76983607 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 76983711 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 76983765 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 76983908 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76983968 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76984058 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 76984198 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76984223 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76984547 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76984683 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76984720 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 76984744 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 76984840 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 76985029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76985342 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76985945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76986534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76987901 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 76988117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76989272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76990048 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 76990365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76990500 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 76993019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76993782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76994442 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 76996589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76996799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76998717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 76999284 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77000748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77000771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77001509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77003495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77004743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77005650 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 77007063 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77007152 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 77007407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77007499 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 77007630 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77009533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77011084 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 77011262 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 77011746 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77011794 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77011916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77012277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77012328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77012712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77013054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77013254 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77013384 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77013731 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77013784 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77014195 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 77014383 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77014788 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77014798 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77014967 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 77015280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77015981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77015990 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 77016012 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77016133 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77016287 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 77016387 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77016407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77016414 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77016448 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77016470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77016645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77016668 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77016676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77016690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77016694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77016718 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77016780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77016828 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77016880 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77017078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77017193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77017541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77018142 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77018913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77019786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77019840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77020199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77021633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77022209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77022213 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77022734 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77022924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77022986 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77023956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77024505 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77025421 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77025865 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77026097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77026145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77027329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77027351 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77027608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77028411 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77029295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77029600 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77029657 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77029700 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77029801 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77029876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77030120 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77030141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77032019 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77032488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77032653 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77032817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77033118 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77033374 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77033600 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77033882 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77033943 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 77034362 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77034790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77034840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77035756 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77036154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77036416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77036908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77037194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77037793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77038294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77038316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77038831 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77039040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77039120 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77039582 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77039727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77040308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77040405 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77040482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77041342 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77042172 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77042557 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77042593 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77043304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77043719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77043852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77044494 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 77044791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77044814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77044838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77044871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77045226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77045964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77045986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77046557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77046869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77047812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77047936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77048364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77048845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77049653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77050495 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77050741 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77050970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77051908 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 77052083 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77053233 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77053994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77054174 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77054323 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77054628 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 77054640 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 77055157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77055478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77055523 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77055557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77055835 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77055854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77056024 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77056082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77057295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77057557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77058905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77059098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77059187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77060371 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 77060731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77060889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77062013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77071034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77071511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77071754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77073103 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77074946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77075194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77075432 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77075480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77075493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77076206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77076776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77076780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77076798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77078730 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77081754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77083716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77083754 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77084092 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77084648 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77085227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77085633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77086367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77086745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77086848 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 77086859 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77087393 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77087395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77088863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77090658 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77090666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77094488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77094588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77095450 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77095719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77096104 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 77096650 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 77096942 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77099678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77099821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77099854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77103223 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77103249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77103294 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77104285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77104523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77104577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77105238 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77108177 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77108783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77110747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77111752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77111880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77112303 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77112337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77114842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77116002 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77119469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77120504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77121280 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77122023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77122244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77122350 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77123529 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77123585 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77124111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77124312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77125221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77125367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77125634 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77126240 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77126511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77127124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77127226 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77127674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77127687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77127867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77128123 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77128190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77128254 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77128260 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77128647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77131202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77131809 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 77132749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77134993 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77135015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77135171 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77135428 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77135516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77135883 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77135896 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77135933 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77135947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77135963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77136233 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77136420 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 77136637 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77136834 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77137568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77137651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77137869 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77138553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77139211 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77139836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77142247 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77143763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77144247 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77145138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77145570 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77145601 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77145898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77145907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77146045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77146165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77146241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77146260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77146391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77146432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77146518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77146521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77146721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77146760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77146773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77146868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77146931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77147373 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77147381 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77147540 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77147620 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77147745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77147784 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77148781 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77148939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77149182 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77149753 G C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 77149922 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 77150288 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 77150392 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77150439 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 77150465 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 77150475 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 77150511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77150615 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 77151024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77151107 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77151232 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77151261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77151292 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77151374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77151745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77152188 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 77152218 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 77152275 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 77152371 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77152689 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77152716 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77152866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77152959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77152968 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77153105 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77153204 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77153358 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77153422 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 77153960 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77154055 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77154310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77154427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77154548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77154719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77154745 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77154954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77154961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77155819 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77156223 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77156586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77156656 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77156695 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77156751 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77156959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77156961 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77157260 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 77157355 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 77157356 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 77157383 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77157489 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77157516 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77157810 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 77157860 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 77157983 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 77157992 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 77158122 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 77158232 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77158254 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77158572 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 77158647 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77158653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77158689 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77158835 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 77159077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77159081 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 77159146 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77159161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77159175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77159448 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77159488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77159645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77159674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77159676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77159686 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77159812 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77159861 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77159900 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77159944 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77160177 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77160310 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 77160320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77160384 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77160413 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 77160484 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77160498 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 77160512 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 77160720 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 77161374 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77161389 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77161471 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77161589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77161811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77161841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77162128 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77162296 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77162648 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77162947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77163531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77163553 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77163564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77163565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77163771 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77163793 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77163844 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77163958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77164017 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77164136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77164156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77164198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77164402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77164432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77164437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77164590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77164626 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 77164750 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77164977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77165153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77165223 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77166519 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77166620 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77166653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77166705 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 77166765 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77166817 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 77166872 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77166926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77166975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77167238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77167422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77167449 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 77167459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77167572 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 77167628 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77167674 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77167831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77167843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77167943 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 77167952 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 77168222 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 77168331 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 77169007 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 77169377 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 77169408 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 77169563 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 77169564 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 77169706 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 77169814 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 77169881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77169929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77169934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77170022 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 77170225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77170372 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 77170496 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 77170563 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 77170626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77170709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77171171 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 77171315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77171349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77171842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77171852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77171920 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 77172095 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 77172212 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 77172534 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77172633 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77172670 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 77172724 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 77172725 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77172797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77172808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77173044 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 77173144 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77173579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77173906 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77173912 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77173918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77173967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77174016 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 77174210 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77174286 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 77174328 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77174527 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 77174547 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 77174559 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 77174810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77174811 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 77174824 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 77174851 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 77175348 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 77175442 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77175468 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 77175522 C G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 77175603 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 77175990 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 77176061 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 77176125 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 77176332 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 77176561 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 77176936 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 77176939 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 77177146 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 77177214 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 77177302 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 77178078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77178335 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77178639 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 77178923 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 77179048 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 77179071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77179189 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 77179272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77179391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77179456 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 77179701 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 77179703 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 77179900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77179988 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 77180032 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77180217 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 77180283 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 77180429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77180755 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 77181022 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77181253 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77181373 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 77181663 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 77181701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77182315 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77182861 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 77183441 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77183732 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 77183954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77184162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77184191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77184436 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 77184591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77185385 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 77185396 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 77185489 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 77185833 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 77186428 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77186549 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 77187850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77187996 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77188035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77188122 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77188812 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 77188899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77188942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77189699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77189748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77190094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77190828 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77192929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77193165 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 77193962 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77194426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77194510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77194721 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 77194746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77195052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77195352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77195754 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77196649 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77197569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77199565 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 77200970 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77201065 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77201442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77203167 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 77203544 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 77203792 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 77203880 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77204712 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 77205283 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 77205400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77205470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77205968 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77206014 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77207492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77207537 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77207579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77207630 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77207691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77209706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77211350 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77211611 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77212135 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77212711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77212846 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 77212933 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 77213826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77215360 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77215409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77215599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77216271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77216555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77216584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77216674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77216682 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 77217164 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 77217243 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 77217254 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 77217738 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77218189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77218210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77218658 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77218679 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77218713 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 77218816 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77218837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77219195 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 77219387 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77220034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77220399 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 77220818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77221122 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77221222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77221345 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77221396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77221633 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77221742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77222493 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77223856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77223867 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77224076 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 77224110 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77224579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77225035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77225310 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77225390 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 77225473 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 77225880 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77226044 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77226107 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77226245 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77226348 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 77226448 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77227595 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77227629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77227725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77228397 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 77228850 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 77229806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77230177 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 77230212 A G Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 77230260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77232127 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77232586 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 77232860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77233019 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 77233353 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 77233815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77234392 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 77234535 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 77234821 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 77234895 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 77234961 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 77235121 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 77235198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77235248 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 77235320 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 77235384 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 77236151 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 77236319 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 77236829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77236859 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 77237086 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 77238003 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 77238359 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77238561 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 77238580 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 77239603 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77239702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77239806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77239837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77240699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77241522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77241551 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77241903 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77242195 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77242580 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 77242613 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 77242694 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 77242837 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77243045 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77243083 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77243789 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 77243870 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 77244169 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 77244466 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 77244982 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77245309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77246048 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 77246420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77246554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77246621 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77246721 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77247194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77248601 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77250102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77250357 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77250779 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77251211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77251220 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77252822 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77254458 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77254505 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 77254822 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 77255000 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 77256504 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77256579 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 77256598 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 77256603 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 77256620 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 77256677 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 77256821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77256848 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 77257122 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 77257308 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 77257862 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 77257932 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 77257989 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 2 77258020 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 2 77258092 T C N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 2 77258145 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 77258241 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 77258347 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 77258396 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 77258409 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 77258512 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 77259186 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 77259458 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 77259739 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 77259784 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 77259785 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 77259907 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 77260641 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 77261367 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 77261597 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 77262174 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 77262574 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 77262739 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 77263461 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 77263524 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 77263532 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 77263681 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 77263832 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 77264065 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77264586 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 77264809 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 77265105 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 77265322 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 77265530 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 77265612 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 77265982 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 77266074 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 77266197 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 77266311 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 77267121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77267301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77268126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77268182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77268282 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77268305 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 77268468 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 77268507 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 77268524 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 2 77268567 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 77268655 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 77268710 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 77268909 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 77269096 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 77269126 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 77269239 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 77269247 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 77269251 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 77269514 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 77269582 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 77269649 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77269720 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 77269822 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77270011 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 77270076 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77270254 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77270382 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77270388 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77270427 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 77270470 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77270478 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 77270556 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77270676 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 77270711 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 77270825 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77270841 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77270863 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 77270876 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 77270899 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77270910 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 77271097 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 77271153 A G Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 77271204 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 77271240 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 77271278 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 77271370 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 77271406 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77271460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77271461 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77271630 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 77271663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77271681 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77271760 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 77271875 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77272071 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77272252 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 77272278 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77272280 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77272324 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 77272433 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 77272936 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 77272940 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 77273332 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 77273454 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 77273511 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77273663 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77273780 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 77273948 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 77273952 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 77274095 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 77274177 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 77274527 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 77275012 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 77275049 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77275285 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 77276545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77276871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77277591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77278261 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77278431 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77278434 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 77278917 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 77279362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77279371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77279788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77280115 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77280974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77280975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77281035 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77281061 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77281830 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 77282864 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77282923 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 77282942 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 77283017 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 77283398 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 77283403 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 77283483 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77283634 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77283670 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77284211 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77284454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77285135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77285168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77285174 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77286559 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77287236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77287268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77287846 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 77288270 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 77288279 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 77288309 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 77291168 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 77291205 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 77291607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77291993 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 77292043 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77292171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77292179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77292187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77292877 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77293002 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77293041 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77293179 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 77293355 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77293824 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77293995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77294059 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77294438 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77294587 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 77294778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77294816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77295421 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77295441 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77295582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77295612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77295778 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 77295936 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77295997 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77296502 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 77296619 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 77296835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77297041 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77297172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77297173 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77297229 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77297533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77297664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77297898 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 77298125 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 77298277 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 77298430 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77298492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77298719 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77298954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77299178 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 77299199 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 77299200 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 77299578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77299948 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77300066 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 77300208 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 77300236 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 77300335 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 77300457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77300855 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77300878 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 77301085 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77301151 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 77301511 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 77301561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77301640 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 77301760 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77301787 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 77301900 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 77302003 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 77302187 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77302331 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77302537 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77302560 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77302584 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 77303195 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 77303799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77304650 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77304677 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77304754 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 77305093 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 77305186 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77305189 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 77305279 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77305383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77305409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77305673 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 77305774 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 77305997 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 77306043 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 77306241 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 77306292 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77306364 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 77306564 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77306655 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77306732 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 77306768 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 77307020 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77308565 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 77308617 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 77309959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77310284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77311247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77311364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77311518 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 77311642 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 77311643 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77311653 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77311666 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77311915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77311918 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77312329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77312405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77312512 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77313367 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 77313462 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77313569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77313649 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 77313684 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 77313685 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 77313935 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 77313980 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 77314008 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 77314048 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 77314516 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77314553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77314574 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 77314647 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77314894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77314964 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77314985 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77315016 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77315598 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77315711 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 77315885 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77315991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77316167 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77316209 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77316277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77316322 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77316334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77316353 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77316560 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77316617 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77316762 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77317184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77317279 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77317323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77317599 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77317621 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77317686 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77317716 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 77317886 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 77317916 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77317962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77318296 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77318344 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77318474 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77318523 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77318623 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77318788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77318896 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77319020 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 77319062 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 77319102 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77319209 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 77319603 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77319742 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77319767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77319806 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77319830 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77319855 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77319905 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 77319926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77320588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77320643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77321034 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77321092 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77321139 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77321444 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77321607 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77321770 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77322183 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77322209 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 77322576 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77322623 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77322724 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77322865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77322978 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77323299 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77323340 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77323951 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77324147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77324794 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 77325318 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77325339 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77325460 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77325478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77325510 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77325521 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77325524 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77325601 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77325938 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77326037 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77326053 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77326106 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77326108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77326147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77326274 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 77326495 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77326749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77326789 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77326874 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77327220 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77328399 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 77328425 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77328604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77328632 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77328763 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77329231 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77329606 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77329832 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77330240 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77330290 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77330813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77331260 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77331583 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77331599 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77331769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77331788 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77332045 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77332111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77332700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77333123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77333948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77334364 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77334711 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77334759 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77334913 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77335034 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77335162 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77335171 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77335256 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77335308 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77335840 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77335957 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 77336026 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77336801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77336804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77336837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77337028 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 77337082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77337405 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 77338380 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77338425 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77339038 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77339630 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77339707 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77339722 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 77339777 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 2 77339873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77340889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77340969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77341118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77341268 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 77341375 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77341516 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77341542 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77341624 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77341773 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77341890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77341909 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 77341970 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77342273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77342349 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77342406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77342496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77342560 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77342600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77343046 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77343450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77343472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77343803 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77343876 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77343914 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77343964 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77344180 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77344429 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77344559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77344745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77344746 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77345641 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77345888 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77346228 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77346346 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77346419 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77347030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77347969 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77348355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77348942 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77349506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77350124 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77350476 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77350567 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77351763 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 77351853 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77351878 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77351887 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77351911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77352088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77352202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77352221 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77352529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77352531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77352611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77352622 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77352682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77353422 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77353503 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77353763 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77354056 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77354293 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77354416 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77354480 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77354585 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77354915 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77354954 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77354964 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77354984 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77355036 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77355038 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77355089 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77355158 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77355243 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 77355284 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 77355301 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 77355406 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77355446 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77355514 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77355585 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77355922 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77355931 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77356021 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77356070 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77356095 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77356105 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77356746 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77356835 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77356845 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77357015 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77357680 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77358286 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77358290 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77358733 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 77359755 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77359782 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 77359794 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77360031 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77360059 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77360169 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77360215 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77360226 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77360319 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77360336 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77360344 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77360371 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77360590 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77360668 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77360669 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77360761 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 77360809 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77360974 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 77361057 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 77361200 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77361260 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77361492 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 77361510 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 77361588 T A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 77361598 C T N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 77361877 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77361880 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77362084 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77362108 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77362186 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77362363 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77362390 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77362548 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77362697 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77363566 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77363683 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 2 77364092 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77364307 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77364975 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77365071 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77366078 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77366160 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77366557 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77366605 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 77366646 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 2 77366905 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77366978 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77367014 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77367020 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77367198 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77367242 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77367285 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77367330 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77367367 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 77367387 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 77367484 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 77367512 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 77367655 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 77367769 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77367886 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77367913 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77368132 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77368293 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77368386 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77368465 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 77368606 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77368831 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 77368976 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 77369042 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 77369433 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77369503 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77369536 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77369698 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77369702 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77370081 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77370104 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77370162 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77370194 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77370325 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77370367 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77370375 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77370451 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77370499 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77371105 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77371115 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77371172 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77371220 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77371232 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77371344 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77371425 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77371597 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77371612 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77371645 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77371663 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77371674 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77371721 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 77371732 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 77371850 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 77371987 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77372030 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77372036 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77372116 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77372411 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77372515 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77372646 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77372769 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77372801 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 77372842 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 77372884 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 77373012 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 77373338 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77373347 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77373361 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77373388 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77373416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77373462 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77373482 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77373590 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77373655 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 77373665 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77373690 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77373709 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77373712 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 77373790 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77373856 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77373874 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77373971 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77373985 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77374065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77374141 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77374338 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77374598 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77374660 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77374802 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77374873 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77374938 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77375020 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 77375275 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77375379 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 77376010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77376120 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77376313 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77376797 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 77376849 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77376871 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77376919 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77376926 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77376955 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 77377007 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77377142 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77377164 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77377236 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77377314 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77377500 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77377604 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77377716 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77377731 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77377791 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77377798 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77377916 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77377954 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77378162 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77378176 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77378254 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77378549 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 77378654 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77378778 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77378839 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 77380304 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77381077 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77381094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77381293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77381826 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77382711 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77383089 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77383463 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77383685 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77383971 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 77384374 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 77386182 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77387835 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77388396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77388794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77389300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77389318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77389378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77389454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77389496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77389509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77389539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77389685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77390376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77391974 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77392219 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77392237 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77392494 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77392588 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77393188 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77393496 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77393549 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77393668 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77393694 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77394417 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77394478 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77394687 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77394874 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77394903 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77395072 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77395173 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77395369 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77395720 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 77395827 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77395880 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 77395881 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 77395927 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77396066 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 77396193 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77396215 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 77396643 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 77396993 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77397042 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77397867 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77398018 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77398933 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 77399026 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 77399027 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 77399293 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77399383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77400112 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77400295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77400461 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 77400761 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77400806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77401019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77401231 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77401366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77401477 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77401488 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77401631 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77401740 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77401886 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77401904 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77402240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77402330 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 2 77402382 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77402385 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77402421 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77402424 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77402470 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 77402487 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 77402538 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 77402541 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 77402572 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 77402591 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 77402640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77403137 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77403431 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77403512 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77403533 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77403542 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 77403756 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77404322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77404354 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77404467 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77404490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77404861 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77405981 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77405983 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 77406006 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77406079 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77406113 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77406218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77406728 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77406737 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77406837 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77406838 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77406851 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77406986 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77407096 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77407206 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77407441 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77407639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77407770 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77407977 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 77407978 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 77408053 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77408086 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77408125 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77408258 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77408266 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77408305 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77408389 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77408415 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 77408594 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77408611 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77408754 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77409579 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 77409675 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77409759 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 77409768 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77409773 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77409898 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77409899 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77409912 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77410007 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77410406 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77410418 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77410492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77410501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77410604 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77410761 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77410766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77410940 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 77411011 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 77411375 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77411580 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 77411603 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77411902 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77411918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77411934 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77412096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77412155 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77412180 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77412216 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77412243 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77412266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77412289 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77412317 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77412454 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77412458 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77412483 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77412561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77412717 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77412795 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77413034 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77413116 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77413257 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77413456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77413477 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77413527 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77413922 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77414564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77414565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77416204 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77418029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77418109 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77418241 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77418522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77419136 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77420463 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 77420524 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77420533 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77420625 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77420709 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77420743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77420858 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 77420955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77421002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77421081 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77422070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77422484 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77422542 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77422657 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77423266 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77423301 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77424639 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77424741 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77427213 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77427412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77427474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77428495 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77428878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77429199 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77429407 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77429445 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77429495 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77429533 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77429534 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77429667 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77429668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77429881 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77430486 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77430788 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77432512 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77432589 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77433171 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77433536 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77433676 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77433959 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 77434197 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77435470 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77435799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77436534 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77436636 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77444815 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77444997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77445854 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77447612 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77447614 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77448229 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77448735 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77448901 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77449529 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77449640 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77450089 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77450116 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77450165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77450434 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 77450508 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77450779 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77450843 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77450856 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77450993 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77451064 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77451099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77451217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77451729 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77451730 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77451961 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77452166 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77452428 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77452460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77452494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77452651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77453096 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77454121 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77454463 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77454818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77454972 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77455637 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 77455652 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 77455798 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77456087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77456105 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77457640 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77457705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77457804 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77457840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77457868 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77457880 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77457997 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77458001 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77458763 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77458862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77458937 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 77458990 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77459033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77459130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77459256 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77459557 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77460022 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 77460480 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77461174 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77461250 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 77461455 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 77461674 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 77461681 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 77461908 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77462295 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 77462397 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77466490 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 77466678 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 77468310 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 77470033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77472314 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 77472752 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77472796 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 77473505 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 77473513 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 77473576 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 77473585 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 77474343 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 77474371 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 77474394 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 77475434 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 77475879 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 77476010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77476049 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 77476113 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 77476334 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 2 77476357 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77476380 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 77476590 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77476626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77476666 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 77476810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77477033 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77477105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77477188 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 77477249 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 77477416 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 77477434 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77477698 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77479027 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77479208 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 77479225 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 77479245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77479260 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 77479442 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77479770 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 77483697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77484304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77485213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77486923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77487005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77487725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77487756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77488117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77488119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77488229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77488293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77488306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77488337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77489087 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77489158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77490218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77490524 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77491115 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77491426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77491451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77491729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77492061 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77492471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77492721 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77492831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77493345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77493375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77493545 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77493623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77494746 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77495346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77495626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77495720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77495831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77495906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77496076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77497573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77497673 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77498347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77498694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77498695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77498980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77499193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77499257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77499485 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77499616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77499768 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77499800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77499882 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77500143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77500170 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77500209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77500245 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 77500557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77500879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77500889 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77500941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77501817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77501828 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77502187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77502294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77502896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77503267 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77503451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77503811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77504345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77504370 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77504379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77504417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77505131 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77505163 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77505395 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 77505396 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 77507371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77508010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77510157 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77510168 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77510278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77510281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77510381 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77510869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77510890 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77510892 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77511553 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77511574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77511675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77511751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77511836 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77511882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77512128 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77512200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77512423 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 77512462 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 77512711 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 77513284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77513295 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77513308 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77513321 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77513347 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77513355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77513376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77513432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77513991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77514044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77514102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77514784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77515137 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 77516231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77517227 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77517647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77517808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77518186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77518298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77518479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77518598 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77518885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77519212 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77519668 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77519679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77520826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77520895 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77521023 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77521479 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77522113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77522304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77522614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77522850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77522890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77523614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77523848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77524440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77524617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77524754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77525003 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77525084 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77525637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77528221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77528796 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77528842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77528862 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77529575 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77529904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77529952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77530164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77530457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77530615 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77531200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77531590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77531624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77531885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77532653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77533796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77534699 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77535688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77535873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77536510 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77536677 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77536781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77536872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77536999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77537097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77537099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77537373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77537489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77537503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77537646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77537668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77538930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77539126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77539602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77539833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77540018 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77541047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77542591 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 77543885 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77544491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77545245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77545419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77545841 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 77546506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77547045 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77547908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77548225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77550331 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77550541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77550574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77552018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77552743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77553448 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77555386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77555392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77555554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77556983 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77557921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77559148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77559323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77559711 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 77561627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77561764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77561946 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77562572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77562744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77563539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77564530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77565215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77565278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77565286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77565381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77568178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77570396 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77573143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77577258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77577634 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77578827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77578886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77579383 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77580361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77580724 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 77581682 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77582799 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 77590713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77592181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77592845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77592890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77592988 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77595122 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77595145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77595325 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 77595542 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77595560 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77597180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77597196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77597530 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 77597601 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77597869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77598433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77599135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77599302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77600185 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77601961 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77602168 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77602287 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77602550 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77602826 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 77602950 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 77603232 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 77603551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77603595 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77603596 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77603618 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 77603725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77603735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77603777 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 77603857 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 77604615 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77604675 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 77604765 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77604846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77604892 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77604910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77604925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77604954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77604996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77605009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77605034 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 77605282 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77605306 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77605436 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77605522 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77605565 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77605669 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 77605896 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 77606536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77606584 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77606818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77606855 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 77607283 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 77607297 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77607305 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77607407 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 77607442 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77607497 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77607510 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77607549 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 77607585 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 77607638 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77607731 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77608232 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77608242 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77608667 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77608671 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77608689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77608764 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77608859 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 77608918 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 77608985 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77609196 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77609266 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77609280 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77609349 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77609651 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77609691 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77609775 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77609788 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77609814 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77609851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77609878 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77610041 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77610047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77610076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77611097 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77611133 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77611307 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77611401 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 77611539 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77611580 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77611708 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77611714 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77611884 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77612035 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 77612312 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 77612357 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 77612376 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 77612401 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77612692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77612828 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77613268 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77613426 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77613477 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 77613487 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 77613715 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 77614086 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77614154 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77614419 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77614421 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77614540 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77614693 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77614729 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77614745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77614827 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 77614948 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 77614992 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 77615004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77615060 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 77615061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77615338 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 77615484 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77615651 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77615984 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77616274 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 77616477 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 77616723 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77616850 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77616870 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77617297 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 77617676 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77618148 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77618196 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77618352 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77618702 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 77619115 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 77619526 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 77619604 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77620393 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 77620431 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77620474 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77620595 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77620678 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 77620726 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77620756 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 77620790 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77620863 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 77620870 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 77620894 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77620911 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77620963 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77620978 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 77620993 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77621110 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 77621184 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 77621216 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77621237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77621266 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77621561 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 77621650 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 77621685 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 77621701 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 77621837 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 77621843 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 77621864 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 77621942 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 77622003 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 77622042 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 77622069 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77622092 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 77622115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77622152 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 77622238 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77622295 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 77622379 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77622400 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77622485 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77622521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77622532 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77622544 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77622598 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77622612 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77622615 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77622721 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77622783 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77622879 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 77623019 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 77623076 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 77623119 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77623139 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 77623235 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 77623285 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77623556 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 77623569 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77623605 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77623632 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77623672 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77623774 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77623992 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77624175 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77624191 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77624251 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77624477 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77624500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77624533 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77624854 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 77624871 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 77625011 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77625187 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 77625418 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 77625619 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77625800 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 77625868 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77625890 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 77625939 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77625991 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77626009 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77626129 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77626292 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 77626309 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77626949 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77627272 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77627273 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77627366 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77627382 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77627392 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77627457 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77627628 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77627754 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77628392 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 77628507 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77628664 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77628798 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77628837 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77628947 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77629162 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77629239 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77629322 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77629373 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77629488 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77629566 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 77629620 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 77629635 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 77629684 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 77629789 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 77629809 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77629960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77630096 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77630099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77630138 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77630152 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77630250 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77630332 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77630569 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77630701 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77630817 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77631196 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77631297 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77631334 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77631459 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77631503 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77631530 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77631606 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77631699 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77631754 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77631867 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77631926 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77632056 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77632189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77632271 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 77632296 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77632748 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77633077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77633205 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77633916 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77634053 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 77634097 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 77634431 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77634461 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 77634584 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77634618 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77634834 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77634864 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 77634908 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77635128 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77635404 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77635614 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77635616 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77635690 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77636386 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77636626 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77636690 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77636740 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77636819 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77636952 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77636969 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77637213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77637379 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77637706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77637726 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77638433 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77638446 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77638509 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77638686 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77638847 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77638858 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 77639677 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 77639740 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77639773 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77639936 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 77639989 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 77640160 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 77640203 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 77640318 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 77640532 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77640545 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 77640625 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 77640631 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77640697 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 77640792 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 77641016 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 77641476 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 77641697 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 77641773 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77641840 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 77641864 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 77641940 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 77642159 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77642227 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77642297 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 77642298 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 77642414 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 77642433 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 77643021 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 77643156 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 77643233 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 77643352 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77643396 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 77643789 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 77643917 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 77643942 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77644018 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77644135 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77644292 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 77644322 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 77644430 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 77644456 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 77644583 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 77645334 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77645478 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 77645636 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 77646170 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 77646231 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 77646277 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 77646311 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77646679 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 77647175 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 77647436 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 77647683 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77647719 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77647807 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77647984 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77648011 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77648132 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77648193 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77648266 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77648331 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77648611 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77649245 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 77649968 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77650185 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77650395 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 77650490 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 77650729 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 77650781 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 77650913 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 77650919 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 77650980 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 77651005 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 77651040 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77651081 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77651184 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77651295 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 77651466 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 77651999 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77652156 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77652770 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 77652775 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 77652793 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 77652874 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 77653011 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 77653346 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77653693 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 77653903 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 77654273 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77654366 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 77654410 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 77655142 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 77656246 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 77657050 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 77657052 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 77657750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77657755 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 77657846 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77658048 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77658604 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 77658648 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 77658703 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77658709 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 77658916 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 77659822 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77659904 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77660071 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 77660724 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77661060 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 77661325 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77662066 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77662188 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77662389 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77662562 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77662942 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77663248 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77663747 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77664059 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77664097 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 77664298 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 77664725 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77665010 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 77665043 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 77665151 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 77665222 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77665625 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77665822 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77665894 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77666194 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 77666414 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 77666428 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77666441 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77666527 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 77667287 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 77667490 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 77667498 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 77667893 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77668050 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77668108 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77669174 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77669234 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77669271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77669317 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77669342 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 77669513 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 77670158 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 77670507 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77670675 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 77671118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77671225 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77671550 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 77671737 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77671742 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 77672299 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 77672305 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77672321 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77672737 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77673110 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77673647 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 77673682 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77673980 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77674006 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77674034 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77674068 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77674302 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77674364 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 77674393 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77674576 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77674598 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77674636 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77674649 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77674660 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 77674990 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77675199 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77675641 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77675643 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77675672 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77675737 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77675871 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 77676011 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77676189 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77676328 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77676667 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77676695 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77676839 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 77677251 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77677258 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 77677264 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77677589 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 77677924 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77678166 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77678378 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 77678388 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 77678833 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 77678913 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 77679032 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 77679034 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77679162 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77679179 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77679732 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77679925 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77679936 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77680019 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77680452 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77680467 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 77680545 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77680774 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77681006 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77681007 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77681039 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77681042 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77681065 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77681115 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77681341 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 77681356 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77681477 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77681856 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77681868 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77681970 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77681981 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77682054 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77682078 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 77682201 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 77682299 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77682302 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77682529 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77682557 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77682594 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77682608 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77682651 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77682655 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77682677 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77682732 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77682788 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77682817 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77682872 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77683029 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77683061 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77683100 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77683279 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 77683317 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77683497 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77683537 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77683550 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77683611 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77683696 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77683756 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 77683778 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77683804 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77683886 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 77684016 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77684085 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77684131 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 77684132 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77684179 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77684208 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77684250 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77684328 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 77684443 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77684460 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77684504 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77684795 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77684895 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 77684940 T A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 77684957 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 77685042 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77685101 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77685113 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77685133 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77685155 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77685284 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77685343 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77685452 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 77685459 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77685588 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 77685682 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77685750 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77686211 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77686282 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77686304 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77686583 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77686839 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 77686906 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 77686949 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77687423 G C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 77687766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77688028 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77688140 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 77688244 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77688391 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77688489 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 77688516 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 77688539 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 77688621 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77688643 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 77688644 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 77688684 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 77688739 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 77689158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77689356 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77689560 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77689700 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 77690001 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 77690266 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77690852 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77690893 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77691101 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77691131 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 77691442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77691545 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77691577 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77691713 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77691732 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77691760 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77691778 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77691803 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 77692034 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 77692678 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 77693154 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 77693520 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77694108 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77694536 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 77694714 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 77694914 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 77695209 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77695286 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77695470 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 77696130 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 77696325 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 77696510 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 77696761 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77697643 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77697661 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77697753 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77697765 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77697840 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77697852 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77697892 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77697963 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 77697974 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77698003 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77698052 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77698071 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77698097 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77698145 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 77698185 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 77698207 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 77698230 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 77698239 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 77698270 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77698319 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77698526 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77698663 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77698696 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77698753 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77698855 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77698983 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 77699032 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77699122 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 77699220 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77699316 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 77699456 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 77699462 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 77699507 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77699579 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 77699614 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 77699754 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 77699921 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 77699962 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 77699995 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 77700004 C G N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 77700135 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 77700366 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 77700467 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 77700740 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 77700797 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 77700868 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 77700981 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 77700992 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 77701034 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 77701057 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 77701413 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 77701846 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 77702083 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 77702117 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77702159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77702280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77702547 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 77702699 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 77702799 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 77703325 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77703331 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 77703545 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77703558 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 77703589 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 77704131 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77704163 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77704327 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77704340 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77704367 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77704386 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77704387 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77704494 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77704536 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77704653 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77704654 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77704830 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 77704852 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77704867 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77704906 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77704916 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77705009 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77705019 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77705047 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77705049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77705115 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77705161 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77705195 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 77705278 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 77705329 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 77705546 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 77705597 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77705734 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 77705757 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 77705816 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77705820 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77705843 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77705863 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77705949 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77705958 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77705990 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 77706026 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 77706049 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77706233 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77706249 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77706372 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77706511 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77706635 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77706789 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77706916 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 77706927 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77707421 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77707564 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77707605 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77707645 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77734160 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 77734171 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 77751156 A G N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 77807358 G C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 77807414 C A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 77865460 G T N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 77865552 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 77865603 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77865639 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77865648 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77865662 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77865670 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 77865775 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77866009 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 77866030 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 77866041 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 77866075 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 77866093 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 77866094 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 77866256 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 77866397 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 77866413 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 77866415 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 77866436 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 77866452 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 77866682 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77866732 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77866848 A T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 77866927 A C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 77867120 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 77867248 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 77867533 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77867558 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 77867578 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 77868012 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77868073 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 77868088 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77868096 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77868164 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77868211 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 77868252 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 77868262 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 77868290 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 77868302 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 77868355 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 77868420 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77868523 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 77868626 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 77868742 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 77868743 C A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 77868774 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 77868931 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 77869317 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 77869450 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77869528 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 77869666 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77869670 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77869678 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77869693 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77869714 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77869855 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 77870222 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77870381 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 77870384 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 77870591 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77870619 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 77870955 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 77871182 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 77871255 T C N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 11 9 2 7 1 2 77871281 G T N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 77871450 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77871499 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77871535 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 77871545 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77871592 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 77871602 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 77871629 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77871658 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 77871678 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77871697 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 77871700 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 77871727 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 77872091 G A N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 2 77872108 T A N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 77872157 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 77872357 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 77872502 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 77872547 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 77872598 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77872798 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77872800 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77872813 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77872876 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 77872878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77872891 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 77873017 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 77873060 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77873247 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77873254 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77873265 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77873381 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77873440 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77873514 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77873645 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 77873726 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77873766 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 77873805 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 77873928 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77873930 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77874032 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 77874035 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 77874046 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 77874132 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 77874153 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 77874180 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 77874188 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 77874196 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 77874246 T A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 77874252 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 77874299 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 77874322 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 77874326 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 77874349 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 77874406 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77874462 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 77874633 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77874648 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77874777 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 77874794 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77874799 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77874863 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77874866 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77875019 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 77875235 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 77875250 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 77875267 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 77875371 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77875406 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 77875409 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77875499 A T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 77875711 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 77876118 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 77876204 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77876305 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77876353 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77876438 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77876476 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77876523 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77876569 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 77876988 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77877117 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77877154 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77877202 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77877212 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77877236 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77877431 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 77877459 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77877497 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77877605 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77877625 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 77877650 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77877720 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77877752 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 77877882 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77877931 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 77877934 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77877944 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77877953 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77878117 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 77878136 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 77878212 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 77878264 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77878351 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77878371 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77878438 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878459 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77878527 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878543 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878628 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878653 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878663 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878683 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77878699 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77878711 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878740 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878747 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878751 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878800 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878843 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77878850 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77878871 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77878890 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77878909 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878921 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878929 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77878946 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77878959 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77879003 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77879011 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77879110 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77879214 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77879274 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77879324 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77879331 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77879354 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 77879357 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 77879370 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77879383 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77879389 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77879445 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77879468 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77879491 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77879541 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77879547 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 77879586 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77879628 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 77879645 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77879668 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77879692 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77879708 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77879754 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77879766 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77879780 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77879824 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77879831 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77879840 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77879901 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 77879916 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 77879930 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 77880054 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77880075 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77880083 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77880096 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77880112 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77880187 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77880198 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 77880207 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77880225 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77880228 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77880259 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77880277 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77880322 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77880326 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77880621 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77880622 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77880665 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77880717 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77880721 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77880731 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77880750 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 77880870 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77880876 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77880924 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 77880935 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 77880965 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 77880966 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77880982 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77881074 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77881086 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 77881127 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 77881132 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 77881147 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77881163 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77881167 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 77881211 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 77881618 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 77881632 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 77881645 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77881646 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 77881676 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 77881706 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 77881760 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 77881778 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77881805 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77881854 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 77881872 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 77881974 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 77882037 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 77882106 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 77882214 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77882265 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 77882350 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77882375 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77882389 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77882410 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77882509 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 77882546 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 77882559 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 77882712 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77882789 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77882817 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 77882844 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 77882888 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 77882989 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 77882997 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77883018 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 77883075 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77883388 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 77883433 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 77883487 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 77883489 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 77883567 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77883648 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 77883666 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 77883914 C G N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 77884065 G C N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 77884125 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 77884136 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77884138 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77884189 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77884257 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 77884418 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77884429 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77884520 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77884538 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 77884601 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77884659 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77884686 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77884772 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77884806 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 77884820 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77884834 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77884900 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77884929 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 77884982 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77885090 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 77885216 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77885248 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77885300 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77885305 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77885402 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77885448 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77885468 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 77885619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77885641 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77885685 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77885761 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 77885762 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 77885807 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77885862 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77885880 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77885917 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 77886234 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77886262 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77886564 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 77886870 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77886884 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 77886944 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 77886956 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 77886990 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 77887015 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 77887144 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77887168 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77887178 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77887215 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 77887259 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77887271 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77887347 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77887466 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77887772 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 77887993 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77888036 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77888039 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77888109 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 77888131 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77888304 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77888392 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 77888394 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 77888428 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77888470 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 77888593 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 77888656 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77888689 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77888778 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77888893 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77888914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77888931 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77888943 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 77889042 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 77889071 C G N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 77889085 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 77889092 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 77889122 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 77889127 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 77889147 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 77889185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77889339 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 77889398 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77889471 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 77889507 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77889548 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 77889553 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 77889612 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 77889627 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77889658 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77889733 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 77890018 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77890021 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77890039 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77890045 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77890098 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 77890136 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 77890155 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 77890282 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 77890369 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 77890373 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77890380 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 77890419 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 77890486 G T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 77890491 C A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 77890546 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 77890726 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 77890764 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77890811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77890813 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77890857 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 77890879 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77890888 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77890923 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77890977 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77891059 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77891060 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 77891075 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77891115 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 77891455 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77891478 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 77891531 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77891541 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77891631 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77891679 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77891693 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 77891814 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 77891868 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77891954 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 77891980 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77892086 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 77892150 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77892321 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 77892365 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77892376 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77892407 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77892454 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77892465 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77892725 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 77892952 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77892955 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77892980 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77893008 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77893775 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 77893974 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 77894008 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 77894131 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77894321 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 77894344 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77894573 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 77894612 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77894919 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 77895110 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 77895132 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 77895177 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 77895288 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 77895376 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 77895503 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 77895522 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 77895653 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 77895812 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77895833 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77895933 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 77896130 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77896353 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77896376 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77896381 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77896414 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 77896502 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77896779 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 77897056 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77897060 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77897086 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 77897249 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77897324 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77897461 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 77897493 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 77897527 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77897551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77897943 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 77898112 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 77898364 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 77898440 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77898575 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 77898724 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 2 77898948 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 77899097 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 77899159 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 77899188 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 77899219 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 77899312 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 77899394 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 77899611 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 77899834 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 77899919 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 77900094 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77900095 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77900268 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77900377 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77900606 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77900728 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 77900744 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 77900833 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77900870 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77900912 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 77900942 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 77900975 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77901065 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 77901149 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77901161 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 77901276 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 77901613 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77901634 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 77901708 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 77901787 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 77901789 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 77901861 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 77901873 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 77901884 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 77901905 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 77902099 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 77902100 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 77902128 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 77902202 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 77902257 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 77902282 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 77902447 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 77902554 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77902586 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77902773 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 77902778 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77902800 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 77902830 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77902859 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77902897 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77902946 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 77903070 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 77903210 G A N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 2 77903226 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 77903446 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 77903718 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77903902 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 77903933 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 77903977 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 77904151 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 77904249 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 77904302 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 77904512 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 77904521 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 77904566 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 77904638 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 77904658 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77904701 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 77905213 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 2 77905774 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 2 77905849 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 77906041 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77906074 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 77906085 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 77906101 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77906147 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 77906182 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 77906398 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 77906437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77906585 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 77906642 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 77906750 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 77907114 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.466666666666667 0.133333333333333 0.4 16 14 7 2 6 2 77907130 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 77907152 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 77907568 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77907872 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 77908086 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 77908154 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 77908209 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 77908355 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 77908510 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77909449 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 77909456 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 77909470 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 77909582 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 77909583 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 77909689 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 77910761 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 77910801 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 77910808 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77910831 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 77910846 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 77910875 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77910885 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 77911008 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77911422 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 77911510 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 77911854 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77911855 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77911922 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77911976 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 77912250 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77912339 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 77912353 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 77912417 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77912431 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 77912580 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77912683 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 77912687 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 77912748 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 77912972 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 77913068 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 77913113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77913136 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 77913161 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 77913172 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 77913386 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 77913524 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 77913573 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77913621 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77913809 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 77913823 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77913826 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77913850 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 77913988 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77914104 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77914292 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77914624 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77914659 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77914694 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77914702 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77914724 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77914756 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 77914777 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 77914856 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77915208 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 77915339 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77915375 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 77915617 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 77915736 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77916122 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77916200 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 77916310 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 77916417 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 77916475 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 77916620 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 77916751 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 77917013 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77917081 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 77917296 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77917310 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77917455 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 77917468 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 77917524 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 77917544 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 77917608 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77917641 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77917667 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 77917753 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 77917770 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 77917781 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 77918057 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 77918219 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 77918263 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 77918383 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 77918426 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77918438 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77918466 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77918474 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 77918492 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77918508 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77918560 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 77918594 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 77918658 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77918672 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 77918699 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 77918931 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 77919022 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 77919229 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 77919413 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77919514 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 77919536 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77919549 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77919624 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77919657 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77919714 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77919727 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77919795 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77919893 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77919903 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 77919959 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77919982 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77920092 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77920110 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 77920111 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 77920127 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 77920178 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77920313 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 77920377 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 77920537 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 77920724 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 77920743 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 77921018 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 77921085 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 77921174 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 77921356 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77921425 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77921427 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77921527 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77921765 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 77921967 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 77922353 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 77922393 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 77922488 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77922719 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 77922780 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 77922837 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 77922877 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 77923037 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 77923048 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 77923062 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 77923198 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 77923244 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 77923406 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 77923438 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 77923585 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 77923656 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 77923762 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 77924111 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 77924203 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 77924204 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 77924216 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 77924712 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 77924714 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 77924751 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 77924785 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77925122 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 77925354 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 77925477 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77925539 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 77925650 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 77925793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77926173 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 77926264 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 77926950 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 77927047 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77927308 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77927404 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 77927497 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 77927926 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 77928240 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77928316 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77928611 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 77928694 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 77928734 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 77928770 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 77928988 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 77929045 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 77929107 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 77929526 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 77929629 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 77929843 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 77929870 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 77929885 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 77929898 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77930031 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77930128 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 77930201 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 77930340 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 77930397 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 77930423 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 77930448 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 77930904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77930967 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 77931178 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 77931403 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 77931627 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 77931820 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 77931878 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 77931957 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 77932227 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 77932423 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 77933334 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 77933553 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 77933587 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 77933737 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77934116 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 77934244 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 77934508 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 77934961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77935112 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77935442 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 77935551 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 77937716 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 77937780 C T Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 77937894 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 77938389 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 77938584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77938885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77940239 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 77940281 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77940462 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77941138 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77941546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 77941727 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77941872 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 77942630 G C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 77942711 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77942764 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 77942765 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77942809 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77943210 A T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 77943343 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 77943347 G C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 77943379 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 77943534 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77943643 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 77943773 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 77943805 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 77943918 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 77943992 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 77944070 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77944083 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 77944556 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77944718 C G Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 77944804 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77944850 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77944864 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 77944928 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 77945812 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 77945878 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 77946137 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77946217 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77946229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77946305 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77946594 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77946829 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 77947265 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77947450 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77947779 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 77949136 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 77949245 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.277777777777778 25 11 12 1 5 2 77949280 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 77949462 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 77949483 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77949493 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 77949674 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77949997 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77950261 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77950487 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 77950494 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 77950738 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 77951185 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77952112 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77952431 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 77952444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77952854 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 77953012 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 77953584 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77953640 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77953816 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77953991 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 77954193 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 77954430 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 77954543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77954731 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 77954858 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 77955014 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 77955030 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 77955101 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 77955107 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 77955339 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77955614 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 77955644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77955646 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 77955697 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 77955763 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 77955776 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 77955813 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 77955823 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 77955832 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 77955936 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77956031 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77956090 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77956205 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 77956457 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 77956637 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 77956755 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 77956758 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 77956770 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77956798 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 77956802 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77956835 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77956862 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 77956863 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 77957029 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77957061 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 77957063 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77957106 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77957169 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 77957173 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77957245 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 77957258 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 77957446 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77957538 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 77957881 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 77957902 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77957932 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 77957956 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 77958009 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 77958125 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77958163 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77958253 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 77958279 G C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 77958364 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 77958510 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77958549 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77958712 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77958755 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77958780 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77958798 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77958823 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77958980 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 77959184 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 77959243 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 77959261 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77959366 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77959456 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77959468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 77959558 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77959660 T G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 77959749 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 77959936 T A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77959969 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77960060 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 77960082 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 77960117 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 77960199 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 77960252 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 77960282 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 77960356 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 77960391 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 77960448 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77960478 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 77960486 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 77960525 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 77960603 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77960609 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 77960620 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77960664 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 77960748 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 77960882 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77960997 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 77961025 C G Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 77961056 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 77961078 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 77961121 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 77961144 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 77961178 T G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 77961179 T A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 77961265 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 77961279 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 77961381 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 77961493 T C Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 77968298 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 77968448 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77968560 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 77968562 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 77969127 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77969146 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77969179 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77969367 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77969503 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 77969547 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 77969696 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77969762 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77969857 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77969858 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 77970164 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77970230 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 77970270 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 77970286 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77970296 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 77970312 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 77970317 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 77970325 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 77970379 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 77970455 G C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 77970474 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77970582 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 77970616 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77970627 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77970709 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 77970756 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77970892 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 77970917 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 77970950 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 77970965 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 77971172 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 77971185 T C Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 77971345 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 77971439 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 77971553 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 77971645 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 77971656 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77971858 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 77971909 G A Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 77971982 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 77972033 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77972059 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 77972304 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77972364 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 77972390 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 77972479 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77972511 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77972645 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77972710 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77972890 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77972913 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 77972929 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77972964 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77972985 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77973142 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77973293 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 77973355 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 77973468 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 77973899 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77973931 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77973945 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77973964 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77974219 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 77974668 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 77974673 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 77974736 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 77974815 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 77974822 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 77975195 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 77975456 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77975600 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 77975627 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 77975887 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 77975955 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 77975984 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 77976017 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 77976108 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77976159 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77976273 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77976468 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77976649 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77976665 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77976810 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 77976842 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 77976864 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 77977052 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 77977055 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77977148 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 77977294 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77977338 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77977357 C G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77977367 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 77977432 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 77977520 G C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 77977530 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 77977765 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 77977790 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 77977800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77977844 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77977995 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77978078 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 77978120 T G N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 77978170 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 77986976 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 77987001 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 77987014 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77987178 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77987291 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77987382 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77987400 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77987496 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 77987530 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 77987713 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 77987986 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 77988017 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 77988033 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 77988128 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 77988219 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 77988306 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77988345 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77988408 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77988440 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77988445 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 77988485 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 77988506 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 77988615 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77988688 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77988786 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 77988859 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77988907 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 77989046 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77989087 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77989359 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 77989577 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77989615 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 77989801 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 77989829 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77989999 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 77990234 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77990281 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77990366 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77990434 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 77990575 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77990682 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77990843 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77990912 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 77991065 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 77991074 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 77991090 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 77991114 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77991441 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 77991469 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 77992044 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 77992537 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 77992742 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 77992797 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 77992902 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 77993011 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 77993278 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 77993321 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 77993365 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 77993491 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 77993547 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 77993624 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 77993636 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 77993670 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 77993696 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 77993706 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 77993733 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 77993759 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 77993973 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77994173 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 77994328 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 77994395 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 77994432 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77994465 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77994466 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77994492 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 77994679 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 77994760 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77994765 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77994806 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 77994922 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 77995024 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 77995037 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 77995096 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 77995454 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 77995484 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 77995512 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77995582 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 77995696 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77995778 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 77995897 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77995920 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77995955 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 77996029 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 77996058 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 77996090 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 77996102 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 77996129 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 77998327 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 77998462 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77998652 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77998685 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 77998948 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 77998960 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77998968 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 77998988 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 77999048 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77999070 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77999083 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 77999154 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 77999172 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 77999220 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 77999245 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 77999279 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 77999360 G C N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 77999708 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 77999721 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 77999731 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 77999747 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 77999807 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 77999928 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 77999971 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 77999986 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 78000061 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78000534 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 78000664 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78001149 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78001164 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78004056 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78005399 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 78005705 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78007785 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 78008379 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78008448 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 78009024 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 78009033 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 78009333 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 78009441 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 78009454 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 78009599 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 78009612 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 78009681 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78009771 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 78009799 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78009919 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78009983 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 78010012 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78010026 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 78010154 T G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 78010696 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78010941 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78010985 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78011066 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78011167 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78011172 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 78011690 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 78011891 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78011944 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78012051 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78012189 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 78012685 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78012759 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78013094 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78013517 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78013527 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 78013808 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78013885 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 78013903 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 78013966 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 78014097 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 78014141 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 78014236 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78014270 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78014350 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 78014444 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 78014496 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 78014593 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78014630 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78014877 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78014920 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78015445 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78015566 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 78016051 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78016168 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78016474 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 78017350 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 78017401 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78017411 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78017423 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78018145 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 78018280 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78018322 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78018344 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78018542 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78018715 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78018756 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78018819 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 78019010 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 78019095 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78019192 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78019355 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 78019473 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78019500 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78019594 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 78019659 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 78019787 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78019835 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78019896 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 2 78019963 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78019997 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78020020 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78020100 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78020412 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 78020767 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78020975 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78020977 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78021118 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 78021351 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 78021455 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 78021689 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78021819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78021836 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 78021869 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78022274 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78022310 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78022354 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78022781 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78022933 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 78023148 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 78023771 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78023917 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78023995 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78024032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78024080 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 78024148 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78024393 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 78024446 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78024885 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78024935 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 78025010 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78025075 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78025146 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78025173 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 78025395 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 78025415 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78025664 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 78025668 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 78025743 T A N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 78025919 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 78026042 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 2 78026050 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 2 78026134 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 78026219 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 78026499 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 78027146 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78027244 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78027303 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78027875 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78027943 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78027994 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 78028091 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 78028239 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78028399 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78028414 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78028608 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 78028680 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78028717 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78028768 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78028786 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78028817 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78028873 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78028898 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 78029033 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78029091 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78029185 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78029317 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78029366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78029614 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78029852 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78029955 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78030065 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78030108 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78030128 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78030132 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78030223 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78030311 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78030450 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 78030572 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78030623 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78030646 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78030721 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78030736 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 78030916 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 78031070 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 78031137 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 78031283 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 78031529 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78031564 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78031569 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78031805 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 78031828 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78031872 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 78031886 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78032472 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78032502 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78033349 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78034709 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78034840 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78034918 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 78034930 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 78034982 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78035111 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78035131 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78035308 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 78035681 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 78035826 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78035833 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78036075 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78036439 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78036450 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78036487 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 78036668 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 78036738 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 78036870 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78036897 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78036945 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78036956 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78037108 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 78037341 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78037491 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78037578 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78037595 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78037614 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78037660 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78037686 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78037790 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78037837 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78037849 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78038220 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78038226 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78038320 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78038415 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78038531 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78038626 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78039024 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78039078 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78039085 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78039129 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 78039249 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78039283 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78039361 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78039404 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78039510 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78039520 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78039593 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78039886 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78040001 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78040007 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78040078 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78040182 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78040296 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78040382 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78040393 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78040494 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78040626 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78040665 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78040727 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78040750 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78040797 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78040812 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78041041 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78041269 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78041415 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 78041437 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78041595 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 78041668 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 78042097 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 78042201 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 78042408 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 78042656 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 78042823 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 78043360 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 78043391 G T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 78043619 T G N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 78043683 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 2 78043751 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 78043857 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 2 78044427 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 78044587 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78045004 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 78045091 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78045367 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78045371 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78045725 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78045808 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 78045809 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78045891 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78045906 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 78046214 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78046356 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78046371 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78046478 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78046788 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78046877 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 78047015 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78047701 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78048575 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 78048663 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78048744 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78048791 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78049402 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78049496 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 78049512 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78049784 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 78049800 T G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 78049806 G T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 78049818 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 78049825 G C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 78049838 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 78050047 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 78050214 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 78050306 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 78050314 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 78050364 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 78050702 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 78050804 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 78050811 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 78050932 T G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 78051117 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 78051356 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 78051367 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 78051447 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 78051784 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 78051973 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 78051975 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 78052112 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78052134 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78052153 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78052169 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78052184 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78052193 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78052252 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78052446 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78052450 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78052491 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78052570 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78052722 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 78052905 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78052982 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 78053022 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78053543 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 78053560 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 78053794 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 78053981 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78054042 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 78054049 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78054061 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78054112 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78054271 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 78054361 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78054412 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78054437 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78054491 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 78054504 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78054672 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78054785 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 78054829 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78054911 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78055016 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 78055288 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 78055422 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 78055466 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78055547 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78055585 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 78055657 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 78055677 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 78056007 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 78056015 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 78056061 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 78056062 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 78056161 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 78056175 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 78056205 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 78056289 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 78056327 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 78056452 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 78056539 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78056560 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78056675 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78056726 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 78056818 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 78057268 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 78057276 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78057472 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 78057497 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 78057522 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 78058105 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 78058324 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 78058513 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78058519 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78058686 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 78058899 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 78058930 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78058966 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78059120 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78059209 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 78059228 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 78059342 G C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 78059439 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 78059573 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 78059616 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 78059633 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78059673 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 78059949 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 2 78059955 A T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 2 78060063 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78060301 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78060348 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 78060513 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 78060521 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 78060548 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78060565 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 2 78060567 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 78060771 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78060827 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 78060850 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 2 78061007 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78061016 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 78061020 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 78061031 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 78061140 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78061246 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78061252 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78061346 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 78061887 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78061932 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 78061986 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78061997 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78062010 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78062011 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78062122 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 78062359 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78062493 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78062674 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 78062717 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 78062747 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 78062850 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 78062855 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78062947 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78063004 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 78063060 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 78063067 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78063182 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 78063306 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 78063330 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 78063740 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78063910 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78064050 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78064288 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78064368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78066224 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 78066839 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78066950 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78066975 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78068500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78068653 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78068943 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78069037 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 78069140 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 78069524 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 78069642 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78070186 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78070697 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78070887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78071782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78071788 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78072034 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78072189 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 78072238 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 78072316 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78072329 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78072359 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78072443 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78072501 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78072673 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78072700 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78072744 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78072934 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 78072988 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 78073035 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78073119 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78073196 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 78073203 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 78073304 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78073426 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 78073487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78073575 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78073883 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78073986 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78074000 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78074347 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78074391 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78074498 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 78074601 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78074901 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78075128 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78075227 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78075338 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 78075340 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78075428 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78075454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78075515 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78075574 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78075722 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78075897 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78076046 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 78076191 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78076240 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78076254 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78076318 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78076470 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78076494 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78076541 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78076590 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78076939 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78077042 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78077069 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78077242 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78077299 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78077405 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78077417 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78077499 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 78077661 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78077769 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78077772 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78077804 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 78077893 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 78078009 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78078043 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 78078112 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78078144 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78078356 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 78078401 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78078486 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78078520 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78078610 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78078743 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 78078815 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78078830 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78078888 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78078903 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78079030 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78079118 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 78079392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78079573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78079697 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78079700 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78079874 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78079916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78079947 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78080179 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78080429 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78080467 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78080526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78080571 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 78080837 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78080849 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78080951 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78081097 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78081306 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78081630 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78081704 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78081849 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 78081863 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78081873 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 78082024 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 78082179 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 78082372 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 78082455 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 78082585 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 78082628 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 78082637 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78082651 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78082744 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 78082758 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78082919 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 78083229 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78083310 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78083400 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 78083418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78083446 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 78083585 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 78083660 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 78083691 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 78083845 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 78083867 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78083873 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78083923 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78083939 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78083944 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78083952 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78083984 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78084985 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 78084998 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 78085209 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78085395 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78085411 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 78085731 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78085908 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 78085982 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78085995 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78085996 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78086010 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78086149 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78086218 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78086219 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78086271 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78086284 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78086394 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 78086464 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78086582 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78086891 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78086894 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78086904 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 78087050 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78087055 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78087103 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78087746 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78088027 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 78088085 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78088134 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78088204 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78088572 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78088699 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78088738 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78088797 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78088814 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78089048 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78089053 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78089107 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 78089184 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78089221 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78089237 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78089376 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78089476 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78089491 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78089510 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78089512 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78089521 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78089572 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78089579 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78089684 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 78089704 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 78089846 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 78089853 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78089942 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78089983 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 78090008 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78090021 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78090201 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78090401 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78090425 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78090433 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78090436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78090564 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 78090697 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78091024 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 78091028 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78091594 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78091637 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78091732 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 78091840 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 78091916 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 78091919 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 78092116 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78092634 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78092640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78092675 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78092954 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78093038 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78093129 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78093182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78093473 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 78093494 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 78093511 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 78094533 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 78094636 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78094675 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78094959 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78095081 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78095483 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 78095486 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 78096247 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78098553 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 78099168 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78100065 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78102517 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78103523 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78103533 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 78103707 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78103722 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 78104108 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78104731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78104764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78105060 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78105437 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78105650 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78105651 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78105778 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78105942 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78106900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78107247 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 78107301 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 78107933 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 78108236 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78108540 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78108936 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78109330 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78109355 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78109398 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78109444 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78109463 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 78109472 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 78109634 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 78109714 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 78109750 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78109783 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 78109854 A T N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 78109872 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 78109963 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 2 78110009 C A N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 78110091 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78110124 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 78110214 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 2 78110263 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 78111270 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78111422 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78111812 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78111913 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 78111954 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78112296 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78112355 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 78112459 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78112578 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78112625 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 78112644 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 78112746 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78112786 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 78112852 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78113154 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 78113335 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 78113472 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78115178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78115210 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78116162 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78116382 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78116564 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 78117371 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 78117989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78118743 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78119025 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78119116 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78120248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78120355 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78120404 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78120505 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78120759 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78121110 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 78121167 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 78122033 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78122042 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 78122185 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78122433 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78123370 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78123561 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78124234 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78124328 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78124484 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78124518 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78124552 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78125039 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78125183 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78126506 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78126507 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78126580 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78128223 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 78128309 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78128537 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 78128727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78128786 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78128881 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 78128997 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78129025 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78129097 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78129192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78129337 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78129601 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 78129633 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 78132062 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78132789 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 78132883 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 78133083 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 78133091 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 78133381 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 78133424 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78134349 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78134726 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78135709 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78135922 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78136064 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78136065 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78136240 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78136522 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 78136583 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 78136627 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78136685 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 78136714 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 78136759 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 78136893 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78136977 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 78137034 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78137080 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78137321 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 78137350 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78137586 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78137626 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78137635 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78137654 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78138308 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78138548 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 78138576 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78139042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78139090 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78139119 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78139211 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78139705 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 78139717 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78140082 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78140571 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78140579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78140594 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78140629 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78140711 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78140723 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78140775 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 78140791 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78140817 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78140851 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78140873 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78140881 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78141064 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78141228 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78141229 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78141446 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 78141468 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78141705 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78141733 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78141740 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78141767 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78141778 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78141818 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78141865 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78141897 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78141981 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78142034 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78142106 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 78142121 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 78142140 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 78142181 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 78142186 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 78142194 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 78142233 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78142281 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 78142322 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 78142328 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 78142342 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 78142389 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78142529 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78142556 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78142574 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78142590 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78142606 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78142659 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78142672 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78142676 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78142759 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78142780 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 78142840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78142870 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78142883 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78142908 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 78142915 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78142922 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78143016 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78143026 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78143030 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78143074 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78143162 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78143190 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78143299 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78143356 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78143364 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78143371 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78143379 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78143405 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 78143505 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78143507 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78143616 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78143636 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78143648 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 78143652 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78143669 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 78143695 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78143697 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78143738 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78143746 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78143779 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78143795 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78143812 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78143817 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78143891 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78143908 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 78144146 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78144157 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78144260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78144727 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78144817 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78145025 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78145112 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78145210 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78145211 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78145239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78145861 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78146091 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78146104 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78146167 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78146277 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78146438 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78146447 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 78146550 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 78146576 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 78146657 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78146664 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78146679 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78146862 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78146896 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78147132 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78147550 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 78147734 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78147974 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78147981 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78148061 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78148086 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78148145 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78148253 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78148270 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78148502 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78148589 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78148600 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78148730 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78148863 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78148875 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78149088 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78149176 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78149216 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78149229 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78149247 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78149261 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 78149267 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78149574 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78149685 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78149787 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78149945 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78150003 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78150059 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78150187 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 2 78151466 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78151508 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78153100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78153327 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78153328 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78153658 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78153780 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78154290 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78154609 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 78155438 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78155675 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78155934 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78160280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78160776 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78161640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78162292 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78162297 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78162429 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78162957 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 78163115 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 78163128 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78163294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78163734 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78164111 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78164332 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 78164798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78164844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78164900 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78164954 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78164996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78165025 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78165170 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78165631 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78166409 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78166685 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78167377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78168227 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 78168719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78168787 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78169171 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78169510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78170034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78170931 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78172060 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 78172472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78172616 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78172851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78173190 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 78173520 G C Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 78179767 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78179822 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 78179847 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 78179923 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78180168 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78180311 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78180321 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78180622 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78180728 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 78181249 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 78181323 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78181548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78181640 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78181731 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 78181742 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 78181835 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78181915 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 78182099 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 78182124 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78182239 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 78182265 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 78182378 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 78182406 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78182574 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 78182630 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78182649 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78182790 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78182950 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78182972 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78183051 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78183217 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78183260 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78183314 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78183426 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78183725 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 78183777 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78183781 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78183882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78183923 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 78184164 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78184222 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 78184230 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78184260 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 78184350 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78184368 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 78184384 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 78184448 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78184572 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78184587 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78184663 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78184703 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78184731 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78184746 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 78184759 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78184877 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78184892 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78185029 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78185087 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78185328 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 78185378 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78185379 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 78185495 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78185815 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78185868 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78185879 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 78185966 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78185992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78186019 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 78186151 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78186382 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78186450 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 78186563 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78186792 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78186815 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 2 78186879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78187255 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78187356 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78187371 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78187386 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 78187632 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78187728 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78188868 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 78188914 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 78189456 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 78189592 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78189679 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 78189787 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78189887 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78190008 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78190473 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78190490 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78191702 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78192016 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78192053 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 78192067 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 78192621 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78192651 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78192800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78192855 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78192887 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78193544 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78194144 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78194808 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78194974 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78195065 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78195346 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78195355 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78195518 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78195542 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78195658 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78195917 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 78196022 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 78196127 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78196197 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78196270 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78196313 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 78196419 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78196570 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78196655 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78196685 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 78196720 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78196772 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 78196979 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 78197009 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 78197067 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 78197098 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 78197131 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78197160 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78197188 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78197263 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 78197369 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78197430 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 78197682 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78197957 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 78197982 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 78198189 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 78198246 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78198299 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78198313 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78198318 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78198444 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78198486 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78198496 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78198568 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78198583 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78198634 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 78198662 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78198690 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78198759 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78198769 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78198773 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78198856 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78198875 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 78198890 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78198906 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78198912 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 78198920 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78198989 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78199008 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 78199026 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78199112 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78199133 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78199145 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78199181 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78199194 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78199245 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78199286 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 78199311 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78199320 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 78199323 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 78199345 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 78199348 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 78199360 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78199376 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 78199385 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 78199393 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78199402 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78199542 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 78199627 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 78199722 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78199751 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78199856 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78199909 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78199917 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78199921 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78199946 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78199981 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 78200000 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78200007 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78200111 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78200113 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78200235 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78200294 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78200306 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78200340 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78200432 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78200496 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78200518 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78200599 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78200692 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78200760 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 2 78200785 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78200935 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 78201038 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78201084 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78201127 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 78201166 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78201177 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78201242 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78201352 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78201384 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 78201402 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 78201443 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78201484 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78201496 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 78201523 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78201575 G T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 78201665 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78201764 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 78202146 T A N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 78202154 T C N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 78202187 A C N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 78202191 A G N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 78202354 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 78202479 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 78202488 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 78202732 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78202998 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 78203098 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78203154 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78203168 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78203194 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78203208 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78203244 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78203369 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 78203509 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78203510 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78203540 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 78203552 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 78203564 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 78203590 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78203605 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78203647 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78203670 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 78203680 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78203733 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78203773 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78203781 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 78203845 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78203974 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 78204010 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78204017 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78204028 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78204073 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78204167 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78204233 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78204300 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78204490 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78204600 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 78204618 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78204674 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78204784 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 78205059 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78205220 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 78205267 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 78205278 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 78205300 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78205323 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78205324 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78205469 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78205496 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78205513 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78205709 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 78205746 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78205857 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78205915 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 78205953 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 78206283 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78206328 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 78206340 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78206352 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 78206393 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 78206429 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78206447 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 78206478 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 78206901 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78207082 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 78207152 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 78207219 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78207937 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78208702 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78208859 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78209554 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78209773 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 78209943 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 78210639 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78210854 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78211124 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78211634 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 78211837 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78211984 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78212116 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 78212292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78212582 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 78212593 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 78212786 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 78212939 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78212948 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 78214097 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 78214340 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 78214660 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78214814 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78214922 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 78215233 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78217271 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 78217565 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78218042 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78218051 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78219158 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 78219353 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 78219709 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 78219715 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 78219731 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78219798 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78219906 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78220186 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 78220197 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 78220243 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 78220874 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 78220940 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78220977 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78221291 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78221333 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78222435 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78222895 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 78223423 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 78224908 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78225201 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78225304 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 78225646 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78225647 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78225732 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 78225941 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78226069 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78226291 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78226360 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78226430 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78226674 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78226775 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 2 78226807 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78226848 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 78226854 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 78226904 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 78227008 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78227013 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78227040 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 2 78227133 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 78227184 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 78227488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78227545 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 78227598 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78228111 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78228253 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78228788 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 78229222 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 78229320 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 78229488 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78229588 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78229797 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 78229813 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78230243 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78230476 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78230519 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78230549 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 78230587 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78230656 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78230667 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78230784 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 78230982 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78230998 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78231039 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78231044 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78231204 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78231239 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78231437 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 78231971 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78232270 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 78232383 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78232467 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 78232642 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78232815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78232957 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78233360 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78233447 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78234098 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78234159 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 78234281 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 78234375 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78235096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78235554 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 78236199 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 78236704 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 78236718 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78236746 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 2 78236948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78237216 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78237258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78237487 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78237504 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78237510 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78237809 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78238201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78238207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78238212 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78238221 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78238358 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78238476 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78238585 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 78238630 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78238698 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78238949 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78239058 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78239230 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78239443 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78239970 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78240168 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78241653 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78242006 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78242151 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 78242461 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 78243312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78243320 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78245303 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78245320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78245419 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78245526 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 78245666 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 78246186 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 78246715 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78246795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78246937 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78247062 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78247388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78247889 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78248087 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 78249179 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 78249582 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78250022 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78250084 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 78250876 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78251141 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78252464 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78252596 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78253353 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78253461 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78254679 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 78255354 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 78256139 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78256191 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 78256202 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 78256978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78257989 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78258124 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78261364 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78261935 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 78262351 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 78262393 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 78262405 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78262411 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78262444 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78262489 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78262552 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 78262590 G C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 2 78262615 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78262628 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 78262702 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78262814 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 78262856 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 78262876 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 78262889 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 78262896 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78262943 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78262958 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78262968 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78263100 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78263116 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78263144 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78263162 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 78263293 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 78263331 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78263364 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78263382 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78263557 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 78263564 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78263587 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78263601 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78263631 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78263721 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 78263772 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78263854 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 78263955 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78264050 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 78264117 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 78264232 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 78264257 A C Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 78264324 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78264338 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 78264366 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78264428 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78264480 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78264497 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78264723 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 78264738 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 78264803 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 78264912 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 78264957 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78264960 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78264994 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 78265130 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78265193 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78265422 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 78265450 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 78265478 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 78265718 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 78265763 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78265792 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78265926 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 78266001 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78266180 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78266411 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78266566 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78266633 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78266634 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78266777 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78266954 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 78266996 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 78267059 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 78267066 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 78267119 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 78267218 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78267223 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78267255 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78267268 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78267293 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78267299 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78267341 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78267365 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78267491 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78267544 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78267588 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 78267635 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78267674 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78267681 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78268024 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78268258 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 78268346 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 78268366 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78268408 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 78268426 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78268539 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78268628 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78268667 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78268746 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78268969 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 78268982 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 78269085 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 78269213 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 78269220 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 78269325 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 78269327 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 78269362 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 78269401 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 78269700 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78269875 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 78269958 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 78270088 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78270268 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78270373 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 78270388 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 78270431 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 78270441 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78270511 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 78270876 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 78271042 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78271170 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78271258 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 78271308 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 78271325 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 78271337 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 78271358 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 78271431 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 78271443 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 78271593 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 78271628 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78271659 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 78271717 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78271723 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78271773 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78271833 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78271865 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78271894 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78271933 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78272027 A C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 78272190 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 78272273 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 78272313 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 78272388 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 78272553 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 78272793 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78272916 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78273037 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78273071 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78273088 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 78273168 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 78273614 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78273660 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78273693 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78273736 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78273753 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78273782 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78273810 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78273844 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 78273855 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 78273893 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78273925 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78273974 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78274010 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78274113 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78274184 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78274338 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78274363 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78274406 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78274482 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 78275479 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78275610 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78276387 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78276421 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78276447 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78276493 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78276539 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78276616 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78276630 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78276641 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78276667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78276714 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78276730 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78276900 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 78276932 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78276947 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78276987 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78277025 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78277029 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78277071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78277126 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78277130 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 78277288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78277304 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78277316 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78277344 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78277350 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78277376 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78277393 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78277423 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78277445 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78277498 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78277513 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78277609 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78277729 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78277778 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78277786 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78277850 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78277892 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78277925 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78277972 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78278012 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78278042 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78278092 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78278286 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78278399 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78278781 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78278876 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78278921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78278960 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78278975 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78279152 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78279298 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78279813 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 78280431 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78280468 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78280629 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78280662 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78280709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78280721 G C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 78280936 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 78281175 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78281439 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 78281605 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78281915 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 78282017 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78282354 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 78282562 T A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 78282798 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78282800 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 78284481 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78284484 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 78284740 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78285017 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78285185 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78285233 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78285459 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78286347 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78286606 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78286815 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78286859 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78286889 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78286890 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78286998 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78287373 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78287813 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78288768 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 78288826 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 78289048 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 78289052 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 78289098 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78289124 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 78289150 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 78289188 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 78289305 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78289310 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78289383 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78289434 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78289557 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 78289918 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78290062 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 78290309 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 78290437 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78290626 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 78290727 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78290736 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78291334 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78291560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78291593 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78291737 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 78291743 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78291819 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 78291923 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78292196 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78292329 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 78292409 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78292721 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78292872 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 78293506 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78293603 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 78293783 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78294114 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78294128 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78294380 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 78294478 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78294665 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78295252 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 78295694 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78295879 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 78296170 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 78296223 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 78296348 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 78296359 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 78296589 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 78296995 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78297078 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 78297271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78297464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78297775 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78298081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78298590 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78298692 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78298724 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78298787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78298877 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 78298891 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78299055 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78299408 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78299816 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78300004 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 78300522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78300552 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78300788 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78301016 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 78301112 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78301124 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78302187 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 78302533 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78302552 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78302555 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78302658 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78302794 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78302879 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78302886 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78302935 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78303005 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78303122 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78303220 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 78303615 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78303758 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78304030 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78304152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78304194 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78304282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78304290 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 78304385 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78304431 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 78304505 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78304537 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 78304566 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 78304583 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 78304611 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 78304641 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78304782 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78304815 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78304831 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78304912 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78305085 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 78305304 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 78305508 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78305667 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 78305881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78305964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78306009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78306037 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 78306724 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 78306753 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78307199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78307441 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78307536 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78307748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78308496 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78308839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78309148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78309640 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78309687 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78310368 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 78310437 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 78310526 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78310557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78310576 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 78310603 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78310721 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78310868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78311024 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78311046 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 78311052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78311105 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78311175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78311233 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78311407 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 78311446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78311573 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 78312632 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78313351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78313517 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78313957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78314102 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78314924 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78315488 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 78316197 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78316433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78316588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78316980 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78317255 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78317453 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78317873 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78317974 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78318093 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78318171 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 78318845 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78319519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78320087 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78320281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78321040 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78322372 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78322463 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 78322871 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 20 4 10 0 2 2 78323730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78323921 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78324062 T G N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 78324077 C A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 78324242 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78324517 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78324673 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78324762 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78325094 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78325474 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78326024 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78326327 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78326338 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78326547 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 78326563 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78326587 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78327004 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78327151 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78327788 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78327944 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78328055 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78329517 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78329674 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78329742 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 78330040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78330466 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78330487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78330657 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 78330789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78331475 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 78331842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78332222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78332284 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78332376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78332391 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78332419 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78332453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78332509 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78332542 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78332543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78332595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78332685 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78332707 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78332784 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 78332815 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 78333046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78333062 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78333900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78334045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78334214 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78334507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78334661 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 78334737 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78334738 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78334812 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 78334835 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 78335005 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 78335143 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 78335211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78335348 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78335569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78335573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78335700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78335742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78335771 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78335915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78336050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78336109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78336307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78336331 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78336344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78336450 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78336466 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78336487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78336724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78336763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78336786 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78337135 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78337139 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78337358 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78337391 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78337408 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 78337485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78337552 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78337607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78337761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78337833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78337921 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78337948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78338090 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78338153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78338342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78338415 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78338588 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78338677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78338972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78339043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78339217 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78339513 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78339535 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78339986 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78340042 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78340109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78340154 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78340168 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78340169 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78340212 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78340257 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78340271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78340352 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78340384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78340408 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78340409 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78340581 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 78340590 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78340800 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 78340844 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78340903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78340972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78341024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78341030 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 78341287 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 78341294 G A Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 78341360 A C Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 78341453 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78341479 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 78341784 A C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 78341841 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 78341877 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 78342083 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 78342127 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 78342154 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78342718 A T Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 78342747 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 78342755 T A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 78342951 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 78343608 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 78343645 G C Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 78344248 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 78344399 C G Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 78344455 G C Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 78344462 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 78344591 T G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 78344750 A T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 78344783 T G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 78351712 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78351718 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78351817 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 78351885 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78351948 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 78353849 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 78354543 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78354576 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 78354765 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78354795 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78354826 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 78354926 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 78355012 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78355062 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78355103 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78355215 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78355313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78355491 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78355606 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78355764 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78355842 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78355953 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78356071 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78356079 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78356109 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78356128 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78356186 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 78356236 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 78356353 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 78356403 A T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 78356533 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 78356551 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 78356604 A T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 78356614 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 78356627 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 78356817 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 78356862 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 78357055 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 78357073 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78357095 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78357138 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78357157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78357185 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78357233 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78357448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78357485 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78357681 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78357706 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 78357776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78357799 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78357962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78358062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78358087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78358163 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78358164 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78358280 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78358291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78358566 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78358630 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78358820 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 78358856 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 78358956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78359013 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78359125 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78359371 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78359462 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78359561 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78359630 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78359678 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78359824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78359843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78359882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78359901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78360097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78360098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78360145 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78360148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78360193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78360420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78360544 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78360560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78360569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78360961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78360999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78361298 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 78361354 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 78361446 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78361538 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78361660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78361671 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78361825 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78361961 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78362008 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78362054 C G N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 78362174 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 78362201 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 78362309 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78362328 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78362376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78362426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78362612 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78362969 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78363128 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78363189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78363199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78363208 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78363273 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 78363297 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 78363324 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 78363410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78363472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78363578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78363627 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78363690 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78363716 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78364448 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 78364731 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78364828 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78365001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78365093 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 78365359 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78365827 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78365941 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 78366216 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 78366422 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78366716 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 78366874 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 78367107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78367126 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 78367153 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 78367363 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 78367446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78367725 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78367734 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78367893 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 78367906 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78367955 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 78368019 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78368136 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 78368275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78368311 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78368357 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78368435 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 78368451 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78368545 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 78368552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78368615 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78369025 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78369340 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 78369717 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78369812 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78370094 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78370106 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78370421 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78370443 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78370625 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 78370691 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78370718 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78370928 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78370929 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78371126 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78371176 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 78371199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78371524 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 78371687 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 78371790 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78372364 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 2 78372429 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78372712 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 78373022 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 78373103 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 78373158 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78373389 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 78373449 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 78373721 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78373753 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78374061 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 78374428 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78374695 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 78375515 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78375896 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78376563 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78377319 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 78377598 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78377736 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78377869 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78379198 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78379249 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 78379490 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 78379599 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 78380275 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 78380403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78380663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78380998 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78381373 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78381804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78382045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78382061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78384423 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78384544 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 78384565 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 78384609 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 78384738 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 78385146 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 78385194 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 78385509 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 78385795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78385849 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 78385915 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 78386121 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78386814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78387004 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78387392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78387868 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 78387925 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78388473 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 78388482 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78388683 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78389678 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78389846 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 78389901 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78389983 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78390488 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78390609 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 78390825 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78391129 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78391177 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78391202 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78391302 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 78391320 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78391364 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 78391499 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78391584 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78391686 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78391728 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78391748 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78392361 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78392690 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78392755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78392961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78393135 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78393207 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78393213 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78393357 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 78393436 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 78393458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78393614 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78393856 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78393893 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78394162 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 78394214 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78394313 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78394385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78394444 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78394621 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 78394863 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 78394926 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 78394936 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78395506 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78396096 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78396124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78396206 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 78396229 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 78396292 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78396334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78396523 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 78396650 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 78396991 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 78397051 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 78397139 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 78397500 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78397652 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78397900 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78397930 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78397976 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78398039 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78398300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78398478 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 78398748 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 78398811 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 78398861 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 78399046 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 78399275 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 78399305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78399374 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 78399466 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78399867 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78400129 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78400219 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78400250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78400298 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78400641 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78400658 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78400677 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78400688 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78401170 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 78401460 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78401496 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78401514 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78401544 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78401649 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78401689 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78402199 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78403006 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78403344 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78403544 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 78403556 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78403589 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 78403815 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78403907 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78404036 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78404413 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78404442 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78404523 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78404550 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 78404594 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 78404619 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 78404692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78404693 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 78405040 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78405062 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78405151 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 78405291 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 78405305 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78405335 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78405349 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78405396 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78405401 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78405466 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78405571 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78405592 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 78405631 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78405686 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78405763 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 78405802 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 78405945 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 78406093 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 78406139 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78406141 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78406425 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78406667 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78407016 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 78407154 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 78407176 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 78407477 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 78407506 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78407566 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 78407728 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 78407802 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78407902 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 78408018 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78408019 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78408044 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 78408171 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 78408309 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78408369 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78408420 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78408460 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78408793 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 78408897 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 78409110 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 78409295 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78409310 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78409328 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 78409339 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78409343 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 78409400 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 78409431 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78409509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78409645 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78409722 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 78409744 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78409769 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 78409823 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78409846 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78409917 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78409945 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78409986 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 78410011 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78410151 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78410283 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78410294 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78410324 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78410392 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78410410 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78410439 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78410475 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78410623 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 78410640 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 78410786 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78411180 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78411251 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 78411294 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78411384 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 78411442 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 78411476 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 78411565 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 78411691 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78411763 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78411977 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78412055 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78412180 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78412206 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78412370 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78412439 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 78412454 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 78412466 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 78413983 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78414006 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 78414077 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78414256 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78414336 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78414349 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 78414426 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 78414760 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78414889 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78415087 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78415139 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78415859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78415901 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 78415981 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 78416067 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78416126 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 78416160 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78416177 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 78416205 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 78416226 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 78416239 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78416295 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78416328 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78416426 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 78416589 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 78416615 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 78416636 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78416653 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 78416769 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78416793 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78416829 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78416844 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78416849 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 78416865 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78416895 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78416920 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78417079 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78417531 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78417575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78417611 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78417630 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 78418260 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 78418275 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 78418387 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 78418486 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78418568 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78418681 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78418754 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 78418758 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78418812 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78418814 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78418865 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78418887 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78419059 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78419210 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 78419390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78419604 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 78419661 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 78419735 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 78419750 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 78419786 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 78419816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78419856 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 78419916 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78419921 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78420046 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78420449 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 78420483 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78420505 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78420520 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 78420604 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78420607 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78420709 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78420742 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78420766 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 78420874 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 78420963 A T N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 78421126 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 78421171 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 78421287 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 78421391 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 78421478 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78421554 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 78421632 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 78421998 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 78422360 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 78423311 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78423782 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78424061 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 78424208 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 78424327 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 78424467 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78424609 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 78424779 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 78424872 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78424996 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78425053 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78425263 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 78425295 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78425302 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78425314 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78425324 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 78425350 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78425423 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78425441 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78425615 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78426035 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78426428 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 78427518 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 78427963 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 78428403 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 78428940 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 2 78428996 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 78429091 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 78430252 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78430897 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 78430982 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 78431012 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78431036 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78431293 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78431494 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78431515 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78431518 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78431746 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 78431761 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 78432049 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 78432071 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 78432188 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78432209 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78432245 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78432255 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78432352 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78432371 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78432376 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 78432400 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 78432467 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78432546 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78432705 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78432710 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78432719 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78432811 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 78432841 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 78433098 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 78433184 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 78433238 T C N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 2 78433282 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 78433363 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 78433368 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 78433404 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 78433592 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78433600 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78433613 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 78433624 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78433702 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78433720 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 78433787 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 78434010 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 78434205 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 78434383 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78434474 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78434497 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78434524 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78434553 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78434574 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78434584 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78434600 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 78434641 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78434726 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78434839 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78434872 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78435268 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 78435368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78435398 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 78435453 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 78435840 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 78436157 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 78436245 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78436544 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78436641 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78436656 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 78436765 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78436881 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78436915 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78436959 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78437023 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 78437025 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78437041 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78437107 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78437193 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78437233 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 78437293 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78437301 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78437891 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78437902 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78437919 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78437925 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78438100 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 78438126 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78438138 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78438156 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78438215 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 78438236 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78438243 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78438387 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 78438479 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78438490 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78438536 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78438542 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78438551 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78438564 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 78438576 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78438590 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 78438768 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 78438816 G T N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 78439054 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 78439174 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78439186 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 78439200 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78439343 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 78439352 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78439448 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 78440007 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 78440041 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78440052 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78440292 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78440465 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 78440485 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78440532 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78440646 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 78440802 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78441065 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 78441476 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 78441612 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78441676 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 78442305 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 78442344 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78442933 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78443020 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78443048 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78443142 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 78443167 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78443609 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 78443639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78443917 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 78443919 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 78443950 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78444008 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78444337 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 78444427 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78444464 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 78444693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78444789 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78444868 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78445146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78445681 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78446950 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78447088 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78447116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78447822 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78448893 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78449135 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 78449427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78449688 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 78449700 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 78449906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78450037 G T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 78450076 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 78450166 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 2 78450335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78450482 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78451441 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 78452824 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78453033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78453597 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 78453623 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78453651 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78455046 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78455105 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78455773 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78455883 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78464441 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78465289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78465321 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78465490 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78465708 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 78466168 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78467790 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 78467828 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78468289 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78468555 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78469332 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 78469333 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 78469378 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78469653 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 78469965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78470133 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78470170 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78470498 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 78471171 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 78472390 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 78472701 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78472714 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 78472732 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78472749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78473034 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78473073 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78474942 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 78475463 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 78475501 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 78475506 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 78475569 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 78475624 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78475755 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 78475792 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78475810 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 78475831 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 78475874 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 78476105 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78476162 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 78476165 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 78476244 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78476295 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78476312 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78476400 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 78476481 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 78476567 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 78476591 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 78477795 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78477806 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78478586 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78479169 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78479188 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78479646 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78480545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78480635 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78480679 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78480833 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 78480911 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 78481047 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 2 78481116 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 78481209 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 78481216 C T Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 78481310 G A Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 2 78481334 A C Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 2 78481351 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 78481369 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 78481518 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78481831 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 78481909 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78482063 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 78482238 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 78482252 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 78482912 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 78482966 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 78483592 G A Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.4 0 0.6 8 12 4 0 6 2 78483593 C A Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 78483756 T C Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 2 78484183 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 78484338 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 78484477 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 78484563 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 2 78484738 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 2 78484985 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 78485047 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 78485205 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 2 78485797 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 78486252 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 2 78486321 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 78486393 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 78486529 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 78486622 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 78486664 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78486684 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 78486836 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 78486886 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 78486921 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78487003 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 78487147 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 78487150 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 78487204 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 78487223 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 78487229 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 78487265 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78487295 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 78487306 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 78487327 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 78487363 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 78487367 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 78487451 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78487564 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 78487628 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 78487728 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78487745 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78487752 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78487798 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 78487965 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 78488056 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 78488225 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78488493 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78488736 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 78488808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78488862 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78489125 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78489276 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78489352 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78489514 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78489539 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78489612 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78489625 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78489658 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78489696 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78489747 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78489892 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78490212 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78490303 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78490489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78490557 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78490978 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78491065 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78491312 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78492086 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78492723 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78492903 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78493044 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78493176 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78493428 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78493449 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78493504 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78493679 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78493817 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 78493949 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78494062 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78494065 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78494095 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78494201 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78494304 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78494350 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78494376 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78494482 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78494630 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 78495148 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 78495154 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78495219 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 78495319 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78495344 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78496123 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78496280 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 78496473 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78497558 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78497570 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78498756 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 78499154 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78509096 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 78510135 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78510235 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78510467 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78510858 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78511288 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 78511390 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78513200 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78514081 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78515482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78515790 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78516400 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78516976 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78517540 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78518103 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78518247 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78519922 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 78520435 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78520618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78522099 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 78522284 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 78522297 T C Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 78522594 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78523141 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 78523276 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78524069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78526203 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78527347 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78527823 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78527832 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78528324 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78528352 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78528468 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78528498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78528673 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78529888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78529919 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78530890 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 78530936 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 2 78530937 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 78531378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78531594 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78532879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78532922 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78533044 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78533737 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78533955 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 78535203 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78535247 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78535560 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78535627 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78536232 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78537208 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78537441 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78538574 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 78538722 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 78538928 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 78538934 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 78538986 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78539209 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78539222 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78539386 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78539448 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78539488 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 78539612 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78539627 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78539678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78539698 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78539734 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78540283 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78540841 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78541123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78542477 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78542843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78542914 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78543017 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78543237 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78543338 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78543458 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78543490 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78543709 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78543873 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78543955 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78544237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78544637 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78545463 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 78545580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78545657 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 78545671 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78545733 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 78545736 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78545778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78545816 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78546218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78546505 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 78546706 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78547934 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 78547985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78548178 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78548271 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78548708 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78548791 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 78548797 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78548924 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78549680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78550650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78550845 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78551212 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78551241 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 78551628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78551871 G C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 78552597 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78553533 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 78554023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78554328 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 78555206 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78555480 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 78555588 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78555674 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78555707 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78555733 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78555788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78555803 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78555881 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78555896 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78555903 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78556067 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78556461 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78556471 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78556760 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 78557154 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 78557180 A C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 78557281 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 78557342 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 78557616 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78557880 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78557991 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78559687 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 78561264 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78561477 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78561987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78562383 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78562627 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78562917 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 78563038 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78563239 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78563756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78564108 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78564239 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78564918 A T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 78566558 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78566603 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78566670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78567669 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78568228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78569178 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78569897 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78570019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78570055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78570527 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78570612 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78571345 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 78571755 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78572230 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78572682 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78572814 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 78572850 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78574657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78575643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78575689 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 78575805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78575941 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78577603 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 78578177 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 78578314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78578358 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78578372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78578376 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 78578399 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78578594 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78578762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78578898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78578971 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 78579135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78579172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78579200 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78579234 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78579349 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78579429 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78579447 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 78579532 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 78579771 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 78579828 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78579973 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78581063 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 78581524 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 78581563 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 78581633 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78581685 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78581945 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78581961 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78582014 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78582108 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 78582381 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78582791 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78582896 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 78583247 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78583433 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 78583553 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78583777 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78584354 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 2 78584609 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 2 78584671 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78584764 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78585207 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 78585250 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78585252 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 78585803 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 78585862 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78585923 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78585965 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78585973 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78586249 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 78586302 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78586720 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78588718 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78589554 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78590110 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78590318 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78590319 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78591610 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78591747 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78592754 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78592970 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78592971 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78593040 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78594803 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 78594851 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78594939 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78595135 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78595232 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 78595420 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78595603 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78595882 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 78595926 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78596102 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 78596343 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78596481 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78596606 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78596966 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78597283 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 78598148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78598819 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78599045 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 78601429 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78601581 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78601707 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78602869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78602870 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78604162 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78604477 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78605134 T C Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 78605594 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78606209 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 78606701 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78607285 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 78607712 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78608275 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78608901 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 78608936 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78610420 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78613458 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 78613492 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78614019 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78615051 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78618646 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78619045 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78620594 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78621156 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 78623012 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 78623033 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78625793 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 78625863 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 78625994 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78626134 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 78626172 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78626197 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78626729 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78627005 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 78627261 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 78627275 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 78627513 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 78628441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78628986 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78629371 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78629403 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 78629525 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78629531 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78629545 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 78629665 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78629776 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78629826 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 78630189 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 78630191 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 78630435 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 78630449 T A N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 78630484 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 78630535 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 78630551 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78630607 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78630662 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78630693 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78630729 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 78630750 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78630838 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 78631058 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78631087 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 78631099 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78631308 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78631423 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 78631687 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78631697 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 78631704 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 78631772 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78631774 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 78631791 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78631883 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78631931 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 78632025 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 78632033 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 78632046 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 78632063 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78632174 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78632292 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78632392 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 78632413 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78632419 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78632650 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78632782 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78632805 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78633779 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78633800 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 78633869 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78634009 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 78634127 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78634161 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78634234 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 78634426 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78634576 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78634647 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 78634708 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78634756 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78635252 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78635263 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78637915 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78639333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78639721 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 78643210 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78643401 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78647099 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78647334 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78647575 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78648239 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78648815 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 78649871 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 2 78650129 T C Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 78650314 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 78650618 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78652195 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 78652388 A C Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 78652389 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78652622 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 78652668 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 78652678 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78652690 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78652761 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 78652786 A G Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 78653966 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78654080 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78656001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78657004 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 78658537 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78659142 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78660353 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 78660421 A T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 78660489 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 78661847 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78662213 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78664627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78664870 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78667367 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78668687 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78668983 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 78674432 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78675419 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 78676068 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 2 78676485 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 78678220 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78678846 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 78678967 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78680142 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 78680443 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78681092 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78681776 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78682350 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78685031 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 78685617 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 78688401 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78688774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78689317 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78689338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78689353 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78689411 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78690197 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78691048 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 78692246 A C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 78692325 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78692707 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78692712 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78692853 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78692930 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 78693724 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78694050 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 78694074 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78694513 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78694559 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78694577 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78694629 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78695525 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78695557 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78695608 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78695615 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78695700 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78695817 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78695873 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78696081 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 78696159 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 78696778 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78697000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78697195 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 78697247 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 78697260 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 78697514 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78697522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78698020 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78698617 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 78698700 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 78698947 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78698957 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78699098 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 78699111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78699139 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78699218 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 78699235 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 78700143 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78700338 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 78700438 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78700640 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78700873 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78701423 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 78701497 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78701515 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78701555 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78701752 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78701789 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78701896 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 78701918 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78701972 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78702030 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78702252 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78702406 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 78702651 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78702660 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 78702723 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 78702996 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 78702999 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 78703147 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 78703251 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78703378 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 78703525 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78703605 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78703684 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78705292 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78705394 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78705821 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78706122 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78706485 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 78706626 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78706738 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 78706813 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 78707075 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78707320 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78707702 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78707849 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78707903 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78708258 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 78708275 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78708587 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78710206 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 78711172 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78711392 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78711694 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78712168 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 78712950 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78715485 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 78715901 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78717915 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78718130 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 78718409 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78718497 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78718504 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78718631 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78719142 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78719876 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 78720489 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 78720630 G A Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 78721163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78722036 C G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 78722699 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78724700 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78724853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78726066 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78726458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78727341 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 78727549 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78727552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78727816 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78727849 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78728621 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 78728627 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78728746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78729451 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 78729725 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78730547 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78731256 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78731743 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 78731833 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 78731872 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 78731877 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 78732205 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 78732213 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78732779 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 78733034 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 78733860 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78734027 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 78734100 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78734725 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 78734924 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78734944 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78735324 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 78735583 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78735867 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78736676 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 78737087 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78738038 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78739703 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78739769 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 78740115 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78740626 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78741126 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 78741272 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78741876 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78742089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78742292 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78743224 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78743259 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78743822 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78743846 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78743892 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78744112 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78744285 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78744358 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78744470 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78745158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78745234 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 78745765 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78746700 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 78746726 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78747154 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78747668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78748032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78748126 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78748428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78748751 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78748786 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78749240 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 78749340 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78749970 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78750120 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 78750735 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 78751017 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78751465 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78751961 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78751965 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78752333 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78752637 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78752707 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 78752808 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78753261 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78753708 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78754377 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78754584 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 78754658 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78755110 C G Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 78755411 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 78755554 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78755736 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78755781 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78755944 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78756234 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78756370 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78756466 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78756472 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78756842 T A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 78757287 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78757463 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 78758117 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 78758139 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78758162 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78758172 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78758299 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78758328 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 78758329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78758677 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78758759 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78759162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78759483 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 78761500 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 78761538 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 78761570 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 78761592 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 78762935 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78763245 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 78763260 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78763794 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 78763970 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 78764213 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78766461 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78766573 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78766871 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 78767804 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78768971 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78769587 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 78769787 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78770789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78771224 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 78771605 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78771635 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78771847 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78771875 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78771992 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78772121 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 78772239 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 78773172 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 78773338 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78773498 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78773618 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 78774387 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78774542 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78774588 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 78774706 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78774713 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78774891 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78774911 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78774918 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78774940 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78775013 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 78775114 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78775185 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78775246 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 78775399 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78775402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78775709 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 78776241 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 78776658 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 78776768 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 78777371 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78777589 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78778043 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 78778381 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78778683 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 78778947 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78779306 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 78779742 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78779863 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 78779915 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78779938 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 78779940 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 78780096 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78780144 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 78780246 T A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 78780371 C A N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 78780379 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 78780391 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 78780488 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 78780588 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 78780608 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78780659 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78780721 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 78780823 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78780916 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78780970 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78780987 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78781007 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78781041 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78781062 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 78781118 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78781144 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78781183 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78781200 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78781314 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 78781401 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 78781411 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 78781560 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 78781567 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78781607 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78781712 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78781996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78782027 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.235294117647059 0.0588235294117647 0.705882352941177 9 25 4 1 12 2 78782076 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78782154 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 78782172 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 78782211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78782227 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 78782247 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 2 78782291 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.3125 0.0625 0.625 11 21 5 1 10 2 78782313 T G Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.294117647058824 0.0588235294117647 0.647058823529412 11 23 5 1 11 2 78782388 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 78782401 A T Y N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.461538461538462 13 13 6 1 6 2 78782421 T C Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.307692307692308 0.0769230769230769 0.615384615384615 9 17 4 1 8 2 78782568 C A Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 2 78782594 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 78782658 A C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 78782713 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 78782716 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 78782747 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 78782844 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 78782896 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 2 78782916 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 78782944 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 78783436 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 2 78783528 A C N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 2 78783681 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78783897 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 78784770 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 78784900 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78785048 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 78785435 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 78785836 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 78785895 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 78785908 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 78786199 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 78786258 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 2 78786297 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 78786441 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 2 78787100 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78787240 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 78787603 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 78788093 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78788133 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78788215 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 78795448 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78795671 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78795891 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78797426 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 78798026 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78798492 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78799474 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 78800313 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 78800606 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 78800671 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78800924 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 78801623 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78801793 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78801829 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 78801841 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 78801911 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 78802046 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 78802424 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 78803032 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 78803215 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 78803261 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 78803466 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 78803504 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 78803591 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 78803627 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78803638 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 78803656 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 78803667 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78803722 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 78804274 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78804397 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78804629 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78804789 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 78804887 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 78804932 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78804948 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78804968 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78804980 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78805050 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78806389 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 78806683 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78806885 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 78807036 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 78807133 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78807135 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78807217 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 78807237 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78807311 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 78807391 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78807466 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78807477 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78807512 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78807576 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 78807682 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 78807696 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78807724 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 78807829 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 78808084 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78808137 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 78808197 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 2 78808372 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78808389 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 78808483 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 78808557 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 78808813 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78808852 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78808905 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78808919 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 78809081 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78809227 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78809317 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 78809488 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78809526 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78809538 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78809830 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 78810213 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 78810854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78810863 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 78811080 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 78811111 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 78811135 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 78811147 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 78811182 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78811212 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78811269 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 78811351 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78811818 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78811842 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 78812086 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 78812463 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 78812476 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78812559 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 78812990 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 78813012 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 78813651 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 78813708 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 78814225 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78814340 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78814344 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 78814441 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 78814538 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78814539 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78814557 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 78814574 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78814607 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 78814634 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 78814652 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78814689 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 78814807 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 78814853 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78814980 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 78815011 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78815260 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78815350 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 78815401 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78815452 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 78815613 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 78815695 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 78815915 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 78816021 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 78816108 T G Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 78816263 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78816296 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78816593 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 78816680 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 2 78816687 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 78816726 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 78816763 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78816776 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78816788 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78816932 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 78816983 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 78817008 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 78817190 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78817297 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 78817428 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 78817506 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 78817557 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 78817603 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 78817627 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78817827 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 78817865 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 78818087 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 78818180 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78818300 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78818401 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78818471 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 78818481 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78818499 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78818508 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78818528 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78818654 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 78818665 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 78818763 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 78818820 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 78818899 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 78818955 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 78819088 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 78819193 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 78819320 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78819328 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78819351 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 78819374 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78819381 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78819527 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78819620 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78819678 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78819755 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 78819801 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78819822 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78819856 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78819869 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78819882 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78819888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 78819930 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78820020 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 78820131 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 78820197 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 78820254 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 78820256 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 78820268 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 78820274 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78820356 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 78820415 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78820650 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 78820898 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78820901 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78820909 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78820917 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 78821107 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 78821171 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78821465 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 78821586 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 78821646 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 78821800 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 78822018 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 78822069 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78822124 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 78822225 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 78822250 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78822287 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 78822463 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 78822585 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 78822600 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78822656 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 78822681 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78822736 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 78822839 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 78822924 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78822976 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78822988 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 78823130 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 78823174 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 78823378 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 78823403 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78823418 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78823449 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78823632 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78823801 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78824028 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 78824231 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78824239 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78824323 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78824355 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78824399 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 78824415 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78824442 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 78824871 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 78824887 G C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 78824890 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 78825008 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 78825737 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78825994 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78826484 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78826560 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78826577 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 78827088 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78827109 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78827404 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78827501 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78827544 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 78827570 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 78827768 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 78827861 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78827870 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78828021 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78828232 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78828314 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78828346 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78828495 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 78828539 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 78828592 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78828637 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78828726 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 78828945 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78829037 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78829063 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 78829079 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78829084 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78829128 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 78829183 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78829232 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78829312 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78829325 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78829449 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78829627 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78829798 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78830047 G C Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 78830202 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 78830485 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 78830545 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 78830578 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 78830584 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 78830681 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 78830816 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78830904 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78830923 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78830977 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78831074 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78831304 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78831437 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 78831471 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 78831556 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78831565 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 78831586 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 78831682 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 78831711 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 78831849 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 78831953 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 78832007 C A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 78832098 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 78832172 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 78832187 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 78832192 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 78832248 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 78832360 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 78832474 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 78832525 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 78832537 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 78832677 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78833035 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 78833050 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78833073 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78833201 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78833537 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78833697 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78833698 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78833838 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78833894 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 78833926 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 78833950 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 78833993 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 78834068 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78834073 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78834090 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78834097 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78834197 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 78834314 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 78834398 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78834498 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 78834502 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78834604 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78835008 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78835272 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 78835349 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78835393 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 78835426 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 78835455 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78835496 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 78835527 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 78835528 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78835542 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 78835621 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78835622 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78835662 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 78835731 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 78836172 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78836219 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 78836220 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78836314 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 78836538 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78836606 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 78836809 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 78836943 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 78837015 C G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 78837069 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78837270 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78837304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78837361 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78838919 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 78839102 A C Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 78839185 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78839225 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 78839331 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78839434 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78839544 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78839786 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78839831 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 78839858 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78839883 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78839885 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 78839948 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 78840077 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78840127 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78840130 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78840183 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78840199 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78840229 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78840299 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78840405 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78840445 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78840456 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78840477 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 78840637 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78840638 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78840652 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 78840657 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 78840673 C A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 78840750 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 78840762 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 78840766 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 78840805 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78840812 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78840837 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78840852 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78840876 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 78840910 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78841067 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78841146 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78841147 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78841164 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 78841165 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 78841291 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78841322 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 78841324 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 78841524 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 78841621 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78841668 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78841716 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 78841717 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78841785 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 78841853 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78841868 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78841869 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78842167 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 78842223 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78842244 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78842250 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78842321 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 78842498 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 78842499 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 78842641 T A N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 78842693 A C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 78842739 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 78842798 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 78842944 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 78842958 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78843070 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 78843087 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 78843092 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 78843179 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 78843438 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78843577 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78843761 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 78843903 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 78844083 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 78844092 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 78844140 T G Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 78844365 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 78844409 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78844437 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 78844494 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78844502 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78844531 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 78844628 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 78844647 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78844697 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78844700 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78844761 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78844790 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78844818 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78844890 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 78844906 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78844945 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78844953 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78844968 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78844982 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78845038 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78845051 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78845152 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78845246 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78845406 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 78845676 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78845759 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78845792 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78845825 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78845836 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78845862 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 78845945 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78846052 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78847033 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78847220 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78847328 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78847524 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 78847673 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78847712 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 78847753 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 78848095 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 78848605 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 78848749 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78848810 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78849163 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78849297 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 78850843 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78851026 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78851323 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78851416 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78851435 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78851468 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78851476 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78851790 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78851896 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78851911 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 78851939 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78852505 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78852609 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78852848 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78852930 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78852949 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78852984 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78853013 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78853043 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78853096 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 78853097 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 78853217 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 78853332 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78853734 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78853833 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78853893 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78853964 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78853995 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78854126 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78854138 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78854224 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 78854307 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78855045 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 78855197 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78855238 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78855366 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 78855428 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78855450 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78855622 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 78855676 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78855806 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 78855839 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78855866 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78855943 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 78856041 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 78856053 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 78856135 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78856154 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78856180 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78856208 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78856279 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 78856311 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78856371 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 78856375 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78856479 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 78856489 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 78856545 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 78856580 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78856611 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78856669 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78856693 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 78856694 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 78856713 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78856715 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78856753 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 78856755 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78856880 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78856893 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 78856906 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 78856912 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 78856938 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78857013 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78857048 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78857065 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78857101 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78857124 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78857213 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78857250 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78857280 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78857360 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78857394 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78857477 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78857478 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78857572 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78857685 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 78857704 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78857713 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 78857722 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78857772 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78858358 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78858659 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78858733 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78858763 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78858968 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78859107 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78859197 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78859235 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78859236 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78859369 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78859490 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78859553 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78859594 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78859650 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78859783 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78860013 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78860099 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78860130 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78860155 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78860328 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 78860333 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78860363 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 78860404 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78860725 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78860781 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 78860840 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 78860879 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 78861005 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78861077 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 78861120 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78861138 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78861139 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78861519 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78861565 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78861589 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 78861725 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 78861739 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78861772 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 78862571 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78862601 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 78862603 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78862622 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78862947 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 78862983 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78863100 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78863114 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78863129 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 78863180 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78863213 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78863384 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78863420 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 78863433 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 78863461 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78863945 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 78864004 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 78864156 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 78864213 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78864317 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78864685 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78864769 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 78864798 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78865201 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78865333 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 78865419 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78865516 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 78865708 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 78865921 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78866020 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78866921 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78867014 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 78867131 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78867153 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 78867186 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78867192 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78867417 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78867742 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 78867879 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 78867963 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 78868059 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78868107 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 78868186 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 78868225 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 78868315 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78868329 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78868336 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78868372 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78868384 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 78868675 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 78868900 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78868907 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 78868921 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 78868999 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 78869566 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78869809 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 78869844 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 78869927 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78870077 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 78870085 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78870111 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 78870133 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 78870156 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 78870314 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 78870366 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 78870410 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 78870528 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 78870593 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 78870658 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 78870799 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 78870876 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 78870892 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 78870996 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 78871012 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 78871033 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 78871375 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78871509 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78871776 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78871852 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 78872064 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 78872430 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78872481 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78872507 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 2 78872512 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78872519 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78872642 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78872720 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 78872732 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78872921 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78872997 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78873377 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78873572 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78873798 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78873946 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78873987 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78874069 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78874162 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78874171 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78874204 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78874220 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78874274 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78874410 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 78874413 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 78874483 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78874652 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78875365 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78875965 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78876422 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78876844 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78876989 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 78877779 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 78878196 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78878922 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78879014 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78879025 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78879143 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78879212 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 78879217 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 78879250 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78879333 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 78880527 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 78881000 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 78881227 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78881248 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78881382 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 78881550 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 78881616 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 78881646 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 78881711 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 78881767 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78881949 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 78881980 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78882090 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 78882175 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78882185 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 78882440 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 78882530 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 78882752 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 78882918 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 78883012 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 78883280 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 78883491 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78883572 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 78883688 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78883714 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78883774 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 78883783 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 78883907 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 78883987 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78884002 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78884101 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78884160 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78884240 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 78884364 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 78884488 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 78884537 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 78884665 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 78884682 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78884702 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 78884723 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78884740 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78884881 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78885069 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78885395 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 78885581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78885636 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78885643 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78885706 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78885752 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 78885787 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78885791 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 78885799 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 78885817 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 78885871 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78885875 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 78885925 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 78886157 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78886213 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78886224 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78886357 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78886416 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 78886437 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78886453 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 78886752 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 78886806 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 78886835 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 78886966 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 78887160 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 78887161 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 78887339 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 78887535 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 78887628 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 78887754 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 78888955 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 78888963 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 78889124 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 78889151 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 78889526 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78889602 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78889654 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 78889814 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78890002 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 78890154 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78890280 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78891417 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78891437 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 78891655 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78891734 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 78891804 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78892208 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78892211 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78892254 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78892344 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 78892587 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78892648 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78892662 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78892673 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78892712 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78892796 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78893130 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 78893138 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78893154 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 78893371 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78893485 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78893729 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 78893747 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78893893 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 78893974 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78893984 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78893997 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78894017 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78894085 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 78894124 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 78894177 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 78894237 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78894253 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78894287 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78894309 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78894322 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78894510 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 78894554 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 78894665 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 78894771 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78894775 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78894851 T A Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 78894864 A C Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 78894915 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 78894928 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 78894952 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78895092 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 78895101 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78895118 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 78895204 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78895212 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 78895349 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 78895450 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 78895474 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78895650 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78895739 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 78895763 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 78895831 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78895943 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78896170 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 78896477 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78896705 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78896969 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 78897081 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78897100 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78897171 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78897189 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78897200 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78897543 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 78897705 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78897752 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78898199 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78898365 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78898385 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78898919 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78898934 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78899018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78899227 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78899275 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78899522 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78900192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78900402 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78900606 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78900613 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78900790 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78900853 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 78901429 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78901493 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78901519 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78901532 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78901544 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78901621 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78901934 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78902250 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78902270 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78902365 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78903089 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 78903267 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78903888 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78904297 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 78905357 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78905754 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 78906183 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 78906195 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 78906314 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78906379 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78906629 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 78906654 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 78907101 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 78907443 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 78907454 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78907669 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 78907893 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 78907903 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 78907914 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78907983 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 78907985 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 78908070 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 78908126 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 78908146 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 78908213 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 78908217 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 78910496 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 78910872 G A Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 78911256 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 78911270 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 78911508 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 78911640 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78911666 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 78912032 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78912042 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 78912237 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78912276 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78912280 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78912587 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78912679 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 78912809 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78912969 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 78913017 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78913074 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 78913507 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 78913796 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78914699 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78914791 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 78915266 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78915329 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.294117647058824 0.0588235294117647 0.647058823529412 11 23 5 1 11 2 78915432 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78915446 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 78915538 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78915540 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 78915643 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 78916000 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 78916363 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78916556 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78916584 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78916668 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78917430 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 2 78917507 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 78917632 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 2 78917829 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78918924 A C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 78918925 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 78918977 A C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 78918983 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 78919021 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 78919066 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 78919090 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 78919462 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78919475 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 78919491 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 78919631 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78919685 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 78919699 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 78919978 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 78920453 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78920613 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 78920807 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 78920849 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78920851 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78920866 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78921006 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78921389 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 78921408 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 78921409 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78921490 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 78921529 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 78921532 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 78921569 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78921831 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78923813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78923934 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 78924187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78924707 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 78925955 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78925963 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 78926534 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78926690 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78927568 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78927762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78928852 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78929152 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78931868 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78932862 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78933882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78934148 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78934350 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78934480 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 78934595 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 78935055 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 78935665 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78936049 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 78936085 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78936462 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78936505 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78936551 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78936644 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 78936662 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 78936754 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 78936777 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78936919 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78936936 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78936988 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 78936995 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 78937152 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 78937179 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78937380 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 78937426 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 78937477 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 78937557 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 78937572 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 78937613 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 78937654 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 78937726 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78938019 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 78938309 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 78938348 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 78938682 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 78938737 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78938792 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78938819 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78938852 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 78938986 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 78939125 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 78939225 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 78939320 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 78939660 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 78939758 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78939785 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78939814 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 78939871 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78939907 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78939954 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78939974 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 78940013 T G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 78940314 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 78940361 A C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 78940393 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 78940406 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 78940512 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 78940789 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 78940828 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 78940872 G C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 78940916 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78941069 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78941592 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 78941830 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 78941874 A C Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 78942500 T G Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 78942521 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 78942800 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 78942898 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 78942946 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 78943024 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 78943058 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 78943115 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78943255 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 78943369 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78943381 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78943409 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 78943460 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 78943545 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 78943658 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 78943797 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 78943891 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 78944037 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78944201 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78944409 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 78944985 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78945367 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 78945382 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78945486 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78946119 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78946207 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78946530 G A Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 78947418 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78947419 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78947689 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78947769 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78947801 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78947832 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78947844 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78948079 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 78948195 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78948260 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78948333 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 78949124 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 78949411 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78949759 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78950333 C A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 78950360 G T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 78950562 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 78950623 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78950772 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 78950906 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78950916 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78950919 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78950936 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 78950976 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78950999 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78951031 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 78951170 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 78951464 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78951490 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78951496 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78951521 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78951649 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78951696 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78951728 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78951749 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78951821 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78951827 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 78951869 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78951922 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78951934 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78951935 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952048 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78952129 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952186 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952191 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952218 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952237 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952254 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952310 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952327 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952371 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952391 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952478 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 78952489 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78952622 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78952656 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952679 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952684 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78952875 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78953006 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953055 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953056 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953117 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953147 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78953248 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953381 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953435 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78953566 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953569 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78953596 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953617 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953694 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953698 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953732 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953749 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953789 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78953802 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 78953817 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78954003 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78954006 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78954074 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 78954118 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78954313 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78954323 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78954353 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78954360 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78954521 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 78954551 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78954563 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78954566 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 78954648 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78954857 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78954873 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78955213 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78955266 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78955345 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 78956537 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78959414 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78960875 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78961420 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78961529 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78961536 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78961695 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78961760 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 78961837 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78962135 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78962209 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78962237 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78962270 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 78962459 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 78962528 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 78962549 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 78962584 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78962867 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 78962872 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78963015 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 78963429 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 78963447 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 78963532 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78963635 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 78963643 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 78963893 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 78963955 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 78963971 C T Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 78965250 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 78965251 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 78965445 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78965712 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 78965993 A G N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 78966055 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 78966322 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 78966384 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78966741 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78966913 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78966989 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78967010 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 78967124 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 78967167 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78967315 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 78967963 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 78968447 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 78969546 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78969815 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78969988 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 78970255 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 78970571 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78970674 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78970689 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78970694 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78971003 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78971058 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 78971413 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 78971681 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 78971761 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 78971810 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 78971833 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 78971902 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 78971993 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78972041 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78972240 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 78972260 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78972316 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78972434 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78972473 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78972500 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78972619 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 78972678 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 78972890 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 78972948 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 78973449 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 78973460 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 78973491 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 78973494 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 78973688 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 78973800 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 78973928 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 78976378 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 78976547 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 78976582 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 78976794 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 78976821 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 78976890 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 78976967 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 78977133 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 78977160 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 78977174 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 78977182 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78977753 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78977764 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78978549 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 78978607 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 78978705 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78978820 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78978895 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 78979053 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78979088 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78979192 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78979249 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 78979424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 78979607 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 78979617 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 78979678 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 78979704 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 78979762 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 78980293 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 78980845 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 78980956 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78981107 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 78981621 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 78982224 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 78982239 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78982394 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 78982699 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 78983005 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 78983059 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78983196 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 78983218 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 78983555 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 78983594 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 78983869 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78984458 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 78985587 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 78986557 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 78987142 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78987360 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 78987384 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78987388 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 78987470 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 78988264 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78988286 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78988340 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78988515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78988694 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78988926 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78988937 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78988980 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78988983 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 78989102 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 78989320 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78989461 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 78989606 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78989624 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 78989745 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 78989861 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78989862 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78989883 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 78989981 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78989982 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 78990107 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78990119 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 78990124 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 78990355 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 78990487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78990490 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 78990631 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78990653 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 78990655 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 78990788 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 78990812 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 78990910 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78991007 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 78991119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78991254 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78991327 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 78991360 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 78991406 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 78991428 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 78991519 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 78991529 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 78991550 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 78991559 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 78991750 T G N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 78991826 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 78991872 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 78991902 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78991916 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 78991952 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78992088 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 78992147 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 78992241 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78993172 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78993242 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78993408 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78993430 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78993439 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 78993559 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 78993792 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 78993844 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 78993927 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 78993936 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 78993976 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 78994056 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 78994130 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 78994155 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78994172 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 78994249 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78994274 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 78994328 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78994609 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 78994632 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78994633 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 78994744 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 78994777 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 78994834 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78994842 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 78994889 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 78994965 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 78995054 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 78995110 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 78995655 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 78995702 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78995882 A C N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 78995916 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 78995917 T A Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 78995999 A G N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 78996069 G C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 78996207 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 78996255 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 78996528 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 78996559 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 78996686 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 78996739 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 78996913 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 78996985 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 78996997 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 78997276 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 78997514 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.0833333333333333 0.75 0.166666666666667 11 13 1 9 2 2 78997781 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 78998223 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78998339 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 78998522 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78998531 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78999173 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78999245 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 78999262 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78999278 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 78999287 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78999313 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 78999345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78999415 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78999593 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78999611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78999677 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 78999727 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79000172 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79000183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79000197 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79000200 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79000268 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79000323 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79000354 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79000374 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79000389 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79000430 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 79001182 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 79001288 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79001340 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 2 79001343 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.375 0.0625 0.5625 13 19 6 1 9 2 79001762 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 79001891 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 79001966 C T Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 79002038 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 79002068 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 79002191 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 79002236 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 79002288 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 79002312 A T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 79002418 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 79002531 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 79002539 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 79002591 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 79002659 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 79002841 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79002859 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79002898 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 2 79002924 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 79003102 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79003298 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 79003365 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 79003832 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79004036 C G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 79004343 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79004427 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79004638 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79004752 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79005034 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79005127 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79005270 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79005346 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79005510 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79005516 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79006133 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79006240 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79006701 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79006861 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79007070 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79007173 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79007438 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79007449 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79007773 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 79007883 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 79008243 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79008252 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 79008854 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 79008899 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 79008921 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 79008951 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79008982 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 79009001 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 79009052 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 79009396 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79009463 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 79009924 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79011342 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 79011718 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 79012200 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79012443 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79012653 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 79013035 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79013072 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79013075 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79013123 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79013145 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79013146 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79013156 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79013321 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79013619 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79013970 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79014312 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79014732 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79014748 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79014781 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79014783 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79014903 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79015018 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79015761 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79015858 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 79016043 G T N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 79016161 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 79017058 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79017746 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79018227 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 79018285 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 79018714 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79018958 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79019553 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79019583 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79019589 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79019746 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 79019762 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 79021530 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79022223 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 79022258 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 79022313 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79022378 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 79022396 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 79022664 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79024768 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 79024781 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 79024787 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79025078 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79025202 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 79026236 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79026477 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79027576 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 79028124 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79028187 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79028332 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79028659 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79028897 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79029375 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 79029922 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79030345 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79030429 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79033270 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79033777 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79035521 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79035895 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79036296 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 2 79036346 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79036797 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79036970 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79037200 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79038724 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 79041357 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 79042008 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79042043 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79042366 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79042407 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 79042436 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 79042631 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79043277 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79043340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79043403 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79043720 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79045093 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79045120 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79045130 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79045159 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79045324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79045396 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79045541 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79045601 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79046093 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79046111 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79046861 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79047131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79047690 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79048369 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79048530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79048551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79048806 G T Y N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 79050686 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79050688 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79053490 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79055538 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79055653 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79058580 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79063312 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79064007 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79064797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79065729 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 79066890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79066910 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79067749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79067828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79068110 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79068475 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79069133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79069418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79069571 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79071635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79071658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79072060 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79073941 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79074511 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79074559 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79075129 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 79075371 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79075540 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79075869 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79075870 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79076252 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79076253 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79076292 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79077581 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79077649 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79077654 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79077709 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 79077746 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79077787 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79077907 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 79077947 A T Y N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 2 79078356 A C Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 79078760 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 79079108 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79079240 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 79079380 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 79079389 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 79079747 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 79080027 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79080189 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79080193 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79080215 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79080653 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 79080943 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79081202 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79081208 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79081545 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 79081553 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79081711 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 79082036 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79082226 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79082290 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79083243 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79083443 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 79083472 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 79083483 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 79083705 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 79084059 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 79084084 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 79084347 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79084636 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79084681 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79084700 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79084744 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79085013 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 79085021 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 79085241 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79085398 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 79085410 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79085463 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 79085485 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79085493 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79085606 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79086790 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79088333 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79088991 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 79089614 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79090478 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79091060 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79092542 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79092633 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79093573 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79096227 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79096606 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79097150 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 79097269 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 79097741 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79097787 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 79098055 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 79098057 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79098183 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79098219 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79098303 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79098454 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 79098794 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 79098862 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 79098939 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 79098953 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 79098955 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 79098975 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79099017 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 79100306 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 79100419 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79101183 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 79101847 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 79101933 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79102015 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 79102365 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79102436 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79102485 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79102594 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79102749 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 79102803 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79102840 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79105039 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79105676 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79107057 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79108681 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 79108839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79109418 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79109419 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79111064 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79111259 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79111861 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79112067 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79112453 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79112481 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 79113628 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79115109 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79115276 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79115753 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 79116371 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79116827 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79116870 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79117068 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 79117087 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 79117193 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 79117296 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79117439 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79117465 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79117668 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79117932 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79118058 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79118273 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79118400 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79118438 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 79118595 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79118632 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79118669 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 79119031 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79119214 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79119632 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79119705 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79119891 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79119958 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79120173 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79120248 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79120453 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79120587 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 79120905 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 79121546 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79121765 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 79121952 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79121975 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79122072 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79122094 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79122109 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79122276 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 79122285 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79122303 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 79122333 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 79122601 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79122612 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 79122708 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 79122729 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79122739 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 79122764 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79122845 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 79123037 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 79123082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79123351 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79123417 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 79123506 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79123518 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79123578 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79123683 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79123843 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79123897 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79124007 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 79124033 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79124053 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79124066 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 79124069 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79124154 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79124272 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79124330 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79124341 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79124434 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79124475 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79124541 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79124619 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79124788 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 79125096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79125114 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79125176 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79125257 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79125282 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79125551 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79125732 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79125824 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79126206 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79126212 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79126272 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 79126458 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 79126471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79126523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79126624 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79126659 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79126721 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79126725 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79126777 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 79126954 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 79126997 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 79127010 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 79127037 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 79127073 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79127145 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79127157 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79127197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79127273 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79127325 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79127350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79127407 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79127432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79127457 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79127637 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79127657 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 79127783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79127791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79127834 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79128031 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 79128141 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 79128331 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79128480 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79128678 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79128748 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79128818 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79128827 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79128883 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79128920 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79128987 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 79129272 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79129305 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79129704 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79129888 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79129950 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 79130024 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79130191 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79130227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79130230 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79130271 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 79130273 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79130889 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 79130895 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 79131474 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 79131755 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79131796 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 79132535 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79132914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79132986 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 79133259 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79133644 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79133748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79134187 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 79134194 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 79134331 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 79134772 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79134857 T A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 79134946 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 79135097 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79135120 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79135165 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79135276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79135418 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 79136043 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79136056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79136106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79136236 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 79136296 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 79136315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79136371 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 79136396 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 79136470 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 79136530 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 79136885 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 79136909 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 79137720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79137772 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79137802 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79138079 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 79138145 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79138199 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 79138299 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 79138309 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 79138463 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79138481 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 79138588 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 79138614 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 79138647 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79138694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79138704 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79138835 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79138845 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79138905 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 79138936 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79138948 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79138958 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79139010 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79139021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79139058 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79139062 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79139165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79139196 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79139211 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79139240 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79139852 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 79140117 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 79140402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79141033 G T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 79141056 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 79141147 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79141304 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79141351 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 79142016 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79142109 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79142150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79142160 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 79142183 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79142395 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79142398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79142411 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 79142426 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79142461 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79142519 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79142606 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79142923 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79143046 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79143123 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79143124 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79144335 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79144603 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79144828 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79145025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79145247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79145397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79146123 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79146151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79146173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79146202 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79146247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79146263 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79146332 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 79146363 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79146474 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 79146568 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 79146776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79146804 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 79146805 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 79146816 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 79146901 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 79146921 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 79147048 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79147069 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 79147263 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 79147290 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79147402 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79147427 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 79147432 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 79147650 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79147718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79147952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79148032 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79148669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79149838 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79150064 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79150095 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79150763 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79151615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79153199 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79153555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79154069 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79154070 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79154657 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 79155213 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 79155673 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79155980 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79156030 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79156046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79156336 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79156337 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 79156348 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79156537 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 79157304 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79157378 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79157740 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79157992 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79158640 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79158675 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79158683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79159992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79161366 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 79162374 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 79162719 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 79163521 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79165129 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79165142 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79165414 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79165539 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79167530 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 79169549 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79169550 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79171545 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79173786 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79173967 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 79174309 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 79174486 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 79174623 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79175135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79176731 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79176828 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79178371 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 79178954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79178963 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79179219 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79179487 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79179599 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79179971 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79180087 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79180552 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 79180697 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79180936 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79181463 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79182430 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79182584 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79183324 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79183471 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79184123 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79184143 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 79184519 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 79184740 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79184806 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79185080 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79185294 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 79185610 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79185623 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 79185677 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79185788 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 79185817 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 79185966 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 79186074 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 79186100 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 79186236 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 79186293 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79186304 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 79186719 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79186978 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 79186994 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 79187407 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 79187509 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 79187608 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 79187666 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 79187719 T G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 79187817 T G Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 2 79187858 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 79187997 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 79188002 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 79188070 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 79188126 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 79188149 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79188212 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 79188263 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 79188275 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 79188354 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79188481 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 79188492 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 79188493 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 79188610 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 79188643 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 79188742 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 79188760 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 79188906 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79188920 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79188996 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79189004 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79189022 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 79189422 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79189423 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79189488 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79189562 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79189574 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79189582 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79189608 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79189638 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 79189975 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 79190081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79190112 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79190310 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79190351 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79190469 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 79190693 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79190782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79190858 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 79191671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79191677 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79191953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79192424 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 79192487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79192705 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79193053 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79193193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79193247 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79193418 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 79193577 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 79193690 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 79193848 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 79193879 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 79193974 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79194038 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 79194096 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 79194328 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 79194361 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 79194386 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79194642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79195303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79195358 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79195493 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 79195518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79195630 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79195677 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79195743 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79195805 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79195807 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79195984 A T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 79195988 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 79196015 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 79196021 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 79196026 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79196328 T C N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 79196333 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 79196387 C G N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 79196405 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 79196456 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79196488 A G Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 79196502 T C Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 79196661 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 79196682 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 79196686 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 79196702 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 79196818 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79196838 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 79196852 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 79196909 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 79196922 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 79197024 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79197080 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79197094 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 79197100 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 79197116 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 79197205 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 79197320 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 79197332 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 79197428 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 79197443 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 79197471 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 79197487 A G Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.285714285714286 0.0714285714285714 0.642857142857143 9 19 4 1 9 2 79197565 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 79197581 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 79197606 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 79197618 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 79197682 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 79197746 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 79197866 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 79198030 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79198031 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79198345 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 79198432 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 79198435 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79198601 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 79198618 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79198642 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79198785 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 79198993 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 79199038 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 79199155 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79199190 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79199226 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 79199227 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 79199495 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 79200722 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79200820 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 79200822 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 79200874 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79200930 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 79201014 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79201137 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 79201219 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79201324 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79201465 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 79201493 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79201516 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79201735 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 79201867 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 79201913 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 79202119 A G N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 79202312 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79202529 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79202787 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 79202830 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 79202875 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 79202943 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79203147 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79203170 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79203176 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79203606 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79203862 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 79203912 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79204028 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 79204176 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 79204238 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79204260 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79204272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79204284 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79204815 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 79204962 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 79205326 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 79205590 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79205600 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 79205602 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 79205773 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 79206015 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 79206052 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 79206064 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79206119 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79206308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79206450 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 79206453 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79206568 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79206659 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79206697 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79209585 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79210974 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79211140 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 79211780 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 79213477 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79213789 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79213822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79214804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79215608 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79216116 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79216422 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79216552 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 79216596 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 79216621 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 79216690 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79216693 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79216742 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79216755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79216925 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79216985 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79217246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79217384 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79217393 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79218424 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79218559 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79218756 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79218801 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79218838 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79220570 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 79220927 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79222105 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79222171 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79222744 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79222776 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79222808 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79222862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79222908 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79222993 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79223085 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79223744 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79223885 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79223933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79223935 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 79224386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79224495 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 79224761 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 79224855 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 79224960 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 79225111 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 79225226 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 79225450 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 79225500 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79225757 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 79225824 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 79226003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79226004 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79226034 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 79226344 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79226710 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 79226951 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79227086 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 79227181 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 79227198 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 79227251 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79227906 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 79228271 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 79229803 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79234035 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 79237321 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79237757 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79241757 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79241859 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 79242464 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79242889 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 79242893 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 79242935 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 79242945 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79242951 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79243027 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79243135 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79243168 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79243206 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79243207 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79243238 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79243330 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79243476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79243480 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79243683 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79243691 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79243755 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79243785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79243811 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79243815 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79243845 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79243859 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79244546 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79244630 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79244949 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79245506 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 79246216 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79246299 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79246710 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 79246865 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79246935 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79247062 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79247085 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79248074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79248852 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79249121 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 79249303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79249466 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79249467 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 79249584 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79249593 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79249701 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79250365 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79250580 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79251681 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 79252957 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79253346 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79253502 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 79253844 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 79254105 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79255512 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 79255875 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 79255925 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 79256024 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 79256089 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79256365 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79257100 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 79257276 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 79257548 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79257667 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 79257682 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79257782 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 79258029 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79258260 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 79259246 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 79259504 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79259927 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79260192 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79260394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79261329 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79261383 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 79261713 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 79262505 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79262544 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 79262635 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 79262663 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 79263123 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 79263248 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79263253 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 79263995 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79265093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79265793 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79266249 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79266674 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79268231 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79268910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79269984 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 79270004 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 79270037 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 79271158 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79271471 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79271488 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79271613 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79271645 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79271652 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 79271699 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 79271920 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79271933 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 79272004 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79272085 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79272127 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79272149 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79272202 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79272271 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79272315 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79272318 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79272437 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79272702 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79272954 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 79273027 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79273032 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79273300 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79273623 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79273624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79273652 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79273663 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79273792 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79273820 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79273904 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79274384 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 79274428 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79274554 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79274561 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79274818 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79275114 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 79275776 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79275818 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79275820 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79275855 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79275909 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79275919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79275937 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79275980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79276005 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79276032 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79276050 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79276107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79276136 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79276222 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79276311 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79276318 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79276340 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79276344 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79276376 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79276473 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79276661 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79276978 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79277013 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 79277128 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79277230 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79277296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79277341 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79277343 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 79277372 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79282264 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79282289 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79282303 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79282311 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79282353 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79282389 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79282427 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79282436 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79282448 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79282491 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79282557 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79282598 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79283027 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79283037 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79283486 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79283594 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79283774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79283906 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79283923 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79283931 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79283965 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79284128 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 79284298 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79284681 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79284712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79284743 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79284784 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79284899 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79285087 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79285110 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79285137 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79285267 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79285310 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79285376 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79285450 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79285494 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79285515 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 79285524 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79285529 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79285619 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79285733 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 79285752 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79285810 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79285917 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79286014 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79286153 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 79286521 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 79286553 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 79286758 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 79286839 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 79286852 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 79286863 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 79286950 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79287288 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79287461 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79287526 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79287587 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79287705 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79287733 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79287834 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79287853 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79288147 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79288385 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79288571 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79288596 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79288705 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79289329 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79289350 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79289527 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 79289792 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79290849 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79291505 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79292095 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79292516 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 79295602 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79295773 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79297966 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79299785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79301148 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 79302766 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79303941 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79303942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79304281 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79307497 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79309163 G A Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 79309731 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79309930 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79313246 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79314124 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79314247 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79314546 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79315455 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79316414 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79317107 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 79318375 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79323774 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79325843 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79326224 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 79326425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79327568 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 79330191 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 79331471 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79333199 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79333398 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79335838 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79336985 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79338150 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79338625 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79338948 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79341428 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79342821 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 79344001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79344842 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79346520 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79346807 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79347734 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79348094 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79348145 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79348627 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79349855 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79350229 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79350295 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79350335 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 79350454 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79350466 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79350521 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79350584 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79350598 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79350682 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79350709 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79350757 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79350783 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79350827 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79351073 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79351092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79351118 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79351217 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79351547 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79351571 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79352058 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79353102 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 79353186 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79353350 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79353456 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79353457 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79353549 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 79353728 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79353791 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 79353915 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 79353995 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79354044 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79354382 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 79354435 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79355684 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 79357103 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79357318 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 79357478 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79357513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79358198 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79359163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79359183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79359436 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79361302 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79361530 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79364893 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79365176 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 79365216 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79365278 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79365735 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79366397 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79368081 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 79368267 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 79368408 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79368442 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79369455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79370571 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 79370653 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79370692 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79370740 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79370749 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79371204 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 79371226 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79371419 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79372015 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 79374752 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 79375233 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79375975 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 79376458 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79377201 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 79377357 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 79377396 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 79378743 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79379458 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79379711 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 79379841 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79380075 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79380304 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79380331 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79380350 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79380674 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79380873 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79381243 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79381320 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 79381379 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79381467 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79381502 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79381564 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 79381674 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 79381732 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79381754 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 79381809 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79381963 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 79382275 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 79382820 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 79382829 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79382975 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 79383209 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79383223 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79383239 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79383339 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79383437 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79383477 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79383519 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79383614 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 79383967 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 79384170 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 79384227 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79384312 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79384337 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 79384474 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79384553 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 79384725 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79384795 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79384838 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 79384883 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79384917 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79385052 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79385147 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79385242 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79385453 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79385587 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79385601 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 79385656 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 79385665 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 79385680 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 79385688 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 79385787 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 79386161 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 79386343 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79386527 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79386702 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 79386709 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 79386790 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 79386838 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79386993 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79387020 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 79387072 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 79387104 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 79387168 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 79387925 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79390219 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79390304 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 79391345 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 79392681 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 79393276 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79393298 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79393306 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79393316 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79393401 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 79393412 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79393428 T A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 79393440 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 79393661 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 79393938 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79394730 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 79395362 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 79396401 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 79396631 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 79396901 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79397374 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79397685 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79398267 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79399130 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79399160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79400096 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79400186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79400222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79400565 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79401538 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79401630 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 79402424 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79403316 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79403575 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79403636 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79403857 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79404186 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 2 79404822 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 79405050 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79405433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79405825 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79405909 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 79407399 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79407500 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79407697 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79408550 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 79408858 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 79409009 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 79409129 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79409162 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79409340 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79409393 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79409454 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79409496 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 79409559 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 79409562 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 79409636 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79409916 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 79410086 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79410091 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79410276 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79410495 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79410509 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 79410701 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79410734 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79410740 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79410785 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79411100 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79411113 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 79411249 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 79411319 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 79411526 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79411564 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 79411612 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 79411662 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79411843 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79411848 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79412022 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 79412023 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79412069 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 79412150 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79412158 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 79412176 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 79412185 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 79412206 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79412282 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79412312 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79412330 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79412461 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 79412504 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79412796 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79413371 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 79413617 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 79414448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79414953 T C Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 79416629 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79416942 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 79417047 G C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 79417338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79417667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79419179 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79419520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79419554 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79419562 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 79419742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79419824 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79419958 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 79420182 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 79420280 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79420668 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79421024 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 79421094 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 79421172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79421210 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 79421351 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 79421526 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79421619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79422736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79423316 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79423997 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79424096 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 79424100 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 79424235 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79424391 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79424423 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79425054 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79425251 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 79425605 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79425970 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 79426106 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79426264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79426858 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79427770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79428477 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 79428508 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79428590 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 79428598 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 79428672 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79428806 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 79428867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79428885 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79429117 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79429217 A C Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 79429235 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 79429296 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 79429373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79429464 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 79429962 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 79430080 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 79430107 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 79430198 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79430218 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 79430290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79430360 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79430595 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 79430623 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79430667 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79430700 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 79430722 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79430730 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 79430819 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 79430902 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 79431105 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79431112 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 79431125 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 79431147 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 79431175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79431290 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79431298 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 79431333 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 79431431 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79431811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79431842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79431978 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79432808 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79432824 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 79432932 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 79432936 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 79433093 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 79433127 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 79433326 A T Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 79433377 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 79433478 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79433508 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79433509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79433608 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 79433684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79433885 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 79433888 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 79433928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79433957 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 79434109 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 79434145 G T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 79434156 T A N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 79434241 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 79434246 C T N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 79434422 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 79434610 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 79434672 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79434708 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 79435003 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 79435530 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 79435803 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79435814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79435947 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 79436029 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79436146 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 79436303 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 79436375 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 79436376 G T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 79437023 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79437847 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79437981 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 79438138 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79438192 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79438193 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 79438260 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79438305 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79438402 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 79438633 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79438950 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79439075 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79439080 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79439121 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79439227 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 79439321 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79439390 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 79439400 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79439498 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 79439681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79439726 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 79439762 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 79439773 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 79439790 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 79439930 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79439935 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79440099 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 79440105 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 79440493 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79440763 C T N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 79440868 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 79441197 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79441260 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 79441323 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 79441382 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79441472 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79441618 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79441767 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 79441844 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 79442033 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79442319 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 79442688 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79442830 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 79442898 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 79442937 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 79442952 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 79443252 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79443280 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 79443420 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 79443504 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 79443628 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79443951 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 79444047 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79444441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79444703 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79444770 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 79444782 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 79444932 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 79445016 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 79445118 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79445248 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79445280 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 79445292 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 79445335 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 79445418 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 79445438 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 79445457 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 79445559 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79445582 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 79445613 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 79445657 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 79445696 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 79445711 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 79445722 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 79445732 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 79445762 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 79446188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79446241 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79446278 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 79446358 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79446677 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 79446863 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79447035 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 79447271 G T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 79447316 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 79447327 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 79447341 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 79447388 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79447402 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 79447408 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79447460 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79447634 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79447681 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79447688 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 79447762 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79447793 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79447913 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 79447986 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 79447989 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 79448168 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79448215 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79448372 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79448469 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79448499 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79448517 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 79448526 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 79448663 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 79448666 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 79448776 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79448860 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 79449123 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79449124 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79449183 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79449194 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 79449199 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79449293 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 79449310 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79449368 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 79449439 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79449476 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79449497 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 79449508 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 79449601 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 79449621 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 79449622 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 79449646 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 79449672 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79449679 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79449765 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79449815 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79449876 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79449994 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79450094 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 79450131 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79450172 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79450198 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79450203 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 79450450 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79450542 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 79450567 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79450620 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 79450661 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 79450688 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 79450736 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79450763 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79450840 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79450869 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 79450907 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79450948 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 79450977 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 79451010 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79451014 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 79451260 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79451358 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79451467 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79451732 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79452054 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 79452165 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 79452274 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79452371 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 79452397 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 79452592 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79452651 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 79452673 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 79452701 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79452824 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 79452897 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79452924 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79452926 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79452944 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79453023 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79453097 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 79453138 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 79453147 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79453241 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79453269 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 79453375 A C N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 79453384 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 79453481 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 79453483 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 79453942 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79454362 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79454448 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 79454683 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 79454727 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 79454863 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 79454874 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 79454948 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79454996 T A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 79455088 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79455142 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79455241 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 79455302 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79455367 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79455370 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79455418 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 79455422 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79455716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79455968 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 79456028 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 2 79456039 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 79456609 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 79456865 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 79456899 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 79456924 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 79457100 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79457153 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79457155 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79457172 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 79457199 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79457327 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79458220 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79458362 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79458492 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79458771 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79458792 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79459225 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79459678 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79459945 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79459970 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79460091 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 79460105 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79460234 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 79460235 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 79460273 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 79460330 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 79460358 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 79460374 C A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 79460661 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79460731 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79460887 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 79460907 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 79461012 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 79461131 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 79461164 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79461207 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 79461239 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 79461337 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79461376 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79461409 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 79461492 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 79461602 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79461618 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79461744 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79461775 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 79462081 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 79462252 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 79462297 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 79462516 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 79462581 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79462717 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79462856 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79462894 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79463011 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79463158 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 79463183 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 79463193 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79463212 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 79463353 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 79463382 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 79463467 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79463512 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 79463582 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79463617 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79463623 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79463635 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 79463712 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79463803 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79463866 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 79463881 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 79463993 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 79464011 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79464143 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79464176 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79464541 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 79465123 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 79465217 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79465341 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 79465615 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 79465800 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 79465839 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 79465902 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 79465909 C T N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 79465949 A C N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 79466170 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 79466292 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 79466305 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 79466357 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79466385 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 79466411 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 79466616 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 79466640 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 79466688 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 79466794 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 79467039 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79467052 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 79467419 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 79467531 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79467751 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 79467882 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 79468640 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 79468657 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 79468848 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 79468964 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79469018 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79469467 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79469683 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79469818 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 79469897 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 79470977 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 79471264 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79473044 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 79473073 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79473193 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 79473356 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79473452 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79473639 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 79473658 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79473746 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79473773 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 79473847 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79473944 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79473957 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79474442 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79474626 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 79474785 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79474832 G T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 79474843 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 79474846 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 79475001 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 79475337 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79475488 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 79476123 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79477517 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 79477858 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 79478414 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79478530 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79478563 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79478928 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79479002 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79479089 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 79479432 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79479655 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 79479709 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 79480182 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 79480258 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79480272 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79480409 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79480500 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 79480539 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79480689 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79480729 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79480855 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79480885 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79480910 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 79480918 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79480998 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79481057 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79481069 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79481225 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79481354 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 79481455 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79481528 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79481624 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79481632 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79481661 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79481958 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79482008 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79482684 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79482736 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 79482980 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79482998 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 79483147 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79483357 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79483471 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79483503 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79483883 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79484181 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 79484374 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79484795 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79484810 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79484959 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79485429 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 79485662 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 79485685 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79485784 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79485833 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79486166 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79486682 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79486696 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79487272 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79487274 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79487497 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79487738 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 79488306 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79488308 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79488582 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 79488713 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 79489052 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 79489924 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 79490354 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79490795 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79490907 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79491297 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79491308 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79491314 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79491340 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79491343 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79491393 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79491536 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79491574 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79491703 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79491736 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79491775 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 79491782 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79491874 G C Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 79494509 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 79494814 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 79494939 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79496397 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79496652 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79496899 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 79497009 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79497639 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79497741 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79498098 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 79498312 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79498335 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79498765 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79501352 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79501666 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 79501783 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79501861 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79501959 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79502480 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79502534 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79502594 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79502807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79503679 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 79503794 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79503881 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79504001 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79504059 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79504079 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79504100 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79504278 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 79504377 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 79504471 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 79504646 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 79504843 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79504999 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79505007 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 79505055 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79505142 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79505167 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79505181 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79505182 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79505222 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79505668 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79505775 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79505873 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79505952 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79505988 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79506146 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 79506267 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79506323 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79506336 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 79506341 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79506541 C A N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 79506547 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 79506672 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 79506867 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 79506998 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 79507109 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79507335 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79507657 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79507833 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79507936 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79507977 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79508225 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79508806 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 79508895 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 79508903 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 79509150 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79509176 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79509190 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79509391 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79509396 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79509433 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79509706 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79509736 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79510072 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 79510221 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79510491 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79510518 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79510672 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 79510736 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79510762 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 79510771 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 79510774 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 79510843 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79510977 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 79511184 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 79511190 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 79512670 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 79513209 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79513222 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 79513231 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 79513483 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79513620 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 79513718 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 79513769 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 79513801 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79513840 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 79514946 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79515152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79515201 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79515376 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 79515389 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79515611 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 79515655 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79515671 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79516060 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79516095 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79516249 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 79516625 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79516653 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79517821 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 79517865 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 79518471 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 79518540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79519198 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 79519485 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79519598 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79519635 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79520787 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79521008 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 79521488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79521679 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 79521818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79523337 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79523359 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79523375 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 79523429 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79523512 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 79523678 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79523723 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79523724 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 79525069 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 79525079 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 79526340 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79526764 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79527114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79527618 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79527657 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 79527726 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79527781 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79527788 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79527815 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79527994 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79528013 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79528177 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79529232 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79529344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79529372 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79529378 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79529422 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79529453 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79529465 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 79529518 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79529581 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79529692 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 79529928 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79530003 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 79530036 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 79530075 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79530107 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79530193 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79530241 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 79530255 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79530323 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79530405 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 79530431 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79530492 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79530529 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 79530807 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79531484 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79531922 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79533019 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79533122 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 79533260 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 79533294 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79533404 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79533437 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79533440 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 79533455 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79533493 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 79533530 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79533537 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79533556 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79533564 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 79533609 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 79533652 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 79534009 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79534294 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79534313 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 79534842 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79535097 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 79535870 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79536144 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 79536238 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79536379 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 79536670 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79536713 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79537362 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79537611 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 79537954 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 79539412 T A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 79539537 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 79539921 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 20 4 10 0 2 2 79540106 A T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 79540460 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 79540501 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79540557 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 79541606 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79541766 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79541781 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79541884 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 79541948 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 79542383 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79542438 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 79542583 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 79542661 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79542949 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 79543086 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 79543217 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79543269 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79543355 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79543533 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 79543599 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 79543900 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 79543927 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79544261 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 79544276 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 79544314 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 79544478 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 79545782 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79545844 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79546055 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79547797 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79547804 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79549943 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79550397 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79550691 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79551247 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 79552634 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 79552729 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79552732 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 79553123 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 79553132 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79554016 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79554468 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79559360 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79559460 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79559479 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79560030 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79560332 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 79560768 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79560855 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 79560907 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 79560928 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 79561010 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79561194 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 79561199 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 79561208 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79561303 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 79561405 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79561510 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 79561526 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79561754 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 79561818 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79561859 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79561904 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79561927 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79561956 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 79562170 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 79562244 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79562424 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 79562469 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79562506 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79563601 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 79564472 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79564501 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79564576 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79564578 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79564651 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79564837 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79564917 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 79565304 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 79565420 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79565538 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79565963 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79566058 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79566231 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79566585 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79566612 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79566902 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79566915 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79567016 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79567497 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79568105 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79568364 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 79570621 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 79570695 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79570725 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79570831 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 79570855 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 79571096 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79571192 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 79571226 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 79571410 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79571649 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79571698 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79571751 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79571839 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 79571950 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 79572052 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 79572240 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 79572318 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 79572320 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 79572570 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 79572851 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 79572916 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 79573007 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79573085 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79573460 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 79573679 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79574110 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79574386 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 79574953 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 79575009 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79575064 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 79575148 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 79575166 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 79575198 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79575548 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79575585 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79575641 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 79575739 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 79575955 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79575972 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 79576015 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79576018 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79576198 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 79576307 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 79576428 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 79576490 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 79576556 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 79576615 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 79576814 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 79576923 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 79577044 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79577056 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 79577069 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79577138 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 79577185 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79577202 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 79577246 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 79577272 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79577303 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79577389 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 79577555 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 2 79577643 A T N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 2 79577665 C T N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 2 79577701 G T N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 2 79577705 C G N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 2 79577715 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 79577721 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 79577757 A T N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 2 79577763 A G Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 79577769 A T N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 2 79577810 T C N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 2 79577886 C G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 14 14 6 2 6 2 79577912 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 2 79577941 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 2 79578017 T C N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 2 79578034 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 2 79578213 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 79578237 T A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 79578243 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 79578256 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 79578403 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 2 79578542 A T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 79578617 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 79578682 C A N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 79578920 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 79578970 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 79579016 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79579133 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 79579236 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79579248 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79579310 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79579348 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79579476 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 79579508 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 79579543 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 79579561 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79579576 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79579774 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 79579795 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 79579871 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 79579878 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 79579891 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 79579936 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 79579959 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79580276 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 79580296 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 79580426 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 79580428 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 79580440 C A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 79580804 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 79581024 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79581076 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79581118 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79581123 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79581149 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79581176 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 79581221 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 79581257 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79581287 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 79581307 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79581432 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79581592 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79581669 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 79581674 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 79581685 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 79581746 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 79581762 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 79581779 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 79581893 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 2 79581899 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 2 79581973 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 79582441 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79582452 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79582690 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79582713 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79582824 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79582939 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79583407 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79583442 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79583687 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79583737 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79583759 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79583933 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79583936 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79584023 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 79584075 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79584198 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 79584250 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 79584252 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 79584277 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 79584337 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79584523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79584590 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79584615 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 79584647 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79584761 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79584833 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79584893 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 79585016 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79585023 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79585112 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79585133 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79585146 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79585161 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79585173 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79585247 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79585251 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79585259 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79585288 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79585325 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79585445 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 79585521 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79585525 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 79585560 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 79585598 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79585846 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79585905 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 79585929 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 79585983 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 79586015 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 79586077 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 79586092 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 79586128 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 79586172 A C N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 2 79586205 C A N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 2 79586299 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 79586317 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 79586673 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79586771 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79586830 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 79587147 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 79587236 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 79587264 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79587622 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 79587637 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 79589692 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79589745 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79589748 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79590251 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79591704 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 79592218 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 79593999 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79594121 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 79594524 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79594563 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79595216 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79595389 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 79595458 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 79595518 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 79595919 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 79595958 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.6 0.0666666666666667 0.333333333333333 19 11 9 1 5 2 79596123 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79596946 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 79598162 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 79598199 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79598341 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 79599931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79600600 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79602998 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79605562 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 79607662 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79607665 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79607715 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 79607991 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79608123 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79608202 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 79608251 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79608286 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79608323 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79608391 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79608662 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79608724 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79608851 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 79608883 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79608916 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79609068 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79609089 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79609236 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79609242 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79609281 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 79609402 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79609419 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79609427 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79609477 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 79609726 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79609832 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79609844 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79609998 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79610187 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 79610393 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 79610412 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 79610433 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 79611060 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 79611321 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 79611429 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79611450 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79611491 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 79611541 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 79611587 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79611622 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79611626 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79611668 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 79611771 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 79611813 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 79611880 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79611890 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79612172 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 79612178 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 79612227 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79612332 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 79612351 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79612418 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79612434 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79612474 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79612652 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79612963 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79613006 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79613125 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 79613168 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 79613435 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 79613444 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 79613454 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 79613686 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 79614006 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79614012 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79614023 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79614081 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79614096 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 79614113 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79614210 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79614212 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79614569 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 79614791 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79614827 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 79615145 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79615259 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79615302 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79615378 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79615407 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79615413 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79615510 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79615530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79615535 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79615643 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79615739 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 79615790 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 79615850 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79615969 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 79615976 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79616156 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79616167 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79616356 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79616357 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79616367 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79616473 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79616577 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79616843 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 79616851 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79616951 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79616981 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79617051 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79617086 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79617166 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79617252 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79617258 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79617263 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79617694 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79617812 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79617844 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79617854 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79619565 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79619616 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79619802 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79619857 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79619915 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79619981 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79620005 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79620036 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79620045 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79620070 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79620413 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79620506 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79620672 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79620792 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79620927 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79621062 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79621208 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 79621252 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 79621276 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 79621318 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79621802 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79622070 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79622172 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79622192 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79622700 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 79622712 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 79622865 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79622877 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79622945 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79622994 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 79622995 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79623005 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79623040 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79623401 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79623512 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79623680 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79623780 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79624016 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79624053 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79624685 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79624693 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79624777 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79624958 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79625073 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79625115 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 2 79625168 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79625303 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79625336 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 79625462 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 79625475 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79625755 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79626518 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79626551 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79626554 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79626587 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 79626620 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79626724 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 79626912 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 79626915 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 79627001 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79627086 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79627101 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 79627155 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 79627156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79627197 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79627261 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79627275 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79627285 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 79627412 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79627476 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 79627556 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 79627884 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 79627893 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79628272 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 79628456 T C N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 79628564 C T N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 2 79628565 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 79628622 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 2 79628914 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79628942 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 79628987 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79629012 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 79629078 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79629122 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79629246 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79629279 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79629283 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 79629312 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 79629484 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 79629489 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79629564 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 79629605 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 79629614 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 79629769 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79629937 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 79629940 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 79630065 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79630124 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79630138 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 79630233 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 79630242 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 79630270 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 79630281 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 79630341 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 79630349 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 79630386 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 79630492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79630541 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79630625 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79630747 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 79630842 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79631002 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79631027 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79631083 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 79631101 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 79631384 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79631386 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 79631395 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79631431 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79631466 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79631491 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79631514 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79631585 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79631593 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 79631645 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79631687 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79631708 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 79631737 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79631747 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 79631820 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79631953 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79631954 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79631989 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79632028 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 79632106 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79632132 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79632177 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79632260 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79632463 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79632699 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 79632804 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 79632854 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 79632940 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 79633145 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79633155 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79633268 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 79633282 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79633434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79633600 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79633612 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79633702 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79633784 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 79633817 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79633913 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 79633948 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79634018 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 79634028 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79634092 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79634105 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 79634121 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79634176 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 79634202 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79634315 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79634485 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 79634487 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79634577 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 79634642 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 79634668 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79634848 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 79634857 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79634926 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79634962 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79634966 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 79635094 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 79635108 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79635109 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 79635270 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79635325 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 79635345 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79635376 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79635422 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79635489 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79635533 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79635568 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79635613 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79635662 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79635664 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79635895 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79635969 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79635996 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 79636026 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 79636033 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79636043 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79636050 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79636141 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79636143 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79636159 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79636177 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79636216 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79636320 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79636364 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 79636387 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79636414 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 79636415 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 79636444 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 79636517 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 79636630 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79636635 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79636646 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79636649 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79636717 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 79637394 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79637424 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79637484 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 79637578 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 79637977 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79637981 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 79638054 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 79638065 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79638084 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79638563 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79638586 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79638696 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 79638779 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79638785 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79638853 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79639093 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79639126 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79639188 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79639230 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79639236 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79639268 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 79639341 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79639353 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79639472 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79639522 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79639558 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 79639606 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79639626 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79639653 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79639697 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 79639716 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 79639846 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 79639943 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 79640065 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 79640098 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79640184 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79640448 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79640473 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79640607 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79640664 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 79640700 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79640803 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79641014 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79641026 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79641071 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79641199 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 79641211 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 79641354 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79641415 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 79641422 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 79641506 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 79641587 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79641705 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79641895 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79641915 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 79641938 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79642029 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79642058 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79642062 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79642178 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79642318 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79642356 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79642369 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79642409 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79642410 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79642441 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79642541 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 79642582 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79642591 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79642649 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79642652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79642705 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79642746 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79642834 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79642856 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79643019 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79643065 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79643135 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79643157 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79643212 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79643256 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79643358 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79643359 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 79643407 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 79643422 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79643454 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79643541 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79643693 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 79643762 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79643785 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79643819 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79643838 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79643851 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79643919 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 79644058 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79644093 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79644124 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 79644302 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 79644518 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79644533 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 79644558 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 79644576 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 79644587 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79644602 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79644608 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 79644668 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79644675 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79644865 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 79644882 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79644893 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 79644904 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 79644918 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 79644948 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 79644989 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 79645050 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 79645241 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 79645272 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79645354 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79645355 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79645440 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 79645489 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 79645585 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 79645845 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79645890 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79645907 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79645940 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79645945 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79646175 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79646207 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79646275 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79646278 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79646296 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 79646325 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79646363 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79646464 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79646639 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79646657 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 79646665 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 79646763 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 79646812 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79646954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79647150 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 79647251 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 79647335 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 79647432 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79647514 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 79647562 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 79647770 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 79648119 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79648213 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 79648290 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 79648369 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 79648499 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79648687 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79648786 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 79648868 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 79648973 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79649199 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 79649454 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79649627 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79649754 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 79649782 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 79649898 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79649945 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 79649965 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 79650054 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79650055 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 79650148 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 79650173 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 79650270 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 79650483 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 79650619 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79650673 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 79650724 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79650793 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 79650821 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 79650824 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 79650848 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 79650909 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 79651058 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79651134 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79651142 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 79651323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79651456 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79651481 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 79651579 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 79651782 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79651843 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 79651958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79652000 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79652084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79652254 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 79652260 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79652280 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 79652397 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79652457 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 79652488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79652665 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79652790 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 79652836 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 79652976 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 79653217 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 79653219 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 79653259 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 79653260 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 79653333 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 79653406 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 79653417 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 79655408 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79655477 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79655814 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 79656279 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79656591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79656789 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79657487 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 79658026 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79658644 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 79658811 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79659220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79659686 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79659888 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79660076 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 79660218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79660335 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79660377 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79660704 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79661276 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79661987 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79662833 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79663072 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 2 79663211 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 79663469 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79664529 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79664693 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79664981 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79665853 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79666056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79666164 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79666831 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 79667358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79667498 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79667531 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79667847 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79668176 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 79668193 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 79668374 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79668581 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 79668630 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 79668705 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 79668973 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 79669003 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 79669102 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79669120 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79669372 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79669445 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79669463 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 79669495 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79669592 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79669754 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 79669764 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 79669958 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 79670114 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79670401 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79670487 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 79670658 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 79670671 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79670686 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 79670835 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 79670879 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79671124 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79671212 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 79671236 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 79671261 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 79671327 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 79671379 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 79671445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79671457 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 79671672 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 79671685 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 2 79671704 T G N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 11 9 2 7 1 2 79671740 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 79671758 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 79671768 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 79671788 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 79671871 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79671957 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 79672066 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79672161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79672277 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79672320 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79672346 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 79672413 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79672463 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79672528 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 79672557 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79672647 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79672695 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 79672738 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79672917 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 79673049 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79673841 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79674010 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79674011 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 79674246 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 79674277 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 79674420 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 79674468 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79674606 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79674627 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 79674641 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79674674 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 79674774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79674797 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 79674827 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79675213 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79675283 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 79675858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79675929 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79675930 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79675961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79676124 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 79676148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79676181 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79676397 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79676545 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 79676671 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79676767 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79676817 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 79676902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79676975 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 79677055 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79677147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79677268 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79677291 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79677353 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 79678100 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 79678107 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 79678179 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 79678180 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 79678353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79678417 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 79678688 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79679211 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 79679262 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79679356 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 79679845 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79679981 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79680585 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 79681285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79681556 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79681616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79681784 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79683157 G A Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 79683257 A T Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 79683282 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 79683461 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 79685965 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 79687190 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 79687832 A C N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 2 79687938 A T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 79687967 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79688950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79688997 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 79689505 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79689701 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 79689777 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79690001 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 79690634 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79690767 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79690777 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 79690885 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79691269 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79691556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79692161 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 79692185 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 79692259 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 2 79692537 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 79692666 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 79692743 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 79692767 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 79692850 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 79692909 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 79692998 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 79692999 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 79693024 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 79693062 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 79693413 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79693671 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 79693673 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 79693688 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 79693800 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 79693932 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 79693962 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 79694668 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79695149 G C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 79695628 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 79695660 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 79695824 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 79695835 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79695891 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79695902 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 79695941 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 79695958 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 79696048 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79696109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79696155 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 79696157 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 79696172 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 79696184 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79696229 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 79696306 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 79696321 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 79696335 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 79696389 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 79696394 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79696504 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79696518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79696520 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79696534 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 79696547 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 79696731 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 79696738 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79696874 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79696916 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 79696921 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 79697004 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 79697081 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 79697429 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79697591 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79697821 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79697959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79698391 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 79698571 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79698580 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79698623 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 79698629 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79698695 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 79698700 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 79698717 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79698738 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79698756 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 79698840 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 79699000 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 79699017 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 79699033 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 79699081 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 79699086 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 79699113 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 79699502 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 79699629 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79699632 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 79699848 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 79699864 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 79700041 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 79700076 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79700085 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79700175 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 79700307 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 79700332 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79700359 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79700378 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79700383 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79700520 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79701739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79702027 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 79702196 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79702229 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79702600 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79702627 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79702661 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79702664 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 79703011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79703032 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79703053 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 79703178 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79703210 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 79703279 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79703467 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79703659 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 79703703 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79703726 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 79703812 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79703877 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79704223 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79704245 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79704262 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79704285 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79705028 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79705140 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 79705280 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79705382 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79705511 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 79705534 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 79705658 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 79705711 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79705722 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79705862 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79706035 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79706123 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79706321 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 79706599 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 79706983 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79706984 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707008 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707058 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79707167 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707213 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79707252 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707303 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707317 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707332 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707411 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707502 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707518 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 79707578 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79707655 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79707672 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707719 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707795 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707806 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707818 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707854 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707947 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79707948 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 79707981 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707989 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79707996 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79708009 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79708026 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 79708123 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 79708126 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 79708611 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 79708689 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 79709050 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 79709051 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 79709070 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 79709119 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 79709270 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 79709598 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79709610 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79709734 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 79709943 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79709945 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79710007 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79710063 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79710098 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79710266 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 79711246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79711354 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79711374 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79711376 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79711653 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 79711749 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 79712143 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 79712474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79712766 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 79713668 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79714197 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79714247 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 79714256 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 79714301 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 79714302 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 79714427 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 79714485 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 79714499 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 79714592 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 2 79714713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79714765 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79714766 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 79714808 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79714850 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 79714880 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 79714881 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 79714898 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 79715042 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79715078 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79715098 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 79715122 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 79715300 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 79715319 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 2 79715361 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 79715560 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79715598 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 79715673 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 79715677 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 79715707 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 79715800 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 79715813 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 79715898 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79715995 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79716043 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79716144 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 79716151 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 79716155 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79716199 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79716298 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79716330 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79716388 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79716455 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 79716687 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79716695 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79717061 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 79717372 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 79717424 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 79717492 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 79717614 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 79717675 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 79717731 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 79717804 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 79718036 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79718181 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79718192 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79718201 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79718221 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79718324 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79718494 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79718496 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79718857 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 79718915 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79718973 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 79719009 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 79719034 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 79719050 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 79719120 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79719133 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 79719165 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 79719393 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79719394 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 79719430 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79719452 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 79719723 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79719744 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79719755 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 79719756 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 79719930 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79720067 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79720178 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79720219 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79720222 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79720298 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 79720625 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 79720692 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79720923 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79721075 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 79724560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79724745 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79726162 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79726170 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 79726244 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 79726418 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79726585 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79726753 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79726840 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79727756 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79728440 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 79728694 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79728837 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79729460 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79729812 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79730032 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79731018 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79731430 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79731478 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 79731699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79731725 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79731816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79732052 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 79732192 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79733297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79733601 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 79733735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79734805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79734811 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79735264 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79735542 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79735621 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79735640 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79735768 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79735982 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79736016 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 79736365 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 79737617 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79738453 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 79738475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79739356 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79740937 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79742272 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79743249 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79744263 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79744475 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79744520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79744526 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 79744620 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79744702 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79745041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79745106 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79745128 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79745208 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79745264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79745281 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79745689 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79745934 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 79745992 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 79746008 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79746038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79746048 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 79746095 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 79746135 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 79746236 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 79746314 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 79746344 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 79746397 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79746565 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79746615 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79746697 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 79746777 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79746982 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 79747122 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 79747198 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 79747246 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 79747518 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 79747587 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79747643 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 79747848 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79747849 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79747949 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 79748083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79748112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79748379 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79748390 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79748741 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79748887 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79748951 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79749115 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79749128 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79749253 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79749348 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79749449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79749578 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 2 79749626 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 79749829 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79749905 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 79749954 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79750154 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79750274 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79750517 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79750915 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79751338 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 79751651 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 79751654 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 79751670 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 79751725 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 79752487 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79752504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79752699 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79752741 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79752767 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79752947 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 79752983 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79753210 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 79753251 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 79753612 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 79753621 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79753812 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 79754497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79754758 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79755970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79757930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79760278 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79761418 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79761435 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79762944 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 79763458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79763791 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79763805 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79764014 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 28 8 14 0 4 2 79764081 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 79764134 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 79764180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79764195 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 79764229 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 79764315 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 79764327 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 79764366 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 79764574 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 79764682 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79764707 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 79764767 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 79764779 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 79765007 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79765033 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79765127 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79765279 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 79765400 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 79765424 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79765613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79765800 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 79765836 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 79765867 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79765914 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 79765948 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 79766099 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79766151 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 79766175 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 79766266 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 79766267 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 79766392 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 79766680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79766817 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79766934 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79766988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79767124 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 79767228 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79767249 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79767297 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79767399 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 79767407 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 79767443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79767473 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 79767683 T G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 79767696 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 79768149 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 79768315 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79768322 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 79768410 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79768497 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79768901 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 79768982 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 79769306 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79769678 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 79769705 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79769722 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 79769886 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 79769912 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79770010 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79770058 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79770430 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 79770678 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79772146 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 79772394 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 79772649 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79772950 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 79773264 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 79773286 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 79773292 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79773313 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 79773340 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 79773621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79774247 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 79774866 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79774923 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79774951 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79775337 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79775856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79775912 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 79775943 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 79776161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79776346 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79776482 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79776654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79776730 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 79784140 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 79784604 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 79784827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79784899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79785300 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79785517 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79786320 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 79786564 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 79786630 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79786790 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 79787023 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79787041 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79787104 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79787176 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 79788227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79788337 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79788891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79789091 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 79789284 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 79789296 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 79789561 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 79789883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79790022 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79790089 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 79790132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79790173 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 79790367 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79790465 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79790467 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 79790488 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79790663 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79790668 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79790696 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 79790716 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79791003 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 79791343 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79791398 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79791416 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79791609 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79791674 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79791676 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79791748 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79791860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79792036 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79792065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79792224 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 79792263 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 79792296 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79792354 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79792407 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79792472 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 79792531 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79792547 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 79792562 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79792623 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79792638 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79792686 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79792698 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 79792756 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79792777 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 79792844 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 79793806 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 79793852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79794849 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79795073 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79795625 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79795772 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79797462 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 79798827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79798917 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79799168 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79799482 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79799496 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79799535 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79799537 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79799547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79799676 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79799762 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 79799824 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79800046 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 79800083 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79800122 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 79800190 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79800424 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79800448 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79800553 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79800874 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79801103 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 79801542 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 79801636 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 79801826 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79801931 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79802096 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79802217 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79802376 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79802576 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79803180 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79803200 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 79803250 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79803280 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 79803297 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 79803509 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79803574 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79803751 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 79804120 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79804388 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 79804550 T G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 79804633 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 79805156 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79805198 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79805270 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79805350 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79805422 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79805551 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79805603 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79805782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79806002 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 79806063 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 79806208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79806322 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 79806335 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79806885 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79808265 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 79809460 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79809745 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79810581 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 79812188 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79812421 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79813846 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79814509 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79815301 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79818726 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 79820562 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 79821412 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 79821437 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 79822361 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 79825110 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79827321 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79828425 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79828439 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79828817 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79836285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79837268 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 79838353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79838784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79838852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79839409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79840122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79840507 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79841176 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 79843037 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79843773 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 79844712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79846373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79847402 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 79847831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79848004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79848192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79848357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79849484 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79853200 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79855666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79858164 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79860070 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 79861756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79862232 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79863238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79864256 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 79864396 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 79864822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79865813 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 79867496 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 79867827 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 79867916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79867925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79867932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79868808 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79869143 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79869248 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 79869862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79871743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79872757 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79875071 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79875849 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 79878521 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79878542 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79878607 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 79879010 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79879178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79879588 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 79880007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79880962 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79881100 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79881954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79882489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79882589 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79882660 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79882666 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79882672 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79882746 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79882759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79882964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79883103 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79883131 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79883160 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 79883188 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79883203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79883219 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79883226 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79883386 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79883980 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79884028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79884052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79884058 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79884206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79884351 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79884357 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79884373 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79884411 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79884601 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79884612 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79884916 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79885083 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79885395 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79885923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79886027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79886148 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79886426 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79886736 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79887097 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79887193 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79887678 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79887747 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79887785 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79887831 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79887883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79887900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79887909 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79887927 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79887957 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79887979 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79888187 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 79888194 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 79888253 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79888336 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79888405 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79888458 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79888623 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79888657 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79888662 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79888708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79888920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79889162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79889197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79889348 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 79889359 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 79889452 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 79889464 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 79889508 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 79889523 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 79889536 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 79889566 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 79889732 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79889749 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79889806 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79889846 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79889857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79889894 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79890149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79890159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79890174 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79890199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79890207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79890373 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79890423 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79890488 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79890492 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79890558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79890659 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 79890672 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 79890930 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 79891235 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79891241 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79891279 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79891291 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 79891327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79891740 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79891792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79892037 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79892261 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 79892332 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 79892458 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 79892526 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 79892573 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 79892866 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 79893406 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79893491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79893629 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79893636 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 79893773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79893930 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 79894001 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79894102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79894108 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 79894125 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79894198 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79894419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79894557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79894637 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79895103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79895133 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79895141 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79895169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79895177 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79895279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79895318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79895361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79895441 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79895469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79895550 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79895571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79895700 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79895894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79896167 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79896196 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79896406 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79896515 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79896586 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79896600 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79896652 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 79897072 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 79897196 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 79897544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79897604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79897609 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79897720 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79897733 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79897746 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79897858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79898114 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79898172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79898183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79898189 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79898199 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79898249 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79898395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79898549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79898585 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79898716 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79898736 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79898953 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79898971 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79899067 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79899102 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79899237 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79899324 C A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 79899343 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79899367 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 79899540 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 79899643 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79899757 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79899877 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79900042 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79900269 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79900329 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 79900665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79900682 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79900701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79900851 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 79900919 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79901021 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79901081 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79901248 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79901265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79901291 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79901313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79901393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79901502 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79901594 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 79901731 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79901735 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79901761 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79901776 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79901827 T G Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 79902025 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79902061 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79902168 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79902335 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 79902425 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79902444 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79902465 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79902815 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79902840 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79902857 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79902901 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79902910 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79903046 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79903048 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79903139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79903229 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79903240 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79903593 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79903597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79903774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79903851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79903946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79903963 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79904026 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79904086 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 79904142 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 79904204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79904249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79904253 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79904318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79904422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79904565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79904634 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79904647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79904966 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79905222 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79905475 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 79905509 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79905534 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79905558 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79906048 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 79906208 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79906845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79907662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79907942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79909160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79909400 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79909830 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 79910693 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79911198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79911536 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 79913246 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79914022 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79914169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79914525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79914643 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 79914880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79915502 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79915643 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79916015 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79916322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79917356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79917458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79917886 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79918382 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79918499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79918942 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79919198 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 79919453 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79920113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79920712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79921841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79923544 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79923846 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79924262 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79925251 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79926661 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79926785 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79928133 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79928603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79928907 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79929844 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79930349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79930835 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 79930957 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79932017 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79933533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79933684 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 79933840 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79934973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79935574 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79935590 A T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 79935644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79938934 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79939635 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79939719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79939770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79940675 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79940739 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79943891 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 79944198 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79944859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79945088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79945160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79945202 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 79945370 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79945530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79945771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79945840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79946446 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 79946694 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79946834 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79946964 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 79948376 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79948417 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 79948537 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 79948730 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79948776 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 79948788 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79949066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79949075 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79949210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79949596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79949984 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79949985 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 79950049 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79950082 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79950293 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79950637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79950692 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79950991 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79951017 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79951025 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79951062 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79951108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79951302 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79951345 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79951449 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 79951793 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79951932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79951999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79952228 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 79952264 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79952357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79952619 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79952823 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79952888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79953038 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79953136 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79953142 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79953155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79953165 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79953222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79953268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79953296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79953301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79953499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79953502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79953525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79953601 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79953624 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79953668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79953721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79953961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79954078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79954148 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79954225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79954262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79954304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79954357 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79954366 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 79954435 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79954442 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79954488 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79954578 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79954602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79954609 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79954649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79954778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79954800 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79954920 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 79954932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79955052 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79955082 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79955121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79955147 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79955166 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79955168 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79955299 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79955326 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79955358 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79955478 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79955499 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79955524 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79955540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79955602 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79955633 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79955649 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79955714 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 79955772 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 79955818 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79955830 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79955851 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79955856 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79955867 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79955881 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79955934 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 79956011 C T Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 79956086 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 79956171 C T Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 79956235 T C Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 79956426 G T Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 2 79956459 A G Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.0833333333333333 12 12 1 10 1 2 79956601 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 79956632 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 79956662 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 79956739 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79956791 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 79956806 C T Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 79956868 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 79956922 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 79957037 G T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 79957065 G T Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 79957119 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 79957202 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 79957265 C A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 79957327 C A Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 79961357 A C Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 79961554 T C Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 79961622 A T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 79961669 T G Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 79961803 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 79961827 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 79961858 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 79961938 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 79961940 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 79962211 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79962291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79962294 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79962324 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79962447 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 79962572 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79962677 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79962692 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 79962794 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79962840 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79962846 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79962955 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79962966 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79963934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79964158 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79964160 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79964273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79964407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79964463 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79964529 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79964695 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79964922 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79964960 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79964977 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79965304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79965308 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79965414 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79965499 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79965733 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79965934 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79965988 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79966068 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79966092 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 79966183 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79966191 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 79966264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79966316 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79966884 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79966945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79967144 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79967162 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79967264 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 79967379 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79967867 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79968313 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 79969558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79970205 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79970276 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79970373 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79970392 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79970807 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 79970882 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79970895 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79970922 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79970932 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79971081 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79971140 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79971185 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79971386 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79971552 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79971563 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79971564 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79971587 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79971612 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79971634 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79971693 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79971702 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79971823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79971834 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79971909 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 79971927 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79971935 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79972044 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79972049 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79972060 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79972099 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79972119 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79972152 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79972157 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79972200 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79972204 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 79972262 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79972301 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 79972407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79972409 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79972494 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 79972536 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79972649 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79972734 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79972834 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79972844 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79973053 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79973089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79973113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79973311 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79973450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79973487 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79973538 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79973627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79974679 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79975060 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 79975430 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79976296 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 79976628 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 79977719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79978910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79979111 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79983802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79986637 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 79986691 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 79986773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79986946 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 79986986 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79987150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79987488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79988267 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79988642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79988677 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79988984 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79989000 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79989253 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 79989322 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 79989814 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79990564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79990693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79990770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79991232 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 79991246 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 79991687 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79992260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79992521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79992795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79992849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79992900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79994287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79994855 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 79994920 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 79995068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79995285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79996273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 79996338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79997049 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 79997073 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 79997612 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79997681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 79998094 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 79998710 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80000428 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80000879 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 80001726 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80001736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80005090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80005266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80005357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80005423 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80005485 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80005593 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80005618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80005831 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80007336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80007865 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80007867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80007996 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80008130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80008690 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80009191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80010601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80010900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80011037 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80011572 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80011929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80013564 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80015869 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0 0.85 0.15 17 23 0 17 3 2 80016565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80016636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80017988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80018467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80018560 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80018844 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80019140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80019579 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 80019598 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80021047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80021819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80022499 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80024973 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80025377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80027098 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80027113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80027387 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80028378 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80028393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80028400 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80028476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80028561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80032246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80032508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80032786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80033725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80033733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80033832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80033908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80034252 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80034978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80035979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80035984 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80036050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80036629 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80037130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80037217 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80037379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80037419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80037606 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80037693 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80037806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80037892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80037963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80038133 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80038135 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80038325 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80038336 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80038365 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80038639 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 80040959 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 80041513 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80041720 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80042001 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80043095 C T Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 80045267 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80048849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80049648 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80050833 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80051381 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80052087 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 80053188 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80053356 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80053459 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 80053651 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80053777 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80053939 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80054486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80054556 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80054567 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80054580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80054655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80054708 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80055892 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80056007 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80056126 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80056323 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80056972 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80057083 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 80057604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80057914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80058329 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80058865 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80059444 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80060386 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 80060698 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 80061294 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80061967 C T Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 80062572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80062631 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80063031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80063086 C T Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 80070983 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 80071688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80072252 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80072639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80073778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80073859 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80073877 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80074020 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80074163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80074189 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80074852 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80075051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80075506 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80075625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80076302 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80076325 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80076413 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 80076488 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80076511 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80076526 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80076546 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80076553 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80076586 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 80076947 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80077138 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80077422 C T Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 2 80077428 T A Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 8 10 0 8 1 2 80077542 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 80077616 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 80077785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80077856 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80077865 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80078021 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80078074 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80078122 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80078145 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80078226 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80078510 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80078666 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80078698 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80079187 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80079416 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 80079423 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 80080698 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 80080754 G A Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 80080832 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80081756 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80081781 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80081784 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80081966 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80082136 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80082273 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80082415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80082634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80082676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80082800 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80082865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80082885 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80083005 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80083160 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80083408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80083482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80083804 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80083878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80083968 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80084426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80084593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80084793 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80084806 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80085128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80085187 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80085190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80085358 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80086883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80098080 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80098489 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 80098989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80099261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80099601 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80100229 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80100423 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80101655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80102744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80102805 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80102827 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80103013 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80103229 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80103335 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80103372 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80103478 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80103622 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80103908 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80104201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80104790 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 80105510 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80105694 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80105723 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80106001 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80106011 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80106129 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80106148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80106287 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80106308 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80106493 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 80106817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80107190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80107399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80107473 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 80107731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80107935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80108021 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80108122 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80108442 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80108576 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80108587 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80109612 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 80109759 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80109857 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80109997 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80110303 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80110347 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80110489 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80110707 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80110983 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80111001 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80111099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80111134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80111296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80111314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80111671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80111799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80111842 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80111895 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80111911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80112007 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80112068 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80112283 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80112426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80112442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80112455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80112498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80112932 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80112977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80112990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80113118 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80113429 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80113519 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80113536 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80113616 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80113622 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80113705 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80113787 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80113809 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80113836 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80113876 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80113901 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80114318 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 80114343 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80114404 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80114416 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80114594 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80114649 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80114659 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80114825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80115330 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80115615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80115776 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80115863 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80115873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80116460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80117166 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80117208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80117312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80117373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80117466 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80117584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80117601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80117650 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80117679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80117752 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80117803 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80117951 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80118156 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80118342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80118358 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80118425 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80118438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80118444 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80118794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80118817 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80119053 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80120574 T C N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 80126673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80130647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80130723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80131686 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80133215 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80133222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80144611 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80144627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80144640 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80147875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80149071 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80150813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80151527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80151729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80154840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80155668 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80155797 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80155929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80156058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80161669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80161835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80162590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80162970 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80164123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80167839 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 80168479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80168521 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80169655 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80170913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80171234 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80171344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80171491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80173402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80175889 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80176267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80176617 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80178434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80178626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80178784 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80179499 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80180073 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80180623 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80182834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80183346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80183447 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80183508 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80183751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80183811 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80184382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80184858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80185318 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80186648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80186888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80189197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80189696 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80189736 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80190568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80190686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80191827 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 80192046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80192087 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80192261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80192276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80192545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80192546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80192616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80193286 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80193980 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80194844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80195921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80196838 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80197995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80198124 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80198714 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80199245 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 80199909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80200987 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80201015 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80202773 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80203027 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80203042 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80203053 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80203162 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80203344 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80203345 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 80203373 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80203610 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80203754 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80203992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80204184 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80204189 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80204430 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80204678 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80204715 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80204910 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80205028 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80205360 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80205370 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80205550 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80205783 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 80205824 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 80205830 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80205950 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 80206001 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80206011 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80206037 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80206107 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80206213 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80206590 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 80206613 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80206645 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80206649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80206672 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80206687 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 80206688 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 80206704 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80206710 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 80206830 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 80206916 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 80207171 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80207236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80207291 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80207314 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80207447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80207460 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80207497 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80207681 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80207716 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80207732 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80207933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80208126 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80208268 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80208405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80208737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80208765 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80209224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80209490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80210325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80210514 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 80210544 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80211291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80211752 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80212060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80212091 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80214298 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80215856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80217496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80217715 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80217974 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80218006 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80218119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80218461 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80218541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80218594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80218634 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80218761 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80218806 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80218916 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80218928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80218950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80218993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80219175 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 80219428 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 80219617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80219850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80219852 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80220142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80220184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80220201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80220202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80220890 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80220983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80221485 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80221497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80221499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80222907 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80222977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80222994 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80223013 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80223030 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80223131 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 80223144 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80223240 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80223260 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80223282 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 80223817 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 80224051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80224147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80224196 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80224197 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80224215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80224280 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 80224599 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80224770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80225352 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80226072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80226197 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80226816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80226842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80226988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80227041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80227297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80227344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80227431 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80227713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80228112 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 80228113 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80228312 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80228333 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 80228652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80228802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80228840 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80229316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80229784 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80229785 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80229812 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80229917 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80230067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80230186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80230463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80230741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80230872 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80231456 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80233575 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80233614 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80233645 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80233980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80234119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80234632 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 80234865 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80235181 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80235621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80235828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80235946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80236014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80236022 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80236167 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80236346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80237283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80237294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80237642 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80237761 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80237801 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80237916 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80237989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80238187 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80238249 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80238264 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 80238433 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80240833 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80240940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80242247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80243256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80243879 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80243939 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80243987 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80243996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80244549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80244853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80244858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80245112 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80245387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80245478 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80245581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80245639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80245847 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80245931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80246408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80246511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80247330 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80248284 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80248885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80250046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80250200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80250973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80251855 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80252018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80252064 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80252090 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80253206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80253300 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80253319 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80253321 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80253384 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80253785 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80253805 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80253829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80254093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80254189 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80254372 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80254382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80254564 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80254565 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80254678 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80254712 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80254714 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80254954 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80254955 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80255176 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80255265 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80256534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80256674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80256719 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80257376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80257902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80258134 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80258531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80258772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80258938 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80258975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80259009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80259065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80259113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80259345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80259521 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80259523 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80259886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80259908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80260341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80260355 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80261205 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80261551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80261611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80261646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80261727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80261943 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 80262125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80262138 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80262252 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80262525 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80262549 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 80262676 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 80262701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80262735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80262841 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 80263286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80263328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80263356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80263453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80263678 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80263757 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80264128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80264159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80264221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80264237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80264485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80264627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80264663 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80264679 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80264878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80265097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80265102 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80265289 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80265698 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 80266128 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80266315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80266446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80267655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80267724 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80267852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80267978 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80267982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80268598 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80269746 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80270052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80270187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80270255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80270361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80270405 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80270457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80271472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80271898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80271989 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80272123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80272507 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80272793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80272949 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80273006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80273007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80273985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80275038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80275248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80275903 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80276576 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80276578 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80276595 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80276697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80276962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80277212 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80278888 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80278899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80279111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80280889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80281206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80281331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80281334 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80281832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80281937 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80281972 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80281989 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80282511 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80282629 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80282694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80282759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80282842 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80282911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80282912 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80282924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80283225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80283439 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80283486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80285278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80286314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80287683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80287747 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80288126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80288282 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80290535 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80291399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80291936 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80292235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80295006 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80295950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80296590 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80297085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80297106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80297232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80297533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80297578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80297846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80298890 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 80298898 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80299179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80299200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80299246 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80300688 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80300765 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80300799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80301462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80301483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80301878 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80302506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80302691 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80302773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80302907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80302909 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80303050 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80303109 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80303146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80303158 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80303239 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80303441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80303492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80303510 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 80303567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80303595 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80303596 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80303640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80303708 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80303750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80303866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80303896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80303927 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 80303941 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 80304040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80304153 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80304434 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80304563 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80305038 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80305158 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80305352 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80305504 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80305597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80305698 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80305738 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80307095 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80310146 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80310861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80311416 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 80311424 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 80311578 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80312677 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80312727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80313041 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80313467 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80313568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80313791 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80313807 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80314317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80314329 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80314662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80315311 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80315437 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80316801 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80317067 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80317096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80317159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80318868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80319914 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80322127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80322717 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80323076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80323951 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80325455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80325654 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80325674 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80326574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80327487 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80328979 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80330482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80330489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80332241 T A Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 80333288 A T Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 80333477 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 80333800 T A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 80335226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80335438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80335583 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80335610 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 80338243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80338845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80338870 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 80338916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80339854 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80339856 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80340550 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 80343290 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80343854 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80343961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80344619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80346239 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80346809 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 80346813 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80347918 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80349128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80349391 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80349894 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80350426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80350634 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80351113 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80352208 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80352493 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80352789 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80352990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80354379 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80354581 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 80354676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80355558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80357362 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80357864 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80358244 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80359655 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80361850 T C Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 80362470 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80363931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80364140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80364333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80364336 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80366710 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 80367076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80369215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80369331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80371948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80372050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80372991 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80373274 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80373507 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 80374302 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 80375100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80375200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80375201 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 80375330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80375394 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80375791 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 80377043 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80377884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80377978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80378149 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80378184 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 80378541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80378675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80380408 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80381533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80381861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80382549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80383311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80384094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80384567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80384756 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 80384888 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 80385456 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 80385728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80386340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80386538 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80388976 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 80389159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80390329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80390692 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 80391334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80393432 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 80394023 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 80394848 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 80395579 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80395711 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80396335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80396480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80398971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80399229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80399961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80400728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80400987 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80400992 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80401700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80401765 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80402553 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80403103 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80403277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80403286 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80403304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80406768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80406784 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80408736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80411961 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80412376 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80413246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80418827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80422172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80422273 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 80422382 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80422386 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 80422721 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 80425276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80425447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80426697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80428748 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80428764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80428817 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80429797 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 80429855 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80429960 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80430174 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80432292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80435673 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 80436315 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80438710 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80441006 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80441154 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80441207 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80441292 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 80441361 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80441381 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80441477 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80441569 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 80441571 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 80441757 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80441878 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 80445955 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80446228 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80446355 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80447093 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80448378 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80448561 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80449024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80449329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80450675 T G N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 2 80450726 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 80453582 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 80454456 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80454693 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80454948 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 80455845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80456755 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 80457036 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80458497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80458612 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 80458637 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80458682 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 80458928 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 80459387 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80459728 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 80459953 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80459956 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80460136 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 80460316 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80460536 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 80460537 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 80460638 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80460653 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 80460739 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 80460971 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 80461044 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 2 80461053 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 80461355 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80461394 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 80461529 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80461539 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 80461601 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 80461617 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 80461618 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 80461760 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 80461840 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80461881 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80461929 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 80461944 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 80461987 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 80462115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80462125 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 80462126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80462172 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80462541 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80462677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80462851 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 80462867 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80462923 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 80462957 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80462977 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80463040 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 80463059 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80463116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80463346 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80463473 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 80463694 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80463734 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80463739 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80463762 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80463998 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80464299 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80464404 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 80464665 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80465191 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80465361 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80465556 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 80465628 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 80465714 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80465874 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 80465928 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80466321 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80466446 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80466481 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 2 80466760 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 80466781 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 80466830 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80466933 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 80466940 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80466974 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 80466992 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 80467248 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 80467340 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80467416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80467424 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 80467456 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 80467477 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 80467618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80467623 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80467670 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 80467761 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 80467787 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80467848 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 80467859 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 80467861 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 80467880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80467884 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 80467982 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 80467993 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 80468016 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 80468244 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 80468267 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80468287 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 80468468 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 80468528 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 80468584 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80468635 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 80468679 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 80468740 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 80469840 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 80469856 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80469905 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 80470466 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 80471177 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80471329 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 80471531 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 80472182 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 80472337 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 80472607 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 80472728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80473094 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 80473151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80473320 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 80473428 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 80473623 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80473871 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80473951 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80473976 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80474056 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 80474063 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 80474083 A C Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 80474153 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 80474270 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80474272 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 80474316 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80474343 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80474355 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80474497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80474837 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 80474899 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 80475118 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 80475399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80475825 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 80475841 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 80476079 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80476090 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80476195 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 80476226 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 80476262 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 80476302 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80476339 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80476380 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80476386 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 80476407 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 80476414 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 80476444 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 80477238 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 80477271 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 80477303 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 80477415 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 80477432 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 80477443 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 80477625 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 80477665 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80477740 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80477801 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 80478065 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80478808 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80478830 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 80478891 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80479134 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80479300 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80479359 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80479500 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80479667 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80480207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80480239 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80481104 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 80481223 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 80481413 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80481444 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80481507 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80481704 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80481827 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 80481834 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 80481896 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80482205 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80482238 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 80482240 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80482387 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80482468 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 80482506 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 80482553 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80482663 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80482699 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80482763 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 80483437 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80483447 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80483460 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80483500 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80483708 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80483824 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80483857 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80483871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80483925 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80484294 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 80484493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80484643 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80484814 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 80484820 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 80485230 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80485295 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80485352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80485448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80485572 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80485633 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 80485761 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80486076 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80486105 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80486248 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80486455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80486478 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80486502 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80486563 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80486616 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80486735 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 80486803 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 80486840 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80486872 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80486933 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80487064 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80487114 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 80487453 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80487458 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80487496 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80487720 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80487821 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80487868 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80487898 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80487899 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80488233 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80488495 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80488657 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80489009 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 80489899 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80489992 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80490017 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80490228 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80490579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80490808 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80491242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80491253 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80491722 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80491793 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80491796 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80491845 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80492733 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 80493185 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80493401 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80493431 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80493459 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80493485 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 80493487 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 80493609 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80493665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80493670 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80493933 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 80493976 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 80493984 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 80494168 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80494248 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 80494541 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80494716 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 80494797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80494826 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80495223 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 80495274 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 80495305 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 80495456 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 80495488 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 80495544 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80495578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80495620 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80495626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80495830 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80495869 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 80496002 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80496028 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80496057 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80496927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80496944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80496997 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 80497031 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 80497092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80497326 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80497926 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 80498055 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80498106 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 80498134 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 80498145 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 80498328 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 80498334 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 80498566 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 80498698 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80499033 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 80499305 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 80499470 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80499960 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 80500174 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 80500326 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80500392 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 80500559 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80500722 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80501063 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80501250 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 80501299 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80501336 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 80501625 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80501635 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 80501857 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 80501932 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80501979 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80502081 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80502104 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80502106 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80502150 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 80502201 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80502202 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80502244 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80502339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80504353 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80504450 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 80504497 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 80504543 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 80505111 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80505149 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 80505214 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80505216 G C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 80505485 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80506153 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80506222 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80506386 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 80506414 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80506512 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 80506706 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80506791 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80506848 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80507073 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80507115 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 80507188 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 80507255 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 80507261 T C N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 80507282 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80507334 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80507427 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80507960 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80507993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80508198 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80508208 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80508436 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80508562 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80508678 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80508862 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80508881 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80509021 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 80509130 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80509244 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80509288 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80509293 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80509324 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80509399 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80509436 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80509440 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80509470 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80509732 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80509736 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80509792 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80510162 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80510314 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 80510344 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 80510394 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80510411 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 80510422 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 80510580 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 80510663 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 80510726 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 80510729 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 80510976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80511066 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 80511097 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 80511151 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 80511641 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80511683 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 80511699 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80511846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80511860 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80512015 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80512028 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80512340 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80512341 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80512681 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80512687 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80512989 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 80513010 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80513019 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80513074 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80513092 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80513223 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80513231 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80513326 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 80513339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80513439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80513624 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 80513650 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 80513682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80513722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80513759 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80513877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514116 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80514336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514423 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80514550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80514900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80514977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80515085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80515284 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80515563 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80515608 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80515612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80515620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80515822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80516238 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 80516703 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 80519007 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 80519058 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80519071 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80519088 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80519126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80519481 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 80519628 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 80519632 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 80519672 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 80519690 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80519763 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 80519898 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80519948 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 80520262 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 80520864 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80521127 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 80521800 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80522916 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80523225 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80523233 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80524260 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 80524461 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80525058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80525527 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 80528625 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80529092 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80529108 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80529549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80529991 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 80530018 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80530053 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 80530060 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 80530201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80530220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80530223 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80530318 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80530338 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 80530406 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80530420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80530442 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 80530495 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80530576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80530586 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80530588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80530602 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80530649 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80530724 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 80530766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80530786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80530840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80530942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80531307 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80531365 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 80531615 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80532026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80532139 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 80532584 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80532670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80532901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80532974 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 80533115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80533257 T A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 80533329 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 80533530 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 80533830 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80533852 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80534066 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80534085 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80534133 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80534324 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80534351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80534390 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 80534433 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80534553 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 80534577 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 80534788 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 80534955 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80535125 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 80535351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80535484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80535677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80535920 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80536381 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80536696 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 80536720 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80536744 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80536793 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80536872 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 80536941 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80536984 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80537360 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80537414 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 80537419 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80537595 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80537842 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80537997 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80538348 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80538499 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80538556 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80538565 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80538705 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80539215 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 80539281 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80539388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80540856 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80540885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80540933 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80541003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80541041 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 80541127 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 80541143 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 80541393 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80541448 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 80541464 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 80541511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80541643 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 80541708 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80541816 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 80541902 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 80542023 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 80542038 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80542130 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80542160 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80542240 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80542452 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80542458 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80542608 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80542762 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80543264 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80543414 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80543456 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80543472 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80543603 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 80543636 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80543789 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 80543875 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 80544105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80544297 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 80544325 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80544474 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80544526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80544829 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 80545020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80545285 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80545382 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80545475 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 80548183 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 80548836 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 80549076 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 80549375 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 80552094 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80552111 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 80552707 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80553170 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 80555297 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80555314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80555556 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80555954 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 80556594 T G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 80556608 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 2 80556739 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 80557643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80558130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80558363 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 80558627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80559558 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80559671 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80559917 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 80560184 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 80563699 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80564336 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80566074 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 80567198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80567425 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 80568066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80569004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80569204 G T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 2 80569976 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80570386 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80571812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80571900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80572233 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 80573357 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80573701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80574148 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80575145 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80576169 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80576702 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80577181 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 80577755 G C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 80578200 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80578989 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80578990 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80580618 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 80581072 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80582679 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80583116 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 80583482 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80583619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80583747 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80583751 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80583796 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80583842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80583925 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80584236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80584412 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80584738 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 80585444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80585609 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80585639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80585670 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80585673 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80587251 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80587257 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 80587314 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80587362 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80588044 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 80588115 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 80588304 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80589694 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80589814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80592416 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 80592734 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80593394 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80593557 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80593591 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80593599 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80593742 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80594009 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80594180 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80594212 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80594264 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80594364 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80594404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80594461 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80594475 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80594476 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80594504 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80594743 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80594761 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80595016 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80595065 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80595149 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80595150 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80595957 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 80596024 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 80596030 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 80596069 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 80596186 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 80596257 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 2 80596396 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80596397 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80596546 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80596843 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 2 80596953 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 80597032 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 80597204 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 80597227 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80597230 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80597241 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 80597285 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 80597359 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 80597380 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 80597527 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 80597626 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 80597627 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80597757 T A N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 2 80597823 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80597826 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 80597870 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80597874 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 80597943 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80597998 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 80598018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80598023 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 80598064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80598143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80598443 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80598456 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80598617 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80598721 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80599215 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80599793 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80599794 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80603387 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80604448 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80605004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80605009 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80605090 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80605129 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80605235 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80605332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80605607 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80605817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80605859 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 80606321 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 80606789 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 80606897 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80607008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80607142 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80607320 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80607528 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 80607558 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80607637 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80607665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80607926 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 80607949 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80608011 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 80608053 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 80608097 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 80608146 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80608230 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 80608288 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 80608309 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80608540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80608737 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80608836 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 80608931 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80608932 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80608978 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 80608985 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 80609283 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 80609826 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80610206 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80610812 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80613708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80613747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80614080 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80614156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80615377 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80615436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80616421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80616563 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80616614 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80617329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80618142 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80620344 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 80620689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80623368 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80625299 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 80625408 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80625608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80625628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80625804 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80625888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80625975 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 80625976 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 80626257 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80626957 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80627105 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80627161 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80627216 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80627374 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80627384 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80627433 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80627620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80627643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80627747 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80627772 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80627791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80628009 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80628072 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80628166 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80628596 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80629067 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80629418 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80629923 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80630339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80630404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80630961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80630971 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80631048 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80631073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80631248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80631733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80632709 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80632721 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80633113 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80633119 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80633131 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80633421 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80633600 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80633654 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80634593 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 80634650 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 80634793 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 80634853 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80634980 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80635300 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80635374 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80635426 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80635458 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80635467 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80635476 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80635495 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80635572 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80635653 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80636235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80636304 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80636421 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80636440 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80636675 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80637110 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80637193 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80637342 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 80637398 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 80637583 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 80637597 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80637622 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80637780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80637879 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80637906 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80638018 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80638159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80638515 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80638516 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 80638543 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80638556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80638710 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80638736 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80638737 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80638759 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 80638856 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80639065 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80639122 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80639216 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80639217 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80639233 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80639276 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80639308 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80639376 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80639403 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 80639545 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80639565 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80639604 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80639759 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80639788 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80639802 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80639843 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80639871 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80639953 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80639997 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80640019 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80640091 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80640095 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80640108 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80640216 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 80640268 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80640362 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 80640408 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 80640417 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 80640460 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 80640541 C G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 80640563 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 80640574 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80640597 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80640603 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80640628 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80640724 A C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 80640731 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80640803 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 80640905 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80640913 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80641032 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 80641226 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 80641269 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 80641414 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80641510 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80641569 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80641577 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80641601 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80641608 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80641683 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80641713 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80641942 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80641966 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80641998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80642015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80642044 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80642071 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80642122 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 80642139 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80642176 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80642198 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 80642589 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80642609 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80642624 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 80642740 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 80642744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80642779 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80642865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80642895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80642962 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80643028 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 80643090 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 80643097 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 80643159 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80643354 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80643541 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80643734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80643825 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80643923 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80643982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80644001 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80644012 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80644093 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80644097 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80644151 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80644184 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80644351 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 80644370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80644388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80644461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80644476 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80644576 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 80644897 C A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 80644971 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 80645115 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80645144 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80645235 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80645239 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80645248 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80645288 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80645307 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80645347 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80645440 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80645505 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80645838 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 80645931 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80657867 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80657936 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80657970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80657993 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80658026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80658703 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 80658735 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 80658842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80658886 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 80659150 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 80659330 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80659348 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80659697 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80659701 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80659765 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80660278 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80660348 T A Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 80660349 T A N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 80660417 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 80660491 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 80660672 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80660684 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80660708 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80660761 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80660922 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80661059 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80661070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80661111 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80674417 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80674429 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80674446 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80674466 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80674470 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80674529 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80674547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80674558 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 80674578 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80674581 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 80674604 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80674625 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80675041 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80675100 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80675135 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 80675168 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80675173 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 80675224 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80675490 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80675558 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 80676161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80676621 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 80676819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80676995 T C Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 80677177 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 80679198 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80679199 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80679239 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80679344 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80679407 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80679627 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80679632 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80679642 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80679676 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80679720 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80679758 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80679769 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80679797 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80679806 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80679846 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80680101 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 80680195 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80680229 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80680344 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80680473 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80680755 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80680939 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80682392 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80683016 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 80683126 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80683188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80683862 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80684264 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 80684874 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 80685824 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80686042 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 80686622 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 80687015 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80687236 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80687887 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80687967 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80688211 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80688367 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80688480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80688568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80688588 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80688627 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80688871 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80689037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80689045 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80689067 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80689125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80689754 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80691858 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80693028 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80694002 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80694745 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80694981 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80696373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80697301 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 80697325 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 80697365 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80697381 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80697398 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80697571 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80697949 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80698140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80698259 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80698272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80698427 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80698489 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80699066 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80699155 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80699210 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80699218 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80699300 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80699402 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80699583 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80699809 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 80700307 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80700777 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 80701244 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80701809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80702766 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 80704287 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 80704577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80704926 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80705775 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 80706396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80706624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80706836 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80706839 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 80706937 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80706977 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80707131 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 80707312 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 80707543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80707567 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80707583 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80707686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80707689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80707851 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 80708045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80708049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80708121 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 80708140 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80708214 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80708414 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 80708428 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80708435 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80708578 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 80708937 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80709018 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80709050 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 80709104 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 80709170 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 80709249 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 80709277 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80709708 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 80709860 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80709949 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 80710234 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80710432 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80710529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80710568 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 80710610 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80710680 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80710844 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80710957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80711091 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80711190 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80711377 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80711457 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80711524 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80711569 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80712101 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80712440 T A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 80712806 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 80712872 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80713267 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80713385 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80713445 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80713458 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80714872 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80716017 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80716098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80718460 C G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 80718740 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 80722114 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80722891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80722922 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80722946 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 80723347 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80723696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80724050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80724083 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 80724342 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80725990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80726509 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80726849 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80727007 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80727632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80727839 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 80727980 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 80728773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80731567 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80731847 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 80732526 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80734273 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 80734910 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 80735231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80735573 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 80735580 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80736525 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80736951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80737044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80737118 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 80737421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80737649 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80737951 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 80738248 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 80738969 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 80739331 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 80739463 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 80739708 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80740071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80740095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80740775 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 80740791 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80740919 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 80740977 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80742127 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80742282 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80742847 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80743369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80743516 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80743868 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80744145 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 80744418 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 80744678 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 80745109 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 80745279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80745471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80745531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80745587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80746224 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 80746541 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 80746590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80746669 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 80746930 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 80746976 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80747284 T G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 80747573 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 80747597 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 80747817 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 80748239 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80748362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80748541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80749218 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 80749472 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80749530 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80749545 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 80749578 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80749701 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80749807 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80749949 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 80750005 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 80750028 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 80750065 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80750082 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 80750106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80750159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80750164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80750377 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 80750521 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80750640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80750677 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80750682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80750999 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 80751528 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 80752059 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80752156 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80752430 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 80752439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80752527 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80752869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80752896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80753145 A C N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 80753345 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 80753358 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 80753390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80753548 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 80753578 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80753605 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 80753627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80753641 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80753758 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 80753827 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 80753873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80753900 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 80753911 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 80753936 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 80753975 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 80754059 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 80754128 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80754166 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80754198 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 80754542 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 80754543 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 2 80754576 T A N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 2 80754652 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 80754737 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 80754763 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 80754848 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 80754849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80755116 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 80755607 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 80755960 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 80756215 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 80756308 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80756405 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80756469 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 80756576 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80756592 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80756617 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80756758 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 80757173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80757202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80757416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80757641 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80757941 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80758013 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80758237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80758257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80758258 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80758498 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80758868 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 80759468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80759871 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 80759965 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 80760007 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 80760027 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80760085 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 80760179 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80760222 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80760240 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 80760453 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 80760625 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80760653 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 80760709 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80761742 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 80761848 G A Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 80761855 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 80761988 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 80761990 C A Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 80762004 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 80763453 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 80763514 G C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 80763531 G T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 80763532 A G Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 2 80763636 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 80763639 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 80763647 C G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 80763655 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 80763699 T G Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 80763800 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 80763904 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 80763928 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 80763981 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80764518 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 80764547 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 80764565 T A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 80764589 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 80764775 G C Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 80764972 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80765025 C A Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 80765256 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 80765258 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 80765328 G T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 80765590 G T Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 80765607 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 80765760 A C Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 2 80765761 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 2 80765920 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80766182 T C Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 80766295 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 80766309 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 80766397 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 80766420 T C Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 80766431 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 80766447 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80766450 G A Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 80766538 A T Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 80766557 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80766633 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 80766634 C A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 80766799 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 80766945 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 80766972 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 80766993 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 80767086 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80767206 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80767363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80767807 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 80767943 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 80767978 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 80767984 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 80768523 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 80768568 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 80768635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80768641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80768681 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 80768800 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 80768808 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 80768835 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 80768856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80768873 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 80768881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80768928 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 80768992 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 80769181 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 80769189 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 80769385 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 80769417 T G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 80769529 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 80769603 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80769661 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 80770001 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 80770015 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 80770111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80770399 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 80770490 C A N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 80770520 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 80770732 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 80771101 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 80771156 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 80771688 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 80771702 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80771761 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 80771777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80771969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80772541 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 80772546 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80772902 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 80773094 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80773158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80773304 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 80773332 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80773543 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 80773893 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 80774208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80774385 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80774500 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80774609 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 80774652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80774948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80775233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80775312 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80775479 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 80775611 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80775633 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 80775744 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 80776002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80776031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80776224 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 80776303 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 80777484 T G Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 80777730 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 80777739 G A N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 2 80777741 T C Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 2 80777894 T C Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 80777917 A G Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 80777937 A C Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 2 80778113 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 80778263 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80778507 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80778613 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80778704 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80778858 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80779025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80779314 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 80779343 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 80779527 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80779737 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 80779765 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 80779879 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 80780145 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 80780519 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80780542 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80780946 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80781260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80781445 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 80781583 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 80781806 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80781844 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80782034 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 80782695 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 80783072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80783313 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80783374 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 80783441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80783702 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80784175 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 80784687 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 80785009 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 80785536 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 80785597 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80785641 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 80785739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80787600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80787645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80787722 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80787787 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 80787805 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80789039 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80789072 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 80789186 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80789365 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 80789491 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 80790138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80790737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80791117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80791123 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80791192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80791202 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 80791252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80791433 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 80791741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80792043 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80792088 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 80792130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80792134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80792158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80792814 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80793233 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 80793789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80794496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80794661 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 80794703 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 80794938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80795657 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 80796236 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80796415 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80796437 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80804387 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 80804400 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80804669 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 80804998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80805755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80806182 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 80806208 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 80806234 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 80806261 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 80806296 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80806307 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 80806660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80806757 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 80806870 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 80807060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80807266 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80807870 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 80810202 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80810217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80811371 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 80811460 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80812058 G A Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 80812167 T G Y N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 80812252 A G N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 80812311 A G Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 80812342 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 80812384 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 80812704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80813171 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80813281 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 80813629 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 80814259 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 80814534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80814758 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80815930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80820587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80821315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80822939 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 80827159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80827720 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 80827826 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 80829102 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 80830440 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80830463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80831045 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80831471 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 80832843 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80832844 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80834849 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80835673 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 2 80835944 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80836469 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 80836483 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80837163 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80837271 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80838338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80847330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80849392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80849410 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80850033 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 80851254 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 80851264 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80851735 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 80852111 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 80852210 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80852461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80853031 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 80853330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80854235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80854310 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80854459 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80854486 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 80854552 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80855541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80855906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80856058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80856256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80858578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80858814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80858846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80860049 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 80860059 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 80860117 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80860962 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80861733 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80862129 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 80862159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80862356 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80862545 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 80862849 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 80863172 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 80863237 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 80863276 G T Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 80863425 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 80863432 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 80863681 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 80863753 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 80863783 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80863815 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 80864192 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 80864302 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80865162 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 80865329 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80865434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80865870 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80866475 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 80866673 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 80866935 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80867100 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80867166 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80867337 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 80867407 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80867463 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80867642 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80867649 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80867661 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 80867802 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 80867826 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 80868283 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80868314 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80868331 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80868347 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80868403 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80868423 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80868497 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80868524 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80868702 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80868703 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80868734 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80868770 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80868780 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80868802 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80868967 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80869083 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80869140 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80869164 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80869260 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 80869313 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 80869327 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 80869392 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80869740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80869884 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80870033 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80870144 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 80870266 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 80870491 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80870698 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80870852 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80870895 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80870912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80871088 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80871089 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80871288 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80871380 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80871439 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80871449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80871498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80871548 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80871640 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80871659 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80872402 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 80872459 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 80872494 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 80872721 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 80873046 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 80873174 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80873324 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80873699 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80873837 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80874337 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80874429 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80874430 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80875074 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80875181 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80875249 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80875422 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80875441 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80875613 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 80875691 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80875844 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 80875947 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 80876061 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80876550 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.307692307692308 17 9 8 1 4 2 80876565 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 80876568 T G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 80876746 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80876825 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80876845 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80877177 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80877555 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80878138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80878298 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80878673 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 80881366 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 80881422 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 80882276 G C Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 80882369 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 80882605 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 80882640 C T Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 80883053 G T Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 80883249 G C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80883388 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 80883651 G C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 80884198 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80884665 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 80885681 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 80887121 A C Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 80887281 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80887432 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80887778 G C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 80887899 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 80888274 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 80888978 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 80890905 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 80891122 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80891598 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80891860 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 80891880 T A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 80892631 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80892666 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80892984 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 80893379 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 80893452 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80893754 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80896396 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80896673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80896832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80896893 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80897016 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80897618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80898957 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80899267 G T Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 80899495 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 80900019 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80900149 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 80900178 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 80900254 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80900411 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80900442 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80900588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80900612 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80900682 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80900820 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 2 80900825 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 80900873 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80900955 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 80901184 T A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 80901305 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80901330 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80901347 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80901371 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 80901398 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80901468 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80901635 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80901656 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80901934 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 80902271 C T Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 80902545 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80902638 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80902872 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 80902884 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 80902925 A C Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 80903452 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80903944 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 80904288 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80904477 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 80904542 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 80905309 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80905315 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80905358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80905400 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 80905931 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80907082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80907143 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80907408 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 80907576 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80907610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80907717 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80907963 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80908070 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80908278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80908316 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80908722 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 80908785 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80908912 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 80915483 T A Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 80915568 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 80915752 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 80916027 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80916082 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80916284 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80916330 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80916362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80916391 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80916457 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80916469 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80916472 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80916535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80916586 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 80916796 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80916852 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 80916893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80917279 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80917350 A T Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 80917353 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 80917381 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 80917568 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80917752 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80918147 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80918299 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 80918874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80919063 G T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 80919089 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 80919092 G C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 80919198 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 80919238 T C Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 80919269 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80919350 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80919351 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 80919365 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80919388 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 80919551 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80919612 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 80919935 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 80920331 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80920661 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 80920942 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80921577 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 80921851 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80921974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80922083 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 80922683 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80923461 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 80923740 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 80924716 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 80924886 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 80925399 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80925431 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80925491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80925546 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 80925709 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 80926151 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 80926188 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80926253 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 80926255 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80926624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80926732 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 80926746 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80926850 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 80927068 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 80927903 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80928095 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80928561 G C N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 80929701 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80930022 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 80930095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80930371 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 80931002 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80931094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80931258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80931269 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 80931546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80931559 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80931979 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 80932044 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80932597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80932710 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80933136 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 80933225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80933804 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 80934157 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 80934188 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 80934235 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80934355 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80934376 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 80935056 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80935176 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80935459 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 80935791 A C Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 80935834 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 80936524 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 80936690 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 80936789 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80937081 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80937282 A G Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 80937409 G C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 80937630 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 80938011 G T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 80938132 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80938191 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80938565 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80938594 A T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 80938705 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80938739 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80939025 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 80939130 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80939348 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80939756 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 2 80941297 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 80941662 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80942164 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80942623 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 80942955 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80943119 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80943155 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 80943435 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80943469 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 80943484 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 80943572 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 80943669 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80943788 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80943795 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80943848 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80943932 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 80944004 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 80944040 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 2 80944227 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 80944247 G A N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 80944315 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 80944424 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 80944459 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80944520 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80944542 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80944819 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80945225 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80945266 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80945439 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80945634 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80945699 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80945848 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 80945914 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 2 80946030 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 80946262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80946432 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 80946550 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80946568 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80946618 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80946770 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80946786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80947035 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80947047 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 80947071 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80947078 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 80947163 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 80947184 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 80947354 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 80947371 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80947464 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 80947496 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80947631 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80947691 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 80947732 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 80947798 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 2 80947982 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 80948038 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80948083 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80948173 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 80948344 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80948390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80948725 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 80948743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80948965 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 80948978 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 80949138 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 80949474 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 80949649 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 80949812 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80949899 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 80950230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80950825 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 80950833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80950858 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80950899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80950987 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80951418 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80951431 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 80951452 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 80951911 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80951953 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 80952077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80952195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80952383 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 80952405 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 80952596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80952786 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 80952830 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 80952873 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80952883 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 80953057 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 80953080 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80953081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80953149 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 80953444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80953577 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80953623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80953755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80953783 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 80953802 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80953877 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 80953953 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 80953990 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80954038 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 80954093 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 80954178 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 80954185 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 80954256 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 80954286 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 80954540 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80954796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80954849 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80954924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80955233 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80955249 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80955300 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80955569 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80955647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80955676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80955682 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80955697 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80955740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80955757 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 80955762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80956000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80956087 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 80956367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80956394 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80956467 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80956476 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80956623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80956637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80956680 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80956839 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80956875 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80957134 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80957410 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80957453 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 80957585 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 80957734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80957747 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80957832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80957850 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 80958250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80958293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80958519 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80958548 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 80958661 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80958673 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 80958679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80958711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80958769 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80958798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80958842 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 80959062 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 80959377 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80959390 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 80959538 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 80959583 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80959822 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80960159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80960183 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 80960233 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80960547 C T Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 80960623 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 80960651 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 80960809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80960935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80961065 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 80961115 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 80961237 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 80961292 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 80961386 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 80961418 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 80961427 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 80961442 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 80961443 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 80961555 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80961572 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80961633 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80961663 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 80961666 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80961757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80961807 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80962149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80962187 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80962211 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 80962221 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80962411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80962432 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80962441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80962453 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80962480 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80962539 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80962649 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 80962686 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80962714 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 80962762 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 80962907 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80962917 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80962958 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80962995 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80963054 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80963075 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 80963079 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80963217 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 80963286 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80963349 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 80963416 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80963418 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 80963470 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80963490 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80963600 G A Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 80963664 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 80963930 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 80964204 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80964480 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 80964513 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 80964532 C G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 80964538 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80964749 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 80964803 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 80964804 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 80965189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80965219 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 80965223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80965260 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 80965361 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 80965395 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 80965517 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 80965746 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 80966255 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 80966540 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 80967362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80967944 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80968231 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 80968465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80968616 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 80968714 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 80969617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80969951 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 80970001 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80971283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80971350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80971465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80972804 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 80973381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80974061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80974432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80974745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80975102 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 80976116 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80976140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80976620 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80976645 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80976849 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 80977397 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80977466 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80978160 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80978458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80978563 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80978806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80980249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80980557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80981434 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80981594 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80982143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80982988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80984350 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 80984530 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 80985134 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80985278 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 80986183 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 80986639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80987000 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 80987315 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 80987892 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80989080 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 80989640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80990114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80990700 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 80991188 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 80991667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80991752 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 80992002 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 80992094 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 80992264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 80992377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80992575 T A Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 80998438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 80998498 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 80998505 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 80998572 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 80998682 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 80998967 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 80999007 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 80999128 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 80999783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81000294 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 81000450 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 81000621 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 81001286 C G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 81001548 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 81002245 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 81002572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81003025 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 81003169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81003248 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 81003857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81004089 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 81004786 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81004802 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81004905 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81005035 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81005837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81006337 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81006869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81006940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81007591 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 81007924 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81008109 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 81008722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81008771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81009717 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81010282 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81010300 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81010831 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81011120 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81012780 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81013476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81013857 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81015660 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81015678 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81016562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81016718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81018033 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 81018150 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81018180 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81019247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81019381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81019392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81019561 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 81019612 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 81019705 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 81019951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81019968 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 81019992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81020019 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 81020100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81020311 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 81020436 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81020551 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 81020629 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81020693 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81021679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81021955 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 81022115 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81022243 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 81022316 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81022405 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 81022939 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 81023727 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 81023782 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 81023877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81024206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81025186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81025327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81025407 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81025726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81026546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81026841 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81028296 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81028492 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 81028648 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81028761 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81028904 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 81029123 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81029231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81029468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81029886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81029961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81030882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81031234 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 81031505 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 81031575 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 81031577 A T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 81031667 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 81031891 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 81031922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81032122 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81032280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81032328 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81032666 C A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 81032857 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 81032949 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81033087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81033128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81033639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81033908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81033956 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81034108 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81034268 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81034384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81034492 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81034594 T G Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 81034870 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81035411 A C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 81035552 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 81035675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81035697 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81035714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81035866 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 81035889 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 81036273 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 81036310 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 81036439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81036527 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 81036588 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81036712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81037000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81037775 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 81037936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81037956 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 81037961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81038056 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81038182 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 81038496 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 81038741 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81039074 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81039094 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 81039099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81039245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81039366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81039467 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 81039477 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 81039486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81039511 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 81039542 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 81039691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81039714 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 81039775 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 81039910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81039998 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81040075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81040185 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 81040236 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 81040340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81040405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81040500 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81040553 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81040672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81040703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81040930 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 81041717 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81041765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81042184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81042387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81042413 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81042604 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 81042981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81043013 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81043276 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81044082 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81044260 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81044274 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81045015 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 81045054 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81045264 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81045497 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 81045712 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81047045 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81047778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81048037 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81048310 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81048344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81048472 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81048834 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81049608 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81049697 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81051378 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81051798 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81051904 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 81052059 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 81052314 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81056495 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81056535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81056601 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81056642 A C Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 81056777 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81057070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81057463 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81058545 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 81058549 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81059668 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81059725 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81059896 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81059916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81060155 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81060265 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81061022 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81061313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81061750 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81061802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81062191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81062724 C G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 81062809 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81062857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81063165 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 81063679 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81064052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81064204 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81064266 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81066157 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81068016 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81068276 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81069595 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81071328 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 81072333 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81072490 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81072496 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 81072654 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81072890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81073576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81073774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81073832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81074030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81074136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81074146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81074211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81074212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81074336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81074405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81074406 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81074491 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81074827 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81075007 C G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 81075013 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 81075071 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81076060 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81077134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81077603 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81077685 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81078148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81078628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81078858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81078922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81079330 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 81079367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81079600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81079722 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81079763 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 81079793 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 81080021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81080052 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 81080066 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81080397 G T Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 81080528 A T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 81080549 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 81080706 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 81080825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81083080 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 81083236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81083244 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 81083267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81083340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81083347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81083589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81084331 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81084797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81084930 C A Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 81084963 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81085380 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 81085405 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 81085459 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81086139 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81086152 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 81086680 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 81086685 T A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 81087099 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 81087223 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 81087395 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81087516 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81087643 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 81087847 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 81087875 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81087908 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 81088036 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81088059 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 81088169 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 81088252 T A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 81088355 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 81088484 T C Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 81088594 A C Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 81088751 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81088899 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81089177 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 81089323 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 81089432 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 81089969 T A N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 81090208 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 81090457 T G Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 81090516 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 81090570 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 81090674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81090757 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 81090829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81091072 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 81091096 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81091306 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81091434 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 81091443 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 81091600 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 81091617 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81091674 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81091677 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81091691 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81091746 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81091775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81092083 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 81092257 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 81092399 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 81092436 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 81092556 C T Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 81092568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81092646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81092675 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 81092766 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 81092803 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 81092849 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 81092914 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 81092983 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 81093005 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 81093006 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 81093074 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 81093091 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81093157 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81093274 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81093308 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81093317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81093323 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81093345 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81093365 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81093377 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81093455 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81093515 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81093595 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81093603 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81093612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81093699 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81093715 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81093779 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81093916 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81094015 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81094120 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81094170 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81094302 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81094596 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81094735 G T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81094763 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 81094772 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 81094926 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 81094970 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 81094997 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 81095095 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81095332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81095348 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81095501 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81095530 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81095539 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81095543 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81095718 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81095720 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81095778 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81095900 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81096212 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81096296 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81096753 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81096841 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81096855 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81096910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81097423 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81097695 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81097910 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 81097932 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81098348 A T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 81098408 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81098429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81098450 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81098575 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 81098744 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81098748 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81098822 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81098843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81098878 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81098914 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81099115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81099139 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81099485 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 81099494 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 81099562 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81100058 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81100154 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81100385 G T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 81100442 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81100501 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81100666 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81100707 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81100763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81100835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81100925 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 81101091 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 81101178 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 81101203 T A Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 81101222 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81101273 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81101385 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 81101709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81101840 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81101878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81102277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81102440 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81102462 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 81102895 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81103093 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81103105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81103157 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81103158 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81103168 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81103198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81103200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81103351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81103379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81103410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81103441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81103611 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81103672 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81103742 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81104031 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81104071 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 81104394 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 81104928 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 81105028 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81105347 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 81105365 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 81105371 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 81105626 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 81105654 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 81105708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81105782 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 81106357 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 81106419 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 81106483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81106606 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81106950 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81107101 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 81107218 T G N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 81107277 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81107302 T A N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 81107318 T A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 81107369 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 81107407 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 81107484 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81108014 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81108035 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 81108124 G C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 81108250 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 81108255 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 81108271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81108356 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 81108486 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 81108522 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 81108612 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81108719 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 81108725 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 81109293 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 81109847 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81109968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81110546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81110734 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 81110814 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81111829 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 81111951 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 81112008 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 81112010 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 81112121 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 81112134 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 81112158 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81112346 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 81112409 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 81112750 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81113283 T A N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 2 81113638 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 81113711 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 81114344 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81114491 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81114799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81114925 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81115133 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81115533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81117044 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81117116 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81123868 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81123952 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81123955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81123990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81123993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81124145 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81124280 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81124341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81124496 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 81124848 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81124905 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 81124979 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 81124981 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81125030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81125082 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81125168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81125232 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 81125288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81125446 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 81125549 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81125616 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81125725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81125727 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 81125737 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 81125881 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81125894 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 81126062 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81126080 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81126469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81126503 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81126572 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 81126645 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81126647 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 81126693 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 81127079 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81127091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81127345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81127373 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81127512 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81127637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81127779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81128047 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81128069 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81128275 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81128578 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 81128604 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81128658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81128684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81128700 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81128773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81128935 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 81128974 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81129235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81129303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81129333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81129395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81129405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81129692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81129803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81129939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81129942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81130003 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81130210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81130319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81130409 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81130418 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81130466 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81130632 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81130645 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81130652 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81130751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81130871 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81130890 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 81131030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81131147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81131169 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81131193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81131230 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 81131403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81131478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81131518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81131524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81131613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81131784 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 81132001 G A N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 81132028 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81132113 A C Y N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 2 81132778 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81132820 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81132917 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81132962 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81133018 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81133062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81133158 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81133357 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81133563 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81133705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81133834 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81133838 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81133933 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81134064 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81134134 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81134160 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 81134214 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81134405 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81134537 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81134625 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81134636 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81134730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81134974 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81135015 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81135425 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81135932 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81136036 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81136357 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81136620 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 81136986 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81137228 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81137264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81137265 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81137637 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81137776 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 81138059 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81138144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81138358 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 81138361 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 81138390 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 81138500 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 81138729 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 81139203 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81139220 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81139315 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 81139318 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 81139476 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81139492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81139511 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81139512 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 81139561 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 81139568 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 81139718 A T Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 81140117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81140228 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 81140297 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 81140503 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81140524 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81140762 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 81141503 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81142330 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81142428 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 81142545 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 81142625 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81142643 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81142945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81143250 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 81143254 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81143499 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81143502 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81144136 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81144353 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81144514 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81145484 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81145548 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81145809 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 81152573 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81152585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81152645 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 81152689 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 81152703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81152757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81152999 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81153020 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81153066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81153146 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 81153215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81153269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81153334 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81153465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81153594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81153719 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81153752 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81153886 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81154089 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81154206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81154234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81154306 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 81154387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81154665 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 81155221 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81155329 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81155395 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81155679 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 81155996 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81156066 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81156102 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81156158 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 81156172 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81156209 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81156218 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81156257 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81156330 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81156405 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81156415 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81156423 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81156672 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81156679 C A Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 81156690 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 81156695 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 81156755 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81156827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81156926 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81157069 C A Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 81157342 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81157468 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81157532 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 81157548 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81157580 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81157888 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 81157911 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 81158001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81158056 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81158135 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 81158154 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81158217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81158229 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81158430 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81158507 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 81158564 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81158618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81158649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81158675 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81158713 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81158763 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81158792 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81158821 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81158854 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 81158915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81159007 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 81159153 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81159230 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81159484 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81159506 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81159533 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81160152 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81160762 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81160806 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81160866 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81160905 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81160965 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81160980 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81161029 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 81161063 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81161155 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81161373 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81161392 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 81161525 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81161664 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81161695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81161712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81161889 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81161895 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81161918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81161961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81162014 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81162026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81162029 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81162053 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81162147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81162182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81162226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81162237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81162252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81162277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81162800 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 81162841 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81162890 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 81162953 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81163295 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81163357 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81163392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81163521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81163627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81164215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81164244 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81164287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81164288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81164373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81164428 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81164435 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 81164675 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81164746 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81164770 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81164860 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 81164937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81165114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81165124 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 81165241 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81165427 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81165619 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81165667 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81165804 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81165859 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81165900 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 81165925 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81165945 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 81165964 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81166169 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 81166174 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 81166206 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 81166244 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81166253 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 81166603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81166712 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81166926 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 81166955 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 81167328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81167370 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 81167382 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 81167534 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81167863 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 81167987 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 81168026 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81168048 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81168078 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81168232 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81168336 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81168348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81168581 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81168597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81168664 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 81168675 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81168676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81168701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81168712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81168717 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81168821 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81168917 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 81169009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81169018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81169028 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81169064 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81169075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81169140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81169166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81169386 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81169497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81169499 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81169539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81169705 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81169767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81169790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81169813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81169829 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 81169904 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81169995 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81170012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81170026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81170179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81170249 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81170251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81170336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81170345 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81170370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81170381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81170405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81170431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81170527 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81170546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81170561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81170662 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81170780 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81170952 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81171031 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81171135 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 81171198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81171210 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81171237 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81171255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81171267 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81171285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81171303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81171408 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81171513 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81171566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81171653 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81171682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81171716 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81171732 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81171764 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81171806 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81171858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81171876 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 81172022 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 81172046 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81172058 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 81172152 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81172195 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 81172201 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 81172262 A G Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 81172372 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81172398 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81172502 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81172661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81172731 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81172743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81172783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81172869 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81172892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81172905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81173060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81173412 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81173588 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81173771 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 81174452 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81174636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81174683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81174722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81174956 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81175309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81175445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81175645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81175667 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81175684 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81175695 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 81175725 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81175754 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 81175780 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81175830 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81175919 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81175954 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81175983 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81176006 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81176119 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81176178 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81176309 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81176333 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 81176379 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 81176401 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 81176462 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81176531 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 81176581 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 81176604 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 81176653 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81176845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81176892 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81176941 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81177037 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81177145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81177904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81178512 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81178535 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81178817 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81178861 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81179246 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81179418 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81180435 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81181442 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81182610 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81183064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81183394 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81184197 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 81184303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81184304 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81184767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81184860 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81185024 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81185080 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 81185700 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81185809 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 81186470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81186590 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81186838 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 81187037 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81187314 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 81187595 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81187641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81188607 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81188811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81188821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81188847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81188875 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81188980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81189356 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81189380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81189512 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81189534 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81189624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81189674 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 81189801 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81189950 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81190011 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 81190067 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81190320 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 81190543 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81190771 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81190796 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81190809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81190822 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81191155 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 81191167 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 81191290 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 81191413 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81191508 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 81191557 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 81191602 T G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 81193333 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 81193496 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81193628 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81194033 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81194311 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 81194380 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 81194409 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 81194411 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 81194546 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81194598 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 81194914 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 81195617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81195905 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81196291 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81196629 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81196677 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81196896 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81197117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81197268 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 81197353 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 81197470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81197555 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 81197633 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81197671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81197913 C A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 81197915 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 81197931 G C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81197956 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81197961 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81197997 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 81198018 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 81198174 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 81198175 G C Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 81198243 A T Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 81198652 T C Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 81198815 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81198845 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 81198885 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 81198896 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 81198956 A C Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 81198989 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 81199022 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 81199051 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 81199114 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81199119 T A Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 81199127 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 81201483 G A Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 81202710 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81202737 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81202766 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81202787 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 81202813 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 81202848 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81203149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81203192 C A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 81203251 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81203274 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81203373 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 81203410 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81203411 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81203848 T G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81203908 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81203910 C G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 81204106 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 81204228 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81204237 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81204414 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81204436 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 81204656 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 81204659 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 81204758 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 81204799 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81204910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81205137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81205340 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81205436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81205457 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81205468 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81205631 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81205650 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 81205681 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81205728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81205768 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 81206291 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81206314 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81206384 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 81207751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81207864 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81208206 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81208438 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81208518 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81209727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81209886 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81210012 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81210209 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81210436 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81210592 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 81211000 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81211723 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81212006 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81212477 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81212705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81212893 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81213205 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81213854 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81213887 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81214045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81214049 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81214407 T C Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 81214818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81215124 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81215368 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81215623 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81215701 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81215817 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81216020 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81216048 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 81216283 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81216327 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81216758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81217568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81218165 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81218949 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81219261 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81219876 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81219930 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81220342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81220889 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81221348 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81221358 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81221557 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81222154 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81222497 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81222596 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81222682 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81222843 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81223151 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81223263 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81223667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81223957 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81224143 A C Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 81224515 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 81224958 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81225132 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 81225146 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 81225265 G C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 81225281 C T Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 81225655 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81225876 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81225915 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81226388 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81226394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81226690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81227154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81227375 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81227389 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81227520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81227550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81227606 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81227653 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81227697 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 81227768 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81228388 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81228399 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81228965 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81229083 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81229143 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81229210 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81229317 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81229435 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81229470 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81229578 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81229973 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81230126 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81230168 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 81230320 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81230337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81230613 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81230688 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81230739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81230802 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81230943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81231005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81231076 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81231140 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81231166 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81231200 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81231256 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81231404 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81231423 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81231471 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81231798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81232115 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81232555 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 81233670 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81233912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81233955 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81234608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81234901 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81235287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81236922 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81238562 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81238678 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81239042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81240368 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81240479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81240564 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 81241478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81241728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81243016 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81243370 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81243397 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81243626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81243655 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81243740 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81243822 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 81244797 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81245624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81245689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81246196 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 81246857 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81246983 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81247015 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81247236 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81247511 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81247650 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81247931 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81248299 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81248382 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81248641 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81248757 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81248916 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81249126 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 81249135 C G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 81249249 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 81249316 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81249340 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 81249728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81249848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81250123 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81250170 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81250210 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81250230 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81250270 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81250666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81250830 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 81251046 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81251052 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81251059 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 81251251 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81251271 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81251344 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81251368 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81251436 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81251440 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81251527 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 81251528 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 81251669 A C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 81251703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81251817 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 81251868 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81251878 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81251905 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 81251910 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 81252311 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81252751 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 81252904 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81253087 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 81253272 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81253326 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81253393 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81253416 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81253439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81253456 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81253935 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 81253952 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 81254131 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 81254141 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 81254176 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 81254231 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 81254307 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81254443 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81254483 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81254534 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81254594 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81254746 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 81254786 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81254845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81254858 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81254869 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81254873 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81254923 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81254978 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81255078 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81255167 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81255211 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81255226 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81255300 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81255574 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81255674 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 81255774 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81255800 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81255884 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81256050 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81256081 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 81256185 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81256382 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81256455 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81256495 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81256630 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81256640 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81256702 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81256772 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81256921 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81256959 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 81257011 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 81257241 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81257434 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81257549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81257586 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 81257738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81258038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81258048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81258333 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81258425 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81258455 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 81258568 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81258650 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81258654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81258779 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81259131 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81259303 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81259582 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 81259753 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 81259965 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 81260239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81260365 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 81260443 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 81260505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81260525 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 81260533 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 81260631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81260826 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 81260841 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 81260915 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 81261048 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 81261112 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 81261234 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 81261242 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81261278 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81262041 A C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 2 81262242 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 81262404 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 81262496 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 81262501 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 81262881 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 81263249 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 81263332 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 81264184 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81264228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81264674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81264786 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 81264880 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 81265249 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 81265713 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81267370 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81267746 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81267803 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81268390 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81268595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81268831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81269310 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81269369 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81270862 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81270978 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81271182 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81271416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81271504 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 81272112 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81272117 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81272339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81272456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81272594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81272666 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81272932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81273750 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81274914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81275630 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81275873 C G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 81276132 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 81276765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81276974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81277061 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81277427 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81277513 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81277667 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 81279042 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81280706 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 81280763 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81281021 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 81282182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81282462 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81282597 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81282628 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81282706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81283068 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 81283189 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81283190 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81283623 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81283727 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 81284582 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81284661 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81285115 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81285245 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81285551 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81286328 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 81286625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81286949 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 81287003 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 81287117 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 81287247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81287327 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 81287395 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81287623 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 81287792 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 81288273 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 81288356 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 81288554 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 81288607 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81288656 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81288784 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 81288856 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 81288893 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 81289010 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 81289102 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 81289187 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 81289390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81289425 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 81289534 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 81289780 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 81289815 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81289955 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 81289956 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 81290057 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 81290067 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 81290077 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 81290109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81290165 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 81290264 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 81290289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81290323 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 81290623 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81290700 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 81290831 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 81291106 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 81291175 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81291187 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81291196 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 81291304 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 81291430 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 81291435 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 81291522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81291654 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 81292003 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81292236 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 81292413 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 81292423 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 81292446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81292492 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81292606 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 81292624 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81292665 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 81292775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81292987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81293222 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 81293361 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 81293453 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81293755 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81293781 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81293958 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81294497 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81294524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81294531 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81294740 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 81294869 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 81295043 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81295066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81295227 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 81295607 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81295629 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 81295898 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 81295899 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81295912 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81296247 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 81296337 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81296411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81296527 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81296843 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81296905 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81297325 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81297433 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 81297589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81297718 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81297850 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81297881 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81297977 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81298109 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81298188 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81298360 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 81298426 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 81298531 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 81298585 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 81298663 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81299985 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81300077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81300105 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81300141 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81308451 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 81308590 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81308655 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81308742 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81308796 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81308902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81309154 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81309233 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81309341 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81309444 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81309553 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81309754 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81309864 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81309969 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81310063 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81310072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81310129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81310166 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81310322 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81310380 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81310393 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81310407 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81310509 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81310588 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81310750 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81310918 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 81310940 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81310957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81310983 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 81310988 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81311440 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81311824 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 81311837 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81311871 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81311968 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81312020 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81312170 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81312499 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81312552 C G N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 81312609 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81312622 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 81312653 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 81312677 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 81312954 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 81313123 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81313280 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 81313311 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81313557 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 81314279 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 81314716 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81314781 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 81314851 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 81314902 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 81315210 C G N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 81315694 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 81315729 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 81315758 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 81316200 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 81316266 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 81316472 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 81316628 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 81316703 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81316787 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 81317011 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81317266 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 81317294 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 81317418 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81317527 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 81317754 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 81318834 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81318835 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81318853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81319392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81319397 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81319792 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 2 81320001 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81321256 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81321258 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81321295 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 81321332 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81321515 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 81321587 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 81321588 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 81321691 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 81321692 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 81322324 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81322420 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 81323084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81323106 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 81323241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81323284 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 81323635 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 81323716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81323757 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81323890 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81323952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81324144 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81324184 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81324319 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81324572 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81324579 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81324592 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81324728 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81324965 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81325097 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81325265 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 81325320 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81325452 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 81325767 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 81325805 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 81325959 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81325999 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81326001 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81326017 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81326235 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 81326296 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 81326333 G C N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 81326371 A G N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 81326698 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 81327100 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81327244 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81327427 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81327484 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 81327571 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 81327739 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81327811 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81327875 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81328981 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81329065 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 81329117 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 81329310 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81329679 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 81329915 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 81330036 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81330359 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 81330544 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81330599 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 81330802 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81331001 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81331107 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81331748 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81331884 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 81332006 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 81332015 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 81332570 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 81332997 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 81335839 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81338167 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 81338283 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81338667 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81339862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81340489 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81341217 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81341218 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81342271 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81342411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81342514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81342638 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81342740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81343211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81343744 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81343766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81345949 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 81346132 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81346800 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 81352034 T C Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 81352434 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81352642 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81353764 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81354515 A T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 81354623 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81354760 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 81355331 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81355709 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81355864 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 81356359 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81356409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81356614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81358346 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81359651 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 81359821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81361435 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81361573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81361595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81361950 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81362197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81362762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81366186 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 81368214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81373122 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81373826 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81376677 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81378215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81379945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81382518 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 81382575 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 81382629 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 81382640 T G N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 81382683 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81382948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81383688 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 81383736 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 81383770 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 81384205 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 81385533 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81386113 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81386690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81386988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81387542 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 81387564 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 81387584 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 81387603 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 81387719 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 81387784 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 81387879 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 81388226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81388236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81388255 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81388467 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81388478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81388611 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 81388850 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 81388872 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 81389030 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 81389421 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 81389692 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 81390004 T A N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 81390065 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 81390331 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 81390615 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81390902 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81391131 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81391139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81391585 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81391643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81391772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81391992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81392028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81392037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81392070 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81392167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81392547 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 81392621 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81393204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81393322 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81393502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81393648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81393823 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 81393872 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81394056 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81394406 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81394639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81394857 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81394951 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81395579 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 81395761 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 81395777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81395785 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81395897 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81395903 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81396324 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81396905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81396982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81397248 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81397913 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81398578 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81398644 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81399056 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 81400713 T G Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 2 81400754 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 81400820 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 81400981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81401041 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81401194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81401237 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81401253 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81401389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81401470 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81401678 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81401900 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 81402273 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 81403016 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81403189 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81403229 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81403673 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81403787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81403798 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81403899 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81403924 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81403963 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81403980 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81404173 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 81404254 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81404463 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81405063 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 2 81405086 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81405188 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81405399 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81405439 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 81405476 T C Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 81405711 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 81405777 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 81405818 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81405848 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 81405947 T C Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 81405998 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 2 81406140 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 2 81406309 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 81406400 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 81406439 C T Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 81406440 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 81406485 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 81406490 T A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 81406505 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81406790 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81406843 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 81406851 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 81406912 C A N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 81406913 T G N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 81406941 G A Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 2 81407283 T C Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 81407312 T A Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 81407658 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 2 81407765 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 81407842 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81407869 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81407957 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 81407976 C T Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 2 81407982 C A Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 2 81407993 C G Y N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 81408086 A T Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 2 81408112 T C Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 2 81408138 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 2 81408261 T C Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 2 81408277 T G Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 81408283 A C Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 81408310 T A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 81408314 C A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 81408321 C T Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 81408330 C T Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 2 81408461 A C Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 81408629 G C Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 2 81408640 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 81408925 G A Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 81409065 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 81409278 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81409377 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 81409530 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 81409535 A T Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 81409617 G A Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 81409700 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 81409738 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 81409791 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81409813 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 2 81409886 A T Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 81410016 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81410167 A C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81410203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81410288 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81410384 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 81410450 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81410513 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81410594 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 81411010 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81411072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81411079 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 81411084 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81411099 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81411115 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81411202 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81411398 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81411730 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 81412088 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 81412143 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 81412182 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81412211 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81412229 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81412232 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81413072 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81413469 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81413554 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 81413612 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81413623 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 81413681 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81413715 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81413773 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81413787 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81413805 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81413837 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 81413893 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 81413924 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 81414615 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 81414661 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81414708 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81414795 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81414899 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81414912 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81415109 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81415172 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81415173 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81420798 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81421484 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81423181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81424808 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 81426093 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 81426435 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 81426739 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81429416 G A Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 2 81435618 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 81435638 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81436442 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81437186 T A N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 81437250 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81439352 G C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 81439885 A C Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 81440980 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81441304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81442023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81443231 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 81443812 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81443913 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81444146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81444194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81444343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81444971 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 81445022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81445026 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81445211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81446398 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81446705 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81447079 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81447117 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81447184 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 81447519 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81449145 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81450435 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81450483 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81450881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81451886 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81452294 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81452771 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81454235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81454257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81454363 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81455223 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 81455955 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 81456420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81458114 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 81458152 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81458196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81458309 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81458911 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 81459016 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81459143 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81459322 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81459445 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81460904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81461116 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81461663 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81461743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81462673 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81462720 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 81463149 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81463278 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 81463590 A C N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 6 12 3 0 6 2 81465027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81465107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81465207 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 2 81465271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81465808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81467766 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81468511 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 2 81468612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81469684 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 81469804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81470177 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81470734 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81471044 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 81472888 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81472924 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81473430 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81473542 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81473875 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81473949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81474083 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81474508 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 81474707 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 81475413 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 81475628 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81476055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81476916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81478464 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81478713 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 81483419 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81485145 A C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 81485276 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 81485444 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81485774 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81486359 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81487453 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 81487679 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81488716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81489007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81490455 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81490603 T A Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 81491151 C G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 81491868 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81492292 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81493369 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 81494306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81496732 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 81497549 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81499775 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81499853 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81500717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81502141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81502610 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81504435 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81504672 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81505249 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 81505615 G T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 81505645 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 81506767 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81506778 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 81506861 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 81506973 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81506997 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81507018 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81507761 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 81507886 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 81507893 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 81508112 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81508273 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 81508489 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 81508539 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 81508631 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 81508793 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 81508825 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81508847 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 81508894 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 81508977 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 81508992 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 81509010 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81509258 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 81509271 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 81509383 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 81509395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81509437 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81509527 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 81509621 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 81509705 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 81509735 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 81509869 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 81509942 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 81509994 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 81510223 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 81510230 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 81510375 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 81510447 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 81510568 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 81510580 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 81510658 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 81510690 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 81510723 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 81510762 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 81510999 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 81511040 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 81511091 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 81511922 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81513209 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81513245 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 81513358 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 81513476 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81513556 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81514904 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81515505 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 81516812 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81516996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81518386 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 81519243 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81519622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81519928 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81520148 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81520190 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 81520355 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81520590 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81520660 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81520701 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81520928 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81520978 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 81521090 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 81521117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81521201 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81521202 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81521212 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81521384 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 81521412 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 81521460 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 81521532 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81521662 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 81521729 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81521745 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81521759 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81521760 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81521898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81522065 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81522210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81522358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81522459 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81522506 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81522646 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81523022 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 81523090 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81523535 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 81523580 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81524259 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 81524366 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81524402 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 81524592 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 81524605 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81524869 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81524909 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81524912 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81524934 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 81525460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81528087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81528105 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81531346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81531351 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 81531786 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 81531853 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 81536763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81537555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81541607 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81543016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81544816 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81545578 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81546291 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81546389 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81547845 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81547913 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 81548066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81549007 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81551149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81551846 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 81552211 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81552390 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81553367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81553552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81553725 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 81553819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81554565 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 81554624 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81556492 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81556536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81556579 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 81556769 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 81556841 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 81557415 C G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81558500 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81558615 T A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 81558886 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 81559033 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81559853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81560655 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81561631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81562193 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81562315 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81562466 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 81562945 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81563888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81565373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81570189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81570397 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81571711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81572199 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81572359 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81574227 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81574332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81574515 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81574696 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81577305 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81578750 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 81579492 G C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 81579633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81579991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81580954 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81582323 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 81582367 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81583412 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81587448 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81587982 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81588258 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 81588333 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81588903 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81590001 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81590851 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0 0.944444444444444 0.0555555555555556 17 19 0 17 1 2 81591028 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 81591039 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 81597881 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81598935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81599330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81600092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81600331 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81601683 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81601826 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81602788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81603802 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 81604238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81604546 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81604867 G T Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 81605526 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81605558 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 81605659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81605678 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 81605704 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 81606276 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81607042 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81607427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81608329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81609111 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81609501 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81610347 T G N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 81611845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81612721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81613614 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81613664 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81613805 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 81613811 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81613961 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81614243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81614803 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81615031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81615459 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81616183 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 81616650 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 81616817 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 81616820 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 81617529 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81619021 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81619191 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81619790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81619825 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 81620307 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 81621666 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 81621722 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 81621846 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 81621872 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 81621915 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 81621953 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 81621955 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 81622018 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 81622069 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 81622184 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 81622373 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 81622382 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 81622399 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 81622453 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 81622455 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 81622477 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 81622620 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 81622661 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 81623053 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 81623222 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81623706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81624075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81624307 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81624362 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81624383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81624654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81625627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81625695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81626595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81627877 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81628896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81629239 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81629481 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81629573 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81629592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81635958 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 81636250 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81636609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81636690 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81637596 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81637802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81638177 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81638319 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81638339 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 81638895 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 81639467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81640356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81640425 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 81640480 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81640688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81640789 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81640828 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81640930 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 81641005 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 81641188 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81641981 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 81642308 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81642665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81643003 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 81643027 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81643278 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 81643370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81643375 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81644080 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81644193 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 81647881 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81648157 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81651435 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81652096 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81652529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81654965 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81656058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81656256 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81657357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81657381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81657736 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 81657793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81657931 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81657988 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81658316 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 81659183 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81659814 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81661346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81662105 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81662901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81663767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81664441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81664611 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81664617 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81665590 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 81667021 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81669896 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81669935 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81670653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81672069 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 2 81673474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81673682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81674931 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81675466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81675708 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81678770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81678942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81679550 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81679662 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 81679808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81680257 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 81680638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81684814 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81685693 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81689560 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 81690108 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81690146 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81690901 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 81690923 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 81691024 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81691221 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 81691491 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81691704 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81691859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81691907 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81692080 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81692097 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 2 81692215 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 2 81692228 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81692293 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81692313 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81692328 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81692843 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81693072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81693118 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 81693155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81695843 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81695946 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81696945 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 81697375 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81697561 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 81697564 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 81697644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81697734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81697838 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 81697840 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 81697895 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81697913 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 81698149 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 81698220 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81698300 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81698313 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81698345 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81698407 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 81698417 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 81698427 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 81698431 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 81698486 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 81698495 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 81698741 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81698791 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 81698869 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81699025 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81699045 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81699087 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81699091 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81699112 G C N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 2 81699144 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 81699479 C G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 81699547 T G N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 81699562 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 81699596 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 81699623 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81699639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81699703 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 81699704 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81699734 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81699907 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81700188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81700219 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81700315 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81700546 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 81700783 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 81700812 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 81700834 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 81700878 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81700971 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81700980 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81701212 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81701301 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81701317 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 81701373 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 81701377 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 2 81701529 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 81701536 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 81701598 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 81701645 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 81701703 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 81701794 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 81701803 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 81701847 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 81701878 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 2 81701976 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81702001 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81702083 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 81702125 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81702254 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 81702314 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81702634 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81702683 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81702757 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81702779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81702878 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81702922 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 81703553 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 81703596 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 81703740 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81703765 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81703769 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81703944 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81704224 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81704441 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81704453 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81704518 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81704523 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81704558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81704634 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81704664 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81704771 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81704824 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81704835 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81704856 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81704901 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81704946 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 81704948 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 81704974 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81705042 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81705074 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81705118 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81705186 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81705476 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81705542 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81705590 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81705705 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81705850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81705930 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81705951 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81705983 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81706051 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81706178 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81706277 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81706297 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81706371 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 81706374 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 81706446 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81706456 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81706576 G T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 81706670 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 81706721 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81706915 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 81706930 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81706946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81707018 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81707107 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 81707258 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 81707500 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81707821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81707824 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81707957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81708236 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81708547 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81708672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81708906 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81709321 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 81709357 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 81709432 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81709760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81709794 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81709821 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81710255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81712864 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81712932 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81713553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81713829 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81714338 A G Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 81715501 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81715864 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81715865 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81716051 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81717710 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81718090 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81718329 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81719818 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81720498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81721727 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81723525 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81723860 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81723893 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 81724599 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 81724739 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81725269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81725564 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81726477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81726478 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81726558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81727019 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 81727252 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81728232 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 81730411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81733027 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 2 81733104 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81733140 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81733282 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81735117 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81735292 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81735386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81735438 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81735645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81736686 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81737697 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81738460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81738757 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 81738789 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 81738914 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81738941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81739011 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81739067 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81739630 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81739992 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81740487 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81740762 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 81741416 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81741827 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 81741998 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81742257 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 81742280 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 81742339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81742350 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81742482 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 81742516 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 81742519 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 81742576 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 81743011 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 81743044 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 81743359 C T Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 81743567 A G Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 2 81743585 T A Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 2 81743782 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 81743822 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 81743897 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 81743987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81744083 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 81744087 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81744136 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81744335 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81744368 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81744423 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81744440 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81744453 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81744480 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 81747134 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 81748170 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81748574 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81748694 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 81748722 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81748948 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 81749138 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81749157 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 81749248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81749301 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 81749323 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 81749523 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 81750428 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81750484 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81750515 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81750630 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 81750708 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81750934 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 81751148 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 81751168 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81751213 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 81751239 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81751288 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 81751929 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81752397 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81752431 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81752496 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81752637 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81752663 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81752777 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81752985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81753021 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81753269 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81753383 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81753550 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81753645 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81753711 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 81753777 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 81753816 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 81753868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81754025 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81754052 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 81754522 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 81754640 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81754718 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81754789 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81754936 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81754941 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81755121 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81755166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81755190 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81755204 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81755205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81755353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81755517 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81755736 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 81755803 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81755856 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81755915 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81755961 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81756105 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 81756288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81756478 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81756481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81756562 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 81756584 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 81756600 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 81756773 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81756800 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81756808 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81756989 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81757101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81757225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81757347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81757397 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81757546 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81757568 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81757685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81757708 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 81757828 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81757837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81758574 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81758668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81759611 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 81761224 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81761700 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 81761785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81762003 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 81764774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81766463 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81766850 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81766890 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81767145 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 81767227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81767280 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 81767594 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 81767642 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81767724 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81767726 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 81767808 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81769109 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81769552 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81770158 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 81770309 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 81770641 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81770658 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81771056 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81771098 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 81771128 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 81771150 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81771155 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81771198 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81771232 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 81771253 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81771256 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81771271 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81771273 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81771302 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81771450 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81771461 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 81771479 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81771552 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 81771573 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81771579 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81771662 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81771691 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81771704 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81771728 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81772117 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 81772121 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 81772213 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 81772220 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 81772303 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81772384 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81772410 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81772413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81772567 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81772800 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 81772811 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 81773353 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81773374 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 81773407 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 81773480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81773675 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81773912 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 81774300 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 81774304 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 81774419 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81774421 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 81774718 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81775228 C G N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 81775845 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81775973 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 81776018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81776111 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 81776174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81776417 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 81776420 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 81776439 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 81776495 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 81776832 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 81777220 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81777528 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 81777722 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 81777781 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 81778730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81779022 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 81779512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81780009 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81780366 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81780600 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81780726 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81781263 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81781416 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81781565 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81784342 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81784370 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81784458 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81784554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81784581 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81784895 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81784962 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81785419 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 81786197 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81786277 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81786493 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 81786539 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 81786947 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 81787021 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81787138 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81787305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81787318 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 81787390 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81787422 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 81787449 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81787612 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 81787620 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 81787921 A T N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 81788056 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 81788057 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81788112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81788546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81788548 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 81788620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81788763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81789208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81789316 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81789368 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81789409 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 81789765 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 81789929 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81790119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81790221 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81790346 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81790411 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 81790548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81790563 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81790693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81790979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81791573 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81791636 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81791695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81791717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81791727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81791785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81791832 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81791843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81791909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81791915 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81791950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81792107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81792172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81792243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81792400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81792451 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81792816 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81792926 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81792934 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81792946 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81792947 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81792973 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81793062 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81793132 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81793235 T G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 81793467 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 81793526 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 81793600 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 81793691 G C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81793701 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 81793791 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81794394 G T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 81794427 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81794442 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81794489 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81795054 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 81795067 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 81795541 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 81795546 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 81795616 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 81795645 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 81795856 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 81795909 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81795936 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81796143 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 81796472 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81796506 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 81796511 T A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 81797443 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 81797583 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 81797783 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81797894 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81798053 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81798077 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81798097 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81798139 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 81798177 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81798195 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81798295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81798837 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81798847 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81798933 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81798938 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81799119 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 81799137 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 81799139 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 81799151 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 81799266 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81799337 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 81799387 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81799504 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81799580 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 81799699 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 81799726 C A N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 81799941 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 81799975 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81799993 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 81800042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81800086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81800121 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81800127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81800212 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81800213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81800279 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81800289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81800292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81800300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81800417 G C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 81800491 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81800959 T A Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 81800999 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81801211 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 81801273 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81801291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81801336 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81801369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81801382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81801584 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81801597 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 81801666 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81801668 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 81801688 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81802195 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 81802207 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81802542 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81802604 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81803010 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 81803325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81803668 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 81803947 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 81804086 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 81804141 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 81804950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81804958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81805551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81805664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81805789 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81805926 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81805988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81806095 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 81806312 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81806329 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81806660 T A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 81806665 G T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 81806783 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 81806886 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81806897 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81806939 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81807057 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 81807083 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 81807116 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81807122 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81807142 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81807408 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81807580 G T Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 81807677 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81807711 A T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 81807719 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 81808163 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 81808261 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81808529 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81808604 C G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 2 81808949 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81809126 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81809372 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81809601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81809758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81810127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81810310 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81810391 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 81810413 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81810882 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81811060 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81811107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81811124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81811610 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81811902 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81812800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81812954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81813018 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81813417 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81813498 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81813669 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81814013 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81814404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81814695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81815428 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81816600 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 81819264 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81819405 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 81819628 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 81819677 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 81820877 G C Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 81821162 G T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 81821357 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 81821555 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 81822076 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81822622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81822625 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81822676 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81822752 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81822801 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81822921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81822977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81823438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81823670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81823911 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81824047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81824175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81824482 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81824483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81824549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81824643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81824667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81825291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81825307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81825745 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81825768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81825912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81825925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81825926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81825974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81826005 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81826009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81826031 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81826032 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81826155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81826211 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81826272 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81826302 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81826312 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 81835446 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 81835530 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81835538 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81835563 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81835571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81835621 A C Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 81835635 G A Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 2 81835656 A G Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 81835759 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81835775 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81835779 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81835800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81835805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81835895 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81835947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81835973 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81836002 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81836005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81836053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81836124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81836170 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81836206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81836219 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81836231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81836250 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81836302 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81836324 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81836501 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81836745 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81836836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81836865 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81836899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81836901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81836990 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81837011 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81837060 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81837105 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81837314 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81837317 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 81837620 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81837673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81837840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81837876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81837886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81837937 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81837956 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81838035 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81838055 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 81838075 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81838229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81838429 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81838724 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 81838766 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81838834 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 81838927 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81839097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81840550 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81840749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81840953 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 81841168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81841391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81841514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81841971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81842046 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81842696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81842999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81843211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81843354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81844582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81844618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81845130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81845796 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81845817 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81845939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81845982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81845989 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81846324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81846449 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81846518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81846756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81846936 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81847096 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 81847392 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81847541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81848665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81851406 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81853608 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81853610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81853720 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81856474 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81857935 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81861739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81863464 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81863689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81864713 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81866697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81867165 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81871715 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81873787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81873966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81876978 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81879081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81881295 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81881819 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81881879 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81887237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81887258 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 81888524 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81889439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81889506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81890464 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81890841 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81891405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81891648 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81892282 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81898386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81898579 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81898869 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 81900057 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81902167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81903884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81905704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81906594 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81907244 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81908385 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81911553 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 81912065 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 81913339 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81913947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81914157 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81915678 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 81915699 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81916173 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81916404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81916554 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 81917427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81918318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81918530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81918722 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81918807 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81921886 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81922012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81922236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81922413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81923028 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 81923270 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81923800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81924196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81924576 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81926336 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81926376 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81928569 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81930305 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81933644 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81934575 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 81935126 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81936737 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81937136 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81937755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81938688 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81938900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81941339 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81942524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81942867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81943084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81943283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81943850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81943948 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81943969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81944123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81944124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81944620 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 81944719 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 81945355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81945417 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 81946027 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 81946182 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 81946215 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 81946274 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 81946503 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81946907 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81946950 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 81947130 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81947325 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 81947512 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 81947583 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81947759 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 81947945 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81947997 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 81948030 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81948376 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81948634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81949028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81949054 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81949081 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 81949150 C A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 81949231 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81949524 T G Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 81949560 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 81949586 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81949845 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 81949879 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 81950158 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81950172 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 81950233 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81950397 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81950641 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81950719 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81950865 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 81951028 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81951302 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 81951315 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81951851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81951867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81952040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81952087 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 81952088 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81952298 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81952364 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81952465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81952827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81953048 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 81953673 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81954446 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81954947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81955596 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81956055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81956097 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 81956250 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 81956305 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 81956345 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81956661 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 81956708 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 81956746 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81956857 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 81956889 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81956957 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81957064 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81957074 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81957134 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81957247 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 81957315 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81957456 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81957510 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81957597 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 81957609 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81957653 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81957723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81957755 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81957790 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81958092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81958155 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81958402 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 81958427 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81958546 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81958563 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81958771 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 81958774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81958903 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81959029 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 81959085 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 81959104 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 81959131 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81959335 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 81959483 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81959524 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81959811 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81959843 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81960049 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81960207 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81960230 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 81960340 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 81960413 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 81960540 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 81960682 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 81960844 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81960941 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81961002 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 81961047 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 81961146 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 81961326 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81961642 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81961650 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 81961788 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81961815 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 81961915 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 81962004 C A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 81962151 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 81962386 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 81962528 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 81962536 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 81962587 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81962674 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81962709 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81963113 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 81963218 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 81963219 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81963254 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81963308 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81963332 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81963337 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81963358 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81963459 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81963520 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 81963849 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 81963949 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 81964033 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 81964139 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81964158 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81964160 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81964188 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81964272 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 81964442 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81964551 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81964585 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81964609 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81964651 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81964657 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81964665 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81964690 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81964815 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 81964941 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81964943 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81965053 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81965153 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81965158 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81965197 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 81965204 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 81965233 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 81966026 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 81966042 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 81966062 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 81966145 C A N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 81966222 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 81966241 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 81966242 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 81966272 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 81966321 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 81966354 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81966392 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81966444 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81966622 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 81966669 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 81966714 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81966730 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 81966754 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 81966794 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 81966886 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 81966936 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 81967025 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 81967073 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 81967206 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81967228 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 81967309 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 81967323 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 81967345 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81967504 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 81968188 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 81968245 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 81969871 C G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 81969900 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 81969991 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 81970044 A C N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 2 81970176 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81970373 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 81970421 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 81970733 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81970788 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81970922 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81970959 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 81971415 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81971426 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 81971649 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 81971767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81972002 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81972053 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 81972202 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81973080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81973085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81973223 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81973232 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 81973477 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 81973509 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81973516 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81973653 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 81974049 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81975028 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 81975036 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 81975048 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81975148 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 81975701 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 81975941 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81976120 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81976470 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 81976560 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81976814 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 81976830 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81976877 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81976942 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81976965 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81977449 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81977548 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81977641 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81977651 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81977721 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81977807 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 81977821 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81978303 G T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 81978493 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 81978562 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 81978610 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 81978739 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81978743 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81978984 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81979232 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81981837 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81981919 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 81984139 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 81985120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81985447 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81987035 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 81988662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81990763 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 81991402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81992193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81992362 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 81992780 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81992800 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 81993377 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 81993659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81993845 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81993950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81994300 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 81997323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 81997558 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 81999351 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 81999640 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82000977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82001194 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82004948 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82005363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82005847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82005865 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82005868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82006084 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82006492 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 82006527 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82006568 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82006960 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82007355 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82007798 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 82008273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82009085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82009198 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82009271 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82009300 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82010201 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82010446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82010809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82010917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82010974 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 82013443 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82015117 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82015161 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82015170 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 82015232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82015458 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82015501 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 82015679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82015983 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82016334 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 82016391 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82016477 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82016920 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 82017374 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 82017585 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 82017604 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82017790 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82018477 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82018666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82019320 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82019468 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82019701 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 82020405 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82020447 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 82020474 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 82020604 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 82020763 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 82020767 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 82020864 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 82020877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82020976 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82021071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82021269 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 82021470 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82021511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82021612 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82021672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82021973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82022200 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82022210 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82022299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82022350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82022580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82023347 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82023856 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 82023867 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 82024111 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82024215 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82024522 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82024718 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82025166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82025173 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82025212 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82025262 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82025395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82025673 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 82028088 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82028337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82028427 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 82028622 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82028980 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82029831 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 82030373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82030556 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82030905 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82031250 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 82032060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82033150 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82035364 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82036678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82037245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82038355 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82038465 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82038946 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 82039112 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 82039159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82039629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82040487 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82040517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82041316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82041463 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82041612 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82041863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82042400 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82050048 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 82050271 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82050727 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82052618 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 82054825 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82057213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82059307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82063106 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82063385 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82063927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82065341 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82066944 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82068070 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82068466 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82068709 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82071271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82071881 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82072260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82076833 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82080456 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82080857 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82081657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82085804 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 82085887 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 82086085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82086503 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 82086514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82087510 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82090654 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82090671 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82090973 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 82091209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82091511 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82091626 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 82091992 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82092763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82092820 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82094412 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82094493 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82094500 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82094552 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82094560 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82094720 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 82095041 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 82095252 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 82095378 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82095512 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 82095674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82095745 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 82095862 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82095922 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82096024 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82096031 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82096099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82096769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82096962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82097183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82097548 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82097558 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82097996 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82098023 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82098083 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82098198 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82098330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82098450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82099698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82100213 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82100220 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82100547 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82100922 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82101048 C A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 82101156 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 82101185 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 82101193 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82101386 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82101538 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82101862 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82102151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82102253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82102418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82102627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82102633 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82102782 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82103090 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82103348 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82103982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82104365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82105383 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82106055 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 82106199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82106673 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82106711 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82107225 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 82107965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82108171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82108834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82110233 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82112075 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 82113864 T A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 2 82114098 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82115243 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82115680 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 82115742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82115966 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 82116264 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82116303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82116324 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82116376 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82116593 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 82118057 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82118173 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82119271 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82120117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82120699 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82121405 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 82121444 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 82121445 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 82121609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82122222 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82122870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82123271 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82123416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82123542 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 82124314 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82124635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82126965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82127195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82127364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82128717 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82129176 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82129242 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82129517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82129764 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82129860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82130123 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82130228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82130238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82130273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82130328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82130347 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 82130396 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82131290 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 82131320 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 82131321 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 82131525 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 82131872 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 82131988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82132000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82132064 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82132424 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82132791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82132844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82133859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82135479 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82136419 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 82137042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82137105 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82137294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82137516 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82137624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82138474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82139200 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82139549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82139801 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 82139952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82140280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82140488 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 82140545 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 82140673 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 82140949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82141527 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 82141855 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 82142855 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 82142897 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82143015 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 82143354 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 82143577 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 82143746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82144710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82145072 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 82145408 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 82145429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82145436 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 82145496 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 82145732 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 82145989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82146216 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 82146342 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82146605 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82146644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82146797 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82146840 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82147605 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82148192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82148485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82148582 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 82148752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82148782 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 82148788 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 82150133 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 2 82150243 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82150422 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 82150561 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 82150662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82150671 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82150891 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82151017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82151474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82152529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82152814 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 82153043 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 82153134 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82154186 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 82155012 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 82155844 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82156270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82156655 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82156662 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82156975 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 82157075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82157119 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82157279 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82158138 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82158159 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 82158190 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 82159125 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82159626 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82159968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82160117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82160312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82160769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82160786 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82160916 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82161011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82161112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82161135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82161212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82161235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82161628 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82162868 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82162904 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82163314 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 82163812 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 82164277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82164578 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82165616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82165684 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82165920 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82166530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82166531 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 82166885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82166913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82167021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82167976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82168157 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 82168810 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82168869 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 82168981 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 82169138 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 82169414 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 82169539 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 82169754 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82169791 A T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 82169933 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 82180346 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 82180404 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 82180739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82180766 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 82181062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82181073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82181106 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82181167 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82181291 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82181413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82181487 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 82181563 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 82181861 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 82181978 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82182251 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 82182338 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82183053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82184240 C G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 82184750 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82185389 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82185713 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82186076 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82187013 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 82187029 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 82187093 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82187182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82187267 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 82187542 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 82187919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82187989 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82187991 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82188622 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82188943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82189294 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82189321 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82189540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82190164 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82190402 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82190404 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82190499 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82191056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82191571 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82191866 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82192126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82192533 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 82192556 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82193572 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82193636 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82193725 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82193876 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82194317 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82194326 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82194544 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82195099 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82195228 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82195309 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82195608 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82195640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82195693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82196095 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82196175 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 82196341 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82196930 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82197102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82197146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82197186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82197242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82198233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82198682 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82198830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82199199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82199297 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82199797 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82199840 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82200491 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82200521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82200767 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 82201807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82201873 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82203882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82203910 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82204064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82205045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82206099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82206566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82206916 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 82207101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82207217 G T Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 82207786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82208520 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 82208571 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82208586 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82209113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82209306 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82209594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82209720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82209845 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82209855 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82210587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82211021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82211605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82213740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82214165 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82214178 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 82214268 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82214335 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82215164 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82215480 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 82215488 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82215550 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 82216728 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82216945 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 82217242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82218420 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 82219761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82219770 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82220117 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 82220149 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82220192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82220267 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 82220562 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82220733 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82220849 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82220864 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82220876 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82221142 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82221377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82221602 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82221781 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82221884 C T Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 2 82222281 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82222383 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 82222544 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82222897 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82222977 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 82223252 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 82223277 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 82223371 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 82223396 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 82223658 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 82223731 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 82223741 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 82224415 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82224484 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 82224842 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82225058 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82225675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82225908 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82226035 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82226064 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82226340 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 82226761 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 82226817 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 82226969 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82227062 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 82227409 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 82227560 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 82227610 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82227755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82227888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82228127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82228257 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 82228400 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82228813 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82228980 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82229077 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82229307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82229385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82229444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82229499 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82229951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82230068 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 82230369 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82230439 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 82230574 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 82230967 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82231058 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 82231628 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 82232101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82232387 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82232492 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82233032 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82233319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82233727 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82233816 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82234094 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 82234096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82234261 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 82234428 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82234784 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82234796 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82235032 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 82235296 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82235316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82235399 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82235445 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82235502 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82235523 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82235554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82235608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82235700 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 82236605 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82236999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82237177 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82237577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82238009 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82238067 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 82238080 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 82238139 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 82238251 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 82238259 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 82238287 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 82238382 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82238577 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 82238670 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 82238716 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82238743 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82238834 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82238938 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 82239267 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 82239342 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 82239349 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 82239494 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82239495 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 82239520 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 82239584 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 82239639 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 82239682 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 82239789 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 82239959 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82239990 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 82240015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82240545 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 82240690 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 82241003 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82241086 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 82241760 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82241892 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82241913 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82242076 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 82242143 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82242337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82242462 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82242556 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82242621 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82242672 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82242696 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82242887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82243228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82243277 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82243295 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82243539 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82243561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82243794 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82243908 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82244124 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82244127 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82244224 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 82244429 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 82244524 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82244821 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 82245054 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 82245254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82245745 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82246146 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82246180 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82246463 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82246651 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82247010 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82247158 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82247186 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 82247301 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 82247378 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82248164 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 82248505 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 82248695 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 82248855 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 82249083 C T Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 82249694 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 82249696 C G Y N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 82250212 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82250690 G A Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 82251222 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82251324 G A Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 82252209 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 82252498 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 82252611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82253621 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82253666 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 82253677 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82253753 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82253941 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 82254784 G C Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 82254895 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 82255036 G A Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 82255491 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 82255524 C A Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 82255672 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82255883 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82256295 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 82256332 G T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 82256355 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 82256375 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 82256744 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82257194 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82257304 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82257305 A C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82257556 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 82257763 A G Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 82257892 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 82258120 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82258342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82258409 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82258459 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82258597 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82258760 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82259433 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82259485 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 82259810 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82259906 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 82260088 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82260193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82260278 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82260323 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 82260340 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 82260357 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82260427 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82260527 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82260531 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82260647 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 2 82260771 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 82260887 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 82261194 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 82261369 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82261452 T C Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 82261627 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82261688 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 82261807 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 82261870 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 82261902 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 82261962 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 82262038 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 82262049 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82262075 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 82262099 C A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 82262187 A T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82262207 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 82262210 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82262321 T G Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 82262402 C T Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 82262420 A C Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 82262421 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 82262917 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 82263007 G C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 82263040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82263283 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 82263338 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 82263402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82263453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82263463 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82263491 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82263578 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82263587 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82263773 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82263879 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82263891 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82264165 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82264212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82264223 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 82264278 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 82264301 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 82264574 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 82264737 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 82264773 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 82264803 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82264857 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 82271757 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 82272211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82272259 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 82272324 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82272367 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82272694 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82272731 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82272808 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 82273191 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82273436 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82273848 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 82273851 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82274010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82274208 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 2 82274284 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82274615 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 82274622 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 82274648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82274736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82274910 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82275022 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82275076 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 82275153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82275165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82275235 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 82275265 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 82275309 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82275314 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 82275463 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82275518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82275521 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82275590 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 82275603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82275608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82275663 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82275897 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 82275985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82276003 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 82276289 C G Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 82276291 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 82276347 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82276354 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82276453 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 82276483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82276559 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 82276615 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 82276651 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 82276670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82276733 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82276761 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82276795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82276831 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 82276972 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82277073 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82277128 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 82277162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82277200 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 82277231 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 82277324 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82277354 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 82277375 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 82277392 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 82277437 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82277440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82277509 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 82277546 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 82277607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82277662 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 82277773 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 82277846 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82277869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82277963 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 82278065 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82278070 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 82278084 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82278167 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82278347 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82278419 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 82278617 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82278859 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82279032 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 82279184 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 82279312 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82279768 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 82279814 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 82279915 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82279961 T C Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 82280005 A G Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 82280228 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 82280777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82280840 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82280921 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82280933 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82280987 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82281025 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82281050 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82281088 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 82281131 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82281149 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82281192 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 82281303 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82281363 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82281394 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82281410 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 82281449 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82281450 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82281535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82281783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82281928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82282051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82282061 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 82282070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82282131 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82282160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82282235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82282296 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 82282361 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82282366 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82282436 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82282453 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 82282464 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82282471 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 82282486 C A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 82282493 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82282513 C A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 82282754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82282761 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82282789 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 82282859 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 82282865 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82282879 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82282984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82283040 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 82283072 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 82283128 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 82283199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82283288 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82283298 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82283383 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 82283399 A C Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 82283420 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 82283442 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 82283453 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 82283474 G T Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 82283479 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 82283636 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 82283679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82283728 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82283734 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82283763 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 82283798 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 82283811 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 82283820 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82283902 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82283909 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82284001 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82284197 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82284202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82284319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82284391 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 82284452 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 82284716 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 82284761 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 82284858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82284887 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82284908 T G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 82285014 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 82285051 A T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 82285151 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 82285188 T C Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 82285266 A C Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 82285345 A T Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 82285376 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82285469 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82285559 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82285664 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82285742 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82285750 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 82285890 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 82285930 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 82286080 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82286126 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82286193 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 82286231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82286388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82286462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82286510 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82286523 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82286699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82286705 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 82286714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82286763 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82286847 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82287270 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 82287290 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82287294 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 82287540 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 82287559 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82287584 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82287689 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82287951 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 82287985 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 82288019 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 82288069 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82288139 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82288216 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 82288266 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 82288358 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82288423 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 82288606 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82288775 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82288782 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82288790 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82288799 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82288912 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82288922 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82288974 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82289019 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82289088 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 82289449 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82289451 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82289467 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82289527 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82289553 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82289608 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82289952 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 82289973 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82290139 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 82290471 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82290579 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82290580 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82290721 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82290951 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82291142 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82291178 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82291180 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 82291250 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82291294 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82291386 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82291747 C A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82291783 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82291895 T G Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 82291951 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 82291988 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 82292029 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 82292046 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 82292096 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82292116 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82292132 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82292142 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82292307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82292375 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 82292461 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 82292492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82292747 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 82292756 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 82292801 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82292809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82292871 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82292886 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 82292908 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82292930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82292982 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 82293056 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82293136 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82293267 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82293311 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82293335 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 82293410 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82293484 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82293612 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 82293629 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 82293705 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82293796 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 82293894 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 82294026 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 82294067 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82294092 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82294137 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82294511 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82294534 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82294804 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82294827 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82294905 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 82295081 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 82295159 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 82295296 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82295319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82295448 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82295461 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82295471 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82295651 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 82295885 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82296127 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82296381 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82296404 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 82296482 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 82297036 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82297079 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82297111 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82297234 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82297316 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82297441 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 82297597 C T Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 82297990 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 82298030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82298219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82298431 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82298473 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82298493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82298961 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82298989 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82299099 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82299129 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82299143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82299237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82299259 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82299632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82299640 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82299670 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 82299865 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82300592 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 82300827 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 82301188 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 82301223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82301241 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 82301266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82301500 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 82301595 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 82301714 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82301908 A C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 82302287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82302344 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82302533 A T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 82302535 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82302642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82302697 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 82302698 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82302962 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82303139 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 82303181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82303362 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82303562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82303572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82303729 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82303845 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82303852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82303989 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82304073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82304183 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82304292 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82304326 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82304343 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82304429 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 82304542 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82304589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82304781 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82304830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82305017 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 82305098 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82305104 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 82305207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82305264 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82305468 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82305472 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82305628 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82306035 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 82306143 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 82306310 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82306452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82306456 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82306482 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82306554 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82307034 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 82307144 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 82307505 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82307513 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 82307560 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 82307572 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 82307580 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82307857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82308017 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 82308018 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82308094 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 82308245 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 82308363 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 82308498 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 82308567 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82308585 C G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 82308991 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82309136 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82309138 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82309362 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82309672 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82309699 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82309710 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 82309833 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82310054 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82310083 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 82310142 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82310301 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82310423 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82310443 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 82310460 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 82310511 G A Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 82310561 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82310585 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82310759 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82310819 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82310833 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82311008 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82311030 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82311222 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82311477 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82311699 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 82311824 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82312019 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82312204 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82312250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82312286 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82312301 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82312435 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82312491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82312550 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82312563 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82312607 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82312885 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82312887 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82313054 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82313247 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 82313442 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 82314056 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82314314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82314361 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82314567 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82314591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82314922 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82314927 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82315139 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82315253 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82315367 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82315571 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82315574 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 82315588 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 82315864 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 82316287 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82316360 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 82316398 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82316486 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82317222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82317644 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82317753 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82317787 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 82317964 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82317999 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 82318036 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 82318062 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82318181 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82318268 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82318286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82318321 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 82318869 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 82318952 A G Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 82319007 G C Y N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 82319175 G T Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 82319400 C T Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 82319440 C G Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 2 82319523 T C Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 82319578 A T Y N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 2 82319671 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82319835 A G Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 82320468 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 82320525 C T Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 82320632 G C N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.3 0 0.7 6 14 3 0 7 2 82320672 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 82320868 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 82320939 T C Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 82320964 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82321159 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 82321405 C T Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 82321430 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 82321481 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 82321701 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 82321818 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 82321981 G A N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 82322026 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 82322243 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 82322310 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 82322433 C A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 82322458 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 82322496 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 82322677 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 82322688 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 82323917 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 82323931 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82323953 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82323979 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82323980 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82324087 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82324234 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82324377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82324496 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82324529 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82324542 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82324568 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82324648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82324652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82324690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82324699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82324749 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82324777 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82324792 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82324901 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82324918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82324928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82324945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82324946 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82324969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82324982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325057 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82325122 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82325128 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82325141 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82325142 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82325171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325174 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325312 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325314 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325471 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325512 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325523 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325590 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325629 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325715 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325797 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82325813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82325841 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82325842 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82336263 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82336346 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82336375 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82336394 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82336429 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82336701 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82336738 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82336742 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82336835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82336844 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82336846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82336858 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82336877 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82336894 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82336936 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82337033 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82337053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82337113 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82337182 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82337296 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 82337424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82337449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82337457 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82337481 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 82337522 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82337573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82337612 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82337687 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82337691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82337699 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82337760 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82337777 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82337830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82337860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82337914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82337970 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82337981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82338179 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82338238 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82338391 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82338442 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82338454 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82338607 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82338674 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 82338686 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82338830 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82339024 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82339203 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82339252 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82339323 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82339328 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82339355 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82339367 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82339489 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82339530 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82339691 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82339765 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82339766 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82339827 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 82339883 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82339934 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82339945 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82340308 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82340339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82340408 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82340410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82340466 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82340498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82340505 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82340637 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82340662 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82340682 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82340747 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82340831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82340883 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82340948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82340974 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82341099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82341120 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82341168 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82341262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82341308 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82341359 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82341462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82341472 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82341492 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82341514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82341564 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 2 82341750 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 82341831 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82341849 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82341935 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82341951 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82341983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82342014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82342042 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82342089 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82342133 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82342181 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82342209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82342217 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82342259 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 82342331 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 82342395 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82342620 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82342698 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82342699 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82342714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82342721 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82342783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82342787 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82342961 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82342991 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82343147 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82343312 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 82343346 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82343381 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 82343399 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82343495 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82343637 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82343957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82344072 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82344127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82344222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82344290 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82344376 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 82344384 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82344424 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 82344579 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82344588 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82344687 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82344793 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 82344820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82344909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82345031 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82345060 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 82345138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82345306 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82345346 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 82345361 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 82345502 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82345661 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82345662 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82345766 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82345823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82345863 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82345905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82345952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82345965 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82346008 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82346054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82346188 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82346203 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82346227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82346250 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82346333 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82346416 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82346432 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82346441 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82346464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82346545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82346588 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82347085 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82347166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82347191 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82347243 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82347378 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 82347387 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 82347413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82347486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82347543 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82347652 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82347670 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82347791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82347799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82347872 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82347888 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82347893 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82347939 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82347987 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 82347998 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 2 82348262 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82348294 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82348313 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82348335 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82348388 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82348399 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82348468 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82348515 T C Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 82348533 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 82348611 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82348637 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 82348784 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82348790 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82348853 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82349086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82349156 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82349236 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82349424 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82349473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82349474 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82349514 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82349525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82349548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82349550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82349576 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82349732 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 82349834 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82349869 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 82349899 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 82349967 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82349995 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 82350081 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82350137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82350191 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82350193 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82350218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82350252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82350320 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82350393 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82350497 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82350547 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82350759 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82350823 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82350843 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 82350946 A T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 82351145 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82351300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82351482 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82351663 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82351689 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 82351706 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 82351896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82351952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82352001 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82352311 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 82352346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82352430 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82352549 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 82352582 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82352615 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82352636 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82352758 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82352782 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 82352794 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 82352863 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82352913 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82353240 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82353255 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82353619 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82353761 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 82353782 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82353817 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82353932 G T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 82353995 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 82354033 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 82354063 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 82354086 A T Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 82354188 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 82354189 A T Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 82354230 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 82354294 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82354701 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82354729 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82355742 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 82355882 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 82355906 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82356062 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 82356069 G T Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 82356154 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 82356185 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 82356264 G T Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 82356277 G C N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 82356478 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 82356574 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 82356619 G C Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 82356821 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 82356855 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82356918 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82357002 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82357016 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82357154 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82357158 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 82357240 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 82357285 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82357296 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 82357309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82357659 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82357943 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 82357961 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 82357962 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 82357994 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 82358028 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82358078 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82358167 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 82358221 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82358293 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82358316 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82358331 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82358341 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82358395 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 82358443 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 82358585 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82358684 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 82358706 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82358827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82359132 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 82359136 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 82359211 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 82360561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82360701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82360769 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 82360832 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 82360887 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82361502 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82361653 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 82361809 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82362083 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 82362348 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 82362432 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 82362603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82362687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82362779 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82362798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82363472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82363667 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 82364681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82364733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82364771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82365537 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 82365595 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82365615 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82365907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82365924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82365927 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82366018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82366045 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 82366201 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82366322 A C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 82366407 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82366468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82366525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82367530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82367643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82368261 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82368433 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82368580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82368653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82369007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82369421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82370144 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 82370367 T A N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 82370572 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82370663 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82371471 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82371556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82371600 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82371826 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82371884 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 82372344 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82372394 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82372490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82372552 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82372890 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 82372977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82373081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82373180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82373616 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82373794 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 82373872 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82373891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82373893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82374009 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82374058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82374161 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 82374488 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82374601 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 82374668 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82374754 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82374840 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 82375254 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82375530 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82375582 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82375692 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82376154 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 82376562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82377016 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82377046 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82377578 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82377790 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82378501 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82378812 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82378817 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82379707 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82379820 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 82380064 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 82380193 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82380247 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 82380470 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 82380478 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82380526 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82380614 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82380742 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82380749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82381410 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82381491 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 82381540 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82381592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82381678 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82381904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82382212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82382781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82382799 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82383264 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 82384205 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82384666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82384799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82385164 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82385376 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 82385674 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82385682 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 82385824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82386126 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82387547 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 82387758 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82388172 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82389491 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 82389814 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 82390061 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 82390075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82390120 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82390216 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82390764 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82390878 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 82391210 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82391561 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 82391740 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82391819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82391829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82392098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82392325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82392371 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82392480 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82392542 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82392747 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82393228 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82393264 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82393359 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82393412 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82393680 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82393702 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82393767 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82394217 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82394354 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82394534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82394809 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82394828 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82395126 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82395152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82395226 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82395298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82395332 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82395682 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 82395867 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 82395995 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82396262 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82396419 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 82396524 C T Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 82396622 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 82396775 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82396873 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82396907 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82397156 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 82397220 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 82398124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82398149 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82398245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82398324 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 82398416 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 82399354 G T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 82399436 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 82399991 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82400188 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82400281 T C Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 82400387 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 82400432 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 82400618 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 82400645 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 82400800 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82401428 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82401484 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82401657 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 82402557 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82402626 A G Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 82403941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82404100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82404730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82406578 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82407702 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82408021 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 2 82408580 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 82409251 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82410117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82410370 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82411243 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82411827 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82412860 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82413034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82413259 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82414643 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82416814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82418862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82423653 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 82424344 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82425998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82429939 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82430320 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82432684 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82434045 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82434792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82439595 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82440804 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82443004 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82447331 T C Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 82447972 A G Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 2 82451276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82452948 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 82453885 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 82455522 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82456888 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82459754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82460547 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82461226 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82461449 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 82462000 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82462148 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 82462798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82465608 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 82466174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82467429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82468585 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 82470501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82471241 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82471519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82471570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82475779 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82476071 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82476731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82477436 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82479188 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 82481659 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 82481924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82483874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82484208 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82484460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82492467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82493487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82493615 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 82493789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82494434 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82494712 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82494787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82495055 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82495198 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82495672 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 82495774 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82495823 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82495883 A C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 82496533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82496552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82496685 C G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 82496995 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82497178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82497398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82497424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82497454 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82497492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82497583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82497629 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 82497875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82498005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82498319 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82498329 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 82498330 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82498659 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82498936 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 82499178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82499486 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82499492 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82499527 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 82499742 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82499781 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 82499857 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82500063 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82500126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82500198 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 82500245 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82500536 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82500800 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 82501100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82501186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82501348 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82501578 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 82501580 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 82504274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82507514 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82508622 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82508686 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 82508967 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82509358 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 82509660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82510523 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82510623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82511261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82511348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82511835 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 82511954 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 82511955 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 82513506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82520650 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 82521932 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82522868 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82522886 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82523092 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 82523105 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 82523661 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82523706 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82523726 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82524145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82524676 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82524744 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82525353 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 82525745 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82526569 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 82526775 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 82527344 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82527507 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 82527896 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82531236 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 82531779 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82532453 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82532746 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 82532835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82533335 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82533396 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 82533520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82533533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82534304 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 82534958 T A N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 82535246 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 82535278 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 82535561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82535987 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 82536380 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 82537055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82537091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82537494 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 82537545 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82537662 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 82537725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82537768 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 82537946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82538021 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 82538104 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 82538129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82538135 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 82538393 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82539943 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 82539949 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82540013 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 82540202 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82540270 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82540336 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82540357 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 82540363 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82540455 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82541252 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 82541588 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 82543140 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 82543344 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82543374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82543411 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82543752 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 82543838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82544136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82544446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82544456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82544582 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82544608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82544825 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 82545768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82545780 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 82545905 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 82546557 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 82547086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82547244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82547565 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 82547839 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 82547934 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 82547955 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 82548191 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 82548212 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82548385 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 82548536 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 82548604 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 82548621 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 82548722 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 82548797 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82549587 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 82550042 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 82550321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82550453 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 82551590 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 82551605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82551638 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 82551783 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 82552771 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 82552899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82554339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82554471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82556288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82558119 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 82558256 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82558342 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82559161 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 82561786 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82570702 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 82571003 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82572864 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82573898 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82575530 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 82578074 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82579268 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82581291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82581324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82582009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82583969 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 82584434 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82585064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82586216 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82588365 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82588413 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 82588629 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82589638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82590729 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 82590772 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82594803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82595304 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 82595588 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 82596010 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82596257 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82596483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82596729 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82596908 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 82599251 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 82600707 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82600946 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82603089 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82603886 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82604338 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82604645 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 82604853 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82605706 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82606582 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 82606818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82607389 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82607602 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82607815 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82607980 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82608382 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 82608752 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 82608989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82608997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82610001 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82610128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82612412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82612620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82613568 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 82616957 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 82621813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82629927 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 82631405 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 82633927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82635805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82639653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82641585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82643603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82643792 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 82643877 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82644045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82644407 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82644734 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 82647756 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 82648444 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82649383 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82651074 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82651141 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82652138 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82652224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82652410 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82652579 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 82652857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82652961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82653021 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 82653041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82654011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82654141 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 82654334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82654674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82654682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82654709 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 82655127 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 82655131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82656218 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82656457 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 82656723 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82657525 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 82657612 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82657768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82657910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82657949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82657996 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 82658224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82658877 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 82659424 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82659763 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82659941 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82660001 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82660059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82660671 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 82661815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82662350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82662731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82664259 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82664878 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82664921 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82665059 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82665144 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82665361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82666087 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 82666257 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 82666685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82666723 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 82667162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82667313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82667763 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 82667857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82667880 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 82668004 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82668125 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 82668695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82669657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82669676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82669787 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82669912 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82669973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82670396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82670483 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82671715 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82672669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82674882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82674883 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 82675013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82675884 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 82677849 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82678227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82678724 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82680435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82680799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82680837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82680853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82680867 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 82680919 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 82681028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82681100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82681421 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82681487 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82681632 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82681657 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82681778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82682292 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82682642 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82683069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82683293 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 82683396 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 82683446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82683877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82684831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82684919 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82685588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82685669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82686083 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82686364 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 82686897 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82687097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82687279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82688132 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82688278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82688367 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82688585 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 82688652 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82689927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82690058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82690123 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82691925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82693719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82693887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82695207 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 82697611 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82698047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82698520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82698921 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 82699003 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82700673 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82701567 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82701966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82702393 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82702397 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82704146 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82704752 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82704928 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82705297 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82706176 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 82706273 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 82706415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82706418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82706559 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 82707095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82707579 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 82708096 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 82708390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82708470 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 82708574 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 82708607 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 82714798 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82714868 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82714869 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 82715103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82715251 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82715816 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82715956 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 82716211 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 82716321 G C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 82716571 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82716601 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 82717085 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 82717963 A T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 82718006 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82718735 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82718852 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82718898 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 82719021 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 82719107 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 82719126 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 82719305 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82719314 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82719320 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82719494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82720143 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82720858 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 82720903 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 82722194 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 82729912 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82729942 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82729993 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82730050 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82730128 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82731090 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82731151 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 82731383 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82731417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82731992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82732551 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82733479 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 82733672 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 82733784 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 82734006 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 82734029 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 82734033 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 82734437 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 82734666 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82734994 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 82735077 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 82735087 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 82735428 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82735696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82735704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82735787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82736420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82736434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82736469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82736547 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 82736637 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 82737062 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82737637 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82738856 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82740139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82740529 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82746029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82746195 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 82747004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82747039 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82747246 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82747382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82747751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82748177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82748414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82748564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82751196 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82752697 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 82755339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82755851 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 82763728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82763922 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 82764955 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82765412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82767614 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82767799 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82767888 A C Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 82769136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82777719 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 82781605 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 82782206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82782691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82782970 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82783288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82785103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82787546 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82789892 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82794567 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82794626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82796814 C T Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 82798052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82801400 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82803732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82805002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82805243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82805414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82808161 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82811554 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82812290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82813257 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82817517 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 82817989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82818010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82819612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82820429 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82820981 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82821385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82824223 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82831632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82831811 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82834232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82835044 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82835203 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82835473 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82835689 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82836343 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82836543 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 82837965 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 82840341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82840551 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 82841304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82842213 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82842264 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82842273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82843014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82843182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82844107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82844274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82845302 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 82845742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82845860 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82846723 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82847245 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 82847444 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 82847582 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 82847718 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 82847733 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 82847835 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 82848032 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 82848358 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 82848735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82848823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82848895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82850030 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82850093 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 82850317 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82850653 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82850809 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82850843 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82851005 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82851337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82851444 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82851716 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82851985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82852172 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82852483 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82852510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82852911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82853732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82853741 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 82853999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82855445 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82855672 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 82855703 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82856415 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82856449 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82856860 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82856978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82857854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82857989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82858990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82859701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82860252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82861131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82861244 G A Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 82861786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82863130 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82863299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82863355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82863382 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82863403 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82863603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82863761 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 82864467 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82864615 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82865118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82868683 C T Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 82869376 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82870283 G T Y N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 2 82870330 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 82872983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82873074 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82873564 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 82879784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82879964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82894379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82894776 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 82894866 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 82895807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82896729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82897322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82897466 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82900809 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82900890 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 82902202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82903375 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82905319 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82906194 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 82907355 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82907709 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 82907728 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 82907776 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 82907777 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 82908027 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 82908974 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 82910582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82912660 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 82919125 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82922504 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82922505 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82922689 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82924244 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82924254 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82927006 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 82927333 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82927846 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 82928129 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82929275 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 82929396 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 82930696 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 82931559 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 82933422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82933748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82933751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82934160 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82934306 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 82934585 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82935628 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 82937546 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82937732 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 82938239 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 82938796 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 82939575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82940953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82941211 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 82941312 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 82941416 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 82941445 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 82941453 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 82941880 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 82941979 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 82942008 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82942152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82942268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82942328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82942463 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 82942987 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82943017 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 82943109 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 82943224 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 82943340 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 82943345 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 82943573 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 82943671 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82944637 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 82945034 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 82945048 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 82945067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82945106 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 82945269 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82945626 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82945651 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 82945671 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 82945681 C G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 82946054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82946399 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82947511 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 82947619 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 82948343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82948698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82949267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82949286 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82949306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82949536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82950359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82950364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82951558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82952349 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82952408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82952444 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82953322 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82953356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82953369 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82954318 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82954461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82957438 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 82963633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82964257 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 82966031 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82966521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82967745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82967897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82968478 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 82972191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82973916 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82974390 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 82974668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82976433 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 82978456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82978855 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 82979459 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82980275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82987067 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 82988312 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82988492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82988831 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82989434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82991840 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 82992149 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 82998685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83000826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83003444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83003466 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83003666 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 83004058 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 83004334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83004986 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83005158 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83006562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83006862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83007415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83007428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83007724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83012861 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83013445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83013805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83015400 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83016098 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83017365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83018201 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83019160 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83019787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83022314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83022551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83023546 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83023985 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 83024413 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83037741 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83041016 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 83041090 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83041145 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83041197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83041569 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83044981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83045203 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 83045502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83045663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83046318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83046340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83050223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83050587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83053286 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83054345 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83055138 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 83057620 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83058090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83059350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83059396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83059864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83059986 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83060190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83060421 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 83061228 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 83061515 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83062262 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83063460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83064865 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83065723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83066124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83067185 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83067222 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83067911 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 83068229 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 83069356 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 83071533 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83072997 G A Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 2 83074722 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 83075309 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 83075987 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 83076462 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83077503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83078863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83080551 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83081899 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83082020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83082327 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83083560 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83084635 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83084647 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83085079 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83085156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83085254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83085702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83085925 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83086590 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83086844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83087036 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 83087045 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 83087775 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83088962 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83090234 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83090381 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 83090437 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 83092034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83092244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83092451 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83092452 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83092618 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83092678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83093974 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83093984 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83094476 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 83094610 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 83095839 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83096452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83100571 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83103441 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83104035 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83104322 A C Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 83104705 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83105611 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83105705 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83106197 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 83106406 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83106465 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 83106879 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83106971 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83107064 G T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 83108475 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83110294 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 83110474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83111005 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 83111089 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83112019 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83113149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83113451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83113516 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83113955 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83114500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83115936 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 83116556 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83117305 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83117438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83117855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83118192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83118798 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83119985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83119992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83120006 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83120451 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83120453 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83121750 C A Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 83121802 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83125736 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83126240 C A Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 83126683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83126688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83127958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83128612 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 83128934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83129155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83131590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83131685 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 83131746 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 83132240 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83134335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83134786 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83135967 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83136562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83136614 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83138579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83139069 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 83139362 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83140998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83141866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83142152 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83143719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83143840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83143876 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 83144210 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83145236 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83147416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83149720 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 83150413 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83150808 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83150838 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83150854 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83151185 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 83151875 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 83152630 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 2 83152793 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 83152829 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 83152925 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 83152980 T G N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 83153360 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83153389 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 83153632 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83153998 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 83154349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83154636 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83154831 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83155163 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 83155185 G C Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 83155320 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83155365 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83155408 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 83155512 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83155513 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 83155745 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83155774 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83155775 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83155919 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83155956 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83155957 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83155988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83155995 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83156016 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 83156176 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83156249 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83156421 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83156439 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83156459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83156489 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83156626 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83156803 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83156843 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83157046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83157072 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83157277 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 83157380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83157634 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83158042 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83158552 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 2 83158723 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 83159092 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 83159184 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83159204 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 83159607 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83159622 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83159984 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 83160032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83160070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83160132 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 83160278 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83160585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83160917 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83160991 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83160998 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 83161125 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83161174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83161244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83161306 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 83162089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83162115 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83162435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83162534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83162575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83162655 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 83163251 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 83163367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83163373 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 83163627 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 83163722 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83163783 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83163805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83163918 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 83164066 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83164164 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 83164243 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 83169171 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83169274 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83169329 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 83169358 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 83169367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83169423 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83169544 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 83169577 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83169922 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 83169968 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 83170051 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83170314 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 83170316 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83170605 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83170717 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83170826 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83171358 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83171363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83171370 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 83171433 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83171532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83171866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83172193 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83172243 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83172416 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83172482 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83172504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83172797 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83172860 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83172911 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83172920 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83173549 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 83173688 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83173984 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83174006 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83174169 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83174239 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 83174322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83174407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83174464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83174491 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83175302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83175350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83175484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83175534 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83175573 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 83175625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83175825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83175853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83175943 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83176052 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83176186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83176258 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83176294 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83176337 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83176361 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 83176469 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83176502 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83176949 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83177033 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 83177380 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83177431 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 83177456 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 83177728 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 83177859 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83178053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83178274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83178354 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83178771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83181384 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 83181630 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83182027 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83182215 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 83182245 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 83182269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83183713 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83184577 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 83184721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83185544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83185684 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 83186263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83186321 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 83187461 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83188187 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83188409 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83188472 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 83188513 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 83188903 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83188928 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83188940 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83188960 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83188987 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83189128 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83189233 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83189506 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83189568 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83189661 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83189663 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83189748 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 83189775 A G Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 2 83189895 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83189902 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83189968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83190148 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 83190183 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83190194 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83190199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83190254 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83190281 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 83190397 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 83190503 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 83190722 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83190996 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 83193365 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 83194250 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83194387 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83194424 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83194569 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83194674 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 83194737 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83194793 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83194826 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83194954 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 83195043 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 83195077 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 83195127 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 83195306 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 6 12 3 0 6 2 83195476 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 83195817 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 83195836 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 83196020 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 83196043 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83196343 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 83196365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83196386 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83196417 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83196450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83196498 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83196528 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83196584 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83196599 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83196622 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83196670 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83196726 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83196832 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 83196848 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 83196877 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83196887 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83196914 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 83196947 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 83197170 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83197198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83197336 T C Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 83197843 G A Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 83197864 G A Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 83197915 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 83197940 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83197944 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 83197981 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 83197993 T G Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 83198089 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83198222 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83198323 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83198375 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83198475 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83198896 G A Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 83198981 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83199158 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83199189 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83199260 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83199324 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83199586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83199668 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83199878 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83199979 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83199981 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83201174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83201217 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83201238 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 83201297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83201450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83202155 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 83202158 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 83202225 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83202409 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83202454 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83202524 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83202540 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83202716 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83202767 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83202791 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83202811 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 83203062 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83203128 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83203262 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83203279 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83204433 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83204540 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83204579 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83204655 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83204753 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83205864 C T Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 83208266 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83208966 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83209100 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83209322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83209348 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83209462 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 83209517 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83209522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83209551 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83209765 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83210131 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83210691 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83211687 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83211937 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83212051 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83212064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83212265 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83212426 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 83212434 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83213114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83213163 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83220404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83220425 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83220539 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 83220645 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83220888 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83221092 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83221406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83221502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83221936 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83222050 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83222484 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 83223026 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 83223236 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83223834 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83223850 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83224085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83224398 G C Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 83224952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83225517 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83225692 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83225890 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83225986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83227150 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83228073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83228080 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83228399 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 83228941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83229106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83229239 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83229925 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83230016 A T Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 83230022 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 83230043 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 83230106 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83230461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83230593 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 83231064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83231210 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83231873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83232724 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83233263 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 83233280 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83233371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83233414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83233586 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 83233606 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83233639 C A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 83233731 T A N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 83233840 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 83233960 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83233969 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 83234007 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 83234122 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 83234207 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 83234259 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 83234284 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83234351 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83234382 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83234403 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83234666 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83234803 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83234804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83234820 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83234998 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83235127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83235250 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 83235399 A G Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 83235427 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 83236210 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 83236222 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 83236237 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 83236267 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 83236315 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83236358 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83236391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83236481 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 83236607 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 83236848 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 83236871 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 83236894 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83237159 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83237571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83238416 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 83241664 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83244597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83245002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83245622 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83245990 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83246961 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 83247501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83248298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83248331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83250838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83251652 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83252269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83252945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83253379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83253558 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 83261698 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 83262146 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83262796 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83262912 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83263101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83263424 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83264151 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 83264590 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83264841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83269937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83278003 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83283198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83283247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83283642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83284651 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83285532 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83286156 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 83286969 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83287111 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83287231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83287422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83287423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83289841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83290067 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 83290396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83290867 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83298794 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83299035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83299367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83302558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83302788 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83302962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83304049 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83304986 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 83305873 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83306153 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83306850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83309086 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 83311242 A C Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 83321062 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 83321071 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 83324461 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83324488 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83324502 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83324732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83324751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83324784 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83324859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83325189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83325373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83326272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83326422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83326792 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83326966 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83326997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83328345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83328642 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83328674 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83328984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83329486 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83329509 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 83329785 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.0909090909090909 11 11 1 9 1 2 83331116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83331500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83331501 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83331513 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83331799 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 83331989 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83332122 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83332247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83332448 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 83332551 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83332622 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83332638 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83332657 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83332686 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 83332701 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 83332748 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 83332772 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83332897 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83333077 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83333084 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83333093 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83333114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83333129 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83333145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83333155 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83333158 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83333187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83333195 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83333429 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83333436 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83333441 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83333447 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83333469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83333492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83333713 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83333817 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83335403 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 83335487 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83335529 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83335537 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83335553 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83335662 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83335673 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83335799 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83335822 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83335878 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83335928 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83335937 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83336005 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 83336009 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83336099 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83336253 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83336294 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83336370 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83336436 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83336455 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83336476 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83336478 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83336555 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83336659 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83336663 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83336711 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83336807 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83336823 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83336840 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83336867 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83336906 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83336955 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83337001 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83337393 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83337478 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83337644 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 83337688 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83337883 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 83337957 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 83338037 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83338273 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83338277 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 83338294 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83338307 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83338436 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83338528 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83338571 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 83338794 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83338849 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83338852 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83338890 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83339076 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83339186 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83339198 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83339312 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 83339422 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 83339500 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83339977 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83339996 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83340054 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83340630 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83340668 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83341245 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83341298 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83341679 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83341787 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83342039 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 83342406 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83342417 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83342571 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 83342576 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 83342594 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 83343066 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 83343338 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83343637 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83343691 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83343770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83343796 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83343837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83343869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83344911 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83345047 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83345080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83345289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83345462 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83345479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83345500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83345603 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83345980 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 83346352 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83346442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83346471 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83346627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83346651 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83346711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83346745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83346790 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83346832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83346936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83347068 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 83347093 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 83347204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83347324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83347444 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 83347480 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83347503 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 83347963 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83348039 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83348070 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83348138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83348181 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83348218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83348249 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83348267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83348420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83348804 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 83348836 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83349002 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83349315 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 83349407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83349507 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83349568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83349614 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83349706 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83349779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83349802 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83349837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83349838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83349920 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83349940 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83349967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83349980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83350116 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83350166 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83350189 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83350200 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 83350487 C T Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 2 83351598 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83351727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83351765 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83351793 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83351851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83356997 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83357055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83357083 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83357165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83357248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83357389 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83357517 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83357583 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83357597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83357829 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83357961 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83357966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83357983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83358013 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83358015 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83358078 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83358086 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83358108 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83358115 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83358202 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83358217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83358282 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83358370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83358373 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83358389 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83358430 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83358452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83358531 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83358653 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83358710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83358723 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83358775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83358959 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83359280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83359313 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83359346 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83359356 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83359367 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83359372 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83359457 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83359507 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83359527 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83359537 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83359538 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83359587 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83359651 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83359686 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83359703 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83359732 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83359756 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83359775 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83359871 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83360015 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83360027 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83360187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83360213 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83360226 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83360235 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83360393 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83360423 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83360468 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83360527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83360596 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83360636 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83360793 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83360806 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83360874 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83360970 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83361011 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83361377 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83361379 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83361464 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83361506 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83361533 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83361617 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83361664 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83361696 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83361711 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83361849 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83361948 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83362043 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83362062 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83362169 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83362209 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83362254 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83362308 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83362406 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83362408 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83362532 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83362796 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83362797 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83362859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83362871 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83362883 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83362920 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 83363024 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83363035 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83363049 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363095 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363128 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363159 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363174 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363185 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363195 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363298 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83363329 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363440 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83363587 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363654 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363663 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363721 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363774 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83363834 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83363986 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83364278 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83364436 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83364490 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83364654 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83364749 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83364868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83364887 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83364931 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83365101 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83365144 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83365287 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83365317 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83365319 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83365341 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83365487 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83365677 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83365929 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83366329 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83366354 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83366575 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83366676 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 83366895 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83367496 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83367530 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83367549 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83369133 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83369289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83369924 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83370166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83370412 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83378124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83378435 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83379181 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83379910 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83379964 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83380008 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83380537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83380790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83387648 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83388116 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 83388145 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83388623 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83389348 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83389538 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83389789 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83390392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83390635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83390692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83390768 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83391015 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83391098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83391099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83391363 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83391421 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83391752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83392125 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83392272 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83392600 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83393027 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83393594 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83393760 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 83393995 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83394207 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 83394219 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83394417 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 83394721 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83394883 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83394952 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83404476 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 83404498 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 83404793 A C Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 83405602 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83405917 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 83406105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83408316 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83408513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83408550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83408579 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83408611 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83408672 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83408774 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83409018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83409145 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83409380 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83409491 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83410193 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83410450 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83410516 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83410694 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 83410788 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83410807 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83410885 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83417167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83417200 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83417265 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83417321 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 83417403 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 83417464 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 83417565 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83417633 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83417730 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83417731 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 83417757 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83417778 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83417797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83417828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83417894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83417952 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83417967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83418018 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83418022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83418035 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83418156 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83418212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83418435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83418472 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83418544 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83418556 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83418573 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83418575 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83418600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83418637 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83418673 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 83429692 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 83429706 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 83429766 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 83429842 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 83429958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83430047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83430106 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83430149 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83430199 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 83430237 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 83430265 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 83430409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83430428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83430460 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83430547 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83430596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83430604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83430609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83430615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83430642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83430858 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 83430907 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 83430933 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 83431079 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83431096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83431119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83431132 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83431146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83431281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83431345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83431391 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83431400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83431472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83431486 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83431509 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83431582 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83431599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83431622 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83431651 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83431672 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83431769 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 83431981 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 83432054 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 83432072 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83432074 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 83432127 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83432200 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83432321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83432339 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83432366 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83432517 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83432584 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83432646 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83432735 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83432892 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83432954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83432988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83433030 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83433101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83433326 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83433334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83433398 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83433406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83433482 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83433497 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83433573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83433620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83433709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83433783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83433790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83433809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83433841 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83434058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83434068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83434132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83434365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83434372 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83434397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83434422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83434561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83434616 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83434696 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 83434754 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83434831 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83435149 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83435157 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83435169 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83435536 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83435565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83435709 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83435787 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83436538 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83436765 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 83436880 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83437251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83437828 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83438018 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83438342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83438493 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 83438652 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83438804 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83439120 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 83439452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83439727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83439869 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83439896 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83440099 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83440183 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83440601 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83441015 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83441076 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83441259 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83442536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83442877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83443059 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 83443759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83443833 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83445219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83445498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83446474 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83448418 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83448590 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83448801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83449252 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83449510 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83449545 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83449557 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83449830 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83450791 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83450877 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83450923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83451015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83451194 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83451785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83451790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83452190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83452391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83452422 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83452432 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83452450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83452691 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 83452819 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 83452968 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 83453025 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 83453394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83453479 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83454671 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83454895 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83455046 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83455471 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83455774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83456489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83456932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83457157 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83457166 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83457217 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83457270 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83457318 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83457365 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 83457581 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83457586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83457607 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83457671 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83457719 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83457785 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83457881 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83458064 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83458234 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 83458272 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83458305 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83458389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83458863 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83458902 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83458951 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83459228 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83459249 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83459377 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83459500 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83459594 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83460356 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 83460382 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 83460463 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 83460664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83460705 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83460771 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83460836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83460838 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83460893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83461270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83461273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83461440 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83461647 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83461667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83461849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83461883 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83461891 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83461914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83462003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83462282 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83462301 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83462331 C A Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 83462387 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83462490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83462498 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83462561 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 83462985 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83463095 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83463137 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83463282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83463481 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 83463502 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 83463545 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 83463637 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 83463714 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83463773 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83463779 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83463861 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83463923 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83464212 T A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 83464416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83464739 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 83464846 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83464977 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83465068 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83465094 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 83465211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83465325 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 83465339 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83465389 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83465416 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83465660 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 83465869 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83466017 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83466539 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83466543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83466560 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83466660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83466690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83466723 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83466970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83467028 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83467175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83467182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83467212 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83467263 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83467267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83467276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83467433 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83467466 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83467627 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 83467817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83467867 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83467888 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 83468623 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 83468624 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 83468659 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 83468674 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83468718 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83468862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83469075 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83469110 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83469239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83469280 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 83469403 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 83469446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83469459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83469618 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83469660 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83469741 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83470058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83470146 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 83470414 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 83470472 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 83470576 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 83470802 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83471120 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 83471144 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 83471296 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 83471467 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 83471785 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 83471935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83471946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83471966 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83472200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83472284 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 83472417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83472809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83473127 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83473274 T A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 83473275 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 83474589 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83474617 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 83474675 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 83474694 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 83475473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83475481 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 83475539 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83475594 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83475631 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83475696 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83475701 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83475934 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83476801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83476937 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 83477229 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 83477301 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83477723 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 83477884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83477909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83477938 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83478042 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83478541 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83479302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83480134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83480668 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 83481985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83484100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83484102 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 83484373 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 83484382 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83484406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83484408 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83484464 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 83484627 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83484743 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83485071 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 83485595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83487370 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83487846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83488136 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 83488307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83488848 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83488960 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83489664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83490151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83490318 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 83490874 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83490982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83491205 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83491232 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83491316 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 83491495 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 83493192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83493268 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83494012 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83494093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83494106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83494135 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83494679 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83495147 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 83496001 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 83496244 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83497346 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83497383 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83497571 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83497721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83498059 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 83498623 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 83499457 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 83499544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83500202 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83500364 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83500625 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 83500665 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 83500678 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 83500684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83500694 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 83500734 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 83501138 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83501929 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 83502109 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83502422 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83502437 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83502485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83503417 A T N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 83505630 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 83506590 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83507454 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83507776 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 83507877 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83508525 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 83508670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83509081 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83509224 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 83509302 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 83509887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83510262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83511548 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 83511595 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83511694 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 83512381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83512909 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 83513435 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83514193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83514336 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83514361 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83514385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83514386 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 83514402 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83514425 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83514442 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 83514453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83514464 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 83514475 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83514545 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83514950 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 83515010 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 83515032 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 83515059 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83515189 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 83515303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83515447 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 83515469 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 83515581 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 83515669 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83515716 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 83515844 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 83515852 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 83515864 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 83515929 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 83515988 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83516008 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 83516306 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 83516405 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 83516413 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 83516549 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 83516576 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 83516597 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 83516769 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83516879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83516885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83517187 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83517210 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83517375 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 83517400 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 83517494 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83517505 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83517724 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83517932 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 83517985 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 83518003 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 83518100 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83518412 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83518723 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83518728 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83518782 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83518811 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83518975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83519008 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83519097 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83519176 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 83519258 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 83519366 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83519462 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 83519527 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83519530 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 83519664 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83520420 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 83520947 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 83521074 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83521696 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83521818 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83521833 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 83522127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83522217 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 83522438 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 83522596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83522930 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 83522938 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 83522942 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 83522957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83522985 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 83523053 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 83523082 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 83523098 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 83523101 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 83523113 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 83523207 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 83523904 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83523948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83524023 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 83524122 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 83524423 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 83524934 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83525026 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83525086 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83525174 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83525343 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83525463 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83525527 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83525543 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83525657 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83525695 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83525718 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83526009 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 83526623 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 83528201 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83528290 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83528428 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83528538 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83528673 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83528807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83528900 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83528917 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83529063 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83529124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83529161 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83529323 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83529381 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83529417 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83529550 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83529569 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 83529721 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 83529729 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83529745 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83529942 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 83530093 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 83530195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83530221 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 83530251 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 83530264 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 83530537 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 83530547 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 83530653 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 83530678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83530901 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83531125 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83531140 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 83531192 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 83531308 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 83531985 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 83532003 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 83532030 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 83532054 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 83532355 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83532596 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 83532665 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83532865 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83532950 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83533377 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83533486 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83533694 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 83533716 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83533778 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 83534111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83534324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83534570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83534712 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 83534761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83534881 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83534883 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83535018 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83535029 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83535076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83535301 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 83535311 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 83535338 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 83535359 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 83535393 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 83535997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83536036 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 83536063 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83536707 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 83536890 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 83538816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83539181 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 83540173 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83541176 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83541978 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83544530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83544540 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 83544544 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83544666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83544693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83544773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83544787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83544915 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83545284 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83545388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83545536 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83546553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83546565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83547021 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83547153 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83547167 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83547177 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83547412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83547629 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83548373 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83548400 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83548481 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83548612 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83548737 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 83548915 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 83549330 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83549506 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83549952 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83550004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83550048 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 83550342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83550765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83550938 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83550971 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83551027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83551085 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83551236 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 2 83551253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83551277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83551312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83551587 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83551675 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83551686 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 83551818 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83551900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83551987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83552037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83552249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83552251 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 83552273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83552276 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83552318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83552346 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 83552823 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83552877 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 83552913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83553135 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83553165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83553206 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 83553609 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83555826 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 83555914 T A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 83555923 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83555991 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 83556624 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83556988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83557018 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 83557873 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83558024 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 83558422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83559052 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83560987 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83561962 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 83562072 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83562128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83562947 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83563030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83564389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83564640 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 83565133 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83565275 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83565741 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 83566482 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83566490 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 83566496 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 83566666 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83566702 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83567597 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83568395 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 83568731 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83568904 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 83569476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83570199 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83570597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83570739 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83570897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83570920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83571222 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83571923 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83572192 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83573374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83575239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83575366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83575684 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 83575697 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83575929 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83576264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83576274 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83577176 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83577721 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 83577761 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 83577955 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83578025 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83578192 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83578603 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83578744 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 83578810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83578905 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 83578907 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 83578924 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83579189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83579201 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83579260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83579637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83580393 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 83580437 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 83580439 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 83580474 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 83580747 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83581696 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 83582612 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 83583225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83583344 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 83583415 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83583462 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83586362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83586475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83587265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83587504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83587510 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83587662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83587685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83587884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83591437 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83593128 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 83594010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83594242 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83594712 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83594933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83594981 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 83594986 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 83594992 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 83595125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83595146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83595787 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83595825 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83596113 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83596348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83598516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83599199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83599336 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83599747 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 83599788 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 83599920 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 83599971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83599992 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83600300 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83600320 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 83600322 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 83600349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83600484 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 83600676 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 83601032 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 83601042 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83601154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83601460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83601714 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 83601749 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 83602190 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 83602228 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 83602390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83602400 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83602468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83602490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83602506 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83602522 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 83602527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83602588 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 83603051 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83603135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83603262 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 83604010 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 83604209 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 83604311 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 83604382 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83604520 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 83604523 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 83604633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83604671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83604902 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83604917 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83605063 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 83605524 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 83605830 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 83605843 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83605844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83605857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83607686 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 83608241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83608319 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 83609175 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83609396 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83609402 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83609510 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83609788 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83609891 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 83610136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83610358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83610885 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83611638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83612095 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83612124 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 83612160 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 83612189 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 83612777 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 83613748 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 83613968 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 83614117 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 83614184 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 83614247 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 83614286 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83614349 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 83614393 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83614547 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83614761 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 83614763 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83614831 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83614924 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83615090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83615111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83615730 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83615954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83616272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83616441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83617296 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 83617709 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 83617710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83617972 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 83618109 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83618377 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83618480 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 83618827 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83618990 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 83619018 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83619348 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83620460 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 83620667 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 83620786 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 83620831 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 83621006 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 83621174 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 83621455 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 83621481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83621512 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 83621890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83621921 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 83623125 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 83623140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83623146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83623160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83623229 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83623310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83623594 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83623865 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83623866 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83623889 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 83623989 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83624063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83624098 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 83624231 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83624336 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 83624584 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83624608 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 83625061 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 83625237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83625283 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 83625400 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83625510 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83625690 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 83625849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83625860 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83625931 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 83626059 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 83626549 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 83626589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83626590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83626801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83626934 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 83626992 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 83627008 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 83627085 C A Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 83627144 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83627292 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83627421 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83627493 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83627576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83627636 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83627641 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 83628006 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83628338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83628492 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 83628600 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83628798 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83628840 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83628860 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83629010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83629228 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83629242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83630029 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 83630133 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83630154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83630251 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83630264 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 83630327 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83631084 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 83631252 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 83631440 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 83631598 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83632176 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83632204 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83632414 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 83632567 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 83632684 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 83632782 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83632921 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83633127 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 83633262 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 83633351 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 83633353 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 83633500 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83633518 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 83633990 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83634062 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83634076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83634187 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 83634230 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 83634292 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83634314 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83634402 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83634728 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 83634925 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83634990 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 83635000 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 83635023 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83635100 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83635756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83636152 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83636690 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 83636722 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 83636725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83636761 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 83636796 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83637094 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83637221 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83637301 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83637530 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83637809 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83637876 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 83638101 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83638213 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 83638282 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 83638296 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83638881 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83638969 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 83638985 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 83639077 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83639134 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 83639208 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83639374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83639394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83639516 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83639539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83639549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83639683 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83639736 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 83639760 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 83639813 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83639837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83639842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83639860 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83640021 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83640063 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83640088 A T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 83640121 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83640144 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 83640325 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 83640340 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 83640380 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 83640473 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 83640665 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 83640749 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83640756 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 83640773 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 83640838 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83640875 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 83640894 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 83640948 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83641343 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 83641394 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 83641513 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83641635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83642109 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 83642116 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 83642161 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 83642215 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83642783 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83642800 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83642900 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83642928 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83642939 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 83643292 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 83643348 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 83643442 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83643491 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83643543 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83643565 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83643570 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83643673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83643741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83643848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83644122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83644186 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83644218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83644398 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83644419 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83644463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83644561 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83644562 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83644592 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83644728 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83644923 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83645293 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83645433 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83646318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83646329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83646569 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83646609 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83646735 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 83647184 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83647236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83647448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83647481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83647623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83647753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83647787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83647799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83647859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83647895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83647914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83647981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83648036 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83648039 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83648063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83648107 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83648112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83648266 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83648353 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83648469 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 83648666 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 83648681 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 83648722 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 83648974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83649016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83649095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83649112 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83649170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83649339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83649343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83649350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83649556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83649671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83649790 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83649814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83649822 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83649931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83650004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83650102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83650200 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83650249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83650289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83650293 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83650308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83650464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83650520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83650536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83650652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83650674 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83650780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83650841 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83651106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83651389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83651418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83651556 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83651644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83651781 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 83651988 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83652372 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83652446 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83652530 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83652792 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83652870 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83653090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83653189 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83653836 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83654028 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83654294 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83654555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83654721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83654738 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83655292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83655364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83655427 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 83655535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83655577 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83655590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83655741 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83656032 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83656034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83656111 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83656292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83656337 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83656631 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 83656653 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 83656705 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83656954 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 83656983 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83657005 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 83657189 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83657292 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83657316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83657654 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83657686 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 83658524 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83658636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83658672 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83658731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83658746 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83658816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83658870 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 83658915 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83659062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83659175 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83659201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83659279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83659376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83659566 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83659670 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 83659743 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 83659866 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83659867 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83659899 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83659905 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83659932 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83659954 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83660090 G C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 83660119 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 83660216 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83660430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83660789 T A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 83660812 G C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 83661062 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83661071 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 83661187 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83661194 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83661322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83661324 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83661364 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83661442 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 83661472 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83661529 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 83661676 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 83661886 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83661910 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83661940 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83661957 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 83661973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83661990 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 83662024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83662172 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83662250 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 83662363 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 83662451 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 83662497 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83662545 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 83662590 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 83662615 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83662648 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83662709 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83662952 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83663054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83663068 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83663117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83663164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83663168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83663207 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83663329 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83663344 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83663436 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83663510 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 83663518 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 83663617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83663618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83663816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83664245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83664279 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83664570 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83664782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83664851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83664867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83664870 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83664899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83664931 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83664938 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83664979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83664989 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83664997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83665006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83665032 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83665103 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83665164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83665172 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83665210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83665256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83665332 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83665429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83665452 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83665481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83665633 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83665679 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83665698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83665749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83666034 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83666054 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83666227 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 83666245 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 83666263 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83666272 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 83666363 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 83666434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83666437 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83666497 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83666629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83666650 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83666711 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83666813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83666981 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83667174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83667291 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83667354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83668341 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83668374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83668582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83668809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83669131 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 83669214 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83669307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83669618 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 83669622 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83669688 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 83669767 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 83670102 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83670183 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 83670302 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83670550 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 83670571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83670657 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83670859 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 83671172 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 83671218 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 83671420 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83671642 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83671646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83671703 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83671740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83671839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83671924 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83671958 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83671977 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 83672012 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83672086 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 83672100 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83672177 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 83672240 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83672282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83672372 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83672502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83672531 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83672544 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83672657 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83672724 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83672844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83672909 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83672924 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83673054 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83673070 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83673139 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83673191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83673456 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83673704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83673705 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83673922 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 83673925 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83673939 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83673975 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83674046 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83674117 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83674137 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83674153 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83674193 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83674243 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83674303 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83674334 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83674496 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83674622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83674805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83674850 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83674867 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 83674917 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 83675011 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83675032 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83675144 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83675162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83675185 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83675214 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83675240 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 83675323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83675386 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83675449 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83675670 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 83675736 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83675868 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83675916 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 83675953 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83676091 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83676264 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83676280 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 83676361 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83676364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83676378 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83676384 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 83676474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83676531 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 83676610 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 83676629 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83676745 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83676787 A C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 83676844 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 83676854 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 83676872 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 83676890 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 83676930 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83677029 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83677230 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83677273 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83677306 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83677421 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83677443 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83677518 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83677571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83677619 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83677663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83677681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83677682 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 83677824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83677858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83677876 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83677883 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83677899 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83677938 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83678065 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83678066 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83678125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83678221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83678357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83678393 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83678396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83678414 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83678439 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83678474 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83678494 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83678558 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83678570 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83678601 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83678651 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83678696 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83678807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83678824 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83678827 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83678891 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83678991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83679032 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83679062 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83679073 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83679108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83679116 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83679520 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83679647 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83679650 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83679777 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83679815 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 83679988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83680040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83680057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83680163 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83680179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83680282 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 83680461 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83680507 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83680616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83680642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83680719 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83680836 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83680889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83680950 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83681741 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 83682088 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 83682156 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 83682209 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83682337 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83682341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83682398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83682484 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83682566 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83682577 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83682600 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83682655 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83682736 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83682756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83682798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83682996 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83683078 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83683089 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83683096 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83683321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83683396 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 83683507 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83683570 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 83683591 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 83683593 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 83683623 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 83683751 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83683844 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83683885 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83684007 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83684061 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83684228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83684270 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83684312 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83684433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83684466 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83684592 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83684631 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83684638 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83684650 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83684740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83684797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83684887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83685002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83685034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83685152 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83685180 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83685580 T G N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 83685712 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83685715 G C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 83685724 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 83686127 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83686179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83686273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83686288 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83686318 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83686330 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83686396 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83686411 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83686473 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83686491 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83686528 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83686551 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83686685 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83686692 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83686824 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83686888 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83686956 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83687054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83687111 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83687195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83687496 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 83687497 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 83687660 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83687728 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83687881 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83688002 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83688007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83688169 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83688197 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83688214 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83688234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83688235 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83688320 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83688341 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 83688402 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 83688413 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83688456 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83688596 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 83688840 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83688928 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83688937 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83688939 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83689075 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83689252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83689614 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83689652 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83689774 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83689855 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83690086 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 83690107 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 83690151 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83690267 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 83690347 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83690400 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83690412 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83690430 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83690442 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83690471 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83690554 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83690630 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83690645 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83690745 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83690765 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83690773 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83690778 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83690784 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83690813 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83690879 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83690901 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83691052 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83691063 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83691106 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83691298 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83691329 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83691369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83691375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83691388 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83691534 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83691558 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83691698 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83691714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83691740 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83691756 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83691783 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83691830 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 83691863 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83691864 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83691888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83691905 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83691913 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83691984 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 83692042 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83692149 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 83692199 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 83692242 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83692268 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 83692294 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 83692372 G T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 83692373 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 83693767 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83693772 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83693899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83693905 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83693923 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83693955 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83693960 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83694018 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83694025 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83694054 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 83694064 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 83694097 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83694098 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83694111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83694146 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83694167 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83694216 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 83694330 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83694349 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 83694413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83694529 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83694926 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83694947 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83694959 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83694985 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83695010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83695046 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83695082 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 83695083 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 83695162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83695170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83695261 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 83695407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83695466 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83695477 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83695547 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83695803 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83695930 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83695935 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83695956 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83696110 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83696126 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83696242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83696421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83696788 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83696972 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83697002 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83697171 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 83697513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83697525 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83697562 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83697632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83697646 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83697665 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83697719 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83697762 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83697814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83697879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83698062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83698170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83698309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83698508 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83698614 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83698671 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83698840 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 83698921 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 83699045 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83699162 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83699255 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83699422 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 83699479 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83699555 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83699577 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83699639 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83699640 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83699772 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83699830 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83699846 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83699871 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83699884 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83699961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83699980 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83700002 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83700073 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83700103 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83700258 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83700296 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83700322 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83700452 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83700854 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 83700955 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83701000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83701016 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83701306 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83701424 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 83701537 T G N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 83701581 A T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 83701606 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 83701616 T C N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 83702138 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 83702163 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 83702182 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 83702366 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83702399 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 83702937 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 83702984 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 83703133 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 83703142 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 83703153 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 83703183 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83703274 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83703301 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83703372 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83703395 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83703452 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83703494 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83703713 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83703725 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 83703730 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 83703749 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 83703808 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 83703834 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83703856 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83703969 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 83704015 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 83704018 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83704069 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 83704071 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 83704161 G C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 83704178 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 83704399 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 83704405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83704426 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 83704458 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 83704608 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83704643 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83704675 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83704676 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83704777 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83704797 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 83704827 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83704845 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83712449 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 83712506 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 83712534 C G N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 83712629 A C Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 83712664 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 83712763 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 83712800 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 83712845 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 83712863 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 83712966 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 83712988 C G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 83713003 G C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 83713062 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83713098 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 83713110 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 83713136 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 83713163 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83713231 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 83713294 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 83713326 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 83713341 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 83713391 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 83713427 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83713431 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83713443 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83713502 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83713559 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83713594 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83713599 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83713610 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83713684 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83713694 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83713741 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83713770 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83713781 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83713829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83713899 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83713957 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83714003 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83714025 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83714057 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83714104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83714125 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83714151 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83714162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83714191 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83714196 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83714208 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 83714411 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83714431 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83714748 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83714907 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83714929 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83715004 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83715029 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83715030 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83715167 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83715187 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83715382 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83715383 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83715500 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83715513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83715615 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83715738 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83715741 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83715806 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83715835 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83715890 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83715919 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83715976 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 83715977 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 83716039 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83716088 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 83716116 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83716129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83716199 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83716300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83716430 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 83716453 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 83716474 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83716509 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 83716733 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83716965 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83717065 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83717087 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83717205 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83717221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83717235 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83717345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83717368 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 83717490 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83717503 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 83717684 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 83717815 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83717817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83717832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83717838 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83717871 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83717953 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83717964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83718074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83718153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83718275 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83718485 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83718528 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83718554 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83718576 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83718609 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83718688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83718719 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83718743 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83719004 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83719134 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83719176 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83719211 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83719253 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 83719256 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 83719345 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 83719354 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83719444 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83720128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83720260 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 83720276 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 83720440 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 83720576 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 83720584 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 83720919 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83720941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83720942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721008 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83721173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721301 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83721320 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83721383 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83721413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83721429 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83721450 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83721491 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83721560 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 83721622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721653 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721746 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83721884 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83721921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83721922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83721951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83722012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83722072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83722171 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83722173 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83722210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83722301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83722330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83722423 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83722426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83722568 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83722609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83722634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83722653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83722654 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83722718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83722786 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83723251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83723412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83723426 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83723505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83723631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83723645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83723652 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83723720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83723864 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83723939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83724077 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83724216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83724221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83724285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83724388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83724452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83724505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83724554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83724558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83724613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83724706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83724721 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83724727 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83724934 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 83725385 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83725418 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83725421 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83725439 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83725458 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 83725459 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83725487 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83725546 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 83725558 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83725564 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 83725589 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 83725647 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 83725787 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83725789 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83725840 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83725869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83725874 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83725882 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83725901 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83726089 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83726091 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83726101 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83726117 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83726120 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83726194 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83726276 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83726302 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83726376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83726562 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83726602 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83726630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83726672 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83726992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83727028 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83733565 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83733652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83733672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83733703 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83733737 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83733829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83733855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83733856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83733934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83733952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83733958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83733969 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734021 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734341 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83734345 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83734368 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83734394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83734617 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83734706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83734893 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83735014 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83735026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83735038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83735053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83735063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83735311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83735362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83735427 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83735431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83735476 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83735497 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83735545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83735607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83735808 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83736051 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83736121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83736203 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83736285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83736549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83736623 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83736875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83737045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83737130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83737412 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83737450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83737472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83737529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83737641 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83737753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83737765 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83737766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83738004 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83738010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83738022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83738034 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83738081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83738108 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83738950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83738999 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83739034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83739485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83739494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83739542 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83739576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83739674 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83739740 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83739859 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83740047 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83740119 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83740267 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83740280 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83740292 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83740325 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 83740343 A C Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 83740406 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83740460 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83740486 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83740525 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 83740530 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 83740558 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 83740720 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 83740884 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 83740936 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 83740961 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 83740973 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 83740981 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 83741110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741135 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83741181 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741193 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741296 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741665 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741784 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83741988 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742037 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83742059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742261 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83742403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742876 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742944 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83742959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743132 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743384 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83743427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83743430 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83743448 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83743809 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83743850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83743999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83744009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83744053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83744063 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83744125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83744167 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83744249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83744258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83744355 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83744383 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 83744430 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83744473 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83744580 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83744596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83744677 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83744683 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83744749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83744764 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83744790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83745059 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83745154 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83745182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83745229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83745241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83745262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83745266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83745388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83745393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83745429 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83745477 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83745488 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83745525 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83745541 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83745559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83745571 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83745630 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 83745631 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83745676 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83745767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83745774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83745791 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83745818 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83745822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83745851 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83745934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83745952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83745966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83745967 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83746024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83746068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83746122 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83746195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83746202 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83746212 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83746236 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83746247 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83746293 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83746319 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 83746332 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 83746341 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 83746349 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 83746353 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 83746397 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 83746401 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 83746428 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 83746505 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 83746519 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 83746526 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 83746537 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83746586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83746594 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83746619 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83746750 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83746775 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83746814 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83749507 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83749553 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 83749563 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 83749699 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 83749705 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 83751650 T G Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 83752265 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 83752348 T A Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 83752401 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83752552 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 83752566 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 83752567 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 83752582 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83752591 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83752593 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83752642 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 83752646 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 83752659 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 83752890 T G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 83752992 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83753141 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83753235 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83753242 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83753273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83753311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83753361 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83753380 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83753388 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83753491 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83753518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83753560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83753620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83753652 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83753674 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83753695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83753749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83753957 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83753958 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 83754038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83754066 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83754099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83754110 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83754127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83754133 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83754162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83754189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83754236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83754258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83754322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83754352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83754529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83754560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83754582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83754642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83754787 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83754818 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83754869 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83754919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83754955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83755002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83755071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83755103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83755188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83755331 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83755389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83755394 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83755480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83755566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83755630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83766182 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83766631 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83767982 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 83772125 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 83777841 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 83891693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83902478 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 83902492 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 83902876 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 83916022 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83918028 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 83918091 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 83918181 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83918209 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 83918404 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 83918527 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83918680 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 83918728 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83918764 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83918785 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83918821 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83918931 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83919040 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 83919069 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 83919118 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83919129 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83919150 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 83919472 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83919498 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83919531 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83919569 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83919877 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83920066 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83920143 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83920167 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83920185 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83920240 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83920263 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83920350 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83920624 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83920732 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83920772 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83920963 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83920968 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83921038 T G N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 2 83927779 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83927834 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83928029 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83928049 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83928086 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83928304 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83928378 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83928564 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 83928657 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83928830 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83928978 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83929017 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 83929020 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 83929060 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 83929091 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83929263 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83929584 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83929750 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 83929852 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83929876 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83930021 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83930252 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83930416 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83930615 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83930652 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 83930775 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 83930927 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83930944 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83931121 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83931127 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83931219 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83931256 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83931354 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83931691 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83931736 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83931737 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83931817 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83931830 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83931861 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83931879 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83932008 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83932919 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 83933212 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83933295 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83933423 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 83933814 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83933856 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83934133 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83934341 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 83934429 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 83934814 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 83934868 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83934869 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83934881 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83935245 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83935322 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 83935380 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 83935383 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 83935421 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 83935644 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83936109 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 83936150 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83936203 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 83936275 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83936287 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83936402 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83936421 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83936506 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 83936546 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 83936580 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83936613 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83936743 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83936769 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 83936841 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83937101 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83937140 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83937184 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83937277 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83937279 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83937361 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83937406 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83937414 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83937651 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83937680 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83937808 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83938237 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 83938314 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83938428 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 83938864 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 83938876 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 2 83939076 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 83939092 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83939125 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83939378 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83939485 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 83939517 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 83939687 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 83939697 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83939718 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 83939737 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83939793 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83939885 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83939889 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83939959 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83940030 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 83940345 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 83940400 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 83940419 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 83940475 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 83940545 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 83940564 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 83940586 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83940717 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83940741 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83940837 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 83940864 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83940919 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83940924 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83940957 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83941106 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83941125 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83941509 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83941556 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83941563 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83941811 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83941866 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 83941879 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 83941905 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 83942217 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83942295 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83943246 A G N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 83943659 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83943764 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 83943963 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83944579 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83944630 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83944662 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83944777 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83944778 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83944802 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83945085 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83945159 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83945162 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83945287 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83945309 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83945471 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 83945489 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 83945628 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 83945724 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83945993 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83946000 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83946088 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83946473 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 83946790 G C N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 83946845 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 83946913 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 83946957 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 83948852 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 83949063 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83949153 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83949226 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83949240 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 83949312 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 83949417 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83949436 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83949543 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 83949584 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 83949768 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83949776 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83950013 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 83950091 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 83950204 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83950227 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83950257 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83950339 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83950438 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83950444 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 83950589 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83950629 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83950654 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83950680 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 83950825 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83950839 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83950938 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83950941 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83951168 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83951189 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83951313 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83951336 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83951356 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 83951404 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83951435 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83951501 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 83952012 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 83952076 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 83952268 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83952325 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83952361 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83952365 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83952387 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83952452 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83952478 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83952506 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83952603 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83952702 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83952774 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 83952952 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83953137 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83953148 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83953346 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 83953405 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83953505 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 83953881 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83953909 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83954013 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 83954332 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 83954432 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 83954512 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 83954609 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 83954622 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 83954788 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83954885 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 83954951 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 83954961 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 83955026 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83955147 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 83955357 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 83955364 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 83955416 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 83955575 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83955623 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83955644 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83955685 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83955691 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83955732 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83955788 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83955822 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83955845 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83956043 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83956168 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83956417 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 83956629 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 83956677 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83956715 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83956819 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 83956832 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83956931 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83956960 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 83957153 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83957214 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83957366 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 83957378 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 83957504 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83957638 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83957712 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 83957756 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83957887 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83957947 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 83958064 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 83958235 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83958320 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 83958372 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 83958465 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83958531 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83958571 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 83958609 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83958698 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83958768 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83958894 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83958948 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 83958949 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83959055 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83959096 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 83959149 C G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 2 83959352 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83959427 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83959794 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 83959799 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 83959978 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 83960038 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83960109 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83960145 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83960217 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83960289 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83960378 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83960392 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83960410 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83960534 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83960535 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83960603 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 83960615 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83960665 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 83960806 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 83960846 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 83960863 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 83960957 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 83961036 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83961180 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83961299 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83961346 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83961351 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 83961389 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 83961854 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83962109 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 83962194 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 83962217 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83962237 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83962251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83962254 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 83962308 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 83962327 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83962449 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83962939 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 83963144 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83963254 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 83963577 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83963702 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 83963717 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83963784 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83963943 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83963957 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83964352 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 83964502 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 83964581 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 83964637 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 83964706 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83964797 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83964877 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83964922 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 83965018 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 83965070 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 83965395 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83965504 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 83965646 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 83965649 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 83965739 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 83965920 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 83966062 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83966142 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83966200 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83966248 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83966274 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83966374 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83966399 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83966411 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83966527 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 83966537 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 83966680 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83966753 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 83966903 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83966977 T C Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 83967199 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 83967240 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 83967429 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 83967472 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 83967519 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83967530 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 83967639 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83967648 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83967654 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83967697 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83967745 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83967779 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83967851 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83967926 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83967939 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 83967949 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 83967960 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 83967992 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83968000 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83968044 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83968046 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83968063 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83968106 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 83968129 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 83968156 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 83968174 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83968212 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83968216 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 83968297 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83968453 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83968592 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 83968641 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 83968702 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 83968709 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 83968737 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 83968750 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 83968759 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 83968811 A T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 83968855 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 83968894 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 83968931 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 83968947 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 83968978 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 83969198 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 83969272 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 83969288 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 83969602 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 83969616 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83969671 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83969681 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83969687 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83969739 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83969961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83969962 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 83969980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83970119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83970188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83970205 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83970274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83970289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83970306 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83970327 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83970374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83970398 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83970463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83970488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83970550 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 83970595 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 83970619 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83970710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83971026 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83971071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83971141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83971159 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 83971257 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83971298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83971357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83971456 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 83971480 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83971483 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83971500 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 83971568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83971746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83971769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83971804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83971894 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83971951 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83971977 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 83971981 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 83972029 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 83986667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83986668 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83986685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83986702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83986768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83986832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83986836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83986927 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83987070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83987278 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83987348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83987481 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83987704 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83987806 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83987823 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83987917 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 83987971 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 83990486 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 83990506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83990711 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83991111 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 83991254 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83991307 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83991539 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 83991596 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 83991603 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 83991618 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 83991637 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 83991701 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83991780 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83991831 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83991941 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83992118 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83992197 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83992267 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83992309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83992330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83992350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83992394 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83992428 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83992546 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83992609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83995502 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83995537 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83995586 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83995593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83995614 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 83995619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83995662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83995681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83995688 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83995778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83995824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83995963 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 83996095 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83996165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83996209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83996345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83996348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83996523 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83996732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83996742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83997080 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 83997177 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 83997284 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 83997355 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 83997625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83997698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83997806 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83998001 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83998075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83998082 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 83998264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83998409 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83998446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83998463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83998542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83998712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 83999152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 83999369 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 83999893 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 83999922 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84000006 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84000059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84000415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84000586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84000761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84001197 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84001415 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 84001495 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84001529 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 84001640 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84001656 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84001851 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84001999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84002402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84002546 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84002709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84002773 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84002816 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84002893 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84002913 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84003011 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 84003045 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84003065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84003080 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84003350 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84003394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84003403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84003423 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84003430 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84003657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84003687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84003701 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84003702 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84003812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84003890 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 84011203 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84011288 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 84011301 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84011531 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 84011543 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 84011815 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 84012447 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84012472 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84012616 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84012621 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84013032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84013156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84013157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84013177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84013353 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84013413 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84013516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84013654 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84013666 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 84013753 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84013901 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84014350 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84014528 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84014550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84014683 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 84014928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84014955 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84014963 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84015218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84015419 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84015761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84016008 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84016182 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84016294 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 84016449 A C N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 84018064 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84018268 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84018360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84018405 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 84018914 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84019090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84019122 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84019218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84019286 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84019290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84019322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84019359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84019641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84019650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84019687 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84019901 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84019924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84020253 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84020342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84020376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84020447 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84020519 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 84020583 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 84020649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84020774 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84020871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84020904 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84020985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84021023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84021131 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84021183 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84021280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84021560 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 84021630 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 84021740 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 84021754 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 84021825 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84021889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84021924 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 84021936 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84021981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84021984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84022222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84022234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84022400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84022473 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84022478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84022518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84022591 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84022839 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84022959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84023138 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84023273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84023312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84023326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84023409 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84023505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84023957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84023986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84023998 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84024037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84024414 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84024435 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 84024503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84024519 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 84024535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84024565 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 84024603 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 84024657 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 84024780 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 84024822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84025489 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84025559 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84025568 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 84025677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84025801 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84025816 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84025901 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 84026039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84026040 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84026053 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84026109 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84026195 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84026232 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84026364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84026870 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84026960 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84027029 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84027090 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 84027122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84027300 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 84027318 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 84027516 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84027662 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84027782 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 84027804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84027866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84028332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84028391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84028471 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84028631 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84028642 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84028650 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84028723 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84028829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84028857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84029076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84029239 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84029309 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84029398 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84029429 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84029443 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 84029510 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84029568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84029580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84029654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84029659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84029693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84029703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84029813 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84029846 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84029879 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84029928 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 84030211 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84030229 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84030309 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84030322 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84030324 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84030334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84030357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84030409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84030488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84031545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84031730 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 84031767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84031928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84031958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84031979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84032058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84032079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84032233 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84032278 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 84032349 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 84032414 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 84032729 A C N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 84033147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84033188 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84033236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84033246 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84033369 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84033623 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84033636 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84033930 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84033978 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84034072 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84034695 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84034760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84041632 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 2 84041651 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84041757 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84041818 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 84041855 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 84041929 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 84042041 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84042131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84042330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84042450 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84042513 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84042587 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84042659 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84042698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84042826 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84042843 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84042876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84042913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84042975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84043024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84043416 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84043511 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84043562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84043570 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84043582 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84043753 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84043940 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 84051646 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84051937 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84051987 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84052093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84052227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84052573 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 84052580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84052589 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 84052685 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84052697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84052759 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84052919 A T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 84052972 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 84053102 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84053191 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84053199 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84053380 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84053397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84053417 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84053631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84053864 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84053873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84053963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84054037 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 84054194 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 84054442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84054775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84054857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84054884 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84054914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84054952 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84054978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84055069 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84055113 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84055138 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84055233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84055350 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84055370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84055476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84055684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84055739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84055804 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84055831 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84055990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84056064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84056139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84056221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84056385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84056437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84056463 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84056522 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84056591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84056607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84056651 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84056718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84056929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84056930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84057040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84057048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84057078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84057103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84057273 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 84057543 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84057585 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 84057604 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84057712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84057728 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84057838 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 84057843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84057849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84057869 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84057886 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 84057918 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84058013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84058107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84058162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84058205 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84058234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84058235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84058292 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84058420 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84058449 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84058520 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84058545 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84058588 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 84058618 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84058911 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84058940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84059108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84059114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84059145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84059213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84059274 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84059331 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84059346 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84059394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84059441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84059457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84059477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84059497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84059521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84059535 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84059550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84059568 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 84059632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84059746 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84059761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84059836 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84059850 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 84059915 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84059967 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 84060189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84060344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84060447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84060458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84060469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84060494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84060545 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84060582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84060596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84060685 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 84060695 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 84060702 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 84060766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84060898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84061001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84061048 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84061136 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84061143 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84061309 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 84061328 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 84061409 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 84061599 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84062062 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84062074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84062123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84062268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84062277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84062623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84062670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84062732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84062822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84062860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84062869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84063107 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 84063276 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84063447 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84063668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84063692 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84063787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84063810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84064038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84064092 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 84064121 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84064177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84064236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84064334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84064359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84064390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84064397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84064433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84064567 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84064721 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84064956 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84064989 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 84065138 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84065178 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84065195 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84065489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84065496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84065892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84065955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84066019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84066360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84066398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84066910 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 84067007 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 84067132 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84067291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84067360 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84067446 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84067543 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 84067613 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84067631 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84067813 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84067981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84067983 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84068028 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84068069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84068175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84068258 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84068311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84068313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84068347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84068409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84068446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84068568 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84068575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84068590 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84068597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84068774 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 84069046 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84069082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84069248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84069450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84069454 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84069720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84069945 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84070045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84070174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84070694 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84070899 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 84071231 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 84071493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84071533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84071751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84071905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84071945 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84072026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84072048 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 84072064 A T Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 84072123 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 84072175 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 84072214 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 84072236 G C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 84072261 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 84072426 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 84072437 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 84072477 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 84072496 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 84072515 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 84072582 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84072617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84072621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84072664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84072666 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84072802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84072848 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 84073003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84073321 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 84073401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84073408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84073690 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 84073809 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84074012 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 84074021 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 84074270 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 84074436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84074547 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 84074647 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 84074666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84074771 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84074810 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 84074845 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 84074846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84074867 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 84074886 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 84074953 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 84074993 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84075247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84076005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84076026 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 84076053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84076146 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 84076160 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 84076223 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84076259 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 84076260 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 84076411 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 84076440 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 84076465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84076473 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 84076589 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 84076654 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 84076666 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 84076667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84076684 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 84076779 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 84076793 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 84076800 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 84076841 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 84076851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84077029 T G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 84077142 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84077154 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 84077170 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84077213 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 84077269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84077411 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 84077555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84077628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84077893 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 84077967 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84078091 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 84078234 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84078256 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84078276 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84078533 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84078554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84078566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84078777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84078788 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84078888 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 84078901 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84078906 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84079274 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 84079534 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 84079541 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 84079580 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84079695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84079816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84080173 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 84080251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84080256 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 84080287 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84080339 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84080376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84080421 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 84080426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84080585 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 84080599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84080702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84080834 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84080875 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84081044 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84081053 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84081061 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84081129 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84081132 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84081143 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84081178 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 84081219 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 84081224 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 84081244 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 84081262 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 84081354 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 84081389 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 84081502 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84081519 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 84081560 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84081565 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84081595 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84081615 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84081625 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84081670 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84081755 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 2 84081785 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 84081816 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 84081846 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 84081850 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 84081857 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 84081861 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 84081873 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 84081915 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 84082370 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84082393 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84082511 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84082604 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 84082664 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 84082682 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84082891 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 84082936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84082981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84082997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84083103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84083141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84083228 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84083637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84083747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84083991 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84084104 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84084177 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84084275 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84084406 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84084425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84084453 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84084466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84084502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84084615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84084797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84084844 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84084896 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84085152 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84085169 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84085183 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84085242 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84085301 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84085332 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84085518 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84085632 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 84085681 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 84085686 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 84085975 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 84086150 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 84086324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84086510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84086555 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 84086582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84086597 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 84086657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84086908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84087235 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 84087407 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84087415 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84087460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84087465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84087545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84087580 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 84087619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84087639 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84087761 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84087783 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 84087845 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 84087852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84087889 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 84088422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84088668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84088791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84088821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84088849 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84089025 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 84089370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84089415 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84089430 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84089482 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84089516 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 84089621 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 84089688 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84089780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84089883 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 84089913 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 84089987 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 2 84090148 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84090158 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 84090409 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84090421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84090435 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 84090443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84090555 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 84090603 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84090672 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84090673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84090693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84090774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84090968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84091418 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84091432 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84091522 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84091540 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84091558 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84091575 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84091584 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84091656 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84091689 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 84091700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84091735 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84091736 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 84091807 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84091835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84091962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84092017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84092033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84092039 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 84092090 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 84092100 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 84092288 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84092346 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84092361 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84092378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84092446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84092656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84092867 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84093007 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 84093046 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84093137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84093203 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84093269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84093300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84093327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84093403 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84094064 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84094081 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84094339 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84094374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84094399 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84094416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84094418 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84094537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84094586 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84094738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84094874 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 84094913 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84094982 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 84095072 T G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 84095116 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 84095122 A C N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 84095130 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 84095154 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 84095240 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 84095284 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84095297 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 84095328 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84095413 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84095421 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84095538 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84095573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84095709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84095842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84095999 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84096005 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84096035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84096184 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84096568 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 84096674 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 84096685 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 84096721 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 84096724 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 84096747 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 84096959 T A Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 84097025 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84097058 G T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 84097079 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 84097094 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 84097229 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 2 84097312 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 84097342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84097399 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 84097491 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84097554 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84097685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84097759 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84097815 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 84097822 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84097852 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84097866 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 84097871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84097879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84097969 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84098116 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84098126 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 84098188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84098200 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 84098256 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 84098301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84098306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84098349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84098465 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84098524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84098598 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84098607 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84098633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84098688 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84098746 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84098818 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84099070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84099096 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84099148 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84099249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84099251 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84099305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84099514 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84099673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84099722 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84099904 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84099964 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 84100016 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84100058 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84100059 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 84100070 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84100105 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 84100141 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 84100181 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84100235 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84100243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84100282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84100321 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84100532 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84100822 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84100845 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84101002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84101015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84101021 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84101144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84101214 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84101322 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 84101345 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 84101417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84101428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84101453 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 84101502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84101530 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 84101695 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84101831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84101967 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84102015 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84102232 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84102469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84102532 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 84102903 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84102943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84102953 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84102982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84103142 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84103234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84103316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84103377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84103550 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 84103712 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 84103789 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 84103814 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84103843 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84104001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84104018 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 84104045 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 84104087 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84104210 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 84104237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84104258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84104317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84104330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84104511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84105029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84105393 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84105792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84105826 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84105906 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84105921 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 84106100 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84106218 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84106266 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 84106426 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84106499 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 84106507 C A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 84106573 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84106589 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84106652 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 2 84106654 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 84106680 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84106684 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 84106722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84106867 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84107007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84107151 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84107349 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 84107417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84107442 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84107649 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84107783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84107844 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84107900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84107954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84107962 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 84108010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84108018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84108516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84108719 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84108762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84108877 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84108895 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84108936 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84109047 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 84109050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84109133 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 84109142 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 84109192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84109232 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 84109260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84109304 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 84109381 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84109450 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84109512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84109587 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84109737 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84109902 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84110011 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84110100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84110138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84110149 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 84110175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84110491 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84110514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84110564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84110573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84110766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84110850 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84110875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84110967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84110982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84111012 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84111084 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84111108 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84111173 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84111263 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84111571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84112155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84112409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84112678 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84112713 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84112859 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84112955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84113056 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84113284 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 84113353 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84113845 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 84115001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84115094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84115154 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84115249 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 84115362 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84115367 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84115481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84115709 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84115736 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84115848 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84115853 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84115864 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84115889 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84116042 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84116154 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84116218 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84116242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84116880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84118418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84119415 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 84119952 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 2 84120343 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 84120400 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 84120404 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 84120491 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 84120876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84121328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84121421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84122326 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84122718 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84122938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84124451 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84125591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84126489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84127675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84128630 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84129849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84129931 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84130435 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 84131165 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84131640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84132114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84133395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84133407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84135188 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84136427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84136440 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 84136449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84136500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84136532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84136544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84137338 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84138492 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84139264 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 84143643 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84151316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84151317 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84151341 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84151395 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84152321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84153329 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 84153354 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 84153357 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 84153766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84153857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84154734 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84162787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84167655 A T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84182631 C G Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 84183264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84183282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84183609 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84184847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84185149 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84185643 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84185719 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 84186930 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84187324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84187334 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84187428 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84187642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84188246 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84188438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84188531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84188542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84188572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84188646 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 84188664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84188712 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 84188767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84188825 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84189105 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84189133 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 84189155 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84189230 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84189257 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84189260 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84189375 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84189837 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 84189966 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84190219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84190250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84190836 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84190861 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 84190930 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84190993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84191324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84191492 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84191674 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84191680 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84192089 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84192242 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84192432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84192787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84192902 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84193474 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84193749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84194029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84194251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84194314 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84194408 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84194474 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84194484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84194490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84194656 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84194727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84194793 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84194897 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84195012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84195065 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84195170 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 84195484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84195665 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84195837 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84197242 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84197258 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84198097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84199214 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84199620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84200092 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84200426 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84200747 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84200796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84200821 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 84200879 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 84200916 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 84201002 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 84201012 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 84201084 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84201101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84201110 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84201131 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 84201214 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84201608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84201853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84204128 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84205692 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84206588 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84206679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84207643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84207716 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84208093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84208255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84208904 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84209085 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 84209201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84209278 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84209321 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 84209530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84209987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84210065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84210693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84210735 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 84211913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84212059 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84212463 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 84212751 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 84212757 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84212923 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 84213142 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84213665 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84213682 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84213839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84213999 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84214017 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84214306 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84214329 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84214371 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84214392 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84214418 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84214641 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 84214825 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 84214905 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 84214927 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84214940 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84214954 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84215045 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 84215307 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84215345 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84215412 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84215839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84215980 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84216147 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 84216409 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84216780 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 84217575 A C Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 84217577 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 84217594 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 84217630 A T Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 84217676 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 84217852 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 84217855 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 84217987 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 84218059 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 84218544 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 84218701 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 84218703 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 84218737 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 84218754 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 84218762 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 84219776 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 84220446 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84220728 A C N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 84220881 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 84222498 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 84223553 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 84224023 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 84224378 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 84224400 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 84225161 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 84225624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84226966 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 84227488 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 84227564 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84227586 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 84227903 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 84227935 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84228439 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 84230565 T G N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 2 84231742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84231870 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 84233689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84234463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84236137 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 84236302 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 84236805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84237524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84237805 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84238565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84240949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84241224 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 84241321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84241406 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84241613 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 84242294 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84244255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84244619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84245709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84245817 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84246925 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 84247261 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84249291 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 84253913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84254552 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 84260640 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84261998 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84263529 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84264379 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84266550 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84266607 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 84266702 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84266705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84266750 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84267367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84268026 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 84268075 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84268155 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84268410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84268913 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 84269084 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 84269429 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84269456 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84269722 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84270675 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84270922 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84270986 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84271003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84271209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84271501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84271806 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 84271850 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84272063 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84272544 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 84272737 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 84272836 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84273111 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84273177 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84273723 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84273970 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 84274251 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 84274409 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 84274851 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84275157 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84276084 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84276138 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84276228 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84277003 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84278078 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84278170 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84278520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84278635 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84279255 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84279725 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84279783 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84279876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84279979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84281439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84282789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84283299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84283631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84283739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84283803 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84283819 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84283947 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 84283974 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 84284010 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84284562 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84284679 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 84285092 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 84285131 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 84285173 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 84285258 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 84285691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84285904 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84285948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84286190 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 84286648 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 84286734 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 84287268 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84287377 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 84287384 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 84287603 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 84287756 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 84287757 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 84287873 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 84288081 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 84288209 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 84288224 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 84288346 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 84288390 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 84288458 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 84288498 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 84288720 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 84288868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84288957 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 84289040 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 84289064 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 84289092 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 84289093 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 84289125 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 84289343 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 84289415 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 84289606 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84289736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84289999 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84290002 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84290259 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 84290278 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 84290290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84290306 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84290475 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 84290487 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 84290550 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 84291151 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84291307 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 84291354 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84292125 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 84292624 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 84292652 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 84292837 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84292855 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 84292859 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84293088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84293111 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84293229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84293297 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84293351 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84293389 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84293396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84293447 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84293472 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84293485 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84293515 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84293533 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84293673 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84293688 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 84293739 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84293757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84293802 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84293872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84293905 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84294126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84294304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84294370 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84294387 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84294395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84294406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84294417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84294768 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84294887 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84295008 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 84295013 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 84295153 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 84295230 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84295279 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 84295625 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84296133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84296297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84296376 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 84296495 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 84296554 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 84296781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84296863 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84296867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84297020 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84297114 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84297348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84297399 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84297412 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84297486 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84297504 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84297683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84298128 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 84298264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84298416 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 84298417 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 84298429 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84298525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84298629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84298719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84298777 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84298807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84298829 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84298908 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 84298984 A T Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 84299056 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84299190 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 84299234 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84299403 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 84299704 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 84299774 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 84300274 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 84300306 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 84300337 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 84300377 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 84300382 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 84300455 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 84300469 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 84300481 C A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 84300557 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 84300818 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 84300860 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 84301025 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 84301209 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84301216 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84301287 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 84301381 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84301423 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 84301437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84301591 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84301607 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84301696 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84302048 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 84302080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84302097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84302137 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84302259 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84302266 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84302456 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 84302532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84302533 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84302566 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 84302581 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 84302632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84302710 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 84302950 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 84303005 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84303416 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 84303511 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84303666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84304005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84304058 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 84304125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84304154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84304172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84304748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84304953 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84305012 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84305026 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84306255 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84306331 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84306367 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 84306398 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84306482 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 84306660 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 84306683 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 84306883 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84306891 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 84306896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84306968 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 84307011 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 84307220 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84307430 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 84307671 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84308987 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84309133 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84309330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84309358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84309488 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 84310788 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84310912 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 84311429 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84312275 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 84312304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84312638 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84312666 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84313309 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 84313573 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84313645 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84313731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84314072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84314325 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84314728 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84315169 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84315194 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 84315233 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 84315666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84315855 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 84315876 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 84316129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84316293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84316325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84317242 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84317508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84318082 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84318211 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84318361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84318476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84318527 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 84318565 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84318973 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84319411 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84319433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84320853 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84320886 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 84320888 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 84320935 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 84321292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84321295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84321776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84322296 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 84324084 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84324587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84325600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84325722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84326074 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 84327086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84327505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84328198 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 84328380 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 84328438 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84328506 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 84328619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84329318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84329334 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 84329440 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 84330121 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84330982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84330993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84331008 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 84331145 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84331149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84331203 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84331255 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84331368 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84331394 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 84331596 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84331631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84331788 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 84332083 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84332396 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84332400 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84332454 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84332472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84332541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84332586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84333006 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84333043 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84333335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84333567 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84335777 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 84336100 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 84336258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84336429 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84336671 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84338323 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84338480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84338697 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 84338981 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 84339121 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 84339274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84339563 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84339925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84340123 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84340125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84342707 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84343219 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 84343418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84343465 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 84344379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84344704 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 84344710 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 84345130 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 84345209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84345263 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 84353265 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 84353641 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84354209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84355043 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84355057 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 84355283 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84355470 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 84355502 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84355780 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 84356010 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 84356287 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 84356351 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 84356499 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 84356610 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 84356891 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 84356915 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 84357217 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84357227 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 84357335 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84357341 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84357896 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 84358399 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84358492 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84358593 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84358623 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84359090 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84359113 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84359177 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84359526 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84359785 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84359859 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84360159 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84360480 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84360503 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 84360517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84360657 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84360817 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84360984 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84361091 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84361112 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 84361222 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84361282 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84361540 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84361616 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 84361641 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84361669 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84361973 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84362310 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84362433 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84362461 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84362846 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84363734 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84363808 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84364085 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 84364180 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 84364189 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 84364305 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 84364330 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 84364447 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84364448 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84364523 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84364986 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84364995 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84365045 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84365308 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84365772 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84365773 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 84365919 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84365980 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84366013 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84366101 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 84366283 G C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 84366460 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 84366751 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 84366807 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 84366965 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84367047 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 84367049 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 84367071 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 84367081 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 84367085 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84367105 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 84367108 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 84367230 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 84367240 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84367277 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 84367354 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84367377 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84367397 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84367411 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84367418 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 84367437 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 84367452 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 84367472 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 84367527 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84367602 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84367622 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 84367674 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84367680 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84367724 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84367855 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84367971 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84368081 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84368230 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84368398 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84368412 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84368526 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84368575 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84368596 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84368827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84368835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84369091 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 84370169 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 84370259 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84370719 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 84370960 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 84371120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84371936 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84371967 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84372070 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 84372688 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84372703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84374799 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84374848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84374981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84375062 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84375067 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 84375073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84375083 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84375103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84375224 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 84376044 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 84376404 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84378955 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84379387 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84380705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84381117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84381598 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84381873 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 84382992 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 84383332 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84384430 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84384756 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 84385629 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84385861 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84388624 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84388825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84388838 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 84388991 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84389403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84389565 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84390057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84390248 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 84390509 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 84391197 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84391419 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 84391496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84391596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84391602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84392781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84393002 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84393933 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84394087 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84394174 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84394339 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84394643 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 84394976 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84395303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84395449 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 84395879 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84396055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84396264 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84396549 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84396572 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84396607 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84396705 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84396776 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84396823 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 84396861 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84397158 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 84397479 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84397494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84397758 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84398000 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84398072 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 84398141 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 84398233 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 84398398 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 84398435 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 84398750 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 84398780 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84399027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84399911 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 84400558 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 84401344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84402117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84402181 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84402413 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84402538 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84402912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84403215 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 84403377 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 84403422 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 84403494 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 84404006 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 84404029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84413630 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 84414185 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 84414755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84415006 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 84417493 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 84417720 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 84418942 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 84419264 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84419546 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84420200 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84421642 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 84423348 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84423435 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84423714 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84426115 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84430201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84432807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84433871 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 84435743 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84437704 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 84437999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84438958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84440084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84444092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84447233 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 84448147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84449451 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84450876 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84451318 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84454984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84459302 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 84462881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84464356 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84464877 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84465080 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84465102 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84465425 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84465475 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84465720 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84465782 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84465788 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84466493 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84467557 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84467811 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84468210 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 84468302 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 84468794 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84469264 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84469944 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84470702 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 84470950 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 84471256 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 84471859 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 84472357 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84472760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84472969 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84473797 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 84474198 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 84474287 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84474293 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84475105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84475143 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84476819 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84477006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84478000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84478883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84480334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84480746 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 84480864 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84481338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84481536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84481793 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84483605 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84483645 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 84484230 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84485354 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 84486282 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84486436 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84486968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84487293 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84487993 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84488914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84489520 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84491504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84491747 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84491797 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84493744 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 84494533 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84496525 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84498354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84504944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84507165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84509802 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84511729 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 84514202 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 84514999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84515207 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84515361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84515999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84516172 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84516843 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84517117 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84517174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84517699 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84518851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84518865 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84520833 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84521441 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84521708 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84522502 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84523364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84524357 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 84526148 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84526161 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 84526171 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84526172 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 84527175 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84531067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84531970 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84532419 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84533541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84534957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84535121 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 84535727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84536919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84539085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84540042 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84540146 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84541170 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84542723 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84543344 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84543725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84544857 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 84547104 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84547612 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84548171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84548187 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84548457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84550097 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84551915 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84552752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84552915 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84555726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84556531 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84557071 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 84557548 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84558496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84558575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84558972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84559066 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84562335 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 84562435 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84562609 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84562699 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84562732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84562759 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84562812 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84563370 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 84563378 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84563406 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84564081 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84564201 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84564243 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84565036 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84565203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84565416 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 84565672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84566298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84567293 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84568085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84568535 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84568683 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 84570275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84570364 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84571219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84571818 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 84573014 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84573414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84575755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84576037 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84576129 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 84576303 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84576534 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 84578229 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 84578693 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 84580354 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84584930 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 84586735 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 84587825 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 84588738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84589039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84589738 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 84591676 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84592907 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 84593322 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84593323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84596626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84596726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84597652 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84597995 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 84598513 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84599477 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 84599634 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84599653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84599772 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 84599864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84600025 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 84600816 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 84601068 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 84601226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84601329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84601373 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84601984 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 84602183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84602481 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84603814 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 84603871 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84604213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84604236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84604744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84605239 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 84605752 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84606031 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84606034 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84606215 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84606314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84606528 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84606805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84606844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84606893 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84609113 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84609750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84609760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84611783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84612491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84613638 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84617138 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 84619348 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 84619372 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 84619376 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 84621153 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84621269 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 84622273 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 84623037 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 84623057 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84623496 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 84623944 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 84624276 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84625182 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 84625540 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84625934 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 84626069 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84626086 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84626663 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 84626933 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84627118 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84627677 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 84628635 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 84628818 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84630850 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84630879 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84631135 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 84631318 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84631438 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 84633077 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 84633096 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 84633102 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 84633108 C T Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 0.0714285714285714 15 13 2 11 1 2 84633114 C T Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 84633120 C T Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 84633126 C T Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 84633132 C T Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 84633860 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 84634030 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84634408 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 84634511 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 84634627 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84635279 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 84635465 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 84635598 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84635719 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84635803 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84636033 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84636309 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84636358 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 84636920 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 84636931 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 84638654 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84638833 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 84639127 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84639422 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 84639865 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84640029 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84640415 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84641773 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 84641783 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84642044 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 84642075 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 84642220 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84643256 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 84643270 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 84643375 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84643767 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 84644014 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84644179 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84644201 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84644291 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84644379 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84644454 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84644459 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84644507 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 84644522 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84644550 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84644581 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 84644968 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 84645434 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 84645475 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 84645520 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84645623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84646186 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 84646388 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84646427 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 84646557 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84646673 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 84647241 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 84647304 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 84647523 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 84648185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84648394 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 84648437 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 84648712 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 84649289 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 84649897 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 84650606 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 84650647 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 84651035 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 84651268 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 84651276 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84651476 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84652034 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84652653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84652946 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84653841 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84654026 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84654140 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 84654144 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 84654333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84654534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84654840 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84654903 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84654940 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84655224 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 84655623 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 84655733 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 84655821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84655926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84656859 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84656935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84656989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84657006 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84657315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84657554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84657560 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84657704 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 84657996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84658027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84658041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84658076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84658086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84658118 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 84658142 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 84658210 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84658288 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 84658457 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84658502 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 84658541 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84658868 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84658918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84658977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84659185 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84659310 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 84659388 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 84659431 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 84659718 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84659772 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 84659935 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84660006 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 84660060 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 84660134 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84660182 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84660356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84660423 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 84660442 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84660444 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84660646 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84660821 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 84660903 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 84660927 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84661782 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 84661786 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84661966 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 84662397 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84662483 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84662525 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84662557 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 84662558 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84662588 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84662598 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84662715 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84662729 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84662743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84662798 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84662811 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84663233 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84663236 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84663303 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84663361 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84663664 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84663696 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84663772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84663783 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 84663834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84663923 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 84664040 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84664118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84664141 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 84664310 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84664491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84664511 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 84664545 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84664701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84664758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84664804 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 84664884 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 84665237 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84665238 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84665315 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 84665316 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84665874 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84665919 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 84665938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84665986 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84665990 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84666264 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 84666376 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 84666741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84666800 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84667043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84667724 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 84668063 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 84668250 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84668253 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 84668316 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 84668327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84668336 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 84668351 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84668399 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84668402 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84668691 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 84668711 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 84668722 T A N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 84668737 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 84668741 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 84669044 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84669330 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84669338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84669361 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84669409 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84669489 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84669565 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 84669741 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84670149 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84670228 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84670440 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84670518 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84670715 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 84670999 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 84671037 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84671230 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 84671267 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84671682 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84671823 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 84672497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84672527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84672561 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84672565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84672615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84672712 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 84672716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84672828 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84672865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84672913 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84672941 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84673016 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 84673109 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84673295 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84673367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84673442 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84673859 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 84674380 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84674748 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 84674926 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84675416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84676803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84677231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84678532 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84678563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84678811 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 84678821 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 84678933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84680118 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84680597 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 84680665 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 84680925 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84680929 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84681464 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 84681819 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84681886 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 84682426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84682535 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 84682591 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 84682695 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 84682774 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 84682776 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 84682818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84682916 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84682940 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84683274 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84683511 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 84683780 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 84683837 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84683853 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84683935 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84684895 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84685278 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84685408 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84685430 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 84685540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84685632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84686713 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 84687008 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84687454 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 84687661 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84687887 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 84687941 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 84688948 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84689162 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84689185 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 84691991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84692429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84692607 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84692697 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84692739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84693010 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84693445 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 84693581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84694016 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 2 84695143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84695295 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 84695317 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 84695446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84695889 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 84696523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84697057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84698997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84699074 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84701666 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84702516 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 84702820 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 84705380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84705389 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 84706961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84711375 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84712232 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84713436 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84713988 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84714232 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 84714655 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 84714860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84714948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84714974 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 84715761 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84718517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84721158 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 2 84722342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84722381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84722407 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84722463 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84723127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84723140 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 84731470 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84731849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84731972 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 84732088 T A Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.333333333333333 0.133333333333333 0.533333333333333 12 18 5 2 8 2 84733896 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 84734121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84734138 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 84734252 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84734520 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 2 84734978 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84735156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84735201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84736689 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 84737021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84737847 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84738110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84745176 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 84748952 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 84750537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84750569 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 84750918 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 84751030 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84751034 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84751076 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 84751147 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 84751158 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 84751166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84751371 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 84752466 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 84752986 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 84753012 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 84753242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84753264 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 84753265 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 84753313 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 84753601 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84753667 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 84753798 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84753863 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 84754292 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84754468 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 84754493 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 84754528 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 84754693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84754709 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84754774 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 84754787 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 84754945 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 84754988 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 84755050 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 2 84755165 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 2 84755611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84756920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84758057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84758081 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84758924 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 84758936 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 84759004 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 84759124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84759251 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 84759421 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 84759528 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84759588 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84759630 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 84759726 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84760184 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 84760284 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 84760474 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84760490 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84760502 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84760512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84760533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84760598 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84761142 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84761329 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84761409 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 84761490 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 84761770 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 84761897 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84762230 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 84762272 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 84762499 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 84762707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84762798 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84762850 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 84762958 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84763035 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84763302 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84763518 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84763564 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84763650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84763698 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 84763724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84763739 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84763774 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84763873 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 84763963 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84764016 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84764129 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84764165 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84764172 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84764260 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84764327 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 84764464 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 84764535 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 84764573 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 84764613 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 84764881 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 84765078 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 84765263 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 84765285 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 84765411 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 84765429 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 84765553 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84765709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84765716 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84765749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84765767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84765951 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84765984 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84766025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84766059 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84766103 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84766140 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84766159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84766224 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 84766530 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 84767669 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 84767693 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 84768818 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84768850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84768871 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 84769130 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 84769347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84769359 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 84769435 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 84769753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84769798 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84769811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84769970 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84770010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84770046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84770052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84771030 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 84771306 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 84771447 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 84771629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84771945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84771955 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 84771968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84772476 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 84772532 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84773730 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84773849 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84775032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84775133 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84780709 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 84782792 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84783713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84783802 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 84784233 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 84785611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84785650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84785754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84786648 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 84787385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84787934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84788619 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84788682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84788805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84792348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84792493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84793084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84793179 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84793385 C G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 84793401 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 84793407 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84793439 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 84793614 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84793757 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 84793793 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 84794037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84794125 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84794160 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84794333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84794348 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 84794458 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 84794531 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 84794541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84794572 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 84794620 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 84794665 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 84794903 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 84795134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84795175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84796322 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84796537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84798358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84798709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84798819 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84798863 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84798935 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84799011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84799013 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84799098 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84799215 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84799228 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 84799261 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84799277 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84799280 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 84799321 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84799364 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84799365 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84799427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84799497 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84799599 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84799652 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84799876 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84799878 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84799909 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84800215 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84800581 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84800666 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84800907 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84800996 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84801053 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84801082 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 84801272 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 84801349 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84801454 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 84801553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84801883 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84801968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84802006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84802032 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84802053 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84802169 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84802170 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84802454 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 84802602 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84802631 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 84802915 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84803111 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84803181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84803227 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84803557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84803653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84803689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84803849 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 84804469 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84805027 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 84805638 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 84806280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84806667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84806698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84806713 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84806784 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84806803 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 84806892 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84806907 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84806908 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84806938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84806978 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84807197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84807200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84807264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84807341 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 84807353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84807359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84807365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84807475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84807514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84807521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84807569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84807680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84808170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84808549 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84808555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84808605 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84808783 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 84808801 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84808991 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 84809106 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84809280 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 84810205 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 84810620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84811234 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84811332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84811555 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84811599 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84812020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84812056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84812145 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84812162 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84812380 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84812433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84812486 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84812600 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 84812696 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84812785 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 84812936 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84813017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84813147 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84813226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84813232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84813379 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84813557 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 84813567 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 84813599 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 84813631 C G N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 84813740 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 84813770 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84813839 C G N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 84814410 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84814418 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84814457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84814549 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84814633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84814712 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 84814798 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 84815093 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84815126 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84815136 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 84815707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84815846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84816071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84816160 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84816346 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 84816415 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84816440 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 84816441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84816557 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84816575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84818927 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 84819238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84820167 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84820621 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 84825334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84825478 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 84827033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84827870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84829325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84829530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84829913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84830094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84830394 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84832672 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84832955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84833095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84833117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84833964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84834053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84834090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84834126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84834579 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84834611 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84834622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84834662 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84834714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84834744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84835039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84835206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84835447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84835456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84835512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84835619 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84836063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84836360 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84836592 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84836617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84836806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84836846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84836965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84837083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84837186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84837253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84837268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84837638 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 84837770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84837896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84837922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84838196 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 84838488 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 84838656 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84838719 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 84838888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84838931 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 84839752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84840131 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 84840134 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84840214 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84840311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84840600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84840793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84840940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84840941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84840956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84841015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84841031 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 84841038 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 84841306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84841611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84841733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84841794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84842880 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84844294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84845813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84848277 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 84849356 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84850396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84850710 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84851774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84851859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84853553 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84853818 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 84853952 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84854214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84854769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84855182 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84856061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84856323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84856718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84858112 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84860459 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 84860466 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 84860494 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 84860570 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 84860584 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 84860614 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 84860646 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 84860655 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 84860855 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84860870 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 84861734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84861838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84861870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84861957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84862053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84862137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84862655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84863478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84863506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84863965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84864370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84865163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84866266 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84866442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84866970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84867000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84867521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84868958 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 84871819 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84872803 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84874336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84876994 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 84877227 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 84877337 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 84877504 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 84881555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84882736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84882796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84882835 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84883211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84883313 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 84884294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84884755 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 84885921 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 84885955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84886392 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 84886889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84887876 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 84888103 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84888652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84888675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84889469 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 84890742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84890967 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 84899923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84900190 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 84900256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84900797 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 84901600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84901643 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84902708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84904278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84905525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84906708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84908123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84908218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84909058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84910343 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84910373 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 84910535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84910687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84910715 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 84910735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84911258 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84911275 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84911391 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84911525 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 84911570 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 84912332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84912492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84912538 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84913018 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 84913625 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84913685 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84914448 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 84914506 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84914607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84915604 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84916865 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 84917824 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 84917868 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 84917957 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 84917992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84917993 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 84918003 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 84918114 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 84918228 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 84918244 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 84925634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84925668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84926934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84927546 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84927769 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84928994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84929175 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84929240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84929493 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84929552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84929700 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84929764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84929808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84929923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84929941 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 84929965 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 84929978 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 84930059 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84930072 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 84930556 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84930564 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 84931097 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 84931191 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 84931572 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84931593 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84931698 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84931858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84931981 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 84932045 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 84932128 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 84932508 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84932516 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84932842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84933050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84933066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84933087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84933219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84933265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84933302 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84933303 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84933325 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84933371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84933460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84933712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84933994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84934035 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 84934039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84934103 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 84934120 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 84934129 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 84934282 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 84934414 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 84934491 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 84934764 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 84934938 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 84934950 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 84935029 T A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 84935073 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 84935493 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 84935519 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 84935622 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 84935623 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 84936220 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84936582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84936665 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 84936873 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84936999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84937137 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84937172 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84937281 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84937692 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84938038 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84938143 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84938205 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 84938616 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 84938647 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84938783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84939371 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84939837 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 84940029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84940310 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84940329 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84940406 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84940424 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84940454 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84940561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84940715 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84940917 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84940948 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84940989 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84940991 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84941163 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84941198 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84941305 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84941472 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84941580 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84942401 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 84942968 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84943279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84944100 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84944335 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84944845 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84945087 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 84945118 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84945452 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 84945579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84945691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84946817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84946910 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 84946960 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 84946977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84947001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84947467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84947621 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84947824 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84948915 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84948975 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84949064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84949473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84949515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84950372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84950519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84950971 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 84951019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84951031 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84951202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84951357 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 84951499 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 84951596 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84951650 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 84951655 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 84951857 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84951921 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84952043 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84952068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84952343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84953190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84953214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84953233 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 84954323 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84954450 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84954989 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84955585 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84958687 A C Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 2 84959397 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84959600 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 84959929 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84960612 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84960802 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84961086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84961148 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 84961249 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84961272 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 84961282 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84961409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84961720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84961801 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84961817 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 84962026 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84962247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84962803 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84962820 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 84962838 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 84962996 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84964256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84965336 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84965734 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84965946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84965962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84966160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84966178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84966182 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84966200 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84966260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84966392 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84966448 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84966507 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84966509 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 84966636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84966676 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84967340 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 84967374 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 84967611 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 84967641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84967694 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84968071 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 84968609 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84968939 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 84969134 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84969138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84969285 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84970381 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 84970400 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 84970534 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 84970536 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 84970559 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 84970613 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 84970751 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 84970752 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 84970985 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84971091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84971167 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84971322 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84971323 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 84971334 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 84971384 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 84971638 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84971650 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84971669 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84971675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84971712 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84971899 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 84972605 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 84973526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84973711 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84973890 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84974057 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 84974223 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 84974494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84974887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84975736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84978087 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 84978115 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 84978194 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 84978232 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 84978244 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 84978256 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 84978494 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 84979176 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 84979741 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 84980187 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 84980267 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 84980293 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 84980337 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 84980502 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 84980652 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 84980694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84980717 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 84980758 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 84980827 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 84980872 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 84980977 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 84981449 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 84981655 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 84981728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84982266 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 84982350 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 84982401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84982414 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 84982648 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 84982764 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 84982768 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84982795 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 84982853 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 84982866 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 84982947 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 84983247 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 84983432 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 84983496 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 84983593 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 84983604 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 84983621 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 84983627 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 84983649 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 84984139 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 84984379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84984582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84984813 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 84984816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84984960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84985403 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 84985682 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 84986436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84987022 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 84987457 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 84988539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84988696 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 84988882 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 84989585 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 84989829 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 84989954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84990538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84992350 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84993148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84994315 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84994329 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 84994420 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 84994448 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 84994477 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84994587 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84994833 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84994940 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 84995054 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 84995144 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84995341 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84995663 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84995700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84996229 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 84997012 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 84999104 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 84999126 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84999147 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 84999335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84999435 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84999500 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 84999719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 84999774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 84999963 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 84999982 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85000080 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85000223 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85000887 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 85001403 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85001446 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85001551 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 85001626 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85002275 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85002902 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 85003315 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 85004322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85005324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85005823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85007211 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85008724 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85008802 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85008853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85008889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85009135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85009289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85009711 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 85010695 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 85010836 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 85011134 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85012228 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85012646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85013221 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85013544 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 85013594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85014390 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 85014458 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85015310 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85015927 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85016220 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85016234 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85016595 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85016764 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85016825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85017485 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 85017989 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85018770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85019039 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85019211 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 85019226 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85019814 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85020043 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85020196 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 85020240 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85021046 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85021063 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85021719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85022438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85022529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85022599 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 85022637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85022664 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85025534 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85027959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85029274 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85030531 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85032695 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85033918 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85034000 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85034052 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85034081 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85034092 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85034708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85035353 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85035416 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85035482 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85036034 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 85037018 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85037220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85037731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85038577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85038752 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85039378 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85040401 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85040559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85040838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85041183 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85041491 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 85041839 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85041864 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85041974 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85042178 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85042315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85042692 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 85042783 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 85043032 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85043268 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85043449 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85043473 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85043526 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85043695 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85044055 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 2 85044501 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 85044518 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 85044533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85044750 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 85044963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85044965 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85045312 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85045608 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85045654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85045676 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85045740 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85045747 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85045761 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85045810 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85045817 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85045947 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 85045957 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85045958 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 85046283 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85046287 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85046314 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85046321 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85046358 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85046411 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85046573 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85047024 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85047041 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 85047094 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85047274 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85047337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85047557 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85047633 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85047729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85047772 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85047929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85047978 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85048083 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85048104 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85048149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85048247 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85048884 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 85049539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85049970 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85050582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85050587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85050614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85051014 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85051123 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85051166 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85051174 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85051237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85051238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85051320 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85051570 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85051729 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 85052062 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 85052206 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85052323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85052360 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85052371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85053137 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85054380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85054416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85054619 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85054898 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 85054939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85054956 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 85055042 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85055057 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 85055276 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 85055800 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85055810 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 85055919 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85055952 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85055978 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85056436 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 85056453 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 85056497 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 85056826 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 85057125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85057169 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85057259 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 85057603 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85057762 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 85057896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85058041 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 85058237 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 85059261 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85059387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85059789 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85059858 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85060570 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85061097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85061768 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 85062604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85062903 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85063302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85063322 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 85063488 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 85063868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85063937 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85064539 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85065036 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85065617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85065633 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 85065899 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85066707 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85066910 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 85067703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85068498 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 85068782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85068933 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85069534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85070743 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85070744 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85070758 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85070853 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85071186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85071951 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 85072233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85072285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85072764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85076567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85076852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85077434 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85077729 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85077815 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85077919 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85077952 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85077978 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85078110 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85078135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85078596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85079338 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 85079696 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 85079830 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85079847 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85079865 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 85079883 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 85079966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85080062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85080274 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85080312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85080586 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85080668 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85080683 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85080959 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85081309 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85081327 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85081335 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85081338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85081707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85081788 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 85081819 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 85082290 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85082375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85082456 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85082473 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85082685 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85082917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85082969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85083108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85083245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85083796 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85084018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85084045 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 85084068 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 85084127 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 85084128 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85084165 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 85084167 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 85084241 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 85084243 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 85084297 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 85084448 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 85084639 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 85084822 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 85084846 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85084851 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85084862 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85084896 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 85085109 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85085166 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85085287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85085647 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85085659 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85086335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85086518 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85086596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85086675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85086743 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85086803 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 85087119 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 85087197 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85087225 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 85087354 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85087436 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85087498 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85087677 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 85087729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85087780 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 85087791 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 85087851 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85087880 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85087887 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85088046 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 85088056 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85088098 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85088403 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85088468 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 85088558 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 85088614 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85088639 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85088671 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85088777 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 85088800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85088811 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85089785 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 85089787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85090303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85090315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85090481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85090530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85091060 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85091141 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85091400 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 85091761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85091781 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85091979 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 85091981 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 85092364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85093197 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 85093823 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 85094057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85094528 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 85095007 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 85095033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85095207 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 85095642 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85095991 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85096035 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85096095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85096181 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85096247 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 85096289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85096746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85096755 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 85096848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85096908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85096981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85097216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85097525 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 85098220 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 85099285 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 85099430 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 85099435 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 85099504 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 85099799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85101608 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85102565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85103631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85103803 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 85103875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85104666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85106221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85106313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85108403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85111265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85111452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85113254 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85113376 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85114291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85115698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85115737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85116172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85116216 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 85116296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85116396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85116466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85116706 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85116732 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 85118204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85118291 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85119089 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85119400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85119512 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 85119707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85119959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85120048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85120357 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85120701 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85120778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85121587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85121642 T C Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 85121840 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 85122087 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85122746 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 85123358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85123397 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85123415 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85123475 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85123482 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85123502 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 85124710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85126223 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85126253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85126821 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85127336 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85127682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85127901 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85128095 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85128191 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85128338 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 85128672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85129298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85129949 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85130809 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85131673 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85133257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85133416 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85133465 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 85143005 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 85143667 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 85144675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85144980 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 85145217 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85145255 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 85145633 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 85146078 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 85146135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85146210 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 85146510 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85146819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85147145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85147685 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85147790 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85149383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85150081 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85150573 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85150584 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 85151207 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85151524 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85152618 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85152989 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85153122 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85154214 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85154315 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85154498 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85154791 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85155959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85156340 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 85156388 A G N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 85156726 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85156785 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85157214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85157291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85157325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85158629 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 85158772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85158960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85159063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85159277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85159700 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85159747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85159799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85159918 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85159920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85160057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85160283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85160367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85160884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85162276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85166071 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85166093 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85166342 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85167473 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 85169623 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85171562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85176381 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85176628 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85177214 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85177712 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 85178377 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 85178480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85180222 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85181801 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 85181972 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 85181992 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 85181993 C G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 85182467 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85182539 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85182949 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85183565 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 85183777 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85183835 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 85184118 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 85184231 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 85184279 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 85184466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85184963 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 85185057 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 85185150 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 85185616 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 85186230 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85186440 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85186760 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85187440 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85187702 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85187876 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85188539 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 85188600 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85188623 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 85188816 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85188881 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85189251 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 85189268 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85189934 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85189962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85189972 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85190784 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 85190914 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 85191306 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85191843 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 85191989 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85192023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85192246 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85192248 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 85192529 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85192668 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 85192711 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85192818 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85193781 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85195329 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85195615 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85195653 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85195734 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85195786 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85195816 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85196068 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 85196185 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 85196842 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85197184 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85197464 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85197787 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85198404 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 85198538 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 85198687 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 85199177 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 85199322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85199416 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85200243 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 85200424 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85200460 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 85200639 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85200667 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 85202875 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 85202939 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85202957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85203024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85203572 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 85203863 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 85203922 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 85203966 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 85206358 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 85209310 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85211200 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 85211470 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 85211603 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85211606 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 85211653 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85211916 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85211921 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85211994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85212008 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 85212028 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85212086 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85212116 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85212122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85212174 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 85212182 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 85212807 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 85212813 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 85213034 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 85213045 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 85213386 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85213399 A C Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 85214116 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 85214262 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85214333 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 85214430 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85214506 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85214587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85214685 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85214708 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85214733 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85214774 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85214805 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85214878 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 85215844 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85215919 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85215951 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85216080 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85216244 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 85216592 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85216747 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85216772 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85216783 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85216859 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85216864 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85216877 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85216934 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85216935 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85216959 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85217092 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85217144 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85217154 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85217205 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85217225 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85217275 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85217284 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85217300 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85217380 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85217425 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85217463 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85217534 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 85217535 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 85217799 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 85217811 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85217815 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85218353 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 85218430 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 85218446 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85218597 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85218805 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 85218964 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85219129 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85219301 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85219320 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 85219447 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85219716 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85219760 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85219959 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85220287 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85220309 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85220438 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85220744 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 85220824 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 85220990 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 85221204 A T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 85221408 A G N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 85221679 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85221777 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85221781 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85221795 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85221828 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 85221878 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 85221920 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85222052 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85222125 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85222398 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85222654 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85222810 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85222941 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85223241 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 85223321 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85223542 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 85223580 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 85223587 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 85223626 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85223752 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 85223773 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 85223801 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 2 85224442 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85224504 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85224544 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 85224607 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85224871 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85224884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85224902 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85224906 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85224972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85225001 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85225195 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85225368 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85225377 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85225416 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85225714 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 85225742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85226057 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 85226321 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 85226592 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85226615 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85226838 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85226839 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85226858 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85227123 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85227234 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85227735 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85227755 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85227954 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 85227955 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 85228227 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85228253 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85228354 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85228395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85228623 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85228668 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85228697 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85228906 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85228909 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85228967 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85229232 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85229489 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85229611 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85229724 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85229754 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85229761 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85229772 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85229795 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85229874 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85229877 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85230061 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85230104 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85230107 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85230170 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85230172 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85230188 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85231966 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85232170 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85232259 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85232357 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85232411 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85232443 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 85232559 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85233067 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85233119 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85233196 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85233473 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85233510 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85233646 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85233673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85233866 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85233877 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85234611 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85234804 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 85234887 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 85235202 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 85235449 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85235540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85236022 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85236150 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85236289 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85236469 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85236501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85236876 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85237066 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85238242 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85238322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85238542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85238704 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 85239299 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 85239460 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85239639 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85239694 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85239762 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85240815 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85241241 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 85241277 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 85241788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85241789 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85241816 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85242075 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 85242247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85242269 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85242271 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85242404 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 85242405 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 85242573 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 85242944 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85242981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85243008 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 85243096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85243138 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 85243225 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 85243331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85243507 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85243738 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85244263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85244312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85244424 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85244599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85244800 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 85246044 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 85246245 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 85246662 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85246781 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85247065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85247945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85248401 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85248402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85248648 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 85249585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85249591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85249734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85250176 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85250423 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 85250483 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 85250534 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85250553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85250580 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85250739 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 85250954 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 85251103 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 85251292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85251312 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85251626 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 85252598 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85252825 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 85253176 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 85253294 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 85253356 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 85253608 T C N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 85253640 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 2 85253909 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 85253996 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85254003 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85254110 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85254882 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85255023 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85255048 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 85255104 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 2 85255393 C A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 85255455 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 85255543 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 85255846 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 85255872 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 85255878 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 85255908 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85256041 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85256256 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85256387 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 85256629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85256867 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85257831 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 85257901 A T Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 2 85257942 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 2 85258000 T C Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 85258299 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85258757 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 85258782 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 85258817 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 85258875 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 85258995 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85259072 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 85259176 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 85259218 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 85259322 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 85259409 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 85259484 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85259998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85260252 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 85261776 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 85261841 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 85261947 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85262022 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85262023 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 85262146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85262192 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85262311 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85262514 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85262662 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85262793 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85263141 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 85263264 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 85263286 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85263424 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85263431 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85263447 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85263467 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85263547 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85263670 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85263708 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85263865 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85263906 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85263989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85264030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85264446 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 85264538 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85264641 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 85264698 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85264708 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85264720 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85264725 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85264763 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85264790 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 85264855 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 85264993 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85265023 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85265055 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85265114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85265239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85265260 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85265275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85265373 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85265465 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85265521 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85265626 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85265720 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85266034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85266213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85266436 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85266513 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85266666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85266760 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85266914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85266931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85266945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85266967 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85266980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85266992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85267063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85267129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85267144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85267242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85267410 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85267441 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85267466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85267542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85267715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85267726 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85267809 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 85267831 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 85267876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85267979 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 85268071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85268256 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 85268298 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85268321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85268363 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85268387 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85268428 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85268598 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 85268628 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85268711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85268838 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 85268928 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85269083 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85269136 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85269431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85270133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85270640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85271287 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 85271347 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 85271395 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85271484 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 85271754 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 85271932 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85272510 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 85273041 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 85273309 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85273608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85273925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85273926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85274262 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 85274264 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 85274334 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85274438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85274561 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85274607 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85274629 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85274788 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 85274810 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85274860 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85275141 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85275145 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 85275292 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 85275310 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 85275395 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85275401 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85275642 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85275732 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85275831 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85275832 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85275966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85276073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85276148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85276560 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85276561 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85276669 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 85276811 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 85276841 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 85276842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85276854 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 85276865 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 85276877 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 85276936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85276951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85277047 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 85277126 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85277148 C G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 85277245 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85277368 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 85277425 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 85277535 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 85277579 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85277994 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85278289 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85278371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85278513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85278901 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 85279253 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85279360 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 85279736 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85279926 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85280089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85280381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85280431 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 85280626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85280629 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 85280677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85280694 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 85280981 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85281713 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85281815 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 85282177 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 85282319 T A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 85282320 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 85282549 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 85282697 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 85282979 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 85283010 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 85283191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85283253 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85283356 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85283395 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 85283539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85283759 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 85283915 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85284159 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85284247 A T Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 85284381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85284423 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85284503 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 85284532 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 85284902 G C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 85284971 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85285053 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 85285307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85285582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85285685 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 85285727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85285910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85286303 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 85286411 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85286992 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 85287261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85287269 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 85287383 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 85287910 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85288236 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85288564 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85288610 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85288870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85288976 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85289106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85289107 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 85289697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85289868 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85291433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85291737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85291802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85292201 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85292337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85292516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85292525 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 85293317 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85294199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85295134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85295316 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 85295502 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 85295527 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85295563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85295575 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85295705 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85295929 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85296122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85296369 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 85296450 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 85296454 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 85296734 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 85296851 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 85297375 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 85298429 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 85298596 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 85298878 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 85299031 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 85299043 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 85299089 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 85299276 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85300208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85300556 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85300601 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85300713 T C Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 85301544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85301575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85302945 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85303054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85303464 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 85303856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85304015 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 85304250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85304287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85305719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85306108 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85306443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85306606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85307024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85307176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85307611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85308889 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85308891 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 85309113 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85311017 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85312099 A C Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 85312823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85312966 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 85313193 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85313757 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 2 85313884 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 85314430 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85314527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85315628 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85316146 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85317819 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85318069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85318327 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 85318336 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85322050 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85323430 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85323602 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85323893 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85324914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85325988 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85326617 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85326738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85327297 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 85328452 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 85328893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85331271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85331525 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 85332109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85332360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85332442 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 85332757 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 2 85333110 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85333361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85333592 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85334395 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 85334726 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 85334967 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85335053 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85335977 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85336138 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85337329 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85338077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85338496 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85339498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85339687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85339830 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 85339959 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85340562 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 85341321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85342235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85342248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85342588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85342730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85342781 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 85342813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85343618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85343688 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 85343809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85345820 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85346209 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 85347032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85347675 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 85347962 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85348350 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85348581 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85348751 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85348807 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85348978 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85349046 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85349161 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85349172 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 85349530 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 85349545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85349609 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85349664 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85349748 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85349833 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85349883 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85350184 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85350247 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 85350349 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85350371 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85350387 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 85350515 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 85351250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85351660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85351802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85352041 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85354698 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85355475 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85355787 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85356027 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85356497 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85357371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85357562 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 85357821 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85358181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85358419 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85360040 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85361252 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85362070 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 85362558 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 85363781 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85363811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85364270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85364275 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85364424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85364634 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85364765 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85364851 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 85365020 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85365740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85365991 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85366251 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 85366777 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85366923 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85366939 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85367133 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85367164 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 85367644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85367893 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85368052 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85368190 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85368228 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85368304 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85368772 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 2 85368773 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 2 85368889 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85369022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85369394 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 85369504 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85369520 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85371271 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 85371358 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85371459 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 85371552 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85371762 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85371822 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 85371971 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 85372254 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 85372315 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 85372427 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85372876 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85372889 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85372915 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 85372970 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 85373048 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85373245 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85373512 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85373693 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 85373722 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 85373774 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85373864 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85374152 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 85374207 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85374227 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 85374384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85374492 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85374701 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 85374825 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 85374928 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 85375010 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 85375066 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85375102 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85375163 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85375201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85375451 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85375596 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85375630 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85375641 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85375722 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 85375738 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 85375743 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 85375868 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 85376006 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 85376008 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 85376017 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 85376067 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 85376164 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 85376953 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85377012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85377563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85377689 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 85377707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85378466 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 85379052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85379306 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85379495 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85379653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85379713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85379722 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 85379751 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85379772 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 85380123 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85380465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85380707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85381192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85381650 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85381719 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85381751 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 85382930 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 85383122 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85384245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85385326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85385640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85386641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85387485 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85387815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85388232 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85389032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85389304 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85390308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85394843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85395456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85395793 A T Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 85398786 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 85398946 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85399030 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 85399098 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 85399560 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85400649 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85400805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85400810 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85401544 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85402048 C T Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 9 9 1 7 1 2 85402093 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 85403085 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85403870 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 85404245 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85404309 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85404729 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 85404845 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85404880 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85405030 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85405033 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85405491 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 85405719 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 85405720 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 85405735 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 85405765 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 85405799 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 85405867 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 85405955 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 85406264 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 85406457 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85406472 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 85407577 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 85408223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85408260 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85408273 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 85408279 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 85408296 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85408320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85408540 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85408551 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 85408618 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 85408619 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 85408696 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 85408697 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85408740 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 85408765 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 85408871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85409953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85410050 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85410082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85410478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85411144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85411879 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85411881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85412247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85412309 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85413180 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85413620 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85413995 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 85413996 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 85414006 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 85414212 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85414304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85414395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85414428 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85414597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85414627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85414736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85414881 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 85415052 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 85415083 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85415218 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 85415226 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 85415229 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 85415240 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85415367 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85415421 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85415549 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 85415550 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 85415709 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 85415732 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85415812 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 85415819 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85415832 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 85415861 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 85416095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85416305 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 85416409 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 2 85416496 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85416512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85416592 T A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 2 85416705 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 85416834 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85416847 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 85416854 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 85416871 C A Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 85416995 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 85417022 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85417023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85417042 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 85417429 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 85417463 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85417537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85417551 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 85417713 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 85417911 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 85417926 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 85418033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85418042 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85418071 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85418082 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 85418162 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 85418291 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85418733 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85418768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85419081 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 85419140 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85419386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85419458 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 85419598 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85420195 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85420511 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 85420740 T A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 85420753 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 85420823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85421459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85422984 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 85423448 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 85423472 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85423643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85423952 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85424019 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 85424080 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 85424126 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85424429 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85424439 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 85424671 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85425101 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 85425431 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85425699 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85425730 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85425839 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85425860 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85425893 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85425908 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85425953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85426115 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 85426165 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85426501 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 2 85426522 A G Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 2 85426764 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 85426771 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 85426787 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 85427214 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85427320 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 85427333 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 85427380 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85427684 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85428285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85429047 G C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 85429578 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 85429696 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85429749 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 85430120 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 85430195 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 85430605 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 85430639 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85430689 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85431274 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85431434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85431642 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85431817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85432041 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 85432496 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85432611 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85432978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85433089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85433134 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85433282 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85433789 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85434263 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 85434415 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 85434585 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 85434735 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85434766 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 85434857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85435182 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 85435188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85435326 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85435380 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 85435436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85435760 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 85436321 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 85437318 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85437399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85437426 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 85437677 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 85437702 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85437708 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85437784 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 85438007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85438256 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85438935 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85439039 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85439417 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85440108 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 85440194 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 85440299 A T N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 2 85440770 C G N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 2 85440828 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 85440830 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 85440839 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 85440853 A T N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 85440862 T A Y N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.153846153846154 0.692307692307692 0.153846153846154 13 13 2 9 2 2 85440880 T C Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 85441298 G T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 85441311 A C Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 85441339 T A Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 2 85441362 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 14 14 2 10 2 2 85441378 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 2 85441385 C A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 85441405 G C N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 2 85441599 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 85441602 T C N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 2 85441626 T C Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 85441643 T C N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 85441647 T C Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 85441678 C A Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 85441758 T A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 85441759 A T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 85441776 A T Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 85441960 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85441982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85442010 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 85442064 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 2 85442075 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85442078 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85442089 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85442136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85442232 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 85442308 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 85442435 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85442445 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 85442452 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85442654 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 85442840 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 85442871 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 85442882 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 85442938 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85442964 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85443044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85443084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85443101 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85443180 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 85443546 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 85443642 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 85443733 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 85443826 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 85444075 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 85444327 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 85444415 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 85444502 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 85444839 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 85445092 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 85445357 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 85445372 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 85445468 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 85445635 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85445695 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 85445724 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 85445806 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 85445814 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 85446098 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85446223 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 85446243 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85446358 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 85446381 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85446428 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85446731 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85446844 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 2 85446879 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 85446904 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 85446937 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 85447103 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85447106 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85447150 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85447187 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 85447402 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85447487 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85447503 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85447577 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 85447618 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85447641 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 85447685 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 85447701 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 85447705 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 85447751 T A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 2 85447809 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 2 85447910 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85447961 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85447992 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 85448150 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85448321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85448424 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85448441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85448463 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85448865 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 85448927 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85448955 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85448976 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85449096 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85449183 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85449203 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85449274 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 85449414 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85449528 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85449648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85449705 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85449749 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85449876 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85449968 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85450060 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 85450067 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 85450207 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85450252 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85450364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85450396 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 85450429 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85450494 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85450495 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85450721 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85451454 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 85451535 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 85451620 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 85451981 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85452217 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 85452509 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85452601 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85452705 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85452879 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 85453021 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 85453107 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 85453346 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 85453476 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85453844 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85454040 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85454278 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85454626 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85454722 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85454907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85455055 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 85455122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85455273 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85455304 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 85455613 A C Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 2 85455754 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 85455782 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 85456537 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 85456562 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 85456725 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 85456913 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 85456993 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85457128 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 85457512 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85457549 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85457697 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85457975 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 85458005 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85458048 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 85458100 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 85458113 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85458195 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85458246 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 85458423 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85458681 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 85458946 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85459030 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85459042 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 85459063 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85459130 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85459286 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85459314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85459335 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85459371 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85459378 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85459417 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85459551 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85459679 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85459852 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 85459865 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85459960 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85459970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85460057 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85460141 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85460230 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85460505 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 85460533 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 85460627 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85460697 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 85460735 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85460893 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85460938 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 85460946 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 85460971 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85461014 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 85461146 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 85461367 T A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 85461368 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 85461545 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 2 85461812 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 85461927 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 85461957 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 85462130 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 2 85462318 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 85462479 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85462573 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85462682 G C Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85462768 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85462836 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 85462963 C T Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 85468856 T C N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 85469018 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 2 85469244 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 85469256 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 85469344 A T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 85469506 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 85469554 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 85469558 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85469605 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85469718 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85469808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85469869 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85469892 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 85469898 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 85470034 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.0833333333333333 0.75 0.166666666666667 11 13 1 9 2 2 85470213 A C N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 2 85470509 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85470625 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 85471086 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 85471187 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 85471418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85471454 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 85471482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85471632 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85471686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85471843 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 85472032 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85472107 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85472386 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85472471 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85472472 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85472652 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 85472734 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85472752 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85472862 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 85473086 A T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 2 85473740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85473758 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85474462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85474897 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 2 85475140 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85475237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85476504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85476513 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 85478240 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85478340 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85478774 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85478824 T A Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 85478885 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85479545 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 85479891 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85480093 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85480138 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85480176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85480224 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85480309 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 85480406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85480421 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 85480504 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85480564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85480630 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85480713 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85480718 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 85480747 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85480835 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85480937 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 85481166 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85482255 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85482291 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85482493 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 85486118 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 85486339 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85486399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85486846 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 85486944 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 85486961 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85487005 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 85487100 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85487231 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 85487353 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85487442 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85487458 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85487499 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85487727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85488440 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 2 85488735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85488776 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85488949 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 18 18 2 14 2 2 85488966 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 85489103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85489114 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 85489297 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85489328 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85489428 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85489481 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85489513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85489533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85489754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85489756 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 85489772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85489785 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85489891 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85489898 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85489977 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85490011 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 85490026 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85490067 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85490215 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 85490368 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 2 85490387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85490414 C G Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 85490546 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 2 85490564 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 85490641 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 85490671 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 85490680 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 85490689 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 85490776 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 85490830 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85490854 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 85490924 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 2 85490938 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85490951 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 85491148 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 85491548 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 85491652 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85491667 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85491671 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 85491684 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85491685 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 85491759 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85491765 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85491775 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85491854 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 85491958 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85492113 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 85492320 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 85492410 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85492421 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85492457 G T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 85492647 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85492732 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 85492873 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85492904 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 85492934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85492998 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85493021 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85493148 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85493196 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 85493376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85493450 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85493496 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85493519 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85493650 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85493668 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85493672 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85493698 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85493704 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85493711 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85493736 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85493739 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85493799 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85493841 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85493847 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85494372 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 85494423 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85494820 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85494952 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85495004 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 85495211 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85495220 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85495472 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 85495507 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 85495740 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85495755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85495922 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 85496211 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85496497 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 85496516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85498351 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 85498680 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85498709 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85499814 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85501057 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85501551 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85501593 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85501608 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 85502002 G T Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 85503651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85503840 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 85503904 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 85504553 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 85504627 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 85506631 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 85507139 C G Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 85507513 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85507820 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85508902 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 85508997 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85510097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85510329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85510338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85511330 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85513660 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85515187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85515561 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 85516206 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 85517134 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85520178 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85521459 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85521683 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 85521944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85523594 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85524117 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85524699 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85526884 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 85527043 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85527294 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85530024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85530237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85531580 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 85532259 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85532421 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85532806 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85532915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85533405 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85533636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85534218 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85534502 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85541927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85542948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85543521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85543568 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85545219 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85545870 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85546325 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85546554 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85546666 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85546718 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 85547116 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85547139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85547222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85547482 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 85547614 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 85547691 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85547941 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85547968 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85548015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85548119 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85548205 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85548329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85548383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85548514 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85548597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85548942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85548963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85549139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85549146 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85549173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85549216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85549930 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85550354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85550375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85550697 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85550741 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85550939 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85551275 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 85551408 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 85551944 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85552464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85552794 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 85552814 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 85552959 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85553163 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85553490 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85553960 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 85554000 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 85554023 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 85554153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85554187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85554303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85554395 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 85554419 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85554877 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 85555113 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85555296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85555311 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 85555469 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 85555501 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 85555718 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85555836 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 85556173 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85556190 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 85556203 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85556736 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 85556752 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 85556769 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 85557036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85557072 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85557120 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 85557436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85557650 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85558746 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85558755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85558761 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85558767 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85559285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85559352 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 85560033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85560079 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 85560101 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 85560156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85560368 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85560724 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 85561076 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 85561230 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85561725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85561812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85561857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85562028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85562388 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 85562913 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 2 85563012 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 85563072 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 85563189 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85563322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85563356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85563423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85564182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85564406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85564573 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 85565095 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85565716 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85565743 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85565763 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85565882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85566251 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85566973 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85567029 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85567068 G C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 85567074 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 85567694 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85567852 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 85568033 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85568463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85568874 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 85569015 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85569281 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85569538 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85569610 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85569717 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85570049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85570107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85570177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85570261 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85571374 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 85571646 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 85571779 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85571903 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 85572493 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 85572904 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85573728 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85573770 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85574073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85574524 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85574538 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 85574620 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 85574636 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85574662 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 85574694 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85574834 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 85575114 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85575550 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 85576182 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 85576307 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85576418 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 85576780 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85577003 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 85577024 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85577497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85577865 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85577883 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85578121 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85578202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85578222 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85578589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85584763 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85584945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85585085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85585099 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85585143 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85585147 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85585549 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85585649 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85585717 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85586084 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85587137 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 85587374 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85587524 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85587726 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85587789 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 85587812 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85587975 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85588054 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 2 85588166 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85588347 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85588362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85588414 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 85588468 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 85588497 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 85588538 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 85588706 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 85588719 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85588726 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 85588765 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85588850 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 85588882 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 85588961 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85589064 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 85589081 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 85589095 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85589097 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85589173 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85589191 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 85589227 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 85589229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85589260 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85589274 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85589293 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85589333 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85589346 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85589420 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 85589434 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85589445 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85589451 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85589532 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 85589570 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85589604 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85589626 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85589632 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 85589697 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85589776 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 85589780 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85589795 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 85589877 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 85589935 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 85590000 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 85590022 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 85590029 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 85590239 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 85590398 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 85590401 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 85590456 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 85590527 T A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 2 85590592 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 85590737 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 85590823 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85590872 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 85590915 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85590924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85590947 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85590989 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85591002 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85591026 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 85591077 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85591106 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85591110 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85591127 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85591142 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 85591163 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 85591164 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 85591190 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85591254 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 85591277 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85591361 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 85591442 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85591466 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 85591527 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85591538 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85591578 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85591599 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85591600 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85591727 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85591770 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85591836 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 85591874 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 85591933 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85591945 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85591946 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85592008 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 85592065 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 85592082 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 85592101 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85592115 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 85592160 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 85592179 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85592222 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 85592271 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 85592290 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 85592374 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 85592425 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 85592430 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 85592442 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85592457 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85592483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85592576 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 85592710 T G N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 85592762 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 85592803 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 85592939 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 85592948 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 2 85592959 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 85593052 T G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 85593084 C A N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 2 85593237 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 85593245 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 85593370 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85593377 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 85593418 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 85593423 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 85593630 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85593723 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 85594202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85594445 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85594447 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 85594499 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85594502 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85594546 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85594562 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85594606 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85594741 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85594747 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85594792 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85594860 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85594877 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 85594911 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85594925 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85594949 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85594978 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85595002 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85595033 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85595068 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85595186 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85595252 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85595274 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85595343 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85595506 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85595622 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85595711 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85595723 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85595762 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 85595768 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85595943 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85595950 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85596026 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85596047 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 85596085 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 85596109 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 85596146 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85596175 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85596194 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85596389 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85596499 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85596528 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 85596566 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85596604 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85596678 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85596749 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85596778 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85596843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85596880 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85596891 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85596924 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85596956 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85597003 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85597087 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 85597152 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85597245 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85597292 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85597326 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85597398 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 85597449 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 85597817 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 85597819 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 85597843 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 85597877 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85597907 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85597918 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 85597969 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85597970 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85598010 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85598015 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85598030 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85598059 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 85598299 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85598374 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85598388 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85598397 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85598424 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85598514 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 85598535 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 85598559 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 85598571 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85598582 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 85598602 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85598612 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85598629 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85598634 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85598669 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85598762 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85598765 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85598776 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85598804 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85598818 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85598821 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85598889 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85598896 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85599126 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85599136 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85599159 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85599176 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 85599195 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 85599226 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85599276 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85599283 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85599287 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85599367 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 85599381 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 85599414 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 85599418 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 85599425 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 85599468 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85599484 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 85599594 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85599776 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 85600439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85600581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85602854 A C N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 85603135 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85603236 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 85603406 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85604392 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85604783 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85605232 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85605318 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85605559 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85605757 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 85605870 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 85606024 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 85606346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85606614 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 85606652 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85606669 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85606689 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85607522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85607680 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85608095 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 85608118 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 85608796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85609112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85609154 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 85609334 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 85609535 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 85609674 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85609826 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85610393 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85610505 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85610529 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85611055 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85611608 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85611978 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85612685 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85613515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85614168 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85614747 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85615111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85615485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85615703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85616055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85616496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85616821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85617111 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 85617301 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85617782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85617966 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 85618842 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85619026 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85619114 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 85619115 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 85619361 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 85619432 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 85619571 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 85619595 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 85619814 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 85619864 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 85619866 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85619985 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 85620017 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 85620046 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 85620047 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 85620102 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 85620387 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 85620410 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 85620487 G C N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 85620551 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 85620603 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 85620643 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 85620648 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 85620682 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85620817 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85620849 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 85620976 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85621035 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85621106 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 85621148 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85621213 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 85621422 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85621604 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 85621695 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 85621734 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 85621843 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 85621869 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 85621902 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 85621904 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 85621959 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85622042 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85622349 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85622825 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 85622858 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 85622868 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85622880 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 85622894 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 85622938 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 85622970 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 85623053 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 85623141 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 85623483 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 85623557 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 85623618 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 85624187 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 85624396 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85624588 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 85624601 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85624813 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 85624838 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 85624864 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 85624886 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 85624922 G C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 85624943 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 85624991 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 85625199 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 85625241 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 85625249 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 85625405 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 85625412 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 85625667 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85625702 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 85626038 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85626099 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85626428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85626613 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85626623 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 85626813 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 85626820 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85627201 A C N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 85627216 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 85627218 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 85627322 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 85627402 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 85627575 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 85627576 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 85627615 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 85627629 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 85627798 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 85627917 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 85627991 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 85628060 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 85628084 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 85628120 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85628205 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 85628220 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85628233 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 85628319 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85628353 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85628354 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85628426 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85628434 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85628535 G C Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 85628902 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85628964 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85629215 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 85629229 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 85629389 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 85629390 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 85630039 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 85630063 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 85630166 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 85630186 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85630212 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85630398 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85630968 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 85631161 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 85631337 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85631386 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85631404 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85631897 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 85632032 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 85632475 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 85632584 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 85632678 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 85632728 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85632748 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85632765 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 85632970 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 85633011 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 85633246 A T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 85633247 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 85633316 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85633347 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 85633469 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 85633566 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 85633723 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 85633742 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 85633745 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85633938 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85634012 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 85634045 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85634085 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 85634112 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 85634146 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85634158 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85634433 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85634506 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85634590 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85634716 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85634744 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85634841 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 85634867 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85636248 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 85636366 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85636466 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 85637054 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 85637164 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85637274 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85637666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85637854 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85637900 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 85638023 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85638047 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85638380 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 85638416 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 85638421 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 85638596 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 85638741 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 85638930 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 85638934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85638986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85639119 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 85639840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85639940 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85640081 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85640414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85640443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85641192 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 85641221 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85641298 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85641328 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85641455 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85642014 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85642553 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85642896 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85642911 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 85642970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85643089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85643090 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85643981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85644166 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85644248 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85644344 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 85644369 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85644516 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 85644528 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 85644602 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 85644643 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 85644725 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85644803 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 85644973 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85645251 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85645336 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85646162 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85646283 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85646408 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 85646501 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85646592 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85646733 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85646863 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 85646866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85646989 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 85647005 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 85647028 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85647031 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85647058 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 85647066 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85647070 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85647220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85647277 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85647296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85647421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85647436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85647641 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 85647827 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85647891 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85647971 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85648058 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85648652 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85648715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85648945 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85648984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85649110 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 85649130 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 85649174 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 85649380 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85649494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85649541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85649660 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85649724 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 85649892 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85650043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85650114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85650186 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 85650504 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85650641 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 85650700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85650945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85651141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85651154 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85651219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85651243 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 85651284 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 85651365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85651399 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85651402 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 85651419 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 85651648 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 85651785 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 85651806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85652179 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 85652206 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85652260 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85652274 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85652308 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85652439 C T N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 85652611 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 85652634 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 85652666 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 85652685 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 85652690 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 85652771 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 85652808 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 85652837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85652884 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 85652887 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 85655739 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 85655788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85655797 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 85655814 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85655815 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 85655825 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 85655853 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85655971 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 85656138 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85656222 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 85656240 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 85656250 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 85656280 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85656405 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 85656428 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85656478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85656520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85656523 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85656551 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 85656596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85656699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85656841 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 85657281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85657508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85657661 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 85657741 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85657906 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85657992 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85658108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85658129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85658476 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 85658577 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85658656 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85658667 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 85658713 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 85659128 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85659208 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85659244 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 85659996 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85660092 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85660143 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85660207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85660334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85660555 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85660578 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85660723 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85660765 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85660855 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85660900 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85661156 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85661379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85661484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85661552 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85661565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85661653 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85661712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85661774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85661884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85661994 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85661997 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 85662016 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85662020 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85662192 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85662273 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85662395 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85662428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85662480 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85662552 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 85662554 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 85662564 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 85662583 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85662775 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85662893 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 85662917 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85662974 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85663146 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85663267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85663321 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85663416 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85664133 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 85664201 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 85664242 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 85664246 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 85664277 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 85664281 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 85664363 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 85664366 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85664465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85664503 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 85664515 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 85664553 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 85664589 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85664753 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85664777 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 85664816 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 85664832 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 85664867 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 85664899 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 85664921 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 85664973 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 85665002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85665032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85665197 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 85665289 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85665429 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 85665447 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 85665500 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 85665647 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 85665766 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 85665905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85665983 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85666034 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85666209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85666216 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85666281 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 85666297 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85666356 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 85666361 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85666401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85666456 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85666476 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85666580 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85666755 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85667053 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85667138 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85667181 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85667695 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85667738 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85667957 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85668135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85669018 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85669892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85670440 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85670947 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85670949 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85671067 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 85671557 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 85672393 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85672421 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85673162 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85673356 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 85673395 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85674769 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85677091 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85678285 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 85678637 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85679478 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85679491 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 85680375 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85683066 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85683197 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 85683458 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85683490 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85683797 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85685316 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85685917 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85685943 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85686408 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85686681 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85688084 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85688150 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85688313 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85690986 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85691181 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85691722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85692319 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85692541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85692733 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85693226 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85693848 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85695662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85696030 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85696614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85696785 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85697517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85698449 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85698512 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85698719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85701522 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85702464 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85704937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85705168 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85705195 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85705539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85706012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85706168 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85707405 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85708114 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85708792 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85709508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85710444 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85712128 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85712308 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 85712872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85719441 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85721731 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85722407 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 85722622 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85722752 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 85722824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85722877 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 85722982 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 85723004 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 85723104 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 85723329 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85723408 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85724386 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85725365 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 85725412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85726184 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85726502 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 85726834 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85726835 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85726994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85727934 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85727943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85728128 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85728289 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 85728710 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 85728757 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85728771 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 85729015 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85729021 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85729179 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85729188 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85729581 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 85729737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85729894 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85730076 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85730131 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 85730362 G T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 85730480 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 85730638 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 85730790 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85731128 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85731433 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 85731649 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85731652 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85732554 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 85732596 A C Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 85732597 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 85732608 T G Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 85733293 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85733355 G A Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 85735604 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 2 85735628 T C Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 85735797 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 85736100 A G Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 2 85736107 T C Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 2 85737167 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85737293 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85737745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85737812 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85737902 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85738073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85738127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85738377 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 85738492 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85738547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85738625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85738798 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85738802 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85738982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85739003 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85739024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85739111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85739182 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85739210 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85739340 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85739366 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85739420 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 85739611 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85740141 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 85740284 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85740331 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85740374 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85740391 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85740468 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85740482 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85740532 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85740599 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85740661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85740742 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85740870 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85740911 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85740942 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85740943 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85740969 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85741057 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85741059 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85741101 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85741131 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85742005 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 85742022 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85742286 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85742393 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 85742691 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85742827 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85742938 C A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 85743240 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 85743320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85743782 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 85743805 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85743859 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 85743988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85744195 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 85744245 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85744481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85745303 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85745446 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85748159 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85748961 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 85749103 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85749381 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85749443 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 85749968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85749969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85750138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85751825 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85752059 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85753498 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 85754077 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85754147 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85754165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85754435 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85754568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85754629 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85754737 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 85754839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85754961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85754976 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85754978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85755080 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85755388 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85755436 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85755445 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85755535 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85755646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85755673 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 85755697 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85755704 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 85755766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85755807 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85755962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85756075 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 85756192 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85756194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85756385 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85756497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85756667 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85756792 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85756901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85759349 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85759782 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85760254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85760256 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85760466 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85760921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85761692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85762253 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85762711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85762939 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85764080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85765233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85765387 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85765465 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85765607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85765964 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85766335 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85766373 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85767416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85767698 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85768057 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 85768281 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85768526 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85768627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85768696 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85768728 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85768751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85768986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85769374 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85769449 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85770872 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 85771115 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85771314 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 85772103 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85772107 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85772348 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85772356 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85772496 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 85772897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85773023 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85773307 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 85773580 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85774612 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85774788 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 85775314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85775472 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85775818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85776443 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85777589 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85777629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85777749 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 85778018 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 85778486 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85779141 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85779467 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 85779908 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 85780033 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 85780040 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 85780408 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85780649 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85781054 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 85781136 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 85781155 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85781258 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85782904 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85787423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85788243 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85788765 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85789000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85789047 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85789653 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 85790158 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85790539 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85790590 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85790734 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85792261 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85793005 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85793307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85794370 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85794916 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 85795048 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85795222 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85795534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85797013 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85797083 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85797913 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85797993 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 85798033 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85799064 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 85799095 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85799206 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85799226 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 85799240 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 85799262 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85800036 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85800068 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85801143 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 85803174 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85803263 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85803434 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85803524 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85803577 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85804071 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85804340 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 85804913 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 85805897 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85806177 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85806663 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85808101 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 85808184 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85808242 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85808308 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85808537 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85808699 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85808700 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85810165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85810491 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 85810632 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85810691 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85811009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85811243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85811560 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85812495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85813389 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85813444 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85813648 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 85813730 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 85814196 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85814259 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 85815153 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85815242 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 85815516 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85816325 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85816370 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85816568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85816777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85816927 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85817105 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85817111 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 85817120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85817380 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 85817397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85817422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85817573 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85817751 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 85817775 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 85817875 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 85817906 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 85817975 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 85818037 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 85818131 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85818236 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85818245 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85818272 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85818331 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85818371 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85818377 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85818382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85818394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85818489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85818514 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85818566 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 85818619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85818679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85818717 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 85818809 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85818905 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85818948 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85818950 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85818959 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85818967 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85819048 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 85819072 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85819196 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 85819248 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85819279 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85819357 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85819503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85819561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85819565 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 85819603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85819685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85819733 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85819805 G C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 85819810 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85819821 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85819915 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85820044 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 85820079 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85820173 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85820263 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85820277 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85820315 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 85820318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85820331 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85820340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85820398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85820619 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85820628 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85820668 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85820684 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85820701 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 85820739 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 85820820 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 85820846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85820883 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 85820985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85821050 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 85821079 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 85821215 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85821369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85821411 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85821425 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 85821512 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85821564 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 85821606 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 85821644 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 85821794 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 85821842 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 85821880 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85822132 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85822267 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 85822343 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 85822560 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 85822640 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 85822783 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85822846 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 85822958 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 85822960 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 85822987 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 85823035 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85823079 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85823096 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85823141 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85823150 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 85823215 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85823227 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85823275 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85823320 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85823350 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 85823377 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 85823395 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 85823430 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 85823544 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 85823712 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 85823816 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 85823915 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85824977 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85825012 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85825098 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85825127 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 85825170 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85825259 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85825355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85825358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85825371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85825377 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 85825385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85825731 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 85825738 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 85825818 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 85825819 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 85825885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85825889 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 85825909 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 85825944 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85825962 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 85826077 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 85826212 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 85826328 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 85826401 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85826407 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 85826534 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 85826580 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 85826630 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 85826677 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85826733 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 85826835 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85826905 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85827373 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85827445 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85827497 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85827695 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85827765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85827846 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 85827901 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85827987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85828231 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85828329 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 85828684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85828686 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 85828793 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 85829027 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 85829139 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 85829689 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 85830179 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 85830228 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85830631 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 85830656 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 85830673 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 85830873 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85831217 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85831404 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85831443 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 85831448 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 85831865 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 85832815 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85832992 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85833101 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 85833106 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85833141 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85833507 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 85833527 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 85834633 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85834659 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 85834729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85834733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85834861 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85835010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85835020 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85835210 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85835263 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 85835367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85835400 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85835548 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85835663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85835712 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85835817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85835882 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85836135 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85836145 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85836179 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85836190 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85836272 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85836310 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85836333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85836375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85836436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85836535 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85836850 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85836855 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 85836863 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85837132 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 85837339 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85837407 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85837562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85837609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85837746 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85837750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85837759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85837960 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85838062 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85838074 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85838160 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838396 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85838452 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 85838485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838648 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838754 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 85838766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85838943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85838948 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 85839022 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85839027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85839194 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 85839450 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85839512 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85839514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85839541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85839573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85839597 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85839666 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85839683 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85839701 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85839770 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 85839781 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 85839825 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 85840046 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 85840268 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85840285 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 85840519 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85840997 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 85841227 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 85841611 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 85841781 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 85841967 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85842007 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 85842180 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85842201 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 85842236 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 85842273 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 85842305 T A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 85842330 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 85842399 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 85842402 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 85842430 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 85842630 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85842741 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85842775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85842817 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 85842895 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 85842912 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 85843087 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85843100 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85843428 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85843452 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85843464 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85843515 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 85843537 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 85843753 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85844037 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 85844120 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 85844277 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85844656 C G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 85845117 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85845858 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85846019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85846036 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85846193 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85846194 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85846274 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85846371 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85846465 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85846583 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85846645 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85846768 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85846876 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85846984 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85847021 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 85847151 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85847185 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85847308 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85847350 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85847401 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 85847460 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 85847605 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 85847930 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85848069 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85848360 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85848853 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85848869 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85848885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85848929 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85849038 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85849044 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 85849449 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85849502 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85849541 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85849550 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85849563 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85849566 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85849911 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 85850047 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 85850100 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85850120 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85850224 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85850339 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85850352 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85850556 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 85850678 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85850884 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85851186 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85851395 T A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 85852472 T A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 85852508 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 85852689 T C Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 85853060 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 85853364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85853704 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85853980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85854122 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85854244 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85854268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85854322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85854334 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85854381 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 85854723 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 85854827 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85854937 T C Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 85855295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85855366 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 85855486 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 85855533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85856090 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 85856235 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 85856584 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85856696 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85856859 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85856978 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 85857536 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 85858031 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85858089 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85864470 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85864517 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85864642 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 85865309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85865339 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 85865351 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85865546 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85865576 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85866240 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 85867409 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 85867544 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 85867695 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 85867768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85867877 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 85868263 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85868449 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 85868457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85868674 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 85868698 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 85868820 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85868955 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85868971 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 85869200 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85869336 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 85869529 T A Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 85869657 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 85869670 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 85870800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85870906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85870954 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 85871602 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 85871718 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 85872855 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 85872930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85873193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85873221 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 85873296 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85873308 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85873330 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85873383 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85873451 C G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 85873477 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 85873481 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 85874083 G C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 85874115 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 85874143 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85874296 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85874323 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85874341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85874351 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85874499 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85874510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85874531 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 85874547 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85874557 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85874596 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85874627 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85874641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85874699 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 85874763 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85874776 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85874831 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85874862 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85874926 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 85875023 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85875027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85875201 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 85875232 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85875252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85875417 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85875418 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 85875474 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 85875520 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 85875580 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 85875622 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85875635 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 85875675 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 85875692 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85875710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85875769 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85875849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85875875 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 85875883 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85875954 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 85876145 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 85876191 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85876203 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 85876207 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85876214 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 85876257 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 85876295 T C Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 85876478 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 85876545 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85876627 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85876646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85876679 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85876779 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85876908 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 85876980 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 85877189 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 85877331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85877623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85877850 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 85877851 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 85877900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85877909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85878103 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 85878119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85878147 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85878362 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85878364 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85878667 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85878798 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 85878887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85878939 G T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 85879250 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85879333 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 85879361 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 85879659 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 85879680 C T N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 85879737 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 85879822 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 85880056 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85880081 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85880296 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85880493 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85880630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85880693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85880901 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85881055 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85881343 A C Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 85881561 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 85881635 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85882370 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85882423 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85882454 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85882460 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85882503 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85882517 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 85882675 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85882681 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 85882699 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85882763 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85882860 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85882865 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85882909 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 85883060 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85883129 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 85883168 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 85883169 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 85883266 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85883302 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85883379 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85883434 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 85883502 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 85883512 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85883612 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85883616 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 85883690 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 85883949 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85884046 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85884078 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85884095 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85884114 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85884151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85884171 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 85884526 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85884530 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 85884551 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85884567 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85884645 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 85884955 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85884970 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85885034 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 85885104 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 85885271 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85885428 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 85885578 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 85885579 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85885714 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85885746 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85885751 C G Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 85885807 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85885819 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 85885821 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 85886052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85886076 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85886291 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85886506 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85886706 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 85887148 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85887258 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85887420 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 85887423 A T Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 85887652 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 85887742 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85887919 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 85888397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85888755 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 85888883 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 85889353 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 85889438 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 85889744 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 85890085 G C N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 85890356 A T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 85890475 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 85890613 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 85890740 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85890872 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85890906 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85891053 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85891156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85891830 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85892018 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85892116 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85892170 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85892300 C A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 85892874 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85893290 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85893292 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85893312 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85893850 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 85893877 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 85893942 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 85894905 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85896218 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 85896735 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 85896787 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 85897061 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85897069 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85897099 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85899438 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85899870 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 85900944 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85910889 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 85911044 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 85912302 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85915285 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 85917570 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 85920563 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85920589 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 85920994 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85921038 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 85921320 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85922786 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 85922835 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 85923790 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85923951 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85924022 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85924092 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85924267 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 85924293 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 85924357 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 85924467 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 85924580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85925051 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85925084 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 85925537 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 85925690 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 85926417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85926742 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 85927326 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 85927538 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85927576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85927599 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 85928541 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85928603 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 85928663 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 85929000 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 85929021 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85929124 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85931262 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 85934641 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 85935919 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 85938698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85938708 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85939859 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85940639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85940930 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85941733 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85941858 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85942206 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85942562 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85942805 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 85943287 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85943293 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85944008 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85945327 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 85945601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85945636 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85946527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85947253 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 85947396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85955856 G T N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 85956094 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 85956926 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 85957467 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85957991 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 85959883 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 85960027 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 85960073 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 85960513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85961068 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85961511 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85963408 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85963833 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 85964165 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 85965018 T A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 85965039 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85965075 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 85965110 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85965249 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85965647 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85966825 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85966982 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 85967233 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85970417 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85970668 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85970985 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85971723 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 85971887 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 85971940 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 85972176 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 85972345 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 85975508 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 85976168 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 85977493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85978678 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 85979100 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 85979675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85980454 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 85980476 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 85980846 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 85980858 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 85980870 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 85980925 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 85983188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85985301 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 85985321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 85986109 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 85987188 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 85987339 T C Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 85987705 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 85990899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85992088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85993243 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 85995281 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 85995820 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 85996717 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 85997921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 85998114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86004271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86004516 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86005447 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 86006605 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86007158 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 86008530 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86009393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86012258 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86012281 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 86014043 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 86014387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86014578 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86015033 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86017683 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86017965 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 86019058 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 86019876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86020126 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86021039 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86022473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86022643 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86022734 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86024909 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 86025434 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86025655 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 86026096 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86026131 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86026214 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86026417 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 86026455 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86026566 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86026580 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86026593 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86026631 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86026712 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86026837 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86026896 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86026904 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86026923 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 86026941 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86026967 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86027086 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86027136 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86027155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86027286 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86027431 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86027446 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86027635 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86027646 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86027660 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86027665 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86027705 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86027708 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86027730 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86027776 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86027821 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86027837 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86028062 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86028063 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86028152 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86028177 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86028192 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86028382 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86028383 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86028410 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 86028508 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86028530 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 86028549 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 86028604 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86028726 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 86028741 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86028757 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86028819 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86028893 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86028927 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86028959 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86029032 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86029087 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86029173 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86029200 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 86031033 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86031044 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86031045 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86031154 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86031267 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86031301 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86031357 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86031369 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86031444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86031514 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86031550 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86031560 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86031672 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86031741 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86031752 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 86031925 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 86031926 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 86032055 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86032072 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86032081 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86032142 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86032171 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86032275 A C Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 86032283 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86032293 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 2 86032320 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 86032451 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86032461 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86032462 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86032503 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86032520 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86032538 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86032543 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 86032572 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86032598 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86032599 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86032618 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86032622 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86032632 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86032667 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86032754 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 86032764 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 86032772 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 86032815 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 86032841 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86032848 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86032872 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86032890 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86032908 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 86032953 C A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 86033115 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86033146 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 86033163 C A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 86033197 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 86033204 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 86033238 A C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 86033348 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86033420 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86033499 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86033621 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86033803 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86033869 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86033908 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86034237 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86034242 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86034282 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86034303 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86034317 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 86034375 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86034407 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 86034418 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 86034443 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86034450 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86034460 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86034480 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 86035684 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 86035776 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86036026 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 86036258 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 86036263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86036402 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 86036477 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 86036572 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86036657 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86036672 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86036720 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86036964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86036985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86037000 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86037020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86037042 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86037092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86037284 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86037288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86037359 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86037395 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86037429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86037456 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 86037483 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86037513 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86037517 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86037552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86037577 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86037617 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86037619 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86037749 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86037764 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86037864 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86037870 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86037908 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86037988 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86038011 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86038146 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86038175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86038809 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86038818 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86038953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86038964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86039053 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86039215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86039220 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 86039263 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86039292 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86039317 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86039381 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86039444 A C Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 86039593 G T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86039640 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86039732 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86039759 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86039766 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86039788 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86039789 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86039807 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86040027 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86040069 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86040182 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86040205 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86040208 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86040480 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 86044653 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 86044811 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86045205 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86046616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86047244 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86047793 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86047808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86047847 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86048086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86048202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86048333 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86048529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86048770 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86048869 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86049451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86049590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86049649 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 86049924 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86050840 A C Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 86050866 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86050900 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86051804 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 86051823 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86052408 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86053273 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86054043 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 86054101 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86054119 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 86054120 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 86054142 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 86054209 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 86054288 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86054293 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86054300 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86054429 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 86054777 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86054912 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86054948 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86054963 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86054987 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86055003 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86055027 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 86055032 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86055038 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86055127 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 86055147 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 86055172 G C Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86055206 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 86055223 T A Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 86055224 A C N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 86055236 A G Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 86055312 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 86055496 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 86055528 A C N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 86055601 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86055857 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86055932 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 86056101 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86056144 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 86056145 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 86056196 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 86056198 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 86056337 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86056343 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86056390 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86056467 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 86056473 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 86056496 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 86056511 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 86056526 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86056540 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 86056576 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 86056836 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86056913 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86056936 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86057335 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 86057605 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 86057626 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 86057879 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86057910 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 2 86057925 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86057961 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86058014 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86058103 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.1 0.85 0.05 21 19 2 17 1 2 86058419 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 86058468 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 86058483 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 2 86058518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86058597 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86058610 G T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 86058683 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86058760 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 86058794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86059083 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86059243 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 86059395 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86059413 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86059446 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86059499 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86059596 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 86059675 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86059677 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86059728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86059791 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 86059799 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 86059887 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 86059897 C G Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 86059940 G A Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 86060264 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86060301 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 86060582 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86060620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86060717 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86060736 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 86060756 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 86060783 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 86060888 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86060893 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86060936 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 86060961 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 86060984 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 86061067 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 86061078 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 86061168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86061226 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 86061246 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 86061254 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 86061309 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86061891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86062111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86062126 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 86062188 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86062672 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 86062734 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 86062740 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86063352 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 86063484 A G Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 86064011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86064219 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86064447 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86064460 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86064565 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86065036 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 86065119 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86065213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86065762 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86065765 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 86065904 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86065920 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86066013 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86066387 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 86066508 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86066686 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 86066863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86066904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86067008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86067038 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 86067039 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86067361 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86067393 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86067405 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86067464 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86067521 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86067687 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86068062 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86068544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86068677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86068836 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 86069016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86069166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86069318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86069335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86069372 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 86069399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86069481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86069483 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86069619 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86069636 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86069769 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86069846 C G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 86069869 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86069870 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86070021 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86070079 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 86070422 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86070463 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86070536 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86070543 G T Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 86070555 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 86070569 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86070575 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86070773 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86070795 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86070810 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86070863 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86070936 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86070995 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86071224 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86071387 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86071552 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 86071623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86071880 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86071912 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86072105 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86072271 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 86072332 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86072407 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86072410 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86072423 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86072476 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 86072563 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86072585 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 86072714 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 86072760 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 86072762 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 86073288 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86073372 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 86073382 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86073579 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86073597 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 86073633 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86073699 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86073829 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86074178 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86074282 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 86074607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86074653 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86074683 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 86074861 C T Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 86074891 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 86074902 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 86074906 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 86074916 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 86074974 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 86074991 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 86075038 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 86075051 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 86075178 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 86075223 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 86075332 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 86075362 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86075410 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 86075412 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86075434 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 86075710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86075728 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86075796 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 86075798 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 86075851 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 86075852 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 86076043 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 86076859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86077301 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86077658 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 86079295 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 86079331 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 86079475 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 86079476 A T N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 2 86079658 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 86079876 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 86080443 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86080992 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86081849 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86082098 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 86082574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86084232 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86084917 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86085113 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86085637 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 86086071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86086644 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 86087236 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 86087244 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86087621 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86087670 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 86087816 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 86087825 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86087972 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86088004 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 86088790 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86088872 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86089017 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86089057 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86089199 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86089251 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86089315 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 86089391 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 86089407 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 86089438 C A Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 86089720 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86089821 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86090018 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86090147 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86090159 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 86090867 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 86090942 C G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86090959 T A Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 86091097 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86091260 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86091552 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86091832 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86091833 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86091905 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86092046 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86092376 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86092630 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86092747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86092790 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 86093066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86093202 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86093418 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86093502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86093538 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86093752 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86093761 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 86094240 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86094426 T G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 86094590 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86094650 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86095332 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86096589 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86097580 C A Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 86098307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86098361 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86099296 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86100779 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86101469 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 86101538 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86101622 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 86103222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86103846 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86103882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86104301 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 86105368 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 86105393 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105398 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105526 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105552 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105558 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105593 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105617 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105695 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105737 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105747 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105761 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105784 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86105791 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105809 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105827 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86105846 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86105849 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86105881 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86105942 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86106063 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86106068 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86106108 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86106161 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86106642 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 86106645 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 86106653 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 86106807 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 86106831 T A Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 86106844 A T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 86106875 A T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 86106877 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 86106887 A G Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 86106944 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 86106961 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86106986 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86106999 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86107021 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86107054 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86107138 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86107167 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 86107273 A T Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 86107274 A C Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 86107379 G T N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 86107391 T C Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 86107464 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 86107846 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 86107918 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86107957 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 86108668 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86108758 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86108770 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 86108830 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 86108845 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 86108857 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 86108941 C T Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 86109052 T A Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 86109204 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86109262 G C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86109480 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86109495 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86109630 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 86109836 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86109852 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 86109877 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 86110088 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 86110376 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 86111940 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86111981 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 86112311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86112391 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 86112453 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86113294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86113773 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86113900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86113961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86114110 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 86114112 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 86114199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86114254 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86114408 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86114445 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86114568 C G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 86114609 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86114637 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 86114661 T G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 86114668 C A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 86114687 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86114734 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86114772 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86114773 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86114943 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 86115021 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86115145 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 86115348 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 2 86115790 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 86115887 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 86116009 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86116064 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 86116891 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86118389 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86119106 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86119668 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86120315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86120731 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 86121425 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86121748 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 86123075 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 86123435 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86124222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86125068 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86125128 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86126055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86127154 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86128539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86128855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86128866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86129211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86130142 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86130566 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86130714 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86131593 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86133028 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86133092 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86136252 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86136979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86137855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86139641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86140595 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 86140705 T G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 86141052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86141170 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 86149663 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86149945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86150149 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86150413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86152851 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86153234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86153789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86154881 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86155310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86155513 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86156325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86159248 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 86162811 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86163909 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86163995 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 86164230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86164351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86164712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86164951 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86164964 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86165421 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86165721 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86165875 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86166170 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86166261 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86166403 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86166731 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 86166994 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 86167072 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86167192 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86167264 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86167426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86167542 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86167861 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86168223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86168286 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 86168315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86168496 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86168549 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 86168588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86168759 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86169154 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86169891 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86169892 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 86170142 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86170198 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86170364 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86170443 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 86170553 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86170564 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86170650 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86170665 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 86170705 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86170904 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86171136 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 86171333 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 86171342 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86171707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86171896 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86172066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86172250 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86172906 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 86173800 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 86174079 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86174470 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86174501 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 86174523 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 86174537 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86174991 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86175208 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 86175218 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 86175242 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 86175458 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86175464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86175552 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 86176249 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86176331 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86176443 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86176497 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 86176540 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 86176698 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 86176756 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 86176795 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86177575 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 86177760 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86177835 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86177857 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86178072 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86178294 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86178377 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86178406 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86178580 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86178643 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86178685 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86178769 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86178770 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86178816 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86178825 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86178841 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 86178905 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86178914 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86178968 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86178983 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86179078 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86179111 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86179199 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86179316 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86179363 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 86179455 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86179566 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 86179601 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 86179616 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86179797 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86179812 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86179823 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86187274 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86187373 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86187412 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86187638 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86187656 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86187925 G T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 86187996 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86188011 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 86188111 T A N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 86188146 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 86188166 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86188541 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86188659 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86188668 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86188877 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86188882 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86189094 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 86189099 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 86189133 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 86189143 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 86189176 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86189187 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86189210 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86189216 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86189313 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86189319 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86189346 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 86189389 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86189537 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 86189544 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 86189687 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 86189787 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 86189816 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86189875 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 86189911 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 86190010 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 86190107 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 86190108 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 86190134 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 86190160 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 86190736 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 86191897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86192376 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86192546 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86192953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86196342 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86196496 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86196548 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86196669 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86196811 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86196818 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86196955 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86197066 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86197075 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86197186 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86197362 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86197385 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86197442 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 86197903 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86197987 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86198003 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86198154 G T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86198273 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 86198314 C A Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 86198395 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 86198477 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 86198643 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86198673 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86198784 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86198788 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86198805 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86198854 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86198865 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86199070 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86199103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86199162 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86199208 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86199214 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86199257 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86199262 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86199271 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86199294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86199346 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86199388 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86199400 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86199423 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86199474 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86199490 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86199540 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86199567 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86199597 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86199617 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86199639 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86199715 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86199720 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86199754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86199936 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86200028 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86200148 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86200259 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86200310 T A Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 86200555 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86200574 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86200662 G C Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 86200698 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86200926 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 86201087 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86201261 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86201429 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86201481 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86201502 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86201556 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86201632 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86201961 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86202134 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86202249 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86202272 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86202273 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86202382 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86202518 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86202707 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86202765 A T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 86202781 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86203004 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86203036 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86203134 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86203183 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86203221 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86203263 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86203297 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86203401 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86203488 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86203577 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86203624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86203743 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86204141 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86204148 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86204186 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86204190 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86204323 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86204615 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 86204622 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86204629 T G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86204669 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86204991 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86205006 G T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 86205029 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 86205066 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86205126 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 86205141 A C N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 86205146 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 86205210 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86205232 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86205250 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86205251 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86205337 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86205380 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86205432 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 86205547 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86205564 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86205607 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86205620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86205641 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86205642 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86205701 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86205712 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 86205775 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86205779 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86205845 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86205853 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86205861 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86205942 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86206091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86208505 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86209236 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86209398 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86209417 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86209437 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86209439 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86209519 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86209569 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86209574 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86209618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86209699 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86209715 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86209719 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86209742 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86209824 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86209927 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86209966 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86210041 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86210048 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86210069 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86210088 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86210135 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 86210141 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86210186 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86210204 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86210420 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86210432 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86210571 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86210651 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86210674 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86210677 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86210835 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86210861 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86210937 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86211032 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86211033 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86211051 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86211103 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86211125 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86211275 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86211325 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86211331 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86211400 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86211421 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86211442 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86211487 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86211499 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86211918 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86211972 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86211996 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86212001 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86212014 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86212026 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86212082 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86212085 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86212189 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86212190 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86212287 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86212310 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86212346 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86212392 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86212394 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86212556 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86212623 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86212631 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86212634 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86212644 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86212649 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86212665 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86212686 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86212731 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86212766 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86212928 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86212999 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86213009 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86213116 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 86213153 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86213168 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86213176 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 86213233 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 86213323 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86213360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86213507 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86213655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86213792 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86213844 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86213851 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86213960 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86213967 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86214178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86214229 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 86214278 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86214352 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86214534 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86214636 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86214728 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86215516 A T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 86215715 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 86215754 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 86215797 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 86216110 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86216482 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86216531 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 86216576 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86216632 C G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86216673 T G Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 86216996 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86217036 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86217286 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86217363 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86217675 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 86217832 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86217868 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86217887 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86217987 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 86218277 G C Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 86218649 C A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 86219243 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86219246 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86220017 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86220232 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86220288 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86221599 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 86221600 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 86222197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86222351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86222576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86223105 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 86223147 G A Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 86225257 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86225392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86225552 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86225940 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 86226052 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 86226149 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86226451 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86226484 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86226562 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86226624 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 86226719 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86226743 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86226898 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86227017 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86227050 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86227080 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86227364 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86227432 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86227445 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86227581 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86227734 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86227750 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86227760 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 86227782 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86227783 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86227852 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86227932 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86227958 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 86227984 G C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 86228006 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 86228059 C T N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 86228069 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86228114 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 86228161 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 86228168 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86228285 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86228544 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86228643 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86228657 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86228700 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86228807 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 86228878 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 86228909 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86228988 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 86229011 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86229075 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 86229125 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 86229158 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 86229175 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86229359 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 86229776 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86229887 G C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86230540 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86230577 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 86230589 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86230723 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86230882 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 86230914 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86230991 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 86230996 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86231121 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86231177 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86231242 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86231517 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 86231545 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86231583 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 86231637 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 86231640 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86231650 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86231675 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86231864 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 86231869 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 86232117 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86232140 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86232285 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 86232354 A G Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 86232494 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 86232540 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 86232542 G C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 86232598 C A N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 86232615 A G Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 86232834 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86232998 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86233025 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86233097 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86233156 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86233944 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86233990 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86234204 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86234345 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86234503 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86234563 C A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86234701 T A Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 86234961 C G Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 86235088 A G Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 86235092 T C Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 86235138 A G Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 86235349 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86235477 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 86235508 C G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 86235568 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 86236013 C A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 86236570 A G Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 86236708 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86237883 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86237980 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86239284 G A Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 86239285 A G Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 86239377 T A N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 86239389 T G N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 86239391 T A N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 86240902 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86241141 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86241273 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 86241323 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86241759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86242256 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 86242590 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86242628 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86243327 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86243569 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86243830 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86243913 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86243990 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 86244108 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86244772 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86245196 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86245243 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86245303 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86245335 T G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86245337 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 86245443 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86245472 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86246274 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86246356 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 86246358 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86246568 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 86246619 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 86246937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86247180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86247209 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86247284 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86247465 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 86247945 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86248348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86248349 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86248521 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86248774 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86249035 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86249203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86249843 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86250588 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86251318 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 86251743 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86252580 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 86252602 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86253021 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 86254010 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 86254242 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 86254459 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86254738 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 86254817 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86254841 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86255963 A T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 86256089 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86256632 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86256654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86256658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86256805 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86256862 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86256914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86257380 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86257408 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86257980 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 86258025 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86258456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86259342 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86259343 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86259745 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 86260460 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86260523 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86260913 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86262438 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 86263736 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86263882 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86264066 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86264778 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86264999 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86266461 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86267277 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86267795 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 86267888 A G Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 86267895 A T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 86268589 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86269086 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86270118 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86271604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86271805 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86272239 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 86273229 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 86273389 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 86273588 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 86273961 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86273974 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86274083 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86274435 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86274511 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86274569 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86274593 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86274618 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86274818 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86275182 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 86275203 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86275244 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86275268 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86275398 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86275426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86275461 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86275506 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86275685 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86275852 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86275885 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86276060 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 86276075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86276086 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 86276112 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86276174 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86276196 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86276209 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86276299 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86276329 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86276534 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86276541 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86276557 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86276623 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86276785 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86276869 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 86277108 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86277172 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86277181 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 86277469 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 86277483 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86278150 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 86278285 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86278332 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86278411 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86278699 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 86278951 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 86278980 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86279022 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 86279146 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86279155 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86279256 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 86279331 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86279388 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86279475 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 86279747 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86279768 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86281029 T C Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0 1 0 16 16 0 16 0 2 86281038 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86281128 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86281143 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86281149 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86281154 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86281477 A T Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 86281563 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86281676 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86281998 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86282251 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86282269 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86282526 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86282576 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86283498 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 86283931 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 86284278 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86284281 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86284579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86284646 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 86284842 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 86284895 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86285018 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86285071 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86285434 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86285472 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 86285547 G C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 86285553 A T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 86285912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86285928 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 86285949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86286155 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86286242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86286283 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86286412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86286437 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86286467 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86286515 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86286620 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86286630 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86286653 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86286786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86286808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86286911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86287104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86287186 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86287240 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86287315 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 86287321 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86287338 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86287388 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86287552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86287795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86287843 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86288291 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86288446 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86288496 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86288504 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86289008 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 86289497 C G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 86289692 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86289993 A C N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 2 86290602 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 86290770 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 86290791 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 86290904 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 86291307 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86291355 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 86291391 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 86291821 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 86291926 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 86292385 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86292544 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 86292601 A T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 86292610 T A N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 86292814 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86293010 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 86293608 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86293782 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86293853 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 86293977 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 86293978 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 86294023 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 86294059 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86294077 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86294181 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 86294182 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 86294198 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 86294291 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86294311 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 86294341 T A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 86294380 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 86294404 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 86294469 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 86294503 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 86294575 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 86294582 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86294689 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 86294716 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86294800 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86294820 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 86294866 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 86295085 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 86295148 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 86295217 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 86295283 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 86295291 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 86295534 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 86295569 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 86295609 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86295622 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 86295657 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86295707 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86295757 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86295800 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 86295952 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 86295955 T G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 86296078 C T Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 2 86296084 G A Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 86296267 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 86296379 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 86296444 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86296447 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86296599 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86296786 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86297085 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 86297192 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 86297319 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 86297390 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86297490 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 86297638 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 86297670 C G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 86297948 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 2 86297965 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 86297969 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 86297989 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 86298169 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 86298318 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 86298371 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 86298383 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 86298460 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 86298475 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 86298623 A C N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 86298686 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 86298812 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 86298921 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 86299172 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86299205 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86299233 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 86299286 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 86299287 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86299328 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 86299526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86299553 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86299563 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 86299594 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 86299788 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 86300054 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 86300069 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 86300080 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 86300169 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 86300196 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 86300265 T C N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 86300396 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 86300399 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86300524 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 86300713 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 86301191 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86301339 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86301349 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 86301396 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86301430 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86301631 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86301692 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86301737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86301738 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 86301750 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86301980 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86301998 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86302432 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 86302517 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86302582 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 86302637 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86302704 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86302743 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86302804 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86302885 C A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86303081 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 86303342 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86303374 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86303455 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86303643 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86303682 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86303730 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86303807 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 86303952 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86304011 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86304174 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 86304384 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 86304534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86304999 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 86305096 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86305145 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 86305175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86305422 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 86305424 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 86305598 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86306438 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86306744 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86306768 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 86306775 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86306786 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 86306965 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86306975 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86307155 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 86307274 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86307575 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86307606 T G Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 86307774 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 86307901 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 86307956 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86308065 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86308093 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86308096 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86308129 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86308307 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86309087 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86309525 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86309756 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86309835 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86310078 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86310200 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86310251 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86310277 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86310287 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86310384 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86310410 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86310655 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86310678 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86310736 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86310783 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86310790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86310908 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86310944 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86311082 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86311096 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86311106 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86311164 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86311238 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86311303 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86311523 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86311658 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86311815 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86311859 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86312094 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86312130 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86312264 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86312338 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86312345 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86312580 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86312839 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86312914 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86312927 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86313054 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86313079 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86313151 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 86313315 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86313432 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86313617 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 86313801 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86313857 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86314197 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 86314418 C G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 86314422 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 86314447 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 86314454 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 86314462 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 86314565 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 86314612 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86314618 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86314656 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86314746 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86314835 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86314961 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 86315114 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 86315148 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 86315245 T G N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 86315334 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 86315370 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 86315866 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86315922 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86316158 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86316551 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86316609 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86316856 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86316881 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86316948 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 86316959 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 86316974 C G N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 86316983 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 86317065 C G N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 86317089 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 86317106 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 86317321 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 86317457 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 86317475 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 86317480 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86317627 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86317638 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86317639 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86317690 C A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 86317768 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86317812 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 86317923 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86317996 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86318055 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86318094 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86318105 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86318143 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86318260 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86318356 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86318424 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86318459 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86318563 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86318611 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86318662 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86318755 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86318821 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86318918 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86319152 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86319246 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 86319672 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 86319851 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86319867 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86320215 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86320396 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86320555 T G N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 86320987 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 86321057 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86321058 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86321351 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86321353 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86321415 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86321663 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 86322556 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86322724 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 86322787 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86322814 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 86323532 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86323889 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86324312 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 86324413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86324483 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86324971 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86325076 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 86325665 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86326416 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86327687 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 86327842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86328194 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86328240 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86328412 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 86328457 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 86329130 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 86329635 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 86330381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86330568 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86330780 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 86331302 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86331359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86331876 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86332005 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 86332325 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 86332341 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86332401 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 86332507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86332546 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86332858 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 86332992 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 86333242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86333310 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86333315 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86334374 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86334603 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86334828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86334879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86334961 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86335078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86335469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86335912 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 86336440 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86336753 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86336935 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 86336999 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86337013 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86337058 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 86337269 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86337516 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86337563 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86337832 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86338116 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86338202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86338217 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86338264 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 86338304 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86338546 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 86338585 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86338812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86338896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86339265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86339294 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86339315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86339324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86339485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86339565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86339594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86339736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86339738 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86339820 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86340026 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86340168 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86340202 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86340222 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86340493 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 86340643 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86341059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86341086 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86341267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86341488 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86341545 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86341635 T A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 86342032 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86342386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86342400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86342416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86343362 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86343427 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86343764 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86343798 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86343858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86343969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86344010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86344137 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86344547 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86344771 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86345115 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86345336 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86345381 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86345582 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86346365 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86346377 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86346403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86346431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86346969 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86347277 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 86347431 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 86347477 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 86348758 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 86348782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86348981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86349029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86349409 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86349770 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86350695 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86351167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86351459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86351469 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86351573 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 86351641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86351711 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86351820 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86351822 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86351832 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86351862 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86352003 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86352006 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86352016 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86352101 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86352158 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86352215 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86352233 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86352234 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86352290 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86352362 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86353155 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86353238 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86353263 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 86353354 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86353506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86354010 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86354093 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86354484 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86354715 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86354892 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86354930 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86354990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86355398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86355488 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86355667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86355691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86355798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86356195 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86356252 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86356262 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86356284 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86356329 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86356620 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86356638 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86357172 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 86357238 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86357291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86357489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86357752 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 86357979 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86358775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86359022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86359200 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 86359604 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 86359720 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86359999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86360091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86360201 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86360325 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86360727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86361140 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86361625 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86361767 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86361896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86361987 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86362285 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 86362399 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86363105 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 86363175 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86363701 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86363765 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86363776 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86364091 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86364719 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86364881 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86365024 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86365454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86365485 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86365663 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86365880 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86366819 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86366880 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86367071 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86367270 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86367460 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86367546 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86367815 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86368069 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 86368335 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86368362 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86368846 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86369036 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86369273 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86369303 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86369370 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86369572 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86369625 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86369753 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86369763 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86369777 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86369789 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86370062 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86370876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86370903 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86370945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86371131 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86371132 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86371158 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86371283 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86371284 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86371452 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86371489 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86371517 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86371721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86371920 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86371972 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86372389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86372781 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86373653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86373960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86375019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86375032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86375928 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86375933 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86375974 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86375988 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86376037 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 86376038 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 86376065 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86376119 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86376195 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86376236 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86376298 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86376778 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86376867 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86377154 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86377315 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86377563 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86377584 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86377608 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86377714 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86377723 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86377803 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86377926 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86377961 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86377970 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86378049 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86378174 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86378453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86378555 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86378924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86379017 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86379949 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86380725 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86380726 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86381392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86381505 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86381824 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86382456 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86382487 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86382490 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86383469 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86383648 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86383722 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86384088 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86384168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86384527 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86384804 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86384875 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86385028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86385267 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86385568 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86386136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86386951 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86387097 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86387557 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 86388503 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86388651 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86388741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86389574 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86389639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86389926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86390493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86391433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86391690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86391937 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86391972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86391986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86392293 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86392358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86392434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86392710 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86392968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86393027 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86393212 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86393669 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86393869 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86394614 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86394738 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 86395066 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86395103 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 86395156 A G N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 86395242 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86396127 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86396425 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86396582 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86396798 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86396937 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86397078 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86397302 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86397341 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86397391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86397742 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86397830 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86398588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86398880 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86399046 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86399218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86400553 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86400655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86400682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86400775 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86400804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86400958 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86400994 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86401073 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86401085 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86401105 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86401172 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86401319 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86401450 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86401458 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 86401479 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86401490 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86401575 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86401612 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 86401625 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86401637 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86401658 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86401783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86401857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86401858 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86401879 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86401936 C A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86404192 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86404208 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86404264 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86404314 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86404451 C A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 86404520 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86407012 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86407038 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86407048 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86407075 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86407108 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86407246 G T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86407310 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86407428 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86407433 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86407445 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86407516 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86407661 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86407662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86407707 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86407851 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86407856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86407863 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86407996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86408071 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86408134 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 86408163 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 86408325 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86408365 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86408611 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86408666 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86408680 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 86408726 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86408739 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86408973 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86409108 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 86409112 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 86409138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86409169 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86409763 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86409830 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86410131 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86410399 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86410423 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86410469 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86410573 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86410905 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 86410922 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86411985 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86411990 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86412284 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86412483 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86412798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86412989 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86413029 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86413178 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86413191 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86413229 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86413377 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86413452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86413462 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86413743 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86413781 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86413824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86413864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86413994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86414080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86414169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86414201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86414276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86414334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86414389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86414495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86414579 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86414833 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86414897 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 86414946 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 86414983 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86415017 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86415020 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86415087 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86415374 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86415585 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86415755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86416217 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86416254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86416409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86416464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86416653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86416757 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86416950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86417085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86417302 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86417430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86417515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86417528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86417670 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86417684 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86417762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86417769 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86418157 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86418280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86418316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86418496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86418645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86418785 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86418826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86418856 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86418909 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86418975 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86418978 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86419000 C A Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 2 86419001 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 2 86419183 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86419625 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86419812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86419987 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86419993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86420394 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86420411 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86420806 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86420933 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86420963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86420965 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86420997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86421075 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86421083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86421156 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86421224 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86421227 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86421386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86421463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86421490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86421491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86421912 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86422012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86422035 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86422125 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86422142 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86422203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86422315 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86422551 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86422597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86422610 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86422625 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86422643 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86422653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86422664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86422672 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86422829 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86423058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86423102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86423425 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86423482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86423553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86423804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86423996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86424202 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86424203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86424245 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86424603 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86424622 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86424662 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86425039 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86425110 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86425148 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86425226 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86425524 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86425817 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86429253 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86430014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86430407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86430459 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86431480 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86431649 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86432386 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86432860 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86433233 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86433430 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86433649 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86435006 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 86447770 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86449531 T A Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 86449532 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 86458703 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86458719 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86459298 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 86461073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86461074 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86461561 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86462100 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86462432 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86462489 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86462949 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86464106 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86464573 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 86464952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86464997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86465042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86465043 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86465320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86466008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86466202 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86466222 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86466441 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86466494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86466586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86467707 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86468261 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86469110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86469169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86470173 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86470238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86470262 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86470919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86471755 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86472160 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86472247 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86473148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86473370 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86474504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86474927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86475112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86475238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86476487 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86476948 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86476965 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86477277 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86477494 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86477930 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86478041 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86478464 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86478755 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86479565 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86479876 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 86479979 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86480862 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86481487 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86482619 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86484335 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86484395 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86485149 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86485418 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86487953 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 86490969 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 86491102 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86491132 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86491333 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 86491417 T G Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 86491658 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86491976 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86492131 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86492487 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86492594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86492909 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86493116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86494205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86494306 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86494670 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 86496295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86496841 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 86496952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86497840 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 86498257 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 86498265 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 86498335 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 86499550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86500171 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86501551 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86502419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86503554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86504261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86504926 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86505703 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86506750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86507034 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86507276 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86507308 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86507538 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86507843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86508688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86509086 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86509123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86509713 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86510229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86511282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86511459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86512255 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86513031 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86513859 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86514957 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86515865 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86517587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86518181 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86519728 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86520314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86520792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86521373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86521817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86521866 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86522606 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86523232 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86523519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86523605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86523783 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86524928 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86525006 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86526756 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86526801 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86526957 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86527512 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86527927 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86528104 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86528456 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86528988 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86530792 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86531225 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86531600 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86531818 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86531822 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86532179 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86532461 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86532542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86532753 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86532924 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86532937 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86533007 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86533023 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86533081 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86533269 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86533390 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86533430 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86533490 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86533577 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86533685 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86533696 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86533726 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86533784 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86533865 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86533923 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86534041 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86534210 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86534217 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86534239 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86534250 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86534370 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86534388 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86534560 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86534630 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86534644 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86534660 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86534744 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86534751 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86534887 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86534903 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86534913 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86535013 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86535102 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86535108 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86535142 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86535153 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86535246 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86535389 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86535398 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86535713 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86535733 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86535782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86535806 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86535825 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86535874 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86535962 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86535993 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536127 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536128 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536156 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536220 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86536247 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536261 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536285 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536304 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536380 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536445 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536535 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536570 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536576 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536592 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536612 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536630 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86536663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86536818 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86536830 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86536840 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86536888 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86537004 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86537064 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86537067 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86537169 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86537258 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86538195 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86538491 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86538621 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86538973 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86538980 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86539116 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86539164 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 86539223 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86539268 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86539271 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86539400 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86539495 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86539529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86539629 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86539640 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86539677 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86539822 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86539865 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86539931 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86539936 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86540001 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86540072 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86540074 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86540132 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86540151 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86540169 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86540170 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86540201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86540302 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86540502 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86540555 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86540597 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86540615 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86540617 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86540706 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86540748 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86540860 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86540925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86540965 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86541000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86541114 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86541154 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86541179 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86541253 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86541364 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86541399 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86541518 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86541534 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86541552 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86541635 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86541636 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86541709 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86541721 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86541732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86541995 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86542199 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86542424 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86542549 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86542579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86542638 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86542774 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86542923 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86542933 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86542969 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86543008 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86543101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86543117 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86543131 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86543284 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86543298 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86543324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86543466 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86543519 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86543555 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86543688 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86543722 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86543807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86543816 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86543824 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86543886 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 86543887 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 86543940 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86543971 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86544074 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86544081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86544240 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86544282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86544310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86544590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86544792 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86544815 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86545061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86545132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86545350 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86545385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86545394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86545424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86545546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86545602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86545668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86545727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86545737 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86545752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86545769 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86545814 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86545841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86545864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86546001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86546052 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86546204 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86546262 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86546415 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86546594 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 86546609 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 86546657 C T Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 86546806 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86547079 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86548798 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86549393 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86549548 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86550338 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86551241 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86551646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86552776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86552962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86553040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86553647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86553868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86554302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86554303 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86556638 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86556991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86557170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86557846 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86558090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86558792 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86558872 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86559209 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86559468 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86560029 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86560155 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86560175 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86561057 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86561502 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86562239 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86562453 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86562484 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86562855 A T Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 86563106 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86563264 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86563345 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86563443 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86563521 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86563737 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86564150 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86564162 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86564295 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86564399 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86564712 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86564759 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86565121 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86565251 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86565459 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86565608 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86566088 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86566136 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86566228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86566263 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86566316 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86566437 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86566478 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86566561 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86567006 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 86567162 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86567189 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86567222 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86567329 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86567499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86567556 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86567648 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86567663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86567782 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86567957 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86568071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86568176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86568389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86568632 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86568771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86568960 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86569002 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86569244 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86569419 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86569655 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86569822 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86570170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86570190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86570297 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86570414 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86570578 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86571028 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86571052 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 86571601 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86572111 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 86572722 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86573403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86573691 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86578812 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86579261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86579579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86580063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86580658 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86580819 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86581430 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86581581 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86581843 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86584934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86585086 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86586265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86586537 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86587752 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86587996 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 86588950 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86588988 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86590072 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86590159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86592945 A C N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 86593595 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86595284 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86596206 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86596503 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86597142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86597547 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86598914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86599748 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86599782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86601587 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 86601871 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86602083 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86602367 G T Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 86602407 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 86603845 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86603846 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86604003 T C Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 86604447 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86605311 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86605786 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86606048 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86606221 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86607160 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86608036 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86609671 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86610502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86611464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86611968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86613153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86615847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86616556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86616797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86616828 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86617149 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 86617804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86617927 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86618541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86619009 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86619332 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86619474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86620114 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86620422 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86620817 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86621061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86621382 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86622619 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86624319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86625367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86627719 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86627725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86628778 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86628812 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86630560 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86632833 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86633218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86635431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86635486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86635527 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86636082 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86637066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86637578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86640237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86640467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86640923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86642326 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86642690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86643144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86643348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86643667 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86644889 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86647900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86648368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86649120 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86649140 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86650903 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86652317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86652759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86657245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86657528 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 86658091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86659078 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86659217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86659292 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86659513 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86659587 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86660338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86660499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86661153 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86663268 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86665025 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86665086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86665366 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86665788 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86665982 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86666863 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86666917 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86667270 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 86667492 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86667817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86668674 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86669399 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86669402 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86671101 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86671481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86672054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86672164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86672208 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86672246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86673180 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 86673275 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 86673623 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 86673718 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 86674012 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86674514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86674634 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86674652 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86674674 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86674717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86675183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86675192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86676002 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86676677 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86677079 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86677243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86678198 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86678705 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86678763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86679860 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86680436 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86680471 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86680493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86681832 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86682360 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 86682372 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 86691400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86692834 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86693322 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86693821 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 86694294 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86694535 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86694791 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86694832 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86694869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86694932 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86695701 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86695756 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86696281 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86696722 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86697191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86697208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86697664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86697836 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86697983 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86698160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86698306 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86698513 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86698601 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86698746 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86698818 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86699025 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86699063 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86699496 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86699552 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86699670 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86699737 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 86699739 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 86699943 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86700281 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86700337 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86700556 T A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 86700658 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86700668 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86700684 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86700755 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86701015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86701101 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86701282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86701292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86701433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86701668 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86701683 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86701710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86701776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86701838 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86701994 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86702450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86702460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86703103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86703418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86703455 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86703588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86703903 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86704037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86704381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86704454 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86704491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86705223 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86705987 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86706087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86706404 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86707351 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86707408 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86707546 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 86707696 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86708104 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86708213 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86708378 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86708799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86708806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86708810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86708821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86708924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86709314 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86709460 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86709618 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86709740 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86709814 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86709863 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86709877 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86709950 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86710033 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86710195 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86710518 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86710609 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86710610 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86710627 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86710646 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86710741 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86710845 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86710891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86711024 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86711353 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86712066 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86712205 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86712395 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86712714 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86712812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86712964 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86713198 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86713363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86713951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86714443 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86714713 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86715623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86715641 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86716979 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86717551 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86717556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86717664 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86717830 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86718041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86718322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86718351 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86718847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86719013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86719263 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86719721 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86720762 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86721064 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86721065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86721845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86722302 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86722361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86722462 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86722816 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86723070 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86723093 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86723458 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86724004 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86724292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86724908 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86725146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86725546 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86725593 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86725798 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86725997 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86726008 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86726200 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86726267 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86726306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86726413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86726679 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86726972 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86727667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86727723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86728755 G A N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 86728957 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 86729157 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86729389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86729493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86729564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86729647 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86729709 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86729779 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86730039 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86730863 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86731315 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86731551 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 86731705 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86731706 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86731757 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86731897 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86732752 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86732782 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86733296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86733297 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86733379 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86733457 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86734523 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86734796 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86735950 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86736173 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 86736319 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86736816 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86737874 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86737895 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86738438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86739334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86739407 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86739556 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86739597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86740256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86740325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86740526 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86740739 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 86740755 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86740886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86742057 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86742548 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86742764 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86742835 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86743914 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86743981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86744931 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86746085 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86746635 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86747861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86747867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86747945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86748209 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86748814 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86749212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86749563 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86749608 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86749970 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86750169 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86750216 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86750390 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 86750786 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86751296 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86751410 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86751823 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86751999 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86752026 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86752959 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 86753035 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86753257 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86754382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86754403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86755216 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86755289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86755797 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86755941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86756880 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86757389 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86757407 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86758233 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86759496 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86759502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86759989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86760502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86760575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86761506 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86762558 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86762924 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 86763042 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86763637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86763640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86763883 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86764093 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86764607 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86765679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86765899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86766021 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86767928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86767961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86768057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86768073 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86768132 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86768352 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86768551 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86770184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86770294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86770983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86772882 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86773178 G A N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 2 86773892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86773895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86773950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86774118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86774910 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86775203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86775206 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86776269 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86776349 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86776363 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86776456 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86776754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86776834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86776847 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86777110 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 86777272 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 86777488 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86777560 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86777959 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 86778135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86778238 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86778443 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86778555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86778737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86779080 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86779086 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86779190 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86779485 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86779754 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86779766 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86779771 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86780238 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86780349 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86780814 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86780853 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86781271 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 86781708 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 86781727 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86781851 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 86781939 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86782084 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 86782272 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86782338 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86782340 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86782448 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86782505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86782713 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 86782908 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86783004 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86783083 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86783170 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86783178 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86783466 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 86783593 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 86783812 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 86783910 A C Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 86783987 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86784249 G A Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 86784263 G T Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 86784576 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 86784800 C G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86785070 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86785196 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86785203 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86785229 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86785263 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86785470 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86785471 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86785597 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 86785717 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 86785728 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 86785813 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86785822 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86785915 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86786084 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86786261 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86786670 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86786900 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86786945 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86787161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86787185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86787232 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 86787294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86787629 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 86787634 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86787853 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86788508 G C Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 86788624 T G Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 86788761 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86789226 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86789529 T A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 86789531 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86789642 G C Y N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 2 86789661 C G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86789737 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86789759 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86789966 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86790167 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86790284 A C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 86790545 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86790684 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 86790919 C G Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 86791013 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 86791440 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 86791470 G T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86791497 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86791543 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86791669 C A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86791692 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 86791713 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86791830 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 86792004 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86792497 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86792530 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86793313 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86793361 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86793473 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86793576 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86793682 T G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 86793848 A T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 86793882 T G Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 86794273 C G Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 86794297 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 86794408 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86794561 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86794660 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 86794709 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86794740 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 86794748 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 86794773 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 86794805 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 86795075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86795123 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86795584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86795651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86796086 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86796283 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86796464 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86796493 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 86797716 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86798089 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86798148 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86799788 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 86800043 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86800295 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86800829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86801021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86801638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86801648 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86803947 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86804059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86805923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86805927 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86806007 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86806537 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86806917 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86807998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86808468 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86808556 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86809153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86809453 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86809779 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86811154 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 86811157 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86811244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86811430 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86811678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86811747 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86811752 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86812134 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86812523 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86812655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86812663 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86813158 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86813230 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 86814191 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86814425 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86814442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86815064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86815254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86815466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86815648 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86815757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86815950 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86816329 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86816930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86818745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86818948 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86818958 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86818963 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86819006 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86819671 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86820792 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 86821909 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86822102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86822558 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86822599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86827063 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86827187 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86829137 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86829264 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86830401 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86830572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86830590 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86830886 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86830898 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86830913 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86831475 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86832207 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86832295 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86832497 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86832593 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 86832813 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86832817 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86832979 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86833391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86833434 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86833483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86833546 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86833830 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 86833864 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 86833887 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 86833890 G C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 86833907 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86833912 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86833934 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 86833993 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 86834052 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86834204 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 86834382 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 86834385 C T Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 86834406 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 86834479 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86835674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86835689 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86835858 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 86835893 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 86835954 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86835991 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86836072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86836170 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86836449 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86836479 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86836626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86836760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86836786 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86836900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86836962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86837073 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86837180 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86837219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86837230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86837332 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86837495 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86837630 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86837681 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86838402 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86839195 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 86839299 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86839651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86839801 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86839866 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86840027 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86840517 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86840590 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86840655 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86840989 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86841065 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86841130 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86841171 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86841369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86841443 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86841817 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86842058 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86842142 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86842163 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86842411 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86842478 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86842532 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86843163 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86843275 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86843418 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86843556 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86843748 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86843843 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 86843995 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 86844291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86844318 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86844324 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86844394 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86844774 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86844969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86845055 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86845121 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86845149 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86845155 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86845213 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86845395 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 86845440 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86845607 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86845941 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86846027 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 86846243 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86846306 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86846882 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86846926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86847065 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86847469 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 86847596 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 86847611 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86847756 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 86847783 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86847792 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86848566 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86848939 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86849085 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86849207 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 86849225 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 86849533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86849634 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86849736 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86849768 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86849779 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86849817 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86850072 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86850526 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86850855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86850936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86850940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86850948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86851012 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86851132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86851506 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86851528 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86851561 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86851991 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86852408 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86852607 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86852651 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86852764 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86852810 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86852889 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86853420 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86853502 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86853505 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86853641 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86853928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86854240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86854287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86854485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86854548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86854919 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86854961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86855340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86855370 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86855545 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86855656 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86855783 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86855861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86856081 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86856396 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 86856677 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86857332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86857416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86857728 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86857782 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86857957 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86858228 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86858308 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86858356 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86858501 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86858750 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86859145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86859772 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86859831 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86860095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86860142 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86860765 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86860786 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86860929 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86861384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86861698 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86861717 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86862456 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86862739 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86863062 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86863170 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86863198 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86864128 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86864409 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 86864629 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86864653 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86864782 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86864901 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 86865155 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 86865265 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86865279 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86865321 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86865674 T A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 86866467 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86866883 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86867175 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86867634 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86867711 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86867725 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86867768 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 86867809 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86867837 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86867848 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86867931 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86867981 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 86868012 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 86868026 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 86868073 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86868219 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86868351 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86868377 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86868442 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86868496 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 86868503 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86868516 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86868582 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86868641 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86868661 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86868676 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86868705 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86868714 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86868734 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86868851 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86868879 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86868943 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86868975 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86868994 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 86869124 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86869162 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86869193 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86869215 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86869246 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86869251 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86869260 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86869285 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86869311 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86869397 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86869407 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86869543 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 86869822 C T Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 86869859 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 86869864 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 86869931 T G N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 86869967 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 86870009 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86870179 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870191 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870255 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870261 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870378 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86870508 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870601 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870621 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870694 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86870783 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870795 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870816 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870866 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86870878 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870881 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870902 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86870930 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86870940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870950 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86870952 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86871010 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871019 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871062 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86871114 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86871144 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871165 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871228 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86871244 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86871255 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86871268 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86871314 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86871367 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86871390 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86871391 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 86871419 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86871429 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871445 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871496 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871525 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86871534 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86871580 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 86871607 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86871635 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871646 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871659 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871739 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86871774 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86871903 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86871931 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871938 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871963 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86871967 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86871984 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86871998 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86872026 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86872032 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86872038 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86872155 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86872193 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86872205 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86872209 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86872217 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 86872244 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86872381 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86872413 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86872418 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86872438 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86872528 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86872577 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86872673 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86872683 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86872706 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 86872764 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 86872945 A C Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 86872964 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86873010 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86873017 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 2 86873070 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86873360 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86873552 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86874092 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86874452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86874543 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86875137 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 86875385 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86877799 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86877842 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86877860 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86877945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86877999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86878263 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86878295 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86878422 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86878426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86878442 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86878549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86878654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86878705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86878755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86878814 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86878817 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86878839 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86878882 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86878907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86879084 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86879103 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86879117 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86879192 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86879216 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86879219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86879232 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86879283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86879387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86879480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86879611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86879808 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86879822 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86879863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86880103 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86880124 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86880155 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86880241 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 86880243 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 86880269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86880325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86880351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86880364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86880489 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86880555 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86880606 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86880644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86880680 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86880755 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86880762 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86880781 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86880859 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86880992 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86881164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86881270 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86881394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86881512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86881591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86881625 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86881633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86881795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86881951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86882034 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86882138 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 86882140 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 86882181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86882285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86882694 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86882767 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86882971 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 86883167 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 86883226 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 86883232 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86883455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86883562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86883591 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86883783 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86883815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86883994 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86884044 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86884050 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86884202 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86884278 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86884491 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86884510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86885049 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86885081 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86885086 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86885354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86885361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86885541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86885803 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86886147 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86886155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86886312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86886360 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86886462 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86886520 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86886694 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86887048 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86887313 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86887531 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86887730 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86887952 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86888188 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 86888315 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86888366 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86888627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86888999 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86889522 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86889775 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 86889839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86889977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86890047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86890225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86890521 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86890593 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 86890775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86890826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86890890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86891043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86891046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86891327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86891350 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86891481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86891569 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86891632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86891657 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86891874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86892464 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86892602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86892795 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86892811 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86893263 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86893269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86893309 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86893379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86893448 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86893604 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86893733 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86893790 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86894052 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86894159 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86894477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86894638 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86894807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86894886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86894961 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86895062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86895119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86895258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86895297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86895877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86896157 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86896292 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86896328 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86896858 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86897048 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 86897051 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 86897104 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 86897226 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86897402 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86897418 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86897577 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86897719 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86897812 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86897867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86897933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86897941 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86897981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86898126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86898469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86898654 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86898970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86899150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86899318 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86899337 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86899554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86899847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86899888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86899902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86899966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86900026 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86900161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86900200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86900284 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86900615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86900767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86901509 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86901593 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86901640 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86901799 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86901851 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86901876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86902173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86902355 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86902442 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 86902546 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86903018 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86903046 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86903097 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86903108 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86903265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86903301 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86903579 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86903783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86903940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86904193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86904302 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86904320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86904327 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86904368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86904393 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86904405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86904518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86904535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86904697 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86904908 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 86905267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86905468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86905897 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86905917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86905989 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86906121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86906134 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86906373 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86906872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86907142 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86907475 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86907596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86908168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86908444 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86908562 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86909289 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86909598 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86909994 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 86910131 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 86910218 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86910719 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86911108 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86911121 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86911261 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86911709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86911771 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86912268 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86912383 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86912413 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86912541 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86912624 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86912748 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86912846 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86912973 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86913199 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86913211 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86913315 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86913372 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86913518 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86913595 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86913605 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86913762 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86913822 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86913871 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86914254 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86914283 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86914303 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86914453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86914768 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86914788 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 86915122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86915145 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86915326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86915348 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86915371 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86915507 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 86915596 A C N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 86915600 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 86915745 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86915858 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 86915865 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 86915940 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 86916085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86916097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86916213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86916616 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86916643 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86916764 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86916900 G T N N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 86917223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86917508 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86917544 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86917575 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86917593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86917698 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86917700 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86917813 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86917827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86917866 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86917932 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86918021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86918077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86918413 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86918486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86918637 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86918654 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86918797 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86918811 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86918887 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86918945 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86918955 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86918972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86919069 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86919095 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86919125 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86919341 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86919425 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86919566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86919675 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86919684 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86919725 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86919783 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86919796 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86919826 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86919923 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86919963 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86920136 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86920204 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86920398 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86920540 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86920589 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86920678 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86920909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86921116 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86921206 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86921219 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86921241 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86921339 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86921364 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86921472 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86921495 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86921502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86921590 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86921653 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86921725 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86921783 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86921808 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86921868 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86921905 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86921996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86922265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86922423 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86922504 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86922505 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86922935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86922954 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86922967 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86922979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86923106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86923217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86923491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86923531 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86923532 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86923559 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86923622 C G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 86923914 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86924149 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86924321 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86924351 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86924773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86924846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86924882 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86924919 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86925449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86925542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86925899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86926044 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 86926058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86926178 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86926281 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86926405 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86926418 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86926622 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 86926626 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 86926810 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86927165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86927225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86927434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86927505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86927548 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86927573 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86928082 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86928231 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86928268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86928371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86928381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86928576 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86928933 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86929886 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86929918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86930105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86930116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86930146 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86930165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86930279 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86930359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86930384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86930417 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86930420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86930688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86930817 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86931006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86931055 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86931163 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86931560 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86931599 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86931797 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 86931837 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 86931950 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86932124 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 86932442 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86932449 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86932490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86932612 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86932779 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86932797 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86932896 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86933189 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86933936 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86933944 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 86933980 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86934037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86934238 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86934251 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86934313 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86934331 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86934375 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86934381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86934399 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86934433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86934577 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86934665 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86934702 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86935096 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 86935156 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86935403 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86935514 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86935582 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86935656 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 86935665 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 86935766 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86936197 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86936251 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86936293 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86936385 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86936464 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86936590 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86936737 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86936879 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86936934 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86937096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86937171 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86937290 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86937497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86937549 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86937652 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86937673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86937694 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86937722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86937770 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86937842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86937931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86938046 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86938183 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86938189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86938223 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86938296 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86938317 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86938382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86938540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86938804 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86938840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86938915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86939007 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86939109 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86939264 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86939345 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86939953 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86939993 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86940130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86940189 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86940245 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86940411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86940540 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 86940813 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 86941034 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86941148 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86941169 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86941203 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86941530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86941651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86941718 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86941719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86941814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86941936 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86941962 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86942074 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86942115 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86942159 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 86942586 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86942592 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86942672 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86942708 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86942735 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86942752 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 86942755 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86943333 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86943843 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 86944177 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 86944693 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 86944794 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86944991 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86945500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86945627 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 86945638 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 86945980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86946302 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86946307 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86946476 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86946758 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86946785 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86946791 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86946875 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 86946929 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86946976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86947107 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86947252 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86947478 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 86947542 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 86948288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86948402 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86948533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86948681 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86948725 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86948889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86949182 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 86949242 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 86949807 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86949835 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86949912 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86949952 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86949999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86950269 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86950604 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86950659 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86950747 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86950879 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 86951142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86951346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86951451 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86951476 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86951587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86951785 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 86952060 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86952142 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86952204 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86952273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86952506 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 86952534 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 86952610 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 86952638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86952682 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86952700 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 86953029 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 86953030 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 86953290 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 86953337 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 86953356 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86953357 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 86953404 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86953637 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 86953684 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86953733 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 86953769 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 86953806 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 86953814 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 86953967 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 86954192 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 86955173 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86955214 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86955799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86956066 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86956100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86956393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86956899 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86956974 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86957008 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86957153 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86957308 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 86957334 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86957600 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86957689 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 86957707 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 86957874 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 86958483 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86958795 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86959089 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 86959117 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 86959244 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 86959914 T C Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 86960236 G T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86960258 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 86960355 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 86960444 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86960555 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86960758 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86960843 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86961058 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86961086 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86961796 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86961823 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86962178 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86962186 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86962254 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86962477 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 86962697 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 86962806 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86962836 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86963044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86963084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86963365 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86963560 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 86963938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86965183 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86965220 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86965246 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86965256 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86965283 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86965286 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86965427 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86965483 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86965573 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86965576 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86965590 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86965635 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86965739 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86965784 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86965825 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86965839 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86965886 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86965895 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86966066 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86966152 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86966160 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86966168 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86966272 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86966314 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86966331 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86966510 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86966519 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86966540 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86966633 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86966702 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86966791 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86966910 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86966911 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 86966946 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86967158 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 86967635 T A Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 86967781 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 86967809 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86967864 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86967929 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86967972 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86968229 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86968345 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86968439 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86968759 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86968796 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86968971 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86969012 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86969030 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86969124 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86969145 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86969146 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86969168 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86969222 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86969404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86969428 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 86969594 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86969717 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86969741 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 86969766 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86969793 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86969822 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86969930 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86969981 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86970018 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86970034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86970056 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86970084 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 86970257 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86970259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86970351 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86970354 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86970369 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86970478 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86970537 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86970689 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86970727 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86970744 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86970890 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86970928 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86971017 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86971022 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86971106 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86971144 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 86971160 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86971206 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86971230 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86971336 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86971352 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86971360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86971403 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86971651 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86971841 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86971869 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86971888 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86971900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86971906 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86972021 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86972077 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86972104 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86972160 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86972186 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 86972634 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86972755 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86973019 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86973023 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86973038 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86973095 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86973124 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86973322 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86973369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86973508 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86973555 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86973611 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86973811 T G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 86973821 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 86973864 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 86973917 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86973934 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86974000 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 86974095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86974277 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86974411 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86974470 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86974478 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86974496 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 86974517 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86974695 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86974766 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86974829 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 86974853 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86974855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86974874 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 86974876 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86974885 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86974896 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86974920 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86974935 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86974990 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 86975068 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 86975143 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 86975219 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86975225 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 86975442 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 86976645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86977390 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86979045 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86979060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86979288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86979295 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86979712 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86980176 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86980380 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86980775 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86981669 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 86981765 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86981860 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 86982068 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86982948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86983457 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86989420 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 86989519 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86989711 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 86992574 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 86996670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 86996754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86997187 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 86997431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 86999340 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87002635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87003404 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87003405 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87006043 T C Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 87006111 T C Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 87006201 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 87006416 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87006510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87006579 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 87006882 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 87008675 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87009158 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 87009240 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87009515 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87009805 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87010255 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87010466 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87011186 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87011378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87011451 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87011938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87011997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87012470 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 87013032 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 87013708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87014310 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87015400 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87015992 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87016207 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 87016339 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87016602 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87017285 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 87017994 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87018676 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87019028 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 87019254 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87020018 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87020091 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87021300 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87021939 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87022756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87023355 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87024769 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87025065 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 87026265 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 87026567 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 87026767 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87027108 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 87027237 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87027471 C G N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 87027477 C G N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 87027483 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87027524 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 87027734 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87028654 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87028698 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87028809 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87029641 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87030842 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 87032716 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87033044 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87033947 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 87035287 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87035485 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87035756 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 87036115 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87036391 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 87036413 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87036498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87036549 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87036591 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87036652 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87036689 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87037443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87037962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87037975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87039323 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87039360 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87039710 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87041928 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87042697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87042725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87043277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87045334 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87047115 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87047959 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87047993 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87048187 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87049599 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87049798 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87049993 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87050136 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87051372 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 87052053 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87052893 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 87053244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87054056 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87054329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87055082 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87055132 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87057705 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87058325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87058460 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87059328 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 87059393 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87060009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87061570 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 87061807 A G Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 87068357 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87068363 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87068408 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87068419 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87068443 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87068470 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87068486 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87068611 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87068647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87069247 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87069281 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87069347 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87069394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87069412 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87069551 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87069571 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87069611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87069723 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87069744 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87069757 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87069763 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87069817 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87069818 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87069830 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87069857 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87069905 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87069916 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87070009 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87070024 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87070030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87070042 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87070086 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87070098 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87070150 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87070155 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87070377 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87070379 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87070475 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87070631 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87070696 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87070727 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87070729 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87070771 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87070780 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87070843 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87070921 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87070970 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87071048 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87071190 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87071318 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87071332 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87071373 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87071423 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87071711 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87071736 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87071834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87073067 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87073157 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87073185 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87073219 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87073232 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87073334 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87073339 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87073353 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87073417 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87073452 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87073558 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87073561 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87073655 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87073805 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87073890 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87074039 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87074132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87074201 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87074232 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87074282 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87074300 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87074433 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87074434 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87074449 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87074456 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87074598 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 87074627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87074846 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87074967 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87074976 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87075090 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87075245 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87075514 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87075583 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87075748 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87075849 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87075887 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87075902 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87075997 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87076114 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87076118 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87076159 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87076209 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87076278 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87076404 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87076535 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87076537 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87076605 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87076658 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87076695 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87076705 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87076990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87077116 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87077119 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87077150 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87077154 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87077433 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87077445 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87077560 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87077628 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87077648 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87077730 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87077743 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87077778 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87077842 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87077843 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87077913 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87077992 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87077999 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87078082 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87078091 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87078096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87078141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87078154 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87078155 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87078321 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87078730 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87078760 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87078785 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87078905 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87079108 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87079195 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87079198 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87079250 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87079276 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87079372 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87079486 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87079500 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87079648 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87079942 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87080026 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87080085 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87080102 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87080159 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87080231 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87080328 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87080530 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87080636 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87080672 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87080798 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87080892 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87080956 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87080997 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87081047 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87081172 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87081350 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87081400 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 87081572 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87081707 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87081741 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87081744 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87081881 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87081986 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87081999 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87082144 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87082150 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87082164 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87082183 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87082355 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87082455 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87082500 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87082773 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87082863 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87083185 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87083439 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87083456 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87083488 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87083594 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87083664 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87083871 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87083877 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87084018 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87084114 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87084140 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87084141 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87084222 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87084257 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87084367 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87084480 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87084666 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87084685 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87085082 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87085123 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87085124 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87085151 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87085176 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87085427 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87085439 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87085448 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87085451 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87085496 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87085529 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87085929 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87085944 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87085970 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87085978 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87085986 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87086057 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87086069 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87086078 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87086117 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87086128 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87086211 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87086272 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87086279 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87086385 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87086484 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87086499 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87086515 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87086554 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87086678 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87086771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87086772 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87086835 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87086839 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87086905 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87086927 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87086979 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87087146 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87087172 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87087413 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87087417 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87087459 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87087509 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87087552 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87087593 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87087597 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87087734 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87087759 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87087904 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87088163 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 87088356 A T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 87088381 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 87088394 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 87088419 T G N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 87088425 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 87088540 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87088541 G A N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 87088699 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87088724 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87088752 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87088803 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87088808 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87088879 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87088892 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87088905 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87088917 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87089058 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87089059 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87089129 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87089152 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87089153 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87089421 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87089449 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87089550 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87089800 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 87089870 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87090073 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87090081 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87090107 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87090369 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 87090548 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 87090627 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87090708 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87090756 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87091009 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87091153 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87091217 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87091260 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87091311 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87091384 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87091427 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87091444 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87091451 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87091626 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87092160 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87092512 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87092532 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87092932 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87092986 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87093275 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87093284 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87093569 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87093742 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 87093880 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87093900 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87094010 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87094064 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87094348 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87094368 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87094422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87094523 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87094589 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87094625 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87094752 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87094769 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87094819 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87094861 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87094974 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87095248 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87095284 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87095360 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 87095377 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87095410 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87095492 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87095688 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87095814 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87095871 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 87096184 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 87096291 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87096411 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87097157 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87097736 C G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 87097742 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87097848 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87097917 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87097970 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87097983 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87098088 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87098479 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 87098595 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87098851 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87098932 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87099018 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87099323 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87099331 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87099469 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87099739 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87099796 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87099931 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87099943 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87100001 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87100075 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87100100 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87100108 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87100200 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87100228 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87100280 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87100621 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87100741 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87100841 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87101047 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87101165 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87101192 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87101331 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87101378 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87101388 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87101414 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87101428 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87101495 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87101708 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87101723 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87101734 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87101803 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87101810 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87101839 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87101908 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87101962 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87101995 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87102001 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87102259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87102429 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87102524 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87102564 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87102666 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87102714 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87102863 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87103246 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87103401 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 87103463 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87103489 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87103554 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 87103614 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 87103702 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87104031 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87104060 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87104374 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87104423 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87104437 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87104457 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87104950 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87104978 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87105162 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87105188 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87105258 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87105317 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87105403 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87105472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87105723 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87105764 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87105920 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87106221 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87106389 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87106425 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87106501 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87106515 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87106810 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87106837 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87106852 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87106916 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87107088 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87107182 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87107497 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87107581 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87107652 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87107686 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87107761 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87107905 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87108182 A C N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 87108235 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 87108390 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87108555 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87108579 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87108732 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87108774 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87108870 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87108946 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87108965 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87109134 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87109172 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 87109292 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87109415 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87109792 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87109931 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87110012 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87110431 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 87110452 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 87110608 T C N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 87110896 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 87110951 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 87111019 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 87111271 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 87111327 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 87111409 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87111476 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 87111554 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 87111597 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 87111617 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87111619 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87111816 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87111819 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87111874 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87111893 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87111923 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87111965 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87112116 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87112160 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87112253 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87112366 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87112643 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87112695 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87112863 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87112866 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87112897 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87112923 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87113097 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87113182 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87113274 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87113276 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87113449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87113453 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87113705 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87113790 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 87114018 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87114360 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87114442 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87114524 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 87114590 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87114626 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87114722 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87114773 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87114908 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87114930 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87115042 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87115057 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87115109 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87115179 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87115283 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87115287 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87115349 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87115501 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87115682 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87115687 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87115717 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87115741 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87115824 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87115972 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87116031 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87116187 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87116208 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87116220 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87116251 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87116273 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87116412 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87116450 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87116493 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87116505 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 87116512 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 87116633 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87116729 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87116743 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87116767 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87116786 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87116795 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87116818 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87116856 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87117050 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87117106 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 87117116 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87117256 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87117281 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87117298 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87117326 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87117380 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87117477 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87117478 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87117575 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87117576 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87117640 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87117651 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87117669 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87117841 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87117853 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87117882 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87117885 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87117936 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87117993 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87117998 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87118015 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87118073 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87118097 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87118270 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87118302 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87118322 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87118346 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87118361 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87118368 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87118376 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87118400 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87118412 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87118458 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87118471 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87118476 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87118511 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87118513 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 87118529 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87118554 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87118567 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87118658 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87118699 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87118887 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87118923 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87119013 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87119067 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87119129 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87119169 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87119191 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 87119199 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87119206 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 87119448 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87119584 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87119623 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 87119645 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87119654 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87119749 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87119755 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87119767 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87119792 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87119802 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87119820 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87119840 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87120009 G C Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 87120021 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 87120070 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 87120107 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 87120119 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 87120131 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 87120133 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 87120145 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 87120177 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 87120187 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 87120188 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 87120243 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 87120249 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87120297 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87120404 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87120425 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87120469 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87120542 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87120552 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87120606 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87120809 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87120837 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 87120879 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87120884 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87120931 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87120932 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87120948 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87120954 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87120961 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 87120970 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87120978 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87121083 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87121091 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87121099 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 87121116 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 87121121 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 87121259 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 87121274 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 87121277 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 87121296 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 87121398 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 87121410 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 87121554 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87121590 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87121628 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87121633 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87121706 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87121722 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87121729 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87121775 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 87121938 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87122005 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87123135 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87123343 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 87123388 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 87123440 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87123471 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87123481 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87123535 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 87123546 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 87123595 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 87123697 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 87123743 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87123747 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87123833 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87123876 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87123881 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87124046 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87124050 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87124074 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87124117 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87124130 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87124147 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 87124152 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87124169 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 87124186 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 87124279 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87124282 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 87124313 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 87124472 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87124481 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 87124556 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 87124604 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87124802 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87124807 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 87124826 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87125290 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87125432 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87125735 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87125742 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87125770 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87125919 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87125958 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87125964 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 87126006 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 87126166 G C N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 87126200 A G N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 87126479 C A N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 87126617 A C N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 87126629 A C N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 87126740 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87126838 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87126890 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87126908 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87126917 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87126946 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87126984 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87126998 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87126999 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87127116 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87127166 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87127185 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87127355 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 87127384 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87127427 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87127433 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87127476 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 87127592 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87127698 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87127740 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87127762 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87127816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87127845 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87127848 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87127967 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128092 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128130 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87128145 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87128161 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87128173 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128185 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128205 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128211 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128242 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128276 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128278 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128304 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128340 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128345 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128367 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128475 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128540 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128579 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128682 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87128687 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128782 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87128903 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87129204 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 87129267 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87129294 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 87129396 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 87129401 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87129620 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87129671 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87129697 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87129823 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87129837 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87129916 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87129920 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87129969 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87130000 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87130022 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87130029 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87130121 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87130134 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87130154 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87130178 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87130192 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87130200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87130234 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87130243 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87130287 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87130293 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87130329 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87130349 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87130420 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 87130458 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87130477 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 87130598 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 87130645 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87130646 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87130706 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87130964 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87131069 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87131138 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87131149 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87131239 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87131263 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87131264 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87131303 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87131349 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87131379 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87131507 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87131573 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87131893 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87131904 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87131913 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87132121 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87132122 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87132137 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87132160 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87132211 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87132215 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87132281 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87132293 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87132499 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87132520 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87132598 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87132637 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87132672 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87132691 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87132906 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87132927 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 87133098 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87133147 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87133271 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87133272 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87133291 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87133315 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 87133321 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87133334 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 87133405 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87133430 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87133464 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87133491 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87133493 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87133515 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87133601 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87133611 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87133618 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87133644 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87133667 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87133742 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87133757 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87133780 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87133822 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 87133856 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 87134066 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 87134078 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87134171 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87134179 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87134202 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87134226 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87134304 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87134335 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87134373 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87134387 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87134459 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87134479 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87134499 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87134574 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87134583 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 87134789 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 87134845 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 87134892 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87135011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87135061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87135754 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87135833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87135873 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87135947 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87135999 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87136005 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87136035 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87136168 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87136202 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87136471 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87136476 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87136540 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87136573 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 87136574 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 87136859 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87136868 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 87136963 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 87137180 T G N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 87137288 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 87137316 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 87137381 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 87137395 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87137491 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87137521 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87137592 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87137640 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87138012 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 87138013 G C Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 87138057 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 87138207 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87138224 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87138252 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 87138256 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 87138264 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 87138270 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 87138282 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87138290 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 87138359 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87138376 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87138384 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87138391 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87138400 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87138448 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87138475 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87138488 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87138541 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87138563 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87138663 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87138682 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87138710 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87138714 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 87138744 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 87138774 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87138988 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87139011 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87139020 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87139113 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87139117 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87139178 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87139219 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87139224 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87139300 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87139362 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 87139377 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87139386 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87139537 A T Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 87139574 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 87139646 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 87139706 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 87139717 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 87139740 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87139769 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87139846 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87139855 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87139869 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87139873 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 87139909 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 87139984 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 87139994 A G Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 87139997 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 87140080 G A Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 87140181 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87140226 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 87140302 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87140303 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87140327 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87140328 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87140450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87140653 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87140692 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87140738 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87140772 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87140797 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87140815 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87141003 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87141107 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87141119 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87141211 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87141232 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87141308 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87141328 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87141368 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87141432 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 87141462 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87141488 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87141529 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87141625 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87141635 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87141639 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87141732 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87141786 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87141838 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 87141853 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87141892 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87141947 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87142014 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87142020 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87142202 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 87142338 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87142405 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 87142439 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87142451 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87142455 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87142875 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87142876 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87142901 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87142941 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87143020 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87143109 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87143149 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87143155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87143200 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87143266 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87143281 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87143325 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87143354 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87143363 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87143365 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87143383 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87143420 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 87143502 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87143584 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87143625 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 87143641 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87143648 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87143677 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 87143700 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 87143755 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87143854 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87143935 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87143947 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87143971 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87144062 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87144100 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87144196 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87144219 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87144231 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87144269 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87144286 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87144358 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87144369 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87144396 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87144513 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87144541 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87144560 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87144608 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87144649 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87144676 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87144685 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87144718 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87144777 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87144789 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87144810 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87145022 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87145037 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87145136 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87145188 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87145236 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87145257 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87145300 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87145339 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87145447 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87145534 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87145559 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 87145629 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 87145757 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87145768 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 87145985 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87145991 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 87146460 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87146533 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87147353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87147479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87147771 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87147989 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 87148573 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87149246 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87149769 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87150062 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87150074 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87150113 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87150373 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87150496 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87150988 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87151042 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87152862 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87153024 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87153184 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 87153279 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 87153354 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 87154108 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87154115 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87154224 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87154678 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87154979 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87155264 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87155458 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87155525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87155690 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87155763 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87156013 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87156719 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87156813 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87157072 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 87157256 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87157278 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87157494 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87157602 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87157721 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87157748 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87157971 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87158975 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87159187 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87159475 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87159490 A T Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 87159502 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87159835 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 87160077 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87160341 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87160618 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 87160973 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87162086 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87162936 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87162947 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87163011 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87164270 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87164339 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87164519 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87164756 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87164761 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87164855 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87165249 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87165642 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87165704 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87165763 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87169766 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 87170757 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87170813 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87170989 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87170990 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87171052 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87171482 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87171769 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87171958 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87172084 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87172146 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87172176 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87172501 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 87172551 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87172593 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87172895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87172924 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87173139 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87173197 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87173198 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87173429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87173588 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87173632 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87173767 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87174207 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87174285 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87174289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87174600 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87174810 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87175548 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 87175649 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87175716 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 87175775 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87176087 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87176124 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87176155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87176258 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87176303 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87176380 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87176416 G C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 87178168 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87178527 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87178531 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87178653 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87178819 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87178827 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87178884 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87179190 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87179270 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87179272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87179343 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87179406 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87179459 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87179464 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87179497 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87179582 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87179664 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87179751 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87179763 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87179810 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87179865 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87179876 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87179894 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87179949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87180042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87180072 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87180126 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87180151 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87180212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87180217 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87180337 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87180402 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87180483 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87180568 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87180611 G T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87180620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87180972 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87181068 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87181142 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87181197 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87181234 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87181469 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87181495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87181524 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87181557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87181595 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 87181625 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87181660 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87182162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87182216 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87182225 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87182251 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87182354 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 87182684 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87182795 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87182863 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 87182982 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87183051 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87183091 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87183093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87183163 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87183336 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87183359 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87183397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87183412 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87183430 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87183507 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87183598 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 87183661 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87183664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87183715 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87183776 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87184082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87184100 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87184254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87184258 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87184372 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184449 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184519 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184528 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184653 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184673 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184753 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87184756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184796 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184819 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87184877 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87184929 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87184936 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87184965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87184992 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87184995 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87185462 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87185570 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87186051 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87186097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87186138 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87186169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87186178 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87186275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87186329 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87186474 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87186673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87186696 C A Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 87186735 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87186741 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87186760 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87186944 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87187065 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87187174 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87187186 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87187568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87187681 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 87187748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87187888 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87187900 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87187951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87187966 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87187974 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87188037 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87188141 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87188192 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87188226 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87188277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87188383 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87188457 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87188552 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87188647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87188708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87188759 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87188794 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87188822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87188852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87188900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87189012 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87189030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87189267 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87189287 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87189438 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87189454 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87189494 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87189528 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87189580 C A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87189721 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87189849 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 87189894 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87189960 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87190033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87190064 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87190069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87190116 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87190160 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87190238 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87190259 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87190358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87190565 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87190730 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87190742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87190754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87190775 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 87190777 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 87190857 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87190889 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87190963 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87191003 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 87191053 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 87191072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87191196 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 87191519 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 87191544 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87191595 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87191612 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 87191879 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 87191941 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 87192212 A C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 87192358 A G Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 2 87192437 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 87192506 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 87192773 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 87192814 A C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 87192871 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 87193005 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87193058 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 87193087 C A Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 87193176 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 87193205 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 87193238 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 87193247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87193268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87193318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87193319 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 87193511 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 87193614 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 87193621 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 87193642 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 87193777 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 87193807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87193920 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 87194005 C T Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 87194052 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 87194063 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87194161 G T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 87194471 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87194473 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87194487 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 87194495 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 87194531 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 87194537 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 87194670 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 87194729 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 87194775 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87194899 C A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 87194923 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 87194955 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87194976 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 87195110 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87195418 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 87195504 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87195531 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87195802 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 87195897 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 87195910 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 87195966 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 87195996 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 87196049 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87196203 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 87196246 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87196369 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 87196430 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 87196447 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 87196596 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 87196740 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 87196768 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87196853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87196865 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 87196873 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 87196964 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 87197156 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 87197414 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87197887 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 87198031 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 87198055 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87198071 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 87198209 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 87198571 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 87198812 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 87198847 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 87198877 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 87198909 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87199087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87199163 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87199246 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87199453 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 87199567 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87199759 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 87199836 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 87199866 C G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 87199882 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 87200354 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87200419 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87200588 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87200644 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87200861 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87200948 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 87200950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87200989 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87201139 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87201781 T A Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 87202598 A T Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 87203282 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 87203305 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 87203338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87203645 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 87204120 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 87204788 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 87205095 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 87205151 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87205216 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 87205256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87205453 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 87205536 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87206017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87206251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87206520 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87206585 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87206598 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 87206623 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87206634 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87206948 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87207053 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87207150 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87207162 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87207190 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 87207407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87207417 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 87207509 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 87207731 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87207756 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87207890 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87207904 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 87207946 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 87207970 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 87208090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87208143 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87208256 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87208338 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87208411 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 87208422 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87208616 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 87209020 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 87209134 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87209162 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87209497 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 87209548 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87209590 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87209626 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87209656 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 87209675 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 87209702 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87209745 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87209808 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 87210100 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 87210196 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 87210215 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 87210572 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 87210590 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 87210623 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 87210678 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 87210734 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87210846 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87210886 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87211019 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 87211060 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 87211099 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 87211115 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 87211242 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87211508 A C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 87211621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87211678 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 87212053 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 87212665 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87213605 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 87214135 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87214148 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 87214357 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 87214521 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87214635 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 87215139 G T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 87215386 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87216394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87216467 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87216589 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87217499 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 87217512 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 87217759 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87218439 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 87219305 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87222816 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 87223198 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 87223526 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87223924 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87224105 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 87224321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87224553 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87224685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87225044 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 87225180 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 87225190 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 87225316 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87225450 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87225811 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87227025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87227421 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 87227617 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87227834 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87227863 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87228538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87229921 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87230004 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 87230224 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87231320 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 87231331 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87232035 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 87232427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87232854 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87232873 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87233219 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87233411 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87233448 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87233554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87233564 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87233651 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87233657 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87234518 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87234615 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87234985 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87235463 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87235476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87235540 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87235613 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87235688 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87235771 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 87235798 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 87235800 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87235933 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87236597 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87236877 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87236885 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87236922 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87236981 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87236990 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87237018 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87237135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87237193 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87237371 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87237398 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87237467 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87237525 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87237580 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87237630 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87237661 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87237740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87237799 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87237840 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87237852 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87237898 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87237914 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87237950 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87237970 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 87237980 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 87238008 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87238060 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87238094 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87238120 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87238124 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87238143 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87238179 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87238184 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87238190 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87238227 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87238291 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87238356 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87238363 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87238418 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87238419 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87238430 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87238433 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87238525 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87238653 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87238895 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87239240 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87239324 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87239692 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87239721 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87239822 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87239925 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87239926 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240070 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240072 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240097 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240111 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240135 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240220 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87240249 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 87240252 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 87240268 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87240295 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87240382 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87240402 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87240449 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87240487 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87240493 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87240506 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240601 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240676 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240688 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87240750 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240806 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240807 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240821 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240822 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240873 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240880 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240902 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240921 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240928 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240954 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240971 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87240977 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87241094 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87241115 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87241128 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87241199 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87241216 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87241217 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87241305 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87241307 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87241336 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87241360 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87241372 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87241399 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87241406 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87241422 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87241432 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87241437 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87241460 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87241472 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87241642 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87241854 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87241920 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87241934 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87241991 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87241992 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87242265 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87242292 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87242374 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87242468 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87242522 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87242532 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87242624 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87242633 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87242657 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87242694 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87242718 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87242759 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87242825 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87243391 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87243636 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87244883 A G Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 2 87244895 C A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 87245012 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87245040 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87245052 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87245069 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87245978 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87246030 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87247293 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 87248824 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87249778 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 87249840 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87249980 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87250104 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250233 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250257 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87250270 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87250344 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250359 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250367 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87250399 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250463 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250473 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250499 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250502 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250510 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250542 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250566 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250605 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250634 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250676 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250688 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250698 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250762 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250792 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250818 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250822 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250852 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250944 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87250970 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251025 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251029 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251051 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251208 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87251233 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251242 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251303 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87251314 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251334 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251389 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251396 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251409 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87251431 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87251471 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87251488 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87251553 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87251568 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87251613 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87251627 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87251688 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87251723 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251736 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87251747 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87251806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87251853 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251898 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251910 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87251923 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87252064 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87252076 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87252111 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87252133 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87252138 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87252183 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 87252199 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 87252212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87252466 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87252566 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 87252573 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 87252588 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 87252589 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 87252602 C A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 87252704 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87252710 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87252757 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87252771 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87252778 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87252797 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87252841 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87252845 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87252892 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87252906 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87252990 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87253032 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87253047 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87253080 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87253093 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87254689 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 87254732 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87254768 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 87254801 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 87254883 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87254902 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87254925 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87254946 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87254951 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87255022 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87255081 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87255128 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87255142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87255153 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87255202 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87255258 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87255342 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87255369 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87255385 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87255510 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87255535 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87255551 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87255583 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87255594 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87255615 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87255657 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87255676 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87255698 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87255701 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87255775 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87255782 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87255810 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87256078 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87256141 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87256169 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87256239 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87256247 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87256270 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87256331 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87256541 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87256770 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87256771 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87256820 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87256831 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87257551 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87257753 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87257764 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87258022 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87258174 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87258614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87259082 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87259115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87259142 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87259157 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 87259158 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87259309 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 87259313 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87259337 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87259489 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 87260007 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 87260471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87260667 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 87260916 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87261297 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87261326 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87261440 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87261470 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87261652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87261660 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87261760 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87261983 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 87262029 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87262232 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87262870 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87262873 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87263859 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87264143 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 87264625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87264764 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 87265618 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87265674 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87265776 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87266189 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 87266303 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87266352 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 87266384 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87266390 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87266543 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87266570 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 87266596 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87266937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87267238 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87267506 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87267577 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 87267604 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87267716 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 87268067 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 87268795 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87268876 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 87269199 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87269357 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 87269546 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87269635 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87269761 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87270367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87270510 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87270572 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 87270623 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87270648 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87270762 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 87271022 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 87271084 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 87271140 G A Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 87271650 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 87271699 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 87271715 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 87271796 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 87271854 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 87271917 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 87271961 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87272121 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 87272397 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87272516 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87272518 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87272548 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87272742 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 87272763 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87272764 A C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 87272861 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87273008 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 87273034 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87273206 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 87273233 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 87273298 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 87273363 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 87273493 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 87273640 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87273796 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 87273853 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87273924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87274182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87274200 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87274209 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87274227 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87274385 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87274392 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87274398 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87274422 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87274449 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87274472 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87274487 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87274490 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87274541 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87274563 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87274575 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87274657 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87274834 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87274971 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87274974 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87274996 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87275047 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87275089 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87275203 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87275233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87275275 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87275297 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87275320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87275329 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87275331 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87275341 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87275404 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87275416 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87275427 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87275453 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87275454 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87275817 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87275875 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87275947 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 87276039 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 87276046 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 87276059 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 87276106 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87276112 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87276120 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87276160 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87276220 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87276274 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87276284 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87276337 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87276399 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87276521 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87276605 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87276697 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 87276716 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87276793 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87276799 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87276804 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87276816 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87276817 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87276856 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87276872 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87276912 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87276948 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87276955 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87276980 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87276989 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277030 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277040 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277059 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277066 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277078 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277160 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277164 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277200 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277255 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277321 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277325 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277346 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87277369 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87277409 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87277423 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277436 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277463 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277534 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277550 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87277564 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277565 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277672 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277674 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277693 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277731 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277756 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277769 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277782 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277786 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87277808 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87278284 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87278367 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87278452 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87278458 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 87278501 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87278531 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87278578 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87278587 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87278688 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87278908 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87278911 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87278984 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87279083 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87279193 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87279446 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87279451 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87279462 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87279472 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87279529 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87279557 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87279593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87279639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87279675 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87280099 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87280114 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87280162 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 87280232 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87280282 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87280360 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87280430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87280479 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87280569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87280583 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87280607 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87280792 A C N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 2 87280820 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 2 87280957 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 2 87282527 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 2 87283256 A T N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 87283275 G A N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 2 87283594 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 87284122 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 87284135 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 87284143 C G N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 87284148 A T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 87284155 A T N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 87284228 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 2 87284347 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 87284447 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 87284450 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 87285010 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 87285160 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 2 87285178 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 2 87285335 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 2 87285468 C G N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 87285494 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 2 87285721 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 2 87285746 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 2 87285817 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87286537 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87286587 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87286684 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87286721 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87286742 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 87286748 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87286835 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87287433 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87287508 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87287517 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87287825 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87287840 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87287887 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87288097 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87288183 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 87291545 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87292348 G C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87292384 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87292969 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87293478 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 87293923 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87293980 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87294083 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87294615 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87294890 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87294896 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 87295066 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87295178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87295410 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87295473 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 87296058 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87296230 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87296427 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87296503 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 87296611 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87296617 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87296641 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87296655 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87296718 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 87296811 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87296893 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 87298740 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 87299068 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87299544 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87299646 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87299778 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87299911 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87299925 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 87299980 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87300080 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87301138 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87301186 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 87301189 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87301203 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87301230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87301238 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87301254 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87301291 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87301437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87301504 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87301587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87301696 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87301716 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87301764 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87301938 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87301939 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87301975 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87301992 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87302001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87302097 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87302128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87302141 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87302187 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87302273 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87302289 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87302361 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 87302737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87304920 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 87304927 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87305133 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87305388 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87305611 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 87306756 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87307655 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87308167 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 87308997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87309625 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 87310385 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 87310659 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87311259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87311882 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87311979 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87314487 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 87315640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87316438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87317930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87318716 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87318766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87319204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87320169 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87320287 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87320577 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87320755 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87321276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87321329 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87321768 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87321947 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 87321955 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 87322027 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 87322176 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 87322206 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 87322221 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 87322368 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 87322472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87322494 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87322759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87322805 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87322821 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 87322825 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 87323062 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87323138 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87323970 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87324315 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 87325070 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87325112 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87325355 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 87325450 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87326012 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87326044 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87326230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87326242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87326348 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87326747 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87326962 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87327397 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87327834 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87327884 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 87327916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87329032 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 87329408 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 87329527 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87329620 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87329839 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87331038 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87332047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87332421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87334327 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87334536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87335529 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 87336250 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87337655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87338095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87338443 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 87338950 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 87338954 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 87339836 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87340790 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87340799 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87341156 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87343188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87345372 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87346719 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 87346858 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 87347081 C G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87347088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87347286 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 87347290 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87347334 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87347355 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 87347367 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 87347453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87347499 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 87347559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87347712 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 87348036 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 87348260 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87348740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87349125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87349432 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87349520 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87350067 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 87350068 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87351829 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 87352020 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87352654 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 87353322 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87353692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87354160 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87354215 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87354938 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87355372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87355851 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87356401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87356506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87356592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87356616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87357087 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 87357827 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87357902 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 87357929 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 87358007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87358357 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 2 87358796 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87358865 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87359212 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 87359664 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87359687 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87359965 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87359996 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 87360261 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 87360375 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87360638 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87361136 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87361226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87361619 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87361805 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87361980 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87362049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87362302 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87362422 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87362477 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 87363005 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87363175 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87363516 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87363605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87363721 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87363905 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87364139 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87364501 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87364527 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 87364751 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 87364905 G A N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 87365063 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 87365167 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87365718 T A N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 87365733 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 87367513 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87367610 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87367670 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87368178 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87368283 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87368665 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87368751 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87368803 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87368807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87369224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87369258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87369266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87369334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87369354 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87369361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87369432 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 87369441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87369952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87370063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87370080 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 87370180 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 87370206 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87370256 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87370261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87370286 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87370331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87370524 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87370541 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87370686 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87370690 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87370854 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 2 87370939 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 87371044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87371104 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87371211 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87371370 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87371609 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87371720 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87371807 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 87371892 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87371917 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87372039 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87372090 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87372142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87372317 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87372621 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 87372629 C A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 87372788 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87372828 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 87372950 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 87373118 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87373137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87373146 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87373171 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87373230 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87373291 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87373297 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87373413 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 87373519 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 87373585 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 87373615 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 87373652 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 87373660 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 87373749 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87373752 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87373873 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 87374166 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 87374190 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 87374221 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87374232 T G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 87374262 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87374279 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87374288 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87374293 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87374380 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87374405 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 87374658 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 87374745 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87374843 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 87374846 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 87374857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87374859 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87374869 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87374873 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87375167 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87375190 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87375211 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87375250 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87375320 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87375475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87375606 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 87375910 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 87375928 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 87375945 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 87376088 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87376186 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87376487 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87376580 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87376634 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87376909 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87376999 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87377068 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87377081 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87377093 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87377094 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87377198 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 87377215 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 87377385 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 87377522 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87377534 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 87377543 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 87377606 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87377667 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87377757 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87377852 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87377906 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87378160 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 87378356 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87378426 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 87378495 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 87378581 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87378640 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87379075 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87379134 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87379488 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 87379551 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87379939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87379950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87380089 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87380264 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87380638 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87380855 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87381051 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87381447 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 87381998 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87382259 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87382475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87382679 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87382720 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87382751 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87382834 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87383101 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87384027 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87384254 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87384409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87384453 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87384976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87385513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87385595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87386165 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87386171 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 87386435 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 87386540 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 87387086 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 87387211 G A Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 87387457 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 87387514 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 87387561 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87387765 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87387781 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87388256 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87388419 T G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 87388471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87388507 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87389122 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 87389184 G C N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 87389223 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87389365 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87389370 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87389654 T C N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 87389836 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87390004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87390070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87390210 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87390239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87390312 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87390345 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87390443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87390499 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87390500 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87390614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87390624 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87390764 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 87390828 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87390933 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87390975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87390995 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87391008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87391026 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87391051 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87391060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87391076 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87391089 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87391119 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87391126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87391140 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87391150 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87391174 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87391245 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87391426 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87391500 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87391561 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 87391693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87391705 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87391710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87391718 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87391817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87391937 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87392061 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 87392080 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87392130 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 87392135 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87392385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87392472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87392488 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87392497 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87392570 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87392753 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87392801 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 87393023 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 87393024 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87393115 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87393233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87393284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87393385 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87393512 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 87393530 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 87393561 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87393949 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87393980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87394087 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87394174 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87394206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87394265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87395250 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87395358 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87395524 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87395541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87395619 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87395630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87395713 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87395746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87395793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87395836 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87395953 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87395954 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87395966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87395973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87395987 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 87396007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87396016 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87396033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87396088 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87396195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87396199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87396223 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87396233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87396241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87396356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87396443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87396631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87396687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87397117 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87397131 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87397195 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87397282 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87397318 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87397490 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87397537 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87397630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87397672 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87397684 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87397696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87397727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87397816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87397860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87398057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87398116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87398174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87398195 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87398205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87398401 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87398450 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87398553 A T Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 87398651 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87398780 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 87398794 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 87398820 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87398851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87398904 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87398952 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87398971 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 87399041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87399056 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87399161 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87399175 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87399233 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87399241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87399332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87399343 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87399369 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87399373 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87399411 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 87399576 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87399596 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87399671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87399716 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87399825 T A N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 87399980 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87400006 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 87400163 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87400233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87400368 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87400511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87400612 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87400687 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 87400692 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 87400706 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87400707 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87400721 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87400786 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87400817 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87400828 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87400841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87400843 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87400865 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 87400942 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 87401031 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87401082 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87401153 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87401159 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87401247 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87401263 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87401270 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87401414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87401521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87401535 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87401561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87401579 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87401698 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87401788 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87401876 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87401877 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87401891 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87401893 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87401919 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87401935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87401945 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87402051 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87402064 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87402188 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87402304 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87402309 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87402320 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87402341 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87402406 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87402510 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87402534 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87402604 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 87402689 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87402696 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87402764 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87402845 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87402855 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87402928 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 87403068 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87403099 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87403114 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87403127 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87403290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87403347 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87403439 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87403452 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87403523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87403592 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87403597 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87403642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87403664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87403762 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87403829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87403837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87403852 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87403882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87403907 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87403943 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87404050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87404169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87404228 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87404248 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87404261 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87404264 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 87404313 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 87404449 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87404477 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87404681 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 87404789 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87404796 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87404807 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87404872 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87404945 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87404961 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87404975 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 87404996 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87405060 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 87405061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87405273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87405390 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 87405441 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 87405729 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 87405856 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87405910 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87405947 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87406001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87406012 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87406043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87406213 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87406224 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87406382 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87406393 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87406400 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87406433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87406518 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87406691 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87406926 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87406983 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87407012 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87407122 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87407354 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87407355 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87407677 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87407814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87407832 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87407922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87407929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87407973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87407980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87408181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87408271 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87408333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87408361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87408393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87408693 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87408955 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87408989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87409062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87409183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87409266 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87409685 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87409817 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87410081 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87410275 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87410547 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87410597 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87410669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87411311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87411622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87411645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87411697 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87411713 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87411722 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87411754 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87411771 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87411843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87411885 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87411942 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87411974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87411988 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87412081 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87412092 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87412378 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87412443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87412561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87412734 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87412833 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87413179 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87413398 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87413726 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87413796 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87413872 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87413971 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87413978 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87414024 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87414067 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87414146 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87414249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87414261 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87414264 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87414626 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87414773 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87415154 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 87415581 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87415593 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87416205 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 87416302 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87416713 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87417082 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87417098 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87417117 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 87417947 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87418521 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87419159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87419335 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87419466 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87419909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87419959 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87420291 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 87420703 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87420813 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87421252 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87421315 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87421948 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 87421972 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 87421996 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87421998 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87422029 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87422033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87422060 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87422110 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87422221 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87422374 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87422527 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87422693 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87423119 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87423137 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87423171 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87423373 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87423435 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87423596 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87423620 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87423700 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87423819 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87424408 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87424625 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87424639 C A Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 87424796 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87425263 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 2 87425435 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87426380 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 87426589 A G Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 87427165 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87427399 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87427504 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87427595 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87427604 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87428216 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87428310 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87428346 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87428430 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87428551 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87428767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87428770 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87429612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87429648 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87429740 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87430218 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87430378 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87430408 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87430565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87430580 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87430835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87430944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87430968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87430991 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87431022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87431215 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87431513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87431526 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87431603 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87431706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87431825 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87431870 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87432647 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87432650 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87432667 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87433405 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87433444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87433455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87433499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87433508 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87433775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87433779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87433932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87437039 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87437209 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87437330 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87437538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87438030 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87438076 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87438122 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 87438141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87438150 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87438220 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87438321 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87438366 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87438474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87438644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87439569 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87439805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87440783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87441089 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87441316 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87441351 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87441457 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87441617 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87441724 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 87441761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87441852 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87441866 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87441919 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87441979 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 87442064 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87442105 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87442184 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87442290 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87442374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87442536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87442556 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87442640 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 87442698 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87442804 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87442838 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87442922 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87442957 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87443239 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 87443283 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87443422 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87443425 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87443453 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87443545 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87443581 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87443677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87443729 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87443763 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87443833 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87444115 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87444116 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87444214 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87444348 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87444353 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87444499 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87444523 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87444532 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87444571 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87444816 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87444858 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87444864 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87444893 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87444936 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87445044 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87445107 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87445168 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87445200 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87445247 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87445273 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87445310 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87445343 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87445534 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87445577 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87445646 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87445687 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87445941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87445954 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87446086 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87446133 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87446209 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87446249 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87446648 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87446690 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87447048 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87447208 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87447274 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87447403 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87447786 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87447798 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 87447804 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 87448056 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87448068 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 87448738 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87448739 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87449134 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87449156 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 87449177 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87449242 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87449264 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87449784 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87449819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87450471 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87450634 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87450736 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87450754 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87451471 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87451584 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87451634 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87451688 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87452049 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87452076 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87452137 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87453333 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87453470 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 87453574 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87453586 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87453799 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87454053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87454394 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87454452 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87455023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87455091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87455266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87455535 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87456511 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 87456805 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87456972 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87457027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87457056 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 87457198 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87457717 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87458323 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 87458577 G A Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 87458664 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 87459026 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 87459270 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87459487 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87459614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87459883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87459916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87460124 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87460187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87460285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87460450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87460556 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 87460600 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 87460836 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87461074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87461231 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87461624 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 87461792 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 87462266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87462947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87463034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87463319 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87463403 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87463885 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87463945 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87465339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87465373 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87465462 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87465570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87465581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87465682 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87465723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87465761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87465940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87466366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87466380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87466470 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87466523 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 87466782 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87466914 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 87466936 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87466991 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 87467259 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 87467268 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87467693 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87467742 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87467978 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 87468146 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87468182 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87468250 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87468256 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87468281 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87468337 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87468538 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87468610 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87468693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87468695 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87469187 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87469392 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87469583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87469604 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87469654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87469782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87469903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87469947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87470092 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87470451 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87470584 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87470860 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87471035 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87471060 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 87471197 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87471383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87471410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87471658 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87471874 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87472387 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87472518 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87472875 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87473016 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87473115 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87473131 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87473851 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 87473981 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87474466 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87474561 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87475855 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 87476643 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87478231 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87478376 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87478486 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 87478544 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87479289 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87479293 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87479318 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87479820 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87479824 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87479925 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87480032 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87480058 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87480658 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87481302 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87481505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87481560 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87481618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87481625 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87481720 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87481747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87481832 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87481838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87481955 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87481965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87481966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87481998 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87482112 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87482227 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87482231 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87482355 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87482518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87482541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87482577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87482699 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87482746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87483024 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87483030 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87483068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87483153 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 87483206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87483224 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87483227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87483244 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87483304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87483349 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 87483380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87483437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87483638 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 87483774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87483802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87483968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87483973 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87484029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87484150 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87484243 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87484260 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87484403 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87484413 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87484508 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87484732 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87484739 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87484755 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87484886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87484900 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87484920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87484960 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87485077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87485141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87485211 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87485232 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87485911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87486013 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87486216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87486284 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87486421 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 87486434 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 87486518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87486519 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 87486618 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 87486800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87486817 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87486843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87486928 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87486945 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87486953 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 87487010 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 87487389 C A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 87487481 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 87487509 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 87487528 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87487578 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87487634 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87487748 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 87488252 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87488600 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 87489173 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87489493 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87490009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87490082 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87490200 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87490379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87490752 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87491397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87491942 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87492080 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87492677 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87492678 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87492930 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87493292 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87493310 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87493646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87493940 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87494656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87494752 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87494765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87494933 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87495076 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87495239 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87495321 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87495499 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87495572 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87495739 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87496673 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87496687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87497581 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87497670 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87498726 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 87499068 T A N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 87499555 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 87499819 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87500044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87500155 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87500647 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87500995 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87501188 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87501447 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87501858 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87501918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87502142 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87502273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87502294 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87502400 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 87502802 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87502900 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87503157 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87503264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87503589 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87503611 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87503684 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87504120 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87504152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87504258 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87504855 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87505073 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87505101 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87505174 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87505203 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87505395 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87505549 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87505556 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87505753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87505786 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87506242 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87506322 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87506435 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87506890 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87506897 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87507320 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87507321 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87507409 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87507754 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87507813 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87507878 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87507888 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87507897 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87507922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87507923 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87507961 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87508207 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87508286 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 87508335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87508416 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87508771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87508808 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87509239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87509313 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87509419 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87509680 A T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 87509730 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 87509756 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 87509890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87510099 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87510143 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87510612 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 87510901 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87511164 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 87512547 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87512810 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 87513160 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 87513194 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87513801 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87513945 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 87514260 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87514469 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87514490 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87514694 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87514759 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87514781 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 87515011 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 87515018 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 87515226 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 87515303 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 87522985 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87523218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87523241 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87523283 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87523714 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87523937 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87524092 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87524603 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87525169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87525225 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87525689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87526124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87526186 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87526350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87526890 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87527193 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87528002 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87528265 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87528386 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87528468 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 87528922 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87528986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87529714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87529971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87530774 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87530817 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 87531247 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87531509 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87531932 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87532017 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87532978 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 87533110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87533507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87533868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87533931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87534271 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87534656 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87535467 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87535598 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87536102 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87536728 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87537209 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87537645 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87537787 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87537906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87537943 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87538250 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87538353 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87539594 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 87540191 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87540376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87540498 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87540585 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87540705 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87540777 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87540879 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87540911 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87547369 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87547558 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87547642 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87548886 A T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 87549184 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87549775 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87549867 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87549888 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87550392 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87551148 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87551778 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87552370 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87552408 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 87552825 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87554279 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 87554739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87554796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87555581 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87555839 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87556634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87556866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87556946 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87557274 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87561677 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87562168 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 87562426 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87563501 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87563574 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87563978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87564017 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87564117 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87564219 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87564385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87564549 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 87564995 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87565071 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 87566095 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87568109 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87568942 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 87569460 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87570388 A C Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 87571009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87571100 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 87571179 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87571314 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 87571462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87571604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87571668 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87571684 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87571775 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 87571987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87572355 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87573144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87573158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87573332 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87573704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87574317 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 87574671 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 87576393 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87579333 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87579882 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 87581057 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 87581063 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 87582537 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87582709 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87582796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87584292 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87584567 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87585080 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87586065 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87586303 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87586804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87587043 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87587242 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 87587382 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87587857 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87588285 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 87588360 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87588946 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 87589704 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87589897 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87589950 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 87590005 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 87590009 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87590266 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87590725 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87591363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87591937 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 87593507 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87593532 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87593762 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87594005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87594102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87594256 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87594354 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 87594590 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87595849 C A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 87595925 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 87596669 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87596729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87596965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87597055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87597601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87597616 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87597729 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87598448 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87599220 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 87599324 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87599665 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87599833 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87599936 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87600106 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87602338 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87602466 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87602575 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87602661 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 87603236 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87603294 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 87603365 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87603501 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87603625 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87603748 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 87603949 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87604104 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87604448 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87604461 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 87604592 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87605013 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87605169 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 87605500 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 87605983 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87606410 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87606600 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 87606754 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87606776 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87606843 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87607132 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87607163 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87607169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87607245 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87607819 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 87607914 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 87607935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87608349 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87608410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87609040 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87614133 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 87614540 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87614640 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87614775 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87614833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87614850 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87614873 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87615134 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87615140 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87615553 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87615741 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87615784 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87616006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87616135 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87616638 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 87616678 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87616680 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87616815 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 87616841 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 87616916 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 87617084 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 87617101 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 87617273 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87617292 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 87617386 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 87617411 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 87617426 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 87617495 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87617520 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87617545 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87617550 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87617610 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87617628 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87617719 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87617796 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87617842 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87617846 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 87617899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87618010 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 87618125 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 87618163 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 87618179 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87618220 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87618233 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 87618371 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 87618428 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 87618501 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 87618549 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 87618638 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 87618763 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87618781 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87618798 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 87618864 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87618914 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87618924 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87618928 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87618978 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 87619074 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87619081 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 87619545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87619643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87619645 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 87619715 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 87619839 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87619843 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87619864 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 87619868 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87619924 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 87620127 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 87620138 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 87620188 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 87620196 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 87620265 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87620312 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87620325 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87620339 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87620541 G A N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 87620546 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 87620697 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 87620743 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87620770 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87620985 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87621037 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87621047 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87621130 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87621162 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87621239 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 87621534 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 87621672 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87621733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87621912 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 87621998 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87622062 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 87622117 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87622156 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87622260 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87622318 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 87622421 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 87622541 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87622767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87622856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87622998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87623040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87623202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87623415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87623666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87623724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87623821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87623848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87624008 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87624093 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87624157 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 87624216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87624227 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87624245 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87624252 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87624295 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87624321 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87624330 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87624337 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87624357 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87624359 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87624450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87624494 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87624525 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87624670 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87624803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87624821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87624973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87624981 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87625045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87625046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87625125 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87625156 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87625166 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87625189 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 87625255 T A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 2 87625663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87625677 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87625714 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87625735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87625839 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87625889 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87625904 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87625925 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87625999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87626037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87626058 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87626076 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87626132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87626229 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87626259 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87626277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87626572 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87626581 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87626794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87626843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87626889 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87626925 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87626960 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87626978 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87628447 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87628557 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87628577 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87628763 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87628919 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87628958 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87628970 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87628982 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87629058 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87629217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87629328 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87629378 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87629429 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87629479 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87629484 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87629546 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87629591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87629646 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87629675 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87629769 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87629841 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87630061 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87630234 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87630302 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87630333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87630363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87630490 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 87630659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87630741 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87630830 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87637030 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87637276 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87637509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87637589 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87637595 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87637660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87637666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87637726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87637839 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87637870 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87638262 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87638281 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87638300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87638462 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87638496 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87638541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87638543 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87638597 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87638735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87638858 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 87639023 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87639096 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87639375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87639388 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87639413 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87639534 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87639582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87639642 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 87639650 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87639759 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87639879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87639908 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87640157 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 87640311 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87640472 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87640496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87640599 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87640709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87640806 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87640845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87640851 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87640865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87641168 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 87641552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87641577 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87641622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87641661 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 87641884 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87642463 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 87642478 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87642754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87642837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87643054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87643118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87643629 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87643679 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87643761 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87643763 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87643953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87643994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87644132 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87644158 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87644277 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87644313 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87644380 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87644498 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87644679 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87644882 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87644996 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87645016 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87645069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87645108 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87645340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87645388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87645395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87645494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87645614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87645854 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87645975 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87646357 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87646597 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87646860 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87647082 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87647243 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87647419 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 87647892 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87647915 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87648097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87648139 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87648177 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87648388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87648703 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87649317 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87649340 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87649417 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87649477 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87649480 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87649533 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87649559 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87649649 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87650134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87650136 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87650644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87651039 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 87651615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87651753 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87651831 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87653051 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87653822 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87654186 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87654262 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87654402 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87654508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87654535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87654762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87655090 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87655235 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87655274 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87655303 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87655627 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87655854 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87655889 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87655943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87656456 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 87656511 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87656771 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87657200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87657539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87657581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87657943 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87657952 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87658111 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87658505 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87659033 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87659135 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87659344 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87659416 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87659579 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87659678 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87659693 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87659721 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87659725 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 87660007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87660125 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87660999 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87661081 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87661202 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87661736 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87661884 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87662350 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87662394 G T Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 87662402 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 87662413 A T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 87662803 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87662884 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87663044 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87663154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87663221 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87663294 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87663322 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87663423 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87663500 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 87663526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87663542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87663948 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87664029 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87664030 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87664051 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87666302 A T Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 87666311 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 87666391 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 87666434 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 87666473 A T Y N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 2 87666532 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 87666733 A G Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 87666780 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 87666792 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 87666932 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 87666956 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 87668729 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87668774 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87669139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87669223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87669240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87669415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87669421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87669510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87669605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87669779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87669830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87669836 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87669859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87669927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87669939 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87670172 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87670202 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87670228 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87670262 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87670361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87670385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87670412 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87670436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87670487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87670665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87670717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87670740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87670806 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 87670807 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 87670973 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87670988 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87671122 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 87671166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87671188 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 87671189 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 87671310 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87671371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87671406 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87671447 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87671463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87671524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87671589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87671662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87671711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87671722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87671758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87671817 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87671830 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87672098 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87672146 C A Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 87672161 C T Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 87672243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87672313 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87672342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87672523 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87672581 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87672692 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87673011 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87673674 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87673983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87674172 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87674278 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87674476 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 87674823 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87674940 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87675048 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87675172 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87675236 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87675497 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87675665 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87676415 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87676492 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 2 87676790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87677046 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87677127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87677139 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 87677215 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87677301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87677436 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87677452 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 87677482 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 87677598 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87677620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87677675 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87677724 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87677978 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87677998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87677999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87678443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87678490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87678532 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87678790 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87678861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87678889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87679031 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87679032 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 87679546 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87679574 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87679599 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87679757 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87679762 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87679776 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87679892 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87679947 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87679948 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87680122 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87680123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87680188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87680631 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 87680771 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87680776 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87680913 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 87680944 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87680954 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87680956 C A Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 87680969 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87680998 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87681153 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87681231 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87681280 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87681364 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 87681445 T G Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 87681446 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 87681579 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87681926 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 87682048 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87682124 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87682327 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87682479 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87682530 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87682664 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87682677 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87682864 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87682926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87683096 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87683102 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87683135 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87683282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87683335 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87683434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87683503 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87683597 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87683627 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87683667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87683674 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87683752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87683785 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87683823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87683872 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87683889 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87684023 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87684129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87684184 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87684412 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87684501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87684567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87684610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87684743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87684915 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87684958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87684965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87685058 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87685181 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87685209 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87685345 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87685556 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87685615 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87685678 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87685781 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87685928 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 87685975 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87686059 T A Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 2 87686239 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87686253 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87686257 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87686520 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87686804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87686886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87686981 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87687056 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87687085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87687125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87687469 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87687496 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87687603 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87687795 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87687856 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87687878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87687975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87688075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87688123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87688157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87688235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87688250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87688287 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87688458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87688467 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87688507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87688686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87688804 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87689373 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87689466 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87689475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87689492 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87689664 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87689685 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87689969 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87689978 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87689986 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87690013 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 87690078 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87690122 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87690144 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87690219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87690298 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87690350 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87690361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87690377 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87690406 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87690458 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87690636 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87690641 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87690664 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87690671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87690700 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87690721 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87690768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87690866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87690891 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87690935 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87690960 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87690963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87691050 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87691070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87691121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87691138 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87691139 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87691339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87691493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87691681 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87691888 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87691914 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87692029 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87692127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87692615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87692657 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87692670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87693043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87693106 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87693107 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87693375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87693529 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87693547 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87693819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87693987 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87694018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87694210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87694432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87694438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87694576 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87694690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87695219 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87695893 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87695992 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87696109 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87696160 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87696255 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87696891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87698417 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 87698569 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 87698581 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87698589 G A Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 87698643 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 87698669 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 87698720 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 87698827 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87699525 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87699698 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87699702 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 87700001 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 87700034 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87700237 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 87700255 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 87700268 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 87700369 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87700381 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 87700489 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 87700490 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 87700546 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 87700650 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87700716 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87700729 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87700741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87700801 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87700812 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 87702265 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87702360 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87702441 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87703297 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87703298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87703450 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87704434 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87704894 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 87705387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87705449 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 87705998 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87706390 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87706441 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87706535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87706660 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 87707215 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87707465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87707522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87707584 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87707613 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87707678 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 87709904 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87710273 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87710296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87710309 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87710746 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87710772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87711188 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87711309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87712007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87712523 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87712584 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87715659 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 87716199 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87716324 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 87716383 G C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 87718471 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87718670 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87732423 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 87732554 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87732760 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87732841 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 87732854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87732879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87732950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87732982 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87732983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87733860 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87734293 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87734340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87734662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87734767 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87735446 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87735651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87735711 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87735774 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87735901 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87736163 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87736164 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87737147 G T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 87737149 T A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 87737173 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 87737200 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 87737230 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 87737587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87737708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87737844 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87739071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87739255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87739344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87739962 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87740175 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87740196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87740989 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 87741208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87741391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87741461 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87741670 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87741671 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87741749 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87742677 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87742742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87743256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87743337 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87743352 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87743373 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87743415 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87743418 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87743454 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 87743625 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 87743781 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 87743955 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87744237 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87744267 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87744443 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87744552 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87744769 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87745268 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87745623 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 87746088 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87746181 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87746259 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87746405 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87746485 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87753073 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87753197 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87753343 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87753493 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87753812 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87754133 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87754244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87754385 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87754449 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87754655 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87754897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87755025 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87755066 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87755135 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87759254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87759457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87759936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87759972 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87760539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87760826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87761050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87761802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87761890 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87762030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87762383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87763910 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87764007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87764889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87765088 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87765831 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87766139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87766257 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87766362 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87771836 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87771906 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 87772557 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87772618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87772966 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87773275 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87773340 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87773607 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87773715 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87773756 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87773821 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87773953 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87774011 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87774020 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87774196 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87774207 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87774222 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87774245 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87774274 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87781581 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87781589 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87781809 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87781886 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87781892 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87781981 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87783046 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87783064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87783935 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87784317 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87784396 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87784502 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87785087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87785317 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87785575 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87786267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87786634 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87786708 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87787249 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87787391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87787920 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87788984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87789246 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87790671 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87791046 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87791060 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87791185 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87792707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87792711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87792722 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87793457 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87793571 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87794117 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87794249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87794758 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87795455 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87796395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87797024 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87797037 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87797081 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87797133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87797134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87797190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87797518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87797623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87797850 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87797889 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87797929 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87798080 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87798124 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87798142 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87798188 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87798218 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87798251 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87798342 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87798531 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87798647 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87798703 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87798732 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87798895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87799375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87799539 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87799722 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87799725 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87799798 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87799802 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87799906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87800028 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87800053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87800071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87800086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87800387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87800393 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87800510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87800694 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87800789 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87800794 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 87800894 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87800945 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87800960 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87800996 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87801001 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87801014 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87801088 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87801354 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87801362 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87801791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87802092 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87802142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87803147 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87803169 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87803216 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87803698 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87803843 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87803927 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87804129 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87804461 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87804882 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87805126 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87805340 G A Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 87805509 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87805527 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87805669 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87805821 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87805824 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 87805963 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87806187 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87806197 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 87806277 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87806385 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87806486 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87806532 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87806606 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87806680 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87806728 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87806951 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87807079 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87807084 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87807166 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87807316 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87807334 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87807585 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87807705 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87807735 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87807806 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87808252 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87808284 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87808337 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87808489 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87808580 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87808582 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87808694 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87808761 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 87808981 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87809091 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87809243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87809421 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87809481 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 87809649 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87809862 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87809942 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87809951 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87809960 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87810059 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 87810068 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87810193 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 87810400 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87810431 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87810461 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87810698 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 87810712 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87810722 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 87810915 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87810931 C A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 87810971 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87811119 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 87811135 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 87811165 C G Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 87811343 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 87811463 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87811503 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87811513 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87811690 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87811697 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87811742 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 87811764 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87811860 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87812039 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87812082 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87812100 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87812166 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87812466 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87812532 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87812552 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87812553 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 87812617 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87812621 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87812775 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87812826 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87812840 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87812894 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87812932 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87812955 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87812991 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87812993 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87813039 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87813056 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87813074 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87813140 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 87813148 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 87813312 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87813501 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87813918 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87814086 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87814593 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87814650 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87814771 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87814849 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87814879 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87814946 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87814965 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87814972 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87814989 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87814995 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87815049 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87815089 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87815127 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87815212 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87815288 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87815295 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87815384 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87815622 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87815705 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87815763 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87815769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87815917 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87815960 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87816038 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87816117 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87816262 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87816515 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 87816570 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 87816676 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87816714 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87816769 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87816776 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87816830 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87816844 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87816883 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87816988 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 87816996 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 87817120 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87817148 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87817153 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87817165 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87817191 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87817206 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87817235 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87817266 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 87817302 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 87817415 G C Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 87817685 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87817848 A T N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 87817860 A T N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 87817866 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 87817878 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 87817949 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 87818076 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 87818155 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 87818217 A C Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 87818948 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 87818958 C A Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 87818985 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 87819135 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87819174 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 87819284 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 87820380 C T Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 87820536 T C Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 87820558 C G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 87820570 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 87820615 A T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 87820631 C A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 87820648 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 87820674 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 87821508 T G Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 87821527 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87821534 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 87821718 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 87821741 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 87821822 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 87821835 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87821876 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87821931 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87822027 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 87822621 A G Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 87822669 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87822830 A C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 87822841 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 87822870 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 87822917 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87822971 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87822984 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87823029 T A Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 87823114 C G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87823159 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 87823167 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 87823189 A G Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 87823208 T G Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 87823232 A T Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 87823247 T G N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 87823268 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 87823281 T G N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 87823334 A T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 87823458 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87823484 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 87823497 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87823513 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87823545 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87823632 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87823820 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87823830 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87823922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87823943 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87823957 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87823977 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87824045 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87824216 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87824253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87824292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87824306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87824324 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87824335 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87824407 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87824466 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87824500 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87824526 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 2 87824529 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 2 87824853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87824857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87824894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87824904 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87824924 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87825029 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87825037 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87825142 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87825179 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87825223 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87825333 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87825348 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87825408 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87825643 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87825704 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 87825748 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87825908 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87825947 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87826221 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87826231 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87826352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87826968 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87827165 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87827178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87827277 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87827304 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87827327 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87827797 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87827825 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87827917 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87827982 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87828017 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87828120 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87828253 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87828301 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87828316 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87828398 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 87828461 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 87828499 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 87828995 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87829392 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87829401 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87829473 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87829756 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87829787 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87829851 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87829852 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87830071 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87830867 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87830873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87831047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87831152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87832155 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87833001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87834309 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87834553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87835307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87835700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87836335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87836414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87837655 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87837953 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87838279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87838509 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87838738 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87838999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87839115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87840039 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87840622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87840852 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87841080 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87841563 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87841710 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87841864 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87841889 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87842033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87842120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87842207 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87842213 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87842248 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87842262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87842352 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87842356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87842369 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87842519 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87842546 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 87842793 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87842798 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 87842857 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87842860 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87842922 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87842960 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87842979 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87843002 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87843012 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87843013 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87843107 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87843108 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87843147 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87843172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87843314 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87843334 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87843351 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87843417 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87843502 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87843654 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87843702 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87843776 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87843922 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87844237 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87844649 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87844877 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87845166 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87845190 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87845305 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87845326 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87846139 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87846148 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87846184 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87846208 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87846768 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 87846942 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 87846948 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 87847044 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87847057 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87847073 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87847161 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87847273 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 87847293 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87847306 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87847404 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87847451 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87847467 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87847513 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87847526 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87847534 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87847633 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87847739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87847820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87848123 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87848129 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87848141 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87848160 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87848164 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 87848278 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87848553 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87848596 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87848707 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 87849054 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87849280 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87849529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87849545 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87849995 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87850368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87850902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87851229 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 87851595 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87851785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87851960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87852263 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87852526 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 87852564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87853390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87853943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87854001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87854168 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87854492 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87854655 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87854716 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87855058 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 87855060 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87855076 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87857870 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87857887 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 87860201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87860276 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87860482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87860992 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 87861403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87862986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87863499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87863878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87864754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87864781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87865030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87866337 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87867966 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87868564 T A Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 87868609 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87871675 T C Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 87872106 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87872525 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87872691 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87873067 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87873410 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 87873525 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 87873558 G C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 87873841 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87874269 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87875462 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87875554 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87876584 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87883845 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87883866 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87883925 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87883934 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87886146 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87887020 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87887375 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 87888485 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87888512 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87889531 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87892325 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87892716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87892748 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87899367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87901141 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87902094 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87902782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87903304 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87904769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87907067 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87908001 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 87911601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87911784 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87912950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87914674 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87916131 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87916703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87919219 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87920147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87921500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87923319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87924414 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87925071 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87925811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87926868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87928674 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87929532 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87932600 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 87932947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87932994 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87933319 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87936628 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87940078 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87941029 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87945729 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87945816 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87948426 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87949591 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87953290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87953430 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87956084 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87963887 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87970089 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87971545 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87971878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87972644 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87973491 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87973933 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87975028 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 87975036 G C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 87975160 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 87975717 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 87976573 G C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 87976943 G C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 87976974 T A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87977877 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87978548 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87981277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87981448 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 87981524 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 87982778 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87983011 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 87983083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87983246 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87983426 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 2 87983429 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87983444 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87983529 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87983962 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87983973 T A Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 87983977 T C Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 87984040 T A Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 87984234 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 87984364 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 87984521 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87984650 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 87984709 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87984748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87985366 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 87985375 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87985383 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 87985400 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 87985865 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 87985874 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87986065 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 2 87986164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87986365 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87986383 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87986489 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87986554 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87986563 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87986590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87986604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87986665 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87986790 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87986993 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 87987030 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87987055 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87987109 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87987553 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 87987587 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87987620 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87987629 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87987646 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87987854 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 87987919 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 87988027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87988314 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87988402 T G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 87988444 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87988509 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 87988548 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 87988828 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87989076 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 87989187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87989596 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 87989700 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87990054 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87990142 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87990226 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87990449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87990555 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87990607 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87990922 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87991047 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 87991330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87991547 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87992173 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87992259 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 87992345 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 87992892 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87993188 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 87993252 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 87993386 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87993402 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 87993445 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87993505 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87993545 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 87993585 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 87993794 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87994322 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87994722 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 87994768 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87994807 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87994866 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 87995175 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87995190 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 87995238 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 87995434 G T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 87995525 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 87997196 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87997370 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 87997384 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87997931 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 87998056 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87998305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87998692 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 87998705 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 87998730 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 87998735 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87998749 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 87998772 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 87999014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 87999455 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 88000226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88000590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88000914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88001789 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.0526315789473684 19 19 1 17 1 2 88002213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88002469 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 2 88002479 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 88002496 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88002679 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 88003085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88003174 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 88003195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88003679 T A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 88004253 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 88004382 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88004662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88005358 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88005723 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 88006452 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88006550 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88006707 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 88006715 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88006800 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88007715 A C Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 88009522 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88009651 G A Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 88009803 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88020685 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 88020698 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 88020732 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 88021791 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 88021940 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88021964 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88022404 A G Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 2 88022502 C A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 88022504 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 88022615 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88022641 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 88022657 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88022770 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 2 88022780 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 88022918 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 88022972 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88023033 T A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 88023088 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88023158 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88023179 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 88023197 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 88023289 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 2 88023318 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88023423 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88023493 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88023543 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88023578 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88023585 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 88023633 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88023674 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88023760 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88023773 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 88023879 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 88023935 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 88023963 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 88024040 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88024147 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88024193 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88024246 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88024350 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 88024487 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88024685 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 2 88024700 A T Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 88024866 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88025020 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88025083 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88025098 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88025314 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88025785 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88025941 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88025978 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 88026038 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88026060 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88026068 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88026074 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88026082 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88026277 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 88026290 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 88026299 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88026311 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88026411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88026444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88026477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88026510 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88026569 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 88026616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88026651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88026694 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88026875 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88026933 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88027091 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88027248 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 88027277 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 88027365 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88027421 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88027450 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88027486 T G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 88027529 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88027600 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88027748 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88027779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88027783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88027837 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88027872 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88027905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88027930 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88027946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88027960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88027980 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88027993 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88028032 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88028033 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88028168 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88028206 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88028209 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88028241 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88028243 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 88028256 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88028284 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88028347 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88028430 C A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88028439 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 88028474 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88028650 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 88028778 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 88028949 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 88028973 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 88028987 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 88029100 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88029141 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 88029197 C T Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 88029269 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88029299 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88029333 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88029450 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88029820 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 88029846 T A Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 88030111 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 88030131 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 88030165 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88030173 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88030220 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 88032228 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 88032282 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88032295 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88032299 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88032328 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 88032803 A G Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 88032949 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88032952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88033002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88033019 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88033026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88033055 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88033102 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88033194 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88033244 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88033268 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88033280 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 88033283 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88033298 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88033366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88033383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88033406 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88033409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88033431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88033532 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88033691 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 88033761 T C Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 88033784 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 88034035 G A Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 88034458 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88034592 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88034630 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88034696 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88034708 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88034724 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88035558 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88035590 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 88035625 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88035670 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88035777 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 88035825 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 88035861 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 88036022 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88036027 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88036077 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88036080 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88036179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88036182 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88036274 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88036284 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88037131 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 88037163 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 88037216 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88037228 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88037450 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88037469 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88037506 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88037516 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88037735 T C Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 88039066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88039275 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 88039771 C G Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 88040077 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88040199 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88040214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88040305 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 88040411 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 88040613 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 88040710 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88040858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88041089 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88041104 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88041114 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88041358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88041374 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88041398 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88041775 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88042218 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88042231 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88042348 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88042372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88042399 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88042503 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88042821 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88042837 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88042969 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88042973 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88043018 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88043064 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88043098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88043176 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88043215 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88043218 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88043260 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88043306 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88043319 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88043325 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88043343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88043348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88043358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88043415 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88043438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88043473 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88043474 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88043529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88043569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88043596 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88043807 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88043846 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88043933 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88043961 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88044022 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88044067 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 88044232 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88044281 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88044282 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88044781 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88044990 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88045056 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88045106 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88045152 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88045267 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88045310 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88045402 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88045416 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 88045425 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88045518 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88045544 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88045606 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88045667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88045964 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88045975 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 88045995 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88046005 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88046038 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88046055 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 88046095 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 2 88046300 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88046386 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88052985 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88053012 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88053049 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88053534 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88053622 A T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 88053839 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 88053968 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88053985 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88054107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88054174 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88054209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88054283 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88054287 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88054505 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88054509 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88054942 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88055113 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88055200 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88055314 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88055315 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88055671 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88055777 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88056026 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88056152 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88056184 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88056190 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88057191 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88057196 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88057215 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88057246 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88057323 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88057375 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88057385 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88057890 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88058000 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88058326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88058358 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88058420 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88058443 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88058653 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88059120 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88059144 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88059373 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88060415 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88060446 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88060459 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88060623 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88060766 G C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88061341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88061385 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 88061415 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88061442 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 88061854 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88061868 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88061892 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88062022 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 88062145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88062426 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88062538 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88062817 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88062862 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88062877 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88063633 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88063758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88064000 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88066966 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 88067236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88067318 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 88067385 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 88068392 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88068708 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88068992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88069132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88069513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88069611 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88069664 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 88069733 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88069746 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88069804 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88069937 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88070018 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88070354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88070355 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88070402 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88070426 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88070491 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88070683 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88070925 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88070955 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 88070956 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 88070997 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 88071462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88071509 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88071535 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88071702 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88072027 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88072091 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 88072178 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88072194 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88072519 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 88072528 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88072568 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88072588 T A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 88072734 G C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 88072807 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 88073983 T G Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 88074082 T C Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 2 88074109 C G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 88074177 G A Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 2 88074430 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 88074894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88075062 G C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 88075256 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 88075461 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88075541 C A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 88075815 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 88075840 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 88075940 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 88076034 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 88076144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88076145 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88076255 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88076348 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88076590 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 88076599 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 88076739 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88076834 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88077020 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88077349 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 88077582 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88077729 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88077841 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88077855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88077873 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88077897 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88077915 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88077918 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88077957 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88078008 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88078127 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 88078212 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88078345 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 88078391 T A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 88078501 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 88078536 A C N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 88078670 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88078677 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 88078710 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 88078753 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 88078956 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 88078965 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 88079002 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 88079008 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 88079016 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88079302 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 88079337 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88079366 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88079442 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 88079617 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88079659 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88079662 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88079716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88079767 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 88079770 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 88079957 C A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 88080143 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 88080194 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 88080333 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 88080380 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 88080606 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88080838 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88080880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88080937 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88081019 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88081108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88081221 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 88081250 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 88087996 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 88088010 T A Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 88088175 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88088190 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88088253 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88088443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88088585 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 88088727 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 88088893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88088948 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 88088975 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 88089137 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88089206 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88089216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88089405 A C Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 88089487 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 88089533 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88089598 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 2 88089650 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88089889 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 88090076 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88090093 C G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 88090110 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 88090354 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88090437 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 88090477 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88090525 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88090589 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 88090660 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88090676 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88090807 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88090954 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88090972 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88090986 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88091008 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88091065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88091097 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88091127 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88091142 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88091230 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88091287 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88091406 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 88091425 G A Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 88091493 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88091532 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88091549 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88091743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88091744 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88091792 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88091929 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88092001 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 88092076 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88092144 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88092149 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88092279 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 88092305 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88092307 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88092330 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 88092337 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 88092586 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88092605 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88092760 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88092819 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 88092884 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88092907 A C Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 88093055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88093061 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88093116 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88093280 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 88093293 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88093298 A T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 88093311 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88093818 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88093944 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88094178 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88094205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88094353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88094379 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88094460 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88094828 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88095000 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 88095008 C A Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 88095017 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 88095191 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88095423 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88095550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88096837 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88097207 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88100176 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 88101882 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 88101899 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 88101905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88102039 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88102275 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88102396 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88102435 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88102569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88102633 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 88102637 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88102647 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88102791 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88103376 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88103860 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88103865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88104276 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88104400 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88104733 T A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 88104758 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88105912 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88105935 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88105976 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88106288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88107290 G C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 88107701 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88107815 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88107988 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 88108213 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88109062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88109579 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88109777 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88109864 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 88110146 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88110214 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88111323 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88111351 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 88111772 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88112856 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88113458 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88114237 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88114469 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88114550 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88115375 C A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 88115635 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 88115783 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88118662 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88118673 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88119162 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 88120148 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 88121291 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 88121658 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88123621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88125313 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88125413 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88125998 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88127417 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88127548 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88128794 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88130412 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88132842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88133202 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88133561 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88135112 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88136642 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88137030 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88137633 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 88138363 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88140967 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 88147716 T A Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 88148399 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88149378 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88149517 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88149739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88150109 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88152264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88152525 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88152541 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88153723 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88156487 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88157334 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88157740 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88158343 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 88159223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88159844 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88162446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88163207 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88163718 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88163801 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88164203 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 88164425 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88164443 C G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 88164452 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 88165263 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88165498 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88165725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88166437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88167093 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88167142 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88167218 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 88167566 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 88167688 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 88167744 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88168224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88168260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88168359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88168432 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88169661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88169702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88169920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88170756 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 88170860 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88170981 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88171014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88172668 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88173082 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 88173518 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88174109 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88174417 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88174764 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88175168 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88175252 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88175279 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88175840 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88175956 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88176982 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 88177343 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 88177369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88177429 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88177860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88178004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88178662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88178704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88178943 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88179207 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88179470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88179683 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88179999 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 88180335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88180676 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88181133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88181237 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88181263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88181689 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 88181951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88182935 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88183120 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88183457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88183527 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88183643 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 88183730 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 88183775 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 88184126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88184168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88184369 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88184717 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88184784 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88184871 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88184906 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88184966 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88185133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88185137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88185187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88185271 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88185493 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88185667 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88185837 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 88186043 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88186110 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88186137 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 88186456 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88186515 G T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 88186754 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88187200 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 88187394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88189180 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88191249 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88191250 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88191304 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88191317 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88191732 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 88191735 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 88192383 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 88192494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88193046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88193090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88193366 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 88193703 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 88193919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88194220 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88194286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88194300 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 88194326 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 88194397 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88194420 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88194523 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88194587 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88194625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88194641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88194916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88194955 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 88195014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88195159 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 88195180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88195620 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88195637 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 88195775 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 88196043 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 88196050 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88196071 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88196752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88196836 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88196968 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 88196977 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88197241 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 88197343 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88197470 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88197701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88197708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88197768 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88197769 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88197805 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 88197930 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88198007 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88198492 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88198551 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88198642 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88198675 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88198772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88198922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88198969 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88198988 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 88199021 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88199064 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 88199121 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 88199133 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 88199191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88199259 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88199270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88199303 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88199307 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88199336 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 88199407 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 88199486 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88199518 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88199655 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88199732 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 88199737 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 88199802 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 88199824 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 88199840 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 88199854 G T N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 88199875 G T N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 88201745 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88201812 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 88201856 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 88201995 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88202016 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 88202171 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 88202340 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 88202551 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88202626 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88202731 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 88202847 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88202866 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88202905 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 88202913 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88202965 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88203096 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88203124 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88203132 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88203148 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88203178 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88203190 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 88203228 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 88203326 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88203411 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88203557 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88203573 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 88209458 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88210313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88210530 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88210569 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88210617 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88210692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88210773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88210829 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88211050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88211169 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88211250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88211349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88211668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88211695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88211860 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88211941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88212108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88212180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88212182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88212248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88212290 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 88212433 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 88212448 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 88212457 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 88212507 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88212702 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88213025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88213090 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88213522 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88213902 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88214047 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88214072 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 88214334 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88214508 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88214911 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88215346 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 88215685 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88216027 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88216421 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88216817 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88216970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88217110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88217124 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88217170 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88217222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88217224 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88217317 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 88217984 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88218303 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88218562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88218949 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88219025 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 88219061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88219114 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88220070 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88220168 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 88220179 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 88220263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88220271 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88220388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88220655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88221117 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 88221458 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88221845 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88221938 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88222119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88222143 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88222304 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88222418 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88222519 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 88222652 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 88223151 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 88223438 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 88223509 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88223530 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88223939 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88224081 G T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88224236 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 88224292 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88224408 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88224565 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88224677 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88224696 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88225174 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88225986 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 88226002 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88226083 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88226639 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88226967 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88227187 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 88227395 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 88227685 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 88227999 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 88228383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88228446 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88228463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88228518 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88228670 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88228730 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88228889 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 88228962 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88229125 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88229256 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88229332 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 88229678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88229800 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 88229876 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88230066 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 88230695 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 88231081 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88232916 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88232938 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88233036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88233077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88233299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88233395 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88233505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88233507 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88233635 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88233712 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88233801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88234006 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88234067 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88234137 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 88234345 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88234807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88234828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88234885 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88234932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88234979 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 88235041 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 88235161 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 88235195 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88235397 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88235778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88235845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88235914 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88236092 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88236136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88236494 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88236496 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88236518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88236534 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88236923 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88237009 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88237039 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 88237050 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88237183 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88237187 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88237269 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88237456 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 88237528 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 88237624 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 88237694 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88237781 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 88237809 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 88237894 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 88237931 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 88237948 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 88237962 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 88237987 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88237990 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88238144 G C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 88238155 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88238230 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88238244 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 88238256 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88238273 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88238286 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88238297 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88238305 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 88238338 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88238383 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88238413 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 88238422 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 88238471 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88238579 C A Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 88238723 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 88238812 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 88238840 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88238863 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 88238894 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 88238914 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88238972 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 88239114 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 88239127 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 88239135 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88239143 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 88239211 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88239297 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 88239592 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 88239684 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 88239702 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 88239755 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88239792 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88239798 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88239804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88239812 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88239867 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88239987 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88239988 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 88240016 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88240044 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88240217 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88240234 A T N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 2 88240379 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88240406 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 88240563 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88240592 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88240606 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88240625 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88240627 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88240681 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 88240691 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88240703 C A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 88240714 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 88240891 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 88240932 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 88240935 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 88241168 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 88241328 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88241339 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88241356 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88241361 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88241382 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88241499 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88242064 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 88242097 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 88242141 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 88242169 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 88242322 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88242361 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88242440 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88242466 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88242494 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88242520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88242543 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88242643 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88242673 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88242700 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88242727 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88242733 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88242781 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88242787 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88242811 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88242824 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88242847 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88243153 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88244415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88244611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88244700 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88245337 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88245740 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88246780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88248746 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88249428 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88250918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88251607 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 88251614 T A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 88251624 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 88252634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88254029 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 88255359 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 88256089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88256123 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88256147 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88256177 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88256232 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88257178 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88258900 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 88260857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88261310 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88263130 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88263322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88263494 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88263564 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88263830 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88264058 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 88264379 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88264468 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88265806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88266869 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88268006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88268791 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88269787 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88270346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88270510 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88271575 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88272070 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88272086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88272625 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88273449 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88273945 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88274358 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88274925 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88276505 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88276692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88277551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88277779 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88277812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88277972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88278533 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 88278658 A G Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 88278805 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88278813 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 88278826 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 88279102 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88280354 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88280694 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88280700 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88281479 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88281615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88281618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88281776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88282050 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88283040 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88283614 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88283782 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 88284348 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88284635 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88284636 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88284803 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88284813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88285019 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88286362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88287410 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 88288930 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88288945 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88290109 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88290515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88291855 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88292916 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88293562 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88294490 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88295269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88295801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88295816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88297953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88298111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88298862 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88298995 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88299087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88300324 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 88300967 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88301458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88302077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88302694 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 88302992 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88303098 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88303874 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88303914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88303964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88304332 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88305252 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88305301 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88306070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88306071 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88306394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88306417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88306543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88306699 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88306735 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88306742 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88306766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88309316 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 88310491 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88310650 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88310844 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88312033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88312347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88313171 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88314713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88314798 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88314984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88314986 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88315845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88315882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88316005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88316169 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88316320 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88316465 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88316536 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88316682 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88316759 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88323198 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88323280 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88323399 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88323460 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 88323491 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88323837 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88324069 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88325630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88325935 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88326135 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 88326971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88328226 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88328669 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88329388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88329483 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 88329601 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 88329630 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88334657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88334796 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88335011 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88335301 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88338815 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88338913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88339730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88341149 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88341662 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 88342843 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88344103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88344252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88344825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88344963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88347054 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88347337 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88355840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88356226 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88358923 A G Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 88359547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88359635 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 88359864 C G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88359875 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88359948 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88360000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88360354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88361389 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88362907 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88363017 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88363635 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88364014 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88366510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88366737 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 88367296 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88367401 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88370684 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88374194 G C Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 2 88374310 C G Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 88374589 T C Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 88375325 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 88376461 T G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 88377540 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88377628 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88377955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88378122 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88378223 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88378338 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88378382 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88380819 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 88383616 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88384890 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88386198 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88387796 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 88388381 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88388811 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88389062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88389259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88389461 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88389640 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 88389717 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88389959 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88390015 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88390025 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88390084 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88390118 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88390226 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88390525 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88390562 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88390634 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88390740 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88390847 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88390908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88390971 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88391316 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88391451 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88391540 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 88391724 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88391757 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88391808 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 88392218 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 88392251 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 2 88392317 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88392384 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 88392433 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 88392477 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88392535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88392647 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88392920 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88393090 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88393114 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88393373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88393411 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88393954 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88393984 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88394466 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 88394559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88394760 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88394972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88395021 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88395299 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88395354 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88395416 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88395438 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88395624 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88395718 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 88395774 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88395776 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88395879 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 88395923 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88395957 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88396129 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88396143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88396165 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88396199 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88396203 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88396318 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88396621 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 88396672 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88396693 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88396883 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 88397260 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88397311 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88397383 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88397596 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 88397614 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 88397674 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 88397869 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 88397939 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88398455 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88398569 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88398730 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88398776 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88398829 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88399115 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 88399136 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 88399858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88400145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88400161 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88400860 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88400877 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 88400928 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88400964 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88401302 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88401353 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 88401387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88401632 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 88401994 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88402058 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88402126 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88402292 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 88402819 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 88403126 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88403303 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88403752 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 88403753 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 88403763 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88403921 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88403981 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88404296 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88404773 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88405130 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88405284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88405622 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 88405760 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88405825 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88405972 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 88406011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88406423 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88406441 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88406602 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 88406771 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 88407057 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88407314 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 88407522 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 88407688 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 88407825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88407882 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 88408147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88408359 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88408608 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88408884 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88409076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88409140 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88409481 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88409617 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88409996 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 88410016 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88410072 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88410143 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 88410255 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88410256 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88410463 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88410556 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 88411188 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 88411296 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 88411391 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88411554 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 88413371 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88413480 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88413718 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 88414177 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88414287 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88414678 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88414925 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88414987 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88415639 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88415909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88415997 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88416101 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88416383 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 88416578 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88417042 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88417876 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88418345 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88418592 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88418854 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88419071 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88419353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88419827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88420002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88420207 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88420478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88420590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88420901 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88421372 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 88421475 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88421494 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 88421513 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 88421538 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88421585 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88421984 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 88422025 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88422137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88422249 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88422512 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88422895 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88422952 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88423035 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88423347 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 88423374 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88423560 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88423653 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88423666 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88423670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88423681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88423885 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 88424090 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88424212 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88424600 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88424674 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88424704 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88424754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88425512 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88425591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88426125 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88426322 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88426376 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 88426394 A T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 88426482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88426619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88426852 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88428255 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88429922 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 88429923 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88430363 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88430487 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88433123 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88433311 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88442083 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 88442519 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88442579 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88442871 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88443544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88443735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88445633 T A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 88446514 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88446544 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88446769 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88447352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88447568 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88447582 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88447798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88448109 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88448448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88448496 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88449075 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88449245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88450215 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88451940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88457710 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88457969 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88459987 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88460052 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88464384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88464438 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88465182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88465441 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88465477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88465651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88465683 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88467009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88467537 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88469586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88470864 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88470914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88470994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88472684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88473181 C A Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 88474234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88474996 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88476679 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88476715 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 88476731 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88476756 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88476861 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88476926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88476927 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88478019 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88478631 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88479125 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88479622 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88479835 C T Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 88479924 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 88480907 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88481226 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 88481231 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 88483324 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88484258 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88485772 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 88487835 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 88487849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88488349 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88489523 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88490146 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88490273 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88490887 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88491211 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88491846 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88494174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88494301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88494412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88494439 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88494761 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88495298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88495515 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88496025 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 88496105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88496836 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88498607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88498816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88499594 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88500211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88501222 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88501224 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88502157 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88502361 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88503033 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88503745 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88503802 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88504016 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88504134 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 88511388 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 88511873 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 88511950 T A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 88511973 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88512651 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 88513211 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88513660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88514113 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 88514775 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 88515330 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 88517593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88517659 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88517768 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 88517970 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 88519185 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88519437 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88519530 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88519568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88519586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88519718 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 88519766 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88520730 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88521092 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88521101 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 88521968 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88522799 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 88523672 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88523919 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88524264 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88525174 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 88525628 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 88526473 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 88526505 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88526553 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88526977 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 88527794 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 88528175 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88528533 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88528741 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88528898 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88528969 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88529439 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 88529552 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 88530179 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88530685 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88531684 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 88531788 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 88532324 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88532404 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 88532801 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88533008 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88534289 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88534998 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88536685 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88536865 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88537179 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88537342 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88537491 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 88538675 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 88539045 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88539170 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88539519 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 88539740 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88539792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88540039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88540481 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88541266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88541350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88541436 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88541868 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 88541916 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88542526 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88543139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88543497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88543793 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88544554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88545055 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88545151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88553011 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88555010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88555125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88555250 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88555963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88556791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88557971 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88560762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88562036 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88564629 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88566016 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 88566932 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 88566976 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 88567444 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88567501 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88567827 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88568044 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88568352 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 88568577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88568664 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88569638 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88569676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88569688 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88569706 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 88569719 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88569896 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88570547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88571137 A G N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 88571272 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88571534 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88572988 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88573020 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 88573073 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 88574513 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88575006 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88575139 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 88575363 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88575536 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88575843 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88576919 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88577171 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88577280 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88578368 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88578455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88578820 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88579552 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88579765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88579785 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88579794 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88580018 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88580087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88581134 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 88581377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88581739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88581965 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88582895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88583686 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88583718 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88583719 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88583924 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88583961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88583989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88584015 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88584017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88584027 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88584155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88584376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88584440 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88584523 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88584690 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88584946 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88584983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88585083 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88585113 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88585442 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88585623 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88585774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88586029 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88586352 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88587339 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88587495 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88587737 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88587843 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 2 88587998 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88587999 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88588064 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88588689 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88588887 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88589100 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 88589107 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 88589344 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 88589418 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 88589419 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 88589489 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 88589493 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88589523 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 88589640 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88589710 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 88589727 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88589771 G T Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 88589887 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 88589906 C T N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 88589922 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 88590026 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 88590073 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 88590097 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 88590182 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88590184 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 88590212 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 88590298 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88590409 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 88590445 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88590463 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88590530 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88590538 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88590556 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 88590610 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88590730 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 88590761 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 88590853 A T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 88590877 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 88590881 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 88590952 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 88590963 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 88591064 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 88591076 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 88591107 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 88591215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88591257 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 88591409 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88591648 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88591662 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88591796 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88592114 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 88592193 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 88592272 A C Y N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 88592460 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 88592539 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 88592854 G T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 88592990 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 88593211 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88593243 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88593362 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 88593955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88594013 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88594265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88594399 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 88594609 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88594631 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 88595133 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88595209 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 88595332 T C Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 88595907 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 88595973 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88596081 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88596522 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88596801 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88597567 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88598030 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 88598083 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88598163 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88598388 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88598765 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 88598822 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88598913 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 88599076 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88599595 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88600672 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88600768 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88601180 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88601577 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88601828 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88601974 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 88602311 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 88602338 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 88602530 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88602817 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88602824 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88602969 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88603021 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88603181 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88603257 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88603332 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88603356 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88603561 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88603640 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88603953 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88603962 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88604005 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88604041 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88604119 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88604228 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88604364 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88604742 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88605479 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88605621 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88605862 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88606235 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88607511 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88607739 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88607754 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88607777 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88608561 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88608653 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88609389 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 88609421 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 88609986 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88610392 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88610417 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88610642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88610798 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88611056 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88611169 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88611291 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88611379 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88611489 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88611520 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88611698 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88611817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88611818 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88611841 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88612101 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88612563 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88612737 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88612976 G T N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 88613958 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88613974 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88614749 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88615170 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88615202 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88615220 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88615270 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88615405 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88615480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88615726 G C N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 88615780 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 2 88621206 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88621339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88621430 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88621839 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88621929 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88621986 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88622085 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 88622115 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 88622142 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88622212 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88622265 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88622428 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88622693 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88622710 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88622935 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88623073 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88623393 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 88623457 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88623534 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 88623546 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 88623632 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 88623840 A G Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 88623857 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 88623974 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 88624083 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88624313 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88624411 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 88627005 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 88627194 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88627430 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88627506 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88627701 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88627776 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88627828 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88627938 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88627941 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88627980 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88628119 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88628121 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88628140 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88628142 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88628159 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88628355 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88628356 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88628371 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88628378 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88628447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88628568 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88628664 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88628714 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88628718 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88628728 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88628738 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88628744 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88628840 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88628923 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88629081 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88629122 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88629131 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88629367 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88629469 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88629478 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88629506 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88629558 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88629708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88629736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88629839 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88629871 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 88629924 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88629950 T G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 88629958 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88629972 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88629976 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88630068 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 88630221 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 88630274 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 88630289 C T Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 88630405 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 88630560 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88630587 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88630679 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88630850 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88630893 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88630972 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88631027 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 88631127 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 88631276 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88631402 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 88631636 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88631734 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88631775 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88631793 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88631995 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88632032 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88632124 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 88632389 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88632582 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 88632621 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88632645 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88632797 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88632830 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88632954 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 88632997 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88633067 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88633188 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88633290 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88633293 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88633303 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88633441 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88634033 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 88634212 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88634330 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88634367 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88634394 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88634424 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88634506 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88634564 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88634723 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88634817 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88634960 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88635213 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88635293 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88635588 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 88635635 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88635740 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88636158 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88636346 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 88636430 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 88636551 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88636644 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 88636719 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 88636816 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88636902 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88637017 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 88637081 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 88637862 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88637975 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 88638310 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88638386 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 88638396 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 88638400 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 88638475 G C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 88638606 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 88638802 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 88638859 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 88639113 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88639165 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88639230 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 88639289 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88639390 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 88639722 T C Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 88639909 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 88639999 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 88640168 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88640233 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88640306 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88640338 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88640451 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88640694 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88640706 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88640810 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88640855 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88640863 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88641084 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88641356 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88641404 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88641510 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88641599 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 88641622 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88641845 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88642130 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88642154 C G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 88642357 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88642426 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88642518 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88642521 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88642951 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88642981 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88643007 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88643225 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88643406 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88643555 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88643670 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88643708 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 88644149 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88644235 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88644612 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88644684 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88644881 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88644916 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88644941 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88645027 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88645118 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88645132 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88645239 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88645309 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88645416 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88645573 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88645831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88645908 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88645953 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88646051 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88646242 T A Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 88646408 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88646441 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88646444 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88646548 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88646561 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88646570 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88646620 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88646734 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88646883 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88646953 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88647018 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88647045 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88647177 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88647519 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88647594 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88647783 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88648041 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88648074 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88648089 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88648428 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88648504 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88648705 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88648763 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88648984 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 88649065 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88649299 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88649318 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88649382 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88649596 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88649786 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88649898 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88650050 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88650077 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88650327 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88650483 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88650541 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88650719 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88651053 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88651220 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88651669 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88651729 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88651832 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88651950 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88652029 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88652356 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88652401 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88652444 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88652494 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 88652527 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 88652623 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88652844 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88652929 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88653058 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 88653114 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88653310 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88653451 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88653571 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88653716 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88653742 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88653843 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88653875 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88653884 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88653985 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88654236 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88654289 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88654491 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88654729 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88654902 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88654929 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88654939 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88654949 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88655048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88655358 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 88655555 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88655742 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88655819 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88655832 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 88655912 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88656003 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88656012 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88656048 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88656075 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88656079 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88656096 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88656110 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88656138 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88656147 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88656173 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88656264 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88656371 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88656407 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88656429 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88656484 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88656571 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88656599 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88656630 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88656671 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88656695 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 88656742 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88656755 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88656759 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88656785 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88656812 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 88656935 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 88656974 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88657045 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88657110 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88657151 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88657176 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88657189 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88657205 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88657318 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 88657338 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88657581 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88657620 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88657706 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88657749 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88657755 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 88657929 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88658160 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88658383 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88658425 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88658551 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88658557 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 88658639 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88658862 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 88658937 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88658987 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 88659055 T G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 88659077 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 88659090 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 88659177 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88659292 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88659295 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88659326 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88659373 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88659463 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88659512 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88659563 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88659631 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88659702 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88659781 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88659830 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 88659946 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 88660006 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 88660016 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88660101 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88660149 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 88660568 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88660577 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 88660594 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88660638 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88660689 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 88660721 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88660792 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88660850 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88660952 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88661018 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88661111 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88661154 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88661281 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 88661387 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88661466 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88661598 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88661648 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88661664 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 88661693 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88661801 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88661871 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88662047 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88662086 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88662279 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88662282 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88662314 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88662359 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88662377 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88662405 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88662406 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88662551 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88662573 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88662575 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88662588 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88662629 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88662684 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88662841 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88662874 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88663000 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88663029 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 88663036 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 88663144 A T N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 88663180 A G Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 88663230 A G Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 88663237 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 88663280 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 88663297 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 88663387 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88663448 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 88663478 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88663530 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88663696 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88663748 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88663838 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 88663862 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88663899 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88664008 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88664043 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88664117 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 88664132 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 88664135 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 88664144 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 88664175 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 88664179 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 88664241 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88664258 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88664319 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88664320 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88664464 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88664638 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 88664711 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 88664875 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 88664938 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 88664947 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 88664985 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 88665075 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 88665182 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88665368 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88665384 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88665419 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88665542 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88665595 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88665641 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88665673 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88665720 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88665905 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88665992 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88666084 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88666115 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88666127 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88666154 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88666167 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88666230 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 88666302 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88666376 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88666485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88666500 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88666608 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88666623 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88666936 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88666946 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 88666953 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88667003 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 88667017 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 88667062 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 88667121 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88667159 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 88667216 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 88667250 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 88667415 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88667438 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88667456 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88667586 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88667590 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88667645 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88667660 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88667692 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88667832 G C N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 88668236 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88668263 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88668302 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 88668358 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88668411 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88668475 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88668519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88668559 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88668742 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88669074 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88669252 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88669299 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88669533 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88669608 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88669629 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88669662 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 88669740 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88669777 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88669794 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88669881 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88669949 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88670044 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88670133 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88670298 A T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 88670301 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 88670563 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88670727 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 88670747 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 88670941 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 88671005 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88671014 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88671067 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88671126 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88671357 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88671428 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 88671681 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88671713 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88671953 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88671959 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88672365 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88672378 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 88672380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88672410 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88672462 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88672637 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88672957 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88672959 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88673004 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88673388 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 88673459 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88673640 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88673718 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88673998 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88674035 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88674124 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 88674174 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 88674189 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 88674223 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 88674311 C A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 88674397 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 88674491 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88674523 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88674545 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88674565 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88674628 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88674834 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88674837 G T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 88675094 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88675244 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88675278 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88675449 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88675563 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88675586 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88675628 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88675643 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88675706 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88675711 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88675746 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88675750 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88675783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88675803 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88675858 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88675863 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88675918 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88676029 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88676052 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88676068 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88676073 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88676145 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88676202 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88676272 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88676297 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88676342 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88676391 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88676476 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88676498 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 88676629 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88676662 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88676671 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 88676770 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 88676846 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 88676933 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88677039 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88677040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88677103 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 88677316 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88677342 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88677349 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88677353 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88677399 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88677402 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88677420 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88677430 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88677437 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88677476 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88677506 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88677644 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88677645 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88677860 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88677928 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 88677940 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88678004 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88678008 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88678015 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88678045 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88678095 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88678291 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88678333 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88678356 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88678409 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88678523 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88678543 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88678674 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88678696 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88678720 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88678793 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88678854 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88678862 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88678933 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 88679070 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 88679177 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 88681882 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88681955 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88682189 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88682201 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88682234 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88682308 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88682450 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88682822 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88682894 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88682951 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88683124 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88683153 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88683208 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88683227 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88683368 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88683574 G C Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 88683676 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 88683861 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88683909 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88684069 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88684185 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88684238 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88684351 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88684356 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88684427 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 88684462 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88684483 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 88684501 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88684541 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88684563 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88684590 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88684613 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88684624 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88684646 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88684799 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88684921 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 88684956 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 88685011 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88685042 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 88685135 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 88685199 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 88685229 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88685256 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88685259 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88685364 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88685490 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88685500 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88685504 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88685585 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88685602 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88685618 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 88685638 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88685651 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88685692 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88685880 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88685888 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 88686123 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 88686155 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 88686577 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 88686634 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 88686798 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 88686807 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 88686817 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 88686878 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 88686958 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 88686985 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 88687049 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88687053 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88687089 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88687112 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88687165 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88687416 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 88687423 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88687469 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88687470 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88687620 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88687647 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88687770 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88687861 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88687945 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88687953 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88688059 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88688060 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88688162 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88688415 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 88688419 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 88688793 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 88688896 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88689051 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88689113 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 88689325 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88689405 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88689520 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88689561 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88689775 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88689800 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88689867 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88689873 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88689893 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88690227 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88690296 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 88691081 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88691099 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88691391 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 88691403 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88691459 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 88691502 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 88691570 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 88691706 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 88691897 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88691918 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88691974 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88692007 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 88692058 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88692132 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88692485 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88693172 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 88693173 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 88693243 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 88693382 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88693511 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 88693806 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88693826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88693849 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 88693911 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 88694004 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88694115 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88694162 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 88694367 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88694397 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88694417 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88694429 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88694566 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 88694712 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 88694841 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88695034 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88695421 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 88695514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88695531 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 88695735 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88695838 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88695949 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88695981 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88696053 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88696148 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 88696149 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 88696323 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88696364 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88696367 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 88696520 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88696556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88696557 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88696580 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88696583 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88696598 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 88696603 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88696657 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88696694 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88696801 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 88696919 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88697011 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88697034 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88697057 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88697065 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 88697069 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 88697105 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88697156 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 88697234 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 88697423 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 88697571 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 88697637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88697660 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 88697847 C T N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 88698077 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 88698079 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 88698118 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 88698226 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 88698280 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 88698340 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 88698588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88698715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88698727 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88698728 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88698877 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88698942 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88700106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88700114 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88700135 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88700165 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88700193 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 88700293 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 88700415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88700440 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88700447 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88700455 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88700462 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88700473 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88700566 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 88700604 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88700615 C G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 88700641 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 88700708 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 88700740 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88700770 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88700774 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88700783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88700791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88700813 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88700817 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88700829 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 88700842 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88700846 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88700859 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88700913 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88700974 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88701006 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88701054 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 88701074 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88701168 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 88701236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88701243 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88701270 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88701465 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 88701468 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88701582 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88701584 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88701615 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88701653 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88701700 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88701735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88701804 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88701817 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88701869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88701888 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88701931 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88701934 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88701946 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88701994 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88702060 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88702169 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88702230 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88702310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88702346 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88702378 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88702384 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88702537 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88702553 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88702586 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88702594 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88702740 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88702752 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88702810 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88702811 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88702958 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 88702959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88703005 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88703011 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88703043 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88703047 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88703070 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88703074 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88703083 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88703087 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88703184 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 88703459 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88703493 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 88703523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88703538 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88703582 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 88703613 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 88703667 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88703731 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 88703755 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 88703773 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 88703891 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 88703945 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 88703970 T A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 88704027 G C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 88704036 G C N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 88704046 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 88704092 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 88704193 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88704215 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 88704221 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 88704298 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 88704334 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 88704352 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 88704380 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88704414 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88704555 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 88704561 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 88704718 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 88704787 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88704896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88704970 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88704997 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88705147 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88705150 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88705169 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88705537 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 88705721 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 88705775 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 88705786 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 88705841 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 88705857 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88706018 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 88706039 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 88706041 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 88706051 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 88706110 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 88706151 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 88706163 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 88706258 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 88706423 T A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 88706443 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 88706448 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 88706476 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 88706502 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 88706505 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 88706522 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 88706644 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 88706772 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 88706793 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88706958 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 88707053 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 88707063 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 88707102 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 88707202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88707229 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 88707236 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88707240 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88707258 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88707404 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 88707412 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88707481 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 88707499 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 88707769 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 88707855 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 88708115 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88708214 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88708395 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 88708500 G C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 88708529 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 88708579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88708730 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 88708939 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 88708960 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88709053 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 88709136 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 88709313 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88709347 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88709448 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88709490 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88709557 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 88709588 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 88709710 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88709753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88709964 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88710067 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88710350 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88710363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88710403 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88710414 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88710617 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 88710625 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88710747 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 88710780 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 88711211 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88711253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88711271 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88711320 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 88711327 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88711337 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 88711610 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 88711706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88711715 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 88712031 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 88712096 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 88712200 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 88712209 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 88712378 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 88712391 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 88712441 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88712795 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 88712998 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88713128 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88713376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88713399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88713410 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 88713469 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88713526 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88713837 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 88713978 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 88713980 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 88714009 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88714238 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 88714245 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 88714465 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 88714509 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 88714589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88714805 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 88714871 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 88715009 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 2 88715713 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 88716043 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88716176 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88716217 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 88716319 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88716339 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 88716369 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88716422 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 88716580 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 88716587 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88716607 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88716737 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88716769 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88716870 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 88717096 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 88717110 G T N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 88717249 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 88717453 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 88717478 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 88717569 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 88717635 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 88717656 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 88717687 T G N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 88717858 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 88718386 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 88718452 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88719423 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88719542 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88719650 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88719783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88719798 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88719812 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88719871 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88719945 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 88719969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88719985 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88719994 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 88720150 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88720199 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 88720235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88720391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88720517 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 88720520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88720915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88720955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88721038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88721099 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88721713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88721841 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 88721870 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 88721941 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88722428 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 88723205 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88723651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88723688 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88723962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88724354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88724503 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88724811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88724903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88724944 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88725079 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88725112 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88726034 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 88726526 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 88726608 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88727194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88727387 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88727546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88728035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88728102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88728787 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88728799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88729133 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88729394 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88729563 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88729652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88730379 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 88730664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88730695 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88730746 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88730804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88731008 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 88731799 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88732134 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88732202 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88732247 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88732311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88732357 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88732645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88732681 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88732705 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88732853 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88733063 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 88733086 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 88733340 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88733401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88733512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88733529 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88733556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88733752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88733929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88733980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88734040 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 88734052 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 88734173 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 88734189 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 88734355 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88734491 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88734510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88734539 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88734545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88734599 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88734625 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88734667 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88734911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88734955 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 88734985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88735195 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 88735221 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 88735690 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88735704 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88735889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88736167 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88736388 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88736717 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88736757 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 88736806 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 88736841 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88737393 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 88737873 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88737880 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88737913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88737986 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88737994 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88738037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88738178 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88738465 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88738513 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 88738690 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 88738943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88738988 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88739291 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88739394 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88739677 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88739826 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88739982 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88740125 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 88740142 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 88740210 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88740237 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88740314 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88740321 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 88740529 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 88740543 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 88740651 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 88740746 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 88740842 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88740957 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 88741489 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88741509 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88741724 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88741748 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 88741822 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88741850 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 88741861 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88741906 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 88742040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88742937 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 88742989 C G N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 88743020 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 88743243 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88743266 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88743405 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 88743475 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88743497 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88743576 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 88743883 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88743885 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88743896 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 88744100 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 88744171 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88744579 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88744625 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88744753 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88744936 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88744949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88745008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88745055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88745112 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88745223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88745572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88745792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88746046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88746125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88746186 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88746532 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88746550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88746590 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88746628 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88746638 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88746655 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88746657 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88746674 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88746686 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88746742 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 88746849 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88746877 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88746880 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88746917 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88746994 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88747006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88747235 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88747254 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88747471 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88747516 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88747535 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88747608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88747617 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88747705 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88748097 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 88748142 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 88748176 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 88748242 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 88748389 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 88748390 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 88748533 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 88748639 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88748956 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 88749246 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88749440 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88749518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88749567 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88749571 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88749664 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88750093 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88751298 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 88751465 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88751619 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88751679 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 88751826 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88751865 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88752204 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 88752205 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 88752239 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 88752440 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 88752678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88752733 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88752849 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88752873 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88753031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88753316 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 88753586 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88753972 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88754020 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88754495 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 88754526 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 88754527 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88754633 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 88755004 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 88755215 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88755341 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 88755745 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 88755813 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 88756301 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 88756528 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88756702 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88756923 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88757033 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88757173 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88757223 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88757759 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88757811 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88757934 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88757989 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88758104 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88758383 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88758462 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88758495 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88758516 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88758718 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88758743 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88758765 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88759763 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 88760134 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88760617 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88760667 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 88760762 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 88761017 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 88761868 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 88762097 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 88762378 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 88762472 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 88762531 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88762659 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 88763572 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 88763833 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 88764029 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 88764282 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88764283 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88764653 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88764752 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 88764793 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 88764827 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 88765821 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 88766388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88766486 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 88766541 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 88766557 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88766649 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 88766889 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88766971 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88766984 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88767159 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 88767207 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88767254 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88767570 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88767600 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 88767948 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88768059 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 88768065 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 88768206 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 88768227 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88768235 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 88768587 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 88768750 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88768856 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88768937 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88769191 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88769296 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88769370 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88769399 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88769463 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88769487 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88769501 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88769556 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88769558 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88770471 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88770482 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 88770496 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 88770500 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 88770630 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88770777 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88770966 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88770986 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88771109 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88771310 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88771316 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88771419 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 88771921 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 88771961 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 88772012 G T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 88772024 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 88772038 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 88772147 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 88773506 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88773598 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88773898 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88773936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88774384 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88774448 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 88774451 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88774694 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88775027 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 88775101 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 88775175 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 88775223 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88775628 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88775724 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88775854 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88775855 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88775907 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88775990 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 88776670 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 88776846 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 88777009 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88777029 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 88777168 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88778600 T A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 88779223 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 88779729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88779786 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 88780040 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88780593 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88782723 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 88782950 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88782972 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 88783042 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88783120 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 88783289 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88784493 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88785846 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 88785953 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88786102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88786245 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88787017 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88787018 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88787439 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88788777 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88789035 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88789235 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88789264 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88789927 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88791178 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 88792329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88792882 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 88793032 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88794427 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88794897 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 88795728 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 88795997 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88796257 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88796815 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88797217 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 88797321 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88797648 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 88798075 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 88798368 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88798556 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88798565 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88799986 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88799987 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88800275 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88800411 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 88801164 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88801965 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 88803499 A C N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 88809881 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 88809954 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 88810186 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88810386 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88810510 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 88810671 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 88810754 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88810785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88810963 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88811036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88811295 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88811651 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 88811707 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 88812166 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88812312 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88813369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88813473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88813569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88814154 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88814499 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88815511 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88816057 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88816114 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88816753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88816840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88817365 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88817675 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88817825 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 88817865 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88817891 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88818105 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88818442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88818617 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88818629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88818720 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88818922 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88819090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88819298 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88819426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88819460 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 88819560 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88820142 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88820558 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88820589 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88820620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88820687 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88820729 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88820738 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88820856 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88820960 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88821249 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88821330 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88821388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88821715 G T N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 2 88822013 A T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 88822887 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88822916 A T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 88823125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88823250 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88823267 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 88823268 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88823304 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88823448 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 88823521 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 88823686 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 88824228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88824420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88824443 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88824453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88824510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88825154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88826190 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88826652 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88827604 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88827873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88828293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88828372 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88828935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88829012 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88830059 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88830186 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88830281 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88830341 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88830812 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88831297 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88831406 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88832634 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88833126 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88833208 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 88833361 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 88833559 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88833596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88833711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88833742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88833925 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88833976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88834082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88834260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88834276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88834304 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88834392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88834404 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88834471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88834537 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 88834709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88834829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88834885 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88834984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88835031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88835127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88835151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88835179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88836327 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 88836428 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88836488 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88836518 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88836578 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88836694 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 88836971 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88837026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88837030 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88837170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88837551 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88837559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88837571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88837579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88837639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88837849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88837871 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88838016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88838039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88838129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88838140 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88838201 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88838214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88838395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88838451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88838614 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88838635 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88838862 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 88838958 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 88839265 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88839419 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88839573 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 88839818 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 88839915 T A N N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 88840167 T G N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 88840169 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 88840216 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88840276 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 88840278 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 88840360 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88840381 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88840393 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88840394 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88840433 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88840503 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88840548 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88840560 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 88840668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88840727 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88840734 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88840764 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88840840 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88840841 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88840879 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88840942 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88840970 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88841146 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88841209 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88841211 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88841397 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88841411 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88841526 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88841607 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88841688 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88841817 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 88841946 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88842208 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88842252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88842414 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88842963 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88843027 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 88843143 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88843164 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88843165 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88843323 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88843360 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 88843636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88843643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88844557 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 88844763 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88844967 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 88845083 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88845821 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88847538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88847946 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88848102 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 88848340 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88848661 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 88849131 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88849659 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88849994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88851004 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88852010 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88852178 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88852440 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88852878 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88853194 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88853356 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88853590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88853614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88855601 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88855957 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88856226 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 88856351 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88856405 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 88856420 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 88857141 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 88857469 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 88858091 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 88858148 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 88858676 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88859009 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88860098 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88861147 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88861632 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 88861706 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 88861869 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88861959 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88862219 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88862273 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88862659 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 88862770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88862977 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88863055 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88863391 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88863652 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 88863721 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88863775 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88863778 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88863946 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88863947 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88864459 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88864560 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88864567 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 88864809 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88864992 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88865190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88866275 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88866845 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 88866928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88868022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88868184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88868637 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88868655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88868748 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 88868823 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88869111 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 88869268 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 88869425 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88869616 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88869984 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 88870136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88870197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88870427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88870603 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88870830 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88870862 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88870879 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 88871011 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 88872142 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 88873803 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88877158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88877415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88877922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88878160 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88878852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88881209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88881533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88881562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88881601 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88881796 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88882451 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88883565 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88883680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88884534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88885291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88885767 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88888361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88888961 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88889665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88889929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88890213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88890689 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88890734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88890803 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 88891901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88892774 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88893549 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88895352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88895770 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 88896920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88898783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88899680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88902205 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88902637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88904137 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88906428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88907420 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 88907527 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 88907625 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88907939 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88907971 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88909940 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88910218 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88910621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88910807 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88912729 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88913308 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 88914355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88915121 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 88915307 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88915849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88917371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88918260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88918991 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88920898 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88921809 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88922592 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 88923572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88924088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88925480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88926894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88927489 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88927572 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 88927706 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88928245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88930628 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 88930697 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88930767 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 88930912 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 88931118 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88931135 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88931154 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88931189 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 88931237 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 88931361 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88931372 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 88931377 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 88931454 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 88931457 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 88931509 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 88931545 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 88931560 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 88931568 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 88931618 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 88931712 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 88931783 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 88931865 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 88931963 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 88932007 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 88932045 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 88932065 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 88932101 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932149 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 88932155 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932213 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932254 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 88932341 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 88932361 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88932436 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 88932484 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 88932489 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 88932517 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 88932530 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88932549 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 88932595 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932607 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88932683 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932709 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932722 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932731 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932816 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88932830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88932838 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932861 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932891 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932909 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932912 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 88932945 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 88933606 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 88934039 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 88934178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88935198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88935414 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88935924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88936089 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 88936814 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88937190 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 88937396 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 88937653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88937668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88938459 C T Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 88938772 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88942422 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 88942537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88943533 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 88943851 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 88946004 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 88947032 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88947617 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 88948127 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88949799 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 88950392 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 88950409 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 88950420 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 88951600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88952061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88952951 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88953644 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88954946 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 88955532 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88958898 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88960764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88963937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88968187 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88969075 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88969894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88969935 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88971253 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88973630 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88974857 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88975544 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 88976365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88977477 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88979796 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 88980335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 88981252 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 88984054 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88985401 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 88986420 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 88987355 C G Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.166666666666667 0.75 0.0833333333333333 13 11 2 9 1 2 88991433 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88992481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88992591 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 88995918 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 88997952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 88999133 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89001462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89002626 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89002781 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 89003095 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 89003202 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 89003769 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89004275 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 89004438 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 89004525 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89005193 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 89006081 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89006844 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 89007160 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89007274 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89007796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89008357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89008708 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 89010456 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 89010873 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 89011116 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 89014465 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 89014724 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89015375 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89015702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89015806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89016570 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 89017082 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 89017362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89017671 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89018447 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 89018460 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89019706 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89020243 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 89020462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89020493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89021468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89021720 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 89022489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89023089 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 89024455 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 89024511 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 89024669 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 89024680 C G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 89024888 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 89025973 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 89026378 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89026600 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89026654 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 2 89026661 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 89026671 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 89027294 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 89027811 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 89028720 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89029608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89030591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89031053 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89032568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89036724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89037384 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89037969 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89038067 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 89038774 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89039989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89041555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89043011 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89043799 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89045623 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 89046623 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89046698 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89086364 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 89087037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89088133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89088249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89089691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89090128 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 89092608 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89095596 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89097397 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 89098047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89098660 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89101170 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89112422 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89112656 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89121490 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 89124229 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89124554 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89130664 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 89132425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89133511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89134294 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 89140978 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 89145179 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89153416 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 89154481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89160137 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89161606 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89162404 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 89163011 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 89163288 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89164586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89167060 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 89167074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89170525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89171658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89173944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89174581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89177448 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89177480 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 89180662 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 89180748 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 89180926 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 89182131 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89183442 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 89183722 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 89191349 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 89191577 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 89192338 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 89199538 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 89199736 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 89200332 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89201289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89201378 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89201410 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 89201575 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 89201929 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 89203339 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 89204777 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89206458 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 89207715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89207945 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 89209422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89209624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89209791 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89210796 C A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 89211030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89215381 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 89218646 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89219139 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89219420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89220999 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 89221256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89221368 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89221536 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89221565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89221759 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89221772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89221958 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 89222567 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89222598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89223035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89223047 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89223958 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89224121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89224293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89224448 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 89224639 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 89226160 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 89226219 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 89227782 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 89227853 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 89227944 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 89228234 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 89228336 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 89228589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89228931 C A Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 89228936 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 89228985 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 89229176 A T Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 89230214 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89231278 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89231279 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89231303 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89231324 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89231492 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89231834 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 89232104 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 89232124 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89232442 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 89232471 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89232523 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89232737 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 89232794 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 89232826 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 89232945 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89232956 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 89233011 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89233906 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 89234861 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 89235258 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89235338 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89235919 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 89236164 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89236367 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89236479 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89237266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89237404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89238131 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89238133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89238707 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89239312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89240025 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89240230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89241217 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 89242778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89243008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89244158 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 89245757 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 89249679 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 89252054 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 89252990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89253343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89254792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89257371 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89257460 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 89257921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89260125 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 89260751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89261530 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 89261532 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 89261704 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89262525 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89262885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89263080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89263694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89266688 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89266976 C A Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 89267662 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89267854 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89267930 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89267993 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89268058 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 89268104 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89268872 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89269143 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89272130 G T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 89272350 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89272379 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 89273168 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89273414 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89273429 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89273904 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 89275124 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 89275531 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 89275692 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89276056 A C Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 89278909 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 89281541 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89284720 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89284730 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89285441 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89286232 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 89287082 C T Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 89287110 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89287180 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 89287233 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 89288028 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89288759 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89288978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89288991 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89289527 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89289578 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89289625 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89289631 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89289643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89289655 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 89289656 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 89289672 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89290142 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89290413 T C Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 89290866 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89291486 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89291540 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89291722 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89292749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89293198 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 89295138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89295367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89297031 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89299274 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89300032 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 89300061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89300072 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89301115 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89302023 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89302905 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89303431 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89303939 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89304084 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89304298 G C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 89304471 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 89305086 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89306388 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89306417 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89306667 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89306782 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89307048 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89307222 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89307398 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89308094 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89308368 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89308888 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89316684 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89317155 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89317672 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89318557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89319578 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 89319586 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89321168 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 89321445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89321670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89321922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89323496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89324717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89324878 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89326856 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89327007 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89327761 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89327838 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89327979 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89327982 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 89328067 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89328272 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 89328300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89328340 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89329159 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 89329162 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 89329753 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 89329962 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 89329963 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89330032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89330099 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 89330189 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 89330198 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 89330208 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 89330261 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 89330483 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 89330555 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 89330612 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 89331017 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 89331195 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89331225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89331283 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 89331316 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 89331493 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89331599 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 89331608 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 89331686 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 89331798 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89331830 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 89332260 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 89332276 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 89332440 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 89332568 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 89332642 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 89332682 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 89332850 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 89333061 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 89333300 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 89334005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89334444 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89334481 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 89334550 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 89334776 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89334801 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 89334804 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 89334815 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89334854 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 89334872 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89334888 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 89334932 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 89334979 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89335051 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 89335096 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 89335165 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89335277 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 89335311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89335359 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89335430 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 89335508 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89335538 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89335557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89335609 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 89335666 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89335947 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 89335949 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 89335968 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 89336000 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 89336104 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 89336168 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89336263 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89336328 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89336639 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 89337112 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89337183 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 89337250 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 89337330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89337515 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 89337580 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 89337869 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 89338175 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89338523 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89339782 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 89340306 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89340757 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 89341614 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 89341646 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 89341959 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 2 89342398 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89342453 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 89342823 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89343002 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 89344152 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89344347 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89344369 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89344372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89344497 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89344589 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89344980 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89345186 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89345318 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 89345510 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89346040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89346451 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89346462 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89347786 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89348304 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 89349225 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 89349814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89350260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89350345 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 89350609 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 89351411 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 89351413 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 89351426 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 89351582 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 89351780 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 89351848 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89352004 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 89352216 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 89352302 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 89352312 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 89352990 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 89353386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89353421 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89353683 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 89353962 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 89353992 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 89360329 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89360742 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 89360854 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 89361032 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 89361103 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 89361207 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 89361843 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 89361875 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 89361961 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 89361982 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 89362140 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 89362187 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89362354 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 89362388 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 89362391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89362477 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 89362743 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 89362829 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 89362847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89362906 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 89363530 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 89364059 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 89364146 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89364231 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 89364356 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 89364787 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 89365262 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89365335 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89365841 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 89365907 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 89366122 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 89366259 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 89366286 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89366435 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 89366584 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89367079 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 89367215 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 89367726 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 89367792 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 89369105 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 89369629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89370155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89370420 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89371259 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89371421 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 89372643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89372809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89373174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89373187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89374301 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 89374397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89374528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89374738 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89375290 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 89375466 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 89375468 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89375616 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 89375720 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89375898 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 89376351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89376739 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 89376780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89377495 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89377735 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89377929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89378424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89379602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89379793 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89380653 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89380872 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89381157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89382032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89382033 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89382060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89382077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89382175 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89382416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89382518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89383441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89383637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89384239 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89384318 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89384382 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89384564 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 89384599 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 89385159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89385920 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89385922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89385967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89386107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89387307 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89387724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89392101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89392350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89392887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89393005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89393173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89393538 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89394366 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89395016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89395028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89395516 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 89395779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89397557 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 89398163 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89398295 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 89398414 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89398456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89398858 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89399042 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89399464 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89399888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89400359 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89400618 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89400823 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 89401013 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89401071 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89401228 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 89401233 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89401529 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89401710 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 89401960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89402077 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89402343 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 89402420 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 89402693 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89402889 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 89403033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89403138 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 89403164 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 89404280 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89404747 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89405826 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89405977 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 89406455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89406696 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 89406806 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89407784 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89408030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89408033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89408702 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89408843 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89408990 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 89409092 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89409655 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 89409664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89410421 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89410425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89410466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89410564 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89410569 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 89410628 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89410873 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 89411337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89411604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89411691 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89411830 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89411861 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89413663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89413884 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89414151 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 89414506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89414587 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 89414631 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89414644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89414969 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89416963 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89417287 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 89418381 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89418522 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 89418651 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89418952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89420279 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 89422007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89422400 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 89424766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89425248 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 89425657 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 89425958 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 89428426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89429263 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 89429343 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 89429516 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89429846 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 89430609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89431134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89431921 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89432227 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 89432346 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 89432718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89434862 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 89435009 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 89435414 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 89435477 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 89435902 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 89436020 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 89436234 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 89436714 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 89436719 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 89436729 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 89436812 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 89437123 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 89437946 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 89438505 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 89441090 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 89441252 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89441539 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89441540 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 89441675 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89441880 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 89441881 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 89442308 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89442398 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89444573 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89445125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89445934 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89446559 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89446683 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89446744 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 89447033 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89447104 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89447119 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 89447441 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 89448606 T G N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 89448623 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 89448698 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 89448769 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 89448792 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 89448803 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 89448826 C A Y N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 89449136 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 89449158 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89449208 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 89449815 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 89450301 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 89450622 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89450823 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 89450886 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 89450912 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 89451035 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 89451460 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 89452051 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 89452374 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 89452512 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 89452573 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 89452650 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 89452795 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 89452825 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89452840 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89452863 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 89452922 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 89452923 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 89453088 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 89453097 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 89453547 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89453625 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89453741 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 89453777 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 89453947 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89454163 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 89454225 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 89454264 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89454478 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 89454591 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 89454743 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 89454867 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89454985 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 89455198 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 89455270 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89455342 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 89456096 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 89456228 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89456229 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89456258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89456325 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 89456384 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 89456507 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 89456519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89456528 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89456636 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 89456684 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 89456717 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 89456730 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 89456781 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89456854 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 89456869 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 89456884 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 89456965 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 89457013 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 89457570 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 89457670 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89457672 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89458362 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 89458398 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89458613 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 89458807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89458847 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 89459080 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89459127 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 89459162 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 89459348 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 89459950 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 89460055 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 89460080 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 89460307 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 89460414 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89460565 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89460676 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 89460716 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89460797 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 89460812 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89460858 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89460882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89460889 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89460908 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89460937 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89461043 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89461067 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89461171 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89461552 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 89461651 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 89461709 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89461729 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 89461976 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89461977 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89462082 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89462089 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89462252 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 89462423 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 89462486 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 89462517 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 89462548 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 89462602 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 89462641 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 89462701 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 89462721 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 89462751 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 89462757 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89462804 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 89462829 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89462834 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 89462859 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 89462964 C T N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 89463019 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 89463033 T C N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 89463060 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 89463107 A T N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 89463134 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 89463353 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 89463413 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89463544 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89463549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89463623 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89463643 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 89463690 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 89463709 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89463774 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89463807 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 89464016 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 89464185 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89464241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89464298 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 89464318 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89464581 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89464707 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 89464790 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89464829 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89465001 T A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 89465026 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89465136 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 89465170 C G N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 89465434 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 89465463 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 89465520 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 10 8 2 6 1 2 89465595 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89465968 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89466094 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89466107 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89466121 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89466177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89466221 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 89466773 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 89466880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89468067 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89468889 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89468910 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89468996 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89469089 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 89469125 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 89469496 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89469628 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 89470065 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 89470389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89471440 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 89471576 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 89471774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89471988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89472391 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89472528 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89473114 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 89474052 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 89474069 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89474176 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89474217 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89474438 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89474718 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 89474725 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 89474898 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 89475025 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89475484 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89475517 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89475786 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89475958 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89476346 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 89477273 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89477291 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 89477292 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 89477682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89477738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89478074 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 89478538 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 89478679 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89478805 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 89478956 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89479005 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 89479317 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89479451 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 89479565 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 89479693 C T Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 89479699 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 89480053 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89480177 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 89480240 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89480654 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89480659 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 89480947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89481139 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89481431 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 89481456 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 89481536 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89481551 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 89481556 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 89481600 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89481747 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89482039 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 89482042 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 89482450 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 89482565 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89482618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89482773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89482840 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89483405 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 89483505 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89483532 T A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 89483545 G A Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 89483661 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89483786 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 89483833 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 89484088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89484245 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 89484270 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 89484399 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89484671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89484939 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89485033 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 89485238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89485263 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 89485351 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 89485434 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 89485520 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89485770 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 89485927 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 89485941 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89486112 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 89486154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89486266 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 89486336 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 89486436 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 89486708 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89486746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89486757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89486950 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89487105 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 89487246 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89488176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89488520 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 89488557 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89488576 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89489255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89489303 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89489314 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89489319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89489374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89489441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89489470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89489730 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89490911 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89490947 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89490977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89490983 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89491076 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89491100 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89491878 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 89491937 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 89492250 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89492393 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89492624 T C N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 89492683 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89493165 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 89493242 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89493835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89493994 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89494008 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89494073 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 89494124 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89494163 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89494322 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89494422 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89494660 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 89495530 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89495679 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 89495863 G T Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 89496438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89497755 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89497788 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89498050 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89498419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89498578 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89499241 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89499716 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89500023 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89500681 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89500970 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 89501187 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89501410 A G Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 89501470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89502056 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89503172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89503271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89504228 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89505230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89505565 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89505909 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89506086 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89506609 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 89507325 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 89508602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89508613 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89508636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89508742 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 89508745 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 89508782 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89508999 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 89509048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89509153 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89509226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89509250 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89509718 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89509923 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89509964 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 89509967 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89510055 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89510093 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 2 89510124 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89510211 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89511580 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89511769 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 89511824 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 89512000 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 89512054 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89512552 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89512638 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89512714 T G N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 89513661 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 89514044 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89514100 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 89515261 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 89515297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89515592 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89515676 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89515825 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89516305 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89516334 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89516437 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 89517443 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89517470 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 89517726 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89517855 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89517955 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89518781 C A Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 2 89519374 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 89519527 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 89519591 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89520396 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89520423 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89520465 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 89520777 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 89521053 G A Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 2 89521353 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89521457 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 89521478 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89521556 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 89521564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89521681 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89521747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89521805 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 89521979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89521980 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 89522235 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89522562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89522563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89522737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89523129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89523843 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89523866 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89523991 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89524777 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89524778 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 89524919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89525238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89525269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89525950 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89526427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89526560 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 89526923 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 89526976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89527407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89528018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89528086 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89528285 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 89528746 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89529277 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89530912 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89531136 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89531137 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 89531406 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89531474 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89531546 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 89531597 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 89531658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89531679 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89531768 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89531788 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 89531803 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 89531853 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89531888 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 89532041 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89532135 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 89532196 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 89532232 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89532298 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89533123 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89533151 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89533193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89533326 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 89533604 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89533659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89533674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89534013 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89535309 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 89538709 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 89538818 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89539421 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89539658 C T Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 2 89539945 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89539965 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89540106 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89540261 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89540419 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 89540432 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 89540915 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89541331 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89541430 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89541520 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89541959 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 89542146 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89542325 A C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 89542451 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89542615 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89542735 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89542934 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89543013 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89543494 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89543748 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89544314 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89544431 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 89544542 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 89544746 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89544842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89544856 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89544885 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89545074 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 89545897 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 89546196 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 89546705 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 89546833 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89546942 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 89547075 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 89547085 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 89547229 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89547483 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 89547583 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89547657 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 89547662 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 89548185 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89548578 G T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 89548934 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 89548984 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 89549191 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 89549565 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 89549586 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89549609 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 89549625 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89549643 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89550527 G A Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 89550614 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 89550818 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 89550967 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 89551435 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 89553142 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89553144 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 89553162 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 89553164 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 89553603 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89553617 G T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 89554002 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89554037 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 89554134 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89554204 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89554418 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89554841 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89555152 G T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 89555196 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 89555201 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 89555213 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 89555250 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89555337 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89555412 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89555459 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89555516 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 89555576 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 89555610 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89555642 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89555663 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89555764 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 89555817 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89555951 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89555962 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89555976 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89556058 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89556233 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89556299 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 89556377 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89556578 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89556767 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89557356 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 89557436 T G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 89557901 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 89558269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89558795 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 89558803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89559098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89559254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89559649 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89559884 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89559912 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89559957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89560044 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 89560090 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89560117 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 89560138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89560678 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89561272 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 89561756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89561763 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89562105 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89562283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89562894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89562988 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 89563033 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 89563556 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 89563717 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89563948 A C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 89564255 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 89564379 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 89564911 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 89565647 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89565686 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89566067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89566200 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89566279 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 89566514 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89566647 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89567434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89567568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89567962 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89568000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89568311 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89568956 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89568980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89569002 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89569107 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 89569193 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89569359 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 89570189 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89570359 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89577130 G A Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 89578042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89578124 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89578453 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89579057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89579601 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89580424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89581416 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89581976 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89582114 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89583085 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 89584136 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 89584179 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89584185 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 89584323 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 89584997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89585594 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 89585807 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 89585856 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89586324 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89586412 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89586799 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89587712 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 2 89587717 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 2 89588355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89588386 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89588540 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 89588617 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89588622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89588634 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89589029 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 89589248 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 2 89589287 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 89589352 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89589891 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 89590031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89590530 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 89591161 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 89591939 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 89592032 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 89593210 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 89593345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89593428 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89593559 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89594011 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89594141 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89594951 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 89597514 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89597959 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 89597967 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89598509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89604624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89606446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89607010 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 89607111 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89607500 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89608907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89615785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89616043 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89616404 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89616577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89616788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89616924 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89617093 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89617388 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89617681 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 89617779 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 89618303 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89618413 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 89618641 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89618713 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 89619610 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89619930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89620632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89620702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89620965 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 89621280 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89621510 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89621882 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89621998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89622128 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 89622132 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 89622193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89624149 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 89624638 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89624980 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 89625431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89626975 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89627678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89627702 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 89627889 T C Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 89628797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89631018 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89631529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89631616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89634156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89634611 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89636428 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 89637743 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89637834 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 89637886 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89638191 G T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 89638535 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 89639487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89639816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89640172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89647274 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89647590 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89649557 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89649604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89651235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89653358 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 89654287 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89659364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89660026 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89660804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89661804 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89662311 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89663181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89663833 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 89665511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89666790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89666942 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 89667032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89667245 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89667823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89667824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89669582 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89671120 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89671366 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 89673540 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89673861 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89674531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89678902 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89681072 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89681082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89681497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89681710 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89682069 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89684114 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 89684444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89685212 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89688048 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 89688401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89688476 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89689395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89690241 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 89691860 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89691903 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89693357 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89693358 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89693446 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89694029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89694053 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 89694352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89694550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89696260 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89700520 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 89701143 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 89701665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89703252 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89704035 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89705186 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89705998 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 89706241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89707930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89708208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89708308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89714514 C G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 89714638 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 89714701 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 89718216 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 89720727 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89721567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89722497 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 89724204 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 89724748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89725238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89727132 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89728334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89729575 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 89743404 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89745917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89746056 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 89746542 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 89746631 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 89746661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89746879 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 89746919 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 89746943 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 89747048 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 89747062 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 89747087 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 89747262 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 89747421 T A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 89747477 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 89747573 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 89747700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89747726 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 89747796 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 89747805 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 89747960 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89748040 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 89748082 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 89748286 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 89748425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89748449 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 89748487 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89748489 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 89748714 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 89748759 A G N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 89748792 T A N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 89748961 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 89749006 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89749082 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89749127 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89749268 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 89750073 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89750110 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89750143 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89750181 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89750233 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89750276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89750301 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89750354 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89750356 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89750391 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 89750402 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 89750455 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89750562 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 89750564 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 89750606 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 89750713 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89750770 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89750773 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 89750840 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89750944 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89751122 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89751176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89751227 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 89751918 C A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 89751935 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 89752017 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 89752112 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 89752150 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 89752169 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 89752211 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 89752508 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 89752540 T G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 89752647 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89752703 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 89752733 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 89753097 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 89753125 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89753215 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89753386 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 89753631 A G Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 89753752 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89753911 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 89754043 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89754111 A T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 89754399 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 89754515 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89754700 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 89754717 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 89755012 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 89755028 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89755153 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 89755166 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 89755178 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 89755940 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 89755974 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 89755994 T C Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 89756053 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 89756214 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 89756229 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 89756345 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 89756361 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 89756370 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 89756404 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 89756630 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 89756647 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 89756741 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 89756947 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89757007 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 89757127 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 89757171 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 89757175 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89757182 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89757332 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89757358 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89757393 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89757597 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89757753 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 89757765 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 89757796 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 89758008 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 89758015 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 2 89758073 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 89758116 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 89758135 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 89758161 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89758167 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89760378 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 89760390 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 89760807 G C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 89760913 T C Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 89761043 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 89761058 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 89761069 G C Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 89761130 A C Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 2 89761137 T G Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 89761151 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 2 89761258 T A Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 89761484 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 89761490 T G Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 89761514 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 89761657 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 89761822 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 89762085 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89762150 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 89762179 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89762188 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 89762388 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 89762404 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 89762586 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89762806 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 89762815 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 89762889 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 89762987 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89763273 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89763432 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89763551 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 89763582 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 89763590 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 89763956 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89764018 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 89764085 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 89764105 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 89764215 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 89764477 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89764560 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 89764683 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 89764750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89764795 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 89765273 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 89765358 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 89765360 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 89765441 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 89765514 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 89765818 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89765832 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89766209 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 89766412 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 89766507 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 89766569 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89766638 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 89766712 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 89766752 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89766829 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 89767064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89767633 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 89767697 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 89767883 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 89768096 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 89768481 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 89768508 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89768712 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 89768847 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89769187 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 89769502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89769538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89769541 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89769981 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 89769985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89770039 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89770124 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 89770219 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 89770357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89770455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89771643 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89771908 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89771909 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 89772215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89772479 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89773193 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89773251 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 89773906 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89774306 C G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 89774737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89774829 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89776224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89776729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89776732 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89776910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89777933 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89778889 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89779909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89779921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89780163 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89780735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89781361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89781809 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89782165 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89782231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89782342 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89782358 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89782534 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 89783066 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89783325 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89783626 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89784669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89786168 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89787222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89787497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89787685 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 89787781 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89787784 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89791616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89796294 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89797846 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89799127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89800344 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89800485 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89801558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89802145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89803355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89803466 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89803591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89804204 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89804211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89804255 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89806480 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 89808672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89808872 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89815256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89817405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89817790 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89817844 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89818539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89818937 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89819306 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89819419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89819541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89819583 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89819626 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89819697 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89819959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89820028 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89820029 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89820099 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89820223 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89820519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89820665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89820785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89821073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89821095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89821387 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 89821486 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89821540 A C N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 89821771 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 89821898 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89822077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89822337 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89823402 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89823409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89824216 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89824362 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89824379 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89824452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89824599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89824603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89824931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89824948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89824953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89825165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89825227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89825483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89825486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89825550 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 89825649 G C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 89825692 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 89825752 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 89825789 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 89825792 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 89825956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89826040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89826059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89826327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89827064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89827575 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89829990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89833572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89834145 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89834892 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89835936 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89836229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89837247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89837379 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89837567 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 89837615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89837807 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89837816 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89837822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89837895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89837930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89837982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89838020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89838028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89838119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89838188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89838197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89838500 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89838533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89838565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89838660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89838868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89839373 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89839462 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89839663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89839964 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89840202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89841991 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89843654 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 89845611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89846304 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89847221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89847469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89847490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89847535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89847771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89848221 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89848849 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89849496 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 89853382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89854839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89855486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89856136 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89856431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89856451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89856546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89857139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89857698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89858272 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89858360 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89859704 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89860131 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89860551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89862305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89862487 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89862613 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89863453 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89864022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89865708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89865975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89866083 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89866115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89866199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89866604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89866815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89867675 T A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 89867706 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 89868032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89870672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89873097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89873141 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89873343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89873452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89873864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89874436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89874705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89874728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89874919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89876147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89877108 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89877437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89877440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89877870 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89877948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89878122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89878583 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 89878724 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 89880733 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89881362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89881701 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89881721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89881791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89881928 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 89882133 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89882231 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89882347 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89882416 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89882460 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89882644 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89882717 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89882794 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89883086 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89883103 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89883135 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89883560 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89883678 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89883736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89883843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89883905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89883928 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89883997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89884005 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89884077 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89884204 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89884351 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89884447 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 89884663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89884770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89884814 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89884897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89889429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89889597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89889669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89889739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89889852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89889919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89889939 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 89889940 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 89889962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89889965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89889975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89889994 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89890029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89890193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89890560 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89891019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89891148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89891395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89892631 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89893301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89894017 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89895242 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89896162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89896168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89896800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89897257 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 89897684 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89898629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89898666 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89898811 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89898999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89901242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89901289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89901406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89902035 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 89902192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89902457 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89902467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89903623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89905515 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89906307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89908015 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89909547 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89911233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89912884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89914446 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89917457 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89919276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89919514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89920013 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89920022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89920030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89920060 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89920285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89920325 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89920327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89920391 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 89920727 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 89920811 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89920828 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89920867 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89921005 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89921278 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89921311 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89921352 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89921618 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89921872 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89921922 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89922035 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 89922065 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89922066 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89922140 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89922163 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89923049 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89923261 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 89923416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89923597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89924789 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89924826 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89924835 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89924908 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 89925088 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 89925281 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 89926396 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 89926549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89926554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89927005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89927064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89927520 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 89934990 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 89935609 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89943255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89943652 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89944358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89945065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89945143 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89945625 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89946935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89947679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89948506 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89948556 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89948792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89949107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89950279 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89953563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89954433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89955361 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 89956391 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89956704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89956966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89957277 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89958732 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89960752 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89960893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89962845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89963064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89963537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89964696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89964799 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 89965724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89965850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89966898 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89967208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89967351 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89967416 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89967723 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 89972758 C T Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 89973131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89973736 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89973842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89974036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89974558 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 89974640 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89975323 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89975640 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89976902 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 89978431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89979211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89979425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89981140 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89981382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 89982256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 89983244 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89983246 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 89985457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89986375 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 89986888 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89992000 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 89992460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89995233 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 89996366 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 89996622 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 89996635 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 90002451 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 90003713 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 90004000 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 90005291 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 90005347 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90006507 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90090772 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90092013 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90093360 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90093523 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90093696 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 90095657 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0 0.85 0.15 17 23 0 17 3 2 90096093 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90096387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90096481 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90096566 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 90096613 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90097206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90097495 G A Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 90099448 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 90099638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90102320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90105504 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90105605 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90106505 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90106516 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 90106624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90106713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90107067 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 90107318 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 90107331 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90107493 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 90107586 C A Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 90107630 A T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 90107636 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90107738 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90109076 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 90109379 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90109397 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90109595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90109655 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 90109952 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 90110295 C T Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 90110316 A G Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 90110324 A G Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 90110373 A G Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 90110828 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 90111025 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90111237 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 90111260 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 90111349 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90111351 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90111389 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90111615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90111647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90111723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90111733 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90111791 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 90111819 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 90111890 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90111952 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90112163 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90112229 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 90112325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90112559 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90112686 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90112753 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 90112766 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 90119276 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 90119411 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 90119446 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 90119450 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90119541 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90119631 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90119743 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90119800 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 90119836 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90119919 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 90120281 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90120316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90120518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90120605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90120885 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 90121073 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90121102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90121558 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90121637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90121923 C A Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 90122419 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 90122712 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 90122738 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 90122942 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 90123078 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 90123146 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 90123214 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 90123250 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 90123734 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 90123797 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 90123892 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 90123915 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 90123952 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 90124114 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 90124334 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 90124475 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 90124714 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 90125000 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 90125023 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 90125107 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 90125134 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 90125423 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 90125710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90125790 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 90126482 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 2 90126673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90126714 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90126883 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 90126903 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 90126938 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 90127577 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 90127676 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 90127781 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 90128026 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 90128248 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 90128446 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 90128457 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 90128771 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 90128929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90129020 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 90129096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90129145 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 90129691 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 90130222 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 90130290 A G N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 90130434 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90130454 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90130953 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90131008 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 90131387 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90131448 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90131730 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 90132137 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 90132303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90132757 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90132819 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 90132881 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 90133032 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 90133080 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 90133547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90134116 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90134559 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 90134989 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90135054 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 90135318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90135717 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90135747 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 90136086 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 90136897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90136993 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 90139052 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90142898 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90143071 C T Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 90143438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90143893 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90144972 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90145355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90145468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90146520 C A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 90147358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90148250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90148266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90148342 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 90149279 G A Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 2 90149355 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 90236499 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90237961 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 90238651 G C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 90239464 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 90239551 T C Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 90239598 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 90239600 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 90240021 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 90241998 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90242153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90244588 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 90244803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90246890 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90247157 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90247453 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 90247867 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90249944 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90251569 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90251845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90252430 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 90252673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90252777 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 90252828 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 90253113 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 90253121 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 90253489 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90253573 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 90255190 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 90255899 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 90263926 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 90263934 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 2 90263952 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 90264943 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90264958 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90266320 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 90266659 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 90266894 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 90273353 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90274217 A T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 90274264 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90274376 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 90274531 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 90274613 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 90274675 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 90275689 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 90275857 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 90277365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90277507 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90277524 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 90279057 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 90279837 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90279884 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90279961 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 90280187 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90281054 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 90281267 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 90281379 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 90281385 G A Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 90281420 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 90281433 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 90281484 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 90282286 C T N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 90282692 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 90282698 G T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 90282703 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 90282776 C T Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 90282803 G A Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 90283844 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 90283940 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 90284089 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 90284122 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 90285406 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90285690 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 90287124 G A Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 2 90287131 G A Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 90287158 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 90287170 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 90287182 T C Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 90287192 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 90287258 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 90287474 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 90287832 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 90287886 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 90287945 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90287982 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90288293 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 90288382 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 90289032 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 90289185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90289205 G C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 90289255 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 90289538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90289609 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 90289661 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90289697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90289748 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 90289910 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90289975 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 90292324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90293403 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 90293657 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90293850 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 90293865 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90293883 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 90294050 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90294063 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90294070 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90294083 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 90294096 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 90294195 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90294450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90294554 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90295574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90295577 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90295599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90295757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90295793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90296056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90296552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90296564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90296677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90296771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90296827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90296853 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90296896 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 90297373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90297455 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90297509 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90297649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90297766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90297856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90297888 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90298150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90298151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90298181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90298266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90298931 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 90298939 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90298944 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90299178 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 90299463 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90299483 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90299513 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 90299539 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 90299565 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90299681 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90299968 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 90300015 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 90300058 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 90300200 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 90300883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90301319 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 90301734 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 90301787 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 90301858 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 90301910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90302163 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 90302188 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 90302295 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 90302775 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 90302784 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 90302929 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 90303026 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 90303050 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 90303501 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90304155 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 90304233 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 90304266 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90304277 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90304282 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90304296 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 90304353 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90304371 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90304410 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 90304424 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 90304443 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 90305394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90305548 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 90305561 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 90305731 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90305751 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 90305930 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 90306013 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 90306106 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 90306110 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 90306401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90306416 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90306792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90306916 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 90307030 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 90307073 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 90307102 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 90307205 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90307215 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 90307446 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 90308037 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 90308207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90308556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90308574 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 90308693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90308695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90308962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90309376 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 90309410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90309455 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 90310057 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90310218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90310407 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 90310486 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 90310825 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 90310992 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 90311016 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 90311123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90311290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90311317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90311544 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 90311999 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 90312533 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 90312559 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 90313122 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 90313240 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 90313244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90313256 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 90313273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90313422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90314284 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 90314317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90314328 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90314994 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 90315018 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90315069 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 90315733 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 90315808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90315873 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90316736 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 90316802 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 90317163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90317510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90318781 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 90319202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90319298 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 90319989 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 90320003 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 90321827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90322007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90322416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90322658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90322922 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90323075 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90325103 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 90325289 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90325361 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90325762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90326388 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 90327059 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 90327283 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 90327343 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 90327357 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 90327452 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 90329042 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 90330954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90331914 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 90332494 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 90332634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90332799 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90332820 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 90332904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90332975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90333061 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 90333845 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 90333994 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 90334023 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 90334619 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 90334942 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 90335022 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 90335170 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 90335175 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 90335239 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 90335283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90335970 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 90336261 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90336315 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 90336362 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 90336489 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 90336540 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 90336562 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90336582 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 90336667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90336687 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 90336846 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 90336871 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90336972 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 90337192 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90337207 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 90337271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90337282 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 90337594 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 90337635 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 90337639 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 90341643 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 90342078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90342330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90342626 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 90342886 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90342935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90343754 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 90343866 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 90344248 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 90344343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90344974 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90345316 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 90345812 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 90346036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90346175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90346397 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 90347243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90347786 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 90347963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90348780 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 90349281 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 90350183 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90352013 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90352568 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 90352943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90353368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90354285 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 90355161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90355451 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 90355483 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 90355574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90356057 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 90356075 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90356103 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90356104 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90356138 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 90356152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90356183 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 90356245 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 90356253 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 90356287 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 90356346 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90356360 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90356439 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90356460 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90356493 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90356574 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 90356832 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 90356884 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 90356892 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 90356905 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 90357213 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 90357974 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 90357993 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 90358961 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 90359100 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 90359181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90359182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90359312 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 90359539 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 90359990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90360071 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 90360189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90361355 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90361909 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90362018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90362496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90363381 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90363712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90363829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90364721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90365368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90365908 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 90366414 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 90366459 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90366555 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 90366557 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 90366574 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90366599 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 90366637 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90366892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90367604 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 90367864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90367912 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90368018 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 90368213 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90368281 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90368446 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90368525 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 90368602 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90369111 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 90369738 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 90369888 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90369954 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 90370187 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90370201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90370461 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 90370481 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 90370634 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 90370666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90370890 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 90370943 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 90371192 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 90371329 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90371384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90371564 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90371579 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 90371859 A C Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 90372195 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 90372789 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 90372884 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 90373289 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 90373342 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 90373537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90373541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90373673 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 90373733 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 90373833 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 90373857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90374195 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 90374313 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90374458 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 90374746 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 90375661 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90375721 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 90375840 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90375870 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90375872 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90376039 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90376221 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90376344 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 90376379 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 90376460 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90376461 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 90376723 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 90378536 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 90378558 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 90378597 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 90378882 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90378920 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 90378977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90379002 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90379036 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 90379564 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 90379626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90379635 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90380204 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 90380244 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 90380259 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90380371 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90380469 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90380471 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 90380744 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 90380799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90381049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90381485 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90384802 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 90384955 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90385174 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 90385345 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90385752 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90386808 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 90387431 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 90387535 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 90387552 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 90387861 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90388230 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 90389012 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 90389023 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90389062 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 90389120 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 90389164 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 90389308 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 90389387 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 90390003 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 90390337 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 90390371 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 90390647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90390984 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90391112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90391353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90391537 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90392524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90392572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90392854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90392876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90392896 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 90392910 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 90392974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90393088 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90393161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90393164 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90393286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90393302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90393323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90393341 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90393421 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 90393542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90393584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90393808 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90394585 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 90394617 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 90394655 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 90394715 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 90394750 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 90394769 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 90394789 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 90394843 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 90394922 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 90394935 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 90394946 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 90395245 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 90395407 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90395994 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 90396049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90396083 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 90396344 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 90396406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90396452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90396517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90396725 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 90396765 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 90396815 G C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 90397022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90397110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90397194 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 90397390 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 90397548 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 90399482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90399495 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90399541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90400010 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 90400417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90400643 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 90400771 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 90401537 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90401593 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90401901 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90401982 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 90403201 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 90405188 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 90405320 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 90405341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90405753 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 90405777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90405786 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 90405822 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 90406262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90406638 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90406795 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90406820 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 90406860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90407968 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90408880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90408916 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 90408939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90408954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90409563 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 90409603 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 90409693 C A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 90409831 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 90410014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90410020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90410056 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 90410370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90410749 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90410766 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90410780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90410800 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90410804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90410925 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90411335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90411395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90411480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90412830 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90413458 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 90414236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90414310 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 90415278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90415856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90416539 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90417909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90421661 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90421910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90422841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90424049 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90424744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90425459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90426437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90426698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90426822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90427258 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 90427297 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90427441 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 90429391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90429966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90431376 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 90432656 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 90432685 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90436028 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90436772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90437701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90438782 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90438837 A T Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 90438864 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90438958 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90439232 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90439565 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 90439801 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 90439808 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 90439868 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90439871 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90439894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90440255 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90440556 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90440574 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90440638 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90440712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90440915 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90440935 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90440986 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90441037 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 90441040 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 90441092 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 90441584 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90441656 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90441858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90441876 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 90442293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90442433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90443049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90443247 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90443484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90443505 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90443868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90443894 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90444422 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 90444498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90444642 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 90444670 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 90444745 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 90446927 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 90447731 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 90448307 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90448409 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 90448512 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 90448707 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 90448711 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 90451804 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90453350 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 90454315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90454837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90454882 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90455579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90455627 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90455839 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90456011 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90456279 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90456545 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 90456665 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 90456782 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90456796 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 2 90457336 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90457657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90457669 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90457924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90458622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90459447 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90460069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90460554 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90461041 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90461201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90461205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90461247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90461266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90461371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90461649 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90461668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90461759 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90461853 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 90461942 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 90461975 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 90464155 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 90464259 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90464429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90465194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90465208 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 90466833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90466949 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 90467170 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 90468031 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 90468097 G A Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 90469302 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 90470045 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 90470159 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 90470635 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90472018 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 90472423 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90474942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90480616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90480632 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90480637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90480946 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 90482857 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90484952 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 90485897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90486602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90486767 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90487504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90487549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90488443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90490134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90490446 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 90490579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90490622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90493716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90499395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90499903 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90499927 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90499950 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90500999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90501145 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90502161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90503964 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 90504344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90504435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90504948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90505291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90505754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90506360 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90506697 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90508019 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90512741 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 90512743 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 90517815 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90518697 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90519380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90520088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90521601 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90522703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90523908 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 90531405 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90537204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90537481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90539162 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90541298 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90542842 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 90543483 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90544683 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90544730 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90544822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90546583 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90548581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90551230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90553866 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90560620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90561888 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90561913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90564124 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90564306 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90564363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90565110 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90566028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90566164 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90568179 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 90568218 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 90568225 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 90568242 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 90574005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90575777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90576010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90576654 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90576690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90576954 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 90578757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90580261 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 90588534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90588836 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90591250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90599362 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90602847 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 90603757 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90603840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90604964 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90606805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90607471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90608764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90609222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90609836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90610771 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90611262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90613594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90613602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90618116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90620871 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90622616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90622736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90624428 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 90625934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90626852 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90627011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90627210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90628756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90630416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90633279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90633291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90634571 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90634629 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90634800 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 90634841 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90635877 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90635951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90637463 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 90638033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90638504 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90639745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90640362 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 90640727 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90640783 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 90640977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90642957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90643997 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90644980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90647170 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90647282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90649450 G C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 90649451 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 90649687 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 90650442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90651837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90657038 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90658930 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90659732 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 90659866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90660262 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90660314 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90660325 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90660334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90660402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90660461 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90660662 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90660701 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 90660952 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 90661039 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90661067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90661142 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90661270 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 90661352 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 90661397 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90661461 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90661503 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90661595 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90661818 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 90661821 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 90661888 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 90662059 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90662499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90662680 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90663185 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90663298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90663301 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90663327 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90663590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90663900 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90663920 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 90664384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90664457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90664647 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 90664726 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90664731 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90664831 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 90664865 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90664938 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 90664998 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 90665026 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 90665037 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 90665171 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 90665356 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 90665466 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 90665587 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90666029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90666045 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90666094 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90666108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90666148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90666259 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90666351 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90666357 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90666433 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 90666634 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 90666775 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90666784 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 90666795 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 90666810 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90666913 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90666994 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90667117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90667289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90667463 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 90667728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90667799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90667800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90668054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90668437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90668620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90668657 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90668686 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90668692 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90668754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90668809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90668844 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90668862 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 90668877 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90668915 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90668945 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 90669007 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 90669051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90669119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90669297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90669395 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 90669434 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90669672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90669950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90670092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90670370 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90670427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90670552 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 90670589 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90670601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90670851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90670904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90670946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90670993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90671424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90671578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90671596 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90671824 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 90671910 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 90672281 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 90672351 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90672548 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90672711 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 90674209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90674872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90674940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90675381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90675514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90677569 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 90678124 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90678257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90679976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90687743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90688609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90689437 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 90689678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90690125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90691816 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90695247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90695666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90695805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90696007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90696183 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 90696256 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 2 90696509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90696705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90696889 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 90697259 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 90697858 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 90698228 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90698659 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90698990 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90699175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90700686 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90701117 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 90701171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90701378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90701630 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 90701661 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 90701719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90701839 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 90702043 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 90702243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90702655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90702788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90703113 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 90704076 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90704935 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 90706903 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90707958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90707966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90708338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90708433 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 90709353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90709375 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90709577 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90709622 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 90709730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90710004 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90710560 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90710582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90711074 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90711133 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90712225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90712365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90712608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90712716 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 90712969 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 90713017 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 90713027 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 90713042 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 90713172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90713329 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 90713330 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 90713411 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90713686 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90713767 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 90713848 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90713852 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90714003 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 90714033 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 90714127 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90714592 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90714601 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90714619 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 90714734 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90714877 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 90715185 A T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 90715233 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 90715338 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90715385 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 90715493 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90715503 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90715517 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 90715581 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 90716112 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90716172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90716198 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 90716421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90716441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90716660 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 90716677 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 90716799 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 90716820 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 90716848 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 90716994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90717759 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 90718376 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90718387 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90718440 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90719427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90719642 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 90720628 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90721090 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 90724613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90725671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90725896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90727940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90729459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90733049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90735075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90735154 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90737424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90737425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90737947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90741072 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90743721 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90743722 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90745539 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 90751965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90753573 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90757190 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90757305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90758103 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 90758286 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90759731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90759968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90760048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90761159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90761224 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90761337 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90762186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90764695 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 90766470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90766631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90768112 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 2 90768426 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 90768977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90769056 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 90769214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90769549 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 90769554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90769570 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 90769694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90769862 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 90769916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90770120 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 90770749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90770784 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 90770889 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90771037 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90771180 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 90771208 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90771882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90772443 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 90772789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90773121 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 90773423 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 90773756 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90773868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90774481 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90774506 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 90775744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90775881 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 90778414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90778537 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90778586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90778608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90778633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90778677 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90779936 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90781082 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90784428 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90788312 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 2 90792965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90795471 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90797018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90798982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90801172 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90802257 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 90802758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90806344 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90809300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90810756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90814573 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90815144 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90815451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90815639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90815699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90817333 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 90817531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90819610 G T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 90820523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90824178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90828656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90830096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90830728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90831210 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90833855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90835636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90841751 C T Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 2 90843194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90843287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90844636 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90848800 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90849020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90849993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90850262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90856490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90858675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90860611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90860717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90861381 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 90861779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90862604 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90863455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90865110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90865283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90867569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90868420 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90870523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90872449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90877505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90877968 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90887058 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90887467 T A Y N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 90891975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90892004 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 90892010 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 90892028 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 90895885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90896626 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90897013 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90897222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90897860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90900289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90905357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90910543 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90912140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90912628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90914766 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 90914823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90915492 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90916924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90917491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90920924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90921538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90923140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90924214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90924570 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 90924613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90924943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90925326 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 90925358 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 90925487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90925594 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 90925781 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 90926087 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90927039 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 90927062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90927072 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90927193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90927268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90927340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90930013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90930604 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90931302 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 90931423 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 90940885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90951494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90952814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90953253 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 90955875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90957285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90957432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90957552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90957581 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90957697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90957751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90958788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90958797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90958888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90959189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90959924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90959925 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90959990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90960096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 90960171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90961975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90962165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90962307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90962613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90963069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90963246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90963316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90963318 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 90964396 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 90964864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90965792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90966533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90966846 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 90967006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90967325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90967737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90967935 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90967968 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90967998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90968126 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 90968131 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 90968183 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 90968470 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 90968581 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 90968651 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 90968739 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 90968763 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 90969320 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 90969561 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 90969715 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 90969768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90969909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90969966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90970081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90970082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90970120 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 90970717 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 90974312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90974472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90978484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90983507 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 90984752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90985446 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 90988528 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 90991976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90995333 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90995526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90996877 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 90996995 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90997042 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 90997203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 90997597 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 90997608 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90997915 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 90998722 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 90999010 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 90999620 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 91001435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91006222 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91009688 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 91011106 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91011716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91012317 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 91012352 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 91012378 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91013464 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 91013765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91013773 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91014238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91014306 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 91014476 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 91014510 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 91015390 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 91015527 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 91016056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91016102 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 91016103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91016538 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 91016636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91017914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91017951 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 91019638 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 91020759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91021087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91021123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91021452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91022771 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 91024485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91025264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91025318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91026217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91027884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91028974 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91030005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91030806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91035017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91040319 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91045485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91049568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91052314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91065008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91066951 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91068324 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 91070975 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91076085 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91076638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91076741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91077427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91077882 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91079056 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 91082260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91083835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91084087 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91084192 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 91084813 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 91084883 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 91085021 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 91086113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91086128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91086168 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91086188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91086586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91087420 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91088270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91088282 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 91088830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91090288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91090482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91092140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91092301 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91093499 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 91096795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91100287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91100802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91102637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91104572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91105933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91108132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91111252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91111875 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91112990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91112991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91115165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91115299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91121111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91122442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91129501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91130220 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91131409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91131618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91131769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91133574 A G N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 91137570 A C N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 91137907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91140434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91140745 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 91141424 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 91142046 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91143742 T G N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 91143791 T G N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 91143835 C T N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 2 91144055 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91144196 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 91144229 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 91144230 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 91144307 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91144545 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 91144657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91145176 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 91145279 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 91145327 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 91145476 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 91147272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91147665 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91148967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91150963 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 91152020 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 91152425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91152458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91156155 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 91158090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91158853 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 91162392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91163302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91166509 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91168054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91168373 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 91169907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91170252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91171268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91175212 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 91175333 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91175578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91178638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91178720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91178732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91181784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91184587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91187354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91188449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91191435 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91191750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91192609 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91194060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91195406 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 91200134 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91203674 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 91205285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91205599 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 91205820 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 91206436 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91206875 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 91208443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91209034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91210666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91211596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91211946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91212036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91212412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91212976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91213170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91213222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91213232 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 91213289 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 91213461 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91214226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91216156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91219311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91220819 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91222913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91223140 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 91224395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91224895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91225006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91225253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91226014 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91226038 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91227528 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 91227989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91228159 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91228406 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91228440 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91228828 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 91229117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91229137 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 91229437 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 91229486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91229908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91230451 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 91230635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91230644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91231502 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 91231949 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 91232520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91232565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91232606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91232687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91232803 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91232902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91232925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91233240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91233598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91233813 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 91234392 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 91234528 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 91234968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91235507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91235583 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 91236088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91236636 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91236747 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 91237044 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 91237047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91237124 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 91237184 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 91237354 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91237747 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 91238659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91239357 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91239609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91239668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91240585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91240616 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 91240918 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91241457 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 91241498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91242386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91243094 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 91243910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91244260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91244369 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 91244406 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 91244422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91244495 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 91244909 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 91244919 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 91245229 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 91245310 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 91245374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91246252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91246323 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91246757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91247021 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 91247045 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 91247116 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 91247171 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 91248058 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91248142 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 91248254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91248480 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 91249190 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91249299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91249575 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91249685 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 91249930 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 91250815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91252231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91255152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91255336 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 91255727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91256560 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91256718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91256997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91257338 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 91258068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91258626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91262777 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91265316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91267932 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91268044 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91268722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91268829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91271001 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91276395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91283965 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91284425 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91285425 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91285659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91286017 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91286698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91287316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91287780 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 91288219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91288611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91290229 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91290570 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91294256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91297588 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 91300620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91302665 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91303594 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 91305359 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91305410 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91305755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91305993 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91308230 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91312239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91312322 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 91313083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91313224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91315711 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 91319083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91322264 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 91322265 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91323751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91325283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91328012 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 91328850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91328891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91329081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91330379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91331236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91332908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91333295 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 91333745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91334125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91334588 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 91336862 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 91337352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91337380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91337794 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 91337957 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 91338332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91338333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91339915 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 91339935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91340848 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91341429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91341779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91341903 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 91341970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91342230 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 91342354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91342821 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 91342858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91343038 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 91343438 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 91344174 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91344219 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 91344380 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91345142 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 91345536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91345990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91346808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91347420 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 91348674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91349670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91350237 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91350634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91350902 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 91350911 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 91351098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91351137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91351159 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91351169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91351214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91351362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91351460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91351533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91351582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91351885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91352044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91352310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91352831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91352835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91352851 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91353101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91353845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91354353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91354477 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91354516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91354536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91354558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91354788 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91355042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91355527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91356738 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 91358569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91359060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91360128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91360348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91360536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91360930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91361088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91364317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91369379 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91370002 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91370118 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91374164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91375775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91379420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91381311 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91388854 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91392666 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 91395382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91409166 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91410155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91410954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91413937 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 91415269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91416901 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91418753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91419883 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91421781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91423492 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 91425969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91426754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91428798 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91433059 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91441908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91442848 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91457860 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91458295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91467080 G A N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 2 91470629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91481238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91483260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91484129 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91488549 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 91488763 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 91490212 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91490252 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91492147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91493762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91494435 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91495898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91498699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91501704 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91505646 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 91506462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91506957 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91509184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91509473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91509569 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91513848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91514089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91517527 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91519885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91525785 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 91526090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91526308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91528713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91536745 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91537138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91537283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91537987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91539022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91539352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91539825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91540128 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91540172 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91540929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91543207 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 91544612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91544870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91548320 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91548734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91548894 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91549002 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91549125 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91549319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91549351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91549685 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91549972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91550761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91554129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91557947 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91561358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91563564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91565281 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 91566297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91566488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91566921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91567000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91572609 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 91572933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91572990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91573121 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 91580154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91581491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91583062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91583229 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 91586863 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91589620 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91592479 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 91593157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91595151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91595865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91596991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91602092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91602942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91605225 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91607814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91608650 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 91608969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91613116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91616431 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 91616870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91621611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91621722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91626306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91629171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91633261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91634890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91634953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91637084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91637793 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91640268 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 91641033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91641463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91641464 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91642013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91642014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91648905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91649313 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91651239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91653659 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 91653845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91655229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91656585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91658686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91658956 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91660750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91661295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91666715 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91667693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91668016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91668718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91671234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91675035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91677018 A G Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 2 91677529 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91678816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91685393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91690104 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91690300 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91694058 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91697809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91698320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91703051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91704060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91708331 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91711110 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91714074 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91714656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91716442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91717567 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91718568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91719598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91723470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91727550 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91731555 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91731726 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91732588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91734397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91735762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91739506 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91747265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91749331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91754694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91759811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91761041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91767143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91769396 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91769484 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91769914 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91770433 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91770816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91771857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91782890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91782893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91786641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91786675 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 91786882 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91789074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91789781 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91792003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91792078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91792386 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 91792567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91794178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91796958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91797260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91799379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91800515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91800544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91807666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91808982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91810642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91810671 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91812259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91812916 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91813691 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91814453 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 91814641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91815838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91816081 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 91816095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91816198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91816217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91816755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91816756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91816989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91817068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91817307 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 91817456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91817581 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 91818165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91818645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91819311 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 91819332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91819399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91821142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91821147 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 91821807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91822110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91822123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91822161 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 91825704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91826568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91826613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91828488 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91829515 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91831676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91831801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91832758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91833335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91834645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91835083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91836051 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 91836056 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 91836542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91836588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91836856 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 91836988 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91837080 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 91837378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91837421 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 91837633 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 91837800 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 91838219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91839231 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 91839286 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 91839323 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 91839344 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 91839394 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 91839775 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 91839790 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 91839792 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 91839805 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 91840270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91840441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91840459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91840619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91840650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91840739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91840820 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 91841856 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91842363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91843305 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91843640 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91843966 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 91843979 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 91844379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91844476 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 91844650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91845334 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 91845563 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 91846276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91846645 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 91847100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91847146 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 91847710 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 91847886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91848578 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91849541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91849773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91849778 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 91852251 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91852425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91853142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91853755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91854347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91857379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91858064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91858209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91859935 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91860019 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 91860448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91860538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91861155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91863501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91866614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91867300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91868953 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 91869077 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91869333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91870198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91871159 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 91871199 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91871454 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91871456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91871498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91871720 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 91871723 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 91871795 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 91871801 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 91871849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91872279 C A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 91872433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91872994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91874406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91874601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91874859 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 91875595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91875968 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 91876334 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 91876467 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91876476 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 91877254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91877690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91877844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91878077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91878253 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 91878514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91878535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91878807 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91878908 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91879039 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91879257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91879564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91880077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91880100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91880265 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91880416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91880502 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91880752 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91880805 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 91880995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91881439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91881444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91881458 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91881490 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91881498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91881531 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 91881551 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 91881648 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91881687 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91881691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91881775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91881923 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 91881925 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 91882105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91882905 G C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 91882957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91883639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91885051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91885609 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91885618 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91885751 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91886316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91886530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91886648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91886881 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91886882 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91887002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91887215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91887255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91887350 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91887490 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91887622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91887624 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91888043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91889290 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 91889514 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91889667 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91890091 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91890353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91894379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91894577 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91895034 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91898890 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91899301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91900642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91901406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91902198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91902552 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91904389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91905469 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91905949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91906907 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 91906972 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 91907534 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91907542 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91908651 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91908695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91909540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91911231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91911438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91911991 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 91912353 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 91912592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91913291 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 91913442 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91913477 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 91913842 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 91914257 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 91914343 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91914383 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91914396 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91914411 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 91914474 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 91914548 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91914607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91914608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91914711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91915363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91915534 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91915543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91915618 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91915628 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91915883 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 91916669 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 91917320 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 91917329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91917345 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 91917538 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91917689 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91918150 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91918200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91918318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91918493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91918540 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 91918626 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 91918652 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91918653 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91918681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91918687 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91918981 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 91919316 G A Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 91919380 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 91919493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91919501 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91920257 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91920304 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91920318 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91920322 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91920422 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91920426 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91920558 G C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91920582 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91920630 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 91920673 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91920787 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91921039 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91921050 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91921075 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 91921113 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91921139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91921422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91921525 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 91921702 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 91921752 C T Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 91921831 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 91921872 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91921874 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91921940 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91921994 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91922443 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 91922469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91922735 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91922791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91922801 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91922919 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91922971 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91923053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91923662 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 91924177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91925311 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91925934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91927102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91927457 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 91927500 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91927543 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91927656 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91927798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91927813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91927958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91928072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91928751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91929228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91930489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91931205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91931362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91932650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91933518 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91935315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91935458 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91936445 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 91937416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91938920 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91938999 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91940356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91940653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91940949 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 91941547 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 91941672 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 91941708 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 91941897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91942108 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 91942354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91942430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91943365 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91944343 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 91944361 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91944593 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 91944955 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 91945688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91946100 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91946379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91946746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91947469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91948765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91948810 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91948970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91949284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91949418 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91949465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91949466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91949702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91950087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91950128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91950366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91950411 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91951176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91951599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91951684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91952535 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91952615 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91952689 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91952849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91953686 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91953755 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91953884 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91953976 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91954059 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91954231 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91954245 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91954268 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91954275 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91954350 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91954468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91954702 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91954802 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91955570 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91955716 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91955728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91955792 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91957681 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91957706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91957721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91959485 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91961574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91961609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91962045 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 91962115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91962176 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91962208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91962723 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91962950 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91963116 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91963213 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91963270 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 91963407 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 91963478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91963633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91963795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91964096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91964365 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91964456 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91964715 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91964732 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91964794 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91964883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91965049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91966049 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91966081 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91966653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91966965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91967431 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 91967497 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91967742 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91967941 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 91967953 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 91968103 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 91968265 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 2 91968424 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91968531 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91968627 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91968707 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 91969619 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91969852 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91969907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91969940 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91969958 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91969991 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 91970139 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 91970323 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91970418 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91970445 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91970787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91971035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91971621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91971939 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91971976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91972346 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91972371 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91972372 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91972442 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91972696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91973408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91973415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91973451 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91973634 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 91974231 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91974332 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 91974451 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91975078 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 91975182 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 91975232 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 91975274 A G Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 91975563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91975580 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91975644 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91976667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91976901 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91977248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91977335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91979664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91979878 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91980283 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91980494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91980763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91980825 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91980829 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 91981557 T G N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 91982212 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91982772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91982781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91982848 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91982972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91983009 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91983017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91983047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91983460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91983548 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91983595 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91983896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91983937 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91983994 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91984012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91984052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91984365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91984381 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91984440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91985181 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91985197 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91986159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91986264 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91986548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91986766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91986976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 91987770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91988392 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 91989156 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91990109 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 91990507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91990537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91991048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91991545 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91991727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91991803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91992008 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91992493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91992537 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91992633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91992642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91992701 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91992817 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 91992818 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 91992978 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 91992989 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 91993014 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 91993084 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 91993173 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 91993453 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91993821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91993822 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91994187 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91994253 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91994316 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91994394 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91994685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91994690 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91994748 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91994903 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91995038 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91995051 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91995092 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91995283 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91995315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91995436 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 91995848 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91995908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91996132 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91996301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91996391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91996465 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91996619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91996809 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 91996867 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 91997362 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 91997601 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 91997622 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 91997636 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 91997840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 91997934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 91998213 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 91999092 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91999456 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 91999832 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 91999950 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 92000015 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 92000183 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 92000827 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 92001005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92001714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92002057 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92002142 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 92002147 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 92002173 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92003619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92003665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92005347 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92005899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92006236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92007962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92008654 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92008748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92009090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92009775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92009962 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 92010787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92010810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92011167 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92012084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92014276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92014334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92017063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92018042 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 92018235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92020312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92020880 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 92021488 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92021521 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92022160 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 92026078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92027020 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92027961 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92029524 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92030674 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92031012 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 92031600 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92033282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92033697 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92034475 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92034716 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 92034739 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 92034862 T A N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 92035981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92037989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92040965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92041124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92042197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92042316 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92042448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92042915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92043366 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 92044523 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92044533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92044942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92046155 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 92046215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92052216 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92052357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92053319 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92054312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92054875 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92055858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92056442 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 92057462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92059452 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92065256 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92068847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92073028 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92073460 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92074821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92075119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92075430 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92075591 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 92075915 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 92075954 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 92076179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92077995 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92079411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92080114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92080309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92083853 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92084461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92085494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92086059 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92089697 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92089984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92090034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92090255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92091450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92092012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92092208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92092652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92093701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92101094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92102707 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92104784 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92105006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92105349 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92107258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92107488 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92107489 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92107596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92107971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92108332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92109418 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92109422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92110555 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92110958 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92111084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92111277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92111996 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92112447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92114375 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92120428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92122273 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 92122693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92123950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92124200 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92127559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92127894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92130013 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92130667 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92131654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92134034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92134915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92136496 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92137649 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92138236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92138424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92139024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92139054 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92140226 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92140239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92140256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92140596 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92143892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92144933 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 92145947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92147500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92147691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92158421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92160081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92161216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92162180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92162389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92163745 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92165098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92166366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92167977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92168298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92168920 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92173389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92175069 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 92176480 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 92177405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92179042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92179637 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92179641 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92179832 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92179989 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 92180279 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92181282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92182686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92182691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92183050 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92183440 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92186316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92190791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92190814 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92192042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92194320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92194602 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92195325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92196230 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92196803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92198123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92198706 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92201198 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 92202200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92202851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92205012 C A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 92205224 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 92206666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92207097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92208475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92209792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92212389 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92213228 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92213818 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92214378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92214932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92215074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92215706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92216066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92217031 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 92217042 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92217059 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92217065 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92217187 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 92217899 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92218004 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92218173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92219635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92219704 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92230331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92230724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92234620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92236047 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92236460 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92237818 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92238116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92242832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92243783 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92244941 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92246440 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92246601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92246809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92246934 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92246986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92247624 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92248090 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92248109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92248790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92249100 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92249110 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92249130 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92249751 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92249970 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92250248 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92251073 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92251205 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 92251226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92251458 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92251486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92251636 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92251677 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92251869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92252092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92252132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92252285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92252507 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92252544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92253078 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92253752 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92254024 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92254226 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92254240 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92254461 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92255313 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92255333 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 92255449 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92255626 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92255664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92255779 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92255795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92255926 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92255988 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92256080 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92256137 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92256374 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92256827 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92256956 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92257354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92257357 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92257440 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92257460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92257577 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92257666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92257726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92258822 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92259065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92259336 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 92259577 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 92259794 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 92260159 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 92260542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92260642 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 92260725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92260750 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 92260850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92260867 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 92260930 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 92260964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92261219 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 92261500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92261511 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92261526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92261611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92261633 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92261744 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92264221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92269079 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92269080 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92269540 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92270517 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92272027 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 92272373 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92272401 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92272468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92272942 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92273224 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 92273255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92273282 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 92273298 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 92273374 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 92275577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92275580 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 92276123 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92276727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92278048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92278245 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92278793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92279560 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92279635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92279868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92280420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92281428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92283286 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92283340 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 92283350 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92283710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92283726 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92284020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92284077 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92284078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92284093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92284169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92284576 A C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 2 92285192 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92285214 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92286158 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 92286190 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 92286271 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92286311 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92287404 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 92287682 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92287752 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92287835 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92287896 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 92288204 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92288213 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92288285 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92288833 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 92288854 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 92288882 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 92288884 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92289056 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 92289164 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92289209 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 92289223 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92289649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92289826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92290482 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92291098 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92291193 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 92291254 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92291289 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 92291390 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 92291749 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92291854 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 92291860 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 92291885 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 92292023 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 92292265 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92292901 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 92292905 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 92293000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92293116 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92293455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92293503 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92293514 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 92293605 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 92293609 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 92293705 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92293721 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92293722 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92293732 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92293997 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92294079 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92294227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92296216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92301275 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92302732 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92302824 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92303246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92303391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92304373 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92304540 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92304586 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92304661 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92304787 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92304939 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92304962 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92305051 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92305880 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92306007 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92306206 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 92307425 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92307431 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92307532 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92307648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92307810 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92307884 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 92307910 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92308067 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92308070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92308165 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 92308281 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92308434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92308439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92308551 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92308574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92308585 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 92308630 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 92308664 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 92308665 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 92308776 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 92308777 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 92308811 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 92308874 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 92308918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92308945 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 92309002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92309024 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92309055 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92309061 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92309072 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92309360 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 92309460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92309729 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92309805 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92309863 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 92309931 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92309942 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92310054 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92310122 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92310150 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92310238 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92310262 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 92310318 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92310332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92310349 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92310418 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92310421 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92310436 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92310456 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92310539 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92310545 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92310723 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 92310856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92310889 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 92310993 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 92311093 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92311382 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 92311417 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 92311465 A C N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 2 92311596 C T Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 92312014 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92312030 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92312153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92312163 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92312174 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92312246 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92312314 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 92312355 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92312434 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92312573 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92312769 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92312779 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92312879 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 92313001 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 92313233 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92313277 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92313432 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 92314160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92314245 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92314591 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92314899 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92315277 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92315982 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92316149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92316234 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92316454 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92316665 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92316779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92316869 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92317526 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 92317569 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 92317840 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92318074 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92318090 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92318390 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92318544 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 92318579 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92318697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92318784 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 92318787 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92318860 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 92318872 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92318927 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 92318957 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 92319142 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92319614 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92319681 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92319726 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 92319828 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 92319934 A T N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 92319950 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 92320259 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92320284 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 92320302 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92320331 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92320357 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92320398 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92320435 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 92320544 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92320632 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 92320757 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92320874 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92321082 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92321107 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92321156 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92321175 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92321317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92321494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92321508 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92321603 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92321622 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92321632 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92321755 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 92321762 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 92321794 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 92321837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92322043 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92322045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92322175 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 92322240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92322246 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92322264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92322716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92322803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92322882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92322905 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92322962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92322987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92323008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92323136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92323147 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92323159 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92323164 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92323201 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92323208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92323248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92323328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92323375 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92323382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92323399 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92323412 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92323464 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92323548 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 92323549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92323599 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92323735 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92323926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92323940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92323958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92323991 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 92324241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92324310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92324537 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92324551 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 92324639 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92324808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92324825 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92324861 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92324871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92324918 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 92326508 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92327293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92327418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92328531 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92328605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92328953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92328954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92329034 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92329318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92329376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92329414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92329803 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 92329847 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92329867 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92329877 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 92329906 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 92329940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92329976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92330203 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92330295 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 92330354 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 92330401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92330431 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 92330434 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 92330511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92330588 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 92330642 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 92330687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92330729 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 92330742 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92330779 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92330966 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 92330980 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 92331006 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 92331036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92331060 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 92331090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92331787 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92332413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92333084 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92333146 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92333259 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92333260 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92333419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92333588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92333641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92333688 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92334287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92334891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92335366 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92335477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92335734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92336026 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 92336174 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 92336336 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 92336587 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 92336612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92336699 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92336998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92337023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92337138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92337243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92337260 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92338038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92338309 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92338310 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92338321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92338393 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92338397 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92338447 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 92338451 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 92338474 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92338501 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92338530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92338614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92338872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92339225 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92339241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92339379 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 92339486 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 92339580 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92339609 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92339945 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 92340138 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92340142 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 92340152 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92340417 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 92340425 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92340515 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 92340595 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 92340737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92341618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92341693 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92341756 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 92341917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92342312 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 92342471 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 92342972 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 92342981 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92343092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92343395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92343475 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92343477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92343826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92343917 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 92343991 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 92344014 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 92344016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92344033 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 92344048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92344050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92344384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92344481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92344498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92346539 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 92346540 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 92346634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92347055 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 92347235 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 92347470 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 92347739 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 92347748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92347846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92348116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92349136 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 92349158 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 92349355 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 92349715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92349825 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 92350000 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 92350014 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 92350135 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 92350180 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 92350227 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 92350298 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 92351211 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 92351385 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92351574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92351889 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92354249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92354889 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92354932 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 92354957 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 92355586 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 92355626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92355645 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 92357491 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 92357570 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 92357914 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92358150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92358326 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 92358414 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92359581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92359586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92359995 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92360018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92360314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92360446 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92360463 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 92360596 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 92361076 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 92361858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92361906 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 92361919 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 92362377 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92362409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92362475 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 92362700 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92362752 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 92364651 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 92365270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92365346 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92365551 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 92365739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92366415 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92366418 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 92366615 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92367051 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92367144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92368690 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92368800 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92368803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92369493 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 92369618 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92369632 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92369652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92370599 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92370711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92370849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92370965 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92372818 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92372826 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92372863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92373117 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 92373142 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 92373351 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92376179 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92376400 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92376410 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92376745 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92376758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92376764 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 92376849 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92376963 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 92376997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92377005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92377080 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92377414 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92377567 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92377661 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92377800 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92378354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92378479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92378654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92378664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92378919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92379448 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 92379737 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92379955 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 92383840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92384240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92384756 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92386162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92386438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92386462 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 92386801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92386818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92386895 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92387011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92387144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92387497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92387831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92387953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92388127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92388250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92388314 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 92388527 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 92389768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92389923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92390148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92390282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92390751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92391381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92392809 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92392864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92393031 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92393841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92394118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92394891 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92394961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92395387 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92395760 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 92396750 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92400139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92400195 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92401088 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 92401720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92402711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92403478 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92406296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92406940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92409170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92409941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92412195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92413856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92413857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92421555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92425112 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92429215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92430438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92430544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92430879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92431255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92432564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92434826 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92434888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92434916 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92435945 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92437382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92442439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92444748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92445521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92446036 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92446077 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92446895 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92447377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92448023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92448140 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92448143 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92448227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92450564 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 92450821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92451182 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92452511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92452812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92452907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92452927 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92453824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92455980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92457156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92457221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92457259 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92458371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92460618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92461853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92462379 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92462599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92462723 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92462739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92462769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92462894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92463177 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92463190 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92463488 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92463867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92463889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92464451 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92465551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92466138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92466454 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92466677 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92467009 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92467032 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92467142 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92467160 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92467236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92467405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92468223 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 92468303 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92469649 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92470435 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 92470749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92471067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92471144 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92471388 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92471863 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92471980 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 92472048 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92472146 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92472163 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92472240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92472259 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 92472270 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92472303 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 92472314 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92472402 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92472758 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92472759 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92472777 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92472802 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92472846 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92473603 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92473683 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92473838 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92474021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92474497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92475341 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 92475805 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92476231 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92476254 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92476782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92477613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92477915 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92478390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92480824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92481675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92481740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92481805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92482103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92482136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92482215 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92482418 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92482452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92482688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92483366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92483498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92483834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92483897 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92485814 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92486717 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92487784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92488981 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92489415 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 92489425 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92490148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92490230 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 92490752 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 92491008 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92491029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92492114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92492408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92493183 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92493563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92493581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92493711 G C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 92493985 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 92494486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92494538 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 92494569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92495070 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 92495121 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92496082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92496405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92497122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92497436 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 92497759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92497914 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 92497916 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92497979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92499743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92499789 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 92500126 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 92500232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92500442 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 92500667 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 92500745 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 92500759 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 92501536 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 92501680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92501942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92503316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92503781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92504553 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 92505181 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 92505193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92507785 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 92510666 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 92510707 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92511068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92511386 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 92511757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92511773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92513865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92514126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92516550 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 92516623 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 92516746 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 92516765 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 92516833 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 92519622 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92521037 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92521728 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 92522587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92523879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92524558 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92524769 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92524868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92525096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92526967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92527606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92528016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92528265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92528300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92528572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92529586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92530224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92530236 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92532259 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92532425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92532493 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 92532613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92532642 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92532644 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92532862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92532945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92533547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92533608 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92533650 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92533659 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92533886 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92534492 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92534498 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92534511 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92534537 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92534666 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92534762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92534832 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 92534858 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 92535044 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92535630 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 92536157 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92536257 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92536524 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92536665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92537247 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92537268 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92537290 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 92537597 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92537731 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 92537818 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92538015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92538048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92538177 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92538275 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 92538520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92538602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92538629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92538885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92538914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92538918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92539313 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92539738 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 92539894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92539910 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 92540324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92541811 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92542282 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92542441 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92542681 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92542713 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92542734 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92542858 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92542868 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92543539 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92543549 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92543568 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92543865 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92543894 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92543921 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92543931 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92544125 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92544148 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92544182 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92544267 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92544337 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92545042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92545092 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92545204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92545303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92545350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92545762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92549467 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92550348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92551995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92553983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92555577 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 92555820 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92555864 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 92558487 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92558505 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92558583 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92558691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92558735 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92558755 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92558776 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92558894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92558897 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92559016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92559101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92559120 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92559665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92560357 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92562827 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92563814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92567007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92571319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92574870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92581248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92583957 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 92583999 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 92585278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92585293 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 92585305 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 92585339 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92585644 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 92585740 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 92586610 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 92587429 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 92587579 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92589102 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 92589322 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 92589820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92590264 G A Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 92590416 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 92590435 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 92590498 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 92590506 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 92590578 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 92590647 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 92591808 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 92591823 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92591979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92592126 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92593246 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 92593811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92594037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92594159 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92594312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92594374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92594791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92595934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92597421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92598165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92598958 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92599015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92599086 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 92599180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92599239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92599962 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92600103 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92600347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92600364 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92600365 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92600436 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92600831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92600868 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 92600888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92600919 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92600967 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92601218 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 92601726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92601773 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92602115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92602159 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92602172 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92602225 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 92602272 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 92602275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92602304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92602423 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92602480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92602510 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 92602638 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 92603091 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 92603120 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 92603153 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 92603158 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 92603252 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 92603408 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92603434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92603913 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 92604084 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92604085 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 92604251 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 92604253 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 92604408 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92604843 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92605406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92606706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92608503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92609273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92610854 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92611100 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92611899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92611905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92611934 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92611971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92612004 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 92612018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92612886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92614067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92614334 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 92614383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92614676 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92614744 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92615511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92615541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92615566 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92615986 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 92616294 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 92616312 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92616359 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 92616402 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92616450 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92616453 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92616496 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 92616527 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 92616530 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 92616540 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 92616580 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92616661 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 92616786 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92616905 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92616926 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92617198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92617341 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 92617385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92618047 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 92618085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92618553 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 92619372 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 92619730 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 92619850 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 92620586 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 92620600 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92620617 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 92620633 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 92620652 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 92620742 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 92620789 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 92620791 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 92620800 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 92620810 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 92620823 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 92620838 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 92620958 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 92621815 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 92622122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92622203 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 92622244 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92624543 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 92624697 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 92624770 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 92624831 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 92624859 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 92626270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92626521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92626566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92626576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92626585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92626608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92626646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92627138 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92627842 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 92628031 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92628162 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92628241 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92628335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92628627 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92628635 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92628703 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92628756 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92628798 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92628886 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92628963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92628990 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92629024 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92629055 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92629062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92629082 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 92629100 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 92629195 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 92629219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92629224 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 92629237 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 92629314 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92629348 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 92629349 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 92629442 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 92629523 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92629539 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92629579 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 92630604 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 92631386 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92631438 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92631472 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92631612 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92631641 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92631854 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 92631935 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 92632248 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 92632472 T C Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 92632500 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 92632515 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 92632625 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92633183 A G Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 2 92633658 A G Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 2 92633994 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92634286 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 92634289 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 92635615 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 92635754 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92635866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92636033 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92637059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92637168 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92637785 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92638305 G A N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 92638344 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 92638438 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 92638474 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 92638505 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92638547 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92638631 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 92639061 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92639155 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92639292 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 92639362 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92639488 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92639545 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92639828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92639881 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 92640441 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 92640591 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 92640623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92641472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92641627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92641629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92641681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92641723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92641791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92641908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92642321 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 92642344 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 92642426 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 92642561 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 92642600 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 92642625 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92642647 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 92642907 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92643042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92643097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92643108 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 92643304 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 92643389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92643405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92643440 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 92643447 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 92643545 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 92643592 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 92643734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92644529 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 92644917 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 92645100 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92646104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92646293 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92646770 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92646906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92647692 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92649408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92649635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92652681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92653812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92656135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92656548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92657471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92659000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92659290 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92659751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92659803 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92660084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92660155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92660712 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 92662440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92662474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92663065 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92664017 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 92664018 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 92664270 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 92665476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92665504 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 92666230 T G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 92666623 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 92666728 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 92666777 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 92666968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92667646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92668322 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92668880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92671438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92675229 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 92677506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92681190 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 92681504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92681505 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92682957 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92682996 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92684480 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92685557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92686748 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92687446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92687807 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 2 92687814 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 92687895 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 92688569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92689498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92690032 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 92690085 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 92690220 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92690280 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92690361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92690717 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 92690808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92691055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92691103 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92691123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92691323 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 92691327 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 92691458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92691604 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 92691702 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 92692147 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 92692908 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 92693040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92693202 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92693216 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 92693958 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92694047 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92694050 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92694167 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 92694177 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 92694249 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 92694457 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 92694525 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 92694545 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 92694558 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 92694601 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92694623 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92694679 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92694688 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92694699 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 92694710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92695012 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92695057 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92695235 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92695398 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92696408 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 92696468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92696531 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92697258 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 92697313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92697446 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 92697518 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92697840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92698087 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92698186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92698593 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92698761 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 92698816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92698835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92698862 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92698905 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92699161 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 92700039 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92700099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92700317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92700527 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 92700564 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 92700568 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92700578 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92700721 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 92700732 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92701410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92701712 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 92701758 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92701806 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 92701916 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92701995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92702106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92702294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92702802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92702978 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 92703103 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 92703354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92704618 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92704746 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92704823 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92704968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92705024 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 92705088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92705105 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92705164 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92705194 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 92705367 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92705681 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92705825 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 92706091 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92706309 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92706902 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92707004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92707068 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92707224 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 92707291 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92707303 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 92707463 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 92707606 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 92707692 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92707703 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92707716 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92707767 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 92707768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92707780 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 92707813 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 92707883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92707951 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 92707985 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 92708017 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 92708060 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 92708178 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92708217 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92708466 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92708573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92709429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92709483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92711104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92711407 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92712946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92713188 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92714472 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92714478 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92715079 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 92715441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92715705 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92715833 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92715914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92715917 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 92715961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92716202 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92716540 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 92716750 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92716887 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 92716901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92716936 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92716947 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 92717773 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92718533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92719662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92721385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92721462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92721927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92722029 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92722097 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 92722213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92722341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92722357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92722373 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92722411 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92722636 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 92722654 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92722675 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 92722924 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 92723006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92723177 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 92723301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92723372 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92723572 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 92723641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92723770 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92723787 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92723791 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92723801 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92723843 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92723973 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 92724575 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 92724638 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92724767 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 92724930 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 92725158 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92725187 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92725509 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92725630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92725652 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92726020 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92726040 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92726141 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 92726201 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 92726401 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92726439 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92726741 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 92726747 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 92726798 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92726990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92727296 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 92727320 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92727354 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 92727478 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 92727565 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 92727642 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 92728019 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92728027 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 92728212 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92728403 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92728422 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92728546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92728666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92728698 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 92728731 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92728757 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92728856 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92728880 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92728914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92728950 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92728983 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 92729030 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 92729496 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92729636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92729751 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92729763 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92729981 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 92730014 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92730474 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92730575 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 92731166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92731379 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92731833 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92731952 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92731957 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92732015 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92732072 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 92732302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92732570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92732771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92732984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92733676 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 92734522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92734796 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 92735406 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92735445 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92735570 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 92735613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92735718 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92736070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92738300 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 92738683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92739556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92743129 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92744325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92746380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92746414 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92746590 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92747121 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92748190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92750387 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92751697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92752621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92753017 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 92753043 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 92753171 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 92753290 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92753355 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 92753540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92753819 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 92754408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92755926 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0 1 0 17 17 0 17 0 2 92755927 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 2 92757048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92758904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92759202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92759305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92759437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92759669 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92759696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92760364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92760410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92760452 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92760832 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 92760949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92761617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92764512 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92766292 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92766870 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 92767119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92767638 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92767648 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92767655 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 92767805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92767831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92768121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92768164 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92768612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92768617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92769214 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92769251 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 92769857 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92769886 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92769942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92770066 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92770136 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 92770152 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 92770303 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 92770340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92770825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92770975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92770997 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92771063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92771073 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 92771099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92771604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92771772 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 92771823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92771923 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92771935 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92772069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92772135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92772164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92772327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92772388 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92772466 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92772753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92772860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92772897 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92772936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92772969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92773148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92773237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92773526 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 92773834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92773916 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 92773936 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92774096 T C Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 2 92774503 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 92774566 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 92774790 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 92775393 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 92775829 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 92776007 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 92776013 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 92777430 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 92777630 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 92777715 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 92777762 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92778134 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 92778442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92778468 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92780440 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92780642 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 92780820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92780824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92781196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92781255 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 92781449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92782050 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 92782231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92782283 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 92782343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92782528 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92782611 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92782633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92782958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92782997 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92783005 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92783694 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92786607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92786903 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 92787499 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 92787740 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92788024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92788065 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 92788402 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 92788491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92788553 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92788723 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92789221 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92789235 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92789342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92789389 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 92789614 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92789664 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92789695 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92789765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92789914 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92789979 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 92789998 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 92790087 A C N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 92790321 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 92790727 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92790756 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 92790762 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92790772 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 92790775 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92790829 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92790877 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 92790948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92790964 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92791106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92791627 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92791679 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92791745 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92791794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92791901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92791993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92792137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92793400 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 92794121 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92800941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92801211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92801339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92801867 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92803858 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92804732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92805548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92805662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92807095 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92807437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92807775 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 92808296 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92809411 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 92811322 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92811340 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92814487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92814794 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 92814822 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92815975 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92816385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92816828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92817438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92817631 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92817735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92817844 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92817928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92819069 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92819146 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92819162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92819206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92819402 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92819413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92819559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92821019 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92822808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92822858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92823074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92824123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92824790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92825323 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 92825324 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 92825348 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92825615 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92825633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92825725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92825804 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92825849 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92827718 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 92828196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92828221 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 92828351 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 92828537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92829774 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92830511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92830635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92833236 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92833244 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92833843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92833937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92833979 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92834323 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92834338 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92834352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92834459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92834726 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92834846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92836577 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92836751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92836949 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 92836966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92837161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92837183 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92837330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92837462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92838268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92838636 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 92838659 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92838685 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 92839249 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 92839331 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 92839444 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92839877 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 92839963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92840012 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 92840628 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 92840707 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 92840801 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92840886 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 92840942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92841012 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 92841015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92841257 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 92841269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92841276 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92841815 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 92841818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92842068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92842082 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 92842088 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 92843865 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 92843951 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 92843977 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 92844104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92844168 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92844543 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 92844565 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 92844568 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 92844625 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92844690 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 92844751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92846801 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92847400 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 92850226 C A N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 92850877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92850925 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92856871 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92857039 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92857328 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 92857363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92858162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92858188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92858358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92858433 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 92858447 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 92858728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92858817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92858988 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 92859049 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 92859056 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 92859668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92859675 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 92860003 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 92860215 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 92860261 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 92860268 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 92860293 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 92860337 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 92860492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92860535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92860597 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92860621 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 92860661 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 92861003 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 92861492 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 92862433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92863126 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 92863194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92864400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92865971 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 92866425 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92866507 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92866756 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 92868946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92869823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92870248 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92872290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92874672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92875267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92878580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92878998 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 92879843 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 92880552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92880897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92882115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92884564 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92884656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92890737 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92891107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92891204 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92892696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92892827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92893008 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 92894748 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92894846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92898666 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 92898821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92901710 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 92901734 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92902527 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92902813 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92902905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92903334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92903630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92905171 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92907184 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 92909426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92911917 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92912038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92912217 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 92912424 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 92913276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92914335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92914513 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 92916691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92916972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92918050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92919943 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 92920946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92921609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92922798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92923338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92924184 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 92924307 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 92924445 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 92924475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92927807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92928584 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92928847 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92931098 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 92931196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92931454 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 92931552 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92931602 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92931689 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 92931692 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 92931730 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 92931769 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 92931781 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 92931913 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 92933058 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92933067 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 92934131 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 92934206 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92934913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92935001 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 92936106 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 92937258 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 92937395 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 92938835 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 92939929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92940511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92941221 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 92941492 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 92942586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92942914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92943014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92946123 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92946672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92947034 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92947071 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92947106 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92947166 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92947242 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 92947305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92947508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92948624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92948827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92948986 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92949177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92949219 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 92952385 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 92952419 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 92952527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92952638 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 92952730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92952749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92954830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92956302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92957234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92957690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92958579 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92960600 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 92961636 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 92964699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92965835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92966272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92967065 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 92967455 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 92968532 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 92968721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92968908 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 92969431 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 92969743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92969770 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 92969838 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 92970053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92970066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92970083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92970128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92970231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92970251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92970268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92970418 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92970577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92970585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92970623 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92970699 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92970751 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 92970760 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 92970770 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 92970773 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 92970933 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92970944 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92971014 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 92971044 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92971153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92971159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92971187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92971195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92971257 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 92971387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92971434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92971487 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 92971536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92971684 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 92971695 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92971832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92971864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92972070 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92972110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92972162 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92972241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92972509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92972684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92972722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92972939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92972975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92972999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973430 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92973636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973671 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92973672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973767 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92973989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92974131 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 92974254 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92974451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92975316 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 92975423 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 92975942 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 92975981 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92976022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92976505 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92976509 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 92976525 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92976652 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 92976962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92977020 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92977059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92977117 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92977545 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 92977836 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 92977899 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92978230 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 92978421 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92978512 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92978564 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92978895 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92978906 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92978918 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92978991 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 92979082 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 92979106 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 92979170 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92979502 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92979670 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 92979736 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 92979899 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 92980645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92981755 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 92981965 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92982051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92984196 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 92984274 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 92986304 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92986947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92987348 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 92987494 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92988606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92988621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92988930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92988997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92991292 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92992142 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 92992179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92993749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92995579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 92997250 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 92998496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92999643 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 92999769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92999784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92999810 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92999814 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92999852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92999943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92999953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 92999954 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 93000019 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 93000027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93000032 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 93000083 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 93000092 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93000296 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 93000405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93000438 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 93000462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93000559 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 93000658 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 93001160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93001252 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 93001269 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 93001346 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 93001414 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 93001541 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 93001729 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 93001994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93002044 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93004347 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 93004538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93005158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93005370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93005765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93006714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93007937 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 93007974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93008129 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 93008314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93008543 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 93008614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93009012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93009170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93009250 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93009254 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93009683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93010008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93012213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93013410 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93013546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93013563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93015651 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93016093 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 93016865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93016981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93017114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93018781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93018864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93018945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93018951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93019053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93019727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93020158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93020917 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93020945 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93021070 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93021282 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 93021308 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 93021512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93021586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93022088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93022679 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 93022820 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93022970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93023036 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 93023526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93023527 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 93024085 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 93024121 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 93024915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93025129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93026626 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93026681 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93026944 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 93026962 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93027020 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 93027358 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 93027449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93027479 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 93027539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93028015 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 93029015 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 93029447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93029606 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 93029687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93030024 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93030199 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 93030592 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93031404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93031573 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93031757 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 93031954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93032335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93035240 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 93036616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93037827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93038883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93040277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93040909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93044264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93045062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93045068 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93045204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93045239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93045480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93045622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93045634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93045678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93046811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93047497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93061254 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93061495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93061745 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93062016 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93062730 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93063109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93063577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93063909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93063937 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93063949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93065121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93065316 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 93065354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93065505 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93065594 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93065959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93066064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93066747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93066915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93071981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93072014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93073719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93073836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93074917 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93075379 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 93075397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93075403 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 93075412 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93075497 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93075511 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 93075535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93075632 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93075633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93076168 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93076230 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93076256 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93076292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93076437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93076929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93077153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93077164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93077296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93077599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93077695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93077741 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93078269 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93078422 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93078535 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93078628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93078678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93080883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93080979 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93081097 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93081102 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93081174 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 93081277 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93081310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93081414 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93081544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93081963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93081984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93082113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93082351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93082379 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93082398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93082644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93082656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93082741 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93082758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93083110 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93083492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93083498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93083578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93083857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93087377 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93087729 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 93088089 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 93094022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93094199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93094247 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93094797 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 93094944 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 93094973 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 93094983 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 93095196 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 93095431 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93095547 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93095580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93095631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93095711 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93095855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93096318 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93097776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93097855 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93097882 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93097917 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93097936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93097939 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93098019 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93098038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93098658 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93098692 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 93098704 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93098714 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93098804 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93098875 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93098903 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93098992 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93099299 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93099415 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 93099581 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93099900 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93099911 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93099986 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93100105 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 93100676 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93100737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93100798 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 93100832 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 93100954 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 93100976 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 93101031 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 93101034 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 93101128 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93101563 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 93101700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93101730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93101795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93101852 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93102594 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93102639 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93102787 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93102932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93102967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93103144 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93103188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93103297 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93103320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93103415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93103425 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93103461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93103479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93103501 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93103516 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93103654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93103811 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93103861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93103872 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93103909 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93103922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93104097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93104180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93104209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93104275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93104321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93104331 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93104562 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93105380 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93105542 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93105551 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93105856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93105924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93106080 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93106290 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93106366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93106565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93106595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93107181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93107972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93108753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93109140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93109149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93109166 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93110660 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93112322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93112402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93113545 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93113584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93114006 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 93114178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93114247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93114387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93114574 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93114707 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93114713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93114814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93115170 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93115213 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93115228 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93115314 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93115325 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 93115327 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93115551 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93115592 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93115858 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93115881 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93116438 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93116456 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93116483 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93118028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93119733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93121542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93121654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93122626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93124726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93125782 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93126395 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93126992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93129238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93129259 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93131391 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93132490 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93132494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93132814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93132821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93132835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93132894 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93133489 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93133927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93133993 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93134208 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 93139054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93139064 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93139181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93139186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93139319 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93139383 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93139451 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93139564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93139710 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93139730 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93139735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93140096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93140736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93141088 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93141328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93141686 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93142698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93142726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93142845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93142948 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93142965 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93143233 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 93143312 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93143717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93146532 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 93148184 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93148285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93148385 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 93149231 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93149412 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93149423 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93150119 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93150219 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93150633 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93150802 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93150919 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93151120 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 93151175 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 93151183 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 93151195 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 93151512 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 93151518 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 93151538 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 93151581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93151651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93152493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93152712 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93152775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93153066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93153996 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93154820 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93158027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93158474 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93159381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93159474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93159687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93160445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93161745 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 93163398 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93163592 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93168563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93170938 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93170939 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93172495 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93175198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93175741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93176147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93176860 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93181186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93181480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93183015 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93183073 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93183130 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93183137 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93184708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93185643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93186027 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93186176 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93186718 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93186812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93186892 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93187049 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93187079 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93187138 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93187609 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93187613 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93187715 T G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 93187951 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93188247 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93189160 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93189598 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93189649 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93189783 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93189812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93189933 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93190037 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 93190147 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 93190236 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93190391 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93190565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93190584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93190912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93190952 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93191050 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93191071 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93191335 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93191443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93191500 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93192081 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93193961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93194764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93194784 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93194981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93195611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93196008 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93196054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93196064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93196451 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93196670 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93196672 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93197259 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93197329 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93197400 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93197462 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 93197575 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93197622 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 93197643 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 93197664 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93198097 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93198154 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 93198262 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93198284 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93198285 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93198427 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 93198762 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93198772 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93198801 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93198876 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93199093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93199130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93199266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93199285 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 93199375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93199378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93199396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93199449 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93199493 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 93199798 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93199888 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93199895 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93199904 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93199923 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 93200042 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 93200289 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93200377 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93200404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93200419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93200452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93200469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93200559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93200585 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93200817 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93201056 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93201202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93201355 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93201428 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93201441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93201442 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93201505 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93201533 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93202246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93202318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93202625 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93202879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93202948 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93203023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93204056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93204249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93204529 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93204977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93205011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93205013 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93205389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93205421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93205489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93205761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93205808 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93205881 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93205902 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93205951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93206309 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93206863 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93206942 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93207093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93207313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93207932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93208090 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93208595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93208964 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93209113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93209131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93209150 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93209839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93211634 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93212102 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93212289 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93213808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93213830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93214098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93214380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93214519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93214802 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93215361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93216404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93217839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93218382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93218487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93218856 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93218904 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93219281 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93219322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93219440 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 93219470 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 93219483 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 93221203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93222463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93223077 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93223525 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93223527 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93223548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93223583 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 93223846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93224074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93224420 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 93224689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93226852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93226959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93227164 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 93227218 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 93227690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93229217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93231436 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93231499 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93231508 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93231865 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 93232852 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 93236093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93236156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93237930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93238142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93238461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93239395 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93240200 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93241469 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93241526 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 93241957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93242848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93243973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93246671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93247475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93247586 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93248000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93248036 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93248037 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93249115 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93249716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93249878 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93249927 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 93249930 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 93250348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93250363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93250369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93250386 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93250485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93250495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93250820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93250924 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 93250975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93250977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93253842 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 93254328 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93255273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93256556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93257196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93258794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93259974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93260019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93262687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93262812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93262814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93263739 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 93267002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93267018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93267137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93267255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93268727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93268853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93270762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93271454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93272164 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93272213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93272301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93272328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93272526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93272834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93274318 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93274321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93274628 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93274635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93274742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93274768 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93275078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93275356 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93275505 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 93275588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93276159 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93276197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93276490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93276504 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93276519 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93276549 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93276634 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93276731 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93276770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93276901 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93277018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93277111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93277150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93277176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93277228 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93277328 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93277360 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 93277476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93277490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93277517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93277641 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93277902 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93278083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93278862 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93279029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93279550 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93279742 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93279955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93279992 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93280034 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 93280215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93280298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93280302 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 93280432 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93280602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93280800 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93280910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93280978 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93281401 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93281589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93281725 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93281962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93281972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93282013 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93282015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93282130 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93282174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93282189 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93282201 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93282202 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93282228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93282294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93282330 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93282990 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93283094 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93283095 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93283118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93283863 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93283882 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93284457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93284520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93284557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93284697 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93284705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93284714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93284946 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93284955 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93284957 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93286269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93286631 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93286856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93288011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93288592 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93288674 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93288686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93290250 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93291175 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93291255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93291665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93292190 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93292203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93292477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93292737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93293186 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93293218 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93293309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93293376 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93293455 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93293576 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93293600 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93293618 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93293745 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93293768 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93294413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93296226 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93296233 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93296313 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93296472 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93296647 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93297398 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93297546 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93297548 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93297674 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93297720 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93297980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93298020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93298127 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93298222 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93298265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93298339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93298356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93298370 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93298404 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93298424 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93298452 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93299111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93299130 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93299139 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93299185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93299279 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 93299405 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93299679 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 93299722 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 93299744 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93299868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93300166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93300357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93300401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93300882 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 93300980 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 93301619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93302840 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93303040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93303430 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93304034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93304342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93304367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93304623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93304684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93305971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93306081 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93306474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93306627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93306642 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93307446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93307583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93308025 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93308068 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93308214 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93308268 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93308319 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93308514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93308715 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93308979 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93309925 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93310013 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93310186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93310587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93310886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93310921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93311213 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93311735 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93311757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93311862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93311910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93312246 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93312269 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93312285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93312334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93312354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93312355 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93312421 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93312478 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93312627 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93312666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93312668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93312743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93312772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93314248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93314831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93315474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93315681 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93315925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93316080 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 93316309 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93316462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93316464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93316648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93316990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93316999 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93317009 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93317063 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93317080 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93317247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93317381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93317383 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93317746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93317752 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93317758 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93318067 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93318913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93319094 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93319642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93319670 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93319782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93319787 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93320895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93321133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93321505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93321693 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93322001 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93322416 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 93322746 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93322974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93323167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93323303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93323391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93323631 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93326019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93327722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93327802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93327832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93327976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93328183 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93328242 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93328697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93329455 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93329761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93329944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93330140 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93330834 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 93331072 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 93331495 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93331793 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93331837 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93332496 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93332507 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 93332734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93332849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93334591 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93334760 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93334972 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93335181 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93335340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93335392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93336082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93336600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93336610 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93337541 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93337551 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93339413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93340456 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93340688 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93341040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93344420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93344476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93345805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93345901 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93350148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93350352 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 93351075 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93351285 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93351512 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93351716 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93351717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93351943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93352122 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 93352271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93352453 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93352637 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93352708 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93354506 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93355039 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93355132 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93356146 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93356337 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93356445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93356736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93357140 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93357210 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93359166 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93359490 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 93359607 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93359675 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93359757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93359960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93359961 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93361483 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93361798 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93363308 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93363697 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93363963 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93363997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93365179 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 93365180 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 93365252 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93365422 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 93365502 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93365519 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93365529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93365676 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93365927 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93365992 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93366067 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93366351 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93366430 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93366528 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 93366561 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 93366609 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93366649 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 93366652 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93366668 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93366725 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93366731 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93367082 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93367172 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93367213 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93367243 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93367276 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93367398 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93367429 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93367507 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93367741 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93367750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93367756 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 93367817 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93367840 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93368199 C G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 93368486 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93368538 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93368606 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93368685 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 93368696 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 93368768 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 93368808 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 93368851 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 93368877 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 93368879 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 93368909 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 93369015 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 93369042 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 93369119 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93369205 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93369279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93369320 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93369579 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93369633 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93369666 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93369667 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93369773 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93369787 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93369798 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93369804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93369867 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93370271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93370304 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93370347 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 93370376 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 93370393 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 93370429 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 93370438 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 93370606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93370653 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93370830 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93371589 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 93371797 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93371964 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93372125 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93372178 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 93372240 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93372756 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 93372770 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93372832 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 93373773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93373791 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93373882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93373920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93374038 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 93374139 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93374292 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93374964 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93374986 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93375071 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 93375207 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93375450 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 93375650 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 93375682 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93375792 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93375793 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93376206 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93376219 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93376261 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93376276 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93376500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93376533 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93376656 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 93376745 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93376867 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 93377004 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93378043 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93378967 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93379084 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93379251 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93379259 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93379281 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93379370 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93379405 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93379419 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93379467 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93379480 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93379701 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93379724 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93379741 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93380016 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 93380054 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93380077 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93380088 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93380109 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 93380194 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93380234 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93380273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93380319 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93380407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93380959 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93380980 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 93381026 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93381080 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93381132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93381192 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93381212 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93381284 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93381291 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93381538 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93381569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93381606 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93381826 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93381832 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93381983 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93382360 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93382468 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 93382473 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93382585 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93382651 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93382751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93382838 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93382858 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93382890 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 93382944 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 93383301 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93383671 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 93383673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93383773 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 93383843 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 93383866 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 93383881 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 93383918 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 93384053 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93386121 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93386540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93387978 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93388000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93388464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93388566 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93389612 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93389646 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93390346 G A Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 93390347 T G N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 93390809 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93393216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93394343 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93395274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93396161 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 93396357 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93396429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93396596 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93396675 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93396781 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93396855 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93396918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93398237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93400846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93401052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93401181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93401213 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93401558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93401754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93401982 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93402004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93402728 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93403129 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93403692 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93404380 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93404442 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93404565 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 93404583 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93405666 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 93405697 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93405811 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 93405961 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93406351 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 93406450 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93406464 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93406488 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93406940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93406963 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93407010 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93407034 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93407047 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93407402 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 93407430 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93407439 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93407585 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93407632 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93407637 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93407730 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 93407747 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 93407902 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 93409052 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 93409392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93410797 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 93410838 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93410982 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93411656 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 93412237 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93412373 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 93413242 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93414820 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93416377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93416873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93416978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93417242 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93417261 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93417676 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93418235 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93418389 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 93418882 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 93419359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93419996 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93420694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93420717 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93421153 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93421184 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93421334 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93421497 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93421541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93423618 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93424020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93424738 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93424855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93426305 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93427137 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93429488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93429619 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93430133 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93430478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93430544 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93430565 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93431916 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93432031 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93432136 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93438806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93439177 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93439314 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 93439338 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93439981 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93440444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93441241 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93441385 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 93441486 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93441583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93441676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93441823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93444218 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93444428 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 93444586 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 93444847 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93444931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93446462 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93448402 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 93448540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93448722 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93449467 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93451335 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93451453 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93451772 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93451777 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93453013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93453169 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 93453205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93454322 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93455799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93456309 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93459319 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93460292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93460464 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93460598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93462628 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93462652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93462861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93462999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93464318 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93466083 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93466252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93466502 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93466577 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93466891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93466997 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93467055 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 93467336 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93467380 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93467766 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93469927 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93470102 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93470504 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93470548 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93470617 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93471247 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 93475380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93476639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93476867 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93477291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93483056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93483690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93484447 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 93484966 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93487789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93490981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93491137 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 93491143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93491151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93491208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93491594 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93492775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93493078 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93494639 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93495058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93495172 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93495889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93496071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93497165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93497462 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 93497546 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93497755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93497764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93497862 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93498005 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 93498292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93498487 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93498616 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93498725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93498764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93499306 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93499734 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 93499994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93500107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93500713 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93500747 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 93500755 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93500787 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93501317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93501337 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93501517 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93502081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93502248 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93502538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93502820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93503964 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93504005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93504076 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93504223 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93504260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93504289 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93504483 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93504566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93504781 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 93504838 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93504914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93504943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93505085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93505131 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93505373 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 93505587 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93506412 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93506439 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93506481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93506884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93506896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93507021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93507080 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93507279 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93507976 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93508102 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93508151 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93508174 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93510377 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93510455 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93511494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93511496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93512368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93512623 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93512795 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93512957 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93513094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93514656 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 93515046 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 93516679 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93517146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93519292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93519747 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93521895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93522481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93522647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93523520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93523652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93523668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93523693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93523750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93523839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93523854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93523876 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93523938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93523987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93525776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93525810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93525982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93526306 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93527333 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93528209 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 93529090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93531020 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93531036 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93531045 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93531554 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93532106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93532327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93533006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93533031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93533948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93535084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93535419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93536282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93538788 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93541586 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 93543097 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 93544300 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 93544711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93545942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93545970 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93548811 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93549364 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93549497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93553869 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93554316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93555296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93559337 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93559523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93560468 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93560524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93564838 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 93570414 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93570541 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93570551 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93570673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93571165 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93571394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93572047 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93572676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93572913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93573561 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 93575441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93577425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93578247 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93580545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93584779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93585029 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 93585620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93585843 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93587605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93588510 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 93591736 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93592271 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93594050 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93594459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93594717 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93595095 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93595180 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93595258 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93595882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93595978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93596169 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93596237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93596357 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93596481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93596522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93596560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93596567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93596835 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93597239 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 93597308 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 93597454 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 93597629 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93597916 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93598214 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 93598324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93598763 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93598951 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93599550 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93599617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93599789 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93599831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93599970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93599974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93600004 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93600015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93600125 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93600176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93600231 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93600384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93600529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93600531 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93600816 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 93601034 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93601047 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 93601271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93601383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93601445 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 93601958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93602002 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93602015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93602098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93602102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93602490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93602538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93603108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93603569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93603622 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93603733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93603774 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93603841 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 93603922 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93604123 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93604314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93604830 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 93604926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93605043 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93605351 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 93605677 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93605814 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 93605858 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93605890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93605964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93605974 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93606218 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93606347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93606505 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93606509 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93606589 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93606606 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93606676 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93606973 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 93606985 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 93607016 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93607162 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93607249 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93607748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93607785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93608198 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 93608232 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 93608266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93608273 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93609083 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93609301 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93609441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93609560 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93609726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93609951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93610106 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93610118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93610150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93610187 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93610266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93610292 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93610333 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93610439 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93610480 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93610580 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93610701 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93610706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93610737 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93610876 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93610877 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93611054 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93611201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93611337 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93611413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93611488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93611535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93611781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93611871 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93611939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93611996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93612089 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93612306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93612315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93612347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93612463 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 93612540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93612610 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93612674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93616030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93616874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93618915 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93618925 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93620874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93621460 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93621581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93622445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93622492 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93626608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93626876 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 93627717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93627990 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 93628020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93628783 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 93628787 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 93628871 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93628872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93629097 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93629258 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93629265 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93629462 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 93629468 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 93630373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93630889 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93632387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93632724 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93632945 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93633082 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 93633152 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93633447 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93633578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93633659 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 93633696 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93633727 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 93633813 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93633826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93634034 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93634080 A C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 93634087 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93634101 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93635244 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93636410 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93636431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93636601 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93636801 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93636856 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93636925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93636977 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 93637100 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 93637260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93637276 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 93637287 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 93637327 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 93637364 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93637376 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93637400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93637642 A T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 93638126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93638300 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 93638383 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93638644 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 93638735 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93639022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93639104 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93639168 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 93639566 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 93639577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93641263 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 93641282 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 93641369 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 93641770 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 93641779 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93642394 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 93642411 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 93642490 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 93642658 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 93642676 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 93642694 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 93642754 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 93642898 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 93642950 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 93642952 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 93643302 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 93643312 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 93643341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93643369 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 93643414 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 93644213 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93644526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93644561 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 93644681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93644778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93645305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93645657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93645690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93645764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93645804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93645950 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93646117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93646144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93646302 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93646312 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93646916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93647026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93647304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93647647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93648347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93648401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93648591 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 93648648 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 93648660 A C N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 93648734 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93648761 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93648775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93648816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93648826 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93648833 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93648839 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93648857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93648978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93648991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93649097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93649144 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93649212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93649221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93649377 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93649417 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93649498 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93649518 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93649804 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93651108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93651459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93652201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93652431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93652794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93653035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93653294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93653459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93653465 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93654370 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93654567 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93655027 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 93655092 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93656603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93657965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93658762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93661791 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93662162 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93662352 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93664028 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93664500 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93672184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93672466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93676204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93679154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93680092 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93680722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93681488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93681881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93682258 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93682379 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93682517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93682552 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93682601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93682616 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93682654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93682675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93682689 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93682699 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93682716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93682777 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93682778 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93682914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93682925 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93683011 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93683047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93683048 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93683163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93683226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93683306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93683317 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93683494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93683688 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93684026 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93684146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93685007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93686251 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93686817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93686924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93687354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93687812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93687835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93687841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93687869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93688623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93688639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93689075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93689380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93689706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93689709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93689758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93689780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93689873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93689894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93689947 C G Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 93689961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93690026 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93690101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93690140 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93690191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93690223 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93690338 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93690464 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93690495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93690563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93690702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93690914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93691620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93691835 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93692011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93692994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93693048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93693073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93693098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93693271 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93693811 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93693951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93694000 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93694062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93694105 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 93694110 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93695419 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93695517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93695603 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93695626 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93695674 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93695813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93696133 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93696190 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93696205 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93696322 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93696340 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 93696586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93696668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93697066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93697210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93697355 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 93697991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93698528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93699001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93699033 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93699176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93700101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93700271 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93700305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93700308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93700396 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 93700614 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93700649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93700718 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93700728 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93700731 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93700778 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93700842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93700967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93701170 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93701209 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93703070 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93705483 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93707968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93708511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93708628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93708929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93709543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93709671 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 93709676 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93709688 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93709756 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93709872 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93709881 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93709911 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93709949 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93710036 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 93710098 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93710112 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93710395 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 93710469 A T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 93710578 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 93710594 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 93710615 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 93710753 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 93711005 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 93711021 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 93711202 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 93711255 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 93711269 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 93711350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93711354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93711384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93711395 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 93711397 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 93711637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93711700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93712056 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 93712274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93712477 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 93712527 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93712619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93712643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93712644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93713011 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93713312 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 93713332 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 93713385 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 93713414 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 93713448 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93713513 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93713650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93713884 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93713905 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 93713907 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 93714024 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93714031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93714594 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93715526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93717870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93717917 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 93717933 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 93718035 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93718178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93718190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93718363 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93718364 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93718743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93718788 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93718854 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93719558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93719777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93719943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93720304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93720345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93720405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93720434 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93720449 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 93720678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93720763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93720798 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93721349 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 93721421 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 93721570 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93721598 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93721602 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93721792 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93721842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93722415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93722680 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93722739 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 93723097 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 93723275 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93723330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93723561 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 93723596 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 93723660 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93723876 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 93723888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93724055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93724085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93724146 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93724260 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93724273 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93724296 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 93724368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93724666 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93724741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93724806 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93724887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93724944 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 93725152 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93725408 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 93725563 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 93725622 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93726184 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93726661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93726741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93726890 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 93726973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93726996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93727003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93727672 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93727753 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93727773 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93727876 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 93727906 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 93728044 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93728129 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 93728143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93728262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93728266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93728579 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93728607 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93728707 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93728870 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93728883 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93728978 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93729114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93729412 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93729420 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93729427 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93729486 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93729680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93729711 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93729794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93729869 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93730024 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93730114 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93730160 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93730613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93730977 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93732476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93732724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93733579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93733798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93733918 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93734375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93734486 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 93734717 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 93734749 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 93734828 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93734924 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93734929 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93734970 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93734989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93735006 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93735087 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93735095 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93735255 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93735330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93735446 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93736027 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93736032 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93736055 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 93736090 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93736171 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93736730 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93736752 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93736960 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93737101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93737117 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 93737247 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93737283 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93737485 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 93737674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93737946 A T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 2 93738917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93739085 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93739107 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93740165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93740249 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93740465 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93740518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93740762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93740772 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93740971 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93741190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93741214 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93741294 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 93741313 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93741316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93741534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93741665 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93742006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93742140 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93742150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93742243 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93742273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93742287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93742333 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93742338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93742399 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93742975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93743152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93743179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93745712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93746519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93746617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93746791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93746986 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93747379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93747976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93747988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93748132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93748184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93748466 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93748906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93749305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93749315 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93749631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93749674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93749907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93749914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93749942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93750038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93750063 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93750123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93750332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93750366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93750441 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 93751464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93751821 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 93752200 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93752215 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 93752605 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93752639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93752829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93753154 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 93753204 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93753240 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93753300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93753446 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93753480 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 93753560 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 93753626 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93753640 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93753820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93753833 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93753846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93753894 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93753979 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93754083 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93754109 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93754131 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93754170 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93754327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93754652 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 93754691 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 93755184 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93755315 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93755430 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93755612 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93755697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93755785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93756240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93756395 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93756693 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93756775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93756915 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93756978 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 93757444 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93757728 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93757992 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93758566 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 93759549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93759601 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93761608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93765076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93765755 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 93766781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93767084 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93768302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93768566 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 93769074 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93770934 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93770943 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93770993 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 93771558 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 93771624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93771687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93771758 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 93771787 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 93771886 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 93772006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93772171 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93772189 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93772216 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 93772233 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 93772304 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93772329 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 93772356 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93772429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93772540 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 93772576 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93772624 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 93773425 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93773458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93773576 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93773607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93773780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93773861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93774266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93774277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93774340 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93774555 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93774745 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 93775840 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93775848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93775909 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93776168 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 93776199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93776337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93776528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93776779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93776782 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93776797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93776803 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93776861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93776865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93776903 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93776960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93776978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93777038 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93777097 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 93777525 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 93777637 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 93777793 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 93777953 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 93778001 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 93778663 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93778697 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 93778797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93779287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93779512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93779924 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93781173 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 93781234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93781391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93781873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93784176 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93784258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93784463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93784552 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93784603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93784689 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93784743 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93784830 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93784941 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93784949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93785021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93785091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93785102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93785124 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93785284 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93785387 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 93785404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93785545 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93785580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93785652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93785678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93785701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93785915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93785996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93786058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93786106 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 93786131 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93786223 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 93786330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93786382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93786404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93786438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93786485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93786710 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 93786783 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93786830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93786873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93786891 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93786938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93787087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93787349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93787398 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93787399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93787565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93792586 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93792834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93793204 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 93793611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93793758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93793787 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 93793918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93793930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93794127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93794214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93794310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93794515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93794519 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93794891 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 2 93795047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93795347 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93796391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93796425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93797353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93797469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93797668 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 93797682 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 93798262 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93798298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93799481 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 93799610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93800270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93800392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93801735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93803618 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93803782 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93804842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93805094 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93805320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93805821 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 93806039 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 93811741 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 93812286 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93812497 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 93813345 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 93814426 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 93814487 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 93815516 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 93815673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93819974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93820810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93821944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93825547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93830978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93832916 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93834861 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93835076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93836839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93836844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93837544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93837725 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93840652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93843498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93844013 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 93844270 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93844506 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93845203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93846976 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93847996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93848936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93850596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93851060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93852927 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 93852932 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 93854147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93855094 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 93855444 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 93856525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93857696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93860104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93860214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93860219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93860262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93860327 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 93860375 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 93860626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93861080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93862336 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 93862473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93862864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93863565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93863715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93864449 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93864676 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93865669 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 93868211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93869429 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 93870979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93871360 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 93873664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93874652 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93875009 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93875677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93876132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93878037 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93880414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93884532 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 93884735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93886965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93888795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93889018 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 93891817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93894632 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93895225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93895434 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 93895441 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 93895466 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 93895636 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 93895850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93895995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93896328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93896373 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 93897047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93897061 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 93897814 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 93899278 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93901275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93901735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93902866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93902908 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 93902937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93903362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93904143 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 93904150 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 93904257 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 93905127 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93906492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93906782 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 93906919 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 93907088 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93907146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93907227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93907357 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 93907379 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 93907480 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93907541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93907764 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93908126 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 93908305 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93908459 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93908488 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93908567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93908683 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 93908717 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 93908767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93909038 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93909043 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 93909049 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93909746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93910539 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 93910656 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 93911099 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93911288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93912257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93912804 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 93914496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93915201 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93915283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93917384 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93920386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93922353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93924716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93925561 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 93926238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93926638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93928743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93930741 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93931060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93931555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93932355 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93932683 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 93933357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93933689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93937353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93937535 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93937806 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 93937879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93939810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93941622 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93943219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93943325 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93943409 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93944787 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 93944914 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93948307 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 93948668 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 93949687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93951685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93952251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93952753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93953733 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93953736 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93955217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93955740 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 93955867 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 93955950 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 93956646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 93956762 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 93956953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93957147 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93957186 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 93957265 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 93957295 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 93957307 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 93957569 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93958026 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93958605 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93958675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93958763 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93958823 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93959497 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 93961039 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 93961576 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 93961713 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93961786 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 93962018 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 93962469 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93962805 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93962890 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93963324 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93963536 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 93963729 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93963782 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 93963876 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93963897 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93963914 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 93963975 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93964167 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93964253 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93964813 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93964858 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93965084 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93965429 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93965463 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93965632 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93965712 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93966040 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93966090 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 93966214 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93966230 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 93966719 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93966739 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93966868 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 93966880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93968153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93968154 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 93968774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93972740 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 93972741 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 93973058 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 93974485 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 93975214 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 93975537 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 93976146 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 93976762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93977646 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93979658 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 93981273 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 93982633 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 93982730 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 93985594 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 93985974 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93986349 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 93986527 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 93989345 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 93990349 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 93992412 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 93993615 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 93995035 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93995081 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93995097 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93995120 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93995189 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 93995341 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 93995409 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 93995585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93995681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93995705 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 93995938 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 93996085 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93996126 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 93996153 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 93996156 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93996169 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93996173 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93996205 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 93996303 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 93996408 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 93996503 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 93996551 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 93997023 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 93997315 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 93999181 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 93999369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94000407 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94000856 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94000910 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94000964 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94000990 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 94001154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94002577 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94002595 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 94005262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94006089 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94006153 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 94006464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94006521 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94006794 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 94006923 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 94006988 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 94007022 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 94007040 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 94007082 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 94007203 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 94007264 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94007419 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94007517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94007541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94007576 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94007635 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 94007690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94008047 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94008065 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94008071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94008093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94008160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94008365 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94008443 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 94008514 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 94008532 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94008644 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94008981 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94009064 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 94009330 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94009395 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94009601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94009703 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 94009829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94009897 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 94009947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94010343 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94010496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94010648 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94010663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94010695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94010824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94010968 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 94011063 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 94011254 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 94011337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94011640 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94011808 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94011815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94011847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94011849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94011894 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94012025 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94012035 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 94012079 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 94012136 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94012308 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 94012366 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94012385 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 94012465 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 94012588 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 94012785 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94012878 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 94013071 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 2 94013110 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94013201 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 94014117 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 94014220 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 94014263 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 94014271 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 94015325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94015550 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94016918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94016919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94017574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94019052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94020841 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 94023427 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 94023521 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94024025 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94024578 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 94024612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94025751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94025809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94025857 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 94026064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94026165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94026286 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94026299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94026338 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 94026385 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94026666 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 94026717 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 94026734 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 94026735 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 94026750 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 94026793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94026816 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94027771 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94027797 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94028012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94028098 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94028829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94032799 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94034285 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 94036179 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 94037356 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94038561 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 94039192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94039874 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 94039935 G A N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 94040785 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94041200 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94042009 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94042081 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 94043335 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 94043626 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 94044073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94044294 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94045057 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 94045149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94046501 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 94046672 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94048880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94051498 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94052762 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 94054758 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 94054915 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 94056643 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 94056669 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 94056802 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 94056803 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 94057244 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94057306 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94057531 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 94057828 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 94058248 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94058354 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94059013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94059279 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94059868 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 94060001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94061305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94061333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94061419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94061953 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 94062629 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94062639 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94065257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94065360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94066031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94067871 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94068116 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94068165 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94068368 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 94068722 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94069756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94071450 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94072018 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 94072531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94073766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94074663 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94075413 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94075466 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 94075467 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 94076712 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 94077266 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94077322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94077436 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94078086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94078242 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 94079055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94079414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94081368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94081606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94083658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94084481 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94084996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94087162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94087401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94088244 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 94088356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94088446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94088548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94089135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94089279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94089807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94089829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94089874 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94090015 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 94090103 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 94090309 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94090315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94090323 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94090591 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 94090622 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 94090836 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94090894 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94090961 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94091043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94091151 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94091269 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 94091323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94091504 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 94091505 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 94093018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94093360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94093754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94093803 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94094472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94094786 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 94095383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94096905 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94097121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94097892 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94098385 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 94098500 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 94106304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94110261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94110331 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 94110344 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94110347 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 94110419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94112794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94114612 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 94116167 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 94116582 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94117162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94117366 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94117389 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 94118007 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 94118102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94118131 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94118141 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94118144 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94118191 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94118212 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94118262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94118402 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94118478 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94118483 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94118573 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94118580 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94118585 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94118612 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94118692 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94118909 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94120010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94120390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94120499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94120525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94120652 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 94120735 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 94120754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94121371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94121586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94121656 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94122138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94122858 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94123075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94123086 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 94123178 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 94123185 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 94123208 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 94123524 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94123548 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94123727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94123811 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94124677 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 94127497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94131590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94136427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94136677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94136947 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 94137337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94137452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94137683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94137707 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94138604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94138683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94138685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94139003 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 94139247 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94139503 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94139889 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94140175 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94140223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94141224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94146813 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 94147067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94147480 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94149623 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94149643 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94150132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94150379 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94150843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94151491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94152524 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94153306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94154222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94154234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94154600 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 94154675 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 94156349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94159774 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 94159795 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 94160907 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 94161273 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 94161362 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 94162568 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 94163374 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94163475 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94163508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94163525 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 94164042 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94164064 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94164154 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 94164830 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94165894 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94167111 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94167984 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 94167988 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 94168801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94169805 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94169831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94170109 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94171181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94171205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94172880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94173870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94174025 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94174879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94174962 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 94174975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94175162 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94175840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94176046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94177089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94177260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94179195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94179918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94183068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94184580 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 94184597 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 2 94185091 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94185580 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94185636 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94185663 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 94185755 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 94185762 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94185779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94185931 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 94185975 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94186193 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94186198 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94186208 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94186236 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94186409 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 94186427 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94187227 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94187373 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 94187824 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 94187903 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94187998 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 94188021 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94188577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94190403 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94190944 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 94191016 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94191080 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94191478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94192435 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94192556 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94192595 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94192607 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94192690 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 94192943 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94193092 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94193160 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 94193265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94193318 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 94193366 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94193484 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 94193557 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94193986 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 94194028 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94194119 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94194332 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94196578 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94197102 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94197215 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 94198099 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94198151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94198316 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 94198343 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 94198801 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 94198861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94198872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94198990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94199158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94199232 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 94199305 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 94199618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94199839 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 2 94200238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94200648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94200857 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94200986 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94201138 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 94201332 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 94201968 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 94203881 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94205440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94206860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94208624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94209602 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 94209651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94213117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94213407 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 94216556 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94216624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94216817 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94217350 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94217707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94219406 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 94219577 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94220093 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 94220170 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 94220318 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 94221721 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 94223815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94223903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94224292 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 94224346 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 94224453 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94224658 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 94225549 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 94225681 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94226551 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 94226862 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94227273 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94227461 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94227462 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94227520 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94227533 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94227553 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94227554 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94227570 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94227963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94227978 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94228044 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94228076 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94228111 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94228142 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94228172 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 94228484 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 94228505 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 94228535 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94228550 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94228677 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 94228765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94228795 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 94228854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94228855 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94228886 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 94229000 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 2 94229265 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 2 94229313 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 2 94229357 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 2 94229791 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 94229833 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 94229869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94230875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94230901 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 94230903 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 94232018 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 94232028 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 94232045 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 94232167 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 94232297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94232413 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 94232439 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 94232679 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 94232818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94232889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94232972 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 94233021 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 94233097 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94233228 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 94233354 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94233492 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 94233505 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94234399 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 94234440 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 94234589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94234851 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94235240 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94235241 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94235455 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 94235756 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 94235904 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94236057 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94236300 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 94236356 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94236384 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94236438 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 94236578 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 94236584 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 94236743 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 94237129 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 94237210 A C Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 94237512 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94237565 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94237695 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94237762 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94237818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94237877 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94237964 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94237966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94238472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94238566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94239347 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 94239381 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94240589 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94240607 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94241421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94241578 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94241779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94242329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94242496 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94242538 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 94243269 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 94243465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94243540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94243677 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94243803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94243880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94243886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94243892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94243935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94244070 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94244110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94244809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94244825 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94245038 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94245083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94245274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94245284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94245348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94245429 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94245477 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94245492 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94245527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94245978 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94245997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94246192 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94246628 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94246842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94246874 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 94247387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94250151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94250637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94252229 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 94252275 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94253019 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 94253123 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 94254794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94254883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94255871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94258307 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 94258416 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 94258733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94259306 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 94259490 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 94260301 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 94261933 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 94262062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94265207 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 94266515 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94266631 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 94266667 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94266755 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 94266821 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 94267060 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94267065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94267750 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94269401 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 94269687 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 94270055 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 94270377 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 94270407 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 94270563 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 94270610 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94270773 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 94271851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94272153 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 94272232 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 94272524 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 94272595 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 94273836 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94274706 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94275355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94275933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94277149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94278492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94278788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94279202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94281068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94281778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94282014 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94282078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94282080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94283015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94283174 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 94283406 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 94283414 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 94283464 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94283586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94283639 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94283755 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94284112 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94284162 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94284326 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94284424 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94284428 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94284557 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 94284769 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94284780 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94284876 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94285221 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94285257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94285552 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94285731 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94285850 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94285948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94286241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94286271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94287827 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 94287888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94287894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94288185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94288240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94288442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94289557 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94289679 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94289815 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 94290004 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94290095 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94290098 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94290179 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94290219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94291012 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94299551 A C Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 94299668 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 94299693 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 94299804 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 94301879 T C Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 94302152 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94302265 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 94302320 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 94302549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94302616 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94302619 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94302637 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 94302965 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 94303080 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94303116 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94303152 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94303505 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94303689 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94303706 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94303723 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 94303777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94303799 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 94303833 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94303835 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94303844 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94304218 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94304226 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94304263 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94304328 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94304450 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94304508 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94304748 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94305180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94305298 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94305310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94305507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94305521 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94305553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94306585 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 94306644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94306700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94306836 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94306897 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94306906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94306930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94307019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94307386 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94307671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94307931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94308040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94308773 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94308797 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94309447 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94309617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94310497 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94310500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94310561 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94310581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94310807 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94312924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94316798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94316830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94316905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94317672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94319131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94319245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94319556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94321139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94321218 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94321250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94322248 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94322853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94322909 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94323317 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94323846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94324601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94324687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94325968 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94326126 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94326530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94328032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94328068 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94328071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94328112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94328123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94329022 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 94330811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94331704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94332071 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94332751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94332765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94333654 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94333677 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94333736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94335004 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94335048 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94335122 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94335665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94335692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94335751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94335754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94335764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94335765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94336256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94336472 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 94336479 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94336587 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94336601 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94336750 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94336764 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94336798 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 94337028 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 94337371 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 94337379 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 94337518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94337576 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 94337794 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 94338001 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94338301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94338450 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94338710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94338750 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94338798 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94338889 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94339102 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94339236 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 94339454 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 94339577 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 94339638 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 94340790 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94340939 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94341017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94341035 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94341093 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94341259 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 94341503 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 94341515 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 94341519 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94341655 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94341745 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94341813 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94341910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94341977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94342320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94342641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94342996 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94343545 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 94343922 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94343999 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94344150 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 94347500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94349365 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94352178 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94353547 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94353571 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94353669 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94354522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94354743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94354833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94355138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94355215 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94355641 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 94356090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94356198 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94356459 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94356481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94356535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94356710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94357695 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94357743 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94357782 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94358185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94358293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94358640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94358863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94359659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94360120 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94360226 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94360233 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94360237 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94360328 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 94360331 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 94360733 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94360750 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 94360803 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 94360832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94360957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94360973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361272 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361470 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94361503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361582 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94361592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94361613 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94361629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94362502 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94362612 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94362633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94362654 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94363967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94364295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94364761 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94364782 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94364867 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94364974 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94365019 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94365700 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94366430 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 94366550 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94366775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94366807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94366823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94366851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94366885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94366925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94366932 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94367114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94367318 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94367342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94367387 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94367415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94367535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94367627 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94367776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94367819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94367820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94367908 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94367920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94368129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94368184 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94368801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94369088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94369295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94369309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94369834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94369890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94370256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94370259 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94370359 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94370407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94370520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94370583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94372008 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94372094 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94372097 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94372547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94372926 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 94372927 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 94373293 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94373469 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94374130 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94374516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94375467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94375949 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94376562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94376739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94377074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94377157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94377940 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94378454 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 94379147 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94379149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94379511 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 94380155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94381662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94382421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94382646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94382900 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 94382961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94383929 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94384560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94388696 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94391032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94391967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94404924 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 94405022 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 94408075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94408618 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94409172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94409858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94412775 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94413293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94413793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94413823 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94414094 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94414636 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94414711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94414717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94414999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94415326 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94415602 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 94415752 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94415810 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94415816 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94418842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94419739 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94419740 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94419946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94420027 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94420041 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94420150 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94420174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94420601 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94421011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94421012 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94421082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94421139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94421248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94421519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94421598 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94421628 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94421702 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94422544 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94422919 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94423344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94425272 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94425603 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94426160 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94426622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94427225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94428108 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94429234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94429498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94429763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94429829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94431590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94434540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94435234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94435634 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94437043 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94438096 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94438114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94439014 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94449153 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 94451009 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94457442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94458531 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94460209 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94460303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94463620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94463945 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94464607 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94466323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94467001 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94467240 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 94467477 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94469006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94469744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94471522 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94471702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94473308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94482121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94482849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94483034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94485268 C A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 94487381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94487683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94490174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94497031 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94499073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94499686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94504837 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 94505800 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94505951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94507174 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94507382 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94509245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94509886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94511143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94511182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94513646 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94514132 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94514327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94515129 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94515840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94515841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94516290 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94516891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94517997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94519465 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94522360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94523950 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94524332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94524374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94524379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94524412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94524592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94524601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94524771 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94524773 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94524785 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94524998 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94525153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94525210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94525299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94525310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94525387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94525409 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94525434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94525962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94526064 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94526155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94526173 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94526289 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94526390 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 94526518 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94526558 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94526616 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94526625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94526680 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94526793 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94526810 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94526929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94526930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94526959 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 94526970 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94526991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94527245 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94527322 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94527341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94527395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94527451 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94527695 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94527700 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94527808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94528036 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94528155 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94528189 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94528201 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94528340 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94528384 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94528409 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 94528461 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94528470 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94528525 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94528540 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94528696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94528762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94528853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94528865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94528914 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 94529109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94529112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94529171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94529411 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94529532 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94529659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94529889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94529938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94531092 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 94531161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94531448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94531984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94532012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94532265 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94532279 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94532299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94532308 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94532310 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94532327 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94532407 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94532682 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94532833 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94532908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94532997 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94533235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94533249 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94533253 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94533470 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94533479 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94533500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94533558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94533673 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94533758 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94533850 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94534142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94534221 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 94534229 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 94535141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94536041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94536122 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 94537016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94537045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94537084 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 94537408 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94537571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94537831 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94537871 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94537885 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94537932 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94537997 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94538137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94538179 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94538338 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94538349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94538360 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94538384 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94538480 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94538484 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94538815 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94538884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94538920 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 94538942 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 94538947 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94538986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94539078 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94539299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94539590 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94539707 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 94539794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94539801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94539990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94541396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94541547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94541612 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94541754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94541817 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94541901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94542154 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94542183 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94542191 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94542231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94542820 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94543273 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 94543444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94543916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94544543 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94544571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94544794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94544927 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94545131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94545181 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 94545244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94545373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94545772 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94545791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94545921 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94546341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94546430 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94546696 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94546847 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94547153 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 94547327 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94547419 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94547578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94547704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94547795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94548245 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94548399 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 94548601 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 94548670 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94548710 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94548938 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 94549638 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94550085 G T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 94550251 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 94550430 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94550515 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 94551108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94551389 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 94556971 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94557146 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 94557153 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 94557218 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94557455 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 94557992 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94558025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94558258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94558308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94558804 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94559331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94559384 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94559547 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94560080 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94560374 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94560416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94560541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94560838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94560856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94560923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94561055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94561429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94561445 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94561467 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94561922 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94562258 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94562275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94562389 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94562592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94562658 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94562859 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94563152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94564116 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94564303 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94564401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94564486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94564648 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94564686 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94564730 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94565074 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94565212 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94565836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94566281 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94566538 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94566790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94566832 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94566850 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94567310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94567355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94567468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94567496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94567731 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94568042 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94568219 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94568341 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94568460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94568957 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94569802 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94569803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94569838 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 94569980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94569992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94570035 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94570253 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94570682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94572021 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94572946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94578730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94579123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94580041 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94580816 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94580818 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94580882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94581052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94582440 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94582449 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94582695 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94582814 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94583257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94584055 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94584071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94584498 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94584532 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94584921 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94584958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94585473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94586866 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94588315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94588364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94588575 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94589076 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 94589284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94589308 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94589342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94589435 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 94589650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94589740 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94590104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94590198 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94590475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94593674 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94593903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94594537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94596662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94598142 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94607621 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94607682 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94607830 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94607980 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94608835 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94609043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94609463 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 94609639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94610590 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94610703 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94610763 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94610955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94611295 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94611317 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94611631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94611634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94611786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94611802 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94611930 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94612312 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94612315 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94612649 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94613211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94613551 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 94613982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94614093 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94614094 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94615353 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94616270 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 94616376 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 94616903 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94616965 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 94617251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94617688 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94617900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94618091 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94618578 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94618702 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94620105 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 94620230 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94620279 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94620375 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94620457 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94620462 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94620490 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94620516 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94620542 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94620593 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94620729 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94621084 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94621101 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94621156 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 94621264 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94621310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94621437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94621856 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94621996 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94623301 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94623370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94623893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94623912 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 94624230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94624430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94624511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94624543 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94625023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94625068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94625086 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94625098 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94625176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94625402 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 94625546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94625552 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94625558 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94625568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94625662 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94625812 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94625923 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94626112 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94626118 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94626371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94626694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94627249 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94627346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94627463 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94627893 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94627943 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94629103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94629311 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94629436 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 94629487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94629568 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94629724 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 94630181 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 94630349 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 94630369 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 94630599 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 94630614 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 94630617 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 94630769 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94630840 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 94631876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94631881 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 94631894 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94632132 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94632171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94632203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94632239 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94632329 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94632496 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94633011 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94633073 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94633384 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94633433 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94633435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94633488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94633832 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94633844 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 94638946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94639084 A T Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 94639249 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 94639321 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94639323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94639340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94639671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94639945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94640110 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94640146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94640342 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 94640381 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 94640442 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 94640453 A T N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 2 94640464 G C N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 94640484 A T N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 2 94640551 T A N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 94640879 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 94640956 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94649757 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94649825 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 94649968 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 94650291 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 94650629 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 94651192 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 94651794 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94651890 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94652945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94653154 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 94653420 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94653905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94654149 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 94654180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94654235 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 94654464 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94654479 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94654498 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 94654585 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 94654626 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 94654817 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 94654836 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 94655048 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 94655086 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 94655098 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94655287 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 94655566 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 94655690 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 94655703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94655802 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94655841 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 94655908 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 94655910 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 94655973 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 94656021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94656075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94656079 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 94656212 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94656234 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 94656242 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 94656371 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 94656498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94656555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94656645 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 94656711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94656862 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94657274 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94657288 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94657342 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94657451 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94657509 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 94657617 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 94657740 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94657843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94657847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94658003 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94658079 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 94658144 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 94658345 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 94658732 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 94658957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94658987 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 94659032 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 94659079 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 94659081 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 94659093 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 94659185 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 94659200 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 94659274 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 94659478 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94659504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94659568 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 94659636 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 94659637 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 94659652 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 94659760 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 94659768 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 94659781 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 94659863 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 94660023 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 94660545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94660703 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 94660731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94660760 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 94660761 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 94660777 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 94660821 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 94660862 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 94660863 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 94661281 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 94661431 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 94661496 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94661550 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 94661671 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94661715 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94661909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94662348 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94662386 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 94662471 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 94662495 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94662513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94662693 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94662703 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94662921 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94663055 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94663149 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94665320 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94665470 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 94665533 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94666430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94666739 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94666802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94667259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94667612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94667780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94667787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94668269 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94668272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94668284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94668775 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94669117 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94669720 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94670209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94670297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94670365 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 94671026 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94671304 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94671369 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94671655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94671800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94671984 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94672155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94672340 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94672577 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94672866 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 94672878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94673001 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94673726 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94673931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94674441 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 94674486 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 94675666 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94675850 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94676097 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 94676171 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94676259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94676455 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 94676590 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94676791 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94677353 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94677670 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94677739 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94677778 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94677790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94678112 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94678233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94678280 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 94678440 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94678484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94678526 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94678801 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 94678828 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 94679119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94679784 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 94680141 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 94680355 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 94681276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94683613 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94683635 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94683751 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 94684009 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 94685642 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94685699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94685711 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94685945 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 94686032 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94686270 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 94686366 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 94686462 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 94686464 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 94686499 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 94686732 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94687515 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 94688085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94688345 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 94688564 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 94688586 A G N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 2 94688788 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 94688827 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94688870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94688926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94688944 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94689130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94689189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94689290 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 94689383 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94689446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94695776 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 94695848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94695852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94696186 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94696213 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94696295 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 94696385 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94696494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94696550 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94696556 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 94696590 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94696643 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 94696680 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 94696725 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94696781 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 94696787 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94696917 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94696946 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 94696976 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 94696993 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 94697014 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94697048 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94697104 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94697123 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94697133 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94697167 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94697176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94697192 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94697539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94697811 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94697823 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94698019 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94698032 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94698039 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 94698061 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94698103 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 94698579 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 94698816 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 94698966 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 94699293 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 2 94699455 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 94699622 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 94700169 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 94700183 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94700208 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 94700223 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94700453 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 94700469 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94700508 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 94700514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94700539 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 94700615 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 94700622 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 94700892 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 94701053 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 94701132 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 94701998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94703042 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94704605 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94704874 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94704961 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94706823 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94707100 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94707137 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94707657 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94709035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94709139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94709342 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94709354 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94711377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94711670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94712054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94712359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94715207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94717150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94718383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94718517 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94718562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94718638 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 94718716 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94718796 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 94718828 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 94718985 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 94718986 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 94719080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94719159 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 94719758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94719809 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94720150 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94720320 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94720917 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 94721410 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 94722303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94722351 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 94722850 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 94723879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94724460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94731654 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94731655 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94731898 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94732604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94732931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94733188 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94733491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94734065 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94734513 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 94734834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94735190 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94735240 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94735891 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94737207 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94737801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94738119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94738154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94738404 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 94738469 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94738506 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94739201 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 94739357 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94739744 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94739838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94742711 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94743611 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 94743773 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94745092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94746414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94746417 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 94747482 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94747811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94748053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94749035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94750342 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94750523 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 94750564 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 94750620 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 94750645 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94751004 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 94752596 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94752825 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94754329 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94754455 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94754472 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94754489 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94754730 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94754928 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94755286 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94755314 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94755360 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94755564 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94755739 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94755804 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94755850 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94756002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94756866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94757121 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94757167 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94757227 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 94757594 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94757719 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94757741 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94757760 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94758087 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94758117 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 94758232 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94758326 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94758389 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94758693 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94758696 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94759270 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94760208 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 94760298 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 94760340 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94760378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94760382 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94760736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94761380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94762685 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 94762895 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94762896 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94763242 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 94763666 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94763677 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94763680 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94765265 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94766251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94767372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94768336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94768608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94769621 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94770119 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94770147 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 94770395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94771119 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94773479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94773910 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94774704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94775205 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 94775332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94775359 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 94775431 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 94775449 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 94775587 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 94775692 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 94775756 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 94775810 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 94775899 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 94776020 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94776037 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94776229 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 94776519 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 94776621 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 94776743 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94776754 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94776822 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 94777052 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94777063 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 94777078 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94777097 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 94777142 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 94777211 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 94777298 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 94777414 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94778073 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94778111 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94778139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94778143 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94778167 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94778270 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 94778286 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94778528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94778640 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94778692 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94778821 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 94778868 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 94778933 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94779212 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 94779595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94779720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94779974 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 94780032 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 94780052 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 94780157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94780350 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 94780383 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 94780468 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 94780600 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94780700 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 94780719 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 94781011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94781218 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 94781283 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 94781310 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94781377 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 94781622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94781796 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94782185 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94782674 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94782863 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 94782890 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 94783039 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 94783123 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 94783218 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94783623 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94783768 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 94784241 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 94784247 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 94784790 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 94785070 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94785071 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 94785695 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94785756 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 94785784 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94785813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94786160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94786859 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 94787050 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 94787058 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 94787097 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 94787328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94787830 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94787886 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 94788291 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94788596 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94788694 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94788736 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94788738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94789047 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94789058 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94789097 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94789215 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 94789229 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94789237 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94789286 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94789300 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94789370 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94790046 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94790141 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94790146 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94790237 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 94790258 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94790304 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94790331 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94790351 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94790477 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94790482 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94790672 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94790676 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94790973 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 94791073 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94791238 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94791366 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 94791395 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 94791407 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 94791412 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 94791438 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94791451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94791473 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94791530 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94791539 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94791699 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94792580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94792879 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 94792960 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 94793010 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 94793028 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 94793241 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94793282 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94793349 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94793657 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94793850 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94793926 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 94793965 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 94797406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94799023 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 94799176 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 94799268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94799287 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 94799294 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 94799335 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 94799496 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 94799507 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 94799526 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 94800099 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 94800193 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 94800409 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94800452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94800467 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 94800695 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 94800942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94801093 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94801151 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 94803010 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 94803319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94803367 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 94803384 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94803385 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 94803409 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94803460 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 94803527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94803735 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94804698 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 94805183 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 94805204 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 94805471 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 94805496 G T N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 2 94806995 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 94807227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94807295 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94807612 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 94807991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94808608 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94810729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94811278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94811701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94812618 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 94812819 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 94812959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94813042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94813068 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94813310 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 94814067 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 94814118 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94815560 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 94816585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94817799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94817880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94818048 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 94818212 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94818982 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 94820722 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 94821107 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94821221 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94821245 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 94821275 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94821337 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 94821545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94821665 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 94821848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94822205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94822322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94822356 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94822381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94822456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94822635 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 94822695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94822792 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 94822804 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 94822922 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 2 94823149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94823486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94823507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94824086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94824383 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94824437 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94824581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94825147 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 94825239 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94825273 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 94825854 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94825939 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 94826083 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 94826553 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 94826700 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 94826712 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 94826723 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 94826832 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94826947 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94827079 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94827212 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94827239 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94827343 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94827372 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94827390 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94827468 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94827488 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94827807 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 94828169 C T Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 94828277 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 94828617 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94828619 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94828660 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 94829786 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 94829798 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 94829881 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 94829898 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 94830059 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 94830240 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 94830295 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 94830400 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 94830427 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94830481 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94830566 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 94830682 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 94830698 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 94830725 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94831139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94831262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94832942 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94833251 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94833922 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 94834199 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 94834223 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94834270 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94835012 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 94835075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94836125 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 94838834 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94839404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94839833 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 94840757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94840786 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94841757 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 94843701 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94844156 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94844337 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94844722 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94845011 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94846447 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 94847166 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94847506 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94847655 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94848068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94849745 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 94850352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94850487 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 94851212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94851653 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94851814 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94852435 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 94853143 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94853165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94854672 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 94854824 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 94854908 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 94855433 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 94855482 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94855556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94855669 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 94855784 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 94856250 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94856369 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94856386 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 94856461 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 94857149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94857209 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94857221 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 94857307 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 94857430 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 94857515 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 94857635 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 94857637 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 94857657 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 94857673 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 94857676 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 94857692 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 94857715 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 94857724 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 94857760 G C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 94857983 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 94858060 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 94858139 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 94858143 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 94858180 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 94858240 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 94858298 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 94858429 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 94858469 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 94858642 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 94859288 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 94859364 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 94859638 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94859924 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94859938 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94859987 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 94860049 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 94860126 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94860231 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94860234 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 94860295 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94861119 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94861987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94861989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94862669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94863383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94863619 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94863987 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94865712 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 94866295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94866367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94866402 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94866546 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94866561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94866813 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94867311 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94867536 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94868772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94869218 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 94870108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94870188 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94870901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94871889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94872199 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94873340 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94874460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94874461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94875385 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94876570 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94876969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94877650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94877736 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 94877775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94878445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94878462 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94878566 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94878741 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 94878885 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 94880041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94880175 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94880194 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 94880433 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94880464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94880736 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94881303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94881392 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94881491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94882691 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94882941 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 94883001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94883457 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 94883531 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94883599 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94883903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94884150 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 94884151 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 94884256 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94884354 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94884367 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 94884473 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 94884713 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94884731 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 94884865 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 94884985 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 94885026 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94885148 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94885167 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94885168 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94885317 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 94885366 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94885385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94885548 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94885554 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94885567 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94885632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94885672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94885685 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 94885718 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94885748 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94885808 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 94885914 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 94885922 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 94885944 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 94885995 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 94886008 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 94886020 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 94886062 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 94886179 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 94886219 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 94886233 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 94886257 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 94886319 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 94886380 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 94886406 C G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 94886488 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 94886615 C T N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 94886628 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 94888341 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 94888457 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 94888477 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94888505 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 94890078 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94890081 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94890492 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 94892787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94892859 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94893050 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 94893438 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94894911 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 94895102 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94895565 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94896078 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94896284 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 94896368 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 94896392 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 94896522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94897039 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 94897671 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 94897695 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94897799 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 94898260 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94899128 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 94899140 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 94899243 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 94899400 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94899457 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 94899670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94899828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94900382 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 94902567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94902842 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94903285 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94903413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94903978 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94904500 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94912741 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 94914032 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94915287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94917692 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 94919082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94919268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94922350 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 94922366 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94922927 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94925512 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94925710 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94927647 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 94927678 A C Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 94928506 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 94929588 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94930769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94935629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94935672 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94935799 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94935816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94938667 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94940561 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94940692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94941382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94942904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94945644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94945899 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94946110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94946291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94946400 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94948193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94948626 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 94950324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94950448 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 94950809 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94951086 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94951301 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94952640 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94952716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94954394 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 94955139 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94958800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94959264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94959402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94959719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94961308 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 94961568 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94962171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94962201 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 94962950 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94963940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94964126 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 94968350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94968460 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 94969048 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94969852 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94970724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94970963 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94971391 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94972062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94974781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94975419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94975905 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 94975933 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 2 94975944 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 94975968 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94976128 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 94976343 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 94976437 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 94976438 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 94976453 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 94976555 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94976942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94976982 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94977840 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94977885 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94977935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94978133 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94978209 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 94978262 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94978293 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 94978472 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94978693 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 94978796 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94979022 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94979152 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94979294 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94979374 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94979394 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 94979430 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94979507 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 94980217 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 94980788 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 94980964 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 94981177 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 94981620 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 94981634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94981684 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94981725 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94982250 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94982499 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94982692 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 94982919 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 94983018 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 94983103 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 94983380 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94983471 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94983491 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 94983565 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 94983621 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94983636 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 94983858 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94983902 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94983952 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94984153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94984196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94984202 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94984248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94984337 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94984428 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94984466 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 94984630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 94984819 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 94984868 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 94985064 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 94985228 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 94985902 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 94986236 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94986253 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 94986287 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 94986369 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 94986425 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 94986541 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 94986599 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 94986763 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 94986782 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94987878 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 94991972 T A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 94991977 C A Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 94992176 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 94992223 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 94992256 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 94992349 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 94992511 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94992936 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 94992938 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 94992987 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 94993016 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 94993034 A T N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 94993164 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 94993184 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 94993243 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94993281 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 94993343 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 94993358 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 94993468 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94993752 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94993857 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 94994473 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94994502 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 94994893 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 94994896 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 94995079 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 94995130 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94995148 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 94995227 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 94995609 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94995718 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 94995934 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 94996007 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 94996152 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94996206 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 94998359 C G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 94998564 A C Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 94998651 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 94999073 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 94999498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 94999553 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94999574 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 94999974 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95000297 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 95000600 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95000977 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95000993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95001152 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95001259 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 95001362 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95001776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95001955 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95003063 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 95003878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95003919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95004193 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 95008268 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95008963 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 95009965 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95010312 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95011679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95011945 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 95012402 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 95014768 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 95015288 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 95015568 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95015621 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95015624 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95016708 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 95018210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95020387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95020663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95021846 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95021895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95022227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95022285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95022480 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95023203 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95023410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95024926 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 95025709 T A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 95026068 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 95026706 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 95026758 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 95028030 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95028645 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 95028960 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 95029091 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95029514 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 95029766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95030207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95030937 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 95033407 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 95033972 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95034905 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95034937 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 95037196 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95038333 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95038597 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95041798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95043046 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95043330 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 95043347 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 95043503 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95044233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95044425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95044822 G A N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 95046313 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95046484 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95046576 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95046621 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95046838 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 95049240 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 95049622 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95049744 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95050185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95050383 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95050560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95050833 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95051917 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 95052720 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 95054510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95054696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95055354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95064364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95064371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95066133 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 95066666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95068247 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95068257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95069419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95070139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95070563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95070968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95071076 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 95071077 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 95074486 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 95074670 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95074800 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 95074900 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 95076976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95077198 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 95077248 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 95078681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95081023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95082804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95084557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95086195 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 95087007 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 95087078 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 95087134 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 95089906 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95101678 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95101742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95102473 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95105375 T G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 2 95106237 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95106863 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 95107395 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 95107899 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95109060 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 95111418 T G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95111547 C A Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 95112729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95113585 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95115609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95115918 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95116036 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 95117891 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95119766 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95120237 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 95120987 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 95142198 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 95144562 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 95144812 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 95145197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95147627 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95147743 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 95148645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95149874 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 95150608 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95152299 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95152889 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 95153873 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95154301 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95155359 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 95155385 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 95155410 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 95155509 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95155613 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 95155798 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95155902 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 95155925 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95156333 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 95156394 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 95156483 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 95156585 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 95156732 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 95156934 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 95156986 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 95157042 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 95157144 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 95157158 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 95158261 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 95158317 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 95158429 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 95158451 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 95158470 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95158830 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 95159066 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 95159170 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95159183 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 95159196 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 95159289 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 95159298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95159449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 95159507 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 95160946 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95161262 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 95161271 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 95161340 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 95161475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95161483 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 95161559 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 95161638 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 95161737 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95161957 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 95162050 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 95162138 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95162140 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95162203 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95163095 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 95163147 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95163188 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95163209 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 95163348 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95163415 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95163557 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 95163595 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95163660 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 95163864 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95163883 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 95163976 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 95164024 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95164149 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164173 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 95164282 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164294 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164447 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 95164462 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164479 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164511 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164548 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164566 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95164570 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 95164701 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164704 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164713 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164751 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164800 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164806 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164835 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164942 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164959 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95164971 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 95165008 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165031 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165042 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165062 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165063 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165088 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165095 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165104 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165162 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165195 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165235 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165248 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165305 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 95165314 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95165344 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 95165363 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 95165400 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 95165457 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95165512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95165750 G C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 95165988 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95166070 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 95166109 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95166126 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95166182 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 95166454 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 95166484 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95166492 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95166579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95166584 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95166726 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 95167150 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 95167265 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 95167470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95167497 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 95167528 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 95167542 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 95167643 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 95168128 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 95168169 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95168265 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95168490 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 95168618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95168688 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95168704 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95168714 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95168779 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 95168936 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95169034 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95169103 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 95169285 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 95169286 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 95169304 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 95169330 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 95169534 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95169558 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 95169734 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95169873 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95169989 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 95170118 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 95170123 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95170207 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 95170209 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95170279 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 95170307 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95170851 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95170895 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95170941 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95171489 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 95171490 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 95171522 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 95171639 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 95171748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95171896 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 95171922 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 95171988 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 95172170 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95172435 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95172568 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 95172634 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 95172740 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 95172744 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 95172852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95173400 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95173473 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95173637 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95173705 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 95173730 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 95173842 C G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 95174206 A T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 95174386 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95174716 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 95174889 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 95174933 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 95175107 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 95175135 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 95175176 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 95175190 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95175374 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95175615 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 95175686 T G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 95175805 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95176021 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 95176160 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 95176223 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 95176517 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 95176635 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 95176676 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 95176692 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 95176754 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 95176806 C A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 95176854 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95176959 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 95176960 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 95177042 C A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 95177419 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 95177480 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95177486 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 95177846 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95177885 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 95177927 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95177938 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 95177948 A T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 95178009 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 95178091 C A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 95178183 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95178267 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 95178464 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95178481 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 95178887 A C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 95178955 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 95179036 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95179063 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 95179067 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95179104 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95179129 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 95179196 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95179268 T A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 95179290 A G N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 95179383 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95179425 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 95179510 A C Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 95179588 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 95179687 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 95179950 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95179964 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95180017 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95180095 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 95180097 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 95180238 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 95180311 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95180379 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 95180690 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95180697 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95180748 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 95180869 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 95180877 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95180902 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 95180908 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 95180937 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95180941 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95180998 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95181036 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95181055 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95181157 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95181184 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95181192 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95181213 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95181248 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 95181343 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95181385 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 95181423 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 95181477 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 95181536 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 95181582 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 95181605 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 95181607 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 95181692 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 95181872 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95181931 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95181945 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95181971 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95182005 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95182008 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95182029 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95182046 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95182056 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95182178 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95182179 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95182342 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 95182365 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 95182370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95182384 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95182433 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95182534 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95182586 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95182669 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 95182858 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 95182897 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 95182968 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 95183046 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 95183051 A C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.214285714285714 0 0.785714285714286 6 22 3 0 11 2 95183137 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95183147 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95183194 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 95183271 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 95183469 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 95183478 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 2 95183516 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 95183571 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 95183613 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 95183618 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 95183699 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 95183815 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 95183824 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95183871 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 95183873 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95184033 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95184051 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95184054 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 95184068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95184075 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95185418 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 95185466 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95185640 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 95185744 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95186066 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 95186184 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95186294 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 95186295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95186347 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95186354 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 95186392 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 95186442 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 95186481 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 95186498 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95186589 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 95186621 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95186650 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 95186692 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 95186707 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95186836 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 95186843 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 95186866 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 95186998 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 95187030 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95187315 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95187393 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95187468 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95187510 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 95187746 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 95187844 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 95188098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95188149 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95188373 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 95188418 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 95188628 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 95189142 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 95189193 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 95189278 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95189394 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95189654 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95189821 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 95189959 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 95190056 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95190057 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95190164 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 95190176 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95190334 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95190418 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95190466 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95190769 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 95191087 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 95191168 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 95191195 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 95191272 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 95191311 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 95191326 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 95191340 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 95191380 G T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 95191691 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 95191782 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95192237 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95192248 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95192356 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 95192416 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 95192463 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 95192541 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95192557 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 95192646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95192664 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 95192770 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 95192807 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 95192816 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95192937 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 95192950 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 95192975 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 95193113 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 95193118 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 95193161 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 95193195 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 95193386 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 95193479 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 95193757 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95193995 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 2 95194094 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 95194147 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 95194386 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 95194409 C G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 95194580 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95194605 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 95194719 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 95194939 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 95195304 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 95195315 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95195449 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 95195667 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95196960 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95197096 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95198197 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95198666 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 95198738 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95198748 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95199056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95199119 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95199147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95199729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95199916 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95199965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95200095 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95200226 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95200237 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95200312 A G Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 95200398 A T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 95200954 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95201179 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95201635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95202318 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95202805 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95202957 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 95202976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95203236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95205800 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 95208060 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95208081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95208266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95208298 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 95208567 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95208786 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95209882 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 95210068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95210377 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 95210381 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95210484 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95210520 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95210713 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 95210925 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 95210999 A T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 95211082 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95211710 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95211875 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 95212209 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95212282 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 95212543 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 95212586 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95212681 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 95213482 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 95213563 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95214344 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95215951 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 95216928 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 95216952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95217363 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 95217391 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95217438 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 95218131 G T Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 95218416 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 95218458 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95218931 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 95222358 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95222546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95223358 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95223940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95225259 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 95225995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95226053 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95226817 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 95226954 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 95227305 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95227500 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95228157 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95228873 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 95229212 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95229325 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95232233 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 95233533 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 95234805 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95235653 A C Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 95235843 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 95236143 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95236698 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95238200 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 95238247 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95239093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95239508 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95240114 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95240121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95240337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95240403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95241828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95242315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95242900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95243571 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 95243921 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95244494 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95246529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95246585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95247830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95248792 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95248871 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95248987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95250292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95250484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95252033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95253967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95260973 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 95261306 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95261547 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95262958 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95263025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95263120 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95263517 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 95263751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95263752 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 95264036 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 95264055 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95264336 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 95264382 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 95264589 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 95264745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95265158 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 95265654 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 95265655 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 95265685 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 95265686 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 95265805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95265811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95265894 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 95265962 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95266137 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 95266160 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 95266246 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 95266247 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 95266265 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 95266317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95266421 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 95266433 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95266442 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 95266455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95266632 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 95266731 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95266831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95266910 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 95266914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95266969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95267239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95268094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95268101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95268164 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95268203 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95268211 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95268270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95268302 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95268349 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95268372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95268424 T A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 95268568 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95268593 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95268624 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 95268651 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 95268664 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95268672 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 95268688 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95268713 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 95268790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95268834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95269107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95269236 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 95269351 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95269794 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 95269876 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95269913 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 95269963 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95270010 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 95270110 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95270305 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95270331 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95270383 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 95270422 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95270461 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95270479 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 95270541 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 95270681 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95270712 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95270791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95270827 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95270842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95270855 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95270856 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95270892 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 95270910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95271070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95271136 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 95271200 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 95271223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95271252 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95271265 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95271303 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 95271319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95271363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95271386 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 95271413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95271432 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95271435 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 95271454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95271699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95271723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95271763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95271918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95271930 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 95271995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95272045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95272061 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 95272062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95272096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95272112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95272114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95272186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95272221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95272334 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95272434 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95272446 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 95272491 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95272493 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95272523 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95272600 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95272605 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95272623 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95272816 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 95272819 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95273028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95273044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95273116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95273207 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95273239 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95273323 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95273364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95273370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95273393 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95273488 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95273675 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 95273701 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95273708 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95273751 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 95273759 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 95276501 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 95276522 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95276557 A C Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 95276558 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 95276772 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95276799 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95276847 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95276860 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95276927 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95277013 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95277114 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95277146 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95277167 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95277257 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 95277489 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95277527 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95277618 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95277630 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95277645 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95277670 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95277675 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 95277820 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95277825 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95277891 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95277970 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95277994 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95278016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95278107 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 95278113 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95278155 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95278180 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95278231 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95278264 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95278445 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95278482 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95278554 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95278651 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95278681 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95278711 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95278786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95278826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95278848 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95278852 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 95278934 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 95278939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95278945 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 95278984 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95278993 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 95279049 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95279113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95279114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95279140 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 95279258 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 95279290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95279365 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 95279473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95279796 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95279797 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 95279845 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95279942 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95280206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95280260 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95280675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95280942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95280943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95280955 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 95281096 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95281639 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 95281739 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95281867 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 95281895 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 95281930 T A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 95282027 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95282111 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 95282209 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 95282243 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95282354 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 95282504 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95282557 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 95282563 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 95282680 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95282770 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 95282806 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95282989 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 95283046 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95283101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95283282 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95283345 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95283708 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95283772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95283809 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95283874 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 95284046 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 95284097 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 95284123 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 95284128 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 95284150 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 95284187 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 95284254 C G N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 95284297 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 95284329 G C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 95284334 G T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 95284350 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 95284374 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 95284432 G T N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 95284469 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 95284651 A T N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 95284691 A G N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 95284846 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 95284963 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95285041 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95285062 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 95285139 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 95285239 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 95285250 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 95285253 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 95285261 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 95285326 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 95285422 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 95285444 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 95285474 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 95285600 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95285694 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95285706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95285712 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95285740 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95285766 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 95285799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95285821 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95285867 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95285874 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 95285917 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 95286006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95286444 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 95286449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95286471 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95287946 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95287959 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 95288165 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 95288266 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 95288313 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 95288518 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 95290058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95290443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95291842 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95292724 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 95292808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95292809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95295381 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95295755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95296060 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 95296112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95296143 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95296213 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 95296664 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 95297251 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95297254 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 95297321 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95297334 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 95297552 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 95297558 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 95297626 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95297718 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 95297899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95297932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95298392 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95298457 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95298482 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 95298569 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 95298685 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 95298712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95298839 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 95298870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95298873 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 95298993 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95299011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95299015 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95299050 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95299055 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95299117 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95299213 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95299231 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95299452 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95299480 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 95299497 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95299622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95299773 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95299775 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 95299799 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 95299820 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 95300054 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95300204 G T Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 2 95301144 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 95301461 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95301934 A G Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 95302774 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 95302788 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 95302791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95302805 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95302908 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 95302932 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 95303396 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95303797 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 95303805 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 95303829 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 95303874 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95303993 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95304040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95304788 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95304894 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 95305357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95306249 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 95306413 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95306551 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 95306628 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95306661 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 95307135 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 95308277 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 95310299 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 95310339 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 95311024 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95311176 T A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 95311321 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 95311354 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 95311412 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 95312503 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95312576 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95314936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95315017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95315464 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 95315628 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95315931 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 95316218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95319347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95320247 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95321300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95322219 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95323910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95325755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95326216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95327837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95328988 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95329249 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 95330390 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95331785 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95333111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95333778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95334046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95334482 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95335051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95335311 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95337689 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 95338136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95340854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95341327 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95344640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95345929 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 95345979 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95347023 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95347553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95348095 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95348598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95349057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95349099 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 95351384 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95351919 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 95352525 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95353207 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95353209 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95353699 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95355697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95356116 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95357942 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95358296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95359229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95360050 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95360709 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95361608 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95362580 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 95363281 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95364828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95365907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95366238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95366806 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95366845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95366955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95367499 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95367735 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95369083 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95369095 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95369137 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95369251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95369394 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95369408 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95369642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95370012 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95370046 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95370063 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95370127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95370143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95371004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95371134 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95372282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95373103 T G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 95373324 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95373388 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 95373492 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95373500 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95374228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95374345 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95375168 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95375251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95375349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95375398 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95375509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95375735 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95376067 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 95376068 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 95376219 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95376288 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95376494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95378581 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 95378967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95379108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95379914 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95380111 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95380172 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95380850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95381307 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95381319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95381372 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95381475 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95381539 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95382239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95382849 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95382933 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95383396 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95383464 T G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 95383553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95383592 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95383780 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95383781 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95385034 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95385169 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 95386655 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95387201 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95388435 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95388481 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95388494 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95388781 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95388900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95388923 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 95389526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95389568 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 95389751 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 95389805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95389840 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95389881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95390146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95390171 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95390597 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95390634 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95390661 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95390691 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95390818 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95390868 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95391438 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95391603 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95391700 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95391792 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 95392007 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95392038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95392683 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95392684 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95392744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95392778 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95392833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95392899 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95393190 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95393512 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 95394069 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95394123 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95394160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95394216 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95394403 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 95394603 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95394926 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95395070 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95395131 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95395237 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 95395288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95395549 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95395648 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95395728 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95396054 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95396114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95396479 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 95396594 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 95396871 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95396899 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95396930 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95397238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95397242 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 95397665 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95397768 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95397817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95398288 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95398522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95399864 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95401934 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95402395 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95402502 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95402692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95403244 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95403277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95403610 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 95404076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95404080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95404233 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95404331 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95404344 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 95404462 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95404536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95404593 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 95404595 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 95405925 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95406720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95407571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95407922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95408310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95408418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95409250 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95410416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95410991 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95411996 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95412752 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95413583 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 95413862 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95413869 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95416545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95416856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95417444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95417471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95418091 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 95418959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95423613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95424895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95426201 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95426830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95426892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95426922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95428208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95428955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95429698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95429978 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95430435 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95430693 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95431085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95431499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95431714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95432355 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95433731 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95433982 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95434344 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95434551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95434697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95435318 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95435771 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95436116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95436587 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95436654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95436782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95437233 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95437445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95438512 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95439505 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95439800 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95439844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95440016 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95440952 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 95441140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95442007 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95442062 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95442268 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 95442588 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95442608 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95442624 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95442678 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95442923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95443010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95443231 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95443536 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95444017 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95444122 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95444243 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95444410 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95444595 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95445297 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95445836 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 95446448 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 95448040 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95448712 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95448758 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 95449661 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95450404 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95451112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95453691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95453968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95454025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95454173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95454184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95454274 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95454454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95454491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95454591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95454620 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95454764 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95454918 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 2 95454995 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95455063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95455088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95455132 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95455314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95455320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95455449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95455522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95455561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95455571 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95455671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95455741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95455847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95455876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95455879 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95455917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95455945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95455949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95455991 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95456027 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95456028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95456052 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95456226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95456250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95456294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95456319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95456336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95456402 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95456426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95456453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95456492 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95456522 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95456537 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95456587 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95456603 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95456607 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95456629 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95456702 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95456802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95456828 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95456829 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95456930 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95456990 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95457068 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95457126 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 95457160 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95457190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95457288 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95457332 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95457346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95457478 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95457715 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95457719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95457738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95457741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95457753 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95457839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95457962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95458172 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 95458184 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 95458377 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95458386 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95458441 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95458501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95458509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95458585 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 95458594 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95458617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95458623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95458720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95458786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95458877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95458889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459011 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459138 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459300 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459401 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459559 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95459579 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459604 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459632 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95459636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95459661 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459832 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95459854 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95459910 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95459961 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 95460215 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95460315 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95460430 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95460477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95460539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95461234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95461246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95461258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95461272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95461428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95461549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95461573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95461688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95461736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95461818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95461832 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95461959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95461978 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95462057 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95463927 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 95463980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95464417 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 95464488 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 95464844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95464872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95464897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95465062 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95465422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95465831 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95466015 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95466033 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95466127 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 95466156 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95466235 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95466811 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 95466857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95466875 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95466970 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95466985 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95467118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95467766 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95468306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95468312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95468627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95468707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95468807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95468818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95469223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95469328 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95469550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95469632 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95471285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95472130 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95472280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95472338 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95472387 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95473590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95473702 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 95474863 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95475913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95476451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95477233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95477692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95477962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95478895 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95479687 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 95480968 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95482015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95484641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95484743 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95484897 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95485085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95485240 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95485387 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95485392 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95485661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95486348 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95486449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95487369 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95487824 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 95487847 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95494836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95495147 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95496100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95496227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95497904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95498450 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95498469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95499092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95499625 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95499771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95499949 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95501652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95502303 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95502594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95502876 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95502940 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95503947 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95504216 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95505297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95506322 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95506494 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95506650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95506814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95507417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95507641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95508228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95510020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95511092 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95511708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95512372 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95512637 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95512648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95512784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95512904 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95513003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95513053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95517342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95518830 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 95520501 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 95521725 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 95521793 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 95521836 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95522471 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95522993 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 95523514 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95523549 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95523853 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 95524143 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95524211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95524330 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95526860 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95527844 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95527959 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95528785 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95530692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95530760 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95530972 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95530973 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95531079 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95531354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95531620 C A Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 95531666 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95532470 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95533272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95534736 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95539149 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95539697 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95540349 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95541434 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 95542642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95543416 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95543725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95543902 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95544075 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95549251 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95549804 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 2 95551017 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95552922 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95554062 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95554401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95554878 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 95554886 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95555914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95556054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95556768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95557001 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95558668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95560496 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95560863 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 95561244 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95561417 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95561829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95562322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95563163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95563578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95564708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95564849 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 95565221 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95566181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95566684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95566822 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95567850 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95568531 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95569512 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95570063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95570129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95570550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95571406 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95571421 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95572101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95572409 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95572894 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95573692 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95573761 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95574050 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95574251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95574745 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95575580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95576393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95576886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95577279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95577501 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95578019 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95578319 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 95578382 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95579845 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95580330 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95583999 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95585085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95585558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95587375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95588941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95589428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95590819 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95591650 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95592558 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95594779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95595065 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95595217 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 95595407 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 95595793 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95596268 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95596719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95597871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95598252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95599359 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95600556 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95601625 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95602809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95603956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95604981 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95605314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95605832 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95606134 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95607109 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95607154 A C N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 95607908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95609452 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 95610818 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95612001 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95612294 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95612316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95613138 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95613313 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95613741 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95613791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95613948 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95614189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95614594 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95615134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95615137 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95615528 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95616063 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95616433 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95616695 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95616709 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95618883 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95618950 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95619528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95620121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95620490 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95620704 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95620852 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95620869 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95621534 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95622083 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95623112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95623480 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 95623840 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95624016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95624557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95625589 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95625744 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95625910 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95626374 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95626477 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95626555 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95626694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95626782 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 95626795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95626826 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95627032 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95627286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95627314 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95627715 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95627785 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95627827 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95627860 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 95628137 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 95628157 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 95628190 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 95628220 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95628236 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 95628256 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 95628511 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 95628580 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 95628686 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95628747 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95629808 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 95630136 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95630657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95631017 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95631164 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95631330 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 2 95631681 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 95631718 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95631726 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 95631859 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 95631972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95632288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95632621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95632624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95632652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95632955 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95632956 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95633091 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95633419 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95640124 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95641262 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95641379 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95641696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95642383 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 95643004 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95643643 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95644211 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95644421 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95644901 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95644916 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95645389 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95646310 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95646629 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95646737 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95646810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95647781 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95648022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95648303 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95648815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95649770 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95650949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95652081 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95653043 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95653577 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 95656017 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95656771 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95656772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95656821 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95657273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95658473 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95659203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95659233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95659887 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95660053 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 95660312 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95660616 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 95661520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95661870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95662143 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 95665401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95667285 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 95667337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95668768 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95669841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95670492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95670772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95671743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95671972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95671995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95672418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95673177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95674275 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95674591 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 95676194 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 95676444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95678275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95679289 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95680724 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 95680859 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95681053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95681065 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95681285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95681351 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 95681515 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 95681672 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 95681688 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95681777 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 95681912 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 95681984 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 95682109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95682172 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95682262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95682280 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 95682316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95682388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95682389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95682427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95682454 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 95682469 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 95682635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95682641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95682758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95682780 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95682852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95682918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95683273 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 95683884 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 95684018 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95684265 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95684275 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 95684391 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 95684578 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 95684744 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95684771 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95684909 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95684947 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 95685006 C A Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 95685277 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 95685340 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95685344 C A Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 95685798 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 95685964 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 95686018 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95686052 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 95686232 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 95686325 T A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 95686501 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 95686649 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95686997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95687034 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95687103 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 95687271 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 95687386 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 95688041 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 95688223 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95688433 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 95688452 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 95688487 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95688524 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 95688634 G T Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 95688851 G T Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 95688983 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 95689185 G T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 95689282 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95689307 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95689383 A T Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 95689619 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 95689717 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95689724 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 95689973 T G Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 95690183 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 95690496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95690594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95690831 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 95690856 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 95690978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95691176 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95691278 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95691389 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 95691461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95691599 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95691655 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95691772 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95691822 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 95691937 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95692367 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95692516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95692627 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 95693227 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 95693435 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95693488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95693524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95693813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95694434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95694633 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95695053 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 95695123 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 95695227 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 95695242 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95695481 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 95695796 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95696194 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 95696435 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 95696543 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95696545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95696723 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 95696948 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 95697501 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 95698113 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 95698250 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 95698459 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 95698474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95699076 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 95699691 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 95699869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95700384 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 95700587 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95700805 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 95701331 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 95701337 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 95701466 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 95701527 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95701594 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 95701827 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 95701842 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 95701854 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95702536 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 95702631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95702791 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 95703284 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95703380 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 95703553 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 95703639 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 95704255 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 95704308 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95704356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95704376 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95704555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95704732 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95704801 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95704863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95704947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95705680 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95705821 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95706078 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95706291 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 95706401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95706466 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95706487 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95706505 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95706540 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95706566 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95706591 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95706696 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 95706900 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 95707138 G C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 95707221 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95707370 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 95707564 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 95707845 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95707914 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 95708084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95708235 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95708371 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 95708396 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95708956 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95709269 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 95709493 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 95709568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95709636 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 95709783 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 95709998 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95710187 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 95710275 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 95710329 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95710587 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95710595 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 95710753 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95710802 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 95710970 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 95711030 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 95711066 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 95711143 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95711274 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95711359 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95711388 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 95711508 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 95711564 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95711600 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95711639 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95711797 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95711977 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 95711980 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95712124 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 95712421 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95712929 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 95713167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95713251 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95713355 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95713367 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95713438 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95713577 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 95713617 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 95713741 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 95713755 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 95713779 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95713867 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 95713932 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 95714369 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95715193 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 95715275 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95715719 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 95715730 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95715875 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 95716124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95716350 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 95716650 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 95716840 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95716947 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 95716960 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 95717204 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 95717266 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 95717506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95717854 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 95718612 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 95718709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95718850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95719286 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 95719464 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95719918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95720084 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95720111 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 95720697 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 95721335 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95721367 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95721404 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 95721504 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 95721550 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 95722476 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95722667 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95722909 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 95723093 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 95723128 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95723531 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 95723637 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 95724216 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 95724319 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 95724348 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 95724677 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 95725058 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95725277 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95725331 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 95725468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95725737 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 95725798 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95726022 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 95726345 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95726700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95726772 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 95726830 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 95726947 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95726975 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95728686 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 95728751 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 95728755 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 95728768 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 95728903 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 95728925 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95729117 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 95729255 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95729732 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 95729835 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 95730183 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 95730296 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 95730368 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 95730461 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95730626 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 95730721 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95730833 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 95730834 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 95730924 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95730953 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95731110 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 95731133 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95731141 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 95731171 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 95731285 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95731356 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95731371 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95731433 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95731526 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 95732084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95732139 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 95732245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95732536 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 95732654 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 95732668 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 95732738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95732891 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95732928 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 95732970 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 95733002 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 95733085 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 95733203 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 95733205 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 95733244 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 95733596 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 95733876 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 95733981 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95734111 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 95734230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95734756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95735116 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 95735243 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 95735256 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 95735277 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 95735501 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95735640 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95735795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95735843 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 95736063 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95736190 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95736210 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95736260 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 95736433 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95736434 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95736511 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 95736621 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 95736633 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95737263 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 95737322 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 95737342 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 95737396 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 95737490 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95737737 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95737965 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95738108 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 95738334 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 95738598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95738618 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 95738963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95739192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95739783 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95739884 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95740338 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95740350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95740894 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 95742719 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 95744179 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95745457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95746271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95746294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95746700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95746978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95746979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95747719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95747940 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95748397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95748627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95748651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95750267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95750314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95750701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95750777 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95750912 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 95750944 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95751042 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95751244 A C Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 95751359 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 95751571 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95751580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95752018 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95752093 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95752705 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95752859 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 95753328 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95753756 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 95753809 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 95753826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95754168 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 95754216 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95754284 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 95755141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95755503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95755703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95755722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95756152 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95756437 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 95756496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95757511 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95758110 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95758769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95758918 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95760361 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95760725 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95761123 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95762947 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95763270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95763842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95764693 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95764865 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 95766585 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95776057 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95777068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95777266 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95777950 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 95778888 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 95779147 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95779786 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 95780146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95780702 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 95781179 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95784164 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95786194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95786758 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 95787649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95788149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95788205 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 95789753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95789823 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95789917 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 95789921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95790201 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95790327 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 95791532 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 95791985 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95793400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95793419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95793733 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95797605 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 95798128 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 95798988 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 95801419 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 95802322 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 95802586 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 95803762 T A Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 95803801 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 95804556 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 95805567 C T Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 95808927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95809170 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 95810333 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95812582 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95812654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95814826 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 95815893 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95815908 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95816692 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 95816765 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95817584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95817821 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 95818396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95818652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95818787 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 95820921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95821516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95821745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95822723 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 95825508 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95827102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95828235 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 95828253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95828543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95828587 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 95828629 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 95828731 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 95828732 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 95828769 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95828799 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 95829109 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 95829316 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 95829414 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 95829889 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95830005 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 95830035 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 95830087 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 95830146 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 95830410 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 95831058 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 95831068 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95831079 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 95831179 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 95831193 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 95831224 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95831328 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 95831372 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95831608 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 95831649 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95831669 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 95831762 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 95831829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95832196 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 95832685 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 95832722 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 95833135 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 95833183 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 95833820 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 95833863 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 95833879 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 95833898 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 95833918 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 95833952 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 95833955 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 95833995 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 95834104 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 95834119 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 95834361 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 95834534 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 95834824 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 95834986 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95835068 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95835183 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 95835256 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 95835318 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 95835431 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 2 95835894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95836062 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95836356 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95836357 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95837145 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95837301 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 95837422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95838018 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95838125 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95838252 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 95838501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95838816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95838886 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95839146 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95839253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95839570 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95839632 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 95840542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95841049 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95841450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95841634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95841955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95842154 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 95842307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95842996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95843041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95843500 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 2 95844359 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95844367 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95844449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95844771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95845421 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95845969 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95849021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95849806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95849924 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95850667 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95851245 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 95851545 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95852769 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95853007 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95855504 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95857086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95857115 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95857828 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 95858007 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 95858020 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 95859597 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 95859609 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95861062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95864740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95865858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95867407 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95867944 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95868585 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95868897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95869615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95873214 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95874306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95874331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95874352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95877295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95877705 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 95878750 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95879425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95880797 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95880961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95882601 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95883995 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95884174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95885000 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95887963 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 95888944 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 95889315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95890782 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95895994 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95896714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95897249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95897505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95898686 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 95900871 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95902506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95902800 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95903014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95903052 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95903215 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 95903606 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 95903634 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95904345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95904536 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 95904845 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 95906726 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95907500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95909317 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 95913521 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 95913738 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95916005 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95916100 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 95916126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95919121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95919125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95919287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95919529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95919645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95919702 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95921738 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 95922367 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95922615 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95922639 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95922736 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 95923236 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 95924080 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95924523 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 95925072 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95925315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95926870 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 95927076 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95927718 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95928718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95929518 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95929651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95930007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95930595 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95931091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95931417 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 95932111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95933545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95935132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95942601 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95946617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95947466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95947754 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95948442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95950078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95950093 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95950887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95950995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95951090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95951781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95951833 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95951860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95952062 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 95952202 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 95952639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95953306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95953926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95954203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95954204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95954723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95954907 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95954978 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95955760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95959455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95959729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95961509 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95962466 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 95962890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95962949 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 95963173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95964897 C G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 95964939 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 95964998 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 95965761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95965854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95966001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95966145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95966438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95966497 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95966680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95967412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95969004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95970106 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95970290 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95970358 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95970676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95971891 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95972744 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95973101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95974135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95974947 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 95977711 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 95978776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95979205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95979907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95980204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95981052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95981122 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95981154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95981376 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95981544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95981933 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 95982836 T A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 95982854 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 95983061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95983578 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95983924 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 95984593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95984895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95986079 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95986192 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 95986960 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95989202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95989395 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95989613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95990038 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95990596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95991478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95992224 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 95992591 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95992664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95993323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95993919 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 95994449 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95994819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95995845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95996110 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 95997216 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 95997416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95997663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95997676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95997906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 95999255 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96002477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96003108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96003110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96005015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96006901 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 96007027 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96007052 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96007764 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96008931 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96009211 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96009512 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 96009563 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 96010773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96011107 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 96011335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96011621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96011795 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 96011836 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96011868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96011872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96012007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96012049 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96012265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96012466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96012633 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 96013498 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96013704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96013768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96013941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96014205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96014237 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96014253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96014488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96014527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96014765 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96014766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96015443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96017056 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96019183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96019431 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96020140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96020233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96020331 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 96021957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96022015 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96022222 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96022455 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96022826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96023099 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 96023536 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 96023554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96023656 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 96023786 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 96023788 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 96023813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96023861 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 96023923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96023987 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 96024069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96024343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96024350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96024473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96024555 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96024690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96025145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96025347 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 96025419 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96025686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96026039 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96026321 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 96026338 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 96026414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96026602 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96026780 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96026888 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96026899 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 96026965 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 96027042 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96028115 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 96028749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96028790 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 96028816 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 96028898 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 96029010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96029041 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96029208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96029462 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 96030004 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96030250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96030291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96030829 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96031086 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 96031361 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96031392 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96031575 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 96039109 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 96039268 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 96039374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96039399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96039503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96039515 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 96040068 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 96040157 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96040363 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96040912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96041643 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 96042405 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96042619 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96042822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96042824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96042856 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96042871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96049700 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96049838 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96049877 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96050035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96050101 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 96050291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96050568 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 96051398 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96051534 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96051565 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 96052511 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96052676 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 96052794 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 96052865 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96052909 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 96053514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96053548 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96053647 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96054842 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96054879 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 96056062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96056215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96056460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96057284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96057641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96057978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96058123 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 96058470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96058481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96058506 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96059017 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96059174 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96062267 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96062584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96062717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96063642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96064067 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96064393 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96064405 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96066069 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 96066697 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96069357 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96069384 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96069596 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96070658 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96070920 G T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 96071131 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 96072035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96072088 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96072477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96072996 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 96074443 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 96075166 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96075310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96076456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96076467 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 96076576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96077251 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96077691 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96078695 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96078837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96079674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96079744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96079891 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96080751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96081169 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96081514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96082010 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96083146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96084476 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96084496 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96084509 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96085381 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96085524 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96086188 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96087545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96087945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96088172 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96088389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96089133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96089934 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96090858 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96091967 T G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 96093236 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96094388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96095961 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96095993 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96096961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96097272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96097493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96097700 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96098419 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96099863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96104635 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 96105718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96105871 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 96106323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96109615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96109704 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96110278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96111093 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96112036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96113861 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96115214 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96115835 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96115898 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 96117054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96117087 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96117311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96118476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96120891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96120938 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96122974 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96123399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96126102 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96128227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96128899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96130469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96131516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96133430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96134076 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 96134082 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96134294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96135397 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96139392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96140293 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 96141287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96141440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96142963 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 96143668 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 96144944 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96145054 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96146374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96146551 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96147763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96147915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96149830 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96150675 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96150700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96153267 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96156744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96156779 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96158406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96159320 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 96160781 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96161397 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96161405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96161765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96161997 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96162231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96164180 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 96170667 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96171155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96171853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96173105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96173437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96173595 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96173597 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96174247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96175780 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96175977 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96179135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96181930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96182438 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96183894 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96184352 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96184948 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96185111 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96187152 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96188114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96189703 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96189867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96190274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96191230 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 96191615 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 96192173 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 96192552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96192600 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96192760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96192827 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96192932 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96192999 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96193417 A T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 96195275 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96196645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96197180 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 96197224 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96198024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96198041 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96198131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96198220 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96199265 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 96199357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96200058 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 96200111 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96200112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96200368 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96203449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96204570 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 96207226 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 96209197 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96209423 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96211548 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96212450 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96213203 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96213259 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 96219281 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96219376 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96219412 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96219673 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96220158 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96221647 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96222713 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96222996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96224091 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96225090 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96225219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96225580 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96226307 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96226554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96226863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96226912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96226953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96227489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96228148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96228284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96230175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96230354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96230772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96231648 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96232884 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96234915 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 96235198 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96235650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96235907 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96237330 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96238610 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96238992 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 96239714 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96240909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96242026 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 96243037 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96243370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96244716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96244824 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 96245268 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96246068 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96246136 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96246457 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96246611 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96246890 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 96246992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96247008 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96247291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96248564 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 96249079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96249945 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96250919 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96250920 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96251057 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96251774 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96252582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96253136 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 96253265 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96253375 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96253427 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 96253851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96254174 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96256696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96257273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96257365 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96257686 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 96257991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96258383 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96258384 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96258430 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96258857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96258965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96260282 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96260830 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 96260886 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96261131 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96261167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96261437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96262573 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 96262574 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 96262673 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 96262876 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 96263409 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96264658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96264742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96266402 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96266613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96266676 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96266709 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96267565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96268180 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 96268429 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 96268660 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 96268866 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 96269261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96270649 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 96270761 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96270779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96277952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96278407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96278512 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96281365 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 96285873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96286678 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96286856 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96286980 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96289863 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 96292125 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 96292579 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 96293527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96295113 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96295167 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96297395 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96300091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96300342 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 96300385 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96301316 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 96302426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96303950 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 96304251 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96304990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96306245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96307109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96307203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96307223 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96307237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96308135 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96308487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96310705 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96312137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96314053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96314292 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 96314652 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96316729 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96318801 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96318946 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96319027 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96319651 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 96320799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96321297 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96324193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96324236 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96324676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96325570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96326141 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96327859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96328237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96328986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96329391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96331151 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96334533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96334711 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96335637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96335953 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 96337817 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 96337860 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96339087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96340500 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 96340825 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 96340906 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 96341161 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96341197 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96341198 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96341248 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 96341253 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 96341440 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96341563 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96343618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96343889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96344272 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 96346163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96348202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96348523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96351181 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 96353814 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96356213 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96356414 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 96356415 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96358342 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96358686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96358717 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96361260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96362125 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 96362256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96366097 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96366208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96367991 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96369621 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96370578 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96371196 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 2 96373164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96374877 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96374988 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96376811 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96378418 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96378420 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96378776 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 96378845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96379004 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96380369 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96381491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96381757 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96382506 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96382609 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96382815 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96383037 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 96383288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96383494 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96383548 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 96383917 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96383957 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96384458 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96384537 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96384557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96384695 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 96384791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96384926 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 96385739 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96386739 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96387034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96390164 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 96390187 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 96390411 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96390966 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96391448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96391669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96392805 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 2 96392807 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 96394214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96395726 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96398839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96399584 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96407298 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96407376 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96407585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96407711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96408305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96409288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96410670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96411253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96412180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96412381 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96412721 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96413316 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96415468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96415634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96416439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96418216 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96418670 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 96420014 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 96420438 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96420465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96421533 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 96422375 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96422416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96422448 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96422488 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96422908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96423209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96424251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96425399 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96427659 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96428115 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96429174 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96429967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96430303 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 96430418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96430793 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96431707 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96432401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96434027 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96434214 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96434684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96434960 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96435503 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96436717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96436771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96437581 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96438750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96441719 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 96443422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96443707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96444222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96444388 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 96444726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96444896 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96445501 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96445616 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 96445675 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96446329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96446620 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96447406 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96450397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96450438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96452061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96454132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96456036 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96457210 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96461024 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 96461306 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96463204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96464320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96466546 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 96467612 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 96468174 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96468945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96469210 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 96469411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96470592 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96470734 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96470966 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96471014 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96471620 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 96473501 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96473630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96476962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96479530 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96479537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96479580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96479604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96479631 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96479723 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96479760 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96480311 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 96480380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96480381 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96480690 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96480968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96481230 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 96481400 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96481428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96481909 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96482587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96483406 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 96483507 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 96484366 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 96484456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96484471 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 96485625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96486176 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96486505 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 96488860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96490938 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96491397 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96495673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96496350 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 96496453 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 96497284 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 96497708 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96500355 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96500523 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 96500825 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96501312 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96501379 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96501381 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96501796 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 96501852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96502252 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 96502363 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 96502669 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96502791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96503177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96503840 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96505269 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 96505746 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 96506071 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 96506161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96506177 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 96506215 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 96506256 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 96506277 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 96506303 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 96506324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96506374 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 96506378 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 96506460 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96506469 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 96506508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96506631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96506821 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 96506995 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 96507744 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96507887 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96508658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96508763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96509065 C T N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 2 96509650 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96509733 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 96509734 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 96509753 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 96510379 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96510399 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 96510441 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96511018 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96511450 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 96511519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96511605 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96512948 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96514844 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 96515373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96515970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96516687 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 96517103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96517212 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 96518124 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 96518633 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96518742 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 96519179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96519383 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 96519397 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 96519848 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 96520091 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96520456 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 96520504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96520539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96520612 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96520636 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 96520693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96520744 T G N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 96520944 G C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 96521130 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 96521149 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96521279 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 96521329 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96521360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96521419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96521462 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96521511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96521612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96521678 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 96521684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96521690 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 96521844 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96522402 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 96522430 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 96522453 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 96522531 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 96522633 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 96522697 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 96523001 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96523257 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96523446 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96523571 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96523653 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96523681 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96523991 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 96524008 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 96524090 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 96524612 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 96525174 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96526693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96527493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96528577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96529762 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96530202 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96531536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96532831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96533909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96536173 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96536377 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96536735 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 96536869 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 96536870 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 96537020 A C N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 96537045 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 96537279 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96537426 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96537445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96537546 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96537613 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96537743 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96537774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96538218 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96538380 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96538458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96538504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96538562 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 96538606 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 96538736 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 96538745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96539127 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 96539402 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96539469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96539946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96541202 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96541245 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96541514 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96542331 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96542551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96542858 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96543609 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96544134 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96544481 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96544629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96545795 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96546292 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 96547562 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96547611 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 96548421 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 96549765 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 96549904 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96549947 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 96550092 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96550302 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96550303 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96550732 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96552166 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 96552986 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 96554126 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 96554211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 96554743 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96554790 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 96555636 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 96555661 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96555975 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 96556434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96556585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96556917 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96557021 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 96557938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96558056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96558114 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96558125 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96558216 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 96558331 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96558515 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 96558814 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 96559913 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 96560082 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96560434 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96561658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96561780 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 96562101 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 96562138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96562163 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96562260 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 96562638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96563351 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96563357 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96563398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96563620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96563732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96564172 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 96564318 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 96564360 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96564402 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 96564454 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96564758 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 96564902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96565428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96565561 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96565587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96565927 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96567258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96567471 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96567582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96567598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96567680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96567805 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96567858 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 96567902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96568034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96568113 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 96568156 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96568351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96569068 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96569139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96569345 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96569504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96569630 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96569650 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 96569678 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96569708 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 96569967 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 96570025 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96570125 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96570260 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96570297 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96570367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96570384 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 96570519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96570734 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96570792 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96570793 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 96571049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96571081 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 96571115 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96571429 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 96571486 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 96571548 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 96571627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96571688 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96571705 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96571789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96571804 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96571858 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96571972 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96571996 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96572139 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 96572284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96572295 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 96572839 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96572875 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96573037 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96573053 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96573085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96573214 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96573300 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96573330 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96573394 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 96573548 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 96573623 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 96573658 G C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 96573665 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 96573780 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96573814 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96573911 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96573970 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96573980 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 96574660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96574774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96575063 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 96575440 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96575497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96575553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96575933 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96576036 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96576051 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96576094 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 96576341 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96576362 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96576461 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96576563 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 96577369 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96577727 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96577743 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96578139 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96578218 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96578338 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 96578377 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96578379 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96578686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96578764 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 96579066 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96579167 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96579276 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96579489 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 96579501 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 96579502 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96579598 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 96579961 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 96580072 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96580249 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 96580263 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96580579 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 96580666 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 96580714 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 96580720 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 96580776 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96580805 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 96580952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96580980 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96581041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96581091 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96581274 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96581321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96581355 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96581387 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 96581453 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96581540 G A N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 96581794 G C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 96581809 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 96581856 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 96581900 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 96581966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96582198 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 96582308 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 96582703 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 96582729 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 96582773 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 96582774 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 96582898 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 96582946 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 96582965 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96583479 G A N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 96583517 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 96583609 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 96583679 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 96583713 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 96583734 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96583741 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 96583875 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 96584022 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 96584351 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 96584459 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 96584560 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 96584637 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96584943 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 96584962 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 96585218 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 96585267 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 96585268 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 96585309 A G Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 96585455 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96585493 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 96585692 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 96585723 A G Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 96585735 A G Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 96585752 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 96585804 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 96586014 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96586110 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 96586168 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96586184 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 96586276 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 96586617 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 96586898 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 96587049 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 96587094 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 96587101 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 96587253 G T N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 2 96587254 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 96587678 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 96587716 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 96587728 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 96587828 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 96587837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96587893 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 96587944 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 96588144 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96588227 T G N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 96588261 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 96588326 G C N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 96588450 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 96588452 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 96588523 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96588603 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 96588722 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 96588791 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 96588865 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 96588876 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 96588901 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 96589056 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96589141 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 96589356 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 96589747 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 96589758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96589812 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 96589910 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96589974 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 96590070 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 96590081 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96590154 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 96590361 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96590476 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 2 96590767 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 96590828 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 96591025 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96591030 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96591096 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96591125 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96591135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96591290 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 96591324 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96591405 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 96591521 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 96591626 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 96591672 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96591729 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96592110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96592153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96592256 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96592337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96592442 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96592450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96592827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96592854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96592916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96593057 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 96593124 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 96593155 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 96593165 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96593213 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96593216 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96593224 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96593277 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 96593300 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 96593333 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 96593336 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 96593361 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.0833333333333333 0.75 0.166666666666667 11 13 1 9 2 2 96593372 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 96593381 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 96593394 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96593407 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 96593430 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96593487 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96593495 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96593528 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 96593546 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 96593562 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 96593621 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 96593723 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96594052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96594137 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96594178 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 96594213 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 96594319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96594424 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96594767 A T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 96594954 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 96594997 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96595094 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 96595097 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 96595112 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96595120 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96595256 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 96595337 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 96595376 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 96595515 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 96596715 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 96596826 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96597096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96597321 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96597680 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96597760 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 96597951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96598136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96598238 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 96598267 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 96598290 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 96598411 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 96598803 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 96599605 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 96599811 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 2 96599821 T A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 96599846 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 96601016 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 96601156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96601249 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96601565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96601663 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96601681 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96601735 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96601817 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96601825 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 96601896 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96601927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96601959 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96601968 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 96602144 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 96602164 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 96602255 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 96602323 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 96602378 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 96602389 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 96602456 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 96602637 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 96602730 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96602857 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 96602870 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 96602967 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96602974 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96602991 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 96603063 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 96603126 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 96603207 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 96603265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96603275 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96603491 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96603527 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96603554 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96603921 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 96604084 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 96604184 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 96604290 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 96604317 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 96604382 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 96604417 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 96605254 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96605282 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 96608554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96609786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96610925 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96612166 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 96612189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96612657 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96613451 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 96616243 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96616468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96617191 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96618776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96620466 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96620821 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96620904 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 96622262 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 96622769 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96624133 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96625037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96625538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96626974 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96627117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96627240 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96627554 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 96628033 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96629453 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 96631770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96631878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96632082 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96632243 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96633590 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96633636 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96634117 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 96634467 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96634694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96635094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96635164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96635370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96635639 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 96635647 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96635696 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96635837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96636094 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 96636122 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 96636130 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 96636302 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 96636447 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 96636529 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 96636918 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 96637193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96637234 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 96637566 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 96638851 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96639209 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96639312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96639778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96639796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96639957 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 96640177 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96640262 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96640385 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96640453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96640489 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96640530 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96641116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96641390 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 96641419 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96641788 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96641836 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96642121 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96642195 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96644595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96645882 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 96646476 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 96646615 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96646708 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96648340 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 96649342 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96649806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96652103 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 96652423 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 96652982 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 96653210 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96655858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96657467 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96657507 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96659093 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96660129 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96660418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96660440 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 96660932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96662725 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96663925 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96667495 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96667931 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96668103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96669016 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96669216 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96669715 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96669744 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96671118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96671373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96671400 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96672482 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96674420 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96676588 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96676967 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96677055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96677269 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 96677564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96678590 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96678802 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96679668 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96679681 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96680206 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96680893 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96681029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96682383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96682985 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96683631 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 96683889 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 96686671 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96687111 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96688182 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 96690024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96692245 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 96693378 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96693448 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96696175 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96696177 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 96696396 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 96699507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96700819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96702279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96702424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96702471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96703028 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96703152 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96704284 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 96706726 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96708593 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96708754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96708879 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96710759 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96711957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96712405 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96712495 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96713131 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96714673 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 96715571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96717642 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96719031 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96719107 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96720109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96720247 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 96720577 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 96720651 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 96720720 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 96721031 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 96721057 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 96721622 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 96721676 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96722130 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 96722199 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96722241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96722429 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96722473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96722547 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96722732 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 96722947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96722959 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96723028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96723165 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96723211 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 96723256 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96723704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96723722 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 96723740 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96725430 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 96725494 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 96725670 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96725909 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96726075 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 96726082 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 96726101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96726133 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96726150 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96726151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96726171 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 96726240 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 96726258 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 96726869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96726946 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96727130 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 96727317 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96727380 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96727411 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 96727528 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96727583 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96727698 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96727852 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96727873 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 96727928 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 96727943 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96728204 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96728211 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96728217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96728451 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96728469 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96728625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96728669 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 96728676 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 96728725 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 96728755 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96728825 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96728908 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 96729137 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96729220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96729267 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 96729305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96729396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96729477 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96729602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96729628 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 96729660 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 96729690 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 96729762 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 96729766 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 96729861 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 96729868 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 96729916 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 96729923 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 96730040 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 96730044 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 96730090 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96730126 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 96730151 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 96730325 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96731026 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96731415 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96731474 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96731775 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96732104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96732195 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96733122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96733543 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96734041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96734246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96735442 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96735455 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96735687 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96735816 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96735825 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96735952 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 96736086 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96736136 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 96736263 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96736444 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96736481 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 96736498 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96736504 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96736520 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 96736673 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96736977 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96736980 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96736996 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96737060 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 96737079 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96737143 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96737191 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96737249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96737315 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 96737317 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 96737331 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 96737350 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 96737376 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 96737398 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96737482 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96737589 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 96737611 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96737849 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96737861 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96738082 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96738098 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 96738100 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96738114 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96738146 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 96738218 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96738252 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96738275 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96738493 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96738538 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96738541 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96738643 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96738649 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96738686 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96738719 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96738787 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96738855 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96738880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96738914 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96738987 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96739026 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96739050 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96739094 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96739098 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96739153 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96739160 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96739196 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 96739201 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96739223 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96739225 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96739237 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96739261 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 96739337 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96739355 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96739404 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96739485 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 96739585 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 96739655 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96739675 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 96739776 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 96739798 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 96739843 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 96740433 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 96740450 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 96740451 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 96740661 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96740867 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 96740981 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96741083 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96741097 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96741231 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 96741323 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96741328 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96741340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96741348 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96741395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96741476 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96741492 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 96741504 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 96741541 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 96741597 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 96741748 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96741846 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 96741868 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 96741887 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96741922 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 96741931 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 96741976 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 96742004 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 96742010 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 96742054 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 96742079 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96742110 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 96742111 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 96742146 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 96742174 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 96742321 T G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 96742369 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 96742371 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 96742427 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 96742456 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 96742479 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 96742531 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 96742548 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 96742561 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96742603 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 96742605 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 96742622 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96742692 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 96742693 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 96742807 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 96742838 G C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 96742839 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 96742864 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96742865 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96742892 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 96742921 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96742962 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96742963 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96742981 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96743023 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96743071 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 96743220 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 96743311 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 96743354 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 96743388 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 96743435 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 96743650 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96743666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96743739 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96743806 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96743846 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96743870 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 96744003 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 96744164 C G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 96744493 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96744495 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96744577 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96744603 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96744694 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96744714 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 96744790 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 96744876 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 96744902 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96744910 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96744968 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96745019 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 96745075 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96745106 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96745114 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96745134 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96745149 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96745180 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 96745629 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 96745649 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96745652 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96745754 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96745811 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 96745815 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96745836 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 96745874 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96745920 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 96746119 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 2 96746143 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 96746183 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96746321 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 96746456 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 96746600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96746885 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 96746892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96746939 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 96746950 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 96747047 A G N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 96747081 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 96747128 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 96747145 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 96747212 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 96747251 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 96747284 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 96747400 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 96747471 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 96747504 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 96747542 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 96747708 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 96748072 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 96748129 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 96748181 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 96748287 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 96748339 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 96748373 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 96748449 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 96749194 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96749531 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 96749975 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 96750081 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 96750109 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96750112 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96750701 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 96750764 T G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 96750793 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 96750797 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 96750869 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96751163 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 96751204 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 96751239 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 96751341 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 96751488 A C N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 96752001 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96752119 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96752364 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96752372 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96752534 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 96752589 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96752892 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 96752953 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 96752966 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 96752994 G C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 96753275 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 96753328 C G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 96753523 A C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 96753826 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96753902 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 96754142 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 96754404 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 96755149 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96755161 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96755456 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96755779 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96756383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96757446 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 96757647 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 96758047 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 96758265 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96758300 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 96758331 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 96758531 A C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 96758545 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 2 96759006 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 96759064 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 96759136 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 96759150 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 96759504 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 96759512 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 96759526 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 96759531 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 96759577 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 96759603 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96759609 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 96759702 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 96759756 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 96759797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96759905 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 96760194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96760233 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 96760248 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 96760336 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 96760427 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 96760547 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 96760679 A T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 96761380 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 96761818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96761914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96762501 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 96762905 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 96762973 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96763009 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 96763159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96763221 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 96763722 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 96764008 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96764234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96764236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96768012 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 96768199 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 96768713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96769622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96769854 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96770635 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96771542 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 96772015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96773815 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96774543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96775439 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96776542 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 96776615 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 96776721 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96777470 A C N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 2 96777511 C T N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 2 96777805 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96778006 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 96778237 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 96778255 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 96778333 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 96778364 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 96778468 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 96778520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96778556 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96778579 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 96778675 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 96778894 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96778949 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 96779186 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 96779205 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96779206 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 96779225 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96779251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96779271 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96779326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96779349 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 96779361 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 96779405 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96779455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96779695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96779701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96780009 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96780057 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 96780203 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96780212 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96780279 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96780467 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 96780469 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 96780599 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96781103 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96781133 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96781141 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 96781168 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96781169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96781202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96781211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96781328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96781359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96781442 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 96781517 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 96781584 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 96781645 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96781711 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96781730 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 96781968 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96782048 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96782202 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 96782213 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 96782314 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96782384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96782443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96782515 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96782835 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 96782855 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 96782979 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 96783008 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96783090 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96783201 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96783350 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 96783376 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 96783388 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96783392 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96783424 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96783692 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96783727 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96783821 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96783852 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96783972 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96784012 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96784187 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 96784191 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 96784210 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 96784234 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96784300 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 96784320 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 96784620 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 96784637 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96784687 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96784976 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 96785000 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 96785042 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 96785060 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 96785082 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 96785267 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 96785302 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96785338 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96785408 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96785441 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96785448 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96785636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96785685 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96785723 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96785778 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 96785794 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 96785827 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96785964 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96785982 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96786150 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 96786227 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 96786245 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 96786490 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 96786520 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 96786524 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96786750 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 96786751 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 96786864 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96786897 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96786992 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96787040 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96787196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96787451 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 96788235 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96788345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96789015 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96789435 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 96789456 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 96790419 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96790588 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 96791177 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96792164 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 96792286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96792526 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96794061 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96794336 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96794527 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96794528 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96794572 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 96794641 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96794754 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96801985 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 96803057 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96803401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96803502 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 96803694 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 96803774 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96803813 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 96803965 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96804053 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96804445 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 96804505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96804745 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96804776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96804808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96805046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96805251 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 96805484 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 96805490 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96805499 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 96805616 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 96805622 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 96805681 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 96805776 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 96805805 T A N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 96805889 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96806082 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 96806083 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 96806321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96806352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96806415 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 96806440 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96806594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96806626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96806647 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 96806732 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96806967 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96806979 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96807151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96807229 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96807298 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96807315 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96807316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96807453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96807530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96807552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96807666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96807807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96807865 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96807871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96807948 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96807958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96808094 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96808315 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96808420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96808492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96808505 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96808562 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96808751 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96808798 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96808858 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96808869 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96808879 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96808956 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 96809021 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96809273 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96809325 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96809328 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96809340 A C N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 96809361 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 96809378 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96809401 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96809553 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96809565 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96809604 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96809637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96809719 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96809761 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96809822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96809837 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 96809864 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96809881 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 96809896 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96809908 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96809958 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96809999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96810076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96810143 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96810238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96810429 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96817613 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 96817679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96817747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96817749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96817880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96818042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96818102 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96818138 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96818188 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96818336 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96818482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96818789 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 96819064 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96819118 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96819171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819183 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96819194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819267 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819607 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 96819617 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819757 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96819885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96820005 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 96820021 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96820111 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96820120 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96820354 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 96820768 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96820771 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96820817 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96820926 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96820947 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96820963 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96820975 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96821069 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 96821259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96821284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96821422 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96821533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96821628 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96821703 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 96821806 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 96821902 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96821932 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96821940 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96822085 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96822189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96822198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96822202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96822426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96822492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96822524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96822587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96822757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96822821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96823016 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 96823017 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 96823293 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96823408 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96823412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96823424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96823476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96823554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96823670 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96823711 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96823730 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96823742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96823795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96823797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96823824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96823853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96823902 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96823930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96823967 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96824012 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96824078 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96824125 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96824194 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96824263 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96824384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96824476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96824488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96824492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96824583 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96824751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96824848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96824918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96824919 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96824970 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96825141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96825193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96825475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96825546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96825645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96825957 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96825968 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96825969 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96826060 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 96826532 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96826625 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96826774 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96826840 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 96826943 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96827236 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96827333 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96827438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96827461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96827624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96828075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96828097 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96828109 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96828155 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96828168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96828320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96828647 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96828695 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 96828880 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96829167 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 96829185 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 96829252 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96829282 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96829356 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96829395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96829501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96829630 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96829735 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96829839 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96829862 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96830165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96830183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96830233 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96830366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96830388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96830398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96830616 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96830619 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96830672 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96830769 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96830832 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96830851 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96830853 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96830968 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96831007 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96831026 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96831058 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96831070 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96831094 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 96831195 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 96831202 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 96831271 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 96831309 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 96831442 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96831788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96831795 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96831827 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96831854 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96831860 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96831869 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 96831970 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96832032 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 96832215 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 96832224 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 96832235 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96832247 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96832276 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 96832347 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96832381 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96832413 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96832415 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96832433 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 96832509 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96832561 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96832580 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 96832682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96832683 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 96832711 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 96832725 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 96832745 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 96832786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96832803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96832839 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 96832867 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 96832877 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 96833030 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96833055 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96833349 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96833369 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96833507 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96833510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96833558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96833568 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96833597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96833620 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96833758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96833969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96834156 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96834173 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96834190 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96834211 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96834221 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96834544 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 96834699 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96834800 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96834866 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96834883 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96834887 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96834996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96835002 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96835018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96835035 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96835094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96835139 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96835164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96835168 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96835194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96835234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96835240 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96835290 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96835361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96835563 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96835573 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96835600 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96835611 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96835688 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96835747 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96835785 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96835788 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96835830 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96835891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96835971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96836086 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96836120 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96836205 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96836295 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 96836340 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96836341 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 96836384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96836488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96836941 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96836949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96837396 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96837695 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96837765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96837874 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96837907 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96838086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96838092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96838146 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96838181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96838185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96838194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96838232 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 96838331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96838366 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96838987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96839053 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96839071 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96839230 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96839258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96839317 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96839337 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96839622 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96839629 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96839805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96839930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96839955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96840109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96840146 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96840184 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96840213 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96840308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96840384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96840484 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96840492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96840536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96840628 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 96840749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96840811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96840844 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96841184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96841523 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 96842116 C G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 96842962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96843302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96843775 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96843838 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 96844130 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96844242 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96844244 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96845648 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96847613 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 96847621 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 96848212 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96848254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96848263 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96848699 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96848747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96849936 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96850006 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96850082 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96850156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96851075 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96851082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96851762 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96852018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96852029 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96852303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96852405 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 96852750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96852756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96853143 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96853256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96853435 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96854129 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 96854273 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96854313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96854400 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96854452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96854648 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96854818 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96855046 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 96855924 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 96858435 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 96858614 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 96858809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96858934 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 96858935 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96859363 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96859372 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96859620 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 96859677 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 96861798 C G Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 96864613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96865308 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96865711 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96865827 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 96866141 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96866572 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 96867082 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 96867712 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 96868032 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 96868116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96869249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96876523 G T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 96876595 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96877055 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96877206 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96877579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96878307 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96878353 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96878678 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 96878745 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 96879821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96881168 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 96881241 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96881745 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 96881797 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96882326 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 96882371 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 96882425 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96882635 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96882696 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 96883092 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96883286 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96883338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96883513 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 96883612 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96883714 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 96884318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96884355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96884360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96885764 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96886349 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96888956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96889318 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96890273 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96890708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96891504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96891991 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96892501 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 96892520 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96892788 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96894715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96894736 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96895540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96897116 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 96897397 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96898482 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 96899726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96901092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96902079 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 96903523 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96904057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96904191 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96904649 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96904963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96906039 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96909981 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96911272 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96912246 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96913417 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96913863 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 96915072 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 96915118 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 96915672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96915696 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96917430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96918030 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96918051 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96918159 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96918258 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96918466 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 96918562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96918794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96919020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96919353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96919409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96920108 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96920364 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96921897 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96922660 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96922661 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96922783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96926909 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96927331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96928014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96928015 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96928547 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96929329 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 96929561 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 96930745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96931166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96931178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96931242 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 96932973 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96933077 T G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 96933598 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96934260 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 96934475 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 96934534 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96934627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96934718 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 96935181 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96935379 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 96935572 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 96935817 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96937613 C T N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 96939267 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 96939400 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 96941413 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96941553 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 96941852 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96942205 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 96942247 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 96942529 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96942586 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 96943013 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96943778 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 96946091 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96946575 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 96947765 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96947824 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 96947942 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 96948078 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 96948716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96948859 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96948897 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 96948924 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96949701 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96949746 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 96949782 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 96949804 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 96950159 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 96950461 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96950525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96950817 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 96950833 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96950839 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96951065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96951116 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 96951137 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96951162 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96951363 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96951375 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96951391 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96951398 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96951429 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96951434 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96951553 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96951555 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 96951579 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96951601 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96951644 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96951688 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96951767 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96951841 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96951879 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96951897 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 96951903 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 96951958 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 96952067 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96952095 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96952166 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 96952203 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96952297 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96952326 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 96952329 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 96952358 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96952396 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 96952777 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96952892 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96952925 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96952983 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 96953056 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96953214 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 96953384 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96953543 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96953655 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96953773 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96954210 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96954306 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96954392 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 96954451 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 96954544 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96954562 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 96954668 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 96954704 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 96954718 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96954783 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 96954877 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96954978 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96955936 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96956277 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 96956335 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 96957054 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96957322 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 96958058 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 96958137 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 96958300 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 96958544 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 96958869 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96958993 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96959203 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96959341 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 96959806 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 96959816 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 96959866 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 96960030 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 96961027 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 96963058 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96963522 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96963904 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 96965189 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 96965530 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 96966323 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96966622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96967104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96969195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96969407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96970852 G C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 96971500 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 96971507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96972857 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 96973070 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 96973954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96974042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96974128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 96975661 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96976720 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 96978244 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 96978371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96979698 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 96979837 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 96985783 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 96986865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96987076 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96987412 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 96989236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96990158 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96991015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96992627 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 96992965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 96996860 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96999117 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 96999320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97000385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97000530 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97001461 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97001784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97003750 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 97006397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97006755 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97009233 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97011297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97013339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97016327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97019365 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97031478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97031945 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 97033706 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 97034193 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97034833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97036536 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 97036878 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97037488 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 97038674 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97039751 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 97039833 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97041214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97041289 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97041464 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 97042144 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97042737 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97042777 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97043457 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97043854 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97044367 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97045497 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97045527 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97045712 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97045855 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97046030 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97046641 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 97047664 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97048300 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 97048431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97048696 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97049870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97050171 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97050191 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97051908 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97054701 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97056957 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 97057050 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97057062 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97058203 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 97059303 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 97059840 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97060059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97061018 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 97061040 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 97061408 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 97062082 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 97062198 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97062227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 97062888 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97063854 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97064531 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 97064698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97064899 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 97065695 A T Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 97067658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97067948 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97068089 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97068892 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97069142 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 97069705 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97070316 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 97070510 A G N Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 97071452 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97072020 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97072794 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 97073106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97073142 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97073597 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97074457 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97074560 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97074898 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97075096 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97075097 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97075740 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97075824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97076338 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97077152 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97077952 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97078237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97087175 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97088312 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97088909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97089028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97089118 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97089127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97089291 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97089330 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 97089367 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97089571 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97089596 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97089702 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97089714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97089784 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97089843 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97089966 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97090059 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97090110 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97090164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97090344 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97090723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97090852 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97090909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97091028 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97091035 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97091241 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97091453 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 97091576 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 97091585 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 97091647 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97091682 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 97092231 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97092375 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97092411 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97092429 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97092880 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97092895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97093010 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97093171 G T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 97093370 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97093485 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97093524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97094190 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 97094345 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 97094404 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 97094686 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97094853 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 97095175 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 97095277 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 97095386 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 97095598 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97095599 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97095625 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97096229 G T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 97096292 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 97096395 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97096448 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97096519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97096650 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97096694 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97096730 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97096749 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97096874 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 97096984 C T Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 97097014 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 97097134 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 97097221 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 97097246 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 97097498 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97097529 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97097567 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97097568 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97097821 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97097958 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 97098114 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 97098322 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97098328 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 97098463 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97098543 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 97098618 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97098674 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97098782 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97098901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97098940 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97099004 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 97099105 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 97099176 C G Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 97099363 A T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 97099451 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 97099554 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 97099590 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 97099618 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 97099701 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 97099799 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 97099809 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97099877 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97099919 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97100044 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97100218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97100236 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 97100451 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 97100503 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 97100512 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97100593 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97100619 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97100735 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97100756 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97100768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97100821 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97101877 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97102027 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97102227 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97102262 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97102319 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97102581 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97102653 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97102797 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97102877 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97103026 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97103096 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97103183 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97103461 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 97103487 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 97103669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97103772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97103783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97103836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97104182 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97104290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97104358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97104496 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97104603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97104615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97104813 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97104881 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 97105036 C A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 97105159 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 97105185 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97105208 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97105330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97105624 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 97105691 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97105838 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 97106024 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97106276 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 97106351 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 97106541 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97106630 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97106673 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97106698 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 97107023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97107619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97109080 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97109542 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97110853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97110909 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97112139 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97113063 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 97113093 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 97113279 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97115771 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 97115821 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97115876 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97116417 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97116604 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97116770 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97117276 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97117418 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97118106 G T N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 2 97118126 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 97118223 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 97118227 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 97118329 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97118685 C G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 97118796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97119053 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 97119703 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 97126327 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97128212 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97128700 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97128959 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 97129476 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97130912 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97131040 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97131707 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 97132154 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97132358 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97134372 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97137367 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97137379 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97137427 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97137539 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97137815 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 97138054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97138328 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 97138808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97139499 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97140094 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97140552 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97142179 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 97142290 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97142439 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97142560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97144682 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97145798 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97146102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97146488 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 97146532 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97146964 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97147118 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97147123 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 97147505 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97154021 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 97154338 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97154537 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97155090 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97155716 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97155875 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97155946 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97156039 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 97156446 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97156666 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97156877 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 97158305 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97159412 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97159442 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97159686 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 97159728 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 97159730 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97159818 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 97159838 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 97159876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97160082 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 97160093 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 97160271 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 97160275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97160327 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 97160726 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 97160884 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97161099 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97161110 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97161121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97167833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97167848 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 97167917 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 97167935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97168302 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 97168543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97168784 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 97169059 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 97169084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97169249 C G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 97169566 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 97169743 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 97169800 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 97170045 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 97170071 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97170176 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 97170191 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97170396 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97170418 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 97170545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97170852 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97170868 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97171075 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 2 97171091 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 97171114 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 97171172 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 97171218 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97171225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97171262 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97171305 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 97171372 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 97171573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97171932 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97172512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97172529 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97173314 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97173591 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97174251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97174848 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97174910 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97175071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97175465 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 97175484 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 2 97175567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97175620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97175772 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97175986 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97176012 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97176066 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97176144 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97176201 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97176862 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97176923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97176931 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97179137 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97179613 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 97181663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97181934 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97182602 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97183124 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97183231 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97187222 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97188314 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97189227 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97189706 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97191426 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97193291 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97193341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97193463 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97194823 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 97194866 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 97195505 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97195576 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 97195723 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97196164 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 97196541 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 97196567 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97196675 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 97197060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97197433 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97197445 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97197543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97198320 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97198477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97198482 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 97198515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97198587 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97198595 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97199137 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97199205 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97199330 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97199421 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97199454 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 97199738 C G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 97200203 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 97200285 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 97200485 C A N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 97200515 G T N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 97200568 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 97200730 A T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 97200781 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 97200906 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97201112 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97201133 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97201453 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97201480 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97201503 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97201558 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 97201585 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 97201627 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97201757 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97201769 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97201888 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97201890 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97201904 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97201923 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97201963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97201977 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97202003 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97202086 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97202130 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 97202258 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 97202261 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 97202371 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97202444 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97202536 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97202545 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97202624 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97202699 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97202716 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97202724 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97202728 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97202842 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97202846 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97202859 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97202924 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97203004 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97203095 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97203136 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97203208 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97203282 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97203317 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97203404 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97203430 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97203439 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97203447 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97203483 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97203507 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97203642 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97203673 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97203689 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97203724 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 97203819 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 97203875 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 97204092 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97204181 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97204323 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 97204403 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 97204419 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 97204492 G C N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 97204495 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 97204650 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 97204788 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 97204800 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 97204960 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97204961 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97205010 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97205097 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97205182 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97205183 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97205316 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97205395 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97205494 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97205558 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97205570 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97205622 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 97205647 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 97205944 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97205945 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97205966 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97205977 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97205986 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206036 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206053 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97206092 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97206120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97206134 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97206212 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206247 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206294 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206312 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206384 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206445 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206462 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206463 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206473 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206480 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206495 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206594 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206596 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206642 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206684 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206692 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206711 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206729 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97206757 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206787 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206800 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97206823 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97206952 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97206957 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97206995 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 97207068 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207082 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97207094 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97207100 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97207161 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97207168 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207233 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207276 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207390 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97207391 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97207425 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207433 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207439 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207454 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207460 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207467 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207485 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207496 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207499 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207550 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207573 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207595 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207696 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207697 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207710 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207731 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207743 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207747 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207849 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97207855 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207873 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97207886 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97207958 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 97207972 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 97207984 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 97208002 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97208054 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 97208146 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97208217 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97208238 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97208263 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 97208412 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97208413 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97208433 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97208451 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97208470 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97208508 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97208533 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97208552 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97208566 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97208608 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97208612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97208800 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97208853 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97208917 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97209055 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97209152 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97209210 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 97209217 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97209414 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97209442 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97209476 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 97209507 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97209581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97209817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97209908 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 97210512 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 97211069 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 97211533 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97212101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97212585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97212743 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97212788 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97213119 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 97213271 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 97213316 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97213367 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97213419 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97214243 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 97214349 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 97214482 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 97215238 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97215408 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97215449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97215528 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97215886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97216001 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97217387 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 97217479 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 97217484 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 97217596 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97217689 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97217766 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 97217880 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 97217902 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 97217982 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 97217986 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 97218029 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 97218055 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 97218246 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97218409 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 2 97218476 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97218616 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97218710 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 97218741 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 97218934 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97219011 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 97219097 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97219200 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97219264 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97219272 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97219328 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97219414 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97219511 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97219568 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 97219579 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97219610 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 97219689 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97219709 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97219744 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 97219785 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97219786 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97219883 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 97219917 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 97220037 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 97220097 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97220154 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 97220174 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97220210 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97220285 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97220318 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97220327 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97220331 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97220373 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97220394 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97220496 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97220671 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97220743 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97220845 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97220967 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 97220983 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97221157 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97221227 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97221255 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97221484 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97221536 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 97221590 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 97221744 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97221819 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 97221953 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97222147 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 97222382 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97222398 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97222413 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97222595 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97222795 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97222996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97222997 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97223063 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97223113 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97223138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97223202 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97223240 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 97223248 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 97223282 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 97223370 T C Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 97223374 G A N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 97223496 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 97223772 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 97223781 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 97223834 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 97223841 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 97223932 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 97223937 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 97223970 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 97224113 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 97224147 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 97224156 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 97224261 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97224280 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97224482 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97224502 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97224510 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 97224517 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97224540 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 97224542 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97224551 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97224569 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97224580 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97224645 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97224809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97224865 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97224874 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97224899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97224924 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97224973 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97224978 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97225052 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97225067 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97225195 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97225212 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97225328 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97225356 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97225406 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97225415 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97225449 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97225558 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97225808 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 97225875 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 97226050 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 97226379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97226449 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97226544 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97226605 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97226670 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97226721 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97226934 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97226978 T G Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 97226983 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 97227105 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 97227264 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 97227338 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 97227375 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 97227391 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97227538 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97227898 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97227945 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 97228025 G C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 97228083 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 97228125 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 97228407 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 97228461 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97228526 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97228586 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97228660 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97228678 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97228703 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97228770 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 97228858 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97228893 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97228953 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97229045 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97229080 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97229108 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97229644 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97229683 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 97229760 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97229763 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97229872 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97229879 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97229999 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97230277 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97230284 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97230515 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97230575 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97230738 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 97230825 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 97230874 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 97230875 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 97231003 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97231191 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97231244 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97231488 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 97231489 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 97231695 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 97231835 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97231904 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97232346 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97232433 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97232985 C A Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 97233334 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97233649 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97233650 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97234049 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97234344 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 97234804 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97236201 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97237020 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97237352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97239236 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97239509 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 97240900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97243933 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97244350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97244515 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97244800 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97245080 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 97245993 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 97247190 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97247213 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 97247441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97247892 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97248279 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 97248910 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97249003 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 97249411 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 97249574 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 97252493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97252751 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97252845 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 97253118 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 97253624 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 97253890 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97253943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97253991 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97254036 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97254239 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 97254885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97256753 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97256846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97257839 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97259179 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97259811 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97259928 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97260002 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97261923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97261969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97262289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97262421 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 97262560 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 97262957 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97263346 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97263913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97264909 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97265655 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97266905 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 97267338 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 97268339 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 97268858 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97268886 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97269034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97269045 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97270539 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 97271116 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 97271217 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 97271560 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97271934 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97272532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97275077 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97275564 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97276880 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 97279715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97280915 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 97281057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97282269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97282345 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97284518 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97285489 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97286131 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97286212 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 97286808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97288584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97289154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97289217 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97289352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97289833 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97291418 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 97292704 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97292946 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97293019 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97293721 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97294701 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97295107 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97295794 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97295806 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97296519 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97296770 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 97300356 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 97301252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97305315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97305773 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97307778 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97309183 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97309631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97310591 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 97311209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97311463 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97312598 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 97315281 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97315647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97316183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97316211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97316240 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97317209 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97317238 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 97317348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97317472 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97317974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97318794 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97319378 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97319492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97320389 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97320517 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97320662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97321437 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97321468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97322106 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97322789 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97322942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97323025 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97323081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97323514 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97324339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97325533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97325828 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97325902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97326000 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97326971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97327502 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97327557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97328531 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97329153 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97329512 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 97329979 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97330102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97330312 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97330464 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97330653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97331124 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 97331376 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97331433 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 97331698 G T Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 97331831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97332056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97332287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97332288 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97333015 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 97333162 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 97333308 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97333687 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97333962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97334451 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 97334833 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97335279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97335408 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97335565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97335641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97335689 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 97336643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97336880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97337019 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97337146 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97337182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97337403 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 97338277 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 97340003 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 97340025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97340297 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 97340971 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97340978 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97340984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97341231 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97342463 C G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 97342950 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97343221 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 97343410 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97343418 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97343627 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97343950 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 97343966 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97344169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97344324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97344349 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97344436 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 97344580 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 97344764 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 97344930 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97345296 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97345344 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97345647 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 97345838 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97346227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97346421 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 97346901 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 97347492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97347726 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97347841 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 97348290 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97348787 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 97348923 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 97349045 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97350232 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97350233 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97350824 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97350867 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 97351016 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97353885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97354260 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 97357202 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97360247 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 97360356 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97360609 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97360832 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 97360927 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 97361057 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 97361077 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 97361089 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 97361123 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 97361176 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.6 0.0666666666666667 0.333333333333333 19 11 9 1 5 2 97361331 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 97361404 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 97361537 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97362381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97362478 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97363712 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 97364206 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97364561 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97365030 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97365553 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97365614 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97365709 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97365769 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97365826 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 97366153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97366619 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97367067 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97367422 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97368212 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97369013 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97369468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97369910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97370152 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97370364 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97370904 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 97371118 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97371801 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97371898 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97372137 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97372609 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97373040 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97373223 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97373239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97373280 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97373313 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97373414 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97373744 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97373804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97374232 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 97374408 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97374413 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 97374466 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 97374506 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97374559 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97374596 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 97374681 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97374739 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97374755 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97374882 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97375826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97376055 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97377023 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 97377157 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 97377176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97377321 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97377322 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97377342 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97377606 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97377688 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97377689 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97377946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97378004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97378776 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 97379263 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97379547 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 97380825 A T N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 2 97380913 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 97382536 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97383056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97383913 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97385763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97387329 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97387808 T G Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 97388305 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97388802 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 97389706 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 97392191 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 97394186 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97394250 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97394330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97394341 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97394752 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 97394979 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97395230 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 97395238 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 97395390 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 97396029 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97396111 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97401270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97402060 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 97403520 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 97405107 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97405247 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97407340 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97411060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97411454 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97413899 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 97413973 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 97414527 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97416209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97416979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97420148 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97422212 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97427409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97427852 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 97428242 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 97431251 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 97432255 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97432343 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 97432928 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97434911 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 97435427 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97435858 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97436313 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 97436515 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97437051 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97437099 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 97437124 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97437299 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 97437316 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 97437505 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 97438182 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97438208 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97439012 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97439770 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 97439852 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97439943 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97440137 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97440162 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97440545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97440906 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97441492 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 97441931 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97442370 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97443522 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97443613 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97443809 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97444017 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97445228 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97445882 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97446502 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97446952 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 97447126 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97448563 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97449195 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97450081 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 97450180 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 97450459 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97450482 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97450806 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97451213 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97452373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97452725 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 97453826 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97454968 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97455052 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97455093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97455485 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 97458247 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 97459477 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97460236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97461759 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 97462146 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97462240 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97462375 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 97463159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97463757 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 97463813 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97464395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97464696 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97465635 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 97465821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97465847 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 97466273 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97466359 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97468227 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97468997 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97472608 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97472703 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97472893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97472947 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 97473398 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97473522 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 97473931 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97474235 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 97474646 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97474688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97475353 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97475426 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97475477 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97475615 G T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 97475960 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97476040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97476109 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 97476319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97476333 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 97476345 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97476525 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97476539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97476560 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 97476665 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 97477229 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 97477621 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97477910 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 97478127 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 97478285 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97478992 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 97479600 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97479893 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97480091 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97480519 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97480728 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 97481106 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 97481462 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97481483 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97481764 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 97481901 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97482145 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 97482300 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97482738 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 97482877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97482921 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97483066 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 97483090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97483252 C G N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 97483777 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 97483880 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97484264 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 97484497 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97484611 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97484636 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97484974 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 97485081 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 97485224 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 97485298 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 97485599 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 97485600 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 97485829 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97486505 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97486586 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 97486946 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97487219 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 97487301 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 97487518 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97487750 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97487824 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 97487860 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97488147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97488191 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 97488251 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 97488823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97488865 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 97488931 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97488933 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 97489663 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97489864 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97489910 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97490136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97490400 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97490519 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97490647 A C Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 97490775 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 97490888 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 97490907 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 97491196 T G N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 97491276 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 97491663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97491705 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 97492156 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97492429 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97492584 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97492682 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 97492725 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97493234 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97493258 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97493361 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97493563 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97493642 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97493866 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97494136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97494140 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97494555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97494629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97494673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97494906 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97495056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97495137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97495242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97495383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97495404 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97495488 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97495664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97495713 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 97495786 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 97495815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97495817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97495913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97495941 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97495970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97496154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97496265 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97496308 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97496323 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97496350 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97496469 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 97496546 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 97496556 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97496817 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97496871 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97497038 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97497060 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97497102 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97498423 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 97498566 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 97499041 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 97499064 A C Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 97499434 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97499685 C G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 97499692 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97499731 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97499744 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 97499764 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 97499980 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 97500002 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 97500014 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 97500035 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 97500168 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97500300 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97500439 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 97500519 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97501096 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97501105 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 97501195 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97501479 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97501864 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97501886 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97502003 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97502031 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 97502393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97502900 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97503670 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97504192 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97504400 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97504507 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97504565 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 97504648 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97505226 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 97505266 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 97505301 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 97505336 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97505454 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97505459 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 97505470 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 97505503 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97505508 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97505634 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 97505688 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97505898 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97505949 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97505964 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97506257 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97506436 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97506547 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 97506636 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 97506860 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 97507367 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 97507370 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97508095 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 97508232 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 97508423 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97508497 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 97508595 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97508824 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97508847 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 97508966 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97509047 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97509119 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97509435 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 97509522 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97509761 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97509886 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97510135 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 97510197 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 97510255 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 97510298 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97510416 A T N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 97510555 C T N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 97510825 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 97517172 T G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 97517205 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 97517380 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 97517399 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 97517409 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 97517651 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97518069 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97518116 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 97518147 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97518162 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 97518372 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97518545 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97518581 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97518724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97518955 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97518969 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 97519000 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97519061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97519332 G C Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 97519335 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 97519599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97519610 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97519643 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97519688 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 97519776 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 97520124 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97520229 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97520357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97520408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97521353 C G Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 97521988 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97521996 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97522370 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97522438 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97522853 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 97522904 T C Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 97523438 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97523462 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97523650 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 97523675 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97523728 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97524119 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97524665 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 97524670 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97524705 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97524800 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 97527048 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 97527076 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 97528191 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97528210 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97528388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97528719 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97529192 G T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 97529441 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97530017 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 97530041 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97530277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97531026 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97532046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97532376 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97532632 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 97533184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97533279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97534266 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97535594 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 97536049 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97536508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97536572 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 97538735 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97538822 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97538972 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97539257 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97539464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97541457 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 97542272 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97542275 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97542487 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97543029 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97543398 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97543654 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97543658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97543946 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97545022 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 97545280 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 97545299 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97545341 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 97545543 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 97546799 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 97547050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97547108 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 97547180 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 97547186 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 97547331 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 97547332 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 97548263 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97548567 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 97548819 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97549037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97549059 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97549343 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 97549630 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 97549676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97550101 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97550160 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 97551253 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97551528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97551892 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97552859 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97553060 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97554489 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 97556057 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 97557195 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97557896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97558102 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 97558192 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97558443 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97558583 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 97560342 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97560672 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97560814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97561634 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97562832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97563048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97563238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97563337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97563734 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97563983 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97564017 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97564048 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97564290 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97564656 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 97564679 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 97565082 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97566444 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97566455 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97573600 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97573832 G C Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 97573890 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 97573932 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 97574032 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 97574033 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97580111 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 97580196 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97580442 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97580730 A C N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 97581316 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97581752 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97583565 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97583768 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97584074 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97585123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97585734 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 97586014 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 97586230 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97586281 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97586342 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97587362 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97587955 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97588499 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97588642 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97588975 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97589235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97590325 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97590652 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 97590861 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97590919 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 97591322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97592162 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 97592356 G A N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 97592614 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 97592699 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 97592744 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 97593107 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 97593302 T G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 97594357 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 97594420 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97594621 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 97596441 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 97596927 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97597264 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97598597 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97599215 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 97599652 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 97599806 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97600485 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97600661 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97608966 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97609447 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97609640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97609711 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97610580 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97612149 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 97612329 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 97613893 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97615199 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97615653 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97615728 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 97616903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97617575 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97618249 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 97618822 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 97620290 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97620884 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97620982 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97621962 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97622320 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97624375 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 97625582 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 97625773 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97625870 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97626224 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97626475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97627022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97628160 T A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 97628161 T A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 97628340 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 97630611 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97631065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97632145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97632642 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97633987 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 97634307 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97634802 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 97635123 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 97635171 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97635591 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 97635827 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97635839 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97636037 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 97636607 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 97636610 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 97636866 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 97636898 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97637195 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 97637221 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 97637275 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97637339 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 97637395 T G Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 97637772 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 97637899 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 97637971 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97638043 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 97638608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97638645 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 97639480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97639539 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97640179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97640711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97641197 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 97645799 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97645830 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 97646007 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97646168 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97646526 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 97646600 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 97647731 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 97647975 A T N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 97648320 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97648418 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97648971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97649214 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97650889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97651039 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97652700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97653443 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97654110 T G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 97654785 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97655297 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97655336 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 97655686 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97656711 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97656817 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97657229 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 97657480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97657812 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97658037 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97658046 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97658281 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 97658509 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97658991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97659077 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 97659860 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97660818 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97660974 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97661988 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 97662364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97662418 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 97662787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97662976 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97663114 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 97663550 C A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 97663905 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97664124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97664267 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97664389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97664524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97664571 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 97664572 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97664604 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 97664645 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 97664858 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 97665029 G A Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 97665410 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97665593 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 97665601 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97665613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97665649 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 97665673 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97666302 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 97666819 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97667066 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97667164 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97667321 A T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 97667430 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97667952 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 97668253 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97668281 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97668436 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97668671 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97669288 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97669824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97669836 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97670298 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97670578 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97670793 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 97671705 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 97672044 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 97672095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97672198 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97672875 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97672918 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97673157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97673189 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 97673252 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97673285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97673350 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97673573 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 97673615 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97673626 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97673764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97673840 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97673867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97673915 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 97673964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97673965 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97674006 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 97674026 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97674092 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 97674401 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 97675090 A G Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 97675337 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97675354 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97675393 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97675651 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 97676081 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 97676250 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 97676259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97676367 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97676508 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97676553 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97676639 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 97676821 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97676843 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97676860 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 97676967 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 97677085 T C Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 97677101 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97677169 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97677232 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97677426 C T Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 97677458 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 97677525 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 97677540 A C Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 97677564 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97677572 T G Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 97677945 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97678130 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97678251 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97678312 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97685547 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 97685634 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 97686031 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97686036 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97686364 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 97686588 T G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 97686637 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 97686638 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97686791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97686891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97687497 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97688351 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 97688863 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97689470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97689493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97690670 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97692129 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97692454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97692592 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97693367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97694446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97694562 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97694572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97696340 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 97696740 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97699586 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 97699782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97700003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97700048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97700506 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97700538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97701216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97701751 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 97701769 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 97701779 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 97701806 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 97701847 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97701986 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 97702600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97704164 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97704355 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97704651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97706393 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 97706887 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97707255 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97709031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97709534 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 97709591 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 97709776 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97709889 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97711090 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 97711238 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97711483 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97712183 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 97712186 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 97717145 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 97718771 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 97718874 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 97719255 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 97719350 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97719727 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 97720302 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97720430 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 97720539 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 97721187 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 97721901 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 97722016 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 97722592 T C Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 97724440 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97727234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97727532 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97727579 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97728018 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97728941 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97730237 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 2 97730243 G A Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 97730886 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97731230 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97733692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97733782 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97733848 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 97734429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97734964 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 97735353 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97743338 A T N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 97744232 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97744235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97744410 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 97744917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97746497 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 97746686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97746795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97747818 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97749832 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97750372 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97750373 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 97750780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97751085 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 97751451 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 97753428 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 97753620 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97754254 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 97754362 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 97754640 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97755413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97755734 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 97756651 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97756664 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 97757117 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 97757300 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 97757376 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97757445 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97757503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97758226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97758633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97758660 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 97758823 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 97759098 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 97759690 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97759700 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 97760873 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 97760875 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 97765786 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97765820 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97766033 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97768486 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 97770492 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 97776050 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97777102 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97777792 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97779655 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 97779745 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 97782051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97782453 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97782600 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97782785 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 97785192 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 97785337 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 97785520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97785556 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97786862 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 97786943 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97787788 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 97789416 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97789573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97789610 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 97790146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97790244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97790317 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97791512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97791537 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 97791928 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97792075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97792375 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 97792425 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 97792467 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 97793090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97793431 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97793538 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 97793548 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 97793556 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 97794047 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 97794484 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97794662 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97794695 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 97794701 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97795254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97795614 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97795675 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97795735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97795923 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97799699 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97800364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97800683 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97800811 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 97801332 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97802097 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 97802594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97802827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97802997 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97804353 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97805971 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 97806705 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 97806714 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97806830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97806869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97808381 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 97809000 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97810656 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97811944 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97812339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97812679 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97813822 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 97814415 C T Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 97814547 G A Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 97816890 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97817052 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 97817211 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97817431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97817909 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97819446 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 97820075 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97820099 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97820977 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 97821304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97821515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97821681 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97822551 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 97822640 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97823494 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 97823519 T G Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 97823887 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 97826041 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97827411 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97828348 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97828446 C T Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 97828881 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97828925 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 97829288 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 97829757 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97829793 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97829916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97830211 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97831484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97831637 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97831800 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97832013 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97832050 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97833839 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 97835390 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97835426 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97836667 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 97836679 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97836905 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97839153 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97839271 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97842099 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97842947 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 97843214 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 97843738 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 97844847 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 97846605 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 97848742 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97848923 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97849307 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 97849768 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97849989 T A Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 97850114 C A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 97850917 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 97851350 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 97851381 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 97852175 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 97852472 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 97852767 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 97854246 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97855200 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97855896 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 97856939 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97857596 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97857657 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97857707 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97858237 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97859935 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 97860236 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97860476 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97860909 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 97861915 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 97862480 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 97863081 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 97863433 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 97866129 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97866375 C G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 97867952 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97868494 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97870299 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97870304 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97871477 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97872488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97872737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97873321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97873541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97873936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97874088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97874541 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97874848 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97875444 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97876070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97876407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97876671 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 97877103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97877212 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97877347 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 97878702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97879163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97879463 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 97879476 A C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 97881190 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97881308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97881496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97881588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97883848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97884247 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97884953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97884992 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97885641 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 97885813 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97885903 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97886279 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97886471 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97886600 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 97887537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97888142 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97888181 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 97888872 C G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 97889134 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 97889316 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97890017 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97890146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97891047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97892223 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97892321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97893359 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97893966 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 97894274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97894663 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97895102 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97895545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97899452 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 97899668 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97899742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97901048 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 97901570 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97902310 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 97902935 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 97904348 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 97904946 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97905146 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 97905257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97905654 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 97906675 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97907367 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 97907973 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 97908497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97909766 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 97910937 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 97910999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97911050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97911112 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 97911136 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97911285 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97911409 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 97911759 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 97912152 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97912186 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 97912894 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 97913021 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97913514 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97914264 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 97914880 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 97914936 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97916311 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 97918555 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 97918627 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 97918996 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 97919180 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 97920819 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97921073 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 97921127 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97921271 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97921310 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 97921629 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 97923697 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 97923718 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97923749 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 97924322 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97924444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97925241 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97925442 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97925865 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 97926384 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97926877 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97927664 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97927697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97928132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97928564 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97928699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97928789 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97928908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97929567 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97930754 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97931154 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 97931305 C G Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 97931404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97931954 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 97932380 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97932593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97932684 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 97933169 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97933369 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 97933814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97933898 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97934342 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97934948 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97936052 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 97936367 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 97936421 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 97937096 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 97937683 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 97937948 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97938065 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97938180 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97939018 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97939423 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97939746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97939876 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97940103 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97940394 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 97940857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97940989 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 97942050 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97942230 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 97942456 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 97942465 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 97942470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97942563 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 97943077 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 97943212 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 97943609 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 97943711 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 97945615 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97945940 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97946167 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 97946240 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97946533 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 97946755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97947406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97948512 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97948603 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97948672 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97948750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97950624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97951453 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 97951740 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 97952490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97953265 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 97953824 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 97953874 G A Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 97954391 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97954527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 97955237 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 97955504 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 97956202 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97961545 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97961935 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 97962092 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 97963034 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 97963811 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 97965587 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 97966130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 97967174 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97967983 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 97969315 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 97969344 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97975698 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97975754 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 97976107 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 97976319 C A Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 97976362 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 97976378 A G Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 97976379 T C Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 97976886 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 97977038 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 97977381 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97977545 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 97977863 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97978448 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 97978727 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 97979058 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 97979108 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97979463 T G Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 97979672 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 97980489 T G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 97981315 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 97981548 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 97983815 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 97984646 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 97988639 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 97989948 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 97991325 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 97991604 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 97991878 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 97991889 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 97992194 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 97992262 A C Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 97992474 A C Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 2 97993097 T C Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 97993207 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 97994642 T A Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 97995830 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 97996344 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 97996718 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 97997485 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 97998448 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 97999728 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 97999973 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 97999974 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 98000220 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98000302 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98004477 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 98004799 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 98005623 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 98005663 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 98006074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98006749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98006785 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 98007786 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 98008625 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 98009596 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98009826 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98011499 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98011542 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98014213 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 98016704 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 98019435 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98020955 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 98021103 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98021974 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 98023161 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 98023482 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 98023817 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98024458 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98024484 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98026285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98026751 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 98027269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98027441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98028377 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98028554 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98030270 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98036970 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 98038317 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98040821 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 98044916 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98046250 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 98051474 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98052787 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 98053590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98053689 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98056555 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98057597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98058317 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98058694 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98060738 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 98060828 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98062436 T G N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 98062877 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98064444 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98064567 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98065299 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98066180 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98070517 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 98071083 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98071524 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 98072619 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98072797 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 98073143 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 98073239 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98073573 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98073645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98074261 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98079571 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98080005 A C Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 98081548 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 98081955 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 98083055 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98084074 G T Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 98086249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98086601 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98088318 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 98089278 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98089544 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98091203 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98091527 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 98091791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98092260 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 98092279 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 98092508 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98092554 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98092708 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 98093497 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98094168 C T N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 98094337 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 98094412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98097753 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 98097949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98098900 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 98100247 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 98101297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98102039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98103671 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 98104421 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 98105824 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98106045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98106770 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98107791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98108945 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 98109111 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98109153 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98109737 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 98110697 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98110736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98112015 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 98112093 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98112327 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98112429 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98113144 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 98115633 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 98116106 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 98116276 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98116827 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98119048 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 98119271 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 98119335 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98119793 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98119879 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 98120201 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 98120251 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98122138 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98122180 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98123650 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98123926 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 98124743 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98125714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98126100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98126374 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98126379 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98126799 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98127785 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98128183 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98128185 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98128410 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98128773 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98128980 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98129153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98129638 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 98130400 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98131168 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98131532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98131968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98131969 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98132702 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98133153 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98134340 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98134495 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98134622 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98135241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98135314 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98135657 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98135865 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98141024 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98141187 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98141531 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98141600 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98141939 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98142087 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98142201 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98142693 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98143328 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98144078 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98144304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98145297 T G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 98145496 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98145953 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98146184 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 98146196 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98146399 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 98146443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98146475 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 98146520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98146697 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 98147115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98155377 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 98156045 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98156232 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98156932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98157275 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98157281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98157416 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 98157725 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98157922 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98158178 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98158541 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98158608 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 98159051 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98159693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98159750 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98160311 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98161345 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98162775 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98163202 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98163456 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98163959 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98165499 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98165696 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98166488 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98166777 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98167681 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98169213 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98169635 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98170112 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98170359 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 98171078 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 98171155 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 98171188 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98171425 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98171576 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98172642 T A Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 98172653 G C Y N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 98172771 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 98173624 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 98174027 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 98174035 A T Y N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 2 98174201 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 98174361 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 2 98174478 A T N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 98174607 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98174857 C A Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 98174888 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 98176040 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 98176103 C T Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 98177601 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 98178112 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98178507 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98179424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98179513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98179934 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98179988 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98180372 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98180735 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98180860 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98181170 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 98181458 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98181798 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98182057 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98182700 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98182968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98183907 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98183981 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98183994 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98184345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98185021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98185791 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98187303 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98187304 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 98188567 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98188882 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98191759 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98192299 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98192888 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98193105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98193140 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 98194409 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98194476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98195142 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98197350 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98197559 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98197749 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98199900 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98200286 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98201222 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98205588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98205710 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98206280 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98207642 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98209605 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98210189 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98210278 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 98210459 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98210712 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98211145 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98211294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98214678 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98214899 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 98215316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98215572 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98217775 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98217789 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98217897 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98218329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98218721 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98219506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98222670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98222850 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98223421 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98230033 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 98230721 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98230780 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98231136 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 98231362 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98232077 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98232242 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98232695 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98233514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98234329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98235044 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98235323 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98235365 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98239718 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98240612 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98241211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98241735 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98242640 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98242923 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98243402 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98243592 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98244060 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98244618 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 98245342 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98247161 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98247632 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98256229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98256411 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98256508 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98256666 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98257897 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98260260 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98260309 C G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98262034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98262480 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98265190 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 98268032 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98276247 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98276573 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98277144 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98277908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98279225 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98279741 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 98281173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98282516 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98282992 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98283876 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98285326 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98286269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98286532 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98291132 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98292279 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98292524 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98294993 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98295120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98295661 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98297192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98298074 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98299343 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98300198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98300696 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98300967 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98301438 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98301904 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98303517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98303796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98304624 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98304986 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98305548 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98305771 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98306872 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98310183 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98311054 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98312068 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98313300 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98314124 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98314882 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98316391 A C N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 98317770 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98318361 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98318501 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98320801 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98321164 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98321850 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98321919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98322991 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98323082 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98323104 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98323111 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98323175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98323199 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98323232 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98323258 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98323335 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 98323393 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98323573 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98323650 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98325168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98325545 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98328635 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98330379 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98330392 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98330683 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98330720 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98330984 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98331164 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98331907 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98332364 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98332615 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98333268 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98333483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98334004 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98334195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98334908 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98335781 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98335848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98336633 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98337457 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98338152 G C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 98339024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98339073 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98341120 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98341121 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98341787 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98341950 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98342318 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98342766 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98342862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98344482 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98344936 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98345816 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 98346720 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98347665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98347841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98347925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98348087 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98349109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98349238 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98349475 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98349578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98349730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98349803 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98349869 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98350252 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98351665 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98352056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98352857 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98352901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98353249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98353367 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98353383 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98353786 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98355172 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98356346 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98357915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98358449 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 98359058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98359059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98359733 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 98359958 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98360773 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98361082 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98361321 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98362373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98364179 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 98364458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98365337 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98365877 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98367485 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98367503 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98368053 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98368644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98369160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98369165 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98369302 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98369990 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98370571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98370805 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98371063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98371983 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98372214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98372306 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98373392 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98373810 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98373917 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98374026 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98374034 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98374426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98374434 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98374465 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98374516 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98374638 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98374670 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98374736 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98374738 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98374758 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98374765 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98374954 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98374985 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98374991 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98375046 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98375337 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98375514 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98375577 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98375589 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98375601 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98375683 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98375684 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 98375790 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98375792 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98375834 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98375854 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98375864 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98375903 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98375961 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98376002 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98376043 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98376187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98376219 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98376362 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98376389 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98376542 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98376677 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98376726 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98377014 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98377093 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98377203 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98377223 A C Y N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 2 98377272 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 98377317 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 98377323 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98377336 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98377608 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98377700 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98377759 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98377791 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98377796 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98377810 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98377832 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98377872 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98377974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98378017 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98378028 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98378088 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98378180 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98378210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98378233 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98378263 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98378286 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98378313 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 98378365 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98378434 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98378865 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98378880 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98378912 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98378953 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98378976 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98378980 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98379046 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98379280 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98379478 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98379699 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98379727 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98379918 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98379981 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98379982 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98380033 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98380058 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98380095 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98380229 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98380385 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98380416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98380443 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98380739 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98380843 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98380916 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98381095 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98381164 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98381168 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98381360 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98381824 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98381958 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98382036 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98382174 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98382310 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98382325 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98382326 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98382394 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98382568 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98382758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98383081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98383137 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98383154 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98383185 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98383219 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 98383311 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98383320 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98383514 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98383594 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98383689 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98383707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98383719 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98383757 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98383855 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98383865 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98383875 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98383894 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98384274 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98384379 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 98386052 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98386064 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98386157 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98386201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98386287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98386290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98386645 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98386766 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98387257 T A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98387302 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98387352 G C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98387442 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98387580 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98387587 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98387663 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98387664 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98387727 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98387789 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98387806 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98387853 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98387948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98387978 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98387986 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98388065 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98388082 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98388145 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98388183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98388536 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98388756 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98388839 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98388861 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98388899 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98389052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98389076 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98389118 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98389174 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98389253 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98389289 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98389381 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98389596 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 98389607 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 98389677 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98389865 T G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 98390073 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98390102 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98390136 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 98390211 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98390233 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98390269 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98390292 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 98390414 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 98390540 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98390584 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98390654 C A Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98390767 A G Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 98390784 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98391002 A C N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 98391020 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98391047 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98391203 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98391312 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98391423 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98391499 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98391591 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98391660 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98391703 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98391706 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98391754 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98391840 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98391959 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98392066 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98392144 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98392265 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98392306 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98392326 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98392570 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98392751 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98392868 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98392888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98392987 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98393008 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98393051 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98393108 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98393202 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 98393419 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 98393422 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 98393583 G C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 98393653 G T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 98393908 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 98393911 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 98393938 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98393974 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98394027 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98394119 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98394179 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98394214 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98394223 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98394256 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98394309 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98394353 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98394436 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98394753 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98394764 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 98394777 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98394885 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98394910 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98394913 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98394968 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98394998 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98395150 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98395164 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98395166 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98395294 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98395356 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 98395412 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 98395452 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 98395600 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98395606 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98395615 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98395640 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98395670 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98395768 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98395782 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98395866 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98395896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98395931 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98395977 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98396636 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98396996 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98397100 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98397317 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98397783 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98397797 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98398028 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98398151 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98398167 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98398699 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98398904 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 98398916 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98398920 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98398950 A G Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 98399612 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98400545 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98400727 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98400777 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98400784 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98400880 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98401297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98401376 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98401498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98401585 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98401713 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98401906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98402109 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98402152 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98402343 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 98402569 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98402629 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98403038 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98403093 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98403349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98403511 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98403848 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98403975 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98404158 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98404441 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98404508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98404576 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98404641 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98404803 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98404830 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98404835 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98404957 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98405059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98405222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98405239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98405530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98405590 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98405610 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98405846 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98405868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98405886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98405926 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98406116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98406290 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98406376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98406501 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98406763 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98406793 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98406901 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98406912 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98407057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98407418 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98407772 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98407775 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98407784 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98407790 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98407845 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98407870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98407931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98407940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98407944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98407956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98407983 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98407987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98408024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98408072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98408073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98408114 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98408124 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98408302 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 98408403 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98408520 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98408608 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98408706 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98408722 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98408807 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98408864 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98408873 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98408958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98409008 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98409320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98409336 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98409519 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98409540 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98409590 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98409626 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98409651 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98409707 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98409724 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98409839 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 98409871 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 98409911 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 98409919 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 98409935 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98410187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98410262 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98410316 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98410317 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98410343 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98410401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98410440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98410642 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98410746 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98410760 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98410765 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98410839 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98411123 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98411329 G C Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 2 98411405 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98411421 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98411622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98411719 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98412045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98412054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98412114 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98412148 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98412239 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98412334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98412370 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 98412371 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 98412387 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 98412641 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98412787 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98412847 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98412859 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98412999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98413122 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98413309 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98413500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98413614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98414100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98414115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98414300 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98414545 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98414616 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98414658 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98414755 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98414800 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98415013 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98415053 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98415376 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98415419 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98415426 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98415503 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98415591 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98415630 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98415671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98415696 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98415709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98415739 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98416045 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98416112 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98416205 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98416280 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98416615 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98416736 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98416792 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98416876 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98416926 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98416987 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98417094 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98417188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98417262 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98417348 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98417476 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98417597 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98417665 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98417808 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98417964 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98418114 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98418217 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98418305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98418361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98418376 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98418387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98418397 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98418434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98418443 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98418477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98418546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98418555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98418572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98418595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98418913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98418926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98418966 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98419123 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 98419257 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98419359 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98419411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98419490 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98419505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98419614 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98419721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98419827 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98419843 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98419889 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98420055 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 98420069 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98420077 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98420172 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98420190 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98420221 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98420254 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98420403 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98420559 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98420795 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98420805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98420815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98420842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98420897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98421035 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98421337 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98421430 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98421493 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98421681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98421701 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98421978 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98422174 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98422177 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98422330 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98422422 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 98422621 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 98422622 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 98422836 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98423229 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98424030 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 98424038 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98424097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98424722 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98424774 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98425054 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98425171 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98425179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98425208 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 98425255 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 98425781 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98425905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98426103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98426119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98426315 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 98426505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98426679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98426683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98426714 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98426723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98426891 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98427010 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98427052 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98427173 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 98427197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98427273 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 98427355 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98427600 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98427661 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98427809 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 98427856 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98427885 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98427922 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98427958 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 98428021 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98428032 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98428173 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98428197 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98428509 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98428608 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98428787 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98429178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98429207 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98429292 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98429502 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98429590 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98429652 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 98429687 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98429702 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98429732 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98429757 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98429895 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98429935 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98429974 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98430446 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98430523 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98430577 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98430583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98430596 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98431064 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98431195 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98431226 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98431379 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98431380 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98431390 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98431422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98431507 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98431620 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98431855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98431978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98432050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98432059 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98432248 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 98432281 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98432412 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 98432437 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 98432468 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98432550 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98432559 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98432718 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98432736 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98432739 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98433009 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98433024 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98433217 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98433281 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98433318 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98433406 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98433429 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98435016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98435097 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98435108 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98435239 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98435278 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98435447 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98435481 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98435599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98435635 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98435728 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98435745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98435760 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98435880 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98435963 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98436084 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98436144 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98436211 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98436439 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98436887 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 98437241 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98437246 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98437421 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98437553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98437822 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98437848 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98437876 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98437977 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98438625 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98438634 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98438637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98438676 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98438803 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98438974 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98439014 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98439299 T G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 98439804 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 98439864 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98439944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98439993 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98440685 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98441140 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98441360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98441480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98441585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98441665 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98441667 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98441721 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98441794 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98441800 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98442457 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 98442641 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98442908 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98443084 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98443231 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98443290 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98443331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98443541 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98443585 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98443625 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98443909 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98444032 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98444138 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98444333 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 98444407 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 98444491 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98444500 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98444543 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 98444574 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 98444667 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98444847 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98444915 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98444976 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98444995 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98445028 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98445105 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98445136 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98445149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98445292 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98445366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98445430 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98445440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98445466 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98445501 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98445517 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98445565 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98445666 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98445672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98445759 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98445909 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98445921 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98446013 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98446058 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98446099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98446101 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98446260 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 98446286 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98446369 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98446462 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98446501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98446762 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98451941 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98452486 T G Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 98452698 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98452728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98452814 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98452821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98452884 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98453348 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98453506 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98453694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98453780 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98453791 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98453938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98454027 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98454050 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98454213 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98454325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98454329 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98454413 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98454440 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98454496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98454614 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98454770 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98454799 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98454872 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98454960 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98454998 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98455203 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98455440 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98455567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98455753 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98455769 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98455798 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98456069 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 98456101 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 98456355 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 98456541 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98456594 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98457336 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98457568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98457651 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98457676 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98457708 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98457732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98457905 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98458057 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98458090 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98458221 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 98458225 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 98458245 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98458799 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 98458949 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98458982 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98459104 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98459323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98459326 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98459338 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98460164 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98460391 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98460519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98460601 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98460728 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98460877 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98460881 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98460974 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98461081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98461160 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98461236 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98461333 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 98461353 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98461370 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98461393 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98461603 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98461636 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98461666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98461676 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98461785 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98462011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98462080 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98462133 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98462171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98462172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98462195 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98462266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98462276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98462427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98465318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98465360 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98465386 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98465417 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98465543 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98465599 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98465768 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98465777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98465823 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98465833 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98465858 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98465881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98465898 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98465916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98465949 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98466060 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98466065 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98466120 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98466247 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98466314 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98466357 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98466377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98466481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98466507 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98466520 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98466616 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98466694 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98466696 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98466757 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98466809 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98466864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98467151 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 98467154 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98467414 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98467424 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 98467439 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 98467453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98467460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98467601 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98467612 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98467713 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98467714 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98467775 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98467907 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98467988 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98468093 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98468104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98468195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98468622 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98468718 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98468738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98468777 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98468824 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98468832 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98468850 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98469064 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98469070 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98469220 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98469359 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98469465 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98469690 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98469787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98469813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98469842 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98469847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98469874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98469881 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98469906 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98469933 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98470091 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98470262 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98470303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98470326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98470376 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98470425 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98470479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98470837 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98470893 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98470926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98470968 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98470995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98471030 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98471155 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98471222 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98471227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98471266 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98471334 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98471338 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98471422 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98471432 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 98471469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98471493 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 98471721 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98471802 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98471837 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98471984 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 98471995 C G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 98472165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98479036 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98479059 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98479107 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98479159 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98479242 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98479254 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98479294 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98479310 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98479392 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98479428 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98479455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98479474 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98479483 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98479487 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98479584 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98479650 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98479672 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98479685 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98479713 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98479828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98479869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98479897 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98479904 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98480022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98480059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98480077 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98480085 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98480089 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98480334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98480468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98480912 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98480961 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98480991 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98481090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98481159 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98481174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98481752 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98481797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98481936 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98482172 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98482226 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98482334 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98482392 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98482396 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98482446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98482626 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98482694 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98482728 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 98483069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98486041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98486187 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98486262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98486480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98486657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98487601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98488172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98488614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98488825 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98489896 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98491530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98491848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98492419 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98492613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98493172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98493382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98497046 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98497627 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98498029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98499240 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98510521 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98511325 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98512049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98512780 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98513154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98513166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98513235 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98515681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98516798 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98519032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98519263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98519647 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98521136 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98522191 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98522357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98522924 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98523460 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98524193 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98524500 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98524855 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 98525267 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98525476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98526875 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98526976 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98527343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98527452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98528345 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98528883 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98529219 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98530876 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98530975 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98531005 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98531785 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98532100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98532144 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98532473 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98533365 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 98533379 A T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 98533725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98533893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98534121 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98534321 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98534878 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98536747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98537058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98538146 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98538150 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98538341 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98538529 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98538938 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98540159 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98540463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98541523 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98542355 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98542570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98542670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98542674 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98542690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98542887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98543792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98545840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98545961 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98546868 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98547666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98547936 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98548623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98549064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98549367 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98550224 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98550364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98550459 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 98551280 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98551343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98551439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98553249 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98553345 T A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 98553465 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98553619 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98553809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98554676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98555034 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 98555143 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98555359 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98555688 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98556640 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98557781 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98559585 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98560116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98560229 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98560783 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98562077 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98569858 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98570062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98570244 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98570815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98571056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98571438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98571887 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98572598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98572879 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98573050 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98573209 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 98573333 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98573387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98573973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98574181 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98574615 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98574649 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 98574713 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98574788 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98574901 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98575019 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98576494 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 98577862 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98577868 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98577932 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 98578726 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 98578804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98578841 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98579467 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98580108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98581723 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98581949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98582521 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98582711 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98584159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98584191 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98586770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98587332 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98587361 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98589102 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98589145 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98589451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98590159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98590224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98590339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98590522 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98591011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98591254 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98591377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98591771 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98597466 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 98597487 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 98598573 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98598616 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98598892 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98599098 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98599393 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98599535 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98600176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98601362 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 98601392 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98602036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98602905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98603307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98603940 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98611787 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98613178 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98615847 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98616249 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98617544 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98617804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98618723 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 98618868 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98619208 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98619247 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 98619489 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98619848 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98620049 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98620190 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98622464 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98625326 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98625856 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98626544 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98627781 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 98628734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98629081 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98630384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98630553 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98631426 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98631764 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98631935 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98632961 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98633302 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 98633586 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98633610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98633921 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98634105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98635323 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98642296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98642987 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98643852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98645030 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98645268 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98645472 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 98645484 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.133333333333333 0.8 0.0666666666666667 16 14 2 12 1 2 98646339 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98647608 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98647992 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98648203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98648350 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98648866 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98648969 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98649542 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98650026 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98650218 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98650471 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98650609 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98650668 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98650677 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98650944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98651279 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98651332 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 98651375 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98651575 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98651613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98651644 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98651665 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98651713 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98651736 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98651749 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98651784 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98651818 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98651838 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98651857 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98651984 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 98652127 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 98652138 C A Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 98652220 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 98652242 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98652484 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98652549 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98652557 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98652629 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98652657 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98652708 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98652748 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98652834 T A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 98652928 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98652929 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98652942 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98653000 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 98653200 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98653232 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98653352 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98653371 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 98653376 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98653411 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98653454 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98653496 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98653866 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98653928 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 98653940 G T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 98654098 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98654240 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98654276 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98654391 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98654422 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98654435 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98654535 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98654601 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98654784 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98654949 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98654972 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 98655035 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98655055 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98655110 C G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 98655115 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 98655134 T A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 98655140 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 98655151 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 98655200 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98655208 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98655259 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98655304 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98655348 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98655366 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98655416 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98655490 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98655492 G C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98655548 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98655565 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98655634 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 98655676 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 98655748 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 98655812 A C N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 98655822 T C N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 98655841 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 98655860 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 98655884 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 98655902 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 98655946 C A Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 98655993 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98656058 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98656077 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 98656095 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98656144 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98656178 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98656208 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98656234 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98656262 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98656321 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98656341 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 98656392 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98656397 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98656499 T C Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 98656704 G A Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 98656813 C T Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 98656917 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 98656954 T A Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 98657044 G A Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 98657193 G T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 98657194 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 98657207 T C N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 98657214 T A N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 98657286 A G N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 98657310 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 98657319 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98657408 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98657423 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98657426 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98657467 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98657581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98657611 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98657733 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98657747 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98657775 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98657782 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98657833 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98657843 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98657930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98657943 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98657958 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98657970 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98657993 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98658029 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98658173 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98658227 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98658300 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98658371 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98658455 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98658648 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98658744 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98658908 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98658910 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98658938 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98659041 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98659361 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98659371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98659428 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98659529 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98659549 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98659582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98659607 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98659664 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98659803 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98660209 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98661848 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98661975 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98663221 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98664548 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98664634 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98664805 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98664869 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 98665469 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98665511 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98665710 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98665916 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98666027 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 98666214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98666674 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98667720 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98667777 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98667799 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 98668087 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98668884 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98669327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98669942 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98670458 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 98671003 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 98672775 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98673510 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98674228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98676771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98677795 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98679207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98680146 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98682037 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98682248 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98682901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98683828 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98683829 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98684004 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98685660 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98685852 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98686787 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98687187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98688183 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98690166 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98690205 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98690946 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98692724 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98693092 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98693142 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98693207 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98695507 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98695663 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98696416 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98696944 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98697207 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98697352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98699520 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98700571 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98701207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98701378 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98705669 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98705688 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98705873 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98705995 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98706055 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98706092 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98706093 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98706311 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98706344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98706391 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98706636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98706874 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98706875 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98707073 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98707311 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98707413 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98707499 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98707564 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98707582 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98707674 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 98707703 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98707762 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98707887 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98707892 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98708582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98708764 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98709002 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98709093 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98709106 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98709140 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98709239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98709366 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98709402 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98709473 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98709670 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98709851 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98709881 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98709932 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98709995 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98710117 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98710257 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98710262 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98710297 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98710449 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98710479 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98710497 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98710525 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98710635 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98710666 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98710842 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98710847 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98711100 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98711291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98711340 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 98711341 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 98711373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98711403 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98711448 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98711460 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98711483 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98711581 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98711597 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98711608 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98711655 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98711673 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98711945 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98711972 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712074 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712141 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712184 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712258 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712301 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712303 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712399 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712430 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712520 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712601 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98712961 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98712999 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98713100 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98713182 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98713190 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98713856 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98713946 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98713957 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98714109 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98714175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98714222 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98714248 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98714318 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98714322 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98714355 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98714373 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98714440 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98714447 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98714489 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98714688 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98714770 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98714772 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98714814 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98714875 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98714932 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98714949 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98715081 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98715084 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98715120 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 98715208 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98715396 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 98715551 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98715630 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98715651 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98715670 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98716163 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98716271 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98716314 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98716403 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98716436 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98716913 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98717891 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 98718477 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98718906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98718945 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98718999 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98719247 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98719330 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98719569 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 98719661 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98719690 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 98721039 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98721998 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 98722134 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98722172 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 98722515 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 98722562 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98722569 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98722783 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98722880 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98723090 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98723107 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98723686 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98723767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98723794 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98723857 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98723946 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98723984 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98724005 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98724063 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98724113 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98724129 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98724166 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98724176 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98724195 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98724228 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98724257 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98724380 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 98724419 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98724431 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98724461 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 98724486 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 98724580 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98724591 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98724703 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98724820 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 98724829 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 98724847 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98724852 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98724928 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98724935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98724980 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98725002 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98725026 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98725047 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98725234 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98725293 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98725362 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98725386 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98725419 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98725452 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98725457 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98725474 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98725482 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98725497 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98725622 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98725642 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98725791 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98725831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98725841 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98725912 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98725913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98725935 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726056 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726057 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98726069 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726080 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726098 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98726154 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726166 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726186 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726260 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726264 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726347 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726363 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726391 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726411 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726434 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726792 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98726863 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726870 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726881 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726895 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98726933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98726941 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98726954 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98727311 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98727991 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98728167 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98728177 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98728855 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98730160 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98730412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98730732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98731011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98731212 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98732124 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98732146 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98732392 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98732558 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98734005 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98734105 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98734279 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98734563 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98735270 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98735431 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98735825 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98735984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98736022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98737249 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98738023 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98738474 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98738668 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98738775 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98738976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98739954 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 98740269 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98741760 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98742181 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98742349 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98742554 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98742613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98742886 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98743099 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98744138 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98744796 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98744815 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98744824 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98745091 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98745129 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98745176 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98745254 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98745353 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98745560 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98746198 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98746352 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98746433 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98746500 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98747466 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98747918 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98748817 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98749142 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 98749454 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98749455 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98749781 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98750118 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98750279 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98750469 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98751164 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 98751639 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98751832 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98752566 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98753802 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 98754976 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98755111 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98755756 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 98756339 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98759470 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 98759551 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98759652 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98761262 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98763609 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98763908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98763935 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 98764534 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98764603 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 98764795 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98764972 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98765363 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98765453 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98765475 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98765484 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98765528 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98765663 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98765727 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98765987 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98766389 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98766610 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98766864 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98767000 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 98767624 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98767769 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98768145 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98769748 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 98769977 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98770078 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98770124 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98770268 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98770353 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98770360 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98770369 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98770541 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98771121 T G N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 98771557 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98771579 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98771672 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98771759 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98772045 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98772057 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98772307 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98772479 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98772532 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98772549 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98772567 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98772594 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98772756 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98773828 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98773864 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98774000 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98774093 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98774360 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 98774479 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 98774655 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98775025 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98775111 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98775522 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98775531 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98775569 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98775718 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98776143 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98776263 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98776312 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 98776722 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 98776726 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98776933 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98776980 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98777236 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98777239 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98777323 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98777403 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98777429 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98777497 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98777543 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98777662 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98777687 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98777691 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98777784 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98777855 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98778018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98778089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98778115 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98778234 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98778292 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98778293 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98778377 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98778424 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98778519 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98778547 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98778557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98778558 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98778613 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98778774 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98778803 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98778891 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98779033 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98779037 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98779103 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98779133 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98779153 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98779189 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98779194 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98779235 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98779288 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98779320 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98779346 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98779604 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98779635 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98779681 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98779692 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98779706 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98779775 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98779801 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98779809 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98779873 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98780113 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98780221 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98780279 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98781294 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98781804 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98781817 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98781838 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98781890 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98782340 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98782803 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98782878 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98783106 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98783183 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98783192 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98783436 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98786586 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98786640 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98786682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98786834 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98786910 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98787189 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98787789 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98787832 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98787984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98788067 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98788845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98789839 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98789944 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98790387 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98790529 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98791363 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98791622 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 98791776 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98791814 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98791846 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98791861 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98791872 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98791957 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98791978 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98792003 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98792015 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 98792246 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98792255 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98792257 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98794216 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 98794234 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 98794255 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98794472 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98794490 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98794601 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98794616 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98794627 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98794665 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98794731 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98795134 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98795253 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 98796281 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98796593 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98797939 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98797991 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98798226 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98798607 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98798843 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98799613 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98800036 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98800343 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98800899 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98801199 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98801225 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98801344 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98801512 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98801544 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98801616 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98801701 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98801732 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98801958 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98802129 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98802441 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98802462 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98802920 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98803100 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98803535 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98803700 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98803917 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98803948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98804086 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98805160 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98806345 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98806378 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98806421 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98806669 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98806746 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98806768 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98807167 C G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98807231 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 98807487 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 98807767 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98807820 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98808041 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98808107 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98808236 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 98809173 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98809243 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98810137 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98810183 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98810207 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98810233 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98810311 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98810463 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98810475 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98810725 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98810877 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 98810961 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98811061 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98811209 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98811278 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98811344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98811462 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 98814643 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98814869 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 98815319 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98815509 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98815633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98815826 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98816013 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98816394 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98816454 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 98816502 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98816858 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98817337 C A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 98818259 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98818381 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98818414 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98818579 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98818616 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98818686 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98818832 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98818846 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98818994 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98819059 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98819298 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98819417 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98819512 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98819582 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98819722 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98819789 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98819867 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 98819961 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98819972 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98819976 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 98820020 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98820067 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 98820081 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 98820106 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 98820342 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 98820469 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98820484 T C Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 98820708 T C Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 98820879 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98820902 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98820913 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98820926 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98820956 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98821087 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98821136 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98821148 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98821160 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98821163 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98821223 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98821224 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98821237 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98821378 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98821417 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98821423 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 98821482 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98821504 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98821555 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98821573 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98821631 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98821657 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98821674 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 98821841 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98821844 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98821869 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98821911 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 98821959 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 98822082 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98822102 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98822438 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98822484 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98822568 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 98822942 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98823033 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98823041 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98823049 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98823241 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98823356 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98823359 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98823445 G T Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 98823452 G T Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 98823520 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98823560 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98823635 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98823761 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 98823854 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98823946 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98824045 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98824060 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98824174 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98824215 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 98824238 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98824590 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98824670 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98824707 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98824734 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98824781 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98824837 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 98824898 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98825000 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98825081 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98825250 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98825274 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98825579 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98825616 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98825622 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98825761 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98825818 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98825838 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98825922 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98826101 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98826251 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98826274 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98826309 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98826340 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98826368 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 98826486 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98826663 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98826701 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98826708 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98826729 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98826736 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98826780 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98826963 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98827044 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98827071 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98827098 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98827130 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98827134 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98827147 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98827241 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98827347 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98827554 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 98827608 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 98827611 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98827746 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98827916 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 98828336 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98828367 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98828413 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 98828596 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 2 98828619 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 98828701 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 98828702 A G N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 98828715 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 98828751 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 98828759 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 98828853 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98828997 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98829075 G T N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 98829097 G T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 98829214 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98829262 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98829286 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98829351 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98829400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98829466 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98829488 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98830261 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98830281 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98830531 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98832306 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98832575 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 98832591 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98832948 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98833100 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 98833199 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98833611 A T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 98833723 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98833947 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 98833998 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98834055 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98834491 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98834546 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 98834808 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98834930 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98835020 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98835025 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98835342 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98835471 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98835502 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98835511 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98835545 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 98835688 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98835824 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98836374 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98836689 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98836861 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98837209 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98837219 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98837340 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98837721 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98837991 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98838195 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98838327 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98838370 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98838731 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98839829 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98839898 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98840390 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 98840519 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 98840925 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98841118 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98841176 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98841863 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98842285 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98842390 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98842391 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98842745 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98842922 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98843149 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98843170 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98843352 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98843546 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98843703 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98843779 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98844460 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98844529 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98844638 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98844640 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98844746 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98844773 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98844776 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98845240 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98845246 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98845443 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98845768 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98845894 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98846225 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98846251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98847042 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98847352 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98847586 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98847591 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98847986 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98848012 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 98848025 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98848572 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 98848834 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98849135 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98849916 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98849929 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98850326 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98850482 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98850711 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 98851320 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 98851600 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98851768 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98852109 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98852413 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98852640 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98852681 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98852692 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98852705 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98853133 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98853145 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98853152 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98853161 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98853329 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98853445 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98853498 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98854442 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98854586 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98854616 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98854722 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98854868 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98855070 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98855090 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98855209 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 98855265 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98855296 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98855458 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98855629 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98856025 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98856519 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98856723 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 98856841 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98857341 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98857453 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98857832 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 98858608 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98858795 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98858949 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98859064 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98859215 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98859324 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98859435 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 98859468 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98859531 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98861182 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 98861358 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98861378 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 98861404 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 98861405 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98861508 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98861533 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98861745 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98862036 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98862355 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98862479 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98862495 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 98862803 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98863116 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 98863203 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98863293 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98863552 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 98863864 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98864254 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98864551 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98864612 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98864731 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98864943 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98864959 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98864972 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98865084 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98865166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98865228 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98865470 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 98865585 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 98865684 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98865697 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98865754 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98866016 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 98866056 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 98866124 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98866155 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98866218 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98866271 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98866322 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98866474 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98866840 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98867420 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98867642 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98868121 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98868237 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98868377 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 98868533 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98868538 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98868563 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 98869240 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98869269 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98869375 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98869445 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98869525 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98869840 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 98871796 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98871800 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98871964 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98872009 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98872191 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98872204 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98872265 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98872455 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98872499 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98872600 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98872758 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98872843 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98873121 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98873150 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98873258 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98873349 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98873760 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98873770 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98873836 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98873844 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98874177 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98877002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98877468 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98877516 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98877798 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98877899 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98877929 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98878120 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98878449 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98878778 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 98878800 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 98879932 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98879958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98880129 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98881062 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98881095 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98881103 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98881122 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 98881253 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 98881351 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98881434 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98881491 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 98881524 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98881615 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 98881652 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98881654 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98881679 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98881713 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98881723 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 98881749 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98881808 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98881897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98881996 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98882009 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98882075 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98882169 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98882195 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98882242 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98882263 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98882296 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98882342 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98882492 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98882520 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98882551 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98882620 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98882716 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98882755 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98882849 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98882965 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98883064 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98883092 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 98883103 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 98883212 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 98883259 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98883267 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98883289 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98883307 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98883319 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98883389 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98883412 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 98883519 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98883527 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 98883646 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 98883657 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 98883668 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 98883694 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 98883727 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 98883761 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 98883786 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98883864 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 98883926 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 98883939 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 98884015 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98884069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98884095 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98884258 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98884273 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98884295 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 98884494 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 98884525 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 98884553 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 98884581 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98884660 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98884662 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98884673 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98884683 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98884728 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 98884749 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 98884769 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98884784 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98884799 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98884816 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98884831 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98884856 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98885004 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98885037 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98885120 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 98885159 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98885188 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98885239 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98885269 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 98885546 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98885549 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 98885665 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98885703 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98885849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98885883 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98885903 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 98885916 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 98885941 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98885961 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98886022 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98886164 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98886394 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98887149 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 98887160 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98887448 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98887597 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98887629 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 98887726 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 98887767 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98887781 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 98887965 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98888001 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98888037 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98888040 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98888122 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98888128 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98888133 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98888178 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98888200 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98888226 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98888234 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98888247 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 98888321 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98888322 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98888355 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98888458 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98888554 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 98889172 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 98889174 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 98889225 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98889234 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 98889447 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 98889677 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98889769 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98889771 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 98889865 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98890516 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 98890530 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 98898851 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98898877 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98898902 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98899042 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98899060 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 98899080 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 98899137 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 98899222 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98899223 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 98899282 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 98899299 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 98899347 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98899498 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98899702 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98899760 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98899808 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98899817 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98899865 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98899924 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98899930 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98899953 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98899998 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98900043 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 98900048 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 98900131 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98900150 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 98900185 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98900194 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98900210 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98900371 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 98900438 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 98900477 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 98900614 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98900711 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98900765 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98900869 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98900988 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98901078 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 98901225 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98901242 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98901277 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98901304 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98901423 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98901434 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98901450 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98901758 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 98901801 T G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 98901923 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98901957 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 98902009 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 98902060 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 98902153 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 98902160 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 98902169 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 98902193 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 98902213 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 98902215 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 98902345 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 98902411 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98902432 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98902474 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 98902516 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98902565 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 98902570 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 98902578 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 98902663 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98902699 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 98902726 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 98902807 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98902809 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98902820 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98902859 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98902890 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98902908 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98902909 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98902981 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98903069 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 98903138 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98903279 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98903360 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 98903431 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98903476 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98903504 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 98903510 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 98903659 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 98903694 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 98903760 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 98903935 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98903937 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98904021 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 98904077 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98904221 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98904331 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 98904483 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 98904664 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98904846 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 98904899 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 98904903 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98905424 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98905438 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98905439 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98905522 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98905524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98905602 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 98905634 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98906032 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98906066 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98906315 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98906324 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98906361 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98906407 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98906418 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98906445 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98906460 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98906517 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98906555 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98906688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98906715 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98906819 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98906967 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98907039 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 98907081 T A N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 98907374 G C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 98907383 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 98907398 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98907414 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 98907432 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 98907691 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 98907813 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 98907864 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98907880 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98907894 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 98908048 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98908092 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98908196 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 98908230 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98908413 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 98908526 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98909068 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 98909096 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98909273 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98909292 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98909394 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98909449 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98909452 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 98909588 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 98909652 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98909985 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98910090 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98910227 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98911040 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98911075 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98911136 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 98911161 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98911316 T A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 98911359 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 98911419 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 98911447 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 98911536 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98911736 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98911840 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98911867 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98912000 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98912016 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 98912069 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98912120 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98913069 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 98913266 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98913498 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98914793 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 98915517 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98915724 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 98915812 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98916510 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98916573 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98917011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98917069 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98917438 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98917686 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98917783 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98918059 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98918257 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98918384 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98918477 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98918682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98918714 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98919208 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 98920161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98920230 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98920526 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98920551 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98920964 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98921939 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98922338 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98922364 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 98923136 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98923459 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98923561 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98923676 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98924257 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98924382 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98925723 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98925728 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98925841 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98926351 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98927084 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98927350 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98929988 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98930741 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98930803 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98931913 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98933180 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98934883 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98938143 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98938643 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98939126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98939190 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98939597 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98940329 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98941188 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98941554 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 98941592 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98941768 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98942409 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98945380 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98947586 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98947871 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98949591 A G N Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 98949853 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98949990 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98950596 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 98950921 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98951251 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 98951912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98952247 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98952613 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98952791 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98953084 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98953139 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98957079 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98957890 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98958539 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98961637 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98961689 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98962174 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98963748 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98964185 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 98964726 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 98965547 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98966139 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 98968374 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98968783 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 98968811 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98969418 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 98970784 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98970939 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98971934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98972031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98972183 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98972200 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 98972224 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 98972245 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98973244 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 98973322 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 98973455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98973772 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98974174 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98974607 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 98974731 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 98974824 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98974922 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98974932 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98975630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98976258 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 98976325 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98976573 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98977346 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 98978161 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98978463 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98980392 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98980631 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 98981594 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 98982453 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98982548 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 98984364 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98984429 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 98985073 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 98985190 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 98985828 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98986048 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98988421 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98988690 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 98988966 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 98990550 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98991680 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 98991760 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 98991855 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 98991909 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98993573 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98994096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98994673 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 98995549 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 98998620 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98999074 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 98999095 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 98999568 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99000186 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99008046 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99008314 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99008458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99008837 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99009362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99009750 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 99010091 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99010370 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99011059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99011215 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99011248 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99011281 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99011556 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99011592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99011753 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99012915 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99013343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99013427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99013548 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99014689 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99016767 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99017955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99018254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99018704 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99019515 A T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 99019689 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 99019699 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 99019717 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 99020188 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99020687 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99021146 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99021231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99021337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99021453 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99021625 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99022030 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99022233 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99022256 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99022273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99022444 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99023081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99025457 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99026688 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 99027301 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99027563 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99027624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99027898 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99029717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99033640 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99034969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99037499 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99037752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99037982 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99038444 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99038521 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99038768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99039078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99039598 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99039641 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99039976 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99040025 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99040492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99040821 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 99040984 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99042796 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99042797 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99042912 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99043837 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 99044127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99044484 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99044559 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99045154 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99045245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99045594 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99045899 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 99046116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99046505 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99046740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99047319 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99048163 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99049469 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99049947 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 99050403 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99050996 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99051826 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99051857 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99051946 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99052359 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99052414 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99053504 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99053967 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99054333 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99054396 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99054444 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99054541 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99054668 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99054688 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99055344 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99055469 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99055564 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99056278 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99056306 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99056441 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99056594 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99057537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99057713 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99057891 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99057894 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99058382 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99059327 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99059400 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99059490 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99059628 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99059724 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99059933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99060300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99062137 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99062324 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99062421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99062434 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99062936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99064757 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99064914 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99065421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99065631 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99069237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99069404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99070121 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99070797 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99071263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99071378 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99071427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99072095 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99072189 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99072841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99074379 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 99074418 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 99074459 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99074588 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 99075353 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99075442 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99075702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99076450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99076964 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99077777 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99078175 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99078670 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99078733 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99078836 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99078907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99079534 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99080397 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99080484 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99080686 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99080814 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99081400 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 99081598 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99081614 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 99081980 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99082237 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 99082522 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99082525 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99082768 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99083039 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99083220 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99083711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99084750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99084904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99084951 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99085047 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99085197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99085234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99085561 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99086096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99086509 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99087076 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99087130 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99087217 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99087727 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99087776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99088243 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99088564 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99088640 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99088727 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99088772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99088940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99088988 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99089010 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99089185 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99089192 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99089268 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99089277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99089625 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99089676 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99089739 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99089767 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99089947 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99089976 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99090294 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99090334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99090496 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99090662 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99090672 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 99090726 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99090745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99090861 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99090871 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99091175 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99091217 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99091660 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99091807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99092028 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 99092029 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99092118 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99092238 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99093780 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99093945 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99093989 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99094053 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99094066 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99094203 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99094426 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99094465 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99094560 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99094579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99094672 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99094674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99094701 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99094710 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99094760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99094788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99094907 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99094959 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99094967 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99095100 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99095150 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99095204 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99095238 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99095343 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99095424 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99095446 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99095459 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99095629 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99095679 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99096018 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99096405 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 99096827 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99097684 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99097885 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99098092 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99098185 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99098215 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99098396 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99099108 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99099377 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 99099523 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99100287 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99100304 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99100394 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99100755 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99100756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99101011 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99101287 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99101308 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99101536 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99101621 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99102029 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99102457 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99102486 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99102864 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99103068 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 99103307 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99103313 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 99103379 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99103428 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99103551 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99103600 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99103894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99104357 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99104408 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99104719 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99104754 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99105855 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99106420 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99106640 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99106736 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 99106998 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 99107040 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99107332 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99107390 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99107469 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99107531 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99107573 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99107626 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 99107669 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99107898 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99107955 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99109380 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99109429 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99109494 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99109505 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99109560 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99109688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99109951 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99110060 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99110082 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99110221 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99110497 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99110633 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 99110656 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99110662 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99110671 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99110674 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99110684 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99110701 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99110777 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99110865 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99110887 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99110889 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99110901 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99110936 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99110945 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99110989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99111056 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99111152 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99111206 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99111296 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 99111484 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99111691 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99112000 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99112001 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99112764 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 2 99113103 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99113218 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99113253 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99113634 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99113825 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99114141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99114234 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99115577 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99115737 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99116104 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99116157 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99116169 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99116358 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99116545 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99116933 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 99117669 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99117831 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99118132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99118295 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99118323 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99118418 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99118435 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99118436 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99118508 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99118972 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99119063 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99119280 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99119408 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99119468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99119526 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99119640 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99119649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99119658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99119774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99119952 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99120240 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99120292 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99120638 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99120646 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99120669 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99120902 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99120966 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99120981 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99121393 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99121401 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99121429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99121654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99121719 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99121839 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99121859 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99121912 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99122086 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99122169 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99122254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99122270 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99122311 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99122342 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99122518 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99122654 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99122805 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99122931 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99123002 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99123118 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99123125 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99123182 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99123197 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99123204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99123210 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99124004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99124014 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99124141 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 99124261 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 99124287 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99124374 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99124886 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99124956 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99125009 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99125010 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99125109 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99125116 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99125161 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99125371 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99125387 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99125406 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99125524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99125539 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99125717 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99125815 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99125858 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99125866 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99125896 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99126101 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99126124 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99126796 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99126801 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99126978 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99127162 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99127310 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99127549 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 99127778 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 99127891 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 99128003 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99128090 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 99128118 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99128207 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 99128253 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 99128255 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99128292 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 99128381 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 99128419 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 99128507 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 99128655 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99128685 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 99128720 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99128777 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99128788 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99128810 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 99128845 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99128888 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 99129050 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99129099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99129114 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99129172 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99129191 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99129274 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99130013 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 99130043 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 99130201 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99130228 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99130523 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99130580 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99130810 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99130921 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99130944 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 99130982 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 99131203 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99131278 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99131287 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99131312 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99131353 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99131388 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99131403 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99131505 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99131539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99131611 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99131654 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99131727 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99131731 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99131771 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99131828 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 99132431 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99132532 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 99132556 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 99132795 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99132813 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99132913 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99132971 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99132979 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99132998 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99133000 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99133501 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99133642 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99133664 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99133724 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99133755 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99133815 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99133832 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99133842 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99133875 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99133903 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99134004 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99134007 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 99134059 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 99134336 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 99134502 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99134525 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99134643 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99134646 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99134654 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99134669 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99134682 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99134790 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99134828 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99135220 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 99135252 T G N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 99135276 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 99135355 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 99135394 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99135398 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99135449 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99135476 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99135547 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99135570 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99135608 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99135716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99135776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99135793 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99135855 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99135882 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99135884 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99135944 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99135959 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99135967 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99136013 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99136067 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 99136121 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 99136148 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 99136669 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 99136674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99136727 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99136786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99136827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99136900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99136920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99136944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99137005 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99137011 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99137018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99137028 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99137041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99137137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99137179 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99137214 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99137278 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99137287 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99137341 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99137344 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99137366 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99137414 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99137449 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99137488 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99137499 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99137756 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99137775 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99137903 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 99137998 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99138010 T C N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 99138139 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99138146 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99138202 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99138289 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99138465 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99138506 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99138547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99138731 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99138747 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99138795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99138977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99138993 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99139003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99139029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99139045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99139144 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99139542 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99139630 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99139681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99139708 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99139741 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99139754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99139796 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99139816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99139855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99139970 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99139992 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99146782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99146787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99146947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99147038 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99147101 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99147318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99147398 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99147526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99147533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99147604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99147707 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99147924 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99147987 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99148036 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99148046 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99148119 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99148169 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99148224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99148269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99148318 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99148327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99148350 C G Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.466666666666667 16 14 8 0 7 2 99148366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99148367 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99148402 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99148443 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99148672 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99148863 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99148936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99148968 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99148997 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99149085 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99149110 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99149190 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99149240 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99149256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99149408 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99149480 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99149614 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99149786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99150063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99150294 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99150478 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99150569 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99150602 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99150611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99150921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99151074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99151115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99151149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99151225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99151227 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99151342 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99151487 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99151543 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99151547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99151611 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99151619 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99151627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99151978 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99152003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99152027 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99152214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99152225 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99152758 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99154133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99154217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99154368 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99154441 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99155018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99155153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99155782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99156000 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99156024 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99156177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99156444 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99156728 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99156953 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99156983 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99157497 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99157973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99158622 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 99159011 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99159038 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99160730 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99160780 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99160875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99161056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99161572 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99161632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99161649 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99161688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99162144 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99162506 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99162637 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99162770 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 99162995 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99163023 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99163262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99163326 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99163343 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99163361 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99163368 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99163406 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99163449 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99163465 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99163478 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99163540 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99163576 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99163714 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 99163739 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 99163774 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99163823 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99163981 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164044 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164091 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164245 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99164247 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99164277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164599 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164663 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164967 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164977 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99164993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99165449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99165550 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99166172 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99166390 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99166542 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99166625 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99166674 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99167445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99167455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99167990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99168438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99169274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99169358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99169816 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99169832 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99170858 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99172363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99172597 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99172931 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99173322 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99173386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99173493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99174522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99174559 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99174835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99174899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99174949 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99175622 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99176473 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99176761 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99176866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99177108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99177363 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99177409 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99177427 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99177634 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99177798 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 99177841 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99177878 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99178140 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99178278 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99178393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99178669 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99179071 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99179474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99179475 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99179520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99179668 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99179922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99180146 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99181865 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 99182076 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99182393 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99182962 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 99183093 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99183276 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99183300 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99183420 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99183429 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99183484 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99183516 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99183526 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99183533 A C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 99183574 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 99183895 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99184634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99184662 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99184803 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99184978 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99185585 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99186295 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 99186588 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99186836 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99186979 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99187057 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99189032 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 99189505 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99189579 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99192189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99193803 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99193954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99194097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99194272 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99194313 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99194686 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99195156 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99195810 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99195888 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 99196342 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99196738 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99196798 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99197010 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99197672 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99197830 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99197957 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99198706 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99199154 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99199307 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 99199446 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99199546 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 99205030 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99205415 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99205700 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99205777 A T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 99212122 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99213772 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 99213903 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99214118 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99215113 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99215520 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99216275 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99216618 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99216696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99217013 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99217266 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99217332 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99217766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99218010 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99218012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99219989 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99220476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99220550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99221265 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99221415 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99221932 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99222056 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99222647 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99222707 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99222756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99223039 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99224895 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99225069 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 99226594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99226928 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99227626 T G Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 99228213 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99228266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99228563 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99229597 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99229634 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99230020 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99230090 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99230395 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 99231205 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99231206 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99231657 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99231660 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99231710 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99231883 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99233093 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99233521 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99233537 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99233786 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99234349 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 99234398 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 99234498 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99234512 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99234612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99234788 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99234992 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99235074 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99236214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99237515 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99237640 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99238071 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99238193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99238496 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99238580 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99238620 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99238812 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99239513 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99239540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99239591 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99239975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99240276 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99240405 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99240878 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99242598 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99242681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99242709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99242721 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99242812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99242839 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99242866 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99243183 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99244373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99244650 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99244826 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99244918 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99246349 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99246406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99246520 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99247039 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99247300 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99247369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99247455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99247521 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99250804 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 99251997 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99253006 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99253815 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99254179 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99254832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99254870 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99255006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99255183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99255198 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99255229 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99255736 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99256017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99257037 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99258303 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99258478 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99258736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99258924 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99258949 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99259159 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99259374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99259994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99260236 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99261716 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 99262250 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99263246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99263746 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99264550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99264862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99265051 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99265548 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99265980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99266330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99266552 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99266685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99268196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99268248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99268609 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99269100 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99270844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99271211 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99271453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99271457 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99271628 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99271980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99272119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99272126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99272362 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99272542 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99272561 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99272585 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99272851 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99272894 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99272938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99272981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99273348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99273515 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99273697 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99273865 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 99273966 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99273981 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99274111 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99274157 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99274463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99274550 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 99274644 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99274679 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99274738 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99274766 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99274796 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 99274818 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 99274859 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 99274885 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 99274964 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99275134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99275238 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99275320 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99275329 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99275399 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 99278937 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99279105 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99279157 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99279165 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99279265 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99279290 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99279360 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99279412 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99279453 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 99279677 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 99279698 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99279832 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 99279856 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99280180 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99280182 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99280231 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99280252 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99280289 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99280498 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99280706 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99280723 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99280767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99280844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99280927 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99281026 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99281130 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99281157 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99281287 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99281314 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99281328 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99281342 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99281404 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99281600 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 99282037 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99282590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99283090 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99283119 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99283305 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99283324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99283421 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99284028 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99284327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99284859 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99284860 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99284912 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99285278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99285321 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99285649 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99285755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99286260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99286367 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99286378 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99286884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99287054 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99287065 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99287077 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99287125 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99287237 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99287545 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99287679 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99287719 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99287767 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99287778 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99287812 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99287833 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99287835 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99288714 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99291454 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99291743 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 99294397 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99294556 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99295716 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99296075 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 99296614 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99297658 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99298148 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99298939 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99299001 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99299040 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99299752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99299872 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99299889 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99299902 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99299985 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99300010 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99300029 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99300602 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99300645 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99300792 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99306677 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99306833 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99306985 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99307404 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99307543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99307708 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99308109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99308152 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 99308257 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99308696 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99308714 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99308869 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99309174 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99309288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99309454 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99309677 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99309914 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99309982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99310231 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99310444 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99310720 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99311252 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99311649 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99312989 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99313590 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99314764 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99315163 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 99315238 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99315502 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99315815 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99316329 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99316913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99317400 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99318389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99320876 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99321018 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 99321068 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99322190 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99322675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99323108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99324299 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99324635 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99326678 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99327048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99327688 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 99327787 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99327876 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99329339 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99329562 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99330364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99330935 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99331270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99331473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99331616 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99332006 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99332165 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99332549 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99334111 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99335192 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99336479 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99337229 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99337603 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99337819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99339483 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99340684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99341030 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99341062 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99341548 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99341710 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99343289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99345014 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 99345449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99345858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99345939 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99346192 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99346921 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99346929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99347502 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99348050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99348571 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99349170 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99349261 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99349447 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99349830 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99349981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99350838 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99351255 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99351543 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99351551 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99352397 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99353366 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99353554 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99353731 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99356096 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99356587 A C Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 99358276 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99358280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99358422 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99358754 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99358755 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99358906 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99359049 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99359708 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99360061 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99360201 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99360384 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99360620 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99360655 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99361212 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99361350 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99361416 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99361444 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99361446 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99361524 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99361630 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99361866 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99361924 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99363841 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 99364042 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99364084 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99364383 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99364416 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 99364650 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 99364870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99364965 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99365187 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99365261 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99365342 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99366324 G T N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 99367144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99373992 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99374560 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99378362 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 99378407 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99378442 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99379820 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99383274 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99384054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99385256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99393953 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99393969 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99394104 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99394614 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99394942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99396897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99397961 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99400071 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99400145 T G N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 99400286 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 99402239 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99403016 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99403519 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99405498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99406630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99408142 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99411675 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99411748 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99415138 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99415405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99415651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99415891 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99416645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99417291 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99417459 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99418082 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 99418865 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99419131 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99419355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99419743 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99419897 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99419956 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99420367 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99420493 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99420619 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99421446 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99421834 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99421838 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99422121 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99422229 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99422271 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 99422508 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99422612 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99422682 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99423505 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99424606 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99425804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99426622 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99426885 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99430742 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99431341 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99431345 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99431370 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99431436 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99431646 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99432071 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99432156 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99432386 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99432422 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99432468 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99432471 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99432480 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99432504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99432531 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99432595 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99434213 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99434273 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99434281 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99434335 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99434365 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99434463 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99434491 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99434547 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99434775 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99434784 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99434807 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99434849 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99434863 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99434892 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99434921 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99434952 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99435003 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99435043 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99435084 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99435092 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99435181 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99435272 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99435362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99435484 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99435510 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99435567 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99435598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99435667 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99435775 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99435796 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99435841 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 99435891 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99436055 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99436080 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99436152 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99436154 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99436165 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99436260 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99436525 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99436552 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99436606 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99436681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99437037 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99437131 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99437167 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99437412 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 99437417 A T N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 99437498 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 99437525 C A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 99437627 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 99437645 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99437670 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99437749 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99438202 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99438241 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99438366 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99438414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99438606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99438787 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99438874 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99439062 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99439109 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99439137 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99439204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99439387 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99440087 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 99440246 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99440407 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99440756 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99440869 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99440973 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99440978 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99441145 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 99441488 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99441628 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99441673 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99441715 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99441716 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99441788 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99441897 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 99442061 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99442088 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99442171 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99442229 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99442241 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99442356 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99442386 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99442443 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99442501 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99442605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99442674 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99442798 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99442892 A C N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 99442980 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99443009 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 99443239 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99443267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99443436 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99443503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99443597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99443789 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99443871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99443966 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99443967 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99444217 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99444282 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99444416 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99444803 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99444836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99444959 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99445198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99445336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99445507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99445578 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99445601 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99445879 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 99446013 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 99446063 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 99446147 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99446628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99446808 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99447294 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99447296 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99447308 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99447327 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99447359 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99447958 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99448142 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99448281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99448431 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99448544 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99448747 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99449033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99449104 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99449197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99449288 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99449338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99449399 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99449526 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99449534 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99449830 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99449869 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99450134 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99450175 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99450234 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99450271 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99450339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99450361 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99450441 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99450454 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99450500 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99450618 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99450660 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99450707 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99450914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99450963 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99450982 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99450986 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99451281 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99451554 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99451655 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99451716 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99451738 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99451920 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99452067 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99452121 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99452264 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99452840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99452846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99452853 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99452872 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99452927 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99452940 C G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 99453109 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 99453347 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99453566 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99454031 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99454032 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99454719 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99455446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99455835 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99455836 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99456195 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99456981 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 99457012 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99457032 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99457062 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99457082 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99457146 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99457208 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99457253 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99457255 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99457721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99457778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99457906 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99458055 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99458062 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99458075 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99458167 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99458238 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99458299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99458544 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99458992 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99458993 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99459172 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99459194 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99459215 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99459226 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99459480 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99459528 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99459560 C G Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 99459605 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99459718 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99459750 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99459825 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99459931 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99459936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99459998 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99460030 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99460262 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99460347 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99460500 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99460680 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99461030 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99461623 C G Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 99462549 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 99463844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99463974 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99464218 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99464405 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99464576 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99464638 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99464813 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99464833 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99465499 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99465623 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99465667 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99465678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99465693 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99465764 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99465889 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99465909 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99465929 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99466131 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99466182 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99466193 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99466213 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99466493 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99466548 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 99466638 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 99467040 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99467169 C A Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 99467810 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 99468121 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99468337 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99468530 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99468537 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99468733 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99468906 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99468933 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99469001 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99469005 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99469081 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99469331 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99469415 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99469992 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99470045 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99470111 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99470356 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99470377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99470441 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99470442 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99470482 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99470490 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99470588 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99470598 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99470699 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99470902 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99471012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99471116 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 99471137 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99471149 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99471363 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99471441 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 99471500 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99471520 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99471590 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99471670 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99471700 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99471724 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99471744 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99471811 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99471983 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99472010 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99472040 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99472065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99473117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99473260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99473479 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99473516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99473540 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99473552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99473840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99473896 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99474059 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99474289 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99474355 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99474507 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99474797 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 99475131 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99475217 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99475220 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99475250 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99475491 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99475510 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99475576 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99475679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99475741 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99476028 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99476122 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99476258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99476280 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99476599 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99477217 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 99477266 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99477470 G T Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 99477641 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99477674 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99477794 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99477910 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99477990 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99478034 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99478085 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99478164 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99478314 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99478319 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 99478522 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99478523 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99478533 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99478629 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99479019 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99479037 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99479256 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99479612 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99479715 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99479835 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99480007 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99480052 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99480153 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99480390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99480456 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99480459 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99480708 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99480806 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99480894 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99480984 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99481023 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99481051 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99481121 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99481680 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99481766 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99481922 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99482046 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99482090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99482193 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99482234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99482411 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99482436 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99482450 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99482474 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99482505 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99482518 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99482632 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99482643 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99482656 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99482667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99482735 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99482952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99482985 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99482996 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99483128 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99483167 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99483179 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99483230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99483264 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99483447 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99483551 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99483629 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99483877 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99483920 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99484136 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99484306 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99484330 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99484442 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99484643 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99484655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99484665 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99484903 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99485015 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99485542 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99485577 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99485581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99485618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99485705 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99485716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99485811 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99485820 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99485886 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99486024 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99486167 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99486192 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99486323 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99486331 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99486371 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99486412 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99486438 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99486531 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99486541 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99486615 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99486617 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99487226 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99487249 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99487416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99487450 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99487480 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99487517 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99487556 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99487610 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99487662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99488146 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 99488321 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99488473 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99488528 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 99488621 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99488628 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99488644 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99488862 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99488884 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99488939 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99488963 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99489011 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99489036 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99489237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99489315 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99489619 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99489765 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99490344 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99490424 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99490545 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99490596 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99490702 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99491291 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99491597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99491607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99491752 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99491888 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99491992 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99492032 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99492060 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99492098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99492679 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99492877 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99492929 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99492988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99493128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99493148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99493169 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99493173 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99493220 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99493313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99493358 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99493928 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99494771 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99495061 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99496191 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99496713 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 99497336 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 99497381 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99497457 G T Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 99497578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99498075 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99499241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99499492 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99500678 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 99501296 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 99501443 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99501667 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99501694 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99501796 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99502212 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99502411 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99502413 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99502613 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99502625 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99502634 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99502685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99503495 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99503510 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99503650 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 99503666 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99504456 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99504560 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99504861 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99504949 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99504958 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99505017 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99505385 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99505896 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99506493 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99506849 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 99507102 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99507297 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99508078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99508236 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99509186 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99509428 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99509487 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99509591 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99509698 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99510407 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99511233 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99511853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99513971 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99514246 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99515595 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99515748 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99516221 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 99521579 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99522158 A T Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 99522856 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99522992 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99530101 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 99531466 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 99532123 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99532386 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99532551 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99532940 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99533734 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 99534067 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 99534699 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99534832 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99534864 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99535317 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99536111 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99536675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99536851 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99538115 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99538390 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99538469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99538561 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99539923 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99540264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99540391 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99540685 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99540739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99541442 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99542242 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99542789 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99543198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99543320 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99544107 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99545862 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99546132 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99546337 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99546361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99546600 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99546604 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99546702 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99547279 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99547588 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99548091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99548592 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99548666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99548760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99549459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99549799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99549860 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99549948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99550028 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99550354 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99550415 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99550522 A T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 99550667 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99550818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99551119 T C Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 99551462 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99552020 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 99552234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99552884 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99553328 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99554233 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99554591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99554741 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99555044 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99555658 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99556070 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99556371 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99556761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99556983 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99557177 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 99557498 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 99557596 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99558216 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99559482 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99559485 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99559811 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99560370 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99560643 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99561952 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99563133 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99563728 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99564936 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99565775 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99566046 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99566676 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99566694 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99566998 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99567166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99567336 C A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 99568227 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99569195 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99569685 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99569927 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 99571092 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99571292 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99571297 A C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 99571673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99571685 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99572375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99572757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99572799 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99573057 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99574824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99574959 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99575263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99575880 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99576347 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99576357 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99576367 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99576579 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99576791 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99577875 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99578076 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99578502 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99579901 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99580230 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99582478 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99583705 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 99583851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99583964 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99585068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99586348 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99587169 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99587259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99588433 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99590122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99590300 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 99590301 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 99591287 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99592464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99592737 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99592817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99594121 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99595126 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99595371 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99595765 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99596301 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 99596693 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 99596788 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99597476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99598135 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 99598356 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99599006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99599103 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99599266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99599267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99600117 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99600639 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99602306 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99603583 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99603605 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99603619 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99603635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99604681 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99605194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99605784 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99605921 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 99608689 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99609002 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 99609766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99610070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99610122 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99610363 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99610459 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99610624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99610912 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99611395 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99611410 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99612327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99612526 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99613375 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99614456 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99616645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99616730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99616812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99617134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99617270 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99617295 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99618565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99619468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99624249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99625952 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99626224 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 99626273 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99627037 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99628299 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99629734 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99634138 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99634227 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99634560 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99638073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99639097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99639648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99639966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99640845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99642148 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99643523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99643774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99644047 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99645317 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99645964 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99646696 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99650420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99650574 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99652534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99652908 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 99654062 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99654178 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99654309 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99654587 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99654683 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 99654719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99655252 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99655955 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99656233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99656440 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99656805 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99657072 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99657099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99657515 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99657591 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99657641 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99658014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99658023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99658363 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99658394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99658418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99658618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99658766 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99659153 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99659361 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 99659467 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99659629 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99659857 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99659858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99659962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99659993 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99660065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99660108 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99661020 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99661434 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99661622 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99661633 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99661759 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99661763 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99662252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99662255 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99662293 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99662437 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99662443 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99662606 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99662877 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99663322 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99663856 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99663942 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99664091 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99664322 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99664468 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99664759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99664839 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99664904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99664958 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99665151 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99665249 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99665452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99665472 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99665563 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99665650 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99666669 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99666687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99666842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99666962 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99667549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99667680 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99667795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99667818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99667825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99668039 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99668067 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99668095 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99668143 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99668975 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99670524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99671258 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99673220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99673428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99674364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99674452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99674503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99674537 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99674605 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99675817 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99675833 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99676414 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99677897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99678731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99678839 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99678889 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99678891 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99679696 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99680642 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99680785 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99680910 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99685101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99685133 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99685175 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99685439 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99692214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99693554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99694787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99696458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99697878 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99698085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99698360 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99698580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99698840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99700132 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99701980 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99702063 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99703845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99705029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99705293 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99705675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99706453 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99706698 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99706733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99707020 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99707768 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99709314 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99709463 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99709555 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99709803 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99709837 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99709892 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99709905 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99709908 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99709930 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99710024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99710132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99710451 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99710646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99711310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99712256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99713417 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99713682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99714478 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99714600 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99714641 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99714653 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99715054 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99715265 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99715267 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99715553 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99716088 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99716215 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99716244 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99716282 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99716415 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99716579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99716716 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 99716790 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99716918 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99717034 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99717131 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99717198 A G Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 99717304 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99717855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99718020 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99718052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99718079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99718137 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99718204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99718237 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99718479 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 99718562 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99718740 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99718989 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99719122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99719198 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99719368 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99720108 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99720118 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99720126 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99720325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99720346 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99720479 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99720626 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99720727 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99720932 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99720957 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99720985 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99721150 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99721164 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99721191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99721216 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99721369 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99721492 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99721501 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99723393 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 99723400 C A Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 99723412 G C Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 99724395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99724556 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99725391 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99725489 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99725978 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99726035 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99726275 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99726883 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99727345 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99727383 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99727888 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99727892 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99728985 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99729096 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99729166 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99729188 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99729231 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99729825 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 99730090 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99730191 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99730219 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99730776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99731229 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 99731392 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99731639 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99732059 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99732168 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99732495 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 99732773 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99733763 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99734719 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99734816 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99735385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99735397 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99735562 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99735817 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99736428 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99737588 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99738726 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99738732 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99738844 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99739323 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99740260 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99740652 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99740980 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99741084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99741222 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99741702 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99741763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99741782 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99743141 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99750749 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99751345 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99751387 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99751426 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99751490 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99751501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99751520 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99751560 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99751739 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99752247 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99752310 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99752345 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99752630 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99752952 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99753448 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99753451 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99753506 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99753569 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99753587 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99753606 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99753935 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99754120 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99754254 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99754321 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99754451 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99754610 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99754638 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99754808 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99754919 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 99755035 G C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 99755096 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99755100 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99755251 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 2 99755280 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99755320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99755431 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99755451 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99755497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99755573 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99755598 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99755703 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99755710 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99755777 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99755802 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99755831 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99755991 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99756335 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99756358 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99756601 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99756718 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99757091 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99757125 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99757225 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99757386 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99757500 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99757674 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99757929 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99758053 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99758418 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99758657 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99758658 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99759028 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99759046 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99759114 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99759239 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99759298 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99760144 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99760146 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99760486 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99760919 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99761517 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99761525 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99761635 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99762023 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 99762309 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99762722 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99763128 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99763624 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99763832 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99764053 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99764152 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99764960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99765248 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99765403 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99765421 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99765674 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99765854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99766172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99766763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99766818 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99767041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99767166 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99767318 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99767353 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99767566 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99767831 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99768030 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99768260 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99768300 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99768341 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99768665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99768668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99768689 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99769056 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99769081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99769205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99769424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99769982 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99770452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99771536 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99771576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99771594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99772117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99772979 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99772992 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99773174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99774406 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99774541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99774716 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99774903 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99774939 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99774964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99778392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99782219 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99782351 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99782764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99784465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99784675 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99786075 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99790925 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99791081 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99791269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99791446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99796074 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99796279 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99796564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99798846 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99799597 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99800176 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99800232 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99800247 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99800256 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99800360 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99800366 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99800448 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99800501 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99800592 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99801072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99801097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99801159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99801203 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99801612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99801693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99801736 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99802378 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99802437 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99802708 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99803186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99803236 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99803237 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99804167 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99804265 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99804430 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99804518 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99804913 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99804927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99805281 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99805301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99805400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99805477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99805904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99806015 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99806339 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99806541 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99806651 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99807010 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99807142 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 99807452 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99807654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99807778 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99807845 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99808199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99808612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99808708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99808918 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99809040 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99809670 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99809688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99810299 C A Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 99810478 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99810674 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99810692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99810744 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99810756 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99810827 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99810897 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99810969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99811057 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99811482 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99811599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99811630 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99811942 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99812096 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99812255 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99812350 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99812490 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99812719 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99812750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99812911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99813063 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 99813117 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99813215 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99813548 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99813697 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 99813742 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99814550 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99814609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99814635 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99814688 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99814713 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99814776 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99814830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99815434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99815704 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99816346 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99816779 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99817443 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99817457 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99817478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99817766 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99817773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99817996 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99818290 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99818511 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 99818569 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99819187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99819411 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99819671 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99819685 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99819985 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99821034 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99821106 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99821835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99822020 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99822239 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99822307 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99822769 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99823541 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99824037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99824101 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99824297 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99824535 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99824826 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99824947 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99824967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99824991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99825138 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99825158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99825470 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99826046 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99826066 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99826205 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99826723 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99826725 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99826836 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99827160 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99827190 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99827786 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99828002 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99830252 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 99830276 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99830341 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99830423 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99830465 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99830519 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99830543 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99830582 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99830645 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99830667 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99830670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99830686 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99830687 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99830714 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99830717 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99830882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99830906 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99830931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99830932 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99830957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99830958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99830983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99831009 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99831026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99831050 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99831110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99831193 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99831241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99831346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99831359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99831368 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99831423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99831640 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99831876 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99832181 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 99832322 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99832633 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99832691 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 99832741 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 99832752 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 99832808 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 99832825 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 99832852 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 99833134 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99833140 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99833240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99833289 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99833456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99833483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99833503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99833576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99833626 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99833656 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99833787 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99833893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99833898 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99834029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99834116 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99834130 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99834325 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99834383 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99834392 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99834442 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99834470 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99834693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99834915 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99834934 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99834955 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99835021 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99835088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99835119 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99835131 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99835261 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99835270 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99835435 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99835506 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99835660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99835914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99836217 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99836268 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 99836796 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99836929 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99836956 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99836992 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99837023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99837216 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99837275 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99837291 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99837419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99837476 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99837530 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99837568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99837748 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99837919 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99838133 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99838158 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99838570 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99838878 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 99839036 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99839069 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99839108 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99839126 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99839213 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99839417 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99839499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99839586 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99839900 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99839918 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99840002 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99840017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99840036 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99840141 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99840328 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99840345 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99840407 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99840432 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99840461 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99840557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99840569 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99840644 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99840664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99840706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99840819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99840845 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99841098 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99841262 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99841265 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99841382 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99841400 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99841409 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99841425 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99841471 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99841608 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99841661 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99841693 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99841733 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99841795 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99841850 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99841851 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99841871 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99841889 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99841922 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99841990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99842110 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99842149 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99842206 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99842503 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99842525 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99842638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99842650 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99842656 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99842662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99842750 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99842814 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99842817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99843010 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99843064 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99843115 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99843211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99843271 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99843276 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99843346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99843537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99843559 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99843816 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 99844107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99844272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99844282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99844327 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99844338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99844376 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99844723 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99844872 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99845051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99845278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99846046 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99846261 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99846437 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99846468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99847213 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99847247 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99847267 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99848156 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99848394 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 99848525 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99849355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99850115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99851820 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 99852375 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99853095 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99853659 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99854280 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99855568 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99855879 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99857601 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99857737 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99857828 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99858040 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99858854 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99858916 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99858928 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99859270 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99859916 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99861891 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 99862413 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99862558 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 99862659 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 99863322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99863324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99863450 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99863458 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99863472 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99864216 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99864217 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99865984 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99866542 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99866589 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99867475 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99867920 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99867921 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99867986 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99868810 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99869197 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 99869680 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99870019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99870776 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99871090 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99871774 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99872204 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 99872241 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99872512 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99874698 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99874735 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99880589 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99880956 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99881104 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99882211 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99882940 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99882956 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99883728 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99884113 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99884232 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99885377 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99886154 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99887938 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99887974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99888303 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99888511 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 99892984 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 99893774 T C N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 99894207 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99894474 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99894540 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99895167 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 99895518 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99895665 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99895877 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99896101 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99896917 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99897100 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99898327 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99899378 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99899961 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99902233 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99902360 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99902440 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99902453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99902521 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99902580 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99902850 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99902970 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99903074 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99903105 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99903213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99903495 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99903798 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 99903947 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99904089 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99904150 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99904201 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99904366 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99904450 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99904620 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99904680 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99904693 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99905093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99905151 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99905814 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99905861 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99906371 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99906390 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99906400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99906612 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99906853 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99906904 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99907013 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99907022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99907369 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99907637 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99907662 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99907856 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99907909 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99907926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99908186 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99908192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99908419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99909118 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99909317 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99909820 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 99910124 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 99910193 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99910227 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99910318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99910768 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99910783 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99910962 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99911301 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99911338 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99911468 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99911580 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99912067 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99912207 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99912231 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99912304 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99912426 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99912433 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99913024 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99913271 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99913311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99914002 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99914074 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99914344 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99914502 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99914739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99915758 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99915818 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 99915822 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99916045 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 99916221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99916309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99916420 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99916615 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99916926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99917105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99917277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99917351 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99917389 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99917601 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99917613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99917958 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99918223 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99918257 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99918311 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99918838 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99919544 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99919974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99920202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99920223 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 99920240 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99920380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99920697 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 99920974 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99921419 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 99922017 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99922096 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99922186 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99922339 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99922355 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99923032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99923553 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99924325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99924465 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99924675 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99925042 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99925269 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99926122 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99926660 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99926773 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99926856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99927273 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99927958 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99927970 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99929109 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99929175 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99929239 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99929298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99929991 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99930169 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99930672 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 99930971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99930999 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99932473 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99933257 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99935126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99935224 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 99935715 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99936662 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 99937843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99938196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99938293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99938840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99939076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99939123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99939264 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99939507 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99939748 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 99939854 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99939947 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99940009 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99940064 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99940140 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 99940324 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99940368 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99940413 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 99940487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99940516 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99940550 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99940555 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99940568 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99940669 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99941320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99941750 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99941935 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99941964 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99941978 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99942173 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99943999 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99944025 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99944151 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99944519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99944848 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99945112 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99945513 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99945682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99946687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99946813 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99947919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99947935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99948142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99948154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99948158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99948216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99948461 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99948530 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99948539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99948586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99948780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99949530 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99949792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99949806 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99949875 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99949902 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99950008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99950032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99950162 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99950217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99950234 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99950252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99950416 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99950426 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99950544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99950558 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99950633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99950676 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99950731 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99950734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99950771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99950846 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99950901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99950998 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99951273 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99951285 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99951409 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99951536 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99951566 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99951767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99951806 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99951836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99951933 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99951945 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99956730 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99956753 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99956805 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99956811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99956934 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99957050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99957052 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99957121 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99957514 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99957538 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99957609 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 99957646 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99957693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99957731 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99957786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99957804 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99957814 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99957902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99957920 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99957976 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99957984 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99958015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99958036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99958043 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99958176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99958260 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99958598 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99958600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99958809 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99958877 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99958998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99959008 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99959106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99959124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99959249 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99959270 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99959274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99959308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99959348 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99959351 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99959445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99959461 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99959478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99959507 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99959579 T A Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 99959711 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99959756 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99959774 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99959776 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99959812 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99959921 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99959978 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99960008 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99960053 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99960062 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99960178 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99960179 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99960316 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99960344 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99960362 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 99960387 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99960474 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99960487 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99960660 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99960670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99960759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99960774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99960818 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99960845 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99960985 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99961050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99961082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99961166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99961190 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99961407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99961433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99961443 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99961491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99961595 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99961654 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 99961707 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99961849 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99961935 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99961962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99961977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99962025 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99962060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99962196 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99962220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99962343 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99962366 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99962374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99962520 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99962658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99962752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99963156 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99963381 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99963392 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99963451 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99963571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99963768 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 99963887 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 99963915 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99964083 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 99964090 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99964171 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99964237 C A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 99964288 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 99964310 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 99964550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99964561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99964570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99964815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99965140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99966063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99966164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99968004 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99968861 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99968965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99968992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99969180 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99969466 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 99969965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99970091 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99970258 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99970320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99970759 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99970763 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99970771 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99970861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99970994 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99971076 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99971127 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 99971129 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 99971152 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99971163 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99971175 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99971207 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99971232 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 99971251 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99971306 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99971346 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99971351 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99971521 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 99971535 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99971567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99971603 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99972116 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99972161 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99972172 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99972177 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99972697 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99972900 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99973219 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99973222 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99973301 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99973363 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99973447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99973529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99973565 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99974208 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99974316 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99974351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99974509 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99974612 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99974711 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99974718 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99974797 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99974894 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99974896 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99975033 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99975084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99975287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99975300 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99975322 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99975495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99975541 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99975566 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99975708 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99975740 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99975752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99975804 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99976359 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99976455 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 99976527 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99976557 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99977054 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99977091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99977334 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99977686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99977697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99977829 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99978115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99978133 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 99978303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99978508 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99978559 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 99978970 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 99979282 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99979533 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 99979793 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99979864 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99979963 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99980155 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99981023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99981037 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99981047 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99981466 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99981478 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99981525 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99981709 T C Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 99981710 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 99981848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99981933 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99982078 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99982090 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99982212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99982232 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99982328 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99982337 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99982569 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99982588 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99982632 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99982715 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99982804 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99982820 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99982840 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99982847 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99982887 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99982948 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99983282 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99983372 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 99983559 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99983560 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 99983629 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99983687 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99983790 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99983819 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99983885 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99983913 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99983919 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99983971 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99984128 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99984165 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99984197 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99984275 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99984325 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99984371 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99984407 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99984500 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 99984585 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 99985129 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 99985297 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99985341 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99985366 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99985708 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99985775 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99985796 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99985818 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99985983 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99986094 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99986115 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 99986162 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 99986289 G C N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 99986321 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 99986438 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99986489 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99986645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99986651 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99986665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99986684 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99986823 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99987318 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99987501 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99987518 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99987669 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99987714 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99987807 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99987898 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99988007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99988055 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99988184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99988214 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99988314 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 99988401 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 99988474 A T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 99988503 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 99988518 G C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99988598 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99988615 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99988628 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99988681 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99988701 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99989116 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 99989291 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 99989341 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 99989541 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99989703 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99989712 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99989765 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99989778 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99989832 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99989834 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99989895 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99989931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99989957 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99990161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99990216 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99990257 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99990310 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99990375 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99990406 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99990474 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99990491 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99990711 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99990932 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 2 99991120 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99991172 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99991209 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99991274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99991358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99991456 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99991859 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99991882 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99992095 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99992813 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 99993055 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 99993130 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99993368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99993388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99993404 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99993772 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99993823 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99993860 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99994001 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99994024 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99994137 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99994229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 99994999 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99995058 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99995083 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99995248 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99995304 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99995397 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99995422 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99995529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99995738 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 99995787 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 99995810 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 99995825 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99996203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 99996268 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99996322 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 99996401 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 99996461 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99996514 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99996648 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99996772 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99997008 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 99997010 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 99997058 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99997092 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 99997244 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 99997358 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 99997559 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 99997575 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 99997881 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99997895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99997930 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99997980 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99998038 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99998089 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99998130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99998344 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99998560 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99998625 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 99998684 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99998765 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99998766 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 99998880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 99999494 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 99999673 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 99999925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100000747 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 100000803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100000884 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100001118 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100001241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100001254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100001319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100001393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100001412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100001469 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100001549 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100001726 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100001807 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100002289 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 100003002 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 100003027 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100003159 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100003224 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100003265 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100003333 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100003504 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 100004078 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 100004255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100004403 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100004576 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100004652 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100004733 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 100004745 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100004773 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100004864 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100005210 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100005542 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100005557 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100005565 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100005602 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 100005677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100005699 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100005882 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100006247 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100006255 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100006269 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100006536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100006691 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100007003 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100007008 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100007079 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100007162 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100007197 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100007204 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100007228 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100007237 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100007311 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100007323 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100007332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100007412 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100007430 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100007511 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100007599 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100007729 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100007808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100007928 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100008180 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100008212 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100008235 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100008257 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100008299 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 100008325 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100008410 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100008701 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100009000 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100009279 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 100009375 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100009414 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100009423 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100009519 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100009617 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100009655 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100009747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100009776 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100009848 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100010034 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 100010337 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100010409 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100010459 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100010664 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100010670 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100010765 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100010847 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100010914 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100011017 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100011043 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100011118 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100015829 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 100015921 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 100016016 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100016131 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 100016145 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100016407 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100016489 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100016631 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 100016998 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100017005 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100017100 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100017291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100017698 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100018074 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100018101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100018180 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100018268 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 100018407 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 100018459 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 100018900 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100019134 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 100019170 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 100019198 T A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 100020505 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100023792 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 100023884 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100023920 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100024003 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 100024064 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100024360 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100024385 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 100024417 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100024598 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100024754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100024906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100024961 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100025380 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100025448 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100025505 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100026022 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100026033 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100026059 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100026079 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100026100 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100026106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100026141 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100026158 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100026317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100026482 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 100026549 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 100026560 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 100026616 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 100026666 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100026803 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 100026814 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100026853 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100026887 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100026947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100026964 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100027507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100027633 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 100027651 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100027769 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100027781 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100027840 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100027867 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100027879 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 100027947 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100027954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100028004 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100028071 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100028124 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100028221 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100028288 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100028300 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100028385 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100028396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100028470 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100028509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100028518 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100028529 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100028554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100028587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100028593 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100028687 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100028691 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100028830 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100028896 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100029006 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100029055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100029072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100029129 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100029161 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100029248 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100029359 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100029505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100029511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100029638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100029673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100029697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100029769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100030073 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100030267 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100030281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100030376 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100030392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100030403 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100030441 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100030499 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 100030623 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 100030673 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100030703 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100030775 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100030786 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 100030887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100030989 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100031027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100031118 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100031182 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 100033299 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100033350 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100033400 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100033431 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100033464 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100033482 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100033504 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100033543 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100033699 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100033727 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100033965 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100033993 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 100033996 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100034062 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100034092 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100034136 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100034204 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100034213 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100034222 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100034515 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100034651 A T Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 100034699 C G Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 100035077 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 100035082 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 100035127 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 100035253 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 100035254 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100035264 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100035306 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100035325 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100035333 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100035363 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100035371 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100035428 G C Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 100035481 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100035613 C G Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 100035677 G T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 100035699 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 100035711 G T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 100035765 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100035807 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100035867 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100035889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100035890 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100035962 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100035977 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100036034 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100036041 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100036062 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100036106 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100036203 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100036225 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100036266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100036283 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100036323 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100036344 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100036600 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 100036625 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 100036641 C G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 100036740 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 100036921 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 100036937 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 100037182 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 100037276 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 100037360 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 100037402 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 100037477 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100037760 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100037838 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 100037940 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 100037982 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 100038051 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100038054 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100038141 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100038351 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 100038394 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100038458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100038509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100038542 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100038562 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100038577 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100038718 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100038720 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100038741 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100038747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100038794 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100038827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100038838 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100038871 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100038917 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100038927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100038940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100039029 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100039161 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100039200 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100039359 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100039371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100039438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100039452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100039804 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100039882 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100039989 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100040260 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100040348 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 100040430 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100040656 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100040674 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100040820 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100040861 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100040888 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100040942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100040961 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100041174 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100041295 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100041437 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100041443 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100041475 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100041584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100041842 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100041928 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100042131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100042337 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100042447 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100042585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100042588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100042614 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100042643 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100042670 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 100042729 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100042862 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100042998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100043031 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 100043077 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 100043150 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100043189 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100043225 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100043253 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100043298 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 100043357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100043388 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100043508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100043910 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 100043984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100044158 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100044277 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100044484 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100044641 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100044751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100044898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100044928 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100044956 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100045327 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 100045453 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100045553 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100045586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100045624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100045631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100045644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100045681 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100045716 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100045727 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100045809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100045831 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100045843 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100045911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100045930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100046030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100046039 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100046062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100046066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100046093 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100046145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100046263 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100046395 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100046456 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100046638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100046915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100047131 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100047464 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 100047478 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100047928 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100048038 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100048094 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 100048261 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100049503 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100049694 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100050306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100050475 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100050555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100050879 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100050882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100051311 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100051655 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100051765 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100051827 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100051979 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100052172 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100052317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100052338 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100052341 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100052352 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100052551 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100052613 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100052855 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100052970 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100053068 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100053094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100053199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100053248 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100053342 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100053351 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100053379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100053592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100053680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100053836 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100054278 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100054286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100054814 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 100055312 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100055323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100055349 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100055356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100055372 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100055425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100056376 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100056424 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100056697 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100057029 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100057084 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 100057189 A C Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 100057263 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100057355 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100057568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100057622 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100057672 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100057686 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100057818 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100057855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100058110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100058211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100058224 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100058287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100058296 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100058458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100058691 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100058815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100058839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100059050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100059055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100059064 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100059074 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100059290 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100059300 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100059528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100060179 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100060467 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100060643 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100060886 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 100061364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100061389 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100061509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100061546 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100061623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100061813 T A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100061958 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100062253 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100062300 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100062379 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100062439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100062919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100063220 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100063325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100063382 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100063425 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100063727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100064201 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 100065505 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100065803 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100065964 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100066222 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100066247 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100066340 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100066341 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100066398 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100066467 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100066658 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100066791 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100066949 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100067004 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100067448 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100067452 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100067583 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100067607 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100067665 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100068235 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100068323 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100068369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100068374 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100068475 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100068553 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100068652 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100069116 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100069241 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100069305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100069347 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100069409 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100069433 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100069767 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100069809 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100070058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100070326 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100070359 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100070403 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100071002 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100071174 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100071292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100071310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100071356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100071378 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100071530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100071539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100071618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100071630 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100071646 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100071708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100071734 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100071760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100071775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100072101 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100072275 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100072415 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100072420 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100072431 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100072458 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100072460 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100072636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100073054 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100073065 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100073094 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100073140 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100073204 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100073207 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100073263 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100073292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100073333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100073404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100073410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100073438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100073467 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100073523 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100073615 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100073629 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100074114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100074238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100074269 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100074274 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100074361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100074452 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100074474 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100074489 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100074572 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100074583 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100074607 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100074630 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100074687 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100074724 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100074748 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100074764 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100074789 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100074873 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100074888 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100074972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100074993 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100075001 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100075052 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100075156 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100075159 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100075442 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100075588 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100075677 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100075680 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100075710 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100075734 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100075915 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100075924 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100075984 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100076009 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100076051 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100076144 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100076164 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100076165 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100076205 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100076224 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100076287 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100076492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100078748 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 100078798 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 100078874 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100078939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100079234 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100079270 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100079431 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100079453 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100079486 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100079534 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100079571 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100079622 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 100079641 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100079683 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100079778 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100079888 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100080278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100080300 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100080328 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100080339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100080401 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100080421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100080824 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 100080867 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 100080911 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100081213 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100081227 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100081335 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100081671 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100081727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100081738 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100081748 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100081805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100082016 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100082047 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100082073 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100082087 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100082159 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100082323 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100082412 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 100082470 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100082485 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100082622 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100082637 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100082694 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100082769 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100082796 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100082809 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100082848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100083198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100083208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100083433 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100083525 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100083849 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100083942 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100084000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100084073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100084080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100084104 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100084132 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100084198 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100084202 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100084219 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100084237 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100084292 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100084414 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100084438 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100084441 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100084501 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100084627 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100084749 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100084805 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 100085038 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100085132 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100085275 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 100085297 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 100085311 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 100085377 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100085440 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100085530 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100085543 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100085574 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100085605 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100085680 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100085799 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100086272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100086389 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100086411 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100087261 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100087262 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100087276 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 100087354 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100087622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100087630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100087699 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100087784 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100087798 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100087854 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100087920 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100087971 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100087978 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100088041 A T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 100088370 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100088374 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100088383 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100088386 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100088442 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100088610 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100089076 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100089081 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100089118 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100089365 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100089692 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100090139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100090393 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100090466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100090648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100090666 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100090705 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100090727 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100090901 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100090948 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100091050 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100091197 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100091357 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100091530 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100091670 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100091790 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 100091808 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 100092268 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100092368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100092386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100092730 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100092779 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100093479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100093517 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100093544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100093746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100093829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100093874 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100093933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100093996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100094151 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100094338 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100094608 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100094631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100094758 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100094921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100095266 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100095294 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100095767 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100095821 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100095840 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100095946 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100096117 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100096124 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100096138 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100096199 A G Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 100096241 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 100096409 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100096451 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100096491 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100096593 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100096631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100096685 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100096694 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100096743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100096818 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100097103 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100097133 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100097225 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100097265 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100097292 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100097324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100097365 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100097560 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100097671 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100098857 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100098876 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100098926 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100098953 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100099120 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100099129 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100099178 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100099213 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100100109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100100224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100100892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100101057 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100101222 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100101223 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100101261 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100101303 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100101477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100101670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100101793 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100101967 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100101989 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100102019 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100102051 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100102084 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100102139 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100102199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100102300 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100102467 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100102526 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100102563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100102596 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100102636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100102651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100102665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100102946 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100102962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100102997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100103018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100103299 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 100103402 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 100103483 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100103747 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100104410 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100104411 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100104627 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100104818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100104926 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100105047 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100105094 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100105215 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100105522 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100105557 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100106187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100106331 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100106379 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100106383 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100106409 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100106449 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100106580 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100106953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100107383 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100107717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100107845 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100107973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100107983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100108003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100108064 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100108079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100108200 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100108724 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100108784 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100108955 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100109325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100109498 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100109519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100109564 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100109707 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100109990 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100110230 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 100110245 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100110505 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 100110543 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 100110858 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100110988 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100111194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100111202 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100111730 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100111960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100112019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100112152 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100112270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100112300 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100112306 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100112410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100112486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100112625 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100112655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100112727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100112763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100112777 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100112830 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100112836 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100112855 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100113527 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 100113957 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100114112 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100114126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100114263 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100114293 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100114342 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100114358 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100114387 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100114533 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100114819 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100114866 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100114915 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 100115044 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 100117249 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100117363 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100117848 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100118150 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100118579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100118872 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100119429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100119444 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100119695 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100119846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100119893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100119922 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100119975 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100120023 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100120284 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100120369 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100120580 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100120701 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100120781 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100120826 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100120888 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100120982 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100120991 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100121060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100121092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100121382 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 100121463 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100121501 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100121517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100121591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100121736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100121750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100121758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100121889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100121955 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100121994 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100122188 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 100122208 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100122368 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100122417 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100122431 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100122538 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100122748 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100122776 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100122852 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100122887 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100123148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100123185 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100123208 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100123218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100123226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100123340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100123394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100123432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100123438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100123595 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100123615 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100123806 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100123936 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100124014 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100124179 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100124230 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100124770 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100124802 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100124805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100124995 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100125091 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100125183 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100125186 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100125317 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100125427 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 100125484 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100125488 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100125670 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100125739 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100125902 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 100125919 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 100126082 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100126193 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100126197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100126261 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100126262 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100126280 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100126310 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100126419 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100126438 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100126444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100126512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100126568 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100126642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100126710 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100126920 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100126964 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100126973 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100127621 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100127645 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100127666 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100127811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100127821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100127841 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100127855 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100127859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100128024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100128030 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100128049 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100128058 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100128104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100128255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100128303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100128330 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100128369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100128439 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100128767 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100128864 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100129045 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100129138 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100129426 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100129454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100129462 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100129878 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100130079 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100130132 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100130336 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100130382 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100130408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100130431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100131595 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100131608 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 100131776 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100131862 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100132059 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100132060 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100132989 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100134131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100134148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100134595 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100134696 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100134780 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100135063 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100135363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100135387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100135762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100135771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100135846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100136005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100136049 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100136052 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100136231 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100136368 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100136629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100136883 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100136965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100136974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100137103 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100137142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100137376 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100137423 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100137580 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100137591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100137808 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100137834 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100137915 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100137955 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100137963 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100137973 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100138152 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100138321 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100138346 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100138361 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100138460 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100138507 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100138528 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100138673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100139214 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100139366 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100139498 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100139716 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 100139731 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 100140070 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 100140242 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100140847 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100140869 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100140998 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100141025 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100141145 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100141233 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100141236 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100141264 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100141431 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100141576 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100141589 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100141593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100141697 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100141876 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100142023 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100142036 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100142066 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100142231 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100142277 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100142439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100146178 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 100146188 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100146277 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100146296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100146351 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100146394 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100146451 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100146566 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100146575 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100146603 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100146654 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100146689 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100146700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100146815 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100146830 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100146890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100146901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100146957 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100147013 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100147071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100147108 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100147115 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100147130 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100147136 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100147159 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100147188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100147207 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100147235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100147301 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100147302 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100147340 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100147372 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100147491 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100147532 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100147589 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100152323 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100152519 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100152535 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100152681 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100152694 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100152715 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100152774 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100152855 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100152975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100152977 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100153305 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100153523 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100153584 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100154054 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100154196 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100154323 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100154623 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100154735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100154805 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100155104 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100155352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100155406 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100155651 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100156010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100157317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100158037 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100158259 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100158858 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100158956 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 100159204 C G Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 100159362 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100159485 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100161093 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100161508 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100161687 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100161846 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100162113 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100162695 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 100162816 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100163054 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100163826 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100163992 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100164268 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100164613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100164709 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100164938 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100166391 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100166875 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100166894 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100167462 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100167802 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100167851 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100168617 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100169803 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100169859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100170097 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100170764 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100172361 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100174359 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100174433 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100174669 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100175173 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100175317 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100176145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100176473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100176518 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100176622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100176801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100176893 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100176903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100177055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100177516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100179369 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100179657 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 100179779 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100179862 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100180287 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100180403 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100180651 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100181134 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100182601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100182676 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 100182837 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 100183432 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100183743 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100184368 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100184695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100184703 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100185983 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100186073 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100186134 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 100186338 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100186386 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100186894 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 100186936 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100187218 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 100187511 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100187512 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100187874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100188526 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100188687 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100189375 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100189518 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100189575 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100189821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100189936 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100190679 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 100191033 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100191147 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100191226 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100191235 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100191327 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100192813 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 100192918 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 100193130 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 100193153 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 100193794 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 100193988 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100194074 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100194714 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 100194769 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 100195849 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100197468 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100197568 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100198091 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100198435 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100198436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100199316 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100199917 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 100200136 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100200174 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100201156 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100201287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100201908 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100202552 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100202630 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100202924 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100203206 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100204621 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100204723 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100204736 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100204882 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100205296 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100205323 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100205584 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100205783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100206127 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100207175 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100208329 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100208596 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100210300 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100212155 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100212778 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100212979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100213621 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100214108 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100214856 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100217673 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 100220492 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100221872 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100222606 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100222783 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100222834 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100227377 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100229423 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100229776 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100230646 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100232100 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100232351 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100234670 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100238513 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100238738 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100241011 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100241226 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100241454 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100241461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100241543 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100241577 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100241603 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100241622 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100241623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100241791 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100241884 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100241974 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100242340 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100242432 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100242591 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100242637 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100242704 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100243002 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100243103 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100243136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100243225 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100243253 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 100244281 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100244474 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100244552 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100244669 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100244753 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100244792 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100244861 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100244870 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100244992 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100245012 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100245185 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100245351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100245547 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100245802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100245836 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100245890 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 100245914 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100245915 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 100245977 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100246025 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100246032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100246065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100246125 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100246263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100246431 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100246474 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100247081 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 100247281 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 100247309 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 100247319 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100247414 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100247428 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100247443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100247447 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100247454 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100247525 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100247569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100247577 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100247623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100247647 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100247698 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100247701 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100247748 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100247749 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100247796 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100247838 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100247869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100247885 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100247912 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100247925 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100248083 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100248098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100248132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100248164 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100248191 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100248200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100248212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100248287 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100248292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100248376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100248656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100248709 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100248732 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100248741 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100248845 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100248884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100248931 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100249064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100249084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100249126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100249146 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100249181 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100249236 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100249253 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100249393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100249407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100249455 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100249505 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100249522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100249555 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100249705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100249744 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100249812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100249851 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100249907 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100249926 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100250013 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100250015 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100250027 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 100250163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100250265 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100250301 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100250355 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100250373 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100250408 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100250429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100250456 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100250480 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100250502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100250533 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100250535 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100250788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100250904 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100250966 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100251295 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100251389 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 100251433 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100251609 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100251756 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100252201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100252228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100253169 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100253621 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100253695 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100253783 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100253785 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100254187 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100254310 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100254530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100254541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100254596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100254764 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100255017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100255104 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100255562 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100256352 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100256657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100256937 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100257216 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100257235 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100257390 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100257674 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 2 100257978 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 100258357 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100258383 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100258437 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100263508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100263802 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100263816 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100263857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100263925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100264150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100264440 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100264455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100264544 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100264601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100265103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100265508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100265626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100265833 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100266361 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100266636 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100266649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100266695 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100266727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100266979 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100267054 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100267091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100267094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100267125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100267295 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100267439 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100267901 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 100267914 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 100268136 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100268201 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 100268210 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 100268468 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 100268904 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100269091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100269409 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100269523 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100269731 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 100269753 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 100269910 T A N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 100270032 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100270547 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100270606 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100270707 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100270815 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100270882 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 100270943 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100270970 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100271025 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100271085 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100271201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100271259 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100271786 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 100272293 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100272502 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100272570 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100272940 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100273052 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100273616 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100274378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100274997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100275178 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100275395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100275829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100275881 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 100276159 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100276246 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100276265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100276297 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100276341 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100276352 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100276464 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100276565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100276607 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100276634 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100276645 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100276835 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100276925 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100277161 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 100277223 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100277224 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100277260 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100277480 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100277487 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100277527 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100277549 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100278287 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 100278517 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100278990 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 100279315 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100279394 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100279563 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100279627 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100279724 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 100279789 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100279932 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100280434 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100280552 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100280762 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100280939 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100282886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100283165 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100283197 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100283573 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100284308 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100284450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100284613 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100284718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100285053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100285199 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100285590 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100285622 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100285667 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100285720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100285878 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100286082 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100286137 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100286151 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100286309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100286346 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100286534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100286607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100286664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100287484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100287583 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100287594 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100287645 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100287646 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100288468 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100288642 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100288653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100288709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100288850 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100289222 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100289587 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100289604 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100290563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100290712 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100291153 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100291225 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100291513 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100291524 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100291541 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100378927 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100379228 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100379722 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100379780 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100444434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100444935 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100444989 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 100618305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100619900 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100619910 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100620002 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 100620026 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100620029 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100620779 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100620949 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100620952 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100621215 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100621459 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100622133 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100622160 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100622171 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100622197 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100622408 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100622593 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 100622826 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100622893 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100623082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100623260 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100623326 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100623585 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100623819 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 2 100624303 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100624339 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 100624414 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100624972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100625065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100625078 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100625378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100626690 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100626799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100628485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100629424 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100629680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100629694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100631415 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100632438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100632851 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 100633297 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100633414 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100633471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100635812 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 100635813 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100636265 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100636325 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100636385 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100636467 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100636471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100636507 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100636580 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100636795 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100636853 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 100637051 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100637329 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100637436 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 100637467 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 100637723 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100637729 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100637773 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100637994 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100638431 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100638449 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100638471 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100638626 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100638816 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100638948 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100639000 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100639032 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100639038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100639048 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100639073 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100639092 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100639181 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100639204 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 100639372 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100639376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100639415 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100639862 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100639874 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100640272 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100640551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100641648 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100642244 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100642841 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100644019 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 100644382 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 100644528 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100644583 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100644929 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 100646041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100646498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100648018 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100648480 T A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 100648619 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100649128 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100649222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100649274 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100649713 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100650734 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100651236 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100651346 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100651416 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100651551 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 100652060 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 100652251 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100652592 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100653658 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100653792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100654274 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100654372 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100654379 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100654544 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100654552 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 100654679 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100655145 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 100655220 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 100655298 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100655468 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 100655487 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 100655764 T G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 100655910 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100655913 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100655970 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100655973 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100656088 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 100656092 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 100656136 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 100656171 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 100656275 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100656282 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100656290 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 100656532 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 100656630 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 100656637 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 100656693 T G N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 100656706 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 100656721 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 100656733 C G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 100656783 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 100656849 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 100656854 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100656894 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100656906 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100656939 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100656984 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 100657130 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 100657294 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 100657382 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100657405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100657504 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100657587 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 100657648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100657681 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 100657726 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100657779 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 100657793 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 100657799 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100657838 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 100657844 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 100657879 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 100657902 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 100657933 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 100657941 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 100658039 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 100658223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100658286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100658356 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100658465 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100658478 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 100658643 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100658698 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100658703 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100658823 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100658887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100658906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100659362 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100660217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100660531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100660535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100660590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100660597 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100662278 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100662779 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 100664484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100665290 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 100665391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100666556 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100667054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100667152 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100667244 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100667290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100667946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100668370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100670235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100673996 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100674220 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100675474 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100675808 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100676849 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100676850 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100677510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100678142 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100680353 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100680997 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100681268 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100681289 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100681314 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100681363 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100681422 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 100681423 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 100681445 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 100681495 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 100681554 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 100681696 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 100681740 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 100682045 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 100682140 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100682504 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100682543 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100682544 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 100682581 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 100682725 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100682981 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100683112 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100683230 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100683622 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100683800 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 100683918 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100684026 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100684923 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100684982 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100685018 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100685194 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 100685580 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100685671 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100685704 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100686150 G T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 100686442 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 100687012 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 100687087 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100687099 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 100687120 G C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 100687122 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 100687155 A T Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 100687234 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 100687300 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 100687301 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 100687997 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 100688768 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100688811 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100689000 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 100689101 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 100689149 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 100689158 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 100689272 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 100689311 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 100689500 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 100689545 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100689772 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 100689888 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100689908 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100689944 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100690394 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100690424 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100690564 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100690682 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100690726 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100691259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100691327 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100691571 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 100691670 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100691770 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100691952 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100692100 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100692118 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100692144 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 100692145 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 100692208 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100692241 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100692372 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100692403 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100692448 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100692583 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100692721 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 100692899 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100693297 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 100693352 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 100693635 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 100693787 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 100693792 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 100693902 A T N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 2 100694067 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 100694778 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100695306 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 100695370 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100695391 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 100695615 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100695624 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 100696031 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100697891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100698279 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100698488 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100698520 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100698572 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100698600 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100699657 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 100699819 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 100699841 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100699879 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 100700154 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100700258 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 100700373 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100700522 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100700531 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100700771 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100701072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100701109 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100701199 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100701413 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100701949 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100702074 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100702263 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100702435 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100702500 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100702979 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100703292 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100703318 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100703329 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100703596 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100703724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100703749 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100703906 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100705467 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 100705839 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 100705947 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 100706827 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 100706854 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100706963 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100707417 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 100707564 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 100707581 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100707646 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100707977 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 100708197 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100708593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100708753 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 100708950 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100709007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100709026 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100709123 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100709130 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 100709220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100709319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100709454 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 100709500 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100709717 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100709823 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100710014 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100710330 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100710356 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100710421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100710442 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100710466 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 100710499 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100710597 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100710864 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 100710915 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 100710943 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100711081 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100711736 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100711752 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100711772 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 100711794 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 100712074 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 100712255 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100712587 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100712877 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100712884 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100712947 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 100713268 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100713662 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 2 100714131 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 100714758 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100715048 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100715166 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100715438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100715524 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100715616 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100717243 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100717518 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 100717587 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100718353 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100718646 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100718970 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100719029 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100719653 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100719924 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100720195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100720211 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100720500 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100720569 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100720579 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100720977 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100721227 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 100722003 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 100722039 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100722233 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100722306 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100722657 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100722700 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 100722861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100723919 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100723963 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100724099 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100724518 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 100724631 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 100724928 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 100725158 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 100725281 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 100726185 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100726392 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100726458 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100726756 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100726898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100727360 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100727474 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100727549 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100727560 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100727569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100727829 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100727976 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100728070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100728121 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100728414 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100729024 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100729196 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100729545 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100729663 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 100729959 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 100730039 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 100731006 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100731068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100731377 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100731438 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100731464 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100731488 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100731596 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100731616 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100731660 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100731897 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100732021 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100732034 G C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 100732198 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 100732199 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 100732270 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 100732307 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 100732424 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100732623 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100732724 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 100732745 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100732749 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100733001 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 100733020 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100733023 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100733035 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 100733057 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 100733076 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 100733085 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100733097 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 100733100 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 100733400 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 100733401 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 100733514 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 100733567 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 100733724 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100734483 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100734793 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100734811 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100734822 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100734986 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100735000 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100735532 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 100735764 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 100735941 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100735989 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 100736074 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 100736215 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 100736223 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 100736321 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 100736355 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100736365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100736549 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 100736565 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 100736760 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 100736829 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 100736922 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 100736945 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 100736976 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100737073 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100744137 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100744193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100744225 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100744315 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100744389 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100744522 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100744762 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100744852 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100744890 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100745023 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100745202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100745325 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100745335 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100745571 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 100745597 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100745653 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100746030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100746052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100746463 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 100746467 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 100746607 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 100746652 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100746973 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100747017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100747064 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100747089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100747101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100747368 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 100747371 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 100747399 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100747698 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 100748039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100748416 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 100748421 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 100748444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100748486 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100748667 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100748668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100748688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100748845 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100748908 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100749019 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 100749124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100749379 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100749482 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100749882 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 100749902 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100749943 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100749966 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100750049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100750148 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100750197 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 100750229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100750231 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100750343 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100750423 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100750441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100750831 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100750897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100750926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100750946 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100751398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100751745 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100751805 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100752169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100752374 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100752542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100752605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100752610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100752709 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100753026 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 100753216 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100753283 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100753299 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100753337 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100753383 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100753715 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 100754088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100754294 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100754349 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100754387 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100754423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100754519 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100754718 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100754874 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100754929 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100755038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100755109 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100755184 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100755649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100755670 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100755976 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100756051 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100756085 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100756227 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100756460 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100756890 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 100757061 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100757068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100757210 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100757373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100757391 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100757453 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 100757575 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 100757641 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100757814 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100757837 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100757998 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100758061 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100758100 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100758129 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100758257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100758417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100758566 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100758609 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100758611 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100758657 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100758675 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 100758807 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100758970 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 100758994 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100759010 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 100759047 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100759096 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100759113 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100759137 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100759210 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100759595 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100759620 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100759858 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100760337 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100760568 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100760679 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100760761 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100760770 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100760894 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100760896 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100761097 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100761315 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100761402 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 100761612 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 100761624 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 100761706 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100761746 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 100761834 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 100761939 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100762012 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100762105 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100762571 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100762803 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100762956 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100762984 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100763083 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100763087 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100763107 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100763546 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100763547 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100763597 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100764734 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100765230 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100765412 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100765713 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 100766318 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100766707 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100767428 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 100767686 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100767720 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100767731 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100767761 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 100767917 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100767934 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100767987 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100768154 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100768425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100768500 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100768559 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100768585 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100768946 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100769147 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100770589 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100770954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100770968 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100771226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100771633 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100771675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100771701 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100771910 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100772019 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100773149 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 100773189 G A Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 100773203 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 100773224 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 100773555 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100773614 G C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 100774277 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 100774335 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 100774664 A G Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 2 100774981 A G Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 100775989 C T Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 100777561 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 100778373 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 100778435 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100779454 G T Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 100779550 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 100780293 G T Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 100780324 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100780428 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100781059 T C Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 100781104 A T Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 100781810 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 100782660 C G Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 100783320 G A Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 100784153 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100784550 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100784620 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100784985 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100786383 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100786576 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100786787 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100786827 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100786836 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100786854 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100786864 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100786956 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100787141 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787176 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787242 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787252 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100787339 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787353 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787411 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100787480 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787589 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787601 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100787612 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787648 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787685 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787705 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787711 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787734 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100787800 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100787870 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100787890 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100787932 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100787965 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 100787983 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100788018 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100788030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100788114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100788157 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100788450 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100788527 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100788528 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100788539 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100788611 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100788625 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100788664 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100788790 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100788798 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100788838 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100788851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100788885 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100789089 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 100789161 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100789230 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100789305 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100789412 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100789583 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100789603 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100789708 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100789932 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 100790038 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100790045 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100790228 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100790257 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100790569 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100790756 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100792040 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100792070 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100792137 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100792616 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100792722 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100792764 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100792857 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100792883 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100793019 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100793129 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100793336 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100793374 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100793406 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100793430 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 100793559 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100794077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100794482 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100794628 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100794633 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100794804 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100794879 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100794888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100795177 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100796749 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100797031 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100797938 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100798199 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100798767 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100799027 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100799395 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100799532 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100799536 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100799642 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100799683 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100799707 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100799773 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100799883 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100800175 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100800475 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100800598 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100800617 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100800748 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100801028 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100801077 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100801286 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100801595 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100801647 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100801688 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100802365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100803924 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100803976 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 100804304 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100804537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100805235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100805317 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100805599 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100805604 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100805922 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100806010 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100806280 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 100806342 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 100806409 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 100806691 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 100807479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100807654 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100807977 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100808061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100808271 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100808544 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100808587 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 100808592 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100808889 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 100808988 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100809168 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 100809458 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100809529 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100809607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100809845 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 100810120 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 100810579 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100811187 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100811242 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100811565 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 100811734 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100811888 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100811997 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100811998 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 100812178 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100812444 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 100812741 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100812962 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100813025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100813191 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 100813452 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100813553 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100814121 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100814136 G C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 100814142 G C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100814270 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100814300 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100814450 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100814479 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 100814707 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 100814725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100814895 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100815406 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100815461 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100815515 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100815844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100815846 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100815868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100815940 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100815941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100816004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100816128 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100816233 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 100816425 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100816493 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100817134 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100817201 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100817410 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100818280 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100818732 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 100818777 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 100819268 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100819902 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100819999 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 100820030 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100820037 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100820484 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100820814 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100820891 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100821663 T A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 100821982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100822291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100822308 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100822343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100822344 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100822355 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100822450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100822533 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 100822605 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 100822899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100822980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100823022 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100823057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100823117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100823196 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100823285 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100823463 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100823475 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100823493 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100823542 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100823550 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100823618 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100823740 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 100823783 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100823796 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100823859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100823866 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100823881 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100824017 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 100824035 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100824058 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100824083 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100824086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100824122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100824168 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 100824171 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 100824195 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100824198 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100824278 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100824347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100824403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100824764 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100824877 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100824891 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100825009 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100825120 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100825445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100825545 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100825592 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100825605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100825793 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100825884 A C Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 100825918 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100826375 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100826486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100827040 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100827047 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100827063 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100827122 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100827152 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100827259 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100827313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100827553 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100827625 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100827779 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100828115 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 100828128 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 100828149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100828214 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100828605 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 100828623 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 100828634 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 100828759 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 100828783 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100828821 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 100828863 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100828899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100829235 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100829291 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100829360 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100829475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100829833 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100829847 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100829852 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100829859 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100830031 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 100830091 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100830140 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100830195 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100830207 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100830295 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100830296 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100830326 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100830371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100830416 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100830468 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100830469 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100830544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100830624 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100830684 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 100830725 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100830729 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100830808 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100830852 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100831168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100831180 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100831317 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100831438 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100831469 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100831695 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 100831818 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100832010 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100832065 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100832168 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100832202 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100832236 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100832248 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100832267 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100832369 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100832753 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100832945 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100833057 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100833058 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100833129 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100833272 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100833324 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 100833327 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 100833345 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 100833394 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 100833753 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 100833818 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 100833824 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 100833847 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 100833889 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 100833909 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100834251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100834441 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 100834497 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 100834582 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 100834755 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 100834865 A C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100834964 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 100835002 G T Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 2 100835157 T G Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 100835254 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100835356 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100835627 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100835997 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 100836678 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 100836712 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 100836741 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100836855 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100836877 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100836893 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100836957 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 100837002 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 100837028 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 100837072 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 100837073 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100837108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100837110 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 100837166 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 100837184 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100837236 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 100837282 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100837331 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100837363 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100837377 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100837453 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100837459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100837475 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100837584 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 100837649 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 100837681 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100837740 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 100837793 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100838052 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100838174 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100838280 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 100838482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100838890 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100839094 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100839117 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100839179 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100839201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100839344 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100839454 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100839489 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100839541 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100839547 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100839685 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100839693 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100839780 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100840058 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 100840081 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100840119 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100840148 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 100840177 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100840209 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100840225 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100840265 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100840418 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 100840466 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100840485 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100840491 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100840500 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100840636 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 2 100840740 G C N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 100840749 T C N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 100840761 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 100840970 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100840984 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100840985 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100840995 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100841003 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100841091 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 100841152 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100841169 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100841187 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100841245 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100841366 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 100841388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100841480 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 100841609 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100841652 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100841687 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100841704 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100841848 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100841876 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100842050 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 100842136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100842179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100842318 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100842597 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100842604 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 100842608 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100842637 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100842715 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100842750 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100842778 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100842829 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100842865 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100842919 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100842962 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100843081 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100843137 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100843179 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100843242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100843449 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100843549 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100843585 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100843663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100843684 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100843807 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100843841 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100843923 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100843947 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100843950 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100843964 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 100843966 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100843995 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100844012 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100844602 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100844613 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100844620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100844698 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100844773 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 2 100844847 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 100844862 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 100844883 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 100844884 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100844904 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100845177 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100845295 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 100845308 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 100845338 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 100845752 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 100845879 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 100845905 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 100846021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100846028 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100846042 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100846108 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100846130 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100846183 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 100846199 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100846240 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100846282 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100846303 C G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100846326 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100846399 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 100846401 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 100846424 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 100846455 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 100846464 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 100846475 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 100846502 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 100846538 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 100846564 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100846622 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 100846669 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100846749 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 100846813 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 100846818 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 100846892 C G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100846942 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100847005 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 100847091 T C Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 2 100847264 C G Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 2 100847293 C T Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 2 100847321 G A Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 100847368 A G Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 100848779 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100848847 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100848852 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100848894 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100849254 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 100849262 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 100849293 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100849332 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 100849374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100849417 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 100849492 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100849743 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100849750 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 100849934 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 100850175 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 100850209 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 100850235 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 100850477 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100850779 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 100850849 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100850869 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 100850935 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100850995 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 100850998 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100851023 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 100851119 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 100851139 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 100851726 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 100851908 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 100852109 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 100852153 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100852175 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 100852213 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 100852303 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 100852381 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100852559 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 100852683 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100852698 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100852825 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 100853075 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100853116 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100853128 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100853390 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 100853522 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 100853915 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100854098 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 100854960 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100855184 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100855444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100855466 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100855532 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100855944 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 100856194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100856398 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100856849 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 100856930 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 100859117 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 100859122 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 100860994 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100861851 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100862119 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100862709 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100863315 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 100864006 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100864067 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100865546 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 100866036 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100867100 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100867468 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 100867848 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100868065 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100868069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100868141 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100868147 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 100868168 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100868210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100868254 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 100868348 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 100868454 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100868475 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 100868938 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 100868965 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 100869033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100869159 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100869171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100869316 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100869344 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100869509 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100869693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100869933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100870179 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100870225 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100870432 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 100870780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100870893 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100870941 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 100871037 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100871065 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100871922 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 100871979 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 100872003 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100872100 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100872116 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100872120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100872216 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100872219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100872281 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100872507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100872528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100872639 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100872664 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100872901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100873008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100873135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100873420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100873487 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100873525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100873597 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100873671 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 100873712 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 100873844 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100873867 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100873891 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100874087 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 100874241 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100874252 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100874287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100874490 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100874524 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100874753 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 100874803 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100874917 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 100874935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100874945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100874952 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100874973 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100875040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100875216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100875326 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100875386 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 100875659 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100876090 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 100876123 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100876201 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100876231 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100876658 T G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 100876845 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 100876852 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 100877221 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100877228 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 100877279 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100877557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100877698 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100877735 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100877751 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 100877945 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100878016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100878154 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100878335 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100878361 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100878891 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100878922 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100878989 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100879266 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100879306 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100879492 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 100879493 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 100879507 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100879567 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100879736 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 100879751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100879773 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100879832 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100879865 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100879875 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100879893 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100880026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100880051 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100880055 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100880269 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 100881146 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 100881945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100882156 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 100882652 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 100882986 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100883801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100884876 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100885085 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 100885552 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100887749 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100888274 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100888491 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100888543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100888549 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100888601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100888899 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100888957 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 100888958 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 100890151 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 100890270 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100890864 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 100891675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100891690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100891781 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100891944 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 100892097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100892429 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100892998 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100893827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100893943 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100894663 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 100895356 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100896536 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 100897959 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 100899021 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100899101 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 100900651 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 100901889 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 100901907 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 100902452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100902455 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100902761 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 100902768 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100903372 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100903706 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100904186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100904239 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 100904697 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 100904862 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100905018 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 100905322 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 100905683 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 100905801 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 100905923 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 100906096 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 100906147 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 100906344 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100906743 G A Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 100906971 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 100907235 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100907928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100909330 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100910242 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100912967 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 100913492 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 100913829 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 100914045 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 100914744 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100914841 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100914930 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100914946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100914986 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100915013 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 100915235 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 100915336 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 100915498 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 100915508 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 100915742 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 100915793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100916197 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100916348 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 100916703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100916748 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100916969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100917262 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 100917369 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 100917478 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 100917733 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100917968 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 100918113 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100918410 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 100918624 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 100918636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100918670 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100919508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100919924 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100919944 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100920012 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 100920032 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 100920106 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100920247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100920284 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100920352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100920439 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100920486 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100920729 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100920797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100920894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100920937 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100921337 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100921382 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100921443 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100921444 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100922220 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100922464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100922696 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 100922745 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 100922850 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 100922923 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 100923016 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100923178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100923195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100923266 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100923370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100923385 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 100923393 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100923645 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100923698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100923729 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 100923842 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100923912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100924375 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 100924380 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 100924390 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 100924479 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 100924675 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100924709 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 100924914 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100925097 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 100925569 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 100925583 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100925665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100925704 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 100925761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100926000 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 100926273 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 100926571 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 100926574 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 100926651 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 100927212 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100927594 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 100927656 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100928298 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 100928600 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100928643 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100929964 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100930632 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 100930828 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 100931137 G C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100931167 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 100931661 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 100931749 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 100931756 G T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 100931774 T G N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 100932017 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 100932196 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 100932622 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 100933549 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 100933585 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 100933866 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100934216 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100934229 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100934411 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 100934608 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100934926 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100935536 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100935695 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 100935716 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 100935741 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100935742 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100935911 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100936016 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 100936117 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 100936147 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100936439 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 100936522 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 100936833 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100936865 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 100937006 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100937059 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100937314 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 100937400 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 100937619 A G N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 100937742 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 100938016 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100938086 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100938240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100938365 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100938411 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100938428 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 100938436 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100938440 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100938665 A G Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 100939077 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100939089 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100939110 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100939171 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100939232 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100939883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100939944 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100940312 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100940449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100940503 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 100940647 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 100940743 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 100940831 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100941113 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 100941581 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100941712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100941835 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100941915 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 100941971 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 100942006 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 100942106 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100942179 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100942234 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 100942376 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 100942377 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 100942466 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 100942492 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 100942507 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 100942738 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 100942758 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 100942807 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100942821 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 100942891 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 100942954 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 100943028 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 100943033 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100943146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100943198 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 100943246 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100943353 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 100943534 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100944688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100945275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100945900 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100946539 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 100951182 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 100951993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100952526 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100952899 A C Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 100957200 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100957305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100959357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100959601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100960496 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100961233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100961415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100961652 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100961713 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100962123 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100963223 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 100963261 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 100963265 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 100963280 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 100963428 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 100963837 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 100964227 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100964312 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 100964346 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100964592 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 100965079 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100965107 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 100965165 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100965222 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100965326 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100965331 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100965349 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 100965360 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 100965374 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 100965399 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100965500 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100965593 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100965614 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100965615 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 100965918 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100965957 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100965983 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 100966021 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 100966049 A T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 100973805 C A N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 100973866 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 100973950 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 100973995 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 100974021 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 100974030 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 100974094 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100974100 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100974109 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100974215 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100974272 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100974527 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100974665 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 100974706 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 100974749 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 100974888 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 100974982 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 100975122 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100975169 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100975200 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100975272 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 100975346 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100975403 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 100975419 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 100975533 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 100975689 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 100975699 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100975721 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100975770 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100975803 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 100975858 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100976047 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 100976236 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100976244 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 100976252 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 100976257 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 100976311 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100976316 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100976350 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100976581 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 100976596 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 100976600 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 100976655 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 100976722 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 100976791 C G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 100976797 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 100977032 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100977066 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100977198 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100977259 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 100977260 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100977517 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100977566 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100977617 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 100977865 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 100977980 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 100978020 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100978033 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100978532 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100978560 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100978607 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100978661 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100978673 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100978950 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100978955 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 100978986 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100979062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100979093 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100979175 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 100979377 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 100979409 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 100979432 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 100979535 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100979570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100979616 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100979642 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 100979718 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100979899 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 100979995 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100980075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100980126 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100980195 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100980257 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100980394 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100980572 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100980774 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100980796 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100980847 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 100980861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100980959 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100981240 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100981497 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100981499 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100981562 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100981578 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 100981704 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100981760 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100981817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100981837 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100982059 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 100982359 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100982478 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100982689 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100982788 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100983348 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 100984212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100985650 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 100994908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100997414 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100997422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 100997561 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 100997798 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 100998489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 100998632 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 100998677 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 100999139 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 100999428 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 100999491 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 100999966 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 101000425 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 101000739 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 101001273 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 101001277 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 101001518 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101001648 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 101001675 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 101001779 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101001900 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 101001979 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 101002005 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 101002165 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101002177 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 101002438 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 101002844 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101002940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101002988 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101003028 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 101003090 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101003225 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 101003298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101003433 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 101003570 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 101003593 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 101003777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101003783 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101003820 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101003828 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101003857 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 101003886 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 101004018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101004144 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101004279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101004341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101004366 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 101004493 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 101004539 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 101004725 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 101004787 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 101004818 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 101004912 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 101004939 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101005201 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101005258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101005290 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101005315 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101005745 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101005769 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 101005834 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101005924 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101005987 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101006517 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101006530 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101006782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101006946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101007057 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101007159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101007266 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101007437 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101007643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101007725 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101007814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101008177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101008311 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101008409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101008441 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 101008550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101008612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101008753 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101008877 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101009009 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101009058 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101009088 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 101009118 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101009160 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 101009179 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 101009220 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101009245 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101009246 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101009332 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 101009433 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101009544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101009803 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101009834 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101009859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101009918 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101010069 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101010088 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101010172 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101010192 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101010279 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 101010475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101010501 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 101010706 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 101010903 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101010920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101010931 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 101011024 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 101011055 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 101011572 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101011621 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101011741 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101012009 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101012026 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 101012338 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101012471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101012752 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101012974 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101013007 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101013044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101013678 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101014277 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101014449 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101014710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101015341 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101015563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101017499 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101018726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101018937 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101019359 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 101019815 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101020037 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101020281 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101020514 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101022207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101022529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101022626 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 14 14 2 10 2 2 101022656 A T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 101022709 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 101022738 T A Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 101023697 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 101024482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101024923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101025496 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 101025510 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 101025923 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 101025990 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 101026108 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101026336 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 101026365 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 101026401 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 101026408 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 101028660 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 101028666 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 101028894 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 101029034 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 101029418 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 101029661 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 101031005 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 101032761 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101033496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101033926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101035355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101035598 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 101035908 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 101036233 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 101036539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101038576 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 101039065 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 101039068 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 101039260 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 101039449 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 101039884 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 2 101040471 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 101040583 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 101041661 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 101041667 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101041677 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 101042723 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 101042772 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 101043281 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 101043487 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 101043590 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 101044126 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 101044624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101045864 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101046974 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101047129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101047585 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 101048370 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 101048897 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 101049777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101049901 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 101050422 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 101050824 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 101051512 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101051938 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101051949 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101052054 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 101052544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101052950 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101053948 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 101054067 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101055032 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 101055033 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 101055102 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101055124 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101055226 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101055251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101055375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101055562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101056642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101057984 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 101058027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101058219 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101059052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101060181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101060478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101062773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101063065 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101066712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101067547 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101071333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101071496 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101075553 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 101075626 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101076787 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101078108 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 101083149 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101084334 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101085950 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 101087620 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101088603 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101090806 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101091839 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101092017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101092792 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101093929 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101094013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101094430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101094434 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101095211 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101095640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101096979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101096995 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101097146 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101097289 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101097523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101099747 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 101099772 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 101099965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101100053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101100147 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101100502 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 101100751 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 101100763 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 101101025 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101101092 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101101962 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101102017 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 101102053 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 101102096 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101102107 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 101102407 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 101102429 G C N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 101102465 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 101102530 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101102790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101102880 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101102926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101103058 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101103328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101103344 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101103366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101103622 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101103877 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101104194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101104201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101104386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101104388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101104414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101104422 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101104448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101104538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101104566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101104658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101104950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101105415 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101106055 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101106083 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101106322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101106710 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101106966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101107106 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101107122 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101107468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101107515 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101107531 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101107967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101107995 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101108110 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101108305 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101108374 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 101108492 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 101108597 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 101108631 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101108777 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101108877 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 101108884 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 101109019 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 101109029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101109232 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101109290 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 101109305 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 101109431 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 101109473 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 101109479 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 101109657 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101109690 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 101109793 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101109845 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101110022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101110033 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101110076 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101110077 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101110110 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 101110304 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 101110323 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101110345 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101110348 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101110429 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101110505 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 101110619 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 101110648 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101110717 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101110874 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101110941 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101110947 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101110978 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 101111022 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101111029 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 101111090 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101111102 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101111183 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101111196 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101111233 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101111262 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101111354 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101111364 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 101111543 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101111560 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101111587 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101111616 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101111619 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101111631 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101111644 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 101111672 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 101111870 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101112317 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 101112567 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101113150 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 101113239 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101114297 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101114332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101115739 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101115920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101115926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101116090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101116900 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101116905 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101116976 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101117577 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101118239 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 101118461 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101118481 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101118510 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101118790 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101119338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101120271 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101120480 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101120976 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101120995 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101121032 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101121042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101121129 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101121206 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101121478 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 101121718 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 101121829 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 101121856 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101121972 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101122396 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 101122745 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101123175 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 101123230 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101123962 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101124062 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101124196 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101124353 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101124529 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101124610 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 101125116 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 101125151 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 101126063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101126087 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 101126249 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101126859 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101127119 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 101127223 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 101127499 G T N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 101127503 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 101127566 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 101127647 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101127934 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101128056 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101128079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101128439 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 101128445 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 101128588 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 101128646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101129033 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101129130 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101129261 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 101130125 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101130319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101130935 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101131314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101131359 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101131416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101132404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101132782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101133152 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101133669 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101135471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101135723 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101135755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101136137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101136402 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 101138515 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101141258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101141450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101141919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101145814 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 101146945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101147208 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101149438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101149547 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101149755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101150773 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101150872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101151946 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101151956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101155687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101157515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101157620 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101157917 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101159420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101159758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101163448 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101165395 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101168825 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 101171889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101172940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101173016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101173367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101173389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101173445 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101173454 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101174961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101175534 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 2 101176388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101176525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101178749 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 101179154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101179751 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 101179820 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 101180610 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101180808 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101180979 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101180980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101181045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101181401 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101181687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101181769 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101182075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101182313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101182326 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101182477 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101182722 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101182829 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101183249 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101183418 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 101183769 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101183977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101192137 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101192773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101194008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101194752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101194769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101194808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101194835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101194977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101194999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101195030 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101195125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101195540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101195879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101196241 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101196485 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101196952 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101197529 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101197686 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 101198223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101198266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101198418 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101198468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101199099 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101199338 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101200378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101201173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101201401 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101201449 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101201490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101201819 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101204123 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101204277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101205418 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101208062 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101208106 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 101212868 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101213617 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101214343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101215775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101216132 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 101217490 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101217997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101220114 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 101222070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101223069 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101224015 T A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 101224121 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101225658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101228064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101229285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101229298 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101230912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101232245 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101232475 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101235240 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101236128 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 101236644 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101236714 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101236779 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101236795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101236825 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101236830 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101236849 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101236972 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101237046 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101237087 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101237268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101237276 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101238040 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101238133 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101238153 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101238164 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 101238193 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 101238645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101238753 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101238776 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 101239222 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101239585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101240375 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101240590 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101241434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101241543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101241576 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 101242667 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101242818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101243063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101243662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101243850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101244523 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 101245281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101245295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101246191 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101247570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101247996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101248064 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101249529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101251506 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 101251548 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101251851 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101252919 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 101253022 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 2 101253897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101254293 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101254434 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 101255297 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101255561 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101256028 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 101256070 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 101256086 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 101256809 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 101257677 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 101258588 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101258929 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 101259000 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101259246 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 101259257 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 101259463 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101259709 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101260278 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101260460 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101260494 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101260852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101261002 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101261347 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 101261360 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101261578 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101261803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101262053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101262967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101262994 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101263319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101263348 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101263439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101263796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101264306 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101264490 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101264816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101264983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101265095 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101265195 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 101265201 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101265730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101265759 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101265762 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 101266371 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 101266448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101266467 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101266852 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 101267115 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101267212 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101267219 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101267552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101267802 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101267888 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101267964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101267985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101268138 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101268286 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101268441 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 101268484 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101268527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101268763 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101268851 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 101268995 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 101269182 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 101269661 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101270363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101271421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101271664 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101272718 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101273298 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101273431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101273559 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101273568 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101273677 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101273778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101274038 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 101274149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101274232 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101274547 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101274567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101274709 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101274725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101274787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101274957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101275224 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 101275226 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 101275414 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101275654 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101275722 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101276276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101276521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101276597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101276781 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101276873 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101277709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101277932 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101278311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101278416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101279306 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101279999 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 101280321 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 101281068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101281071 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101281086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101281179 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101281468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101282636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101282818 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101282855 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101282907 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101283209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101283240 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101283488 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101283763 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101284150 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101284216 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 101284691 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 101284808 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 101285085 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101285226 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101285618 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101285645 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 101285695 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101285734 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101285785 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101285833 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101285893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101286088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101286089 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101286313 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 101286333 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101286401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101286524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101287366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101287469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101287582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101287625 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101288980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101288991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101289428 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101289552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101289681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101289714 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101289957 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 101290637 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 101290720 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 101290867 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101291093 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101291100 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101291168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101291306 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101292160 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101292226 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101292239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101293599 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101293841 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101294069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101294306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101295358 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101295503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101295542 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 101295746 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101296023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101296104 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101296117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101296122 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101296209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101297880 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101298937 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101299080 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101299108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101299554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101299942 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101300695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101300699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101300942 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101301071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101301213 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101301214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101301230 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101301554 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101301651 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101301696 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101301762 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101301847 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101301853 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101301870 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101301963 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101302016 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101302273 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101302306 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101302980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101303421 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101303423 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 101303445 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101303470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101303502 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101303531 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101303570 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101303571 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101303778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101303936 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101304813 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101304999 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101305357 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101305405 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101305868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101306900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101306954 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101307353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101307383 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 101307411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101308791 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 101308801 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 101311850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101312515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101313265 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101313526 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101314193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101315013 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101317820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101318137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101318283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101318477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101318670 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101318844 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101318848 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101318973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101319021 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101319247 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101319337 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101319345 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101319700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101320416 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101320434 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101320448 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101320509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101320514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101320562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101320709 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101320711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101321212 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101321344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101321405 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101321458 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 101321538 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 101321594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101321681 C A Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 101321685 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 101328261 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101328471 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101328493 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101328553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101328652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101328835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101328851 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101329105 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 101329232 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101329454 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 101329555 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 101329684 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101329994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101330004 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101330296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101330854 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101330881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101331015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101331302 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 101331334 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 101331484 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 101331553 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101331647 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101331722 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101331960 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101332328 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 101332388 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 101332423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101332459 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101332604 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 101332606 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 101332619 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101332793 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101332813 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 101333301 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101333422 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 101333478 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 101333534 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 101333644 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 101333753 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101333799 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 101333930 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 101334084 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101334130 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101334154 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 101334278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101334431 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 101334605 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 101335088 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101335361 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101335514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101335522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101335549 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101336184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101336947 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101337259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101337579 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101338350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101338955 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101340508 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 101341622 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101341779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101341951 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101342015 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101342117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101344422 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 101344616 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 101344651 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101344655 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101344722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101344756 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101344805 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101344894 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101344917 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101345005 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 101345139 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 101345400 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101345559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101345845 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 101345868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101346118 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 101346168 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101346224 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 101346231 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 101346279 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101346349 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 101346437 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101346465 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101346502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101346534 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101346567 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101346597 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 101346663 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101346677 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101346788 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 101346893 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 101347073 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101347115 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101347180 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101347274 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101347859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101347904 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101347956 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101348028 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101348184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101348237 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101348372 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101348473 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 101348497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101348525 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101348667 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 101348702 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101349038 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101349112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101349137 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101349183 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101349362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101349696 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101349728 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101349861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101350657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101350998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101351009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101352104 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 101352427 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101352464 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101352577 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101352693 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 101352713 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101356419 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101356444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101356451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101356512 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101356513 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101356537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101356701 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101356769 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101357062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101357353 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101357434 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101358173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101358185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101358246 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101358257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101358284 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101358359 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101358364 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 101358527 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101358948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101359321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101359544 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 101359546 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101359637 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101359729 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 101359856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101360107 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101360114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101360683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101361700 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 101361730 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 101362191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101362569 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 101362652 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 101362978 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 101362980 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 101363006 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 101363023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101363047 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 101363226 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 101363595 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101363698 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101365026 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 101365327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101365533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101365897 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101366119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101366283 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 101367631 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 101368491 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 101368567 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 101369629 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101369658 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101370264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101371463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101371468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101371519 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101371528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101371681 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 101371812 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 101371815 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101371864 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 101371909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101371979 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101371992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101372019 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 101372030 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101372056 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101372125 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101372190 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 101372199 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101372305 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101372360 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101372441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101372444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101372591 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 101372749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101372899 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101372956 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101373216 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 101373318 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101373811 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 101373855 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 101373925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101373935 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101374098 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101374547 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 101374585 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 101374587 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 101374607 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101374702 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 101374750 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101374878 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101374929 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101374943 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 101374969 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 101374982 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 101374986 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 101375073 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101375239 G C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 101375333 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 101375405 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101375875 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 101375893 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 101375940 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101375983 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101375993 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101375995 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 101376037 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 101376079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101376186 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101376268 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 101376292 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 101376309 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101376343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101376403 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101376524 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 101376555 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 101376617 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 101376865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101377128 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101377155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101377176 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101377209 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 101377228 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 101377277 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101377326 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 101377337 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101377408 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 101377497 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 101377589 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101377850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101377975 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101378034 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 101378053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101378128 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 101378188 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 101378213 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 101378220 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 101378335 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 101378724 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101378741 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 101378761 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 101378775 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101378786 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101378792 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101378846 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101378874 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101378989 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101379075 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101379109 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101379110 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101379357 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 101379394 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 101379410 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 101379655 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 101379762 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 101379791 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 101379817 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101379904 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101379923 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 101379974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101380034 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 101380459 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101380468 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 101380481 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101380491 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101380517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101380590 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 101380596 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 101380612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101380674 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 101380797 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101380840 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 101380873 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101380897 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101380912 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101381115 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 101381131 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101381729 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 101381847 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 101381897 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 101381983 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101382063 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 101382108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101382115 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 101382215 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101382242 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101382548 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101382605 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101382667 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101382679 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101382688 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101382769 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 101382774 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 101382957 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 101383106 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 101383976 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101384146 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 101384241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101384281 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101384368 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101384423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101384607 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 101384637 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101384668 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 101384781 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101384810 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101384866 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 101384881 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101384948 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101384994 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 101384997 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 101385074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101385087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101385189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101385255 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 101385284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101385395 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101385432 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 101385612 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 101385984 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 101386037 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101386153 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 101386159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101386235 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 101386238 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 101386358 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 101386597 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101386796 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101386838 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 101386930 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 101386933 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 101387006 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 101387050 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101387130 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 101387152 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101387245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101387316 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 101387431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101387607 T G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 101387646 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.272727272727273 0 0.727272727272727 6 16 3 0 8 2 101387649 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 101387791 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 101387817 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 101387854 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101387899 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 101388007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101388196 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101388236 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 101388352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101388369 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101388715 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 101389586 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 101390908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101391389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101391408 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 101391463 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 101391489 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 101392254 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101392881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101393214 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101393515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101393619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101394125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101394819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101394829 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101395299 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101395691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101395814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101395905 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 101396004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101396379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101396410 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101396462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101396512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101396599 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 101396600 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101397027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101397251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101397634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101397659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101398149 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101398249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101398354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101399343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101399587 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 101399725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101399836 G C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 101399932 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101400038 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 101400257 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101400402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101400617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101400769 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101401435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101401563 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101401604 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 101401616 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101401805 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 101401818 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 101401829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101402258 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 101402344 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 101402440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101402565 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 101402691 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101402725 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101403140 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 101403172 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 101403384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101403501 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101403585 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101403592 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101404254 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 101404652 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 101404712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101404764 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101404787 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101404965 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101404999 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101405140 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101405170 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101405202 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101405288 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101405308 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101405309 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101405325 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101405407 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101405408 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101405450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101405481 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 101405625 T A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 101405630 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 101405670 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 101405742 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 101405784 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 101406017 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 101406068 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 101406099 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 101406111 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 101406113 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 101406311 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 101406370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101406372 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 101406471 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 101406526 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 101406543 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101406589 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101406747 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 101406795 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101407001 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 101407015 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 101407016 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 101407064 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101407089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101407103 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 101407154 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 101407273 T A N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 2 101407275 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 2 101407358 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 101407359 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 101407409 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 101407765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101407970 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 101408249 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101408394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101408418 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 101408432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101408446 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 101408459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101408478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101408480 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 101408517 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 101409695 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101409721 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101409798 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101409885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101410288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101411607 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 101411773 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 101412298 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 101412586 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 101413808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101413850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101413964 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 101414120 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 101414691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101415125 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101415263 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101415916 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101416479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101416568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101416620 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101416646 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101416933 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 101417288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101417583 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101418396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101419730 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101420683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101422193 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 101422194 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 101422744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101424105 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101425049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101425760 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 101426049 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 101427386 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101427446 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 101428231 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101428447 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101431209 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 101431448 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101431516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101431626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101433430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101434926 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101435968 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101438191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101438895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101439120 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101439358 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 101439396 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 101440145 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 101440488 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 101440529 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 101440658 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 101441553 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 101441632 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101441648 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 101441652 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 101441844 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101442243 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 101442262 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 101442300 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 101442502 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101442522 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101442745 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101442855 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 101443004 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 101443027 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 101443150 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 101443169 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 101443287 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101443335 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101443547 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101443742 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101443812 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 101443818 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 101444107 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 101444180 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 101444266 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 101444276 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 101444367 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 101444447 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 101444464 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 101444509 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 101444522 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 101444554 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101444710 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 101444807 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 101444976 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101445236 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101445532 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 101445591 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 101445638 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101445677 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 101445738 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101445764 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101445788 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 101446065 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 101446134 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 101446145 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 101446317 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101446348 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101446407 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 101446552 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101447453 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 101447552 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 101447572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101447670 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 101447964 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 101447991 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 101448170 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 101448250 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 101448417 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 101448545 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 101448979 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101448981 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 101449146 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 101449281 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 101449498 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 101449651 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101449682 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 101450099 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 101450298 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 101450921 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 101450969 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 101451603 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 101452117 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 101452135 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 101452138 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 101452241 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 101452797 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 101453113 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 101453653 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 101454935 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101455796 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101455810 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 101456213 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 101456256 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 101456679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101456880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101457002 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101457196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101457327 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101458018 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 101458785 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101458904 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 101459027 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 101459109 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 101459197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101459629 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 101459930 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 101460101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101460846 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 101460972 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101460989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101461300 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 101462154 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101462271 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101462602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101462654 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101462970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101463526 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101463870 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101464210 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 101464444 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 101464909 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 101464927 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101465251 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 101465384 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 101465402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101465724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101465734 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101465755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101466251 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 101466279 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 101466297 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 101466674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101466855 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 101466878 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 101466906 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 101466909 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101466953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101467017 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 101467156 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 101467172 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101467195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101467218 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 101467262 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 101467345 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 101467470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101467701 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 101467950 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 101468652 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 101468958 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101469011 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101469090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101469123 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101469221 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101469938 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 101470553 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101470577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101470724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101470765 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101470826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101471116 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101471152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101471355 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101471515 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101471675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101471837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101471889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101471931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101472775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101472829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101473177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101473313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101473372 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101473597 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101473638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101473760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101474223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101474370 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 101474479 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 101474680 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 101474685 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 101474714 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 101474719 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 101474804 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 101474843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101474886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101474916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101475099 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101475106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101475354 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 101475392 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 101475688 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 101475821 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101476129 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101476365 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 101476369 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101476434 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101476466 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101476684 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101476704 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 101476872 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0 0.8 0.2 16 24 0 16 4 2 101477058 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101477116 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101477245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101477250 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 101477374 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101477381 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 101477773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101477975 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 101478076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101478088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101478090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101478259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101478894 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101478897 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101478929 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101478985 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101479001 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101479010 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101479013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101479134 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101479150 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 2 101479152 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 101479266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101479279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101479417 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 101479611 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101479625 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101479646 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101479686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101479770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101479864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101480059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101480390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101480483 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101480556 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101480819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101480870 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101480898 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101480919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101480949 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101480963 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101481042 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101481112 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101481205 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101481222 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101481277 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101481479 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101481708 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 101482088 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101482247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101482759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101483916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101484725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101485305 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101485484 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 101485764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101489384 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 101490228 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101490309 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101490313 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101490500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101491057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101491354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101491920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101493687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101493807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101494170 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 101496529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101499072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101499785 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101499859 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 101500002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101500790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101500911 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 101501581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101501633 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101501842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101501852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101501875 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 101501876 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 101502054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101502147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101502210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101502269 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101502273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101502291 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 101502292 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101502427 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 101502430 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101502525 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101502537 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101502550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101502596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101502718 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101502723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101502752 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101502801 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101502862 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101502891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101502918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101502957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101503215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101504081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101506319 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101506400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101508041 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 101508313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101509076 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 101509197 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 101509727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101509987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101510544 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 101510563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101511679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101511703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101512428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101512560 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 101512697 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 101512964 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 101513252 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 101513399 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 101514159 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 101516121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101516615 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101516734 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 101516956 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101517798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101518098 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101518258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101518264 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101519119 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101519626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101522848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101523524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101525086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101527906 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101528346 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101529467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101529811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101534030 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 101537937 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101539286 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 101539750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101540269 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101540399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101540732 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 101540738 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 101540841 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101541086 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 101541225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101541346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101541416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101541606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101541831 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 101542251 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 101542286 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 101544162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101545702 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 101546889 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 101547087 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101547319 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101547550 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101547812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101547839 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 101547844 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101547861 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101547863 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101547899 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 101547909 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 101548076 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 101548095 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 101548220 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101548334 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 101548570 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 101548887 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101548888 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101549028 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 101549075 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 101549107 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101549123 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101549124 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101549181 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 101549419 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 101549791 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101549827 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 101550323 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101550475 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101550592 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101550972 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101551257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101552297 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101552335 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101552541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101555631 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101556189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101556959 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 101556980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101557898 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101558896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101559512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101560479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101560655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101561256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101561638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101561990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101562767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101562875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101562898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101562920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101562992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101563611 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101563842 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 101563886 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 101563967 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 101563978 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101564056 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101564467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101564641 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 101564684 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101564717 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101564860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101564889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101564907 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101564937 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 101565223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101565505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101565610 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101565707 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101565741 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101565955 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101565983 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101566076 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 101566078 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 101566137 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 101566168 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101566217 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101566359 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 101566770 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101566821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101566879 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 101569106 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 101569221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101570040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101572183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101572468 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101574092 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 101574121 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 101574167 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101574383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101575155 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101575166 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101575327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101575413 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101575443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101575742 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 101575843 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 101575878 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 101576161 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101576315 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 101576442 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101576485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101576565 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101576794 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 101576853 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 101576859 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101576889 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 101578036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101578103 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101578129 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 101578181 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101578344 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 101578381 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 101578395 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 101578432 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101578513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101578612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101578625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101578741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101578748 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 101578753 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 101578844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101578855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101578959 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 101579004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101579046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101579145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101579152 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101579457 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101579480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101579541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101579777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101580092 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 101580110 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 101580115 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 101580234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101580413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101580593 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 101580602 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101581602 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 101581789 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 101582751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101582967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101583101 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 101583602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101583603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101584214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101584223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101585609 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101585700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101586332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101586716 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 101586753 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 101586789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101588415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101588950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101589097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101590113 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101592691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101593046 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101593096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101593721 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101593765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101594678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101595462 G C N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 101595606 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101596118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101599285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101602404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101602454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101602699 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101603038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101603240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101604434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101605565 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101605616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101605618 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 101605923 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101606230 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 101606550 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 101610893 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101611163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101611683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101612415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101613184 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101613420 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 101613802 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101615101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101615251 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101616236 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 101616256 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 101616804 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101616853 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101617021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101617086 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101617147 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101617192 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 101617294 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101617356 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 101617430 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 101617439 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101617472 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101617505 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101617898 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101617929 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101617987 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101618521 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101618815 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101618989 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101619010 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101619013 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101619098 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101619099 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101619141 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101619788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101619800 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101619853 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101620128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101620355 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 101620381 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 101620428 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 101620443 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101620502 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101620511 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101620523 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101620658 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101620705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101620748 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101620855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101620981 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101621052 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 101621295 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101621362 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 101622204 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 101622853 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101623034 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101623039 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101624281 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 101624305 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101624354 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 101624388 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 101624407 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 101624412 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 101624515 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 101624527 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 101624528 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 101624572 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101624711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101625029 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 101625249 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101625311 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 101625549 C G Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 101626930 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101627083 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 101627598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101627661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101627940 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 101627988 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 101628304 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 101628429 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 101628601 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101628831 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 101629300 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 101629451 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101629497 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101629499 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101629518 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101629798 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101629829 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101629894 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101630092 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101630201 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101630405 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101630515 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101630597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101630664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101630801 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101630823 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101630957 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101631092 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101631127 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 101631138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101631156 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101631173 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 101631473 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101631572 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101631588 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101632363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101634518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101636687 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 101637139 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101641517 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 101641772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101641835 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101642478 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101642514 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101642842 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101643105 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 101643227 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101643711 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101644259 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101644276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101644368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101644385 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 101644461 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101644553 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 101644758 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 101645191 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 101645238 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101645364 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101645442 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 101645451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101645463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101645485 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 101645500 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 101645538 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101645570 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101645585 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 101645692 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 101645720 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 101645739 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 101645742 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 101645787 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 101645836 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 101646154 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 101646187 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 101646190 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 101646284 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101646401 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101646844 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 101646978 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 101647000 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 101647057 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101647075 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101647330 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101647333 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101647360 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101647426 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101647440 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101647463 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101647597 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 101647637 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101647870 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101648578 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101650647 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 101653565 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 101653575 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 101653582 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 101655581 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101657722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101659129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101660221 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101660721 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 101660784 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 101660787 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 101660936 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 101660946 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 101661125 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 101661251 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 101661411 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 101661882 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 101661897 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101662160 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 101662524 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 101662738 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 101662773 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 101663878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101665888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101667336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101667534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101668746 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101669067 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101669627 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101669719 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 101669810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101669813 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101670033 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101670067 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101670589 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101671045 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 101671527 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101671546 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101671561 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101671605 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101671607 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101671719 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101671743 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101673123 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 101673148 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101673198 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101673707 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101673723 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 101673879 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101674099 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101674175 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 101674236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101674422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101674440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101674482 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 101674531 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 101674540 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101674610 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 101675091 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 101675144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101675175 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 101675238 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 101675270 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101675361 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101675385 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101675392 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101675399 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 101675403 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101675413 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 101675539 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 101675617 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 101675619 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101675771 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 101675802 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 101675911 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101675986 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101675987 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101676165 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101676205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101676207 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101676254 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101676263 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101676494 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101676551 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101676827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101677326 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101677937 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 101677953 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 101678349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101678599 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 101678707 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101678811 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101679022 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 101679563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101679578 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101679787 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101683341 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101683344 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101684278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101684370 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101684528 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 101684663 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 101684703 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 101684975 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 101685058 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101685098 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 101685137 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 101685277 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 101685572 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101685606 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101686295 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101686586 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101686727 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101686737 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101686830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101686842 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 101686862 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101686891 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101686998 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 101687049 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 101687207 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 101687235 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101687414 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 101687533 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 101687565 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 101687588 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 101687612 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 101687639 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 101688313 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101688344 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 101688345 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101688461 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 101688654 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 101688836 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 101689020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101689099 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 101689333 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101689352 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101689445 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101689567 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101689608 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 101689862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101689896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101690573 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 101690671 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 101690759 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 101691031 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101691507 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101691520 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101691770 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101691952 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101692150 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101692203 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101692316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101692352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101692370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101692814 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101692843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101692985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101693013 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 101693022 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101693391 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 101693576 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 101693676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101693684 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101693719 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101693748 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 101693770 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101693778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101693835 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101694034 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101694052 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 101694102 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101694106 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101694340 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101694388 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 101694413 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101694666 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 101694924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101694958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101695177 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101695283 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101695667 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101696358 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101696360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101696651 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 101696688 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101696752 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101696757 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101696774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101696913 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101696971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101697251 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101697253 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101697289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101697462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101697464 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 101697528 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101697696 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101698144 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101698578 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101698702 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101699138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101701126 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101702888 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101706043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101706648 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101706661 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101706933 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 101707402 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101707461 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 101707624 G T N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 2 101707679 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 101707805 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 101707970 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 101708000 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 101708223 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 101708292 C G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 101708299 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 101708761 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101708840 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101709189 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101709205 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101709277 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 101709346 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 101710254 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 101710478 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 101710880 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101711166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101711185 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 101711554 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101711922 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101711973 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101711982 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 101712136 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101712243 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101712783 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101713064 C G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 101713382 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101714005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101714032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101714217 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101714231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101714279 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101714826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101714837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101714877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101714977 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 101715033 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 101715041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101715089 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101715260 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101715539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101715552 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101715692 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101716122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101716288 C A Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 2 101716290 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 101716562 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101716781 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 101717663 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 101717704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101721003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101721230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101721374 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101723536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101726638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101727309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101728166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101728904 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101730783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101731328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101731918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101735014 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101735442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101736118 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101736396 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101738506 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101738913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101739272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101740751 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101740758 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101740770 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101746150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101747275 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101747291 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101747662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101748237 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101749027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101749140 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101749205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101749243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101749320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101749399 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101749485 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101749585 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101749746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101749759 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 101749854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101749881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101750038 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101750142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101750242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101750243 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101750269 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 101750494 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101750552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101751263 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 101751428 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101751554 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101751581 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101751685 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 101751702 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 101751752 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101751812 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 101751850 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 101751907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101751963 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101751976 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 101752048 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 101752571 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101752793 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101752855 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101752856 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101752905 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101753052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101753079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101753691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101753751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101753843 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101753968 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101754023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101754055 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101754078 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101754144 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 101754149 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101754225 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101754262 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101754506 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 101755375 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101755390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101755490 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101755588 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101756318 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 101756663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101757239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101757664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101757726 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101758100 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101758681 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101759175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101759378 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101759550 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 101759611 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101759687 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101759787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101759912 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101759934 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101760003 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101760030 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101760103 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 101760732 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 101760805 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 101760920 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 101761022 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101761029 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 101761058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101761129 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 101761150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101761214 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 101761382 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 101761532 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 101761677 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 101761687 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101761697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101761760 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 101761886 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 101762092 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 101762144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101762273 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 101762279 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 101762357 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 101762422 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101763078 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101763094 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101763119 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101763151 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101763346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101763404 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101763764 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 101763766 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 101763860 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101763981 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101764000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101764091 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 101765040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101765182 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 101765992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101768623 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 101770218 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101770333 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101771152 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101771433 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101771851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101772237 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 101772374 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 101772778 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101773875 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 101774200 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101775073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101775753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101775866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101776351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101776352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101777628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101777951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101778821 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101778871 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101778916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101779420 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 101779865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101781659 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 101782690 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 101783028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101784226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101784650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101784770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101785308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101785864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101786067 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101786201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101786292 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101786299 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 101786313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101786591 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101786714 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101787229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101787877 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 101787998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101788448 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 101788493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101790623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101792828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101796220 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101796227 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 101796245 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101796346 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101797100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101797704 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 101798266 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101798383 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101798684 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101798825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101798921 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 101801047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101801207 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101801291 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 101801311 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101801648 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101801765 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 101804306 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101807212 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101807903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101808339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101809114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101809131 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101809132 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 101809245 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 101809311 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 101809355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101809473 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 101809515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101809679 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 101809731 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 101810113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101810465 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 101811001 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101811042 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 101811143 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101811401 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101811402 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101811446 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101811512 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 101811588 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 101811599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101811631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101811671 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101811890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101812225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101812851 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101813218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101813555 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101813742 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 101813743 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 101813823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101813915 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 101814356 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 101814392 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101814410 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 101814474 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 101815623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101815628 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101815825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101816576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101816905 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101816919 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 101816920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101816961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101817160 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101817413 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101817456 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101817779 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 101817847 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 101817937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101818023 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101818436 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101819661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101820129 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 101820366 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 101821233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101822032 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101823416 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101823649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101824376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101824744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101825256 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101825543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101826131 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 101826261 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101827338 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101827770 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101829071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101831578 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101831581 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101831787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101831908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101831916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101832189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101832261 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101832389 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101832874 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101833148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101833708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101833873 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101833876 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101833936 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101833995 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101834008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101834040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101834180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101835123 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 101835253 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101836237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101836497 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 101836594 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 101836612 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 101836806 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101836833 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101836892 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101836964 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 101838908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101839125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101839247 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 101839251 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 101839345 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 101839491 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101839636 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 101839637 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 101839766 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 101839768 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101839843 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 101840057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101840061 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101840126 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101840159 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 101840330 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101840425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101840733 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101840788 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 101840841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101841760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101841959 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 101841984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101842059 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 101842070 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 101842071 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 101842168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101842237 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 101842288 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101842523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101842594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101842725 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101843425 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 101843959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101845389 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 101845889 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 101846075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101846124 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 101846761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101846788 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101847233 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101847302 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 101847631 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 101847648 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 101847722 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101847764 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 101847770 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 101847780 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101847942 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101847974 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 101848037 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101848107 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101848185 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 101848453 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 101848550 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101848612 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 101848622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101848730 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101848747 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 101848842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101848911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101848943 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101848948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101849086 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101849255 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101849279 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101849328 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 101849335 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 101849345 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 101849397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101849439 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 101849453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101849557 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 101849586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101849697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101849706 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101849850 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 101849936 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 101850050 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 101850143 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101850256 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 101850417 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101850521 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 101850642 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101850679 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 101851005 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 101851036 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 101851076 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 101851152 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 101851174 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 101851361 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101851495 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101851496 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101851722 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 101851740 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 101851742 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 101851805 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 101851842 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 101851896 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101851914 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101852008 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 101852009 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 101852532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101852540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101856711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101857181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101857261 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101857309 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 101857890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101858075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101864590 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 101864742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101864781 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 101864988 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 101865158 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101866201 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101866209 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101866227 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101866235 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101866686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101867404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101875725 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101876063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101876909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101876980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101877309 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101878869 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101879303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101880806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101881465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101883032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101885481 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101886372 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 101891225 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101891441 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 101891494 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 101893995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101894359 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 101894885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101895860 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101895922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101896438 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 101896442 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 101898240 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101898250 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101898252 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101898280 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101898291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101898300 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101898316 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101899353 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101899425 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101899636 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101899647 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101900346 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101900433 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101900543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101900679 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 101900768 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101900769 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 101900836 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 101900941 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101901090 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 101901461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101901764 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 101901996 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101902115 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 101902357 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 101902381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101902393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101902453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101902489 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 101902574 G C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 101902604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101902619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101902646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101902665 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101902837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101902839 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101902926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101902978 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 101903112 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 101903161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101903426 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101903613 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 101903643 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101903752 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 101903848 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101904067 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101904183 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101904228 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 101904229 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101904334 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 101904339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101904381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101905493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101905494 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 101905711 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101906128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101906242 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 101907870 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101908018 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101908095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101908097 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101908145 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101908171 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101908219 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 101908241 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101908297 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101908336 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101909144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101909227 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101909348 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 101909516 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 101909619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101909884 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 101910202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101910469 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101910545 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 101910631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101910633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101910659 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101910823 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101910824 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101910845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101911190 A T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 101911252 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 101911354 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101911470 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101912082 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 101912090 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101912138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101912248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101912294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101912367 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101912427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101912932 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 101912989 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101913037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101913155 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101914009 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 101914024 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101914067 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101914079 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 101914171 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 101915331 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101915811 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101916278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101916344 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101916356 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101916386 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101916488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101917430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101918824 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101919139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101920981 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 101920993 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 101921119 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 101922393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101922716 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101923901 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 101924029 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101924087 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101924381 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 101924393 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 101924624 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 101924638 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 101925167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101926272 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101928382 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101928399 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101928434 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 101928536 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101928692 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 101928896 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101928927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101929037 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101929813 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 101929845 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 101929887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101929909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101930037 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101930052 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 101930219 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 101930231 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101930236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101930252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101930751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101930769 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 101930865 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 101931037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101931080 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101931313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101931406 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101931511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101931566 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101931594 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101931676 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101931985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101932142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101932221 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101932222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101932323 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101932446 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101932481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101932549 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101932650 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101932659 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 101932661 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 101932705 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101932957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101933113 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 101933144 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 101933232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101934426 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 101934844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101936716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101937095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101938430 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101938632 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 101940216 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 101940306 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 101940463 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 101940483 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101940524 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 101940595 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101940735 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 101942546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101942872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101942975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101943129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101943185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101943504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101943906 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101943923 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101944303 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101944901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101944994 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101945247 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 101945289 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 101945598 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 101945641 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 101946316 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101947349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101947476 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101947509 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101947510 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101947744 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101947837 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101948161 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 101948193 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 101948553 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 101949340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101949740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101949949 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101949965 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101950102 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101950137 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 101950179 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 101950489 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 101950502 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 101951048 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 101951356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101951460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101951471 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 101951490 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101951925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101952446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101952550 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101952621 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101952722 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 101952858 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101952909 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101952918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101952933 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101952939 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101953021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101953161 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101953951 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 101954160 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101954210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101954270 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 101954365 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 101954381 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101954572 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 101954589 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 101954806 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101954895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101954911 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101954951 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 101954995 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101955080 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 101955711 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101955729 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101955957 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101955995 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 101956064 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 101956107 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 101956256 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 101956393 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 101956453 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 101956499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101957186 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101957250 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 101957585 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101957814 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101957826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101957886 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101959281 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 101959445 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101960638 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101960858 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101961188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101961515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101961655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101961995 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 101962164 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 2 101962374 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 101962460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101962469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101962499 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 101962522 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 101962675 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 101962738 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101962787 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 101962897 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 101963478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101963549 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 101963705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101964171 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 101964330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101964368 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 101964471 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 101964516 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 101964555 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 101965054 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 101965115 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 101965219 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101965263 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101965367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101965474 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101965714 C A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 101965920 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 101965923 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 101965934 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 101965983 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 101966300 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101966449 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 101966507 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101966601 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101966798 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 101966799 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101966939 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101966983 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 101966987 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 101967000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101967356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101967400 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101967488 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101967530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101967575 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101967611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101967659 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 101967820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101967877 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 101967970 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 101968091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101968224 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 101968314 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 101969213 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 101969359 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 101969386 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 101969402 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 101969972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101970155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101970162 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 101970270 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 101970283 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 101970450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101971081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101971343 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101971364 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 101971889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101973680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101974039 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101976208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101976372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101977191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101978312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101979333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101980508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101980596 T G Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 101980761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101980900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101981544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101981988 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101982427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101982939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101983456 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101983799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101985705 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 101986163 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 101986199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101986204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101986246 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101986285 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101986291 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 101986725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101986771 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 101986852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101986863 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 101986911 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 101987076 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101987332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101987510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101987525 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 101987578 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101987634 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 101987706 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101988110 A C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 101988432 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 101988758 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 101988780 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 101988818 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 101988840 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 101988919 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 101989065 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 101989106 A T Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 101989278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101989400 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 101989403 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 101989464 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 101989515 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 101989537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101989596 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 101989660 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 101989693 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 101989735 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 101989804 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 101989840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101989875 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 101989961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101990458 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 101990530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101990563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101990765 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 101990807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101990864 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101990876 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 101991325 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 101991352 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 101991647 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 101991658 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 101991849 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101991921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 101991923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101991979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101991994 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101992017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101992145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101992152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101992196 T G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 2 101992344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101992646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101992653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101992902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101993042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101993617 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101993688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101994737 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 101994773 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101994932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 101995229 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 101995488 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 101996470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101996551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101996788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101997229 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101997244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101997316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101997340 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101997481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101997535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101997671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101997705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101997906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101998618 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 101998778 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101999196 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 101999260 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 101999276 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 101999286 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 101999336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101999345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 101999364 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 101999416 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101999451 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101999514 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 101999723 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 101999757 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 101999785 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 101999788 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102000006 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102000178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102000385 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 102000452 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 102000460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102000638 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102000749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102000798 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102000837 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102000856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102000907 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102001010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102001092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102001210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102001472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102001595 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102001703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102001756 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102002086 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102002160 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 102002205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102002334 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 102002509 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 102002547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102002726 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 102002742 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 102002752 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 102002768 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102002774 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102002785 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102002823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102002916 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 102002917 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102002973 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 102003006 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 102003032 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 102003050 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 102003062 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 102003065 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 102003154 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 102003232 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 102003243 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 102003452 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 102003690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102003835 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 102004000 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102004101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102004287 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 102004517 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102004520 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102004754 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 102004883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102004907 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 102005160 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102005198 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102005261 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102005377 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102005596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102005625 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102005691 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102005752 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102005837 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102006143 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102006170 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102006322 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102006344 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102006571 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102006673 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102006734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102006828 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102006978 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102007031 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 102007312 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102007393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102007560 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102007786 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102007816 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102008116 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102008339 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102008442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102008458 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102008678 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102009096 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102009292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102010495 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102010720 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102011124 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102011820 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102011981 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102012020 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102012078 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102012094 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102012758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102012885 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102013060 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 102013102 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 102013341 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 102013736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102013843 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102013999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102014015 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102014290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102014521 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102014798 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 102014802 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 102014997 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102015466 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102015482 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102015512 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102015645 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102015804 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102015927 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102016004 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102016011 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102016543 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102016566 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102017440 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 102017623 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102018207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102018305 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102018342 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102018402 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102018434 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102018673 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102018701 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102018775 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102018803 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102018840 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102019206 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102019251 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102019297 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102019343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102019483 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102019674 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102020957 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102021444 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102021537 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102021674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102022029 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102022280 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102024300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102025191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102025257 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 102025484 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102026665 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102026893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102026916 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102026943 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102027010 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102027193 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102027233 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102029614 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 102030206 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 102030638 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102030715 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 102031050 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102031101 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102031202 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102031224 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102031370 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102031395 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102031877 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 102032598 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102032838 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102033444 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 102033747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102033807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102034248 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102035361 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102036088 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102036838 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102037140 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102038934 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102039057 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 102039221 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 102039413 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102039475 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102039537 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102039557 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102039585 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102039637 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102039640 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102040548 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102040576 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102040650 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102040694 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 102040715 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 102040760 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 102041050 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102041071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102041094 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102041599 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 102041810 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 102041888 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 102041959 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102042160 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102042431 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102043084 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 102043359 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 102043731 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102043824 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 102043825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102043861 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102043957 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 102044037 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102044156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102044548 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 102045361 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102047229 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 102047514 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102048183 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102050512 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 102050707 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102051517 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 102053108 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 102053124 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 102053919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102054374 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102055083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102055386 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102055836 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102055897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102055931 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 102056236 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102056443 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102056494 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102057116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102057196 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102057267 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 102057646 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 102058373 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102058374 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102058495 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 102060077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102065853 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 102066053 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 102066747 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 102068555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102069037 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 102069414 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102069766 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 102070000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102070419 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 102070509 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102070678 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 102070849 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 102070853 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102070865 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 102070895 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 102070951 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 102070986 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 102071016 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 102071063 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 102071097 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102071116 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102071140 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 102071177 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 102071186 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 102071404 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 102071469 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 2 102071525 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 102071886 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 102071901 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 102071936 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 102072303 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 102072381 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 102072647 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 102072722 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 102072769 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 102072770 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 102072918 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102072957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102072970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102073003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102073089 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 102073337 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 102073412 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 102073421 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 102073597 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 102073739 T G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 102074161 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102074382 A T N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 102074735 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 102074814 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 102074897 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102074949 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102075276 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 102075277 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 102075700 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102075815 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 102075849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102075959 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 102076010 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 102076026 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102076080 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102076122 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102076161 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102076475 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102076502 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 102076568 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102076569 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102076667 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102077011 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 102077033 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 102077163 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102077167 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102077270 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 102077284 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102077345 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 102077432 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 102077448 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102077513 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102078380 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102078401 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102078573 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102078802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102078880 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 102078891 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102079119 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 102079589 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102079716 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 102079951 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 102080538 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102080716 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102080727 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102080762 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102080896 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102080905 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102080917 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102080930 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102081214 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 102081305 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102081319 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102081372 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 102081846 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102081858 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102081951 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 102082096 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 102082114 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102082491 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102082505 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102082749 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102082843 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 102083169 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 102083614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102083617 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 102083700 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102083716 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102083843 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102083870 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102083871 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102083933 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102084018 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 102084069 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102084429 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102084497 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102084522 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 102084858 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102084976 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102085319 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 102085596 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102085828 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 102085895 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 102086095 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102086495 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102086688 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102087063 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 102087295 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 102087557 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 102088012 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 102088056 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 102088501 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 102089159 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 102089292 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 102089789 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102090065 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102090097 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102090474 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102090491 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102091429 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 102091519 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 102091660 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 102091685 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 102091755 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 102091794 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 102092259 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102092293 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102092304 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102092343 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102092534 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102092611 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 102092766 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102092859 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 102093395 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 102093422 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102093424 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 102093433 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 102093485 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 102093805 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102093855 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102093865 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 102093914 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 102094064 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102094065 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102094281 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 102094490 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102094718 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102094726 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102094770 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102094873 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102094915 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102094928 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102094947 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102095040 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102095585 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102095606 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102095875 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102095911 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102095946 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102095967 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102095997 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102096136 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 102096157 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 102096554 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102097076 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102097112 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 102097143 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 102097165 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 102097520 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102097566 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102097684 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102097928 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102097930 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102097985 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102098253 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102098324 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102098496 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102098690 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102098703 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102099120 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102099170 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102099337 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 102099830 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102100252 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102100358 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102100416 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102100427 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102100561 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102100653 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102100680 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102101015 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102101144 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102101344 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102101410 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102101465 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102101624 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102101810 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102101829 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102101894 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102101901 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102102214 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102102225 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 102102266 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 102102283 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 102102298 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 102102456 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102102920 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102102946 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102102966 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102102976 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102103009 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102103082 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102103502 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 102103574 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 102103775 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102103798 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 102103933 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102104019 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 102104926 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 102104940 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102104974 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102105004 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102105116 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102105247 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 102105248 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 102105414 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102105533 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 102105667 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102105669 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102105752 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 102105942 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102106061 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102109452 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102110763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102110770 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102110887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102111559 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102114313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102115740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102116165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102116515 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 102116590 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102116684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102116691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102117840 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102120925 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 102121273 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 102121311 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102121687 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102121734 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 102121978 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102123231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102123262 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 102123561 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102123810 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102123915 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 102123917 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 102123986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102124324 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 102124458 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 102124463 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102124488 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 102124542 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102124604 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102124614 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102124615 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102124648 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102124830 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102124886 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102124901 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102125362 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102125693 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102125800 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102125889 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102125900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102126430 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102126629 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102126648 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102126688 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102126697 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102127696 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102127967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102128826 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102128956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102129010 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102129264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102129307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102130126 G C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 102130617 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 102130713 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 102130813 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 102130929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102131402 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 102132503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102132624 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 102132690 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102132836 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 102133152 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 102133402 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102134152 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102134196 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 102134200 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 102134269 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102134323 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102134423 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102134538 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 102134547 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 102134563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102134918 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102134942 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102134989 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102135153 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102135673 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102136059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102136195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102136545 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102136875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102136921 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102137739 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 102137907 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 102138146 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102138538 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102139289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102139320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102139913 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102140826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102140852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102143500 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102143936 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102145731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102145831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102147646 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102148340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102149620 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102149765 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102150336 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 102150892 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102151459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102151823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102152508 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102152796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102153198 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 102153636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102154424 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102155398 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 102156670 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102157111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102157623 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102158536 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 102158552 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102160969 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102161032 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102161487 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 102161693 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 102162205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102163144 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102163369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102163725 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 102163775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102165507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102168117 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102168260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102169830 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102170201 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 102170246 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 102171133 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 102172133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102172996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102173290 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102175039 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 102176648 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102176809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102176869 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102177383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102177988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102178056 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 102178382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102179320 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102179335 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 102180147 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 102181190 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 102181204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102181980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102184381 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102184390 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102187622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102188778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102190177 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102192634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102194440 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102195329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102196042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102196043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102197149 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102198826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102199392 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102199437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102203950 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102204099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102205310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102207795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102207960 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102208539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102209969 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102210114 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102214854 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102221920 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102222231 T A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 102222242 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 102226570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102226628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102228575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102229056 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102230302 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102231195 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102234661 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102235483 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102238816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102241334 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 102244014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102244740 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 102246858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102248414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102250503 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 102252086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102252128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102252348 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102252355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102252637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102252672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102252913 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102253326 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102253327 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102253376 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102253495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102253577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102253831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102253942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102254108 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102254186 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102254733 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102256305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102256321 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102256533 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102256547 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102256616 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102256626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102256705 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102257029 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 102257098 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 102257216 G T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 102257233 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 102257356 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 102257576 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 102257587 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 102257641 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 102257649 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 102257661 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 102257679 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 102257681 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 102257768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102257769 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 102257847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102257963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102258217 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102258230 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102258274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102258607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102259072 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 102259183 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 102259261 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 102259287 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102259388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102259507 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102259593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102259847 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 102260412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102260507 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 102260794 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 102260880 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 102261051 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102261079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102261185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102261186 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102261203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102261712 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102261733 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102261854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102261881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102262975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102263581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102263872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102264125 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 102265344 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 102265727 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 102267764 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102267899 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102270569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102273380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102273678 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 102280083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102283406 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 102283781 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102283807 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102283834 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102283861 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102283980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102284017 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102284058 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102284345 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102284641 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 102285396 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102285408 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 102285466 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 102285708 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 102286111 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 102286301 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 102286722 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102287747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102289094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102289451 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102290123 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 102292165 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 102292720 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102292773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102293220 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102293842 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102293921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102294899 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102296015 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102296412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102298445 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102299160 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102299263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102299546 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102299846 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102299955 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102300711 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102301168 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 102301464 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102302553 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102304045 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102304101 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102304694 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 102305014 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102306165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102306174 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102306432 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 102307110 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102307729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102307849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102308235 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 102308374 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102308517 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102308927 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102309796 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102309823 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102310371 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102311385 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 102311487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102311623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102311836 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 102311852 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102312117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102312456 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102315825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102315915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102316020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102316169 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102316185 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102316193 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102316756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102316778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102316812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102317051 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102317071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102317084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102317239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102317348 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102317417 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 102317437 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102317439 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102317521 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102317617 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102317644 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102317647 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102317666 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102317701 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102317781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102318157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102318406 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102318554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102318564 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102318984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102319083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102319093 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102319228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102319239 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102319244 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102319257 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102319388 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102319407 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 102319419 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 102319423 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 102319438 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102319678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102319764 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102319840 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102319853 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102319928 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102320246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102320267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102320503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102320564 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102320638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102320653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102320813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102320841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102321120 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102321772 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102322057 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102324478 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102324629 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102325606 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 102326542 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102329300 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 102329672 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102332514 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102333520 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102333589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102333932 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 102334091 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 102334282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102334683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102334691 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102335145 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 102335693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102335822 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102335876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102336557 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102336627 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102336655 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102336703 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102336842 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 102337009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102337035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102337080 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102337104 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102337155 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102337319 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102337605 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102337808 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102337820 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102337846 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102337941 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 102337979 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 102338009 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 102338032 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 102338084 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102338124 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102338143 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102338228 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102338242 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102338413 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 102338729 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102338772 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102338850 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102338899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102338907 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102338948 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102338975 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102339002 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102339083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102339112 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102339124 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102339150 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102339220 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102339290 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 102339309 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102339325 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102339355 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102339356 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102339479 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102339481 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102339563 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102339573 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102339634 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102339725 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102339857 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102339858 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102340028 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 102340085 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102340143 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102340145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102340272 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102340380 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 102340466 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 102340546 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 102340607 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 102340643 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 102340660 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 102340757 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 102341024 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102341065 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102341084 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 102341230 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102341283 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102341328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102341345 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102341404 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102341421 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102341502 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102341540 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102341729 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 102341740 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 102341758 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102341934 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 102341942 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 102341958 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 102341976 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 102342348 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 102342420 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102342541 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102342650 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102342687 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102342723 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102342732 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102342914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102342937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102343088 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 102343207 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102343314 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 102343734 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102343902 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102343925 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102343945 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102344004 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102344100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102344121 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102344268 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102344279 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102344296 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102344310 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 102344350 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102344469 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102344480 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102344576 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102344599 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102344684 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102344876 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 102345022 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 102345092 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 102345107 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 102345212 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 102345297 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102345319 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102345337 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102345339 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102345524 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102345547 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102345601 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102346463 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 102346607 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102346686 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102346925 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102347004 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102347459 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102347461 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102347703 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102347815 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102347847 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102348080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102349573 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102350671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102351642 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102353900 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102354179 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102354182 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 102354652 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102354823 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 102354851 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102354852 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102354939 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102355030 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102355070 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102355079 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102355093 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102355128 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102355224 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102355240 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102355297 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102355306 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102355478 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102355482 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 102355502 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102355557 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 102355610 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102355852 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 102355865 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102355873 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102355910 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102356160 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102356203 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 102356287 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102356370 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 102356422 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 102356584 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102356631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102356678 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102356786 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 102356828 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 102356907 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 102356973 G T Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 102356977 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 10 8 2 6 1 2 102356993 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 102357026 G A Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 102357032 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 102357191 C T N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 2 102357227 C A N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 102357240 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 102357340 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.153846153846154 0.692307692307692 0.153846153846154 13 13 2 9 2 2 102357355 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 102357364 A C N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 2 102357371 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 102357461 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 102357627 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102357642 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102357643 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 102357673 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 102357686 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 102357729 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102357749 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102357780 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102357882 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 102357985 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102358103 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102358640 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102358936 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 102359040 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 102359130 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102359207 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102359262 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102359411 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102359735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102359807 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102360014 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102360046 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102360180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102360846 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102360938 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102361068 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102361082 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 102361349 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102361365 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102361384 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102361472 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102361615 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102361636 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102361699 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102361931 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 102361967 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 102361968 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102362067 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 102362199 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102362285 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102362288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102362474 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102362480 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102362566 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 102362590 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 102362708 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102362863 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 102363411 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102363419 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102363469 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102363638 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102364253 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 102364280 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102364331 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 102364387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102364416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102364973 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 102364990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102365041 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 102365061 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 102365349 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102365355 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102365599 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102365777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102366014 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102366210 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102366230 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102366636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102366862 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 102366941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102367184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102367275 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 102367342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102368005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102368732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102368769 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102368974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102369041 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102369523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102369573 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102369912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102370270 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102370325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102370966 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102371321 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102371395 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102373528 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102373543 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102373773 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102374160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102374220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102374222 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102374438 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102374524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102374749 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102374750 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102374804 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102374910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102374949 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102374977 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 102374989 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102374993 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 102375794 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102375822 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102375865 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102375981 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 102376230 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102376272 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102376472 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102376495 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102376728 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102376935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102377271 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102377785 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102379383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102379387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102379925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102380481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102380746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102381259 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102381292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102381727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102381749 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102381807 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102381809 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102381886 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102381986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102381989 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102382192 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102382193 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102382793 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102383214 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102383414 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102383460 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 102383705 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 102383779 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 102383935 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 102384175 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 102384204 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 102384699 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102384964 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102385363 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 102385619 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 102385719 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 102385725 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 102385920 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 102386351 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102388572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102388985 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 102389829 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102389830 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102390111 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 102390255 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102390908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102391419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102391673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102392053 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102392180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102392284 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102392314 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102392633 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102392870 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102392871 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102393140 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102393186 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102393213 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102393252 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102393260 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102393465 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102393682 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102393726 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102393727 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102393788 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 102393936 T A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 102393997 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 102394176 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 102394212 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102394403 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 102394738 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102394784 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 102395450 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 102395556 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 102396036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102396342 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 102396904 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102397277 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 102397290 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102397338 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102397376 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 102397795 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102397835 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 102397933 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102398875 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102398882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102399301 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102399986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102400594 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102400737 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 102400940 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102401272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102401330 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102402086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102402109 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 102402159 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 102402281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102402584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102402644 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102402678 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102402827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102402909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102403271 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102403282 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102403954 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102404023 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 102404033 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102404411 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102405109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102405646 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102406154 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102406234 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102406265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102406658 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102408467 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 102408468 G T N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 102408605 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 102409396 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102409869 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102411837 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 102414350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102414693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102414799 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102415613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102415749 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 102416630 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102418674 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102418733 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102419109 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 102419166 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102419995 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102420075 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102420247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102420248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102420339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102421202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102421573 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102421576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102422269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102422766 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102422886 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 102422982 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102423037 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102423135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102424089 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102424254 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102424284 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102424962 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102425038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102425559 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102425600 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102425616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102425831 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102425866 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102426701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102427675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102428891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102429379 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 102429679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102429815 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102429862 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 102429909 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 102430106 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102430382 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102430590 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102430627 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 102430722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102430813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102430872 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 102430947 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102430997 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102431005 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102431060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102431255 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102431383 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102431548 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 102431709 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 102432219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102432373 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102432455 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102432489 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102432633 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102432679 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102432686 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102432932 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102432982 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102433044 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102433174 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 102433183 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 102433258 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102433260 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 102433375 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102433515 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102433549 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102433668 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102433736 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102433882 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102434163 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102434182 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102435144 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102435391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102435392 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102435715 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102435750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102435808 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 102435861 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102435920 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102435969 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 102436045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102436057 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 102436075 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 102436160 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102436171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102436308 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 102436384 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 102436405 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102436520 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 102436558 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 102436559 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 102436654 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102436672 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 102436792 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 102436819 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 102436922 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102436957 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 102437333 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 102437361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102437604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102438627 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102438708 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102439205 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102439367 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 102440189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102440257 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102440332 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 102440434 T A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 102440974 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 102440992 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102441057 T A N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 2 102441092 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 102441109 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 102441235 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102441254 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 102441277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102441531 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102441583 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 102441662 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 102441688 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 102441760 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102441808 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 102441835 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102441848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102441872 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102441957 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 102442294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102442299 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 102442394 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 102442529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102442610 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 102442700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102442730 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102442752 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 102442809 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102442830 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102442983 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 102449960 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 102450041 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102450218 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 102450312 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 102450374 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102450441 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102450495 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 102450512 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 102450642 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102450883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102450918 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102451439 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102451452 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 102451469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102451595 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 102451767 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102451779 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102452326 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 102452835 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 102453008 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 102453051 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 102453082 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 102453211 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 102453428 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 102453634 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 102453699 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 102454262 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102456203 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102456619 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 2 102456805 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102456924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102457013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102457471 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102457580 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 102457762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102457991 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102458038 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 102458153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102458154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102459241 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 102459579 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102459781 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 102460450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102461190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102461873 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102462290 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102462860 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102464370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102464610 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102465187 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102465193 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102465211 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102465254 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102465279 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102465301 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102465385 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 102465451 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102465557 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 102465679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102465691 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 102465766 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 102466001 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102466097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102466111 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 102466223 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 102466240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102466386 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102466878 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102466909 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102466924 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102467043 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 102467080 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 102467267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102467297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102467318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102467320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102467355 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102467657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102468827 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 102468840 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 102469056 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102469220 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102469339 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 102469379 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102469486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102469527 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102469690 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102469758 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 102469923 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 102470038 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102470062 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102470066 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102470280 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 102470454 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 102470709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102470807 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102470921 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102471229 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102471420 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102471530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102471685 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 102471919 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102471925 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 102471954 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 102471997 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 102472125 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102472590 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102472714 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102473006 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 102473116 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 102473137 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 102473200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102473281 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102473407 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102473432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102473532 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102473633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102474073 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102474089 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102474100 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102474125 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 102474377 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102474401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102474713 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102474929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102475036 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 102475317 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 102475446 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 102475797 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102476227 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102476312 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102476803 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102476806 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102476820 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102476839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102476872 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102476936 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102477067 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102477635 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102478124 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 102478152 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 102478196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102478243 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102478265 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 102478501 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102478705 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102479881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102480280 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 102480302 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102480376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102480706 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102480723 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102480770 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102481133 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102481154 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102481168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102481181 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102481212 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102481219 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102481240 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102481269 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 102481289 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 102481312 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102481594 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102481751 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102481752 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102481894 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102481943 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102481993 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102482955 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102482997 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102483374 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102483644 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102483704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102483748 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102484116 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102484142 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102484469 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 102484624 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102484671 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102484705 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 102484780 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102484785 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102484884 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 102485137 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 102485173 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102485175 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102485330 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 102485370 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102485463 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102486096 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102486287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102486357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102486794 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102486905 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 102486934 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 102487171 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102487235 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 102487620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102487669 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 102487994 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 102488224 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 102488235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102488432 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 102488568 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102488588 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 102488669 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102488735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102488773 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102489622 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102490170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102490247 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102490549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102490775 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 102491053 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102491085 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102491211 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102491240 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 102491249 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 102491330 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 102491383 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 102491580 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102491628 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102491699 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 102492218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102492287 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102492542 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102492561 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102492646 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 102492691 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 102492764 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 102492835 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102492863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102492921 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102492940 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 102492964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102492967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102493134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102493141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102493179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102493258 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102493287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102493323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102493354 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102493452 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102494490 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102494609 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102494636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102495021 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102495393 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102495664 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102495707 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 102496023 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102496043 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102496180 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 102496208 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102496250 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102496367 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102496613 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102497056 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 102497335 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102497400 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 102497417 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102497480 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 102497512 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102497544 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102497551 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 102497570 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102497970 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102498168 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 102498457 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102499788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102500613 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102500682 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102500838 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102501976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102502400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102502446 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102502831 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 102502888 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 102503030 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 102503451 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 102503533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102503920 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 102504040 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 102504328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102504364 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 102504465 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102504740 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 102504777 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 102506129 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 102506147 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 102506149 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 102506164 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 102506235 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 102506500 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102506539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102506670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102506732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102506769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102506874 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102506929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102506997 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102507020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102507069 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 102507073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102507138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102507164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102507244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102507580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102507692 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 102507693 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 102507776 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 102507807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102507971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102508130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102508227 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 102508250 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 102508304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102508328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102508559 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 102508784 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 102508859 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102509024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102509060 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102509073 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 102509322 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 102509668 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102509935 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 102510049 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102510287 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102510787 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 102510842 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 102510938 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 102511014 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102511096 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 102511112 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102511177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102511208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102511367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102511408 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102511422 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102511458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102511475 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102511476 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102511490 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102511744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102511762 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 102511808 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102511866 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102511933 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102512053 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102512063 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 102512169 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102512200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102512203 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102512216 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102512517 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 102512699 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102513075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102513393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102513428 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102515265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102515705 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102515959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102517457 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 102517493 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102518366 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 102518618 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 102518983 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 102519166 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 102519201 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102519241 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102519319 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 102519531 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 102519622 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 102519878 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102519996 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 102520025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102520037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102520072 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102520096 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102520152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102521222 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102521256 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102521379 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 102521466 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102521477 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102521630 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102521818 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102521921 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102521932 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102521935 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102521963 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102521979 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102522010 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102522078 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102522338 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102522358 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102522480 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102522590 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102522631 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 102522677 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102522685 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102522794 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102522829 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102523012 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102523021 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 102523097 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 102523121 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102523212 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102523652 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102524029 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102524034 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102524088 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102524146 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 102524185 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102524438 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102524643 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102524754 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102524857 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102524992 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102525021 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102525050 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102525082 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 102525193 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 102525220 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 102525297 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102525678 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102525750 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102525768 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102525770 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 102525780 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102525822 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 102525832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102525838 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102525987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102526036 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102526483 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 102526498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102526644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102526645 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 102526657 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 102526754 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 102526786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102526822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102526825 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102526939 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102526989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102527002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102527018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102527046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102527242 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 102527311 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102527598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102527784 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 102528148 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 102528334 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 102528493 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102528514 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102528991 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102529047 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102529080 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102529081 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102529113 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102529127 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102529275 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102529305 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102529326 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102529501 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102529529 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102529710 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102529859 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102530171 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102530204 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102530321 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102530373 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102530490 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102531249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102531252 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102531332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102531812 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 102531827 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 102531977 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 102532082 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 102532159 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 102532174 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 102532273 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 102532300 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 102532509 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 102533121 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 102533192 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 102533493 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102533741 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102533804 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102534814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102534855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102535129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102535524 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102535970 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102535984 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102536274 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 102536463 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 102536498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102537988 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 102538511 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102538567 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 102538702 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102539117 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102539316 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102539344 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102539346 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102539386 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102539652 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102539679 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102539754 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 102539778 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 102539863 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 102540401 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102540413 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 102540551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102540606 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102540622 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 102540638 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102540678 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 102541139 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102541321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102541380 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102541455 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102541470 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 102541657 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102541929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102542113 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102542281 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102542367 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102542468 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 102542492 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 102542555 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 102542838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102542862 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 102542948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102542986 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102543055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102543327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102543472 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 102543475 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 102543575 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 102543731 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102543763 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 102543845 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 102544375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102544424 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102544425 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102545335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102545966 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 102546065 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102546068 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102546305 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 102546322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102546338 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 102546595 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 102546647 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 102546715 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 102546761 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 102546777 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 102546821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102546944 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 102546970 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 102547042 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 102547137 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102547192 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 102547243 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102547329 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 102547341 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 102547526 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102547579 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 102547738 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 102547748 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 102547922 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102547961 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 102547986 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102548063 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 102548141 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 102548379 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 102548726 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 2 102548764 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 102548779 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 102548916 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102549026 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102549073 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102549401 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102549428 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102549499 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 102549658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102549802 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102549900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102549950 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 102549965 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 102549987 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 102550049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102550056 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 102550120 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102550897 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 102551063 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102551064 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102551209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102551558 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 102551905 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102552070 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102552217 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 102552308 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 102552588 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102553073 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 102553191 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102553920 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102553931 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102553953 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102553968 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102553970 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102554491 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 102554693 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102554717 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102554747 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102555015 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102555106 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102555444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102555484 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 102555641 C A Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 102555649 C T Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 102555653 G C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 102555755 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 102555859 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 102556285 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102556554 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102556857 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 102556966 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102557067 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 102557152 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102558178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102558401 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102558449 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102558469 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102558606 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102558685 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102558798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102559482 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102559633 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102559826 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102560178 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102560196 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102560247 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 102560294 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102560414 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 102560438 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 102560798 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 102560878 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102560915 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102560952 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102561076 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102561550 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102561624 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 102562369 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102562432 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102562547 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102562567 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102562578 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102562602 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102562892 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102563442 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102563522 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 102563568 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102563575 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 102563581 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102563823 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102563857 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 102563910 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102563957 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102564267 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102564273 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 102564326 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 102564709 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102564712 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102565140 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 102565206 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102565827 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 102565831 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 102565906 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 102566455 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 102566906 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102567114 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102567641 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102569262 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102569402 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102569430 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 102569699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102569844 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 102570273 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102570408 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102570464 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102570945 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102572035 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102572148 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102572215 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 102572865 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102572968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102573048 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102573133 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102574007 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 102574106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102574811 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 102574863 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102575262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102575408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102575441 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 102576254 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102576281 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102576288 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102576306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102576452 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102576843 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 102576928 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102576976 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 102577293 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 102577299 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 102577321 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102577332 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102577676 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102577847 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 102577930 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 102578064 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 102578524 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102578927 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102579059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102579456 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 102579531 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 102579732 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 102580194 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 102580436 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 102580723 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 102581085 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 102581147 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 102581384 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102581620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102581732 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 102581735 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 102581880 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 102582014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102582130 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102583472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102584227 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102585043 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102585074 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 102585511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102586005 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 102586030 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 102586117 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102586192 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 102586464 A C N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 102586885 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102587253 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102587698 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102587759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102588449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102588854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102588890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102588919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102588930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102588987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102589037 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102589083 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102589120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102589146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102589298 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 102589377 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 102589388 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 102589389 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 102589507 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102589551 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 102589788 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102589817 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102590069 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102590165 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102590671 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 102590714 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 102590881 C T Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.333333333333333 15 9 7 1 4 2 102590885 C T Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.333333333333333 15 9 7 1 4 2 102590936 T G N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.461538461538462 13 13 6 1 6 2 102590963 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 102591206 C G Y N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 2 102591322 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 102591497 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 102591555 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 2 102591775 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.428571428571429 0.0714285714285714 0.5 13 15 6 1 7 2 102591856 A T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.384615384615385 15 11 7 1 5 2 102592024 G T Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.25 17 7 8 1 3 2 102593213 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102594294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102594349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102595057 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102595105 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 102596893 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 102596921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102598411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102601105 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 102601106 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 102602016 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 102602630 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102602651 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102602839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102603010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102603707 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 102603788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102604420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102604977 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102605185 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 102605335 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102605419 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102605425 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 102605463 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 102605464 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 102605512 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 102605657 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102605684 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102605698 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 102605921 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 102607410 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102608547 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102609791 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102610013 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 102610396 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 102610449 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102612629 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102613259 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 102613270 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 102613875 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 102613980 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 102614134 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 102614298 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102614551 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 102615234 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102616185 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 102616353 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 102616400 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 102616467 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102616496 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 102616505 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 102616515 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102616553 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 102616632 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 102616677 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 102616789 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 102616861 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 102617086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102617325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102617343 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102617346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102617366 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102618025 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 102618110 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 102618232 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 102618572 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 102618600 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102618702 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 102618726 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102618850 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102618975 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 102618987 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 102619022 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 102619170 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102619176 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102619191 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102619222 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 102619391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102619566 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102619748 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 102619753 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 102619997 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 102620047 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 102620049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102620290 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102620451 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 102620663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102621082 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102621302 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102622706 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102622947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102623318 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102623562 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102623878 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102625097 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 102625167 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 102625425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102625828 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102626306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102626535 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102627683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102628272 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 102628585 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 102629682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102629902 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102630970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102632729 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102633405 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 102637445 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102638011 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 102638052 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 102638107 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 102639178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102639801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102641575 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 102642242 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102642283 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102642309 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 102642319 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 102642334 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 102642358 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 102642380 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 102642387 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 102642618 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 102642833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102642921 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102643012 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102643063 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 102643112 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102643216 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 102643531 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 102643589 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 102643613 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 102643618 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102643626 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102643651 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102643655 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102643663 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102643729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102643771 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 102644452 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 102644454 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102644669 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102644780 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 102644927 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 102645041 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 102645304 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 102645354 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 102645567 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 102645689 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102645714 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102645799 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102645820 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 102645828 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102645845 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 102645964 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102646029 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 102646239 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102646446 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102646625 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102646993 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647010 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647055 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647101 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647138 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102647238 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647240 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647252 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647290 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 102647366 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647512 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647630 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102647766 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647869 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647870 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102647909 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102648038 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102648124 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102648185 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102648284 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102648292 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 102648575 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 102648596 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 102648667 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 102648750 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 102649154 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 102649275 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102649300 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102649316 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102649404 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102649480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102649593 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102649647 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102649664 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102649756 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 102650068 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 102650115 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 102650252 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102650324 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102650353 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 102650416 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 102650450 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102650487 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102650497 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102650532 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102650543 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102650572 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102650575 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102650636 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102650638 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102650674 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102650748 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 102650803 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102650905 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 102650933 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 102650948 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102650955 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102651084 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 102651097 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 102651167 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 102651407 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 102651442 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 102651443 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 102651486 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 102651493 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 102651554 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 102651588 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 102651663 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 102651704 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102652109 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102652378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102652458 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 102652482 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102653028 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102653311 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 102653468 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 102653649 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102653801 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102653855 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 102654192 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102654356 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102654604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102654772 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102654887 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102655037 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102655128 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102655135 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102655268 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 102655333 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102655550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102656100 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102656179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102656276 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 102656279 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 102656509 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 102656583 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 102656646 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 102656673 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 102656794 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102656958 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 102657243 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 102657892 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 102657996 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102658042 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 102658045 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 102658090 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 102658127 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 102658187 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 102658234 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102658294 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102658319 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 102658545 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 102658562 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 102658746 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 102658748 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 102658774 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 102658818 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 102658999 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 102659049 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102659065 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 102659087 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 102659096 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 102659491 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102659524 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 102659598 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 102659850 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 102660002 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 102660082 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102660190 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102660235 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 102660451 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102660798 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 102660892 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102661067 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102661112 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102661120 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102661277 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 102661569 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 102661717 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102661729 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102662321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102662338 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102662887 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 102663302 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102663497 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102663556 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102663597 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102663629 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 102664369 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102664633 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102667014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102667330 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102667489 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 102667660 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102667694 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 102667875 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102667893 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102667900 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102667933 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102668164 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102668182 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102668374 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102669446 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 102670040 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102670164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102670980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102672876 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102672990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102673056 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102673290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102673425 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102674655 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 102674790 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102674989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102675019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102675164 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 102675286 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 102675481 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 102675519 A C Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 102677319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102677727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102678140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102678231 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102678232 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102678901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102678969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102679132 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102679414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102679417 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 102679861 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102680003 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 102680435 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102680613 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102680685 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 102680999 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102681675 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 102682093 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 102682566 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102682962 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102683015 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 102683027 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 102683100 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 102683295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102684254 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 102684322 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 102684390 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 102684401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102684445 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 102684630 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 102684631 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 102684668 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102684737 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 102684830 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 102685060 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102685061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102685202 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 102685293 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102685315 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102685654 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 102685771 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102685783 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 102685841 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 102685921 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102686070 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102686089 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102686204 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 102686213 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 102686299 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102686411 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 102686528 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 102687082 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 102687196 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102687405 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 102687493 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 102687641 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102687758 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102687837 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102688099 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102688112 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 102688178 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 102688411 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 102688430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102688658 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 102688985 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102689063 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102689165 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102690096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102691306 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102691311 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102691420 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102691456 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102691955 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102691960 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102691970 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 102692257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102692294 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102692782 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 102692854 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102692966 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 102692998 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 102693025 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 102693116 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102693259 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102693556 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 102693600 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102693629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102693667 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102693701 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102693864 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102693899 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102694333 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102694349 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 102694373 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102694509 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102694589 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 102694620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102694624 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102694647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102694676 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102694816 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102694938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102694976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102695017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102695094 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102695256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102695268 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102695286 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102695317 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102695327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102695354 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102695355 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 102695412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102695421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102695465 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102695473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102695511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102695518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102695563 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102695634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102695699 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102695757 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102695814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102695918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102695986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102696052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102696066 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102696195 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 102696409 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102696466 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 102696469 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 102696516 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 102696542 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 102696558 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 102696586 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102696970 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 102697023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102697103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102697125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102697199 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102697244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102697297 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 102697349 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102697386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102697426 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102697453 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102697652 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102697838 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102697963 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 102698192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102698382 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 102698474 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 102698490 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 102698578 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 102698683 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 102699201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102699424 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 102699542 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 102699583 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 102699759 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 102699816 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 102699840 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 102700238 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 102700602 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102701188 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 102701275 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102701336 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 102701343 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102701555 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102701648 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102701987 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102702028 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102702088 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 102702104 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102702258 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 102702421 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102702433 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102702745 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102706151 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102706713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102707225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102707599 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102708110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102709821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102710665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102711930 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102711979 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 102712509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102712680 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102713618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102713761 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102714352 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102714854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102715469 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102715474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102715730 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102715984 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102716592 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 102716652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102717108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102717131 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102717239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102717772 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102718151 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102718951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102719311 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 102719495 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102719612 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 102719681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102720115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102720484 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 102720777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102721059 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 102721353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102721371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102721394 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102721545 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102721598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102722000 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102722651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102722907 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102722996 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 102723029 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102723045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102724246 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102725761 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 102726526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102728011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102728169 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102731096 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 102731320 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102731536 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 102732322 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 102732414 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 102732812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102733419 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 102733447 C G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102733691 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 102733767 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102733773 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102733793 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102733918 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102733936 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 102734067 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102734160 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 102734406 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102734670 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102734681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102734699 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 102734782 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 102734896 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102734899 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102734911 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 102734926 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 102734952 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 102735257 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 102735266 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 102735294 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102735298 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 102735308 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 102735476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102735477 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 102736044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102737064 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102737506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102737619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102738362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102740978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102741135 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 102741735 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102742133 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 102750097 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102750850 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 102752299 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 102752575 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 102755218 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102755244 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102755411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102755571 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 102755911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102756009 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102756139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102756156 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 102756498 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102756710 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102757045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102757229 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102757246 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102757313 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102757354 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 102757357 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102757403 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 102757653 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102757668 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102757849 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102758188 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102758254 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 102758347 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102758467 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 102758553 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102758775 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102758802 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102759072 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102759141 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 102759410 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 102759511 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102759863 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102759902 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 102759936 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 102759942 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102759974 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102760006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102760040 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 102760174 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102760544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102760555 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102760669 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102760717 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102761064 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102761314 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102761317 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102761723 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102761790 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102761890 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 102761976 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102762281 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102762487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102762488 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102762509 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 102762696 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 102762878 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102762889 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102762948 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102762971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102764066 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102767190 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102767198 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102767430 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102767719 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102768034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102769226 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102769577 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 102770017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102771804 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102771815 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 102771835 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 102771870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102773493 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102774361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102774768 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102774789 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102774936 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102774962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102774992 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102775008 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 102775227 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102775247 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102775326 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102775412 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 102775426 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 102775431 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 102775483 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102775514 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 102775641 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 102775708 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 102775928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102775973 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102776066 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102776204 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102776369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102776467 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102776543 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 102776998 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102777351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102777828 A C N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 2 102777978 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 102778033 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102778666 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102778801 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 102779122 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 102779311 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 102779553 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 102779663 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 102779956 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 102779957 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 102780017 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 102780143 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102780145 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 102780193 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 102780240 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 102780332 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102780337 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 102780356 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102780717 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 102780864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102780906 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102780921 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 102781052 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102781177 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102781181 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102781196 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102781309 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102781358 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 102781370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102781800 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 102782276 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 102782354 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 102782371 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 102782632 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 102782710 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 102782829 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102782918 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102783233 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102783357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102783377 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 102783633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102783655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102783801 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102783839 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 102783941 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102784110 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102784206 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102784276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102784465 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 102784562 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102785203 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102786027 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 102786297 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102787695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102788079 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102788360 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102789137 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102789349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102790224 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102790588 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102791342 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102792454 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 102792719 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102793704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102796246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102798589 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102799418 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102800458 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 102801205 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 102803824 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102803870 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102804122 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102804708 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 102804711 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 102807655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102808496 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102808513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102810491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102810523 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 102810656 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102810762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102810934 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102810936 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102811176 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102811801 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 102811978 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 102811991 A C N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 102812016 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 102812346 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 102812426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102812528 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102812529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102813650 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102813882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102815513 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102815556 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 102815599 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102815890 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102816084 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102816186 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102816248 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102816504 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102816731 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102816734 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102816779 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102817058 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102817310 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102817650 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102818947 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 102819271 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102819888 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102820531 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102820776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102821138 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102821922 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 102822522 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102823449 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 102824212 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 102824471 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 102824553 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 102824836 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102825161 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102825418 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 102825844 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102826530 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 102826665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102826739 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102826965 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102827110 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102827291 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102827340 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 102827437 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 102827451 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 102827493 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102827889 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102827900 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102828092 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102828279 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102828371 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102828446 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102828538 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102828616 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 102828762 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 102829468 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 102829975 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102829985 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102829986 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 102830426 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102830732 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 102830812 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102831649 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102831860 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102832081 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 102832082 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 102833330 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102833516 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 102833564 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102833608 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 102833683 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 102833741 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102833784 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102833969 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102834019 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102834054 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102834183 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 102834225 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102835123 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 102836041 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 102836575 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102836611 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 102836683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102837508 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 102837635 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102837655 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102837893 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 102838113 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102838163 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 102838366 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 102838653 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102838794 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 102838959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102839084 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 102839112 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102839197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102839260 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102839446 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 102840130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102840154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102840360 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 102840373 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102840435 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102840577 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 102840995 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 102841052 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102841055 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102841141 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 102841226 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 102841396 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 102841405 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 102841454 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 102841593 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 102842186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102842282 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 102842363 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 102842616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102842701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102842705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102842891 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 102844075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102844103 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102844131 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 102844155 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 102844247 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102844257 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102844851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102844898 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102844951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102844987 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 102845134 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 102845197 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102845221 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102845344 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 102845760 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102846045 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 102846081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102846156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102846368 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102846500 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 102846606 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 102846750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102847194 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 102847686 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102847795 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102847857 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 102847967 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102848122 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102848179 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 102848532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102848924 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 102848954 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 102848964 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 102849047 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 102849084 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 102849293 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102849613 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102849645 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102849823 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 102850158 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102850188 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 102850312 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102850532 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 102850544 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 102850577 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102850918 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 102850997 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 102851035 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 102851043 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102851283 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 102851305 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102851339 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 102851458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102851572 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 102851599 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 102851653 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 102851694 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 102852301 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 102852476 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102852546 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 102852549 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 102852587 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102852677 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102852705 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102852706 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102852803 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102852930 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102853016 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 102853143 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102853264 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 102853321 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102853466 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 102853516 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102853517 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 102853548 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102853694 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102854237 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 102854679 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 102854757 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 102855446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102855838 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102855883 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102855936 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102856105 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 102856178 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 102856218 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102856852 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 102856900 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 102856987 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102857095 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102857133 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 102857153 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102857471 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102857828 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102858221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102858330 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 102859331 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102859655 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 102860050 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 102860317 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 102860627 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102860986 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 102861122 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102861435 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 102861463 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 102861499 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102861511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102861576 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102862318 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 102862467 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102862608 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102862898 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 102862969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102862990 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 102863004 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102863024 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102863149 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102863172 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102863190 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102863412 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102863463 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 102863505 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 102863523 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 102863611 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 102863683 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 102863702 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102864197 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 102864198 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 102864270 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 102864509 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 102864557 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 102864601 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 102864613 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 102864688 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 102864718 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 102864913 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 102866162 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 102866172 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 102866322 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 102866328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102866361 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 102866439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102866792 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102866833 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 102866932 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102867137 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102869323 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 102871073 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102871208 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 102871264 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102871265 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102872045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102872097 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102872220 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 102872644 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 102872834 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 102872866 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 102872972 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 102873111 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 102873521 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102873815 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 102873852 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 102874484 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 102874849 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 102874940 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102875344 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102875684 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 102875745 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 102876313 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 102877569 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102878261 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 102878268 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102878658 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 102879297 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 102879510 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 102879547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102879740 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102879768 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102880095 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102880322 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102880477 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 102880889 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 102880970 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102881100 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102881167 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102881274 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 102881698 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 102881898 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 102882128 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102882182 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 102882665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102883240 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 102883684 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 102884176 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102884345 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102884350 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102884437 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 102884461 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 102884676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102884853 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102884856 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102884887 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102884939 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 102885360 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102887572 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102887605 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 102887733 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 102887793 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102887901 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102888107 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 102888142 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102888364 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 102888380 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 102888385 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 102888462 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 102888467 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 102888602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102888667 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 102888763 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102888788 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 102888826 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 102888914 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 102889077 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102889163 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102889483 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 102889701 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 102890027 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 102890286 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 102890309 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 102890393 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102890424 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102890432 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102890525 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102890579 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102890580 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102890782 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102890799 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102890871 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 102890997 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 102890998 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 102891457 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 102891560 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 102891639 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102891731 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102891738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102891758 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 102891843 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102891909 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102891932 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102892226 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 102892276 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 102892278 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102892375 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102892420 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102892457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102892474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102892475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102892685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102892733 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102893244 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 102893697 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 102893900 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 102893962 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 102893991 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 102894191 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 102894719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102894743 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 102895480 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 102896421 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 102896841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102897069 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 102897171 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 102897233 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 102897252 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 102897431 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 102897444 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102897479 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102897577 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102897591 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102897600 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102897605 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102897611 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 102897627 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102897695 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102897730 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102897746 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102897783 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 102897858 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 102897976 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 102897996 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 102898073 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 102898169 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102898218 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102898304 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102898435 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 102899049 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 102899061 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 102899252 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 102899299 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102899314 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102899470 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102899635 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 102899690 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102899700 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 102899729 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 102899768 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 102899825 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 102899920 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102899931 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102899956 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102899974 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102900283 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102900344 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 102900363 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102900395 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102900410 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102900472 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 102900603 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102900715 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 102900825 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102900869 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 102900904 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102900948 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102901062 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 102901074 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102901107 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102901139 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 102901156 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102901234 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102901363 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102901752 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 102901983 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 102902043 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 102902075 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102902084 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102902129 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 102902181 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 102902191 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 102902270 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 102902734 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 102902892 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102903350 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 102903351 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 102903384 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 102903451 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102903499 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 102903804 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102903847 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 102904090 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 102904418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102904569 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.307692307692308 0 0.692307692307692 8 18 4 0 9 2 102904795 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 2 102905086 T A N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 2 102905211 A G Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 2 102905215 G A Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 2 102905253 G T Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 2 102905994 T C Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.7 0 0.3 14 6 7 0 3 2 102906401 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 2 102906543 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 102906630 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 9 11 4 1 5 2 102906878 A G Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 102906904 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 102906905 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 102906992 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102907014 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102907030 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102907247 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 102907257 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 102907674 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102908495 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 102908503 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 102908769 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 102908950 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102909254 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102909673 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102910086 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102910269 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102910390 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 102910688 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102911413 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 102911466 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102911533 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102911538 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102911580 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 102911592 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 102911798 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102911854 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102911988 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 102912066 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102912202 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102912260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102912267 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102912342 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 102912376 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 102912738 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 102912852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102912933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102913584 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 102913666 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 102913783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102913869 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102913928 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102915479 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102915949 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 102917155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102918543 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102918561 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 102918933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102919343 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102919365 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102919367 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102920533 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 102920715 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 102920840 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 102921407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102921751 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 102922098 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102922127 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102922142 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102922144 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 102922556 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102922635 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102922678 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102923091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102923105 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102923180 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102923436 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 102923723 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 102923863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102923869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102923978 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 102924123 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102924220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102924475 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 102924605 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 102924753 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 102924976 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102925609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102925935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102926345 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102926357 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 102926632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102927309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102928348 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 102928497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102929014 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102929520 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 102929832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102930044 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 102930736 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 22 18 10 2 8 2 102931990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102932096 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102932135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102932200 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102932536 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102933542 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102935880 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 102939842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102939996 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 102945790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102946687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102946741 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 102947587 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102948204 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102948772 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102948839 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 102949639 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102950746 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102951193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102951237 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102951247 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102951429 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102952240 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102952321 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 102953211 G C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 102953420 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 102955456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102955595 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 102956126 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 102956270 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 102956835 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 102957469 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102957473 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 102957495 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102957548 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102957611 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 102957753 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102957824 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 102957875 C G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 102958232 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 2 102958396 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 102958459 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 102958500 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102958517 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 102958555 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 102958591 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102958623 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 102958634 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 102958829 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102959045 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 102959102 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 102959216 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 102959294 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 102959325 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 102959421 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 102959439 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 102959525 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 102959575 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 102959808 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 102960314 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 102960827 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102960850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102960917 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102960954 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102960983 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102961085 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 102962291 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 102962893 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 102962988 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 102963232 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 102963327 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 102963389 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102964211 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102964265 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102964295 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102964304 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102964349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102964411 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102964423 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 102964694 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 102964706 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102965096 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 102965361 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102966426 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102966436 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102966760 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 102966944 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 102967096 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102967577 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 102967692 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 102967814 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 102967845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102968110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102968119 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102968334 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102968653 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102968682 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 102968715 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 102968852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102968855 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102970279 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102970399 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 102970564 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102970945 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 102971046 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102971283 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102971393 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102971431 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102971859 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 102971873 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 102972035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102972728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102972790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102974751 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102975567 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102976119 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102976363 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102978171 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102978193 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 102978329 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 102978966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102979971 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 102979979 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 102980140 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102980192 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 102980912 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102981137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102982042 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 102984134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102985186 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 102985189 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 102985261 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102985369 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 102985534 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 102985568 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 102985787 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102985838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 102985859 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 102985874 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102986031 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102986569 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102986622 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 102987403 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 102988884 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102989400 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 102989561 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 102989572 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 102989879 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 102989964 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 102991807 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 102992037 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 102992512 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 102992528 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102993099 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 102993604 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102993937 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 102994228 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 102994910 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 102996485 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 102997870 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 102999323 T C Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 2 102999748 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 102999753 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 102999768 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 102999831 C T Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 103001825 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103002978 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103003225 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 103003911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103004081 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103004165 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103004429 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 103004537 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103004546 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 103004569 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103004963 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 103005361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103005475 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 103005534 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103005734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103005751 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103005823 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103006221 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 103006518 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103006701 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 103006805 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103006976 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103007160 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103007247 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 103008457 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103008661 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 103009076 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103009108 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 103010851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103011801 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103012022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103012181 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 103012223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103012268 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103012281 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 103012416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103012505 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 103012515 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 103013006 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 103013274 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 103013316 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103013407 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103013871 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103014017 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103014112 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 103014127 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103014272 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 103014372 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103014664 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103014712 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 103014758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103014774 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 103015347 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103015359 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103015807 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103016487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103017774 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103018077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103019091 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103019612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103019984 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 103021584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103022908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103022930 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 103022933 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 103023106 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103023575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103023710 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 103023729 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103023923 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103024069 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103024130 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103024289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103024879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103025261 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 103025812 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103025851 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103026178 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103026698 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103027051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103027247 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 103027456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103027516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103027554 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103027629 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103028507 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103028675 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103028811 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103029591 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103029615 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103030337 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103032329 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 103033945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103036072 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 103036197 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 103036525 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103036782 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103038099 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103038120 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 103038461 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 103038790 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103039032 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103039065 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103039085 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103039086 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103039504 T G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 103040105 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103040177 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103040284 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103040971 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 103041246 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103041265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103041355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103041515 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103041536 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103041659 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 103041724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103041788 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103041899 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103041909 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103041975 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103041979 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103042198 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103042220 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 103042287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103042302 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103042311 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103042314 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103042380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103042466 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103042473 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103042480 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103042496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103042543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103042886 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103042904 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103043387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103043988 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 103044268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103045032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103046475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103046635 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103046787 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103046801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103046974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103047320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103047448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103047652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103048917 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103049457 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103049711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103050402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103050454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103050491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103050573 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103050615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103050975 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 103051059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103051329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103051398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103051754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103052126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103052441 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 103052491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103052690 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103052999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103053077 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103053227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103053396 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103053610 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103053992 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103054121 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 103054358 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103054394 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103054607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103055410 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 103056512 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 103056804 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 103056835 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 103056942 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 103056978 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 103057059 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 103057129 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 103057400 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 103057410 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 103057438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103058576 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103061016 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103061526 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103061661 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 103061680 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 103061805 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 103062514 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 103062606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103062610 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 103062714 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103063243 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103063341 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103063424 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103063459 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103063654 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103064242 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103064322 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103064363 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103064524 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 103064822 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 103064864 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103065218 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103065642 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103065645 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103066887 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103068374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103068508 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103068699 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103070271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103072448 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 103072598 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 103073054 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103073293 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103073315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103073346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103075398 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103075438 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103076235 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103076946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103077176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103077281 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103079224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103079584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103082745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103084098 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103085187 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 103085255 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 103085567 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 103085592 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 103085660 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103085670 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 103085684 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103085748 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 103085918 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103085961 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 103087510 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103090039 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103090370 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 103091791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103092573 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103093592 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103093800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103094015 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 103094022 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 103094144 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 103094164 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103094265 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 103094296 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 103094325 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 103094482 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103094716 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103095816 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103096755 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103096763 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103098197 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103099445 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103099844 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103102302 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103102339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103104684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103106552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103107416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103108925 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103109122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103109345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103109778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103109839 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 103109841 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 103109987 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103110418 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103111187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103111189 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103112492 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103112515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103112798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103112894 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103114305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103115660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103116346 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103117583 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103119319 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 103121175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103121449 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 103121603 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103121747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103121932 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 103122008 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 103122073 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 103122081 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 103122244 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 103122434 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103122630 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 103122964 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 103123052 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 103123107 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 103123537 C G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 103123603 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 103124069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103124152 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103124183 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103124201 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103124332 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 103124491 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 103124535 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 103124546 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 103125024 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103125104 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103125168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103125357 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103125370 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103125434 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103126105 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103126455 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103126524 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 103126588 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103127029 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103127191 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103127478 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103127480 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103127506 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103127532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103127763 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103127766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103127776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103127862 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103127874 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103128021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103128304 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 103128314 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 103128586 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 103128605 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103128795 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 103128899 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 103128901 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 103129031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103130124 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103130316 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103130374 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103130382 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 103130419 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 103130466 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103130690 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103130796 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103130846 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103130860 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103130901 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 103131038 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 103131207 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103131235 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103131459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103131524 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 103131569 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103132037 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103132073 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103132429 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 103133017 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103133031 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103133032 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103133095 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 103133159 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103133170 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 103134383 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103135381 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103135726 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103135894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103135978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103137904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103139594 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103140403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103142032 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103142104 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103142392 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103142475 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103142644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103142680 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103142815 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103143021 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 103143357 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103143517 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103143577 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103143681 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103143714 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103143859 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103143952 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103144523 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 103144748 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 103145974 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103148013 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103148117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103149516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103149679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103149946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103149987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103151051 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103151072 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103151367 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103151383 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103151552 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 103151633 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103151697 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103151816 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103151866 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103151888 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103151967 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103153571 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 103153625 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 103153845 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103153877 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103154339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103155126 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103157135 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103158299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103158982 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103159564 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103160264 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103162221 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103163247 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103164945 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103165421 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103165578 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103165773 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103165928 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103166045 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103166097 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103166161 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103166194 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103166336 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103166364 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103166407 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103166422 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103166445 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103166696 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103166806 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103166826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103166841 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103166849 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103166908 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103166948 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103166963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103166987 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103167007 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103167280 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 103167297 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103167821 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103167953 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103168132 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103168232 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103168255 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103168261 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103168335 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103168339 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103168459 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103168472 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103168499 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103168582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103168713 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103168714 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103168733 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103168783 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 103168817 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103168834 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103169244 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103169437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103169528 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103169705 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103170544 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103170609 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103171134 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103171142 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103171660 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103171710 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103171737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103171928 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103172375 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103172422 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103172499 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 103172523 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 103172539 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 103172548 C G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 103172768 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 103172824 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 103172988 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 103173845 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 103174017 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 103174102 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103174475 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103174498 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103174532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103174556 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103174631 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103174638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103174680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103174915 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 103175160 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 103175209 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 103175362 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103175386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103175800 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103175892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103176072 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 103176543 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103176624 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103176674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103177127 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103177272 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103177445 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103177476 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103177882 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 103178694 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103178928 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103178963 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103179146 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103179166 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103179297 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103179375 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103179608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103179690 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103179964 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103180248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103180341 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103180357 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103180494 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 103180544 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103180582 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103180661 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103180797 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103180953 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103180964 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 103180973 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 103181074 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103181084 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103181211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103181361 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103181398 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103181501 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103181599 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103181792 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103181823 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103181847 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103181860 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103182111 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103182206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103182209 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103182274 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 103182307 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 103182437 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 103182517 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103182532 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 103183498 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103183568 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103183595 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 103183729 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 103184841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103185764 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 103186338 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103186832 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103186870 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103187167 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103187501 C G Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 103187661 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 103188232 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103188527 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103188754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103188925 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103189098 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103189099 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 103189314 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103189435 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103189483 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103189523 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103189632 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103190246 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103190347 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103190496 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103190591 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103190773 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103190799 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103190800 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103190825 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103190939 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103190958 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103190970 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103191082 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103191097 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103191147 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103191173 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103191487 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103191759 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103192096 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103192149 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103192153 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103192453 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103193361 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103193576 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 103193773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103193827 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 103194112 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103194125 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103194150 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103194193 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103194570 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103194603 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103194644 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103194715 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103194780 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103194797 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103194879 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103194883 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103194943 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103194959 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103195131 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103195136 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 103195176 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103195401 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103195419 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103195660 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103195678 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103195862 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103195887 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103195930 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103195959 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103196140 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 103196149 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103196152 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103196250 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103196301 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 103196302 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 103196363 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103196383 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103196430 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103196535 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103196557 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103196569 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103196794 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103197082 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103197359 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 103197420 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103197436 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103197496 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 103197535 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103197952 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103198050 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103198079 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103198259 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 103198296 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 103201080 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103201314 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103201333 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103201357 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103201358 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103202909 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103205073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103205347 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103206422 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 103206679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103207759 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103208277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103208951 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103210180 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103210227 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103211472 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103211966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103211988 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103212825 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103213190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103213199 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103213234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103213245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103213722 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103214049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103214234 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 103214253 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103214273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103214311 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103214426 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 103215113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103215162 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103216268 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103216564 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103217214 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103217549 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103218159 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103219333 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103220415 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103221444 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 103221472 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 103221653 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103221852 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103221876 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103222346 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103222716 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103222923 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103222986 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103223070 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103223085 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103223101 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103223176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103223195 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103223198 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103223493 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103223503 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103223589 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103223605 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103223920 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103224266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103225188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103225319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103225852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103227070 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103227295 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103229804 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103230135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103230294 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103230327 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103230699 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103233217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103233222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103233272 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103233536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103233859 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103234104 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103234245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103234737 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103235282 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 103235507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103236928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103237499 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 103237992 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 103238022 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103238032 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103238285 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103238520 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103238567 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103238590 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103238671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103240540 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 103241425 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103241516 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103241721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103246888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103247473 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103248841 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 103249210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103250977 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103251573 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103253524 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103254120 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103254393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103256068 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103256090 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103256696 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103256937 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103257102 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 103257126 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103257144 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 103257156 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 103257180 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 103257230 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103257249 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103257616 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103257645 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103257742 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103257871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103257910 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103257996 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103258046 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103258133 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 103258245 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 103258317 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 103258364 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103258433 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103258558 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103258649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103258657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103258662 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103258677 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103258731 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103258737 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103258897 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103259690 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103261493 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103261852 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103263467 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103263664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103265090 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103265896 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103265897 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103266225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103268837 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 103269831 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103269995 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103270067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103270177 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103271379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103271990 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103273676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103273723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103274136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103275317 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103275583 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 103275634 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103276448 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103276513 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103276614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103276819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103276966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103277364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103277440 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103279433 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103279615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103279816 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103280324 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103280382 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 103280420 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103280585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103280757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103280764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103281087 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103281116 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103281343 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103281767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103281846 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103281925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103282115 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103282133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103282403 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103282557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103282690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103282719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103282952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103282986 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103283020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103283045 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103283259 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103283274 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103283357 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103283397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103283414 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103283455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103283773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103283833 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103284172 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103284876 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103284943 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103284999 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103285240 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 103285538 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 103285540 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 103285627 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103285687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103285722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103285723 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103285739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103285778 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103285924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103286360 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103286361 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103286430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103286556 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103286625 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103286812 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103286857 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103286903 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103286985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103287320 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103287706 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103287719 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103287878 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103287959 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103287987 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103288001 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103288739 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 103288836 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103289009 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103289265 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103290195 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103290267 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 103290867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103290884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103291693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103291774 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103291845 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 103292041 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103292764 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 103293225 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103293640 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103293962 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103294101 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 103294112 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 103294162 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 103294206 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 103294231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103294946 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 103294983 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103295040 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103295073 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103295372 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103295521 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103295698 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103295707 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103296072 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103296248 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103296265 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103296284 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103296397 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103296570 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103296590 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103296752 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103296783 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103296838 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103297280 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103297704 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103297872 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 103298340 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 103298380 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 103298446 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103298553 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103298561 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103298587 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103298589 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103298602 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103298736 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103298738 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103298871 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103299133 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 103299164 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103299207 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103299322 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103299331 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103299386 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103299393 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 103299438 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 2 103299453 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103299489 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103299567 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103299617 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103299675 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103299691 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103299803 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103299883 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 103299936 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103300853 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103301116 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 103301335 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103301383 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103301391 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 103301431 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103301530 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103301604 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103301801 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103302370 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103302423 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103302577 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103302761 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103303248 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103304092 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103304315 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103305127 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103307183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103307784 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103307823 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103308048 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103308065 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103308135 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103308197 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103308504 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103309559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103309657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103309822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103310609 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103311638 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103312281 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 103313072 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103313603 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103313808 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103314156 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103314415 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 103314487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103315268 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103315386 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103315484 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103315598 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103316815 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 103316836 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 103317128 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103317330 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103317507 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103318827 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103320352 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103320805 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103321082 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103321547 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103321889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103322196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103322367 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103322510 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103322546 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103323355 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103323532 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103323534 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103323550 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103324126 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103324135 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103324218 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103324280 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103326162 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 103326640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103326649 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103327257 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103327534 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103327613 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103327709 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103327726 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103327789 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103327817 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103328434 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103328545 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103328579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103328725 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103328965 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103329013 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103329429 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103329494 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103329563 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103329589 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103329611 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103329617 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103329663 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103329697 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103329845 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 103330109 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103330167 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103330209 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103330258 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103330279 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103330289 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103330363 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103330382 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103330417 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103330466 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103330505 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103330516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103330576 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103330652 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103330654 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103330796 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103330804 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103330838 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103331316 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103331413 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103331500 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103331552 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103331739 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103332057 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103332086 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103332166 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103332472 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103332574 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103332644 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103332648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103332661 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103333127 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103333302 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103333645 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103333689 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103333791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103333964 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103333966 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103334573 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103335672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103335935 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 103338395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103338761 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 103339687 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103339695 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103339919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103339940 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103339972 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103340155 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103340169 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103340192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103340222 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103340287 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103340315 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103340358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103340444 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103340619 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103340714 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103340735 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103340758 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103340776 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103340860 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103340909 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103340923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103340945 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103341149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103341390 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103341476 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103341494 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103341501 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103341570 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103341810 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103341867 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 103342217 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 103342393 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103342416 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103342417 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103342680 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103342724 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103342804 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 103343165 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103343191 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 103343229 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103343260 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103343419 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103343598 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103343665 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103343883 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103344129 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103344200 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103344245 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103344374 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103344404 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103344633 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103344681 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103344703 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103344731 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103344794 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103344811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103344994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103345064 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103345447 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103345566 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103345658 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103345693 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103345707 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103345719 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103345751 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103345935 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103345991 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103346180 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103346220 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 103346465 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103346480 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103346555 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103346640 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103346706 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103346722 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103346784 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103346790 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103347011 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103347167 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103347174 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103347247 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103347511 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103347569 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 103347573 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 103347712 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 103347843 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 103347879 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 103347930 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103347989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103348019 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103348146 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103348152 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103348166 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 103348178 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103348239 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103348330 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103348357 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103348428 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103348431 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 103348447 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 103348523 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103348570 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103348634 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103348646 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103348910 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103349158 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103349189 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 103349456 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 103349465 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103349506 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103349583 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 103349924 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 103349967 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 103350029 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 103350499 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103350731 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103352089 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103352349 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103352399 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103352777 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 103353087 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103353210 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103353525 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103353536 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103353554 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103353632 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103353668 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103353710 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103353765 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103353919 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103354206 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103354278 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103354444 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 103354468 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103354483 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 103354806 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103354974 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103355003 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103355011 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 103355076 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103355267 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103355334 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103355360 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 103355387 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103355529 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103355570 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103355612 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103355855 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103355875 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103355949 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103355960 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103356474 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 103356972 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 103357046 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 103357102 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103357206 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103357349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103358072 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103358119 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103358140 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103358245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103358247 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103358388 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103360001 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103360950 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 103361271 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 103361687 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103361914 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103361932 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103362094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103362143 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103362654 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103362923 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103363533 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103364096 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103364100 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103364132 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103365050 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103365151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103365350 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103365484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103365696 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103366056 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103366938 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 103367678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103367718 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103368115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103368214 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103368473 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103368474 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103368491 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103368532 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103368690 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103368730 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 103368886 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 103368927 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103368944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103369038 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 103369044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103369058 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103369094 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 103369122 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103369142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103369250 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 103369304 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103369376 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 103369384 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 103369481 C T Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 103369498 G A Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 2 103369689 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 103369794 A T Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 103369910 C T Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 103369940 C T Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 103370110 C G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 103373241 A G Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 103373262 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 103373347 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 103375262 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 2 103375404 G A Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 103375423 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 103375427 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 103375446 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 103375503 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 103375546 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 103375711 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 103375753 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 2 103375823 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103375880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103376299 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 103376325 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 103376456 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103376461 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103376507 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103376549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103376567 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103376800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103376901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103377205 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103377340 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103377358 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 103377482 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103377541 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103377553 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103377581 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103377585 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103377610 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 103377696 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103378044 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103378081 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103378091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103378127 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103378321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103378339 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103378383 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103378561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103378565 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103378649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103378753 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103378811 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103378839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103378883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103379143 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103379310 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103379768 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 103380147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103380643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103382068 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103382153 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103382628 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103383461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103383990 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103384686 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103385613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103387197 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103387814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103388166 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103389129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103389607 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 103389739 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103389838 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103392788 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103393827 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103393943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103394188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103394209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103394213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103396087 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 103397249 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103397671 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103397676 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 103397708 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 103398215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103400483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103400513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103402313 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103403929 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103404306 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103405600 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103406647 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103406695 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103406895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103408535 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103411449 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103412776 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103413436 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103414023 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103414058 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103414198 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103414199 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103414244 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103414255 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103414344 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103414358 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103414382 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103414463 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103414644 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103414654 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103414727 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103414732 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103415030 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103415111 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 103415439 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103415696 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103415768 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103415796 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103415993 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103416235 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 103416368 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103416803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103417337 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 103417554 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103417731 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103417907 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103418338 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103418428 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103418429 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103418527 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103418567 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103418620 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103420049 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103420059 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103420100 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103420127 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103420187 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103420191 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103420235 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103421272 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103422767 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103423617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103424446 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103424579 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103424603 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103425641 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103425808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103427205 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103427240 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103427453 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103427531 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103427542 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103427564 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103427567 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103427716 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103427766 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103427769 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103427779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103427821 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103427827 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103427961 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103428006 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103428009 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103428296 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103428391 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103428664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103428688 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103429060 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103429470 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103429911 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103430216 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103430222 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103430288 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103430750 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103432152 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103432226 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103432480 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103433228 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103433655 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103434300 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103434647 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103434717 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103434843 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103434866 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103434999 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103436706 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103436711 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103436852 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103436977 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103439951 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103441495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103441670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103442622 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103443885 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103444707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103444787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103445444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103446787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103446831 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103447013 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103447253 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103447826 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103448087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103449137 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103449325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103449504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103449646 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103449694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103449707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103449708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103449720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103449948 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103449990 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103449997 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103450040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103450077 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103450210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103450264 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103450314 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 2 103450315 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 103450491 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103450603 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103450673 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103450932 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103451406 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103451588 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103451659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103451930 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103452085 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103452128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103452153 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 103452155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103452170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103452174 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103452226 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103452264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103452395 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103452753 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 103452821 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 103452913 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103452923 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103453347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103454147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103454232 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103454280 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 103454535 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103454737 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103454777 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103454789 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103455014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103455045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103455184 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103455339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103455815 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103455827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103455884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103456176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103456220 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103456258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103456506 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103456513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103457289 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103457455 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103458335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103459269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103459768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103459779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103459891 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103460169 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103460216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103460316 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103460346 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103460374 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103460419 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103460430 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103460444 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103460638 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103460668 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103460980 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103461369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103461380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103461511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103461893 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103461914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103462317 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 103462418 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103462543 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103462763 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 103462930 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103463211 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103463287 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 103463442 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103463582 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 103463713 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103464147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103464186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103464326 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 103464333 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103464343 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103464442 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103464460 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103464470 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103464471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103464540 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103464590 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103464680 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103464703 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103464880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103465035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103465303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103466302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103466353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103466530 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103466772 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103466827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103466845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103467166 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103467218 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 103467292 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103467334 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103467341 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103467363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103467446 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103467518 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103467641 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103467721 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103467817 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103468074 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103468083 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103468192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103468212 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103468293 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103468390 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103468551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103468553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103468563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103468625 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103468949 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 103468959 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103469011 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103469030 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103469034 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103469045 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103469102 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103469114 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103469149 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103469238 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103469588 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103469768 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103470286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103470375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103470376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103470421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103470882 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103471016 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 103471430 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 103471986 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103472097 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103472099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103473267 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103474893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103475362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103475366 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103475491 T G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 103475536 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103477997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103478247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103478490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103478998 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103480218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103480713 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103482694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103484364 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103485336 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 103485480 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103485767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103486062 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103486273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103486490 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103487070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103488582 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 103489298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103490332 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103490784 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103490876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103491122 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103492780 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103493231 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 103493485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103493640 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 103493834 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103493906 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103494128 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 103494195 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103494399 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103494467 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 103494685 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103495067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103495695 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 103495954 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103496131 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103496340 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103496474 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103496490 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 103496732 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103496790 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103496831 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 103496887 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103497146 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 103497670 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103497771 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 103497979 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103498387 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 103498412 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 103498480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103498576 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103498586 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103498650 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103498672 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103498679 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103498802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103498886 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103498971 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 103499048 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103499061 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 103499280 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 103499294 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103499617 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103500647 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103501489 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103501493 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103502102 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103502203 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103502775 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103502776 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103502789 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103502936 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103502970 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103502992 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 103503477 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103504422 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 103504439 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 103504720 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103504911 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103505509 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103505679 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103505707 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103506291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103506405 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103506841 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103506845 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103506856 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103507675 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103507680 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103507796 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103509263 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103509395 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103509956 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 103509977 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 103510107 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 103510294 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103510678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103510742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103510935 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103511042 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103511056 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103511621 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 103511668 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 103512174 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103512298 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103512372 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103512460 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103513030 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103513366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103514371 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103514869 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103514958 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 103515537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103515622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103515681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103515862 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103516219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103516813 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103516887 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103517197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103517255 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 103517419 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103518090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103518402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103518433 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103518437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103518497 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103518539 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103518548 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103518556 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103518565 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103518675 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103518692 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103518694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103518736 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103519193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103519323 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103519415 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103519488 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103519770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103519820 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103519842 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103520211 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103520242 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103520320 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103520359 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 103520431 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103520489 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103520533 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103520663 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103520795 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103521189 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103521348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103521405 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103521421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103521828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103521846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103521909 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103521970 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103521972 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103521999 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103522029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103522064 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103522072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103522079 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103522396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103522418 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103522435 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103522456 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103522545 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103523220 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 103523878 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103523955 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103523993 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103523998 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103524035 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103524084 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103524132 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103524159 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103524183 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103524233 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 103524280 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103524354 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 103524362 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 103524540 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103524581 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 103525606 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 103525675 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103526069 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 103526153 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 103526570 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103526689 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103527545 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103528072 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103528333 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103528358 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103528439 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103528646 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103528690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103529096 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103529496 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 103530248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103530335 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103530429 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103530434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103530725 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103530855 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103530883 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103531019 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103531102 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103531120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103531430 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103531970 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103531989 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103532089 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103532090 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103532118 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103532122 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103532725 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103532736 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103532755 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103532930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103533122 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103533232 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103533381 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103533616 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103533651 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103533837 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103534077 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103534417 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103534419 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103534562 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103534834 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 103534892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103535425 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103536356 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103536717 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103537860 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103538049 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103538575 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103538582 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103538679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103538905 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103538906 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103538933 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103539031 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103539097 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103539170 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103539204 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103539217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103539223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103539332 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103539464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103539659 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103540042 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103540088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103540240 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103540267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103540523 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103541063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103541190 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103541348 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103541538 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103541803 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103541858 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103542091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103542120 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103542148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103543228 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 103543243 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103543344 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103543371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103543372 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103543397 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 103543444 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103543464 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103543585 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103543813 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 103544143 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103544172 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103544300 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103545113 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103545409 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103545466 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103547451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103547478 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103547598 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103548580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103551925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103552384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103554521 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103554524 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103555135 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103555140 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103555155 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103559534 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 103561234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103561235 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103561250 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103561455 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103561544 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103562568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103562731 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103562742 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103567628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103569731 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 103570469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103570573 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103570795 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103571876 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103572010 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 103572034 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103573645 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103574025 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103574051 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103574558 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103574561 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103574678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103574942 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103575461 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103576602 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103576648 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103576913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103577265 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 103577288 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103577292 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103578685 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 2 103579116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103579211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103579314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103579402 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103579459 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103581637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103581676 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103582212 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 103582264 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 103582602 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103582804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103583294 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103583627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103584000 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103584053 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103584162 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103584317 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103585137 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103585324 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103585764 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103587265 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103587383 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103587403 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 103587858 A G Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 103589462 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103589590 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103589659 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103589792 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103591128 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103591176 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 103592216 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103592234 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103592983 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103593195 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 103593341 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103597202 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103599582 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103599974 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103600049 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103601511 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103602410 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103602905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103604534 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103605068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103609069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103609472 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103609498 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103609826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103611464 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103615489 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103615520 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103616750 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103618534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103619175 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103620389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103623830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103623921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103624059 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103624513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103626968 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103627602 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103628004 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103628730 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103629128 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 103629664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103629973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103631188 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 103631517 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103632194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103635022 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103635396 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103641848 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103642683 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103643319 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103643438 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103643766 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103644388 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103647580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103649984 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103650561 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103651352 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103651569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103654127 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 103654199 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 103654207 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 103654232 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103654313 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103654714 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103655202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103655641 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 103655778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103655974 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 103658328 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103659022 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 103659103 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 103659518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103659568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103659628 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 103659638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103659702 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103659732 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103659737 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103659854 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103659879 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 103660383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103660384 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103660467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103660480 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 103660595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103660688 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 103660699 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103661133 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103661180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103661561 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103661711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103661736 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103661808 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103661897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103662063 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 103662392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103662639 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 103662696 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103662972 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103663030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103663253 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103663323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103663327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103663775 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103663903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103663951 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103663983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103664329 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 103664360 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 103664383 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 103664562 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 103665023 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103665497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103665536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103665540 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103665561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103665635 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103665647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103665788 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103666452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103667088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103667847 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103667862 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103668146 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103668224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103668289 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103668364 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103668404 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103668423 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103668432 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103668558 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103668696 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 103668712 A T N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 2 103668750 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 103668756 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 103668871 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103668953 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103669410 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103669827 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103669972 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 103670055 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103670215 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103670548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103670918 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103671198 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 103671574 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103671674 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 103671789 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103671794 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 103672173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103672769 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 103673641 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103673742 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103674303 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103674599 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 103674601 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 103674659 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 103674791 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103674831 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103674957 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 103674970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103675549 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 103675550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103675637 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 2 103675643 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 103675684 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 103675699 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103675713 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103675778 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103675849 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103675980 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 103676000 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103676051 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 103676195 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103676271 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 103676303 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103676317 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103676343 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103676432 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 103676492 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103676586 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 103677059 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103677266 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 103677834 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103677972 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103678227 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103678233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103678335 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103678517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103678591 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103679086 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103679104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103679114 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103679179 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103679206 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103679211 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103679427 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103679534 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103679839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103679980 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103680000 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103680158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103680251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103680426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103680889 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103680910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103681034 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 103681113 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103681275 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 103681279 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103683639 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103684146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103684176 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103686678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103686774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103687820 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103687984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103690104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103690270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103690666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103691833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103698054 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 103698353 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103698810 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 103699349 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103705276 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103705511 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103705582 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103708176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103708806 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103709097 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103711008 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103711764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103712363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103714184 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103714597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103715867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103716326 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103716382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103716444 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103716542 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103717215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103717245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103717250 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103717289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103717369 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103717405 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 103717434 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 103717945 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103717995 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103718188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103718304 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 103718318 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103718341 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103718394 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103718447 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103718471 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103718490 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 103718528 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103718531 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103718540 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103718594 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103718666 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 103718670 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103718741 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103718825 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103718899 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103719055 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 103719096 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103719099 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103719221 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 103719234 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 103719252 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103719274 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103719287 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103719367 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 103719385 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103719426 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103719451 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 103719558 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 103719563 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 103719575 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 103719690 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 103719881 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103720133 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103720324 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 103721438 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 103721646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103723077 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103723223 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 103723238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103723294 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103725261 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103726096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103726234 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103726307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103726382 A C N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 2 103726646 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103726743 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103726848 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103727050 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 103727133 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103727261 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103728405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103728505 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103729097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103729285 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103729349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103729371 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103729493 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103729575 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103729611 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103729703 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103729801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103729977 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103730019 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103730108 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103730155 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103730261 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103730906 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103731023 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103731391 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103731564 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103734493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103735870 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103736173 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103736778 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103738096 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103738208 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103739074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103739274 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103740248 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103740259 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103740331 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103740416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103740429 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103740431 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103740466 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103740591 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103740929 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103741264 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103741266 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103741385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103741580 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103742264 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103742462 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103742756 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103744475 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103744476 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103751120 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103751224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103751536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103753699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103755581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103755846 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 103756650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103757642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103757877 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103758228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103758726 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103759605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103760284 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103760316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103760428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103760584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103760875 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103760887 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103761179 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103761181 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103761195 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103761237 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103761461 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103761568 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103762586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103763126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103764192 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103764856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103772344 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103774129 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103775248 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103776012 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103776423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103777179 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103777308 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 103778725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103780709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103781259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103781662 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103781802 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103783421 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103783465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103785652 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103785778 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103787596 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103789651 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103789691 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103790037 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103790128 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 103790291 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103790331 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103790363 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103790869 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103791140 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 103791571 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103791872 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 103794522 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103794584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103794687 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103795132 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103795687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103795920 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103796452 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103796464 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103796472 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103796582 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103796611 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103796866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103796915 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103796951 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103796962 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103797128 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103797412 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103797489 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103797849 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103798055 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103798082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103798125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103798370 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103798449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103798455 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103798533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103798822 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103799195 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103799197 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103799494 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103799717 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103799785 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103800082 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103800145 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 103800339 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103800393 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103800469 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103800729 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103800862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103800881 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103800942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103801142 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103801180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103801295 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103801330 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103801362 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103801384 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103801528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103801933 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103802039 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103802084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103802139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103802274 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103802290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103802312 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103802505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103802509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103802973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103803118 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103803158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103803199 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103803224 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 103803235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103803241 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103803252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103803278 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103803502 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103803524 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103803572 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103803708 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 103803837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103804647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103805333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103805398 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103805443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103805502 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103805574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103805636 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 103805710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103805954 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103805972 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103806021 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 103806263 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103806778 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103806882 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103806883 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103806910 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 103806984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103806987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103807375 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103807387 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103807437 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103807536 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103808546 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103808599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103809277 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103810059 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103813053 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103815403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103815794 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103818246 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103818276 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103818436 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103818760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103819565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103820043 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103820202 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103820547 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103820558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103820656 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 103821282 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103821295 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103821296 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103821389 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103822263 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103822484 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103823012 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103823546 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103823734 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103823811 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103823945 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103823975 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103823993 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103823994 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103824024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103824089 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103824144 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103824267 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103824484 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 103824675 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 103824679 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 103824908 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103824918 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 103825176 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103825189 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103825335 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103825812 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103825841 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103825930 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103826075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103826076 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103826278 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 103826367 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 103826440 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103826495 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 103826562 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103826622 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103826631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103826969 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103827298 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103827324 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103827671 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103827729 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 103827730 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 103827789 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 103827854 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103828350 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103828410 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103828455 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103828478 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 103829108 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103829207 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103829317 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103829378 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103829665 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 103829710 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103829732 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103830047 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103830156 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103830756 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 103831083 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103831910 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103832099 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103832103 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103832133 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103832385 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 103832680 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103833079 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103833757 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 103833881 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 103834008 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 103834114 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103834658 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 103834911 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103834919 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103836160 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103838350 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103838889 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 103843017 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103844252 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 103844413 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 103844510 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 103845194 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103845641 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103845703 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103846313 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103846416 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103847802 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103857831 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 103857902 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 103858134 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 103858485 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 103859155 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 103859694 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 103859731 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 103859792 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 103859809 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 103859860 C G N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 103860071 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 103860325 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 2 103860326 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 2 103860370 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 2 103860372 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 103860386 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 2 103860418 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 2 103860435 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 103860440 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 103860476 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 103860681 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 2 103860821 C T Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 103860828 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 103860936 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 103860978 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 103862020 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103862765 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103862792 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103866405 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103866516 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103866547 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103866655 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 103868400 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 103869043 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103869406 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103870997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103872318 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103875798 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103877047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103877293 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 103877294 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103878798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103879403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103879639 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 103882356 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103882737 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103884397 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 103889065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103891442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103891861 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103892646 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 103893155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103894019 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 103894407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103894707 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103896389 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 103898354 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 103899883 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103899901 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103900113 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103900495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103900618 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103901194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103901956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103902489 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103904769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103905176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103905195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103905357 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 103906385 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103906559 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103906608 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 103906663 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103906696 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103906768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103906828 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103907858 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103908483 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 103908499 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 103909287 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 103909293 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 103909336 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 103909383 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 103909416 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 103909799 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 103910004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103910460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103911082 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103911110 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 103911724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103912176 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 103912271 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 103913230 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103913576 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103914597 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 103914612 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103914630 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 103914654 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 103914783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103914879 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103918286 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 103918628 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103918630 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 103918833 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 103918839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103919343 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103919359 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 103919393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103919635 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103920292 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 103920449 G C Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 103920601 A C N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 103920648 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 103920684 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 103920806 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103920862 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 103920913 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103921067 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103921274 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103921364 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103921477 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103922239 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103923489 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103924380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103924933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103924941 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 103925263 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 2 103925476 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103925679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103925921 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 103926767 G C Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 103927272 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 103927286 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103927332 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103929962 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 103929974 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 103929985 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 103931527 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 103931666 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 103932636 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 103932678 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103932679 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103932969 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103933046 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103933143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103933250 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103933578 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103933697 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103934170 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 103934278 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 103935033 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103935359 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 103935528 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 103935534 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 103935601 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 103935616 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 103935628 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103935661 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103936316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103936414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103936555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103936610 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103936622 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103936650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103936683 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103936694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103936720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103937067 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 103937173 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103937493 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103937504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103937598 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 103937813 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103937984 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103938175 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103938193 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 103938217 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 103938225 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 103938402 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 103938533 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 103938765 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103938805 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 103938850 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103939947 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 103940483 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103941073 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103943431 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 103943549 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103943555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103944108 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103944290 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103944393 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103944722 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103944803 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 103944946 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103944973 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103945203 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 103945518 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 103945653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103945666 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 103946064 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103946621 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 103946635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103947930 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 103948462 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 103948775 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 103948885 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 103948894 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 103949001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103949546 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 103950099 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103950251 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103950314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103950336 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103950605 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103950626 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103950627 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103950770 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103952208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103953870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 103955204 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 103955299 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 103956008 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103956348 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103956615 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103957392 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 103957481 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 103957500 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 103957865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103959724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103960536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103960660 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103960752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103963170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103964910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103966681 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 103969332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103971090 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 103972845 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 103973034 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 103973067 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 103973073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103973108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103973113 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 103973803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103973994 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 103974021 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103974082 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 103974332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103975966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103977123 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103977695 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103977726 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103978466 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103978771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103978957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103979368 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103979779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103979967 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103982516 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103983080 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103983210 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 103983750 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 103983755 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103983988 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 103984261 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 103984288 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103984446 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 103984931 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103984997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103985095 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 103985254 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 103985316 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 103985416 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 103985443 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 103985450 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103985467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103985496 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103985603 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103985792 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103985917 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103986027 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103986161 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 103986381 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 103986477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103986520 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 103986636 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 103987078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103987536 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 103988642 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103989094 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103989499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103989503 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103989523 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 103989529 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 103989608 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 103989613 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 103989910 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103989935 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103990095 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 103990475 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103990541 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103990598 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103990687 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103990741 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103990975 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103991445 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103991470 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103991575 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103991872 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 103991879 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103992008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103992035 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103992073 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103992248 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103992256 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103992516 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103992897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103993905 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103994033 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 103994571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103995827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 103998100 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 103998475 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 103998742 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 103998749 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 103998946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 103999853 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104000059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104001631 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104001751 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104002675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104002690 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104003468 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 104004484 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 104004515 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 104004647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104004909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104005085 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104005308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104005363 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104005614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104005706 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104005708 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104006598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104006848 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 104007067 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 104007104 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 104007236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104007306 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104007349 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 104007350 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 104007416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104007434 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104007464 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 104007487 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 104007593 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104007666 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104007800 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104007908 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104008052 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104008118 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104008127 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104008166 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104008220 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104008285 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104008386 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104008449 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104008735 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104008762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104008833 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104008834 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104008888 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104009007 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104009164 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 104009185 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104009294 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 104009328 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104009448 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 104009534 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 104009586 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 104009660 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 104009661 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 104010521 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104010586 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 104010660 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104010708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104010782 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104011025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104011027 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 104011037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104011082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104011085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104011175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104011188 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104011212 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104011269 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 104011392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104011428 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104011503 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104011782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104011847 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104011852 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104011880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104011981 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 104012005 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104012020 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 104012073 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104012100 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 104012145 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104012741 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104013031 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104013165 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104014224 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 104014297 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104014873 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 104015021 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 104015128 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104015227 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104015291 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104015313 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104015326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104015360 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104015435 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104015445 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 104015459 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 104015479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104015531 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104015820 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104015857 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104016532 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104016658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104016748 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104016749 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104016780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104016782 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104016846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104016847 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104016948 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104016950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104016986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104017093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104017288 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 104017334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104017554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104018059 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104019170 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104019405 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 104019483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104019608 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104019665 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104019707 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104019741 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104019764 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104019788 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104019809 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104019866 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104019876 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104019960 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104019993 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 104019996 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104020059 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104020065 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104020074 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104020196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104020244 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104020479 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104021050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104021079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104021081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104021104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104021128 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104021187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104021230 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 104021240 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 104021267 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104021273 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104021439 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104021484 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104021519 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 104021545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104021605 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104021624 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 104022013 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 104022082 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 104022108 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 104022116 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 104022248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104022785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104022821 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 104023204 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 104023213 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 104023236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104023254 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 104023312 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 104023336 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 104023441 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104023445 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 104023478 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104023630 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 104023725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104024012 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 104024108 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 104024119 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104024161 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 104024171 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 104024239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104024287 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 104024646 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 104024658 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104024829 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104024948 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 104025100 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104025152 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 104025167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104025266 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 104025291 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 104025342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104025347 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 104025362 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 104025825 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104025829 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104025864 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 104025984 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 104027549 T A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 104028151 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 104029130 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104030517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104032010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104032175 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104032354 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104032397 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 104035236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104035411 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 104035820 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104037013 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104037330 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104037380 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 104037600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104038056 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 104038581 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 104038824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104039141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104039156 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 104039582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104039707 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104039709 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104039718 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 104039748 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 104039755 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 104040004 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 104040011 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 104040440 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 104041220 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 104041266 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104041510 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104041847 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104042339 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104042812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104045417 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 104046846 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104047577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104047599 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 104048148 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 104048605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104048642 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104049031 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104049210 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104049252 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104049333 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104049384 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 104049608 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 104049666 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 104050076 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104050102 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104050162 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104050243 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 104050272 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104050297 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104050435 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 104050650 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 104050655 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 104050664 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 104050699 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104050906 G C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 104050994 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104051164 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104051451 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104051454 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104051754 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 104052146 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104052225 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 104052259 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104052418 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104052674 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104052684 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 104052725 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104052843 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 104052844 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 104052879 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 104052893 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 104052901 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104053021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104053077 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 104053145 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104053147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104053228 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104053376 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 104053709 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104054002 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104054789 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 104054819 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104055036 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 104055113 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104055715 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 104055732 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 104055745 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 104055830 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104055841 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104055989 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104056103 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104056114 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104056131 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104056156 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104056302 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104056331 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104056530 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 104056559 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104056575 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104057145 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104057169 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057233 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057320 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 104057386 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057392 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057478 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057572 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057588 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057604 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057751 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057827 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057842 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 104057844 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 104057860 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057888 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057894 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057899 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057930 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057949 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057964 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104057978 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 104058122 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104058146 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104058538 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104058602 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104058627 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104058648 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104058707 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 104058848 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 104058941 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104058991 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104059202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104059978 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 104060109 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 104060573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104060840 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 104060911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104061012 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104061066 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 104063272 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104064011 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104066337 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104066400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104067010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104068824 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104068938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104068953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104068970 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104069513 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 104069558 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 104069609 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104069649 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 104069901 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 104069904 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 104070120 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 104070872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104071136 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 104071167 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 104071226 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 104071239 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 104071322 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104071634 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 104071719 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 104071830 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 104071857 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104072099 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104072165 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 104072634 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104072799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104073461 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104073515 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104073613 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104074094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104074152 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104074454 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104074547 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 104074976 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 104075036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104075186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104075227 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 104075350 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 104075420 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104075576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104075666 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 104075806 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 104075849 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104076001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104076151 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104076275 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104076341 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104076350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104076441 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 104076552 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104076625 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104076702 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 104076825 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104076828 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104076876 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 104076936 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 104076954 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104077015 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 104077097 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104077622 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 104078102 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104078248 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104078360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104078694 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104078748 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 104078759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104078766 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104078984 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104079023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104079072 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 104079088 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 104079668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104079809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104079854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104080575 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104080724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104080751 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 104080799 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104080971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104080998 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104081141 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 104081920 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104082212 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 104082277 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 104082517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104082526 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104082630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104082990 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 104082991 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 104083018 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104083401 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 104083815 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104083842 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104084289 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 104084368 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 104084388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104084429 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 104084534 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 104084535 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 104084655 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 104084656 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 104084715 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 104084751 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 104084818 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 104084837 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 104084918 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 104085004 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 104085006 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 104085024 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104085461 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 104086384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104086930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104087176 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104089132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104091824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104092391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104093381 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104093709 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 104093845 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104093992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104094251 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 104094755 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104094956 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 104096709 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 104096810 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 104097327 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104097687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104097742 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104097855 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104097921 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 104098065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104098822 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104098831 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104099008 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 104100887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104101664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104103310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104103381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104103815 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104106107 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104106131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104107309 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104107316 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104107356 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 104107445 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 104107450 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 104107860 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 104108264 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104108277 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104108386 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 104108388 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 104108399 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 104108412 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104108421 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104108952 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104109189 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104109219 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104109343 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104109347 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 104109424 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104109441 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104109493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104109495 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 104109662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104109679 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104109702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104109727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104109749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104109790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104109895 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104109907 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104110342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104110386 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 104110390 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104110416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104110827 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104111248 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104111936 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 104112000 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104112014 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 104113186 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 104113944 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 104114157 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104114258 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104114496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104114861 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 104115357 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104115558 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104115603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104115840 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 104115989 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 104116032 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104116058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104116173 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104116354 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104116379 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104116458 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104116465 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104116521 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104116540 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104116566 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104116615 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 104116683 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104116705 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104116827 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104116828 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104116846 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 104116921 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104116931 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104116935 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104116942 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104117160 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 104117269 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 104117332 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 104117456 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 104117500 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 104117510 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 104117665 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104117672 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104117773 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104117832 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104117858 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104118182 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 104118199 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 104118209 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104118329 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104118330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104118580 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104118680 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104118702 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104118708 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104118931 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 104118991 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104119261 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 104120675 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104120676 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104121144 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 104121676 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104121685 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104122139 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 104122140 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 104122243 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104122362 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 104122370 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 104122813 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 104123188 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 104125437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104125467 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104126779 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104126935 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 104126940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104127075 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 104127139 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 104127161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104127605 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104127664 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104127836 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 104128109 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 104128247 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104128405 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104129258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104129804 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104131000 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104131286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104131692 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104131722 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 104132172 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 104134063 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104134277 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104134284 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104134308 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 104134311 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104134499 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 104134670 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104135516 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104135543 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104135573 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 104135687 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104135707 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 104135753 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 104136092 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 104136162 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104136403 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 104136509 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104136684 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 104136956 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104137109 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 104138504 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104138830 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104138839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104139376 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 104139564 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104139991 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 104140779 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 104140996 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 104141677 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 104141680 C A Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 104142330 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 104142974 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 104143053 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104143812 C G Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 104144251 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 104144375 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 104145362 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 104145735 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104145742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104145746 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104145766 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104146111 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 104146158 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104146172 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104146615 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104146774 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104146862 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 104147099 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 104147267 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 104147279 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 104147291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104147294 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104147598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104148075 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 104148365 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 104148443 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104148533 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104148546 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104148562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104148732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104148734 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104148902 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104148907 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104149070 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104149133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104149279 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104149409 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104149442 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104149481 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104149773 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 104149812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104149959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104149967 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 104149970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104150025 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104150043 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 104150214 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104150325 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104150365 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104150786 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 104151009 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 104151353 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 104153042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104153322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104154759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104154871 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 104154872 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 104155469 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 104155641 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 104155692 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 104155739 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 104155912 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 104156418 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 104156573 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 104156621 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 104156650 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 104156778 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 104156816 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104157013 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 104157544 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104157745 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 104158981 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104159124 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104160956 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 104161608 G C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 104161675 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 104161732 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 104162085 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 104164027 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 104164042 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 104164324 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104164424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104164434 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104164500 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104164504 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 104164519 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 104164562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104164884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104166149 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104166202 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 104166462 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 104166665 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104166669 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104166710 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104166773 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 104166889 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 104166911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104166934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104166942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104167133 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 104167363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104167410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104167961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104168067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104168117 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104168199 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104168237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104168343 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 104168349 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 104168524 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104168905 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104169388 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104169949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104170353 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104170383 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104170384 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104170764 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 104170769 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 104170880 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104171327 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 104171356 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104171386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104171531 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 104171849 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104173001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104173415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104173713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104174317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104176174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104176352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104176535 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104176653 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104176913 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 104176939 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 104177086 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 104177125 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 104177217 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104177231 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 104177261 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104177758 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104177959 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 104178219 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104178624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104178678 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104178895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104178910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104179505 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 104179713 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 104179956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104180107 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 104180135 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104180167 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104180411 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 104181496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104181537 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 104181648 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 104181835 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 104181989 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 104182025 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 104182031 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 104182274 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 104182297 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 104182299 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 104182489 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 104182538 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 104182563 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 104182780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104182926 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104183478 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104183528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104183544 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 104183630 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104183641 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 104183676 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104183770 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104183771 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 104183794 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 104183811 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 104183865 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104183900 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 104183914 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104184473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104184772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104184799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104184857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104184937 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 104184957 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 104185226 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104186048 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 104186115 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104186910 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104187559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104188094 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104188471 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104188792 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104189125 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104189442 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104190825 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 104190881 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 104190984 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104191006 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104191023 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104191088 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104191225 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104191511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104191758 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104191759 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104191852 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104192083 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104192152 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104192157 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104192864 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104192866 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104193492 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104193642 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104194189 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104194461 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104194497 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104194569 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104194622 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104194757 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104195763 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104197984 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104198337 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104203680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104204506 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104207780 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104213192 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104214848 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 104216502 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 104216704 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104216723 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104216796 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 104216863 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104217259 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 104217298 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104218014 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104218046 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 104218540 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104218648 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104218967 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104219080 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104219122 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 104220257 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104220511 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 104222099 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104222106 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104222173 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104222528 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104222628 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104222662 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 104223648 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 104223649 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104223762 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104224203 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104224562 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 104224796 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104224863 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104225427 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104225428 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104227416 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 104228036 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104228757 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104228909 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 104230310 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104231258 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 104231313 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 104231609 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 104231689 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 104231714 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 104231720 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 104231796 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104231878 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104231993 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 104232182 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104232201 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104232223 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104232285 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104232295 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104232353 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104232478 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104232736 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104233014 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 104233028 G C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 104233241 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 104233814 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 104234839 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104235499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104236016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104236265 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104236293 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104236372 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 104236420 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104236574 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104236616 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104236631 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104236693 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104236727 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104236873 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104236909 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104236939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104236993 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104236995 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104237039 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104237166 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104237167 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104237280 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104237286 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104237415 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104237442 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104237643 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104237734 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104237747 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104238471 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104238666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104238677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104238705 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104238717 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104239302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104239614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104240006 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 104241289 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 104241912 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104242008 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 104242565 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104242666 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104242863 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104244934 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 104244945 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 104245120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104246492 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104246554 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104246677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104248709 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104249984 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104250210 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 104250598 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104250750 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104250787 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104250797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104250941 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104251082 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104251410 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104251805 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104252028 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 104253759 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104253823 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104253845 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104254599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104255678 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 104255831 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 104255960 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 104256033 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 104256121 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 104256344 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 104256363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104256500 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104256598 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104256775 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 104256826 T A N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 104256951 A T N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 2 104256953 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 104256978 C T Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 104256984 C T Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 104257002 A C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 104257110 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 104257218 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104257354 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 104257403 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104257455 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 104257525 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104257626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104257861 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104257905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104257918 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104258034 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104258323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104258338 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104258579 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104258811 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 104258832 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104259192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104259533 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 104259751 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 104259889 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 104260033 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 104260050 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 104260257 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 104260327 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 104260334 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 104260361 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 104260499 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 104260651 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 104260760 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 104260762 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104260779 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 104261417 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104263286 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104264883 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104264899 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 104265879 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104266165 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104269182 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104270742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104271544 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 104272482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104272939 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 104272967 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 104273271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104273872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104274508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104274575 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 104277144 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104278374 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 104279331 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104279819 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 104279821 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 104281618 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104283138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104283370 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 104284127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104284653 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 104285007 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 104286277 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104286908 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 104287626 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104287766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104291351 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 104291741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104292399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104292720 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104292766 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104293883 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104294074 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104295278 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 104295300 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104296593 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104297827 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 104301246 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 104301302 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 104301726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104303722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104304749 G T N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 104305399 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 104307161 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104307251 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104308128 T G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.0833333333333333 0.75 0.166666666666667 11 13 1 9 2 2 104308384 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 104308473 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 104309257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104310814 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 104312429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104313467 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104314111 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104314348 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104314520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104316640 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104318983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104325428 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104325491 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104330083 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 104337016 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104341305 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104342621 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104343377 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104343850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104344563 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 104344630 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104344887 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104345036 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104346076 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104346246 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104346443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104346593 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104347906 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104347926 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104348853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104349535 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104349666 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104350022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104350418 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104350776 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104351210 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104353535 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 104353816 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104353982 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104354369 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104354608 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104355156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104355320 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104355965 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104357829 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104359505 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104359528 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104360743 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104361228 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 104362445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104363068 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104364111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104364360 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104365918 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104365968 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104367408 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 104368163 C G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 104369219 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104369274 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 104369338 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104369379 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104369414 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104369525 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104369633 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 104369643 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 104369660 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 104369849 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 104369999 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 104370091 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104370107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104370343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104370571 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104370651 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104370659 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 104370893 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104370900 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104371070 G C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 104371283 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104371334 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104371524 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104371553 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104371562 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104371565 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104371599 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104372030 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104372093 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104372185 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104375345 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 104375351 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 104375429 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 104375435 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 104375645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104375939 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104375971 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104377130 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 104377191 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104379380 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104380685 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104381264 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104381724 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104381741 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104381828 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104381850 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104382299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104382449 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104382623 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104382746 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 104382759 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 104382766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104382796 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104382925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104383058 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104383238 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104383676 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104383717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104384138 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104384210 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104384761 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104385016 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104385166 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104385853 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104385874 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104386083 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104387824 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104388081 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 104388370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104389562 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104393098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104395760 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104396283 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 104396865 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104398101 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104399129 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 104400966 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104401552 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104402556 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 104402991 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104403608 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104404221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104407957 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104408028 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104409299 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104409315 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104410421 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104411388 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104411743 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 104412071 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 104412384 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104415276 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104416460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104416589 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104416641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104417736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104418416 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104420759 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104421369 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104421756 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104423426 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 104423610 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104423821 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104423948 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104424093 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104424220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104424558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104424662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104424727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104424798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104424819 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104425529 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 104425939 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 104426345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104426459 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 104426545 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 104426679 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 104426771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104428172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104428198 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104428207 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104428337 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104428876 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104429036 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104429068 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104429261 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104429301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104429320 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104429422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104429790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104429846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104429938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104431532 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104433590 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 104434472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104434684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104434719 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 104437074 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 104438574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104439578 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 104440648 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104441739 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104443323 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104444281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104444303 C T Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 104445208 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104445768 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104445979 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104446421 C G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 104450727 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104450729 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104450766 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 104451871 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 104451885 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 104453957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104454510 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104454985 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 104455044 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104455158 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104455484 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104455742 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104455759 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104456528 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104457487 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 104458494 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 104458972 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 104460695 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104462437 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104462744 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104466925 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104467570 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104468210 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 104469351 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104474044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104474355 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 104474631 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104476055 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104476528 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104478031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104481515 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104482172 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 104482336 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 104482337 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 104482777 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104482785 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104483459 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104483570 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104483674 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104483890 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104484002 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104484026 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104484195 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104484200 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 104484362 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104485396 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 104485477 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 104485525 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 104485790 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104485873 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104486033 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104486048 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104486214 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104486222 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104486239 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104486311 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104486359 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 104486641 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 104486715 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 104486747 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104487067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104487136 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104487918 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104489560 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104489954 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104493593 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 104494506 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 104495088 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104496959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104497389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104497511 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 104497542 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104497919 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104498234 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104498829 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104498968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104499544 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104500075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104500336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104500364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104500370 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104500787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104500817 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104500917 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104500986 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104501495 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104501511 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104501643 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104501846 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104502035 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104502501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104502514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104502670 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104502788 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104502837 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104502918 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104502963 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104503389 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104503558 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104503968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104504005 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104504341 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104504542 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104505354 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 104505361 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104505636 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104505662 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104505977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104506096 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104506284 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 104506357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104506453 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 104506577 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104506634 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104506897 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104507080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104507153 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104507366 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 104507769 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104508839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104508951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104508968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104509138 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104509333 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104509564 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 104510004 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104510028 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104510054 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104510084 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104510263 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104510363 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 104510429 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104510636 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 104510764 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104510875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104515011 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104515029 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104515206 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104515248 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104515261 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 104515276 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 104515284 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 104515367 G T N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 104515391 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 104515410 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 104515564 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104515621 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104515909 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104515951 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104515972 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104515985 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104516160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104516173 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 104516245 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104516345 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 104516346 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 104516498 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 104516513 A T Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 104516639 G A Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 104516775 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 104516780 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 104516861 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 104516943 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 104516947 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104517085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104517161 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104517526 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104517592 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104517769 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 104517818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104517911 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104518000 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104518042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104518076 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104518094 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 104518102 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104518107 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104518330 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104518410 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104518459 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104518691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104518740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104518959 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104519051 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104519122 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104519123 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104519162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104519251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104519446 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104519551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104519557 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104519722 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104519895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104520468 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 104520903 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104521390 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104521424 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 104521541 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104521788 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104521955 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104522160 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104522331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104522353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104522461 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104522514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104522629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104522738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104522833 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104522912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104522933 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104523112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104523113 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104523135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104523148 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104523363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104523371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104523420 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104523447 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104523468 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104523995 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104524901 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104524967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104524985 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104525002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104525125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104525326 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104525372 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104525379 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104525436 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104525838 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 104525854 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104526124 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 104526243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104526477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104526906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104528016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104528026 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 104528550 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104529065 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104529197 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 104529367 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104529378 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 104529921 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 104529922 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 104529937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104530161 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104530205 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104530234 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104530294 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104530300 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104530363 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 104530474 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 104530567 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104530618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104530625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104530933 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104531024 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104531025 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104531058 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104531071 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104531828 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 104531835 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 104531878 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104532026 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104532128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104532130 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104532225 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104532227 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104532300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104532355 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 104532634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104532661 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104532722 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104532733 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104532844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104532917 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 104532971 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104532988 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104533006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104533390 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 104533660 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104533697 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104533832 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104533991 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104534004 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 104534102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104537609 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 104537618 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 104537628 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 104537647 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104537982 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 104537983 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 104538013 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104538080 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104538174 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 104538326 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 104538336 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 104538445 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 104538559 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104538899 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104538964 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104539170 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104539191 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 104539224 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104539659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104539701 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 104539781 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 104540167 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 104540210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104540313 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104540454 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104540464 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104540622 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 104540699 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104541390 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 104541676 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104541814 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 104541865 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104541909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104542427 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104542714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104543259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104543268 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104543432 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104543454 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104543515 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104543549 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104543622 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104543698 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104543745 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 104543764 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104543935 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 104543936 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 104544036 T G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 104544460 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104544478 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 104544606 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104544615 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104544770 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104545234 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104545493 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104545531 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 104545807 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104546084 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 104546286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104546287 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 104546302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104546998 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104547056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104547095 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104547138 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104547156 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104547292 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104547293 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104547360 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 104547866 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104547878 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104547891 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104547894 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104547912 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104547991 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 104548222 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104548416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104548536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104548800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104548817 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104548916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104548982 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104549010 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104549469 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 104549498 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 104549500 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 104549531 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104549587 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104549710 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104549773 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 104549879 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 104549958 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104549985 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 104550038 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 104550179 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104550402 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 104550624 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104550835 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104551007 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104551281 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104551320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104551521 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104551536 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104551561 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104551587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104551626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104552754 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104553024 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104553113 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104553498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104553570 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 104553983 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104554047 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104554114 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104554230 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104554544 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104554556 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104554564 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104554571 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104554585 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104554880 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104554881 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104555246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104555389 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104556114 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 104556121 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104556312 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104557417 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 104557999 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104558369 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104558544 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 104559337 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 104560134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104563973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104564297 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104564845 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 104567581 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104567883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104568631 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104569081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104569896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104571122 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104572670 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104572807 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104573899 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 104573938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104574106 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104575425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104576399 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104576409 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104576778 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104577001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104577051 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 104577541 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 104577629 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 104577678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104577747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104578267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104578312 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 104579121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104579392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104581289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104581616 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104583008 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 104583020 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 104587362 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 104587378 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104587398 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104588300 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104590113 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104590636 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 104590679 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 104591226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104592450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104593326 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104594583 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104596637 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104597628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104599188 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 104600575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104601544 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104602795 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 104603280 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104603503 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104605086 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104606586 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104607232 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104608656 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104612460 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104614201 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 2 104614724 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104617117 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104617308 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104618901 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 104619020 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 104621876 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104622972 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104623494 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104624311 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104625597 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104626720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104626852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104627173 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104630275 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104630430 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104630556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104634781 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104641628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104643445 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 104645223 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 104645230 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104647756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104647772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104648790 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104650169 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104651650 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104652709 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104656563 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104659505 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104660147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104661036 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104663540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104663802 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 104663803 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 104663994 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104664569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104665498 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104665565 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104666287 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104666299 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 104666676 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 104666694 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 104666782 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104666832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104666853 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 104666866 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 104666922 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104666937 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 104667128 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 104667138 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104667168 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 104667230 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 104668657 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 104668908 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 104668910 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 104668998 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 104669609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104669679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104669851 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 104670061 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104670068 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 104670138 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104670217 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104670227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104670275 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 104670410 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104670438 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104670457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104670502 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104670669 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104670733 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104670782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104670863 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104670866 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104670923 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104670992 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104671045 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104671354 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104671372 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104671564 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 104671605 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 104671803 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104671939 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104671994 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104672014 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104672149 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104672249 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 104672455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104672592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104672700 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 104672892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104673323 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 104673324 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 104673786 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 104673984 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 104674004 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 104674470 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 104674524 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104674528 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104674609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104674948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104675015 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104675049 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 104675148 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 104675176 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 104675320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104675421 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 104675609 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 104675793 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 104676043 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104676072 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104676231 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 104676956 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104677014 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104677360 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104677775 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 104677778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104678846 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104679528 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 104680697 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 104681009 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104681184 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104681653 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 104681657 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 104684052 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104686303 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104687128 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104687337 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104687657 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 104688766 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 104689691 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104691369 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104695697 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 104696915 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 104697036 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104697079 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104697648 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 104698076 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104698149 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104698793 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104698997 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104699038 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104699117 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104699156 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104699212 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104699460 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104699472 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104699507 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104699577 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104699826 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104699845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104699949 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 104699964 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104699980 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104700013 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 104700046 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 104700262 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104700457 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104700512 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104700652 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104701026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104701319 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 2 104701501 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104701668 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 104701669 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 104701680 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104701703 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104701759 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104701910 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104702002 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 104702014 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104702082 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104702259 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104702317 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104702454 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 104702482 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 104702509 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 104702536 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 104702679 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104702691 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104702703 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104702882 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104702987 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104703051 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104703157 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104703209 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 104703220 G C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 104703301 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104703338 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104703356 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 104703368 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104703374 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 104703415 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 104703436 G T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 104703440 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 2 104703689 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104703884 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104704121 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104704180 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104704340 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104704549 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104704587 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104704755 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104704764 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104704780 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104704828 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104704875 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104705570 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104706635 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 104707338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104708019 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104708118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104708137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104708417 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 104708462 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104708500 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104708533 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104708544 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104708667 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104708724 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104708734 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104708971 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 104709199 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104709297 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104709394 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104709424 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104709504 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104709709 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104709720 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104709768 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104709970 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 104710006 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 104710044 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 104710047 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 104710098 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104710142 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104710198 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104710231 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104710478 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104710963 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104711563 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 104711598 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104711811 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104712289 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104712464 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104712930 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104713183 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 104713973 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 104714188 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104714249 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 104715310 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104716093 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104716314 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 104716620 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104717041 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104717227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104717954 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 104718228 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104718337 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104718449 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104719007 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104719373 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104719451 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104719956 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 104720175 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 104720222 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 104721811 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104721980 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104722286 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104722330 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104722733 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 104723131 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104723223 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104723265 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104723357 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 104723370 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 104723581 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104723600 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104723895 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104724111 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104724140 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104724214 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104724350 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104724571 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104724789 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104724985 G C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 104725012 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 104726152 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104726337 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104726877 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104726937 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104727568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104730366 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104731037 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104731188 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104731477 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104731506 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104732093 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104733432 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104733652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104735578 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104736373 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104737929 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104738068 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 104739088 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104740186 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104740915 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104742140 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104743073 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104743469 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104744038 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 104744372 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104744406 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 104744407 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 104744418 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104744513 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104745327 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104745351 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104745823 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104745854 T C Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 104745933 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 104746043 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104746117 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104746166 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104747371 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104748368 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104748687 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 104749030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104749710 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 104749881 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104750630 C T Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 104751746 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104753005 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 104753343 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104753513 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104753727 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104753813 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104755849 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 104756253 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 104756366 A T N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 104756958 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104757025 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 104757139 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104759292 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104759924 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104760054 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104760088 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104760141 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104763118 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 2 104763731 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104764182 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 104765924 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104766632 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 104766714 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104766757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104766759 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104767123 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 104767163 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 104768230 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 104768247 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 104768294 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 104768361 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104768479 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104768683 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 104769070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104770301 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104771306 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 104771844 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104772770 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104772852 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 104773124 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 104773185 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104773267 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 104773322 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104773758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104773830 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104774231 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 104774628 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104776694 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104777053 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 104777086 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 104777196 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104777212 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 104777259 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104777340 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104777531 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104777623 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 104777791 C G Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 104777828 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 104778160 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104779109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104779151 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104779623 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 104780688 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 104781386 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104781387 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104782008 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104782179 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 104782338 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104782463 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104782501 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104782551 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104782640 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104783571 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104783596 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104783850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104784791 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 104785186 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 104785334 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 104785453 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 104785459 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 104785802 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104786746 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 104786783 T G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 104786804 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 104787074 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104787143 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 104787280 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104787359 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104788659 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104788767 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104788808 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104788989 C A Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 104789067 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 104789086 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 104789878 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 2 104790900 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104790934 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104790980 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104790998 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104791134 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 104791315 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104791538 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104792914 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104793234 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104793301 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104793621 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104793945 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104793950 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104796946 C A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 104797723 T C Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 104797910 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 104798531 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104799104 C T N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 104799115 C T N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 104799940 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 104800045 A T Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 104800421 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104801160 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104801581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104801642 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104801880 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104802826 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104803243 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 104803554 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104803665 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104804032 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104804128 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 104804426 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 104804740 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 104806016 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 104806302 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104806423 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 104806476 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 104806615 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 104806698 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 104806948 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104806949 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104807130 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104807240 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104807408 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 104807437 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104807448 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104807732 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104807877 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104808024 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104808073 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104808086 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104808101 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104808297 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104808377 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104809142 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 104810079 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104810266 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104811376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104811616 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104812426 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104812872 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104813763 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 104813910 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 104813998 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 104814286 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104814289 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 104815065 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104815090 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104815381 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104816968 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104817341 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104818242 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104818390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104818612 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104819596 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 104819699 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104819713 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104819834 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 104820003 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104820683 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104820926 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104821273 A T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 104821533 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 104821624 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 104821926 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104822260 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104822309 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104822317 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104822378 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104822509 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 104822575 G C Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 104822824 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 104822893 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 104823135 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 104823765 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104823778 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 104824182 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104825159 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104825380 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104825760 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104825997 A T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104826277 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104826284 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104826334 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104827382 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104828052 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104828998 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104829095 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104829448 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104829474 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104832051 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104832321 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104832539 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104832647 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104832648 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104833272 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104833518 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104834109 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104834658 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104835325 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104836000 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104836045 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 104836090 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 104836122 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104836402 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104836560 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104836932 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104837567 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 104837572 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 104837814 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104837827 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104837931 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 104837968 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104838512 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 104838991 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104839038 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104839611 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 104839644 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104840025 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104840041 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104840757 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104841138 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104841625 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104841753 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104842146 G T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 104842173 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 104842353 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104842585 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104843045 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104843159 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104843183 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104843277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104843563 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104844412 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104844781 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104844960 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104845208 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104845315 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104845403 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104845441 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104845544 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104845726 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104845802 C G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 104845836 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 104845837 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 104846067 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 104846208 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104846462 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 104846759 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104846813 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104846899 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104847162 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104847227 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104847699 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 104848558 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104848579 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104849359 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104849785 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 104849809 C G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 104849972 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 104850369 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104850387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104850864 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104851276 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104851324 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104851520 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104852275 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104852529 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104854275 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104854508 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 104855057 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104855579 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104855610 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104856550 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104857369 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104857404 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104857434 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104857683 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104857895 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104858024 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104858310 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104858562 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104858846 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 104859344 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104860634 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104861186 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104861449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104861627 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104862382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104863340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104865215 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104867527 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104868552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104869014 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104869059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104869255 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 104870131 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104870345 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104870854 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104871807 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104871891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104872525 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104872609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104873657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104874390 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104874458 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104874645 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104875214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104876197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104876447 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104877879 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104878164 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 104878548 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104879080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104879114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104879381 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 104879615 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104880394 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104882076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104882197 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104885474 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 104885550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104885567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104886019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104886139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104886692 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104886901 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104887041 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 104887416 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104887590 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104887665 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 104887727 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 104888088 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 104888106 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104888186 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 104888217 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104888229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104888429 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 104888540 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104888705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104888857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104888899 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 104888969 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 104889007 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104889114 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104889163 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 104889183 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104889196 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104889227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104889300 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104889579 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104889656 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104889698 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 104889704 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104889739 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 104889793 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 104889800 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 104890005 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 104890247 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 104890276 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104890283 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 104890321 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104890391 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 104890438 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 104890455 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 104890505 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 104890528 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 104890541 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 104890633 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 104890699 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104890929 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 104890938 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 104890989 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104891025 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104891099 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104891100 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 104891148 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104891152 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 104891190 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104891612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104892125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104893166 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 104893180 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104896140 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104897356 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104897812 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 104899201 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104899212 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104900072 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104900413 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 104900522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104900542 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104900634 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104900763 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104900801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104900838 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104902194 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104903072 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104903594 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 104904404 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104904798 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104905272 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 104905344 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 104905538 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 104905822 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104905989 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104906651 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104906915 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104907045 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 104908421 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 104908433 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 104908693 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104909249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104909313 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 104909450 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104909751 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104909965 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104910208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104910555 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104910748 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 104910758 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 104910779 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 104910835 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104910877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104910968 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104910997 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104911240 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104911256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104911374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104911479 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104911495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104911720 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104911857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104911994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104912231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104912250 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104912339 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104912341 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104912354 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104912356 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104912379 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104912610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104912647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104912801 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104912811 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104912956 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 104913146 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104913337 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104914876 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104915061 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104915065 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 104915087 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 104915515 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104916405 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104916620 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104916638 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 104916743 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104916819 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 104916972 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 104917235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104917385 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104917799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104918079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104918185 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 104918846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104919046 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 104919095 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104919346 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104919373 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104919535 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 104919646 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104919777 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 104919817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104920013 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 104920279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104920718 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 104921193 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104921233 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 104921261 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104921499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104921510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104922030 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104922066 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104922068 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104922089 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 104922140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104922146 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104922178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104922462 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 104922597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104922606 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104922810 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104922841 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104922938 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104923740 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 104923916 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 104923990 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104926124 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104926661 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104926798 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104926937 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 104927062 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 104928780 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104929501 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104929555 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104929682 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104929759 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104931482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104931593 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104933528 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104933772 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104934705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104935131 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104935252 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 104935730 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104935885 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104936667 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 104937205 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104937226 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 104937696 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104937697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104938318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104938810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104938848 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104939699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104939765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104940124 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104940171 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104940203 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104940691 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104940797 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104941209 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104941664 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104942000 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 104942462 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104942486 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104942666 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 104942879 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104942906 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104943365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104943411 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 104944178 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104944807 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104945421 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104945642 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104945990 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 104945996 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104946130 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 104946186 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 104946478 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 104946508 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 104946700 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 104946721 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 104946798 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104947304 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 104947315 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104947387 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104947390 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 104948232 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 104948690 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 104948824 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 104949013 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 104949553 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 104949889 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 104950218 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104950291 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 104950295 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104950439 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 104950574 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 104950698 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 104950711 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 104950762 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104950765 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 104950822 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 104950823 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 104951018 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 104951194 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 104951303 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 104951526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104951723 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104951790 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 104951847 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104951987 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 104953637 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 104953845 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 104954167 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 104954316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104954548 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 104954564 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 104954584 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 104954668 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 104955983 G A N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 104956026 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 104956351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 104957451 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 2 104957661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104960450 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 104960496 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104960514 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 104962301 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 104962309 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 104963592 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 104964100 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 104964260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104964398 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 104966210 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 104967994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104968055 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104968289 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104969553 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 104969578 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 104970187 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104970932 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104971099 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104971255 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104971458 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104971532 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104971676 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 104973047 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 104973153 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 104974611 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104975537 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104975541 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 104976136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104978153 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104979533 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 104980871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104981752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104982463 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104983400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104983401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104983801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104983916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104984006 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104984254 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 104984565 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104984742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104984816 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 104984828 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 104984949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104985125 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 104985140 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 104985170 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 104986860 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104987624 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104987824 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 104988098 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 104989264 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 104989498 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 104989883 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 104990270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104990272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 104990563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104991194 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 104991232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104991444 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104992094 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 104992619 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104992849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104993003 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104993691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104993815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104993898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104996508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104997520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 104997935 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104997942 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 104998044 C G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104998132 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104998166 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104998254 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104998295 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104998718 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104998837 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 104998844 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104998885 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 104998917 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104999080 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 104999123 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104999214 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 104999610 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105001167 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105002173 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 105002236 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 105002299 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105002401 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105002490 A T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 105002709 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 105002844 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105003109 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105003344 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105003432 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105003497 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 105003622 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 105003625 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 105003661 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105003944 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105003956 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105003959 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105004018 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 105004104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105004402 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105004407 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105004850 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105005054 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 105005074 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 105005294 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 105005552 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 105005643 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105005779 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105006037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105006165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105006435 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105006436 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 105006522 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 105006527 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 105006538 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 105006543 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 105006571 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 105006583 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 105006604 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 105006624 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 105006649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105006825 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 105006871 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 105006890 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 105006903 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 105006953 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 105007644 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 105008242 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105008271 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105008744 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 105008913 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105008928 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105009017 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 105009107 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105009124 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 105009160 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 105010396 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105013142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105013361 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105014289 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105014530 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105014724 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105015456 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 105016091 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105016786 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105017671 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105018096 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105018108 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105019276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105019289 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105020279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105020945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105021507 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105022842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105023356 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105023465 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105024242 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105024390 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105025302 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105025309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105025572 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105027860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105028905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105029689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105030571 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 105031555 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 105032701 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 105032721 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105032737 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105032810 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 105032886 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105033384 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 105033392 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 105034395 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105034682 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105034788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105034967 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 105037611 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105039987 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105040437 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105040621 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105041211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105041317 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105042729 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105042933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105043316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105044191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105044822 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105045523 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105045528 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105046302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105047092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105047345 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105048016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105048037 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105048856 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 105049117 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105049129 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105049156 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105049280 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105049562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105049930 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105050004 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105050369 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105050373 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105050395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105051021 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 105051195 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105051218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105052253 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105052300 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105053103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105053793 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105056193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105056348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105056776 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105056851 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105057003 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105057363 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105057592 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105057593 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105057604 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105057644 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105057811 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105057880 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105058220 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 105058363 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105058405 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105058408 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105058510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105058605 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105058765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105058856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105059107 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105060089 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 105060886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105062457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105062597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105063934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105064798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105065011 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105066240 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105066320 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105067029 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105068699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105070613 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105071486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105073396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105073437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105074082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105074567 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105074589 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105074646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105076614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105076964 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105076971 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105077007 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105077994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105080450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105080768 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105082093 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 105082250 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105082316 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 105082318 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 105082426 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105082464 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105082572 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105082607 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105082653 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105082736 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 105082791 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105082858 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 105082939 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105082966 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105083016 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105083090 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105083093 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105083138 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105083239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105083607 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105083728 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105083759 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105083837 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105084125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105084155 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105084276 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105085302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105085423 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105085816 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 105086056 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 105086073 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 105086188 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 105086350 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 105086359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105086991 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105087019 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 105087504 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105087510 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105087519 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105087529 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105087557 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105087734 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 105087793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105087903 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105087991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105088003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105088060 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105088075 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105088093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105088700 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105088743 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 105088806 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 105089089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105089120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105089177 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105089246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105089254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105089293 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105089345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105089354 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105092178 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105092315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105092394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105092512 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105092522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105092551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105092580 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105092779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105092782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105092860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105092991 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105093296 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105093406 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105093551 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105093581 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105093641 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 105093759 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105093765 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 105093822 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105093839 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105093907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105093919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105093920 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105093969 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105094007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105094058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105094191 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105094300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105094360 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105094363 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105094377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105094414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105094417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105094512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105094577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105094722 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105094791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105094805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105094881 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105095075 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 105095126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105095136 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105095140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105095160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105095429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105095438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105095614 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105095641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105095720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105095885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105095887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105095897 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105095933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105095941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105096021 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105096116 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105096125 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105096249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105096266 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105096370 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 105096866 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105096879 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105096975 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105096994 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105097397 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105097546 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105097633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105097769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105099134 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 105099271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105099537 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105099555 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105099581 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105099598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105099676 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105099825 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 105099860 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105100002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105100007 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105100020 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105100760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105100814 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105100815 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105101009 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105101337 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105101432 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105101474 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105101608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105101612 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105101775 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105101826 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105102100 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105102123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105102328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105102926 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105103208 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105103215 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105103259 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105103342 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105103346 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105103380 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105103645 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105104456 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105105553 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105105688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105105729 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105105804 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105106012 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105106184 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105106567 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105106648 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105106679 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105106686 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105106703 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105106786 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105106941 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105107029 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105107067 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105107351 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105107407 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105107581 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105107582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105107774 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105107923 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105108105 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 105108298 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 105108862 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105109156 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105109167 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105109358 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105109475 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105109976 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105110024 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105110178 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105110184 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105110199 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105110315 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105110327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105110600 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105110641 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105111066 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 105111188 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 105111189 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 105111686 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105111831 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105111971 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105111974 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105112037 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105112544 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105112762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105112786 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105112805 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105112816 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105112914 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105113578 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105113841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105113848 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105114154 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105114262 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105114307 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105115169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105115511 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105115705 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105115864 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105116025 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105116948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105117028 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105117507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105117577 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105117616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105117938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105117995 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105118148 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105118756 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105118833 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105118925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105118945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105119271 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105119393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105119428 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105119624 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105120105 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 105120132 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 105120232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105120266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105120303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105120965 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105121222 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105121325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105121396 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105121851 T G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 105121881 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105121887 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105121942 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105122006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105122154 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105122183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105122228 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105122276 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105122316 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105122384 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105122442 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105122533 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 105122591 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105123428 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105123518 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105123532 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105123545 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105123907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105123988 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105124114 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105124173 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105124208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105124296 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105124307 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105124399 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105124601 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105124615 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105124897 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105124907 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105124987 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105125062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105125433 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105125488 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105125525 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105125687 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105125712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105125788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105125811 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105125951 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 105125965 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105126060 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105126205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105126214 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105126347 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105126433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105126617 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105126665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105126692 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105126701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105126706 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105126783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105126786 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105126946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105126950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105126978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105126995 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105127077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105127123 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105127177 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105127341 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105127367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105127408 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105127502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105127914 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105127987 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105128072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105128091 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105128257 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105128288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105128722 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 105129358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105129502 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105129558 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105129559 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105129579 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105129693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105129728 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105130030 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105130324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105130494 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105130676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105130698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105130966 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105131199 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 105131514 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105131582 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 105131613 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 105132990 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105133243 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105133264 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 105133300 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105133504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105133609 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105133715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105133800 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105133938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105136829 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105137406 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 105137956 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105139266 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105139275 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105139342 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105139827 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105139922 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 105140258 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 105140301 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105140369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105140457 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105140481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105140839 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105141673 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105142107 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 105142203 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105142365 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105143073 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105143225 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 105143227 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 105143236 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 105143265 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 105143277 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 105143427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105144377 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 105144405 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 105144569 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 105145280 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105145346 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105145371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105145484 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 105145554 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105145782 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 105145808 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105145833 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 105146133 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105147089 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105147144 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 105147168 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105147299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105147887 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105147926 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105147958 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105148473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105148672 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105148801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105149153 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105149248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105150030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105150561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105150766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105152094 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105152597 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105153227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105153725 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105153733 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105153911 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105153912 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105157287 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105159536 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105161041 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105162832 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105162848 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105163033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105164595 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105164753 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105164763 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105168649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105169966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105170636 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105170694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105172171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105172340 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105173007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105173490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105173575 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105173583 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105174021 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105174079 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105175257 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 105175444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105175462 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105175495 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105175507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105175509 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105175816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105175859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105175921 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105175922 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 105175985 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105176027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105176066 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 105176077 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105176084 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 105176088 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105176110 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 105176150 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 105176222 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 105176453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105176543 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105176651 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105176710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105176827 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 105178759 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 105179044 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105179200 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 105179740 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105179761 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105180161 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105180164 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105181268 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105181806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105181807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105181842 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105181904 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105182089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105182727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105183369 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105184545 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105184645 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105184984 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105184985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105185868 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 105187289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105187311 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105187573 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 105188865 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 105189178 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105191935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105192029 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105192087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105193347 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105193390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105195873 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105196099 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105197382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105197480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105197507 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105197779 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 105197822 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105197962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105197986 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105198344 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 105198383 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 105198592 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 105198632 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 105198752 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 105199004 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105199472 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105199647 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 105199687 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105200142 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105200598 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105200674 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105200828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105200881 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105200899 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105200949 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105201717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105201899 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105201921 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105201934 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 105201957 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105201969 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105202094 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105202110 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105202111 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105202149 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 105202163 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105202201 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105202349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105202361 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 105202371 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 105202424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105202499 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 105202599 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 105202730 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 105202794 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 105202849 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 105203046 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 105203811 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 105204035 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 105204144 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 105208232 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105209843 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 105210260 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105214137 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105214335 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105215273 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 105216497 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105218819 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105218885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105219051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105219134 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105220177 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 105221958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105222424 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105227550 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 105228284 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 105228915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105229590 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105229738 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105230053 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 105230066 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 105230218 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 105230279 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 105230306 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105230386 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 105230388 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 105230438 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105230879 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105230897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105231013 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105231260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105231273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105231592 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 105231729 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105231811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105232008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105232364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105232448 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 105233424 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105233520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105233749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105234231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105234791 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105235552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105235593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105236270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105236344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105236367 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 105238029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105239587 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 105239879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105239933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105240254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105241238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105242982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105243029 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105243030 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105243065 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105243084 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105244474 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105244490 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 105244917 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 105245227 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105245826 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105246238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105246556 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105247121 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 105247572 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105248371 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105250326 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 105250329 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 105250728 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105250770 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105250776 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 105251445 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105251660 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 105251905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105252275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105252382 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105252684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105253704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105253796 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 105253889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105253926 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105254249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105254562 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 105254688 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 105254689 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 105255093 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 105255571 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105255611 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105255668 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 105255850 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 105256333 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 105256357 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105256367 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105256368 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 105256845 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 105258649 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105258762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105260359 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105260444 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 105260488 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105260553 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105261341 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 105261365 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 105261371 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105261479 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105261527 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 105261582 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 105261598 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 105261643 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 105261749 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 105261900 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 105262313 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105262315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105262877 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105262909 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105263014 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 105263169 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 105263199 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 105263226 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 105263244 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 105263318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105263586 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105263616 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105263681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105263744 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105263939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105264274 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 105264436 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 105264538 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105264749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105265050 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 105265086 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105265364 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105265443 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105265459 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105265496 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105265543 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105265640 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105265928 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105266086 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 105266186 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 105266202 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 105266405 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105266468 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 105266489 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 105266822 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105266842 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 105266854 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 105266978 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105267013 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105267043 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 105267051 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105267145 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105267202 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 105267209 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 105267229 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 105267240 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 105268072 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105268832 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 105269083 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 105269468 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 105269624 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105269943 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 105270009 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 105270209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105270627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105270736 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 105270801 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 105270835 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105270839 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 105271413 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 105272232 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 105272325 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105272944 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 105275452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105276238 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105277269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105278663 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 105279728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105281184 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105281780 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 105283902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105286731 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105287071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105287434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105287629 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105288475 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105288481 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 105288827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105288846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105288866 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105288923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105288969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105289405 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105289506 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105289828 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 105289832 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105290069 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105290238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105290340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105290460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105290992 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105291169 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 105291303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105291428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105291593 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 105291606 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105291616 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 105291850 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105291908 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105291931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105292019 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105292096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105292152 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105292156 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105292195 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105292196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105292242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105292279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105292293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105292820 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 105292893 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105294849 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105294920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105297054 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 105297553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105297636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105298823 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105300645 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105301031 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105303045 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105303641 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105304369 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 105306689 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105306755 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 105309464 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 105309545 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105310042 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 105310211 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105311613 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105313426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105314228 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105314956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105315137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105316108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105317287 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105318225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105318791 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 105320052 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105320792 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105321277 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105321941 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105322875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105325423 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105325483 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105328549 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105328781 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 105328838 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 105328846 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105328865 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105328887 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 105329236 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 105330648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105330744 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105331402 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105332479 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 105333170 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 105333492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105334609 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 105335554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105335775 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 105335783 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 105335901 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 105336056 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 105336428 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105336461 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105336556 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 105336663 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 105336664 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 105336776 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105336791 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105336922 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 105337031 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 105337039 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 105337368 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 105337427 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105337574 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105337577 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 105337747 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105337788 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 105337867 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105337946 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105337961 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105337981 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105338016 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 105338057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105338131 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105338215 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105338243 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105338370 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 105338408 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 105338515 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105338677 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 105338794 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 105338911 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 105339041 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 105339208 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 105339404 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105339682 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 105340017 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 105340793 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 105340974 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105341107 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 105341343 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105341352 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105341393 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 105341424 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 105341426 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 105341447 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 105341627 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105341630 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105341648 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105341795 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105341807 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 105341831 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105341935 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 105341970 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 105342032 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 105342106 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 105342193 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105342386 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 105342724 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105342772 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105342902 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105342923 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105342991 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105343057 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 105343147 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 105343171 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105343380 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 105343411 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 105344116 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 105344143 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 105345419 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 105345629 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 105345749 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105346637 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 105346978 G C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 105346988 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 105347164 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 105347179 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 105347262 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 105347319 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105347354 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 105347434 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105347527 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 105347582 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 105347668 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 105347684 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 105348122 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 105348135 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 105348706 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105348777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105348880 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 105348923 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 105348994 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105349198 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 105349812 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 105349826 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 105350807 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105352085 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105353939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105356986 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105358090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105358475 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105358502 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105360165 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105360570 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105360905 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 105361147 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105361993 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105362458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105362479 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105363103 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105363106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105365046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105366286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105366614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105369793 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 105370224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105371880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105372170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105377801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105389660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105409995 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 105411394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105419024 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 105422502 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105422766 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105423483 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 105423552 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 105425438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105425448 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105425475 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105426044 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 105428496 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105433581 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 105433901 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 105438855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105439232 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105441013 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 105441438 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 105441469 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 105441536 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 105441574 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105442273 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105442524 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 105442978 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105443145 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 105443469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105443686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105443894 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105444935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105445386 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 105446868 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 105449904 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 105450816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105450915 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 105452666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105455792 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105460827 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105462175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105462396 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105464574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105465380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105465705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105466337 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105472678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105474250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105475195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105478120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105490197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105491659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105493060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105493317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105494021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105494373 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105497644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105502299 G C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 105508489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105510105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105510629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105511052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105513607 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 105514622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105517491 G T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 105521913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105522962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105528069 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105530611 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105533116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105535489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105540114 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105541924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105542816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105543712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105548373 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105548380 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105548430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105548434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105548442 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 105551078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105551699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105554035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105554616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105555149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105555481 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105556986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105558481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105562366 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105564478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105564929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105566195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105567449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105569152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105569589 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 105571166 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105572416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105576043 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 105583789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105586781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105586825 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105592064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105606368 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105606958 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 105607856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105609794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105615206 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 105617241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105619395 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105624232 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105626243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105627850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105633259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105636810 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105641769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105642650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105645780 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105649260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105650045 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105659285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105659962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105660917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105664749 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105664856 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105668034 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105671725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105671769 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105672592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105673039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105675741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105676137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105676144 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105676441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105677122 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105677889 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105678218 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 105679140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105680898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105682655 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105696149 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 105697616 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 105705555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105706295 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 105707336 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 105708514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105708922 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 105709808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105709945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105713536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105714235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105715514 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 105716735 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 105716891 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 105717504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105717577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105718330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105719219 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105720037 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105720102 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 105721469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105721509 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105722771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105723496 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105724369 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 105724760 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 105725211 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105725221 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105727311 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105727444 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 105731338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105732584 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 105732716 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 105732727 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 105732729 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 105732742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105735293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105736795 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105741193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105741504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105741663 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 105742792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105742913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105743083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105745157 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105746303 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105747732 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105749137 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105751562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105751740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105752674 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 105754613 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 105755744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105755838 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 105756773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105760424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105761328 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105763190 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105763907 T G N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 2 105764351 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 105764923 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 105765225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105765661 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105765890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105766241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105767682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105767975 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105768445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105768664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105768672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105769896 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 105770150 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105770198 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105770215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105774192 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 105775172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105779196 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105780482 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105780847 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 105781117 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105792837 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105794977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105795304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105795547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105797649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105797844 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105798072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105798143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105799306 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105801213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105809125 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105810072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105810129 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 105811195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105816015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105816148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105818259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105818314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105819403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105820116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105821908 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 105822358 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105822404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105822792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105823695 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105825186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105827238 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105828194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105829211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105830043 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105830526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105834128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105836423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105839775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105841170 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 105844177 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105844668 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105845107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105846490 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105851545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105852881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105854396 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105854491 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105857400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105857812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105858516 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105859004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105860087 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105860950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105867090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105872329 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105875830 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 105877211 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105877765 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105878835 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105879983 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105880255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105881269 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105885981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105886112 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105888321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105890771 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 105892445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105894435 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105894714 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105899069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105900306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105900802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105903926 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 105907257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105908564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105908603 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105909344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105911881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105913221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105920157 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105928121 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105928239 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 105928614 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105929869 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 105930054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930262 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105930332 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 105930360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105930394 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930454 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105930521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105930886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105931691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105931697 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105931714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105931739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105931884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105931894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105931938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105931970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105931980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105932395 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 105932586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105932648 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 105932802 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 105932856 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 105932857 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 105932917 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 105933320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105937063 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105938187 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105938517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105938807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105939412 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105939531 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 105939709 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 105939809 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 105941616 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105942656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105943858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105945906 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 105946227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105948583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105950653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105951669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105953492 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 105953536 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105957155 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105958594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105959419 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 105959444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105960027 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105960055 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 105961619 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 105961984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105962116 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105962245 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105962335 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105962362 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105962488 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 105962664 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 105962738 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 105962776 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 105962831 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 105962835 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 105962843 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 105962855 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 105962912 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 105962987 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 105962988 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 105963037 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105963040 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 105963090 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 105963108 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 105963122 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 105963167 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 105963190 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 105963207 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 105963328 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105963356 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 105963369 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105963396 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 2 105963398 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 105963499 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105963535 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105963543 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105963646 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 105963669 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105963712 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105963837 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 105963838 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 105963878 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 105963918 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 105963954 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 105963958 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 105964044 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 105964055 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 105964061 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 105964073 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 105964139 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 105964477 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 105964546 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105964620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105964630 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105964689 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105964756 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105964821 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105964856 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105964862 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105964907 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 105964929 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 105964940 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 105965049 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 105965110 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 105965305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105965398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105965401 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 105965436 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105965540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105965772 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105965782 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105965783 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 105965794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105965808 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105965823 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 105965829 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105965856 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105966160 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105966193 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105966284 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105967518 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 105967535 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105967574 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 105967703 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 105968255 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 105968353 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 105968427 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105968485 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105968497 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105968917 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 105968921 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 105969002 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 105969043 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 105969064 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 105969066 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105969078 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 105969081 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 105969094 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105969141 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105969176 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 105969209 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 105969283 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 105969298 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 105969325 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 105970152 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105970164 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105970238 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105970243 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105970283 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105970296 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105970325 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105970329 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105970341 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105970401 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 2 105970415 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 105970423 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105970428 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105970769 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105970794 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105970802 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105971033 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 105971042 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 105971084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105971114 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105971137 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105971144 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 105971158 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105971174 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105971233 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105971281 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105971341 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 105971506 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 105971616 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105971777 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 105971783 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105971882 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105971991 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105972326 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 105972353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105972621 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 105973182 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 105973201 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 105974250 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105974393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105974532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105974655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105974707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105975187 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 105975708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105975749 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 105975753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105976036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105976042 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105976156 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 105976238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105976413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105976446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105976679 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 105976868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105976996 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 105977036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105977102 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 105977404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 105977526 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105977547 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 105977560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105977703 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 105977914 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 105978662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105978706 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 105978741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105979173 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 105979228 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105979399 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 105979400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 105979471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105979671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105980445 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105982290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105986761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105988219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105989048 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 105989049 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 105991182 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 105991853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105993107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105994137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 105999062 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 106001745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106004792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106005818 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106006437 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 106012419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106014025 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 106015157 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 106016211 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106016579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106018284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106019446 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106020592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106022208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106022769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106025080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106026776 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106028948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106029081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106031635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106032203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106032812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106032924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106033038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106033671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106037905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106040433 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106040434 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106040884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106041523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106041916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106043713 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 106045543 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106046119 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106046229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106046262 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 106046435 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 106046543 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 106047250 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 106047331 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 106047407 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 106047503 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 106048821 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 106049344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106050009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106050752 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106052000 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 106053723 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106055785 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 106056807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106057072 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 106057149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106057405 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 106057476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106057539 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 106058150 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 106058322 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 106058369 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 106058600 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 106058618 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 106059128 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 106059191 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 106059306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106059367 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 106059440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106059443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106059497 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 106059624 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 106059657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106059890 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 106060033 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 106060506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106060542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106060633 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106060684 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 106060961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106061049 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106061055 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 106061303 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 106061615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106062414 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106062827 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 106063176 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106063707 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106064417 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 106064587 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 106064642 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 106064740 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106065157 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 106065168 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 106065248 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 106065286 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106065319 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 106065514 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 106065519 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 106065959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106066125 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106066838 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106066839 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106066940 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 106067276 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 106067414 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 106067419 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 106067446 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 106067564 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 106067648 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 106067897 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 106068099 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 106068106 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 106068124 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 106068652 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 106068847 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 106068909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106068922 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 106068999 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 106069224 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 106069235 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 106069236 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106069319 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 106069348 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 106069464 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 106069470 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 106069493 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 106069560 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 106069651 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 106069652 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 106069805 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 106070189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106070294 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 106070319 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 106070490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106070634 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 106070758 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 106070783 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 106070788 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 106072014 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 106072121 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 106072217 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 106072266 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 106072361 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 106072393 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 106072397 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 106072467 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 106072516 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 106072595 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 106072691 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 106072800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106072810 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 106072812 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 106072950 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 106073071 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 106073078 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 106073146 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 106074403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106076502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106076515 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106076987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106077105 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 106077278 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106077823 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 106078410 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 106079005 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 106079654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106079917 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106079948 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 106080002 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106080315 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106080635 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 106081489 A C Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 106082871 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 106082880 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106082925 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 106082965 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 106083137 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 106083558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106084061 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 106084815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106085567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106085586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106086059 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106086464 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 106087941 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 106088678 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 106088736 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106089248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106090059 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 106090695 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106090932 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 106091019 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 106091359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106091454 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 106091514 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 106091553 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 106091624 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 106091649 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 106091676 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 106091735 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 106091791 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 106091803 T A Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 106091935 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106091972 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 106092014 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 106092033 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 106092059 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106092061 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 106092117 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 106092144 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 106092157 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 106092237 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 106092270 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 106092525 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 106092731 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 106092763 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 106092791 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 106092815 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 106092816 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 106092890 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 106092959 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 106093005 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 106093075 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 106093094 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 106093147 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 106093204 C G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 106093276 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 106093326 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 106093346 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 106093357 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 106093358 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 106093387 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106093581 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 106093721 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 106093847 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 106094004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106094057 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 106094590 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 106094946 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 106095014 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 106095028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106095239 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 106095273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106095305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106096109 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 106096964 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106097797 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 106098442 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 106099194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106099524 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106100009 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 106102464 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 106102707 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106105405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106105406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106106897 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 106107422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106107936 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106108449 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106109682 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 106110726 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106111061 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106111187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106111398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106111909 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 106112558 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106112588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106114974 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 106115044 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 106115046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106115170 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106115709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106116033 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 106117299 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 106117658 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 106118191 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 106118409 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106118669 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 106118763 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 106119310 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 106119359 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 106119445 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 106119451 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 106119815 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106120097 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 106120331 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 106120759 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 106120882 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106121526 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 106121983 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 106122135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106122378 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 106122673 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 106122739 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106123403 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 106123512 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 106123662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106123933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106124154 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 106124472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106124923 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106125252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106125260 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 106125692 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106126201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106126329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106126638 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 106129814 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 106134100 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106134668 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 106136232 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106138317 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106140571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106144040 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 106144262 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106144414 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106144447 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 106145194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106145842 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 106146203 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106146218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106146603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106148626 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 106148720 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 106150145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106152026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106153364 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106154460 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106159654 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106159706 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106161542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106162606 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 106163316 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106166102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106166165 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 106166270 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 106166952 A C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 106167035 T A N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 106167158 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 2 106167168 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 106167443 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 106167543 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 106167589 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106167617 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 106167639 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106167657 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106167665 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 106167786 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 106167854 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 106168007 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 106168032 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 106168070 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106168260 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 106168324 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 106168600 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 106168608 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 106168672 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 106168915 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 106169914 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 106170027 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106170046 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106170839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106171259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106173093 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106175394 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106175948 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106176033 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106176190 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106177354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106177420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106177868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106179567 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106179906 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 106180393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106180983 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 106180999 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 106181013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106181051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106181129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106181264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106181419 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106181659 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 106181827 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 106182015 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 106182083 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 106182096 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 106182107 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106182766 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106183856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106186031 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106186196 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 106186391 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 106187036 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 106187123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106187241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106187263 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 106187451 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 106187589 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106187610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106187623 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106188172 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 106188759 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106188952 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106189062 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106189076 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106189239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106189269 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106189270 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106189596 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106190688 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 106191095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106191587 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 106191845 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 106191976 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 106191996 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 106192160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106192843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106193032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106193305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106196718 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106197648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106198804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106198944 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106200215 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 106200300 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 106200913 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 106201375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106201399 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106201481 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106201798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106201913 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 106205264 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 106206657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106207044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106207349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106207353 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 106208650 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106209798 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 106210306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106211596 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 106213087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106213462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106213540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106213561 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 106213573 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106213798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106213992 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 106215058 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 106215171 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 106215512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106215828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106215838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106217015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106217167 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 106217727 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106218463 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106218540 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 106218561 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 106218798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106219254 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106219712 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106219929 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 106220150 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106220392 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106220613 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106221612 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106221765 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106222046 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106222144 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106222350 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106223148 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106223165 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 106223502 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106223562 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106223684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106223802 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 106224509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106224846 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 106225023 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 106225132 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 106225204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106225447 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106225669 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 106226033 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 106226746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106227400 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 106230081 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 106230359 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 106233621 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 106234471 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 106236940 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 106237166 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106237514 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106237650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106238464 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106238580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106240100 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 106240858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106240957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106240995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106241151 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106241165 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106241422 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 106241466 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 106242157 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 106242421 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106242427 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106242538 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 106242709 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106242752 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 106242778 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106242870 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106243129 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106243172 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 106243313 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106243343 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106243533 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 106243845 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106243870 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106243903 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106243977 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 106244154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106244408 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106244887 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 2 106244912 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 106245046 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106245654 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106245710 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106245753 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106245916 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106246242 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106246288 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 106246528 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106246534 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 106246636 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 106247395 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 106247427 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106247530 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 106247686 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106248431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106249632 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106251250 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106252862 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106252905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106253098 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 106253136 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106253209 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 106253215 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 106253254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106253260 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 106253269 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 106253339 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 106253345 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 106253696 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 106253735 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106253751 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 106253770 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106253944 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106253991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106254002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106254133 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106254261 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 106254401 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 106254466 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106254696 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106254743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106254769 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106254799 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 106254957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106255029 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 106255135 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 106255283 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106256025 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 106256120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106256207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106256662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106256849 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 2 106256861 G T N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 2 106256867 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 106256965 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 106257077 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 106257103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106257151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106257175 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106257277 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 106257297 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 106257300 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 106257308 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 106257318 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 106257339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106257374 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 106257388 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 106257403 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 106257500 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 106257736 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 106257815 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 106258030 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 106258042 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 106258091 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 106258218 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 106258285 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 106258356 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 106258372 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 106258462 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106258477 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 106258517 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 106258610 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106258623 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106258648 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 106258665 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 106258676 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 106258687 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106258805 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 2 106258831 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 106258848 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 106258869 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 106258880 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 106258935 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 106258966 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 106259140 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 106259202 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106259224 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106259246 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 106259248 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 106259268 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 106259272 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 106259314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106259320 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 106259353 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 106259397 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 106259468 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106259597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106259625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106259643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106259684 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 106259733 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106259735 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106259866 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106259907 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106259930 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106259991 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106260025 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106260073 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106260093 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106260217 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106260452 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106260870 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 106260925 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 106261048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106263549 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106263555 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 106263570 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106263683 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 106264070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106264123 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106264342 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 106264615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106264920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106265006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106265047 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106265233 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 106265474 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 106265484 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 106265738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106266016 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 106266171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106266239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106266267 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 106266281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106266806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106266845 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 106267749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106268865 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 106269034 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 106269055 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 106269124 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 106269283 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 106269459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106269548 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 106269561 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106269579 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 106269695 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106269739 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 106270366 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 106270734 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 106270787 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 106270892 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106270896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106270968 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 106271010 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106271058 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 106271178 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106271349 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106271535 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106271755 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 106272672 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 106272694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106272972 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 106273115 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106273232 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106273287 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 106273303 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 106273376 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 106273377 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 106273388 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 106273450 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 106273812 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106273898 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106274164 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 106274176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106274246 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106274402 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106274425 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106274623 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106274669 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106274712 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106275027 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 106275139 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106275436 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 106275527 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 106275580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106276285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106276616 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106276630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106276932 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 106276972 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 106277234 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 106277522 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 106277882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106278650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106279746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106279860 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 106279989 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 106280105 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106280216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106280292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106280321 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106280368 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 106280515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106281215 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 106281245 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106281389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106281417 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 106281656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106281740 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106281901 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 106282254 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 106282268 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 106282271 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 106282387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106282484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106282500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106282536 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 106282626 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 106282713 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 106282747 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 106282813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106282861 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 106282873 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 106282973 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106282976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106283080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106283158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106283244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106283264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106283270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106283423 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 106283482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106283952 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 106284055 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 106285015 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106285103 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106285135 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106285229 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 106285589 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 106285698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106285749 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106285807 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106285955 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106285988 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106286018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106286898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106286958 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106287173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106287205 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 106287490 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106287530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106288036 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 106288161 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106288234 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106288310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106288340 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 106288354 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 106288424 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106288560 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106288606 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106288621 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106288628 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 106288715 T G Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 106288797 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106288811 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 106288838 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 2 106288853 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 106288958 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106289098 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106289138 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106289311 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 106289463 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 106289761 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106289979 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106290017 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 106290756 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106290946 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 106290963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106290984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106292296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106294449 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 106294489 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106297259 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 106297359 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106297981 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 106298238 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106299050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106304620 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 106304770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106306157 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106306222 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 106306331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106306439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106306541 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 106306542 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 106306646 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 106306763 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 106307092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106307240 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106307291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106307441 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106307588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106307655 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 106307804 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 106307837 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 106307907 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 106307940 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 106307982 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 2 106308158 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 106308163 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 106308216 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 106308370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106308447 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 106308645 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 106309222 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106309431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106309486 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 106309666 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 106309721 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 106309777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106309908 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 106309947 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 106310223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106310247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106310260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106310265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106310528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106310573 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106310611 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106310617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106310652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106310682 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 106310844 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106311302 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 106311355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106311479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106311545 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106311623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106311852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106311859 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106311895 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 106311986 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106312135 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 106312217 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106312430 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 106313027 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 106313060 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 106313073 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 106313103 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 106313395 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 2 106313401 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 2 106313446 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 106313503 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 106313557 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106313583 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 106313593 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 106313607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106313780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106313950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106314315 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 106315120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106315742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106315851 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 106317114 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106318069 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 106318556 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106318636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106319146 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106320349 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106320575 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 106320596 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 106320684 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 106320860 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 106320946 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 106321136 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 106321139 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 106321267 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 106321467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106321610 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 106321643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106321799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106321867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106322009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106322083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106322105 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106322137 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106322504 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 106324091 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106324254 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 106324464 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 106325111 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 106325152 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 106325162 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 106325167 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 106325305 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106325603 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106325688 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106325705 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 106325765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106325940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106326792 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106327350 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 106327419 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 106327447 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 106327492 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 106328894 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 106329852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106330284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106330437 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 106330450 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106330846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106335213 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 106336132 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 106336280 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 106336531 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 106336547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106336610 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 106336626 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106336743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106338193 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 106338235 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106338466 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 106338708 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 106339026 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106339197 T G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 106339401 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 106339487 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 106339526 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 106339911 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 106340381 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 106340621 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 106341014 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106341174 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 2 106341253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106342035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106342263 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106343292 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 106343355 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 106343482 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 2 106344428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106344492 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106344573 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 106344635 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106345275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106345276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106347933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106348112 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106348408 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 106348472 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 106348870 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106348931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106349466 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 106349509 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 106350122 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106350197 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 106350365 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 106350545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106351400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106351516 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106351677 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106352238 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 106352386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106352665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106352707 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 106353468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106353506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106354005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106354633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106355230 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106355604 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 106355613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106356875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106357470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106358370 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106358451 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106358844 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 106358873 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 106359155 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 106359265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106359424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106359653 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 106359979 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106361070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106361219 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106364500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106364603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106364983 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106365003 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106365440 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 106365577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106365835 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106366434 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106366612 T G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 106367033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106367057 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 106367574 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 106369941 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 106370323 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106370364 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 106370644 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 106370664 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106370933 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106371057 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106371318 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106371320 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106371553 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106371971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106376354 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106381564 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 106386885 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106389885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106391279 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106391653 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106391722 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106391925 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 106391968 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106393736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106394820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106395224 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106396140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106396221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106397024 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 106397405 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106398580 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 106398605 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106398714 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106399537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106399874 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 106399922 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106400067 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 106400070 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 106400215 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106400253 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 106400254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106400681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106400732 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 106400855 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 106400897 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 106400962 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 106401091 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 106401116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106401146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106402692 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 106402803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106403152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106403483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106403607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106403882 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 106403990 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 106404111 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 106404311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106404335 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106405024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106405403 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106405712 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 106406099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106406427 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106406526 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106406597 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106406738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106406844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106407003 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 106409576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106409615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106409684 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106410540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106410898 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106411013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106411039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106411204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106411356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106412092 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106412355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106412454 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106412820 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 106413946 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 106414022 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 106414249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106414308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106414363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106415132 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 106415210 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106415221 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106415422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106419428 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 106425669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106426806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106426833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106427485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106427557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106427574 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106427973 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 106428392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106429458 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106430265 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 106430467 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106430526 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 106431036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106432252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106433976 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106434098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106436073 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106436842 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106438340 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106440696 C T Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 106441815 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106442542 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 106442596 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 106443228 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 106443474 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 106443999 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 106444369 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 106444563 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 106444866 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106445604 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 2 106445694 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 2 106446040 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 106446305 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 106446306 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 106446414 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 106446530 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 106446597 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 106446622 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106446640 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106446711 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106446712 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106446742 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106446750 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 106446757 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 106446765 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106446775 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106446791 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106446795 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106446889 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 106446891 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 106446942 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 106447120 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 106447122 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 106447414 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 106447494 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 2 106447523 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 106447636 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 106447786 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106447974 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106448140 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 106448193 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 106448259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106448483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106448732 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106449251 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106450080 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106450110 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 106450195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106450300 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 106450323 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 106450370 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 106450388 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 106450447 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 106450588 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 106450775 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 106450828 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106450844 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106450912 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106451120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106451257 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106451307 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 106451312 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106451465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106451554 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106451671 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106452228 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106452452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106452497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106452915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106453449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106453752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106453805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106454769 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106455351 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106455649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106455666 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 106455680 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 106455737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106455782 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 106455819 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106455820 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 106455835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106455952 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 106455958 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 106455989 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 106456021 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 106456109 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 106456133 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 106456190 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 106456193 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 106456255 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 106456322 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106456421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106456480 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106456490 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106456509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106456628 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106456641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106456873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106456890 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106456902 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106456905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106457034 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 106458215 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 106458673 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106458769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106458790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106458899 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 106459054 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106459221 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106459325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106459958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106460032 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106460590 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106460989 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106461135 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 106461161 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106461201 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106461764 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 106461811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106461897 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106462218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106462552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106463845 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106464197 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 106464686 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 106465105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106465863 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106466815 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 106466909 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 106467036 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 106467140 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 106467250 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 106467435 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106467483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106467600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106467805 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106467825 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 106468045 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 106468109 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 106468158 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 106468313 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 106468391 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 106468801 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106469091 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 106469322 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106469324 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106469337 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106469352 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 106469364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106469381 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 106469401 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106469520 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 106469538 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 106469573 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 106469581 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106469913 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106470016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106470090 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 106470255 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 106470267 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 106470287 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 106470371 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106470397 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 106470485 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 106470516 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 106470517 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 106470535 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 106470572 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 106470596 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 106470638 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 106470653 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 106471038 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106471099 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 106471132 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106471204 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 106471292 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 106471310 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106471403 G A N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 106471446 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 106471467 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 2 106471513 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106471548 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 106471558 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 106471572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106471808 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 106471850 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 106471936 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 106472017 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 7 13 3 1 6 2 106472135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106472184 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106472198 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106472252 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106472254 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106472429 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106472508 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106472536 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106472555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106472594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106472672 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 106472681 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 106472695 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 106472716 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 106472804 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106472807 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106472869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106473218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106473702 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106473758 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 106473827 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 106473902 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 106474322 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106474542 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106474687 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106474810 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106475045 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 106475291 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 106475393 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106475492 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 106475551 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106475631 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106475776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106475797 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106476002 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106476046 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106476081 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106476084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106476371 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 106480342 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 106480414 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 106480559 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 106480628 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 106481442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106481443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106482024 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106482063 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 106482194 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 106482217 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 106482285 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106482431 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106482537 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 106482597 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 106482729 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106482874 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106483008 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106483077 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106483086 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106483092 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 106483196 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 106483245 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 106483323 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106483452 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 106483453 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106483580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106483879 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106483884 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106483918 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106484473 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 106484628 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106484737 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 106484738 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 106484824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106485047 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106485078 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106485100 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106485181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106485251 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106485257 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106485284 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106485320 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106485355 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106485571 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106485774 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 106485794 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 106485877 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 106485914 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 106485957 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 106485981 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106485990 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106486131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106486144 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106486320 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106486351 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106486442 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106486466 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106486543 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106486556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106487183 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106487184 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106487238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106487256 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106487417 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106487510 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 106487646 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 106487657 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 106487679 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 106487710 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 106487752 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 106487765 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 106487868 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 106487917 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 106488199 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106488271 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106488307 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 106488320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106488354 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106488362 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 106488408 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 106488415 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 106488463 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 106488632 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106489226 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106489314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106489342 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106489363 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 106489440 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106489498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106489662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106489670 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106489794 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106489803 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106489879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106490180 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106490274 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106490787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106491097 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 106491209 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 106491284 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 106491506 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 106491678 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 106491783 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 2 106491801 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 106491810 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 106492202 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 106492254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106492687 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 106492721 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 106493032 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 106493233 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 106493323 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106493333 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106493336 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106493353 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106493374 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106493459 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 106494032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106494395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106494693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106494804 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 106494856 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 106494878 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 106494884 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 106494894 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 106494906 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 106494951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106496247 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 106496675 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106496919 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 106496983 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106497279 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 106497604 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 106498158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106498522 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 106499076 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106499111 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 106499120 G C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 106499143 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 106499175 G C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 106499310 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 106499473 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 106499613 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 106499615 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106499632 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 106499666 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 106500185 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 106500199 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 106500207 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 106500288 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 106500555 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106500649 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 106500740 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 106500911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106501096 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106501310 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 106501325 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 106501326 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 106501412 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106501434 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106501490 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106501600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106501640 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106501734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106501860 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106501994 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 106502022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106502282 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 106502393 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106502697 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 106503126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106503174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106503343 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 106503402 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106503410 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106503466 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106503548 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 106503549 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106503694 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106503712 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106503756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106503853 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106503863 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106504104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106504305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106504404 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 106504424 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106504481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106504551 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 106504755 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106504769 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 106504822 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106504825 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106505297 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106505519 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106505630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106505666 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106505670 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106505690 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 106505720 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106505891 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106506089 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 106506150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106506821 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106507682 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 106508029 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 106508391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106509190 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 106510286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106511373 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106511606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106512545 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106512627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106513051 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 106514576 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 106514629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106515299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106515993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106518617 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106518819 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106518851 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106518912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106519035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106519335 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 106525462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106528128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106528338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106529222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106530183 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106531363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106531599 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 106533893 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 106536041 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 106536110 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 106536180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106536889 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 106537122 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 106537254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106537627 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 106538022 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 106538063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106538219 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 106538403 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 106538411 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 106538577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106538611 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 106538649 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106538704 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 106538994 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106539242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106539282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106539987 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 106540110 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 106540395 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 106540425 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 106540432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106540447 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 106541707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106542207 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 106545186 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 106545833 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 106546626 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106547682 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 106548045 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 106548065 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 106548110 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106548159 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 106548443 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106548702 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106548789 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 106549105 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 106549125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106550272 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106550308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106550322 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 106550325 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 106550491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106551769 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 106551927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106552429 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 106554544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106554592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106555118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106557421 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 106560554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106563819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106563834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106564121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106566015 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 106580321 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106586605 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 106591148 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 106591247 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106591306 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 106591922 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 106592325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106593084 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106593253 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 106593413 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 106594626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106595047 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106595117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106595157 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106595739 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106595946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106596585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106597305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106597369 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106598355 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106598700 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106599106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106599141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106599173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106599397 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106599823 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106600154 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106600245 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106603521 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106603670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106604032 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 106604357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106604476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106604735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106606421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106606552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106608017 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 106608328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106609474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106610219 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106610475 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 106610513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106610537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106610999 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106611013 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106611170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106611463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106611948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106612221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106612226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106612522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106629928 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106636898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106638897 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 106638933 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106641037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106641656 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106642532 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 106642562 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106642975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106642994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106643045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106643053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106643389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106643444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106643513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106643526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106643529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106643691 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 106643758 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 106643812 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 106644151 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 106644409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106644732 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 106644824 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 106644848 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 2 106645164 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106645390 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 106645467 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 106645499 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 106645646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106645686 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 106645702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106645760 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 106646125 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 106646278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106646469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106646748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106646781 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 106646937 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 106647003 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 106647059 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 106647061 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 106647275 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106647490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106647764 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106647776 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106647782 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106647800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106647819 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106647824 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 106647852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106647863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106648255 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 106648408 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106648543 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 106648736 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 106648753 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 106648778 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 106648783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106648831 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106648840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106649026 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 106649037 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106649141 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106649155 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106649169 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106649232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106649290 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 106649337 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106649656 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 106649807 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 106650012 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 106650039 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 106650107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106651395 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 106651638 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 106651639 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 106651761 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106652817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106653271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106653561 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106653816 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106654880 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106655100 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 106655102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106655318 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 106655427 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106655442 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106655680 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 106655696 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 106655754 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106655766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106655800 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 106655836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106655876 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106655914 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 106656065 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 106656133 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106656139 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 106659381 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 106659402 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 106659720 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 106659732 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 106659746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106659779 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106659938 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106660173 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106661247 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106661553 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106661911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106663552 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 106663557 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 106663664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106665001 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106665002 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 106665161 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 106666182 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 106666505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106666936 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106666949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106667159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106669284 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106670067 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106671977 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 106672021 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106672639 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 106673497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106673944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106674871 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106674879 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106674884 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106678512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106678557 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 106681627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106683325 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106683524 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 106684140 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106684145 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 106684263 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106684291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106684406 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 106684899 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 106687386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106702212 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106702913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106704273 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 106704325 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106705234 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 106705800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106706896 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106707124 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106707445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106708577 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106708728 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106709047 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106709222 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 106709228 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106709527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106710023 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106710182 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 106710390 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106710614 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106712282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106714145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106714588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106714681 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106714848 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 106715894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106716346 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106716423 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106716463 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 106716962 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106717248 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 106717769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106717927 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106719207 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106719563 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106719746 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 106719909 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 106719972 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 106720017 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106720019 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106720037 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106720054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106721146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106722419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106722434 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106722574 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 106722856 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 106723129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106723173 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106723366 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106723523 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106724037 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106724324 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 106724765 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 106725227 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 106725715 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106727062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106727988 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106729022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106729521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106731718 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 106735348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106735398 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106738290 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 106740854 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 106741422 T A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 106741460 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 106742513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106742543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106743948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106744329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106744810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106745484 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 106746591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106747972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106748088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106750232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106750451 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106751786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106752024 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 106752906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106752998 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 106753037 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 106753058 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 106755623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106755754 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 106757486 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106757627 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106757717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106757846 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106758040 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106758082 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 106758106 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 106758107 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 106758229 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106758308 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106758781 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 106758864 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 106758903 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 106758944 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 106758949 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 106758996 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106759026 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 106759043 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106759052 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 106759232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106759262 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 106759316 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106759330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106759345 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106759518 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106759556 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 106759592 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 106759644 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106762397 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 106762414 A T Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 106763905 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 106766737 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 106766823 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 106766989 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 106767016 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 106767020 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 106767030 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 106767055 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 106767059 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 106767128 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 106767486 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 106767838 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 106767873 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 106767899 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 106768267 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 106768527 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 106768549 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 106768576 G A N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 106768599 T A Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 106768738 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 106768785 T C Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 106768794 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 106768980 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 106769086 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106769132 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 106769150 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 106769283 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 106769295 C G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 106769390 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 106769428 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 106770159 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 106770916 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 106771230 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106772375 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106772481 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 106772615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106772676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106772821 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106772915 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106772948 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 106773204 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106773238 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106773365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106773527 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 106773542 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106773603 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 106773621 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 106773635 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 106773756 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106773805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106773806 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106774017 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106774063 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 106774087 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 106774088 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 106774147 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 106774148 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106774161 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 106774197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106774200 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 106774304 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 106774388 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 106774395 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 106774516 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 106774612 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 106774849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106774960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106774974 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 106775002 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106775106 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106775123 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106775328 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106775364 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 106775377 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 106775410 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 106775516 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 106775633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106775657 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106775736 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 106775769 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 106775894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106775933 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 106775944 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106775947 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 106776166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106776197 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106776216 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106776300 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106776371 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 106776399 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 106776458 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 106776520 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106776525 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106776579 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106776590 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 106776634 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 106776673 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106776751 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 106776830 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 106776984 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106777032 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 106777079 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106777337 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106777490 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 106777500 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 106777593 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 106777683 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 106777907 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106778022 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 106778066 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 106778142 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106778164 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106778174 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106778222 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106778236 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106778281 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106778302 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106778321 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 106778324 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106778343 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106778421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106778440 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 106778464 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 106778732 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 106778782 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106778800 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 106778822 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 106778887 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106778952 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 106778968 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106778982 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 106779013 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 106779035 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106779066 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 106779104 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106779110 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 106779590 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 106779719 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 106780183 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106780639 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 106780785 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 106781063 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106783552 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106783589 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 106783822 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 106784016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106785378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106786897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106787387 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 106787397 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 106787416 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 106787645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106788023 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 106788060 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 106789008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106790477 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106790664 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 106790908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106792817 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 106793652 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 106794466 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 106795192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106797289 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 106797383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106797830 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 106797892 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 106798383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106798619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106802456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106803160 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106803389 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 106803584 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106804430 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106804860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106806392 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 106809968 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106810152 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 106811751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106813416 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 106813662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106817385 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 106817438 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 106817449 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 106818178 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106819169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106819278 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 106819280 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106820879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106821360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106821800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106822228 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 106822896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106822981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106826251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106828049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106828219 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 106828791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106828847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106829877 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106829920 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 106829921 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 106830295 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106830766 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 106831099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106831679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106831870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106831931 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106832191 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 106834677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106835804 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106836382 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106837074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106838254 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 106838270 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 106838349 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 106838594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106839022 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 106839308 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 106839402 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 106839426 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 106839660 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106839759 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 106839802 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 106839907 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 106840446 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 106840541 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 106842467 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 106842584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106842639 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 106842670 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 106842759 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 106842802 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 106842838 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 106842847 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 106842861 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 106842914 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 106843048 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 106843106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106843132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106845040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106845234 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 106845672 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 106845846 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 106845942 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 106846193 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 106846316 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106846557 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 106846740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106846860 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 106846877 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 106847171 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 106847313 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 106847410 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 106847516 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 106848167 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 106848368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106849096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106849197 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106849261 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 106849323 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 106849377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106849396 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 106849397 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 106850232 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106850614 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106850618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106851657 G C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 106851717 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 106851826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106851934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106851980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106851996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106852006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106852048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106852069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106852154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106852232 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106852283 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 106852425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106852449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106852628 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106852703 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106852705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106852892 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106852924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106852995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106853250 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106854153 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106854171 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106854682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106854770 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106854799 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 106854909 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 106856789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106857004 G C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 106857034 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 106857211 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 106857823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106858327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106858557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106859067 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106860054 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106861334 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 106861471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106862239 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 106863703 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 106866175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106866417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106868970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106869330 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 106869339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106871759 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 106872749 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106873070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106873253 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 106876171 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106876275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106876924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106877620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106877849 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 106878937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106879756 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 106880254 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 106880271 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106882003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106882658 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 106883402 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 106883473 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 106884344 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 106884662 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 106885191 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106885423 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106885564 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 106885580 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 106885788 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106885895 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106886442 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 106886447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106886569 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 106886737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106887330 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 106887436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106887698 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106888158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106888836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106888870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106889249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106889254 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106890023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106890187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106890509 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106891384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106891550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106891823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106892005 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106892489 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 106893610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106895981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106897024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106897951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106899243 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 106902620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106902988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106904756 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106905524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106905650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106906199 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 106906253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106906256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106906265 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 106906267 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 106906333 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 106906337 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 106906401 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 106906419 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 106906507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106906512 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 106906551 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 106906569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106906833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106907070 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 106907078 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 106907084 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 106907115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106907120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106907221 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 106907265 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 106907280 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 106907296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106907392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106907397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106907434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106907493 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 106907601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106907701 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 106907839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106907970 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 106907980 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 106907991 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 106908276 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 106908288 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 106908394 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 106908436 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 106908596 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 106908655 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 106908718 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 106909204 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 106909945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106911218 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106911400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106911973 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 106912147 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 106912172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106915375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106916543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106916885 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106917095 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106917414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106919396 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 106920503 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106921081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106921383 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106921497 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106921608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106921979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106922684 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106922961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106924674 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 106925189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106925466 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 106925512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106926330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106927120 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106927696 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 106927855 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 106928868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106930761 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106931660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106932687 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106933420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106933795 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106934234 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106936586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106939370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106939712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106947655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106949247 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106949524 T A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 106949791 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106950087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106950243 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106952170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106952415 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 106954171 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106954368 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 106954399 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 106954404 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 106954585 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106954773 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 106955546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106956350 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106956661 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 106956687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106957380 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 106957488 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 106957489 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 106957823 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 106958348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106958376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106958668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106958765 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106959036 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106959068 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 106959372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106959592 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 106960256 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 106961048 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 106961261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106961519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106961647 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106962171 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106962173 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106962953 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 106963046 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 106963070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106963219 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 106963310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106963691 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106964030 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 106964183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106966699 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106966777 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 106967295 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106967837 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106968272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106968509 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 106968655 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106968841 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 106968883 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106968900 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106968932 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 106969052 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 106969059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106969081 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106969219 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106969425 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106969497 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106969872 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 106969936 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 106970041 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 106970965 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 106971226 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 106971322 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 106971423 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 106971568 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 106971816 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106971868 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 106972164 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106973184 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 106981063 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 106985299 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106985315 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106985842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106985976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106990105 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106990244 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106990958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106991851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106991955 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 106992156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106992248 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 106993815 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 106993828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 106993962 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 106994384 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 106994815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106995118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106995766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106996309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106996492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106996907 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106997026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106997296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106997553 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106997598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106997608 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106997890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106998336 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 106999105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 106999204 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 106999643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107000237 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107000392 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107001013 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107001485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107002027 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107002301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107002360 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 107003123 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107003170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107003349 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 107004137 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107004698 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107004879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107004927 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 107004944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107005352 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 107005559 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 107012227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107013391 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 107014560 C T Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 107014711 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 2 107014730 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107015565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107015991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107016188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107016517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107016736 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107017034 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107017147 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 107017180 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 107017283 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 107017319 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 107017443 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107017664 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 107017739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107017751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107018022 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 107018066 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 107018069 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 107018225 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 107018585 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 107019479 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107019824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107020252 T A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 107021273 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 107021285 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 107021364 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 107021480 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 107021496 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 107021500 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 107021510 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 107021536 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 107021571 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 107021846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107022255 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107022860 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107024883 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 107025357 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107026037 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 107026524 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107026623 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 107027402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107027520 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107027617 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107029633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107029657 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107030300 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107031337 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107031444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107031478 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 107031677 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107031760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107032585 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 107032761 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107033181 C A Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 107033980 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 107034334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107034682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107035444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107036067 G A N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 107036733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107037701 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107037748 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 107038820 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 107040238 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 107041427 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107041473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107041622 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 107041949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107042644 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107043777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107044694 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107044865 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107046594 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107046958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107048709 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 107049193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107049559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107050342 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107050699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107051233 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 107051334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107051460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107052854 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107054455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107054725 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107055104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107055691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107055834 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107056294 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107056695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107057610 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107057651 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107057913 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 107057969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107058056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107058833 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107059437 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 107060214 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107061198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107061247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107061294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107061314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107061338 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 107061353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107061457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107061486 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 107061661 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107061696 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107061899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107061941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107062078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107062170 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107062179 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107062198 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107062340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107062386 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 107062393 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 107062431 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 107062509 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 107062522 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 107062597 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107062641 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 107062657 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 107062697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107062786 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107063051 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107063067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107063093 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 107063184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107063236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107063254 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107063309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107063316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107063336 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107063341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107063365 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107063374 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107063482 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107063539 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107063643 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107063658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107063702 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107063825 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 107063912 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 107063988 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107064026 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 107064030 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 107064080 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 107064088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107064207 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 107064265 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107064450 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107064471 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107064490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107064492 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 107064516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107064535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107064548 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107064711 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 107064741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107064797 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 107064803 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 107064910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107065618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107065773 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107065802 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 107066543 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107066742 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 107066966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107067101 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107067342 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 107067356 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 107067612 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 107067623 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 107067644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107067654 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 107067675 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 107067739 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 107067747 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 107069312 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 107069531 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107070785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107071398 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107071682 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107071709 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 107072251 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107072366 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 107072662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107072718 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107072814 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107072832 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 107073182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107073221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107073952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107074238 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107074981 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107075407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107075706 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107076034 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107076049 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 107076173 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 107076491 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107076538 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 107076989 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 107077387 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 107078187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107078235 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 107078701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107078803 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 107078811 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 107078820 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 107078868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107078926 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 107078972 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 107078988 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 107079133 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 107079201 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107079263 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107079378 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 107079389 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 107079404 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 107079471 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107079472 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 107079491 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 107079765 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 107079877 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 107079922 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 107079984 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 107080024 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 107080131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107080133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107081147 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 107081468 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 107081998 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107082858 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107083205 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 107083260 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 107083319 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 107083501 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107083595 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107083618 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107083647 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107083717 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 107083772 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 107084295 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 107084349 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107084493 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107084516 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107084569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107084738 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 107084742 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 107084776 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 107084881 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 107084945 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 107084949 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 107085074 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 107085173 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 107085176 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 107085222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107085339 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107085374 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107085393 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 107085461 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107085567 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107085584 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 107085784 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 107085885 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 107085924 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 107085957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107086737 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 107086800 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107086852 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 107086886 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 107087164 G C N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 107087703 T G N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 2 107087757 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107087773 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 107087942 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 107087943 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107087967 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 107088001 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 107088228 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 107088229 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 107088473 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 107088504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107088675 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 107089016 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 107089189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107089388 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 107089985 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107090258 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 107090424 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107090933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107091689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107092502 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107094305 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107094729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107094774 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 107094966 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107095477 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 107095632 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107096270 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 107096298 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107096316 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107096804 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 107096823 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 107096834 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 107097004 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 107097226 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 107097937 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 107098586 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 107099660 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 107099670 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 107099883 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 107099902 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 107099950 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 107099967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107100029 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 107100107 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 107100135 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 107100284 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 107100841 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 107101360 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107101567 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107102134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107103115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107103176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107103643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107103650 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 107103774 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 107103920 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107103973 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 107104061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107104065 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107104464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107104834 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 107104877 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107105324 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 107107007 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107107144 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 107107669 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 107108335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107108569 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107109273 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 107109793 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 107109794 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 107109854 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 107109885 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 107109901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107110632 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107111395 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107111707 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 107111751 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107111929 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 107112057 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 107112079 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 107112286 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 107112330 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 107112643 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 107113060 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 107113194 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 107116221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107116332 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 107116707 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107117293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107117306 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 107118977 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107119341 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 107119588 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 107119628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107119708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107120316 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 107121425 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 107122551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107122755 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107122799 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107123160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107123161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107123369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107123704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107123902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107123940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107124020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107124136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107124204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107124504 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 107125010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107125171 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 107125322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107125530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107125737 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 107125949 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107125964 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107126090 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 107126894 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107127246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107127578 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 107128038 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 107128483 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 107128495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107132642 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 107133447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107134550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107137353 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 107137776 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107137939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107138919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107141463 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 107142183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107142330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107142377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107142537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107143299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107143789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107143970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107146907 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107146983 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 107147102 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107147134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107147304 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107147312 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107147395 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107147743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107147752 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 107148577 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 107148787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107149074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107149116 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 107149139 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107149162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107149473 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107149502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107149835 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107150398 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107150552 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107150576 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 107150638 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 107150908 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 107151121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107151391 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107151477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107151552 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107151662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107151775 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107151871 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107151892 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 107151896 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107151918 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 107151993 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107152007 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 107152088 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107152149 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 107152846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107152900 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107152936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107153233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107153259 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107153267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107153392 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107153400 T G N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 107154401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107154693 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107155272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107155540 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107155573 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 107155717 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 107155731 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 107156308 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 107156402 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 107156414 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107156596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107156630 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107156763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107158186 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 107158431 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107158739 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 107158787 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 107159000 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 107159122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107159147 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107159550 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 107159829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107159891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107159980 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 107159993 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 107160273 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 107160288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107160571 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 107160582 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 107160836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107160927 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 107161109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107161196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107162367 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 107162676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107162702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107162783 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 107162867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107163182 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 107163741 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 107165492 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 107165655 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 107165924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107166187 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107166246 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 107166649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107166965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107167051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107167110 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 107167380 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107167422 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107167545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107167673 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 107167967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107168171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107168172 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 107168277 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107168283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107168578 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107168770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107168777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107168806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107168992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107169003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107169004 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 107169186 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 107169668 T A Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 107169815 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 107169898 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 107169907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107170077 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 107170146 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107170186 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 107170350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107170699 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107170937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107170953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107170984 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 107171657 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 107171872 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107172098 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 107172251 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 107172267 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107172314 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107172417 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 107172433 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 107172515 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 107172594 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 107172739 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107172741 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 107173390 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107173405 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 107173411 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 107173427 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 107173469 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 107173507 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 107173613 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 107173619 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 107173669 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 107173694 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 107173750 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 107173796 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107173889 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 107173944 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 107174075 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107174105 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107174123 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107174132 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 107174615 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 107174665 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 107174786 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 107174796 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107174808 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107174939 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107174985 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107174998 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 107175101 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 107175359 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 107175363 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 107175612 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107175649 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107175729 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107176424 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 107176620 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107176876 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107177036 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107177044 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 107177198 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 107177210 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107177609 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 107177868 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107177891 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107178068 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 107179860 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 107181175 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 107181335 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 107181808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107181840 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 107182154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107183346 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107183616 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107184507 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 107184715 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 107185309 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 107185369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107188156 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 107188221 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 107188871 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107189085 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107189199 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 107189216 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 107191095 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107192245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107192686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107192955 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 107193153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107193310 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 107194486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107195084 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107195396 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 107195454 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 107195706 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 107196209 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 107196211 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 107196221 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 107196222 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 107196466 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 107196660 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107196824 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107196945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107197536 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 107197795 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 107197828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107198036 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 107198178 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 107198318 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 107198718 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 107198725 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 107198846 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 107198847 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 107199059 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 107199902 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 107200974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107201084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107201280 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107201348 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 107201413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107201450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107201549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107201613 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 107202532 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 107202539 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107202845 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 107202886 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107203043 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 107203283 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 107203301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107204254 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 107204643 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107204743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107204803 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 107204873 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 107204898 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107204921 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 107205325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107205814 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107206399 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 107206460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107206581 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 107206598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107206638 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107206655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107206678 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 107206854 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 107206907 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107207036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107207063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107207150 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107207320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107207630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107207632 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107207660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107207685 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107207732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107207742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107208104 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107208238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107208679 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 107208984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107209175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107209331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107209388 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107209430 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107209463 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107209532 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 107209574 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 107209688 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 107209937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107210031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107210049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107210102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107210147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107210572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107210844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107211890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107212435 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107212740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107214560 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 107214858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107217555 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107217838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107221904 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 107223788 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 107223853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107225071 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107228692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107229078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107229240 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107229755 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107230025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107230083 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 107230263 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107230526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107230638 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 107231702 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 107233078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107233802 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107238345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107238346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107238790 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 107238870 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107240436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107242227 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107247113 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107247349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107248423 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 107248709 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107249664 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107249714 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 107249724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107249810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107249814 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 107249902 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107249934 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 107250345 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107250628 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 107250694 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 107251478 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107251893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107251975 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107253050 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107253627 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107254395 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107254711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107255336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107255415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107255943 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 107256342 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107258369 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107259261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107259791 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107260264 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 107260532 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107263343 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 107264188 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107264226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107264263 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 107264279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107265002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107265614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107268896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107270851 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107272676 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107273732 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107273734 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107274159 G C Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 2 107274509 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107276359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107276842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107277724 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 107278247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107278269 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107278296 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107278335 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107279279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107281781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107281863 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107284178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107285976 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107287288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107291314 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107291445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107294109 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107295759 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 107296018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107296616 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107298295 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107301020 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 107301562 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107302052 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107302204 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107302366 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107302407 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 107302440 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 107302604 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 107302605 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107302914 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107303034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107303109 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107303116 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107303143 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 107303203 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 107303206 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 107303214 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 107303291 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 107303392 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107303420 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107303461 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 107303507 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 107303528 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 107303549 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107303557 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107303610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107303618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107303746 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107303825 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107304202 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107304239 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107304531 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 107304548 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107304688 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107304722 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107304730 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107304958 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 107305019 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 107305047 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 107305563 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107306265 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 107306380 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 107306578 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 107307310 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107307581 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 107307628 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107308206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107308431 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107308845 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 107310724 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 107311469 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 107311747 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 107312121 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 107312327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107312782 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107312856 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 107312890 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 107313029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107313060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107313378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107313539 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 107313940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 107313992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107314075 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107314195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107314825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107314994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107315060 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 107315641 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 107315914 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 107316731 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 107317101 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 107317508 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 107317683 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 107317699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107317754 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107318413 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 107318658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107319758 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 107319789 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 107320521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107321239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107322101 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 107322182 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 107322197 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107322360 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 107322369 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 107322912 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 107323293 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 107323757 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107324473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107325702 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 107326338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107326504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107327226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107328138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107328342 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107328343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107328914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107329177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107329243 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107329328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107329345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107329941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107330126 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 107330143 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 107334799 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107334981 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107335206 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107335881 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 107336063 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107336083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107336146 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107336348 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107337497 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107338347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107339436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107339449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107339461 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107339480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107339851 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107340095 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107340428 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107342326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107343103 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107343953 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 107344010 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107344190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107344476 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107345728 A C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 2 107346560 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107346754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107348975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107350608 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107353265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107353989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107355830 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 107355960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107356721 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107357170 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107357757 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107357927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107358260 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107358684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107359171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107359478 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107360545 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 107361979 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 107362826 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 107362830 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 107363488 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 107363924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107364027 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 107364401 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107364753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107364764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107364920 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107365012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107365100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107365337 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107366235 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 107366363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107367874 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107368103 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 107368317 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 107368517 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 107368634 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107368782 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 107368820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107368928 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107369250 C A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 107369435 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107369594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107369673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107369751 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 107369762 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107369866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107369875 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 107369898 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 107369919 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 107369940 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107370052 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 107370065 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 107370069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107370210 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 107370369 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 107370618 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107370940 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 107370998 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 107371302 C A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 107371403 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107371444 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 107371551 G A Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 107371610 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 107371621 T C Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 107371666 A T Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 107371677 G C Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 107371811 T G Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 107371917 T A Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 107372763 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 107372846 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 107373272 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107373551 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107374698 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 107375356 T G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 107375357 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 107375447 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107375926 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 107376254 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107377048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107378708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107378824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107379535 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107380404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107382955 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107384916 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107387994 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107389010 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 107389449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107389583 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107391881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107393483 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107394807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107395766 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107396414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107396606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107399965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107401055 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107401506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107401623 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107401825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107403017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107405361 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 107406463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107408067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107408909 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 107409837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107410611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107411002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107411128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107411533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107411999 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107413357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107414178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107414220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107415480 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107415499 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 107416119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107417766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107417772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107417863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107418511 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107419400 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107420207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107420683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107420903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107421381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107422387 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 107422497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107423491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107423676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107424588 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107424659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107425347 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107425405 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107425958 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 107426090 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107426289 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107426303 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 107426304 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107426355 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107426512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107427328 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 107427757 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107428857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107429212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107429389 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107429561 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107431248 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 107431346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107432770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107432798 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107433948 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107441662 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 107441751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107441780 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107442902 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 107444697 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 107444921 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107445285 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 107445369 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107445467 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107445972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107445977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107445983 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107446119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107446370 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107446460 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107446514 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107447988 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107447992 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107448437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107448452 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107448713 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107449805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107450057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107450269 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 107450859 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107450992 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107451108 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107451132 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107451211 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 107451251 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 107451827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107451881 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107452034 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107452158 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107452604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107452605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107452618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107452625 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107452641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107452888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107453518 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107453667 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 107453987 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107454034 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107454039 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 107454096 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107454243 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107454261 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107454448 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107454523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107454574 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107454646 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107454648 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107454869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107455349 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 107455350 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 107455412 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107455571 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107455741 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107455810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107455926 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107456053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107456146 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107456210 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107456339 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 107456348 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107456465 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107456496 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107456622 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107456653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107456722 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107456773 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107456801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107456840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107456890 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 107457024 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107457215 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 107457498 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 107457675 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 107458118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107458245 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107458426 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 107458436 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107458462 A T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 107458498 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 107458532 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 107458867 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107458948 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107459015 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107459019 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107459151 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107459182 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 107460247 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 107460332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107460371 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 107460417 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 107460418 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 107460494 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107460512 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107460528 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 107460554 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107460601 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107460624 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107460694 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107460733 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 107460834 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107460865 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 107460870 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107461834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107463026 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107466164 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107468580 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107468779 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 107469111 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107469822 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 107470086 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107470333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107471200 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107471863 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107472932 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107473069 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107474528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107475258 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 107475748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107476186 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 107477240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107478914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107480211 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107481440 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 107482047 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 107482321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107482594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107483025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107483103 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107483133 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107483507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107484976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107485395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107485650 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107486217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107486495 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107486642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107489220 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 107491038 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 107494191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107495000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107495062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107495111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107495112 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107495894 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107495980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107496299 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107496404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107497826 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107497948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107498026 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107499338 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107499713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107499973 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107500177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107500571 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107501832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107502187 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107502507 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107503093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107503589 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 107503600 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 107503668 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 107503775 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 107503996 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107504552 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107504559 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 107504905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107504906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107504928 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107504945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107505098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107505384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107505456 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107505724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107505851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107506265 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107506319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107506576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107506671 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107506762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107506813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107506842 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107506872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107506878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107506957 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107507204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107507286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107507321 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107507546 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107508059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107508172 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107508211 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107508973 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107509374 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 107509644 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107509782 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107509837 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107509938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107510167 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107510873 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107511126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107511131 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107511464 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107511534 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107512009 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107512125 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107512339 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107512566 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 107512860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107512884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107512925 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107513011 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107513172 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 107513194 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107513659 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107513864 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107514178 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107514230 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 107514505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107514575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107514759 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107514786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107514810 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107514852 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107514893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107514919 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107514920 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 107515074 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107515313 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 107515329 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 107515341 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107515356 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107515429 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107515465 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107515582 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107516328 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 107516725 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107516748 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107516761 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107516980 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107516988 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107517261 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 107517317 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 107517320 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 107517401 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 107517403 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107517535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107517784 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107517844 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107518205 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 107518315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107518604 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 107518665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107518892 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107518945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107519085 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 107519222 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 107519225 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 107519264 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107519301 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107519312 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107519317 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 107519346 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 107519353 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107519611 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 107519764 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 107520006 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107520291 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 107520360 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107520380 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107520382 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107520575 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 107520641 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107520651 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107520670 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 107520701 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 107520712 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 107520807 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 107520819 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 107520829 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 107520859 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 107520868 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 107520872 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 107520987 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 107521095 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 107521216 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 107521256 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 107521316 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107521350 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 107521406 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107521467 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 107521471 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 107521533 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 107521557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107521606 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 107521637 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107521826 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107521949 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107522026 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107522133 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 107522157 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 107522160 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 107522345 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 107522375 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 107522417 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 107522429 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 107522659 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107522752 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 107522804 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 107522812 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 107522852 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 107522931 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 107523018 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107523031 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107523035 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107523077 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107523082 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107523124 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 107523128 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107523148 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 107523269 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107523343 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107523351 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107523457 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 107523541 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 107523626 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 107523646 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107523691 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 107523774 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107523899 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107523919 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107523931 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107523943 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524011 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524033 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524048 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524065 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107524122 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524127 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524205 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524220 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524243 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524271 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524281 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524575 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 107524606 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107524637 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107524708 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107524728 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 107525905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107527535 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107527996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107528462 A G N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 107528882 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 107530478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107532449 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107533264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107533737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107534597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107537115 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107537385 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 107537677 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107537844 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107538404 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107539476 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107540000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107540427 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107541106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107543651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107543962 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107544544 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107546344 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107552766 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107552870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107552951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107552954 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107553276 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107553279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107553342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107553602 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107553644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107554207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107554295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107555272 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 107557153 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 107557757 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 107557997 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107558004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107558276 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107558305 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107558311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107558336 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107558476 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107558641 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107558827 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107558916 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107559193 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107559284 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107559397 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107559426 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107559439 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107559451 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107559628 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107559873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107560798 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107560945 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107560972 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 107561033 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107561034 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107561245 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107561469 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 107561477 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107561497 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 107561691 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107561726 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 107561727 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 107561783 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 107562180 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107562243 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107562431 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107562434 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107562939 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107562940 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107563207 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 107563275 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107563294 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107563331 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107563789 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107563911 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107564056 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107564059 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107564326 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107564655 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107564853 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 107565027 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107565252 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107565457 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107565475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107565818 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 107565846 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107566167 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 107566246 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 107566270 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107566292 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 107566582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107566804 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107566843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107566919 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107567519 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107567671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107567701 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 107567817 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 107567840 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 107568011 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 107568030 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 107568330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107568361 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107568632 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 107568880 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 107569161 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107570231 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107570319 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107570439 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 107570508 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107570514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107570658 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107570683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107570734 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107570812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107570871 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107571635 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107571851 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107571899 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 107572096 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 107572478 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107573061 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107573247 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107573255 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 107573359 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107573372 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107573392 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 107573605 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107573701 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107573863 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107574114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107574351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107575113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107575188 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107575688 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107575886 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107576076 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107576665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107577813 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107578091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107578207 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 107578329 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107578465 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 107578628 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 107578754 G C N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 107578764 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 107578805 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 107578860 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 107578867 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 107578971 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 107578975 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 107579010 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 107579018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107579032 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 107579054 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 107579118 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 107579120 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 107579207 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107579226 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107579230 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107579260 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107579369 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107579377 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107579454 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107579531 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 107579569 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 107579602 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107579642 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107579669 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107579733 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107579747 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107579843 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107579847 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107579857 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107580018 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 107580034 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107580040 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107580053 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 107580129 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107580144 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107580424 A C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 107580811 C A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 107580816 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 107580884 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107581093 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 107581147 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 107581305 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 107581432 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 107581541 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 107581558 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 107581609 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107581716 G T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 107581877 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 107588361 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 107588375 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 107588583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107589289 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 107589532 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 107590067 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107590417 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107591209 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 107591313 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107591347 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107591430 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 107591557 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 107591682 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 107591834 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107591899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107591933 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107591971 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107591995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107592356 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 107592397 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107592406 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107592478 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 107593113 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107593178 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107593208 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107593236 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 107593289 A C Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 107593674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107593708 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107593709 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107593739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107593819 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107593940 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 107594095 G C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107594098 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 107594239 G C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 107594777 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107594821 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107594841 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107595271 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 107595402 C G Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 107595429 A G Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 2 107605600 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 107605697 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107605745 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107605785 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107605814 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107606178 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 107606237 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107606480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107606859 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 107607324 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107608490 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107608914 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 107609252 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107609372 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107609742 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 107610247 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107610329 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 107610989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107611286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107611969 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107612111 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 107612744 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107612835 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 107612879 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107613131 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107613279 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 107613419 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 107613618 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 107613620 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107613655 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 107613662 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 107613673 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 107613694 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 107613702 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 107613809 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107613834 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 107613908 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 107614009 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107614047 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 107614097 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 107614167 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 107614419 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 107614546 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107615019 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 107615066 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107615192 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 107615506 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 107615764 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 107615776 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107615900 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 107616305 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 107616449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107617410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107617462 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107617637 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 107617652 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 107617725 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 107618238 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 107618484 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107618647 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107618831 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 107619143 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 107619355 A T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 107619690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107619809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107620020 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107620021 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107620059 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107620717 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 107621075 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107621205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107621238 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 107621318 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 107621336 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 107621347 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 107621413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107621687 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 107621988 T G N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 107622065 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107622085 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 107622173 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107622174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107622198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107622277 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107622511 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 107622559 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107623728 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107623736 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107624855 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 107624883 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 107624954 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107625080 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107625085 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107625104 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107625125 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 107625205 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107625214 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107625240 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 107625313 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 107625314 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 107625381 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107625402 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107625411 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107626302 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 107626363 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107626369 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107626471 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107626564 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 107626619 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107626804 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 107626863 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107627081 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 107627161 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 107627259 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 107627287 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 107627538 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 107627555 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 107627565 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107627591 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107627594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107627649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107627929 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 107627948 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 107627999 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 107628017 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 107628049 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 107628198 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107628201 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 107628799 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 107628835 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 107629379 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 107630300 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 107630865 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107630880 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107630953 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107630964 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 107630977 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 107631010 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 107631216 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 107631657 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107631957 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 107632012 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 107632047 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 107632242 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 107632334 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 107632549 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107632660 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107632671 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 107632706 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107632724 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107632727 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107632739 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107632765 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107632983 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 107632986 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 107633012 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 107633040 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 107633044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107633072 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107633137 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 107633275 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107633296 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107633321 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 107633322 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 107633407 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107633433 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107633477 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107633506 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107633591 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107633625 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107633743 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107633769 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107633803 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107633882 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107633970 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 107634004 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107634250 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 107634279 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107634489 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107634505 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107634573 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107634825 A G N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 107635120 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 107635663 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 107635686 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 107635727 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 107635790 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 107636020 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107636089 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107636257 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 107636440 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 107636525 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 107636552 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 107636581 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 107636602 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 107636736 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107636808 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 107636838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107636870 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 107636899 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 107636973 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107637183 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107637195 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107637199 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107637228 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107637293 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 107637349 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107637356 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 107637454 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107637486 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107637697 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 107637704 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107637834 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 107637845 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 107637955 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 107637969 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 107637980 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 107638014 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 107638160 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107638170 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107638195 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107638284 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107638313 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107638407 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 107638424 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107638440 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107638468 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 107638494 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 107639701 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 107639704 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 107640292 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 107640502 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 107640683 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 107640862 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107641003 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 107641335 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 107641511 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107641587 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 107641831 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 107641846 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107641880 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107641926 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 107641928 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 107642035 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 107642107 C T Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 107642141 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 107642161 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 107642746 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 107642821 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107645014 T C Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 107645174 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 107645559 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 107645913 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 107645952 G T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 107646459 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107646474 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107646485 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 107647525 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107647917 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107648697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107648769 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107648896 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 107649008 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107649009 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 107649226 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 107649230 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 107649262 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107649755 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107650190 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107650255 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 107650297 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107650398 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 107651726 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 107651873 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 107651929 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 107651990 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107652050 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107652091 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107652102 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 107652338 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 107652364 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107652377 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107652550 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107652572 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107653041 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 107653044 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 107653793 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 107654129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107654170 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107654281 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 107654540 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 107654623 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 107654626 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 107654700 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107654715 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107655659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107655852 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 107656358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107656364 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 107656458 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 107657311 A C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 107657616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107657622 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 107657628 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 107658700 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 107658912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107659045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107659223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107659227 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107659651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107660047 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 107660968 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 107661389 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107661596 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107661745 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 107661778 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 107661835 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 107661887 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 107662047 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 107662117 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 107662211 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 107662469 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 107662608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107662626 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 107662679 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 107662742 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107662821 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107662954 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 107662995 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 107663018 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 107663197 C A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 107663289 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 107663403 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 107663495 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 107663550 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 107663631 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107663634 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107663748 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107663761 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107663768 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 107663780 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 107663854 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107664007 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107664192 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 107664236 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 107664408 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 107664593 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 107664597 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 107664742 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107664769 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 107664938 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 107665260 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 107665529 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 107665572 C A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 107665658 C T N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 107665897 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 107665987 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107666188 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107666208 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107666304 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107666352 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 107666471 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 107666539 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107666586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107666704 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107666733 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107666759 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107666765 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107666779 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107666815 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 107666883 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 107666980 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 107667059 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 107667085 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 107667109 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 107667272 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 107667297 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 107667395 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 107667411 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 107667420 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 107667444 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 107667449 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 107667480 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 107667588 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107667614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107667643 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 107667702 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 107668039 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107668053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107668095 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 107668147 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107668206 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 107668229 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 107668237 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 107668356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107668445 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 107668493 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 107668661 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 2 107668734 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 107668738 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 107668784 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 107668945 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 107668958 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 107668998 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 107669084 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 107669182 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 107669253 T G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 107669580 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 107669581 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 107669591 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107669718 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 107669728 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107669766 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 107669995 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 107670045 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 107670071 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 107670259 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 107670305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107670310 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107670338 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107670940 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 107671405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107672833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107673198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107675197 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107675549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107676479 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107677080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107677335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107677989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107679208 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107680252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107681768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107686035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107686291 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 107686315 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 107686439 A C Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 107686996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107687157 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 107687509 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 107687608 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107687711 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107687749 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 107687793 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107687815 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107687862 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107688004 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 107688008 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 107688257 A T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 107688282 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107688288 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107688305 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 107688407 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 107688434 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107688455 C G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 107688517 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107688659 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 107688744 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107688753 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107688840 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 107688929 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 107688947 A T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 107689001 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 107689029 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 107689152 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 107689157 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 107689185 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 107689261 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 107689300 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 107689335 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 107689390 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107689411 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107689436 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107689503 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 107689510 C G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 107689544 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 107689568 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107689582 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 107689591 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107689603 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107689611 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 107689626 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 107689672 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 107689753 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 107689904 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 107689973 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107690066 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 107690159 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 107690514 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 107690546 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 107690606 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 107690626 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 107690702 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 107690766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107690863 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 107690885 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107690981 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107691001 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107691052 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 107691056 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107691208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107691328 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 107691755 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107692221 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107692539 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107692636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107692857 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107694004 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107694288 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107694376 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107694542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107694621 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107694815 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107695120 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 107695283 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 107695392 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107696299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107696580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107696814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107697615 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107697991 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 107698699 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107698957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107700157 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107700583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107700620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107700637 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107701088 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107701107 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 107701617 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107701627 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107702716 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 107702877 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 107703244 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 107703295 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 107703489 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 107703608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107703734 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 107703818 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 107704308 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107705297 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107705902 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107707319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107707861 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 107707920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107708117 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107708313 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107708320 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107708359 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 107708859 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 107708907 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 107708996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107709143 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 107709485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107709544 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107709582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107709681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107709722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107709843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107710489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107710621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107710687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107710829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107710900 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 107711234 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 107711255 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107711363 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107711377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107711431 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 107711506 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107711752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107711821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107711908 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 107711919 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 107711940 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 107712088 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 107712129 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 107712182 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 107712225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107712271 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107712272 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107712436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107712568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107712585 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 107712620 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107712628 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107712638 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 107712676 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 107712703 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 107712859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107712921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107712947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107712948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107713094 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107713113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107713162 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107713168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107713186 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107713355 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107713420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107713432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107713636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107713763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107713795 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107713897 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107713908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107714010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107714493 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 107714494 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107714522 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 107714823 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 107715084 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107715326 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 107715645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107715831 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107716228 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107716240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107716612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107717897 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107717936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107718607 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 107718740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107719822 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107720512 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107720946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107721291 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107721534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107721817 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 107723002 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 107723720 A T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 107723771 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 107726589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107726601 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107727053 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107727352 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107727624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107728238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107728855 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 107728884 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107729320 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 107729498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107730125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107730886 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107731198 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107731262 A C Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 107731367 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 107731722 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107731789 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107731838 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 107731887 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 107731888 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107731992 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107732192 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107732455 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107732705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107733002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107733342 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107733415 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 107733429 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 107733679 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107734916 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 107735079 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 107735351 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107735403 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107736285 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107736403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107736532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107736664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107736815 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107736881 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107736989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107737105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107737119 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107737235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107737438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107737623 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107738051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107738237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107738423 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 107738551 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 107738944 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 107740120 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107740154 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 107740636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107740829 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 107741609 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 107741845 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107741958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107741997 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107742284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107742561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107743231 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107743953 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107744028 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 107744321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107744391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107744905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107745141 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107745563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107745588 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 107745718 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107745993 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 107746376 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107746513 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 107746807 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 107747298 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 107747616 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 107747897 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 107748208 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 107748375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107748602 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 107749024 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 107749085 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 107749176 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 107749397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107749505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107749591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107750313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107750898 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 107751312 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107751428 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 107751534 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107751901 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107751959 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107752307 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 107752503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107752608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107752640 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 107753663 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 107753680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107753743 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107754099 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107754958 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 107755076 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 107756190 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 107756543 C G Y N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 107757405 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 107758373 T G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 107759346 A T Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 107760027 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107760275 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107760299 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 107760307 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 107760431 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107760460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107760700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107760771 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107760842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107760935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107761033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107761180 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 107761269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107761298 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 107761341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107761919 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107762436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107762534 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 107762572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107762638 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107762937 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107763089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107763199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107763219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107763468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107763876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107764325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107767007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107768992 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 107769056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107769290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107769736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107769988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107770225 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107770511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107770828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107771227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107772806 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107772975 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107773326 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107774234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107775349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107775545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107778177 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107778858 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107779178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107779282 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107780290 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107781769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107783665 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107784480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107784576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107785508 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 107785687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107785994 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 107790924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107790980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107792435 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107792452 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107797095 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 107797191 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107797405 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107798658 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107798885 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 107799306 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107800072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107800284 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107800833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107801668 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 107801775 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107804000 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 107804372 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 107804431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107804814 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107805007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107805120 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107805408 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 107805713 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107806684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107807772 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107808303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107808577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107809068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107809114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107810031 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107811351 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 107811384 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 107811851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107812554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107813492 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107813711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107814879 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 107814925 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107814988 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 107816657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107823613 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 107824060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107824695 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107825615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107826459 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107827945 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107830347 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107830606 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107832282 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 107834597 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107834946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107844644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107845095 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107846494 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107846727 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107848167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107848502 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107849576 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107849668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107850311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107851317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107851568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107852827 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107854330 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107856367 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107856891 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107856933 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 107858160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107858701 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107859469 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 107863463 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107863813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107865764 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 107868333 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107869480 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 107869515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107869781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107871326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107872881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107873658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107875492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107876563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107876904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107877325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107878361 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107879234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107880450 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107880538 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107881639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107881693 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107882892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107883363 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107886087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107890163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107890401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107891065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107891096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107891442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107891671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107892013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107893229 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 107894721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107895504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107896498 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 107897535 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 107897987 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 107898993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107900192 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107901925 G C Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 107902773 C A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 107903282 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 107903429 A C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 107903567 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 107903706 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 107905173 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 107905706 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 107905709 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 107906840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107907363 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107907388 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 107909477 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 107911381 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 107912882 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107913152 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 107913200 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 107915230 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107919076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107919111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107921942 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 107923737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107924010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107925769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107926274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107926732 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107927006 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107927691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107929122 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107930077 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107930520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107930669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107931753 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107936757 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 107936948 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107937008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107937014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107937199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107937924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107938962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107942257 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107944656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107944868 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 107944891 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107945575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107945840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107945853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107947183 A T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 2 107949149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107951107 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107951222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107953400 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107955301 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107956532 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107958248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107958704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107959132 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107965707 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 107967118 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107967139 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 107971818 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 107972032 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107972398 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 107978362 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 107978393 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 107978507 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 107981807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107985689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 107988982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 107998599 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 107998687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108003461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108003814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108006527 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108007724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108008194 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108009284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108010643 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 108011021 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 108012300 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 108013258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108013343 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 108013386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108013432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108013657 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 108013767 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 108013886 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108015362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108015908 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108015919 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108016857 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108017038 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108017173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108017222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108017255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 108017782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108018453 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 108018480 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108018627 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108018698 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108018805 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108018955 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 108019558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108020588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108020695 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108021215 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108021304 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108021871 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108021963 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108021965 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108022534 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108022767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108023089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108023970 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108024644 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108024938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108025015 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108025024 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108025087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108025544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108025745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108026241 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108026460 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 108026775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108026888 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108030442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108031923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108036256 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108038055 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108039138 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108040079 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 108041921 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 108041927 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 108041935 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 108043046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108046174 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 108046420 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108047698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108049209 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108050775 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108053199 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108053665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108053875 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108057339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108058461 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 108061645 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 108061885 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108063230 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108063381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108064031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108067866 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 108068483 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108068792 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108069139 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 108070883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108074297 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108074399 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 108080047 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108080310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108081603 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 108082102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108082291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108082470 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108083220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108083802 T A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 108085509 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 108085656 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108086425 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 108086450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108086866 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 108087376 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 108087591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108087676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108088597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108088650 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108088875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108089556 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108089979 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108090354 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108090680 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 108091615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108091935 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108093216 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108093418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108094863 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108095930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108096119 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108096463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108096510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108097174 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108098844 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 108103434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108104986 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108106229 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108106539 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108107454 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108108254 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108111620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108112811 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 108112849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108113109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108113395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108113584 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 108113635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108113768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108114364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108114608 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108116025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108116330 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108116692 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 108117227 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108117410 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 108117798 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 108117825 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108119577 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108120186 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108122896 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108122928 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108124000 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108126289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108129354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108130178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108130957 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108131229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108131921 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 108134671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108134762 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 108136212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108136231 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108137978 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108138692 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108141264 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108141666 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108141689 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108142034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108142331 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108142695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108142829 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108144268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108144837 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 108144938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108144962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108145054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108145968 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108147300 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108149597 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 108153660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108154122 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108155274 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108156109 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 108158595 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108158666 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 108159720 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 108160154 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108160594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108162614 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108163515 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 108163785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108163944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108164064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108166384 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 108174999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108175808 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 108178198 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108178305 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108178695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108178726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108179766 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108180441 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 108182844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108182969 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108183487 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108183739 A C N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 108183755 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 108184454 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108185407 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108186446 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108187007 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108187604 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108187637 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108187734 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108188018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108189140 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108190063 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108190258 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 108190407 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108190468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108191300 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108191989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108192755 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108194159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108194541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108195228 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108195583 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108196396 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 108198042 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 108198048 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 108199865 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 108200766 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 108203045 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 108204181 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 108204429 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108208108 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 108210000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108212327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108213733 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 108213831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108214103 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108214563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108215349 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108216766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108218372 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108218833 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 108220448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108220547 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108220733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108221560 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108221735 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108222365 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108224721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108225354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108226752 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108226768 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108227596 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108227623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108227802 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 108229234 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108229303 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108229500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108231038 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108231522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108231558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108231694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108231895 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 108232014 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 108232312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108232545 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 108233739 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 108234236 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108236660 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 108238380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108238655 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 108240443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108240600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108241475 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108242380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108243067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108244554 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108245526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108245665 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108246214 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108246348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108246641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108246972 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108248384 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 108248546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108248859 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108249589 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108250008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108251715 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108254057 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108254083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108256346 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108257445 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108257898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108258232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108259537 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108260454 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108261382 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 2 108261497 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108261708 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 108264364 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108264494 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108265373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108267394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108268430 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 108270538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108270587 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108271320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108272886 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 108273111 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108273900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108274956 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108275723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108276462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108276913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108277303 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 108277412 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108281341 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 108282271 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 108283196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108290723 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108292523 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 108293547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108295260 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108299926 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108303335 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108303748 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108303999 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 108309838 T C Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 108310344 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108310496 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 108310710 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108311415 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108313727 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108313742 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108314467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108314998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108316896 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108317625 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 108318039 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108318047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108318281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108321310 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108321694 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 108322876 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108324215 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108325236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108325525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108325568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108327605 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108329143 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108329688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108332435 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108332576 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 108336449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108337375 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108338239 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108340454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108341074 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108341932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108342062 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108342109 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108345141 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108348058 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 108348269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108348473 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108349528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108351148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108351618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108352857 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108354483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108355753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108355913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108356232 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108356386 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108357107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108358372 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108359483 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108359537 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 108360367 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108360700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108361142 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108361250 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108361860 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108362187 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108362539 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108364565 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108364616 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108366489 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108367450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108369453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108370737 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108371600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108371677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108372406 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 108373035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108374880 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108375342 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 108375645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108376729 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108378777 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 108379919 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108381519 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108384503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108384841 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108387917 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108388735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108388955 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108389541 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 108390706 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108390783 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 108391012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108391033 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108391399 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 108391478 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108391506 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108391971 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108399773 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108400082 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108400817 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108401779 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 108402476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108402674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108402830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108404410 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108404698 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108405676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108407287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108407346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108407728 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108410314 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108410558 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 108410656 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108411891 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108412906 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108417437 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 108418543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108418946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108420076 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108420589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108420952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108421537 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 108422004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108422665 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108422899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108424957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108429670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108429973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108430328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108432400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108432449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108433093 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108433411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108433964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108434211 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108434242 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108434910 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 108434915 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 108435080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108441097 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108442051 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108442480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108443897 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 108444119 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108444592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108444751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108446062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108446783 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108447335 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108447439 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108447874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108447996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108448367 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 108452514 A T Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 108454868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108456856 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108458653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108458981 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108459559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108460392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108462690 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108467282 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108467438 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108468881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108472278 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 108473595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108473831 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108474917 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108475558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108475797 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 108477496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108477631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108478591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108478838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108479375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108479642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108481952 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108484183 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108484292 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 108484381 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108486099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108486312 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108486806 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 108487122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108487628 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108487739 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108488267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108489331 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 108489334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108489845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108489881 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108490681 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 108492018 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108493112 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108494087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108494607 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108494676 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108494831 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 108495624 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108495703 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108496275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108496686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108496710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108497799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108497844 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108499499 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 108499562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108500805 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108500898 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108501532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108501870 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 108501971 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108502474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108502989 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108504394 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 108504827 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108504952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108505655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108505707 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 108505788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108506092 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 108506767 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 108508069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108508165 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 108509277 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108509438 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108509555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108510349 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108512752 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108513368 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108513792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108514127 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108515489 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 108515594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108516060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108516123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108516387 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108518141 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108518199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108519379 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 108521222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108522460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108524897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108525390 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108527694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108529370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108533910 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108534958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108535252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108536074 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108537600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108537922 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 108538125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108539907 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108540965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108541792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108542129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108542218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108543671 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 108544051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108546132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108546225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108547123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108547165 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108549569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108551284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108553374 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108554074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108554401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108556081 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 108557571 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108560594 C A N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 2 108563768 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108564207 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108564714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108565708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108565777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108566914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108568734 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108573804 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108574004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108574198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108577566 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 108577675 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108579855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108580090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108581235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108584821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108584862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108585117 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 108585318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108587695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108588507 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108589019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108589715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108589898 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108592341 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108593194 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108593914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108597729 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 108599996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108600574 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 108600583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108603951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108603994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108604065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108604141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108604422 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108604661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108604759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108605072 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108605125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108605666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108605710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108605755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108606503 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108606964 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 108606974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108607029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108607079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108607176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108607282 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108608111 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 108608676 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 108608793 G C Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 108608955 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 108609675 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 108609867 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 108610281 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 108611105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108611503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108611755 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 108613058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108613494 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 108613583 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108614514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108616097 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108616656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108616931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108617463 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 108618561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108618977 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108620719 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 108621653 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 108622746 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108623313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108623680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108626112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108628401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108631263 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108632634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108633187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108634408 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108635731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108636744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108636839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108637971 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108638795 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108638928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108639322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108640158 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 108640623 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 108642135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108642285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108643224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108645571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108647213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108649122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108649166 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108649453 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108650415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108650609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108654162 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 108655579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108656252 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108656515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108657561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108661299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108662971 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108663361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108664240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108666385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108666619 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 108668170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108669293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108670825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108670905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108670943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108672040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108672388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108672763 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 108673154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108673486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108673787 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108678331 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108679670 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 108679960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108681883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108682138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108682139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108684791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108685297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108687310 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 108689476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108690209 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108691616 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108696682 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108696825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108697699 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108698007 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108698561 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 108699653 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 108699655 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 108699681 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108699706 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108701179 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 108702927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108703312 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108704025 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108708501 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108709295 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108714192 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108717177 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108719004 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108719837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108722182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108722255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108723942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108725156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108725217 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108727714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108728115 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 108728993 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 108729935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108730441 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 108730656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108730868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108731459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108733050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108734071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108735004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108735800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108739129 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108740031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108741114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108741534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108742453 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108742515 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 108743093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108745317 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108745873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108746266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108746641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108749437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108749630 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108750908 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 108750949 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108753728 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108758264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108761039 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108763046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108764557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108765849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108766718 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108766772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108767453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108768160 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 2 108768988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108770976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108771025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108771046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108771064 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108771909 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108771939 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 108772069 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 108772185 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 108772242 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 108772274 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 108773063 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 108773325 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108773604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108773654 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108773689 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 108774037 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 108774138 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 108774496 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 108774821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108775090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108775166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108776211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108776281 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 108776925 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108777102 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 108777666 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 108778157 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 108778350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108778440 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 108778503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108778527 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 108778579 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 108778628 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 108778682 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 108778723 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 108778738 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 108778744 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 108779031 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 108779039 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 108779090 C A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 2 108780003 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 108780171 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 108780229 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 108780273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108780480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108780753 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 108780935 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 108780957 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 108780993 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 108781037 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 108781042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108781301 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108781614 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108781719 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 108781772 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 108782251 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 108783701 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 108783964 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108784406 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108784515 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 108784606 G A Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 2 108792484 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 108793163 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 108793186 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 108793366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108793410 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 2 108793536 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108793544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108793631 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108793659 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 108793734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108794844 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 2 108795122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108795391 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 108795471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108795707 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 108795803 T A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 108796099 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108796503 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 2 108797108 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108797370 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 108801239 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108801327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108801503 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 108801754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 108802285 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 108802606 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 108803095 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 108803283 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108803291 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 108803482 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108803676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108803876 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 108803890 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 108804741 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 108804786 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108805326 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 108805384 C G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 108805587 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 108805680 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 108805735 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108806647 G A Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 108806785 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108806880 A C Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 108806910 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 108807690 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 108807940 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 108808546 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 108808592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108808707 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 108809124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108809421 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 108809430 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 108809532 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 108809834 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108810175 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 108810218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108810441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108810703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108810813 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 108810948 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 108811331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108811752 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108814135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108814569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108815080 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108815257 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108819719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108820175 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108820286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108821564 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 108822047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108823551 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 108824628 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 108824980 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108825240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108825719 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108825761 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108828606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108830957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108833453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108836318 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108836461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108838954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108839225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108839538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108842926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108852515 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108853377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108854595 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 108854993 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108855943 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 108856796 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 108856990 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 108857000 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 108857038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108857049 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 108857067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108857828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108858085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108858174 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 108858277 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 108858618 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108859182 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 108859233 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 108859346 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108859870 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 108859950 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 108860120 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 108860200 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 108860241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108860293 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 108860335 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 108860337 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 108860373 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 108860375 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 108860426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108860596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108860723 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 108860939 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 108861211 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 108861394 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 108861401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108861471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108861664 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 108861830 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 108861835 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 108861866 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 108862059 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 108862060 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 108862199 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 108862396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108862425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108862573 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108862811 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108862912 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 108862962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108863064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108863458 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 108864281 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 108864557 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 108864572 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108864622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108865028 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108865828 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108866119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108866344 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 108866534 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 108866598 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108868610 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108868871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108869113 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108870003 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108870072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108870412 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108870465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108870638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108870770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108871445 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 108871486 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 108871572 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 108872099 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108872214 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 108872259 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 108872404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108872426 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 108872476 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 108872484 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 108872547 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108872562 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 108872604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108872851 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 108872921 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 108873162 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108873198 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 108873346 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 108873415 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 108873566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108873608 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 108873638 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 108873769 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 108873913 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 108874051 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 108874183 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 108874214 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108874239 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 108874395 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 108874445 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 108874748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108874965 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 108874997 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 108875321 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 108876510 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 108877207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108877598 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 108878474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108879310 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 108879973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108880062 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108882125 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 108882645 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 108883904 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 108885840 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108886066 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108888956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108889108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108889801 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 108895550 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 108895551 A T Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 108900880 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 108900891 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 108900972 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 108901866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108903705 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108905906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108906294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108906789 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 108907040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108908398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108908982 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 108909111 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 108909838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108910971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108911639 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108911640 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 108911675 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 108912111 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 108912649 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108917304 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108917575 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108918070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108922021 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 108923245 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108923375 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 108923932 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 108926832 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108927019 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108927499 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108927608 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108935030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108936545 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 108937247 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108944798 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 108947481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108948764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108950189 C A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 108952559 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 108955868 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 108956208 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 108960790 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 108962079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108965644 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 108965977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108967967 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 108968037 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108970418 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108970433 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108970807 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108970918 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108971467 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 108974630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108975794 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 108977265 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 108978896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108980750 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108981895 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 108984366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108985521 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 108987457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108988716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108995327 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 108996655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 108998664 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 108999505 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 109000816 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 109001040 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 109006452 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109010502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109012322 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 109016079 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109016522 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109017585 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109018242 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 109018758 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109019597 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109024508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109025261 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 109025579 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109026337 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 109031850 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109033477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109035616 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 109035962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109036038 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109039773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109039834 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109041822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109041951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109045201 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 109049081 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109049191 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109050096 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109051391 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109051868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109052326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109054860 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109054953 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 109056977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109059401 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109059988 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 109060774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109062134 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109063977 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109064011 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 109069203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109070309 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109070835 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109071730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109078935 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109079562 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109079604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109080191 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 109083909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109089504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109089944 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109089984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109091925 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 109092255 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 109093117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109096887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109102998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109106463 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109109297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109109339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109110031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109110703 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109111390 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109114745 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 109114982 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 109118247 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 109118555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109120590 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109122304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109126693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109127618 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 109129026 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 109129484 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 109129549 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 109130316 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109130574 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 109130808 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109131127 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 109131272 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 109131326 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 109131548 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 109131854 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109131878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109131937 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 109131997 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109132185 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 109132213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109132239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109132354 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109132710 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109132834 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 109132867 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109132874 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 109132956 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 109133108 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 109133220 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109133621 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109133683 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109133684 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109133854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109133867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109134114 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 109134147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109134240 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 109134267 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 109134277 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 109134309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109134348 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109134361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109134423 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 109134920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109134942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109135312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109135510 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109135527 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 109135571 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109135716 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 109135763 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109135801 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109136109 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 109136267 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109136308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109136309 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109136689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109136720 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109137116 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 109137324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109138001 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 109138205 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 109138448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109138748 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 109138900 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109138941 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 109139292 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 109139328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109139352 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 109139749 C G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 109139794 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109139824 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 109139960 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109140217 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 109140247 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 109140597 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109140609 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 109140995 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 109141062 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109141294 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109141607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109141723 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109142396 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109142927 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109143440 G C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 109143472 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109143708 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 109144236 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109144267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109144472 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 109144798 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 109145371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109145372 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109145384 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 109146242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109146243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109146529 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 109146567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109147147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109147698 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 109148067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109151230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109151831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109152307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109152653 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109153793 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109153944 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109156562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109158602 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109164430 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109171989 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 109172311 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109173671 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109175046 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 109175047 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 109176176 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109181839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109181943 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 109182202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109184382 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 109184383 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 109184836 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109188677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109190418 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109190484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109191234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109197804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109203132 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 109203761 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109203942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109205360 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109205806 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109206849 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 109213347 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109213722 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109217259 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 109218438 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109220664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109220862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109221416 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109221442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109222333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109222711 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109222848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109223063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109223394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109225398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109226210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109227634 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 109228572 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 109228905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109229299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109231042 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109231964 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109233279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109233750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109236341 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109236456 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109236638 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 109237327 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109238751 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109239002 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 109239370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109239549 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 109240068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109242260 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109244696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109245461 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109246006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109247239 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109249661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109250311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109251363 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109252464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109257796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109258660 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109260387 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 109260571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109260572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109261908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109262354 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109262915 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109263227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109268166 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 109270726 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109271951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109272060 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109273283 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109274624 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 109274912 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109275496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109275993 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 109276313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109276426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109277559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109278991 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109282263 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 109284081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109286035 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109287219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109287278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109287759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109288088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109288699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109292662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109294083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109294533 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109297974 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 109298236 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109299045 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 109308058 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 109308348 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 109311524 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109311999 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 109312049 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109314478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109319067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109322387 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 109322400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109323677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109324344 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 109324694 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109325035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109327798 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109327968 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109328193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109329603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109329742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109330577 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109330913 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 109335293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109335757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109337212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109342055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109345208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109346011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109347250 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 109347271 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 109347592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109349326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109350672 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 109350941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109351269 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 109352051 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 109352487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109353984 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109354232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109355674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109356402 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 109359135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109359949 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 109359959 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 109359981 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 109360012 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 109360076 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 109360383 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109360394 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109360395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109360465 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109360582 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109360593 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109360672 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109361171 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 109361176 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 109361731 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 109361843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109361849 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 109362189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109362521 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 109362737 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109363250 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 109363802 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 109363818 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 109363921 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 109363973 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 109364089 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 109364347 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 109364575 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109365260 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109365426 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 109365458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109366441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109366675 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109369872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109370176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109370575 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109371151 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109371539 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109374454 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109375806 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 109376395 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109376677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109378051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109378178 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109379334 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109381747 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109381877 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109381945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109383131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109383906 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 109384465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109384672 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 109384743 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 109384948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109385527 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109386042 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109386105 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 109386413 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109386425 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 109386488 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 109386508 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109386711 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 109386740 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 109386938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109386952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109387280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109387444 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109387489 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109387535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109387724 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109387756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109387765 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 109387850 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109387878 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109388188 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 109388303 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109388642 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 109388726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109388906 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 109389109 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109389312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109389614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109389733 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109390113 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109390399 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109390444 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109392651 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 109392652 A C N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 109395014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109396024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109397191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109400175 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 109400634 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 109400805 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 109402268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109403571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109404020 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109405024 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 109407052 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 109407351 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109410509 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109410761 C G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 109411376 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 109411610 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109412380 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 109413196 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109413318 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109415036 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 109416799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109416953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109417887 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109418822 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 109419196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109419279 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 109419340 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109419455 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109419471 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 109419476 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109419505 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 109419512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109419560 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109419624 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109419639 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109419710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109419732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109419743 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 109420015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109420566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109420971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109421254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109421788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109430542 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 109431591 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109431737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109433576 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109434778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109435599 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109436541 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109436568 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109436569 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 109436580 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 109437388 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109437804 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109438278 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109438992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109439705 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109444257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109447879 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109448274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109451129 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109453329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109455303 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109456156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109458124 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109462604 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109462958 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109464798 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109467600 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109479314 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 109480032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109480631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109481438 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109483217 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109483553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109485532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109485888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109488973 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109489198 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 109489345 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109490214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109490668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109490859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109491577 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109494652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109497699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109498305 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 109499359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109501508 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109504131 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 109504785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109505711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109506550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109507463 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 109509439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109510413 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 109519947 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109519962 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109521656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109522679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109522788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109523080 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 109525682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109525796 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109526232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109526746 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 109531191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109533530 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109534214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109535585 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109537443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109540551 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109540982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109541029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109541609 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 109543297 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 109543457 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109543750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109544315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109544923 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109544927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109545110 T G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 109545209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109545355 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109545564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109546718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109548735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109548981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109550616 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 109550755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109551159 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 109551208 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 109551905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109552033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109552340 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109552716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109552797 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 2 109553350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109553401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109553471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109553805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109553920 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109553944 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 109554180 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109554332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109554381 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 109554506 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 109554649 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109554684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109555219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109555244 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109555344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109555988 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 109556062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109556092 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109556290 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109556332 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109556359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109556374 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109556536 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109556547 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 109556637 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 109556678 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109556987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109557217 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 109557395 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109558006 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 109558261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109558500 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 109559016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109559022 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 109559157 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 109559621 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109559907 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 109559981 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109560020 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109560171 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109560255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109560369 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109560470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109560572 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109560746 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 109561342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109563008 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 109564012 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109566448 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109566690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109568174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109569793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109570649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109571414 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109571436 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 109571476 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 109571649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109571822 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109571864 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 109571865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109571913 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109571926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109571942 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 109572283 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 109572348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109572410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109572657 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109572815 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 109573014 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109575383 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 109577160 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 109580192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109580310 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 109580328 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 109582433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109582485 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 109582806 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 109582924 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109583041 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109585453 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109586137 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 109586304 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109586800 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 109586801 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109587056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109587157 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 109587269 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 109587285 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109587314 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 109587349 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 109587408 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 109587451 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109587481 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 109587498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109589302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109590202 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 2 109590958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109591717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109591778 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109591881 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109593484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109593673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109594062 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109594063 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109594540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109595078 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 109595157 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 109595529 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 109595869 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 109596072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109596407 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109596802 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 109598363 G C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 109600589 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 109600881 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 109600945 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 109601035 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 109601481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109601941 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 109602405 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 109602569 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109603011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109603193 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 109603539 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 109603608 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 109604027 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 109604154 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109604159 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 109604166 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 109604542 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 109604559 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109604919 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 109604935 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 109605751 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 109605812 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 109605851 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 109605944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109607517 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109607562 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 109607882 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 109608088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109608480 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 109608642 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 109609360 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109609371 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 109609400 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 109609901 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 109610251 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 109610448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109610637 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 109610653 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 109611200 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 109611593 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 109611707 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 109612235 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 109612455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109612635 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 109612641 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 109612809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109613127 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109613396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109613626 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109613629 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109613760 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109613904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109614521 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 109614773 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 109614962 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 109615362 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 109615746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109615907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109616217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109616229 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 109616365 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 109616611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109616872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109616877 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109616932 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109616944 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109617072 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 109617129 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 109617334 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 109617337 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 109617410 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 109617629 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 109617985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109618060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109618472 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 109618500 T A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 109619023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109619116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109619226 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 109619227 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 109619258 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 109619393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109619438 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109619465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109619475 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109620005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109620170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109620960 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109621069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109621182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109621260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109621336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109621658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109621666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109621670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109621693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109621801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109621842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109622379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109622439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109622622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109622853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109622966 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109623211 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 109623212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109623821 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109623981 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 109624123 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109624839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109625254 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 109625881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109627408 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 109627980 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109629372 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 109629664 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 109629923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109632597 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109634411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109635040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109638097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109639629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109642870 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109642962 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109643133 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109643561 A G Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 109647140 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109647272 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 109647418 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109650076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109650808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109652414 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 109652464 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109652824 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 109652910 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 109653313 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109653849 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109653920 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 109654323 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 109654408 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 109654737 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109654759 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109655048 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109655225 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109655508 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109655566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109655628 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109655681 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109655710 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 109655737 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 109655820 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 109655837 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 109655885 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 109655995 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 109655999 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 109656171 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 109656440 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109656660 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 109656989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109657002 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 109657020 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 109657035 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 109657054 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 109657064 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 109658485 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109659012 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109659139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109659982 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 109663430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109668309 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109669818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109670958 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109672139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109672465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109675131 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109675147 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 109675526 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109675734 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109675977 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 109681798 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109685198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109686873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109688052 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109688495 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109694014 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 109694211 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109695731 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 109697046 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 109699351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109700171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109702296 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109702484 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 109702485 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 109702496 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 109702674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109703618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109705595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109706936 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109707233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109711751 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109712598 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109715384 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109715708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109716898 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109718540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109719047 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109720707 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 109720797 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 109720986 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 109722575 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109723035 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109725971 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 109727220 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109731059 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109731937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109733129 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 109733315 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109733599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109737019 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109739493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109741755 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 109742710 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109743730 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109745336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109745421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109745613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109745804 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 109745841 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 109746969 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 109747933 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109748216 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 109748737 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 109749029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109749128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109749299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109749312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109749344 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109749934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109750279 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109750761 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109750828 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 109751333 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 109751590 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 109751731 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 109751999 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 109752113 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109752353 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 109752629 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 109752893 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109753201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109754058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109754774 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109755044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109755247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109756271 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109756482 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109756969 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 109757345 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109757357 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 109757470 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 109757478 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 109757628 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109759345 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 109759458 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109759522 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109759606 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109759670 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109759671 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109759720 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109759789 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109759845 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109759892 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109759948 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109759965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109760380 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109761045 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 109764254 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109765098 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109765762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109766688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109768226 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109770262 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 109770666 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 109770804 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 109770813 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 109771007 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 109771112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109771194 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109772590 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 109772606 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109775068 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 109776681 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109778386 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 109778520 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109779208 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 109780185 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109780853 T A N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 109780928 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 109781056 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 109782781 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 109783642 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 109783751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109783937 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109784129 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109784621 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109784774 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 109785080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109785142 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 109785658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109786561 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109786734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109787170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109787921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109788712 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 109789225 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 109793297 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109793315 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109793689 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109793817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109794441 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 109794465 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 109794575 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 109794756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109795457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109795542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109795722 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 109796134 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109796354 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109796365 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109796723 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109796783 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109796800 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 109796832 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 109796888 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 109797043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109797103 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 109797379 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 109797546 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 109797837 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 109797859 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 109798042 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 109798044 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 109798089 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 109798250 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 109798293 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 109798503 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 109798693 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 109799211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109799407 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109800995 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109803065 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 109803321 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 109803874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109804392 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109804493 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109804621 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109805948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109806194 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109806344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109806371 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109808938 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 109809273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109810086 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109810479 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 109813896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109813990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109814776 T G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 109814874 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109815369 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109815629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109815960 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109816170 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109816936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109817112 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 109817304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109817339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109817526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109819069 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109819399 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 109819513 G C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 109819868 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109822019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109822407 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 109823399 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109824929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109825081 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109827089 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109828733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109828756 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 109828762 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 109829997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109830076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109830295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109830798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109831951 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109832079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109832869 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 2 109832921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109837100 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 109837333 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109838692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109839617 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 109839745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109840022 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 109841544 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 109841619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109842000 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109842590 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109842780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109843928 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 109843987 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109844169 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109844814 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109845478 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109846997 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109847718 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109847768 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109847841 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109848069 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 109848234 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109852303 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109852424 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 109853225 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 109855753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109856268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109856590 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109858117 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109859078 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109859092 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109859390 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109860138 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109860218 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 109860272 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109860294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109860607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109862054 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 109862091 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 109862435 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109863448 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109865153 C A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 109865863 G T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 109867142 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109867195 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 109867286 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 109867404 A G N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 109867480 C G Y N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 109869197 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 109869224 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 109869394 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109870099 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109870170 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109870394 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109870462 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109870606 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 109871518 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 109871654 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109872058 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 109872317 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109872844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109872939 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109872942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109873497 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 109873969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109874200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109874372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109874547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109874783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109875033 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109875812 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 109877118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109877291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109877840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109878072 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109878366 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109879610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109879756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109880054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109880115 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109880678 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109880694 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109881968 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109882071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109882286 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109884791 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 109885747 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109885913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109886752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109887154 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109887459 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 109887541 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 109887640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109887658 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109887719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109887843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109888277 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 109888593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109888747 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109888875 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109888922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109889122 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109889277 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 109889354 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 109889412 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 109889487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109889511 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 109889606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109889650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109889706 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 109889913 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109890051 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109890170 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109890199 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 109891433 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 109891442 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 109891638 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 109892539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109892570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109893394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109894131 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109894525 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 109895149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109895331 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109895647 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 109896041 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 109896175 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 109896249 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109896496 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 109896787 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109896833 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 109897065 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 109897201 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109897245 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 109897323 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 109897374 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109897402 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 109897431 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 109897542 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109897642 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109897745 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 109897918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109898157 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109898164 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109898392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109898415 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109898429 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109898741 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 109899018 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 109899041 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109899083 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 109899141 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 109899288 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109899316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109899597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109899644 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109899821 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109899853 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109899869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109899908 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 109900113 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109900153 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109900189 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 109900539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109900722 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109900757 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109900797 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109900912 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 109900925 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109900972 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109901011 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 109901023 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109901146 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109901266 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109901295 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109901313 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109901357 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109901444 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109901465 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109901515 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 109901799 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109901826 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109901881 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109901899 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109901945 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 109901996 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 109902015 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109902085 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 109902297 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 109902328 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 109902578 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 109902753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109902756 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109902786 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109902817 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109902882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109902892 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109902934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109903012 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 109903023 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109903055 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109903115 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109903250 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109903459 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109903563 C G Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 109903635 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 109903718 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 109903723 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 109903729 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 109903761 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 109903922 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109903935 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109903943 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109903995 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109904019 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 109904064 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109904095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109904200 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109904211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109904267 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109904309 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109904428 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 109904473 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109904477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109904511 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 109904565 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 109904659 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109904817 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109904840 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 109904853 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 109904863 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 109904953 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109905046 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109905091 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109905117 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109905129 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 109905152 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 109905320 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109905361 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 109905372 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 109905411 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 109905447 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 109905652 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 109905687 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 109905719 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 109905786 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 109905859 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 109905904 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 109906021 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 109906038 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 109906174 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 109906181 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 109906198 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 109906439 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 109906539 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109906581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109906609 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109906612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109906776 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109907105 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 109907178 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109907319 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109907357 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109907411 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109907426 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109907471 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109907720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109907777 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109907801 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109908782 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109909209 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109909294 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 109909455 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109909528 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109909603 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 109909845 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 109909942 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 109910058 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109910247 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 109910291 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 109910548 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 109910744 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 109911616 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 109911743 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 109911799 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 109911964 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109912061 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109912219 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109912488 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109912646 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 109912751 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109912820 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 109913186 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109913353 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109913364 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109913730 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 109913742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109913879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109913931 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 109915093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109915503 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 109915589 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 109915616 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109915653 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 109915678 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 109915740 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 109916106 C A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 109916323 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109916474 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 109916506 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109916535 G C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 109916548 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 109916551 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 109916625 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 109916682 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 109916696 C A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 109916804 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 109916827 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 109916852 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 109917688 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109917752 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109918022 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 109918024 T G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 109918094 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 109918249 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 109918670 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 109918717 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 109918774 A C Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 109918794 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109918932 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 109918992 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 109919022 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 109919273 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 109919284 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 109919362 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 109919427 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109919790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109919814 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109919911 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 109920098 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 109920197 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 109920377 G T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 109920442 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 109920469 C G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 109920528 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109920553 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109920557 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109920702 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 109920711 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 109920793 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109920798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109920825 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109920920 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109921094 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 109921110 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 109921157 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 109921683 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109921715 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 109921735 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 109921765 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 109921829 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 109921895 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109921964 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109921974 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109921997 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109922104 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 109922235 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 109922265 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109922344 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109922393 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 109922440 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109922443 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109922455 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109922478 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109922524 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109922581 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109922625 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 109922658 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 109922707 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 109922771 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 109922881 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109922932 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109922963 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109922985 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 109923010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109923075 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109923106 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109923254 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109923330 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 109923465 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109923469 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109923534 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 109923552 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 109923563 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 109923585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109923601 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 109923610 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109923728 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 109923759 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109923779 T G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 109923788 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 109923813 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 109923819 G C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109923834 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 109923853 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 109923960 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 109923975 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109923997 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 109924014 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 109925328 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 109925360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109925533 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 109926315 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109926427 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109926810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109927427 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 109928538 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 109930160 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 109930168 C G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 109930304 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 109930327 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109930450 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 109930722 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109933303 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109933675 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109933816 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 109934037 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 109934062 C G Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 109934414 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 109934637 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 109935863 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 109935889 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109936234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109936440 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109936652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109938295 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109938944 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109939302 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109940054 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 109940857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109941532 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 109941794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109942078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109942360 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109944087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109951235 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109951892 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109951966 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 109951978 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109952710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109953523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109955328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109955909 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109955930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109956024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109956083 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109956305 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 109956376 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109969239 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109970016 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 109970313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109970417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109971821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109973565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109975743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109977524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109978493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109979685 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 109985236 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 109985952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109986167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109986307 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 109987761 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109990974 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 109991733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109991811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 109991824 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 109991884 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 109991891 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 109992091 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 109992760 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 109992943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109993644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109995163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109995361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 109995816 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 109996964 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 109997118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110003690 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110004215 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110004823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110004923 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 110007447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110008093 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110008285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110008458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110008825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110009077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110010266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110011075 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110011502 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110012103 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110013702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110014060 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 110015492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110015946 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110016063 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110016826 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110017278 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 110017365 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110017387 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110017550 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110017551 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 110017570 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110017753 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110017895 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110018294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110018296 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110018619 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 110018730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110018922 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110018963 T G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 110019045 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110019063 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110019430 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110019433 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110019529 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110019553 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110019602 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110019638 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110019806 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110019811 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110020010 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 110020093 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110020229 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110020428 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110020954 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110021012 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110021437 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110024067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110024435 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110024639 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110025745 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110026104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110026197 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 110027313 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110027506 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110027737 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110028412 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110028637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110030949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110031320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110031979 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110032479 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110032707 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110033074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110033500 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110034455 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110034596 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110034680 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110034861 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110034878 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110035114 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110035165 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110035192 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110035229 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 110035274 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110035544 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 110035566 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110035644 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110035652 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110035929 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110035930 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110036743 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 110036795 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 110036849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110036942 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110036983 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110037216 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110037612 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 110037705 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110037766 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110037768 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110041157 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110041959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110042109 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110042347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110043232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110043497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110044374 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110044384 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 110044442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110044451 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110044455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110044571 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110044592 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110044692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110045683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110045794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110045857 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110045906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110045910 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110046364 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 110046496 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110047704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110047798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110047887 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110048171 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110048197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110049369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110049860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110049886 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110050467 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110051040 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110051114 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 110051185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110051287 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110051297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110051913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110052072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110052508 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110054262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110054957 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110054996 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110055094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110055445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110055893 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110055911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110056232 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110056337 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110056562 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110056635 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110056677 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110056743 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110056854 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110056876 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110056909 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110056957 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110057048 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110057736 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 110058112 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110058237 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 110058287 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110058411 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110058429 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110060199 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 110060700 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110061264 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110061319 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110061526 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110061615 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110061785 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110061793 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110061844 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 110061862 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110061890 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 110061927 T G Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 110062042 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 110062050 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 110062132 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110062395 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 110062430 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110062526 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110062539 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110062574 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 110062586 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110062613 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110062617 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110062667 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 110062715 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110062879 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110063033 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 110064452 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 110064807 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110064831 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110064884 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110064921 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110065213 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110065251 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 110065316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110065627 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110065660 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110065782 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110065847 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110065980 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110066057 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110066218 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 110066223 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110066250 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110066471 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110066516 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110066537 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110066578 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110066615 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110066860 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110067058 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110067472 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110067782 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110067806 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110067968 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110068146 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110070092 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110070740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110070916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110070930 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 110071573 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110072590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110073659 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110073853 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110074856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110075140 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110075383 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110075448 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110076222 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110077300 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110077333 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110088026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110090514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110090709 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110090751 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110091417 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110092210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110095427 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110095447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110095947 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 110096947 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110098088 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110098228 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110098243 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110098642 T C Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 110099732 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110099889 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110100092 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 110100131 T G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 110100262 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 110100435 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110100728 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110101335 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110102461 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110102710 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110102738 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110103470 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 110103810 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110103822 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110103860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110104622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110104760 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110105292 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110105332 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110105967 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110105981 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110106586 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110106907 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110107633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110107879 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110110207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110112545 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110114621 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110114700 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110115509 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110115910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110116028 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110116029 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110116044 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110116160 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110116315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110116624 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110117135 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110117150 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110117174 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110117249 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110117339 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110117478 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110117711 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110117804 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110117844 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110117951 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110117960 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110117964 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110117984 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110118017 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110118029 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110118049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110118076 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110118133 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110118215 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110118246 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110119128 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110119464 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110119545 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 110119669 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110119797 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110119840 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110119901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110120024 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110120025 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110120210 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110120333 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110120406 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110121252 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110121382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110121422 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110122031 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110122245 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110122353 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110122501 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110122824 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110123014 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110123089 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110123208 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110123360 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110123477 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110123908 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110123920 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110124327 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110125438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110125726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110125941 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110127052 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110127096 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110128155 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110128255 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110128301 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110128371 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110128470 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110128521 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110128604 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110128745 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110129478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110129591 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110129928 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110130051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110130063 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110130279 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110130280 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110130304 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110130897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110131026 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110131165 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110131221 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110131378 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110131626 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110131661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110131758 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110131891 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110132159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110132425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110132973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110133568 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110133745 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110133932 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110134359 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110134872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110135007 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110135029 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110135521 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110135622 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110135833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110136014 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 110136079 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110136579 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 110136937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110137045 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110137056 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110137158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110137194 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110138191 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110138221 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110138233 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110138236 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110138391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110138402 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110138456 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110138540 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110138598 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110138674 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110138681 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110138697 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110138710 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110138744 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110138788 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110138798 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110138871 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110138932 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110139044 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110139062 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110139176 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110139253 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110139277 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110139581 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110139589 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110139642 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110139707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110139708 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110139802 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110139810 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110139818 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 110139842 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110139843 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110139867 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110140104 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110140121 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110140187 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 110140191 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110140243 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 110140261 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110140323 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110140786 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110141327 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 110141406 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110141513 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110141595 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110141627 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110141724 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110141726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110141735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110142431 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110142488 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110142590 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110142630 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110142667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110143091 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110143256 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 110143870 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110144358 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110145038 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110145425 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 110145562 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 110145744 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110145840 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110145910 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110145949 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110145973 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 110146028 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110146038 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110146040 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110146065 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110146127 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110146242 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110146293 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 110146338 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110146518 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110146570 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110146745 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110147028 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110147137 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 110147173 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110147312 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110147332 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 110147346 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110147437 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110147447 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 110147464 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 110147513 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 110147606 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 110147941 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110148001 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110148043 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110148055 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110148070 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 110148106 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110148166 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110148187 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110148219 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110148338 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110148380 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110148403 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110148419 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110148518 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110148549 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110148585 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110148781 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110148990 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 110149018 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 110149085 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 110149106 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110149177 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110149242 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110149323 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 110150076 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 110150192 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110150236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110150370 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110150588 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110150591 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110150741 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110150770 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 110150814 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 110150862 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110150940 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110150949 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110150981 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110150997 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 110151041 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110151044 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110151181 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110151246 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110151259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110151278 C G Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 110151467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110151524 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 110151542 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110151693 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 110151801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110151839 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110151843 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 110152041 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 110152063 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110152168 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 110152237 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 110152347 C A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 110152395 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 110152496 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110152535 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110152580 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110152708 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 110152734 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110152752 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 110152806 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 110152832 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 110152880 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 110152930 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 110153188 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110153222 G C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 110153287 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 110153650 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110153764 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110153847 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 110154071 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 110154095 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110154193 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110154223 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110154269 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110154281 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110154525 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110154735 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110155095 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110155146 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110155155 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110155230 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110155355 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110155530 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110155696 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110157007 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 110157064 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110157174 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110157193 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110157215 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 110157228 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110157249 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 110157278 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110157296 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 110157342 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 110157368 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110157454 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110157488 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110157936 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 110158180 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 110158334 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110158382 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 110158425 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 110158462 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 110158548 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 2 110158586 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 110158618 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 110158683 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110158759 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 110158911 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 110158978 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 110159125 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110159173 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110159191 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110159285 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 110159339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110159351 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110159551 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110159589 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110159590 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110159639 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110159867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110159902 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 110160318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110160338 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110160625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110161050 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110162068 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110162258 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110162382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110162791 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110163354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110164369 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110165541 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110166304 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 110166770 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110166788 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110167564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110167955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110168182 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110170370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110170371 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110171306 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110171726 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110172007 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110172947 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 110173055 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110173456 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110173707 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110174036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110174068 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110174102 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110174557 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110174692 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110174768 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110174895 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110175003 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 110175111 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110175113 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110175683 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110176491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110177893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110178242 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110178798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110178812 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110179183 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110179751 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110179849 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110187361 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110187414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110187602 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 110189878 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110190061 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110190069 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110190088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110190958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110191447 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110191592 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110191745 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110191932 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110191984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110192007 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110192046 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110192145 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110192349 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110192381 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110192408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110192468 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110192473 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110192531 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110192544 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110192550 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 110192612 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110192616 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110192673 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110192708 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110192716 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110192760 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110192769 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110192789 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110192808 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110192824 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110192991 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110193388 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110193574 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110193882 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110194028 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110194215 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110194261 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110194302 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110194389 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110194404 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110194485 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110194516 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110194529 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110194605 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110194685 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110194700 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110194730 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 110194858 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 110194861 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 110195013 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 110195060 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 110195176 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 110195321 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110195415 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110195427 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110195571 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110195753 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110195755 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110195877 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110195878 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110196010 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110196029 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110196080 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 110196316 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110196326 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110196410 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110196419 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110196458 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110196501 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110196577 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110196582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110196622 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110196731 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110196810 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110196834 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110196847 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110196911 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110196950 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110196979 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110197038 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110197062 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110197141 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110197283 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110197767 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 110200256 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110201042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110201572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110202216 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110202278 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 110203514 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 110204299 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110204855 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110206061 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110206612 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110206657 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 110206759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110207356 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110207799 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110209772 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 110209893 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110210664 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110211944 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110211998 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110212165 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110212302 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110213370 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110215081 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110215356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110215620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110216799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110217549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110218309 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110219012 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110219068 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110220297 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110220530 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110220788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110221232 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110221478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110222544 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110223517 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 110223924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110224506 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110226631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110226745 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110227448 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110227696 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110227700 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110227746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110228192 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110228325 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110228327 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110228909 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110229064 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110229580 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110230385 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110231318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110231496 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110231985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110232046 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110232301 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110232331 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110232769 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110233321 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110233530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110233750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110234148 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110234187 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110234408 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110234552 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110235145 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110236128 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110236169 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110236224 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110236297 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110236686 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110236925 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 110237664 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110237768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110237921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110238278 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110238344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110238687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110238904 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110239708 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110240064 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110240099 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110240256 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110240269 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110240270 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 110240406 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110240495 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110240797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110240830 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110240974 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110241167 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110241357 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110241377 T A N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 110241412 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 110241639 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110241656 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110241812 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110242440 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110242491 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110242812 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110242853 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110242874 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110242875 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110242910 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 110242921 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110242990 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110243045 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110243049 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110243068 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110243216 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110243417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110243571 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110243597 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110243606 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110243613 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110243768 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110243834 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110243895 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110243898 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110244057 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110244065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110244110 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110244164 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110244285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110244771 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 110245314 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110246654 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110246812 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110246910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110247140 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110247244 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 110247326 T A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110247433 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110247502 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110247762 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110247982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110248415 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110249487 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110249657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110250191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110250194 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110250366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110250564 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110250673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110250793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110251548 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110251579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110252029 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110252264 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110252727 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110252962 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110253165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110253459 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110253570 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110253595 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110253758 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 110254239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110254277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110254401 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110254669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110254772 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110255002 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 110257086 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 110257218 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 110257349 T C N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 2 110257383 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 110257401 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 110257984 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 110259493 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110259503 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110259708 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110259784 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110260276 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110260492 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110260678 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110260688 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110260735 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110260824 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110261053 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110261078 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110261096 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110261225 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110261269 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110261296 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110261308 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110261331 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110261349 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110261464 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110261531 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110261607 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110261621 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110261694 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110261784 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110261799 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110261846 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110261847 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110261865 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110261912 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110261926 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110262239 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110262324 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110262353 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110262384 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110262448 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110262480 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110262505 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110262543 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110262776 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110263064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110263135 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110263233 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110263235 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110263343 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110263541 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110263601 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110263609 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110263766 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110263812 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110263935 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110264035 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110264374 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 110264652 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110265316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110265817 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110266063 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110266626 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110266714 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110267141 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110267314 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110267779 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110267830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110276571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110277579 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110277966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110279042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110279409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110281009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110284178 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110284454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110284732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110287491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110288331 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110289701 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110289742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110291233 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110291465 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110291531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110292356 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110292396 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110292708 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 110292720 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 110292904 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110292971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110292994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110293087 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110293319 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110293542 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 110293821 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110293892 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110294071 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110294081 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110294206 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 110294276 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 110294327 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 110294433 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 110295005 T G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 110295121 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110295422 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110295484 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 110295517 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110296194 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110296222 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110296240 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110296739 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110296821 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110296924 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110296931 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110297002 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110297129 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110297176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110297382 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110297437 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110297904 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110297981 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110298037 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110298377 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110298448 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110298600 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110298715 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110298777 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110298963 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110298977 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110298986 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110299106 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110299334 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110299425 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110299604 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110299676 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 110301229 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110301295 A T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 110301440 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110301519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110301665 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110302080 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110302122 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 110307854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110308337 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110308372 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110308459 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110308629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110308653 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110308737 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110308823 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110309503 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110310037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110310236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110310296 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110310340 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110310376 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110310612 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110310668 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110310879 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110310897 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110310945 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110311200 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110311798 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110312278 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110312941 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 110313088 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110313107 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110313135 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110313178 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110313196 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110313315 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110313347 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110313373 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110313495 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 110313775 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110313844 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110313956 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110313963 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110314158 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 110314217 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110314365 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110314556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110314673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110315137 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110316139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110317051 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110317153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110318290 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110318501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110321162 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 110323703 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110323713 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110324613 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 110326300 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110327575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110327646 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110327679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110327765 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110327994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110328056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110328203 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110328222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110328888 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110328926 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110328939 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110329073 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110329340 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110329676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110330204 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110330758 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110331195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110331575 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110331633 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110331888 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110331953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110332403 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110332625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110332873 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110333066 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 110333573 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110333703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110333928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110333983 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110335480 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110335849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110336666 A G Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 110337255 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 110337795 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110338531 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110339012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110339221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110339323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110339573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110339731 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110340048 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110340457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110340741 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110341189 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110341190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110341227 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 110342148 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110342381 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110342518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110342731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110343558 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110343815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110344408 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110344641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110344742 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 110346011 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110346341 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110347725 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110347911 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110348659 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110348749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110348827 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110349002 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110349325 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110349330 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110349353 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110349420 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110349451 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110349489 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110349658 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110350140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110351756 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110351758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110351815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110351857 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110353189 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110353203 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110353579 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110354102 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110354958 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110355503 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110355595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110355867 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110356137 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110356294 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110356351 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110356405 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110356412 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110356464 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110356642 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110356679 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110357614 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110357680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110358088 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110358190 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110358317 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110358913 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110359220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110359242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110359907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110361226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110362668 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110362980 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110363011 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110364503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110365597 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110366920 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110367228 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110368151 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110368213 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110369011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110369182 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110369222 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110369514 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110369716 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110369919 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110369949 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110371199 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 110371343 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110371502 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110374420 C A Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.272727272727273 0 0.727272727272727 6 16 3 0 8 2 110374460 G T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.230769230769231 20 6 10 0 3 2 110374988 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110376315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110376462 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110376503 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110377054 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110377336 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110378052 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110378949 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 110381433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110381435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110381477 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110382362 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110383037 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110383112 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110383199 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110383390 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110383532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110383758 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110383902 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110383944 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 110383975 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 2 110384328 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110384361 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110384434 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110384505 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 110385533 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 110392396 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 110392652 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110392677 A T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 110394241 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 110394270 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 110394680 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 110394686 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110394887 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110394968 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110395354 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110395575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110395666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110395736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110395737 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110396087 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110396829 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110396952 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110397003 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110397018 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110397084 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110397336 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110397520 C G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 110397720 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 110398104 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 110398574 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110398866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110399241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110399280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110399331 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110399385 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110399494 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110399501 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110399569 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110399584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110399669 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110399812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110399884 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110400071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110400130 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110400171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110400281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110400360 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110400388 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110400406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110400424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110400486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110400683 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110400701 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110400708 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110400909 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 110401173 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110401392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110401428 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110401552 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110401628 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110401729 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110401743 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110401801 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110402034 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110402122 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110402356 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110402357 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110402526 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110402627 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110402714 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110402746 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110402751 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110402775 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110402783 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110403004 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110403306 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110403408 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110403535 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110403554 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110403814 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110403866 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110404307 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110404561 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110404698 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110404756 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110405841 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110405947 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110406014 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110406142 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110406182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110406819 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110406950 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110407444 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110407544 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110407580 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110407662 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110407742 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110407754 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110407775 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110408015 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110408126 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110408150 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110408231 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110408483 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 110408650 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 110409056 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 110409213 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 110415265 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 110415313 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 110415315 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 110415361 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 110415415 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110415432 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 110415639 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 110416717 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 110418349 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 110423380 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 110424371 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110424400 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110424423 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 110424480 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110424508 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110424520 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110424538 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110424589 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 110424635 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110424658 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110424703 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 110424720 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110424766 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110424839 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110424849 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110424911 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110424986 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110425054 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110425201 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110425220 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110425269 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110425334 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110425394 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110425515 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110425783 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110425834 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110425845 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110426010 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110426115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110426175 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110426194 G T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 110426405 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110426438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110426458 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110426544 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110426844 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110426947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110427084 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110427202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110427215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110427304 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110427345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110427433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110427653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110427688 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110427870 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110427901 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110427934 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110427951 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110428017 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110428297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110428330 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110428523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110428551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110429397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110430505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110430782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110432366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110433145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110433797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110434030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110434163 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110435695 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110435752 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110436060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110436280 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110438686 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110438786 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110439051 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110439228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110439326 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110439331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110440422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110440452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110440772 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110442765 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110442967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110442984 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110443110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110443148 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110443229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110443243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110444152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110444581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110444763 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110445489 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110445553 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110445750 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110446962 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110447087 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110447464 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110447582 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110448253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110448502 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110448737 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110449103 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 110449116 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110449243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110449692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110449749 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110449865 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110449882 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110449941 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110449942 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110449996 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110450029 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 110450187 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110450402 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 110450546 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110450650 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 110451097 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 110451103 C T Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 110451381 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110451420 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110451447 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110451565 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110451622 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 110451637 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 110451840 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110451860 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110451984 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110452037 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110452050 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110452086 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110452164 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110452178 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110452228 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110452297 G T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110452304 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110452308 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110452468 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110452529 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110452683 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110452781 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110452817 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110452826 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110452844 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110452850 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110452973 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110453107 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110453168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110453216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110453283 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110453342 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110453365 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110453369 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110453425 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110453478 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110453869 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110453916 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110453922 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110454370 A G Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 2 110454374 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 2 110454404 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110454728 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110454794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110454860 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110454861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110454886 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110454918 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110454974 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110455217 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110455249 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110455299 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110455376 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110455546 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110455564 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110455692 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110455743 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110455751 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110455790 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110455813 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110455903 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110455972 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110455991 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110456000 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110456085 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110456127 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110456137 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110456494 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110456506 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110456518 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110456537 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 110456569 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110456665 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110456742 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110456801 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110456905 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110456989 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 110457119 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110457350 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110457351 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110457390 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110457691 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110457856 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110457888 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110458248 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110458251 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110458306 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110458396 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110458432 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110458495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110458674 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110458701 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110459198 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110459395 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110459413 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110459759 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110459860 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110460298 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110460482 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 110460488 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110460554 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110460683 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110460684 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110460745 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110460757 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110460818 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110460855 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110460897 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110460898 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110460928 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 110461079 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 110461229 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110461265 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 110461267 A T Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 110461439 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 110461466 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110461496 A G Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 110461528 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110461561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110461658 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110461811 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 110461827 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 110461970 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110461974 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110462082 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 110462088 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110462102 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 110462109 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 110462134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110462167 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110462206 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110462339 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110462351 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 110462379 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 110462438 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110462490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110462628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110462638 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110462686 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110462754 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110462759 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 110462785 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110462809 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110462837 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110462881 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110462908 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 110462936 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110463095 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 110463103 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 110463106 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 110463203 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 110463246 T A N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 110463297 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 110463343 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 110463378 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 110463593 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 110463620 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110463636 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110463664 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110463960 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110463969 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110463997 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110464152 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110464172 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110464427 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110464515 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110464641 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110464749 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110464770 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110464774 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110464936 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110464949 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110464983 T G Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 110465054 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110465145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110465266 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110465327 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110465334 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110465391 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110465539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110465567 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110465708 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110466169 C T Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 110466248 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 110466257 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110466270 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110466271 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110466283 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110466311 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110466460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110466495 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110466568 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 110466571 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110466604 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110466674 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110466676 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110466871 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110466896 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 110466985 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 110466992 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 110467119 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110467249 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 110467308 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110467423 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 110467459 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110467462 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110467472 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110467510 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 110467628 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110467633 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110467644 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110467683 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 2 110467700 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 110467730 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110467761 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 110467832 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110467863 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110467866 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 110467919 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110467995 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110468196 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 110468229 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 110468255 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 110468348 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 110468350 C T N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 110468641 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 110468708 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 110468753 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 110469001 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110469076 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 110469134 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 110469156 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110469298 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110469530 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 110469584 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 110469652 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110469735 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110469774 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110469787 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110469834 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110470037 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110470119 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 110470130 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110470207 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110470221 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110470234 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 110470247 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110470255 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110470275 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 110470358 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110470678 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110470709 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110470719 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110470742 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 110470746 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110470763 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110470765 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110470870 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110470957 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110470972 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110470984 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110471019 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110471040 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110471105 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110471156 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110471203 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110471206 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110471214 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 110471224 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110471271 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 110471342 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110471360 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110471450 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110471475 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110471486 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 110471516 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110471518 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110471599 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110471647 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 110471648 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 110471789 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110471812 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110471827 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110471880 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110471881 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110471996 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110472034 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110472060 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110472096 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110472116 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 110472132 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110472242 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 110472301 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110472397 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 110472414 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110472577 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 110472685 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 110472782 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110473021 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110473099 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110473282 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110473286 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110473387 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110473429 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110473574 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110473582 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110473593 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110473681 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110473701 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110473787 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110473819 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110473846 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 110473910 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110474060 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110474066 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110474183 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110474199 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110474295 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110474334 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 110474385 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 110474393 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110474400 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 110474422 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 110474441 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110474456 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110474466 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110474468 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 110474628 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110474643 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110474656 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 110474727 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 110474898 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110474992 G C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 110475024 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 110475487 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 110475626 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110475636 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 110475670 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110475751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110475790 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110476043 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110476089 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110476110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110476133 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110476197 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110476305 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 110476811 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110476919 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 110477075 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110477180 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 110477241 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110477477 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110477572 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 110477595 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 110477631 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 110478544 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 110478657 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110478691 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110478814 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110479272 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110479315 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 110479322 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110479523 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110479706 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110479805 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110479947 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110480009 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 110480068 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110480099 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 110480329 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 110480412 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 110480636 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110480637 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 110481014 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110481166 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110481423 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110481430 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110481464 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110481542 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110481563 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110481625 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 110481680 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110481820 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 110481825 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 110481897 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110481960 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110481999 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110482029 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110482059 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 110482292 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110482301 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110482643 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110482733 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110482884 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110482944 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110482977 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 110483051 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110483115 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110483271 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110483313 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110483323 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 110483326 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110483412 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 110483616 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110483619 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110483681 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110483741 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110483823 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110483853 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110483914 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110484183 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110484459 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110484809 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110484865 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110484954 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110485125 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110485457 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 110485839 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110486415 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110486428 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110486680 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110486760 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110486766 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110486785 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110486789 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110486804 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 110486974 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110487032 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110487033 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110487225 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110487251 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110487257 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110487275 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110487324 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110487336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110487526 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110487657 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110487693 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110487708 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110487727 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110487752 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110487836 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110487872 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110487976 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110487979 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110487994 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110487997 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110488111 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110488126 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110488445 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 2 110488452 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 2 110488613 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110488699 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110488732 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110488818 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110488855 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110488880 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110488897 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110489008 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110489095 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110489155 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110489225 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110489319 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110489430 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 110489457 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 110489487 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110489584 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 110489599 C A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 110489665 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 110489863 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 110489868 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 110489950 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110489978 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110490014 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110490115 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110490178 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110490197 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110490201 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110490546 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 110490590 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 110491044 G T N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 110491158 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 110491175 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 110491228 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110491475 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110491509 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110491539 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110491772 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110492026 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110492195 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110492286 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110492342 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 110492553 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110492722 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110492769 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110492794 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110492833 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110492956 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110493232 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110493267 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110493340 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110493375 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110493594 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110493619 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110493637 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110493821 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110493958 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110493994 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110494011 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110494033 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110494128 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110494192 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110494322 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110494442 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 110494563 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110494585 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110494663 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110494693 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110494695 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110494799 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110494836 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110494863 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110494956 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110495024 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110495034 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110495035 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110495100 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110495131 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110495146 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110495164 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 110495302 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110495370 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 110495460 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110495641 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110495802 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110496169 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110496192 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110496301 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110496309 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110496511 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110496539 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110496591 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110496604 G T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 110497359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110497404 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110498090 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110498132 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110498265 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110498493 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110499168 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110499267 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110499946 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110500065 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110500364 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110501266 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110501527 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110502915 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 110503333 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110503412 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110503526 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110503775 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110503776 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110503793 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110504719 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 110505523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110505665 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110505832 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 110506383 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110506744 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110506757 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110506795 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110506805 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110506849 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110506934 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110507060 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110507119 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 110507164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110507203 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110507256 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110507381 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 110507447 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 110507618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110507678 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 110507708 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110507723 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110508243 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110508384 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110508774 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110508916 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110508963 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110508976 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110509000 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110509053 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110509296 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 110510172 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 110511578 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110511681 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110511882 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110511939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110512412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110512565 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110512776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110513076 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110514931 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110514948 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110515104 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110515367 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110515517 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110515542 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110515590 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110515631 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110515774 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110516153 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 110516187 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110516299 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 110516496 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110516630 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110516733 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110516796 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110517442 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110517906 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110517914 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110518014 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110518077 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110518124 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110518407 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110518552 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110518821 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110519040 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110519057 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110519115 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110519309 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110519337 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110519369 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110519402 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110519490 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110519534 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110519555 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110519593 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110519722 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110519740 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110519769 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110519921 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110520051 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110520066 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110520207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110520315 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110520461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110520468 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110520482 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110520523 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110520746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110520757 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110520784 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110520894 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110521073 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110521465 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110521672 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 110521936 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110522075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110522127 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110522134 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110522237 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110522307 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110522335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110522428 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110522633 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110522952 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 110523060 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110523304 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110523472 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110523482 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110523599 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110523602 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110523713 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110523830 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110523832 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110523884 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110523910 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110524077 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 110524128 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 110524180 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 110524290 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 110524292 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 110524329 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110524341 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110524388 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110524396 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110524484 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 110524630 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110524638 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110524664 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110524688 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110524749 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110524825 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110524867 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110524873 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110524900 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 110524901 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 110524974 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110525102 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110525112 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110525358 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 110525401 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110525433 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 110525453 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110525551 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110525557 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110525638 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110525923 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110525954 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110526088 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110526172 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110526234 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110526395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110526452 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110526489 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110526611 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110526618 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110526898 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110527003 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110527140 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110527517 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 110527564 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 110527996 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110528125 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110528234 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110528312 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110528358 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110528360 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110528390 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 110528560 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110528672 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110528679 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 110528693 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110528783 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110528837 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110528872 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110528892 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110528930 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110528954 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110529023 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 110529137 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110529190 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.0666666666666667 15 15 1 13 1 2 110529206 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110529210 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110529274 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 110529294 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 110529406 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 110529429 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 110529440 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 110529441 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110529491 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110529589 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110529622 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110529633 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110529674 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110529733 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110531093 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110531100 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110531128 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110531152 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110531171 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110531226 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110531362 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110531374 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110531460 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110531486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110531571 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110531645 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110531745 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110531805 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110531887 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110531901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110531911 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110532036 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110532061 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110532127 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110532142 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110532162 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110532219 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110532344 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110532412 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110532690 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 110532954 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110533107 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 110533127 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 110533151 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 110533312 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 110533334 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 110533528 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110533532 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110533567 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110533730 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110533882 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110534076 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110534089 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110534210 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110534227 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110534452 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110534570 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110534727 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110534760 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110534789 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110534838 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110534866 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110535001 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110535013 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110535024 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110535038 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110535124 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110535137 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110535243 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110535829 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110537172 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110537521 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110537627 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 110537774 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110538137 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110538427 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 110538526 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 110538570 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110538587 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110538947 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110539101 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110539283 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110539641 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 110541076 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110541141 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110541216 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110541250 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110541255 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110541657 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110541677 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110541722 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 110542019 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110542332 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110542496 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110542804 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 110542823 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110542863 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110543063 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110543149 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110543176 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110543411 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110543442 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110543467 G C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110543534 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110543580 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110543738 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110543758 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110543959 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110543979 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 110544415 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110544470 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 110544480 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110544961 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110545224 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110545306 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110545394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110545490 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110545577 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 110545660 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110545762 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110545880 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110545935 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110545994 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110546020 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110546024 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110546035 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110546291 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110546298 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110546388 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110546398 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110546465 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 110546517 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110546608 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 110546655 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110546683 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110546724 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110546739 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110546834 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110546897 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110546902 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110546915 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110546946 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110546963 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110547061 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110547078 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110547093 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110547228 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110547276 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110547290 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110547429 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110547440 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110547475 T A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110547480 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110547498 A C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110547501 C G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 110547552 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 110547569 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110547616 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110547618 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110547642 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110547653 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110547735 G C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110547891 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110548028 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110548260 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110548290 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110548349 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 110548366 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110548417 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110548467 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110548599 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110548648 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 110548681 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110548810 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110549697 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110549824 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110549851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110549931 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110549982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110550100 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 110550146 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110550171 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110550887 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110550891 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110550986 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110551034 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110551069 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110551080 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110551091 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110551206 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110551311 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110551401 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110551482 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 110551677 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110551829 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110551839 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110552048 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110552051 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110552088 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110552109 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110552266 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110552330 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 110552373 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110552495 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110552705 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 110552737 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110552743 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110552994 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110553024 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110553209 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 110553220 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 110553513 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110553525 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110553546 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110553562 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110553636 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 110553657 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 110553742 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 110553763 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 110553830 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 110553901 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 110553903 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 110554253 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110554323 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 110554330 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 110554354 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110554376 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110554481 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110554534 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110554535 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110554628 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110554743 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110554868 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110554956 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 110555039 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110555096 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110555155 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110555396 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110555415 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110555909 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110556029 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 110556076 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110556267 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110556371 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110556718 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110556731 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110556886 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110557083 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110557179 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110557551 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110557742 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 110557744 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 110557782 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110557983 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110557984 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110558457 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110558464 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 110558479 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110558575 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110558598 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110558734 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110558832 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110558881 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110558981 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110559144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110559254 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110559316 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110559332 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110559486 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110559763 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110559786 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110559906 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110560017 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 110560044 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110560157 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110560442 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110560503 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 110560549 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110560640 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 110560646 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110560706 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 110560760 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110560884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110560896 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110560965 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110560978 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110560993 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110561051 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110561196 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110561198 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110561289 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110561822 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110561838 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110561847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110561876 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110562279 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110562472 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110563097 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 110563986 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 110564605 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110565028 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110565464 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110565580 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110565777 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110565811 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110565856 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110565869 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 110565911 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 110565923 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 110565929 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 110565961 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 110565974 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 110565979 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110565989 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 110566031 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 110566074 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 110566170 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 110566189 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110566280 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110566314 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 110566323 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 110566577 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110566631 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 110566650 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110566699 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 110566766 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110566767 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110566777 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110566779 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 110566813 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110567106 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110567121 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110567169 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110567228 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110567326 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110567367 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 110567380 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 110567399 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 110567407 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 110567469 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110567492 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110567501 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110567536 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110567584 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 110567610 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 110567652 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 110567667 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110567668 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110567742 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110567758 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110567923 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110567938 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110567944 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110568021 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110568044 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110568089 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110568096 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110568117 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110568122 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110568169 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110568394 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 2 110568486 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110568545 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 110568554 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110568820 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110568845 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 110568927 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 110568965 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110569033 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 110569096 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110569172 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110569350 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110569358 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110569399 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110569407 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110569417 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110569434 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 110569555 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110569670 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110569690 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110569838 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110569851 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110569927 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 110569968 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110569969 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110570035 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 110570189 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 110570191 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 110570235 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 110570262 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110570293 C G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 110570355 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110570386 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110570387 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110570520 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110570525 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110570591 T A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 110570605 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 110570708 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110570757 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110570827 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110570924 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 110571014 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 110571084 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 110571122 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 110571201 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 110571330 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110571437 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110571519 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110571667 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110571773 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110571977 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110572001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110572083 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 110572121 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 110572280 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 110572299 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110572303 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110572588 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 110572627 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 110572765 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 110572822 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 110572895 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 110572908 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110573200 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 110573244 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 110573332 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110573441 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110573486 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110574006 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 110574138 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 110574168 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110574175 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 110574323 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 110574363 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 110574368 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 110574467 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110574489 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 110574515 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110574699 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110574703 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110574798 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110574827 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110574852 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110574878 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 110574922 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 110574939 G C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 110574950 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 110574987 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 110574989 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 110575022 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 110575852 G T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 110575881 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 110576029 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 110576041 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 110576715 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 110576779 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 110576801 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 110576957 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 110576988 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110577002 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 110577004 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110577027 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110577038 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110577076 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110577108 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110577289 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110577590 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110577658 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110577786 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110577891 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 110577933 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 110577958 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 110578076 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 110578078 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 110578130 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110578191 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 110578463 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110578572 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110578595 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110578600 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110578606 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110578621 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 110579204 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110579355 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110579671 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 110579743 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 110579997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110580136 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110580267 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110580302 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110580351 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110580427 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 110580461 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110580490 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110580569 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110580622 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 110580720 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 110580804 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110580879 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110580957 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110580962 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 110580986 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 110580993 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 110581184 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110581263 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 110581399 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110581412 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110581413 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110581665 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110581898 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 110581933 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110582000 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110582179 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110582270 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110582639 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110583034 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 110583893 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110583955 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110583976 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110584007 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110584360 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110584455 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110584586 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 110584619 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110584673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110584797 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110584842 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110584923 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110585092 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110585103 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110585130 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110585281 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110585380 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110585500 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 110585502 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 110585627 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110585644 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 110585674 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 110585963 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110586296 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 110586334 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110586365 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110586372 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110586410 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110586436 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110586458 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110586495 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110586516 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110586706 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110586753 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110586803 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110586995 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 110587013 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 110587080 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 110587081 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 110587133 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110587146 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110587148 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 110587159 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110587406 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 110587470 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 110587484 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 110587708 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 110587761 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 110587829 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 110587843 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 110587999 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110588036 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 110588190 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110588233 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 110588395 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110588528 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110588557 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110588603 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110588661 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 110588707 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110588841 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 110588853 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110588881 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 110588885 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110589042 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110589248 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110589498 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 12 6 6 0 3 2 110589514 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 110589705 A G N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 2 110590256 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 2 110590331 T A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 110590384 A G N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 2 110590562 T G N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 2 110590894 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 110590916 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 110591065 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110591079 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110591150 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 110591231 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110591236 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110591255 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110591309 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110591400 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110591416 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110591474 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110591515 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110591528 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110591586 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 110591630 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110591703 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 110591812 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 110591852 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110591854 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110591900 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110591921 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110591923 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110592022 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 110592059 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 110595063 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 110595135 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110595581 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 110595751 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 110596209 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.1 0.85 0.05 21 19 2 17 1 2 110596296 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 110596358 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 110596379 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 110596447 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110596541 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110596557 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110596887 A T Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 110596999 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 110597521 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110597592 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 110597629 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 110598012 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110598230 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110598303 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 110599147 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110599251 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110599315 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110599316 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110599601 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110599817 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 110600987 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110601173 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110601212 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110601883 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110602356 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110602382 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110602424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110602565 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110605851 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110607717 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110608140 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110608141 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110608425 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110608446 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110608469 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110608697 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110608866 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110610066 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 110610187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110610206 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110611258 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110611517 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110611672 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110611707 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110612183 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 110612291 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110612398 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110612547 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110612774 A T Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 110612775 T G Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 110612804 A C Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 110612882 G T Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 110613115 G T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 110613170 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 110613185 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 110613225 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110613270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110613319 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110613380 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110613392 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110613413 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110613424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110613507 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110613567 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110613572 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110613653 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110613678 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110613842 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110613870 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110614046 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110614201 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110614273 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 110614664 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110614687 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110614808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110615101 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110615159 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110615310 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110615321 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110615889 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110616026 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110616250 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 110616555 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110616604 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110616712 A C Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 110616929 A C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 110616961 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110617348 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 2 110617372 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 110617394 C G Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 2 110617485 A G Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 110617605 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 110617809 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 110617825 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 110617862 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 110617873 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 110617987 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 110618181 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 110618278 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110618607 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110618653 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110618706 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 110620509 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 110620542 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 110620598 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110620633 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 110620743 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110620890 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110621054 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 110621275 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110621496 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110621667 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110621804 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110622077 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110622637 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110622654 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110622768 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110623228 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110623246 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110623266 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110623534 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110623590 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 110623758 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110623805 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110623964 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110624032 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110624258 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110624349 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110624431 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110624579 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110624595 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110624715 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110624756 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110625080 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110625180 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 110625379 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110625414 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 110625496 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110625532 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110625598 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110625635 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110625646 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110625668 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110625780 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110625796 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 110625851 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110625915 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110625919 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110626109 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110626294 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110626321 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110626450 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110626766 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110626869 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110626929 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 110626983 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110627453 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 110627750 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110627837 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110627866 T A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110627945 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110627955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110628034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110628399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110628420 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110628518 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 110629116 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110629138 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110629160 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110629199 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110629458 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110629509 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 110629574 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 110629808 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 110629972 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 110630067 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 110630223 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 110630319 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 110630411 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110630484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110630593 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 110630687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110630720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110630815 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110630993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110631083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110631293 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110631344 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110631477 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110631623 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 110631770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110631812 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110631904 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110631975 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110632136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110632137 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110632293 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110632489 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110632523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110632550 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110632608 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110632712 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110632721 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 110632786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110632803 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110632881 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110632889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110633026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110633065 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110633122 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110633176 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110633180 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110633200 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110633300 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110633324 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110633451 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110633495 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 110633757 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 110633889 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110634022 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110634127 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 110634265 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 110634267 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110634297 T G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 110634307 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 110634308 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 110634446 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110634508 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110634570 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110634709 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 110634746 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 110634817 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110634821 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 110634883 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 110634983 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 110635329 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 110635374 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 110635391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110635414 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 110635891 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110635979 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110636056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110636143 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110636196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110636236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110636468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110636488 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110636532 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110636669 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110636718 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 110636753 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 110636956 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110636960 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 110636973 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110636986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110637075 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110637149 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110637151 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110637260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110637379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110637449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110637513 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110637616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110637644 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110637889 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 110638140 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 110638219 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110638366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110638393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110638410 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110638509 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110638857 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110638916 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 110639202 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 110639229 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110639335 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 110639666 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110639726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110639747 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110639761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110639805 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 110640134 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110640300 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110640301 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110640311 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110640551 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 110640688 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110640775 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110640902 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110640942 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110640956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110640993 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110641160 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110641336 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110641340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110641374 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110641406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110641446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110641522 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110641606 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110641641 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110641694 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110641714 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110641747 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 110641766 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 110641798 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110641824 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110641880 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110641923 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110642192 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110642447 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110642563 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110642655 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110642710 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 110642846 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 110642885 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 110642891 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 110642936 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110642946 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 110642966 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110642968 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 110642999 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110643021 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110643198 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 110643789 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110643793 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110643974 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110644007 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 110644106 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 110644158 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110644197 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110644202 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 110644208 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 110644219 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 110644484 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110644517 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110644557 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 110644559 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110644606 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110644609 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110644622 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110644662 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110644731 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110644733 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110644922 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110644939 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110644990 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110645043 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 110645172 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 110645426 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110645453 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110645472 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110645662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110645816 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 110645849 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110645912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110645956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110646027 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110646037 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110646045 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110646066 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110646210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110646218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110646237 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110646422 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110646581 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110646749 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110647034 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110647266 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110647306 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110647355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110647416 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110647571 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110647608 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110647694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110647864 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 110647893 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 110647926 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110647954 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110648110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110648111 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110648227 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 110648715 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110648741 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110648835 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 110648908 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110648909 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 110648966 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110649320 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110649675 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 110649750 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110649995 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110650001 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110650147 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 110650204 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110650207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110650216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110650221 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110650881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110651224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110651278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110651298 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110651354 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110651461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110651582 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110651624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110651756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110651784 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110651929 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110652080 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110652110 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110652182 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110652325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110652482 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110652704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110652786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110652795 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110652888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110652968 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110653080 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110653082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110653145 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 110653194 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110653309 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110653320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110653437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110653445 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110653497 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110653500 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 110653529 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110653530 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110653542 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110653684 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110653775 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110653784 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110653862 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110654054 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110654078 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110654090 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110654170 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110654186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110654221 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110654308 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 110654338 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110654371 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110654489 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110654501 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110654529 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110654676 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110654691 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110654712 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110654728 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110654802 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110654813 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110654930 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110654980 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110655003 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110655021 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110655050 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110655063 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110655234 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110655275 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110655408 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110655416 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110655517 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110655550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110655836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110655844 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110655858 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110655891 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110655945 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110656005 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110656021 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110656120 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 110656333 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110656447 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110656462 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110656526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110656707 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110656748 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 110656801 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 110656819 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 110656834 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110656876 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 110656910 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110656928 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 110656986 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110656994 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 110657184 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110657208 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110657330 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110657492 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110657521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110657545 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110657557 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110657583 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110657588 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110657605 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110657621 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110657626 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110657651 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110657674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110657691 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 110657820 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110657860 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110657983 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 110658121 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110658189 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110658245 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110658301 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110658316 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110658339 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110658347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110658350 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110658401 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110658551 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110658585 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110658604 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110658607 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110658646 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110658705 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110658773 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 110658874 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110658882 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110658902 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110658918 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110658935 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110658974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110659029 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110659033 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110659125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110659176 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110659265 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110659274 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110659287 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110659337 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110659355 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110659372 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110659377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110659434 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110659973 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 110660022 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 110660041 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 110660047 G C N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 110660113 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110660122 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 110660170 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110660242 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110660296 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110660448 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110660475 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110660514 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110660529 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110660548 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110660612 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110660638 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110660644 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110660672 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110660677 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110660731 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110660760 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110660763 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110660820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110660827 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110660975 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661022 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110661025 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110661042 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110661157 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661187 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661202 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661208 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110661219 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110661312 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110661384 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110661456 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661505 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661535 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661600 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110661628 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110661707 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 110661719 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661739 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661778 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110661785 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110661824 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661872 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661903 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661929 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110661968 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110662018 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110662041 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110662056 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110662470 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110662498 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110662571 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 110662598 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110662699 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110662708 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110662741 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110662793 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110662799 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110662923 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110662928 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110662935 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110662963 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110663010 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110663032 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 110663041 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110663251 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 110663272 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 110663364 A C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 110663562 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 110663570 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 110663626 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110663673 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 110663687 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 110663689 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 110663803 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110663815 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110663836 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110663887 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110663905 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110663952 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110664015 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110664054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110664149 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110664194 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110664207 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110664249 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 110664286 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 110664369 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110664663 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 110664674 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110664685 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110664686 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110664771 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110664786 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110664810 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110664909 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110665104 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110665169 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110665251 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110666521 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110666638 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110666641 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110666656 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110666667 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110666772 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110666797 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110666815 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110666826 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110666880 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110666910 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110666924 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110666962 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667050 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110667079 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667085 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667218 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667226 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667247 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667268 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667294 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667356 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110667364 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110667386 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110667431 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667442 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667458 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667490 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667495 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 110667501 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110667530 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110667543 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 110667631 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110667641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110667696 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667823 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110667834 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110667863 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110667873 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110667956 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 110668011 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110668098 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 110668253 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110668265 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110668317 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110668337 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 110668422 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110668435 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110668449 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110668512 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110668520 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 110668544 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 110668563 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110668608 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110668655 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110668818 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110668852 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 110668877 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 110668939 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 110669009 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 110669030 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 110669167 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110669203 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 110669229 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110669403 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 110669415 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110669489 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110669515 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110669604 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110669639 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110669696 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 110669864 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110669964 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 110670012 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110670018 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110670152 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 110670248 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110670298 T A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110670306 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110670321 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110670333 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 110670354 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110670427 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110670597 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110670609 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110670617 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110670694 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110670843 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110670861 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 110671119 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110671136 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110671144 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110671155 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 110671416 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110671499 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 110671508 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 110671781 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110671862 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 110672623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110672627 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110672659 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110672873 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110673095 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 110673262 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 110673702 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110673819 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110673892 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110673924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110674173 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110675219 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110675360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110675460 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110675500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110675660 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110675672 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110676406 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110676633 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110676705 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110676851 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110677030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110677348 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 110677972 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110678001 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110678021 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110678072 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110678216 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 110678386 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 110678556 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 110678657 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 110678848 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110678924 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110679031 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110679161 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 110679204 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110679264 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110679638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110679877 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110680020 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 110680360 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110680671 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110680783 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 110680784 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 110680855 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 110680882 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 110680987 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110681121 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110681145 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110681157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110681219 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110681237 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110681288 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110681363 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110681515 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110681576 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110681584 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110681606 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110681679 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110681691 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110681727 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110681761 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110681801 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110681850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110681938 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110682115 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 110682160 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 110682287 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110682431 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 110682433 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110682530 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110682558 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110682764 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 110682831 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 110682916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110683210 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110683219 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110683325 A C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 110683354 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 110683415 A T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 110683422 T A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 110683497 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 110683533 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 110683616 C G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 110683760 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110683777 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 110684154 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 110684251 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 110684309 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 110684351 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 110684456 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110684532 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110684577 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110684604 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110684644 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 110684714 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110684780 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110684863 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110684909 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110684958 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110685073 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110685205 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110685434 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110685446 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110685474 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 110685515 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 110685553 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 110685571 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 110685584 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 2 110685633 C A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 110685668 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 110685699 G T N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 110686223 C A Y N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 110686303 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 110686326 G A Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 110686334 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 110686519 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 110686558 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 110686724 A C N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 110686802 C G Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 2 110686849 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 2 110686869 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 110686896 C T N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 110686906 C T Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 110686981 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 110687031 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110687109 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 110687115 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 110687284 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 110687425 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 110687789 T A Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 110687852 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 110687889 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110687899 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110687988 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110688000 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110688095 A C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 110688148 A C Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 110688180 A T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 110688224 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110688256 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 110688305 A C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 110688652 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110688704 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110688853 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 110688864 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 110689028 T A N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 110689033 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 110689392 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 110689402 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110689421 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110689459 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110689485 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110689520 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110689562 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110689583 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110689636 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110689653 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110689668 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110689722 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110689744 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110689775 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110689862 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110690203 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110690271 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 110690334 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 110690413 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110690444 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110690509 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 110690607 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110690730 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110690794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110690863 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 110690940 A T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 110691382 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 110691476 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110691544 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 110691655 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110691830 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110691846 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110691912 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110691992 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 110692122 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110692155 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 110692334 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 110692464 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 110692542 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110692681 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110692764 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110692892 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110693218 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 110693554 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 110693623 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110693905 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110693953 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110694068 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110694188 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 110694189 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 110694201 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110694286 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110694393 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110694421 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 110694473 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110694479 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110694581 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 110694599 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110694622 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110694710 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110694724 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110694754 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110694825 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110694907 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110694974 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 110695280 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 110695306 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110695499 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110695674 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 110695778 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 110695838 T G Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 110695924 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 110695951 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 110695968 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110696069 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 110696155 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110696172 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110696189 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110696219 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110696256 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110696268 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110696283 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 110696302 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110696404 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110696434 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110696549 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110696590 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110696693 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110696727 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110696748 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110696759 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110696784 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110696859 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110696887 C G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 110696926 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110696971 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110697005 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110697148 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110697217 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 110697364 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 110697397 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110697463 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 110697477 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 110697494 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 110697506 T G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 110697528 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 110697686 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 110697752 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 110697878 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110697924 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110697939 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110697977 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110698000 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110698049 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110698060 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110698296 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110698298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110698371 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110698527 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110698529 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110698775 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 110698780 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110698816 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110698835 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 110698841 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110698874 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110698879 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 110699040 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110699065 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110699103 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110699154 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110699299 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110699643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110699863 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110699887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110699987 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110700018 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110700023 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110700032 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 110700724 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110701012 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110701365 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110701482 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 110701916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110702891 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110702961 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110703216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110703231 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 110703630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110704016 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 110704196 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110704308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110705911 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 110706318 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 110706557 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 110707142 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 110707230 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 110707388 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110708333 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110708639 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 110708710 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110709431 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110709489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110709526 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110709624 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110710272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110710314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110710398 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110710421 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110710941 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110711023 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110711605 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110711822 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110712786 A T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 110712787 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 110713206 A G Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 110713518 G A Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 110714358 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110714516 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 110714673 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110714679 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 110714687 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 110714756 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110714811 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110714812 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110714945 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 110715023 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 110715330 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 110715449 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110715475 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110715526 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 110715527 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 110715579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110716293 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 110716354 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 110716377 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110716587 C T Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 110716626 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 110716833 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110716946 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110717176 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110717573 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110717671 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110717855 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110718026 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110718179 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 110718210 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110718238 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110718681 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110718827 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110718977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110719014 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110719046 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110719119 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 110719240 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 110719251 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110719257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110719263 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110719422 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110719712 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 110719975 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 110720239 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 110720354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110720683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110720816 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 110721057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110721179 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 110721731 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 110722134 T G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 110722169 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110722178 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110722558 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 110723313 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110723500 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110723514 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110723599 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 110724354 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110724558 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110724716 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 110724807 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110724976 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 110725680 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110727081 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110727165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110727822 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110728115 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 110728486 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110728538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110728774 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110729018 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110729019 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110729177 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110729585 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110729611 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110729634 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110730116 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110730212 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110730270 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110730341 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110730533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110730546 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 110730711 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 110730800 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 110730830 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 110731018 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 110731025 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 110731040 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 110731079 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 110731166 G T Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 110731257 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 110731258 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 110731289 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110731360 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110731364 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110731409 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110731661 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110731716 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110731727 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110731823 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110731967 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110731997 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110732040 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110732063 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110732081 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110732084 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110732145 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 110732156 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 110732355 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110732397 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 110732450 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 110732460 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110732486 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 110732487 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110732621 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110732631 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110732636 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 110732649 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110732657 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 110732671 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 110732693 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 110732763 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110732863 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110732884 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110732912 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 110732970 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 110732996 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110733018 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110733103 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 110733112 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110733183 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110733258 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 110733364 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110733450 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 110733481 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 110733522 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110733524 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 110733605 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110733654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110733702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110735914 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110735997 T G Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 110736064 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110737122 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110737192 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 110737681 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110738430 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110738879 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110738922 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 110739179 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110739316 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 110739650 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110739825 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110741049 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 110741332 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 110741724 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 110741738 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 110742454 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 110742458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110742477 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110742724 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110742747 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110743904 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110743958 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 110743996 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 110744055 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 110744121 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 110744397 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110744760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110744790 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110744974 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 110745115 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110745454 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110745505 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110745668 C T Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 110745688 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 110746020 T C Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 110747368 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110747756 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 110747775 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 110747964 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 110748641 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110749035 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 110749063 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110749245 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110749350 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110750098 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110750372 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110750890 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 110751051 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 110751151 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110751490 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110752347 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110753107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110753536 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110753766 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110753848 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110754006 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 110754090 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110754119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110754464 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110754531 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110755254 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 110755327 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110755802 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110755849 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110757310 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110757780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110759084 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110759641 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110760218 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110760412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110760464 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110760589 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 110761364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110761823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110762792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110763057 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110763127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110764878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110765346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110765468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110765672 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110765821 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110767239 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 110767667 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110767889 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 110768391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110768688 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110768780 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 110769167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110769638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110771295 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110771444 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 110771803 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110772066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110773027 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110773359 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110773459 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110773707 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110773962 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110774291 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110774662 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110775080 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 110775255 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110775840 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 110776431 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110776580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110776718 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110777026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110777301 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110777386 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110777783 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110777830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110777963 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 110778203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110778406 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110778729 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 110779480 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110780244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110780315 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 110780535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110780864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110781026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110781558 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110781850 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110781926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110781991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110782581 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110782802 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110782904 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110783044 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110783067 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110783151 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110783452 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 110783528 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110783563 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110783580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110783638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110783910 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110784271 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110784338 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110784493 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110784573 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110785350 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110785468 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110786242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110787407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110787654 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110787837 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110787976 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110788016 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110788676 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110789604 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 110791648 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110791839 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110792113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110792848 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110792876 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 110792950 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 110792969 T C Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 110793123 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 110793295 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 110793805 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110794362 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110794538 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110795517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110795555 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110795892 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 110796002 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110796023 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110796949 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110797032 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110797521 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110799036 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110799061 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110799275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110799698 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110800327 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110800626 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110800795 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 110800813 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 110801229 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 110802181 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110802777 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110803466 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110804275 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110804281 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110804337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110805285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110805857 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110806259 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110806341 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 110806584 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 110809625 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110810004 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110810557 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110811032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110811129 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110812009 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110813505 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110813783 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110814199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110814742 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110815506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110816124 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110816811 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110817346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110817697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110818707 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110818772 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110818811 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110820959 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110822994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110823093 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 110823105 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110823165 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110823653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110824381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110825503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110825516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110827925 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110829839 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110830783 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110832618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110832632 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110832822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110833323 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110833616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110833710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110834002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110834017 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110834363 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110835148 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110835713 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 110835941 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110836057 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110836937 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 110837724 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 110839120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110839573 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110839721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110841728 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 110842075 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 110842874 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110843027 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110843479 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 110844343 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 110845491 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110845637 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 110858961 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 110859110 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 110859170 T G Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 110860775 C T N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 110860940 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 110868516 A T Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 110869664 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 110869731 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 110870003 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110871458 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 110871916 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110872252 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110872271 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110874345 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110874739 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110874886 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110875205 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110875576 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110875758 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110875987 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110876589 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110877245 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 110877324 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110877393 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 110878060 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110878354 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110878548 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110878646 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110879145 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110879393 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 110880176 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110880182 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110880320 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 110880362 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110880492 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110880513 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110880632 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110887543 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110887612 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 110887696 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110887803 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110888785 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110889142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110889261 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110890149 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110890378 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110890551 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 110890753 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110891756 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 110891859 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110893475 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110893593 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110893900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110894536 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110894601 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110895444 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110895559 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 110895791 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110896001 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 110896038 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110896049 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110896229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110896357 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110896516 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 110897323 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 110897477 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 110897575 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110897870 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110898746 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 110899219 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110899407 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 110899939 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 110900221 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 110900362 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110900385 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110900826 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110900887 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 110901069 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110901285 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 110901376 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110902186 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110902432 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110902694 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110903034 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110903084 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 110903564 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 110904001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110904045 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110904563 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110904605 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110904883 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 110905382 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 110905960 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110906301 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110906645 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110906690 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110906838 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110906862 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110907046 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110908346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110908454 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110908783 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 110909061 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 110909098 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110909111 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110909452 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 110909541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110909739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110909763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110910090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110910116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110910910 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 110910946 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110911204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110911601 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110912068 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110912093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110912306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110912645 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110912834 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 2 110914090 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110914994 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110915345 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 110915456 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 110916162 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110916563 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110918176 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110919102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110921113 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110921322 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110922060 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110923418 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 110923420 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 110924513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110924515 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110924558 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 110925916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110926037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110926691 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110927413 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 110928695 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110929494 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110929846 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110929926 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 110929995 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110930474 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110930905 G T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 110932195 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110932404 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 110933321 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 110933919 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 110934037 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 110934267 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 110935091 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 110935658 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110935861 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110935955 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 110936093 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 110936637 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110936974 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 110937218 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110937260 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 110938015 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110938050 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 110938778 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 110938830 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 110939181 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 110940445 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110940472 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110940758 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110940952 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110941317 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 110941782 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110942514 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110942998 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 110943030 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 110944782 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110944793 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110945260 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110945296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110945402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110945406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110945907 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110946457 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110946697 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110946745 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110947266 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 110947584 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110948151 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110948529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110948562 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 110948564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110948895 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 110948976 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110949030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110949107 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 110949307 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 110949381 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110949430 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110949566 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110949824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110950680 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 110951406 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 110951456 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110952984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110953023 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110954131 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110954397 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110954545 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 110954704 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110955804 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110956276 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110956340 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110964420 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 110964452 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110965461 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110966318 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110966938 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 110967214 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110967652 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110968235 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110970255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110970420 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110972471 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 110972590 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 110973258 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110973688 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 110974586 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110974720 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 110975159 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110975487 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110975503 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110976743 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 110976757 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 110977126 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110977701 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110978123 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110978851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110979013 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 110979193 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 110979293 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 110979430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110979454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110979904 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 110979929 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 110980108 A C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 110980109 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 110982092 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 2 110982680 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110984510 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 110985947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110986074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 110986905 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110987767 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 110987783 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 110988086 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110990185 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 110992111 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 110994113 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 110995996 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110998641 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 110998654 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 110998690 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 110998878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 110998927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111002238 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111004827 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 111005166 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 111005190 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 111006061 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111006911 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111007129 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111007209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111007688 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111007967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111008493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111010262 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111013808 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 111022189 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111022688 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 111022756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111023174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111023551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111023859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111024075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111024524 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111025182 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111025515 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 111025991 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111027555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111027647 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 111028356 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 111028774 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111029165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111029603 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111029795 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111029905 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111030505 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111030624 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111031614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111031663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111032165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111032675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111033156 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111034250 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111035511 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111036300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111037389 G T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 111037711 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111037955 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111038084 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111039645 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111039722 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111039833 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 111040378 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 111041209 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 111041747 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111042779 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111044087 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111044959 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111045600 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111047806 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111048260 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111048754 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111049637 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 111049684 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 111050304 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111050685 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 111051418 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 111051568 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111051676 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111051751 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 111051775 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 111051952 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111052239 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111052389 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111052529 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111053068 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111053390 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111054688 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111054803 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 111054810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111055035 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111055207 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111055797 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 111055803 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 111056265 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111056270 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111056532 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111056969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111057164 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 111057200 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 111057426 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111057718 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 111058946 C A Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 111059032 G C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 111059125 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 111059197 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 111059343 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 111059347 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111059467 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111059549 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111060686 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111060778 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 111060793 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111061514 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 111061627 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 111061674 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111061944 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111062012 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 111062511 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 111062685 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111062727 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111063638 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 111063701 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 111063909 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 111063924 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111063995 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111064571 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 111064830 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111064833 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111064887 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111065337 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 111065487 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 111065713 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111065946 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111066911 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111067308 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111067319 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111067944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111068421 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111068878 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111069684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111069890 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111069936 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111069985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111070425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111070486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111071400 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111074160 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111074562 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111074886 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111075405 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111076149 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111076333 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111077609 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 111077876 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111079336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111079449 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111079826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111080297 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 111080623 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111081250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111081465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111081617 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111081658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111083422 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111084074 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111085284 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111087294 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111087980 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 111088416 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 111088600 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111089239 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111090264 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 111091148 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111091537 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111093627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111102209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111104497 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111105553 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111105763 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111105816 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111105957 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111106277 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111107186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111107670 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 111109278 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111110958 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111111066 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 111111675 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111111812 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111111903 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 111113016 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111113285 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111113884 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 111114002 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111114178 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111114454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111114508 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111114644 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111115087 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111117231 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111118109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111119017 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111128798 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111129347 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111130094 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 111130941 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111131955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111132088 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 111133062 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111133760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111134387 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111135549 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111138046 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 111139548 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111139560 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111139636 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111141040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111141404 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111142184 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111143044 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111144901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111145233 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111145272 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111146305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111147518 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111147533 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111147548 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111147843 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111148465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111148593 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 111148748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111150299 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111150568 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111150889 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111151219 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111151254 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 111151305 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111152407 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111153589 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111153606 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111153937 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111154129 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111154135 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111154368 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111154423 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111154940 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111155623 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 111156345 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 111157094 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111157401 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 111157469 A G Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 111157481 C G Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 111157969 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111158157 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111158283 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111158326 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111158591 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111158641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111158729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111159076 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111159576 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111159610 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111159731 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111161402 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111161621 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111161715 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111162270 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111162994 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 111162995 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111163276 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 111164499 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111164744 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111165325 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 111165600 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111166154 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 111166242 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 111166392 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111166409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111166546 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111166646 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111166999 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 111167598 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 111169582 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111170185 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 111170975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111171318 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 111171367 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111171509 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111171567 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 111171586 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 111171653 G C N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 111171786 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111171842 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111172219 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111172282 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111173854 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 111174046 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111178815 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111180827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111184391 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111184855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111192043 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111194066 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111194899 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111195732 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111195870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111196045 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 111196422 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111196425 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111196742 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 111197302 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111197790 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111200150 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111201252 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111201358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111201560 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 111201627 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 111201704 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111201718 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 111201979 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111202362 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111202391 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111207353 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111207588 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111208275 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111209372 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 111214702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111214910 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111215709 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 2 111215816 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 111216701 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111221019 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111224016 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111224210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111225369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111227046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111230160 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111230525 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111230651 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111231420 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111231486 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111233009 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 111235610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111236807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111236866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111237388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111238478 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111238965 G C Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 111241838 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111242309 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111242442 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 111244147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111248947 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111250900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111251453 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111251493 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111251620 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111251640 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111256138 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111257435 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111258577 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111258589 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111258750 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 111258880 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111258960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111261999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111262932 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111263135 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 111263225 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111264292 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111265667 T A Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 111267481 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111268044 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111271977 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111272326 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111272582 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111275959 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111276078 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111276193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111278395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111280412 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 111280493 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 111281418 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111281447 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111284334 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111286085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111286681 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111288606 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 111288693 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111290259 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111291658 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111291963 C G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 111294407 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111295108 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111297375 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111297553 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 111297762 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111298516 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111299867 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 111307308 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111310022 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111310389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111314057 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111314172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111314766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111314855 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111317244 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111318210 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111318423 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111319206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111320424 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111320499 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111320540 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111320661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111321121 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111321166 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111321206 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111321396 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111321467 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111321774 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111321996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111322185 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111322186 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111322218 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111322286 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111322385 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111322434 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111322442 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 2 111322535 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111322563 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111322617 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111322622 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 111322704 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111324525 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111325301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111325403 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111326465 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111326827 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111327641 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111328015 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111328269 A C Y N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 2 111328593 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111329902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111329903 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111330388 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 111331992 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111333642 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111334325 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 111334969 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111336408 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111336452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111338440 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111339222 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111339506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111339749 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 111340564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111341538 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111342053 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111342095 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 111342612 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111343354 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111344972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111345379 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 111345788 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111345866 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111345867 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111345929 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111346412 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 111346515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111346603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111346712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111346752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111346792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111346834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111346914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111347011 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111347024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111347045 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111347144 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111347262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111347278 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111347352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111347641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111347742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111347769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111347872 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111347966 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111348195 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111348389 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 111348398 C A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 111348403 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111348456 A G N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 111348638 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 111348650 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 111348714 T A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 2 111348717 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111348761 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111348769 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111348839 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 111348875 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111348996 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 111349423 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111349457 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111349735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111349755 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111349832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111349944 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111349979 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111349989 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111350063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111350074 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111350085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111350192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111350332 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111350362 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 111350389 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111350412 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111350432 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111350732 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111350733 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111354371 G T N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 2 111354623 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111354633 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 111354694 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111354731 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111354768 G T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111354902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111355016 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111355097 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111355273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111355299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111355325 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111355506 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111355509 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111355644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111355697 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111355709 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111355746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111355824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111355846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111355894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111355899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111355907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111355918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111355987 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111356026 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111356037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111356219 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 111356235 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111356292 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 111356365 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 111356416 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111356443 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 111356444 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 111356494 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 111356592 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111356710 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111356776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111356783 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111356866 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 111356942 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111357120 T G Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 111357155 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111357214 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111357312 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 111357339 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 111357346 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 111357606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111357657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111357665 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111357688 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111357730 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111357884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111357887 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111358117 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111358154 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111358222 C T Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 111358361 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 111358401 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111358444 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111358446 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111358569 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 111358622 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111358623 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111358633 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111358747 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111358834 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111358879 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 111359004 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111359421 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111359470 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111359595 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111359755 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111359763 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111359768 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111359790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111359800 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 111359831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111359858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111360023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111360059 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111360066 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111360235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111360574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111360730 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 111360849 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111360856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111360942 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 111361007 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 111361161 A G N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 111361265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111361361 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111361425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111361556 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 111361683 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 111361749 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 111361805 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 111362031 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 111362117 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111362147 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111362180 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111362325 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 111362411 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 111362614 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111362759 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 111362809 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111362839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111362942 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 111362997 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111363030 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111363041 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111363074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111363127 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111363542 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111363671 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111363690 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111363699 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111363711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111363739 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111363844 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111363876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111363999 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111364153 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111364309 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111364414 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111364513 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111364739 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 2 111364847 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111364958 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 111364999 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111365149 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 111365199 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 111365312 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111365320 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111365426 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 111365647 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 111365674 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 111365760 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 111365794 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 111366312 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111366360 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111366383 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111366451 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111366605 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111366786 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111366818 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111367018 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111367118 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111367123 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111367391 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111367508 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111367514 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111367525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111367604 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111367647 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111367949 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111367955 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111368414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111368723 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111368897 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111368908 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111369067 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 111369790 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111370408 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111370409 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111370545 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 111370671 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111370833 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111370920 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111372369 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111372487 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111373030 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 111373894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111374009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111374027 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111374115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111374205 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111374438 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111374493 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111374652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111374877 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111374995 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111375310 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111375751 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 111375909 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 111376294 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111376688 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111376924 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111377009 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111377510 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111377753 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111379256 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 111379557 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 111379724 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111380583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111381019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111381391 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111382088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111382415 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111382671 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111382680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111382794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111382846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111382894 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 111383077 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111383105 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111383138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111383308 A C Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 111383449 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111383456 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111383566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111383624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111383964 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111384023 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111384059 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 111385088 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111385095 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111385610 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 111385626 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111387384 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111388146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111395179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111395802 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 111395860 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111396428 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111396957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111397282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111397289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111397363 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 111397495 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111397817 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111397934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111398536 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111399095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111400726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111401122 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111401249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111401329 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111401404 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111403010 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111403039 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111403096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111403690 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111405919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111406599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111408599 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111408832 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111408976 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 111409207 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 111409228 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111409969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111410246 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111411436 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111412564 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111413118 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111413126 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111413199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111414031 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111414048 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111414402 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111414507 C G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111414683 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111414705 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111416193 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 111416255 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111416353 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 111416400 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111416404 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111416749 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 111418267 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111420369 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111421196 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111421199 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 111422066 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111422108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111422138 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111422331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111422341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111424770 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111424780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111425004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111425824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111425886 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111426306 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 111427946 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111429469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111430032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111432908 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111433095 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111433141 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 111433351 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111434579 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111434680 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 111435004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111435053 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111435292 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111435622 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 111436800 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111437043 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 111437712 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111438019 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111438835 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 111439740 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111439741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111439870 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111440722 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 111441196 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 111442378 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 111442486 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111442487 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111443246 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111443471 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111443894 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111444463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111444482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111444726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111444971 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 111445104 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 111445138 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111445141 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111445197 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 111445411 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111445540 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111445776 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111445786 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 111446251 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111446589 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111446664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111446703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111446792 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111446820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111446968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111447210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111447352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111447487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111447649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111447701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111448020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111448237 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111448676 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111448711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111448763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111448778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111448804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111448939 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111449623 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111449984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111450015 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111450073 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 111450115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111450228 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111450230 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111450402 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111450512 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111450520 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111450739 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111450956 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111451019 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111451135 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111452941 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111453310 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111453436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111453451 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111453704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111453722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111453885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111453931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111454115 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111454130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111454260 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 111454293 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111454586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111454997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111455015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111455087 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111455226 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 111455457 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111455803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111455931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111456117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111456125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111456156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111456563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111456592 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111456613 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111456614 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111456747 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111456759 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111456997 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111457009 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 111457069 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111457083 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111457096 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111457166 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111457201 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111457298 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111457347 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 2 111457381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111457735 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111457759 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111457779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111457822 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111457900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111457928 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111458287 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111458321 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 111458607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111458613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111458752 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111458882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111458899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111458941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111459013 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111459074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111459319 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111459387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111459722 A T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 111459892 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111460252 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111460274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111460539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111460683 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111460724 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111460880 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111460983 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111461091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111461915 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111461963 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111462107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111463255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111463294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111464021 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111464264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111464349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111467305 T A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 111467618 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111468024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111468152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111472766 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 111472769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111473776 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111474851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111475606 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111477780 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111482271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111482287 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111482863 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111483035 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111483105 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111483210 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 111483213 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 111483620 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111486516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111486539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111486842 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 111486948 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111487560 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111488670 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111488671 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111489962 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111490053 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 111496367 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111496400 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 111496757 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111499312 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111510341 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111510447 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111511489 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111513421 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 111525995 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 111526500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111526512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111527781 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 111530318 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111531070 G A Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 111532649 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 111533176 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 111533915 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 111534029 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 111534655 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111535158 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111535183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111535571 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 111535802 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111535828 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 111535847 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 111536291 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111536448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111536515 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111536726 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111537102 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111537121 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111537258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111538138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111538289 C T Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 111538300 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 111538368 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 111538409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111538874 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111539728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111540055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111540504 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111540639 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111541759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111543945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111544200 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 111545239 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111546752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111546913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111547721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111547801 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111548951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111549645 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111550203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111552604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111552773 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 111552875 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 111553942 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 111554495 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 111554824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111555164 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111555182 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 111555217 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 111555218 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111555383 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 111555630 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111555719 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 111555827 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 111555844 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 111555897 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 111556158 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111556245 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 111556358 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111556392 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 111556528 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111556565 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111556573 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111556639 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111556730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111556837 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 111563640 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 111563779 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111563857 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111563991 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 111564061 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111564288 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111564334 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111564362 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111564378 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 111564394 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111564468 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111564628 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111565014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111565084 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111565133 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111565193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111565301 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111565332 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111565343 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111565398 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111565434 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 111565653 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 111565658 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 111565758 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 111565784 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111565786 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 111566142 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 111566198 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111566448 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111566469 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 111566518 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 111566617 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 111567296 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111567463 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111567606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111567712 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111568211 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111568731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111568850 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111569024 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 111569168 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111569213 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111569405 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 111569459 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 111569485 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111569566 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111569636 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111569657 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111570034 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111570043 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 111570084 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111570152 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111570383 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111570452 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 111570478 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111570501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111570714 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111570805 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111570845 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111570851 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111570967 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111571310 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111571324 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111571670 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111571683 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111571768 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111572011 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111572013 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111572129 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111572161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111572162 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111572317 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 111572345 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111572510 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 111572586 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 111572625 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111572876 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111572978 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111573127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111573191 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111573332 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111573381 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111573484 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111573829 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111574232 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 111574677 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 111574697 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111574704 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111574741 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 111574803 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111574841 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111574847 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 111575139 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111575239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111575294 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111575307 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111575350 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111575375 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111575482 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 111575573 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111575576 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111575605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111575650 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111575667 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 111575691 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111576082 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 111576433 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111576446 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111576460 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111576486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111576521 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111576681 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111576903 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 111576966 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 111576986 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 111577101 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111577110 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 111577394 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111577436 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111577468 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 111577715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111577762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111577849 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111577876 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111578041 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111578488 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 111578547 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111578603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111578817 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111578905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111579120 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111579145 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111579171 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111579198 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111579218 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111579224 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111579271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111579428 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 111579429 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 111579486 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 111579496 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 111579500 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 111579514 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 111579540 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 111579566 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 111579572 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 111580133 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 111580317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111580335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111580596 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111580634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111581316 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 111582204 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111582300 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111582657 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111582918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111582991 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111583316 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111584411 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111584449 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 111584647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111586020 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111586726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111587295 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111588070 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111589232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111591334 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111592189 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111592447 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 111592893 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111593101 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111593797 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111595458 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111595998 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111596217 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 111597538 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111599206 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111599690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111602368 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111602432 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111602644 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111603811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111605593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111607212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111607602 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111609159 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111609678 G A Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 111610113 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111610326 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111610452 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111610902 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111610921 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111612319 C G Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 111613597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111615478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111615864 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111617393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111617527 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 111618750 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111618992 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111619101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111619548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111619608 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111620010 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111620231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111620336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111620500 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111620554 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 111620662 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111621099 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111621992 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111622059 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111622066 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111622104 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111622372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111622455 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 111622616 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111622646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111622855 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111622863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111622896 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111623221 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111623297 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111623949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111623967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111623975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111624066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111624251 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111624375 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111624377 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111624392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111624398 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111624492 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111624613 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111624704 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 111624739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111624906 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111624963 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111624964 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111625122 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111625162 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111625189 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111625233 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 111625292 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111625300 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 111625384 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 111625700 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111625913 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 111625924 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 111626207 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111626486 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111626492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111626531 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111626636 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111626637 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111626707 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111626799 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111626836 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111626970 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111627003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111627031 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 111627126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111627143 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111627151 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111627163 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111627555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111627730 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111627773 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 111627863 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 111628168 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 111628672 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111629061 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111629074 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111629081 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111629094 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 111629109 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 111629204 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111629214 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111629224 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 111629230 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111629323 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111629549 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111629599 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111629600 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111629612 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111629721 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 111629722 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111629743 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111629780 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 111629790 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 111629818 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 111629965 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111630132 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111630142 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111630234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111630261 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111630393 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 111631001 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111631160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111631197 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111631345 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111631659 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111631665 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111632596 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 111632623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111632887 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111632889 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111633081 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111633148 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111633150 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111633160 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111633231 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111633244 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111633414 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111633436 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111633581 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111633674 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111633717 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111633783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111633942 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111633990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111634066 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111634182 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 111634241 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111634383 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111634397 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111634462 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 111634468 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111634833 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111634865 T A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 111634880 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 111634941 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 111635119 C A N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 2 111635132 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 111635712 G C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 111635921 G A Y Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 111635999 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 111637661 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111637705 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111637769 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 111637778 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 111637883 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111637901 C T Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 2 111638049 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 111638215 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111638266 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111638273 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 111638323 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111638393 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 111638511 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111638515 G T N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 111641066 T G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 111641095 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 111641225 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 111641252 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111641303 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111641601 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111641613 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111641784 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111641811 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111641832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111641852 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111641946 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111641952 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111641984 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111642176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111642203 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111642243 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111642247 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111642289 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111642337 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111642442 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111642605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111642893 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111643002 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111643069 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111643088 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111643125 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111643139 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111643168 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111643200 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111643267 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111643279 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111643374 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111643401 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111643453 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111643544 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111643975 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111643977 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111644010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111644082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111644084 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111644247 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 111644294 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 111644499 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111644545 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111644656 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111644832 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111644990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111645208 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111645321 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111645419 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 111645461 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111645468 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111645513 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111645700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111645751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111645761 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111645772 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111645836 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111645930 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111645962 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111645982 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111646049 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111646132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111646360 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 111646482 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111646563 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111646625 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 111646637 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 111647090 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111647122 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111647150 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111647173 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111647222 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111647255 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111647440 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111647504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111647613 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111648276 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111648391 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111648655 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111648784 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111648884 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111648969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111648974 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111649040 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111649180 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111649268 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111649466 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111649556 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111649589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111649611 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111649652 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111649729 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111649741 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111649769 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111649811 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111649834 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111650022 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111650360 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111650403 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111650489 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111650536 A C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 111650608 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111650728 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 111650879 C T N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 111650884 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 111650970 T A N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 111651118 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 111651172 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111651244 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111651269 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 111651371 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111651386 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111651402 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111651577 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 111651659 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 111651690 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 111651800 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111651916 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111652025 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111652060 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111652103 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111652116 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111652188 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 111652314 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 2 111652493 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111652538 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111652584 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 111652678 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111652714 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111652758 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111652873 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 111652919 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111653018 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111653048 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111653118 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111653184 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111653229 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111653332 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111653340 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111653449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111653521 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111653623 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111653631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111653671 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111653674 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111653712 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111653785 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111653791 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111653882 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111653936 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111653992 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111655057 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 111655090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111655168 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 111655173 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 111655193 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 111655203 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 111655204 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 111655263 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111655358 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 111655397 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 111655399 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 111655446 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 111655448 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 111655478 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 111655501 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111655557 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111655615 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111655750 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111655789 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111655839 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 111655846 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 111655853 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111655992 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 2 111656097 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 111656111 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 2 111656301 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111656345 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 111656363 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 111656449 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 111656486 T A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 111656491 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 111656603 C A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 111656622 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 111656644 A G N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 111656646 C G N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 111656710 G A N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 111656728 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 111656753 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 111656832 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 111656844 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 111656872 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111656882 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111657036 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111657116 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111657177 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 111657210 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 111657313 C A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 111657340 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 111657374 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 111657409 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 111657412 C G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 111657533 T A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 111657645 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 111657719 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111657731 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111657762 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111657795 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111657911 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 111657924 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111658073 T C Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 111658265 T A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 111658387 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 111658395 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 111658442 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 111658448 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111658481 C A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 111658572 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 111658599 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 111658602 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 111658716 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 111658739 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111658808 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111658812 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111658866 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111658887 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111658911 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111658925 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111659013 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111659024 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111659118 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111659119 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111659142 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111659225 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111659227 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111659296 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 111659430 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111659480 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 111659581 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111659596 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111659668 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111659684 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111659704 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111659725 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111659769 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111659801 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111659839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111659843 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111659898 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 111659999 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111660049 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 111660103 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 111660168 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111660187 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111660269 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 111660286 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111660321 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111660358 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 111660480 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 111660600 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 111660653 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111660678 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111660687 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111660689 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111660723 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111660743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111660752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111660800 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111660810 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111660829 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111660840 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111660874 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111660883 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111660890 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111660900 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111660931 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111660966 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111661002 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111661056 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 111661241 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111661281 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111661324 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111661379 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111661583 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111661787 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 111661832 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111661908 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111661943 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111662083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111662272 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111662287 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111662299 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111662334 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111662395 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111662397 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 111662409 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 111662431 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 111662456 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 111662532 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111662641 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 111662691 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111662694 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 111662718 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 111662757 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111662840 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111662961 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 111663097 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 111663115 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 111663156 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111663312 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111663406 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111663422 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111663438 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111663496 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111663557 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111663759 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111663814 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 111664403 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 111664432 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 111664438 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 111664536 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 111664576 A C N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 111664735 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111664736 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111664749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111664761 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111664772 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111664893 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 111664943 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 111665025 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 111665046 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 111665369 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 111665422 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111665546 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 111665549 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111665625 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111665649 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111665651 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 111665785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111665809 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111665843 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111666059 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 111666116 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 111666121 A G N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 111666506 T G N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 2 111666660 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 111666695 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111666696 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 111666707 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111666895 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 111666914 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 111666926 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111667005 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111667464 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 111667485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111667495 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 111667509 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111667573 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111667589 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111667674 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111667781 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111667833 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111667952 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111667995 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111668138 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 111668176 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111668449 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 111668514 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111668589 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111668601 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111668602 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111668669 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111668752 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111668803 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111668929 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111668974 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111669041 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 111669161 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111669200 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 111669336 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 111669339 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111669372 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 111669715 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111669986 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111669996 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111670360 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111670406 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111670446 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111670540 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111671055 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111671089 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111671213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111671248 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111671249 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111671569 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111671589 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 111671622 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 111671669 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 111671712 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 111671744 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 111671858 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 111671896 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 111672197 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111672441 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111672510 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111672574 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111672581 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111672606 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111672620 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111672621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111672711 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111672866 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111672893 G C Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 111673029 G A Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 111673039 C T Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 111673040 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 111673095 C A Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 111673110 C A Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 111673145 A G Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 2 111673366 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 111673397 G C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 111673516 C T Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 111673544 A C Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 111673596 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 111673598 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 111673667 T G Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 111673729 C A Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 111673817 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111673889 G T Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 111673945 T C Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 111674141 C A Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 111674542 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111674642 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111674657 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111674897 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 111675139 G A Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 111675156 C A Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 111675373 A T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 111675596 A C Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 111675627 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 111675731 C A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 111675843 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111675866 G A Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 111675879 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 111675913 G T Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 111677125 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 111682691 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111682706 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111682793 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111682809 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111682845 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111682862 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 111682890 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111682931 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111683059 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111683086 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111683203 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111683299 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111683336 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 111683351 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 111683355 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111683438 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 111683461 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 111683582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111683596 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 111683764 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111683989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111684005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111684044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111684058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111684155 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111684209 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 111684238 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 111684318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111684338 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111684346 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111684351 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111684371 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111684390 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111684462 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 111692102 T G N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 2 111692106 C T Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 111692289 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 111692372 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111692379 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111692435 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111692480 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111692516 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111692518 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 111692653 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111692684 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111692722 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 111692745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111692775 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 111692860 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 111692861 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 111692892 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111692912 G A Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 111692949 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111692969 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111693050 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111693213 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 111693227 C G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 111693298 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111693319 C G Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 111693328 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 111693410 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111693424 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 111693454 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 111693530 C G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 111693556 C A Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 111693664 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 111694068 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111694101 A T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111694745 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111694833 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 111694840 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 111694990 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111695033 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111695049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111695190 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 111695323 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111695327 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111695443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111695543 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 111695548 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 111695595 C G Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 111695781 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 111695854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111695968 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111696089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111696099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111696332 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111696392 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111696529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111696548 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111696610 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111696625 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111696785 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 111696788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111696919 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 111696944 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111697091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111697128 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111697233 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111697429 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111699539 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111699600 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111699633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111699673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111699804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111699843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111699860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111700145 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111700161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111700203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111700230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111700459 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111700575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111700581 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111700612 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111700676 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111700882 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111700938 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111700973 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111701080 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 111701123 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111706609 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111706733 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111706753 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111707096 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111707097 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 111707114 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111707162 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 111707165 G C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 2 111707263 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111707276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111707312 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111707333 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111707373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111707398 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111707443 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111707450 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 111707533 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111707561 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111707611 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111707683 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 111707776 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111707785 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 111707810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111707818 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111707946 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111707947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111707965 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111708065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111708176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111708330 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111708546 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111708554 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111708701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111708813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111708900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111709080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111709090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111709197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111709236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111709294 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111709357 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111709369 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111709412 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111709863 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 111709957 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 111709968 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 111709976 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111709979 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111709998 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111710016 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111710017 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 111710226 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 111710272 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 111710318 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111710388 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 111710438 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 111710453 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 111710454 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 111710476 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 111710629 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111710669 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111710686 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111710710 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 111710743 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111710755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111710764 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111710886 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111710960 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111710999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111711000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111711136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111711150 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111711223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111711282 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111711312 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111711330 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111711349 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111711363 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111711501 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111711559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111711582 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111711740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111711974 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111712008 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111712035 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111712081 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111712090 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111712104 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111712145 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111712168 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111712176 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111713011 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111713062 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 111713624 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111713945 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111714503 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111714697 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 111715385 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 111715903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111715977 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111716010 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111716104 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 111716223 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 111716553 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 111716885 A C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 111717838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111718005 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 111718207 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 111718456 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 111719349 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 111719624 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 111720377 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111720543 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111721167 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111721274 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111721329 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111721630 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111721769 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111721783 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 111721842 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111721996 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 111722464 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111722579 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111722594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111722694 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 111722971 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 111723156 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111723177 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111723448 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111723881 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111724054 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111724660 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111724701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111724874 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111724937 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 111725212 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 111725223 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111725244 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111725433 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111725455 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 111725769 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111726203 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111726232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111726448 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111726454 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111726643 C A Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 111726856 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 111727096 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111727157 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111727664 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111742318 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 111742791 A C N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 111742893 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 111743003 A T Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 111743568 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 111743609 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 111743761 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111743785 A C N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111743790 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111743825 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 111743851 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 111743981 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 111745140 A C Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 111746413 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 2 111747386 G A N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 111747490 C G N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 111747507 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111747672 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 111747690 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 2 111747995 A G N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 111748130 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 111748144 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 111748161 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 111748528 C T N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111748589 C A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111748604 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111748690 C T N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111748725 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111749034 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 111749060 T G N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111749448 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111749461 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111749653 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111749659 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111749730 G T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111750285 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 111750459 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111750468 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 111750524 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 111751113 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 111751177 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 111752495 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111752498 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111752599 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111752647 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 111752954 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 111753701 G C N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 111753987 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 111754169 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111754432 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 111756257 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 111757145 A G N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 111757202 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111757276 C T N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111757507 T G N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 111757617 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 111757847 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 111758082 T A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 111758243 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 111758288 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 111758295 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 111763534 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 111763575 C G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111764334 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 111764349 T G Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 111765460 G T Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 111765466 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111765535 A C N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 111766399 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 111766433 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111766441 C G N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 111766878 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111767154 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111767578 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111768357 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 111769996 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111770148 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111770315 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111770408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111770540 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111770766 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111770985 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111771021 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111771122 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 111771170 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111771281 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111771641 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111772183 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 111772511 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 111772601 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111772729 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 111772970 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111773653 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111773797 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111774123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111774167 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111774247 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111774702 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 111775361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111775409 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111776261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111776279 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111776473 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111776975 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111777017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111777232 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111777242 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111777379 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111777449 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111777602 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111777796 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111777922 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111777937 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111777966 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111778318 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111778811 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111779031 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111779167 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111779605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111779633 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111779794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111780866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111780960 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111781103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111781287 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111781394 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111781402 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111781414 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111781976 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111782046 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111782386 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111783037 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111783417 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111783432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111783577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111783750 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 111783849 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 111784371 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111786914 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111787264 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111788188 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111789167 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 111789447 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111789856 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111789937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111789947 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111791186 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 111791262 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111791275 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111791591 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111791629 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111792122 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111792165 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111792283 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 111792490 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111792565 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111792647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111793110 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111793276 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111793772 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111794105 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111794276 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111794628 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111794915 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111795069 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 111795636 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111796087 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111796469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111797067 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111797145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111797475 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111798266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111798505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111799505 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111799667 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 111800145 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 111800589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111800935 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111801322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111801364 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 111802488 C G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 111802520 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111802578 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111803336 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111804830 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111805274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111806519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111806840 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111806991 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111813432 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111816000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111816099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111816337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111816564 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111817726 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 111818426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111818504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111819071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111819335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111820923 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111823058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111827039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111829280 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111831358 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111835261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111836640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111838086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111839427 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111840095 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111843922 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 111847633 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 111848171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111850678 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111851142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111852207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111852653 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 111854092 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 111854135 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 111855995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111856600 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 111856637 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 2 111856643 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 111856649 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 111856655 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111857486 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111859176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111862687 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111864026 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111864927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111865689 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111867422 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 111868466 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111868799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111869129 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111871102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111871347 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111872136 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111872773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111873426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111873832 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111874478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111874787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111875121 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 111876139 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111876378 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111877578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111877661 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111877765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111877779 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111877784 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111877804 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111877917 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111877941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111878081 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111878164 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 111878431 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 111878460 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111878501 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 111878702 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 111878792 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111878972 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111881024 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111883242 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111885178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111886544 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111886653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111891554 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111892714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111893308 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111893803 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 111900938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111902370 A T Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 111905668 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 111908604 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111909615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111909749 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111910555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111912157 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 111912397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111913066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111913583 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111914320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111918743 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 111918756 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 111918863 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 111918976 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 111919035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111919038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111919223 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 111919225 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 111919433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111919450 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111919462 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 111919525 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111919561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111919573 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111919839 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 111919920 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 111919971 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 111920017 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111920070 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 111920071 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111920090 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111920111 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 111920116 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111920183 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111920257 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 111920440 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 111920485 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 111920538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111920666 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111920682 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 111920702 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 111920803 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 111920844 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 111920871 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111920882 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111920883 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111920956 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 111920957 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111921038 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 111921175 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111921195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111921226 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 111921245 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111921320 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111921378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111921398 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 111921411 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111921414 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 111921509 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111921523 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111921661 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 111921672 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 111921735 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111921742 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111921784 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 111921796 A T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 111921807 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 111921863 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111929610 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111929694 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 111929868 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111929946 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111930074 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111930077 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111930119 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111930364 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 111930429 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111930505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111930547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111930585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111930617 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111930624 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111930636 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 111930842 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111930858 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111930912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111931002 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111931182 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 111931209 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 111931235 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111931272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111931284 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 111931367 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111931392 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111931598 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111931653 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111931680 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111931722 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 111931796 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111931867 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 111931877 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 111931885 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 111931957 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111931999 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111932029 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111932074 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 111932113 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111932115 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111932476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111932563 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 111932684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111932926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111933108 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111933123 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111933140 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111933473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111933789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111933936 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111934403 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111934448 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111934527 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111934603 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111934617 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111934629 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111934756 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111934811 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111934918 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111934981 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111934992 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111935224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111935239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111935547 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111935631 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 111935678 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111935753 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111935756 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111935811 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111935871 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111935903 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111936037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111936094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111936170 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111936236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111936266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111936300 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111936484 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111936518 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 111936781 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111936874 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111936971 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111937101 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111937157 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 111937375 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 111938042 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 111938062 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 111938274 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 111938410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111938415 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111938503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111938549 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 111938670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111938890 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 111940226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111940245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111940291 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111941851 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 111942118 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111942425 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 111942517 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111944371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111944846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111945039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111945903 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111947510 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111948697 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111948858 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111949294 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111949324 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 111950615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111954773 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111955724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111956948 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111957042 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111957408 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 111957591 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 111958294 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111958572 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111958735 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 111959884 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111961046 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 111961932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111962214 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 111962426 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 111962615 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111963145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111964771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111964781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111965086 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 111965228 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111965323 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111965699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111966617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111967093 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111967552 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111968682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111969322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111969567 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111969644 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111970130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111973710 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 111974132 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111974943 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111976935 A T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 111976959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111977329 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111977385 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 111977501 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111978166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111978304 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111978651 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111979078 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 111979804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111980031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111980351 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111980537 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 111982217 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 111983150 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111983586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111983781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111985064 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111986731 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111988315 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 111988620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111990101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111990859 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 111991077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111991638 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111991961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111992155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111992493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111993549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111994368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111995777 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 111996057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 111997163 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 111997996 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 111998753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112000045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112000590 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 112004165 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 112007277 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 112007866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112008256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112008845 C G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 112009051 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112009072 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112011063 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 112011867 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112012204 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 112012795 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 112013469 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 112016490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112017157 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112017842 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112018840 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 112020239 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112021200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112023094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112024845 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112025821 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112026129 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 112028496 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112028520 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112028579 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112031196 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112032622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112032691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112034268 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112034985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112035403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112035857 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 112036310 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 112036808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112037078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112037150 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112038466 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 112038903 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 112039010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112040120 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112040375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112040756 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 112040765 C G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 112046369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112048551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112049737 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 112054226 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 112054793 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112055221 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 112055311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112055435 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112055457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112055600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112055906 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 112055913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112056158 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 112056669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112059760 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 112059777 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 112060063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112060802 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112060862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112061531 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 112062280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112071706 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 112071746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112071836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112072073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112072210 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 112072641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112073472 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 112073580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112073845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112074042 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 112074227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112074330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112074360 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 112074714 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112074859 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 112074878 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 112077209 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 112081770 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112083706 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112084632 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112084658 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112085507 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 112085610 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 112086467 G T N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 112086796 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 112087055 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112087747 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112087790 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112088272 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112088306 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112091406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112091555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112091678 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112091725 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 112092049 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112092235 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112092372 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112092872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112092906 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112093367 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 112093586 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 112093599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112095089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112095696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112098550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112099296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112102402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112102648 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112103132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112103176 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112106717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112107316 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112107356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112107513 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 112109604 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 112110335 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 112110388 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 112110593 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 112110666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112114135 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 112114444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112114765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112114775 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 112115931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112117216 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 112118793 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112120105 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112120778 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 112122552 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112126251 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112129210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112129444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112131547 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112133271 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 112133286 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 112134961 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 112135881 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112139637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112141861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112142379 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 112144709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112144967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112145068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112145517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112147267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112147790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112148806 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 112148832 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112148964 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112148981 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 112149912 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112150210 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 112150331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112150392 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 112150747 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 112151194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112151290 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 112151617 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112151731 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 112152400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112152613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112152636 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 112152656 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112152657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112152721 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 112153991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112154007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112154225 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 112154251 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 112154611 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112155258 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 112155619 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112155709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112155768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112155921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112156064 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 112156152 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112156510 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112156839 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 112157039 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 112157149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112158061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112158299 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112158760 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112158950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112169532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112171298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112171557 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112173121 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 112173850 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112174070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112176429 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 112176580 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 112176948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112177164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112177466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112177994 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 112178074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112179774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112179957 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112180088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112180248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112180327 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112181042 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 112184535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112184881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112191112 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 112191550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112191705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112195586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112197413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112197860 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112198126 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 112198928 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112199016 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112199048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112206399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112208129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112208692 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112211876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112211927 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112212522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112212571 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 112212766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112214244 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112214245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112214778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112215584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112217166 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112217878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112219460 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112220368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112220593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112220801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112222019 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112225412 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112225760 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112225811 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112226588 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 112227761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112228101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112228380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112231422 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 112232824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112232881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112233806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112234701 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 112235742 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112235843 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 112235937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112236572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112238703 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112239316 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112240436 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112241085 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 112241988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112242058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112242547 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112243887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112247175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112247412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112247645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112248168 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112249413 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112249609 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112252182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112254393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112256369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112264061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112265552 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112265851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112265901 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 112266063 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112266368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112266762 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112267000 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112268091 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112268394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112268791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112269844 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112270051 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112275052 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 112275827 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 112275974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112277634 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112278353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112279495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112281673 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 112281888 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112281916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112282054 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112286930 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112287636 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112287846 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112288061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112290001 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 112290878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112290968 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112290998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112291009 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 112291029 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112291295 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112291324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112291533 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112293209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112294571 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112294877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112294879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112298146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112298990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112300527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112300896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112301087 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 112302789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112303517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112305119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112305798 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 112305879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112305881 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112306067 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112306161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112306185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112306742 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 112309323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112309522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112310990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112311481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112311548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112311684 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112311904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112312110 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112314065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112314349 T G Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 112314468 A G N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 112314704 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 112316261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112316374 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 112316678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112318041 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 112318074 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 112318527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112318752 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112318895 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 112318904 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 112318968 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112319009 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 112319285 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112319953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112320133 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 112322156 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 112322794 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 112322911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112325835 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112328495 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112328757 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 112329168 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112329905 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112331824 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112332649 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112332674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112332692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112333693 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112334092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112338023 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 112338024 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 112346658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112347270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112348064 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112348217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112348785 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112350072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112351878 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112352346 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112353215 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112354244 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 112354269 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 112355016 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112355036 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112355865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112357477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112358575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112358877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112359310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112362486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112364439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112365451 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112366148 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112366624 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112366793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112367233 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 112367693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112368425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112371386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112374591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112376592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112377866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112384914 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 112385971 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112388546 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112396041 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 112396087 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 112396275 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 112396377 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 112396467 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112399789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112399939 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112401023 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112403031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112403332 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112403512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112404426 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112405034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112405116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112405207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112405679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112405873 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112405892 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112405915 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112406146 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112406381 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112407134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112407607 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112407934 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112408006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112408016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112408102 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112408181 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112408182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112408306 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112408347 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112408451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112410405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112410468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112410501 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112410504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112410528 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112410633 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112410695 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 112410699 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 112410779 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112410798 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112410870 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112411000 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 112411130 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112411286 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112411288 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 112411553 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112411636 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 112411781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112411868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112412007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112412127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112412160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112412187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112412204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112412230 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112412233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112412249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112412275 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112412287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112412305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112412384 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112412399 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 112412564 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112412570 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112413685 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112414769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112415118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112417274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112417880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112417899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112419743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112422078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112423690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112424046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112424199 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112427650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112428564 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112428632 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112428943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112428991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112431887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112432003 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112432565 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112433686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112437109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112437123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112438316 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112438573 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112438576 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112438708 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112438733 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112438997 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 112439278 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 112439510 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112439758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112440141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112440148 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112440158 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112442339 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 112444685 G A Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 112444721 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 112445223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112445451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112445468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112445982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112447095 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112447466 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112448715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112450107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112450347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112450658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112451480 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112454108 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112454610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112458453 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112458747 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 112460908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112461286 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112461860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112462795 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112463954 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112466418 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 112467505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112468505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112469840 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112470054 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112471751 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 112473645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112475725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112475902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112480049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112480169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112480692 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112481125 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112482215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112482569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112482587 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112483384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112483974 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112484668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112484728 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112486531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112486853 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112487493 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 112487801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112488973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112489136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112489148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112489550 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112491622 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 112491656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112491775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112491829 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112491891 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 112491910 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112491913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112492208 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112492342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112492391 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112496288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112496759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112499246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112499844 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 112500577 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112501562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112501994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112502358 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112505029 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 112507105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112507910 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112508386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112508611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112508827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112509412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112511963 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112512358 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112512423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112512497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112512548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112513605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112514814 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112518042 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112518057 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112518084 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112518102 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112518463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112518624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112520305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112521652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112521725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112522611 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112522830 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112523042 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112524514 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112524898 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112525458 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112525830 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112526100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112526848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112526949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112527380 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112527470 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 112527581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112527958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112528061 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112528064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112528255 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 112528409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112528597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112528828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112528842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112529661 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112529710 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112529712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112530313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112530511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112530850 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 112531412 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 112531954 T G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 112531993 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112532041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112532048 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112532631 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112533510 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 112533719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112533778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112534390 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112534412 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112534748 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112535025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112535478 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112535601 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112536212 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112536289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112536566 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112536621 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112536862 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 112536912 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 112537161 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 112537242 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112537369 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112537418 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112538220 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 112538365 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 112538370 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 112538402 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 112538463 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112538521 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 112538523 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 112538544 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 112538620 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 112538652 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 112538747 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 112539661 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 112539873 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 112540325 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 112540411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112540949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112549691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112551289 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 112551829 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 112553057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112555460 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112556799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112558104 C G Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 112558133 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 112558160 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 112559308 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 112559412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112561113 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112561208 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 112561460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112561515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112562615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112563080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112563369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112565471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112566729 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 112566813 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 112567303 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112567552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112567648 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 112567813 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 112567875 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112567947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112567966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112568150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112568283 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112568400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112568501 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112568546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112568612 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112568823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112568941 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112569919 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112569984 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112570224 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112570320 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112570408 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112570908 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112570971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112571033 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112571245 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 112571431 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112571441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112571452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112571565 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112571615 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112572009 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 112572245 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112572246 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 112572268 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 112572351 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112572701 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 112572766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112572770 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 112573004 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112573090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112573518 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 112573735 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 112574521 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 112575135 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 112576171 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 112576204 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 112582528 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 112582965 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112584269 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 112584836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112584991 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 112586414 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 112586468 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 112586757 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112586815 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 112587314 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112587341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112587423 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 112587490 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112587518 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 112587826 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 112588025 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112588278 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112588292 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112589043 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 112591071 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112591540 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 112592474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112592475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112593362 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112593598 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112593736 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112593862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112594054 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 112594103 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 112594193 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 112594262 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 112594287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112594312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112594379 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 112594528 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112594629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112594858 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112594869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112594891 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112594917 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112594918 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 112595027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112595258 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112595309 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112595329 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112595331 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112595410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112595411 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112595522 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112595559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112595728 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 112595746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112595764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112596562 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112596584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112596692 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112596893 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112597030 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 112597305 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 112597306 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 112597404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112597739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112598045 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112598235 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 112598241 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 112598272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112598382 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112598397 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112598420 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 112598488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112598504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112598519 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112598572 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112598658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112598702 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112598759 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112598955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112599029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112599207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112599244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112599250 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112599271 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 112599372 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 112599401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112599428 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 112599598 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 112599622 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112599687 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112599694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112599789 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112599795 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 112599845 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 112599914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112600003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600021 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600042 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600235 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 112600247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600391 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600509 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 112600561 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112600670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112600961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112601004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112601143 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 112601157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112601551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112601979 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 112602166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112602208 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 112604271 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 112604613 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 112605178 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112605305 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 112605907 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 112608014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112608305 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 112608319 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 112609515 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 112609549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112609701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112610208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112610233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112610265 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112610318 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 112610328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112610448 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112610649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112610708 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112610750 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112610777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112610787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112610853 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112610875 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112610917 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 112610957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112610992 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 112610995 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112611109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112611157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112611261 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112611437 A T Y N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 112611536 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 112611771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112611970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112612140 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 112612342 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 112612560 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112612689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112613483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112613548 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 112613665 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 112613673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112613734 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 112613735 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 112615331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112616494 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112616913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112616917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112617296 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112617525 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112617626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112618588 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112619055 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112619061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112619196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112619217 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 112619220 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 112619272 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 112619285 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 112619325 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112619776 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112619898 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112620068 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 112620083 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 112620363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112620429 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112620436 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 112620454 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 112620495 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112620500 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 112620541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112620661 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 112620712 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112620745 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 112620789 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 112620839 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112620840 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 112620895 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 112620953 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 112620955 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 112621007 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112621683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112621915 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112622026 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112622273 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112622677 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112622737 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112622975 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112623000 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 112623233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112624076 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112624193 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112624576 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112624646 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112624759 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 112624774 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 112625080 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 112625109 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 112625114 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 112625187 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 112625259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112625367 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112625368 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112625448 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112625575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112625577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112625639 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112625797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112625883 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112625916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112626050 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112626257 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112626381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112626483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112626503 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112626622 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112626637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112626688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112626814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112626882 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112626941 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112627035 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112627093 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112627194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112627208 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112627327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112627386 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 112627418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112627450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112627461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112627463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112627472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112627753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112627798 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112627847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112627860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112627902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112627927 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 112628047 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 112628174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112628357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112628411 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 112628496 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 112628698 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112628710 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 112628781 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112628834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112628975 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112629027 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112629058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112629158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112629320 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 112629337 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112629452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112629640 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112629673 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112630405 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112630771 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112630788 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112630871 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112630919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112632640 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112633035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112633701 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112634043 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112634044 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112636047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112636523 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 112637213 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112638361 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112639105 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112639153 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112639218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112639269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112639888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112640542 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112641375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112641710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112641883 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112641919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112641922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112641977 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112641990 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112642069 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112642094 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 112643467 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112643730 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 112644496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112644547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112645034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112645084 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 112645097 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112646389 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 112646669 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 112646686 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 112646711 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 112646842 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 112647016 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 112647192 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 112647337 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 112647378 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112647557 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 112647565 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 112647618 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 112647916 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 112647987 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 112648287 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112648379 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 112648964 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112649366 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112649403 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112649578 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 112649979 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 112650303 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 112650366 T A Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 112650411 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 112650584 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112650735 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112650898 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 112650990 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 112650994 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 112651043 A C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 112651080 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 112651467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112651708 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 112651909 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112651998 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112652365 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 112652572 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 112653065 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 112653158 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112653225 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 112653293 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112653451 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 112653615 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 112653661 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112653744 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 112653891 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112654062 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112654214 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 112654236 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 112654246 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 112654272 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112654360 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 112654519 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 112654531 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112654782 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112655263 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112655332 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 112655381 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112655502 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112655577 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 112655581 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 112655700 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 112655718 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112655743 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112655789 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112655812 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112655832 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112656075 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 112656184 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112656817 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112657048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112657201 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 112657729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112658616 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112658885 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 112658976 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112659019 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112659142 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112659203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112659207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112659301 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112659444 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112659514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112659625 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 112659628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112659928 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112659999 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 112660399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112660962 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112661327 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 112661376 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 112661539 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112661581 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112661607 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112662378 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112662782 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112662789 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 112663173 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112663213 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112663431 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112663539 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112663644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112663940 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112664106 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112664112 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112664223 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112664325 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 112664339 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 112664356 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112664510 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 112664529 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112665206 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112666002 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112666221 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 112666446 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 112667644 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112669829 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 112670268 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112670470 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112672035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112672158 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112672203 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 112672309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112672345 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112672753 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112672797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112672823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112674804 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112676636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112678596 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112678718 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112679136 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112679423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112680072 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112680254 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112680270 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112680471 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112680560 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 112680598 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 112681696 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112683410 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 112685613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112686893 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112691191 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 112691396 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 112691624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112691785 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 112691803 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 112691945 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 112692013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112692126 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 112692142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112692356 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112693014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112693317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112693337 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112694156 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 112694212 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 112694220 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112695271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112695388 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 112695644 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112695784 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 112695952 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112696433 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112696818 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112697131 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112697623 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 112697651 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112697712 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112697780 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 112698798 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 112698954 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 112698971 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 112699142 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 112699210 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 112699422 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112699743 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112700415 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 112700507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112701302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112701495 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 112701539 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 112701885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112702140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112702168 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112702282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112702609 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112702827 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112706471 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112708218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112708361 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 112708764 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112709122 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 112709138 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112710580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112711695 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 112714314 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112715058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112715872 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 112717309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112718812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112719002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112720734 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112721912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112722214 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112724247 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112724437 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 112725009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112725129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112725972 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112726031 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 112727240 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112727473 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 112727765 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 112728008 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112728009 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112728883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112729252 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112729546 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112729697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112731351 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112735888 T G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 112737610 G A Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 112739802 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 112740069 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112742192 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 112742489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112743453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112744627 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112745433 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 112745455 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 112746833 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 112746875 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 112747981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112748953 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 112749228 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 112749603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112749708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112750923 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 112751539 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112751838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112756796 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 112760022 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 112762570 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 112763140 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112764621 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 112764926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112764996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112765523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112765728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112766128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112767101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112767718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112768416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112771095 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112771662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112771916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112772982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112773259 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112773260 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112774229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112774286 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 112774465 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 112774517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112775319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112776226 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 112776639 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112777260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112778377 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 112778596 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112778843 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112779106 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 112779799 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 112781426 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112781699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112782725 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 112782978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112783142 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112783292 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 112783382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112784151 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112784191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112784877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112785076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112785092 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112785727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112786190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112786772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112786813 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112788220 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 112789704 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112790490 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112791485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112791620 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112791887 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112792105 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 112792864 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112794347 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 112794427 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112794732 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112797584 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112798190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112798200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112800782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112801701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112801998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112802430 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112802508 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112803748 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 112804078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112804833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112806428 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112808714 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112809314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112809554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112809628 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112810121 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112811570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112811895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112813361 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 112813401 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112814810 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 112815275 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112816516 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112816870 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112817034 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112817035 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112817369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112818949 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 112819216 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 112820804 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 112820911 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112821399 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 112822472 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 112822640 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112822785 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112822786 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 112822804 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 112822807 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 112822858 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 112822897 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 112823015 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 112823162 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 112823610 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112823623 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112823661 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112823728 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 112823817 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112823974 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112824027 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112824418 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 112824531 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112824880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112824953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112825003 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112825164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112825335 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112825464 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112825596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112825777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112825778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112825795 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112825923 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112826295 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 112826582 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112827818 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 112827826 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 112828821 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 112829063 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 112829079 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 112829181 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112829235 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112831724 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 112831839 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112831963 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112832343 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112832387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112832889 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112833043 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 112833172 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 112833266 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 112834620 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 112834840 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 112834993 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112835204 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 112835836 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112836181 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112836269 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112836321 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112836617 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 112836705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112836721 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 112836758 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112837254 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112837440 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112837463 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 112837494 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 112837512 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112837605 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 112838128 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112838264 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112838612 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112838722 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 112838779 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112839030 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112839302 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112839354 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112839361 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 112839544 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112839746 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 112840022 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 112840235 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112840454 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 112840865 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112841027 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112841068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112841111 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 112841191 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 112842067 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112842136 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112842142 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112842385 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 112842399 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 112842408 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112842444 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112842521 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112842532 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112842863 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112842971 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 112843024 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112844055 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112844490 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112844607 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112844774 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112844981 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112845052 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112845093 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 112845313 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112846057 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 112846323 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112846589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112846810 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112846913 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 112847042 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112847105 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112847556 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112847658 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 112847671 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 112847715 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112847751 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112847832 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 112847939 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 112848074 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 112848085 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112848549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112848727 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112848797 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 112848959 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 112851741 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 112852173 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112852199 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 112852240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112853312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112853639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112853710 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 112853805 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 112853888 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112853891 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112853952 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112853974 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112853985 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 112853988 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 112854006 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 112854273 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112854284 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 112854324 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 112854336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112854411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112854532 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 112854652 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112854788 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112854871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112856103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112856327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112856368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112858014 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112858586 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 112859016 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 112859748 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 112859844 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 112860653 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 112862018 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112862427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112862770 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112862981 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112864464 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112865784 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112866050 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 112867497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112867744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112868100 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 112868529 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112869985 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 112870299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112870755 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112871159 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112871222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112871443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112872517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112874492 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 112876920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112877491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112878681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112878755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112879413 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112880590 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 112880684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112881191 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112881346 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112881359 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112883115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112884513 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112884749 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112885295 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 112887117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112887609 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 112887917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112888821 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112890977 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112892695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112892809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112893264 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112895675 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 112896612 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112896613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112896728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112898446 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 112898949 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 112899259 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 112899426 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 112899512 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 112899561 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 112899676 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 112899769 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 112899817 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 112900094 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 112900100 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 112900418 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 112900468 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112900538 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 112900563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112900629 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 112900790 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 112901086 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112901161 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112901359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112902140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112902142 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112902371 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 112902469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112902932 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 112903352 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 112903361 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 112904007 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 112904062 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112904449 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 112904595 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112905051 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 112905086 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112905211 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 112905295 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 112905546 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112905820 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 112906217 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112906461 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 112906569 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 112906690 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112906915 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 112907273 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 112907435 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112907715 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 112907822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112907964 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 112908921 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 112910347 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112910899 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112910966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112911497 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112911538 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112911580 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 112911590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112911624 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 112911677 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 112911854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112911896 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 112911907 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112911912 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112911954 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112911969 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112912021 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112912042 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112912086 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112912102 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112912112 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112912135 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 112912164 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112912171 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112912193 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112912208 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112912216 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 112912301 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112912423 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 112912537 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112912539 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112912707 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112912713 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 112912797 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 112912825 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 112913122 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 112913431 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 112913437 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 112913458 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112914000 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 112914002 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 112914035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112914183 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 112914242 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112914257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112914296 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 112914331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112914360 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 112914400 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 112914423 C A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 112914465 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 112914469 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112914484 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 112914490 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 112914516 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 112914542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112914608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112914768 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 112914905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112914924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112915146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112915183 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112915386 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 112915700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112915719 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 112916337 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 112916345 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 112916566 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 112916702 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 112916706 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 112917057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112917219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112919203 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112921851 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 112921988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112922353 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112922839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112923041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112923357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112923409 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 112923622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112924233 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 112924348 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 112924378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112924867 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 112925165 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 112925197 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112925309 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 112925407 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 112925410 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 112925495 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 112925516 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112925565 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 112925578 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 112925614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112925750 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112925832 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 112925840 A T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 112926086 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 112926104 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 112926133 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 112926136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112926144 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 112926259 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 112926267 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 112926312 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 112926452 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 112926483 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 112926504 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 112926527 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 112926817 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 112926872 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 112926886 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 112926929 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 112927102 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 112927175 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 112927240 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 112927295 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 112927299 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 112927322 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 112927637 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 112927893 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 112927946 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 112927999 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 112928032 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 112928041 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 112928248 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 112928436 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 112928448 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 112928476 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112928698 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 112928750 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 112928881 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 112928908 G T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 112929072 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 112929601 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 112929618 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112929620 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 112929798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112930030 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 112930048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112930185 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 112930435 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112930485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112930544 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112930554 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112931139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112931272 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112931679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112931737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112932261 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112933535 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 112933776 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 112933961 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 112934479 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112934594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112934619 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 112934661 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 112934687 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112934710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112934782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112934836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112934879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112934947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112934963 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 112935379 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112935454 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112942501 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112942513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112942839 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112943244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112943746 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112945276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112948674 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 112949684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112949763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112950346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112950908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112950991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112951006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112951058 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 112951107 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 112951208 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 112951610 A C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 112951628 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 112951637 C A Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 112951945 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 112951973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112952000 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 112952097 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 112952142 A C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 112952223 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 112952229 A T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 112952436 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 112952510 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 112952578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112952579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112952758 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 112952783 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 112952792 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 112953186 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 112953202 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 112953283 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 112953478 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 112953844 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 112953925 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 112954100 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112954251 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 112954342 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 112954641 A C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 112954643 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 112954768 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 112954843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112956166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112956209 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 112956405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112956849 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112956949 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 112958886 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112959446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112959847 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112960866 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112961153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112961238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112961259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112961527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112961552 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112962309 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112962421 G A Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 2 112964939 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 112964966 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 112965556 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112966152 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112966370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112966529 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 112966544 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 112966653 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112966768 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 112967218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112967252 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 112967253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112967396 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 112967402 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 112967419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112967532 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112967901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112968016 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 112975678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112975680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112976074 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 112976290 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112976616 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 112977092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112977645 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112977880 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112977940 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112978090 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112978140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112978168 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 112978194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112978254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112978352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112978405 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112978519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112978793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112978925 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112980777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 112982199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112982617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112984492 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112985381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112985947 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 112985951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112986399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112987018 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 112987375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112987609 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 112987611 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 112987800 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 112987931 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 112987989 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 112988017 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 112988140 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 112989002 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112989059 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112989066 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112989105 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112989133 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 112989297 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 112989435 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 112989497 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112989510 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 112989581 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 112989591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112989647 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 112989661 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 112989870 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 112989874 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 112989996 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 112990081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112990129 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 112990169 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 112990182 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 112990335 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 112990359 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 112990425 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 112990430 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 112990594 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112990628 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112990668 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112990691 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112990764 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112990767 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112990923 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 112991002 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 112991022 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 112991127 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 112991149 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112991223 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112991274 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112991317 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112991368 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 112991416 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112991463 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112991483 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 112991610 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 112991611 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 112991643 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112991707 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 112991767 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112991846 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 112991850 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 112991880 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112991988 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112992079 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112992111 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112992122 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112992178 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 112992322 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112992463 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112992477 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 112992767 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112993452 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 112993463 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 112994249 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 112994504 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 112994518 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 112994584 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112995006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112995105 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 112995740 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112995772 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 112995786 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 112995790 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112995851 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112995910 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112995966 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112996091 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112996221 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 112996251 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 112996257 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 112996264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112996342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112996580 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112996673 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112996707 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112996887 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 112996914 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 112996993 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112996994 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112997100 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112997280 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112997302 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112997437 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112997528 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 112997546 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 112997587 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 112997653 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 112997691 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 112997784 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 112997835 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 112997907 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112997970 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 112998226 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 112998241 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 112998245 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 112998258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 112998298 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 112998504 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112998556 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 112998617 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 112998618 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 112998788 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 112998821 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 112998838 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 112998848 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 112998963 C A Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 112999043 C A Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 112999570 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112999635 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112999824 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 112999909 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112999957 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 112999966 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 113000060 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113000077 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113000087 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113000139 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 113000140 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 113000213 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113000381 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113000474 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113000481 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 113000486 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 113000521 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 113000557 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113000572 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 113000671 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 113000737 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 113000778 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113000855 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 113000918 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 113001004 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 113001179 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 113001194 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 113002270 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 113002508 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113002627 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 113002850 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113002908 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113003011 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 113003299 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 113003370 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 113003409 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 113003649 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 113003665 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 113003953 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113004031 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113004076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113004390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113005190 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113005276 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113005277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113005781 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 113005808 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 113005845 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 113005870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113005895 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113006179 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 113006180 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 113006555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113006798 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.0666666666666667 15 15 1 13 1 2 113006854 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 113006996 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 113007014 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 113007174 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 113007326 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 113007327 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 113007409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113007539 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 113007580 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 113007640 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 113007653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113007930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113007964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113008021 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 113008034 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 113008774 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113008815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113008829 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113008949 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113009008 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113009024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113009032 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113009108 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113009134 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 113009197 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113009229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113009314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113009410 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113009773 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113009946 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 113009949 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 113010230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113010275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113010386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113010397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113010455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113010549 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 113010557 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113010574 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113010902 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113010944 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113011121 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113011144 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113011189 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113011213 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113011254 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 113011545 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 113011792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113011846 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 113011866 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 113011978 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 113012219 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113012313 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 113012383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113012493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113012558 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 113012737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113013135 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 113013283 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 113013294 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 113013313 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113013368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113013678 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113013681 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113013732 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 113013755 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113013778 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113013781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113013942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113014026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113014032 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113014119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113014177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113014189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113014204 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113014228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113014229 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 113014409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113014476 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 113014579 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113014709 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113014748 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113014811 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 113015268 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 113015445 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113015526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113015651 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 113015853 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 113015895 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 113015950 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 113015986 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 113016049 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 113016194 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 113016273 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 113016393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113016638 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113016658 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 113016704 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113016904 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 113017202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113017747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113017779 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 113017868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113017943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113018290 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 113018379 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 113018600 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113018700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113018716 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 113018855 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 113018862 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 113019056 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 113019163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113019316 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 113019474 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 113019475 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 113019772 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 113019999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113020074 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 113020087 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 113020147 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113020283 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 113020422 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113020625 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 113020632 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 113021351 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113021515 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113021607 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 113021608 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113021630 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 113021719 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113021830 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113021921 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113021927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113021946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113021955 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113021980 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 113022645 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113022650 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 113023185 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113023244 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113023442 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 113023954 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 113024169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113024379 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113024406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113024611 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 113024700 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113024731 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113024732 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113024927 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 113025178 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113025262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113025296 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 113025354 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 113025435 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113025471 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113025476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113025653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113025917 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 113025974 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 113026139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113026495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113026743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113026778 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 113027894 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113028520 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 113029163 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 113029545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113029660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113030614 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113032302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113032306 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 113032704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113032817 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113035163 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 113035192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113035586 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113035779 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113035793 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 113035865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113036165 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 113036185 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 113036467 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113036503 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113036592 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113036875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113037049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113037125 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113037394 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113037412 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 113037587 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 113037718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113037913 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 113038075 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 113038181 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113038234 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113038492 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113038533 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113039529 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113040301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113040393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113041316 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113043035 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 113043061 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 113043115 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 113043275 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 113043825 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113043857 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113043932 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113043971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113044559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113044570 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113044590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113045086 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113045145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113045378 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113045544 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 113045597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113045610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113045650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113046019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113046085 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113046146 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 113046407 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113046424 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113046482 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 113046537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113046598 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 113046656 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113046708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113046893 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 113047291 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 113047401 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113047471 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 113047473 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 113047508 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 113047532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113047687 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 113047865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113049193 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 113049491 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 113049578 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113049623 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113049913 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113049921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113049984 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113050082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113050161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113050193 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 113050635 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 113050681 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 113050768 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 113050959 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113051557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113051663 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 113051694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113051903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113051972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113051987 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 113052138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113052243 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 113052437 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 113052917 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 113053065 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113053335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113054357 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 113054399 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113054504 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 113054710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113054737 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 113055031 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 113055070 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 113055132 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 113055259 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 113055736 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 113055905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113055983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113056120 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113056315 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113056827 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113057728 A T Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 113059355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113059556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113061646 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 113062434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113062620 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 113063478 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 113063693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113063701 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113063728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113063744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113063806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113064005 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113064733 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113064925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113064930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113066251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113066723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113067224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113067331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113068171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113068251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113068348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113068526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113068534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113068551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113068876 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113069080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113069449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113069695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113070288 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 113070843 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113070963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113071140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113071348 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113071511 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 113071837 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113071843 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 113072269 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113072302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113072387 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113072533 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113072628 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 113072797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113072855 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113072922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113073021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113073187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113073453 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113073536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113073636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113073801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113073990 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 113074032 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 113074045 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 113074123 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 113074132 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 113074140 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 113074191 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113074233 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113074267 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 113074515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113074525 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113074579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113074632 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113074740 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 113074754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113074917 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 113074919 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 113075298 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 113075304 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 113075329 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 113075340 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 113075392 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 113075401 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 113075517 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 113075554 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 113075595 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 113075601 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 113075729 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113075755 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 113075766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113076115 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113076200 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113076213 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 113076578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113076581 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113076654 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113076716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113076790 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 113076795 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113076976 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113077065 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113077294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113077355 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 113077463 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 113077507 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113077568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113077758 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 113077810 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 113077964 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 113077990 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113078345 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 113078428 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 113078512 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113078570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113079297 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 113079625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113079643 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113079677 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113079689 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113079706 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113079765 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113079775 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113079807 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113079824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113080039 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113080095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113080245 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 113080370 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 113080380 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113080448 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113080517 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113080551 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 113080674 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 113080776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113080888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113082339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113096443 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 113098176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113099882 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113100226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113100529 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113100537 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 113103623 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113104695 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 113107204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113107744 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113108577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113109018 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 113109121 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 113109356 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 113111379 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113111390 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 113111652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113112094 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113113032 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113113054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113113103 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113113181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113113345 G T Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 113113402 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 113115346 T A N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 2 113115775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113115911 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 113115928 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 113116053 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 113116064 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113116114 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113116115 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113116167 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113116281 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113116283 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113116438 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 113116914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113117035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113117291 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 113117545 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 113117668 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 113117899 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 113118037 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113118178 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113118453 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113118655 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 113118729 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 113118830 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 113118846 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 113118869 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 113118967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113119087 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 113119402 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 113119425 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113119559 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 113119578 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 113119853 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 113119981 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 113120648 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113120739 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113120751 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 113120778 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113120889 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113120927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113121094 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113121213 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113121777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113121896 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113123502 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113124121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113125488 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 113126596 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113126768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113127751 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113128299 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 113128438 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113128663 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113128696 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113128726 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113128872 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113128991 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113129009 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113129046 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113129072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113129385 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113130299 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113130348 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113130354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113130379 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113130386 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113130986 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 113131070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113131252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113131271 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 113131706 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 113131718 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 113131719 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 113131780 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 113131825 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 113131830 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 113132028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113132373 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113132519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113132731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113132761 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113132768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113132772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113132845 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 113132887 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 113133040 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 113133068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113133080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113133092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113133156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113133296 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113133341 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113133438 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113133458 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113133513 C A N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 113133542 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113133551 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113133740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113133822 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113133927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113134159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113134161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113134178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113134258 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 113134415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113134463 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 113136893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113139337 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 113141975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113142643 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113143372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113143525 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113143526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113143919 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113143965 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113143980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113144023 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113144040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113144076 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113144290 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113144422 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 113144475 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 113144755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113144892 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 113144907 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113145893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113146049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113146087 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 113146681 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113147813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113149107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113149486 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113149490 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113149873 C T N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 113149914 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113149939 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 113150271 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113150279 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113150297 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113150357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113150374 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113150500 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113150503 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113150514 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 113150699 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113150774 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 113150808 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 113150838 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113150841 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113150854 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113150882 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 113151009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113151010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113151146 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 113151173 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 113151291 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 113151357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113151535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113151683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113151764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113151887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113151915 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113152258 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113152487 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113152841 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 113153095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113153101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113153233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113153538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113153694 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 113153734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113153861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113154419 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113154589 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113154721 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113154776 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113155108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113156018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113156115 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113156529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113157063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113157080 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113157110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113157134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113157282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113157906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113158177 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113158357 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113158372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113158412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113158495 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113158499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113158536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113158554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113158565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113158572 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113158586 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113158717 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113158780 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113158990 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113159038 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113159056 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113160242 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 113160470 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 113160739 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113160761 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 113160990 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113161096 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 113161283 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113162498 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113163889 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 113164870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113165338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113165890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113165931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113167309 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113167932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113169068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113169338 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113170425 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113173949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113173975 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113174451 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113176785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113177730 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113179234 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 113180015 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 113180221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113180947 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113181450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113182196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113184121 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 113184335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113185589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113185727 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113186012 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113187069 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113187491 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 113187581 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113187701 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113187729 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113188147 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113188384 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113188668 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 113188737 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 113188844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113189136 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113189442 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 113189595 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 113189840 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 113189960 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113189965 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113190058 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113190161 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113190435 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113190548 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113190968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113191100 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113191131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113191176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113191226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113191337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113191558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113191727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113192435 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113193312 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113193468 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113193711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113193893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113193900 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113193927 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113194038 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113194044 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113194062 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113194066 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113194077 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113194301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113194373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113194376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113194406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113194565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113194571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113194579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113194596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113194635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113194660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113194888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113194945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113194959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113195015 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113195148 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113195222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113195233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113195259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113195288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113195443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113195551 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113196164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113196515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113196640 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113197001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113197127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113197375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113197922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113198338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113198517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113198521 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113198816 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 113198842 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 113198873 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113199052 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113199088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113199310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113199445 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113199556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113200084 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113200527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113200703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113200927 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 113200953 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113201001 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113201022 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113201107 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 113201150 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113201167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113201213 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 113201373 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113201768 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 113202269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113202508 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113202565 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113203282 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113203320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113203687 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113203913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113205118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113207273 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 113208342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113208810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113208964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113211654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113212923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113212926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113212978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113213381 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 113213384 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 113214535 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113215044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113215677 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113215819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113218587 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113218879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113218953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113219630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113219889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113221479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113221622 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113222120 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113222248 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113222249 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 113222275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113222303 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113222304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113222570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113222592 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 113222642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113222950 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113222963 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113223024 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 113223038 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 113223189 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 113223248 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 113223363 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113223450 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 113223534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113223906 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113223914 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 113224162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113224196 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113224284 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 113224287 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 113224802 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113224875 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113225002 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113225077 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113225101 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113225108 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113225157 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113225202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113225483 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 113225510 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 113225806 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113225913 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 113226280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113226437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113226789 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113226907 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113226937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113227066 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 113228380 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113228936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113230690 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 113230769 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 113232205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113232379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113232421 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113236459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113236472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113236637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113236882 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 113237694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113237705 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 113237866 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113238320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113238345 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113238470 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113238586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113238958 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113239201 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113239424 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113239445 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113239453 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113239722 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113241058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113241195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113241322 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113241662 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 113241775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113241877 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113242287 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113242722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113243394 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113243424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113243627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113244063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113244149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113244863 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113245346 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113245578 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 113246160 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 113246631 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 113246680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113246702 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113246736 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 113246752 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 113246830 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113246962 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 113246992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113247028 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113247186 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113247425 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 113247477 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113247503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113247543 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113247597 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113247723 C A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 113247739 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113247802 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113247821 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113247859 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113247864 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113248034 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113248042 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113248046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113248194 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 113248269 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 113248459 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113248511 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113249111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113249158 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113249197 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 113249401 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113249441 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113249524 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 113249642 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 113249684 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113249802 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113249853 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 113249923 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113249946 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113250215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113250226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113250427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113250531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113250673 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113250752 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113250757 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113250776 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113250817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113250836 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113250871 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113250883 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113250908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113250939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113251233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113251277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113251354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113251430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113251520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113251696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113251768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113251862 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 113251886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113251895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113251929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113251940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113251979 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 113251980 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113252002 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 113252024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113252149 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113252343 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 113252524 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113252571 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 113252589 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 113252643 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113252857 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113252975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113253035 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113253165 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 113253180 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113253252 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 113253274 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 113253327 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 113253374 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113253460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113253496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113253608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113253669 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113253681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113253747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113253770 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113253866 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 113253880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113253958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113253979 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113254087 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113254496 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 113254511 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 113255156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113255235 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 113255603 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113255749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113255811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113256009 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113256010 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113256234 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 113256396 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113256495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113256532 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 113256777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113256885 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 113257114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113257162 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113257212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113257559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113257939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113257959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113258048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113258237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113258253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113258291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113258414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113258487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113259010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113259042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113259345 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113259470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113259604 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113259812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113260046 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113260064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113260351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113260396 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113260701 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113261014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113261086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113261092 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113261199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113261344 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113261388 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113261583 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 113261585 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113261808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113261945 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113261984 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113262001 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113262015 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113262455 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113262477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113262622 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 113262660 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 113262845 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113262921 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113262961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113263302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113263387 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 113263433 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113263730 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113263812 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 113263849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113263960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113264173 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 113264200 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 113264399 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 113264417 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 113265329 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 113265523 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 113265825 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113266122 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 113266274 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 113266289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113266602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113267095 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 113267663 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 113267769 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113267831 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 113268154 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113268452 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 113268514 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 113268555 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 113268584 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 113268682 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 113268898 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 113269113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113269640 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 113270049 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113270052 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113270120 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 113270508 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113270569 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113270570 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113271203 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 113271569 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 113271577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113271586 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 113272791 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113273093 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 113273380 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113273394 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113273412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113273421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113273882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113274155 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113275146 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 113275483 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113275484 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 113275695 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113275931 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113276136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113276328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113276374 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 113276585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113277154 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113277190 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113277309 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113277488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113277630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113277721 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 113277788 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113277951 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113277982 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113278247 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 113278275 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113278508 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113278866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113279273 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113279324 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113279663 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 113279743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113279991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113280586 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 113280854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113281221 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113281698 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113282592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113282807 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113284516 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113284639 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 113284975 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113285104 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 113285462 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113285619 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 113285749 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113285773 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 113285846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113286080 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 113286110 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 113286879 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113286888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113287356 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113287443 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113287487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113287518 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113287573 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113287642 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 113287671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113287701 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113288325 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113288915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113289146 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 113290312 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113291356 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113291978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113293365 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 113293958 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 113295091 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113295372 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113298590 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113298764 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 113302186 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113302696 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113302941 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113304364 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 113304509 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113304751 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113304792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113306024 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 113306413 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 113306496 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 113306685 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 113306726 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 113306811 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 113306918 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 113306979 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 113307010 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 113307466 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 113307857 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 113307884 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 113308361 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113308651 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 113308689 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 113308946 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 113309121 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113309203 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113309216 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 113309270 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113309288 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113309399 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113309414 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113309571 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113309582 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113309686 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 113309845 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113309887 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113309890 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113310023 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113310156 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113310169 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 113310227 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 113310426 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113310451 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113310472 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113310514 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113310517 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113310527 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113310551 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113310667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113310717 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113310793 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113310811 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113311166 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 113311211 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 113311272 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 113311594 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 113311624 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 113312232 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 113312239 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 113312328 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 113312463 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 113312499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113312702 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113312751 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 113312762 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113312915 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113313141 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 113313187 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 113313229 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 113313253 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 113313264 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 113313267 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 113313305 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 113313519 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 113313530 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 113313560 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 113313613 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 113313650 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 113313710 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 113314053 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113314088 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113314439 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113314518 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113314718 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113315022 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 113315057 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113315114 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113315133 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113315145 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113315183 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113315299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113315417 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113315476 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 113315540 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113315562 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113315568 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113315797 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 113315820 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 113316029 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 113316631 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113316708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113317633 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113317767 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113317823 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113317872 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113317985 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113318157 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113318187 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 113318418 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113318551 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 113318626 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 113318723 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113318737 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113318769 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 113318833 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113318858 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 113318917 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113318924 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113318997 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 113319240 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113319442 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 113319680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113319695 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113319744 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 113319810 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 113319835 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113320042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113320187 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113320193 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 113320205 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113320214 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113321073 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113321384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113321527 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 113321678 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113322244 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113322382 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 113322529 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113322649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113323136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113323168 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 113323559 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 113324145 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 113324338 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113324555 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113324616 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 113324657 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 113324917 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113325047 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113325139 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 113325152 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113327473 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113328686 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113329406 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113330349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113330432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113330557 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113331045 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113331098 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113331129 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113331380 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 113331625 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113331659 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113331721 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 113332138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113332269 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113332313 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 113332600 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113332711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113332736 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 113332803 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113332824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113333459 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 113333797 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113334001 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113334219 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113334687 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 113334809 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113335188 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 113335539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113335608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113335620 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113335782 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113336925 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113337975 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113338258 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 113338340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113338438 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113338984 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113339267 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113339268 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113339456 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113339481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113339528 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113339531 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113339576 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 113339636 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113339669 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113339701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113339875 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113339880 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113339893 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113339900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113339942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113339960 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113340155 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113340349 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113340360 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113340429 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113340432 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 113340449 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113340483 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113340492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113340574 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113340712 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113340826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113340876 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113340890 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113340894 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113340918 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113341058 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113341238 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113342810 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113342997 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113343088 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113343136 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113343397 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113343428 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113343731 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113343860 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113343946 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113344201 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 113344303 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113344324 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113344839 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113345079 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113345272 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 113345332 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113345337 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113345614 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113345704 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113345790 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113345847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113345959 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113346136 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 113346423 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113346641 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113346760 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113347245 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113347259 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113347421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113347863 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113348070 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113348158 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113348700 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113348735 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113349166 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113349360 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113349457 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 113349766 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 113349790 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 113350202 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113350974 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113351133 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113351335 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113351610 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113351713 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113351945 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 113352844 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113352952 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113352987 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113352999 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113353097 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113353119 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113353147 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113353176 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113353447 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113353493 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 113353600 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113353770 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113353829 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 113354141 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113354330 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113354749 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113354887 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113354921 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113355010 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113355030 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113355408 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113355476 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 113355600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113355675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113355833 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113355834 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113355935 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113355940 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113355951 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113355968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113356218 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113356592 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113356608 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113356735 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 113356801 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113356976 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113357478 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113357560 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113358326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113365405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113366424 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113366651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113368544 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 113368861 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113369145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113369409 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 113369703 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113372657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113374280 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113375411 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113375461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113375481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113375665 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 113375893 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113375940 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 113376346 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 113376652 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113376887 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113376974 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 113377130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113377514 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113377940 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113378277 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113379792 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113380824 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 113381104 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 113381110 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 113381297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113381355 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113381422 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 113381764 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 113381818 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 113381980 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113382027 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 113382287 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113382423 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113382481 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 113382655 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 113382777 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 113382854 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 113383010 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 113383103 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 113383126 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 113383130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113383184 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113383218 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113383343 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113383365 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 113383470 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113383750 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 113383805 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113384426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113384457 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113384651 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113384957 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113384959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113385036 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113385159 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113385344 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 113385781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113386459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113386608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113386797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113387059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113387249 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113387363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113387435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113387440 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 113387463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113387474 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113387511 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113387515 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113387528 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113387591 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113387752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113387764 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113387776 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113387876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113388279 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113388322 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 113388334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113388337 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113388373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113388501 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 113388519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113389205 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 113389338 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 113389461 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 113389467 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 113389575 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 113389658 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 113389775 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 113389853 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113390184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113390230 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 113390266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113390283 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 113390394 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113390405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113390415 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 113390491 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113390543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113390599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113390607 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113390610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113390677 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 113391010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113391074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113391152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113391213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113391295 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113391426 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113391476 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113391568 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113391658 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113391670 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113391694 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113391821 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 113391825 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 113391881 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113391909 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 113391928 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113391939 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113392086 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113392111 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113392138 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113392147 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113392157 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 113392190 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113392359 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113392391 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113392399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113392426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113392448 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113392472 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113392497 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113392531 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113392650 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 113393782 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 113393844 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 113393872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113394004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113394124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113394139 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113394213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113394239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113394270 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113394440 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 113394561 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113394582 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113394611 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113394646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113394676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113394880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113394881 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113394895 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 113394901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113394977 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 113395016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113395535 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 113395627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113395635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113395671 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113395737 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113395961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113396056 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 113396175 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 113396380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113396571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113396739 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113397163 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 113397181 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 113397483 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113397532 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 113397639 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 113397693 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 113397707 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 113397747 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 113397881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113397938 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 113397981 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113398026 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113398547 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 113398749 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113398886 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 113398979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113399319 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113399931 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113400229 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113400387 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113400522 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 113400533 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113400564 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113400734 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 113400768 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 113400864 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 113401094 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 113401143 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 113401472 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113401508 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113401509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113401545 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113401606 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 113401672 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 113401790 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 113401829 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113401853 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113402072 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113402225 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113402234 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113402250 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113402326 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113402391 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113402420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113402427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113402452 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113402548 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 113402561 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 113402568 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 113402578 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113402589 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113402802 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 113402871 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 113403016 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 113403039 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 113403111 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 113403188 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113403265 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113403544 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113403603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113403937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113406194 C T N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 113406208 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 113406827 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 113407509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113407800 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113407872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113407873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113408092 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 113408188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113408250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113408265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113408270 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113408490 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 113409097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113409338 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 113409341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113409371 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 113409414 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113409468 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113409516 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113409595 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113409983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113409995 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113410331 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113411488 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 113412014 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 113414328 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 113414679 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113414695 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113415108 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113415126 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 113415393 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113416797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113416919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113417153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113417336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113417358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113417561 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 113417748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113418349 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113419001 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113419665 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113419865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113420449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113421070 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113423066 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 113423654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113424037 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113424470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113425348 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113426122 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 113428359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113429237 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 113429352 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113430096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113430631 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113430676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113430941 A T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 113432648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113434602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113434615 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113434683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113435558 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 113435646 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 113436020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113436601 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113436930 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113440962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113442013 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113443002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113443834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113444067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113445450 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113445726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113446919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113447252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113448377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113448928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113449791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113451167 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113451476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113452352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113454660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113455110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113455432 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113456444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113458620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113458628 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113462957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113463265 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113463412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113463664 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113465579 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 113465609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113466599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113467398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113468235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113469448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113469689 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113472649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113472862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113473033 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113473549 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113476303 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113477525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113479340 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113479562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113479729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113479743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113479906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113480158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113480488 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 113480917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113480978 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113481117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113481339 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113481458 T G Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 113481880 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 113482036 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113482332 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113482819 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 113483384 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113484337 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 2 113484974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113484975 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113485389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113486167 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113486791 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113486911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113487375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113487561 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113488022 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 2 113488530 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113489302 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113489991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113491610 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113491621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113492264 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113492725 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113492807 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113492856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113492999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113493388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113493779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113493963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113495331 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113496714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113497095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113499032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113499190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113503481 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 113503676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113503763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113505540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113510371 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113511051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113511170 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 113513356 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113517074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113517253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113517264 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113517284 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113517300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113517316 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113517390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113517516 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 113517532 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 113517536 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 113518029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113518248 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113518366 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113518438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113518553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113519213 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113519391 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113519644 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113519814 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113519817 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113519870 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113520103 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113520339 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113520402 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 113520406 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113520414 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 113520438 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113520449 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113520517 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 113520600 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 113520615 T G N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 113520621 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 113520662 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 113520663 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 113520797 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 113520867 T C N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 113521014 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 113521138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113521244 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 113521271 G A N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 113521427 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 113521621 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 113521770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113521810 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 113522329 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 113522654 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113523050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113523192 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113524007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113524073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113524431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113524900 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113525085 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113525326 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113525493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113525562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113526028 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 113526087 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 113526243 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 113526977 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 113527065 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 113527089 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 113527210 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 2 113527213 G A N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 113527378 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 113527455 A T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 2 113527573 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 113527732 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 113527786 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113527855 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 113528017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113528035 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 113528101 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 113528128 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113528160 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113528359 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 113530437 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 113530812 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 113530840 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 113530954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113530980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113531423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113532189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113532289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113532305 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 113532402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113533009 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113533042 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113533073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113533472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113534381 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113535394 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113535413 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 113535415 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 113535509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113535559 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113535607 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113535639 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113536682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113537505 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113537664 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113538434 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113538926 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113539127 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 113539160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113539550 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113539646 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113539781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113539795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113540542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113542700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113544208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113544353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113544434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113544661 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 113544709 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113544805 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113545071 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113545140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113545375 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113545430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113545724 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 113545725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113549322 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 113549398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113550050 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 113550431 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113550724 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113551331 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113551678 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113551681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113551695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113552245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113552397 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113555096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113559391 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113559842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113563425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113564294 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113564381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113564439 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 113564463 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113564521 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113565134 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113565427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113569036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113576500 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113577785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113579120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113579121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113580555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113580720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113580993 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113581152 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 113581275 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 113581282 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113581475 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 113581619 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 2 113581650 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 113582027 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113582028 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113582178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113582295 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 113582418 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 113582501 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113582510 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113582556 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 113582940 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 113583287 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 113583290 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 113584045 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113584347 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 113584348 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113584524 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113584586 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 113584636 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 113584927 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 113585067 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 113585132 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113585171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113585217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113585591 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113585599 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113585608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113585944 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113585965 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 113585988 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113586025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113586028 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113586779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113586957 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113587191 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 113587685 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 113587968 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 113588707 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113589123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113589382 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113590117 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 113590213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113590896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113591092 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 113591387 G A Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 113591869 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113592139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113592688 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 113592881 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 2 113592916 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 113593175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113593189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113593599 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113593809 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 113593992 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 113594285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113594795 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113594841 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113596285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113596412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113596416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113596645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113601049 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113601376 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113601389 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113601537 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113601759 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113603135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113603219 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113603440 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 113604370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113604605 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 113604634 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113604644 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 113604757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113604914 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113604976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113604982 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 113605452 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113605471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113605489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113605922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113607006 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113607866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113607895 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113608135 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 113608729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113608740 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 113609033 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113609779 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 2 113610092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113610501 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113610594 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113610686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113610955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113610992 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113611345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113611665 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113612217 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 113612303 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 113613006 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 113613026 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 113613048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113613056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113613092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113613279 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 113613555 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113613569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113613791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113614184 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 113614418 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 113614437 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 113614527 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113614550 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113614743 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 113614812 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 113615585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113615627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113615912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113615967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113616402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113617812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113619407 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113619416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113621028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113621090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113622332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113622828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113632627 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 113634344 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113638150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113638619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113640132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113640860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113641497 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113641537 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113641788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113642000 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 113642032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113642573 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113642744 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113643108 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 113643141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113643146 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 113643334 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 113643495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113643602 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 113644056 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 113644094 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 113644135 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113644166 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 113644263 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 113644421 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113644526 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113644563 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113644570 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113644575 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113644804 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 113644809 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 113644932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113645007 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113645037 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113645118 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113645120 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113645241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113645515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113646329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113647689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113649409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113658039 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 113658884 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113659046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113660690 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 113660908 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 113661097 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113661731 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 113661797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113662438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113662503 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113663039 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113663041 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113663127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113663155 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113663156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113663218 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113663625 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113663907 A G N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 113664001 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 113664256 G T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 113664701 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113664922 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113665194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113665284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113665540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113665611 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113665659 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 113665735 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113665736 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113665959 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 113665961 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113666242 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 113666503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113666571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113666847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113667124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113667509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113667698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113667768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113668047 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113668140 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 113668202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113668245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113668295 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 113668303 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113668507 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113668533 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 113668658 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 113668660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113669089 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113669114 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 113669187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113669906 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113670041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113670620 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113671828 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113671935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113672160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113673481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113673926 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113674010 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113674204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113675267 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113675342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113675569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113675750 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113676656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113677016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113677684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113677983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113678321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113678432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113678576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113678737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113679165 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113679467 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113679812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113681358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113681910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113682329 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 113682339 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113682824 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113683154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113683305 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 113683313 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 113683367 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113683481 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113683622 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113683987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113684909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113685414 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113685465 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113685814 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 113686031 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 113686459 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113686522 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 113686618 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113686670 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 113686806 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 113686867 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113686990 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113687028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113687274 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 113687395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113687849 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 113687850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113687935 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113688545 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 113688776 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 113689084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113689301 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113690019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113690033 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113690352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113690461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113690614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113690683 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113690822 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113690906 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113691310 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113691327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113691485 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113691547 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113691556 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113691571 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113691589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113691606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113691653 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113691742 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113691748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113691783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113691787 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113691957 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 113692050 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 113692246 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 113698682 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113698728 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113698886 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 113698937 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 113698974 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113699347 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113699348 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113699414 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113699693 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 113699967 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 113700323 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113700326 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 113700355 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113700439 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113700475 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 113700485 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 113700544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113700847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113700865 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113700913 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113701003 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113701258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113701311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113701446 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113701606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113701819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113701991 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 113702084 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 113702116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113702130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113702139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113702257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113702355 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113702643 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113702869 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 113702882 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 113703077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113703308 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113703445 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 113703575 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 113703599 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 113703666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113703712 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 113703742 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113703834 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113703892 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 113703918 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 113704104 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 113704253 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 113704270 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113704388 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113704437 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 113705213 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 113705253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113705355 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 113705420 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 113705421 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 113705488 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 113705496 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 113705527 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 113705683 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 113705687 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 113705764 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 113705890 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 113706192 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 113706258 G C N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 113706312 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 113706345 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 113706485 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 113706576 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 113706759 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 113706779 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 113706915 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 113707073 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 113707120 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 113707229 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 113707282 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 113707285 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 113707317 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 113707493 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 113707506 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 113707515 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113707529 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113707563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113707728 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113707729 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113707756 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113707761 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113707791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113707893 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 113707971 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 113708215 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113708235 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113708257 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113708269 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113708305 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 113708350 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113708813 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113708974 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113709089 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 113709200 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113709232 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113709273 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113709290 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 113709302 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113709319 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113709455 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 113709551 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113709554 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113709564 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113709572 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113709610 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 113709658 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 113710436 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113710491 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113710571 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113710616 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113710750 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113711265 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113711956 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 113712030 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 113712048 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113712210 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113712464 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 113712512 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 113714964 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113715233 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113715442 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113715565 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113715779 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 113715862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113716282 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 113716451 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113716744 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 113716924 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113716927 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113717009 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113717011 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113717030 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113717063 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113717386 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113718370 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113718401 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113718444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113718511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113718520 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113719033 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113719050 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113719058 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 113719621 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 113719710 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 113719752 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 113719781 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 113719845 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 113719922 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 113719930 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 113719960 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113720248 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 113720265 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 113720328 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 113720698 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 113720711 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 113720752 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 113720794 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 113720924 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 113721069 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 113721151 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 113721336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113721508 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 113725669 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 113726999 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 113727264 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 113727367 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 113727404 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 113727455 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113729554 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 113731684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113732385 C A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 113732424 T A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 113732480 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113733307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113783878 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113783884 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113784155 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113784176 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113784256 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 113784287 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 113784362 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 113784554 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113784705 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113784923 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113785103 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 113785384 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 113785730 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113785818 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 113785897 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 113785913 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 113786125 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 113786136 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 113786212 C A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 113786213 C A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 113786243 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 113786273 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 113786904 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 113786965 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 113786966 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 113787635 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113788289 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 113791501 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113792690 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113797972 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 113801119 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113802382 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 113802443 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113802526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113802898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113806769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113807557 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113807888 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 113808227 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 113809164 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113809505 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113810418 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113810507 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 113812136 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113813762 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113814082 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113814550 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113814772 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 113814853 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113814867 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113816623 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113818894 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113820349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113822261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113823701 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113823722 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113823735 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113824665 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 113824709 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113825226 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 113825741 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 113825820 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113825912 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113826219 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 113826438 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 113826440 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 113826480 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 113826486 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 113826777 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113826955 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113827024 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 113827068 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113827126 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 113827154 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113827166 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113828114 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 113828145 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113828548 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113829515 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113829807 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 113830095 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113830401 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113830672 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 113830684 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 113831014 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113831107 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 113832266 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113832363 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113832371 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113832540 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113832643 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113832953 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113833361 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113833471 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113833497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113833583 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113833868 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113833935 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113834085 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 113834298 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113834718 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113834757 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113834937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113834984 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113835234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113835636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113836195 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113836565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113838251 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 113839148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113839534 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 113839550 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113840396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113842576 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 113843318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113846061 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113846214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113846632 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113846920 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 113847060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113847528 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113847659 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113847894 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113848215 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 113848718 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113851684 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 113851730 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113851769 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113851872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113852562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113852795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113854697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113855214 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113855336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113856024 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113856794 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 113856919 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113856937 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113856962 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113856983 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113856995 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113857117 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113857239 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113857458 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113857531 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 113857761 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 113857763 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113857789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113857888 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113857977 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 113858091 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113858170 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 113858253 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113858299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113858300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113858499 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 113858635 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113858825 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 113858867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113858888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113858985 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113858993 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113858997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113859046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113859128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113859293 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113859302 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113859687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113859717 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113859756 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113859923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113859997 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113860039 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113860152 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113860211 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113860212 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113860229 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113860316 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113860348 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113860538 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113860681 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113860709 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113860776 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 113860825 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113860872 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113860887 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 113860892 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 113860969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113861038 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 113861097 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113861291 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 113861307 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 113861364 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 113861376 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113861496 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 113861551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113861578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113861607 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113861617 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113861692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113861694 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113861772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113861826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113861912 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113861915 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 113861982 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113862102 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113862264 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113862280 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113862360 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113862364 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113862443 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113862481 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 113862521 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 113862682 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113862751 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113862781 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113862983 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113863026 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113863060 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113863076 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113863195 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113863315 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113863341 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113863682 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 113863949 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113863996 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113864003 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113864572 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113864607 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113864608 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113864670 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113864694 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113864727 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113864953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113864966 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113864994 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113865171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113865231 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113865236 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113865257 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113865366 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113865442 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113865532 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113865821 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113865872 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113866148 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113866211 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113866346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113866397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113866414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113866540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113866955 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 113867223 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113867350 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113867581 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113867778 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113867823 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113867900 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113867910 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113868017 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113868047 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113868103 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113868189 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113868204 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113868232 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113868615 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113868712 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113868757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113868871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113869265 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113869402 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113869803 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 113869894 G T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 113869909 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 113869912 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 113870133 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 113870137 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 113870200 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 113870375 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113870390 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113870391 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 113870406 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 113870480 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 113871063 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113871126 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113871162 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113871192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113871271 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 113871288 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 113871333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113871376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113871397 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 113871465 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113871468 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113871491 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113871562 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 113871613 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 113871709 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 113871794 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113871809 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113871814 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113871823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113871837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113871922 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113871933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113872175 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113872816 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113872881 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113872957 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113873134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113873138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113873200 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113873367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113873558 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 113874227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113874277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113874434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113874464 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113874470 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113874605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113874718 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113874792 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113874835 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113874839 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113874854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113875451 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113875452 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113875474 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113875481 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 113875780 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 113875823 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113875863 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 113875893 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 113875936 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 113876426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113876470 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 113876823 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113876929 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 113876936 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113877228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113877270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113877373 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 113877525 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113877645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113877666 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 113877756 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 113877858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113878005 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 113878067 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 113878093 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 113878109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113878179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113878216 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 113878713 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113878846 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 113878888 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113879052 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 113879129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113879155 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 113879165 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 113879645 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 113880558 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113880582 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 113880585 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113880645 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 113880762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113880891 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113880918 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 113881259 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113881274 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 113881453 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113881640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113881994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113882000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113882024 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 113882246 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 113882285 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 113882325 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113882382 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 113882612 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 2 113882750 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 113882779 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 113882952 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113883010 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113883067 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 113883720 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 113883818 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 113883971 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 113884012 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 113884078 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113884196 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 113884311 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113884338 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113884466 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113884473 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113884536 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 113884959 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 113884976 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113884979 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 113884990 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113885021 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 113885053 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 113885091 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 113885121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113885162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113885185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113885429 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 113885539 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113885597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113885620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113885783 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113885890 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113885978 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 113886011 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113886053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113886479 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 113886617 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113886651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113887070 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 113887159 G T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 2 113887167 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 113887906 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 113887957 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113888282 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 113889056 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 113889244 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 113889452 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113889659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113889678 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113889804 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113889976 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113890014 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113890442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113890498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113890692 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 113890813 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113890859 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113890873 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113890874 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113890934 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 113892047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113892285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113892288 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113892444 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113892660 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113892818 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113893222 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113893457 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 113893481 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 113893523 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113893596 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 113894491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113894773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113895244 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 113895376 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 113895469 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113895769 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 113895812 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113896141 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 113896145 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 113896174 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113896599 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113896802 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113896955 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 113897158 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 113897270 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113897271 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113897299 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113897327 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113897370 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113897508 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113897825 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113897979 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113898191 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 113898326 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 113898387 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 113898511 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113898647 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113898656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113898663 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113899155 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113899223 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113899238 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113899242 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 113899515 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 113899587 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113899592 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113899600 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113899723 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113899799 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113899828 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 113900051 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 113900080 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 113900375 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113900399 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113900543 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113900603 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 113900708 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 113900901 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113900921 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113900925 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 113900956 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 113901177 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113901611 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113902870 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 113903136 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 113903377 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 113904081 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 113904098 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 113904221 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 113904383 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113904401 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113904499 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 113904668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113904724 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 113904745 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 113904777 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113905591 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 113905868 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113906171 C A N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 2 113906538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113907220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113907764 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113907810 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 113910182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113910382 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113910447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113910458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113911705 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 113911911 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113912206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113912315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113912330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113912380 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113913132 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113916156 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113916675 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113917203 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 113917743 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113918251 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 113918753 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 113920215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113920691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113920869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113922317 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 113922389 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 113922487 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 113924336 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113924527 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 113924550 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 113925109 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113925215 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113925378 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 113925420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113925454 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 113925676 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 113925768 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 113925769 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 113925828 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 113925833 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 113925954 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113925986 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113926029 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 113926053 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 113926113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113926230 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113926312 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 113926330 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 113926338 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113926357 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113926409 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 113926514 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 113926588 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113926630 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113926631 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 113926787 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113926796 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 113926935 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113926953 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 113927059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113927063 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113927090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113927136 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 113927308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113927512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113927718 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113927743 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113927871 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 113928016 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 113928097 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 113928273 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113929495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113930598 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 113930988 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113931108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113932318 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 113932383 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 113933717 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 113934090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113934800 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113937904 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 113938756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113938902 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 113938929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113941527 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113943170 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 113943418 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113944084 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113944149 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 113944184 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 113944329 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 113944354 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 113944387 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 113945081 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 113945119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113945214 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 113945228 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 113945288 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113945307 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 113945570 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 113945571 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 113945641 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 113945667 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 113945845 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 113945865 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 113946005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113946571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113946641 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 113946644 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 113946664 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 113946719 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 113947382 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113947405 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113947426 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 113947522 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113949594 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113949791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113950787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113950926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113951148 A T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 113952646 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 113952677 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 113953125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113956538 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 113956634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113957437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113957740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113959916 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 113960862 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 113961824 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 113962130 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113962172 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 113962294 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 113962356 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 113962411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113964241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113964459 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 113964812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113964991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113965710 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 113966098 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113966522 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 113967357 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 113967737 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113968170 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 113968310 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 113968589 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 113968620 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 113969291 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 113969758 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 113970068 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113970155 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113970189 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113970507 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113971193 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113971234 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113971693 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 113971868 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 113972033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113972174 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 113972797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113972868 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113973203 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 113973224 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 113973515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 113973629 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 113974004 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 113974079 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 113974381 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 113974443 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 113974824 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 113975228 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113975314 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 113975349 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113975369 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 113975370 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 113976114 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113976165 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113976287 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113976502 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 113976556 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113976817 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113976991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113977207 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113977325 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 113977355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113977432 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 113977747 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 113977947 G C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 113978112 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 113978277 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 113978790 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 113978916 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 113978938 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 113979063 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 113979425 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113979548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113980826 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 113982618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113982797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113982856 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113983077 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113983256 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113983297 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113983580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113983639 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 113983918 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113984165 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113984376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113984528 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113984591 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113984923 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 113984950 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 113985000 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 113985124 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 113985180 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 113985201 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 113985310 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 113985314 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 113985389 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113985406 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113985441 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113985442 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 113985539 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113985628 G C N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 113985666 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 113985675 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 113985907 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113986338 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113986464 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 113986567 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113986581 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113987048 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113987155 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113987172 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113987217 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 113987456 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113987537 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 113987641 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113987679 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113987786 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113988186 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 113988305 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 113988310 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113988495 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113988564 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 113989136 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113989262 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113989276 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113989298 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 113989312 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 113989373 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113989388 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113989444 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113989508 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113989531 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 113989546 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 113989629 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113989846 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 113989886 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113990057 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113990107 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113990162 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113990234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113990237 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113990485 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113990500 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113990534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113990658 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113990713 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113990783 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113990853 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113990985 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 113991002 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 113991168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113991261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113991405 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113991423 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 113991428 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 113992610 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113993876 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113994234 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 113994238 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113994490 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 113994898 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 113994955 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 113995187 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 113995278 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 113995902 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 113995923 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 113996094 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 113996658 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113996684 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 113996748 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 113997545 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113997762 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113997842 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 113997892 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113998101 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113998439 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 113998494 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 113998528 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 113998591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113998694 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 113999189 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 113999436 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 113999495 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 114000228 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114000323 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114000983 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114001137 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114001155 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114001168 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114001193 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114001251 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114001255 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114001284 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114001473 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114001546 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114001551 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114001773 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114002147 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 114002385 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 114002392 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114002734 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114002747 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114002765 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114002900 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114002916 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114003068 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114003113 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 114003132 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114003163 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114003250 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114003261 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114003388 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114003414 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114003482 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114003494 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114003531 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114003543 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114003587 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114003605 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114003686 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114003767 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114004916 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114006480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114013109 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114013970 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114014362 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114015212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114015954 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 114018005 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114018958 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 114020746 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 114022201 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114022212 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114022441 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114022899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114023068 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114023450 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 114023943 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114024179 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 114024305 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 114025151 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 114025212 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 114026015 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 114028749 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114030096 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114030354 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114032427 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114032700 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114032725 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114032803 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114033040 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 114034042 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114034109 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114034329 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114034346 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114034358 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114034382 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114035185 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114035333 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114035471 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114037115 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114038278 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114038323 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114039115 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114039117 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114040922 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114041017 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114041272 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 114041717 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114041999 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114042693 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114042868 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114043154 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 114043432 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114044076 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114044108 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114044177 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114044189 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114044234 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114044467 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 114044794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114045101 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 114045941 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114045973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114046047 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114046054 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114046505 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114046833 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114046933 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114047421 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114048131 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114049586 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 114049780 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114050044 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114050339 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114050505 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 114050905 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 114050982 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 114051023 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114051130 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114051181 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 114051189 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 114051323 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 114051349 T C N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 114051412 T C N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 114051483 A T Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.166666666666667 0.75 0.0833333333333333 13 11 2 9 1 2 114051600 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 114051620 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 114052820 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 114053038 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 114054036 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 114055407 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 114055531 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 114055740 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114055754 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114056711 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 114057028 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 114057212 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 114057318 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114057872 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 114057908 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 114057985 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114058146 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114059100 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114059472 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 114059792 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 114059975 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114060112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114060404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114060439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114060537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114060604 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 114060625 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 114060642 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 114060649 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114060712 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 114061002 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 114061031 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 114061122 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 114061270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114061394 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 114061425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114061642 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 114062182 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114062382 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 114062404 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114062539 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 114062610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114062822 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114062915 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114063981 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114064074 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 114064178 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114064538 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 114064711 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 114064964 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 114065007 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 114065138 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 114065217 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 114065271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114065941 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 114066139 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114066235 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114066437 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114066511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114066980 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 114067013 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 114067566 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 114067570 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 114067583 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 114067617 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114067705 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114067787 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114067839 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114067890 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 114067937 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114068158 C G N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 114068164 C T N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 114068263 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 114068264 T A Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 114068325 G C N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 114069659 T C Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 2 114069983 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 114070019 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 114070225 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114070298 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114070315 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114070321 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114070456 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114070521 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114070562 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114070577 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114070580 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114070613 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114070623 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 114070676 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114070766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114070852 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114070868 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114070882 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114070968 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114071016 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 114071043 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114071067 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 114071232 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 114071247 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114071441 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114071519 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114071582 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 114071868 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 114071907 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 114071918 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 114071926 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 114071948 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 114071964 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 114071992 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114072014 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 114072081 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114072108 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114072346 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114072998 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 114073009 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 114073081 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 114073157 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114073860 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 114074104 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114074129 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114074767 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114075210 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 114077655 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114078731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114079709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114079782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114079818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114080225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114080743 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 114080818 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114082934 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114086901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114087121 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114087472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114087478 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 114087647 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 114087672 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 114087695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114087830 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 114087913 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 114087976 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 114088067 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 114088472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114088491 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 114088692 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 114088857 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 114089027 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 114089106 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 2 114089115 G A N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 114089166 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 114089281 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 114089287 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 114089311 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 114089335 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 114089363 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 114089415 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 114089435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114089750 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 114090007 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 114090718 A C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 114090746 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 114090789 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 114090794 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 114090997 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 114091160 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 114091176 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 114091203 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 114091258 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 114091296 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 114091298 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 114091572 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114091583 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 114091806 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 114091830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114092017 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 114093675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114093788 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 114093940 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114097175 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 114097294 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 114097297 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 114097956 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 114098346 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114098595 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 114098679 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114100893 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 114104960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114106076 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114109466 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114109551 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114111204 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 114111773 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 114111784 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 114111786 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 114111986 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 114112128 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 114112149 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 114112170 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 114112180 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 114112193 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114112211 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 114112247 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 114112279 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 114112297 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 114112319 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 114112485 G T N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 114112494 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 114112499 G A Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 114113107 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 114113417 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114113528 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 114113684 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 114113894 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114113945 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 114114368 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 114114553 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 114114742 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114115411 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 114116052 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114116325 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 114116763 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114116901 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114117288 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 114117319 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 114117423 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 114118420 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 114118469 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 114118954 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 114119125 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114119278 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 114119555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114119696 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114119822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114120449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114120731 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114120866 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 114121074 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 114121236 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114122739 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 114123020 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 114123170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114123318 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 114123399 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114123742 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 114123819 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114123882 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114123960 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 114123974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114124014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114124051 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 114124770 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 114124981 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 114125346 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114125373 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 114125815 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 114125991 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 114126058 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 114126132 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 114126135 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 114126230 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 114126510 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114126701 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 114126911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114127068 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 114127613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114127810 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 114127930 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 114128107 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 114128368 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 114128370 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 114128396 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 114128433 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114128481 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 114128482 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 114128539 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 114128611 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 114128625 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 114128812 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 114128872 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 114129005 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 114129159 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 114129473 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 114130256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114130665 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114132448 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114133170 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114133788 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114134653 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 114134935 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 114135179 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 114135252 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 114135424 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114135645 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114135818 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 114135905 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 114136299 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114136352 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114136505 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 114136638 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114136701 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 114136757 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 114136787 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 114136886 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114137009 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114137063 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 114137083 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 114137305 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114137310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114137411 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 114137529 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114137539 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114137652 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114137664 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 114137702 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114137797 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 114138136 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114138197 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114138301 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 114138727 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114138767 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114139603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114139608 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114139693 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114139704 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114139951 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114139955 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114139995 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 114140061 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114140202 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114140308 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 114140661 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114140950 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 114141031 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114141052 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114141053 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114141088 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114141116 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114141313 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 114141467 A G N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 114141571 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 114141634 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 114141728 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114141756 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 114141939 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114141972 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114141974 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 114142244 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 114142517 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 114142577 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 114143950 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114144264 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114144762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114144848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114145505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114146306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114146311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114147079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114147776 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114149271 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 114149444 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114151672 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114151745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114152365 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 114152620 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 114153079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114154422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114154560 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114154871 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114155697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114156071 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114156246 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 114156275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114156592 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 114158398 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 114159021 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 114159886 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114160199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114160279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114160762 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 114161274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114161979 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114162708 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114162751 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114163496 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114163665 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114163769 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114164095 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 114164214 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 114164217 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 114164679 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 114165718 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114165727 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 114165884 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114168120 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114168540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114168808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114169512 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114169674 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 114170809 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 114170823 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 114170869 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114170889 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114170906 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114170974 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114171019 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 114171080 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 114171165 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114171562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114171856 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 114172337 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 114172566 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 114172775 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 114173034 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114173261 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 114173589 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 114173769 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114174231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114174395 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 114174630 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 114174928 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 114175375 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 114175855 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 114175907 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 114175942 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 114176025 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 114176217 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114176569 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 114176574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114176664 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114176858 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114177295 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 114177391 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114177409 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 114178426 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 114178576 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 114178812 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114178848 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 114178972 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114178992 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 114179024 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 114179049 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 114179259 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 114179410 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 114179412 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 114179428 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 114179487 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 114179522 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 114179638 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114179691 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114179900 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 114180017 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 114180197 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114180339 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114180523 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114180618 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 114181472 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 114182150 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 114182156 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114182369 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114182516 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114182822 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114182875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114183189 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 114183213 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114183559 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114184031 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114184246 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 114185041 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 114185170 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114185245 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114185250 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114185275 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114185359 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 114185572 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 114185682 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114185689 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114185752 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114185850 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 114185872 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 114185955 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 114186110 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 114186169 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114186193 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114186229 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 114186366 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 114186474 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114186732 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114186751 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114186910 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114187004 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 114187127 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114187354 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114187497 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 114187530 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 114187642 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 114187643 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 114187654 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114188606 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114188812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114188914 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 114189075 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114189096 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 114189282 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 114189395 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114189515 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114189611 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 114189767 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114189791 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114189809 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 114190048 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114190404 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 114190419 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 114190430 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 114190559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114190666 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 114190677 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114190729 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114191022 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114191146 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114191414 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114191607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114191660 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114191785 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114191829 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 114191843 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114191876 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114191929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114192162 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 114192408 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 114192636 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114192857 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 114193027 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114193045 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114193240 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114194009 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114194724 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114194915 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114194991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114195023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114195487 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114195854 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 114196211 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114196607 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114196876 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 114196915 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114197073 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 114197406 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 114198635 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 114199021 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114199041 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 114199057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114199280 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114199748 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114199862 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114199968 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 114200029 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 114200177 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 114200315 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 114200369 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 114201314 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 114201639 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 114204420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114205619 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114206629 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 114206949 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 114207305 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114208131 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 114208244 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 114208522 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 114209012 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 114209317 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 114209903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114210283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114210438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114211179 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114211441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114211496 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 114212618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114213438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114213886 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114214288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114215184 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 114215306 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 114215494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114217473 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114217484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114217909 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114218128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114218768 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114218972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114220038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114220368 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114222769 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114222892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114224896 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 114225512 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114226419 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 114227465 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114227769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114228226 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114228398 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 114230161 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114230576 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 114230868 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114232170 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114232982 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114233420 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 114233720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114233957 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114233991 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114234027 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114234108 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 114234599 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 114235509 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 114236046 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114236228 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114236705 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114237828 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114238880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114239300 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 114239457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114239567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114240151 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 114241305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114241557 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 114242268 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114242614 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 114243101 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114243548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114243703 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114244217 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114244614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114245696 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114245698 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114245753 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 114245808 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114245997 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246033 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246060 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114246204 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246239 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246284 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246402 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246437 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246481 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246490 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246570 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246577 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246583 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246588 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114246621 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 114246644 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246701 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114246711 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114246764 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 114246861 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246871 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114246991 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 114247067 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 114247093 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114247119 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114247174 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 114247259 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114247263 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 114247803 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 114247910 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114248101 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114248260 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 114248765 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114248849 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 114248850 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 114249758 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 114250681 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 114250747 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114250770 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114251041 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 114251218 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114252246 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114253151 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 114253290 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 114253412 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 114253592 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 114253773 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 114253836 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114254160 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 114254172 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 114254332 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114254346 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 114254372 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 114254703 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 114255326 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 114255549 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114256130 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 114256146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114256166 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114256167 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 114256254 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 114256756 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 114256818 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 114257587 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114258035 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 114258067 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114260438 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 114260563 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114260705 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114261252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114261558 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114262048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114262070 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 114262162 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 114262178 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 114262295 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 114262298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114262444 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114262682 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114262739 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 114262786 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114263953 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114264069 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114264715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114264793 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 114265489 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114266501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114268181 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 114268733 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 114269217 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 114269218 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 114270038 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114270993 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 114271958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114271966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114272070 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114272208 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 114272729 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 114274363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114274569 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114275888 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 114277407 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114279011 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 114279038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114279364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114281388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114282101 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114286089 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114286813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114287182 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 114287427 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114287438 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114287576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114287905 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114287966 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114288337 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 114288482 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114288488 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114288588 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 114288922 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114289000 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 114289051 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 114289092 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 114289178 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 114289305 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114289579 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114289605 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114289610 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114289860 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 114289868 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114289900 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 114290098 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 114290262 G A N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 114290368 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 114290507 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114290584 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114290643 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114290683 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114290791 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114290792 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114290973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114290987 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114291726 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114291748 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 114291800 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114291844 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 114292395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114293872 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114294085 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 114294278 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 114294316 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 114294329 A C Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 114294333 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114294485 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114296592 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 114296612 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 114297318 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114297399 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114297624 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114298211 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 114298535 G T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 114298601 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 114298823 G C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 114298864 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114299172 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114299772 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 114299846 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 114299885 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 114300849 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114300874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114300913 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 114301001 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114301207 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114303104 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114305371 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114312671 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114313396 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114315906 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114316102 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114316630 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 114317009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114317037 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 114319179 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114319418 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 114319447 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 114320610 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 114320923 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 114321292 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114321635 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114321846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114322712 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 114322863 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114323091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114329858 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114329893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114329957 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 114329969 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114330014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114330045 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 114330046 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 114330096 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114330133 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114330160 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114330209 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114330216 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114330698 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 114330775 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 114330988 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114331077 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 114331248 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 114331360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114331515 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 114331928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114332095 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114332202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114332427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114332690 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114332954 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114332995 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 114333140 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 114333143 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 114333153 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 114333605 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 114333896 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114334170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114334289 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 114335218 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 114335882 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 114336046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114337440 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 114337642 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114337889 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114338427 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114338474 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 114339192 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 114339527 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 114339592 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 114339617 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 114339634 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 114339715 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 114339838 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 114340420 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 114340445 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114341011 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 114341030 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 114341247 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114341606 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114341940 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114342358 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 114342823 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114342845 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114343480 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114343494 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114343508 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114343520 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114343631 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 2 114343749 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 114343829 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 114343891 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 114343964 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114344048 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114344067 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114344079 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114344164 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114344207 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 114344322 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114344382 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114344417 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114344745 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 114344816 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 114344828 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114344886 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114344924 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114344952 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114345067 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 114345234 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 114345626 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 114345636 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114345696 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114345999 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 114346302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114346334 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 114346353 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114346543 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114346735 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 114347359 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114347720 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114347842 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 114348231 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114348238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114348513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114348538 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114348800 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114348927 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114348936 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114348945 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114348957 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114348980 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114349051 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114349248 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 114349279 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 114349417 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114349462 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 114349661 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114349797 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114349951 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 114350097 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 114350307 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114350530 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114351318 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114351474 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114351721 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114351937 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114351955 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114352065 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 114352370 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 114352391 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 114353703 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114354079 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114354454 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114354590 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114354884 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114354929 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 114355859 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114355971 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114356119 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114356225 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114356367 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114356442 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114356681 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114356711 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114357185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114357526 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114357814 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114358076 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 114358258 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 114358396 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 114358433 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114358683 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 114359416 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 114359442 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 114360134 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 114360245 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114360313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114360322 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 114360336 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 114360831 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114360956 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 114360972 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114361014 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 114361482 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 114361999 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114362042 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 114363295 C A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 114363533 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 114363826 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 114364050 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 114364068 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 114364205 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114364247 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114364258 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 114364428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114364672 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114364853 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 114364888 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114365183 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114365244 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114365305 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114365345 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 114365786 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 114365999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114366169 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114366198 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114366227 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 114366257 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114366414 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 114366447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114366666 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114366739 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114366750 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114366793 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114366805 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114366956 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114366958 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114367030 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114367324 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 114367351 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 114367570 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 114367661 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 114367982 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114368198 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114368965 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114369011 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114369241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114369649 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114370071 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 114370321 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114370445 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114370824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114371284 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 114371508 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114371652 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 114371655 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 114371799 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 114371831 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 114372336 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 114372573 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114372642 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114372990 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114373254 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114373443 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114373685 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 114374052 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 114374374 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114374408 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 114374411 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114374508 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114374560 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114374769 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114374928 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114374963 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114374983 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114375104 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114375106 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 114375118 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 114375159 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114375182 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 114381148 T C Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 114381652 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114381653 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114381723 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114381771 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114382418 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114382634 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114382973 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114383336 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114383413 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114383585 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114383660 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114383841 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114384414 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 114384450 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 114384878 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114384985 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114385001 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114385192 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114385351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114385574 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 114385698 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 114385891 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 114385974 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114386121 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114386426 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114386512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114386635 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114386674 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114386715 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114386997 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 114387045 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114387058 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 114387125 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 114387188 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 114387284 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114387294 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114387325 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114387395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114387471 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114387567 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 114387641 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114387680 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114387755 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114387756 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 114387794 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 114387839 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 114387970 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 114388028 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114388238 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 114388279 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 114388313 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 114388408 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 114388650 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114388651 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114388674 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 114388778 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114388835 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 114389084 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114389300 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114389301 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 114389418 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114389427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114389528 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114389548 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 114389825 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 114390000 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 114390012 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 114390014 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 114390163 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 114390956 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114391708 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 114392344 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114392693 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114392834 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 114392839 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114394479 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 114394551 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114394733 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114394829 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114395366 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 114395379 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 114395619 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114395633 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 114395999 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 114396021 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 114396247 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114396675 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 114396762 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114396782 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114396927 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 114397088 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114397914 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 114397939 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 114398101 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 114398510 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 114398636 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 114398763 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114399093 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114399178 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114399204 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114399306 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114399327 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 114399378 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114399400 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114399693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114399827 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114399838 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114399854 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 114399976 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114400016 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114400077 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114400218 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114400282 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 114400329 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114400544 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114400546 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114400717 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114400769 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114400820 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 114400940 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 114401012 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 114401063 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114401137 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114401299 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114401318 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 114401542 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114401841 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114402088 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114402553 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114402554 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114402602 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114402691 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114402733 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114402915 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114402920 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114403139 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114403397 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114403416 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114403675 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114403914 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114404049 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114404132 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114404225 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 114404373 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 114404798 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114404853 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114404969 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 114405274 G C N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 114405443 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 114405670 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 114405803 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 114405978 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114406943 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114407314 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114407548 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114407611 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114407616 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114407713 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114408798 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114409438 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114409450 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114409459 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114409568 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114410112 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 114410134 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114410183 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 114410633 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114410765 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 114410768 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 114411893 G A Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 114412015 A G N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 114412181 A G N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 114412237 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114412259 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114412269 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114412288 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114412337 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114412378 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114412791 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 114414137 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114414160 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114414217 G T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 114414404 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114414768 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114415700 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 114415821 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 114416450 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114417238 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114417367 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114417616 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114418305 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114418387 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114419592 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114419673 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114420354 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114421107 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114421320 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 114422045 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 114423644 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114423817 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114424088 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114424333 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114424848 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114425905 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114426579 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114426736 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114427559 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114428204 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114428246 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114430522 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 114431077 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 114431377 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 114432623 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114432876 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114433247 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 114434044 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 114434409 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114435817 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114437638 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114437824 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114438337 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114439341 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114439424 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 114440064 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114440290 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114441162 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114441398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114441623 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114443086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114443152 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114443187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114443565 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 114444172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114445073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114445988 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 114446011 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 114447005 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114449098 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 114449202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114449672 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114450376 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114451176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114451702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114451940 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114452731 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114453310 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114453580 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 114454131 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114454358 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114454474 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114454490 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 114454528 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 114454765 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114454786 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 114454834 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114454845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114454927 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114455328 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114455445 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114455507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114455712 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 114455717 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 114456717 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114457226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114457337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114457485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114457887 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114457998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114458445 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114458468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114458530 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114458819 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114459136 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114459227 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114459263 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114460472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114460704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114461279 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114461410 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 114461572 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114461595 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 114461954 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114462106 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114462125 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114462325 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 114462361 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114462382 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114462920 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 114463271 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114463475 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 114463853 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 114463874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114463958 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 114464042 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 114464238 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114464681 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 114465727 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 114465946 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 114466009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114466170 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114466192 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 114466543 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114466626 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114466690 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 114466939 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114467327 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114467406 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 114467848 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 114467872 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 114468184 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 114468290 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 114468434 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 114468811 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 114468833 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 114468845 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 114468953 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114470066 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114470183 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114470433 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114472308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114472461 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114472462 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114472648 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 114473254 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 114474949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114478283 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 114478398 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 114478815 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114479540 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114480162 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114480176 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114480203 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114480353 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114480359 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114480536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114480953 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 114481048 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 114481120 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 114481142 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 114481149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114481415 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 114481476 G A N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 114481929 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 114482267 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 114482534 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 114482603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114482893 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 114483135 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 114483309 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114483441 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 114483590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114483820 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114484178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114484296 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 114484323 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 114484331 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 114484356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114484367 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114484398 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114484432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114484505 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114484533 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114484636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114484655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114484685 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114484688 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114484773 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114484838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114484847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114484914 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114485358 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114485527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114485626 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114485695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114485852 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 114486014 T C N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 114486178 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 114486327 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114486349 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114486440 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114486694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114486734 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114487011 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114487026 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114488095 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114488280 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114489203 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114489290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114489602 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114490077 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114490167 G T N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 114490212 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114490264 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114490767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114491069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114491309 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114491551 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114491813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114491984 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114492099 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 114492155 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114492169 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114492179 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114492355 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114492629 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 114492781 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114493300 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114493389 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114493793 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 114493960 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114494168 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114494203 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114495302 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114495749 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 114496083 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114496108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114496895 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114496902 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114497079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114497484 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114497502 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114497583 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114497592 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114497843 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 114497864 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114498052 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 114498383 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114499094 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114499292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114499559 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 114500017 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114500345 A T Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 114500499 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114501331 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 114501624 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114501695 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114501939 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 114503530 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 114504484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114504683 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114504732 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114504843 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 114505312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114505508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114505941 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 114506068 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114506322 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114506724 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114507153 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114507448 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114508764 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114509194 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 114512310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114513734 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114514451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114514458 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114514909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114515024 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114515175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114515602 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114515915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114516635 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114518488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114518928 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114519303 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114524015 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114524180 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114525023 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114526010 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 114526011 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 114526115 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114526550 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 114527983 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114528188 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114528715 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114531430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114532172 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 114532512 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 114533015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114533415 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114534112 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114536652 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114536674 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 114540354 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 114540482 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 114540647 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 114540990 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114543768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114545545 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114545796 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 114547200 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114547327 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114547343 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114547361 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114547376 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 114547448 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114547771 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114547961 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 114548207 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 114548629 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114548731 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 114548765 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 114548851 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 114548922 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 114548994 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 114549047 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114549121 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 114549440 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 114550324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114551780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114553630 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114555152 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 114555783 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114556563 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114558022 G T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 114559196 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 114559522 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 114561657 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114561765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114562742 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114563124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114563565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114573009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114573551 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114573690 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 114573879 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114574069 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114574487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114574677 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114574690 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114574766 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114574865 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114576199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114577075 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 114577167 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114578706 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114578905 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114579547 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114579814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114580259 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 114580380 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 114581110 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114583158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114583531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114584226 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114584354 T A N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 114584481 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 114586473 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114586484 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114587594 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114587599 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114587647 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114587665 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114587785 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114588600 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 114588633 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114588867 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114588910 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114589772 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114590237 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114591709 A C Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 114591712 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 114592732 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114592764 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114592896 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114593021 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114593338 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114594033 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114594106 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114594399 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 114594459 T G N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 114594598 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 114595207 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114595351 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114595656 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 114596204 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114596418 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114597726 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114597740 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114598147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114598282 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114599007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114599581 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114599796 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114600040 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114600928 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 114602858 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114603180 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114603204 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114604604 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114604712 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114606364 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114606376 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114606424 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114606602 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114606625 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114606986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114607036 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114608975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114610413 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114610895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114612093 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114612422 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114612949 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114613417 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114613764 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114614702 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114615013 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 114615026 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 114615058 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 114615860 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114615861 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114616074 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114616297 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114616373 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 114620225 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 114620428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114620865 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114622215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114622655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114623252 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114623570 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114624851 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114626078 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114626337 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114626359 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114627011 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114627320 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 114629289 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114629697 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114629698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114630382 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114630500 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114631238 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114631488 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114631835 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114632275 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114632460 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114633297 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114635564 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 114635969 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 114636496 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114636658 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114637156 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114637441 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114639053 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114640084 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114641221 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114641909 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114643054 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114643133 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114643439 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114643977 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114644142 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114645518 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114648770 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114648856 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114649468 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114649637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114650597 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114651873 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 114651874 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 114652219 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114652997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114654348 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114654397 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114654506 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114654614 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114654669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114654848 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 114657642 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114657872 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114658634 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 114658742 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 114659240 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 114659701 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 114659720 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114659774 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 114659838 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 114660149 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114661218 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114664771 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 114665123 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114666254 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114667061 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 114667232 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114668142 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114668359 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114668782 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114674133 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 114675595 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 114677663 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114679574 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114683005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114683347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114683928 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114684363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114684579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114684695 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114685097 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 114685165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114687122 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 114687210 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114687689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114688947 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114689619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114691050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114693493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114695275 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 114695362 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 114695378 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 114695465 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 114695470 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 114695676 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 114695918 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 114696166 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114696247 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 114697127 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 114697306 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 114697335 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 114697491 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 114697534 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 114697675 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 114697682 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 114697694 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 114697835 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 114697848 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 114697870 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 114697871 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 114697900 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 114699020 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114699537 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 114699656 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 114699721 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 114699722 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 114700472 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 114700708 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114700974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114701431 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114701505 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 114701793 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114702679 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 114703131 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114703256 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 114703411 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114703505 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 114703507 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 114703591 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114703608 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114703926 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 114703945 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114704576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114705294 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114706616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114706733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114706909 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 114707520 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114707788 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 114710242 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114711642 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114713431 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114714235 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114714534 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114716001 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114716508 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114717167 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114717425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114717443 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114717470 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114717560 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114717575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114717659 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 114717790 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 114717811 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 114717845 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 114717993 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 114718136 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 114718152 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 114718273 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 114718311 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 114718361 A C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 114718502 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 114718517 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 114718553 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 114718658 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 114718669 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 114718747 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 114718845 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 114718935 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 114718953 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 114719039 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114719053 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114719160 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 114722039 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114722081 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114722178 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114722303 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 114722356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114722359 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114722732 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114722898 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 114722922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114723158 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114723228 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114723489 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114723511 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114723542 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114723730 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 114723731 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 114723769 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 114723869 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114723966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114724189 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114724198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114724232 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 114724255 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114725052 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 114726041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114726504 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 114726549 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 114726944 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 114727044 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 114727106 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114727107 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114727858 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 114727870 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 114727939 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 114728036 T A Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 114728223 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114728310 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 114728321 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 114728392 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 114728633 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114728642 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 114728648 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 114728662 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 114728725 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 114728734 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 114728949 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 114728961 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 114729038 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 114729039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114729086 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 114729111 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 114729178 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 114729269 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 114729281 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 114729331 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114729348 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 114729452 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 114729490 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 114729514 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 114729585 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 114729603 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 114729604 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 114729641 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 114729785 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 114729793 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 114729841 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 114729882 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 114729912 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 114729930 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.0833333333333333 0.75 0.166666666666667 11 13 1 9 2 2 114729931 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 2 114730378 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 114730391 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 114730408 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 114730513 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 114730584 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 114730586 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 114730747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114731161 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 114731239 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 114731244 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 114731259 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 114731307 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 114731317 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 114731347 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 114731397 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 114731405 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 114731747 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 114731920 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 114731931 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 114732120 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 114732126 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114732137 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 114732247 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 114732256 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 114732470 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 114732527 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 114732569 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 114732600 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 114732651 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 114732823 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 114732985 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 114733003 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 114733066 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 114733067 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 114733128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114733276 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 114733752 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 114733754 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114733819 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 114736027 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114736495 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114736779 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 114738473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114738841 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 114739403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114740493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114741890 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114742045 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114742097 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114742308 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114742369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114743417 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 114743620 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114743837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114743898 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 114743908 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 114744397 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114745355 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 114745527 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 114745541 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 114745565 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114745590 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 114745822 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 114746006 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 114746015 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 114746026 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 114746133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114746185 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114746445 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114746483 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 114746906 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114747116 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114747213 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 114747273 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 114748412 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 114748428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114748486 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 114748487 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 114748917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114749116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114749125 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114749134 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114749248 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114749473 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 114749792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114750009 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 114750054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114750083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114750180 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114750232 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114750551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114750563 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114750785 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 114750831 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 114751455 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 114751569 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 114751628 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 114751645 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 114751772 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 114751810 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 114751842 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 114751874 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114751922 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 114751931 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 114751937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114751972 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 114752052 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 114752070 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 114752201 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114752350 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 114752364 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 114752378 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 114752404 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 114752519 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 114752739 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 114754763 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114754835 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 114754968 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 114755080 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 114755104 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 114755181 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114755664 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114755759 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 114755802 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114755959 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114756226 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 114756347 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 114756527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114756842 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 114756990 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 114757046 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 114757268 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 114757408 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 114757505 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114757697 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 114757965 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 114759042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114759368 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 114759577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114759587 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 114759903 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 114760312 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 114760578 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114761907 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 114761951 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 114762955 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114763156 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 114763622 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114764198 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114764941 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114765742 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 114766169 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114767609 C T Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 114767844 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114768031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114768164 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114768181 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114768412 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 114769394 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114769438 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114770311 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 114770876 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 114770968 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 114771687 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 114771752 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 114772049 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114772224 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 114772267 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 114772280 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 114772313 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 114772430 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 114772474 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 114772505 C A Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 114772666 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 114772843 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114772902 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 114772955 A C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 114773318 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114773623 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 114773775 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 114774060 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 114774122 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 114774207 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 114774339 T A Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 2 114775155 T G Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 114775319 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114776638 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 114776693 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 114777010 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 114777032 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 114777103 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114777166 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114777320 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 114777358 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 114777518 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114777588 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 114777601 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 114777787 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 114778591 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 114778597 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 114778980 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 114779734 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114779760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114780096 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 114780177 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 114780299 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 114780834 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 114780844 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 114780858 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 114781214 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 114781247 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 114782182 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 114782404 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 114783020 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114783044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114783157 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114783178 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 114783231 C G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 114784173 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 114784252 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 114784424 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114784465 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 114784590 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 114785073 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114785231 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114785262 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114785420 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114785911 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114787007 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114787112 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114787139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114787738 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114788194 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114789876 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114789889 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114790436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114790786 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114790805 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114791443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114792447 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 114792551 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 114792702 C A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 114792938 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 2 114792987 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 114793076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114793207 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114793435 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 114793503 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114793522 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 114793523 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 114793636 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114793640 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114793689 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114793733 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114793826 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 114793845 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 114793861 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 114793868 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 114794106 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114794117 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 114794136 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 114794139 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 114794167 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114794174 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 114794530 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114795478 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114796789 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114796791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114797037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114798400 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 114798444 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114798512 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114799670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114800084 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 114800467 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114802301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114802797 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114802988 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114803902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114804355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114804650 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114805170 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 114807357 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114807562 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114808190 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114808342 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 114809049 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114810160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114810179 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 114810763 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114810981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114811048 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114811563 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 114812046 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114812207 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 114812386 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114812389 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114812465 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114812696 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114812772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114813724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114814148 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114814234 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 114814598 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114814781 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 114816298 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114816340 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114817782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114817947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114817979 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114818294 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 114818322 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 114818493 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 114818879 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 114819192 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114819438 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 114819987 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 114820272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114820608 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114820631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114820800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114820850 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114822141 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114822252 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114822259 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114822326 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114822791 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 114823272 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114823333 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114824158 T C Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 114824186 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 114824405 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114825059 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114825216 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 114825217 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 114826240 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 114826306 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 114826405 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 114826447 G C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 114826856 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 114827248 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 114827257 C A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 114827393 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 114827663 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 114828323 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 114829636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114831704 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114832576 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114833051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114833648 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114835219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114835679 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114835696 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114835817 G T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 114836109 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114836209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114836335 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 114836418 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114836589 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 114836611 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 114836856 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114837014 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 114837339 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 114838137 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 114838339 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 114838426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114838759 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 114838927 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 114839001 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 114839006 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114839542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114839938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114840013 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 114840402 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 114841122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114841507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114841646 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114841969 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114841989 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 114842038 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 114842111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114842866 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 114843504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114843736 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 114843948 T C N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 114844346 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 114845812 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114846218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114846581 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114846787 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114847076 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 114847327 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114847605 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 114847607 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114847645 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 114848270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114848486 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 114848509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114848518 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114848966 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114849168 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114849386 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114849673 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114850587 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114850691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114850838 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114850850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114851016 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114851115 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114852608 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 114852752 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114852958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114852985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114853011 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114853272 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114853369 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 114853486 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 114853777 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114853822 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114853843 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114854028 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114855487 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114855656 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114855726 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114856602 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114856777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114857503 T C Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 114857884 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 114858377 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114858479 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114859001 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 114859518 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114860162 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114861027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114861280 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114862420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114862671 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114862790 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114863071 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 114863439 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114864214 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 114864895 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114865258 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 114866782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114867278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114867822 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114868434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114868942 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114869275 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114869390 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114869417 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114869522 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114869571 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114869695 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 114869869 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114869913 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 114869944 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114870498 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 114870500 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 114870572 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 114870593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114870741 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114870874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114871036 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 114871290 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 114871294 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 114871389 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 114871562 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114871563 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114871944 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 114871967 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114872137 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 114872193 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 114872300 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114872455 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 114872502 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114872646 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 114872756 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 114872772 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 114872856 T G N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 114872949 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 114873317 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 114873507 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114873596 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 114873610 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 114873741 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 114873770 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 114873783 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 114873795 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114873891 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 114873978 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 114874248 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 114874385 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 114874516 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 114874534 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 114874599 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 114874664 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 114874805 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 114874848 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114874879 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114874887 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 114874931 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 114875145 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 114875217 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 114875413 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114875653 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 114875659 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 114875692 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 114875709 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 114875808 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114875846 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 114875924 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 114875959 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 114875996 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 114876029 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 114876135 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 114876145 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 114876342 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 114876384 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 114876400 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 114876401 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114876436 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 114876437 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 114876562 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 114876670 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 114876907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114877317 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114877412 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 114877439 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 114877503 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114877559 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 114878353 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 114878823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114878875 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114878876 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 114879699 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114879838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114879917 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114879928 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 114880229 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 114880442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114880525 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 114880635 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 114880777 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114881789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114884342 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114885085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114885370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114885428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114885604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114886150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114886540 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114886703 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114886709 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 114887814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114888082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114890771 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114891437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114893050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114894718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114895093 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 114896112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114897692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114898065 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 114898165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114899535 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114899851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114901399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114901550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114902095 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 114902441 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114902626 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114902780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114903558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114904050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114904367 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114906084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114906485 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114907418 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 114908835 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 114909540 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114910261 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114910729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114911268 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114911549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114911718 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114911738 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114912397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114914703 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114915349 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114916468 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114917384 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114917990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114918866 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114918975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114919551 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 114919675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114920809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114920836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114921272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114922859 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 114923535 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114923917 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114923979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114924448 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114924613 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114924636 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114925027 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114925314 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114925490 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114926157 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 114926359 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114926414 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114926875 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114927906 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114928083 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114928384 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114928526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114928642 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 114928930 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114929044 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114929831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114929867 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114930190 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114930331 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114930722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114931190 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114932646 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114932648 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 114933100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114933727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114934200 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114935357 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114935371 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114935506 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114935589 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114935675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114936165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114936307 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 114936335 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114936358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114936447 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114936509 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114937389 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114937494 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114937506 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114937518 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114937555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114937638 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114937768 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114937790 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 114937954 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 114938528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114938723 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114938738 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114939044 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 114939050 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 114939063 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 114940159 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114940201 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114940299 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114940359 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 114940388 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 114940463 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114940538 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114940644 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114940728 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114940903 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114941330 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 114941340 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114941403 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114941411 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 114942032 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114942150 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 114942233 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114942394 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114942405 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114942429 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114942521 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 114942550 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114942555 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114942561 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114942616 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114942751 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114942774 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 114942836 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114943154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114943929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114944404 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 114944976 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114945694 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 114946560 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 114946587 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114947431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114949152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114949933 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114950471 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114953229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114953267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114954516 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 114954747 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114956316 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114957069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114959244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114961407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114962627 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114962677 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114966718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114970479 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114971606 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 114971712 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 114971896 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 114972464 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114972816 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 114972897 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 114973154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114974513 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114974584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 114975163 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 114975544 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 114975548 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 114975583 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 114975631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114975926 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 114988992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114989056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114989295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114989705 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 114989734 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114989856 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 114990730 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114991400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114992163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114992906 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 114993285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114993625 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 114993637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114995357 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 114995368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114995501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114998657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 114999412 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115001393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115002003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115002224 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115002283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115004714 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115004845 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 115005546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115006435 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 115006572 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115006692 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 115006995 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115007162 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 115007885 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 115008153 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115008447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115008515 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 115009119 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 115009139 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 115010885 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115011512 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 115011644 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 115011738 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115011895 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 115012098 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115012541 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 115012658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115012937 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 115013013 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 115013193 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 115013406 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 115013528 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 115013558 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 115013599 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 115013627 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 115013868 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115014071 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115014111 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 115014124 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 115014141 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 115014251 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115014566 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115014649 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 115014689 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 115014723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115014812 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 115014993 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 115014994 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 115015034 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 115015100 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 115015103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115015418 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 115015691 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 115015714 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 115015795 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 115015884 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 115015914 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 115016050 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 115016059 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 115016068 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 115016103 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 115016186 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 115016216 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 115016332 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 115016677 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115016679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115016776 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 115016779 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 115016810 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 115016965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115017078 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 115017258 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 115018892 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115019876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115020742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115021367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115021702 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115022164 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115026108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115026272 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115028344 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115029805 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 115031893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115032249 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 115032352 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 115034565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115034817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115036072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115038276 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115039545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115039689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115040935 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 115040936 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 115041246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115041969 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115042349 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115044872 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115046181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115050606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115050698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115053838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115054131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115055552 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115055637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115056460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115056978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115057006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115057340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115059574 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 115060197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115061582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115061891 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115062746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115063228 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115063494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115063772 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115064569 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115064768 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115064902 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 115065371 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115065666 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115065759 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115066300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115066367 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115067174 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115067246 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 115067465 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115067552 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115067656 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115068010 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115068081 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115068109 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115068138 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115068299 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115068354 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 115068429 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115068650 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 115068878 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 115069306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115069315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115069317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115069648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115069665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115070088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115070842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115071758 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115071785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115072376 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115072407 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115072465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115072475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115073135 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115073158 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115074455 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115074725 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115074930 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115074945 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115074978 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115075002 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115075063 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115075077 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115075080 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115075468 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115075481 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115075592 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115075612 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115075692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115076450 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115076504 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115076544 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115076558 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115076575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115076622 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115076632 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115076642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115076892 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 115077112 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115077215 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 115077229 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 115077240 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 115077485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115078489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115078553 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115078659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115078660 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115078881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115078914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115079371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115079470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115079643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115079650 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115079727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115079871 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115080174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115080195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115080199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115080293 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115080326 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 115080329 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 115080355 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115080394 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115080468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115080570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115080602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115080689 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115080915 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 115081030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115081119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115081332 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115081337 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115081759 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 115081852 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 115082515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115082623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115082627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115082761 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115082834 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115085125 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 115085579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115085584 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115086052 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 115086237 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115086553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115086581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115087093 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115087469 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115087701 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115088508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115088545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115088593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115088830 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115089001 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115089338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115089692 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115089909 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115090282 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115090289 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115090353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115090460 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115090493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115090526 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115090587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115090626 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115090677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115090792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115091378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115093799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115094750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115097151 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115097483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115097919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115098205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115098473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115098479 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115098670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115098996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115098999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115099305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115099459 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115099643 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115099845 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 115099865 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115100096 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115100375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115100521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115100654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115100807 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115100930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115100989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115101020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115101189 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115101267 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115103128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115103237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115103269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115103291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115103306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115103343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115104399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115104610 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115104611 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115104732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115105150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115105684 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115105940 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 115106657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115107147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115107519 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115107683 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115107887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115108167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115108614 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115108681 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115108798 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115108915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115109201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115109246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115109420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115110149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115111662 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 115111922 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 115112986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115113253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115114917 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115115339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115118849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115119025 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115119843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115120060 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115120424 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115122605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115123064 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115124180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115124409 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115126478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115127038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115128873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115129522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115129868 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115130394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115130860 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115131798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115132251 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 115132664 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115132901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115133272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115133273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115137199 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115137472 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115137581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115137954 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115139803 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115139918 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115140128 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115140136 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115140685 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 115141368 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115142274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115142679 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115142796 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 115142897 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115143158 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115143455 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 115144842 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115145634 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115146090 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115146361 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115146404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115146731 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 115147111 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115147198 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 115147872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115151007 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115153119 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115154251 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 115154497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115154736 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115154873 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115154885 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115155108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115155307 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115155446 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 115155562 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 115156028 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115156796 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 115156819 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115156851 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115157009 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115157277 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 115157397 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 115157450 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 115157516 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 115157748 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 115157950 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115158150 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115158246 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115158448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115158502 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115158647 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115158719 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115158963 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115159155 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 115159494 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 115159656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115159660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115160006 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115160543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115161055 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115162778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115165268 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 115165891 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115168710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115168921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115169285 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115169874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115170090 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115170545 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115170671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115170715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115170725 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115171010 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115171083 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115171991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115173714 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 115174715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115174919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115175172 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 115175181 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 115176812 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 115178581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115179131 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 115180598 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 115182097 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 115182127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115182207 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 115182280 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 115182300 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 115182652 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115182916 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 115184686 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 115185326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115189119 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 115189173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115189459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115189704 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115189905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115192080 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 115193195 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115193648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115194487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115197118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115197640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115202466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115202787 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 115203068 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115203815 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115205829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115206480 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115207152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115207561 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 115208474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115210251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115210734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115211633 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115212774 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115212787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115212797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115212804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115216386 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115216452 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115217597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115218430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115218915 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115219066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115219284 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 115219294 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 115219585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115219633 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 115219683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115219712 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115219719 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 115220089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115220597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115220923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115220945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115220988 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115221253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115221345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115222126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115222201 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115223095 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 115223830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115224817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115224827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115225882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115226563 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115226718 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115227245 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115227266 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115227284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115227347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115227825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115227891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115227958 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115228318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115228440 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115228504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115228572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115228598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115228781 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115228795 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115228837 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115228887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115228895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115229005 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115229010 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115229023 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115229036 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115229070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115229075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115229099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115229192 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115229283 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115229301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115229380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115229404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115229566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115229683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115229743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115229895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115229924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115229980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115230235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115230271 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115230449 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115230678 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115230684 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115230948 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115231084 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115231208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115231494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115232327 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115232532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115232734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115232924 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 115232962 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 115233320 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115234815 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115235396 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 115235987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115235992 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115236112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115237053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115237847 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115237862 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 115237947 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115238541 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115239166 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 115239343 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 115240138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115240183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115244569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115244747 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115245601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115246133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115246142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115246368 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115246815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115247493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115248630 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115248780 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115248795 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115250810 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 115250838 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115253737 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115253962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115254078 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115254291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115261747 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115262027 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115265517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115266223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115266356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115267140 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 115267233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115267684 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115267703 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 115267879 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 115269113 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 115269435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115269571 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 115269884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115271704 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115272581 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115272630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115273003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115273311 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 115273334 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115273436 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115273493 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 115273612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115273844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115274231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115274242 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115274275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115274440 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115274560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115274726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115274889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115274972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115274986 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115275892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115275960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115275976 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115276374 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115276475 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115276820 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 115277702 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115277778 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 115277795 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 115277797 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 115277813 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115277826 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 115277978 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 115278232 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115278360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115278398 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115278742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115280263 T G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 115280495 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115283486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115284384 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115284530 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115285002 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115286756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115287095 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115287459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115289529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115290039 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115292412 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115292426 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 115292970 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115293237 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 115293938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115294632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115295160 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115295335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115295403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115296693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115299400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115300701 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115300959 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115302587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115303028 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115303584 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115304757 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 115306042 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115309120 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115309259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115309507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115310198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115310229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115310529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115314194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115314778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115316803 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115317490 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 115317537 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 115317685 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 115317717 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 115317901 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 115318806 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 115319486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115319552 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 115319571 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 115319681 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 115319879 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 115319968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115320125 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 115320326 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 115320380 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 115320381 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115320732 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115320783 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 115320850 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 115321157 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115321230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115321286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115321343 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 115321422 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 115321514 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 115321527 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 115321571 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 115321629 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 115321813 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 115322331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115323214 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115323351 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 115323429 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 115323433 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 115323516 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 115324107 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 115326386 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 115326404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115326593 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 115328091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115329126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115330392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115331934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115332008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115333034 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115335744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115337352 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 115338386 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115338430 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115340618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115342013 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115343370 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115344273 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115344345 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115344924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115345336 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 115347597 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115347978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115349003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115349756 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115349878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115355508 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115359521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115363136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115364003 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115366952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115367896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115369902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115370378 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 115373745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115375183 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115381139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115381939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115385719 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 115385756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115385860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115386526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115386646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115386695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115387130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115387375 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 115387672 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 115387771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115387847 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115388268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115388642 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 115389101 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115389220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115389308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115389569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115391580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115391930 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115402081 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 115402962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115409058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115410049 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 115412423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115415946 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115417670 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115418846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115419146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115419542 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115423414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115423493 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115426674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115427174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115429110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115429293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115432952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115433998 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 115445236 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 115445995 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115447156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115447680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115448757 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 115450392 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115450952 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115454346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115455085 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115455133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115458298 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115458484 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115460888 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115461648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115462173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115463086 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115463794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115464577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115464579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115465760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115466164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115466168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115466185 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 115469904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115473063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115473696 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115473763 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 115477361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115477610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115480205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115480338 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115482582 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115485949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115486440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115486878 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115487248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115487885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115488463 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115490385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115491340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115492356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115494150 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115498123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115498326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115498467 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 115498996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115500185 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 115504286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115504609 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115505233 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115505854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115506532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115507171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115508883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115511821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115512947 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115514353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115516859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115517603 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115517961 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115518017 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115520747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115522626 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115524657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115528594 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115528879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115530066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115531417 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115535017 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115535050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115535134 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115536310 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115546053 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 115546752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115547916 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115551846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115553066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115553331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115554184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115554542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115554820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115555415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115555435 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115556584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115557677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115558070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115560075 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115561044 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115563726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115563986 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115564836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115565115 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 115565240 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 115565794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115568526 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115570091 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115570379 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115570485 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115571141 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115571157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115573494 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115573562 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115573808 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115573860 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 115573922 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 115573945 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115573956 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115574186 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 115574380 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115574400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115574482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115574651 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115574790 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115574799 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115574873 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115574888 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115574966 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115574980 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115575001 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115575202 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115575353 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115575522 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 115575991 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 115576032 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115576631 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115576684 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 115576782 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115576852 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 115576873 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 115576945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115577153 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115577312 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115577881 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115578072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115578179 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115578183 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115578310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115578349 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115578356 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115578652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115578668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115578873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115578891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115578909 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115579109 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 115579158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115579574 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115579821 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115579823 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115581876 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 115582581 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115584831 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115585856 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115586394 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 115587614 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115589050 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 115589668 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115590529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115590820 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115590824 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115591376 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115591682 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 115591685 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 115591994 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115592042 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115593945 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115594083 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115594997 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115595976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115597293 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115597371 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115597688 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115597733 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115597954 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115598013 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115598240 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 115598331 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115598346 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115598646 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115598704 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115598749 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115598961 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115598964 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115599046 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115599884 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115599904 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115600346 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115600459 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115600581 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115600879 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 115601865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115601992 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115601995 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115602103 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115602104 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115603082 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 115603349 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 115603604 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 115603828 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 115604281 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115604337 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115604397 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115604412 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115604415 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115604992 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115605098 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115605333 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 115605395 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 115605853 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115605972 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115606382 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115606431 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115606538 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115606608 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115606718 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115606834 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 115607572 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115607634 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115608064 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 115608070 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115608507 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115608695 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 115608727 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115608833 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115608947 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115608954 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 115609351 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115609544 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115609572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115609651 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 115609709 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115609780 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115610026 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115610050 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115610083 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115610095 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 115610227 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115610349 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115610385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115610480 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 115610592 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 115610647 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 115610702 A T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 115610832 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 115611025 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115611121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115611436 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115611528 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 115611549 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115611551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115611564 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115611977 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115612143 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 115612526 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115612587 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115612617 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 115612662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115613002 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115613030 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 115613037 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115613054 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115613077 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115613198 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115613207 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115613271 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115613272 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115613287 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115613312 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115613321 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115613325 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115613384 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115613387 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115613400 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115613426 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115613446 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115613561 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115613713 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115614126 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115614170 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115614179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115614254 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115614353 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115614374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115614497 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 115614979 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 115615046 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115615078 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 115615251 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 115615302 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 115616007 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115616200 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115616321 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115616355 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115616356 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115616538 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115616604 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115616641 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115616808 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 115616852 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 115616894 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 115616898 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115617003 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115617212 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 115617337 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 115619972 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 115620186 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 115620206 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 115620288 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 115620319 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 115620382 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 115620401 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 115620511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115620523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115620552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115620764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115620769 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115621068 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 115621365 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115621430 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115621461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115621555 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115621594 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115621794 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115621984 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115622175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115622459 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115622686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115622772 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115622860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115622965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115623275 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115623481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115623501 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115623519 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 115623524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115623562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115623712 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 115623774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115623865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115624004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115624031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115624230 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115624260 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115624366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115624371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115624386 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115624575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115624593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115624799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115624885 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 115624911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115625060 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 115625172 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 115625217 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115625742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115626204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115626289 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115626445 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 115626502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115626735 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 115627047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115627320 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115627380 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115629157 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 115629185 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 115629212 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 115629268 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 115629406 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 115629555 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 115629643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115629878 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 115629942 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115630106 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115630154 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 115630615 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 115630858 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 115630974 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 115631713 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 115631759 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 115632119 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115632139 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115632196 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 115632235 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115632240 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 115632582 G C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 115632670 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 115632700 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 115633174 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115633193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115633228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115633240 T G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 115633407 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115635006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115636348 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115636504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115636787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115637194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115637429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115638978 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115639006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115639228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115640980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115641036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115642172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115643240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115644086 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115644685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115645018 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115647334 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115647568 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 115648655 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 115649059 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115650961 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115650968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115651006 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 115651506 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115651819 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115652738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115654627 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115655234 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 115655560 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115655661 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115655797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115656805 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115657058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115657822 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115661024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115662397 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 115662561 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115662566 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115662588 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115663410 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115663427 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115663744 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115664412 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 115668992 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115669227 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115670567 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115672607 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 115673159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115674336 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115676078 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115676499 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115680879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115691034 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115691064 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115691635 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115693475 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115693587 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115693750 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115693998 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115694085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115696302 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115697012 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115697130 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 115698008 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 115698281 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115698883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115699111 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115699455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115700060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115700605 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 115700760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115700909 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 115701607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115703218 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 115706911 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115707610 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115708530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115708598 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115708600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115708895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115711255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115711753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115711806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115711823 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115711945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115711972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115712037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115712189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115712335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115712380 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115712473 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115712516 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 115712695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115712715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115712771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115712818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115712863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115713116 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115713214 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115713300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115713368 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115713715 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115713751 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115713781 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115713875 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115714060 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115714123 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115714226 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115714227 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115714317 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115714332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115714492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115714667 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115715088 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 115715116 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115715157 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115715583 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115716041 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115716189 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 115716314 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 115716532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115716542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115716547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115716559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115716583 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115716651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115716787 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115716859 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 115716900 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115717279 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115718077 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115718190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115718602 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 115719415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115720277 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115721261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115722704 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 115722918 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115724536 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 115727051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115727164 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115727257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115727449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115728549 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115728646 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115729821 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 115731102 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 115731166 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 115732665 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115734626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115734679 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 115734865 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 115734984 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 115735066 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 115735837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115736709 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 115737867 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 115738413 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 115739116 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 115739135 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115739312 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 115739443 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 115739509 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 115739756 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 115740437 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 115741055 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 115741160 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115741259 G C Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 115741487 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 115741897 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 115741950 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 115741954 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 115742261 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 115742536 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 115742745 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115742798 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 115742808 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 115742847 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 115742918 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115742959 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 115743236 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 115743401 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 115743529 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 115744466 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 115744491 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 115744740 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 115744787 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 115744957 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 115745457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115745743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115747161 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 115748016 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115748334 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 115748369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115749392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115749393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115750611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115750857 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115751152 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115751550 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 115751680 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 115751744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115751929 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 115751966 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115752135 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 115752344 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 115752477 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 115752674 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 115753992 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 115754294 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115754299 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 115754317 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115754470 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 115754510 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 115754710 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 115754750 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 115754783 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 115754835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115755049 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 115755258 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 115755475 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 115755726 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 115756021 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 115756124 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 115756131 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115756160 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115756185 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 115756226 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 115756304 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 115756361 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 115756468 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 115756719 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 115756919 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 115757454 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115757540 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115757933 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115758030 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 115758836 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 115759034 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 115759360 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 115759627 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 115759891 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 115760281 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 115760365 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 115760622 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 115760971 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115761060 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 115761817 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115761947 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115763643 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115763741 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 115764487 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 115765664 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 115765812 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115765972 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 115766058 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 115766122 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 115766795 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 115766881 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 115767200 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 115767281 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 115767289 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 115767412 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 115767586 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 115767629 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115767712 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115767926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115768031 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 115768091 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 115768130 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 115768136 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 115768173 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 115768174 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 115768334 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 115768344 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 115768391 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 115768449 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 115768464 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 115768492 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 115768559 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 115768600 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 115768835 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 115769018 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 115769109 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 115769632 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 115770124 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 115770273 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 115770284 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 115770379 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 115770666 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 115770687 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 115770869 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115771052 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 115771055 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 115771123 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115771203 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115771211 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 115771428 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115771528 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 115771564 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 115771615 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115771671 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 115771704 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115771842 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 115771906 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 115771959 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115772061 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 115772095 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 115772132 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 115772138 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115772176 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115772213 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 115772215 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 115772400 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115772467 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115772680 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 115772869 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 115773177 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 115773307 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 115773327 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 115773573 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 115773578 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 115773683 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 115773696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115773730 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 115773781 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 115774828 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 115774853 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 115775013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115775113 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115775205 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 115776368 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 115776802 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115777205 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 115777216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115777225 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 115777245 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 115777357 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 115777631 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 115777669 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 115777692 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 115777782 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 115777825 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 115777953 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 115778323 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 115779375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115780145 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115781289 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115781933 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115782267 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 115782395 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 115783136 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 115783175 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115783758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115783882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115784885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115785769 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 115786240 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 115786988 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 115787129 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 115787428 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 115788056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115789076 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115789082 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 115791004 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 115791266 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 115791293 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115791306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115791773 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 115792071 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115793593 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 115794416 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 115795489 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115796619 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 115797058 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115797731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115797812 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115798356 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 115800526 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115800988 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 115803463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115804846 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115805935 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115806393 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 115807205 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 115807347 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 115807447 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 115807581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115807713 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115808788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115811999 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115812391 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 115812706 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 115815375 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 115815757 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115815797 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 115816035 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 115816041 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 115816067 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115816371 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 115816395 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 115816503 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 115817719 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115817837 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 115818047 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 115818055 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 115818239 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 115818578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115818712 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115818713 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115818915 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 115818957 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 115818967 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 115819813 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 115820231 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 115820499 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115820631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115820644 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 115820754 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 115820760 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 115820840 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 115821402 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 115821672 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 115825649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115826370 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 115829441 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 115831885 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 115831982 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 115831996 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 115832325 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 115832371 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 115832393 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 115832503 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 115832933 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 115833047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115833247 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 115833397 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115833580 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115833849 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 115833988 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 115834077 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 115834289 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 115834322 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 115834459 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115834624 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115835223 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115836258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115837764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115842947 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 115844703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115845300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115850737 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 115851114 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 115853774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115858552 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115859004 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 115861577 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 115862104 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115862482 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 115863059 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 115866372 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115866388 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115866583 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 115866631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115866776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115866777 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 115866995 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 115868287 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115868407 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115868443 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115869753 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 115870285 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 115870669 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 115871731 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 115871971 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 115872051 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 115873106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115873175 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 115873526 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115875255 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 115875507 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 115875868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115877246 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115877496 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115877604 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115879876 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115880096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115880816 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 115881855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115881869 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115883072 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 115883161 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 115884580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115885216 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 115885972 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 115886109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115887776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115887796 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115890275 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 115890402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115892439 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115892559 C G Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 115892867 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115894694 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 115896224 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115896730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115896911 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 115898751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115899977 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 115901182 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 115901782 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 115901784 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 115901800 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 115903468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115903560 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115904109 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115905217 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 115905458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115905704 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 115909297 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 115909973 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 115910694 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 115911051 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 115912156 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 115912279 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115912332 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 115914533 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 115916124 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115916691 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 115917050 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 115917725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115918540 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 115918727 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 115918842 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 115918927 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 115918992 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 115919030 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 115919093 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 115919155 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 115919218 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 115919275 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 115919331 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 115919427 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 115919495 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 115919699 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 115920724 A C Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 115921032 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 115921111 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 115921117 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 115921200 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 115921201 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 115921386 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 115921471 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 115921497 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 115921505 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 115923409 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 115924068 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 115925584 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 115928258 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 115928995 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 115930163 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 115931009 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 115931082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115931328 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 115931496 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 115931537 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 115931571 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 115931572 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 115931703 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 115931866 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 115932580 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 115933708 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 115933942 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115933959 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 115934219 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 115934851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115934870 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 115936269 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 115936849 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 115937015 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 115938096 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 115938131 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115938205 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 115939396 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 115940425 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 115940584 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 115941199 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 115942743 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 115943436 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 115944673 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 115944854 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 115944998 C T Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 115944999 A G Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 2 115945036 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115945440 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 115945635 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 115947174 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 115949954 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 115953125 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 115953298 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 115954022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115955519 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115955703 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 115955760 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115955777 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115955810 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 115955840 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115955855 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 115955899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115955997 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115956042 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 115956096 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115956297 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 115956339 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 115956485 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115956590 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115956593 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115956633 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 115956700 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 115956763 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115956803 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115956808 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115957186 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 115957258 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115957436 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115959340 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 115959846 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115960017 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 115960888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115964701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115966124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 115966701 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115966998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115967178 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115967813 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115969010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115970416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115970643 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 115971343 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 115971423 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 115971520 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 115971965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115972227 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 115972258 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 115972308 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 115972493 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 115972555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115972582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115973019 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 115973182 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 115973511 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 115973697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115973758 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 115973892 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 115974144 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 115974217 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115974363 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115974435 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115974538 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115974692 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115974776 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115975051 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115975090 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115975507 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 115975559 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 115975806 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 115983255 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 115983336 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 115983369 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 115983726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115984265 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 115985659 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115985959 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 115986106 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 115986121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115986632 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 115986690 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 115986866 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 115986928 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 115987043 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 115987150 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 115987506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115987524 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115987559 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 115987571 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 115987573 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 115987628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115987650 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115987848 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115988224 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 115988257 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 115988404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115988514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115988596 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 115988634 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 115988691 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 115988703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115988794 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115988896 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 115989046 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 115989050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115989260 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115989315 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 115989354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115989756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115989920 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 115989963 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115989972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115990169 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115990190 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115990399 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115990731 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 115990738 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 115990761 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 115990861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115990869 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 115990929 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115991006 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 115991010 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 115991357 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 115992467 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115992929 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 115993164 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 115993175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115993220 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 115993259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115993445 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 115993655 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 2 115993664 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 115993776 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 115993922 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 115993941 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 115994027 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 115994033 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 115994058 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 115994300 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 115994516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115994643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115994707 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 115994763 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 115994785 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 115994791 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 115994874 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 115994933 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 115994968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115995001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115995055 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 115995113 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 115995237 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 115995247 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 115995369 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 115995532 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115995662 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 115995728 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115995769 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 115995782 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 115996115 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 115996476 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 115996692 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115996778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115997263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115997296 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 115997447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115998696 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 115998975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115999265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115999360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 115999886 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 115999994 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 116000050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116000349 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116000788 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116000989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116001113 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 116001469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116001553 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116001773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116001802 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116002033 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 116002210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116002899 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116003095 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116003341 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116003375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116003458 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 116003643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116003843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116003937 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116004013 G T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 116004321 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116004674 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 116004739 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116004876 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116004937 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 116004997 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 116005246 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 116005318 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 116005649 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116005673 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116005917 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 116006379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116006456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116007038 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116007107 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116009191 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116009596 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116010292 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116010522 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 116010945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116011948 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 116012436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116012627 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 116012701 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 116012729 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116013348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116013760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116014301 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116015638 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116015855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116016075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116016094 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116016188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116016379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116017062 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116017261 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116017292 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116017540 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116017567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116017875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116017937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116018003 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116019123 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116019152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116019365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116021328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116022011 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116022087 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116022154 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116022170 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116023131 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116023276 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 116023347 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 116023358 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116023383 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116023401 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116023495 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 116023508 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 116023563 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116024508 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116024885 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 116025070 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 116025300 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 116025478 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 116025929 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 116026179 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 116026236 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 116026329 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116026440 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 116026602 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 116026670 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116026691 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116026703 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116026959 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 116028198 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 116028289 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116029443 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116031135 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116031260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116031975 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116032610 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116034461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116034722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116034849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116035002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116035028 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116035513 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116035530 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116035750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116036085 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116036967 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116037040 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116037089 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 116037388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116037570 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116037880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116039472 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116039587 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116039825 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116039894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116039923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116039993 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116039995 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116040049 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116040066 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 116040148 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 116040278 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116040412 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 116040614 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 116040705 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 116040792 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 116040829 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 116040998 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 116041038 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116041087 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116041367 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 116041452 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 116041495 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 116041598 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 116041603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116042335 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116042473 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 116042484 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 116042536 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 116042621 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 116042643 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116042653 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116042684 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 116042698 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116042741 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 116042825 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 116042875 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 116042882 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 116042891 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 116042948 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 116042959 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 116042990 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 116042992 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 116043044 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 116043051 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 116043082 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 116043334 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 116043414 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 116043417 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 116043453 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 116043455 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 116043470 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 116043475 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 116043503 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 116043507 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 116043663 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 116044753 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 116044804 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 116045428 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 116045437 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116045473 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116045485 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116045534 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116045548 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 116045573 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 116045577 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 116045632 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 116045644 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116045890 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 116046114 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116046237 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 116046427 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116046596 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 116046617 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116046671 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116047004 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 116047114 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116047171 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116047258 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116047262 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116047312 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 116047344 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 116047575 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 116047576 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116047586 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 116047601 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 116047646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116047929 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116048261 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116048335 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 116048337 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116048362 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116048441 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116048477 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 116048568 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116048625 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 116048635 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116048723 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116048741 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 116048852 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 116048878 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 116048893 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116048982 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 116049150 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 116049497 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 116049839 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 116049871 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 116049881 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 116050234 G T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 2 116050558 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 116050775 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 116051019 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116051060 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 116051098 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 116051500 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116051512 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116051528 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116051887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116052442 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 116052613 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116052749 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 116052957 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116053130 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 116053142 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116053318 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 116053479 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 116053547 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 116053569 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 116053574 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 116053640 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 116053699 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 116053841 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 116054117 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116054257 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 116054314 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 116054333 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 116054399 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116054459 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 116054491 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 116054542 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 116054610 C T Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 116054686 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 116054935 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 116054969 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 116054986 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 116055121 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 116055752 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 2 116055814 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 116056001 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 116056356 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 116056437 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116056548 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 116056689 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 116056741 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 116056851 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 116056868 G C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 116056870 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 116056948 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 2 116057154 G A N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 2 116057289 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 116057539 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 116057569 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 116057596 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 116057687 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 116057755 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116057792 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 116057808 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 116057813 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 116058144 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 116058311 C T N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 2 116058364 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 116058654 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 116058692 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116058970 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 116058995 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 116059068 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 116059083 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 116059168 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116059291 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116059436 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 116059470 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116059523 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116059873 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 116059962 G A Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 116060010 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 116060011 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 116060056 A C Y N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 2 116060121 A G Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 2 116060144 G A Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 2 116060217 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 116060393 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 116060710 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 116060740 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 116060790 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 116060868 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 116060870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116061024 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 116061038 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 116061062 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 116061174 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 116061352 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 116061404 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 116061865 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116062021 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116062061 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 116062250 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 116062256 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 116062337 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 116062882 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 116062887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116062964 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 116062993 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 116063013 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 116063033 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 116063153 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116063295 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116063312 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116063526 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 116064020 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116064368 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 116064413 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116065006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116065138 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116065205 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 116065669 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 116065671 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116065829 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116066094 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116066176 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116066405 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116066661 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 116066919 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 116066925 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 116066978 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 116067261 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116067482 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116067491 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116067499 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116067771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116067774 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 116068058 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 116068377 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116068407 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116068564 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 116068761 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 116068770 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 116068883 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 116068885 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 116068946 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 116069120 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 116069125 T C Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 116069140 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 116069221 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 116069236 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 116069284 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 116069289 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 116069295 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 116069343 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 116069401 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 116069496 T G Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 116069591 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 116069770 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 116069952 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 116069987 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 116070105 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 116070220 T G N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 116070262 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 116070263 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 116070499 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 116070519 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 116070581 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 116070584 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116070670 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116070751 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 116070762 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 116070846 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 116070885 C G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 116071063 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 116071197 T G N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 2 116071342 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 116071351 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 116071445 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 116071526 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116071727 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 116071782 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 116071914 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 116071919 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 116071960 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116072103 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116072268 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 116072291 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116072637 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116072660 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116072771 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116072842 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 116072945 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 116073028 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116073071 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 116073112 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116073132 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 116073206 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 116074494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116075976 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116076153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116076912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116080671 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116080936 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116081944 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116083155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116083447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116084076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116084091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116084118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116084127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116084271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116084499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116086015 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116086188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116086214 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 116086298 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116086341 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116086851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116088600 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 116088612 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 116088624 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116089098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116091212 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116091431 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116091594 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116091598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116102678 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116102944 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116102961 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 116103025 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 116104481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116104628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116104701 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116104756 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 116105181 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 116105200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116105312 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116105375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116106060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116106105 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116106112 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116106155 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116106362 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116106523 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 116106689 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 116106722 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 2 116107979 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116108057 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 116108090 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116108268 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116108296 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116108317 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 116108364 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 116108458 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 116108579 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 116108582 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 116108734 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116108936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116110175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116110225 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 116110285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116110894 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116110903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116111104 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116111146 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116111570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116111801 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116111819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116111933 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116112320 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116112912 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116113849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116113867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116116163 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116116492 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 116117383 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 116117399 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 116118003 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116118123 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116118273 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116118280 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116118292 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116118872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116118899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116119371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116119483 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116119536 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 116119566 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116119619 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 116119620 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 116119706 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116119818 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 116120178 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 116120184 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116120476 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116120477 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116120547 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116120588 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116120605 A G Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 116120719 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116120724 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116120897 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 116120943 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 116121068 C T Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 116121140 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 116121158 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 116121554 G C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 116121563 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 116121622 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 116121641 T G Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 116121663 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 116121938 C G Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 116122392 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 116122561 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 116122629 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 116123455 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116123508 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116123868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116124160 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116124203 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116124253 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116124287 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116124302 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116124392 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116124945 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 116124986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116125138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116125191 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116125870 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116125894 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116125900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116126702 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116127012 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116127293 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116127734 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116127741 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116127895 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 116128345 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116129127 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116129409 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116129615 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 116129624 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116129831 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 116130095 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116130150 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116130578 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 116130585 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 116130595 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 116131038 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116132107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116132122 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 116132298 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116132780 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116133266 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116133755 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116133909 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116134240 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116134300 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116134846 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116135463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116135489 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116136350 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 116137280 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116137281 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116137430 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116137461 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116137495 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 116139273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116140079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116140473 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116140522 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 116140826 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116142469 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 116143185 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116144784 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 116145072 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 116145220 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116146222 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 116146556 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 116148648 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116149080 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116150703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116151047 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116152209 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 116152701 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 116152913 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116152979 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116152997 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116153029 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116153051 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116153157 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116153448 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116153449 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116153469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116153542 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116153607 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116153698 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116153906 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 116153967 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 116154094 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 116154114 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 116154243 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 116154371 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116154419 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116154452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116154486 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116155037 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116155096 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116155152 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116155304 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116155412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116155548 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 116156042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116156337 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116156506 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116156571 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116156676 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116156790 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 116156905 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 116157095 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 116157131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116157141 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 116157171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116157196 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116157585 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116158063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116158147 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116158276 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116158403 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116158503 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116158519 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116158562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116158587 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 116158647 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 116158718 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 116158766 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116158769 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 116158778 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 116158785 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 116158937 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 116159148 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 116159202 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116159229 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 116159325 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 116159326 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 116159416 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 116159735 T G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 116159781 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 116159889 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116159905 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116159917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116159943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116159961 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116160220 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116160224 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116160250 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116160319 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116160659 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 116160814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116160834 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116160873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116160979 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116160987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116161081 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116161113 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 116161134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116161170 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116161279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116161378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116161444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116161447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116161687 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116161736 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116161740 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116161758 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116161979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162042 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116162047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116162154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162575 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116162590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116162708 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162833 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162858 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116162893 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116162992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116163282 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116166670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116167170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116167333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116168345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116168603 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116170444 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116171511 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 116172180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116172690 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116177465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116179858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116180555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116181827 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 116182044 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 116183238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116183263 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 116184660 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116186157 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 116186219 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 116187519 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116189331 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116191125 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116191567 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 116191763 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 116193643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116193717 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116194089 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116194096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116196865 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116197634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116199513 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116199619 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116199715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116199870 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 116201490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116202556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116203378 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116203755 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116204251 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116204434 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116204446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116204995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116205812 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116206588 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 116207619 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116208786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116208836 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116209494 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116209638 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116209977 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116209985 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116209996 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116210066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116210802 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 116210921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116211082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116211886 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116212008 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116212263 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116213663 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116214027 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116214548 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116214563 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116214724 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116214938 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116216176 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 116216289 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116216344 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116216421 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116216424 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116216460 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116216529 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116216745 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 116216769 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116216784 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 116216807 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116216883 T G N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 116216931 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116216933 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116216965 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116217140 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116217155 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116217170 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116217174 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116217220 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116217234 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116217254 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116217650 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116217651 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116218718 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116218729 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116218911 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 116218951 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 116219203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116219211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116219862 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 116220061 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116220159 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116220184 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116220416 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116220434 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116221101 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 116221153 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116221192 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 116221321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116221569 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116221715 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116221733 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116221791 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116222321 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116222446 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116222782 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116222856 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116222858 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116222895 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116222903 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116222924 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116223519 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116224326 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 116224423 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 116225047 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116225316 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116225489 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116225717 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116225785 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116226048 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 116226106 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116226128 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116226633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116226703 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116226856 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116227060 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 116227190 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 116227202 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116227274 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116227281 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116227473 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116227484 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116227572 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116227663 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116227698 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116227745 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116227781 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116227879 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116229047 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116229373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116230226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116230552 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 116230766 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116231160 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116232174 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116232418 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116232854 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116232924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116232981 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 116232984 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 116233046 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116233587 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 116233746 C A N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 116233767 T A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 116235200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116235357 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116235503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116235701 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116235745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116235871 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116235922 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116236027 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116236346 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116236652 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116238142 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116238294 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116238605 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116238816 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116239926 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116239944 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116240445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116240791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116242194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116242975 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116243401 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116243445 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116243478 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 116243625 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 116243707 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 116243761 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 116244006 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116244030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116244229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116244272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116244463 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116244538 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116244621 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116245111 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116245148 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116245170 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116245183 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116245382 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116245451 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 116245585 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 116245689 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 116245778 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116245780 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116245874 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116245892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116246260 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116246306 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116246473 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116246481 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116246626 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116246708 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116246734 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116246739 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116246774 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116246806 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116246818 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116246835 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116246847 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116246888 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116246895 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116246990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116247086 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 116247089 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116247185 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116247230 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 116247231 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116247292 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116247508 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116247566 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116247572 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116247712 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116247818 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116248051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116248086 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116248203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116248391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116248425 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116248499 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116248509 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116248524 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116248942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249242 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116249280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249356 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116249452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249675 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116249693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116249872 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116249912 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116250923 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116251073 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116251430 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116251550 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116251579 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116251677 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 116251977 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 116252005 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116252141 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116252149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116252238 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116252254 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116252534 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116252537 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116252558 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116252581 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116252675 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 116252683 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116252790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116252800 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116252821 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116252869 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116252934 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116252970 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116253008 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116253037 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116253047 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116253059 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116253139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116253281 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116253366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116253558 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116253657 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116253670 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116253672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116253770 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116253776 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116253805 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 116254042 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 116254143 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 116254152 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 116254222 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 116254231 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 116254268 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116254334 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 116254409 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116254582 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116257431 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116257471 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116257512 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116257551 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116257593 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116257595 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116257609 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 116257697 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 116257929 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116257984 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116258124 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116258130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116258157 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116258170 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116258184 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116258186 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116258252 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116258316 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116258341 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116258371 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116258391 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116258396 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116258490 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116258603 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 116258639 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 116258943 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 116259272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116259896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116259910 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116260135 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116260195 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116260196 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116260394 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116260723 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116260775 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116261195 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116261394 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116261469 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116261510 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116261611 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 116261637 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116261728 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 116261769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116261853 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 116261937 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116262145 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116262199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116262241 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116262268 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116262333 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116262396 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116262474 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 116262728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116262913 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116263058 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116263165 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116263188 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116263557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116263836 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116264117 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116264342 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116264462 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116264492 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116264793 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116265071 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116265302 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 116265307 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 116265453 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116265804 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116265860 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 116265908 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116266303 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116267035 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116267467 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116267524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116267754 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116268260 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 116268596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116269400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116269738 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116270450 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116270472 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116270644 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116270649 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116271185 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116271596 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 116271610 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 116271713 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116271813 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116271993 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116272050 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116272104 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 116272118 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 116272226 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 116272244 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116272366 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116272383 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116272536 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116272556 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 116272596 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 116272798 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 116272881 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 116272959 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116273059 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116273588 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 116273698 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 116273824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116273984 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116273992 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116274063 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116274074 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116274427 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116274557 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116274878 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 116274923 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 116275088 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 116275360 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 116275709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116275716 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116276291 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116276657 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 116276690 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 116277372 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116277568 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116277701 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 116277754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116277826 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 116277975 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116278478 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116278726 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116278803 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 116278807 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116278866 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116279345 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116279502 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116279827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116286536 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116286635 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116286658 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 116286708 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116286716 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116287427 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116288311 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 116291241 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 116293372 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 116293775 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116294460 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 116294851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116295292 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116295533 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116296493 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116297146 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116297203 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116299058 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116299454 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 116299975 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 116302151 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116302489 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116302573 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116303631 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116306389 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116307773 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116309020 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 116309689 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 116309723 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116311310 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116311329 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 116311509 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 116311629 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116311637 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116311659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116312140 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116312567 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 116313188 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116314319 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116328348 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116328559 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116328966 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 116329014 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116329028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116329566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116329573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116330563 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116330881 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 116330950 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 116331190 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 116331297 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 116331397 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116331727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116331847 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116332083 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116332103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116332921 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116333063 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116333192 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116333265 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116333333 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116333407 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 116333629 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 116334836 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 116335943 A G Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 116335958 T C Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 116336047 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 116336158 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 116336998 T A Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 116338634 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116338712 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116339113 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 116340040 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 116340079 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 116340123 T C Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 116340341 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 116340356 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116340538 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 116340632 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 116340986 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116341062 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116341259 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116341847 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116342242 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 116342321 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 116343135 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116343551 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 116350248 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116350417 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 116350608 A G Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 116350815 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 116351242 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 116351447 C T Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 116353357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116354443 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116354582 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 116355089 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116355315 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116355360 A T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 116356105 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 116356127 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 116356149 T A Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 116356453 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116358018 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116358182 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 116358435 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116361081 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116364471 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116364636 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116365505 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116365694 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116366127 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116367712 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116367804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116369425 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116372713 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116375441 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116375672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116375936 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116378873 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116383432 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 116390946 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 116391440 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116391856 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116393728 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116394072 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 116394123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116394151 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116394282 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116395245 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116396042 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 116396127 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 116396283 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116396876 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116398651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116398972 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116399251 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116400021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116400030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116400678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116401136 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116403438 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116403775 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116403779 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 116404672 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116405660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116405832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116407863 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116408381 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116408839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116409703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116410081 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 116410365 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116411066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116411367 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116411733 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 116411753 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116420205 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116420832 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116420969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116423083 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116423084 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116424698 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116424854 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116425186 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116425467 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116429575 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116429970 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116430751 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116432267 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116434312 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 116434815 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116435722 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116435733 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116436208 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116436819 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116436926 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116438002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116439285 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116440445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116444026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116445436 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116448155 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116449988 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 116453455 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 116453742 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 116454251 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116454892 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116455132 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116458011 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116458183 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 116458186 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 116458410 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116459310 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116460678 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116460873 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116461687 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116463377 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116463383 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116463448 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116463555 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116463942 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116464489 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116464567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116464693 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116464864 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116465162 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 116465231 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 116465489 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 116465693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116465771 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116465883 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116466213 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116466245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116466300 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116466427 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116466452 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116466636 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116466637 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116466844 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116466977 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116467495 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 116467718 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 116468006 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116468043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116468282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116469233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116470041 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 116471162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116471195 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116473435 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116476801 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116477221 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116479049 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116479144 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116479307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116479580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116479611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116479630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116480090 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116480787 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116481059 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116482307 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116483459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116483676 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116484138 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116485281 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116485301 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116485341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116485584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116485731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116486177 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0 0.944444444444444 0.0555555555555556 17 19 0 17 1 2 116486398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116486503 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116487781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116488602 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 116489201 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116489314 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116489674 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116489933 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116490100 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116490294 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116490975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116491030 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116491070 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116491110 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116491311 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116491484 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116492740 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116492773 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116492839 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116493475 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 116493705 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116494087 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116494241 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116495860 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116495885 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116495893 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116496068 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116496472 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116496688 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116496887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116496988 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 116499122 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116499928 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 116500306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116500320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116500935 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116504287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116504940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116505068 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116505422 C A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 116505435 G T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 116505734 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116506086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116508001 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116508115 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116508668 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116509187 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 116510408 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 116510576 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 116510976 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116511009 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116511026 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116511107 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116511313 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 116511415 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 116511506 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 116511512 A T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 116511531 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 116512271 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116512292 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116512343 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116512349 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116512369 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116512452 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116512505 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116512788 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116512803 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116512910 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116512919 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116512926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116513004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116513031 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116513072 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116513169 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116513191 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116513302 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116513662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116513678 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116513934 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116513949 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 116514118 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116514444 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116514457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116514756 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116514852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116514888 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116514911 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116515053 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116515064 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116515072 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116515158 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116515253 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116515820 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116515851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116515878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116515927 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116515995 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116516075 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116516100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116516182 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116516551 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116516577 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116516585 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116516690 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116517602 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116517697 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116517879 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116517925 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116518146 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 116518162 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 116518208 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116518264 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 116518514 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116518550 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116518811 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 116519198 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116519485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116520008 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116522614 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 116523881 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116524775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116524818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116524968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116525243 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116525926 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116526249 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116527220 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116527233 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116527469 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116528537 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116528590 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116529956 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116530293 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 116530463 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116530738 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116530907 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116530913 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116530924 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116531870 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116532186 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116532297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116532664 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116532913 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116534475 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116535169 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116535466 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116535567 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116536056 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116537013 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116537146 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116538223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116538636 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116538705 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116538769 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116538874 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116539017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116539103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116539107 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116539616 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 116540544 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116540620 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116541256 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 116541348 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116541656 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116541868 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116541912 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116541992 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116542160 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 2 116542238 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116542635 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116542726 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116542762 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116542805 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116543353 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 116543441 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116543525 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 116543806 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 116543878 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 116544861 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 116545071 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 116545214 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 116545474 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116545827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116545957 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 116546039 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116546096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116546834 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116546870 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116546884 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116547091 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116547143 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 116547223 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 116547309 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116547443 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116547463 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116547663 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116547769 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116548347 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116548691 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116548722 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116548761 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116548930 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116549111 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116549130 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116549145 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116549146 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116549249 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116549440 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 116549905 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116549947 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116549960 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 116550031 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116550073 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116550281 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116550431 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116550556 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116550644 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116550902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116551034 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116551099 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116551459 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116551533 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116551879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116552255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116552970 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 116553646 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116554455 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116555105 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116555184 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 116555204 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 116555339 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 116555575 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 116555596 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116555791 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 116555941 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116556019 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116556223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116556278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116556295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116556344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116556435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116556617 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116556765 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116556970 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116557120 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116557333 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116557435 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 116557854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116558047 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116558228 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116558239 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116558454 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116558509 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 116558783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116558862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116558874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116558991 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116559003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116559251 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116559326 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116559509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116559554 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116560198 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116560209 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116560301 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116560813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116560938 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116561409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116561743 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116561797 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116562070 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116562090 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116562183 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116562330 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116562495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116562499 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116562520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116562742 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 116562776 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 116562849 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116563246 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116563351 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116563593 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116563615 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116566390 G T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 116566556 A T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 116566568 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 116566752 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116566780 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116566865 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 116566882 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 116567157 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 116567265 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 116567270 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 116567307 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116567338 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116567378 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116567421 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116567446 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116567661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116567804 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116567851 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116567861 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116567960 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116568024 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116568106 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 116568188 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 116568220 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 116568253 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 116568258 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 116568265 A T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 116568287 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 116568302 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 116568317 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116568535 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 116568555 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116568582 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116568662 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116568782 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116568794 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116568821 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116568929 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116568989 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116569042 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116569093 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116569120 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116569279 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116569282 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116569308 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116569318 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116569323 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116569353 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116569642 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116569647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116569663 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116569951 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116570017 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116570273 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116570420 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116570451 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116570658 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116570659 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116570966 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 116571064 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116571266 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116571368 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116571400 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116571466 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116572024 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116572142 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 116572452 C G N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 116572476 T C Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 116572485 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 116572689 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116572771 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116572805 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116572900 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116573025 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116573410 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116573692 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116573790 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116574827 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 116574889 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 116575279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116575529 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116575752 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116575853 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116576256 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116576390 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116576427 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116576439 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116576549 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116576666 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116576785 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116576835 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116576838 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116576953 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116576996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116577060 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116577088 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116577113 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116577292 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116577393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116577460 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116577472 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116577473 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116577541 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116577860 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116577884 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116577940 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116578807 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116578950 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 116579046 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 116579178 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116579235 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116579283 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116579399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116579475 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116580009 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 116580056 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 116580134 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116580264 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116580835 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116580895 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116580957 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116581036 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116581548 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116581679 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116582229 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116582534 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116582601 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116582681 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116582692 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116582716 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116582824 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116582856 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116582919 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116583042 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116583103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116583117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116583144 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 116583161 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116583254 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116583282 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116583367 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 116583862 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116583936 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116584239 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116584397 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116584525 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 116584595 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116585122 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116585178 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116586359 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116586494 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116587487 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116587647 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116587776 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116589409 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116589414 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116589422 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116589629 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116589640 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116589784 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116589817 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 116590433 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116590466 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116590508 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116590875 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116590923 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116591223 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116591413 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 116591519 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 116591692 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116591875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116592001 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116592766 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116592931 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 116596575 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 116596980 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 116597050 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116597204 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116597515 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116597565 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116597653 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116597696 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116597697 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116598047 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116598106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116598434 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 116598905 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116598956 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116599023 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116599091 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116599296 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116599954 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 116599962 G T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 116600368 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116600626 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116600635 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 116600783 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116600920 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116600985 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116601022 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116601207 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116601252 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116601403 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116601452 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116601535 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116601553 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116601627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116601770 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116601940 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116602066 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116602297 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116602499 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116603030 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 116603163 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 116603953 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116603982 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116603993 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116604083 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116604110 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116604299 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116604393 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116604776 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116606764 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116607053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116608270 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 116608306 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116608798 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116609470 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116609905 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116609935 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116610867 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116613225 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116613248 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 116613711 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116613810 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116614199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116614232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116614314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116614327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116614461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116615343 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116615377 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 116615805 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116616768 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116620300 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 116621087 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116621480 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116621714 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116621906 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116622694 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116623001 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116623562 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116623570 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116624770 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116625526 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 116625655 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 116625775 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116626546 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116626916 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116627589 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116627636 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116627892 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116628349 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116628377 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116628578 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116628851 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116628865 T G Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 116628916 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 116629186 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 116629374 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116629528 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 116629733 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 116629833 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 116629879 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 116629894 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 116629906 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 116629907 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 116629943 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 116629944 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 116630111 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 116630147 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 116630187 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116630209 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116630262 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116630294 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116630312 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116630313 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116630386 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116630405 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116630419 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116630460 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116630475 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116630503 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116630593 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116630598 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116630708 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116630709 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116630814 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116630818 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116630838 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116630934 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116630976 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116630982 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 116630989 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 116631176 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116631233 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116631252 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116631465 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 116631473 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 116631692 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 116631693 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 116631792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116631808 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116632839 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116633016 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116633171 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116633564 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116633566 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116634692 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 116634760 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116636003 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116636245 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116636272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116636529 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 116636871 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 116637482 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116637603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116637653 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116637864 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116638037 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 116638039 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 116638093 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 116638288 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 116638499 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116638716 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116638837 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116638998 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 116639360 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116639475 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116639636 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116639763 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116639784 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116640880 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 116640945 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 116641130 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116642163 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 116642484 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116642495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116642562 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 116643712 A C Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 116643728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116644033 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116644264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116644382 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 116649510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116650621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116651432 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116652216 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116652465 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 116654410 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116654605 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116655257 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116655287 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 116655350 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116656074 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116656308 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 116656639 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116657221 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116657330 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116657463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116657524 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116657593 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 116658291 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116658302 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116658460 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 116658552 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 116658557 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 116658566 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 116658623 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 116658810 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 116658856 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 116658963 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116659145 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 116659225 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 116659271 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 116659322 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 116659356 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 116659420 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 116659437 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 116659656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116659903 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 116660083 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 116660256 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 116660318 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116660360 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 116660819 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116661112 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 116661160 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116661557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116661979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116662006 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116663701 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116663995 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 116664234 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 116664363 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116664366 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116664501 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 116664687 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116664973 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116665255 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116665306 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116665426 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116665427 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116665491 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116665519 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116665532 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 116665589 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 116665782 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 116665974 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116665976 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116666079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116666087 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116666202 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116666237 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116666302 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116666652 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 116666669 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116666858 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116666935 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116667044 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116667067 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116667077 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116667203 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116667330 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 116667331 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 116667346 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 116667402 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116667496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116667570 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 116667604 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 116667607 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 116667620 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116667676 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116667736 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 116667752 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 116667839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116668000 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 116668182 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 116668271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116668371 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116668391 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116668529 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116668532 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116668750 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 116668761 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 116668810 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 116668829 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 116668840 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 116668861 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 116668997 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 116669228 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116669356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116669503 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 116669519 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 116669536 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116669537 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116669761 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116669809 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 116669850 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116669916 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116669936 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 116670000 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116670016 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116670119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116670340 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116670363 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116670379 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116670459 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116670482 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116670501 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116670645 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116670678 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 116670742 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116670783 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116670844 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116670903 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116671270 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 116671287 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116671388 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116671409 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116671502 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116671729 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116671773 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 116671799 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 116672003 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116672218 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116672227 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 116672409 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116672748 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116672828 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116673213 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 116673462 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116673485 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116673505 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116673690 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116673733 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 116673863 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 116674149 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 116674690 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116674716 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116674798 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116674876 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 116674953 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116674955 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116674990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116674993 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116675012 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116675044 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116675049 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116675138 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116675434 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116675768 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 116675875 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116675877 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 116677583 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116677812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116677980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116678208 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116678374 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116678389 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116678423 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116678545 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116678567 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116678913 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116678927 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679035 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679056 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679073 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679129 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116679183 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116679188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116679231 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679232 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679257 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679258 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679277 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679448 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116679607 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116679773 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679846 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679864 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679910 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116679931 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116680168 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116680182 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116680288 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116680359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116680362 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116680504 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116680636 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116680641 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116681446 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116681501 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116681525 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116681585 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116681728 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116681764 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116681770 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116681879 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116681893 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116681968 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 116682136 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116682144 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116682208 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116682290 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 116682561 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116682986 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116683069 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 116683083 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 116683091 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 116683132 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 116683172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116683219 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116683427 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116683541 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 116683584 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116683788 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 116684098 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116684984 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116685277 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116685707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116686427 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116686454 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 116686687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116687021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116687242 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116687304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116687555 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 116687915 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116688037 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116688294 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116689363 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 116689532 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 116690332 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116690856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116690984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116691577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116691628 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116694958 G T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 116695293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116695510 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 116695943 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 116695981 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 116696008 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 116696275 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116696575 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 116696614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116696854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116696865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116696924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116697031 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116697119 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 116697245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116697579 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 116697681 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116697687 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 116697858 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 116697878 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 116698457 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 116698534 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116698687 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116698706 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116698746 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116698758 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116698910 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 116698945 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116698994 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 116699007 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116699082 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116699130 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116699140 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116699152 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116699258 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116699345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116699440 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116699460 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116699467 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116699480 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116699502 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116699503 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116699567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116699715 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116699742 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116699765 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116699827 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116699875 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116700027 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116700209 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 116700338 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 116700399 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 116700456 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116700680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116700740 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 116700757 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 116700779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116700811 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 116700959 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 116701227 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 116701544 A G Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 116701588 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 116701612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116701623 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116701625 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116701800 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116701965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116702790 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 116702851 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 116703141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116703725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116704444 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116704527 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 116705255 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116705575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116705637 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 116705760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116705834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116706167 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 116706251 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 116706263 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 116706391 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 116706493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116706494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116706728 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116706875 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 116706922 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 116706943 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 116707058 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 116707073 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 116707115 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 116707220 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116707221 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 116707401 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116707414 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116707425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116707438 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116707465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116707559 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116707602 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116707862 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116707891 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116707926 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116707941 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116707942 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116707953 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116708008 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116708050 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116708089 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116708261 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116708268 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116708272 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116708346 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116708361 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116708378 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116708410 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116708535 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116708613 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116708617 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116708771 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 116708795 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 116708982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116709037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116709069 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116709223 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 116709290 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116709306 A T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 116709307 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116709339 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 116709355 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116709431 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116709444 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116709533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116709627 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116709669 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116709708 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116709861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116709902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116709916 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116709922 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116709942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116710046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116710498 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116710738 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116710867 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 116710933 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116710953 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116710957 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116710975 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116711057 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116711058 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116711173 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116711230 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116711248 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116711249 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116711304 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116711334 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116711365 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116711377 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 116711642 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116711667 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116711695 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116711798 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116711883 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 116711908 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 116711941 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 116712066 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 116712151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116712215 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 116712233 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116712305 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116712411 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116712592 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116712819 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116712859 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116712915 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116713054 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116713884 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116713905 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116713909 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116713956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116714090 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116714135 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116714160 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116714175 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116714236 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116714254 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 116714316 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116714349 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116714804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116714893 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116714900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116714931 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116714953 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116714965 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 116714967 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116715207 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116715213 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116715616 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 116715623 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116715639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116715658 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 116715679 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116715809 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116716231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116716258 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 116716350 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116716433 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116716439 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116716555 G C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 116716561 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 116716680 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 116716727 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116716729 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116716760 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 116717128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116717188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116717247 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116717251 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 116717348 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 116717358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116717405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116717453 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116717484 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 116717544 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 116717720 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116718090 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116718308 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116718339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116718601 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116718649 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116718658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116718713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116719054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116719374 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 116719595 G T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 116719601 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 2 116719821 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116719836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116722616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116722673 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116722858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116724939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116724973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116725493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116725961 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 116725978 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116725990 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116726050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116726069 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116728324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116728939 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116728969 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116728987 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116729093 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116729108 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116729180 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 116729313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116729556 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 116729903 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 116729940 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 116729970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116730020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116730455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116730495 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 116730601 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 116730627 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116730684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116730767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116730877 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116730932 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 116731089 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116731164 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116731328 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 116731704 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 116731856 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116731889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116731901 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 116732018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116732033 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 116732086 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 116732199 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 116732293 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 116732456 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116732490 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116732984 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 116733224 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 116733277 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116733740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116733967 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116734058 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116734063 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116734295 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116734380 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116734392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116734396 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116734406 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116734408 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116734592 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116734607 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116734702 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116734762 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116734838 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116735158 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116735185 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 116735251 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 116735307 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116735536 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116735843 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116736069 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 116736137 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 116736152 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 116736161 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 116736183 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 116736204 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 116736228 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116736367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116736456 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116736494 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 116736506 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 116736533 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 116736551 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 116736552 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 116737044 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116737053 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116737097 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116737119 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 116737153 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 116737251 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116737293 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116737494 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116737551 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116737555 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116737676 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116737799 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116737838 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116738028 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116738089 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116738334 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116738387 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116738389 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116738422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116738463 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116738510 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 116738542 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 116738581 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116738589 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 116738648 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 116738665 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 116738713 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 116738928 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116739041 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116739183 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 116739373 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 116739433 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116739663 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116739739 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116740040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116740193 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 116740222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116740266 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 116740315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116740342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116740493 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 116740647 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 116740716 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116740833 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116741036 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 116741193 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116741592 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 116741597 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 116742466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116742533 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 116742574 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116743277 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 116743469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116743526 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116743778 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116743838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116744623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116744735 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116744785 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116744942 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116745088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116745115 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116745158 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116745605 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 116745715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116745792 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116746372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116746937 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 116747125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116747663 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 116748187 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 116748472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116749736 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 116749827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116750317 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 116750370 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 116750485 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116750514 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 116750572 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116750614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116750701 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116750843 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116750921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116751126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116751201 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116751434 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116751477 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 116751500 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 116751524 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 116751529 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 116751658 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 116751667 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 116751681 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 116751704 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 116751724 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 116751735 A C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 116751801 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116751811 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 116751848 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 116752289 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116752592 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116752695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116753140 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116753279 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116753302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116753356 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116753718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116754027 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116754207 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116754345 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 116754364 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116754430 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 116754431 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116754639 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 116754691 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 116754692 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 116754705 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116754717 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116754722 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116754737 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 116754748 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116754950 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116754961 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 116755033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116755119 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116755155 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 116755165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116755255 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116755328 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 116755405 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 116755421 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 116755831 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116755874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116756104 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 116756419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116756696 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116756800 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 116756814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116756842 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 116756916 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116756992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116757271 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116757330 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 116757346 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 116757372 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116757391 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116757431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116757484 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 116757534 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116757592 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 116757601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116757621 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 116757649 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 116757665 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 116757710 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 116757783 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 116757795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116757819 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 116757881 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 116757907 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 116758161 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 116758482 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116759531 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116760138 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116760691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116761069 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 116761253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116761416 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116762214 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116762234 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 116762435 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116762482 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 116762529 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 116762583 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 116762687 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116762689 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 116762775 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116762843 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116762894 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116762969 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116763008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116763009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116763764 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 116763800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116763807 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 116763837 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 116764084 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 116764088 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 116764238 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 116764315 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 116764667 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 116764779 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116764808 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 116764819 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116765167 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 116765253 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 116765306 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 116765401 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 116765413 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 116765428 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116765565 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 116765695 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 116765721 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 116765789 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 116765912 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 116765913 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 116765989 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 116766098 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 116766106 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 116766203 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 116766223 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 116766231 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 116766357 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116766426 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 116766634 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 116766657 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 116766961 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 116767102 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 116767513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116767564 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116767608 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116767709 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116767847 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 116767872 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 116768066 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116768836 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116769595 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 116770094 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116770145 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116770254 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116770406 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116770578 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116770665 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 116770726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116771199 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 116771574 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116771706 C G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 116771783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116772090 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 116772115 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116772177 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 116772316 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 116772371 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116772435 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116772501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116772517 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 116772553 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116772752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116772879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116772981 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116773118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116774238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116774992 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116775126 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116775252 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116775284 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 116775811 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116775979 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116776197 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116776652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116776898 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116777462 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116777808 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 116777822 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116777899 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 116778023 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 116778095 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 116778258 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 116778277 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 116778718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116779467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116779469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116780532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116780668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116780748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116781188 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 116781324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116781983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116782302 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116782320 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 116783050 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 116783114 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116783155 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116783268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116783416 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116783489 G T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 116783640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116783654 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116783891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116784847 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116784921 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116785174 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116785233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116785886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116787420 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116787712 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116788086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116788300 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 116788380 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 116788568 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 116788902 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 116789046 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116789143 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116789758 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 116789937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116790436 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116790927 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116791672 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116791707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116791829 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116792541 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116792589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116793009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116793178 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 116793283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116793313 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116793670 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116793873 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116794411 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116795646 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 116797133 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 116798393 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116798451 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116799209 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116799211 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116799277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116800124 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116800767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116802157 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116804099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116804130 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116804689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116804856 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116804934 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116804949 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116806105 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116806686 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 116807769 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 116809380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116810004 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116815481 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116815777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116816950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116817203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116817544 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 116819434 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 116819561 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116820541 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116821140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116821345 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116821685 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116822274 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116823389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116823694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116824752 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116826119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116827924 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116828936 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116829121 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 116830179 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116830397 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116831406 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116831442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116831443 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116831567 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116831842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116831888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116832070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116832375 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116833282 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116833742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116835014 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 116835287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116835451 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 116835940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116836323 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 116836527 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116838380 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116839299 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116840297 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116842281 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116847829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116849565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116849587 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116850250 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116850480 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116850544 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 116850641 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116850664 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116850718 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 116851527 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 116851704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116851873 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 116851972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116852018 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116852145 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 116852203 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 116852320 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 116852383 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116852532 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116852560 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116852607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116852729 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 116852860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116853073 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116853356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116853358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116853412 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116854191 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116854365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116854988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116857362 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116858022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116858143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116858647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116858794 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116859033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116859504 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116859680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116861157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116861445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116861887 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116861961 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116862005 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116862032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116862659 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116862748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116862766 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116862820 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116862842 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116862942 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 116862960 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116862963 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116863097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116863152 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116863588 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 116863599 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 116863625 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 116863671 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 116863704 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116863724 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116863746 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 116863767 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116863979 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116863987 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 116864051 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116864056 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 116864120 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 116864130 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 116864269 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 116864362 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116864374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116864649 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 116864764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116864822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116864930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116865216 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116865275 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 116865339 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116865449 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 116865510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116865562 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 116865578 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116865742 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 116865800 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 116867828 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 116868467 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 116868482 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116868523 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116868627 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116868684 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 116868845 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116869023 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 116869070 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116869283 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 116869327 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 116869356 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 116869482 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 116869665 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 116869690 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 116869842 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116869983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116870053 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 116870220 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116870237 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116870256 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116870351 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 116870415 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 116870422 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116870428 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 116870439 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116870478 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116870479 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116870504 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116870525 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116870612 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116870647 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116870822 A T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 116870846 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 116870933 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 116871212 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 116871305 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116871306 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116871334 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 116871354 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 116871467 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116871511 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116871686 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 116871786 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 116871789 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 116871844 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116871856 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116871921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116872175 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116872500 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116872591 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 116873134 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 116873171 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 116873800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116873849 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 116873855 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 116873890 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 116874063 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116874239 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116874685 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116874774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116874946 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116876322 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116876373 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 116876477 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116877235 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116877507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116878219 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116878571 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 116878868 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116878998 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 116879118 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 116879189 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116879293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116879591 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 116879714 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 116879912 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116880086 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 116880094 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116880321 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116880375 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 116880451 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 116880517 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116880560 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116880592 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116880593 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 116880785 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116880831 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 116883141 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116883813 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 116884372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116885004 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 116885860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116885962 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116887107 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116887278 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 116887323 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 116888209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116890399 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116890790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116890815 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116891234 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116892041 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116892442 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 116892697 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116892712 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116892933 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 116892967 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116893704 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116894096 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 116894100 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116896577 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116896592 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116896626 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 116896723 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116896728 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116897043 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 116898739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116899170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116899336 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 116901449 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116901703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116901874 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 116902903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116903934 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116905366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116907720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116907889 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116908340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116910796 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116910847 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116914330 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 116917637 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116919662 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116919915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116923812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116925120 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116925264 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116925707 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116925767 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 116925778 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 116925843 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116926306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116926811 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116927415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116927461 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116927598 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 116927612 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 116927627 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 116927641 G A N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 116927642 G A N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 116928142 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 116928145 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116928356 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116928390 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116928441 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116928665 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116928724 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116928755 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116928777 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116928809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116928861 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116929823 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 116930545 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 116930826 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 116933204 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116933291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116935835 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 116935860 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 116936293 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116937620 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116938720 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 116938787 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 116938802 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 116939339 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116939729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116940436 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 116940468 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116940508 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 116942926 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116942960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116943846 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 116943995 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 116945129 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116945194 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116945368 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116945418 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116945445 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116945597 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116945791 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116950556 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 116950610 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 116950785 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116950830 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116950924 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116951012 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116951284 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116951450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116951868 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116952443 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116953053 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116953192 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116953647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116954044 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 116954560 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116955127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116955231 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116955469 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 116955927 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 116955954 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116956190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116956244 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 116956631 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116956878 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116957043 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116957473 A G Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 116958094 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116958233 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116958490 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 116959226 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116960067 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 116960190 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116961207 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116961598 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116962087 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116962571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116963675 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 116964843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116965553 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116965745 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 116966886 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 116967800 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 116968013 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 116968021 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 116968851 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116968985 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116969073 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 116969134 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 116969754 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116969873 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 116970135 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116970269 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 116970329 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 116970376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116970738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116971919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116973173 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116974293 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116974420 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116974706 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116974843 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116974918 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 116975007 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116975057 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116975169 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116975483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116975577 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116975605 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116975725 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116976048 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 116976116 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 116976377 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 116976413 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 116976490 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 116976519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116976753 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 116977113 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116977824 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 116978225 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116978228 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 116978694 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 116979155 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116979427 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116979522 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 116979567 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 116979574 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 116980798 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 116980890 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116980914 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116981977 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 116982251 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116982397 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116982597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116982890 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 116983039 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 116983484 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 116983567 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 116983585 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 116983590 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 116983679 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116983843 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 116983844 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116984157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116984216 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116984244 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 116984511 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 116984622 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116984688 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116984877 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 116985435 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 116985649 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116985721 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116986095 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116986603 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116987245 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 116987369 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116987555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116987638 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 116987868 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 116987967 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 116988319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116988502 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116988905 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116988906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116989016 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 116989055 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116989511 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116989549 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116989604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116990006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116990071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116990283 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 116991124 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116991169 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 116991235 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 116991286 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 116991379 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116991391 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116991877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116992030 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 116992658 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 116992790 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 116993014 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116993065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116993255 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 116994006 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116994141 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 116995202 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116995271 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 116995434 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 116995789 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 116997558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116997666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116998083 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 116998093 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 116998121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 116998228 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 116998344 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116998358 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 116998418 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 116999832 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117000642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117000889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117003930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117005871 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 117006248 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117008038 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117008853 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117010180 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117011049 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 117011678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117011710 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117011891 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 117011908 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 117011958 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 117012175 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117012232 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 117012667 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117012818 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 117013129 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 117013398 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117013682 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117014140 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117014148 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117014176 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 117014251 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 117014416 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 117014509 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 117014639 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 117014757 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117014823 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117014907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117015728 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 117016522 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117018186 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 117018343 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117018423 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117019513 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117019713 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117019828 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117020220 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 117020452 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117020817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117021304 G C N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 2 117021466 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 117021566 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117022585 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 117022606 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 117022691 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 117022736 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 117022800 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 117022944 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 117022986 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 117022987 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 117023001 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 117023008 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 117023018 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 117023375 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117023741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117023959 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117024528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117025294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117027544 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117027782 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117028629 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 117030217 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117030270 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117031077 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117031213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117033846 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117034185 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117034227 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117034383 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117035400 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 117036327 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117036514 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117037087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117037127 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117037696 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117037731 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117037791 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117037819 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 117037842 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 117038005 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117038138 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117038151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117038267 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 117038278 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117038449 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117038465 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117038468 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117038558 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117038885 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117038971 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 117039243 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 117039401 C T Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 117039440 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117039533 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 117039673 A T Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 117039807 G T Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 117040238 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 117040312 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 117040318 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117040373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117040438 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117040932 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 117041948 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117042184 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 117042386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117042422 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117042423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117043165 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117044106 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 117046508 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117046787 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117046813 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117046843 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117047007 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117047071 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117047080 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117047111 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117047114 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117047234 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 117047416 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117047604 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117047671 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 117047709 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117047767 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117047777 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117047778 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117047845 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117048059 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117048139 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117048973 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117048978 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117049013 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117049105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117049131 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117049795 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117049810 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117049830 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117049853 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117049861 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117049915 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117049927 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117049931 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117049965 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117049992 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 117050173 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117050213 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117050593 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 117050636 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117050855 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 117051032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117051183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117051231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117051296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117051589 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117052011 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 117052100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117052555 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117052598 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117053270 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 117053278 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 117053285 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117053434 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117053480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117053572 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 117053587 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117053735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117053815 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 117054129 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117054170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117054212 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117054314 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117054322 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 117054422 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 117054470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117054486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117054501 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117055016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117055065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117055103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117055170 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117055181 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117055182 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117055231 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117055546 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117055551 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 117055638 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117055714 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117055731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117055759 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117056258 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117056447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117056511 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117056536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117056606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117056696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117056798 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 117056883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117058244 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117061275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117063368 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 117063370 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 117064017 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 117064293 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 117066441 C G Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 117068743 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117069631 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 117069818 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117070071 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 117070163 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117070242 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117070331 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 117071251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117071543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117072247 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117073231 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 117073503 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117074321 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117075533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117075759 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 117076274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117077458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117078041 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117078085 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117078538 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117079414 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117080440 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117081611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117081690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117082160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117082205 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 117085879 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 117086728 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117087935 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117087993 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117088858 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117089136 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117089290 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117090200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117090348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117090443 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117090832 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117091198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117091697 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117094644 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117094708 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 117094837 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117094882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117095044 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117096286 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 117096883 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117098325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117098494 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 117098532 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117098615 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 117098835 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 117099289 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117099299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117100534 T A Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 117104070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117104092 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 117105023 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117105174 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117105186 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 117105373 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117107290 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 117108112 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 117108248 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117108435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117108808 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 117108824 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 117109963 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 117111444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117112461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117112465 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 117113369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117115311 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117115419 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117115491 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117115655 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 117119193 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117119242 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117119845 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117121353 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117121354 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 117121736 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 117121821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117121829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117125178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117127004 A T Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 117127013 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 117127024 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 117127042 A G Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 117127054 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 117127783 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 117127940 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117128434 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 117128820 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117129138 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 117129776 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117129897 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 117129932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117130080 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 117130403 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 117130965 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117131456 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 117132388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117132446 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 117133316 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 117133500 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117133725 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 117134719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117135283 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117135442 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 117135820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117136273 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 117136303 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117136319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117136419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117136481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117137024 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117138214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117138281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117140022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117140033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117140112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117140354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117140402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117141088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117141435 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117142820 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 117143177 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117143626 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 117145628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117146130 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 117146139 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117147021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117147627 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117148678 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117148682 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 117148834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117148860 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117149169 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 117149251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117149353 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117149683 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117149835 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117150207 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117150353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117150397 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117150457 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 117150731 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 117150750 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117150776 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117150849 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117150998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117151486 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117151681 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117151859 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117151917 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 117152270 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 117152975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117153775 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 117153938 T A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 117154901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117156043 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 117157967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117158519 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117158580 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117158812 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 117158969 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 117159373 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117159611 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117160002 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 117160449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117162165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117162289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117162311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117164217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117164647 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117164873 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117164883 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 117164984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117165102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117165165 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117165255 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117165272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117165285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117165376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117165457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117165533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117165787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117165801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117165881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117166309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117166601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117166679 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117166861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117166986 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117167154 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117167234 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117167357 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117167616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117167799 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 117168002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117168010 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117168136 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117168180 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117168333 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117168362 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117168766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117168844 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117168966 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117169044 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117169084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117169236 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117169640 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117169882 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 117169936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117169937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117170069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117170130 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 117170394 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 117170654 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117170658 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117170992 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117171027 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117171579 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117171827 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 117171950 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 117172277 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117172968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117173042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117173488 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 117173825 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117174005 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117174076 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117174295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117174518 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117174587 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117174802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117174912 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117174976 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117175030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117175102 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117175245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117175279 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 117175312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117175333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117176998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117178904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117179062 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 117179110 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 117179173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117179181 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117179198 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117179583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117179737 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117179766 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117179806 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 117180233 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117180309 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117180330 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117180374 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117180378 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117180411 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117180443 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117180538 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117180689 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117180702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117180781 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117180784 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117180828 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117180975 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117181060 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117181107 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 117181133 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117181197 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 117181328 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 117181421 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 117181428 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117181492 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 117181518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117181604 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117181621 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117181674 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117181685 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117181728 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117182246 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117182307 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 117182333 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117182379 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117182411 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117182417 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117182461 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117182465 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117182601 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117182652 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117182706 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117182783 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117182837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117182869 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117182884 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117182926 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117182941 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117183053 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 117183247 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117183309 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 117183445 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 117183485 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 117183511 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 117183568 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 117183929 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117184148 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117184149 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117184168 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117184269 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117184331 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117184406 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117184454 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117184479 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 117184557 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117184601 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117184671 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117184728 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117185002 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117185040 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117185087 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117185134 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117185178 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117185397 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117185745 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117185975 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117185986 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 117186025 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 117186042 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 117186102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117186138 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117186250 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117186258 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117186267 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117186412 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117186433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117186445 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117186767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117187277 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 117187353 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117187394 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117187411 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117187533 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117187587 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117187700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117187732 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117187846 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117187956 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117187986 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117188188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117188319 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117188580 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117188765 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117189095 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117189382 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117189404 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117189624 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117190022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117190195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117190586 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117192634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117193284 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117194380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117194609 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117195362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117195459 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117195691 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117195776 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117195791 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117195804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117195839 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 117195869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117196259 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117196517 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117196544 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117196566 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117196817 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117197032 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 117197033 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117197049 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 117197077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117197413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117197447 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117197943 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117197960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117198326 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117198466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117198511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117198549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117198566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117198969 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117199169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117199202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117199218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117199385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117199876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117200033 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117200351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117200531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117200578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117200768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117200805 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 117201328 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117201343 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117201364 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117201466 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117202615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117202702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117202731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117202861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117202918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117203061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117203168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117203297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117203451 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 117203512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117203603 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117203853 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117203884 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117204064 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117204164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117204894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117205188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117205247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117205487 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117205908 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117206240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117206336 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117206484 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117206571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117206613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117206738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117206761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117207329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117207376 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117207517 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 117207660 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117207819 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117208337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117208705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117208710 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 117208803 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117208815 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117209411 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117209620 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 117209633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117209747 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117209779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117209800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117209850 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117209914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117210180 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117210184 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117210585 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117210913 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117210946 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 117211160 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117211211 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117211239 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117211367 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 117211388 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117211444 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117211509 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117211571 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117211621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117211671 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 117211865 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117211986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117211987 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117212014 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117212199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117212255 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117212301 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117212372 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117212387 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117212716 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117212829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117212861 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 117212970 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 117213066 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 117213172 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 117213745 C T N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 117213757 T G N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 117213775 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 117214042 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 117214118 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117214287 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117214390 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117214622 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117214742 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117214801 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117214828 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117215025 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117215101 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117215124 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117215146 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117215193 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117215963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117216665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117217003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117217301 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 117217454 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 117217483 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 117217976 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117218088 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117218143 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117218606 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117218892 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117218906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117219304 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117219469 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 117219746 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117219781 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117219782 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117219855 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 117219931 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 117219950 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 117220372 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 117220408 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117220458 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117220624 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117220644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117220722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117220893 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117220969 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 117220981 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117221002 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 117221072 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 117221075 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 117221222 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 117221272 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 117221474 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 117221676 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 117221734 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117221818 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117222166 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 117222203 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117222269 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117223606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117224203 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 117224696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117224782 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117224976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117225038 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 117225049 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117225077 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 117225118 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117225165 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 117225202 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 117225209 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 117226251 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117226297 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 117226298 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 117226523 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117226581 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 117226928 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 117227095 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 117227302 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117227553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117227662 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117227668 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117227920 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117228110 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117228257 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 117228352 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 117228535 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 117228767 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 117228805 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117228816 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117228819 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 117228927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117229029 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117229267 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117229308 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 117229312 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 117229763 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 117229773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117229831 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117229981 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117229994 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117230044 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117230110 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117230113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117230168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117230169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117230198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117230266 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117230423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117230675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117231115 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117231130 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117231663 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117233996 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117235441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117235465 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117235546 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117235701 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117235808 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117235854 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117236122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117236359 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 117236519 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117236700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117236868 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117237375 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 117237426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117237501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117237966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117238382 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 117238424 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117238729 G A N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 117238735 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 117238992 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 117239080 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 117239220 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117239221 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117239245 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117239424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117239425 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117239716 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117239735 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117239748 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 117239848 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 117239881 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117239966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117240237 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117240353 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 117240436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117240480 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 117240505 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117240539 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117240553 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 117240564 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117240667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117240773 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117240862 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117240909 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117240923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117240945 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117240970 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117240995 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117241072 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117241151 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117241155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117241166 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117241177 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117241186 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 117241215 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117241256 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117241319 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117241373 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117241376 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117241464 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117241477 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 117241480 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117241503 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117241559 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117241624 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117242158 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 117242542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117242686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117242866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117244446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117245313 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 117246257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117247774 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117247785 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117248132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117248203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117248959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117249893 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117252433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117254178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117254454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117255229 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117255624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117256498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117256628 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117256932 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 117257099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117257391 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117257394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117257409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117257422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117257529 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 117258160 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117258313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117258551 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 117259159 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117259170 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117259278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117259315 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117259367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117259572 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117259577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117259617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117259701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117259750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117260020 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117260150 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117260161 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117260202 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117260493 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 117260694 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117260696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117260786 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117260828 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117260851 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117260875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117260923 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117261042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117261107 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 117261561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117262047 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 2 117262075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117262194 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 117262306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117262516 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117262966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117263883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117264610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117264624 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 117264841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117266332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117266700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117268234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117268751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117268759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117269186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117269458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117269629 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117269809 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117270018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117270984 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117271378 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 117271646 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117271918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117272586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117274731 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117275052 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 117275077 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117275366 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 117275611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117275766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117275923 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117276032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117276088 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117276585 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 117276699 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 117276898 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117277034 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117277165 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117277232 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117277267 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 117277323 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 117277334 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117277489 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 117277803 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 117277903 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117277969 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 117278094 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117278261 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 117278346 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 117278351 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 117278379 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 117278428 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 117278500 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 117278503 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 117278576 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 117278633 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 117278640 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 117278795 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 117278862 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 117278933 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 117279231 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 117279278 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 117279538 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 117279574 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 117279636 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 117279652 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 117280078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117280184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117280196 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 117280205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117280219 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 117280381 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117280490 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 117280525 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 117280652 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117280782 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 117281205 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 117281499 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 117281578 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 117281863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117282068 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117282089 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117282277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117282365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117282812 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 117283321 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 117284738 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 117284869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117284930 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 117285031 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 117285073 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 117285155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117285607 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 117285633 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 117285634 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 117285667 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117285764 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 117285869 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117286087 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 117286138 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 117286153 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 117286377 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117286422 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 117286452 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117286626 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 117286633 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 117286701 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117286758 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 117286800 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 117286885 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 117287380 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 117287591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117287708 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117287931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117287972 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117288894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117290993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117292205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117294663 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117296550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117297368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117297426 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117298208 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117299366 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117299389 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117299899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117299966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117301115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117302214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117303751 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 117304700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117304943 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117306741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117306990 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 117307477 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117308465 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117308530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117308602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117308946 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 117309174 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 117309432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117309454 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 117309456 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 117309695 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 117309696 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 117309953 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 117310033 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 117310197 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 117310205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117310285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117310300 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 117310304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117310379 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 117310604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117310804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117310823 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117310922 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117310952 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117310992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117311138 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 117311185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117311645 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117311939 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117312106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117312155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117312166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117312597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117312790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117312802 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 117312833 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 117313226 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 117313292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117313391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117313429 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 117313501 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 117313706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117313742 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 117314073 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117315482 T A N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 117315522 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 117315687 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 117315707 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117315992 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 117316049 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117316090 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 117316109 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 117316150 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 117316187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117316224 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 117316254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117316428 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117316467 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 117316669 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 117316879 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 117316896 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 117316949 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117317066 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117317169 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117317210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117317253 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117317314 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 117317333 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 117317352 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 117317476 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 117317683 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 117317717 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117317771 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117317772 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117318478 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 117318512 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 117318670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117319091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117320617 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117320618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117321599 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117321674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117321695 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117322732 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117322848 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117322922 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117325144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117326147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117326265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117326897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117326917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117329322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117329350 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117329479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117329503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117329535 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117329868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117330683 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 117330794 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 117331046 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117331381 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 117331479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117331951 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117332241 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117332319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117332393 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117332421 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 117335667 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117335744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117336240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117336295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117336339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117336587 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 117336722 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 117336738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117336742 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117336823 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117336893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117337171 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117337209 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117337251 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117337287 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117337368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117337625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117337919 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117338180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117338299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117338560 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117338667 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117338703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117338840 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117339092 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 117339296 T C N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 117339382 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 117339412 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 117339447 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117339670 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117339752 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117339762 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117339811 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117339831 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117339911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117339936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117339979 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117339983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117340113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117340249 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117340393 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117340399 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117340451 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117340926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117342340 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117344544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117348571 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117348596 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117348902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117350216 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117350243 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117350249 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117350304 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 117350309 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 117350331 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 117350375 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 117350462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117351560 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117353973 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 117354027 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117354427 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117354817 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117355606 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 117355921 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117355923 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117356209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117356240 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117356274 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117356313 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 117356350 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 117356362 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117356417 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117356508 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117357005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117357268 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117357334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117357433 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117357780 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 117357789 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117357839 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117357952 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117358256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117358271 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 117358443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117358896 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117358918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117359245 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117359263 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117359295 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117359308 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117359463 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117359513 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117359567 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117359621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117359700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117359714 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 117359749 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117359772 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117359877 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117359944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117359967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117359977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117359981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117360003 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117360004 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117360033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117360122 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117360263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117361488 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117361728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117361853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117362683 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117362934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117363256 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 117363282 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 117363852 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117364325 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117364608 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117364695 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117364857 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117364970 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 117365015 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117365113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117365439 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 117365829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117365838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117366019 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117366045 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117366481 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117367067 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 117367179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117367415 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117367488 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117367557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117367571 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 117367583 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 117367588 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117367669 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117367702 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117367735 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117367912 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117367981 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117368004 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117368085 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117368097 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117368269 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117368321 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117368380 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117368389 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117368510 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117368529 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117368543 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117368597 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117368871 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117368983 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117369338 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117369407 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117369591 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117369601 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117369639 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117369656 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117369680 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117369690 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 117369738 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117369999 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117370017 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117370029 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117370392 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117370449 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117370501 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 117370639 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117370773 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117370830 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117371041 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117371295 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 117371624 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 117371723 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117371818 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117372127 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117372294 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117372750 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 117372815 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117373036 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117373062 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 117373226 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117373227 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117373428 G C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 117373895 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117374096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117374595 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117374945 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117375082 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117375119 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117375160 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117375302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117375311 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117375402 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117375501 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117375557 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117375589 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 117375861 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 117375976 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117376059 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117376227 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117376274 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117376599 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117376665 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117376876 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117376953 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117377033 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117377098 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117377162 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117377196 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117377414 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117377579 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117377627 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117377740 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117377862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117377962 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117378002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117378505 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117378629 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117378875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117378973 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 117378989 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 117379018 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117379079 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117379270 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117379299 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117379341 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117379380 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117379480 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117379493 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117379509 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117379520 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117379528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117379554 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117379697 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117379742 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117379760 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117379772 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117380206 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117380207 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117380235 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117380330 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117380555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117380572 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117380591 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117380766 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 117380779 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 117380926 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117381031 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117381169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117381198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117381350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117381401 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117381422 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117381488 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117381802 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117381842 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117381882 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117381909 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117381920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117381974 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117382020 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117382025 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117382400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117382454 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117382476 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117382536 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117382558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117383060 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117383078 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117383377 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 117383424 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 117384413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117384465 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117384485 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117384487 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117384607 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117384801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117384805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117384852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117385138 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117385693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117385728 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117385794 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 117386313 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117386622 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117387603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117388074 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117388773 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117388808 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117389018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117389141 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117389145 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117389179 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117389225 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117389258 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117389395 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117389423 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117389562 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 117389572 C A N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 117389600 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 117389778 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 117389831 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 117389938 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 117391999 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 117392251 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117392318 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117392421 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117392424 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117392475 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117392479 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117392531 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117392563 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117392602 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117392649 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 117392796 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117392947 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117393122 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117393238 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117393251 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117393317 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117393381 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117393473 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117393511 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117393745 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117393843 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117393855 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 117394332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117394347 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117394358 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117394379 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117394464 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117394653 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117394673 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117394745 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 117394789 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 117394831 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 117394850 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 117394869 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 117395211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117395283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117395879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117396194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117397372 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117397638 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117397685 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117397711 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117397958 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117398179 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 117398559 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117398628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117398850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117398939 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117399171 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 117399307 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117399420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117399526 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 117399541 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117399706 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117399798 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 117399822 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117399852 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 117399906 T A N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 117399979 T C N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 117400011 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 117400055 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 117400069 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 117400240 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 117400380 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 117400616 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 117400681 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117400682 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 117400760 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117400880 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117400904 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117400925 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117400996 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117401289 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 117401321 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117401386 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117401678 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 117401923 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117402311 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 117402577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117402591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117402729 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117402751 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117403274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117403290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117403322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117403788 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117403826 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117403863 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117403904 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 117404317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117404432 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117404507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117404544 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117404590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117404746 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117404847 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 117404896 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117404936 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117405075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117405089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117405109 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117405127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117405152 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 117405180 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 117405207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117405240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117405241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117405304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117405321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117405504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117405578 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117405599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117405705 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117405713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117405996 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117406046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117406086 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117406296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117406303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117406402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117406410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117406432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117406561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117406614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117406712 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117406755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117407022 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117407263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117407325 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117407384 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117407560 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117407668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117407853 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 117407964 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117408061 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117408181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117408226 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117408381 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 117408392 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 117408659 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117408679 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117408695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117408706 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117408723 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117408739 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 117408878 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117408998 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 117409026 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 117409169 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 117409201 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 117409298 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 117409321 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 117410063 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117410117 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117410140 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117410265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117410377 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117410630 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117410750 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117410921 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117411065 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117411088 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117411100 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117411204 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117411468 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 117411551 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 117411623 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117411645 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117411781 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117412214 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117413218 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 117413238 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 117413331 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 117413782 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117413855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117414688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117415034 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117415866 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117416170 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117416474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117416497 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 117416609 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117416698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117418109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117420966 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117421960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117423205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117425988 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117426953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117427538 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117427580 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117427881 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 117428339 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117428430 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117429282 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117429406 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117429660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117430114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117430143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117431762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117433154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117434094 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 117435994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117436286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117436308 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117437198 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117437921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117438958 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117439748 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117440422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117441021 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117441622 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117442142 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117442159 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117442180 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117442261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117442301 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117442379 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117442421 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 117442457 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117442767 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 117443050 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117443109 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117443126 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 117443130 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 117443157 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117443174 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117443325 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117443359 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117443500 G T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 117443505 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 117443704 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117443754 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 117443821 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 117443915 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117444375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117444516 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117444887 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117444905 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117445000 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 117445040 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 117446100 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117446146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117446353 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117446495 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117446547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117446562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117446977 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117447611 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 117448108 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117448354 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117448407 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117448602 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117448689 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117448769 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117448798 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117448822 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 117448836 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 117449000 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117449210 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 117449249 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 117449313 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117449425 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117449694 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117449726 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117449792 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117449804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117449807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117449836 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117449862 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117449943 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117450165 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117450231 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117450282 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117450612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117450621 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117450640 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117450879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117450900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117450981 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117451013 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117451160 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117451199 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117451307 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117451368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117451557 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117451722 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117451855 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117451989 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117452218 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117452345 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117452347 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117452401 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117452445 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117452555 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 117452570 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117452659 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117452768 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117452812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117452927 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117453251 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 117453938 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117454467 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 117454610 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117454675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117454720 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117454767 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 117454860 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 117454904 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 117455071 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117455183 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 117455360 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 117455408 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 117455410 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 117455443 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 117455549 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 117455586 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 117455716 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117455889 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117456043 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117456099 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117456118 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117456254 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117456339 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117456448 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117456611 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117456639 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117456823 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117456852 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117456867 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117456882 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 117456909 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117457080 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117457237 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117457273 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117457419 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 117457518 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 117457568 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 117457582 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 117457741 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 117457827 G T Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 117457950 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 117457970 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 117458111 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 117458121 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 117458250 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 117458265 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117458354 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117458548 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117458620 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117458759 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117458771 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117458789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117458795 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117458803 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117458954 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117459001 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117459155 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117459165 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117459180 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117459217 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117459252 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117459296 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117459378 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117459490 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117459596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117459643 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117459689 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117459731 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117459789 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117459994 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117460014 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117460062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117460300 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117460394 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117460452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117460693 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 117460817 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117461062 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117461165 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 117461178 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117461272 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 117461322 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117461338 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117461473 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117461479 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117461485 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117461659 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117461753 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117461761 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117461780 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117461792 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117461863 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117461884 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117461944 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117461948 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117462078 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117462138 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117462149 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 117462216 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117462298 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117462304 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117462472 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117462539 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 117462581 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117462592 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117462603 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 117462682 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117462878 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117462881 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117462924 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117463146 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117463238 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117463379 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117463437 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117463476 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117463491 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117463500 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117463505 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117463558 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117463567 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 117463590 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117463616 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117463644 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 117463708 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 117463828 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 117463843 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 117463886 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 117464026 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 117464126 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 117464407 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117464417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117464467 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117464676 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 117464718 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 117464720 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 117464820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117464901 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 117464957 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117465554 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117465593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117466086 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117466319 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117466423 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117466451 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117466571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117466686 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117466698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117466766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117467178 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117467230 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117467274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117467294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117467405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117468496 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117468554 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117469660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117469785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117470293 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117470485 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117470516 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117470582 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117470614 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117470622 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117470659 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117470741 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117470781 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117470808 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117470813 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117470820 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117470843 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117470877 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117471042 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117471077 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 117471081 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 117471127 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117471222 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117471354 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117471487 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117471580 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117471685 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117471754 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117471963 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117472086 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117472182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117472291 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117472363 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117472600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117473050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117473299 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 117473315 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 117473432 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117473591 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117473792 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117473901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117474462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117474495 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117475731 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117475978 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117476170 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117476224 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117476305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117476901 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117476942 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117477009 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117477373 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117477482 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117477649 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117477673 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117477704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117477753 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117477826 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117477872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117477892 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117477945 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117477950 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117477961 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117478524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117478750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117478849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117478859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117478903 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117480614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117481455 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117481827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117481973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117482159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117482729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117483585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117484147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117484151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117484411 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117484588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117484621 G T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117484929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117485022 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117485721 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117485787 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117485795 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117485841 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117485849 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117485944 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117486164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117487449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117488560 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117488634 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117489056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117491748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117492136 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117492172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117492247 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117492617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117492737 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117493181 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117493312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117493387 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 117494010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117494229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117494376 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117494379 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117494390 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117496439 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117499078 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 117499079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117499463 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117501177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117501343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117501404 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117501555 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117502087 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117502197 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117502351 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117502373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117502417 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117502425 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117502591 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117502629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117502656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117502705 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117502765 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117502783 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117502785 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117502879 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117502888 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117502937 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117502973 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117503090 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117503095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117503194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117503221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117503319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117503341 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117503406 G C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 117503536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117503568 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117503649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117503650 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117504228 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117504323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117504363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117504421 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117504433 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117504856 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117504878 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117504906 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117504914 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117504999 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117505565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117505579 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117505593 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117506269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117506322 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117506914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117507433 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117507623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117507744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117508269 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117508469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117508688 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117509014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117509330 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117509427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117509968 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117510181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117511029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117511098 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117511133 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117511192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117511522 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117512564 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117512990 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117513087 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117513539 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117513671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117514977 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117515037 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117515146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117515158 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117515254 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117515552 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117515632 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 117515824 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117515889 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117516078 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117516102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117516186 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117516465 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117516627 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117517015 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117517235 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 117517409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117517576 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117517629 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 117517635 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 117517644 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 117517668 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 117517698 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 117517720 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 117518020 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117518267 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117518289 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117518818 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117519090 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 117519101 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 117519274 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117519278 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117519307 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117519338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117519398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117519475 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117519535 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117519561 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117519562 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 117519614 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117519682 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117519754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117519785 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 117519798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117520106 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 117520207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117520327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117520461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117520500 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117520544 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117520553 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117520569 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117520597 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117520748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117520761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117520891 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 117520911 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117520973 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117521008 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117521079 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117521117 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117521317 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 117521343 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117521382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117521396 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117521511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117521655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117521692 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117521699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117522052 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117522155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117522175 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117522530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117522634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117522709 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117522726 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117522814 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117522846 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117522885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117522922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117523245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117523270 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117523471 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117524318 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 117524546 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117524548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117524658 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117524678 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117524720 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117524828 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 2 117524830 G C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 117525016 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117525083 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117525132 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117525215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117525401 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117525585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117525616 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117525734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117525866 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117526162 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117526330 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117526691 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117526949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117527204 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117527320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117527426 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117527452 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 117527480 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 117527550 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117527756 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117527971 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117528028 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117528157 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117528235 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117528378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117528499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117528590 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117528592 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117528643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117528792 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117528986 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 117528998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117529079 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117529184 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117529197 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117529751 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117529789 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117529808 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117529809 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117529978 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117530027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117530032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117530110 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117530137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117530173 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117530266 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117530361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117530892 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117530941 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117531213 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117531601 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117531611 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117531806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117532183 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117532324 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117532500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117532706 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117532914 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117533082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117533128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117533300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117533347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117533582 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117533618 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117533704 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117533931 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117534669 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 117540589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117541520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117543300 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117543385 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117543394 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117544149 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117544193 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117544349 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117544693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117544699 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117544770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117544889 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117545020 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117546185 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117547959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117549640 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117549781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117550192 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117550616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117550886 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117551117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117551145 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117551154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117551270 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117551314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117551403 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117551463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117551525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117551554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117551698 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117552076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117552140 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 117553067 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117553202 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117553383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117553512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117555210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117555483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117556241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117556554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117557245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117557359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117557493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117557766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117557905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117558416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117558418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117558586 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117559912 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117560166 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117560347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117560377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117560982 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117561218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117561506 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117562132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117562220 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117562365 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117562700 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117563204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117563439 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117563493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117563738 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117563871 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117563947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117563955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117564006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117564967 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117565326 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 117565449 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117565679 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117566540 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117566542 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117566581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117566679 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117566716 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117566928 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117566975 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117567000 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117567022 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117567028 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117567080 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117567378 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117567669 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117567774 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117567868 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117567896 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117567966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117567969 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117568108 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 117568167 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117568183 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117568260 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117568286 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117568357 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117568392 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117568431 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 117568432 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 117568483 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117568515 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117568536 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117568583 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117568624 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117568855 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117568941 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117568970 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117569114 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117569160 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117569195 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117569250 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117569282 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117569344 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117569422 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 117569720 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117570028 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117570083 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117570152 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117570332 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117570417 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117570424 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117570465 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117570467 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117570508 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 117570525 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117570575 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117570601 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117570611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117570625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117570641 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117570681 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117570715 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 117570716 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117570797 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117570842 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117570861 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117570899 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117570926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117570934 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117570939 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117571080 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117571149 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117571152 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117571175 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117571240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117571515 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117571526 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117571709 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117571782 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117571832 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117572262 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117572395 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117572432 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117572526 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117572623 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117572645 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117572802 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117572899 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117572923 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 117572931 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117572939 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117573003 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117573077 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 117573080 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 117573106 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117573543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117573800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117573890 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117574218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117574280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117574310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117574428 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117574757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117574920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117574955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117574985 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117575011 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117575135 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 117575148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117575170 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117575180 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117575190 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117575330 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117575343 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117575366 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117575367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117575384 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117575536 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117575556 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117575600 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117575642 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117575656 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117575709 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117575765 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117575923 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117575944 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117576010 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117576013 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117576036 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117576051 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117576056 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117576131 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 117576163 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 117576369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117576509 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 117576556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117576562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117576582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117576751 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117576805 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117576806 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117576870 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 117576882 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 117576977 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 117577100 A C Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 117577123 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 117577155 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117577194 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117577224 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117577281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117577497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117577498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117577535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117577698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117577843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117577927 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117577955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117577965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117577995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117578002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117578091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117578119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117578163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117578301 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 117578366 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 117578582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117578613 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 117578637 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117578728 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117578808 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117578814 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117578889 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117578960 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117578997 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 117579216 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117579226 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117579284 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117579325 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117579376 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117579455 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 117579488 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 117579541 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 117579577 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117579615 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 117579765 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 117579832 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 117579916 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 117579919 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 117579935 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 117579941 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 117579979 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117579987 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 117580032 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117580059 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117580161 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 117580171 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 117580214 C G Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 117580390 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 117580403 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 117580452 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 117580519 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 117580559 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117580587 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 117580644 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 117580791 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117580889 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 117580940 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 117580986 A T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 117581071 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 117581073 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117581235 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117581274 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117581285 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117581298 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117581341 A T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 117581421 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 117581470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117581472 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 117581515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117581686 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 117581708 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 117581773 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 117581774 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 117581802 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 117581815 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 117581896 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 117581932 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 117581966 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 117581978 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 117583179 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 117583185 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 117583255 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 117583267 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 117583339 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117583382 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117583396 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117583437 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117583440 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117583475 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117583499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117583605 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117583628 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117583671 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117583699 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 117584173 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117584453 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117585013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117585379 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117585473 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117585748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117585910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117586182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117586810 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117587313 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117587696 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117587945 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117588012 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117588016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117588044 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117588156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117588471 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 117588544 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117588571 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117588733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117588814 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117588946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117589303 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 117589310 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 117589531 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 117589582 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 117589844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117589941 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117590106 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117590402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117590404 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117590760 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117590952 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117591053 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117591063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117591082 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117591234 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117591280 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117591418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117591636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117591875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117592010 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117592467 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117592822 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 117592968 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117593015 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117593132 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117593140 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117593161 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117593334 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117593337 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117593356 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117593395 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117593517 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117593518 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117593535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117593555 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117593575 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117593950 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 117593970 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117593983 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117594079 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117594140 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117594267 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117594394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117594973 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117595032 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117595398 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117595727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117595749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117595879 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117595967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117596009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117596010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117598430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117598459 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117598503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117598649 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117598754 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117598778 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 117598822 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 117598857 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117598882 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117598953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117599069 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 117599083 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 117599097 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 117599180 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117599181 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117599241 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117599286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117599382 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117599395 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117599399 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 117599634 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117599692 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117599769 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117599796 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 117599911 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 117599913 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 117600086 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 117600164 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 117600208 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 117600258 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117600606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117600924 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117600996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117601012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117601114 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117601224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117601447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117601676 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117601802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117601942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117602130 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 117602760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117602779 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117602796 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 117603256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117603313 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117603363 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117603403 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117603421 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117603445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117603779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117603878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117604025 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117605487 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 117605964 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117606226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117606487 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117606584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117606605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117606769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117607040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117607135 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117607686 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117607768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117608195 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117608248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117608303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117608326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117608448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117608588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117608896 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117608911 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117608935 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117609140 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 117609153 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117609227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117609302 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117609327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117609467 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117609469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117609483 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117609497 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117609540 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117609823 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117609924 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117609951 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117610032 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117610901 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 117611079 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 117611149 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117611197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117611482 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117611488 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117611498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117611501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117611736 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117611807 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117611836 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117611956 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117612010 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 117613059 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117613103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117613622 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117613623 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117614043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117614526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117614570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117614750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615421 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615464 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117615626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117615693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117615985 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117616023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117616067 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117616256 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117616311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117616398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117616426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117616473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117616563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117616607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117616620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117616669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117617002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117618561 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117618930 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 117619341 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117619357 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117619529 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117619543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117619567 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 117619790 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117620213 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 117620736 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117621053 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117621159 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117621334 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 117621537 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 117621897 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117622646 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 117622701 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117622727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117622902 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117623070 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 117623346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117623691 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117623917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117624212 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117624389 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117624526 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117624572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117624771 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117624937 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117624993 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117624994 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117625400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117625543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117625646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117625657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117625777 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117625931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117625932 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117625994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117626010 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117627093 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117627138 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117627246 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117627283 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117627312 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117627433 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117627519 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117627617 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 117627648 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 117627702 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117627789 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117628013 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117628267 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117628283 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117628416 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117630832 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117631103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117631370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117631432 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 117631486 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117631506 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117631610 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117631617 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117631674 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 117631783 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117631834 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117631903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117631909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117631973 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 117632067 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117632073 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117632124 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117632173 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117632362 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117632421 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 117632561 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 117632578 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117632583 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117632589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117632601 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117632612 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117632624 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117632767 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117632825 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 117633367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117634693 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 117635691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117636807 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 117637258 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117638033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117639239 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 117640984 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117641066 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117642073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117644282 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117644317 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117644344 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117644600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117644795 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117645213 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117645265 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117645322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117645357 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117645508 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117645783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117645934 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117645961 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117645998 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 117646057 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117646138 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117646297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117646551 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117646610 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117646656 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117647012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117647354 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117647560 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117647625 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117647685 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117647800 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117647834 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117647861 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117647954 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117648108 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117648116 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117648222 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 117648844 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117648974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117649165 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 117649166 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 117649253 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 117649478 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117649580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117649676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117649875 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 117650015 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117650057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117650146 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117650402 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117650510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117650577 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117650926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117651127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117651208 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117651323 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 117651355 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117651674 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117651923 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117651969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117652584 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117652791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117652818 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117652833 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 117652885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117652910 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117653272 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117653687 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117654423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117654769 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 117654948 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117663329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117665387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117666892 T G N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 117667406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117667461 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117667566 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117668403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117668612 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117668677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117668779 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117669190 G C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 117669203 G T Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 117670146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117670287 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117670413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117670492 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117670896 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117671185 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 117671191 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 117672161 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117672329 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117672866 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117673020 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117673197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117673550 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117674649 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117675562 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117675732 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117675754 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117676090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117676206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117676412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117676414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117676702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117677035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117679513 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 117680467 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117680732 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 117680887 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117682170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117682756 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117682757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117682995 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117683172 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117685986 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117686470 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117686765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117686863 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117686993 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 117687545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117688397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117688828 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117689062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117690071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117693529 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117693748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117693944 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 117694553 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117695486 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117695605 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 117695673 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117696072 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117696113 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117696118 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117696847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117696873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117696916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117697147 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117697372 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117697541 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117699112 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117699226 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117699790 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 117700138 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117700286 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 117700648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117701356 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117702544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117703996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117704366 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 117705453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117706211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117706852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117707234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117707847 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117707883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117707931 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117707972 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117707977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117708907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117708918 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117708926 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117708951 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117709177 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 117709204 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117709312 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117709411 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 117709434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117709510 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117709515 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117709575 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117709579 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117709612 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117709849 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 117709950 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 117709962 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 117710012 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117710085 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 117710086 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117710125 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117710193 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117710303 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 117710413 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117710460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117710798 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117710843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117710898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117711764 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117712630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117713742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117715001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117715382 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117716148 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117716585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117718316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117718822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117722067 C A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 117722739 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117723857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117724050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117724290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117724528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117724959 A G Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 117725468 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 117725594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117726167 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117726731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117727587 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117728916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117728945 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117729594 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117730542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117731166 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117731390 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117732224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117732337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117733049 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 117733054 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117733329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117733384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117734203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117734358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117734850 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 117735054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117736189 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 117736702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117736833 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 117736941 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117737587 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117737615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117737760 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117737845 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117738081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117738148 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117738163 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117738226 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117738556 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117738936 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117739076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117739650 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117740195 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117740197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117740309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117740369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117740496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117740702 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 117740853 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117740862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117740865 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117740956 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117740989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117741182 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117741337 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117741338 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117741512 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117741649 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117742057 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 117742124 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 117742166 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 117742190 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117742193 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117742383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117742390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117742416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117742824 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117743389 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117743445 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117743488 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117743586 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117743633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117743648 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117743738 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117743763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117743952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117743953 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117744004 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117744120 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117744144 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117744165 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117744200 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117744205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117744291 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117744308 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 117744315 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117744367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117744375 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117744415 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117744476 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 117744574 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117744576 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117744689 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117744705 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117745000 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117745083 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117745147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117745195 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117745342 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 117745373 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 117745439 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 117745482 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117745948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117746129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117746164 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117746432 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 117746463 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 117746536 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 117746582 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117746584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117746644 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117746758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117746771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117746950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117747007 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117747020 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117747028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117747261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117747356 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 117747366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117747412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117747476 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117747585 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117747754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117747877 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117747972 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117748046 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 117748121 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 117748142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117748153 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117748480 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117748663 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 117748666 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 117748682 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117748692 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117748791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117748792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117748850 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117748977 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117749040 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 117749061 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 117749426 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 117749445 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 117749480 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 117749515 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 117749641 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117749685 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117749719 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117749903 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117749922 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117749936 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117749946 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117749959 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117750064 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117750150 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117750188 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 117750245 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 117750256 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 117750351 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117750406 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117750458 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117750489 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117750515 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117750575 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117750596 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117750660 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117750739 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117750761 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117750913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117751180 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117751277 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117751599 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117751622 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 117752139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117752176 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117752185 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117752224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117752275 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117752280 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117752292 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117752314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117752315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117752721 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117752760 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117752787 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117752809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117752874 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117753062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117753143 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117753170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117753260 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117753331 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117753490 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117753562 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117753591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117753612 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117753674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117753763 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117753876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117753903 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117753977 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117754193 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117754205 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117754252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117754350 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117754547 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117755062 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117755186 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117755213 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117755470 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117755725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117755786 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117755874 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117755914 T G Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 117755981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117756070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117756508 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117757384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117757441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117757517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117757572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117757797 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117757822 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 117758085 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 117758314 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117758430 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117758444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117758455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117758457 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 117758494 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 117758981 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117759158 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117759246 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117759252 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117759454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117759614 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117759728 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 117759899 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 117759931 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 117760125 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 117760209 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 117760420 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117760423 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 117761451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117761614 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117761632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117761654 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117761781 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117761882 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117762064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117762097 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117762216 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 117762269 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117762305 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117762363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117762369 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117762421 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 117766235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117767744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117770046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117770563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117770708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117771307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117771393 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117773026 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 117773090 C A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 117773704 T G N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 117773790 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 117773921 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 117773925 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 117774333 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 117774758 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117775062 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117775559 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117775851 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117777973 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 117778822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117778905 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117778924 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117779065 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117779079 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 117779153 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117779169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117779183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117779262 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 117779340 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 117779341 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117779357 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 117780021 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117780113 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 117780153 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117780314 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117780440 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117780507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117780626 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117780657 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117780742 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117780931 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117780948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117781236 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 117781304 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117781306 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 117781887 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117782336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117782400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117782496 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117782745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117783059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117783578 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117783824 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 117784325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117785166 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117785357 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117785945 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117786071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117786072 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117786217 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117786228 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117786546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117786591 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117786938 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117787105 G A Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 2 117787493 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117788669 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117788922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117789097 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117789331 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117789606 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 117789812 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117790067 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 117790332 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 117790339 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 117792188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117792571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117794114 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 117796886 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117796920 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117797712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117798220 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117801944 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117806168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117806530 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117806553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117806576 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117807024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117807275 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 117809707 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117809880 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 117811870 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117814102 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 117814209 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117815611 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117815983 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 117816152 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 117816173 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 117816175 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117816325 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117816516 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 117816537 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 117816546 T C Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 117816576 T G Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 117817139 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 117817647 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 117817680 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 117817808 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 117818317 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117818385 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 117818774 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117818958 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117819411 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117820135 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117820148 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117820206 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117820221 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117820385 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117820453 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117820553 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 117820846 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 117821205 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117821641 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 117821739 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 117821745 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 117821930 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 117821938 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 117821953 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 117822600 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 117822673 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117822754 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117822917 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 117822982 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 117823272 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 117823307 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117823328 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117823562 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 117823681 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117823716 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117824124 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117824167 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117824198 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117824548 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117824640 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 117824759 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117824927 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117824970 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117825205 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 117825235 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 117825335 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117825463 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 117825513 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117825850 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 117826085 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 117827165 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117827207 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117827389 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117827472 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117827876 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117828415 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117828487 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 117828508 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117828668 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 117830190 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117830634 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 117831219 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117832113 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117832468 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117833734 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117835209 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117838931 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 117838945 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117838988 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117838995 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 117839391 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117840475 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117841189 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117848106 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117848825 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 117848926 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117851214 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117851408 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 117851705 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117854594 C A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 117855105 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117855177 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 117855194 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 117855229 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117855339 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117855368 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117855761 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117855817 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117856080 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117856199 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117856985 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117857005 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 117857299 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117858170 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117858477 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117858517 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 117858529 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117858561 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117858668 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 117858669 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117858826 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 117858894 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 117858991 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 117859011 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 117859418 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117859615 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 117859617 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 117859985 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117859994 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117860884 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 117861052 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117861152 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117861244 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117861257 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117861289 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117861396 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 117861424 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 117861485 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117861512 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117861644 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117861910 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 117861933 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117862216 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117862358 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117864307 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117864985 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117865028 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117865658 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117865805 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117865927 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117865997 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117866117 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117866520 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 117866590 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 117866622 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 117866625 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 117866853 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 117866854 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 117866967 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117867077 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 117867590 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117867616 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117867695 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117867708 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 117867843 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117867935 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 117867940 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 117867971 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 117867997 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117867998 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117868060 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 117868077 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 117868190 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117868200 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117868289 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 117868308 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 117868494 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117868638 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 117868641 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 117868660 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117868876 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117869109 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117869217 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117869308 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117870210 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117870422 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117870599 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117870890 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117870932 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117871134 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117871170 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117871175 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117871192 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117871215 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117871223 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117871404 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117871516 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117871518 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117871528 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 117871534 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117871573 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117871770 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117871871 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 117872232 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117872331 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117872362 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117872502 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117872574 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 117872604 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117872641 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117872663 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117872691 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117873244 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117873539 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 117873554 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117873568 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 117873593 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 117873660 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 117873725 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 117873816 T G N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 117873860 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 117873949 A T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 117874354 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117874396 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 117874451 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117874534 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117874587 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117874666 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117874698 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 117874703 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 117874711 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 117874748 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 117874769 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117874800 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117874999 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117875022 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117875177 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117875390 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 117875618 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117875646 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117875658 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117875665 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117875803 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117875864 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117875963 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117875993 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117875999 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117876037 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 117876062 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 117876731 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 117876738 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117876944 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117877323 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117877624 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117877761 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 117877777 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117877795 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 117877923 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117877941 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117877967 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117878085 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117878150 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117878531 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 117878624 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 117878677 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 117878880 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117878927 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117878978 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 117879021 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117879041 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117879042 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 117879178 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117879198 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 117879205 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117879231 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 117879256 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 117879278 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117879346 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117879347 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 117879378 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117879467 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 117879635 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117879964 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117879989 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117880018 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117880024 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117880129 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117880234 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117880299 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117880453 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 117880474 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 117880483 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117880530 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 117880659 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117880731 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117880821 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117880833 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117881063 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117881190 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117881764 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117881804 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117881905 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117881984 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117882446 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117882533 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 117883102 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117883137 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117883154 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117883277 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117883409 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117883433 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 117883446 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117883491 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117883567 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 117883716 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 117883752 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117883817 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117883956 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117883959 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117884019 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117884083 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117884127 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117884161 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 117884227 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 117884364 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 117884476 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117884477 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117885104 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117885133 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 117885153 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117885168 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 117885404 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117885470 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117885960 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 117886000 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 117886038 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117886093 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 117886121 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117886328 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 117886352 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 117886408 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 117886490 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117886719 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 117886812 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 117887187 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 117887320 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117887392 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 117887550 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117887688 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117887959 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117888058 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117888964 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 117889140 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117889352 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117889637 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117889769 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 117890145 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 117891775 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 117891836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117892306 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117892319 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 117892320 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 117892345 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 117892375 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117893336 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117893582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117893599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117893738 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117893768 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117893874 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 117894060 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117894208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117894392 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117894485 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117894511 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117894564 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117894619 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117894888 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 117894936 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117894976 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117894989 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117895011 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117895025 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 117895387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117895519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117895541 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117895595 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117895668 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117895673 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117895724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117895881 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 117895902 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 117895970 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117896066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117896375 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117896454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117896475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117896938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117897151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117897152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117897229 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117897384 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117897414 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117897446 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117897447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117897563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117897588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117897625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117897919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117897973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117898002 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117898078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117898093 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117898120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117898137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117898281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117898393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117898723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117898779 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117898837 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117898841 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117898872 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117899020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117899116 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 117899132 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 117899275 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 117900066 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117900067 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117900128 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117900340 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117900341 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117900353 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117900364 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117900493 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 117900505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117900644 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117900733 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117900797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117901068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117901085 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 117901155 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 117901157 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 117901280 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 117901281 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 117901292 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 117901373 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 117901513 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117901634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117901664 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 117901787 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 117901886 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117901905 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117901996 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117902000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117902023 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117902086 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117902099 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117902100 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 117902226 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 117902317 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117902380 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117902455 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117902480 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117902616 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117902682 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 117902718 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117902736 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117902757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117902782 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117902801 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117902938 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117902942 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117903204 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117903222 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 117903512 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117903552 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 117903646 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117903655 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117903697 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117903851 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117904083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117904291 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117905186 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117905302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117905325 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117905327 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117905345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117905579 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117906126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117906291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117907657 C T Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 117907692 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 117907970 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117908304 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117908314 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117908373 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 117908626 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117908637 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117908673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117908697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117908893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117910097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117910131 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117910459 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 117910583 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117910949 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117911220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117911697 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117911743 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 117912011 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117912014 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 117912137 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117912439 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117912611 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 117912635 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 117912686 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 117912700 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 117912753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117912831 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117913696 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117913838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117913990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117914112 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 117914127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117914372 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 117914393 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 117914456 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 117914599 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117914797 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 117914903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117914996 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 117915039 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 117915130 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117915226 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117915361 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117915363 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 117915418 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117915427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117915444 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 117915488 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117915495 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117915595 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117915675 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117915801 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117915833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117915949 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117916067 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 117916212 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117916271 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 117916287 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117916300 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117916393 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 117916409 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117916413 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 117916478 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117916511 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117916553 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117917072 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 117917107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117917167 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 117917903 C G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 117918733 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117920683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117924012 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 117924642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117925068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117925581 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117925933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117926260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117926481 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 117926494 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117926506 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117926613 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 117926747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117926815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117927080 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117927095 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 117927225 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 117927262 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117927286 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117927348 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117927429 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 117927568 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117929776 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 117929988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117930157 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 117930475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117933026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117934312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117935940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117936437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117936565 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 117937087 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 117937510 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 117937624 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 117937871 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117937945 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 117937946 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 117938719 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 117939145 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117939687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117939727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117940196 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117940264 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117940281 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117941139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117943359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117944159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117947250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117947481 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117947482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117947517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117947518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117947863 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117947916 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117947947 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117948538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117948551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117948556 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117948563 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117948718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117948800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117949423 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117949705 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117950286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117950556 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 117950791 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117951553 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117952028 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117952140 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117952311 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 117952488 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117952718 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117953069 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117953205 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117953206 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117953454 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117953707 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 117953743 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117954039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117954566 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117955128 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117955362 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117955500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117955594 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117955810 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117955971 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117956315 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117956316 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 117956490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117956494 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117956555 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117956789 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117956801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117956843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117956865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117957176 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117957184 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117957221 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117957222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117957823 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 117957860 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117957888 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117957894 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117957974 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117957980 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117958010 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117958072 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117958107 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117958378 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117958384 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117958417 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117960838 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117960918 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117960962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117961403 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117961537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117961569 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117961685 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117961687 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117961732 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 117961806 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117961822 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117961993 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117962151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117962425 G T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 117962603 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 117962832 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117963032 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117963463 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117963832 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 117964030 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 117964150 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117964396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117964472 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117964567 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117964749 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117964877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117965300 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 117967930 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117967968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117967973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117968030 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117968035 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 117968122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117968186 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 117968214 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117968220 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117968282 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117968308 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117968675 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117968902 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 117969253 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 117969463 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 117969573 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 117969915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117969979 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 117970037 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117970278 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 117971289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117971405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117972105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117972177 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 117972365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117972504 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117972554 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117972816 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117973137 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 117973446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117973571 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 117973579 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117974104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117974677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117974750 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117974838 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 117974839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117974952 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117975114 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117975216 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 117975420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117975475 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117975939 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117976007 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117976019 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117976193 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117976212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117976219 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117976266 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 117976470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117976584 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117976593 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117976611 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 117976652 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117976772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117976898 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117977057 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117977152 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 117977856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117978023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117978774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117978961 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 117979885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117980515 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117980845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117981438 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 117982747 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117983111 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 117983795 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 117985044 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 117988657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117989479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117989964 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117989991 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117990091 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 117991233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117992379 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117994059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117994172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117994184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117994233 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117994612 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117994643 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 117994671 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117994676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 117994877 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117995067 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 117995101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 117995423 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 117995855 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 117995888 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 117997324 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 117999618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118000570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118000788 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118001538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118002428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118003264 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 118003373 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118005365 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 118007065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118007898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118009330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118011543 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118011812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118012278 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 118013232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118014441 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118014731 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 118015220 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 118015516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118017568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118018602 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118018896 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118020091 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 118020299 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 118021262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118021403 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118021475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118022859 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118022999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118023583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118023596 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 118023599 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 118025836 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118026372 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118028138 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118028885 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118029426 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118029791 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118031286 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118031297 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 118031377 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 118031408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118031505 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 118031554 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 118031714 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 118031771 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 118031847 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 118031929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118032024 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 118032131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118032351 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 118032387 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 118032524 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 118032618 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 118032715 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 118032737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118032772 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 118032777 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 118033210 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 118033419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118033707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118033764 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118034244 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 118034499 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 118034600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118034615 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118034625 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 118035006 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 118035066 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118035221 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 118035783 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118035821 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 118035863 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 118035901 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 118035911 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 118035917 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 118036273 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118036762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118036792 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 118036793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118038624 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118039273 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118040094 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118043429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118044307 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118044389 A C Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 118044550 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 118044605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118044617 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 118044732 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118044810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118044886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118046639 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118047352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118051776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118053141 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 118053577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118056124 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118061625 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 118061927 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118062007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118063636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118063638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118064160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118065702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118066166 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118066817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118068134 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 118069925 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 118069933 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 118069943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118069981 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118070144 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 118070471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118070546 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118070657 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118070733 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 118070734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118071008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118071163 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118071440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118071630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118071634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118071664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118071672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118071730 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118071757 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118072543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118073082 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 118073560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118073733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118074259 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 118075764 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118075891 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118075907 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118075926 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118076022 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118076070 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118076323 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118076370 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118076594 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118076683 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 118076703 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 118076858 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 118076945 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 118076949 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 118076976 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118076982 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118077010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118077048 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118077092 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118077165 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118077182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118077287 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 118077332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118077368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118077437 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118077460 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 118077514 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 118077559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118077604 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 118077866 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 118077938 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118078014 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118078039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118078079 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 118078110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118078205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118078434 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 118078464 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118078467 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118078497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118078537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118078558 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 118078606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118078648 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 118078691 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118078696 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118078768 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118078932 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118078943 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118078963 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118078973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118079030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118079043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118079064 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118079121 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 118080188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118080350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118080570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118081360 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 118081833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118082292 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118082750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118083517 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118084490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118085016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118085975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118087140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118088258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118088462 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118089498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118090048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118091413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118091444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118091718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118092211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118092702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118093566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118094298 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118094663 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118094702 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 118094751 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 118094836 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 118095067 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118095928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118096100 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118096511 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 118096520 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 118096545 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 118096577 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118096634 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118097187 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118097196 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 118097208 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 118097313 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118097343 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118097862 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 118097934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118098001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118098042 A C N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 118098130 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118098180 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 118098205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118098354 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118098371 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118098456 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118098564 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118098654 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 118098662 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118098665 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118098695 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118098718 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118098765 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 118098808 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118098897 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118100163 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118100697 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118100943 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 118101502 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118106277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118107719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118108907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118108976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118109271 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118110021 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118110075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118110121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118110137 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118110148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118110162 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118110296 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 118110299 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 118110372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118110585 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 118110616 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118110794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118110807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118110955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118113385 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118113538 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118114299 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 118114435 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 118114543 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118114560 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 118114646 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118114776 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118114814 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118115062 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118115097 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118115200 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 118115372 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 118115377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118115433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118115458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118115597 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 118115601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118115643 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118115736 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 118115790 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118115835 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118115844 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118115870 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 118116029 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118116050 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118116055 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118116069 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118116195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118116273 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118116276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118116437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118116492 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118116882 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 118116898 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 118117163 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 118117181 C A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 118117234 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118117256 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118117290 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118117293 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118117592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118118100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118118331 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118118368 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 118118624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118118733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118118796 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118118866 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118118925 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118119032 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 118119069 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 118119117 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 118119184 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118119619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118119828 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118120175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118120819 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 118121081 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118121100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118121235 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118121332 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118121406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118121409 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118121469 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118121528 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118121566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118121704 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118121807 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 118121855 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118121908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118122794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118122867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118122872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118123026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118123068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118123081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118123117 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118123246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118123277 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118123316 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118123324 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118123501 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118123520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118123632 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118123702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118123778 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118123992 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118124366 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118124575 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118124609 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 118124617 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118124632 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118124881 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 118125242 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118125605 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 118125721 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 118125941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118125946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118126002 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118126091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118126559 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118126660 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118126707 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118126789 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118126818 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118126885 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118126886 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118127302 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118127319 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 118127402 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 118130742 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 118130761 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 118130766 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 118131049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118131050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118131112 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 118131757 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118131760 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118132206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118133068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118134119 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 118134141 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 118134324 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 118134454 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118134476 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118134545 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118134575 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118134631 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118134797 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118134938 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118135274 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118136246 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118136610 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118136705 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118136966 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118137515 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118137671 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118137678 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118137699 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118137934 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118138216 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118138528 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118138539 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118138542 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118138730 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118138892 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118139056 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118139077 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118139088 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118139240 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118139644 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118140026 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118140253 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118140337 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118140372 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 118140384 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 118140432 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 118140447 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 118140614 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118140815 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118140919 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 118140996 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118141034 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118141111 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118141613 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118141711 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118142003 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118142023 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118142038 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118142105 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118142156 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118142183 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118142360 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118142373 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118142619 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118143482 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 118143667 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118143720 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118144274 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 118144563 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118144702 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118144738 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118145063 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118145407 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118145628 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118145764 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118146061 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118146069 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118146131 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118146157 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118146312 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 118146616 G C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 118146642 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 118147062 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118147076 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118147313 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118147410 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118147676 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118147776 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118148582 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118148671 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118148695 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118148712 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 118148904 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 118149004 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 118149055 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 118149074 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 118149230 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118149314 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 118149324 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 118149370 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118149400 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118149507 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118149647 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118151369 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 118151447 C G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 118151465 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 118151751 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118151761 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 118152015 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 118152515 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118152596 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118152904 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118152922 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118152985 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118153178 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118153234 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 118153304 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118153802 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118154137 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118154142 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118154288 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 118154424 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 118154507 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118154513 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118154572 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118154573 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118154583 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118154595 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118154605 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118154616 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118154625 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118154651 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118154675 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118154676 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118154707 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118154918 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118155102 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118155138 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118155536 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118155643 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118156165 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 118156248 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118156334 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118156517 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 118156603 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118156668 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 118156833 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118157196 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118157222 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 118157263 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 118157440 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 118157562 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118157564 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118157628 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118157741 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118158477 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118158764 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118158967 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118159128 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 118159203 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118159214 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118159223 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118159493 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118159738 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118159739 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118159828 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118160100 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118160165 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118160779 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118164062 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118164185 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118165658 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118165971 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118167094 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118167110 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118167173 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118167261 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118167332 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118167451 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118167538 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118167595 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118167906 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118168007 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118168037 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118168082 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118168098 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118168162 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118168218 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118168295 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118168497 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118168518 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118168579 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118168809 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118169449 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 118169650 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118169676 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118169742 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118169755 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118169756 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118170362 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118170792 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118170869 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118171302 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118171642 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118171722 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118172069 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118172211 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 118172357 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 118172683 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118172756 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118172796 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118172800 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118173362 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118173384 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118173409 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118173443 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118173465 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118173474 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118173571 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118173603 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118173647 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118173739 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118174129 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118174333 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118174526 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118174538 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118175358 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118175544 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118176066 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118176425 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118176480 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118176553 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118176893 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 118177737 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 118179010 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118179051 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118179153 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 118179679 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118180237 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118180272 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118180296 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118180809 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118180831 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118180888 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118181112 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118181384 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118181400 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118181533 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118183111 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118183327 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118183382 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118183573 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 118183703 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118183887 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 118183975 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118184034 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118184188 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 118184308 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118184336 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 118184414 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 118184431 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 118184599 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 118184610 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 118184615 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118184749 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118184844 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 118184884 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118184922 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 118184963 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118184992 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118185281 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118185385 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118185778 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 118185814 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 118185853 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118185907 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118185937 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118185959 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118186916 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118186937 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118187017 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118187090 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118187520 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118187982 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118188099 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118188150 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118188296 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118188487 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118190784 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118190851 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118190870 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118191107 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118191600 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118191695 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118191997 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118192506 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118192560 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118192569 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118192671 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118192679 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118192741 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118193232 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118193298 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 118193416 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 118193439 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118193498 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118193804 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118193864 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118193946 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118193965 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118193971 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118193978 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118194014 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118194405 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 118194505 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 118194712 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118194728 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118194743 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118195113 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118195189 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118195333 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118195555 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118195670 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118195740 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118196066 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118196067 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118196095 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118196119 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118196124 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118196307 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118196323 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118196385 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 118196726 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118196877 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118197021 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118197767 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118198020 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 118198058 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118198080 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 118198097 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 118198200 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118198225 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 118198339 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 118198530 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118198582 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118198989 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118199370 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118199409 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118199491 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118199503 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118199523 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118199628 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118200612 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118200798 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118200930 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118201060 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 118201619 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118201737 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118201916 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118202040 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118202097 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118202557 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118202639 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118202642 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118202833 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118202998 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118203724 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 118203758 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118203770 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118203771 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118203992 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118204039 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118204093 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118204464 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118204500 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118205324 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118205431 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118206394 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118206731 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118208048 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118208196 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118208247 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118208308 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118208316 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118208660 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118208979 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118209740 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 118209885 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118209939 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118210021 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118210123 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118210145 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118210308 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118210317 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118210366 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118211136 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118211527 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118211871 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118212235 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118213677 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118214220 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 118214359 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118214895 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118215278 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118215794 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118216100 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118216287 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118216375 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118216462 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118216932 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118217203 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118217207 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118217328 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118217783 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 118218698 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118218905 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118219246 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118219430 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118219468 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 118219485 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 118219805 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 118220605 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 118220666 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118220927 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118220954 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118221145 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 118221946 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118222063 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118222425 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118222686 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118222795 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118223002 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118223047 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118223064 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118223278 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118224248 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118224350 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118224374 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118224386 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118224446 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 118224449 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 118224488 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118224498 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118224588 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118224609 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118225187 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118225245 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118225533 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118225643 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118225971 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118226003 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118226088 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 118226352 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118226366 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118226369 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118226445 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118226457 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118226458 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118226551 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118226558 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 118226651 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118227238 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118227308 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118227903 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118228293 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118228346 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118228429 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118228495 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118228590 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118228732 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118228745 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118228875 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118228996 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118229048 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118229066 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118229181 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118229301 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118229443 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118229679 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118230798 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118231404 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118231412 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118231833 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118231932 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118232127 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118232162 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118232719 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118232757 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118234939 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118234940 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118235048 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118235325 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118235370 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 118235612 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118235695 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118235867 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118236026 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118236238 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118236509 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118236760 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118237337 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118241620 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118241678 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118241730 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118241882 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118241914 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 118242100 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118242715 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118242942 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118243098 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118243515 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118243804 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118243978 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118244001 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118244211 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 118244311 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118244378 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118244412 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118244422 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118244448 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118244471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118244516 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118244972 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118244996 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118245128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118245147 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118245177 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118245262 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118245333 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118245807 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118246081 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118246304 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118246323 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118246369 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 118246542 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118246813 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118246904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118246925 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118247128 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 118247145 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 118247227 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 118247249 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 118247500 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 118247595 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118248501 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118248622 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118248670 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118248812 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 118248813 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118248918 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118248925 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118248937 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118248993 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118249098 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118249820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118249878 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118249963 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118249999 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118250028 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118250093 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118250094 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118250119 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 118250137 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 118250235 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 118250290 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 118250347 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 118250388 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118250430 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118250457 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118251217 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 118251237 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118251670 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118251677 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118252821 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118252829 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118252897 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118252951 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118252957 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118252970 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118253101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118253432 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 118253488 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118253747 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118253996 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118254243 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118254293 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118254800 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118254832 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 118254858 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118254863 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118254890 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118254949 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118255056 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118255081 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118255231 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118255250 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118255270 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118255358 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118255457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118255589 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118255722 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 118255756 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 118255780 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 118255873 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 118256051 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118256090 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118256101 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118256218 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 118256271 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 118256342 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 118256366 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118256447 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 118257000 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118257124 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118257409 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 118257540 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118257548 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118258044 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118258527 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118258983 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118259644 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118259672 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118259962 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118260758 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118260759 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118260934 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118260967 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118261049 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118261105 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118261539 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118261572 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118261702 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118261826 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118262077 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118262126 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118262557 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118262586 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118262656 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 118262748 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 118262793 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 118263161 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118263681 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118263890 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118264622 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 118264972 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118265010 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118265500 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118265558 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118265690 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 118265958 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118266561 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 118266863 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118266872 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118266883 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 118266930 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118267135 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 118267156 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 118267269 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118267344 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 118268622 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 118268660 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 118268735 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 118268776 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118268990 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118269011 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118269052 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118269097 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 118269143 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 118269155 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 118271536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118271605 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118271661 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118271835 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118271965 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 118272435 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118272438 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118272571 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118272632 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118272644 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118272892 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118272893 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118272923 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118272994 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118273003 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118273033 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 118273143 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 118273156 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118273302 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 118273388 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 118273455 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118273536 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118273624 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 118273711 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118273730 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 118273786 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118273831 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118273889 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118273926 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118273935 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 118273949 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118274301 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118274414 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 118274649 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118274665 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118274796 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118274973 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118275010 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118275045 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118275058 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118275160 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118275201 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118275460 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118275726 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 118275773 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 118275775 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118276042 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118276150 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118276199 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 118276231 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118276282 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118276294 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118276436 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 118276437 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 118276773 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 118276788 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 118277290 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118277333 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118277358 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118277379 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118277567 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118277581 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118277639 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118277678 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118277816 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118277881 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 118277902 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118278131 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118278151 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 118278154 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 118278195 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 118278218 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118278289 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118278371 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118278387 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118278526 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 118278534 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118278539 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118278619 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118278729 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118278817 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118278823 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118278956 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118279270 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 118279290 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 118279356 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 118279419 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 118279425 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 118279497 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118279531 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 118279574 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118279639 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 118279815 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118279931 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118280060 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118280070 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118280116 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118280119 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118280131 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118280147 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118280449 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118280505 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 118280523 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118280536 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118280738 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118281376 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118281404 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 118281685 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118281717 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118281943 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118281990 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118282086 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118282105 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118282438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118282704 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118282933 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118283037 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118283105 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118283385 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118283997 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118284024 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118284190 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 118284492 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 118284529 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 118284569 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 118284666 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 118284697 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 118284765 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 118284887 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118284922 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 118284931 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 118285042 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118285119 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 118285326 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118285411 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 118285460 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118285513 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 118285539 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118285548 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118285944 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118285964 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118286062 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118286063 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 118286173 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 118286177 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118286196 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118286511 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118286536 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118286538 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118286555 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118286707 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118286759 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118286761 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118286813 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 118286814 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 118286854 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118286981 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118287769 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 118288205 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 118289065 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118289172 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 118289215 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118289301 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118289569 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118289603 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118290675 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 118290679 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 2 118290939 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 118290967 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 118291506 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 118292243 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118292495 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118292771 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118292775 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118293091 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118293492 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118293709 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118294228 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118294252 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 118294341 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 118294713 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 118294787 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 118295262 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118296106 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118296207 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118296488 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 118296739 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 118296998 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118297045 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118297464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118297519 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118297568 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118297791 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118297885 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118298546 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 118298594 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118299245 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118299283 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118299461 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118299478 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118299500 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118299577 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118299705 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118300290 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118300648 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118301040 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118301124 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118301218 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 118301831 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118302085 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 118302099 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118302186 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118302215 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118302312 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118302361 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118302501 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118302707 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118302758 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118302800 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118303118 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118303141 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118303167 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118303188 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 118303200 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 118304083 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 2 118304089 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 2 118304096 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 118304180 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 118304343 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118304714 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118304906 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118304952 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 118304971 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 118305107 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 118305314 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118305695 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118305784 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118305797 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118305845 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118305847 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118306141 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118306178 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118306191 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118306198 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118306316 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118306375 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118306379 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118306694 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118307023 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118307148 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118307212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118307231 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118307333 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118307800 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118307803 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118307943 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118308092 C A Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 2 118308160 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118308431 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 118309128 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118309254 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118309305 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118309346 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118309401 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118310276 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118310502 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 118310703 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 118310773 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 118310815 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 118310819 G A Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 118311179 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118311347 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118311580 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118311628 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 118311645 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 118312261 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 118312432 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118312730 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118312773 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118312871 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118313019 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118313033 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118313085 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118313103 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118313174 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118313569 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118313957 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118314061 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118314086 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118314114 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118314141 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118314224 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118314233 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 118314249 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118314428 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118314431 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118314471 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118314569 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118314967 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118315086 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118315198 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118315219 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118315266 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118315347 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118315874 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118315875 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118315915 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118315938 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118316235 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118316280 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118316932 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118317301 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 118317499 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118317614 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118317771 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118317813 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 118317893 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118317949 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118318034 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 118318556 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118318875 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 118319148 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 118319198 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 118319362 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 118319426 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118320135 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118320177 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118320345 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 118320567 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 118320669 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118320987 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 118321070 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118321105 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 118321122 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 118321124 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 118321518 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 118321605 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 118321617 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 118321959 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118321990 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118321991 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118322148 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118322177 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 118322210 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118322225 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118322239 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 118322374 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118322494 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 118322630 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118322708 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118322802 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118322836 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118323001 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118323039 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118323047 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118323083 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 118323202 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118323317 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118323356 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118323383 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118323603 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118323749 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118323903 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118324243 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118324467 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118324500 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118324577 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118324630 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118324671 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118325048 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118325339 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 118325630 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118325755 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 118326052 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118327079 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118327236 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118327406 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 118327941 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118327976 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118328033 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118328064 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118328106 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118328109 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118328167 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118328247 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118328267 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118328291 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118328317 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118328551 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 118328558 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 118328723 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118329051 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118329107 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118329111 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118329142 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118329198 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118329201 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118329516 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 118329545 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118329558 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118329577 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118329611 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 118329745 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118329817 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118329899 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118329983 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118330018 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118330293 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118330377 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 118330400 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118330461 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118330491 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118330577 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118330642 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118330649 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118330979 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118332780 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118333145 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 118333692 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118333925 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118333965 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118333979 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118333989 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118334011 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118334021 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118334218 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118334822 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 118334919 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 118336210 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118337102 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118337223 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 118337447 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118337701 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118339003 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118339610 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118340308 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 118340322 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 118340506 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118342183 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118342277 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 118342301 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118342321 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118342427 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118342654 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 118344195 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118344988 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 118345425 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118345466 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118345910 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118345975 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118345976 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118347210 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 118347747 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118348372 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118348725 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118349457 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118350045 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118350060 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118350115 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118350188 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118350226 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 118350567 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118350819 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118350943 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118351367 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118351924 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118352225 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118352557 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118352666 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118352766 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 118353170 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 118353393 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118353469 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118353555 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118353599 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118353728 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118353777 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118353896 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118354213 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118354652 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 118354859 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118354954 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118355625 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118356856 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118356898 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118357455 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118358354 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118358416 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118358489 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118358523 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118358668 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118359914 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118360583 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 118360623 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118360838 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118360855 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118360891 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118360924 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118361026 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118361090 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 118361224 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 118361630 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 118361806 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118361878 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 118361921 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118361936 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118362429 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 118362545 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118362801 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118362843 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118363886 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118363937 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118364068 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118364243 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118364252 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118364290 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118364391 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118364427 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118364598 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 118364624 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 118364781 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 118364790 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118364818 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118364823 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118364915 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118364935 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118364996 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118365072 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118365082 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118365090 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118365247 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118365250 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118365313 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 118365849 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118366197 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118366336 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118366408 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118366411 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118366647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118367506 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118367520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118368084 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118368146 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 118368834 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118370550 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118371920 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118372582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118373961 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 118374043 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 118374336 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118374683 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118374703 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118374961 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118375720 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 118375754 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 118375861 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118376063 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118376853 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118377044 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 118377215 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118377875 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118378200 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 118378247 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118378271 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118378413 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118378515 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118379118 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118379372 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118379482 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118379496 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118379618 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118384536 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118385244 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118385474 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118385639 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118385843 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118386053 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118386088 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118386333 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 118386631 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 118386692 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 118386694 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 118386711 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 118386734 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 118386894 G C N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 2 118386943 T G Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 118387047 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118387069 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 118387108 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118387209 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118387260 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118387324 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118387441 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118387470 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 118387679 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 118387710 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118387810 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118387869 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118387914 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118387932 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118387977 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118388162 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 118388431 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118388478 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118388715 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118388798 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118388885 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118388910 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 118388921 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118389041 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118389058 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118389153 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118389532 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118389535 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118389640 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118389698 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118389732 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118389744 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118389858 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 118389915 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118389916 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118389965 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118389966 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118390174 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118390238 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118390568 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118390624 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 118390708 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118390753 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118392583 T C Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 118393837 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 118393976 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 118393991 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 118394034 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118394101 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118394120 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 118394266 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 118394274 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 118394522 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 118394613 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 118394635 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 118394729 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118394817 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118394912 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118394994 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 118395436 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118395564 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118395589 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118395596 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118395705 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118395711 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118395817 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118396378 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118396394 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118396419 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118396433 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118396450 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118396454 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118396503 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118396565 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118396591 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118396646 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 118396746 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 118396962 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118396980 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118397011 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118397176 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118397323 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 118397356 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118397473 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 118397495 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 118397525 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 118397908 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118398115 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118398601 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 118398607 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 118398693 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 118398706 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118398772 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 118398915 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118398958 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118398961 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118399016 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 118399091 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 118399186 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 118399196 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 118399302 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 118399496 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 118399507 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118399639 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 118399849 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118399915 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118399955 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 118399995 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 118400003 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 118400406 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118400449 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 118400551 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 118400581 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118401392 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118401431 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118401500 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 118401511 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118401522 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118401530 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 118401613 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118402745 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118402837 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118402905 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118404315 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 118404362 C T N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 118404582 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 118404708 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 118404865 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118404910 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118404917 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 118405234 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 118405350 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118405363 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118405616 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118405617 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118405762 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118405767 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118406176 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118406177 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118406292 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118406397 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118407910 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118407955 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118408117 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118408349 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118408798 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118408903 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 118409183 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 118409421 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 118409554 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 118409572 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118410127 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118410140 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 118410292 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118410315 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118410355 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118410507 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118410529 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118410604 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 118410994 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118411016 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 118411075 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 118411134 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 118411202 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 118411336 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 118411364 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118411385 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 118411528 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118412119 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118412282 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118413947 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118413991 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118414030 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118414273 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 118414420 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118414633 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118414725 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118414817 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118415044 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118415245 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118415255 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118415686 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 118415730 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118415753 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 118415807 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118415865 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118415879 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118415978 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118416072 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 118416115 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118416882 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118417744 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118417884 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118418035 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118418134 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118418157 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118418168 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 118418495 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 118418519 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118419045 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118419123 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118419546 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 118419656 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 118419926 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118419990 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118420254 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118420266 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 118420275 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 118420331 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118420345 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 118420368 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118420470 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 118420660 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118420681 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 118421247 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118421361 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118421616 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118421940 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118421984 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118422043 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118422287 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 118422288 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118422339 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118422348 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 118422459 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118423154 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 118423171 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118423203 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118423248 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118423349 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 118423451 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118423632 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118423648 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118423749 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118423788 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118424049 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118424120 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118424266 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118424289 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118424331 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118424475 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118424536 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118424627 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118424641 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118424782 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118424805 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118424850 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118424860 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118424884 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118424919 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118424948 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118424976 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118425007 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 118425030 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 118425051 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118425083 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 118425132 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 118425174 G C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 118425296 T G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 118425325 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 118425395 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 118425412 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 118425482 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 118425591 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118425599 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118425609 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118425666 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118425728 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118425729 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118426364 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118426685 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118426942 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118426989 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118427004 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118427890 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118427982 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118428520 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 118429123 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 118429285 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118429378 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118429908 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118430189 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118430201 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118430350 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118431279 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118431508 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118431563 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118432087 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118432322 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118432436 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118432514 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118432996 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118433105 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118433392 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118433876 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118433892 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118433894 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118434087 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118434130 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118434131 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118434481 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118434561 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118434574 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118434944 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118435150 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118435659 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118435850 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118435886 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118435908 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118435963 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118435976 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118436576 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118436642 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118436705 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 118437026 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118437099 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118437160 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118437201 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 118437667 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118437846 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118439037 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118439163 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118439866 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118439891 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118439946 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118439963 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118440539 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118440686 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118440759 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118440768 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118441454 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118441660 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118441754 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 118441761 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118442295 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 118442296 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 118442353 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118444047 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 118444200 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118444857 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118445139 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 118445893 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118445899 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118446018 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 118446138 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118446222 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118446258 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118446305 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118446384 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118446736 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118446739 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118446783 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118446978 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118447030 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118447151 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118447205 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118447221 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118447284 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118447330 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118447441 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118447767 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118447783 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118447799 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118447977 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118448022 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 118448606 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118448999 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118449195 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118449220 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 118449247 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118449513 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118449872 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118450171 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 118450255 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118450272 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118450366 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118450369 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118450383 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 118450408 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118450629 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 118450848 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118450858 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118450892 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118450896 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118450935 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118450959 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118451099 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118451108 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 118451123 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 118451362 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118451388 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118451396 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118451416 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118451446 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118451669 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 118451883 C A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 118451915 A T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 118451930 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 118451947 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 118452138 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 118452283 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 118452340 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118452349 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 118452355 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118452518 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 118452578 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118452730 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 118452752 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 118453031 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 118453064 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 118453318 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118453331 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 118453405 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118453452 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 118453459 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 118453498 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 118453721 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 118453753 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 118454041 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118454085 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118454098 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118454146 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 118454169 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 118454461 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 2 118454597 G C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 118454618 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 118454718 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118454766 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 118454868 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 118455212 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118455309 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118455357 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 118455406 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118456034 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118456043 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118456099 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118456138 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118456200 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118456538 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118456572 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118456612 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118456696 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118457412 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118457497 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 118457559 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118457676 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118458082 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118458266 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118458329 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118458358 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118458399 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118458429 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118458483 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118458592 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118458799 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 118458907 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118458920 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118459115 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 118459143 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118459238 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118459505 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118459565 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118459616 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118459877 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118460003 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118460006 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118460539 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 118460655 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118461065 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118461082 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118461184 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 118461401 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 118461954 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118462043 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118462117 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118462319 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118462395 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118462605 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118462693 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 118462748 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118462845 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118463168 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118463197 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 118463393 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 118463562 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 118463872 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118463898 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118464130 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118464388 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118464439 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 118464474 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118464479 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118465106 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 118465350 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118465506 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118465654 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118465904 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118466493 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118466497 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118466598 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118466613 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118466618 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118466741 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118467062 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118467064 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118467145 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 118467405 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118467470 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 118467485 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118467518 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118467880 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118468193 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118468524 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118468564 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118468580 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118468755 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 118468803 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118468805 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118468926 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 118468947 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118469815 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 118470079 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118470313 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118470371 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118470450 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 118470530 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 118470664 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 118470698 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 118470701 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 118470743 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118470770 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118470771 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 118470961 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118471519 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118471523 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118471556 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118471573 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118471586 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118471696 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118471722 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118472497 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118472533 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118472537 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118472862 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118473013 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118473213 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118473224 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118473287 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 118473510 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118473519 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118474043 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118474308 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118474465 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 118474528 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118474923 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118475098 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118475107 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118475122 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118475216 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 118475231 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118475374 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118475425 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118475525 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118475575 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 118475591 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 118475780 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118475800 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118475828 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118475846 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118475880 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118476016 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 118476041 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118476232 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118476267 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118476320 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118476500 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 118476612 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118477004 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118477072 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118477141 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118477238 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118477355 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118477529 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118477574 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118477655 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 118477670 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 118477741 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118477792 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118478519 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118478614 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118479028 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 118479080 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118479115 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118479169 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118479300 T C Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 2 118479328 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 118479413 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 118479613 A T N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 2 118479614 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 118479674 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118479703 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 118479780 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 118479794 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118479825 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118479826 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 118479859 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 118479978 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118480086 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118480103 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118480382 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118480423 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118480474 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118480658 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 118480776 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 118480800 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118480821 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 118480964 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 118481169 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 118481184 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118481241 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 118481290 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 118481409 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 118481674 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118481756 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118481829 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118481836 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118481921 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118481946 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118482006 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118482327 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118482373 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118482673 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118482732 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118482830 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 118482980 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118483148 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 118483156 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118483193 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118483244 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118483274 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118483367 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118483418 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118483657 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118483766 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118483775 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 118484010 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118484163 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118484253 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 118484284 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118484313 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118484452 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 118484669 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 118484733 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118484890 A T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 118485178 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118485493 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118485556 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118485687 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118486541 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118486665 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118486751 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 118486768 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118486826 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 118486920 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 118487066 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 118487137 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118487495 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118487547 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118487792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118487933 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118488008 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 118488383 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118488688 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118489055 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118489189 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118490260 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118490558 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118490865 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118490919 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118491268 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118491353 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118491447 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118491630 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118491826 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118492003 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118492133 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118492394 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118492401 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118492442 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118492896 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118492914 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118492930 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118493122 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118493257 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118493438 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 118493532 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118493634 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 118493672 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118493790 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118493843 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 118493862 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 118493932 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118493997 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 118494012 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118494117 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118494306 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118494535 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118494611 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118494614 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118494705 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118494903 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 118494957 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118495027 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 118495156 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118495181 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118495391 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118495544 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118495548 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118495730 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118495793 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118495930 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118495963 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 118496239 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118496290 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 118496360 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118496920 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118497010 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 118497376 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118497447 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 118497482 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118497512 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118497525 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118497708 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118498024 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118498031 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118498592 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118498601 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118498615 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118498674 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118498714 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118498848 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118499044 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118499437 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 118499548 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118499568 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 118499894 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 118499921 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 118500277 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118500687 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118501178 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118501546 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118501548 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118501618 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 118501763 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118501789 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118501868 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118501869 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118501935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118501936 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118502197 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118502239 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118502258 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118502349 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118502418 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118502473 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118502488 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118502587 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118502625 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118502760 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118504307 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118504635 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118504674 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118504922 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118505042 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118505920 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118506153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118506764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118506791 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118507212 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 118507500 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 118507582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118507699 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118508303 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118508346 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118508447 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118508990 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118508994 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 118509430 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118509441 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118509549 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118509740 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118509869 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118510419 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 118510422 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 118510935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118511238 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118511422 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118511477 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118511761 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118511853 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118511870 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 118512071 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118512325 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118512487 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118512537 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118512810 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118512873 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118513099 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118513118 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 118513162 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 118513220 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118513464 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118513575 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118513625 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118513644 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118513734 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118513831 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118514292 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118514304 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118514341 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118514426 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118514778 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118514819 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118514840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118514948 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 118514968 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 118516664 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118516814 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 118516832 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 118517273 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 118517356 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118517364 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 118517614 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118517737 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118517772 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118517827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118518277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118518299 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118518684 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118520459 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 118521154 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 118521169 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118521868 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 118522220 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118522870 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118523047 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 2 118523258 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118525702 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118526162 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118526652 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 118527632 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118529286 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118529420 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 118531475 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118531721 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118531840 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118531967 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118532685 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 118533434 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118533454 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118533577 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118534031 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118534108 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118534181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118534452 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118534718 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118534836 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 118535070 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 118535129 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 118535257 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 118535262 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 118536184 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 118536214 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 118536224 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 118536229 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 118536269 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118537095 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118537120 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 118537196 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118537253 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 118537286 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 118537850 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 118538752 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118538837 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 118539012 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118539026 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 118540013 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118540629 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 118545974 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118546483 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118546618 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118546706 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118547150 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118547953 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118548921 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118550294 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 118551737 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118551790 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118551953 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118552233 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118552383 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118552510 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118552736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118552985 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118553516 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118553548 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118553598 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118553943 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 118554310 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 118554560 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 118554650 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118554727 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118554919 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118554924 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118554946 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118554965 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118554987 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 118555005 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118555022 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118555135 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118555304 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118555487 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 118555560 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118555700 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 118555701 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 118555771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118555787 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118555970 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118556094 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118556117 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 118556142 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118556883 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 118557527 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118557857 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118557911 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118558052 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118558317 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118558873 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118559702 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118559804 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118559829 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118559911 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118559941 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 118559965 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118560580 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 118560649 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118560661 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118560708 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118560940 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118560952 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 118560955 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 118561113 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 118561190 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118561336 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 118561357 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118561377 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118561658 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 118561753 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118562016 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118562050 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118562061 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118562173 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118562329 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 118562538 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 118562602 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 118562732 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 118564598 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 118564618 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 118564622 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 118564743 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118564744 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 118564839 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118564844 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118565180 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 118565741 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118565776 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118566078 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118566141 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118566178 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 118566181 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 118566225 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118566280 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118566330 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118566341 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118566456 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 118566650 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 118567123 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118567435 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 118567524 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 118568015 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118568017 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118568048 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118568626 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 118568807 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118568889 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118569095 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118569491 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118569771 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 118570468 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118570879 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118573006 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 118573853 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118574238 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118575480 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118575481 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118575519 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 118575780 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118575862 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 118575921 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 118576157 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 118576446 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 118576611 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118577668 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118577895 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 118577945 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 118579401 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 118580133 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 118580506 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118580596 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 118580647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118580708 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118580777 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118581095 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118581124 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118581311 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118582517 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118582540 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118582600 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118582632 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118582784 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 118582851 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118582891 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118583034 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118583263 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118583352 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 118583353 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 118583406 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118583462 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118583591 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 118583728 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 118583730 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 118584326 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118584508 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118584690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118584692 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 118585157 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118585606 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118585668 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118586360 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118586370 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118587480 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118587628 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118587634 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118587654 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 118587766 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118587820 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118588014 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118588361 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118588828 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 118589109 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 118589901 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118589933 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118589983 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118590034 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118590201 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118590338 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 118590450 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 118590454 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 118590658 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 118590729 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 118591572 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 2 118591600 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 118591908 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 118592754 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118593005 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 118593557 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118593871 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 118594000 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118594097 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 118594104 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 118594150 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118594218 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 118594366 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118594395 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118594538 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 118594626 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 118594666 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118595246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118595354 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118595547 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118595595 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118595847 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118596008 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118596054 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 118596148 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118596204 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118597506 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118597511 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118597593 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118597705 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118597988 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 118597991 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118598047 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118599068 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118599129 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118599884 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118599897 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118599956 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118599983 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 118600026 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118600069 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118600119 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 118600224 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118600343 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 118600395 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 118600412 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118600530 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 118600625 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118600652 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118600773 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 118601176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118601193 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118601311 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 118601500 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118601683 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118602233 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118602271 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118602455 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 118602706 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118602914 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118603266 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118603705 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 118604063 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118604070 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118604296 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118604361 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118604700 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 118604821 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 118604846 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118605341 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118605885 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118606151 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118607672 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118607777 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118608510 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118609104 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 118609188 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 118609269 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118609363 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 118609548 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118609590 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 118609692 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118609792 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 118610309 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 118610693 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118610795 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 118610910 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118610928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118610981 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118610999 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118611140 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118611191 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 118611223 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118611330 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118611344 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118611364 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 118611367 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118611538 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118611602 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118611622 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118611715 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118611744 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118611756 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 118611806 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118611842 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118611983 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118612368 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 118612553 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118612574 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118612968 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118613251 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118613630 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118613911 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 118614143 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118614176 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118614183 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118614463 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 118614575 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118614618 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118614739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118614835 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118614906 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118614948 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118615145 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118615255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118616910 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118616933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118618843 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118618909 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118619032 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118619482 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118619640 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 118619685 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118620307 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118620319 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118620373 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 118620428 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 118620565 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118620714 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 118620725 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 118621058 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118621204 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118622644 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 118622691 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118622749 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118622845 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118622953 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118623050 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118623293 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118623462 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118623553 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118623570 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 118623583 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118623676 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118623680 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 118624049 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118624105 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 118624116 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118624129 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118624190 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 118624193 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 118624534 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118624603 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 118624830 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 118625027 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118625391 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118625399 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118625698 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118626585 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118628255 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 118628325 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 118628447 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 118628516 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118628583 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118628592 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118628844 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118629054 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 118629097 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 118629262 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 118629321 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118629356 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 118629543 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118629654 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118629672 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118629694 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118629822 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118630015 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118630047 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118630167 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118630431 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118630638 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118630723 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118630884 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118631174 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118631281 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118631493 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118631548 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118631604 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118631639 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118631655 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 118631714 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118631746 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118632192 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118632231 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 118632461 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118632574 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118633039 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 118633243 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 118633432 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118633609 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 118633704 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 118633750 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 118633768 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 118634131 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118634156 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 118634246 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118634260 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118634277 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118634393 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 118634435 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 118634441 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 118635410 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 118635457 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118635718 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118635859 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 118636124 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 118636137 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 118636684 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 118636804 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118637101 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 118637179 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 118637240 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 118637370 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118637834 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118637955 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 118638129 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 118638160 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 118638217 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 118638769 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118638961 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 118639167 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 118639172 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 118639396 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118639424 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118639473 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118639504 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 118639667 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118640123 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 118640244 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 118640316 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 118640379 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 118640402 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 118640444 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 118640450 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 118640650 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 118640788 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 118640809 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 118640931 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 118641129 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 118641325 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118641345 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 118641632 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 118641804 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 118641891 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 118641985 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118642010 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 118642025 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118642445 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118642462 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 118642467 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118642475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118642508 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 118642521 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118642635 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 118642821 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118642894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118642966 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 118643081 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118643101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118643133 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 118643209 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 118643277 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 118643521 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118643586 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118643964 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118644131 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118644393 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 118644789 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118644909 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 118645119 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118645168 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 118645256 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118645590 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 118648420 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118649054 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 118649384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118649625 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 118649714 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118650012 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118650135 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118650180 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118650212 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 118650226 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 118650456 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118650467 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118650491 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118650519 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 118650569 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 118650691 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 118650951 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 118650979 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118651137 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 118651223 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118651247 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118651252 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118651373 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118651379 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118651384 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118651393 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118651490 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 118651551 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118651748 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 118651770 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 118651897 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 118651898 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 118651919 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118651992 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118652001 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118652048 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118652089 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118652309 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 118652320 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 118652665 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 118652730 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 118652785 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118652792 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118652813 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 118652867 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118652879 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118653043 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118653066 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118653130 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118653197 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118653296 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118653638 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118653660 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118653699 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118653785 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118653818 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118654190 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 118654244 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118654395 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 118654488 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 118654574 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118654592 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118655016 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 118655867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118655874 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118655922 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118655967 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 118656434 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118656556 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118656779 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118656810 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 118656907 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 118656918 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 118657692 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 118657780 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 118657942 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118658054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118658091 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118658223 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118658364 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 118658481 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 118658536 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118658619 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 118658688 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 118658704 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118658718 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 118658737 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 118658795 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 118658803 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118658848 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118659012 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 118659100 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 118659146 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 118659305 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 118659400 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118659450 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 118659653 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 118659807 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118660138 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 118660200 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 118660209 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 118660327 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118660521 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 118661542 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 118661989 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118662177 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118662627 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118662636 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118662640 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118662699 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118662942 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 118663598 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118664678 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118664777 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118664784 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 118665120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118665562 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 118666084 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 118666497 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 118666502 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 118666522 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118667010 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 118667122 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118667176 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118667544 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 118670186 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 118670602 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 118670701 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118670745 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118670882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118672171 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 118672326 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 118672950 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 118672955 A G Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 118672979 C T Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 118673327 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118673340 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118674014 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118674397 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118674583 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118676092 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 118676145 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118678074 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 118678606 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 118679441 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118679447 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 118679872 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 118680447 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118680486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118681171 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 118681176 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 118681794 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118682157 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 118682754 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 118683673 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118684318 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 118684755 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118684773 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118685165 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118685525 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118685566 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118685601 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 118685829 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118685850 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118685905 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118685966 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118686169 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118686382 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 118686537 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118686788 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 118687244 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118687393 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118688156 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 118689002 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118689240 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 118689395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118689529 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 118690167 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118690314 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118690351 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118690473 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118690601 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118691140 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 118691157 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118691193 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118691219 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 118691247 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118691278 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 118691376 G C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 118691407 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 118691437 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118691438 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 118691510 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 118691724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118691793 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 118691846 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118691868 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 118693140 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118694878 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118694917 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 118695126 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118695449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118695586 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 118696320 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 118696661 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118697425 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118697446 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118697476 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118698164 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 118698180 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 118698737 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118698781 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118698803 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118698832 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118699862 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 118700442 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 118701187 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118701216 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118701681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118702508 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 118702633 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118702675 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118702780 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118702834 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 118702924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118703110 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118703834 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 118703862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118703880 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118703949 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 118704157 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 118704174 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 118704287 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118704334 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 118704376 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118704390 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118704392 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118704406 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118704419 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118704481 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118704552 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 118704581 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 118704632 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118704849 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 118704997 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118705328 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118705374 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118705922 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 118706021 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118706548 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118706582 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118706768 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118706805 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118707173 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118707208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118708120 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118708536 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118708666 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118708718 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 118708769 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118708890 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118708980 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118709147 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118709366 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118709382 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118709500 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 118709655 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 118709656 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 118709773 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 118709784 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118709927 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118709937 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118709968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118709983 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 118710054 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 118710263 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118710320 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118710438 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118710542 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118710563 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 118710956 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118711438 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118711673 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118711744 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118711977 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118712097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118712111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118712241 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118712264 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118712285 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118712303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118712424 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118712433 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118712440 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118712563 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118712624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118712723 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118714046 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118715283 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 118715608 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118715709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118715751 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 118715834 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118715900 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 118716008 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118716043 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118716184 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 118716370 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118716456 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118716471 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118716531 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 118716745 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 118716840 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118716853 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 118717176 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 118717364 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118717427 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118717673 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 118718195 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118718434 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118718576 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118718874 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118719077 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118719188 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118719412 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118719416 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 118719615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118719645 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 118719781 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118719786 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 118719825 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 118720415 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 118720445 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118720543 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118720976 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118721036 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118721082 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118721097 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118721180 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118721405 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118721451 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118721523 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118721559 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118721620 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118722252 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118723236 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118723976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118724033 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 118724637 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118725390 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118725435 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118725902 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118726209 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118726274 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118728967 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118729095 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118729712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118729827 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 118731231 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118731650 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118731787 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118732307 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118732977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118733492 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118733603 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118733724 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118734029 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118734116 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118734516 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118734728 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 118734756 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118735147 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 118735283 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118735501 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118735707 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 118737251 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118738628 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118738770 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 118738904 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 118739053 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118739196 C G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 118739301 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118740444 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118741258 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118741268 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118741535 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118741673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118741751 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118741904 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118742315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118742396 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118742460 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118743226 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118743574 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118744417 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118744714 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118744822 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118745108 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118745478 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118746950 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 2 118747007 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 118747132 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 118747225 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118747545 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118747559 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118747572 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 118747853 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118748526 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118749615 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118750302 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118750556 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118750586 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118750759 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 118754212 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118754213 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 118754291 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 118754329 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 118754479 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118755062 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118755584 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118755618 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118756531 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118756676 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118756690 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 118756727 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118756736 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118756861 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118757023 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118757777 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 118757951 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 118757969 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 118758279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118758280 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118758458 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118758664 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118758882 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 118758995 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118759106 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 118759117 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 118759175 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 118759206 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 118759512 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118759774 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118759803 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118759828 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118761091 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 118761185 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118761809 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 118761876 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118761978 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118763287 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 118763460 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 118763550 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 118763669 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 118763674 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 118763740 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118763897 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 118763991 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118764128 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 118764293 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118764406 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118764457 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 118764810 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118764887 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118764912 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118765040 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118765247 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 118765735 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 118765798 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 118766405 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118766468 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118766633 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118767376 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 118767731 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118767992 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118768134 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118768495 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118770186 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 118770427 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118770596 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118771931 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118772166 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118772527 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118773147 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118773180 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118773431 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 118773790 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 118773822 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 118773876 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 118773978 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118774088 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 118774151 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118774643 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118774783 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 118775143 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 118775804 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118776381 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 118776388 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 118776398 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 118776596 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118776857 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 118777070 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 118777078 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 118777857 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 118778030 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 118778352 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 118778446 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118778461 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118778685 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118778946 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118779649 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 118779692 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 118779738 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118780201 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 118780715 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118780892 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 118781021 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 118781024 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118781092 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118781214 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118781224 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 118781228 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 118781289 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118781339 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118781577 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118781598 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118781837 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 118781933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118782015 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 118782071 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118782096 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118782150 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 118782310 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118782413 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118782540 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 118782619 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118782782 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 118782815 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 118782825 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118782832 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 118782839 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 118782850 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 118782853 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 118782861 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 118783026 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118783153 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118783397 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118783496 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118783635 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 118783646 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118783749 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118783840 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 118784017 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118784091 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118784193 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 118784223 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118784545 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 118784588 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 118784650 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118784873 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 118785013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118785571 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 118785824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118785851 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118785871 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118785879 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118786294 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118786793 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118787567 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118787675 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118787677 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118787856 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118788151 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 118788921 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 118789099 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118789312 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118789435 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 118789528 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118789600 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118789886 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118789983 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118790008 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118790052 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118790075 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118790159 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118790207 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 118790372 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 118790563 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 118790894 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118790897 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118790936 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118790948 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 118791071 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118791191 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118791224 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118791304 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118791378 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118791407 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118791606 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118791609 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118791913 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 118791940 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 118791949 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118791963 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 118792106 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118792127 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118792221 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118792495 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 118792503 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 118792903 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118792960 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118793040 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 118793635 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118793655 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 118793751 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118793757 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118793897 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118793911 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118793952 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118793988 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118794052 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 118794199 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118794302 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 118794632 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 118794823 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118794848 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118794978 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 118795029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118795144 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 118795153 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 118795230 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118795345 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118795430 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118795434 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118795528 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118795550 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118795606 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 118795613 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 118795643 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 118795875 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 118796685 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118797184 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 118797680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118797814 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118798336 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 118798667 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118799343 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118799489 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118799779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118800047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118800069 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 118800086 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118800577 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118802265 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 118802299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118802353 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118803122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118803428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118804496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118804982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118807326 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118807438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118807995 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118808499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118809049 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118809148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118810006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118810591 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118811612 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118812118 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 118812413 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118812471 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118812639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118812669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118812780 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118813744 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118814254 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 118816271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118816732 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 118817225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118817236 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118817245 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118818001 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118818555 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118818750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118818920 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118819720 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 118820169 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118820195 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 118820196 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 118820588 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118820607 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118821096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118821100 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118821150 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118821226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118821512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118821989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118822082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118822169 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118823241 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118823273 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118823290 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118823323 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118823415 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118823416 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118823571 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118823827 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118824027 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118824034 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118824122 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118824156 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118824352 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 118824517 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118824533 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 118824895 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 118824958 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 118825046 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118825058 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118825231 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118825296 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118825556 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118825700 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118825801 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118825953 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118826009 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118826062 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118826172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118826763 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118826848 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118826911 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118827068 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118827107 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118827132 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118827446 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118827447 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118827558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118828656 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118828826 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118829325 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118829413 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118829417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118829514 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118829543 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118829573 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118829995 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118830147 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 118830198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118830304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118830362 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 118830494 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118830666 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118830756 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 118830807 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118830887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118830888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118830992 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118831002 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118831010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118831079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118831086 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118831096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118831103 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118831203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118831305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118832454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118832488 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118833034 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118833235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118833275 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118833407 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 118833959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118833973 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118834054 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118834165 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118834166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118834255 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118834811 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118835179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118835252 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118835295 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118835302 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118835479 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 118835639 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 118835676 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118835681 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118835696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118835745 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118836219 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118836537 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 118836703 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118836978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118837014 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118837321 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118837652 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118837673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118837715 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 118837818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118837864 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 118837929 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118838072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118838720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118838864 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 118839349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118839735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118840946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118841490 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118841972 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 118842208 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 118842465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118842793 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 118842871 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 118843343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118843378 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118843799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118843992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118844268 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118844355 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118844532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118844560 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118844694 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118845025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118845036 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118845216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118845234 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118845519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118845608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118845625 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118845665 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 118845666 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 118845967 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 118845974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118846059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118846160 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118846370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118846764 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118846838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118846859 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118847113 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118847114 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118847252 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118847304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118847305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118847397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118847413 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118847503 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 118847533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118847552 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 118847791 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 118848094 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118848138 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118848219 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118848222 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118848391 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 118848968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118849019 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118849308 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 118849414 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 118849598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118849961 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 118850325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118850404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118850435 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118850494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118850514 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 118850585 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 118850715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118850729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118851251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118851356 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118851607 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118851822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118852257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118852263 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118852304 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118852383 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118852419 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118852733 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118853353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118853585 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118853593 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118854276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118854733 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118854800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118854811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118854963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118855489 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 118856245 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118856313 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 118856492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118856929 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118857323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118857329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118857537 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118857601 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 118857706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118857855 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 118857999 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118858991 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 118859043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118859070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118859181 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 118859251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118859673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118859807 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 118860005 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 118860221 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 118861418 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118861934 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 118861964 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118862159 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118862185 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118862207 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118862592 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118863166 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118863437 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118863474 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118863510 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118863575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118863739 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118863747 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118863823 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118863911 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118864771 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118864844 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118864894 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118864972 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118864990 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 118865222 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118865259 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118865511 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 118865689 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118865846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118865887 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118866039 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 118866120 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 118866310 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118866417 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118866656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118866739 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118866741 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118866914 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118867059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118867138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118867178 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118867227 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118867243 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118867256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118867258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118867269 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118867399 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118867418 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118867473 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118867516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118867663 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118867804 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 118867885 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118867944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118868280 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118868615 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118868725 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118868890 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118869021 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 118869082 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118869708 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 118870146 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118870281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118870461 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118870741 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 118870843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118870874 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 118870964 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 118870979 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118871273 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 118871429 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 118871444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118871508 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 118871538 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118872054 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 118872426 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 118873004 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 118873144 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118873344 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 118873450 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 118874007 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 118874258 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118874442 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118874556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118874599 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118874806 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 118874997 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 118875114 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 118875286 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 118875384 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 118876127 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 118876138 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 118876420 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 118876425 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 118876560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118876605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118876640 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 118876697 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 118876766 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118878335 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118878358 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 118878642 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 118878851 C A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 118878867 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 118878896 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118878951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118878996 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118879049 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 118879066 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118879104 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118879224 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118879546 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 118879562 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 118879843 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 118879919 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 118880128 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118880199 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 118880242 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 118880246 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 118880855 G C N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 118880857 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 118880967 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118881029 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 118881093 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118881103 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118881160 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118881418 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 118881456 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118881724 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 118881858 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 118881859 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 118881870 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 118881904 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118881914 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118881953 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 118882028 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 118882077 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 118882154 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118882239 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 118882512 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118882748 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118883202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118883269 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118883325 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 118883359 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 118883409 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118883457 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118883804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118883836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118883846 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 118883883 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 118883892 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118883914 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 118883994 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 118884036 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 118884106 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 118884430 T C N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 118884518 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 118884607 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 118884862 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 118885058 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118885374 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 118886382 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 118886819 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118886906 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118887024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118887107 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118887198 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118887252 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118887268 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 118887436 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118887482 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 118887590 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118887614 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118887785 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 118887895 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 118887972 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 118887973 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118888310 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 118888538 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 118888757 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118890036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118890078 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 118890263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118890386 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 118890899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118892659 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 118892741 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 118893157 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118893683 T G N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 118893688 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 118893788 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 118894395 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118894472 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 118894532 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 118894649 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118894962 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118895025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118895396 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118895680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118895710 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118896227 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 118896725 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 118897412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118897436 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118897454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118897467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118897683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118897832 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118897953 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118898259 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118898401 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118898428 A T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 118898540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118898849 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118899111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118899161 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118899211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118899299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118899304 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 118899475 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118899489 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 118899536 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 118899554 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 118899739 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 2 118899927 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 118899952 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118900101 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 118900114 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 118900151 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 118900167 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118900242 A C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 118900273 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118900371 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 118900400 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 118900909 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 118900970 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118901035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118901098 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118901143 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118901214 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118901581 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118902154 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 118902268 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 118902370 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 118902422 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118902557 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 118902565 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 118902866 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118903086 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 118903095 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 118903357 T C N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 118903390 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 118903543 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 118903883 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 118903925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118903928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118904182 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118904201 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118904272 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118904401 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118904403 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118904722 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 118904737 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 118904862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118904920 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 118905077 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 118905103 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 118905389 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 118905478 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 118905649 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 118905817 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 118905885 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 118905911 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 118905972 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118906083 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 118906201 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 118906222 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 118906252 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 118906396 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118906402 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 118906411 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118906559 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 118906560 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 118906576 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 118906654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118906915 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118907258 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118907496 C A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 118907523 T C Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 118907526 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 118907535 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 118907561 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 118907614 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 118907713 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 118907728 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 118907815 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 118907959 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 118908129 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 118908235 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 118908288 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 118908372 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 118908380 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118908426 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 118908536 G C Y N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 118908606 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 118909103 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118909114 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118909166 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118909186 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 118909216 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 118909264 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118909281 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118909387 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118909404 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118909816 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 118910028 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 118910160 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 118910182 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 118910225 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 118910309 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 118910420 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 118910447 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 118910821 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 118910935 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 118910959 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 118911062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118911107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118911156 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 118911243 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118911274 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 118911290 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 118911354 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118911362 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118911376 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118911377 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118911433 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118911650 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118911756 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118911764 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118911793 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118911896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118911901 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118912116 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118912120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118912210 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 118912445 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118912450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118912482 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 118912488 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118912499 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118912606 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118912719 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 118912925 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 118912969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118912970 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118913127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118913140 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118913579 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118913610 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118913633 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118913888 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118914101 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118914198 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118914203 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118914223 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118914465 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118914513 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 118914657 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118914931 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118914962 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 118915119 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118915159 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118915248 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118915265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118915805 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118916083 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 118916102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118916136 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 118916192 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118916305 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118916465 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118916506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118916513 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118916520 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118916555 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118916572 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118916759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118917003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118917094 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 118917135 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118917148 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118917262 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118917329 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118917469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118917725 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118917812 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118917895 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118918042 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 118918146 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118918186 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118918390 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118918441 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 118918501 A T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 118918555 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 118918579 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 118919143 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118919199 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118919603 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 118919605 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 118919624 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118921043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118922253 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118922308 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118922333 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 118922664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118922699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118923145 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118923480 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 118923931 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118923932 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118924292 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118924413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118924511 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118925007 C G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 118926680 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118927204 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118927488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118927493 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118927527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118927695 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118927993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118929065 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118929362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118929527 A T N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 118930725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118931248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118933627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118934139 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118934256 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118934288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118934352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118934844 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118934845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118934864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118934908 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118938408 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118938678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118939077 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118939635 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118939870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118941701 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118942453 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 118942953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118946382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118946953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118947131 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118947724 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 118947807 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118948903 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118949413 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 118949690 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118949757 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118950152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118951193 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 118951251 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 118951536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118951622 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118952047 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118952322 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118952456 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 118952482 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 118952485 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118952770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118953198 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118953203 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 118953214 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118953848 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118953900 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118954079 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 118954089 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118954448 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118954579 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118954695 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118954726 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118954786 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118955369 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118955395 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118955713 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118955808 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 118955896 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118956300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118956486 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118957360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118957500 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118957532 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118958081 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 118958167 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118958190 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 118958217 A C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 118958264 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 118958371 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 118958430 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 118958690 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 118958812 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 118958875 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 118959034 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118959574 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118959582 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118959615 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 118959729 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118960067 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118960224 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118960415 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 118961095 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118961545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 118961660 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 118961733 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 118961912 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118961992 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 118962147 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118962636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118962712 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118962788 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118962960 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118962970 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118963078 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 118963569 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118964332 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118964530 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118964586 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 118964903 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 118964918 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 118964987 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 118966351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118966354 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118967505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118967531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118967533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118968513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118968689 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 118969303 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118969415 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 118969447 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 118969796 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118970277 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118970800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118971248 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118971332 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 118971921 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118972084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118972544 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 118972807 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118972877 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118972926 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 118973632 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118973747 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118973799 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 118973957 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118973963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118974503 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 118974572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118974802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118975147 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 118975172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118975372 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118975616 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 118977335 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118977553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118977752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118977805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118978945 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 118979141 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118979425 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118979472 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 118979637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118980314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118980630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118980695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118981224 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118981439 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 118983756 G C N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 2 118984656 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 118984665 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 118984692 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118985026 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118985029 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 118985121 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 118985159 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118985221 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 118985646 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 118986291 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 118988421 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 118988968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118990958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118991176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 118991243 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 118991884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118991887 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 118991938 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 118992033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118993872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118994183 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 118994284 G C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 118994867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118995242 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 118995274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118995696 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 118996176 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 118997058 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 118997091 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 118997161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118997170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118997288 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 118998368 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118998396 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118998591 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 118998829 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 118998874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 118999118 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118999121 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118999136 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 118999207 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 118999439 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 118999531 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119000589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119000650 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 119000728 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119000772 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119000844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119001027 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119001789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119001881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119001980 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119002189 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 119002296 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 119002352 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119003146 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 119003191 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 119003481 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 119003500 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 119003543 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 119003603 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 119003653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119003685 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 119003839 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 119004347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119004373 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119004383 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 119004713 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 119004983 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119004986 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 119005025 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119005269 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119005385 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 119005401 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 119005645 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119006655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119006702 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119006811 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119006887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119006906 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119006929 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119006978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119007047 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119007138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119007499 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 119008169 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 119008527 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 119008560 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119008662 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 119008908 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 119010259 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119010889 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119011139 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119011143 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119011245 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119011279 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119011304 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119011350 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119011372 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119011514 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119012066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119012122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119012181 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119012737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119012917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119013001 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 119013183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119013219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119013362 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119013423 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 119013447 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119013452 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 119013819 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 119013996 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 119014256 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 119014493 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 119014693 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 119014795 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119015098 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 119015803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119017199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119017549 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 119017658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119017743 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 119017883 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 119018199 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 119018201 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 119019026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119019421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119019433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119019573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119019595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119019766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119020164 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 119020258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119021228 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 119021597 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 119022738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119022811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119023039 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119023040 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119023569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119023602 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119023628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119024011 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119024206 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119024317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119024953 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 119024983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119025019 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119025410 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 119025584 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 119025602 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 119025634 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 119025728 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 119025820 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 119025890 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 119026025 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 119026054 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 119026167 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 119026208 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119026283 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119026313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119026416 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119026417 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119026498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119026612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119026707 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119026714 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119026847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119026924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119026939 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119027033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119027476 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119027541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119027557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119027560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119027654 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 119027689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119027715 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 119027718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119027988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119028161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119028181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119028236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119028480 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119028653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119029374 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 119029421 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 119029475 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119029530 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119030042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119030091 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119030237 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119030496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119030840 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119031591 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 119032027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119032876 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 119033056 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 119033160 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 119034454 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119035130 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119035935 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119036531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119036535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119036962 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119036969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119038111 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 119038135 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119038154 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119038239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119038783 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119038784 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119039536 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119040030 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 119043320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119044255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119044271 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119045204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119045222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119045253 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119045912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119046239 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 119046282 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119046453 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119046513 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119046704 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 119047032 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119047039 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119047279 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 119047780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119047787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119047802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119048080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119048100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119048335 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119048559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119048576 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119048687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119048705 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119048797 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119049210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119050025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119050134 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119050143 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119050279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119050529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119050894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119051207 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119051214 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119051837 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119052000 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119052265 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 119052489 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119052511 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119052596 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119052661 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119052744 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119052757 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119052865 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119052898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119053037 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 119053070 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119053288 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119053671 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119053737 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119053885 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119054268 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119054270 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119054293 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119054319 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119054366 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119054374 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119054417 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119054907 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119054955 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119054967 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119054973 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119054987 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119055064 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119055545 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119055610 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119055673 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119055763 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119055800 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119055816 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 119056052 A C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 119056053 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 119056098 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119056983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119057408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119057456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119057548 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119058018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119058320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119058379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119058665 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 119059257 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119060192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119061567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119061851 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 119061962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119062411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119062879 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119063031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119063144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119063421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119064851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119065192 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119065367 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119066258 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119066634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119066696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119066851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119067448 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 119067518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119067627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119067628 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119067780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119067979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119068037 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119068046 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119068307 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119068778 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119068801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119068873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119068948 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119069225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119069404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119069558 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 119069704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119069713 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119069955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119070007 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 119070158 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119070159 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119070222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119070253 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 119070636 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119070827 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119071037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119072446 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119072487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119072967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119075420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119076641 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119077019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119077202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119077363 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119077589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119077924 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119078005 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119078058 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 119078154 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 119078202 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 119078327 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 119078337 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 2 119078432 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119078694 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119078762 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 119082575 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119082603 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119082615 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119082624 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119082650 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119082916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 119083146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119083807 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 119083942 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 119084124 C G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 119084125 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 119084181 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 119084596 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 119084924 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 119084926 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 119085026 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119085030 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119085079 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 119085296 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119085312 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 119085893 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119086038 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119086232 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 119086233 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 119086283 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119086366 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119086625 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 119086666 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 119086775 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119087046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119089499 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119089688 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119089707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119090894 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119091657 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 119092983 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119093731 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 119094266 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119094511 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 119094618 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 119096621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119096994 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119097257 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 119098046 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 119098612 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 119099353 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 119099452 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 119099716 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 119100749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119100929 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 119101005 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 119101136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119101665 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 119102798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119103548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119103638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119103735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119103791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119103814 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119103865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119104375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119104384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119104398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119104620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119104627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119104944 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119105007 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 119105025 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 119106066 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119106307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119106341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119106419 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119106528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119107313 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119107451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119108021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119108709 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 119108716 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 119109307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119109656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119110256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119110520 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119110558 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119111338 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 119111647 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 119112980 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 119113012 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119113335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119113350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119113552 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 119114103 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119114371 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119114419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119114596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119114650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119115113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119115240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119115600 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119116155 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119116160 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119116397 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119117514 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 119117802 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119117805 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119117813 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 119118076 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 119118350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119119121 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 119119634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119119667 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119121385 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119121390 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119121533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119122513 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 119122595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119124854 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119125102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119125922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119126213 T C N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 119126273 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 119127351 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119127690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119127815 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 119127821 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 119127973 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119128381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119128556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119128770 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119129309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119129438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119129782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119131852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119131863 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119132560 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119132978 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119133048 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119133183 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119135216 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 119135251 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 119136146 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 119136255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119137113 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 119138561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119138598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119138768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119139270 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 119139444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119139771 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 119140697 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 119142110 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 119142129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119142312 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119142513 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 119144195 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119144592 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 119144975 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 119146218 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 119146802 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 119146814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119146876 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 119147612 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119148565 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119150755 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 119156775 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119157170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119157285 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119157455 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119157712 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119158514 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119158845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119158925 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 119159123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119159231 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119159664 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119160493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119160973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119162660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119163219 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119163953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119164008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119164094 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119164126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119164237 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 119164241 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 119164363 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119164656 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 119164659 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 119164736 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 119164758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119164914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119165067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119165192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119165200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119165388 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119165405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119165430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119165752 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119165914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119166217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119166274 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119166291 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 119166321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119166322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119166524 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 119166597 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 119166625 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119167021 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 119167355 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 119167527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119167700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119167727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119168130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119168339 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119168614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119168647 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119168666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119169296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119169304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119169727 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119170141 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119170986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119171196 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 119171281 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119172092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119172282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119172356 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119172465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119172515 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119172535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119172949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119173007 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119173810 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119174084 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 119174213 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119174539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119174889 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 119175349 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119175383 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119175826 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 119175871 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119176111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119176242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119176954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119177111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119177833 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119177857 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119177883 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119178452 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119178604 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119178821 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 119180256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119180388 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 119180457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119181309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119181322 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 119181526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119182864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119182876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119183064 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 119183144 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 119183751 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 119183763 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 119184378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119185148 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119185156 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119185212 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119185255 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119185430 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 119185560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119185579 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119185719 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119185747 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 119185957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119186160 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119186290 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 119186340 G A N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 2 119186417 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 119186426 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 119186537 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 119186556 A G N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 2 119186558 G T N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 2 119186580 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 2 119186607 G A N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 2 119186952 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 119187074 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 119188314 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119188464 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119188680 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 2 119188744 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119188778 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119188789 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119188807 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119188810 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119188875 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119191270 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119193302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119194446 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119194554 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 119194933 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119195676 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119195685 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119195983 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119196067 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119196457 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119196529 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 119197064 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119197564 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 119198468 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119198474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119198703 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 119198724 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119199636 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119199744 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119201235 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119201323 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119202320 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119202337 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119202775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119204791 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119205076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119205989 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 119206716 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119206904 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 119206931 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 119207136 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119207339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119207378 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 119207803 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 119208567 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119208834 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 119209059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119210041 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 119210044 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 119210213 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 119210387 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 119211105 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 119211154 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 119211434 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119211471 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119211619 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119211788 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 119212060 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 119212064 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 119212319 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 2 119212962 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 119213130 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 119213939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119214218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119215285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119215436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119217164 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119218438 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119218964 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119219651 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119219777 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119220220 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119220889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119221955 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 119223019 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119223219 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119223773 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119224012 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119224203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119224296 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119224754 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119226170 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119226568 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 119226662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119226731 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 119226850 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 119227855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119228285 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 119228655 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119228985 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119229080 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119229201 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 119229393 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119229417 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119229826 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 119229881 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 119229996 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 119230678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119230997 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 119234357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119234514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119235070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119235091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119235669 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119235672 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119235721 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119239081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119239515 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119240049 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119240101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119240228 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119240229 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119240748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119241388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119241389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119242302 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119243095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119244040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119245345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119245402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119246781 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 119247582 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119249321 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119249878 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 119250018 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119252922 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 119254396 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119254430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119254519 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 119254632 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119254717 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119255063 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119255066 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 119255088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119255110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119255124 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 119256012 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119256017 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119256911 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 119257057 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 119257343 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119257519 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119257599 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 119257600 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 119258306 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 119258321 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 119258385 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 119258566 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 119258734 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 119258918 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 119259040 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119259179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119259221 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119259285 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 119259416 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 119259450 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119259535 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 2 119260608 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119260638 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 119261163 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119261919 A C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119261994 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 119262113 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 119263400 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119263440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119263750 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119264457 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119264929 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119265040 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 119266517 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 119266923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119267036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119267052 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119267918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119269402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119270072 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119270889 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119271913 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 119272090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119272125 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119272382 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119272415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119273056 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 119274261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119274380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119274836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119274958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119274998 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119275389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119276187 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119276981 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119277232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119277841 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119277875 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119277890 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 119278855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119279052 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119281488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119282703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119282759 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 119284485 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 119284790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119284827 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119284837 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119285307 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119285516 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119285971 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 119286187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119286260 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 119286480 A C N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 119286698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119287049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119287237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119287424 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119287668 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119288035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119288402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119288756 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119288968 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119289095 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119289482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119289520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119289770 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119289800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119290359 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119290578 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119290846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119290939 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 119292249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119292284 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119292487 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119292699 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119292889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119293028 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119294154 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119294682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119295345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119295407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119295465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119295735 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 119296154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119296282 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 119296308 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 119296410 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119296666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119297087 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 119297839 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 119298205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119298527 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119298915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119299031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119299546 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 119300454 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119300479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119300954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119300981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119301157 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119301364 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119301809 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119301815 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 119301843 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119301844 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 119304562 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 119304920 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119304957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119305044 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119305899 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 119306275 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119306652 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119306703 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 119306865 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119306977 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 119307033 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119307047 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 119307172 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119307619 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119307717 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119307729 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119308136 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119308677 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119308850 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119308873 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 119308970 A C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 119309116 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119309358 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 119309424 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119309446 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119309555 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 119309586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119309765 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119309891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119310012 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119310016 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119310181 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 119310226 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119310229 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119310619 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 119310856 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 119310931 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119311007 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 119311183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119312532 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 119312536 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 119312699 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 119312711 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119312728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119312934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119313107 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 2 119313220 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119313259 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119313291 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 119313317 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 119313330 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119313342 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 119313536 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119313648 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 119313656 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 119313765 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 119313923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119314026 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119314632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119314653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119314673 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119314701 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119314867 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119315388 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 119316189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119316410 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119316537 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119316709 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119317559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119317674 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119318037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119318369 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 119318508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119318589 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119318678 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119318849 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119319035 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119319133 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 119319536 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119319537 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119319872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119319907 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119319940 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 119320383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119320480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119320497 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 119320518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119320536 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 119320778 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 119321472 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119321717 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119321769 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 119321780 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 119321937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119322104 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 119322105 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119323039 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119323502 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 119325161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119325189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119325487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119325703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119325977 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119326634 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119326672 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119326896 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119327190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119327374 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119327387 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119327399 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119327449 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119327474 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119327482 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 119327531 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 119327615 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 119327767 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 119328006 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 119328088 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 119328143 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 119328215 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 119328220 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119328480 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 119328482 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 119328570 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 119328829 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 119329365 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 119329869 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 119329897 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 119330045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119330707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119330863 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 119330993 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 119331027 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 119331045 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 119331156 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 119331179 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 119332044 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119332610 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119332777 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119332824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119333520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119333732 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119333737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119333959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119334539 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119334679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119334703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119334864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119334885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119334909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119334995 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119335820 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119335879 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119335927 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119336190 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 119336256 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119338084 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 119338113 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 119338206 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119338668 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119339371 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119340099 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119340409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119341127 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119341229 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 119341293 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119341384 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119341430 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119341526 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119341796 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119342074 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 119342376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119342987 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119342999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119343044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119344104 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 119344159 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119344679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119344884 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119344912 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 119345272 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119345998 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119346321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119346388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119346491 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119346924 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119347111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119347213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119347614 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119347735 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119347767 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119349133 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119349173 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 119349286 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119349839 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 119349840 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 119349886 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119349899 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119349905 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119350046 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 119350434 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119350589 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119350924 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119350947 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119351159 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119351250 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119351866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119351884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119352189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119352227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119352480 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119352746 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119352839 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 119353052 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 119353829 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 119353886 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 119354196 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119354737 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119355060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119355142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119355949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119356063 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119356147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119356404 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119356434 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119356452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119356495 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 119356663 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119356666 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119356766 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119356956 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119357196 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 119357237 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119357296 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119357313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119357374 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119357490 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119357505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119357632 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119358382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119358446 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119358510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119358513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119358928 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119359532 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119359551 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119359940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119360030 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119360139 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119360352 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119360754 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119360765 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119360867 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119360981 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119361112 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119361157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119361581 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119361723 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119361992 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119362007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119362015 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119362037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119362104 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119362922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119362938 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119363001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119363100 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 119363335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119363356 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 119363703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119363935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119363944 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119363971 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119364274 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119364301 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119364363 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119364614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119364941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119365053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119365253 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 119365266 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 119365284 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119365309 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 119365406 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119365534 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119365576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119365594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119365692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119365700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119365999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119366311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119366319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119366335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119366388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119366407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119366417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119366427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119366461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119366497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119366508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119366510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119366703 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119366854 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119366992 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119367236 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 119367446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119368006 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 119368339 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119368389 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119368422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119368457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119369424 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 119370124 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119370205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119370872 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119370906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119371148 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119371236 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 119371468 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119371607 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 119371636 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 119371779 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119371821 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119372178 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119372783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119372784 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119373303 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119373447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119373985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119373996 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119374114 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119374455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119374530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119374588 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119374591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119374908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119375503 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119375874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119376114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119376331 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 119376462 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 119377229 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119378151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119378601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119378861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119380069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119380374 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119381596 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119381615 C G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 119381906 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 119382585 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119382994 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 119384009 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 119385062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119385180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119386270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119387106 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119387346 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119387440 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 119387486 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119387489 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119388320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119388344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119388389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119389369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119390016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119390251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119390487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119390565 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 119390966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119392079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119392280 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119392620 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119393631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119394059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119394375 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 119394474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119394484 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119394993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119395411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119395802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119396132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119398373 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119398628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119400019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119400651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119401114 A T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 119402775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119402941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119403750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119404935 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119405166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119405208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119405744 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119406043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119406808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119407520 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 119407556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119408108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119408970 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 119409682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119410131 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119410820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119410851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119413227 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119413482 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 119413565 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119414368 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119415635 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119415968 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119416005 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119416651 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119417269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119417791 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 119418159 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 119418351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119418369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119418573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119418628 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119419509 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119419538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119419807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119420196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119420229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119420529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119420928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119421014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119421144 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119421857 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 119421883 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 119422859 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119422905 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119423082 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119423145 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 119423893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119425860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119426346 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119427471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119428066 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 119428091 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119428109 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 119428139 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119428614 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119430519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119431614 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119431723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119432050 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119432154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119432280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119432363 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119432634 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 119433087 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 119433772 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119434038 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 119434840 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 119434984 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 119435287 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 119435299 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 119436391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119436966 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119437130 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119437369 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119437737 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119437909 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 119438170 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 119438403 A G Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 119438509 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 119438882 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119438948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119439221 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119439442 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 119440748 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 119441379 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 119441441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119441891 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 119442419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119442523 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119442572 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119442680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119442867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119443121 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 119443717 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119443841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119444433 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119444498 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119444547 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119444574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119444819 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 119444834 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 119445070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119445220 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119445535 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119445620 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119445632 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 119446168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119446189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119446275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119446934 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119447118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119447262 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119447300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119447719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119448412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119448441 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119448603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119449037 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119449191 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119449358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119449649 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119449724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119451281 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119452399 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119452597 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119453102 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119454350 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119454717 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119454905 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 119455281 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 119455294 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 119455351 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 119455409 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 119455508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119455679 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119455776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119455777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119455844 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119456074 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 119456353 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119457412 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119457523 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119457593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119457613 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119457785 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119457808 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 119457894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119458115 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119458418 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 119458645 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 119459162 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119459342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119459547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119459696 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119459936 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119460399 T C Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 119460721 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 119460723 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 119460801 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 119461197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119461238 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119461516 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 119462125 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119462154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119462168 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119462390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119462428 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119462721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119462860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119463099 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119463176 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119463450 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 119463474 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 119463533 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 119463910 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119463967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119464018 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119464064 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119465125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119465809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119465935 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119466840 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119466862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119467410 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119468027 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 119468051 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119468702 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 119469080 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 119469081 A T N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 119469251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119469352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119469917 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119470080 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 119471086 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 119471333 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 119471448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119472011 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 119472138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119472611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119472809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119472810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119472890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119473015 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119473039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119473112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119473379 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119474105 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119475302 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119475501 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 119476284 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 119476840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119477795 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119477879 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119478007 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119478218 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119478880 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119481167 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119482353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119484106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119484572 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119487607 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 119488506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119488636 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119489131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119489164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119489730 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119492076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119492157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119492405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119492617 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119494510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119494833 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119495130 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119495739 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119495745 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119495860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119496590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119496843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119497723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119498237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119499088 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 119499806 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119501196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119502819 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 119503941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119504043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119504490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119505588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119506721 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119507084 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119507094 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119507373 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119507777 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119507826 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119508959 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 119509145 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 119509690 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 119509916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119510062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119510535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119510607 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119511038 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119511695 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119513166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119513383 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 119513741 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 119513931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119514060 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119515105 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119516290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119516581 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119516630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119517375 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119518297 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119518506 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119518601 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 119518718 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 119519004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119519326 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119519450 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119519564 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119519643 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119520349 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 119520598 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119521450 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119521467 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 119521961 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119522260 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119522266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119523359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119523376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119523525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119523753 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 119524565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119524799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119524931 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119525521 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119525556 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119525855 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 119526409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119526513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119527014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119527439 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119527733 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119527800 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 119528282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119528322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119528749 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 119528862 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119529214 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 119529367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119529803 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119529822 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119530046 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119530095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119531248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119532064 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119532117 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119532213 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 119532225 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 119532449 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119532458 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119532611 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119532634 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119533447 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 119533749 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119534038 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119534059 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119534394 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 119534558 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119534755 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119534792 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 119534812 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 119534909 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 119535246 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119535273 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119535375 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119535465 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119535486 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119535519 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119535570 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119535710 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119535832 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119535886 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119536020 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119536029 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119536117 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119536492 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119536651 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119537128 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 119537169 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119537312 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119537374 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119537715 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119537736 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119538074 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119538080 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119538152 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 119538170 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 2 119538290 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119538295 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119538331 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119538533 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119538567 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119538758 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119538801 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 119538873 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119538921 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 119539142 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119539461 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119539670 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119539872 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119540076 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119540083 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119540665 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 119540726 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119540832 A T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 119540904 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 119541057 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 119541074 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119541782 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119541797 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119542159 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119542164 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119542234 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119542492 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119542791 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 119543206 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119544007 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119544098 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119545432 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 119545557 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119545807 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119545872 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119546153 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119546418 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119546424 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119546455 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119546547 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119547238 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119547664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119547878 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119547917 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119548064 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119549106 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119549626 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119549776 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119550270 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 119551064 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119551242 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119551668 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 119551717 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119551747 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119552224 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 119552239 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119552608 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119552612 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119552853 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119552873 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119552877 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119552891 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119553244 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119553362 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119553409 T G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 119553525 A T N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 119553692 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119553693 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119553862 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119553975 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 119554044 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119554088 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119554398 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119554488 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119554603 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119554730 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119554847 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 119554979 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 119555007 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119555250 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119555392 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 119555400 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 119555418 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119555450 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119555503 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119555521 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119555554 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119555656 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119555822 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119555852 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 119555860 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 119555985 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119556137 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119556213 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119556272 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119556320 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119556387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119556598 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119556599 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 119556830 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119556972 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119557193 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119557287 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119557315 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119557400 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119557542 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119558830 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119559511 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119559677 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119560035 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 119560792 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119560797 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119560827 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 119561216 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119561228 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119561790 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119562011 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119562024 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119562150 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119562164 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119562180 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119562545 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 119562799 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 119562848 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 119563328 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119563408 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119563411 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 119563550 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119563836 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119564008 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 119564025 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 119565238 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 119565344 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119565369 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119565440 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119565789 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 119565859 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119565860 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119565908 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119566621 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119567282 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119567437 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119567720 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119568789 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119568792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119569623 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119570299 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 119571322 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119571543 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119571734 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119572221 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119572566 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119572896 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 119573150 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 119573165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119573169 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 119573243 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 119573811 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 119573812 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119573824 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 119574007 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 119574048 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 119574072 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 119574156 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 119574165 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119574295 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119574316 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 119574813 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 119576166 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119576167 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119576364 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119577026 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119577163 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119577380 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119577707 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119579136 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119579446 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119580567 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119580712 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 119581049 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119581213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119581509 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 119581515 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 119581521 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 119581620 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 119581663 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 119581806 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 119581824 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119581878 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119582000 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119582370 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119582514 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119582869 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 119582883 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 119582924 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119583299 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119584167 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 119584698 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119584728 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 119584981 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 119585052 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 119585404 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 119585618 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 119585842 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119586831 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119587260 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119587573 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 119587831 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119587953 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 119588003 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119588306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119588688 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119588709 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 119588731 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119589176 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 119590257 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 119591224 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 119591441 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 119591911 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119592088 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 119592143 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119592146 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 119592274 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119592508 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 119592700 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 119593073 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119593874 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119595433 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119595548 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119595806 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119596329 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119597176 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119597320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119598023 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119598505 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119598792 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119598936 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119599103 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119599122 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119599206 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119601545 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119601980 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119602012 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119602219 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 119602220 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 119602394 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 119602505 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119602546 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119602761 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119603254 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119603265 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119603400 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119603431 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119603580 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119604123 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119604127 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119604143 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119604297 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 119604554 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119604557 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119604666 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 119604688 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119604702 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119605224 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119605241 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 119605920 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119606276 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 119607013 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 119607650 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119607676 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119608897 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119608901 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119610177 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119610343 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 119610527 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119611103 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119611534 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119611686 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119612023 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119612048 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119612176 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 119612188 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119612280 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119612515 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 119612615 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119612704 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119612890 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119613081 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119613245 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 119613502 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119613504 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119613628 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119613630 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119613680 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119614133 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 119614134 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 119614144 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 119614211 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119614328 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 119614364 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 119614481 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119614575 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 119615074 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119615143 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119615203 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119615356 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119615749 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119615789 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119615860 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 119615881 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119615931 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119616171 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 119616413 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 119616420 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 119616604 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 119617186 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 119617291 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 119617362 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 119617403 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 119617649 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119617714 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119617722 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119617868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119617880 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119617968 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119617969 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119618020 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119618063 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119618251 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119618391 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 119618633 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119619015 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119619173 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119619178 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119619197 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119619357 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119619363 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119619396 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 119619878 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119620006 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119620601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119620663 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 2 119621604 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119621917 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119622112 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 119622336 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119624328 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 119625876 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 119626586 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 119627689 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119628754 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 119629435 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119629930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119629994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119630361 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 119630380 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119630411 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119630716 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119631144 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 119631232 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119631235 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119631704 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119631790 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119631794 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119631811 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119631820 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119631834 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119631850 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119631892 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 119632101 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119632236 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119632262 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119632347 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119633184 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119634294 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119634470 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119634620 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119634634 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119634906 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 119635082 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119637092 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119637146 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119637288 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119638155 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119638292 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 119638970 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119640982 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119641671 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119643487 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119643743 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119644094 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119644117 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119644542 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119644662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119645132 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 119645334 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 119645443 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119645533 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119645778 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 119646665 A T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 119646676 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 119647046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119647537 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 119648087 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 119648666 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119648709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119648775 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 119648852 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119649009 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119649044 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 119649062 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 119649243 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119649320 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119649788 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119649886 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119650166 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119650327 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119650381 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119650477 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119650568 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 119650588 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 119651028 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119651217 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119651218 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119651482 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119651508 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 119651647 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 119652125 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119652263 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119652273 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119652632 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 119652683 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119652740 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119653199 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119653668 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119653676 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119654033 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 119654108 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119654627 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119654653 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119654732 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119655172 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 2 119655821 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119655991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119656271 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 119656436 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119656570 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119656644 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119656691 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119657381 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119657482 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 119657515 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119657639 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119657857 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119657950 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119658044 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119658098 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119658118 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119658211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119658496 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119658531 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119658706 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119658717 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119658758 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119658759 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119658769 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 119658961 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119659422 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119659447 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119659453 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119659468 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119659710 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119659765 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119659842 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119660028 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119660094 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119660135 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119660179 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 119660629 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119660650 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 119661048 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119661060 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119661104 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 119661107 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 119661147 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 119661441 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119661629 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119662025 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119662115 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119662989 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119662999 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119664077 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119664400 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119664609 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119664624 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119664669 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119664720 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119664732 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119664753 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119664761 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119664875 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 119665002 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 119665173 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 119665243 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 119665663 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119665705 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119666194 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119666505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119666597 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119666906 C A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 119666972 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 119667572 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 119667632 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119667893 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119667926 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119668044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119668892 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119668928 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119669311 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119670477 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119670851 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119670977 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119671095 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119671106 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 119671693 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119671710 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119671818 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119672003 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119672190 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119672317 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119672442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119672727 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119672947 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119673843 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119674166 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 119674317 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 119674352 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119674554 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119674583 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119674738 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119674800 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119675158 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119676409 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119677389 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119677497 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119677727 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119677928 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 119677943 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 119678178 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119679050 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 119679116 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119679122 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119679321 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119679804 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119680242 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119680278 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 119680320 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119680332 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119680358 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 119680367 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119680523 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 119680666 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119680716 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119680722 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119680804 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 119680811 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 119681070 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119681087 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 119681212 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119681761 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119682179 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119682889 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 119683059 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119683127 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119683514 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119683774 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119684340 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 119684826 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119685174 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 119686028 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 119686744 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 119687068 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 119687419 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119687559 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119687926 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119688136 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119688206 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119688392 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119688498 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119688510 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119688549 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119688709 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119688788 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119688927 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119688950 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 119689147 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 119689472 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 119689484 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119689497 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119689654 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119689699 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119691093 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119691329 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119693392 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 119693590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119694554 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119694705 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 119694882 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 119694925 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119694926 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119695129 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 119695135 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119695141 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 119695147 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 119695159 C A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 2 119695370 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119696265 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119696404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119697452 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 119699728 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119700904 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119701042 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119702772 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119703174 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119703263 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119703280 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119703437 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119703689 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119704347 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 119704479 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 119705666 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 119705746 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 119706851 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 119709204 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 119709398 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119709881 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119711323 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119711349 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 119712198 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119712513 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 119713400 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119714292 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119715106 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119717209 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119717637 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119718639 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 119718761 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119718794 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119719140 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119719372 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 119720620 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119720899 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119721018 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 119723491 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119726455 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119726551 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119726700 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119726764 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119726796 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119727442 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 119728636 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119729634 G C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 119730896 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 119730971 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 119732468 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119733845 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 119734028 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 119734101 G C N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 119735548 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 119735554 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 119737082 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119737316 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 119737441 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 119738552 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 119738872 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119739090 G T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 119739233 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 119739577 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119739858 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119740072 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119740427 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119740730 T G Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 119742803 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119742893 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119743579 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119744792 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119745502 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119746169 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 119747328 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119747691 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119748739 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119749454 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119750848 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119751044 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119751514 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119751524 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119751557 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119751599 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119752511 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119752856 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 119752895 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119752924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119753171 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119753450 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119754086 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 119756734 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119757096 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119757502 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119757730 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119759034 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119762137 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119762425 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119762447 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 119762801 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119762833 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 119762859 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 119763654 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 119766065 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119768179 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119768969 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 119769058 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119769325 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119769501 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 119769507 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119769532 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119769917 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119770605 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 119771010 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 119771090 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119772261 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119772313 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119774406 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 119774548 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 119775433 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 2 119775861 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 119776555 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119776735 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119777935 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 119778005 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119778138 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119778597 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 119779266 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119779372 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 119780305 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 119780739 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119781895 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 119782567 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 119782777 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119782787 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119783487 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119784333 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119784516 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 119784642 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119785364 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 119785579 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 119785865 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 119786566 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119786969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119787014 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119787038 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 119787448 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119787705 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119788302 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119788409 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 119789600 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 119790038 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119790150 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119790305 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119790594 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119790601 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119790997 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119791316 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119792798 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119792844 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 119793183 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 119793236 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 119793848 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 119793975 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119794116 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119794375 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119794602 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 119794638 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 119795006 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119795152 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 119795157 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 119795281 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119795358 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 119795708 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 119795754 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119795862 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 119796086 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 119796225 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119796592 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119797813 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 119797941 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119798000 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119798005 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119798476 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119798483 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119799001 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119799005 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119799149 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119799499 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119799703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119800343 C A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 119800408 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119800578 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 119801683 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 119802118 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119802465 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119802466 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119802556 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119802812 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 119803714 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119806682 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119809599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119809930 T G N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 119810377 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119811794 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119811857 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 119812011 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119812605 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119812714 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119812762 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119812833 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119812934 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119812957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119812992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119813027 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119813057 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119813128 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119813186 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119813309 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119813743 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119813774 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119813943 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119813953 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119813981 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119814018 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119814076 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119814105 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119814211 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119814744 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119814783 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 119814821 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 119814855 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119814995 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119815140 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119815395 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119815457 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119815470 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119815562 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119815603 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119815690 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119816033 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119816069 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119816239 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119816452 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119816544 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119816574 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119816720 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119816869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119816910 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119817256 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 119817490 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119817643 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119817647 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119817704 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119818770 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 119818790 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 119819403 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 119819680 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119819824 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119819952 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119820085 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119820374 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119820396 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119820717 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 119820724 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119820776 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 119820902 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119821059 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119821881 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119822577 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 119822826 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119823063 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119823208 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119824613 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 119824699 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119824991 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119825498 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119825530 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119827372 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 119828501 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119828518 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119830351 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119830956 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 119831293 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119832303 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119832404 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119832445 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119832640 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119833212 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119833445 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119833989 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119834824 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119834825 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119834875 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119834931 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119835384 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119835397 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119835411 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119835963 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119836353 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119836370 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119837140 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119837504 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119837562 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119837912 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119838013 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119838229 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119839585 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119839703 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119839705 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119840220 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119840279 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119840902 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119841016 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119841342 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119841581 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119841677 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 119842046 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119842370 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 119842793 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119843065 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119843704 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119843772 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119843998 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119845820 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119846551 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119846613 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 119846799 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119847031 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 119847261 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119847294 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119847706 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119848950 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 119849832 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119850336 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119850399 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119850850 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119850944 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119851115 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119851210 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 119851317 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119852314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119853718 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119853809 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 119854498 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 119854655 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119855365 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119855383 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119855475 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119856755 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 119856801 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119858094 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119858717 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119859174 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119859379 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119859418 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119861480 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119863874 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119863916 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119864010 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119864522 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 119865353 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119866288 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119866750 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119868600 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119868632 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119868979 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 119869198 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 119869749 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119870275 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 119870794 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119871874 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119871961 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119873109 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119873543 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119873801 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119873876 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119873879 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119874423 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119874483 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119874643 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 119874664 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 119874786 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119875126 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119878484 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 119878562 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 119880191 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119880308 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119880335 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119880863 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119880980 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119881007 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119881208 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119881280 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119881460 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119881496 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119881721 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119881735 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 119881817 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119881983 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 119882457 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119882557 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119882628 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 119882932 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119883227 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119883369 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119883494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119883728 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119883860 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119884041 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119884108 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119884415 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119884634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119885060 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119885368 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119885392 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119885528 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119885550 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 119885846 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119886437 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119886552 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119886608 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119886738 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119886771 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119886809 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119886881 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119887003 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119887045 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119887070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119887097 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119887183 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119887185 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 119887218 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 119887238 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 119887406 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119887484 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 119887498 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119887554 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119888747 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 119888885 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 119889123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119889186 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119889299 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 119889820 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119889848 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119889851 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119889939 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119889971 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119890056 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 119890156 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 119890157 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119890181 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 119890235 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119890377 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119890703 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119890774 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119890936 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119891931 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 119892063 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119892708 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119892719 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119892793 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119892868 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 119892891 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 119892933 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 119893048 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119893090 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119893802 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 119893825 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 119893965 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 119894100 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 119894256 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119894369 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 119894516 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 119894553 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 119894583 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 119895581 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119896625 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 119896724 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 119896876 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119896900 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119897529 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119898493 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 119899164 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 119899227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119899346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119899401 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 119899643 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 119899704 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 119899807 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119900491 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 119901449 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 119902235 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119902603 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119903329 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 119903507 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 119903790 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 119903885 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 119904710 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 119904720 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 119904725 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119905008 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119905545 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 119906918 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119906937 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119908644 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119908876 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119909651 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119910422 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 119911080 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119911109 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119911607 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119911674 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119911743 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 119911936 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119912096 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119912207 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119912408 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119912409 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119912504 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 119912659 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119912715 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119913033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119913069 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119913086 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119913118 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119913133 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119913144 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119913403 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119913415 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119913739 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119913889 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119913893 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119913936 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119913971 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119914094 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119914571 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119914582 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119914593 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119914616 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119914719 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119915576 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119915608 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119915859 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119915874 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119916302 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119916580 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119916802 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119918082 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119918157 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119918220 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119918237 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119918301 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119918395 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119918478 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119918479 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119918491 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119918492 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119918512 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119918620 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119918742 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119918773 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119918805 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119918894 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119919139 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119919620 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119919690 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119920547 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 119920659 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119920771 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119921043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119922294 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 119922548 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 119922913 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119923517 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 119923575 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 119923729 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119923794 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119924256 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119924351 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119924441 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119924526 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 119924781 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119924804 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119924829 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 119924943 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119925154 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119925162 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119925389 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 119925443 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 119925485 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119925620 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119926337 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119927275 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119927296 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119927342 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119927348 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119927359 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119927455 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 119928195 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 119928505 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119928538 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119928723 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 119928749 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119928843 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119928879 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119929315 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 119929458 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119929888 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119930019 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119930592 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119930651 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119930978 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 119931651 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119932531 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 119933108 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119933187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119933631 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 119933783 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119933785 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119933931 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119934421 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119934566 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119934592 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 119935147 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119935229 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119935247 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119935323 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119935361 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119935428 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 119935435 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 119935456 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119935466 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 119935536 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119935560 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119935596 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119935666 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119935682 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119936099 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119936315 T G Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 119936892 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119936898 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119937096 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119937148 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119937253 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119937444 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119938221 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119938337 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119938630 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 119938758 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119938859 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119938881 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119939135 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119939423 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119940060 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119940389 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119940628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119940688 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119940702 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119940791 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119940835 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119941246 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119941273 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119941334 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119941452 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119941487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119941503 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119941538 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119941552 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119941699 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119941735 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119941761 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119941762 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119941802 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119941847 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119941877 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119941910 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119942042 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119942176 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119942320 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119942471 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119943167 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119943208 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119943951 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 119944802 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119945145 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119945344 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119945352 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119945370 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119945613 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119945734 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 119945935 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119946157 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119946542 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119946647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119947006 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119947467 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 119947811 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119947988 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119948366 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119948414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119948441 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119948462 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119948535 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119948745 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119948887 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119949035 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 119949191 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119949320 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119949584 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119949597 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119949673 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119950191 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119950362 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 119950383 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119950389 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119950473 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 119950584 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119950706 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119951662 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 119952010 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 119952050 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119952619 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 119953531 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 119954170 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 119954275 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 119954774 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119954811 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119954949 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119955143 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119955196 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119955219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119955256 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119956038 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119956197 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119956388 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119956634 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119956973 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119957078 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 119957278 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119957411 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 119957503 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119958128 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119958140 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119958640 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119958897 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 119959398 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119959551 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119960087 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119960485 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 119961018 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119961104 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119961209 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119961592 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119962020 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119962047 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119962049 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119962207 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119962337 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119962922 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 119962947 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119962960 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119963081 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119963224 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119963730 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119964757 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119965019 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 119965454 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119967742 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 119968302 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119968349 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119968711 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 119968821 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119969261 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119969709 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119969752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119970535 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119970585 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 119971076 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 119971171 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119971981 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 119973225 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119974276 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119974956 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 119975135 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 119975148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119975239 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 119975257 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 119975359 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 119975921 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119976024 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119976062 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 119976493 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119977225 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 119977368 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 119977641 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119977827 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119977837 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 119978129 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119979267 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119979278 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119979363 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 119980439 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119980462 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 119980502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119980795 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119980836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119980969 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119981410 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 119981779 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 119982146 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119982477 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 119982676 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 119982775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119982897 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119982937 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119983033 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119983068 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119983075 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119983277 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 119983452 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119983467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119983912 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119983947 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119984274 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119984372 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119984881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119984910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119985327 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119985736 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 119985744 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 119986903 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119987498 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119987518 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 119987815 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119987836 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119987991 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119988166 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 119988279 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119988336 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119988388 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 119988482 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119988570 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 119988575 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 119988585 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 119988620 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119988755 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119988902 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119988918 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119988976 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 119990404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119990727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119990861 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 119991141 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 2 119991162 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 119991261 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 119991303 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 119991585 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 119991952 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119992062 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 2 119992063 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 119992161 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 119992371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119992687 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 119992799 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119992866 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 119993077 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 119994491 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119994665 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119994726 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119994829 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119994953 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 119994955 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 119995017 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 119995022 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 119995102 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 119995216 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119995519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 119995573 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119995636 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 119995709 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119995991 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119996055 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119996366 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119996474 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119997065 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119997089 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119997312 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 119997422 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119997881 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119998087 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 119998513 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119998526 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 119998658 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119998716 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 119998828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 119998859 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 119998891 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119998914 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119998945 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119999140 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 119999238 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119999540 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 119999592 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 119999649 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120000061 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120000199 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120001176 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 120001241 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120001376 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 120003020 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120003036 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 120003049 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 120003539 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120003679 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120004021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120004118 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120004136 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120004310 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 120004614 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120005358 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 120005757 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 120005928 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120006014 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120006120 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120006158 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120006429 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 120006431 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 120006560 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120006798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120006919 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120006948 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120007305 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120007442 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120007714 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120007742 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120007967 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120008091 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120008832 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120008855 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120008974 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120008987 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120009010 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120009016 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120009023 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120009295 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120009523 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120009631 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120009754 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 120009833 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 120009867 T G N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 120010380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120010452 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120010529 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120010553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120010628 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120010697 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120010912 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120011022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120011159 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 120011367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120011704 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 120011935 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 120012054 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120012165 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120012206 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120012260 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120012360 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120012510 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120012585 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120012596 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120012629 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120012758 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120012798 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120013075 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120013153 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120013286 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120013352 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120013460 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120013474 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120013647 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120013658 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120013673 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120013770 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120014023 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120014424 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120014431 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120014664 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120014734 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120015185 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120015354 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120015369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120015467 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120015645 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120016690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120017207 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120017296 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120017515 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120018084 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120018272 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120018918 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120018938 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120019364 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120019398 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120021323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120021412 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120022388 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120022405 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120023196 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120023245 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120023395 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120024286 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120024959 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120025071 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120025108 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 120025126 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 120025378 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 120025379 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 120025653 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120026099 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120026181 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120026223 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120026416 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120026490 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120026540 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120027071 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120027122 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120027172 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120027176 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120027196 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120027200 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120027450 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120029015 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120029119 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120029736 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 120029891 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120030342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120030807 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120031277 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120031383 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120031407 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120031685 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120031820 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120032117 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120032206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120032646 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120033582 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120033680 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120034016 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120034068 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120034096 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120034106 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120034293 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120034317 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120034322 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120034490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120035011 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120035089 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120035725 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120035742 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120036271 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 120036434 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120036628 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 120036676 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120037027 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120037696 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120037712 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120037775 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120037847 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120037907 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120037960 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120037977 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120038026 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120038310 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 120038461 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120038506 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120038560 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120038689 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120038847 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120039233 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120039646 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120040004 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120040217 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120040555 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120040938 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120040969 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120040978 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120040992 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120041241 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120041292 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120042285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120042302 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120042456 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120042476 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120042506 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120051140 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120051236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120052609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120052893 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120053737 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120054489 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120056321 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120056459 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120058427 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120058644 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 120058683 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 120058701 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 120058979 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 120061901 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120061974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120062157 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120063148 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120063190 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 120063808 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120063905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120064039 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120064407 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120065438 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 120065483 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120065508 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120065637 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120065825 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120066235 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120066325 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120066395 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120066549 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 120066852 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120067006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120067272 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120067388 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 120067405 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120067523 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 120067537 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 120067579 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 120067719 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120067735 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120067743 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120067753 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120067754 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120067849 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120067860 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120067991 G T Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 2 120068015 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 2 120068136 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 120068140 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 120068268 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120068568 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120068715 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120069483 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120069643 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120069824 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 2 120069860 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 120069945 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120069970 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 120069982 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 120069984 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 120070042 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 120070043 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 120070162 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 120070212 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120070337 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120070428 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120070445 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120070491 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120070547 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120070559 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120070648 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120070809 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120070823 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120071077 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120071098 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120071247 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120071364 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120071380 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120071383 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120071427 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120071522 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120071563 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 120071777 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 120071904 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 120072006 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120072042 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120072282 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120072292 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120072487 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120072571 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120072573 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120072649 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120072684 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120072836 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120072873 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 120072889 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120072966 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 120073184 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120073265 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120073394 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 120073685 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 120073708 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120073721 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120073858 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120073914 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 120074260 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 120074261 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120074340 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120074428 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120074441 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120074562 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120074607 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 120075253 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 120075358 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 120075435 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 120075480 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 120075731 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 120076271 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120076309 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120076344 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120076554 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120076559 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120076592 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 120076690 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120076723 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120076774 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120076829 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 120076844 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120076931 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120077394 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120077437 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 120077602 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120077623 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120077641 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120077664 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120077734 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 120077759 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 120077763 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 120077856 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120077911 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120077926 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120077965 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120078012 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120078080 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120078152 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120078382 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120078442 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120078453 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120078489 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120078697 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120078717 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120078718 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120079020 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120079084 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120079113 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120079194 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120079225 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120079268 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120079310 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120079320 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120079331 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120079352 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120079440 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120079507 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120079550 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120079890 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120080223 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120080296 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120080527 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120080623 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120081064 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 120081109 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 120081223 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120081571 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120081858 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120081974 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120082162 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 120082308 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120082595 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 120082694 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 120082718 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120082741 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120082792 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120082852 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 120083335 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120083600 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120083715 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120084138 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120084363 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120084752 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 120085396 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 120085570 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120085927 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120085961 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120086463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120086585 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 120088493 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120089812 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 120091679 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120092913 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 120092922 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120094004 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 120095111 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 120095554 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120095868 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120095933 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120096118 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 120096151 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120096206 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 120096239 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 120096310 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 120096534 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 120096629 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120096633 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120096688 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120096725 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120098261 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120099018 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 120100121 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120100891 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120102429 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120102643 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120104149 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 120106302 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120106620 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 120106753 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 120106841 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 120108262 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120108497 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120108641 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120109170 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120109856 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120110625 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120110846 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120111206 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120111209 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120111282 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120111479 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120111804 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120111812 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120111975 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 120112439 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120113613 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120114877 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120115687 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120115960 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120117351 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120119249 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120120153 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120120305 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120120443 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120120869 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 120121009 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120121020 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 120121076 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120121177 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120121216 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120121410 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120123824 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 120124919 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 120125136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120125752 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 120126585 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 120126667 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 120126712 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120126858 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 120127147 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 120127217 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 120127500 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 120127680 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120127733 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120127846 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 120127895 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120127942 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120128175 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 120128376 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 120128421 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 120129573 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 120129801 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 120130066 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 120130245 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 120130284 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 120130596 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120130603 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120131371 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 120131404 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 120131573 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120131777 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 120131790 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 120132186 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 120132912 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 120133051 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120133181 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120133188 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 120133287 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120133324 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120133488 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 120133848 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 120134209 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 120134236 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 120134313 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 120134647 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 120134767 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 120135418 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 120135973 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120135976 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 120136243 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120136258 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 120136456 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 120136547 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 120136653 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120137151 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120137336 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 120137386 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 120137532 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120137551 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120137606 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120137652 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120138776 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 120138841 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120140012 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 120140712 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 120140931 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 120141046 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120141108 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 120141253 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 120141287 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 120142073 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120142496 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120142506 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120143515 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120143674 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120144392 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120144649 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 120144734 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 120144760 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120144876 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120145099 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120145105 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120145113 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120145332 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120145345 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120145346 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120145476 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 120145787 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 120145837 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120145857 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 120145871 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 120145909 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120146044 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120146107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120146254 T G N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 120146889 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 120146986 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120147650 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120147887 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 120147958 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 120148030 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 120148176 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120148229 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 120148601 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120148694 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 120149005 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120149942 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 120149975 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120151086 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120151459 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120152095 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 120152119 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 120152268 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120152405 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120152482 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120152528 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120152533 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120152684 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120152700 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120152732 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120152968 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120153297 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120153341 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 120153934 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 120154044 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 120154063 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 120154780 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 120154867 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 120155992 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120156040 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 120158173 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120158199 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 120159716 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120160329 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120163271 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120163273 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120163418 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 120163797 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 120163827 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 120163881 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120164542 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120165470 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120165858 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120166328 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120166473 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120166693 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 120166697 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 120167263 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 120167405 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120167620 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120167629 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120167859 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 120167892 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120168163 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 120168220 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 120168718 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120169271 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120169420 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120169680 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120170141 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 120170426 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120170831 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 120171850 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120172858 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 120175127 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120177044 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120177538 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 120177799 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 120177877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120177955 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 120178359 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120178620 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 120179138 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 120179369 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120179514 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 120179752 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120179844 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 120179988 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120181184 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120181991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120182037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120182654 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 120182660 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 120182764 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 120184183 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 120184283 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120185058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120186367 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120186835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120187200 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120187353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120187739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120187791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120188485 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120189662 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 120191892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120192141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120192377 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120192406 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120192471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120196658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120197397 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120198591 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120199059 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120199407 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 120200596 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120200608 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120200819 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 120200901 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120200949 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 120200955 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 120200967 T A Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 120201332 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120202245 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120202417 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120202678 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120202711 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120202722 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120203433 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120203852 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120203925 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120204084 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120204486 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 120204522 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120204824 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120205284 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120205950 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120205970 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120206010 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120206034 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120206143 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120206417 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120206788 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120207262 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 120207346 G C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 120207842 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120208069 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 120208329 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120208413 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120208431 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120208449 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120208795 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120208853 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120208923 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120209109 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 120209164 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 120209186 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120209417 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 120209503 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120211592 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120211696 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120212134 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120212397 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120212605 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120213213 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120213634 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 120213850 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 120214009 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 120214071 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 120214072 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 120214824 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120214878 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120214892 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120215231 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120216250 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 120216297 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120216722 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120217059 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 120217245 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 120218089 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 120218437 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120218589 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 120218920 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120220014 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120220027 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120220350 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120220544 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120221034 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 120221487 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120221722 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 120221806 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120222067 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120222170 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120222789 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120223057 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120223614 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120223623 T G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 120223690 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120223941 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120224236 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120225185 T G N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 120225622 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 120225740 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 120226290 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 120226365 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120226581 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120226867 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120227330 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120227726 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120227831 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 120228187 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120228365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120228413 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120228677 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 120229206 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 120230760 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120230865 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120231222 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 120231325 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120232512 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 120233101 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 120233136 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 120233271 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 120233503 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120234771 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 120234980 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 120235210 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 120236024 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 120236297 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 120236504 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 120236684 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120236873 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120236961 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 120236973 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 120237197 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120237477 G T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 120237705 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 120237716 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 2 120237995 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120238036 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 120238059 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 120238154 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120238380 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120238402 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 120238425 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 120238512 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 120238514 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120238529 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120238711 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120238748 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 120238789 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 120238805 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120238818 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 120238913 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 120239199 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120239279 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120239387 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 120239397 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120239426 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 120239432 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 120239737 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 120239817 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 120239828 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120239873 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 120239924 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120239984 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 120239993 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120240064 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 120240224 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 120240513 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 120240657 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120240908 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 120241068 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 120241231 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120241309 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 120241381 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120241478 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120241583 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120241670 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120242036 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120242733 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120242911 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120243019 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120243242 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120243269 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 120243365 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 120243383 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120243464 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 120243521 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 120243635 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 120244262 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120244288 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120244573 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120244810 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 120244825 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 120245362 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120245432 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 120245512 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 120245593 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120245815 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120245857 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 120246003 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120246025 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120246103 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120246229 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 120246243 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 120246451 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120246570 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 120246596 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120246598 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120246663 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120246699 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120246732 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120246755 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120246814 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120247048 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 120247101 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 120247226 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120247247 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120247385 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 120247544 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120247801 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 120247970 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 120247972 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 120248128 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120248429 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 120248474 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120248582 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 120249389 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120249617 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120250000 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 120250909 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120251049 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 120251303 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120251502 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120251640 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 120251885 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 120251907 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 120252096 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120252245 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 120252351 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 120252421 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120252525 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120252584 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120252741 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120252816 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120253177 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120253195 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120253212 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 120253219 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120253256 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120253379 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120253380 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120253618 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 120253626 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 120253973 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120254661 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120254723 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120254747 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120254806 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 120254878 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120255175 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 120255375 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 120255773 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120256479 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120258489 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120258853 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120258924 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120259200 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120259374 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120259718 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120260015 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120260292 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120260329 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120260494 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 120260751 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120261031 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120262836 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 120263332 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 120263631 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120263639 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120263866 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 120263867 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120263904 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120264349 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120264391 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 120264456 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120264467 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120264563 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 120264645 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 120264676 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 120264743 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120264967 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 120265164 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120265289 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 120265687 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120265812 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120265820 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 120266041 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 120266322 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120266544 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120266686 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 120266784 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 120267015 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120267157 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120267269 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120267404 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 120267416 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120267448 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120267457 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 120267885 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 120267896 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120267981 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120268000 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 120268075 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120268230 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120268328 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120268369 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120268431 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120268497 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120268534 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120268562 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 120268784 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120269055 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120269122 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 120269513 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 120269539 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120269770 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120269812 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120269828 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120269849 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120269887 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120269902 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120269944 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120270002 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120270034 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120270312 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120270408 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120270781 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 120271077 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 120271355 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 120271380 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 120271399 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120271406 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120271417 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120271424 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120271662 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120271995 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120272297 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120272320 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120272337 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 120272494 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120272513 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120272696 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 120272991 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 2 120273197 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 120273221 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 120273247 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 120273274 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 120273307 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 120273337 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 120273367 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 120273416 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 120273426 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 120273438 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 120273494 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120273563 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120273577 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120273688 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120273704 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120273721 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 120273739 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120274037 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 120274222 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 120274300 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 120274337 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 120274357 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 120274425 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 120274427 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 120274449 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 120274457 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 120274468 C G N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 120274567 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 120274674 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 120274695 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 120274753 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 120274840 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120274852 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 120274900 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 120274955 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 120275268 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120275292 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120275343 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120275348 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120275360 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 120275518 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120275592 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120275667 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 120275702 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120275792 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120275808 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120275855 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120275950 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120276257 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120276338 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120276598 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120276642 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 120276654 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120276972 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120276986 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 120277035 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 120277205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120277402 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120278704 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120278784 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120279003 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 120279322 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 120279359 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 120279560 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120279874 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 120279909 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 120279943 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 120280768 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120281428 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120281565 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 120281647 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120281664 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120281690 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120281817 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120281837 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 120281854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120282058 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 120282230 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 120282256 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 120282331 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 120282591 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 120282631 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 120282668 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120282768 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120283004 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120283210 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 120283232 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 120283319 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 120283340 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120283430 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 120283556 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 120283619 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 120283665 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120283678 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 120283680 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 120283818 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120283911 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 120283940 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 120284004 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120284032 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 120284073 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 120284365 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 120284458 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 120284523 C A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 120284524 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 120284741 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 120284964 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120284970 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120285052 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 120285283 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 120285350 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 120285370 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 120285383 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 120285391 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 120285415 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120285416 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 120285427 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120285471 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 120285497 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 120285598 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120285629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120285672 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120285751 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 120285803 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 120286040 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 120286256 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 120286274 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 120286285 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 120286383 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 120286406 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 120286485 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 120286671 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120286698 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 120286794 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120286869 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120286910 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 120286920 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 120286947 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 120287051 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120287143 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 120287220 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120287287 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 120287341 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120287365 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 120287368 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120287462 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120287485 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120287517 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120287544 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120287685 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120287934 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120287957 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120288046 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120288561 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 120288568 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 120288583 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 120288588 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 120288716 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 120288732 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120288747 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120288779 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120288802 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 120288829 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 120288914 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120288953 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120289037 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120289074 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120289144 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120289163 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120289176 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120289194 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 120289336 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120289338 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120289366 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120289433 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 120289541 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 120289591 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120289647 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 120289740 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120289743 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 120289805 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120289965 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 120290036 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120290163 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 120290214 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120290682 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 120290936 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 120291469 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120291500 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120291741 C A N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.444444444444444 0 0.555555555555556 8 10 4 0 5 2 120291906 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 120292119 C G N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.454545454545455 0 0.545454545454545 10 12 5 0 6 2 120292798 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.454545454545455 11 11 5 1 5 2 120292847 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.444444444444444 0 0.555555555555556 8 10 4 0 5 2 120292966 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0 0.5 10 10 5 0 5 2 120293316 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0 0.5 10 10 5 0 5 2 120293422 C T N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 2 120293724 G A N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.375 0 0.625 6 10 3 0 5 2 120293852 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.4 0 0.6 8 12 4 0 6 2 120293969 C A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0 0.5 10 10 5 0 5 2 120293999 T G N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 2 120294095 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0 0.5 10 10 5 0 5 2 120294179 T A N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.4 0 0.6 8 12 4 0 6 2 120294398 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 120294933 T C N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.375 0 0.625 6 10 3 0 5 2 120295155 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.444444444444444 0 0.555555555555556 8 10 4 0 5 2 120295925 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.5 0 0.5 12 12 6 0 6 2 120296092 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.363636363636364 0 0.636363636363636 8 14 4 0 7 2 120296565 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.5 0 0.5 12 12 6 0 6 2 120296731 G T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.454545454545455 0 0.545454545454545 10 12 5 0 6 2 120297022 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.4 0 0.6 8 12 4 0 6 2 120297104 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 120297118 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 120297596 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 120297600 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 120297689 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 120297922 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 120298533 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 120298805 G C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 120300069 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 120300109 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 120300506 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 120300595 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120300622 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120300640 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120300884 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 120300897 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 120300967 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120302496 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120302546 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120302584 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 120302915 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120303013 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120303034 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120303100 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120303105 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120303364 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 120303418 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 120303730 A T N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 2 120303740 T A N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 120303914 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 120304045 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 120304180 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 120304388 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 120305148 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 120305196 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 120305238 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 120305290 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 120305557 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 120305560 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 120305568 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 120305573 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120305690 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 120305721 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 120305812 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 120305859 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 120305993 C G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 120306044 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 120306046 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120306334 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120306719 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 120306932 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120307076 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120307187 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120307374 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120307697 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120307774 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 120307797 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 120308624 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120308639 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120308858 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 120308909 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120308964 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120308983 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 120309052 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 120309059 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120309867 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120310019 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120310132 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 120310205 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 120310214 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 120310847 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 120310953 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120311525 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 120311526 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 120311628 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120312089 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120313135 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120313514 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 120313530 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120313727 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120313821 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120313935 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 120314300 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 120314393 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120314476 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120314491 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 120314703 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120314716 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120314764 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120314857 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 120314991 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120315191 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120315241 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120315344 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120315443 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120315559 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 120315564 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 120315752 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120315804 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 120316649 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 120316969 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120317228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120317626 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120317897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120318139 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120318171 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 120318483 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120318692 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120319069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120319218 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120319351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120319387 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120319536 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120319776 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120319790 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120320279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120320833 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120320839 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120320946 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120321008 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120321082 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120321110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120321148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120321817 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120321919 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120322038 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120322048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120322308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120322358 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120322380 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120322608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120322710 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120322899 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120323078 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120323257 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120323909 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120324490 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120324628 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120325603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120326246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120326412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120326523 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120326607 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120326870 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120326890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120327105 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120327130 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120327144 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120327168 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120327371 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120327656 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120327746 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120328412 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120328426 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120329226 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120329605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120329648 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120329896 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 120329966 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120330090 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120330091 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120330113 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120330158 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120330175 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120330300 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120330637 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120330643 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120330693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120330770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120330916 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120330983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120331787 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120336013 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120336052 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 120336177 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 120336590 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120336591 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120336604 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120336661 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120336706 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120336742 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120336881 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120337817 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 120338177 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120338774 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120339038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120339279 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120339664 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120339709 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120340033 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120340295 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120340461 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120340609 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120340984 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120341406 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120341455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120341888 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 120342002 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120342279 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120342542 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 120342667 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 120343274 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120343682 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120344219 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120344331 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120344379 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120344414 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120344526 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120344537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120344539 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120344974 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120345044 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120345592 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120345619 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120345779 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120345849 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120345989 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120346353 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120346447 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120346486 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120346561 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120346687 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120346730 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 120346758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120346799 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120346825 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120346912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120346925 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120347313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120347339 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120347434 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120347638 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120347771 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120347779 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120347815 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120347985 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 120348153 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120348638 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 120348708 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 120348916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120348944 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 120349076 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120349187 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120349266 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120350810 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120350866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120351265 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120351688 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120351922 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120352165 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120352331 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120352895 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120352906 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120352926 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120353078 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120353157 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120353269 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120353416 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120353675 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120354633 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120354670 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120354692 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120354706 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120354897 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120354905 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120355183 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120355248 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120355296 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120355305 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120355378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120355433 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 120355464 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120355611 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120355697 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120355713 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120355920 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120356453 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120356630 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120356676 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120356896 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120357085 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120358027 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120358057 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120358639 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120359030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120359098 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120359581 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120359677 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120359699 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120359741 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120359755 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120359764 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120359994 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120360075 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120360153 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120360455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120360945 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120360973 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120361567 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 120361568 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 120361588 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 120361822 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120361826 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120361854 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120362034 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120362300 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120362503 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120362575 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120362958 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120363234 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 120363552 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120363562 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120363596 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120363670 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120363735 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120363844 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120363876 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120364080 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120364224 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120364226 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120364409 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120364472 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120364619 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120364725 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 120364765 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120364822 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120364845 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 120365847 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120366167 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120366298 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 120366326 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120366376 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120366436 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120366482 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120366519 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120366524 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120366812 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120366896 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120367055 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120367302 A C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 120367526 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120367531 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120367702 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120367707 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120368006 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 120368440 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120368540 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120368550 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120368835 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 120368931 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120369070 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120369283 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120369300 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120369436 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 120369494 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 120369501 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 120369545 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120369779 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120369801 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120369865 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120369922 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120370212 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120370219 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120370536 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120370820 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120370865 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120370984 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120371064 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120371066 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120371299 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120371315 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120371362 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120371475 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120371482 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120371716 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120371835 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120372090 T C Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 120372493 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 120372559 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 120373040 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120373103 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120373241 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120373278 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120373311 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120373348 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120373543 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120374014 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120374042 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120374083 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120374183 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120374215 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120374450 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120377784 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120378268 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120378485 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120378629 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120378847 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120379320 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120379785 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120380408 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120380606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120381629 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120382555 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120382736 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120383434 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120383676 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120383693 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120383732 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120383840 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120383946 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120384045 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120384375 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 120384603 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120384706 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120384943 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120385847 C G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 120385874 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120386797 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120386969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120387809 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120388101 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120388507 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120388766 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120388801 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120389122 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120389691 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120389769 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120389788 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120390021 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120390149 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120390522 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120391375 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120391573 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120391806 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120391987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120392037 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 120392042 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 120392127 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120392604 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 120392829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120393245 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120393349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120393857 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120394531 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120394818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120394835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120395105 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120396744 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120398040 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120398647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120398669 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120399162 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120399495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120400251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120401033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120401785 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120402083 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120402281 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120403170 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 120403182 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 120403484 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120403638 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120404151 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120404310 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120404522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120405053 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120405066 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120405100 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120405104 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120405234 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120405372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120405720 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 120405956 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120406426 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120406471 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120406950 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120406996 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120407079 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120407182 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120407558 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120408052 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 120408175 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120408252 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120408367 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120408409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120408441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120408482 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120408591 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120408641 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120408695 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120408736 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120408935 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120408990 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120409413 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 120409501 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120409659 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120409815 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120409967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120410492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120411011 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120411072 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120411233 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120411406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120411484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120413610 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 120413854 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120414585 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120414880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120415993 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120417696 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120418590 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120418665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120419415 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120420105 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120421239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120421830 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120425713 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120426893 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120428213 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 120428886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120429385 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120429644 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120429796 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120430650 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120432402 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 120433169 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120433703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120434264 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120434482 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120435786 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 120436133 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120436144 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120436423 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 120436788 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120436978 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120437098 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120437166 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120437325 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 120437400 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 120437589 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 120437664 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120437665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120437794 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0 0.944444444444444 0.0555555555555556 17 19 0 17 1 2 120437876 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120438164 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120438282 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120438374 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120438397 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 120438453 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120442147 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120442424 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120442583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120442625 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120442707 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120442987 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120443005 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120443347 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120443903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120444896 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120445560 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120445795 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120446106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120446163 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120446728 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120446783 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120446794 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 120446881 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120446892 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120446898 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120446920 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120446934 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120447198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120447538 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120447690 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120447846 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120447998 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120448918 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120450164 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 120451079 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 120451478 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120451599 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120451755 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120451995 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120452511 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120452757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120452819 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 120453321 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 120453325 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 120454377 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120454607 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120455943 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 120456635 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120456680 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120456983 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120457084 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120457306 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120457560 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 120457640 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120457909 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120458499 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120458512 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120458519 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120458699 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120459274 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120459818 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120461211 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120465083 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120465420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120465770 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120465860 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120465872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120466461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120467540 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120467590 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120467968 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120467992 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120468413 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120468781 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120469073 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120469439 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120469767 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120469772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120469847 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120470756 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120470775 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120470826 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120471246 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120471631 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120471659 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120471733 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120471758 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120471835 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120472059 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 120472346 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120472379 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120472388 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120472477 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120472655 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120472715 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120472757 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120472888 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120472894 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120472931 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120473527 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120473530 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120475881 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 120476018 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120476228 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120476352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120476569 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120477081 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 120477190 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120477303 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120477331 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120477411 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120477656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120477754 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120478498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120478898 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120480599 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120480676 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 120480844 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120480950 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120481097 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120481319 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120481391 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120481495 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 120481515 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120481640 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120481671 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120481684 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120481707 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120481726 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120481744 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 120481749 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120481765 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120481857 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120481867 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120481896 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120482211 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120482219 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120482259 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120482318 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120482525 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120482560 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120482650 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120482652 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120482686 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120482738 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120482817 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120482860 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120482920 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120482987 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120482988 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120483121 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120483136 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120483246 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120483281 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120483327 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120483378 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 120483411 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120483492 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120483497 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120483535 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120483555 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120483562 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120483629 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120483743 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120483993 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 120484027 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 120484188 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120484608 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120484630 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120484678 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120484708 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120484718 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120485061 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120485158 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120485297 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120485307 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120485621 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120485632 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120486005 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120486220 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120486252 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120486356 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120486428 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120486499 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120486579 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120486659 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120486847 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120487094 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 120487245 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120487467 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120487685 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 120488128 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 120488409 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120488432 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 120488441 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 120488505 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120488613 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120488671 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 120488794 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 120488802 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 120489025 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 120489063 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120489208 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120489376 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120489377 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120489989 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120490260 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120490261 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120490904 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120492681 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120493717 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120493890 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120494271 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 120494400 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 120494541 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120494561 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120494672 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120494978 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120494982 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120495051 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120495135 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120495269 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120495319 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120495376 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120496166 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120496243 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120496253 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120496262 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120496444 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 120496475 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120496579 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120496738 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120496757 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120496893 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120496930 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120496935 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120496956 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120496976 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120496983 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120497053 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120497613 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120497807 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120498117 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 120498262 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120498293 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120498399 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120498540 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120498776 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120498838 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120499063 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120499760 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120499859 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120499885 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120499895 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120500098 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120500111 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120500215 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120500222 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120500244 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120500758 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120501050 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120501298 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120501581 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120501691 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 120501757 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120501804 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120502135 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120502149 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120502770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120502978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120503150 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 120503417 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120503440 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120503927 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 120503965 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120504004 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120504030 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120504119 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120504274 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120504398 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120504537 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120504801 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120504882 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120504987 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120505018 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120505128 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120506023 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120506068 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120506087 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120506094 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120506756 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120506770 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120506877 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120506878 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120507794 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120508556 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120508648 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120508769 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120509020 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120509057 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120509695 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120509706 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120509721 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120509733 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120509878 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120509942 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120510083 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120510174 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120510527 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120510533 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120510753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120510936 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120510978 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120511268 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120511353 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120511367 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120511394 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120511416 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120511452 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120511501 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120511530 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120511532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120511727 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120511861 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120511893 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120511974 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120512008 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120512022 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120512076 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120512120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120512414 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120512588 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120512623 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120512647 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120512713 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 120512722 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 120512949 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120513239 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120513264 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120513280 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120513368 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120513376 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120513392 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120513588 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120513703 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120513732 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120513739 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120514061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120514086 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120514294 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120514328 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120514841 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120515284 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120515305 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120515342 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120515453 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120515574 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120515591 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120515904 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120515962 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120516175 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120516222 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120516228 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120516365 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120516490 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120516665 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120516698 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120516723 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120516731 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120516786 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120516848 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120517007 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120517020 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 120517271 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 120517399 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 120517870 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 120517982 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120518153 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 120518251 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120518267 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120518391 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120519132 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120519253 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120519381 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120519554 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120519627 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120519692 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120519812 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120519866 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 120519942 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120520571 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120520697 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120520712 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120520804 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120520883 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 120521360 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120521377 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120521390 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120521668 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120521726 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120522137 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120522200 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120522389 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120523425 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120523730 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120523833 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120523941 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120523956 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120524090 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120524131 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120524365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120524378 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120524615 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120524959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120525005 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120526316 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120528791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120528840 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120529265 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120530009 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120530220 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 120530405 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120530435 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120530512 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120530520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120530569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120530570 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120530714 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120530895 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120531017 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120531018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120531031 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120531639 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120531703 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120531926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120531939 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120531946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120532916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120533102 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 120533363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120533581 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120533668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120533919 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120534044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120534801 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120534973 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120535506 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120535677 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 120535932 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 120535979 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 120536020 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120536067 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120536086 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120536601 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120537440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120537925 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 120538891 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120539405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120539497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120541193 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120541225 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120542366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120542467 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120543195 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120544086 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120544854 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120545231 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120545409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120545962 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120546125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120549233 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120549793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120550033 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120551037 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120551059 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120552638 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120553184 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120554026 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120554576 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120554964 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120556601 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 120557276 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120557818 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120558035 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120558233 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120558234 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120558327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120558339 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120558401 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120558901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120558936 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120559089 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120559218 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120559228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120559591 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120559912 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120559956 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120559988 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120560765 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120561036 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 120561042 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120561312 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120561506 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120561587 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120561829 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120561835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120562464 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120562484 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120562529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120563793 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120564183 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120564255 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120564290 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 120564298 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120564520 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 120564710 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 120564726 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 120564932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120564979 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120565051 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 120565150 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120565355 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120566100 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120566290 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 120566397 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120566608 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 120567110 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120567196 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 120567201 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 120567344 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120567421 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120567428 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120567432 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120567641 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 120567800 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 120568026 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 120568279 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120568280 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 120568301 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 120568375 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 120568536 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120568614 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 120568912 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 120569164 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120569427 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120569999 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120570154 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120570404 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120570675 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120570998 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120571081 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120571249 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120571356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120571552 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120571717 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120572928 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120573315 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120573319 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120573525 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120573606 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120573740 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120573973 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 120574080 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 120574852 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120575018 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120575032 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120575068 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120575396 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120575591 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120575647 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120575691 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120576219 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120576259 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120576710 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 120576738 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 120576746 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 120577014 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120577045 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120577046 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120577351 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120577598 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120577679 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120577816 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120577856 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120578170 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120578216 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120578331 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120578743 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120578998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120579647 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120579899 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120580008 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 120580104 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 120580105 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 120580419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120580439 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120580944 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120581109 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120581692 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120581799 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120581869 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120581949 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 120581950 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 120582257 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120582553 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120582761 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 120582775 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 120583200 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 120583403 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120584074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120584075 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120584716 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120584947 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120585896 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 120586168 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120586514 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120586955 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 120587655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120587780 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120587912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120587942 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120588133 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 120588258 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120588568 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 120588903 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120589022 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120589114 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 120589200 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 120589803 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120589981 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 120590292 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120591276 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 120591329 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120591767 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 120592104 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 120592575 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 120592701 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 120592822 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120592845 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 120592858 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120594393 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120594432 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120595397 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120595548 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120596154 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120596958 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 120597126 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 120597221 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120597510 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120597647 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 120597659 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 120597794 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 120598379 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120598383 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120598404 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120598426 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120598433 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120598958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120599313 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120599375 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 120599376 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 120600126 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120600171 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120600432 G T Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 120600659 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 120600737 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 120601074 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 120601146 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 120601441 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 2 120601505 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 120602175 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 120602508 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120602512 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 120602529 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120602538 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 120602900 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 120602977 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120603138 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120603809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120604376 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120604699 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120604819 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120604899 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120604995 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120605736 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120606377 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120606548 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120606582 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 120607293 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120608159 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 120608310 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 120608588 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120609503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120610090 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 120610297 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120610579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120610623 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120611123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120611672 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120611693 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 120611832 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120612052 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 120612422 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 120613929 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120614534 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120614804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120614808 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120615850 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120616150 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120616789 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120617111 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120617623 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120618924 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 120619334 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120619567 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120619570 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120620045 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120620167 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120620322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120620346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120620667 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 120621188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120621268 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120628496 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120628762 C G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 120629900 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 120629983 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 120631013 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120631467 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120633916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120635057 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120635586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120635847 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120636020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120638475 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120638793 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120638901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120639408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120646976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120647315 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 120647407 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120648996 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120649616 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120650707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120651179 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120651872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120652925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120653754 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120654353 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 120654479 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120654527 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120655532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120655651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120656070 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120656261 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 120657542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120657630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120658070 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120659259 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120661715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120662213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120662679 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120664119 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120664780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120665718 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120666634 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120666994 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120667031 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120667628 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120667827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120668406 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120668468 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120668607 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120669132 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120669435 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 120669707 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120669724 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 120669743 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 120670265 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120671161 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120671892 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120671894 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120673919 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120674013 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 120674034 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120674998 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120675625 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120675987 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 120676724 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120677139 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120677168 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120677888 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120678585 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120678589 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120678724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120678927 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 120679355 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 120679690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120679708 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120679710 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 120679838 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 120680636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120681551 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 120682888 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120683199 G C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 120683551 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 120683943 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120684751 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120685333 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 120685780 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120686555 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120687190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120687745 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120687939 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 120690531 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120690779 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120692130 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120692738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120693208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120693707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120693729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120694533 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120694741 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 2 120694770 C T Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 120695168 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120696139 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 120696219 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120696469 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120696794 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 120697324 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120697599 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120697627 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120698080 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 120698137 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120698189 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120698265 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120698419 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120698537 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120698626 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 120699262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120699525 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120700076 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120700220 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120700723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120700946 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120701016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120701309 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120701454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120701951 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 120702786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120702809 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120703927 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120704427 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120705226 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120706183 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120706540 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 120706720 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 120707066 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 120707237 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 120707347 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 120707733 G A N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 2 120708633 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120708801 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 120709395 A T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 120709451 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 120709755 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120710247 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 120710366 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120710712 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120710824 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120711058 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120711248 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120712933 A C N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 120713129 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 120714461 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 120714559 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 120714912 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120715459 A C N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 120715604 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120715727 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120715815 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120716032 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120716114 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120716368 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120716673 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 120716676 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 120716781 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 120716836 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 120717080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120717142 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120717655 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120718571 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 120718749 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120720186 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120720478 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 120720936 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120721376 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120721863 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 120722370 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 120722754 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120722897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120723010 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120723185 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120723213 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120723384 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120723712 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120724903 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120725086 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120725745 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120725833 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120726281 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120726785 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 120726822 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120727645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120727659 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120727831 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 120727862 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 120728073 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 120728122 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 120728278 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120728453 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120728512 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120728641 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120728969 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 120729163 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 120729235 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 120729418 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120729548 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120729572 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120729584 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120729809 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 120729824 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120729872 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120729982 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 120730271 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120730662 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120730947 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120730948 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120731042 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120731062 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 120731123 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120731299 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 120731309 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 120731373 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 120731443 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 120731586 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 120731678 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120731781 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120731995 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 120732103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120732219 T G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 120732342 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120732362 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 120732400 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 120732500 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 120732734 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 120733057 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 120733491 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120733534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120733566 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120733643 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120733678 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 120733735 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120733748 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120733980 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 120734309 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120734362 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 120734413 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 120734424 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 120734461 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120734611 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120734689 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120734923 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 120735015 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120735065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120735123 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120735172 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120735315 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120735352 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120735530 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120735558 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120735622 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120735720 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120735842 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120735862 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120735923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120736045 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120736064 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120736173 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120736180 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120736267 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 120736277 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 120736363 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120736428 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120736870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120736896 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 120737121 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120737193 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120737380 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120737473 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120737598 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120737652 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 120738035 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120738092 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120738272 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120738306 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120739582 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120739618 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120739938 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120740519 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120740522 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120740640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120740829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120740912 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120741392 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 120741864 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 2 120741865 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 120742633 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 120742686 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120743845 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 120743929 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120744933 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 120745016 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 120745525 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 120745615 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 120745638 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120745656 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120745704 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 120746145 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120746295 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 120746394 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 120746567 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 120746791 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120747060 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 120747144 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 120747354 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 120747368 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 120747386 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 120747523 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120747525 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120747585 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 120747975 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120748658 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120750072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120750306 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120750611 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 120750834 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 120751143 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120751413 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120752818 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 120753099 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 120753154 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 120753671 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 120754332 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 120754624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120754926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120755004 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 120755256 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120755602 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120755853 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120756514 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120757415 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120757538 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120758163 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120758412 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120758421 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 120758457 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 120758620 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120758707 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 120758750 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120758774 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120758839 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120759678 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 120759707 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 120759781 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120759964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120760183 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120760240 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120760345 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120760354 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120760367 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120760808 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120760873 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 120760919 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 120761227 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 120761327 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120761425 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120761507 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 120761649 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 120761661 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 120761677 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 120761686 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 120761724 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 120761754 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 120762004 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 120762138 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 120762187 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 120762289 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120762302 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 120762772 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120762948 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120762966 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120763060 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120763146 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120763466 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 120763733 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120763802 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120764149 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120764215 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120764350 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120764453 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 120764523 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 120764698 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 120764755 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120764912 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120764929 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120765624 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120765628 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120765683 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 120766031 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120766041 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 120766372 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 120767359 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 120767437 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 120767635 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 120767791 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 120768083 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120768320 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120768530 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120768624 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120768863 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120769201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120769230 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120769571 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120769912 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120770246 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 120770534 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120770601 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 120770684 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 120770907 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120771036 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 120771138 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 120771238 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 120771258 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 120771269 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120771922 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 120772273 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120772685 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120773581 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120774006 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 120774107 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 120774194 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120774197 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120774724 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120775719 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120776013 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120776039 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 120776088 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120776251 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 120776267 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 120776293 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 120776301 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 120776313 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 120776380 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120776444 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120776616 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120776642 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120776749 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 120777017 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120777046 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 120777154 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 120777228 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120777257 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120777399 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120777400 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 120777673 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 120777698 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 120777756 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 120777821 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120777990 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120778005 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120778013 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120778152 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 120778163 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120778711 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120778734 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 120778740 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120778764 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120778972 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 120778989 T G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 120779105 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 120779231 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 120779303 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 120779435 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 120779491 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 120779538 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 120779549 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120779728 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 120779729 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 120779988 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120780015 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120780027 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120780037 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 120780086 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 120780180 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 120780249 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 120780288 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 120780489 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 120780789 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 120780872 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 120780985 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 120781028 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120781078 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120781079 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120781102 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 120781131 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120781310 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 120781339 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 120781436 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 120781483 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 120781768 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 120782159 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120782160 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120782187 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120782639 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120782830 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 120784331 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120784365 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120784724 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 120784938 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120784945 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120785033 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 120785243 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120785334 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120785344 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120785368 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120785650 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 120785681 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 120785685 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 120785910 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 120785971 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 120786031 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 120786404 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 120786568 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 120786569 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 120786579 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 120786690 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 120786738 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120786803 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120786967 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120787022 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 120787090 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 120787207 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120787303 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120787319 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120787394 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 120787605 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 120787643 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 120787764 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 120787777 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 120787908 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 120788203 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 120788294 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 120788326 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 120789055 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 120789436 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 120789441 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 120789860 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 120789961 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 120790161 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 120790657 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120790710 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120790745 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120790860 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120790870 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 120791019 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 120791308 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120791580 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 120791786 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 120791844 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 120791888 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120791968 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120792053 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120792141 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120792747 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 120792787 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120792813 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120792845 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 120793071 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120794502 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120794932 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 120795103 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 120795889 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120796657 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120796751 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 120796824 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120797257 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 120797365 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 120797662 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120797733 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 120797954 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120797980 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 120798428 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 120798732 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120798840 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120799030 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 120799077 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120799150 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120799423 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120800247 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 120801150 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120801464 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 120801588 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 120801708 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 120801938 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 120802617 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120802847 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120802981 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 120803130 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 120803983 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 120803989 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120804024 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120805208 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120805596 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120805797 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120806222 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 120806241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120806418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120806975 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 120807049 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 120807180 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120807220 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 120807521 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 120807582 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 120807604 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120807766 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 120807796 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120808081 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 120808481 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 120808547 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 120808577 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120808579 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 120808680 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 120808687 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120808703 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120808785 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120808829 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 120808841 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 120808908 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 120809095 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120809176 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 120809475 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120809476 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 120809541 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 120809606 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 120809608 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 120809634 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 120809715 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 120810097 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120810342 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 120810404 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 120810909 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 120811052 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120811134 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 120811279 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 120811288 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 120811331 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120811532 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 120811616 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 120812131 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 120812530 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 120812946 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 120813025 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 120813356 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 120813370 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 120813400 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 120813734 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 120814260 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 120814358 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120814667 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120814791 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120814795 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120814877 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120815005 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 120815605 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120816372 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 120816553 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 120817247 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120817730 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 120817762 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120817772 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120817902 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120818036 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120818165 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 120818177 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120818178 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120818298 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 120818419 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 120818599 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120818649 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120818668 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 120818743 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120818778 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120818799 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120818809 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120819585 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 120819718 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120819812 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 120819976 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120820052 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120820632 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 120820884 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 120820997 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120821022 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 120821055 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120821339 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120822376 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 120823399 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 120823601 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 120823866 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120823935 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120824702 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 120824721 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 120825061 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 120825371 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 120825431 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 120826348 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 120826715 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 120827477 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120827639 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120828023 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 120828576 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 120828593 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 120828608 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 120828617 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 120830422 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 120830982 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 120831079 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 120831825 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 120832308 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 120832495 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 120832505 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 120832686 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120834394 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 120834602 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 120835033 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 120835448 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120836332 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 120836470 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 120836540 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120836556 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 120836561 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120836704 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 120836806 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 120836818 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120837001 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 120837086 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 120837192 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 120837467 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120837633 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120838275 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120838506 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 120838614 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120838784 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120838802 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 120838806 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 120838854 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 120838979 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120839125 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120839368 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120839387 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 120839414 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120839479 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 120839516 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120839797 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120839928 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 120840407 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120840437 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120840471 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120840479 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120840508 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120840541 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120840672 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120840689 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120840698 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120840877 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 120840904 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120841011 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 120841043 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120841050 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 120841065 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 120841159 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120841215 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 120841223 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 120841474 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120841495 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 120841626 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120841820 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120841987 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 120842049 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 120842192 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 120842287 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120842296 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 120842474 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120842567 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 120842984 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 120843219 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 120843220 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 120843676 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 120843726 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120843728 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120843748 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 120843873 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 120843904 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 120843925 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 120843946 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120844006 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 120844092 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120844200 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 120844238 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 120844303 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 120844306 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 120844327 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120844344 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 120844507 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120844508 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120844523 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 120844547 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 120844702 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 120845404 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 120845409 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 120845442 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 120846070 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 120846247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120846479 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120846643 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 120846644 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120846897 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120847028 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 120847045 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120847115 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 120848040 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 120848041 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 120848133 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 120848302 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 120848352 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120848400 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 120848412 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 120848473 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120848518 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120848587 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120848830 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 120849089 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 120849532 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120849568 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120850270 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120850539 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 120850787 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120850995 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120851006 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 120851106 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 120851179 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120851795 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 120851802 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 120851827 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 120851828 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 120852185 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120853860 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 120853927 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120854051 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 120854290 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 120854291 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 120854307 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 120854344 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120854548 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120854556 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 120854628 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120854900 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120854935 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120854984 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120855470 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120855526 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120855882 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120855900 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 120856118 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120856119 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 120856250 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 120856271 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120856272 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120856285 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 120856551 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120856708 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 120856927 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120856953 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 120857042 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 120857139 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120857195 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 120857279 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 120857449 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120857486 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 120857805 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 120857814 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 120857963 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 120858013 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 120858035 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120858117 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120858252 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120858366 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 120858808 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 120858828 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120859112 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120859259 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 120859708 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 120859760 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 120859818 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 120860281 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120860410 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120860555 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 120860564 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 120860856 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 120861277 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 120861355 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 120861464 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 120861535 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 120861557 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 120861757 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 120861880 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 120861901 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 120861909 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 120863060 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 120863644 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 120863646 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 120864368 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 120864449 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120865141 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 120865555 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 120865643 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 120865716 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 120865732 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 120865920 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 120865983 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120866314 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 120866362 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 120866831 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 120866877 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120866939 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 120866994 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120867075 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120867183 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120867438 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 120867522 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 120868324 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 120868679 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 120869397 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 120869410 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120869441 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120870364 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 120870405 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 120870457 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 120871544 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120871795 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 120871962 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 120871985 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 120871993 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 120872133 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120872361 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 120872403 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 120872900 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 120872988 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 120873028 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 120873058 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 120873083 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 120873132 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 120873776 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 120874286 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 120874305 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 120874370 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 120874432 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 120874498 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 120874877 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120874937 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 120875048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120875142 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 120875158 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 120875172 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 120875185 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120875195 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 120875199 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 120875508 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 120875717 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120875884 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120875951 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120875973 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 120875990 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120876008 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 120876143 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120876246 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 120876249 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 120876266 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 120877447 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 120877448 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120877481 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120877817 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 120878185 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120878734 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120878753 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 120878778 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120878818 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120878848 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120878904 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 120878995 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120879035 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120879038 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120879171 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 120879641 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 120879841 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120879872 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120879909 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120879944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120880113 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 120880114 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 120880135 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120880280 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 120880298 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 120880329 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120880353 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120880821 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120880829 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120880873 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120880896 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120880967 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120881001 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120881063 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120881171 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 120881211 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120881277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120881383 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120881707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120882314 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120882430 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120882536 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120883359 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 120883588 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120883785 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 120883998 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120884017 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120884272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120884486 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120884487 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120885451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120885848 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 120885872 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 120885891 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120886072 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120886205 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120886219 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120886227 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120886236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120886249 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120886253 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120886382 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120886402 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120886468 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120886517 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120886574 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120886578 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120886586 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120886656 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120886726 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 120886987 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120887148 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120887202 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120887252 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 120887304 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120887522 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120887678 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 120887695 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 120887805 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 120888098 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120888139 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 120888305 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120888381 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120888402 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120888435 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120888461 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120888665 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 120888774 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 120888814 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120888854 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120888911 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120888935 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120888953 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120888979 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120888991 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 120888993 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 120889151 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 120889181 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120889311 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 2 120889404 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 120889445 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 120889496 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 120889577 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 120889713 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120889717 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120889733 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 120889756 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120889762 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120889824 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120889867 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120889872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120890018 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 120890078 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120890111 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 120890174 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120890187 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120890332 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120890373 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 120890516 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120890773 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120890791 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120891919 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120891970 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 120891975 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120892006 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120892038 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120892201 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 120892398 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 120892403 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120892544 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 120892647 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120892790 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 120892842 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 120892847 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 120893011 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 120893023 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120893038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120893120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120893122 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120893176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120893208 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120893241 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120893670 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120893876 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120893975 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 120894030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120894048 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120894306 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120894341 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 120894371 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 120894929 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120896239 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 120896368 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120896706 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 120897378 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 120897815 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120898725 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120899051 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 120899620 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 120899761 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 120899967 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120900047 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120900451 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 120900689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120900710 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120900848 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 120900952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120901142 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120901576 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120901815 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120901848 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 120902179 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120902204 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 120902332 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 2 120902437 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 120903450 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 120903562 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 120903694 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 120903799 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 120903926 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 120904847 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 120904981 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120904988 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120905177 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120905513 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120905933 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 120906014 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 120906157 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 120906258 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120906319 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120906391 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 120906444 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 120906494 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 120906495 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 120906566 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 120906776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120906786 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 120906984 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120907182 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 120907210 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120907245 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120907380 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120907386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120907407 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120907412 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 120907443 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120907597 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 120907613 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 120907655 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 120907656 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 120907739 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 120907837 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 120907844 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 120907865 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120907946 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 120908126 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120908407 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120908739 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 120908749 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120908772 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120908806 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 120908991 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 120909102 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120909121 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120909126 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120909161 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120909239 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120909249 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120909324 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120909356 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120909389 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 120909795 G C Y N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 2 120909832 C T N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 120909839 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 120910328 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120910733 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 120910808 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 120910944 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 120911515 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120911775 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120911820 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120912100 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120913029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120913080 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120913429 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120913984 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120914384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120914554 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120915354 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120915886 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 120916439 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120916578 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120916625 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120916646 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120916696 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120916869 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120916979 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120916996 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120917206 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120917213 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120917272 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120917468 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 120917774 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120917944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120918062 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120918664 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120919942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120921566 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120922826 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 120923682 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 120927642 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120930211 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 120930466 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120930577 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 120930587 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 120930594 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 120930673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120930799 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 120931060 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 120931133 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120931220 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 120931235 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120931368 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 120931813 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 120931840 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 120931910 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 120932052 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 120932054 T A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 120932160 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 120932317 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120932350 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 120932537 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120932756 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 120932805 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 120932851 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 120932948 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 120932995 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 120933008 T A N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 2 120933040 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 120933089 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 120933107 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 120933194 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 120933220 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 120933233 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 120933252 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 120933272 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120933328 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 120933350 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 120933425 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 120933439 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 120933522 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 120933539 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 120933558 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 120933573 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 120933812 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 120933826 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 120933887 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 120933929 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 120933979 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 120934203 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120934213 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120934267 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120935140 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120935151 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 120935191 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120935200 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 120935241 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 120935313 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120935326 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 120935370 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120935377 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 120936760 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120937602 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 120937860 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120938183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120938732 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 120938864 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120939613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120940127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120940701 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120941352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120941532 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120944182 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 120944435 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120945602 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 120945671 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120947110 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 120948080 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120948363 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 120948979 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 120949003 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120949254 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 120949723 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120950001 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 120950015 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 120950164 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 2 120950388 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 120950731 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 120951257 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120951647 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 120951975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120953017 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 120953073 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120953551 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 120953689 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 120953713 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120953768 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 120953863 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 120953967 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 120954304 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 120954456 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 120954568 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 120954646 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 120954650 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 120954726 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 120955529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120955591 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 120955930 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120956910 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 120956940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120957028 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 120958008 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 120958092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120959472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120959602 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 120959651 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 120959798 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 120960482 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 120960506 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 120961340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120962077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120962204 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 120962232 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 120962471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120962796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120962847 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 120963078 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 120963250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120964107 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 120964290 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 120964664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120965032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120965422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120965967 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120966340 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120966499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120967470 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120967500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120968113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120968192 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120968228 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 120968499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120969085 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120969252 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120969504 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 120969670 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 120969782 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 120970805 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 120971021 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 120971084 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 120971085 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 120971112 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 120971121 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120971631 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 120971646 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 120971670 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 120971769 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 120971951 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 2 120971956 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 120972033 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 120972144 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 120972343 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 120972421 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 120972433 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 120972544 A C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 120972889 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 120972984 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 120973117 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 120973152 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 120973289 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 120973308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120973427 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 120973599 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 120973791 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120973808 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 120974900 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 120974997 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 120975629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120975644 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 120976828 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 120977129 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 120978188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120978409 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 120978634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120979176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120981477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120982601 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 120982615 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120982617 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120982638 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 120984032 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 120985095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120986085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120986188 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 120987266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120987589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120988633 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 120992132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120992771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 120995731 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 120996502 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 120997515 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 120999806 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121001020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121001033 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121004004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121004559 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121004575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121004706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121005042 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121005320 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121008011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121010582 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121010609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121010693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121010745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121010750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121014895 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121015760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121017224 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 121017316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121019459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121021369 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 121021370 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 121022064 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121022791 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121022962 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121023302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121023665 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 121023766 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121023801 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 121024474 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 121024936 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 121024950 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121025726 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 121025773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121025962 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121025981 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 121025984 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 121026476 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121027020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121027304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121027527 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121027831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121029360 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121029709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121030151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121030302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121030595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121030759 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 121032304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121033151 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121033165 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121033980 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 121034723 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121035269 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121035686 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121036840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121036966 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121037194 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121037290 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121037699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121037842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121037982 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 121038138 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 121038155 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 121038353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121038358 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121038623 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121038714 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 121038873 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121038969 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 121038974 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 121039134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121039142 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 121039260 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 121039270 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121039272 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121039415 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121039641 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 121039741 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121039760 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121039865 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121039869 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121040055 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121040238 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 121040329 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121040340 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121040515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121040861 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121040913 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121040924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121041124 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121041781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121041841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121042250 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 121042454 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121042915 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121043206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121043276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121043688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121044042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121044143 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121044230 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 121044712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121044850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121044858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121045047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121046360 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 121047017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121047886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121049664 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 121049674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121050585 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 121051041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121051227 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 121051973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121052624 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 121054548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121055029 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 121056572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121058139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121058695 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 121058848 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121059161 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121059253 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121059591 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121059754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121061158 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121061476 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 121062662 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121062843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121063139 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 121064034 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 121064053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121064069 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121064077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121064100 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121064139 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121064419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121064583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121064584 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 121064634 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121065145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121065367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121065383 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121065483 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121065536 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121065550 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121065552 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121065929 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 121066946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121067894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121068413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121068857 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 121069802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121069983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121071503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121072312 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121073071 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121073693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121073694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121073879 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 121074082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121075023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121076235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121077244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121077500 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121077598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121078406 T C Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 121078428 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121078462 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 121078722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121080105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121080555 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121081111 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121082042 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121082202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121082741 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121084277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121084398 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 121084569 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121084592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121085018 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121085296 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121085879 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121086066 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121086598 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121087267 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121089878 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 121090371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121090796 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121091208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121091725 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121091726 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121092094 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121092892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121093583 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121093672 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121093912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121094666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121094673 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121095494 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121095528 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 121095631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121096116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121096857 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121097710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121098105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121102332 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121103799 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 121103979 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121104105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121104418 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 121104974 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 121105532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121105845 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121106660 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121107203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121107566 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121107870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121108215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121108778 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121108977 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 121110438 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121110921 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 121111245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121111463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121111829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121112542 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121112546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121112883 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121112938 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121113212 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121114102 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121114174 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121115100 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121116675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121116852 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121117309 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121118413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121119204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121121047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121121245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121121780 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121122198 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121122243 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 121122933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121123150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121123284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121123290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121123490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121123545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121123735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121123867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121123906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121123907 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 121126645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121126732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121129060 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 121129247 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121129455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121129472 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121129786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121129925 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121131148 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121131155 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 121131728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121131952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121132078 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 121132451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121133209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121134314 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121135442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121137320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121138165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121139881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121140184 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121140813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121141693 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 121141930 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121142303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121142652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121142803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121143044 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121143063 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121143093 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 121143564 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 121143573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121143771 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 121144364 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 121144799 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121144830 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121145591 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121146128 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 121146413 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121147065 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121147228 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121147643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121147852 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121147875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121147899 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121148357 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121148519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121148591 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121148601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121149493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121149843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121150671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121150796 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121151571 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 121152020 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 121152070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121152756 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121153293 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 121153699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121153785 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121153970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121154293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121154297 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121154363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121154584 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121154748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121155204 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121155208 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121155252 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 121155283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121155291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121155598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121155930 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 121156206 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121156420 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121157134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121157150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121158554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121158649 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121158864 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121158874 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121158880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121158965 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121159294 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121159609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121159644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121159652 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121159667 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121159877 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 121159904 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 121159945 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121159949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121159960 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 121160032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121160105 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121160385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121160396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121160558 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121160637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121160912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121160928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121160963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121160972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121161099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121161133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121161236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121161247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121161383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121161463 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 121161701 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121161775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121162014 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121162042 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121162134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121162135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121162423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121162555 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121162689 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121162720 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 121163166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121163203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121163380 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121163457 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121163550 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121163703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121163813 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 121163995 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 121164162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121164204 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121164263 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121164297 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 121164526 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121164600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121164648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121164966 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121165038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121165180 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121166194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121166502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121166786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121166953 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 121167013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121167074 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 121167099 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 121167495 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 121167813 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121167821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121168224 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121168687 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121168691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121169003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121169112 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121169548 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 121169706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121171538 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121172277 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121172290 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 121172495 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 121172704 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 121172826 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 121172870 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 121172881 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 121172983 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 121173598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121173883 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 121174742 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121174877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121174949 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121175003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121175141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121175143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121175411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121175626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121175657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121175670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121175893 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 121175937 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 121176144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121176481 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121176506 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121176915 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121178710 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121179727 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 2 121179915 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121180459 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121181262 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121181657 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121181801 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121182402 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121182494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121183801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121183846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121183848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121184083 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121184167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121187060 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121187518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121188631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121188674 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121188779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121189411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121189844 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 121189929 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 121190747 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121190809 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121191024 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121191141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121191215 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121191310 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121192484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121193641 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121193765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121194309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121194608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121195336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121195528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121195744 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121196214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121196266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121196288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121196366 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121199000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121199040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121199109 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121201750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121201877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121202004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121202248 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121202299 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121203189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121203195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121203461 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 121204066 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121204151 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121204203 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121204542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121204627 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121206483 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121207058 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121208689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121208829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121208841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121209074 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121209960 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121210046 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121210154 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121210155 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121210285 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121210288 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121210480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121210505 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121210781 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121211005 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 121211117 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 121211201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121211599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121211958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121211967 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121212557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121213237 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121213474 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121213587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121216293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121218453 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121219448 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 121219771 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 121219823 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121220639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121221582 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121222016 G C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 121222057 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121222171 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 121222512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121222945 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 121222966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121223288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121223772 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121224212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121224905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121226560 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121226756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121226925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121226970 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121227260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121227282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121227298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121227716 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 121227879 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121228719 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 121230224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121232870 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 121234703 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121235318 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121235570 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121235617 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 121237401 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121237859 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121240860 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 121241393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121241759 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 121242446 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121242471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121242758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121243163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121243216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121243380 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 121243436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121243634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121244060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121244188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121244311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121244321 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121244461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121244703 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121245186 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 121245340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121246051 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 121246386 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 121247901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121248284 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 121248367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121249044 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 121249412 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 121249565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121249852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121249914 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 121249926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121249942 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 121250024 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121250480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121250624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121250675 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 121250686 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 121250690 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 121251558 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121251563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121251638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121251944 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 121251951 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 121252090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121252869 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 121253072 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 121253114 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121253849 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121253869 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121253997 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 121254739 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 121255042 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 121255063 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 121256171 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 121256286 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 121256581 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 121256748 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 121256993 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 121258337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121258713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121259168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121259191 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121259451 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121259754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121260230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121260855 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 121261117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121261761 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121262726 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121262892 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121263158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121263199 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121263598 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121263738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121264433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121264511 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121264522 A T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 121264593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121267609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121268126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121268537 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121270065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121270319 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 121270337 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 121270522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121270832 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121270851 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 121271311 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121271413 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121271535 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121272438 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121272557 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 121273259 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 121273928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121274070 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121274988 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 121275216 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 121277436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121277588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121278210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121279569 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 121280042 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 121280069 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 121280204 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 121280206 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121280284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121281833 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121281905 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 121282266 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121284244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121284388 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 121284707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121284896 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121285049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121285352 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 121286233 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 121286354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121287153 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121293695 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 121293727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121297621 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 121297879 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 121298087 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121298869 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 121299305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121299477 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 121299536 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121299666 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121299778 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121299910 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121299925 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121300054 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121300058 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121300082 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 121300086 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 121300593 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 121300790 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 121300938 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121301254 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 121301514 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121301519 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121301544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121302004 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121302016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121302130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121302187 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 121302409 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 121302418 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 121302579 G A Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 121302583 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 121302642 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 121303068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121303201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121303221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121303271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121303289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121303299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121303384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121303469 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 121303570 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121303588 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 121304122 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121305165 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121306078 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121306365 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121306649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121306804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121308538 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121309177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121309187 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 121309593 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 121309713 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 121310238 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 121313728 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121314832 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121315014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121316258 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121319435 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121320968 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 2 121321138 T C Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 121326246 C G N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 2 121326410 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121328965 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 121329123 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 121329167 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 121330429 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121330617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121330618 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121330654 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121331017 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 121331448 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121331457 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121331550 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 121331562 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 121331648 G A Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 121332660 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121333359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121333750 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 121333858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121334115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121334284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121334394 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 121334434 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121334711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121334881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121335184 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 121335278 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 121335315 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121335328 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 121335347 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 121335851 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 121335973 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121336191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121337037 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 121337118 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121337449 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 121337467 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 121337727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121337756 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121337770 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121337840 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121338004 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 121338085 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 121338086 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 121338198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121339084 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121339202 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 121339939 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 121340030 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 121340154 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 121340197 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 121340809 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 121341279 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 121341669 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 121341843 G T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 121341845 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 121341859 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 121342159 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 121342201 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 121342334 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 121342337 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 121342361 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 121342515 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121342670 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121342737 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121342766 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 121342772 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121342784 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121342819 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121343186 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 121343252 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121343259 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121343558 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121343607 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121343667 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121343717 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121343718 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121343765 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 121343780 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121343788 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121343907 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121343919 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121343948 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 121344013 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121344118 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 121344183 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121344196 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121344210 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121344399 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121344400 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121344417 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121344425 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121344450 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121344471 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121344499 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121345490 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 121345542 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 121345561 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 121345593 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 121345685 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 121345760 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 121345915 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121347326 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 121347351 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 121347508 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 121347556 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121347729 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 121347736 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 121347813 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 121348761 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 121348936 T G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 121349353 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 121349740 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 121349932 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 121350091 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121350115 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 121350126 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 121350145 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 121350170 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 121350298 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 121351055 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121351699 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 121351818 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 121351874 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 121352064 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121352190 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121352222 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121352387 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 121352852 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 121352903 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 121352939 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 121353190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121354737 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121354912 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 121356290 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 121356333 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 121356386 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121356563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121358245 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 121360522 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121360550 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 121361603 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 121361756 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 121361807 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 121361860 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 121361918 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 121361985 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 121362008 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 121362672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121362804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121363227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121363285 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121363295 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 121363314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121363390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121363401 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121363438 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121363603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121363693 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121363961 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121363984 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121364028 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121364250 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121364276 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121364306 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121364436 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121364636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121364697 G C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 121364758 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121365022 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121365189 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121365266 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121365307 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 121365392 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 121365555 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121365636 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 121365697 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 121365719 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 121365880 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 121365955 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 121366009 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121366010 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121366021 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 121366022 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 121366058 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 121366075 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 121366175 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121366223 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121366227 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121366820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121367111 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121367159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121367355 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121367400 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 121367410 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 121367440 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 121367481 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 121367910 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 121368047 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 121369029 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 121369039 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121369043 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121369259 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 121369282 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121369321 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121369688 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 121369854 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 121369986 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 121370016 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 121370206 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 121370210 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 121370487 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 121370553 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 121371082 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 121371119 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 121371136 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 121371696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121372417 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121372444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121372895 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 121372998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121373268 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121373350 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 121373587 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 121374042 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121374126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121375035 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121375361 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121375431 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121375822 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121375823 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121375978 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121376078 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 121376364 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121376405 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121376572 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121376654 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121376896 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121377017 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121377296 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121377360 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121377444 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121377452 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121377524 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121378098 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121378221 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121378227 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121378483 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121378513 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121378540 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121378569 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121378606 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121378607 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121378623 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121378743 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121378767 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121378875 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121379064 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121379065 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121379193 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121379219 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 121379227 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 121379340 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121379840 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121380039 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121380118 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121380215 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121380216 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121380252 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121380398 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 121380468 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121380530 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121380553 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121380666 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121380836 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121380886 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121381152 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121381195 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121381236 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121381432 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121381433 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121381512 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121381527 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121382321 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121382341 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121382377 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121382446 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121382519 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121382564 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121382606 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121382739 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121382826 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 121382846 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121382847 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121382958 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121383346 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121383356 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121383385 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121384387 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121384701 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121385095 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121385100 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121385108 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121385123 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121385517 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121385571 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121385627 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121385629 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121385678 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121385683 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121385706 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121385752 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121385767 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121385992 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121386069 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121386077 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121386116 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121386118 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121386403 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 121386446 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121386552 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121386654 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121386663 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121386713 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121386743 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121386774 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121387328 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121387646 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 121387670 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 121388101 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121388184 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121388266 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121389208 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121389269 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121389403 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121389412 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121389417 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121389856 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121390044 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121390074 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121390173 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121390192 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121390207 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121390348 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121390361 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121390395 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121390410 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121390433 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121390464 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121391007 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121391253 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121391341 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121391444 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121391514 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121391986 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121392457 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121393668 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 121394381 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 121394491 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121394775 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 121394849 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121394861 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121394862 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121394927 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121395143 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121395365 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 121395494 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121395548 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 121395549 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121395595 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121395611 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 121395687 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 121395761 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 121395807 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121395936 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121395948 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121396074 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 121396139 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121396272 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121396417 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121396683 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121397084 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121397492 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 121397512 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121397573 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121397593 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121397604 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121397609 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121397873 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 121397935 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 121398576 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121398707 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121398764 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 121398776 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 121399478 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121399686 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121399735 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121399749 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121399783 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121399877 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121399913 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121399929 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121399969 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 121400190 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121400200 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121400302 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 121400316 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 121400318 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 121400427 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 121400437 G A N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 121400522 C T N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 121401599 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121401783 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 121401887 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121401920 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 121401935 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121401983 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121402321 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 121402548 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121402720 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 121402726 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121402742 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121402926 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 121402960 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 121402964 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121403210 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121403236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121403258 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 121403308 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121403372 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 121403531 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121403818 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121403822 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 121403845 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121403894 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 121403937 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 121403953 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 121404008 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 121404016 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 121404048 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 121404316 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121404352 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121404359 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121404469 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121404582 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121404626 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121405079 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121405111 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121405191 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121405273 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121405671 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 121405817 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 121405906 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 121407084 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121407372 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121407514 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121407685 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121408697 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 121408930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121408932 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121408985 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 121408990 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121409151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121409811 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 121410408 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121410629 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121410878 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 121410898 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 121411143 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 121411270 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 121411748 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121411858 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121412259 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 121412443 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121412596 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121412913 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 121412948 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121413311 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121414580 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121414700 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121414712 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121414809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121415109 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 121415305 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 121415856 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121417026 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121417684 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121418341 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 121418958 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121419935 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 121419986 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121420285 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121420534 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121420823 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121420855 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 121420911 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121420954 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 121421160 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121421245 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 121421298 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121421369 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 121421750 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121422038 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121422244 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 121422345 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121422532 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 121423042 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 121423061 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 121423195 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 121423420 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 8 10 1 6 2 2 121423667 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 121423784 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121423797 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121423944 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 121423965 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121424122 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121424127 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 121424301 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 121424318 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 121424345 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121424372 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121424475 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 121424491 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 121424852 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121424922 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 121425042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121425089 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 121425225 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121425238 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121425255 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121425274 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121425275 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121425657 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 121425679 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121425874 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121426298 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 121427351 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121427369 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121427400 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121427425 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121427458 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121427476 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121427477 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121427521 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121427606 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121427733 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121427821 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121428141 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 121428923 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121429087 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121429465 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 121429530 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121429729 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121430079 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121430100 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121430666 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121430826 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121430899 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121431593 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121431806 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121431931 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121432035 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121432195 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121432217 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121432797 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121432851 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 121432863 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 121432929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121432937 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121432988 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 121433292 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 121433310 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121433369 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121433390 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121433810 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121434314 T C N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 121434420 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121434540 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 121434759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121435042 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 121435232 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121435547 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121435790 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121436459 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 121436670 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 121436757 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121436849 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 121437049 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 121437836 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121437842 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121437878 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121437956 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121438262 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 121438400 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 121438423 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 121438426 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121438621 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 121438677 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121438731 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121438880 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 121439006 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 121439017 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121439131 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 121439132 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 121439254 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 121439292 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121439349 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 121439379 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 121439600 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121439708 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121439868 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121439987 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 121440494 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 121440506 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 121440519 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 121441291 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 121441481 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121441673 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121441710 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121441752 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121441844 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121441911 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121441977 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121442110 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121442164 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 121442191 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 121442208 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 121442322 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121442335 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121442472 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121442561 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121442656 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 121442679 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121442756 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121442855 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121443047 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121443073 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 121443423 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121443649 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121444064 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 121444527 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121444537 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121444687 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121444768 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121444928 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121445001 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121445003 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 121445034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121445074 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 121445087 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121445124 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121445201 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121445520 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121445546 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121445607 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121445652 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121445775 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121446024 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 121446144 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121446204 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121446251 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 121446265 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 121446280 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121446317 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121446394 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121446408 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121446422 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 121446429 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121446542 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121446649 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 121446650 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121446664 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 121446724 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121446758 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121446798 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121446801 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121446810 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121447108 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121447207 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121447213 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121447265 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121447272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121447313 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121447449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121447465 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 121447472 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121447879 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121447963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121447998 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 121448026 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121448053 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 121448262 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 121448480 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121448562 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121448733 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121448747 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 121448951 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121449073 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121449198 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 121449372 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121449382 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121449615 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 121449649 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121449909 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121449986 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121450064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121450093 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 121450122 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121450169 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 121450205 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121450240 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121450395 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121450400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121450459 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 121450982 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 121450993 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121451007 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 121451106 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 121451374 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121451408 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121451691 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 2 121452124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121452138 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 121452202 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121452334 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121452570 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121452632 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121452666 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121452794 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121452928 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121453042 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121453150 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 121453159 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 121453247 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121453362 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 121453383 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121453469 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 121453472 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121453689 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 2 121453699 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 121454185 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121454238 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 121454381 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121454494 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121454615 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121454652 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121454675 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121454678 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121454689 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 121454703 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121455625 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121456025 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121456121 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121456386 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121456431 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121456643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121456674 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 121456935 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121457405 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121457635 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 121458501 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121458702 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121458940 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121459152 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121459409 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 121459506 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121459576 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 121459667 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 121459991 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 121460068 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 121460087 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 121460096 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 121460176 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 121460942 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 121461259 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 121461674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121461985 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 121462267 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 121462269 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121462320 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121462322 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 121462525 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 121462673 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 121462767 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 121463216 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121463245 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121463313 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121463330 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121463331 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121463352 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121463470 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121463560 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121463835 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121464249 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121464270 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121464723 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 121464774 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 121464775 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 121464935 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 121465062 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 121465085 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 121465096 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 121465129 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121465276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121465501 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121465664 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121465697 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121466262 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121466324 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121466624 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121466772 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121466944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121466972 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121467103 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121467176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121467402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121467485 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121467682 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121468015 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 121468073 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121468147 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121468341 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121468342 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121468781 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 121468968 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 121469013 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 121469021 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 121469126 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 121469154 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 121469877 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121469923 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121470210 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121470335 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121470357 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121470361 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 121470452 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121470666 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121470788 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121470980 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121471150 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 121471164 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121471303 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 121471332 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121471720 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 121471813 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 121471904 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 121471912 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 121472022 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 121472221 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 121472371 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121472383 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121472413 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 121472446 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121472472 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121472546 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 121472638 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 121472877 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121472900 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121473013 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121473116 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121473210 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121473214 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121473242 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121473245 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121473271 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121473293 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121473307 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121473573 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121473886 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121473928 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121473977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121474186 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121474311 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121474427 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121474487 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 121474640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121474652 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121474789 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121474863 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121474917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121475375 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121475640 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121476074 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121476120 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121476174 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121476559 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 121476668 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121476814 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121476852 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121476984 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 121477087 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121477199 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121477221 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121477397 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121477453 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121477549 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121477573 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121477577 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121477745 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121477943 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121478208 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121478538 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121478557 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121478612 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121478684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121478690 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121479343 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121479480 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121479949 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121480096 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121480363 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121480559 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121481277 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121481318 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121481631 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121482403 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121482404 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121482480 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121482703 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121483237 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121484148 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121484388 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121484588 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121484774 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 121485111 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121485176 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121485647 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121487528 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121487530 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121487562 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 121487910 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121487969 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121488009 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121488202 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121488262 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121488432 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121488437 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121488498 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121489111 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121489132 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121489183 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121489208 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121489213 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121489395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121489463 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121489564 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121490383 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121490804 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121491062 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121491118 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121491194 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121491299 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121491352 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 121491399 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 121491423 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121491447 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121491588 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 121491785 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121491875 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121491887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121491985 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 121492053 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121492182 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 121492332 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 121492387 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121492389 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121492776 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121492995 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121493041 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121493150 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121493155 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121493171 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121493240 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121493251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121493257 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121493266 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121493355 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121493397 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121493398 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121493857 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121493961 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121494031 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121494477 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121495774 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121496110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121496327 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 121496738 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121496803 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121496819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121497117 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121497391 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121497470 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 121497528 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 121497649 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121497754 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121497790 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121497942 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121498019 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121498112 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121498413 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121498446 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121498911 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121498988 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121499170 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121499193 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121499279 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121499362 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121499580 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121499755 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121499757 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121500219 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121500336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121500573 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121500591 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121500673 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121500946 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 121500948 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 121500985 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 121500987 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 121501133 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121501145 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121501151 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 121501235 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121501251 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 121501266 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 121501279 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 121501319 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 121501344 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 121501353 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121501357 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121501543 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121501789 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121501923 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121502118 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121502194 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 121502464 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121502513 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 121503260 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121503342 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121503763 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121503955 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121504043 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121504178 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121504224 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121504261 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121504265 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121504291 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121504325 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121504364 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121504428 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121504457 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121504672 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 121504698 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 121504769 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 121504780 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121504786 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121504805 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 121504859 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121504953 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 121504994 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121505152 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 121505371 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 121505527 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 121505539 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 121505541 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 121505594 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121505690 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 121505695 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121505707 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121505917 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 121506362 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121506995 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 121507048 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121507114 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121507217 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121507256 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121507345 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 121507505 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121507537 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 121507989 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121508133 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121508680 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121509049 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121509147 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121509414 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121509543 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121509598 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121510169 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121510532 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121510590 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121510716 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 121511109 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121511133 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121511336 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 121511730 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121511913 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121512111 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121512141 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121512168 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121512207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121512522 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121512538 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 121512585 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121512617 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121512623 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121512675 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 121512789 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121512820 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121513079 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121513294 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 121513295 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121513624 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121513637 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 121513760 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121513795 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121513818 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121513899 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121514514 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 121514565 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121514629 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121514716 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 121514802 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 121514809 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 121515042 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121515179 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121515197 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121515510 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121515524 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121515553 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121515556 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121515689 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121515980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121516048 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 121516213 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 121516217 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 121516314 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 121516356 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121516462 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121516464 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121516660 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121516673 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 121516747 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 121516798 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 121516939 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 121517159 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121517271 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 121517304 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 121517368 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 121517402 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 121517452 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121517464 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 121517556 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121517674 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 121517757 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121517781 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 121517809 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121517982 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121518160 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121518505 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121518657 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 121519004 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121519195 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 121519211 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 121519271 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121519456 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121519633 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121520288 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121520430 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 121520473 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121520563 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 121520643 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121520644 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121520677 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121521247 T G N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 121521367 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 2 121521577 G A N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 121522049 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 121522144 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121522176 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121522365 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 121522540 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121522543 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 121522559 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 121522635 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 121522686 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121522895 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121523069 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121523175 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121523200 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 121523301 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121523465 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 121523482 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 121523486 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 121523611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121523708 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 121524052 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121524144 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 121524175 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121524232 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121524292 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121524487 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 121525015 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121525058 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121525071 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121525263 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 121525434 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 121525440 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 121526134 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 121526554 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121526569 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121527307 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121528053 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121528256 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121528289 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121528766 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121528874 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121528892 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121528899 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121529177 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121529188 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121529566 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121529738 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121529989 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 121530110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121530160 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121530201 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121530252 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 121530386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121530528 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121530622 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121530623 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121530657 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 121530773 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 121530804 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121531102 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121531247 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121531546 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121531754 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121531856 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121531919 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121531961 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 121532015 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121532173 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 121532407 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121532510 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 121532656 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 121532718 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121532728 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121532905 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 121532937 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 121532996 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121533159 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 121533250 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121533310 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121533377 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121533397 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121533416 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121533420 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121533428 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121533439 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121533470 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121533568 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 121533903 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121533963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121534024 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121534028 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 121534078 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121534090 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121534157 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121534193 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121534269 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 121534271 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121534348 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121534479 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 121534535 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121534602 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121534697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121534776 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 121535184 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121535225 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121535258 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121535287 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121535392 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 121535436 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 121535493 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121535546 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121535562 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121535612 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121535664 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121535756 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121535761 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121535775 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121535805 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 121535811 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121535975 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121536037 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121536050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121536061 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121536128 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121536257 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121536360 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121536542 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121536582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121536599 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121536769 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121536878 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121536946 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 121536982 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 121536983 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 121537664 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121538296 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121538345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121538409 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 121538487 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121538506 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 121538610 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121538748 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121539070 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121539433 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 121539622 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121539717 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121539803 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 121539977 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 121540364 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121540381 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121540519 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 121540564 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121540932 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121541040 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121541440 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121541611 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121542054 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121542392 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 121542497 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121542791 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121542796 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121542827 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121543334 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 121543399 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121543443 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 121543972 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121544037 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121544949 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121544951 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121545204 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121545300 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121545334 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121545380 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121545774 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121545792 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121545813 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121545816 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121545827 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121545908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121545991 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121546595 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121546598 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121546638 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121546661 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121546741 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121546763 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121546772 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121547227 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121547239 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121547504 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121547553 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121547647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121547697 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121547712 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121547769 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 121547813 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121548078 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 121548182 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121548223 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121548382 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121548592 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121548631 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121548721 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121548780 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121548835 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121549137 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121549254 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121549307 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121549379 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121549437 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121549557 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121549842 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121549991 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121550005 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121550006 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121550194 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121550446 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 121550524 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121550582 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121550657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121550690 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121550912 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121550918 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121551435 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121551562 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121551631 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121551726 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121552384 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121552552 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121553294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121553548 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121553819 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 121554341 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121554645 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121555674 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121555785 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 121555789 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 121556146 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121556646 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121556672 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121556891 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121556971 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 121557160 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 121558034 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121558251 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121558253 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121558282 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121558415 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121558594 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121558742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121558861 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121559074 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 121559079 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 121559238 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 121559368 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121560105 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121560258 T G N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 121560981 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121560998 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121561034 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121561153 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121561440 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121561525 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121561875 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121562273 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 121562284 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 121562479 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121562628 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121562636 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121562885 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121563274 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121563311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121563365 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121563552 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121564270 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121564417 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121564510 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121564558 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121564632 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121564635 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121564689 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121564729 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121564745 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121565292 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121565295 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121565570 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121565594 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121565621 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121565973 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121565997 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566151 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121566168 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121566174 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566193 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566341 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566352 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566355 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121566383 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566384 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121566505 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566517 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566521 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566581 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566829 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566846 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566849 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566861 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566897 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121566939 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121567061 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121567068 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121567077 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121567130 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121567191 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121567211 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121567373 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121567380 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 121567404 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121567444 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 121567459 T G N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 121567886 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121567900 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121568331 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121568361 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121568401 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121568485 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121568524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121568546 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121568562 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121568574 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121568618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121568725 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121568731 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121568914 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 121569025 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 121569123 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121569131 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121569195 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121569297 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121569361 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121569405 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121569468 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121569487 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121569546 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121569602 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 121569792 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121570024 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 121570026 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 121570514 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121571016 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121571058 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121571399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121571416 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121571556 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121571579 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121571590 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121572026 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121572261 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 121572466 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121572812 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121573395 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121573424 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121573441 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121573500 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121573506 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121573643 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121573655 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121574473 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121574497 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121574540 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121574636 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121575187 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121576464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121576488 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 121577270 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 2 121577853 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121577977 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121578222 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121578306 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121578359 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121578438 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121578441 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121578914 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121578916 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121578928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121578953 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121579437 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121579601 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121579611 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121579706 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121579877 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121579882 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121579936 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121580063 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 121580122 T G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 121580263 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121580352 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 121580379 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121580703 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121580714 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121580721 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121580728 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121580786 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121580849 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 121581402 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121581438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121581480 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121581521 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121581689 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 121581741 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121581844 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121581860 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121581874 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121581878 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121581895 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121582257 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 121582297 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 121582331 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121582364 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121582443 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121582758 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121582918 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121583017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121583127 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121583592 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121583659 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 121583718 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121583960 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121584080 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121584226 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121584469 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121584882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121584966 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121585319 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121585581 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121585669 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 121585706 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 121585864 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121585926 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121586046 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121586325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121586328 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121586344 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121586391 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121586411 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121586852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121586923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121586950 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121587137 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121587625 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121587678 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121588210 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121588246 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121588557 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121588694 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121589227 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 121589536 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121589635 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121589735 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121589825 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121590093 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121590476 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121590491 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121590835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121590847 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121591003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121591137 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121591284 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121592248 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121593048 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121593157 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121594143 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 121594230 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 121594376 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121594513 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121594517 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121595724 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121595751 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121596480 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121596603 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121596666 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121596667 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121596700 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121596721 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121596739 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121596855 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 121596965 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121597190 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121597332 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121597636 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 121597637 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 121598102 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121598157 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121598179 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121598202 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121598329 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121598672 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121599417 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121599426 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121599479 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 121599553 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121599608 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121600265 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121600349 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121600354 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121601063 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121601166 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121601193 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121601279 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121601745 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121601759 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121601776 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121601804 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121601828 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121602259 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121602309 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121602445 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121602521 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121602814 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 121602944 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 121603142 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121604067 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 121604284 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121605178 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121606332 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121606525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121606588 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121606591 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 121606702 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 121606756 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 121606795 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121606898 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121607066 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121607072 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 121607203 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 121607646 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121607806 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121607997 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 121608089 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 121608122 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 121608229 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 121608287 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121608482 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 121608691 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121608713 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 121608822 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121608874 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121609000 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121609183 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 121609308 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 121609406 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121609442 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121609445 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121609514 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121609525 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121609535 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121609599 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121609621 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121609739 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121609967 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 121609994 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121610060 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121610099 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 121610103 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121610170 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121610472 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121610504 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121610521 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121610556 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121610648 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121610699 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121610788 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121610792 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121610816 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121610877 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 121611233 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121611266 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121611311 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 121611334 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121611385 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 121611412 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121611413 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121611509 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121611563 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121611598 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121611657 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121611663 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121611740 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121611861 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121611863 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121611901 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 121611996 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 121612036 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 121612171 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 121612285 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121612369 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121612649 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121612719 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 121612794 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121612935 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121613168 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121613401 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121613429 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121613730 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 121613789 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121613893 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121614170 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121614280 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121614323 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121614345 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121614366 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121614506 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121614539 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121614802 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121614969 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121615004 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121615036 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121615037 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121615094 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121615154 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 121615203 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121615215 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 121615232 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 121615238 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121615344 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 121615375 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121615486 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121615569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121615858 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121615937 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121615965 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121616054 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121616078 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121616150 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121616280 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 121616440 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121616455 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121616708 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 121617025 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121617027 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121617101 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121617148 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121617314 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 121617406 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 121617546 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 121617700 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 121617762 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121617837 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121617854 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121617895 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 121617936 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 121617966 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 121618028 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121618048 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121618235 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121618490 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 121618691 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121618923 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121619192 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 121619326 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121619350 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121619384 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121619651 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121619666 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121619727 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121619918 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 121619963 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121620006 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 121620320 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121620403 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 121620750 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121620786 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121620910 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121620912 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121620928 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121621126 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121621164 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 121621673 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 121621988 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121622011 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 121622909 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 121622989 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 121623015 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 121623073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121623237 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 121623254 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 121623278 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 121623367 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 121623474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121623567 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121623606 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 121623656 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 121623681 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121623688 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 121623748 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 121624239 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 121624255 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 121624384 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 121625134 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 121625239 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 121625329 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 121625583 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 121625595 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 121625610 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 121625803 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 121625915 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121625980 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 121626077 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121626153 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 121626338 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121626600 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121627349 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121627582 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121627737 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121627871 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 121627880 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 121627980 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121628146 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121628173 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121628249 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 121628289 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 121628390 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121628426 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 121628492 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121628584 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121628741 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121628861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121629074 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 121629091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121629172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121629702 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121629744 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121629917 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 121630701 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 121631286 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 121631332 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121632189 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 121632684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121632868 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121633109 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121633134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121633208 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121633514 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 121633861 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121634102 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 121634472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121635013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121635178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121635227 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121635403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121635564 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121635755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121635768 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121635786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121635792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121635854 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121635874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121636268 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121636389 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121636518 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 121636557 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121636809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121636813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121636842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121636990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121637015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121637218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121637372 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 121637466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121637598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121637620 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121637659 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121637673 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121637836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121637948 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 121638147 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121638228 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121638255 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121638286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121638343 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121638382 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 121638475 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 121638476 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 121638678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121638760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121638883 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 121638968 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121639024 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 121639818 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 121639950 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 121640244 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 121640252 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 121640275 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121640394 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121640736 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 121641013 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 121642121 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121642306 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 121642352 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 121642353 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 121642984 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 121642991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121643038 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121643479 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 121643668 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 121643687 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 121645187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121645233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121645279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121645314 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121645525 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121645565 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 121645685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121645814 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 121645887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121645982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121645983 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121646470 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121646562 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 121646573 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 121646588 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 121646649 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121646918 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 121646953 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 121646967 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 121647124 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121647148 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121647153 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121647164 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121647186 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121647372 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 121647453 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121647557 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 121647558 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 121647568 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 121647582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121647590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121647597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121647634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121647679 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121647835 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121647840 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121648085 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121648092 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121648132 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 121648155 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 121648359 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 121648495 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121648612 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 121648677 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 121648745 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121648891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121649052 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 121649057 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121649149 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 121649294 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121649323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121649464 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121649546 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 121649556 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 121649644 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121649694 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 121649702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121649729 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 121649744 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121649758 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121649763 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121649787 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121649816 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121649977 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121650056 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 121650103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121650601 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 121651006 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 121651124 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 121651150 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 121651151 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 121651173 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 121651185 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 121651189 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 121651245 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 121651264 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 121651354 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 121652695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121652992 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 121653053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121653177 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121653569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121653701 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 121654050 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 121654125 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 121654296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121654514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121654595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121655261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121656056 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121656665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121656723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121657075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121657246 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 121657293 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121657325 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121657402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121657416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121657496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121657921 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121658171 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121658287 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121658411 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 121658413 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121658643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121658928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121658996 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121659186 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121659320 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 121659346 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 121659404 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 121659625 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 121659735 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 121660264 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 121660267 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 121660359 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 121660368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121660401 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 121660720 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 121660765 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 121660808 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121660863 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121660875 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121660902 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121660977 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121661135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121661142 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121661152 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121661326 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121661378 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121661485 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121661743 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121661934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121662004 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 121662068 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 121662083 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121662159 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121662165 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 2 121662324 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121662352 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 121662763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121662779 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121662916 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 121663032 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 121663098 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121663347 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121663671 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121663680 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121663683 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121663696 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121663759 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 121663779 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121663831 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121663943 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121664085 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121664132 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121664146 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121664147 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121664211 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121664214 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121664292 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121664320 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121664489 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121664618 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121664623 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121664682 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121664699 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121664701 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121664719 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121664750 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121664765 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121664800 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121664820 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121664837 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121664862 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121665144 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121665190 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121665202 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121665246 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121665342 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 121665347 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 121665389 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121665508 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121665520 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121665544 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121665669 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121665688 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121665944 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121666137 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121666426 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121666437 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 121666443 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121666505 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121666581 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 121666660 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 121666679 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 121666864 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 121666969 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 121667131 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 121667259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121667521 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121667537 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 121667633 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 121667655 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121667672 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 121667695 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 121667731 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121667746 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121667872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121667891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121667953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121667975 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121668074 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121668085 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 121668095 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121668178 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121668444 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121668479 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121668501 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121668555 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 121668581 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 121668746 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 121669130 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121669307 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121669651 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121669679 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121669805 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121669991 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121669999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121670332 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121670412 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121670602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121670910 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121671273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121671343 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121671372 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 121671472 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121671480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121671530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121671612 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 121671714 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 121671751 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 121671757 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 121671872 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121672523 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121672698 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121672796 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 121672897 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121673057 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121673070 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121673237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121673307 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121673347 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121673401 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121673637 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121673652 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121673658 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 121673716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121673805 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121673827 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 121673880 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 121673883 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 121673936 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 121673953 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121674088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121674158 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 121674214 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 121674252 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 121674326 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 121674506 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 121674540 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 121675075 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121675090 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121675091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121675295 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121675321 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121676130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121676266 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121676641 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121676674 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121676814 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121676975 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121677059 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121677071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121677128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121677193 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121677241 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121677312 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121677484 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121677509 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121677514 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121677611 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121677684 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121677730 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121677746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121678016 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121678085 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121678137 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121678328 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121678346 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121678547 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121678570 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121678721 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121678748 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121678943 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121679089 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121679323 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121679712 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121679806 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121679873 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121680038 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121680198 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121680274 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 121680394 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 121680418 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121680475 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121680488 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121680497 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121680586 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121680602 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 121680670 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 121680693 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121680767 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121680786 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 121680799 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121680993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121681046 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 121681056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121681167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121681613 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121681765 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121682262 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 121682703 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 121682838 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 121682877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121683051 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 121683118 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 2 121683131 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 121683302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121683331 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 121683492 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121683579 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121683607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121683688 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 121683697 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 121683705 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 121683905 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 121684339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121684461 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121684509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121684610 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121684811 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 121684915 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 121685272 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121685278 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 121685805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121685892 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 121686526 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121686924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121687434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121687799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121688122 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 121688209 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 121688291 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 121688358 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 121688371 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 121688372 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 121688497 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121690016 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121690368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121690547 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121690882 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 121691090 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 121691441 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121691603 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 121691797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121692165 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121693081 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121693766 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 121694433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121694445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121694733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121696031 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121697736 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121698817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121699023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121699645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121699992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121700210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121700425 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121700444 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 121700653 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 121701322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121701711 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121701941 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 121702087 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121702234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121702313 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 121702749 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 121703056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121703249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121704114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121704289 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 121704370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121704845 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121705915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121705968 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121706332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121706895 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121707187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121707804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121708400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121708900 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 121709612 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121710229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121711870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121713771 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121713962 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 121713993 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121717121 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121717474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121717600 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121717643 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121718357 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 121719081 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121719195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121719513 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 121719960 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 121720203 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121720566 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121721101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121721193 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121721392 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121721496 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121722401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121722543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121722704 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121722892 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121723619 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121723731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121723744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121724238 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121724268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121724618 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121725286 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121725524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121725532 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121725892 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121726183 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121726598 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121727034 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121727763 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121727829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121729107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121729994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121730265 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 121731671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121732060 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121732262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121732626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121732958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121733497 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 121733850 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121734153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121734175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121734388 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121734715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121734820 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121735305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121735460 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 121735886 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121736193 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121737174 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 121737188 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121737379 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121738107 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 121738186 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121738323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121738754 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 121739166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121739368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121739955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121740010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121740826 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121741152 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 121741681 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 121741707 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121742789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121743223 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 121743433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121743587 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121743912 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121743993 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121744055 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121744583 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121744996 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 121745542 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121745943 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121746335 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121746728 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121746738 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 121746757 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121746897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121747270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121747477 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 121747620 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121747836 A T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 121748394 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121748502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121748617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121748763 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 121750071 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121750216 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 121750280 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 121750481 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121750604 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 121750644 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 121750992 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121751049 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121751082 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121751213 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121751849 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 121752323 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 121752335 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 121752379 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 121752597 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 121752625 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121752670 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121752674 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 121753005 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 121753568 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 121754067 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 121754118 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121754298 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 121754364 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121754407 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 121754533 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 121754547 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 121754648 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 121754694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121754769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121754807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121754890 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 121754945 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121754958 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121754960 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121755064 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121755279 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121755345 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 121755541 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121755575 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121755656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121756001 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121756372 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121756378 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121756383 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121756458 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121757115 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121757123 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121757206 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121757297 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121757537 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121757584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121757860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121758272 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121758387 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121758610 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121758648 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121759070 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121759147 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121759754 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121759772 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121760202 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121760222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121761007 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121761138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121761430 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121762301 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121762348 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121762396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121762576 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121762620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121762774 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121762890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121763008 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121763056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121763289 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121763488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121763620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121764044 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121764124 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121764352 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121764377 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121764380 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121766586 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121766701 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121767270 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121767403 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121767417 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121767482 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121767496 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121767706 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121767811 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121767821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121767833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121768067 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121768294 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121768401 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121768504 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 121769232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121769283 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121769301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121769379 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121769443 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121769810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121770254 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121770258 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121771089 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 121771563 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 121771603 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121771605 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121772029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121772294 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121773229 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121773678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121773830 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121773934 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 121774356 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 121774770 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 121775018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121775085 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 121775147 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121775880 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121776466 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121776472 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121776606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121777135 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 121778266 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121778588 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121778980 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121779856 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121780205 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 121780783 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121780972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121781590 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121781758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121781909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121782024 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121783221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121783626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121783795 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 121784031 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121784133 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121784897 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121785004 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121785681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121785782 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 121785874 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121785962 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121786085 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 121786144 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121786456 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121786712 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121787244 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 121787733 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121787941 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 121788600 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121788800 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121788832 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 121789327 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 121789603 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 121790238 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121790245 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 121790313 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 121791427 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121791834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121791848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121792890 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 121792910 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 121793238 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121794410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121794641 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 121794913 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121795125 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 121795614 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121795673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121795804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121796132 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 121796261 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 121796914 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 121797142 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 121797170 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 121797633 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 121797926 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121797946 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121798319 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 121798900 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 121799726 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 121800330 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 121800835 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121800870 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121801167 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121801251 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121801296 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121801361 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121801528 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121801856 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121801878 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121802192 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121802266 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121802334 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121802429 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121802544 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 121802627 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 121802630 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 121803310 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121803926 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121804524 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 121804948 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121805510 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 121805651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121805800 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121805923 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121805962 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121806037 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121807359 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 121807845 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 121807868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121808135 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121808572 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 121809241 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 121809487 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121809545 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121809875 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121810062 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121810091 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121810421 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121810716 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121810819 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121811285 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 121811468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121811484 C A Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 121811491 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121811519 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 121811760 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121811778 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121812133 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 121813079 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121813373 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121813784 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121813843 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121813934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121814296 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121814854 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121815032 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121815048 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 121815102 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121815243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121815271 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121815324 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121815449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121815687 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121815733 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121816511 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121816593 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121817094 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121817103 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121817407 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121817433 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121817436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121817447 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 121817853 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 121818084 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121818101 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121818325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121818475 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121818528 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121818548 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121818895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121819007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121819371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121820908 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121821323 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121824458 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 121824705 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121824993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121825232 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121825263 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121825387 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121825427 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121825598 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121825711 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121825749 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 121825768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121825787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121825876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121827941 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121828202 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121828333 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121829564 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121830623 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121830791 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121830862 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 121831804 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121831845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121831992 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121832207 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121832962 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 121833341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121833409 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121834773 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121835005 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121835207 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121835243 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121835369 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121835511 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121835940 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 121836098 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 121838474 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121839706 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121839994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121840143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121841006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121841603 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 121841823 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121841988 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121842006 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121842021 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121842282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121842336 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121843192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121843340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121844183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121844366 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 121844478 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121844575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121844774 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121845988 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 121846188 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 121847075 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121847325 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 121848157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121848232 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121848445 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121848993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121849023 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121849044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121849109 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121849460 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121849658 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 121850014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121850409 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 121850416 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 121850473 C G N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 121851066 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 121851081 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 121851211 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121851391 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121851537 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121851717 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 121851922 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121852223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121852306 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121852363 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121852551 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121852873 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121853393 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121853540 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121853910 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 121853979 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 121853997 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121854101 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121854874 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 121855651 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121855664 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121856288 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121856289 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121856536 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121856912 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121856914 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 121856934 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 121856958 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121856959 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121856972 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121857062 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121857135 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121857152 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121858126 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121858163 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121858807 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121858998 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121860729 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 121860789 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 121861037 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121861172 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121861819 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121861880 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121862448 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121862575 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121862677 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121863138 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121863504 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121863629 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 121863715 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121864138 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 2 121864160 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 121864919 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 121865342 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121865676 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121865834 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 121865840 T A Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 121866712 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121867268 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121867667 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121867813 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121868242 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121868489 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 121869701 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121869820 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121869826 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121869850 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121869950 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 121870834 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121870840 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121871282 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 121871605 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121872275 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121872356 G T Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 121872391 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 121873062 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121873315 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121873399 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121873594 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121874002 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121874038 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 121874050 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121874056 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121874065 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121874081 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121874460 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121874469 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121874925 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121874934 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121875190 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121880648 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 121880659 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 121882161 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 121882181 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 121882213 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 121882980 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121883290 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 121883441 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 121884193 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121884509 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121884590 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 121884834 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 121885723 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 121886424 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121886822 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 121886835 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 121886953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121887212 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121888874 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121888963 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 121889120 C G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 121889862 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121891328 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121891510 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121891523 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121891606 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121891670 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121891870 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121892786 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121894199 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 121894403 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121895364 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121895375 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121895401 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121896051 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121896384 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 121897578 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 121897907 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121898311 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121898985 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121899084 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 121899192 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 121899202 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 121899603 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 121899779 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121899825 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 121900050 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121900058 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121900652 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121901011 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121901544 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121902228 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 121902490 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 121902703 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 121902946 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121902994 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121904288 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121904457 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121904607 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121906067 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121906348 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121906479 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121906954 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121907824 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121908414 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121908672 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121908833 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 121909578 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 121910310 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121910391 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121911098 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121911497 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121912744 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121912833 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121914727 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121914917 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121915432 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121916398 A T N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 121916619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121916906 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 121917881 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121918045 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121918093 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121918455 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121919457 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 121919806 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121919884 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121919936 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121920041 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 121920136 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 121920359 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121920647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121921068 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121921584 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 121922310 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121924386 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121924428 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121924737 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 121924793 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 121924832 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121924858 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 121925068 G A Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 2 121925195 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 121925286 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 121925446 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 121925777 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 121925784 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 121925880 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 121926023 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 121926524 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121926533 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121927370 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 121927396 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 121927500 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121927520 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 121927739 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 121927758 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 121927937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121928032 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121928048 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 121928138 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121928250 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 121928311 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121928326 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121928380 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121928446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121928561 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121928717 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121928820 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121928847 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121929180 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121929189 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 121929416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121929476 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121929491 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121929963 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 121930009 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 121930042 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121930451 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121930605 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 121930816 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121930877 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121930902 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 121930924 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 121931236 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 121931264 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121931540 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 121931663 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121931690 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121931960 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121931964 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121932105 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121932139 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 121932303 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 121932417 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121932601 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 121932645 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 121932689 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121932706 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121933033 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 121933043 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 121933242 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121933267 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121933343 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 121933360 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 121933452 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 121934722 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 121934762 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 121935076 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121935108 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121935195 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121935217 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121935542 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121935575 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121936090 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121936323 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121936373 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121936534 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121936906 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121937064 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121937198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121937260 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121937285 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121937387 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121937726 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121937827 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 121938017 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 121938470 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 2 121938570 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 121938680 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121938756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121939128 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121939164 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 121939195 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121939544 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121939690 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 121939749 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121939815 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121939864 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 121939896 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121939970 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121940103 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121940159 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121940203 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121940213 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121940566 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121940596 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121940921 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121940988 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121941076 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121941251 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121941274 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121941373 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121941783 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121941787 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 121941858 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121941903 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121941950 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121941966 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 121941967 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 121941986 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121942011 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121942088 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 121942196 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121942220 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 121942391 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 121942399 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121942456 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 121942595 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 121942596 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 121942708 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 121942980 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121943105 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 121943765 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121945117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121946269 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 121946318 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 121947710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121948281 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 121948585 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 121949049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121949514 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 121950398 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 121950408 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 121950435 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 121950499 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 121950665 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 121950962 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121951073 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121951139 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 121951338 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 121952532 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121952619 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121953056 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121953501 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121954211 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121954663 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121955022 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121955147 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 121955157 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121955883 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 121956674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121957581 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121957729 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 121958169 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 121958499 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121958624 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121958922 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121959114 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121959145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121959816 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121961205 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121962701 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121964019 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121964178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121964711 A C N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 121964876 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 121965528 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121965750 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121965831 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 121965900 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121966660 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 2 121966928 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121967049 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121967057 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121967277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 121967397 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121967452 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121967561 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121967849 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121968723 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 121969259 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121973781 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121974838 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121974991 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121976036 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121978459 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121978507 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121978745 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121978884 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121978981 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121979618 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121979746 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 121980714 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121981039 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121981563 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121981650 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121981725 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121982010 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121982067 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121982257 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121982623 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121982706 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 121982907 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 121982910 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 121983067 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 121983185 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 121983226 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121983253 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121983458 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 121983504 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121983647 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121983669 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121983870 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 121984117 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121984168 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121984213 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 121984521 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121984545 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121985277 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121985363 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 121985675 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 121985913 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121985932 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121986270 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121986613 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 121987242 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 121987467 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121987492 C G Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 121987522 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121987537 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121987960 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 121988047 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 121988221 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 121988245 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121988431 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121988658 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121988923 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 121989153 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 121989171 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 121989221 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 121989422 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 121989641 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 121989666 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121989872 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121989892 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121990367 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121990531 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 121990739 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 121990871 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 121991013 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121991190 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121991240 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121991864 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 121991943 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 2 121992704 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121992940 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 121992958 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 121993048 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 121993281 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121993413 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121993434 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 121993734 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121993924 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 121993931 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 121994036 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121994417 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121994518 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121994569 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121994618 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121994646 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121994753 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121994768 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 121994920 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 121995011 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 121995056 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 121995413 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 121995651 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 121995666 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 121996307 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121996325 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 121996466 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121996512 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121996551 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121996562 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 121996860 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121997047 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121997151 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 121997194 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 121997251 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121997365 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 121997418 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121997668 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121998491 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 121998522 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 121998783 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 121999480 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 121999631 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121999725 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 121999730 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 121999767 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122000016 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122000033 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122000074 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122000125 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122000399 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122000415 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 122000447 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122000483 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 122000513 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 122000523 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 122000544 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 122000582 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 122000585 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 122000622 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 122000860 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122000975 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 122001004 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 122001096 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 122001100 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122001123 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122001432 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 122001598 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 122001694 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 122001784 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 122001842 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122001895 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 122002012 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122002061 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122002266 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 122002441 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122002453 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122002496 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122002610 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 122002630 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 122002776 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 122002961 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 122002969 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 122003221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122003489 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 122004081 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122004083 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122004103 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122004113 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 122004154 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122004309 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122004769 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122005166 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 122005223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122005268 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 122005282 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122005378 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122005566 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122005694 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122005749 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122005836 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122005869 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122006215 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 122006230 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 122006301 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122006429 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122006500 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122006742 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 122006858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122007098 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 122007480 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122007674 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122007738 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 122007753 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122007899 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 122008023 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122008247 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122008355 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 122008385 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 122009845 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 122010147 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 122010253 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 122010288 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 122010629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122010811 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122010941 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 122011045 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 122011344 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 122011529 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122011616 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122011644 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 122011674 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 122011975 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 122012154 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122012158 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122012187 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 122012359 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122012502 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122013430 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 122013624 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122013760 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 122013810 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 122013820 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122014047 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122014112 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 122014127 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122014227 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 122014269 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 122014467 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122014840 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122014852 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 122014969 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122015412 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122015609 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 122016041 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 122016512 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122017058 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122017138 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122017514 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 122017821 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122019099 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 122019191 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122019924 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 122020068 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 122020085 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 122020241 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 122020942 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 122021242 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122021472 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 122021843 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122022052 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122022084 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 122022123 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 122023514 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122023543 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 122023580 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122023809 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122023986 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 122024228 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122024281 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122024392 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 122024465 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 122024812 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 122024814 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122024834 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 122024920 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122024946 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122025031 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 122025037 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122025076 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 122025179 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 122025226 A T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 2 122025249 G T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 122025338 G T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 2 122025363 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 2 122025372 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 122025397 A T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 122025471 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 122025523 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 122025705 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 2 122025720 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 2 122025796 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 2 122025923 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 2 122026119 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 122026130 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 122026156 G C N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 2 122026173 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 122026287 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 122026358 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 122026416 A C N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 2 122026658 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122026886 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122026906 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122026943 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 122027050 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122027052 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122027077 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122027623 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122027804 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 122027849 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122027851 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122028015 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122028209 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122028472 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122028758 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 122028838 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122029020 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122029041 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122029493 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122030656 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 122030740 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 122030755 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 122030761 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 122030807 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 2 122030881 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 122031722 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 122033206 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 122033268 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 122034264 A T N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 122034949 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 122035336 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 122035436 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 122037232 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122037297 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 122037589 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 122037903 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122038070 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122038089 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122038506 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 122038520 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122038790 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 122038891 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 122039422 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122039438 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122039456 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122039694 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122041164 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122041179 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122041615 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 122041657 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 122041849 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 122041855 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 122041974 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122042068 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 122042070 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 122042177 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 122042354 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122042391 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 122042584 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122042722 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 122042752 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 122043013 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122043243 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122043796 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 122044108 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122044236 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122044391 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122044482 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122044524 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122044637 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 122044729 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 122044836 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 122045009 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 122045033 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 122045053 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 122045057 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 122045264 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 122045268 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 122045377 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122045498 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122045522 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122046459 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122046583 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122046599 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122046733 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122047034 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122047289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122047352 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122048393 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122048652 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122048745 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122049107 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122049898 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 122050003 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 122050650 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122050957 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122051137 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122051201 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 122051242 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 122051462 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 122052353 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122052505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122052874 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 122053180 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122053211 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122053243 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 122053304 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 122053398 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 122053479 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 122053631 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 122053675 C G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 122054024 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 122054096 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122054271 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 122054317 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 122054509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122054510 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122054540 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 122054613 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 122054781 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 122054802 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 122054840 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122055010 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 122055016 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 122055113 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 122055499 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 122055694 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122055758 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122056211 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 122056212 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 122056261 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122056584 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122056611 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 122057026 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122057045 G T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 122057879 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122057892 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122058019 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122058029 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 122058486 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122058598 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122059090 C A Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 122059113 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 122059586 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 122059726 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122060176 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 122060459 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 122060503 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 122060890 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122061741 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122061960 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122062366 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 122062454 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122062486 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 122062582 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 122062588 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 122062653 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 122062824 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 122063078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122063229 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 122063677 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122063796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122064007 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122064335 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122064363 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122064425 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 122064488 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 122064718 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 122064813 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 122064814 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 122064828 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122065010 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 122065246 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 122065247 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122065285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122065459 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 122065611 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 122065778 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 122065809 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 122065954 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 122066043 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 122066056 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 122066113 A C N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 2 122066210 A T N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 122066217 G A N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 122066546 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 122066559 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 122067423 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122067440 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 122067790 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 122068014 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 122068081 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 122068211 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 122068247 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 122068558 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 122068618 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 122068639 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 122068646 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 122068845 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 122068879 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122068966 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122069038 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 122069048 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 122069071 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 122069109 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 122069246 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 122069251 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 122069257 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 122069262 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 122069290 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122069484 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 122069911 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 122070051 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 122070280 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 122070408 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 122070633 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 122070964 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 122071177 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 122071635 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 122071667 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 122071823 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122071846 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 122071927 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 122072027 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122072087 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122072148 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122072312 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 122072345 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122072540 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122072757 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122073004 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 122073167 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122073225 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 122074236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122074797 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 122076035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122076472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122077261 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 122078036 C G N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 122078100 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 122078607 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 122078779 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122079363 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122082941 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122083843 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122083845 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122084503 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122084963 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122085386 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122085419 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122085452 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 122086207 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122086478 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 122087830 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122087933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122088146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122088150 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122088176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122089302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122089512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122091546 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122092152 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 122092174 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 122092538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122093338 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 122093365 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122093528 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 122093540 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122093701 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122094116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122094314 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122094448 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122095118 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122095283 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122095287 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 122095413 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 122095506 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 122095776 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122095808 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 122095890 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122097012 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 122097028 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 122097190 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 2 122097244 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 122097726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122097969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122098027 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122098586 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122098999 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122102021 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 122103274 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122103344 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122103635 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122103721 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122103809 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 122103900 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122104844 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 122105407 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122105448 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122105516 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122105520 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122105929 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122106099 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122107651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122107727 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 122108177 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122108310 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122108404 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122108448 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122108659 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122108695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122108704 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122108709 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 122111417 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122111750 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122111752 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122112015 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122113985 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 122114110 G T N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 122115729 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 122115751 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 122115819 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 122115951 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122116052 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 122116586 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122116781 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122117037 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122117242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122117851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122117963 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 122118900 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 122119012 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122119264 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 122119492 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 122119528 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 122119558 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 122119613 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 122119733 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 122119749 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 122119793 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 122119828 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 122119962 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122120004 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122120108 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122120205 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122120252 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122120278 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122120302 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122120311 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122120610 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122120614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122120657 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 122121023 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 122121893 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 122122586 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 122122757 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 122122874 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 122122888 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122123505 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122123955 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122124023 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122124086 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122124094 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122124217 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122124251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122124507 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122124548 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122124662 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122124682 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122124708 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122124935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122125531 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 122125584 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122125735 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122125767 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122126017 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122126221 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122126588 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122126736 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122127110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122127204 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122127215 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122127222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122127361 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122128219 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 122129653 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122129825 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122129880 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122129924 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122130699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122130710 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122130715 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122130810 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122130846 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122131749 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122131796 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122132214 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122132379 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 122132380 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122132797 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 122132882 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 122133266 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 122133431 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122134051 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 122134709 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 122135638 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 122135656 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 122136350 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122136357 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122136379 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122136713 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 122136840 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 122137237 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122137304 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122137502 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122137712 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122137740 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122138120 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122138990 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 122139208 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122139265 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122139584 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 122139603 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 122139617 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 122140376 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 122140447 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 122140626 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122140653 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 122141309 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122141348 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122141552 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122141655 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122141750 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 122142751 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 122142927 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122142938 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 122144349 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122144391 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122144453 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122144549 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122145251 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 122145713 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122145738 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 122145779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122145883 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 122146149 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 122146330 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 122146413 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 122146765 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 122146868 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122146881 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122146900 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122147093 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122147172 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122147281 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122147343 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122147361 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122147743 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 122147870 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 122147908 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122147937 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122147961 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122148086 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122148130 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122148309 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 122148751 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 122148776 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122149594 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 122149599 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 122150720 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122151152 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 122151285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122151897 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122152017 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122152084 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 122152085 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 122152703 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122152797 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122154231 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 122154313 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122154645 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122154760 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122155136 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122155595 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122156263 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 122156284 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122156289 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122156402 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 122156436 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 122156931 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122157049 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 122157077 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 122157192 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 122157198 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122157268 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122157323 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122157458 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 122157859 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122157974 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122158094 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122158103 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 122158239 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 122158250 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122158274 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122158567 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 122158606 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122158673 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122159011 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122159116 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 122159202 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122159240 T G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 122159370 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 122159389 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122159520 C G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 122159768 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 122159964 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122160580 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122160599 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 122160685 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122160836 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122160864 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122160865 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122160925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122160977 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122161033 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122161056 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122161094 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 122161095 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 122161167 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122161208 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122161356 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122162378 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 122162430 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 122162891 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 122162941 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 122163240 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 122164769 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122164903 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122165231 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122166354 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122167334 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122171008 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122171147 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122171550 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 122171624 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122172642 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122172737 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122173478 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122174177 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122175479 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122175641 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122175653 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122175664 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122176173 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122176284 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 122176517 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 122176526 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 122177136 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122177245 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122178605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122178646 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122179027 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122179114 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122179948 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122180653 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122180789 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 122182163 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 122182165 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122182632 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122183811 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 122184110 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122184141 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122184631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122184898 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122185952 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122186724 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122186870 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 122186901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122187042 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 122187090 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 122187117 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 122187172 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122187335 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 122187337 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 122187902 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122188272 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122188359 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 122189230 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122189284 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122189883 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122189894 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 122191735 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122192204 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122192232 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122192301 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122192777 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 122193249 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122193285 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122193393 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122193415 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122193757 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122194259 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122195411 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122195422 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122195756 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 122195944 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122196191 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122196275 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122196295 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 122196320 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 122196937 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122196976 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122197004 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122197039 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 122197264 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 122197286 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 122197444 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122197722 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122198102 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122198213 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122198214 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122198525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122198779 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122198908 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122199027 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122199063 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122199131 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 122199335 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122199430 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122199604 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122199641 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122199941 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122200135 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122200233 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122200238 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122200553 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122200594 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122200967 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 122201506 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122201814 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122202053 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122202088 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122202327 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 122202407 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 122202845 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 122202864 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 122202909 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122203017 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122203283 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 122203915 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122203968 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122203975 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122204001 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122204011 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122204033 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122204037 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122204047 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122204134 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122204139 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122204189 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122204197 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122204230 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122204271 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122204538 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122206355 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122207764 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122208053 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 122209159 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122209196 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122209246 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122210002 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122210053 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122210162 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122210216 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122210229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122210280 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122210288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122210348 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122210370 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122210374 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122210473 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122210600 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122210755 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122210817 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 122210901 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122210935 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122210988 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122210995 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 122211049 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122211061 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122211066 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122211153 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122211155 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 122211169 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122211208 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 122211229 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122211312 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122211333 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122211693 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122211761 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 122211788 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122211794 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122211905 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 122211953 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122211960 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122212023 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122212035 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122212148 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 122212629 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 122212702 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 122212945 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 122213516 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 122213602 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122213637 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122213661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122213678 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 122213689 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 122213714 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122213715 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 122213823 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122214223 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122214695 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122214756 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122214954 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122214981 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122215030 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122215041 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 122215072 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215081 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122215087 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215102 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215145 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122215146 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215172 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215199 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122215216 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215241 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122215274 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215276 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215290 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122215295 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122215323 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122215357 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122215411 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122215469 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215492 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215494 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215520 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122215544 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122215553 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215556 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122215754 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122216223 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 122216237 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122216263 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122216895 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122216924 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122216929 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122216967 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122217019 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 122217035 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 122217613 A T Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 122217616 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 122217659 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 122217669 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 122217989 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122218048 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122218071 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122218229 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122218608 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122218721 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 122218727 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 122218793 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 122218845 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 122218849 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 122218872 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122218912 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 122218948 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 122218970 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122218991 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122219022 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122219023 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122219102 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122219136 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 122219142 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 122219219 A T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 122219256 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 122219285 C A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 122219287 G T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 122219313 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 122219322 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 122219393 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 122219402 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 122219420 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 122219426 G T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 122219528 G C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 122219557 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122219574 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122219641 C G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 122219760 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 122219763 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 122219816 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 122220152 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122220174 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122220344 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122220378 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122220379 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122220405 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122220426 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122220539 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122220598 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122220599 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122220610 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122220623 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122220631 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122220653 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122220657 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122220666 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122220847 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122220903 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122220958 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122220990 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122221008 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122221012 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122221027 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 122221072 G A Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 122221090 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 122221225 A T Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 122221233 C A Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 122221318 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 122221335 A T Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 122221361 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 122221692 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122221695 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 122221710 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122222052 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122222060 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 122222074 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122222106 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122222306 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 122222324 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122222422 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122222710 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122222860 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122224696 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 8 10 0 8 1 2 122224712 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 122224944 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 122224969 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 122225276 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122225651 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 122225661 A T Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 122225666 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 122225921 T C Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 122225952 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 2 122225958 T G Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 2 122225963 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 2 122225975 T A Y N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 122226043 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 122226202 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122226209 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122226376 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122226381 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 122226387 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122226394 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122226404 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122226459 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122226475 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122226486 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122226577 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122226597 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122226693 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 122226790 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122226805 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122227256 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 2 122227292 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122227470 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122227654 C A Y N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 122227676 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 122227689 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 122227786 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122227790 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 122227821 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122227840 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122227852 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122227883 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122227918 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 122227925 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 122227951 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 122228005 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 122228348 A G N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 122228359 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 122228410 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 122228449 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 122228525 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 122228541 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 122228663 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 122228667 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 122228675 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 122228681 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 122228706 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122228935 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122228949 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122229281 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122229322 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122229346 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 122229358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122229403 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122229404 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122229443 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122229454 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122229455 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122229465 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122229467 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122229507 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122229518 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122229612 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122229616 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122229625 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122229675 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122229686 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122229740 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122229747 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 122229762 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122230584 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 122230926 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 122231105 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 122231222 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 122231250 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122231252 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 122231522 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122231584 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 122231599 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122231671 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122231694 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122231715 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122231741 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122231752 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 122231753 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122231772 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122231784 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122231981 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122232046 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122232824 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122232869 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122232874 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122233329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122233501 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122233663 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122233682 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122233724 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122233852 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122233863 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122233911 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122233919 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122234028 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122234052 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122234065 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122234100 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122234107 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122234157 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122234168 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 122234207 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122234244 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122234262 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122234271 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122234282 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122234311 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122234312 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122234324 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122234349 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122234373 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122234386 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122234419 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122234444 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122234448 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122234458 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 122234495 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122234500 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122234545 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122234568 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 122234597 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122234614 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 122234646 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 122234735 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 122234772 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122234787 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122234822 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122234910 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122235199 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 122235446 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122235981 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 122239428 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 122239691 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 122239985 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 122240097 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 122241278 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122242407 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122242434 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 122242453 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122242471 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122242472 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122242483 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122242497 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122242555 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122242560 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122242592 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122242594 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122242619 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122242746 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122242777 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122242805 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122242822 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122242827 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122242840 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122242926 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122242949 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122243020 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122243043 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122243097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122243142 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122243171 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122243181 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122243212 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122243223 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122243900 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122243921 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122244029 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122244118 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122244130 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122244170 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122244430 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122244460 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122244461 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122244486 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122244540 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122244552 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122244591 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122244613 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122244663 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122244671 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122244729 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122244732 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122244748 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122244859 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122245090 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122245118 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122245119 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122245416 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122245486 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122245538 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122245539 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122245781 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 122245924 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122246189 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122246787 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 122246831 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122247200 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122247661 G T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 122248232 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122248454 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122248465 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 122248489 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122248509 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122248519 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122248535 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122248553 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122248749 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122248784 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122248795 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 122248798 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122248809 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 122248948 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 122249622 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122249629 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122249643 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122249653 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122249691 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122249694 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122249711 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122249802 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122249839 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122254276 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122254513 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122254536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122254660 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122255590 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 2 122255742 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122255857 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 122255921 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 122256383 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 122257215 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122257696 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 122257931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122258158 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122258633 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 122258674 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122258883 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 122258895 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 122258945 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122259182 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 122259236 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122259927 T A Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 2 122260130 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 122261101 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 122261761 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 122262016 C T Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 122263631 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 122263805 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122263846 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122264281 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122264293 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122264732 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 122264985 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 122265176 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 122265187 T G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 122265199 A T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 122265226 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 122265372 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 122265384 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122265397 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 122265417 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122265443 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 122265459 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122265508 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122265513 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122265546 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122265645 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122265788 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 122265896 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122266070 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 122266164 A G Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 122266828 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122266983 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122267058 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 122267116 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122267323 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 122267362 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122267751 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 122267767 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122268151 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 122268178 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 122268517 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 122268690 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122268883 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 122268914 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 122269046 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122269049 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122269077 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122269108 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122269335 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122269353 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 122269380 A C Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 122269518 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122269535 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 122269698 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 122270272 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122270919 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 122271149 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 2 122271185 G C N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 122271296 C A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 122271297 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122272000 A T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 122273050 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122273074 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 122273103 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 122273119 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122273128 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 122273331 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 122273368 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122273379 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122273408 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122273947 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122274134 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122274260 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122274302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122274368 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122274460 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122274956 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 122275012 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122275050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122275318 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122275360 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122276025 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122276126 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122276236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122276405 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122276546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122277114 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122277422 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 2 122277748 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 122279163 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 122279246 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122279368 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 122279417 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 122279466 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122279467 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122279535 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122279546 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122279631 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 122279721 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 122281952 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122282049 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122282050 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122282379 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 122282490 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 122282505 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 122282976 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122285246 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 122285282 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 122285287 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 122285345 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 122285351 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 122285382 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122285438 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 122285694 C A Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 122285712 T C Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 122285796 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 122286680 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 122286720 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122286765 A G N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 122286817 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 122286952 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 122287787 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122287861 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122287938 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 122288644 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122288835 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 122288840 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 122289352 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122289513 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 122289738 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 122289786 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 122289887 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122289897 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122289931 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122289959 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122289963 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122289996 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 122289997 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122290010 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122290017 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122290065 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122290090 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122290129 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122290160 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122290285 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122290309 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122290326 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122290360 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122290373 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122290376 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122290391 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122290396 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122290420 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122290695 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122290763 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122290836 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 122290849 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 122290856 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122290881 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 122290929 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122290961 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 122291059 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122291223 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122291229 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122291246 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122291259 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122291293 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122291299 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122291473 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122291498 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122291660 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122291665 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122291743 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 122291792 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122291812 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 122291816 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 122291830 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122291863 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122291882 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122291962 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122292007 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122292084 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122292117 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122292119 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122292135 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122292139 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122292150 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122292262 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 122292498 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122293395 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 122293610 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122293717 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122293862 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122295634 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122295922 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122296068 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122296465 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122296699 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122296860 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122296901 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 122297361 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122297605 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122297696 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122297918 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 122297991 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 122298284 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122298305 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 122298611 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 122298704 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122298710 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122298719 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122298724 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122299025 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 122299207 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122299352 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 122299598 C G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 122299603 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 122299646 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 122299917 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 122300090 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 122300093 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122300725 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 122300913 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 122300949 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122300979 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122301045 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122301067 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122301121 C A Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 122301178 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 122301182 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122301191 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122301195 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122301311 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122301351 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 122301363 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 122301398 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122301405 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122301514 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122301519 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122301543 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 122302102 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122302260 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122303471 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 122304052 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122304058 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122304070 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122304108 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122304110 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 122304137 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122304268 G C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 122304374 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 122304446 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122304460 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 122304468 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 122304577 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122305316 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122305317 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122305341 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122305349 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122305697 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122305706 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 122306270 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.15 0.8 0.05 22 18 3 16 1 2 122307046 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122308064 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 122308219 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122308268 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122308273 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122308321 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122308326 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 122308350 G A Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 122308359 C G Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 2 122308372 G A Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 122308429 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 122308630 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 122308660 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 122308721 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122308734 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122309098 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122309410 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122310200 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122310208 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122310250 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122310316 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122310350 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 122310454 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 122310465 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 122310477 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 122310732 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122310733 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 122312488 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122313275 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122313487 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122313557 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 122313572 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 122313597 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122313737 T A Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 122313926 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122313979 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 122313989 C A Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 122314032 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 122314097 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 122314145 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 122314367 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 122314435 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122314504 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 122314506 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122314549 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122314621 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 122314837 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 122314851 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 122314872 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 122314908 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122314929 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 122314930 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 122315270 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122315624 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122315847 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122315983 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 122316178 G A Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 122317356 T C Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 122317360 A G Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0 0.9375 0.0625 15 17 0 15 1 2 122317398 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 122317457 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 122317476 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122317597 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 2 122317789 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 122317810 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 122317818 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122317831 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 122317839 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122317853 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122317857 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122317867 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122317872 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 122317944 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122317949 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122317955 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122317988 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122318019 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 122318022 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122318451 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122318464 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122318509 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 122318538 T G Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 122318832 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 122318833 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 122319523 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 122319537 T G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 122319552 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 122319554 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 122319592 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 122319609 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122319611 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122320066 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 122320706 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 122320842 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 122321034 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122321091 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122321125 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 122321467 G C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 2 122322112 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122322163 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 122322595 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122322610 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 122322707 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122322727 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122322770 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122322830 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122323149 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 122323182 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122323194 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 122323209 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122323242 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 122323664 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122324081 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122324128 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122324779 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122324846 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 122324896 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 122325095 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 122325224 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122325288 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122325673 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 122325699 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122326240 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122326280 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122326542 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122326562 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122326741 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 122327488 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 122327524 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 122327537 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122327859 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122328156 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122328730 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122329055 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122329110 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122329255 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 122329719 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122329907 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 122330076 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 122330153 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122330178 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122331989 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 122332008 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 122332506 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 122332830 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122332915 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 122334743 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 122334788 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 122335631 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 122335822 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 122335828 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 122335961 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 122335998 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 122336234 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122336432 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122336584 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122336590 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122336852 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 122336977 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 122336989 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122337328 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122337393 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 122337428 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122337734 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122337826 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122338058 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122338059 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122338263 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122338280 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 122338290 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122338445 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122338904 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 122339784 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122340174 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 122340272 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 122340302 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122340358 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 122340369 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 122340416 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122340850 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 122341284 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122341616 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 2 122341829 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 122344448 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122345238 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 122345426 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122345442 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 122345459 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122345565 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 122345733 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122347823 C T Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 122348183 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 122348199 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122348333 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 122348374 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 122348482 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 122348494 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122348569 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 122348580 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 122348581 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 122348631 G A Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 122348646 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 122348768 T A N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 122348789 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 122348809 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 122348916 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 122349052 A T Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 2 122349095 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 122349115 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122349195 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 122349196 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 122349374 T A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 122349446 T A N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 122349472 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 122349537 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 122349554 T G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 122349638 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 122349653 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 122349694 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122349699 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122349873 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122349893 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122350003 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122350016 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 122350022 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122350143 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 122350261 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122350273 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 122350290 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 122350291 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 122350320 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 122350370 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 122350408 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 122350545 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 2 122350650 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 122350665 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122350678 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122350770 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122350801 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 122350804 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 122350935 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 122350999 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 122351309 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 122351442 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 122351461 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 122351649 G C Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 122351657 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.375 0 0.625 6 10 3 0 5 2 122351758 T A N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 2 122351776 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 122351852 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 122351860 C T Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 2 122351883 A T Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0 0.5 10 10 5 0 5 2 122351907 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 2 122351947 A T Y N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 122351962 G T Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 122352092 C G Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 122352160 C T Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 122352276 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122352423 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122352436 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 122352638 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 122352646 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 122352675 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 122352680 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122352697 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 122352746 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 122352794 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 122352814 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122352835 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 122353592 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 2 122353613 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 122353686 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122353730 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 122353836 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 122353848 A T Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 122353862 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 122353900 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 122353974 T A Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0 0.5 10 10 5 0 5 2 122353977 G T Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 122354157 A C N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 2 122354166 C T Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 2 122354219 T A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 122354258 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 122354412 G T Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 122354487 A G N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 122354536 C A N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 122354561 A G Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 122354567 G A Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 122355148 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 122355211 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 122355262 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 122355850 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122355867 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122355888 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122355984 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 122356148 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 122356230 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122356255 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122356266 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 122356290 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122356420 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 122356446 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 2 122356464 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 122356876 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122357181 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122357228 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122357331 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122357437 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122357476 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122357521 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122357553 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 122357562 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122357590 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122357639 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 122357801 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 122357877 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122357980 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122358023 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122358148 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122358239 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122358317 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122358439 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122358479 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122358930 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 122359523 T G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 122359580 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122359605 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122359983 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122359995 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122360029 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 122360527 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 122360719 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122360771 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 122361057 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122361192 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 122361258 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122361270 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 122361646 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122362009 T C Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 122362390 T C Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 122362943 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 2 122363347 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 122363394 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 122365440 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122365472 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 122367428 G C Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 122367526 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 2 122367722 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 122367738 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 122367785 G T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 122367826 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 122367833 C G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 122368003 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 122368029 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 122368088 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 122368128 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 122368131 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 122368181 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 122368238 A G Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 122368339 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 122368392 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 122368420 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 122368588 A T N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 122368634 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 122368761 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 122368971 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 122369063 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 122369115 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 122369139 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 122369597 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122369691 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122369705 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122369993 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 122370054 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 122370126 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122370189 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 122370215 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122370580 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122370584 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122371076 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122371280 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122371509 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122372707 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122372796 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122372907 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122372971 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122373043 G A Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 122373105 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 122373177 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122373313 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122373461 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 122373503 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 122373536 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 122373714 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 122373824 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122374016 A G Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 122374167 C A Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 122374299 G C Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 122374504 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 122374855 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 122375162 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 122375430 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 122375512 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122376064 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122376400 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 122376699 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 122376784 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 122376854 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 122377192 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 122377211 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 122377578 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 122377639 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 122377804 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122377895 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122378059 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 122378400 A T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 122378532 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122378612 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 122378735 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122379465 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122379586 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122379612 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122379964 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122380436 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 122380704 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122380711 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 122380748 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122381158 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122381176 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122381236 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 122381276 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 122381284 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122381319 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122381329 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122381333 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122381358 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122381365 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122381433 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122381479 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122381485 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122381533 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122381553 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122381563 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122381582 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 122381617 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122381726 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 122381946 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 122382212 T A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 122382755 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122383159 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122383172 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122383621 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122383747 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122383843 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122383864 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 122383901 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 122383983 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 122384231 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122385799 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122385962 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122386187 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122386369 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 122386695 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122386708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122386953 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122387155 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122387219 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122387248 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 122387285 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122387375 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 122387405 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122387630 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122387664 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122387877 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 122387906 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122388158 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122388205 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122388239 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122388268 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122388287 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122388365 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122388370 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122388647 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122388650 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122388802 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 122388901 T G N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 122388909 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 122389161 A C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 122389209 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 122391274 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122391283 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122394509 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 122394829 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122394864 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122394867 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 122395430 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 122395450 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122395632 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122395903 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 122396007 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 122396052 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122396197 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122396219 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122396258 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122396408 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122396695 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122396938 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 122397198 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122397477 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 122397732 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 122397850 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 122397920 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122398060 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122398073 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122398219 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122398374 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122398396 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122398398 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122398488 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122398568 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122398743 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122398861 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 122398876 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 122398933 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 122398967 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 122398982 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122399263 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122399615 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122399659 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122399769 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122399867 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122401059 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122402342 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122402438 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122402606 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 122402844 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122403028 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 122403070 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122403203 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122404133 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 122405010 T G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 122405110 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 122405159 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122405235 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122405381 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 122405505 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 122405587 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 122406198 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122406444 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122406504 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122406600 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122406664 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122406668 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122406692 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122406994 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122407029 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122407242 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 122407285 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122407478 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122407627 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122407864 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122407979 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122408174 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122408818 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122408924 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122409157 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122409216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122409353 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122409475 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122410070 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122410192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122410211 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 122410371 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 122410372 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 122410433 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122410526 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122410527 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122410621 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 122410641 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122410784 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122410890 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122410891 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122410913 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122410955 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122410972 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122411026 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122411159 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122411170 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 122411193 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122411458 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122411498 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 122411503 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 122411517 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 122411544 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122411673 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 122411719 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 122411825 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 122412357 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 122412507 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122412514 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122412531 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122412609 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122412637 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122412671 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122412678 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122412713 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122412748 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 122413098 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122413140 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122413159 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122413189 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122413259 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122413311 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 122413358 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122413563 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122413888 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122414149 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122414778 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122414793 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122414926 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 122414943 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 122414965 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 122414981 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 122415019 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 122415039 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 122415072 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 122415131 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122415370 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 122415653 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 122415655 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 122416680 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122416683 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122416791 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122417096 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122417401 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122417432 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122417437 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122417730 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122417900 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122417924 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122418218 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 122418343 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 122418379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122418631 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122418799 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122419045 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122419168 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122419266 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122419578 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122419823 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122420084 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122420485 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122420813 T A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 122421692 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122421955 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122421984 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122422132 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122422767 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122422909 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122422920 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122422977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122424144 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122424453 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 122425008 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 122425127 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 122425192 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 122426110 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 122426124 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 122426299 A T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 122426317 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 122426677 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 122426865 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 122426957 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122427135 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122427615 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122427797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122427801 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 122428185 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 122428331 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122428485 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122428684 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 122428728 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 122428756 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122428762 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122428780 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122429028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122429037 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122429130 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122429603 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122429858 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 122430141 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122430223 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122431171 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122431182 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 122431429 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122431617 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122431674 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122431697 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122432271 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122432446 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122432584 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 122432641 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 122432758 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122432829 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122432910 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 122433758 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122434164 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122434274 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 122434565 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 122434679 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122434966 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 122434967 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 122435063 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 122435118 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122436493 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122436785 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122436790 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122437187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122438074 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122438161 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122438634 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122439831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122439905 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122439981 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122440439 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 122440601 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122440775 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 122440777 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 122441013 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122441504 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 122441643 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122441802 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122441937 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122442225 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122442245 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 122442308 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122442863 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122442969 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122443112 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 122443149 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 122443304 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 122443386 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122443455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122443540 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122443796 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 122443868 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122443882 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 122443965 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122443999 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122444040 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122444044 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122444080 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122444098 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122444670 C G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 122444680 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 122444726 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122444823 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122445030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122445073 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122445134 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 122445149 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122445164 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122445331 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122445354 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 122445445 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122445463 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122445576 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122445583 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 122445849 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122445858 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122445889 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 122445930 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122445943 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122445946 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122445957 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122445988 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446008 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446014 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446026 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446322 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446628 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446646 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446685 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446686 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122446720 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446753 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446807 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446860 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446862 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122446896 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446955 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122446978 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122447144 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122447560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122447674 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122447697 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122447915 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122448004 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122448436 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 122448722 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122448874 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122448892 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122448904 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 122448974 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122448994 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122449179 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 122449275 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122449387 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122449600 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122449973 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 122450737 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 122450750 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 122450840 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 122450847 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 122450871 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 122451451 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 122451453 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122451543 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 122451601 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 122452745 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 122452809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122453091 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 122454296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122454711 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 122455053 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 122455180 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 122455312 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122455686 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122455762 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122456691 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122456829 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122457096 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122457644 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 122458157 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 122458534 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 122458807 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 122458836 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 122459194 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122459260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122459622 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 122459810 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 122460022 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122460081 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122460101 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 122460150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122460219 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 122460327 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 122460338 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122460407 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122460420 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122460578 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122461045 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 122461051 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122461181 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122461227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122461422 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122461439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122461496 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122461640 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122461667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122462081 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122462835 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122463141 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 122463342 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122463368 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 122463544 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 122463631 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 122463714 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 122463725 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 122465023 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122465137 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122465167 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122465914 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122467308 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122467455 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 122467535 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122467678 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 122467983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122468997 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122477016 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122481044 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122481071 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122481494 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122481593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122481728 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122482483 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122482501 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122482672 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122482931 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122482991 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122483102 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122483971 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122484107 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122484197 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122484246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122484374 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122484462 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122485036 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122485519 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 122485560 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122485783 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122486472 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122486495 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122486507 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122486558 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122486771 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122486772 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122486857 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122487301 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 122487406 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 122487466 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 122487659 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122487676 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122487724 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122487815 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122487826 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122487889 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122488071 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122488162 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122488265 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122488467 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122488488 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122488502 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122488607 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122488804 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122488951 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122488954 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122489095 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122489280 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122489393 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122489649 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122489650 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122489661 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122489779 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122489903 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122489978 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122489995 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122490482 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 122490518 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 122490608 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 122490795 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122490811 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122491747 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122491799 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122491823 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122491941 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122492706 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122492730 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122492876 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122493007 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122493417 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122493926 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122494099 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122494224 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122494248 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122494313 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122494350 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 122494515 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 122494695 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122494720 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122495042 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122495307 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122495401 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 122495579 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122495799 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122495851 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 122496289 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122497162 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122497655 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122497660 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122498089 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 122498292 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122498840 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122498880 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122499705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122500080 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122500657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122500688 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122500792 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122500928 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122502289 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122502353 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122502690 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122503303 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122503410 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122503733 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122504272 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122504430 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122504992 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122505050 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122505170 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122505249 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122505561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122506122 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122509050 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122509497 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122509506 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122510692 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122510930 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122511076 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122511540 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122512969 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122513025 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122513053 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122513203 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 122513960 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122519902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122520121 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122520720 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122521182 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122521316 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122521501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122522511 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122522693 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122522887 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122523615 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122523721 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 122523750 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122523852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122525356 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122525969 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122526142 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122526416 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122526765 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122527036 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122527390 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122527555 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 122527854 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 122528856 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122528969 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122529204 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 122529656 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122530343 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 122530371 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122530766 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122530776 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122530848 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122531042 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122531438 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122531573 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122531579 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 122531590 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 122531607 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122531720 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122531745 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 122531746 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122531893 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122532043 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 122532057 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122532101 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122532108 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122532420 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122532534 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122532827 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122533080 A T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 122533171 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 122534586 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122534809 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122534856 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122534921 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122535195 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122535217 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122535319 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122535569 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122535723 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122535876 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 122535932 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122535936 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 122536287 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 122536465 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122536630 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122536660 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122536756 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122536766 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122536781 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122537958 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122538268 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122538301 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122538305 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122538316 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122538384 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122538797 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122538824 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 122538950 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122539281 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 122539405 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 122539492 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 122539537 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122539733 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 122539824 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 122539995 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 122540042 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 2 122540064 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 122540163 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122540279 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 122540343 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122540481 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122540615 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 122540687 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122540751 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122541133 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122541250 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122541303 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122541312 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 122541315 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122541330 C A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 122541839 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122542276 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122542425 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 122542550 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122542553 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 122542619 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122542691 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 122543410 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 122543566 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122543920 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122543995 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122543996 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122544256 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122544849 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 122544851 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 122544916 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 122544984 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122544985 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122545512 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 122545718 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 122545786 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122545855 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 122545891 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 122545994 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 122546003 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122546087 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122546154 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 122546442 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122547225 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122547274 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122547457 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 122547856 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122547964 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122548303 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122548524 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 122548540 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122548811 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122548871 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122548919 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 122548942 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 122549055 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 122549206 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122549260 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 122549395 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122549650 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 122549709 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 122549725 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122549739 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122549767 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 122549797 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 122549798 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 122549878 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 122550051 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122550153 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122550183 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 122550854 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122550866 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 122550971 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122551028 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 122551038 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122551336 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122551519 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 122551655 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122551822 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122551916 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 122552046 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122552062 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122552063 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122552234 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122552674 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 122552707 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 122552733 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122552875 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122552956 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122553036 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122553233 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122553421 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122553974 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122554877 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 122555088 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122555462 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 122555521 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122555752 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 122555789 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 122555856 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 122555901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122556052 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 122556684 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122559168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122559425 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122560041 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122560208 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122560235 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 122560635 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122560778 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122561019 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122561082 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122562614 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 122562664 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122562921 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122563426 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122564919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122568293 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122568704 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122569222 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122570155 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122571082 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122571589 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122571597 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122571796 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122572274 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 122572471 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122572752 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122573353 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122573364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122573563 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122573646 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122573793 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122575985 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122575996 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122576604 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122576655 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122576836 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122577350 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122577385 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122577501 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122578075 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122578215 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122578428 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122578967 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122579234 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122579720 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122579986 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122580453 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122580463 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122580609 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122580662 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122580716 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122580823 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122581135 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122581246 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122581570 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122581712 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122582009 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122582048 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122582078 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122582247 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122582511 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122582818 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122582971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122583196 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122583207 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122583276 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122583323 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122583335 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122583550 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122583856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122584870 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122585166 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122585519 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 122585882 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122586290 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122588548 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122588716 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122588780 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122588823 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122589040 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122589522 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122589547 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122589750 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122589833 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122589835 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122590922 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122591005 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122591523 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122591579 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122591614 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122591633 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122591758 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122591815 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122592019 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122592028 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122592115 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122592701 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122592731 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122592804 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122592873 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122592896 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122592965 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122592999 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122593096 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122593340 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122593442 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122593454 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122593532 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122594085 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122594222 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122594328 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122594338 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122594526 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122594555 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122594561 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122594646 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122594745 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 122595029 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122595033 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595050 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595171 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122595192 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595269 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595307 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595311 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595327 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595370 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595371 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595443 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595473 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595555 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595566 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595578 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595690 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122595692 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122595760 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122595922 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 122596141 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 122596194 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 122596226 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122596239 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122596252 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122596256 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122596294 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122596295 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122596310 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122596370 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122596429 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122596504 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122596627 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122596689 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122597024 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122597657 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122597726 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 122597729 T G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 122597756 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122597781 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 122597927 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 122597969 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 122598027 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 122598082 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 122598111 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122598192 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122598193 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122598273 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122598713 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122598859 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122599039 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122599046 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122599069 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122599231 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122599253 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122599287 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122599450 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122599538 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122599629 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122599675 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.0526315789473684 19 19 1 17 1 2 122599885 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122599917 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122599978 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122600037 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122600453 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122600509 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122600623 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122600880 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122600910 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122601161 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 122601382 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122601907 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122601918 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122603547 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122603681 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122604165 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122604951 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122604959 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122604973 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122605053 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122605074 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122605121 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122605140 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122605153 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122605216 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122605258 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122605272 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122605341 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122605403 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122605511 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122605543 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122605746 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122605762 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122605858 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122606186 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122606232 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122606359 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122606406 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122606422 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122606474 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122606529 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122606625 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 122606676 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122606745 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122606750 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122606848 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122606888 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122606906 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122607038 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122607039 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122607962 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122608102 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122608241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122608242 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122608271 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122608440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122609485 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122609787 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 122609890 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122609906 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122609922 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610029 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122610043 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610097 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122610142 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610163 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610191 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610202 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 122610215 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610221 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610234 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610262 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610265 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610355 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610387 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122610753 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610777 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122610858 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122611068 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122611144 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122611158 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122611183 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122611224 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122611233 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122611294 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122611366 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122611435 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122611453 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122611553 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122611568 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122611622 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122611720 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122611746 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122611770 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122612138 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122612571 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 122612580 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 122612652 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122612712 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122613322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122613809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122614057 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122614505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122614528 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122615016 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122615715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122616292 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122616392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122616751 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122617326 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122617566 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122617967 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122618218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122618674 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122618816 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122618996 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 122619112 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122620593 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 122620701 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122620961 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122622952 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122623116 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122623865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122624261 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 122624380 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122624442 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122624581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122625653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122625875 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 122626444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122627383 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 122627464 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122627527 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 122627547 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 122627871 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 122628024 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122628062 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 122628179 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 122628207 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122628236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122628285 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122628300 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122628364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122628365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122628450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122628468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122628485 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122628638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122628680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122628857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122628933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122629039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122629050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122629096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122629123 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 122629159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122629173 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122629228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122629392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122629423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122629940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122630601 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 122631240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122631468 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 122631498 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 122631889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122632946 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 122633424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122634268 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122634338 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 122635575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122637240 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122637244 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122637526 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122638832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122639129 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122639236 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122639287 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122639539 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122640117 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122640464 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122640755 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122641073 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122642204 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122642212 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122642763 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122642769 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122642875 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122642938 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122642940 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122642956 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122642957 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122642970 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122642990 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122643862 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122644057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122644680 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122644733 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122645301 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122645793 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122646040 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122646056 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122646085 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122646249 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122646497 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 122646673 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122647298 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122647327 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122647336 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122647382 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122648071 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122648112 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122648848 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122648878 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122648956 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122649403 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 122649889 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122649938 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 122649955 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 122649985 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122650653 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122650996 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122651121 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122651194 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122651545 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122651575 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122651617 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 122651762 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122651781 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122652326 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122652708 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122652756 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122653050 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122653115 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122653571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122653685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122653723 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122653776 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122653777 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122654098 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 122654513 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122654790 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122655233 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122655626 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122655839 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 122655862 T C Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 122656282 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122657212 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122658216 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122658689 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122659359 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122659412 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122659795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122660034 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122660160 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122660746 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122661004 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122661050 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122661178 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 122661833 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 122662174 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 122662397 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122662799 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122662946 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122663312 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122664057 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122665394 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122665806 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 122666235 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122666334 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122666360 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122666471 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 122666533 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122666587 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122666625 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122666628 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122666720 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122666762 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122666830 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122666850 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 122666851 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 122666972 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122667022 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122667129 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122667157 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122667494 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 122667743 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 122667752 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122667763 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122667856 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122668155 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 122668206 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122668552 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 122668693 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122669146 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122669189 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122669660 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 122669860 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122669977 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122670017 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122670645 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 122671336 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 122671337 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 122672262 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122672794 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 122673055 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 122673233 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 122673402 A G Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 122673561 G T Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 122673593 T C Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 2 122673800 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 122674156 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 122674275 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122674433 G T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 122674466 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 122674812 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122674989 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122675024 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 122675070 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122675446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122675681 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 122675762 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122676011 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 122676181 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122676247 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122676440 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 122676684 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 122676946 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 122677058 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122677095 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 122677137 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 122677145 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122677170 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122677210 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122677300 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122677746 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122678625 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122678781 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122678801 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122678918 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122679117 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122679210 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122679249 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 122679329 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 122679366 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 122679375 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 122679467 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122679529 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122679549 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 122679556 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122679609 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 122679787 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 122680118 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 122680510 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122680854 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122680967 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 122681407 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122681463 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122681804 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122681819 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122681873 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122681987 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122682046 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122682084 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122682095 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122682181 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122682188 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122682231 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122682865 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122682996 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 122683219 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 122683256 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 122683327 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122683348 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122683695 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122683734 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122684030 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122685053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122685103 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122685252 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122685355 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122685606 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122685683 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 2 122685771 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122685896 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122686153 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122686370 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122686454 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122686559 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122686816 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122686849 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122686997 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122687149 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122687466 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122687820 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122687833 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122687934 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122687956 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122688287 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122688575 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122688584 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122688625 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122688691 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122688787 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122688908 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122689033 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122690222 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122690366 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122690377 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122690673 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122690811 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122691088 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122691171 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 122691433 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122691652 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122691842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122692380 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122692494 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122692574 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122693100 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122693198 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122694573 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122695678 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122699561 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 122699707 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 122700754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122701368 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122702281 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122703171 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122704913 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122705760 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122706019 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 122710203 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 122710215 T G Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 122711486 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122711561 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 122711738 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122712130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122712231 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122712403 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122712435 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122712749 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122712777 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 122713291 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122713337 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 122713535 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 122713599 T C Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 122713710 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 122713723 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 122714119 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122714184 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 122714543 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 122714712 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 122714819 A T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 122715898 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122716307 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122716315 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122716496 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122717234 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122717301 C A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122717616 T G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 122717811 G T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 122718008 A C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 122718009 A C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 122718441 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122719388 G T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122719803 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122719990 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122720058 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 122720186 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122720206 G T Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122720270 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 122720286 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 122720429 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 2 122721247 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122721677 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122722029 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122722060 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122722373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122722644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122722837 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122722954 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122724039 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122724448 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 122724557 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 122725418 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122725439 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122725536 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122725610 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122726058 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122726309 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122726544 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122726585 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122726612 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122726986 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122727161 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122727251 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122727696 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122727760 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122727872 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122727888 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122728183 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122728228 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122728656 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122728705 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122728858 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122729096 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122729282 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122729547 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122729577 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122729583 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122729613 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122729880 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122729907 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122730009 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122730148 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122730248 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122730280 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122730304 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122730356 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122730369 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122730373 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122730396 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122730457 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 122730586 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122730865 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122730940 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122731117 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122731158 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122731245 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 122731803 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122732323 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122734692 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122736952 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122739410 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122739623 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122739678 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122739769 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 122739794 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122739827 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122740817 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122740987 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122741021 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122741097 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122741325 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122741639 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122742541 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122742845 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122743107 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122743374 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122743801 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122744545 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 122745958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122746651 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122747104 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122747189 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122747234 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122747311 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122747403 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122748263 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122748453 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122748530 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122750348 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122750716 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122750865 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122751391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122751635 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122751732 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122752315 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122752874 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122753639 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122753761 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122754044 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 122754279 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122754401 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122755456 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 122755862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122755920 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122756311 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122756346 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122756514 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122757325 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122757384 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122757601 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 122757637 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 122757683 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 122757714 A C N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 122758514 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122758594 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122758621 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122758967 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122759227 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122759255 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122759289 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122759384 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 122759398 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122759467 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122759472 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122759519 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122759567 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122759633 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122759813 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122759938 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122760062 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122760210 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 122760261 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122760421 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122760511 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122760539 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122760605 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122760627 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122761063 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122761337 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122761380 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122761464 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122761547 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122762309 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122762370 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122762502 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122762571 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122762619 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 122762655 T C Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 122763697 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 122763762 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 122763794 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122764108 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 122764109 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 122764673 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 122764965 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122765209 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122765235 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 122765815 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 122766028 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 122766029 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 122766151 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 122766260 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 122766476 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122766490 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 122766504 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 122766508 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122767653 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 122767776 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 122767857 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 122768301 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 122768465 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 122769082 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122769238 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122770295 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122770449 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122770759 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122770855 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122771122 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122771214 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122771224 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122771523 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 122771617 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122771748 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122771749 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122772172 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 122772197 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122772466 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122772624 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122772701 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122773971 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 122774272 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 122774381 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122774503 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 122774731 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 122774811 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 122774976 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 122775068 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122775107 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 122775157 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122775248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122775261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122775271 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122775506 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 122775600 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122775694 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 122775705 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122775787 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122782737 C A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 122783330 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122783451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122783575 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 122783597 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 122783789 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122784354 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 122784415 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122784523 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122786223 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 122786985 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 122787142 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122787195 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122787504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122788433 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122788796 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122789431 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122789559 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122789655 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122789826 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 122789849 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122789938 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122790104 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 122790210 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 122790347 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 122790426 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122790553 C A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 122790836 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122791068 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 122791240 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 122791553 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122791737 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122792175 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122792374 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122792382 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122792921 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122792940 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122792967 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122793184 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122793247 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122793329 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122794385 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 122794763 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122794807 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122795100 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122795151 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122795984 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122796507 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122796637 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122798058 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122798139 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 122798187 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 122798556 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 122799538 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 122800811 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122800961 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122801991 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122802409 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122802425 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 122802466 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122802695 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122803314 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122803341 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122803352 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122803556 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122804128 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 122804209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122805189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122805512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122805847 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122806383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122807157 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122807709 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 122807736 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 122807747 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122807928 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 122808605 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 122808676 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122808829 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122809044 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122809061 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122809167 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122809322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122809372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122809658 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122809895 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122810030 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122810354 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122810708 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122810746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122810775 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122810951 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 122811709 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122811833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122811896 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 122812021 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122812303 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122812426 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 122813407 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 122813543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122813594 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122813974 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122814345 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 122814566 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 122814804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122815571 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 122816049 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 122816490 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 122816669 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122816735 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 122816817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122816877 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122816950 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122817162 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122817280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122817505 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 122817747 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122817837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122817868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122817888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122818799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122818810 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122818845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122818899 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 122819034 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 122819079 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 122825335 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122825377 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122825478 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 122826152 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 122826343 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 122826344 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122826426 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122826436 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122826622 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122826765 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122827107 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 122827249 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122827295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122827340 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122827588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122827620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122827643 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122828030 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122828074 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 122828416 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 122829258 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122829646 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122829781 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122829827 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 122829828 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122829866 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 122829882 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122830004 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122830396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122830397 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122830571 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122830668 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122830692 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122830755 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122830789 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122830792 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122830870 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122830881 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122830931 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 122831038 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831063 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831092 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831106 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831120 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122831221 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831256 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831281 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831307 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831312 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831325 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831327 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831353 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831364 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831379 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 122831470 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831554 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831565 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831616 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122831638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122832061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122832087 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122832100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122832290 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122832351 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 122832573 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122832783 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122832903 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122832922 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122833980 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122834055 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122834072 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122834605 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 122834752 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 122834799 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 122834843 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 122834929 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122834960 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122834995 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122835062 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 122835427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122835433 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 122835438 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 122835506 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122835567 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122835576 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122835780 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 122835783 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 122835886 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122835977 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122836277 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122836421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122836535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122836717 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122836891 T G N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 122837037 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122837110 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 122837327 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122837338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122837535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122837715 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 122838360 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122838429 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122838513 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122838803 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122838841 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 122838869 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 122838975 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122839015 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122839197 T C Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 122839560 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122839619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122839787 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122839961 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122839962 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122840637 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122840722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122842301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122842345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122842450 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 122842457 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122842593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122842636 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122842763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122842767 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122842950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122843140 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122843398 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122843423 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122844109 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122844997 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122845017 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122845038 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122845087 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122845310 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122845316 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122845368 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122845478 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122845507 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122845550 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122845954 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122847416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122848659 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122849144 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122849363 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122850040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122852535 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122853262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122853315 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122853797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122854509 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122854605 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122854866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122855107 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122855274 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122855841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122856550 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122857012 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122857127 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122857270 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122857456 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122857833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122858241 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 122858712 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122859082 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122859166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122859475 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122859638 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122860050 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122860065 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122860995 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122862420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122862577 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122862773 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122862794 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122862822 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122862932 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122862952 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 122863100 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 122863119 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122863129 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 122863189 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122864062 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122864835 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122866544 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122866665 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122866847 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122867382 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 122867483 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 122867935 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 122868560 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122868778 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122869121 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 122869765 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122869827 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122870004 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122870515 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122870743 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122870752 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122870789 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122870797 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122870807 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122870909 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122870948 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122871029 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122871206 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 122871368 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122871527 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 122871637 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 122871701 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122871710 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122871720 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122871812 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122871916 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122872061 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122872633 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122872732 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122873123 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122873791 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122873826 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122873955 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122874066 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122874249 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122874728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122875631 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122875658 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122876209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122876480 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122876994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122877342 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122877456 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122877926 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122877929 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122878107 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122878651 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122878692 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122878717 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122879420 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122879720 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 122880160 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122880625 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122880832 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122881591 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122881897 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122882185 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122883923 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122885170 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122885304 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122885449 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122885498 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122885905 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122886292 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122886303 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122886776 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122887971 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122887991 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122888213 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122888367 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122888420 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122888492 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122888636 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122888694 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122888822 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122888972 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122889003 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122889047 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122889180 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 122889800 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122889887 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122889904 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122890032 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122890295 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122890798 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122891089 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122891566 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122891574 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122891616 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122891702 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122891833 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122891835 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122891994 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122891995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122892237 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122892296 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122892996 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122893025 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122893349 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122893553 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122893587 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122893615 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122893778 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122893851 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122893857 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122893933 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122894007 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122894360 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122894965 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122895156 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122895577 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122895656 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122895743 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122895744 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122895792 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122896062 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122896196 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 122896287 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122896397 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122896729 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122896882 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 122897276 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 122897801 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122898298 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122898529 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 122898578 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122898798 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122898903 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 122898973 A T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 122898993 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 122898998 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 122899272 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 122899729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122899896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122899932 C A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 122900948 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122901061 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122901305 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122901373 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122901390 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122901437 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122901568 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122901571 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122901733 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122901756 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122901869 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122902549 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122902608 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122902772 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122902824 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122902875 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122903248 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 122903274 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122903321 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122903356 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122903593 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122904416 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122904700 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122904963 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122905050 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122905263 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122905371 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122905455 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122906058 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122906245 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 122906297 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 122906325 G C N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 122906446 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 122906635 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122906651 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122906669 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122907032 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122907078 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122907124 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122907226 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122907401 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122907737 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 122907915 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122908057 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122908108 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 122908188 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122908367 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122908609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122908800 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 122908842 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122908874 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122909127 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122909128 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122909174 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122909208 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122909670 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122909699 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122909722 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122909770 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122910312 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122910798 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122911058 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122911077 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122911158 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122911320 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122911480 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 122911611 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122911626 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122911665 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 122911736 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122911960 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122911962 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122911983 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122912064 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122912102 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122912146 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122912321 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122912474 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122912518 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122912549 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122912633 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122912645 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122912657 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122912844 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122912888 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122913119 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122913559 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122913666 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122913803 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122913820 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122913961 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122914061 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 122914070 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122914166 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122914288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122914525 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122914729 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122914941 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122915292 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122915297 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122915681 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122915798 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122916943 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 122917155 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122917480 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122917556 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122917580 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122917678 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122917752 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122917790 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122917931 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122917945 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122917946 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122917992 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122918091 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122918118 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122918132 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122918168 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122918341 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122918352 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122918498 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122918956 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122919741 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122919989 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 122920090 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122920484 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 122920699 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122921001 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 122921444 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122921476 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122921942 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122922003 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122922088 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122922257 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122922263 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122922654 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122922914 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122923597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122923673 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 122923694 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 122924272 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122924463 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122924466 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122924592 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 122924658 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122924760 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122924862 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122925064 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122925173 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122925263 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122925315 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122925380 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122925563 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122925934 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122926294 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 122926647 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 122926656 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 122927312 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122927524 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122927593 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 122927824 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122927845 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122928024 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122928157 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122928412 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122928494 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122928655 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122928896 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122929123 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122930030 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 122930515 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122930567 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122930686 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122930735 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122930811 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122930986 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122931545 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122931619 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122931670 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 122931740 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122931823 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122931831 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122931842 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122932017 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122932105 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122932110 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122932146 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122932241 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122932251 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122932637 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122932807 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122933196 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122933903 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122934128 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122934208 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122934560 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122934625 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122934626 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122934833 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122936322 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122936806 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122937268 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 122937638 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122937652 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122938164 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122938420 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122938665 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122938709 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122938910 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122939095 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122940907 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122940960 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122941300 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122941319 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122941331 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122941405 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 122941453 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122941499 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122941573 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 122941610 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 122943929 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 122944073 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122944149 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122944257 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122944332 T A Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 122944861 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122945043 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 122945101 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 122945775 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122946307 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122946436 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122946629 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122946924 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122946965 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 122946984 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122947301 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122947778 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122948076 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 122948213 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122948445 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122948481 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122948565 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122948763 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122948892 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122949254 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122949287 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122949396 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 122949511 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122949614 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122949893 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122949972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 122950359 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122950777 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122951323 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 122951462 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 122951660 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122951954 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122952004 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122952051 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122952397 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122952731 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122953025 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122953055 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122953233 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122953394 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122953595 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122954099 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122954114 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122955005 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122955059 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122955217 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122955430 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 122955511 A G N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 122955660 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 122955678 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 122955749 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 122955865 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 122955902 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 122955964 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 122956745 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122956755 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122958027 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 122958303 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122958933 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122959626 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122960052 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122960445 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122960483 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 122960717 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122960799 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122960945 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 122961066 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122961157 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122961341 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122961359 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122961385 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122961458 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122961523 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122961538 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122961605 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122961807 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122961878 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122962247 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 122962396 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 122962822 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122962828 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122963189 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122963379 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 122963410 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122964050 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122964383 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122964637 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122965117 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122965609 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122966215 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 122966572 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122966801 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122967129 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122967367 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122967500 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122967952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122968115 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122968273 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 122968373 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122968394 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122969135 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122969327 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 122969596 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 122969653 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122970534 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122970604 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122970773 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122971046 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122971179 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122971335 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122971474 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122971555 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122971658 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 122971907 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122972396 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 122972490 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 122972726 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122972802 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122973017 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122973091 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 122973098 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 122973213 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122973483 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 122973523 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 122973815 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 122973984 C A N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 122974255 T A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 122974424 C A Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 122974564 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122974591 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122975531 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 122975655 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 122976046 C A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 2 122976049 T G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 122976057 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 122976213 C A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 122976304 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122976340 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122976451 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 122976575 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122976620 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122976887 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122977297 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 122977878 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122977895 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122977904 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122977912 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 122978119 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 122978352 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122978398 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122978410 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122978421 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122978467 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122978607 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 122978632 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 122978750 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 122978814 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 122978935 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 122979028 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122979272 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 122979319 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 122979372 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 122979555 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 122980712 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 122980756 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 122980789 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 122980840 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122981086 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 122981118 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 122981224 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122981277 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 122981419 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 122981996 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 122982757 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122982776 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 122982839 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122982851 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122982893 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122982920 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 122982939 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122983163 T G N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 122983167 C T N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 122983192 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 2 122983212 C A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 122983267 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 122983362 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122983417 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122983478 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122983506 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122983636 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122983652 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 122983687 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122983688 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122983705 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122983792 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122983860 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122983884 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 122983933 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122983957 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122984049 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122984115 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 122984150 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 122984162 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 122984223 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 122984225 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122984256 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122984279 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 122984454 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 122984546 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 122984549 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 122984572 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 122984585 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 122984590 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 122984795 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122984826 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122984828 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122985281 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 122985447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122985491 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122985726 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122985769 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 122985855 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 122986096 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 122986287 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 122986518 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122986746 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122987131 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 122987232 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122987936 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 122988498 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122988606 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122988714 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 122988803 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 122988843 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 122988988 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 122989278 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 122989377 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 122989655 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 122989780 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 122989790 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 122989811 A C Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 122990002 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122990113 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 122990221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122990298 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 122990542 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122990619 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 122990629 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122992230 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122992803 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122992959 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 122996076 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 122996690 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122997848 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 122997962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 122998273 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 122998427 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 122998836 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 122999305 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 122999340 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123000361 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123000430 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123000500 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123000580 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123000714 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123001004 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123001161 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123001166 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123001183 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123001362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123001364 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123001814 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 123002166 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123002640 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123002674 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123002899 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123003054 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123003171 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123003201 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123003779 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123004043 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123004473 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123004580 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123004658 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 123004691 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123004871 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123004882 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123004956 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123005128 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123005255 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123005272 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123005277 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123005395 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123005440 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123005505 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123005616 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123005760 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123005867 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123005935 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123005941 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123006177 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123006228 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123006283 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123006300 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123006311 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123006328 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123006329 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123006365 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123006423 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123006517 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123006602 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123006705 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123006731 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123006740 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123006746 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123006828 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123006903 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123006936 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123006955 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123006968 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123006978 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123007024 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123007061 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123007071 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123007137 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123007175 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123007312 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123007386 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123007460 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123007924 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123007942 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123008022 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123008358 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123008398 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123008416 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 123008443 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 123008483 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 123008584 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123008836 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123008899 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 123009062 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123009080 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123009191 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123009203 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123009252 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123009298 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123009413 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123009417 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123009569 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 123009677 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123009689 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 123009720 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 123009931 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123010033 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123010264 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 123011113 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123011409 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123011415 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123011535 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123011853 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123011884 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123012152 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 123012180 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 123012266 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123012273 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123012416 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123012459 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123012515 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123012526 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123012543 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123012573 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123013270 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123013351 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 123013365 A T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123013404 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123013463 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123013477 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123013572 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123013647 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123013863 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123013979 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123013984 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123014014 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123014033 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123014120 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123014156 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123014186 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123014212 T G Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 2 123014280 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123014332 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123014362 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 123014409 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123014537 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123014616 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123014674 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123014716 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123014816 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123014830 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 123015064 T A Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 123015122 T A Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 123015136 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 123015164 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 123015195 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 123015196 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 123015468 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123015469 C T Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 123015513 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123015526 T G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 123015582 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 123015607 G T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 123015639 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 123015651 C A Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 123015656 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 123015667 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 123015684 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123015698 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123015746 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123015844 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123015876 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123015901 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123015946 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123015950 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123015959 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123016015 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123016041 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123016204 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123016232 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123016498 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123016614 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123016643 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123016698 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123016877 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 123017332 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123017366 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123017370 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123017476 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123017485 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123017510 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123017604 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123017730 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123017849 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123017943 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123018488 G C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 123018507 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123018605 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123018632 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 123018839 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123019229 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123019231 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123019300 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123019558 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123019724 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 123019793 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 123019802 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 123019940 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123019955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123020074 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123020242 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123020289 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123020388 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123020491 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123021392 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123021640 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123021704 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123021917 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123022140 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 123022141 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 123022340 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 123022562 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123022574 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123022750 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123022763 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123023325 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123024268 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123024376 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123024461 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123024690 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123025083 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123025490 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123025529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123025575 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123026200 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123027057 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123027122 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123027551 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123028171 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123028250 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123028642 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 123029046 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123030479 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 123030641 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123030665 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123030701 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123031078 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123037597 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 123038609 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123039085 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123039086 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123039374 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123039410 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123039828 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123039946 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123040335 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123040350 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123040373 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123040537 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123040666 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123041195 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123041231 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123041254 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 123041353 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123041399 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123041417 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123041418 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123041507 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123041553 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123041823 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123042033 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123042230 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123042455 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123042568 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123042796 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123043089 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 123043862 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123044193 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123044238 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 123044644 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123044918 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123045121 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123045172 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123045204 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123045289 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123045574 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123045575 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123045605 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123045731 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123045751 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123045775 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123045862 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123045909 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123045935 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123045937 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123045984 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123046062 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123046120 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123046264 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123046312 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123046333 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123046460 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123046530 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123046602 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123046626 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123046650 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123046670 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123046903 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123047095 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123047133 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123047160 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123047212 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123047225 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123047230 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123047265 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123047277 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123047442 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123047479 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123047498 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123047703 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123047719 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123047868 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123047963 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123047964 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123048096 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123048150 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123048398 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123049086 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 123049123 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 123049441 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 123049448 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 123049476 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123049606 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 123049668 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123049727 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123049829 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123050041 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123050117 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123050343 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123050472 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 123050572 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123050590 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123050613 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123050625 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123055327 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 123055376 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123055426 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123055469 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 123055592 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123055627 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123055662 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123055767 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123055783 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123055834 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123056255 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123056376 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123056411 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123056529 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123056531 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123056648 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123056688 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123056724 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123056860 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123056959 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123057038 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123057104 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123057206 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123057374 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123059595 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123059597 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123059615 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123059660 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123059805 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123059889 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123059923 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123059962 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123059963 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123060041 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123060163 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123060180 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123060321 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123060458 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123060547 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123060556 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123060728 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123060760 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123060882 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123060924 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123060957 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123061032 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123061096 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123061222 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123061276 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 123061472 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123061555 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123061625 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123061647 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123061649 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123061744 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123062068 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123062199 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123062207 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123062214 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123062236 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123062474 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123062489 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123062499 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123062512 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123062587 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 123062840 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 123063224 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123063261 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123063372 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123063404 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123063411 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123063436 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123063667 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123063776 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123063942 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123063953 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123063962 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123064064 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123064101 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123064105 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 123064206 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123064257 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123064270 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123064296 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123064328 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123064337 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123064512 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123064571 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123064633 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123064671 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123064874 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123064914 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123065032 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123065093 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123065288 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123065337 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123065342 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123065367 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123065386 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123065446 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123065477 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123065566 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 123065659 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123065733 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123065807 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123065884 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123065958 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123065964 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123066029 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 123066032 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 123066082 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 123066277 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 123066405 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 123066428 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 123066458 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123066522 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123066588 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123066641 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123066674 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123066847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123067036 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123067154 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123067211 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123067219 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123067243 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 123067377 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123067419 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123067474 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123067477 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123067564 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 123067700 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123067728 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123067776 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 123067919 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123067975 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123068168 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123068217 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123068346 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123068496 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123068597 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123068603 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123068659 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123068767 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123068805 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 123068888 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123068948 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123068993 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123069034 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123069130 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069161 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123069162 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123069259 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069294 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123069345 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069394 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069468 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123069487 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069626 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069681 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069721 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069737 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069781 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069907 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069916 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069918 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069934 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123069940 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123070126 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123070379 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123070387 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123070399 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123070434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123070480 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123070745 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123070763 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123070783 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123070834 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123071062 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123071183 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123071277 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123071292 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123071304 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123071357 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123071392 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123072862 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123073489 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123073683 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123073748 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123073762 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123073824 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123073829 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123073892 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123073979 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123073992 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123074021 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123074177 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123074186 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123074255 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123074278 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123074375 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123074399 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123074512 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123074514 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123074577 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123074578 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123074612 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123074676 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 123074708 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123074795 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123074902 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 123074913 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 123075099 C G N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 123075100 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 123075117 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 2 123075137 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 123075242 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 123075272 T C Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 123075323 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 123075353 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 123075394 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 123075461 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123075496 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123075576 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 123075578 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 123075603 C A Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 123075605 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 123075651 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123075686 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 123075714 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123075753 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 123075768 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 123075784 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 123075872 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123076100 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123076103 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 123076117 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123076221 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 123076283 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123076361 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123076541 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123076696 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123076750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123076800 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123076982 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077001 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123077034 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077066 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077110 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123077121 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123077133 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123077193 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077236 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123077247 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123077289 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123077293 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077342 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077404 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077409 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077431 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077449 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077450 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077548 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077584 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077718 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123077774 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123078022 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123078147 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123078274 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 123078416 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123078490 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 123078579 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 123079938 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123080067 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 123080103 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123080117 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123080119 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 123080170 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123080291 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123080301 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123080310 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123080456 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123080528 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123080579 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 123080808 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123080874 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123080914 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 123080934 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123081035 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123081124 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123081200 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123081323 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123081364 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 123081367 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 123081395 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123081430 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 123081444 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123081524 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123081567 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123081639 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123081688 A T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 123081794 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123081834 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123081870 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 123081925 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123082059 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123082213 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123082233 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123082257 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123082287 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123082298 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123082559 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123082721 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123082787 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123082806 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123082892 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123083057 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 123083156 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123083413 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123083435 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123083439 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123083487 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123083550 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123084045 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123084053 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123084080 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123084308 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123084571 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123084680 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123084761 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123084829 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123085130 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123085295 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 123085956 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 123086042 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123086313 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 123086751 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123086763 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123086907 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123087073 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123087165 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123087425 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123088838 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123089477 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123091163 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123091164 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123091744 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 123093311 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123093995 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 123094939 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 123094952 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123094969 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 123095805 A T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 123096593 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 123096761 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 123096823 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123097016 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123097252 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123097508 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123097705 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123097769 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123097804 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123097977 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 123098016 C A N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 2 123098105 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 123098137 C G Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 123098179 T C Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 123098228 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 123098236 C T Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 123098262 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 123098824 G T N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 123098826 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 123099229 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123099389 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123101209 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123101356 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123101617 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123102320 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123102570 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123102683 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123102821 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123102857 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123103069 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123103075 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123103486 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 123103542 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123105801 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123106405 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 123106846 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123107037 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123107038 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123107197 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123107208 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123107593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123108225 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123108669 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123109062 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123109240 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123110621 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123110694 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123111450 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123112579 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 123112808 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123113225 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123113258 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123113383 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123113521 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 123120367 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123120825 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123121289 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123121504 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123122421 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 123122866 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123124079 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123124323 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123124459 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123125212 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 123125552 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123127558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123128139 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123129309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123132295 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 123132297 G C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 123133721 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123133766 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123133855 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123134012 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123134089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123134091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123135190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123135251 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123135435 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123135591 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 123135988 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123136619 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123136784 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123136878 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123137514 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123137698 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123137706 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123137709 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123137742 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123137871 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123138320 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123138400 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123138586 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 123138855 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123138858 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123138992 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123139357 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123139713 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 123140050 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123140307 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123140381 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123140537 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123140909 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123140973 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123141026 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123141250 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123141850 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123142289 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 123143158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123143777 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123144545 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123144840 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123145290 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123145572 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123145960 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123146101 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123146260 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123146303 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123146677 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123146744 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123146748 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123146915 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123147155 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123147434 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123147711 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123148994 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123148995 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123149132 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123149134 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123149216 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123149395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123149431 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123149469 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123149699 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123149878 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 123150330 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123150349 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123150365 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123150506 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123150657 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123150724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123150952 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123151030 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123151617 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123152004 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123152643 G T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 123153418 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123153645 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123153710 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123153739 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123153742 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123153819 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 123153869 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123153888 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123153959 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123154068 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123154122 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123154156 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123154248 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123154380 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123154490 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123154539 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123154748 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123154811 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 123155179 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123155716 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123155776 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123156482 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123157130 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 123157384 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 123157688 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123157958 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123158414 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123158418 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123158584 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123158615 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123158667 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123158729 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123158795 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123158877 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123158882 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123158892 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123159426 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 123159479 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 123159684 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123159892 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123160267 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123160668 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123160936 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123161103 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123161534 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123161669 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123161714 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123161722 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123161792 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123161834 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123161885 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123161945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123162044 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 123162210 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123162248 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123162278 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123162353 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 123162423 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123162628 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123162992 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 123163100 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123163407 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 123163993 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123164043 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123164186 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123164217 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123164235 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123164285 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123165223 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123165235 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123165579 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 123165768 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123165792 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123165903 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123166051 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123166157 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123166205 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123166284 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123166338 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123166388 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123166526 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123166893 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123167002 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123167097 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123167142 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123167174 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123167183 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123167223 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123167383 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123167392 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 123168160 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123168365 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123168500 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123168544 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123168602 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123168935 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123169192 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123171665 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123171751 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 123171770 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123172126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123172304 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 123172440 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 123172473 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123172487 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123172529 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 123172560 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123172586 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123172941 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123172957 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123173086 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 123173217 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123173300 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123173303 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123173619 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123173731 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123173807 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123173866 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123173877 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123173879 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123173923 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123173968 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123174007 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123174009 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123174026 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123174099 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123174269 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123174280 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123174455 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123174593 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123174782 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 123174818 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 123174870 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123174908 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123175008 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123175315 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123175454 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123175661 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123175893 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123176118 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123176158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123176207 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123176209 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123176248 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123176689 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123177007 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123177040 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123177044 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123177675 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123178064 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123178236 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123178252 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123178497 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123178797 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 123180273 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 123180291 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 123180298 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 123180506 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 123180673 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123180692 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123180700 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123180720 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123180779 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123181028 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123181136 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123181202 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123181429 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123181508 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123181646 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123181673 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123181930 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123181982 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123182137 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 123182456 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123182457 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123182538 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 123182651 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123182712 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123182859 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123182925 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123183842 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123183856 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123184838 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123185494 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123186708 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123187428 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 123187614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123188078 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123188320 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 123188445 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 123188502 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123188543 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 123188612 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123189029 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123189632 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 123189989 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123190721 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 123190792 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 123190897 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123191089 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123191447 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123191856 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123192415 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123192739 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123192796 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123192846 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123192955 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123193098 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123193157 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 123193292 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123193544 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 123193798 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 123193909 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123194121 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123194187 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123194239 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123194455 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123194477 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123194658 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 123194665 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123194734 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 123194985 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123195048 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 123195093 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 123195144 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 123195294 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 123195322 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123195354 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123195385 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123195408 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123195417 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 123195465 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 123195651 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123195682 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 123195814 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 123196065 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 123196084 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 123196250 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 123196260 G A N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 123196367 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 123196522 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123196885 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123196889 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123196901 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123196961 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123196965 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123197171 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 123197358 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123197442 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123197727 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123197882 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 123197924 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 123198031 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 123198046 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 123198166 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123198184 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123198185 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123198223 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123198277 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123198359 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123198400 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123198516 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123198542 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123198668 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123198856 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123198902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123198912 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123199340 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123199376 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123199500 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123199557 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123199618 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123199624 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123199704 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123199738 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123199821 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123199841 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123199876 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123200010 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123200021 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123200246 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123200254 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123200810 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123200865 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123201103 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123201131 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123201216 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 123201271 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123201495 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123201533 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123201768 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123201900 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123201938 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123201973 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123202235 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123202284 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123202324 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123202372 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123202481 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123202536 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123202583 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123202608 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 123202703 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123202909 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123203245 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123203291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123203335 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123203469 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123204370 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123204789 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 123205003 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 123205278 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 123205330 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123205563 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123205622 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123206016 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123206144 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 123206219 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 123206229 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123206506 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 123207001 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123207015 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123207036 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 123207110 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123207426 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123207435 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123207471 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 123207501 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 123207615 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 123207809 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123207844 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123208083 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 123208283 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123208333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123208342 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123208367 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 123208413 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 123208421 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123208472 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123208530 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 123208536 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123208594 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 123208787 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 123208889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123208971 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123209273 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123209895 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123210006 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 123210058 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123211002 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123211333 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123211354 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123211373 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123211627 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123211635 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123211727 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123211824 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 123211841 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 123211912 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123212017 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123212082 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123212087 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123212221 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123212266 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 123212568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123212655 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123212972 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 123212984 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 123213251 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123213656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123213681 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123213805 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123213921 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123213961 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123213968 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123214052 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123214160 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123214226 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123214235 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123215193 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123215278 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 123215934 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123216020 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123216532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123216562 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123216711 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123216892 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 123216930 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123216945 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123217030 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123217689 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123217955 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123218163 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 123218209 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 123219049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123219397 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123219411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123219510 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123219652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123220388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123220653 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123220843 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123221583 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123222116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123222767 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123223040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123223052 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123223180 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123223181 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123224455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123224593 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123225722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123225794 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123226017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123226425 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 123226470 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123226486 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123226527 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123226846 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 123227127 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 123227170 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123227189 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123227197 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123227275 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123227479 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123227518 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123227535 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123227621 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123227626 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 123227891 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123227894 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123227968 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123228357 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123229030 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123229114 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123229160 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123229423 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 123229477 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 123229835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123229896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123230368 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123230819 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123231302 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123232121 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 123232379 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 123232441 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123232734 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123232823 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123232969 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 123233691 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123234397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123234954 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123235998 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123236174 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 123236195 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 123236227 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 123236650 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123236699 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 123236799 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123237000 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 123237318 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123237489 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 123237908 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 123238088 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 123238113 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 123238229 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123239180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123239728 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123239744 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123239756 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123240249 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123240380 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123240601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123241018 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123241132 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123241237 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123241415 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123241550 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123241557 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123241817 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123241842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123241848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123241908 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123242200 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123242283 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123242308 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123242379 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123242437 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123242544 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123243027 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 123243126 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123243492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123243618 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123244162 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123245503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123246101 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123246334 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123247032 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123247055 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123247261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123248450 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123249428 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123249949 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123249990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123250173 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123250794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123250896 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123251590 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123252078 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123252380 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123252421 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 123252518 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123252525 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123252544 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123252719 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123252884 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123253014 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123253059 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123253298 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123253433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123253612 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123253818 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123254028 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 123254092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123254167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123254382 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123255790 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123256040 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 123256185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123256219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123256351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123256740 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123257046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123257180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123257331 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123257492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123257925 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123258068 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123258163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123258556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123259025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123259521 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123260090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123260225 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 123260807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123260820 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123263541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123264396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123265096 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123265550 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 123265642 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123265669 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123265705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123265910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123266501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123266569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123266627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123267010 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123267565 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123268012 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123269983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123270007 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123270098 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123270358 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 123270361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123270744 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123272746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123272968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123273180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123273203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123274003 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123274088 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123274112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123274487 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123274610 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123274816 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123275031 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123275350 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123275432 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123275616 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123275644 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123275679 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123276398 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123276804 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123278122 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123278131 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123279300 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123279854 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123280963 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123281004 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123281024 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123281105 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123281108 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123282333 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123282408 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123282726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123283273 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123284513 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123284571 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123285449 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123286314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123286329 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123286478 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123286610 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123286712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123286749 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123286819 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123286874 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123286903 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123286904 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123286920 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123287058 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123287164 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123287306 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123287310 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123287939 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123288015 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 123288259 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 123288327 A C N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 123288754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123289789 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123289898 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123290473 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123290729 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123290771 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123290814 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123290888 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123291206 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123291212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123292936 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123292947 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123293026 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123293139 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123293758 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123293783 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123294021 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123294324 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123294325 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123294564 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123294693 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123294797 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123294822 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123295201 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123295426 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123295563 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123295780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123295947 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123296104 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123296118 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123296303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123296361 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 123296362 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123296721 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123296835 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123297419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123297455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123297559 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123297572 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123297750 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123297866 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123297886 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123297952 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123299127 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123299342 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123299392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123300257 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123300274 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123300800 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123300924 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123301004 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123302053 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123303344 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123304394 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123304528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123304630 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123304985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123305029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123305250 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123305918 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123306092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123306751 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123306975 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123307014 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123307133 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123307222 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123307479 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 123307677 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123308017 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123308720 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123309806 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123310145 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123310522 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123310722 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123310765 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123310877 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123311137 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123311246 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123311674 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123311739 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123311909 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123312547 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123312570 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123312620 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123312656 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123313079 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123313147 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123313234 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123313437 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123313679 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123314331 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123314378 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123314490 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123314556 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123314599 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123314654 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123314817 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123315016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123315388 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123315427 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123316116 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123316224 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123316242 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123316614 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123316655 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123316696 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123316743 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123316750 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123317000 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123317132 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123317262 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123317579 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123317615 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123317616 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123318117 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 123318227 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 123318239 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 123318740 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123318830 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123318903 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123319163 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123319305 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123319660 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123320447 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123320460 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123320480 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123321554 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123321560 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123321981 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123329347 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 123329444 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 123330551 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123330836 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123330922 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123331218 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123331440 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123331970 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123332182 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123332764 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123334924 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123335108 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123336187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123336283 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123337447 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123337479 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123337808 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123338495 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123338864 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123339098 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123352466 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123352814 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123352959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123353077 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123353470 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123353496 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123353597 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123353954 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123354035 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123354127 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123354901 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123354938 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123356728 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123357017 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123357291 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123357306 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123357455 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123358713 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123358928 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123359188 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123360000 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123360035 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123360062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123360689 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123360712 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123360831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123360955 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123361027 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123361108 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123361118 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123361964 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123362397 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123363084 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123363367 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123363383 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123364300 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123364394 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123364479 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 123365040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123366288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123366467 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123366563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123367466 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123367594 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123367611 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123368080 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123369130 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123370133 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 123370302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123370334 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123371997 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123372801 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 123373851 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123373858 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123373928 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123374023 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123374033 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123374468 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123374649 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123374873 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 123375030 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123376348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123377985 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123378121 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123381668 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123381961 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123382314 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123384409 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123384691 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123384758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123387062 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123388291 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123389025 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123395771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123396211 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123396432 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123396992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123397433 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123397648 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123397998 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123398242 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123400084 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123400093 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123400326 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123401110 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123401130 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123401925 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123402005 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123402817 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123403053 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123403424 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123403582 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123403744 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123404877 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123404947 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123405291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123405561 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123405929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123405997 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123410563 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123410664 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123410691 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123410795 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123410873 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123411021 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123411136 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123411194 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123411659 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123411800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123411952 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 123413071 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 123413134 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123413530 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 123413729 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 123413742 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 123413853 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123413908 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123414337 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123414463 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123414478 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123414488 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123414871 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123414938 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123414958 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123415005 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123415048 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123415131 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123415142 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123415167 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123415177 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123415178 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123415188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123415296 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123415300 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123415375 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123415517 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123415708 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123415731 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123415888 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123416010 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123416115 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123416217 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123416309 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123416345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123416395 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123416403 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123416426 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123416449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123416523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123416552 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123416603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123416719 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123416860 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123417185 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123417200 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123417411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123417438 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123417461 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123417668 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123417690 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123417857 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123417921 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123418010 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123418094 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123418096 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 123418120 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123418134 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123418140 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123418185 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123418278 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123418279 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123418293 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123418489 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123418600 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123418610 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123418652 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123418777 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123418796 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123419139 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123419147 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123419367 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123421056 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123421451 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123421578 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123421909 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123422843 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123423154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123423317 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123424199 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123424211 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123424625 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123425333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123425404 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123426056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123427015 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123427775 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123427776 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123427828 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123427993 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123432250 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123432274 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123432485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123433447 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123433623 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123433843 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123433973 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123434339 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123434367 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123434463 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123434548 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123434771 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123434802 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123434844 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123434850 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123434861 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123434880 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123434913 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123435130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123435154 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123435402 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123435434 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123435496 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123436158 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123436181 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123436214 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123436377 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123436540 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123436642 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123436765 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123436818 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123437292 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123437544 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123437765 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123437977 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123438001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123438051 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123438297 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123438558 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123438760 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123438762 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123438930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123438939 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123439210 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 123439310 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123440137 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123440266 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123440619 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123441100 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123441294 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123441381 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123441629 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123441794 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123441912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123442207 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123442229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123442272 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123442569 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123443445 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123443576 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 123443663 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123444001 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123444400 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123444527 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123445388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123445490 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123445643 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123445912 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123446086 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123446158 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123446239 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123446869 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123446928 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123447035 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123447265 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123447378 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123447935 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123449494 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123450225 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123450251 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123450510 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123450647 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123451070 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123452816 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123452864 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123453138 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 123454832 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123454839 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123454862 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123455043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123455445 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123455543 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123455601 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123455654 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 123455676 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 123455711 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 123455755 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 123455786 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 123455802 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123455812 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 123455867 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123456511 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123456576 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123457026 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123457035 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123457200 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123457229 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123457391 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123457418 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123457438 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123457586 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123457602 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123457827 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123457831 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123458248 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123458281 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123458458 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123458476 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123458710 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123458787 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123458821 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123458836 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123458911 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123459050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123459069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123459094 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123459351 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123459362 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123460022 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123460029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123460291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123460422 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123460670 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123460746 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123460762 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123460933 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123460960 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123461088 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123461273 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 123461298 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 123461344 G A Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 123461618 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123461888 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123461947 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123462138 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123462193 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123462625 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123462671 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123463047 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123463197 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123463694 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123463750 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123463761 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123464203 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123464341 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123464655 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123464779 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123464863 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465017 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 123465064 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 123465092 A T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 123465175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465189 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 123465512 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465550 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465554 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465627 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465631 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465658 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465766 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465912 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465955 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465989 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123465996 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123466030 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123466072 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123466190 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123466479 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123466633 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123466754 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123466939 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467011 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467189 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467203 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467205 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467224 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467237 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467316 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467353 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467376 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467690 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467872 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467877 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123467891 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123467916 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123468326 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123468477 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123468797 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123468878 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123469086 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123469247 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123469357 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123469446 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123469801 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 123469955 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123470184 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123470347 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 123470644 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123470661 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123470848 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123470884 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123470910 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123470964 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123471019 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123471038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123471050 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123471406 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 123471427 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 123471484 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 123471500 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123471560 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123471604 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123471663 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123471695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123471698 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123471747 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123471798 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123471830 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123471894 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123471921 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123472217 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123472244 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473066 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123473137 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473145 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123473190 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473199 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473230 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473274 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473275 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473285 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473302 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473384 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473422 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473456 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473463 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473483 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473597 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473622 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473658 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473666 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123473999 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123474177 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 123474441 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123474474 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 123474613 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123474687 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123474710 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123474758 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123474941 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123475036 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123475078 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123475233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123475474 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123475627 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123475713 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123476044 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123476046 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123476108 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123476168 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123476385 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123476410 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123476432 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123476441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123476574 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123476722 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123476790 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123476834 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123476860 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123476867 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123477000 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123477469 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123478213 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123478832 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123480732 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123481306 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123481439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123481593 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123483121 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123483974 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123484438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123485650 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123489384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123490309 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123491416 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123491536 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123491677 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123492004 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123492046 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123492101 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123492553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123493519 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123494593 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123495417 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123495451 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123495769 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123495866 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123495928 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123495955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123495959 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123496937 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123497021 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123497275 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123498132 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123498834 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123500348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123500565 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123501778 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123502015 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123502217 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123502658 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123502679 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123502737 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123502786 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123502867 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123503063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123503158 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123503445 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123503574 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123503616 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123503845 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 123503977 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123503982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123504206 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123504368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123504920 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123505054 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123506161 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123506838 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123507730 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123507748 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123507839 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123508031 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123508081 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123508096 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123508118 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123508131 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123508210 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123508283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123508314 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123508363 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123508374 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123508437 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123508474 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123508489 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123508505 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 123508515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123508549 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123508721 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123508743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123508805 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123508815 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123508858 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123509089 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123509125 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123509195 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123509214 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123509488 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123509883 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123509933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123510000 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123510147 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123510620 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123510671 T C Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 123511047 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123511289 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123511406 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 123511443 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123511483 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123511636 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123511980 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123512000 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512043 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123512394 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512575 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512596 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512603 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512626 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512656 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512672 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512743 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512754 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512797 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512839 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512868 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512959 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123512995 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123513054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123513092 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123513268 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123513523 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123513554 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123513643 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123513707 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123513719 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123513739 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 123514096 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123514189 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123514311 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123514352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123514530 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123515112 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123515932 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123516305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123516327 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123516442 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123516778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123516818 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123516970 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123516992 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123517048 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123517987 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123518018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123518260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123518359 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123518386 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123518395 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123518479 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123518599 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123518719 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123519314 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123519396 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 123519731 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123519778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123519951 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123520020 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123520333 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123520481 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123520595 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123520657 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123520662 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123521034 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123521249 C A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 123521295 T G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 123521471 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123521675 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123521966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123522063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123522662 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123522776 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123523060 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 123523121 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 123523191 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 123523730 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123525902 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123526130 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123526275 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123526417 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123526939 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123526951 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123527017 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123527197 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123527215 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123527248 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123527260 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123527273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123527284 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123527295 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123527322 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123527334 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123527364 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123527429 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123527549 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123527642 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123527843 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123528000 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123528107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123528136 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123528394 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123528407 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123528433 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123528567 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123528606 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123528979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123529192 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123529220 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123529270 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123529305 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123529499 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123529725 T A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 123529815 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 123529839 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 123530297 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123530372 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123530530 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123530599 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123530699 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123530745 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123530990 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123531073 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 123531074 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123531317 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123531390 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123531407 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123531566 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123531613 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123531919 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 123532047 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 123532156 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123532222 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123532495 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123532580 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123532582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123532663 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123532856 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123533031 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 123533073 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123533602 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123533885 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123534957 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123536007 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123536256 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123536587 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123538808 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 123539424 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123539443 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123540277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123540448 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123540715 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123540902 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123541741 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123542094 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123542290 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123542447 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123542467 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123542593 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123543162 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123543499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123544260 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123544797 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123544991 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123545155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123545369 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123546453 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123546667 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123546727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123546757 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123546790 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 123546964 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 123547357 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123547573 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123547700 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123548430 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123549422 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123549457 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123549490 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123549809 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123549860 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123551051 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123551217 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123552057 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123552435 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123553238 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123554099 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123554223 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123555019 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123555186 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123556423 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123556878 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123557229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123557526 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123558031 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123559384 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123559625 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123561694 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123562497 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123562698 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123564657 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 123564666 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 123564687 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123564756 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123565766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123566131 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123566217 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123566456 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123566492 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123569871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123570310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123574739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123575837 C A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 123576574 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123576744 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123577139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123577895 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123578266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123579306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123579324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123579610 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123581132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123581235 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123581237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123582290 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 123583355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123583858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123585582 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123585745 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123586319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123586336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123586694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123587926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123588707 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123589288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123589615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123589779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123590216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123591248 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 123591703 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123593011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123593241 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123593263 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123593361 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123593632 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 123593836 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123593916 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123593985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123594173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123594206 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123594320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123594426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123594439 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123594934 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123595160 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123595165 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123595583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123595839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123595924 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123595932 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123596560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123596815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123597242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123597659 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123597825 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123597881 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123601484 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123601635 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 123601856 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123602368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123602900 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 123603397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123603473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123603967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123604858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123604895 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123604956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123605101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123606405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123607033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123607581 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123607759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123608819 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123616902 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123616980 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123617563 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123617723 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123618725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123619322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123619539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123619569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123619587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123619664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123620366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123620450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123620992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123621225 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123621396 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123621508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123621859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123621929 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123622329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123623125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123623324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123623336 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123623391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123623520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123623555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123623605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123623717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123623767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123623971 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123624019 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123624300 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123624364 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123624501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123624545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123624600 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123624795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123624816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123624868 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123624876 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123624956 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123624998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123625201 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123625468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123625698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123625805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123626114 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123626320 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123626659 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123628616 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123628765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123629054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123629092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123631501 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123632448 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123632976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123633376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123633431 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123633500 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123633888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123634133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123634257 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123634315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123634841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123635487 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123636670 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123637951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123638496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123638616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123638653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123638668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123638947 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123639008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123639082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123639145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123639880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123639947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123640082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123640086 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123640358 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123640371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123640794 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123641355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123641358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123641422 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123641840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123641848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123642982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123643830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123644493 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123646194 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 123646538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123646979 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123647055 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123647566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123651424 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123651803 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123652957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123653469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123653750 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123654145 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123655317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123656065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123656939 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123657828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123658971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123659177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123661572 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123663211 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123663215 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123663769 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123666128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123666531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123666551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123666716 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123667095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123667313 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123667469 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123667544 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123667664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123667920 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 123667940 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 123667953 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 123668055 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123668115 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123668139 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123668201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123668428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123668474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123668546 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123668776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123668879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123668904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123669033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123669062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123669124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123669157 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123669161 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123669168 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123669242 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123669307 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123669433 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 123669435 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 123669504 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 123669567 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 2 123669645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123669819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123670337 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123670340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123670351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670364 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123670556 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123670577 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123670693 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 123670901 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 123670943 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 123670969 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123671035 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123671197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123671324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123671330 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123671358 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123671376 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123671379 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123671458 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123671463 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123671478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123671624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123671626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123671651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123671666 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123671705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123671808 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 123671846 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123671980 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123671984 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123672049 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123672271 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123672282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123672352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123672361 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123672441 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123672579 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123672642 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123672743 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123672752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123672765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123672936 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123673732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123674228 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123674627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123675366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123675400 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123676235 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 123677458 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123677681 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123677734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123678537 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 123679026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123679855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123680083 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123681320 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123681600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123682950 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123682965 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123682968 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123684013 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123684342 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123684850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123685016 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123685047 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123686064 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123686633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123686850 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123686911 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123687281 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123688036 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 123688273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123688653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123689416 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123689423 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123689615 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123689669 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123690020 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 123690141 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 123690152 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 123690403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123690436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123690897 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123690907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123691403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123691424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123692005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123692009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123692353 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123692578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123693668 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123693716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123693741 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123694244 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123694354 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123694463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123694509 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123694649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123694679 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123695080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123695403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123695855 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123696637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123696966 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123697110 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123697256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123697448 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123697649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123699076 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123699542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123699716 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123699956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123699981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123700241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123700284 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123700346 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123700508 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123700535 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123700951 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123701176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123701250 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123701373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123701608 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123701634 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123701677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123701757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123701790 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123701808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123702002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123702206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123702346 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123702593 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123702629 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123702692 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123702731 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123702822 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123703005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123703163 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123703328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123703422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123703436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123703623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123703767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123703769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123703854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123704109 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123704117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123704126 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123704167 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123704257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123704315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123704523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123704906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123712874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123712892 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123713567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123713876 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123713881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123714596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123714873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123715050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123715061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123715242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123715502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123716056 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123716063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123716774 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123717353 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123717382 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123718051 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123719267 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 123719408 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123719848 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123720144 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123720152 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123720735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123721007 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123721039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123721489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123722483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123722664 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123722717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123722808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123722941 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123723002 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123723006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123723024 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123723045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123723235 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123723277 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123723606 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123723623 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123724213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123725232 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 123725306 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123725367 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123725394 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123725427 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123725428 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 123725450 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123725465 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123725477 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123725509 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123725515 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123725541 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123725545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123725575 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123725724 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123725733 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123725788 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123725795 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123725850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123725856 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123725908 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123726052 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123726063 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123726151 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123726186 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123726192 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123726212 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123726269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123726434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123726437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123726567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123726679 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123726714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123727200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123727517 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123727637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123727680 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123728338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123728429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123728502 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123729258 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123729282 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123729323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123730072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123730086 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123730102 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123730129 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123730262 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123730362 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123730376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123730424 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123730453 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123730489 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123730594 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 123730714 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 123730993 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123731015 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 123731043 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 123731062 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 123731451 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 123731743 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123732114 A G Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 123732164 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 123733326 C A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 123733450 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 123733464 C G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 123734605 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123734648 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123734726 C A Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 123736106 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 123736118 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 123736192 G T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 123736270 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 123736287 C A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 123736451 T A Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 123736495 C A Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 123736537 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123736570 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123736753 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 123736784 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123736817 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123736894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123737040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123737063 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123737104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123737137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123737300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123737310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123737311 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123737423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123737465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123737543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123738047 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123738380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123738389 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123738747 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123738803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123738881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123739206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123739298 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123739467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123739725 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123739962 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123740079 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123740139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123740198 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123740332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123740380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123740482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123740721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123740759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123740863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123741180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123741269 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123741315 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123741351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123741533 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123742233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123742595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123742608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123742858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123743072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123743286 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123743325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123743346 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123743483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123743543 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123744135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123744177 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123744185 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123744195 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123744249 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123744687 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123744713 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123745207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123745262 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123745546 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123745566 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123745772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123746061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123746269 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123746584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123746687 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123747034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123747592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123749982 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123750389 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123750862 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123751122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123751319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123753151 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 123753441 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123753471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123753562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123754374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123754682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123754920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123755197 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123756240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123756281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123757247 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123757817 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123758608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123758838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123758935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123759085 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123759297 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123759425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123760069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123760401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123760508 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123760712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123760782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123760795 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123760840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123761059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123761063 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123761114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123761145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123761615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123762579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123762665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123763023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123763027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123763137 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123763411 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123763557 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123763917 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 123764006 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123764685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123764862 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123765301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123766338 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123766612 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123767192 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123767477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123767942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123767991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123768340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123768624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123768643 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123769089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123769166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123769775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123769797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123769993 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123770323 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123770962 A T Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 123771915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123771973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123772097 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123772132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123772199 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123772231 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123772517 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123772548 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123772678 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123772783 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123773674 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123773750 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 123773874 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123774060 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123774112 T G Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 123774123 C A Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 123774135 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 123774402 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 123774637 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123774689 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123775012 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123775226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123775420 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123775521 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123775581 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123775783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123775895 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123775914 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123776069 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123776221 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123776400 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123776710 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123776907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123777312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123777367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123777612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123777716 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123777897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123777972 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123778055 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123778726 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123779591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123779871 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 123780160 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 123780489 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 123780598 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123782119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123782163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123782399 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123782634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123783351 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 123783680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123783719 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123783773 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123784629 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123784679 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 123785312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123785639 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123786287 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123786346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123786422 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123786478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123787110 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123787155 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123787884 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123792170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123792201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123792453 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123792747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123792858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123792987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123793448 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 123793541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123793703 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123794116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123795995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123796093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123797782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123798473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123799677 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123800408 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123800510 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123801549 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123802041 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123802169 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123802171 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123802291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123802659 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123802713 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123802883 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123803401 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123803447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123803513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123803632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123804263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123804345 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123804506 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123804772 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123804971 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123805110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123805112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123805295 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123805369 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123805908 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123806394 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123806723 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123806781 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123807080 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123807098 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123807203 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123807451 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123807521 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123807568 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123807618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123807674 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123807708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123807904 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123807931 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123808000 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123808206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123808434 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123808550 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123808854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123809508 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123809535 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123809543 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123809750 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123809868 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123809951 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123809972 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123810019 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123810322 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123810879 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123811143 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123811297 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123811397 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123812827 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123813052 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123813188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123814033 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123814145 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123814146 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123814345 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123814380 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123814624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123814656 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123814828 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123814886 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123814937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123815393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123815696 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123815732 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123815987 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123816283 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123816368 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123816800 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123816848 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123817009 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 123817238 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123817362 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123817405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123817471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123817547 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123817567 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123817607 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123817650 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123817694 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123817795 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123818014 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123818024 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123818199 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123818200 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123818219 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123818285 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123818345 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123818449 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123818454 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123818461 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123818553 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123818560 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123818661 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123818677 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123818721 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123818733 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123818764 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123818910 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 123819049 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123819147 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123819152 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123819374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123819510 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123819665 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123819705 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123819786 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123819912 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123819916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123820473 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123820605 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123820714 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123820861 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123821065 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123821087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123821092 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123821162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123821774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123822008 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123822123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123822190 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123822254 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123822282 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123822437 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123823300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123824042 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123826050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123826280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123826310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123826949 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123827014 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123827215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123828579 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123828630 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123829116 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123830140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123831750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123832207 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123832684 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123834230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123835335 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123835795 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123837277 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 123838380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123839400 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123839484 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123840558 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123840582 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123841616 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123841644 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123841753 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123841929 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123841980 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123842004 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123842088 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123842452 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123842734 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 123843806 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123844278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123844475 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123844481 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123844753 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123845294 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123845331 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123845346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123845356 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123845695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123846008 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123846110 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 123846480 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123846590 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 123846591 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 123846702 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123846706 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123846788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123846880 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123846947 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123847090 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123847365 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123847455 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123847565 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123847576 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123847626 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123847660 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123847879 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123847944 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123848444 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123848642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123848986 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123849880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123850918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123850930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123851234 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123852262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123852426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123852521 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123854919 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123856766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123857560 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123857999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123858797 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123860960 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123862427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123863033 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 123863228 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123863362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123868706 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123868808 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123869625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123870115 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123870609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123870704 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123871173 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123872053 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123872839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123873392 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123874210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123875042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123875162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123875715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123875950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123876039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123876293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123876329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123876385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123876935 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123877090 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123878006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123878341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123878709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123878842 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123880647 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123881228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123881243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123882560 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123882703 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 123882811 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123883825 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123884805 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123885297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123885382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123885648 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123886060 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123888380 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123890808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123890987 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123891363 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123892885 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123893722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123894283 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123895315 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123895553 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 123895701 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 123896208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123896225 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123896304 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123897330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123898079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123898215 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123898598 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123898783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123899409 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123900001 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123900400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123903440 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123904757 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123904931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123905299 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 123905431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123905544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123905582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123905611 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123905673 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123905745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123907022 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123908303 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123908751 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123908847 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 123910211 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123911347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123915026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123915437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123916140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123917340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123923166 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123924782 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123925839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123926349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123927861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123928310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123931136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123932640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123933141 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123933488 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123933514 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123933572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123933676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123933920 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123934123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123934159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123934199 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123934224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123934365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123934424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123934487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123934527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123935140 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123935169 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123935227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123935231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123935272 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123935330 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123935365 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123935371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123935503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123935520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123935545 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123935554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123935574 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123935580 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123935602 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123935748 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123935892 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123935963 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123936245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123936440 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123936552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123936627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123936657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123936977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123936994 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123937262 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123937648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123937754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123937919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123937943 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 123937998 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123938112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123938246 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123938331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123938384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123938400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123938694 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123938766 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123938825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123938944 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123939138 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123939236 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123939352 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123939556 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123939626 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123939683 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123939759 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123939862 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123940248 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123940359 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123940958 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123941003 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123941430 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 123942371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123944490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123945266 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123945315 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 123945379 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123945405 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 123945875 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 123945918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123945945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123946014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123946099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123946195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123946330 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123946379 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123946446 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123946454 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123946484 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123946527 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123946588 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 123946732 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123947112 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123947232 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123947620 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123947689 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123948806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123948882 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123949474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123949619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123949657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123949763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123949908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123949909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123949992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123950031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123950054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123950159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123950201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123950219 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123951549 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123951607 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 123952180 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123952458 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123952724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123953752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123955364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123955671 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123955909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123956020 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123956115 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123956584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123956604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123957212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123957651 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123957855 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 123958446 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123958879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123960426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123962248 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123962415 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 123962762 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123962917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123963103 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123963551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123963902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123963944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123964153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123964387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123964421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123965034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123965613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123966169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123966815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123967149 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123969358 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123970430 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 123971170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123971258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123972367 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 123972685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123975401 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123975846 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123975913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123976588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123976701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123977784 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123978213 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123978289 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 123979255 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123980404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 123984278 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123990823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123992183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123993670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 123995137 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123997206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123998712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123999374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 123999390 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124000765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124000770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124002392 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124002453 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124002829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124004054 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124004846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124005668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124006593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124007688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124007751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124007788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124008004 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124008268 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124008485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124008990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124009392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124009442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124010188 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124010993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124011217 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124011555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124011591 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124011721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124011957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124012000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124012628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124012724 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 124012776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124012788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124012903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124013236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124013266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124013361 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124013645 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124014044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124014048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124014165 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124014223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124014331 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124014345 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124014470 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124014497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124014583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124014708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124014839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124015004 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124015037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124015118 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124015372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124015573 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124016222 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124016298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124016554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124016555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124016707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124017522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124017536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124017550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124017582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124018262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124018265 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 124019115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124019232 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124019233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124019328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124019756 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 124019896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124020876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124021003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124021519 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124021710 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124022594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124022612 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124023053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124023458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124023494 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124023737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124023826 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124023886 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124023968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124024005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124024203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124024349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124024350 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124024401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124024416 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124024470 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124024538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124024555 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124024685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124024699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124024736 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124024750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124024964 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124024990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124024993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124025025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124025294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124025640 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124025682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124025696 C G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 124025712 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124026011 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124026110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124026202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124026208 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124026325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124026420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124026455 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124026603 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124026811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124026874 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124027168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124027177 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124027194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124027350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124027402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124027754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124027986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124028671 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124028871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124028900 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124028906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124028965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124028979 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124029037 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124029125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124029258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124029279 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124029283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124029391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124029584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124029676 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124029795 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 124030026 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124030044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124030065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124030133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124030147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124030200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124030240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124030275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124030284 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124030388 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 124030800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124030912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124030958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124031521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124031542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124031630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124031812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124031857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124031927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124031939 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124031954 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124032163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124032212 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 124032280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124032332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124032360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124032418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124032427 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124032438 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124032504 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124032533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124032625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124032660 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124032680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124032705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124032803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124033069 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124033129 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124033242 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124034231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124034799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124034813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124034886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124034934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124035187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124035373 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124035504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124035559 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124035568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124035605 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124035636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124035641 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124035678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124035736 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 124035751 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124035772 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 124035805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124035868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124035988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124036013 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124036037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124036079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124036383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124036435 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124036641 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124036734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124036927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124036947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124036985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124037448 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124037701 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124038211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124038361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124038573 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124039074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124039846 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124039889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124040071 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124040072 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124040311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124040352 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124040424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124040521 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 124040726 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 124040747 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124040871 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124040949 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124041226 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124041304 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124041400 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124042145 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124042326 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124042375 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124043371 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124043469 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124043670 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 124043831 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124043928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124043948 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 124044090 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124044091 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124044375 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124044440 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124044791 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124044804 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124044859 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124045007 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124045221 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124045271 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124045334 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124045606 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124045769 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124045901 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124045902 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124045966 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 124046115 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124046218 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124046298 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124046302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124046374 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124046538 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 124046909 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 124046994 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 124047734 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124047751 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124049209 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124049239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124049352 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124050229 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124051545 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124052388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124052408 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124052435 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124052461 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124052499 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124052549 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124052750 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124052790 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124052837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124053040 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124053138 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124053140 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124053176 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 124053269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124053366 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124053413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124053443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124053502 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 124053978 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124053982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124054078 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124054203 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124054232 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124054249 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124054393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124054396 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124054612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124054951 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124054965 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124055002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124055182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124055481 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124055507 T A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 124055659 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124055718 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 124055895 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124056278 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124056332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124056417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124056486 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124056548 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124056661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124056709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124056819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124057304 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 124057837 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 124057889 T G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 2 124057899 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 124058127 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 124058701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124058834 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124059892 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124060182 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124060985 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 124061010 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124062597 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124062652 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124062658 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124062938 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124063017 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124063155 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124063173 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124063203 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124063434 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124063576 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124063613 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124063627 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124063641 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124063671 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124063722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124063777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124063826 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124063833 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124063874 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124063975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124064027 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 124064429 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124064836 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124064903 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124064922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124064936 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124065015 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124065127 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124065249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124065389 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124065460 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124065680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124065965 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124065994 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124066016 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124066764 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124066778 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124066864 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 124067111 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124067236 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124067394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124067395 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124067465 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124067470 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124067619 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124067637 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124068507 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124068622 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124068739 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124068891 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124068928 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124069379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124069625 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124069938 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124069945 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124069958 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124069960 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124070035 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124070092 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124070956 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124071143 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 124071967 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 124072221 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 124072970 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124073571 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124073620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124074293 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124082042 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124082082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124082289 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124082752 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 124083730 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124083744 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124083906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124084872 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124085785 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124085793 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 124085991 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124086045 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 124086499 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 124086718 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 124086762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124087029 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 124087356 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 124088142 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124088161 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 124088424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124088934 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 124089002 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124089078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124089087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124089151 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 124089206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124089337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124089482 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 124089507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124089520 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124089583 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 124089592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124089607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124089664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124089721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124089733 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 124089759 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124089860 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 124089867 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 124090257 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 124090344 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 124090420 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 124090448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124090470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124090534 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 124090624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124091243 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 124092911 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124093057 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124093629 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124093912 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124097035 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124098016 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124098478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124100474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124101003 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124101717 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124102277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124103449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124106122 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124108671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124108955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124109558 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124110689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124111796 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 124112168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124112209 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124112261 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124112513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124112599 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124112917 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124113217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124113262 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124113445 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124113448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124113553 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124113627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124113636 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124113649 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124113915 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124113934 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124113960 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124114213 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124114257 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 124114291 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124114319 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124114349 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124114375 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124114392 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124114412 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 124114585 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124114593 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124114634 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124114647 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 124114694 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 124114741 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124114764 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124114786 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124114923 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124114932 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124114943 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124114972 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124114988 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124115048 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124115049 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124115084 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 124115129 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124115173 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124115422 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124115525 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124115602 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124115670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124115757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124115835 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124115901 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124116071 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124116139 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124116170 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124116259 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124116270 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124116272 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124116281 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124116451 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124116469 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124116684 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124116699 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124116720 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124116821 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124116842 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124116854 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124116911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124117023 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124117069 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 124117341 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124117354 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124117457 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124117487 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124117577 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124117646 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124117753 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 124117806 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124117810 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124117836 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124117964 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124118085 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124118330 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124118354 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124118670 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 124118869 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124118909 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 124118914 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124118945 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124119145 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124119165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124120007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124120347 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124120362 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124120454 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124120457 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124121592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124121629 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124123628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124124769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124125106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124125675 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124133109 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 124134799 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124135543 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124136777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124136843 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 124137267 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 124137311 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124137632 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124138034 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124138265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124138416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124138828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124139000 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124141250 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124141552 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124141857 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124143832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124148879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124149220 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124149413 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124150686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124151056 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 124151440 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124151441 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124151801 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 124151823 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124151838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124151979 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124152213 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124152342 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124152464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124152472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124152478 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124152608 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 124152824 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124152852 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124153073 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124153185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124153286 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 124153311 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 124153380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124153410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124153738 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124153824 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124154015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124154104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124154403 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 124154709 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 124154912 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 124154939 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 124154967 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124155084 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 124155206 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 124155368 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124155644 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 124155645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124156411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124156741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124157267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124157565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124157965 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 124158091 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 124158097 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124158692 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124160231 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124161037 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 124161803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124162158 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 124163250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124165672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124166085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124166102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124166777 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 124166801 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 124166969 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124167132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124167165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124167549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124167648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124167655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124167855 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124168138 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124168275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124168339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124168344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124168375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124168446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124168552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124168609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124168732 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 124168743 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 124168854 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124168877 C A Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 124168889 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 124168895 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 124169628 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124169982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124170143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124170144 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124170363 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124170475 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124170597 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124170612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124170699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124170746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124170827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124170831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124171113 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124171282 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 124171380 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 124171661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124171761 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124171989 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124172550 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 124172770 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124172849 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 124172946 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 124172952 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124172987 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 124173376 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 124173496 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 124173514 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 124173560 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 124173649 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 124173657 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 124173944 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 124174005 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 124174019 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 124174108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124174131 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 124174153 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 124174285 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 124174359 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 124174632 C T Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 124174658 C A Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 124174748 G A Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 124174862 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 124174987 C G Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 124175146 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 124175641 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124175642 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124175720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124175793 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 124179443 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124179564 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124179570 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124179630 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124179819 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124179966 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124179986 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124180253 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124180313 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 124180335 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 124180365 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124180417 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 124180464 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124180480 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124180598 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 124180645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124180690 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124180693 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124180820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124180830 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124180841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124180938 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124180966 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124181102 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124181151 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124181209 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124181490 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 124181672 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124181673 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124181705 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124181709 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 124181831 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 124182001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124182188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124182390 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 124182617 T A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 124182738 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 124182863 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124183124 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 124183442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124183782 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124184349 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124184406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124184490 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124184497 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 124184516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124185125 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124185493 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124185705 A C N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 124186272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124186491 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124186561 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 124186674 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 124186950 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 124187262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124187615 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 124187652 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 124187653 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 124188872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124189694 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 124190282 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 124191794 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 124192502 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 124192503 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 124194597 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 124194931 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 124195167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124195787 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 124196086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124196852 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124196950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124197179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124198740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124199348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124199629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124200920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124200948 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124202839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124202864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124203234 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124204218 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124205546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124207334 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124209623 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124210096 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 124210100 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124210349 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124210523 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124210595 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124211021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124211134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124212602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124212607 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 124213040 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 124213069 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124213551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124214084 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 124214096 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 124214101 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 124214358 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 124214592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124214746 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 124215018 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124215037 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 124215196 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 124215277 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 124215298 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 124215508 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 124215569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124215582 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 124215740 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 124216083 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124216186 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 124216410 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124216509 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 124216538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124216606 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 124216683 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 124217079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124217085 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124217158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124217236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124217586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124217635 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 124217975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124218497 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 124218536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124218760 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 124218767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124219034 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 124219115 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 124219171 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124219231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124219258 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 124219716 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 124219800 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 124219845 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124219915 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 124219936 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 124219965 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124219977 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 124220017 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 124220027 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 124220387 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 124220443 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124220488 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124220621 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124220740 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 124221020 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124221349 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124221664 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 124221720 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124221767 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124221911 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124222048 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124222080 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124222088 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124222106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124222230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124222354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124222416 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124223253 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124223804 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 124224232 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 124224375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124224804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124225078 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124225208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124225274 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124225381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124225728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124226104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124226134 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124226204 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124227464 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 124227542 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 124227596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124227616 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 124227822 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 124227912 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 124228159 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 124228211 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 124228316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124228374 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 124228380 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 124228416 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 124229371 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124229845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124229872 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124229942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124229955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124231051 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124231187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124231537 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124232293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124232904 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 124233220 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 124233737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124233932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124234323 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 124234352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124235617 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 124237265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124237901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124238027 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124238104 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124238118 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124238133 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124238134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124238441 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124238599 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124238937 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 124238963 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124239010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124239124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124239570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124239982 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 124239996 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124240119 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124240187 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 124240308 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124240485 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124240515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124240724 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 124240745 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124241552 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124241784 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124241829 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124242115 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124242166 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 124242224 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 124242229 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 124242251 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 124242259 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 124242321 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 124242341 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 124242361 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124242444 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124242464 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124242477 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 124242570 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124242605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124242667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124242668 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124242699 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 124242795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124242883 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124242892 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124242907 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124242945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124243061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124243174 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 124243595 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 124243892 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 124243993 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124244072 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 124244159 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 124244160 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 124244573 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 124244616 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 124244645 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 124244702 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 124244825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124244827 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124245002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124245616 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 124245855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124246134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124246596 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124246778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124247017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124247061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124247088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124247129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124247553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124247658 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124247665 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 124248029 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 124248068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124248086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124248112 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124248380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124248403 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124248419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124249169 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124249654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124249718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124249761 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124249933 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124250026 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 124250503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124250706 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124250971 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124251136 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 124251294 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124251300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124251311 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124251421 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124251461 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124251905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124252125 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124252457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124252547 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124252641 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124252709 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124252742 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124252877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124253065 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124253091 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124253191 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 124253217 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124253249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124253273 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 124253386 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124253494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124253741 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124254173 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124254294 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124254366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124254450 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124254453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124254481 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124254496 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124254559 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124254685 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124254749 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124254770 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124254813 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124254841 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124254844 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124255287 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124255389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124255415 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124255709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124255862 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124256083 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124256365 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 124258341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124258898 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124259052 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124259171 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124259349 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 124259412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124259477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124260231 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124260269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124261321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124262280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124262545 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124262989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124263244 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 124263420 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 124263454 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 124263593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124263594 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124263629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124263715 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124263789 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124263806 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124263839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124263903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124263931 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124264127 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124264685 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124264940 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124265104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124265348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124265760 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124265867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124266081 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124267020 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124267456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124267883 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124267891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124268207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124269628 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124269743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124269804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124270068 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124270252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124270283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124270397 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124270824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124271026 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124271837 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 124272052 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124272232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124273394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124273610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124275409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124276164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124276527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124277593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124277766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124277855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124277924 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124278274 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 124278382 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 124278604 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124278644 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124279415 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124279450 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 124279575 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124279648 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 124279649 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 124279915 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 124280169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124280419 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124280459 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124280465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124280620 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124280642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124280643 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124280739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124280856 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124281149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124281672 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124282083 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124282853 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124282933 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124282976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124284509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124285156 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124285705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124285941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124287612 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124287625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124290433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124293819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124293928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124293968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124294005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124294106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124294122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124294243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124294399 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124294444 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124294520 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124294564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124294617 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124294947 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 124295879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124295905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124296652 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 124296899 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124297278 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 124297409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124297505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124297536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124297817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124298943 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 124299304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124299596 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124302591 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 124302648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124302674 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 124302799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124303236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124303628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124305277 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 124305304 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 124307415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124307430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124307690 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124308485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124308660 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 124308967 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 124308984 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 124309113 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124310284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124310490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124311396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124312059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124312338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124312355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124312494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124312576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124312918 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 124313585 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124313708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124314433 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124315122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124315208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124315519 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124315695 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 124315721 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 124316973 A G Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 124317393 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124317723 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124319081 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124321167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124324621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124325036 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124325087 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 124325404 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124325407 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124325536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124325993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124326378 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124326943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124326969 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124327094 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124328344 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124328358 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124328460 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 124328724 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 124328750 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 124328991 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124329060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124330116 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124331673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124332221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124332492 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124332510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124332554 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124332798 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124332825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124334177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124334980 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124334981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124335029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124335192 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 124335395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124335826 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 124335898 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 124335995 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 124336065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124336464 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124336476 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 124336734 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124336763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124336825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124337838 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124338463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124338510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124338562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124338935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124339103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124339150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124339228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124339232 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124339337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124339354 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124339464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124339960 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124340317 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 124340412 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 124340695 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124340725 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 124340803 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 124340870 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124340875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124340922 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 124341000 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124341011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124341164 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 124341250 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124341330 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124341338 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124341349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124341544 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 124343427 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 124343511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124343846 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 124343867 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 124344408 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 124344878 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124345053 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124345080 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124345088 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 124345150 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124345161 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124345330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124345382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124345948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124346036 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124346334 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 124347148 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 124347233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124347438 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124347560 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124347561 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 124347583 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 124347647 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 124347916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124348374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124348496 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 124348656 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 124348741 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 124348928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124349436 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 124349450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124349462 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 124349613 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124349629 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 124349844 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124349982 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 124350231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124351200 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124352226 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124352843 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 124353202 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 124353251 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 124353304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124353508 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124353537 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 124354912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124355970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124356038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124356086 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124356493 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124356797 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124357256 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124357319 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 124357427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124357446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124357467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124357486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124357524 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124357547 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124357559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124357872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124358454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124358988 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124359020 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124359221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124359332 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 124359426 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124359477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124360512 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 124362220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124362539 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124362855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124362866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124363492 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 124363504 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 124363509 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 124363747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124364306 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124364447 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124364788 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124364956 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124365033 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 124365036 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 124365075 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124365104 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 124365124 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124365125 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124365440 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124365525 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124365592 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 124365619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124366426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124366469 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124366644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124366785 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124367131 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 124367150 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 124367295 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 124367485 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 124367550 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 124367652 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124367654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124368100 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 124368157 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 124368167 A T N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 124368814 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124368882 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 124368927 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 124369035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124369036 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 124369202 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124369275 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124369292 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124369517 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 124369597 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124369958 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124370033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124370257 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 124370281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124370345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124370646 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 124370703 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124370895 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 124371094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124371111 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 124373111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124373332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124373470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124373837 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 124374604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124374869 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 124374894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124376181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124376448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124376882 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124376970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124377580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124377669 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124377759 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124377770 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124377821 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124378252 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124378328 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 124378623 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124378820 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124378939 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124378970 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124379142 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124379190 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 124379218 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 124379225 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 124379274 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 124379433 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124379446 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 124379928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124380006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124380780 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124380827 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124380933 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 124381352 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 124381372 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124381388 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124381403 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 124381412 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 124381424 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124381554 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124381557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124381592 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 124381619 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124381624 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124381737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124381747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124382005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124382047 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124383070 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124383188 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124383241 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124383287 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124383375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124383400 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124383627 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124384106 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124384453 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124384519 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124385175 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124385229 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124385636 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 124385823 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 124385965 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124386188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124386203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124386818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124387011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124387254 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 124388624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124389016 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 124390031 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124390476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124390872 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 124391029 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 124391233 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 124391267 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124391269 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124391322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124391421 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124391491 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 124391583 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 124391705 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124391776 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 124391816 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 124391843 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 124391972 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124392087 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124392094 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124392168 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124392182 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 124392188 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124395084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124396654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124399381 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124400369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124400596 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124400862 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124400934 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 124400980 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124401356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124401516 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 124401544 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 124401717 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124401801 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124401820 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124401832 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124402642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124403895 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124404565 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 124404953 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124406705 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 124407001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124407535 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124407653 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124408027 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124408111 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124408646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124409623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124409809 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124410731 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124411486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124412206 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124412250 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124413150 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124413905 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 124414055 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 124414124 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 124415222 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124415286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124415337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124415466 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 124415483 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 124415773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124416174 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 124416408 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 124416462 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124417227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124417892 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 124418714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124419605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124420166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124420378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124420490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124420601 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124421342 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124421414 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124421448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124421482 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124421549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124421711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124421780 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124421949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124422625 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 124422810 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124422949 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124423177 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 124424296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124424601 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 124424759 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124424765 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124424781 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124425032 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124425048 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124425148 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124425247 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124425286 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124425310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124425341 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124425398 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 124425521 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124425552 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124425574 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124425589 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124425781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124425844 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 124425862 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 124425973 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124426018 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 124426056 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 124426095 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 124426228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124426264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124426741 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124426752 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 124426794 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 124427152 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124427278 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 124427392 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124427554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124427606 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124427686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124427826 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 124427856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124428013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124428053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124428148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124428382 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124428556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124428982 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124429006 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124429035 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124429184 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124429236 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 124429249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124429355 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124429617 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 124429625 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124429675 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 124429786 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124430573 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 124430827 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124430876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124430935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124431502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124431602 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124432000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124432113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124432186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124432727 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124433308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124433346 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124433480 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124433621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124433765 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 124433859 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 124433931 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 124434154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124434164 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 124434318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124436290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124436346 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 124437049 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 124439866 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 124441261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124441580 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124441637 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 124443254 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 124443933 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124447723 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 124447738 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 124448254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124448747 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 124448890 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124449742 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124450142 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 124450365 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124450808 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124451073 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 124451460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124451480 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124451519 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124452133 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 124453629 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124453711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124454152 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 124454716 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 124454804 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 124454808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124454840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124454917 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124455131 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124455764 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124456066 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124456122 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124456585 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 124456641 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 124456801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124456981 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124456995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124457025 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 124457866 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 2 124458163 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124458200 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124458905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124461230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124461504 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124463336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124464782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124466461 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124470605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124471203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124472458 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124472555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124473572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124473815 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124474674 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124474679 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 124475096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124475142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124475914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124475981 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124476627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124478556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124480363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124481403 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124483220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124483355 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 124483809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124483960 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 124486020 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124486101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124486123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124486240 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 124486549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124487065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124487117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124487352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124487694 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124487760 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124504391 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124504664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124504769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124504841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124505416 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124505711 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124505888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124505987 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 124505992 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124506000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124506035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124506107 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124506135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124506195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124506210 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124506405 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124506417 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124506426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124506929 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124507073 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 124507207 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124507488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124507521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124508086 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124508180 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124508289 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124508292 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124508479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124508493 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124508720 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124509594 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 124509610 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124510093 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124510630 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124510854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124510902 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124512039 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124512216 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124513637 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 2 124514056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124516690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124516801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124517610 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 124517723 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 124518451 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124518677 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124519223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124521805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124522938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124524111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124525325 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 124527685 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 124528152 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 124528821 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124528982 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124529989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124530071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124532718 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124534511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124534554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124534560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124534584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124534591 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124534610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124534715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124534802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124534828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124534940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124535129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124535130 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124535188 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 124535213 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 124535319 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 124535551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124535830 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 124535842 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124535848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124535995 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 124536009 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 124536134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124536137 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 124536210 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124536226 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124536228 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124536275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124536327 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124536366 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 124536403 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 124536404 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 124536433 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124536446 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124536527 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 124536637 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124536669 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124536791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124536843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124536862 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 124536959 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124536972 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124536988 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124536994 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124537047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124537183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124537252 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 124537358 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 124537394 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 124537445 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 124537460 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 124537588 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124537774 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 124537851 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 124538151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124538232 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 124538243 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 124538250 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 124538256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124538358 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 124538425 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 124538607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124538699 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 124538702 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 124538945 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 124539258 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 124539297 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 124539427 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 124542061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124544225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124544272 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 124544360 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 124544749 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124544948 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124545071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124545113 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124545130 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124545147 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124545161 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124545192 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124545234 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124545339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124545392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124545795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124545889 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 124545985 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124546007 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124546422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124546624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124546674 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124546861 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124547348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124547709 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 124548121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124548234 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 124548297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124548551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124548916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124549484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124549605 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 124549814 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 124550605 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 124551419 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124551991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124552211 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124552829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124554317 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 124556073 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 124556098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124556916 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124557454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124557487 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124557697 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 124557801 A T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 124557929 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124558368 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 124558648 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124559140 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124559283 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124559284 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124559406 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 2 124559670 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 124559705 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124559741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124559899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124559980 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 124560028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124560046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124560201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124560633 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 124561037 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124561074 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124561346 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 124561445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124562015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124562138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124562314 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 124562694 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 124562924 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 124562984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124563013 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 124563215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124563886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124564195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124564244 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 124564314 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 124564368 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 124564384 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124564890 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124565062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124565141 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124565174 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 124565608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124566376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124566833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124566850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124566888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124567406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124567485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124567572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124567842 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124567971 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 124568638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124568686 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 124568820 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124568998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124569050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124569217 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124569236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124569304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124569372 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 124569655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124569696 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124569698 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124569752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124569824 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 124569938 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 124570081 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 124570783 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 124570799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124571457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124573644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124575371 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124577433 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 124577490 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 124577688 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124577802 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124577848 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 124577852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124578513 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 124578620 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124578869 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 124578980 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 124579066 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 124579825 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124579830 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124580021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124580325 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124580373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124580424 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 124580461 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 124580720 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124581862 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124583620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124583878 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124584158 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 124584520 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124586384 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124586634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124588488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124588553 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124589623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124590952 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124594500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124596529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124597062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124597278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124597666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124597708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124598071 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124598293 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124598723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124598953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124599041 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124599115 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 124599713 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 124599717 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 124599788 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 124600095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124600173 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 124600215 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 124600258 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 124600355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124600591 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 124600753 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124600988 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 124601076 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 124601230 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 124601551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124601955 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124601966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124602068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124602509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124602583 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124602610 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124602612 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124602656 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124602659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124602748 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 124602772 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124602773 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124603227 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 124605451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124605680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124608314 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 124608739 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 124608984 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124609162 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 124609166 A C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 124609190 C T Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 124612775 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124615166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124615588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124619503 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124620905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124620978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124623406 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124623623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124633447 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124634162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124634677 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124637835 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124638140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124638515 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124638583 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124638962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124638979 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124639064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124639084 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124639553 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124639963 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124640059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124640123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124640748 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124641112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124641336 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124641414 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124641683 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 124645002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124647078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124650011 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124650205 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 124662048 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 124663413 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 2 124663484 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 124664249 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124665559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124666407 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124666886 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124668089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124668578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124668617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124668618 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124669250 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 124669477 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 124669645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124669695 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124669783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124670124 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124670382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124670608 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124670829 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124671176 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124671389 A T Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 124671635 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 124672555 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 124672716 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124673621 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124673722 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124674527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124674535 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124675025 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 124675064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124675157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124675227 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 124675335 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 124675371 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 124675699 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124675712 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124675754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124675962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124675991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124676021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124676029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124676103 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124676284 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124676358 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 124677725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124678132 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124678233 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 124678354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124678773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124680195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124680272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124680325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124680353 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124680667 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 124680725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124680783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124680938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124681002 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124681021 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124681068 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124681480 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 124682915 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 2 124682919 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 124683940 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124684648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124685764 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124688998 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124689088 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124689697 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124690419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124693356 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124693421 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124693874 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 124693929 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 124694091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124694134 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124694282 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124694292 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124694376 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124694403 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124694422 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124694974 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 124695054 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124695123 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124695346 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 124697322 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124698277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124698725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124698939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124704769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124705359 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 124705496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124706329 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 124706654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124713302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124713331 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 124713799 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124714714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124714721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124714806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124715655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124716330 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124716535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124717323 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124717432 C A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 124717517 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124717536 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124717792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124717848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124718276 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 124718515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124718760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124718844 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124718864 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124718867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124718901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124718927 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124719280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124719282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124719348 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 124719434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124719511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124719520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124719553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124719563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124719672 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 124719790 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 124719887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124719924 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124720041 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124721201 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124721232 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124721238 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124721690 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124721868 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124722045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124722213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124722286 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124722396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124722475 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124722507 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124722653 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124722675 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124722681 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 124722709 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124722735 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124722758 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124722813 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124722893 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124722896 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124724435 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 124724517 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 124724529 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 124725003 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 124725022 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 124725630 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124725953 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124726216 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124726383 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 124726385 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 124726540 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124726603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124726612 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124726624 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 124726698 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 124726752 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 124726755 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 124726784 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124726895 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 124726975 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124727067 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 124727087 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124727130 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124727242 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124727254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124727261 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 124727271 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 124727272 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 124727452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124727659 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 124727673 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124727696 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124727781 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 124727883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124727965 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124728624 A C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 124728901 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124729019 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124729423 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124729704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124730556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124730563 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124730635 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 124730786 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124730917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124730952 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 124731037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124731135 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124731198 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124731402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124731711 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 124731979 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124732006 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 124732523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124732612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124732828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124732848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124732918 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 124732938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124733201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124733444 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 124733780 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 124733815 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 124733838 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 124734013 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 124734016 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 124734099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124734186 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 124734215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124734693 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 124734748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124734792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124734886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124734894 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124735232 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 124735286 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 124735299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124735386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124735435 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 124735450 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 124735464 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 124735489 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 124735719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124735934 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 124736064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124736145 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124736165 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 124736391 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124736542 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124736597 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 124736603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124736647 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 124736656 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 124736844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124737118 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124737212 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124737243 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124737431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124737514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124737839 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124738053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124738912 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 124739371 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 124739531 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 124739553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124739571 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124739762 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124739776 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124739916 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 124739947 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124739956 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 124739993 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124740688 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 124740800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124740907 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 124740976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124741007 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124747103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124747144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124747360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124747895 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124753792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124755424 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124758013 C G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 124758146 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 124758270 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 124758621 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 124758773 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 124758943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124759098 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124759243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124759593 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 2 124759666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124760086 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124760465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124760909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124761576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124761858 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 124762035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124762118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124762382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124763142 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124763230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124763240 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124763700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124764029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124764123 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124764187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124764271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124764552 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 124764690 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 124764751 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 124765186 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124765190 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124765251 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 124765372 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124765870 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124765883 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124774804 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124774929 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124777059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124781658 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124781756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124783076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124783230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124783792 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 124783949 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124784126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124784343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124786379 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124787315 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124788091 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124790864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124794580 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 124795485 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 124795978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124796755 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124796840 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 124796896 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 124796906 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124796944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124797079 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 124797105 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124797124 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 124797127 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 124797219 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 124797230 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124797347 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 124797357 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 124797359 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124797392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124797484 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 124797692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124797849 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124798029 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 124798495 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 124798496 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 124798667 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124798696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124798724 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124798726 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124798756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124798803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124798840 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124798864 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 124799002 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 124799184 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 124799198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124799258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124799317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124799800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124799875 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 124800257 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 124800393 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 124800510 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 124800694 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 124800918 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 124801205 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 124801251 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124801376 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 124801471 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124801668 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 124801711 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 124801747 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124802728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124804062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124804546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124812438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124812619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124812723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124812985 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 124812994 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 124813061 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 124813083 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 124813361 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 124814582 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 124814836 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 124814933 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 124814949 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 124816066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124816313 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 124817128 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 124817420 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124817541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124818515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124818952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124819874 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124819875 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124819921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124819946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124820009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124820030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124820119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124820349 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 124820395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124820829 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124821118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124821414 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 124821433 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 124821565 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 124821690 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 124821817 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 124822101 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 124822187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124822833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124823288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124823899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124823916 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124823936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124826706 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 124826718 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 124827152 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 124827178 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 124827182 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 124827197 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 124827202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124827301 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 124827311 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 124827335 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 124827624 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 124827637 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 124827700 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 124827928 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124828067 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 124828079 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 124828090 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 124828413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124828716 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 124829232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124829326 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 124829459 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 124829518 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 124829690 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124829727 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124830728 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 124831063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124832179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124832558 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 124833122 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 124833238 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 124834320 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124834509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124834700 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 124834873 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124834921 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 124834933 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 124835018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124835284 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 124835320 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 124835332 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 124835386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124835509 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 124835578 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124835710 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124835768 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 124835770 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 124835822 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 124835861 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124836673 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 124837006 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 124837009 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 124837020 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 124837025 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 124837145 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 124837564 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 124837804 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 124837818 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 124837847 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 124838010 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 124838253 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124838274 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124838507 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124838625 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 124838662 C A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 124838692 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 124838966 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124840015 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124840082 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 124840536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124841792 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 124842361 A C N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 124842471 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 124843431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124844391 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 124844571 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 124844808 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 124844868 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 124845324 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124845378 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124845400 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 124845413 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 124845425 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 124845446 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 124845447 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 124845466 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 124845476 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 124845585 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124845597 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 124845640 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 124845773 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 124846194 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124846316 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 124846365 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 124846433 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 124846458 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124846461 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 124846503 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124846538 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124846545 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 124846639 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 124846696 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 124846978 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 124847057 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 124847073 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 124847327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124847399 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 124847409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124847455 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124847535 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 124847638 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124847640 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124847800 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 124847917 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 124847956 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 124847962 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 124848222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124848270 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124848296 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124848353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124848493 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 124848529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124848618 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 124848642 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 124848776 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 124848783 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 124848794 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 124848885 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 124848924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124849031 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 124849078 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 124849121 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 124849262 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 124849324 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 124849338 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 124849388 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 124849395 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 124849543 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 124849924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124850302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124850871 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 124850872 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 2 124850891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124851040 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124851140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124851161 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124851191 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124851289 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 124851315 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 124851484 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 124851500 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124851575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124851618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124851647 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 124851758 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124851824 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124851841 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124852141 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 124852217 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 124852330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124852389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124852506 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124852578 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 124852696 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124853048 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 124853321 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 124853532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124853563 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 124853810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124853925 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 124854055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124854488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124854558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124854562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124854762 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 124854894 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124854921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124855342 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124855891 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 124856514 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124856593 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124856905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124857030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124857221 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124857361 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124857376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124858354 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 124858876 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 124859235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124866180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124869353 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 124870111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124870407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124873612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124874520 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 124875629 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 124876707 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 124877092 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 124877114 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 124877189 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 124877455 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 124877559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124877665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124877674 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 124877697 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 124877737 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 124877755 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 124877778 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 124877799 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 124878344 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 124879498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124879872 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 124880216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124880463 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124881275 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 124881566 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 124881568 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 124881637 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124881702 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 124881711 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 124881727 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 124881791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124881810 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 124882098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124882121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124882131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124882361 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 124882541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124882773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124883261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124883270 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124883317 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 124883512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124883905 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 124888072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124888884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124889096 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 124889388 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 124890040 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 124890258 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 124890693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124893357 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 124894073 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124894075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124894090 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124894272 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124895167 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124896563 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124896841 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 124898176 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 124898402 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 124900356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124900669 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124901086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124901388 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124901660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124903278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124903979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124904378 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 124904881 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 124905091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124905311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124908407 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 124908612 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 124909190 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124909685 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 124910397 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124910476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124910595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124912172 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124912212 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124912339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124914835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124915580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124916667 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124917202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124917290 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124917366 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124917619 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 124918402 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124921528 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 124921987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124922570 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124925329 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124925801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124927006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124929490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124930608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124930707 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124932245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124932477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124939555 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 124939869 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124940039 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124945729 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 124947068 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124955796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124956159 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 124956205 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 124956532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124957276 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 124957468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124959033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124960313 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124961373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124962752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124963164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124963179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124963517 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 124963977 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124963993 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 124964361 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 124964586 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124965167 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 124965696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124966073 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 124966154 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 124966184 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 124966227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124966448 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124966467 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124966588 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 124966795 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 124966983 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 124967040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124967185 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 124967662 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 124967785 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 124968346 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124968410 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 124968411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124968483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124968612 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124968831 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124970744 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 124970928 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124970987 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 124973440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124973528 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 124974254 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 124976390 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 124976459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124976735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124977347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124977644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124978035 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 124978088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124979364 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124980196 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 124980506 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 124981053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124982156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124982428 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 124982846 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 124984182 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 124984448 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124985089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 124985449 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124985941 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 124986005 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 124988255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124988917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124989095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124989418 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124994325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124995584 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 124996350 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124997041 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 124997273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124997368 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124997619 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 124997798 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 124997906 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 124997992 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 124998026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124998051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124998169 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124998255 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 124998256 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 124998378 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 124998475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 124998476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124998494 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 124998511 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 124998516 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 124998646 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 124998890 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 124998934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124998954 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 124998977 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 124999080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124999550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124999587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 124999827 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 124999906 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 124999990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125000160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125000298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125000486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125000595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125000782 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 125000784 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 125000823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125000994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125001000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125001033 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125001136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125001157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125001172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125001774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125001841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125001989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125002249 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125002453 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125002555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125002770 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 125003542 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 125003660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125003661 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 125003745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125003909 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 125003940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125004030 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125004061 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125004135 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125004250 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125004560 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125004635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125006050 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 125006108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125006201 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 125006365 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 125006409 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 125006469 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 125006538 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 125006726 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 125006797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125006817 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 125006989 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 125007022 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 125007031 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 125008103 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 125008244 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 125008269 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 125008620 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 125008922 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 125008936 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125008947 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 125009421 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 125009725 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 125009811 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 125010114 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 125010197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125010266 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 125012308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125012900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125013022 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 125013303 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 125013444 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 125013490 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 125013493 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 125013702 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125013835 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125013883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125014475 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125014571 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 125014675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125014736 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 125015062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125015084 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125015094 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125015665 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 125016105 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 125016821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125016957 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 125016986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125017227 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 125017590 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 125017603 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 125017765 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 125017816 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 125017919 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125017929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125018111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125018164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125018276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125018347 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125018355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125018391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125018408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125018416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125019241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125019261 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125019498 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 125019725 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 125019748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125019786 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 125019806 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 125019840 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 125019898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125019904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125020337 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 125020350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125020566 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 125020670 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 125020702 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125021255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125021771 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 125022087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125022107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125022772 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125023433 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 125023447 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 125023499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125023518 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 125023622 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 125023640 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 125023922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125025289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125025738 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 125027146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125028401 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 125028862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125031219 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125031730 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 125032258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125032642 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125033204 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 125033268 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125033307 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 125033473 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 125033690 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 125033921 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 125034002 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 125034075 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 125036776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125037091 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 125037393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125037660 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125038961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125039329 A G Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 125039506 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 125040661 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125041919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125042993 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 125043734 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 125044884 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 125044969 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 125044990 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125045029 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125045229 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125045455 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 125045482 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125045759 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125045787 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125045798 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125045835 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125045888 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125045974 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125046177 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125046461 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 125046613 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 125046677 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 125046679 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 125047122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125047138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125047259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125049083 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125049199 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 125049449 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125049510 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125054794 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125056677 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125057014 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125057200 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125058011 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 2 125060508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125060892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125061133 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 125061769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125061957 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125062326 A T N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 125062528 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125062625 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125062657 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 125062661 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125062684 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125062770 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125062777 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125062802 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125062861 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125062886 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125062893 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125063082 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125063134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125063153 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125063183 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 125063225 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125063283 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125063295 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 125063367 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 125063413 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 125063598 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125063759 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 125064296 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125064807 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125065009 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125065134 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125065481 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 125065602 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125066654 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 125066670 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125066718 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125066750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125066790 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 125066833 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125066950 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125066963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125067115 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125067180 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 18 18 2 14 2 2 125067235 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125067363 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125067494 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125067539 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125067551 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125067750 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125067874 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125067992 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 125068039 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125068049 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125068065 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125068084 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125068317 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125068851 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125068866 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 125068867 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 125069249 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 125069357 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125069367 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 125069571 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125069652 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125069691 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125069902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125070343 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 125070517 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 125070569 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 125070583 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 125070639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125070654 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125070671 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125070735 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 125070778 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 125070798 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125070873 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125070889 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125070893 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125070903 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125070914 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125070920 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125071204 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125071832 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125072620 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125072742 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 125075226 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125076187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125076419 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125076941 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125077040 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 125077044 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 125077057 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125077089 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125077262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125077349 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125078452 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125078625 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125079319 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125082419 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125083513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125084391 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 125084598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125084819 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125085164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125085204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125085265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125085882 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125086102 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125086910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125087825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125088855 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125088894 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125089355 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125089455 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125089676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125089752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125089849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125089850 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125090038 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 125090198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125090205 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 125090571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125090584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125090631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125091783 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125092047 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125092059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125092113 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 125092223 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 125093427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125093759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125093968 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125094001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125094048 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 125094256 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125094371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125094947 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 125095032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125095105 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125095142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125095506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125095543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125095575 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125095583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125095691 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125095693 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125095748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125095902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125095932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125096015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125096090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125096333 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 125096342 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 125096360 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125096554 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125096569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125096590 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125096684 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125096725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125096749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125096900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125096922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125097027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125097092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125097138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125097150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125097433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125097458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125097459 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125097993 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125098395 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125098963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125099551 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125101197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125101309 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 125101794 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 125102608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125102695 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125102696 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125103335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125103392 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125103417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125104515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125104517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125105334 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125105459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125106846 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 125106907 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 125107001 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 125108389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125113146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125114032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125114403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125116087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125116515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125116917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125117083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125117287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125117650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125117691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125117775 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 125117963 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 125117982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125118590 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 125118647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125118735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125118741 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 125119079 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125119474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125120203 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125120276 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125120469 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125120500 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 125120870 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125120932 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 125120996 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125121506 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125121537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125121613 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125121646 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125121679 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125121840 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125121842 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125121863 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 125121893 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125122321 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 125122497 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125123444 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125123509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125124445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125124875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125124944 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125125242 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125125260 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 125125276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125125286 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125125363 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125125394 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125125514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125126241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125128235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125128699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125129132 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125129146 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125129149 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125129270 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125129305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125129308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125129921 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125130081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125130418 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125130646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125131554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125132280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125132331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125132450 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125132549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125132556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125132593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125132680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125132710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125132717 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125132838 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125133868 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125133879 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125134028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125134126 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125134780 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125134783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125134798 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125134850 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125134886 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125134924 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125134935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125134947 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125135066 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125135068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125135109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125135199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125135280 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125135735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125135749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125135946 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125135957 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125135959 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125135990 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 125136160 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125136177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125136596 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125136651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125136670 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125136688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125136733 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125136753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125136785 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125136807 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125136857 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125136950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125136956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125137447 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125137539 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125137657 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125137681 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125137696 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 125137715 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125137744 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125137762 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125137794 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 125137885 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125137958 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125137966 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125137976 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125138034 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125138380 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 125138395 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 125138585 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125139081 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125139173 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 125139287 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125139352 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125139379 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125139641 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125139749 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125139896 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125140660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125140727 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 125140801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125141255 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 125141288 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125141313 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 125141318 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125141927 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125141947 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125141969 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 125142004 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 125142216 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125142229 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 125142313 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125142488 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 125142943 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125143380 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 125147609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125148370 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 125148837 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125149686 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125149896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125150361 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 125150602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125150948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125151163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125151178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125151208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125151338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125152707 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 125153005 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 125153472 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125153495 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 125153592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125153969 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 125153990 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 125154874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125154878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125155968 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125156130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125156152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125156241 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 125156701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125156807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125156924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125156999 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125157018 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125157048 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125157052 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125157067 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125157103 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 125157104 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125157120 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 125157133 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 125157149 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 125157153 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 125157232 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 125157249 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125157670 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125158558 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125159116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125159615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125160350 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125160503 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 125160522 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 125160523 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 125160579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125160655 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 125160656 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 125160805 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 125160808 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 125160825 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 125160832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125160839 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 125160847 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 125160989 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 125161042 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 125161186 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 125161201 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 125161511 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125161623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125161818 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125162180 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125162784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125162939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125163607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125165566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125168213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125168751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125168786 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125169611 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 125169753 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125169774 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125170036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125170158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125170509 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125170592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125170654 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125170893 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 125170906 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 125170942 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125170991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125171142 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 125171256 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 125171300 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 125171317 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 125171496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125172853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125173147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125173273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125173283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125173435 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 125173844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125174072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125174273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125174757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125175497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125175621 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 125175622 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 125175729 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125175730 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125175766 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 125175772 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 125175787 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 125176031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125176660 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 125176670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125176679 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 125177280 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 125177595 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125177663 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 125178707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125179041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125179234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125179244 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 125179427 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 125180245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125180804 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 125180857 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125181167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125181226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125182279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125182771 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 125183388 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125183418 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125183657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125184709 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 125185352 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125187781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125188405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125188811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125188878 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125189185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125189189 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125192152 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125192411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125194945 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125195010 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125195175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125195588 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125195813 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125197477 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125198969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125199024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125199185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125199419 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125199773 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125199774 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125199813 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125199866 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 125200003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125200020 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125200067 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125200090 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125200132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125200240 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125200247 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125200253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125200259 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125200267 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125200270 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125200371 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125200495 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125200562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125200588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125200649 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125200842 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125201722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125201748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125201890 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125202072 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125202231 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125202587 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125203656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125204029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125204377 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125208088 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125210883 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125212175 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125212538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125213794 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125214335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125215669 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125217127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125217401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125217404 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125217533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125218398 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125219366 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125221360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125222345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125222387 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125224669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125225609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125226318 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125226460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125226604 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125226609 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125226768 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125226972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125227433 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125227847 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 125227974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125228178 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 125228179 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 125228312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125228483 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125230276 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125238523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125238920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125242005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125243494 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 125244618 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125244714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125245301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125245363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125245868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125247095 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125247339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125248451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125250622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125252826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125252905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125254373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125254806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125255315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125256394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125257586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125257992 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125258004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125258720 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125259795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125262294 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125262499 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125263291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125264495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125264823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125265023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125265343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125265951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125268388 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125269270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125270387 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 125270497 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 125272632 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125272734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125273613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125273777 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125273801 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125273949 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125273992 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125274372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125274409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125274483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125275229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125275273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125275644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125275773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125275781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125276050 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125276243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125276619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125276833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125276911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125277040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125277073 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125277164 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125277477 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125277620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125277797 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125278015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125278184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125278245 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 125278608 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 125278610 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 125278650 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 125278666 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125278722 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 125278781 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 125279017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125279521 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 125279564 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 125279597 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 125279908 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 125280002 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 125280470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125280938 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125281805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125282425 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125283326 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125283336 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125283764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125283879 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 125284051 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 125284191 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 125284707 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 125285211 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125285855 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125286067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125286194 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125286409 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125286463 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125287634 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125287721 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125288059 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 125288099 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 125288146 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 125288462 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 125288536 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 125288721 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 125288750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125288830 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 125288852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125288946 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125288950 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125289000 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 125289012 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 125289200 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125289443 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125289444 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125289506 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125289508 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 125289519 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 125289622 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125289623 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125289641 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125289824 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125289835 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125290359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125290417 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125290501 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125290523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125290631 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 125290697 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 125290770 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 125290809 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 125290877 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 125291035 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 125291050 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 125291162 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291165 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125291175 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291287 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 125291348 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 125291363 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 125291381 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291388 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291414 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291428 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 125291456 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 125291482 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291513 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291584 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291631 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 125291695 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291716 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125291859 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291873 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291911 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125291957 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125292038 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125292126 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 125292144 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125292210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125293698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125294034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125296986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125297193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125298634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125299196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125301595 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125302005 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 125302934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125303499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125304168 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125306101 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125306471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125308891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125309088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125310647 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125311397 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125311595 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125311758 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 125312024 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125312033 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125312054 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125312096 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125312159 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125312327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125312444 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125312545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125312579 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125312979 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125313074 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125313194 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125313389 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125313396 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125313413 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125313863 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 125314044 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 125314085 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 125314154 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125314230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125314343 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125314421 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125314572 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125314614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125314618 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125314673 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125314725 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125314875 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125314922 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125315003 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125315307 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125315660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125316427 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125317406 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125318114 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125319095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125320288 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125320862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125325712 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125328017 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 125334169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125340716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125341813 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125341848 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125341951 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125342092 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125342160 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125342164 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 125342234 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125342248 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125342266 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 125342817 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125342943 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125343105 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125343170 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125343189 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125343242 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125343495 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125343518 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125343649 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125344298 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125344505 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 125344985 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 125345026 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125345332 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125345345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125345425 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125345537 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125345589 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125345592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125345620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125345826 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125345830 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 125345857 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125345923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125346030 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125346034 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 125346107 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125346267 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125346375 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125346376 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125346432 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 125346511 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125346546 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 125346572 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 125346574 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125346650 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125346705 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 125346746 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 125346767 G T Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 125346769 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 125346778 C A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 125346816 T G Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 125346827 T C Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 125346839 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 125346913 G C Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 2 125347126 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 125347133 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 125347232 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125347262 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125347325 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125347360 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125347479 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125347494 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125347524 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125347545 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125347684 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125347860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125348010 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125348125 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125348541 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125348915 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125348919 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125348964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125349168 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125349266 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125349415 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125349449 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 125349732 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 125350023 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125350142 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125350189 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125350500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125350574 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125350604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125350975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125351004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125351110 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125351462 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 125351525 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125351600 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125351612 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125351693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125351704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125352527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125352713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125354332 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125354804 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125354814 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 125354828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125354857 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 125355383 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125355443 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125355643 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125355794 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125355911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125355971 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 125355995 G C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 125356067 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125356108 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125356201 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125356590 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125356722 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125356995 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125357206 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125357808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125357975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125358077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125358871 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125359988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125360654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125362046 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125362207 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125362328 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125362953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125363700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125364552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125364620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125366477 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125367111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125370433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125370450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125370506 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 125370669 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125371400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125373475 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125373521 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125374049 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125374056 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125374086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125374116 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125374125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125374129 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 125374234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125374262 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125374263 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125374285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125374508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125374765 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125374966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125375086 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125375388 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125378146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125378979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125379250 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125379555 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125381300 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125381498 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125381589 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125381638 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125381884 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125381886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125381957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125382013 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125382029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125382235 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125382699 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 125382856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125384296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125385045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125385053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125388060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125388087 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125388115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125388491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125390363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125390700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125390727 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125391585 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125391969 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125392475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125392687 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 125392904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125393454 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125393742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125395632 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125401542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125401584 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 125402472 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125403096 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125403712 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125404861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125405443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125407845 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125408970 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125409181 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125409350 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 125411414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125412244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125412656 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125412658 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125412703 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125412712 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125414165 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125414192 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125414299 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125414687 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125414808 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 125414901 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125415698 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125415857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125416837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125417978 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125423985 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125424677 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 125424982 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125425159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125425412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125425906 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125426058 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125426060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125426091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125426123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125426596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125428191 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125429268 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125431378 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125432111 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 125432380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125433669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125439227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125442331 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125446644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125449495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125449882 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125451329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125451557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125453015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125453182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125455221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125455255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125456378 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 125462148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125463229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125464161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125464224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125465334 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 125465864 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 125470456 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125470516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125472082 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 125472305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125472357 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125472816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125473347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125473642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125473841 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125475202 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125475455 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 125476183 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 125476218 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 125476243 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 125476481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125477897 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 125479165 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125479326 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125480004 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125480097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125480138 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125480594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125481324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125481623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125482715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125483157 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125484207 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 125484231 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 125484322 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 125484333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125486985 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125487175 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125487194 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 125487342 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 125487578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125487585 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125487755 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 125488103 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 125488299 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 125488325 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 125488799 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 125489138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125489425 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 125489540 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 125489721 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 125489888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125490621 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125491350 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125491374 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125491438 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 125491632 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125491733 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 125491922 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 125492289 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125492466 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125492472 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 125492575 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 125492593 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 125492637 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125492655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125492765 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 125492785 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125493076 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 125493217 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125493333 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 125493384 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 125493407 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 125493574 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125493575 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125493613 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 125493614 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 125493749 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125493840 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125493885 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125493900 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125493952 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125494036 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 125494063 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125494091 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125494705 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 125494720 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 125494813 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 125494861 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125494982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125495008 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 125495098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125495148 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 125495159 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 125495188 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125495294 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 125495425 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 125496242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125496346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125496382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125496909 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 125496914 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 125497278 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125497318 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 125497385 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 125497420 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125497546 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 125497590 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125497610 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125497621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125497658 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125498277 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125498579 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 125501698 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125502491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125502545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125502863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125503289 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125504399 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125504738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125504845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125506198 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125506605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125506732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125507300 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125507480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125508289 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 125509115 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 125509120 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 125509303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125509369 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125509663 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 125509705 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125509746 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125509763 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125509765 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125509955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125510028 T C Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 125510123 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 125510453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125511044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125511629 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 125511807 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 125512429 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125512563 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125514426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125514627 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 125515001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125515077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125515858 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125516486 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125517256 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125517832 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125518133 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 125518171 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 125520071 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 125520411 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125521688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125523144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125524007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125524389 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 125524439 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125524473 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 125525745 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 125526201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125526280 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 125526466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125526557 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125526676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125527846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125527929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125528945 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125530644 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 125530856 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 125530976 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125530992 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 125531041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125532293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125532721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125533988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125534092 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 125534932 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 125535027 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 125536145 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 125536210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125539742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125539793 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125540018 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 125540026 C A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 125540194 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 125540768 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 125540854 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 125541806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125542562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125542832 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125545910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125546827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125546854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125549700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125549819 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125549822 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125550949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125551151 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 125552670 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125554123 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 125554248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125556598 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125556768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125558244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125566544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125567287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125567764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125568814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125570705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125571268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125571968 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125572818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125573678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125576676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125577267 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125585649 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 125586827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125588265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125590510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125595344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125596483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125598082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125603288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125606999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125607450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125607923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125608124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125608730 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 125608859 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125609033 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 125609746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125609912 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 125612649 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 125612684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125612699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125613215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125614279 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 125614750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125615102 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 125615624 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 125616135 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 125617385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125617392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125617748 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 125617842 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 125618136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125618386 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125618528 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 125618647 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125619204 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 125619309 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 125619435 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125620266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125620560 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 125620568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125621014 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125621055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125621330 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125621666 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125621778 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 125622184 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125622211 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125622222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125622242 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125622274 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125622275 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125622424 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125622529 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125622601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125622758 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125623075 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125623237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125623441 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125623543 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 125624809 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125624897 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125625046 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 125625094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125625212 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125625474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125625702 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 125625712 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 125626317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125626447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125626761 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 125627678 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 125627801 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 125628059 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 125628094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125629115 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 125629184 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 125629224 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 125629386 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 125629429 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125629879 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 125629903 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 125629912 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125630747 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125630808 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 125630964 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125631177 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125631199 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 125631284 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 125631587 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 125632275 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125632372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125632544 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125632743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125633008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125633110 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 125634187 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125634377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125634438 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 125634654 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 125634933 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 125635038 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 125635088 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 125635110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125635192 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125635274 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125635280 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 125635322 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 125635329 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 125635457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125636160 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 125636165 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 125636252 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 125636348 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 125636644 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 125636655 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 125636676 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 125636848 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 125636999 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 125637258 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 125637763 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 125638263 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 125638290 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 125638438 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 125638450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125638490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125639417 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125639768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125639799 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125639972 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 125640001 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 125640074 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 125640147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125640179 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 125640480 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 125641153 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125641905 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 125642272 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125642349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125643268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125643935 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125644415 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 125646628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125646815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125646935 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125647153 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 125648289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125648291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125649044 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125649163 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 125649167 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 125649258 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 125649410 A T Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 125649437 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 125649656 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125649695 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125650088 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125650216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125650262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125650299 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125650500 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125650534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125650585 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125651334 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 125651659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125651709 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125651743 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125652042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125652044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125652092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125654039 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125655504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125655984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125655994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125657649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125658628 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125658750 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 125658784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125658866 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 125658969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125660571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125660719 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 125660912 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 125661618 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 125662607 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 125662691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125662898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125663028 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 125664094 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125665288 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125665432 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125665495 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 125666309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125666884 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 125667370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125668969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125669085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125670154 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125670716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125670741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125671416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125671684 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 125672084 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 125672584 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 125673390 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 125673741 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 125673914 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 125673924 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 125674474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125674522 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 125674591 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125676104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125676339 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125676349 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125676629 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125676729 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125676883 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125677497 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125677902 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125678207 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125678284 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125678299 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 125679332 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 125679430 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125679830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125680017 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125680281 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125680598 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125681062 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125681352 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125682159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125682190 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125682589 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 125682673 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 125683414 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 125683678 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 125685333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125685593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125685596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125685705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125686153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125686288 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125686483 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 125687230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125687794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125688617 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125688635 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125688807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125689799 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125690266 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 125693599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125696206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125698416 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 125703705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125706495 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125708577 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125710855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125711189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125711448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125714379 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 125715334 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125717553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125717986 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125719806 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125724880 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125725601 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 125728199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125730072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125731926 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 125732805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125734166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125734330 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125734902 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125739034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125744067 A G Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 125746395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125746628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125747182 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 125747328 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125747430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125750006 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 125750393 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125750430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125751530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125751935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125752334 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125752661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125752967 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125753087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125753925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125754035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125754746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125758386 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125762313 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125764725 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125767418 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 125768284 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125769383 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125769647 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 125772846 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125777805 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 125785655 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 125787397 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 125793971 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125794094 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 125794282 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 125794484 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125794716 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125794916 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 125795148 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125795937 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 125796003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125798981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125800681 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125800837 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125800973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125801129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125802855 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 125802863 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 125802942 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 125803189 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125805597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125806193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125806217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125806355 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125806674 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125807967 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 125808698 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 125808753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125809228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125810098 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 125810235 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 125810410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125810513 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 125810538 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 125810541 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 125811573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125811860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125812194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125812385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125812402 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 125812935 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 125813317 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 125814026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125814264 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125814992 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125815823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125815934 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 125819250 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 125819750 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 125820070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125828011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125829539 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 125829557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125830900 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125831474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125836678 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 125837517 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 125838344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125838371 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 125838383 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125838656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125839393 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125840721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125841133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125842839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125849704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125852805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125853601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125853861 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 125854089 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 125854430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125860945 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 125861274 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 125861776 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 125861808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125861906 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 125861961 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 125862026 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 125862614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125862815 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125862949 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 125862993 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 125862994 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 125863260 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125863327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125863560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125863609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125863671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125863730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125864525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125864567 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 125865042 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 125865925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125866915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125867352 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125867408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125867642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125869027 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 125869456 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 125870267 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 125870274 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 125870652 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 125870769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125870879 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 125871222 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 125871386 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 125871460 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 125872073 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 125872183 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 125872462 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 125872479 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 125872642 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125873035 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125873410 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125874774 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 125875326 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 125875884 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125876406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125877840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125879551 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125879597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125880154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125880349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125880353 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 125881410 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125881423 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125881448 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 125882607 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125884099 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125885030 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 125885852 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 125886746 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125887460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125889249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125891795 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125892970 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125892985 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 125892993 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 125893000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125893528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125896136 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 125896658 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125896690 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125897359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125900869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125901107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125904451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125904696 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 125904791 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125905293 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 125906276 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 125906670 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 125907144 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125908008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125908733 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125910548 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125911498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125911637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125912871 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 125913803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125914433 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125914434 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 125914481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125915576 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125916357 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 125917268 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 125917382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125917596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125917971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125918207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125918413 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 125918433 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125918831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125919124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125919624 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 125920506 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 125922131 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 125922770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125923209 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125924741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125925208 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125925490 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 125925927 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125926122 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125926134 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 125926296 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125926528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125926883 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 125927283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125928156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125928245 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 125928300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125928391 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 125928546 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125929196 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 125929882 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125930028 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 125930295 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 125930533 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 125935859 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125935910 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 125936911 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 125936922 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 125937103 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 125937119 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 125937148 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 125937189 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 125937219 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 125937233 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 125937683 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 125938412 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125939535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125939649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125940666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125940711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125941930 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125942161 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 125942423 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125942637 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125943224 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 125943383 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 125943622 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 125943972 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125944018 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 125944228 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125945490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125945494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125946359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125948715 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125950479 G T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 125951978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125952110 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 125953470 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 125954828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125954978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125955009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125955539 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125955621 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 125956092 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 125956648 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125956948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125957079 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 125957797 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125957973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125958453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125958686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125958752 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 125958762 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 125958764 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 125959598 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125960104 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125960290 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 125961070 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125961517 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125961647 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 125962375 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 125962502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125963137 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 125963398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125964045 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125964203 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125964742 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 125966058 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 125966273 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125966316 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125966389 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 125966442 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125966952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125967036 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125967471 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 125967503 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 125967573 T A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 125967655 T G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 125969129 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125969849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125970553 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 125971275 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 125971695 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125972192 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125972298 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125972442 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 125974605 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 125975151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125976241 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 125976482 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 125977141 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 125977167 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 125977702 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125977831 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 125978428 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125978803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125979885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125980414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125980557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125980719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125982821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125982845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125986502 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125987595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125988288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125991712 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125992666 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125993156 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125993574 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 125993589 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125993695 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 125993906 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 125994096 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125994107 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 125994140 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125994206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 125994313 A C Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 125994321 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 125994332 C G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 125994347 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 125994359 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 125994365 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 125994403 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 125994414 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 125994484 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 125994541 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125994545 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 125994673 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 125994893 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125995107 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125995162 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125995414 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 125995738 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125996088 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 125996108 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 125996406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125996811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125996887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125997391 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 125997534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125997604 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 125997760 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 125998859 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 126002787 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 126002927 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 126003827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126003937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126004449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126005696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126007966 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126008121 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126008507 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126009202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126009673 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 126010364 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126011214 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 2 126011534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126012646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126013446 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 126013973 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 126014231 C G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 126014575 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126014699 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 126016034 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126016074 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126016585 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126016644 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126017302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126017473 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 126017593 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 126018168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126018567 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126019405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126019530 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 126019703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126019776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126021914 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126023128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126025449 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126025656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126026402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126027103 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126027295 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126027299 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 126027320 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126027369 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 126027626 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 126027934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126029081 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126031804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126033164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126034781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126036346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126039998 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 126048117 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 126049709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126051855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126051876 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126053371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126053519 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126054825 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 126054974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126055081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126055632 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 126055919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126057588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126057694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126057757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126058222 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126059570 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 126060229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126060463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126060506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126060841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126061335 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126062700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126063847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126071249 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126071672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126072252 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 126073406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126074196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126075899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126076289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126077081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126078449 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126080118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126080858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126081911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126082178 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 126082268 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126082806 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126083544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126083992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126084004 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126090696 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126090899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126093240 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126093326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126093856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126094347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126094429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126094764 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126095073 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126095096 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 126095319 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126095771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126096046 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126097405 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126100107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126100253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126101481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126102575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126103947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126104255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126104546 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126104767 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 126105368 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126105877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126109129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126109750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126109885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126112260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126112261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126113745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126123409 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 126123796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126124532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126125294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126127087 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126127830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126130575 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126132533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126134389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126136164 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126137475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126139970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126141906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126142292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126142312 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126143493 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126144609 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 126144617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126144663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126144994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126146541 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126146753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126146780 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126148181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126148810 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126148889 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126149039 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 126150426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126151516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126151555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126152392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126154463 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126157270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126158043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126158356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126159386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126161050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126161859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126162820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126167165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126167686 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 126167706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126167718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126167914 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126168050 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126168645 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126168700 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126168862 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 126168881 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 126168904 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 126168922 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 126169002 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126169062 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 126170211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126170919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126170943 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126171031 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126171357 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126171570 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 126171672 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126171684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126172094 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 126172553 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126172768 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126172828 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126173040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126173127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126173152 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126173238 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126173524 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126173804 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 126173808 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 126173942 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126174018 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126174115 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126174581 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 126174723 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126174897 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 126175642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126175992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126176293 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 126176927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126177657 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 126178092 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 126178789 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 126178862 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 126178941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126178964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126179376 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126179488 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126180031 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126180616 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 126180659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126180925 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 126180955 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126181353 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126181444 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 126181762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126181994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126182245 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126182706 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 126182905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126182987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126183007 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126183047 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126183505 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126183555 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126183625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126183730 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126183732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126183866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126183881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126184441 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 126184898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126184966 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126184991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126185008 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126185162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126185235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126185332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126185401 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126185889 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126186326 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126186401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126186430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126186657 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 126187747 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 126188803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126189485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126190301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126190432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126190484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126190488 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126190899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126192263 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 126195587 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126196431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126196560 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 126196969 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126197347 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126197491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126197688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126198304 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126198370 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126198514 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126199168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126199180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126199252 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126199457 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 126199651 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126199682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126200129 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126200524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126200866 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126200912 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126200989 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126200993 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126201148 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 126201240 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126201254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126201646 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 126201685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126201793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126201987 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 126202193 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 126202223 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126202331 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 126202332 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 126202427 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 126202478 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126202483 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 126202685 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126202687 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126202760 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 126202789 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 126202959 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126202961 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126202975 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126203003 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 126203149 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 126203223 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 126203309 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126203339 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126203349 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 126203390 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 126203420 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126203904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126204033 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126204524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126205299 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126205513 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 126205555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126205566 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 126207847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126209306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126209887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126212104 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126212389 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126212665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126215277 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126217561 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 126218292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126218560 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 126219440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126223804 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126223963 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 126225117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126225640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126225809 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 126226104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126226106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126227268 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126227501 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 126230260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126230647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126231832 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126232890 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 126233051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126233626 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 126233682 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126235466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126236017 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 126236697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126236825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126237724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126238074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126238745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126238878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126239079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126239325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126239862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126239896 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126240324 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126240525 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126240786 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 126240836 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 126240875 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 126241000 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 126241322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126241484 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 126241514 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 126241545 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 126241558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126241586 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 126241702 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 126241762 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 126242152 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 126242241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126242456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126242999 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 126244822 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126246251 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 126247283 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126247571 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126247597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126247625 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 126247819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126247856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126247897 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126247904 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126247915 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126247977 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 126248028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126248764 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126248773 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126248901 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 126248958 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 126248963 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 126249161 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 126249616 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 126249652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126249868 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 126250049 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 126250194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126250211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126250410 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 126250411 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126251852 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126252140 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126254723 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 126254986 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 126255064 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 126255067 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 126255718 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 126255733 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 126255763 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126255776 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126255778 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126255790 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 126255989 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 126256018 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 126256149 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 126256193 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 126256302 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126256380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126256698 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 126256741 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 126256807 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 126256814 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 126256832 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 126256883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126257473 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 126257595 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126257601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126257774 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126257829 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126258031 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126258077 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 126258264 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126258303 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126258419 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 126258599 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126259189 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 126259327 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126259517 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126259822 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126260183 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126260234 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126260292 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126260555 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 126261022 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126261140 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 126261374 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126261385 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126261948 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126262192 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126262241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126263041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126263352 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 126263404 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 126263470 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 126264144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126264361 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 126264394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126264442 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126264457 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 126264462 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126264490 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126264519 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126264520 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126264551 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126264803 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126264815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126264830 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126264849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126264985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126265340 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126265359 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126265388 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126265580 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 126265919 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126266089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126266871 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 126267674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126270549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126271098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126271112 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126273107 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 126273348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126273475 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126273557 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 126273760 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 126273856 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 126273897 C T N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 126273916 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 126273917 A T N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 126273966 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126273968 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 126274005 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 126274029 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 126274088 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 126274103 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 126274116 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 126274129 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126274189 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 126274250 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 126274251 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 126274266 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 126274280 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 126274390 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 126274427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126274493 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 126274505 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 126274636 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 126274682 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 126275062 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 126275070 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 2 126275117 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 126275521 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 14 14 6 2 6 2 126275643 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 126275685 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 126275758 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 126276567 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 126276627 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 126276793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126277181 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126277307 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126277393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126277467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126277526 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126277631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126277671 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 126278140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126278576 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126278858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126279795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126280002 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 126280037 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126280267 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 126280400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126280534 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 126280783 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126280821 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 126280840 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 126280852 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 126280902 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126281106 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 126283046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126285271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126285341 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 126285501 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 126285514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126285557 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126285558 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 126286223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126286253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126286337 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126286438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126286441 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126286467 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126286501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126286619 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126286772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126286807 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126286822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126286895 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126286911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126286940 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126286970 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126286996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126287000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126287013 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 126287139 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126287160 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126287232 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 126287242 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 126287369 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 126287627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126287680 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126287708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126287806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126287831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126287858 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 126288216 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 126288287 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126288356 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 126288483 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 126288512 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 126288540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126288582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126288628 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 126288629 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 126288730 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126288755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126289138 G C N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 126289411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126289689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126289919 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 126290311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126290549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126290588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126290764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126291869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126292144 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126292183 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126292611 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126292937 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126293095 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126293562 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126293812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126294386 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126294556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126294652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126295000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126295360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126296005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126296415 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 126296439 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 126296727 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126296944 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126296951 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 126297043 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126297148 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 126297156 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126297216 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 126297248 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 126297378 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126297544 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126297620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126297670 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126297685 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 126297693 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126297715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126297806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126297828 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 126298008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126298037 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126298083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126298367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126298520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126298592 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126298619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126298783 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 126298958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126300551 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 126300780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126301155 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 126301518 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 126301613 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126301729 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126301764 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126301805 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126302372 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 126302478 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 126302557 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 126302855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126303014 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126303729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126304573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126304631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126304762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126304798 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126305025 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 126305229 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 126305537 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126305663 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126305748 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 126305803 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 126305925 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 126305978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126306050 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126306280 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 126306288 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 126306308 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 126306449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126306467 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 126306544 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 126306659 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126306672 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126306705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126306764 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 126306813 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 126306846 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 126307268 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126307279 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126307471 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126307522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126307555 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126307585 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126307892 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 126308015 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126308020 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126308090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126308143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126308439 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 126308964 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 126309082 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 126309422 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 126309424 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 126309478 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 126309745 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126312438 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126312537 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126313022 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 126313184 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 126313251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126313401 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126313465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126313730 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 126313767 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 126313769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126313862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126313917 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 126314411 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 126314518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126314722 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 126315017 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126315038 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126315052 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 126315104 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 126315306 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 126315504 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 126315525 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 126315647 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 126315782 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 126315828 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 126315927 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 126316080 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 126316209 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 126316319 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 126316373 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 126316569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126316631 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 126316644 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 126316664 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 126316719 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 126316762 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 126316830 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 126316902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126316940 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 126317755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126317881 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 126317975 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 126318142 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126318518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126318523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126318546 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126318655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126318790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126319049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126319379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126320910 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 126321943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126321996 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 126322106 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 126322151 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126322368 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 126322888 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126323357 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 126323414 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126323856 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126323892 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 126323910 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 126323930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126323943 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 126323979 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 126323996 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 126324062 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 126324119 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 126324174 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 126324175 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 126324190 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 126324329 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 126324330 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 126324348 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 126324391 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 126324532 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126324584 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 126324615 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 126324698 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 126324934 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126325000 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126325284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126325324 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 126325395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126325563 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 126325816 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 126325917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126325932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126325953 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126325981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126326393 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126326471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126326563 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 126326763 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 126326820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126326834 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 126327097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126327179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126327429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126327648 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126327700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126328326 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 126328420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126328610 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126328718 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126328782 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126328792 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126328839 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126328885 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126328892 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126328925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126328929 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 126328960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126328975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126329144 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 126329163 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 126329340 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126329582 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126329799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126329829 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 126329847 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 126329886 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126330092 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 126330103 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 126330155 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 126330749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126330802 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126330863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126331376 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 126331425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126331948 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 126332018 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 126332098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126333178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126333210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126333263 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126333871 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126334012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126334251 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 126334496 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 126334502 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 126334513 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 126334567 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126335186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126336098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126336373 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126336462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126336474 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126336763 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 126336857 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126338183 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 126339552 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 126339665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126339672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126339762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126339994 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126340612 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126341797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126341989 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 126342234 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126343130 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 126343171 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 126345380 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 126345491 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126345661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126346579 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126347438 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 126349162 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 126349502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126353894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126354730 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 126355061 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 126355316 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 2 126355409 T A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 126355437 G T Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 126355597 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 126356358 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 126356603 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 126356707 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126357018 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 126357201 T C N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 126357578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126357579 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126357818 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 126358432 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126360076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126360624 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 126362272 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 126362750 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126362762 C G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 126363203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126363377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126363407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126363427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126363571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126363576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126363764 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126363840 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126363853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126363998 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126364019 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 126364062 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 126364120 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 126364147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126364768 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 126364830 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 126364985 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 126365266 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 126365508 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 126365553 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 126365619 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 126365636 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 126365679 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126365684 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 126365698 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 126365962 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126365967 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126366027 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 126366146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126366570 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 126366594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126366947 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 126367939 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 126368410 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 126368627 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 126368681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126368916 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 126368937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126371246 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126371565 T A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 126371903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126372114 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126372238 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 126372559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126372602 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 126373510 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126373685 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 126373717 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 126373810 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 126373939 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 126374770 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 126375046 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126375539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126375542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126375962 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 126375970 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 126376009 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 126376023 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 126376570 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 126378572 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 126381573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126382125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126382601 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 126382960 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126383536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126384399 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126385164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126387661 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126389392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126389609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126390265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126392130 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126392316 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126392805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126396624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126400263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126401502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126403184 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126403559 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 126403952 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 126403960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126403963 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126404289 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 126404300 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 126404349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126404350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126404362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126404366 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126404517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126404530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126404551 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 126404562 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 126404565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126404847 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126404972 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126405067 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126405144 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 126405163 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126405204 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 126405265 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126405312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126405373 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 126405393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126405487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126405596 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126405620 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126405622 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 126405687 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126405940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126405993 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126406123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126406190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126406243 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 126406539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126406944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126406964 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 126406965 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126407147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126407161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126407215 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 126407704 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 126407716 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 126407842 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 126407885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126407949 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126407963 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 126408082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126408130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126408227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126408429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126408632 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126408683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126408761 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 126410579 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126411130 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126411598 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126412700 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126412754 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126412996 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126413825 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 126414410 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 126416031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126416266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126416268 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126419964 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126420312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126420355 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126420460 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126422845 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126422940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126424406 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126427254 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126427306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126434120 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126434349 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126434361 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126434450 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126434527 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 126434826 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 126434849 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 126435780 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126437204 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 126438415 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 126438668 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 126440211 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126440794 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 126440930 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126442378 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126445143 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126446179 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126448174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126449134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126449313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126453553 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126454632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126456212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126456424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126456540 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126456645 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126456730 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126456766 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126457021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126457468 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126458341 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126459635 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126460132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126460278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126460773 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126461927 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126463204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126466917 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126467630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126467938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126468753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126470645 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126473695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126474356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126474397 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126476467 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126476571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126476879 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126477446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126477551 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126478608 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126479220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126480719 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126480805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126481155 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126481794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126483542 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126484767 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126484772 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126485027 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 126485246 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 126485538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126486827 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126486905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126487890 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 126488206 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126491579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126491751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126493214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126493411 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126494003 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126494645 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126496191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126498106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126498500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126499169 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126499620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126501816 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126501994 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126502066 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126502119 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126502695 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126502758 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126502953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126503026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126503576 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126503663 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 126503672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126504304 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126504341 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126504408 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126504707 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 126504933 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 126505012 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126505381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126505685 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126505762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126505848 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126505858 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126506866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126507162 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126507693 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126507735 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126508158 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126508473 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126508554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126508675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126508733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126508925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126509222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126509515 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126509782 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126509877 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126510121 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126510161 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126510242 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126510414 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126510711 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126510821 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 126511152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126511341 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126511360 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126513075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126513137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126513226 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126513537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126513557 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126513888 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126513890 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126514094 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126514147 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126514407 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126514475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126514609 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126514676 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126514693 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126514710 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126514711 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 126514868 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126515290 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 126515359 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 126515548 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 126515675 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 126515726 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 126515839 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126515906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126515909 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126515947 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126516023 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126516151 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 126516274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126516710 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126516745 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126517393 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126517415 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126517485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126517559 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126517585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126517701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126518070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126518142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126518214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126518277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126518328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126518396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126518582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126518587 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126518701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126518814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126519125 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126519961 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126521315 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126521353 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126521584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126521587 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 126521692 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126521812 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126523076 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126523712 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126524313 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126526137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126526240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126526375 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126526376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126526508 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126526962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126527262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126527927 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126527950 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126527967 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126528036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126528099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126528758 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126529220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126529392 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126529418 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126529495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126529506 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126529543 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126529556 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 126529899 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126529959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126530055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126530109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126530202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126530335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126530341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126530715 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126530773 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126530872 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126530932 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126530944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126531007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126531009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126531098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126531158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126531171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126531215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126531224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126531324 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126531325 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126531360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126531412 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126531416 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 126531460 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126531494 A T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 126531791 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126531878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126532060 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126532126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126532144 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126532210 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126532258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126532259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126532282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126532303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126532323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126532334 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126532361 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126532415 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126532494 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126532906 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126534033 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126534181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126535560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126536374 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126537214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126537612 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126538321 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126538495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126538504 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126539406 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126539584 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 126540173 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126540755 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126540987 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126541153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126541502 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126541853 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126542049 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126542063 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126542318 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126542418 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126542433 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126542534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126542578 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126542907 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126542994 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126543139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126543264 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126543290 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126543305 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126543367 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126543443 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 126543476 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 126543762 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126543838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126543880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126544138 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126544237 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126544320 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126544505 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126544631 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126544900 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126544944 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126545029 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126545190 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126545238 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126545264 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126545324 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126545365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126545384 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126545428 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126545441 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126545562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126546014 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126546087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126546280 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126546281 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126546393 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126546434 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126546581 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126546643 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126546685 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126546950 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126546962 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126547361 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 126547468 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126547823 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126547834 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126547978 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126548043 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126548697 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126548716 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126549113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126549309 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126549456 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126549603 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126549641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126550012 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126550389 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 126550604 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126550703 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126550749 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126551458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126551505 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126551743 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126551890 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126552009 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126552252 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126552348 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126552446 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126552453 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126552684 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126552756 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126553095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126553146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126553181 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126553312 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126553461 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126553511 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126553678 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126553685 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126554077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126554137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126554225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126554259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126554333 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126554343 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126554476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126554605 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126554654 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126554839 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126554870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126554876 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126555012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126555625 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126555628 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126555659 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126555730 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126555883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126555964 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126555988 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126556330 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126556376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126556597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126556614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126556636 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126557270 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126557276 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126557306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126557678 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126557730 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126557797 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126557854 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126557904 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126557975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126558007 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126558237 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126558259 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126558369 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126558538 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126558767 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126558835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126558876 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126558935 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126559062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126559250 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126559421 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126559462 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126559574 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126559915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126560107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126560147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126560168 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126560244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126560251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126560280 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126560288 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126560420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126560433 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126560487 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 126560557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126560565 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126560587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126560600 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126560723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126560851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126561197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126561517 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126561612 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 126561720 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 126561799 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 126561917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126562279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126562373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126562563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126562709 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126562853 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126562884 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126562917 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126562979 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126563050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126563070 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126563377 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126563645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126563749 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126563755 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126563945 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 126564436 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126564600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126564646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126564656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126564721 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126564751 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126564903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126565346 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126565671 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126565699 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126565706 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126565783 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 126565901 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126566086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126566113 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126566182 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126566252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126566279 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126566353 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126566559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126566892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126566901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126566993 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126567078 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126567176 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126567337 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126567462 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126567540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126567602 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126567816 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126567982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126568778 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126568779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126568990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126569024 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126569433 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126569474 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126569530 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 126569608 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126569798 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126570597 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 126571014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126571018 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126571086 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126571171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126571252 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126571268 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126571281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126571477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126571687 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126571700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126571712 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126571959 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126571984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126572005 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126572033 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126572178 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126572202 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126572205 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126572230 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126572248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126572429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126572999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126573041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126573126 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126573344 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126573486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126573665 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126573742 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126574179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126574249 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126574304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126574351 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126574584 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126574627 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126574824 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126574879 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126574980 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126574989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126575286 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 126575330 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126575389 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126575438 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126575509 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126575573 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126575600 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126575887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126575943 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126576015 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126576321 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126576328 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126576609 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126576634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126576662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126576713 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126577157 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126577374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126577413 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126577431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126577530 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126577868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126578068 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126578203 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126578232 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126578518 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 126578551 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126578621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126578908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126578923 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126579085 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126579092 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126579259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126579491 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126579520 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126579550 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126579628 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126579703 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126580261 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126580511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126580518 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126581437 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126581677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126581840 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126581899 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126581981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126582334 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126582441 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126583378 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126585382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126585729 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126586461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126586487 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126586504 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126586788 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126586893 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 126586927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126586971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126587848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126587869 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126587904 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126587911 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126588083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126588142 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126588461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126588782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126589367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126589627 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126589684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126591852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126591876 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126592141 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126592144 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126592176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126592233 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126592287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126592455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126592701 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126593200 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126593478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126593875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126594126 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126594145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126594164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126594357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126594528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126594636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126594695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126594814 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126595029 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126595066 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126598293 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126598375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126600280 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 126601082 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126601155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126601653 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126601654 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126603471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126603952 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 126604167 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126604185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126604788 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126604795 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126604823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126604923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126604986 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126605236 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126605587 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126605732 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126605844 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126605853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126607191 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 126607220 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126607642 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126608594 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126608693 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126608787 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 126609113 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 126609132 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 126609214 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 126609232 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 126609331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126609413 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 126609581 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 126609775 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 126610025 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126610650 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126610788 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126611021 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126611161 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126611168 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126611192 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 126611193 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126611221 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 126611333 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126611525 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126611545 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 126611570 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126611664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126611702 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126611994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126611995 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 126612093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126612572 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126612876 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126613524 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126613556 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126613558 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126613577 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 126613610 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 126613747 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 126614058 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126614059 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126614279 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 126614290 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 126614851 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 126615500 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126615529 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 126615896 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 126616341 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126616410 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 126616776 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126616949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126618345 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126618842 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 126619024 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126619385 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126619565 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126619769 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126621008 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 126621477 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126621505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126621563 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126621569 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126621586 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 126621593 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 126621802 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 126622482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126623004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126623554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126624123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126624156 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126624740 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126625433 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126625563 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126625642 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 126625957 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126626534 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126626552 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126626562 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126626589 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126627720 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 126627751 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 126628045 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 126628191 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126628705 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 126629619 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 126630091 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 126630294 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 126630334 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126630783 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 126631227 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 126631732 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126632142 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126632763 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126632764 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126633738 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 126633845 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 126634016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126634092 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 126634426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126634634 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 126634706 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126635168 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126635878 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 126636404 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 126637062 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 126637156 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126637321 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126637420 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126638380 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126638517 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126641605 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126643232 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 126645010 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126645695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126645868 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126646617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126649343 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126649439 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 126651973 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126652311 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126652417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126652849 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 126652959 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126653191 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126653734 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 126654201 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126654479 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 126654515 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126654743 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126655412 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 126656317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126656318 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126656431 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126656783 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 126657195 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 126657238 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126657473 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 126658293 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 126658961 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126659215 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126659289 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126659362 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 126659593 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126659648 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 126659833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126659906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126659986 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126660115 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126660167 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126660285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126661110 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126661142 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126661654 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126661687 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126661689 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126662079 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 126663264 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126663546 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126663575 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126663822 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126664092 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 126664376 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 126666129 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 126666193 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 126667068 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126667368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126667668 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 126667888 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 126668031 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126668165 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126668337 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126668477 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126668869 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126669388 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 126670308 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 126670538 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126670590 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126670800 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 126670888 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126671073 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 126671095 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 126671144 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126671148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126671709 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126672999 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126673151 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 126673262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126673601 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 126673654 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 126674058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126674532 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 126674612 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 126674864 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126675218 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126675999 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126677066 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 126677331 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 126677479 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 126677686 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126678013 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126679630 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126679688 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 126679746 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 126680000 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126680092 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126680096 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 126680161 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 126680444 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 126680459 C G N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 126680841 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 126680948 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 126681137 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 126681489 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126681605 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126682002 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 126682004 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 126682149 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126682395 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126682488 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126683019 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 126683239 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 126683320 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 126683448 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 126683573 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 126683642 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 126683669 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 126683707 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126683748 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 126683772 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126684023 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 126684555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126684674 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126684706 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 126684811 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 126685128 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126686876 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126687172 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126687688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126688264 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126689539 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126689594 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 126690269 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126690308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126690485 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126696041 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126696178 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126696188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126696251 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126696401 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126697247 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126697536 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126697929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126700725 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126703718 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126703934 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126707444 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 126707460 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126708845 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 126709141 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 126709646 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 126709653 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 126709727 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126709737 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 126709752 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126709916 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126710923 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 126710964 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 126711080 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 126711415 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 126712025 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 126712236 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 126712435 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126713061 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 126713316 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 126713710 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 126713780 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126713903 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 126713955 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126714016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126714422 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126714696 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 126714973 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126715073 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 126715083 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 126715084 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 126715201 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 126715336 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126715358 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 126715376 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 126715884 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 126716036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126716052 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 126716100 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 126716192 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 126716193 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126716221 C G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 126716373 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126716643 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126716831 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126716835 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126716863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126716940 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126717102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126717109 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126717246 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126717365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126717613 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126717844 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126717875 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126718108 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 126718120 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 126718184 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126718194 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126718416 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 126718434 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 126718576 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126718616 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126718618 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126718684 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126718724 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126718741 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126718783 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126718848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126719154 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126719279 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126719341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126719864 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 126719904 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126720070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126720121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126720333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126720358 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126720678 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126720679 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126720711 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126720755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126720826 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126721002 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126721016 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 126721051 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 126721052 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 126721116 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 126721248 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 126721369 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 126721784 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 126721986 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126722022 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126722400 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126722561 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126722816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126722830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126722901 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126723064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126723367 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126723921 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 126723930 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126723993 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126723996 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 126724650 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126724680 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126725042 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126726187 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 126726528 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126726915 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126727258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126727484 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126727668 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126727819 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126727836 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 126727902 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126728236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126728352 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126728448 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126728884 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126728946 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126728976 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126729395 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 126729472 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 2 126729596 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 126730099 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126730122 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126730131 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 126730229 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 126730538 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 126731427 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126731429 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126731729 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 126734393 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126735148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126735572 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 126735871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126735967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126736018 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126736242 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126736427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126736453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126737100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126737217 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126739153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126739507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126739736 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 126740248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126740989 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126741033 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126741085 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126741278 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126741562 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126741576 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126741579 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126741596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126741599 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126742670 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126742730 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126742959 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126743113 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126743161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126743253 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126743347 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126743441 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126743838 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126744014 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126744395 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126744410 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126744759 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126744887 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126744984 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126745024 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126745042 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126745098 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126745200 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126745218 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126745671 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126745794 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 126745814 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126746212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126746395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126746399 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 126746434 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126746437 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126746484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126746591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126746663 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126746747 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 126747180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126747341 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126747345 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126747789 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126747828 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126747922 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126747924 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126748218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126748605 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126749614 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126749770 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 126749771 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 126749784 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 126749856 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 126749952 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 126749979 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126750103 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126750113 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 126750388 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 126750617 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 126750667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126751265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126751880 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 126752236 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 126752702 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126752946 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 126752965 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126753029 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126753066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126753199 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126753326 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 126753741 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 126753889 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126754061 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 126754280 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126754300 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 126754333 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126754371 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126754377 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126754386 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126754450 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126754771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126754794 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 126754888 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126754956 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 126755350 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 126755516 C T N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 126755689 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126755778 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126755823 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 126755889 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 126755978 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126755981 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 126756299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126756331 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126756463 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126756496 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126756504 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126756703 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 126756709 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126756800 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126756922 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 126756926 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126757088 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126757185 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126757598 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 126757667 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 126758065 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 126758109 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126758154 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 126758183 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126758467 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 126759033 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126759101 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126759170 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126759461 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126759481 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126759588 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126759960 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126759961 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126760047 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126760392 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 126760451 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126760516 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 126760583 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126760769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126760775 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126760977 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 126761112 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126761153 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126761284 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126761297 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126761329 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126761529 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126761571 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126761600 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126762030 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126762454 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126762603 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 126762834 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 126763204 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126763377 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126763439 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 126763528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126763625 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 126763824 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126764513 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 126764523 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 126764630 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 126764713 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 126764896 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 126765118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126765136 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126765186 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 126765204 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 126765206 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 126765301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126765407 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126765418 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 126765462 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 126765659 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126765675 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 126765761 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126765776 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 126765818 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 126765837 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 126765928 A C N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 126765935 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 126766100 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 126766172 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 126766261 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 126766280 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126766437 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126766447 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126766482 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126766505 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 126766516 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126766691 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126766793 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126766862 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 126766907 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 126766923 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 126767185 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 126767223 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 126767256 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 126767579 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 126767862 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 126767982 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 126768212 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 126768435 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126768442 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126768457 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126768465 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126768496 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126768574 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126768586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126768618 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126768740 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 126768752 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 126768845 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126768882 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 126768887 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 126768979 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 126769009 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 126769068 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126769170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126769342 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126769343 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126769496 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 126769681 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 126769718 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 126769756 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 126769939 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 2 126770122 T G N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.214285714285714 22 6 11 0 3 2 126770258 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 126770407 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 126770485 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126770513 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 2 126770653 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 126770671 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 126770769 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 126770862 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126771066 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 126771415 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 126771523 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126771778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126772002 G C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 126772054 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 126772107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126772271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126772310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126772334 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126772370 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126772409 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126772475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126773639 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 126774119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126774146 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 126774259 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 126774340 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 126774488 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 126774607 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126774762 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 126774960 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126775006 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126775102 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126775117 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126775171 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126775173 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 126775238 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 126775241 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 126775307 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 126775583 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126775628 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 126775725 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126775782 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126775973 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126775977 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126776036 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 126776282 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 126776549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126776718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126776874 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126776882 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 126777499 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 126779625 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 126779657 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 126779699 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126779703 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126780442 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126783616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126787022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126787390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126787468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126787722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126787878 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 126787879 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 126787900 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 126787932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126787960 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126788000 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126788156 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 126788206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126788360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126788803 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126789081 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126789551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126789714 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 126790019 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 126790020 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 126790697 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126798010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126798021 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126798106 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126798255 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 126798496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126798624 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126798653 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 126798667 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126798731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126798840 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126798952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126799034 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 126799060 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 126799158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126799760 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 126799769 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 126800133 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126800200 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126800276 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 126800553 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 126800748 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 126800794 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 126800932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126800975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126801317 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126801343 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126802820 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126805002 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126805114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126805377 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126805467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126805617 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 126805769 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126806308 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126806339 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126806822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126807293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126808605 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126809175 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126809183 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126809621 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126810078 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126810357 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126810376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126810488 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126810778 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126811492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126811613 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126811658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126811697 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126811951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126812005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126814814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126815720 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 126816358 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 126816519 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 126816593 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 126816665 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 126816875 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 126816924 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126816939 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126818147 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126818209 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 126818379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126818704 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126820267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126821727 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 126821864 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 126821891 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126821929 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126822193 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 126822315 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 126822959 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 126823078 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 126823270 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126823795 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 126823810 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 126823886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126824886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126824988 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 126825076 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 126825107 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 126825288 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 126825323 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 126825378 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 126825415 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 126825737 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126825802 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 126825857 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126825922 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 126826069 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 126826169 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126826431 G C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 126826444 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 2 126826445 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 126826461 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 18 18 2 14 2 2 126826493 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 126826502 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 126826547 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 126826756 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 126826859 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 126826929 C T N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 126826930 C A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 126826949 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 126827131 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 126827174 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 126827218 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 126828762 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 126829226 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126829314 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126829590 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126829890 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 126829970 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 126829998 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126830081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126830838 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 126831304 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126831493 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126831679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126831817 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 126832170 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126832205 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126832214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126832250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126832266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126832294 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126832307 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126832377 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126832722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126833021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126833693 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 126833939 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126836151 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 126836876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126836956 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 126837239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126837377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126837814 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 126837924 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 126837944 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126837983 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126838154 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 126838353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126838441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126838558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126839154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126839156 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126839316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126839363 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 126839454 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126839539 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 126839624 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126839817 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126839840 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 126840143 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 126840149 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126840197 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126840234 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126840236 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126840837 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126840931 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126840945 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126840982 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 126841119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126841499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126841781 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 126841877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126842070 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126842105 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 126842308 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126842359 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126842974 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126843226 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 126843304 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 126843644 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 126843851 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126843896 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126843899 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126844035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126844132 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126844216 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126844394 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126844405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126844533 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 126844706 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 126844918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126845556 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126845580 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126845646 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 126845750 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126845807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126845828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126846013 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126846028 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126846175 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126846189 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 126846224 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126846258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126846403 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126846419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126846488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126846508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126846583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126846669 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126846693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126846720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126846755 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 126846779 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 126846785 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126846798 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 126846894 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 126847002 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126847102 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126847159 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126847271 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 126847294 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126847342 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126847343 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 126847396 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 126847472 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126847596 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126847890 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 126847907 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126849063 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 126849098 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126849116 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126849177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126849342 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126849352 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126849360 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 126849372 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 126849574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126849611 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 126849753 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 126849829 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 126849883 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 126850465 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 2 126850518 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 2 126850605 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 2 126850748 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 126850826 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 126850866 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 126850899 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 126850975 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 126851113 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 126851203 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 126851225 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 126851336 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 126851388 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 126851412 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 126851429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126851614 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 126851706 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126851806 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 126851816 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 126851969 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 126852186 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126852276 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 126852327 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 126852477 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 126852496 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 126852894 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 126853111 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 126853268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126853318 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 2 126853331 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 126853466 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126853672 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 126854114 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126854315 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 126854341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126854496 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126854506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126854546 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126854791 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 126855059 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 126855360 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126855438 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126855474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126855475 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 126855492 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 126855583 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 126855623 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 126855702 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 126856711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126856789 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 126856790 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 126856801 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 126856943 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 126856953 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 126856979 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 126857002 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 126857014 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 126857376 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 126857427 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 126857698 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 126857707 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126857727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126857784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126857934 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 126858059 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 126858107 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126858124 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126858126 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126858218 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126858331 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126858366 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126858407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126858408 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126858471 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126858500 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126858599 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 126858688 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126858705 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 126858715 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 126858749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126858806 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126859082 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126859139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126859179 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 126859616 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 126859684 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 126859809 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 126860063 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126860243 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 126860249 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 126860303 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 126860328 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 126860378 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 126860409 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 126860468 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126860497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126860538 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 126860836 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 126861230 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 126861249 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126861321 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 126861586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126861663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126861768 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 126861771 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126861789 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 126862209 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 126862211 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 126862298 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126862308 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 126862423 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 126862443 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 126862495 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 126862519 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 126862573 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 126862697 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 126862935 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 126863029 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 126863227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126863272 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 126863671 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126864131 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126864283 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 126864305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126864340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126864348 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 126864673 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 126864836 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 126865006 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 126865411 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 126865462 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 126865833 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 126865848 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 126865968 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 126866416 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 126866668 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 126866706 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126866856 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 126866888 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 126867052 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126867564 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 126867761 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126867883 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 126868014 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 126868166 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126868187 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126868388 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 126868405 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 126868523 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126868814 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 126868883 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 126868970 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 126869304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126869352 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 126869630 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126869775 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126869908 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 126870041 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126870101 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126870171 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126870310 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 126870347 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 126870479 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126870704 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 126870861 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126871100 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 126871220 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 126871260 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126871287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126871544 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 126871606 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 126871756 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 126871976 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 126872038 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126872236 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 126872255 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126872256 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 126872573 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126873021 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126873057 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 126873110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126873216 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 126873231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126873457 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126873616 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 126873692 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 126873874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126873935 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126873997 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126874350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126874405 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 126874441 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126874456 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126874727 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 126874902 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 126874992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126875032 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126875904 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126875924 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126876008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126876207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126876254 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126876306 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 126876749 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 126877199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126877404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126877680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126877683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126877719 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126878036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126878080 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126878090 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 126878102 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 126878550 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126878795 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 126878841 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126878911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126879346 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126879350 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 126879372 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126879375 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 126879450 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 126879467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126879842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126880174 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126880635 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 2 126880643 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 126880817 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126880820 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126881169 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126881731 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 126882138 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126882418 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126883380 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 126883842 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 126884679 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 126884778 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126884805 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126884848 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 126884876 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126885276 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 126885368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126885489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126885596 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 126885856 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 126885998 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 126887010 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 126887340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126887456 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126887480 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 126888292 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 126888480 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126889180 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 126889507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126889911 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 126890400 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126890708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126891427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126894559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126896316 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126896320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126896552 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126899028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126899512 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 126899672 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 126899760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126900347 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126901941 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 126902248 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126902987 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 126903057 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 126903735 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126904497 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126905383 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126905393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126905511 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126906325 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126906351 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126906656 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126906859 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 126907770 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126908053 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 126908220 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 126908643 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126908935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126909998 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 126911264 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126911598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126911977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126911995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126912385 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126912536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126913025 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126913164 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126913482 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126914056 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126916632 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 126916897 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 126917059 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 126917070 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 126917143 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 126917334 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 126917860 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 126917891 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 126918131 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126918150 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 126918493 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126918774 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 126918793 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126919056 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126919482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126919957 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 126920353 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 126921465 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 126921534 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 126922342 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126922477 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 126922896 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 126923026 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126923862 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 126923878 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 126923883 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 126924028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126924338 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126924366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126924527 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126925141 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126925173 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126925595 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126926263 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126926750 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126926785 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126927084 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126927287 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 126927386 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126928066 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 126928069 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 126928330 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 126929470 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126929701 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126930865 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 126930979 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 126931374 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126931473 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126931836 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126931902 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 126932317 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 126932804 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 126933358 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 126934977 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126936239 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126936392 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 126936435 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 126936657 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 126936764 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126937075 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 126938247 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126938312 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126938314 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126939512 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126939778 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 126940290 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 126941294 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 126941305 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 126941307 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 126941354 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 126941577 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 126941797 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 126941913 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 126941942 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126941996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126942087 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 126942128 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 126942225 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126942253 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126945744 T G N N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 126946074 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126946082 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126946200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126947888 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126948328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126951872 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126952848 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126953468 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126955191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126957067 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126958308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126959389 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126959390 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126961024 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 126961649 C T N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 126962480 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 126962700 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126963467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126963620 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126963877 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126964018 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126964220 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126964545 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126965238 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 126965249 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 126965541 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 126965560 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 126966046 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126967277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126967364 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126968645 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 126969120 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 126970227 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126970793 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 126970885 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126971236 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 126971413 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126971416 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 126971471 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126971594 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126971604 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126971743 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126971781 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126971789 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 126971939 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 126971955 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 126972099 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 126972234 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126972303 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126972757 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 126972830 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 126972925 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126973043 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 126973075 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 126973116 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 126973198 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126973264 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126973288 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126973397 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126973835 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126973851 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126973852 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126974039 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126974045 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126974080 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126974110 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 126974114 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126974168 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 126974181 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 126974267 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 126974297 G C Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 126974302 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 126974311 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126974314 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 126974325 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 126974548 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126974572 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 126974757 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 126974804 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 126974812 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126974915 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 126975104 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 126975119 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 126975303 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 126975336 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 126975337 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 126975385 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 126975484 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 126975505 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 126975717 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 126975721 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 126975892 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 126975962 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126976193 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 126976214 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126976483 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126976609 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 126976653 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126978109 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 126978448 T A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 126978502 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 126978531 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 126978807 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 126978936 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 126978988 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 126979077 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 126979262 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 126979264 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126979411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126979530 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 126979548 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 126979626 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 126979703 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 126979711 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 126979716 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 126979726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126979863 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 126979866 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 126979905 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 126979916 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 126979929 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126979934 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126979943 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 126980089 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 126980172 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 126980312 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 126980404 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 126980594 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 126981504 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 126982051 T C N Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 126982257 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 126982373 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 126982456 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 126982520 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126982578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126982978 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 126983584 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 126983840 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126984289 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126984296 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 126984337 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 126984362 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 126984387 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 126984898 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 126985245 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126985589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126985635 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 126985932 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 126986054 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126987096 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 126987124 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 126987153 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 126987224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126987857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126988010 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126988127 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 126988288 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 126988945 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126988947 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126989540 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 126989690 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126990199 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126990350 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 126990351 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 126990535 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126990660 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126990679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126990759 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126990782 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126991022 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 126991036 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126991113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126991150 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126991155 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 126991194 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126991199 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126991231 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 126991280 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126991514 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 126991813 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126991831 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126991877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126991894 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126992009 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126992090 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 126992226 C G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 126993063 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 126993086 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 126993121 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 126993289 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 126993349 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 126993384 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 126993395 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 126993428 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 126993511 G T N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 126993809 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 126993825 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 126993827 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 126994015 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126994049 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126994354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126994388 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126994405 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126994519 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 126994550 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 126994568 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126994675 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126994702 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 126994711 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126994776 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 126994854 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126994860 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 126994905 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 126994968 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 126994973 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 126995045 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 126995225 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 126995387 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 126995403 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 126995510 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 2 126995558 G T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 126996575 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 126996599 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 126996721 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126996771 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 126996798 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 126996863 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 126996906 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 126996931 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 126997011 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 126997070 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 126997104 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 126997135 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 126997205 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 126997250 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 126997305 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 126997436 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 126997612 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 126997674 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 126997712 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 126997739 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126997800 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126997864 C G N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 126997877 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 126997912 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 126998054 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 126998061 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 126998078 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 126998079 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 126998111 C A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 126998228 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 126998430 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 126998528 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 126998558 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 126998586 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126998592 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126998607 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 126998612 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 126998717 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 126998816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 126999026 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 126999172 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 126999190 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 126999314 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 126999320 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 126999335 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 126999407 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 126999580 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 126999803 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127000376 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 127000669 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 127000707 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 127000836 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 127001007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127001128 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127001385 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127001408 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127001468 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127001530 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127001567 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127001602 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 127001636 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 127001740 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127001852 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127001966 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127002089 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127002095 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127002325 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127002339 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127002343 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127002491 A C Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 127002711 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 127002739 T C Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 127002744 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 127002766 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 127002870 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127002886 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 127002925 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127002942 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127002954 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127003583 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127003639 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127003791 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127003909 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127003980 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127004510 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127005400 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127005571 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127005878 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127006031 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127006078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127006432 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127006510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127006663 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127006859 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127006898 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 127006917 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 127006925 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 127007045 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127007157 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 127007161 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 127007174 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 127007177 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 127007258 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 127007271 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 127007722 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 127007737 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 127007739 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127007807 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 127007903 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127008089 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127008102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127008104 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127008145 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 127008188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127008216 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127008217 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 127008287 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127008398 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127008544 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 127008555 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127008570 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 127008664 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 127008704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127008883 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 127008889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127008937 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127008991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127009184 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127009739 C A Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 2 127009742 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127009845 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 127009945 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 127009949 A T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 127010094 A G Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 127010240 A T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 127010241 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 127010252 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 127010746 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127010793 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127010828 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 127010877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127010924 G C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 127012193 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127012214 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127012379 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127012446 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127012609 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127012702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127012802 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127013384 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127013525 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 127013919 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127014125 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127014320 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127014394 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127014418 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127014516 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 127014793 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 127015051 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 127015091 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 127015325 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127015351 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127015415 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 127015683 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 127015709 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127016043 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 127016046 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 127016106 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127016282 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 127016395 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 127016533 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 127016551 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 127016592 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 127016828 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 127016932 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 127016975 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 127017225 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127017513 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127017514 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 127017532 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 127017593 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127017678 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 127017728 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127017781 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127017804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127017851 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 127018113 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127018123 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127018160 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127018188 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127018214 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 127018275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127018374 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127018385 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127018527 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127018590 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127018602 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127018613 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127018700 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127018708 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127018764 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127018823 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127018875 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127018936 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127018937 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127018948 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 127018990 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127019039 G C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 127019059 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127019094 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127019101 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127019161 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127019186 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127019229 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127019480 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127019481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127019567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127019613 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127019617 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127019755 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 127020116 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127020173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127020233 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127020327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127020356 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127020524 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127020534 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127020651 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127020814 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 127020841 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127021045 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127021051 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127021086 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127021089 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127021118 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127021189 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127021265 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127021453 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127021527 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127021720 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127021742 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127021783 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127022093 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127022246 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127022347 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127022349 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127022738 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 127022757 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127022764 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127023062 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127023367 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127023389 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127023959 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127024058 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127024086 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127024245 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127024441 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127024634 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127024689 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127024696 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127024786 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127024865 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127024969 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127025104 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127025190 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127025465 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127025486 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 127025578 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 127025649 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127025748 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127025861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127025991 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127026002 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127026079 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127026255 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127026309 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127026327 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127026511 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127026514 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127026684 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127026697 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127026728 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127026759 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127026818 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127026857 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127027034 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127027047 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127027096 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127027165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127027320 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127027517 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 127027568 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 127027857 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127027964 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127028053 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127028143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127028145 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127028215 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127028430 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127028456 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127028523 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127028689 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127028738 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127028742 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127028809 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127028845 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127028916 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127029058 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127029097 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127029209 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 127029229 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127029270 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127029305 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127029450 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127029515 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127029576 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127029682 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127029722 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 127029909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127029925 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127030031 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127030052 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127030106 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127030107 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127030186 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127030222 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127030257 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127030261 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127030454 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127030531 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 127030592 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127030742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127030910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127031149 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127031180 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127031318 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127031341 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 127031433 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127031501 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127031605 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 127031716 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127031770 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 127031799 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 2 127031810 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 127032887 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 127033013 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127033035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127033187 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127034568 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127035063 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127035133 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127035168 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127035298 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127035336 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127035432 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127035553 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127035678 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127035712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127035717 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 127035795 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 127035868 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127035910 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 127036080 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127036085 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127036204 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127036249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127037252 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127037916 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127040098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127041013 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127042888 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127042904 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127043067 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127043350 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127043351 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127043417 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127043597 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 127043795 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127044391 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127044423 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127045274 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127045453 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 127045526 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127045536 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127046088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127046949 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127046972 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127047068 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127047139 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127047184 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127047241 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127047743 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127048178 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127049648 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 127049902 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127050340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127050415 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127051433 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127051446 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127051526 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127051909 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127051925 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127052888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127052967 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127054247 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127054373 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127054443 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127054455 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127054597 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127055071 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127055741 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127055812 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127059515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127059610 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 127059611 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 127059621 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 127059706 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 127060122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127061114 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127062804 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127064716 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127064763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127064792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127065004 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 127065049 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 127065084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127065299 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127065347 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 127065723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127066085 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127066120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127066187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127066339 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127066482 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127066832 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 127066903 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 127066967 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127066990 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127067115 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127067303 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127067329 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127067510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127067524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127067762 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127067805 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127067885 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127067943 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127068102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127068182 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 127068196 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127068253 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 127068945 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127068953 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127068986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127069139 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127069211 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127069360 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 127069381 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 127069434 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127069856 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 127070213 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127070217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127070473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127071107 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127071124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127071166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127071349 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127071453 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127071734 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127071778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127073127 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 127074206 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127074856 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127075555 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127075820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127075842 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127076112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127076311 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127076571 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127076594 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127076704 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127076708 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127076932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127076960 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127077286 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 127078398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127078468 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127078521 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127078816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127078838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127079185 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127079200 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127079244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127079272 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127079351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127079915 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127079982 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127080088 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127080266 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127080396 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127080597 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127082428 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127083160 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127084289 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 127084490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127085040 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127085219 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127085221 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127086256 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127086262 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127086274 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127086337 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127086392 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127087008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127087747 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127088601 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127088831 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 127088873 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 127089148 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127089504 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 127089507 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 127089590 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127089678 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127089887 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127090008 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127090085 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127090320 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 127090337 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127090354 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127090500 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127090526 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127091340 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127091381 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127091513 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127091567 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127091654 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127092828 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127092839 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127093171 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127093537 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127093590 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127093733 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127095755 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127095987 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127096122 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127096123 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127096254 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127097344 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 127097368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127097830 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 127098527 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127098787 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127099140 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 127099822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127100339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127100368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127100454 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127101289 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127101313 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 127101488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127102141 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127102929 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 127103326 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127103379 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127104405 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127104528 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127104578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127105143 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127105677 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 127105868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127106104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127106444 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127109071 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 127109256 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127109645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127109898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127111351 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127112222 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127112388 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127112448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127112542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127112812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127113577 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127113727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127114053 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127114477 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127116869 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127116895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127116912 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127117495 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127117640 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127118288 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127120236 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127120494 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127120980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127122055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127122558 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127123391 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127124032 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127124098 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127124958 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127125189 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 127125208 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 127128163 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127130402 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127130482 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127130817 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127131634 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 127131636 C T Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 127131872 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 127132005 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 127132432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127132465 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127132524 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127132526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127132638 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127132875 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127132901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127133063 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 127133160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127133584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127133590 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127133642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127134322 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127134501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127134529 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127134702 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127134787 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127134805 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 127134862 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 127134959 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127135037 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127135073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127135100 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127135129 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127135154 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127135203 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127135359 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127135361 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127135383 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 127135386 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 127135486 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127135508 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127135511 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127135833 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 127135836 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 127135870 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127135999 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 127136020 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127136046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127136060 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127136081 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127136172 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 127136190 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127136309 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127136330 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127136607 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127136668 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127136720 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127136742 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127136805 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 127136871 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127136880 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 127136891 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127136906 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127137041 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 127137083 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 127137410 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 127137532 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127137925 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127138004 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127138033 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127138085 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127138272 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127138420 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127138489 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127138535 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127138628 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127138631 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127138767 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127139409 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127139502 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127139519 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127139693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127139823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127139895 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127140066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127140111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127140519 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127140642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127141194 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127141430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127141626 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 127142195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127142681 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 127142682 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 127142728 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127142745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127142794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127142900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127143520 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127143599 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127143800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127144082 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127144348 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127144370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127144601 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127144690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127144700 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127144701 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127145077 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127145289 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127145486 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127145495 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127145530 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127145709 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127145866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127146372 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127147097 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127147484 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127147617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127147647 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 127147664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127148450 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127148593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127148738 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127148790 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127148990 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127149434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127149707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127150228 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127150393 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127151005 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127151070 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127151078 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127151115 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127151413 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 127151463 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127152213 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127153157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127155598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127156021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127157270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127157324 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127157686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127158698 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127158829 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 127159429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127164332 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127164951 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127167536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127168010 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127168029 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127168261 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 127168283 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127168461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127168472 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127168486 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127168522 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 127170079 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 127170114 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 127170635 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127170827 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127170993 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 127171486 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127171555 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127171590 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127171607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127171683 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 127171964 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127173842 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127173999 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127174166 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127174235 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 127174292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127174299 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 127174307 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 127174431 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127174600 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127174660 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127174709 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 127174773 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127174889 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 127175050 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127175165 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127175277 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127176005 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127176079 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127176306 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127176429 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127176559 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127176561 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 127176614 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 127176846 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127176967 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127177046 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 127177080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127177084 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127177099 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127177157 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127177175 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127177191 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127177211 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127177264 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 127177314 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 127177464 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127177559 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127177670 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 127177757 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 127177846 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127177933 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 127178062 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127178086 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127178105 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127178111 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127178152 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127178179 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 127178180 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 127178206 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 127178216 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 127178394 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127178490 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 127178839 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 127179054 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127179085 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 127179149 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127179150 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127179234 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 127179257 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127179393 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127179441 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127179469 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 2 127179516 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 127179559 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127179632 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 127179662 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 127179744 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 127179951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127180310 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127180359 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127180370 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127180415 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127180425 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 127180426 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127180575 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 127180604 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127180629 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127180679 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127180740 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127181578 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127181593 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127181734 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127181738 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127181772 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127181951 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127182102 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127182105 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127182128 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127182223 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127182456 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127182632 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127182645 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127183190 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127183372 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 127183389 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 127183428 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 127183635 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 127183763 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127183978 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 127184127 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127184222 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127184224 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127184392 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127184436 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127184605 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127185132 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127185146 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127185163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127185168 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127185179 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127185906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127186009 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 127186092 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127186166 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127186196 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 127187285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127188685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127189980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127191689 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127191729 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127192045 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127192147 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127192738 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127192779 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 127192796 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 127192803 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 127192857 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 127193055 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127193890 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127193921 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127194077 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127194098 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 127194462 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 127194571 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 127194584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127195136 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127195197 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127195920 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127195965 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127196149 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 127196161 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 127196233 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 127196248 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 127196254 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 127196314 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 127196358 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 127196905 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 127197206 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 127197675 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 127197820 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127198547 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127198887 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127200066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127201420 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 127201422 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 127201553 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 127201999 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 127202099 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 127202345 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127202453 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127202625 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 127202740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127202807 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 127202860 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127202931 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 127202932 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 127202999 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 127203119 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127203122 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127203222 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127203229 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127203306 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 127203598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127203622 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 127203741 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127203745 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 127203764 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 127203910 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 127204039 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127204112 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127205420 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127205596 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127205684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127205709 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127205800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127205870 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 127206070 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127206137 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127206235 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127206457 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127206553 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127206571 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127206577 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127206595 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127206607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127206648 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 127207351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127207577 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127207578 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127207672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127207705 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127208090 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127208256 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127208327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127208389 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127208534 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 127208613 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127208840 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 127208848 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 127209006 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127209011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127209152 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 127209253 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127209375 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127209678 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127209757 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127209782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127209800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127210105 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 127210117 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 127210133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127210153 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127211106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127211132 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 127211364 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127211505 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127211585 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127211586 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127211687 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127211920 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127211990 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127212005 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127212052 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127212317 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127212328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127212342 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127212354 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127212442 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127212475 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127212546 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127212551 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127212809 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 127212882 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127213177 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127213282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127213418 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127213505 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127213610 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127213625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127213626 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127213859 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127214079 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127214309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127214490 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127214510 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127214589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127214922 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 127215160 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127215331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127215442 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127218091 G T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 127218273 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127218282 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127218311 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127218428 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 127218738 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127218775 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127219115 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 127219268 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127220869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127221023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127221590 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127221992 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127222146 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 127222216 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127222230 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127222253 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127222368 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127222404 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127222417 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127222426 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127222452 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127222563 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127222608 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127222845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127223096 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 127223393 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 127223429 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127223489 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 127223490 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 127223500 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127223554 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127223656 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127224131 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 127224209 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 127224249 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127224273 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127224283 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127224305 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 127224309 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 127224380 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127224428 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127224544 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 127224593 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127225280 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127225296 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127225443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127225500 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127226368 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 127228406 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127228686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127228752 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127228922 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127229482 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127229775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127230776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127232014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127233916 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127234336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127234632 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127234692 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 127234743 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127234748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127234810 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127235818 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127236518 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127237331 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127237359 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127237412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127237420 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127237481 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127237559 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127237560 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127237615 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 127237754 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127237772 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127237801 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127237955 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127238028 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127238082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127238448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127238668 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 127239284 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 127239403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127239840 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127239943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127240070 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127240161 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 127240231 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127240254 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 127240400 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127240466 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 127240471 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 127240515 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 127240541 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127240571 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127240603 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127240633 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 127240751 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 127240841 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 127241618 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 127241632 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127241682 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127241697 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127241718 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127241880 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127242816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127244337 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 127244680 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 127245644 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127245884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127245916 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127246021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127246143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127246887 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127247475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127247831 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127248730 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127248999 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127249485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127250329 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127252863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127253726 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127253895 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127254318 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 127254487 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127254824 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 127254985 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127255050 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 127255216 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127255347 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127255364 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 127255385 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127255408 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127255431 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127255619 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127255795 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 127255802 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127255809 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 127255843 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 127255888 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 127255918 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127256052 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 127256085 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127257819 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127258197 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127258365 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127260898 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127260899 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127261190 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127261450 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127261510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127261613 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127262194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127262464 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127262626 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127262764 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 127264799 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127264927 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 127264932 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 127265003 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 127265155 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127265371 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127265832 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127265870 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127266109 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127266118 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127266152 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127266561 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 127266580 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127266774 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 127266906 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127266932 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127266975 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127266999 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127267157 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127267186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127267356 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127267393 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127267484 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 127267550 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127267561 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127267666 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127267726 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127267809 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127267842 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127267864 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127267884 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127267945 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127267954 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127267970 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127268004 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127268117 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127268262 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127268587 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127268600 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127268879 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127268952 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127268962 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127268965 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127268973 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127268986 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127268991 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127269050 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 127269116 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 127269191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127269255 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127269641 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 127269669 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127269893 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127269949 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127270052 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127270062 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127270160 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127270208 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127270218 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127270415 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127270501 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127270514 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127270603 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127270965 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127271298 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127271353 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 127271463 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 127271569 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 127271582 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 127272127 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127272207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127272227 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127272374 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 127272460 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127272507 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127272529 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127272626 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 127272689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127272702 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 127272738 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 127272754 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 127272800 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 127272848 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127272853 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127272864 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 127272874 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127272885 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 127272910 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127273049 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127273210 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127273233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127273238 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127273253 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127273286 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127273303 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 127273304 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 127273334 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127273366 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127273391 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127273434 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127273502 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127274166 C A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 127274625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127274663 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 127274668 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 127274727 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127274778 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 127275031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127275055 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127275096 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127275219 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 127275250 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 127275256 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 127275301 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 127275324 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 127275529 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 127275531 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 127275540 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 127275559 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 127275603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127275619 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127275841 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 127275896 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 127276040 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 127276055 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 2 127276139 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 127276255 G A N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 2 127276605 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 127276643 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 2 127276666 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 127276690 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 127277198 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 127277332 A G Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 2 127277366 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 127278061 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 2 127278207 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 2 127278884 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 127279035 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 127279378 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 127279650 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 127282016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127282205 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127282836 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127282862 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127282924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127283504 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 127283528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127283671 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127283937 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127284056 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127284142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127284223 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127284753 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127284826 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127284923 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127285417 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127285431 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127285553 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127285601 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127285878 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127285892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127285903 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127286056 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127286655 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127286944 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127286962 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127286983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127287011 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 127287014 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127287195 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127287201 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 127287352 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127287536 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127287550 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127287787 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127287865 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 127288155 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127288786 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127289187 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127289241 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127289242 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127289324 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127290046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127290127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127290139 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127290173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127290435 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127291071 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127291374 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127291482 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127292570 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 127293912 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 127294129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127294227 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127294242 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127294249 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127294795 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 127294849 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127294914 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 127295040 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127295199 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127295237 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127295495 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127295513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127295556 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127295666 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127295708 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127295825 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127295854 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 127295961 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127295978 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127295994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127296086 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127296184 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127296696 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127297044 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127297097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127297109 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127297136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127297166 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127297269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127297272 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127297283 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127297284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127297512 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127297557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127297575 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127297600 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127297639 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127297661 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 127298515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127298774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127298999 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 127299020 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 127299024 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 127299552 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127299569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127300126 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127300322 C A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 127300598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127300645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127300700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127301362 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 127303232 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127303892 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 2 127304082 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304170 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127304178 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304183 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304259 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304278 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127304309 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304317 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304513 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 127304530 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127304536 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304567 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304653 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304811 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304849 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304883 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304904 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304906 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304932 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127304972 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127305057 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127305137 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127305477 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127305742 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127305981 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 127306540 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127306571 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127306613 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127306627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127306630 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127306659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127306828 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127306831 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127306867 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127307165 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 127307808 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127308133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127308143 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127308344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127308457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127308596 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127309005 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 127309169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127309228 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127309289 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127309486 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127309504 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 127309578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127309694 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127309755 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127309867 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127310728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127311159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127311658 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127311743 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127311749 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127312018 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127312627 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127312653 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127312846 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 127313104 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 127313220 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127313566 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127314278 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 127314301 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 127314305 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 127315308 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127315311 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 127315968 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 127316126 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 127316424 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127316488 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 127316514 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127316763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127317681 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127318208 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 127318299 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127318362 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 127318599 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127319099 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127319452 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 127319675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127319833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127319990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127319991 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127321144 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 127321808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127322269 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127322713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127322875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127323181 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127323200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127323502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127323521 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127323525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127323617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127323696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127323735 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127324121 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127324268 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 127324306 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127324323 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127324327 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127324345 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127324817 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127325804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127326040 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 127326125 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 127326155 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 127326570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127327151 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127327157 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127327247 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127327452 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127327646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127327810 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127327823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127327998 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 127328005 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127328377 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127328408 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127328435 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127328580 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 127328729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127329096 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 127329628 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 127330148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127330270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127330339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127331065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127331425 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127331782 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127331926 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127331927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127333289 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 127333306 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 127333410 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 127333464 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 127333575 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 127333638 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127333675 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127333738 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127333811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127333885 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127333940 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127334032 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127334110 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127334123 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127334344 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127334359 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127334408 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127334477 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 127334499 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127334569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127334658 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127335216 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 127335279 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127335332 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127335346 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 127335409 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127335450 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127335461 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127336092 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 127336214 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 127336220 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 127336341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127336375 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127336386 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127336837 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 127336854 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 127337131 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127337360 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127337879 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127337948 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127338053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127338063 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 127339388 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127340118 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127340242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127340328 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127340334 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127340582 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127341090 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127341284 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127341357 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127341404 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127342034 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127342530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127342731 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 127342812 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127343324 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127343449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127343468 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127343701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127343888 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 127344336 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127344379 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127344556 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127344562 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127344624 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127344649 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127344694 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 127344704 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 127344760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127344815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127345980 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127346138 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127346632 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127346822 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127347801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127348184 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127348370 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127348435 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 127348460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127348548 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127348818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127348862 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127349340 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 127349345 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 127349594 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127349647 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127349693 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127350108 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 127350358 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127351006 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127351012 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127351061 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127351087 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127351147 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127351177 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 127351395 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127351492 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 127351509 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 127351539 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 127351545 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 127351567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127351571 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 127351606 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127351721 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 127351729 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127352094 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 127352150 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 127352182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127352235 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 127352281 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127352288 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 127352453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127352466 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 127352495 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 127352619 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127352620 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127352649 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 127352837 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 127352898 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 127353278 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 127353365 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127353546 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127353663 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127353688 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127353747 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127353749 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127353847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127354222 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127354240 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127354421 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 127354432 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 127354461 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 127354463 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 127354484 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127354669 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127354717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127354897 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127355730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127355770 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127355792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127356148 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127356286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127356324 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 127356541 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127356612 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127356778 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127356801 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127356905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127357353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127357936 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 127357958 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127358037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127358052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127358715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127359044 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 127359220 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127359286 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127359445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127359504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127359566 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127359697 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127360054 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127360073 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127360095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127360109 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127362189 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127362738 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127362955 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127362978 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 127363047 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127363208 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127363673 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 127363856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127363975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127364092 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 127364198 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127364223 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127364370 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127364379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127365216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127365251 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 127366570 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127366591 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127366832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127366925 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127367044 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 127367246 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127367385 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 127367605 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 127368225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127368303 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 127368652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127370074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127370086 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 127370123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127370224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127370342 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127370368 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127370486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127370562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127370755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127370765 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127371014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127371165 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127371376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127371456 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127371458 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127371488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127371526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127372209 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127372346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127372495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127372642 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127372650 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127373493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127373545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127374286 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 127374391 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 127378220 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127378238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127379233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127379261 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127379382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127379386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127379409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127379526 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127379706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127379742 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127379775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127379778 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127379853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127379877 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127379883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127379941 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127380092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127380261 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127380529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127380679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127380868 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 127380871 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 127380897 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127380916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127380917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127380945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127380989 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127381039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127381043 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127381220 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 127381536 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 127381691 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 127381885 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 127382075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127382095 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127382148 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127382158 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127382579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127382615 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127382801 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127382884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127383160 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127383383 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 127383659 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127383696 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127383697 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127383756 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127383885 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127383933 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 127384117 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127384138 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127384167 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 127384206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127384682 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 127384962 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127385163 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127385283 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127385690 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127385718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127385827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127385828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127385856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127385868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127385928 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127385954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127385994 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127386047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127386066 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 127386081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127386091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127386160 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127386161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127386232 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127386415 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127386597 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 127386674 G A Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 127386700 G A Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 2 127386722 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 127386788 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 127386945 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127387070 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127387137 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127387157 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127387596 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127387803 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127387829 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127387970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127388004 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127388099 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 127388522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127388754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127388780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127388905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127388907 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127388957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127389007 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127389171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127389175 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127389244 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127389295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127389316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127389350 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127389407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127389470 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127389508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127389667 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127389903 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127389920 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127389973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127390028 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127390119 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127390134 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127390137 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127390178 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127390221 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127390370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127390386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127390394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127390409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127390432 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127390444 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127390478 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127390493 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127390649 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127390669 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 127390675 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127390680 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127390688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127390702 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127390743 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127390816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127390843 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127390872 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127390875 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 127390903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127390905 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127391022 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127391088 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127391115 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127391121 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127391145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127391345 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127391399 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127391427 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 127391428 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 127391456 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 127391458 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 127391537 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127391538 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127391652 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127391706 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 127391760 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127391765 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 127391794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127391830 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127391941 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 127391953 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 127391973 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127391985 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127392024 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127392265 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127392288 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127392320 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127392343 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127392359 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127392615 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 127393392 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127393667 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127394138 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 127394339 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127394342 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127394775 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127395444 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127395654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127396013 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 127396299 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127396645 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127396684 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127397084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127397142 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127397293 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127397351 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127397438 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127397476 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127397493 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127397507 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127397601 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127397631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127397650 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127397664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127397736 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127397885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127397977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127398106 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127398247 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127398332 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127398502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127398629 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127398710 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 127398741 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127398948 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127399046 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 127399054 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 127399208 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 127399215 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 127399306 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127399338 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 127399399 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127399620 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 127399638 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 127399640 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 127399676 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 127399721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127399735 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127399815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127399819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127399833 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 127399834 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 127399855 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 127399894 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 127400368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127400541 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 127400615 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127400651 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127400736 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127400747 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127401023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127401188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127401218 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127401404 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 127401415 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127401463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127401584 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 127401763 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 127401868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127401891 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127401971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127401987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127402181 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 127402187 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 127402256 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127402302 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127402410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127402457 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127403493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127403644 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127403876 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127404268 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127404391 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 127404392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127404577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127404602 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127404631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127404645 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 127404661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127404690 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 127404775 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127404786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127404797 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127405077 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 127406625 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 127406828 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127407173 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127407367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127407397 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127407493 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 127407540 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127407551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127407603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127407695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127407794 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127407828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127408190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127408499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127408559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127408654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127411072 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127411092 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 127411203 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 127411322 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 127411370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127411725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127411870 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127411947 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127412055 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127412201 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127412372 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127412497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127412577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127412666 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127414744 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127415068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127415150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127415838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127415860 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127417237 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127417354 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 127419458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127419801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127420049 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 127421091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127422080 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 127422113 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 127422172 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 127422366 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 127423475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127423539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127424966 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127426456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127427294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127428934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127429000 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127429063 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 127429156 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127429172 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127430250 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 127430343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127430383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127430481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127431080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127431084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127431160 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127431583 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127431988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127432036 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127432241 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 127432267 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 127432274 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 127432757 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 127432863 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 127433375 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127433456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127433703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127433777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127434572 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127434870 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 127434990 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 127436535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127438086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127438113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127438822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127442494 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 127442804 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127443208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127443952 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 127444423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127444453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127448911 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127449380 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127452587 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 127453057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127454235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127454423 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 127456749 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127457937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127458550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127458811 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 127459736 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127459797 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 127459818 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127460977 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127460991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127461136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127461179 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127461386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127461900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127466537 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127466944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127467938 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 127468023 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 127468098 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 127468290 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 127468313 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 127468571 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 127468821 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127468963 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127469420 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 127470058 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127471049 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127471178 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 127471564 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127472101 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127472132 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 127472281 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127472346 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 127472424 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127472724 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127474601 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 127474822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127475333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127479542 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127480300 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127480689 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127480765 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127480994 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 127481516 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 127482059 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127482158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127484519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127485145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127485290 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 127485675 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127485682 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127485940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127486204 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 127486292 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 127486474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127486588 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127486645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127487109 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 127487686 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 127487829 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 127487925 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127488604 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127488679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127488768 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 127488857 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 127488867 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 127489417 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127489621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127491226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127491571 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127491584 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127491701 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 127491727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127491885 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127491902 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 127493712 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 127493730 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127494347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127494968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127495645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127495658 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 127495848 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127495952 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127496064 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127496272 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127496289 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 127496375 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 127502939 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 127502952 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127503050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127503325 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127503358 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127503422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127503447 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127504040 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127504272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127504296 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127504319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127504338 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127504382 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 127504411 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127504447 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127504450 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127504546 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127504685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127504859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127505036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127505828 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127506120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127507089 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127507213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127507884 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127507924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127508042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127508140 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127508147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127508167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127508270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127508348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127508477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127508548 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127508552 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127508682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127509249 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127509360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127509480 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127509506 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127509919 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 127510051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127510200 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 127510343 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 127510961 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127511139 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127511586 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 127511805 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127511872 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127511939 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127512121 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127512167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127512175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127512382 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127512389 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127512948 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127513158 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127513270 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127513299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127513484 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127513766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127513961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127514071 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127514204 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127514243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127514382 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127514498 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127514527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127514586 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127514957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127514969 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 127515514 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 127515853 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 127515921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127516139 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 127516368 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 127516423 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 127516456 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 127516549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127516631 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127516976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127517018 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 127517285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127517307 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127517428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127517556 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127517776 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 127518669 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 127519213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127519285 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 127519397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127519983 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127520144 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 127520174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127520419 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127520535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127520757 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127521100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127521269 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 127522710 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127523602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127524688 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 127524752 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 127524793 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 127525015 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 127525043 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 127525158 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127525740 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127526405 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127528385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127530656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127531328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127535935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127538067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127539487 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 127539813 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 127539868 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 127539931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127540030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127540058 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 127540082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127540101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127540137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127540190 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 127540209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127540346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127540366 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127540459 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 127540565 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127540795 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127540931 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127540993 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127541031 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127541339 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 127541350 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 127541973 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127542181 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127542183 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127542219 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127542314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127542648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127542716 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 127542831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127542882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127542883 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 127542903 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 127543362 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 127544348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127544696 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 127545006 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 127545709 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127546013 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127546373 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 2 127546719 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 127546732 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 127546733 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 127546918 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 127547011 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 127547290 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 127547647 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 127547742 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 127547935 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 127547976 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 127547988 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 127548242 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 127548557 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 127548758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127549421 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 127549702 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 127549766 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 127549860 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 127550077 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127550376 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127550588 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127550931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127551181 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127551296 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127551512 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 127551542 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 127551955 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127552039 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 127552357 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127552426 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 127552518 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 127552801 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127552904 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127552988 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 127553986 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 127554388 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127554923 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 127554928 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 127554948 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 127554967 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127554987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127555194 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127555201 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127555282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127555323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127555371 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 127555427 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127555890 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 127556076 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 127556101 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127556143 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 127556302 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127557291 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 127557361 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 127557381 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 127557443 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127557485 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 127557661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127559669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127560406 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127560814 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127560920 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127560997 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 127562559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127563013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127563350 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127563460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127563500 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 127564503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127564705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127565928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127566042 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127567343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127567768 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 127568559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127568797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127569211 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127569588 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127569820 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127570555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127571150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127572724 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 127573503 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 127573557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127574380 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 127574708 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127576087 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 127576445 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127576629 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 127576689 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 127577301 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127577820 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127577834 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 127577929 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 127577931 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 127578223 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 127578354 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 127579160 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127580660 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 127580794 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127580812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127580873 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127580953 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127580966 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127580988 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127581030 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 127581076 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 127581165 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 127581249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127581285 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127581558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127581563 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127582036 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127583408 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127584129 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127584311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127584425 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 127586975 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127588340 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 127589786 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127589796 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 127589835 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 127589981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127590376 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 127590557 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127590690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127590720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127590821 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 127592943 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127593311 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127593397 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 127593425 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127593519 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127593614 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127594135 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 127594165 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 127594177 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127594933 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127594955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127595011 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 127595084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127595085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127595173 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 127595204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127595487 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127597634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127598862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127602225 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127602440 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127602746 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127602988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127603031 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127603299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127603582 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 127604303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127604423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127604688 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 127604774 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 127604992 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127604993 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127605268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127605672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127605901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127605932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127606016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127606023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127606296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127606808 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 127606896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127607267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127608066 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127608430 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 127608446 A C Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 127608639 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 127608755 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 127608898 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 127609345 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127609348 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127609516 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 127609524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127609550 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127609948 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 127609973 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 127609984 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 127610079 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 127610194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127610199 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127610218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127610446 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 127610535 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 127610831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127610834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127610852 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127610937 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127611388 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 127611430 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127611463 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127613758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127613784 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 127614015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127614027 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 127614117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127614134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127614358 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 127614502 A G N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 127614652 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 127614876 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 127614943 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127614957 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 127615009 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 127615768 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127615782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127616563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127617675 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127617699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127628003 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 127628536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127630590 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127632077 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127632366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127633051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127636528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127637008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127639767 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 127641261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127642895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127644139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127644141 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127644541 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 127644701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127644874 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127645118 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127645214 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 127645338 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127645822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127645953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127646947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127647077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127647113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127647164 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127647187 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 127647271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127647382 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 127647849 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127648470 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127648998 T A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 127649004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127649253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127649297 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 127649369 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 127649635 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127650215 A T Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 127650746 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127650789 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 127652157 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127652331 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 127652477 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 127652559 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127653302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127653516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127655622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127655840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127655939 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127656532 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 127656677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127657547 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127657605 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 127657779 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 127658144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127658534 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 127658650 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 127659038 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127659347 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127659365 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 127659401 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127659886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127659909 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127660050 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127660091 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127660117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127660248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127660458 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127660501 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127660892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127660899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127661036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127661051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127661139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127661257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127661276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127661327 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 127661416 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 127661524 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 127661623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127661842 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127661957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127662019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127662161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127662193 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 127662212 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 127662221 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 127662226 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 127662269 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 127662438 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 127662483 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127662555 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 127662706 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 127662735 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 127662753 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 127662771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127662790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127662799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127662825 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 127662924 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 127663067 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 127663198 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 127663311 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127663324 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127663454 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127663665 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127663753 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127663805 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 127663950 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 127664081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127664371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127664435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127664650 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127664871 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 127664945 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 127665104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127665240 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 127665341 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127665361 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127665405 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127665646 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127665664 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127665886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127665962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127666247 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 127666351 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127666425 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127666591 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 127666636 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127666788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127667195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127667422 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 127667637 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 127667682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127667697 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 127667833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127667948 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 127668088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127668171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127668749 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127668772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127668779 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127669289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127669401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127669457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127670285 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127670311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127670538 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127670564 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 127670601 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 127671461 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 127671741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127671760 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 127672032 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 127672536 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127672896 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127673016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127673355 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127673401 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 127673601 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127674519 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127675530 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127676288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127676429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127679907 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 127681267 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127683042 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127684583 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127684868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127685983 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 127686427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127687352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127687563 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127688639 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127688796 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 127688803 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 127688953 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 127689057 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 127689092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127689126 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127689594 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 127689950 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 127689993 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127690052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127690281 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 127690437 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 127690573 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127690749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127690763 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 127690894 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127691065 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 127691092 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 127691246 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127691269 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127691390 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 127691507 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 127694306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127695973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127696588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127700099 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127700439 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 127700644 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 127700707 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 127700724 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 127701333 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 127701918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127702044 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127702076 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 127702363 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 127702990 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 127703229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127703601 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127703670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127704591 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 127704760 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127704874 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127705050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127706908 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 127707031 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 127707162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127707289 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127707868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127708795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127709641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127710756 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127712645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127713944 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127715237 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 127717922 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 127719228 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127719383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127722753 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127723395 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127724389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127725283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127725426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127725434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127726096 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 127726251 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127727032 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127727217 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 127727289 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 127727322 G C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 127727374 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 127727463 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 127727493 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 127727570 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 127728150 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127728306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127728480 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 127728490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127728639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127728678 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127728784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127729009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127729037 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127729262 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127729317 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127729635 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127730912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127730917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127731656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127731857 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127732442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127734492 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127737844 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 127738001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127739933 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 127739943 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127739991 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127740189 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 127740619 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 127740641 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127740647 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127740940 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127741098 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127741105 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127741481 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127741519 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127741682 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127741696 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127741723 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 127741792 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127741801 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127741815 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127741867 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127741889 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127741895 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127742086 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127742089 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127742110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127742129 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127742174 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127742190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127742604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127743012 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127743201 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127743258 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 127743270 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 127743488 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127743873 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127743892 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 127744008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127744546 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127744716 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127744754 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127744800 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 127744840 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127745235 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127745453 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 127745467 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127745727 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 127746993 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127747104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127747171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127747220 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127747334 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 127747566 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127747599 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127747684 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127747829 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 127747849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127747903 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127748536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127748942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127749992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127751054 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 127751057 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 127751115 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127752718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127754316 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 127754447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127754672 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 127754768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127756300 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127760250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127761083 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127761307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127761312 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127761359 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 127761379 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127761575 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127761647 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127761780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127761785 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 127761870 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127761930 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127762004 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127762085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127762246 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 127763299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127763388 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127763464 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127763562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127763571 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127764239 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 127764313 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127764324 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127764325 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127765498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127765520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127765770 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127765792 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127765946 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127766089 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127766390 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127766475 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 127766531 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 127766568 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127766575 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127766587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127766591 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127766858 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 127767073 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127767275 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127767449 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127767815 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127768178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127768689 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127768859 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127768964 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127768987 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127769294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127769985 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127770081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127770323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127770330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127770347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127770390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127770446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127770454 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 127770578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127770638 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127770703 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127770725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127770770 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 127770926 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127771237 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127771325 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127771586 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127771770 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127771788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127771826 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127771921 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127771923 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127771999 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127772075 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127772557 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 127772562 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127772662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127772695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127772964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127772975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127773073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127773298 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127773483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127773760 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127773884 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127774436 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 127774449 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 127774727 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 127774928 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127774929 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127776099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127776372 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 127776683 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127776925 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 127777047 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 127777141 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 127777330 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127777403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127777457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127777476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127777733 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127778164 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127778272 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127778712 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 127778800 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 127778987 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127779011 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127779029 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127779048 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127779089 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127779173 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 127779177 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127779237 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127779259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127779318 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127779562 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 127779752 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 127779867 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127779896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127779960 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 127781077 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127782205 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127782722 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127782984 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127783125 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127784385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127786223 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127786571 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127787332 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127789699 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127794358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127794786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127795142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127795634 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127795658 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127795711 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127795805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127795833 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127795859 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127796017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127796031 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127796068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127796099 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 127796109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127796111 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127796148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127796198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127796769 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127796848 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127797247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127798243 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127799162 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127799191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127799690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127800262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127802123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127803244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127804874 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127805600 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127806303 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127810694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127814811 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127816683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127816847 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127818403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127820958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127824003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127824217 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127824655 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127828276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127828311 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127829029 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 127829365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127829375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127829496 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 127829500 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 127830130 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 127830243 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127831676 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 127831880 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 127832005 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127832403 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127832685 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127833041 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127833074 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127833142 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127833200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127833924 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 127834176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127834610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127834668 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127834678 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127835060 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127835841 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127835988 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127837581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127840710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127840824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127841344 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127842407 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 127843352 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127843563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127843895 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 127843930 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 127844204 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 127844944 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127845047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127845193 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 127845267 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127845484 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 127845513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127845519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127845558 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127845736 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127845754 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 127845994 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127845995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127846075 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127846166 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127846623 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 127846842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127846881 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 127847146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127847204 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127847227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127847473 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127847493 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127847789 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127847934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127847971 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127847976 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 127847998 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127848004 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127848409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127848843 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127848927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127849217 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127850121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127852446 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127853509 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 127855640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127855721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127857537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127858280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127860362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127863708 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 127863969 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127864124 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127864250 T G N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 127865337 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 127865670 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 127866742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127867109 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 127867708 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127867969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127868204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127868428 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127868934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127869013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127869458 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 127869654 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 127870580 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 127870633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127873613 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127873795 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 127874182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127874700 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127875166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127875784 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127876490 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 127876534 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 127879752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127881017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127881320 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 127881408 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127881485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127881612 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 127881763 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127881834 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127881847 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 127881907 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 127882170 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 127882243 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 127882514 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 127882552 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 127883629 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127884861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127884874 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127885077 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 127885458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127886408 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127886575 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127886920 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127887627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127888291 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127888401 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127888427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127888440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127889236 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127889771 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127889802 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 127889848 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127889861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127889863 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127889959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127889999 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 127890007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127890265 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 127890625 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 127890677 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127890744 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127890981 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127891037 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 127891123 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 127891124 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127891143 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127891180 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127891196 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127891256 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127891292 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 127891338 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127892490 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 127896446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127897054 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 127897724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127898349 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127898385 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 127898390 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 127898539 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 127898548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127898910 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 127899619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127899708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127901730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127902428 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 127902722 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127904215 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 127905192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127905620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127906092 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 127907349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127907973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127908630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127909149 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 127909684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127910002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127910015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127910655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127912520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127912701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127913139 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127913215 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127913279 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 127913804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127913888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127914769 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 127916502 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 127916543 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127916623 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 127916882 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127917437 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 127917515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127917955 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 127918291 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127918679 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 127919188 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127919219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127919375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127919561 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 127919596 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 127919732 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127919746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127920045 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127920166 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 127920223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127920915 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 127920961 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 127921130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127921684 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127922003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127922032 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127922385 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 127922436 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 127922984 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 127923086 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127923123 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 127923143 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 127923207 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 127923208 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 127923276 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 127923361 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 127923378 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 127923404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127923460 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 127923537 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 127923871 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 127923925 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 127923962 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 127924089 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127924218 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 127924339 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 127924359 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 127924784 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127924836 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 127925423 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 127925682 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127926044 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 127926629 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 127926634 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 127926654 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 127926675 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 127926684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127926725 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127926733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127928046 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 127929211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127930202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127930423 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 127930630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127930958 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127930977 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127931016 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 127931024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127931180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127931195 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127931282 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127931366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127931648 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 127931690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127931774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127931777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127931835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127931885 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127931906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127931968 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127932075 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127932089 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127932123 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127932232 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127932247 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 127932253 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 127932420 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127932464 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 127932648 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127932660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127932662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127934021 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 127934706 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 127936944 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 127937333 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 127937394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127937609 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 127939993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127940163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127941737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127943739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127943835 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 127943867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127943892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127944008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127945081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127945455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127945666 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 127945719 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 127946097 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127946209 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 127946233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127946835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127946958 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127948119 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127949234 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 2 127949375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127949429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127950005 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127950993 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127952482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127954281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127955861 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 127956184 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 127956503 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 127956867 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127956982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127956998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127957074 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127957095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127957225 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127957558 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127957762 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 127957839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127958398 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 127958409 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 127958424 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127959323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127959471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127959496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127959650 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127959686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127960054 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 127961043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127961044 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127961139 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127961270 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 127961459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127961479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127961696 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 2 127961742 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 127961881 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 127961909 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 127961953 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 127961961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127962332 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 127962408 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 127962596 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 127962792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127962895 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 127963144 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 127963292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127964409 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127964460 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 127964536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127964795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127965263 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127965747 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127965886 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 127965947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127966145 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 127966212 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 127966245 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 127966255 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 127966453 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 127966459 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 127966681 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 127966931 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 127967654 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 127967752 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 127967858 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127968027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127968113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127968372 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 127968381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127968444 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127968548 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 127968549 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 127968711 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 127968751 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 127968766 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127968781 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 127968809 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127968821 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 127968833 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 127968999 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 127969005 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 127969094 A G Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 2 127969171 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 127969190 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127969218 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127969297 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 127969310 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 127969586 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 127969692 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 127969704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127970037 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 127970050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127970161 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127970654 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 127970726 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 127971094 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 127971388 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 127971410 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 127971549 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 127971785 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 127971810 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 127972197 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127972346 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 127972528 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 127972964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127973058 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 127973071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127973356 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 127973477 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 127973649 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 127973710 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 127973938 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127974055 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 127975193 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 127975255 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 127975683 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 127976167 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 127976565 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 127976754 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 127976799 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 127976834 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 127976915 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127976951 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 127977392 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 127977643 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 127977697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127978884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127980214 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 127980354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127980512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127980769 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127982997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127983699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127985388 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 127985454 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 127985821 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 127988308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127989681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127989721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127990523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127991976 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127992745 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 127993056 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 127993196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127993251 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127993349 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 127993511 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 127993512 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 127993615 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 127993931 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 127993975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127993986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127994106 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 127994569 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 127994619 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127994641 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 127994829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127994936 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 127994963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127995702 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127996368 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127996479 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 127996621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127996893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127996966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127997430 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 127997444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127997479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127997502 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 127997586 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 127997742 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 127997794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127997922 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 127997924 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 127997998 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 127998169 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 127998446 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 127999777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 127999784 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128000416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128000537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128001039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128001615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128001910 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 128002165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128002523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128002828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128003760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128003999 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128004032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128004139 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128004213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128004494 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 128004780 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128004795 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 128005180 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128005230 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128005361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128005388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128005478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128005798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128006382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128006712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128006713 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 128006819 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 128007452 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 128007541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128008104 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 128008425 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128008541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128010525 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128011636 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 128011862 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 128012425 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128012437 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 2 128012491 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 128012559 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 128012956 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128013218 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128013246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128013266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128013469 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 128013759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128013763 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 128013852 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 128014006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128014007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128014027 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 128014071 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 128014081 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 128014097 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 128014140 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 128014147 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 128014160 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 128014291 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 128014305 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 128014346 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 128014353 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 128014363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128014374 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 128014405 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 128014590 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 128014751 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128014752 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128014918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128015354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128016243 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 128016981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128017078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128017159 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128017567 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 128017648 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128017697 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128018401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128018438 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 128018597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128018668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128023613 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128024103 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 128024441 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 128024662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128024830 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128025288 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 128025625 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 128025701 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128025933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128027420 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 128028322 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 128028796 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 128028856 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 128029156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128029278 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 128030171 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128030949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128031193 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 128031314 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 128032139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128032239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128032576 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 128033239 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 128034279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128034972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128035082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128035149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128035170 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 128035360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128035395 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 128035555 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 128036212 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 128036580 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 128036641 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 128036678 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 128036727 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128038215 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128038338 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 128038488 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128038833 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 128039112 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 128039172 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 128039180 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 128039186 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 128039245 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 128039507 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 128039741 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 128039863 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 128039893 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 128039925 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 128039975 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 128040086 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 128040122 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 128040283 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 128040284 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128040348 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 128040508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128040744 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128041109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128041711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128041728 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128041825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128042067 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 128042095 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 128042478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128043593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128043656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128043876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128043892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128044939 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128045200 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 128045308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128045447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128045500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128045510 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128046542 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 128046719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128047033 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 128047367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128047469 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 128047562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128047691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128048291 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 128048330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128048479 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 128048488 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 128048536 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 128048626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128048663 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128048695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128048731 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 128048763 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 128048829 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 128048876 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 128048877 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 128048973 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 128049008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128049032 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 128049040 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 128049126 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128049236 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 128049433 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 128049496 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 128049545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128050370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128050508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128050526 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128050555 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128050573 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128050603 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 128050613 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128050658 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 128050855 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 128050955 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128051027 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128051054 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128051082 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128051167 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128051336 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128051454 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 128051533 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128051631 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 128051787 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 128051789 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 128051825 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 128051887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128051967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128052243 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 128052270 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 128052509 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 128052519 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128052553 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 128052596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128052957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128052964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128053240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128053436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128053521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128053606 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128053689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128054197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128054540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128054878 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128054937 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 128054939 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 128054952 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 128056380 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128056390 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128057133 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 128057139 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 128057327 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128057460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128057638 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 128057737 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 128057801 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 128059104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128059251 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128059268 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128059437 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128059957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128061959 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 128062037 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 128063071 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063307 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 128063361 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 128063391 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 128063566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063578 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128063668 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128063789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128064451 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128064469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128064502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128064521 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 128064588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128064592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128064624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128064627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128064718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128066201 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128066261 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 128066641 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128066728 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128066865 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128067170 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 128067202 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 128067290 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 128067398 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128067433 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128067565 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128067736 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128068009 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 128068029 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128068040 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128068072 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128068212 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128068324 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128068376 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 128068396 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 128068407 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 128069560 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128069846 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128070239 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128070686 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128070801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128070828 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 128070851 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128070875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128071104 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128071222 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 128071758 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 128071807 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128071844 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 128071857 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 128071912 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 128071926 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 128072018 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128072045 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 128072050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128072162 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 128072180 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 128072259 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 128072372 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 128072545 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 128072548 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 128072655 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 128072887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128072898 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128073012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128073215 G C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 128073231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128073245 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 128073536 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128073755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128073760 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 128073788 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128073841 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128074567 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128077562 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128077709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128077976 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128078309 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128078948 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128079123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128080064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128080245 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128080524 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128080669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128080895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128080949 T G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 128081783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128082001 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 128082299 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 128082385 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128082415 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128082464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128083337 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 128087832 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128088141 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128088906 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128089104 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 128089368 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128093101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128093882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128094881 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 128095053 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128095061 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128095116 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128095128 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 128095540 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 128095637 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 128095738 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 128095761 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 128096346 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 128096662 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128096795 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 128096992 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128097000 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 128097610 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128098284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128098537 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128098686 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128098688 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128098781 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128099441 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128099497 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128100768 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128100809 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128100845 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128100859 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 128100930 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128100979 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128101026 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128101030 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128101490 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128101550 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128102431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128103180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128103993 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128104475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128105778 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128106046 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128106151 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128110177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128114143 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128115093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128115223 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 128115528 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128115702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128117004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128124541 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128129951 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128130121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128130662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128130883 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128132004 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 128132691 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128133033 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 128133400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128133565 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 128133579 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 128133841 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128134622 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128135519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128136173 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 128136317 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 128136376 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128136528 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128136545 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128137210 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 128137257 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 128137521 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 128139634 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128140372 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 128141262 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128141619 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128142278 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 128142518 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128142698 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 128143205 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128143799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128143813 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128144411 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 128144772 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128144899 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128144943 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 128144944 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 128145048 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128145069 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128145173 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 128145190 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128145284 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128145380 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 128146108 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128146242 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128146369 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 128146409 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 128146427 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 128146538 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 128146559 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 128146561 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 128146576 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 128146581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128146889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128146937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128146984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128147022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128147061 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128147289 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128147844 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128147876 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128147902 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128148047 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128148059 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128148094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128148235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128148384 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128148502 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 128148617 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 128149271 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128150048 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128150137 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128150860 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 128150876 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128151016 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 128151156 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 128151182 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128151760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128152078 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128152113 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128152216 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 128152230 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 128152913 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128152960 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128154342 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128154681 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128155135 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128155180 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 128156216 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128156564 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 128156586 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 128156599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128156715 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128156760 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128157249 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128157748 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 128157792 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 128158181 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 128158801 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 128160680 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128162005 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 128162812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128165058 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 128165409 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 128166752 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128167077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128170290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128170684 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128170905 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 128171224 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 128172283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128172521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128173484 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 128174064 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 128174087 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128174128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128175978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128177072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128177485 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 128179774 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 128179883 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 128179896 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 128180006 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 128180075 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 128180363 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 128180604 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128181054 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 128181299 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 128181559 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 128181673 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 128181912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128182121 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128182482 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 128182518 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 128182624 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 128182646 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 128182698 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128182925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128183331 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128183386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128183425 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128183801 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 128185069 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 128185597 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128185619 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128187143 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128187367 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 128188906 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 128189045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128189331 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128189451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128189488 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 128189730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128189780 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 128192145 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128193180 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 128193214 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 128193493 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128193885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128194174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128198505 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 128198818 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 128199144 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128199204 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128199227 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 128199943 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 128200184 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 128200285 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128200384 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 128200682 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128200813 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128201962 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 128203281 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 128203496 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128203706 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 128204317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128204997 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 128206707 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 128209197 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 128212341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128212769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128214135 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128217099 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 128217183 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 128217217 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128217233 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 128217288 A C N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 2 128217609 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 128217637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128217671 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128217850 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 128220397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128221457 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128223006 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128223475 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 128223638 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 128223642 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 128223792 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 128224089 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 128224299 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128224436 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128224490 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 128224871 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128224997 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 128225137 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 128225150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128225152 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128226044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128226224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128226316 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128226446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128226494 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128226500 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128226861 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 128226872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128227297 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128227331 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 128227450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128227632 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128227705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128227740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128227757 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 128227933 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 128227988 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 128228067 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 128228110 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128228336 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128228593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128228614 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128228912 A G N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 9 11 1 7 2 2 128229177 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 128229416 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128229589 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128230078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128230231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128230330 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 128230454 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 128230567 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 128230603 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128230688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128230829 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 128231162 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 128231455 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 128231482 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 128231869 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 128232013 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 128232214 A T N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 128232247 C T N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 2 128232306 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 128232436 C G Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 128232441 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 128232645 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 128232699 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 128233091 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 128233242 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 128233257 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 128233348 A T N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 2 128233437 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128233553 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 128234033 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 128234067 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128234328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128236179 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 128236398 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128236516 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128236632 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128236903 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 128237032 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 128237561 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128237705 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128237804 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128237990 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 128238460 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128239110 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128239487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128239764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128239783 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 128240147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128240787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128241620 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128241896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128241901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128243904 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128244100 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128244284 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 128244592 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128244649 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128245663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128246737 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128246982 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 128248364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128249583 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128249825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128249858 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128249955 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 128250111 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128250128 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128250130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128250567 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 128253272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128253540 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 128253667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128253989 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 128254328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128254811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128255022 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 128255614 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 128255901 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 128256086 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128256250 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 128257003 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128257139 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 128257458 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 128258091 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128258122 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 128258271 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 128258622 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 128258760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128259192 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 128259270 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128259456 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128259487 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128260308 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 128261586 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 128262371 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 128262987 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128263041 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 128263523 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128263821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128265292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128265665 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128265699 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128265706 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128265720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128265748 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 128265883 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128265947 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128265976 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 128266099 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 128266499 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128266503 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128266552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128266594 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 128266595 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 128266644 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 128266699 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 128266912 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 128267285 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 128267588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128267635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128268068 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 128268135 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128268206 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 128269604 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128269929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128270646 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 128270846 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 128270849 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 128270860 A C N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 128271220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128271238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128271558 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 128271846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128272592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128272816 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 128274530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128275057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128275379 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128275415 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 128275453 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128275471 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 128275499 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128275546 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128276179 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128276208 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128276305 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 128276356 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 128276378 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 128276666 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128277540 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128277717 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128277749 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 128277811 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 128277862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128277929 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 128278063 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 128278113 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 128278137 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128278154 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128278340 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128278364 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128278676 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 128278771 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 128278799 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128279233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128279625 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128279628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128279731 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128279992 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 128280068 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128281076 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 128281316 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128281392 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 128281443 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128281877 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128282218 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128282225 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128282351 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128282372 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128282416 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128282593 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128282641 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128282646 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128282714 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 128283022 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 128283026 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 128283340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128283355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128283382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128283451 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 128283659 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 128284107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128284328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128284363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128284433 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 128284462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128284482 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 128284647 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128284975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128285054 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 128285156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128285185 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128285192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128285281 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128285306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128285533 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 128285603 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 128285944 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128285963 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128286027 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128286241 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 128286323 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128286363 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128286465 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 128286940 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128286966 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128287320 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128287672 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128287745 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128287781 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128287858 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 128288008 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 128288026 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128288126 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 128288241 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128288269 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128288869 G C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 128288948 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128288992 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 128289005 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 128289050 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 128289269 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 128289291 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128289520 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 128289557 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128289684 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 128289868 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 128289934 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 128290060 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128290086 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 128290099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128290190 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 128290248 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128290326 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128290346 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 128290416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128290464 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128290472 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128290564 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128290584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128290676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128290695 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128290909 G C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 128290970 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128291015 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128291431 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128291709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128291859 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128292104 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 128292155 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 128292691 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128292737 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 128292836 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128292873 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128292918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128292940 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128292941 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 128292965 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128293021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128293201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128293251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128293310 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128293439 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 128293579 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 128293595 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128293634 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 128293844 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 128294086 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128294865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128294873 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128294962 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128295028 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 128295425 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 128295435 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 128295646 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128295754 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 128295928 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 128295932 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 128295951 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128296314 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 128296353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128296382 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 128296517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128296567 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 128296855 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 128296856 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 128296930 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 128297298 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128297302 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128297337 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128297377 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128297459 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128297553 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128297617 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128297630 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 128297680 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128297719 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128297740 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128297851 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128297854 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128297877 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128297888 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128297945 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128297960 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 128298032 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128298044 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128298177 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128298178 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128298207 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128298211 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128298233 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128298308 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128298481 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128298666 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128298701 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128298789 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128298825 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128299030 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128299246 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128299290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128299293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128299314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128299319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128299551 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128299604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128299662 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128299677 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128299955 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128300048 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128300191 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128300336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128300484 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128300607 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128300648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128300773 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 128300779 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 128300801 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128300839 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128300873 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 2 128300874 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 2 128300935 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128300997 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 128301022 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 128301037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128301130 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128301173 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128301183 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128301193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128301203 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128301231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128301369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128301523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128301613 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 128301743 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128301863 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128302095 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128302277 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128302345 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128302358 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128302580 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128302583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128302611 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128302708 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128302786 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128302863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128303179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128303195 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128303579 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128303762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128303887 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128304589 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128304606 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 128304652 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 128304672 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 128304673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128304750 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 128304826 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128304830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128304850 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128304928 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128304992 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128304997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128305054 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128305094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128305116 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128305126 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128305152 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128305283 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128305420 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128305435 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128305652 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128305679 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128312792 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128312802 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128312803 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128313063 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128313105 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128313147 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128313148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128313309 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128313593 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128313670 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128313686 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 128313747 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 128313793 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128313855 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128313920 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128313931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128314039 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128314279 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128314298 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128314305 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128314330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128314386 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128314545 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128314763 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128315133 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128315420 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128315499 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128315519 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 128315554 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128315562 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128315612 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128315613 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128315699 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 128316285 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 128316308 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 128316348 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 128316922 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 128316993 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 128317172 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 128317195 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128317208 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 128317662 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128317666 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128317762 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128317763 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128317931 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128318003 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128318728 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128320287 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128320489 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128320516 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128320653 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128320683 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128320916 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128321652 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128321709 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128321711 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128322043 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 128322137 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128322470 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128322525 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128322649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128322670 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128322676 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128322907 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128322922 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128323060 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128323645 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128323993 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128324031 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 128324042 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 128324043 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 128324183 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128324219 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128324246 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128324263 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128324267 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128324285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128324535 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 128324792 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128324805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128324887 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128324892 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128324920 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128325031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128325052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128325108 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128325476 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128325742 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128326200 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128326276 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 128326880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128327147 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128328554 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128328950 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128329032 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128329094 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128330084 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128330113 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128330135 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128330152 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128330232 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128330305 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128330342 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128330475 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128331031 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128332099 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128332450 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128333190 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 128333297 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 128333360 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128333650 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128333733 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128333815 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128333868 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128334149 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128334158 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128334175 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128334194 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128334209 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128334454 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128334558 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 128334704 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128334722 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128334727 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128335080 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128335137 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128335255 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128335451 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128335470 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128335471 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128336100 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128336283 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128336285 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128336467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128336477 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128336564 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128336585 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128336607 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128336706 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128336748 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128336762 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128336874 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128336876 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128337127 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128337141 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128337418 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 128337462 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 128337467 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128337495 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128337794 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128338084 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128338199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128338400 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 128338510 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 128338567 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128338614 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128338625 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128338941 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128338954 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128339016 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128339292 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 128339295 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 128339404 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128339424 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 128339448 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128339532 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128339557 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128339596 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128339650 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128339687 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128339756 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128339777 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128339956 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128339971 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128340153 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128340428 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128340450 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128340600 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128340705 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128340839 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128340946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128341128 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128341412 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128341475 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128341568 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128341744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128342137 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128342171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128342184 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128342304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128342787 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128342854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128342876 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128342882 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128342902 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128342965 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128342974 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128343073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128343124 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128343128 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128343153 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128343262 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128343268 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128343289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128343291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128343669 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128343705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128343748 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128343866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128343986 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128344062 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128344110 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128344393 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128344420 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128344458 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128344482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128344509 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128344576 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128344772 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128347060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128347105 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128347641 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 128347998 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128348307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128349006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128349222 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128349534 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128349567 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128350489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128350661 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128351003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128351020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128351619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128351621 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128351660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128351893 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128352200 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 128352457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128353059 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128353653 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128353669 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128353678 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 128353738 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 128353775 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128353885 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 128354009 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128354086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128354094 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128354158 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128355090 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128355130 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128355136 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128355205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128355223 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128355463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128356859 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 128357051 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 128357755 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128357802 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128357992 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128358231 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 128358244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128358281 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128358389 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128358410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128358460 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128358948 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128359005 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128359048 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128359053 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128359065 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128359141 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128359484 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128359521 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128359572 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128359656 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128359819 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128359822 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 128359847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128359917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128360042 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128360163 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128360612 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128360613 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128361002 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128361041 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128361047 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128361480 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128361950 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128362377 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128362389 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128362674 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128362708 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128363775 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128363801 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128364024 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128364086 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128364230 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128364505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128364535 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128364555 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128365033 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128365227 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128365244 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128365253 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128367090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128367107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128367134 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128367285 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128367887 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128367992 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128368236 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128368305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128368657 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 128369379 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 128369444 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 128369512 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128369854 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 128369916 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 128369965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128369987 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 128370179 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128370834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128371895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128371980 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128372074 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128372113 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128372200 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128372313 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128372679 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128372766 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 128372837 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128372917 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128372921 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 128373104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128373358 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 128373396 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128373408 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128373454 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 128373493 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 128373596 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 128373623 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 128373660 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128373665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128373846 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128374005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128374014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128374240 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 128374373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128374518 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128374629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128374765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128374972 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 128375875 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128377200 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128377244 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128377707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128379168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128380704 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 128380741 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 128380743 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 128381063 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 128381065 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 128381165 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128381770 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128381907 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128382604 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128382714 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 128382817 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 128382818 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 128382834 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 128382886 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128383962 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128384142 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128384240 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128384540 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128384626 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128384632 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 128384651 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 128384802 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128384869 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128384888 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 128384941 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128384956 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128384983 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128385037 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128385290 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128385344 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 128385345 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 128385416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128385445 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128385525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128385668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128385691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128385720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128385760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128385772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128385803 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128385870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128385907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128386139 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128386170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128386203 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128386245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128386409 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 128386544 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128386773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128386785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128386930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128387021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128387075 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128388585 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 128388699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128388710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128388728 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128388857 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128388880 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128388884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128388891 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 128389201 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128389358 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128389415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128389444 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128389469 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128389536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128389760 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128389820 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 128389902 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128390056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128390499 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128390899 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128390934 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128391186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128391793 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128391983 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128392001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128392128 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128392590 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128393168 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128393249 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128393409 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128393489 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128393501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128393606 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128393748 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 128393749 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128393766 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 128393908 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128394035 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128394655 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128395736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128400341 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 128401768 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128402678 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128403523 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128406497 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128406890 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128407348 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128410285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128410332 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128411902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128412912 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128412970 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128413500 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128414472 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 128414844 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128415568 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128418444 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128418771 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 128419468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128421365 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 128423658 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128424961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128425256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128427060 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128427112 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128427117 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128427306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128427839 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128432470 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 128433340 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128434427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128436376 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128436540 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128438180 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128439599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128439721 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128440426 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128442084 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128443021 G T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 128443348 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128444672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128444707 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128445859 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128446434 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 128447873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128447958 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128448281 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 128448412 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128448418 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128449107 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 128450096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128450161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128452569 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 128453185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128454028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128454039 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128456353 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128456951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128457465 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128458553 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 128459942 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 128460721 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 128461585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128461902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128462286 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 128462622 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128462889 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128462971 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128464207 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 128464334 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128464339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128467341 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128467431 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128467533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128468888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128469734 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128469922 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 128470344 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128470446 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128471127 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128471325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128471336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128471545 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128471803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128472214 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128472249 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128473013 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128473339 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128473553 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128474414 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128475445 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 128475653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128475877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128476247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128476968 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 128477197 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128477252 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 128478077 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128479654 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128480299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128480877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128481157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128481673 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128481743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128482798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128483138 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128483917 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128484309 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128486745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128487326 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128487520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128488246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128489131 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128489990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128492524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128492811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128493961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128495041 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 128495574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128498024 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128498749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128499147 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128501080 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128504797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128504905 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 128511151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128513078 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128514728 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128515738 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128517203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128517840 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 128518047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128518313 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 128518375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128519670 C G N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 128521501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128521518 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 128521763 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 128521908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128522126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128522788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128523413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128523920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128525043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128526058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128526133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128526664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128527513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128527534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128527927 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 128527959 T G N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 128527961 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 128528061 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 128528236 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128528922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128528954 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128528976 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128529102 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128529128 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128529236 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128529279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128529328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128529479 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128529857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128530671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128531244 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128531256 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128531497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128532054 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 128532453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128532861 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 128532908 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128532911 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128532997 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 128533024 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 128533089 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 128533826 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128533844 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 128533856 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 128533992 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 128534039 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 128534043 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 128534140 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 128534209 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 128534622 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128534666 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128534854 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128534936 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128535164 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128535521 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 128535885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128536351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128536552 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128536561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128536587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128536720 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128536897 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128537076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128537360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128537643 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128537675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128537681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128537686 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128537759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128538194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128538233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128538536 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128538790 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128538900 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128538924 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 128538987 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 128539038 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 128539110 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 128540420 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128540474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128544830 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128544945 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128544948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128545202 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 128545264 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 128545291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128545562 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 128545605 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128545795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128545810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128545894 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128545915 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 128545916 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 128545930 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128546007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128546025 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 128546099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128546112 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128546252 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128546472 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128546703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128546723 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 128546815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128547590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128549048 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128549233 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 128549949 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128550295 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128551586 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 128554331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128555070 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 128556372 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128557580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128560755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128560764 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 128561352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128561826 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128561957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128561992 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128562357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128564130 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 128565800 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 128565813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128565880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128568396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128568851 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128570347 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 128570595 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128571688 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 128571747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128573019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128573557 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 128574555 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 128574586 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 128574773 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128574805 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 128574860 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 128574988 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128575084 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128575086 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 128575112 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128575123 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 128575141 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 128575148 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 128575322 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128575365 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128575526 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 128575691 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128575771 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 128576044 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 128576189 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128576247 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 128576290 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128576472 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128576600 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 128576628 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128576754 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 128576793 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128576796 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128576967 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128577027 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 128577077 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 128577354 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128577559 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128577920 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 128577985 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 128578125 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 128578141 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128578167 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128578179 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 128578193 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128578219 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128578239 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128578258 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128578308 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 128578382 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128578850 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128578924 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 128579010 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 128579183 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 128579186 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 128579934 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 128580165 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 128580283 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128580348 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128580379 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 128580402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128580669 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128582853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128583897 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 128584346 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128584781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128585564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128585991 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128586921 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128587311 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128587388 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128587444 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128587682 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128587706 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128587885 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128588048 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 128588059 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128588088 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 128588117 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 128588132 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128588195 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 128588224 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 128588234 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 128588257 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 128588527 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 128588605 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128588639 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128588688 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128588689 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 128588860 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128588959 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128588968 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 128589133 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128589410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128589889 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128590238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128590415 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128590523 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128590678 T A N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 128590712 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 128590721 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 128590815 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 128590883 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128591187 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128591259 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128591337 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128591504 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128591754 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128592016 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128592398 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128592429 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128592441 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 128592476 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128592544 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128592576 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128592599 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128592675 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128593187 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128593314 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128593315 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128593427 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128593433 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128593517 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 128593524 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 128593560 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128593568 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128593628 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 128593645 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 128593649 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 128593662 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 128593739 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 128593849 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 128593966 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128593978 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128593992 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128594237 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128594245 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128594326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128594346 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 128594383 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128594684 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128594705 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128594843 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128594913 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128595196 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 128595229 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 128595260 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128595277 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128595353 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128595383 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128595411 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128595447 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128595535 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128595617 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128595669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128595726 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128595728 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128595857 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 128596053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128596135 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128596194 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128596394 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128596502 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128596554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128596618 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128596908 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 128597926 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128597956 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128597957 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128598003 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128598047 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128598062 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128598159 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 128600421 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128600691 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128600697 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128600705 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128600715 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128600757 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128600975 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 128600977 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128601045 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128601172 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 128601175 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 128601251 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128601612 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128601839 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128601890 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128602314 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 128602436 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128602469 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 128603078 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128603224 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128603244 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128603375 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128603904 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 128603948 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 128603950 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 128603981 T A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 2 128604011 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 128604125 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128604150 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128604177 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128604691 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 128605095 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128605824 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 128605839 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 128605910 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128605952 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128606282 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 128606307 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 128606329 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 128606420 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128606533 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 128606618 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128606646 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128607317 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 128607334 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 128607368 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 128607509 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128607720 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128607736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128607743 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 128607779 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128607837 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 128607855 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 128607911 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128607987 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128608363 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128608374 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128608418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128608422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128608429 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128608447 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128608450 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128608559 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128608798 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128608969 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128608986 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128609032 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128609050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128609133 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 128609155 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 128609162 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128609248 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 128609467 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 128609474 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 128609489 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 128609544 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 128609570 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 128609695 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128609762 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 128609896 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128610066 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 128610110 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128610126 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 128610341 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128610356 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 128610456 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128610603 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128610736 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128610781 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 128611069 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 128611110 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128611151 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 128611164 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 128611291 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 128611308 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128611380 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128611569 T A Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 128611740 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128611777 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128611779 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128611788 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128611853 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128611907 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128611936 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128612369 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 128612450 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 128612491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128612515 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128612962 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 128612986 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 128613027 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 128613057 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 128613227 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128613410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128613416 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128613488 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128613561 C G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128613625 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128613650 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128613657 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 128613670 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128613673 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128613682 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128613785 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128613786 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128614160 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 128614226 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128614287 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 128614448 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 128614550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128614815 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 128614837 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 128614858 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 2 128614878 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 128614889 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 128614893 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 128614909 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 128614912 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 128615116 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 128615253 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 128615259 T C Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 2 128615448 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 128615464 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 128615702 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128615732 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 128615834 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 128615869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128615883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128615899 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 128615973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128616196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128616277 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128616443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128616582 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 128616590 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 128616652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128616743 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 128616772 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 128616848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128616860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128616926 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128616930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128617009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128617034 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128618559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128619891 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 128620021 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128620304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128620672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128627803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128628013 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 128628317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128630426 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128630870 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128632149 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 128632328 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128632621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128633623 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 128636735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128641052 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128641686 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 128644388 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 128645846 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 128646287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128646349 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128646689 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128646746 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128646773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128648259 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128648277 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128648278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128648416 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 128648474 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 128649184 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 128649311 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 128649382 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128649580 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128649636 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128649640 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128649778 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 128649790 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 128649921 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128649923 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128650097 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128650201 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 128650586 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128651624 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128652121 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128652133 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128652162 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128652404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128653470 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128655213 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128655612 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128658169 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128661899 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128662740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128662988 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128663303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128663566 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128665478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128666287 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 128667480 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 128668762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128668992 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128670769 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128671651 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128672361 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128672523 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128673463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128673711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128673749 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128674277 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128674437 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 128674575 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128674737 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128674994 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128675297 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128675304 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128675421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128675496 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128675502 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 128675538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128675592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128675625 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128675629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128675758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128675843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128676204 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128676206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128676242 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128676308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128676422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128676440 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128677376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128677411 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128677452 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128677454 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128677498 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128677614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128677631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128677645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128677788 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128677903 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128677913 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128678137 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128678341 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128679937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128680077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128680194 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128680276 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128680321 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128680419 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 128680437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128680496 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128680578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128680765 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128680893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128680904 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128680926 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128680952 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128680962 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128680976 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128681471 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128681508 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128681618 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128681625 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128682038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128682052 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 128682232 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 128682276 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 128682451 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128682510 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128683502 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128683673 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128683698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128685049 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128687454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128687488 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 128687582 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128687583 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 128687689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128687743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128688005 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 128688375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128688537 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128688577 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128688803 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 128688822 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 128689990 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128690207 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128690284 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128690758 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 128691042 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128691243 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128691578 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128691679 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128691831 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128692165 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128692273 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128692303 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 128692834 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128693094 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 128693099 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 128693166 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128693386 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128693505 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 128693824 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128693888 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128694021 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128694312 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 128695090 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128695093 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128695250 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128697869 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128698071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128698110 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128698140 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128698200 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128698228 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128698296 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128698336 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128698361 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128698407 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128698513 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128698644 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128698668 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128698908 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 128699045 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 128699063 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 128699089 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128699122 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128699139 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128699145 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128699272 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128699308 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128699853 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128700249 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128700475 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128700535 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128700710 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128700789 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128700976 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128701564 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128701922 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128702157 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128702412 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128702567 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 128702821 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128702825 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 128703093 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128703296 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 128703339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128704294 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128704396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128704401 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128704472 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 128704506 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128704575 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128704836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128704896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128705301 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128705364 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128705407 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128705474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128705605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128705749 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128705819 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128705922 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128705940 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 128705943 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 128705964 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 128706002 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 128706066 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 128706789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128706819 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128706854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128706993 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 128707050 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 128707062 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 128707315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128707345 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128707603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128707695 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128707703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128707717 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128707944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128708009 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128708046 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128708095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128708104 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 128708164 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128708200 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128708367 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 128708370 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 128708785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128709149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128709271 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128709278 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 128709485 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128709550 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128709642 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128709755 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128709780 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128709785 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 128709954 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128709961 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128710068 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128710106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128710864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128710983 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128711165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128711241 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 128711284 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128711454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128711491 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 128712254 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128712278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128712390 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128712477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128712527 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 128712929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128712931 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128712943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128713051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128713238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128713258 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128713323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128713844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128714274 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128714358 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 128714546 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 128714571 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 128714611 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 128714722 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128714741 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 128714758 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 128714823 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128714860 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128715199 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128715222 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 128715372 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128715674 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 128715788 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 128715847 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 128715865 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 128715879 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 128715883 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 128715947 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 128716032 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 128716103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128716270 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 128716310 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128716338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128716382 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128716422 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128716594 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128716615 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 128716679 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128716932 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128716954 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 128716964 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128716979 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 128717008 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128717015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128717022 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 128717027 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 128717229 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128717278 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128717414 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128717451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128717667 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 128717745 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 128717992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128718021 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128718032 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128718048 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128718090 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128718192 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128718219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128718258 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 128718297 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 128718405 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 128718470 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 128718622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128718964 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128719062 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128719134 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128719151 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128719289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128719391 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128719781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128720207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128720322 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128720344 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128720398 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128720481 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 128720638 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128720668 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 128720671 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 128720749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128720812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128720839 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 128720873 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 128720953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128722110 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128722710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128722725 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128723016 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128723111 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128723998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128724380 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 128724383 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128724401 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 128724535 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 128724554 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 128725816 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 128726066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128726205 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128726278 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128726417 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 128726924 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128727180 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128727455 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 128727470 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 128727656 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 128727659 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 128727719 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 128728396 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 128728451 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 128728755 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128729973 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128730451 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 128730670 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 128730752 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 128730990 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128731211 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 128731734 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128732060 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 128732212 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128732367 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 128732467 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 128732483 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 128732522 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128732635 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 128732738 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128732756 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128732799 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128732830 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 128732833 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128732880 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 128732902 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 128732929 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 128732954 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128732959 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 128733065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128733085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128733774 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 128733786 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 128734139 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128734297 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128734779 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 128734860 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128734939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128734948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128734966 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128736686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128736794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128738927 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 128740002 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128740017 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 128740567 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128740899 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 128741251 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 128741688 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128741781 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 128742198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128742473 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 128742936 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128743790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128744256 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 128745509 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128745819 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128746268 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128746303 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128746440 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128747242 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 128747308 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 128747396 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 128747442 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128747477 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128747517 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128747568 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 128747588 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128747691 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 128747701 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 128747878 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 128747895 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 128747918 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128747995 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128748032 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 128748074 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128748075 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128748107 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128748690 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128748695 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128748977 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128749014 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128749064 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 128749110 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 128749210 A T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128749506 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 128749542 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 128749658 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 128749838 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 128749923 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 128750015 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128750054 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 128750060 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128750090 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 128750287 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128750396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128750544 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128750675 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 128750822 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 128751346 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 128751437 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 128751487 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128751488 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128751630 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 128751767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128752106 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128752116 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128752289 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128752297 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128752628 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128752711 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 128752721 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 128752757 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128752844 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 128753052 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 128753053 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 128753200 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 128753243 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 128753276 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128754062 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128754172 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128754190 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 128754241 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128754250 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128754292 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128754368 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 128754433 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 128754454 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 128754877 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 128754938 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128755241 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128755364 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128755393 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128755480 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128755708 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 128755767 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128755921 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 128756229 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 128756240 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128756265 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128756374 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128756375 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128756897 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128756909 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128756973 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128756996 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 128757190 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128757213 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128757247 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128757265 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128757481 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128757491 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128758381 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128758505 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128759161 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 128759174 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 128759296 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128759720 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128759722 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128759831 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128759854 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128759872 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 128759990 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128759991 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 128760039 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 128760409 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 128760700 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 128761097 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128761367 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 128761499 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 128761710 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 128761729 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 128761774 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 128761998 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 128762004 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 128762012 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 128762114 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 128762158 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 128762191 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 128762210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128762362 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 128762401 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128762443 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 128762451 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 128762564 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 128762629 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 128762689 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 128762753 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 128762776 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 128762860 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 128762861 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 128762900 A C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 128763178 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 128763261 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 128763274 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 128763317 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 128763320 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 128763441 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 128763589 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 128763617 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 128763686 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128763712 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128763825 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 128764096 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 128764550 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 128764868 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 128765549 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128765714 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 128765815 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 128765823 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 128765895 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 128766034 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128766190 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 128766230 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 128766303 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128766322 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128766328 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128766495 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 128766524 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 128766549 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 128766556 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 128766595 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 128766816 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128766823 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128766922 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 128766971 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128767061 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128767126 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128767183 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128767238 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128767250 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128767422 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 128767583 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 128767848 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 128767928 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 128767939 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128768178 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128768412 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128768484 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 128768521 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128768523 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128768591 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 128768695 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 128768948 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 128772040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128772592 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128772969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128773210 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128773710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128773821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128777649 C G Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 128777841 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 128781069 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 128781341 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 128782408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128782477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128789427 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128792945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128794677 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128795732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128796385 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 128796562 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 128796568 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 128798007 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128798170 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 128799095 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 128799933 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128800094 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128800846 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 128802362 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128802393 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128804333 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128806499 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128807262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128807302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128808431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128808696 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128809891 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128810349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128812538 G T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 128819691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128820037 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 128823134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128824828 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 128826165 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128826184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128827982 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128828121 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 128828816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128828960 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 128829155 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128830687 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128830907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128831458 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128834770 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 128835516 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128839477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128840516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128842933 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 128843069 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128843935 T A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 128846373 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128846751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128846759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128847549 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 128849785 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128849830 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128851390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128853251 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128853749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128854115 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128854218 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128854296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128855193 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128856777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128858616 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128858647 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128860383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128863245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128863865 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 128864364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128864493 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 128865587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128867037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128867302 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128868276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128868331 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128868496 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128868563 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128868706 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128868814 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 128869257 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 128869412 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 128870115 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128870170 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 128871037 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128871085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128871446 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128871919 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 128872235 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128872350 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128872615 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128872650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128872986 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128874309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128874824 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128875005 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128875013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128875321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128876358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128876864 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128877646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128877858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128878661 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128878670 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128878686 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128878690 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128878737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128879360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128879822 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 128880273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128880893 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128881555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128882434 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 128883371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128884382 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128885950 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 128886040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128886050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128886083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128886210 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 128886450 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 128886707 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128886939 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 128887196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128887207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128887316 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 128887896 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128888190 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 128888775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128888984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128889479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128889858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128889864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128891578 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128893109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128893493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128895638 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128895717 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128897016 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 128897281 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128897459 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 128897510 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128897527 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 128897926 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128899457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128899785 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 128900546 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 128900591 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128900648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128900704 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 128900716 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128900717 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128901248 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128901303 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128901529 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128901646 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128902173 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128902201 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128902229 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128902572 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 128902755 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128902774 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128902823 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128902832 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128902995 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128903078 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128903142 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128903171 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128903221 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128903260 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128903306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128903312 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128903438 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 128903648 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 128903754 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128903758 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128903833 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128903878 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 128903981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128904071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128904431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128904808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128905081 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128905303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128906065 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128906539 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128907093 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128908779 T A N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 128911182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128911606 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128911713 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 128911905 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 128911911 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 128911921 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 128911932 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128911949 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 128912010 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 128912326 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128912346 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128914233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128915310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128915463 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128915712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128916380 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 128916403 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 128917545 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128917709 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 128918350 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 128918439 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128918443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128918567 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128919922 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128919996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128920559 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128920565 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128921209 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128921612 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128921751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128921784 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128922179 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128922230 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128922259 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128922277 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 128922281 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 128922293 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 128922335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128922691 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 128922705 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128922779 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128923126 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128923259 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 128923283 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128923287 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 128923346 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128923425 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128923539 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128923576 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128923633 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128924367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128924591 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 128924908 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 128925074 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128925653 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 128925728 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128925745 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128926005 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128926059 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128926686 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 128927011 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128927026 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128927466 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128927469 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128927506 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128927551 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128927583 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128927594 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128927720 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 128927964 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128928249 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128928326 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 128928433 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128928454 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128928476 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128929136 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128929158 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 128929161 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 128929275 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128929306 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128929310 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128929860 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128929937 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128930001 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 128930014 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 128930055 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 128930062 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 128930160 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128930163 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128930534 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128930570 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 128930676 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 128930689 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 128930714 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 128930775 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128930899 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 128930927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128931499 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 128931609 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 128931677 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 128931678 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 128931719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128931746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128931864 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 128932583 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 128932585 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 128933915 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128933970 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 128934011 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128934061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128934122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128934389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128934621 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128934814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128934886 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 128934912 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 128935291 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 128935314 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 128935342 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128935346 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128935415 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 128936368 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128936465 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 128936623 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 128936639 T G N N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 128936658 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 128936688 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 128936752 G C N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 128936973 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 128936977 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 128937073 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 128938145 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 128938825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128938860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128941040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128943473 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128943640 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 128943660 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128947010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128949452 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 128949978 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 128950822 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 128952134 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 128953347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128954464 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128954465 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 128954880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128956315 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 128956762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128956872 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128957124 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128957234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128957302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128957466 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128958092 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 128958253 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128958365 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 128958367 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 128958391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128958404 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128958617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128958727 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128959059 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128959236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128959815 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128959987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128963584 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128963624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128963640 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128963669 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128963683 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128963686 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128963707 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128963708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128963775 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128963816 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128963867 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128964043 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128964086 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128964406 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128964476 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128964506 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 128964555 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128964761 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 128964765 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 128964880 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 128964998 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128966774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128967928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128969044 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128969430 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128969596 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 128970873 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 128971825 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128971848 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 128972095 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128972295 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 128972589 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128972802 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128973481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128973656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128974360 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 128974401 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128974484 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 128974583 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128974691 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128975080 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 128975328 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 128975348 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 128975405 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 128975416 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 128975431 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 128975432 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128975504 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 128975509 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 128975659 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128975797 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128975819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128975849 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128975912 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128975939 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128975992 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128976001 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128976018 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128976041 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128976109 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128976340 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 128976375 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 128976513 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128976543 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128976583 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 128976599 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128976804 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128976815 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128977128 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128977159 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128977175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128977194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128977206 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128977283 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128977438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128977595 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128977610 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 128977621 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 128977628 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128977640 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 128977653 T G Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 128977802 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 128977838 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 128977854 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 128978060 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 128978114 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128978343 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128978573 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 128979177 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128979181 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 128979201 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128979230 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 128979768 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128979831 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 128980336 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 128980363 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 128980675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128980700 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 128980774 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128980781 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128980817 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128980827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128980927 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 128981002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128981007 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128981050 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 128981110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128981178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128981383 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 128981631 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 128981773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128981801 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128981867 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128981914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128981981 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 128982128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128982140 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 128982179 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128982217 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128982311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128982328 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128982332 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128982434 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128982466 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128982502 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 128982694 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 128983066 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128983157 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 128983375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128983385 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 128983411 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128983629 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 128983643 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 128983652 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 128983752 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 128983771 A G Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 128983845 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 128983867 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 128983975 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128984065 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128984111 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128984134 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128984136 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128984181 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 128984214 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128984291 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 128984357 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 128984451 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 128984480 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 128984606 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128984770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128984900 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 128984904 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128985077 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 128985209 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 128985216 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128985291 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 128985441 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 128985465 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128985467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128985674 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 128985691 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128985742 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 128985766 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128985962 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 128986246 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128986303 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 128986325 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128986526 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 128986562 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 128986586 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 128986839 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 128986913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128986940 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128986945 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 128987102 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 128987109 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 128987293 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 128987303 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128987359 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 128987411 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 128987501 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128987527 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128987573 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 128987646 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 128987749 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 128987846 T G N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 128987931 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 128987975 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 128988059 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 128988079 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 128988244 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 128988265 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 128988563 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 128989358 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 128989465 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 128989689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128990213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128990248 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 128990285 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 128990468 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 128990501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128990702 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 128990718 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128990819 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 128990922 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 128990986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128991012 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 128991327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128991385 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 128991484 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 128991891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128992847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128993037 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 128993079 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 128994355 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 128994374 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 128994385 T G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 128994389 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128994399 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128994417 A C Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 128994423 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 128994430 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128994708 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 128995112 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 128995139 G T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 128995175 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 128995470 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 128995488 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 128995654 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 128995659 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128995890 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 128998080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128998182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128998310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128998323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128998620 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 128998636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128998907 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 128998908 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 128998968 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 128999054 A C N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 128999111 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 128999256 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 128999369 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 128999502 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 128999829 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 128999909 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128999933 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128999961 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 128999984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129000199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129000252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129000289 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 129002122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129002302 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129004369 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 129004709 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 129005057 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 129005860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129006087 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129006341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129008576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129008661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129008691 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 129009060 C G N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 2 129009109 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129009843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129010227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129010279 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129011972 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129012130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129013541 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129018470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129019477 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129019498 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 129019957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129020076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129020337 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129020390 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129020485 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129020652 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129020913 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 129021762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129022421 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129022432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129022436 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129022635 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 129023278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129023679 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129023728 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129023807 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129025448 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 129026423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129029214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129029926 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129034621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129035398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129038117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129038499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129038550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129040065 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129040876 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 129042223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129043816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129044547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129047854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129048044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129048697 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129049210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129050617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129053624 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 129054941 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129058941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129059048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129059340 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129059378 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129059405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129059976 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129060574 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129060948 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129061009 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129061567 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129061649 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 129062027 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 129062078 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129062205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129062212 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129062261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129062477 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129062815 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 129063162 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 129063247 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 129063379 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 129063996 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 129064014 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129064289 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 129064411 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129064437 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129065109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129065115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129065122 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129065180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129065297 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129065349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129065474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129065594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129065686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129065932 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129066558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129066559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129066634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129066731 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129067167 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 129067193 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 129067493 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 129067557 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129067619 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129067620 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 129067645 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 129067651 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 129067685 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129067938 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129068485 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129068492 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129068632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129068692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129068705 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129068813 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129068830 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 129070491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129070492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129070744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129070836 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129071185 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 129071214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129072300 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 129072367 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129072572 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129072705 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129073968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129073980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129074716 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129074720 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129075301 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129075721 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129076183 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129076241 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129078407 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129078496 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129078651 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129079728 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 129079801 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129079949 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 129079994 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 129080231 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129080263 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129080428 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129080464 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 129080488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129080489 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129080854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129081037 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129081109 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 129081137 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129081590 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129082150 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129082161 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129082189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129083224 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129083285 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129083364 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129083575 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129083578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129083707 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129083783 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129083857 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129083991 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129085402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129085453 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129085488 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129086338 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129086585 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 129086737 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129086816 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129086932 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129087104 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 129087111 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129087264 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 129087287 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129087308 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129087371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129087611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129087723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129087739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129087851 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129087984 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129087999 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129088142 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129088213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129088316 C A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 129088841 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129088854 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129088907 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129088951 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129088952 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 129088967 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 129089009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129089048 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129089192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129089261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129089355 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129089418 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129089421 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129089432 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129089480 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129089510 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129089645 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129089790 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129089825 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129089906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129089920 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129089927 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129089977 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129090109 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129091485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129091771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129091773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129091899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129091943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129091967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129092018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129092114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129092151 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129092311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129092902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129092948 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 129092956 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 129092995 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129093048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129093134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129093137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129093156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129093173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129093216 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129093230 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129093270 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129093443 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129093469 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129093589 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129093648 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129093693 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129093713 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129093778 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129093804 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129093809 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129094015 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129094131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129094438 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129094490 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129094509 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129094575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129094631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129094708 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129094801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129095227 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129095270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129095464 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129096052 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129096139 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129096280 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129096344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129096371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129096556 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129096610 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129097013 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129097027 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129097053 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129097075 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129097170 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129097408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129097536 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129097548 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129097943 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129098107 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129098114 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129098128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129098163 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129098171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129098180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129098195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129098219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129098225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129098687 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129098861 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129098942 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129099014 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129099048 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129099052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129099077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129099293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129099329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129099454 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129099558 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129099609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129100215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129100351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129100628 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 129100645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129100687 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 129100969 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129101417 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129101614 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129101615 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129101732 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 129101980 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129102006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129102236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129102324 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129102340 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129102368 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129102407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129102433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129102656 A C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 2 129102716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129102760 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 129103104 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129103113 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129103165 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 129103205 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129103335 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 129103512 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 129103516 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 129103818 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129104357 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129104397 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129104595 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129104607 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129104649 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129104698 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129104860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129104963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129105016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129105176 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 129105183 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 129105262 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129105333 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 129105560 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129105563 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129105907 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129106001 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129106489 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 129106624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129106772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129106783 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129107168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129107276 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129107787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129107973 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129107997 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129108424 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129108588 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129108596 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129108800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129108871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129108882 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129108883 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129109473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129109697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129109755 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129110420 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129110781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129110994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129111116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129111245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129111266 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129111491 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129111610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129112374 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 129112486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129112621 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129112741 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 129112834 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 129112865 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129113133 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129113272 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 129114294 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129114396 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129114632 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 129114866 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 129115092 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 129115094 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 129115108 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 129115475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129115676 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129115681 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129116027 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129117212 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129117226 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129117946 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 129120443 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129120482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129121174 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129121612 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129121626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129121660 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129121779 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129121842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129121865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129122008 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129122209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129122284 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129122454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129122711 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129122745 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 129123297 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129123457 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129123535 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129123892 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 129124351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129124393 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129124827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129124878 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129124949 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129124972 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129125356 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129125489 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129125602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129126743 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129127639 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129127998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129128053 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129128119 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129128291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129128302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129128636 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129128696 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129129024 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129129442 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129131026 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129131068 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129131074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129131134 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129131346 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129131366 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129131869 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129132715 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 129132741 C G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 129133077 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129133249 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129133291 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129133293 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129133661 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129134232 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129134273 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129134274 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129134585 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129134630 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129134781 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129135458 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 129136065 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129137431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129138157 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 129138169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129138275 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129138295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129138908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129139047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129139846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129141109 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129141171 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 129142446 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129143390 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129143632 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129143694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129143956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129144360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129144929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129145244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129145496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129146218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129146386 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129146535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129146751 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129148013 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129148018 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129151322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129151596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129152248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129152569 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129152641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129152776 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129153005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129153292 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129153559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129154246 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129154399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129154534 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129154587 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129154656 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129155372 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129155385 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129155422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129155495 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129155573 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129155599 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129155703 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129155755 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129156076 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129156166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129157083 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129158141 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129158577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129159003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129159488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129160041 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129160162 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129160256 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129160779 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129160966 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129160996 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129161000 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129161023 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129161024 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129161142 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129161461 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129161467 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129161511 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129161537 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129161600 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129161789 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129161857 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 129161897 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129161908 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129162013 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129162104 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129162224 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129162333 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129162337 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129162415 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129162428 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129162477 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129162871 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129162912 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129162975 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 129163484 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129163571 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129163593 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 129163619 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 129163633 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 129163734 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129163745 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129163948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129164399 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129164415 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129164465 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129164970 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 129165004 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 129165348 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129165356 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 129165534 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129165792 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129165833 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129166012 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129166027 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129166040 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129166190 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129166200 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129166404 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129166410 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129167616 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 129167693 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129167715 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129167837 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129168036 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129168122 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129168172 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129168570 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129168585 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129168738 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129169081 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129169090 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 129169254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129169276 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 129170073 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 129170360 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129170547 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129170915 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129171164 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129171310 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129172116 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129172288 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129172826 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 129172949 A C Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 129173136 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 129173154 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129173380 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 129173387 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 129173491 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129173809 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129174321 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129174744 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129175081 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129175147 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129175257 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129175271 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129177506 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 129178118 T C Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 129178265 T A Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 129179248 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 129180311 C G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 129180319 T G Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 129181054 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 129181079 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 129181091 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 129181204 T G Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 129181227 T G Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 129181248 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 129181396 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 129181436 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129181464 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129181709 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129181784 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 129182126 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 129182218 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129182813 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129182818 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129183589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129184136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129184222 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129184248 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129184335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129185804 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129185920 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129186566 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129186585 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129186678 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129186969 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129187030 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129187085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129187968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129188261 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 129188545 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 129188625 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 129188732 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129188837 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129188841 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129188849 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129188960 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129189091 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129189137 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129189341 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129189364 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129189453 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129189614 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129189736 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129189878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129189899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129190185 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129190383 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129190441 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129190708 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129190722 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129190933 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129191069 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129191358 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129191594 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129191625 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129191655 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129191972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129192042 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129192167 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129192568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129192595 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129192659 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129192891 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129193079 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129193418 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129193427 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129193444 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129193577 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129194518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129194698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129194839 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129194848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129195058 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129195156 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129195302 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129195675 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129195882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129196362 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129197078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129197371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129198753 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129199380 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129200068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129200212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129200387 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129200798 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129200989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129201382 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 129201645 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129201763 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129201835 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129201934 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129202162 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 129202207 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129202216 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129202221 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129202322 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129202326 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129202734 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129202743 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129202796 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129202842 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129202861 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129202936 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129203003 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129203228 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 129203494 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 129203518 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129203615 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129203638 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129203827 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129203954 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129203955 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129204069 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129204135 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129204156 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129204180 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129204221 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129204263 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129204337 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 129204446 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129204509 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129204544 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129204554 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129204596 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129204597 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129204630 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 129204645 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 129204711 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 129204728 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 129204803 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 129205139 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129205141 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129205191 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129205289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129205321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129205382 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129205418 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129205445 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129205449 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129205499 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129205527 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129205628 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129205666 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129205748 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 129205803 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129205865 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129205884 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129206227 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129206236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129206565 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129206688 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129207027 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129207200 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129207226 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129207741 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129208349 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129208403 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129208450 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129208455 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129208481 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129208493 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129208528 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129208535 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 129208746 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 129208829 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129209121 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 129209301 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129209307 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 129209363 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129209530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129209628 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129209654 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129209711 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129209807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129210382 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129210514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129210578 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129210670 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129210675 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129210729 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129211152 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129211200 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129211239 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129211319 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129211346 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129211449 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129211548 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129211610 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129211829 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129211879 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129211987 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129212026 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129212052 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129212113 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129212174 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129212190 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129212390 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129212412 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 129212452 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129212586 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129212851 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129212902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129212919 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129212928 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129212937 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129212991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129213000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129213077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129213119 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129213204 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129213205 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129213241 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129213329 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129214351 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129214387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129214572 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129214935 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129215403 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129216396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129216543 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129217510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129217603 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129217948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129218057 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129218165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129218947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129219132 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129219573 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129220982 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129221313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129221335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129221359 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129221664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129221698 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129222002 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129222058 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129223703 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129224490 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129225981 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129227114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129228170 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129228301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129229190 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129229681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129229819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129230887 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129231161 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129231617 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129231888 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129232030 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129232204 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129232442 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129232475 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129232548 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 129232563 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 129232696 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129233058 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129233079 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129233263 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129233335 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129233358 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129233423 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129233451 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129233488 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129233616 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129233656 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129233669 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129233690 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129233691 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129233704 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129233718 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129233748 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129233880 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129234058 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129234060 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129234100 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129234181 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129234196 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129234717 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129234765 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129234844 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 129235066 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 129235472 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129235579 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129235609 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129236558 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 129238272 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129238428 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129238545 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129238577 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129238579 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129238616 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129238703 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129238999 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129239014 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129239116 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129239162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129239164 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129239997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129242158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129242470 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129243078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129243185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129244258 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129244454 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129246805 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129247157 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129247317 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129247377 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129247411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129249405 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 129251257 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129251302 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129252860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129253123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129253406 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129254551 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 129256029 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129256726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129258072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129258392 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129258617 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129259480 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129260012 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129260014 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129260122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129260568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129260757 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129260831 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 129260996 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129261198 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 129261308 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129261466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129261648 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129261766 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129261784 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129262441 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129262583 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129263594 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129264599 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 129265312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129265982 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129266105 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129266297 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129266905 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129267710 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129268648 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 129268657 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 129268668 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129268834 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129268930 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129268965 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129268982 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129270376 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129270659 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129270929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129270969 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129270970 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129271045 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129271185 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129271212 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129271260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129271276 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129271471 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129271776 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 129272000 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129272009 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129272045 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 129272097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129272098 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129272168 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129272755 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129272968 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129280976 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 129280995 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 129281061 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 129281270 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129281476 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129281556 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129281647 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129281673 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129281686 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129281729 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129281754 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129281852 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 129281932 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 129282091 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129282187 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129282239 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129282391 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 129282434 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 129282716 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129282755 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 129282756 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129282798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129282893 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 129282895 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129283114 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129283241 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 129283293 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 129283296 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129283330 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129283418 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129283806 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129283900 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 129284025 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129284103 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 129284385 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129284523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129284545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129284590 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129284676 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129284844 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129284937 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129285176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129285178 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129285687 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 129285871 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129285899 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129285949 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129286120 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129286490 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129286514 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129286949 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 129287094 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129287250 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129287313 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129287332 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129288137 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129289140 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129289280 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129290028 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129290081 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 129290891 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 129290899 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129291769 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129291928 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129291958 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129292181 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129292186 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129292502 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129292555 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 129292683 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129292702 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129292754 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129292769 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129292811 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129293049 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129293138 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129293439 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129293467 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 129293470 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129293841 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129293942 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129294531 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129294593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129295056 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129295547 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129295636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129296247 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129296963 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129297108 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129297871 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129297881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129298274 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129298339 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129298634 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129298678 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129298808 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129299198 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129299375 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129300009 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129300020 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129300366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129300912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129301011 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129301596 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129303290 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129303658 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129303832 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129304215 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129304264 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129305120 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129305186 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129305197 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129305287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129305547 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129305895 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129306675 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129306725 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129307141 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129307526 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129307584 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129307586 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129307811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129308134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129308445 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129309081 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129309319 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129309369 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129309417 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129309721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129309898 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129310668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129310714 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129310776 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129311882 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129312214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129312434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129312763 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129313210 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129313384 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129314032 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129314875 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129315108 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129316211 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129316301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129316404 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129316419 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129316864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129317531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129317744 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129317758 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129317786 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129317811 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129318494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129319061 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129319370 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129319790 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129319984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129320374 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129320513 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129320685 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129321323 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129321371 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129322542 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129322754 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129322778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129322897 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129323156 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129323199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129323415 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129323449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129323558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129323684 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129323703 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 129323901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129323903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129324098 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129324398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129324464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129324471 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129324525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129324529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129324558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129324644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129324684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129324765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129324862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129324897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129324965 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129326342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129326374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129326421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129326463 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129326464 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129326489 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129326524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129326565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129326581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129326653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129326678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129326773 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 129326889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129326923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129326999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129327125 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129327272 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129327402 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 129327428 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129327918 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129327977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129328002 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129328440 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129328511 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129328861 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129329273 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129329647 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129329684 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129330327 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 129330587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129331106 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129331474 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129331500 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129331608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129332846 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 129337205 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 129337206 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 129337216 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 129337218 A G Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 129337325 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 129337337 C T Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 129337345 A T Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 129337625 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129338763 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129339263 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129340296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129341054 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129341407 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 129341598 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129341683 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129341732 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129341897 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129341898 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129342125 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129342250 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129342478 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129342561 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129342644 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129342806 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129342903 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129342929 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129343345 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129343501 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129343637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129343772 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129343805 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129343819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129343866 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129344148 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129344251 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129344568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129344723 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129344737 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129345007 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129345163 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129345591 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129345592 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129345604 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 129345776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129345805 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129345838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129345906 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129345922 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 129345999 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129346019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129346110 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129346252 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 2 129346367 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129346672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129346719 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129346750 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 129346764 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129346788 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129346817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129346960 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129346966 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129350915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129350973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129351031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129351035 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 129351044 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 129351114 A G Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 129351187 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129351221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129351292 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129351337 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 129351348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129351417 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 129351443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129351446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129351491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129351567 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 129351615 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129351754 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 129351763 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129351810 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129351823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129351897 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 129351910 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 129352035 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129352045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129352103 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129352174 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129352357 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129352381 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129352384 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129352462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129352664 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129352773 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129352931 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129352997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129353023 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 129353095 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129353101 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129353135 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129353266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129353446 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129353489 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129353671 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 129353963 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 129353972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129354003 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129354094 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129354963 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 129355156 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129355179 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 129355448 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129355902 T G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 129355978 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129357068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129357158 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129357286 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 129357349 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 129357837 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129357859 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 129358024 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129358159 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 129358226 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 129358241 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129358282 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129358333 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129358446 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 129358605 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129358801 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 129358852 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129359062 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129359119 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129359479 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129359573 A T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 129359616 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 129359860 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129359886 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 129359891 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 129360257 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 129360438 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129360873 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129361599 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129361810 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129361835 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129362031 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129362065 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129362145 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129362364 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129362472 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 129362599 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129362632 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 129363251 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 129363643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129364801 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129364945 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 129365012 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129365679 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 129365765 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 129366137 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129366386 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129366464 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129366530 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129366532 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 129366548 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129367184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129367192 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129367604 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129367848 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129367927 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 129367971 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129368150 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 129368570 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129368652 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129368901 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129368942 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 129368960 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129368985 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129369076 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 129369177 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129369283 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129369313 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 129369377 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129369540 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 129369632 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129369745 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129369757 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 129370081 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129370373 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129370382 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129370403 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129370563 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129370569 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129370576 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129370586 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129371178 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129371293 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129371541 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129371561 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129372160 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129372450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129372904 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129373004 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 129373052 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 129373083 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 129373188 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129373265 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129373277 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 129373283 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 129373475 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 129373514 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129373928 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 129374072 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129374359 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 129374494 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 129374868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129375015 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129375026 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129375104 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 129375157 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 129375800 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129375818 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129375899 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129375933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129376046 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 129376144 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 129376636 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129376657 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129377212 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129378014 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 129378088 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129378207 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 129378652 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 129378713 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 129378841 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129379011 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 129379159 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129379240 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129379330 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 129379470 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129379824 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 129379826 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 129380034 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129380565 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129380927 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129381613 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 129381618 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129381786 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 129381841 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129381913 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129382185 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129382434 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129382483 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129382967 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129383028 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129383049 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 129383097 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129383954 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 129383984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129384001 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 129384431 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 129384498 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129384705 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 129384732 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129385048 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129385233 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129385278 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129385307 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129385555 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129385667 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129385689 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 129385807 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129386114 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129386156 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129386258 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129386313 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129387164 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129387976 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 129388187 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 129388296 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 129388931 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129389302 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 129389472 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 129389687 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 129389719 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 129390636 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 129390810 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129391185 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129391301 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129391405 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129391418 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 129391421 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 129391588 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129391625 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129391653 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129391656 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 129391687 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 129391713 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129391803 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 129391957 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129392007 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129392277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129392719 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129392901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129393102 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129393251 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 129393347 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 129393434 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129393964 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129394137 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129394153 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 129394329 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129394441 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129394446 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129394453 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129394530 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129394560 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 129394562 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 129394852 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 129394853 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129394891 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129395017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129395744 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 129396365 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129396549 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 129396810 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 129396848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129396850 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129396991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129397020 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129397036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129397115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129397424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129397457 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 129397661 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129397715 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129397785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129397794 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129397806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129397883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129397915 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129397966 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129398022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129398366 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129398551 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 129398954 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 129399137 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 129399304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129399322 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129399398 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 129399519 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 129399581 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129399949 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 129400454 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 129400504 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129400707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129400739 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 129401761 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129401992 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 129402074 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 129402422 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129402434 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129402621 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129402844 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 129402912 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129402993 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129403360 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 129403460 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 129403499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129403566 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129403695 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129403771 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 129403772 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129403877 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129403947 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129404013 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129404218 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 129404253 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129404271 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129404282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129404373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129404406 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 129404430 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129404512 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129404914 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 129405450 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 129405912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129405983 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 129405993 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129406103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129406153 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 129406338 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 129406351 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 129406531 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 129406702 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 129406805 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129406995 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 129407007 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 129407035 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 129407068 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129407205 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129407318 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129407329 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 129407391 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129407396 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 129407461 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 129407520 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 129407558 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 129407849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129407970 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 129407974 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 129408018 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129408031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129408044 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129408111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129408329 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 129408476 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129408751 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 129408857 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129409027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129409040 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129409055 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 129409103 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129409200 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129409201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129409319 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 129409576 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 129409598 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 129409648 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129409689 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129409854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129409988 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129410018 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129410034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129410143 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129410160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129410228 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129410230 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129410276 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129410371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129410510 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 129410522 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129410575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129412111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129412371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129412409 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 129412522 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129412563 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129412660 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129412862 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 129412885 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 129412913 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 129413577 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129413600 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 129413608 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 129413631 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129414548 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129414906 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 129415669 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 129415741 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 129416098 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129416129 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129416576 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 129416692 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129417097 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129417402 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129417763 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 129417772 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 129417789 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 129417802 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 129418198 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129418431 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 129418515 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129419192 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 129419366 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 129419493 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 129419602 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 129419754 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 129419876 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129419999 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129420346 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 129420697 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129420749 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 129421006 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 129421176 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129421203 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 129421421 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 129421554 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 129421755 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 129421826 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 129421850 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129422404 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 129422506 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 129422512 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129422901 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129422917 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129422936 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129422973 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 129423094 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 129423166 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129423309 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129423320 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 129423361 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129423453 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 129423485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129423490 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 129423517 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129423602 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129423929 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129424177 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 129424973 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 129424974 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 129424996 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 129425102 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129425175 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129425205 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129425220 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129425467 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129425485 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 129426349 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129426362 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129426401 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129426414 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129426509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129426524 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129426584 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129426589 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129426625 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 129426634 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129427099 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 129427234 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 129427351 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129427365 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129427561 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 129427576 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129427616 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129427715 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129427885 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 129427989 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129428760 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129428815 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129428880 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 129428957 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129429041 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129429087 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 129429874 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129430351 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 129430389 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129430408 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 129430441 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129430476 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 129430511 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 129430738 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129430860 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129430888 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129430889 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 129430942 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129430969 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 129430970 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 129430982 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 129430988 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129431035 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129431036 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129431190 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129431307 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129431356 G T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 129431419 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 129431532 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129431542 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 129431547 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129431638 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129431649 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 129431788 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129432102 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 129432167 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 129432192 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 129432266 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 129432279 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 129432718 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129432809 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129433450 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129433580 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 129433665 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 129433675 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 129433998 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129434038 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129434058 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 129434159 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 129434266 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 129434327 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 129434378 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 129434382 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 129434525 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 129434530 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 129434628 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129434843 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 129434884 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 129434921 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129434955 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 129434961 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129435170 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129435317 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129435355 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 129435463 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129435495 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 129435554 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129435652 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129435667 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129435875 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129435993 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 129436068 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 129436080 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 129436163 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129436174 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129436190 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 129436202 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129436285 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129436415 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129436562 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129436619 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129436620 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 129436694 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129436785 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 129436802 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129436817 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129436831 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 129436933 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129436948 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 129436954 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 129436967 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129436973 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 129436992 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 129437061 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129437122 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129437146 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 129437155 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 129437226 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129437238 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 129437280 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 129439372 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 129439411 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 129439430 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 129439460 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 129439470 C G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 129439486 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 129439789 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129439913 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129440045 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129440056 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 129440209 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 129440322 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 129440325 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 129440348 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 129440540 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 129440564 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 129440572 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 129440600 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 129440641 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 129440676 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129440715 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129440905 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 129440906 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 129441011 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 129441026 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 129441324 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129442473 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 129442563 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129442568 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129443042 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129443082 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 129443233 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129443334 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 129443398 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129443403 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129443701 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129444459 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 129444536 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129444709 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129444737 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129444779 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129445115 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 129445165 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129445266 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129445376 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129445468 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 129445487 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 129445647 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129446294 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129446312 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 129446329 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129446370 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129446377 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129446452 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129446478 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129446586 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 129446607 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 129446650 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 129446763 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 129446853 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 129446891 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129446893 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129447300 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129447477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129447562 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 129447680 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129448099 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 129448166 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 129448932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129449957 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129450524 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129451192 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 129451345 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129452039 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129452653 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 129452730 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129452733 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129452745 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 129452750 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 129452785 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129452805 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129452820 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129453509 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 129453604 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 129453829 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129453931 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129454505 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129455211 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 129455354 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129455366 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129457556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129458092 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129458722 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129458838 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129459330 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129459562 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 129459569 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129459981 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 129460666 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 129460667 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129460885 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 129462444 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 129462605 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129462638 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129462669 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 129462732 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 129462814 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 129463755 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129463853 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129464294 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129464295 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129464437 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129464452 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129464474 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129464480 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129464718 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129464890 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 129464947 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 129465042 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 129465207 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 129465858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129465953 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129467657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129468354 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129470310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129470411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129470849 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 129470979 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129471178 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129471360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129472179 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129472258 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129472283 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 129472780 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129474157 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129474574 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 129474590 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129474651 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129475837 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129476102 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 129476207 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129476357 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129477416 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 129477806 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 129478118 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 129478247 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129478263 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129479017 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 129479182 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 129480041 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 129480466 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 129480530 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129480718 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 129480799 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 129481271 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 129481360 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129481418 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129481450 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129481485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129481712 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129481830 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 129481861 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 129482015 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129482130 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 129482144 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 129482167 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 129482224 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129482293 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129482386 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129482418 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 129482619 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 129482785 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 129482805 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 129482844 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 129482937 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129482962 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 129482999 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 129483013 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129483025 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 129483251 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129483353 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 129483498 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 129484243 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 129484329 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 129484695 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129484956 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129484962 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129485318 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129485816 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129485869 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129486113 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129486374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129486458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129486526 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129486539 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129486544 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 129486559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129486568 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129487117 G T Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 129487166 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 129487242 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 129487318 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 129487326 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 129487438 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129487469 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 129487486 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 129487586 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129487607 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129487741 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129487793 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129487932 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129488036 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 129488173 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 129488182 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 129488276 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 129488326 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 129488422 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 129488582 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129488641 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129488651 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 129488741 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 129488762 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 2 129488778 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 129488938 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 129489050 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 129489096 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 129489133 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 129489160 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 129489291 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129489345 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 129489356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129489415 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 129489421 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129489427 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129489438 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129489690 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 129489845 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129489889 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 129489899 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 129489936 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129490065 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 129490143 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 129490322 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129490398 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129490471 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 129490492 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 129490515 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 129490591 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 129490656 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 129490767 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 129490782 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 129491141 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 129491170 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 129491189 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 129491257 C G Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 129491427 A G Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 129491444 G C Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 129491482 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 129491564 A T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 129491576 A T Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 129491605 A T Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 129491665 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 129491705 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 129491714 T C Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 129491751 A C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 129491762 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 129491945 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 129491988 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 129492057 T A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 129492127 C A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 129492411 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129492574 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 129492575 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 129492982 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 129493140 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 129493155 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 129493171 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 129494227 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 129494252 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 129494384 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 129495022 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 129495232 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129495300 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 129495368 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129495726 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 129496167 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 129496200 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 129496317 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129496351 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129496748 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129496868 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129496870 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129497798 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 129498142 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129498283 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129498301 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 129498416 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129498426 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129498528 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 129498529 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 129498555 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129498588 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 129498599 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 129498687 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 129498756 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129498935 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 129499027 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129499049 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 129499124 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129499197 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129499312 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 129499355 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129499417 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129499483 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129499484 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129499521 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 129499529 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129499565 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129499752 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 129500710 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 129500922 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 129501013 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 129501103 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129501396 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 129501658 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 129501673 G C Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 129502019 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129502037 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129502130 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129502298 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129502352 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 129502409 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 129502466 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129502493 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 129503202 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129503471 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129503567 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 129503681 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129503705 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129503901 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129503945 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 129504330 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129504484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129504629 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129504717 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129504881 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129504891 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129504952 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129505026 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129505244 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129505267 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129506095 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129506206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129506308 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129506392 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129506850 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 129507074 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 129507080 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 129507287 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129507326 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 129507415 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129507618 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129507837 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129507841 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129508073 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129508097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129508154 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129508223 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129508362 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129508496 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129508517 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 129508847 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 129508977 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129508982 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129509056 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129509278 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 129509291 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129509541 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 129509545 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129509581 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 129509598 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 129509969 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129510029 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129510143 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 129510188 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129510259 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129510304 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129510328 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129510332 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129510393 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129510427 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129510441 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 129510454 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 129510531 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 129510573 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129510581 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 129510607 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129510704 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 129510715 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129510759 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 129510885 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 129510891 T G N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 129510954 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 2 129510992 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 129510993 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 129511013 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 129511071 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 129511087 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 129511201 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129511265 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129511317 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129511649 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129511685 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129512159 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129512598 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 129513085 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 129513139 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129513169 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129513454 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 129513538 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129513595 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 129513608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129513612 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129513619 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129513653 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 129513683 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129513845 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129513940 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129514662 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 129514760 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 129515200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129516701 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 129516772 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 129516799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129517819 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129517889 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 129517983 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129518271 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 129518439 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129518473 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129518603 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129519723 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129519778 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129520119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129520466 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 129520520 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 129521664 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129521781 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129521783 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129521801 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129522142 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129522154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129522262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129522519 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 129522523 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 129522533 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 129522543 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 129522589 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129522682 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129522802 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129523385 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 129523773 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129524253 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129524683 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129524719 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129524878 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129524951 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129524961 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129525023 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 129525153 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129525179 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 129525288 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129525300 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129525393 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 129525517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129525599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129526097 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129526199 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129526367 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129526552 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129526553 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 129527632 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 129527665 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129527755 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129527906 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129528055 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129528106 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129528206 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129528353 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 129528357 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 129528372 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 129528415 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 129528473 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129528483 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 129528491 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 129528510 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129528537 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129528709 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 129528716 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 129528753 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129529157 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129529212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129529249 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129529569 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129529630 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129529667 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129529720 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129530018 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129530028 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 129530219 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 129530273 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129530293 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129530344 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129530345 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129530404 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129530593 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129530735 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129531263 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 129531452 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 129531717 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 129531720 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 129532020 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129532159 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129532228 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129532334 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 129532638 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129532872 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129533160 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 129533303 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 129533309 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 129533725 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 129533745 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 129534221 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 129534281 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 129534339 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129534854 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 129535190 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 129535909 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129536021 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 129536087 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 129536273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129536484 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 129537016 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 129537321 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129537327 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129537348 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 129537507 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 129537660 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129537670 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129537796 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 129537939 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129539326 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 129539343 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 129539472 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 129539473 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 129539697 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129540076 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129540180 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129540669 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129540936 A C N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 129540938 A T N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 2 129541260 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 129541737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129541851 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129541855 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129542005 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 129542115 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 129542272 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129542526 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 129542626 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 129542774 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 129542808 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129542894 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129542912 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129542973 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 129543037 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 129543119 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 129543138 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 129543145 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129543237 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129543299 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129543300 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129543634 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129543665 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 129543735 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129543736 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 129544374 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129544487 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 129544529 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129544849 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129544892 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 129544894 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 129545047 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129546146 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129546812 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129546835 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 129546976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129547215 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129548497 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129549141 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 129549188 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 129550678 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 129551723 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 129552602 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 129552810 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 129552883 C G Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 129553149 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 129553150 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 129554057 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 129554666 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 129554772 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129554821 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129554848 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129554873 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 129555216 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 129555271 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 129555382 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 129555503 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 129555513 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 129555536 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 129555599 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 129555879 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 129555970 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 129555972 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 129556483 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 129556498 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 129556695 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 129556855 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 129556938 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 129556995 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 129557287 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 129557448 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129557578 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129557913 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129557971 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129558034 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 129558083 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129558117 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129558344 G C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 129558622 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129558820 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129558974 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129559089 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129559115 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129559208 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129559404 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129559433 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129559621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129559841 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129560121 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 129560215 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 129560239 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129560288 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129560332 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 129560505 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 129560526 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129560532 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129560620 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 129560754 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129560755 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129560772 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129560861 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 129560916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129561236 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 129561749 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129562133 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129562383 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 129562430 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 129562629 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 129562767 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 129562940 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 129562988 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 129563027 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129563192 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129563197 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129563274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129563495 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129563572 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129563633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129563709 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 129563888 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 129563910 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 129563929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129563998 T A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 129564001 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 129564011 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 129564097 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 129564121 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 129564181 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 129564409 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 129564542 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 129564570 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 129564604 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129564675 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129564773 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 129564851 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 129564903 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 129564914 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 129565096 C T Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 129565105 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 129565121 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 129565192 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 129565201 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 129565264 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129565276 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 129565372 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 129565490 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 129565513 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 129565565 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 129565603 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129565661 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 129565716 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129565802 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 129565937 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129566027 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 129566088 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 129566106 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 129566147 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129566162 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 129566574 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129567185 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129567307 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 129567355 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 129567485 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129568214 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129568553 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129568621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129568671 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129568998 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129569749 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129569759 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 129569802 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129570017 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129570534 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 129570809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129571238 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129572591 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 129572635 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 129572749 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 129572871 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 129573041 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129573054 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 129573164 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129573296 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129573298 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129573406 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129573507 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129573583 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129573597 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129573621 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129573683 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129573903 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129573954 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 129573963 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 129573975 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 129574025 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 129576079 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 129576386 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129576466 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129576541 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129576637 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 129576804 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129576886 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129576913 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129576944 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 129577030 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129577231 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 129577233 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 129577274 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 129577297 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 129577314 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 129577366 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 129577384 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 129577593 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129577630 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129577660 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129577846 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129577886 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129577898 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129578749 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129578880 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 129579052 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129579401 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 129579652 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129579750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129579853 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129580031 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129580359 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129580386 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129580457 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129580920 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 129581013 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129581067 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 129581085 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 129581101 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129581402 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129581476 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 129582153 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 129582190 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 129582243 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 129582480 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129582549 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 129582612 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129583045 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129583240 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129583350 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129583599 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129583778 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 129584032 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129584118 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 129584422 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129584519 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129584821 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 129585047 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 129585066 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129585135 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129585145 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129585274 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 129585460 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129585501 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 129585671 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 129585717 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 129586609 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 129586730 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129586784 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129587005 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129587040 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 129587203 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 129587253 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 129587269 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 129587284 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 129587314 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129587330 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129587432 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129587518 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129587536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129587618 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129587699 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129587816 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129588004 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129588072 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 129588145 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129588296 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129588352 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 129588435 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129588475 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129588553 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129588589 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129588807 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129588817 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129588836 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129588844 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129588963 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 129590292 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 129590311 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 129590735 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129590821 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 129591206 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129591254 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129591256 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129591316 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 129591671 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129591757 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129591856 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 129591918 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 129592063 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129592091 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 129592366 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 129592390 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 129592466 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 129592594 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 129592742 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129592820 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129592833 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 129592860 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129592976 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129593044 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129593094 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129593131 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 129593365 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129593462 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129593688 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129593702 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 129593713 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129593779 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129594083 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129594269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129594420 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129594446 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129595615 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129596366 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129597518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129598017 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 129601258 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129607165 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 129607953 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129608838 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 129611496 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129612240 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 129613804 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129614288 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129614363 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129614573 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129615295 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129616030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129616399 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 129616700 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129616938 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129617208 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129618292 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129618443 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 129619641 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 129620606 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 129620875 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129621141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129621396 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 129621433 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 129621512 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129621591 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 129621793 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129621823 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129621849 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 129621887 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 129621896 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 129621914 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 129621965 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 129622209 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129622324 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 129622372 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 129622420 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 129622509 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 129622540 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129622581 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 129622707 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129622724 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 129622934 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 129622982 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129623021 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 129623028 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 129623228 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 129623579 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 129623582 C T N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 129623611 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 129623704 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 129624405 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129625261 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 129625567 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129625725 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129626073 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129626228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129628637 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 129629116 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129630891 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129631417 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129631647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129632341 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129633180 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129633204 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129633280 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 129633341 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 129633471 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129633656 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129633680 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129634092 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129634093 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129634114 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129634140 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129634914 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 129635213 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 129635696 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129637118 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129637342 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 129637551 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 129637836 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 129638074 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129638243 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129638279 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129638398 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129638409 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129638489 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129638549 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129638551 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129638760 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129638784 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129638837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129638877 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129638895 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129639051 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129639208 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129639386 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129639446 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129639608 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129639643 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129639667 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129639688 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129639773 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129639797 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129640130 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129640267 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129640275 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129640284 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129640382 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129640594 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129640604 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129641347 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129641355 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129641759 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129641862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129641966 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129642141 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129642627 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129642745 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129642786 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 129642990 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 129643859 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 129643894 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 129644000 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 129644557 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129645217 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 129645261 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129646112 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 129646498 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129646571 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129646582 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129646856 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 129646946 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 129646950 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129647203 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129647797 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 129648532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129648699 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129649138 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129649261 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129650571 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 129650605 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 2 129650617 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 129650618 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 129650643 T C Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 129650648 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 129651309 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129651374 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129651381 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129652706 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 129653127 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129653130 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 129653475 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129654917 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129655385 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129655573 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129655592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129655757 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 129656037 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129656042 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129656152 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 129658344 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129658542 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129658548 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129658559 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129658845 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 129658937 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129659304 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 129659339 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129659378 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129659396 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129659414 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129659692 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129659725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129659835 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 129660645 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129660954 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129661537 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129661574 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 129662118 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129662158 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129662175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129662211 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129663452 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129663609 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129664327 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129664346 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129664880 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129664881 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129665128 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129665331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129666769 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129666930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129666953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129667330 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129667467 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 129667548 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 129667868 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129668015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129668148 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129668266 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129668328 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129668460 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 129668494 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 129668514 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 129668525 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129668667 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 129668701 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 129668736 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129668882 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 129669063 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129669158 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 129669334 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 129669377 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 129669557 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129670281 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129670350 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129670377 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129670675 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129671115 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129671139 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129671224 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 129671367 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129671496 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 129671732 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129671892 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129671977 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129672066 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129672176 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129672207 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129672284 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129672356 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129672432 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129672498 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129672566 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129673909 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129674384 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 129674942 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129674992 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129676672 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129677064 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129677206 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 129677861 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 129678457 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 129678561 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 2 129678593 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129678619 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129680519 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129683089 T A Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 2 129683695 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 129683742 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129683929 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129684052 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 129684110 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129684402 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 129684877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129684904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129685015 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 129685132 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 129685823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129685931 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 129686265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129686676 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129686700 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129687430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129687840 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129687841 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129687862 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 129688035 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129689693 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 129689892 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129689993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129691432 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129691652 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129691665 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 129692035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129692243 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129692387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129692425 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129692513 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 129693113 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129693125 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129693277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129693381 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129693537 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129693631 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129693634 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129693868 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129693963 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 129694183 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129694192 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129694263 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129694341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129694395 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129694420 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129694430 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129695407 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129695423 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129695450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129695502 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129695563 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 129695579 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 129695950 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 129695971 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129696638 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129696656 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129696675 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129696752 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 129696976 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129697001 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 129697052 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 129697450 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 129697563 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 129697579 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129697601 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129697606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129697997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129698045 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 129698400 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 129698598 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 129698635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129698689 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 129698859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129698939 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 129699029 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129699040 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129699390 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129699412 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129699485 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129699893 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129699908 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129700065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129700155 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 129700660 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129700782 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 129700825 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129700943 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129701588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129701624 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129701664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129701681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129701802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129701930 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129701960 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 129701968 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 129702018 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 129702019 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 129702031 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 129702038 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 129702505 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129702557 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129702564 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129702599 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129702627 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 129702646 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 129702695 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129702700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129703432 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129703764 A C N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 129703798 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 129703848 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 129703917 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129703966 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129704040 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 129704299 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 129704362 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 129704393 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129704431 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129704464 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129704504 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129704557 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 129704581 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129704734 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 129704781 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 129704821 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129704822 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129704845 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 129704915 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129705730 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 129705885 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129706363 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129706395 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 129706418 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 129706420 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129706440 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 129706451 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 129706454 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 129706491 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129706653 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129707159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129708685 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129708925 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129709213 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 129709329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129709883 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129709967 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 129709968 G T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 129710813 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129710862 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 129710920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129711044 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 129711295 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 129711495 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 129711497 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129711516 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 129711592 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129711595 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129711651 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129712319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129712403 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 129712518 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129712881 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 129712917 G C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 129713248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129713321 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129713453 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 129713806 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 129713954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129714006 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129714021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129714045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129714052 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129714105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129714380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129714503 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129714652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129714683 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129714718 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129715064 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 129715306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129715343 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129715441 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129715485 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 129715569 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129715628 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129715657 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 129715698 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129715718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129715779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129715858 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129715891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129716041 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129716308 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129716353 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129716481 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129716668 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129716721 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129716841 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129716903 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129716934 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129717057 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129717160 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129717172 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129717295 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129717305 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129717308 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129717517 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129717695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129717700 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129717793 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129717999 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 129718133 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129718234 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 129718307 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 129718326 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129718398 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 129718505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129718616 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 129718779 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 129718794 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 129718927 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129719697 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 129720315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129720512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129721162 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129721241 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 129721347 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 129721583 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129721613 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129721645 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129721746 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129722766 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 129722835 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 129723137 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 129723340 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129723344 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 129723440 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129723485 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 129723503 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129723547 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 129723793 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129723805 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129723997 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 129724342 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129724413 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129724569 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129724729 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 129725080 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129725178 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 129725705 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129726036 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 129726076 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129726169 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 129726462 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129726463 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 129726503 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129726613 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129726630 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 129726654 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129726701 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129726858 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129726943 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 129726960 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129727040 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129727086 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129727128 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129727139 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129727156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129727184 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129727267 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129727304 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 129727668 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 129727730 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 129727743 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129727767 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129727788 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129727842 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129727905 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129727973 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 129727989 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129728001 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129728013 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129728150 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129728455 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129728882 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 129729111 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129729287 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129729364 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129729381 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129729488 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 129729990 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 129730126 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 129730134 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129730151 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129730209 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 129730502 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 129730666 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129730677 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 129730704 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129730740 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 129730922 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 129730942 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 129730948 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 129730965 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 129731075 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129731076 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129731188 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 129731201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129731258 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 129731279 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129731287 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129731461 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129731523 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 129731857 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129732110 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129732537 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129732623 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129732669 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129732865 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 129732907 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129733318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129733344 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129733352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129733476 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129733936 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129733943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129734522 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129734552 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129734630 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129734678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129734741 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129734744 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129734799 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129734873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129735328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129735405 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 129736372 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 129736913 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129737000 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 129737449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129737460 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129738086 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129738138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129738194 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129738207 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129738209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129738322 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129738440 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129738732 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129738736 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129738809 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 129739004 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 129739130 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 129739325 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 129739430 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129739556 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129739610 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 129739639 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 129739752 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 129739779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129739783 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129739859 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 129739999 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129740027 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129740118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129740205 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129740216 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129740543 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 129740609 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 129740771 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129740861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129741084 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129741665 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 129741757 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 129741773 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 129741968 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129741971 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129742045 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129742178 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129742237 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129742277 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 129742421 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129742441 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 129742462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129742779 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 129742869 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129742877 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 129742971 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 129743230 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 129743416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129743443 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129743474 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 129743491 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 129743502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129743509 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 129743523 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129743666 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129743686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129743758 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129744119 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 129744405 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 129744531 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129744544 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129744567 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129744600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129744622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129744655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129744841 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 129744892 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 129744947 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129744960 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129745096 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129745102 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129745112 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129745141 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 129745151 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 129745221 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129745306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129745333 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 129745355 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129745364 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 129745426 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129745436 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129745465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129745563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129745717 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 129745799 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129745872 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129745928 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129745987 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129746026 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129746095 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129746109 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 129746244 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129746262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129746395 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129746408 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129746510 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 129747152 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129747259 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 129747306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129747429 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 129747468 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129747694 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 129747772 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 129748308 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129748334 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129748465 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129748475 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129748560 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129748633 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129748677 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129748755 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129748847 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129748994 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129749375 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129749398 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129749442 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129749599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129749631 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129749858 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129749898 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 129750088 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 129750228 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 129750258 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129750466 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 129750634 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 129750673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129750760 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 129750905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129751084 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129751110 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129751377 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129752230 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129752269 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129752825 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129752837 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129753263 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129754269 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129755348 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 129755605 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 129755641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129755657 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129755808 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 129756579 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129756638 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129756667 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129756770 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 129757041 A C N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 129757513 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129757662 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 129757709 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 129757825 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 129757965 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 129757988 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129758175 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 129758176 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 129758432 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129758445 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 129758538 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129758595 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 129758681 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129758749 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129758874 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 129758968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129759289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129759457 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 129759689 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129759795 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 129759817 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129759840 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129759864 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129759963 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 129760004 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129760199 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129760214 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 129760265 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 129760409 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129760604 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129760726 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129760784 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 129760892 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 129760903 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129761000 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129761087 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129761114 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129761158 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129761159 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129761264 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 129761406 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129761430 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129761455 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129761708 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129761794 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129761842 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 129761845 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 129761901 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129761906 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129761949 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129761999 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129762085 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129762348 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129762365 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129762582 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 129763167 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129763221 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129763383 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 129763727 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 129763940 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129764164 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129764170 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 129764444 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 129764483 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 129764953 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 129765006 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 129765253 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 129765428 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 129765664 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129765939 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 129765977 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129765995 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 129766089 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129767015 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 129767404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129767487 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 129767755 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129767842 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 129768004 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 129768145 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 129768314 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129768589 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129768971 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129769035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129769122 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129769169 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129769370 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129769437 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 129769574 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129769590 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129770058 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129770078 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129770238 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129770362 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 129770430 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129770486 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 129770524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129770543 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129770625 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129770673 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129770762 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 129770990 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129771002 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 129771142 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 129771143 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129771168 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 129771204 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 129771272 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 129771361 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 129771376 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129771458 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 129771522 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 129771753 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129771942 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129772065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129772339 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129772625 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 129772631 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 129772681 G A Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.333333333333333 15 9 7 1 4 2 129772809 C G Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 2 129773043 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 129773125 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 129773156 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 129773218 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 2 129773247 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 129773274 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 2 129773312 G A Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 2 129773834 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.357142857142857 0.0714285714285714 0.571428571428571 11 17 5 1 8 2 129773860 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.384615384615385 0.153846153846154 0.461538461538462 12 14 5 2 6 2 129773880 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.357142857142857 0.0714285714285714 0.571428571428571 11 17 5 1 8 2 129773881 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 2 129773947 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 129774084 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 2 129774115 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 129774145 T C Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 129774203 C T N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 2 129774205 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.272727272727273 0.0909090909090909 0.636363636363636 7 15 3 1 7 2 129774244 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.272727272727273 0.0909090909090909 0.636363636363636 7 15 3 1 7 2 129774360 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.307692307692308 0.0769230769230769 0.615384615384615 9 17 4 1 8 2 129774509 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 2 129774583 A G Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 2 129774615 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 129775083 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 129776545 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 129776585 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 129776841 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 129777288 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 129777585 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 129778046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129778615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129779309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129780297 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129780449 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129780606 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129781269 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129781730 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129781735 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129781909 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129782324 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 129782600 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129782908 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 129783127 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129783308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129783372 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129784445 A C Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 129785003 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129785420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129786844 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129786944 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 129787256 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129787692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129787804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129787810 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 129787843 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 129788011 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129788105 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 129788173 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129788231 C A Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 129788277 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129788367 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 129788774 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 129788805 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 129788825 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 129789048 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129789094 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129789355 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 129789470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129790154 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129790351 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 129790536 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 129790730 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 129790779 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 129790821 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 129790920 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 129790922 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 129790971 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 129791152 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129791186 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129791341 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129791406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129791510 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129791875 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129792349 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129792437 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 129793378 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 129795964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129796872 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129797058 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 129797801 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 129798319 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129798517 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129798642 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129799316 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129800027 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129801168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129802397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129803405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129804195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129804234 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 129804382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129804469 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129804536 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129804655 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 129804663 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 129804691 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 129804718 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129804804 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129804810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129804912 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 129805232 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129805276 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129805280 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 129805288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129805385 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129805432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129805469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129805520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129805710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129805722 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129805878 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 129805927 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129806278 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129806429 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129806498 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 129806893 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129806915 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 129806954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129807234 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 129807278 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 129807380 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 129807403 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129807927 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129808293 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 129808779 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 129808889 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 129809110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129809153 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 129809173 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 129809268 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129809535 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129809777 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 129810264 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129810290 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129810425 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 129810456 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 129810482 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 129810783 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 129810815 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 129810909 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 129810913 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 129810943 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 129810944 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 129811110 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 129811339 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 129811450 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 129811835 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 129811839 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129811868 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 129812197 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129812436 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 129812754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129812761 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 129812820 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129812933 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129812993 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 129813119 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 129813147 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 129813231 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 129813259 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129813440 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 129813491 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129813617 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 129813736 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129813875 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 129813896 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 129814037 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129814056 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 129814132 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 129814508 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 129814727 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 129814929 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129815096 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129815110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129815213 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129815297 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 129815337 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129815362 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129815370 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129815432 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 129815577 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 129815607 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 129815722 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 129815923 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 129815943 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129815999 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129816054 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 129816343 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129816391 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 129816430 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 129816507 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 129816642 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 129816816 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 129817132 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 129817258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129817282 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 129817283 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 129817356 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129817448 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129817554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129817561 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129817595 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129817677 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129817722 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129817804 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129817854 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 129817870 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129818211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129818853 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129819846 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 129819958 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129820155 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129820606 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129821049 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129821929 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129822367 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 129822492 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 129822899 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129823090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129823727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129824540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129824584 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129826805 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129827222 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129827414 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129827510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129829200 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129829277 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129830096 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129830283 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129830927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129830982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129831583 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 129832329 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129832543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129832699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129832811 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 129833036 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129833055 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 129833131 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 129833149 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 129833154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129833352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129833367 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 129833745 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 129833769 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 129833823 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 129833838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129833943 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129833959 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129834122 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129834135 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 129834188 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129834197 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 129834287 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 129834363 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 129834669 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 129834747 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 129834841 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129834911 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 129835541 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 129835544 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129835561 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 129835886 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 129836323 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129836529 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 129836808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129837227 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129837539 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129837636 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129838134 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 129838287 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129838985 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129839144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129839270 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129839294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129839329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129839597 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 129839625 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 129839675 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129839720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129839722 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 129839991 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129839999 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129840092 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129840164 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129841623 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129841656 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 129841900 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 129841974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129842034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129842593 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129842663 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129842798 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129842936 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129842953 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129842963 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 129842973 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 129843306 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 129843861 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129843975 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 129844060 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129844084 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129844110 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129844113 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129844218 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 129844237 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 129844248 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129844249 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129844360 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 129844392 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129844413 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 129844455 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 129844466 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 129844667 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129844833 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 129845837 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 129845864 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 129845892 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 129846048 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 129846127 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 129846150 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 129846153 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 129846278 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 129846349 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129846378 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129846408 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129846418 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129846592 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 129846632 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129846660 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129846702 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129846809 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129846838 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129846879 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129847023 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 129847168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129847211 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 129847248 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 129847256 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 129847282 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 129847352 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129847358 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 129847495 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 129847881 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 129847899 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 129847925 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 129848062 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 129848122 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129848141 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129848301 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129848515 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 129848655 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 129849778 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129849881 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129850527 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129851279 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 129851349 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129851366 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 129851367 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129851398 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 129851528 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 129851636 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 129851817 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129852058 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129852177 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129852270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129852323 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129852329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129852673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129852725 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129852831 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129853390 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 129853399 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 129853516 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 129853555 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 129853593 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 129854289 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 129854453 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 129854554 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 129854656 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 129854995 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 129855122 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 129855995 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 129856324 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 129856386 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129856409 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 129856490 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 129856520 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 129856525 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129856898 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 129856899 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 129857272 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129857299 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129857367 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129857569 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129857945 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129858021 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129858034 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129858048 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 129858131 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129858232 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 129858499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129858668 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 129858713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129858802 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129858990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129859049 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129859125 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129859146 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 129859168 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 129859439 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 129859694 G C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 129859923 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129859924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129860031 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 129860070 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129860206 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 129860274 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129860315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129860348 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129860471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129860494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129860757 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 129860810 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129860966 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 129861001 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 129862163 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 129862729 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 129862942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129865344 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 129865352 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129865767 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 129866431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129866968 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129867376 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 129868105 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 129868183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129868238 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129868379 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129868395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129868408 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 129868444 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129868503 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 129868547 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129868703 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 129868989 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 129869107 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 129869197 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 129869305 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129870381 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 129870458 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 129870635 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 129870653 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129870858 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 129871429 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 129871899 A G N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 2 129872056 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 129872460 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 129873074 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 129873666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129874445 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 129875586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129875632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129876636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129876648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129879428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129880025 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 129880047 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 129880297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129880390 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 129880549 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 129880804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129880828 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129880839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129881712 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 129881947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129882144 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 129882462 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 129882612 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129882661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129882780 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129882824 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129882920 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 129883041 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 129883197 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129883377 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 129883388 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129883408 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129883434 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129883459 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129883761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129883799 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129883967 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 129884106 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 129884253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129884278 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 129884358 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129884412 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129884422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129885022 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 129885083 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 129885343 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129885399 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129885468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129886129 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129886370 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129886658 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 129893521 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129894098 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129894105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129894613 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 129894646 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 129895051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129895142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129895147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129895207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129895219 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129895266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129895295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129895575 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129895756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129895875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129896120 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129896350 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129896368 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129896603 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129896904 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129897341 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 129897445 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 129897541 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 129897739 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129899567 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 129899761 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129899967 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 129899994 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 129899999 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 129900091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129900232 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129900339 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129900384 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 129900402 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129900445 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129900547 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129901049 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129901164 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129901202 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129903354 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129904101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129904226 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 129904568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129904722 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129904738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129904916 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129905576 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129905631 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 129905774 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129906228 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129906539 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129906597 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129906688 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 129906719 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129906779 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 129906846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129907375 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 129907547 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129907882 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129908830 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129909162 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129909432 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 129909803 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 129909990 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 129910076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129910161 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 129910188 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129910203 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 129910333 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 129911025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129911258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129911372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129911532 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 129911985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129913086 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 129913331 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129913390 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129913391 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129913649 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129913767 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 129913803 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129913829 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 129913883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129913926 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129914350 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129914401 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 129914612 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 129914679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129914880 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129915171 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 129915221 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129915529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129915775 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 129915993 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 129916059 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 129916095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129916121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129916247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129916252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129916395 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129916460 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129916517 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 129916638 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129916641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129916783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129916908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129916947 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 129917033 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 129917492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129917731 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129917980 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129918742 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129918815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129918960 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 129919098 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129919610 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129920385 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129920406 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 129920987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129922414 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129922494 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129922510 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129923374 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 129923610 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129923737 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 129924477 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129924599 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 129924677 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129925085 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 129925126 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 129925534 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129925948 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129926077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129926326 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129926664 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129926778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129927681 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 129927713 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 129927919 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 129927944 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 129928031 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 129928051 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129928136 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129928180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129928284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129928337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129928415 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 129928450 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 129928492 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 129928502 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 129928747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129929678 C A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 2 129929713 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 129930016 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129930111 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 129931482 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129931766 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129932551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129932775 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 129933137 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 129933856 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 129933857 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 129934065 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129934148 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129934183 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 129936221 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 129936446 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129936613 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 129937054 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129937218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129937329 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 129937476 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 129937527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129937592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129937825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129937927 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129938031 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 129938099 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129938118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129938245 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 129938247 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129938343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129938344 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 129938389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129938391 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 129938580 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 129938704 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 129938734 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 129939020 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 129939068 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129939126 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 129939206 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 129939209 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 129939320 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 129939357 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 129939488 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129939843 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 129939932 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129940097 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129940115 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129940246 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129940284 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 129940394 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 129940475 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 129940545 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129940586 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129940657 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129940671 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 129940699 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 129940766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129940909 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129941023 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129941114 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129941551 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129941677 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 129941868 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 129941960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129942038 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 129942070 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129942105 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129942309 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129942488 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 129942495 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 129942603 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129942629 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 129943046 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 129943345 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129943427 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129943451 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 129943520 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129943548 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129943802 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129943956 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129943983 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129943992 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 129944124 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 129944378 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129944486 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 129944491 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129944586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129944604 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 129944683 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129944723 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 129944914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129944941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129945051 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129945223 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129945297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129945942 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129946283 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 129946352 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129946602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129946618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129946628 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129946650 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 129946817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129946896 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 129947169 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 129947733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129948064 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 129948145 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 129948266 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129948404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129948423 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129949053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129949519 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 129949914 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129949981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129950231 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 129950250 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129950322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129950373 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129950379 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 129950453 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 129950481 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 129950482 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 129950495 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 129950499 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 129950523 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 129950551 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 129950564 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 129950899 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129951022 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 129951111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129951224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129951297 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129951394 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129951465 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129951470 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 129951559 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129951585 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129951648 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129951674 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 129951699 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 129951721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129952345 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 129952347 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 129952384 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 129952761 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 129952848 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 129952886 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 129952910 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 129953395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129953790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129953813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129954282 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129954709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129954953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129957063 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 129958097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129958428 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 129958455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129958460 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129963556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129965654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 129965740 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 129966003 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 129966849 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 129967236 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 129967323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129967359 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 129968033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129968291 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 129969524 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129969738 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129969849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129970551 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 129970975 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 129971480 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 129971573 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 129971583 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 129971669 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 129971729 G T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 2 129971974 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 129974131 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 129974509 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129974848 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 129975390 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129975433 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 129975475 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 129975476 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 129976004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129976814 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 129976872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129977011 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 129977793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129977819 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 129978061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129978164 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 129978206 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 129978320 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 129978369 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 129978458 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 129979267 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 129979377 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 129979753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129980288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129981945 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 129982095 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 129982160 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 129982170 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 129982191 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 129982565 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 129982604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129982794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129983451 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129983750 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129984035 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 129985051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129985210 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 129985358 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 129985476 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 129985868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129985950 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 129986310 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129986343 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 129986345 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129986357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129986369 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 129986382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129986541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129986646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129986685 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129986779 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129986798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129987057 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 129987219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129987279 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 129987304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129987356 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 129987780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129987800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129987809 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 129987865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129988047 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 129988114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129988160 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129988223 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 129988240 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 129988273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129988375 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 129988560 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 129988610 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 129988624 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 129988662 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 129988674 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 129988687 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 129988745 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 129988866 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 129988893 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 129989196 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 129989429 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129989448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129989469 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129989526 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 129989551 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 129989568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129989602 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129989653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129989668 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129989718 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129989729 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129989743 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129989754 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129989799 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 129989811 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129989883 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129989918 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 129989996 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129990108 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 129990119 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 129990146 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129990256 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 129990374 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 129990409 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 129990421 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 129990553 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 129990963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129993061 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 129993335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129993770 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 129994316 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 129994851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129994885 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129995151 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 129995236 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 129995793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 129995798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129995956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129996809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129997092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129997122 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 129997805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129998229 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 129998287 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 129999028 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129999664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 129999906 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 129999995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130000050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130000475 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130000903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130001462 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130001652 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130002026 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130003926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130004035 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 130004543 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130004926 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 130005151 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130005188 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 130005617 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130005771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130006714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130006754 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 130007289 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 130007299 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 130007314 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 130007317 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 130007774 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 130008471 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 130009196 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 130009213 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 130009280 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130009344 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 130009533 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 130009697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130009793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130009862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130009887 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 130009940 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130010248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130010266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130010656 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 130011186 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130011328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130011354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130011366 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 130011532 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 130011533 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130011767 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130011840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012336 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 130012436 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012721 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 130012773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012795 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130012862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130012993 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 130012997 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 130013164 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130013170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130013230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130013232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130013276 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130013398 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 130013493 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 130013663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130013676 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130013741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130013783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130013798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130013809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130013969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130014225 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130014269 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 130014302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130014400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130014478 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130014820 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130015197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130015402 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130018976 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 130019226 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 130021240 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130024923 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130025914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130027596 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 130028896 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 130030614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130031462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130032887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130036539 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 130036702 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 130036756 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 130036870 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 130036984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130037102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130037161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130037194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130037839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130038091 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 130038156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130038349 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 130038367 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 130038371 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 130038598 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 130038607 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 130038636 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 130038639 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 130038674 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 130038703 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 130038885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130039125 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 130039277 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 130039339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130039403 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 130039563 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 130040525 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 130040657 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130040684 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130040747 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 130040762 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 130040794 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 130040866 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130040914 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130040923 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130041019 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 130041053 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130041078 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 130041093 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130041102 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 130041298 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 130041320 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130041339 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130041389 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130041390 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130041400 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130041411 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130041422 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 130041509 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130041524 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 130041599 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 130041702 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 130042016 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130042043 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130042644 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 130042702 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 130042721 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130042736 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 130042906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130043050 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 130043883 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130043997 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130044079 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 130044157 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 130044420 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 130044564 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130044566 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130044630 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130044703 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 130044710 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 130045108 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 130045213 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130045320 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 130045405 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130045562 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130045596 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130045717 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 130046250 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130046335 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130047214 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 130047357 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 130047609 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130047833 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130047849 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 130047993 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 130048299 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 130048479 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 130049384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130049642 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130049659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130049721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130049981 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130050138 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 130050148 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 130050415 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 130050586 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 130050633 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 130050754 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 130050877 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 130050988 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 130051156 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130051346 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130051452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130051695 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 130051707 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 130051733 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130051831 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 130051834 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130051919 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130051952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130051964 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130052023 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130052035 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 130052222 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 130052258 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 130052314 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130052317 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 130052336 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 130052346 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 130052401 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 130052473 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 130052513 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130052521 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 130052584 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130052608 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 130053160 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130053223 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130053284 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130053328 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 130053590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130053639 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130053648 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 130053669 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 130053673 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 130053695 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 130053715 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 130053745 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 130053886 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130053907 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130053909 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130053938 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 130053966 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 130053998 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 130054015 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 130054017 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 130054096 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 130054175 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 130054183 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 130054196 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 130054214 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 130054275 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 130054323 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 130054353 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 130054356 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 130054380 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 130054413 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 130054430 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 130054468 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 130054501 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 130054513 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 130054538 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 130054547 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 130054568 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130054581 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130054688 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 130054717 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 130054719 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 130054806 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130054856 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 130054907 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 130055074 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130055081 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 130055118 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130055154 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130055290 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 130055330 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 130055497 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 130055499 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130055681 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130055749 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 130055820 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 130055869 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130055871 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 130055908 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 130056244 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130056253 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130056487 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 130057042 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130057184 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 130057367 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130057468 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 130057490 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 130057961 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 130058311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130058424 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130058472 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 130058557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130058558 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 130058606 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 130058626 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 130058866 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 130058973 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 130058995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130059242 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130059252 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130059257 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130059282 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130059288 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130059303 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 130059425 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130059442 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 130059477 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130059591 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130059631 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130060075 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130060312 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130060314 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130060325 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130060411 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 130060462 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130060544 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130060613 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130060819 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130060830 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130060847 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130060901 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130060990 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130061189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130061359 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130061386 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130061401 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130061472 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130061532 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130061557 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130061715 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130061751 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130061832 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130062044 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130062122 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 130062184 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 130062240 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130062409 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130062463 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 130062535 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130062541 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130062587 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130062696 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130062793 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130062831 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130062844 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 130062862 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 130062874 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 130063063 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130063090 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130063102 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 130063217 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130063352 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130063356 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130063460 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130063537 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130063596 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130064110 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130064113 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130064218 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130064234 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130064254 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130064372 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130064431 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130064502 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130064523 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130064628 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130064683 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 130064861 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 130064940 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 130064985 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 130064990 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 130065209 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 130065240 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 130065499 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 130065507 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 130065513 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 130065521 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 130065555 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 130065564 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 130065599 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 130065615 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 130065659 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130066521 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130066525 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130066690 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 130066868 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 130067030 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 130067070 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 130067083 C G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 130067087 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 130067199 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 130067238 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130067342 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 130067433 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 130067614 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 130067688 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130067752 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130067766 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130067899 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 130067900 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 130068040 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 130068163 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130068262 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130068322 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 130068380 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 130068430 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 130068456 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130068642 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130068909 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130068934 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130068936 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130068970 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130069225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130069346 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 130069451 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130069550 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130069606 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 130069931 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130070044 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130070047 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130070293 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130070474 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130070541 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130070633 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130070639 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130070672 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130070702 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130070715 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130070779 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130070795 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130070911 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130070920 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130070957 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130071033 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130071189 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130071235 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130071287 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130071297 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130071335 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130071358 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130071427 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 130071441 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130071590 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 130071648 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130071649 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 130071665 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130071680 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130071938 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130071957 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130071986 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130072014 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130072018 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130072029 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130072059 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130072206 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130072250 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130072253 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130072264 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 130072477 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 130072482 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 130072651 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 130072763 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 130072983 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 130073212 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130073273 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130073320 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130073726 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130073835 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130074208 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 130074643 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 130074696 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 130074838 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 130074854 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130075236 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 130075318 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 130075711 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130075752 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130075948 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 130075949 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 130077260 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130081320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130082060 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130082356 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130082817 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130082818 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 130082867 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130083047 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130083394 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130084130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130088610 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130090327 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130092786 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130093168 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130093688 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130099028 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130103102 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130106928 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130109386 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130110420 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 130110565 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 130110811 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130110830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130110967 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 130111035 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130111076 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130111115 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 130111161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130111420 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130111484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130111730 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130111962 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 130111984 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 130112051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130112150 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 130112233 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130112252 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 130112267 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 130112287 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 130112291 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130112303 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130112393 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130113347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130113721 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130119085 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130122437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130122955 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130124033 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130126750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130126871 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130127996 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 130128229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130128683 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130128923 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130129772 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130130126 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130130130 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130130317 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130130411 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130131303 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130131325 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130131334 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 130131556 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130131727 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130131740 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130131827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130132760 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130132888 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 130133041 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130133050 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130133454 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130133467 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130133478 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130133502 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130133648 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 130133681 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130133759 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130133765 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130133802 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130133873 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130133994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130134793 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130135639 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130135663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130135966 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 130137484 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130137954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130138198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130139832 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130140875 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 130140971 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 130141080 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130141166 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130141249 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130141342 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 130141363 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130141364 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130141544 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 130141574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130141754 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 130141778 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 130141803 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 130141982 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 130142287 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 130142336 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130142579 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130142703 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130142739 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130143057 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130143066 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130143128 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130143164 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130143184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130143510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130143704 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 130143801 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130143814 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130143843 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 130143923 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 130143936 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130144098 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130144155 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130144211 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130144364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130144416 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130144586 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130144731 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 130144739 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130144867 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 130144894 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 130144896 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 130144919 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 130144977 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 130145012 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 130145045 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 130145252 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 130145356 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 130145560 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 130145605 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130145711 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 130145732 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130145817 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130145890 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130145901 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130145941 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130146059 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130148355 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 130148376 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 130148423 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130148763 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 130148764 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130148916 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130148960 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130149006 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130149035 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 130149457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130149544 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 130150300 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 130150321 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130150797 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130150818 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 130150840 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130151362 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 130151750 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 130151956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130152008 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130152044 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 130152158 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130152182 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130152183 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130152236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130152345 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130152578 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 130152824 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130153042 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130153062 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130153100 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130153153 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130153195 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130153316 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130153366 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130153875 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130154118 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130154153 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 130154168 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130154280 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130154339 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130154352 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 130154447 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 130155416 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130156015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130158361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130158590 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 130158741 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 130158758 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 130158775 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130159121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130161330 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 130162416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130164169 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 2 130165248 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 130165249 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 130166377 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 130166461 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 2 130168087 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130168806 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 130168848 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130168853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130169238 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 130169241 A C N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 2 130169500 A G N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 2 130169555 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 130169607 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 130169646 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 2 130169647 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 2 130169698 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 130169702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130169752 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 2 130170116 G T N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 130170451 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 130170574 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 130170601 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 130170790 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 130170793 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130170849 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.625 0.0625 0.3125 21 11 10 1 5 2 130171229 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 130171248 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 130171288 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 130171309 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 130171316 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 130171362 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 130171702 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 130171738 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 130172294 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130173435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130174037 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130174127 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 130177284 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 130178434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130178968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130179986 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130180081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130181591 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130184926 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130185319 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130185887 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130187709 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130192061 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130192126 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130196132 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130196469 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 130196978 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130197129 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 130200921 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 130201042 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 130202274 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 130202484 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 130202516 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 130202529 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 130202596 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130202683 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130202837 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130203259 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 130203736 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130207048 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130207277 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130207615 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130209683 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130210227 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130211367 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130211591 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130211957 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130212169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130213281 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130213375 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130213563 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130214018 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 130215823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130216198 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130216674 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130218506 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130218728 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 130219851 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130220517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130220518 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130221372 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 130221748 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 130222115 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130222468 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130223582 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130223776 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130224066 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130224074 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130224417 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130224595 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 130224644 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 130224751 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 130224789 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130224791 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130224809 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130224996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130225612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130226767 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130227008 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130229555 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 130230162 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 130230466 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130230471 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130230497 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130230539 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130230961 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130231226 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130231276 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 130231287 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 130231643 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130236291 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130239497 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130239607 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130239818 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130239819 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130239907 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130239927 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 130240159 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130240169 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130240331 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130240345 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130240486 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130240554 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130240820 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130240843 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130240972 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 130241009 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 130241191 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130241636 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 130241641 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 130241865 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 130242325 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130242532 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130242701 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130242812 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130243128 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130243154 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 130244603 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130245718 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 130245832 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 130245871 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 130245915 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130245950 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130246243 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130246295 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 130246452 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 130246499 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130247036 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 130247071 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130247268 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 130247351 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 130248999 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130250182 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 130250444 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130251454 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 130251525 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 130251531 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 130251625 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130251728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130252041 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130252147 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130253021 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 130253745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130253924 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130254415 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 130254721 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 130254749 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 130254953 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 130255008 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 130255631 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130255697 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130257525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130259074 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130259709 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130259974 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130260645 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 130261082 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 130261576 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 130266869 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130268776 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130269414 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130269604 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130270085 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 130271060 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 130271073 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130271098 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 130271706 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130271864 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130273490 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130274971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130275207 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130276810 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 130277428 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130277569 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130277590 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130277694 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130278888 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130279070 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 130279107 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 130279147 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130279493 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130279679 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130279710 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130279927 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 130280360 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 130280366 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130280513 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130280608 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130280643 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 130280915 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 130280955 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 130281016 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130281077 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130281290 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130281328 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 130281740 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 130281781 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130281876 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 130282225 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 130283201 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 130283375 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 130283791 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130283904 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130283929 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 130284551 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 130284922 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130284934 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130285331 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130285460 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 130285477 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130285598 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 130285627 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130285836 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130285853 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130286150 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130286227 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 130286327 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 130286382 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130286443 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130286735 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130286736 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130286886 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 130286959 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130287321 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130287767 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130287843 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130287900 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130288095 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130288856 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 130288915 G T Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 130288944 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 130289011 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 130289105 T A Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 130289161 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 130289288 C T Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 130289398 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130289452 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130289990 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 130290040 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 130290136 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 130290158 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 130290322 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 130290383 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130290595 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130290665 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130290867 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130291390 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 130291464 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 130291486 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 130291759 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130291934 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130291959 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130291982 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130292274 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 130292325 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 130292437 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 130292481 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130292543 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 130292724 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130292782 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 130292834 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 130292943 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130295536 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130295589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130296471 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130296546 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 130296592 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130296846 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130297160 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130297493 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 130297613 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 130297658 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 130298246 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 130298411 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 130298567 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 130298575 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 130298579 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 130298620 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 130299161 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130299242 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 130299268 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 130299359 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 130299627 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130299637 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130299644 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130299848 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130299925 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130299935 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130300159 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130300160 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130300230 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130301012 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 130301165 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130301187 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 130301577 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130301820 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130301938 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130302141 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130302183 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130302616 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130302828 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130302839 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130303214 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130303621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130303863 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130304063 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130304932 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 130307753 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130308078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130308358 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 130308428 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130308594 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130308668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130308694 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130309082 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130309182 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130310218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130310951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130310995 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 130311069 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130311123 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130311433 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 130311826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130312142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130312454 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130314783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130315549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130315568 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130317420 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130317498 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130319592 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130321139 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 130321267 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130321524 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 130322492 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130325420 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130326469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130326529 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130327541 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130328164 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130328765 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130329655 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130330188 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130331038 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130332137 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130332288 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 130333815 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 130336960 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 130338399 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 130338491 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 130338719 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130338824 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130339037 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130339986 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 130340782 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 130340982 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130341425 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130341507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130341727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130341948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130342115 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130346151 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130346379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130346391 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130346422 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130346823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130346865 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130346918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130347155 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130347161 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130347393 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130348073 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130348156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130348834 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130348835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130350093 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130351165 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130351210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130352274 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130352342 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130352491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130354128 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130354145 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130354251 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130355030 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130355101 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130356698 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130357675 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130357676 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130358038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130358960 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 130359373 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130359569 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130361485 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130361885 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130362215 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 130362621 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130363126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130364510 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 130364515 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 130365043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130365738 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130365800 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130365804 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130366715 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 130366834 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130367692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130368211 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130368717 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130368802 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130368925 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130368950 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130369156 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 130369166 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130369174 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130369264 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130369352 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 130369360 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130369653 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130369715 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130369722 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130369730 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130369778 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 130369994 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130370465 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 130370491 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130370829 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130370908 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 130371095 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 130371251 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 130371320 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 130371362 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 130371410 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130371559 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130371589 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130371623 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130371817 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130371881 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 130371988 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130372027 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 130372132 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130372165 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 130372245 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 130372254 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130372288 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130372376 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 130372661 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 130372959 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130372968 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130373042 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130373057 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130373066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130373191 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130373422 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130373445 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130373462 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130373966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130374239 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130374270 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 130374325 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130374398 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130374752 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 130374780 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 130374827 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130374829 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130374897 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130375708 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130375939 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 130376186 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 130376263 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 130376365 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130376418 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 130376696 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 130376990 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130376993 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130378166 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130378216 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130378276 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 130378435 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130378436 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130378448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130378515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130378581 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130379479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130379764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130379831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130379832 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130380220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130380254 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130380303 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130380493 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130380548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130380727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130380738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130381347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130381591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130381672 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130381800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130381888 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130382229 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 130382539 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 130382588 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 130382604 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130382692 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130382710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130382758 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130382790 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130382935 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 130383031 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130383223 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 130383227 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130383263 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130383323 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130383426 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130383463 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 130383504 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130383638 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130383653 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130383654 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130383693 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130383822 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 130383849 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 130383918 G A N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 2 130383922 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 130383934 T C N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 130383979 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 130384030 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 130384116 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130384170 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130384186 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130384316 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130384328 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 130384334 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130384364 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130384400 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130384810 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 130385003 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130385004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130385100 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 130385182 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 130385211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130385509 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130385640 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130385695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130385766 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130386255 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130386411 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 130386497 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 130386560 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130386578 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130386661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130386679 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130386785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130386793 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 130386855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130386958 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130387047 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130387148 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 130387395 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130387454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130387635 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130387645 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130387707 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130388070 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130388282 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130388369 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 130388467 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 130388655 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130388726 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 130389318 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130390189 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130390379 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130390392 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130390462 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130390485 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130390508 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130390645 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130390953 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130391083 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130391143 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391172 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391190 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391209 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391369 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391382 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391426 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130391439 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391464 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391505 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391515 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391519 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130391569 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391632 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391635 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391671 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130391680 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391754 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391818 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391862 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391891 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391905 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391929 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130391959 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130391971 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130391980 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130392007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130392128 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130392963 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130392982 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130392987 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130392994 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130393387 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130393407 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130393451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130393557 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130393740 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130393759 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130393763 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130393786 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130393806 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130394010 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130394173 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 130394203 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 130394240 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 130394263 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 130394501 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130394523 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130394581 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130394694 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130394756 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130394973 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130395100 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130395288 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130395472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130395512 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130395513 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130395525 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130395578 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130395680 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130395726 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130395741 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130395804 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396006 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396036 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396046 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396061 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396101 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396234 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396253 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396254 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396283 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396365 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396429 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396566 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396893 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130396998 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130397018 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130397025 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130397162 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130397243 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130397287 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130397392 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130397460 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130397518 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130397541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130397593 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130397614 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130397727 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130398410 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130398416 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130398865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130398962 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130399036 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130399157 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130399658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130399725 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130399776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130400624 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130401285 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130401448 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 130401602 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130402626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130402678 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130402976 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 130403067 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130403456 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130403564 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130403650 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130404309 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 130404363 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 130404398 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130404434 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130404435 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130405333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130405489 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130405596 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130405644 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130405656 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130405673 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130405751 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130405839 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130405968 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130406003 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130406051 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130406158 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130406171 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130406202 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130406222 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130406563 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 130406596 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130406730 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 130407558 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130408017 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130408018 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130408049 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130409029 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130410830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130410855 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130415773 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130415975 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130418027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130418143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130420119 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130420899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130422629 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130422708 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130423603 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130423626 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130423916 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 130424145 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130424582 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130425118 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130426278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130427663 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130428814 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130429716 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130430575 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130430772 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130431148 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 130431212 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 130431886 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130433353 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 130434763 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130434787 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130435651 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130436007 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130436456 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130436489 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130436648 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130437061 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130437819 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130437827 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130438365 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130439506 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130439865 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130439972 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130440240 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130443769 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130444286 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130444963 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130445410 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 130445842 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130445853 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130445870 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130445890 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130445970 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130445977 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130446018 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130446616 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130446950 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 130448221 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130448308 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130448845 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130448940 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 130448941 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 2 130452397 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130454186 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 130455595 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130456074 T G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 130456906 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130457233 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130457656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130458021 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130458735 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130459418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130461259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130462902 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130463930 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130465424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130466011 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130466281 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130467396 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 130467985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130468058 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130470431 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 130471372 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 130471679 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 130472488 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130474507 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 130475119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130475551 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130476311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130478630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130479418 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130480843 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130480913 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130488531 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 130488822 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130488888 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 130489965 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130494397 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130494425 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130494518 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 130496576 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130498474 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 130498878 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130499529 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 130501808 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130501867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130502714 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 130502885 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 130503929 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130505920 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 130506208 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130509146 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 130509148 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 130509182 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130509453 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 130509518 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130509549 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130509565 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 130509587 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 130509592 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 130509774 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 130509796 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130509838 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130512222 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130512228 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130512295 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 130512376 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 130512423 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 130512731 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130512873 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130514349 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 130515124 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 130515263 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 130515345 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 130515960 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 130516331 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130516801 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 130517885 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130518946 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 130519630 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 130519907 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130520674 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 130520763 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130520787 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 130520803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130521504 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130523233 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130523284 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130523677 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130523701 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130524069 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130524113 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130524244 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130524675 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130525076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130525572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130527439 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130530060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130530120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130530289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130534029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130537260 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130539081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130541629 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130541942 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130543093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130544328 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130547277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130550350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130551499 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130551736 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130559332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130559658 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 130560020 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 130560697 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 130560758 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130560871 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130560891 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130560909 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130561170 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130563339 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130563503 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130563525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130563713 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130563737 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 130563742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130563813 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130564038 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130566849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130566855 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 130567008 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130567012 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 130567317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130567853 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130568047 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130568050 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130568133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130568309 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130568680 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130568844 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130568863 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130568908 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 130569118 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130569195 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 130569275 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130569286 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130569307 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130569373 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 130569428 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130569509 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 130569530 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 130570206 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 130570327 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 130570624 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130570963 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 130571183 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130571203 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 130571275 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130571646 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130571647 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130571672 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 130571713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130572729 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 130573625 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130573656 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 130573882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130574755 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130577053 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 130577535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130577594 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130577947 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 130578162 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 130578915 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 130580803 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130580858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130581336 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130582458 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 130582631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130583004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130583199 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130586708 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130587932 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130588331 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 130588723 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 130588927 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130589376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130589694 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130590146 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130590453 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 130590633 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130590921 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 130591350 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 130591384 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 130592101 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130592382 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 130592401 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 130592500 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130592527 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130592682 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130592878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130593292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130593315 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 130593784 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 130593930 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 130594093 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 130594121 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130594469 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 130595090 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 130595095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130595238 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 130595759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130596107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130596183 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130596442 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 130596463 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 130596922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130596934 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130597013 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130597102 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 130597267 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130598090 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 130598250 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130598740 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130599416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130599806 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130600560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130600654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130600682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130601393 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130602220 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 130603251 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130604084 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130604765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130605093 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130605281 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130607471 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130607804 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 130608044 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130609288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130610079 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130610991 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130612131 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 130612171 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130613712 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130613755 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130614255 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130614769 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130615545 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130615635 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 130615871 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 130615939 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 130616081 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 130616454 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 130616473 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130616596 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130616881 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 130617557 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 130617787 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 130618042 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 130618333 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 130618475 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130618597 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130618665 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 130618699 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 130618904 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 130618961 T C N Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 130618994 C G N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 130619092 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 130619168 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 130619321 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 130619331 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 130619887 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 130619888 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 130619898 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 130619935 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130620328 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 130620417 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 130620500 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 130620702 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 130620927 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130621389 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 130621491 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 130621624 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 130621743 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130622130 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130622371 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 130622407 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130622430 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 130622438 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 130622445 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 130622513 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130622906 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130623072 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130623868 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 130624022 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 130624145 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 130624325 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 130624441 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 130624554 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 130624569 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 130624759 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 130624797 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130624885 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130624896 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 130624924 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 130624970 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 130625514 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130625680 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 130625749 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 130625786 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130625901 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 130625912 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 130625976 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 130626423 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 130626582 T A N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 2 130626647 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 130626658 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 130627246 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 130627457 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 130627786 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 130627903 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 130627943 A T Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 2 130627988 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 130628035 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130628303 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 130628603 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130628618 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 130628662 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130628853 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130628874 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 130628897 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 130629062 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 130629135 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 130629192 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130629200 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 130629262 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 130629270 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 130629330 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130629335 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130629352 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130629370 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130629430 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130629437 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130629521 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130629584 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130629588 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130629602 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 130629611 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 130629623 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130629652 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 130629727 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 130629807 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 130629813 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 130629882 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130630074 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 130630364 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 130630365 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 130630408 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130630451 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130630523 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130630531 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130630574 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 130630619 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130630672 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 130630705 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130630718 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130630730 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130631013 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130631022 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130631048 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130631293 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130631338 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130631537 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 130631970 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130632046 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130632749 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 130633574 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130633772 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130633793 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130633933 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130634008 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130634200 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130634991 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130635330 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130636181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130636214 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130636238 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130636270 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130636393 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130636437 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 130636722 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130636747 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130637142 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 130637319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130637497 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130638793 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130640099 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130640166 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130640167 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130640524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130640906 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130641206 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 130641357 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130642162 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130642893 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130643081 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 130643956 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130644081 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130644384 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130644559 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 130644810 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130645307 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130645546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130645631 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 130645686 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 130645753 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 130645835 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 130646023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130646060 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 130646400 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130646491 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 130646721 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 130647013 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130647088 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130647250 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130647259 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130647312 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130647342 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 130647410 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 130647500 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 130647622 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 130647637 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 130647734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130648073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130648807 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130649737 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130649865 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130650227 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130650567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130650694 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130651074 C A Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 130651130 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 130651401 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130651790 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 130651864 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 130651997 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130652113 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130652388 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130652450 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 130652636 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130652641 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130652742 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 130652817 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130652967 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 130653043 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 130653083 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 130653120 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 130653451 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130653705 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 130653746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130653843 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 130653976 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 130654062 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 130654191 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130654308 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 130654437 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 130655533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130655763 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130656098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130656148 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 130656219 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130656523 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130656992 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 130656993 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 130657326 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130657941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130658030 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 130658393 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130658860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130659116 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 130659580 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130659659 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130659794 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 130659816 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 130660030 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 130660046 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 130660312 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130660763 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 130660809 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130660868 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 130661004 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 130661005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130661279 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 130661377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130661816 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130661944 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 130662037 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 130662887 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 130663148 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 130663155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130663187 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 130663337 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 130663461 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 130663508 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 130663529 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 130663538 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 130663563 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 130663890 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 130664101 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130664169 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 130664247 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 130664297 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 130664364 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 130664366 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 130664379 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 130664775 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 130664965 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 130664975 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130664981 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 130665131 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130666367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130670019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130671469 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130673149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130674314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130674483 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130675578 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130675835 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130677558 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130678556 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 130678683 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130679022 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 130679331 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130679437 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 130679642 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 130679740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130680120 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130680688 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 130680723 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 130681577 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 2 130682620 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130682621 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130682631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130683071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130683157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130683239 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130683320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130683487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130683508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130683578 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130683795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130683871 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 130683981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130684017 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130684139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130684160 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130684613 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130685013 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 130685025 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130685052 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 130685054 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 130685135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130685210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130685267 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130685344 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 130685362 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 130685802 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130685845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130685900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130686064 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130686076 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130686433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130686738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130688007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130688086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130688264 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 130688303 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 130688474 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 130688484 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130688859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130688873 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 130689080 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 130689336 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 130689396 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 130689441 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 130689536 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 130689782 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 130690349 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130690424 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130690721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130690969 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 130690988 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 130691168 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 130692220 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 130692959 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 130693809 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130694136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130694300 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130694640 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 130695211 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 130697791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130697963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130698002 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130698124 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 130698243 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130698591 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 130698679 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130698976 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 130699033 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 130699113 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 130699195 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 130699249 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 130699278 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 130699307 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 130699337 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 130699372 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 130699391 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 130699414 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130699531 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 130699551 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 130699562 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 130699612 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 130699755 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 130699773 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 130699838 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 130699909 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130699933 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130699966 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130701512 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 130701649 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 130701680 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 130701727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130701733 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130701821 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 130701830 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 130701937 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 130702016 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130702030 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 130702177 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 130702549 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130702803 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130703234 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130703641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130703823 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130704126 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 130704178 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 130704236 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 130704303 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 130704314 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 130704340 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 130704395 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 130704439 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 130704451 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 130704467 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 130704492 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 130704514 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 130704557 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 130704561 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 130704569 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 130704635 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130704650 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130704660 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130704709 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130704913 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130705042 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 130705047 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130705155 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130705159 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 130705181 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 130705182 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 130705194 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 130705279 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 130705604 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130705613 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 130705645 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130705690 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130705697 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130705726 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130705850 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 130706110 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 130706284 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 130706344 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 130706373 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 130706416 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 130706543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130706610 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 130706636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130706699 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 130706792 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130706793 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130706822 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 130706897 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130707582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130707614 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 130707686 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130707847 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130707886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130708051 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 130708110 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 130708284 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 130708566 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 130708603 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 130708868 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 130709303 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 130709366 G T Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 130709594 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 130709844 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 130709856 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 130709864 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 130710683 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 130711262 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 130711631 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130711642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130711655 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130712013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130713172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130717570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130720140 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 130720151 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130721047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130721095 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 130723300 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130723513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130724116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130724286 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130725164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130726153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130726785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130727134 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130727460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130727591 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130730133 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130730359 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130731228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130731782 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130732092 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 130732738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130732957 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130733197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130735368 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 130735473 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 130736016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130736146 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 130736248 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 130736266 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 130736858 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 130737046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130737399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130737442 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 130737582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130737615 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 130737836 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 130738092 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 130738118 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130738426 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130738480 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 130738835 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 130739270 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130739522 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 130739642 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130739737 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130739991 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 130740058 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130740082 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130740299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130740601 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 130740614 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 130741305 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130741343 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130741375 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130741561 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130742319 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130743493 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130743883 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 130745001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130745027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130745031 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130745142 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 130745894 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 130746598 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 130746689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130747170 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130747196 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130747273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130747434 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 130747444 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 130747649 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130747677 G C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130747695 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 130747712 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130747765 A C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 130747899 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 130748184 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 130748627 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 130748900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130749056 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 130749385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130749466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130749805 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130749843 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130749866 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130749982 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130750326 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 130750453 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 130750620 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 130750749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130751131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130751156 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130751229 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130751251 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130751366 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 130751401 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 130751432 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130751453 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 130751479 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 130751994 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 130752093 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 130752548 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 130752665 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130752708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130752854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130753042 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130753464 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 130753541 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 130753667 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130753683 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 130753735 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 130753776 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 130753823 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 130753982 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 130754079 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130754145 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130754174 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130754223 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130754532 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 130754762 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 130754926 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 130755014 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 130755153 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 130755197 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 130755751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130756343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130756624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130757101 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130757161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130757165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130757363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130758181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130758993 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130759035 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130759064 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130759264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130759590 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 130760959 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130761970 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130762443 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 130762450 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 130764218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130764323 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 130765760 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 130766918 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 130768391 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130768411 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130769649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130770093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130770572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130770815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130771108 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130772234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130772340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130772943 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 130773765 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 130774750 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130775053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130775361 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130777719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130777824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130780531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130784434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130787388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130787671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130791368 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130791894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130793759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130794616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130796766 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 130798422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130801472 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130802248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130803345 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130805018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130805296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130805494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130807011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130807293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130807458 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 130807503 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 2 130810602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130812495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130813252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130813307 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 130813622 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 130814227 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 130814510 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130816009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130816390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130816907 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 130817600 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 130818716 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 130820987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130825506 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130826101 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 130826710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130827610 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130827831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130828238 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 130828277 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 130828372 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 130828648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130829872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130835136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130835492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130835578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130836264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130837615 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130838170 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130839235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130841040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130841290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130841915 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 130845274 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130845959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130846847 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130847047 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130848669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130849877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130850559 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 130851874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130852006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130855009 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130855062 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130855278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130856406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130857896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130857902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130857930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130859018 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130860215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130860352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130862349 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 130862515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130862745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130863709 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 130863715 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 130863730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130863750 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130863819 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 130864354 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 130864426 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130864575 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 130864643 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 130864893 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 130865647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130866214 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 130867035 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 2 130867433 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 130867567 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 130867581 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 130867617 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 130867666 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 130867689 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 130867915 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 130868066 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 130868577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130869379 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130869420 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130869514 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130869515 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 130869582 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 130869660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130869987 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 130870008 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 130870346 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 130870566 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 130870648 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130870854 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 130871029 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 130871177 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 130871222 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 130871227 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 130871238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130871334 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130871390 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 130871444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130871466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130871654 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 130871792 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 130871815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130871898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130871918 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130871931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130871951 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 130872053 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130872076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130872086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130872143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130872176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130872181 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 130872257 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 130872268 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 130872323 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 130872358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130872361 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 130872372 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130872429 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 130872743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130872745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130872936 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130872985 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130873001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130873226 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 130873355 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130873462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130873793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130873971 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 130873976 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 130873991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130874049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130874086 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 130874189 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130874362 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130874694 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130874710 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130874715 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130874723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130874846 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130874875 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130874914 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 130874940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130875124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130875168 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130875204 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 130875232 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 130875261 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 130875865 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130876177 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 130876260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130876329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130876335 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 130876708 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 130876736 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 130876901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130877736 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130877888 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 130877918 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 130877940 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 130877973 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 130877985 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 130877998 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 130878028 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 130878060 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130878072 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130878186 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 130878204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130878344 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 130878372 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 130878400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130878545 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130879646 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130881144 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 130882156 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130884994 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 130885178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130885652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130886873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130887841 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 130888206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130890523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130891427 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130891462 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 130896430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130902971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130904716 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 130906557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130906642 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130906658 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130907004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130907909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130908088 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 130909073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130909381 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 130909404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130909432 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 130910157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130910322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130910338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130912281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130912557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130913439 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130913504 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130913649 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130913650 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130913661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130913960 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130913991 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130914137 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130914206 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130914722 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130914750 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130914847 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 130914890 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130914997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130915008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130915088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130915094 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130915125 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130915130 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 130915167 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130915206 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130915248 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130915295 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130916206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130916472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130917013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130918533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130919853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130920676 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130920710 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 130920817 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 130920885 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 130921089 T C Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 130921106 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 130921129 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 130921264 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130921278 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130921293 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 130921301 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 130921364 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130921466 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130921493 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130921564 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130922020 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130922032 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130922111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130922164 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130922239 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130922244 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130922569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130923067 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130923178 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130923235 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 130923525 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130923764 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130923775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130923940 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130923945 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130924178 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130924231 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130924236 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130924274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130924289 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130924424 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130924772 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130928167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130928347 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130929825 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130929834 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130930121 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130930204 C T N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 2 130930211 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 130930251 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 130930287 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 130930290 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 130930340 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 130930346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130930372 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 130930642 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130930709 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130930714 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130931100 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130931131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130931328 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130931464 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 130931697 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130931827 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130932263 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130932595 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130932961 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130933403 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 130933736 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130933796 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 130933798 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 130933914 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 130933915 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 130934076 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130934248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130934812 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 130934888 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 130935118 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 130935125 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 130935163 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130935191 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 130935352 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 130935512 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 130935524 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 130935535 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130935635 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130936073 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130936111 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130936127 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130936150 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130936201 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130936419 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130936434 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130936627 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130936640 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130936666 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130936694 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130936805 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130936806 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130936953 C A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 130936987 A C Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 130937022 G A Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 130937370 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 130937448 T A Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 130937462 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 130938248 A T Y N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 2 130938279 A C Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 2 130939541 C G N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 130939679 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 130939697 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 130939845 A G Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 130940318 G T Y N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 130940566 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 130942790 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130942817 C T Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 130942854 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 130943070 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130943093 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130943169 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130943186 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130943398 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130943467 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130943653 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 130943696 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130943733 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130943775 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130943907 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130943938 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130944233 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130944349 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 130944414 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130944445 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130944446 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130944463 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130944566 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 130944583 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 130944586 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 130944770 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130944828 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130944885 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 130945365 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 130945374 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 130945427 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 130945470 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130945596 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 130945967 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 130946061 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130946307 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130946662 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 130946817 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130947294 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130947314 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130947436 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130947633 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 130947694 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 130947710 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 130948331 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130949182 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130949193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130949265 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130949326 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130949426 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 130949495 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130949540 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130949641 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 130949851 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 130950323 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130950324 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 130950733 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130950765 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 130951172 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 130952456 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130952801 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130952979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130953029 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 130953168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130953182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130953193 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130953281 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130953352 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130953446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130953469 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130953499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130953794 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130953854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130953948 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130953957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130954241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130954280 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130954327 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130954337 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130954432 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130954787 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130954805 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 130954939 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130955198 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130955221 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130955519 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130955533 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130955573 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130955587 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 130955647 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130955872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130955892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130955920 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130955957 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 130956006 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130956017 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 130956074 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130956729 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 130956771 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 130956902 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 130956945 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 130956964 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 130957004 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 130957025 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 130957043 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 130957103 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 130957119 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130957179 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 130957249 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 130957271 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 130957276 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 130957289 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130957291 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 130957594 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 130957861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130958072 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 130958259 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 130958328 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 130958352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130958378 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 130958444 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 130958847 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 130959478 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 130959740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130960986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130961698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130961904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130962300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130962538 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 130962625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130962738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130963328 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130963373 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130963581 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 130963702 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130963721 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 130964613 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 130964686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130964880 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130967006 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 130967704 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 130967867 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130968004 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 130969422 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130969620 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 130970124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130971248 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 130971326 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 130971554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130971955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130972038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130973667 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 130973825 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130973838 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 130974375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130976141 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 130976373 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 130977785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130977967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130978095 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130978115 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130978323 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130978358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130978361 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130978407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130978413 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130978475 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 130978712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130978764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130978852 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 130978909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130978911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130979024 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 130979503 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 130980180 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 130983413 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 130983431 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130984054 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130984078 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130984574 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130984660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130985454 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130985872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130987106 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130988194 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130989013 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 130990064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130990221 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 130990273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 130990338 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130991269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130991387 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130991530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130991672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 130992589 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 130992914 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 130996062 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 130996155 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 130996992 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131000432 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131001031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131001280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131001934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131002071 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131002171 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 131002781 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 131006436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131011058 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131012059 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131012396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131014483 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131014537 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131014986 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131015114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131015291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131015596 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131016252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131018580 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131018664 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131018666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131019561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131020224 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131021337 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131021411 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 131021530 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 131021696 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131021930 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 131022031 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131022037 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 131022102 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 131023527 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 131023853 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 131023878 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 131024229 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131024505 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 131024667 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 131024810 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 131025333 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131025392 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131025790 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 131025937 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 131025992 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131026296 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 131026315 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 131026513 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 131026641 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131027614 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131027664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131027774 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 131028144 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131028390 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131028586 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 131028724 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131029294 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 131029297 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 131029353 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 131029374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131029682 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131029919 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131030325 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 131031104 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 131031176 T C Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 131031549 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 131031818 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131031849 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131031895 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131031950 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 131032007 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 131032088 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131032171 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 131032173 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 131032711 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131032729 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131032825 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 131032839 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 131033036 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 131033042 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131033072 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131033244 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131033282 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 131033330 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 131033413 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131033552 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131035795 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131037945 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 131038052 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131038375 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 131038847 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 131038925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131038982 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131038998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131039272 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 131039623 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 131039681 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 131039723 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131039837 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131039932 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 131040202 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131040652 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 131041802 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131042164 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 131042230 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131042432 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131044203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131044207 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131044217 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 131044226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131044264 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 131044413 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131044531 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131044818 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 131044819 T A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 131044876 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 131044995 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 131045029 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131045143 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131045202 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131045219 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131045540 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 131045609 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 131045658 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 131045682 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 131046034 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131046303 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131046847 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131047359 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 131047504 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131047572 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131047666 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131047792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131047845 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131047856 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131047898 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131048074 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 131048121 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 131048710 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 131049641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131050527 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 131050864 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 131051005 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131051203 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 131051452 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 131051885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131054079 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 131054561 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 2 131055028 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131055273 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131055323 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131055705 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131055749 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131055939 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131056255 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131056562 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 131056660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131057071 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131057346 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 131057645 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 131058027 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 131058429 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 131058575 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131058690 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131058937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131059003 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131059065 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131059239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131059477 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131059509 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131059562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131059948 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 131061668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131062568 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131062900 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 131062911 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 131063125 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 131063283 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131063846 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131064027 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131064091 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131064145 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 131064292 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131064438 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 131064491 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131064889 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 131064915 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131065197 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131065470 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 131065685 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131065725 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131066007 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131066614 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 131067234 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131067545 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131067657 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131067698 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 131068671 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131068856 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131069223 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 131069494 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 131069505 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131069567 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 131069657 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131069730 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131069886 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131069996 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 131070003 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 131070195 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131070746 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 131070787 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131070814 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131071570 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131071623 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131072264 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131072350 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131072417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131073085 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 131073179 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131073861 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 131075160 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131075754 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 131075776 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 131075973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131076109 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 131076252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131076867 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 131077524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131077599 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 131077841 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 131078012 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 131078853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131079210 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 131079239 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 131079674 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131080097 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 131080203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131081297 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 131081739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131081843 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131082163 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 131082227 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 131082418 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131082496 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 131082853 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 131082886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131082968 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 131083039 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131083102 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 131083230 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131083247 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 131083252 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 131083603 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 131083959 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 131084156 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 131084970 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131085714 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 131086194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131086569 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131086769 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 131086956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131087069 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131087134 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131087446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131087540 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 131087894 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131087991 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131088146 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 131088759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131088811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131089134 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131089385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131089690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131090121 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131090351 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131090436 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131090545 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131090652 T A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131090706 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 131090713 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 131090746 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131090837 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131091122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131091270 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131091555 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131091731 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 131092292 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131092312 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131092351 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131092474 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131092585 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 131092665 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131092754 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131092867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131092908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131092953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131093156 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131093287 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 131093430 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131093725 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 131093793 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 131094035 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131094097 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 131094283 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 131094387 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 131094691 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131094747 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 131095068 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 131095148 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 131095372 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 131095479 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131095733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131096095 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 131096103 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 131096206 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 131096240 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131096266 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 131096365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131096503 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 131096587 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 131096786 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131096847 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 131096955 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 131096984 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 131097100 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 131097502 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 131097686 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131097721 G C Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 131097803 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 131097918 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 131097925 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 131097930 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 131098027 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 131098067 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 131098144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131098145 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131098206 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 131098217 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 131098224 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 131098274 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 131098351 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131098522 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 131098527 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131098538 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 131098583 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 131098605 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 131098689 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 131098852 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 131098853 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 131098869 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 131099135 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 131099221 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 131099334 G T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 131099498 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 2 131100334 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 131100560 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131100561 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131100946 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 131101399 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 131101453 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131101892 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131101940 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 131102039 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 131102406 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131102502 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 131102816 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131102908 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 131103105 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 131104006 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 131104076 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131104357 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 131104839 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131104871 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 131105324 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 131105507 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131106634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131106691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131106851 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131107070 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131107389 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 131107414 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131107624 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 131107804 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131107979 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131108139 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131108801 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131108845 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131108911 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 131109007 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131109191 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 131109777 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 131109786 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 131109799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131109857 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 131109873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131109945 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 131110197 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 131110463 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 131110482 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131110702 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131111330 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 131111661 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 131112079 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 131112178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131113122 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 131113589 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 131114258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131114993 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 131115375 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 131115992 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131117343 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131117790 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131118712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131119607 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 131119907 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131122328 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131123866 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 131124531 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131124789 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131125025 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131125108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131125218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131125278 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131125541 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 131126176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131126199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131127021 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 131127140 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131127436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131127553 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131128295 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131128360 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 131129582 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131131791 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131132814 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131133182 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 131133911 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131133942 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131134401 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131135575 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 131135798 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 131136982 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131138604 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131138712 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131138827 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131138902 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 131139167 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131139168 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131139299 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131139537 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131139641 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 131139643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131139852 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 131139885 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 131139995 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 131140153 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 131140342 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 131140452 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 131140474 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 131140515 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 131140704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131140790 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131140921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131141232 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131141406 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 131141535 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 131141575 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 131142518 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 131142520 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 131142879 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131143003 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131143132 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131143256 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131143260 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131143329 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 131144865 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131145277 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131145307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131148360 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131149069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131150502 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131150972 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131152143 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131154180 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131155302 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131155553 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131156057 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131156145 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131157388 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131159600 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131160574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131163115 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 131163138 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 131163215 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 131163238 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131163284 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131164310 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131165033 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 131166279 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 131166493 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131167625 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 131168049 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 131168215 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131168403 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131171154 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131171306 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 131171309 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 131172370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131176292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131176781 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131180285 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131182279 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131182461 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131182951 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131183291 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131183334 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131184353 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 131186178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131186806 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131186830 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131187073 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131187743 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131187818 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131188041 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131191466 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131191508 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131192414 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131192774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131193440 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 131194269 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 131195140 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 131197475 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 131198068 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131198194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131198335 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131198422 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131199104 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131199391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131200001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131201685 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131201779 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131204320 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131204336 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 131204532 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 131204819 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131204991 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131205287 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131205294 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131205355 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131205592 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 131205883 A G N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 131207984 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 131208992 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131209452 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131209583 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131209628 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 131209647 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131209668 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131209801 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131209855 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131209909 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 131209964 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131210053 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131210213 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131210270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131210289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131211047 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131211429 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 131211669 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131211764 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131211835 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 131212375 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131212386 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131212478 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131212547 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131212609 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131212677 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 131213590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131215340 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131216786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131216821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131217886 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 131218346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131218727 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131219031 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131219165 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131219965 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 131219967 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 131220182 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 131220212 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131220226 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131220286 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131220300 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131220347 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 131220367 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131220998 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131221010 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131221049 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131221134 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131221387 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131221398 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131221416 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131221468 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131221489 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131222196 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 131222877 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131223043 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131223355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131224780 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131225107 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131225375 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131225515 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131225560 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 131226833 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131227175 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131230457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131233342 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131234175 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 131234475 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 131234929 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131235404 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 131235596 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 131235717 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 131235836 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 131236006 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131236390 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131236717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131238559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131239894 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131240712 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131240779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131241178 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 131241564 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131241914 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131242060 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131242203 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131242397 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131242491 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 131242494 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 131242602 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131242702 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 131242731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131242852 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 131242993 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131243119 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131243193 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131243200 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131243248 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131243274 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131243317 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131243326 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131243347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131243360 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 131243394 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 131243517 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131243588 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 131243640 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 131243716 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131243733 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 131243788 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 131243869 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131244498 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 131244741 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131245444 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 131246233 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131247141 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131250440 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131250584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131256759 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 131258237 T C N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 131259695 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131261003 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131261100 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 131262027 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131262411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131266723 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131266763 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131267642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131268520 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131268610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131268895 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131269610 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131271329 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131272249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131272515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131273789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131275761 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 131275795 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131275888 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131275946 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131276211 G T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 131276428 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131276434 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131276458 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131276538 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131276598 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131276643 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131276728 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131276752 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131276927 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131276985 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131276987 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131277027 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131277120 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131277152 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131277154 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131277233 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131277353 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131277376 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131277386 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131277860 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131277964 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131278006 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131278147 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131278175 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131278179 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131278192 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131278256 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131278300 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131278323 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 131278324 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131278338 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131278356 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131278367 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131278369 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131278400 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131278442 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131278490 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131278532 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131278554 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131278756 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131278838 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131278856 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131278857 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131278919 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131278933 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 131278946 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131278949 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131278957 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131279148 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 131279723 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131280087 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 131280162 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 131280513 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 131280741 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 131280963 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131281401 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131281598 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 131282604 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131282748 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 131282998 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131283512 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131283551 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131283811 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 131285224 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131286475 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131286604 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131288003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131288679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131290706 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 131291839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131293988 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 131295674 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131295986 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131296821 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131298819 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131298962 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131299932 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 131301724 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131301749 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 131302097 A C N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 2 131302156 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 131302206 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 131302222 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131302279 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 131302400 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131302710 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131302753 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131302818 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131302875 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 131303040 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131304274 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 131305001 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 131305522 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131306528 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 131306863 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 131308275 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 131308822 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131311887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131311938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131312209 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 131312896 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131313271 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 131313329 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131313487 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 131313761 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 131313887 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 131314502 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 131314619 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 131314648 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131314701 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 131314845 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 131314932 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 131314964 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 131315064 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 131315181 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 131315638 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 131315663 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 131315897 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131316503 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 131317294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131317447 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131318210 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131318537 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131319338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131321165 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131327522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131334381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131334825 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131334934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131335034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131338276 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131340154 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131340858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131341453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131341862 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131342780 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131347681 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131348136 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131349844 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131351375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131351590 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 131352155 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131354012 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131356133 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131356207 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131356676 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131356936 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131357541 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 131357586 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 131357795 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131358226 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131358421 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 131359475 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 131360399 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131360737 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131363909 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131363929 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131364941 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131364943 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131365154 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131365306 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131365404 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131365410 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131365504 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131365714 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 131365786 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131366030 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 131366735 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 131366819 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 131366837 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 131367042 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 131367050 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 131367073 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131367174 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 131367187 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131367216 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131369765 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131371126 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 131371643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131371708 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131371718 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131371852 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131372091 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131372341 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 131372515 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 131372556 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131372580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131372714 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131372787 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131373448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131374066 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 131374407 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131374564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131375017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131375041 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131375067 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 131375329 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 131375459 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131375490 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131376444 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131376978 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131377372 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131377413 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131377423 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131377439 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131377477 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131378185 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131378425 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131378446 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131378467 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131378967 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 131380598 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131381171 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 131382036 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 131386686 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 131388620 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131388655 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131390958 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131390960 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131391227 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131391662 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 131391681 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 131392263 T C Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 131392627 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 131392673 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 131393542 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131393927 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131394485 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131394633 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131394675 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131394716 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131394730 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131395201 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 131395265 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131395367 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 131395370 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 131395380 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131395460 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 131395469 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 131396241 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 131396374 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131396573 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131396690 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131396698 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131397052 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 131397247 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 131397639 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131397892 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 131397953 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 131398447 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131398670 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131398671 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131398682 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131398914 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131398961 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 131399052 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 131399069 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 131399085 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 131399283 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 131399344 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 131399510 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131399642 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131399728 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131399736 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 131399776 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131399801 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131399809 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131399826 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 131399949 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 131400004 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 131400097 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 131400116 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 131400126 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 131400263 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 131400583 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 131400675 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 131400869 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 131400931 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 131401012 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 131401054 C A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 131401065 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 131401096 C T N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 131401441 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 131401475 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 131401478 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 131401540 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 131401729 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 131401760 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 131401998 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131402107 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131402187 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131402351 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 131402352 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 131402405 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 131402526 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 131402547 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 131403195 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131403201 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131403219 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 131403266 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131403279 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131403283 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131403311 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131403415 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131403761 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 131403893 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 131404265 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 131404434 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131404464 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131404572 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 131404715 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 131404722 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131404742 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 131404770 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131404771 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131404899 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 131405037 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131405079 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131405106 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 131405118 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 131405129 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 131405130 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 131405148 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 131405197 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 131405300 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131405335 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131405518 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 131405547 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 131405608 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 131405696 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 131405809 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131405833 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 131405933 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131405977 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131406020 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131406143 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131406283 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131406303 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 131406304 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131406776 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131407061 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131407142 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 2 131407549 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131408131 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131408132 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131408255 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131408340 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131408623 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 131408707 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131408743 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131409530 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131409556 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 131409597 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131409674 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 131409805 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 131409874 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131410009 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131410153 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 131410262 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131410390 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 131410544 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131410716 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 131410777 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 131411386 T A N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 131411497 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131411536 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131411704 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131411856 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131411918 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131412078 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131412148 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 131412151 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131412230 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131412255 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131412317 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131412352 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131412415 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131412433 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 131412853 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 131412879 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131413012 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131413147 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131413177 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131413232 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131413341 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 131413955 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 131414052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131414134 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131414228 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131414286 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 131414306 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131414367 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 131414594 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131414829 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 131415121 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131415159 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131415353 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131415354 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 131415364 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131415523 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 131415564 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 131415800 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131415875 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131415912 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 131415984 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 131416006 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 131416013 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 131416084 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 131416188 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131416209 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 131416219 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 131416301 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 131416334 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 131416352 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131416354 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131416627 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131416672 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131416723 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 131416794 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 131417207 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 131417222 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131417312 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131417478 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 131417479 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 131417519 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131417521 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 131417570 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 131417609 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 131417649 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 131417696 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 131417753 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 131418312 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 131418619 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131419788 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 131419789 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 2 131419963 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 131420011 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 131420191 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 131420228 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 131420264 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131420275 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131420276 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131420459 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 131420472 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 131420540 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 131420641 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131420714 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 131420740 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 131420924 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131421686 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 131421718 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131421785 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 131421829 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 131423025 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 131423073 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 131423232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131423284 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 131423317 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131423341 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 131423473 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 131423627 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131423629 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 131423834 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 131423923 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 131423947 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 131424008 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 131424161 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 131424238 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 131424291 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131424330 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131424366 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 131424372 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 131424384 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131424460 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131424515 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131424604 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 131424752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131425323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131425348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131425393 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 131426114 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 131426254 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 131426289 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131426314 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 131426321 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 131426361 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131426764 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131426959 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131426980 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 131427023 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131427216 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 131428854 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 131428871 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131429127 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 131429256 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 131429638 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131430585 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 131431664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131432106 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131432926 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131432950 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131432970 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131433038 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131433126 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 131433169 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 131433452 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 131433826 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 131433859 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 131434135 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 131434317 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131434567 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131435295 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131435327 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131435330 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131435448 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131435456 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131435482 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131435516 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131435523 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131435598 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131435621 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131435709 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 131435959 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 131436101 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 131436527 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 131437563 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 131437594 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 131437959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131438678 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131438708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131438831 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131438914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131438939 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131438964 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131438992 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 131439009 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 131439239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131439312 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 131440945 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 131440952 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 131441119 T C Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 131442435 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131443055 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131443130 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 131443283 A G Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 131443329 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 131443440 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131443552 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131444625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131446599 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 131446636 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 131446640 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 131446723 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131446728 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131446792 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131446896 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131446951 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131447081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131447522 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 131447566 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 131447628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131447650 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 131447756 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 131447821 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131447822 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131448024 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 131448075 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 131448096 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 131448194 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 131448338 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131448855 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131448876 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131449137 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 131449164 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131449407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131449470 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 131449956 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 2 131450069 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.153846153846154 0.692307692307692 0.153846153846154 13 13 2 9 2 2 131450316 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131450674 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131450679 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131450741 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131450824 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131450873 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 131450883 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131450941 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131450964 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131451006 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131451188 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131451211 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131451506 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 131451641 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 131451659 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 131451697 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 131451876 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131451912 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131452175 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 131452266 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 131452310 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 131452414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131452746 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131452751 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131453052 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 131453278 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 131453362 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131453566 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131453571 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131453584 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 131453709 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131453844 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131453950 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131454647 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131454705 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131454838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131454839 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 131454857 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131454895 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 131455130 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131455232 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131455266 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131455274 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131455369 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 131455373 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 131455466 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 131455542 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131455578 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131455584 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 131455649 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131455722 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 131455747 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 131455802 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131455860 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 131456207 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 131456352 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131456358 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 131456976 C T N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 9 9 1 7 1 2 131457127 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 131457530 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 131458115 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131458489 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 131458594 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 131458633 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 131458899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131459715 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 131459789 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 131459879 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 131459890 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 131461078 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131461560 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131462127 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131462952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131463110 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 131463649 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131463923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131464151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131464644 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131464739 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131465211 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131466436 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131466486 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 131466558 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131466699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131466736 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131466774 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131466779 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131467196 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131467233 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131467446 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131467602 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131467747 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131467814 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131467834 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131468002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131468083 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131468309 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131468408 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131468417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131468432 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131468442 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 131468587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131468635 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131468852 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131468923 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131469217 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131469520 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131469693 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131469800 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 131469873 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131469912 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131470007 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131470011 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 131470132 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131470142 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131470170 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131470193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131470322 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131470436 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131470479 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131470480 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131470530 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131470539 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131470546 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131470653 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 131470695 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 131470950 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131471026 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131474146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131474432 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131474645 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131474889 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131474915 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131475192 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131475728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131475883 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131475891 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131476024 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131476888 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131477046 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131477169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131477196 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131477416 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131477425 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131477443 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131477488 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131477499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131477616 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 131477631 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131477752 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 131477763 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131478094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131478148 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131478498 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131478787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131478878 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131481643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131482147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131482153 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131482874 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131485606 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131488814 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 131488922 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 131489195 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 131489287 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131489346 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131489627 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131490143 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 131490309 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 131490319 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 131490344 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131490423 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 131490638 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131491126 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131491133 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131491905 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131491912 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131491927 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131492323 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131493246 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131493257 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 131493263 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131493296 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 131493418 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131493785 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131493935 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 131494116 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131494554 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 131495536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131495828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131498267 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 131499111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131501163 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131501618 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 131501667 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 131501680 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 131501699 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131501704 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131501749 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 131501816 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131501836 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131501907 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 131501941 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 131501974 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131502020 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131504470 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131504782 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131505082 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131505333 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 131505475 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 131505532 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 131505598 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131505608 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 131505620 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 131505705 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 131505861 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 131505875 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 131505938 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131505952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131506015 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131506029 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131506051 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131506153 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131506180 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 131506199 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 131506211 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 131506252 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 131506307 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131506353 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131506382 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 131506396 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 131506397 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131506582 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131506628 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131506683 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131506694 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 131506830 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 131506926 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131506954 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 131506998 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 131507035 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131507036 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131507094 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 131507600 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 131508002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131508808 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131509403 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131510090 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131510878 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131511247 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 131511511 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131511625 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131511692 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 131511769 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 131511938 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131512213 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131512385 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131512393 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 131512423 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 131512486 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131512606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131512632 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131512641 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131512723 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 131512787 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 131512829 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 131513033 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131513079 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 131513123 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 131513411 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131513455 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131513506 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 131513580 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 131513605 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131513718 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131513750 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 131513792 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131513893 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131513930 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 131514093 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131514437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131515015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131515697 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131516049 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131516403 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 131517220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131517429 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131517513 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131517599 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131517601 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131517670 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131517816 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 131517834 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 131517867 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131517875 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131517982 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 131517993 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 131518160 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131518167 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131518290 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131518333 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131518427 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131518649 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 131518692 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 131518785 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 131518909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131518936 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131518937 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131519050 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131519130 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131519218 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131519366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131519385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131519475 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 131519651 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131520010 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 131520014 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 131520277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131520305 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131520444 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131520560 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131520590 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 131522589 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131522901 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131523524 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 131523807 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131524388 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 131526474 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131526674 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131526710 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 131527476 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131529307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131529622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131531250 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131533866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131534039 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131535372 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131536252 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131537428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131537620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131538153 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131538197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131538452 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131538598 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131538651 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131538775 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131538998 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131539025 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131539062 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131539088 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131539092 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131539107 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131539113 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131539165 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131539203 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131539246 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131539436 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 131539445 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 131539476 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 131539488 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131539619 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131539735 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131539864 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 131539877 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131539972 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131540007 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131540020 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131540025 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131540087 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131540303 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131540304 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131540386 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131540418 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131540492 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 131540558 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 131541262 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131541535 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131541537 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131541735 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 131542045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131542281 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131542312 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131542924 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131543090 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131543229 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131543316 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131543766 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131543863 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131543918 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131543971 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131543973 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131543991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131543994 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131544406 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131544487 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131544529 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131544549 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131544630 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131544749 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131544783 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131544846 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131544858 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131545444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131545631 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131548080 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131550995 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131551280 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131551282 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131551396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131551675 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131551775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131551842 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131552196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131552388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131552578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131552742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131552853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131552941 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131553634 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131553863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131553925 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131553940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131554447 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131554558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131554572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131554587 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131554601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131554751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131554788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131554804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131554915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131554940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131554974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131555067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131555144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131555175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131555207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131555525 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131555624 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131555752 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131556077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131556078 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131556410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131556452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131556475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131556838 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131556953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131557038 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131557213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131557321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131557339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131557406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131557410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131557545 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131557649 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131557775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131558454 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131558505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131558772 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131561653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131562389 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131562550 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131562721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131565189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131565279 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 131566537 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131566591 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131566667 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131568695 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 131568803 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131569755 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131569760 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131569925 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131569940 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131570631 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131574035 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131574456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131575204 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131575274 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131575362 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131582710 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131582711 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131583078 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131583117 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131583299 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131583322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131583865 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131583950 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131584136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131584447 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131585236 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131585251 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 131585331 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131585865 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131585943 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131585976 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131586122 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131586768 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 131587529 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131588055 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 131588368 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131588450 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131588451 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131588523 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 131590076 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131590372 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131590439 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131591686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131592625 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131592631 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131593894 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131595100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131596307 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131596510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131597820 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131601334 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131601339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131602845 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131603047 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131604498 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 131604549 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131604611 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131604681 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131604728 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131604779 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131605074 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131605100 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131605142 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131605147 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131605566 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131605708 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131605764 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131605781 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131605832 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131605969 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131605970 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131606047 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131606073 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131606174 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131606313 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131606546 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131606593 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131606689 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131606737 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131606842 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131606922 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131606933 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131607114 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131607163 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131607231 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131607242 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131607266 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131607301 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131607383 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131607416 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131607636 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131607848 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131607888 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131607902 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131607912 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131607970 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131608031 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131608216 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131608247 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131608297 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131608637 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 131609013 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131609081 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131609099 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131609160 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131609338 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131609406 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131609443 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131609523 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131609525 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131609853 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 131609945 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131609966 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131610005 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 131610024 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 131610359 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131610378 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131610474 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131610738 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131610746 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131610967 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131611068 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131611121 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131611145 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131611163 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131611215 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131611235 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131611291 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131611465 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 131611466 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 131611541 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131611580 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131611719 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131611806 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131611851 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131612161 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131612183 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131612258 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131612325 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131612328 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131612469 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131612592 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131612660 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131612767 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131612774 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131612823 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131612830 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131612860 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131612887 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131612907 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131612915 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131612932 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131612969 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131613029 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131613219 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131613235 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131613279 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131613442 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131613472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131613475 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131613498 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131613536 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131613712 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131613758 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131613799 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131613813 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131613823 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131613831 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131613835 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131613906 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131613941 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131614015 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131614023 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131614031 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131614085 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131614103 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131614234 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131614377 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131614468 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131614485 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131614497 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131614513 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131614549 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131614611 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131614643 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131614682 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131614690 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131621077 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 131621193 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131621356 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131621563 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131621598 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131621769 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131621817 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131621840 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131621880 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131621910 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131621923 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131622092 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131622139 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131622163 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131622173 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131622203 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131622247 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131622432 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131622448 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131622462 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131622463 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131622512 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131622624 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131622729 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131622849 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131623774 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131624411 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131624804 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131624863 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131624924 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131625103 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 131625147 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131626089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131626498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131627714 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131628700 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131629383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131629845 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131629850 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131630024 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131630034 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131630071 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131630141 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131630180 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 131630208 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131630227 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131630235 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131630294 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131630322 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131630687 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131630782 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131630921 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131631026 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131631038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131631063 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131631249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131631309 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131631442 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131631445 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131631462 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131631693 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131632905 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131632950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131633021 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131633055 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131633150 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131633221 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131633314 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131633588 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131633776 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131633843 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131633923 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 131633944 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 131633968 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 131633969 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131634075 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131634094 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 131634199 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 131634301 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 131634441 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131634467 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131634516 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131634549 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 131634655 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131634725 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131634733 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131634946 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131634986 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131635109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131635117 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131635139 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131635159 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131635410 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131635686 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131635771 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131635833 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131635835 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131635928 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131636111 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131636200 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131636212 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131636236 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131636280 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131636476 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131636511 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131636607 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131636643 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131636764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131636887 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131636903 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131636917 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131636926 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131636932 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131637059 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131637121 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 131637293 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131637307 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131637451 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131637596 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131637641 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131637834 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131637913 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131638074 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131638156 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131638471 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131638484 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131638819 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131638873 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131639103 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131639106 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131639171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131639175 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131639546 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131639581 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131639714 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131639772 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131639871 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131639872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131639905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131639926 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131639959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131640044 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131640902 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131641384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131641765 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 131641848 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131641932 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131641938 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131641945 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131642015 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131642143 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131642152 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131642205 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131642292 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131642300 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131642340 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131642404 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131642583 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131642597 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131642745 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131643259 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131643788 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131643798 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131643852 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131644021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131644074 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131644082 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131644103 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131644130 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131644149 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131644163 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131644204 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 131644333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131644418 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 131644462 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131644530 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131644843 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131645022 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131645190 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131645245 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131645383 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131645491 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131645773 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 131645799 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 131645941 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 131646042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131646049 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131646177 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131646185 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131646587 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131646699 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131646955 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 131647067 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 131647347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131647446 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131647468 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131648309 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131648471 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131648487 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131648733 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131648734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131648915 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131649546 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131649580 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131649647 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131650276 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131650758 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131650990 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131650997 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131651082 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131651117 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131651119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131651179 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131651196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131651322 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131651341 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131651381 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131651389 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131651424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131651440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131651453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131651484 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131651485 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131651895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131651896 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131652355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131653038 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131653624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131653730 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131654201 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131654211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131654288 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131654634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131654836 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131654914 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131654973 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131654996 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131655230 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131655334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131655367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131655373 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131655430 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131655518 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 2 131655636 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131655637 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 131656674 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131656880 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131657079 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131657199 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 131657258 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131657271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131657292 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 131657327 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131657382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131657518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131657736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131657749 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131657787 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 131657792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131657919 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131657968 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131658000 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131658382 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 131658581 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131658884 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131659002 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131659022 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131659153 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 131659197 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 131659285 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131659323 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131659632 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 131660048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131660054 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131660077 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 131660089 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131660098 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131660155 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131660227 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131660609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131660643 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131660667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131660692 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131660805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131660860 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131660868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131660909 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131661010 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131661064 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 131661078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131661215 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131661243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131661325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131661334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131661482 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 131661519 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131661584 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131661648 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131661653 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131661659 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131661746 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131661840 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131661850 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131661891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131661924 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131662146 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 131662161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131662303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131662345 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131662355 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131662416 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131662542 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 131662838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131662980 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131663167 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 131663180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131663224 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131663271 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 131663701 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131663784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131664696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131665008 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131665962 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131666806 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131668706 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131672795 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 131673370 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 131673784 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131674067 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131674077 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131674101 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131674130 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131674224 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131674445 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 131674907 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131675429 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 131676041 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131676078 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131676210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131676541 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131677038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131677703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131678113 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131678152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131678168 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131678210 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 131678244 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131678434 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 131678723 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131678730 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131678940 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131679181 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131679186 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131679223 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131679416 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131679577 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131679704 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131679865 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131680004 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131680140 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131680289 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131680370 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131680403 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131681241 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131681370 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131682354 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131682387 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131682518 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131682761 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131682814 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131682962 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131682990 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131683027 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131683093 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131683301 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131683921 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 131684229 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131684248 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131684329 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131684345 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131684437 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131684474 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131684697 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131685275 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131685295 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131686307 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131686626 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131687291 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131687342 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131687589 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131687723 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131687729 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131687741 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131687882 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131687909 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131687956 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131687965 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131689781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131690046 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131696729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131700951 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131701304 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131701467 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 131701483 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 131702346 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 131703381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131704447 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131705112 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131705160 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131706185 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131707373 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 131707388 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 131708579 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 131709575 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 131710433 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131712263 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131712415 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 131712435 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 131712446 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131712578 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131712662 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 131712790 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131712889 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 131712893 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131712916 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131712982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131713108 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131713142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131713183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131713207 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131713244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131713354 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 131713374 A T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 131713400 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131713457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131713537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131713623 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131714121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131714122 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131714312 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131714327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131714381 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131714671 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131714731 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131714770 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131715146 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131715153 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131715157 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131715189 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 131715315 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 131715452 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131715463 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131715586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131715684 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131715697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131716104 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131716137 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131716229 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131716242 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131716254 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131716270 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131716411 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131716422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131716572 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131716760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131716784 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131716811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131716875 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131716998 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131717023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131717045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131717081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131717134 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131717182 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 131717402 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 131717434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131717506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131717518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131717649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131717661 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 131717663 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131717764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131718093 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131718390 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131718590 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131718597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131718657 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131718765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131718820 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131718839 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131718891 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131718973 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131719195 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 131719234 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131719247 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131719264 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131719289 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 131719322 A T Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 131719422 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131719442 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 131719569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131719664 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131719676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131719734 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 131719739 T C Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 2 131719867 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131719973 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 131719981 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 131720017 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 131720036 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 131720076 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 131720087 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 131720113 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131720161 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 131720279 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 131720452 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 131720467 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131720535 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131720549 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131720552 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131720593 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131720615 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131720729 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131720749 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 131720787 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131720807 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131720958 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131721092 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131721139 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131721708 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131721775 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131721939 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 131722050 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131722101 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 131722141 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131722255 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 131722257 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 131723013 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131723098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131723218 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 131723220 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 131723312 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 131723407 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 131723647 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131723740 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131723778 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 131723881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131723952 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131724002 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 131724008 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131724057 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131724173 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131724239 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 131724304 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 131724311 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 131724424 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 131724587 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131724594 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131724600 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131724636 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 131724754 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131724769 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 131724794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131724844 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131724895 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131725089 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 131725642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131725658 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131725697 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131725835 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 131725881 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131725939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131726046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131727029 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131727487 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131727625 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131727709 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131727927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131727999 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131728070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131728895 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131729004 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 131729410 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 131729858 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131729921 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131729999 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131730040 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131731156 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131731182 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 131731346 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 131731722 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131732333 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131732492 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131732528 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131733020 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131733265 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 131733291 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131733439 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131733450 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131733613 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131733845 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131733916 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131733967 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131734177 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131734515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131735642 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 131735687 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131736205 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 131736283 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131736811 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131736824 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131736904 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131737054 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131737137 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 131737148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131737168 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 131737402 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 131737850 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 131738158 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131738159 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131738208 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131738317 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131738580 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 131738588 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131739128 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 131740094 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 131740633 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 131741670 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 131741872 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 131742065 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131742126 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 131742271 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131742288 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131742344 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 131742390 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 131742704 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131742835 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131742872 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131743178 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131743193 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131743390 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131743671 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 131756850 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131756935 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131756963 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 131756989 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 131757049 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131757052 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131757101 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 131757184 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131757225 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131757328 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131757505 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 131757594 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 131757609 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 131757629 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 131757843 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131758007 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131758088 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 131758092 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131758149 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131758285 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 131758574 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131758600 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 131758687 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 131758865 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131759082 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 131759222 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131759235 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131759761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131761345 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131761538 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131761823 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131761946 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 131763371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131763859 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131763936 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131764213 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 131764720 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131764758 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 131764792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131764868 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131764928 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 131765108 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131765114 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131765173 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 131765284 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 131765386 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131765394 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131765486 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 131765558 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131765699 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131765788 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131765853 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131765977 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131766026 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131766163 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131766190 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131766199 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131766209 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 131766517 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 131766547 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131766645 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131766690 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131766723 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131766744 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131766917 A T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 131767068 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131767149 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 131767282 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131767623 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131767638 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131767641 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131767657 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 131767698 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 131767822 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 131767851 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131767906 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131767925 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131767980 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131768062 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131768063 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 131768087 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131768340 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131768744 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131768820 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131768845 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 131768929 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131769016 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131769032 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131769090 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 131769102 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131769156 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131769231 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131769453 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 131769518 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 131769650 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 131769654 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 131769678 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 131769693 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 131769727 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 131769777 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 2 131769780 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 131770324 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 131770446 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131770501 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 131770502 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 131770615 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131770808 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 131770829 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 131770981 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131771221 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131771447 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131771465 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131771565 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 131772136 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131772940 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131772954 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131773077 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131773111 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131773124 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131773201 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131773478 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131773485 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131774183 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131774208 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131774317 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 131774327 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131774350 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131774561 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 131774637 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 131774682 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131774942 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131775041 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131775100 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131775695 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131775820 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131775842 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131776018 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131776046 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131776092 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 131776141 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131776191 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 131776318 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131776513 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 131776587 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131776750 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131777219 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131777327 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 131777330 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 131777591 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131777746 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131778147 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131778620 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 131779234 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 131779246 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131779271 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131779293 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131779339 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131779530 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131779914 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131780027 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131780050 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 131780117 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131780123 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 131780176 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131780380 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131780560 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 131780754 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131781268 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131781278 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131781284 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131781354 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131781376 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131781457 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131781604 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131781635 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131782196 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 131782597 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131782610 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131782756 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131782914 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131782972 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131782996 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131783026 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131783184 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131783193 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131783609 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 131784049 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 131784797 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131784904 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131784995 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131785016 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131785071 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131785195 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 131785205 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 131785232 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131785456 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 131785567 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131785608 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131785832 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131785850 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131785877 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131785936 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131786122 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131786531 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131786551 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131786608 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131786631 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 131786737 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131786782 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131786794 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 131786795 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131786918 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 131786991 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 2 131787003 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131787075 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131787153 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131787189 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131787216 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131787760 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131787818 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131788544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131793006 G C Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 131795422 C T Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 131795539 C G Y N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 131795891 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 2 131798308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131798433 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131799217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131799992 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131801292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131801482 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 131801710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131801909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131802365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131802968 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131803909 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 131803969 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131804005 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131804031 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 131804104 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 131804226 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 131804271 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 131804708 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 131804723 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 131804727 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 131805045 T C Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 131805072 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 131805149 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 131805154 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 131805179 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131805211 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 131805214 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131805273 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 131805291 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 131805296 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 131805314 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 131805405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131805479 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131805689 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 131805690 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 131805796 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 131805834 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131805860 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131805960 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131805981 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 131806078 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 131806233 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 2 131806304 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 131806331 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131806332 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131806379 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 131806416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131806867 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131806975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131810497 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131812106 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131812394 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 131812404 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 131812420 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 131812565 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131812840 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131812943 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131812952 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131813029 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131813044 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 131813371 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 131813923 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131813996 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131814300 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131814382 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131815022 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 131815253 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 131815284 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 131815394 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 131815622 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 131815846 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131815893 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131815994 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131816061 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131816099 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131816182 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131816280 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131816480 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 131816533 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131816583 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131816675 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131816726 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131817322 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 131817497 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131817755 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131818104 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131818352 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131818536 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131818587 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131818627 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 131818753 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 131819562 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 131820730 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131820740 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131820772 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131821441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131821504 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131821600 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131822787 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131822841 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131822844 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131822935 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131823067 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131823096 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131823140 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131823220 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131823253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131823257 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131823378 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131823390 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131823498 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131823581 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131823622 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131823741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131823859 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131823905 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 131824086 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 131824101 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 131824104 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 131824126 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131824150 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 131824308 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131824499 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 131824569 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131824572 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 131824615 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 131825213 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131825234 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131825324 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131825363 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131825402 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131825470 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 131825474 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 131825517 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131825582 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 131825607 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131825641 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 131825696 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131825700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131825789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131825882 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131826022 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131826112 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131826132 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131826149 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131826308 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131826568 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 131826718 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 131826739 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 131826750 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 131826751 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 131826805 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 131826867 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 131826880 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 131826900 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 131826912 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 131826922 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 131827006 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 131827018 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.0666666666666667 15 15 1 13 1 2 131827086 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131827126 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131827135 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131827197 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 131827229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131827657 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131827754 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131827886 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131828017 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131828238 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131828754 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131828822 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131828951 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131829758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131829759 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131830002 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131830439 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131830635 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131831025 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131831511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131831724 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131832032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131833661 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131833770 T A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 131834092 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131835083 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131835224 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131836360 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131836408 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131836434 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 131836838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131837135 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131837268 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131837456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131837533 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131839366 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 131839927 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131840116 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 131841014 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131841816 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131842301 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 131842434 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131842625 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131842790 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131842972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131843062 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131843596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131843936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131844056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131844127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131844251 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 131844414 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131844504 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131844526 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131844616 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131844631 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 131844870 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131844977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131845709 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131845934 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 131846450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131846480 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131847068 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131847196 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131847269 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131847313 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131847478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131847691 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131847858 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131847876 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131847904 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131847946 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131848490 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131848514 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131848515 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131848671 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131848868 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131849104 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131849178 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131849248 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131849787 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131849979 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 131852417 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131852447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131852498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131852513 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131853001 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131853504 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131854488 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131854773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131855413 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131855923 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 131857578 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131859196 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 131859462 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131860166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131860230 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 131860602 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 131863576 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131864486 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 131864986 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131866239 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131866710 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131866830 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 131867332 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131868155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131868264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131874555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131874714 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 131877570 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 131877778 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131878023 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 131878915 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131882836 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131882872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131884082 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131884121 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131885480 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131886288 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131886301 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 131886487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131886917 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131886935 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 131888156 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131889862 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131890653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131891630 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131891787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131892856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131893351 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 131893480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131893764 T G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 131894927 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131894936 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131895842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131896227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131896456 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131897845 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131898077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131898174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131898320 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131904763 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 131905308 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 131906007 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131906549 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131908482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131908838 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 131908898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131908943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131909179 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131909329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131909360 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131909635 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131910979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131911779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131912195 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131914328 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131914398 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 131914411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131914443 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131915857 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 131916330 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131917071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131918289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131918602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131919115 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 131919148 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 131919474 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131920089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131920345 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 131922155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131922820 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131924368 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131924477 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 131924994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131925119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131925435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131926071 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131926665 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131927393 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131927763 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 131928711 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 131929420 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131930177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131930205 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131930239 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131930368 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131931458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131931650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131931762 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 131931780 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 131931934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131932707 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 131932860 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 131932929 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 131933203 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 131934310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131934312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131934739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131935237 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 131936518 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 131936970 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 131937418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131937592 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 131938187 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 131938525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131938579 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 131939138 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 131939386 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 131939643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131939680 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 131940248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131940270 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 131940674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131942192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131942611 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131942988 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131943097 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 131944164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131944298 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131944526 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131945946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131946634 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131947214 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131947218 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131948524 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 131948604 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 131949144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131949518 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131949608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131949632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131949724 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 131949738 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 131949846 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131949933 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 131950079 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 131950412 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 131950423 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131950653 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 131950659 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 131950724 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 131950775 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 131950892 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 131950933 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 131950995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131951075 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 131951080 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 131951088 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 131951219 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 131951502 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 131951531 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 131951611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131951661 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 131951759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131951917 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 131951946 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 131952271 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 131952388 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 131952412 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 131952540 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 131952543 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 131952622 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 131952643 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 131952659 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131952769 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 2 131952948 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 131952950 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 131953142 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 131953392 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 131953484 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 131953527 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 131954843 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 131954892 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 131954935 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 131955237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131955845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131956284 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 131956370 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 131956441 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 131956505 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 131956632 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131956796 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 131956860 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 131957053 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 131957139 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 131957220 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 131957236 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 131957260 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 131957275 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 131957561 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131957623 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131957685 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 131958065 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 131958124 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 131958272 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 131958311 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131958524 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 131958699 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 131958714 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 131959483 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131959611 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131959671 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 131959674 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 131959797 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 131960452 T G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 131960589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131961064 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131961212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131961223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131961289 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131961389 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 131961394 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131961454 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 131961593 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 131961625 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 131961681 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 131961805 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 131962424 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 131962445 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 131963731 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 131964505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131964673 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 131964764 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131965035 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131965199 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 131965674 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131965747 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 131965911 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131965957 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 131966104 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 131966245 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 131966693 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 131966791 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 131967001 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 131968375 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131968574 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 131971123 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 131971857 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 131972202 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131972609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131972678 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 131973259 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131973535 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131973994 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131974368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131975456 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131975826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131977070 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131977287 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131977331 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131977406 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131977434 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 131977478 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131977777 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 131977794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131977988 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 131978055 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131978183 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 131978263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131978266 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 131979266 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131980033 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 131980366 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 131980461 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131980462 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 131980857 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 131981017 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 131981038 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 131981088 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 131981147 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 131981453 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 131981483 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 131981496 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 131981498 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 131981564 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 131981674 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131981687 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 131981780 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131982029 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 131982275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131982333 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 131982459 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131983665 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131983938 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131983945 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131983953 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 131983974 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131983983 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131984032 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131984083 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 131984100 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 131984155 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 131984178 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 131984263 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 131984335 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 131984384 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 131984566 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 131984707 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 131984744 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131985527 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131985613 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 131985653 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131985699 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131985908 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131985914 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 131985954 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131986000 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131986002 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 131986110 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131986292 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131986305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131986356 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131986437 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 131986449 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 131986462 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 131986476 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 131986477 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 131986488 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 131986550 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 131986600 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 131986605 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131986724 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 131986746 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 131986933 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131986948 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 131986962 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 131987049 T A Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 131987105 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131987144 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 131987156 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 131987196 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 131987276 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131987308 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131987314 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 131987323 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131987386 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 131987434 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 131987566 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 131987585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131987597 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131987760 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131987877 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131987888 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131987909 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131988081 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 131988220 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 131988279 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 131988331 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 131988431 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 131988704 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 131988833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131988892 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131988924 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 131989003 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 131989026 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 131989073 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 131989147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131990203 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 131991041 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 131991045 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 131991164 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 131991191 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 131991440 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131993029 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 131993134 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131993513 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 131993516 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131993584 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 131993730 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 131993752 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131993759 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131993790 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131993905 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 131994066 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131994164 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 131994301 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131994481 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131994539 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 131994554 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 131994806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 131995000 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 131995148 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131995209 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 131995225 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131995289 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131995341 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131995613 G C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 131995615 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131995644 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 131995667 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131995729 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 131995746 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 131996062 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131996485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 131996658 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 131997095 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 131997677 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 131997707 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 131997850 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 131998035 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131998108 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131998110 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131998122 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131998221 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131998247 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131998300 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131998318 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131998376 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 131998501 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 131998527 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131998670 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 131998824 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 131998894 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 131999329 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 131999879 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132000263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132001379 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132001599 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 132001677 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 132001709 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 132001834 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 132001847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132001873 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 132002841 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132003960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132005158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132006303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132008722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132008739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132008997 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132009081 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132009286 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 132009386 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132009411 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132009418 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132009900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132009923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010104 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010113 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 132010166 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132010250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132010278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010345 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132010681 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132010870 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132011070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132011134 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 132011481 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 132011724 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 132011783 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 132011797 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 132011945 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 132011953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132012264 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 132012307 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132012391 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 132012457 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 132012531 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 132012563 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 132012626 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132013010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132013135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132013179 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 132013362 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 132013447 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132013598 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132013741 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 132013843 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 132014946 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 132015169 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132016206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132017329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132019546 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 132019832 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 132022874 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 132023848 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132023981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132027219 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132032207 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132032334 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 132032335 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 132032518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132032520 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132033659 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 132035996 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 132036290 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 132036319 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 132036657 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132037576 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132042915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132044335 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132044542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132045063 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132045071 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 132045167 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132045174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132045209 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132045231 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132045340 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 132045353 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 132045396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132045495 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132045600 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 132045726 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 132045933 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132046000 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 132046132 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 132046208 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 132046468 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 132046612 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 132046654 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 132046749 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132046767 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 132046810 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 132046902 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 132046909 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 132047112 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 132047506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132047530 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 132048081 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 132048085 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132048663 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132048845 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132049010 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132049383 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 132049432 A C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 132049672 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132050448 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132050518 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132050598 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 132050655 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 132050703 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 132050744 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 132050754 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 132050873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132051434 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 132051438 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 132051472 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 132051533 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 132051611 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 132051646 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 132051809 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 132051835 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132052119 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 132052189 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 132052209 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 132052318 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 132052443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132052518 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 132052565 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132052628 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132052666 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132052707 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132052713 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132052732 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132052740 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132052775 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132052847 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132052952 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 132052990 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 132053003 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 132053108 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 132053114 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 132053327 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 132053429 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 132053437 G C N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 132053729 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 132053859 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 132054270 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132054390 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 132054457 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132054506 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132054548 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132054599 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132054638 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132055006 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 132055031 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132055090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132055227 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132055414 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132055467 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 132055771 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132055797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132056178 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 132057972 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 132058479 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132058542 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 132058580 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 132059814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132059856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132060003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132060129 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132060646 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 132060715 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 132060719 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132060749 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132060804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132060901 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132060985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132060991 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132060998 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132061011 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 132061196 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 132061208 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 132061272 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 132061346 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 132061417 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 132061574 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132061635 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 132061960 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 132062081 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132062118 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132062260 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132062291 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132062294 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132062307 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132062322 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132062361 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132062440 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132062457 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132062588 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 132063020 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 132063045 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 132063088 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 132063407 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132063753 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 132063875 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 132064892 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132065932 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 132066013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132066484 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132066525 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132067546 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132067552 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132067560 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 132067596 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132067640 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132068236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132068291 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 132068541 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132068542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132068845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132069121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132069673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132073976 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 132074147 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 132074319 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 132074334 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 132074430 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 132074462 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 132074571 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 132074664 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 132075458 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132075497 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 132075517 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 132075598 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132075776 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 132075823 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 132075841 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 132076101 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 132076129 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 132076475 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 132076505 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 132076940 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 132077182 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132077266 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 132077361 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 132077373 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 132077995 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132078217 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 132078375 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132079046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132080128 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132080532 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132080574 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132082053 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 132082087 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 132082136 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 132082226 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 132082287 G T N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 132082290 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 132082351 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 132082387 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 132082405 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 132082429 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 132082431 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 132082537 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132082639 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132083109 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132083158 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 132083183 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 132083556 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 132084446 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 132084687 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 132084976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132085535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132085604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132086584 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132086976 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 132086982 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132086988 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132087107 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132087131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132087192 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 132087218 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132087439 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 132087510 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 132087801 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 132087942 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 132087973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132088129 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 132088789 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 132088854 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 132089030 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 132089101 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 132089151 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 132089421 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132089465 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 132089988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132090164 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132090223 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 132090895 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132091263 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 132091365 A T N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 132091552 A T N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 132091570 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 132091592 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 132091604 A T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 132091605 A T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 132091654 A C N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 132091681 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 132091764 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 132091802 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132091816 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132091849 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132091850 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 132091912 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 132091919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132091933 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 132091946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132091951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132092004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132092246 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132092302 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 132092312 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 132092330 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132092370 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 132092374 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 132092502 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 132092575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132092672 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 132092740 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 132092950 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 132093023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132093094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132093182 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 132093226 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132093310 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 132093487 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 132093786 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132093850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132094005 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132094027 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132094113 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 132094172 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 132094465 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132094555 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 132094556 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 132094646 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 132094722 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 132094795 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 132094883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132094961 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 132095018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132095243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132095337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132095375 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132095752 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132095960 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 132095991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132096262 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132096417 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132096583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132096585 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132096594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132096693 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 132097418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132097476 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 132097486 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 132097574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132097645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132098016 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 132098026 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 132098044 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132098070 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 132098112 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 132098176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132098477 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132098658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132098728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132098992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132099195 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132099561 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132099615 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 132099997 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 132100459 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132100639 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 132100722 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 132100932 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132101019 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 132101326 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 132101329 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 132101435 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 132101445 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132101559 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132101657 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 132101852 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 132101989 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 132102117 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 132102119 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 132102286 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 132102508 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132102712 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132103137 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132103173 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132103289 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132103344 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 132103502 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 132103589 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 132104005 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 132104026 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 132104171 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132104343 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132104590 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 132105079 C T N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 132105402 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132105535 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132105559 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132105680 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132105765 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 132105837 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132105877 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132106071 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 132106490 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132106597 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132106621 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 132106722 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132106736 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 132106749 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 132108688 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132108818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132108842 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132109043 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132109075 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 132109236 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 132109237 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 132109268 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132109491 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 132109560 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132109606 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132109680 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132109682 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132109831 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 132110003 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 132110045 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132110089 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132110128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132110171 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 132110181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132110241 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132110369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132111359 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132111697 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 132111764 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 132111876 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 132112056 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132115039 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132115225 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 132115337 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 132115548 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 132116673 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132117253 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132117538 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132119203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132119423 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132119766 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132121024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132121026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132121926 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132121977 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132122325 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132122541 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 132122700 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 132122702 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 132122873 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 132122898 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 132122910 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132123167 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 132123273 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 132123279 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 132123323 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132124021 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132124100 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132124102 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132124122 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132124129 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132125544 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 132125621 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 132126186 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132126260 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 132132044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132134953 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132136311 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132136897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132137955 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132138394 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132138598 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132139799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132140696 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 132141394 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132142658 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132143303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132146209 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 132146470 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 132146557 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 132146577 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 132146582 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 132146603 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 132146838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132147196 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 132147232 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132147250 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 132147533 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 132147883 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132147978 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 132148051 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132148065 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132148115 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132148131 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 132148186 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132148489 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132148542 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132148592 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132148613 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132148621 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132148787 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 132148998 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 132149028 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 132149039 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 132149107 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132149114 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 132149147 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132149179 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132149460 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 132149671 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132150268 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 132151556 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132151844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132151891 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132152154 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132152733 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 132153091 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 132154024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132154246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132154267 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 132154348 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 132154542 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 132154555 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 132156554 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132156654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132157598 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132158529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132159693 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 132164593 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 132164854 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132164953 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132165405 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132165731 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132166148 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132166877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132169301 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 132169723 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132171463 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132171633 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132173315 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132173577 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132174630 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132174675 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132177000 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 132177161 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 132177220 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 132177259 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 132177263 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 132177997 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132178187 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 132179082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132179741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132181743 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132182057 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 132182372 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 132186389 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 132190771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132190968 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132191256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132192382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132192635 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 132192740 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132192752 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132192869 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132192995 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132193156 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132193181 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132193241 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132193257 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132193271 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132193381 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132193705 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132193756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132193808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132194098 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132194126 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132194127 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132194143 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132194167 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132194201 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 132194327 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132194453 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 132194463 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 132194512 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132194565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132194577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132194708 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 132194722 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 132194844 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 132194848 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 132195003 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 132195219 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 132195465 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132195752 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132195891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132195913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132195983 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132195997 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 132196117 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132196134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132196396 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132196494 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132196988 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132197240 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132197276 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132197903 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132197988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132198363 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132198469 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132198499 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132198510 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132198625 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132198637 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132198844 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132199007 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132199029 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 132199126 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 132200007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132200496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132201585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132202240 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 132203242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132203442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132204573 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132204773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132205305 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132205489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132206256 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 132207561 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132207617 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 132207650 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 132207667 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 132207703 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 132207795 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 132207887 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 132208124 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132208157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132208171 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132208217 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132208327 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 132208507 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 132208949 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 132209103 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 132209290 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132209510 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 132210236 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132210371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132210551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132210556 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132210847 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132212562 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 132212662 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132212681 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132212697 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132212850 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 132212881 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132212924 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132212941 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132213013 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132213345 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132213616 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132213647 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132214234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132214252 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132214317 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132214366 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132214488 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132214513 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132214564 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132214705 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 132214734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132214764 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132214847 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132214975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132214976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132215043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132215087 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132215103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132215368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132215381 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132215397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132215447 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132215833 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132215851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132215888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132216234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132216823 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132217003 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132217050 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 132217051 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 132217169 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132218145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132218197 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132219314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132219327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132219344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132220102 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132220731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132221037 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132221167 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 132221370 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132221788 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 132221819 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132222254 T A Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 2 132222410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132222440 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 132222674 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132222687 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132222986 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 132223115 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132224054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132225527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132229145 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 132230083 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132232416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132234622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132235087 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132235099 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132235266 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 132235623 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 132235698 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 132236440 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 132237144 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132237391 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 132237411 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132237429 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132237451 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 132237466 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 132238733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132239338 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132239967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132242772 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132242859 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132242860 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132242904 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 132243640 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 132243828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132243837 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 132243893 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132244029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132244305 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132244454 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132244471 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132244621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132245115 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 132245330 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 132245332 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 132245831 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132246055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132246272 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 132246446 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132246448 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132246507 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 132246526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132246573 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132246625 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 132246630 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132246671 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132246676 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132246703 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132246711 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132246758 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132246861 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 132246862 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132246891 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 132247085 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 132247187 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132247275 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132247282 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132247605 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132247612 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132247635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132247649 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132247728 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 132247777 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132247800 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132247880 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132247977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132248158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132248531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132251411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132252265 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132252766 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132253067 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 132253081 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 132253704 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 132253928 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132254024 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132254033 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132254060 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 132254062 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 132254137 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132254180 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132255033 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132255175 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132255224 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132255360 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 132255373 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 132255452 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 132255460 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 132255490 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 132255599 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 132255612 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 132255780 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 132255781 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 132256258 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132256612 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132257199 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 132257304 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132257317 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132257455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132257940 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132258067 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132258112 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132258329 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 132258586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132258780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132259029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132259097 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132259315 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132259436 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132259454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132259464 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132259498 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132259631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132259666 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132259687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132259755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132259861 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 132259940 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 132259974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132260048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132260049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132260120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132260123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132260198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132260290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132260408 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132260419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132260552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132260653 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 132260766 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 132260829 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 132262289 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132262298 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132262334 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132262414 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132262568 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132262572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132262672 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 132262752 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 132262802 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132263006 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 132263064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132263072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132263082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132263121 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132263201 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132263280 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132263371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132263599 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132264168 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132264200 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132264240 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132264371 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 132264404 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132265271 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 132266894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132267352 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132267533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132268328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132268722 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 132268900 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132270756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132271233 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 132271780 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 132272099 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 132272338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132272505 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132272523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132272985 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 132273332 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132273418 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132273918 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132274224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132274236 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 132274264 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132274407 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132274995 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 132275502 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132276106 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 132276154 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 132276519 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 132276594 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132276595 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132276971 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 132277098 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 132277104 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 132277120 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 132277139 G C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 132277261 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132277277 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 132277324 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 132277388 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132277422 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132277623 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132277624 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132277659 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132278432 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132278498 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132278594 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132279245 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 132279361 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 132279449 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132279591 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132279619 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132279651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132279699 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132279841 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 132279844 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 132279885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132279952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132280063 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 132280071 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 132280099 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 132280126 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 132280219 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132280259 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132280389 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 132280607 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 132280685 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 132280756 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 132280996 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 132281246 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132281296 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132281664 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132281775 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 132281801 C A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 132281871 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 132282155 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132282510 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132282555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132282770 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132282783 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132282857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132282902 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132282904 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132283120 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 132283269 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 132283330 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132283663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132283710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132283738 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132283757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132283781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132283842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132283857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132283869 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132284120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132284211 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132284216 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132284284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132284305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132284314 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132284320 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132284361 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132284526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132285395 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132285985 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132285991 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132288183 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132288419 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 132288608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132289484 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132290247 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 132290276 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 132290285 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 132290326 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 132290327 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 132290356 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 132290758 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132290887 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132290912 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132290924 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132291138 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 132291139 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 132291158 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 132291185 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 132291209 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132291229 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132291242 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132291280 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132291331 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132291400 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132291517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132291703 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 132291788 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 132291808 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 132291923 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 132292010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132292051 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 132292057 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 132292119 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 132292122 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132292176 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 132292201 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 132292289 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 132292305 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 132292328 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 132292334 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 132292436 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 132292605 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132292608 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 132292699 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 132292716 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 132292788 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 132292809 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132292812 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132292863 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132292951 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132292968 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132292972 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132293052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132293096 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132293111 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132293223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132293228 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132293286 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 132293336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132293339 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132293416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132293431 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132293444 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132293551 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132293723 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 132293888 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132293913 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132294003 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 132294063 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 132294084 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132294096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132294100 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132294146 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 132294688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132294772 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132295351 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132295476 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 132295987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132296299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132296379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132296645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132296666 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 132296791 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 132296945 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 132296981 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 132297005 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132297012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132297117 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132297167 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132297261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132297317 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 132297377 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 132297459 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 132297694 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 132297788 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 132297878 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132298094 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132298634 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132298713 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132298736 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132298782 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132298790 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132298811 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132299485 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132299668 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132299824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132299991 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132300009 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132300014 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132300125 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 132300545 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132300549 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132300597 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132300681 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132300895 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132301083 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 132301148 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 132301160 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 132301792 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132301849 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132301904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132301942 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132302512 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132302542 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132302546 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 132303366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132303440 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 132303556 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132304041 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132304360 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132304361 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132304416 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132306749 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 132306828 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 132306832 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 132306911 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 132307177 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 132307224 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132307378 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132307486 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 132307489 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132307849 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132307958 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 132308150 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 132308359 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 132308458 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132308542 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132308624 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132308676 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132308749 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132309075 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132309507 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132309748 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 132310131 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132310454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132311069 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132311542 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132311596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132311734 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132311812 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132311879 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132311887 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132311894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132312063 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132312079 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132312142 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132312200 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132312203 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132312234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132312304 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132312456 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132312486 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132312492 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132312540 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 132312542 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 132312826 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 132313071 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 132313164 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 132313274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132313281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132313298 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132314375 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132314603 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 132314641 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132315387 A G Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 132315388 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 132315580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132315655 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132316092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132316204 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132316637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132316759 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 132317006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132317236 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132317454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132317700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132317709 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 132323538 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 132323646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132323710 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132323735 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 132324176 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132324197 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 132324339 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 132325435 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 132326139 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 132326224 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 132326227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132326431 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 132326433 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 132326722 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 132326758 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 132326811 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 132327101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132327124 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 132327255 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132327280 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 132327562 A C N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 132327628 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 132327720 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132327889 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 132327894 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 132328005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132328138 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132328142 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 132328169 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 132328181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132328200 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132328367 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132328373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132328383 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132328387 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132328394 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132328506 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132328534 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132328535 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132328575 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132328791 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132328868 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132328881 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 132328894 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 132328901 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 132328951 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 132329125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132329196 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132329206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132329209 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132329234 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132329357 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132329368 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132329421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132329703 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132329776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132329803 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132329804 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132330007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132330012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132330053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132330070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132330120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132330140 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132330179 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132330222 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132330297 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132330636 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132330703 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 132331012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132331050 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 132331062 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 132331072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132331105 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 132331123 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 132331231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132331480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132332043 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132332845 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132333170 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132333837 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132333850 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132333933 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132334181 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 132336886 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132337505 C T N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 132337583 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 132338172 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132338298 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 132338466 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132339235 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132340369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132340861 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132341215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132342820 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132343248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132344049 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132344107 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132344115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132345021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132345404 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 132345412 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 132345622 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132345633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132345750 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132345800 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132345849 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132345938 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132346002 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132346071 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132346390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132346537 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132346635 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 132346702 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132346721 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132346872 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132346877 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132347759 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132347978 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132348689 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 132349069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132349215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132349499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132349546 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132349924 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 132350024 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132350105 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 132350167 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132350182 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132350264 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132350724 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132350921 C A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 132351092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132352066 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132352259 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132352440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132353015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132353672 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132354455 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132356865 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132358334 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 132358874 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132359706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132361350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132363166 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132364318 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132365184 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132365388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132365718 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 132365967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132366166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132366465 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132368844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132369086 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132371605 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 132372981 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132373686 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 132374279 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132374392 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132375307 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 132379499 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132379850 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132382034 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132382954 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132384852 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132386217 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 132386310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132387889 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 132388720 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132389213 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132391880 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132394666 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132395612 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132396493 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132401433 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132401528 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132401567 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132401667 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132402472 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132403281 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132405346 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132405581 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132407074 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 132407129 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 132407708 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132407975 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132408149 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132409082 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132409144 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 132409384 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132409483 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132410261 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132410273 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132410305 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132410361 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132410373 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132410526 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132410881 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 132411179 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 132411345 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132411395 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132411621 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132411670 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 132411745 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132411782 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 132411808 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132411809 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132411833 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132411843 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 132412414 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132412570 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132412663 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132412681 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132412690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132412805 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132412873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132412949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132413100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132413110 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132413126 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132413129 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132413246 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132414049 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132414326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132414445 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132415782 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132415793 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132416477 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132416482 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132416593 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132416623 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132416948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132417031 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132417049 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132417240 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 132417820 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132418225 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132418284 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132418379 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132419040 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132419182 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 132419428 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132419744 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132419791 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132419844 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132420285 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132420401 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 132420969 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132421494 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132421596 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132422212 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132422232 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 132422821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132423011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132423204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132423403 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 132423929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132424633 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 132425113 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132425121 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132425218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132425504 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 132425712 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132425973 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132426111 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 132426122 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132426208 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 132426209 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132426226 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 132426263 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132426268 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132426286 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132426341 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132426598 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132426685 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132427520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132428651 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132428731 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132428746 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132428830 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132428962 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 132429018 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132429093 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132429151 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132429220 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 132429341 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132429626 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132429824 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132429956 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 132430230 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132430701 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132430950 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132430955 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132431464 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 132431526 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132431862 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 132432483 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 132432499 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 132432519 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 132432645 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132432789 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132432881 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132432935 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132432944 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132433059 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 132433168 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132433232 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132433422 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132433642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132434647 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 132434804 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132435499 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132435678 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 132435882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132436104 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132436272 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132436402 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132437731 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132437799 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132438674 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132438893 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132439520 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132442181 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132442836 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132443265 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 132443779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132443789 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 132443815 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132443897 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132443919 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132443999 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132444039 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132444077 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132444153 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132444154 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132444446 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132444548 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132444575 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132444908 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132445025 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132445130 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132445140 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132445193 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132445240 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132445550 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132446183 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132446315 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 132446838 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 132447020 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132447163 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 132447446 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132447566 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132447600 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 132448365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132448938 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 132449213 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132450021 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132450134 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132450481 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132450621 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132451159 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132451252 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132451463 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132451818 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132452500 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132453560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132453826 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132454126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132454132 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132454148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132454267 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132454786 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132454901 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132454920 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132455003 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 132455040 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132455201 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132455251 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 132455317 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 132456003 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 132456200 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132456710 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132456717 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132456869 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 132456982 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132457056 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132457061 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132457090 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132457155 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 132457383 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 132458018 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132458104 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132458364 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132458367 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132458457 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132458848 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132458920 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132458921 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132458985 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132459026 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132459158 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132459159 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132459186 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132459229 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132459235 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132459484 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132459489 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132459545 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 132459615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132459680 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132459687 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132459759 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 132459883 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 132460282 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132460323 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132460348 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132460668 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132460821 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132460847 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132460853 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 132461034 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 132461175 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 132461224 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132461267 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 132461377 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 132461394 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132461749 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132462011 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132462861 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132463116 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 132463154 A C N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 132463170 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 132463195 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 132463238 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 132463356 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132463396 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132463654 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132463688 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132463703 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132463755 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132463859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132463932 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132464084 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132464190 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132464205 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132464417 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132464459 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132465109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132465155 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132465156 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132465431 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132465435 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132465605 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132465611 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132465649 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132465794 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132465998 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 132466000 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132466046 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 132466115 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132466321 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132466387 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132466433 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132466500 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 132466547 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132466633 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 132466789 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132466944 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132467649 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 132467867 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132467878 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132467896 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 132467978 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132468162 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132468279 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132468343 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132468383 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132468530 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132469780 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132471003 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 132471101 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 132475496 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132476026 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 132476883 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 132477308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132478015 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 132479852 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 132481230 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 132482694 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132483049 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132483193 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 132483221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132483662 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132484157 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 132484248 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 132484338 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 132484350 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 132484457 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132484485 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 132484520 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 132484580 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 132484595 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 132484603 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 132484703 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 132484724 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 132484782 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 132484789 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 132484887 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 132484933 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 132484944 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 132484994 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 132485037 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 132485088 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 132485252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132485305 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 132485317 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 132485400 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 132485404 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 132485453 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 132485575 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 132486004 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 132486117 T A Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 132486129 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 132486320 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 132486322 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 132486500 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132486534 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132486549 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132486620 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 132486622 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 132486638 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132486643 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132486687 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132486766 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 132486798 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 132486809 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 132486835 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 132486869 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 132486975 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 132487075 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132487087 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132487099 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132487109 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132487117 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 132487135 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 132487145 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 132487156 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132487192 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132487216 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132487232 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132487249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132487270 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 132487280 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 132487293 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 132487349 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 132487360 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 132487396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132487537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132487573 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 132487682 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132487717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132487735 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132487744 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132487752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132487823 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 132487842 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132487866 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 132487920 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132487938 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132488089 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132488157 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132488495 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 132488590 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132489172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132489176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132489186 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132489295 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 132489616 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 132489747 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132489764 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132489768 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132489824 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 132490557 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132490779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132491140 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132491602 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132492081 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132492102 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132492129 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 132492338 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 132492534 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132492642 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132492697 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 132492845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132492870 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 132492905 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132493233 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132493237 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132493300 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 132493393 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132493753 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 132493818 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 132493848 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 132493910 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 132494045 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132494053 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 132494144 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 132494157 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132494356 A T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 132494376 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132494463 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 132494477 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 132494479 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 132494501 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132494541 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 132494595 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132494620 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 132494625 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 132495020 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132495189 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132495233 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 132495256 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132495264 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132495330 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132495334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132495357 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132495381 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132495386 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 132495540 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 132495542 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132495555 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 132495559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132495629 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 132495706 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 132495890 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132495898 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132495929 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 132496003 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132496095 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132496225 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 132496230 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132496420 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 132496451 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 132496481 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132496559 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 132496575 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 132496601 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 132496604 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 132496645 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 132496664 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 132496668 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 132496679 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 132496735 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 132496774 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 132496779 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 132496790 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 132496824 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 132497262 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 132497306 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132497313 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 132497365 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 132497462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132497479 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 132497503 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132497543 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 132497721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132498055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132498617 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132498638 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 132498695 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 132498732 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 132498864 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 132498879 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 132498941 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132498977 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 132499007 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 132499018 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 132499026 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132499174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132499202 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 132499208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132499227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132499246 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 132499257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132499298 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 132499326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132499380 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132499524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132499562 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 132499607 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 132499726 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 132499739 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 132499776 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132499778 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132499789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132499891 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 132499949 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 132499965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132500009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132500064 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132500072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132500311 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 132500486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132500522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132500734 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132500775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132500793 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 132500821 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 132500925 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132501097 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132501098 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132501147 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132501157 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132501186 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132501225 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132501368 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132501402 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132501511 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132501513 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132501612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132501676 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132501697 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132501704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132501742 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132501771 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 132501900 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 132501981 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 132502013 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 132502209 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 132502711 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 132502807 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 132502976 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 132503157 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 132503382 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 132503404 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132503729 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132505194 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 132507810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132508234 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132508453 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132510427 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132510517 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132510589 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 132510614 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132510626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132510669 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132510835 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132510849 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132510855 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 132511001 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132511010 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132511542 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 132511565 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 132511792 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132511871 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132512386 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 132512656 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 132513924 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132514293 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 132514296 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 132514318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132515398 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132515951 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132516151 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132516378 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132517550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132517753 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 132517776 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132517793 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132518398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132519096 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132519434 C G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 132520293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132520452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132520778 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132524379 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 132524878 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132525084 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132525147 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 132525229 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132525239 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132525243 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132525266 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 132525402 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132525568 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132525570 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132525589 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132525855 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 132525889 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 132526228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132526267 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 132526298 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132526312 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132526322 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132526353 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132526480 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132526807 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132526940 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132526997 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132527197 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132527242 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 132527321 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132527331 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 132527472 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 132527665 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 132527707 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 132527863 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132527877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132528131 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132528257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132528291 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 132528341 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 132528356 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132528497 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132528578 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132528602 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 132528620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132528719 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132528867 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132528880 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132529540 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 132531016 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132531350 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 132531790 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 132532160 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132532232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132536147 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132537631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132537931 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 132539364 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132540114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132540839 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 132541125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132542747 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132544396 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132544705 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132544816 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132544922 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132545002 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 132545127 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132545506 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 132545514 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132545662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132545678 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132545742 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132545812 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132545818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132545867 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 132545964 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132546190 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132546204 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132546258 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 132546420 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132546552 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132547179 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132547334 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132547407 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 132547792 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132548940 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 132548998 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 132549496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132549536 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132550083 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132550879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132551538 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132552044 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132552104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132552105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132554984 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132557570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132557651 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132558172 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132558209 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132559403 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132559896 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 132559949 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 132560132 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132560162 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132560296 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132560510 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 132560537 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132560543 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 132560716 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132560796 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 132560839 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132560895 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 132560976 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 132561327 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 132561464 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 132561671 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132561745 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 132561817 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 132561827 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 132561843 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 132561873 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 132562107 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 132562129 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 132562389 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132562638 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132562713 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 132562820 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 132562984 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 132563003 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 132563067 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132563286 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132563981 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132563994 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 132564338 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132565391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132565675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132566123 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132568579 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 132568628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132568722 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132569093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132569711 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132573320 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132573836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132575835 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132575883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132576978 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132577014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132577453 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132577702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132578590 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132579585 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 132580006 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 132580022 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 132581513 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 132581614 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 132581883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132582351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132582873 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132584802 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132585620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132585791 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132586457 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132587529 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132588578 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132588668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132589117 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 132589972 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132590607 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132592341 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132594870 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 132594961 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132595409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132595827 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 132596572 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 132596586 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132596900 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 132597013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132597147 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132597753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132597934 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132598106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132599507 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132600724 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132601235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132601255 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132601945 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132603037 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132604069 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132604606 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132605430 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 132605720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132606057 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 132606272 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132606367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132606452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132606522 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132606691 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 132607389 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132610037 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132610862 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132610889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132612101 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132612124 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132613032 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132614849 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 132615119 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 132617040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132617124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132617203 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132617544 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132617629 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 132618178 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132620176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132620330 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132620348 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 132620578 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132622252 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132622599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132624104 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132624226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132624292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132624336 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132624546 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132624605 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132624671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132624757 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132624826 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132624950 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132625395 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132625438 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132625496 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132625595 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132625637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132625998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132626065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132626178 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132626182 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132626487 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132626501 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132627856 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 132627932 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132628580 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132628706 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132629819 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132630666 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132631319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132631476 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132631957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132632303 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 132632628 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 132633380 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 132633406 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 132633770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132634094 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132634104 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132634127 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132634418 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132634575 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132634905 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132635105 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 132635236 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132635316 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 132635333 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132635407 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132635411 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 132635447 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132635484 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132635519 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132635737 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132635804 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132635854 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132636012 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 132636140 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132636191 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 132636331 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132636379 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132636476 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132636477 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132636673 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132636907 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 132637015 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 132637049 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 132637052 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 132637113 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 132637248 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 132637262 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 132637267 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 132637306 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 132638208 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 132638216 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132638241 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132638384 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132638420 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132638537 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132638824 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 132638889 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 132638998 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 132639057 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 132639082 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 132639140 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 132639194 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132639281 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132639305 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132639334 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 132639373 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 132639392 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132639410 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132639569 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 132639647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132639880 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 132639911 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 132639937 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132639974 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132639976 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132640037 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132640049 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132640129 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132640234 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132640236 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 132640305 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132640352 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 132640457 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132640459 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132640570 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 132640601 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 132640848 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 132640866 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 132642464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132643728 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132644315 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 132645506 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132645512 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132646827 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132649584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132652250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132652427 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132652545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132652995 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132653490 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132653566 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132653697 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132654156 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132654269 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132654455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132654558 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132654681 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132654702 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 132654824 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132654839 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132654885 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132654922 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132654943 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132655045 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132655086 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132655404 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132655444 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132655638 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132655650 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132655716 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 132655773 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 132656469 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132656694 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132656773 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132656857 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 132656877 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 132657064 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132657066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132657131 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132657201 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 132657271 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 132657499 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132657550 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132657726 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132657778 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132658043 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132658198 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132658226 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132658747 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132658826 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132658886 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132659005 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132659012 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132659191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132659207 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132659252 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132659414 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132659489 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132659498 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132659517 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132659570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132659607 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132659703 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132659705 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132659801 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132659844 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132659881 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132660400 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132660437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132660625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132660653 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132660729 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132660858 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132660905 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 132661068 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132661166 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132661167 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 132661191 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132661274 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132661500 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132661694 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132661701 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132661717 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132661741 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132661793 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132661835 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 132661845 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 132661870 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 132661893 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 132662080 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 132662112 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132662205 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132662422 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132662790 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132662823 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132662951 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132662961 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132662963 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132663074 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132663287 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132663352 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132663353 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132663366 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132663389 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 132663414 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 132663492 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132664050 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132664060 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132664086 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132664094 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132664680 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132664719 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132664790 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132664799 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132665064 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132665205 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132665767 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132665997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132666035 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132666308 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132666316 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 132666571 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132666572 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132666594 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132666708 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132666928 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132667004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132667153 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132667194 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132667205 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132667390 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132667628 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132667867 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132667875 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132667933 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132668092 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 132668196 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 132668329 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132668468 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132668593 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132668611 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132668851 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132668923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132669072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132669185 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132669186 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132669500 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 132669535 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 132669545 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 132669607 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132669970 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132669978 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 132670059 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 132670114 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132670676 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132671494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132671746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132672510 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 132673879 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 132674070 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132674505 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 132674623 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132674899 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132674929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132674946 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 132675336 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132675539 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132675786 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132675801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132675857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132675892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132675910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132675922 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132676087 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132676212 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132676228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132676426 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132676446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132676451 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 132676485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132676498 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132676516 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132676732 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132676737 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132676772 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132676894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132677026 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 132677063 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 132677958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132678471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132678639 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132678695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132679055 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 132679255 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 132679297 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132679370 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 132679662 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 132680023 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 132680151 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132680206 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 132680209 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132680417 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 132680809 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 132680855 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 132680912 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132680999 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 132681007 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132681067 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132681073 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 132681183 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132681562 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132682337 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132682457 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 132682724 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 132682782 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132684180 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132684455 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132684462 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132684539 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132684645 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 132684835 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132684864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132684946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132684961 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 132685021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132685066 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132685179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132685216 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132685482 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 132685694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132686521 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 132686548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132686654 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132687430 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132687971 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 132688046 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132688157 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 132688736 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132688749 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132688902 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132689140 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 132691370 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132691495 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 132693013 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132693022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132694549 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 132696460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132698359 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 132698814 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132698919 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132699380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132699548 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 132699986 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 132699990 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 132701257 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132701294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132702343 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 132702470 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 132702486 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132702692 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 132702925 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132702982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132703316 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132703378 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132703719 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 132704392 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 132704413 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132706834 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132707130 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132707369 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132708916 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 132708992 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 132717983 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132718149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132718454 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132719052 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132719087 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132719288 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132719324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132719577 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132719628 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132719632 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132719645 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132719653 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132719716 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132719893 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132720206 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132720477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132720485 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132720861 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132721132 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132721280 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 132721296 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 132721306 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 132721358 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 132721383 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 132721475 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 132721548 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132721549 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132721583 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132721585 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132721622 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132721629 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132721653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132721728 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132721776 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132721837 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132721838 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132721902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132721913 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132721945 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132722022 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 132722045 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132722840 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132725377 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 132725958 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132726501 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 132726741 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 132726861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132726908 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132726941 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 132726954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132727027 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132727044 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132727158 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132727159 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132727171 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 132728059 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132728064 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132728142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132728261 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132728296 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132728923 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132730196 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132730285 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132730315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132730316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132730412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132730452 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 132730633 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 132731037 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132731047 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132731164 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 132731302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132731569 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132731605 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132731735 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132731758 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132731803 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132731883 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132731884 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132733914 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 132734207 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 132734706 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 132735229 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 132735305 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132735356 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 132735370 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132735438 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 132735503 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132735516 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132735681 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132735774 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132735775 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132735839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132735913 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132735925 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 132736042 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 132736144 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 132736292 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 132736393 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132736395 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132736471 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 132736559 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132736636 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 132736704 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 132736721 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132736757 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 132736850 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 132736989 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132736995 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132737018 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132737043 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132737117 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132737182 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132737494 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132737809 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132738103 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132738469 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132738650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132738685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132738932 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132739081 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132739426 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132739428 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132739737 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 132739759 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132739796 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132739980 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132739986 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 132740046 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 132740116 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 132740368 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 132740424 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 132740435 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132740496 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 132740553 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 132740719 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 132740743 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 132740861 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 132741666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132742230 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132742400 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132742436 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132742503 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132742852 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132744370 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132745014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132745604 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 132746824 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132746875 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132747480 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132747528 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132748679 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132749499 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132749739 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132749800 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 132750469 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 132750640 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132751012 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132751634 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 132751650 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 132751742 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132751744 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132755037 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132755157 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132755335 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132755466 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132755618 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 132756071 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 132758641 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132759717 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132763171 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132764569 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 132764583 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 132765312 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132765323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132766706 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 132767157 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132767222 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132767226 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132767370 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132767480 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132767906 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 132768249 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 132768270 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 132768749 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132768861 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132769055 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132769171 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132769284 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132769350 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132769883 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132770120 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132770362 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 132770448 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132770898 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132771179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132772273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132773065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132774057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132774538 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132775218 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132775416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132775463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132776826 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132777063 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 132777087 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 132777433 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 132777521 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132777524 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132777539 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132777601 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132777647 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132777731 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132777771 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132777794 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132780362 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132781815 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132781873 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132782170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132784011 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132784577 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132784675 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132785101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132786356 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132789766 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 132790461 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132790487 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132791732 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132791753 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132791907 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132792379 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132792495 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132792496 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132792648 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132792731 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132792747 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132792749 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132792775 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132792828 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132793015 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132793113 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132793300 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132793432 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132793477 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132793484 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132793515 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 132793560 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 132793589 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 132793755 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132793773 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132793778 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132793793 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132793805 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 132794521 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132794607 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132794769 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132794832 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132794849 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132794888 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132794921 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132794987 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132795541 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132795637 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132795767 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132795808 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132795814 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132796434 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132796631 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132796650 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132796968 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132797154 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132797544 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132798678 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132798698 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132799085 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132799111 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132799929 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132803532 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132804205 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132804377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132806423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132807325 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132807336 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132807992 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132808869 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132809110 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132809150 G C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 132810436 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132810503 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132810508 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132810556 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132810592 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132810687 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132810849 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132811445 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132811606 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 132811876 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132811933 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 132812220 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132812266 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 132812393 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 132812410 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 132813023 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132813165 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132813226 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132813294 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132814354 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 132814368 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132815350 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132815415 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132816268 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132816319 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132816607 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132817349 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132817925 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132819298 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132819352 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132819447 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132819539 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132819749 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 132819974 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132820029 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132822116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132822251 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 132823320 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 132823352 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 132825430 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 132826750 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 132826883 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 132827111 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132827153 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 132827785 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132827799 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132827843 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 132827911 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132827980 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132828012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132828021 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 132828048 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 132828264 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132828272 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132828388 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 132828907 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132828923 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132828935 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132828944 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132828965 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132828996 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132829003 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132829012 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132829026 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132829084 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132829134 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132829357 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132829407 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 132830014 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 132830393 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132830401 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 132831283 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 132831390 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 132831441 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132831980 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 132832017 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 132832211 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 132832445 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 132832801 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132832981 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132833475 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 132834260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132835741 A T Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 132835817 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 132836919 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132837076 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 132837228 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132837335 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132838408 G A Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 2 132838439 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 2 132840104 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 132840194 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 132840662 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 132841906 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 132843110 T C Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 132843257 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 132843945 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 132843976 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 132844188 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 132844215 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132844224 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132844412 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 132844567 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132844665 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 132844799 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132845472 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 132845749 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132845762 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 132845777 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132845782 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 132845825 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132845830 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 132845867 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132846094 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 132846256 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132846354 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132846378 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132846403 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132846495 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132846603 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132846789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132846795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132846882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132846980 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132847029 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132847057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132847277 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 132847318 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132847325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132847340 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 132847365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132847384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132847399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132847418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132847494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132847499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132848221 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 132848242 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 132848563 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 132850220 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132851814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132856660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132861422 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132861975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132866176 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 132872045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132872239 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132874372 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 132879082 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 132879087 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132880222 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132881857 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132882917 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132890932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132910430 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 132912613 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132912843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132913949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132916720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132916955 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132917144 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132919399 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 132919926 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132920138 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132920183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132920190 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132920213 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132920783 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 132921176 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132922053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132922154 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 132922549 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 132922578 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132923475 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 132923503 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132923737 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132923802 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132923982 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132924143 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132924147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132924273 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132924284 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132924307 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132924321 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132924345 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132924349 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132924364 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132924384 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132924460 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 132924516 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132924697 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132924700 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132924902 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132924924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132924953 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132925062 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 132925102 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132925215 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132925267 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132925302 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132925328 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132925334 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 132925420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132925435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132925464 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132925483 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132925527 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132925567 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132925688 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132925770 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 132925774 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 132925921 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132926139 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132926190 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132926210 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132926323 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 132926457 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132926683 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132927079 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132927143 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132927173 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132927390 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132927408 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 132927465 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 132927484 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132927507 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132927624 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132927713 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132927727 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 132927728 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 132927814 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132927847 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 132927914 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 132928004 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 132928096 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132928104 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 132928132 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 132928201 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132928238 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132928249 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132928274 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132928371 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132928461 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 132928470 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132928486 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 132928491 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 132928528 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 132928794 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132928800 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132928813 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 132928977 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132928984 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132929165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132929231 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132929278 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 2 132929313 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132929518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132929776 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132929828 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 132929882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132930119 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132930221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132930312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132930404 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 132930432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132930489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132930771 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132930787 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132930852 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132930881 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132931000 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132931035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132931102 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132931104 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132931122 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132931169 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 132931266 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132931282 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132931436 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 132931463 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132931652 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 132931658 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 132931689 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132931710 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132932015 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132932028 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132932032 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 132932078 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132932284 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132932291 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 132932367 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132932371 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132932671 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132933516 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132933541 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132933589 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 132933647 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 132933682 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 132933715 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 132933967 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 132934216 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 132934263 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132934356 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 132934432 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 132934642 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 132934647 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 132934867 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 132934925 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 132935040 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132935251 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 132935279 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132935309 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132935338 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 132935361 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 132935543 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 132935567 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 132935629 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 132935924 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 132935954 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 132936049 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 132936165 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 132936423 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 132936927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132939254 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 132939903 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 132940123 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 132940146 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 132940614 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 132940900 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 132940994 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 132941339 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132941450 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132941525 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 132944863 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 132945410 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132945532 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132945965 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 132946030 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 132946179 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132946743 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132949018 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 132949037 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132949345 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132950198 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132950757 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132951679 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132953904 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132954044 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 132954340 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132955920 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 132957562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132958632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132958967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132959312 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 132959646 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 132960916 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132961918 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 132963097 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132968496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132968585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132969101 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 132969896 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 132969999 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132970068 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132970399 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132970438 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132970826 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132971266 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132971639 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 132971643 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 132971657 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 132971917 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 132971933 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 132972009 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 132972177 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 132972315 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 132972707 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132972710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132972743 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 132972996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132974199 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 132974219 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132974286 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132974334 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132974349 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 132974377 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132974710 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132974858 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 132974868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 132974924 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 132974949 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 132975125 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 132975174 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 132975210 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 132975256 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132975299 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 132975420 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 132975480 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 132975763 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 132975834 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 132975939 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 132976078 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 132976111 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132976189 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132976246 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132976334 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 132976501 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132976559 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132976637 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 132976641 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132976677 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132976889 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132976987 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132977011 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132977092 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 132977106 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132977152 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 132977159 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 132977389 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 132977462 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 132977504 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 132977587 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 132977645 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 132977927 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132977958 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 132978007 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 132978206 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 132978235 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 132978288 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 132978307 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 132978418 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 132978452 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132978616 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132978811 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132978822 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132978841 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132978996 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 132979209 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132979319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 132980058 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132980212 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 132980546 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 132980965 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 132981360 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 132981479 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 132981490 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 132982259 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 132982304 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132982807 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132982926 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 132983176 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 132983177 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 132983548 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132983668 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 132983669 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 132983713 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 132983806 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 132983863 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 132983884 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 132984295 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 132984357 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 132984396 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 132984506 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 132984524 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 132984554 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 132984574 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 132984838 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 132984857 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132987921 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 132988173 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 132988471 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132988777 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 132988819 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 132989912 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 132991261 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 132991723 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 132991775 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 132994038 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 132996218 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 132998027 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133000361 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133003003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133005708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133005849 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133007939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133009468 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 133009527 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133009611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133009729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133009976 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 133010136 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133010753 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 133010838 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 133012517 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133012518 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133012730 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133012766 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 133012895 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 133014469 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 133014851 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 133014897 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 133014903 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 133015032 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133015181 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133015219 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 133015308 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133015391 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 133015407 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 133015552 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133015562 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 133015570 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 133015586 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 133015636 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133015640 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133015691 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133015750 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 133015751 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 133016010 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 133016147 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 133016490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133016714 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133016769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133016924 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 133016928 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 133016967 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133017015 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133017024 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 133017055 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133017114 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133017445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133017528 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133018705 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 133019289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133019747 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 133019902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133019904 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133019952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133020030 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 133020911 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 133020943 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 133020958 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 133022656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133024147 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133024949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133025564 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133025732 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133025907 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 133026205 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133026386 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133027215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133027945 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 133028450 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133028713 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133028962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133029166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133030225 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133030488 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133031674 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133032389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133032419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133035003 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133036178 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133036348 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 133036397 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133036726 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133036803 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133036822 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 133036831 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133036871 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133036932 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133036958 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133036992 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133037021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133037025 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133037412 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133037594 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133037652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133037741 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133037780 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133038052 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133038084 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133038137 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133038515 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133038543 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 133038753 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 133038801 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133038820 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133038857 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 133039181 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 133039304 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 133039565 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 133039593 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 133039662 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 133039728 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 133040079 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133040288 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 133040313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133040347 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 133040669 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 133040970 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 133041145 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 133041471 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133041541 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133041581 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133041591 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133041648 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133041694 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 133041988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133042153 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 133042223 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 133042449 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 133042508 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 133042587 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 133042730 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133043109 T G Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 133043151 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 133043158 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 133044756 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133045950 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133047155 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133047821 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133049212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133053470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133055021 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133055432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133055750 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133056010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133056578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133056870 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133057525 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133060967 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 133061409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133061456 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 133061575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133064861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133071677 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133073021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133073542 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133073841 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 133073972 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 133074032 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133074036 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133074587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133074747 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133075029 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133075454 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133075835 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133075863 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133075895 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133076013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133076165 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133076173 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133076433 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133076487 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133076593 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133077105 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 133077247 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133077366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133077475 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133077625 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133077870 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133078550 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133079045 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133079065 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133080892 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133081054 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 133081231 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 133081245 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 133081299 G A N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 133081305 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 133087848 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133087910 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 133087958 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133087982 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 133088108 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 133088235 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 133088249 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133088279 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133088328 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133088330 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133088521 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 133088566 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 133088770 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 133088773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133088890 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133088931 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133089286 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133089317 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133089400 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133089470 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133089610 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133090018 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 133090044 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 133090063 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133090075 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133090078 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133090099 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133090146 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133090402 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133090471 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 133090892 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 133091049 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133091298 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 133091336 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133091358 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 133091374 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 133091394 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133091435 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133091473 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 133091514 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 133091572 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133091593 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133091797 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 133092091 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133092123 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133092133 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133092139 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133092160 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133092190 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133092409 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133092445 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133092621 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 133092632 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133092710 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133092750 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 133092844 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 133092873 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 133092904 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 133092950 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 133093016 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133093022 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 133093170 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133093681 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 133093724 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 133093757 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 133093829 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 133093911 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133094067 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133094081 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133094111 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 133094201 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133094222 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 133094321 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 133094551 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 133094690 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 133094821 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133094999 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133095029 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133095032 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133095081 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133095476 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133095493 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 133095548 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133095993 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 133096139 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133096274 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133096339 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133096515 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 133096540 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133096616 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 133096635 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 133097747 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 133099100 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133099210 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133099387 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133099913 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133101853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133102309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133103525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133106039 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133107013 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 133107447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133108309 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133109411 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133111340 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133111518 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 133112243 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133112580 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133113398 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 133115068 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133115845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133116700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133117758 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133118751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133119990 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133120074 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133121028 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133121140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133121238 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 133121396 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 133121432 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133121724 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133121979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133122150 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133122575 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 133122843 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133123107 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 133123163 A C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 133124589 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 133124734 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133124794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133125055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133125065 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133125069 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133125197 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 133125231 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133125269 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133125282 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133125399 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133125413 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133125426 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133125514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133125781 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133125802 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133125916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133126149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133126235 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133126279 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133126297 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133126825 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133126910 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133127062 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133127114 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133127385 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133127454 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 133127493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133127555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133127585 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 133127586 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 133127604 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 133127696 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 133127717 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133127822 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133128018 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 133128151 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 133128443 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 133128552 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133128747 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133128779 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133129006 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133129100 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133129132 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133129135 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133129273 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133129304 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133129372 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133129384 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133129421 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133129517 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133129825 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133129836 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133129996 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133130435 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133130745 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133131074 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133131138 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133131284 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133131297 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133131298 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133131375 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133131419 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 133131503 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133131915 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133132175 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133132290 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133132357 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133132467 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133132752 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133132834 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 133132921 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133133082 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133133165 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133133250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133133473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133133508 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133133570 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133133585 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133133924 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133133926 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133133943 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133134023 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133134098 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133134490 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133134580 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133134582 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133134594 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133134608 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133134647 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133134703 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133134737 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133134751 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133134787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133134795 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133134861 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 133134881 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133134931 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133135449 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133135458 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133135839 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133136351 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133136631 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133136778 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133137281 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 133137511 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133138074 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133138252 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133138292 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133138603 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133139008 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133139161 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133139254 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133140049 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133140247 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 133140395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133142864 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 133142958 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133144932 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133145886 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 133145977 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 133146761 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133149180 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 133149191 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 133149219 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133149225 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 133149560 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133149608 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 133149634 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 133149672 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 133150354 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133150900 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 133151109 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 133151197 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133151317 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133151446 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 133151560 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133153423 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 133153652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133153682 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133153796 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133155634 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133155753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133157361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133157844 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133160939 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133161554 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133161980 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133166402 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133166450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133167499 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133168383 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133168480 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 133168748 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133169006 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133169313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133169437 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133169476 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133169513 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133170987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133173073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133174855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133175444 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 133176562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133181153 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133181618 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133182381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133183849 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133184179 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133184489 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 133184729 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 133185218 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133185251 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133186721 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133187246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133187786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133188313 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133188571 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133189124 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133190138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133190218 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133190447 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133190976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133190996 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133191236 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133191288 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133191540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133191891 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 133191964 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133192255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133192405 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133192861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133193704 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133194124 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133194190 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133194252 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133196010 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133198106 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133198716 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 133198730 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 133200901 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133202934 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 133203053 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133203498 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133203564 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133203616 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133203696 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133203983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133204112 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133204123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133205243 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133206964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133207572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133208091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133208534 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 133209475 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133210117 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133210626 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133211152 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133212374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133212482 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133212553 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133212584 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133213051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133213381 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133214605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133215259 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133215635 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133216054 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133216146 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133216246 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133216690 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 133216725 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133217505 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 133218070 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133218633 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133218787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133219575 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 133220299 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133221231 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133221884 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133222047 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133222630 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133222856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133223081 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133225550 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133226315 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 133226617 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133227242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133227275 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133227342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133227403 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 133227503 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 133228313 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133228438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133228451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133228526 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 133228555 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 133229552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133230823 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133231662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133231681 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 133231798 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133232486 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133232731 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133232743 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 133233321 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 133233417 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 133233424 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 133234159 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133234861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133235100 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 133236084 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133236397 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 133237056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133238067 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 133238908 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133239154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133240192 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133240364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133241390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133241465 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133241667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133241817 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133242072 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 133242115 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133242448 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133243921 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 133244019 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133245392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133245484 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133245494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133246147 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133246317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133246334 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133248729 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133249714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133250387 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133251146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133251636 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133252289 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 133252309 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 133252487 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133252615 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133252661 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 133253033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133253168 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133253318 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 133253609 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133254134 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133254186 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133254935 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133255822 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 133255988 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133256412 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 133257350 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133257671 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133257991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133258210 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 133258253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133258508 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 133258545 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 133258695 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 133258924 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133258952 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133258976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133258977 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133259091 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 133259108 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 133259216 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133259259 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 133259271 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 133259865 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133259869 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133260014 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 133260149 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133260213 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133260266 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133260436 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133260447 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133260502 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 133260650 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133260775 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133260789 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133260916 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 133260954 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133260979 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 133260985 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 133261185 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133261202 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133261205 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133261252 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133261988 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133261989 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133262363 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 133262804 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 133263008 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133263030 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 133263528 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 133264957 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133265065 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133265979 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 133265984 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 133266380 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 133266594 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 133266744 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 133266774 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 133266801 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133266858 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 133267255 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 133268385 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133268424 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133268481 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133268550 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133268619 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133268772 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 133268891 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133268959 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133268993 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133269028 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133269122 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133269123 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133269190 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133269600 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133269695 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 133270215 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133270266 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133270338 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133270376 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133270825 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133270981 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133270998 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133271037 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133271077 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133271134 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 133271157 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133271368 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133271601 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133271609 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133271882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133271972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133272174 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133275851 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133276961 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133276974 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133277866 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133278918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133279399 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 133279885 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133280019 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 133280041 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 133280226 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133280405 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 133280407 T G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 133280489 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133280531 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133280673 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133280979 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133281047 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133281069 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133281073 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133282145 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133282191 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133282207 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133282507 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133282509 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133282534 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133282601 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 133282662 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133282682 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133282824 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133282960 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133283171 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 133283268 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133283280 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133283299 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 133283460 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133283578 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133283813 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133283905 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133283926 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133284221 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133284348 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133284665 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133284666 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133284883 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133285153 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133285243 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133285292 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133285401 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133285764 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133285926 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133285943 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133285944 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133286003 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133286022 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133286050 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133286176 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133286307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133286372 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133286373 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133286482 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 133286515 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133286618 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133286805 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133287000 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133287131 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133287348 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133287494 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133287514 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133287578 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133287600 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133288050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133288112 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133288346 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133288380 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133288391 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 133288394 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133288421 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133288441 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133288511 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133288610 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133288718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133289238 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 133289314 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133289747 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133290054 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 133290168 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133290275 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133290441 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133291217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133293179 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133293182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133293532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133293671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133294471 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 133294514 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 133294903 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133295416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133295467 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133295829 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133296086 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133296601 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133296750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133297364 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 133298149 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 133298354 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133298615 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133300510 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133303978 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133304014 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133304400 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133304481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133304900 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 133305265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133306346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133306753 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133306912 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133306924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133307021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133308017 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133308326 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 133309758 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133309837 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133310195 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133310674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133310913 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133310949 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 133310973 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133311221 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133311241 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133311259 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133311506 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133311626 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133311627 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133311660 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133311736 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133311738 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133311756 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133311786 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 133311831 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133312004 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 133312086 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133312113 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 133312152 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133312155 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133312185 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 133312243 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133312345 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133313104 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133313182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133313228 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133313281 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133313287 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133313362 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 133313497 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133313556 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 133313566 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133313810 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133313928 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 133313934 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133314005 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133314015 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133314407 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133314430 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133314653 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133314959 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 133315016 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 133315128 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133315213 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 133315306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133316963 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133317227 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 133317875 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133318457 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133318529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133318852 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133319028 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133319249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133319302 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133319476 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133319725 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 133319769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133320086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133320108 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133321128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133322886 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133323028 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133323128 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133324444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133324464 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133324500 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133324738 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133325069 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133325573 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133325631 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133325843 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133326681 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 133327094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133327323 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133327415 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 133327558 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133327650 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133328129 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 133328375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133329067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133329111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133329380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133329722 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133330714 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133330729 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133331026 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 133331071 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 133331075 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 133331103 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133331161 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133331339 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 133331476 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133331849 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133331934 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 133331987 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133332185 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133332239 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 133332288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133332293 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 133332380 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 133332448 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133332452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133332650 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 133332662 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133332727 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133332814 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 133332847 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 133332998 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133333017 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133333027 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133333094 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 133333900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133334064 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133334449 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 133335759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133336869 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 133336875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133337037 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 133337955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133338320 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133338628 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133339163 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133339250 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133339760 C A Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 133340038 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133340313 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133340496 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133340574 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 133340648 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133340668 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133341923 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133341966 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 133342052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133343092 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 133343431 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 133345403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133346268 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133346294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133346598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133346644 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133346892 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133347820 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133347883 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133348439 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133349655 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 133350707 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 133351910 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 133352328 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 133352357 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 133352819 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 133353036 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133353096 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133353984 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 133354508 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133354625 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133354873 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 133354938 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133354976 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133355365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133355814 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 133356169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133356861 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133357167 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133357224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133357646 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 133357763 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 133357928 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133358207 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 133358243 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 133358382 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133358517 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133358708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133358968 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133359048 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 133359171 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133359217 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133359233 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 133359322 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 133359580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133359986 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133360269 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133361018 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133361246 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133361365 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133361367 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133361487 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133362036 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 133362142 T C Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 133362169 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 133362250 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 133362445 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 133363293 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 133364072 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133364587 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 133366414 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 133366641 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133367478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133370699 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 133372486 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 133374596 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133375074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133375085 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133375119 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133375922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133376218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133377679 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 133379757 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 133380589 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 133380654 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 133380786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133382225 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 133382353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133382442 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133383258 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133384622 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133385212 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 133386145 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 133386285 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 133386620 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 133386623 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 133393108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133393164 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133393379 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133393387 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133393774 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 133394006 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 133394277 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 133394436 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 133394460 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 133394527 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 133394918 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 133395107 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 133395116 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 133395128 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 133395233 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133395610 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 133395763 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133396478 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133396632 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 133397068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133397277 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133397707 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 133397950 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133397958 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133397998 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133398141 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133398151 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133398158 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133398371 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133398824 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133398844 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133400556 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133401903 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 133402301 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 133404224 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133404293 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 133404567 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133405139 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133405414 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133405472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133405791 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133405833 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 133405842 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 133405848 G T Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 133405875 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 133405894 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 133405925 T A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 133405943 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 133405948 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 133405963 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 133406027 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 133406032 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 133406053 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 133406063 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 133406079 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 133406087 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133406226 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 133406228 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133406259 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 133406301 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 133406386 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133406409 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133406435 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 133406785 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 133406878 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 133407098 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 133407106 A C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 133407136 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 133407213 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 133407265 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 133407355 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 133407394 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 133407777 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 133407897 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133408101 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133408108 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133408122 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 133408274 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133408506 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133408531 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133408598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133408649 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133408773 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 133408877 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133409203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133409254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133409536 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 133409596 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 133409660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133409681 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133409907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133410064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133410440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133410722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133410886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133410948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133411226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133411381 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133411591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133411608 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133411741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133411848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133411964 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133412504 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 133413931 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133414016 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133414107 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133414287 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133414798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133414901 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133414918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133414975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133415196 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 133415236 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133415322 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 133415339 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 133415600 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133415965 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133416024 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 133416087 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133416107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133416117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133416231 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133416254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133416350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133416515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133416524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133416573 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 133417577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133418014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133418329 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 133418409 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 133418433 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 133418472 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 133418495 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 133418496 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 133419227 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 133419318 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 133419500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133419611 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 133419626 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 133419675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133419741 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133420123 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 133421032 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133421178 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133422360 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 133423991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133424740 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 133425849 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 133427795 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 133428097 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 133428323 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133428878 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133428891 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 133429150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133429567 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133429840 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133430592 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133431042 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133431095 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133431420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133431716 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133431775 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133431863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133431985 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133432473 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133433034 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133433907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133434101 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133434631 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133435372 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133435600 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 133435709 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133435777 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 133435874 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133435881 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133436321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133437552 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 133437553 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 133437904 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133437958 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133438046 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133438344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133439130 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133440014 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 133440021 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133440289 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133440593 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133440631 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 133441510 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133441568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133441658 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133441759 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133441803 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133441809 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 133441865 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 133441999 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133442051 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 133442131 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133442226 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 133442283 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 133442284 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 133442434 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133442451 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133442602 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 133442606 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 133442983 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 133443000 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 133443216 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133443449 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133443717 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133443978 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133444345 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133444383 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 133444434 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133444602 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 133444747 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 133444919 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133445013 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133445043 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 133445095 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 133445226 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 133445239 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 133445470 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 133445543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133445563 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 133445705 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133445709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133446174 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133446462 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133446477 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133446506 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133446996 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 133447521 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133447523 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133447644 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133447863 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133448043 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133448257 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 133449282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133449387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133449666 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133449847 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133449854 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133450398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133450830 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133451072 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133452185 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 133452627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133452742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133455603 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 133456326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133457115 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133457335 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133457518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133458434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133460180 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 133461759 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 133462090 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 133462205 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133462448 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133462577 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 133462741 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 133462802 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 133462829 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 133462847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133463246 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 133463247 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133463278 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 133463296 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 133463298 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 133463371 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133463393 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 133463524 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 133463663 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 133463711 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 133463974 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 133464209 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 133464329 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133464794 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 133464842 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 133464849 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 133465005 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 133465124 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 133465265 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 133465396 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 133465543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133465810 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 133465824 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 133465878 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 133465920 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133465989 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 133466030 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 133466034 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 133466104 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 133466191 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 133466211 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 133466306 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133466446 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 133466500 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 133466568 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 2 133466633 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 133466671 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 133466701 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 133466879 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 133467058 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 133467146 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 133468964 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 133469184 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 133469300 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133469354 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133469436 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 133471376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133472643 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133473827 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133476995 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 133477473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133477602 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 133478059 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 133478654 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133478709 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133478722 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 133478802 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 133478893 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133479221 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133479775 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133479992 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 133480614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133480682 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 133481124 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133481243 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 133481508 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 133481512 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133481546 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133481603 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133481614 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133481623 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133481635 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 133481665 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133481687 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 133481762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133481821 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133481825 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133481837 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133481884 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 133481978 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133482012 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133482050 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 133482055 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 133482087 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 133482105 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 133482222 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 133482236 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133482371 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133482468 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133482503 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 133482515 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133482522 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133482586 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 133482629 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133482829 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 133482920 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 133483291 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133483315 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 133483357 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133483448 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 133483616 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 133483641 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133483684 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133483772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133484011 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 133484250 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 133484463 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 133484488 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 133484525 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 133484709 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133484898 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 133485234 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133485545 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 133485804 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133486183 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 133486538 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 133486551 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 133486689 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 133486915 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133487432 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133487631 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133487672 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 133488686 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 133489036 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 133489044 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 133489066 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 133489086 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 133489266 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 133489349 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133489350 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133489468 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133489477 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133489511 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133489557 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133489579 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133489603 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133489615 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 133489674 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133489704 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133489737 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 133489749 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133489812 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 133489834 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133489897 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 133489905 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133489922 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133489939 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133489951 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133490068 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 133490241 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133490329 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 133490399 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133490400 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133490744 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 133491491 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133491976 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133493740 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 133494506 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133495283 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133495348 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133495473 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 133495734 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133495739 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133495747 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133495897 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 133496049 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133496051 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133496368 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133496504 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 133497116 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133497119 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 133498053 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133498091 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 133498417 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 133498558 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 133499111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133500721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133501672 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 133502326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133503386 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133503468 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133504045 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 133505746 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133506288 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 133506726 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 133506848 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133506879 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 133507113 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 133507226 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 133507688 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 133507907 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 133508021 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133508042 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133508104 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 133508139 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 133508199 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 133508221 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 133508244 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 133508359 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133508386 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 133508589 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 133508612 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 133508740 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 133509117 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133509812 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 133509956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133509968 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133510192 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133510204 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133510425 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133510676 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 133510801 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133510887 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133511261 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 133511471 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133511729 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133512326 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133512484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133512573 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 133512612 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 133512623 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133513431 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133513810 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133514041 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133514526 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133514728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133515406 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 133515716 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133516058 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133516978 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133518115 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 133520723 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133521808 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133523551 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133525752 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 133526573 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 133531418 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 133533245 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 133533457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133535082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133535455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133535749 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133535756 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133535833 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133535892 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 133536806 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133536818 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133537937 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133538106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133538129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133538437 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133540625 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133541746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133543231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133543290 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133544983 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133546291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133548003 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 133548476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133553113 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133553600 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133553794 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133555011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133556338 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 133559345 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 133562381 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133566059 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133566149 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133566161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133566222 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 133566537 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133567830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133568554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133569839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133570101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133570728 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133571246 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133572960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133573395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133575487 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133576760 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133578197 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 133578437 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 133579045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133579321 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133579688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133580034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133581102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133581174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133581205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133582255 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133582606 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133582687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133582731 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133582881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133583122 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133583446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133585267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133585880 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133587357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133587590 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133587596 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133587637 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133588512 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133589014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133589053 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 133589264 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 133589603 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133589891 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133590288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133590915 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133591171 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133591198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133591216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133591226 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133591466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133592213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133592624 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133592705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133593725 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 133593745 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133593905 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 133593922 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 133593974 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 133594139 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 133594143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133594680 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133594744 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 133594778 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 133595335 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 133595472 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133595657 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 133595889 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133595999 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133596025 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 133596246 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133596418 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 133596494 G T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 133597156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133597328 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 133597466 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 2 133597527 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133597995 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 133598318 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 133598614 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 133599234 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133599687 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 133601154 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 133602618 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 133603498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133603558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133605499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133605566 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133605695 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133605844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133606302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133606316 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 133606407 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 133606466 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 133606649 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 133606827 T G Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 133606853 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 133606876 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 133606995 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 133607035 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 133607131 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 133607146 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 133607310 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 133607414 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133607602 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133607969 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 133608186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133608580 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133608739 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133609396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133610148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133610421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133611090 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133612003 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 133613190 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133613716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133613975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133614079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133615010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133615036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133615226 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 133615486 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133615534 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133615553 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133615895 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 133615904 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 133616012 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133616673 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 133616989 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133617917 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 133619311 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 133619337 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 133619339 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 133619472 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133619706 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133620013 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 133620049 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 133620942 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133621530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133621770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133621776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133622625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133622868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133622886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133622924 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133622990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133623054 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133623405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133624571 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133626751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133627618 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 133628540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133631412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133631496 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133631593 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 133631665 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 133631711 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 133631990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133632582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133633422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133640640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133640712 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133640847 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 133640900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133641328 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 133641398 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133641449 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 133641847 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 133642746 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133643445 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 133643609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133644293 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 133644300 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 133644867 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 133644884 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 133644920 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 133644936 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 133644981 C G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 133645265 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 133645377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133645410 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133645849 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133645889 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133646049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133646208 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 133646258 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 133646293 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133646477 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 133646762 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 133646765 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 133646836 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133647180 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133647521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133647625 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133649676 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133650022 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133650799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133651319 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133651807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133651808 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133651818 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133651840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133652270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133652284 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133652479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133652547 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133652629 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 133652650 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 133653084 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133653387 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133653464 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133653557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133653657 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133653761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133653981 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133654028 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133654384 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133654408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133655021 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133655041 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133655384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133657207 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 133658482 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133658993 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133659041 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133660029 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133660316 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 133660549 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133660980 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133661000 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 133661020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133661086 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133661153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133661212 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133661297 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133661353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133661373 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133661414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133661438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133661550 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133661563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133661581 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133661681 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133661777 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133661842 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133661930 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133661957 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133661973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133662078 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133662236 C G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 133662320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133662340 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 133662355 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133662424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133662438 C A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 133662470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133662548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133662610 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133662628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133662649 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133662699 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133662724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133662747 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133662768 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133662860 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133663665 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133664009 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 133665858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133666100 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133667878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133668045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133669972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133673104 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 133673118 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133674316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133674672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133674798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133674822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133674914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133675449 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133675532 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133675913 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133676097 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133676127 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133676631 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133676695 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133676750 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133676763 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133677042 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133677402 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 133677803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133678094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133679468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133679470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133679576 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133680045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133680419 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133681009 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133681114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133683276 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133684185 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 133686003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133686867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133688202 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 133688418 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133688440 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133688590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133688798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133689289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133690028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133690658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133690710 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133690928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133691930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133692930 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133692963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133693687 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133694327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133694763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133694835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133695460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133695973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133697357 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133697669 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 133697769 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133698010 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133698035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133698073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133698173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133702641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133703425 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133703441 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133703512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133703758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133703768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133703879 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133704027 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 133704642 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133704736 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133704782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133704815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133704822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133704894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133705056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133705187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133705238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133705400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133705408 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133705458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133705674 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133705767 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133706071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133706098 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133706135 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133706179 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133706256 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133706416 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133706516 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133706957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133707218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133707434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133707636 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133707864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133707978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133708034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133708043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133708071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133708234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133708786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133709385 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133709443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133709529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133709553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133709583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133711527 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133713904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133714346 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133714462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133715909 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133717068 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 133718216 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133718828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133719453 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133721275 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133721626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133721730 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133723972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133724280 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133725110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133727256 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 133727329 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133728767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133728824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133729752 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133730132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133730402 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133731122 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133733674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133734357 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 133734463 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 2 133734803 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133735342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133735468 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133740128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133740262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133740712 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133743089 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133745565 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133745695 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133745696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133745807 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133745810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133746347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133746652 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133746903 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 133747568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133747593 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133747878 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133748173 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133748649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133749935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133751426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133751502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133752737 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133754706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133754959 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133754976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133755874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133756477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133757437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133757438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133758714 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 133766233 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133766336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133766539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133768706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133769599 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133769683 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133771153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133771252 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 133771565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133771682 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133772175 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133772599 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133773517 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133775206 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133776309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133776927 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133778999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133780512 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 133782376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133784014 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 133785191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133786492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133787306 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133787509 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133787639 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133788169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133788302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133797639 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 133797843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133797998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133798142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133798332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133798956 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133798971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133799180 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133800919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133803394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133804956 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133805228 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133805507 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133805534 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 133805582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133808105 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133808437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133808483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133811778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133812537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133819053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133820599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133821329 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133821560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133822603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133822633 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133824200 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133824235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133824250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133824348 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133825736 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133827670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133834122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133834142 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133834574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133834594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133835635 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 133836760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133838304 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 133838487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133840336 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133841520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133844760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133845593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133846173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133848133 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133848488 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 133849391 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133849432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133850808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133853524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133853810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133854006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133854055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133854087 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133854564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133854587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133854659 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133855065 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133855178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133855565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133855704 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133856454 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 133857346 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133859193 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 133859196 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 133859381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133859862 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133860941 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 133862616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133863144 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 133863696 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133864059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133864210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133864248 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133864255 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133864264 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133864288 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133864337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133864442 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 133864469 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 133864815 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 133865039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133865523 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 133865696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133865761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133866034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133866058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133866256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133866401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133866528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133866677 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133866788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133866908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133866989 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133867074 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 133867129 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 133867135 A G Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 133867464 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133867719 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133867732 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 133867806 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 133868052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133868136 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 133868156 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 133868184 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 133868196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133868289 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133868322 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133868471 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133868568 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 133868569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133868597 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 133868608 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133868667 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133868746 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133868767 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133869198 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 133869237 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133869900 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133870033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133870117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133870143 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133870219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133870222 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133870284 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133870374 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133870419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133870690 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133870713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133870939 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 133871031 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133871163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133871212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133871263 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133871265 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133871287 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133871322 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 133871425 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133871441 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133871496 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133871511 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133871523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133871542 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 133872046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133872058 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 133872455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133872466 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133872799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133873325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133873415 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133873420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133873435 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133873555 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133873731 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133873733 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133873946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133874096 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133874172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133874208 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133874290 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133874353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133874383 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133874412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133874554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133875381 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133875727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133875946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133876238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133876383 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133876399 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133876437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133876814 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133877229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133877440 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133877703 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133877900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133877913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133877918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133878186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133878213 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133878314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133878386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133878441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133878875 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 133878985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133879207 G T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 133879223 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 133879747 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 133880359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133880894 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 133881130 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133881292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133881463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133881485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133881622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133882955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133883090 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 133884344 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133884886 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133884894 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133884912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133885139 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133885553 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 133886699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133886728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133886819 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133887010 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 133887293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133887640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133887656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133887881 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133888134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133888171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133888875 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133889112 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 133889656 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 133890083 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 133890316 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133890413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133891245 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 133891712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133891898 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133892323 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133892356 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 133892617 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 133892674 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 133892705 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 133892823 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 133893041 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 133893714 A C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 133894975 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133895521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133895844 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 133896034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133896079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133896315 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133896538 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 133896928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133897922 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 133898836 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133899636 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133900597 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133900758 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 133900773 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133900893 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133901848 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133902088 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133902198 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133902316 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133902423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133902969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133903168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133903541 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 133904241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133904493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133904568 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133905076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133906607 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133907477 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133908970 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 133910554 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133910629 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 133910998 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 133911906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133911916 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133912323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133913058 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 133913103 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 133913322 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133913646 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133913703 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133913733 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133913735 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133913834 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133913929 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133913932 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133914823 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 133914898 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133914990 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133915109 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 133915792 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 133916049 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133916061 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133916174 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 133916222 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133916246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133916264 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133916372 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133916494 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133916551 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 133916769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133916841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133917081 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133917107 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133917157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133917442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133917565 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 133917596 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 133917602 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133917812 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 133917815 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 133917875 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 133918024 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 133918631 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133918714 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 133918727 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 133918836 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 133918889 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133919100 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 133919192 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 133919317 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 133919340 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 133919415 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 133919447 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 133919738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133919865 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 133919880 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 133919904 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 133920006 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 133920140 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 133920276 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 133920552 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133920659 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133920666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133920924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133920996 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133921080 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133921276 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133921452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133921709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133921834 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133921842 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133923601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133923904 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 133926287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133926337 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133926466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133926507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133926813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133927567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133928003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133928097 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 133928780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133929085 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 133929121 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 133930527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133930901 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133931364 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133931784 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133932193 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 133932383 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 133932401 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133932592 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 133932680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133933183 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133933599 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133933616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133934017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133934108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133934390 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 133934435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133934815 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133934829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133934860 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133934921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133934937 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133934966 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133935029 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133935076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133935089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133935114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133935184 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133935195 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133935242 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 133935587 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 133935635 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 133935942 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 133936279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133936458 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 133936636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133936796 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133936857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133937359 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133937384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133937493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133937552 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133937701 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133937754 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133937879 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133937959 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133937969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133938080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133938101 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133938108 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 133938276 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133938457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133938493 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133938585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133938666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133938750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133938960 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133938996 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133938999 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133939107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133939132 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133939135 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133939162 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133939279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133939341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133939451 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 133939463 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 133939549 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133939567 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133939773 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133939782 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133939793 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133939794 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133939832 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 133939860 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133939865 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133940057 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133940082 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133940278 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 133940288 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133940301 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 133940314 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 133940391 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 133940429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133940593 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133940594 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133940626 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 133940660 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133940743 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 133940744 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 133940770 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133940837 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133940850 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133941051 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 133941081 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133941170 C T N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 2 133941219 C A N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 133941252 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 2 133941567 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 133941628 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 133941656 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133941672 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 133941764 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 133942014 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 133942065 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 133942087 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 133942270 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 133942316 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 133942341 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 133942362 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 133942387 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 133942393 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 133942502 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 133942559 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 133942598 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 133942641 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 133942966 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 133942982 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 133943006 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 133943450 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 133943963 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 133948030 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133949468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133950168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133951113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133951735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133952101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133953254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133953415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133954387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133955105 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 133955455 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 133956163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133956358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133956730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133957544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133958787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133959877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133960768 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133961105 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133961234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133962582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133963961 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133965115 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133967030 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 133968900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133969637 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 133973427 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 133973552 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 133975656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133975657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133979436 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 133979917 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 133980460 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133983647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133987278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133987822 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 133988020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133988089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133988993 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133989146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133989332 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133990492 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 133991481 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 133992433 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133994595 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 133996414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 133998573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133999367 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 133999850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 133999928 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134001548 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134001674 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134001687 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134004500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134004527 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134004536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134005143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134005181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134005252 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134005775 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134006012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134006202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134008012 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134012064 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 2 134012275 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134012557 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134013456 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134013511 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 134013519 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134014179 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134015786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134016352 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 2 134017023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134017478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134017517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134020066 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 134020617 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 134020836 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134020878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134021624 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134021896 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134022877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134023092 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134023093 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134023231 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 2 134023292 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 2 134023928 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134024877 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.6875 0.0625 0.25 23 9 11 1 4 2 134025095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134025123 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 2 134025416 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134025970 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134026068 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 134026178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134026253 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 2 134026361 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134026367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134026465 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 2 134026563 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134026592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134027378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134027483 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134027914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134028012 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 134028172 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134028320 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 134028791 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134028845 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 134029032 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134029210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134029354 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 134029634 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134029637 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134029800 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 134030088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134030119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134030851 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 134031341 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 134033712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134034346 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134036887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134036914 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 134037354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134037630 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 134037805 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 134037897 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 134037898 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 134037916 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134037926 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 134037934 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 134040242 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134040617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134041176 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134042605 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 134042834 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 134042852 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 2 134042912 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 134042959 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 134042983 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 134043202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134044089 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 134044105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134044176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134044231 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 14 18 6 2 8 2 134044370 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 134044569 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134044682 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 134044742 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 2 134044929 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134045083 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134045410 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134045499 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134045592 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134045774 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134045838 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134045910 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134045925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134045971 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134046062 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134046074 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134046112 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134046177 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134046412 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134047070 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 2 134047071 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 2 134047105 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134047277 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134047856 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134047980 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 134047985 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134048028 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 2 134048032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134048275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134048307 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.333333333333333 0.0555555555555556 0.611111111111111 13 23 6 1 11 2 134048321 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.315789473684211 0.0526315789473684 0.631578947368421 13 25 6 1 12 2 134048576 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 134048652 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134048775 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134048840 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 2 134048855 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 2 134048856 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 2 134048929 T G Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 2 134049032 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 134049174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134049381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134049463 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 2 134049465 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 2 134049540 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 2 134049952 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134049983 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 2 134050077 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 134050113 A G N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 134050630 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134050767 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134051079 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 134051121 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 134051601 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 134051602 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 2 134051767 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134051801 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134051830 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134051949 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134051963 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134052348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134052455 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134053333 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134053382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134053487 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134053884 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134053982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134054003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134054029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134054237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134054801 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134055219 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134056068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134056508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134057673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134057693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134058332 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134058829 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134059266 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134061573 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134061753 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134061760 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134062047 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134062202 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134062798 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134062851 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134062877 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134062908 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134062943 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134062948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134063189 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 134063278 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 134063313 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134063350 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134063365 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134063472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134063583 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134063601 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134063627 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134063657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134063825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134064174 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134064275 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134064329 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 134064603 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134066788 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 134066929 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 134067089 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 134067171 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 2 134067242 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134067328 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134067380 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134067563 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134067594 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134067958 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 134067991 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134068000 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134068040 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134068073 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 134068187 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134068618 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 134068673 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134068756 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134068832 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 134068909 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134068951 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134069084 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 134069190 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134069314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134069436 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 134069508 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 134069518 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134069569 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134069666 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 2 134069780 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 134069819 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 134069901 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134069936 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134069945 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134070004 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134070015 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134070039 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134070059 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134070076 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134070117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134070214 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134070572 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 134071259 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134071500 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134071786 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134072100 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134072103 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134072146 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134072147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134072224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134072239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134074737 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134074876 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134075496 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 134075873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134076445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134077043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134077431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134079893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134082147 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 134082267 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134082694 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134085042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134085059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134085584 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134088089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134088502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134088990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134089018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134089083 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134089981 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 134093778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134093878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134094260 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134096160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134096397 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134096736 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134100707 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134101131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134101577 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134101785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134104372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134105256 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134106785 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134106841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134107025 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134107280 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134107694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134113805 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134114563 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134115723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134116089 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134116362 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134116678 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134116742 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134117733 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134120600 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134122171 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134122947 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 134123198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134123301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134124882 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134124982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134126810 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 134128540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134128650 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134129106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134130034 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134130805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134131162 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134131850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134132791 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134132863 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134133774 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134134648 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134135198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134135401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134135983 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134136184 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134136966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134138523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134144653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134145294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134146615 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 134147113 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134148037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134148254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134151330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134154098 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134154410 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134155178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134155469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134155578 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 134155763 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134157386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134157536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134157773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134159203 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134159412 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134160381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134160545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134160576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134161882 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 134162101 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134163672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134164672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134164784 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 134165185 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134165506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134166167 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134166697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134167679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134168787 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134169333 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134169991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134170142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134170367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134170681 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134171399 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134172992 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134173293 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 134174038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134174514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134174561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134175335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134175657 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134176684 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134177062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134177448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134179932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134179973 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134180963 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134181328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134182250 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134182725 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134183020 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134183173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134184125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134184688 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134186612 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 134186822 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 134189999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134190272 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134190389 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 134190630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134190665 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134190833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134190917 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134190981 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134191038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134191217 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 134191347 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134193289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134193612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134195734 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134196005 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134196656 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134198670 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134198752 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134198875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134199224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134199542 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134201330 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134202599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134203320 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134203796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134205636 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134206186 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134207519 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134208699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134208902 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134209611 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 134212812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134213782 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134214287 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134214633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134216068 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134216484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134216913 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 134217922 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134218112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134220177 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134220236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134220242 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134220776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134222614 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134222794 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134222934 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134223760 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134228622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134229175 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134230759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134231286 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134231429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134231443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134231612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134231697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134231845 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134231891 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134231923 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134232022 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134232447 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134232498 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134232594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134232683 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233019 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233046 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233057 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233073 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233079 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233220 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134233252 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233254 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233298 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233319 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134233331 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233481 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233573 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233601 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233606 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134233680 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134233683 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134233728 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233841 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134233966 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134233971 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134234012 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134234033 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134234222 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134234268 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134234269 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134234303 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 134234326 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134234376 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134234414 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134234432 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134234508 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 134234553 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 134234556 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 134234632 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 134234659 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134234660 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134234889 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134234935 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134235218 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134235227 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134235236 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134235301 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134235483 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134235510 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 134235677 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134235757 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134235819 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134235829 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134235970 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 134236031 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236038 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236045 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236082 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134236176 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236198 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236202 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236210 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236262 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236363 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236414 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236443 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236497 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236503 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236508 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236515 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236526 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236532 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236680 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134236844 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134236854 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134236899 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134236907 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134236947 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 134236980 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 134237379 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 134237490 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134237543 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134237569 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134237577 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134237623 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134237796 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134237893 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134238175 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134238183 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134238210 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134238226 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134238352 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134238358 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134238395 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134238499 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 134238558 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134238583 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134238729 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 134238735 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 134238803 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134238816 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134239106 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134239292 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 134239429 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134239747 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134240345 T G Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 134241287 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 134241419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134241492 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134241501 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134242710 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134242734 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134243466 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134243972 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134245180 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134245264 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134247429 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134247469 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134248027 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134248605 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134250786 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134257166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134257539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134259059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134261288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134262118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134263779 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134263783 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134264045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134264500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134267346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134267385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134268107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134268212 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134268439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134269364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134269382 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134269568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134271390 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134271778 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 134272664 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134273167 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 134273350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134273660 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134275596 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 134276427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134280441 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134282224 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134284635 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134285087 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134286755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134286772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134288381 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 134288400 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 134288655 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 134289127 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 134289175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134289278 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 134289290 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134289470 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134289522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134289549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134289558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134289852 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 134290106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134290178 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134290289 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 134290722 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 134291199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134291283 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 134291298 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 134291322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134291417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134291492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134291730 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 134291772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134291792 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134291793 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134291803 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 134291972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134292014 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 134292033 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134292132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134292155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134292251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134292260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134292583 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134292584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134293252 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134293311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134293490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134293495 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 134293978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134293995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134294122 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134294258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134294575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134294662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134294666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134294678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134294743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134294819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134295597 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 134295599 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134295661 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134295962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134296442 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134296554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134296575 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134297727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134297971 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134300367 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134306060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134306228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134307615 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134311902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134312171 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134312342 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134313959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134313975 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 134314003 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 134314632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134315517 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134315809 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134316977 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134317477 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134318591 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 134319284 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134321208 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 134321263 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 134322092 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134322855 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 134322993 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134324704 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134324745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134324883 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134324912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134324915 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134325118 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 134325320 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134325365 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 134325408 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134325515 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 134325585 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134325605 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 134325629 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 134325631 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 134325687 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 134325729 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134325798 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134325832 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134325882 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134325883 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134325933 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134326017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134326140 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134326152 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134326197 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134326434 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134326737 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 134326812 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134326860 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 134327079 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134327295 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 134327842 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134327890 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 134327930 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134327938 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134328065 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134328106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134328214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134328638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134328714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134328726 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 134328957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134329120 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134329215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134329216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134329242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134329266 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 134329308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134329342 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134329352 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 134329368 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134329369 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134329386 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 134329609 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 134329611 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 134329653 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 134329725 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 134330011 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 134330255 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134330293 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134330737 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 134330854 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 134330873 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134330948 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 134331322 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134331487 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134331544 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 134331582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134338750 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134338807 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 134338885 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134338955 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134339041 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134339067 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134339107 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 134339350 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134339437 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134339440 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134339528 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 134339536 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 134339647 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 134339728 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134339793 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 134339810 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134339822 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134339890 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 134340003 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 134340044 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 134340156 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 134340166 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 134340187 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 134340221 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 134340222 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134340323 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 134340346 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 134340432 A C N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 134340529 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 134340671 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 134340723 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 134340761 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134340779 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 134340787 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 134340795 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 134340798 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 134340908 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134340923 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 134340937 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134340955 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134340976 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 134340977 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 134340999 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 134341046 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134341092 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134341117 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134341118 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134341172 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134341226 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134341297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134341326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134341351 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134341365 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134341473 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134341649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134341795 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 134342927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134342988 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 134343001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134343010 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134343038 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134343357 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 134343670 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134343730 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134344118 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 134344285 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 134344419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134345135 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134346135 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134346194 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134346285 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134346355 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134346476 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 134346555 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 134346833 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134347049 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 134347548 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134347549 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134347755 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134348202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134348593 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134349023 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 134349317 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134349571 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 134349711 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134349951 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134350356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134350878 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134351614 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 134351740 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 134351804 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134351868 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 134351869 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 134352086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134352093 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134352142 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134352301 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134352494 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 134352516 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 134352688 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 134353028 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134353043 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 134353392 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134353420 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134353444 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134353560 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134353920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134354209 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134354242 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134354253 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134354290 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134354301 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134354454 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134354497 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134354512 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134354648 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134354691 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 134354781 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 134354909 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 134355298 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134355578 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134355606 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134355681 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134355700 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134355749 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 134355934 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134356463 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134356701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134356711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134356718 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 134356756 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134356869 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 134356898 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134357140 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 134357202 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 2 134357811 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 134357837 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 134357996 T G N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 134358030 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 134358208 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 134358238 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134358305 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134358324 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 134358335 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134358411 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134358538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134359246 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134359289 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134359440 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134359459 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134359729 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134359823 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134359969 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134360018 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 134360034 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134360069 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 134360089 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 134360169 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134360307 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134360312 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134360320 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134360337 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134360386 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 134360389 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 134360470 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134360669 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134360675 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 134360823 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134360860 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134360983 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134361385 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134361424 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134361460 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134361513 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134361522 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134361530 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134362123 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134362137 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134362224 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134362230 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134362287 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134362298 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134362488 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134362492 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134362515 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134362593 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134362625 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134362727 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134362732 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134362776 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134362800 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134362825 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134362838 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134362841 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134362857 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134362862 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134362878 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134362957 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134362958 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134363009 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134363010 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134363021 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134363096 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134363120 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134363130 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134363156 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134363195 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134363217 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134363315 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134363325 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134363352 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134363453 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134363497 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134363501 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134363532 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134363563 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134363641 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134363664 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134363674 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134363700 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 134363731 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 134363787 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134363795 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134363803 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134363829 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134363906 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134363940 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134364063 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134364066 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134364080 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134364129 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134364537 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134364593 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 134365073 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134365227 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134365240 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134365258 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134365326 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134365381 G C N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 134365421 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134365467 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134365563 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134365573 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134365599 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134365735 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134365754 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134365987 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134366173 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134366175 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134366244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134366292 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134366313 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134366388 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134366402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134366413 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134366427 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134366449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134366571 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134367023 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134367033 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134367088 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 134367097 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 134367155 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134367200 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134367276 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 134367410 T A Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 134367531 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 134367546 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 134367554 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 134367579 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 134367615 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 134367659 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 134367687 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 134367699 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134367757 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134367776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134367908 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134368056 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134368122 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 134368375 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 134368458 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 134368626 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134368926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134368931 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134368947 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134369069 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134369287 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134369359 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 134369497 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134369561 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 134369641 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 134369657 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134369741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134369821 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 134369842 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134369843 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134369906 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 134370051 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 134370098 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 134370115 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134370393 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 134370462 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134370525 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 134370649 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134370712 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134370737 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134370912 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 134371083 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 134371164 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 134372611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134372871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134374460 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134374519 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134374917 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134375238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134375901 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134376041 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134376236 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134376486 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134379114 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134379245 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 134380025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134380247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134380291 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 134380306 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 134380338 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 134380453 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134380567 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134380675 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134380700 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134380739 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134380764 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134380956 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 134381051 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381214 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381226 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381238 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134381240 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381323 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381378 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134381453 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381460 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381477 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381601 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381718 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381780 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134381833 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134381862 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134381865 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 134381954 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381964 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134381999 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134382047 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134382090 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134382211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134382248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382306 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134382320 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134382334 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134382385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134382464 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382490 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134382491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382611 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382735 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134382845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134382962 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 134382991 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134383143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134383394 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134383423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134383449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134383451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134383517 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134383528 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134383529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134383558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134383631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134383690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134383703 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134383791 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134383837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134384034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134384117 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134384166 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134384171 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134384237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134384261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134384299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134384410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134384421 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134384479 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134384495 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134384512 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134384531 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134384552 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134384620 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 134384626 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 134384665 G T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 134384677 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 134384789 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134384819 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134384957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134384994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134385004 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134385018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134385055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134385071 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134385089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134385124 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134385129 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134385147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134385163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134385174 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134385278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134385434 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134385438 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134385516 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134385683 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134387704 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134387717 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134387811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134387837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134387979 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134388038 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134388094 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134388108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134388145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134388147 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134388210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134388296 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134388350 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 134388512 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134388565 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134388624 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134388625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134388649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134388691 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134388713 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134388754 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134388755 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134388778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134388807 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134388825 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134388885 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134388901 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 134388916 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134388989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134389035 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134389064 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 134389089 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134389131 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134389152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134389252 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134389266 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 134389293 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134389324 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 134389404 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134389562 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134389615 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134389674 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134389736 G T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 134389864 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134389918 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134389935 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134390368 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134390543 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 134390699 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 134390779 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 134391101 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134391193 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 134391237 T G Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 134391244 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 134391263 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134391292 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 134392648 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134392746 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134392825 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134392895 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134392969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134393010 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134393054 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134393060 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134393094 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134393102 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134393202 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 134393249 C A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 134393292 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134393706 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134393750 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134393810 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 134393852 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 134393984 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 134394065 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 134394092 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134394145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134394428 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134394442 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134394461 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134394480 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134394572 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 134394715 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134394794 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134394830 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134394850 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134394852 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 134394861 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134394867 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134394892 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134394893 T G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 134394908 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134394980 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134395018 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134395030 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134395054 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134395135 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134395192 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134395262 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134395304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134395347 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134395375 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134395379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134395418 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134395496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134395506 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134395687 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134395767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134395796 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134395832 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134395834 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134396117 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134396148 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134396156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134396221 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134396241 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134396269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134396304 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134396316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134396380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134396432 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134396651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134396716 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134396743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134396753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134396921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134397112 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134397139 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134397423 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 134397476 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 134397676 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134397677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134397709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134397735 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134397881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134397945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134397989 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134398022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134398031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134398106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134398241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134398256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134398292 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 134398324 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134398347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134398355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134398497 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134398790 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134398799 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134398974 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134399161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134399290 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134399343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134399649 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134399752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134399820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134399821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134399947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134399992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134400000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134400159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134400177 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 134400190 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134400299 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134400315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134400394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134400446 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134400470 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134400489 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134403699 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134403718 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 134404067 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 134404125 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134404244 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134404393 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 134404527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134404536 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134404584 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134404615 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 134404624 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134404629 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 134404694 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 134404775 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 134404784 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134404818 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 134404842 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134404893 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 134404910 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 134405069 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134405108 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 134405232 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 134405243 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 134405250 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 134405364 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 134405637 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134405695 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 134405767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134405850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134405939 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134406086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134406142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134406189 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 134406192 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 134406349 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 134406442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134406460 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134406471 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 134406544 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134406679 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134406790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134406840 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 134406886 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134407019 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 134407087 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 134407093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134407115 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134407134 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134407155 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134407222 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134407292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134407501 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 134407550 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134407680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134407802 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 134407840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134407896 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134408000 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 134408201 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 134408252 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 134408300 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134408328 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 134408540 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134408678 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134408766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134409136 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134409199 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134409570 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 134409609 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134409941 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 134410158 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 134410523 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134410993 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 134411171 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134411238 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 134411571 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 134411759 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134411944 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134411956 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 134412299 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 134412362 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 134412726 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 134413600 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134413810 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 134413927 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134414271 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 134415273 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134415311 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134415416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134416052 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134416098 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134416153 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134416848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134417183 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 134417294 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 134417853 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134417995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134418041 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 134418365 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 134418423 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134418442 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134418477 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134418787 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134419046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134419162 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 134419367 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134419516 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134419604 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134419690 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134419786 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134420073 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134420111 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134420781 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 134420935 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134421090 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134421189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134421309 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134421322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134421335 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134421560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134421695 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134421906 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134422032 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 2 134422490 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134422492 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134422752 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134422763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134422903 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 134422910 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134423442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134423485 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134423583 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134423888 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134423909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134424119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134424916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134424930 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134424974 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134425034 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 134425214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134425217 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134426642 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134427429 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134427668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134427706 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134428145 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 134428282 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134428309 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134428343 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 134430488 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134430593 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134430646 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 134430766 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134430798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134430847 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134431001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134431002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134431238 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 134431396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134431765 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 134432836 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134432856 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134432930 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134433079 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134433265 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134433529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134434191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134434264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134434787 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 134435467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134435554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134435616 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134435620 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134435769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134435778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134435835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134435930 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 134436070 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134436313 T G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 134436318 A G Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 134436355 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 134436362 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 134436394 T A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 134436397 C A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 134436556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134436589 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 134436745 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134436910 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134437342 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134437412 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 134437657 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 134437693 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134437723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134437764 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134438584 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134438671 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134445761 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134445778 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134446471 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134447057 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 134447312 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134447624 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134447777 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 134448045 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134448075 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134448109 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 134448396 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 134448416 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134448606 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134448903 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134448985 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134449208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134449232 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134449825 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134450000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134450093 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134450172 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134450189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134450191 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 134450399 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134450638 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 134450857 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 134451656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134451715 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134451758 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134452177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134452209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134452737 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134452851 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 134453189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134453434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134453443 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134454078 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134454726 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134454896 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 134455428 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134455530 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134455922 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134455944 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134456021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134457075 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 134457135 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134457253 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134457335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134457598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134457628 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 134457903 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134458004 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134458419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134458569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134458726 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134458750 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134458771 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 134458964 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134459205 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134459357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134459564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134459583 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134459974 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 134460046 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134460051 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 134460288 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 134461104 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 134462060 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134463318 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 134463730 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134463787 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134463994 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134464374 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 134464418 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134464593 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 134465036 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 134465261 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 134466174 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 134466637 A T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 134466775 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 134466919 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 134467371 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 134467446 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 134467546 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 134467940 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 134468224 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 134468962 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134470187 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 134470254 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 134470620 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134470625 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 134470663 G C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 134470779 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134471038 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 134471415 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134471600 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134471601 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 134471639 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134471691 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134471694 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 134471807 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134471896 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 134471925 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134472004 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134472408 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.214285714285714 0 0.785714285714286 6 22 3 0 11 2 134472543 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134472660 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 134472715 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134472926 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 134473045 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134473072 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134473149 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134473254 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134473397 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 134473576 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 134473701 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 134473735 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 134473748 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134473768 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134473769 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134473861 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 134474076 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 134474147 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134474149 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 134474175 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 134474230 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 134474270 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134474315 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 134474628 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134474987 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134475043 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 134475108 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134475129 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 134475171 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 134475404 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134475465 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 134475482 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 134475558 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 134475559 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 134475880 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 134475959 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 134476573 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 134476618 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 134476665 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 134476689 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 134477091 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 134477176 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134477268 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 134477549 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 134477677 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134477744 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 134477786 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134477965 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134478138 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 134478348 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134479269 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134479693 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134479998 T G N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 134480196 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 134480299 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 134480733 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134480757 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 134480762 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134481562 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 134481692 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 134481776 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134481865 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 134482004 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134482058 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 134482095 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 134482270 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 134482647 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134482786 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 134482836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134483058 G T N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 134483278 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134483549 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134483553 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134483599 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134483693 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134483710 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134483883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134483892 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 134483963 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134484014 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134484056 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134484115 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134484126 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 134484127 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134484232 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134484305 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 134484332 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134484467 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134484474 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134484520 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134484742 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134484793 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134484813 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134484839 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 134484850 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134485298 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134485354 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 134485731 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 134485774 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 134485828 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 134485909 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 134485916 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 134486084 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134486117 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134486121 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 134486136 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 134486154 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 134486184 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 134486280 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 134498899 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134498965 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134499810 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134502278 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 134505212 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134508280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134510469 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 134510602 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 134510695 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 134510721 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 134510798 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134510854 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134510924 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 134511178 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 134511197 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 134511230 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 134511331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134511362 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134511405 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 134511408 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 134511459 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 134511525 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 134511624 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134511964 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 134512009 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134512203 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134512285 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134512336 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134512487 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 134512558 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 134512662 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 134512726 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134512764 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 134512770 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134512962 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134513043 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134513050 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134513237 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 134513249 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 134513290 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134513304 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 134513315 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134513328 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 134513350 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 134513395 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 134513657 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134513725 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134513796 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134514004 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134514122 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134514229 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134514402 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 134514406 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 134514708 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 134515045 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 134515053 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134515112 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134515244 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134515374 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134515436 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134515506 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134515791 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134515816 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 134515903 A C N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 134515917 G C N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 2 134515933 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134516168 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 134516197 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 134516225 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 134516251 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 134516290 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134516302 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 134516378 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 134517197 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134517208 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 134517672 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134517675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134518084 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134518263 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134518587 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134518721 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 134518962 C G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 134519291 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 134520179 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 134520187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134520327 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 134520744 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 134521068 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 134521216 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134521322 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134521364 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134521524 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134521806 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134522112 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134522856 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134522936 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 134523028 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 134523044 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 134523083 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 134523128 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134523139 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134523234 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134523251 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 134523259 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134523278 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 134523370 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 134523402 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134523423 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134523455 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134523487 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 134523518 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134523526 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134523538 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134523540 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134523560 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 134523654 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134523688 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134523830 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134523833 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134523842 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134523867 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134523906 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 134523922 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134523932 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134523970 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134523991 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134524067 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 134524101 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 134524162 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 134524255 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 134524301 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 134524334 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134524354 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134524379 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134524383 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134524397 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 134524421 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 134524586 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134524661 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 134524734 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134525002 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 134525242 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 134525250 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134525372 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134525426 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134525430 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134525486 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134525699 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134525715 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134525732 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134525973 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 134526215 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134526291 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 134526374 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134526403 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134526440 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134526508 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134526577 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 134526596 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 134526867 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134526980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134526995 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134527236 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134528087 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134528847 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134530210 A G Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 134532607 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134533380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134533999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134536928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134538593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134538817 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134541300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134541663 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134542059 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134542129 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134543007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134543701 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134544312 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134544756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134545482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134546758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134547491 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 134547641 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 134547646 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 134547764 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134548241 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134548698 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134549117 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 134549371 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134550267 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134550714 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134551479 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 134551492 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 134551516 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134551527 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 134551769 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134551863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134552528 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 134552610 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134555676 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134556307 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 134556335 C T Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 134556934 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 134557011 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 134558287 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134558397 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 134558516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134558678 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134558719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134559665 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134559961 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 134560098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134560929 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134562805 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134562896 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 134563398 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 134564620 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 134564654 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 134564688 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 134565188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134565675 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134565838 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134568077 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 134569126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134569943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134570022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134572187 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 134572205 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 2 134572221 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 134577172 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 134577280 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134577294 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134577308 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134577334 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 134577345 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134577532 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134577548 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134577564 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134577669 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 134577687 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134577708 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134577711 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 134577725 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 134577726 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134577751 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134577771 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134577856 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134577940 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134578132 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 134578174 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 134578350 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134578408 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134578468 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134578846 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 134578895 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 134579144 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134579884 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134580031 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 134580047 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134580117 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134580324 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 134580423 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134580499 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134580509 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134580585 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134580586 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134580740 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134580743 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134580883 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 134580939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134580993 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134581114 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134581155 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134581202 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134581269 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134581289 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 134581305 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 134581324 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 134581547 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134582072 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134582238 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134582289 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134582331 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134582472 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134582488 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134582606 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134582620 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134582710 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 134582724 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134582764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134582783 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134582796 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134583194 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 134583482 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 134583518 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 134583536 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 134583542 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 134583581 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134583587 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134583609 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134583722 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134583857 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134583880 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134583894 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134583921 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134583949 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134583959 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134583987 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134584010 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134584011 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134584030 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134584031 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134584054 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134584061 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134584111 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134584112 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134584206 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134584209 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134584218 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 134584226 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134584229 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134584249 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 134584259 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134584345 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134584446 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134584457 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134584467 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134584624 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134584661 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134584720 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 134584739 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 134584981 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 134585081 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 134585133 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 134585914 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134585937 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134586166 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 134586773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134586818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134586971 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 134587361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134588422 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134589611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134589613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134589725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134589764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134589836 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134589958 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 134589998 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 134590031 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 134590078 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 134590095 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 134590115 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 134590139 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134590206 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 134590291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134590366 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 134590454 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 134590552 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134590586 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134590862 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 134590875 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 134590963 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134591047 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134591057 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 134591211 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 134591312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134591581 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 134591760 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134591900 G T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 134592240 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 134592330 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 134592396 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134592402 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134592429 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 134593074 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 134593376 G T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 134593497 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 134593519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134593538 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134593717 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134593791 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134593820 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 134593924 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 134593967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134594111 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 134594493 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 134594694 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 134594732 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 134594771 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 134594796 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 134594805 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 134594811 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 134594882 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 134595006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134595068 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 134595234 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 134595282 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 134595342 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 134595373 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 134595501 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 134595511 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 134595560 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 134595595 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 134595627 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134595797 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134595872 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 134595918 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134595945 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 134595960 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134595985 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134596003 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134596187 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 134596260 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 134596262 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 134596288 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 134596347 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 134596401 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 134596442 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134596472 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 134596581 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134596584 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 134596689 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 134596716 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 134596791 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134596810 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134596922 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 134597031 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 134597136 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 134597192 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 134597248 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 134597334 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134597336 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 134597460 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 134597470 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 134597524 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134597567 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 134597587 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 134597588 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 134597606 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134597743 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 134597746 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 134597776 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 134597811 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 134597919 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134597986 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 134598355 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 134598457 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134598482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134598497 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134598517 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 134598543 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 134598669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134598688 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 134598808 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134598885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134598890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134598956 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134598998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134599177 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 134599207 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134599240 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134599259 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134599274 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134599299 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134599329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134599334 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134599340 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134599377 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134599406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134599509 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134599623 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134599693 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134599766 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 134599770 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134599780 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134599829 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134599840 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134599861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134599925 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134600061 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 134600079 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134600113 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134600160 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134600200 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134600252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134600403 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 134600404 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 134600447 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134600609 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134600670 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134600673 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134600733 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134600783 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134600958 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 134601026 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134601033 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134601083 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 134601157 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134601187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134601202 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134601285 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134601292 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134601560 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134601611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134601641 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134601740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134601828 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134601880 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134601896 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134602178 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 134602438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134602499 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134602744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134602866 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134602885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134602901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134602992 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134603027 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134603036 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134603416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134603447 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134603482 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134603571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134603583 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134603586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134603685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134603729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134603742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134603845 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134603920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134603997 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134604102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134604251 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134604350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134604729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134605044 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134605108 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134605120 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 134605301 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134605339 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134605355 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 134605444 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134605529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134605952 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134606008 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134606264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134606271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134606308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134606494 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 134606526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134606591 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134606612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134606652 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134607549 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134607639 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134607686 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 134607799 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134607905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134608122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134608454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134608467 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134608605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134608763 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134608842 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 134608873 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 134610102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134610277 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134610382 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134610848 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134611004 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134611051 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134611344 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134611983 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 134611995 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 134612048 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134612182 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134612398 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134612597 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 134612741 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134612754 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134612860 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134612949 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 134613210 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134613310 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 134614027 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 134614237 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134614423 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134614557 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134614560 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134614656 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134614784 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134614887 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134614925 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 134614957 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134614968 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134614986 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134615017 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134615030 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134615157 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134615204 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 134615407 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 134615419 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 134615436 G T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 134615444 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 134615728 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134615877 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134615903 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134615953 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134615958 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134615986 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134616051 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 134616141 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134616221 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134616278 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134616324 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 134616342 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134616496 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134616609 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134616610 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134616819 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134617385 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 134617431 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 134617436 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 134617487 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 134617517 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 134617670 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 134617672 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 134617846 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 134617871 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 134617920 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 134618031 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134618126 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 134618130 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 134618348 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 134618350 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 134618469 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 134618488 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 134618502 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 134618944 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134619097 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 134619222 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134619442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134621413 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134622216 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 134622817 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134623119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134623338 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 134623368 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134623760 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 134624113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134624114 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 134625198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134625438 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134627080 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134631927 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 134636213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134636681 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134639435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134640025 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 134641181 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134643467 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134643986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134646920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134647192 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134647605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134647861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134648297 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134649240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134650935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134651166 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134651312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134651469 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134652185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134652347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134653009 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 134653773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134656197 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 134656203 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 134656286 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134656314 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134656650 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134657132 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134658391 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134658707 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 134658797 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 134659087 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134659914 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134661454 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134662383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134662711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134663815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134665623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134666229 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134667980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134668381 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134668404 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134669003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134669055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134669372 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 134669480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134669587 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 134669710 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134669779 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134669884 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 134669939 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134669963 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134669985 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134670058 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134670275 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 134670413 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134670429 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134670431 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134670738 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 134670796 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 134670837 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134670970 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 134670974 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 134670988 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 134671014 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 134671783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134672091 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 134672250 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 134672266 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 134672684 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134673264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134674008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134674117 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134674900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134679021 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134680333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134680401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134681895 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134683192 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134683607 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134683636 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134684088 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134684112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134684202 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134684362 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134684432 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 134684439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134684448 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 134684578 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 134684959 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 134685440 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134685450 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134685662 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134685731 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134685862 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134685961 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 134686088 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 134686255 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 134686448 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 134686510 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 134686519 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 134686549 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 134686618 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 134686623 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 134686968 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 134686977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134687501 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 134687594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134687662 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 134688936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134689074 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134689212 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134689220 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134689582 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134689976 A G N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 134690101 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 134690289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134690733 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134691169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134691468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134691522 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134691734 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134691980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134691987 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134692021 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134692301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134692317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134692349 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134692416 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 134692426 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134692428 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134692607 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134692691 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134692951 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 134693165 T C Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 134693384 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134693585 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134693972 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 134694110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134694231 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134694272 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134694311 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 134694340 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 134694359 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134694376 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 134694501 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 134694513 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134694531 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 134694642 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 134694704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134694721 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 134694811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134694835 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 134694908 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 134694974 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134695145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134695726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134695899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134695958 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134696051 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134696119 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134696387 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134696784 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 134696838 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134696922 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134696937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134697051 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 134697114 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134697414 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134697583 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134697603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134697889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134698082 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 134698343 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 134698537 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 134699023 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 134699047 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 134700026 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134700391 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134700876 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 134700885 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134701342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134702508 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 134703174 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134704212 G C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 134705066 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134705591 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 134705611 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134706760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134707341 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134707536 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 134707613 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134707619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134708215 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134708404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134708475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134708731 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 134708869 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134708990 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 134709049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134709185 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134709199 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134709421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134709463 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134709848 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 134709910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134710296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134710479 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 134710771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134710885 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134711734 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134711769 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 134711887 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 134711905 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134711997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134712038 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134712117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134712385 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 134712736 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134712758 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134712804 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134712881 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134713045 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 134714009 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134714060 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 134714532 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 134714913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134715075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134715708 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134716597 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134717086 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134717094 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134717693 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134717725 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134719992 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134720019 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134720160 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 134720526 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134721342 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134721567 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134721569 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 134721702 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134721893 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134721949 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 134722338 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134722411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134722458 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134722487 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 134722821 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 134722845 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134722869 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134722966 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134723028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134723212 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134723340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134723387 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134723406 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134723439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134723459 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134723589 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 134723931 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134723990 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 134724581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134724706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134724801 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134724821 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134725801 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134726780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134726871 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134728016 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134728082 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134729090 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134729118 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134729348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134729718 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134730267 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134730488 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134731377 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134731507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134732843 G T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 2 134733376 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134733767 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134734093 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134735193 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134735361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134735435 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134735532 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134735620 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134736359 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 134737957 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134738339 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134738361 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134739005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134739231 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134740043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134740326 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134740345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134740911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134741851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134741887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134742172 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134742907 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 134743052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134743261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134743335 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134744324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134744648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134745119 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134745632 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134746725 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134747515 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 134748536 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134748870 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134748889 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134748977 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134749016 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134749362 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 134749756 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134750334 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134750521 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134750571 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134751230 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 134752576 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134753013 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134753299 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 134753324 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 134754159 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134754234 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134754541 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134754646 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134754731 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 134755262 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134755529 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134755876 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134755926 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134756010 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134756237 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 134756304 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134756424 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134756431 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 134756487 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 134756682 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134756826 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 134756835 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134756848 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 134756864 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134756907 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134757182 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134757551 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134757956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134758670 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134759308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134759322 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134759368 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134759735 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 134760468 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134760891 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134760963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134761489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134761617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134761781 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134761985 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134762105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134762404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134763218 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134763841 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134765470 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134765866 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134766667 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134767022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134767333 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134769244 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 134769914 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 134770362 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134770441 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134770522 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134770579 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134770597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134770680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134770803 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134771094 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 134771110 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134772115 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134772331 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134772619 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 134772887 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134772969 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134772983 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134773040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134773049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134773061 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 134773077 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 134773085 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 134773196 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134773331 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 134773345 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 134773384 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 134773403 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 134773429 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134773550 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 134773840 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 134774252 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134774434 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134774470 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134774509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134774710 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134774767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134774988 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134775065 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134775170 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 134775520 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 134775536 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 134775622 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 134775946 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134776309 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134776319 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134776379 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134776404 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134776438 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134776521 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134776531 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134776774 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134776783 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134776870 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134776928 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134776938 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134776966 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134776986 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134777031 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134777062 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134777138 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134777167 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134777269 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134777326 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134777516 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134777587 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134777594 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134777696 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134777719 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134777735 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134777750 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134777791 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134777800 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134779691 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134780087 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134780099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134780675 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134780679 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134780764 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134780847 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134780896 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134780903 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134781010 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134781165 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134781497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134781578 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134782435 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134784270 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134784310 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134784424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134784995 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134785293 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 134786543 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134786581 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134786593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134786752 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134787197 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134787223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134787343 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134787993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134789426 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134789784 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134789903 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134791501 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134791513 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 134791838 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134793720 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134796940 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134796942 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 134797010 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134797475 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134797507 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134797534 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134797585 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134797966 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134798188 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134798424 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134798439 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134798710 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 134799094 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134799261 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134799325 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134799440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134799527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134799534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134799871 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134800003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134801346 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134801720 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134801858 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134801933 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134802470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134803794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134803813 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134804027 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134804050 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 134804126 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134804224 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 134804229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134804308 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134804310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134804327 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134804403 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134804784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134804845 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134804968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134805629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134806029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134806077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134806429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134806464 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134806596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134807011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134808395 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 134808572 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134808856 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134809422 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134809497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134809552 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134809634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134809764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134810096 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 134810202 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 134810233 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134810251 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 134810332 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 134810361 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134810514 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134810589 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134810650 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 134810672 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134810719 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134810748 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134810796 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134810863 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134810995 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134811009 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134811013 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134811034 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 134811063 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134811227 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134811288 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 134811308 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 134811317 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134811348 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 134811407 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 134811441 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134811460 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 134811478 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 134811623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134811627 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134811712 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134811725 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 134811730 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 134811751 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134811755 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134811780 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 134811805 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 134811860 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 134811889 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 134811892 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 134812066 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134812184 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 134812240 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 134812243 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 134812316 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 134812362 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134812367 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134812382 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134812406 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134812421 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134812464 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 134812490 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 134812555 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134812575 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134812737 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134812742 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134812750 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134812896 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134813088 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 134813258 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 134813323 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 134813331 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 134813399 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 134813438 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 134813529 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134813964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134814456 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134814462 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134814488 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134814491 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 134814570 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 134814593 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134814949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134815435 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134815522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134815614 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134815691 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134815748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134815840 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134815841 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134815872 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134815997 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134816075 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134816087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134816132 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134816219 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 134816461 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 134816481 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134816488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134816542 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134816572 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 134816653 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 134816666 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134816729 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134818074 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134818263 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 134818383 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134818798 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134818876 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134818904 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134819014 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134819155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134819344 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 134819389 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134819393 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134819436 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134819502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134819522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134819541 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 134819549 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 134819845 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134819849 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134820085 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134820296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134820882 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134821300 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 134821482 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134822386 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 134822529 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 134822960 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134822961 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134823497 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 134824033 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 134824066 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134824636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134824654 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 134824727 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134824776 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134824993 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 134825408 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134825419 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134825470 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134825628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134825698 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134826476 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134826710 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134826799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134826807 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134826985 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134827141 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134827594 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134827718 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134827963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134827998 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134828152 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134828344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134828373 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 134828729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134828792 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134828917 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134828973 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134828998 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134829420 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134829493 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134829596 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134830208 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 134830231 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134830271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134830458 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134831204 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 134831261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134831278 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134831348 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 134831394 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 134831522 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 134831532 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 134831562 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 134831577 A T Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 134831624 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 134831731 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 134831786 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134831819 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134831820 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134831951 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134832062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134832247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134832253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134832272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134832347 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 134832617 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 134832628 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134832647 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134833932 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134834094 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 134834306 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 134834740 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134834816 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134834843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134834855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134834894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134835170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134835265 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 134835319 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 134835440 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 134836562 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134836620 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 134836823 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134836824 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134836859 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134836939 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134836941 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134836972 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134836988 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134837051 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 134837170 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 134837205 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134837235 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 134837262 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134837437 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134837483 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134837484 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134837554 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 134837578 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134837673 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 134837714 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 134837781 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134837825 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 134837887 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 134837915 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 134838002 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134838021 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 134838036 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 134838052 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134838069 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 134838075 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 134838217 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 134838241 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134838251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134838449 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134838727 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134838777 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134839336 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134839411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134839428 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 134839509 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 134839551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134839936 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134839976 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 134839978 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 134840205 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134840611 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134840728 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134841918 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134841940 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134841955 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134841977 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 134842837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134842904 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 134842908 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 134842972 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134843132 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134843486 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134844018 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134844406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134844837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134845041 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134845115 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134846206 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134846452 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134847575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134847618 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134847788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134847822 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 134848040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134848174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134848709 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134848773 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 134849075 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 134849164 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134849363 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134850304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134851862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134852157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134852509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134854768 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134854789 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134854983 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134855299 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134855324 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134855349 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134855939 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134856619 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134856966 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134857111 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 134857145 T A Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 134857576 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134857621 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 134857680 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134857746 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134857763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134857876 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134858056 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134858744 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134858800 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134858927 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134859004 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134859162 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134859192 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134859240 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134859366 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134859418 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134859433 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134859509 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134859525 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134859754 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 134859792 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 134860055 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134860107 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134860228 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 134860244 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 134860369 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 134860441 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 134860446 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 134860717 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 134860719 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 134860778 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 134860781 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 2 134860941 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 134860960 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 134860963 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 134860991 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 134861091 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 134861226 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 134861393 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 134861438 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 134861462 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 134861587 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134861616 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 134861668 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 134861814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134862010 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 134862022 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 134862094 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134862108 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 134862111 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 134862186 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134862462 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134862493 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 134862680 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134862720 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 134862880 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 134863124 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 134863180 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134863185 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 134863237 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 134863538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134863824 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 134863907 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134864331 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134865051 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134865115 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 134865161 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 134865187 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 134865294 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 134865424 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 134865540 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 134865654 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 134865755 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 134865793 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 134865861 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 134865925 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 134866121 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134866181 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 134866311 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 134866368 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 134866430 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 134866480 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 134866697 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 134866897 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 134866992 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 134867001 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 134867273 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 134867274 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 134867326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134867339 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134867341 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134867392 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 134867420 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 134867582 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134867615 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134867767 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 134867771 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 134867824 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 134867849 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 134867911 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 134867935 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 134867974 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134868024 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134868055 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 134868064 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 134868091 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134868121 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134868132 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134868193 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 134868194 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 134868223 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 134868424 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134868479 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 134868501 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134868653 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134868673 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134868739 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134868765 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 134868815 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 134868863 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134868940 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 134869250 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134869393 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134869470 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 134869519 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 134869558 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134869628 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134869656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134869678 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134869699 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134870077 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134870232 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134870298 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134870440 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134870470 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134870923 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 134870974 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134871583 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 134871629 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 134872242 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 134872275 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 134872724 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 134872803 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 134872996 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134872997 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134873019 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134873375 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134873563 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 134873824 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 134874299 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 134874518 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134874580 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134874864 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134874887 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134874896 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134874932 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134874946 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 134874971 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 134875049 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 134875076 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134875171 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134875475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134875872 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134875927 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134876029 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134876219 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134876232 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 134876520 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134876639 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 134877354 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134877427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134877447 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134877450 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134877739 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134877903 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134878474 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134878892 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134878905 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134879148 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134879160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134879757 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134879797 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134880184 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 134880695 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134881156 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 134881361 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134881569 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134881917 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134882160 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134882214 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134882231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134882856 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 134883291 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134883299 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 134883555 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 134883662 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 134883890 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 134883896 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 134884026 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 134884332 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 134884333 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 134884592 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 134884600 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 134884620 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 134885684 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134885778 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 134885837 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134885872 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134885891 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134885919 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 134885937 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 134885958 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134887782 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 134887792 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 134887862 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134887899 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 134887997 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 134888007 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 134888088 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 134888095 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 134888272 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 134888344 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 134888408 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134888469 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134888542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134888565 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 134888612 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 134888728 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134888752 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 134888809 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 134888881 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134888929 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134888959 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134888969 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134889019 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134889020 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134889050 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134889069 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134889073 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134889155 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 134889165 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 134889178 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 134889503 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 134889548 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134889563 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 134889635 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 134889705 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134889730 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134889745 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 134889796 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 134889799 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 134889843 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 134889920 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134890259 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 134890373 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134890668 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 134890738 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 134891141 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134891159 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134891180 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134891202 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134891245 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134891275 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134891304 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 134891473 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134891477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134891530 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 134891565 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 134891575 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134891604 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 134891638 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 134891681 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 134891885 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134891891 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 134891977 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 134892210 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 134892579 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 134892760 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134892855 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134893553 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 134893726 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134894085 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 134894549 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 134894553 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 134894754 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134894792 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 134894877 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134895075 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 134895157 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 134895366 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 134895437 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 134895605 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134895784 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134896136 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134896561 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134896910 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 134896924 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134897213 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134897360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134898239 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134898811 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 134898888 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134899073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134899143 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134899166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134899323 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 134899465 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134899687 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 134900553 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134900678 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134900772 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 134900915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134901198 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134901870 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 134902140 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134902319 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134902764 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134903095 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134903162 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 134903206 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 134903237 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 134904450 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134905268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134905698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134905769 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134907424 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 134907430 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 134907441 C G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 134907496 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 134907554 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 134907679 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134907804 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 134907819 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 134907825 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 134907851 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 134907886 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 134907909 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 134907939 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 134907942 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 134908009 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 134908070 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 134908080 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134908091 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134908152 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 134908153 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134908163 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 134908268 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134908310 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 134908338 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134908342 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 134908427 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 134908468 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 134908537 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 134908676 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134908683 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134909052 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 134909072 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 134909145 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134909185 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 134909271 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 134909342 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 134909368 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 134909402 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 134909439 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 134909472 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 134909532 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134909580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134909618 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 134909621 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134909629 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 134909723 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 134909724 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 134909854 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 134909934 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 134909957 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 134909959 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 134910024 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134910184 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 134910281 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 134910456 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 134910467 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 134910487 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 134910575 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 134910579 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134910703 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134910798 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 134910850 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 134910892 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 134910947 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 134911393 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 134911432 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 134911446 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 134911488 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 134911503 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 134911777 T G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 134911804 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 134911823 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 134911959 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134911988 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134912083 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134912315 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 134912466 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134913212 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134913296 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134913328 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 134913619 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134913628 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134913636 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 134913644 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 134913651 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134913712 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 134913792 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 134913831 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134913945 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 134914009 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 134914079 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 134914128 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134914460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134914685 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134914761 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134914846 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 134914937 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134915060 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134915064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134915209 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 134915295 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134915332 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 134915529 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134915541 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 134915634 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134915658 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 134915705 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134915835 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134915975 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 134915981 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 134916062 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134916104 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134916138 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134916307 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134916372 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134916463 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 134916561 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134916573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134916644 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 134916789 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134916983 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 134917080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134917091 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134917395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134917567 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 134917772 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 134917834 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 134917840 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 134917946 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 134918053 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134918073 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134918127 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 134918488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134918988 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134919165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134920026 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134920449 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134920689 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134920742 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 134921836 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134922143 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134922166 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134922222 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 134922795 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134922847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134922960 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134922990 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 134923026 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 134923337 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134923403 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134923404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134923506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134923623 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134923658 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134923687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134923753 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134923758 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134923810 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134923847 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134923869 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134923909 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134924030 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 134924044 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 134924057 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 134924099 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134924208 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134924774 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134924899 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134924926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134925425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134925598 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134925711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134925806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134925840 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134925941 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 134926131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134926251 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 134926488 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 134926584 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134926585 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134926682 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134926758 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134926846 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134926960 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 134927103 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 134927223 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 134927262 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134927332 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134927411 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134927476 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134928705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134929923 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134932663 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134934085 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 134934160 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 134934387 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 134934435 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134934654 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134934670 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 134934713 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134934812 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134934819 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134934860 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134934957 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 134935151 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134935208 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 134935243 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 134935244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134935566 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134935600 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 134935999 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 134936304 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134936330 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134936482 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134936537 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134936608 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134936611 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134936995 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 134937016 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134937043 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134937101 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134937129 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134937264 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 134937280 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134937325 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134937388 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 134937393 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 134938752 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134940646 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 134941705 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134942144 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134942192 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134942218 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134942428 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134942850 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134942996 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134943011 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134943030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134943052 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 134943153 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134943215 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134943663 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134943839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134943907 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134944192 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 134944202 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 134944322 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134944367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134944373 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134944439 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134944525 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134944551 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134944748 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134944794 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 134944795 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 134944865 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 134944895 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134944976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134945023 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134945180 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134945293 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134945315 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134945325 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134945357 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134945403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134945454 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134945543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134945587 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134945648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134945675 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134945688 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134945710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134945731 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134945783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134945862 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134945909 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134946227 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 134946297 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134946626 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134946726 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134946761 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134947361 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134947411 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134947417 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134947523 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134947545 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134947856 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134947914 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 134948004 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 134948039 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134948058 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134948117 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134948129 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134948139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134948170 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134948171 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134948199 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134948206 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134948210 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134948219 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134948323 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134948522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134948533 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134948648 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134948754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134949197 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134949286 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134949369 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134950220 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134950400 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134950402 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134950485 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134950553 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134950555 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134950719 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134950783 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134950939 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 134951011 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134951023 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134951120 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134951169 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134951247 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134951565 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134951589 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134951775 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134952121 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134952125 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134952162 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134952180 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134952183 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134952191 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134952239 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134952284 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134952326 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134952459 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134952506 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 134955896 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 134956028 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134956207 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 134956284 G C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 134956322 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 134956540 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 134956689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134956706 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 134956761 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134956826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134957002 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134957059 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 134957243 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134957594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134957645 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 134957744 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 134957829 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 134958078 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134958129 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134959097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134959311 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134959315 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134959402 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134959756 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134959949 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134960052 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134960061 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134960108 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134960479 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134960903 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134962807 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134962870 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134962897 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134962950 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134963144 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 134963216 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134963292 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 134963347 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134963476 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134963528 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 134963596 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 134963678 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 134963833 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 134963834 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 134963885 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 134963958 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 134963995 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 134964032 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 134964152 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 134964198 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134964354 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 134964428 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134964431 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 134964460 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134964520 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 134964756 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 134964829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134964848 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 134964936 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 134965173 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 134965269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134965494 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134965497 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134965625 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 134965669 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134966374 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134966524 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 134966647 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 134966678 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134967348 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 134967598 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134967778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134967828 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134968275 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 134968682 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 134968710 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 134968884 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134968885 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134969136 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134969152 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 134969208 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134969322 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134969401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134969705 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 134969973 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134969999 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134970088 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134970173 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134970259 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134970280 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134970378 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134970405 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134970431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134970479 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134970502 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134970599 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134970663 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134970682 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 134971121 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 134971253 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 134971550 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 134971560 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 134977837 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 134977848 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 134979310 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 134979515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134979660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134980314 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134980794 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134984104 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134986667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134987289 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134987757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134988351 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 134988491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 134990364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134991431 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 134991830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134991856 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 134992490 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 134992607 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134993711 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 134994424 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134994561 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134995485 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 134995529 C G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134995800 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996021 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996083 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 134996157 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134996192 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 134996233 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 134996259 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 134996281 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 134996425 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996452 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996512 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 134996525 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 134996808 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 134996809 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 134996826 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996895 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996904 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996907 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996934 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996940 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996956 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996970 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134996973 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 134997054 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 134997076 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134997090 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134997109 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134997161 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134997232 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 134997237 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 134997287 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 134997479 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134997550 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134997554 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134997642 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 134997743 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134997750 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134997839 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134997949 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 134997994 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134998092 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134998106 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134998159 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134998206 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 134998876 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134999090 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 134999517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135000124 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135000232 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135000415 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135000527 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135000546 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135000620 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135000685 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135000744 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135000817 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135000825 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135000948 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135000970 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135001053 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135001089 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135001130 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135001971 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135002040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135002111 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135002237 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135002299 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135002399 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 135002445 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135002477 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135002837 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 135003318 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135003368 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 135003610 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 135004105 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 135004669 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135004707 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135004749 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135004887 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135004971 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135005216 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135005454 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135005661 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 135005799 A C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 135005967 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 135006018 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135006337 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 135006502 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135006579 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135006937 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 135007029 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135007089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135007369 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135007729 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135007730 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135007870 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 135008425 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135008688 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135008855 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 135008952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135009096 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135009309 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135009540 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135009892 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135010342 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 135010352 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 135010470 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 135010527 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135010586 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135010654 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 135010895 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135011477 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 135011609 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135011845 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 135012000 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 135012104 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135012248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135012821 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135013108 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135013248 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135013623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135013886 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135014494 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135014625 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135014722 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135014754 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 135015109 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135015136 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 135015240 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135015259 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135015279 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135015339 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135015600 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135015634 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135015718 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135015757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135015830 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135015832 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135015898 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135015912 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135016075 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135016166 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135016255 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135016271 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135016282 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135016306 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135016483 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 135016592 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135016638 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135016642 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135016687 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135016697 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135016877 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135016888 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135016915 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135016945 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135016948 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135016994 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135017169 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 135017251 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135017264 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135017288 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135017313 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135017438 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 135017500 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135017623 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135017693 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135018033 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135018101 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135018145 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 135018216 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135019077 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 135019105 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 135019212 A T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 135019478 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135020755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135021212 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 135021262 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 135021512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135021836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135022734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135024066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135025087 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135025367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135026318 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135027039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135027112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135028193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135030482 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135031138 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 135031578 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 135031630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135031656 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135031787 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135031815 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135031828 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135031882 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135031948 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135031956 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135031996 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135032008 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135032332 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 135032355 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 135032505 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135032614 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135032634 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135032660 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135032661 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 135032721 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135032740 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135032759 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135032969 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135033013 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 135033022 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135033026 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135033060 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135033135 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135033171 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135033282 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 135033293 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 135033305 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 135033484 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 135033708 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135033743 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135033815 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 135033819 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135033834 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135033838 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135033870 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135033941 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135034020 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135034099 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 135034408 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135034479 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135034567 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135035002 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135036036 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135037067 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135037296 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135037379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135038835 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135042394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135042488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135042747 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135043736 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135043827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135043849 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135045870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135046903 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 135048464 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 135048887 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135049032 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 135051179 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135051768 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 135052755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135053317 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135053563 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135053761 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 135053823 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 135053827 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 135053843 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135053870 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 135053899 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135053915 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135053956 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135054023 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135054141 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135054297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135054305 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135054502 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 135054585 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135055108 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135055115 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 135055199 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 135055240 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 135055244 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 135055282 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 135055349 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135055431 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135055821 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135056023 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135056031 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135056082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135056109 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135056111 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135056293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135056475 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135056520 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135056582 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 135056639 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 135056650 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135056726 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135056761 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135056767 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135056782 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135056786 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135056823 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135056846 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135057109 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135057268 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 135057311 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135057424 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135057448 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 135057635 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135057707 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135057756 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135057943 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135057955 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 135058155 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135058304 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 135058307 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135058347 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135058499 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135058627 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135058635 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 135058705 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135058709 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135058748 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 135058782 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135058798 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 135058803 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135058839 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135058873 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135058879 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135058934 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 2 135058950 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 135059199 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135059232 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 135059238 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 135059297 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 135059521 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135059587 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135059627 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135059672 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135059691 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135059726 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 135059782 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135059842 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135059965 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135059982 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135060177 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135060191 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135060307 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135060312 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135060423 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135060485 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135060591 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135060645 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135060709 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135060866 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135060912 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135060922 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135061587 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135061717 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135061785 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135061845 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 135061847 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135061978 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 135062010 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 135062192 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 135062226 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135062237 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135062252 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135062384 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 135062422 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135062507 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 135062517 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135062534 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135062576 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 135062896 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135063060 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135063091 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135063166 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135063258 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 135063323 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135063449 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 135063525 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 135063577 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 135063597 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 135063648 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 135063806 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135063820 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135063843 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 135063849 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 135063920 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135064062 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 135064067 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135064164 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 135064172 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135064197 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135064307 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135064319 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135064335 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135064372 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135064728 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 135064762 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 135064854 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135064923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135065006 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135065087 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135065123 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135065139 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135065269 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 135065365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135065369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135065683 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135066093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135066148 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 135066346 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135066347 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135066444 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 135066479 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 135066492 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 135066528 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135066541 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135066546 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 135066594 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 135066629 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135066717 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 135066798 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135066895 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 135066896 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 135066966 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135066982 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135067002 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135067024 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135067078 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135067332 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135067357 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135067427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135067654 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135067693 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 135067933 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135068175 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135068229 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135068239 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 135068876 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135069289 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 135069302 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135069457 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135069514 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135069535 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135070053 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135070060 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135070505 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135070620 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 135070699 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 135070733 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 135070854 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 135070860 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135071002 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 135071068 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 135071080 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135071089 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 135071092 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135071172 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 135071185 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135071363 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 135071417 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 135071644 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 135071741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135071799 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135071996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135072279 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135072282 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135072299 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 135073145 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135073329 C G Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 135075190 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 135075259 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135075319 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135075437 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 135075449 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 135075595 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 135075639 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 135075808 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 135075932 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 135076005 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135076162 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135076170 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135076202 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135076209 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135076320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135076419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135076424 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135076741 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 135076820 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 135076869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135077049 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 135077172 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135077269 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135077571 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135077574 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 135077635 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 135077781 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135077796 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 135077816 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 135077817 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 135077864 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 135077909 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 135077963 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 135077984 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 135078023 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 135078051 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 135078161 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 135078259 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 135078274 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 135078492 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135078636 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135078784 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135078825 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135078826 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135078848 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135078921 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135078970 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 135078981 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135079089 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135079180 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135079231 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135079241 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135079259 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135079340 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135079341 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135079441 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135079673 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135079707 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135079753 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135079782 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135079860 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135079885 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135079903 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135079905 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135080198 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135080328 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135080753 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135080844 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135080870 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135080957 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135081143 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 135081245 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135081251 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135081284 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135081333 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 135081795 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135081941 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135082633 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135082637 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135082706 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135082789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135082805 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135082829 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 135082887 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 135083153 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135083160 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 135083224 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 135083240 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135083262 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135083391 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135083423 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135083437 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135083495 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135083580 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135083583 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135083780 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 135083857 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135083862 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135083893 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135083941 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135083994 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 135084402 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135084548 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135084644 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135085111 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135085193 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135085297 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135085560 G T N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 135085717 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 135085765 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135086082 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135086116 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135087095 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 135087175 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135087216 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 135087340 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 135087401 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 135087526 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135087570 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135087615 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 135088031 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 135088259 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 135088831 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 135089745 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135090036 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135090195 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135090223 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135091294 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135091492 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135091851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135091909 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135092291 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 135092849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135093010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135093122 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 135094125 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135094272 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 135094557 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135094638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135094919 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135095088 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 135095100 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 135095275 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135095527 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135095531 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135096867 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135096991 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135097246 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135097912 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135098878 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 135099434 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135099936 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135100191 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135100565 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135101890 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 135101936 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 135102547 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135104046 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135104824 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135105048 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135106192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135106981 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135107079 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135107125 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 135107292 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135107425 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135107561 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 135107575 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 135107763 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135108024 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135108964 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135109307 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 135109638 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135109725 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135110214 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 135110334 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 135110672 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135110980 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 135111172 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 135112307 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 135112512 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135112677 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135113029 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135113462 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135113630 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 135114379 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135114564 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135114586 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135114946 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 135114960 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 135115009 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 135115292 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 135115467 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 135115743 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 135115765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135116116 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135116249 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 135116266 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135116619 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 135116655 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135116966 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135117053 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135117121 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135117177 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135117229 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 135118103 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 135118105 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 135118343 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135118371 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135118514 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135118930 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 135119556 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 135119649 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135120521 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135120544 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135120933 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135121104 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135121242 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 135121258 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135121287 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 135121288 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 135121313 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 135121348 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135121351 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135121404 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 135121438 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135121445 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135121499 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135121510 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135121529 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 135121591 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135121614 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 135121760 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135121894 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135121903 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135121905 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135121982 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135123088 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135123344 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 135123403 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135123428 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135123458 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 135123467 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135123580 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135123717 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135123771 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135124126 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135124169 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135124181 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135124297 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135124360 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135124404 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135124445 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135124455 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135124478 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 135124565 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135124601 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135124661 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135124758 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135124909 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135124942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135124956 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135124988 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135125021 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135125048 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135125094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135125138 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135125217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135125454 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135125794 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 135126012 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135126083 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135126454 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135127844 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 135128156 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135128503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135130047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135130425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135130825 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135131004 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135131484 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135132699 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135133608 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135133611 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135133867 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135133995 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135134288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135134628 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135135206 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135135831 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135135901 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 135135910 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 135135959 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135135985 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135136097 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135136137 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135136140 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 135136262 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135136264 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135136354 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 135136361 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135136380 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 135136488 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135136611 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135136648 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135136901 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 135136904 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 135136932 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135136947 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135136955 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135137044 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 135137052 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 135137257 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135137283 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 135137330 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 135137371 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 135137445 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 135137525 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 135137660 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 135137808 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 135137934 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135137988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135138468 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 135138600 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 135138614 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135138644 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135138699 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 135138754 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 135138763 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135139130 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 135139680 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 135139737 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 135140085 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135140253 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 135140403 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135140404 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 135140417 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 135140628 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135140629 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135140806 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 135140817 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135140958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135141019 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 135141042 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 135141058 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135141230 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 135141250 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135141297 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 135141318 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 135141403 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 135141446 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 135141511 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135141515 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135141530 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135141773 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 135141897 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135142002 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135142019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135142077 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135142290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135142298 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135142431 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 135142489 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135142573 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135142603 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135142954 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135143070 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135143145 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 135143169 A T N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 135143231 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 135143297 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135143348 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135143368 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135143569 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 135143584 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 135143651 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135143741 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135143813 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 135143830 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 135143856 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 135143871 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135143945 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 135144028 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 135144076 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 135144179 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135144213 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 135144274 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 135144577 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135144615 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135144748 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135144787 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 135144795 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 135144878 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135144902 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 135144933 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135144952 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 135144955 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 135145036 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135145062 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135145157 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 135145191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135145253 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 135145315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135145347 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135145509 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135145633 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135145806 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135145808 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135146087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135146238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135146239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135147203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135147644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135148016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135149035 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 135149067 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135150038 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135150043 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 135150333 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135150412 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135151000 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135151205 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 135151298 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 135151301 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 135151472 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135151575 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135151628 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135151631 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135151681 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135151778 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135151893 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135151895 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135151941 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135151988 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135152165 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135152260 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 135152364 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 135152536 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135152709 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135152771 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 135152820 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135152834 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 135152837 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 135152881 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 135152920 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 135152971 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 135153093 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 135153135 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135153180 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 135153208 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135153306 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 135153312 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 135153317 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 135153331 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 135153955 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135154530 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135154766 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135154772 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135155057 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 135155257 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135155341 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135155446 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135155478 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135155648 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 135155659 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135155706 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135155773 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135155808 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 135155826 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 135155845 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 135155975 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135156107 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135156155 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135156159 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135156205 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135156394 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 135156413 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 135156815 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135157769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135157991 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 135158411 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135159814 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135159850 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135159960 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135160519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135160797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135162574 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135162614 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135162620 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135163278 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135164999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135165215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135165631 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 135166318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135166827 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135166863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135168175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135168380 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 135168623 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135170461 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135171194 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135171941 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135172115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135172130 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 135172844 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135173404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135174203 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135174856 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 135176280 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135176921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135177144 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135177324 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135177915 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135178453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135182861 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135183309 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135183335 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135183955 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135184227 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135184297 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135184350 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135184743 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135185299 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 135185608 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 135186892 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 135187108 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 135187113 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 135187307 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 135187349 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 135187350 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 135187428 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 135187510 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135187514 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135187531 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135187666 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 135187714 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 135188097 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 135188294 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135188324 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135189193 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135189243 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135190156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135190622 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 135190640 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 135190819 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 135191171 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 135191193 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 135191424 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135192479 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135192502 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135192532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135192669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135192723 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 135192884 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135193572 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135194077 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135194214 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135194619 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135194686 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135194966 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 135194991 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135195031 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135195043 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135195118 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135195119 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135195282 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 135195440 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135195598 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135195700 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135195720 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135195798 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 135195829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135196007 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135196051 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135196750 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 135196805 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135197024 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135197153 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135197179 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 135197183 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 135197195 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 135197304 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 135197347 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135197379 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 135197434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135197612 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 135197662 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135197753 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135197830 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 135197945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135198233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135198319 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135198571 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 135198660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135199849 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135200343 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 135200358 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 135200397 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 135200540 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135200578 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135201011 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135206278 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135206624 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135207094 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135208084 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 135208341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135208360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135208839 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135210181 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135210233 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135210315 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 135210841 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135211166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135211301 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135211429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135211593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135212196 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 135213873 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135213894 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 135214326 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135214523 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 135214755 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 135214756 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 135214774 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135215049 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 135215358 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 135215359 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135215534 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135215542 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135215558 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 135215752 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 135216009 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135216092 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135216594 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 135216631 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 135216738 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135216750 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 135216838 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 135217179 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 135217367 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135217382 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135217413 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 135217465 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 135217506 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 135217654 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135217892 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 135217954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135218036 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 135218052 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135218068 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 135218103 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135218144 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135218170 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135218267 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135218279 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135218295 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135218334 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 135218335 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135218565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135218955 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 135218975 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 135219046 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135219068 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 135219310 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 135219444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135219459 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135219674 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 135219741 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135219814 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135219847 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135219979 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135220032 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135220049 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 135220155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135220157 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135220271 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135220303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135220334 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135220391 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 135220418 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 135220430 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 135220437 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 135220806 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 135220860 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 135220864 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 135220883 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135220892 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135220932 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 135220974 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135221009 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135221040 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135221247 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135221296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135221299 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135221337 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135221346 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135221390 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135221476 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135221485 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135221615 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 135221687 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135221690 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135221707 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135221715 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 135221778 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135221865 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135221980 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 135221998 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135222136 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 135222193 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135222219 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135222269 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 135222290 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135222338 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135222441 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 135222611 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135222654 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135222836 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135222843 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 135222855 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135223023 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135223367 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 135223609 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135223731 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135223746 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135223819 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 135223832 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 135223842 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 135223964 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135224032 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 135224519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135225165 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135225186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135225291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135225388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135225423 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 135225475 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135225527 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135225618 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135225811 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135225829 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135225902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135226000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135226058 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226077 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226084 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135226300 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226516 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226532 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226660 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226700 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226704 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226739 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226760 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226768 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226771 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135226782 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226788 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135226852 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135227050 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135227151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135227162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135227175 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135227279 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135227636 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135227642 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135227696 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135227768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135227928 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135228277 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135228395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135228646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135228702 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135228726 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 135228751 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 135228920 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 135228939 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 135228973 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135229395 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 135229514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135229709 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 135229825 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135230386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135230822 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135230911 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135230975 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135231059 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 135231062 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 135231072 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 135231104 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 135231139 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 135231170 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 135231216 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 135231224 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 135231669 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 135231844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135232057 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135232427 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135232428 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135232514 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135232576 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135232633 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 135232701 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 135232976 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135233183 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135233216 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135233222 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135233253 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135233387 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135233388 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135233420 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 135233468 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 135233482 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 135233596 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 135233694 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 135233851 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 135233890 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135234007 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 135234145 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 135234162 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 135234171 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135234188 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135234458 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 135234464 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 135234512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135234634 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135234636 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135234953 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135235014 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135235085 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135235183 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135235259 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135235295 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135235520 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135235627 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 135235682 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 135235684 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 135236052 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 135236117 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 135236171 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135236273 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135236365 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135236416 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135236567 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 135236740 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 135236835 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135236873 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135236909 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 135237100 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135237214 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 135237222 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 135237298 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 135237410 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135237484 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 135237653 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 2 135237709 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135237716 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135237812 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135238184 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135238586 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 135239964 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135241163 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135241944 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135242243 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 135242871 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 135242874 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 135242911 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 135243191 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135243192 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135243564 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135243684 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 135243695 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135243820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135243950 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135243951 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135244149 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135244184 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135244503 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135244525 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135245753 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135246225 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135248843 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135249903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135251082 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 135251150 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 135251541 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135252430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135252792 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 135253528 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135253898 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 135253899 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 135253978 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135254778 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 135255226 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135257338 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135257419 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135257442 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 135257776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135257803 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 135258100 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135258404 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135258446 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 135258741 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 135259126 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 135259152 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 135259200 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135259238 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 135259253 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 135259400 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 135259459 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 135259461 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 135259920 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135259981 G T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 2 135259989 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 135260036 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 135260118 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 135260130 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135260153 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 135260154 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 135260164 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 135260196 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135260233 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135260296 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135260360 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 135260463 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135261107 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135261561 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 135262232 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135262532 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135263774 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 135263778 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 135264151 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135264623 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 135264716 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135264739 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135264985 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 135265044 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 135265113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135265270 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135265377 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 135265441 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 135265511 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 135265576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135265597 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 135265622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135265685 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135265715 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135265834 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135265881 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135266170 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135266194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135266524 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135266902 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135267039 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135267101 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135267185 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135267197 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135267811 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135267831 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135267933 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135267957 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 135268138 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135268214 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 135268354 T G N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 8 10 0 8 1 2 135271392 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 135271421 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135271479 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 135271586 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 135271636 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 135271863 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135271864 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135272266 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135272318 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135272461 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135272464 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135272495 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135272500 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135272562 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135272564 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135272591 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135272723 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135272731 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135272811 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135272836 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 135272917 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135273003 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 135273177 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135273192 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135273218 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135273273 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135273363 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135273381 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135273417 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135273427 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135273434 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135273450 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135273528 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135275072 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135275114 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135275155 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135275210 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 135275319 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135275335 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 135275414 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135275430 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135275440 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135275469 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135275668 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 135275741 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135275796 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 135275835 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135275848 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 135275946 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135276016 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 135276040 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 135276079 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 135276098 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135276127 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135276146 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135276151 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 135276213 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135276331 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135276528 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 135276567 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 135276576 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 135276598 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 135276655 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135276882 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135277059 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135277066 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135277390 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 135277492 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 135277574 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135277575 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135277586 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135277661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135278005 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135278096 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135278169 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 135278457 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 135278481 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135278618 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 135278738 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 135278897 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 135278955 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135278985 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135279164 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 135279437 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135279505 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135279795 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135279796 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135280170 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 135280238 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135280465 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 135280989 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 135281270 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 135281373 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 135281749 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 135282308 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135282338 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135282534 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 135282639 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 135282774 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135282858 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135282935 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135283024 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135283097 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135283485 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 135283493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135283504 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135283527 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135283604 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135283652 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135283798 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135284039 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 135284056 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135284073 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135284108 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135284114 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 135284366 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135284428 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135284524 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135284635 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135284723 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 135284744 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135284753 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135284881 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 135284978 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135285051 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135285267 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135285352 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 135285788 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135285822 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135286347 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135286355 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135286439 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 135286440 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 135286491 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135286551 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135286657 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135286658 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135287024 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135287205 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135287245 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135287297 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 135287329 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 135287412 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 135287444 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 135287541 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 2 135287670 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 135287681 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 135287730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135287747 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 135287828 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135287848 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 135287883 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 135287916 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135287927 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 135287963 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 2 135288049 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 135288087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135288184 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 135288186 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 135288255 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 135288293 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 2 135288329 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 2 135288337 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 135288347 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 135288440 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 135288534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135288546 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135288647 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 135288696 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135288754 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 135288776 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 135288783 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135288914 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 135288927 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 135288941 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 135288965 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135289004 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135289039 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 135289130 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 135289179 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135289210 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 135289375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135289483 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 135289506 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135289525 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 135289669 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135289678 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 135289818 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 135289868 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 135289877 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 135289936 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 135289953 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 135290014 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 135290259 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 135290395 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 135290498 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135290664 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135290709 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 135290726 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 135290746 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 135290758 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 135290800 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 135290903 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 135291153 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 135291313 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135291406 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135291483 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 135291505 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135291603 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135291626 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135291720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135291723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135291770 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135291853 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 135291867 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135291923 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 135291971 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 135292035 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135292083 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135292184 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135292198 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 135292556 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135292571 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 135292623 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135292680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135292725 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 135292739 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135292770 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135292779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135292797 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 135292951 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 135292992 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 135293001 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 135293007 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 135293058 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135293073 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135293119 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135293362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135293377 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135293392 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135293442 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135293536 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135293633 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135293640 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135293756 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135293766 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135293803 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135293816 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135294260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135294317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135294319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135294356 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135294402 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135294420 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 135294456 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135294499 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135294582 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 135294678 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135294690 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 135294806 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 135294862 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 135294882 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 135294947 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135294980 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135294991 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135295126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135295173 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 135295259 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 135295326 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135295376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135295417 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135295436 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 135295494 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135295528 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135295579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135295593 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135295635 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 135295638 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135295652 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 135295660 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 135295798 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 135295823 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135295828 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135295847 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135295970 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135295985 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 135296095 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135296178 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135296303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135296439 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135296503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135296515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135296574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135296626 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135296700 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135296701 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135296844 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135296903 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135296917 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135297003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135297015 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135297141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135297171 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135297209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135297358 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135297468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135297469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135297494 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135297941 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135298090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135298093 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135298110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135298324 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135298433 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135298671 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135299402 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 135300142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135300597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135301654 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135301829 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135302535 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135304069 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135304477 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135304972 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135305006 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 135305224 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135305413 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135305414 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135305450 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 135305532 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135305711 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135305766 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135305790 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135305830 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135305866 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135305944 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135305962 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135305974 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135306410 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 135307089 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135307205 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 135307842 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135309765 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135310508 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135310546 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135310860 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135310972 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135312851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135314263 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135315611 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 135317142 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135317536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135317829 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 135317868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135317872 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135318026 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135318164 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 135318177 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135318242 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135318294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135318478 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135318654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135319036 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 135319174 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 135319832 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 135320690 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135320691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135321872 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 135322028 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 135322042 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 135322055 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 135322094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135322113 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 135322174 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 135322194 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 135322301 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135325043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135326062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135326115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135326184 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135326185 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135326651 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135327345 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 135327444 T A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 135327551 T G N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 135327552 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 135330635 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135331062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135331373 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135331857 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135332039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135332130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135332228 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135332305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135332717 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135332948 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135333062 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135333190 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135334190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135335997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135336214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135345957 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135346298 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 135347053 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135349139 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135349368 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 135349657 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135349662 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135350599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135351055 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135351719 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135351755 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135351872 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135352460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135352727 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135352930 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135353549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135354184 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135354296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135355405 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135357151 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135357364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135357566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135357987 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135362351 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135362875 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135363323 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135363485 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135364952 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135365023 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 135365282 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135365474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135365713 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135365806 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135366238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135366281 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135367051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135367195 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135367339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135367346 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135367370 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135367418 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 135367505 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 135367520 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 135367621 C A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 135367832 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135367851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135367917 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135368009 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135368057 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135368087 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135368116 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135368396 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135368898 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135369055 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135369270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135370353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135371927 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135372016 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 135372162 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135372172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135372173 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135372580 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 135373260 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 135373928 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135373947 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135373971 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135374099 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 135374209 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 135374233 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135374317 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 135374396 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 135374400 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 135374503 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 135374508 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135374519 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135374604 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135374631 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135374654 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 135374750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135375027 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135375066 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135375075 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135375077 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 135375242 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135375350 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135375399 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 135375512 C T Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 135375740 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 135376824 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135376850 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135377333 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135377750 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135377915 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135377917 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135378091 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135378283 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135378315 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135378503 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135378734 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135379269 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135379418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135379514 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135379986 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135380379 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 135380521 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135380742 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135380918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135380990 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 135381006 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 135381207 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 135381214 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 135381248 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 135381396 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 135381471 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135381492 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 135381523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135381596 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 135381616 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 135381673 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135381762 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135381954 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 135382030 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135382146 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135382183 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135382378 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135382464 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135382482 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 135382621 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135382742 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 135384156 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135384194 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135384201 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135384418 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135384612 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 135384722 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135385042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135385158 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 135385213 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135385241 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 135385257 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 135385283 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135385450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135385522 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135385706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135385887 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135386008 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135386163 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135386165 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 135386557 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135386637 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135386802 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135386977 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 135387004 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135387058 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135387226 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135388474 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135388995 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135389108 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135389230 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135389258 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 135389279 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135389319 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135389367 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 135389465 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135389492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135389539 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135389559 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135389750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135389794 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 135389899 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 135390239 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 135390250 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135391215 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135391239 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135391299 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 135391500 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135391554 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135391566 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 135392804 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 135392888 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135393088 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135393154 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 135393165 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 135393181 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 135393236 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135393372 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 135393544 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 135393750 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 135393806 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 135393921 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135394022 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135394315 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135394689 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135394721 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135394756 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 135394851 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135394922 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135394942 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135394947 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135395013 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 135395065 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135395078 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 135395108 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 135395126 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 135395128 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135395190 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135395397 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135395475 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 135395505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135395511 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 135395538 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135395616 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 135395713 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135395767 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135396075 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135396154 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135396160 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 135396182 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135396308 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 135396370 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 135396432 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135396453 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 135396639 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135396820 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135396906 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135397013 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135397018 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135397032 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135397044 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135397099 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135397119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135397159 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 135397223 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135397287 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135397471 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135397535 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 135397584 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 135397640 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 135397722 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135397736 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135397751 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135397782 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 135397886 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135397900 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 135397965 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135397980 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 135398031 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 135398115 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 135398142 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135398174 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135398261 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135398383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135398399 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135398453 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135398512 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135398531 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135398990 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135399209 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 135399265 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135399324 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135399482 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135399500 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 135399505 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 135399963 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 135400026 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135400027 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135400555 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 135401045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135401071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135402301 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135403734 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 135404634 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135405085 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135405168 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 135405681 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 135406064 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135406066 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135406201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135406249 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135406428 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135406445 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 135406565 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 135406918 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 135407021 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 135407035 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 135407201 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135407266 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135407280 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135407297 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135407339 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 135407364 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135408103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135408304 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 135408327 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135408719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135409435 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135409579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135409742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135409828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135409868 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135409956 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 135410064 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135410079 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135410084 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135411497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135416056 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135416968 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135418025 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 135418067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135418242 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 135418308 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 135419699 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 135419973 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 135420009 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 135420038 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 135420302 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 135420580 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 135420589 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 135420591 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 135420651 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 135420780 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 135420819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135420841 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 135420940 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 135421046 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 135421112 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135421126 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135421303 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135421322 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135421341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135421495 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 135421532 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 135428138 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135428352 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135428463 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 135428729 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135428900 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 135428993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135429066 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135429377 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135429494 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135429562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135429604 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135429755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135430257 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135430262 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135430311 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135430338 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135430527 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135430842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135431408 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 135431453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135431526 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 135432157 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135434052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135434168 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135434171 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135434989 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135435580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135437535 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135437726 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 135438498 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135439749 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135439956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135440291 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 135441370 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135441806 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 135443902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135444360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135444764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135444985 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135445970 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135446187 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135447188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135447215 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 135447277 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135447284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135447339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135447377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135447481 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135447497 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 135447523 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135447541 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135447709 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 135447873 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 135448105 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 135448110 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 135448127 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 135448157 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 135448159 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 135448304 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135448408 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 135448497 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135448565 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 135448782 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135448859 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135448873 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135448900 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135449028 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135449043 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135449083 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135449270 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135449466 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135449559 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135449662 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135449822 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135449836 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135449852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135450090 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135450179 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135450271 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135450272 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135450418 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135450419 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135450440 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135450476 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135450607 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135450810 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135450814 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135450830 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135450839 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135450882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135450974 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135451091 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135451092 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135451155 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135451169 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135451171 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135451263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135451345 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135451366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135451426 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135451544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135451604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135451734 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135451795 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135451846 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135451931 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135451937 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135451998 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135452031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135452134 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 135452974 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 135453371 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135453451 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135453504 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135454434 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 135454526 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135455008 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135455026 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135455256 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135455312 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135455383 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135456336 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135456837 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135460172 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135460262 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 135460885 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135460956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135463607 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 135464746 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 135466374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135466593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135467718 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 135468694 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135468698 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135470092 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135470179 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135472639 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135472735 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 135472930 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135473106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135475208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135475543 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135475659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135478976 T A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 135479412 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135480091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135480345 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135482381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135487292 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 135488369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135488448 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135489187 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 135491123 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 135493134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135498403 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135498995 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135499241 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135499579 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 135502474 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135502717 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135505029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135506407 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135506706 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 135507155 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135507183 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135507194 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135512356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135515049 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135515122 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135519046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135519988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135525854 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 135526177 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135528097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135530811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135535109 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135538563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135538891 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135539757 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 135539791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135539945 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135540154 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135540241 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 135540364 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135540432 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 135540804 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135540911 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135540982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135541038 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135541172 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135541330 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135541382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135542213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135542383 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135542635 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135543262 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135543358 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135543428 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135543458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135544022 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135544095 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 135544350 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135544753 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135544786 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135545411 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135545585 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 135545588 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135545652 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 135546194 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 135546474 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135547260 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135547867 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135547916 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135547969 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135547990 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135548178 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135548206 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135548401 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135548416 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135548421 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135548436 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135548608 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135548724 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135549111 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 135549167 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135549180 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135549194 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135549208 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135549294 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 135549524 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135549536 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135549666 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 135549690 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 135549736 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 135549756 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 135549763 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 135549849 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135549918 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135549975 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135550043 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135550070 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135550266 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135550507 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135550678 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135550700 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135550924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135550954 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135551078 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135551090 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135551117 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135551129 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135551169 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135551243 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135551422 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135551810 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135552152 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135552193 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135552233 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135552489 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135553126 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135553237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135553420 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135553469 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135553474 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 135553653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135553671 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 135554816 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135556607 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 135558521 C A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 135558686 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135558843 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135559012 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135559339 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135559859 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 135560635 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135561306 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 135562275 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135562327 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135562961 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135563132 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135563174 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135563184 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135563191 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135563413 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135563581 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135563884 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135564917 T G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135565368 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135565782 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135565787 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135565870 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 135565943 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135567015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135569491 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135569554 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135569618 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135570579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135571348 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135571722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135574737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135578385 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135579700 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135580191 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135581035 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135581573 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135584869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135584923 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135585327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135585394 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135585410 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135585470 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135586159 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135586206 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135586695 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135586971 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135587137 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135587168 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135587201 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135587468 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135588577 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135594566 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135595817 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135597410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135597660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135597774 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 135598631 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135598992 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135599192 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135599547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135600208 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135600324 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135600770 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135601031 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135601383 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135601895 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135602660 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135602912 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 135603531 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 135604691 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135604726 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135604899 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135604907 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135605313 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135605941 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135607632 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135609243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135610764 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135613039 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135615307 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135615334 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135615515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135615588 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135615784 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135615936 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 135615961 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135616108 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135616320 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135616400 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135616463 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135616475 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135616477 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135616551 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135616559 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135616632 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135616669 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135616702 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135616715 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 135616794 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135616914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135617278 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135617283 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135617619 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135617710 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135617951 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135618015 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135618027 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135618063 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135618240 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135618261 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135618264 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 135618338 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135618345 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135618450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135618473 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135618479 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135618578 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135618613 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135618682 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135619074 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 135619094 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135619095 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 135619619 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135619674 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135619746 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135619750 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135619876 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135620565 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135620683 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135620812 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 135621163 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135621170 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135621294 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135621303 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135621657 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135621683 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135621985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135622215 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135626338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135628015 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135628690 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135631482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135631632 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135631682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135631832 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135631945 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135631959 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135631975 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135632093 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135632118 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135632167 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135632350 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135632388 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135632403 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135632463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135632487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135632501 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135632541 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135632630 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135632698 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135632743 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135632755 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135632780 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 135632832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135632851 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135632997 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135633122 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135633610 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135633861 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135634096 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135634145 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135634236 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135634473 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135635465 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135635751 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135635871 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 135636092 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135636209 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135636234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135636330 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135636961 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135637126 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135637195 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135637283 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135637296 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135637365 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135637406 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135637580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135637710 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135637918 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135638086 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135638121 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135638253 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135639049 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135639118 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135639156 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135639217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135639348 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135639611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135639622 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135639659 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135639700 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135639836 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135639861 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135639988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135640106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135640110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135640412 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135641224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135641444 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135642063 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135642312 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135642436 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135642633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135643611 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 135643676 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135643708 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135643862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135644321 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135644324 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135644681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135644745 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135644933 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135645031 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135645159 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135645245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135645252 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135645483 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135645625 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135646710 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135646984 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135647158 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135647785 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135648020 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 135648153 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 135648314 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 135648686 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135649062 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135649115 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135649151 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135649508 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135649754 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135649963 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135650439 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135650541 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135650874 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135651127 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 135651141 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 135651311 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135651561 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135651976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135652284 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135652460 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135652516 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135652587 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135652599 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135652604 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135652619 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135652674 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135652704 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135652741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135652757 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135652794 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135652827 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135652907 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135652963 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135653054 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135653232 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135653367 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135653420 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135653434 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135653445 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135653488 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135653517 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135653527 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135653555 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135653564 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135653572 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135653610 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135653654 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135653700 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135653702 T G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 135653712 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135653758 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 135653759 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135653832 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135654059 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 135654118 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135654138 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135654215 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135654298 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135654539 G C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 135654794 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 135654901 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 135655337 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135655503 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135655566 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135655805 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135655911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135656071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135656147 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135656190 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135656211 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135656355 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135656896 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135656901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135656955 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135657222 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135657362 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135657387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135657404 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135657415 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135657448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135657505 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 135657517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135657741 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 135657835 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135657844 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135658049 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135658117 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135658199 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135658257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135658263 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135658349 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135658653 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135658771 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135658984 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135659034 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135659091 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135659108 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135659171 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135659292 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135659318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135659412 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135659530 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135659545 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135659855 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 135659908 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 135659970 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 135660123 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 135660132 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 135660165 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135660311 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135660678 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135660748 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135661442 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135661850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135661854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135662199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135662529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135662533 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 135662756 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135663094 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 135663842 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135663903 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135664369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135664503 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 135664637 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135664806 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135664923 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135664995 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135665140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135665183 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135665219 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135665247 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135665289 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135665332 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135665454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135665545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135665629 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135665754 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135665796 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135665863 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135665940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135665986 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135665994 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135666028 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135666302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135666344 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135666347 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135666359 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135666390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135666562 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135666563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135668040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135668143 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135668154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135668301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135668356 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135668796 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135668810 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135668857 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135668932 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135668980 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135669009 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135669077 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135669094 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135669124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135669148 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135669173 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135669245 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135669252 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135669370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135669570 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135669638 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135669943 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135669980 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135670073 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135670163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135670473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135670526 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135670531 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135670589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135670601 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135670610 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135670739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135670787 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135670801 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135671092 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 135671339 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135671632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135671868 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135672872 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135673086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135673544 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 135675649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135675727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135675752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135676738 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135676866 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135676889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135676955 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135677165 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135677235 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135677243 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135677483 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135677783 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135678131 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135678164 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135678319 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135678320 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 135678334 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135678488 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135679088 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135679591 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135679610 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135679628 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135679805 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135680092 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135680845 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135681521 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135682253 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135682375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135683735 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135683755 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135683761 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135683780 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135683910 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135683957 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135684062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135684064 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135684323 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135684443 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135684487 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135684751 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135684845 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135684893 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135685001 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135685114 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135685339 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135685357 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135685499 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135686016 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135686379 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135686426 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 135686668 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135686787 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135687003 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135687009 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135687053 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135687174 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135687296 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135687429 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135687685 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135687841 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135687998 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135688280 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135688714 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135689433 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135689977 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135690154 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135691029 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135691179 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135691291 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135691321 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135691338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135691397 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135691401 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135691416 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135691426 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135691520 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135691565 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135691591 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135691660 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 135691716 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 135691781 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135691821 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135691903 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135691944 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135692141 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135692228 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135692715 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135693092 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135693094 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135693107 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135693128 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135693333 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135693609 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135693711 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135693964 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135694010 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135694041 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135694059 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135694075 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135694087 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135694088 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135694171 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135694278 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135694339 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135694363 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135694706 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 135694915 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135694952 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135694987 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135695033 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135695071 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135695099 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135695229 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135695323 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135695421 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135695706 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135695757 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135695885 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135695923 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135696388 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135696486 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135696507 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135696512 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135696627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135697944 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135698894 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135699085 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135699234 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135699251 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135699261 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135699374 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135699422 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135699555 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135700159 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 135704027 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135704082 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135705802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135706202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135706972 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135707723 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135707805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135707820 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 135707860 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135708278 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135708581 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135708682 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135708709 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135708752 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135708797 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135709494 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 135709518 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135709860 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135710419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135711187 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135711276 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135711318 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135711381 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135711425 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135711544 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135711591 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135711613 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135711679 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135711779 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135712874 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135713458 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135714074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135714406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135715625 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 135715670 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135715774 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135716013 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135716161 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135718119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135718286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135719818 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135719957 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135722690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135726362 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135726422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135726447 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135726998 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135727324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135727735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135727773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135729121 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135730832 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135730933 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135731551 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135733431 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135736332 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135736409 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135736735 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135737784 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135739011 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135743278 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135745343 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135745703 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135746880 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135747630 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135748635 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135749300 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135749301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135749967 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135751729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135754524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135755052 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135755809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135756520 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135757042 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135757124 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135757179 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135757499 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135757734 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135758747 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135758921 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135759056 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135760057 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135760197 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135760227 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135761045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135761818 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 135762785 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135763304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135763794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135764017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135764152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135765207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135770870 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 135771277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135772772 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135773489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135773531 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135773936 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135773969 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135773976 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135774016 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135774067 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135774576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135775221 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135775411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135775583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135776459 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135776999 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 135777112 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 135778417 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135778558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135779364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135780072 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135781022 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135781044 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135781077 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135781312 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135781372 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135782126 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135782175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135782230 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135782302 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135782310 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135782378 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 135782618 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135782636 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135782706 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135782712 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135782733 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 135782837 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135782851 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135782934 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135782943 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135782955 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 135783008 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135783020 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135783096 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135783200 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135783252 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135783265 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135783296 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135783451 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135783684 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135783715 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135783733 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135784039 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135784430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135784538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135786203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135786555 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 135787324 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135787335 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135787416 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135787430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135787937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135788000 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135788391 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135788745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135788873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135789590 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135791882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135792089 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135792129 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135792382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135793277 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135793280 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135793339 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135795118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135795209 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135795742 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135796176 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135796406 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135796513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135798033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135798204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135798335 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135798407 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135798431 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135798475 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135798486 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135798502 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135798511 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135799228 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135799275 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135799288 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135800296 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135800355 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135800478 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135800511 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135800512 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135800581 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135800601 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135800623 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135800646 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135800654 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135800751 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135800815 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135800944 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135800960 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135801016 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135801088 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 135801256 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135801313 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135801443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135801511 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135801522 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135801553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135801681 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135801837 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135802071 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135802081 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135802090 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135802104 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135802124 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135802148 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135802206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135802479 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135802565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135802632 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135802749 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135802794 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135802949 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135803436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135803826 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135803974 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135804034 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135804623 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135805184 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135805815 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135807721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135807921 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135807926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135808598 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135809842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135810205 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135810432 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135810455 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135810490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135811023 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135811031 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135811499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135811513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135811653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135811657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135811735 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135811736 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135811902 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135812215 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 135812280 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 135812432 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135812515 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135812543 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135812624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135812671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135812699 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135812775 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135812788 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135812822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135812866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135812885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135812977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135813384 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 135813439 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135813469 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135813704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135813716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135813800 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135813805 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135813889 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135813943 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135813954 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135814014 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135814016 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135814027 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 135814042 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 135814150 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135814822 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135814903 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135815054 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 135815132 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135815133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135815271 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135815278 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135815333 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135815341 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135815412 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135815479 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135815509 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135815809 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 135815884 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135815905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135816744 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 135817206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135818357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135818466 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135819229 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135819600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135819784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135820673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135820924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135821750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135822171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135822373 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 135822374 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 135822444 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 135822458 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 135822519 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 135822844 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135822906 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135822939 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 135823074 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135823104 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135823139 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135823173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135823342 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135823381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135823489 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135823600 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135823628 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135823635 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135823742 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135823876 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135823880 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135823919 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135824556 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135825269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135825284 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135825525 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135825608 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135825629 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135825665 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135825699 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135825730 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135826544 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135826694 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135826837 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135826960 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135827044 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135827184 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135827334 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135827336 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135827451 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135827452 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135827655 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135828061 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135828085 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135828152 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135828185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135828292 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135828414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135828501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135828608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135828845 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135828964 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135829045 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 135829129 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135829262 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135829315 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135829322 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135829337 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135829395 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135829409 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135829924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135830118 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 135830137 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 135830369 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 135831376 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135831395 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135831414 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135831696 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135831712 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135831733 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135831957 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135832503 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135832844 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135833051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135833972 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135834569 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135834846 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135834864 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135835263 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135836190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135837515 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135837823 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135837831 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 135838062 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 135840244 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135840676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135841156 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 135842190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135844096 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135844972 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135845406 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135845492 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135845607 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 135845859 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 135845940 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 135845960 C G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 135849289 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 135849300 G A N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 135849314 T A N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 135849334 A G N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 135849387 T A N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 135849623 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 135849627 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 135849635 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135849640 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 135849657 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 135849742 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 135849754 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 135849821 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 135849913 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 135849972 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135850113 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135850199 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135850395 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135850532 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 135850549 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 135850555 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 135850892 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135850904 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135850943 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135851001 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135851035 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 135851087 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135851089 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135851109 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135851110 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135851209 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135851222 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135851307 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135851323 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 135851377 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135851378 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 135851570 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 2 135851707 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135851741 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135851795 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135851824 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 135851839 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135851859 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 135851921 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135852010 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135852027 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135852059 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135852100 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135852108 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135852157 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135852229 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135852249 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135852286 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135852291 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135852342 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135852446 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135852508 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135852533 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135852610 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135852640 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135852716 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135852735 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135852741 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135852767 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135852819 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 135852853 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 135852954 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135852977 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135853020 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 135853236 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 135853299 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 135853431 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 135853472 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 135853484 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 135853574 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 135853589 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135853614 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135853620 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 135853806 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135854240 T G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 135854285 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 2 135854430 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135854442 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 135854520 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135854643 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135854725 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135854956 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135855095 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135855147 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 135855152 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135855263 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135855406 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135855407 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135855438 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 135855656 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 135855838 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 135856039 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 135856049 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 135856100 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 135856185 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 135857043 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 135857177 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 135857273 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 135858642 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135859039 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135859186 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 135859207 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 135859218 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135859345 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135859687 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 135860196 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135860870 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 135861133 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135861169 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135861627 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135861662 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 135861756 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135864119 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135866147 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135866215 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135866593 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135866644 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135866704 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135867112 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135868095 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135868288 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 135868352 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 135868422 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 135868508 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 135868599 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135868613 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 135868740 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 135868746 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135868783 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 135868810 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 135868870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135868883 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 135868999 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135869148 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 135869490 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 135869665 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 135869838 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135869874 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 135869934 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135869978 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135869995 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135870027 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 135870083 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 135870124 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135870192 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 135870215 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135870464 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135870601 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 135870622 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 135870650 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 135870747 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 135870756 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 135870772 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 135870814 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 135870937 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135871260 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 135871267 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135871298 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 135871319 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135871475 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135871654 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135871713 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135871775 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135871838 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 135871842 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 135872491 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135872668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135873977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135875742 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 135875750 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 135875815 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 135875879 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 135876623 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135877125 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135877216 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135877303 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 135877320 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135877598 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135877762 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135878373 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 135878597 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135880154 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 135880926 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135881665 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135881714 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 135883604 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135883730 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135883904 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135884062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135884423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135884660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135884691 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135886841 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 135886891 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135887458 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 135888289 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 135889322 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135890246 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135890632 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 135890708 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135890799 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135890962 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135891006 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135891007 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 135891170 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 135891280 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135891327 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 135891454 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 135891535 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 135891539 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135891883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135892553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135893034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135893254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135894349 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 135896067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135896092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135898319 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135898846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135900538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135900776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135900909 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 135901627 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135901895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135903470 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135903496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135903745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135904872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135906106 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 135906110 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135906347 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135907303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135908230 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 135909270 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 135909773 A T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 135910123 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 135910404 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135911163 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 135911259 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135911662 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135912940 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 135913009 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135913387 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135914087 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135915609 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 135915625 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 135916066 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135916813 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135916978 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135917232 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135917607 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135921400 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 135921562 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 135923366 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 135923885 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 135924946 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135924968 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135925998 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135926016 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 135926085 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135926207 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135926292 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135926329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135926530 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135926984 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135927058 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135927096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135927101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135927318 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 135927441 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135927728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135927970 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135928013 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135928061 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135928181 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 135928271 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 135928366 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 135928390 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135928599 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 135928604 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 135928669 C A N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 9 11 4 1 5 2 135928672 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 9 11 4 1 5 2 135928689 A T Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0 0.5 10 10 5 0 5 2 135928696 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.454545454545455 11 11 5 1 5 2 135928922 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 2 135928972 T G N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 9 11 4 1 5 2 135929024 T A N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 2 135929283 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 2 135929304 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 2 135929410 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135929442 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135929470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135931771 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135931797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135931862 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 135931863 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 135931928 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135931945 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 135931959 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135931961 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135932218 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 135932277 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 135932326 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135932583 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135932902 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 135933005 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135933055 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135933061 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 135934440 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135934693 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135935464 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135935719 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135936752 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 135937177 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 135937871 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135938969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135939254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135939591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135940597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135944340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135944375 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135946724 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135946772 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135946777 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135946896 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135946958 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 135947007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135947042 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 135947107 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 135947155 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 135947204 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 135947517 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135947522 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135947534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135947536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135947587 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135947632 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135947639 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135947643 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135947678 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135947708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135948159 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135948250 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135948350 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 135948501 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 135948519 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 135948811 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 135948819 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135949229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135949306 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 135949381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135949513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135949708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135949718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135949746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135949790 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135949797 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 135950064 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 135950129 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135950429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135950488 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135950545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135950995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135951044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135951341 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 135951522 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 135951702 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 135951746 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 135951936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135952179 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 135952208 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 135952218 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 135953633 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135953692 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135954487 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135955180 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 135957183 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 135957355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135958059 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135958070 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 135958192 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135960338 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 135960496 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.444444444444444 10 8 5 0 4 2 135960601 C A N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 2 135962902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135963684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135963828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135963857 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 135964817 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 135964828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135966154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135966453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135966859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135966955 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 135966974 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 135967341 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 135967416 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 135968379 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 135969009 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135969127 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135969987 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135970249 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135970258 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135970303 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135970338 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 135970404 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 135970501 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135970517 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135970846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135971216 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135971293 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135971681 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135971727 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135973192 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135973688 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135974423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135974436 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135975401 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 135975827 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135975856 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135975884 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135976026 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135976102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135976139 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135976156 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135976165 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135976176 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135976304 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135976356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135976495 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135976520 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135976911 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135977028 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135977038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135977039 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135977316 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135977543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135977597 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 135977614 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135977725 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135977820 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135977929 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135978408 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135978795 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135979106 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135979234 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135979235 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135979354 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 135979507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135979513 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135979602 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135979611 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135981173 G C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 135981474 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 135981513 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 135981732 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 135981733 G T Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 135981800 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 135982011 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135982098 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135982527 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135982573 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135982593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135982645 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135982719 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 135982940 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135983810 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 135983872 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 135984113 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135984120 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 135984326 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 135984714 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135984859 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 135984894 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 135985024 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135985041 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135985150 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135985191 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 135985225 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135985302 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 135985303 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135985424 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135985485 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 135985547 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135985567 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135985586 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135985650 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135985703 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 135985710 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 135985731 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135985855 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135985883 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135985886 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135986008 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 135986233 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135986234 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135986257 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 135986407 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135986432 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135986468 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135986536 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135986599 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 135986818 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135986875 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 135986898 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135986955 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135986967 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 135987061 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135987164 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135987174 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135987233 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135987365 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135987658 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135987693 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 135987773 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135987800 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 135987804 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135988051 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135988246 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135988541 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 135989256 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135989324 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 135989580 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135989897 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 135989966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135989971 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135990036 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135990041 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135990110 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135990248 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 135990285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135990286 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135990306 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135990328 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135990339 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135990364 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 135990813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135990832 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135991930 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135991980 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135992600 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 135992706 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 135992806 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135993101 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135993171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135993358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135993719 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135993934 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135994402 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135994573 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135994585 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135994864 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135995092 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135995124 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135995130 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135995245 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135995247 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135995270 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135995355 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135995374 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135995519 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135995563 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135995613 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135995644 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135995675 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 135995680 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 135995705 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135995714 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135995725 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135995801 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135995842 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 135995858 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 2 135995922 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 135995985 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 135996036 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 135996044 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 135996050 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 135996058 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 135996067 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 135996142 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 135996167 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135996174 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 135996192 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135996290 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135996294 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135996417 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 135996447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135996477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135996523 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135996553 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135996619 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 135996665 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 135996687 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135996702 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 2 135996917 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 135996953 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135996972 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135997013 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 135997264 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135997295 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135997358 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135997369 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 135997396 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135997544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135997563 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135997583 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135997660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 135997686 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 135997755 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135997826 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 135997883 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 135997891 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 135997940 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 135997973 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135997997 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135998014 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 135998061 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135998128 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 135998195 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135998201 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 135998243 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135998326 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135998467 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135998504 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 135998532 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 135999011 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 135999017 T G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 135999102 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 135999138 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 135999146 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 135999244 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 135999356 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 135999455 C A N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 135999490 A T N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 135999561 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 135999572 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 135999688 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 135999929 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 135999935 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 136000039 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136000047 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136000132 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136000200 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 136000295 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136000339 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136000346 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136000370 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136000396 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136000521 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136001014 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136001208 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136001278 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136001347 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136001601 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136001903 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136001947 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136002235 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136002307 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 136002382 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 136002508 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136002576 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136002658 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136002947 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 136002984 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136003298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136003313 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 136003314 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136003358 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 136003474 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136003488 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136003535 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 136003755 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136003808 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 136004260 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 136004684 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136004899 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 136004913 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 136004965 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136004968 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136005376 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 136005507 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 136005611 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 136005847 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 136005867 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136006204 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136006236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136006337 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136006543 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 136006922 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 136006973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136006987 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 136008493 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136008621 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 136008647 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136008657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136009345 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 136009394 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136009586 T C Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 136010102 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 136010347 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 136010397 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 136010895 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 136011021 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 136011056 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136011118 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136011206 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136011419 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136011691 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136011825 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 136011991 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136012066 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136012184 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 136012212 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136012225 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136012230 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 136012279 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 136012321 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 136012351 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 136012471 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 136012514 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136012668 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136012683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136012797 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 136012932 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136013515 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 136013520 C T N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 136013968 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 136014852 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136014899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136015234 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136015351 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136015419 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136015442 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136015446 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136015458 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136015792 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136016863 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136016872 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136017230 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136017313 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136018185 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136018210 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136018267 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136019541 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136020193 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136021456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136021665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136022054 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136022270 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136022325 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136022486 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136022645 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136022761 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136022762 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 136022917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136022928 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136023167 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136023300 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136023351 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136023413 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136023495 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136023602 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136023656 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136023657 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136023974 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 136024126 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136024279 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136024348 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136024393 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136024515 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136024574 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 136024577 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 136024643 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136024913 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136024940 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136024985 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136025066 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136025071 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136025163 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 136025164 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 136025174 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 136025201 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136025276 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136026163 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136026265 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136026303 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136026381 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136026406 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136026416 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 136026425 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136026486 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 136026767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136027068 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136027545 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136028262 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136028431 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136029671 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136030110 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136031573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136031816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136032033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136032986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136034435 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136034775 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136035194 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136035515 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136035625 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136035940 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136037037 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136038465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136045098 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 136045794 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 136046886 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136047164 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136047280 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136048297 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 136048386 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136048683 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136048813 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136048838 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136049143 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136049165 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 136049167 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 136049264 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 136049266 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 136049439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136049457 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 136050093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136050102 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 136050149 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 136050204 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 136050882 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136051125 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 136051257 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 136051488 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136052000 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136052035 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136052438 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136052481 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136052592 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 136052876 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136053021 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 136053367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136053621 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136053745 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136053756 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136053799 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 136053826 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 136053874 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 136053884 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 136053939 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136054074 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136054130 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136054163 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136054174 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136054296 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 136054525 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136054597 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136054704 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136054776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136054952 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136054962 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136054996 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136055023 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136055210 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136055512 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 136055747 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136055825 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136055906 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136056077 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136056190 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136056201 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136056331 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 136056372 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 136056424 A C Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 136056442 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 136056547 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136056953 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136057371 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136057520 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136057567 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136057865 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 136057866 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 136058050 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136058104 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136058565 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136058631 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136058645 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136058691 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 136058749 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136058975 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136066210 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136066400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136066552 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136066649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136066661 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136066701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136066714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136067023 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136067100 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136067121 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136067298 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136067308 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136067371 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136067442 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136067446 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136067524 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136067636 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 136067654 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 136067681 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 136067685 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 136067844 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 136068037 T G Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 2 136068094 T A Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 136068116 T C Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 136068194 C G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 136068299 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136068303 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136068441 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136068445 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136068592 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136068644 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136068687 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136068851 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136068903 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136069037 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136069051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136069092 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136069093 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136069119 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136069163 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136069181 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136069193 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136069196 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136069269 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136069282 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136069411 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136069449 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136069468 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 136069509 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 136069517 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136069526 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 136069568 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136069569 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136069698 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136069707 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136069713 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136069857 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136069870 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 136069950 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 136069986 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 136070007 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 136070035 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136070104 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136070156 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136070221 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136070325 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136070390 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136070758 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136070805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136070820 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136070824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136070925 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 136070990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136071088 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 136071189 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136071222 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136071267 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136071509 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136071668 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 136071797 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136071810 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 136071863 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136071882 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136071966 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136072190 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136072345 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 136072352 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 136072365 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136072422 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136072570 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136072622 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 136072630 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136072635 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136072891 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136072927 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136072962 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136072966 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136072983 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136073124 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136073201 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136073276 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 136074104 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 136074141 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 136074244 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136074373 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136074416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136074489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136074574 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136074723 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 136074726 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 136074756 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136074889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136075093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136075280 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136075307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136075344 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136075397 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 136075405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136075442 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 136075503 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136075506 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136075591 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 136075691 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 136075761 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136075831 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136076001 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136076119 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136076174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136076269 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136076273 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136076281 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136076445 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136076468 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136076478 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136076522 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 136076610 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 136076623 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136076851 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136077112 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136077128 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136077907 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136078198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136079328 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136079912 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136079913 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136079944 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 136081963 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 136083805 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136084199 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 136084930 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136085026 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 136085278 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136085300 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 136085999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136086304 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136086560 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 136086900 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136089425 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 136089563 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 136089783 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 136089815 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 136089935 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 136089962 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 136090145 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 136090175 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 136090205 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 136090219 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 136090238 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136090293 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 136090352 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 136090424 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 136090540 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136090541 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136090769 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 136090831 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 136090836 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136090863 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136090864 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136090904 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136090944 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136090972 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 136091070 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 136091073 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136091140 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136091148 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136091213 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136091347 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136091472 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136091513 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136091542 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136091838 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136091912 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136092057 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 136092062 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136092101 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 136092102 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 136092133 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136092140 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136092158 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136092193 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136092440 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136092608 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136092614 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136092789 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136092841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136092844 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136092858 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136092918 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136092919 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136093277 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136093300 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136093336 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136093341 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136093560 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136093732 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136094410 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136094460 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136094474 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136094561 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136094669 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136095129 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 136095268 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136095336 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136095534 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136095661 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136095676 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136095861 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136095872 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136095902 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 136095961 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136095967 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 136096006 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 136096037 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 136096235 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 136096237 C A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 136096246 A T N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 136096485 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136096565 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 136096575 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 136096612 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136096625 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136096854 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136096881 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136096896 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136096957 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 136096978 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136097049 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136097050 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136097797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136097812 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136097834 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136098105 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136098375 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 136098617 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 136098639 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136098648 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136098774 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136098779 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136098850 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136099167 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136099259 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136099327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136099329 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 136099374 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136099391 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136099579 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136099685 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136099951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136100005 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136100021 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 136105226 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 136105261 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 136105647 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136105649 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136105721 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 136105824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136105938 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 136105956 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 136106014 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 136106339 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136106505 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136106548 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 136106601 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136106613 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136106629 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 136106658 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 136106827 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 136106893 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 136106999 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 136107014 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 136107040 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 136107121 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 136107133 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 136107181 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 136107195 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 136107216 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 136107237 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 136107247 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 136108201 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136108229 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136108242 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136108335 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 136108433 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136108457 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136108485 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136108571 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 136108624 T A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 136108628 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 136108643 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 136108760 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136108762 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136108775 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136108792 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136108811 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136108833 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136108870 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136108886 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136108936 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136108945 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136108952 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136108969 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136108993 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136109034 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136109047 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136109107 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136109173 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136109176 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136109210 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136109256 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136109276 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136109292 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136109308 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136112851 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 136113568 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 136113670 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136113683 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136114070 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136114158 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136114433 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 136114854 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 136115414 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136115582 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 136115653 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136116771 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136116860 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136116894 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136117333 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136117338 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136117573 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136117722 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 136118102 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136118160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136118466 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136119346 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136119370 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 136121250 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 136121393 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136123436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136123755 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136123972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136125080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136126691 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136126803 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136127784 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 136127883 C T Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 136127961 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 136128393 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136128496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136128720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136128942 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136129228 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136129797 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136131781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136134708 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136135012 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136135327 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136135539 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 136140099 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 136142648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136142766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136144462 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136144640 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136147017 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 136147191 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136147477 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136148529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136150328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136152398 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136152561 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 136152773 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 136153562 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136153907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136154185 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136157665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136158096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136158760 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136158831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136158860 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136159017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136159087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136161035 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136164911 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 136165528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136165815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136165993 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136166063 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136167001 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136167445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136167651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136168600 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 136168816 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136169147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136170030 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 136170086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136171337 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136172431 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136172818 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 136173794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136175497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136175862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136176582 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 136176805 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 136177423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136177799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136178936 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136179925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136180249 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136180289 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136180673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136180717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136181356 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136181362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136181592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136182499 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 136182860 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136183441 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136183823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136183844 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 136184352 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 136184476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136184975 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 136185075 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136185867 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136186005 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136186078 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136186567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136186920 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136186947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136187134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136187156 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136187529 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136187726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136187835 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 136188695 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 136188919 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 136189038 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136189086 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136190652 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136191009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136191889 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136192043 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136193290 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 136193555 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136193685 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 136193815 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136194253 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136194613 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136194662 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136194808 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136194928 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136195984 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136196097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136196346 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136196370 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136196907 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 136197126 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136197248 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136198922 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 136201485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136203198 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 136203877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136205090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136206818 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136208291 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136208365 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136209642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136212224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136213682 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 136214259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136214584 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136218372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136218719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136218803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136218941 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136219440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136219997 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136222219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136222274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136223617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136223686 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136227274 C T Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 136228170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136230611 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136236569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136239495 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136240105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136240624 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136240959 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136241550 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 136241719 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136241744 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136242381 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136242511 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 136243176 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 136244008 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136248913 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136248950 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136249385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136249923 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136250277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136253207 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136253889 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136254431 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136254568 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136254872 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136255234 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 136259908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136261125 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136261539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136261560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136262593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136262725 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136263758 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136264055 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136264536 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 136264927 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136265155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136265206 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136265245 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136265499 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 136265850 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136265951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136266439 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136269500 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 136271566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136271671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136272638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136274169 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136274392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136274485 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136275647 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 136275814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136277061 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136280816 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136282342 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136283269 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136284706 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136285336 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136285752 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136288225 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136288496 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136289604 A T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 136290293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136290745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136291851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136292853 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136293392 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 136293589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136293883 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136296044 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136296266 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136297335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136299431 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 136301059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136302130 G T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 136304162 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136305032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136306082 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136306138 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136306146 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136306187 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 136309334 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136312792 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 136313171 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136313195 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136313229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136313458 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136313475 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136313561 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 136313635 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 136313654 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 136313750 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136313807 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136313833 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136313882 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 136314219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136314470 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136314481 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136314611 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136314619 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136314991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136314993 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136315187 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 136315381 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 136315515 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136316491 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 136316511 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136316528 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 136316589 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136316619 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136316662 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136316686 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 136316715 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136316813 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 136316851 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136316956 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136317063 G C Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 136317421 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 136317503 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 136317511 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 136317532 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136317974 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 136318047 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 136318145 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136318334 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136318379 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 136318422 C A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 136318493 A T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 136319108 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136319255 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 136319455 C A Y N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 136319791 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 136319830 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 136319979 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 136320292 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 2 136324000 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 136324051 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 136324116 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 136324156 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 136324347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136324761 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 136324942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136325015 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136325294 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136325486 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 136325522 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136325687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136326457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136326459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136326689 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 136326877 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 136327040 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 136327063 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 136327065 G T Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 136327202 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 136327296 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 136327379 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 136327605 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 136327669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136327708 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 136327738 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 136327751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136327848 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 136327959 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136327967 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136328003 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 136328030 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 136328248 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136328463 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 136328610 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136328680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136329680 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136329690 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136329876 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 136329881 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 136329935 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136330110 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136330117 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136330547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136330565 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 136330717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136330810 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136331048 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 136331070 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 136331502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136331598 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 136331756 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136331944 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136332013 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136333110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136334606 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136334691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136335541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136336470 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 136337258 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136339478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136339589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136340244 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136342561 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136342914 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 136343510 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 136345239 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 136345493 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 136346279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136347281 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136347379 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136348055 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136350808 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136350908 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 136351821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136352730 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 136353525 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136353786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136353903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136355894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136357115 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136357277 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136358190 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136358495 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 136358588 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 136358800 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136358997 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 136359541 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136359674 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 136359721 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136359747 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136359767 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 136359904 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 136359966 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136360972 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136361266 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136361475 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 136361530 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 136362322 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136363343 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136363919 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136365479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136366789 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136367238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136367742 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136370233 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136370237 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136371333 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136371751 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136371811 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136372017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136372485 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 136372717 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136373134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136373334 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 136373527 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136373746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136373770 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 136373809 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 136374070 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136374071 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 136374139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136374247 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136375186 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136375203 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136375285 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136377269 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 136377273 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 136377387 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136377931 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 136378371 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136378871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136379315 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136379943 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 136379966 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 136379981 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 136380047 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136380392 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136380573 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136380604 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 136380691 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136380738 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136380739 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136380751 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136380778 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136380915 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136380951 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136381352 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 136381663 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 136381937 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 136382139 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 136382149 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 136382212 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 136382282 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136382486 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136382505 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136383004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136383299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136383358 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136383425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136383770 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 136384198 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 136384303 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136384633 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136384800 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 136384805 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136384934 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 136384954 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136384967 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136385002 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136385082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136385100 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136385190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136385205 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136385775 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136385785 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136386222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136386244 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 136386258 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136386288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136386341 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 136386413 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136386467 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136386547 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136386682 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136386720 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136386726 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 136386841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136387001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136387288 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136387313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136388462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136388465 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136388781 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136388822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136388993 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136389289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136389391 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136391092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136391126 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136391237 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136391279 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136391288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136391434 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136391449 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136391517 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136391575 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136391589 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136391619 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136391766 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136391773 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136391849 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 136391909 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 136391932 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 136391937 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 136391948 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 136391984 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 136393047 T A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 136393177 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 136393252 G A Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 136394396 C T Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 136394408 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 136394510 T C Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 136394545 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 136394590 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136394712 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136394755 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136394759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136394824 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136394866 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136394918 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136395003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136395054 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136395057 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136395251 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136395381 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 136395533 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136395651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136395774 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136395817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136395849 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 136395884 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136395917 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 136396266 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 136396275 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 136396290 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136396340 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 136396344 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 136396380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136396489 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136396548 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136396556 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136396703 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 136396753 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 136396754 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136396765 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 136396766 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136396936 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136396953 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136397037 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136397120 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136397443 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136397456 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136397489 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136397532 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136397631 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136397706 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136397713 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136397765 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136397777 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136397873 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136397888 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398015 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398055 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398080 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398124 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398142 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398237 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398332 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398404 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398543 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398577 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398594 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398601 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136398677 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136398864 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 136398908 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 136399012 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 136399260 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 136399423 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136399513 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 136400073 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 136400106 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 136401048 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136401051 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136401772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136401892 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136402070 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136402176 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136402401 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 136402417 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136402894 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136403584 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 136404580 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136404635 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136404639 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136404653 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136404658 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136404818 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 136405116 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136405132 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136405371 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136405905 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136405981 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136406360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136406413 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136406467 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 136408662 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136410180 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136411137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136411764 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136412227 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136412375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136415238 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136415293 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136416848 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136418017 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136418439 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 136419019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136419347 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136419355 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136419433 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136419451 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136420594 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136421510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136421993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136422248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136423412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136425645 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136426344 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136426731 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136427423 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136427557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136427682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136427761 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136427824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136428105 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136428833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136428842 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136429229 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136429343 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136429590 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136429647 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136429685 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136429700 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136430775 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136430942 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136433448 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136433622 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 136434157 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 136434929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136434966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136436998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136437503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136437823 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 136438396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136438503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136439486 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136439753 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136440959 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136441713 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136441730 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136441905 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136442060 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136442747 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136443214 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136443290 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136444892 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136445542 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 136445722 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 136446168 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136446903 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136447049 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136447491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136447788 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 136448904 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136449203 G A Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 136450271 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136451258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136452369 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 136453048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136453327 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136453499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136454217 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136454291 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136454327 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136454380 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136455541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136455546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136457147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136457195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136457237 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136457566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136458116 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 136458208 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136459483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136461226 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136463594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136463616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136463846 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136464224 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136464445 C G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 136464547 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 136464833 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 136465286 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136465487 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136465748 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136466511 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136467066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136467078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136467156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136467343 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136467358 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 136467387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136467564 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136467932 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 136468084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136468393 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 136468727 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136468863 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136469104 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136469109 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136469142 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 136469175 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136469210 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 136469351 T A N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 2 136469564 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136469894 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136469925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136469931 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136470561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136470668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136471246 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 136471463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136471530 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136471547 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136471614 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136471639 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 136471689 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 136471718 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136472060 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136472503 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136472520 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136472570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136472811 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136472977 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136472999 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136474989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136475581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136476286 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 136476384 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136476444 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136476665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136476784 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 136477598 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 136477992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136478732 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 136480130 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136480276 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136480412 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136480472 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 136480785 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136480984 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136482606 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136483350 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136483437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136484011 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 136484046 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136484132 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136484261 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136484316 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136485463 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136485910 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136485912 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136486315 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136489330 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136491923 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136492836 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136493391 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136494318 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136494578 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 136496452 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136497922 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136499230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136499565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136499932 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136500073 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136500805 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136501443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136502285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136504006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136505008 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136506354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136506526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136509528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136509851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136510060 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136511789 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136515541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136517563 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136517926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136517971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136519462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136519528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136520472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136521288 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136523435 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136523594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136524074 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136525165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136526508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136527292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136527328 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136530357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136533025 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136533212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136533306 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136533651 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136533669 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136534116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136535433 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136536011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136537133 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 136538616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136538828 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136538871 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136539737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136542914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136544924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136545018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136547783 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 136548411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136548695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136548862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136548911 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136548938 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136550403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136550681 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136552963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136554117 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136555378 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136556637 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136557021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136557943 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136558892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136559908 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136560214 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136560425 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136560513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136560721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136562401 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136562687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136563429 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136563501 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136563585 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136563822 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136564091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136564247 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136564553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136564767 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136564941 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136565440 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136565666 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136565789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136565794 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136565845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136565908 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136565931 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136565974 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136566176 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136566229 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136566236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136566285 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136566300 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136566586 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136566641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136566653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136566730 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136567108 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136567119 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136567252 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 136567341 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136567584 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136567788 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136567894 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136567900 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136568030 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136568620 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136569081 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136569228 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136569291 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136571156 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136572010 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 136572245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136572839 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136573183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136574217 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136574704 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136574727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136575571 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136577546 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136578953 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136580169 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136582974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136583273 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136583847 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136585365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136585684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136585755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136585866 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136586536 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136586713 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136586730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136586743 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136588168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136588421 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136591361 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136591555 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136592113 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 136593104 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136593364 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136593725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136594876 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136596600 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136597561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136598471 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136599017 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136601078 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136601371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136601379 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136601406 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 136602094 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136602135 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136602315 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136602871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136602929 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136603241 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136604444 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136604720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136606487 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136606496 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136606778 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136607672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136607788 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136608855 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136610562 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136610797 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136612154 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136612529 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136612579 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 136613709 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136613857 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136614796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136615125 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136615149 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136615329 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136615331 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136615605 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136615741 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136616315 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136616626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136616697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136616712 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 136616790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136616872 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136617325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136617339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136617704 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136618710 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136619618 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136619726 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136619738 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136619908 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 136619939 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 136619960 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 136619991 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136620005 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136620032 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 136620084 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136620135 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136620332 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136620506 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136620523 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136620536 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136620540 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136620563 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136620604 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136620704 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 136620758 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136621079 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136621169 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 136621177 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 136621238 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 136621261 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 136621323 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 136621358 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136621792 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136621851 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136621881 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136622370 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136622546 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136622562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136623096 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 136624961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136625630 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136625812 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136626772 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136627878 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136628018 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136628815 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136629458 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136630396 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 136630397 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 136630645 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136631113 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136631464 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 136633747 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136633781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136634665 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136634858 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136634859 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136636237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136636451 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136636548 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 136636562 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 136636604 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136636662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136636903 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 136636914 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 136637093 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 136637460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136638785 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 136638788 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 136638990 G C N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 136639261 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 136640733 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136641326 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136641355 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136641611 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136641622 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136641758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136641839 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136641847 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136641877 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 136641994 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136642143 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136642182 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136642393 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136642419 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 136642484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136642688 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 136642689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136642715 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136642878 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136642901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136643044 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136643061 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136643084 C A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 136643338 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136643367 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136643417 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136643422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136643522 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 136643562 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136643623 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 136643770 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136643787 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136643983 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136643986 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136643998 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 136644012 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136644055 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136644064 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136644086 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136644203 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 136644737 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136644749 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136644783 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136644789 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136645029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136645116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136645149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136645393 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136645691 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136645860 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136649093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136649481 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136649603 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136649815 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136652019 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136652049 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136652452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136652851 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136654160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136654831 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136655083 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136655150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136655683 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 136657581 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136657587 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136657699 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136657874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136657923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136658152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136658370 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136658433 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136658753 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136659061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136660395 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136660668 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136660736 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136660792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136660794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136660874 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136661120 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136661166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136661320 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136662090 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136662163 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136662167 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136662218 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136662221 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136662256 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136662306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136662562 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136662737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136662743 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136663536 G C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 136663831 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136663891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136663962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136664084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136664108 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136664157 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136664932 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136664973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136665225 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136665338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136665353 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136665481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136665553 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136665571 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136665584 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136665612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136665653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136665742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136665767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136665793 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 136665885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136666004 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136666025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136666142 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136666274 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136666438 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136666454 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136666806 C A Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 136666807 A G N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 136666867 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136667138 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136667300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136667496 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 136667694 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 136667732 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136667752 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 136667788 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 136667795 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136667824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136667840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136667955 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136668126 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136668174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136668188 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136668265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136668280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136668385 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136668481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136668558 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 136668583 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 136668611 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136668705 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136668823 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 136668908 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 136669085 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 136669124 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136669126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136669262 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136669335 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136669344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136669377 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136669427 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136669531 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 136669545 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 136669569 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 136669579 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136669631 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 136669725 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136669760 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136669818 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136669963 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136669975 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136670110 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136670166 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136670245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136670248 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136670293 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 136670343 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136670361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136670362 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 136670454 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136670546 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136670555 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136670594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136670707 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136670814 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136670881 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136671094 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136671552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136673062 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 136673684 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 136674015 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136674261 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 136674684 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136674968 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136674985 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 136675120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136675261 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136675326 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 136675486 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136675784 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136676263 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136676652 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 136676751 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136676764 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 136676916 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136677170 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136677223 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136677247 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136677806 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 136677826 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136678440 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 136678748 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 136678926 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 136679216 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136679343 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 136679373 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136679446 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136679546 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 136679711 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136679724 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 136685853 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136686468 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136686540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136687782 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 136687875 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136688489 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136688510 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136688694 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136688840 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136696834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136699013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136699105 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136699459 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136699679 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136699809 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136699878 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136699919 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136699940 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136700000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136700063 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136700586 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136700713 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136700734 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136701047 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136701121 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136701144 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136701289 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 136701293 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136701376 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136701385 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136701659 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136701812 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 136701817 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 136701969 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136701991 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136701993 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136702030 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136702083 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136702135 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136702200 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136702205 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136702396 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136702484 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136702718 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136702860 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136702929 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136703140 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136703192 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136703545 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136703560 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136703630 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136703641 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136703663 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136703706 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136703774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136704005 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136704053 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136704059 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136704064 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136704080 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136704110 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136704131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136704189 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136705178 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 136705342 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136705366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136705530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136705659 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136705672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136705708 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136705720 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136705775 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 136705868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136705918 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136705981 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136706059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136706189 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136706196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136706262 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136706472 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136706746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136706808 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136707015 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136707020 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136707110 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 136707121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136707190 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 136707241 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136707498 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 136707538 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 136707664 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 136707908 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 136707960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136707999 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136708053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136708158 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136708202 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 136708825 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 136708947 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 136709489 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136710262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136710666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136710896 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136711401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136711546 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136711582 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136711977 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136712918 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 136713111 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 136713298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136713349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136713784 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 136714114 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136714174 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136714261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136714712 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136714872 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136715093 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 136715445 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 136715828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136716262 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136716527 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136717434 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136717510 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 136717614 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136717661 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136718471 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136718877 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 136718899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136719332 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 136719362 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 136719540 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 136719627 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136719669 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 136719828 T A Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 136719916 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 136719997 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136720183 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136720260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136720335 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 136720685 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 136720691 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 136721230 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136721399 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136721856 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 136722101 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136722665 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 136722809 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136723172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136723647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136723648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136723935 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136725722 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136726016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136726335 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 136726468 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136727570 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136727646 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136727694 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 136728106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136728180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136728489 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136729743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136732360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136736001 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136738518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136739326 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136741273 T A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 136744005 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 136748402 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 136748425 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136748590 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136750371 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136751842 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136752672 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136752927 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136755367 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136757054 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 136758615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136759075 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136759343 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136761926 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136763865 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136764777 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136764956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136765354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136765765 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 136765971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136768967 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 136769498 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136771856 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136777514 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136778111 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136778414 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136778730 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136779395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136780110 T G Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 136783856 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136788823 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136789055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136789074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136791568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136797181 A C N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 136798214 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136799128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136799722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136800238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136801049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136802557 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136802775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136804307 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136805569 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136806979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136808080 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136808410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136808502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136808596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136808917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136813883 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136816108 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136818644 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136818966 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136818998 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136820318 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136821609 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136824960 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136826057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136828454 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136829085 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136832209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136833613 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136834077 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136834094 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136835308 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136835896 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136835899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136837015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136838011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136838848 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136839235 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 136839564 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136839713 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 136841703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136843109 T G N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 136843185 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136844795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136846271 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136846351 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 136847460 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 136851165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136851200 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136851478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136851566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136852781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136853608 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136859955 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136860124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136863926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136865392 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136866486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136868150 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136870355 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 136871600 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136873166 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136877134 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136877735 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 136879402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136883706 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136884054 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136884683 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136884739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136884838 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136884971 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136885025 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136885126 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136885164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136885712 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136885715 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 136886240 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136887004 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 136887100 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 136887279 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136887476 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 136887481 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136887775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136887881 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 136889256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136889292 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136889568 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136889593 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136890670 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136890921 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136890966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136891009 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136891022 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136891023 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136891071 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136891074 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 136891925 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136892370 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136892921 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136893326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136893390 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136893568 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 136893727 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 136893874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136893875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136893979 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 136894772 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136895080 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136895934 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 136896660 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136896821 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 136896886 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 136897063 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 136897126 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 136897133 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 136897213 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 136897215 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 136897231 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 136897252 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 136897325 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136897428 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 136897587 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 136897651 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 136897834 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 136898020 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136898159 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136898181 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136898338 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 136898635 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136898687 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 136898694 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136898807 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 136899147 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136899247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136899439 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136899495 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 136899682 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136901109 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136901312 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 136902488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136903322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136905708 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 136906857 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136907075 C A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 136907805 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 136911386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136911862 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136912193 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136912303 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 136912333 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136913262 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 136913540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136914049 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136914050 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136914142 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136914484 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136914612 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136914637 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136915104 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136915125 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136915170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136916029 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 136916044 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136916355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136916600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136917457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136917773 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 136918587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136918866 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136919285 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 136919345 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136919411 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 136919539 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136919783 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136919848 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136919872 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136920471 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 136921547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136922119 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 136922381 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136923487 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136923788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136923995 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136924568 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136924666 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136924682 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136924848 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136925426 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136925449 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136925535 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136925545 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136925594 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 136925664 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136925685 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 136925883 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 136925887 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136925897 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 136925913 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 136925937 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 136925983 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 136926015 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 136926037 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136926101 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 136926237 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 136926640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136926982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136928462 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 136929591 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136930202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136930540 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 136932132 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136932489 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136932503 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136932547 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 136932742 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136932901 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136932907 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 136933495 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 136933650 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 136935473 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136935646 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136936108 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136936363 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136936471 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 136936748 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 136937080 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136937104 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 136937175 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136937549 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 136937553 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 136937811 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 136938336 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 136938484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136938776 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 136941821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136941952 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 136942473 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136943367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136943589 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136943601 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136943680 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136943743 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136943853 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 136944041 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 136944088 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 136944635 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136944935 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 136944945 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 136945130 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136945185 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136945294 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 136945333 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 136945424 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136945947 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 136946025 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 136946100 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 136946368 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 136946533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136946617 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 136947118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136947481 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136947948 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 136948051 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 136948114 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 136948870 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136948871 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 136949771 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136950654 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136953233 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136956198 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136956239 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 136956279 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136956942 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 136959828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136960501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136960631 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 136961310 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 136962624 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 136963308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136963481 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 136964504 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 136965206 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 136965435 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 136965647 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 136966075 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 136966235 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 136966356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136966521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136969294 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136970444 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136970620 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136971358 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136973224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136973236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136975128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136976164 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136976334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136977292 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 136977344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136978269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136980656 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 136983727 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 136983746 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 136983845 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 136983874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136983905 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 136983913 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 136983985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136984024 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 136984201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136984693 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 136984736 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 136985305 G A Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 136985476 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 136985639 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 136985993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136986159 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 136986165 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 136986340 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 136986363 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 136986379 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 136987830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136988122 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 136988188 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 136988193 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 136988405 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 136988412 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 136988444 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 136988455 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 136988475 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 136988477 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 136988511 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 136988522 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 136988534 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 136988586 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 136988824 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 136988889 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 136989434 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 136989709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136989780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136991252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136993050 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 136993326 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 136993414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136993422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136993484 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 136993667 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 136993688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136994629 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 136994992 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 136995315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136995772 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 136995944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136996096 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 136996337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136996588 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 136996680 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 136996710 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 136996760 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 136996871 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 136996885 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 136996909 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 136996962 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 136997203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136997352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136997434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136997451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136997470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136997883 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 136997997 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136998149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136998734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136999147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 136999379 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136999492 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136999554 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 136999620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136999745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 136999819 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 136999824 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 136999884 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 136999916 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 136999919 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 136999932 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 136999995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137000146 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 137000609 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137000742 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137000771 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137000788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137001004 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 137001291 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 137001313 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137001498 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 137001681 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137001705 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137001814 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 137001836 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 137001884 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 137002004 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 137002035 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 137002042 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 137002062 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 137002066 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 137002137 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137002333 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 137002349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137002390 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 137002477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137002545 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137002549 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137002655 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 137002681 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 137002699 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 137002833 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 137002875 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 137002909 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 137002923 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 137003386 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 137003408 T A N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 137003688 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137003870 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 137003934 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 137003954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137003991 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 137004043 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137004107 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137004329 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137004346 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137004378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137004463 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137004843 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137004858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137004901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137005414 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137005872 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 137005899 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 137005901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137005967 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137005998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137006172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137006329 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137006504 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137006903 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137008946 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 137009599 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 137009677 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 137009856 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137010613 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137010894 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 137011040 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137011050 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 137011358 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137011524 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137011538 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137011902 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 137011937 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137011980 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 137012003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137012027 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137012033 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137012048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137012298 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137012489 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 137012601 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137012820 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137013069 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 137013073 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137013095 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137013248 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 137014452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137014542 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137014618 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137014701 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137015970 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 137016221 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137016309 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 137016444 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137016954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137017174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137017498 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 137018194 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137019303 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 137019687 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 137019756 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 137019896 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137019954 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137019966 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 137019981 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 137020003 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137020014 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 137020098 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137020112 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 137020125 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 137020173 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137020202 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 137020235 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 137020293 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 137020320 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 137020424 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 137020428 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 137020527 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 137020787 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137021060 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137021157 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137021312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137021566 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 137022857 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137022960 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137023186 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 137024117 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137025277 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137027121 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137028102 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137028395 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137029190 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137031353 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137031447 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137032503 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 137033060 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137033157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137033179 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137033696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137034245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137035581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137035611 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137036473 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 137037298 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137040528 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137041884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137042229 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137042307 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137045135 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137045246 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 137046505 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137047079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137048320 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 137048450 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 137048560 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137049928 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137049957 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137050035 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137050036 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137050093 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137050322 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 137050469 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137051703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137052087 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137052258 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137052279 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 137053273 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137053364 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 137053371 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 137053479 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137053496 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137053517 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137053534 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137053551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137053556 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137053586 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137053613 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137053626 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137053642 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 137053705 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137053731 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137053815 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137053883 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137053907 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137054150 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137054181 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 137054189 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 137054231 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 137054342 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 137054391 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 137054427 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137054497 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 137054666 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 137054680 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 137054686 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 137054951 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 137054963 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 137054964 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 137055011 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 137055129 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 137055253 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137055361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137055437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137055805 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 137055834 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137055863 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137056567 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 137056579 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 137056582 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137056595 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137056796 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 137056840 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 137056863 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 137056874 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137056879 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137056893 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 137057061 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137057085 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137057171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137057654 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 137057700 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137057759 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137057886 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 137057913 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137057966 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 137058055 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 137058230 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137058257 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 137058264 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 137058289 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137058506 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137058614 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137058664 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137058732 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137058758 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137058809 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137058827 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137058897 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 137058898 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 137058916 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 137058964 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 137058987 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 137058997 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 137059167 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 137059217 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137059296 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 137059431 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 137059628 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 137059746 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137059878 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137059903 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 137060036 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137060047 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 137061029 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 137061067 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 137061598 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 137062047 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137062113 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 137062372 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 137062570 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137063186 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137063523 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137063556 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137063648 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137064121 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137064194 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 137064284 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137064351 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 137064695 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137065278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137065514 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137065587 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 137066215 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 137066297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137066361 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137066377 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 137066413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137066463 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137066490 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 137067035 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137067079 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137067148 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137067225 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 137067296 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 137067324 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 137067356 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 137067465 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137067490 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 137067877 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137068026 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137068203 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 137068236 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 137068274 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137068306 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137068331 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137068337 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137068390 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137068582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137068612 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 137068963 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137069102 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137069370 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137069442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137069657 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137069792 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137070085 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137070135 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 137070220 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137070314 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 137070604 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137070789 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 137070942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137071115 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 137071559 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137071580 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 137071614 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137071927 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 137071948 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 137072103 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137072743 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137072877 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137073297 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 137073352 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137073439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137073946 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137074599 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 137074885 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 137075124 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137075150 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137075230 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137075275 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137075768 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 137075888 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 137075953 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 137075956 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 137076046 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 137076104 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 137076689 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 137076849 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137076858 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 137076984 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 137078121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137078516 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137080762 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 137083101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137085546 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137089917 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137090355 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137091746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137091762 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137092740 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137092842 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 137093065 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 137093077 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 137093222 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 137093368 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 137093819 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 137094018 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137094374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137094567 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137094572 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137094590 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 137094643 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137094681 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 137094739 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137094821 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137094855 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137095135 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137095195 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137095360 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137095606 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 137095618 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 137095760 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 137095889 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 137095893 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 137096064 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137096127 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137096181 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137097279 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 137097280 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 137097410 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137098444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137104675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137104966 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137107421 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137107538 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137107561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137107562 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137107829 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137107921 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 137108591 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137108607 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137108991 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 137110157 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137111299 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137111345 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 137111493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137111850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137112081 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137112182 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137112231 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137112578 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 137112645 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 137112658 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 137112660 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 137112894 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 137113031 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137113349 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137113436 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 137113440 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137113516 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 137113527 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137113539 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137113801 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137113927 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137114017 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 137114472 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 137116051 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 137117850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137117900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137117932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137118653 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 137119247 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137119288 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137120704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137120788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137121619 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 137122075 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137122111 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 137122893 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 137123100 T G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 137123120 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 137123143 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 137123493 C T Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 137123633 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 137124661 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137125074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137125109 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137125568 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137125867 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 137126000 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 137126033 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 137126038 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 137126045 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 137126057 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 137126089 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 137126092 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 137126392 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 137126677 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 137126681 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 137126752 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 137126842 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 137127266 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 137127958 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 137128042 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 137128089 T G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 137128412 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 137128488 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 137129407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137129478 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 137130379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137131940 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137132012 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137132602 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137133902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137134505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137135245 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137136209 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137136898 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137137590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137138136 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 137138372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137139146 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 137139179 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137139362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137139424 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137139793 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 137140039 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 137140220 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137140983 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 137141806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137142397 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137144916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137145695 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137145718 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 137145832 G C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 137146267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137146649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137146738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137147373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137147575 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137147903 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137148556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137148641 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137148984 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137149444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137149534 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137150223 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137151886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137156428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137156695 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 137158029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137158688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137158979 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 137159721 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137160390 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137161301 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 137162390 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137162627 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137162796 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137162824 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 137163048 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137163336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137163352 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 137163499 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 137163659 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 137163666 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 137163865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137164096 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 137164713 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 137164761 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 137164796 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137165234 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137165402 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 137165511 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137166610 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137166940 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137166973 G T Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 137168849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137169424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137179582 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 137179588 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 137180781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137180956 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137182526 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137182782 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137184094 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137184669 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137184888 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137185721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137185871 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 137186012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137186305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137186315 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137186415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137186722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137186732 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137186995 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137187152 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137187164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137187344 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 137187657 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 137187660 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 137188248 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 137188264 T A N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 137188531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137188550 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 137188944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137189145 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 137189149 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137196085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137196240 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 137196329 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 137196360 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137196394 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137196594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137196659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137196808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137196825 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137196952 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137197008 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137197063 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 137197134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137197155 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 137197449 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 137197610 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137197622 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137197627 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 137197706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137197976 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137198208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137198853 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137199157 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137199417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137199717 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137199791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137199848 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137200673 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137201014 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137201124 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 137201220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137201291 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137201514 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137201525 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137201856 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 137201979 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137201985 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137202452 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137202980 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137203045 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137203134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137203138 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137203167 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 137203187 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 137204334 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137204447 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137204779 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 137205009 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 137205028 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137205193 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137205195 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 137205595 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 137205647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137206186 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137206331 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 137206354 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137206393 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137206588 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137206870 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137206916 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 137208601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137211243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137211508 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137211625 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 137211786 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137211868 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 137212661 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137214077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137214649 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137215224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137215513 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137216679 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137217784 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137217880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137218539 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137218554 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137218877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137218955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137219875 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137219979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137220091 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137223708 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 137223807 A G Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 0.0714285714285714 15 13 2 11 1 2 137223902 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137224905 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137231456 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137231523 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137233263 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137234668 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 137235043 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137235736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137235744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137235927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137236603 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137236744 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137236756 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137236770 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 137236775 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137237354 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137237585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137237624 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137237727 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137237802 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137237932 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 137237949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137237957 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137238043 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137238067 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137238220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137238322 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 137238367 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 137238417 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137238789 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 137239052 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137240129 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137240181 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137240821 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137241784 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137242065 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 137242392 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 137242868 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137243216 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 137243358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137244131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137245373 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137245667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137245806 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 137246120 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137246354 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 137246616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137246906 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137246975 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137247070 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137247116 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137247122 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137247283 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137247368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137247443 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 137247489 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137247503 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137247521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137247560 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137247561 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137247594 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137247604 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137247751 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 137247760 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137248010 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 137248095 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 137248120 C G N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 2 137248301 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 137248376 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137248448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137248471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137248508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137248590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137248763 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 137248772 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137248965 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137248969 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137249010 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137249029 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137249038 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137249058 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137249128 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137249183 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 137249219 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 137249458 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 137249483 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137249658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137249749 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137249812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137249932 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137249952 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137250054 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137250360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137250378 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137250516 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137250600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137250605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137250743 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 137250764 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 137250939 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 137251029 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 137251143 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 137251199 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 137251255 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 137251280 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137251370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137251387 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137251413 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137251479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137251515 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137251527 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 137251538 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137251771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137251806 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137251953 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137252500 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 137252514 A C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 137252574 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 137252939 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137253263 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137253408 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137253415 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 137253446 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137253650 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137253868 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137253869 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137253898 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137253966 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137254152 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137254191 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 137254416 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 137254450 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 137254704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137254719 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 137254742 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137254808 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 137254962 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137254965 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137254976 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137254997 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137255010 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 137255197 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137255276 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 137255439 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137255491 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137255782 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 137255830 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137255945 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137256001 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 137256065 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137256873 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 137256966 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 137257172 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137257209 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 137257245 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137257327 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 137257346 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137257489 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 137257812 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137257911 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 137257927 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 137258176 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137258749 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137259245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137260030 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137260488 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 137261287 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137261310 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137262142 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137262203 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 137262321 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 137262803 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137262894 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137263030 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137263112 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137263181 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 137263182 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 137263342 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137263478 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137264039 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 137264145 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137264248 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137264269 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137264318 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 137264331 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 137264460 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137265012 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 137265243 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 137265266 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 137265278 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137265645 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 137265684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137265708 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137266049 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 137266266 T C Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 137266528 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137266697 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137267798 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 137267824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137267869 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 137268227 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 137268320 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137268333 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 137268405 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137268491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137268506 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 137268541 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137268579 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137268583 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 137268733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137268895 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 137269173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137269394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137269854 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137269886 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137270783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137271463 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137271717 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137272139 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137272307 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137272471 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137272577 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137272866 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137274338 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137274699 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137275152 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137275680 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 137275861 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137276045 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 137276078 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 137276680 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137277025 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137277379 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137277620 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137277966 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137278087 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137278584 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137278785 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137278820 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 137278906 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137279830 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137280546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137282155 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137283018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137283512 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137284651 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137284797 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 137284902 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137286027 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137286056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137286065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137288416 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 137289778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137290597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137290694 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137290829 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137291818 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137292024 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 137292027 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 137292053 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137293274 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137294102 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 137294327 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137294345 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137294353 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 137294390 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137294397 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 137295266 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137295267 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137295315 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137295618 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137295630 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137295897 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137296293 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 137296498 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137296534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137296864 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137296884 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 137297015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137297030 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 137297305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137297328 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137298006 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 137298456 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 137298553 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137298966 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137299029 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137299396 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 137300111 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 137300132 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 137300213 T G Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 2 137300245 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 137300532 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 137300752 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 137300950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137302930 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137303020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137303708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137305580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137306109 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137308194 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137309366 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137309881 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137309950 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 137310017 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137310214 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137310290 A T Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 137310375 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137310449 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137310554 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137310604 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137310614 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 137310617 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 137310859 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 137310962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137310969 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137310977 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137311031 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 137311037 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137311047 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137311133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137311349 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 137311374 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 137311405 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 137311451 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137311570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137311628 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137311676 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137311704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137311708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137311770 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137311879 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137311882 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137311965 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137312017 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137312080 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137312120 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137312153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137312624 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 137313413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137313716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137313734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137313923 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137313937 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137313971 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137314041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137314156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137314162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137314196 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137314231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137314289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137314290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137314313 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137314317 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137314447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137314457 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137314548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137314596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137314631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137314656 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137315725 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137315873 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 137316075 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137316970 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137317013 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137317312 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 137317329 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137317417 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 137317419 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 137317730 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137317737 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 137318045 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 137318217 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 137318615 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 137319028 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 137319265 T A Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 137319332 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 137319478 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 137320112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137320641 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137321722 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 137322774 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137323650 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137324029 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 137324046 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 137324088 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 137326092 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 137326144 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137327383 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137327541 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 137327687 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137328309 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 137328552 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137328938 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 137329062 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 137329435 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137330364 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137330550 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137330864 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 137333812 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 137334088 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 137335037 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137335534 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137335786 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137335987 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137337431 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137339159 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 137339242 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 137339450 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 137340452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137340840 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137342638 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137344413 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137344921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137346217 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137347194 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 137347474 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 137348005 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 137348082 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137348446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137348488 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137348749 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 137349986 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 137351208 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137351460 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137352028 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137352158 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137352177 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 137352491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137352904 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137353132 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137354087 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137354238 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137355493 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137355585 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137358333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137358586 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137358647 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137360126 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137360327 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 137360861 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137362869 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 137363181 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137363244 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137364312 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 137364726 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137364891 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137368628 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137369312 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137370082 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137370087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137370377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137371099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137371267 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137371416 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137371630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137371801 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 137372059 A G Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 137372601 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137374099 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137375570 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 137376534 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137376687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137377015 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137377757 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137377972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137377978 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137378176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137378267 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137378272 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137378289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137378311 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137378368 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137378587 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137378827 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137379033 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137379670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137379842 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137380895 G C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 137381046 G C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 137381138 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 137381497 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137381567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137381695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137382707 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137383875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137383922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137384458 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137384497 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 137384540 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137384597 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137384697 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 137384904 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 137384971 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137385214 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137385272 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137385273 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 137385304 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137385336 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137385642 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137385951 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137385968 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 137386512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137386515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137386558 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137386658 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137386848 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137387687 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137387793 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137387825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137387848 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137388386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137389892 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137390062 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137391455 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137391597 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137391702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137391857 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137392485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137392895 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 137393051 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137393305 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137393356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137393402 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137395127 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137395131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137395535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137395552 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137395937 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137396022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137396836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137397111 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137397175 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137398382 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137399301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137399421 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137399581 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137402190 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137402281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137402511 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137402673 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137402703 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137403038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137403212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137405503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137405701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137405790 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137406020 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137406096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137406264 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137406393 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 137406978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137407922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137407930 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137409526 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137411524 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137411732 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137412152 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137412841 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137413413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137414201 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137415151 T G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 137416692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137417101 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137418342 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137419370 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137419457 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137419469 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137419596 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137420561 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137420958 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 137422679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137422698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137423125 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137424278 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137424339 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137424406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137424409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137424582 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137425507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137425876 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137426040 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137426110 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137426221 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 137426287 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 137426470 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 137426547 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137426558 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137426601 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137426657 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137426812 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137426947 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137427097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137427308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137427902 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137428019 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137428118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137428155 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137428185 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137428244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137428322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137428365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137428817 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 137429255 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137429317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137429361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137429423 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137429557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137429652 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137429714 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137429862 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137430026 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137430045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137430065 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137430084 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137430167 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137430175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137430266 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137430282 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137430289 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137430304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137430345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137430442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137430569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137430599 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137430607 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137430614 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137430628 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137430778 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137430808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137430999 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137431148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137431187 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137431246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137431280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137431840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137431851 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137431904 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137431954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137432321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137432610 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137432677 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137432786 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137432894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137433195 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 137433676 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137433745 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137433751 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137433772 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137433806 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137433906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137433965 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137433991 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137434117 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 137434357 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137434517 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137434836 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137434892 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137434895 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137434958 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137435025 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137435043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137435152 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137435173 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137435203 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137435486 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137436247 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 137436389 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137436443 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137436545 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137436850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137437000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137437046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137437277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137437500 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137437579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137437590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137437839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137437883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137438109 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137438353 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 137438582 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 137438670 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137439040 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137440033 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137440516 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 137440522 C G N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 137440538 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 137440751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137440752 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137440862 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137440998 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137441108 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137441289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137441319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137441366 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 137441473 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137442504 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137442516 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137442796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137443059 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137443170 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 137443242 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137444525 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137445203 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137445310 C T Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 2 137447254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137447835 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137448231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137449853 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137450563 A C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 137451164 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137454406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137455060 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137456340 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137456708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137457286 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137457980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137458372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137458782 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 2 137458805 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137459482 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 137459691 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137459698 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137459720 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 137460318 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137460418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137460521 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137460903 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137461227 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137461244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137461621 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137461657 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137462081 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 137462089 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137462299 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137462640 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 137462658 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137462971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137463137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137463348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137463485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137463837 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137463857 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137463937 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137464312 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137465610 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 137468632 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137468795 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137468800 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137468935 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 137469091 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137469461 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 137469474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137469792 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 137469796 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 137469803 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 137469950 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 137469967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137470070 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 137470136 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137470208 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137470231 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137470269 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137470712 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137470788 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137470933 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137470952 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137470977 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 137470987 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 137471102 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137471348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137472336 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137472698 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137472707 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137472754 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137472781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137473124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137473206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137473322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137473367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137473523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137473613 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137473788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137473969 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137474021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137474280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137474613 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137474642 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137474718 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137474978 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137475161 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137475209 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137475341 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137475398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137475430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137475458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137475508 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137475683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137475743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137475757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137475838 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137475851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137476040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137476050 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137476092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137476273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137476400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137476433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137476669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137476732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137476778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137476844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137476851 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137476959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137477025 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137477102 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137477172 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137477222 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137477250 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137477257 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137477267 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137477431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137477563 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137477714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137477746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137478068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137478222 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137478276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137478307 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137478576 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137478652 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137478771 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 137479077 T A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 137479226 A G N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 137479241 G A N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 137479303 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 137479559 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 137480272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137480633 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 137483079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137485549 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 137486982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137487328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137489094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137489563 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137490281 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 137490435 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137490700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137493012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137493106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137493111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137494191 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137495355 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137496127 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 137496679 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 137496819 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137497156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137497412 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137497447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137497545 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 137497548 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 137497843 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 137498280 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137498743 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137499180 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137499372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137500260 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137500512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137500693 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 137500852 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137500923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137501040 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137501231 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 137501564 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 137501659 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137501710 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 137501791 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 137501960 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137502046 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137502129 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137502344 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137502452 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137502470 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137502483 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137502546 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137503002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137503169 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137503555 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137503597 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137504160 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137505083 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 137505188 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137505348 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137505469 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 137505515 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 137506277 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137506548 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137506568 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137506606 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137506782 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137507023 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 137507062 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 137507072 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 137507073 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 137507091 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 137507123 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 137507191 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 137507204 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 137507260 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 137507318 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137507321 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 137507496 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 137507507 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137507541 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137507548 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 137507590 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137507596 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137507601 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137507625 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137507800 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137507829 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137507939 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137507994 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137507995 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137508074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137508118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137508394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137508591 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137508600 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137508610 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137508700 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137508749 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137508839 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137508886 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137509166 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137509279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137509352 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137509444 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137509482 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137509495 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137509578 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137509743 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137509811 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 137509843 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137509863 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137509880 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137509890 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137509953 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137509968 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137509986 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137510035 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137510099 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137510217 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137510239 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137510412 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137510424 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137510499 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137510714 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 137510958 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 137511001 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 137511053 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 137511315 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137511375 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137511394 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 137511561 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137511598 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 137511791 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 137511915 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137512100 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 137512122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137512318 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 137512345 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 137512366 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 137512570 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137512754 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 137512943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137513099 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137513267 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137513401 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137513525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137513923 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137514101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137514264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137514309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137514735 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137515286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137515287 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137515454 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137515488 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137515972 T C Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 137516104 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 137516121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137516287 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 137516394 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 137516671 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137516752 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137516778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137516781 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137516997 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137517042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137517133 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137517357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137517508 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137517798 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137518014 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137518236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137518362 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137518576 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137518835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137518926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137518948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137519327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137519682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137519777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137520140 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137520330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137521324 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137521355 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137521402 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137521537 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137521587 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137521696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137521750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137521849 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137521873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137521931 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137522354 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 137522365 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 137522406 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 137522720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137522832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137522861 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137522964 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137523082 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 137523113 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137523150 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137523166 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137523194 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137523203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137523256 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137523279 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 137523358 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 137523502 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137523578 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137523587 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137523612 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137523673 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137523699 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137523787 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137523837 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137523950 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137524073 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137524181 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137524201 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137524218 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137524349 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137524381 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137524390 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137524395 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137524505 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 137524529 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137524539 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137524557 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137524587 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137524593 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137524788 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137524869 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137524917 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137525067 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137525082 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 137525262 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137525320 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137525328 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137525415 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137525531 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 137525575 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 137525637 A C N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 137525638 A C N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 137525648 T A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 137525653 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 137525822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137525878 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137525890 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137525900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137525952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137525953 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 137525964 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137525978 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137526039 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137526040 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137526074 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137526201 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137526263 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137526278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137526304 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137526361 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137526370 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137526400 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137526584 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137526596 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137526721 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137526722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137526817 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137526860 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137527025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137527240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137527269 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137527397 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137527442 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137527454 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137527508 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 137527510 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 137527653 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 137527785 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137527893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137527938 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137527987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137528048 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137528086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137528106 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 137528143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137528146 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137528409 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137528424 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137528441 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137528490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137528552 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137528643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137528917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137528969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137529168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137529207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137529256 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137529284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137529502 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137529546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137530057 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137530220 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 137530599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137532066 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137532226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137532563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137532611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137533324 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137533513 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137533594 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137533598 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137533796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137533823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137533838 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137533997 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137534005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137534097 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137534317 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137534319 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137534338 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 137534901 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137534932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137535976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137536886 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137537140 G T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 137539611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137539816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137541603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137541622 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137542691 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137543333 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137543811 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 137545296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137546970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137549266 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137550594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137551626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137551895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137553111 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137553354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137553473 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137553488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137554908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137554909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137554943 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137557969 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 137558570 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137558749 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137559066 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 137559208 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137559463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137559501 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137559504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137559564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137559615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137559789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137559937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137559944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137559960 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137559971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137560278 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 137560699 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137560870 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 137561254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137561675 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137561777 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137561882 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 137561936 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137562174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137562304 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137562941 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137563054 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137563522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137563608 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137564211 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137564448 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137564619 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137564995 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137565168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137565181 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 137565648 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 137566066 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137566141 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 137566182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137566194 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137566318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137566438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137566463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137566799 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137566969 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137567021 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137567389 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137567632 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137568303 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137568309 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137568350 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 137568770 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137568789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137568928 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137568929 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 137568957 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137568966 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137569006 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137569074 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 137569088 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 137569095 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 137569124 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137569149 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137569188 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137569260 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 137569261 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137569355 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 137569637 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137569639 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 137569652 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 137569699 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137569756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137569767 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137569815 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 137569835 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 137569862 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137569923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137569944 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 137569977 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 137569983 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 137570035 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 137570054 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 137570083 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 137570109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137570188 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137570224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137570337 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137570401 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137570450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137570508 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 137570600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137570610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137570638 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 137570837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137571624 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137571838 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 137572069 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 137572238 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 137572318 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 137572725 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137572798 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 137572808 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 137572811 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137573059 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 137574799 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 137575357 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 137575935 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 137576108 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137576246 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137576974 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137577221 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 137577591 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137577780 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137577809 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 137578381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137578382 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137578393 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137578447 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137578650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137578829 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137578921 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 137578923 C A N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 2 137578994 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137579107 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 137579250 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 137579955 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137580040 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137580083 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137580375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137580412 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137580500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137580648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137580740 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137580847 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137580929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137581247 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 137581369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137581394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137581552 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 137581865 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137582410 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 137582966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137582972 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137583021 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137583180 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137583371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137583634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137583652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137583659 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 137583668 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 137583769 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137584074 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 137584185 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137584258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137584770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137584871 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137584881 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137584950 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 137585048 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137585068 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137585180 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137585196 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137585236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137585286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137585336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137585386 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 137585537 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137585545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137585599 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 137585606 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137585822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137585995 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 137586016 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137586166 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137586396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137586425 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137586537 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137587532 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137587560 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137587704 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137587709 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137587738 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137587793 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 137587832 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137587887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137587958 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137587965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137588092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137588094 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137588236 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 137588402 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 137588422 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137588466 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 137588499 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137588517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137588660 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 137588672 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 137588693 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 137588733 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137588754 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137588904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137588996 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137589270 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137589943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137590002 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137590091 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 137590154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137590312 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 137590460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137590593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137590953 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137591061 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 137591215 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137592317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137592401 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137592454 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137592512 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137592656 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 137592958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137593061 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 137593261 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 137593336 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137593504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137593878 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 137594001 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 137594180 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 137594191 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137594242 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 137594257 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 137594361 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 137594374 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 137594497 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137594567 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137594926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137594960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137595198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137596457 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137596612 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137596655 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 137596742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137596814 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137596921 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 137597111 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137597535 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137597612 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 137597955 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137598408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137598561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137598590 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137598752 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137599156 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 137599201 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137599288 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137599568 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 137599608 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 137599950 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137600187 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137600188 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 137600260 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137600265 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137600277 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137600772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137600938 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137601203 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 137601885 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 137602865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137603424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137603806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137604464 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137608743 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137611562 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137612073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137613543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137614152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137614753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137616211 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137616337 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137616341 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137616881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137618159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137618630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137618781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137619256 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137619353 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 137620490 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137622261 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137622332 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 137622346 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 137622559 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137622672 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137622785 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 137622936 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 137622986 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 137623004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137623393 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 137623529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137623551 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 137623772 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137623799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137624447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137624590 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137624979 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137626173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137627044 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137628115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137629109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137630174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137630571 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137631426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137631959 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137634622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137635196 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137635207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137636374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137637054 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137637515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137638190 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137638449 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137639423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137639729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137640613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137640653 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137642117 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137643473 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 137643531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137643582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137643692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137643930 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137643979 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137644066 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 137644694 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137645342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137645395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137645449 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137645642 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 137645710 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137645758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137645806 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137646485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137646563 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137647229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137647665 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137647710 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137647726 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137648943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137650597 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137651791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137654345 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 137654664 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137656162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137656243 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 137656475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137656598 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 137659029 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 137659247 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 137659639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137659641 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 137659739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137659758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137659790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137659815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137659850 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137661874 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 2 137662583 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137665296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137665439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137666757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137667672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137668432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137670229 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137672492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137672878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137675797 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137676223 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137676824 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 137677505 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 137678348 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137678937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137681622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137683932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137685132 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137687537 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137694137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137700491 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 137700819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137700995 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 137701231 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137701806 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 137701951 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 137702186 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 137702391 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137702508 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137702773 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 137702856 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 137702860 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 137702900 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 137702929 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 137702932 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 137703033 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 137703041 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 137703048 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 137703064 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 137703100 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 137703171 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 137703176 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 137703197 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 137703250 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 137703270 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 137703403 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137703530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137703578 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 137704549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137704630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137704656 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 137705022 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137705254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137705806 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137705939 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137707088 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137708537 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137708654 G T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 137708788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137709514 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137709775 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137710216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137710288 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 137710403 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 137711073 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137712390 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 137713313 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137713563 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137720901 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 137720959 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137721158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137721499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137721636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137721818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137722047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137722879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137723039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137723328 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137723532 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137723980 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137724020 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137724896 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 137725022 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137725095 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 137725869 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 137726107 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 137726729 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 137727169 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 137727225 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 137727285 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 137727296 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 137727374 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 137727714 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 137727718 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 137727986 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 137728034 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 2 137728129 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 137728574 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 137728775 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 137729080 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 137729150 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 2 137729283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137729517 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137729536 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137729575 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137729586 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137729629 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137729687 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137729710 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137729738 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137729754 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137730005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137730091 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 137730298 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 137730887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137733727 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137733951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137736449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137736911 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137736969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137737021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137739116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137739261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137741904 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 137741964 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137744122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137744169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137744497 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137744524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137745004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137746655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137747567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137748133 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137749667 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 137749838 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137749848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137749957 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 137750265 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 2 137750292 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 2 137750710 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 137750970 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137751404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137751636 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 137751854 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137752328 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 137752363 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 137752503 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137752509 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 137752603 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 137752767 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 137752850 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 137753115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137753266 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137753300 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 137753462 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137753593 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 137753642 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137753764 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 137753772 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 137753805 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 137753921 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 137754058 G C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 137754489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137754526 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137754589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137754723 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137754749 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137754861 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137754883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137755781 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137756279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137756495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137756557 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137756566 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137757050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137757310 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137757338 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137757341 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137757384 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 137757423 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 137757440 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 137757557 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 137757629 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 137757707 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137757724 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 137757733 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 137757753 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137757881 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 137757933 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137758013 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137758042 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 137758067 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 137758263 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 137758343 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137758378 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137758690 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137758763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137758832 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 137758862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137758996 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137759234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137759294 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137759493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137759540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137759546 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137759858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137759925 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137760024 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 137760214 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137760355 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137760928 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137760943 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 137760957 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137761050 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137761151 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137761277 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 137761498 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137761682 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 137761708 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 137761748 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 137761875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137761879 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137761938 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137762500 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137762527 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 137763160 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137763369 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 137763478 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 137763649 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137763671 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137763710 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137763737 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 137763811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137763840 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137763940 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137764068 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 137764249 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 137764268 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 137764329 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 137764340 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 137764377 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 137764427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137764438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137764533 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 137764668 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 137764684 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 137764849 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 137764906 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 137764980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137765077 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 137765199 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 137765228 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137765258 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 137765411 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 137765587 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 137765660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137765702 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 137765714 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137765736 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137765991 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 137766057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137766092 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137766114 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137766399 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137766760 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137766857 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 137766861 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 137766926 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 137766965 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 137767005 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 137767097 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 137767130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137767256 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 137767273 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 137767283 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 137767394 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 137767547 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 137767607 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 137767749 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137767756 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137767880 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 137768049 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 137768569 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137768628 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 137768706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137768729 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137768758 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 137768914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137768936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137768982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137769034 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137769216 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137769312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137769464 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137769495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137769512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137769581 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137769681 C G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 137769719 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 137769759 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137770072 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137770081 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137770290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137770494 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 137770975 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 137771070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137771174 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 137771443 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 137771708 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 137771723 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137771740 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 137771764 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137771922 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137772016 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 137772048 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137772118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137772146 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137772171 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 137772194 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137772367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137772370 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 137772422 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137772496 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 137772530 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137772572 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 137772680 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 137773038 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137773090 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 137773179 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 137773280 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137773334 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137773383 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137773389 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137773427 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 137774090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137774241 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 137774249 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 137774324 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 137774441 G A N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 137774566 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 137774615 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 137774650 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137774680 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137774782 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 137774787 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 137774863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137774891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137775013 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 137775067 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137775073 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137775129 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137775145 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137775199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137775217 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 137775231 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137775250 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137775479 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137775668 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 137775972 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 137775981 G A N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 2 137776217 A T N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 137776486 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 137776567 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137776657 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137776844 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 137776876 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137776883 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 137777043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137777200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137777613 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 137777654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137777754 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 137777836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137778580 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137778672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137778719 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137779391 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137779580 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137780431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137780792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137781309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137781569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137781758 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 137782036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137782422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137782584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137783484 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137784644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137786189 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 137786235 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 137786415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137786565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137786696 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137789329 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137790092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137790999 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137791337 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 137791805 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 137791807 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 137791891 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137792190 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 137792304 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137792494 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137792623 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137792625 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 137793369 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137795746 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137796290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137797997 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137798488 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137798512 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 137798594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137798788 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 137798813 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 137798930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137799185 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 137799603 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137799704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137799837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137800095 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 137800110 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137800281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137800370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137800497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137800538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137801385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137801696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137802283 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137802446 A T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 137802510 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 137802868 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 137803421 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 137804186 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137804350 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137804389 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137804416 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 137804436 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137804482 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 137804505 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137804634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137804805 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 137804907 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 137805315 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 137805796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137807237 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 137807751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137809508 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137810959 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137811061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137811072 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 137811170 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137811208 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137811314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137811907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137815118 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137815730 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137815897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137816374 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 137816953 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137816980 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137817944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137818972 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137820921 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137821099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137821160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137822692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137823604 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137824948 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 137825125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137825284 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137825616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137825628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137825828 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137825898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137825925 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137826048 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 137826050 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 137826190 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137826195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137826250 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137826491 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137826696 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137826754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137826799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137826978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137827043 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 137827108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137827244 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137827274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137827283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137827372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137827404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137827471 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 137827492 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137827706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137828042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137828043 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 137828239 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137828247 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 137828293 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137828310 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 137828385 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137828417 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137828519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137828609 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 137828614 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137828661 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137828873 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137828905 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137829437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137829605 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137829698 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137829705 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137829881 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 137829882 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 137829895 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 137829920 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 137830115 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 137830177 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 137830398 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137830419 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137830746 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 137830779 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137830813 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137830822 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 137830885 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137830949 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137830962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137830967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137830997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137831107 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137831136 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137831541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137831542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137831574 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 137831651 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 137831673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137831752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137832038 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137832057 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137832273 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 137832514 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137834387 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 137834645 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137834658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137834700 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137835111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137835254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137836210 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137836261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137837698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137838117 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137838921 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 137839232 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137839299 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 137839576 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137839658 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137839822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137839866 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 137840044 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137840076 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137840272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137840427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137840540 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 137840594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137840611 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137840646 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137840693 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 137840896 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 137840953 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 137841374 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137841475 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 137841635 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 137841822 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137841862 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137842171 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 137842229 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137842232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137842399 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 137842455 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 137842485 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 137842551 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 137842562 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 137842582 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 137842647 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 137842711 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 137842771 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 137842782 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137842872 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137842873 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 137842890 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137843103 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137843117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137843197 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137843313 A C Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 2 137843352 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137843401 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137843405 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137843463 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 137843473 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137843485 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 137843520 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 137843546 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 137843599 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 137843645 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 137844150 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 137844163 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 137844317 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 137844344 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 137844385 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 137844414 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 137844474 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137844567 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137845672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137845792 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 137845805 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 137845836 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137845910 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137846008 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137846047 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137846236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137846285 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 137846358 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 137846643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137846805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137847406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137847494 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 137850004 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137852221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137852446 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137852522 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 137852982 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137853245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137853424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137853461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137853586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137854071 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137854505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137854513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137854545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137854745 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137856790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137859395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137859786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137860726 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 137860727 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137866167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137868220 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 137869023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137869780 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 137870517 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 137871294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137872618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137872984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137873013 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137873359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137873463 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 137873534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137874280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137874585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137875503 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 137876032 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 137876129 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137876752 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 137876952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137877099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137877348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137877357 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 137877654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137878400 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 137878597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137878643 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137878657 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 137878673 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 137878675 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 137878769 G C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 137878799 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 137878904 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 137879261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137879398 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 137879420 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 137879711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137879793 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 137879905 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 137879909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137879982 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137880014 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137880244 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137880250 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 137880638 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 137880698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137880776 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 137880941 G A N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 137881070 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137881146 G A Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 137881250 G A Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 137881272 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 137881481 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 137881529 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137881551 A T Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 137881627 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137881734 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 137881896 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 137882231 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 137882523 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 137882735 C A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 137883215 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 137883336 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 137883394 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137883441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137883837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137884213 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 137884336 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 137884550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137884572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137884592 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137884671 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137885137 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137885373 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137885606 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 137885762 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137885975 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 137886061 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 137886063 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 137886144 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 137886146 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 137886161 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137886169 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 137886190 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 137886226 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 137886354 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137886355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137886395 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 137886540 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137886812 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137886908 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137886937 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137887084 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 137887169 G T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 137887172 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 137887188 A T N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 137887310 G A Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 137887350 C A Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 2 137887359 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 2 137887510 T C Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 137887560 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 137887631 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 137887855 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 137887884 T G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 137887933 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 137888012 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137888026 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 137888136 A C Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 137888183 T G Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 137888196 A G Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 137888698 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 137888883 C G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 137888999 G A Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 137889017 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 137889023 A C N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 137889667 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 137889698 T C Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 137889830 A G Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 137889851 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 137889892 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 137889898 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 137889906 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 137889951 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 137890002 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137890029 G T Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 137890147 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 137890267 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 137890366 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 137890499 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 137890677 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 137890678 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 137890755 G A Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 137890775 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 137890777 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 137891005 G A Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 137891382 T C Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 137891438 T G Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 137891466 A T Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 137891480 A G Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 137891558 G A Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 137891589 C T Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 2 137891676 C T Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 137891713 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 137891781 G T Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 2 137891802 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 137891803 A G Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 137891843 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 137891874 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 137891953 C T Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 2 137891961 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 137892387 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 137892424 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137892473 G C Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 137892513 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 137892541 T A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 137892586 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 2 137892627 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 137892803 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 137892809 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 137892814 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137892843 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137892965 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137892973 G C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 137892981 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137892994 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137893007 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137893041 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137893052 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 137893146 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 137893172 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137893236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137893259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137893405 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 137893421 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 137893452 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137893471 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 137893498 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 137893501 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 137893552 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137893762 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 137893907 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137894055 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137894113 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 137894142 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 137894268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137894521 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137894557 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137894568 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137894604 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137894780 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 137894973 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137894980 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137894998 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137895098 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 137895184 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 137895286 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 137895296 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 137895306 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 137895316 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 137895405 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 137895407 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 137895444 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 137895503 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 137895529 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 137895536 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 137895573 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 137895574 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 137895626 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 137895773 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137895850 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 137895954 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137896000 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 137896035 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 137896156 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 137896202 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137896300 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 137896305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137896354 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 137896507 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 137896680 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137896743 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 137896803 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137896836 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 137896957 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 137897082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137897147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137897164 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 137897193 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 137897234 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 137897303 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 137897316 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137897355 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137897369 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137897407 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137897462 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 137897464 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 137897553 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 137897587 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 137897589 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 137897600 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 137897912 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 137898224 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 137898280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137898363 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 137898589 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 137898952 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 137899035 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 137899128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137900394 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137900448 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137900551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137901510 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 137901545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137901973 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137903383 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137904623 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 137904930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137906042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137907064 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137907264 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 137907371 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 137908257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137912775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137913508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137916082 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137917702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137919211 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 137919274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137920465 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 137920621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137922090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137923197 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137923281 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 137923458 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137923571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137923678 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 137923697 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 137923717 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 137923917 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137924171 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 137924190 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137924294 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137924576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137924723 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137924815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137925775 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 137925939 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 137926263 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 137926393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137926485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137926523 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137927008 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137927594 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137928782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137929624 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 137929948 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 137930487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137930493 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 137930591 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137930716 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 137930747 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137930830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137931745 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 137931773 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137931890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137931981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137933317 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 137933933 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137934594 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 137935119 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 137935196 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 137935257 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 137935282 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 137935291 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 137935297 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 137935314 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 137935507 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 137935601 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 137936015 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 137936043 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 137936106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137936287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137936752 T G Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 137936955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137937078 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137937417 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 137937493 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 137937594 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137937803 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 137937950 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 137938305 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 137939202 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137939447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137939966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137940244 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137940400 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 137940418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137940448 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137940752 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 137940754 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 137941046 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 137941736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137941809 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 137942151 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 137942164 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 137942207 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 137942213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137942286 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 137942815 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137943009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137943205 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 137943392 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 137943410 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 137943654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137943678 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 137943695 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 137944061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137944100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137944438 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137944560 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 137944707 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137944742 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 137945196 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137945251 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137945308 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137945732 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137945939 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 137946065 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137946129 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137946233 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137946394 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 137946445 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 137946490 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 137946491 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 137947028 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 137947045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137947705 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 137947718 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 137947740 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 137947821 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137947940 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137948144 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137948218 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 137948310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137948487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137948620 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 137948696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137948839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137948892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137948915 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 137948955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137949065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137949239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137949768 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 137950106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137950187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137950517 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 137950770 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137950996 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137951254 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137951468 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137951630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137953355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137953704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137954110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137954422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137954965 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137955990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137956088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137957542 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137958210 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 137958316 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 137959043 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137960324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137961174 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137961206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137961265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137961720 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137961729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137961780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137961871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137961959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137962400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137962453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137962512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137962522 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137962545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137962694 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137962715 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 137962751 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 137962799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137962902 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137962925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137962962 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 137962984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137963003 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 137963026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137963061 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137963091 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 137963113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137963181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137963184 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137963252 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137963350 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137963429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137963437 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137963667 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137963669 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 137963943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137964558 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 137964577 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 137964645 C A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 137964721 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137964726 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137964767 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 137964768 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137964878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137964884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137964958 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137965450 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 137965631 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 137965700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 137965747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137965802 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 137966104 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 137966281 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 137966358 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 137966392 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 137966412 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 137966471 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 137966548 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 137966578 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 137966665 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137966910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137966944 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137967124 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137967184 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 137967595 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137967692 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 137967939 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 137968061 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137968081 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137968164 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137968276 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137968280 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 137968402 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 137968724 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 137968735 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 137968739 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 137968959 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137970185 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137970245 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137970310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137971140 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137971204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137971688 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137972285 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137972363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137972844 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137972973 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137973344 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137973878 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137975144 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137975412 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137975940 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 137975948 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 137976070 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137976215 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 137977163 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137977229 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137977269 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137977322 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137977471 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137977505 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 137977541 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137977569 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137977681 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137978810 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 137979737 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137979738 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137980203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137980562 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137980602 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 137980759 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137980849 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 137980882 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137980960 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137981134 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137981583 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 137981944 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137982682 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137983027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137983469 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137984102 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137984760 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 137984929 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 137985816 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137985999 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137986249 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137986449 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137986529 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 137986767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137986810 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 137986922 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 137986954 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 137987015 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 137987017 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137987400 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 137987818 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137988918 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137988989 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137989261 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137989469 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 137989653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137989835 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 137989894 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 137989983 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 137990066 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 137990169 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137990346 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137990358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137990463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137990504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 137990673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 137991005 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 137991028 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 137991229 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 137991630 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 137991773 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 137991840 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137992090 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137992092 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137992122 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137992128 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137992211 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 137992235 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137992265 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137992423 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137992447 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137992494 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137992559 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 137992765 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 137993072 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 137993152 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 137993185 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 137993372 A T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 137993588 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 137993743 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 137994083 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 137994252 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 137995037 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138000415 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 138000601 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 138001114 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 138001207 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 138001430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138002405 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138003362 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 138003628 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138003871 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138004111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138004112 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138004279 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138004444 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138004560 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138004571 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 138004771 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 138004922 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138005300 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138005345 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138005376 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 138005512 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 138005747 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 138005777 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 138006327 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 138006330 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 138006419 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 138006595 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138006767 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138007225 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 138007491 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138008406 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138008410 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 138008859 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138009183 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138009239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138009287 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138009799 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138009951 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138010112 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138010424 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 138010447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138010470 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138010639 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138012575 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138012631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138012883 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138013353 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138013419 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 138013463 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138013509 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138013619 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138014210 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138014948 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138015060 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 138015140 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138015451 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 138015806 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138015917 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 138015995 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 138015997 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 138016078 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138016107 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138016166 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 138016173 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 138016287 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138016328 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138016350 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 138016351 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 138016392 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138016442 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138016455 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 138016468 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138016483 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 138016785 T C N Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 138016822 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 138016835 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 138016937 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 138017129 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 138017138 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 138017159 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 138017267 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138017327 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138017358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138017487 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 138017662 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 138017694 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138017712 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138017759 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138017893 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138018079 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138018199 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138018492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138018509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138018802 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138018949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138019033 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138019285 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138020898 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 138021049 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 138021363 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 138022037 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 138022337 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138022420 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138022453 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138022463 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138022489 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 138022571 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 138022574 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 138022680 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138023127 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 138023142 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138023211 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138023604 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 138023619 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 138026482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138026966 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 138027145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138029503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138029843 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138029917 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 138030843 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138030844 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138030924 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138031115 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138031193 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138031943 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138032946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138033588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138033828 C G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 138033846 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 138034156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138040706 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138041119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138041293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138041640 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138041920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138041934 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138042565 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138043100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138043224 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 138043321 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 138043402 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 138043852 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138044686 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138044703 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138044781 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 138044861 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138045009 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138045187 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138045201 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138045225 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 138045350 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138046423 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138046437 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138046462 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138046464 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138046505 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 138046642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138046710 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 138046713 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 138046912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138047081 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 138047111 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138047375 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138047490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138047563 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 138047612 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138047655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138047681 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138047694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138047800 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138047824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138047831 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138047924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138047925 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138047953 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 138047969 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138048002 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138048245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138048425 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138048434 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138048483 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138048514 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138048524 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138048565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138048644 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138048657 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138048976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138049049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138049077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138049139 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138049503 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 138049616 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138049622 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 138049745 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138049806 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 138050044 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 138050274 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138050614 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138050730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138050793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138050796 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138050999 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138051290 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138051339 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138051363 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138051405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138051419 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138052292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138052339 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138052340 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138052557 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138053042 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138053103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138053245 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138053340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138053447 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138053509 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138053927 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 138054060 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138054439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138055724 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138055754 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 138056236 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138056731 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138056750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138056884 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138056886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138057079 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138057738 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138058183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138058445 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138058834 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 138059240 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138059348 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 138059975 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138060156 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138061190 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138061972 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 138064063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138065020 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138065527 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 138067831 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138069282 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 138069444 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 138069463 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 138069493 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138069534 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 138071106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138071190 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 138071216 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 138072376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138072658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138074021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138076638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138077931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138079339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138080014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138080570 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 138080717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138081193 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 138082413 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138082546 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 138083928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138084306 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 138086570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138086609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138087329 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 138087494 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138087562 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138087582 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138087591 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138088133 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 138088187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138088472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138088484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138088515 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138088621 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 138088674 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138088731 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 138089479 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138090112 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138090413 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138090473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138090698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138090811 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 138090984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138091022 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 138091434 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138091768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138091857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138091937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138092180 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138092181 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 138092191 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 138092201 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 138092597 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138092647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138092921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138092940 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138092968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138093054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138093504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138093955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138094118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138094143 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138094756 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138094841 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138096419 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138097692 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138099501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138099860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138100300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138103032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138103087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138103838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138104125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138104285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138104916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138105016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138105913 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 138106372 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138106706 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138106806 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 138107032 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 138107105 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 138107634 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138107752 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 138107893 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138108527 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 138108675 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138109083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138109488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138110459 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138110468 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 138110532 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138113463 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138113782 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 138114515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138114833 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138116806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138116981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138117613 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138117818 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138117844 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138117879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138117912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138117944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138117999 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 138118119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138118416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138118591 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138119097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138119134 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138119193 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 138119254 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138119301 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138119350 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138119563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138119582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138119656 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138119663 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138119761 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138119792 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138119999 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138120017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138120043 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138120081 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138120092 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138120110 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138120117 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138120214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138120220 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138120328 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138120329 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138120346 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138120370 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 138120418 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138120436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138120493 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138120532 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138120753 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138120758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138120784 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138120831 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138120968 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138120988 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138121016 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138121054 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138121150 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138121178 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138121212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138121252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138121268 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138121423 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138121592 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138121618 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138121826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138121839 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 138121865 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 138121977 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 138122146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138122467 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 138122479 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 138122574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138122674 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138122797 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138122822 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138122939 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 138123315 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138123332 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138123693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138123926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138124137 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138124554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138124959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138124963 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138125239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138125924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138126087 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138126089 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138126240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138126999 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138127025 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138127059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138127157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138127290 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138127524 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138127572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138127813 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138127916 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138127919 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138127996 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138128290 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 138128369 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138128529 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138128628 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 138128782 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138128806 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138128825 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 138128930 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138128957 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138128969 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138129182 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138129325 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138129383 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138129494 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138129606 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138129619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138129690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138129789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138129802 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138129927 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138129946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138129948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138130054 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 138130169 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138130238 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138130261 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138130306 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138130325 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138130385 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138130453 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138130466 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138130476 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138130515 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138130573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138130584 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138130586 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138130652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138130679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138130697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138130716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138130734 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138130835 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138130880 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138130921 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138130941 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138130951 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138131009 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138131057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138131063 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138131079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138131149 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138131342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138131381 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138131567 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138131603 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138131670 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138131749 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138131837 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138131904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138131922 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138131939 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138131943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138131980 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138131982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138132070 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138132257 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138132301 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138132840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138133046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138133065 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138133357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138133358 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138133399 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138133500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138133711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138134005 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138134140 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138134151 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138134380 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138134510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138134544 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138134572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138134748 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138134856 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138134968 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138135017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138135269 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138135277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138135342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138135895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138135921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138135949 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138135951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138136004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138136073 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 138136182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138136271 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138136670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138136750 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138136899 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138136926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138136971 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138137081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138137226 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138137243 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138137282 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138137829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138138255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138138550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138138662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138138746 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138138750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138138808 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138139152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138139204 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138139259 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138139343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138139437 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138139474 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138139900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138139920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138139932 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138140065 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138140105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138140125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138140146 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138140195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138140423 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138140527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138140888 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138141016 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138141092 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138141506 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138141851 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138141996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138142023 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138142179 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138142644 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138142693 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138142868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138142884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138143054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138143149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138143189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138144719 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138144794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138144818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138144857 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138144871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138144893 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138145056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138145120 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138145126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138145223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138145250 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138145277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138145353 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138145444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138145499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138145506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138145638 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138145845 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 138145877 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 138145894 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 138145895 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138145934 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138145954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138145973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138146006 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138146080 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138146088 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138146119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138146181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138146265 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138148278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138148671 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138149011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138149191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138149350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138149361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138149418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138149459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138149520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138149521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138151576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138152574 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138154333 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138155858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138155949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138156565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138157089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138158629 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138158910 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138159940 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138162717 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 138162739 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 138162790 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138163023 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 138163991 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138164002 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138164023 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138164070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138164727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138164891 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138164949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138165226 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138165315 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138165318 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138165484 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138165555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138165792 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138165897 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138166038 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138167159 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138167801 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138168156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138169137 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138169305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138170181 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138170999 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138171002 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138172120 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 138173652 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138174660 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138175426 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138175898 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138177620 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138178316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138178370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138179083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138179254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138179317 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138179550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138179756 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138181271 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138181813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138183641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138183782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138183807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138184294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138184714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138184783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138184847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138185166 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138185341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138185373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138185443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138185528 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138185621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138186277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138186356 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138186402 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138186417 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138186546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138186549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138186901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138186929 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138187241 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138187291 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138188432 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138189098 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 138189215 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138189227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138189404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138189446 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138189484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138189617 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138189670 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138189683 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138189738 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138189746 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138189802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138189982 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138191516 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138192853 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 138193229 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 138194217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138194307 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138194670 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138195434 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138195597 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138195779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138196093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138196094 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138196169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138196299 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 138196409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138196442 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138196538 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138196543 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138196715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138196746 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138196833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138196934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138196980 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138197031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138197108 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 138197227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138197438 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 138198191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138198399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138199354 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138199366 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138199707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138199914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138200131 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 138200446 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138200862 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 138201301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138201433 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138201469 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138201660 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138202031 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 138202310 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138202641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138202824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138203411 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138204028 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138204390 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138204459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138204494 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138205088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138205097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138205865 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138206686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138206704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138207329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138208181 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138208694 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138209492 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138210251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138211002 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138212176 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 138212519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138212752 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138212754 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138213728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138213791 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138213905 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138213926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138213927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138213996 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138214145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138214461 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138221304 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138221460 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 138221650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138221820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138222328 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 138223321 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138223586 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138225236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138225458 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138227124 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138227601 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138227715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138228060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138228111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138228202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138231213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138232573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138232876 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138232926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138234614 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138237428 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138238592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138239666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138242875 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138243831 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138243992 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138243993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138244009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138244013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138244074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138244078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138244109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138244485 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 138244643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138244787 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138244790 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 138244981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138245072 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138245119 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138246248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138246963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138247074 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138247095 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138247097 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138247179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138247232 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138247556 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138248162 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138250134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138250402 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138251566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138252062 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138252082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138252127 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138252722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138252764 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138252821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138253106 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138253700 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138253789 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138253809 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138253919 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138254822 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138255064 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 138255154 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138255422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138255498 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138255546 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138255737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138255846 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138256312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138256434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138256537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138256640 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138256643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138257283 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138257285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138257434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138257700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138257744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138257775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138257903 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138258147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138258157 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138259423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138259434 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138259436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138259701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138260062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138260197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138260266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138260283 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138260322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138260497 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138260722 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138260759 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138260936 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138260986 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138261127 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138261232 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138261233 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138261390 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 138261514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138261762 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138261775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138261827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138261945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138262020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138262128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138262195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138262336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138262546 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138262552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138262586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138262717 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 138262981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138263046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138263138 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138263667 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138263855 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138264039 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 138264246 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 138264259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138264260 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 138264304 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138264346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138264494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138264745 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138264981 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 138265177 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138265467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138265492 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138265493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138265537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138265604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138265705 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138266059 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 138266065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138266079 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138266321 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138266474 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138266515 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138266655 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138267045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138268348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138269879 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 138269891 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138271233 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138272643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138272735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138272955 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138273030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138273170 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138273238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138273559 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138273605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138273606 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138274226 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 138274380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138274963 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138277368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138282133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138282200 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138282273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138282468 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138282471 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138282549 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138282602 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138282855 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138283153 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138283372 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138283461 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138283473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138283486 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138283559 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138283663 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138283718 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138283894 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138284027 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138284272 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 138284376 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 138284518 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 138284519 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 138284556 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 138284642 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 138284708 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 138284768 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 138284801 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 138284858 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138284943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138284960 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 138284979 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 138284984 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 138285059 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 138285071 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 138285148 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 138285264 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 138285431 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 138285503 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138285526 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 138285593 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 138285659 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 138285844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138285860 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138285962 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138286069 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138286173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138286251 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138286297 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138286359 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138286416 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138286431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138286563 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138286599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138286898 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138286921 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138286973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138286991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138287070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138287108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138287145 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138287297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138287309 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138287349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138287424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138287481 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138293362 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138293483 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 138293589 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 138293743 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138293945 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 138294038 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 138294314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138294354 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138294888 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138295135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138295204 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 138295227 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138296297 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138296464 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 138296468 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 138296558 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138296790 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 138296820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138297178 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138297319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138297488 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138297704 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 138297759 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 138297821 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138297883 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138298111 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 138298241 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138298303 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138298357 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138298558 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138298574 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138298668 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 138298721 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 138299047 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138299060 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 138299554 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 138299568 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138299570 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138299635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138299753 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 138299821 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 138299987 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138300407 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138300436 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138300453 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138300515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138300599 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 138300628 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 138300648 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138300691 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138300701 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138300721 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138300776 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138300953 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 138301145 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138301146 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138301180 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138301315 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 138301430 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 138301453 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138301526 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 138301727 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138301800 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138302953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138303118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138303178 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 138303404 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 138303617 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 138305217 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138305427 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 138305465 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138305756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138306086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138306224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138306277 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138306367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138306767 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 138307032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138307103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138307148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138307398 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 138307407 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138307472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138307834 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138308218 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138308503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138308931 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 138309008 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138311509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138312241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138313300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138314321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138314655 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138315090 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138315379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138318591 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138318798 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 138320193 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 138326195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138327111 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138327684 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138329931 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138329944 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 138330046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138332002 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138332247 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138333996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138334615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138334723 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138334837 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 138335020 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138335376 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 138339019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138339620 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138340838 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138340953 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 138340959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138341198 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138341299 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138341413 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138341470 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138342319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138342598 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138342652 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138342687 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138351314 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138352771 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138352893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138352991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138353203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138354123 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138356512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138356643 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138357120 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138357904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138358443 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138358639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138359225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138360692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138363485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138363712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138364243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138364500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138364907 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138366192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138366423 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138366996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138367327 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138367637 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138367724 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138367775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138367927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138367967 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138368478 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138368682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138368804 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138368831 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138369307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138369787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138369825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138370100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138370129 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138370475 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138370612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138372560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138372896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138372965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138372996 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138373006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138373220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138373386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138373556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138373621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138373675 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138373749 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138373772 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138373920 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138373995 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138374020 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138374088 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138374343 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138374400 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138374414 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138374453 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138374454 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138374958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138375241 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 138375289 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 138375461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138375609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138375688 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138375833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138376096 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 138376199 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138376335 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138377823 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138378050 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138378055 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138378311 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138378360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138378418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138378578 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 138378599 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138378751 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 138378867 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138378934 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138378972 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138379426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138379630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138379631 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138379682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138379746 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138379809 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 138379810 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 138379952 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138380088 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138380089 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 138380141 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138380209 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138380271 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 138380433 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138380439 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138380483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138380542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138380618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138381104 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138381286 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138381314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138381325 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138381390 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138381790 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138381830 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138381877 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138381987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138382381 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382386 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382410 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382493 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382565 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382600 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382661 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382704 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138382713 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382724 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382728 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382749 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382761 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 138382777 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382781 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138382792 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138382802 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138382816 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138382968 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 138383120 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138383229 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 138383334 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 138383379 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 138383405 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138383416 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138383481 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138383551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138383586 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138383620 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138383971 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138383987 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138384225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138384247 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 138384274 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 138384563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138384643 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138384670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138384679 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 138384707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138384809 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 138384842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138385105 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 138385156 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 138385193 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138385274 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138385435 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138385525 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138385789 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 138385876 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138386071 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138386094 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138386293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138386455 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138386470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138386644 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138386659 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 138386843 G C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 138386908 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138387077 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138387253 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 138387490 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138387662 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138387826 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138397679 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138397866 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 138397896 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138398009 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 138398152 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138398325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138398459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138398489 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138398638 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 138398842 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138399197 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138406300 A C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 138406475 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 138406500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138406601 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138406646 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138406654 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 138406865 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 138406955 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138407014 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 138407086 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 138407161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138407176 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138407228 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138407521 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138407576 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138407603 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138408021 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138408525 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138409165 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138410133 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 138410648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138410896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138411630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138412564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138413135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138414577 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138414976 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138415131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138415337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138415853 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138416145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138416376 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138416402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138416429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138416596 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 138417058 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138417059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138417073 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138417149 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138417288 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138417625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138417721 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138417753 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138418868 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138419068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138419388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138420523 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138420570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138420692 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138420760 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138421054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138421539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138421596 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 138421637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138421751 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138421755 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138422641 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138422682 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 138422714 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 138422778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138422814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138422913 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 138422956 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 138423005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138423018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138423047 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138423358 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 138423416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138423464 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 138423631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138423691 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138423771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138423815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138423877 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138424033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138424873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138425189 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 138425293 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138425317 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 138425361 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 138426137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138426168 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 138426237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138427450 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 138427493 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138427586 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 138427614 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138427655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138427888 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138427910 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138428091 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138428098 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138428139 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138428150 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138428181 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138428328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138428545 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138428806 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138428862 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138428916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138428932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138428983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138429038 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138429159 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138429240 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138429371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138429440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138429482 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138429676 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138429866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138429930 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138430077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138430293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138430615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138430665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138431321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138431443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138431683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138431791 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138431802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138432264 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138432569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138432575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138432973 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138433613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138433728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138433903 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138434274 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138434472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138435353 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 138435417 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138436238 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 138436320 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138436493 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138436789 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138436791 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138436807 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138436912 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138437003 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138437005 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138437307 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138437360 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138437423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138437539 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 138437608 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 138437781 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 138437875 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 138437876 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 138437888 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138437964 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 138437980 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 138438088 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138438492 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138438542 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138438631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138438676 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138438823 T A Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 138439049 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138439080 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138439923 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138439973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138440460 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138441570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138442191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138442228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138442514 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138442551 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138442608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138442619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138442807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138443235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138443334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138443407 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138443569 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138443573 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138444059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138444160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138444233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138444418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138444435 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138444449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138444456 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138444472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138444686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138445342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138446106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138446505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138450265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138450357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138450371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138454096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138454850 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 138454959 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 138455001 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 138455348 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138455805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138455841 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 138455844 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138455962 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138456197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138456201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138456222 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 2 138456266 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 138456312 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 138456438 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 138456616 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138456686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138456725 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138456886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138457650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138457773 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 138457778 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 138457811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138458061 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 138458327 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 138458352 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 138458356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138458896 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138459022 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 138459156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138459238 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 138459494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138459904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138459968 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 138459969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138459985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138460174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138460518 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 138460524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138460551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138460631 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 138462066 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138462090 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 138462469 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138462860 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 138462967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138463069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138463115 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 138463245 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138463280 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 138463545 G C Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 138463596 G C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 138463613 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 138463881 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 138463918 G T Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 138464010 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 138464050 T G Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 138464098 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 138465129 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 138465225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138465376 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 138465472 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 138465591 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 138465617 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 138465827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138465881 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 138465886 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 138466250 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 138466277 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138466290 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138466302 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 138466313 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 138466314 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 138466417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138466851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138467252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138467516 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 138467816 T A N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 138467954 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 138468217 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138469779 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 138470914 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 138470938 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 138471053 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 138471185 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138471191 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138471400 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 138471603 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 138471716 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138472177 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 138472211 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 138472456 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138473073 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138473074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138473162 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138473231 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138473275 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138473601 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138473709 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138473920 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 138473935 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138474026 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 138474098 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 138474224 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 138474544 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138474722 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138474778 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138474833 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138474845 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138474926 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 138474958 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 138475126 A T Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 138475364 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 138475373 A G Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 138475396 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138475404 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138475458 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138475470 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138475509 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138475548 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138475559 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 138475699 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138475700 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 138475755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138476583 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138477280 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138477792 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 138477956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138478561 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138479781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138480573 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 138482806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138483038 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 138483729 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 138484295 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 138484504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138484700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138486705 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138486730 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138487064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138487084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138487881 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138487920 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138487921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138488101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138488617 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138489507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138489962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138490474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138490993 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138491864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138492694 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 138492980 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138492997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138493260 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138493275 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138493424 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138493442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138493452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138493493 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138493669 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138493733 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 138493801 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 138493818 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 138493849 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 138493968 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 138494042 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 138494197 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 138494200 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138494263 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138494352 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138494657 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 138494687 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 138494801 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138494831 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 138495245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138495576 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 138495629 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 138495855 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 138495927 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 138496274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138496539 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138496619 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 138496923 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138497313 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138497398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138497801 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138498037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138498125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138498764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138498881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138498961 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138499052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138499123 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138500025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138500176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138500346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138500455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138500476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138500612 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 138500622 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 138500752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138500763 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 138500770 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 138500802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138500835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138500926 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 138500944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138501330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138501525 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 138501551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138501590 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138501605 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 138501632 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138502945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138503594 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 138504554 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138504825 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138505315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138506044 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138506338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138506352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138506540 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138506941 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138506981 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 138507224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138508077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138508228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138508488 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138508549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138508819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138508883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138509051 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138509216 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 138509340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138509536 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138509757 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 138509761 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 138509794 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 138510049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138510372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138511065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138511127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138511142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138511155 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138511232 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138511238 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 138511415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138511590 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138511645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138511660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138511818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138511860 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138511892 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 138512095 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138512166 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 138512193 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 138512345 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 138512390 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 138512435 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 138512482 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138512524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138512584 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 138512662 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 138512698 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 138512939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138513266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138513271 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 138513296 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 138513583 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 138513795 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 138514209 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 138514362 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138514376 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138514523 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138514812 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 138514822 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 138515023 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138515024 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138515040 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 138515064 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 138515079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138515172 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 138515186 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 138515464 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 138515500 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 138515542 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 138515616 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 138515644 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 138515675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138515705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138515830 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 138516077 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 138516111 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 138516423 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 138516447 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138516608 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 138516640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138516828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138516858 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138517359 A T N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 2 138519391 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 138519436 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 138519549 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138519673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138519888 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 138520141 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 138520416 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 138520427 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 138520567 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 138520578 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 138520667 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 138520696 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 138520708 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 138520716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138520766 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 138520784 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 138520796 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 138520829 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 138520939 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 138520979 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 138520987 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138521030 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 138521044 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 138521295 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 138521296 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 138521331 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 138521486 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 138521499 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 138521555 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 138521640 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 138521820 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 138522436 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 138522994 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138523061 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138523103 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138523755 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138524066 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 138524325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138524443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138524503 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138524631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138525397 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138525469 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138525509 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138525540 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 138525629 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138525767 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 138525917 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 138526179 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 138526181 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 138526232 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 138526302 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 138526392 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138526526 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138526538 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138526547 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 138526629 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138526866 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 138526946 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 138526947 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 138527060 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138527106 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138527173 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 138527268 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 138527340 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 138527508 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138527535 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 138527757 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138527834 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138527940 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138528006 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138528031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138528090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138528098 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138528416 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 138529241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138529586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138529834 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138529979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138530244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138530619 T C Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 138531012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138531063 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 138531391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138531471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138532198 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 138532201 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138532484 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138533214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138534296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138534629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138534691 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138534786 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 138534954 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 138535031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138535044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138535211 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138535267 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138535312 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 138535361 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138535511 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138535885 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138536219 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138537137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138537218 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 138537660 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 138537767 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 138537770 C G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 138537952 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 138537959 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 138538009 C G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 138538102 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138538154 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138538163 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138538206 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138538417 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138538439 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138538466 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138538642 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138538657 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138538698 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138538699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138538768 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138538794 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138538830 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138539032 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 138539162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138539172 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 138539181 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 138539201 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 138539238 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138539318 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138539367 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 138539394 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 138539428 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138539465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138539660 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138539686 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 138540033 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138540208 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 138540215 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 138540245 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 138540337 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 138540427 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 138540501 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 138540525 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 138542033 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 138542195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138542568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138543015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138543085 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138544464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138544641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138545427 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 138545429 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 138545533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138545669 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 138545763 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 138545773 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 138547886 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 138548086 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 138548102 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 138548138 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 138548152 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 138548177 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 138548542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138548869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138553695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138557428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138558010 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138559412 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138560023 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 138560160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138560350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138563851 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138564361 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 138564588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138565182 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138565517 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138566821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138566911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138568287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138568619 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138570640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138572393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138573321 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 138573504 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 138574057 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 138574092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138574252 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 138574481 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 138574599 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138574694 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 138574695 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 138574708 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 138574725 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 138574836 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 138574867 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 138574900 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 138574995 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138575066 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 138575127 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138575156 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 138575170 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138575359 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138575518 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 138575792 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138575846 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 138575945 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 138575997 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138576017 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 138576146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138576426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138576832 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138577003 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 138577405 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138577415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138577775 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138578056 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138578186 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 138578352 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138579100 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 138579117 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 138579611 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138579734 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138580029 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138580259 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 138580344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138580624 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 138580656 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138580956 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 138580993 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 138581226 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138581517 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138581650 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138582039 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 138582742 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138582777 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 138582798 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 138582931 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138582944 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 138582974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138583170 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 138583228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138583284 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138583626 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138583869 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 138583968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138584006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138584077 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138585987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138587691 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 138587747 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 138589781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138590758 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138591283 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138591809 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 138591966 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138592343 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 138592643 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138592771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138592806 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 138593682 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 138593894 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138593934 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138593992 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 138594156 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 138594271 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 138594296 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138594609 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 138594630 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 138594686 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138594771 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138594917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138595170 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138595335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138595528 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138595551 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 138595552 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 138596192 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 138596205 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 138596218 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 138596334 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 138596381 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 138596399 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 138596438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138596491 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 138596523 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138596675 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138596690 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138596777 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 138596782 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138596803 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138596867 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138596895 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138596936 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138597012 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138597046 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138597108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138597366 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 138597394 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 138597426 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 138597594 G T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 138597617 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138597678 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 138597859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138598044 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 138598237 G C N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 138598315 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 138598862 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 138599201 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 138600115 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 138600446 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138601252 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 138602336 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 138602665 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138602828 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 138603121 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 138603434 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138603561 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 138603574 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 138603614 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 138603671 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138603885 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 138603895 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138603931 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138604073 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138604090 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 138604199 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 138604251 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 138604260 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 138604365 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138604371 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 138604407 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 138604413 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 138604441 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138604487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138604547 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 138604733 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 138604772 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 138604903 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 138604954 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 138605060 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 138605062 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 138605251 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138605377 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 138605556 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138605567 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 138605607 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138605639 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138606198 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 138606211 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138606323 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 138606337 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 138606652 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138606688 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138607062 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 138607135 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 138607405 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 138607515 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 138607535 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 138607843 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 138608423 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 138608563 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138608594 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138609312 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 138609390 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 138609449 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 138609759 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138609834 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 138609843 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 138610237 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 138610289 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 138610445 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 138610519 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 138610610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138610690 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 138610769 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 138611010 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138611065 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138611258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138612077 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 138612161 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138612587 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 138612654 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 138612689 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138612768 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 138613027 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 138613526 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138613887 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138614003 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 138614792 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138615420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138615954 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 138616164 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 138616678 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 138617247 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 138617285 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 138617371 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 138617569 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 138617766 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 138618154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138618599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138618824 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 138621613 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 138622137 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138622342 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 138622802 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138623678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138624026 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 138625498 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 138626073 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138626299 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 138626455 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 138626784 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 138627128 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 138627715 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 138628305 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138629137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138629329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138629402 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 138629586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138629624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138629806 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138629963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138630421 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 138630606 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138631128 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138631381 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138631474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138632216 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138632467 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138632569 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138632619 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138632637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138632638 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138632695 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138632784 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138633287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138634772 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138635277 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138635440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138636220 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138637347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138637418 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138638015 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138638603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138638619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138639805 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138639988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138640168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138640684 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 138641366 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138641402 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 138641606 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 138641822 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138641875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138642855 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138643010 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138643683 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 138644312 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138644712 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 138645274 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138645519 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138645555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138646154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138647236 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138648026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138648978 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138649140 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 138649419 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 138649504 T C Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 138649672 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 138649691 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 138650645 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 138651249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138652677 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138652977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138653298 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138653649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138654051 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138654566 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 138654729 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 138655275 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138655310 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 138655680 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 138656439 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138657268 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 138657934 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 138659299 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 138659318 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 138663798 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138663811 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138664011 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138664166 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 138664168 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 138664189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138664484 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138664637 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138664777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138664793 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138664854 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138665966 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 138666107 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138666509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138666707 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138667384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138667748 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138669073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138669581 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138679751 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 138679820 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 138679836 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 138679968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138680229 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 138680745 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 138680777 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 138681809 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 138682560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138683311 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 138683644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138684606 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138684765 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 138685266 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 138685971 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138686148 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 138686234 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 138686355 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 138686416 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 138687221 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 138687474 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 138687599 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 138687656 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138687823 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 138687850 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 138687883 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 138688570 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 138688763 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138688844 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 138689057 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 138689109 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138689592 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138689610 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138689695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138689785 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138689805 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138690242 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 138690282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138690349 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138690372 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138690376 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 138690591 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138690659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138690751 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 138690762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138690782 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 138690803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138691020 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 138691047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138691124 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138691553 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138691683 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138691939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138691997 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138692091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138692154 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138692209 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 138692427 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 138692722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138692934 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138693092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138693101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138693781 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138694175 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138694468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138694576 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138694586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138694700 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138694795 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 138694802 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138694979 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 138695433 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 138695434 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 138695520 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 138695623 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 138695666 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138695719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138696034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138696450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138696677 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 138696882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138697114 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 138697131 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 138697147 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 138697236 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138697491 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 138697681 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138697811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138697899 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138698072 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138698578 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138699054 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 138699055 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138699100 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 138699312 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138699523 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 138699814 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138699857 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138700454 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138700467 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 138700487 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 138700871 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 138700899 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 138701059 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 138701148 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 138701187 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138701323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138701408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138701436 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138701556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138701558 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 138701649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138701768 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138701853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138701878 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138701918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138701942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702078 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138702115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702126 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702440 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702603 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 138702633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702692 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138702858 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 138702909 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 138702959 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 138703029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138703081 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138703113 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138703176 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138703228 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138703249 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138703294 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138703305 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138703320 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138703379 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138703430 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 138705056 A C Y N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 138705269 A T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 138705284 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 138705369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138705383 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138705395 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138705412 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138705419 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138705458 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138705475 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 138705601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138705650 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138705686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138705734 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 138705870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138705912 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138705963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138706017 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 138706148 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 138706200 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138706201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138706286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138706354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138706514 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 138706530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138706539 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138706609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138706639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138706667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138706685 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138706777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138706873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138706900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138706963 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138706979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138707052 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 138707126 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138707150 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138707171 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138707198 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138707815 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138707888 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138708059 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 138708125 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 138708259 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138708282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138708474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138709104 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 138709159 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 138709357 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138709408 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 138709483 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 138709724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138710109 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 138710115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138710126 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138710136 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 138710170 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 138710185 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138710204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138710218 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138710285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138710410 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 138711930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138712502 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138712544 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138712777 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 138712908 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 138714150 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 138714176 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138714386 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138714429 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138714568 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 138714584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138714782 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 138715056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138715102 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138715206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138715353 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 138715382 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 138715860 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138716205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138716559 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 138716615 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138716850 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 138717640 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 138717882 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 138718259 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138718309 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138718565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138718665 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138719585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138720159 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138720211 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 138721140 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138721419 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138721635 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 138721750 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 138722848 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138723234 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138723515 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 138726755 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138727525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138727554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138727685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138727741 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138728579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138728784 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138730538 T C Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 138733989 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138734747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138735100 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138735121 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138735653 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138736665 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 138739704 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138745325 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138745614 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 138748942 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138751230 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138751660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138751764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138752174 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138752481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138753197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138756423 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138756447 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138756787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138756832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138756870 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138756912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138757023 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138757358 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138757466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138757529 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138757567 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138757617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138757774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138757873 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138757886 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138758204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138758419 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138758427 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138758736 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138758737 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 138758769 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138760930 T C Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 138761866 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 138762718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138763060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138763446 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138763484 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138763644 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138765622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138765723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138766061 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138766778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138766779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138768322 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 138768903 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138768954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138769038 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138769059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138769113 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138769148 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 138769172 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138769253 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138769596 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138770720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138771320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138771439 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138771493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138771538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138771679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138772119 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138772196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138772197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138772288 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138772402 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 138772428 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138772533 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 138772565 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 138772855 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138772875 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 138773046 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 138773066 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138773196 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 138773590 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138774336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138774341 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138774833 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138774860 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138774919 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138774948 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138774993 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138775030 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138775049 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138775087 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138775160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138775528 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 138775591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138775764 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 138775922 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138775936 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 138775970 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 138776024 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138776152 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 138776183 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138776714 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138776720 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 138776765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138777026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138777128 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 138777134 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 138777208 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138777288 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138777521 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138777526 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138777806 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138778952 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138780617 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 138780778 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 138782679 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138782686 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138782815 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138783770 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138783820 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138783965 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138784085 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138784302 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 138786766 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 138786833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138787185 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 138787189 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 138787342 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138787871 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138787908 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138787926 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138788026 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138788236 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 138788351 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138788365 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138788374 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138788842 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138788939 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 138789027 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 138789098 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 138789361 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138789429 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 138789591 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138789611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138789655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138789694 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138789769 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138789792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138789826 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138789951 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138790149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138790166 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138790173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138790214 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138790299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138790364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138790465 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138790492 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138790738 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138790759 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138791348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138792041 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 138792529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138792681 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138792761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138792901 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138793329 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138793661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138794021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138794079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138794106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138794224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138794303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138794376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138794714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138794972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138795074 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138795194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138795225 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 138795276 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138795433 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138795588 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138795660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138796314 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138796458 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138796464 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 138796522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138796652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138796842 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 138796904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138796916 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 138796919 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138797080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138797240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138797276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138797381 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138797498 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138797787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138798087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138798390 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138798391 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138798475 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138798486 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138799039 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138799100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138799486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138799582 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138799601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138800100 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 138800193 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 138800419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138802640 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138802773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138802795 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138802825 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 138804041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138804821 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138804861 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138804905 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138805007 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 138805225 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 138805300 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 138805333 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 138805710 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138805949 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 138805975 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 138806304 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 138806847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138807410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138808208 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 138808870 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 138809673 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138810821 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 138813119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138814246 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 138814774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138814844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138816562 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 138817953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138818766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138825409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138825712 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138826234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138826765 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138830654 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138831404 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 138833698 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 138834785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138835264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138836378 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138837254 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 138838871 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 138839134 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138840454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138840910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138841968 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 138842133 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 138842325 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 138844360 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138844418 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138844662 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138845830 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138846585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138847498 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138847603 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138849426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138849588 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138849738 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138849759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138850020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138850071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138850326 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138851403 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 138852449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138853079 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138853195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138854512 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138854749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138855042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138855239 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138855263 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 138855418 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138855483 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 138855608 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138855777 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138855798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138855908 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138855918 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138856016 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138856025 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 138856094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138856115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138856117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138856389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138856404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138856586 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138856812 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138857095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138857129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138857139 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138857333 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138857568 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138858422 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 138858817 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 138859600 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138860427 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 138860696 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138861139 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138861140 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138861185 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138861510 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 138861528 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138861536 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138861590 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138861666 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 138861667 G C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 138861736 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138861748 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138861789 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138862000 T G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 138862063 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138862069 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138862145 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 138862393 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138862536 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138862574 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138862580 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 138862645 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138862698 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 138862938 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138863161 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138863316 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138863691 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138863884 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 138863917 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138863927 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138864050 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138864092 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 138864132 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 138864429 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138864580 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138864927 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 138864977 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138865669 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138866351 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138866352 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138866432 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138866579 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138866677 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138866681 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138866695 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138866696 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138866745 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138867082 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138867237 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138868243 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138868352 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 138868430 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 138868760 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 138868856 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 138868887 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138868914 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138869267 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138869269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138869655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138869889 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 138869890 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 138871452 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138871777 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 138871949 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138871986 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 138871999 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 138872227 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 138872253 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 138872594 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 138872812 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138873021 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138873325 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 138873634 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 138873836 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138873938 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 138874217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138874219 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138874253 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138874613 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138874661 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 138874687 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 138874696 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138874764 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138874892 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 138874896 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138874980 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138875149 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 138875164 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 138875178 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 138875232 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 138875722 C G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 138875769 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 138875809 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138875862 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 138875995 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138876050 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138876071 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138876161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138876251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138876467 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 138876521 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 138876599 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 138876633 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138877379 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 138877396 A C N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 138877402 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 138877581 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 138877613 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 138877736 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138877782 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138877934 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138877996 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 138878093 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138878100 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138878126 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138878129 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138878162 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138878300 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 138878374 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 138878418 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138878430 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 138878464 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138878545 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 138878590 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 138878609 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 138878755 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 138878899 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 138878908 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 138878936 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 138878962 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 138879073 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 138879136 A C N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 2 138879226 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 138879683 A G N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 138879691 G A N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 138879705 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138879738 G T N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 138879741 G T N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 138879841 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138879944 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138880069 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 138880145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138880194 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138880429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138880472 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138880699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138880755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138880794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138880838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138880843 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138880866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138881021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138881173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138881412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138881419 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138881520 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138881580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138881736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138881745 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138881794 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138881824 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138881869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138881938 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138881976 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138882003 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138882015 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138882017 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138882066 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 138882072 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 138882093 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 138882098 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 138882160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138882185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138882229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138882255 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138882292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138882349 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138882410 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138882459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138882490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138882538 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138882673 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138882821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138882842 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138883021 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 138883024 T A N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 138883306 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138883308 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138883322 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138883396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138883443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138883519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138883554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138883588 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138883602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138883780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138884100 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138884194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138884200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138884322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138884330 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138884464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138884563 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138884568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138885117 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138885119 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 138885169 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138885465 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138885542 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138885872 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138885892 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138885907 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138885925 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138885947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138886001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138886038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138886086 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138886291 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138886292 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138886706 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 138886771 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138886986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138887118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138887224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138887227 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138887294 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138887369 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138887390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138887456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138887566 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138887636 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138887897 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138887961 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138888048 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138888329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138888711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138888740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138888752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138888769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138888790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138888804 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138888828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138888918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138888942 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138888976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138889063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138889079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138889197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138889269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138889274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138889389 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138890029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138890430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138890444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138890704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138890723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138890790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138893928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138894002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138894117 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138894213 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138894222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138894367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138894434 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138894519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138894546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138894605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138894665 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138894878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138894954 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138895158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138895169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138895189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138895273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138895449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138895490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138895545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138895594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138895707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138896135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138896386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138896745 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 138896873 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138896906 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138897046 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138897049 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138897083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138897123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138897230 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138897449 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138897559 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138897881 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138898904 A T N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 138898913 A G N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 138898936 A C N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 2 138899077 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 138899810 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138899841 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 138899921 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138900143 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138900256 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138900271 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138900291 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138900313 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138900849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138900896 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138900918 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138901155 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138901227 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138901296 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138901392 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 138901604 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 138902124 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 138902213 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 138902269 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 138902299 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 138902350 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 138902372 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138902528 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138902540 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138902729 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138902756 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 138902835 T G N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 2 138903156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138903522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138904782 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 138904788 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138908211 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138908365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138908544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138909267 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138910339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138911438 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138912846 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 138912937 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 138913296 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138913468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138913977 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138914311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138915228 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138915288 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138915449 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 138916657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138917895 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 138918224 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138920571 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138920925 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138926034 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138926279 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138926994 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 138927595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138928147 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 138928245 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 138928443 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138928570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138928777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138929008 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 138929010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138929571 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138929586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138929622 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138930439 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 138930808 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138930817 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138931083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138932247 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 138932380 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 138933988 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 138934130 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138935640 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138936050 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 138936145 A C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 138937070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138937731 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138939665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138940297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138941143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138941985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138942154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138942323 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 138942389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138943924 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138944233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138944594 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138944696 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 138945008 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 138945295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138945454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138946219 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 138946366 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 138946937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138946951 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 138947935 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 138948298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138948817 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138950336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138950955 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138952633 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138953611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138954109 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138954733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138955423 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138955495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138956096 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138957061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138957556 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 138958144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138959251 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138959503 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138959527 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138960896 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138961031 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 138961374 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138961378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138961770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138962146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138962942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138963123 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138963160 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138965500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138965578 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138967431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138967489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138967500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138967743 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138969339 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 138969771 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138969788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138969813 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138969995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138970257 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138970294 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138970335 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 138970345 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 138970399 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138971545 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 138972858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138973111 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 138973158 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138973195 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 138973531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138973819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138974279 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138974347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138976027 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 138977090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138977155 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 138977416 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138977496 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 138978685 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138979304 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138979379 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138979499 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 138979766 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138980579 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138980630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138980834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138981071 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 138981147 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138981688 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138983685 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138983909 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138984247 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138984565 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138985331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138985419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138985490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138985518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138985567 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138985582 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138986190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138986278 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138986431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138988049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138988388 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138990895 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138991229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138992340 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138992595 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 138992661 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 138993654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138993946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138996608 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 138996700 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138998411 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138998464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138998586 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138998593 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138998638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138999096 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138999189 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 138999345 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 138999512 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 138999614 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 138999649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138999702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138999916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138999941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 138999945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139000005 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 139000078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139000081 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 139000122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139000169 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 139000272 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139000378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139000621 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 139000748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139000760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139000794 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 139000832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139001102 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139001292 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 139001304 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139001464 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139001632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139002225 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 139005599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139005654 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 139006594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139008132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139008360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139008462 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139008677 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 139009833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139010147 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 139011526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139011654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139012606 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139013492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139014400 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139014456 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139014486 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139014546 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 139014889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139014945 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139015573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139016290 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139016459 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 139018576 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 139018605 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139019144 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139019337 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 139019601 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 139019771 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139020789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139021122 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 139021425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139021432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139021702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139022436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139023088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139023240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139024496 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 139024524 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 139024561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139024568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139024608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139024659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139024688 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 139025443 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 139025585 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 139029119 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139030502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139031795 T G N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 139032806 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139033328 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139033744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139033931 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139034941 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 139035009 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 139035318 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 139035910 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 2 139036699 G C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 139036944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139038618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139039151 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139039839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139039958 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139040236 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139040500 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139040508 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139040757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139040831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139040908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139040939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139040943 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 139041289 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139041294 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139041430 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139041635 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 139041808 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139042004 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 139042005 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 139042111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139043026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139043957 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139045337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139045755 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 139045947 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139045987 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 139046096 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139047379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139048278 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139048373 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 139049107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139049130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139049147 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 139049151 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 139049348 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 139049546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139049859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139051012 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139051360 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139051419 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139051420 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139051484 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139051562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139051592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139051636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139052549 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139052586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139052601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139052766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139052903 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 139054652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139054849 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139054985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139055022 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139055086 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139055758 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139056422 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 139056731 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 139056842 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 139056907 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 139056922 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 139057407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139057631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139057671 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 139057819 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139058192 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139058562 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 139058663 A T N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 139058822 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139058959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139059724 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139060582 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139060668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139060896 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 139060930 G T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 139061140 C G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 139061169 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139061172 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139061278 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139061331 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139061398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139061616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139061784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139061888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139061900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062334 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 139062341 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 139062431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139062534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062724 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062924 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139062958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139063369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139063593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139063647 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139063715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139063878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139068093 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139068213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139068285 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139068811 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139068889 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139068927 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 139068933 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139068956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139069241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139069365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139070165 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139070295 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139070760 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 139071297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139071414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139072130 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139072883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139073186 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 139074086 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139074126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139074499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139077184 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 139077204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139077801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139078179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139078258 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 139078613 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139078919 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 139079488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139079522 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 139079655 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 139079666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139080016 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 139080113 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 139080193 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 139080212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139080561 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 139082086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139083161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139083710 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139084716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139084788 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139084798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139085104 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139085233 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 139085399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139085613 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139088399 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 139088908 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139090804 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 139092325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139093197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139093495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139095097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139095115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139096143 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139097072 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139098981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139101176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139102872 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139102919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139102942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139103088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139103128 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139103140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139103268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139103566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139103577 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139103852 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139104123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139104601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139104805 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139105306 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139105316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139105554 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139107928 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139108891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139111560 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139113396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139113772 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 139114308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139115489 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 139116104 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139119104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139119489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139119857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139120220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139121890 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139122034 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139122664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139123055 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139124418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139124504 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139125011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139125860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139126327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139128519 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139128919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139130962 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139132742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139132762 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 139132764 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 139133899 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139137500 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139138876 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139141494 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 139141677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139142811 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139143507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139144169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139144911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139146620 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139147743 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139148961 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139149084 T G N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 139152582 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139152813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139153016 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139153025 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139153183 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139154164 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139154459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139155336 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 139156841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139158090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139159685 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 139159690 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139161617 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139164194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139164263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139164485 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 139168749 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139169386 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139172952 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 139174722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139175849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139177897 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139178218 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139178414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139179026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139179379 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139180295 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139180959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139181186 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 139181326 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 139182165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139182684 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139184176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139185278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139186387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139188720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139189154 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139189454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139190740 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139191011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139191274 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139191306 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 139191542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139191922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139191932 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139192006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139192028 C G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 139192085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139192366 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139192445 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139192542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139192679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139192822 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139193590 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139193895 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139193912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139194051 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139194071 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139194086 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139194200 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139194264 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139194265 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139194301 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139194358 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139194393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139194414 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139194623 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139194682 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139194795 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139194902 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139194980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139195043 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139195123 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139195350 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139195469 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139195477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139195829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139195961 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139196049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139196357 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139196815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139196831 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139197077 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139197154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139197694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139197804 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139197876 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139197972 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139198037 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139198044 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139199336 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139200034 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139200178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139200289 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139200304 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139200360 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139200557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139201073 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139201322 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139201377 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139201417 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139201547 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139201765 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139201780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139201829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139202267 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139202370 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139203225 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139203235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139203295 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139203431 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139203442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139203911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139203928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139203937 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139204010 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139204034 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139204546 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 139204887 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139205878 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 139205943 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 139206025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139206167 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 139206606 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139206801 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 139206919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139206983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139206990 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139207031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139207941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139208010 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139208885 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 139208918 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139209314 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 139209444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139209544 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 139209819 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 139210119 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 139210189 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139210279 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139210296 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139210329 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 139210419 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 139210464 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139210878 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139210884 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139211259 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139211453 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139211757 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139211803 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139211828 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139212320 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139212380 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139212390 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139212409 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 139213296 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139213627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139214223 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 139214360 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 139214527 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 139215647 A G Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 139215659 T C Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 139216265 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139216598 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139217271 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139218555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139219224 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 139219267 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 139219268 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 139219337 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139219834 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139220649 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139221107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139222923 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139223302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139224253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139224597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139224971 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 139225646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139226208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139226535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139226752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139227276 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139227299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139233993 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139234147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139235309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139235573 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139237177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139237464 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139237592 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139237932 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139240519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139241676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139242207 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139242349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139242350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139243110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139243592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139244845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139245272 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 139246374 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139247106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139247148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139248609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139249020 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139249158 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139249203 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139249447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139249719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139250223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139250447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139250698 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139251754 T G Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 139252393 G A Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 139252900 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 139253078 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 139253204 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 139254638 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139254690 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139255027 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 139255857 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 139257000 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 139257032 C T Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 139257054 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139257228 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139257967 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 139257990 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 139258458 G C Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 2 139267288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139267759 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139268040 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139268945 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139269665 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139270065 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 139270181 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139271086 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139271227 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139271228 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139272842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139273082 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139273340 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139274075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139275672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139275909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139276891 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139277339 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 139278495 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 139278496 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 139278837 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 139279902 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 139280389 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 139280596 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 139280641 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 139280854 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 139280875 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 139281270 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 139281588 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 139283088 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 139283152 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 139284566 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139284855 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139284893 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139285182 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139285440 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139285521 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139285695 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139285785 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 139285973 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139286414 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139286537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139287046 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139287143 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139287196 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139288110 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139289137 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 139289466 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139289531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139289644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139289868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139291860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139292396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139292430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139294377 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 139295685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139295887 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139295965 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139302651 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139303131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139303504 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139303581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139304316 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139304767 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139306453 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139306706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139307201 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 139308568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139309815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139309980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139310031 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139311010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139311153 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139311524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139311555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139311612 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139312431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139312852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139312916 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 139313856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139314252 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 139314371 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 139314503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139314504 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 139315191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139316361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139316938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139316972 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139316984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139317030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139317306 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 139317644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139318057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139318460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139318649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139318986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139319273 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139319416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139319417 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139320659 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139320874 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 139320961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139321594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139321878 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139321946 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 139322074 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139322173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139322235 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 139324364 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139324789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139325429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139325596 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 139325784 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 139326094 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 139326203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139326245 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 139326397 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 139326747 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139327120 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 139327187 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 139327461 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 139327888 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 139328768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139329061 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139329300 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 139329500 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139329564 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139331792 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139334890 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 139335479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139337413 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139337475 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 139337484 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 139337748 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 139338549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139338641 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139339371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139339930 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139340649 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139340693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139341392 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139341573 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139345573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139345699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139346111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139354563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139355721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139356068 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139356930 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139359260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139359387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139359493 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139360360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139360878 A G Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 139361585 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 139362492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139364222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139364535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139367045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139368399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139368739 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 139369113 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139369336 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139370325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139370757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139371230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139371482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139371890 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139371931 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 139372786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139375127 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139377309 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 139377533 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139377978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139378480 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139378499 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139378591 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139378651 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139378720 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 139379540 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139379721 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139380146 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139380460 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139380663 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139380796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139381129 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139382200 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139383676 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139384472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139385069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139387424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139387431 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139387515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139387527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139388866 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139389108 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139389215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139389243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139389252 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139389643 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139390080 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139390473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139390695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139391422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139391594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139392307 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139393775 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139393962 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139394000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139394532 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139394951 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139395572 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139395758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139396890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139400904 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139401652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139402953 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139403183 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139404713 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139406726 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139410873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139411310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139413303 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139413488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139413523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139415339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139415474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139417926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139418188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139419480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139420672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139422769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139425544 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139429705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139430939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139431701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139431789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139433898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139435491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139435976 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139436571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139437410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139438037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139438284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139438657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139439097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139439204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139439913 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139440691 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139440692 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139440703 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139440729 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139440740 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139440767 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139441089 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139441301 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139441640 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139441963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139443004 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139443760 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139445629 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139445894 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139447718 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139448355 C T Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 139450647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139451636 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139452202 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139452455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139453028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139453226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139453260 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 139453377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139453466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139453470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139453497 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139453650 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 139453846 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139454165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139454228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139454256 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 139455724 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139456452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139458176 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 139458992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139459499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139459563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139460988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139462352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139466145 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139469050 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139471075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139472011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139472229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139472496 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 139473453 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139473729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139475929 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139476697 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139476861 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139477528 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139477782 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 139478336 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 139478410 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 139478500 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 139478507 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 139478603 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 139478739 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 139479019 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 139479147 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139479279 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 139479467 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139479727 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 139479749 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 139479997 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 139480060 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 139480266 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 139480425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139480899 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139481152 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139481202 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139481259 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139481751 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 139481859 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139481864 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139482094 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139482106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139482384 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 139482646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139482654 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139482673 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139485122 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 139485945 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139486108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139486512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139487036 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 139487376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139487536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139488241 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139488302 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139489658 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 139489707 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139492098 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139492233 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 139492917 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139492993 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139493139 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 139493206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139493329 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139493453 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 139493525 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 139493548 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139494141 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139494281 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139494987 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139495035 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 139495636 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 139495641 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139496024 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 139496140 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 139496505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139496520 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 139497403 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 139497829 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139498436 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 139498493 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139498508 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139498579 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139499438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139499948 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139500056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139501019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139501101 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139501247 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 139501333 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139501417 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 139501430 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139501884 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139503787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139503850 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139505288 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 139505558 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139506217 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 139506263 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 139507696 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 139509277 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 139509425 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139513104 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139513442 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139513887 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139514300 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139515005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139517441 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139517510 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139519657 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139520325 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139521671 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139528567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139528872 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139529429 C A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 139530476 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139531333 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139533372 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139533476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139534898 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139535871 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 139537512 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139537929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139541559 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139541647 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139541932 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139541948 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139541970 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139541972 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139542009 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139542320 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139542390 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139542585 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139542606 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139542665 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139542673 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139542701 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139542871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139542981 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139543138 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139543243 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139543244 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139543296 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139543318 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139543329 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139543347 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139543404 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139543433 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139543434 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139543455 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139543607 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139543741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139543782 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139543858 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 139543882 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139543919 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 139543946 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 139543963 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 139543966 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 139544064 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139544107 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 139544114 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 139544124 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139544208 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 139544214 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139544223 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 139544227 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 139544246 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 139544603 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139544656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139544762 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139544985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139545046 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139545049 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139545102 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139545115 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139545292 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 139545358 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 139545377 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 139545936 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139546051 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139546480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139547744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139548538 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 139548658 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 139548725 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 139549025 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139549559 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 139549796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139550588 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 139550697 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 139550785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139550922 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 139550954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139551135 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139551684 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139551886 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139552386 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 139552628 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139553740 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 139553882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139554081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139554322 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139554961 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139554987 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139555066 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139555110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139555161 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139555221 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139555758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139556277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139556592 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139557356 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139557376 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 139557566 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139557632 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 139557656 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139557912 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139558034 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139558085 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 139558278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139558308 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139558328 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139558446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139558546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139558960 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 139559043 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139559146 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 139559413 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139559629 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 139559653 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 139559737 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139560141 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139560298 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139560334 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139560355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139560603 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139560616 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 139560664 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139560895 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139560981 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 139561103 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139561106 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139561134 G T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 139561136 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 139561378 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 139561414 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 139561541 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139561588 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139561802 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139561879 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 139562001 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139562280 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139563038 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 139563165 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139563193 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 139563295 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 139563497 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139563651 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139565073 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139565433 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 139565527 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 139565664 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139565745 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139566102 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139566494 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 139566538 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 139566706 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 139566820 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 139566894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139567310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139567590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139567647 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139567752 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139567837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139567900 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 139568157 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139568166 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 139568198 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139568266 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139568807 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 139568872 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139569017 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139569625 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139569716 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 139569767 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139570142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139570160 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 139570334 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 139570362 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 139570545 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 139570566 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 139570589 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139570709 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139570791 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 139570955 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 139571099 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139571155 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 139571289 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 139571351 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 139571398 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 139571444 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 139571533 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 139571547 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 139571668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139571921 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139572029 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139572126 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 139572147 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 139572291 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139572405 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139572481 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 139572701 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139572834 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139572893 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139572939 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 139573470 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139573477 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139573709 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 139573920 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 139573955 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139573976 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139574065 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139574401 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139574424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139575426 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 139575447 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139575693 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 139576997 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139577037 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139578423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139579065 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139579242 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 139579390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139579442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139579871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139580458 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139580460 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139580847 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139582454 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139583844 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139584247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139584571 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 139584581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139584925 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139584957 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139585010 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 139585857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139585896 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139585925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139586202 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139586361 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 139586772 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 139587116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139589519 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139590005 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139590383 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139597355 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139599505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139600453 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139600643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139600761 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139601202 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139605911 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139607395 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139608926 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 139609517 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139612187 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 139613778 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 139614136 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139614649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139617085 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139617179 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139618404 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139619001 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 139619169 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139620682 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 139620866 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 139621211 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139621602 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 139621700 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 139623949 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139624989 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139626094 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 139626141 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 139626165 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139626311 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 139626464 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 139626645 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 139626730 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 139626784 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 139626818 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 139626896 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 139627134 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 139627147 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139627291 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139627292 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139627344 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139627353 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 139627364 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139627390 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139627395 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139627476 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 139627489 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139627651 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139627656 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139627700 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139627705 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139627762 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 139627771 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 139627790 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139627916 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 139627918 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 139627947 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 139627986 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139628017 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139629722 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139630414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139631717 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 139631981 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139633124 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 139633399 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139634938 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139634966 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139636589 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139638703 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139640067 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139640508 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139644552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139646114 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 139646438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139648911 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 139649586 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139649847 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 139650574 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139651468 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139651815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139651966 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139654236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139656273 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 139656320 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139656416 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 139656446 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 139656486 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 139656653 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 139656778 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139656792 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 139656811 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 139657064 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139661493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139663289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139663630 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139664501 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139664588 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 139667484 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 139669025 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 139676234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139680067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139683122 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139684371 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 139684683 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.307692307692308 17 9 8 1 4 2 139687084 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 139687709 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139687953 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 139688128 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139688457 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 139690601 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 139691344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139691735 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 139695948 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139696600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139697486 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 139698316 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139701803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139702174 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139703899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139704752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139707792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139707795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139708104 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 139708528 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 139711593 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139713156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139715055 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139715882 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139716359 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139719135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139721390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139722580 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139722664 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139724049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139731084 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 139731573 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139731873 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 139732029 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 139732145 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 139732246 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139732251 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 139732310 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139732323 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139732372 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139732396 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 139732536 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 139732567 T A Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 139732729 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 139732754 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 139733179 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 139733486 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 139733527 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 139733616 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 139733811 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 139733960 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 139733995 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 139734061 G C Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 139734238 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 139734559 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 139734773 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 139735005 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 139735014 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 139735091 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 139735105 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 139735315 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139735450 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 139735461 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 139735796 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 139736363 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139736851 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139737322 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 139737417 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 139737441 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 139737460 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 139737691 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 139738209 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139738612 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139738745 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139738838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139739458 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 139739550 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 139739551 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 139739644 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 139739684 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139739731 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139739930 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 139740099 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139740307 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 139741124 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 139742811 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139743182 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 139744414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139747276 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139747610 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 139747900 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 139749097 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139749586 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 139749822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139751994 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139752583 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 139752721 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 139753210 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139753298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139753377 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139753537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139754056 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139754234 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 139754420 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 139754462 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 139754552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139754598 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 139754627 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 139754741 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 139756331 A T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 139756482 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139756555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139756970 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139757957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139758032 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139758199 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 139758213 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139759193 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 139759295 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139759362 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139759369 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139759422 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 139759519 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139759538 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139759567 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 139759780 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139759822 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 139759909 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139759926 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139759969 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139760023 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139760042 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 139760090 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139760195 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139760266 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139760310 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 139760317 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 139760341 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 139760360 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139760679 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 139760807 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 139761103 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139761211 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139761306 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 139761379 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 139761518 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 139761527 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139761636 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139761653 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139761699 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 139761959 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139762113 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139762348 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139762386 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139762538 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139762648 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 139762694 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 139763032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139763066 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139763137 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 139763478 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139763764 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139764272 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 139764677 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139769567 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139771567 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 139771881 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 139772500 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139773091 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139773381 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 139773553 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 139773557 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 139773632 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 139773759 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 139774247 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 139774305 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 139774635 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 139774662 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 139774884 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 139774929 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 139774993 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 139775068 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 139775209 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 139775293 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 139775344 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 139775370 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 139775442 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 139775466 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 139775498 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 139775507 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 139775556 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 139775594 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 139775636 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 139775745 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 139775779 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 139775800 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 139775938 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 139776104 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139776117 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 139776423 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 139776436 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 139776459 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 139776630 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139776679 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139776781 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 139777412 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 139777841 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 139781588 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139781674 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139781760 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139783711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139785482 T C Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 139786920 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 139787315 G A N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 139788058 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 139788538 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 139789216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139790046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139790547 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139791514 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139793397 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139793809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139794082 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 139794371 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 139794977 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139795463 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139795892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139796457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139797225 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 139798644 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139800064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139800120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139800157 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 139800270 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 139800312 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139800341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139800641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139800671 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 139801047 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139801263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139801317 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139802490 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 139803137 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139803945 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139803999 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139805021 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139806578 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139806810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139808682 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 139809826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139810014 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139810738 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139812900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139813107 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139816049 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139816076 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 139816116 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139816210 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 139816350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139816864 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139816979 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139817237 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 139817552 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 139817786 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 139818008 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 139818397 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 139818573 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 139818696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139818871 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139819166 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139819316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139819392 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 139819418 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 139819483 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139819573 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 139819995 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139820025 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139820178 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139820264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139820349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139820795 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139820967 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139821139 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139821224 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139821443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139821732 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 139821740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139822288 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139822398 G A N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.272727272727273 0.0909090909090909 0.636363636363636 7 15 3 1 7 2 139822448 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 139822480 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 139822532 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 139822583 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 139822604 C T N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 139822637 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 139822690 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 2 139822774 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 2 139822784 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 2 139822814 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 2 139822866 C A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 2 139822892 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 2 139822926 A T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 2 139822985 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 2 139823044 T G N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 139823048 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 139823093 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 139823240 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 139823314 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.25 0 0.75 6 18 3 0 9 2 139823377 A T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 139824301 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 139824314 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 139824315 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 139824348 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 2 139824366 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 2 139824372 A T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 2 139824387 T A N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 2 139824414 T A N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 2 139824488 C A N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 2 139824571 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 139824650 C A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 2 139824651 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 2 139824755 G A Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.384615384615385 15 11 7 1 5 2 139825049 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 2 139825342 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 2 139825429 G T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 2 139825698 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 139825771 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139825815 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139825993 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139826220 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139826355 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 139826474 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139826475 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139826504 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139826522 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139826539 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139826642 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 139826651 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139826699 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139826817 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139827042 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 139827069 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 139827128 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139827135 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139827224 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 139827258 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139827401 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 139827505 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 139827536 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 139827546 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139827869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139828011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139828027 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 139828126 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139828330 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 139828345 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 139828445 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139828512 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139828964 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 139829022 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139829523 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139829580 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139829635 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139829674 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139829697 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139829757 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139829773 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139829913 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 139829951 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139829959 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139830286 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139830316 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139830359 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139830876 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 139830924 C G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 139830937 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 139831031 G T Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 139831056 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 139831227 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 139831429 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 139831455 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139831482 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 139831515 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 139831557 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139831785 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 139831860 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 139832041 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139832044 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139832072 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139832126 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139832195 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139832285 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 139832299 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139832394 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139832401 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 139832482 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139832554 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139832598 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139832618 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139832711 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139832747 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 139832807 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 139832906 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 139833155 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 139833280 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 139833602 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 139833639 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139833952 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 139833974 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139833989 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 139834028 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139834214 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 139834457 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139834599 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 139834640 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 139834649 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139834712 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 139834733 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139834750 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139834945 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 139835130 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139835221 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139835281 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 139835336 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139835520 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139835542 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139835581 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139835666 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139835681 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139835750 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139835831 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139835996 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 139836026 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 139836103 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139836163 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 139836247 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139836310 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 139836366 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 139836372 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 139836457 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139836557 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139836576 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 139836586 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 139836593 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 139836617 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 139836758 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 139836759 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 139836873 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 139836909 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 139837135 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 139837170 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 139837192 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 139837193 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 139837237 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 139837361 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 139837389 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139837516 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 139837535 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139837548 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139837661 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139837715 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139837727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139837751 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 139837784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139837956 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139838167 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139838179 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139838252 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 139838256 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 139838393 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139838432 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139838443 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139838503 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 139838516 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 139838621 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 139838740 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139838876 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139838884 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139838955 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139838970 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139839020 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 139839052 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 139839107 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139839120 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 139839241 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139839257 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 139839284 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 139839306 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 139839370 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139839373 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 139839519 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139839549 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 139839621 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139839636 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139839748 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139839992 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139839994 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139840195 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 139840495 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 139840496 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139840542 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139840587 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139840598 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 139840601 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 139840775 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139840787 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139840971 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139840977 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139841441 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 139841465 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139841478 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139841671 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139841719 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139841737 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139841960 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 139842064 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139842119 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 139842211 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139842268 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139842423 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139842470 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 139842497 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 139842515 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 139842612 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139842746 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 139842826 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 139842858 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 139842978 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 139843002 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 139843037 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 139843086 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 139843140 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139843514 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139843522 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 139843594 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139843715 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139843894 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139844045 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139844049 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139844114 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 139844145 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139844147 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 139844236 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139845165 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 139845225 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 139845229 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 139845345 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139845459 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 139845596 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139845802 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139845840 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 139845868 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 139846101 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139846161 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 139846248 T A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 139846277 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 139846283 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 139846289 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 139846342 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139846365 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139846595 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 139846746 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 139846753 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 139846764 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 139846780 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139846823 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139846950 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 139846991 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139847151 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 139847165 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 139847210 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 139847363 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139847386 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139847402 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 139847600 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 139847602 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 139847926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139848091 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139848339 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 139848466 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 139848717 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 139848753 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 139849110 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139849457 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 139850334 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 139850700 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 139851012 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 139851544 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 139852185 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139852216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139852258 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 139852263 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 139852281 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 139852539 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 139852911 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139853446 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 139853759 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 139853805 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 139853982 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 139854007 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 139854068 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 139854409 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139854419 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 139854592 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139854691 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139854781 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139854819 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139854925 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 139855104 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 139855859 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139856021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139856071 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139856250 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 139856448 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139858737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139860051 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139860119 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139860541 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139860544 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139860734 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 139860819 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 139860938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139861817 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139862406 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139862923 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 139862999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139863425 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139863610 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 139863643 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 139864380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139864603 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139864919 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139865829 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 139865890 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 2 139865945 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 139867127 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139867297 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139867410 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139867416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139867707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139867757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139867796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139869084 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139869754 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 139870646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139872085 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 139872318 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 139872808 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 139873037 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 139873662 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 139876012 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 139876437 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139877318 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139877382 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 139878136 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 139878903 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 139879671 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 139879939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139880137 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139880149 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 139880328 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 139881169 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139883669 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 139883685 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139883717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139883923 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139884060 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 139884074 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139884078 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139884564 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139885628 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139886273 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 139886457 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139887307 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139888033 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139888980 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139891203 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139892692 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 139892714 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 139892845 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139892915 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139892933 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 139892978 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139893006 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139893266 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139893511 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139893758 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 139893830 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 139893853 T C N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 139893872 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 139893901 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 139894026 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139894115 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 139894146 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 139894222 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 139894319 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 139895035 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139896352 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 139896415 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 139896457 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139896458 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139896606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139896618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139896728 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 139897025 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 139897170 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 139897287 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 139897309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139897323 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 139897331 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 139897468 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 139897469 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 139897486 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 139899252 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139901738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139901808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139907198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139908209 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139908228 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139910659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139911604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139914883 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139915211 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 139915429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139915812 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139919088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139920934 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 139921092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139921269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139922847 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 139923697 T C Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 139928377 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139928468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139929689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139930932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139932953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139934183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139934542 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139936167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139937449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139937538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139937562 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 139938125 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 139938193 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 139938212 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 139938270 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139940742 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 139941128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139943761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139946836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139947264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139952001 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139952852 G C Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 139953046 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 139953127 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139956703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139958704 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 139960767 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139961622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139962743 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 139963465 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 139964181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139964593 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 139964819 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139966681 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 139966686 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 139966741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139968170 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139969793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139969897 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139970701 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139971166 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139971613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139976609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139976924 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139978849 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 139978912 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139980341 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139982779 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 139989817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139990233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139992131 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139992593 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139993648 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139993882 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 139995003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139995129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139995490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139995622 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139995630 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139996639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139996683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139996758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139996807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139996832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139996993 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 139997016 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 139997076 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 139997153 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 139997278 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 139997306 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 139997481 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 139997545 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 139997565 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 139997667 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 139997917 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139998022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139998121 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 139998185 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 139998210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 139998226 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 139998227 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 139999200 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 139999308 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 139999361 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139999367 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 139999410 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 139999430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 139999449 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 139999537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 139999644 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 139999777 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 139999853 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 140000012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140000015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140000045 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 140000439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140000930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140000984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140001196 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140001359 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140001500 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 140001687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140001717 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140001746 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 140001840 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140001856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140002121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140002181 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140002218 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 140002430 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140002712 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 140005371 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 140005409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140005520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140005570 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 140005763 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 140005986 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 140006127 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140006303 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 140006310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140006467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140006536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140006956 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 140007000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140007163 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140007634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140007868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140007869 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140008140 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140008143 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140008219 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140008264 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 140008267 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 140008435 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140008445 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140008773 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140009084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140009157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140009164 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140009193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140009212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140009257 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140009291 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140009313 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140009551 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 140009561 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140009796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140009799 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140009893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140010234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140010249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140010336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140010493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140010559 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140010776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140010837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140010858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140010936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140010952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140010958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140011026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140011442 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 140011608 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 140012295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140012394 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 140013812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140014023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140014702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140015283 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 140015404 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 140015658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140015865 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 140015985 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140020410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140020658 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140021908 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140024731 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 140025841 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 140026067 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 140026219 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 140026308 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 140026436 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 140026585 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 140026696 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 140027194 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 140027210 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 140027269 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 140027289 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 140027707 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 140027744 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 140027770 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 140028294 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 140028329 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 140029129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140029265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140029339 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 140029472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140029589 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140029621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140029931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140030016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140030723 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 140030726 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 140030814 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 140030939 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140031062 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140031266 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 140032741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140033838 T A Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 140034368 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 140035132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140036316 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140036383 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140037006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140038268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140039216 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140039268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140043380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140043451 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140043609 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140043676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140043753 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140043811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140043823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140043911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140044092 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 140044107 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 140044142 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 140044145 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 140044220 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 140044348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140044392 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140044773 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140045055 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140045060 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140045166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140045169 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 140045198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140045224 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 140045366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140045393 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 140045494 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140045511 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 140045530 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 140045860 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140045946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140045958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140045968 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 140046059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140046372 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 140047002 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 140047120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140047136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140047220 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 140047470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140047612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140047627 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140047681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140047721 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 140047790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140047944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140047971 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 140048420 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140048674 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140048711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140048784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140048947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140049561 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 140049631 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140049636 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 140049677 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140049692 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140049696 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140049705 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 140049848 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 140049970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140050051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140050303 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 140050330 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 140050496 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140050639 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 140050641 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 140050668 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 140050678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140050796 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 140050825 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 140051043 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 140051238 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 140051446 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 140051717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140051841 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 140052011 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 140052319 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140052444 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140052599 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 140053338 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140053418 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 140053685 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140055090 G T Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 140055631 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 140055924 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140056066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140056905 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 140056937 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 140057320 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 140057352 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140057545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140057660 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140057928 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 140058547 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140058625 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 140058932 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 140058954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140058990 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140059167 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 140059297 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 140059614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140059680 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 140059703 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140059905 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 140059917 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 140060111 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140060179 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 140060424 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 140060600 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 140060679 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140060851 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 140061447 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140062492 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 140062513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140062628 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 140062769 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 140062865 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 140062942 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 140063044 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140063377 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140063464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140063479 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 140063580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140063600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140063620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140063702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140063710 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 140063820 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 140063833 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140063964 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 140063995 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140064138 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140064626 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140065186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140065440 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 140065451 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 140065487 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 140065509 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 140065542 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 140065573 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 140065581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140065705 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 140065772 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 140065799 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 140065866 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140066005 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 140066097 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 140066112 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140066125 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 140066244 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140066368 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140066462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140066950 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140066980 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 140067446 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 140067628 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140067842 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140068004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140068320 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140068670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140068825 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140069141 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140069250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140069254 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140069356 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140069562 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140069695 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140069900 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140070305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140070420 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140070431 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 140070610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140070721 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 140070737 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 140070765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140071028 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140071070 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 140071295 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 140071806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140072357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140072395 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140072424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140072562 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140073440 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140073629 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140073922 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 140074096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140074181 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 140074438 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 140074645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140074870 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140075117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140075221 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140075648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140076390 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 140077033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140077315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140077613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140078334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140078598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140080012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140080164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140081506 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 140081785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140082160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140082397 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 140083474 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 140083487 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 140083611 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 140083643 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 140083764 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 140083808 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 140084033 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 140084081 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140084297 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140084302 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140084311 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140085468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140085909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140086156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140086312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140086435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140086573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140086769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140086804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140086941 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140086968 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 140087029 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 140087321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140087405 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 140087716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140087813 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 140087966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140087993 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 140088065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140088682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140088987 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 140089521 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 140089522 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 140089850 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 140089874 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 140089876 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 140089932 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140090053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140090649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140090695 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140090915 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140091097 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140091184 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140091211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140091344 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140092008 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140092189 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 140093233 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140093348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140093572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140093599 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 140093677 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 140093999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140094068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140094786 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140094890 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140094974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140096076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140096629 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140098454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140099165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140100412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140102054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140104110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140104723 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 140105728 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140106448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140106617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140108439 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140108612 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 140109311 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140109457 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 140109839 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 140109846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140110076 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 140110177 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 140110451 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 140111398 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 140111433 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 140111747 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 140112232 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 140112599 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140112750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140112964 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140113366 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 140113702 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140113709 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140113743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140113805 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140113812 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140114540 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 140114718 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140114739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140114916 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 140114921 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140115059 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140115279 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 140115393 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140115595 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 2 140116050 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 2 140116082 A T Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.0833333333333333 12 12 1 10 1 2 140116189 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 140116312 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 140116413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140116459 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140116473 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140116551 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140116790 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140117152 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 140117236 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 140117337 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140117443 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 140117814 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 140118407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140118620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140118747 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 140118884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140119366 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 140119369 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140119499 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140120110 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 140120151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140121584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140121785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140122688 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140123045 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140123046 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 140124090 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.0526315789473684 19 19 1 17 1 2 140124310 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140124442 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 140124627 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 140124664 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 140124688 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 140124894 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140125296 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 140125311 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 140125440 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 140125998 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140126040 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140126608 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140127085 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140127982 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140128450 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140128941 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140130079 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140130101 G T Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 140130188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140130243 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 140130638 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140130665 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 140130681 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 140131024 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140131025 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140131840 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 140132285 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 140132949 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 140132961 C G Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.7 0 0.3 14 6 7 0 3 2 140132973 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 12 6 6 0 3 2 140133112 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.6 0 0.4 12 8 6 0 4 2 140133229 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 140133367 T C Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 2 140133825 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 140134012 T C Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 2 140134100 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 2 140136777 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140136826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140137547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140138041 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140138184 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140138244 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140138566 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140139455 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140142062 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140142188 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140142328 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 140142346 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140142383 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 140142425 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140142599 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140142902 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140143882 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140144353 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140144354 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140144393 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140144593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140144719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140144868 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140144978 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 140145012 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 140145361 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140146292 T G Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 140150213 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140150288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140150757 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140151118 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140151540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140151737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140151884 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140151900 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140151973 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140151978 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 140152021 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 140152054 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140152090 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140152098 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140152139 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140152147 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140152188 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140152216 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140152218 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140152242 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140152245 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140152380 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140152388 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140152539 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140152552 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140152590 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140152927 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140153112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140153847 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140153920 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 140154115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140155251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140155484 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140155850 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 140156327 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 140156328 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140156384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140156671 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140156753 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140157401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140157689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140158219 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140158827 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 140159067 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140159835 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140159939 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140159996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140160024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140160076 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140160091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140160407 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 140160444 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 140161043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140161293 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 140161323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140161412 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 140161735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140161756 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140161944 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 140161950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140161980 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140162198 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140162361 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140162407 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140162452 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140162502 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140162566 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140162569 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140162646 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140162695 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140162740 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140162783 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140162819 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140162932 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140162971 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140163024 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140163042 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140163107 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140163111 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140163118 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140163153 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140163160 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140163193 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140163349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140163607 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140163630 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140163642 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140163701 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140163705 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140163978 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140163980 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140164044 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 140164180 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140164198 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140164209 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140164217 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140164221 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140164529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140164555 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 140164565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140164580 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 140164729 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140164741 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140164751 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140164866 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 140164905 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140165024 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 140165052 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140165053 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140165200 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 140165264 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 140165390 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140165684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140165909 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140165911 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 140166295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140166301 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 140166312 A T Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 140166319 A T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 140166562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140166611 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140166639 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140166827 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140166838 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140166902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140166941 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140166998 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140167044 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140167066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140167651 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140167695 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140167722 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 140167730 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 140167801 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 140168121 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 140168141 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140168159 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 140168201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140168492 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 140168506 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 140168518 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 140168581 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 140168707 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 140168793 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140168813 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140168846 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140168848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140168866 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140168874 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140168880 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140168923 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140168983 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 140169005 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140169060 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140169083 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140169112 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140169127 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140169175 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140169179 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140169190 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140169220 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140169234 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140169386 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140169488 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140169722 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140169805 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140169819 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140169943 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 140170009 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 140170014 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 140170023 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 140170030 T C Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 140170039 C G Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 140170176 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 140170219 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 140170280 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 140170305 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140170332 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140170378 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140170397 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140170410 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 140170501 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 140170517 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 140170674 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140170703 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140170717 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 140170784 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 140170952 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 140170971 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 140170982 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 140171074 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140171108 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 140171155 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 140171170 A C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 140171192 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 140171216 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 140171378 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 140171436 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140171456 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 140171545 C A Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 140178137 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 140178169 G C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 140178275 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 140178346 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140178355 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140178383 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 140178385 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140178484 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140178585 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 140178589 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 140178601 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140178700 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140178751 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140178900 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140179114 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 140179143 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 140179181 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 140179344 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 140179444 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 140179472 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140179493 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140179558 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 140179783 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 140179822 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140179939 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140180073 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 140180265 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 140180295 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 140180628 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140180690 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140180736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140180812 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 140180828 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 140180879 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140180902 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140180932 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140180989 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 140181086 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 140181123 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 140181133 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 140181137 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 140181154 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 140181191 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 140181194 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 140181214 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140181259 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 140181319 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 140181362 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140181409 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140181414 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 140181476 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140181541 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 140181620 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140181792 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140181799 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140181818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140181823 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140181940 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140181963 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140181987 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140182017 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140182038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140182046 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140182122 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140182183 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140182201 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140182248 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140182251 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 140182906 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 140183270 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 140183513 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 140183729 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 140183758 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 140183857 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140183976 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140184166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140184200 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140184210 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 140184229 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 140184239 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 140184274 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140184322 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140184339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140184409 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140184419 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140184548 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 140184651 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140184671 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140184691 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140184701 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140184707 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140184728 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140184770 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140184865 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140184869 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140184904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140184969 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140184978 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140185056 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140185094 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140185113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140185155 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 140185179 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140185228 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140185248 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140185264 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 140185389 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140185525 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140185607 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140185694 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140185717 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140185880 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 140185928 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140185934 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140185956 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140185973 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140185978 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140186087 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 140186224 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140186479 C T Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 2 140186541 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 140186639 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 140186759 G A Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 140186809 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 140187207 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 140187294 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140187395 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140187463 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140187470 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140187623 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140187734 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140187807 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140187809 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140187853 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 140187864 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 140188111 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 140188243 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140188359 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 140188618 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140188639 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140188854 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140189025 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 140189148 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140189234 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 140189352 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140189372 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140189396 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140190135 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 140190167 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 140191147 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140191255 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140191548 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 140191568 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 140191996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140192179 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140192254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140192368 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140192472 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 140192474 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140192577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140194134 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140194169 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140194593 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140194735 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140194870 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140194871 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140194925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140195088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140195091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140195501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140195737 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140195784 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140195816 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140195943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140195962 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 140196078 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 140196201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140196307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140196407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140196686 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140196737 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 140196738 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 140196785 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 140196812 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140197022 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 140197042 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140197046 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140197151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140197856 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 140198334 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140199022 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140199228 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140199435 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140199667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140199994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140200181 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140200185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140200227 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140200280 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140202039 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 140202598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140203008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140203391 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 140203915 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140204977 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140205150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140207016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140207420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140207755 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140208455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140208456 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140208832 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 140208855 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140208936 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140209307 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140209363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140209406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140209600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140209727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140209730 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140209911 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140210316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140211153 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140211212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140211225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140211342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140211356 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140211556 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140211604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140211624 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140211954 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 140211967 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 140212068 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 140212960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140213069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140213581 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140213686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140213696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140214187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140214234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140215126 C A N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 2 140215255 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140215607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140215649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140215936 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140216022 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140216131 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140220056 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140220506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140222446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140223380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140226316 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140228253 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140228667 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140230132 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140230352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140232276 C G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 140233813 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140234612 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140235017 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140236698 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140238306 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140238748 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140239699 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140240207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140241534 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140242111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140243548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140243985 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140244030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140244430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140246668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140246907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140247022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140247274 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140250247 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140250709 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140250751 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140250858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140252501 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140252998 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140253258 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140253326 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140253495 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 140253859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140254188 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140256265 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140257553 A T N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 9 11 1 7 2 2 140257676 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140258815 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140260260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140261274 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140263486 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140268619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140270158 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140270580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140270581 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140271029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140271412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140272718 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 140273126 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140273241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140273735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140273897 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 140274408 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140276205 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140276871 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140278161 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140279308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140280011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140281589 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140282470 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 140282704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140284159 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140290509 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140290655 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140290820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140290968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140291143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140292454 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 140293587 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140293648 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140294686 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140295283 C T Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 140295866 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 140298534 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140298636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140301494 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140301658 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 140302209 T A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 140303634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140304211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140304749 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140306090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140307777 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 140310030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140312625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140313571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140315260 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140315444 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140315618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140315717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140315916 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140316021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140316114 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140317560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140318594 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 140318693 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140319245 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140320022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140320524 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140320637 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140322152 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140322340 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140322343 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140323047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140323790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140324102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140325635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140326240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140326405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140327154 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140327355 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140328675 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 140328840 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140331193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140333033 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140334695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140334898 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140336013 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140336581 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140338079 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140340036 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140340220 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140340529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140341049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140341085 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 140341370 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140342066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140342237 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140343224 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 140343348 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140343773 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 140343886 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140344331 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140345326 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140345529 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 140345824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140345985 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140346020 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140346690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140347247 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140348659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140348663 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140349030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140349156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140349255 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140349392 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140349588 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140349821 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140350360 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140350671 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140351063 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140351636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140351678 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140351795 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140351949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140351963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140352166 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140352449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140352550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140352661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140352664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140352733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140352880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140353101 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140353203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140353346 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140353562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140353597 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140353739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140354069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140354165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140354328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140354414 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 140354610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140354698 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140354822 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140354824 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140354902 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140354927 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 140354954 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 140355117 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 140355172 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 140355438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140355555 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140355582 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140355818 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140355821 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140356544 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140357028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140357954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140359665 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140359846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140359982 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140360322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140360516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140360684 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 140360757 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 140361073 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140361208 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140361954 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140362573 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 140363258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140363302 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140363543 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140364334 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140364426 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140364437 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140364466 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140364486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140372824 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140373295 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 140373497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140374236 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 140374381 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140374413 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 140375283 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140375678 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 140376144 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 140376498 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 140376529 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 140376619 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140376637 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140376702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140376886 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140377168 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140377191 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140377209 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140377409 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140377443 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140377502 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140377532 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140377645 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140377687 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140377712 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140377928 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 140377929 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 140378141 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140378264 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 140379050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140379254 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 140379261 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 140379494 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 140379659 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140379664 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140379742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140379997 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140380056 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140380191 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140380265 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140380478 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140380512 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140380534 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140380828 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 140380867 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140380881 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140380972 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140380975 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140380995 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140381047 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140381354 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140381393 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140381397 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140381424 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140381567 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140381602 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 140381831 G A Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 140381920 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 140381959 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 140381983 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 140381998 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 140382151 G A N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 140382194 A T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 140382204 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 140382205 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 140382445 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140382490 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 140382491 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140382603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140383152 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140383311 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140383410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140383415 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140383571 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140383830 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140383924 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 140383970 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 140384009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140384428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140384444 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140384544 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140384655 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140384757 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140384991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140385010 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140385068 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140385581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140386268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140386630 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140386674 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140387367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140387381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140387389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140387872 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140388022 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140388178 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140388405 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140388412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140388467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140388570 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140388670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140388728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140388740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140389292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140389465 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140389659 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140389813 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140389834 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140390017 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140390295 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140390402 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140390442 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140390460 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140390491 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140390508 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140390637 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140390667 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140390671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140390680 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140390716 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140390940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140391056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140391146 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140391286 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140391399 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140391441 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 140391639 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140392232 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140392345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140392437 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140392712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140392753 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140392760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140392780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140392797 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140392860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140392984 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140392994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140393036 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140393098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140393110 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140393117 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140393210 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140393211 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140393266 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140393316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140393346 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140393444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140393497 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140393507 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140393523 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140393578 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140393580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140393594 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140393657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140393706 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140393811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140393821 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140393861 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140393882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140393885 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140393919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140393975 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140394004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140394034 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140394081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140394285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140394366 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140394451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140394526 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140394555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140394845 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140394931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140394975 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140395464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140395465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140395552 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 140395553 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140395587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140395589 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140395674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140395755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140395872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140395917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140395921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140395930 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140395990 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140396057 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 140396263 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 140396962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140397009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140397318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140397358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140397376 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140397388 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140397454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140397541 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140397724 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140397796 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140397819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140397900 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140397909 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140397913 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140397947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140397954 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140398099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140398207 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140398428 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140398673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140398877 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140399246 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140399425 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140399530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140399598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140400836 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140401184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140402322 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140402532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140403947 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140405814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140405924 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 140406310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140406835 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140406920 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140407236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140407354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140409943 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140410067 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140410778 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140410896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140411678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140411738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140411802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140411813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140411815 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140412009 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 140412354 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140412509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140413199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140413279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140413295 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140413342 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140413511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140413844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140413929 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140413930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140413998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140414163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140414178 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140414598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140414612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140414620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140414623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140414640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140414679 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140414684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140414693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140414905 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140415100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140415681 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140416979 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 140419647 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140421861 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140422050 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140425063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140425565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140426490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140427131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140431091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140431357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140432096 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140437159 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140438294 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140441513 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140442509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140442602 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140442715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140442756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140443416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140443438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140443619 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140443921 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140444322 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140444879 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140445252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140445453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140445464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140445522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140445886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140446478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140447449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140447467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140447888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140448021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140448668 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 140449536 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140449605 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140452023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140452548 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 140453167 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140454555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140456023 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140456090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140456865 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140457041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140461479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140463005 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140463006 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140463040 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140463843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140463931 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140463982 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 140466931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140469176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140472189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140474626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140474795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140475064 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140475249 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140475510 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140476887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140477654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140478234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140480004 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 140480162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140480351 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140480860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140481707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140483490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140483699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140484615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140487107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140488391 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140489704 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140490005 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140490007 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140490025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140490134 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140492402 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140492481 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140492638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140492705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140493204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140493312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140493477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140495513 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140496726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140498932 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140499391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140499937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140501745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140502024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140502454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140504952 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140506196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140507274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140507310 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140512406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140513241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140514182 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 140515299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140516724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140518567 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140521595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140522144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140522855 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140524210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140525759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140527415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140529777 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140532569 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140533240 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140533550 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140533766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140534532 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140535075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140537034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140537556 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140539956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140540521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140540638 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 140541386 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 140542648 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 140542714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140543231 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140543251 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140544112 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 140544477 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140544700 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140544824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140544857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140545051 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 140546160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140548537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140551909 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140552860 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140555154 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140555155 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140556297 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140557514 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140558698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140558970 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140568038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140568341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140570879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140584818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140584908 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140587061 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140587329 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 140587406 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140587564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140587995 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140588669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140589177 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140589452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140590020 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140590842 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140592334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140594257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140594401 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140594678 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140594845 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140594862 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140594954 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140595140 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140595351 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 140595482 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 140595682 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 140595732 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 140595850 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 140595936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140596080 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 140596238 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 140596337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140596404 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140596428 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 140596504 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 140596505 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 140596518 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 140596592 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 140596607 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140596787 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 140596843 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 140596904 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 140597151 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 140597470 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 140597472 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140597598 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140597736 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 140597779 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 140597789 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 140597814 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140597991 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140598040 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 140598236 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140598372 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 140598374 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 140598506 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140598654 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140598665 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 140598708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140598722 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 140598758 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140598897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140598991 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 140599143 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140599168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140599393 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 140599561 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 140599866 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 140599925 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140600042 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 140600088 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 140600135 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140600200 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140600247 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 140600384 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 140600461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140600476 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 140600597 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140600614 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 140600839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140600989 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140600999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140601070 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140601157 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140601199 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 140601271 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140601871 T A N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 140601883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140601952 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 140602033 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140602050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140602060 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140602214 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140602283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140602315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140602370 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 140602456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140602582 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140602649 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140602685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140602746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140603191 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140603430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140603447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140603920 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 140603932 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 140603943 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 140604059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140604067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140604140 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 140604212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140604224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140604228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140604504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140604509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140604565 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140604587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140604692 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 140604728 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140604730 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140604801 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 140605212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140605318 T G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 140605486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140605608 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140605805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140606180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140606245 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 140606269 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 140606309 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 140606399 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 140606468 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140606817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140606821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140606833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140606848 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140606863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140606904 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140607082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140607129 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140607448 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 140607485 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140607487 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140607508 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 140607754 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 140607936 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 140608081 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140608568 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 140608872 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 140609485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140609647 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 140610026 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 140610647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140610674 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 140611543 T A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 140612973 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140613017 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140613264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140613386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140613392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140613820 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140614065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140614331 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140614391 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140614413 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140614549 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140615173 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 140615336 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 140615686 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140615988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140616054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140616137 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140616405 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 140616791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140616852 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 140616866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140616920 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 140616973 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140616992 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140617043 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140617207 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 140617239 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140617495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140617508 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140617578 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140617636 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 140617737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140618208 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140618212 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140618467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140618667 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140618696 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140618739 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140618813 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140620091 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140620332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140620685 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140621895 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140622168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140622571 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140623596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140624267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140625461 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140626551 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140627092 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140627179 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 140627879 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140628061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140628062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140628805 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140629432 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140629567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140629626 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140629994 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140630137 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140630612 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140630843 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140631130 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140631381 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140631396 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140631488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140631706 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140632001 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 140632107 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140632125 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140632382 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140632393 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140632411 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140632444 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140632647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140632932 A G Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 140633075 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 140634506 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140634716 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140635390 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140635617 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 140635922 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 140636369 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140636492 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 140636627 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140636644 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140636865 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140636875 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140636922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140636962 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140637011 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140637046 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140637152 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140637332 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140637441 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140637447 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140637453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140637489 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140637509 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140637584 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140637706 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140637756 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140637976 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140638018 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140638072 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140638108 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140638191 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 140638238 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140638354 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140638416 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 140638435 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140638591 A C Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 140638641 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 140638698 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140638807 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140638866 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 140638887 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 140638927 T C Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 140638937 T G N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 140639037 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 140639044 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 140639079 A T N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 140639195 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140639216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140639239 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140639278 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140639301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140639351 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140639428 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140639516 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140639634 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 140639696 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 140639806 G T Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 140639825 C A N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 140639840 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 140639953 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 140639970 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 140640085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140640263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140640321 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140640397 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140640515 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 140640564 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140640612 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140640652 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140640666 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140640798 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 140640850 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140640955 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140640973 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140641022 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140641118 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140641154 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140641285 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140641319 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 140641322 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 140641446 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140641486 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140641588 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140641653 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140641807 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 140641975 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140642134 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 140642164 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 140642461 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140642462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140642590 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140642632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140642641 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 140642756 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 140642792 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 140643032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140643049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140643165 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140643169 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140643228 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 140643255 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140643263 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 140643477 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 140643516 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 140643589 T C N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 140643607 C T N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 140643723 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 140643737 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 140643749 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 140643769 T A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 140643853 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 140643966 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140644111 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140644188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140645281 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140645532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140645598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140645808 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140645809 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140645862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140646468 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140646532 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 140646894 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140647133 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140647652 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140648217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140648863 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140648936 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140648965 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140649021 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140649127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140649139 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140649175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140649213 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140649251 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140649371 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 140649404 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140649542 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140649546 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140649618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140649661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140649734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140649847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140650042 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140650697 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140650721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140651019 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140651179 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140651206 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 140651827 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 140651895 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 140651993 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140652007 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 140652177 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140652217 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140652308 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 140652310 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140653068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140653528 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140653551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140653571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140653695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140653741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140654016 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 140654112 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140654434 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140654690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140654831 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140654984 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140655203 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140655457 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140655827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140656046 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140656266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140656423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140656607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140656629 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140657833 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140658141 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 140658800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140659650 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140661100 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140661101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140661157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140661160 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 140661294 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140661456 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140661476 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140661589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140661676 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140661727 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140661750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140662030 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 140662054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140662147 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140662280 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140662627 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140662632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140662646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140662728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140662793 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140662996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140663355 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140663387 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 140663397 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 140663438 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 140663447 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140663676 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140663755 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140663801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140664159 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140664491 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140664599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140665290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140665836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140666649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140666775 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140667299 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 140667527 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140667894 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140667940 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140668144 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140668163 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140669563 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140670975 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140671819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140672653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140673205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140673547 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 140673553 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140673651 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140673875 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140674080 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140674187 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140674217 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140674270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140674319 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140674332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140674354 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140674402 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140674491 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140674501 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140674679 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140674702 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140674726 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140674735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140674785 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140674896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140675207 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140675439 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140675715 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140675737 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140675754 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140676578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140676965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140677186 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140677405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140678724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140679838 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140680031 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 140680134 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 140680560 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 140680569 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140680834 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140680938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140681522 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140681697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140681764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140681815 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 140681871 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140681882 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140681969 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140682162 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 140682264 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 140682409 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 140682513 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 140682551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140682696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140682849 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140683270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140683620 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140684301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140686313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140687219 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140687793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140687805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140687910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140688925 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 140689151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140689302 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140690025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140691130 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140693762 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140695975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140697509 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140697633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140698113 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140698881 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140698962 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 140699791 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140700518 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140701736 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 140701984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140702569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140704737 G T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 140705384 C T Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 140705387 G A Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 140705434 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 140705583 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 140705751 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 140705955 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140707930 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140708756 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140709024 T A Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 140709179 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 140709628 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 140709661 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 140709934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140710146 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 140710197 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 140710273 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 140710339 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140710504 A C Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 140710973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140711684 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 140712173 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 140713316 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 140713865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140714091 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140714177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140714334 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140714475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140714525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140714624 A C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 140715278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140715587 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 140715637 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140715755 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 140715769 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 140715865 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 140715870 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 140715876 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 140715886 T A Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 140716633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140716840 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140719181 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140720225 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140720498 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140720972 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 140722234 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 140722412 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140722719 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 140722747 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140722751 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 140722805 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140723054 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140723100 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 140723190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140723202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140723362 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 140724464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140724495 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 140724499 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 140724892 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140725133 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140725368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140725694 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140725698 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140725976 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 140725978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140726081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140726321 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140726558 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140726804 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140726844 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140726961 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140727131 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140727219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140727538 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 140727620 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 140727628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140728152 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 140728172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140728943 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140728962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140729133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140729285 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140730159 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140730208 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 140730417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140730663 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140731124 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140731134 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140731141 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140731222 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140731563 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 140731642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140731706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140731831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140732315 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140733784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140734343 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140734366 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140734524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140735358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140735506 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140735538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140735598 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140735631 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140735989 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140737314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140737424 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 140739249 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140740675 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140741382 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 140741802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140742019 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140742329 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 140742386 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 140742930 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140743173 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140743239 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140743242 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140743408 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 140743559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140743592 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 140743921 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 140744490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140744895 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 140744899 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 140744906 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 140745241 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140748622 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140752720 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 140753395 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140753778 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 140754808 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140756652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140757260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140758059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140758741 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140759137 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140759138 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 140759355 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140759440 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 140759521 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 140759549 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140759865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140760505 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 140760519 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140760562 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 140760645 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 140761008 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 140761045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140761080 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 140761143 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140761799 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 140761871 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 140761905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140761937 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 140761939 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 140761986 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 140762045 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 140762380 A T N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 140762381 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 140762744 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 140762752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140762755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140762799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140762868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140762998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140763225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140763307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140763326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140763359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140763921 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140764334 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140765365 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140765809 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140766506 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140767173 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140767651 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 140767724 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 140767961 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140768040 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140768235 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 140768468 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 140768697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140769137 A C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 140769337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140770440 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 140770930 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140771029 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 140771058 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140771082 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140773510 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 140774340 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140774574 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140774597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140775416 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 140775907 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 140776022 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140777731 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140779345 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140779992 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140779993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140780761 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140780907 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140780910 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140780977 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 140781211 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 140781348 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140781484 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140781504 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 140781772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140781803 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 140783624 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 140783980 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 140784757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140784826 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 140785133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140785309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140785892 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 140786022 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 140786062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140786070 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.05 0.8 0.15 18 22 1 16 3 2 140786180 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 140786469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140786543 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 140786548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140786582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140786787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140787066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140787821 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140788033 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140788050 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140788071 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140788139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140788757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140789120 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 140789180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140789218 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 140789616 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140789620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140789788 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 140789951 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 140789958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140790513 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 140790811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140790821 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 140790849 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 140791464 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140791648 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140791736 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140792307 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140792322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140792442 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 140792477 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140792761 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 140792803 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140792811 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140792940 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 140793170 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140793198 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140793226 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140793466 A T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140793627 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 140794050 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 140794272 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140794324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140794831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140794901 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 140794932 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 140794955 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 140795974 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 140796271 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140796529 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 140796552 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 140796557 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140796945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140797023 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 140797207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140797248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140797467 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140797562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140797995 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 140798891 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 140799391 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 140800168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140801026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140801112 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140801158 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140801397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140801399 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140801444 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 140801500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140801542 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140801643 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140801999 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140802283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140802297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140802302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140802368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140802469 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 140802471 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 140802521 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140802532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140802580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140802729 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 140802860 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 140802928 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140802982 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 140803107 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 140803231 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 140803370 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 140803431 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 140803757 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 140803923 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 140804096 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140804235 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140804309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140804404 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140804408 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140804509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140804626 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 140804998 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140805048 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 140805073 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140805142 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 140805225 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 140805276 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 140805446 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140805470 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140805618 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140805689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140805766 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140805804 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140805835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140805884 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 140806019 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 140806073 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 140806094 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140806209 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140806229 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 140806244 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 140806246 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 140806266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140806357 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140806438 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140806476 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140806524 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 140806855 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140806858 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 140807008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140807175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140807638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140807648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140808040 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 140808221 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140808299 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 140808325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140809078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140809091 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140809325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140809948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140809955 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 140810623 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140810848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140811927 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140812146 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 140812174 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140812349 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 140812604 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140812661 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 140812918 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140812948 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140813268 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 140813475 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 140813903 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 140813908 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 140813922 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 140813948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140813967 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 140814089 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140814114 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140814216 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 140814217 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140814270 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140814424 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140814441 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140814718 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 140815040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140815248 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 140815293 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140815297 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 140815548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140815643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140815900 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 140815929 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 140816262 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140816467 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 140816748 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140817538 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140817844 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140817858 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140817927 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140817959 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140818000 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140818043 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 140818415 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 140818664 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140818687 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140819613 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140819619 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 140819642 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 140819697 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 140819712 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140819825 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140819980 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140820105 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140820243 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 140820468 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140820602 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 140820637 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140820714 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140821032 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 140821152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140821749 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 140822210 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140822302 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140822798 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 140823033 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140823331 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140823358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140823587 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140823923 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140824525 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140824563 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140824754 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140824824 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140824856 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140824965 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140824988 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140824996 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140825112 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140825401 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140825712 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 140825713 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140826437 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140826483 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140826859 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140827042 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140827205 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140827339 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 140827383 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140827430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140827571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140827773 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 140827849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140827918 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 140828152 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140828162 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140828169 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140828278 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140828295 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 140828356 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140828572 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140828603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140828631 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140828634 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140828892 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140829028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140829036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140829061 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140829107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140829140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140829189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140829238 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140829381 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140829466 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140829705 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140829852 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140829884 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 140829989 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 140830060 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140830157 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 140830214 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140830220 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140830325 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140830472 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 140830485 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 140830498 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 140830508 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 140830542 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 140830546 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 140830566 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 140830604 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 140830768 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 140830777 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 140830905 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 140830911 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 140830917 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 140830935 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 140830959 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 2 140831021 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 140831080 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 140831368 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140831376 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140831391 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140831429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140831548 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140831556 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140831657 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140831710 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140831716 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140831733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140831749 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140831841 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140831842 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140831956 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140831988 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140832010 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140832111 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140832136 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140832242 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140832290 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140832346 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140832543 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140832556 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 140832577 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140832650 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140832692 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140832953 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 140833113 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140833302 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140833933 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140834146 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140834253 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140834292 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 140834551 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 2 140834565 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140834624 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140834744 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140834844 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140834894 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140835177 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 140835552 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140836063 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140836502 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140836984 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140837730 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140837931 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140837990 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140838203 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140838411 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 140839036 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140840080 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140840116 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140840737 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140841216 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140841229 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140841245 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140841759 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140841763 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140842128 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140842327 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140842471 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140842975 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140843481 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140843509 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140844059 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 140845067 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140845252 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 140845340 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140845419 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140846126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140846734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140847973 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 140848559 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140848767 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 140850137 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140852987 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140854523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140854539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140854729 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140855362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140855813 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140855998 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140856541 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140857067 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140857441 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140857449 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140858419 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140858438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140858700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140859007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140859683 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140859776 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140859794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140859835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140859923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140860195 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140860466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140860703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140860816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140860946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140861088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140861506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140861627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140861870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140861947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140862381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140862566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140862864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140862929 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140862937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140863027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140863030 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 140863195 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140863248 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140863316 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 140863380 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 140863418 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140863548 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140863669 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140863802 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 140863891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140863951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140864018 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140864023 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140864238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140864281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140864283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140864321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140864420 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140864538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140864576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140864665 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140864788 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140864792 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140864962 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140865217 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 140865244 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140865326 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140865349 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140865370 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140865371 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 140865494 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140865497 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 140865588 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 140865589 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 140865936 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140865988 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140866030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140866188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140866299 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140866319 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140866334 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 140866498 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140866518 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140866550 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140866568 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140866678 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140866809 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140866814 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140866824 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140866902 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140866966 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140867035 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140867108 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 140867113 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 140867316 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 140867332 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 140867393 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140867429 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140867486 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 140867542 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 140867553 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 140867574 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 140867575 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 140867617 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 140867697 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140867866 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140867877 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140867900 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140867935 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 140868053 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 140868324 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140868360 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 140868388 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 140868390 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 140868401 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 140868647 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140868704 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140869131 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 140869139 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 140869214 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140869245 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 140869413 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140869461 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140869505 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140869622 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 140869741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140869848 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 140869960 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 140870001 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 140870031 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 140870051 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 140870117 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 140870257 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 140870389 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140870624 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 140870916 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140870931 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140870954 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140870974 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140871106 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 140871114 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 140871119 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140871164 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140871181 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140871457 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 140871471 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140871483 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140871560 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 140871582 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140871613 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140871672 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 140871727 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 140872116 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 140872206 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140872208 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140872249 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140872367 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 140872386 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140872411 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140872414 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140872629 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140872788 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140872983 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 140873025 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 140873053 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140873163 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 140873168 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140873178 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 140873197 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 140873346 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 140873581 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140873731 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140873917 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140874129 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140874422 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140874442 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 140874485 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 140874559 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 140875025 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140875227 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 140876159 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 140876215 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 140876229 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 140876479 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 140876483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140876627 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140876668 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140876670 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140876687 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140877415 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140877447 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140877464 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140877977 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140878081 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140878086 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140878442 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140878589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140878612 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140878627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140878757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140878991 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140879204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140879205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140879246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140879304 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140879334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140879347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140879419 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140879466 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140879533 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140879570 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140879573 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140879627 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140879639 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140879662 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140880627 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140880831 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140880833 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140880917 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140881152 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140881240 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 140881274 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 140881403 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 140881434 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140881697 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 140881724 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 140882405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140882612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140882742 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140882796 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 140883493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140883725 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140883751 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140883962 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140884332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140884463 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140884642 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140884662 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140884727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140884792 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140885071 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 140885178 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 140885188 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 140885201 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 140885265 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 140885589 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140885681 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140885689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140885704 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140885813 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140886072 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140886117 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140886198 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140886292 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140886303 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140886369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140886467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140886647 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140886950 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 140887115 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140887178 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140887451 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140887491 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140887589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140887707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140887925 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140888447 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 140888614 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 140888651 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 140888807 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140889317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140889323 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140889356 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140889357 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140889556 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140889564 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140889625 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140889849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140890759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140891939 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140892081 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140892706 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 140892827 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 140893532 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140893711 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140894598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140895202 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140895543 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140895686 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140897651 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140897862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140897916 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140898123 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140898370 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140899674 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140899976 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140900807 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 140901512 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140901589 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 140902067 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140902647 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 140903667 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140904327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140904343 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140904377 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140904410 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 140904697 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140904941 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 140905056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140905083 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140905092 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140905144 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140905168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140905203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140905288 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140906026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140906087 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140906092 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140906144 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140906169 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140906310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140906392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140906527 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140906538 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140906563 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140906635 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140906687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140906718 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140906739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140906834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140906970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140907050 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140907085 G T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 140907859 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 140907950 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 140907957 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 140907989 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140908147 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 140908295 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140908383 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140908468 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 140908648 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140908692 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 140908763 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 140908855 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 140908885 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 140908994 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 140909084 C G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 140909130 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140909179 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 140909302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140909317 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 140909354 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 140909391 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140909546 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140909568 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140909594 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 140909635 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 140909660 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 140909697 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 140909832 A T Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 140909837 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140909893 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 140910017 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 140910058 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140910337 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140910347 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140910394 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140910458 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140910552 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 140910618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140910695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140911069 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 140911297 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 140911348 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 140911523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140911535 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 140911592 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 140911698 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 140911957 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140912078 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140912233 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140912250 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140912294 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140912407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140912545 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140912583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140912674 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 140912719 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140912732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140912832 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140912961 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140912973 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140913033 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140913056 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140913080 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140913090 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140913100 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140913142 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140913145 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140913188 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140913197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140913271 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140913272 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140913317 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140913373 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140913378 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140913402 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140913414 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140913458 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140913462 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140913552 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140914281 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140914286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140914326 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140914360 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 140914384 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140914386 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140914402 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140914613 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 140914985 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140915009 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140915027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140915138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140915331 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140915411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140915425 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140915620 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140915756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140915815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140916315 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 140916361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140916432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140916442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140916450 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140916469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140916562 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 140916576 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140916645 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 140916868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140916911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140916946 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 140916951 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 140917164 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140917227 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140917384 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140917461 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140917595 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140917736 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140917744 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140918037 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140918067 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 140918082 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 140918132 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140918366 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140918373 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140918388 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140918425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140918596 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140918628 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140918666 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140918775 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140918805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140918905 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140919135 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 140919169 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140919266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140919296 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140919445 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140919449 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140919461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140919522 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140919574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140919726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140919767 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 140919769 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140919841 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140919856 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 140919890 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140919917 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 140919922 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 140919994 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 140920002 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140920033 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140920114 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 140920154 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140920370 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140920380 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140920748 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140920759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140920805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140921112 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 140921220 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140921346 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 140921469 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140921494 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 140921557 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 140921685 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 140921736 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 140921741 C A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 140922030 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140922089 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 140922211 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 140922294 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 140922295 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140922388 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140922609 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140923328 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140923438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140923951 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140924039 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140924113 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140925078 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 140925215 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140925606 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140925954 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140925968 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140926587 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140927103 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140927120 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140927734 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140936898 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140937523 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 140937573 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 140937904 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140938012 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140938111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140938197 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140938214 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140938264 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140938298 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140938494 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140938513 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140938583 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140938688 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140938705 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140938708 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140938718 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140938832 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140938857 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140938957 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 140938979 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140939114 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 140939243 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 140939883 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140939893 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140940021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140940306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140940887 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140940956 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140943526 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 140943736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140944312 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140944711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140944869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140945401 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140945438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140945452 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140945754 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140946039 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 140946108 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 140946234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140946505 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 140946727 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 140946797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140947042 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 140947049 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 140947075 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 140947086 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 140947321 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 140947322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140947343 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 140948440 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 140948605 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140948946 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140949078 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140949217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140949299 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140949337 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 140950083 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140950277 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140950290 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140950319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140950363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140950425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140950733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140950842 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140950935 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 140951090 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140951179 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 140951201 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140951423 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140951516 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 140951543 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 140951563 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140951580 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 140951612 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 2 140951783 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140951803 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 140951830 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140951891 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 140951896 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 140951964 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 2 140951979 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140951996 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 140952077 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140952090 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 140952131 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 140952138 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 2 140952321 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 140952323 A C N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 140952374 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 140952394 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 140952463 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 140952601 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 2 140952617 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140952741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140952760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140952789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140953038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140953065 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140953139 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140953147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140953153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140953212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140953228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140953513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140953565 G T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 2 140953615 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 140953629 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 140953886 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 140953927 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 140953957 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 140953999 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 140954142 G C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 2 140954198 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 140954364 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 140954451 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 140954698 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140954745 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140954910 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140955027 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140955044 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 2 140955081 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140955113 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140955236 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140955251 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140955295 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 140955305 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 140955378 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 140955403 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140955438 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 2 140955617 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 140955629 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 140955667 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 140955834 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140955843 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140956485 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140956791 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140956914 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140956968 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140956983 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 140957138 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140957156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140957194 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140957309 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140957318 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140957335 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140957420 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140957426 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140957623 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 140957646 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 140957693 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 140957758 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 140957808 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140957863 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140957921 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140958179 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140958182 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 140958369 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140958372 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140958462 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 140958494 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 140958707 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140958720 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140958744 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140958772 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140958808 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140959004 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 140959009 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 140959035 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 140959191 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 140959216 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 140959362 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140959434 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140959475 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140959486 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140959595 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140960087 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140960114 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140960554 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 140960793 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 140961377 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 2 140961455 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140961690 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 140961694 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 140961704 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 140961817 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 2 140961842 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 140961990 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 2 140962026 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 140962119 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 140962469 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140962656 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 140962833 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 140962867 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 140963812 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140963976 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140964028 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 140964162 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140964164 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 140964187 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140964241 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 140964380 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140964404 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 140964585 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140964783 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 140965620 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140965879 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140966162 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140966167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140966324 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140966366 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 140966655 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140966741 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 140966799 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140966907 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140967293 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 140967330 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140967723 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140967797 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 140967985 T G Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 140967989 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 2 140968113 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140968478 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 140968488 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 140968709 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140968710 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 140968898 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 140968901 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 140968930 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140968945 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140968985 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140969617 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 140969885 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 140970033 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140970040 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140970238 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140970338 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 140970518 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140970806 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 140970859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140970952 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 140971007 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140971097 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140971527 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 140971568 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 140971667 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 140971762 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 140971811 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 140971842 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 140972034 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140972065 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140972148 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140972165 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140972193 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140972250 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140972290 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140972563 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140972962 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140973028 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140973292 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140973310 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140973409 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140973554 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 140973630 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140973677 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140973805 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140973828 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140973886 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140973930 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140974160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140974267 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140974319 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140974377 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140974417 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140974455 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140974698 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140974944 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140974993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140975016 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140975060 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140975135 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 140975154 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140976216 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140976551 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 140976763 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 140977143 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140977688 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140977698 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140977784 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140977786 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140977809 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140977947 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140978868 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140979231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140979262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140979467 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 140979575 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 140979798 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140980000 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 140980785 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 140980917 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140981209 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 140981235 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 140981534 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 2 140981753 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140981774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140981894 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 140981973 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 140982036 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 140982245 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140982464 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 140982578 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140982854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140983066 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140983107 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140983197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140983269 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 140983537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140983643 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140983686 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140983844 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140984137 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140984446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140984626 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140984929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140985141 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 140985898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140985952 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140986249 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140986521 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 140986665 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 140987793 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 140988162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140988391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140988417 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140988517 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 140988931 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140989038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140989089 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 140989546 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 140990273 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140990622 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140990931 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140991302 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140991334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140992001 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 140992271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 140994266 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 140994478 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 140994810 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 140994948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 140998290 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141000312 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 141000717 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141003790 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 141004673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141006158 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141007384 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141008866 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141009252 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141009723 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 141009931 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141010141 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141010184 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 141010263 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141010311 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 141010378 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 141010420 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 141010497 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 141010974 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141011108 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 141011647 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 141013043 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141013057 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 141013692 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141014587 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141014730 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141014938 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 141016304 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141016326 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141016612 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141016714 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 141016871 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141017048 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 141017052 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141017111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141017121 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141017166 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141017285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141017348 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141017714 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 141017860 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141017929 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141018056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141018068 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141018112 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 141018171 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 141018457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141018599 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141018967 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141019632 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 141019748 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141019907 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141021420 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141022371 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141022382 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141023056 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141023654 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141023704 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141023722 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141023731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141023810 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141023826 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141023832 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141023863 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141023961 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 141024047 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 141024112 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 141024174 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141024303 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141024405 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141024583 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 141024637 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 141024647 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 141024737 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 141024803 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141024927 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141025063 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 141025137 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 141025175 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141025296 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 141025934 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141025952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141025988 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141026184 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141026215 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 141026351 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141026595 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 141026651 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 141026679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141026680 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 141026690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141026805 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141027144 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 141027187 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141027616 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141027741 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 141027861 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141027948 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141028069 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141028241 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141028375 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141028452 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141028791 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141028896 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141028914 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141029060 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141029066 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141029099 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141029478 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141029500 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 141029932 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 141030559 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 141030951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141032319 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141032497 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 141032584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141032586 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 141033176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141033482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141034421 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 141036312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141037068 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141037282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141037690 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 141037726 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 141037875 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 141037893 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 141037973 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 141037992 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 141038376 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 141038632 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 141038657 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 141039037 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 141039045 G A Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 141039191 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 141039735 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141039829 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 141039975 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 141040017 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 141040046 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 141040121 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 141040140 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 141040243 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 141040263 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 141041184 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 141041187 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 141041293 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 141041328 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 141041363 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 141041441 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141041653 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 141041903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141042403 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 141042635 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 141042645 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141042745 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 141042776 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 141042884 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 141042998 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 141043352 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 141043734 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 141044019 G T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 141045235 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 141045397 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141045456 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 141045638 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 141045641 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 141045942 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 141046023 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 141046065 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141046101 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 141046145 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 141046338 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 141046556 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141046702 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 141046939 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 141047316 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 141048022 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141048458 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 141049174 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141049521 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 141049651 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 141049972 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141049979 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141050012 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 141050209 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141050508 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 141050662 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141050854 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 141050868 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 141050899 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141051231 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 141052095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141054331 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141055044 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141055211 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 141055709 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 141055823 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141056113 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141056735 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141057273 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141058615 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 141058887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141064401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141065066 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141065258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141065330 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 141065482 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141065504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141065857 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141066022 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141066404 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141066488 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 141067567 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141067704 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141067853 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141068377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141068419 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141068588 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141068932 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141069090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141069359 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 141070214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141070231 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141070371 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141072011 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 141072245 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141072710 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 141073117 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 141073268 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141073289 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 141074416 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141074732 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141075152 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141075238 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 141075298 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141075461 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141075958 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 141075973 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141076000 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141076195 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141076726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141077179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141077271 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141077977 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 141078089 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141078181 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141078355 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141078403 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 141078734 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 141078740 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 141078874 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 141079055 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 141079327 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 141079357 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 141079373 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 141079472 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 141079473 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 141079789 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141079954 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141080052 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 141080312 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 141080334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141080722 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 141080947 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141081509 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141082423 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141083330 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141083372 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141083424 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 141083476 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141083552 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 141083993 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141085419 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 141085754 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 141085834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141086030 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141086995 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 141087114 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141087961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141087997 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141088259 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 141088272 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 141088292 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141088550 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 141088874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141088943 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 141089345 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141089858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141090391 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141090434 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 141090518 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 141090554 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 141091078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141091097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141091593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141092337 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 141092946 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141093253 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141093428 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141093568 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141094254 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141095182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141095345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141095348 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141095384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141095481 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141095732 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 141095763 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141096000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141096122 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141096481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141096484 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 141096973 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 141096974 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 141097045 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 141097164 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141097175 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141097177 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 141097257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141097327 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 141098356 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141098600 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 141098624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141098912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141099013 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141099099 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 141099233 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 141099282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141099369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141099471 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 141099669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141099697 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141099708 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 141099720 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141099804 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 141099935 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 141099991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141100254 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 141100263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141100817 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141100989 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 141101044 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141101212 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141101312 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 141101366 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 141101409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141101504 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 141101517 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141101531 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141101672 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 141101955 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 141101999 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 141102041 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 141102349 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 141102382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141102429 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141103426 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 141103625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141103692 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 141104191 G C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 141104317 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 141104334 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 141104831 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 141104856 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 141104997 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141105256 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141105302 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141105308 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141106118 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 141106250 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 141106453 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141106783 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141106860 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141106931 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141106988 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141107318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141107375 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141107565 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141107624 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141107639 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141107721 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141107966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141108302 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141108327 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141108431 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 141108479 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 141109021 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 141109420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141116961 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141119490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141120896 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141121513 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141121943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141125236 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141125245 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141126002 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141126090 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141128037 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 141128200 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141128546 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141128777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141129882 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141130142 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 141130797 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141131412 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 141131456 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 141135206 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141135404 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 141135798 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 141136040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141136927 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141138319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141138786 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141138863 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 141138926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141139311 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141141228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141141997 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 141143155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141143404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141143422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141143508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141144622 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141144680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141144901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141145322 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141145639 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 141145978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141146563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141147266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141147267 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141149715 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141150812 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141150959 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141152256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141152824 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 141153246 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141153354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141153409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141153552 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 141153793 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 141153865 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141153895 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 141154016 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 141154069 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 141154070 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 141154116 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 141154151 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 141154222 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 141154372 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 141154444 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141154463 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 141154512 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141154631 G T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 2 141154827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141154858 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141154894 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 141154917 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141155107 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141155122 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141155274 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141155331 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141155396 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141155410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141155414 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 141155528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141155773 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 141155894 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141156086 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 141156122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141156180 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141156333 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141156641 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141156664 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141156762 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141156987 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141157101 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141157115 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141157274 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141157317 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141157463 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141158224 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141158636 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141158881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141159191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141160016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141160167 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141160322 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141162489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141163067 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 141164900 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141165852 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141166620 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141166626 C G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 141166759 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 141167014 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 141167260 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 141167261 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141167333 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141167390 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141167412 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 141167444 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 141167462 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141168098 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141168155 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 141168188 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141168204 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 141168604 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141169809 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141169976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141170058 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141170556 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 141170672 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141170673 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141170826 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 141171193 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 141171416 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 141171737 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 141171801 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141171920 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 141172112 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 141172242 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141172256 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141172287 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141172479 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 141172527 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 141172586 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 141172662 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 141172666 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 141172676 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141172749 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141172854 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141172977 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141173439 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 2 141173498 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 141173505 G T N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 141173569 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 2 141173572 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.384615384615385 0.153846153846154 0.461538461538462 12 14 5 2 6 2 141173728 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 141173764 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 141173908 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 141174473 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141175164 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141175266 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141175482 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141175938 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 141175942 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 141176001 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 141176067 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141176094 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141176191 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141176328 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141176463 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141176792 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141176840 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 141176993 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141176994 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141177184 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141177241 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 141177255 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141177275 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141177414 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 141177416 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 141177494 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 141177501 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 141177937 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141178117 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 141178154 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141178203 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141178238 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 141178317 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141178333 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141178367 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141178822 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141178948 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 141179137 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141179142 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141179157 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141179219 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141179238 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141179255 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141179705 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141179924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141180098 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141180316 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141181319 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141181712 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141181917 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141182280 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 141182344 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 141182471 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 141182814 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141182899 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141182932 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141182951 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141183002 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141183287 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141183749 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141183834 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 141183885 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141183912 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141183946 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141184013 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141185073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141185512 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141186139 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141186335 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 141186658 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141186714 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141187012 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141187021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141187093 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 141187127 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141187158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141187595 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141187911 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141188995 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141189065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141189327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141189358 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141189394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141190062 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141190669 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141190898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141191069 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 141191243 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 141191372 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 141191385 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 141191861 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 141191890 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 141192229 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 141192396 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141192613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141192675 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141192802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141193361 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141193559 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 141193600 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141194220 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141194630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141194637 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141194755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141195040 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141195414 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141195448 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141195630 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 141195986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141196467 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141196765 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 141197407 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141197410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141198446 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141198589 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141198594 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 141198851 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141199018 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141200010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141200226 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141201108 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141201355 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141201363 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141202193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141202866 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141203080 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 141203442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141203515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141203572 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 141204190 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 141204939 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141205767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141206451 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141207915 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 141210606 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 141210920 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 141211266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141211390 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 141211605 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 141211872 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 141212001 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 141212102 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 141212216 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 141212929 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 141213146 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141213222 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141213280 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141213387 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141213810 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 141213855 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141213857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141214284 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141215443 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141215826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141216224 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 141216297 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 141216475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141216552 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141216868 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 141217038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141218033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141218092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141218441 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 141219636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141219731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141220194 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141220291 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141220687 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141220799 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141222428 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141222456 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141222559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141222603 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 141222673 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 141222775 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 141224010 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141224174 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 141224491 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 141224751 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141225504 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141225567 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141225822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141226114 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141226563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141228258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141229165 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141229415 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141230597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141231074 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141231147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141231159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141231249 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141231284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141231390 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141231896 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141231968 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 141232251 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 141232784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141232873 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 141233047 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 141233170 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 141233532 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141234456 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141234520 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141235057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141235278 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141236020 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141237277 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141238448 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141238588 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141239574 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 141239588 A C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 141239715 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141241274 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141241998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141243058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141243166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141243167 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 141243498 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141243505 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141243531 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 141243740 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 141243756 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 141243839 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 141243955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141244013 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141244257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141244328 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141244333 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 141244549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141244552 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141244599 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 141244628 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 141244794 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 141244797 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 141244845 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 141244865 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 141245023 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141245038 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 141245377 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 141245430 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 141245463 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141245465 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 141245561 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 141245695 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 141245730 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 141245747 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141245817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141245872 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 141245968 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 141246132 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141246196 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 141246273 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 141246296 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 141246413 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141246727 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 141246891 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 141246990 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141246991 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141247276 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 141247519 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 141247635 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 141247823 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141247855 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 141247868 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 141248316 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141248534 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 141248719 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 141248868 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 141249097 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 141249416 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141249558 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141249644 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 141249649 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 141249708 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141249904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141249910 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 141250042 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 141250527 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 141250574 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 141250965 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141251182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141251435 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141251605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141251706 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 141251830 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 141251845 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 141251866 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 141251952 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 141252192 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141252278 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 141252297 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 141252384 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 141252426 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 141252630 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 141252750 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 141252831 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141252874 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 141252903 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141252919 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 141252932 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 141253044 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141253057 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 141253177 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 141253196 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 141253263 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 141253308 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141253476 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 141253532 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 141253556 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 141253688 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 141253751 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 141253936 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 141253957 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 141254030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141254080 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 141254159 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 141254172 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141254178 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 141254377 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 141254378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141254400 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 141254449 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 141254454 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 141254489 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 141254503 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 141254505 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 141254634 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 141254635 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 141254800 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 141255049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141255072 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141255621 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 141256117 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 141256118 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 141256270 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141256306 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 141256318 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 141256542 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141256560 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141256574 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141256578 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141256601 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141256626 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141256758 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141256769 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141256949 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141256957 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 141257218 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 141257307 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 141257354 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141257391 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141257544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141257555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141257585 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141257754 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 141257787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141257821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141258064 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 141258304 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 141258346 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141258356 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 141258480 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 141258496 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 141258629 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 141258812 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 141258856 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 141258889 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 141258918 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 141259015 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 141259059 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 141259097 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 141259116 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 141259178 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 141259209 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 141259306 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 141259339 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 141259348 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 141259365 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 141259379 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 141259403 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 141259435 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 141259462 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 141260241 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 141260438 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 141260620 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141260878 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141260975 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141261074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141261217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141261254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141261261 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141261449 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141261555 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 141261588 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141261596 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 141261620 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 141261688 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 141261807 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 141261811 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141261955 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 141262587 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141262713 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 141262734 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 141262861 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 141263460 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 141263535 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 141263602 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 141263809 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 141264172 A T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 141264390 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 141264397 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 141264813 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 141264924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141265974 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141267283 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 141267297 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 141267303 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 141267486 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 141267714 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 141267817 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 141267940 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 141268384 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141268833 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 141268886 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141269047 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141269051 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141269173 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 141269227 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 141269253 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 141269937 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 141269960 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 141269978 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 141270005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141270256 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141270273 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 141270301 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141270397 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141270481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141270613 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 141270698 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 141270803 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 141270817 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141270827 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141270928 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 141271024 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 141271141 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 141271179 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141271251 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141271357 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141271371 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141271451 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141271485 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141271489 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141271519 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 141271721 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 141271764 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 141271780 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 141271883 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141272020 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 141272157 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 141272161 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141272236 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141272245 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141272253 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141272576 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141272791 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141272980 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 141273011 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 141273048 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141273093 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 141273459 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 141273651 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141273830 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 141275318 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141275487 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 141275518 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141275562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141275594 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 141275778 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 141275847 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 141275929 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 141276253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141276668 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 141276753 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 141277066 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 141277134 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141277157 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 141277242 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 141277317 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141277376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141277443 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 141277453 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141278263 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141278352 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 141278448 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141278638 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141278696 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141278847 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 141278857 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141278949 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 141279106 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 141279464 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 141280218 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141280311 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141280312 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141280351 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 141280384 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141280406 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141280571 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141281150 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 141281326 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 141282969 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 141283018 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 141283104 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 141283614 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141283786 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141284164 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 141284251 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 141284266 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 141284284 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 141284344 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 141284695 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141285074 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 141285079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141285137 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 141285741 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141285820 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 141285966 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 141285982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141286227 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 141286824 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 141287115 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 141287190 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 141287321 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 141288174 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 141288192 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 141288195 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 141288218 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 141288233 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 141288389 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 141288456 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 141288607 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 141288631 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 141288635 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 141288653 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 141288665 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 141288667 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 141288904 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141289685 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 141289723 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 141289742 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141290364 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 141290745 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141290911 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141290978 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141291059 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141291088 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141291102 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 141291116 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 141291315 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141291419 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141291424 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 141291631 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141291793 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 141291983 T A Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 141292121 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 141292271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141292382 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141292444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141292778 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141292789 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141292947 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141293003 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141293012 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141293087 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 141293278 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 141293348 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 141293380 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 141293391 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 141293396 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 141293451 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 141293514 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 141293559 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141293626 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141293643 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141293650 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 141293741 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 141293946 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141294743 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141295293 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141295414 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 141295563 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 141295564 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 141295589 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 141295634 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 141295839 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141295889 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 141295897 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 141295916 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 141295920 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 141296042 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 141296167 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141296300 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 141296358 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141296384 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141296524 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 141296995 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141297134 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141297213 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141297593 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 141297810 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141297898 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141298076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141298430 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 141299030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141299255 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 141299494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141299809 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 141299926 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 141300026 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 141300584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141300692 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141300831 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 141301060 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141301462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141301476 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141301502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141301504 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141302033 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141302082 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141302217 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141302283 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141302324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141302330 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 141302395 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 141302627 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141302672 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 141302744 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 141302745 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 141302785 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 141302808 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 141302854 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141302889 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 141302938 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 141303419 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 141304270 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 141304781 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141304890 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 141305625 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 141305799 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 141306046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141306541 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141306815 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 141306869 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 141306877 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 141307266 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141307300 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 141307619 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 141307666 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 141308676 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 141308772 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 141308920 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141308956 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141309043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141309115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141309452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141309710 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 141309829 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 141310447 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141310535 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141311066 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141311141 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141311183 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141311225 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141311238 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 141311302 A T N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 141311587 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141311646 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 141311774 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 141311818 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141311842 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 141311922 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 141313435 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141313592 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 141313602 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141313678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141314369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141314507 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141315569 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141316583 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141316824 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141317130 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141317195 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141317196 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141317280 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141317316 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141317354 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141317358 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141317434 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141317625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141318288 G C N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 141318714 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 141318930 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 141318965 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 141319258 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 141319354 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141319422 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 141319941 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 141320119 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141320588 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 141320680 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 141321085 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 141321099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141321281 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 141321724 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141321907 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 141322178 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141322542 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141323282 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141323429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141323612 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 141323660 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 141324184 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 141324617 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141324719 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 141324822 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 141325189 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141325356 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141325599 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141325626 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141326068 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 141326396 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141326400 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141326542 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 141326549 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 141326615 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141326798 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141326815 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141327089 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141327178 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141327228 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141327267 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141327284 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141327285 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141327316 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141327343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141327346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141327367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141327380 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141327386 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141327589 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141327748 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 141327940 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141327985 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141327998 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141328069 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141328092 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141328182 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 141328252 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 141328366 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 141328379 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 141328415 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 141328449 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 141328525 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141328539 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 141328552 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 141328575 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 141328628 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141328750 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 141328911 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 141328944 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 141328968 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 141329149 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141329336 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 141330326 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141330628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141330634 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141331473 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141332024 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 141332031 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141332091 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141332092 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141332260 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141332372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141332580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141333309 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141333812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141333853 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141334030 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 141334530 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141334653 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 141334791 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141334913 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141335059 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141335830 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 141336047 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141336208 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141336479 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141336585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141336637 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141337180 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141337192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141337238 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141337537 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141337546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141337760 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141337857 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 141337962 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 141338113 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141338167 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141338181 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141338444 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141338484 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141338786 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 141338865 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141338987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141339107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141339141 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 141339156 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141339242 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141339265 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 141339281 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141339301 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 141339674 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141339929 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141340146 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 141340162 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141340174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141340478 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 141340485 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 141340512 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 141340567 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141340740 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 141340769 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141340805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141340879 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141341227 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141341526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141341530 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 141341542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141341719 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 141341904 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 141341989 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 141342022 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 141342039 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 141342055 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 141342220 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141342303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141342358 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141342431 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 141342484 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 141342491 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 141342499 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 141342534 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 141342684 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 141342696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141342886 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 141342904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141342920 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 141342940 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 141343017 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141343042 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 141343278 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 141343343 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 141343367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141343384 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 141343447 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 141343611 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 141343629 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141343727 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 141343805 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141343841 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 141343853 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 141343864 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 141343929 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 141344007 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 141344014 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 141344029 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 141344040 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 141344213 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 141344241 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 141344617 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141344630 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 141344684 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141344764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141344819 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 141344842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141344854 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 141345016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141345065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141345116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141345160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141345203 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 141345495 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141345497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141345577 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141345651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141345690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141345711 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141346320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141346331 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 141346446 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141347119 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 141347291 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 141347332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141347516 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141347680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141347973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141348243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141348531 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 141348608 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 141348914 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 141349204 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 141350618 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141350734 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141351094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141351228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141352069 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141352072 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141352167 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141352281 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141353144 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141355790 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 141355991 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141358514 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141359576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141360082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141360220 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141360431 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141360735 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141365681 T C Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 141367551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141368213 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141368859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141368939 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141369654 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141369807 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141369846 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141369919 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141369977 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141370049 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141370163 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 141370282 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141370289 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141370316 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 141370340 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141370347 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141370376 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141370382 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 141370453 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141370462 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141370478 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141370546 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141370590 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141370668 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141370826 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141370827 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141370978 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141371025 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141371167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141371268 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141371463 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 141371702 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 141372235 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 141372475 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 141372536 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 141372794 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141373194 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 141373662 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141374108 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 141374484 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141374580 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141374618 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 141374640 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141374710 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141375340 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141375471 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141375478 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141375547 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141375627 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 141376008 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 141376068 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 141376141 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141376158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141376614 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141376780 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141376817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141376980 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141377038 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141377117 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141377221 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141377275 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 141377354 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141377402 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141377442 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141377524 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141377589 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 141377638 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141377673 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 141377939 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141378096 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141378552 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 141379088 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 141379497 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 141379548 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141380293 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141380506 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141380577 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141380752 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141380919 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141380995 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 141381301 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141381456 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141381677 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141381899 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141381927 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141382145 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 141383249 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141383277 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 141384200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141384381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141384395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141384642 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 141384732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141385085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141386471 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141386752 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141386923 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 141387088 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141387346 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 141387545 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141387888 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141387902 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 141388003 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 141388244 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 141388274 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141388296 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 141388444 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 141388447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141388912 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141389017 C G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 141389126 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 141389413 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 141389426 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141389452 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 141389460 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 141389465 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 141389505 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 141389507 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141389521 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 141389555 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141390445 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141390546 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 141390567 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141391105 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141391702 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141391728 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 141392694 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141393654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141394754 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141396189 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141398402 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 141400249 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141400293 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141400420 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141400650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141400793 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141401100 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141401201 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141401435 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141401526 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141401562 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141401606 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141401922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141402050 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141402225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141402938 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141403203 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141403591 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141403627 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141403743 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141404099 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141404329 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141404484 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141404624 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 141404773 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141404911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141405493 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141408024 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141408030 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141408591 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141409235 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141409510 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141409624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141409703 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 141409947 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141410072 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141410182 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 141410396 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141410610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141411357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141411615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141411746 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 141411784 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141411842 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 141411924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141412098 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141412116 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141412161 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141412175 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141412235 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141412650 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 141412678 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141412686 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141412995 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141413096 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141413380 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141413520 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141413572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141413803 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141413993 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141414292 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141414342 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141414890 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141415187 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141415471 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141415538 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 141415861 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 141415970 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141416144 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 141416268 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141416567 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141417026 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141418014 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141418740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141418775 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141419155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141420637 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 141422507 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141422626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141423291 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141425376 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141425743 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141425918 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141426626 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141427164 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141427334 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141428368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141429046 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 141430039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141430341 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141430619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141432750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141432887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141433575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141433703 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141433931 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141435829 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141437103 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141438312 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 141438321 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141438413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141438414 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141438437 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141438661 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 141439094 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141439845 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141439880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141441558 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 2 141441602 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 2 141441747 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141441814 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141441816 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141441836 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141442015 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141442303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141442404 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 141442430 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141442493 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141442585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141442643 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141442970 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141442999 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141443163 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141443191 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141443351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141443418 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141443543 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141444050 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141445396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141445784 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141446128 A G Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 2 141446909 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141446940 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141446957 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141447114 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141447152 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141447333 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141447354 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141447453 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141447595 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141447644 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 141447877 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141448336 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 141448342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141448442 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141448591 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141448655 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141448923 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 141449000 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141449237 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141449322 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141449333 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141449389 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141449822 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141449896 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141450008 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141450051 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 141450193 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141450211 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141450224 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141450477 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 141450571 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 141450639 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 141450920 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141451002 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 141451226 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141451593 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 141451803 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 141451889 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 141451899 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 141452108 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141452123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141452142 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141452166 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141452247 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141452421 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141452765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141453065 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141453109 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141453148 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 141454571 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 141455387 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 141455523 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141455574 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 141455711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141455797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141455798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141455898 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 141456916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141457196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141457494 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141457760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141457864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141458059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141458063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141458407 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141458580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141458607 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141458806 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141459012 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141459036 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141459041 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141459324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141459373 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 141459643 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141459674 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 141459693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141459842 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141459898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141460632 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141460665 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141461031 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 141461137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141461330 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 141461352 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 141461443 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141461459 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141461465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141461591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141461664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141461739 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141461753 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 141461772 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141461887 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141461949 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141461972 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141461997 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 141462115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141462118 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141462195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141462208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141462236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141462247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141462324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141462336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141462569 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141462880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141462885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141462904 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141462984 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 141463062 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141463067 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141463173 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 141463319 T G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 141463417 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 141463617 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 141463743 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 141463763 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 141463830 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141463831 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141463848 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141463864 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141463897 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 141463952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141464148 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 141464183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141464432 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 141464517 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 141464612 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 141464652 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 141464710 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141464894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141464914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141464926 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 141465108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141465207 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141465349 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141465565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141465745 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 141466123 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141466146 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 141466149 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 141469302 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141469333 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 141469703 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 141470398 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 141470461 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141470697 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 141470742 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141470980 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 141471022 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 141471632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141471905 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141471939 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141472597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141472957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141473087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141473724 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 141474095 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 141474440 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 141474629 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141474709 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141474812 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141474825 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141474852 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141474871 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141474940 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141475015 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141475150 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141475171 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141475188 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141476133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141476280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141476377 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141476453 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 141476664 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141476911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141477010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141477361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141477452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141478409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141478431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141479087 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 141479378 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141479401 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141479440 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141479743 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141480076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141480282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141480424 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141480617 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 141480628 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 141480685 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141480734 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141480758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141480787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141481212 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 141481488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141481632 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141482096 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141482218 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 141483132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141483146 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 141483202 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 141484230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141484711 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141485368 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 141485427 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 141485990 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 141486449 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141486536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141486611 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141488033 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141488838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141489373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141489442 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141489733 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141489761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141489966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141490507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141490769 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141491087 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 141491129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141491179 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141491759 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141492128 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141492701 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141494589 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 141495437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141495519 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 141495657 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 141495879 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 141496257 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141496403 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141496768 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141497146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141497261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141497318 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141497556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141497845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141498390 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141498495 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141499918 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 141500206 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141501809 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141502125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141503675 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141503731 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141504234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141504458 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141504561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141504996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141505734 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 141506201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141506216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141506358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141506413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141506452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141506586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141507243 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 141507398 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141508799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141510322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141510865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141511376 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 2 141511724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141511762 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141511942 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141512456 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 141512669 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141512712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141513041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141513448 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 141513740 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 141513747 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 141513774 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 141513819 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 141513906 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141514024 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141514164 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141514580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141514598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141514941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141515917 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141516261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141516599 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141518105 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141519592 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141519995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141522567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141522873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141522960 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141524676 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141524688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141525733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141526160 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141529553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141530441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141530701 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141532737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141534497 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 141535740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141537675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141538295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141538504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141539873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141545132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141546283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141547153 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141547448 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 141549599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141550491 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141552197 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 141552987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141553537 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141554406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141554996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141555138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141555172 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 141555375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141555883 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141556509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141556565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141556603 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 141556710 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141556741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141556883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141556926 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 141557030 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141557060 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 141557111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141557208 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 141557238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141557349 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 141557491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141557579 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 141558151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141558167 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 141558281 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141558324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141558453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141558620 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 141558652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141558867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141558946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141559268 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 141559627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141559797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141559815 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 141559826 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141559887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141559893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141559937 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 141560025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141560137 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141560239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141560331 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 141560356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141560598 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 141560609 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 141560612 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 141560888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141561184 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 141561196 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 2 141561233 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 141561495 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 141561575 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 141561584 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 141561727 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141561830 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 141561908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141562026 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 141562085 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141562134 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 141562171 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 141562248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141562278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141562447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141562493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141562577 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141562595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141563020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141563090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141563168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141563423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141563443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141563698 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141563756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141564075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141564612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141564669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141564994 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141565100 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 141565124 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 141565181 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 141565496 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141565699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141566238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141566605 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 141567014 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 141567652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141567993 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 141568045 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141569097 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141569210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141569794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141570187 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141570873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141571320 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141571457 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 141571867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141571885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141571914 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 141572141 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141572161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141572204 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 141572323 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 2 141572926 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 141573493 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 141573544 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 141573589 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 141573612 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 141573838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141573894 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 141573928 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 141573967 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 141573969 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 141574040 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 141574140 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 141574149 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 141574310 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 141574386 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 141574494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141574611 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 141574758 T A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 141575013 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 141575282 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141575370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141576555 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 141576680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141576808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141577153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141577635 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141578161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141578525 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141578588 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141578596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141578665 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141578709 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141578769 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141579394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141579780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141580872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141583314 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141583432 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141583755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141584167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141584309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141585002 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141585046 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141586114 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141586325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141589291 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 141589727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141589993 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141590100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141590304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141590334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141590499 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141590682 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141590878 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141590971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141591463 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 141591562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141591592 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141591998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141592103 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 141592352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141592456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141592660 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 141593367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141593422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141593976 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141595798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141595841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141596708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141596868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141597899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141597920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141598308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141598395 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141598531 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141598724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141599042 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141599252 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 141599263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141599719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141599945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141600033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141600266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141600492 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141602114 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 141602237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141602291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141605891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141606201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141607642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141607755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141608809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141608981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141609848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141611648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141612129 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 141612205 G C Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 141612390 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 141612677 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 141612686 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141613255 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141613283 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 141613328 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141613376 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 141613422 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 141613585 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 141613621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141614514 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141614740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141615891 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141616040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141616043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141616071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141616131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141616187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141616212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141616283 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141616574 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 141616609 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 141616918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141617199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141618479 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 141620632 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 141621549 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 141621555 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 141621565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141622233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141622977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141623237 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141625005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141625324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141625349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141625435 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141625436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141625607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141625933 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 141626301 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 141626558 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 141626600 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 141627273 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 141627284 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 141627316 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 141627346 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141627357 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 141627464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141627500 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 141627701 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 2 141627712 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 2 141627742 T A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 2 141627797 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 141627849 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 141627900 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141627933 T G N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 141627981 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 141628027 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 141628072 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 141628138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141628153 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 141628226 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 141628324 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 141628352 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 141628442 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 141628458 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 141628513 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 141628605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141628696 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 141628892 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141628911 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 141628914 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 141628927 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 141629047 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141629066 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141629084 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141629115 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 141629211 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141629241 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141629351 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141629422 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 141629577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141629665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141629976 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141630208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141630348 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141630885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141630944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141630946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141631268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141631345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141631896 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 141632239 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141632241 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141632509 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141632567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141632783 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141632799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141633002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141633702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141633707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141634001 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 141634593 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 141634660 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 141634702 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 141634731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141634850 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 141634948 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 141634949 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 141634959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141635683 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 141635778 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 141635823 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 141636023 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141636243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141636289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141636302 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141636320 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141636503 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141636608 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141637275 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 141637282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141637414 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 141637669 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141638004 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 141638007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141638037 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 141638096 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 141638109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141638128 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 141638136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141638178 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 141638875 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141639350 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141639353 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 141639400 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 141639470 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141639492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141639517 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 141640005 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 141640020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141640079 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141640193 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 141640385 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 141640450 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 141640462 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 141640504 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 141640569 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 141640596 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141640616 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 141640672 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141640951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141640958 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141640985 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141640992 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141641080 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141641123 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 141641192 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 141641200 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 141641268 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141641272 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 141641293 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 141641364 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141641458 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 141641474 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 141641697 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141641701 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141641740 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141641754 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141641861 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141641889 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141642445 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 141642461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141642697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141642754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141642935 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141642992 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141643252 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 141643294 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 141643332 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141643337 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 141643384 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141643387 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141643598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141643613 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141643703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141643830 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 141643868 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 141643911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141644029 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141644063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141644077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141644140 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 141644141 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 141644159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141644236 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 141644275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141644401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141644880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141645454 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 141645457 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 141645566 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 141645678 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 141645866 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 141646638 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 141646819 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 141646865 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 141646956 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 141646959 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141647517 C T Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 2 141647842 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 141647983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141648066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141648110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141648158 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 141648159 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 141648185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141648306 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 141648719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141649032 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141649135 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 141649512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141649916 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 141649962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141650131 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 141650301 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141650939 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141650942 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141651132 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141651181 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 141651439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141651459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141651927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141652604 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141653066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141653254 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 141653264 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141653508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141653764 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141653896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141653998 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 141654119 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141654243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141654311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141654426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141654454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141654814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141654871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141654942 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 141654989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141655011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141655126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141655270 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141656167 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141657555 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141658825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141658968 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141659843 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141661461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141661784 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141662004 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 141662084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141662425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141664109 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 141664132 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141664285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141664408 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 141664448 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141664601 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141664988 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141665279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141666575 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 141667880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141667890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141667941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141667959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141668539 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141668697 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141669030 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 141669459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141670030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141670838 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141671058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141671222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141671630 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141672957 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141672984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141675607 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 141675608 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141676036 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 141676232 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 141676598 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141677151 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 141677297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141677397 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 141677762 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141678304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141678553 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 141678724 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 141678764 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141679109 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 141679125 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141679192 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 141679356 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141679549 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 141679566 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141679684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141679693 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 141679801 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 141679858 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141679895 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 141679898 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 141679907 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 141680030 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 141680038 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 141680317 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141680319 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141680330 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141680488 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141680654 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141680664 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141680709 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 141680817 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 141680832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141680927 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.0666666666666667 0.8 0.133333333333333 14 16 1 12 2 2 141681017 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 141681031 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 141681112 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 141681130 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 141681159 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 141681329 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141681335 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141681354 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 141681450 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 141681454 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141681466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141681478 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 141681541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141681572 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141682900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141683266 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 141686537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141687158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141687239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141688122 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 141688173 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 141688265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141688302 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 141688931 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141689185 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 141689683 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141689755 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141690090 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141690123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141690126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141690229 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141690264 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141690331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141690903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141691066 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 141691132 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 141691229 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 141691276 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141691332 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141691337 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141691345 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141691484 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 141691508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141691547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141691720 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 141691842 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 141691849 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 141692010 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 141692076 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 141692090 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 141692097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141692142 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 141692147 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 141692184 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 141692193 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 141692357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141692982 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 141693108 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141693349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141694317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141694575 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 141694863 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141695567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141695721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141695842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141696735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141696889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141697163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141697209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141697723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141698684 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 141699537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141700048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141701242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141702889 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 141702897 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 141702943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141706997 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 141708198 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 141708393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141708987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141709107 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141709123 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 141709232 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 141709240 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 141711217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141712466 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 141713044 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 141713648 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 141713652 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 141713817 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 141713855 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 141713893 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 141713971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141714192 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141714517 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141714650 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 141714901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141715416 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 141715647 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 141715928 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 141717000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141717022 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 141717607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141717965 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 141717996 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 141718036 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 141718401 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 141718955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141718986 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141719087 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 141719182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141719210 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 141719357 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141719362 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 141719724 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 141719890 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 141720378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141720579 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141720748 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141720784 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141720965 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141721010 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141721279 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141721960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141722042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141722102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141722129 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141722151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141722202 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 141722207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141722229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141722244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141722266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141722332 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 141722469 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 141722597 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141722609 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 141722921 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 141722922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141722996 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 141723008 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141723310 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 141723325 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 141723359 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141723438 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 141723441 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 141723463 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141723541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141723601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141723608 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 141723844 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 141723975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141724106 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 141724207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141724946 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 141724951 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 141731533 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141731562 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 141731645 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 141731717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141731728 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 141731858 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 141731961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141732597 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 141732891 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 141732960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141733155 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 141733529 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 141733936 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 141734098 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141734587 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141734891 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 141734912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141734942 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141736447 C A N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 2 141736718 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141736834 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 141737138 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 141737319 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 141737603 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141737640 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 141737641 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 141737740 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 141738127 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 141738161 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 141738752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141739129 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141739627 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 141740134 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 141740135 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 141740796 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 141741008 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 141741284 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141741589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141741684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141741998 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141742050 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141742690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141742840 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141742964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141743083 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141743299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141743825 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141743826 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141744064 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141744154 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141745256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141745481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141745489 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141747316 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 141747582 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141747954 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 141748032 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141748047 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141748069 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141748107 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141749849 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141750147 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 141750804 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141750912 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141751065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141751437 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 141751455 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141751731 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141751764 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 141751839 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141751953 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141752245 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 141752643 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141752793 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141752998 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141753395 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141753568 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141753842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141754045 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141754838 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141755846 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 141756201 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 141757507 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141758016 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141758062 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141758321 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141758396 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141759904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141760175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141760945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141761195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141761330 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 141761456 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141761719 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141762083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141762105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141762605 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141763543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141763816 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141763986 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141764029 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141764092 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141764182 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 141764326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141764586 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141764650 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 141764740 G C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 141764765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141764847 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141765056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141765433 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 141765676 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 141765914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141766523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141766570 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141766717 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 141767015 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 141767018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141767032 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 141767295 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 141767492 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 141767493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141768258 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141769347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141769590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141770448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141771807 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141772287 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141773148 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141773231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141773932 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141774035 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 141774168 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141778076 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 141778765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141779619 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 141780007 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 141780008 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 141780425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141782151 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 141782555 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141782976 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 141783007 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 141783086 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 141783140 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 141783191 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 141783261 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 141783341 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141783400 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 141783414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141783416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141783466 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141783587 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141783730 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141783837 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 141783890 T G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 141783953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141784034 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 141784221 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141784361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141784415 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141784477 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 141784509 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141784526 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141784559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141784568 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141784586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141784653 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 141784729 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141784983 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 141785252 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141785333 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 141785543 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 141785616 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 141785803 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 141785808 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 141785816 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 141786263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141786712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141790446 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141791203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141791891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141793059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141795575 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141796440 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 141797007 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 141797234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141797236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141797585 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141797750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141798887 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 141798971 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141799146 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141800616 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 141800837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141800939 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 141801344 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141801484 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141801853 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 141802396 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141803240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141803296 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 141803310 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 141803323 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 141806577 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 141806843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141807184 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 141807283 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141807306 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 141807354 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 141807360 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 141807890 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141808075 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141808117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141809883 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141809905 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141809933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141810047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141810080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141810086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141810216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141810281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141810410 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141810429 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141810719 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141810747 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 141810792 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141810828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141810845 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141810859 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141810927 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 141810985 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141811000 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141811014 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141811099 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141811138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141811163 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 141811254 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141811354 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141811405 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141811510 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141811538 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141811540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141811614 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141811679 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141811759 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 141811828 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 141811867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141811939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141812219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141812261 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141812272 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141812300 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141812323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141812332 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141812370 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141812441 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141812896 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141812915 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 141812930 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 141812964 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 141812999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141813032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141813093 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 141813171 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141813230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141813284 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 141813306 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 141813324 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 141813345 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 141813362 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 141813656 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 141813721 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141813786 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 141814894 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 141814897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141815041 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 141815111 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 141815186 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 141815255 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 141815632 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 141815770 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 141815897 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 141815966 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 141816038 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 141816134 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141816180 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 141816270 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 141816310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141816311 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 141816610 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141816948 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141818168 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141818305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141819940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141820156 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141820614 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141820820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141821910 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141822166 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141822183 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141822279 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 141822401 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141822911 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 141823142 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141823299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141824140 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141824803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141825035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141825224 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141825411 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 141825612 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 141826144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141826160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141826394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141826602 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141826657 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141826744 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141826804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141826947 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141827195 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141827216 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141827248 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141827647 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141828025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141828068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141828095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141828253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141828525 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141828780 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141829662 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141830079 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141830581 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141831264 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141831289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141831528 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141831610 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141831698 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141832289 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141833009 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141833353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141833529 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141833601 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141833602 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141833779 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141834262 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141834469 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141834510 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141834684 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 141834707 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141834828 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141835092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141835109 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141835179 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141835222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141835283 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141835340 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141835404 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141835466 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141835475 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141835604 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141835737 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141835747 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141835815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141835895 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141835909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141835951 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141836041 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 141836082 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141836099 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141836378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141836421 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141836546 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 141836560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141836755 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 141836966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141837243 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141837271 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141837292 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141837301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141837464 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141837706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141837850 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 141837974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141838009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141838116 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 141838139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141838181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141838251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141838942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141839038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141839112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141839138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141839281 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141839487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141839920 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141840054 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141840317 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141840665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141841051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141841138 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141841564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141841615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141841981 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 141842215 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 141842322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141842344 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 141842391 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141842635 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 141842677 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141843701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141844363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141845258 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141845280 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141845765 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141845816 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 141845903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141845939 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141846009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141846150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141846178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141846288 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141846369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141846625 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141846647 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141846817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141847679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141848066 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141849265 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141851094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141851664 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141853830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141854473 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141856775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141856864 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141857226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141857367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141859952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141860552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141860841 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 141860928 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141861379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141861481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141861573 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 141862195 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141863548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141863844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141864883 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141864888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 141865958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141866411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141866815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141867027 C A Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 141867725 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 141869198 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141870335 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 141872073 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141873109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141876126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141883197 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141886543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141886738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141890329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141893436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141894437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141894856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141894882 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 141895033 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 141895160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141895270 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 141897046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141897361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141898252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141898500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141899425 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141900288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141900452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141902229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141903525 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141903643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141906080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141906587 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141908732 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141910170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141911316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141911415 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141912736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141912910 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 141915103 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141915785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141917280 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141917287 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141917359 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 141917389 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141917546 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141917703 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 141917844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141917857 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141918291 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 141918980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141919226 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141919861 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141920563 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 141920654 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 141920682 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 141920945 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141921005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141921009 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141921030 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 141921205 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141921531 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141921551 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141921930 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141922348 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141922596 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141922947 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141922954 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 141923565 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 141923921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141923932 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 141924284 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 141924309 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141924933 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141925934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141926387 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 141926799 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141927050 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141928470 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141928823 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141928828 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141928843 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141929260 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141930450 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 141930534 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 141930640 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 141930714 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141930763 A C Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 141930821 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 141930907 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 141931898 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141932088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141932289 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 141932508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141932967 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 141933111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141933368 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 141934556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141935377 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141935705 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 141935706 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 141935949 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 141936589 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141936597 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 141937299 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141937388 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 141937448 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 141938469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141938693 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 141939279 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 141939495 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141939889 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 141940035 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141941093 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 141941410 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 141941553 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 141941611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141942050 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 141942087 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141942546 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 141943152 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 141943209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141943241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141943259 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 141943332 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 141943347 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 141943365 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 141943474 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141943798 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 141944398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141944475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141944634 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 141944936 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 141944993 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141945092 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141945803 C A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 141945905 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 141946293 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 141946372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141946456 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 141946490 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 141946617 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 141946666 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 141946753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141946844 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141947264 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 141947265 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 141947291 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 141947358 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 141947383 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 141947440 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 141947571 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 141947712 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 141947745 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 141948081 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141948102 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 141948125 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141948292 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 141948767 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 141948787 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141948853 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 141948869 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 141948888 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 141948897 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 141948975 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141949094 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 141949150 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 141949547 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 141949554 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 141950647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141951030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141951083 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141951159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141951214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141951367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141951378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141951681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141951804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141951810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141951824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141953835 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 141956024 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141956170 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 141956191 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 141956232 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 141956234 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141956391 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 141956478 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 141956687 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141956773 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141956800 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 141956999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141957125 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141957236 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 141957289 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 141957335 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141957505 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 141957775 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141957843 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 141958046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141958111 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 141958129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141958925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141958938 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141958979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141959083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141959108 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141959125 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141959141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141959224 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141959277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141959289 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141959295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141960299 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 141962261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141963021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141963503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141964326 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141965558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141965950 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141967084 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141967631 A G Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 2 141968842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141969100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141970704 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 141971189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141972530 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 141973163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141973312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141973594 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 141973611 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 141977494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141978862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141978888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141978971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141980030 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 141981263 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141981759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141981912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141983805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141988753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141989861 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 141990271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141990692 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 141990875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141991008 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 141991053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141993140 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141993625 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141994187 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 141994218 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 141994775 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141994804 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 141995082 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 141995139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141995298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141996275 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 141996440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141998409 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141998573 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141999613 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 141999668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 141999976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142000630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142000895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142001439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142002533 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 142002950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142005196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142006271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142006343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142006469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142007129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142007140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142007697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142009635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142009989 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 142010860 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 142012388 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142012678 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 142013058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142013077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142013438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142013449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142013616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142013954 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 142014253 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 2 142014455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142014473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142014723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142015292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142015358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142015827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142015836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142017345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142017591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142019517 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 142020991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142021086 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 142021787 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 142030599 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142033376 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142033565 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142034733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142035016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142035599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142035783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142036265 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142037325 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142037410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142039392 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 142039590 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 142039679 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 142039711 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 142039734 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 142039771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142039903 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 142040021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142040358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142041336 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 142041391 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142041683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142041917 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 142041930 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 142042329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142042334 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142042347 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142042369 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 142042374 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142042471 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142042565 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142042681 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 142043425 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 142043476 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 142043501 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 142043504 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 142043513 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 142043573 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142043634 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 142043825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142043977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142044129 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142044207 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142044245 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142044259 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142044270 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142044272 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142044298 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142044310 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142044396 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142044616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142045027 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142045028 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142045267 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142045599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142045641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142045670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142045805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142045900 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 142046016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142046724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142047675 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 142049405 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 142049736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142049788 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142049797 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 142049889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142049930 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 142050060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142051018 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142051133 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142051564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142052727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142052787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142053059 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142053330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142053333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142053363 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 142053519 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 142054209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142054243 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142055511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142056968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142058653 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142060282 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 142066842 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 142066857 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 142067097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142067962 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 142068387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142068599 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142068683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142068900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142069367 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 142069877 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142070048 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 142070349 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142071090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142071454 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 142071603 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 142071787 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142072197 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 142072569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142072919 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142072978 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 142073450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142073570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142073588 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142073659 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142073730 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 142073733 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 142073869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142073884 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 142073917 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 142074033 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 142074238 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142074294 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142074396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142074407 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 142074590 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142074623 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 142074687 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142074698 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 142074733 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142074740 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 142074756 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 142074827 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 142074836 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 142075156 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 142075489 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142075507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142075929 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 142075930 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 142075955 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142076127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142076373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142076697 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 142076827 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 142076846 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 142077723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142077788 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 142077924 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142077967 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142077970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142078161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142078178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142078196 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142078268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142078563 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142078803 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 142079038 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142079378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142082824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142088252 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 142090702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142092360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142092946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142094685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142095541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142095793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142098184 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142098257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142098320 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142099462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142100982 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142101033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142101139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142101771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142102275 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 142102564 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142102656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142103133 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 142103173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142103475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142103501 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142103513 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142103763 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142103794 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 142103846 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142104686 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 142104758 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142104896 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142104903 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142104956 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142105207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142105225 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 142105494 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142105529 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142105706 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 142105897 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 142105901 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 142105929 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 142105961 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 142106065 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 142106187 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 142106235 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 142106299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142106319 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 142106333 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 142106504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142106732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142107341 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 142108836 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142110449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142110723 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 142111074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142111659 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 142111737 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 142111764 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 142111899 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142112118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142112251 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 142112371 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 142113038 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142113385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142113837 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142113922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142114096 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 142114923 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142114949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142115858 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142117112 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 142117429 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 142117689 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142118130 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 142119664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142120486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142120524 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 142120578 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 142120674 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 142121077 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 142121578 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 142122468 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 142122530 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 142122657 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 142122852 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142123180 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 142123223 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 142123240 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 142123390 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 142123698 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142123812 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 142124009 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142124244 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 142124297 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 142124304 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 142124464 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 142124588 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 142124884 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 142125049 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 142125120 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 142125121 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 142125325 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142125437 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 142125451 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 142125515 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 142125558 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 142125612 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142125729 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 142125748 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142125876 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142125882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142125947 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 142126129 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142126212 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142126237 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 142126356 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142126435 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 142126526 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142126556 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142126575 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142126655 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 142126663 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142126682 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142127080 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142127105 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 142127362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142127386 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142127397 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142127533 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 142127565 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 142127575 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 142127841 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 142129258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142131390 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142137829 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142138256 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 142138704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142139240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142139563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142140410 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142141590 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142141726 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142141731 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142142039 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142142253 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 142142502 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142142583 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142142654 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142142796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142142816 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 142142818 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 142142901 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142143080 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142143134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142143232 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142143237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142143411 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 142143430 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142143634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142143828 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142144252 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 142144359 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142144440 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 142144536 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 142144563 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 142144687 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 142144694 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 142144860 T G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 142145107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142145204 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142145341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142145421 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142145707 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142145768 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142145966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142145970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142146037 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142146370 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142146519 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 142146520 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 142146563 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142146645 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 142146870 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142146969 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 142146987 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 142147030 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142147080 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 142147207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142147311 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 142147336 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 142147474 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 142147476 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 142147511 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142147549 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142147783 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 142147821 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 142147830 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 142147848 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142147895 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 142147927 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 142147981 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 142148032 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142148189 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 142148203 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142148206 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142148226 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142148307 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142148313 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142148354 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142148465 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 142148471 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 142148477 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 142148546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142148596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142148599 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142148666 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 142148716 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142148727 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 142148758 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142148781 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142148949 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142148960 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142149074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142149085 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142149377 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 142149454 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 142149460 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 142149484 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 142149918 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142150096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142150105 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142150172 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 142150710 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 142150797 A T N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 142150834 T C N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 142150856 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 142150985 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 142151175 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142151187 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142151207 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142151223 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142151422 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 142151446 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 142151457 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 142151466 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 142151498 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142151579 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 142151788 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142151823 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 142151843 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 142151931 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142152048 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142152052 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142152085 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142152181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142152252 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142152287 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142152311 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142152327 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142152345 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142152361 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142152376 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142152485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142152490 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142152563 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 142152588 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 142152618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142152797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142153705 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 142153927 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 142153933 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 142153974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142154229 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 142154278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142154329 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 142154343 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 142154355 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 142154597 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 142154714 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142155052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142155095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142155117 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142155234 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 142155251 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142155295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142155346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142155959 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142155980 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 142155982 G T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 142156040 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 142156431 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142156741 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 142156846 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 142156878 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 142157025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142157068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142157189 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142157393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142157482 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 142157529 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 142157636 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 142157638 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 142157659 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 142157714 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142157762 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142157811 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 142157874 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142157935 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 142158025 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142158223 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 142158312 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142158613 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 142158742 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 142158743 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 142158784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142158819 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142158987 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 142159130 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142159230 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142159387 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 142159655 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 142159851 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142159859 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142160027 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 142160054 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142160110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142160245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142160328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142160483 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142160593 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 142160618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142161102 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 142161684 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142162003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142162155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142162228 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142162260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142162386 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 142162482 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142162547 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142163590 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 142163624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142163690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142163742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142164011 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 142164402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142164427 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142164526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142164640 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142164801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142164926 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142165161 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142165261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142165485 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 142167954 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 142169162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142171460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142171470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142171506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142171566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142171591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142171594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142171675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142172215 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142173716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142173728 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142173779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142174007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142174057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142174712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142174990 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142175069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142175109 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 142175159 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 142175350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142175389 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142175405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142175504 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142175518 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142175871 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 142176591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142177220 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142177465 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142177599 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142177618 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142178321 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142178367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142178667 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142178718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142178880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142178998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142179062 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142179230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142179313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142179362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142179441 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142179506 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142179581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142179805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142180179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142180182 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142180366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142180565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142180907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142180993 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 142181065 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 142181072 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 142181088 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 142181103 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 142181341 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142181370 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 142181401 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142181412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142181635 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142181708 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142181800 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142181855 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142181880 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142181898 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142181910 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142182123 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142182257 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142182440 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 142184156 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 142184168 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 142185116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142185258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142185259 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 142185387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142185420 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142185504 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 142185572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142185792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142185854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142185946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142186008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142186386 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142186751 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 142186842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142186902 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142186995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142187056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142187094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142187508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142187673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142187741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142189181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142189717 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 142189816 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 142190246 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 142190532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142190828 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 142190876 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 142191112 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 142191671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142191787 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 142192085 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 2 142192717 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142192759 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142192784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142193008 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142193084 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 142193251 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 142193366 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142194645 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142194713 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142194792 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142195088 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142195553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142195592 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142195724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142196053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142196541 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 142197168 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142198600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142199148 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142199370 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 142200323 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 142200420 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142200509 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142200552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142200601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142200683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142200816 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 142200891 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 142200915 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 142201352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142201383 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 142201473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142201491 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 142201884 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142202021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142202463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142202561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142202664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142202793 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 142202803 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142202811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142202814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142202866 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142203075 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 142203205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142203332 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 142203384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142203765 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 142203802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142203832 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 142204097 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142204220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142204760 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 142205080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142205262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142205268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142205310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142205417 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142205667 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142205700 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142205828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142205881 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142205935 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142205964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142206587 A T N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 142206706 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 142206917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142208099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142208213 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142208279 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 142208349 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142208350 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142208686 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142213051 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 142213340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142213555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142214432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142214761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142217276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142218999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142222949 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 142228077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142228122 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142229437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142230236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142230305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142230396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142230788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142230871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142231243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142232894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142233649 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142234026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142250368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142253607 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 142254461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142258158 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 142259356 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 142259520 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142259604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142259690 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142259740 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 142259895 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 142260059 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142260367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142260826 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 142260830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142261141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142261559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142262488 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142264584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142264625 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142264829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142265323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142265406 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142265571 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142265763 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142265897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142266697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142266787 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142267784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142269493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142269808 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142270572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142271103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142271139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142272131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142273019 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142273521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142274835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142275888 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 142276034 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 142276807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142277345 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142277386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142277388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142277470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142277717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142277941 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142278022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142278552 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142278591 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 142278656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142278861 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142279036 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142279106 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 142279141 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 142279185 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142279193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142279225 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 142279342 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142279437 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142279504 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 142279530 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142279657 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142279793 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142279814 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142280290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142280451 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142280585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142280623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142280651 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 142280928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142280954 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142280955 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142280985 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 142281521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142281546 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 142281580 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 142281782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142281837 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142281985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142282160 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142282183 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142282196 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 142282219 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 142282302 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 142282325 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 142282328 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 142282433 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142282472 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 142282503 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142282567 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142282666 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 142282734 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 142282755 A T Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 142282769 A G Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 142282818 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 142282865 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 142282877 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 142282891 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 142282905 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 142283003 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 142283043 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 142283056 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 142283153 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 142283232 C G Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 142283292 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142283398 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 142283475 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142283486 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 142283528 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 142283549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142283577 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142283599 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142283612 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142283617 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 142283648 A T Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 142283661 T C Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 142283719 C G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 142283723 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 142283733 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 142283744 C G N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 142283807 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 142283889 G T Y N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 142283955 G C Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 142284003 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 142284008 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142284057 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 142284089 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 142284101 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 142284128 T G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 142284142 A T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 142284168 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 142284175 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 142284228 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 142284251 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 142284258 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 142284271 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 142284388 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 142284419 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142284431 T A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 142284463 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 142284504 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 142284518 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 142284535 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 142284666 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 142284694 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 142285281 A G Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 2 142285301 T C Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 142285367 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 2 142285375 G T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 142285490 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142285509 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142285604 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 142285721 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 142285786 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 142286342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142286412 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 142286462 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 142286519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142286761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142286784 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142286820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142286893 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 142287072 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 142287094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142287213 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 142287258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142287292 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 142287307 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 142287340 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142287394 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142287460 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142287488 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142287523 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142287613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142287632 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142287741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142287792 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142287886 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142287903 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142287915 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142288124 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142288136 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142288164 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142288241 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142288295 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142288361 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142288374 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142288479 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142288615 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142288832 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142288845 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142288962 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142289143 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 142289146 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 142289169 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 142289240 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 142289535 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 142289753 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 142289764 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142289791 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 142289843 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142289846 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142289884 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 142296490 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142296521 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142296593 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142296595 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 142296623 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142296624 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 142296702 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 142296817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142296844 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 142296907 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 142296928 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 142296930 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 142296980 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 142296999 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142297056 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142297106 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142297121 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142297312 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142297326 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142297341 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142297352 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142297653 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 142297671 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142297826 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142298164 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142298465 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 142298490 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142298530 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142298605 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142298657 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142298873 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 142298879 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 142298983 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 142301868 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142302088 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142302251 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142302291 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142302317 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142309132 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142309152 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142309172 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142309185 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142309480 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 142309495 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 142309585 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 142309587 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 142309675 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 142309678 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 142309704 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142309737 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142309761 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142309895 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142309896 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142309964 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142310087 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 142311296 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 142311524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142311675 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142311782 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 142311888 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142312022 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142312066 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142312073 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142312270 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142313420 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142313471 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142313838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142314464 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142314693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142315233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142316119 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142316591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142316706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142316934 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142316940 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142317310 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 142317487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142318011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142319843 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 142320020 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142320275 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142320393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142321515 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 142322644 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 142322655 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 142324191 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142326673 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 142327167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142327513 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142327582 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142327613 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142327759 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142328005 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142328640 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 142328668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142328677 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142328741 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 142328977 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 142329217 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 142329339 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 142329908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142330550 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 142331320 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142331560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142331953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142332293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142332328 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 142332737 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 142332751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142333314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142333477 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142333479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142333492 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 142333644 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 142333719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142333816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142333840 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 142333874 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 142334598 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 142334713 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 142334766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142334949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142334989 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142335164 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 142335380 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142335457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142335718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142335746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142336094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142336150 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 142336166 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142336200 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 142336626 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142336666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142336773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142336785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142337225 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 142337241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142337247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142337375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142338138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142338140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142338214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142338238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142338374 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 142338393 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 142338436 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142338444 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 142338530 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 142338544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142338554 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 142338584 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 142338604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142338662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142338677 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 142338689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142338789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142338917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142338960 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142339174 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 142339179 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 142339273 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 142339572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142339578 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 142339835 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142339919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142340108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142340113 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142340176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142340191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142340391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142340774 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142340919 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 142341167 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 142341213 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142341283 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142341288 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142341485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142341618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142341916 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 142342053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142342101 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 142342132 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 142342143 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 142342152 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 142342155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142342359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142342612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142342902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142342977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142343036 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 142343066 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 142343224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142343513 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 142343682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142343953 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142344006 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142344031 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142344088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142344093 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142344164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142344869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142345525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142345861 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142345971 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142346016 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142346029 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 142346080 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 142346123 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 2 142346235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142346332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142346336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142346822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142346979 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 142347034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142347332 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 142347398 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 142347430 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 142347656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142348123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142348180 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 142348217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142348683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142348810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142348830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142348878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142348911 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 142348918 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 142348924 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 142349200 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 142349454 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142349562 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142349659 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142349845 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142349975 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142349986 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142350120 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142350260 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142350415 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142350551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142350592 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 142350606 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 142350620 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 142350756 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 142351413 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142351486 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142351578 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 142351579 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 142351608 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 142351654 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142351684 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 142351685 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 142353583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142353994 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142354000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142354182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142354188 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 142354201 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 142354474 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 142354528 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142354534 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142354578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142355016 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 142355136 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142355218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142355238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142355269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142355412 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 142355484 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142355716 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 142355726 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 142357950 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 142358437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142358776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142360318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142360391 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 142360435 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 142360515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142360534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142360636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142360639 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142360665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142360678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142360761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142360816 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 142360948 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 142361024 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142361188 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142361250 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 142361362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142361645 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142361708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142361820 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 142361851 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142361969 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142361976 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142362479 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142362585 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 142362678 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142362688 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 142362870 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 142362987 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 142363029 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 142363093 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 142363111 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 142363120 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142363132 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 142363184 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 142363248 C G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 142363250 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 142363353 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 142363441 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142363469 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142363519 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 142363618 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 142363644 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 142363684 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 142363696 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 142363708 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142363755 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 142363826 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142363864 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142363877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142363883 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142363895 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142363952 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 142364154 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 142364169 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142364196 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 142364235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142364329 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142364363 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142364370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142364423 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 142364778 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 142364802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142365313 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 142365495 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142365561 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142365592 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142365675 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142365676 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142365771 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142365918 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142366081 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142366240 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 142366513 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 142366860 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142367187 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 142367370 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 142367543 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142368028 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 142368146 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 142368776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142370218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142370278 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 142370477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142374912 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142375641 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142378135 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142379844 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 142380508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142381226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142381699 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142382026 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 142382345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142382486 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 142382514 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 142382561 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142382707 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142382843 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142382883 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 142383038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142383076 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142383091 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142383106 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142383548 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142383605 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142383659 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142383670 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 142383915 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 142383965 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142384057 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142384420 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142384556 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142385367 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 142385570 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 142385770 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142386006 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142386419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142387010 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142387023 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 142387257 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 142387395 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 142387409 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 142387425 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142387569 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142387795 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142387866 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142387938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142387946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142388419 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 142388580 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 142388776 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 142388922 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 142388981 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 142389017 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 142389164 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 142389166 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 142389417 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 142389546 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 142389575 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 142389627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142389759 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 142390104 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 142390115 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 142391334 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 142391366 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 142391616 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142391758 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 142391773 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 142391791 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 142391861 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 142392056 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142392335 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 142392755 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142393343 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 142393481 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 142393811 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 142393813 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 142393849 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142393883 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142393990 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 142394042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142394422 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 142394544 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142395024 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 142395235 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 142395289 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 142395327 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142395352 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 142395425 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 142395683 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 142395737 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 142395901 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 142396049 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142396105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142396430 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 142401950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142402603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142402650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142403398 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142404621 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 142404625 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 142404675 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 142404875 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 142404911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142404947 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 142404948 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142405147 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 142405326 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142405749 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 142405906 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 142406026 C T Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 142406578 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 142406583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142406644 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 142406649 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 142406880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142406882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142406952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142407023 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 142407636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142407677 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 142407810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142408000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142408078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142408095 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142408133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142408264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142408281 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142408422 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 142408434 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 142408435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142408524 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 142408663 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 142409794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142410290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142410443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142410686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142411201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142411569 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142412001 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142412677 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142412692 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 142412810 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142413339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142413393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142413408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142413542 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 142413640 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 142413649 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142413671 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 142413764 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142413765 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142413816 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142413827 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 142414069 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 142414119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142414134 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 142414315 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142414329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142414360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142414409 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 142414727 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 142414811 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 142414861 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142415104 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142415292 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 142415374 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142415414 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142416167 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 142416186 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142416232 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142416235 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142417522 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 142417578 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 142417591 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 142417686 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 142417694 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 142417851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142417926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142417973 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 142418129 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 142418987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142419697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142420248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142421801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142423069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142423754 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142423877 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142423881 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142424263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142424370 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142424377 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142424922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142425190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142425297 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142425623 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 142425741 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 142425839 C A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 142425937 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142426088 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 142426204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142426264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142426310 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142426463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142426977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142427023 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 142427112 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 142427485 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 142427524 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 142427657 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142427855 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 142427994 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 142428705 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 142428743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142429223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142429548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142429710 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142429720 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142430103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142430130 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 142430296 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 142430329 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 142430439 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142430459 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142430483 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 142431045 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142431057 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142431075 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142431210 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 142431220 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142431234 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 142431255 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 142431262 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 142431327 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 142431447 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 142431633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142431638 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142431666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142431981 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 142432129 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 142433460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142433735 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142434270 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 142434318 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142434780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142435497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142435859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142437094 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142438596 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142440674 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 142441438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142443101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142443255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142443645 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 142443735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142443805 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 142443814 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142444029 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 142444056 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 142445196 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142445737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142445761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142446018 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142446741 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142446830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142447064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142447145 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 142447445 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142447807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142448678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142449249 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142449500 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 142449731 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142449950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142450060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142450401 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142451476 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 142451477 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 142451628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142452928 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142453636 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 142453788 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 142453820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142454378 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142455705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142456040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142456476 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142456491 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 142456787 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142456788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142457327 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 142458463 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142458471 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 142458488 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142458617 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 142458719 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142459817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142459952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142460154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142460610 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142460732 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 142460782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142460801 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142460878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142460969 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 142461064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142461067 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142461336 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 142461348 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 142461368 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142461489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142461647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142461716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142461733 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142461752 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142461965 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142462175 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142462202 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142462380 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 142462456 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142462559 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142462616 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142462746 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 142462755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142462771 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 142462798 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 142462918 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 142463077 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 142463221 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 142463371 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 142463437 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142463452 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 142463928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142463944 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 142464108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142464131 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142464380 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142464505 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142464513 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142464727 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 142464782 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142464858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142464886 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142464931 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142465043 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142465063 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 142465085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142465435 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 142465859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142465938 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142466265 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 142466770 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142466953 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 142467132 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 142467260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142467339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142467891 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142469511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142470053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142470467 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142471201 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142472261 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142472773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142473125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142475982 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142476977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142477728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142480962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142481831 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142482866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142484493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142484734 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142484806 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142485553 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142490376 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142490694 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142490773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142490791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142490932 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142491099 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142491117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142492962 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142494602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142494632 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142494766 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 142494770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142494851 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 142495162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142495681 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 142495809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142495889 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142495892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142495922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142495941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142495970 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 142496253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142496313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142496377 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142496381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142496633 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 142496842 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 142497144 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142497198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142497204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142497419 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 142497500 T C N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 142497696 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 142498347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142498366 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 142498933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142499056 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142499744 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 142499791 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142499910 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142500753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142500953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142500997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142501127 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142501329 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142501625 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142501633 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142501665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142501667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142501707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142501759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142501835 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 142502052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142502061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142502066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142502223 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142502454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142502459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142502483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142502542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142502570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142502592 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142502640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142502656 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142502850 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 142502873 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142503084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142503137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142503422 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142503569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142503595 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 142503685 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 142503701 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 142503749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142503873 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142503954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142504043 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142504048 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 142504093 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 142504133 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142504179 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 142504284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142504319 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142504374 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 142504379 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 142504524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142504676 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142504713 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 142504778 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 142504779 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 142504963 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 142505814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142505855 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142506072 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142506317 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142506386 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 142506598 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142506599 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 142506620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142507185 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142507429 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142507648 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 142507698 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 142507775 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142507791 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142507828 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 142507903 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142507910 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142507991 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142507992 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142508201 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 142508292 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 142508303 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142508785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142508812 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142509041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142509109 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142510465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142510825 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142511366 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 142511518 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 142513398 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142513544 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142514631 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 142514690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142514745 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142514858 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142514936 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142515002 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 142517859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142518085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142518650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142518716 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142520062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142520104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142520173 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142520334 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142520371 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142520711 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142521427 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142521606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142522188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142522398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142526301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142526407 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142528735 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142528775 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 142528777 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 142529601 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142530131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142530709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142531261 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 142538189 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142539814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142540462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142541316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142541450 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 142542502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142543813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142543993 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142544595 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142544626 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142544774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142545902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142546035 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142546885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142547224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142547954 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142548095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142548283 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142548463 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142548496 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 142548890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142548915 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 142549815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142550173 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 142550411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142550433 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142550434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142550615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142551559 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142551944 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 142552204 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 142552627 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142553016 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142553121 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 142553542 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 142553712 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 142553918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142554937 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142555492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142555586 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 142555655 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142556810 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142556852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142556881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142556907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142557037 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142557179 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142557526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142558312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142558480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142559338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142559592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142560118 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142560417 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142560612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142560761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142561695 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142561779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142562007 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142562168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142562493 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142564272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142564295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142565589 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 142565853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142566221 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142567002 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 142567919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142568273 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142568314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142568748 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142568879 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142569825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142571434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142572269 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142573367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142573924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142575131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142575554 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142576986 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142577403 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 142578267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142578409 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142578602 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142578864 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 142578884 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 142578939 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142578940 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 142579354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142584085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142584959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142586457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142587978 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 142588600 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 142588848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142589188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142592074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142592100 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142592122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142592295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142592303 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142593517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142594295 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 142596160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142597644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142598342 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142599407 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142599422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142599580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142600264 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142600410 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142602177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142607788 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 142608608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142609087 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142609279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142610181 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 142611720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142612143 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 142612934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142613346 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142614471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142614856 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142621958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142622031 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142622226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142624865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142624984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142625298 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 2 142626450 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142626713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142626872 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 142627321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142629784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142629808 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142631802 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 142632012 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 142632274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142632760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142634842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142634961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142636482 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 142636668 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 142638709 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142638810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142640252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142640425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142640493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142646522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142651360 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 142654110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142655169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142655205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142655304 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 142655995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142656876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142657116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142657434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142658847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142658869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142659203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142661158 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142662790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142665395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142665966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142666579 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 142667083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142673284 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 142673419 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142673612 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 142675191 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142676258 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142676806 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 142680149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142680946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142681197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142681283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142681903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142683326 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142686091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142686765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142686828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142686838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142686848 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 142687325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142687326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142687348 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142687466 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 142687629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142687694 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142687697 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 142688635 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142691538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142692585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142694730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142696144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142696283 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 142696387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142696529 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142699066 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 142699322 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142699747 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142701730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142702157 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142703832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142704388 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142704518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142704534 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 142704536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142704644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142704710 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 142705224 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 142707243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142709705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142711873 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 142715007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142716110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142716214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142716215 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142717315 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142717688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142717842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142718940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142719456 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142719520 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142719573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142719683 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142719689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142720158 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 142720208 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 142720518 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 142720722 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142720736 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 142720834 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 142721235 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 142721510 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 142721511 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 142721521 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 142721582 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142721759 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 142721823 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142722102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142722118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142722178 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 142722321 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 142722438 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 142722491 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 142722553 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142722658 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 142722858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142723032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142725089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142725202 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 142725759 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 142725779 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 142726273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142726407 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 142726445 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 142726929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142727605 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 142728653 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142731358 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 142731699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142732920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142733553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142734755 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142734934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142735138 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142735173 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 142735177 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 142735443 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142735458 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 142735563 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142735636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142735881 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 142736000 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142736039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142736110 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 142736265 A C N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 2 142736287 C T N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 142736330 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 142736471 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 142736725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142737064 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 142737473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142737484 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 142737770 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 142739026 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 142739201 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142739466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142739558 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 142740226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142740942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142740947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142741938 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 142741986 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 142742171 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 142742378 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 142742818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142743270 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142743357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142743630 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 142743634 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 142743654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142743775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142744586 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142744626 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 142744894 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 142745095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142745244 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 142745351 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 142745439 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 142745572 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 142745595 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 142745693 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 142745707 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 142745795 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 142745898 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 142745914 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142745934 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 142745974 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 142746144 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 142746221 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 142746231 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 142746376 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 142746383 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 142746422 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142746428 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 142746866 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 142747034 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 142747199 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142747300 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 142747839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142747891 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 142748036 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 142748143 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 142748253 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 142748291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142748348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142748380 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 142748382 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 142748719 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 142748780 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142748785 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142748804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142748876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142749145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142749259 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142749371 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142749599 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142749607 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142749874 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142750094 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 142750505 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142750772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142750893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142751052 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142751402 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 142752248 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142752814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142753073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142753862 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142754503 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 142754642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142755443 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 142755580 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 142755681 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 142756198 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 142756203 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 142756256 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 142756314 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 142756336 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 142756352 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 142756505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142756864 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 142757006 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 142757381 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 142757499 A G Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 142757715 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142758044 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 142758456 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142758611 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142758945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142759103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142759444 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142760364 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 142760462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142760623 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142760700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142760719 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142760858 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142760895 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 142760937 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142760938 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142761005 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142761191 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142761297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142761354 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142761860 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142762622 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142762668 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 142762695 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 142762776 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 142762822 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 142762843 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 142762876 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 142762936 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 142763111 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 142763112 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142763150 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 142763361 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142763368 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142763392 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142763538 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142763658 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142763685 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142763728 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 142763750 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 142763965 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 142764311 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 142764678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142764760 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142764787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142764820 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 142764830 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 142764855 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 142765167 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 142765411 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142765491 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142765513 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142765689 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142765811 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 142765870 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142766081 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 142766156 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 142766250 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142766290 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142766471 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142766622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142766642 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 142767163 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142767192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142767321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142767423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142767428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142767562 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 142767609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142767620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142767725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142767802 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 142767855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142767867 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142768123 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 142768515 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 142769127 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 142769193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142769207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142769271 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 142769332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142769452 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 142769498 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 142769657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142769688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142769752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142769777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142769845 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142770060 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 142770080 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 142770190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142770682 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 142771710 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142771743 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142771799 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 142771847 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 142771851 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 142771865 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142771873 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 142771942 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 142772514 A C Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 2 142780422 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 142780440 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142780460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142780471 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142780582 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 142780602 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142780649 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142780678 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142780764 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142780773 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 142781298 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 142781299 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 2 142781338 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142781518 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 142781533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142781620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142781713 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 142781723 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142781847 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 142781991 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 142782228 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 142782305 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 142782456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142782546 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 142782580 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 142783021 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 142783168 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 142783174 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 142783335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142783525 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142784190 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142784376 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 142784416 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142784921 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 142785958 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142786025 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142786168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142786194 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 142786196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142786422 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142786450 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 142786859 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 142787460 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142787598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142787652 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 142789115 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142789161 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 142789275 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142789364 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 142789429 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 142789462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142789477 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142789513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142789524 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 142789589 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142789971 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142790409 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 142791253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142791428 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142791513 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 142791530 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 142791576 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 142791616 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 142791650 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 142791655 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 142791689 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 142791789 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 142791847 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 142791859 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142792106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142792169 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 142792229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142792354 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142792641 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 142792768 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142792980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142793343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142794750 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 142794753 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 142797026 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142797271 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 142797317 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 142797943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142798118 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 142798213 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142798327 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 142798408 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 142798468 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 142798579 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 142798773 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142798887 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 142798962 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 142798978 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 142799090 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142799801 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 142799824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142799853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142799926 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 142800076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142801257 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142801592 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142801593 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142802710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142802718 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 142802761 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 142803373 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 142803508 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142803876 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142803914 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 142803952 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142803964 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 142803973 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 142803979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142804273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142804517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142804521 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 142804704 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 142804737 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 142805094 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 142805118 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 142805199 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 142805272 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 142805419 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 142805542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142805864 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142806067 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 142806123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142806418 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142806460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142806634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142806868 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142807075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142807266 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142807352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142807426 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 142807449 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 142807463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142807903 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142807971 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 142808368 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 142808635 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 142808706 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 142808721 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 142808949 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142809546 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 142810406 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142810632 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142810886 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142811202 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142811467 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142811773 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142813778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142813826 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142813868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142813903 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142814290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142814341 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 142814602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142814614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142815032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142815110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142815315 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 142815337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142815433 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142815484 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142815543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142816022 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 142816176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142816963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142817779 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 142818486 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142819266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142819476 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142819607 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 142819689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142820898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142822554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142822729 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142823782 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142825258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142829924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142830043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142831619 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142831623 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142833132 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142833453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142833763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142835025 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 142835972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142838430 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 142839248 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 142839985 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 142840745 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 142841252 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142843026 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 142844040 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142844165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142844179 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142844643 G C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 142845431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142846547 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 142847339 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 142848115 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 142848643 C G Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 142850209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142851103 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142851618 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142853592 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 142854491 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142857564 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142858648 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 142858913 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142860485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142863538 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142863776 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142864951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142865255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142865847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142867235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142867253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142868047 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 142875627 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142875672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142876585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142877063 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142881007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142885537 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 142887820 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142892153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142892252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142892776 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142893191 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 142893310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142893559 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 142894252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142894793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142894836 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 142894859 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 142898087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142900596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142901836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142904358 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142905637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142905809 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142906441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142906515 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142908809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142909780 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 142910751 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 142910919 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142911592 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142912328 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 2 142912384 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 142912436 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 142913610 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 142913981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142915268 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 142916848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142917820 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 142917828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142918399 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 142918407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142918581 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 142918596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142919169 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 142919211 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142919588 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142919599 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 142919666 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 142919758 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 142919782 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142919810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142920392 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142921924 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142922649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142922713 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 142922723 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142922743 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 142922894 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 142922913 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 142922926 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 142922977 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 142923086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142923297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142923312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142923354 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142923418 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142923454 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 142923460 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 142923487 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 142923625 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142923652 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142923718 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142923792 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 142923798 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 142923848 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142923910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142923931 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142923946 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142923960 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142923977 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142924046 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142924066 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 142924121 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142924234 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142924248 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142924259 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 142924507 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142924532 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142924555 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142924681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142924808 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 142925129 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142925565 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 142925658 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142926552 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 142926811 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 142926845 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 142926875 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 142926941 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 142927024 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 142927158 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142927497 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 142927705 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 142929223 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 142929705 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142930160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142930330 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 142930341 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 142930389 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 142930818 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 142930846 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142930982 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 142931145 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 142931152 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 142931431 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 2 142931459 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 142931930 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 142931990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142932396 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 142932550 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142932748 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 142932766 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142932985 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 142933071 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 142933163 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 142933175 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 142933203 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 142933248 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 142933322 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 142933657 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 142933744 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 142933996 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142934204 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 142934252 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 142934533 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 142934824 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142934929 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142935526 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 142935634 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 142935807 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 142936313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142936445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142936552 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 142936707 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 142937010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142937079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142937591 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 142937595 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142937618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142937719 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 142937720 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 142938062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142938097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142938269 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 142938336 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 142938456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142938530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142938538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142938809 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 142939037 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 142939122 T C Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 142939747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142940138 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 142940205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142941688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142942139 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142942176 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 142943435 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142944318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142944586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142946159 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142947438 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 142947968 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 142948010 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 142948101 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142948129 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142948197 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 142948497 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 142948834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142949057 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 142949153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142949568 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142949590 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142949604 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 142949803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142950061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142950837 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 142951013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142951363 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142953127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142953699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142953704 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 142955669 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 142956368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142958393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142958760 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142959277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142959551 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 142959997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142960408 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 142960463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142960610 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 142960613 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 142960931 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142961466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142962489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142965009 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 142966190 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 142966227 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 142966608 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 142970292 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142970317 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 142971238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142972428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142972446 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 142972876 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 142974786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142975375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142975954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142976346 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142976352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142977769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142980327 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142980744 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 142980745 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 142981263 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142982059 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 142983230 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 142983306 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142984086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142984103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142984133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142984270 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142984392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142984427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142984478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142984624 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142984753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142985691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142987233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142988300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142988409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 142991222 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 142991600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142992269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142992419 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142992567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142992856 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 142994174 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142996263 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 142996643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142998411 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142998792 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 142998998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 142999909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143000703 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143003229 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 143004446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143004880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143005494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143005548 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143005647 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143007038 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 143008966 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 143008971 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 143008999 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143010198 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143010849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143010971 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 143011037 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143012829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143013218 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143013281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143014028 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 143016666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143017627 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143021246 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143024440 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143025298 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143026803 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 143026824 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 143026830 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 143026845 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143026979 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 143027000 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 143027144 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 143027173 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143027239 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143027264 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 143027386 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143027417 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 143027510 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 143027535 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143027550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143027783 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 143027842 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 143027867 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143027869 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 143027950 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 143027966 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 143028651 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 143028734 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 143028764 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143028844 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 143028873 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143028896 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 143028936 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143029013 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 143029112 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143029118 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 143029154 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143029165 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143029244 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143029323 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 143029420 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 143029434 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143029435 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 143029476 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 143029496 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 143029504 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143029526 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143029623 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143029644 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 143029653 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143029660 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143029680 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 143029692 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 143029775 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143029843 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 143029870 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143029888 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143029957 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143029968 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143029974 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143030087 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143030106 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143030166 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143030181 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143030185 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143030208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143030536 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 143030601 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143030687 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143030738 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143030994 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143031075 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143031098 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143031180 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 143031432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143031550 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143031643 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143031900 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 143031964 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 143032059 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 143032171 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143032199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143032213 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143032290 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143032393 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143032436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143032516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143032928 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143033104 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143033182 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143033624 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 143033826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143034089 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143034307 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143034695 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 143034815 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143035239 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143035634 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143035743 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 143036059 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 143036579 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 143037474 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 143037557 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143037938 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 143037970 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143038010 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143038136 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143038610 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 143039179 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143039571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143039801 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143039931 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143040119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143040659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143041753 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143041827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143041989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143042011 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143042029 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143042285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143043838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143044863 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 143045144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143045521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143045542 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 143045955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143045966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143045983 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143047020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143048089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143051160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143051491 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 143051545 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 143053006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143057794 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 143058477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143059405 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 143060521 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143061859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143064083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143064738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143065824 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 143066058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143066394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143068198 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 143068438 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 143068604 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 143070091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143072442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143073659 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 143076568 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143077633 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143077758 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143078557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143081673 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 143081813 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143081984 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 143082454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143082547 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143086300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143086340 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143086376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143087315 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 143087368 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 143087606 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143087977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143088137 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 143088412 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143088912 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143089111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143089270 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 143089293 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 143089956 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143090566 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143090673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143091210 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143091357 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 143091519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143092419 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 143093075 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143094242 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 143095290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143096968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143097507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143098488 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143098654 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143099098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143099149 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143099942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143101131 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143101484 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 143101522 T G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 143101970 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143102229 A C Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 143102508 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143102705 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 143103117 G T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 143103128 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 143103245 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143104076 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143104552 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 143104684 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143105637 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143105695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143105725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143106897 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143107428 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143107748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143108320 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 143108414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143108756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143109350 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 143109417 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 143109487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143110776 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143111037 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 143111149 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143112007 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143112239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143114157 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 143120671 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 143121187 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143121940 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143121956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143124303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143124333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143124801 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143125566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143125768 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143126096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143126121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143126216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143126236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143126308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143126665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143126891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143127117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143127122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143127139 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 143127548 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 143127791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143127838 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 143128012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143128026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143129629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143129816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143129888 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143130024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143130146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143130848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143131153 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143131603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143131640 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143132241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143132327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143132457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143132462 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143132573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143132958 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143133368 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143133737 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 143133803 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143133807 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143134071 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 143134360 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143134543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143134791 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143134808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143134809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143134849 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143135005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143135079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143135176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143135539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143135600 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 143135756 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 143136013 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 143136068 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 143136081 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 143136213 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 143136359 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143136530 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143136668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143136761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143136770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143136843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143137101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143137203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143137306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143137344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143137438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143137461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143137478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143137558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143137845 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143137899 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143137939 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 143137962 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143138057 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143138130 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143138177 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143138272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143138303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143138340 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143138349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143138390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143138463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143138539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143138595 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143138597 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143138688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143138864 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143138909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143139104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143139108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143139270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143139310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143139374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143139526 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143139631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143139725 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143139729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143139893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143139917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143139975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143140002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143140135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143140225 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143140250 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143140315 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 143140455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143140472 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143140593 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 143140624 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143140662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143140738 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143140833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143140857 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143140876 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143140900 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 143141007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143141080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143141096 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143141118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143141170 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143141173 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143141192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143141358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143141445 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 143141608 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143141628 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143141760 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 143141824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143141969 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 143142447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143142496 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143142523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143142563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143142757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143142761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143142792 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143143235 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143143327 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143143502 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 143144285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143145645 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143146025 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143146558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143147732 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143148361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143150194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143151848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143151988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143152041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143152398 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143153803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143154208 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143156816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143159052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143159880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143159881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143160313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143160334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143161419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143161653 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143162643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143163520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143163873 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 143165491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143166307 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143166931 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143167070 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 143167182 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143167950 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143168521 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 143168630 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 143168731 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 143168773 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 2 143168856 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 143169936 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143170008 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143172315 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143172974 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143174184 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143177051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143177115 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143180393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143183557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143186520 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143187410 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143190227 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 143190691 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 143190975 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143193019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143193814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143193926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143194841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143196273 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143196617 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143196733 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143197718 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143198278 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143198829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143199655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143202677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143202748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143203211 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 143204973 G C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 143207291 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 143209072 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 143209102 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143209873 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 143210079 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143210248 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 143210986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143211625 T A Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 143212010 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 143213289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143215177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143217021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143218084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143218085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143218126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143218463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143219539 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 143219575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143219589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143219652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143219904 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143219940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143220038 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143220141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143220271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143220568 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 143221213 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 143221231 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 2 143221295 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 143221299 G C N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 143221644 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143222003 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143222074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143222076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143222100 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 143222167 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 143222203 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 143222381 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 143222395 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143222604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143222736 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 143224048 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143224394 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143224464 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 143224465 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 143224576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143224756 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 143224876 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 143224948 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 143225010 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143225228 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143225409 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 143225417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143225451 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 143225475 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 143225632 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143226110 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143226339 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143226340 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143226670 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 143226790 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 143227088 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143227275 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143227434 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 143227836 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 143227926 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 143227991 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 143228073 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 143228283 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143228438 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 143231749 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143232522 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 143232801 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 143232924 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 143232939 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 143233124 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 143233229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143233237 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 143233253 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 143233282 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 143233381 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143233436 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143233488 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143233561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143233893 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143234166 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 143234185 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 143234462 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 143234558 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143234772 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 143234969 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143235011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143235718 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 143236628 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143236743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143237045 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143237244 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143237247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143237352 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 143238332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143238421 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143239093 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 143240078 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143240079 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143240434 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143240663 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 143240744 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143240817 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143240838 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 143240968 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143241333 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143242132 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 143242149 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 143242173 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143242380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143242537 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 143242712 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 143242741 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143243026 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143243147 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 143243159 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 143243317 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143243681 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143243699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143243778 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143243781 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143243860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143243912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143244156 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143244400 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 143244437 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 143244748 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143245127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143245192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143245844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143246154 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143246577 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143247681 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 143248782 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143249162 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143249187 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143249513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143249588 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143249859 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143249959 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143250048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143250080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143250643 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143250672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143250915 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143251921 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143251957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143258981 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 143259007 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 143259316 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 143260768 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143261514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143261543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143262343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143263091 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143263446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143264568 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143264726 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143264730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143268501 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 143268893 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143270887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143271223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143272182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143272352 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143272517 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 143272525 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143273465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143273727 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 143273728 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143273748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143273907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143276168 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 143276198 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 143276581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143277695 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 143277900 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143277928 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143278538 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143278699 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143278781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143279020 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143279577 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 143279706 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143279877 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 143280056 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 143280190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143280320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143280497 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143281001 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 143281062 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 143281254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143281298 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143281330 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143281335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143281378 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143281430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143281525 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143281642 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 143281687 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143281705 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 143281726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143282279 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 143282283 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143282305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143282347 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143282490 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143282637 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 143282711 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143282771 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 143282895 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 143282938 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 143283001 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 143283014 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 143283139 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 143283150 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143283466 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 143283471 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 143283545 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 143283572 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143283578 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 143283742 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143283747 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143283774 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143283808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143283825 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143283868 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143283897 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 143283955 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143284009 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143284080 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143284164 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 143284274 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143284289 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143284485 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 143284593 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 143284915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143284934 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143285218 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 143285362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143285621 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 143285692 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143285858 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143286879 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143286934 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 143287179 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 143287191 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143287232 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143287327 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143287359 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 143287364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143287407 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143287561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143287739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143287772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143287807 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143287951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143288009 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143288017 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143288028 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143288145 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143288426 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 143288643 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143288664 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 143289172 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 143289242 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 143289300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143289329 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 143289330 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 143289475 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 143289552 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 143289649 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 143289675 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 143289704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143289733 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 143289968 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 143290030 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 143290106 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 143290188 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143290202 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 143290240 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 143290307 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 143290324 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 143290458 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 143290535 G T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 143290783 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 143290913 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 143290963 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 143290972 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 143291542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143291596 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 143291616 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143291628 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 143292164 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 143292288 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 143292379 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 143292437 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 143292695 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 143292730 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 143292817 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143292830 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143292917 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143293057 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 143293206 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 143293226 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 143293229 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 143293251 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143293302 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143293353 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143293600 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 143293804 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143293979 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 143294572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143294668 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 143294717 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 143294730 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 143294771 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 143294774 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 143294925 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 143295455 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 143295549 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 143295637 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 143295710 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 143295788 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 143295963 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 143295988 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 143295989 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143296080 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 143296112 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143296206 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 143296294 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 143296344 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 143298547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143298938 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143298983 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 143299179 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143299209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143299438 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 143301103 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 143301126 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 143301127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143301186 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 143301503 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 143301549 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 143305832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143307533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143307949 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143308329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143308949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143308951 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143309004 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 143309106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143309173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143309179 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 143309235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143309343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143309741 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143310154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143310180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143310229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143310745 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 143310930 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 143311166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143311220 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 143311289 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 143311428 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 143311558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143311562 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 143311584 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 143311734 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143311749 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 143311819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143311836 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 143312151 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143312189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143312195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143312205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143312229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143312238 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143312293 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 143312301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143312386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143312406 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 143312445 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143312461 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143312495 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 143312604 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 143312768 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 143312774 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 143312996 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 143313051 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143313137 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143313176 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 143313277 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 143313423 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 143313970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143317229 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143318369 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 143318531 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143318536 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 143319545 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 143320501 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143320746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143321126 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143321127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143321639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143321722 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143321953 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 143322307 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 143322769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143322787 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 143323063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143323472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143323501 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143324826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143325897 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143326730 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143327433 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 143327435 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 143327769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143329418 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 143329616 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 143330055 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 143330247 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143330912 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 143331225 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 143331273 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 143331532 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143331952 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 143332045 A T N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 2 143332154 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 143332216 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 143332321 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 143332387 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 143332440 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 143332996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143333414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143334477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143335282 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 143335364 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143335373 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 143335444 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143335561 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143335579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143335618 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143335645 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143335662 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 143335666 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143336007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143336244 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 143336386 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 143336388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143336407 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 143336480 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143336543 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143336584 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143336765 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 143336904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143337062 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 143337093 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 143337336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143337339 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143337521 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 143337584 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 143337594 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 143337667 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 143337899 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143337939 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143337993 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143338034 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143338219 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 143338220 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 143338255 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143338261 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 143338332 A T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 143338343 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 143338351 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 143338417 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 143338863 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 143339029 T A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 143339073 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143339090 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 143339107 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 143339181 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 143339201 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143339343 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 143339404 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143339414 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143339492 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 143339556 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 143339586 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 143339612 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143339655 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143339674 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 143339735 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143339744 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 143339768 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143339902 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 143339948 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 143339988 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143339992 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 143340069 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143340136 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 143340197 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 143340231 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 143340282 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 143340317 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 143340340 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 143340371 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 143340420 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 143340433 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 143340559 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 143342200 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 143347479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143347595 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 143347893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143348067 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 143348264 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143348504 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 143348610 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143348921 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 143349180 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143349886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143349904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143350421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143350450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143350473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143350594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143350834 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143350840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143350872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143351022 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143351033 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143351148 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 143351236 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143351547 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 143351642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143351665 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143351671 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 143351777 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143351844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143351957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143352076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143352079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143352214 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143352839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143352901 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 143353143 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 143353964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143354737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143355815 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143355909 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143356238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143356424 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143358291 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143358607 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 143358792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143358842 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 143360394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143360449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143360545 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143360653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143360736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143362028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143362087 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143362410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143362488 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 143362680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143362691 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143363100 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143363504 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143363776 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143364677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143364806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143365113 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 143365320 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143365998 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 143366158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143367130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143367461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143367627 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143368891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143369193 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 143369369 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143369679 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 143369879 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143369912 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143370191 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 143370595 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 143370697 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 143374067 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 143374336 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143375087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143375848 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 2 143376280 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 143376462 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 143376479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143376783 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143378414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143378831 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 143381231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143381386 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143382551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143383097 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 143383141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143384970 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143385617 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 143386815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143387287 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143387408 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 143387418 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 143387555 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143387665 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 143387724 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 143387801 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 143387851 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 143387915 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 143387933 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 143388106 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143388168 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 143388488 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 143388624 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 143389471 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 143389591 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 143390030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143390042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143390059 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 143391010 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 143391088 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 143391728 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 143391854 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 143391923 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143392153 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143392244 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 143392245 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 143392269 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143392447 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143392475 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143392947 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 143393264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143393319 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143393693 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 143394022 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 143394198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143394386 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143394838 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 143394841 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 143394912 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 143395008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143395115 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 143395488 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143395631 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 143395639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143395684 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143395991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143396195 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143396334 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 143396385 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 143396462 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143396536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143396654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143397062 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143397256 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 143397926 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143399129 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143399451 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143399921 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143400010 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 143400177 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 143400279 A T N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 143400305 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 143400333 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143400462 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143400541 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143400556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143401476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143401600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143401718 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143401913 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143403034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143403064 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143403073 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143403121 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 143404496 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143404652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143406035 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 143406045 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 143406053 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 143406340 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143406448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143406710 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 143407349 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143407399 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 143407400 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 143407526 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143407589 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143408098 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 143408203 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 143408426 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 143408455 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 143408461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143408466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143408479 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 143408545 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 143408622 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 143408629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143408879 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143409159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143412290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143413510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143414253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143415832 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 143415835 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 143416500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143416856 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 143416870 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143417539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143419093 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 143419284 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 143419930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143420472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143420711 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143421094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143421285 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143421314 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143421337 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 143421343 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 143421352 A T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 143421354 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 143421439 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 143421464 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 143421471 C T Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 143421537 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 143421606 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 143421784 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 143421810 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 143421839 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 143421842 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 143422246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143422247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143422347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143422391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143422402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143423045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143423285 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143423437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143423839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143423893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143424256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143424673 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143424701 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143425032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143425282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143425507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143425582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143425891 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 143425941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143426435 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 143426559 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143429142 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143429184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143429206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143429339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143429648 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143430737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143430889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143431480 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 143431598 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 143433315 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143433721 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 143434833 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 143434858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143434872 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 143435181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143435228 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143435646 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 143435752 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143435753 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143435801 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 143436159 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 143436461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143437033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143437354 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 143437447 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 143437474 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 143437917 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 143437920 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143437937 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 143437985 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 143438379 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 143438380 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 143438447 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 143438874 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 143439045 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 143439425 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 143439464 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 143439484 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 143439494 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 143439525 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 143439622 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 143440201 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 143440289 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143440510 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 143440631 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 143440753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143440902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143441486 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143441611 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 143441681 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 143441945 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 143442030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143442103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143443093 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 143443152 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 143443223 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143443411 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143443623 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 143443643 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 143443673 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143443850 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 143443894 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 143443926 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 143443969 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 143444003 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 143444024 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143444050 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 143444139 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 143444198 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 143444199 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 143444272 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 143444474 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 143444498 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 143444536 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 143444593 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 143444613 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 143444738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143444841 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 143444881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143447099 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 143447589 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143447684 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143449877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143450491 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143450847 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143457835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143458359 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143458487 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 143460738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143460817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143461307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143461842 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143462322 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143462862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143463713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143464007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143464121 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 143465175 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143465655 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143465671 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 143465675 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 143465804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143466415 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 143467216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143467329 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143467929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143468284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143468382 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143470727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143471401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143472161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143472755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143472815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143473796 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 143473951 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143474255 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143474320 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143474738 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143474828 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 143475083 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 143475119 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 143475719 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 143475811 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 143475941 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143475952 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 143476006 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143477575 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143478526 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 143478965 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 143479014 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 143479015 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 143479184 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 143479453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143479499 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 143479761 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143479794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143480517 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 143480646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143480695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143481478 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143483837 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143484480 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143484711 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143484886 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143485009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143485137 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143485292 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143485308 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143485387 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 143485629 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143485721 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143486093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143486247 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 143486299 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 143487911 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 143487978 G A N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 2 143488589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143489119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143489618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143490389 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143491903 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143491983 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 143492778 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143492998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143493476 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 143493607 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143493679 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 143493726 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 143493904 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 143493941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143494483 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 143494547 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 143494618 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 143495307 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143495315 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143495356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143495482 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143495494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143495508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143495546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143495560 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143495653 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143495815 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143495829 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143495970 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143496016 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 143496033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143496082 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 143496620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143496650 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 143496845 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 143497059 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 143497090 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 143497124 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143497199 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 143497238 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 143497363 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 143497412 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 143497458 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 143497467 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 143497599 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 143497695 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 143497701 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 143497739 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 143497869 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 143497892 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 143497938 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 143498031 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 143498045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143498062 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 143498173 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143498193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143498218 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 143498251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143498392 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 143498427 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143498488 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 143498529 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143498572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143498785 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143498847 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 143498869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143499267 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143499375 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 143499503 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143499531 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143499544 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143499780 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143499785 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 143500556 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 143500618 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143501034 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143501218 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143501276 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143501302 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143501448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143501510 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143502026 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143502143 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 143502433 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 143502580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143502905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143502929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143503144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143503193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143503631 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143503760 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143503873 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 143504152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143504232 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 143505969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143507067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143508365 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 143508366 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 143510874 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 143510898 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143510979 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 143511045 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 143511073 G T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 143511114 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 143511170 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 143511233 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 143511409 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143511417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143511639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143511859 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143512059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143512093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143512241 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 143512363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143512451 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 143512689 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 143512830 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 143513021 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 143513077 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 143513100 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 143513296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143513515 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143513520 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 143515220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143515295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143516676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143517159 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 143517365 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143517407 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143517452 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 143517591 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 143517616 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 143517705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143517905 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 143517928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143520710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143521241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143521249 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143521463 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143521904 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143522264 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 143523737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143524736 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143524755 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 143524978 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 143526098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143526266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143526291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143526645 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143528638 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143528804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143530517 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143533291 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 143533987 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143536663 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 143536761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143540586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143541180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143541638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143542958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143542987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143543004 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 143543101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143543870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143544102 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143544212 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 143544336 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143544637 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 143544664 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 143544733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143544769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143544803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143544857 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 143545216 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 143545245 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 143545257 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 143545278 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 143545314 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 143545416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143546067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143546084 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143546274 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 143547139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143548899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143549068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143559319 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143559607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143559768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143560154 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143560364 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143560700 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 143560704 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 143561016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143562186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143563725 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143563913 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143567965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143570350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143572167 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 143572707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143573224 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 143574530 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 143574610 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143574615 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 143575554 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 143575773 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 143575783 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 143575818 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 143575902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143575968 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 143576143 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 143576284 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143576290 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143576311 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 143576404 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143576577 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143576667 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 143580156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143581030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143581035 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143582582 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143582608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143583628 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 143584138 G A Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 143592295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143592327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143592338 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 143592376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143592408 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 143592481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143592486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143592715 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143592783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143592786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143592969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143593002 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 143593036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143593076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143593206 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 143593225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143593417 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143593439 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143593514 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143593993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143594232 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143594244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143594290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143594356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143594589 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143594616 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 143594633 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 2 143594688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143594773 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 143594925 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143594967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143595088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143595107 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 143595177 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 143595312 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 143595369 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 143595381 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 143595414 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 2 143595530 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 143595531 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 143595588 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143595592 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 143595602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143595671 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 143595678 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 143595790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143595803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143595860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143596010 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 143596069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143597173 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143597458 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 143597684 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 143597816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143597917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143598049 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 143598246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143598300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143598583 T C N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 143598621 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 143598913 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143599299 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 143599448 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 143599760 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143599895 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143599974 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 143599975 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 143600225 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 143600265 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 143600325 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 143600609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143600660 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143600741 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143600821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143600838 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 143601059 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 143601329 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143601402 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143601437 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 143601486 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 143601570 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143601712 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 143601754 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143601921 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 143602030 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 143602038 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143602045 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143602180 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 143602343 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 143602445 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 143602462 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 2 143602483 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 143602543 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 143602544 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 143602592 A T N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 143602971 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143603524 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143603687 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143603759 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143603789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143603861 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143603927 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143603949 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143603995 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143604058 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143604194 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 143605442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143606163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143606571 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 143608049 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 143608093 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143608148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143608172 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143608204 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143608223 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143608483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143608772 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 143608931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143609150 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143609627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143609826 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143609829 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 143609914 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 143609935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143610110 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143610157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143610616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143610772 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 143610782 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 143610899 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 143610982 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 143610984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143611046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143611081 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 143611495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143611674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143611701 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143611719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143611789 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143611813 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143611873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143611884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143611939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143612197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143612357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143612653 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 143613028 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 143613123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143613138 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 143613160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143613313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143613903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143614172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143614248 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 143614253 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 143614569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143614603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143614733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143614802 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143614932 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 143615187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143615650 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 143616360 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 143616595 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143619449 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 143619605 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 143619618 T A N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 143619752 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 143619807 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 143619861 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 143619894 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 143619925 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 143619926 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 143620289 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 143620551 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 143621019 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143621264 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 143621283 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143621314 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 143621318 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 143621334 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143621352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143621434 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143621587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143621614 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 143621718 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143621966 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 143622187 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 143622201 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143622336 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 143622351 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143622454 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 143622502 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 143623020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143623056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143623212 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 143623244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143623253 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143623283 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 143623319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143623392 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 143623468 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 143623552 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 143623907 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143623908 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143624218 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 143624303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143624501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143624505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143624515 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 143624569 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 143624589 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143624734 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143624747 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143625125 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143625205 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143625303 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 143625629 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 143625632 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 143625656 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 143625708 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143625766 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 143625990 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 143625993 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 143626251 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 143626301 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143626308 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143626319 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143626351 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143626406 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 143626426 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 143626594 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143626682 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 143627433 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143627466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143627582 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143627898 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143628249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143628304 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143628306 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143628594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143628613 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143628658 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143628688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143628746 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143628789 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143629111 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143629262 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143629387 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143629517 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143629650 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143629750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143629892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143631156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143631283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143631366 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 143631395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143631486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143631494 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143631688 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 143631720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143632412 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143632619 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143632659 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143634176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143635804 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143635859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143635901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143635917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143635955 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 143636073 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143636175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143636278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143636539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143637004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143637060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143637355 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143637410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143637425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143637492 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143637704 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 143638021 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143638035 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143638432 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 143638461 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 143638470 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 143638726 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 143638884 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 143640010 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 143640231 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 143640267 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143640329 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143640390 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143640395 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143640413 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 143640455 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 143640506 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143640779 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143640979 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143641135 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 143641801 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 143641882 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143642558 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143642634 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143643020 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143643069 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143643181 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143643691 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143643855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143644091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143644299 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 143644424 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 143644496 A G Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 143644520 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 143644665 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 143644748 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143644766 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143644802 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 143644893 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 143645112 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 143645149 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 143645290 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143645583 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143646139 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143647978 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 143648346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143648484 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143648530 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143648553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143648652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143648718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143648792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143648960 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 143649008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143649149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143649223 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 143649262 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 143649297 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143649316 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 143649360 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143649477 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 143649517 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 143649845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143649930 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143650077 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 143650508 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 143650688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143650714 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143650757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143650769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143650807 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143650840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143650902 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 143650965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143650980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143651056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143651540 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 143651552 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 143651601 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143651781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143651957 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 143652078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143652111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143652227 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143652577 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143652591 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143652699 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143652732 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 143652773 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 143652891 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143652902 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 143653074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143653794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143654233 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143654356 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143654440 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143654456 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 143654567 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143654579 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 143654722 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 143654764 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143655860 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143655896 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143656065 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143656378 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 143656854 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 143656870 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 143656876 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 143656912 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 143657308 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 2 143657408 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 143658620 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 143658708 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 143658785 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143658894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143658936 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 143658937 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 143659723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143659759 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 143659833 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143659890 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 143660413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143660532 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 143660558 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143660593 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 143660700 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143661271 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143661350 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143661406 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143661824 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143661827 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143662051 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 143662935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143663399 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 143663515 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 143664939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143666680 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 143668155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143668451 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 143668492 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143668539 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 143668970 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143669170 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 143669718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143669729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143669928 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 143669970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143669997 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 143670079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143670154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143670590 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 143670631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143670716 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 143670893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143670964 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 143670990 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143671005 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 143671039 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 143671235 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 143672588 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 143672688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143672921 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143672952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143672954 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143673020 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 143673102 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143673113 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143673226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143673266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143673590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143675237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143676771 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143677002 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 143677336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143677676 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 143677706 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 143677749 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 143677771 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 143677843 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 143678234 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143678586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143679499 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 143680827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143681793 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 143682130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143682921 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143684697 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143685252 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143687559 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143687676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143690316 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 143690480 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 143690497 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143694440 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143694581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143694661 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143694932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143695205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143696270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143696439 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143696573 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143698033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143698130 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 143699168 G C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 143700855 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 143701757 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143703263 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 143703733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143703883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143705148 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 143705360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143705997 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143708146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143710362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143711776 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143712096 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143712216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143712235 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143714083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143714211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143715744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143715772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143717629 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143717656 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 143718696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143718894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143719748 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 143719886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143720176 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143721155 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 143721284 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143721298 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 143721454 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143721570 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 143721579 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 143721667 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 143721769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143722161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143722244 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 143722320 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143722336 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143722345 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 143722368 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 143722396 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143722411 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143722739 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 143722760 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 143723139 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 143723510 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 143723704 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 143723755 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143723774 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 143723876 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 143723962 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 143724235 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 143724263 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 143724678 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143724719 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143724834 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143724893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143724982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143725018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143725768 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143725848 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143726659 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 143726665 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 143726715 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 143726939 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 143726984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143726985 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143726998 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 143728205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143728952 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 143728997 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 143729756 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 143729892 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 143729908 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 143730010 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 143730165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143730243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143730316 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 143730319 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 143730523 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143730566 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 143730592 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 143730631 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 143730812 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 143731291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143731373 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143731407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143731408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143731713 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143731749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143731837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143731969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143732012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143732115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143732156 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143732256 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143732264 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143732322 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143732336 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 143732738 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143732740 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143732764 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 143732799 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 143732860 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 143732877 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 143732893 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 143732976 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 143733331 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 143733357 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 143733358 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 143733401 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143733512 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 143733897 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 143733992 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 143734114 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 143734297 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 143734332 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143734414 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 143734813 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143734830 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143734848 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143734912 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143735198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143735872 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 2 143736307 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 143736347 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 143736394 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 143737109 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 143737284 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143737323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143737420 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 143737472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143737554 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 143737651 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 143737769 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 143737772 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 143737881 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 143738053 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 143738085 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 143738266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143738314 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 143738921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143738960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143739286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143739624 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 143739628 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 143739663 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 143739858 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143739898 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143739931 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 143740155 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143740191 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143740280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143740863 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143741312 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143742459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143742483 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 143743160 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143743192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143743381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143743793 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143743805 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 143743851 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143744227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143744270 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143744317 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143744390 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143744399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143744670 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 143745106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143745194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143745437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143745592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143748161 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143748340 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 143748677 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 143749089 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 143749120 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 143749122 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 143750271 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143750311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143750981 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 143751003 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143751382 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 143751395 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 143751421 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 143751424 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 143751750 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143751986 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 143752611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143753413 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 143755660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143755999 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 143756261 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143757726 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143760334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143760817 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143761053 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143762794 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143762819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143764634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143774259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143774855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143775020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143775648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143780812 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143780839 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 143782145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143782624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143784556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143785238 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 143786307 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143787161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143788830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143789282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143794418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143796112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143796117 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 143796571 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143797284 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143797682 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143798700 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143802225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143806579 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 143806703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143806944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143808846 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 143809826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143812156 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143817576 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143817793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143818649 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 143822890 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143822911 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 143826022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143826661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143827451 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143828481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143829284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143829402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143830577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143830982 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143832429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143833007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143833053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143833565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143833885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143834131 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143834284 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 143834855 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143834928 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 143837635 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 143837667 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 143837884 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143837889 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143837896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143837930 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 143837931 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 143838024 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 143838712 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 143838761 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143838773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143838895 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143838927 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 143839042 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 143839102 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143839187 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143839841 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 143839847 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143840116 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 143840308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143840545 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 143840558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143841245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143841470 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143841539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143841585 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143841655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143841671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143841697 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143841732 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 143841852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143842129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143842134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143842752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143842802 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143842807 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143843029 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143843115 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143843148 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143843166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143843188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143843247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143843290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143843291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143843528 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143843544 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143843568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143843596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143843625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143843631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143843661 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143843723 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143843736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143843800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143843932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143844061 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143844226 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143844445 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 143844505 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 143844603 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143844624 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 143844652 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 143844752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143844779 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143844805 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 143844836 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143844848 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143844877 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143845043 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143845882 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143846172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143846281 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 143846341 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143846384 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 143846431 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143846604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143846837 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 143846873 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143847203 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143847248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143847258 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143847273 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143847311 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143847391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143848070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143848103 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 143848125 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 143848267 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 143848575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143848615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143849827 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 143850570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143850585 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 143850655 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143850974 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143851252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143851329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143851720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143851941 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143851955 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143852243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143852325 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143852438 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143852492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143852522 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143852676 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 143852746 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 143852888 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 143853118 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 143853215 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 143853221 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 143853247 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 143853417 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 143853554 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 143853568 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 143853593 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143853619 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 143853647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143853693 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 143853866 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 143853879 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 143854122 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 143854138 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 143854150 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 143854182 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 143854220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143854225 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 143854285 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 143854309 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 143854375 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143854603 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 143854663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143854689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143854699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143854911 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 143854979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143855040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143855084 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 143855119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143855156 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143855178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143855249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143855332 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 143855652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143855826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143855917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143856135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143856257 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143856271 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143856509 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 143856558 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 143856629 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143856895 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143856922 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 143857245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143857255 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143857311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143858281 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143859576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143860516 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 143861750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143862586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143862887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143862899 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143862938 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143862978 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143863061 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143863102 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143863111 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143863116 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 143863884 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143864125 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 143864173 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143864565 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 143864576 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 143864660 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 143864738 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 143864781 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143865050 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 143865112 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143865305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143865403 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143865419 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143865762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143865805 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143865808 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143866193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143866271 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143866707 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 143867326 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 143867375 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 143867416 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143867483 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143867782 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143867916 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 143867928 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 143868063 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143868215 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143868440 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 143868443 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143868472 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143868613 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143868851 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 143869334 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 143869443 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 143869579 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 143869804 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 143871049 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 143871143 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 143871276 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 143871278 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 143871481 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143871531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143871686 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143871878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143871921 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143871926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143872254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143876687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143876805 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 143876828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143878760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143880187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143884034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143885292 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143886526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143886844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143887002 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 143887113 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 143888750 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 143889011 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 143890666 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143890784 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 143891727 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143891739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143891911 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 143892219 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143892368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143892623 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143892680 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143892949 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 143893057 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143893090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143893161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143893259 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143893294 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143893435 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143893591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143893930 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143894095 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 143894264 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 143894497 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 143894534 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 143894569 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 143894606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143894689 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 143894840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143895081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143895418 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 143895486 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143895723 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143895784 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143895931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143895972 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143896730 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143896860 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143897112 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143897197 G T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 143897336 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 143897694 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 143897892 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143898092 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143898592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143898696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143899699 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 143900585 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143900885 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143900913 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 143902164 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 143903051 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143903272 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 143903486 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143903570 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143903803 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 143903812 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 143904146 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143904157 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143904528 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143904901 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143904929 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 143905006 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143905065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143905696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143905731 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143905751 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143905828 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143905834 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143906261 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143906275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143906437 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 143906497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143906526 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 143906586 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 143906692 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 143906714 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 143906773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143906865 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143907000 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 143907113 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143907179 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143908425 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143908450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143908728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143908776 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 143908835 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 143908862 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143909111 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 143909583 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143909857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143910132 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 143910205 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143911293 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143911404 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 143911658 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143911760 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 143911828 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 143911843 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 143912079 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143912836 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 143912851 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 143912853 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 143912949 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143913227 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 143913255 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 143913258 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143913585 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143913672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143913833 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143913895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143914005 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 143914467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143915305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143917304 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143917747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143918276 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 143919736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143920098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143922940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143923139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143925610 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 143925615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143926151 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 143926721 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143926867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143926902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143927428 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143927615 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143928589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143928791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143929004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143929071 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143929324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143929377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143929389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143929409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143929729 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143929731 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143930921 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 143930958 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143931165 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 143931905 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143932457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143932524 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 143933149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143933225 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 143933235 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143933309 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 143933558 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 143933632 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 143933679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143933813 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 143934002 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143934136 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143934179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143934281 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143934293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143934403 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143934578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143934671 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143934822 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 143936249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143936409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143936583 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 143936670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143936709 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143936855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143936963 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 143937062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143937131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143937171 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 143937193 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143937461 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 143937465 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 143937513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143937522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143937561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143937562 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143937628 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143937656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143937738 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143938066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143938126 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143938251 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 143938258 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 143938312 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143938318 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143938324 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143938343 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143938496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143938534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143938617 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143938635 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143938647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143938688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143938831 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143938887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143938941 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 143938942 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 143938962 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 143939123 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 143939139 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143939411 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143939424 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143939425 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143940110 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143940525 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143940810 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143940965 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 143941318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143942056 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143942064 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 143942112 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143942135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143942200 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 143942719 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143942919 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143943682 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 143943704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143944413 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143944940 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 143945317 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 143946633 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 143946643 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143946717 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 143947013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143947063 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 143947094 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 143947942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143948845 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 143949083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143949566 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 143950678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143951744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143952191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143952581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143953298 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143956410 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 143958651 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 143958846 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 143958975 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 143959112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143959520 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 143959591 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 143959708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143959827 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143960111 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 143960307 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 143960800 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 143960825 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 143960844 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 143960927 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 143961102 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 143961233 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 143961277 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 143961368 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 143961549 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 143961859 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143961906 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 143961907 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 143962828 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143963027 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 143963612 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 143963664 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143963854 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 143963887 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 143963926 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 143963948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143964309 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143964400 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143964415 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 143964416 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 143964442 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 143964463 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 143964516 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143964536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143964753 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 143964950 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 143965253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143965403 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 143965526 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143966090 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 143966106 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 143966114 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 143966165 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 143966185 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 143966186 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 143966383 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 143966480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143966577 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 143966747 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 143966935 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 143967557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143967676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143967882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143967924 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 143967987 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 143970232 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 143970259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143970550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143970681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143970690 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 143970784 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 143971073 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 143971215 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 143971480 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143971584 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143971823 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143971913 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143972183 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 143972285 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 143972338 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 143972716 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 143972825 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143972847 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 143972901 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 143974366 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 143982375 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143982380 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143982422 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 143983195 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 143983260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143983322 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143983759 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 143983766 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 143983842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143984129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143984202 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 143984305 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 143984622 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143984734 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 143984762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143984904 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 143985276 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 143985354 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 143986572 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 143987669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143989480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143989593 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143990109 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 143991653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143991739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143991749 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 143993729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143993891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143993924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143993948 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 143994054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143994215 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 143997159 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 143997271 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 143997395 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 143997484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143997571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143999228 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 143999588 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144000077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144001468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144001519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144001628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144002444 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144004725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144004970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144009768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144010283 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144010366 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144010471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144010515 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 144012856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144013248 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 144013268 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 144013314 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 144013920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144014098 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 144014462 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 144014780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144015200 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144015677 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144015932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144016077 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 144016556 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144016770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144016810 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 144017019 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 144017076 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 144017269 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 144017630 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 144017674 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 144017865 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 144017870 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144018277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144018401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144018451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144018501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144018787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144018837 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 144018887 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 144019058 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144019114 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 144019226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144019258 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 144019259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144019335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144019345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144019655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144019801 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 144019851 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 144019857 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 144020352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144021692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144021713 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 144022365 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 144022416 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 144022923 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 144022975 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 144023116 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 144023418 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144023693 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 2 144023699 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144023777 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 144024034 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 144024036 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 144024152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144024245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144024394 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144024637 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144024721 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144024998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144025242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144025831 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144025870 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144025909 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144025983 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144025997 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144027084 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144027326 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144027418 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144027664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144027827 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144028727 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 144028962 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 144029809 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144030364 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144032255 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 144032533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144032562 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144032836 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 144033075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144033142 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144033255 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 144033459 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 144033537 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 144033588 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144033591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144033671 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 144033782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144033843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144034711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144035304 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144035459 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 144035654 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144036081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144036168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144036169 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 144036218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144036347 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 144036392 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 144036533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144037183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144037919 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 144039002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144039475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144040519 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 144040792 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144040961 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 144040963 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 144041300 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144041311 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 144041580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144042201 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144042244 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144042723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144043063 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144043103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144043310 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 144043534 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 144043865 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144043880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144043920 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 144044070 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 144044182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144044184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144044251 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144044567 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144044626 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144044671 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144044688 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144044874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144045026 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 144045099 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144045129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144046547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144047062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144047083 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 144047094 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144047195 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 144047227 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144047251 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144047252 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144047509 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 144047512 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 144047524 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 144047553 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 144047571 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 144047593 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 144047602 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144048136 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 144048199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144048245 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144048377 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 144048381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144048449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144048482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144048517 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144048535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144048554 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 144048576 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144048603 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 144048705 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 144050611 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 144050790 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144050793 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 144050859 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144050930 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 144051183 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 144051254 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144051350 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 144051361 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144051537 A G Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 144051586 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 144051588 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 144051733 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 144051777 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 144051778 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 144051788 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 144051848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144051920 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144051924 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144052051 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 144052060 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 144052138 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144052364 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 144052405 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 144052475 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 144052794 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 144053173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144053207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144053812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144053917 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144053992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144054054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144054096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144054116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144054118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144054135 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144054253 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 144054294 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144054415 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144054554 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144054656 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144054683 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144054733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144055275 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 144055375 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144055376 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144055524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144055537 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144055573 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144055581 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144055673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144055693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144055733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144055941 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144056076 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144056346 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144056347 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144056646 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144056648 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144056675 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144057100 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144057114 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144057463 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144057471 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144057517 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 144057558 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144058132 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144058154 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144058224 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 144058467 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144058620 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144058621 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 144058867 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144058876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144058968 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144059025 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144059228 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144059327 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144059391 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144059488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144059629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144060300 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144060332 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144060390 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 144060869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144062147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144067624 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 144069106 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144070593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144071897 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 144076123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144078973 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144081938 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144081961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144082455 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144083990 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144086981 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 144087221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144089627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144089633 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144090440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144092030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144092805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144093488 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144094943 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 144095312 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144095393 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144096275 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 144097804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144099280 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144100887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144101480 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144103162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144104091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144104119 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144104146 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144104465 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 144106139 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144106146 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 144106538 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 144106646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144106762 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144107165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144107425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144107809 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144109039 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 144109177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144110770 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 144111132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144111945 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 144113857 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 144115558 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144115693 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 2 144116799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144117134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144120080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144122426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144122529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144124358 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 144124362 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 144126843 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 144127634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144127921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144128380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144128552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144128646 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144128864 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144132864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144134827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144136698 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144138929 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 144140168 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144140980 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144141659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144141837 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144144438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144147532 C G Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 144148229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144149286 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144150159 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144150395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144150644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144151816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144152867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144153224 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144153353 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144153717 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144153777 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144153795 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144154408 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144154477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144154490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144154828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144155195 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144155373 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 144155508 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 144155521 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 144156329 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144156357 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144157009 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 144157581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144157612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144157766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144158190 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144158375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144158479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144158486 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144158975 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144160196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144161097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144161267 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144163106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144163314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144164787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144165266 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144165327 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144165372 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144165775 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144165830 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 144165909 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 144165950 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144165951 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144165987 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144166001 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144166086 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144166126 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 144166149 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 144166593 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 144166606 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 144166818 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144166914 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144166937 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144167888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144168095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144168277 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144168303 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144168304 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144168397 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144168472 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144168627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144169210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144169278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144169310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144170093 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144171605 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144171640 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144171863 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 144171924 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144171962 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144171999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144172029 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144172130 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144172141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144172149 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144172154 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144172175 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144173095 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144173097 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144173133 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 144173941 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144174947 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144175075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144175130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144175210 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 144175441 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 144175461 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144175734 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144175751 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 144175875 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 144175882 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144175899 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 144176036 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 144176056 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 144176534 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144176547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144176978 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 144177007 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144177028 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 144177069 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 144177193 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 144178355 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144178735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144179075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144180236 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144180809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144181157 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144181203 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144182263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144183601 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 144186556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144187853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144188058 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 144188098 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144188525 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 144189070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144189253 C G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 144189803 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 144190017 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144190018 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144190030 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144190170 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144190499 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 144193922 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 144194074 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 144194260 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 144194522 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144195215 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144195511 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144196446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144196748 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144196884 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 144197372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144197486 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144198070 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 144198344 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144198746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144199775 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 144199788 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144199799 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 144199879 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 144199925 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 144199937 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 144199961 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 144200008 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144200026 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 144200157 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 144200161 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 144200179 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 144200194 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 144200326 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144200485 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144200670 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144200732 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144200937 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 144200965 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144201144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144201482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144201684 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144201731 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144202453 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144202825 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 144203092 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144203370 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 144203392 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 144203621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144205143 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144205309 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144205536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144205589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144205602 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144205618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144205733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144205748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144205923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144205936 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 144205958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144206005 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 144206006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144206032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144206123 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144206173 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144206258 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144206263 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 144206389 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144206423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144206569 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 144207250 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144207305 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144207360 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144207438 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144207724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144208193 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144208269 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144208300 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144208305 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144208437 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 144208518 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144208595 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144208651 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144208872 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144209144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144209616 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144209646 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 144209698 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144210126 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 144210268 C T Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 144210269 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 144211244 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144211368 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144211420 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144211805 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144211807 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144211863 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144212001 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 144212007 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144212273 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 144212545 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 144212619 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 144212782 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 144212850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144212956 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 144213075 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144213689 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144214175 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 144214176 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 144214191 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 144214950 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 144215165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144215446 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 144215550 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144215576 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 144216162 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144216176 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144216661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144216841 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144217561 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144217627 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144217758 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 144217775 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 144217793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144217905 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144218175 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144218235 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 144218333 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144218403 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144218420 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 144218577 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 144218593 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144218848 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 144218873 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 144218916 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144219019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144219221 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144219284 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144219299 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144219967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144223102 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 144225261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144225873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144225927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144225962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144227053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144227068 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 144227457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144227703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144227992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144228928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144229111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144229431 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 144231485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144231869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144232815 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144234041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144235524 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 144236967 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144237650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144237925 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144238902 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144238991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144239099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144240800 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144240806 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144240825 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144240965 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144241340 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144241344 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144241360 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144241408 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144241409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144241432 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144241497 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144241504 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144241560 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144242509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144243073 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144243162 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144243271 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144243295 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 144243614 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144243636 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 144243994 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 144244038 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144244316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144244329 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 144244343 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144244787 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144244816 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144245175 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 144245176 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 144245377 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 144245383 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 144245458 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 144245475 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144245551 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144246388 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144246640 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144246666 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144246676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144246719 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144246791 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 144246897 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 144247240 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144247323 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144247338 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144247424 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144247434 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144247492 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144247505 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144247780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144248517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144248575 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144248605 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144248646 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144248653 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144248660 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144248682 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144248736 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144248830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144248859 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144248948 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144248965 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144248992 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144249022 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144249046 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144249111 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144249152 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144249190 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144249287 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144249318 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144249467 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144249543 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144249546 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144249587 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144250152 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 144250162 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 144250303 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 144250614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144250726 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 144251156 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144251181 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144251246 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144251353 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144251362 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144251373 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144251410 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144251482 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144251642 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 144251745 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 144252072 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144252088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144252152 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144252370 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 144252386 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144252435 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144252473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144252568 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144252571 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144252888 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 144253034 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144253048 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144253053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144253064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144253069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144253449 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 144253468 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 144253591 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 144253660 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144253752 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144253768 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 144253912 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144254164 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144254172 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144254194 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 144254251 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 144254387 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144254466 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 144254563 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 144254680 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144254772 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 144254781 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 144254815 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 144255085 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144255159 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144255161 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144255246 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144255438 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144255559 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144255697 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144255775 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144255851 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144256138 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144256191 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144256199 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144256298 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144256406 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144256555 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144257015 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144257088 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144257101 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144257162 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144257447 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 144257542 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 144257969 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144258015 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144258028 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144258439 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 144258608 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144258620 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 144258634 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 144258638 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144258688 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 144258886 G A N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 144259657 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144260613 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144263042 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144263272 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144263318 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144263856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144264816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144265632 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144265700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144266187 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 144267319 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144268039 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144268107 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144268221 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 144268248 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 144268428 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144268964 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144269088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144269107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144270790 C T Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 144271207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144271227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144271249 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 144271264 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144271358 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144271453 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144271637 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144271749 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144271869 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144272217 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144272231 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144272237 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144272256 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144272262 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144272324 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144272350 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144272474 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144272575 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144272577 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144272602 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 144272633 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144272785 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 144273072 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 144273123 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 144273156 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144273157 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144273218 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144273270 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144273313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144273355 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 144273357 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144273560 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144273595 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144273630 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144273771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144273821 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144273890 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144273917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144273971 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144273992 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144274028 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144274050 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144274054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144274074 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144274110 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144274149 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144274279 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144274605 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144274645 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 144274650 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144274699 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144274746 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144274854 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144274865 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144274913 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144274955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144275055 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 144275115 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 144275286 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144275322 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144275367 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144275431 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144275732 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 144275775 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144275781 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144275823 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144275895 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144275936 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 144275965 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144275994 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 144276195 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 144276250 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144276264 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144276305 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144276323 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144276411 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144276464 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144276468 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144276484 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144276528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144276562 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144276587 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144276694 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144276745 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144276768 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144276956 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144277035 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144277274 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144277419 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 144277451 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144277477 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144277946 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144277949 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144278340 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 144278565 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144278606 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144278680 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144278955 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 144279010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144279291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144284870 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144286089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144286756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144287707 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144289145 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144289218 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144289307 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144289372 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144290056 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144290057 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144290143 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144290172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144290271 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144290318 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144290468 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144290504 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144292384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144292451 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144292550 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144292643 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144292935 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 144292979 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144293079 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144293142 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144293153 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144293161 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144293388 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 144294068 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144294170 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 144294407 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144294851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144295132 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144295275 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 144295744 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144296651 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144297212 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144297423 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144297537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144297543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144297576 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144297585 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144297612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144297651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144297700 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144297861 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 144298493 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144298768 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 144298817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144298976 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 144299106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144300121 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144300475 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144300895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144301263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144301382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144301418 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144301764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144302023 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144302207 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144302433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144302448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144302543 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144302614 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144302790 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144302825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144302845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144303750 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144304286 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144304319 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144304357 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144304492 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144304517 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144305931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144307596 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 144308022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144308237 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 144308411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144309086 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144309233 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144309812 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144309814 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144309832 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144309997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144310024 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144310043 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144310217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144310268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144310276 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144310297 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144310323 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144310467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144310730 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144310776 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144310794 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 144310795 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 144310919 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144311290 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144311421 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144311427 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144311835 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144311950 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144311986 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144312201 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144312344 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144312404 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144312422 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144312599 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144313190 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144313236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144313273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144313280 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144313575 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144313660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144313701 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 144315294 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144315379 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144319886 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144320225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144320231 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 144320834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144321461 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144321882 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144322021 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144322161 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144322164 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144322388 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 144322407 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 144322546 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144322575 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 144322594 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144322810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144322913 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144322924 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144323141 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144323219 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144323299 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144323397 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144323418 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144323495 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144323504 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144323687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144323778 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144324130 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144324268 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144324345 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144324475 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 144324568 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 144324582 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 144324586 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 144324628 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 144324997 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144325282 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144325403 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144325619 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144325815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144325859 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144325868 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144326004 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144326134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144326146 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144326217 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144326247 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144326275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144326724 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 144327058 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144327184 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144327278 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144327487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144328272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144328614 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144328628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144328864 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144328990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144329075 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144329154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144329210 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144329336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144329363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144329637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144329698 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 144329724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144329749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144329900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144330148 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144330225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144330375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144330530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144330596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144330637 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144330751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144330752 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144330822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144330891 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144331153 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144331266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144331283 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144331349 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144331417 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 144331464 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 144331638 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144331696 T A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 144331699 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 144332496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144332614 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144332621 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144332875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144333251 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144333261 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144333272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144333276 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144333328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144333929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144334086 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144334115 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144334208 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 144334222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144334237 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144334240 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144334268 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144334316 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144334433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144334471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144334493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144334595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144334622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144334685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144334687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144334711 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144334754 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144334836 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144334913 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 144334915 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144335051 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 144335091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144335270 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144335276 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144335317 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144335389 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144335496 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144335531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144335569 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144335633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144335910 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144336158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144336170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144336613 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 144336616 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 144336806 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144337034 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144337191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144337203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144337402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144337442 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 144337501 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144337502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144337735 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144337812 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144337831 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144337856 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144337907 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144338044 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144338603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144338679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144338762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144338832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144339162 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144339753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144340481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144340704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144341256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144341311 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144341407 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144341411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144341459 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 144341605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144341629 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144341645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144341652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144341692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144342110 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144342157 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144342165 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144342230 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144342739 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 2 144342989 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144343071 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144343190 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144343200 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144343284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144343322 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144343334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144343343 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144343364 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144343429 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144343472 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144343604 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144343660 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144343717 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 144344024 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144344090 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144344111 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144344159 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144344170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144344179 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144344195 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144344206 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 144344218 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144344235 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144344240 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144344326 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144344344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144344436 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 144344546 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 144344581 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144344656 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144344686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144344701 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144344742 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144344790 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144344840 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144344876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144344913 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144344977 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144344983 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144345235 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144345354 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144345444 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144345477 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144345502 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144345532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144345684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144345746 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144345815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144345867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144345887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144345893 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144345982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144346206 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144346209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144346322 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144346328 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144346382 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144346383 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144346473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144346620 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144346626 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144346673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144346685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144346691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144346714 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144346729 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144346764 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144346826 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144346833 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144346917 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144346925 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144346989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144346998 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144347080 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144347133 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144347185 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144347219 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 144347325 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144347432 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144347708 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144347769 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144347939 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 144348001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144348012 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144348139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144348445 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144348656 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144349027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144349041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144349065 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144349191 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144349198 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144349522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144349913 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 144350647 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 144350995 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144351234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144351317 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144352315 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144353617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144353677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144353693 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144353934 G T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 144354021 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 144354036 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 144354076 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144354309 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144354350 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144355145 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144355403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144355577 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144355666 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144355711 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144355891 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144355909 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144356671 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 144356951 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 144357278 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144357292 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144357647 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144357894 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144358666 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144359040 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144359063 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144359114 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 144359990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144360281 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144360752 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 144360937 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144360945 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144360977 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144361101 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 144361206 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144361431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144362012 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144362442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144362529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144363335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144363457 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144363498 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144363501 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144363533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144363662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144363692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144363740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144363865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144364042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144364080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144364138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144364226 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144364383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144364537 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144364621 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 144364667 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 144364751 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 144364819 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 144364859 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144364889 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144364931 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144365041 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144365079 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144365208 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144365250 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 144365262 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144365292 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144365297 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144365382 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144365580 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144365587 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144365598 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144365715 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 144365765 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144365849 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144365941 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144366015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144366371 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144366510 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 144366664 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144366952 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144367145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144367190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144367455 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 144368159 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144368182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144368217 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144368323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144368355 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144368430 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144369089 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144369247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144373128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144374469 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144374617 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144374956 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144375054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144375108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144375126 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144375184 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144375220 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144375286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144375294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144375383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144375389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144375421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144375429 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144375438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144375526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144375616 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144375811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144375907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144376015 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 144376260 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144376361 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144376389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144376570 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144376630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144376639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144376766 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144376836 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144376874 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144376983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144377233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144377245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144377486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144377532 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144377671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144378198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144378204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144378210 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144378260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144378328 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144378438 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144378554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144378613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144378661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144378818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144378883 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144378905 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144378957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144378966 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144379119 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144379212 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 2 144379214 T A N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 2 144379445 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144379525 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144379566 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144379735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144380027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144380040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144380181 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144380184 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144380226 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144380261 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144380552 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144380655 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144380708 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144380823 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144380934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144380935 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144381066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144381188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144381227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144381230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144381329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144381350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144381356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144381381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144382051 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 144382112 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144382113 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144382654 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144382773 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 144382940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144383150 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 144383201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144383316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144383347 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 144383358 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 144383378 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 144383386 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 144383421 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 144383425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144383499 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 144383569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144383850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144383979 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144383995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144384217 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 144384327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144384460 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144384687 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 144384775 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144384806 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 144384881 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 144384930 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 144385393 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 144385401 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144385464 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144385583 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144385618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144385625 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 144385705 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 144385715 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 144385734 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 144385913 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 144386037 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144386052 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144386072 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144386353 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 144386377 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144386997 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144387038 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 144387174 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 144387183 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 144387188 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144387201 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144387221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144387243 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 144387255 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 144387386 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144387422 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 144387429 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144387447 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144387478 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 144387492 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 144387512 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 144387599 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 144387671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144387683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144387727 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 144387941 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144387948 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144387992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144387996 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 144388029 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144388115 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144388122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144388321 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 144388352 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 144388516 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 144388699 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 144388725 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 144388932 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144389033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144389261 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144389278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144389314 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144389326 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144389335 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144389350 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144389393 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144389398 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144389413 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 144389456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144389487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144389515 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144389598 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 144389620 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 144389644 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144389697 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 144389869 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144389873 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 144389880 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144389912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144390010 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144390163 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144390461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144390694 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144390755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144390909 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144391057 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144391110 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144391136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144391221 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144391253 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144391258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144391407 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144391430 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144391861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144391910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144392050 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144392051 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144392149 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 144392160 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 144392168 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144392379 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144392660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144392743 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 144392744 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144392953 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144393113 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 144393335 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 144393338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144393557 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 144394077 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144394113 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 144394279 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 144394752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144394801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144395029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144395046 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 144395089 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144395122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144395392 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144395480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144395576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144395620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144395648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144395709 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144395832 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144395880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144396162 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144396217 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144396310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144396420 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144396559 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 144396588 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144396743 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144397060 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144397077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144397086 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 144397141 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144397824 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144397906 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144398049 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 144398360 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144398464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144398645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144398803 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 144398910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144399037 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144399156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144399167 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144399490 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 144399571 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144399909 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144399912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144399951 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 144399954 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 144400143 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144400157 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144400177 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144400183 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144400199 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 144400235 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144400237 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144400261 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144400282 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 144400314 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144400316 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144400327 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 144400456 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 144400459 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 144400650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144400680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144400866 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 144401289 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 144401290 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 144401337 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144401355 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 144401518 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144401537 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144401597 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144401864 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144402442 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144402461 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144402557 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144402710 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144403675 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144403731 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144403828 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 144403851 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 144403984 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 144404333 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144404448 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144404627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144404783 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144404784 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144405474 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144405578 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144405615 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144405684 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 144405730 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 144405839 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144405879 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144406006 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144406086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144406330 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144407915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144408003 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144408020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144408860 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144408962 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144409058 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 144409062 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144409364 G C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 144409673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144409968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144410632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144411310 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 144411899 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 144413007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144413016 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 144413075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144413250 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 144413333 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 144413438 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144413462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144413471 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 144413497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144413542 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144413698 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144414001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144414101 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144414376 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 144414720 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144414780 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 144414817 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144414984 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 144415007 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 144415793 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 144417371 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 144417381 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144417505 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144417519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144417540 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 144417638 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144417824 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144418122 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144418348 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144419962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144420175 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144420647 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144421174 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 144421192 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144421200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144421292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144421470 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144421472 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 144421588 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 144421603 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 144421646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144421747 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 144421753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144421882 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 144421917 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144421970 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 144421973 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 144422024 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 144422028 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144422138 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144422565 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 144422579 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 144422723 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144422724 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144422736 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144422752 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 144422764 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 144422976 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144423130 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 144423134 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 144423167 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 144423267 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 144423740 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 144423753 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 144423826 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144424036 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144424311 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144424693 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 144424792 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 144425122 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 144425178 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 144425559 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144426171 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144426324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144426335 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 144426397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144426426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144426594 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 144426660 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144426878 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144426988 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144427063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144427165 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144427216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144427293 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144427406 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144427486 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 144427525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144427730 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 144427989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144428246 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 144428345 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144428553 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144428637 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144428707 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144429120 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144429190 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144429282 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144429291 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 144429370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144429469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144429657 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144429740 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144429759 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144429902 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144429942 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 144430390 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144430435 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144430451 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 144430602 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 144430633 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 144430690 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 144430879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144431429 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 144431447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144431909 G C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 144431932 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 144432246 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 144432736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144437927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144438962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144440548 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144441398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144444322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144445284 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144445829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144445846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144446254 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 144446896 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 144447473 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144447672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144447784 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 144448496 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 144448507 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144448734 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144448798 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 144448848 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144449081 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144449084 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144449099 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144449268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144449383 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144449415 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 144449426 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 144449433 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 144449439 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 144449770 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 144449795 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 144449810 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 144449985 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144450223 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144450227 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144450303 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144450472 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144450482 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144450550 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144450593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144450949 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144451109 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144451147 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144451229 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144451456 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144451677 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 144451757 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144451885 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144451944 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144452009 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 144452049 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144452096 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144452174 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144452210 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144452274 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 144452600 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144452633 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 144452685 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144452907 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 144452994 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 144453144 T G N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 2 144453145 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 2 144453251 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144453532 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144453568 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144453570 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144453589 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144458143 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 144458578 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144458834 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 144461282 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 144461283 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 144462630 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 144462838 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144463418 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144463422 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 144463893 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144464622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144464807 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144465733 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144467550 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144467660 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144470754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144470791 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 144471352 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144471451 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144471496 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 144471516 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 144471686 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 144471964 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 144472097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144472353 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 144474173 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144474881 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144476002 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144476357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144476597 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144477207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144477323 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144477526 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 144477611 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144478142 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 144479920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144482713 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144482789 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144483953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144484146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144484358 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144486429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144487870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144488428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144488657 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 144490972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144491166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144491415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144492389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144493134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144493165 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 144494197 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144494754 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144497493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144497847 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 144498028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144499239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144507799 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 144508783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144509226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144510135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144510381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144511441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144514196 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 144521745 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144523807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144524836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144526913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144527045 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144528651 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144529701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144531246 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144531703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144531879 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144531945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144531963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144532142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144532598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144533184 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144533559 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144535491 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144536488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144537714 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144539140 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144539688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144541339 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144541353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144542161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144542806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144545681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144546459 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144546902 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144546993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144550142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144550336 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144550534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144551296 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 144552084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144553660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144554043 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144554932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144556012 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144556291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144556785 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144558035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144558249 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144559521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144559656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144561529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144561802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144561930 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144562413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144563559 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144566057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144566188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144566834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144567218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144568845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144571349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144572027 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 144572071 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144572458 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 144572478 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 144573546 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 144574068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144574268 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 144574331 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 144574366 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 144574661 T C Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 144574722 C T Y Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 144574733 T C Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 144574751 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 144574791 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 144574816 A G Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 144574901 T A Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 2 144574963 T C Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 144575041 G A Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 2 144575083 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 144575125 A G Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 144575402 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 144575579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144575813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144575822 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144575899 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144575916 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144575924 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144576012 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144576220 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 144576413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144581378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144584528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144584698 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144584849 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144584853 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144584898 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144585069 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144585180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144585258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144585310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144585370 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144585517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144585583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144585713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144585939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144586152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144586180 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144586290 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144586303 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144586599 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 144586633 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 144586640 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 144586817 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 144589378 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144589654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144589732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144590265 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 144590418 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 144590778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144590947 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144591167 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144591267 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144591449 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144591501 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144592453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144592474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144592490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144592524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144592594 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 144592773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144592966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144593758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144593762 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 144593968 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144594101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144594327 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144594746 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144594789 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144594860 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144594976 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144595069 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 144595481 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144595635 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144595699 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144596312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144597078 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 144597148 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 144597331 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 144597374 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 144597413 C A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 144597685 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 144597908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144597941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144597987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144598033 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144598302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144598353 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144598477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144598493 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144599032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144600218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144600221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144600433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144600522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144600530 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144600814 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 144600902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144601198 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 144601282 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 144601287 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 144601454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144601590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144601917 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 144602176 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144602272 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144602391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144602810 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144602874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144603018 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144603136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144603208 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144603212 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144603341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144603581 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144603715 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144603741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144604036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144604038 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144604686 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144604867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144604875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144604949 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144604992 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144604996 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144605557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144605612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144605868 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 144605995 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 144606002 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 144606264 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 144606669 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 144606850 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 144606857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144607164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144607220 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144607246 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 144607405 T A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 144607585 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144607591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144607722 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 144608122 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 144608134 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 144608181 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 144608301 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 144608341 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 2 144608360 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 144608427 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 144608623 G A N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 144608656 C G N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 144608680 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 144608803 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 144608896 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 144609149 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 144609378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144609399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144609410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144609424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144609496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144609511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144609603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144609685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144609809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144609896 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 144610370 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 144610396 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 144610410 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 144610518 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 144610551 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 144610552 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 144610603 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144610681 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144610715 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144610720 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144610777 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144611300 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 144611635 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144611686 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144611765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144611790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144611837 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144611865 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144611878 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144611884 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144611928 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144612011 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 144612372 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 144612574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144612662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144612663 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144612685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144612772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144612778 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144612828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144612838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144612928 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144612951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144613500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144614143 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144614162 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 144617151 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144617224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144617622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144618407 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144618557 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144619106 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144619296 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 144619316 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 144619480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144619627 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144619700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144620096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144620139 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144620379 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144620445 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144620529 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144620541 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144620591 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144620861 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 144621067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144621464 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144621630 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144621769 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144621914 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 144622134 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144622322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144622385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144622516 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144622586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144622670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144622695 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 144622871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144622958 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144623060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144623063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144623077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144623078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144623492 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144623531 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144623605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144623927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144624584 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144624943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144625363 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144627184 T A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 144627715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144627798 C G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 144628723 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144628733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144628901 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144628950 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144628976 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144629000 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144629056 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144629091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144629107 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144629245 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144629274 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144629381 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 144629537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144629681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144629720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144629726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144629803 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144629863 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 144629876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144630280 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144630635 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144630853 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 144631195 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144631539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144631821 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 144632015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144632139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144632156 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 144632237 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144632348 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144632420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144632614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144632915 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144633146 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144633239 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144633295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144633994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144636193 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144637283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144637698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144639156 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144640096 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144640648 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 144641049 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 144641262 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 144641263 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 144642104 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 144643249 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144644994 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 144645468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144646618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144647086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144648541 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 144648967 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144649110 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 144651266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144651597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144651949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144653033 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 144653948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144654446 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144655233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144655942 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144657433 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144657721 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144658651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144660036 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144660163 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 144660457 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 144661165 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 144661589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144661938 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144662991 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 144663582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144665535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144667189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144667304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144667448 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144668039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144668213 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 144668436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144669428 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144669473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144669550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144670146 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144670292 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 144670521 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144670911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144672048 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144672166 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144672228 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 144672230 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 144672544 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 144672742 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 144672794 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 144672892 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 144672963 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 144673083 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144673123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144673142 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144673155 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 144673174 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144673212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144673621 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144673690 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 144673838 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144673985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144674245 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144674303 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 144674385 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144674515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144674666 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144674702 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144674962 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 144675271 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144675425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144675500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144675526 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144675542 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144675581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144675588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144675598 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144675825 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 144675959 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144676109 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144676192 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144676235 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 144676278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144676333 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 144676552 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144676621 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 144676644 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144676731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144676800 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 144676812 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144676819 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 144677117 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144677119 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144677349 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 144677726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144678074 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144678104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144678345 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144678671 T G N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 144678706 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 144678714 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 144678803 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 144678828 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 144678862 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 144678891 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 144679081 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 144679139 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 144679375 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144679910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144680029 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144680923 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144681114 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144681142 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144681492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144681552 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144681597 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 144681656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144681665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144681798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144681945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144682037 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 144682089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144682259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144682477 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 144682858 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 144682886 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 144683375 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 144683440 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144683505 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144683589 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 144683625 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144683700 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144683743 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 144683750 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 144683801 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 144683826 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 144683907 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 144683919 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144684022 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 144684061 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144684108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144684159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144684214 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144684287 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 144684378 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 144684464 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 144684599 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144684686 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144684835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144684933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144685035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144685227 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144685228 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144685279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144685830 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144685849 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144685863 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144685876 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 144685946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144686108 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 144686178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144686651 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144686700 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144687164 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 144687391 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 144687710 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 144687761 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 144687927 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 144687953 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 144688216 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144688486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144688641 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144688697 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 144688790 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144689043 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 144689056 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 144689058 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 144689143 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 144689171 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 144689275 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 144689296 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 144689861 T G N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 144689906 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 144689913 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 144689969 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 144690207 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 144690416 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 144690464 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 144690473 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144690540 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144690688 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 144690691 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144690710 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144690759 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 144690774 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 144690790 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 144690868 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144691058 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144691121 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 144691184 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144691323 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 144691367 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 144691500 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 144691503 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 144691661 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144692145 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144692265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144692385 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144692399 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144692540 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144692572 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 144692616 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144692819 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144692840 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 144692919 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144693095 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 144693109 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144693388 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144693465 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144693783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144693823 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144693982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144694188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144694609 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144694941 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 144695009 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144695508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144695759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144695851 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 144695922 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 144695981 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 144695995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144696034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144696035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144696064 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 144696142 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 144696168 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144696180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144696333 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 144696348 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 144696375 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 144696550 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 144696639 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 144696678 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 144696861 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 144697156 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 144697177 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144697255 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 144697584 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144697659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144697737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144697822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144697888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144697974 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144697986 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144698029 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 144698054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144698058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144698087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144698382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144698438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144698461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144698478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144698676 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144698688 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144698705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144698706 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144698997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144699053 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144699061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144699150 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 144699168 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 144699183 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 144699208 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144699231 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144699283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144699310 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144699454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144699495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144699646 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144699793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144700033 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144700052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144700183 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144700197 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144700306 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144700327 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144700427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144700509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144700540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144700574 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144700615 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 144700833 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 144700944 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 144700983 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 144700990 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144701183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144701189 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144705756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144706670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144707715 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144708781 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 144713168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144713679 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144713740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144714320 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 144715101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144715312 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 144715316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144715836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144715912 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 144715965 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 144716192 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144716713 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144719738 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144720049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144720216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144722408 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 144722412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144723212 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 144723238 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144726678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144726771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144727617 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144728750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144729591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144729730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144730953 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144731150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144731753 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 144732047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144732149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144732412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144732439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144732707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144732760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144732973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144734078 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144735936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144736615 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144737734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144738643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144738864 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 144739410 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144739493 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 144739556 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 144739809 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144740132 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144740920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144741047 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 144742074 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 144742148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144742225 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144742540 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144742967 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144742997 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144743118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144743163 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144743189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144743322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144743494 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144743522 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 144743558 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 144743692 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144743699 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144743858 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144743942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144744131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144744306 A C Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 144744361 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144744381 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144744460 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144744658 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144744765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144744930 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144745208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144745659 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144745825 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144745875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144747679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144747719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144747915 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144747921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144747927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144747972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144748184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144748481 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144748547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144748614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144748730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144748901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144749010 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144749167 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144749341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144749349 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144749419 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144749499 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144749530 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144749560 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144750356 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144751253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144751382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144751427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144751455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144751470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144751484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144751702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144751723 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144751893 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144752127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144752268 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 144752394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144752404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144752455 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144752457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144752876 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144754537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144755108 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 144755282 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 144755534 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144756519 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144757129 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144757416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144757463 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144757551 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144757607 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 144757720 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144757937 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144758040 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144758109 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144758183 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 144758475 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144758674 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 144758763 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144758805 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 144758905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144759107 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144759150 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 144759200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144759224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144759283 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144759423 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144759496 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144759586 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144759723 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 144759725 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 144759761 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 144759816 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144759852 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 144760014 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144760023 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144760027 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144760161 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144760213 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144760224 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144760225 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144760276 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144760360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144760443 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144760494 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144760500 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144760519 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144760586 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144760749 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144760794 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 144760875 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 144760902 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144760926 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 144760980 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144760999 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 144761078 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 144761297 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144762433 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144762570 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144762704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144762901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144762916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144763014 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144763441 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144763482 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144763637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144763730 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 144763792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144763811 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144764056 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 144764257 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144764273 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144764451 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144764457 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144764511 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144764514 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144764579 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144764630 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144764648 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144764735 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144764813 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 144764957 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 144765041 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 144765052 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 144765243 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144765277 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 144765389 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144765494 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 144765572 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 144765602 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 144765814 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144765957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144766178 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144766196 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 144766213 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144766268 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 144766823 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144767089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144767130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144767141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144767254 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144767626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144767688 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 144767705 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144767833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144768186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144768273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144768903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144768972 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144769264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144769299 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144769362 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144769531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144769688 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144769699 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144770173 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 144770220 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 144770422 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 144770503 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144770509 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144770739 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144770762 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144770787 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144770802 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144770806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144770883 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144770971 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 144770972 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 144770984 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 144771024 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 144771113 G T N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 144771365 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 144771442 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 144771594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144771771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144771845 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 144771936 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 144772203 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 144772353 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144772416 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144772480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144772604 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144773345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144773735 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 144773787 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144773824 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 144773834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144773847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144773951 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144774090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144774098 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 144774153 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 144774160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144774201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144774223 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144774380 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144774404 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 144774463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144774560 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 144774637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144774741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144774788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144774885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144774906 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 144775130 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 144775238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144775393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144775441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144775546 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 144775558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144775669 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144775708 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 144775778 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 144775942 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144776158 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144776226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144776588 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144776662 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144776729 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 144776805 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 144777063 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144777114 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 144777587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144778079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144778109 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144778227 T A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 144778279 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144778433 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144778498 T C Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 144778504 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 144778509 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 144778590 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 144778610 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144778618 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 144778731 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 144778757 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 144778774 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144778909 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144779438 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144779474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144779640 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144779690 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144779719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144779846 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 144780196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144780470 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 144780503 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144781427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144781450 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 144782306 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 144782462 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 144782898 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 144782925 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144783006 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 144783354 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144783514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144784059 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 144784063 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144784269 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 144784328 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 144784443 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 144784630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144784926 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 144785412 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 144785633 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 144785763 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144786193 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 144787790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144788034 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 144788143 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 144789217 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 144792280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144792352 G A Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 144794521 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144794984 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 144795501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144796052 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144796157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144796292 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 144796744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144797354 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 144797567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144797690 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 144798159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144798947 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144802056 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144803332 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144803582 A T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 144803961 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144804469 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 144804690 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 144805805 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144805826 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144807635 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144807735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144807901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144810361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144810573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144810925 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144810942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144811483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144812084 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144812262 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144815259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144816506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144817138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144818244 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144819699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144820584 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144824484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144825165 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144826491 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144826723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144827255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144827641 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 144829581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144832663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144833676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144836001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144836016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144836854 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144838674 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144839888 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144840859 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144841907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144842144 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144842240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144843981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144844233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144845831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144847170 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144848793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144849619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144850023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144861176 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144861620 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144861961 A G Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 144863371 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144863828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144864131 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 144864344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144864572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144864643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144865776 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 144866519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144866999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144867285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144867360 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144870799 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144871598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144873420 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 144873560 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 144873655 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144873846 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 144873854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144876515 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144877232 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 144877287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144877441 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144877544 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 144877843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144877926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144877998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144878150 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144878192 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144878730 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 144879040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144879063 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 144879489 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144879601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144879670 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 144880114 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144881558 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144881732 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144882010 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 144882595 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 144884052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144884510 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144884907 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144886142 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 144886593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144886647 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 144887110 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 144887115 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 144887153 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 144887183 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 144887323 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 144887382 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 144887430 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 144887499 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 144887562 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 144887680 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 144887769 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144887788 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144888104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144888143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144888150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144888230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144888921 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 144888950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144889018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144889207 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144889553 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 144889921 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144889944 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144890012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144890200 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144890265 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144890379 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144890475 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144891015 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 144891290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144891472 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 144891686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144891867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144891883 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 144891901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144892055 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144892132 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144892213 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144892238 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144892253 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144892290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144892322 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144892488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144892501 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144892591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144892638 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144892729 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144892744 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144892962 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144892974 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144893073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144893091 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 144893120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893214 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893370 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893418 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144893618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893776 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144893818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893820 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144893832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144893953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144894004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144894025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144894042 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144894249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144894262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144894271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144894277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144894347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144894354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144894454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144894552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144894651 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144894702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144894803 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144894825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144894983 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144895003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144895089 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144895178 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144895263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144895335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144895391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144895431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144895444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144895446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144895462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144895495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144895511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144895526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144895557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144895605 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144895732 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144895746 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144896580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144897450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144897559 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144897678 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144897747 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144898055 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 144898698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144899067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144899520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144899631 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144899883 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144899924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144900038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144900266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144900794 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144900902 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144901332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144901575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144902180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144902631 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144902948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144902981 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144903024 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 144903218 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144903474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144903502 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144903543 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144903672 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144903717 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144903742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144903813 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144904023 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144904232 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144904246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144904556 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 144904666 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144904832 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 144905033 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144905107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144905268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144905849 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 144906096 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 144906175 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 144906213 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 144906371 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144907101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144907117 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 144907178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144907222 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144907275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144907277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144907287 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144907344 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144907345 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144907385 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144907457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144907495 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144907540 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144907584 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 144907592 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144907595 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144907624 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144907642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144907721 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144907738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144907792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144907835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144907884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144907935 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144908151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144908179 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144908508 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144909049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144911034 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 144911150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144911235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144911514 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144912861 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144913992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144914026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144914213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144914263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144915119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144915348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144915541 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144916273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144917537 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144917884 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 144918715 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144918851 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 144918963 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144919120 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144919228 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144919446 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144919501 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 144919502 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144919567 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 144919591 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 144919841 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 144919861 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144919912 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144920046 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 144920198 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 144920324 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144920344 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144920365 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 144920366 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 144920393 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 144920395 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 144920417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144920503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144920602 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 144920615 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 144920621 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 144920920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144920949 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 144921347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144921374 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 144921396 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 144921439 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144921950 A T Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 144922132 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 144922194 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 144922898 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144923082 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144923505 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144923801 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144924333 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 144924408 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144924600 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144924724 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 144924924 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144924982 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144925072 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144925296 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144925695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144925711 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144925851 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144925873 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144925957 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144926158 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 144926256 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144926285 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 144926404 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144927050 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144927757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144927829 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144928233 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 144928261 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 144928329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144928642 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144928674 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 144928741 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144928860 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144929072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144929645 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144929797 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 144930004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144930334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144930816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144931236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144934001 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144934286 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144934384 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 144934653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144934885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144935090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144935463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144936383 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144936685 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144936743 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144936992 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144937029 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144937078 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144937136 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144937407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144937410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144937715 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 144937854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144937961 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144938050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144938053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144938189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144938203 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144938216 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144938339 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144938524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144938938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144939168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144939665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144943041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144943151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144950627 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 144951271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144951461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144953823 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144954736 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 144956416 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144957560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144958057 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144959244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144962002 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144963236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144963764 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144964400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144973842 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144974598 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 144974647 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 144974710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144975215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144975378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144976540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144976685 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144976686 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144977010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144977098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144977402 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144977432 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 144977458 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144977501 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144977745 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144977800 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144977918 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144978317 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 144978485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144978499 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144978500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144979012 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 144979017 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144979030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144979142 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 144979248 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 144979265 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 144979706 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144979834 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 144980170 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144980595 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144980622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144980686 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144980858 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144980884 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144981159 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144981549 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144981589 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144981705 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144981768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144981901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144982172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144982796 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 144983024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144983054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144983086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144983415 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144983525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144983553 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144983610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144983721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144983861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144983865 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144983922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144983935 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 144984217 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144984221 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144984478 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 144984727 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 144984802 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144984868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144985093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144985118 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144985124 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144985184 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144985209 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 144985243 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144985417 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 144985485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144985569 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 144986594 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144987259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144987658 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 144987905 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 144988369 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 144988504 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144990057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144990716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144990765 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 144992158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144992578 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 144994805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144994853 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144995261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144995453 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144997412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144997437 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 144998006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144998120 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 144998289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144998290 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144998794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 144999236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145000203 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 145000595 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145000757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145001014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145001733 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 145001762 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145002608 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145002741 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145002935 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 145003005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145003042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145003152 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 145004256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145005240 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 145005256 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145005422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145005774 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 145006186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145006280 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 145006529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145007643 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 145008169 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145008391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145008581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145008669 A T Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 145008673 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 145008723 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145009039 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 145009404 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 145009837 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145009962 A T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 145010149 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145010177 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145010209 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145010235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145011011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145011782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145014499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145018991 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145019051 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145020054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145020069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145020781 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145020821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145021300 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145021436 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145021514 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 145021776 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145021784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145021863 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145022084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145024125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145024619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145025153 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 145025462 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145027270 C A Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 145028244 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145029768 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145030224 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145030382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145030664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145031778 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145032155 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145032634 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 145032821 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 145032823 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 145032885 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 145034044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145034064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145034079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145034749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145035494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145035811 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 145035938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145036635 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145037560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145037641 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145037841 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145038262 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145039001 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 145039254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145039982 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145045641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145046013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145047099 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145048366 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 145048434 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 145048906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145049449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145051760 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145053058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145053159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145053786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145053793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145054013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145054728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145054742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145054902 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 145055036 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145055096 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145055184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145055185 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145055213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145055680 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145056222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145056434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145056444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145056491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145056594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145056751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145056836 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145056843 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145056853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145057073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145057127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145057129 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145057191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145057197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145057249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145057264 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145057297 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145057322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145057366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145057449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145057450 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 145057564 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145057677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145057753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145057866 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145057968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145057999 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 145058110 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145058129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145058163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145058166 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145058244 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145058659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145058821 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145058841 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145059590 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145059596 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145059803 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145059853 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145059911 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145060066 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 145060669 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145060737 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145060802 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 145060968 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145061213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145061320 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145061345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145061372 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145061419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145061475 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145061734 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145061751 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145061884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145068821 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145068897 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 145068910 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 145068948 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145068990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145069056 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 145069215 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145069440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145069584 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145069643 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145069678 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145069906 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 145069965 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145069975 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145070047 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145070057 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145070181 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145070945 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145070946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145071238 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145071556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145071656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145071785 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145071803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145072173 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 145072252 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145072964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145073492 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145073624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145073809 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 145073954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145074200 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145074813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145076319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145076643 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145077828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145078519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145079620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145080043 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 145082434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145082698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145083243 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145084533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145085853 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145087591 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145088030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145088488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145089109 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145091656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145101620 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145103989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145104576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145106503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145106603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145108721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145108990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145111477 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145111828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145112439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145114027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145115199 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145115449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145115928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145115941 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145116125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145116515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145116686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145117130 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145118080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145119120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145119918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145120032 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145120672 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145120712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145121801 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145123782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145123872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145124187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145124280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145125626 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145127614 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145128366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145128883 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145129388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145130399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145130658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145130729 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145130917 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 145131030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145131211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145131329 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145131419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145131430 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145131908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145132823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145133740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145134336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145134625 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145135896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145137031 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145137418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145137705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145138921 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 145138948 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 145138995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145139055 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145139296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145139387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145139747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145139862 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 145139989 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145140020 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 145140038 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145140047 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145140069 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 145140073 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 145140189 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 145140225 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 145140248 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 145140498 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145140513 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 145140684 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 145143109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145143534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145145944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145147230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145147715 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 145147749 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145148244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145148562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145149864 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145151071 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145151326 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 145151477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145153368 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145153749 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145154294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145157657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145157683 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 145157774 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 145159211 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 145159617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145159789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145160375 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145160546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145160858 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145160954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145160982 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145161176 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 145161262 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 145161705 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 145161777 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 145163562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145163594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145165586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145165892 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 145165928 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 145166678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145168440 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 145168544 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 145168566 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 145168776 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 145168900 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 145169181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145169435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145169522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145169548 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 145169613 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 145170537 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145170997 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145172774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145174519 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 145176580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145177492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145177650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145178527 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145180219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145181059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145181068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145181339 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 145181610 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145181739 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 145181782 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 145181796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145181950 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145182012 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 145183124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145183205 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 145183234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145183285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145183398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145183511 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 145183594 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145183710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145183713 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 145183725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145184451 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145184528 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145184735 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145184791 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145185553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145186545 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145186941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145189012 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145189026 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145190079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145190158 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145190371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145190599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145190807 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145191047 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 145191048 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 145191184 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 145191375 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145191395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145191581 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 145191605 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145191823 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 145191915 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 145192267 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145192272 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145192394 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145192742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145192796 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145192841 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145192867 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 145192937 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 145193069 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 145193332 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 145193369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145193396 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145193419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145193420 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145193455 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145193486 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145193488 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145193717 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145193780 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 145194051 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 145194231 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 145194240 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 145194279 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 145194402 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145194494 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145194501 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145194532 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145194667 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145194670 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145195057 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 145195179 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 145195199 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145195225 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 145195278 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145195288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145195348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145195349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145195365 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145195403 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145195422 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 145195544 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 145195578 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 145195711 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 145195760 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 145195887 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 145196101 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 145196701 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 145196808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145196842 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 145196874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145196919 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 145197285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145197314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145197363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145197364 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145197390 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145197415 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145197534 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 145197668 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 145197723 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 145197776 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 145197912 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 145197919 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 145198367 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145198563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145198729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145198906 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145198943 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145199208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145200111 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145200274 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145200816 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145201170 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145201374 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145201468 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 145201502 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145201620 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145201638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145201812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145202206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145202286 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 145202313 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 145202379 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 145202427 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 145202429 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145202464 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 145202524 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145202534 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145202559 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145202582 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 145202633 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145202637 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 145202807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145202875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145202884 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 145203076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145203106 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145203266 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145203283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145203332 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 145203403 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 145203526 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 145204424 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 145204440 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 145204453 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145204466 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145204494 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 145204500 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 145204507 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 145204704 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 145204775 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145204786 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 145205071 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 145205088 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 145205154 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 145205383 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145205638 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145205653 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145205723 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 145205764 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 145205778 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 145205779 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 145205833 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145205865 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145205914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145206004 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 145206091 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 145206278 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 145206382 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 145206386 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 145206485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145206512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145206540 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 145206549 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 145206555 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 145206604 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 145206690 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 145206762 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 145206894 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 145207139 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 145207443 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 145207541 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 145207564 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 145207645 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145207707 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 145207907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145207938 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 145208716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145210108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145210162 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145210900 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 145211251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145211796 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 145211938 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 145212146 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 145212425 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 145212470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145212546 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145212606 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145212629 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145212671 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145212698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145212705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145212760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145213733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145218546 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 145220975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145223550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145223686 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145226782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145227206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145228014 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 145231325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145231731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145231732 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145232104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145233743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145235944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145236746 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 145237597 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145237643 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 145240437 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145240799 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145240898 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145241307 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145241764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145241809 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145242008 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145242125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145242137 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145242171 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145242385 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 145243168 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145244875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145245119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145247098 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 145249362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145249525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145253352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145255037 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145256022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145256175 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 145256999 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 145257048 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145257113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145257306 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 145265272 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145271369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145272059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145277162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145280077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145282079 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145283462 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145283523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145283527 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145283555 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 145283644 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 145283710 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 145283831 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 145283878 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 145283894 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 145283957 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 145284221 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 145284412 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 145284431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145284483 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145284580 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 145284592 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145284697 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145284820 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145284835 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145284839 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145285198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145285460 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 145287236 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145287382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145287644 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145287668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145289108 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145291235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145293213 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145293945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145295773 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145296460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145296497 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145299105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145299378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145299550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145300428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145308066 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145308753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145310117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145311023 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 145311915 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145312453 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145312885 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 145313893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145314418 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145314635 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145315436 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145315517 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145317201 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 145320033 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 145321764 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 145321884 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 145323103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145323593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145325486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145326633 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145329105 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 145329434 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 145329506 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 145329593 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145329601 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145329628 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 145332336 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145333938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145333951 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145334341 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145334358 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145334371 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145334379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145334483 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 145334571 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145334672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145334832 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145334933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145335086 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 145337317 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 145337478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145337589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145337693 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 145337848 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 145338207 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 145338649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145338859 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 145338860 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 145339097 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145339153 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145339157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145339194 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145339266 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145339350 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145339396 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145339510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145339512 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 145339819 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 145339896 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 145340519 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145340841 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 145340850 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145340890 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145340941 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 145342450 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 145344107 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 145345028 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 145345621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145345654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145346717 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 145346722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145347490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145348698 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 145348729 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145350102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145350718 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145351531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145351677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145353154 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145353879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145354000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145354828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145356731 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145359149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145359166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145359212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145360142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145360988 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145361725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145361874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145362411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145362743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145362877 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 145363280 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145364215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145364362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145364397 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145364529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145368545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145369853 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 145369933 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 145370270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145370756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145370938 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 145370986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145372460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145372552 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 145373345 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145373349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145373516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145374001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145374643 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145374689 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145374843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145374874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145375430 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 145375573 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 145375596 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 145375860 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 145375915 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 145375942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145376016 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 145376069 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145376114 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 145376126 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145376153 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145376383 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 145376450 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 145376466 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 145376506 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 145376622 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 145376653 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 145376732 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 145376837 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 145376884 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 145376913 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 145377829 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145377830 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145378285 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145378460 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145378461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145378709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145378872 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 145378880 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 145378923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145379198 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145379243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145379414 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145379531 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145379570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145379601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145379681 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 145379725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145379849 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 145379863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145379979 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145380243 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145380345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145380522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145380988 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145381060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145381229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145381282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145381416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145381479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145381548 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 145381577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145381719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145382154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145382356 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145382367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145382424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145382692 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145382908 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 145382954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145382995 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145383069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145383164 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145383310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145383323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145383329 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145383723 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145383728 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145384317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145384632 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 145384980 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 145385036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145385227 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145385280 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 145385653 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 145386057 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145386083 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145386088 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 145386157 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 145386443 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145386472 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 145386490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145386546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145386573 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145386605 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145386627 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 145386667 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 145386717 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145386962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145387002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145387044 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145387221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145387302 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 145388657 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145389234 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145394153 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145394795 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145394951 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145395487 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 145395527 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145395765 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 145395790 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 145396245 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 145397004 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 145397049 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 145397057 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 145397238 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145397251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145397284 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145397325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145397345 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 145397429 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145397516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145397603 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145397741 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145398389 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 145399013 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145399351 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145400585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145401090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145403198 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145403498 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145406023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145406144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145406372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145407935 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145408163 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145408237 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145408544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145409065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145410057 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 145410152 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145410205 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 145410239 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 145410250 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 145410313 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 145410705 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145411229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145411798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145411811 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145411845 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 145412103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145412127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145412168 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 145412256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145412266 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145412348 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145412573 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 145412687 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145412767 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145412845 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 145412873 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 145412959 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145412984 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 145413031 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 145413035 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 145414485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145414670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145416286 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145416680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145424971 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145426040 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 145426052 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 145426260 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 145426372 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145426405 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145426459 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145426478 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 145426889 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145427080 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 145427220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145427231 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145427256 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 145427280 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 145427309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145427416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145427428 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 145427829 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 145427844 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 145428220 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145428286 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145428369 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145428394 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145428497 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145428500 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145428547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145428618 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145428976 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 145429006 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 145429031 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 145429133 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 145430037 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 145431012 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 145431231 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145431262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145431286 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 145431356 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 145431682 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145431911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145432087 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145432569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145432972 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 145433908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145434511 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145435244 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145435466 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 145435621 G C Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 145435747 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145435753 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 145436176 C A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 145436340 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 145436425 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145436480 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 145436880 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145436950 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 145437067 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 145437111 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 145437158 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 145437159 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 145437413 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145437542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145437615 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145437714 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145437745 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145437809 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145438157 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145438466 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 145438501 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 145438534 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 145438641 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145438661 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145438786 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145439540 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 145439725 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 145439742 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145439800 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 145439814 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 145439829 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 145439832 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 145439861 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 145439915 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 145440671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145440898 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 145440930 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 145440973 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145441144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145442646 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 145442787 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 145442845 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 145442961 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 145443038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145443048 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 145443148 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 145443196 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 145443200 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 145443512 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 145443739 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145443769 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 145443777 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 145445071 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 145446568 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 145447111 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145449366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145450874 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 145456415 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145456567 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145456963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145457367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145457383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145457384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145457449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145457477 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145457486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145457493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145457593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145458083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145458087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145458147 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 145458310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145458471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145458849 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 145458903 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 145459020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145459044 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 145459254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145459464 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 145460091 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 145460518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145460876 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 145460955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145461080 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145461378 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 145461515 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 145461618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145461625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145461639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145462136 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 145462206 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145462511 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145462602 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145462615 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145462682 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145462766 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 145462993 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145463182 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145463461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145463512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145463593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145463636 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145464423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145464445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145464841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145464952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145466316 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 145467688 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 145467691 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 145468206 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 145468286 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 145468419 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 145468420 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 145468556 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 145468862 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145468897 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 145469237 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145469302 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 145469336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145469478 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 145469662 G T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 2 145469664 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 145469716 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 145469720 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 145469818 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 145470399 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 145470423 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145470610 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 145470700 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 145470905 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 145471036 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 145471288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145471609 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145471622 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 145471891 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 145472026 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 145472063 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 145472110 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 145472308 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145472328 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145472411 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145472412 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145472463 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145472474 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145472563 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145472567 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 145472665 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145472666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145472709 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 145472722 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145472769 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145472836 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 145472839 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 145472908 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 145472917 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145472955 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145473064 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 145473177 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145473379 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 145473380 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 145473447 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145473585 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145473634 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145473689 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145474049 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145474150 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145474200 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145474229 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145474322 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145474377 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 145474418 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145474496 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145474504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145474555 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145474561 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145474597 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145474600 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145474628 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145474640 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145474670 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 145474856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145474945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145475088 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145475256 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145475434 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 145475598 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145475623 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145475697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145475905 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145475917 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145476018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145476033 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145476214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145476317 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145476356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145476486 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145476512 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145476850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145476904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145477361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145477422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145477691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145477973 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145477998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145478018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145478038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145478082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145478152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145478267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145478376 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145478394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145478735 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 145479302 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 145479319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145479491 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 145480310 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145480897 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 145480908 T A N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 145481170 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 145481244 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 145481265 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 145481284 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 145481460 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145481687 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 145481828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145482030 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145482051 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 145482424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145482911 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 145483808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145483948 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145484016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145484648 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 145484675 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 145485381 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145485422 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145485588 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145485600 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145485646 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145485877 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145486088 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 145486240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145486365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145486434 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 145486481 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145486483 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145486579 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145486588 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145486619 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145486713 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145486748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145487085 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145488421 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 145488444 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 145488487 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 145488507 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145488533 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 145488742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145488756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145488799 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 145488801 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 145489667 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145489681 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145489869 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145489984 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 145489996 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 145490567 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 145490651 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 145490738 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 145490751 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145490817 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 145490822 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 145490976 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145490977 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145491038 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 145491150 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 145491176 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 145491190 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 145491232 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 2 145491256 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 145491266 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 145491397 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 145491418 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 145491460 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145491472 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145491476 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145491493 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145491567 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 145491588 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 145491978 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 145492051 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 145492104 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145492129 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145492144 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145492196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145492236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145492277 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145492433 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145492476 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145492555 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145492576 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145492714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145492782 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145493480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145493779 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 145494220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145494739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145494789 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145495068 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145495220 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 145495648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145495842 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 145495867 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 145495871 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 145496019 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145496690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145496733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145496898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145497418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145497443 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145497497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145497789 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145497792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145497858 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145498754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145498859 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145498863 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145498897 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145499030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145499143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145499202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145499212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145499216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145499258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145499602 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145499813 C G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 145499867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145499870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145499886 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145499888 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145500045 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145500085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145500156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145500172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145500271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145500299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145500435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145500500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145500557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145501054 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145501219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145501224 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145501770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145501993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145502273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145502291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145502406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145502782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145503187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145503211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145503318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145503535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145504131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145504436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145504576 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 145504879 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145505755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145506124 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145506883 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 145506894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145507219 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145507572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145507597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145507623 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145507715 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145507725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145507772 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145507954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145508079 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145508168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145508246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145508278 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 145508358 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 145508368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145508394 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 145508514 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145508519 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145508818 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145509113 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 145509190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145509216 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145510135 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145510303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145511240 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145511372 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145511695 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145511870 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145511908 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145512321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145512505 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 145513141 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145513166 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145513438 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145513455 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145513871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145513948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145514002 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145514099 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145514503 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145514528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145514564 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145514583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145514613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145514617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145514632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145514753 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145514861 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 145515256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145515824 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145515866 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145515916 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145515944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145516034 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145516068 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145517022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145517174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145518051 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145518943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145519028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145519053 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145519513 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 145519800 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145520377 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145520449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145520544 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145520566 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145520720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145520732 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145520733 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145520871 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 145520895 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145520913 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145520939 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145520955 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145520979 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145521001 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145521181 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 145521184 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 145521262 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145521416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145521451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145521452 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145521632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145521685 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145521866 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145521867 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145521965 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 145521971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145522047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145522090 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145522097 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145522113 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145522131 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145522175 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 145522189 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 145522259 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145522353 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 145522363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145522606 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 145522653 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145522919 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 145523087 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145523143 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 145523144 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 145523169 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 145523225 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145523259 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145523267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145523340 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 145523351 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145523416 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 145523491 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145523492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145523580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145523595 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145523611 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145523629 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145523694 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145523703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145523762 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145523909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145523972 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145523988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145523989 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145524037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145524075 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145524089 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145524105 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145524173 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 145525049 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145525073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145525154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145525443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145526073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145526091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145526328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145526350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145526714 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145526816 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145527342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145527349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145527366 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145527498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145527525 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 145527534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145527601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145527649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145527650 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 145527729 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 145528016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145528155 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 145528164 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 145528367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145528371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145528387 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145528532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145528712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145528721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145528754 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145528889 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145528890 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145528926 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145529384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145529666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145529676 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 145530070 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145530251 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 145530286 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 145530360 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 145530445 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145530451 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 145530473 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 145530670 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145530671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145530943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145531153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145531235 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145531375 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145531888 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 145532014 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145532174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145532210 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145532232 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145532250 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145532293 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 145532313 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 145532327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145532344 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 145532405 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145532430 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 145532494 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145532533 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 145532615 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 145532998 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145533109 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 145533125 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 145533179 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145533201 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 145533390 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 145533496 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 145533757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145533934 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145534055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145534059 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145534127 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 145534168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145534386 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145534481 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 145534502 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145534592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145534642 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145534667 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 145534707 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145534733 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145534738 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145534748 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145534758 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 145534867 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145535130 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 145535225 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145535257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145535298 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145535338 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145535365 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 145535453 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145535496 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145535644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145535717 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145535752 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145535766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145535777 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145535781 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145535844 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145535942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145536027 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145536070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145536229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145536295 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 145536297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145536582 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 145536623 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145537255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145537654 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 145537696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145537719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145538045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145538056 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145538119 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 145538133 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 145538227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145539276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145540564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145540802 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145541005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145543965 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 145545105 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 145549892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145549913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145549973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145550014 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 145550015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145550179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145550290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145550565 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145550590 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145550634 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145550861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145551026 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145551104 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145551249 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 145551270 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 145551444 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 145551463 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 145551480 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 145551783 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145552134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145552169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145553175 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145554569 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 145555050 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 145555228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145555302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145555418 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 145555425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145555491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145555827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145555943 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145555945 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145556404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145556635 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145556998 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145557815 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145558387 C T Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 145561084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145561774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145561824 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145561830 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145561857 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145562328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145562975 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145564902 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145565598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145566045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145566348 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145566368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145566553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145566612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145566773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145566790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145567025 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145567150 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145567166 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145567232 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145567276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145567296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145567372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145567409 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145567491 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145567497 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145567504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145567804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145567916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145567948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145568161 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145568265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145568340 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145568354 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 145568424 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145568454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145568463 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145568494 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145568503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145568530 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145569075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145569092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145569110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145569215 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145569543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145569694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145570676 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 145570789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145570800 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145570833 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145571541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145571695 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145571925 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145572052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145572665 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145572725 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145572810 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145572820 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 145572822 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 145573108 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 145573411 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145573435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145573509 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145574282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145574896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145574898 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145575339 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 145575629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145575807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145576083 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 145576084 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 145576115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145576601 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 145576605 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 145576793 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 145576907 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 145577086 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 145577088 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145577508 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 145577671 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 145577672 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145577935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145578025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145578291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145578385 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145578512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145578794 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145578865 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 145579138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145579338 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 145579586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145579915 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 145580502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145580620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145582610 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145582776 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 145583765 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145583806 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 145583838 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 145583945 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 145583956 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145583972 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145584160 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 145584259 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145584343 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145584431 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 145584496 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145584589 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 145584779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145584809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145585005 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145585259 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145586043 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 145586294 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 145586361 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 145586449 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 145586450 G C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 145586471 G T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 145586477 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 145586486 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 145586538 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 145587852 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 145588662 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145589100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145589332 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145589333 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145589448 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 145590114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145590189 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 145590213 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145590222 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 145590319 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 145590469 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 145590595 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 145590603 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 2 145590719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145590722 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 145590789 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145590892 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 145590972 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 145591224 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 145591316 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145591320 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145591341 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 145591371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145591374 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145591396 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145591437 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 145591470 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145591473 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145591566 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145591726 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 145591786 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 145591845 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145591931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145592091 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 145592506 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 145592557 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145592777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145592840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145592957 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145592998 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145593077 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145593135 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 145593324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145593984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145594180 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145594256 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145594288 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 145594353 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145594413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145594452 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145594532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145594607 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145594615 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 145594639 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 145594646 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145594666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145594890 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 145594983 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 145595089 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 145595160 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 145595170 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145595220 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145595233 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145595272 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 145595360 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 145595407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145595751 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 145595754 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 145595812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145595862 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145596084 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145596225 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145596845 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145596889 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145597237 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145597658 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 145597664 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 145597825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145598016 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 145598622 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 145598745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145598888 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145598901 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145598995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145599307 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145600019 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145600054 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145600094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145600099 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145600220 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145600663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145600745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145601354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145601782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145601863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145602658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145602682 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 145602685 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145602740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145602805 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 145602821 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 145602909 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 145602960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145602982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145603093 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 145603151 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145603258 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145603457 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 145603646 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 145605120 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145605200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145605331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145605389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145605458 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145605469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145606015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145606211 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145606272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145606290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145606411 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 145606521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145606628 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 145606693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145606925 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145608090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145608098 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145608198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145608450 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 145608938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145608967 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145609066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145609079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145609092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145609213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145609461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145609553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145609769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145609775 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 145609824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145609926 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 145610419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145611333 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 145611672 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145611901 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 145612072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145612100 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145612466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145612642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145612649 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 145612830 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 145613279 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145613359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145614028 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 145614317 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 145614417 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145614626 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 145614641 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 145614644 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 145614712 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 145614785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145614810 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 145614854 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 145614875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145615016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145615255 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 145615307 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145615320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145615377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145615778 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 145616033 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145616110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145616209 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 145616298 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 145616370 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 145616545 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 145616690 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 145616805 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145616864 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 145616877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145618139 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 145618155 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145618312 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 145618391 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 145618408 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145618411 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 145618422 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 145618432 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 145618489 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 145618539 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 145618742 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 145618788 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145619027 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145619137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145619292 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145619441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145619637 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 145619638 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 145619648 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145619660 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 145619975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145620328 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 145620717 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145621082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145621545 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145621778 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 145622461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145622682 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145622859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145622873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145623237 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 145623274 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 145623396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145623485 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145623502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145623510 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 145623619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145623655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145623724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145623752 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145624880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145625280 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 145625520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145625548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145625567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145625625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145625658 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145625742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145626392 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 145626459 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 145626510 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145626727 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 145627345 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 145627418 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 145627719 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 145628220 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 145628253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145628851 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 2 145628941 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 2 145628955 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 2 145628971 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 2 145629243 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 2 145629319 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 2 145629344 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 145629377 G T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 2 145629398 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 2 145629441 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 145629639 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 145629725 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 145629781 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 145629793 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 2 145629814 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 145629904 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 145629942 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 145630057 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 145630857 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 145632591 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 145633042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145633453 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145633984 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145634271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145634357 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145634927 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145635251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145636355 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 145636456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145636590 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 145636642 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145636643 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145636816 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145637103 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145637174 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145637179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145637194 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145639662 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145640242 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 145640733 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145640825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145641402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145641484 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 145641536 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 145642357 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145643739 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 145644597 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145646597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145647045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145648142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145648223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145649605 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 145656495 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145656956 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145657157 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 145660270 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145660527 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145660861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145662144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145664515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145664609 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 145665063 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 145665113 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 145665123 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 145665184 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 145665197 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 145665238 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 145665289 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145665334 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 145665473 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145665483 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 145665973 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 145666161 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 145666229 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 145666239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145666990 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145667322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145670085 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145670797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145673012 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145673779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145674034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145674321 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145675365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145675481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145676147 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145676345 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 145676438 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 145676675 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145677100 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 145677435 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145677728 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 145677829 T C N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 145678027 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145678143 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 145678210 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145678269 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145678333 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145678374 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145678423 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145678826 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 145678997 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145679104 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145679231 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145679249 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145679706 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 145679723 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145679756 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 145679880 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145679998 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145680008 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145680050 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145680054 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145680505 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145680513 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145680923 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 145680993 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 145681113 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145681136 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145681483 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145681520 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145681544 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 145681586 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145681628 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145681649 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 145681866 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 145682430 C T N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 2 145682514 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 145682605 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 145682687 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 145682994 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145684464 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145684521 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145684659 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 145684935 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 145685058 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 145685116 T A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 145685304 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145685405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145685510 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 145685582 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 145685766 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 145685783 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 145685994 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 145686276 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145686402 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 145687354 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145687427 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145687521 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145688205 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 145688313 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145688497 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145688661 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 145688839 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 145689823 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 145690278 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145690443 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 145690502 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 145691084 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 145691484 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145692703 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145693542 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 145693584 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 145693644 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145693724 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145693758 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 145693836 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 145693909 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145693978 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145694259 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145694313 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 145695291 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145695449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145695498 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 145695554 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145695843 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 145695879 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145695925 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 145696110 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 145696116 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145696443 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 145696478 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 145696498 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145696508 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 145696513 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145696775 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 145696835 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 145696878 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 145697175 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 145697580 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 145697647 A C Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 145697660 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 145697718 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 145698306 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 145698619 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145699097 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 145699369 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145699624 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 145699735 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 145699736 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 145699832 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145699961 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145699967 A T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 145699989 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 145700019 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145700152 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145700200 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 145700413 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 145700441 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 145700445 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 145700555 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145700557 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145700677 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145700690 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145700805 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145702763 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145702870 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145703811 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 145704409 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145704455 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145704529 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145704765 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145704789 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145705013 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145705014 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145705061 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145705194 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145705269 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145705366 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145705700 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 145705711 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 145706006 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145706046 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 145706055 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145706082 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145706165 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 145706253 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 145706392 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 145706740 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145707105 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145707107 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 145707146 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145707213 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145707241 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145707437 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145707520 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145707775 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 145707905 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145707914 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145707957 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145708090 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145708162 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145708225 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145708541 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145708548 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 145708588 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145708735 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145708802 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 145708915 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145708918 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145709017 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 145709042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145709245 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145709258 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145709349 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145709855 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 145710021 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 145710103 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 145710120 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 145710137 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 145710193 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145710232 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 145710305 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145710661 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145711122 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145711261 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145711449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145711872 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145712056 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145713376 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 145714182 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145714601 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145715835 A T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 145716004 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 145716234 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 145717041 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145717226 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 145717602 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145717911 C G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145718189 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145718472 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 145718737 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 145719053 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145719166 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145719239 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145719361 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145719573 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145720149 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145720282 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145720311 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 145720913 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145720933 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 145720960 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 145721377 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145722236 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145722303 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 145722359 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145722368 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145722555 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145723476 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 145723753 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 145723872 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145723952 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145723953 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145724239 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145724413 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145724416 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145724572 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145724697 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145724820 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 145724890 C A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 2 145725173 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 145725927 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 145726549 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 145726765 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 145726956 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145728565 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 145730259 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145730426 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145732387 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145733082 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145733915 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145734219 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 145734596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145734865 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145735669 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145735896 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145736283 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145736942 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145737441 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145738151 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145738541 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145738653 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145739683 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 145739835 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145740230 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145740231 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145740243 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145740843 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145741004 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145742102 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 145742499 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145742500 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145742959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145743382 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145743546 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145744289 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145744739 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145745410 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145745692 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145745783 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145745795 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 145745913 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145746003 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145746153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145746186 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145746210 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 145746378 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145746464 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145746542 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145746554 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145746594 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145746658 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 145746713 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145746775 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145746881 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145746884 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145747224 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 145747476 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145747610 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145747706 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145747802 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 145747961 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145748009 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145748149 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145748167 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145748173 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145748344 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145748373 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145749283 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145749332 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145749375 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 145749497 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145749511 G A Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 145749559 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145749671 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 145749705 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 145749750 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 145749785 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145749850 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145749965 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145750094 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145750266 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 145750424 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145750447 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 145750490 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 145750517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145750607 A C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 145750706 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 145750727 T A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 145750741 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 145750760 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145750795 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 145750906 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 145751047 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 145751250 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 145751658 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145751695 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 145751816 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145751911 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 145751992 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145752325 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145752364 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145752623 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 145752934 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 145752945 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145753082 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 145753764 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145754341 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 145754391 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145754544 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145754720 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145755225 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145755371 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 145755372 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145755441 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145755443 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145755541 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145755581 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145755593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145755660 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145756183 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145757041 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145757827 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145757923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145757948 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145758211 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 145758386 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145758846 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145759355 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145759411 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145759475 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 145759632 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 2 145759639 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 2 145759883 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145759968 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145760048 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145762071 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145762329 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 145762760 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145763005 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145763118 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145765212 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145765989 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145766032 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145766103 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145767238 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145767374 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145767428 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145767528 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145767639 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145767710 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 145767790 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145767803 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145767819 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145768113 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 145768928 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 145769348 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145769649 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145769660 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145769717 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145769821 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145769855 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145770026 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 145770355 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 145770490 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145770491 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145770542 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145770606 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145770614 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145770764 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145771286 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 145771351 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145771700 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145771767 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 145772036 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145773171 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145773194 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145773382 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145773510 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145773524 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145773629 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145773742 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145773755 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145773784 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145774094 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145774141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145774247 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145774270 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145774293 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145774395 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145774446 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145774508 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145775619 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145775636 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 145775891 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 145776425 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 145776473 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145776888 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145777427 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145777676 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145777742 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145777743 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145777757 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145777923 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145778174 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 145778268 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145778286 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145778288 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 145778557 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145778596 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 145778613 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 145778666 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145778743 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145778814 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145778925 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 145779005 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145779017 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145779044 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 145779085 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 145779152 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 145779208 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145779221 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 145779232 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 145779233 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 145779404 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145779407 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 145779421 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 145779645 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 145779696 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 145779721 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 145779745 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 145779834 C G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 145779867 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 145779974 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 145779989 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 145780008 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 145780122 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145780137 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145780209 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145780220 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145780268 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145780336 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145780534 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 145780554 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145780629 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145780674 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 145780980 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145781273 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145781310 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145781324 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145781453 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145781506 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145781507 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145781696 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 145781776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145781885 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145781968 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 145782101 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145782160 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145782223 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145782255 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 145782463 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145782509 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145782849 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145782862 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 145782880 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145782881 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 145783066 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 145783076 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 145783230 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145783235 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145783329 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145783462 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145783638 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 145783646 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 145783652 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 145783706 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145783795 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 145783936 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 145784021 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145784102 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 145784211 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145784221 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 145784444 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145784523 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145785176 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145785334 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145785342 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 145785413 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 145785982 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145786472 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145786759 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145787076 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145788085 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145789795 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145789862 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145790220 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 145790224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145790719 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145790833 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145790846 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 145790917 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 145790970 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 145791058 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 145791082 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 145791097 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 145791395 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145791499 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 145791502 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 145791511 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 145791821 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 145792207 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 145792544 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145792667 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 145793345 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 145793839 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 145793883 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 145793902 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145793955 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 145793966 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145794273 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145794384 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 145794641 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 145794772 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145794948 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145795718 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145795855 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145796031 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145797048 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 145797124 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 145797251 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 145797513 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 145798706 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 145799029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145799036 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145799383 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 145799802 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 145799806 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 145799954 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145800029 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 145800077 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 145800233 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145800628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145800671 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145800700 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 145800745 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145800792 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145800885 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145801222 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 145801325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145801581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145801582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145802063 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 145802192 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145802247 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145802607 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145802633 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145802706 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145802711 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145802782 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145803038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145803080 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145803115 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145803130 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145803177 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145803328 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145803429 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 145803555 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145803639 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145803685 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 145804159 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145804291 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145804823 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145805049 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145805241 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 145806039 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145806792 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145807063 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145809029 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145809867 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145810775 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 145810948 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 145811014 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 145811223 A C N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 145811541 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145811636 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 145812537 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145813090 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145813166 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145813716 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145813809 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 145814023 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 145814032 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145814082 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 145814281 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 2 145814424 G T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 145814459 T G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 145814480 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 145814565 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 145814570 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 145814703 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145814709 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145814771 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145814814 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145814868 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 145815090 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145815185 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 145815189 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145815209 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145815227 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145815246 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145815254 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145815278 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145815331 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 2 145815482 C A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 145815669 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 145815682 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 145815708 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 145816856 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 145816869 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145817382 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145818133 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145818353 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 145818726 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145818737 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145821425 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 145823040 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145823561 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145823626 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145823636 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145824262 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 145824384 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145824529 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145825130 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145826081 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145826729 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145826970 G T Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 145827400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145827532 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145828025 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 145828061 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145828234 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 145834796 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145834806 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145834875 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145834920 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145835016 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145835442 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145836086 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145836121 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145836150 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145836195 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145837046 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145837108 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145837156 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145837257 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145837575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145837855 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145838037 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145838732 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145838749 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145838836 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145838883 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145839017 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145839035 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145839115 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145839128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145839170 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145839319 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145839360 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145839398 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145839518 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 145839532 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 145839614 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 145839661 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 145839735 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145840420 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145841478 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145842024 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145842432 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145842559 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145842577 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145842809 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145843005 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 145843329 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145843436 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145843487 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145843567 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145843608 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145843842 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145843927 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145844074 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145844884 C G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 145845227 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 145845319 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145845352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145845373 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145845388 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145845395 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145845407 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145845534 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145845540 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 145845571 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145845685 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 145845695 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 145845738 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 145845860 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145845987 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 145846062 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 145846070 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 145846108 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145846130 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145846159 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145846173 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145846242 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145846281 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145846302 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145846352 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145846531 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145846619 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145846652 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145846683 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145846730 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145846847 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145846881 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 145846961 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145846995 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 145847141 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145847189 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 145847201 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 145847233 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 145847281 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145847303 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145847404 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145847537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145847552 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 145847576 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145847600 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145847620 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145848821 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145848949 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 145848955 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145848965 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145848969 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145849190 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145849612 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145849750 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145850006 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145850092 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145850447 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145850647 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145850945 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 145851018 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145851074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145851671 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145852191 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 145852729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145852827 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145852952 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 145852966 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 145853056 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 145853114 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145853344 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145853390 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145853415 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145853459 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145853467 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145853580 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 145853751 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 145854130 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145854240 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 145854511 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145854545 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 145854576 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 145854978 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145855027 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145855028 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145855205 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 145855231 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145855251 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 145855271 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145855273 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145855297 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145855453 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 145855537 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 145855590 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 145855601 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 145855651 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 145855930 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145855996 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145856234 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 145856253 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 145856335 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145856380 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145856466 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145856492 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145856518 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 145856522 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145856675 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145856905 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 145858059 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145858075 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145858248 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 145859098 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 145859563 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145859658 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145859708 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145859725 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 145860034 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145860075 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145860511 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145860541 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 145860673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145860808 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 145860854 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145861219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145861389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145861409 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 145861492 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145861493 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145861720 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145862001 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145862004 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145862146 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145862371 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145862397 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145862483 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145862519 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145862674 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145862684 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 145862698 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145862732 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145862905 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 145862985 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 145862996 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 145863036 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 145863051 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 145863078 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 145863094 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 145863234 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 145863262 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 145863264 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 145863287 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 145863346 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 145863384 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 145863400 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 145863439 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145863489 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145863570 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145863776 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145863780 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145863790 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145863839 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145864002 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145864062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145864087 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145864169 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145864224 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145864480 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145864559 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145864727 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145864742 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145864772 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 145867678 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145867729 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145868127 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145868622 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145868763 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145868779 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145868785 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145868820 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145868864 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145869035 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145869359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145869530 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145869573 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145869649 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145869780 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145869825 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145869836 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145869859 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145869918 C G Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 145869951 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145869971 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145870036 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145870102 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145870167 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145870302 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 145870701 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145870818 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145871584 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145871623 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145871697 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145871715 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145871918 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145872066 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 145872123 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145872148 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145872243 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 145872423 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 145872510 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 145872819 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145872830 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145872997 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145873059 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145873106 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145873227 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145873408 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145873550 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145873614 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145874016 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145874149 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 145874223 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145874494 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145874626 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145874741 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145874832 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145874837 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145875177 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145875268 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145875612 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145875924 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145875932 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145876532 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 145876533 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145876925 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145876951 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145877060 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145877179 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145877790 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145877919 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145878060 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145878080 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145878499 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145878530 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145878593 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145878671 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 145878686 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 145878698 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145878713 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145878830 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145878846 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145878873 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145878886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145879253 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145879274 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145879717 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145879730 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145879793 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145879798 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145879860 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145880066 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145880229 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 145880258 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145880352 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145880422 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145880551 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145880709 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145880713 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145880758 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145880900 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145880977 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145881073 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145881137 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145881141 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145881151 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145881153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145881163 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145881164 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145881175 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145881187 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145881203 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145881207 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145881221 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145881337 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 145881612 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145881623 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145881672 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 145881758 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145881775 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145881934 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145882119 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145882130 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145882385 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145882433 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145882445 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145882515 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145883334 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145883483 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145883885 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145883974 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145883983 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145884012 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145884439 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 145884960 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 145885388 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145885616 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145885629 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 145885660 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 145885671 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 145885694 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 145885735 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 145885804 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 145886011 C G N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 145886017 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 145886182 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145886249 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 145886262 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 145886692 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145887260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145887888 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 145888129 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 145888705 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145888706 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145889069 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145889073 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145889139 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145889211 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145890610 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 145890658 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 145890659 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 145890878 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145891387 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145892014 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145892183 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145892559 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145893156 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145893239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145893881 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 145893913 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145893965 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145893974 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145894008 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145894899 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 145895286 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145895454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145896044 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 145896143 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145896208 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145896362 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145897107 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 145897127 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 145897141 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 145897153 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 145897528 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 145897908 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 145898179 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 145898354 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145898365 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145898681 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145898863 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145898931 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 145899247 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 145899412 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145899429 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145899500 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 145899663 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 145900397 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145900427 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145900434 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145900468 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145900511 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145900523 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145900533 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145900545 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145900550 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145901152 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145901218 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145901262 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145901300 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145901476 T C N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 2 145901789 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 145901808 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145901822 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 145901910 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145901938 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145901983 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145902179 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 145902313 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 145902344 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145902953 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145903245 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 145904775 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145904906 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145904976 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 145905272 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145905811 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145906236 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 145906342 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145906354 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145906684 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145906773 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145907277 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 145907584 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 145907752 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145907946 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145907953 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145907974 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145908020 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145908228 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 145908339 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 145908982 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145909005 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145909474 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145909558 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145909614 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145909847 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 145909941 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145909949 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 145910081 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145910128 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145910260 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145910316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145910328 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145911795 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 145911909 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145912561 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145912749 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 145912821 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145912854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145913392 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 145913416 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145913499 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145913760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145914780 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 145914818 A C Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 145915349 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 145915396 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 145915864 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 145916638 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145916686 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 145916806 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 145917067 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145917097 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145917168 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145917296 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145917383 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145917417 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145917502 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145917571 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145917672 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145917694 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145917879 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 145918131 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145918352 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145918353 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145918409 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 145918528 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145918555 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145918589 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 145918605 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 145918762 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 145918821 G T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 145918890 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 145919066 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145919133 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 145919286 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 145919499 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 145919511 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 145919610 C G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 145919629 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 145919656 C A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 145919888 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145919897 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145919905 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145919924 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145919970 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145920070 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145920200 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145920220 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145920235 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145920269 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145920403 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145920465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145920580 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145920760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145920821 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145920878 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145920979 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145921027 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145921059 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145921198 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145921581 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145921638 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145921661 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145921707 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145921814 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145922098 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145922108 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145922149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145922212 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145922241 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145922329 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145922572 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145922982 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 145923181 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145923312 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145923394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145923754 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145923980 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145924371 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145924478 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145924956 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145924984 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145924990 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145924997 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145925032 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145925049 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145925059 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145925069 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145925083 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145925136 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145925144 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145925165 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145925337 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145925921 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145926343 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 145926660 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145926820 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145927173 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145927393 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145927471 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145927487 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145927872 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145927879 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 145927904 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145927944 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145927989 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 145928022 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145928386 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 145928423 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145928826 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145928887 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145928965 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 145929028 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145929171 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145930400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145930669 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145930670 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145930853 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145931090 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145931110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145931502 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145931544 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 145931610 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145931818 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 145931876 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 145931999 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145932265 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 145932343 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 145933099 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145933117 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145933138 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 145933470 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 145933585 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 145933745 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 145934268 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145934701 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 145934711 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145934822 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145934831 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145934888 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145934891 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145934901 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145934923 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145934935 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145934968 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145935098 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 145935105 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145935326 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145935508 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145935581 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145935846 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145935935 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145936056 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 145936289 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145936471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145936708 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145936947 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 145937950 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 145937962 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145938027 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 145938344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145938523 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145938525 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145938665 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 145938687 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 145938696 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 145938741 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 145938828 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 145939197 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 145939423 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145939437 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145939439 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145939464 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 145939526 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 145939577 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145939589 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145939688 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145939690 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145939753 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 145939762 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145939853 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145940128 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 145940145 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 145940433 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145940506 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145940510 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145940571 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145940601 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145940659 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145940807 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145940855 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145941100 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 145941512 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 145941513 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145941997 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 145942036 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 145942066 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 145942286 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 145942407 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145942494 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145943720 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 145944262 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 145944552 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 145944732 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145944745 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145944747 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145944895 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145945514 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 145945535 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 145945546 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 145945680 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 145945890 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145945913 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 145945939 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145946021 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 145946214 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 145946508 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 145946571 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 145946666 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 145946749 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 145946976 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 145947071 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 145947312 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 145947416 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 145947550 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 145947603 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 145947607 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 145947634 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 145947679 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145947939 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 145947942 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 145948305 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 145948397 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 145949656 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145950411 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145951542 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145951573 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 145952160 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145952355 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145952459 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145952720 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145953557 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 145953986 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 145955221 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145955745 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145956543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145956695 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 145957075 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145958381 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145958675 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 145959147 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145959250 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 145959554 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145959705 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145960472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145960674 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 145960809 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145960905 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 145960993 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 145961004 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 145961095 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145961376 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145961446 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 145966078 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145966464 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 145966969 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 145967226 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 145969237 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145969560 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145970055 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145970116 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145970366 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145970367 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 145970715 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 145971100 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145971248 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 145971270 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 145971439 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145971745 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 145971824 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 145972026 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 145972201 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 145972558 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145972927 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 145972959 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 145973007 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145973103 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 145973320 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 145973359 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145973376 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 145973822 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 145974007 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 145974235 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 145974371 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145974426 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 145974473 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 145974544 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145974942 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145975106 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 145975352 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145975415 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 145975630 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145975891 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 145975897 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 145976036 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 145976634 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145976723 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145976734 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 145977401 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 145977506 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145977671 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 145977759 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145977776 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 145977880 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145977913 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 145977944 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145977955 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145978002 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145978063 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145978069 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145978145 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145978158 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145978240 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145978249 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145978364 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145978692 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 145978907 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145978937 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 145979040 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145979174 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 145980155 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145980243 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 145980651 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 145981089 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145982195 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 145982499 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 145982772 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145982898 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 145982961 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145983031 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145983096 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 145989518 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145990482 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 145990487 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 145990553 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 145990559 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 145990599 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145991744 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145991759 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145991777 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 145992104 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 145992317 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145992960 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 145995151 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145995679 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 145996022 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 145996100 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145996612 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 145996723 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145996964 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145997000 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145997053 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145997055 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 145997103 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 145997139 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 145997401 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 145998130 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 145998630 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 145999522 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146002932 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146003440 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146004217 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146004981 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146005201 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146005810 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146005869 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146005884 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146005963 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146006154 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146006261 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146006471 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146006511 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146006572 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146006662 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146006709 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146006920 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146006997 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146007014 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146007305 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146007319 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146007329 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146007397 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146007417 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146007433 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146007574 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146007591 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146007661 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146007686 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146007748 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146007933 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146008011 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146008014 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146008025 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146008172 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146008607 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146008617 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146008915 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146009215 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146009652 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146009923 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146010218 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146010505 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146010712 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146011160 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146011344 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146011498 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146011511 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146011512 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146012168 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146012527 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146012832 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 146012843 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 146012999 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 146013667 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146013694 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146014646 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146014766 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146014847 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146014952 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146015036 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146015492 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146015793 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146015918 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146016049 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146016195 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146017529 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146017563 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146017680 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146018227 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146018796 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146018961 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146019208 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146019548 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146019789 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146019805 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146020053 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146020098 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146020618 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146020775 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146021056 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146021677 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146021694 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146021704 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146021736 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146024349 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146024477 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146024647 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146024677 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146024813 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146024894 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146025663 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146025680 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146026313 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146026751 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146026940 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146027089 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146027620 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146028380 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146028435 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146028493 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146028629 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146028817 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146029312 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146029340 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146029854 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146030798 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146031482 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146031648 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146031745 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146031972 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146032158 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146032243 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146032289 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146032767 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146032863 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146033466 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146033690 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146033744 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146034146 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146034276 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146034548 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146034730 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146034904 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146035068 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146035363 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146035671 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146035677 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146035928 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146035956 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146037423 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146037482 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146037496 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146038016 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 146038983 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146040612 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146044003 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146045885 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146046350 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146049153 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 146049349 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146052978 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146053812 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 146053911 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146054267 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146054363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146054686 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146054799 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146054839 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146055129 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146055155 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146055611 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146056357 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 146056426 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146056433 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146056497 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146056502 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146056612 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146056635 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146056816 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146056971 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146057100 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146057251 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146057506 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146057509 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146057600 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146058036 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146058219 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146058229 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146058290 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146058805 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146059882 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146060505 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146060810 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146061059 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146061133 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146061318 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146061948 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146062205 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146062332 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146062398 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146062470 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146062502 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146062546 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146063293 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146063321 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146063482 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146063868 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146064078 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 146064283 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146064311 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146064620 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146064704 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146064832 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146064937 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146064959 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146065275 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146065678 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146065771 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146066075 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146066127 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146066502 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146066694 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146066922 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146067289 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146067311 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146067318 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146067398 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146067743 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146067911 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 146068664 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146068757 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146070613 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146070794 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146070916 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146070917 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146071051 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146071567 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146071772 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146071990 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146072931 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146073040 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146073156 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146073768 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146074150 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146074239 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146074284 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146074308 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146074497 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146074812 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146075376 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146075382 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146075809 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146075888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146075908 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146077172 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146077610 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146078362 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146079114 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146079174 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146079664 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146080812 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146080933 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146080934 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146081692 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146082510 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146082912 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146083829 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146085558 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146086114 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146086529 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146087723 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146088367 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146088535 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146088566 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146088924 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146089595 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146089681 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146089977 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146090099 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146090328 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146090467 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146090728 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146090776 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146090902 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146092376 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146092503 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146092752 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146092984 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146093229 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146093232 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146093271 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146093377 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146093394 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146093542 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146093555 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146093691 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146094018 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146094163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146094528 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146094966 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146095101 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146095110 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146095144 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146095571 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146095949 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 146096051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146098029 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146098174 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146098360 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146098373 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146098392 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146099153 A T Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 146099199 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146099315 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146099372 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146099459 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146099638 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146099685 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146099686 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146099843 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146100710 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146100871 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146101176 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146101291 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146101352 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146101386 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146102321 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146102364 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146102541 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146102586 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146102679 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146102909 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146102982 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146103011 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146103451 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146103542 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146103788 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 146103835 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 146103844 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 146103855 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 146104035 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146104058 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146104124 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146104131 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146104241 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146104737 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 146106481 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146107142 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146107766 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146108525 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146111900 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146111946 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146111958 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146112039 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146112468 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146112758 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146114122 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146115271 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146115360 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146115709 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 146115804 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 146116158 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146117031 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146117316 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146117345 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146118043 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146118249 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146118394 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146118593 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146118962 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 146119327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146119690 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146119713 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146120012 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146120275 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146120949 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146121867 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146121940 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146122043 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146122246 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146122408 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146122888 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 146123437 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146123598 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146124230 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146124570 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146124682 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146124893 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146125017 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146125096 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146125163 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146125202 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146125212 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146125275 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146125286 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146125296 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146125407 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146125490 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146126209 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146126333 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146126555 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146126568 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146127225 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146128593 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146128610 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146129295 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146130524 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146130556 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146130802 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146133172 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146133195 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146133509 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146134195 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146134601 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146134901 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146135159 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146136756 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146136788 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146137075 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146137196 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146137472 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146138224 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146138477 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146138580 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146138812 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146138898 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146140249 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146140712 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146140913 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146141269 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146142965 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146145533 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146147186 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146148301 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 146148703 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146148851 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146148862 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146150475 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146150673 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146151778 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 146151995 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 146154716 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146154729 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146154889 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146154914 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146155355 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146155567 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146155816 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146157703 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146158081 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146158098 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146158434 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146158898 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146160614 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146160688 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146161073 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146161556 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146161563 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146162860 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146163075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146163803 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146164548 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146164940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146164968 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146165947 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146166120 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146166233 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146166437 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146168036 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146168061 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146168540 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146168596 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146168653 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146168735 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146168823 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146169059 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 146169069 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 146169209 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146169241 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146169388 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 146169551 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146169616 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 146169857 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146169944 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146169947 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146170232 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146170249 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146170450 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146170594 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146170649 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146170751 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146170755 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146170928 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 146170944 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146171037 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146171538 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146173297 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146173648 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146173717 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146175434 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146178410 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 146181840 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146181989 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146182195 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146182217 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146182237 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146182471 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146184093 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146184110 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146184150 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146184402 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146184428 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146184925 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146185116 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 146185156 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 146186204 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146186825 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146186876 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146187362 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146187651 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146187776 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146187932 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146187946 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146187971 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146188458 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146189857 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146190087 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146190348 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146190680 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146190766 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146191209 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146192684 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146193003 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146193065 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146193254 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146193450 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146193533 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146193574 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146193861 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146194009 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146194567 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146194822 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146195229 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146195708 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 146195776 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 146195879 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146196168 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146196813 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 146197010 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146197390 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146197544 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146197554 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146198305 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146198655 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146198744 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 146199681 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146199969 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146200480 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146200524 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 146201606 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146201861 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146202104 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146202487 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146202506 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146202887 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146202899 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146202934 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146203138 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146203218 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146203476 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146203483 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146203536 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146203693 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146203753 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146203899 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146204002 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146204358 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146204475 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146207436 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146208900 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 146209994 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146210352 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146211569 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146211726 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146212137 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146212229 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146212538 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146214563 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146215015 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146215093 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146215605 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146216634 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146218360 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146218369 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146222883 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 146222972 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 146222985 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146223010 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146225468 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146225755 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146225868 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146225869 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146226085 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146226185 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146226512 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146227624 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146228760 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146229445 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 146229496 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 146231574 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146232700 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 146232825 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146233160 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146233215 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 146233486 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146233956 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146235015 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146235105 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146235198 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146236520 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146236556 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146236744 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146237130 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146237131 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146237598 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146237608 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146237695 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146238038 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146238742 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146238811 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146239116 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146239227 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146239255 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146239264 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146239378 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 146240209 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146240232 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146240372 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146241002 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146241106 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 146241447 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146241626 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146241640 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146241911 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146241927 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146241948 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146242006 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146242153 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146242154 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146243812 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146243889 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146244019 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146244488 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146244532 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146244533 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146244679 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 146244932 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146244961 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146245156 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146245244 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146245275 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146245530 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146245586 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146245620 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146245662 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146245835 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 146245954 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146246013 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146246071 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146246079 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146246084 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146246113 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146246118 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146246151 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146246202 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146246308 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146246423 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146246437 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146246501 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146246527 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146246626 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146246705 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146246737 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146247028 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146247102 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146247465 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146247613 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 146247752 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146247935 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 146247996 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146248077 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 146248297 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 146248307 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146248527 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 146248684 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146248941 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146249093 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146249122 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146249321 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146249323 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146249491 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146249963 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146249979 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146250019 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146250256 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146250435 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146250824 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146251083 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146251623 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146252259 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146252578 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 146253144 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 146256063 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146256830 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146257162 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146257505 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146260078 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146260274 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146261951 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146264020 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146264552 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146265024 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146266075 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146266344 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146267292 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146267700 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146267708 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146268454 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146268459 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146268485 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146268537 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146268569 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146268577 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146268594 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146268598 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146268746 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146268983 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146268991 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146269046 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146269272 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146269279 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146269399 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146270365 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146270428 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146270452 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146270809 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146270838 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146271104 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146271298 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146271383 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146272249 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146272668 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146272690 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146273493 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146273551 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146273570 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 146273768 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146273802 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146274001 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146274062 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146274363 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146274465 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146274495 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146274909 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146274935 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146274974 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146275119 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146275167 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146275308 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146275322 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146275343 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146275806 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146276027 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146277459 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146277672 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 146277890 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 146278641 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146278741 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146278878 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146280299 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146280567 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146280810 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146281645 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146282283 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146282295 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146282436 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146282475 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146282797 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146283611 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146285931 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146285938 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146286142 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146287467 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 146288207 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146289464 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146289616 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146289821 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146289833 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146289992 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146290010 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146290172 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 146290340 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146290343 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146290380 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 146290582 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146290741 C A N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 2 146291528 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146291704 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146291786 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146291791 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146292466 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 146292813 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146292816 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146292827 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146293165 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146293261 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146293962 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146293970 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146294485 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 146295241 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146295337 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146295911 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146295928 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146295945 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146296523 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146299054 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146299553 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146299992 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146300073 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146300156 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146300312 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146301598 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146302008 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146302622 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146303031 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146303109 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146303228 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146303249 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146303364 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146303441 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146303453 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146303459 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146303478 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146303673 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146303824 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146303856 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146304006 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146304488 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146304822 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 146304854 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 146305398 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146305454 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146305772 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146305947 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146306469 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146306482 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146306638 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146306766 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146306902 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146307038 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 146307509 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146307702 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146307746 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146307945 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146307958 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146307972 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146307979 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146308045 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146308542 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146309350 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146310019 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146310226 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146310406 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146311036 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146311108 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146311585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146312708 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146312853 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146313384 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146317319 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146318379 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146318663 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146319045 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146319068 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146320027 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146320236 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146320886 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146320988 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146320995 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146321382 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146321474 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146321618 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146321884 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146321955 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146321970 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146322054 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146322217 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146322237 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146322367 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146322389 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146322690 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146322847 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146322871 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146322895 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146323018 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146323173 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146323501 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146323521 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146324151 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146324186 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146324266 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146324279 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146324327 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146324345 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146324440 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146324493 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146324599 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146325465 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 146325863 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 146326124 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146326272 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 146327028 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146327863 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 146328074 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146328332 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146329039 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146329167 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146330520 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 2 146330724 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146330750 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146331739 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146332330 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 146332387 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 146332710 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146333042 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146333193 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146333339 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146333723 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 146334099 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146335683 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146336786 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146337499 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146337877 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146338002 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 146338238 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 146338312 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146339391 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 146339519 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 146339671 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 146340605 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146341404 A T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 146341782 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146341826 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146342104 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146342348 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146342537 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146342627 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146343324 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 146343511 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146343927 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146343934 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146343987 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146343988 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 146344468 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146344523 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146344886 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 146345287 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146345409 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146345506 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146345535 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 146345540 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 146346081 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146346267 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 146346291 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 146346375 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 146346389 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146346396 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146346429 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146346431 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 146346449 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 146346516 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 146346594 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 146346599 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 146346608 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146346613 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146347051 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 146347224 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146347232 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146347327 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 146347655 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146347705 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 146347720 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146347817 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146347857 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146348313 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 146348328 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146348330 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146348386 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146348402 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146348422 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146348432 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146348450 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146348457 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146348639 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146348641 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146348652 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146348678 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146348715 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146348718 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146348743 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146348824 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146348909 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146348951 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146349021 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146349092 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146349109 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146349170 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146349511 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146349663 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146349686 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 146349784 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146349886 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146350057 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146350197 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146350209 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146350221 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146350272 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146350314 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146350375 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146350522 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 146350540 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 146350573 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 146350700 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146351179 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 146351728 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 146351730 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 146351885 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 146351919 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 146352064 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 2 146352310 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 146352329 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 146352490 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 146352691 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 146352699 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 146352714 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 146352719 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 146352802 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 146353005 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 146353149 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 146353321 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146353462 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 146353471 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146353626 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146354111 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146354417 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146354435 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 146354579 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146354588 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146354610 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 146355803 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 146356383 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146356611 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146356739 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146356932 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146356944 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146357079 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146357269 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146357641 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 146357742 A T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 146358066 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146358204 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146358411 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146358565 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146360028 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146360195 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146360405 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146360411 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146360417 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 146361976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146362587 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146363073 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 146363076 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 146363137 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146363168 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146363214 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146363249 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146363345 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146363627 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146363920 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 146363984 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146364063 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 146364134 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146364153 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146364250 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 146364306 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 146364328 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146364333 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146364489 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146364497 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146364554 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146364878 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146364993 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146365041 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146365051 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146365726 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146365788 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146365814 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 146365871 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 146365933 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146366178 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146366216 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 146366228 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146366343 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146366346 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146366384 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146366502 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146366504 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146366600 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146367161 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146367258 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146367320 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146368514 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146368519 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 146368546 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 146368556 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146368742 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146368786 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146368805 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146368927 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146369041 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146369369 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146369617 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146369791 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146370150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146370349 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146370382 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146371310 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146371326 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146371337 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146371369 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146371451 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146372362 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146372665 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146372754 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146372758 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146372860 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146372904 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146373450 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146374195 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146374266 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146374304 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 146374965 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146375239 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146375415 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146375447 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146375535 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146375549 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146375553 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146375926 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 146376116 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146376152 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146376217 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146376230 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146376329 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146376569 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146376650 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146376677 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146376680 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146376903 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146377093 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146377346 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146377355 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146377415 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146377419 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146377438 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146377479 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146377643 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146377757 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146377847 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146377888 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146377931 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146378269 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146378274 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146378689 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146378953 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146378970 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146379093 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146379169 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146379240 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146379434 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146379517 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146379535 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146379830 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146379872 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146379890 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146380658 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146381322 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146381674 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146381742 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146381748 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146381835 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 146381915 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146382157 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146382557 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146382617 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146382738 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146382798 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146382850 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146383192 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146383413 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146383416 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146383485 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146383518 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 146383562 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146383620 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 146383648 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 146383700 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146384067 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146384072 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146384138 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 146384466 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146384522 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146384617 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146384632 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146384922 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146384990 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146385543 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 146385871 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 146386007 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146386199 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146386353 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146386673 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146387133 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146387512 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146389060 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 146390700 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 146390810 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146391267 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146391320 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146391380 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146391397 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146391500 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146391528 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146391533 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146391624 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146391649 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146391817 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146392528 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146392573 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146392616 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146392658 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146393189 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146393201 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146393362 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146393393 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146393628 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146393855 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146394446 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146394483 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146394686 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146394964 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146394987 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146395077 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146395131 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146395166 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 146395211 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146395469 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146395779 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 146395964 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146396067 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 146396099 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146397085 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 146397209 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 146397234 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146397274 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146397441 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146397768 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146400159 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146400204 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146400254 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146400284 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146400436 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146400438 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146400499 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146400512 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146400541 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146400657 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146400800 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146400924 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146401016 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146401115 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146401203 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 146401328 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146401424 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146401433 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146401511 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146401726 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146401890 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 146402298 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146402510 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146402520 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146402590 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146402614 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 146402707 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146402761 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146402794 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146402866 T A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 146403009 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146403038 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146403300 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146403307 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146403347 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146403379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146403965 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 146403984 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 146404019 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 146404116 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 146404632 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146404700 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146404706 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146404711 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146404891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146404930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146405005 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146405109 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146405207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146405375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146405394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146405656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146405775 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 146405785 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 146405951 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146405968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146406031 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146406049 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146406067 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146406208 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146406209 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146406265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146406272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146406283 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146406394 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146406462 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146406676 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146406706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146406725 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 146406739 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146406802 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146406818 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146406871 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146407021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146407027 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 146407083 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146407133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146407370 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146407447 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146407564 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146407573 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146407890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146408249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 146408340 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146408618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146408737 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146408814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146409018 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 146409065 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146409155 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 146409170 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 146409336 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146409576 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146409616 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146409626 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146409667 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146410237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146410423 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146410646 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146410697 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146410738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146410770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146410789 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146410957 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 146411000 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146411001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146411493 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 146411834 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146411853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146411886 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 146412012 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146412162 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146412620 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 146412623 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146412649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146412871 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 146412915 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146412998 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146413157 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146413221 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146413384 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 146413388 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 146413445 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 146413476 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 146413556 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 146413681 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146413724 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146413779 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146413988 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 146414001 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 146414046 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 146414111 C A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 146414737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146414856 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146414863 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146415181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146415236 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146415311 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146415421 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146415478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146415851 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146416032 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146416092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146416120 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146416165 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146416186 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146416356 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146416365 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146416482 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 146416650 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146416779 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146416805 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146416882 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146416906 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146416931 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146416936 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146417082 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146417311 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 146417321 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146417438 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146417510 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146417522 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146417539 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146417591 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146417602 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146417604 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146417624 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146417660 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 146417662 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 146417696 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146417798 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146417947 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146417951 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146417960 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146418087 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146418146 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146418242 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146418277 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146418318 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146418408 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146418788 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146419050 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146419180 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146419306 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146419380 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146419397 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146419442 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146419506 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146420016 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146420432 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146420489 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146420605 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146420826 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 146420884 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146420974 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 146421094 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 146421265 T C Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 146421280 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 146421381 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 146421382 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 146421469 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146421625 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 146421663 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146421776 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146421943 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146422025 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 146422068 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146422103 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146422325 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146422333 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146422496 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146422819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146422858 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146422956 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146422966 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146422973 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146423079 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146423095 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146423142 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146423187 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146423281 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146423306 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146423309 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146423456 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146423463 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146423801 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146423938 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 146424199 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146424210 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146424226 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146424489 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146424501 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146424578 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146424586 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146424809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146424810 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146424996 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146425009 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146425112 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146425154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146425908 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146425955 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146426016 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146426154 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146426186 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 146426293 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146426465 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146426528 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146426579 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146426582 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146426608 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146426614 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146426696 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146426715 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146426723 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146426734 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146426928 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146426950 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 146426984 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 146427020 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146427076 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146427133 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146427216 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146427310 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146427393 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146427396 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146427454 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146427472 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146427532 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146427545 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146427632 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146427661 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146427768 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 146427809 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 146427820 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 146427851 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 146428018 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146428058 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146428294 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 146428305 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 146429105 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 146429170 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 146429184 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 146429352 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146429441 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146429588 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146429745 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146429777 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 146430366 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146430471 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146430727 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146430741 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146431032 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146431345 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146431447 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146431451 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146431512 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146431529 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 146431625 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 146431659 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146431786 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146431800 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146431911 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146432469 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146432546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146432573 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146432582 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146432590 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 146432827 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146432872 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146432877 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146433043 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146433053 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146433109 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146433143 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146433152 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146433172 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146433605 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146433620 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146433694 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146434381 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146434386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146435963 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146436042 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146437172 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146437318 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146438001 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146438080 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 146438091 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146438105 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146438162 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146438259 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 146438266 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 146438291 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146438306 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 146438373 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 146438398 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146438417 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 146438429 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 146438485 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146438536 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146438545 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146438625 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146438679 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146438703 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 146438838 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146438943 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146438965 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146438970 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146438994 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146439076 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146439168 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146439169 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146439295 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146439296 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146439374 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146439671 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146439879 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146439881 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146439904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146440310 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146440360 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146440498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146440589 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146440843 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146440873 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146440900 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146440975 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146441006 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146441023 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146441036 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146441142 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146441486 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146441525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146441573 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146441715 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146441772 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146441794 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146441996 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146442018 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146442098 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146442112 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146442150 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146442246 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146442249 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146442279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146442289 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146442385 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146442456 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146442462 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146442470 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146442480 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146442501 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146442503 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146442689 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146442707 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146442738 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146443375 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146443852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146443913 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146443921 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146443932 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146444284 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146444443 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146444451 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146444472 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146444485 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146444768 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146444797 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146445237 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146445278 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146445575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146445595 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146445616 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146445664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146446011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146446074 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146446136 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 146446152 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146446174 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146446276 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146446478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146446771 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146447064 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146447130 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146447220 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146447236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146447246 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146447274 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146447304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146447308 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146447317 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146448236 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146448494 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146449095 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146449285 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146449782 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 146450556 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146451006 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146451072 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 146451305 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146451345 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146451356 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146451416 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146451490 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146451496 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146451601 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146451655 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146451784 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146451984 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146452135 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146452153 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146452735 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146452909 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146452972 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146453366 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146454233 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146454256 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146454383 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146454483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146454680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146455101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146455252 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146455385 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 146455398 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 146455423 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 146455567 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 146455906 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146455912 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146456002 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146456426 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146456666 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146456817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146457791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146457879 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146457900 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146457955 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146458021 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146458066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146458368 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146458381 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146458692 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146459035 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146459053 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146459068 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146459102 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146459119 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146459298 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146459351 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146459365 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146459383 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146459413 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146459539 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146459553 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146459666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146459744 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146459757 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146459817 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146460151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146460514 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146460547 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146460647 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 146460649 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 146460850 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 146461099 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146461141 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146461264 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 146461321 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146461378 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146461386 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146461773 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146461776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146461810 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146462089 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146462108 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146462154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146462498 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146462562 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146462764 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146462771 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146462986 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146463147 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146463797 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146463956 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146464162 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146464627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146464788 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146464861 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146465132 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146465269 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146465636 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146465680 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146467379 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146467407 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146467694 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146467836 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146468105 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146468165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146468265 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146468267 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146468427 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146468446 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146468534 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146468581 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146468669 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146468686 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146468709 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 146468737 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 146468818 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146468849 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146469279 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146469882 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146470057 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 2 146470353 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146470382 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146470406 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146470416 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146470478 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146471209 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146471256 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146471454 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146471646 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 146471852 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 146471859 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 146471972 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146472839 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146472840 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146473161 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 146473212 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146473361 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146474610 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146475767 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146476064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146476256 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146476462 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146476584 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146476628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146476755 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146476798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146476893 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146477441 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146477918 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146477919 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146477958 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146478097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146478225 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146478239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146478419 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146478420 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146478482 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146479591 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146480216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146480320 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146481050 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146481304 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146481797 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146481988 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146482583 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146482674 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146483359 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146483519 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146483825 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146483930 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146483952 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 146484163 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146484399 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146484425 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146485172 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146485512 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 146485667 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146486033 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146486095 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 146486099 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 146486107 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146486693 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146486717 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146486802 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146487773 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146488047 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146488272 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146488922 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146489002 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146489151 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146489379 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146489407 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146489438 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146489549 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146489587 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146489686 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146490136 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146490225 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146490327 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146490358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146490377 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146490454 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146490522 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146490552 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146490583 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 146490916 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146490919 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146490945 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146491041 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146491102 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146491429 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146491499 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146491515 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146491673 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146491868 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146491977 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146492246 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146492398 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146492776 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146492961 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146493007 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 146493267 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146493939 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146494127 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 146494520 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146494730 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 146494752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146494766 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146494881 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146495054 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146495687 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146495733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146495985 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146496043 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146496058 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146496367 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 146496512 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146496958 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146497001 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146497359 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146497419 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146497612 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146497807 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 146499026 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 146499289 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146499672 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146499693 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146499716 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146499774 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146499908 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146500017 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146500080 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146500187 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146500214 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 146500272 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146500411 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146500609 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146500630 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146500639 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146501099 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146501195 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 146501407 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 146501452 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 146501598 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146501865 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146501912 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 146501938 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146502121 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146502292 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146502697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146502745 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146502765 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146503755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146503791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146503854 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146503952 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146504116 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146504363 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146504459 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146504579 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146505216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146505288 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146505430 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146505613 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146505616 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146505676 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146505907 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146505961 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146505972 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146506362 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146506514 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146506586 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 146506602 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146506855 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 146506900 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 146506976 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 146506985 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146507200 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146507208 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146507297 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146507314 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146507326 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146507351 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146507355 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146507418 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146507419 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146507442 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146507541 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146507605 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146507610 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146507635 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146507668 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146507695 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146507703 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146507707 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146507743 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146507780 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146507786 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146508088 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146508120 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146508127 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146508152 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146508223 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146508246 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146508420 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146508688 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 146508870 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 146508957 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 146508976 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 146509025 A T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 146509037 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 146509065 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 146509093 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 146509098 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 146509664 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 146509782 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146510153 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146510760 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146510788 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146510792 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146511581 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146511692 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146512421 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146512543 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146512741 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146512745 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146512833 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146512889 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146512910 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146513048 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146513442 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146513905 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146513934 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146513952 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146514044 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146514307 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146514372 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146514891 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146514969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146515107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146515213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146515353 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146515430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146515605 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146515843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146515959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146515976 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146515977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146516101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146516112 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146516210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146516382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146516682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146516902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146516988 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146517084 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 146517087 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 146517269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146517314 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146517351 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 146517352 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 146517429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146517439 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146517449 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146517478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146517512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146517534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146517545 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146517552 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 146517588 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146517604 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146517607 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146517645 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146517746 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146517760 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146517761 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146518026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146518039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146518073 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 146518231 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 146518242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146518407 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146518804 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146519205 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146520248 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 146521178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146521817 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146521873 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146522491 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146522508 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146522768 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146523364 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146523779 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146523815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146523818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146523961 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146524049 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146524097 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146524175 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146524245 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146524754 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 146524791 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146524793 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146524899 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146525093 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146525104 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146525121 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146525127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146525164 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146525196 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146525428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146525441 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146525565 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146525631 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 146525674 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146526225 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146526239 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 146526757 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 146527092 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 146527174 C T Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 146527244 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 146527272 A C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 146527278 C G Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 146527324 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146527380 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146527753 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146527810 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146527845 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146528215 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146528593 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146528929 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146529383 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146529769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146529794 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146529888 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146529994 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146530013 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146530124 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146530370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146530487 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146530756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146530802 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146530820 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 146531085 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 146531243 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 146531417 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146531466 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146532246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146532468 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146532630 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146532658 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146532689 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146532812 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146532995 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146533015 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146533072 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146533096 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146533188 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146533270 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146533340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146533378 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 146533389 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146533881 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146534078 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146534097 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146534187 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146534295 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146534437 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146534832 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 146535169 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146535215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146535363 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146535449 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146535456 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146535462 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146535622 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146535643 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146535645 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146535745 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146535751 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146535771 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146535839 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146536007 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146536679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146537407 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146537444 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146537738 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146538019 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146538199 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146538306 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146538310 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146538404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146538442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146538679 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146538680 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146538712 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146538888 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146538890 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146538908 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146538962 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146539028 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 146539082 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146539253 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146539263 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146539344 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146539434 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146539585 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146539774 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 146539797 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146539886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146540117 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146540152 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146540328 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146540332 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146540355 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146541029 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 146541109 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146541240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146541588 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 146541686 A T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 146541688 C A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 146541763 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 146542018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146542227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146542329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146542540 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146542584 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146542670 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 146542824 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146543659 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146544586 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146546335 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146548045 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 146550578 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146551403 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146551577 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146551703 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146552780 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146552817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146552952 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146553000 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146553120 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146553266 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146553281 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146553416 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146553574 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146553668 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146553803 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146554665 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146555697 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146556275 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146556457 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146556502 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146556749 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146557333 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146558616 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 146558913 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146558967 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146558974 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146559775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146560474 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146560531 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146560748 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146560827 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146560887 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146560983 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146561557 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 146561620 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 146561651 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 146561655 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 146562389 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 146562432 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146562822 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146563031 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146563259 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146563431 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146563454 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146563494 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146563559 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146563610 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146563623 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146563645 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 146563646 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146563687 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146563691 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146563740 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146563750 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146565092 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146565124 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146565464 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146565474 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146565490 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146565802 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 146566046 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146566162 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146566292 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146566325 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 146566372 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146566381 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146566756 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146566951 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146567167 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 146567760 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 146568644 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146569019 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146569053 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146569078 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146569990 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146570016 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146570219 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146570549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146570574 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146570946 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146570950 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146570993 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146571734 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146571798 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146572021 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146572364 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146572575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146572586 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146572601 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146572655 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146572692 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146572897 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146572931 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146573358 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146573402 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146573410 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146573596 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146573815 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146573835 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146573875 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146573919 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146573954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146573967 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146574247 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146574361 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146575468 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146576270 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146576460 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146576888 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146577350 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146577805 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146579378 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146580004 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146580170 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 146580259 T C Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 146580324 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 146580360 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146580383 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146581402 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 146581411 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146581441 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 146581456 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146581464 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146581469 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146581481 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146581484 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146581495 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146583374 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146583380 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146583388 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146583406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146583573 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146583625 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146583630 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146583636 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146583667 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146583810 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146583832 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146583941 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146583986 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146584020 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146584680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146584802 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146584911 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146585054 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 146585198 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 146585220 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 146585424 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146585481 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146585605 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 146586405 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 146586453 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146587014 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146587238 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146587754 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146587916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146588214 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146588236 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146588491 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146589352 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146589354 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146589876 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146589999 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146590979 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146591155 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146591297 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146591395 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146591429 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 146591466 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146591476 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146591525 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146591648 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146591663 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146591673 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146591727 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146591799 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146592065 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146592105 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146592136 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146592403 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146592757 G C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 146592758 C A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 146593313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146593855 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146594767 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146594819 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146594869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146595158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146595573 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146595719 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146596046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 146596424 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 146596434 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 146596458 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 146596497 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 146596772 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146596783 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146596812 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146596818 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146596865 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146596919 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146596986 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146597019 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146597033 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146597083 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146597109 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146597150 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146597185 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146597255 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146597336 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146597386 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146597859 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146597863 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146598462 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146598527 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146598717 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146598967 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146598978 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146599002 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146599028 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146599072 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 146599075 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146599083 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146599095 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146599121 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146599177 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146599226 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146599233 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 146599286 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146599354 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146599445 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146599559 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146600019 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 146600044 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 146600056 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 146600120 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146600220 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 146600333 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146600346 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146600385 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146600395 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 146600411 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 146600421 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 146600578 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146600680 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146600943 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146601232 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146601301 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146601340 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146601388 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146601504 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146601545 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146602297 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146602373 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146602883 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146603031 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146603067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146603416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146603567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146604586 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146605885 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146605900 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146606214 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 146606327 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 146606357 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146606473 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146606486 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146606664 A C Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 146606768 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146606817 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146606823 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 146606882 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146606944 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146606980 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146607072 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 146607135 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 146607410 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 146607495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146607515 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146607751 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 146607817 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146607843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146607849 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146607939 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 146608063 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146608345 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146608411 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146608439 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 146608483 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 146608508 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146609259 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146609303 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146609787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146610151 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146610248 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 146610786 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146612134 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146612135 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146612398 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146612518 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146612605 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146612796 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146613105 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146613321 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146613510 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146613531 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146613552 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146613638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146613641 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146614047 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146614072 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146614153 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146614154 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146614189 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146614226 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146614240 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146614900 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146614906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146614991 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146615266 T A Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 146616454 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 146616630 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146616669 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 146616825 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146616881 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146616916 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146617073 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 146617172 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 146617182 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 146617338 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146617493 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146617581 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146617635 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146617649 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146617878 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146617897 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146617916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146618206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146618236 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146618314 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146618362 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146618642 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146618676 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146619058 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146619139 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146619258 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146619264 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146619291 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146619555 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146619569 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146619571 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146619623 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146619832 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146620326 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 146620450 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146620680 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146620704 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146620776 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146620938 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146621209 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146621310 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146621526 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146621661 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146621755 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146622009 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146622021 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146622284 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146622304 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146622963 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146623037 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 146623307 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146623308 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146623598 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 146623825 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 146623847 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146624155 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 146624177 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146624625 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146624968 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146625464 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 146625598 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 146626204 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 146626338 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146626361 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146626627 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 146626756 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 146626891 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146626985 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146627349 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146627574 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 146627666 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146627760 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146627933 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146628058 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146628123 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146628145 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146628188 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 146628228 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 146628322 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 146628395 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 146628547 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146628555 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146628600 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146628664 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146628873 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146628905 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146628911 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146628967 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146629175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146629532 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146629699 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146629764 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146629852 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146629877 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 146629889 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 146629981 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146630002 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146630139 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146630256 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146630264 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146630301 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146630329 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 146630409 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 146630491 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 146630499 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 146630723 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 146631193 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 146631272 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146631305 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146631330 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146631344 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146631388 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146631436 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146631486 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 146631597 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146631705 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146631842 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 146631868 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146631911 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 146631947 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146631987 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 146632096 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146632131 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146632182 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146632183 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146632242 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146632251 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146632293 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146632454 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146632544 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146632545 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146632805 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146632965 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146633066 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 146633360 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146633407 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146633677 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146633852 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 146634512 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146634530 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146635030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146635249 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146635297 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146635319 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146635390 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146635496 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146636038 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146636051 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146636141 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146636151 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146636165 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146636170 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146636183 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146636241 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146636282 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146636298 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146636419 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146636442 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146636471 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146636594 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146636663 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146636701 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146636721 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146636747 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146636812 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146636817 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146636931 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146637128 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146637183 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146637191 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146637213 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146637295 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 146637375 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 146637404 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 146637680 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 146637785 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146637808 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146637896 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146638071 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146638196 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146638198 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 146638629 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146638776 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 146639269 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146639354 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 146639487 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146639521 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 146639535 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 146639625 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 146639688 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 146639831 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 146639981 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 146640007 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 146640028 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 146640046 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 146640318 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146640477 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 146640521 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146640535 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146640576 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146640597 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 146640742 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146640910 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146641009 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 146641025 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 146641037 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146641086 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 146641108 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146641123 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146641170 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146641184 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146641482 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146641494 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146641522 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146641561 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146641567 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146641575 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146641593 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 146641630 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146641679 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146641719 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 146641839 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146642026 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146642030 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146642043 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146642081 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146642085 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146642202 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146642220 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 146642287 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146642388 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146642425 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146642428 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146642495 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146642563 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146642596 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146642733 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146642756 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146642852 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146642903 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146642909 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146642936 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146643005 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146643107 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 146643206 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146643214 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146643240 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146643350 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146643396 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 146643506 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146643517 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146643533 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 146643535 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 146644231 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146644863 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146644959 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146645318 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146645789 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146645949 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146646025 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 146646062 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 146646156 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 146646165 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 146646241 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 146646419 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 146646702 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146646737 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 146646756 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 146646757 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 146646784 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 146646973 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146646980 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146647091 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 146647259 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 146647716 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 146647982 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 146648037 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146648435 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 146648545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146648731 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 146648790 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146648921 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146648928 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146650479 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 146651785 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146651844 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146651849 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146651861 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 146651928 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146652009 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146652015 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146652318 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 146652549 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146652626 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146652668 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146652676 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146652747 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146652822 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146652936 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146652988 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 146653003 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 146653176 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146653238 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146653274 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 146653297 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 146653325 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 146653345 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 146653356 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146653379 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146653954 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146654010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146654068 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 146654251 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 146654257 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 146654432 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 146654555 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146654637 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146654862 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146654916 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146655077 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146655104 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146655228 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 146655377 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 146655465 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146655559 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 146655560 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 146655707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146655890 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146656131 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146656402 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 146656497 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146657107 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 146657245 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146657288 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146657289 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146657423 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 146657431 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 146657444 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 146657474 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 146657518 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 146657566 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 146657643 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 146657814 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 146657841 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146657863 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146658019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146658127 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146658165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146659546 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 146659817 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 146660642 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146661108 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 146661928 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 146661933 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146662037 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 146662164 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146662363 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146662849 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146662852 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146663204 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146663304 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146663450 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 146664226 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146664456 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 146664576 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146664683 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 146664864 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146665919 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 146666004 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 146666458 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146666908 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146667202 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146667250 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146667273 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146667572 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 146667585 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 146668141 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146668162 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 146668275 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146668398 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 146668410 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 146668413 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146668931 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 146669178 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 2 146669221 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 2 146669234 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 2 146669580 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 146669607 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 146669906 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 146670164 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 146670209 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 146670288 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 2 146670349 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146670350 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 146670817 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 146670865 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146670892 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 146670912 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 146670925 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146670936 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 146670937 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146671000 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 146671028 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 146671163 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 2 146671183 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 146671214 G C N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 2 146672075 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 146672104 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 146672135 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 146672285 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146672376 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146672388 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 146672561 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 146672578 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 146672860 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146672862 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146672909 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146672997 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 146672999 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 146673194 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 146673406 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 146673542 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146673734 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.277777777777778 25 11 12 1 5 2 146673844 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146673953 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146673954 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146673997 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146674014 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146674017 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 146674036 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146674044 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146674178 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 146674226 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146674266 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 146674337 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146674352 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146674449 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 146674550 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 146674992 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146675146 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146675181 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 146675316 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 146675350 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146675433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146675457 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 146675720 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 146675844 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146676016 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146676017 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146676091 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146676151 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146676420 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146676507 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 146676550 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146676624 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146676685 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146676708 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146676985 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 146676991 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146677079 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 146677488 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146677614 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146677677 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146677692 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 146677723 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 146677815 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146677851 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146678165 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 146678441 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146678450 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 146678482 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146678777 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 146678860 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 146678872 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 146678876 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146678975 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146679040 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 146679084 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 146679110 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146679555 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 146679569 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146679944 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146680839 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 146682077 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146682144 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146682649 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146682906 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146683106 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146683707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 146683838 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146684983 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146686258 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146686492 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146686700 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146688399 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 146688454 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 146688509 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 146688604 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 146688843 T A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 146689965 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146690251 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 146690380 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146690715 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146690835 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146690863 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146690881 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146690930 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146691016 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146691078 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146692003 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146692242 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146693115 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146694284 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146694358 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146694361 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146694432 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146694522 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146694569 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146694674 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146694919 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146694970 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 146694990 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146695006 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 146695035 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146695474 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146695497 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146695727 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146695797 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146695825 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146696060 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146696199 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146696315 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146696351 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146696560 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146696765 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 146698223 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146699277 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146699463 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146700447 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146700651 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146700676 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146700803 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146700843 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146700955 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146701473 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146701628 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 146701891 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 146701922 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 146701923 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 146702102 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 146702275 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 146702293 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 146702299 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146702370 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146702453 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146702454 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146702464 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146702468 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146702522 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146702538 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146702612 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146702680 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146702818 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146702897 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146702933 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146703003 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146703121 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146703129 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146703283 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146703323 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146703427 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146703498 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146703538 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146703961 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146704330 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146704336 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146704390 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146704409 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146704471 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 146704535 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146704712 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146704720 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146704842 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146704845 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146704855 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146704985 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146705009 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146705054 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146705086 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146705459 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146705517 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146705593 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146705619 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146705631 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146705632 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146705722 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146705763 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146705806 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146705989 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146706202 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146707350 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146707490 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146707663 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 146707664 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 146707678 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 146707719 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146707767 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146707837 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146707970 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146707985 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146708126 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146708437 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146708697 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 146708825 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 146708966 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146709166 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146709371 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 146709747 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146709784 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146709971 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146710032 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146710225 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146710881 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146711102 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146711224 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146711297 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146711364 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146711472 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146711686 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146711776 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146711824 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146711897 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146712159 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146712294 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146712439 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146712958 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146713223 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146713278 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146713384 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146713480 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 146714067 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146714068 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146714315 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 146714988 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146715436 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 146715477 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146716294 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146716622 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146716629 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146716765 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146716814 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146717630 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146718031 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146718407 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146718459 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146718566 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146718997 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146719104 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 146719691 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 146719878 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146719901 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146720426 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146720657 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146721846 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146721864 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146721963 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146722214 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146722413 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146722442 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146722649 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146722747 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146723155 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146723317 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146723575 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 146723695 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 146724044 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146724050 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146724320 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 146724745 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146725227 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146725253 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146725385 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146725754 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146726017 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 146726131 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 146726254 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 146726259 A G Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 146726621 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146726791 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146727042 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146727490 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146727492 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146727777 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146727924 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146728286 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146728413 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146729367 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146729538 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146729572 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146729579 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146729786 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146729970 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146730124 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146730310 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146730624 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146730636 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146732692 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146732862 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146733291 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146733481 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146733643 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146733762 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146734431 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146734641 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146734895 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 146735328 C G N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 2 146735407 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146736105 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146736109 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146736156 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146736417 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146736428 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 146737276 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146737485 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 146737519 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146737681 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 146738001 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 146738029 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146738184 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 146738278 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146738308 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146738884 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146738975 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 146739040 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146739139 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 146739532 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146739547 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 146739602 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 146739604 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 146739648 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146740050 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 146740340 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146740349 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146740380 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 146741135 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146741200 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146741266 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146741438 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146741496 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 146742055 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146742132 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146742169 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146742173 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146742662 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146742874 A G N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 2 146742990 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 146743065 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 146743076 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 146743143 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 146743333 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146743450 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146743937 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 146743978 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146744142 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146744148 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146745360 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146745925 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146746796 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146747614 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146747634 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146747665 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146747776 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146747806 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146747927 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146747974 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 146748032 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 146748243 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 146748344 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 146748581 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 146748620 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 146748629 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 146748656 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 146748911 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146748943 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146749044 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146749053 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146749299 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 146749354 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146749360 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146749782 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 146750051 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146750473 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146750520 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146750608 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146750612 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146750771 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 146750850 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 146750951 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146750971 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 146751049 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 146751163 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 146751242 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146751305 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146751365 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146751597 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 146751677 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146751850 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146751961 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146752058 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146752077 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 146752237 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 146752270 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 146752291 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 146752718 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146752752 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 146753336 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146753477 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146753519 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146754198 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146754294 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146754884 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146755035 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 146755088 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146755274 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146755288 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146755324 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146755359 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146755366 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146755785 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146755836 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146755904 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146756266 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146756478 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146756509 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146756573 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146756739 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146756804 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146757029 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146757051 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146757070 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146757205 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146757373 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146757554 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146757691 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146757845 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146757994 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146758001 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146758193 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146758274 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146758276 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146758293 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 146758378 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 146758540 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 146758674 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 146758700 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 146758701 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 146758795 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 146758949 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146759031 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146759076 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146759370 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146759661 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146759683 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146759700 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146760793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146760848 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146761036 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146761197 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146761242 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146761642 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 146762031 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146762203 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 146762317 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146762460 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146762545 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146762766 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146762934 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 146763101 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146763336 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146763608 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146763647 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146763831 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146764327 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 146764925 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146765091 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146765165 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 146766212 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146766853 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146766999 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146767228 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146767254 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146768578 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146769424 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146769829 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146770023 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146770035 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146770128 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146770651 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146770785 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146772340 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146772583 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146772667 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 146772682 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 146772711 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 146772735 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 146772744 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 146772774 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 146773102 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 146773176 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146773282 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 146773345 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 146773455 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146773562 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146773621 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146773719 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146773736 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146773769 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146773770 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146773953 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146774060 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146775058 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 146775193 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146775221 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146775451 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146775730 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146776060 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146776949 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 146777358 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 146777699 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 146777928 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146778019 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146778038 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146778258 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146778342 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146778409 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 146778519 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 146778537 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 146778593 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 146778834 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 146778877 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146778991 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146778996 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146779173 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146779251 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146780176 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146780602 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 146780837 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146780900 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146780995 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146781158 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146781309 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146781545 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146781644 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146781695 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146781827 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146782247 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146782686 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146782904 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146783266 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146783388 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 146783437 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146783572 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 146783707 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 146783750 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146784354 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146784991 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146785079 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146785543 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146785596 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 146786225 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146786254 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146787461 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 146787708 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 146788013 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146788220 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146788315 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 146788340 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146788373 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146788455 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 146788573 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146788605 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 146788671 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 146788681 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 146788706 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146788820 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146788953 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 146788980 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146789194 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146789396 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146789720 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 146789755 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 146789810 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 146789938 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146790140 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146790750 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146790824 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146790888 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146790907 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146790993 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146791011 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146791047 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146791055 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146791094 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146791125 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 146791146 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146791148 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146791225 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146791267 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146791323 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146791409 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146791425 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146791432 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146791490 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146791520 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146791556 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146791729 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146791835 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146791863 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146791890 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146792127 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146792809 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146793298 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146793498 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146793503 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146793539 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146793632 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146793642 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146793650 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146793721 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146793920 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146794117 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146794184 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146794213 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146794308 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146794319 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146794322 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146794332 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146794398 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146794448 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146794759 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146794774 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146794921 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146794927 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146794946 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146794988 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146795046 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146795069 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146795192 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 146795209 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 146795397 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146795421 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146795471 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146795518 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146795653 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146795739 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146795807 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146796427 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146796481 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146796511 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146796597 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146796677 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146796687 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146796724 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146796809 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146796830 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146796898 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146796955 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146797087 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 146797124 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146797219 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146797221 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146797254 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146797331 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146797465 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 146797477 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 146797590 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146797674 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146797697 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146797780 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146797903 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146798145 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146798166 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 146798351 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 146798522 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146798590 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146798731 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 146798836 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146798845 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146798880 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 146798881 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146798968 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146799400 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146799634 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146799816 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146799856 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 146799900 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 146800016 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146800096 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146800322 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146800351 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146800365 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146800385 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146800437 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146800455 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 146800475 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 146800511 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146800515 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 146800540 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146800555 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146800587 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146800765 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146800884 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 146801110 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146801600 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146801697 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 146801717 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 146801742 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146801757 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146801769 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146801929 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 146801979 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146801983 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146801993 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146802090 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146802130 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146802174 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146802189 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146802215 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146802644 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146802682 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146802756 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146802879 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146802933 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146802952 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146803156 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146803424 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 146803451 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146803509 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 146803519 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146803566 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146803611 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146803646 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146803659 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146803686 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146803746 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146803883 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146803952 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146804017 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146804203 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 146804732 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146804759 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146805281 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146805511 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 146805566 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146805810 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146805820 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 146805853 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 146805923 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146805945 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146805959 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146805978 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146806073 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 146806393 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146806395 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 146806474 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146806569 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 146806605 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146806748 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146806886 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 146806887 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146806986 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146807161 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146807326 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146807449 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146808022 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146808311 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146808671 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146808685 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146808800 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146808886 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146808978 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146809239 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 146809259 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 146809382 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 146809913 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146809975 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146810048 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 146810127 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146810130 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146810187 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146810204 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146810226 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146810413 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146810536 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 146810646 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146810689 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146810821 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146810935 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 146811034 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 146811072 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 146811225 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146811342 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146811386 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146811396 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146811415 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 146811419 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 146811457 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146811662 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146811702 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 146811749 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146811783 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146811909 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146811911 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146811922 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146811995 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146812074 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146812104 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146812164 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146812177 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146812264 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146812351 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146812361 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146812510 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 146812566 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 146812578 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 2 146812731 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146812788 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146812789 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146812815 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146813058 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146813092 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146813454 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146813571 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146813633 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 146813716 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146813746 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 146813959 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146814631 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146814656 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146814704 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146814715 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146814718 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146814727 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146814819 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146814897 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146814909 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146814939 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146814983 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146814999 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 146815050 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 146815095 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146815385 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 146815390 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146815559 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146815564 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146815575 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146815716 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 146815880 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146815916 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146816516 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146816769 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146817252 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146817702 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146817736 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146817762 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146817922 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146817930 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146817954 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146817973 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146818064 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146818106 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146818545 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146818740 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146818820 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146819203 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 146819346 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 146819501 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146819616 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146819725 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146820057 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146820356 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146820652 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146820728 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146820805 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146820823 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146820851 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146820889 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146821118 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146821187 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 146821212 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 146821234 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146821370 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 146821846 T A Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 146831295 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146831411 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146831576 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146831707 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146832302 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146832380 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146832667 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146832817 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 146832902 A C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 146833030 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146833064 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146833136 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146833138 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146834335 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146834410 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146834571 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146834931 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 146835289 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 146835401 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 146835566 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 146836047 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146836580 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146837004 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146837087 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146837424 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146837481 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146838112 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146838270 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146838345 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146838536 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146838679 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146838685 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146838977 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146839025 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146839117 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146839137 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146839204 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146839267 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146839336 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146839774 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146839982 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146840005 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146840384 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 146840725 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146841189 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146841251 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146841740 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146841894 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146842326 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146842398 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 146842773 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146842874 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146843406 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 146843969 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146844207 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146845297 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146845307 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146845575 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146845620 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146846072 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146846242 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146846336 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146846441 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146846518 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146846691 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146846708 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146847338 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 146847348 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 146847717 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 146847864 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146847971 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146848082 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146848278 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 146848373 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146848792 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146849309 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146849591 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146850159 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146850806 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146851116 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146851121 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146851205 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146851291 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146851329 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146851455 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146851543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146851664 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146852083 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146852733 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146852870 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146853227 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146853583 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146853836 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146854244 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146854246 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146854300 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146854331 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146854336 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 146854545 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146854663 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 146854757 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146855380 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146855444 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146856379 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146856521 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146856605 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 146856724 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 146856725 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 146856757 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 146856790 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 146856983 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 146856986 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 146857391 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146857457 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146857749 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146858327 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 146858710 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 2 146859053 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146859097 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146859341 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 146860075 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 146860158 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 146860213 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 146860345 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 146860349 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146860374 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 146860815 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 146860855 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146861357 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 146861576 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146861641 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146861838 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146862175 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146862318 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146862668 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146862920 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146862940 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146863186 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 146863724 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 146864455 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146864570 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 146864837 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 146865420 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146865932 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146865959 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146866041 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146866303 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146866469 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146866809 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 146868556 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 146869179 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146869354 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146869512 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 146869549 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 146869868 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 146869919 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 146870063 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146870163 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146870855 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146870906 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146871107 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146871257 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 146871508 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146871816 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 146872160 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146872622 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 146872812 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 146873600 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146873786 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146873874 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146874201 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146874624 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146874625 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146874880 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146874905 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146875148 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146875161 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146875336 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146875748 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146876098 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146876270 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 146876274 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 146876561 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146876990 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146877101 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146877232 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146877344 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146877437 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 146878147 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 146878608 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146878727 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146878741 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146879363 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146879763 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146879790 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 146879815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146880623 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146880833 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146881165 T A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 146881330 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146881522 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146881524 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146881755 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146881792 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146881794 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146881836 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146881853 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146881886 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146882160 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146882168 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146882504 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146882591 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 146882763 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146882783 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146883355 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146884758 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146885040 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146885089 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146885414 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146885496 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146885885 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146887915 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146887950 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146888275 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146888923 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 146889143 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146889433 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 146889571 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146889575 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146889685 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146889700 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146889762 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146889789 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146889884 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146890276 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146890286 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146890318 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146890332 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146890346 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146890483 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146890546 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146890640 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146890695 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146890729 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146890891 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146891315 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146891464 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 146891838 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 146892087 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146892109 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146892235 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146892327 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146892461 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 146892505 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 146892570 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 146892804 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146892881 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 146893198 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146893265 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146893332 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146893425 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146893583 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 146894376 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146894415 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146894420 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146894460 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 146894484 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 146894519 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146895229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146895328 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146895362 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146895496 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146895521 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146895530 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146895540 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146895783 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146895852 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146896325 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146896379 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146896818 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 146896922 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 146897005 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146897103 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146897218 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146897286 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146897379 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 146897520 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146897535 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146897558 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146897854 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 146897892 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 146898057 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146898092 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146898624 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146898841 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146898931 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146898945 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146899058 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146899176 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146899570 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 146900195 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146900247 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146900320 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146900446 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146900877 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146900947 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146901347 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146901461 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146901664 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146901726 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 146901971 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146902029 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146902287 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146902288 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146902562 T A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 146902579 T G N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 146902632 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 146902682 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 146902951 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146903031 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146903828 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 146904332 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146904390 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146904759 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146904823 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146905740 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146906101 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146907026 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146907597 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146907759 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 146907977 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 146908735 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 146912671 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146912882 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 146913171 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 146913707 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 146913860 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146913933 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 146914252 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 146915416 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 146915656 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 146915670 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 146916083 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146916119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146916499 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 146918089 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146918891 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146919215 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 146919683 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146919997 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146920582 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 146920735 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 146921000 T A N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 146922541 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 146922774 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 146923068 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146923639 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 146923645 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 146923651 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 146923669 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 146923681 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 146924215 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146925049 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146925078 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146925159 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 146925681 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146925721 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 146925738 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 146925931 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146925976 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146926153 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146926486 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146928980 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 146929360 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146929727 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 146930494 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 146930513 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146930976 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 146931038 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 146931480 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146931532 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146931538 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 146931561 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 146931745 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146932020 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146932138 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 146932200 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 146932221 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146932274 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 146932669 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 146932696 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146932716 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146932745 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146932860 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 146933065 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146933066 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146933425 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 146933615 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146933731 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146933804 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 146934062 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146934519 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 146936425 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 146936637 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 146937030 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 146937280 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146937467 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 146937479 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 146937791 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 146937866 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146938156 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146938334 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146938677 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 146938701 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146938910 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146939321 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 146939342 T A Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 146940156 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 146940161 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146940248 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146941095 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 146941511 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 146943076 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146943867 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 146943914 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 146943930 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 146944556 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 146944841 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 146945060 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146945792 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146945830 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146946059 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146946323 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146946474 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146946959 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 146947365 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146947401 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 146947451 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146947558 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 146949454 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 146949534 C G Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 2 146949754 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 146950631 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 146950902 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146950926 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 146951222 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 146951322 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 146951919 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146952297 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146952299 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146952815 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146953055 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 146953509 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146953605 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 146953643 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146953733 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146953871 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146953912 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146953971 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146954011 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146954098 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146954117 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146954299 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146954315 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146954623 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146954736 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146954981 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146954991 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146955154 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146955341 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146955916 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 146956120 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146956238 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146956582 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146956859 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 146957009 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146957033 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146957292 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146957424 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 146957501 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146957706 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 146957825 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146958329 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146958689 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 146958826 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146958898 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146958907 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146958958 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 146959216 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 146959239 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146959407 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 146959534 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146959535 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146959616 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146959744 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146959940 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146961232 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 146961265 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 146962556 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146962585 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146962689 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146962708 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146962838 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146962971 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146963043 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 146963044 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146963059 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146963078 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146963097 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146963137 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 146963142 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 146963163 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146963205 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146963234 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146963313 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 146963323 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 146970070 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146970136 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146970144 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 146970200 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 146970306 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146970325 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146970442 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146970455 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 146970541 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 146970584 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146970603 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 146970648 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146970660 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146970755 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146970864 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146971069 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 146971406 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 146971465 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 146971544 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 146971635 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 146971698 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146971956 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 146972027 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146972033 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146972164 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 146972243 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146972256 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146972357 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 146972358 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 146972527 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146972537 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146972567 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146972754 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146972784 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146972849 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146972924 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146972925 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 146974340 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 146974343 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146974429 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146974453 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146974549 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 146974611 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146974687 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146974730 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146974815 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 146974959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146975003 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 146975382 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146975390 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146975508 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146975682 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146975748 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146975845 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146976029 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 146976051 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 146976162 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146976572 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146977382 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 146977612 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 146978033 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146978421 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146978833 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146979487 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146979690 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146980101 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146980169 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146980289 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146980307 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 146980622 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146980890 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 146981071 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 146981465 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146981477 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 146981558 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 146981687 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 146982896 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 146983065 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 146983074 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 146983093 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 146983281 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 146983407 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146983611 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 146983879 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146983885 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146983904 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146984063 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 146984103 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146984140 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 146984168 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 146984256 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 146984316 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 146984336 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 146984401 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146984404 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 146984447 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 146984641 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146984684 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 146984844 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146984845 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146985001 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 146985064 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146985278 T A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 2 146985399 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 146985426 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 146985432 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 146985524 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 146985539 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 146985607 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146985626 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 146985650 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 146985682 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 146985685 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 146985753 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 146985903 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 146985994 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 146986066 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 146986144 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 146986260 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146986282 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 146986288 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 146986346 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 146986358 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 146986380 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146986613 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 146986948 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146987193 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 146987513 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146987514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146987571 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 146987788 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146987960 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 146988287 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146988405 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146988449 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 146988526 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 146988630 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 146988680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146989125 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 146989252 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146989256 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146989716 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146989812 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146989833 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146989854 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146989965 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 146990225 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146990341 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 146990361 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 146990528 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146990532 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146990573 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146990639 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146990691 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146990727 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 146990764 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 146990898 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 146990913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146990919 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146990941 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146990973 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 146991013 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146991041 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146991056 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146991081 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146991099 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146991107 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146991185 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 146992011 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146992115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 146992153 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146992231 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146992337 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 146992379 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 146992425 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146992449 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 146992548 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146992675 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 146992683 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 146992802 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 146993112 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146993296 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146993331 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146993364 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146993511 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146993528 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146993721 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 146993760 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146993807 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 146993890 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 146993920 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146993974 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 146993987 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 146994114 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 146994157 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146994440 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146994573 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146994612 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146994699 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146995106 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146995272 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 146995331 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 146995335 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 146995390 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 146995516 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 146995802 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 146996112 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 146996182 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146996224 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 146996298 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146997004 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 146997090 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 146997194 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 146997255 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146997359 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 146997543 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 146997583 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 146997671 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 146997848 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 146997943 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146997944 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146998256 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 146998417 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 146998418 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 146998447 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 146998543 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 146998601 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 146998602 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 146998657 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 20 4 10 0 2 2 146998688 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 146998731 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 146998899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146999070 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146999096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 146999128 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 146999269 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 146999295 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 146999383 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146999406 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146999452 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 146999604 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 146999849 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 146999861 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 147000279 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147000375 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147000404 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147000568 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147000584 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147000716 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147000742 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147000812 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 147001293 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147001507 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147001508 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147001593 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147001616 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147001672 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147001756 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 147001810 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147002207 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 147002239 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 147002307 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 147002337 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 147002349 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 147002443 C G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 147002473 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 147002491 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 147002565 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 147002571 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147002623 G T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 147002702 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 147002714 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 147002724 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 147002947 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 147002997 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147003002 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147003325 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147003360 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 147003368 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 147003418 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147003427 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 147003508 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147003551 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147003597 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147003737 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147003978 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147004098 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147004175 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147004223 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147004518 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147004659 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147004664 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147004753 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147004770 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147005013 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147005025 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147005067 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147005102 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147005238 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147005499 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147005713 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147005750 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 147005843 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 147005852 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 147005879 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 147005978 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 147006049 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 147006083 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 147006095 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 147006383 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 147006698 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147007012 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147007056 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 147007099 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147007188 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147007513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147007593 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147008092 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147008096 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 147008133 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147008167 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147008255 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147008546 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 147008616 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147009063 C A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 147009614 A T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 147009670 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147010217 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147010247 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147010460 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 147011247 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 147011263 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 147012017 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 147012400 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147013040 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 147013049 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 147013422 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147013729 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147013797 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147014935 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147015148 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147015172 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147015401 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147015488 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147015654 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147015717 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147015954 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147016001 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147016047 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147016067 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147016128 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 147016134 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147016385 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147016491 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147017021 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147017053 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147017056 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147017423 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 147017835 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147019363 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147019745 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147020041 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147020171 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 147023649 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147023833 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147023932 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147024279 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 147026596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147027800 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147028124 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 147028127 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147028581 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147031888 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147032867 G A Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 147032881 T C Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 147034036 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147035356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147036920 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147036985 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147037018 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147037064 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 147037364 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147037430 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147038243 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 147038449 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 147038493 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147038586 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147038665 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147038682 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147038849 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147038883 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147038934 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147039363 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147039401 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147039414 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147039451 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 147039485 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147039567 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 147039570 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 147039939 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 147040163 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 147040513 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147040624 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147040727 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 147040827 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147040852 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147040866 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 147041005 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 147041006 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 147041152 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 147041208 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147041289 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147041292 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 147041410 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 147041623 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147042461 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 147042626 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147042627 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147043100 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 147043102 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147043274 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147043279 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147043326 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147043343 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147043860 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147043922 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147044128 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 147044233 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147044273 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147044576 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147044619 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147044681 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147044750 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147044759 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147044863 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147044899 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147044932 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147044989 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147045035 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147045036 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147045073 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147045091 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147045115 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 147045129 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 147045166 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147045497 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147045540 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147045604 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147045614 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147045786 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 147045801 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147046208 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147046275 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147046542 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 147046590 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147046636 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147046694 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 147046716 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 147046773 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147047049 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 147047050 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 147047080 A C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 147047198 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 147047232 C A N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 147050805 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 147050891 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 147050911 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147050932 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 147050938 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 147050955 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147050966 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147051015 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147051076 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147051092 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147051106 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147051107 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147051145 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147051179 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147051852 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 147051869 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 147051896 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 147051917 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 147052016 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147052066 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147052088 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147052234 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 147052373 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 147052386 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147052450 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147052453 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147052484 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147052538 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147052544 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 147052581 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147052637 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147052789 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147052862 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 147052887 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 147052897 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147053195 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 147053196 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 147053378 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147053383 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 147053451 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147053791 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147053818 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147053830 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147053883 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 147053893 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 147053922 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 147053952 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 147054125 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147054166 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147054175 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147054183 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147054205 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147054243 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 147054244 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 147054296 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147054448 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147054537 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 147054564 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 147054633 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147054647 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147054675 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147054681 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147054748 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 147055106 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 147055207 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 147055399 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147055641 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147055732 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147055747 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147055805 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147055835 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 147055873 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 147055917 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147056003 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 147056017 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 147056033 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 147056046 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147056282 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147056313 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147056536 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147057053 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147057259 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147057738 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147057812 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147057865 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147057902 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147057934 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147057961 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147057991 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147058045 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147058102 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 147058121 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 147058194 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147058314 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147058406 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 147058501 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147058640 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 147058735 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 147058743 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 147059095 C T N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 147059224 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 147059239 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 147059283 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 147059317 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 147059541 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147059545 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 147059722 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 147059878 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 147059906 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 147059937 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 147059954 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 147059960 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 147060020 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 147060101 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147060164 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147060458 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147060682 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147060764 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147060871 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147060913 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147061084 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147061108 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147061166 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147061195 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147061259 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147061283 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147061390 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147061751 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147061872 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147062022 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 147062135 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147062221 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 147062273 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147062407 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147062442 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147062525 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147062614 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 147062630 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147062631 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147062666 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 147062680 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147062939 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147062960 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147063085 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147063518 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 147063542 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147063556 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147063561 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147063598 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 147063633 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147063722 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 147063825 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147063844 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147063853 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147063855 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147063869 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 147063894 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147063933 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 147063939 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 147063956 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 147063967 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 147064062 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 147064114 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147064217 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147064331 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147064373 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147064522 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 147064597 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147064899 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147065220 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 147065277 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147065477 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147066346 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 147066370 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147066412 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147066417 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147066557 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 147066592 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 147066626 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147066731 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147066896 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147066970 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 147067028 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 147067226 C T Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 147067248 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 147067604 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147067673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147067726 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147067787 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 147067832 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 147067983 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 147068056 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 147068112 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 147068114 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147068153 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 147068596 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147068658 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147068673 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147068676 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147068707 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147068710 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147068787 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147068848 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147068901 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147068956 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147068968 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147068979 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 147068982 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 147069113 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 147069197 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 147069205 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 147069213 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 147069229 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 147069237 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 147069653 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147069705 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147069733 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147069792 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 147069875 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147069925 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147071211 A T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.307692307692308 18 8 9 0 4 2 147071293 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 147071296 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 147071329 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.357142857142857 18 10 9 0 5 2 147071349 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.357142857142857 18 10 9 0 5 2 147071362 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 2 147071373 C A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 2 147071387 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.384615384615385 16 10 8 0 5 2 147071411 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 2 147071444 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.357142857142857 18 10 9 0 5 2 147071467 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 2 147071536 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 20 8 10 0 4 2 147071570 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.230769230769231 20 6 10 0 3 2 147071657 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 147071729 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 2 147071782 C A Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 2 147071841 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 147071859 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147071872 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 147071997 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147071998 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 147072047 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147072058 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 147072115 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 147072141 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 147072224 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 147072337 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 147072354 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 147072366 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 147073553 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147073723 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147073892 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147074404 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147074736 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147075536 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 147075869 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147076252 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147076940 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147077372 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147077541 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147077834 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147077927 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147078022 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 147078041 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147078105 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147078118 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147078208 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147078283 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 147078329 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 147078361 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147078392 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 147078808 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 147079050 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147079262 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 147079303 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 147079419 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147079445 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147079464 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 147079478 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 147079695 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147079865 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147080138 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147080207 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147080444 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 147080462 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 147080541 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 147080690 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 147080932 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 147080981 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147080986 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147081181 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147081345 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147081347 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147081360 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147081402 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147081421 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 147081724 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 147081725 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 147081744 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 147081755 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147081775 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 147081915 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147082010 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 147082023 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147082041 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 147082089 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 147082204 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 147082243 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 147082293 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147082311 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 147082346 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 147082411 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 147082437 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 147082495 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147082514 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 147082527 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 147082531 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 147082798 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147083312 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 147083330 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 147083344 G T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 2 147083380 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 147083461 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 147083468 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 147083479 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147083608 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147083679 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 147083683 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147083775 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 147083900 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147084007 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 147084008 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 147084026 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 147084103 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 147084113 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147084245 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 147084264 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 147084297 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 147084318 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 147084328 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 147084377 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 147084409 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 147084414 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 147084443 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 147084545 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 147084633 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147084641 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147084667 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 147084685 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147084701 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147084708 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147084842 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 147085167 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 147085305 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147085324 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147085339 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147085398 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 147085423 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147085448 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147085451 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147085461 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147085482 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 147085581 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147085591 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147085665 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147085684 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147085692 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 147085755 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 147085756 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147085793 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147085849 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147085910 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147085992 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 147086021 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147086036 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147086143 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147086215 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147086225 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147086305 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 147086347 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147086377 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147086393 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147086399 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 147086428 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147086463 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147086497 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147086501 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147086552 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147086712 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147086713 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147086724 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147086728 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147086841 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147086891 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147086900 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147086914 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147086930 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147086999 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147087042 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147087125 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 147087185 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 147087218 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 147087319 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147087332 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147087361 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 147087436 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 147087584 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147087651 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147087672 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147087880 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147087929 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147088166 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 147088231 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147088368 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 147088409 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147088443 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147088723 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147089194 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147089483 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 147089543 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147089595 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147089942 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147090023 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147090150 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 147090195 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147090414 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147090657 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147090770 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147090819 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147090990 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147091000 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 147091790 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147091980 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 147091981 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147091997 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147092451 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 147092632 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147092825 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147092842 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 147093179 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147093187 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147093250 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147093386 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147093505 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147093544 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147093863 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 147093880 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147094052 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147094067 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147094219 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 147094338 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147095166 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147095205 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147095377 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 147095422 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 147095513 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147095541 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147095720 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147095758 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 147095816 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 147095852 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 147095960 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 147095969 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147096004 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 147096086 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147096100 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 147096558 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147096694 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 147096860 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 147097008 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 147097027 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 147097044 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 147097068 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 147097070 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147097105 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 147097282 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147097348 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147097598 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 147097637 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 147097725 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147097735 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 147097782 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147097852 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 147097927 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147097939 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 147098030 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147098507 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147098533 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147098572 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147098600 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147098698 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147098766 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147098815 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147098862 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 147098898 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147098977 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147099023 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147099052 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147099058 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147099192 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147099229 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147099241 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 147099251 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147099293 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147099312 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147099351 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 147099518 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147099541 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147099572 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 147099585 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147099617 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 147099791 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147099986 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 147100058 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147100074 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147100266 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147100270 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147100394 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 147100401 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 147100410 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147100454 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 147100478 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147100493 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147100901 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147100921 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 147101244 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 147101326 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 147101338 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 147101447 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147101470 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147101486 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147101517 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147101552 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147101603 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147101680 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147101744 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 147101847 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 147101855 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 147101875 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 147102016 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 147102025 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 147102170 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147102413 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 147102969 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147103296 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 147103638 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147103729 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147103796 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147104486 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 147104683 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 147104699 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 147104919 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147105286 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147106097 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147106156 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 147106265 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147106367 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 147106443 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147106474 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 147106484 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 147106612 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147107129 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 147107179 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 147107213 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147107381 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 147107786 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 147108066 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147108189 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147108296 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 147108467 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 147108517 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147108924 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147108989 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147109108 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 147109155 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 147109166 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147109576 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 147109618 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147109805 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147109878 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147110002 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 147110157 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147110270 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147110460 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147110680 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 147110710 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147110749 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147110773 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 147110852 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147111009 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147111028 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 147111079 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147111131 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 147111497 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 147111640 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147111674 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147111713 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147111761 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147111768 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147111826 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 147112489 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147112760 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147113561 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147113601 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147113666 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147113774 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147113793 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147113821 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 147113897 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147113913 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147114098 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147114103 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147114314 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147114486 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 147114515 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147114738 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 147114740 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147114829 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147114835 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147115092 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 147115477 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147116397 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 147116403 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147116628 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147116721 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147116863 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147116887 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147116929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147117110 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147117339 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 147117387 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147117423 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 147117723 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147117798 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147118133 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147118141 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147118156 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147118206 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147118234 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147118694 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147118766 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147118785 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147119002 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147119007 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147119099 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147119146 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 147119317 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147119404 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 147119483 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 147119484 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147119605 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147119641 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147119654 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147119734 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 147119771 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147119949 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147120007 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147120035 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147120086 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147120121 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147120186 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147120204 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 147120232 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147120321 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 147120335 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 147120437 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 147120477 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 147120741 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147120814 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147120946 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147120982 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147121028 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147121068 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147121121 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147121639 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147121733 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147121802 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 147122299 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147122317 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147122376 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147122420 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147122483 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147122542 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147122543 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147122578 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147122636 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147122695 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147122733 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147122866 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147122920 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 147122979 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 147123008 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 147123012 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 147123044 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 147123055 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 147123078 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147123198 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 147123296 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147123300 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147123354 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 147123370 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147123408 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147123596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147123834 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147123846 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147123888 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147123895 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147124209 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147124239 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147124356 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147125291 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147125407 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147125418 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147125538 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147125594 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 147125607 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147125641 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147125687 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 147125775 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 147125976 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147126007 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147126042 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 147126060 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147126151 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147126193 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 147126207 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147126300 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147126405 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147126468 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147126960 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147127068 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147127408 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147127490 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 147127963 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147128032 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147129086 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 147129089 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147129288 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 147129402 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 147129433 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 147129604 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147129607 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 147129635 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147129667 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 147130066 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 147130098 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 147130125 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 147130259 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 147130294 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147130416 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 147130505 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 147130621 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147130660 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147130696 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147130802 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147130813 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147130838 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147130858 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147131551 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147131620 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 147131654 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 147131834 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147131867 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 147131903 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 147131950 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147132005 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 147132020 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 147132105 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147132183 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 147132213 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 147132406 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147132440 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147132501 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147132541 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147133379 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147133962 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147133977 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147134094 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147134276 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 147134379 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147134438 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147134612 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 147134838 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147134883 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147134983 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147135321 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147135350 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147135378 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147135743 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 147135843 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147135992 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147136144 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 147136191 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 147136196 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 147137058 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 147137257 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147137317 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147137371 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147137602 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147137800 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147138337 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147138536 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147138693 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 147138951 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 147139677 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147141274 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147141317 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147141337 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147141404 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 147141427 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 147141434 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 147141455 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 147141512 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147141552 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147141829 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 147141926 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147142031 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147142077 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147142212 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 147142233 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 147142247 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 147142274 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147142283 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 147142354 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147142472 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 147142637 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147142658 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147142677 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147142803 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147142806 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147143175 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147143288 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147143300 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 147143380 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 147143470 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147144058 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 147144063 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147144109 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147144203 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147144256 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 147144280 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147144394 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147144448 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 147144478 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 147144541 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147144548 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147144558 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147144613 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 147144940 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 147144965 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147145035 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147145240 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147145348 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147145440 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147145502 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147145580 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 147145621 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147145630 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147145729 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147145802 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147145942 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 147145993 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147146042 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147146083 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 147146089 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 147146116 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 147146140 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147146192 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 147146314 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147146344 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147146352 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147146440 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 147146498 T A N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 147146576 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 147146596 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 2 147146611 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 147146618 C G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 147146755 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147146768 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147146828 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147146999 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147147002 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147147041 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147147099 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147147188 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147147229 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 147147239 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147147261 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147147271 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147147517 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147147976 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147148041 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147148121 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147148921 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147148926 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 147148933 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147149091 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147149280 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147149397 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 147149398 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 147149440 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147149443 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147149464 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147149557 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147149593 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147149645 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 147149668 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147149897 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147150100 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147150177 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147150195 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 147150295 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147150426 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147150433 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147150510 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 147150538 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147150635 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147150760 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147150810 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 147150897 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 147150923 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 147150963 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147151182 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147151211 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147151291 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147151313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147151445 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147151459 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147151502 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147151560 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 147151563 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147151600 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147151814 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147151815 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147151980 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147152036 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147152038 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147152153 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147152188 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147152214 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147152604 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147152669 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147152708 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147152791 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147152820 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147152860 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147152953 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147152956 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147153021 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147153054 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147153305 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 147153448 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 147153449 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147153560 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147153752 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147153762 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147153832 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147153951 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147154015 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147154019 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147154130 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 147154302 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147154392 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147154405 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147154438 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147154448 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147154486 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147154595 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147154637 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147154672 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147154751 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147154772 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147154785 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147154822 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147154828 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147154849 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147154879 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147154892 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147154900 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147154933 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 147155141 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 147155152 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 147155380 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 147155521 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147155653 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147155716 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147155734 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 147155751 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147155858 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147155927 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147156003 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147156127 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147156150 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147156204 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147156228 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147156265 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147156302 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147156312 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147156340 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147156389 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147156428 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147156521 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147156527 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147156562 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147156724 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147156762 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147156827 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147156861 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147156894 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 147156908 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147157043 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 147157052 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147157207 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 147157495 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 147157579 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 147157660 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 147157692 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147157711 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 147157717 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147157795 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147157843 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 147158040 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147158054 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147158125 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147158139 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147158168 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147158269 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147158323 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 147158394 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147158414 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147158943 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 147159312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147159890 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 147159916 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 147160258 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 147160327 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147160362 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 147160402 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147160468 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 147160592 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147160670 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147160999 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 147161334 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 147161348 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 147161540 A G N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 147161640 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 147161693 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 147161824 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147161839 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147161918 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 147161980 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 147162059 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 147162110 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 147162150 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 147162228 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147162309 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147162334 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 147162627 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 147162710 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147162786 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147162854 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 147162919 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147162983 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147163157 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 147163159 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 147163218 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 147163407 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147163556 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147163565 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147163578 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 147163684 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147163886 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147163907 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 147164033 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147164226 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 147164377 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 147164405 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147164436 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147164784 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 147165075 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 147165128 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 147165225 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147165333 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147165359 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147165404 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147165409 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147165688 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147165689 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147166921 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147167146 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 147167191 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 147168396 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 147168528 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 147168698 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 147168761 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147169444 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147169475 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147169687 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 147170272 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 147170902 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 147171174 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 2 147171197 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 147171685 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147171696 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 147172187 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 147172210 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 147172222 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 147172234 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147172486 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 147172615 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147172775 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147172834 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147172872 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147172904 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147172920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147173061 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147173227 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 147173256 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147173358 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147173387 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147173438 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147173440 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 147173518 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147173558 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147173585 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147173613 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147173654 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147175736 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147175847 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 147175848 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 147175931 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147176057 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 147176069 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147176145 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147176202 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147176312 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 147176543 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147176640 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147176645 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147176788 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147176939 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147176959 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147177297 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 147177368 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147177596 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 147177630 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 147177663 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147177893 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147178055 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147178524 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 147178764 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147178784 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147178915 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147178953 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147180330 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147180982 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 147181043 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 147181378 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147181464 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147181476 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147181507 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 147181525 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147181565 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147181662 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147181729 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 147181826 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 147181871 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 147182309 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147182390 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147182433 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147182878 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 147182967 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 147184467 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147184499 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147185013 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147185090 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147185265 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147185390 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147185541 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147185860 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147186164 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147186442 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 147186563 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 147186595 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147186966 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147187268 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147187306 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 147187399 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147187558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147187636 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147187868 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 147188147 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147188282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147188450 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147188491 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147188516 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147188535 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147188536 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147188555 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147188573 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147188603 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147188773 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 147188802 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147189160 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 147189171 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 147189400 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147189613 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 147189630 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 147189701 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 147189782 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 147189788 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 147189897 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 147189932 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 147189963 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147190028 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147190131 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147190172 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147190488 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 147192109 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147192161 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147192325 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147192537 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 147192600 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147192821 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147192843 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 147193191 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147193223 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147193519 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 147193623 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 147193683 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147193877 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147195468 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147195645 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147195987 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 147196015 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 147196046 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147196106 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147196480 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 147196580 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147196643 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147196830 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 147196936 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 147196948 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147197023 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 147197075 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 147197091 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 147197106 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 147197126 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 147197131 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 147197176 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 147197239 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147197306 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147197351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147197507 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 147197547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147197729 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147197732 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147197781 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 147197833 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147197939 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147197990 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 147198102 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 147198139 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 147198414 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147198484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147198671 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147198691 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147198786 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147199059 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147199083 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147199095 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147199565 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147199584 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147199898 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147200138 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147200388 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147200595 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147200654 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147200797 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 147200860 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147200951 C G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 147201542 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 147201797 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147201965 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147202106 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 147202230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147202341 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147202348 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147202377 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147202661 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147202720 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147202843 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147203046 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147203082 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147203129 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147203344 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147203353 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 147203567 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 147203595 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147203617 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147203789 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 147203971 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 147204288 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147204386 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147204559 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147204882 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147204964 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147204994 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 147205146 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147205205 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147205341 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 147205374 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 147205431 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 147205482 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 147205632 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147205671 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 147205977 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147206070 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147206096 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147206116 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147206210 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147206274 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 147206331 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147206443 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 147206500 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147206656 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147206740 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147206784 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147206897 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147207601 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 147207788 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147207999 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 147208040 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147208139 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 147208187 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147208348 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 147209156 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 147209334 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 147209351 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 147209740 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147209771 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147210064 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 147210118 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 147210548 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 147210637 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 147210881 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 147211059 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 147211074 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147211209 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147212213 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147212771 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 147213540 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147216105 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147216413 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 147216620 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147217563 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147218295 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147218346 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147218903 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147219540 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147219653 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147219759 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147219906 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147219970 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147221045 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147221265 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147221802 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147221871 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147222116 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 147222688 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147222979 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147223000 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147223246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147223257 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147223374 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 147224032 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147224444 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147224651 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147224700 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147224752 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 147224974 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147225451 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147225977 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147225980 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 147226395 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147227403 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147227463 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147227691 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147227789 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147227938 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 147228415 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 147228447 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 147228466 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 147228859 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147228937 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147228947 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147229004 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147229008 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147229048 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147229049 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147229092 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147229124 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147229233 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147229296 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147229355 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147229363 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147229375 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147229453 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147229454 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147229534 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147229541 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147229567 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147230202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147230365 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147230514 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147231054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147231480 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147231911 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147231997 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 147232100 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 147232104 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 147232299 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 147232430 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 147232654 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 147232813 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 147232890 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 147232993 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 147233081 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147233224 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 147233354 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 147233413 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 147233503 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 147233644 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147234607 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147234694 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 147235014 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147236011 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147236454 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147237354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147239899 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147240229 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147240303 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147240326 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147240390 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147240396 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147241045 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147241128 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241192 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241212 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241238 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147241269 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241286 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241300 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241317 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241488 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147241551 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241568 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147241570 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241620 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241675 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241739 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241817 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147241865 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 147241892 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147241966 A C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 147241991 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147242031 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147242287 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 147242334 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 147242796 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 2 147243031 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147243041 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147243108 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147243115 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147243438 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 147243462 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 147243529 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147243665 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147243734 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147243840 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147243866 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 147244059 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 147244174 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147244196 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 147244271 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147244353 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 147244984 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 147244998 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 147245785 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 147245847 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147245911 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 147246028 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 147246129 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 147246206 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 147246732 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 147246826 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 147247503 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147247931 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 147247986 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 147248633 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 147249269 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147249312 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 147249487 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147249724 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 147249750 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147249765 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147249802 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 147249821 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 147249854 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 147250035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147250043 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 147250048 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147250321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147250415 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147250463 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147250680 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147250808 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147250981 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147251382 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 147251415 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 147251483 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 147251486 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 147251548 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 147251553 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 147251618 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 147251669 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147251679 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147251740 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147251826 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 147252019 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147252064 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 147252189 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 147252202 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147252205 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147252226 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 147252282 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147252341 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147252382 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147252425 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147252462 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147252726 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 147252785 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147252950 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 147253334 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147253432 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147253694 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147254185 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147254465 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147254952 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147255170 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147255394 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 147255735 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 147255738 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 147255928 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 147256019 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147256525 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147256584 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147256680 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147256876 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 147256931 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147256977 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147257095 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 147257456 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147257655 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 147258073 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147258125 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147258580 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147258646 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147259120 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147259127 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147259682 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147259716 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147259772 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147259852 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147260005 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147260340 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147260635 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 147260888 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 147261346 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147261560 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 147261585 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147262179 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 147262193 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147262224 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 147262236 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147262239 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 147262877 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147263133 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 147263546 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147264481 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147264516 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147264612 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147264689 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147264766 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147264772 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147264777 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147264881 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147264940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147264982 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147266098 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147266340 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147266513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147266574 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147266658 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 147266944 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147267790 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147267812 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 147267838 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 147267872 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147268203 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 147268245 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147268814 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147268967 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147269031 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147269177 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 147269226 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 147270186 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 147271206 C T N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 2 147271225 C T N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 147271230 A G N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 2 147272760 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147272786 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147272869 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147272958 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 147272996 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 147273020 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147273141 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147273182 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 147273265 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147273281 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 147273353 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147273372 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147273430 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147273560 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147273581 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147273906 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147274104 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147274184 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147274197 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 147274208 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 147274212 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147274282 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147274580 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 147274595 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147274614 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147274666 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147274688 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147274696 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147274738 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147274777 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147274845 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147274931 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 147274943 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 147274990 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147275170 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147275416 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147275503 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 147275617 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147275747 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147275790 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147276125 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147276184 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147276199 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147276349 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147276386 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147276410 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147276557 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147276613 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147276663 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147276775 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147276883 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147276937 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147277047 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147277107 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147277328 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147277339 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147277485 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147277509 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147277572 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147277794 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147277812 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 147277857 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147277883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147277920 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147277966 C G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 147277982 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147278075 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147278088 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 147278601 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147278671 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147278797 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 147278814 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147278910 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 147279014 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 147279037 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 147279101 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147279132 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 147279201 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 147279258 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147279334 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147279447 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 147279493 A G Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 147279591 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 147279643 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 147279978 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 147279979 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 147280009 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 147280048 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 147280181 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 147280207 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 147280239 A C N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 147280374 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 147280487 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147280489 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147280534 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147280625 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147280680 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147280696 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147281094 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147281186 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147281279 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147281324 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147281373 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147281942 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147282001 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147282168 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147282246 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147282257 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147282290 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147282303 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147282434 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147282485 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147282617 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147282678 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147282706 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147282838 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147282889 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147282933 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147283041 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147283303 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147283372 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147283606 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147283698 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147283828 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147283901 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147284025 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147284065 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147284087 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147284217 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147284250 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147284310 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147284332 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147284351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147284397 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147284532 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147284636 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147284807 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147285036 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147285075 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147285205 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147285278 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147285478 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147285611 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147285650 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147285710 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147285761 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 147285822 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 147285920 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 147286010 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147286087 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147286113 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147286116 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147286239 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147286307 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147286410 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147286715 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147286895 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147287020 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147287021 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147287053 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147287130 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147287152 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147287170 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147287686 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147288159 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147296480 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147296494 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147296537 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147296540 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147296626 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147296634 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147296640 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147296779 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147296790 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147296822 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 147296863 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147296892 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147296910 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147296923 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147297006 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147297008 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147297058 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147297245 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147297538 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147297641 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147297723 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147297916 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 147297953 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147298148 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147298216 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147298318 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147298385 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147299453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147299503 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 147299580 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147299875 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 147300238 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147300390 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147300445 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147300542 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 147300970 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147301008 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147301045 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147301059 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147301300 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147301461 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147301495 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147301501 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147301545 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147301575 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147302247 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147302273 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 147302499 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147302902 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147303029 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 147303151 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 147303240 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147303312 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147303403 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 147303668 G C Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 147303693 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 147303732 C G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 147303755 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 147303779 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 147303799 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 147303812 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 147303827 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 147303932 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147304055 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 147304232 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147304358 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147304522 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147304634 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 147304856 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 147304869 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 147304883 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147304926 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 147304942 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147304964 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147305063 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147305181 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147305249 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147305274 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147305353 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147305364 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 147305720 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 147306204 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147306233 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 147306309 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147306312 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147306427 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 147306443 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147306517 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 147306643 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147306721 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147306789 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147306895 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147306911 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147306916 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147306975 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147307033 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147307051 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147307206 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147307220 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147307269 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147307353 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147307468 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 147307776 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147307814 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147307864 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147307865 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147307966 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147308047 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147308094 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147308187 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147308639 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147308845 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147309454 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147309521 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147309694 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147310488 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147310529 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147311072 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147311124 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147311214 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147311237 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147311310 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147311613 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147311623 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147311948 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147312041 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147312117 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147312247 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147312307 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147312359 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147312382 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147312412 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147312457 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147312544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147312954 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147312966 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147312998 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147313506 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147313511 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147313620 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147313701 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147313809 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147314463 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147314586 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147314637 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147314813 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147314908 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147315546 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 147315581 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147315713 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147315907 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 147316271 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147316376 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147316621 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147316712 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 147316826 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147316930 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147316943 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147317009 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 147317065 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 147317085 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 147317117 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 147317282 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 147317353 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147317587 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147317627 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147317889 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147317938 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 147318063 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 147318086 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 147318160 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147318310 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147318317 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147318492 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147318536 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147318791 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147318833 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147318968 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147319115 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147319133 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147319134 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147319208 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 147319306 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147319375 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147319399 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147319443 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 147319469 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 147319494 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147319496 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147319557 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147319581 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147319585 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147319594 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147319603 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147319606 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147319617 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147319634 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147319654 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 147319795 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147319968 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147320002 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147320052 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147320056 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147320063 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147320103 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147320221 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 147320231 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147320285 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 147320328 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147320381 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147320548 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147320772 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147321198 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147321217 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147321292 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147321426 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147321519 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 147321540 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147321547 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147321565 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147321720 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147321813 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147322073 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322122 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147322188 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322246 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147322256 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322270 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322296 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322314 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147322522 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147322536 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322551 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322560 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322586 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322645 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147322666 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322667 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147322720 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322871 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322932 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322961 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322980 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147322995 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147323011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147323019 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147323069 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147323103 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 147323239 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147323433 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147323569 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147323700 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147323745 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147323823 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147323897 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147323901 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147323980 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147324022 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147324181 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147324262 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147324618 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147324629 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 147324695 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147324860 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 147324947 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 147324977 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147325166 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 147325225 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147325506 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 147325527 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 147325619 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 147325641 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147325692 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 147325735 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 147325751 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 147325783 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147325799 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147325802 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147325855 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147325897 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 147325936 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 147326042 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 147326112 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 147326413 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147326515 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147326619 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147326727 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 147326741 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147326920 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147326964 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147326965 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147326984 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147327029 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147327351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147329225 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147329898 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147330487 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147330838 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 2 147331100 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 147331434 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 147331464 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147331474 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147331479 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 147331504 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147331527 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 147331544 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147331578 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147331777 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147331810 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147331816 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147332157 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 147332334 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 147332433 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 147332482 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 147332543 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147332582 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147332607 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147332660 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147332749 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147332750 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147332766 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147332780 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147332924 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147333204 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147333214 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147333264 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147333284 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147333338 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147333341 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147333445 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147333463 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147333464 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147333600 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147333632 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147333652 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147334185 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147334236 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147334288 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147334308 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147334373 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147334395 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147334425 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147334427 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147334820 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147334824 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147335006 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147335043 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147335069 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147335078 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147335329 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 147335556 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147335588 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147335813 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147335879 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147335947 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 2 147335966 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147335970 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147336183 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147336670 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147336795 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 147336951 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147336975 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 147337037 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 147337055 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147337082 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 147337297 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147337333 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147337364 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 147337425 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147337615 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147337637 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147337679 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147337813 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147337849 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147337980 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147337981 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147338126 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147338181 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147338234 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147338243 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147338508 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147338538 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147338912 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147339029 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147339089 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147339157 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147339183 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147339403 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147339493 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147339496 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147339548 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147339732 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147339772 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147339836 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147339926 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147339961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147340085 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147340111 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147340118 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147340301 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147340539 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 147341085 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 147341240 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147341439 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147341520 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147341523 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147341612 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147341695 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147341707 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147341754 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147341809 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147342114 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147342129 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147342204 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147342317 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147342593 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147342644 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147342737 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147343148 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 147343238 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147343408 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147343431 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147343514 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147343604 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147343656 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147343710 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147343755 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 147343834 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147343862 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147343884 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147343886 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147343935 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147343973 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147343993 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147344037 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147344068 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147344141 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147344330 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147344349 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147344675 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147344796 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147344991 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147344999 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147345031 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 147345048 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147345102 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147345503 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147345695 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 147345954 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147345959 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147346088 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147346151 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147346682 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147346890 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147346895 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147346906 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147347109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147347310 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147347311 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147347502 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147347610 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 147347705 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147348318 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 147348402 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 147348854 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 147348948 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147349169 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 147349261 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147349283 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147349306 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 147349533 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147349739 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147349752 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147349830 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147349863 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147349923 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147349946 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147350159 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147350196 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147350344 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 147350386 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147350397 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147350506 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147350523 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147350524 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147350562 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147350768 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147350794 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147350824 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147350892 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147350916 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147350998 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147351020 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147351550 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147351644 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 147351803 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 147351878 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147351910 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 147351936 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 147352064 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147352168 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 147352176 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 147352201 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 147352241 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 147352242 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147352664 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147352737 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147352753 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147352815 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147352969 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147352984 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147353038 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 147353240 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 147353390 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147353405 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147353417 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147353420 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147353434 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147353439 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147353456 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147353481 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147353565 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147353686 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147353764 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147353939 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147354028 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147354055 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147354242 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147354257 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147354334 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147354496 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 147354583 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147355517 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147355746 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147355895 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147355914 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147356143 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147356267 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147356355 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147356493 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 147356586 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147356612 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147357266 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147357345 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147357375 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147357418 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147357449 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147357597 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147357616 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147357625 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147357640 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 147357709 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 147357886 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147357950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147358070 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147358080 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147358111 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147358127 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147358149 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147358169 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147358218 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147358355 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147358403 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147358435 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147358462 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147358481 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147358485 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147358508 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147358555 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147358626 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147358754 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147358766 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147358904 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147358939 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147359074 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147359099 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147359100 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147359212 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147359311 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 147359319 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 147359540 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 147359564 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 147359591 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 147359741 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147359821 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147359873 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147359962 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147359992 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 147360069 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147360125 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147360161 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 147360250 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147360284 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147360347 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147360405 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147360995 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147361501 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147361590 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147361898 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147362781 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147362838 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147362877 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 147363128 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147363229 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147363267 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147363275 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147363380 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147363520 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147363726 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147363775 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147363789 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147363828 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 147363884 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 147363934 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147363982 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147364312 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147364326 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147364603 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 147364678 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 147364908 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 147365090 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 147365929 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 147366056 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 147366133 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 147366277 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 147366281 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 147366675 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 147366754 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 147367072 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147367118 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 147367346 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 147367475 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 147367508 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 147367584 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 147367604 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147367683 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 147367749 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 147367756 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 147367801 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 147367802 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 147367813 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 147367923 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 147368056 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 147368116 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147368128 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147368250 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 147368306 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 147368505 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 147368586 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 147368813 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 147368834 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 147369182 C A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 147369529 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 147369708 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147369969 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147370367 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147370404 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 147370441 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 147370634 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147370650 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147371060 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 147371208 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147371246 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147371343 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147371482 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147371567 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147371642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147371961 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 147372281 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 147372286 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 147372825 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147373346 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147373351 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 147373423 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 147373457 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147373496 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147374129 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147374185 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147374394 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 147374955 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147375046 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147375150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147375290 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147376569 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147376574 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147377130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147377440 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147377887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147378099 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147378155 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147378277 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147378303 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147378733 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147378767 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147379111 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 147379958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147380621 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147380641 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147380705 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147381159 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147381215 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147381283 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147382471 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147382581 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147382596 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147382648 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147382663 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147382678 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147382708 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147382772 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147382783 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147382975 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147382977 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147383057 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147383116 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147383125 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147383190 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147383543 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147383546 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147383556 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147383567 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147383656 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147383747 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147383795 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147383840 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147383910 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147384305 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147384372 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147384481 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147384483 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147384542 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147384549 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147384643 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147384647 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147384660 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147384683 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147384695 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147384772 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147384782 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147384845 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147384923 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 147385043 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147385219 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147385279 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 147385338 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147385430 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147385476 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147385733 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147385913 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147386149 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 147386827 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147387094 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147387180 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147387181 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147387531 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147387550 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147387570 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147387739 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147387804 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147387970 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147388011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147388026 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147388071 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147388100 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147388195 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147388206 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147388265 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147388355 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 147388401 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 147388416 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 147388422 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147388442 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147388509 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147388615 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147388674 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147388680 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147388720 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147388761 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147388771 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147388772 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147388787 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147388802 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147388855 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147388865 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147388878 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147388910 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147388935 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147388967 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147389005 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147389006 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147389020 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147389035 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 147389897 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147390088 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147390120 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147390124 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147390146 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147390226 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147390259 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147390296 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147390328 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147390337 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147390379 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 147390390 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147390547 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147390594 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147390611 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147390632 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147390928 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147391144 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147391148 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147391233 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147391404 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147391668 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147391797 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147391887 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147392011 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147392786 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147392865 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147392923 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147392938 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147393252 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147393641 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147393672 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147394174 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147394235 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147394542 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147394691 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147394711 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147394833 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147395111 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147395580 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147395965 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 147396232 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147396413 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147396580 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147396605 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147396646 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147396729 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147396758 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147397405 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147397552 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 147397765 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147398098 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147398272 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147398274 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147398318 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147398414 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 147398668 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147398701 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147398733 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 147398742 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147398754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147398755 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147398795 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147398889 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147398897 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147398998 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147399098 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147399136 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147399209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147399213 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 147399278 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147399314 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147399325 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147399369 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147399481 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147399494 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147399501 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147399508 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147399610 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147399624 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 147399625 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 147400137 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 147400168 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 147400216 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 147400223 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 147400357 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147400370 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147400491 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 147400583 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147400597 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147400601 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147400643 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147400896 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147400940 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147400992 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147401047 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147401061 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147401158 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 147401259 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 147401312 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 147401384 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147401485 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147401776 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147401932 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147401949 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147402096 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147402151 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147402252 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147402254 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147402312 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147402410 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147402437 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147402453 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147402460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147402534 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147402598 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147402712 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147402746 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147402747 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147402902 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147402949 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147402990 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147403074 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147403155 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147403162 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 147403189 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 147403254 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 147403332 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 147403374 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 147403384 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 147403563 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 147403616 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147403627 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147403674 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147403873 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 147403992 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147404037 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147404151 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147404197 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147404258 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147404494 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 147404525 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 147404636 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147404716 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 147404762 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 147404784 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147404819 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147404870 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147404913 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147405104 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147405132 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147405195 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147405247 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147405357 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 147405452 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147405661 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147406232 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 147406282 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 147406559 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 147406642 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 147406734 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 147406792 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 147406808 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 147406987 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147407059 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 147407145 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147407429 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147407464 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147407490 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147407793 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147407979 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 147408077 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147408170 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147408287 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147408482 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147408542 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147408570 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147408769 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147408812 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147408923 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147409009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147409131 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147409296 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147409301 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147409484 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147409502 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147409569 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147409576 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147409697 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147409760 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147409788 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147409798 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147409860 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147409867 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147409916 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147409939 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147410037 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147410052 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147410053 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 147410120 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 147410163 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147410278 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147410492 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 147410806 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 147410906 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 147410945 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 147410963 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 147411138 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 147411267 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 147411280 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147411367 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147411416 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147411464 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 147411640 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147411779 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 147411966 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 147412098 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147412155 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147412197 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 147412311 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 147412369 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147412428 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147412484 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147412627 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147412853 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147413233 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147413262 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147413814 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147414015 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147414062 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147414302 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147414342 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147415326 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147416028 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 147416052 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 147416163 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147416240 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147416308 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147416573 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147417201 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 147417553 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 147417620 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147417845 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147417846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147418684 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147427152 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147427472 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147427760 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147427895 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147428468 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147428648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147428711 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147428932 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147429085 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147429112 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147429432 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 147429838 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147429954 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147429984 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147429986 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147430046 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147430089 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147430371 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147430742 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147430887 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 147430963 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 147431150 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 147431162 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 147431174 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 147431198 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 147431625 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147431645 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147432185 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 147432399 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147432436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147432500 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147432548 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147433013 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147433288 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147433661 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147433743 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147433755 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147433782 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147433922 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147433941 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147434005 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147434077 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147434471 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147434645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147434662 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147434704 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147434960 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147435120 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147435178 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147435227 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147435252 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147435276 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147435305 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147435352 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147435353 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147435481 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147435524 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147435540 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147435637 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147435703 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147435835 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147436292 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147436368 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147436430 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147436446 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147436452 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147436581 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147436701 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147436735 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147436837 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147436905 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147437097 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147437130 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147437153 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 147437160 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147437170 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 147437225 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 147437248 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 147437249 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 147437376 A T N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 2 147437456 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147437493 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147437574 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147437827 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147437850 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147437886 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147437992 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147438078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147438204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147438225 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147438293 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147438417 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147438512 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147438629 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147439078 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147439312 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147439944 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147439955 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147440004 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 147440846 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147440931 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147442027 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147442042 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147442159 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147442289 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147442348 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147442378 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147442392 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147442478 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147442502 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147442527 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 147442606 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147442615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147442680 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 147442833 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 147442890 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147443070 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 147443487 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147443741 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147444676 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147444677 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147444769 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 147444919 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147444936 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 147444946 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147445047 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147445068 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147445119 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147445152 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147445184 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147445307 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147446386 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147446409 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147446448 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147446489 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147446609 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147446640 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147446731 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147446769 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147446818 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147446842 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147446923 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147446936 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147446954 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147447429 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 147447592 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147447605 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147447985 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147448304 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147448387 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147448521 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147448619 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147448787 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147448841 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 147448872 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147448962 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147449004 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147449309 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147449451 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147449628 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147449660 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147449681 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147449722 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147449753 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147450022 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147450705 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147451085 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 147451289 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147451644 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147451887 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147452043 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147452180 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147452191 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147452220 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 147452266 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 147452924 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147452968 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147453261 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 147453697 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147453869 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147454073 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147454147 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147454592 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 147455146 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147455692 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147456276 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147456728 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 147456730 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147456979 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147457146 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 147457210 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147457271 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147457408 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147457851 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147458335 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147458937 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147458976 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147459096 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147459171 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147459230 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147459238 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147459249 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147459576 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147459595 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147459713 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147459811 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147459867 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147459877 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460159 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460193 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460227 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460280 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460298 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460319 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460368 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460435 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460457 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147460483 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460493 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147460494 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460612 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460669 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460741 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147460767 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460801 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147460840 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147461028 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147461061 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147461169 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147461217 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147461235 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147461266 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147461442 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147461467 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147461610 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147461723 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147461739 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147461750 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147461781 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147461815 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147461901 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147462055 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147462066 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147462137 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147462145 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147462447 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147462485 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147462511 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147462532 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147462589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147462959 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147463019 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147463346 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147463379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147463384 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 147463439 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147463504 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147463637 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147463709 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147464069 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147464507 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 147464672 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147464754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147465111 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 147465239 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147465452 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147465485 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147465634 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147465995 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147466152 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 147466590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147466597 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147466827 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147466850 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147466987 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147467042 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 147467213 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 147467433 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 147467822 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147467831 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147468034 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147468451 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147468795 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147468878 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147469266 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147469535 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 147469770 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147469829 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147469900 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147470138 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147470274 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147470477 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147470614 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 147470651 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147470654 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 147470764 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147470826 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147470839 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147470872 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147471222 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147471280 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147471325 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147471405 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147471443 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147471455 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147471483 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147471566 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147471614 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147471646 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147471680 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147471699 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147471737 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147471834 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147471901 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147471919 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147472053 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147472067 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147472092 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147472144 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147472438 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147472633 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147472732 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147472750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147472757 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147472811 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147472975 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147473111 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147473335 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147474015 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147474044 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147474187 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147475590 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147475867 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147476226 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147477271 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147477402 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147477605 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147477777 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147477820 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147477927 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147478044 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147478075 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147478154 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147478374 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147478428 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147478438 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147478682 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147478691 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147478723 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147478768 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147478829 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147478920 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147478929 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147478979 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147479057 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147479404 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147479408 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147479445 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147479478 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147479537 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147479636 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147479759 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147479779 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147479834 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147479845 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147480106 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147480127 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147480138 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147480152 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147480154 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147480431 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147480644 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147480646 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147480695 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147480747 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147480804 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147480913 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147481028 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147481068 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147481069 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147481417 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147481472 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147481584 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147481590 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147481641 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147481642 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147481673 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147481720 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147481876 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147481933 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147481995 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147482027 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147482722 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147482762 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147482801 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 147483057 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 147483148 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147483359 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147483374 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147483398 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147483432 A T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 147483622 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 147483885 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147484017 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147484061 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 147484325 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 147484354 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147484375 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 147484378 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147484412 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 147484426 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147484522 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 147484546 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 147484558 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147484642 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147484768 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147484835 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147484840 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147485204 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147485745 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147485902 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147485988 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147486004 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147486067 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147486173 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147486236 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147486263 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147486311 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147486416 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147486462 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147486526 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147486530 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147486562 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147486586 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147486960 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147487052 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 147487167 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147487201 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147487248 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147487348 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 147487382 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147487647 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 147487988 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147488054 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147488138 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147488148 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 147488274 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147488431 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147488446 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147488464 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147488550 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147488568 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147488625 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147488648 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147488828 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147488856 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147488940 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147488973 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147489275 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 2 147489856 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 147490011 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 147490115 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147490174 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147490322 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147490363 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147490375 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147490445 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147490462 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147490834 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147490835 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147490886 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147491004 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147491101 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147491216 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147491496 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147491673 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 147491771 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147491831 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147492061 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147492282 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147492440 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147492491 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147492503 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147492531 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147492539 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147492577 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147492596 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147492622 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147492738 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147492784 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147492804 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147492827 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147492946 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147493010 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147493082 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147493203 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147493231 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 147493408 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147493411 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147493438 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147493460 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147493616 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147493709 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147493736 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147493756 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147493814 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147493821 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147493826 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147493912 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147493923 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147494006 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 147494050 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 147494067 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147494123 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147494197 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147494286 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147494297 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 147494302 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147494347 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 147494393 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 147494435 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 147494446 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 147494458 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147494480 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147494543 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147494605 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147494776 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 147494870 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147494891 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147494976 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147494986 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147495054 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147495116 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147495220 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147495234 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147495261 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147495272 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147495612 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147495647 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147495944 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147496111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147496564 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147496582 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147496583 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147496649 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147496864 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147497191 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147497345 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147497400 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 147497632 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 147504353 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147504478 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147504525 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147504561 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147504859 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 147505116 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147505261 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147506149 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147506700 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147506968 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147506995 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147507162 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147507185 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147507237 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147507259 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147507327 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147507688 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147507868 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147507906 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147507993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147508019 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147508035 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147508185 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147508263 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147508579 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 147508742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147508938 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147509270 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147509403 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147509412 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147509666 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147509738 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147509914 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147509955 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147510065 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147510114 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147510403 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147510513 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147510564 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147510583 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 147510994 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147511021 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147511513 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147511515 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147511903 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147512311 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147512460 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 147513044 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147513598 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147513695 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147513767 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147514124 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147514174 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147514242 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147514270 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147514485 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147514486 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147514572 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147514616 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147514743 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147514856 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147514867 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147514905 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147514973 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147515030 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147515121 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147515424 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147515803 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147516038 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147517641 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147518342 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147519501 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147519576 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147519711 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147519759 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147519811 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147519934 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147519971 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147520162 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147520351 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 147520366 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 147520409 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147520447 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147520509 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147520559 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147520718 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147520729 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147520777 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 147520801 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147520875 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147521001 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147521016 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147521161 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147521168 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147521261 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147521314 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147521317 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147521435 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147521583 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147521641 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147521966 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147521973 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147522000 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147522005 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147522096 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147522111 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147522286 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147522332 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147522372 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147522466 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147522753 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147522861 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147522937 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147523054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147523130 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147523285 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 147523519 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147523520 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147523676 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147524258 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147525275 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147525395 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147525463 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147525923 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147526137 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147526547 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147526556 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147526866 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147526874 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147527191 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147527238 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147527295 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 147527434 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 147527483 A G N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 147527516 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 147527958 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 147528192 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147528208 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147528601 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147528728 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147530517 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147530597 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147530644 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147530737 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147530821 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147530950 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 147531465 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147531821 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147531935 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147532117 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147532139 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147532343 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147532482 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147532543 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147532656 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147532731 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147532749 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147532875 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147532878 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147532887 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147533013 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147533026 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147533119 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147533136 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147533537 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147533712 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147533751 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147533775 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147533945 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147534215 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147534286 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147534336 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147534349 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147534416 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147534500 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147534559 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147534581 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147534625 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147534931 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147534940 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147534959 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147534983 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147535304 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147535442 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147535515 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147535571 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 147535632 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 147535749 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147535802 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147535832 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147535876 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147535939 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147536013 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147536129 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147536214 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 147536215 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147536237 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147536548 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147537588 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147537744 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 147537977 C G N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 147539216 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147539885 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147539898 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147539905 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147539930 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147539953 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147539958 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147539983 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147539989 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147540342 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147540400 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147540686 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 147540854 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 147540927 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 147540932 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 147541044 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147541196 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 147541305 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 147541361 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 147541385 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 147541396 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 147541401 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 147541432 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 147541538 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 147541620 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 147541747 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 147542409 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 147542694 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 147543518 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 147544131 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147544165 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147544781 T A Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 147544912 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 147545283 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147545394 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147545496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147545658 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147545944 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 147546217 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 147546535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147546940 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 147547448 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 147547525 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 147547818 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 147548084 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 147548184 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 147548302 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 147548347 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147548350 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 147548364 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 147548440 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 147549309 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 147549700 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 147549868 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147550087 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 147550133 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147550741 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 147550743 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147551037 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 147552420 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147553323 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 147553324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147554167 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 147554293 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147554967 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147555366 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 147555459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147555613 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 147556506 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147556542 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 147556866 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147556946 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 147557024 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147557118 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147557124 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147557164 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147557242 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 147557269 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 147557392 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 147557400 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 147557639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147557772 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 147557817 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 147557821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147558359 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 147558424 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147558543 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147558581 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147558593 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147558608 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147558689 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147558707 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147558753 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147558795 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 147558981 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 147559082 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 147559102 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 147559131 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 147559142 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147559310 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 147559321 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 147559363 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 147559374 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 147559424 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147559683 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 147559775 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 147559905 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 147560173 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147560538 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147560585 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147560810 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147560849 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147560934 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 147561039 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 147561133 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 147561202 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 147561531 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 147562370 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147562656 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147563153 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147563693 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 147563731 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147563755 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147563794 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147563808 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147563821 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 147563835 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 147564023 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 147564057 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147564109 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147564113 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147564561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147565090 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 147565103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147565222 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 147565292 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 147565357 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 147565400 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 147565565 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 147566397 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 147566588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147566863 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 147567134 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147567391 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147567916 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147567917 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 147568013 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147568307 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147568443 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 147569059 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147569312 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147570230 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 147570234 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 147570356 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147571002 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 147571046 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 147571277 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 147571338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147571384 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 147571402 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 147571465 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147571908 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 147572281 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 147572326 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 147572975 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147573592 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147573695 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147573699 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147573761 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147574604 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147575013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147575051 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147575255 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147575419 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 147576421 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147577153 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147580221 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 147581563 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 147582435 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147582519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147582520 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 147582944 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147583131 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 147583303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147583323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147584109 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147584184 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 147584718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147585917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147586026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147586613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147586712 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147586873 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147586906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147587196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147587318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147587748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147588114 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 147588115 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 147588283 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 147588500 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 147588542 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 147588722 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 147588840 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 147589507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147589684 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 147589735 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 147589747 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 147589814 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 147590050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147590058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147590070 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 147590335 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147590359 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147590706 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 147590743 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147590861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147591104 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 2 147591335 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147591508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147591864 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 14 14 6 2 6 2 147591924 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147592452 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 147592580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147592888 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147592890 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147593187 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 147593210 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147593212 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147593326 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147593787 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 147595009 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147595859 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 147595867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147596542 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 147597137 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 147597182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147597642 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147598186 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147598273 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147598469 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 147598567 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147598588 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147598739 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147598813 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147599035 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147599132 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147599657 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147600539 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 147600815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147600819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147600827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147601124 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147601186 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 147601282 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147601364 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147601488 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 147601511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147601529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147601589 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147601707 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 147601788 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 147601820 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147601853 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147601859 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147602137 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147602408 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147602586 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147602704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147602796 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 147602815 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 147602839 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147603172 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147603339 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 147603368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147603422 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 147603493 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 2 147603511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147603514 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 147603533 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 147603616 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 147603739 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147604673 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147605751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147605874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147605935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147606408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147606682 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147606759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147607015 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147607368 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147608850 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147608994 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147609020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147609246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147609268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147609294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147609475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147609523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147609534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147609902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147609974 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 147610064 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147610088 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 147610135 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 147610136 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 147610532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147610796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147610985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147611847 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147611863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147611874 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147611915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147612024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147612571 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147612712 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147613114 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147613187 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147613226 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147613476 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147613493 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147614039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147614286 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147614387 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147614402 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147614482 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147614537 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.333333333333333 0.0555555555555556 0.611111111111111 13 23 6 1 11 2 147614547 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 2 147614658 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 147614928 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 147615128 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147615147 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147615597 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 147615686 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147615728 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147616383 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147616488 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147616833 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147616933 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147617069 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147617626 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147617629 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147617688 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147617809 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147617841 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 147618098 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147618195 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147618205 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 147618267 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147618431 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 147618619 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 147618653 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147618673 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147618678 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147618750 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147618800 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147618821 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147618842 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147618880 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147618890 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147618896 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 147618979 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 2 147619069 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 147619101 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 147619104 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 147621444 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147621704 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147622633 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 147622702 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147622706 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 147622814 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 147622900 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 147625260 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147625303 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147625446 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147625730 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147626094 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147626207 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 147626271 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 147626407 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 147626591 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147626828 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147626887 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147626945 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147627224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147627305 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 147627684 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147627792 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147627819 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147627854 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147627956 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147628091 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 147628147 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147628316 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 147628730 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 147629268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147629521 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147630019 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147630069 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 147630305 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 147630574 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147630663 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147631126 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147631963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147632770 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147632913 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147632986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147632991 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147633207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147633314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147633360 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 147633392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147633478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147633505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147633562 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147633588 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147633593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147633603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147633617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147633626 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634078 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147634205 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147634245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147634410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634425 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147634929 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147635066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147635172 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147635178 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 147635213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147635247 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147635390 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147635555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147635557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147635599 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147635636 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147635641 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147635666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147635677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147635709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147635713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147635751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147635759 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147635773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147635796 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147636435 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147636449 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147636768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147638130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147638699 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147638792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147639003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147639072 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 147640376 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147642041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147642331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147643710 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147643718 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147643906 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147644131 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 147644422 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147644443 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 147644485 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147644678 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147644863 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147644919 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147645409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147645628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147646015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147646391 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147646915 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147647836 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147648024 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 147648084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147648101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147648212 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147648226 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 147649351 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147649624 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147649828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147650157 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147650424 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 147650719 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 147651156 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147651238 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147652173 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 147652516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147652664 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147653658 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147653685 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147653701 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147653802 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147653910 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 147653921 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 147653936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147653937 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147653954 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147654044 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 147654072 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 147654159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147654210 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 147654260 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147654337 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 147654372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147654465 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 147654756 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147654781 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 147654867 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147654878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147655001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147655006 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 147655116 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147655255 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 147655265 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147655416 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147655437 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147655483 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147655524 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147656048 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 147656146 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 147656190 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 147656272 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 147657590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147659226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147660108 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147660270 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147662759 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147665698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147667850 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147669544 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 147669599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147669790 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147671995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147672084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147672464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147673049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147673220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147674095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147674172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147674344 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 147674930 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 147675364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147675433 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147677060 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147677122 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147677125 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147677215 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147677300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147678322 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 147678435 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147678989 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 147679018 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147679242 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147679300 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147679743 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 147679947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147681193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147681711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147681730 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147681915 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 147681960 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147682322 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 147682591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147682766 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147683011 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147683026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147683165 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147683223 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147683291 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 147683297 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147683394 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147683423 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 147683430 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147683458 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147683522 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147683799 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147684120 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147684192 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 147684251 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 147684312 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 147684347 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 147684397 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147684462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147684499 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147684574 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147684640 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147684774 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147684865 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147684994 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 147685226 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 147685237 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 147685556 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147685576 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147685733 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147685756 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147685776 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 147685969 T C Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 147685992 T A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 147686166 G C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 147686197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147686624 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147686769 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147687127 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687154 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687196 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687197 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687266 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687298 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687331 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687333 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687342 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687364 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687415 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147687458 C G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 147687459 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 147687589 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 147687603 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 147687605 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 147687629 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 147687778 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 147687851 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687925 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147687968 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147688075 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147688084 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147688385 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 147688417 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147688528 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147688612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147688613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147689141 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147689196 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147689874 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 147690198 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147690237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147690267 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147690268 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147690300 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147690391 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 147697170 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147697291 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147697646 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 147697679 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147697725 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147698071 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147698355 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147698388 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147698402 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147698409 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147698563 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147698836 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147699035 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 147699137 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 147699150 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147699164 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147699179 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147699180 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147699268 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147699383 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147699399 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147699408 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147699418 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 147700717 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147700719 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147701008 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147702003 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 147702078 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 147702287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147705798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147706176 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147706577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147708131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147709082 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 2 147709095 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 147709312 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 147709319 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 147709718 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 147709842 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147709920 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 147709935 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147709994 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 147710158 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 147710199 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147710200 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147710238 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 147710241 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 147710349 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147710422 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 147710524 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147710541 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 147710556 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147710557 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147710797 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147710799 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147710830 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 147710889 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 147710894 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 147711017 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147711041 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147711053 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147711062 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147711080 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147711233 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147711277 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147711329 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147711396 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147711447 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147711511 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 147712100 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 147712297 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 147712656 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 147712744 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 147712745 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 147713087 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147713132 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147713215 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147713248 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147713444 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 147714089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147714381 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 147714974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147715423 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 147715872 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 147716222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147716228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147716447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147716492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147716719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147716804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147716834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147716842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147716924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147716947 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147717032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147717061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147717072 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147717176 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147717255 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147717336 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 147717596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147717653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147718263 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 147718360 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 147718439 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147718553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147718656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147718680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147718722 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147718763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147718778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147718832 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147718836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147718897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147718933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147718949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147719010 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147719038 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147719112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147719191 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147719282 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 147719298 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 147719318 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147719391 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 147719426 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147719637 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 147719691 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147719727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147719732 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 147720007 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 147720034 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 147720352 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147720466 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147720515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147720615 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147720652 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147720744 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 147720776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147720792 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147720860 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 147721009 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147721015 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147721033 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147721043 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 147721197 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147721315 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 147721332 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 147721440 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147722185 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 147722196 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 147722215 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 147722308 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 147722353 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147722367 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147722386 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 147722734 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 147722898 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147722909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147722997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147723030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147723123 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 147723196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147723504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147723510 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147723572 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147723640 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147723703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147724223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147724368 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147724498 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 147724530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147724556 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 147725265 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147725885 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147727614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147727796 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 147729866 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 147733643 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 147733716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147733728 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147733836 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 147734902 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 147734912 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 147737011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147737311 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 147737841 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147738447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147738472 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147738623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147738631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147738666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147738863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147739148 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 147739180 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 147739958 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 147740981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147742832 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147743473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147743730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147743848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147743984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147753320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147753438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147753678 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147753900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147754018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147754724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147755811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147756359 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147757674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147758899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147759484 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147759502 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 147759552 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147759595 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147759744 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 147759823 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147759845 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 147759914 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147759960 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147760079 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147760110 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147760399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147760455 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147760504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147760832 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 147761117 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147761179 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147761214 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147761273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147761621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147762652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147762753 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147763083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147763351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147763355 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147763368 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147763873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147764116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147764159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147764306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147764341 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147764361 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147764434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147764458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147764545 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147764986 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147765216 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147765302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147765331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147765516 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147765639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147765758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147766017 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147766111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147766712 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147766721 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147766737 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147766758 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147766893 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147766895 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147766922 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147767530 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 147767805 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147769321 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147771236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147771898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147772284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147772335 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147773210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147775866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147777484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147777737 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147780369 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147780459 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147780702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147781643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147781828 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147781883 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147781892 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147782309 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 147782580 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 147782610 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 147782699 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147782732 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 147782782 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 147782861 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 147782917 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 147782990 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147783150 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 147783626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147784648 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147784672 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 147784692 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 147784694 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 147784717 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 147784776 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 147784799 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 147784818 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 147785333 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 147785373 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 147785389 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147785431 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 147785481 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147785492 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 147785540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147785575 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 147785686 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 147785720 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147785743 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147785745 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 147785769 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147785804 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147785848 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147785878 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147785896 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147785923 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147785926 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147786269 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147786579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147786751 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147786809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147787278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147787324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147787744 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147787883 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147787913 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147787936 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 147788130 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147788164 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 147788184 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 147788196 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147788446 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147788538 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147788570 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 147788593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147788986 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 147789068 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147789099 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147789117 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 147789138 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147789169 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147789170 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147789189 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147789289 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147789301 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147789462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147789715 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147789726 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147789891 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 147790036 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147790253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147790262 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 147790429 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 147790545 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 147790698 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 147790808 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 147791269 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 147791404 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 147791645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147791744 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 147791894 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147792476 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 147792536 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 147792567 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 147792958 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 147793126 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147795217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147795572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147796266 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 147797953 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147802047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147803778 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 147804938 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147804952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147805223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147805253 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147807287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147808301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147808562 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147808683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147808924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147808928 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147809259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147809362 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147809485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147809498 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 147809518 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 147809719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147809732 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 147809925 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 147810009 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 147810276 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147810844 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147810922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147811020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147811132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147811722 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 147811968 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147812036 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147812161 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 147812165 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 147812565 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 147812611 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 147812637 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 147812802 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 147812885 A C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 147813022 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 147813052 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 147813148 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 147813249 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 147813252 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 147813272 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 147813283 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 147813457 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 147813660 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 147813695 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 147813696 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 147813721 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 147813761 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 147813793 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 147813810 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 147813814 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 147813821 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 147813899 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 147813916 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 147813943 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 147813960 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 147814057 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 147814117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147814216 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147814304 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147814314 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 147814324 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 147814409 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 147814421 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 147814611 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 147814737 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 147814771 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 147814889 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 147814939 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 147814993 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 147815017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147815042 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147815176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147815212 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 147815246 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 147815366 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 147815853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147815910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147816022 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147816050 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 147816518 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 147816973 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 147817002 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 147817022 T A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 147817375 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 147817779 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 147818060 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147818781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147819319 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 147819781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147819824 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147820401 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 147820888 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147820924 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147821040 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147821584 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147822104 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147822234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147823373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147823798 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147824033 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147824353 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147824469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147824683 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147825065 C G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 147825070 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 147825931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147828114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147829460 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147829762 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147829864 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147829959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147830111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147830924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147831569 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 147831898 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147832018 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147832135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147832176 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147832957 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147832982 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147833059 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147833715 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 147833780 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147833809 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147833966 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147833968 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147834023 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147834082 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147834116 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147834150 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147834181 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147834186 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147834220 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147834385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147834501 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147834657 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147834864 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 147834873 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 147834883 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 147835008 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 147835504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147836149 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147836175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147836459 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147837730 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147837764 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147837810 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 147837824 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147837844 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 147837852 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 147837955 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147838044 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147838059 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147838098 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147838141 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147838164 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147838233 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147838284 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147838498 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147838562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147838587 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147838606 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147838668 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 147838702 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147838717 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147838906 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147838938 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147839003 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147839345 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147840062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147840159 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147841934 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147842069 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 147842611 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147842762 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147843032 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147843117 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147843379 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 147843508 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147845073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147845333 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147845392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147846462 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 147847009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147847303 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147848362 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147850552 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147852405 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 147852972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147853234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147853971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147854428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147854609 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147858610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147859073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147859610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147860262 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147860369 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147861017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147863210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147865266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147865342 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147865676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147866818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147867097 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 147867257 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 147867618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147869816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147870931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147871032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147871549 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147872203 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 147872753 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147873860 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147874022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147874042 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147874462 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147875619 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147876522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147876858 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 147877491 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147877742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147878173 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147878637 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147878783 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147878831 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147878940 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147878975 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 147878987 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 147879128 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147879254 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147879890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147880463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147880907 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 147881059 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147881249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147881250 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147881391 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147881487 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147881629 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147882249 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 147883210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147883259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147883735 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147884080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147884332 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147884487 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147884491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147884619 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147884699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147884731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147884776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147884886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147884893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147884958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147885033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147885047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147885093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147885094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147885147 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147885246 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147885522 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 147885529 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 147885668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147885736 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 147885769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147885780 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 147885817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147886008 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 147886054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147886750 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 147886818 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147886820 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 147887034 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147887061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147887139 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147887152 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147887347 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 147887596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147887879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147887884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147887993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147888073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147888552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147889104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147889550 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147889671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147889748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147890174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147890175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147890625 G C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147890932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147892505 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147892805 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147892806 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147892836 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147892848 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147892977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147893023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147893171 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147893472 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147893485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147893538 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147893547 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 147893594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147893927 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147894076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147894848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147894923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147894925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147894998 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147895025 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 147895409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147895418 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 147895483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147895623 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147895690 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147895732 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147895891 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147895924 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147895973 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 147896219 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 147896232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147896245 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147896249 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147896307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147896372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147896520 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147896614 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147896632 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 147896795 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 147896818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147896836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147896919 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147896937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147896955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147896975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147897049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147897064 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147897561 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147897774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147897854 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147898064 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 147898589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147898707 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147898905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147899705 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147899732 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 147900036 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 147900077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147900683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147900930 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 147901405 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147901432 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147901434 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147901497 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147901674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147901696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147901733 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147902300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147902770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147902940 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 147903702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147903925 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147904049 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 147904253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147904593 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147904755 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 147904796 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147904806 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147904810 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 147904832 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 147905016 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 147905189 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147905205 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147905276 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147905345 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147905395 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 147905440 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 147905451 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147905504 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147905607 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147905854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147906078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147906212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147906236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147906387 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147906563 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 147906667 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147906702 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 147906784 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147906940 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147907044 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 147907171 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 147907353 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147907375 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147907417 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147907458 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147907514 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147907608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147908132 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 147908790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147909182 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 147910362 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 147910570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147910732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147910904 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147911553 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147911564 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147911916 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 147912101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147912672 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 147912698 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 147912764 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 147913200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147913386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147913858 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 147914030 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147914668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147915720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147915882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147917348 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147917653 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147918832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147919044 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147919093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147919325 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147919383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147919513 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147919887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147919923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147919992 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 147920126 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147920222 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147920236 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147920284 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147920298 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 147920424 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 147920429 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 147920505 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147920519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147920585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147920762 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147920922 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147920927 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147921066 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147921123 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147921234 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147921235 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147921328 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147921345 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147921360 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147921375 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 147921400 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147921487 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147921617 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 147921778 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147921787 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 147921795 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147921805 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147921922 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147921950 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147921951 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147921963 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147922278 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 147922286 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 147922440 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 147922708 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147923480 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 147923624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147923719 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147923736 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147923779 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147923827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147923842 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147924136 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 147924156 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147924230 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147924233 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147924728 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 147924866 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 147925078 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 147925130 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147925186 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147925236 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147925265 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147925378 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147925454 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147925513 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147925608 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147925654 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147925730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147925873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147926209 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147926439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147926457 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147927012 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147927655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147930679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147930767 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 147931697 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147933337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147934034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147935412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147935866 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147936249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147936785 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147938144 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 147938148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147938170 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147938236 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147938237 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147938270 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147938297 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 147938338 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147938374 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147938516 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147938528 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147938534 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147938562 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147938675 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 147938694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147939011 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 147939073 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147939223 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147939309 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 147939475 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147939800 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147939829 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147939856 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147939868 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147940421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147940579 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147940794 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147940932 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 147940969 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 147941014 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147941081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147941088 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147941095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147941152 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147941165 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147941175 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147941194 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147941247 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147941298 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147941329 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147941331 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147941343 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147941368 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147941407 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147941468 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147941528 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147941660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147941696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147941793 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 147941919 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147941991 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147942008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147942078 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147942269 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147942505 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147942539 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147942599 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 147942608 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147942647 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 147942700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147942720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147942776 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147942826 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147942892 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147943020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147943024 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147943034 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147943054 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147943075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147943174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147943214 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147943246 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147943277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147943357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147943386 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147943407 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147943447 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147943489 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147943770 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147943796 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147943936 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147944012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147944051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147944196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147944268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147944296 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147944504 T C N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 2 147944525 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 147944606 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 147944723 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147944856 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147944870 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147944977 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147945398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147947010 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 147947448 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147947616 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147947726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147947768 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 147947941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147948349 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147948370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147948374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147948610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147948651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147948730 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147948804 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147948878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147948894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147949021 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147949022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147949034 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147949122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147949143 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147949226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147949252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147949271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147949376 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147949769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147949817 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147949828 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 147949879 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147949950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147950478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147950494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147950495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147950555 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 147951246 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 147951281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147951295 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147951309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147951341 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 147951354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147951415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147951450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147951509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147951536 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147951557 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147951558 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147951715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147951729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147951781 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147951807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147951885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147951920 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147951928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147952165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147952204 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 147952698 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147952725 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147952810 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147952860 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147952875 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147952930 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147953059 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147953071 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147953244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147953392 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147953522 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147953620 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147953774 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 147953775 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 147954111 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147954212 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147954321 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147954400 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147954440 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147954444 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147954499 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147954530 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147954778 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147954803 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147954833 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147954843 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147954977 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147955095 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147955105 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147955108 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147955225 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147955249 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147955265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147955267 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147955293 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147955308 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147955471 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147955567 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147956237 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147956339 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147956706 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147956722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147956772 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147957033 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 147957066 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147957087 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 147957093 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147957185 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147957192 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147957236 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147957340 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147957366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147957398 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147957413 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147957428 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147957490 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147957573 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147957661 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147957704 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147957772 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 147957785 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 147957790 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147957873 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147958108 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147958204 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147958216 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147958301 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147958356 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147958683 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 147958819 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147958878 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147958906 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147958963 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147959026 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 147959039 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 147959057 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147959072 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147959407 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147959430 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147959486 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 147959808 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 147959886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147960132 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 147960451 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 147960461 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 147960473 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147960591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147960749 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 147960768 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 147960789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147960915 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147961100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147961238 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147961486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147961879 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147961972 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 147962101 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 147962153 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 147962496 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147962714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147962726 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147962920 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147962927 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 147962939 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 147963137 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147963290 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147963339 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 147963494 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 147963860 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147964012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147964212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147964317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147964881 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 147966520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147967079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147969123 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147969684 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 147969706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147974142 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147974599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 147974641 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147974949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147975915 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147975935 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147976019 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 147976408 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147976449 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147976507 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 147976635 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 147976639 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 147976680 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 147976944 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 147976978 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147977003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147977018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147977059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147977786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147977840 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 147978740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147978765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147980766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147980958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147985044 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147985431 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 147987226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147987594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147988111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147988888 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 147990177 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 147990430 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 147991890 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 147992025 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 147994266 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 147994865 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147995428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147996043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147996140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147997003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147997974 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 147998455 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 147998922 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 147999706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 147999790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148000993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148001595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148001673 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148001696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148001769 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148001780 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148001949 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148002213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148002328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148002346 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148002351 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148002653 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148002776 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148002781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148002820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148002846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148002865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148002882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148002921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148002971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148002976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148002991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148003314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148003441 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148003497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148003610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148003705 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148003732 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148003933 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148003937 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148003975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148003978 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148004924 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148005111 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148005237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148005792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148006007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148006544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148012233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148013737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148014180 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148014273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148014289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148014492 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148014516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148014877 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148015141 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148015268 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148015595 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148015669 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148017278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148018865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148020158 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148021138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148022314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148025974 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148028039 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148028409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148029406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148029920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148031010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148033725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148034001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148037010 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 148037219 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 148037576 C G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 148037725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148037914 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 148038120 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 148038222 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 148038246 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 148038268 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 148038296 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148038341 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 148038402 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148038411 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148038439 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148038461 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 148038577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148038623 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 148038641 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 148038658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148038748 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 148038840 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148038866 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148038896 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148038954 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148038966 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 148039021 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 148039090 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 148039149 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148039495 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148039684 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 148039706 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 148040083 T C Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 148040181 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 148040188 C A Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 148040199 T A Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 148040288 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 148040298 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 148040311 T C Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 148040503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148040623 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148040893 C T Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 148040915 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 148041102 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 148041163 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148041286 C A Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 148041323 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 148041353 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148041357 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148041429 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 148041437 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 148041509 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148041556 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148041628 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 148041655 G C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 148041676 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 148041699 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 148041733 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 148041788 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 148041893 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148041897 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 148041924 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 148041938 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148042058 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 148042108 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 148042121 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 148042129 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 148042134 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 148042186 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 148042209 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 148042231 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 148042294 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 148042321 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 148042704 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148042721 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148042817 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 148042859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148042893 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 148043067 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 148043138 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148043183 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148043201 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148043300 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 148043331 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 148043344 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 148043395 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 148043466 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 148043480 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 148043503 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148043519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148043575 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148043591 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148043796 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148043802 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148043810 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148043834 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148044113 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148044129 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148044165 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 148044176 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 148044216 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 148044266 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148044270 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148044351 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 148044511 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148044552 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148044577 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 148044589 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 148044590 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 148044621 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 148044727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148044736 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148044788 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148044815 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148044816 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148044868 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 148044959 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 148044965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148044972 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 148044976 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148045010 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148045085 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 148045125 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 148045293 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148045337 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148045489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148045577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148045599 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148045705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148045736 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148045765 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148045979 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148045980 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148046026 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148046082 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148046154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148046686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148046782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148046799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148046817 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148046919 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148047433 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148047764 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148047819 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148048526 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148048538 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148048817 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148048824 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148049189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148049201 G C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148049227 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148049308 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148049333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148049672 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 148049712 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 148049906 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 148049982 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148050218 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148050314 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148050587 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148050719 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148050838 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148051249 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148051414 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148051457 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148051866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148051909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148052122 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 148052144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148052583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148053216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148054543 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 148054570 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 148054603 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148054605 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148054718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148055029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148055055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148055132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148055422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148055447 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148056244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148056387 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 148056416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148056621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148057058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148057235 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 148057286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148057795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148057835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148057979 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148058411 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 148058430 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 148058431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148058481 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 148063266 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 148063275 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 148063818 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148063974 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 148064367 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148064633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148066078 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148066327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148067588 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148067678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148067794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148067885 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148068292 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148068334 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148068836 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 148069735 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148070120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148070169 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148070200 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 148070541 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 148070748 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 148070793 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148071181 A C Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 148072360 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148072406 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 148072823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148073002 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 148073015 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 148074841 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148076058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148076174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148076905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148077110 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148077247 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 148077301 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 148077393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148077456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148077459 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148077541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148077706 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148077930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148077971 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 148078129 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 148078238 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148078539 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 148078614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148078750 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148078798 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 148078845 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148078910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148082154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148082194 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148082252 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 148082303 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148082382 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 148082532 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148082600 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 148082684 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148082703 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148082717 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148082809 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148082816 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148082826 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148082847 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148082906 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148083004 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148083089 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 148083233 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 148083367 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148084019 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148084253 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 148084258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148084313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148084318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148084660 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 148084781 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148084787 C A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 148084801 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 148084851 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 148084974 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148085030 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 148085379 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148085432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148085574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148085686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148085794 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 148085824 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148085958 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 148086284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148086308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148086327 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148086400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148086471 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148086486 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148086984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148087205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148087351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148087641 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148087814 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 148087897 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148087933 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148088117 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148088148 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 148088165 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 148088181 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148088231 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 148088253 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148088273 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148088302 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148088325 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148088451 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 148088592 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148088626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148088629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148088645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148088699 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148088749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148088793 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148088878 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148088880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148088902 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148088934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148089041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148089053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148089070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148089479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148089537 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148089538 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148089575 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148089761 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 148089770 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 148089777 C T N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 148089797 A G N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 148090068 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148090089 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148090166 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148090264 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148090299 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 148090394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148090448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148090498 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148090547 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148090592 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 148090689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148090751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148090773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148090839 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148090933 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 148090965 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148091032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148091086 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148091093 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148091142 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148091196 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 148091267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148091552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148091775 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148091829 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148091841 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148091885 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 148091906 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148091909 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 148092007 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148092576 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 148092618 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148092938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148093112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148093120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148093140 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148093144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148093223 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148093344 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148093438 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 148093690 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148093728 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 148093761 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148093901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148094120 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 148094327 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148094387 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148094398 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 148094522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148094555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148094649 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148094687 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 148095041 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 148095150 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 148095537 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148095764 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148095853 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 148095914 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 148096126 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148096207 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148096284 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148097002 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148097882 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148097917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148098174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148098363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148098793 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 148099475 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 148099797 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148099885 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148099911 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148100007 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 148100100 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148100177 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148100242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148100283 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148100340 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148100373 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148100375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148100452 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148100703 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148100795 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148100845 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148100852 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 148100866 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 148100869 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 148100906 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 148100924 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 148101011 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 148101049 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 148101148 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 148101155 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 148101165 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 148101305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148101354 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148101358 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148101373 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 148101407 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 148101493 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148101505 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148101538 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148101585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148101714 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148101802 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148102107 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148102891 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 148103117 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148103794 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148103910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148104121 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148104367 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 148104845 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148104903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148105058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148105203 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 148105269 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 148105312 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 148105517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148105555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148105967 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 148106004 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148106005 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148106074 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 148106177 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148106190 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148106271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148106293 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 148106486 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 148106533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148106618 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148106699 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 148106728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148106753 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 148106935 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148107097 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148107239 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148107384 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148107456 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 148107591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148107630 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148107678 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148107771 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148107792 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148107840 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 148107856 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 148108157 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 148108194 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 148108338 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148108354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148108447 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148108515 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148108547 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148108556 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148108633 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148108682 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148108686 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148108768 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148108781 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148108824 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 148108852 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148108949 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148108960 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148108983 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148108994 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148109061 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148109068 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148109079 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 148109182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148109218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148109224 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148109259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148109278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148109362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148109374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148109467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148109498 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148109508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148109634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148109648 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148109791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148109822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148109922 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148109940 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148109958 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148110013 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148110032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148110049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148110068 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148110138 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148110150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148110157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148110265 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148110340 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 148110465 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148110477 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148110484 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148110586 A C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 148110651 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 148110836 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148110956 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148111009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148111011 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148111037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148111072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148111083 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148111120 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 148111131 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148111228 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148111273 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148111317 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148111354 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148111436 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148111456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148111504 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148111511 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148111598 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148111612 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148111639 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148111689 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148112038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148112302 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 148112344 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148112526 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 148113688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148114293 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 148115303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148115479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148115550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148115567 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148116196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148116227 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148116498 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 148116639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148117217 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148117258 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148117344 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 148117445 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148117646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148117830 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148118014 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 148118135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148118228 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 148118231 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 148118360 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 148118598 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148118977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148119065 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 148119289 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148119422 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148119430 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 148119481 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148119997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148120185 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 148120568 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148120977 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148121224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148121447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148121478 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148121616 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148121811 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 148122158 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148122166 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 148122197 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148122218 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 148122573 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 148122701 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148122826 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 148123049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148123159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148123298 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148123311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148123344 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148123681 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148123720 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 148123895 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 148124036 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148124057 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 148124186 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148124238 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148124250 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148124290 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148124483 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 148124531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148124665 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148124679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148124686 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148124695 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 148124715 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 148124773 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 148124799 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 148124949 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 148125102 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 148125315 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148125484 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148125488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148125517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148125605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148125616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148125722 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 148125727 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 148125733 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 148125821 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148125836 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148125848 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 148125863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148125901 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148125962 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148126049 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148126155 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 148126259 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148126276 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148126410 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148126459 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148126912 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 148126913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148126983 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 148127038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148127158 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148127332 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148127424 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148127458 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148127471 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 148127486 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 148127507 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 148127537 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148127621 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148127628 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148127700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148127746 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148127749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148127833 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148127961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148128288 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148128293 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148128318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148128489 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148128759 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148128877 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 148130682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148130855 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148131207 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 148131256 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 148131268 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 148131285 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 148131391 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 148131826 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 148132323 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148132601 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 148133601 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 148140048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148140525 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148142233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148143209 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148145243 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148147635 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148147765 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148147896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148147910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148147920 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148148327 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 148148650 G C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 148149442 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148149535 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148149861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148150060 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 148150176 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148150299 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148150325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148150402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148150792 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148151101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148152505 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148153154 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148153270 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 148154099 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148154284 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 148154449 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 148154544 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 148155282 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 148155543 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 148155635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148155683 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148155824 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 148155887 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 148157070 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148157461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148157877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148157909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148158874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148159423 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148159568 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148159911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148160429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148163110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148163720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148165149 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148165395 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148166926 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148168294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148168382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148169479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148170444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148170516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148175305 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 148175345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148177223 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148177235 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 148177257 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 148177861 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 148178243 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148178350 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 148179248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148179357 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 148179513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148181355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148181402 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148181636 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148187056 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148189546 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148189763 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 148189891 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 148189938 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 148189969 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 148190085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148190161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148190304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148190395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148190687 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148191601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148191731 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 148191961 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 148192399 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148192629 A T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 148192755 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 148193101 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148194006 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148194691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148194713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148196111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148196730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148198638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148200333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148201119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148201198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148201441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148201672 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148201727 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 148201842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148202542 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 148202690 C G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 148202777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148202831 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 148203221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148203360 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148203383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148203395 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 148203581 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148203786 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 148204190 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148204193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148204257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148204287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148204378 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 148204732 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 148204863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148205053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148205094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148205181 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148205216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148205435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148205646 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148205648 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 148205678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148205701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148205720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148205725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148205777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148205854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148205991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148206151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148206241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148206323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148206731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148206855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148207160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148208006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148208066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148208338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148208374 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148208528 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148208587 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148208862 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 148209159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148209227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148209361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148209411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148209466 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148209789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148209997 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148210008 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148210056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148210085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148210206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148210324 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148210336 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148210360 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148210412 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148210543 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148210561 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148210577 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148210790 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148210845 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148210855 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148210892 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148210912 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148210973 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 148211115 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 148211150 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148211162 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 148211174 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148211201 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 148211204 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 148211302 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 148211322 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 148211426 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148211458 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 148211473 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 148211478 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 148211512 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 148211624 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 148211638 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 148211651 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 148211654 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 148211771 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 148211859 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148212023 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148212177 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148212248 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148212347 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148212357 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148212396 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148212422 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148212507 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148212691 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148212733 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148212762 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148212803 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148212841 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148212862 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148213375 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148213397 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148213417 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148213501 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148213514 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 148213537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148213557 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148213564 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148213638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148213694 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148214034 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148214184 T G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 148214247 G C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 148214361 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 148214377 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 148214382 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 148214412 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 148214466 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 148214507 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 148214512 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 148214579 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 148214662 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 148214715 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148214734 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 148214745 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148214768 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148214886 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148215075 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148215116 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148215152 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148215215 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 148215282 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 148217199 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 148217549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148217949 A T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148218162 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 148218521 A C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148218546 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148218732 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148219172 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148219448 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148219572 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 148219677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148219866 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 148219890 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 148219898 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 148219939 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148220555 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 148220588 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148220626 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 148220643 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 148220819 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 148220866 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 148221218 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 148221227 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 148222855 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148222966 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148223119 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 148223142 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 148223791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148225926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148225988 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148227157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148227648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148228999 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148235377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148242497 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148243370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148243860 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 148244220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148245237 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148245966 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148247388 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148248999 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148249630 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 148249643 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 148249716 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148249739 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148249852 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 148249973 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148251858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148252158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148253124 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148253294 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148254077 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148254810 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 148255332 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148255426 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148255547 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148255627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148256191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148256303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148256514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148258256 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 148258471 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148258594 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148258631 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148258653 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148258671 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148258758 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148258896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148259018 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 148259052 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148259053 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148259176 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 148259223 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148259298 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148259331 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148259381 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 148259430 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 148259433 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148259631 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 148259730 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 148259856 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 148259857 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 148259934 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 148259970 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 148259985 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 148260063 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 148260141 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148260152 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 148260292 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 148260306 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 148260366 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 148260400 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148260436 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 148260488 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148260906 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148260917 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148261005 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148261200 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148261207 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148261213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148261261 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 148261361 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148262149 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148262260 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148262700 A C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 2 148262980 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148263026 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 148263043 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148263062 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148263171 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 148263410 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148263464 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148263470 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148263476 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148263569 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 148263634 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148263669 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148263673 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148263718 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148263905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148264222 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 148264323 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148264445 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 148264502 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 148264698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148264752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148264781 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148264994 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 148270216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148271255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148271745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148273877 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148274224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148276953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148277632 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148278472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148278558 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148278561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148278717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148278871 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148279073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148279280 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 148279406 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148279467 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148279474 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148280157 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148280616 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 148280712 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148280767 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148280844 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148280909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148281186 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148281219 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148281240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148281267 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148281442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148281473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148281477 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148281501 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148281533 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 148282118 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148282157 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148282164 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148282232 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 148282403 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 148282420 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148282607 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 148282723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148282861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148282893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148282903 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148282923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148282964 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148282967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148282996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148282998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148283073 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148283122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148283136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148283153 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148283602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148283667 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148283986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148284001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148284009 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148284121 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148284303 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148284305 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148285561 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148292961 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148293401 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148293606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148293715 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148294816 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148294822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148294842 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148294926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148295507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148295655 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148295670 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148296546 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148296935 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148297306 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 148297345 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 148297395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148297465 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148297988 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 148298158 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 148298303 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 148299521 C T Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 148299990 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 148300061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148300064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148300106 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 148300180 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 148300282 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 148300458 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148300498 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 148300512 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 148300540 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 148300547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148300681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148301401 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 148301585 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148301598 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148301799 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148302170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148302438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148302508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148302878 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148302911 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148302969 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148303177 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148304235 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148304438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148304459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148304463 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148304507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148304626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148304631 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148304715 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148304765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148304780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148304820 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148304898 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148304948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148304994 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148305152 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148305228 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148305252 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148305320 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148305331 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 148305342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148305358 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148305422 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148305431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148305494 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148305531 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148305594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148305627 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148305742 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148305972 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148306005 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148306035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148306435 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 148306446 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148306730 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148306751 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148306798 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148306812 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148307247 A C N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 148307311 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 148307427 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 148307429 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148307500 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 148307531 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148307584 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148307610 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 148307676 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148307706 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148307736 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148307779 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148307784 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148307883 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148307886 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 148308001 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148308018 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148308108 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148308112 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148308171 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148308205 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148308261 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 148308309 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 148308321 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 148308334 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 148308344 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 148308588 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148308619 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148308743 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148308893 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309036 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309071 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148309087 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309120 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309169 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148309236 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309244 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309252 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148309311 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309315 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309362 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309375 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309495 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309645 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148309663 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148309717 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309748 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309792 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148309802 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148310018 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148310187 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148310291 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148310363 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148310419 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148310594 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148310667 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148310672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148310705 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 148310833 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148310855 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148310895 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 148310919 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 148310957 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 148311051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148311061 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148311117 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148311811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148311898 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 148311956 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 148311981 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 148312113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148312119 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 148312232 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 148312347 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148312689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148312752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148312787 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 148312973 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 148313379 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148314229 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 148314768 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 148314823 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148315496 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 148315536 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 148316059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148316086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148316619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148316869 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148318154 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148318317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148318394 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 148318447 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148318516 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 148320721 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148320812 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148324704 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148324722 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148324796 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148324839 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148324871 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148324875 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148324981 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 148324982 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148325127 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 148325143 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 148325165 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148325178 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 148325184 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 148325327 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148325352 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148325369 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148325377 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148325520 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148325523 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148325548 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148325775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148325789 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148325855 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148325982 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148326392 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 148326410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148326582 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 148326593 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 148326912 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 148327204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148327261 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 148328149 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148330017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148330036 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 148330152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148330285 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148330311 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 148330490 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148331054 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 148331155 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148331193 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 148331937 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 148332165 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 148332235 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 148333638 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 148334879 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 148335359 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148335432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148336195 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148336204 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148336530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148336637 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148336882 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 148336907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148336970 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 148337081 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148337159 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148337605 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148338547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148338968 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148340620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148342424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148342954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148343689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148344228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148344643 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148345453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148345534 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148345969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148346650 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148348542 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148349581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148349651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148349919 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148349957 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148349986 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148350004 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 148350033 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 148350423 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148350490 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148350594 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 148350606 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 148351146 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148351445 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148351575 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 148351927 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148352299 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 148352606 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 148352675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148352684 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 148352757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148352779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148352865 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148353006 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148353504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148353534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148353556 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148353659 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 148353915 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 148353925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148354060 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 148354156 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148354173 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 148354201 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.25 17 7 8 1 3 2 148354917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148355190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148355436 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148357423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148357568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148358303 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 148358318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148358511 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 148358720 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148360309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148360523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148360680 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148360874 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 148360893 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148361339 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148361528 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148361721 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148361858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148362125 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 148362155 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148362699 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 148362774 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 148362880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148362885 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 148363098 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148363126 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 148363347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148363517 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 148363577 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 148363666 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148363670 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148363682 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148363707 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148364226 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148364500 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148364657 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148364700 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148364740 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 148364763 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 148364779 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 148364790 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 148365427 A C Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 148365875 G A N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 148365947 T A N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 148365990 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 148365996 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 148366148 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 148366156 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148366196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148366262 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148366906 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148366992 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 2 148367123 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148367345 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148367420 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 148367473 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 148367570 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148367690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148367782 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148367812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148368084 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 148368349 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148368451 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 148368469 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148368477 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148368497 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 148368592 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148368775 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148368806 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 148368899 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 148368973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148369395 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148369405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148369458 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148369581 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 148370059 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148370078 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 148370099 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 148370197 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148370214 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 148370379 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148370407 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148370501 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148370647 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148370697 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 148370719 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 148370728 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 148370771 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148370814 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148370911 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 148371158 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 148371490 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148371518 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148371961 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 148371978 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 148372012 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148372084 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148372262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148372660 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 148372879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148373108 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148373179 G T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 148373672 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 148373705 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148373740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148373747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148374526 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 148374832 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148375488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148375614 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148375688 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148375750 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 148375821 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148375946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148376097 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148376145 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 148376342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148376350 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 148376596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148376770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148377062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148377141 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 148377437 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148377668 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148377669 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148378032 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 148378256 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 148378330 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 148378331 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 148378444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148378460 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 148378499 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 148378502 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 148378630 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 148378665 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 148378758 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 148378815 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 148378940 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 2 148378984 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 148379214 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 148379321 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 148379426 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 148379500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148379633 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148379727 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148379799 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148379924 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148380759 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 148383529 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148385585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148385785 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 148385943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148386333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148386530 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 148386531 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 148386605 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 148386617 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 148387422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148387429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148387612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148387860 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 148387991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148388001 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 148388120 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 148388266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148388282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148388391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148388401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148388408 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 148388619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148388649 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 148388737 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 148388930 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148388946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148388965 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 148388980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148388984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148389002 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 148389052 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148389442 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 148389485 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 148389526 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 148389541 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 148389552 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 148389707 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 148389786 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148390007 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148390191 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 148390246 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 148390316 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391174 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391209 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391224 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391234 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391254 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391256 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391316 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391411 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391473 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391504 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391586 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391629 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 148391654 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391670 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391691 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 148391770 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 148391842 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 148391950 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 148392014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148392193 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148392353 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148392385 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 148392860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148393191 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 148393488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148394121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148394411 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148394467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148394489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148394804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148395207 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 148395243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148395271 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 148395542 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 148395556 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 148396217 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148396243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148396259 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148396264 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148396332 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148396378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148396385 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148396459 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148396873 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148396902 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 148398905 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 2 148400984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148401675 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148402148 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148402664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148403238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148404118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148405493 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 2 148405883 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148408749 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 148409923 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 148409936 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148409965 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 148410209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148411269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148411942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148412852 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 148412873 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 148412898 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 148413059 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 148413181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148413288 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148413612 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 148413621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148414022 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 148414320 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 148414344 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 148414356 G C N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 148414494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148414495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148414624 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 148414665 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148414689 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148414703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148414714 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148414837 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 148414871 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148414985 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148415353 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 148415487 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148415616 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 148417747 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148417822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148417827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148418008 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148418117 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148418422 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 148419025 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 148419193 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 148419204 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 148419209 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 148419218 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148419896 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 148419897 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 148420192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148421203 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 148421551 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 148421684 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148422313 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 148422319 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 148422377 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 148422395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148422700 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 148422793 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 148422837 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148423108 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148423962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148424030 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148424309 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 148424553 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 148424620 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 148424710 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 148424712 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 148424764 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 148424827 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 148425029 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 148425543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148425594 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 148425650 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 148425654 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148425785 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 148425868 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 148425950 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148426039 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148426116 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 148426203 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148426235 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148426253 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 148426446 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 148426509 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 148426525 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148426570 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 148426578 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 148426648 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 148426665 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 148426669 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 148426990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148427007 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148427037 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 148427104 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 148427145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148427200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148427221 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 148427273 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 148427280 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 148427401 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 148427519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148427794 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 148427972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148428210 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 148428256 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 148428417 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 148428418 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 148428482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148428995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148430611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148432871 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148432882 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148432934 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 148432953 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148432989 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148433173 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148433717 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148433767 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148433779 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148433808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148433959 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148434402 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148434530 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148434582 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148434747 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148434939 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148434969 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148435070 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148435091 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148435156 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148435209 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148435252 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148435258 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148435351 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148435481 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148435530 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148435590 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148435637 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148436035 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148436046 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148436058 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148436087 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148436093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148436100 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148436206 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148436281 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148436307 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 148436324 C G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 148436369 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148436398 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148436404 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148436437 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148436604 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148436678 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148436721 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148436798 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148436985 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148437202 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148437209 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148437266 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148437340 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148437445 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148437466 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148437478 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148437498 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148437605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148437654 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148437689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148437706 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148437825 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148437868 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148437912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148437936 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 2 148437952 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148438009 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148438084 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148438278 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148441450 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148441507 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148441626 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148441802 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 148441805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148441971 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148442008 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148445879 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148445885 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148445912 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 148446085 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148446331 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148446343 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148446344 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148446486 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148446494 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148446515 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148446542 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148447190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148447246 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148447270 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148447286 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148447292 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148447478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148447490 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148447519 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148447534 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148447538 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148447613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148447627 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148447628 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148447701 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148447737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148447767 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148447865 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148448123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148448168 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148448706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148448800 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148448905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148448913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148449004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148449331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148449526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148449835 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148449955 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148450035 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148450096 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148450221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148450362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148450412 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148450431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148450497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148450507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148450554 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148450620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148450649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148450689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148450823 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148450853 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148450920 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148450932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148451388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148451534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148451558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148451564 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148451931 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 148451960 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148452089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148452130 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148452355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148452445 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 148452528 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 148452580 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 148452649 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 148452986 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148453177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148453346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148453375 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148453725 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148453742 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148453749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148453767 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148454034 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148454062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148454162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148454259 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148454287 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148454993 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148455233 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148455695 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148455941 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148455950 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148456262 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148456687 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148457330 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148457367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148457603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148457769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148457774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148457818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148457891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148457952 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148457962 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148458047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148458074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148458127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148458225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148458227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148458276 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148458339 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148458605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148458680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148458708 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148458737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148458821 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148458944 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148459198 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148459208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148459265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148459539 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 148459634 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148459720 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148460028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148460084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148460088 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148460107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148460177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148460215 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148460245 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148460334 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148460335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148460362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148460497 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148461326 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 148461610 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148461611 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148461673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148461751 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148461793 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148461869 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148461953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148461974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148462083 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148462094 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148462115 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148462117 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148462170 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148462188 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148462298 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148462387 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148462423 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 148462458 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 148462578 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 148462615 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 148462699 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 148462715 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 148462718 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 148462894 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148462917 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148463017 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 148463026 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 148463035 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 148463041 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 148463124 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148463190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148463220 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148463225 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 148463356 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148463507 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148463932 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148464036 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148464037 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148464069 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148464088 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148464199 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148464255 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148464264 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148464270 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148464284 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148464385 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148464424 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148464514 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148464617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148464654 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 148464738 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 148464741 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 148464754 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148464768 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148464770 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148464832 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148464859 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148464865 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148464972 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148465052 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148465115 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148465164 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148465165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148465305 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148465489 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148465537 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 148466632 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 2 148466717 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148466808 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148466820 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148466950 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148466985 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148467000 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148467097 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148467168 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148467231 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 148467295 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148467599 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148467792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148467861 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148467976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148467989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148468075 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148468158 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148468232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148468368 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 148468433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148468556 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148468577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148468659 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148468697 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148468920 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148468921 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148469019 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148469106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148469314 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 148469332 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148469368 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148469431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148469452 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 148469584 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148469794 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 148469822 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148470181 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 148470189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148470207 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148470333 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148470383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148470613 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 148470891 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 148470935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148470982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148471012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148471051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148471090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148471120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148471341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148471779 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148472068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148472464 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 148472471 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 148472597 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 148473234 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 148473518 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148473571 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148473626 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148473641 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148473681 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148474043 G C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 148474444 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 148474481 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 148475015 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148475043 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148475230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148475322 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 148475334 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 148475500 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148475655 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148475665 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 148475669 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 148475791 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 148475822 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148475824 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148475846 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148475859 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148475901 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148475903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148476078 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148476120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148476140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148476175 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148477009 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148477055 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148477125 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148477215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148477587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148477966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148478196 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148478229 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148478275 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148478592 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148478618 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148478627 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148478794 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148478807 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148478874 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148479384 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148479407 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148479424 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148479449 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148479523 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148479601 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148479612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148479633 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 148479635 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148479861 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148479914 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148479995 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 148480095 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148480193 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148480287 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148480488 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148480603 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148480632 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148480703 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148480933 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148481427 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148481501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148481623 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148481770 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148482384 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148483150 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148483154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148483346 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148483366 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148483389 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148483394 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148483417 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148483442 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148483633 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148483666 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148483672 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148483748 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148483911 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148483916 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148484163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148484363 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148484370 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148484446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148484687 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148486305 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148486317 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148486320 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148486484 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148486497 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148486506 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148486658 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148486762 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148486780 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148486790 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148486825 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148486903 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148486954 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148487294 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 148487469 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148487741 G C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 148487780 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 148487863 G A Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 148487900 A G Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 148487999 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 148488104 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148488141 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 148488153 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148488170 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148488222 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148488237 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148488296 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 148488371 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148488379 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148488530 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148488666 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 148489147 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148489431 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148489529 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148489894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148490102 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 148490114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148490413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148490532 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148490912 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148491246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148492108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148495203 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148496099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148497314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148497944 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148497990 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148498191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148498791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148500120 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148501967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148502761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148504059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148505490 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 148505770 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148507226 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148507914 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148508646 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148508821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148509121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148509186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148509781 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148510030 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148510140 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148510165 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148511026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148511184 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148511271 G C N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 148511410 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148512014 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148512038 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148512941 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148513085 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148513153 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148513158 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148514062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148514107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148514280 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 148514656 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 148515255 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148515303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148519193 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148519324 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148519435 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148519437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148519487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148519514 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148519536 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148519545 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148519593 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 148519710 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148519815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148519886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148519939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148519947 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148520239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148520256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148520258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148520280 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148520336 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148520422 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148521002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148521151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148521501 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 148521516 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 148521618 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148521676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148521756 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148521856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148521882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148521942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148522000 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148522098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148522256 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148522270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148522292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148522344 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148522579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148522597 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148522641 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148522692 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148522801 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148522944 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 148523277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148523351 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148523668 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148523730 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148523759 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 148524494 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 148524537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148525059 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148525296 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 148526145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148526169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148526350 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148526690 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148527100 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148527327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148528696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148529446 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148529447 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148530578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148531584 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148531799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148531801 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148533110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148533163 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148534666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148534845 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148534957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148534958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148536592 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148536778 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148536831 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 148536900 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148536924 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148536966 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148537030 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148537031 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148537107 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148537313 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148537344 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148537399 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148537408 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148537445 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148537500 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148537621 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148537824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148537896 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148537936 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148538185 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148538210 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148538352 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148538400 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148538430 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148538508 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 148538518 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 148538527 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 148538544 T A Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 148538545 T C Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 2 148538558 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 148538580 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 148538585 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 148538602 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 2 148538695 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 148538733 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 148538776 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 148538816 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 148538819 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 148538860 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 148538879 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 148538881 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 148538945 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 148538971 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148538988 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148539003 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148539031 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148539042 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148539048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148539089 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148539101 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148539103 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148539148 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148539161 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148539219 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148539237 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148539275 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148539908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148540006 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148540022 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148540041 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148540125 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148540357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148540400 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148540472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148540474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148540489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148540662 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148540728 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148540969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148541106 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148541415 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 148541477 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 148541501 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 148541603 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148541900 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148541984 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148542213 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148542296 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148542298 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148542328 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148542468 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148542500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148542551 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148542653 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148542758 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 148542768 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148542772 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148542861 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148542884 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148542912 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148542976 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148543024 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148543263 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148543280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148543457 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148543562 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148543684 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 148544005 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148544006 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 148544181 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148544282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148544283 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148544317 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148544644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148545085 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 148545725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148546149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148546942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148546988 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148547075 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 148547130 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148547354 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148547571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148547790 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148547796 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148547951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148548021 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148548106 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148548188 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 148548581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148548804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148549180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148549181 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148549220 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148549263 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148549319 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148549341 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 148549364 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 148549400 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 148549411 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148549450 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148549460 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148549536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148549911 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148549954 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148550268 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 148550357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148550604 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148550748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148550784 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148550904 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148550941 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148551111 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148551209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148551213 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148551400 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148551495 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148551655 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148551688 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 148551709 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 148551851 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148552036 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 148552227 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148552251 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148552348 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148552360 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148552565 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148552639 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148553093 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 148553274 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 148553384 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148553427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148553501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148553623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148553865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148553959 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148553984 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 148554109 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148554427 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148554488 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148554903 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148554965 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148555042 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148555393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148555409 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148555465 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148555638 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148555877 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148555911 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148555960 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 148556012 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 148556138 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148556161 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148556210 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148556687 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148556843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148557250 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148557343 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148557395 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148557543 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148557598 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148558285 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148558970 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148558971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148558994 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148559130 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148559158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148559174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148559447 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148559448 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148559476 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148559487 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148559583 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148559587 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148559627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148559686 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148559717 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148559719 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148559976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148560494 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148560728 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148562379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148562432 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148562448 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148562531 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148562543 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148562666 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148562777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148562948 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148562960 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148562984 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148563207 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148563221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148563878 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148563883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148564183 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148564252 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148564932 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148565143 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148565367 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148566184 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148566203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148567072 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148567132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148567808 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148567830 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148567892 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 148567955 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148567987 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 148568133 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148568174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148568211 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 148568256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148568301 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148568376 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 148568471 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 148568485 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 148568641 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148568825 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148568876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148569418 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 148569633 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 148569660 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 148569713 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148569764 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148569766 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 148569802 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148569933 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148570105 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148570254 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148570312 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148573565 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148573679 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148573697 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148573760 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148573977 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148574149 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148574242 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148574301 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148574602 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148574830 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148575605 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148575885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148575949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148576098 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148576099 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148576125 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148576186 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148576909 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148576953 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148577397 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148577417 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148577431 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148577495 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148577730 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148577747 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148577756 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148577979 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148577983 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148578023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148578124 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148578140 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148578779 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148578786 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148578792 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148579021 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148579038 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 148579372 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148579402 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148579441 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148579595 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148579712 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148579731 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148580319 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148580528 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148580558 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148580688 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148580822 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148580914 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148580920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148580958 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148581246 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 148581259 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148581268 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148581310 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 148581525 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 148581769 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148581870 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148581891 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148581894 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148581905 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148581934 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148581947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148581952 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148582032 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148582071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148582173 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148582175 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148582230 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148582248 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148582337 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148582396 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148582414 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148582477 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148582482 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148582525 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148582542 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148582615 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148582694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148582714 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148582734 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148582842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148589322 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148589342 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 148589354 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 148589374 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 148589407 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148589834 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148590013 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148590025 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148590042 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148590052 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148590121 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148590129 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148590149 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148590245 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148590258 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148590264 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148590307 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148590341 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148590348 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148590424 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148590460 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148590466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148590575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148590644 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148590684 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148590714 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148590774 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148590801 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148590810 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148590931 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148590961 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148590993 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591099 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148591240 C A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 148591453 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148591476 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148591482 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148591508 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591518 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 148591543 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591551 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591582 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591585 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591620 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591698 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591721 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148591756 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591825 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591855 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 148591900 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591953 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591965 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591991 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148591994 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148592039 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148592048 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148592057 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148592126 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148592192 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148592321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148592341 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 148592397 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148592521 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148592685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148592756 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148592948 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 148592971 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 148593090 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 148593117 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 148593341 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 148593352 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 148593355 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 148593464 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 148593504 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 148593564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148593604 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148593745 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 148593765 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148593845 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148593868 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148594166 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148594170 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 148594184 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148594228 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 148594389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148594429 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148594556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148594572 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148594597 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148594620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148594668 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148594719 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148594790 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148594905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148594963 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148595007 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148595148 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148595219 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 148595328 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148595436 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148595438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148595480 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148595690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148595752 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148596012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148596031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148596227 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148596457 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148596485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148596657 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148597130 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148597890 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 148598191 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148598399 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148598678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148598718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148598786 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148598800 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148598915 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148599210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148599402 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148599424 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148599440 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148599456 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148599524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148599617 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148599652 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 148599668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148600273 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 148600971 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148601747 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 148601941 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148601973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148602372 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148602906 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 148602957 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148603359 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148603360 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148603471 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148603778 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 148603860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148604026 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148604136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148604400 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148604458 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148604593 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148604757 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148604791 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 148604897 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 148604923 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148604974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148605020 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148605065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148605087 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148605278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148605332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148605341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148605760 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148605902 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 148605903 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 148606129 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 148606210 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148606297 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148606318 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148606329 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148606378 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148606394 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 148606520 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148606596 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148606695 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148606870 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148606879 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148607113 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148607395 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148608014 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148608126 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148608460 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148608611 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148608919 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148608934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148608964 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148609057 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148609216 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 148609313 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148609339 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 148609358 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 148609761 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148609776 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148609781 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148609807 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148609972 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148609983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148610036 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148610235 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148610299 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148610625 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 148610642 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 148610825 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148611108 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148611624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148611686 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148611802 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148612270 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148612471 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 148612686 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 148612716 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148612827 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148613199 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 148613554 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148613643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148613776 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 148614096 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148614135 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148614220 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148614308 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148614351 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148614432 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148614493 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148614549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148614558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148614740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148615378 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148615407 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148615496 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148615502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148615605 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148615749 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 148615772 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 148615791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148615828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148615868 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 148615937 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148616033 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 148616034 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 148616127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148616160 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148616163 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 148616182 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 148616269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148616385 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 148616646 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148617133 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148617337 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148617467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148617591 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148617600 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 148617645 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148617648 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148617776 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 148617813 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148618588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148618657 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148618700 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148618753 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148618789 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148618895 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148619114 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148619212 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148619330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148619727 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148619823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148619867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148620131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148620253 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148621273 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 148621599 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 148621846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148621909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148621967 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 148622352 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148622422 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148622538 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148622712 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148622844 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148622848 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148623034 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148623148 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148623172 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148623234 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148623237 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148623325 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148623408 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148623485 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148623499 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148623520 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148623591 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148623698 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148623749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148623755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148623766 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148623794 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148623800 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148623812 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148623836 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148623911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148623993 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148624156 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148624163 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148624259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148624284 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148624296 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148624508 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148624621 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148624668 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148624854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148624922 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148625035 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148625058 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148625134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148625147 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148625160 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148625343 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148625357 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148625418 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 148625474 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148625611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148625657 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148625675 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148625677 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148625992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148626102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148626754 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148626796 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148626964 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148626980 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 148626994 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148627438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148627457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148627487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148627524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148627568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148627588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148628900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148629291 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148629695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148629771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148630295 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 148630440 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148630457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148630489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148630754 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148630945 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148631025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148631552 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148631575 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 148631897 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148632192 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 148632305 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 148632523 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148632745 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 148633114 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148633171 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148633429 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148633757 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148634021 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 148634064 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 148634318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148634354 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148634392 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148634778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148634787 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148634957 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148635079 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148635087 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148635127 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148635153 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148635187 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148635214 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148635235 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148635276 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148635291 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148635482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148635484 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148635531 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 148635569 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 148635642 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148635673 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148635701 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148635731 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148635997 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148636084 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148636190 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148636210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148636238 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148636277 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 148636487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148636572 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148636577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148636756 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148636910 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148637185 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148637290 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 148637583 A T Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 148637848 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148637951 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 148638114 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 148638274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148638580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148638719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148639463 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148639527 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148639930 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148640166 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148640521 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148640626 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148641344 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148641941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148642269 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148642274 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148642920 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148643791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148644334 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148644955 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148645194 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148645277 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148645861 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148645989 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148646373 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148646375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148646403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148646596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148646723 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 148646775 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 148646884 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148647016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148647025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148647051 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148647099 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148647229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148647235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148647285 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148647350 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 148647394 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148647448 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148647449 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148647472 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148647576 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148648158 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148648395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148648421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148648426 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148648535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148648739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148648863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148649287 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148649288 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148649362 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148649408 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 148650652 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148651131 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148651317 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148651531 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148652031 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 148652120 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148652174 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148652203 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148652221 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148652264 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148652306 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148652319 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148652383 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148652520 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148652529 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148652672 A C N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 148652677 C G N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 148652814 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 148652979 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148653197 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148653236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148653348 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148653412 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148653451 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148653463 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148653584 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148653604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148653606 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148653618 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148653756 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148653762 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148653807 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148653814 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148654012 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148654025 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148654232 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148654310 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148654311 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148654332 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148654443 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148654532 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148654705 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148654706 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148654719 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148654753 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148654792 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148655117 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148655289 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148655358 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148655466 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148655519 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148655889 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148656281 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148656288 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148656362 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148656474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148656686 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148656764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148656868 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148656920 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148656964 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 148657040 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148657043 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148657165 C A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 148657323 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 148657336 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 148657359 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 148657411 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 148657430 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 148657603 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148657613 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148657631 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148657639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148657735 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 148657738 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148657769 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148657772 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148657793 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148657820 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148657856 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148657938 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148658046 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148658137 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 148658157 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148658178 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148658191 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148658249 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148658259 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148658302 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148658325 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148658393 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 148658401 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148658475 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148658511 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 148658527 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 148658596 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148658627 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148658640 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148658656 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148658682 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148659142 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 148660453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148660476 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 148662557 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148662955 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148662956 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 148664624 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148664654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148664850 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148664886 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148664995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148665145 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148665689 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 148666003 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148666313 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 148666839 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 148667006 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 148667008 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 148667092 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 148667108 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 148667147 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 148667177 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 148667302 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 148667477 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 148667494 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 148668190 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 148668510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148669455 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148670038 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148670081 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 148670756 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148670763 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148670796 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148670833 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148670864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148670945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148671015 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148671127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148671370 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 148672070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148672581 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 148672899 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148673067 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148673600 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148673695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148674594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148674922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148675496 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148675530 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148678161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148679076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148679710 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 148679925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148679931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148679992 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148680119 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 148681308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148681953 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148681978 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148682163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148685361 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148685675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148686560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148687391 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 148687484 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 148687501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148687648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148687725 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148688467 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 148688602 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 148688624 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 148688763 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 148688801 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148688904 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 148689184 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 148689379 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 148689412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148689583 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 148689584 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 148689610 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 148689720 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 148689806 T G N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 148689819 A C N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 2 148689875 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 148689888 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 148689892 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 148689911 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 148690010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148690086 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 148690712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148691075 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148691089 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148691409 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 148691446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148691497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148691515 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 148691867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148691913 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148691981 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 148692070 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 148692164 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 148692244 T G N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 2 148692258 T G N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 148692268 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 148692269 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 148692286 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 148692441 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 148693074 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 148693135 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148693402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148693447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148693658 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 148693699 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 148693899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148694085 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 148694238 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 148694471 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 148694558 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 148694929 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 148695189 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 148695311 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148695546 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148696004 G C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 148696190 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148696313 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 148696330 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 148697115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148697164 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 148697452 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 148697496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148698372 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 148698421 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 148698443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148698446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148698955 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148699337 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148699444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148699477 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148699484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148700262 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148700702 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148700722 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148700735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148701283 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 148701703 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148702016 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148702034 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 148702321 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 148702641 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 148702657 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 148702676 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 148702703 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 148702771 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 148702797 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 148702838 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 148703074 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 148703226 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148703240 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148703289 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 148703426 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 148703501 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148703517 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 148703547 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 148703637 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 148703688 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 148703746 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 148703937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148703963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148703992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148704142 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 148704207 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 148704257 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148704271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148704638 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148704650 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148704987 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 148705410 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148705596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148705598 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148705732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148705803 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 148705826 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 148705926 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 148706021 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 148706087 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 148706253 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148706256 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148706335 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148706401 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 148706405 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 148706464 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148706488 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148706523 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 148706563 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 148706978 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 148707350 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 148708183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148708415 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148709214 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148709386 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 148709511 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148710061 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148710322 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148710827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148711467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148712038 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148712312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148713108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148713126 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 148713507 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148713779 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148713838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148713964 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148714293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148714662 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148714680 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148714788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148714998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148715016 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 148715394 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 148715569 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 148715741 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 148715933 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148716479 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 148716684 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148716774 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 148716967 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 148717273 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148717287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148717715 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148717765 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 148718667 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148718679 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 148718739 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148718857 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 148719366 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 148719468 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148719554 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148719651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148719747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148720015 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 148720028 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148720072 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148720128 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148720154 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148720260 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148720359 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148720428 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148720449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148720633 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 148720660 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 148721449 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 148721463 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148721471 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148721509 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148721511 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148721670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148721832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148721851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148722389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148722407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148722427 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 148722464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148722596 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 148722612 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 148722720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148722817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148722818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148722847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148723596 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 148723600 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148723710 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148723750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148724134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148724674 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148724702 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148724899 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148725349 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 148725609 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148725951 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 148726032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148726126 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 148726400 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148726666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148726981 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 148727027 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 148727072 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 148727163 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 148727179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148727311 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148727640 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148727740 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148727839 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 148727902 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 148727911 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148728081 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148728252 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148728440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148728470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148728472 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148728754 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148728791 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148728806 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148729038 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148729434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148729843 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148730413 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148730609 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148730867 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148733644 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 148733645 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 148733700 T A N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 148733721 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 148733838 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 148733872 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 148733876 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 148734208 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 148734661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148734720 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148734804 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 148734815 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148734843 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148734906 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148734913 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148734949 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148735033 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148735036 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 2 148735068 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148735150 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148735223 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148735252 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148735323 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148741099 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 148741234 G A Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 148743825 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 148743891 T G N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 148743907 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 148743913 A T N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 148743940 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 148744498 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 148744534 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 148744826 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 148744845 C A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 148744855 A C N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 148744887 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 148749228 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 148749278 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 148749305 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 148749352 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148749365 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 148749543 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148749664 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 148749746 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148749754 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148749774 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 148749778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148749946 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148750125 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148750224 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148750384 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 148750410 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148750783 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148750785 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148750898 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148750943 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148750984 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 148751038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751067 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751068 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751149 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751196 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751211 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148751222 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751252 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751287 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 148751380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148751482 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148751688 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148751700 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148751701 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751717 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751753 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751795 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751867 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148751871 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751887 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148751894 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 148751909 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 148751962 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148752071 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148753308 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 148754388 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 148754772 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148754983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148756958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148757355 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148758757 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148760318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148760328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148761241 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148768442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148770086 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 148770533 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 148771506 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148771778 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148771871 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148774234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148774985 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 148822433 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148823343 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148824838 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148825730 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148826693 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148833037 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148835401 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 148837601 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148837688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148843727 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 148844226 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148844361 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148845086 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148845847 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148846124 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148847078 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148847097 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148847124 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148847125 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148847156 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148847455 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148847461 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148847489 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148847603 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148847663 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148847859 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148847993 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148848037 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148848055 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148848518 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148848569 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148848654 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148848682 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 2 148848950 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148849042 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148849132 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148849360 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148849492 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148849580 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148849623 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148849637 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148849772 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 148850009 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148850020 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148850088 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148850090 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148850343 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148850378 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148850508 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 148850987 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148851017 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148851033 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148851248 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148851404 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 148851477 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148851596 G A Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 148851824 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148851857 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148851863 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 148851873 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148852064 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148852075 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148852536 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148852558 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148852647 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148852658 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148852661 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148852669 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148852690 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148852730 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148852950 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148852951 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148853022 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148853110 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148853289 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148853375 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148853412 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148853473 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148853500 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148853513 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148853646 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148853659 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148853691 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148853740 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148853787 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148853807 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148853860 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148853907 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148854126 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148854192 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148854245 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148854281 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148854500 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148854512 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148854577 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148854584 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148854758 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 148854997 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148855100 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148855112 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148855171 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148855211 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148855343 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148855419 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148855498 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148855508 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148855590 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148855876 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148856019 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148856145 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148856153 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148856219 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148856319 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148856435 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148856439 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148856490 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148856532 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148856559 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148856583 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148856606 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148856626 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148856643 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148856718 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148856761 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148856781 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148856864 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148856956 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148856959 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148856980 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148857152 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148857317 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148857327 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148857385 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 148857450 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 148857469 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148857490 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 148857535 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 148857540 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 148857574 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 148857724 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148857762 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148857884 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148857955 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148858029 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148858188 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148858249 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148858277 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148858278 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 148858307 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148858321 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 148858357 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 148858363 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 148858376 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 148858396 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148858476 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 148858496 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 148858518 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 148858525 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 148858578 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 148858611 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148858845 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 148858867 A C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 148858941 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 148858996 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 2 148859044 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 2 148859068 A C Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 148859070 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 148859112 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 148859347 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 148859497 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148859502 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148859550 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148859613 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148859674 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148859739 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148859819 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148859839 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148859849 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148859889 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148859897 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148859927 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148859951 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148860121 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148860430 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148860507 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 148860593 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 148860641 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148860706 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148860726 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148860824 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148860851 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148860867 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148860939 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148860964 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148861050 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148861184 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148861300 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148861418 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 148861431 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148861452 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148861459 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148861486 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148861546 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148861560 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148861743 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148861753 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148861774 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148861935 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148861982 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148862043 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148862059 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148862075 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148862159 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148862160 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 148862174 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 148862277 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148862345 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148862415 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148862474 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148862512 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148862516 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148862536 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148862634 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148862714 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148862763 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148862910 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148862916 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148862930 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148862936 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148863014 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148863060 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148863098 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148863153 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148863898 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148863977 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 148863989 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 148864006 G T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 148864072 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148864080 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148864086 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148864115 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148864145 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148864164 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148864320 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148864416 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148864420 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148864586 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148864609 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148864643 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148864665 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148864732 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148864734 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148864748 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148864875 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 148864933 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148865032 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148865102 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148865198 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148865222 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148865311 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148865317 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148865380 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148865462 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 148865467 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148865487 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148865529 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148865535 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148865855 G C N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 148865939 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 148866026 A C N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 148866034 G C N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 148866065 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 148866072 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 148866088 A T N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 148867725 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 148867726 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 148867896 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148867961 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148867972 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148867975 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 148868041 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148868075 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 148868295 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148868305 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148868327 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 148868329 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 148868380 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148868522 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148868529 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148868631 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 148868667 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 148868684 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148868718 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 148868821 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148868897 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148868946 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148868952 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148869024 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148869042 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148869064 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148869177 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148869196 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148869259 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 148869265 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 148869298 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 148869314 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 148869474 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148869589 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148869634 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 148869665 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148869802 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148869876 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 148869915 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148869927 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148869989 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148869994 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148870021 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148870040 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148870132 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148870167 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148870250 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148870268 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148870280 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148870445 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148870481 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148870574 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148870603 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148870642 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148870699 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148870701 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148870714 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148870744 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148870750 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148870785 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148870817 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148870873 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148870972 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148870974 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148871024 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148871082 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148871130 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148871281 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148871287 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148871430 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148871443 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148871544 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148871574 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148871612 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148871615 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148871642 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148871649 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148871666 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148871733 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 148871817 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148871842 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 148871858 T G Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 148871968 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148871976 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148872021 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 148872028 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 148872549 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148872609 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 148872610 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 148872726 A T Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 148872733 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148873030 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 148873055 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 148873072 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 148873127 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148873146 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148873160 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148873175 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148873178 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 148873210 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148873222 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148873260 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 148873324 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148873337 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148873364 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148873383 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148873399 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148873450 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148873463 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148873534 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148873579 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148873598 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148873829 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 148873845 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148874117 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148874424 C G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 148874754 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 148874857 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148874887 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148874905 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148874950 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 148875078 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148875206 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148881948 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148882097 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148882186 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148882232 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148882241 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 148882252 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148882277 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148882443 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148882649 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148882661 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148882684 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148882762 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148882779 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148882858 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148882954 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148883029 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148883052 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148883098 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148883172 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 148883224 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148883334 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148883343 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148883392 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148883398 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148883419 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148883426 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 148883444 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148883480 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 148883526 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 148883584 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 148883585 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 148883704 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 148883713 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 148883730 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 148883877 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 148883907 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 148883960 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 148883985 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 148884027 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 148884301 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 148884323 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148884332 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148884503 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148884588 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148884599 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148884652 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148884655 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148884780 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148884920 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148884935 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148884963 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148885027 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148885069 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148885098 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 148885387 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148885398 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148885401 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148885500 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148885533 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148885588 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148885630 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148885658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148885672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148885676 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148885693 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148885702 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148885709 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148885769 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148885834 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148885880 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148885936 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148886032 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148886166 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148886446 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148886800 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148886834 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148886846 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148886946 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148886957 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 148886978 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148887021 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148887178 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148887227 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148887239 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148887339 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148887368 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148887433 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148887487 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148887652 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 148887720 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 148887727 G C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 148887812 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 148887952 C G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 148887979 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 148888155 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148888214 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148888347 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148888427 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148888433 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148888582 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148888608 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148888692 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148888711 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148888735 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148888766 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148888829 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148888877 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148888894 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148888968 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148888969 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148889046 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148889071 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148889102 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148889238 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148889343 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148889393 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148889468 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148889492 C A N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 148889509 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 148889584 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 148889586 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148889707 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148889851 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148889852 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148889965 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148890042 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148890127 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148890166 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148890186 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148890222 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148890373 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148890549 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148890562 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148890605 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148890653 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148890656 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148890719 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 148890869 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148890999 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148891011 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148891029 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148891341 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148891521 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148891550 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148891688 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148891824 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148891853 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148891988 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148892021 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148892132 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148892152 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148892199 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148892292 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148892301 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148892359 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148892383 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148892396 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148892436 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148892478 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148892482 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148892630 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148892641 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148892679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148892787 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148892793 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148892909 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148892932 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148893228 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148893305 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148893450 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148893590 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148893611 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148893663 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148893787 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148893798 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148893843 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 148893866 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148894194 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148894197 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148894208 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148894362 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148894375 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148894391 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 148894392 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148894437 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148894445 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148894479 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148894533 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 148894609 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148894611 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148894726 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148894730 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148894827 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148894876 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148894930 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148894956 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148895110 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148895186 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148895187 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148895408 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148895422 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 148895477 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 148895508 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148895560 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148895575 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 148895599 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148895660 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148895673 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148895823 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 148895848 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 148895969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148895994 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148896095 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148896128 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148896154 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148896170 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148896247 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148896266 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148896267 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148896278 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148896284 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148896330 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148896341 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148896351 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 148896409 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148896494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148896498 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 148896516 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148896540 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148896558 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148896668 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148896689 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 148896732 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148896794 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148896992 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 148897006 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148897017 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148897051 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148897088 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148897104 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148897115 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148897122 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148897165 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 148897205 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148897235 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 148897245 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148897276 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148897368 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148897445 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148897629 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 148897659 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148897687 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148897709 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148897794 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148897801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148897807 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148897831 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148897875 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148897896 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148897923 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148897953 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148897959 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148898012 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148898013 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148898054 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148898145 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148898179 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148898219 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148898288 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148898292 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148898306 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148898475 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148898532 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148898533 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148898619 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148898684 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148898691 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 148898695 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 148898718 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 148898747 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148898780 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 148898845 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 148899011 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 148899027 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 148899188 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 148899216 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148899285 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148899302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148899368 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148899390 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148899441 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148899449 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148899466 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148899652 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148899708 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148899751 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148899790 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148899826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148899923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148899930 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148899994 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148900018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148900041 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148900108 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148900209 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148900252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148900264 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148900281 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148900309 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148900334 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148900373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148900399 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148900534 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148900583 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148900661 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148900672 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148900673 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 148900686 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148900820 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 148900839 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148900912 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148900940 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148900948 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148900976 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148901022 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148901059 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 148901082 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148901117 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148901131 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148901144 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148901152 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148901203 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148901259 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148901266 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148901278 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148901343 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148901473 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148901513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148901530 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148901592 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148901631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148901682 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148901722 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 148901751 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 148901884 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148901903 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148901991 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148902010 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148902056 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148902175 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148902197 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148902202 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 148902214 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148902258 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148902262 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148902276 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148902304 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148902314 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 148902358 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 148902391 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148902398 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148902451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148902510 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148902575 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148902639 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148902655 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148902660 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148902676 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148902726 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148902735 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 148902744 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 148902790 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148902815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148902832 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148902852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148902860 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148902990 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148903012 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 148903098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148903158 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148903205 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148903212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148903217 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148903251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148903364 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148903417 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148903451 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148903541 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148903552 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148903594 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148903635 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148903640 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148903690 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148903718 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148903758 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148903808 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148903821 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 148903822 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148903860 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148903942 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148904020 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 148904025 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148904035 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 148904076 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 148904082 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148904127 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 148904163 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 148904208 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148904213 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148904223 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148904320 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148904358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148904386 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148904444 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148904491 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 148904552 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148904593 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148904605 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148904748 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148904974 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148904975 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 148905015 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148905090 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148905145 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 148905156 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148905200 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148905256 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148905406 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148905445 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148905507 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148905509 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148905554 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148905572 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148905818 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 148905891 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148905976 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148906005 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148906176 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148906259 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 148906286 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 148906504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148906539 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148906672 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148906730 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148906887 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 148907062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148907082 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148907101 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148907231 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148907370 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148907646 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 148907794 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148907798 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 148907835 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 148907893 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 148907899 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148907948 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148908044 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148908045 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148908173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148908234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148908372 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148908500 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148908573 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148908617 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148908838 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148908932 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148909104 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148909228 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148909458 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148909547 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148909552 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148909578 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 148909819 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148909991 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148910036 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148910112 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 148910164 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 148910174 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 148910199 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148910249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148910526 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148910534 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148910574 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148910633 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 148910713 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 148910836 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148911203 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 148911276 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148911368 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148911632 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 148911663 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 148911694 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 148911695 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 148911708 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148911721 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 148911803 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148911979 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148911984 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 148912235 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 148912280 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 2 148912335 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 148912342 A C Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 148912362 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 2 148912467 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 148912644 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 2 148912645 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 148913593 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148913609 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148913626 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148914133 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 148914147 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 148914152 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 20 20 2 16 2 2 148914783 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148914878 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 2 148914882 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148915137 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 148915466 T A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 148915480 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 148915491 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148915492 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 148915503 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 148915514 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 148915537 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 148915590 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148915823 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 148915868 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148915995 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148916000 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148916033 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 148916039 G T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 148916182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148916507 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148916547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148916580 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148916599 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148916970 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 148916999 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148917010 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148917174 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 148917217 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148917234 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 2 148917323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148917511 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 148917515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148917697 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148918257 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148918353 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148918410 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148918417 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148918425 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148918457 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148918462 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148918509 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148918519 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148918552 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148918571 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148918578 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 148918680 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 148918895 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148919138 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148919184 T G Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 148919187 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 148919254 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148919397 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 148919643 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 148919671 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148920046 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 148920191 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148920245 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 148920290 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 148920330 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 148920446 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148920552 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 148920680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148920756 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148920794 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 148920842 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148921083 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148921113 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 148921151 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148921202 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 148921411 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148921592 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148921618 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 148921627 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148921673 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148921758 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148921780 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148921847 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148921852 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 148921859 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 148921872 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148921915 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148922050 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 148922278 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 148922309 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148922438 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 148922539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148922647 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 148922730 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 148922911 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148922941 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148922942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148923339 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148923417 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 148923578 T G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 148923585 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 148923596 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 148923625 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148923641 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 148924009 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148924056 T G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 148924128 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148924209 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148924224 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148924238 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 148924349 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 148924567 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 148924581 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 148924617 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 148924648 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 148924720 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148925560 C A N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 148925649 A C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 148925719 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148925732 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148925869 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148925894 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 148925956 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148925982 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148925994 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148926044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148926137 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 148926213 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 148926538 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 148926650 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148926689 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 148927140 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 148927287 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148927409 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148927480 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 148927515 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148927662 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 148927714 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148927732 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 148927877 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 148927992 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148928150 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 148928192 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148928204 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148928239 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148928297 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148928377 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 148928505 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 148928542 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148928613 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148928615 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 148928708 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148928766 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148928901 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 148928927 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148928994 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 148929227 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 148929375 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148929495 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148929496 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148929555 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148929561 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148929623 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 148929803 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 148929877 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148929900 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 148929924 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148930114 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 148930287 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 148930598 T A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 148930656 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148930691 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148930752 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 148930753 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148930829 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 148930867 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 148930913 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 148930919 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148930968 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148930984 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148930985 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148930998 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 148931310 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.230769230769231 20 6 10 0 3 2 148931374 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 148931438 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148931503 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 148931562 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 148931588 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 148931611 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148931783 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148931891 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 148932018 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148932086 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148932515 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 148932521 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148932585 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 148932691 A C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 148932908 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148933060 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 148933219 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 148933238 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148933355 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148933404 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 148933561 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 148933576 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148933612 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 148933664 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148933734 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 148933773 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148933805 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 148933907 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148933952 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148933993 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148933999 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 148934091 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 148934752 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148936344 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 148938905 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 148941286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148941371 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 148941672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148942547 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 148943428 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 148945081 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 148945535 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148945541 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148945893 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148946575 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 148947679 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148947717 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148947832 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148947880 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148947888 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148948044 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 148948064 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148948084 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148948105 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148948195 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148948245 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148948248 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148948340 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 148948371 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148948376 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148948873 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148948913 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 148948990 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 148949190 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148949988 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148949995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148954968 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 148954990 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 148955007 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148955009 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148955329 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148955379 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148955451 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 148955477 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148955546 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148955549 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148955573 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148955583 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148955696 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148955709 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148955715 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148955729 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148956927 G A Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 148962843 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148963118 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148963205 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148964271 A T Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 148964309 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 148964321 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 148964339 T G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 148964582 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148964625 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148964646 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148965483 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148965484 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148965515 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 148965516 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148966986 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148967168 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148967203 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148967230 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 148967260 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148967273 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 148967278 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148967284 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148967528 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 148967554 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 148967819 A T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 148967844 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 148968061 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 148968605 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 148968607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 148968703 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148968769 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148968777 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148968813 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148968828 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148969003 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148969059 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 148969061 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148969165 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148969361 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148969372 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 148969376 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148969789 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148969791 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148969807 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148969810 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148969960 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148970164 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148970181 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148970219 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148970241 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148970249 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148970255 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148970270 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148970278 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148970342 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 148970345 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 148970543 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 148970646 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148970649 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 148970976 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148971106 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 148971123 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148971169 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 148971487 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148971491 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148971577 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148971593 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148971914 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 148972244 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148972628 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148972717 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 148972807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 148972823 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 148972840 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148972849 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148972917 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148973030 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 148978029 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 148978045 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 148978285 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 148978479 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 148979358 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 148979373 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 148979429 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 148980284 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 148980298 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 148981818 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 2 148982651 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 2 148985299 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 148991650 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 148991915 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 148992025 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 148992048 A C N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 148992565 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 148993654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149002277 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 149003949 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 149007334 C G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 149010581 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 149017083 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 149017111 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 149017167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149017187 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 149017322 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 149017435 G C N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 2 149017458 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149017708 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149017740 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 149017765 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149017791 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 149017818 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149017873 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 149017918 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149017964 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149017984 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149018046 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 149018391 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 149018618 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149018639 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149019569 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 149019681 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 149019726 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 149019735 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 149019808 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149020072 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 149020204 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 149020266 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149020283 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 149020337 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 149020354 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 149020366 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149020582 G C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 2 149020708 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 149020772 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 149020778 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 149020819 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 149020846 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 149020855 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 149020933 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149021097 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 149021151 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149021153 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 149021349 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 149021380 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149021402 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 149021449 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 149021469 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149021597 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149021633 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 149021728 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 149021739 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 149021770 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 149021855 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 149021875 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 149021894 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149021896 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 149022057 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 149022140 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 149022340 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 149022342 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 149022515 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 149022633 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 149022899 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 149023230 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 149023513 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 149023542 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149023548 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 149023563 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149023650 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 149023663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149023721 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 149023751 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 149023854 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 149024018 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149024162 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 149024216 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149024429 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 149024504 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 149024508 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149024521 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149024655 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149024689 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 149024722 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 149025558 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 149025566 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 149025611 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 149025721 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 149025727 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149025922 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149026003 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149026041 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149026063 A C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 149026133 T G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 149026224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149026254 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149026375 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 149026512 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149026844 G C Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 149027151 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149027301 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149027800 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149028068 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 149028412 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149029116 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 149029246 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 149029265 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 149029287 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149029314 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149029589 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149029675 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149029809 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 2 149030156 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149030157 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149030195 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 149030220 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 149030238 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 149030243 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 149030276 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 149030394 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149030598 A T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 149030633 A T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 149030666 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 2 149030800 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 149030807 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 149030831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149031000 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149031118 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149031134 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149031162 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 149031217 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 149031239 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 149031249 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 149031270 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 149032007 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 149032134 A C Y N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 2 149033091 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149033113 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 2 149033693 G C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 149033696 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 149034137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149034261 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149034339 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149034408 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 149034647 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 149036226 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149036512 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 149036606 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149037094 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149037101 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 149037528 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 149037759 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 149038482 A T Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 149039385 G C Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 149039425 T G Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 149039586 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 149039996 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 149040370 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 149040622 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 149040791 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 149041077 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149041107 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 149041305 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149041352 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 149041563 G C Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149041604 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 149041934 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 149042012 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 149042302 A T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 149042420 A T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 2 149042491 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149042770 A T N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 149042784 G T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 149042800 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 149042883 G C N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 149042995 A T N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 2 149043464 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 149043547 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 149043679 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149043763 T G N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 2 149043790 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 149043891 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 149044017 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149044039 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 149045172 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 149045651 G C N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 149046093 A C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 149046329 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149046571 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 149046596 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 149046670 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149046926 G C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 149047018 C T N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 2 149047227 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149047626 T A N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 2 149047926 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149047976 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 149048144 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149048239 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 149048916 A C Y N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 2 149048930 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149049152 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149049357 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 149049402 G T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149049658 A C N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 149049798 A G N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 2 149049864 T G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 149049975 T A N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 2 149050767 A G N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149050803 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 149050967 A C N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 149051157 T G N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 149051394 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 149051455 T G N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149051589 C G N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 149051855 C T Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 149051943 C G Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 149051990 C T N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149052004 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 149052026 C T Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149052051 T G Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149052085 T G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 149052094 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 149052108 A C N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 149052165 A G Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149052171 G T Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149052196 G A Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149052198 G A Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149052208 G A Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149052256 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 149052523 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 149055859 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 149056165 C T Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 2 149058069 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 2 149059642 G C Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 149059897 G A Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 149060003 T C Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149060118 T A N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 149060175 C T Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149060186 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 149060239 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 149060259 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 149060266 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 149060351 C T Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149060496 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 149060510 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 149060511 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 149060526 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 149060734 G T Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149060846 G A Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149060977 A G Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149061021 G C N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 149061023 A T Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 149061039 C T Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 149061054 A C N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149061223 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 149061251 T A Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 149062194 G T Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149062291 C T Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 149062393 A G Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149062398 A G Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149062412 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 149062552 A C Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 149063405 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 149063406 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 149063453 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149063486 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149065253 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 149065261 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 149065740 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 149065823 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149065890 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149065905 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149065915 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149065952 A C Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149065959 G C N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149066084 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149066085 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149066151 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149066193 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149066203 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149066393 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 149066566 G A N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149066827 A G Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 149066910 A G Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 149066959 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149067032 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149067047 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149067048 G C Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149067087 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149067092 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 149067136 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149067194 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149067496 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149067526 G A N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 2 149067558 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149067752 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149067813 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 149067838 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149067915 G T Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 149067922 T A Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 149067933 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 149067950 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 149067990 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 149068033 A G Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 149068046 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 149068052 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 149068386 A C Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149068395 A C N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 149068406 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149068431 C A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 149068465 G C Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 149068585 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 149068592 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 149068627 A T Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149068681 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 149068721 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149068734 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149068746 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149068818 G T Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 149069131 G T Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 149069201 T A N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 149069437 G C Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149069445 A T Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149069450 T A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149069715 T G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149069919 A T Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149069947 G A Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 149070187 G T Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149070196 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149070295 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 149070426 G T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149070468 C G Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 149070481 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149070494 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 149070515 C G Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 149071165 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149071206 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 149071255 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149071475 G T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149071496 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149071519 G T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149071633 T A Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149071750 A C N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149071823 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149072012 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149072016 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149072122 C G N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149072582 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 149072808 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 149072838 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149072892 T G Y N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 2 149072920 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149073045 G A Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149073080 C T Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 149073109 G A Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 149073341 A T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 149073344 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 149073378 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149073426 T G Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149073449 G T Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 149073581 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149073795 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149073866 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149073994 A T Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 149074927 A G N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 149075043 G A Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149075113 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149075154 A T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 149075164 A C Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149075192 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 149075207 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149075229 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149075235 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 149075381 A C Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149075497 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 149075591 T G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149075677 C T Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149075708 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 149075759 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 149075855 C A N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 2 149076179 C G N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 149076185 G A N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 2 149076267 T G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149076367 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149076374 T C N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149076381 T C Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 149076387 C T Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 149076442 A G Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 149076502 T G Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149076532 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149077177 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149077191 C A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149077220 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149077230 G A Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 149077408 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149077430 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149077438 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149077442 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149077454 A T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149077458 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149077526 A G Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 149077538 T C Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 149077791 A T Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 149077843 T G Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 149078356 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149078413 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 149078422 T G N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 149078425 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149078461 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 149078496 T C N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 2 149078516 G A Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 149078684 G T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 2 149078701 C A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149078714 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149078727 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149078729 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149078759 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149078972 C A Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 149079025 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149079191 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149079200 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149079222 G C N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 149079245 A T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149079257 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149079327 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149079384 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 149079438 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149079455 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149079462 A T N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 149079470 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149079658 C G Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149079662 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149080049 G T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149080167 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149080185 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149080284 C G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149080288 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149080463 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 149080473 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149080476 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149080738 A T Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 149081109 C A N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 149081128 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 149081414 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149081466 T A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149081469 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 2 149081490 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149081622 G A Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149081650 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149081660 T A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149081699 C G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149081728 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149081825 A T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149081829 C G Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149081936 A T N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 149082006 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149082164 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 149082408 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 149082430 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149082437 A G Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149082456 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149082629 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149082645 G T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149082673 T G Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 149082771 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149082778 C G Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149082937 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 149082968 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149082989 T A Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083052 T C Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083056 G C Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083072 T G Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083077 A G Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083233 A C Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 149083241 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 149083245 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 149083291 C A Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 149083530 C T Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083546 C T Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083590 C T N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083607 G T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083615 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 149083630 T A N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083638 T C Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083658 A G Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 149083659 T C Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083694 A G N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083704 G C Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 149083746 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 149083761 T G Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149083791 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149083807 A C Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 149083821 C G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149083833 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149083870 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 149084012 T A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149084049 A G Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149084220 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149084238 T G Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149084253 A T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149084273 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149084500 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149084512 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149084515 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149084524 A C Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149084651 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149084669 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149084677 C G Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149084719 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 149084720 C T Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 149084803 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 149084814 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149084822 A C Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149084825 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149085387 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149085661 C A Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 149085689 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149085708 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149085768 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149085793 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149086315 C A N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 149086950 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149086973 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 149087670 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149087681 C A Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 149087813 T C Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 2 149087858 C T Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 2 149088041 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149088058 T G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149088082 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149088087 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149088094 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149088101 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149088120 C A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149088333 A T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149088339 T C Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 2 149088985 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 149090215 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 149091142 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 149092163 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149092826 C T Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 149092827 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 149092869 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 149093943 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149102708 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 149102754 A T Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 149102775 A C Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 149103079 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 149103662 G T Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 149103686 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149104919 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149105332 A C N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 2 149105844 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 149106075 T G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149106225 A T Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 149106292 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149106308 C G Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 149106759 T C Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 149106765 T A Y N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 149108307 G A Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 149108336 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 2 149108572 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 149110875 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 149110909 C A N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 149118763 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 149119560 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149120104 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149125690 C T Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 2 149126279 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 149127434 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 149127979 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149133832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149135619 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149136020 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149137132 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149138854 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 149139091 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 149141174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149153978 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 149154644 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 149154653 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 149154662 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 149155239 C T Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 149156391 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 149156792 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 149157168 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 149158506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149163070 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149164520 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149164588 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149165040 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149165864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149166177 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149166555 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149166981 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149167194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149167265 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 149167629 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149167695 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149168018 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149168475 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149168526 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149174605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149174644 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149176223 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149176707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149177144 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149178226 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149179924 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149181470 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 149183453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149184063 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 149184881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149185718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149185747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149186144 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149188641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149188918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149189017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149189088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149191646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149193703 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149194670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149198092 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149200061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149200900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149201588 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149203338 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 149203892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149204005 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149204129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149204239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149205709 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149205924 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 149208021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149208229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149208246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149208641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149208808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149210444 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149211479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149211666 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 149212174 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149213530 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 149219337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149220843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149221162 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149221415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149222456 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149223017 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 149223949 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149223987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149226133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149227530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149229419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149229729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149231586 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 149233310 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 149233869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149237652 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 149238252 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149238330 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 149241855 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149247042 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149247914 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149247947 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149249083 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149249313 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149249350 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149249370 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149249691 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 149249755 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149249786 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149249883 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149250067 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149250316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149250421 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149250583 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149250609 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149250649 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149250989 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149251140 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 149251449 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 149253911 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149257285 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149257808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149258143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149262732 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 149263146 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149263498 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149267476 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149267696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149268461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149268905 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 149270666 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 149270692 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149270722 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149270984 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 149271077 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 149271152 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 149271179 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 149271275 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149271348 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149271417 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 149271495 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 149271530 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 149271555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149271855 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149271896 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149272187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149272215 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149272296 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149272358 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149272409 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 149272418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149272497 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 149272688 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149272776 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149273618 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 149273750 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 149273785 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149273792 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 149274019 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 149274201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149274887 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149275006 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 149275027 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 149275298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149275328 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149275547 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149275833 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149275859 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149275867 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149275879 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149275956 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149275995 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149276132 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149276585 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149276658 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149276673 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149276991 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149277010 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149277051 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 149277251 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149277273 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149277340 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149277678 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 149277766 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149277839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149278853 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149278929 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149279267 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149284717 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 149286408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149287794 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 149288426 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149290042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149290714 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 149290864 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 149293112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149294057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149294203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149294269 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 149295267 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149295916 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149297174 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149298355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149299887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149300459 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149300619 C A N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 2 149302752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149302779 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149302795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149303242 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 149304394 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149304966 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149306440 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149306755 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149307117 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 149308242 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149308244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149308312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149308899 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 149309118 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149317011 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149317879 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149318574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149321139 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149321414 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149322135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149323165 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149324093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149324338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149326415 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 149327239 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149328860 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 149329279 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 149329535 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149333430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149333882 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149337241 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149337553 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149337591 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149337595 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149337618 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149337666 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149337745 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149337862 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149337870 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149337884 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 149337915 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 149338186 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 149338663 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149339038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149339207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149339260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149339296 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149345575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149345862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149345879 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 149345953 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 149348817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149348876 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149348894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149348910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149348924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149348941 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 149348976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149349116 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149349277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149349412 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149349430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149349581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149349593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149349599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149349728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149349806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149349895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149350004 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 149350039 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 149350082 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 149350125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149350176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149350187 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149350191 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149350222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149350264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149350310 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149350489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149350509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149350590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149350754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149350763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149350785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149350802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149350807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149350863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149351105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149351193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149351276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149351359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149351385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149351402 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149351467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149351479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149351507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149351514 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149351529 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149351544 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149351582 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 149351586 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 149351727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149351873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149351899 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149352547 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149352585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149353589 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149353791 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 149353880 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149354058 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149354062 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149354228 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149354942 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149355954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149355956 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 149356026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149357708 T C Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 149357932 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149358228 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149358406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149358540 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 149359556 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 149359949 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 149360161 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 149360279 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149360448 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 149360732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149360809 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149361197 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 149361325 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149361560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149361586 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 149361739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149362546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149363060 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 149363564 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149363969 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149365125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149365146 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149366119 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 149367117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149368348 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149368571 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149369579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149369708 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 149369866 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 149370285 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 149370541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149370847 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149371008 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149371072 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 149371092 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 149371812 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 149372842 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 149372954 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 149373250 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 149373260 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 149373676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149374883 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149375017 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149375149 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 149376249 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 149380729 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149381362 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149381460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149384418 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149385142 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 149385393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149386112 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149386694 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149386765 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 149386766 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 149387119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149387642 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149387724 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149391437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149391461 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149391535 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149392833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149394215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149398211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149398665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149398690 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 149399854 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149400245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149401113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149401613 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149401902 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149402236 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149402517 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 149403427 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149404344 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 149404448 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 149404912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149405008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149405444 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 149405723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149406021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149406221 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 149406369 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 149406571 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 149406747 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149406857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149407023 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 149407351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149407535 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149407551 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 149407686 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 149407885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149408309 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 149408544 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149408660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149408820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149409238 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 149409395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149409424 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149409643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149409814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149409884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149411152 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149411429 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 149413528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149413668 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149413724 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149413780 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149413839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149413970 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149414028 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149414052 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149414070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149414080 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149414133 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149421421 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149421422 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149421618 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 149421683 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 149421838 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149421903 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149421914 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149422083 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149422159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149422250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149422456 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149422508 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149422517 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149422542 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149422562 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149422597 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149422754 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 149422770 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 149422915 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 149423160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149423247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149423384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149423399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149423571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149423711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149423894 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149424203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149424365 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149424370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149424544 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149424717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149424751 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149424858 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149424894 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149425068 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149425094 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149425333 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149425762 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 149425790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149425956 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149426057 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149426094 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149426105 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149426110 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 149426476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149426478 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 149426614 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149426830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149426862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149426880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149426884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149426895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149427095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149427155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149427422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149427503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149427564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149427677 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149427679 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149427718 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149427721 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 149427893 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149428174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149428235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149428282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149428384 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149428416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149428428 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149428432 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149428469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149428587 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149428682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149428753 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149428961 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 149429182 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149429401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149429411 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149429449 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149429451 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429480 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149429569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429696 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429807 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149429953 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149429996 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149430008 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149430052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149430055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149430070 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149430088 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 149430378 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149430424 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149430454 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149430463 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149430498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149430569 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149430570 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 149430598 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149430629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149430665 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149430749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149430755 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 149430814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149430817 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149430994 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 149431038 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149431060 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 149431089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149431118 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 149431126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149431188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149431398 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149431414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149431569 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 149431895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149431971 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 149432021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149432207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149432269 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149432285 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 149432294 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149432348 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 149432356 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 149432451 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149432481 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149432484 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149432517 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 149432785 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 149432887 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 149432979 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 149433024 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149433035 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149433048 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149433824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149433911 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 149433926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149433961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149434430 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149434606 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149434656 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 149434760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149435577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149435688 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 149435765 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 149435836 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149436697 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 149436761 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 149436800 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149436844 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149436869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149437069 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149437228 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 149437295 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149437467 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 149437705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149437715 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 149437839 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 149437849 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149437850 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 149437896 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 149438053 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 149438098 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 149438243 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 149438320 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149438390 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 149438539 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149438810 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 149438854 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 149439045 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149439097 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 149439098 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 149439305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149439419 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 149439460 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 149439546 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 149439645 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 149439785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149440017 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 149440082 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 149441016 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 149441211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149441372 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 149441571 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 149441605 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 149441722 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 149441816 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 149441934 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 149441935 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 149442214 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149442647 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 149442660 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 149442667 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 149442674 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 149442701 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149442714 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 149442721 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 149442848 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 149442865 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 149442866 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 149442951 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 149443175 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 149443319 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 149443327 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 149443397 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 149443643 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 149443773 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149443801 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149443997 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149444072 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 149444134 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 149444220 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149444260 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 149444265 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 149444278 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 149444308 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 149444331 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 149444332 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 149444377 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149444438 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 149444454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149444471 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 149444490 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149444501 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149444528 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 149444538 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 149444567 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149444598 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149444609 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149444653 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149444777 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149444977 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149445020 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149445077 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149445305 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 149445371 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149445491 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149445560 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149445565 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149445657 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 149445725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149445800 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149446025 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 149446050 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 149446060 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 149446130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149446346 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149446402 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149446434 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149446444 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149446450 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149446485 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149446560 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149446898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149446901 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149446936 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149447094 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149447139 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 149447205 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 149447269 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 149447295 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 149447342 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 149447353 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 149447472 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 149447476 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 149447886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149448560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149450345 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149450351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149450721 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 149450725 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149450853 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149450856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149450869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149450996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149451234 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149451291 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149451598 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149451755 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 149451922 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149452128 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149452181 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 149452321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149452750 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 149452758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149452764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149452828 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 149452857 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 149452884 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149452965 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149453106 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149453122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149453145 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149453165 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149453178 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149453195 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149453212 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149453283 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149453307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149453324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149453694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149453868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149453922 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149454081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149454122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149454144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149454232 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149454253 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 149454498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149454511 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149454610 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149454749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149454750 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149454803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149454804 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149454959 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149454988 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149455013 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455062 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455065 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455096 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455275 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 149455333 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455338 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455353 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455393 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455396 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455423 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455429 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455438 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455448 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455515 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455615 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455633 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149455714 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 149455765 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 149455808 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 149455844 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 149455850 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 149455864 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 149455882 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 149455884 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 149455915 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 149456131 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 149456172 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 149456247 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 149456313 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 149456441 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 149456537 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 149456595 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149456662 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149456759 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 149456850 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149456867 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 149456929 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149456965 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149457608 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149457614 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149457648 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 149457658 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 149457666 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 149457778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149457883 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 149457915 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 149457928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149458020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149458046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149458172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149458191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149458246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149458296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149458356 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149458513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149458756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149458819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149458864 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149458910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149458931 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 149458971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149459053 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 149459213 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 149459246 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 149459283 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 149459353 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 149459361 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 149459529 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 149459798 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149459866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149459867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149459976 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149460926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149461041 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 149461094 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 149461418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149461476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149461484 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 149461541 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149461679 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149461729 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 149461844 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149462017 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149462213 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149462315 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149462420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149462615 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 149462674 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 149462758 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 149462816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149462874 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149463275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149464363 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 149465091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149465609 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149465936 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 149466217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149466243 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 149466482 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 149466958 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 149467431 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149467764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149467786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149467884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149468024 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 149468567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149468960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149469175 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149470416 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 149470490 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 149470593 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 149471054 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 149471804 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 149472923 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 149473182 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 149473428 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 149474494 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 149474534 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149474657 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 149475160 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 149475607 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 149475904 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 149477100 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 149477355 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 149477395 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 149477398 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 149477454 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 149478598 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149478817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149479384 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 149479419 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 149479436 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 149479465 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149479596 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 149479660 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 149479677 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 149479814 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 149479824 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 149479899 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149479979 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 149480111 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 149480169 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149480316 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 149480423 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 149480491 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 149480643 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149480785 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 149480809 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 149480849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149480858 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 149480869 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 149480929 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149481035 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149481419 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149481443 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149482926 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149483004 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 149483127 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 149483199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149483415 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 149483442 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 149483632 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149483880 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149483911 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 149483912 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 149484031 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 149484065 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 149484455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149484531 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 149484765 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 149484766 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 149484888 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 149485128 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 149485135 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 149485227 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 149485949 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 149486006 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 149486189 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 149486248 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149486304 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 149486431 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 149486522 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 149486811 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 149487024 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 149487887 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149487981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149488548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149488597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149489944 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 149489953 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149490061 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 149490202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149490509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149490812 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 149490952 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149490981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149491038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149491170 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149491984 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 149492323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149492402 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149492493 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149492891 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 149493580 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 149493612 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 149494066 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149494487 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149494522 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149494651 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149494652 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149494694 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149494718 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149494719 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149494773 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 149494868 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 149494929 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149495106 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 149495242 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 149495353 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 149495403 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 149495610 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 149495768 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149495808 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149496222 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149496241 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149496314 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 149496347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149496576 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 149496668 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 149496912 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149497262 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 149497280 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 149497357 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 149497384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149497637 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 149497662 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 149498035 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 149498351 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 149498449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149498496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149498555 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149498828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149498851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149499368 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 149499484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149499582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149499714 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149499806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149499813 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149499832 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149500300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149500370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149500646 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 149500746 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 149500795 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149500823 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 149500952 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 149501283 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 149501324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149501716 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 149502633 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 149502736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149502950 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 149503189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149503308 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 149503410 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 149503664 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 149503725 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 149503777 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 149503781 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 149503922 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149503933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149503990 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149504150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149504253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149504339 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149504399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149504450 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149504490 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 149504584 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149504819 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 149504890 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149505058 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 149505069 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 149505098 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 149505123 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 149505223 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 149505311 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 149505397 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 149505471 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 149505498 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 149505844 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149507082 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 149507085 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 149507136 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149507377 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 149507384 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 149509025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149509079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149509647 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149517503 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149520496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149524546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149524620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149526799 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 149527417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149528815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149530013 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149530243 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149530783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149530823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149530991 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149531756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149531866 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 149531884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149532061 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 149532359 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149533144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149533432 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 149533505 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149533908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149534497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149534539 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149534557 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149534568 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149534585 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149534622 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149534639 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149534687 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149535206 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 149535466 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149535906 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149536161 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149536824 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 149538360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149538848 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149540957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149542552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149542643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149543330 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149543686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149543818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149544084 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 149544273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149544329 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149544420 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 149544424 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 149544443 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149544529 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149544572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149544612 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149544672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149544711 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149544740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149544896 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 149544973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149544992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149545031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149545036 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149545050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149545074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149545081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149545098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149545435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149545911 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 149546556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149546590 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 149546595 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 149546644 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 149546773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149546841 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 149546951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149547002 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 149547080 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 149547085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149547098 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 149547124 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 149547179 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 149547262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149547383 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 149547462 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 149547488 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 149547547 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 149547617 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149547657 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149548035 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 149548101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149548113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149548401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149548543 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149548854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149549162 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149549209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149549593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149549642 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 149549668 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 149549907 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 149550267 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 149550342 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149550392 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149550733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149551028 C T N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 2 149551433 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 149551552 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 149551594 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 149551675 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149551823 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 149552142 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149552269 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 149552353 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 149552354 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 149552651 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149552669 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149553282 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149553877 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149554278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149554307 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149554315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149555656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149556267 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149556563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149558557 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149560863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149561210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149561384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149561575 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 149565597 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149566072 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 149566154 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 149566322 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 149566431 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 149566933 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149567074 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149567567 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149567686 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 149567964 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 149568082 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 149568748 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149568770 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 149570475 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149570650 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149571144 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 149571196 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 149571246 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 149571295 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 149571298 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 149571807 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 149571912 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 149572269 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 149572274 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 149572308 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 149572321 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 149572341 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 149572456 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149572509 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149572555 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 149572598 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149572599 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149572714 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149572742 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 149572940 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149572979 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 149573368 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 149573402 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 149573429 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149573577 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 149573591 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149573603 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149573628 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 149573834 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149574294 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149574846 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149574932 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149575337 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 149575832 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 149576871 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149576925 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149577000 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149577017 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149577044 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149577197 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149577214 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149577219 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149577522 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149577550 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149577678 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 149577689 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149577692 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 149577732 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149577759 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149577776 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149577787 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149577912 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149577930 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149578184 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 149578309 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 149578328 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 149578391 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 149578425 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149578609 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 149578647 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 149578658 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149578663 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149578676 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149578731 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 149578870 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149578890 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149579023 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149579045 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149579125 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149579261 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149579288 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149579341 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149579519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149579749 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 149579902 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149580016 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 149580859 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149581234 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 149581456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149581492 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149581786 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149581847 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149581958 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 149582093 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 149583188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149583880 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149584569 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149586389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149586701 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149587003 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 149587325 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149588173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149588223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149588419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149589825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149590170 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149592189 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149592935 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149593183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149594182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149595594 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 149596556 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149597212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149597561 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149597715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149597770 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149597917 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149598450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149598514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149599011 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149599782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149601299 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149601614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149601905 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149603389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149603629 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149603827 T G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 149604350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149604829 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149604842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149604879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149604881 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149605424 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149605577 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 149605681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149605741 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 149606608 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149606646 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149607405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149607489 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149609048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149609496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149611588 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149612051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149615616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149616214 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149618217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149618312 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149620349 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 149620676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149620860 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149620970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149621649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149621816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149621918 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149622050 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 149622091 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 149622156 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 149622212 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149622244 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 149622358 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 149622656 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149622941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149623585 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149623798 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149624244 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149624252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149624784 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149624785 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149624879 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149624882 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149624954 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149624999 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 149625023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149625066 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 149625110 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 149625137 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 149625177 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 149625186 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 149625211 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 149625283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149625330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149625371 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 149625404 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 149625469 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 149625490 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 149625498 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 149625501 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 149625616 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 149625692 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149625701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149625823 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149625836 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149625986 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149626100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149626206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149626339 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 149626712 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149626795 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 149627028 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 149627175 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149627254 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149627291 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149627514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149627647 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 149628115 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 149628386 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149628639 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 149628689 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149628700 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 149628795 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 149628871 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 149628973 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 149629020 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149629491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149629616 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 149629951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149629961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149630297 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 149630346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149630466 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 149631044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149631048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149631071 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149631239 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149631470 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149631521 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 149631914 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149631978 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 149632039 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 149632138 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 149632700 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 149633354 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 149633433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149633582 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149633610 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149633762 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 149633765 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 149633803 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 149633809 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 149633841 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 149633851 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149633872 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 149633961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149634112 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149634154 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149634303 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 149634847 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 149634908 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149635335 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149635672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149636192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149636294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149636538 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 149636566 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 149636636 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149636706 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 149636898 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 149636989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149637019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149637330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149639328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149639487 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149639940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149640640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149641014 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 149641112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149641230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149641296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149641645 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 149642641 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 149642650 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 149642733 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 149642744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149642853 A C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 149643067 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 149643154 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 149643155 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 149643302 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 149643832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149649309 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 149649662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149649741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149650647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149650979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149651280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149651542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149651684 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 149651787 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 149651990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149652172 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 149652233 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 149652458 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 149652529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149652681 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 149652781 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 149652792 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 149652795 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 149652892 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 149653143 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 149653192 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 149653200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149653203 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 149653276 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 149653341 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 149653406 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 149653771 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 149653775 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 149654585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149654600 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 149654606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149654655 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 149655878 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 149655925 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149656123 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149656293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149656719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149657619 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149658046 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 149658848 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 149659147 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 149659366 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149660468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149660543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149660889 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149661409 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149661595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149661882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149661930 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 149662105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149662144 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 149662165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149662235 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149662541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149662916 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149663131 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 2 149663996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149664084 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149664355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149664640 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149664681 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149665014 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149665152 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 149665810 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149665833 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149665838 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 149666072 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149666175 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 149666254 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 149666296 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149666410 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149666568 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149666693 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 149667204 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 149667296 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149667612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149667811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149667868 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 149668069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149668460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149668803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149668804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149669106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149670418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149670941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149670957 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149671208 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149671600 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 149671863 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149672011 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149672314 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149672878 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 149673541 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149674200 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149674292 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149674534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149674582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149674947 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 149675078 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 149676548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149677114 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149677599 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149679836 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149680518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149680965 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 149681022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149681032 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149681900 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149684050 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149688286 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149689320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149690022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149690528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149690663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149690977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149691043 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149691753 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 149692125 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 149693450 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149693666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149693670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149693777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149694869 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149695376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149695412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149695788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149697479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149699699 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 149701548 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 149701809 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 149702048 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149702196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149702978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149703079 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 149703904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149705720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149706720 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149707647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149709738 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149710219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149711488 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149712695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149712977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149713801 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 149714085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149714493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149716543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149716944 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 149716952 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 149716958 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 149717012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149717146 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149717264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149717357 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 149718011 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 149718183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149718239 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 149718707 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 149718855 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 149718937 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 149718963 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 149719052 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 149719437 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149719477 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 149719607 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 149719718 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 149719795 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 149720211 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149721349 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 149721389 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 149721476 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 149722536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149725690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149726369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149726580 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149726866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149728859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149729212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149729627 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149729880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149730689 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149730742 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149730799 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149730943 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 149730974 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 149731000 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 149731172 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 149731186 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 149731192 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149731318 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 149731436 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 149731854 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 149732171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149732425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149732502 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 149732519 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149732532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149732629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149732720 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149732930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149733189 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149733221 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 149733243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149733276 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 149733367 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 149733528 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 149733542 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 149733637 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149733806 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 149734041 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 149734051 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 149734072 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 149734116 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 149734162 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 149734237 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 149734299 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149734332 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 149734377 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 149734670 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 149734750 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 149734810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149734982 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149736211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149736547 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149738680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149741138 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 149741932 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 149742629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149744238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149744409 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 149744661 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 149744809 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 149744932 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 149745778 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149745821 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149745969 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 149746281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149746501 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149746590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149749012 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 149749100 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 149749199 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 149749726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149749946 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 149749976 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 149750242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149750454 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 149750471 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 149750486 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 149750507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149750553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149751904 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 149751915 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 149752144 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 149752508 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 149752548 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 149752649 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 149752742 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 149752785 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 149752789 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149752803 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149752866 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 149752948 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 149753033 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149753229 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 149753337 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 149753339 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 149753370 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 149753399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149753437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149753445 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 149753525 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149753618 G C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 149753619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149753637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149753673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149754089 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149754277 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 149754370 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149754464 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 149754776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149755713 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 149755856 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149755869 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 149755907 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 149755914 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 149756012 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 149758595 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 149759859 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149760105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149760348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149760439 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 149760836 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149760923 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149761006 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149761102 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149761542 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149764707 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149765217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149765417 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 149765482 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 149765546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149766055 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149766358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149767249 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 149767547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149767688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149767749 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 149768015 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149768017 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 149768483 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 149768721 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 149768971 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149769243 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 149769269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149769328 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 149769376 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149769438 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 149769712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149769912 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 149770111 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 149770625 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 149770673 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 149770753 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 149771075 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 149771574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149771696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149771946 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 149772000 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 149772171 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 149772405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149772499 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 149772617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149772775 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 149772863 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 149772921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149772968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149773144 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 149773173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149773200 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 149773280 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 149773315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149773348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149773412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149773510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149773548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149773549 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149773892 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 149774479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149774570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149774609 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149774802 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149774931 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149774972 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149775073 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149775407 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149775656 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 149775982 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149776447 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 149776467 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 149777167 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 149777661 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 149777737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149778021 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 149778215 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 149778241 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 149778685 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149779573 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 149779614 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 149779836 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 149780142 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 149780218 T C N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 149780476 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 149780484 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 149780800 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 149780818 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 149780905 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149780952 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 149781141 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 149781177 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149781194 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149783940 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149784383 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 149784439 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149784908 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 149784909 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 149785021 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149785029 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149785035 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149785041 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 149785132 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149785167 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149785348 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 149785453 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149785477 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149786121 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 149786472 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149786495 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 149786518 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 149786829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149787095 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149787201 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149787657 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149788177 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 149788554 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 149788555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149788874 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 149789485 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 149789541 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 149789750 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 149790044 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 149790682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149792525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149793023 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 149793203 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 149793255 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 149793831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149796074 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149796836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149797105 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 149798366 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149800370 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149802074 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149803947 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149804250 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149804749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149807323 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149807593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149807846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149808270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149808308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149808318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149808369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149808511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149808640 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 149809040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149815031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149815099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149815223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149816977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149819577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149821942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149822288 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149823009 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 149823231 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 149823248 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 149823358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149823384 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 149823983 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 149824546 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 149824956 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 149824967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149824982 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149824984 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149825235 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149825399 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149825470 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 149825743 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 149825945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149826175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149826186 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 149826517 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 149826724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149826829 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 149826931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149828316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149828828 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149830158 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149830935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149831118 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 149831454 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 149832172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149832987 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149833019 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149835725 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 149835874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149837618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149837629 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149837644 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149837658 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149838131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149838759 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149838967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149839653 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149839886 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149842007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149842078 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 149844251 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149844351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149844924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149846972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149852358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149854765 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 149854887 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 149856089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149858375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149859630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149860099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149860164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149860265 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 149860527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149862532 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 149862557 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 2 149862576 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 149863061 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 149863376 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 149863381 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 149863495 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 149863496 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 149863744 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 149863760 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 149863821 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149864467 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 149864497 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149864631 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 149864719 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 149864891 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 149864913 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 149865026 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 149865120 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 149865263 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149865424 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 149865650 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 149865666 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 149865674 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 149865738 A T Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 149865747 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 149865798 T G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 149865824 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 149865829 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149865868 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 149865922 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 149865999 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 149866089 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 149866418 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 149866583 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149866881 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149866912 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 149867033 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149867376 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 149867530 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 149867555 G T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 149867616 C A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 149867915 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 149867922 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 149868041 C G Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 149868074 C A Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 149868257 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 149868312 A C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 149868313 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 149868349 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 149868395 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 149868406 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 149868450 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 149868592 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 149868593 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 149868615 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 149868653 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 2 149868783 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 149868809 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 149868829 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 149868887 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149868897 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 149868916 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 149869286 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149869481 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 149870179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149870776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149872111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149874790 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 149875608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149875750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149877034 G T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 149877191 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149879211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149880848 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149883263 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 149884026 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 149884284 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 149885856 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149886237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149886250 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 149886399 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 149886549 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 149886616 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 149886779 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 149886780 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 149886966 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 149886998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149887153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149887716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149887766 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 149888322 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 149888347 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 149888366 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149888667 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 149888829 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 149888958 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 149888960 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 149889155 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 149889206 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149889508 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 149889693 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 149890149 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 149890696 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 149890698 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 149890711 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 149890734 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 149890756 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 149890896 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 149891221 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 149891244 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 149891286 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 149891517 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 149891566 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 149891743 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 149891791 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 149891973 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 149892108 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 149908811 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149909902 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149910781 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149911240 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149912920 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149913000 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149916605 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149916655 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149916693 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149916728 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 149916878 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 149916980 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149917011 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149917119 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 149917149 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 149917225 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149917235 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 149917263 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 149917371 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 149917631 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 149917655 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 149917808 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 149918144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149918187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149918262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149918370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149918415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149918428 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149918474 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 149918517 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 149918554 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 149918787 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 149918978 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149919121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149919154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149919159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149919316 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149919359 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149919392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149919502 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149919515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149919579 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149919958 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149920155 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149920303 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149920386 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149920518 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 149921023 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149921313 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 149921568 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 149921594 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 149921633 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 149921712 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 149921717 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 149921768 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 149921775 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149921782 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 149922059 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 149922107 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 149922678 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 2 149922684 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 149922705 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 149923019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149923195 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 149923203 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 149923265 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 149923357 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 149923450 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 149923493 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149923590 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149924834 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 149927426 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149930636 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 149930983 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149931474 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 149931561 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149931562 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 149931583 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 149931616 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149931687 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 149931787 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 149931843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149931918 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149932070 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 149932624 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 149932880 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149932942 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 149933036 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 149933291 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149933294 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149933327 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 149933998 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 149934130 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149934162 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149934181 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149934432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149934616 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 149934742 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 149934755 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 149934771 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 149934804 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 149934951 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 149935019 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 149935042 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 149935096 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 149935154 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 149935164 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 149935250 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 149935268 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 149935289 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 149935550 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149935782 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149935799 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 149935803 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 149935818 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149935885 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149935923 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 149935999 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 149936060 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 149936063 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 149936104 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 149936108 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 149939016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149939229 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149939249 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149939373 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149939927 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 149939956 A T Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 149939966 T A Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 149941549 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149943636 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 149944256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149946455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149947312 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 149947331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149947490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149947515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149947594 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 149947619 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 149947692 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 149947915 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149947985 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 149948755 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 149948810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149949290 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149950034 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149951071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149951365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149952210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149952750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149952936 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149953793 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149953890 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149954342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149954362 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149954988 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149955452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149955713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149956185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149956200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149956688 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 149956719 C G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 149956830 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 149957097 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 149957302 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 149957419 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 149957459 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 149957590 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 149957604 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 149958047 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 149958103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149958377 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149958386 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149958419 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149959500 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 149959547 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 149959614 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149959806 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 149959843 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 149959977 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 149959984 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 149960090 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 149960155 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 149960353 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 149960713 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 149960770 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 149960968 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 149961003 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 2 149961110 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149961243 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 149961314 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 149961336 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 149961370 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 2 149961420 G T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 149961508 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 2 149961509 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 149961599 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149961629 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 149961643 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 149961672 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 149961689 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149961703 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 149961704 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149961742 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149962009 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149962147 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149962525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149962588 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149962727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149962922 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 149962925 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 149963191 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149963414 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 149963507 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 2 149963571 T A N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 149963621 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 149963646 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 149964028 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 149964032 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 149965426 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149965473 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149967198 T G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 149967532 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 149968934 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 149969165 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 149969172 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 149969696 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 149972742 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 149973627 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 149975986 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 149976183 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 149978218 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149979548 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149982474 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149984199 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 149985469 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 149985561 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 149985580 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 149985615 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149985761 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 149985762 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 149985834 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149985950 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 149986003 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149986277 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 149986332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149986410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149986480 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 149986582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149986630 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149986675 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 149986729 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 149986777 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 149987135 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 149987189 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 149987190 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149987215 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149987353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149987403 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 149987464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149987480 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 149987529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149987638 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 149987659 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 149987668 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 149987767 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149987910 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 149988000 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149988221 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 149988249 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 149988251 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 149988336 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 149988368 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 149988482 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 149988488 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 149988694 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 149988899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149988940 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149988954 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 149988991 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 149988992 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 149989065 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 149989092 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 149989180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149989265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149989342 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149989345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149989505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149989826 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 149989840 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149989854 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 149990090 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149990170 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149990191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149990287 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149990375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149990459 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149990616 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 149990795 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149990832 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149990851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149990852 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149991055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149991157 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 149991250 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149991266 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 149991314 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 149991433 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 149991691 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 149992085 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 149992232 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 149992747 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 149993044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149993188 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 149993228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149993243 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149993253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149993281 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 149993293 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 149993300 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 149993341 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149993388 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 149993402 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 149993529 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149993636 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149993733 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149993973 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 149994057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 149994235 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149994439 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149994473 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149994596 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149994597 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149994646 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 149994709 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149994721 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149994734 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 149994785 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 149995024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149995057 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 149995062 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 149995147 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 149995160 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 149995183 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 149995644 A C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 149995695 A G Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 149995773 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 149995776 T G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 149995826 G C Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 149995850 C T Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 149995873 T C Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 149995906 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 149995949 A G Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 149996085 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 149996104 T A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 149997381 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149997918 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 149997922 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 149998109 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 149998152 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 149998396 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 149998639 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 149998708 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 149998913 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149999018 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149999047 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 149999160 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149999243 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149999264 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 149999349 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 149999464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 149999495 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149999666 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 149999701 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149999762 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 149999817 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 149999948 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 150000011 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 150000024 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 150000035 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 2 150000084 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 150000108 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150000162 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150000240 G C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 150000295 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150000315 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 150000412 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 2 150000602 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 150000762 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 150000766 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150000777 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150000836 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150000963 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 150000989 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 150001071 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150001129 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150001195 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 150001276 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 150001932 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150001941 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150002022 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150002174 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150002188 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150002460 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 150002474 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 150002595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150002674 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 150002991 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 150003029 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150003439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150003489 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150005790 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150005793 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150006431 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150006462 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 150007271 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 150007520 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 150008451 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 150009706 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150009821 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150009993 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150010125 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 150010512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150010591 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150011262 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150012059 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 150012704 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150013452 T G Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 2 150014674 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150014777 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 150015169 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 150015316 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 150015574 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150015575 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 150016105 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150017986 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 150018141 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150018207 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150020420 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 150020486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150022302 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150022486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150024370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150024887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150025585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150026103 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150026106 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 150026620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150027069 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150027958 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150028296 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 150029513 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150029525 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 150029794 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 150029990 C A N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 2 150030206 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150031303 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 150032269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150032879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150033419 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150035956 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 150036924 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 2 150037104 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150037235 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150037242 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 150037449 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150037722 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 150038030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150038121 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150038124 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 150038244 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150039018 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 150041426 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 150042536 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 150042542 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 2 150042558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150042692 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 150044175 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 150044828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150044910 G A Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 2 150045118 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 150045205 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 150045375 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 150045450 G C Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 150045452 G C Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 150045467 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150046753 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150048190 A G Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 150049556 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 150049559 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150050003 A G Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 150050055 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 150050091 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 150050095 A G Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 150050348 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150051600 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 150051602 A C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 150052785 G A Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 150052857 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 150053177 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150053202 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 150053361 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 150054585 C T Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 150054586 T G Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 150054608 T A Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 150054692 T A Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 150054702 G T Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 150054711 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 2 150055026 C G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150055047 G C Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 150055114 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 150055257 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 150055354 T C Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 150055987 C T Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 2 150056082 A C Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 150056369 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 150056500 A G Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 150057406 T A Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 150057740 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 150057816 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150058062 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 150058099 G A Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 150058144 A G Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 150058159 T C Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 2 150058257 T A Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 150058272 T G Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 150058344 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 150058404 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150058539 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 150058563 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 150058648 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 150058655 A C Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 2 150058681 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 2 150058728 A C Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 150058764 C A Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 2 150058769 T G Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 2 150059565 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 150060212 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 2 150060724 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 150060733 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 150060736 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150061101 T A Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 150061232 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150061716 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150061799 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 150062322 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150063210 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 150063419 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150063427 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 150064103 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 150065959 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 150067167 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 150067209 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 150068033 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 150068351 C G Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 150068352 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 150068471 A C Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 150068497 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 150068544 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 150068545 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 150068569 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 150068694 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 150068925 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 150069082 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 150069494 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 150069583 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 150069666 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 150070336 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 150070360 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150070469 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 150070487 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 150070645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150070646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150071243 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 150071301 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 150071325 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 150071362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150071385 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 150071444 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 150071600 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 150073123 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 150073217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150073807 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 150073859 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150074139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150074475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150074525 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 150074539 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 150075102 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 150075189 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 150075210 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 150075283 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150075556 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 150075794 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 150076196 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 150076387 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 150079171 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 2 150079683 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 150081164 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 150081386 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 150082031 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 150082256 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150082507 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 150082797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150082866 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 150083030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150083297 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150085054 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150085708 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 150085780 G A Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 2 150086024 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150086448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150086750 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150086914 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150086975 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 150087175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150088442 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150088641 G T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 150088918 T A N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 150089093 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150089223 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 150092288 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 150092344 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 150093420 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150093585 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 150095372 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150095389 A G Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 150095630 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150095837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150097303 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 150097366 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150097450 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150097558 A C Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 2 150098561 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150098593 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150098645 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 150098890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150099508 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150099788 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 150099818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150100069 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150100073 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150100308 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150100789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150103035 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150103481 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 150103768 C A Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 150104103 G T Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 150104412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150104487 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150104885 C A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150105143 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150105416 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 150106428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150107401 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 150107568 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 150107569 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 150107718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150108162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150108897 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150108903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150109016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150109370 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 150109524 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150109590 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150109706 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150110355 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 150111086 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 150111276 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150111689 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150111723 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 150111725 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 150112167 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 150112256 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150112265 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 150112308 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150112448 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150112449 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150113198 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150113412 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150113413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150113797 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150113913 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150114094 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 2 150114095 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150114302 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150114309 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150114484 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150114592 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 150114759 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150114766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150115140 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150115176 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150115218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150115279 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150115323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150115354 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 150115526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150115651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150115685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150116054 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150116168 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150116406 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150117134 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150117454 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150117603 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 150119242 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150119518 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150119844 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 150119860 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 150119879 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150119884 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150119933 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150120157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150120249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150120512 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 150120666 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 150120714 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150120720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150121012 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150121634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150121858 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150121908 G C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 150122019 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 150122210 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 2 150122274 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 150122416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150122456 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150122527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150122564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150122569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150122798 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150122835 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 150122839 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150122874 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150122965 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150127115 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150127326 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 150127947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150127979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150128028 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150128144 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150128167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150128477 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 150128480 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 150128534 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150128570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150128733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150129285 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150129360 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150129737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150129796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150130019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150130020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150130157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150130225 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150130254 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 150130392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150130505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150130579 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150130620 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 150130743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150130888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150130889 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150131190 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150131289 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150131541 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150131563 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 150131629 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 150131680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150131817 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 150131822 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 150131854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150132208 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 150132380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150132422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150132488 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150132890 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 150133260 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 150133312 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 150133322 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 150133395 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150133441 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 150133523 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 150133564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150133638 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 150133666 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 150133742 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 150134063 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 150134067 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150134095 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 150134185 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 150134584 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 150134689 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 150134703 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 150134781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150134817 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 150134955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150135051 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 150135070 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 150135113 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150135155 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 150135462 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 150135645 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 150135646 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 150135724 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150135738 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 150136022 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150136069 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 150136098 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150136114 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 150136123 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150136252 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 150136312 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 150136367 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150136513 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150136677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150136745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150136908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150136970 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150136978 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150137136 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150137197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150137354 C G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 150137359 T A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 2 150138095 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 150138169 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150138225 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 150138231 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 150138248 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 150138269 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150138281 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150138309 C A Y N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 150138438 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 150139226 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 150139240 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 150139371 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150139455 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150139512 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 150139827 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 150139847 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 150140018 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 150140098 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 150140143 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 150140913 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150141243 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150141748 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 150142014 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 150142295 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 150142505 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 150142506 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 150142562 A G Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 150142593 T A Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 150142709 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 150142739 G C Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 150142769 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 150142773 T G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 150142785 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 150142972 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150143070 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 150143601 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 150143638 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 150143677 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 150143892 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 150143896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150143945 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 150143956 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 150144015 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 150144022 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 150144027 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 150144067 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 150144102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150144247 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 150144357 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 150144425 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 150144438 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 150144534 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 150144548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150144831 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 150145107 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 150145171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150145445 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 150145463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150145508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150145521 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150145929 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150146176 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 150146262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150146609 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150146617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150146714 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150146811 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150146816 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150146825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150146940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150146965 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150147051 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 150147499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150147541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150147564 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150147589 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 150147792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150147793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150147918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150148000 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150148117 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 150148309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150148344 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 150148418 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 150148424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150148431 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 150148507 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 150148699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150148812 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 150148888 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150148985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150149127 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 150149237 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 150149420 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 150149464 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 150149523 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 150149699 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 150149769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150149785 A C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 150149833 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 150149839 C G Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 150149850 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 150150263 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 150150297 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150150617 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 150150958 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 150151130 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150152581 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 150152839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150152871 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 150152960 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150155143 C A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 150155197 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 150155840 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 150156380 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150156574 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 150156651 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 150156759 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 150156810 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 150156921 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 150156931 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 150156952 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 150157057 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 150157058 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 150157083 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 150157109 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 150157595 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 150157639 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 150157642 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 150157844 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 150157899 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 150158057 T A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150158064 G A Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 150158121 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 2 150158409 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 150158458 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150159006 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 150159588 C A Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 150159725 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 150160569 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 150161700 C G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150161884 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150162058 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150162166 C G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150162224 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150162250 C T Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 150162493 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 150162576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150162894 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150163158 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 150163252 C T Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 150163253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150163313 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150163322 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150163457 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150163535 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150163592 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150163612 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 150164795 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150164817 G C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150164821 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150165259 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150165437 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150165665 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150165695 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150165821 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150165849 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150165995 G T N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 150166135 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 150166152 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150166189 G A Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 150166243 C T N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 150166245 G T N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 2 150166266 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 150166297 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 150166365 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150166572 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150166860 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150167010 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150167026 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150167027 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150168915 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 150169442 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 150169590 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 150170230 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 150170456 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 150170842 G C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 150171035 T G Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 150171719 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150172343 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 150172346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150172389 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 150172394 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 150172407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150172436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150172500 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150172608 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 150172758 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 150172765 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 150172787 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 150172832 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 150173070 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 2 150173113 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 150173234 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 150173239 C T Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 150173504 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 150173568 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150173991 A G Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 2 150174277 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 2 150174292 A T Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 2 150174392 A T Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 150174405 T C Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 150174450 C T Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 2 150174569 G C Y N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 150174625 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150175154 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 150175218 C T Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 150175565 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 150175646 G C Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 150175743 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 150175821 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 150175877 G A Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 150175891 G T Y N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 150176058 A C Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 150176160 A C Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 150176195 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 2 150176324 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 150176406 C T Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 150176675 C G Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 150177315 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 150177356 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150177534 C G Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 150177548 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 150177604 C G Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 150179206 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 150179346 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 150179421 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 150179557 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 150179593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150179911 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 150182334 G T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150182340 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150182666 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150182685 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 150182712 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 150183587 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150184561 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150184619 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 150184659 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150186685 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150187303 G T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 150187331 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150187343 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150187364 T C Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 150187450 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150187609 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150187659 T G Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 150188427 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150188428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150188690 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150188716 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150189091 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 150189196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150189243 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150189255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150189261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150189281 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150189377 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150189438 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150189655 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150189664 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150189692 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150189756 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 150189828 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150189836 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150189873 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150190053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150190060 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150190199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150190218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150190291 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150190362 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 150190518 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 150190552 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 150190619 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150190837 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150191024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150191205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150191401 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150191455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150191593 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150191622 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150191660 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150191816 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150191967 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150192008 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150192358 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 150192359 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 150192438 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150192449 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150192835 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150192867 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150192906 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150192931 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150193080 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150193111 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150193186 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150193263 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150193362 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150193397 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150193468 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150193957 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 150194087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150194140 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150194198 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 150194644 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150194717 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150194814 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150194838 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150194930 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150195022 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150195041 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150195064 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150195132 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150195333 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150195555 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150195728 G T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 150195799 A C Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 150195809 T A Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 150195990 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 150196019 T A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150196086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150196241 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150196303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150196364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150196371 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150196382 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150196393 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150196394 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150196445 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150196551 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150196583 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150196723 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150196733 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150197015 C G Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 150197047 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 150197062 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150197100 C A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 150197114 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150197276 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150197379 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150197392 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150197423 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150197446 T A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150197487 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150197515 G T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150197579 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150197771 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150197936 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150197964 G C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150198046 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 150198105 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150198190 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150198217 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 150198265 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150198286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150198324 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150198332 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150198367 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150198403 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150198456 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150198539 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 150198570 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 150198641 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150198884 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150198918 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150198956 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150199017 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 150200384 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 150200430 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150200687 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 150200691 C T Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 150200704 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150200770 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150200782 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 150200956 C G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 150201704 T G Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 150201766 G C Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 150201769 A G Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 150201837 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 150201888 G A Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 150202014 C A Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 150202087 T G Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 150202126 T G Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 150202177 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 150202294 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150202333 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150202350 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150202444 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150202542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150202646 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150202751 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150202795 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150202854 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 150203171 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 150203360 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 150203363 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 150203388 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150203454 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 150203523 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150203681 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150203840 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150203857 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150203893 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150204224 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150204388 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150204447 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150204504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150204958 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150205048 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 150205226 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 150205230 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 150205275 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150205276 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 150205305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150205390 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150205550 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150205666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150205685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150205866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150205968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150205975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150206001 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150206250 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150206383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150206398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150206404 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150206418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150206531 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150206596 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150206645 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150207047 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150207130 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150207214 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150207259 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150207337 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150207490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150207547 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150207602 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150207628 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150207796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150207901 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150207927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150208053 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 150211999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150212077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150212090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150212249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150212375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150212486 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150212798 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150212803 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150212825 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 150212851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150213009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150213075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150213208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150213492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150213549 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150213594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150213662 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150213692 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150213713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150213843 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150214012 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150214039 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150214079 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150214116 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150214156 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150214207 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150214433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150214446 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150214548 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150214661 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150214696 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150214697 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150214720 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150214723 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150214745 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150214788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150214790 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150214824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150214876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150214887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150214924 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150214933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150214943 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150215011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150215046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150215113 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150215205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150215271 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150215373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150215492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150215572 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150215862 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150216036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150216049 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150216137 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150216718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150216761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150216814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150216932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150217179 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150217515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150217700 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150217951 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150218569 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150218700 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150218750 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150218760 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150218791 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150218878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150219111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150219148 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150219318 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150219410 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150219425 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150219431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150219447 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150219551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150219600 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150219944 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150220690 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150220750 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 150220902 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150221482 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 150221660 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150221734 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150221855 G T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 150222093 A T Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 2 150222180 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 150222531 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150222665 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150222806 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150222870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150222953 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150222954 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150222967 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150223022 T G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150223033 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150223142 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 150223153 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 150223200 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150223280 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150223282 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150223323 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150223337 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150223340 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150223424 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150223511 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150223565 A T Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 150223662 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150223741 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150223744 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 150223793 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150223823 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150223986 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 150224221 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 150224828 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 150224891 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150224914 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 150224916 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 150224937 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150224986 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150225042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150225383 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150225389 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150225541 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150225707 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150225798 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150225869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150225933 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150225948 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150225975 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150225979 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150226020 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150226087 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150226105 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 150226234 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150226280 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150226314 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150226355 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150226367 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150226460 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150226681 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150226708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150226714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150226865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150226866 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150227019 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150227388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150227821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150227867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150227924 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 150228221 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150228302 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150228307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150228337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150228483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150228581 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150228621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150228926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150228936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150229247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150229977 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150229981 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150230032 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150230035 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150230101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150230123 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150230137 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150230175 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150230786 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 2 150231249 T C Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 150232228 A T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 150232413 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150232549 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150232556 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 150232768 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 150232779 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 150232797 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 150232818 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150232919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150233417 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150233534 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150233712 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 150234014 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 150235126 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150235244 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 150235840 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 150236054 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150236063 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150236077 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150236098 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150236809 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150237087 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150237295 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150237348 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150237429 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150237548 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 150237636 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 150237818 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150237854 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150237974 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150238007 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150238013 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150238125 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150238177 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150238410 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150238414 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 150245032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150245109 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 150245219 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 150245279 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 150246714 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 150246732 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 150246748 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 150246760 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 150246771 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 150247023 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150247036 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 150247837 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150249051 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150253581 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150253629 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150253689 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150256395 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150257167 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150262262 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150263862 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150263966 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 150264108 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 150264117 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 150265271 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 150265299 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150265313 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 150273390 T G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 150273588 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150273637 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 150273687 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 150273724 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150273744 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 150274021 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150276354 G T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 150277078 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 150277181 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 150277200 A G Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 2 150277467 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150277761 G A Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 150277776 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150277777 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 150278361 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150278500 A C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 150278773 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150278815 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 150280000 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150281205 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 2 150281263 C T Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 2 150281384 T C Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0 0.909090909090909 0.0909090909090909 10 12 0 10 1 2 150281480 G A Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 150281695 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 150281766 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 150282532 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 150282538 G A Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 2 150282559 T A Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 2 150282605 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 150282690 T C Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 150282779 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 2 150282802 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 150282868 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150282915 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150283176 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150283436 G A Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 150283566 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150283640 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 150283705 T C Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 150283750 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150284689 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150284691 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150284743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150284830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150285062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150285192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150285695 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 150285773 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 150285788 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 150285933 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 150285934 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 150285986 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150286030 T A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 150286032 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 150286090 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150286285 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150286476 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150286587 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 150286607 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150286615 G T Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 150286619 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 150286752 C T Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 150286753 T G Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 150287738 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150287783 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150287853 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150288022 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 150288549 T C Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 2 150288859 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 150288896 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150289016 T G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 150289232 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150289632 A T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150289653 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 150289694 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150289728 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150289764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150289923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150290027 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150290031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150290174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150290271 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150290294 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 150290465 G C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 150290466 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150290484 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 150290636 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150290719 T C Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 150290731 A G Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 2 150290754 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 150291429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150291707 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 150291843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150291939 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150292035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150292078 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150292089 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150292364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150292408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150292567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150292617 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150292666 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150292679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150292752 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150292755 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150292833 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150292863 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150292874 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150292926 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150292970 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150293053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150293274 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150293838 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 150294950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150294987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150295261 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150295385 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150295396 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150295726 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150295761 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150295767 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150295822 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150295856 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150295874 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150295908 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150295951 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150295986 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150296114 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150296215 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150296225 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150296377 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150296837 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 150297111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150297119 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150297577 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150297591 A T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 150297973 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 150298321 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 150298341 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150298447 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150298503 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 150298842 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150299504 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150300055 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 150300056 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 2 150300100 C G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 150300270 A C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 150301096 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 150301104 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 150301317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150301506 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 150301510 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 150301555 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 150301562 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150301613 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150301706 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 150301839 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150302607 T A Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 150302618 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 150303380 T C Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 150303384 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 150303393 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 150303411 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 150303457 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150303607 C A Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 150304007 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150304188 A T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 150304400 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150304401 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150304812 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150304974 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 150305214 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 150305727 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150305879 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150305881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150306044 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150306128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150306333 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150306444 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150306620 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150306943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150307010 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 150307776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150307866 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 150308324 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 150308378 C A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 150308983 G C Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 150308988 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 150310987 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150311398 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150311547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150311685 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150311692 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150311732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150311777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150311887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150311944 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150312109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150312280 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150312552 T G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 150312679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150312789 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150312810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150312827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150312849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150313168 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150313336 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150313341 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150313354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150313388 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 150313434 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150313519 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150313601 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 150313653 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150313717 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 150313753 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 150313791 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150313827 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150314023 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 150314098 C G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 150314099 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150314309 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 150314368 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150314396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150314474 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150314677 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 150314763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150314794 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 150314812 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 150314870 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 150315137 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150315276 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 150315281 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150315500 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150315506 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150315572 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150315573 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150315640 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150315739 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 150316138 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150316209 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 150316371 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 150316454 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150316840 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150316907 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 150317143 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150317304 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150317376 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150317395 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150317396 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150317575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150317583 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150317620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150317686 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150317688 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150318475 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150318807 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150318941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150318970 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 150319154 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 150319248 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 150319392 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 150319393 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150319515 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 150319563 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 150319662 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 150319838 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 150319845 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 150319859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150319894 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150319903 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 150319935 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150320035 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150320202 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150320209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150320231 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 150320261 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 150320302 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 150320309 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150320695 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 150321004 C T Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 150321614 C A Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 150321618 G T Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 150321824 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 150321863 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 150323380 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 150323394 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 150323396 G T Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 150327802 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 150328051 G T N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 150328303 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 150328426 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 150328441 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150328470 G T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 150328472 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 150328684 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 150328827 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 150328868 G A Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 150328922 C T Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 150328923 C T Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 150334961 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 150335051 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 150335114 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150335186 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150335270 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150335273 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150335283 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150335290 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150335308 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150335312 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150335507 T A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150335510 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150335602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150335674 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150335707 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150335710 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150335762 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150335818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150335830 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150335985 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150336012 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 150336043 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150336045 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150336359 G C Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 150336488 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 150336528 G C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150336586 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 150336676 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 150336725 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 150336822 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 150336855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150336871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150336896 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150337257 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 150337436 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150337476 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150337491 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150337502 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150337568 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 150337716 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 150337719 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 150337731 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 150337847 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 150337884 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 2 150337917 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150337950 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 150337951 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 150338094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150338120 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150338223 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 150338279 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150338329 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150338341 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150338377 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150338435 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150338588 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150338595 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150338616 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150338718 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150338772 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150338787 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150338828 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150338980 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150339084 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150339187 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150339209 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 150339309 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150339336 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150339366 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150339466 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 150339497 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150339555 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 150339622 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150339647 G T Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 150339832 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 150339942 G C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 150340088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150340093 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150340501 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150340518 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150340577 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150340587 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150340661 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150340723 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150340876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150340889 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150341071 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 150341135 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 150341290 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 150341302 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 150341336 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150341530 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150342521 T C N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 150342751 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150346694 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 150351218 G A Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 150373471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150373473 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150373572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150373787 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150373985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150373993 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150374007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150374102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150374213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150374238 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 150374420 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150374439 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150374505 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150374535 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 150375043 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150375269 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150375832 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150375893 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150379197 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 150379422 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150379456 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150379647 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 150383449 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150383481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150383570 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150383605 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150383660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150383695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150383698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150383728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150383739 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150383802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150383819 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150383830 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150383855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150383966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150384011 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 150384051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150384058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150384307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150384332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150384788 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150385012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150385448 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150385524 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150385546 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150385671 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 150385791 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150385934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150385978 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150386005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150386118 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 150386136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150386219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150386814 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150386837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150386859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150386883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150386919 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150386979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150387078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150387098 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150387186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150387337 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150387366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150387498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150387590 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150387655 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 150387731 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 150387856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150388312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150388326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150388662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150388816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150388915 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150389146 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150389174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150389214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150389375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150389456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150389523 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150389583 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150389867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150389943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150390155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150390303 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150390546 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150390661 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150390827 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 150391453 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150391704 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150391797 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150391809 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150391860 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150391887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150391954 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 150392024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150392070 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150392174 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150392176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150392193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150392235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150392253 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150392264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150392270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150392361 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150392469 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150392481 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150392889 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150392983 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150393128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150393216 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150393327 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150393335 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150393391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150393521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150393675 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150393709 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 150393712 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150394565 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150394566 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150394616 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150394624 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150394676 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150394840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150395032 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150395098 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 150395179 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150395217 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 150395273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150395347 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150395450 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150395529 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150395654 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 150395662 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 150395771 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150395781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150395820 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150395888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150395956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150396558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150396641 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150397012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150397339 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150397349 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150398103 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150398278 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150398378 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150398650 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150399376 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150399424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150399587 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150399705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150399721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150399727 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150399754 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150399840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150399857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150399865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150399900 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150399902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150399942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150399979 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150400076 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150400146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150400292 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150400456 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150400463 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150400936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150400940 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150400963 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150401132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150401638 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150401688 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150401709 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150401896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150402393 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 150402394 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150402614 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150403053 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 150403070 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150403164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150403795 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150403927 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 150403948 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 150404057 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150404098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150404513 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 150404897 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150405299 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150405307 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150405790 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150406040 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150406126 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150406432 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150406534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150407024 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 150407035 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150407191 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 150407237 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 150407249 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150407263 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150407501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150407573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150407844 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150408021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150409368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150409491 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150410264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150410847 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150411259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150413032 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150413203 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150413389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150413534 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150413622 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150413717 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150413723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150413817 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150413858 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150413861 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150413934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150413974 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150414057 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150414089 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150415030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150415275 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 150415738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150416435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150416490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150416599 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150416819 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150416838 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150417273 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150417867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150417874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150417896 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150417966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150418199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150419314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150419533 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150419980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150420217 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150420322 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150420392 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150420470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150421185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150421471 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150423393 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 150423598 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150424041 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150424113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150424314 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150424369 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150424685 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150424705 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150425259 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 150425829 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 150426078 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150426165 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150426695 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 150427084 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150427230 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 150427250 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 150427282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150427304 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 150427550 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 150427606 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 150427629 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150427758 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150427830 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150427859 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150427911 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150427977 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150427989 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150428149 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150428216 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150428234 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150428555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150428601 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150428667 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150428770 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150429032 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150429042 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150429201 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150429955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150430180 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150430696 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150430863 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 150430956 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150430986 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 150431023 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150431394 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150431615 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150431657 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150431947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150432656 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 150433700 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150434246 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150434448 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150434764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150435055 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 150435112 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150435179 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150435197 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150435219 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 150435402 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150435444 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150435490 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150435501 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150435565 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150435696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150435771 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150435799 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150435825 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150435889 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150436519 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 150436621 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 150436698 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150436712 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150436838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150436929 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150436984 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 150437055 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 150437326 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150437362 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150437376 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150437434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150437471 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150437505 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150437573 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150437645 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150438046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150438783 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 150439109 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150439212 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150439620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150439657 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150439863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150440371 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 150440571 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150440604 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150440790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150441068 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 150441362 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 150441573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150442364 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150442575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150443219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150444290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150444684 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150444774 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150444785 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 150444807 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150444989 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 150445058 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 150445156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150445182 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 150445245 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 150445259 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 150445282 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 150445283 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 150445307 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 150445335 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 150445634 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150445826 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150446165 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 2 150446876 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 150448910 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150449030 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150449232 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150449240 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150449326 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 150449516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150449535 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150449784 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 150449785 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 150450081 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150450261 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150450264 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150450280 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150450390 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150450901 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150450920 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150450950 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150451106 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150451773 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150451782 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150451804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150451924 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150452317 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150452371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150452393 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150452535 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150452608 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150452623 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 150452714 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150453816 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 150453869 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150454604 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150454731 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150454814 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 150455173 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150455200 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150455213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150455349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150456006 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150456062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150456077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150456249 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 150456262 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 150456458 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150456560 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150456670 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150457170 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 150457174 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150457224 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 150457628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150457668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150457941 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150458120 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 150458122 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150458150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150458151 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 150458247 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150458248 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150458260 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150458273 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150458331 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150458395 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150458412 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 150458929 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150458930 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150458941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150458998 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 150459198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150459249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150459363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150459472 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150459493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150459644 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150459714 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150459938 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150459988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150460110 C G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 150460115 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 150460377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150460503 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 150460540 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 150460672 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150460796 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150460901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150461601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150461908 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 150462046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150462134 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150462247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150462384 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150462418 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150462419 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150462451 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150462958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150464237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150464458 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 150464864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150464944 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150465215 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150465251 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 150465337 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 150469169 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150469778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150470089 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150470102 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150470204 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150470208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150470298 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150470344 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150470364 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 150470460 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150470965 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150471100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150471176 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150471710 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 150472144 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150472169 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150472195 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150472211 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150472262 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150472263 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150472535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150472571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150472608 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150473298 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150473354 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150474231 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150474264 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150474349 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150474423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150474549 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150474687 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 150474902 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150474975 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150475152 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 150475169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150475284 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150475318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150475388 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 150475426 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150476167 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150476180 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150476337 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150476853 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 150477856 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 150478262 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150478317 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150478397 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150478425 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150478472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150478626 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150479143 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 150479165 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150479242 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150479292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150479426 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150479758 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150479800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150479877 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150480039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150480511 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150480547 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150480675 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150481418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150481552 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150481987 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150482188 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 150484565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150484638 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150484654 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150485182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150486269 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150486337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150486399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150486685 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150489120 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150491356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150494038 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 150497998 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150498481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150498965 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150498983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150499201 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150499559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150502065 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150505996 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150506112 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150506116 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 150506239 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150506285 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150506762 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150506779 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150507065 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 150507066 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150507162 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 150507181 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 150507298 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150507390 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150507405 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 150507619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150507646 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150507745 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150507766 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 150507781 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 150508121 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 150508527 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 150508708 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 150510373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150512141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150512504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150513213 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150513384 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150513604 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 150515677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150516503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150516706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150516709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150516895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150516979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150517057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150517167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150517542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150517547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150518361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150518367 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 150518407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150520093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150520840 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150521234 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 150522261 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150522373 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 150522625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150523060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150525801 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150526321 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150526328 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150527006 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150527188 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150533231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150533562 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150533610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150533883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150533948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150534017 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 150534349 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150534509 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150534539 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 150534663 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150534918 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 150535009 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150535048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150535393 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 150535449 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150535480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150535482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150535837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150535868 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 150535912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150536185 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 150536406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150536612 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150536705 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150536730 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150536772 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150536774 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150536828 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150536950 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 150536963 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150537029 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150537057 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150537070 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150537171 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150537222 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150537443 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 150537451 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 150537568 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 150537768 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150537786 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150537836 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150538066 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150538144 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150538386 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150538544 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150538575 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150538771 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150538897 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150538901 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150539176 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150539246 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150539305 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150539617 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 150539758 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 150539852 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150539963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150539985 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150540039 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150540098 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150540290 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150540330 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150540338 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150540462 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150540562 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150541041 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150541085 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150541119 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150541169 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 150541176 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 150541223 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 150541262 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150541597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150541617 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150541669 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150541752 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150541774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150541805 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150541858 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150541912 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 150542013 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150542817 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150543396 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150543640 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150543941 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150544047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150544332 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150544855 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150544953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150545414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150545997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150546047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150546301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150546995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150547154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150547217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150547868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150547901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150548130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150548174 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150548356 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150548431 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150548738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150548746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150548760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150548770 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150549157 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 150549334 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150549340 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150549460 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 150549608 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150550263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150551958 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150552443 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 150552565 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150552756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150552912 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150552996 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150552997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150553618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150561607 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150561797 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 150562221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150562522 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 150562531 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 150562625 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 150562662 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 150562743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150562750 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150562802 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150562866 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150563241 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 2 150563381 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150563480 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 150563695 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 150563779 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150563805 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150563807 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150563837 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150563859 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150563869 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150563870 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150563882 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150564231 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150564298 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 150564343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150566000 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150566093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150566104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150566560 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150566662 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150566712 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 150566720 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150566871 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150567055 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 150567434 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 150567494 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 150567496 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150568346 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150569405 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 150569426 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 150569589 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150569725 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150570446 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 150570676 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150570704 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150571055 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150571109 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150571149 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150571181 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150571274 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150571405 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150571423 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 150571569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150571680 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150571708 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 150572733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150572994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150573514 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150573595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150573725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150573959 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150574079 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150574080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150574239 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 150574249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150575544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150577266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150579312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150579424 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 150579912 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150579934 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150580050 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 150580230 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 150580453 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 2 150580456 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 2 150580465 A G N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 2 150580713 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 150580749 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 150580814 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150581366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150581525 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 150581555 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 150581721 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 150581726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150581837 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 150582138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150582173 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 150582264 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 150582287 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 150582315 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 150582630 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 150582713 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 150582805 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150582820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150582834 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150582853 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150582995 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150583028 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150583221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150583417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150583493 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 150583539 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 150583635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150584592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150584834 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150584840 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150584856 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150584873 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150584885 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150584902 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150584961 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 150585126 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 150585140 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 150585285 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 150585545 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150585578 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 150586188 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150586279 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150586317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150586415 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150586438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150586454 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150586470 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150586496 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 150586516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150586560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150586592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150586597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150586685 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150586871 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150586893 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 150586902 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150587022 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 150587357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150587383 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 150587410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150587421 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150587471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150587473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150587508 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 150587611 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 150588248 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150588335 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150588389 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150588401 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 150588403 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 150588437 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150588503 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150588721 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 150588834 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 150588957 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 150588964 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 150589078 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 150589135 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 150589143 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 150589159 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 150589252 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 150589481 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 150589550 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 150589567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150589571 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 150589688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150589808 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 150589936 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150590061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150590338 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150590451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150591617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150595022 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150595214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150595366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150597947 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150598083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150598476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150598883 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150599140 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150599156 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 150599440 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150600332 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150601238 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 150601447 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 150602296 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150602370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150602802 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150602925 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150602964 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150606113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150606605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150607444 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 150607479 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150607998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150608178 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 150608542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150608614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150608697 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150608699 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150608740 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150608816 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 150609395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150609584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150609770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150610341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150610418 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150611019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150611355 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 150611428 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 150611436 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150611452 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 150611557 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 150611588 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 150611663 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150611670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150611703 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 150611733 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 150611753 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150611784 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150611855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150612061 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 150612091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150612254 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 150612325 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 150612371 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 150612404 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 150612897 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 150613085 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 150613448 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 150613849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150614778 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150615249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150615726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150615976 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150616125 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 150616134 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 150616169 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150616334 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 150616445 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150616706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150618174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150618304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150618351 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 150618395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150618396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150618421 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 150618444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150618470 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150618688 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 150618802 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 150618889 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 150618976 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150619109 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150619147 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 150619193 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 150619460 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150619561 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 150619703 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150619759 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 2 150619788 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 150619796 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 150619829 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 150619843 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150619857 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 150619902 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 150619963 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150619997 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150620006 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150620086 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150620202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150620265 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150620456 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150620662 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150620663 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150621312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150622225 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 150622975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150623087 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 150623097 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 150623115 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 150623472 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 150623570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150623930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150624427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150624457 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150624895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150627172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150627484 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 150627490 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 150627623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150627678 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 150627729 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150627730 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 150627792 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150627995 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150628315 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 150628345 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150628352 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150628395 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150628414 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150628431 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150628534 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 150628567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150628602 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150628627 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150628719 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150628750 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150628773 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150628819 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150628834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150629637 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 150633872 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150633910 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 2 150634102 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150634105 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 150634594 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150634647 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150634653 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 150634677 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150634856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150634930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150635163 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150635173 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 150635368 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150635634 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150635637 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 150635701 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 150635757 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150636138 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 150636255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150636620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150637019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150637247 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 150638905 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150638926 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150639329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150639340 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150639497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150639502 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150639561 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150639601 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150639619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150639634 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 150639863 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150640069 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 150640395 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 150640491 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150640567 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150640585 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150640881 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150640898 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150641123 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150641879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150641920 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 150641924 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 150641932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150641944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150642009 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 150642161 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 150642895 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 150643596 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 150643600 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 150643795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150643811 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150643864 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 150644113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150644193 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150644207 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 150644269 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150644365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150644395 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150644407 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150644498 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150645774 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150646216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150646285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150646371 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 150646430 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 150646739 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150646829 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150647134 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 2 150647198 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 150647354 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 150647463 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150647491 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150647507 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 150647627 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 150647716 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 150647758 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 150648116 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150648675 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 150648963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150649020 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150649093 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 150649111 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150649212 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150649215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150649329 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 150649434 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150649567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150649680 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150649787 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150650417 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150650517 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 150650885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150651013 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 150651184 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150653913 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 150653948 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150653949 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 150654436 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 150655718 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 150657150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150658778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150660816 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150662993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150663348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150663493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150663694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150663714 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150664242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150664426 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150664427 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150664598 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150665055 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150666515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150666648 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150667080 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150667093 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150667363 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 150667387 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150668694 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 150668696 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 150668722 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 150668724 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 150668818 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 150669299 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150669326 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150669703 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150669769 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150669796 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 150670246 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150670606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150670660 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150670826 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 150670938 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150671023 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 150671527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150671700 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150671851 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150672266 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150672288 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150672294 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 150672467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150672616 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 150672702 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150672820 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150672942 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150672946 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150672957 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 150673053 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150673466 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150673542 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 150673545 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 150673576 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150673613 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 150673625 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 150673874 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 2 150673983 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 150674616 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150674623 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150674783 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 150675092 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 150675687 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150675993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150676533 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 150678937 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 150678960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150679043 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150679167 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150679321 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 150679480 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 150685153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150687966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150688410 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150688958 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 150690592 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150690817 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150692090 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150693718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150694136 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150696905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150698752 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150699118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150701283 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 150702953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150704663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150711820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150712969 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 150713302 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150714648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150715918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150718656 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 150718662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150719864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150720185 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150720631 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150720883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150721637 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150722316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150723245 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150724100 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150725019 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 150725233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150726063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150726678 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150727431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150730795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150731372 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150731390 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 150731421 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 150731458 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 150731540 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 150731563 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 150731804 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150731945 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 150732107 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 150732323 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150732614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150732745 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150733078 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 150733318 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150733660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150734765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150734910 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 150735223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150735985 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150736486 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150736487 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150738477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150738522 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 150738745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150738825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150738841 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 150739356 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 150739377 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 150739386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150739394 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 150739418 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150739430 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 150739458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150739472 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150739701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150739743 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150740626 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150741221 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 150741245 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 150741304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150741314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150741867 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150741929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150742459 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150742610 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 150742671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150742686 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 150742823 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 150743167 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150743216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150743222 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 150743313 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 150744109 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150744355 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150745573 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 150746818 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150746920 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150747263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150747299 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150747321 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150747373 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 150747960 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 150748116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150748176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150748208 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150748215 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150748466 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 150748480 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 150748657 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 150749477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150749675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150750226 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150750323 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 150750406 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 150750601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150750932 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 150751044 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 150751121 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 150751237 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 150751656 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 150751668 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 150751803 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 150752001 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 150752286 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150752374 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 150752387 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 150752503 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150752629 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 150752751 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 150752811 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 150753111 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150753269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150753291 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150753923 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 150754190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150754458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150754491 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150754901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150755802 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 150756198 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150756900 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150758076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150759913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150760578 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150761949 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 150761955 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 150762971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150763077 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150763347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150763350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150763367 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150763610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150763769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150763831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150764103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150764114 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 150765574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150765594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150765729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150765784 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 150765919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150766528 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 150766540 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150767613 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150767710 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 150767726 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150767754 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150767763 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 150767791 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 150767832 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150768232 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150768798 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150769720 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 150769726 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150769738 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150769988 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 150769991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150770080 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 150770087 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 150770158 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 150770722 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 150770737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150771174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150771449 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 150771700 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 150771821 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 150772150 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150772592 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150772673 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150772693 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 150772865 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 150772915 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 150773395 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 150773535 G T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 150773559 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 150773581 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 2 150773780 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 150773872 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 150773954 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 150774199 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 150774595 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 150774929 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150775040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150775141 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 150776347 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 150776769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150776942 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150777328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150777816 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150777899 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 150778082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150778100 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150778316 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 150778613 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 150778837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150778951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150778964 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 150779380 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 150779422 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150779579 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 150779760 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 150779777 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 150779815 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 150779895 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 150779896 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 150780032 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150780360 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150780468 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 150780529 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 150780537 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 150780550 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 150780589 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 150780704 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150780760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150780764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150780944 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 150780974 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 150781019 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150781298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150781496 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 150782672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150784063 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150785840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150785850 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 150786111 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 150786308 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 150786775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150786790 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 150787601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150788572 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 150788598 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150788614 G C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 150788831 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150788849 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 150788862 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 150788960 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150789387 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 150789636 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 150789681 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 150789743 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 150789887 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150789932 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 150789968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150790353 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 150790440 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150790459 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150790540 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 150790563 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 150790572 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 150790582 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150790655 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 150790688 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 150790698 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 150790717 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 150790835 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 150791178 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 150791213 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 150791285 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 150791411 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 150792744 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 150796120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150796250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150796444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150796523 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 150796583 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 150796655 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 150796718 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150798143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150798156 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 150798218 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150799016 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 150800222 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 150800725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150800944 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150802613 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 150802674 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 150802675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150802939 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 150803434 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 2 150803447 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 150803520 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150803719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150803886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150803949 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 150803957 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 150804045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150804082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150804222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150804933 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 150805145 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 150805203 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 150805270 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 150805384 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 150805556 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 150805614 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 150805627 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 150806074 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 150806079 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 150806278 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 150806416 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 150806493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150806583 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150806752 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 150806888 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 150806989 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 150807005 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 150807185 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 150807193 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 150807198 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 150807304 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 150807307 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 150807390 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 150807453 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 150807817 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 2 150808241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150808288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150808389 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150808597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150808831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150809526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150809557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150809603 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 150809622 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 150809966 A G Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 150809971 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 150810013 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 150810387 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150810807 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 150811096 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 150811160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150811323 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 150811335 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150811547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150812866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150813167 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150813364 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150813951 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 150814281 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 150814314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150814350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150815810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150815843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150816320 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 150816594 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 150816962 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 150816988 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 150817027 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 150817088 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 150817328 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150817588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150817876 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150817957 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 150818097 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 150818634 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 150818683 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 150818733 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 150818757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150818772 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 150818836 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 150821354 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 150821689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150822736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150824389 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 2 150825376 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150825500 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 150825965 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150826278 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150826518 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 150826657 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 150827576 C A N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 150828273 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 150829277 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 150829341 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150829574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150829763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150831358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150831881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150833208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150833805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150835784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150836662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150837769 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 150837799 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 150837904 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 150838325 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 150838965 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 150839188 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 150839343 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 150839345 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150840316 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 150840320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150840358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150840387 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 150840684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150840891 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150841069 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 150842354 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150842482 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 150842703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150842798 T C N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 150844310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150844398 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 150844410 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150844440 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 150844593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150845093 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150845144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150845163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150845244 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 150845897 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150847549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150848046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150849385 G T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 150849686 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150850692 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 150851585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150852573 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 150854162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150854198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150856945 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 150860001 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150860877 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 150862293 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150865419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150865469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150865485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150866535 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 150867215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150867245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150867322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150867678 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 150868710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150869015 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 150869239 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150869445 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 150871111 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 150871112 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150871130 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 150874047 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150875810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150875967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150875974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150876851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150877160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150880403 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150880622 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150880669 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150880867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150881561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150881683 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150881874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150882702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150882720 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150883105 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150898617 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150898747 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150899181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150899800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150899963 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 150900780 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150902544 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150902873 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150903343 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 150903643 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150904951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150907394 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 150907723 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150908216 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 150910520 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 150919696 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150921492 A G Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 150930086 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 150931980 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 150932425 A C Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 2 150933429 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 150934258 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 150934265 A C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 150934716 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150935895 C A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 2 150941241 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150942060 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 150946127 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 150946230 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 150947455 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 150947612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150947625 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150947699 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150947723 C G Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 150947742 G T Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 150949325 A T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 150949348 C T Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 150949361 A T Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 150949723 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150949816 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 150950122 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 150950167 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150950683 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150950780 T G N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 2 150950838 A C N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 150950839 T A N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 150950972 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150950980 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150950985 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 150951004 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150952827 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 150953021 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 150953614 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 150954009 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150955306 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 150955361 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 150962173 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 150962233 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 150962575 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 150962598 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 150964516 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150964676 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150964687 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150965304 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 150965944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150966120 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150966396 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 150968209 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 2 150968215 C A Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 2 150968421 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 150969459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150969813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150970297 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150970403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150972362 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 150972399 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 150972400 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 150973142 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 150973611 C A Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 150974116 G T Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 150974340 A T Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 150974441 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 150974506 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 150975018 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 2 150975125 G A Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 150975210 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 150978360 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 150979447 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 150980865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150981033 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150981041 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 150981069 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150981070 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150981660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150981910 T C Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 150982006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150982738 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 150983838 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 150984595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 150994021 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 2 150996742 G C Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 150998045 C T Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 151000738 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 151000768 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 151001575 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 151001735 T A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 151002591 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 2 151002759 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 151002761 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 151002851 G A Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 151003217 G C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 151003293 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 151003316 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 151003374 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 151003436 C T Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 151003457 G T Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 2 151003813 C G Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 151003861 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151004484 C A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 151004552 C T Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 151004625 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151004679 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 151016031 C G Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 151016187 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 2 151016370 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 151016884 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 151016983 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 151017055 C T Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 151017455 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 151018039 A G Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 151018088 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 151018208 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 151018351 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151030278 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 151030504 A T Y N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 2 151037890 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 151037943 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 151037983 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 151038392 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 151040266 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151040534 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151040570 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 151040885 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 2 151041371 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151043704 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 151046741 C A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 151046985 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 151048342 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 151056220 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 151056256 T C Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 151066967 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 151072430 T G Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 151072433 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 151073588 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 151102380 G A Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 151105159 G A Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 2 151105167 G A Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 2 151108307 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 151108332 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 151109100 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 151109138 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 151110719 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 151113230 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151113414 T A Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 151113558 T C Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 151120366 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 151121671 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 151124279 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 151144394 T A Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 151157944 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 151158442 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 151167310 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 151175217 T G Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 151176488 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151176574 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151178377 A C Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 151182513 G C Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 151184072 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 151184263 A C Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 151185135 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 151185209 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 151186797 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 151186874 A G Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 2 151187301 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 151187669 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151189275 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 151190458 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 151191738 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 151191783 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 151193062 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 151193075 T C N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 151194183 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 151196986 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 151197284 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 151197977 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 151198387 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 2 151198794 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 151198934 A C Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 151199044 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 151199224 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 151202071 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 151202986 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 151203631 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 151203751 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 151203819 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 151204008 G T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 151204079 C T Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 151204083 C A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 151204320 T C Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 151204398 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 151204673 C T Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 151205022 T C Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 151205057 A G Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 151205098 A G Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 151205119 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 2 151205261 G A Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 151205433 A C Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 151205720 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 151205773 T C Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 151205787 A T Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 151206077 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 151207113 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 151207139 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 151207175 G A Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 151207201 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 151207510 A T Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 151207684 G C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 151208407 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 151208434 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 151208492 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151208829 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 151212211 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 151213077 A C Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 151213613 T G Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 151215409 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 151220004 G A Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 151220028 G A Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 151222506 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 151222807 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 151224823 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151225263 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 151227090 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151227844 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 151242866 T G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 151242899 A T Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 151247081 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 151252294 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 151252301 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 151254735 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 151257837 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 151258096 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151259258 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 151259731 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 151259845 A C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 151259973 A C Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 151260139 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 151260448 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 151263881 C A Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 151263904 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 151265146 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 151265151 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 151267904 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 151268138 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151268758 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 151268919 G T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 151269563 C T Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 2 151270947 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 151271215 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 151271384 C G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 151271980 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 151272867 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 151281459 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151282035 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151282118 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151282128 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 151286032 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151286108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151295646 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151297344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151297772 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 151299274 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151300569 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 151302890 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151304433 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151304717 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 151306318 T C Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 151307348 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151307909 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 151308802 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151308933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151309749 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151309969 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151310127 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151310245 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 151310648 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151310670 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151310683 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151310843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151311246 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151311743 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151314534 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 151316896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151317477 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 151319672 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151320805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151322898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151324025 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151325309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151325333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151325527 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151326382 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 151334955 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 151337639 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 151337905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151338999 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151341815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151342462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151344446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151345576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151347971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151347986 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151349290 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 151349366 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151349695 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151350753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151350949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151355548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151356615 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 151357205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151357485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151361293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151363282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151364914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151365223 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151366374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151367374 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151368939 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151369692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151370771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151373777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151375939 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151376103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151376164 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151378189 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151378497 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151378528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151378601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151380366 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 151381118 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 2 151381288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151381727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151382269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151382555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151383300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151384022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151386010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151386087 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151386995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151388123 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151389761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151391617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151392063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151393055 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151393166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151394139 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 151394181 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 2 151394518 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 151394881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151395732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151396227 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151401161 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151401337 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 151401682 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151402054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151402121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151402640 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 151402999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151403325 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 151403854 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 151403996 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 151404032 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151406014 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 151406082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151406244 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 151407900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151408401 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151411760 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151412607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151414177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151414499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151415739 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151416435 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 151416612 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 151418225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151420582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151424354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151424825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151427613 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151430448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151431712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151433804 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 151434236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151434786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151436636 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151436786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151436827 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151438013 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151438095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151438108 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 151439369 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151439404 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151439474 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151439483 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151439519 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151439548 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151439629 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151439867 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151439944 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151439990 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151440875 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151440994 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151443221 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 151445255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151445626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151446033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151446928 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151446967 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151446980 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 151447190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151447208 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151447327 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 151447463 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151447465 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 151447480 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 151447563 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 151447590 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151447890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151447958 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151447961 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 151448049 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 151448186 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 151448639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151448651 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 151449538 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151449614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151449821 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 151450061 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151450679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151452044 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 151452315 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 151452347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151452440 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 151452455 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151452736 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151452752 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151452788 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151452799 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151452802 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151452858 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151452995 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 151453146 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 151453157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151453272 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 151453667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151453698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151454099 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151454182 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151454374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151454501 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151454502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151455820 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151455888 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151455951 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151456494 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 151456700 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151457849 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151457910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151459099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151459132 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151459148 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 151459733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151459939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151460274 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 151460357 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 151460711 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151461360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151461466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151461517 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 151461549 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 151461903 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 151462231 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 151462287 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151462451 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151462522 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151462783 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151463003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151463188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151463685 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151464266 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151464310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151464505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151464675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151464688 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 151464812 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 151464874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151464900 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 151465151 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151465679 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 151465689 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151465694 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 151465706 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 151466027 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 151467851 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151468323 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 151468326 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 151469319 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151469346 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151469466 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151469621 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151469651 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 151471051 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151471099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151471418 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 151471503 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 151471589 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151472081 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151472567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151472632 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151472792 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151472831 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 151472843 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 151472853 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 151472881 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 151472975 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 151473870 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151474015 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151474424 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 151474569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151474633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151474665 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 151474724 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151475310 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151475531 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151475775 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 151475777 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 151477362 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 151477930 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151478454 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 151478591 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151478772 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151478780 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151478951 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151479007 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151479467 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151480197 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151480278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151480306 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151481116 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 151481171 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151481178 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151481277 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151481657 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151481666 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151481790 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151481946 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151482169 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 151482372 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 151482429 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 151482486 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 151482623 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 151482674 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 151482790 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 151482820 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 151482826 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 151482949 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 151483042 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 151483067 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 151483075 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 151483112 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 151483122 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 151483151 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 151483157 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 151483341 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 151483354 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151483363 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151483541 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 151483609 A T Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 151483612 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 151483997 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151484023 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151484203 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151484210 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151484751 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 151484784 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 151484799 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 151485107 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151485174 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151485264 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151485518 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 151485741 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 151485911 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151485957 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 151486002 T C Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 151486044 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 151486054 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 151486069 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151486150 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 151486255 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 151486298 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151486473 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151486555 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151486605 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151487041 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151487286 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151488174 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151488486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151488537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151488607 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151488744 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 151488897 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 151489020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151489243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151489248 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 151492329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151492664 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151494619 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 151494920 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 151495212 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 151495553 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151495696 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151495718 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 151495900 A G Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 151497271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151497411 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 151497714 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151497791 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 151497816 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151497904 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 151498131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151498336 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151498363 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151498453 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151498652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151498672 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151498700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151498724 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151499516 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151501837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151502297 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151502592 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151503261 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151503631 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151503966 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151504016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151505027 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 151505486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151505907 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 151505982 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 151506757 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 151506769 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 151507165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151507284 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 151507643 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 151507664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151507789 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 151507888 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151508098 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 151508195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151508252 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 151508772 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 151508861 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 151509072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151509079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151509150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151509187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151509245 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 151509511 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 151509518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151509711 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 151509758 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 151509825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151509900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151509952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151510402 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 151510508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151510736 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 151510794 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 151510849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151510852 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151510865 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 151510886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151511041 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 151511279 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 151511671 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 151511738 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 151511755 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 151512628 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151512648 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151512675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151512797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151513156 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151513342 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151513396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151513507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151513892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151514200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151514212 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 151514217 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151514653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151514807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151517450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151520773 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 151520887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151520907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151520972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151521728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151522118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151522855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151522886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151522909 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 151524174 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151524460 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 151525455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151525614 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 151525727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151526371 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 151526455 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151526508 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151526707 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151526799 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151527183 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 151527275 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 151527407 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 151529296 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151529546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151530502 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 151531426 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 151531448 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151532750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151532942 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151532959 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151532978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151533645 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151533830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151533956 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151533972 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 151534101 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151534595 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151534745 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151534963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151535071 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151535214 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151535455 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 151536199 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 151536223 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 151536237 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 151536394 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 151536532 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 151536554 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 151536627 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 151537463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151539196 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151539368 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 151540003 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 151540485 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 151541597 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151541760 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 151541826 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 151541954 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 151542176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151544662 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151544663 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151545634 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151546534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151547863 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 151548413 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151548527 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151549450 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151550465 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151550942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151551889 T A Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 151555316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151555826 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151556652 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 151556874 A G Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 151557292 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151558244 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151560123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151560448 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151561572 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 151562676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151563093 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 151563525 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 151564278 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 151564321 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 151564634 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 151564831 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 151566120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151566129 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 151566920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151567391 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151567515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151567635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151567672 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151568004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151568013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151568258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151568321 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 151568346 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 151568447 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 151568881 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 151571592 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151572258 G C N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 151573034 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151573074 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151573695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151573759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151573924 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151576111 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 151576672 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151576676 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151576775 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151576848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151577135 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151577193 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151577474 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151577553 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 151578057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151578719 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 151579816 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151580348 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 151584671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151584697 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151586453 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151586562 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151586966 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151587336 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151591405 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 151591684 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 2 151591780 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 151592633 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151592776 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151595140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151596171 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151596185 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151596917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151597041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151597857 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 151598586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151598879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151599499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151599588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151601013 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151602001 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 151602067 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 151602164 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 151603175 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151604290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151606757 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 151607441 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 151607817 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151607871 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 151608460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151611684 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 151612660 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 151612920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151613786 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151613872 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151614585 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151614589 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151615062 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 151617426 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 151617542 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151617628 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151622896 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151624690 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 151625344 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 151625502 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 151627347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151629206 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151630506 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151631952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151634159 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151634172 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151634869 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151634905 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 151634987 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151635114 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 151635504 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151635540 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151635675 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 151635684 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151635710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151635794 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 151636745 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 151636772 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 151636801 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 151637173 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 2 151637376 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151637424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151637427 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151637460 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 151637695 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 151637713 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 151638109 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 151638153 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151638255 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151638424 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 151638571 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151639149 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 151639236 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151639438 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151639881 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 151639944 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151639945 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 151639989 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151640007 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 151640082 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151640247 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151640335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151640345 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 151640555 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 151640613 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 151640919 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151640940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151641303 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 151641342 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151641466 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 151641691 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 151641946 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 151641954 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 151641958 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 151642265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151642832 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151643473 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151643508 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151643860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151643927 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 151644048 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151644411 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 151644495 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 151644569 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 151644890 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 151644895 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 151645123 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 151645169 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 151645382 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 151645394 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 151645398 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 151645845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151645851 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 151645939 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 151645974 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151646003 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 151646180 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 151646196 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 151646198 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 151646373 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 151646488 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 151646528 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 151646624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151646741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151646742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151646855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151647167 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 151647459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151647598 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 151647692 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151647723 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151647730 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 151647776 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 151647779 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 151647871 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151647915 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 151647970 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 151648030 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 151648497 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 151650040 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 151650277 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 151650344 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 151650437 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 151650492 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 151650495 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 151650557 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 151650565 C G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 151650795 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 151650831 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 151650950 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 151651008 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 151651041 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 151651060 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 151651234 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151651502 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 151651513 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 151651563 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151651580 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151651956 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 151652784 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 151653242 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 151653247 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 151655237 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 151656984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151657840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151657984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151658960 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151658988 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151659802 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151660656 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151660667 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151660721 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151660979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151661155 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151661362 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151662090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151662387 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151664887 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151665354 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151665371 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151665461 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151666488 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 151667460 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151667581 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 151668093 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151668196 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151668313 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 151668447 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 151669129 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151670119 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 151670161 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 151670240 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 151670369 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151671806 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151671838 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151672448 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 151672466 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151672552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151673296 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 151673312 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 151674683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151674943 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151675422 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151675920 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151677167 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 151677507 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151677751 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 151680391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151680487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151680638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151684529 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151684555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151684850 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151686429 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151686842 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151687639 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 151687667 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151688045 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151688069 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151688073 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 151688123 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 151688165 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 151688252 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 151688368 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 151688493 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 151688567 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 151688638 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151689059 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 151689139 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 151689174 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 151689195 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 151689289 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 151689319 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151689434 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151689471 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 151689511 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 151689589 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 151689658 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 151689726 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 151689926 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 151690470 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151690877 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 151690906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151690975 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 151691142 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 151691189 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151691355 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 151691455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151691466 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 151691476 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 151691652 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 151691653 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 151691733 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 151691785 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 151691868 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 151691872 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 151691886 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151692017 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 151692131 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 151692158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151692202 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 151692229 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 151692249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151692301 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 151692367 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 151692406 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151692425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151692458 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 151692531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151692773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151692798 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 151692856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151693562 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 151693649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151694041 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 151694174 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 151694274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151694399 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 151694765 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 151695019 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 151695089 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151695094 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151695112 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 151695132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151695153 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151695312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151695884 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 151695977 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151696113 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 151696620 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151696745 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 151696849 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 151696872 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 151696947 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 151696967 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 151697138 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 151697427 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 151697541 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 151698105 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151698359 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151698584 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151698937 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151700431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151700732 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151701803 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 151701814 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 151702583 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 151703378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151703950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151704424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151705852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151706082 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151712595 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 151712867 A C N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 151713366 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 151713683 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 151713871 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 151714902 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151715027 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 151716274 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 151716295 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 151718328 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151719492 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 151720029 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 151720243 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 151720340 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 151720628 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 151720631 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 151720689 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 151720757 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 151720759 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 151721523 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151721739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151721791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151721862 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151721944 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 151721996 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 151722159 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151722173 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 151722413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151722443 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 151722461 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 151722649 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151723622 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 151723644 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 151724079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151724333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151726252 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 151726518 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 151727016 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151727172 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 151727335 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 151727390 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 151727399 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 151727512 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 151727740 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 151727831 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 151727891 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 151728068 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 151728081 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 151728157 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151728218 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 151728243 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151728261 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 151728329 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 151728346 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 151728382 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151728389 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 151728399 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 151728412 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 151728490 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 151728535 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 151728545 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 151728553 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 151728586 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 151729151 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 151729234 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 151729295 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 2 151729666 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 151729670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151730004 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 151732424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151732676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151733532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151736170 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 151740204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151741303 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 151741606 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 151741658 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 151741770 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 151741772 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 151741934 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 151743337 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 151743338 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151744382 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 151745185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151745488 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 151746410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151747196 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 151747309 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 151748180 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151748524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151749248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151749306 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 151749635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151750807 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151751010 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 151752127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151760374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151761483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151761516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151762139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151762155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151762169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151762288 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151762330 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151762343 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151762492 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151762522 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151762630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151762794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151762798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151762818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151762920 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 151762995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151763237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151763877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151768505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151768889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151768976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151769319 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 151770785 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151776358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151779690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151779948 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151780669 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151780974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151780975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151781885 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 151783371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151783668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151783909 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 151784007 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 151784119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151784126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151784151 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151784173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151784247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151784502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151784535 A T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 151784645 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 151784827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151785324 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151785434 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151785787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151786179 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151786279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151786328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151786330 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151786366 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151786450 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 151786643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151786732 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151787342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151788323 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 151788386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151788574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151788839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151790257 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 151790706 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151790877 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151791478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151792212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151793934 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151795804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151797405 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151797714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151798416 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151799636 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151800312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151800371 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151800515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151800532 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 151800606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151801201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151801382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151801542 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151801698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151801719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151802119 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151802784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151803174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151803264 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151803425 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 151803443 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 151804113 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151804713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151804942 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 151805090 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151805203 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151805504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151805815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151806066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151806221 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151806482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151806552 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151806628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151806730 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 151806907 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 151807042 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 151807209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151807357 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 151807385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151807621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151807762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151807872 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 151807991 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151808224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151808423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151809429 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 151810034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151810087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151810091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151810156 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151810162 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151810311 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151810539 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151810663 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151810720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151811633 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 151811732 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 151811788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151811878 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151812186 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 151813371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151813437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151814275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151814572 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 151814593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151815651 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 151816028 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 151816073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151816375 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 151816387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151816551 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 151816639 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 151816670 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 151817041 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 151818028 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151818345 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151818839 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 151818862 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 151819784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151819821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151820021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151820961 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 151821031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151821162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151821170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151821817 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151822113 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 151822138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151822636 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151823840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151823847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151823852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151824015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151824651 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 151824792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151825167 C A N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 2 151825521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151826357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151826489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151827760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151827792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151827864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151828034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151828563 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 151828820 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151829114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151829197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151829241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151829320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151829395 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151829835 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151830934 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 151830958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151831117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151831186 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151831187 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151831216 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151831292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151831384 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151831913 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 151832572 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151834173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151834337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151834602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151834725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151834752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151836054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151836260 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 151837703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151838620 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 151838891 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151839286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151839473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151839527 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151839558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151839636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151839669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151839680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151839768 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151839825 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 151839826 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 151839969 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151839988 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151840724 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 151840761 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 151840871 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 151840884 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 151840898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151840899 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 151841080 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151841084 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 151841502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151841525 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 151841554 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 151841812 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 151841960 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 151842058 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151842136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151842266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151842497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151842499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151842518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151842577 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151842593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151842625 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151842648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151843165 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151843177 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 151843296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151843374 A T Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 151843450 T C N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 151843664 C T N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 151843834 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 151844186 A C Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 151844211 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 151844258 A G Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 151844307 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 151844360 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 151844399 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 151844408 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 151844633 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 151844960 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 151845125 G A Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 2 151845379 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 151845384 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 151845397 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 151845403 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 151845467 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 151845518 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 151845662 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 151845691 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 151845743 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 151845768 A C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151847639 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151847782 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 151848302 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 151848334 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151848685 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151848828 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151848847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151848902 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151849050 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151849232 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151849254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151849299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151849309 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151849353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151849432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151849546 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 151849587 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151849613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151849638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151849652 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 151849710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151849761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151849804 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 151849990 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 151850053 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151851468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151851980 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 151852267 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 151852337 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 151853149 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151853240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151853383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151853492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151853502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151853560 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151853767 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151853893 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151854405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151854435 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151854452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151854498 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151854521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151855178 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 151855300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151855424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151856070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151856107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151857586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151857753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151858381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151858648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151858690 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 151858744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151858787 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 151858964 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 151858998 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 151859337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151859378 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 151859836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151860143 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151860445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151860670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151860699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151860737 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 151860760 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 151860824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151860902 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151861036 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 151861046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151861077 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 151861121 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 151861250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151861412 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 151861428 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 151861457 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151861497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151861501 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 151861798 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 151861923 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151861992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151862246 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151862418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151862426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151862580 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151862779 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 151862799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151862895 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 151863038 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 151863050 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 151863078 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151863092 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 151863114 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 151863368 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151863377 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151863383 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151863389 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151863512 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151863599 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151863619 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151863699 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151863895 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151863927 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151863968 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151863979 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151864125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151864246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151864304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151864333 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 151864468 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 151864506 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151864648 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 151864818 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151864907 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 151865154 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 151865258 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 151865696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151865710 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 151866353 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151866445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151866653 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151866790 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 151867003 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151868194 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151868303 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 151868847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151869246 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151869601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151869651 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151869684 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 151871875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151872094 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 151872411 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 151872632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151872718 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 151873707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151874010 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151874175 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151874661 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151874742 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151874787 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151875111 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 151875147 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 151875190 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151875306 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 151875655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151875942 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151876082 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 151876757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151877421 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151878118 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 151878535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151879521 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 151879607 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 151880072 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 151880073 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151880838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151883068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151883527 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 151885085 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 151885102 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151885161 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151885470 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 151885473 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 151886259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151887036 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151887490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151887571 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151887702 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 151888099 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151889341 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151891001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151891224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151891232 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151891240 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151891252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151891317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151891348 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151891366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151892300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151892668 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151894071 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151894274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151894754 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151895831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151896371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151896549 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151896652 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151896911 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 151897973 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151899170 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151899870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151902513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 151903418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151903656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151903662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151903721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151909017 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151910122 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 151910903 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 151912474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151912492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151912515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151913677 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 151914006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151914010 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 151915233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151915802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151916671 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151916681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151916742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151916755 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151916802 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 151917100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151917166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151917509 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151917538 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151917654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151917689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151918001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151918042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151918093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151918599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151918693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151918728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151918748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151918817 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151918877 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151918883 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151919869 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151921646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151921910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151922133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151922173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151922374 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151922435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151922443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151922505 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151922803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151922806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151923053 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151923675 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 151924601 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151924628 T C N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 151924963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151924975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151926061 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 151926259 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 151926429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151926518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151927110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151927440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151928183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151929360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151929721 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 151931051 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151931723 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 151931774 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 151933431 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 151934197 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 151934784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151935225 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151936779 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151937602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151937961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151938556 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 151939553 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151939626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151939862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151939895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151939928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151939996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151940164 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151940209 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151940218 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151940272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151940281 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151940987 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151941113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151941237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151941462 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151941490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151941830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151941964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151942343 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151943493 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151943501 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151943537 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151943545 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 151943561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151944023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151946042 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151946057 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151946139 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151946472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151946902 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151946921 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151946979 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151947244 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151947289 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151947485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151947664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151947669 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151947685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151947823 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 151948337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151948469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151948609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151948963 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151949333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151949507 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151949604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151949753 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151949813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151949929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151949931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151950317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151950412 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151950423 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151950538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151951401 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151951644 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 151952345 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 151952754 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 151952969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151953166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151953439 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 151953480 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151953612 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151953640 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151953769 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 151954634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151955353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151955651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151955890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151955947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151956011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151957116 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 151957143 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 151957276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151957397 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151957858 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 151958135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151959128 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151959130 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151959249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151959266 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 151959351 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 151959388 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151959406 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 151959511 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151960220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151960366 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151961485 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 151961486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151961715 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151961867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151963106 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151963107 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151963136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151967024 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 151970117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151970193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151974151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151975194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151975961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151977320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151977448 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151977663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151978662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151980099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151980346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151982479 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 151985600 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 151985868 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 151985880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151986051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151987457 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151988017 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 2 151988276 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 151988509 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 151991410 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 151993667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151993824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151994741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151995324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151995544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151995740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151995742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151995847 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 151995864 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 151995899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151997512 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 151998213 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 151998312 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 151998365 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 151998503 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 151998506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151998784 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 151998890 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 151998891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 151999042 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 151999082 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 151999129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151999145 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 151999338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 151999642 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152001928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152001995 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 152002057 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 152002471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152003608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152003651 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152004414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152004483 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 152004540 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 152004750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152005306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152005389 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152005499 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152008407 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 152009068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152010123 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 152012697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152013050 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 152013587 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152014873 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 152015857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152016748 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 152016766 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 152016876 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 152016897 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 152016956 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 152016961 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 152017045 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 152017082 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152017231 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 152017761 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 152018008 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 152018011 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 152018041 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152018073 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 152018104 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 152018144 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 152018148 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 152018363 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152018368 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 152018489 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 152018528 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 152018618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152018668 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 152019210 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 152019215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152019632 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 152019699 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 152019799 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 152019813 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 152019994 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 152021626 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 152021708 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 152021841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152021895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152022110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152022127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152022130 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 152022486 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 152022542 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 152022545 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 152022562 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 152022614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152022766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152023131 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 152023335 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152023341 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152023750 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152025718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152027256 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 152031488 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 152031550 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 152031579 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 152031610 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152031778 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152031993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152037118 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 152037332 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 152037338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152037345 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152037354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152037397 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152037412 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 152037435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152037440 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 152037448 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 152037457 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 152037485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152037498 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152037730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152037876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152038748 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 152038805 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 152038997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152039002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152039092 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 152039202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152039491 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152039683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152041566 C T Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 152041572 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 152041578 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 152042857 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152042883 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152043231 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 152043347 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 152045234 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 152045541 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 152045677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152046004 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 152046378 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 152046394 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152046496 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152046506 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152046697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152046709 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152046720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152047908 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152047970 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152047976 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 152048005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152048018 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 152048030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152050604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152051230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152052440 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152052485 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152052507 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152053228 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 152061519 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152062168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152062383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152062929 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152064960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152067155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152067265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152067887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152068056 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152069602 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152072034 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 152072668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152073335 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 152073414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152074224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152076515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152077062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152081267 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152083361 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 152085187 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152096652 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152099522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152100117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152100990 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152103816 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 152110598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152111104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152113344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152113935 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152114621 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152126649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152128440 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 152128457 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 152129649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152131553 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 152132506 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152132896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152135395 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 152138060 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152138061 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152138212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152138316 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152139548 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 152140840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152142155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152142187 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152144534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152145184 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152145324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152147959 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152147961 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152148585 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 152150520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152150838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152150849 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152150917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152151588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152151755 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 152151910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152152162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152152397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152152800 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152153488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152153566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152153759 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152153880 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152154356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152154404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152154644 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152154736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152154752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152154815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152154818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152154892 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152155003 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 152155243 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152155433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152155752 A T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 152155814 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152155819 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152155834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152155869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152155998 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152156016 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 152156047 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152156075 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152156111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152156199 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 152156265 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 152156274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152156368 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 152157589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152158018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152158751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152162335 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 152162768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152162975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152164609 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152164641 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152164778 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 152164997 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152165272 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 152165735 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 152166075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152166215 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 152166285 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 152166337 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 152166546 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 152166619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152166725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152167087 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 152167109 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 152168083 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 152170582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152170946 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152171221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152172982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152173166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152177068 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152177773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152177801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152178817 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 152179903 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 152179976 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 152180287 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 152180308 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 152180800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152181587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152182002 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 152182309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152182488 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 152182914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152183013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152185431 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152186116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152188730 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152189450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152189631 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 152189970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152190383 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 152190414 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 152190501 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 152190502 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 152190519 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152190588 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 152190893 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 152190914 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 152190952 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 152190963 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 152190972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152190987 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 152191112 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 152191329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152191337 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 152191395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152191426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152191473 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 152191522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152191622 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 152191736 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 152191743 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 152191778 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 152192060 A C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 152192075 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 152192159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152192184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152192214 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 152192357 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 152192358 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 152192621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152192759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152193918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152194216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152194705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152195868 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 152196623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152197737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152197954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152198092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152201659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152203626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152205024 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152207314 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.416666666666667 0 0.583333333333333 10 14 5 0 7 2 152208366 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152208606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152211471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152213173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152213178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152213876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152214130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152217107 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 152217126 G C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 152217588 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 152218314 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 152218478 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 152219620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152219789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152219943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152225913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152227942 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152227959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152228204 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 152228240 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 152229391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152230097 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 152231282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152231811 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152231869 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152232096 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152232192 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152232486 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 152232798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152234489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152235116 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 152235675 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 152235821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152237003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152237102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152237808 A T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 152238360 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152238404 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 152238809 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 152239064 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152240102 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 152240327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152240714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152242131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152243099 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152243312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152244235 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152246838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152247363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152248879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152249099 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 152249127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152249403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152251798 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 152251834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152253528 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 152253852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152254617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152260038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152260377 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152265625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152266905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152268602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152268756 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152270395 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152270437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152270581 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152270583 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152270601 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152270606 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152271620 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152272739 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 152273090 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 152273094 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 152273591 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152274299 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152274376 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152274519 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152275168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152275321 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 152275325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152275658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152276524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152276667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152279382 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152279690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152279849 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152279871 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 152280233 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 152280337 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 152280712 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 152280738 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 152281410 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152282204 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 152282265 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152282562 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152282687 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 152282823 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152282951 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152283342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152283380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152283417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152283456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152283617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152284104 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 152284451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152284555 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 152284661 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 152287667 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152288986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152288998 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 152290513 A G Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 152290622 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152290623 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152290634 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152290754 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152290776 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152290931 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 152290935 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 152291341 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 152291425 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152291499 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 152291680 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152291683 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152291716 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152291732 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152291748 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 152291757 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 152291922 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152291967 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 152291968 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152291983 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 152292030 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152292173 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152292381 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 152292423 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 152292440 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 152292472 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 152292495 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 152292680 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 152292732 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152292781 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 152292796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152292883 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152292912 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152293416 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152294918 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 152295395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152296903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152298271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152298679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152298814 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152298868 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 152298874 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152298988 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152299044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152299296 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152299446 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 152299919 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 152299951 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 152300057 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152300084 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 152300101 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 152300186 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152300195 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152300201 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152301976 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152304482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152305532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152306742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152313535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152314288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152317462 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 152318083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152318115 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 152318290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152319867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152319983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152320562 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 152320575 T C Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 152320578 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 152320598 G C Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 152322952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152324291 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152324860 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 152329529 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152329577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152330044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152330566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152330610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152330921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152331822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152333624 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152334878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152337635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152340596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152340703 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 152346428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152346704 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152350761 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152350783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152352794 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 152353222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152353274 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 152354906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152356455 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152357340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152358206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152358406 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 152359565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152359748 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 152359786 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 152360060 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 152360144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152360235 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 152360240 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152360287 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 152360480 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152360622 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 152360728 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 152360788 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 152361073 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 152361143 G T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 152361179 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 152361221 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 152361295 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 152361353 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 152361509 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 152361603 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 152361769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152361876 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 152361908 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 152361926 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 152361982 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 152362007 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 152362028 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 152362116 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 152362276 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 152362291 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 152362303 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 152362732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152362772 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 152362784 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152362794 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152362814 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152363663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152363846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152363851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152364094 G T Y N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 152364169 C T N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 2 152364354 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 152364394 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152364504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152364521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152364540 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152364723 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 152364821 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 152364883 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 152364897 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 152364924 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 152365150 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 152366162 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152366310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152366467 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152367380 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152367395 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 152367513 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152367569 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 152367593 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 152367654 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 152367669 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 152367753 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 152367810 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152367862 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152367886 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152367937 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152367968 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152368079 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152368081 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152368107 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 152368111 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 152368151 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152368155 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152368205 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 152368600 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152368612 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152368658 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 152368667 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152369017 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 152369077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152369103 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 152369113 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 152369259 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152370698 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152372708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152373109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152375639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152375652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152375720 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152376123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152376486 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152376579 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 152379193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152379468 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152380090 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 152380733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152381193 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 152381277 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152384685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152385612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152386185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152386430 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 152387791 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 152388995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152389571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152390146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152390321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152390523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152391535 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 152391549 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152392885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152394062 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152395032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152395130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152395942 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 152395946 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 152396517 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152396567 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 152396776 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152397769 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 152401031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152401625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152402227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152403034 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 152403312 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 152403811 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 152404409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152404485 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 152404553 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 152404996 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152406775 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152406785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152406979 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152408936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152410124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152410160 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152410173 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152410944 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 152412793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152412958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152413807 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152414122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152417311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152417670 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152418885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152419840 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 152423637 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 152423827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152424017 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 152425822 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 152425862 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 152426125 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 152426166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152426314 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152426456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152426642 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 152426910 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 152426935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152427002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152427069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152427109 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152427239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152427371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152427444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152427773 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 152427831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152427832 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 152427902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152427914 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152428016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152428035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152428056 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 152428147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152428225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152428492 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152428582 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152428600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152428624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152428795 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152428845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152428920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152428938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152428947 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 152429027 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 152429155 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 152429198 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 152429210 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 152429220 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 152429414 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152429517 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 152429582 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 152429617 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152429707 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 152429768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152429862 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152429954 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152430612 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152430614 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152430625 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152430699 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152430768 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152430780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152430786 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152430932 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 152430939 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 152431025 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152431146 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152431516 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 152431555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152431934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152432089 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152432423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152432812 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152432846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152432849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152435459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152436344 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 152436599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152436726 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 152436809 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 152437600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152438191 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 152438281 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 152438350 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 152438546 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 152438568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152438863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152438916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152439166 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 152439267 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 152439334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152439354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152439384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152439816 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 152439827 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 152439943 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 152440171 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 152440249 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 152440264 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 152440681 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152440731 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 152440732 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 152440869 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152440936 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 152440964 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 152441092 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 152441980 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 152442123 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 152442130 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 152442347 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 152442644 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152443335 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 152443359 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 152443439 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 152444399 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152444409 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152444477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152444548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152444694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152444808 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152444948 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152444949 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152445019 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152445102 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152445563 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152445635 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 152445722 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152445723 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152445760 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152445883 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152445913 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152446861 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152446997 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 152447059 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 152447539 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152450425 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152451109 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 152451616 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 152452449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152453398 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 152454565 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152455311 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152455794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152456233 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152456430 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 152457846 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 152458002 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 152458076 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152458521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152459745 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 152459940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152460544 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 152460574 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152460608 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 152460710 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 152460820 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 152460911 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152461136 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152461146 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 152461672 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 152461822 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 152461910 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 152462040 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152462125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152462307 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152462317 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152462676 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152462707 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152462730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152463048 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152463470 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 152463799 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152463805 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152464418 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152464558 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 152464617 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152464649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152465391 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 152465785 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152465842 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152466060 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152466236 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 152466245 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 152466288 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 152466332 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152466366 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 152466443 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 152466570 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 152466850 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 152466899 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 152466985 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 152467177 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 152467996 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 152468096 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152468366 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 152468397 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152468413 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 152468494 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 152469271 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 152469307 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152469316 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 152469746 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152469873 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152470556 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 152470570 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 152470636 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 152470663 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152470690 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152470755 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152471191 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152471351 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152471573 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152471581 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152471708 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 152471794 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152472139 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152472285 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152472348 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152472441 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152472876 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152472902 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 152472972 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152472995 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 152473031 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152473139 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152473174 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152474118 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 152474545 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 152474978 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 152475186 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 152475646 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 152475670 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 152475780 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152476163 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152476186 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 152476343 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152476871 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152476911 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152476950 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152477765 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 152477882 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 152477928 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478234 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 152478269 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478328 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478336 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478471 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478484 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478515 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478578 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478611 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478636 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478660 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478693 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478713 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152478761 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478777 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152478905 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 152479070 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 152479119 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 152479411 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152479441 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152480756 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152480823 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152480878 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 152480883 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152481247 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 152481266 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 152481459 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152481521 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 152481593 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152481621 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 152481669 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 152481801 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152481826 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 152481874 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 152481883 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 152481996 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152482046 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 152482107 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 152482134 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 152482477 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152482498 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 152482542 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 152482571 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 152482697 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152482761 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152482900 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152483006 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152483082 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152483088 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152483151 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152484083 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152484846 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152485059 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 152485168 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 152485279 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152485293 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 152485444 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 152485603 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 152486084 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152486104 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152486145 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152486149 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152486171 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152486255 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152486362 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152486516 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 152486690 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152486706 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 152487077 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 152487442 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 152487563 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152488549 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 152490142 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 152490143 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 152490401 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152490613 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152490623 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152491587 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 152492248 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 152492261 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 152492403 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 152492490 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 152492628 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152492886 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152493248 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 152496448 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 152496479 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 152496504 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152496881 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152498300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152499204 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152499317 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152500090 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152500266 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152500456 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 152503396 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 152503643 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 152503645 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 152504425 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152504447 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152504580 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152505485 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 152505547 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 152505792 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 152506476 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152508254 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152508609 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152509432 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152510854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152511363 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152511414 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 152511422 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 152511677 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152511956 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152512461 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152512601 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 152512767 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152512770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152513752 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 152513802 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 152515103 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152515839 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 152516105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152517160 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152518044 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 152518048 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 152518305 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 152518811 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152519092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152519881 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 152520290 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 152520499 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 152520795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152520849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152521124 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 152521954 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 152521985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152522138 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152522901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152522916 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 152523147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152523372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152523399 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 152523563 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152524673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152524685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152524784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152524879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152524937 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 152525092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152526550 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152527476 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 152527974 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152528020 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 152528533 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 152528876 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152528881 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152530935 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 152531060 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152531111 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 152531159 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152531192 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152531825 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152531929 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152532422 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 152534183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152534375 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 152534480 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 152534526 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 152534668 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 152534772 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 152534829 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 152534853 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152534862 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152534930 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152535173 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152535299 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 152535322 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 152535418 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 152535723 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 152536239 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 152536240 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 152536509 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 152536528 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 152536677 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 152537492 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152537526 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152537529 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152537683 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152540111 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152540307 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152540315 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152540336 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152541721 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 152542045 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152542199 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152542210 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152543486 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152543858 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 152544054 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152544085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152544181 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 152544184 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 152545198 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152546462 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 152547420 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 152548760 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152548827 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152549188 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 152549214 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152549937 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 152550154 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 152550762 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 152550772 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 152551035 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152551115 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 152551174 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 152551233 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 152551653 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 152551867 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 152551956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152552018 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 152552042 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 152552995 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 152553182 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 152553222 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 152553422 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 152554363 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 152554535 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 152554565 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 152554607 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 152555067 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152555106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152555264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152555518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152557143 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 152557243 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 152557284 T A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 152557285 T A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 2 152557348 G C N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 152557634 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 152557643 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 152557658 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 152557951 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 152557982 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 152558003 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 152558025 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 152558033 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 152558094 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 2 152558197 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 152558266 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 152558843 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 152559025 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 152559031 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 152562526 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 152563111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152563252 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 152566056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152568945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152569796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152570290 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 152570355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152571549 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 2 152571550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152571621 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 152571624 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 152573462 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 152573901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152574586 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152575647 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152575839 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 152576385 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 152576494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152576841 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 152576908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152576987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152577089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152577230 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 152577329 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152577896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152577989 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152577991 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 152578038 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 152578063 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 152578163 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152578244 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 152578375 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 152579015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152579144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152579792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152580237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152581102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152581186 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 152581711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152581837 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 152581905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152581955 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 152581958 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 152582004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152582094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152583956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152584075 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152584930 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 2 152585436 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 152585439 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 152585458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152587882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152588258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152589578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152589717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152592292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152592342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152593795 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152593857 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 152593922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152594162 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152594342 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 152594371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152594706 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 152594708 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 152594882 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 2 152595027 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 152595032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152595041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152596358 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152596632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152596634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152596872 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 152597142 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 152597209 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 152597872 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 152598146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152598677 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 152598994 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 152599018 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 152599686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152600294 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 152600587 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 152600588 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 152605519 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 152605983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152612054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152612650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152612856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152613275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152616729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152616732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152617401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152617486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152618761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152619974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152620560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152620739 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 152620862 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 152621807 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152622261 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 152622459 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 152622525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152622588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152622806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152623283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152625960 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152627971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152628509 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152630819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152631389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152631454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152634259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152635343 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152637884 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152646563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152652725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152654834 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152656155 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 152657332 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152659001 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 152659421 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 152659561 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 152659608 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 152660558 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152660687 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 152660914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152661738 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152661768 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152662045 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152662205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152662249 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 152662285 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 152662324 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 152662339 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 152662826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152662828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152662849 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 152662861 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 152662990 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 152663099 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 152663471 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 152663670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152663671 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 152663721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152663788 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152663814 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152663891 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152663923 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152664196 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 152664226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152664257 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 152664263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152664471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152664597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152665248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152665281 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152665564 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152665790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152667497 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152667613 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 152673559 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152677738 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152680782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152682132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152683830 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 152683909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152684570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152685278 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152685457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152687570 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152687651 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 152688666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152688815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152689678 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 152690346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152690500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152690643 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 152690737 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152690782 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152690900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152690904 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152691120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152691502 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 152691936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152692010 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 152692660 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 152692729 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 152693023 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 152693101 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152693491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152693923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152694073 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 152695047 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 152695366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152695438 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 152695807 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152695911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152696044 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152696350 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 152696753 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 152697002 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 152697173 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 152697350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152697647 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 152699169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152699258 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152699847 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 152700021 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 152700427 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 152700655 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 152700812 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 152700855 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 152701184 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 152701185 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 152701232 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152701946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152710118 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 152711600 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152712746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152718236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152718272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152718452 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152718665 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 152718820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152718894 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152719241 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 152719468 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 152719515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152719837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152719931 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 152719932 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 152719955 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 152720105 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 152720184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152720657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152721503 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 152721507 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 152721933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152722038 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152722312 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 152722507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152722639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152723047 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 152723077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152723184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152724017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152724933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152725311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152725615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152725662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152725714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152725828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152728193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152728200 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 152728896 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 152728909 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 152728964 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 152729026 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 152729292 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152729502 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 152729914 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 152730439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152730570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152730924 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 152731067 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 152731199 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 152731244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152731572 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 152731598 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 152733156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152733444 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 152733450 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 152733634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152733688 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 152733731 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 152733803 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 152733880 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 152734476 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 152734501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152737407 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 152739363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152739534 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 152739896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152741902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152743809 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 152743928 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 152743968 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152744264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152744935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152745254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152745688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152745722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152745967 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 152746243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152746577 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152746588 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 152747719 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152747742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152748213 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 152750908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152754344 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152755000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152755739 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152756798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152756888 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152757123 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 152757551 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 152757874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152760043 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 152760958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152765863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152768130 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 152768330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152770097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152770212 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 152770440 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152770597 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 152770845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152773380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152773672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152773821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152775292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152775441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152775606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152775744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152778733 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152778994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152779368 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 152779486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152779579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152781616 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 152782137 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 152783696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152784107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152784805 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152788234 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152790909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152791452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152793205 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 152793439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152794461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152794553 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 152797480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152801745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152802609 T C Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 152804250 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152804374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152809321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152809498 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152809585 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 152810122 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152810736 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 152814361 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152815017 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152815028 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152815048 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 152816218 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 152817640 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 152817735 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152817792 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 152818120 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 152818203 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152818255 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152818396 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152818420 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152818439 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152818462 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 152818488 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152819248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152819895 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 152820134 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 152820471 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152820629 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 152820643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152820644 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152820742 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 152821318 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152821319 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152821479 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 152821566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152821798 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 152821982 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152821994 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152822141 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 152822190 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152822228 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152822248 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152822286 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152822351 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 152822376 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 152822649 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152822675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152822693 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152822703 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152822713 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152822782 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152822868 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152822975 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 152823012 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 152823116 G A N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 2 152823292 G T N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 152823293 A T N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 152823304 G T N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 152823331 G T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 152823376 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 152823410 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 152823460 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 152823588 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152823683 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152823781 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 152823996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152824035 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152824185 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 152824237 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152824394 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152824465 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152824627 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152824658 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152824943 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 152824964 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152825404 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152825452 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152825488 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152825536 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 152825537 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 152825556 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152825623 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152825638 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152825719 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152825755 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152825812 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152826086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152826090 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152826188 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152826256 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 152826324 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 152826521 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 152826806 C A Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 152827123 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 152827138 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152827274 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 152827294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152827312 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 152827421 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152827507 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152827510 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152827643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152828182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152828247 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 152828298 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 152828299 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152828379 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152828414 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152828429 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152829144 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 152829689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152829763 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152829767 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152829961 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 152829972 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 152829987 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 152830003 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 152830054 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 152830183 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152830380 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152831346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152831424 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 152832532 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152832824 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 152833064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152833083 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 152833239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152833291 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 152833360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152833418 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152833498 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152833531 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152833539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152833628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152833646 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 152834017 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 152834131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152834154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152834206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152834256 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152834281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152834326 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152834388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152834445 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152834463 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152834506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152834511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152834608 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 152836135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152837139 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152837257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152837792 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 152838932 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152840233 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152840398 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152843736 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 152843774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152843849 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 152844353 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152847186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152847283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152848192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152848380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152850736 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 152853204 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 152853404 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152853419 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152853699 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152853809 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 152853861 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 152854009 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 152854127 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 152854164 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 152854245 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 152854316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152854683 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152856626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152857172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152857403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152858800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152858924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152859342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152859817 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152863375 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152864331 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152865009 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152865172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152865326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152865619 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 152865835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152865846 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 152866144 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 152866170 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152866536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152866554 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152866699 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152866705 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152866710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152866996 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 152867419 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152867617 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152867632 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 152867822 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152867858 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 152868024 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 152868891 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 152869376 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152869441 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152869616 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152870046 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152870112 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 152870383 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 152870648 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 152871143 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 152871204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152871216 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152871229 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 152871236 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 152871301 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152871342 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 152871393 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 152871397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152871477 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 152871662 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152871684 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 152872137 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152872993 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152873156 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 152873206 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152873251 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 152873491 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 152873594 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152874851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152875347 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 152875609 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152876101 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 152876594 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 152876921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152877126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152880938 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152881002 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152881966 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 152882038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152882247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152882550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152882564 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 152882990 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 152883011 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 152883406 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152883751 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 152883791 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 152884429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152884627 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 152884743 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 152886139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152886147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152886270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152886297 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 152886669 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 152886773 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152886836 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152886882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152887635 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 152887679 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152888082 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 152888095 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 152888122 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152888130 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 152888149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152890023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152890304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152890436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152890482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152890536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152890625 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 152890641 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 152890988 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 152891020 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 152891030 T G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 152891032 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 152891127 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 2 152891131 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 2 152891171 G A N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 152891420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152891443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152891489 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 152891725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152891905 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 152891988 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 152892084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152892338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152892803 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 152892817 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 152892846 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 152892866 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 152893428 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152894015 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 152894026 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 152894498 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 152894811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152895889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152895928 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152895935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152896074 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 152896292 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 152896293 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 152897167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152898034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152899076 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152899078 G C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 152899092 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 2 152899238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152899744 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152899771 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152899818 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152899969 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152900005 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152900027 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 152900078 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152900091 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152900234 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152900410 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152900421 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152900453 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 152900471 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 152900594 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152900699 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 152901132 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152901172 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152901257 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 152901281 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152901319 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152901333 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152901336 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152901353 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152901363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152901418 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 152901454 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 152901478 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 152901518 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152901554 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 152901567 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 152901827 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 152902839 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152903046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152903729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152903846 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 152905191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152905334 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 152905850 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 152906183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152906243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152906718 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 152906721 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 152906733 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152906742 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152906953 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 152906965 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 152906988 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 152907392 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 152907931 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152908193 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152908434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152908487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152908905 A C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 152909173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152909204 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152910355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152911125 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 152911151 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 2 152911276 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 152911892 T C Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 152911893 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 152912424 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152912500 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 152912510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152912545 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 152912562 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 152913150 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 152913504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152913954 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 152914707 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152914754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152914816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152914832 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152914892 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 152915079 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 152915101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152915143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152915167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152915750 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 152915889 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 152915910 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 152915967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152916165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152916259 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152916270 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152916390 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 152916643 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 152916710 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 152916761 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 152916892 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 152917042 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 152917087 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 152917471 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 152918321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152918360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152918405 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152918566 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 152918628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152918920 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 152918976 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 152919548 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 152919553 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152926297 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 152926438 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 152926607 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 152927706 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152928077 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152928872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152929332 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 152929451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152930604 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152930626 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 152930805 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 152930858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152930880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152931342 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 152931509 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 152931988 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 152932947 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 152932956 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 152932973 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 152933000 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 152933045 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 152933339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152933354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152933423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152933436 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 152933724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152933889 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 152933907 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 152933967 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 152933986 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 152934040 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 152934049 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 152934066 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 152934184 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 152934401 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 152934706 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 152934982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152935720 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 152936188 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 152937105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152940054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152941302 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152941557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152942552 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 152942920 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 152947891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152950671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152950810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152952283 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 152952489 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 152952589 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 152952630 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 152952795 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 152952812 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 152953034 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 152953510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152953645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152954227 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152954260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152954716 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 152954769 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152955429 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 152955466 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 152955505 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 152955534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152955549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152955602 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 152955673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152955676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152955906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152956069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152956150 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 152956158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152956421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152956468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152956494 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152956535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152956545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152956550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152956592 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152956797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152957329 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152957430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152957431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152957737 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152957758 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 152957792 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152957921 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 152957989 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152958201 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 152958446 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 152958964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152960269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152960980 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152961023 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152961067 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152961290 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152961317 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152961329 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152961540 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152961822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152961869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152962248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152962338 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152963214 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152963215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152963389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152963571 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152963572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152963740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152963842 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 152964454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152964528 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152966520 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 152967022 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 152967078 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 152970163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152973005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152974425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152974554 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152974586 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152974894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152974902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152975028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152975373 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152975624 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 152975635 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152975654 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152975680 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152975725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152975894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152975907 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152976061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152976214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152976243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152977237 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152977243 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 152978505 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 152978792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152978808 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152979276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152979515 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152979527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152980876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152983727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152991500 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 152991874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152993612 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152994689 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152995111 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152995707 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 152996566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152996742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 152996956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 152997072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153037978 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153058968 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153062525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153068360 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153071144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153072362 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 153073487 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153077976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153078153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153080826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153087563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153088276 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 153110508 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153111404 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 153117289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153117322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153119184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153120669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153120822 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153122010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153122457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153123273 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153124351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153124559 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153126291 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 153127049 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 153128017 G C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 153128550 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 153129069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153131264 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 153131386 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153131898 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153131936 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 153131989 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153132149 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 153132513 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 153132596 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153132717 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153133577 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 153134630 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 153134678 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 153134853 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 153135056 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 153135067 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 153135312 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 153135419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153135465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153135582 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 153135781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153136157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153136181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153136225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153136237 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153136516 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 153136615 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153137507 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153137966 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153137977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153138078 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153138549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153138719 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153139048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153139477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153140131 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 153140199 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 153140213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153140516 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153140536 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153140558 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 153140599 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153140663 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153140777 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 153140891 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 153140960 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 153141169 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153141536 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 153141814 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 153144135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153145626 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153146661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153147223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153151131 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 153154423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153154522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153160267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153161353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153161874 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153162813 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153164076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153165424 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153167040 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 153169035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153169153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153169592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153170022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153170345 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153171182 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153172503 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153172506 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153172880 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153175811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153177070 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153177942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153178882 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153180008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153182319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153184522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153185934 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 153187446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153188934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153191718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153193175 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153198728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153199993 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 153205196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153211741 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 153213380 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153216830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153221765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153223762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153224753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153225807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153228073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153228262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153229814 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153230318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153230976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153235595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153238298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153238612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153239026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153240153 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153244664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153248546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153252312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153252329 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153252635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153253752 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153254176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153254935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153254988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153255058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153257700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153259599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153260915 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 153262272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153267153 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153268119 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 153270879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153271970 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153273727 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153274006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153278236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153281565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153281625 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153283457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153285653 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 153287242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153288424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153292758 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153293996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153294172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153295410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153295658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153297145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153297907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153298518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153303304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153306155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153309615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153310107 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153312063 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 153314018 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153315323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153316625 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153322983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153324588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153325545 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153325828 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153328671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153329523 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153335337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153335670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153339608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153339645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153343259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153345437 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153345907 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153346171 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 153353393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153359520 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 153359623 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 153360196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153361131 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 153361321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153361417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153365075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153365337 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 153365382 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 153365919 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 153365982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153366157 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 153366805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153367743 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 153369920 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 153370452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153373051 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153377535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153379647 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 153381398 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153381498 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 153382153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153382208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153385053 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153387909 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 153387940 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 153389463 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 153389465 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153389636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153389650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153389704 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 153389716 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 153389859 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 153390091 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153390106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153390232 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 153390244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153390270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153390407 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153390639 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153390805 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 153390844 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 153390846 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 153390874 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153390881 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 153390902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153391012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153392524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153393051 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153393151 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153393152 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153393657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153395547 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 153395559 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 153395748 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153395761 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153396481 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 153396735 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153396976 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 153397009 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 153397159 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 153397209 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153397608 A G Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 153397627 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 153397646 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153397743 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 153397817 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153397863 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 153398405 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 153398420 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153398569 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 153398579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153399221 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 153399245 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153399583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153400334 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153400967 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 153402039 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 153402582 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 153403720 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 2 153405427 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 153405459 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 153406296 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153406864 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153407540 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153407688 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153407823 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153407879 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153408239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153408431 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153408856 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153409132 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153409554 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 153409800 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 153410298 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 153410611 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 153411047 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 153411538 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 153411599 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 153412250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153412489 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 153412623 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153413087 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 153413092 T G N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 153413111 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 153413121 T G N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 153413198 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 153413203 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 153413279 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 153413386 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 153413449 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 153413515 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 153414159 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153414166 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153414213 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153414295 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153414333 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 153414742 T G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 153414867 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 153414957 T A N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 2 153415161 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 153415278 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 153415292 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 153415314 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 153415358 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 153415481 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 153415622 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153415684 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153415695 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153415914 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 153415923 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 153416047 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153416078 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153416151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153416173 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 153416192 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 153416362 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 153416374 T C Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 153416414 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 153416463 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 153416485 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 153416743 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 153416781 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 153416799 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153416812 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 153417302 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 153417541 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 153417554 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 153417575 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 153417802 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 153418732 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 153418763 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 153418853 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 153418918 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153418964 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 153419556 T C Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 2 153419686 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153419962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153420251 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 153421138 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153421162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153422033 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 153422057 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 153422090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153422097 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153422121 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 153422287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153422308 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 153422333 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 153422575 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 153422651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153423531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153424323 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153425561 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 153429682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153429848 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153431299 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153431353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153431643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153434303 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 153435083 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153436503 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153437358 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153437416 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 153437444 T A N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.181818181818182 0.727272727272727 0.0909090909090909 12 10 2 8 1 2 153437880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153438446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153438787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153439054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153439162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153439351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153439539 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153439575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153439600 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153439604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153439625 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 153440276 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 153440554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153441646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153441793 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 153442972 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153443027 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 153443040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153445132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153445154 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153445816 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 153445906 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 153445987 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153446183 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 153446256 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 153446833 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 153446905 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 153446936 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 153446979 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 153447011 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 153447012 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 153447052 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 153447053 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 153447131 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153447171 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 153447208 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153447222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153447995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153448878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153449237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153449250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153449326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153449440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153451337 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 153451594 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153451627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153451640 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 153451661 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 153451748 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 153451985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153452137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153452288 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 153452679 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 153453151 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153454186 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 153454508 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153454782 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 153455522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153456203 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 153456248 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153456334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153456528 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153456698 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 153456731 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 153456918 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 153457511 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153457755 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 153457913 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153458046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153458220 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 153458535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153458872 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153458965 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 153459036 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 153461701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153462058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153463091 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153466715 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153467622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153468713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153468866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153469027 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153471255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153471956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153472418 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153473140 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 153473502 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 153473835 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 153473951 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 153474116 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153474390 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 153474763 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 153480477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153486568 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 153486661 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153486675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153488578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153493789 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153499568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153524515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153524548 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 153524577 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 153526420 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 2 153526705 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 2 153530045 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 153530208 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153534609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153538202 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 153538209 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 2 153543520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153546336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153548331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153548494 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153549633 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153551631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153551901 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153553391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153554991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153555058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153555762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153559977 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 153560083 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 153560907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153561130 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153561912 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 153562270 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 153563143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153563158 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 153563371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153563375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153563717 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153563731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153563914 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153564516 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 153564851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153565643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153567523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153569316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153572928 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153576640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153578947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153579394 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153580830 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 153580976 C A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 153582803 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153582805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153584092 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153585635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153586007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153586172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153586225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153586916 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153587573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153588111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153588337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153588722 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 153588927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153589128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153589398 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 153589457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153589815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153590105 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153590484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153591790 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 153591985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153592097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153592310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153593325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153593364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153593666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153593867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153595046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153595509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153595686 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153595699 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153595800 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153596210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153596724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153597066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153597465 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 153597483 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 153598495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153598529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153598764 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153598827 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153598951 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153599311 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153599476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153599711 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153600061 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153600104 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153600126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153600153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153600257 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153600381 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 2 153600393 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 153600583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153600766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153600878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153600980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153600984 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153601136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153601281 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153602983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153603041 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 153603299 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153604586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153605329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153605395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153606146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153606213 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153606226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153606353 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153606448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153606540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153606575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153606603 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153606614 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153607823 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 153608286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153612271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153612517 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153612707 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153614596 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153614688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153614831 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 153615442 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 153615614 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153615636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153616508 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 153616797 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 153616834 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 153617153 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153617479 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 153622880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153623569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153623572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153624139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153624214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153624230 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153624931 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153625000 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153625230 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 153625321 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 153625407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153625586 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 153625854 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 153626509 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 153626594 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 153626760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153626809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153626835 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 153626874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153626883 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153626902 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 153626915 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 153626919 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 153627342 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 153627540 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153627741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153631364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153633912 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 153634019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153634316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153635000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153635464 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 153636112 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153636712 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153637143 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 153637202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153637226 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 153637262 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153637474 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153637491 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 153637536 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 153637547 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 153637592 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153637660 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153637716 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153637787 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153637956 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 153638024 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153638312 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 153639973 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 153641564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153641575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153642251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153642615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153644739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153645101 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 153646609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153649224 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 153650929 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 153651122 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 153651969 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 153654860 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153655369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153655765 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 153660414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153660472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153660962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153661955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153663042 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 153667865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153668386 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 153669720 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 153670407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153670493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153674978 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153677116 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153680668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153681348 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153681489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153681500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153681606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153681664 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153681763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153684174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153684255 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153684549 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 153685668 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 153686980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153687474 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 153687496 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 153687764 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 153690012 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153690603 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 153691891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153696340 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 153696757 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 153696770 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 153696806 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 153698405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153701150 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153704046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153705605 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153705719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153705744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153706048 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153706254 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 153706594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153706682 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 153706713 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153706763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153707656 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 153707669 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 153707773 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 153707831 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 153707850 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 153707855 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 153707928 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 153707983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153708065 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 153708093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153708122 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 153708160 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 153708335 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153708365 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 153708472 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 153708571 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 153708578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153708587 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153708645 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153709256 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 153709447 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 153712993 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 153713091 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 153713262 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 153713339 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 153713357 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 153713427 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 153713579 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 153713582 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 153716720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153718145 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 153723699 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 153725421 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 153725484 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 153725503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153726168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153726986 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 153728264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153728855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153729914 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 153729993 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153730143 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 153731586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153735536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153736020 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153736389 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153737743 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 153737862 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153737929 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153737991 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153738235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153738295 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 153738621 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 153738829 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 153738872 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 153739533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153739858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153742248 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153742255 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153743393 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153743552 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 153743647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153744203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153744361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153744489 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 153744669 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 153744830 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 153745094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153745133 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153745141 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153745601 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153745675 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153746073 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153746520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153746861 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 153746944 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153748295 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 153749830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153751199 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 153751849 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 153751858 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 153752178 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 153752313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153754617 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 153756042 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 153756171 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 153756297 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 153756364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153757233 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 153757296 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 153757316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153757333 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 153757354 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 153757374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153757452 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 153757464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153757738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153758778 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 153758799 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153758818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153758866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153758923 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 153758951 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 153758992 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153759031 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153760105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153760116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153760149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153760420 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 153761781 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 153761862 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 153761863 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153761880 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 153761966 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 153762116 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 153762413 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 153762830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153762948 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 153763451 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 153763634 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153763700 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 153763894 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153764163 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 153764181 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153765239 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153765249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153765310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153765404 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153765444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153765547 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 153765585 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 153766821 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153766846 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153766868 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 153767111 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153767234 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153767304 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 153767419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153767546 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153767806 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 153768106 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153768380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153768394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153770638 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 153770860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153770861 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 153770879 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153770886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153770935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153770946 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 153770989 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 153771132 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153771261 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 153771368 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153771403 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 153771778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153771823 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153771832 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 153771978 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 153772282 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 153772375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153772514 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 153773048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153773135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153773148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153773183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153773626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153773671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153773709 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 153773780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153774071 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 153774074 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 153774101 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 153774282 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153774736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153774862 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153774893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153775044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153775049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153776424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153776466 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 153776879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153776973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153777752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153778680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153779410 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153782225 G C N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 153783198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153785978 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153786219 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153786755 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153786813 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153789121 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153789406 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 153789514 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 153790099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153790507 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 153790822 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 153790834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153791140 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 153791264 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 153791331 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 153791620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153791869 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153791879 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 153792146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153792928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153793341 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153793433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153793734 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 153793762 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 153793809 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153793852 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 153794312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153794371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153794910 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153794921 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 153795463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153796751 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 153796770 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 153796780 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 153796805 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 153796946 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153797602 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 153797707 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153797782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153798003 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153798019 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153798028 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153798058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153798063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153798357 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153798487 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153798599 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153799937 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 153799987 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 153800087 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 153800243 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 153801490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153801542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153801582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153802032 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153802071 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153802137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153802250 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 153802947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153802970 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153803153 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153803255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153803282 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 153803297 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 153803563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153803687 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 153803857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153803896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153803902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153803907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153803951 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153804261 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153804462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153804884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153804909 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153804920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153806193 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153813459 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 153813843 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153813853 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153814048 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153815368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153819008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153819715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153826253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153827210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153828796 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153829515 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 153829525 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 153829837 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 153829845 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 153829849 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 153830019 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153830498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153831648 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153831675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153831688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153831711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153831963 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153832158 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153832683 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 153833217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153833655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153834372 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 153834968 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 153834984 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 153835005 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 153835282 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153835471 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 153835532 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153835599 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153835671 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153835803 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 153836428 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153836865 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 153836874 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 153836881 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 153837365 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 153837442 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 153837446 T G Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 153837952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153838143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153839890 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153842106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153845569 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153846123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153848090 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153848531 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153855260 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153856556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153856575 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153856576 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153856871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153856913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153856922 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 153857175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153857194 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153857274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153857283 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153857342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153863112 T G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 153863627 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153863703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153863725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153863896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153864046 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153864412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153864415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153864425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153864509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153864563 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153864564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153864599 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153864656 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153864705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153864710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153864837 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153864915 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153864990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153865000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153867178 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153867308 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153867325 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153867357 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153867861 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 153867867 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 153868247 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 153868447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153868464 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153868792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153869120 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153869420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153869859 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153869976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153869980 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 153870424 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 153870557 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153870892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153871331 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153871475 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153871544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153871684 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153871774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153871847 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153872210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153872725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153872770 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153873093 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153873104 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153873132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153873329 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 153874304 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153874743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153875903 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153876157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153876291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153876608 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153876908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153877820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153878760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153879824 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153879846 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 153879983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153879992 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 153880464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153881510 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153881559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153881715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153881757 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 153882069 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153882357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153882661 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153882769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153882976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153883000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153883558 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 153883582 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 153883913 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 153883926 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 153883939 T G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 153883941 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 153884046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153884096 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 153884220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153884224 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153884310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153884976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153885016 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 153885038 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 153885078 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 153885187 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153885194 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 153885227 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153885244 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 153885267 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 153886230 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153886360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153886434 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 153886445 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 153886470 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 153886534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153886551 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 153886590 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 2 153886610 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 153886630 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 2 153886681 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 153890134 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 153890234 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 2 153890386 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 153891762 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 153891882 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153891978 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 153891992 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153892105 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 153892203 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153892221 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 153892487 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 153892945 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 153893133 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 153893332 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153893459 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153893779 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 153894159 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 153894194 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 153894386 T A N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 2 153894594 C G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 153894856 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 153894998 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 153895042 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 153895110 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 153895284 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 153895332 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 153895372 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 153895424 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 153895438 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153895440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153895500 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153895514 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153895669 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153895865 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 153895879 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 153895903 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 153895937 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 153896006 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153896154 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 153896170 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 153896177 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 153896308 C A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 153896415 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 153896445 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153896504 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 153896843 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 153896886 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 153896907 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 153896926 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153896969 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 153897033 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 153897117 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 153897405 C A N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 2 153897448 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 153897545 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 153897631 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153897643 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 153897675 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 153897717 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153897800 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153897847 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 153897966 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 153897969 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 153898039 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 153898096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153898129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153898150 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 153898161 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 153898418 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 153898529 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 153898605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153898692 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 153898765 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 153898892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153904109 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153904436 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153905235 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153906608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153908138 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 153908206 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 153908273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153908278 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 153908376 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 153908486 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 2 153908689 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153908718 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 153908781 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 153909161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153909258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153909323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153909749 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 153909760 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 153909825 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153909901 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 153909929 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153910040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153910181 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 153910205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153910322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153910366 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153910378 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153910382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153910389 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153910550 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153911200 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 153911434 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 153911508 A C Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 2 153911532 G A Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0 0.909090909090909 0.0909090909090909 10 12 0 10 1 2 153911654 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 153911996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153912018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153912033 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 153912083 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153912226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153912255 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153912490 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 153912714 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153912945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153912993 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153913036 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153920557 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 153920828 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 153920836 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 153920905 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 153921039 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 153921458 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 2 153921770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153921848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153921876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153921907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153921995 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 153922331 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 153922332 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 153922365 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 153922390 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 153922649 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 153922775 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 153922788 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 153922799 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 153922833 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 153922911 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 153922924 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 153922964 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 153922979 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 153923032 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 153923182 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 153923230 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 153923321 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153923327 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153923494 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 153923585 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 153923654 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 153923672 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 153923804 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 153923844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153923987 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 153924789 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 153924898 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 153924996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153925096 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 153925142 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 153925206 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153925214 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 153925317 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 153925362 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 153925363 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 153925395 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 153925449 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 153925493 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 153925640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153925740 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 153925814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153925834 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 153926152 A T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 153926244 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 153926342 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 153926349 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153926409 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 153926467 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 153926505 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 153926602 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 153926750 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153926892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153926908 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 153926995 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 153927015 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 153927028 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 153927314 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 153927348 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 153927481 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 153927567 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 153927589 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 153928231 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 153928537 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 153929501 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 153929848 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 153930385 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 153930754 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153930853 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 153931347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153931629 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153931804 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153931855 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153931884 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153931953 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153932013 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153932046 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153932084 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153932098 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153932132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153932325 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153932653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153932818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153933001 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 153933024 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 153933219 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153933229 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153933303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153933355 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 153933361 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 153933404 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153933408 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 153933418 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 153933479 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 153933490 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 153933494 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153933501 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 153933552 G T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 153933666 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 153933750 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 153933819 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 153933863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153933864 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 153933877 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 153933926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153933968 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 153934007 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 153934083 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 153934148 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 153934380 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 153934644 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153935170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153935290 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 153935308 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 153935353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153935428 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153935442 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153935679 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153935747 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153935854 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153935901 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153935952 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 153936103 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 153936840 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 153937218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153937301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153937434 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 153937449 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 153937462 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 153937496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153937595 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 153937603 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 153937703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153937971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153937999 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153938081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153938105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153938193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153938217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153938238 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153938495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153938662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153938701 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153938749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153938843 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153939832 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153940057 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153940162 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153940201 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153940224 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153940291 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153940326 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153940442 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153940481 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153940485 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153940584 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153940603 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153940717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153940949 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153941366 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153941746 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153941832 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153941891 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153941907 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153942129 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 153942180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153942253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153942272 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 153942275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153943614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153943619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153943744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153943869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153944008 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153944085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153944129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153944166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153944184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153944218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153944426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153944511 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153944582 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153944637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153944691 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153944696 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153944752 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153944928 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153944988 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153944990 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153945056 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153945162 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153945612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153945625 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153945710 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153945857 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153945913 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153945950 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153946206 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 153946269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153946547 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 153946770 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153946970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153947092 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153947107 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 153947177 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153947180 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153947323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153947554 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153947591 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153947731 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153947755 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153947774 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153947851 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153948095 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 153948157 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153948277 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153948479 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 153948547 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 153949108 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153949117 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153949157 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153949201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153949312 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153949423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153949438 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153949548 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153949558 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153949607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153949616 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153949671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153949744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153949749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153949778 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153949793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153949803 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153949906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153949923 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153949934 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153949939 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153949972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153950108 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 153950151 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 153950214 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 153950227 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 153950274 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 153950378 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153950400 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153950405 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153950451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153950511 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 153950581 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153950607 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 153950669 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153950721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153950748 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 153950768 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 153950770 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153950813 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 153950815 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 153951039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153951178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153951450 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153951523 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153951677 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153951719 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 153951758 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 153951769 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 153951793 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 153951933 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 153952145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153952158 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153952686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153952735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153952876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153953885 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153953955 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 153953980 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 153954264 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 153954266 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 153954277 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 153954291 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 153954325 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 153954458 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 153954480 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 153954572 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153954634 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153954644 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153954711 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 153954754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153954792 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153954800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153954813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153954832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153954873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153954985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153955231 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 153955281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153955353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153955462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153955474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153955558 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153955807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153955808 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153955828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153955847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153955954 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153956700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153956754 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153956785 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153957350 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153957382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153957468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153957569 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153957612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153957664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153957666 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153957679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153957833 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153961160 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153961222 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153961440 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153962956 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153963193 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 153963362 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153963539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153963632 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 153963804 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153963914 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153963997 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153964094 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153964154 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153964306 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153964346 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153964390 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153964857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153964926 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153965639 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 153965793 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 153965926 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 153965935 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 153965956 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 153965970 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 153966436 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153966612 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 153966619 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 153966705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153966823 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153966960 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153967021 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153967489 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153973829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153978703 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153979393 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 153983270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153984843 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 153986217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153990294 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 153990307 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 153990904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153991176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153991379 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153991561 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153991569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153991890 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153991992 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153994216 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 153994545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153994708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153995119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153995252 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 153995440 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 153995553 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 153995595 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 153995942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153996237 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 153996302 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153996394 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 153996445 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153996501 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 153996502 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 153996718 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 153996810 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 153996812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153996873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 153996881 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153996989 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 153997013 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153997045 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153997111 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 153997221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 153997906 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 153998339 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154006352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154007950 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154007957 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154008537 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 154010534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154014880 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154014928 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 154015485 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 154015581 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 154016166 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154016219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154016492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154016493 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 154016843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154016971 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154016993 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154017222 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154017241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154017682 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154017684 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 154017700 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154017955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154017964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154018034 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 154018152 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 154018278 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 154018325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154018332 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 154018456 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154018462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154018473 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 154018532 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154018545 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154018656 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 154018727 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 154018800 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154018932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154018996 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 154019016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154019031 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 154019033 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 154019138 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154019170 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154019187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154019212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154019249 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154019428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154019457 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154019721 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 154019723 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 154019733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154019799 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 154019869 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 154019879 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154020089 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154020110 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154020203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154020367 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 154020391 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154020405 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154020560 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154020679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154023631 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154024664 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 154024688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154024907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154025771 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 154025853 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 154025961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154025962 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 154026128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154026143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154026361 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154026373 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 154026474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154026505 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 154026589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154026613 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154026614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154026729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154026733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154026748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154026756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154027196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154027232 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 154027323 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 154027334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154027364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154027371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154027440 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 154027703 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154027714 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154027869 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154028159 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154028770 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154029075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154029726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154030111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154031990 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154033016 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154033062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154033161 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154033860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154033865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154033939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154033961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154034097 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154034187 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154034347 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154034364 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 154034414 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154034475 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154034480 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154034489 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154034626 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 154034671 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 154035013 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154035014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154035171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154035174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154035348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154035353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154036003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154036149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154037111 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154037150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154037192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154037269 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154037283 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154037335 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154037358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154037391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154037769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154037950 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154038089 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154038206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154038234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154038439 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 154038724 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 154038950 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154040109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154040958 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154041160 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154041276 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 154041277 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 154041336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154041467 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 154041819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154041991 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 154042070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154042109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154042246 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 154042446 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 154042523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154042721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154042736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154044321 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154044335 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 154045028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154045197 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 154045403 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 154045639 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 154046035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154047207 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154047728 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 154047788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154047880 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 154047881 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154047944 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 154048074 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 154048086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154048340 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 154048361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154048365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154049056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154050611 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154051614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154052061 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 154054467 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 154057300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154057771 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 154058254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154058608 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 154058617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154061813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154063056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154063143 G C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 2 154064919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154064921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154064945 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154064957 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154064998 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 154065177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154065217 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 154065273 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 154065330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154065456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154065490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154065498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154065504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154065756 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 154066036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154066480 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154066584 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154066599 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154066637 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154066724 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154066737 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 154066810 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 154066847 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 154066851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154066914 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154066945 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154066954 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 154069491 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154069706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154069772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154069789 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154069871 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154070321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154071147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154071170 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154071465 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 154072386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154072798 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154072921 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154072927 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154073023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154075029 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154076282 C G Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 154080400 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154081549 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154081962 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154081985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154082241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154085827 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 154086068 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.1 0.85 0.05 21 19 2 17 1 2 154086527 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 154086867 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 154093877 G T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 154095479 G C Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 154097419 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154101671 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154105537 A C Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 154107100 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154107611 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154107927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154107931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154108273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154108317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154108348 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154108846 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154108990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154109019 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 154109056 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 154109204 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 154109218 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 154109236 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 154109351 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154109376 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154109614 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 154109685 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154109731 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 154110093 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154110245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154110604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154110652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154110800 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154110910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154110936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154111345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154111422 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154111451 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154111581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154112015 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 154112214 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 154112413 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 154112966 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 154113189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154113423 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154114388 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 154116348 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154116427 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 154116458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154116511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154116591 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 154117683 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 154119066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154122110 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 154122494 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 154124708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154126954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154128463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154128468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154129050 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154129102 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154131336 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154132010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154132560 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154133849 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 154135237 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 154135556 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 154135890 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 154136367 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 154136614 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 154136676 T A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 154147658 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154151653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154154342 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154154713 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154155424 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 154155963 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154156002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154156756 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154156796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154157938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154157987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154158265 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154158703 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 154159025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154159404 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 154159945 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154160619 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 154160625 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 154160663 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154160922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154161196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154161675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154161695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154162237 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154163425 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154164066 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154165583 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154166969 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154167278 A G Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 154167286 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 154167330 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 154167629 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154168760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154169103 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154169667 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154169677 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 154170893 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 154171159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154172408 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154172924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154172937 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 154173704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154174921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154175175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154175269 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 154175976 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154177877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154178494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154178771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154178867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154178915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154178983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154179245 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154179730 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154185382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154185472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154185724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154185725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154186140 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154187394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154187693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154188992 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154190110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154190279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154191218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154191358 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154191735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154193356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154195113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154200072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154201270 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 154201290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154201373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154201384 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 154201564 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 154201771 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154202198 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 154202229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154203467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154203701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154203762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154204619 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154204770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154205548 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154205963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154205983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154207308 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 154209455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154209480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154210399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154211737 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 154212316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154213064 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154213974 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154214057 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 154215221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154215872 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154218434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154218572 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154219187 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154219198 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154220266 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.0833333333333333 0.75 0.166666666666667 11 13 1 9 2 2 154221560 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154222780 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154222835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154224538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154224588 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 154225339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154226200 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154227733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154228077 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 154228329 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154229146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154230465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154230884 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 154233974 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154234706 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154237086 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154237256 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 154238312 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 154239987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154240396 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 154241250 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 154242576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154242718 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154242783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154244850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154245022 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 154245875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154246958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154249540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154252072 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154253398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154253726 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154253733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154254643 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154256544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154257322 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154258247 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154259495 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154259698 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154261937 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154263597 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154271883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154276564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154277142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154277226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154278149 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154278256 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 154279864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154281654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154284109 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154286506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154287603 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154289093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154289365 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 154290862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154291560 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154292358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154293260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154293956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154294095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154294584 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154303136 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 154304291 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 154305887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154306025 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154306790 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 2 154311726 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154312195 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154314277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154315160 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154315752 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154322576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154323038 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 154323459 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 154323773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154324313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154324926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154327850 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 154328255 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154331969 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154333225 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154334823 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 154336499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154337350 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 154341261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154341290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154341326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154345376 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154345402 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154345807 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154349288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154349625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154351530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154351868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154354589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154355436 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154355453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154357219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154358801 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154361316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154362736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154366684 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154366715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154367343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154367751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154368823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154369842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154369900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154370477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154373108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154373131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154374713 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154375687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154377265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154383728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154387911 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 154388966 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154389006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154398363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154398743 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 154399753 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 2 154400107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154400555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154400676 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154404903 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 154404908 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 154404915 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 154405018 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154405117 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 154405234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154405416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154405555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154405588 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 154406167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154406467 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 154407061 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 154407739 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 154407796 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154407862 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 154407902 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 154408583 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 154409454 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 154409478 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 154409494 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 154409626 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 154409630 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154409680 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154409887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154409897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154410475 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154410693 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 154410703 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 154410711 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 154411034 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 154411178 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 154411264 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154411283 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 154411318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154411423 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154411801 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154411998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154413023 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154413361 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154414533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154415170 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154416855 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154420513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154420659 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154420914 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 154421154 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 154421840 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154421869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154421912 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 154422030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154422192 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154422253 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154422263 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154423012 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154423836 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 154424473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154425063 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 154425807 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154435307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154437125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154439438 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 154439442 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 154439467 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 154439474 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 154439521 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 154441018 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154445429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154445574 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154445684 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154448496 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154448596 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 154448603 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 154448857 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154449295 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154454310 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 154459508 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154459681 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154460667 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154460681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154460784 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154460814 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 154461022 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 154461193 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154461413 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154461516 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 154461530 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 154461602 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 154461617 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 154461791 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 154463150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154463513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154464838 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154467537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154468553 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154468921 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 154468939 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154469499 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 154469504 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 154469804 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154469939 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 154469970 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154470154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154470362 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154470470 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154470643 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 154470961 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154471010 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154471493 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 154472771 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154473021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154473049 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 154474061 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154474952 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154475074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154475096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154475418 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154475448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154475571 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 154475590 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154475627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154475650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154475726 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154475733 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154475777 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154476034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154476043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154476139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154476362 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 154476370 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 154476388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154476945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154477027 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154477214 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154477457 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154477805 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 154479106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154480460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154481012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154483103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154484806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154485282 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154485367 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154487332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154487713 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154488325 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 154490051 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 154496140 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154498742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154498972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154501654 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154504292 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154504416 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154504473 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154505455 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154506865 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154508331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154511756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154512920 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154515766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154516654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154518908 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154520122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154521533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154523096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154523333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154527961 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154529517 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154533110 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 154533382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154533555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154534041 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154536349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154537261 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154538562 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 154539925 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 154539930 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 154539942 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 154539957 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 154540087 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 154540480 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154540734 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 154540781 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 154540804 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 154541112 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 154541136 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 154541454 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154541565 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154541646 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154542126 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 154542214 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 154542372 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 154542837 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 154542987 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 154544043 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 154544191 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 154544576 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154544700 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154544719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154544903 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 154545088 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154545260 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 154545342 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 154545464 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154545625 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 154545934 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 154545951 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154546053 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154546731 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154546755 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154546846 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154547092 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154547193 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 154547203 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154547209 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154547440 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 154547587 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154547633 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154547664 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154547676 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 154547777 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154547839 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154547928 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154548203 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154548277 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154548459 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154548466 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154548522 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154548848 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154549340 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154549370 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154549490 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154549728 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154549754 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154549766 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154549795 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154549935 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154550135 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154550313 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154550348 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154552782 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154553277 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154553656 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 154553772 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 154553789 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 154553949 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 154554314 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 154554589 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154554701 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154555583 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 154555694 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154556205 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 154556444 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154556781 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154557087 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 154557230 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 154557246 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 154557362 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154557381 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154557468 G T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 154557713 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 154557920 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 154557967 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154558861 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154558872 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 154559047 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154559090 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154559108 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154559918 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154559981 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154560299 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 154560353 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154560439 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154560443 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154560547 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154560674 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154560949 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154561030 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 154561050 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 154561106 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 154561112 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 154561130 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 154561147 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 154561155 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 154561169 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 154561184 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 154561291 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 154561312 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154561339 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154561673 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 154561921 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 154562214 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 154562244 G T Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 154562292 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 154562342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154562379 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154562581 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 154562870 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154562936 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154563044 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154563073 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154563299 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 154563301 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 154563367 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154563403 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154563574 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154563733 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154563991 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154564142 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154564232 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154564251 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154564484 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154565072 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154565331 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154565453 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154565807 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154565863 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154565879 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154565888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154565891 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154565936 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 154566170 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154566183 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154566238 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154566304 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154566343 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154566380 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154566417 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154566471 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154566897 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154566996 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 154567008 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154567067 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 154567543 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154567669 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154567843 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154568505 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154568715 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154568936 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 154568960 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154569154 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154569342 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154569548 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154569661 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154569683 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154569698 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 154569779 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 154569926 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154569942 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154569964 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154570279 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154570321 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154570377 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154570442 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154570507 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 154570559 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 154570561 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 154570584 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154570626 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154570631 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154570643 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 154570861 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154570879 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154570883 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 154571069 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 154571116 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154571133 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154571165 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154571180 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154571191 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 154571212 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 154571442 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154571450 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154571544 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154571815 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 154572022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154572229 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154572351 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154572485 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154572559 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154573032 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154573040 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154573058 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154573079 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154573484 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154573501 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 154573521 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154573655 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154573697 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154573811 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154573955 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154574076 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154574220 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154574298 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154574429 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154574558 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154574630 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154574672 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154574817 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154574825 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154574832 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154574920 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154574971 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154574986 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154575523 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154575845 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154575874 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154575959 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154576146 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154576149 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 154576237 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154576245 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154576480 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 154576526 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 154576551 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154576613 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154576831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154577262 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154577682 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154577775 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154577957 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 154578310 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154578315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154578553 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154579163 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154579705 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154579753 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154579872 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154579894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154580219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154580695 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154580698 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154580785 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154580789 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 154580992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154581095 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154581144 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 154581193 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 154581206 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 154581355 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154581453 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154581459 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154581552 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 154581655 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154581672 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154581684 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154581693 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154581705 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154581741 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 154581763 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154581804 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154581813 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154581834 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154581895 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 154582390 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 154582775 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 154583206 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154583249 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154583279 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154583370 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154583383 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154583397 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154583403 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154583462 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 154583560 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154583712 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154583864 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 154583901 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 154583914 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154583924 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154583960 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154583988 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 154584313 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154584507 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154584687 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154584790 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 154584918 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 154584922 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154585137 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154585276 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 154585301 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 154585416 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 154585490 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154585585 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154585649 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154585848 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154585939 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154585956 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154585967 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154585983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154586007 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154586008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154586096 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154586222 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154586245 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 154586266 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154586317 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 154586338 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 154586426 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154586447 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154586513 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 154586530 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 154586543 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154586560 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 154586574 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 154586651 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 154587022 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 154587321 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 154587452 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154587516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154587580 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154588191 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154588206 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 154588357 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154588469 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 154588692 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154589027 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 154589239 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154589271 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 154590054 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154590120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154590661 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154590767 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154590870 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154590984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154591185 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154591545 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154592544 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 154594474 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 154594476 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 154594623 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 154594647 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 154594769 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154594865 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 154594886 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 154594925 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 154594971 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 154595657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154595713 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154595923 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 154595966 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 154596822 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154596965 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154596973 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154597018 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154597075 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154597343 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154597965 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 154598069 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154598389 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 154598952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154599738 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154599813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154599936 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154599983 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154600324 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154600377 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154600502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154600730 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154600941 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 154601066 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154601150 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154601243 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 154601304 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 154601429 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154601435 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 154601510 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 154601593 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 154601596 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 154601609 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 154601984 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154602001 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 154602010 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154602024 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154602145 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 154602168 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154602264 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154602286 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 154602448 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 154602600 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 154602612 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 154602704 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154602705 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 154602785 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 154602811 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154602971 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154603223 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 154603417 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 154603616 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154603758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154603767 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154604068 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154604333 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 154604685 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154604808 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154604958 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154605027 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154605142 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154605291 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154605493 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154605560 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154605585 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154605655 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154605987 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154606081 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154606092 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154606603 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154607089 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154607141 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154607214 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154607239 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154607257 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154607273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154607357 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 154607364 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 154607540 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 154607574 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154607592 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154607683 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154607696 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154607939 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154607958 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154608205 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154608621 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 154608714 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154610050 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154611973 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154611979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154612101 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154612497 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 154612499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154612845 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154612924 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 154613142 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 154613663 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154613775 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154613802 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154613936 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154614079 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154614129 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154614237 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154614280 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154614281 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154614335 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 154614432 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154614485 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154614493 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154614550 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154614557 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154614581 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154614597 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154614796 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154614846 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154614864 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154614901 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154614919 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154615563 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154616323 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154616409 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154616517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154618399 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 154618458 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154618550 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154618634 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154619925 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154620028 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154620044 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154620230 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154620414 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154620581 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154620699 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154620720 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154620730 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154621158 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154621732 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154621841 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154622081 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154623379 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154623533 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 154623633 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 154623715 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 154623893 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154623975 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154624032 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154624088 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154624152 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154624233 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154624361 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154624631 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154624779 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154624825 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154624888 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154624924 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154624953 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154624979 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154625150 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154625244 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154625282 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154625313 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154625354 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154625664 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154625827 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154625940 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154626065 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154626500 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 154626910 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 154627004 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154627005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154627192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154627221 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154627255 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 154627766 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 154627769 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 154628001 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 154628711 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154628774 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154628986 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154628993 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154629244 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154629371 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154629391 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154629804 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154629807 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154629930 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154629939 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154630280 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 154630519 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 154630961 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154631048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154631178 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154631337 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154631758 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154631840 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154631935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154631951 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154632127 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154632173 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154632215 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154632361 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154633141 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154633312 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154633551 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154633599 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154634063 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154634087 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154634655 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154634821 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154636029 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154636061 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154636120 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154636135 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154636200 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154636383 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154636384 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154636721 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154636722 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154637064 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154637138 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154637217 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154637260 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154637625 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154637748 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154637964 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154637969 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154638024 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154638137 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154638263 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154638346 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154638380 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154638435 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154638536 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154638793 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154638878 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154639223 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 154640017 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154640084 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154640368 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154640397 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154640481 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154640718 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154640756 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154640836 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154640916 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154640939 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154640994 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154641105 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154641254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154641529 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154641593 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154641714 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154641864 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154642417 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154642468 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154642915 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154643030 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154643320 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154643352 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 154643492 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 154643533 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 154643768 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 154644522 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154644590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154644981 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 154645041 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 154645145 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154645341 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 154645348 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154645462 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 154645544 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 154645972 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 154646496 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 154646512 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 154646973 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 154647410 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154647705 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 154647760 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 154647815 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 154647966 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 154648208 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 154648481 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 154648766 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 154648926 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 154649150 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 154649202 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 154649229 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 154649305 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 154649395 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 154649465 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 154649544 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 154649687 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154649688 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154650954 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 154651029 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 154651450 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 154651484 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 154651673 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 154651800 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 154651817 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154651965 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 154652058 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 154652611 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 154652765 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 154652927 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154653389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154653480 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 154653703 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 154653949 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 154654048 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 154654070 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 154654552 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154654556 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154654752 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154655036 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 154655193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154655294 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 154655352 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 154655763 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154656442 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 154657041 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154657415 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154657875 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154658773 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154658818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154659241 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 154659458 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154659507 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154659577 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154659731 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154660001 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154660091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154660169 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154660217 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154660537 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154660914 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154661032 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154661079 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154661084 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 154661120 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154661453 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154661639 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154662749 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154663046 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154663269 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154663367 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154663567 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 154663956 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 154663960 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 154663971 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154664009 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154664019 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154665077 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154665251 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 154665866 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154665879 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154666157 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154666240 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154666256 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154666492 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154666865 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154667027 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154667054 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154667451 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 154667452 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154667506 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154667583 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 154667644 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 154669085 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 154669478 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 154669891 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 154669894 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 154670090 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154670223 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154670471 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154670679 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154670985 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 154671368 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154671475 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 154671806 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 154671807 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 154672064 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154672377 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 154672449 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 154672805 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154673176 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154673177 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154673194 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154673252 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154673981 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154674500 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 154674741 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154674886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154675202 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154675795 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154676424 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154676489 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154676606 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154676656 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154676742 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 154676754 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 154677232 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154677344 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154677724 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154677981 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 154678680 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154678704 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154679481 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 154680389 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154680656 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154680705 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154680733 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 154680735 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154680751 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154681306 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154681699 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 154682512 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 154682635 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 154683560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154683833 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154684086 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154684089 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154684163 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154684237 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154684960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154685051 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154686210 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 154686574 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154686591 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154686650 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154688010 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154688046 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154688517 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154688708 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154689905 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154690072 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154690507 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154690528 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154690635 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154691402 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154691434 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154691788 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154691846 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154691866 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154693044 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154693458 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154693914 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154694039 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154694165 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154694372 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154694475 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154695249 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154695473 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 154695563 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154695631 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154695869 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154696007 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154696247 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154696947 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154696975 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154697207 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154697455 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154697649 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154698008 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154698164 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154699162 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154700587 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154700881 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154701447 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154701822 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154701929 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154702208 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154702909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154703172 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 154703186 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154705079 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 154706832 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154707348 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154708696 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154708701 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154708840 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154708972 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154709440 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154709469 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154710880 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154711206 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154711653 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154712256 C T Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 154713310 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154713686 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154714392 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 154715200 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154715480 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154715556 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154716449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154716505 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154716509 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154716870 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154717368 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154717677 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154717999 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154718877 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 154718914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154719125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154719423 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154719992 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154720063 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154721750 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154722083 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154722161 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 154722308 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 154722349 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154723686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154727115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154727461 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154728348 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154728478 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154728495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154728710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154729159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154729555 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154729822 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 154729954 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154730186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154730302 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154730428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154730704 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154730901 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154730928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154730942 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154731113 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154731313 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154731374 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 154731680 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 154731937 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 154732251 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154732284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154732291 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154732320 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154732340 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154732358 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154732416 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154732696 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154732981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154732984 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154733007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154733081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154733216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154733238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154733300 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154733543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154733575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154733596 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154733762 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154733820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154733831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154734118 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 154734154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154734387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154734466 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154734467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154734511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154734564 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154734638 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 154734840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154734877 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 154734934 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154734943 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154734981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154735165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154735217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154735266 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154735463 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 154735571 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 154735666 T A N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 2 154735731 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 154735826 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 154736370 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154736437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154736691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154736749 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154737261 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154737314 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154737446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154737507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154737565 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154737910 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154737956 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154738014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154738060 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154738611 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154738630 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154738867 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154739439 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154739842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154740221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154740261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154740309 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154740333 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154740419 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154740576 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154740835 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154740852 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154741040 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154741097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154741478 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 154741617 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154741670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154741685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154741835 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154741857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154741997 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154742152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154742484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154742536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154742573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154742809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154742889 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154742896 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154742939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154743083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154743087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154743098 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154743158 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154743192 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154743308 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 154743355 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 154743455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154743602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154743669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154743758 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154743780 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154743927 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154743959 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154743981 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154743988 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 154744065 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154744123 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 154744159 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 154744162 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 154744171 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 154744208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154744306 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154744323 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154744381 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154744442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154744449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154745466 G A N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 154745535 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 2 154745858 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154745876 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154745892 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154747160 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154747238 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154747241 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154747286 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154747508 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154747537 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154747549 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154747563 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154747614 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154748600 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 154749046 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154749053 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 154749304 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 154749462 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154749573 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154749644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154750068 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154751518 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154751538 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154751596 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154751709 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154751795 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154751938 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 154752653 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 154752673 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154752922 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154752970 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154753343 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 154755258 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154755724 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154755852 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 154755938 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 154757034 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154757038 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154757285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154757598 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154757784 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154758058 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 154758070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154758101 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 154759565 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 154759567 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 154760141 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 154760183 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 154760341 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154760442 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154760532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154760597 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154760749 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154760839 G C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 154761046 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 154761049 T A Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 2 154761905 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 154762004 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154762145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154762315 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154762373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154762550 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 154762662 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 154762920 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154763070 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 154763121 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154763310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154763492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154763510 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154763514 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154763809 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154763846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154764124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154764564 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154764642 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154764978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154765316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154765331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154765393 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 154765896 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 154766080 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154766111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154766113 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154766128 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154766831 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 154767098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154767319 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154767328 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154767537 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 154767821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154767993 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154768459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154769004 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 154769072 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154769265 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154769576 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 154769630 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 154769793 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 154769827 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 154769958 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154769987 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154770127 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154770162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154770369 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154770491 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 154770572 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154770778 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154770851 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154770899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154770902 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154770920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154770957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154771107 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 154771169 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 154771210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154771262 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154771415 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 154771504 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154771531 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154771586 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154771629 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154771725 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154771978 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154772007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154772231 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154772296 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154772320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154772552 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 154772583 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 154772719 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154772790 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154772792 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154772841 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154772884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154772890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154772895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154773049 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154773053 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154773060 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154773068 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154773071 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154773100 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154773131 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154773197 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154773246 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154773309 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154773364 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154773500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154773540 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154773566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154773585 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 154773646 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154773699 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 154773710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154773731 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154773807 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154773841 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154773869 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154774052 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154774340 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154774470 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154774479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154774665 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154774683 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 154774688 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 154774707 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 154774747 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 154774771 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 154774876 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154774881 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154774921 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154774966 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154775012 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154775061 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154775062 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154775107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154775181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154775182 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154775270 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 154775301 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154775351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154775360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154775404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154775448 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154775453 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154775583 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154775640 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 154775683 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 154775716 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154775734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154775893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154775913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154775930 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 154775978 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154776000 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154776045 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154776108 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154776206 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154776452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154776525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154776594 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154776674 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 154777692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154777859 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154778197 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154778217 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 154778227 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154778275 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 154778291 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154778292 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154778312 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 154778339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154778439 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154778548 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154780438 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154780545 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154780557 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154780808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154780863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154781021 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 154782253 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154782344 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154782667 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154782798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154782840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154782862 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154782905 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154782916 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154783002 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 154783050 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154783356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154783402 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154783470 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 154783515 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154783591 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154783658 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 154783727 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 154784070 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 154784100 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154784101 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 154784204 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 154784251 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154784424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154784570 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 154784626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154785011 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154785383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154786500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154787113 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154787118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154787484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154787593 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 154787901 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154788179 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154788602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154788628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154788635 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154788711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154788788 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154788910 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154788953 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154789236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154789248 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154789903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154789934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154790041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154790090 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154790139 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154790329 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154790331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154790519 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154790587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154790649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154790896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154790945 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154791670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154791739 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154791746 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154791782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154791800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154791808 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154791819 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154791824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154792138 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154792221 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792343 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792400 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792416 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154792519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792537 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154792991 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154793007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154793391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154793458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154794797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154796408 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154796437 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 154797359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154798527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154798585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154800711 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154801926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154803705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154804548 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 154804577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154804859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154805946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154806051 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154806091 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154806148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154806241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154807975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154808048 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154808371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154808382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154808409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154808446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154809030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154809225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154809676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154809867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154809993 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154810261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154811033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154811059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154811205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154811242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154811419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154811542 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154811607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154811981 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154812091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154812104 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154812173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154812182 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154812202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154812215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154812383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154812504 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154814247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154814520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154814585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154815216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154816234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154816297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154816340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154817003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154817391 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154817854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154818214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154818325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154818492 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154818626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154818632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154818746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154818759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154818814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154818910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154818982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154819094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154819136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154819181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154819461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154819602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154819822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154819858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154819904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154820229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154820521 C T Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 154820580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154820687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154820739 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154820810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154820831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154820851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154820852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154820873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154820941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154821057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154821092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154821306 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 154821463 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 154821485 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 154821562 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154821578 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154822197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154822213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154822249 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154822308 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154822320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154822323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154822411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154822447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154822487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154822565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154822869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154823104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154823650 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154823682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154823704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154823709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154823806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154823813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154823825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154823829 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154823880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154823893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154824166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824190 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824359 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154824443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824620 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154824991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154825019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154825194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154825308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154825582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154826205 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 154826244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154826511 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154826528 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154826556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154826767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154827334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154827808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154827859 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154828081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154828214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154828731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154829175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154830023 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154830468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154831060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154831123 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154831505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154831586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154831901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154831911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154831971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154832007 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154832053 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154832427 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154832462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154832464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154832973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154833899 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154835035 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154835703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154835925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154836034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154836045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154836332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154836353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154836463 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154836590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154836751 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154836865 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154836895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154836897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154836972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154837260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154837276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154837304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154837311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154837688 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154838200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154838205 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 154838535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154838581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154838775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154839361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154839394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154844329 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 2 154844398 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 154844413 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 2 154844429 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 2 154844464 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 154844512 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 154844647 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 154857609 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154857976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154858042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154858195 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154858691 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154858914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154859044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154859588 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 154859740 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 154860221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154860983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154861044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154861075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154861482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154862072 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154862177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154862267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154862296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154862480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154862539 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154863155 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 154863507 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 154863562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154865691 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154865761 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154867245 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154868765 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154868890 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 154869644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154869837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154869849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154870908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154870934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154871639 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 154872606 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154873061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154873127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154873403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154873851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154875430 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 154875925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154876536 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 154876860 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 154876903 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 154876937 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 154877058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154877061 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 154877139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154877247 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 154877486 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154877517 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 154877594 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 154877654 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 154877778 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 154877879 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 154878043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154878115 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 154878118 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 154878218 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 154878285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154878288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154878592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154878640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154878709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154878785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154878788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154879205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154879253 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 154879622 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 154879672 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 154880660 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154881626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154883360 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 154883641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154883807 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 154885025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154886830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154886959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154887566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154888617 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154889089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154890219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154890229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154890349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154890634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154890649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154890720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154890803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154890859 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154890891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154891559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154891570 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154891599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154891697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154891819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154891854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154891878 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154891898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154892655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154892690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154892752 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154892901 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154892904 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154892958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154893183 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154893393 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154893521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154893563 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 154894039 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154894060 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154894079 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154894080 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154894164 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154894217 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154894418 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154895058 G C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 154895461 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154895510 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154895741 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154896328 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154896370 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154898835 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154899164 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154899405 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154899418 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154899552 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154899851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154901079 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901099 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 154901100 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901384 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901425 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901436 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901547 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901657 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901660 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901760 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901765 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901788 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901828 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901840 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901858 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901874 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154901891 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154901901 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 154902199 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 154902311 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 154902324 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 154902358 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 154902472 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154902493 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154902678 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154903057 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154903712 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154903924 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154904123 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154904186 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154904341 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154905134 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154905846 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154905941 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154905967 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154906035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154906120 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154906176 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154906686 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154906769 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154907224 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154907280 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154907506 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154907976 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154908104 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154908130 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154908312 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154908380 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154908381 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 154908659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154908666 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154908753 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154908761 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154908765 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154908813 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154908814 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154908940 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154909070 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154909185 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154909257 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154909277 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154909388 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154909389 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154909744 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154909953 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154910251 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154910391 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154911151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154912422 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154912905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154912997 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154913645 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154914409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154914455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154914550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154914652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154915162 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 154915416 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154915786 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154916024 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154916090 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154916160 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154916295 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 154916434 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154917364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154917768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154919312 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154919778 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 154919993 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154922105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154922429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154924355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154924531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154924626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154924692 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154925719 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154925953 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154925994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154926139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154926350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154926572 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154926882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154926998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154927027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154927036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154927077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154927113 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154927627 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154927855 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154928029 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154928124 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 154928241 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 154928575 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154928678 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154928733 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 154928748 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154928872 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 154928884 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 154929432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154929477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154929664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154929666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154929690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154929696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154929713 A C Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 154929801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154929822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154929881 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154930526 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154930633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154930781 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154930882 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 154931062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154931081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154931403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154931448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154931508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154931761 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154933087 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154933333 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154933509 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154933847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154934292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154935374 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154935741 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154936195 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154936340 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154936347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154936581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154936865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154936866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154936885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154936887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154936981 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154937122 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154937363 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154937380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154937408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154937442 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154937530 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154937554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154937699 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154937770 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154938715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154938815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154938920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154939156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154939232 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154939621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154939851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154939895 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154940338 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154940359 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154940481 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 154940485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154940854 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154940918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154941076 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154941266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154941352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154941369 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154941381 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 154942155 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154942259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154942369 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154942428 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154942569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154943222 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154943423 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154943424 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154943473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154943735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154943750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154943912 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154943925 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154944222 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154944321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154944419 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 154944896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154944910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154945088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154945845 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154945951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154946650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154954150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154954389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154954411 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 154954781 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154954792 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154956326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154957060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154957781 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 154958159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154958176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154958884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154959237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154959570 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 154959926 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154960279 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154960347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154961305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154961325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154961430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154961463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154961950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154961955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154961979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154962142 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154962692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154962768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154962779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154963114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154963172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154963540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154963812 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154964072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154964090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154964160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154964251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154964937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154965727 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 154966494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154966603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154967180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154967330 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154967349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154967579 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154967593 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154967626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154967917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154967988 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 154968355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154968600 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154969334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154969795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154969953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154969955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154970119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154970367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154970513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154970855 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154971078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154971562 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 154971577 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154972350 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154972641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154972693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154973094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154973215 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154973454 A C Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 154975017 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154975061 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154975234 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154975321 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154975453 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154975670 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154976297 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 154976478 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 154977023 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 154977053 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154977183 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154977194 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154977265 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154977762 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154977829 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154978365 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154978855 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154979346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154981484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154982045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154982491 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 154983770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154983894 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154984002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154984187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154984576 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 154984716 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154985091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154985578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154985842 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 154985843 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 154985882 T A N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 154985883 T A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 154985990 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 154985997 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 154986149 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154986489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154986537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154987353 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154987636 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 154987714 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 154987797 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154987833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154987860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154987912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154987921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154987987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154988139 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154988428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154988479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154988856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154988930 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154989264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154990370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154990397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154990941 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 154991158 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154991191 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154991326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154991370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154991631 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154991833 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154991834 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154992043 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 154992220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154992223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154992460 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154992464 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154992610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154992717 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 154993262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154993813 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154993910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154994032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154994089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154994379 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 154994643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154994732 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154994779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154994863 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 154994864 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 154995005 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154995597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154995785 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 154995816 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154995924 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 154995999 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 154996096 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154996458 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 154997175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154997615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154997765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154997997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154998436 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154998476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154998494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154998852 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 154998887 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 154999633 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 154999849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154999866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 154999893 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 154999928 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 154999956 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155000114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155000385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155000820 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 155001003 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 155001005 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155001413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155001624 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155001722 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155002106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155002121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155002290 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 155002388 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 155002473 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 155002991 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 155003041 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 155003665 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155003700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155003859 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 155003929 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155004403 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155004434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155004898 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155004906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155005259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155005359 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155005463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155005543 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 155005686 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155005712 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155006573 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155006737 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155006741 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155006816 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155006826 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155007134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155007643 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 155008558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155008729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155008731 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155009020 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155009057 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155009196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155009221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155010703 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155010747 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 155010784 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155011443 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155011721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155011766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155011770 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155011783 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155012229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155012424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155012720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155012858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155012965 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 155013007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155013037 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155013122 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155013247 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155013631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155014584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155014656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155015223 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 155015654 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155015671 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155016055 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155016158 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155016367 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155016482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155016646 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155016727 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155016888 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155016929 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 155017154 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 155017248 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 155017274 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 155017419 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155017420 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155017525 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155017565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155017610 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155018564 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155018845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155019312 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 155019543 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155019888 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155020126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155020176 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155020194 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155020453 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155020795 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 155020841 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 155020926 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 155020968 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 155021189 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155021521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155021550 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155022085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155022140 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155022516 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155022633 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155022656 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155022713 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155022730 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155022819 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155023025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155023123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155023714 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155023901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155023939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155023964 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155024399 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155024931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155024974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155025577 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155025958 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155026073 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155026204 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 155026264 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155026540 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155026720 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155026734 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155027280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155027387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155027647 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155028121 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155028122 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155028546 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 155028920 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155028970 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155029811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155030030 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155030203 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155030232 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155030254 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 155030624 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 155031028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155031032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155031103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155031216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155032323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155032532 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155032855 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155033335 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155033397 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155033410 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155033481 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155033485 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155033973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155034115 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155034142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155034231 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155034286 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155035189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155035571 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155035607 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155035647 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155035803 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155035921 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155035950 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155036027 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 155036170 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155036188 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155036484 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155036576 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155036732 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155036806 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155036887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155037048 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155037078 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155037191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155037243 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155037589 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155037923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155037970 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155038215 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 155038507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155038728 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155038862 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155039060 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155039098 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155039214 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155039415 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 155039416 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 155039575 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155039892 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155039913 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155041397 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155041467 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155041696 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155041823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155042522 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155042642 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155043093 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155043105 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155043863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155043931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155043944 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155044193 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 155044253 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155044557 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155045011 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 155045126 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155045241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155045260 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155045450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155045466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155045743 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155045787 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155045891 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155046057 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155046152 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155046155 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155046218 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155046351 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155046461 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155048125 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155048162 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155048418 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155048575 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155048726 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155050048 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155050536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155051503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155051561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155051658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155053300 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155055116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155055320 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155055417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155055632 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155056944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155058951 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155059001 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155059068 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155059201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155060242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155060319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155060428 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155060764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155060850 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155060886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155061032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155061096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155061586 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155061810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155061816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155062061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155062146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155062187 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155062393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155062513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155062624 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155062893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155063103 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155063160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155063306 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155063307 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155063337 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155063348 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155063357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155063704 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155063882 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155063915 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155063938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155064044 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155064148 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155064154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155064736 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155065073 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155065074 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155065323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155065427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155065529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155065793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155066338 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155066365 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155066549 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155066669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155066675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155066858 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155066941 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155066962 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155067331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155067483 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 155067989 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155068390 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155069773 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155070495 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155071200 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155071721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155072409 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155072599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155072694 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 155073030 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155073133 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155073323 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155073327 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155074535 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155074708 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155074794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155075513 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155075514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155076157 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155076177 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155076661 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155076680 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155076776 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155077154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155077259 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155077282 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 155077547 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155078097 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 155083904 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 155084557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155084637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155084916 C T Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 155084974 A G Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 155085706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155086500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155086582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155086642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155086653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155086757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155086795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155087450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155087943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155088072 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155088117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155088125 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155088285 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155088352 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155088355 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155088415 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155088429 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155088432 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155088676 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155088690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155089190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155089423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155089734 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 155089765 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155089940 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155090027 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155090242 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155090303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155090394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155090414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155090571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155090610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155090670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155091088 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155091106 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155091184 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155091185 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155091195 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155091196 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155091608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155091685 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155091756 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155091801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155091895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155092012 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155092013 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155092036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155092179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155092195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155092282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155092545 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155092548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155092568 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155092579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155092649 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 155092753 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155093043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155093077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155093090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155093536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155093656 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155093661 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155093706 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 155093795 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155093823 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155093866 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155093957 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155094005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155094570 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 155094808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155094854 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155094908 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155094990 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 155095148 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155095423 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155095703 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 155096067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155096615 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155096617 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155096638 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155097545 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155098040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155098287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155098327 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155098341 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155098392 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155098406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155098428 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155098485 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155098508 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155099017 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155099055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155099763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155100036 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155100219 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155100403 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 155100461 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 155100796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155100955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155101918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155101941 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155102800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155105183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155105274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155106414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155107490 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155107670 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155107839 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155108194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155108590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155108984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155109050 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155109170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155109182 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155109392 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155109447 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155111062 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155111184 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155111602 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155111841 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155111891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155111896 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 155112033 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 155112060 A G N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 155112172 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155112643 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155112674 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155112779 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155112927 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 155113878 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155113898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155114329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155114399 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155114434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155114446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155114458 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155114583 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155114611 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155114654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155114662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155114719 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 155114752 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155114877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155114923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155114980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115043 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155115139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155115418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115463 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155115499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115531 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155115584 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115780 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155115983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155115985 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155116091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155116170 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155116190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155116254 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155116310 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155116323 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155116430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155116541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155116554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155116570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155116655 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155116695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155116773 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155116805 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 155117222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155117448 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 155117657 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155118130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155119114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155119144 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155120318 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155120517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155120520 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155120553 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155120635 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 155120650 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 155120705 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 155120872 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155120900 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155120937 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155121508 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155121539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155121554 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155121568 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155121989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155122341 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155122385 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155122591 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155122598 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155122735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155122968 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155123002 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155123101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155123199 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155123337 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155123542 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155123668 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155123865 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155124231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155124421 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155124424 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155124580 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155124644 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155124728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155125343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155125351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155125600 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155127274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155128551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155128580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155128799 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155129031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155129495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155130143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155131480 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155132308 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155132574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155133421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155133434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155134366 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155135004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155135332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155135350 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155135364 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155136706 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 155136881 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 155136904 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 155137867 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155137979 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155138060 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155138074 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155138077 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155138157 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155138196 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155138200 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155138280 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155138395 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155138407 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155138427 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155138449 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155138724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155138768 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155139473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155139482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155139629 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155139667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155139767 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155140139 A G N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 155140572 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155140714 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155140724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155140865 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155141013 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155141022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155141176 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155141294 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155141310 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155141313 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155141332 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155141356 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155141630 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155141746 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155142037 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155142140 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155142161 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155142224 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155142265 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155142317 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155142344 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155142385 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155142456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155142901 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155142933 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155142994 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155143015 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155143529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155143686 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155143824 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155143897 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155144559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155144743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155145121 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155145198 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155145262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155145623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155145654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155145670 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155145832 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 155146106 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155146305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155146953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155147486 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155147528 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155147579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155147735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155147879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155148182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155148609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155148611 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155149212 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155151746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155151897 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155152331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155152567 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155153122 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 155153504 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155153555 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155154647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155154690 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155154790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155155156 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155155583 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155157730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155159440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155161490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155161491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155161771 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155161782 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155161874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155161895 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155162935 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155163003 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155163216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155163288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155163977 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155164051 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155164344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155164619 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155164717 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 155165579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155165593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155166611 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155166654 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155166696 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 155167015 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155167270 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155167343 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155167432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155167871 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155167877 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155168001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155168363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155168452 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155169021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155169110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155169117 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155169133 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155169167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155169426 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155169434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155169507 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155169515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155169731 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155169912 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155170241 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155170514 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155171224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155171902 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155172139 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155172257 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155172461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155172525 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155172531 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155172577 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155173032 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155173095 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155173128 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155173225 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155173331 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155173548 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155173614 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155173657 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155173662 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155173677 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155173740 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155174286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155174301 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155174563 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155174743 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155174746 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155174784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155174806 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155174995 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155175021 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155175029 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155175112 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155175119 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155175157 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155175169 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155175283 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155175339 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155175361 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155175404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155175420 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155175455 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155175515 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155175570 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155175919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155175968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155176076 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155176113 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155176363 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155176473 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155176479 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155176710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155176745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155176843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155176905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155177083 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155177096 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155177299 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155178152 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155178467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155178683 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155178818 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155178863 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155178937 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155179426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155179556 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155179596 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155179821 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155180322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155180406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155180739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155180762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155181063 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155181122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155181125 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155181192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155181355 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155181443 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155181447 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155182092 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155182559 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155182699 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155183277 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155183441 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155183866 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155183886 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155184064 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155184358 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155184617 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155184780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155184884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155185407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155185572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155185603 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155185773 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155186203 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155187518 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155187615 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155187920 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155188203 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155188324 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155188351 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155188679 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155188729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155188775 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155188840 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155188910 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155188933 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155188934 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155189010 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155189079 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155189105 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155189142 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155189213 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155190059 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155190070 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155190078 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155190129 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155190183 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155190194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155190360 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155190387 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155190756 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155190900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155191106 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155191145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155191475 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155191555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155191563 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155191614 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155191740 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155191877 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 155191928 C A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 155192454 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155192457 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 155192804 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155192984 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155193028 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 155193060 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155193091 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155193445 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155193540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155193956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155194097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155194169 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155194377 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155194616 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155194773 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155195927 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155195928 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155196214 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155196415 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155196500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155196833 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155197227 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 155197511 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155197636 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155197652 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155197688 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155197902 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155198111 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 155198230 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155199456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155200385 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155200827 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155200853 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 155201256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155201400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155201675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155201775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155202122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155202139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155202235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155202502 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155202601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155202643 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155202868 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155203860 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155203907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155204361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155204384 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155204592 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155205029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155205608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155205744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155206484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155206707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155207021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155207122 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155207378 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 155207769 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155208011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155208345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155208833 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155209425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155209474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155209739 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155209819 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 155210561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155211032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155212753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155213209 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155214316 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 155214888 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155215537 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155215862 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155216798 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155218364 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155218572 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 155218613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155219321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155220500 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155220514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155220525 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 155220527 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 155221390 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155221654 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155221781 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155222020 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155222306 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155222675 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155222807 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155222823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155223002 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155223458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155223555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155223733 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155224605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155224902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155225040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155225070 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155225082 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155226107 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 155226133 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155226574 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155226606 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 155227402 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155227701 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155227863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155227991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155228618 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155229521 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 155230318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155230395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155230652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155231022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155232526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155234314 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155234612 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155234945 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 155235961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155236701 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 155236722 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 155236766 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 155236912 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155237028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155237058 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155237791 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155237929 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155237965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155238062 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155238122 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155238485 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155238701 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 155238825 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155238988 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155239092 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155239148 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 155240259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155242363 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155242647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155242752 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155242840 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155243293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155243338 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155244207 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155244648 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155247451 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 155248371 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155248895 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 155249934 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155249993 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 155250082 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155250164 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 155251430 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 155251720 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 155251880 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155252021 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155252294 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155252389 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155252455 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155252494 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 155252500 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 155252543 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 155252660 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 155253715 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155253732 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155253752 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155254187 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155254210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155254219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155254252 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155254888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155255534 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155255779 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155256660 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155256725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155256736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155256740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155256776 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155256813 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155256842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155256848 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155256927 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155256930 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155257720 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155257866 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155258354 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155258457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155258764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155259536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155259628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155259833 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155260263 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155260476 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155260651 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 155262726 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 155263070 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 155263128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155263173 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 155263453 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155264162 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 155264506 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 155265103 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 155265644 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155265661 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 155266064 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155266097 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155267513 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 155267541 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155267568 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155267569 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155267581 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 155267690 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155268097 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 155268505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155269389 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155269629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155269704 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155270389 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155270399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155270460 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 155270534 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155270568 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155270875 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155270899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155271069 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155271387 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155271477 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155272939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155273294 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 155273653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155274547 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155275070 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 155275526 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155275531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155275922 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155276155 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155276170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155276364 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 155276400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155276748 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 155277945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155278461 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155278938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155278987 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155279008 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 155279011 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 155279052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155279055 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155279765 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155279788 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155280400 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155283542 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 155285622 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155285627 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155285694 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 155286406 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155286619 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155286653 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 155286859 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155287103 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155287900 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155288468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155289072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155289127 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 155290145 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 155290444 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 155290805 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 155290830 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 155291384 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 155291412 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155291474 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155291770 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155291877 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 155292018 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 155292380 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155292401 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155293246 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155293514 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155293587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155293730 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155295660 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155295756 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155296217 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155296355 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155297114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155297116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155297870 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 155298216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155298326 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155298870 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 155300355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155300455 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155300657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155300668 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 155301899 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 155302637 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 155302850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155304253 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155304658 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 155305164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155305653 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155305666 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155305762 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155306871 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155307597 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155307920 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 155308019 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 155308059 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 155308294 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155308397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155309248 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 155309389 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155309466 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155309486 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155309622 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155309658 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155309695 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155309721 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 155309849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155309871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155309893 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155309934 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155309936 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155310011 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155310067 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155310068 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 155310084 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155310087 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155310247 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 155310655 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155310684 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155310705 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155310707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155310732 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155310827 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 155310993 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155311460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155311905 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155312116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155312197 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155312210 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 155312294 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155312439 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155312827 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155312851 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155313407 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 155313424 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 155313447 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 155313463 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 155313588 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155313771 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155313837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155313974 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155314003 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 155314072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155314087 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 155314103 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155314709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155314737 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 155314832 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155315045 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155315401 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155315763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155315970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155316037 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155316041 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155316065 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155316585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155317180 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155317221 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155317226 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155317266 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155317324 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155317376 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155317733 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155317746 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155317756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155317792 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 155317941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155317993 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155318005 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 155318061 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155318722 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155319600 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 155319604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155319713 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 155320381 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155320770 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155320859 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155320860 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155320933 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155321334 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 155321553 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155321675 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155321886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155322068 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 155322094 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 155322317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155322515 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155322561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155322605 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155322716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155322743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155322754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155322773 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 155322811 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155322828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155322895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155323177 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155323238 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 155323249 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155323252 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155323335 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155323353 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155323591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155323784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155323881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155324025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155324156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155324173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155324186 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155325055 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155325062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155325067 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155325268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155325350 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 155325634 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155325719 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155325782 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155326008 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155326140 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155326142 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155326211 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155326557 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 155326566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155326766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155326868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155327057 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155327069 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 155327282 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 155327303 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155327305 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 155327427 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155327491 T A N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 155327628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155327834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155328153 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155328205 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 155328662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155329590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155329772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155329955 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155330303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155330977 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 155331266 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155331347 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155331391 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 155331415 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155331602 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155332528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155332551 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 155332644 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 155332936 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155333060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155333157 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155333379 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155333934 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155335636 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155336612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155337358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155337620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155337810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155338069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155338109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155338154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155338319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155338453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155338575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155338638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155338675 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155338691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155338810 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155338852 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155338853 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155339085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155339111 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155339633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155339634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155340051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155340902 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155340982 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155341177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155341209 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155341389 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 155341658 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 155341843 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155341848 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155342170 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155342224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155342226 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155342277 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155342317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155342323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155342343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155342359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155342927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155343633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155344134 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155344609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155344667 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155344679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155344894 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155345026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155345036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155345051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155345083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155345202 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155345214 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155345311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155345363 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155345454 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155345486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155345685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155345787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155345913 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155345940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155346017 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155346316 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155346387 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155346516 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155346580 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155346618 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155346847 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155347064 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155347275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155347282 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 155347395 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155347513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155347524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155347554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155347559 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 155347576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155347642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155347653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155347657 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155347757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155347978 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 155347997 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 155348027 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 155348181 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155348225 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155348237 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155348271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155348299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155348308 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155348328 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155348376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155348396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155348413 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155348478 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155348558 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155348695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155348717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155348749 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 155348791 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 155348889 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155348900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155348931 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155348980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155349006 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 155349066 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155349095 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 155349276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155349290 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155349425 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155349562 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155349592 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155349786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155349815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155349881 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155349898 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155349917 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155350109 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155350220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155350227 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155350584 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155350664 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 155350699 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 155350714 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 155350727 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155350760 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 155350963 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 155350993 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 155351173 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 155351223 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 155351261 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 155351322 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 155351469 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 155351671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155351727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155352104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155352242 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155352297 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155352376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155352558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155352614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155352751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155352841 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155352865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155352984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155353099 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155353143 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155353217 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155353325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155353390 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155353658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155353696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155353767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155354395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155355220 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155355811 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155356177 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 155356257 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155356340 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155356342 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155356588 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155356629 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155356713 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155356734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155356986 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155357084 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155357218 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 155357235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155357488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155357668 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155357787 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155357799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155357898 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155358000 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155358101 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155358112 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155358191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155358315 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155358586 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155358606 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155358711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155358800 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155358844 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 155358887 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 155359132 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155359147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155359273 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 155359329 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155359387 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155359412 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155359450 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155359543 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155359917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155360117 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155360136 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155360350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155360623 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155360794 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 155360882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155361112 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155361290 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155361737 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155361738 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155361844 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155361981 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155362396 T C N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 155362408 T A N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 155362814 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155363189 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155363524 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155363572 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155363647 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155363673 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155363700 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155363752 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155364884 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155365123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155365353 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155365741 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 155366293 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155367157 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155367434 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155368673 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155368899 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155369177 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155369257 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155369312 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155369439 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155369757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155370000 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155370381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155371143 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155371180 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155371182 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155371203 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155371488 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155371550 A C Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 155372338 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155372417 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155372800 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155372867 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155372896 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155372991 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155373015 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155373283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155373378 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155374399 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155374455 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155374571 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155374661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155374673 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155374762 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 155374885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155375285 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155375405 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155375613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155376525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155376594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155376767 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155377163 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155377275 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155377316 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155377424 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155377641 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155378025 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155378028 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155378065 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 155378355 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155378547 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155378733 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155378890 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155379238 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155379439 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155379545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155379748 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155379915 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155379935 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155379957 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155380018 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155380297 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155380341 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155380489 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155380540 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155380583 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155380590 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155381869 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155381880 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155381885 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155382366 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155382424 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155382443 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155383318 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155383408 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155383570 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155384257 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155385226 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155385439 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155385844 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155386967 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155386998 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155387045 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155387392 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155387440 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155388170 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155388748 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155388815 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155389584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155389734 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155389844 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155390043 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155390308 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155390314 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155390666 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155390875 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155391155 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155391165 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 155391284 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 155391418 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155391549 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155391872 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155392231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155392413 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155392519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155392757 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155392807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155393083 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155393110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155393114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155393483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155393501 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155394181 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 155394337 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155394515 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155394692 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155394815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155394956 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155395004 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155395042 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155395082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155395624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155396056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155396554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155396695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155397520 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155397872 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155398115 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155398156 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155398312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155398336 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155398428 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155398460 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155398471 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155398472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155398498 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155398791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155398941 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155398964 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155398965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155399229 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155399342 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155399367 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155399501 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155399842 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155400064 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155400209 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155400250 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155400377 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155400522 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155400882 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155401005 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155401181 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155401429 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155401482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155401501 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155401502 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155401603 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155401629 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155402056 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155402229 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155402349 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155402548 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155402590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155403432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155403522 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155403615 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 155403630 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 155403631 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 155403922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155404216 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155404249 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155404283 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155404313 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155404475 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155404736 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 155404824 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 155405515 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155405535 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155405666 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155405676 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155405700 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155405709 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155405763 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155405804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155405964 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 155406081 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 155406359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155406760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155406779 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155406801 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155407911 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155408068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155408126 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155408481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155408818 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 155408846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155409215 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155410416 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155410514 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155410621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155411299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155411459 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155411611 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 155411972 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155412327 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155412546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155412681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155412906 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155413234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155413262 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155413580 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155413650 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155413696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155413697 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155414116 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155414172 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155414218 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155414516 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155416155 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155416257 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155416451 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155417522 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155418140 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155418954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155419674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155420698 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155420786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155420957 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155421041 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155421471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155421574 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155421641 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155421660 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155421762 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155421763 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155421979 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155421981 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155422201 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155422258 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155422282 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155422309 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155422317 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155422400 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155422427 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155422432 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155422884 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155423817 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155424309 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155424420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155424786 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155425093 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155425631 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155425749 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 155425763 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155426053 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155426103 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155426151 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 155426242 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155426247 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155426270 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155426279 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155426704 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155426789 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155427061 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155427366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155427580 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155428386 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155428576 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155428777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155428797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155428907 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155428945 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155429365 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155429395 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155429475 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155429834 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155429835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155429855 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155429952 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155429964 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155430178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155430199 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155430205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155430220 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155430380 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155430398 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155430441 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155430623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155430667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155430766 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155431198 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 155431291 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 2 155431313 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 2 155431371 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 155431643 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155431685 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155431772 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155432015 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155432139 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155432153 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155432311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155432359 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155432384 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155433295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155433882 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155434101 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155434118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155434175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155434203 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155434229 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155434244 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155435267 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155435294 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 155435407 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155436376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155437290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155437350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155438172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155439427 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155439724 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155440747 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155441107 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155441318 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 155441583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155441780 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155442089 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 155442304 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155442500 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155442504 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155442599 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155442695 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155442708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155442747 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155442750 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155442815 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155442816 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155442831 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155442926 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155443022 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155443136 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155443217 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155443337 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155443351 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155443359 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155443561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155443761 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155443909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155443957 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155444128 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155444157 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155444176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155444394 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155444402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155444417 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155444445 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155444939 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155444980 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155445058 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155445216 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155445237 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155445339 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155445359 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155445372 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155445591 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155445676 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155445728 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155445823 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 155445833 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155445997 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 155446018 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155446019 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155446066 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155446068 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155446113 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155446149 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155446185 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155446305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155446435 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155446521 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155446554 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155446602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155446778 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155446958 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155447414 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155447430 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155447483 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155447501 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155447744 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155447765 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155447785 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155447798 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155447993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155448142 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155448172 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155448340 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155449130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155449140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155449142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155449223 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155449253 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155449400 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155449814 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155449890 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155449931 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155449947 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155450063 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155450217 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155450302 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155450375 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155450478 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155450500 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155450769 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155450854 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155450949 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155451136 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155451172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155452664 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155452691 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155452750 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155452792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155452794 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155452904 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155452936 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155452965 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155453664 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155453718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155453769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155453832 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155453901 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155453940 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155454011 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155454014 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155455431 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155455557 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 155455644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155455835 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155455896 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155456141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155457047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155459413 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155459847 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155459968 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155460290 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155462205 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155462269 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155462284 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155462416 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155462694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155462748 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155462767 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155462799 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155463074 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155463079 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155464218 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155464238 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155464325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155464372 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155464519 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155464618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155464692 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155464718 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155464749 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155464777 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155465184 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155465318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155465377 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155465483 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155465666 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155466056 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 155466067 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155466096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155466571 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155466607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155466770 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155466838 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155468582 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155468638 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155468671 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155468697 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155468869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155468886 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155468974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155468980 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155469109 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155469166 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155469230 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155469293 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155469592 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155469661 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155469791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155469807 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155469808 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155469962 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155469986 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155470034 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155470045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155470058 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155470108 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155470160 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155470319 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155470343 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155470366 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155470594 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155470608 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155470617 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155470633 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155471209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155471291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155471321 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155471325 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155471720 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155471794 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155471867 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155471883 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155471930 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155471960 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155472300 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 155472401 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 155472441 T C Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 155472525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155472564 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155472768 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155472802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155472910 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155473086 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155473128 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155473668 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155473674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155474207 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155474309 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155474341 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155474389 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155474404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155474538 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155474551 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155474601 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155474752 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155474819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155475033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155475041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155475078 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155475416 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155475724 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155475888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155475943 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155476546 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155476557 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155476716 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155477237 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155477357 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 155477423 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155477623 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155477656 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155477848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155478345 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155478670 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 155478767 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155478883 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 155479758 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155479808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155480096 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 155480500 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155480672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155480755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155480835 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155480983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155481108 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155481215 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155481399 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 155481677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155481824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155481957 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 155481993 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155482153 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155482309 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155482663 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155482939 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155483421 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155483805 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155483898 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155483936 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155484229 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155484273 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155484299 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155484306 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155484586 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155485415 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155485458 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155487177 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 155487300 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155488098 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155488510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155488539 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155488585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155488999 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155489028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155489327 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155489838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155490632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155491368 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155491519 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155491691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155491717 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155492020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155492481 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 155492484 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 155492510 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155492876 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 155493229 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 155493344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155493567 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155494634 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155495010 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155495589 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 155495634 C G N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 155495668 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 155496156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155496504 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155496523 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155496527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155496535 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155496567 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155497248 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155497289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155497916 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155498298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155498307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155498437 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155498648 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155499352 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155499711 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155499791 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155500156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155500241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155500340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155500962 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155500963 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155501116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155501569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155501650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155502066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155502128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155502158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155502354 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155502527 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155502588 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155502905 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155503048 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155503060 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 155503128 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155504444 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155504472 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155504533 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 155505459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155505841 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155505989 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155506013 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155506014 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155506027 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155506217 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155506236 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155506671 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 155507418 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 155507963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155508237 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155508569 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155508628 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 155508731 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 155509079 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155509230 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 155509260 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 155509410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155509789 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155510531 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 155510791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155510830 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155510968 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155510979 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155511245 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155511282 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155511291 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155511555 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155511647 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155511780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155511877 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155511923 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155511930 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155511999 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155512007 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155512212 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155512563 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155512601 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155512604 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155512624 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155512733 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155512741 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155512818 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155512984 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155512999 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155513431 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155513436 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155513599 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155513840 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155513883 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155513906 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155514012 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155514053 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 155514132 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155514158 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155514197 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155514249 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155514278 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155514683 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155514729 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155514749 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 155514882 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155514952 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155514968 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155515008 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155515079 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155515189 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155515285 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155515337 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155515341 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155515472 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155515526 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155515579 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155515676 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155516050 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155516089 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155516254 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155516277 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155516384 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155516387 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155516659 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155516898 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155516962 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155517162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155517300 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155518318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155518741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155518880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155519084 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155520565 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155520771 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155520824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155520922 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155521007 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155521070 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155521096 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155521201 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155521316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155521966 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155522011 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155522062 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155522166 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155522255 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155522302 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155522344 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155522634 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155522858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155522996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155523199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155523206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155523271 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155523609 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 155523638 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 155523733 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 155524003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155524247 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155524345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155524365 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155524395 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155524414 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155524465 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155524633 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155524669 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155524682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155524796 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155525166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155525364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155525421 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155525509 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155525529 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155525833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155526082 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155527175 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155527249 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155527308 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155527689 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 155527919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155528016 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155528251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155528629 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155528868 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 155528891 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155528927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155528966 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 155529128 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155529152 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155529157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155529585 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155529662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155530296 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155530415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155530513 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 155530523 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155530585 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155530783 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 155530956 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 155532058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155532136 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155532140 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155533274 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155533339 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155533393 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155533641 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155533959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155534581 A G Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 155535165 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155535205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155535257 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155535290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155535327 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155536438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155536453 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155537291 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 155537622 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 155538153 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155538262 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155538278 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155538816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155538818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155538835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155540382 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155541019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155541070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155541106 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155541366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155541589 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155541626 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155542130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155542181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155542468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155542477 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155542511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155542518 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155542537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155542561 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155542621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155542693 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155542705 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155542744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155543626 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155543660 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155544453 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155544622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155544629 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155544679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155545697 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155546075 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155546354 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155546524 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155547165 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155547228 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155547668 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155547869 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155547979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155549137 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155549255 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155549720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155549848 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155549866 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155550042 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155550059 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155550209 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 155550233 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155550244 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155550274 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155550461 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155550478 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155550811 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155551084 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155551176 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155551396 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155551817 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155551888 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 155551952 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155551956 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155552308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155552947 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155553474 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155553842 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155553987 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 155554093 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155554135 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155554447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155554518 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155554909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155555331 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155555371 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155555384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155555666 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155555767 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155556113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155556122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155556394 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155556545 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155556692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155556869 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155556913 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155556998 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 155557167 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 155557434 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155557744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155558056 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 155558136 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 155558670 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155558778 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155558891 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155558898 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155558903 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155559039 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155559106 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155559140 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155559164 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155559367 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155559650 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155559749 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155559771 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 155560035 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 155560150 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155560160 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 155560200 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 155560496 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155560537 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155560557 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155560561 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 155560573 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155561213 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155561370 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155561393 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155561402 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155561408 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155561496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155561585 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155561629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155561689 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 155561769 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155561772 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155562410 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155562722 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155563007 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155563196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155564563 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 155564577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155565371 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155565393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155565970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155566044 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155566239 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155566293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155566971 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155568575 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155568634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155568799 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155568839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155569063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155569106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155569380 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155570569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155570576 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 155570695 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155570705 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155570717 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155570747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155570767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155570899 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 155571004 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155571282 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155571344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155571688 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 155571727 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155571749 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155571900 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 155572578 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155572590 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155572683 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155572844 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 155572878 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155573037 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 155573054 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 155573220 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 155573229 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 155573232 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 155573276 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 155573336 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 155573410 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 2 155573561 A C N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 2 155573697 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155574051 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155574061 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155574131 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155574413 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155574452 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155574697 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155574737 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 155574835 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155575100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155577497 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155578225 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155578323 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155578448 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155578501 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155578948 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 155579125 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155579366 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155580355 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155580701 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155581692 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 155582931 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155583102 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155583278 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 155583698 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 155584470 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155584513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155584600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155584809 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155584898 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155584951 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155584972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155585713 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155587453 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 155588047 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 2 155588067 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 155588241 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.1 0.85 0.05 21 19 2 17 1 2 155588372 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 155588581 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 155589502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155589552 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 155589686 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155590939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155591133 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155592447 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155592710 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 155593224 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155594055 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155594099 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155594100 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155594139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155594378 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155594853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155595758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155595833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155596049 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155596160 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 155596431 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 155596694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155596727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155596818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155597124 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 155597178 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155597232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155597381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155597573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155598027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155598098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155598122 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155598372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155598483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155598514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155598522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155598773 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155598872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155600023 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155600094 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155600635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155602147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155602523 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 155602563 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155602841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155602928 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155603125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155603391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155603429 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155603692 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155603737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155603832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155603883 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 155604027 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 155604377 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155604384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155605204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155605349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155605691 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155605753 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155605881 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155606204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155606288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155607318 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 155607384 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155607509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155607535 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155607566 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155607599 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155607788 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 155607892 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 155608178 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 155609524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155609642 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155610225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155610391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155610614 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155611712 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155611997 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155612608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155612636 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155612871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155613302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155613864 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155613909 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155614013 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155614053 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155614104 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155614191 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155614248 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155614295 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155614355 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 155614478 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 155614843 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155614929 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155615078 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155615185 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155615305 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155615793 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155615856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155616286 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155616482 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155617520 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 155617858 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155617941 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155618913 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155619322 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155619650 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 155619978 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 155620204 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 155620282 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 155620498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155620659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155620871 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155621557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155621918 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 155621954 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 155622178 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155622356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155622472 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155622826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155624314 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 155624325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155624493 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155624508 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 155624512 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155624530 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155624547 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155624571 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155624583 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 155624619 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155624636 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 155624686 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155624757 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155624803 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 155624814 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 155624929 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 155624949 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 155624950 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 155624967 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 155625021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155625244 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 155625807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155625858 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 155625962 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155625968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155626007 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155626018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155626205 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155626525 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155626549 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155627152 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155627279 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155627478 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155627523 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155627583 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155627711 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155628180 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155628304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155628330 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155628462 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155628522 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155628561 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155628671 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155628741 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155628765 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 155628959 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155628970 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155628991 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155629011 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155629076 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155629180 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155629577 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155629660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155629991 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155630037 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155630140 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155630158 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155630328 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155630351 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155630393 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155630533 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155630546 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155630699 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155630719 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155631466 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155631630 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155631790 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155631815 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155634374 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 155634943 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155635156 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155635183 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 155635636 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155636078 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155636123 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155636226 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155636234 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155636485 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155636869 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155637389 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155637577 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155638036 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155638096 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155639424 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155639426 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155639613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155640009 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155640080 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155640162 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155640803 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155640843 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155640881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155640950 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155641219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155641795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155643183 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155643297 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155643661 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155644178 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155644427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155644552 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155645112 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 155645130 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155646440 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155646517 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155647001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155647214 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155647908 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 155647921 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 155650885 T A Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 155651291 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155651301 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155651811 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155652065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155652338 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155652373 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 155652456 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155652481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155652496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155652566 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155652693 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155652820 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155652856 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155652871 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155652910 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155652961 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155652995 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155653009 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155653117 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155653264 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155653299 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155653389 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155653441 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155653476 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155653821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155654081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155654232 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155654260 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155654270 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155654362 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155654395 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155654402 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155654555 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155654657 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155654681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155654877 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155655327 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155655348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155655423 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155655554 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155655585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155655741 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155656223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155656812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155657856 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 155658231 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155659340 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155659484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155659582 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 155659593 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 155659698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155659704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155661795 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155661925 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155662164 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 155662738 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155663759 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 155664010 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 155664706 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 155664937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155665140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155665230 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155665405 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155665466 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 155665835 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 155665875 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155666391 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 155666429 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155666473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155666559 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155666853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155666970 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155666981 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155667253 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155667269 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155667290 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155667296 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155667671 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155667706 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155667878 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155667939 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155668199 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155668280 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 155668388 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155668477 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155668678 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155668683 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155668832 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155668918 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155669033 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 155669084 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 155669126 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155669137 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155669198 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155669259 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155669274 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155669275 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155669352 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155669374 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155669425 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155669461 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155669478 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155669533 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155669538 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155669569 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155669608 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155669633 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155669974 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155670031 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 155670340 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155670414 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 155671007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155671608 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 155671619 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 155672580 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 155672980 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 155673301 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155673479 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 155673527 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 155673530 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155673539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155673596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155673743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155673750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155673754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155673801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155674083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155674281 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155674413 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155674477 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155674551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155674566 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155674579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155674581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155674667 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155675361 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155675372 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155675699 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155676435 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155677110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155677218 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 155677379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155677437 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 155677488 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 155678155 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 155678193 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155678246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155678250 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155678272 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155678273 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 155678313 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155678316 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155678584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155678975 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155679118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155679204 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155679308 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 155679310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155679592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155679668 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155680286 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155680298 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155680602 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155680646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155680653 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155680675 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155680890 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 155681049 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 2 155681178 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155681418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155681539 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 155681597 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155681599 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 155681638 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 155681670 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 155681792 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 155681818 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 155682011 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155682022 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155682039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155682161 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155682270 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155682360 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155682720 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155683031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155683320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155683969 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155683983 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155683990 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155683999 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155684018 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155684045 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155684067 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155684144 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155684246 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 155684254 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155684269 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155684287 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155684337 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 155684734 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155684814 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 155684861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155685032 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155685109 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 155685138 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155685169 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 155685636 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155685716 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155685974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155686356 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155686396 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155686622 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155686732 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 155686781 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155686854 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155686888 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155686958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155687092 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 155687157 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 155687186 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155687236 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155687313 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 155687569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155687765 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155687847 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155687968 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155687970 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155688111 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155688367 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155688475 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155688481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155688493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155688890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155689230 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155689261 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155689317 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155689326 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155689439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155689482 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155689554 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155689744 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155689765 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155689780 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155689817 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155689872 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155690000 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155690084 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155690120 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155690190 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155690229 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155690480 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155690574 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 155690697 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155690802 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155690806 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155690850 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155690919 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 155691064 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 155691254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155691305 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155691457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155691582 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155691600 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155691601 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155691616 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155691793 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155691866 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155691900 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155692025 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155692086 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155692101 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155692162 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155692168 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155692184 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155692503 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155692510 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155692527 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155692786 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155692795 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155693274 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155693275 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155693956 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155693987 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 155694117 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 155694251 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155694760 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155694762 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155694955 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 155695161 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155695163 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155695303 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155695316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155695331 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155695428 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155695498 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155695524 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155695620 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155695683 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 155695748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155695824 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155695866 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155696163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155696167 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155696229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155696403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155696446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155696461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155696813 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155697141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155697147 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155697282 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155697286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155697723 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 155697866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155697930 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155698049 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155698301 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155698571 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155698639 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155698715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155698755 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155698769 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155698777 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155698851 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155699186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155699202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155699358 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155699834 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155700034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155700115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155700186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155700249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155700290 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155700458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155700518 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 155700753 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155700779 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 155701036 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155701063 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155701111 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155701136 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155701268 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155701363 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155701867 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 155701987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155702050 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155702111 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 155702190 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155702337 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155702534 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155702691 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155703060 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155703367 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155703418 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155703496 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155703582 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155703853 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 155703898 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 155704051 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 155704259 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 155704269 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 155704293 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 155704332 G T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 155704645 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155704656 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155704680 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 155704927 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155704982 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155705018 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 155705463 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155705644 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 155705662 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 155705693 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155705771 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155705937 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155705988 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155706111 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155706281 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155706367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155706385 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 155706454 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 155706543 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155707122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155707538 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 155707550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155707777 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155707791 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155707989 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155708277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155708357 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155709095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155709448 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155709678 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155709694 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 155709869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155710044 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155710456 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155710527 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 155710830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155710958 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155711904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155712301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155712394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155712577 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155712637 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155712801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155712827 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 155713040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155713228 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 155713777 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 155713873 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 155714440 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 155714781 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155715259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155715273 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155715554 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155715573 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155715582 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 155715796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155715873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155715875 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155715946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155715948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155716039 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 155716167 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155716189 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155716339 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 155716434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155716583 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 155716596 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 155716626 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 155716636 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 155716659 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 155716676 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 155716679 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 155716824 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 155717087 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 155717311 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 155717319 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155717428 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155717495 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155717571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155717996 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 155718014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155718058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155718313 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155719090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155719146 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155719315 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 155719338 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 155721007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155721563 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155722198 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 155722703 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155723362 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 155723678 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 155723854 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155723909 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155723940 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155724623 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155725100 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155725429 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 155725891 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155726077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155726564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155726687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155726790 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155726903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155726913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155726974 C T Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 155727521 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 2 155727721 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.0833333333333333 12 12 1 10 1 2 155728165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155728460 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155728526 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155729235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155729458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155729645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155729743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155729747 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 155729788 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155729857 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155729861 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155729869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155729933 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155729966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155729977 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155730223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155730418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155730427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155730501 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155730719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155730943 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155731052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155731312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155731323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155731679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155732082 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155732163 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155732306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155732444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155732595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155732642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155732665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155732759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155732770 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155732809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155732851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155732871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155732891 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155732941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155732951 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155733105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155733111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155733141 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155733156 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 155733314 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 155733371 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155733424 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155733496 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155733573 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155733632 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155733713 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155733753 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155733762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155733841 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 155733861 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155733866 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155734060 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 155734066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155734275 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 155734295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155734421 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 155734483 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 155734499 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155734503 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155734542 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 155734576 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155734645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155734656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155734847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155735238 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155735271 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155735665 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155735743 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155735844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155736283 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155736291 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155736347 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155736649 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155736811 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 155736814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155736939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155737178 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155737292 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155737305 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155737368 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155737423 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 155737684 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155737727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155737843 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155737902 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155737908 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 155737958 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155737975 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155738196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155738247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155738253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155738341 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155738356 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155738359 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155738371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155738386 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155738469 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155739027 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155739161 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155739200 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155739287 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 155739604 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155740170 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155740353 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 155740589 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155740607 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155740627 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155740661 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155740874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155740942 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155740995 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 155741005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155741018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155741055 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155741357 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155741382 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155741383 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155741393 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155741425 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155741819 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155741847 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155741889 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155741937 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155741964 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 155742047 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 155742123 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 155742202 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155742274 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155742435 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155742749 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155742826 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155743264 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155743269 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155743290 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155743381 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155743419 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155743522 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155743536 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155743625 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155743727 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155743767 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155744024 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 155744388 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155744409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155744435 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155744464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155744589 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155744594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155744605 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155744674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155744693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155744708 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155744747 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 155744761 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155745008 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 155745127 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 155745141 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155745169 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155745175 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 155745194 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 155745229 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 155745253 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 155745335 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 155745355 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 155745402 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 155745423 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155745428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155745458 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 155745547 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155745580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155745638 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155745702 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 155745748 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155745844 G A Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 155746941 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155746974 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155747091 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155747258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155747281 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155747323 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155747331 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155747521 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155747610 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155747645 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155747810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155747893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155748050 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155748058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155748079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155748741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155748762 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155748803 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155748863 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155748936 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155748999 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155749051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155749108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155749164 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155749240 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155749364 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155749486 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 155749524 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 155749657 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155749719 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 155749754 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155749862 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155749967 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155749969 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 155749994 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155750136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155750178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155750206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155750229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155750232 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155750252 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155750255 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155750272 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155750279 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155750288 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155750318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155750349 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155750378 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155750418 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155750555 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155750633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155750739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155750941 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 155751033 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 155751377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155751520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155751666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155751753 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155751925 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155752133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155752285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155752412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155752461 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155752667 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155752847 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155752852 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155752971 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155753102 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 155753155 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155753414 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155753516 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155753565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155753758 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155753799 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155753951 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155754028 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155754047 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 155754145 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155754276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155754297 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155754344 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 155754772 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155754855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155755031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155755137 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155755329 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 155755457 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 155755526 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155756054 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 155756100 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 155756135 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155756210 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155756236 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 155756239 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 155756295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155756428 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155756431 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155756688 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155757185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155757215 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155757548 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 155758155 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155758189 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155758581 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155759028 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 155759262 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 155759317 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155759755 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155759776 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 155759921 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 155760094 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 155760156 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155760198 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 155760617 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155760916 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155761243 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155761275 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 155761288 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 155761318 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155761530 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 155761531 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 155761592 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 155761602 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155761754 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155761769 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155761786 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155761866 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155762178 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 155762459 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155762480 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155762567 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155762613 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155762654 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 155762662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155762716 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155762737 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155762836 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155762999 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155763053 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155763213 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155763225 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155763439 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 155763595 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155763721 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155764398 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155764536 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155764593 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 155764660 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155764662 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155764761 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 155764779 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 155764876 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 155765009 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155765079 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155765095 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155765208 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155765248 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 155765260 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155765267 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155765586 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155765807 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155765955 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 155766159 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155766895 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155767226 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155769076 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155769085 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155769206 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155770500 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155771533 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155771849 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 155772293 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155772565 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155772566 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155773069 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 155773355 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 155773789 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155773823 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155775083 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 155775939 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155775949 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 155775983 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155776006 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155776204 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155776360 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155776553 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 155777432 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 155778373 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155778399 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155779325 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155779545 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155779743 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155780250 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155780273 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155780395 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 155780499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155780701 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155780891 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155782244 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155782259 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155782325 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155783097 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155783327 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155783949 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155784416 T C N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.3 0 0.7 6 14 3 0 7 2 155784455 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.25 0 0.75 6 18 3 0 9 2 155784523 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 155784596 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 155784618 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155784724 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155784751 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155784847 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 155785100 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155785427 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155785583 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155785656 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155785768 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155786043 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155786073 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 155786315 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155786639 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 155786957 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 155786974 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155787119 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155787291 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 155787806 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155787901 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155788074 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155788086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155788346 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 155788495 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 155788882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155789157 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155789230 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155789369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155789605 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155790265 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155790379 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155790639 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155790742 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155790995 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155791008 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155792215 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 155792250 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155793692 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155793749 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155793761 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155793773 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155793892 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155793960 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155794194 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155794265 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155794346 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155794607 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 155794739 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155794794 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155794976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155795074 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 155795191 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 155795220 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 155795618 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155795828 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 155795832 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 155795879 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 2 155795984 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155795991 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155796091 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155796339 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155796580 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155796600 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155796650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155796671 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155796849 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155797086 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155797132 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 155797243 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155797394 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 155797510 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155797845 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155797859 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155797933 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155797964 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155798404 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 155798610 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155798653 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155798754 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155799028 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155799177 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155799203 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 155799260 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155799282 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155799325 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155799433 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155799643 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 155799722 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155799796 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155799835 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155799883 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155800056 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155800075 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155800919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155801142 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155802184 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155802466 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 155803701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155803775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155803795 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 155804067 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 155806117 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 155806270 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 155806751 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155808433 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155809517 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155810240 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155810305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155811788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155811973 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155812165 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155812352 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155812456 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155812578 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155812763 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155813085 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155813960 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155814089 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 155814221 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155814409 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155814524 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155814525 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 155814789 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155814879 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155815075 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155815680 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155815858 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155816011 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155816046 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155816686 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155816689 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155817962 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155818073 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155818268 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 155818303 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155818964 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155819252 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155819289 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155819624 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155819660 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155819670 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155819747 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155819854 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 155820812 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155821409 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155821413 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155821547 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155821565 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155821616 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155821733 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155821756 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155821776 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 155822610 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155822634 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155822682 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155822715 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155822751 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155822968 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 155823442 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 155823451 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155824215 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155825537 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155825556 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155825802 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155825826 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155826270 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155826436 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155826680 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155826853 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155826873 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155827323 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155827410 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155827432 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155827711 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155827740 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155827759 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155827766 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155827773 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155828191 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155828335 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155828490 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155828639 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155828643 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155828777 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155828824 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155828908 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 155828955 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155828959 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155829822 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155829870 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155830286 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 155830346 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 155830410 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 155830422 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 155830466 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 155830718 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 155830801 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155831394 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155831420 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155831700 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 155832055 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 155832077 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 155832271 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155832287 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155832340 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155832524 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155832921 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155835070 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155835158 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155835352 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155835407 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155836611 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155836658 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155837054 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155837759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155837810 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155837827 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155837862 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155837878 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 155838052 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155838394 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155838415 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155838625 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155838756 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155838919 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155838944 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155838946 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155839053 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155841882 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155842092 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155843525 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155843536 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155843745 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155843925 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155844100 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155844167 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155844287 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155844713 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 155844993 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155845010 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155845228 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155845311 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155845654 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155845690 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155845735 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155845760 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155845789 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155846003 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155846861 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155847212 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155847330 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155847396 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 155847441 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155847545 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155847579 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155847672 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155847933 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 155847944 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 155847991 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 155848018 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155848050 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155848129 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155848134 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 155848243 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 155848262 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 155848388 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155848757 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155848765 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 155848842 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155848982 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155849159 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155849166 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155849190 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155849259 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 155849346 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 155849506 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155850106 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155850245 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155850251 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155850259 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 155850279 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 155850297 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 155850316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155850355 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155850616 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155850648 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155850653 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155850728 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155850923 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155850940 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155850956 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155850981 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155851009 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155851028 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155851048 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155851060 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155851409 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 155851471 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155851516 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 155851558 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 155851686 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 155852619 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155852934 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 155852959 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155852992 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155853009 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155853090 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155853564 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155853731 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 155853998 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155854003 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155854011 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 155854114 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155854335 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155854411 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155854439 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155854455 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155854524 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155854537 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 155854558 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155854579 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155854598 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155854743 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155854784 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155854879 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 155855042 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155855240 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155855285 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155855334 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155855598 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155855724 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155855842 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155855916 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155855931 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155855934 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 155855965 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155855968 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155856138 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 155856305 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 155856366 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 155856419 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 155856980 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155857046 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155857246 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155857249 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155857297 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155857496 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155857573 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155857648 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155857722 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155857926 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155858049 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 155858372 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155858390 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155858437 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155858527 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155858590 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 155858594 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155858713 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155858814 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155858886 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155860120 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 155860567 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155861079 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155861348 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 155861427 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 155861580 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 155861831 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155861874 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155862025 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 155862066 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 155862214 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 155862753 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 155862967 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155863355 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155863654 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155864238 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 155864266 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 155864280 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 155864306 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155864419 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 155864440 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155864540 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155864617 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 155864736 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 155864852 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155865191 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 155865724 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155865744 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155865778 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155865950 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155866189 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 155866241 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 155866373 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 155866389 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 155866431 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155866786 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 155867330 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 155868279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155869494 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155869802 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 155870243 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155870883 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155870924 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155871163 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155871359 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155871584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155871608 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 155872218 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155872343 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155872373 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155872405 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155872508 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 155872527 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 155872566 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 155872604 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 155872622 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 155872656 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 155872663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155872892 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 155872895 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 155872923 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 155872961 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 155873158 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 155873428 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155873451 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155873537 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155873588 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 155873831 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155873956 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155874271 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155875026 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155875295 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155875580 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155876268 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 155876803 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 155877365 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155877503 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155877517 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155877787 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 155877858 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155878243 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 155878306 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155878379 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 155878464 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 155878559 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155878570 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155879306 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155879316 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155879324 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155879446 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 155879643 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 155879673 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155879690 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155879810 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155879907 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155879908 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 155879926 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155880161 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155880179 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155880210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155880355 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155880379 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155880500 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155880531 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155880999 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155881108 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155881130 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155881138 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155882150 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155882181 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155882260 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155882285 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155882753 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 155884257 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155884394 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 155884490 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155884501 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155884520 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155884613 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155884747 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 155885078 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155885165 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155885256 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 155885461 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155885578 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 155885753 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155885763 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 155885766 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 155885838 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 155885842 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 155885928 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 155886021 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 155886041 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 155886075 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 155886083 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 155886346 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155886516 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155886530 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155886537 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155886716 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 155886740 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155886743 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155886858 G A N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 155886862 G C N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 2 155887237 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155887269 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155887333 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 155887451 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 155887712 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 155887749 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 155887796 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 155888059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155888194 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 155888338 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 2 155888632 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 155889564 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155889582 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155889942 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155890084 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155890504 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 155890701 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 155890742 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155890779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155890809 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 155891038 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155891892 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155891952 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 155891953 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155892500 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155892676 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 155892808 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155893164 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155893473 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155893598 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155894402 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155894637 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155894638 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155895035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155895042 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155896198 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155896279 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 155896285 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 155896371 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 155896492 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155897005 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 155897108 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155897857 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155898299 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155898641 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155898658 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155898669 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155898802 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155898944 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155899199 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155899288 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155900114 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 155900470 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155900472 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155901224 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 155901458 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155901695 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155901798 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155901822 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155901928 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155902541 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155902609 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155902622 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155902701 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155902784 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155902849 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155902883 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155903270 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155903630 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 155905407 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155907348 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155907482 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155907541 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155907699 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155908133 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155908144 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155908324 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155908418 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155908508 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155908607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155908874 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155908916 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155909044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155909112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155909162 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155909663 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155909668 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155910542 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155911159 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155912377 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 155912570 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155913106 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155913690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155914395 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155915436 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155915802 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155916758 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155918544 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155919250 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155919963 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155921942 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155922372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155923100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155923722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155926292 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155926679 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 155926895 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 155927447 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155929363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155930822 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155930829 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155931764 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155932034 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155932070 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155934056 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 155934186 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155935684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155935691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155935783 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155937062 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155937086 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155937646 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 155938286 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 2 155939130 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 155939303 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155946131 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155947565 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155947634 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155947828 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155948877 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155950415 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155951385 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155951423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155951424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155951872 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155952105 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 155952123 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 155953448 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155953865 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155954088 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155954341 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 155954539 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155954823 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155955527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155957077 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155957113 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155957306 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155957830 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155957909 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155957969 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155957988 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155958099 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155958382 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155958448 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155958535 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155958670 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155958864 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155958936 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155958997 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155959131 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155959246 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155959325 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155959420 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155959631 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155959837 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155959890 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155960129 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 155960133 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155960250 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155960430 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155960799 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 155961306 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155961404 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155962018 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 155962019 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155962101 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155964229 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 155964723 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155964832 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155965177 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 155965384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155966655 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155966862 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 155966873 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 155966926 A T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 155968693 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155968818 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155968881 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155969584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 155969657 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155970814 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155971154 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155971300 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155972099 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155972651 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155973163 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155973365 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 155975288 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155975584 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155975607 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155976425 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155976918 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155977847 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 155977848 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 155978065 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155978183 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 155978926 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155980573 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155981463 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155983324 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 155983557 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 155985119 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 155987065 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155987501 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 155987960 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155988308 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155988821 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 155989022 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 155989456 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155989875 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155989888 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155990829 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 155991999 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 155992780 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155994136 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 155994247 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 155994826 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 155995360 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 155997146 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 155997668 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 155997806 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 155998212 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 155999089 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156000136 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 156001556 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 156002854 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156002911 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156004793 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156006311 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156006408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156006589 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156007401 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156008321 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156009101 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 156009120 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 156009147 G T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 2 156009151 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 156009317 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 156009366 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 156009728 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156009995 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 156010022 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156010031 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 156011683 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156011687 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156012112 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 156012146 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156012208 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156012212 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156013308 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156013614 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156014091 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156014257 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 156014314 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 156014396 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156014504 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 156014512 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156014813 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156014862 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156014895 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156014945 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156015038 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 156016000 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 156016155 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 156016180 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 156016310 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 156016329 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 156016561 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 156016966 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 156017147 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 156017166 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 156017300 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156017519 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 156017563 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156017653 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156018314 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156020675 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156022963 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 156023807 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 156023997 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 156023999 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 156024067 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156024918 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156025091 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156025223 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 156025450 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156025638 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 156025674 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156025690 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156025704 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156025752 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156027105 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156027377 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156027697 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 156027914 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 156028346 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 156028552 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156029120 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156029589 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 156029707 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 156029860 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 156029969 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 156030086 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156030397 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156031166 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 156031385 G C N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 2 156031504 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 156031524 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 156031627 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 156031722 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156031734 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156031872 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156032205 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156032213 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156032258 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156032498 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 156032706 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 156032713 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156032727 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156032750 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156032764 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156032767 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156032782 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156032897 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156033381 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156033527 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156033578 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156033696 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156034135 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156034212 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156034840 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156034907 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156035004 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156035022 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156035191 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156035206 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156035935 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156036029 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156036077 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156036139 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156036514 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156036634 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 156040263 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156040523 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156040583 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 156040743 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156040963 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156041058 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 156041066 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 156041133 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156041735 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 156041896 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156041946 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 156042100 A T N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 156042262 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 156042406 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156042424 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156042426 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156042529 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156042606 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156042968 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 156043410 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156043585 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156043586 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156044491 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 156044935 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156045677 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156046497 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 156046749 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 156046751 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 2 156046921 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 156047115 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 156047308 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156047343 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156047975 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156048049 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156049337 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156049595 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156050033 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156050856 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156051400 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 156052258 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156052577 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156052636 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156052917 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156053065 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 156053189 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156053403 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156054179 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156054850 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156054885 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156055419 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156055466 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 156056320 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156056321 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156057075 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156057842 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 156058361 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156058828 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156059375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156059718 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156059808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156059988 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156060010 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156060032 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156060061 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156060378 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156060418 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156060801 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156061630 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156061719 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156061885 G T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 156062151 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 156062296 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 156062745 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156063762 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 156063993 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156064274 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156064670 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 156066545 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156066790 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 156067138 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156067216 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156067622 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156068391 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 156068487 G A N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 2 156068729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156069616 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156069821 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156070279 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 156071424 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156072295 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156073528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156074352 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156075251 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156076960 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156078016 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156080485 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156080499 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156081002 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156081064 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156083907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156084765 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156085267 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156085579 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156088937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156089019 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156090695 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156090748 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156091924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156092565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156094005 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156094210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156094785 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156095567 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 156095680 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 156095896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156097362 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156097443 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 156097546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156097571 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156097618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156097682 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156097980 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156098238 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 156098997 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156099123 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156099186 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156099363 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156099741 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156101223 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 156101395 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156104767 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156105177 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 156105195 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 156105564 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156105651 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156105739 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156105893 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156106206 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156107025 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156108043 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156108116 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156108972 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156109374 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156109475 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156109501 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156109878 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156110321 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156110800 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156110816 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156111376 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156111772 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156111989 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 156112027 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156112113 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156112152 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156112539 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156112898 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156114597 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156114805 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156115397 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156117117 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156117638 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156117755 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156118028 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156118654 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156119332 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156120692 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156121663 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156122158 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 156122225 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 156122235 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156122255 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 156122441 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 156123244 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156123874 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156123996 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156125022 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156125064 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156125433 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 156125502 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 156125913 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 156127304 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156127741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156130048 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156130749 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156131051 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156132327 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156132641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156133685 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 156133686 T A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 156137435 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156138145 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156138158 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156139784 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 156141488 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156141697 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 156141994 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156142293 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156142459 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156142548 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156143067 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156143189 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 156143274 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 156143509 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156143566 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156143853 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156143893 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156144094 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 156144163 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156144169 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156144338 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156144730 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156144946 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156145334 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156145345 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156145526 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156146014 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156146114 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156146545 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156146570 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156147166 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 156147449 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 156147476 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 156147591 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 156147594 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 156147796 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156148248 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156148333 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 156148815 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156149346 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 156149464 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 156149670 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156149841 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156149882 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156150057 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156150696 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156150847 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156150884 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156150930 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156150965 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 156151147 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 156153486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156153586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156155578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156155610 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156155829 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 156156053 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156156423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156156929 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 156157033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156158385 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 156158405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156158444 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 156158490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156158685 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 156159383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156159806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156160100 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 156160175 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 156160483 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156162084 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 156162639 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156162817 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 156162908 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 156163277 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 156163688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156164276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156164590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156165060 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 156165486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156166536 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 156166751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156166812 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156167006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156167193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156167213 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 156168487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156168596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156168881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156169553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156169729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156170012 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 156170101 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156170162 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 156170278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156170279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156170289 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156170491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156170596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156170604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156170657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156170943 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 156171771 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 2 156171793 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156171800 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 156172110 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156172413 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 156173346 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 156173536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156174120 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156174133 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156174181 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156175240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156176289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156176910 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 156177152 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 156177341 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156177483 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 156177685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156179509 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 156179776 C A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 156179898 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 156180005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156180098 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 156180150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156180534 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156180547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156180557 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 156180913 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 156180954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156180971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156181424 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 156181428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156181887 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 156182233 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 156190084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156190217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156190510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156190814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156191081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156191132 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156191477 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 156191731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156191774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156191785 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 156191790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156191818 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156191826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156191833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156192012 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156192071 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 156192546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156192773 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156193310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156193618 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156194418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156194777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156195187 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 156195599 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 156195601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156195694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156195695 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156195786 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156195787 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 156196319 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 156196365 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156196370 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156196441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156196775 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156196863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156196864 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 156197067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156197108 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156197135 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156197189 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156197333 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156198188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156198392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156198474 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156198501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156198530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156198765 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 156199231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156199444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156199817 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 156200280 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 156200400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156201194 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156201391 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 156201426 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 156201571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156201614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156201621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156203180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156203461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156205294 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 156205681 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 156206170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206226 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 156206264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206778 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 156206781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206841 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156206855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156206914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156207019 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156207024 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156207149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156207155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156207163 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156207188 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156207275 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156207280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156207296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156207452 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156207464 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156207526 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156207656 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 156207748 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156207775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156207786 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 156207789 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 156207800 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 156207814 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 156207863 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 156207865 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 156208009 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 156208064 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 156208105 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 156208114 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156208121 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156208161 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156208241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156208411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156208656 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156208799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156208823 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156209012 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 156209068 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 156209772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156209784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156210380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156210471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156210602 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156211609 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156211678 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156212469 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 156212471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156212483 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 156213044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156213331 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 156213734 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 156219011 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 156219205 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 156219236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156219289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156220490 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156221041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156221250 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 156221293 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 156221403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156221551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156221861 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156221866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156222230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156222434 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156222500 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156222555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156222670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156222781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156222789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156222847 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156222853 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156222895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156223152 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 156223164 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 156223183 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 156223219 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 156223332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156224479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156225153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156225303 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156225804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156226059 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156226286 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 156226293 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 156226747 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 156226967 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 156227231 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 156228949 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156228981 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 156229076 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 156229170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156229678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156229694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156229727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156230188 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156230451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156230710 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156230804 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156231047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156231230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156231276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156231291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156231299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156231331 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156231558 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156231591 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156231692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156232150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156232504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156232604 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156232659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156233104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156233152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156233178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156233262 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 156233348 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 156233557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156233998 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 156234322 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 156234409 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 156235751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156235826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156235876 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 156235884 A T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0 0.8 0.2 16 24 0 16 4 2 156236042 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 156236452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156236755 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 156236917 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 156238008 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156238061 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 156238084 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 156238182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156238861 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156239215 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156239443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156239623 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156239702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156240087 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 156241160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156241189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156241288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156241439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156241451 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156241844 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156241924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156242082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156242213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156242565 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 156242626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156242700 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 156242847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156242967 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 156243009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156243058 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 156243379 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 156243450 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156243466 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 156243807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156244025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156244519 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 156244580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156244978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156245307 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156245384 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156245440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156245762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156245781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156245818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156245859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156245881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156245900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156245989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156246147 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156246177 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156246292 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156246430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156246495 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156246497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156246557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156246668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156247464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156248312 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156249100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156249848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156250353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156250652 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156250672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156250708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156250729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156250731 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156251615 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 156251752 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 156251885 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156252358 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156252404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156252407 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156252417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156253050 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156253101 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156253123 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156253547 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156253581 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 156253909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156254017 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156254026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156254304 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 156254308 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 156254395 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156254594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156254669 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156254697 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156255038 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156255062 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156255087 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156255174 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 156255194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156255302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156255405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156255564 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156256343 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156256378 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156256391 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 156256586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156256702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156256903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156256965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156256969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156257051 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 156257748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156257906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156258124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156258512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156258524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156258528 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156258776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156259386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156259596 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 156259704 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156259709 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156259754 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 156259772 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 156259829 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 156259831 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 156260079 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 156260094 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 156260163 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 156260261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156260322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156260437 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 156260473 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156260489 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156260712 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 156260754 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 156260782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156260809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156261641 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156261678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156262458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156262668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156262820 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156262890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156262964 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 156263069 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 156263419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156263445 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156263498 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156263585 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156263665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156263909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156264282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156264284 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156264618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156264676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156264688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156264697 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156264711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156264984 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 156265668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156266299 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156267205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156267355 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156267715 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156267779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156268062 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 156268073 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 156268094 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156268374 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156268785 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 156268801 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156268848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156268949 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 156268968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156269097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156269173 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 156269273 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 156269289 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 156269350 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156269560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156269571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156269594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156269673 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 156270189 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 156270198 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 156270847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156271213 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156271426 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156271470 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156274407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156274646 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156275526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156275591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156275850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156275855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156276865 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 156276912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156277119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156278385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156279036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156279062 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156279209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156279719 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156280359 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156280431 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156280740 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156280799 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156280830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156280870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156280893 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156280935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156281018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156281034 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156281054 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156281095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156281125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156281145 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156281309 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156281330 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156281338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156281407 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156281453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156281792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156281862 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156281991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156282187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156282405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156282499 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156283239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156283306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156283452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156283529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156283537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156283657 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156283781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156283817 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 156283970 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 156284028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156284148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156284215 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 156284227 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 156284243 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156284331 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 156284366 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156284407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156284459 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 156284502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156284768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156284960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156284974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156285001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156285025 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156285087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156285104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156285384 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156286033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156286088 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156286219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156286334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156286402 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156286458 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 156286605 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156286848 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 156287034 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156287125 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 156287138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156287262 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156287407 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156287453 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156287484 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156287534 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156287796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156287973 A T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156288059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156288117 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156288676 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156288722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156288857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156288888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156288991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156289088 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156289116 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156289243 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 156289286 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 156289305 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156289332 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 156289367 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 156289579 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156289631 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156289642 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156289705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156289738 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156289739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156289757 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156289941 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156289978 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 156290770 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156290818 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156290870 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156290873 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156290891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156291166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156291171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156291266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156291277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156291282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156291402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156291403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156291472 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156292952 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156293440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156293624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156293821 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 156294504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156294640 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 156294655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156294710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156294877 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 156294906 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156294931 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156295033 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156295095 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 156295479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156295522 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 156297344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156297489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156298112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156298200 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156298545 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 156298625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156298818 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 156298822 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156298902 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156299051 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156299118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156299143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156299321 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156300191 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156301956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156302122 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156302446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156303691 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156303754 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156304209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156304412 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 156304459 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156304823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156304940 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 156306164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156306806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156307620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156308127 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156308278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156308288 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156308296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156308427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156308977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156311465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156311958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156313298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156313301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156313941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156314131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156314143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156314446 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156315460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156316702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156318272 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 156318395 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156318432 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156318544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156318568 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156318637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156318695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156318717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156318845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156319018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156319088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156319107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156320240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156320345 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156320368 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156321213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156321451 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156321637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156321678 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156321750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156321831 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156322191 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156322412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156322423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156322998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156324742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156324937 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156325290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156327322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156327627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156328415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156328473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156328571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156328618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156328700 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156328734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156328738 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156329014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156329810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156329817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156329832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156330340 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156330439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156331061 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156331134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156331168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156331209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156331702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156332089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156335170 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156335376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156335390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156335423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156336039 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 156336106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156336173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156336700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156338159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156340102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156340129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156340917 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 156341447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156341580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156341889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156342075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156342115 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156342162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156342180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156342218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156342798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156342906 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156342952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156343020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156343134 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 156343179 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156343256 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156343271 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156343595 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156343625 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156343728 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156343816 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 156343819 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 156343951 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156343996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156344110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156344111 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156344164 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156344227 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 156344397 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 156344643 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 156344896 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 156344921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156345005 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 156345120 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 156345124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156345453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156345589 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156345613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156346541 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 156346609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156346647 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156347375 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156347435 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 156347901 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 156348083 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 156349503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156349873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156351320 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156351347 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156351354 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156351375 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156351499 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156351504 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156351579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156351644 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156351970 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156352075 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156352221 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156352777 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156352992 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156353179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156353191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156353371 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 156353488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156353862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156353875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156353891 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156353903 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 156353946 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 156353976 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156355388 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 156355576 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 156355803 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156355908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156355977 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 156356086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156356442 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156356495 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 156357666 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 156357745 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156357747 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156357790 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 156357847 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 156357914 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 156358209 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 156359133 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 156359135 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 156360842 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 156361313 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156361498 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156362667 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156362832 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 156363966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156366374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156366810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156367698 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156369411 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156370426 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 156370568 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 156370601 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 156370625 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 156370883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156371104 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156371716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156371774 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156372233 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156372289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156372401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156374276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156375188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156375430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156377214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156377302 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156378752 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156383033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156383466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156384515 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 156384844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156386543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156387059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156387362 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 156387705 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 156387875 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 156387986 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 156388024 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 156388050 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 156388094 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156388101 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 156389093 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156389125 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156389225 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156389742 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 156389783 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156389800 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156390089 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156390209 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156390688 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156390754 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156390841 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156390845 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156390991 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156391073 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156391483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156392379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156392883 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156392966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156393098 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156393230 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 156393231 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 156393289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156394160 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 156394827 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 156394991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156395421 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156395472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156395669 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 156396439 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156396790 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 156397036 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 156397071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156397677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156397692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156397862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156398343 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 156398700 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156398761 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 156398792 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 156399040 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156399711 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 156400462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156400605 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 156400989 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 156401687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156401801 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156402079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156402141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156402981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156403383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156403439 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 156403477 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156403545 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156403828 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156404404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156404409 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156404420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156404557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156404585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156404816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156404827 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156405075 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 156405229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156405289 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 156405387 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 156405482 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 156405737 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 156405782 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 156406183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156406681 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 156407415 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156407453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156407774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156407883 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 156407942 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 156407945 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 156408045 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 156408069 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 156408119 G C N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 156408308 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 156408540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156408576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156408777 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 156408835 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 156409702 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156409739 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156409790 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156409946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156409962 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156410665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156410803 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 156411117 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156411996 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 156412201 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156412301 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 156412623 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 156412632 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156413109 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 156413479 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 156413488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156413623 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 156413692 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156413759 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156414654 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156416682 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 156417351 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 156417379 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 156417419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156417427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156417938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156418301 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 156420035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156420580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156420994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156421661 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156421739 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156421752 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156421767 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 156421846 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 156423189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156423263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156423473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156424127 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 156424208 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156424238 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 156424437 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 156424523 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 156424553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156424564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156424681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156424843 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 156424948 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 156425052 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 156425196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156425896 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 156426034 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156426762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156426829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156426842 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 156426847 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 156427936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156428818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156429778 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 156432697 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156433016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156435239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156436076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156442886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156443364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156444315 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156444688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156444710 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 156447726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156449390 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 156451331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156452109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156453378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156456600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156457225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156457532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156458482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156460495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156461694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156461830 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156462568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156464516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156464538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156464645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156466943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156467029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156467901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156469214 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156469236 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156469239 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 156470043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156472493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156473397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156474071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156474432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156475069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156475848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156475862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156477161 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156477410 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 156478302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156478542 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 156479028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156479093 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156481253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156482367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156486262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156486291 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 156486457 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 156486468 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 156486535 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 156486536 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 156486599 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 156486658 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 156486988 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 156486989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156487040 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 156487055 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 156487162 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 156487446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156488117 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156488402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156488812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156491433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156491971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156492743 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156493031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156493683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156494160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156494531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156494686 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 156495069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156495606 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156497601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156499166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156500262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156500523 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156500775 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 156500826 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156501300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156501486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156504961 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 156505109 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156505204 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 156505308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156505312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156505457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156505481 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156505509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156506339 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156506795 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 156508131 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 156508156 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 156508394 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 156509277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156509458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156509518 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 156509594 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156509645 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156509758 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156509797 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156509839 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156509847 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156509871 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156510714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156510759 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156511005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156511021 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156511367 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156511374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156511635 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 156511696 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 156511772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156512116 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156513344 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156514156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156514482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156514564 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156514691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156514703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156514705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156515076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156515129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156516956 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156517094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156517300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156517327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156518213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156519041 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 156519638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156520591 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156522486 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156528847 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 156529701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156529864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156529914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156530047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156530134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156530500 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156530558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156530571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156530624 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 156530774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156532360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156532398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156532477 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156532670 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156532746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156532876 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156533250 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156538226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156540279 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156543172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156544264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156545429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156545943 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 156548696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156549606 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 156550608 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 156551333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156553740 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 156556561 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156557175 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 156557198 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 156557683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156559221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156562469 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 156563396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156567474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156568842 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156568855 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156569521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156569544 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156572632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156572730 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156573281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156576151 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156576190 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156577828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156580102 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156581423 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 156584734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156585598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156587453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156591933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156594878 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 156595300 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 156596321 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 156597030 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 156598251 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 156598965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156600625 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 156601211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156603445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156603985 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156604191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156604644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156606514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156608044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156609342 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156609608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156609623 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 156609640 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156609917 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 156610070 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 156610088 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 156610194 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 156610430 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 156610504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156610724 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 156610780 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 156610790 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 156610815 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 156610816 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 156611019 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156611068 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 156611074 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 156611218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156611809 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 156611980 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 156612046 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156612968 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 156613258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156613429 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 156613798 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 156615130 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 156615265 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 156615354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156615375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156615517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156615798 G C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 156616086 G T Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 156616325 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 156616456 G A Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 2 156616491 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 2 156616556 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 2 156617462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156617536 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 156617680 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 156617837 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 156618103 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 156618648 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156619357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156619397 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 156619445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156619862 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 156620565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156621384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156622742 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 156624332 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156625387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156626429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156628118 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 156628449 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156630433 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 156631032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156631039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156631148 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 156631190 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 156631241 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 156631388 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 156631459 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 156631542 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156631832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156632055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156632404 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156633185 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156633222 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 156633238 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 156633258 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156633275 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 156633352 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156633448 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 156633455 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 156633554 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156633594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156633608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156633627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156633720 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 156634479 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 156634763 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 156634847 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 156635389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156635673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156635716 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156635732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156636019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156636239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156637384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156639187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156639444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156640114 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 156640138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156640155 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 156640590 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 156640898 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 156640949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156640971 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 156641101 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 156641125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156641151 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156641195 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156641197 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156641253 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 156641269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156641310 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 156641322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156641545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156641659 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 156641774 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 156641867 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 156641883 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 156641884 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 156642000 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 156642385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156642942 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156643983 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 156646303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156647271 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 156648208 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156648220 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156649234 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156649846 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 156651336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156654212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156656499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156656969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156659015 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 156659052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156659662 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 156659862 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 156660241 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156660747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156663066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156665802 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156668105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156669579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156669600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156669689 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156671078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156672626 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 156673723 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156673896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156673985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156674097 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 156674545 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 156675233 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 156675536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156680293 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 156680337 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156681251 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156683370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156684025 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156684125 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 156684636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156687865 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156687921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156687934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156688051 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156688332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156688505 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 156688835 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 156688901 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 156689630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156689886 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 156690696 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156690711 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156690938 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156691158 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156691687 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 156691884 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 156692006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156692568 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156692889 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 156692933 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 156694168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156696365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156697169 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 156698956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156700000 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156700892 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156700897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156703482 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156703497 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 156703568 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156703572 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 156704077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156704112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156704607 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 156704652 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156705068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156705563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156705718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156705912 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 156706058 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 156706253 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 156706314 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156706413 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 156706422 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 156706425 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156706480 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156707130 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 156707287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156707304 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 156707402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156707510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156707616 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 156707854 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 156708035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156708083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156708135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156708152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156708225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156708290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156708355 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 156708541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156708665 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156708728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156708852 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 156708955 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156709114 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 156709238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156709374 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 156709378 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 156709401 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156709455 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 156709558 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 156709823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156709872 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 156709899 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 156709929 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156709977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156710068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156710094 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 156710096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156710245 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 156710575 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156710653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156710699 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156712456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156712490 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 156712890 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 156713447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156713538 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 156713565 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 156713607 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156713612 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 156713675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156713695 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 156713716 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156713739 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 156713771 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156713841 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156713843 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156713988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156714042 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 156714170 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 156714232 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 156714321 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156714329 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156714709 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 156714739 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 156714746 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156714783 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 156715313 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156715660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156715908 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 156716181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156716399 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 156716463 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 156716946 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 156716998 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 156717429 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 156717599 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156717601 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156718016 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156718356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156718366 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156718593 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156718620 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156718698 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156718746 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156718756 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 156718764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156718890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156718916 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156719335 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 156719589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156719751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156720066 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 156720178 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 156720363 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 156720369 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 156720451 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 156720681 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 156720714 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 156720815 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 156720867 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 156720953 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156720965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156721196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156721371 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156722022 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156722337 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156722406 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156722885 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156723134 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156723173 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 156723210 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 156723287 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156723700 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156723968 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156723981 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 156724031 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156724075 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156724962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156725004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156725029 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156725277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156725388 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156725405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156725535 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156725636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156725678 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156725789 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 156725842 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156725918 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156726110 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156726139 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156726141 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156726261 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 156726296 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 156726663 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 156728021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156729291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156729679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156731433 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156731493 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 156731631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156731954 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 156732119 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 156732171 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 156732409 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 156732696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156733181 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 156733459 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156733556 T G Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 156734066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156736182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156737528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156738270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156738495 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 156738743 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156739177 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 156739623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156740271 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 156740341 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 2 156740348 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 156740633 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 156741013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156741488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156741577 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 156741621 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 156743061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156743280 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 156743857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156744290 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156744639 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156744776 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 156745170 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156745178 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156745199 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 2 156745421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156745458 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156745502 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156745585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156745673 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 156745687 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 156745693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156745728 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 156745744 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 156745759 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 156745962 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 156748429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156748907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156749347 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 156749997 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 156750582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156751217 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 156751275 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 156752360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156756220 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 156756368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156756813 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 2 156757039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156757855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156758542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156758619 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 156758953 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 156758955 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 156758996 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 156759067 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 156759224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156759325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156759372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156759453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156761905 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 156761919 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156762554 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156762667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156763732 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 156763816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156763939 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 156764420 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156764494 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 156764506 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 156764563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156764721 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156764775 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156764921 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 156765147 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156765240 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 156765512 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 156765704 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 2 156765942 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 156766397 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156766483 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156766515 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156766560 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 156767045 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 156767944 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 156767978 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 156768005 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 156768217 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 156768218 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 156768358 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 156768394 A T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 156768396 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 156768463 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 156768568 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 156768691 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 156768756 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 156769222 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 156769316 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156769359 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156769380 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156769521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156769870 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 156769891 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 156769931 C G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 156769942 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 156770076 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 156770083 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 156770112 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 156770692 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 156770897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156771128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156771163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156771345 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 156771394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156771630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156771764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156771950 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 156771957 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 156771981 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156771996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156772077 G T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 156772159 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 2 156773737 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 156777131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156777661 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 156781682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156782042 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156782418 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 156782700 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 156785996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156789650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156790061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156790647 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156791577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156792617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156792952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156794564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156794602 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 156795209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156795523 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 156795608 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 156795621 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 156795656 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 156795745 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156795788 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156795886 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 156796116 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 156796370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156796888 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 156797045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156797301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156797315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156797388 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 156797414 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 156797453 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 156800343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156800865 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 156800873 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 156800877 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 156800938 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 156801580 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156802178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156802190 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156802210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156806764 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 156808635 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 156814948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156815512 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 156816939 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156818149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156820629 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 156821534 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156823671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156823873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156824283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156825483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156825526 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 156825645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156826178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156826276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156826757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156826796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156826804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156826860 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 156827126 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156828088 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 156829255 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 156829449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156829726 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 156830786 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 156831345 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 156831619 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 156831695 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 156831778 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 156831780 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 156831891 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156832001 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156832009 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 156832365 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 156832560 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 156832592 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 156832718 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 156833112 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 156833320 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 156833339 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 156833362 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 156833442 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 156835344 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 156835476 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 156835526 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156836683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156836916 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156837184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156837481 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 156839667 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 156841303 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 156842163 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 156842837 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156842884 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 156843054 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156843215 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156843483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156843490 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 156843521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156843550 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 156843569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156843724 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156844997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156845638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156847551 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156848306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156852671 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156852672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156853330 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156853436 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 156854611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156854651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156854737 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 156854818 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156854848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156854851 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156855708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156855711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156855745 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 156855904 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 156855925 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 156855927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156855954 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 156856050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156856169 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156856273 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156856440 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156856450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156856454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156856542 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156856954 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156857347 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156857432 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156858103 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 156858629 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 156858631 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 156858749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156858925 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156859193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156859238 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156859240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156859305 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156859325 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156859432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156859506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156859641 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 156859810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156861392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156861438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156862858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156863023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156864323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156865343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156866900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156867086 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156867103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156867106 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156867118 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 156867180 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 156867208 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156867236 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156867267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156867355 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156867388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156867808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156867846 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156867900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156867970 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 156867975 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 156868006 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 156868627 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 156868777 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156868836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156868891 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156868967 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156869143 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 156869184 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156869185 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156869211 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156869212 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 156869418 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156869438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156869455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156869889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156869902 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156869924 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156869954 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156870132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156870227 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156870341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156870378 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 156870610 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156870614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156870815 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 156870894 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156870930 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156871166 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156871238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156871264 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156871329 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 156871378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156871398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156871406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156871415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156871585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156871595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156871673 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156871754 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 156871823 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156871868 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156871912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156872294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156872374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156872527 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156872781 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156872883 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156872964 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156873220 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 156873250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156873275 G C Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 156873351 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 156873374 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 156873391 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 156873398 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 156873432 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156873448 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 156874987 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 156875089 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156876217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156877563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156877700 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 156878284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156878633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156879495 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156879557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156879839 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156879874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156879898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156879909 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 156880649 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156881329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156881472 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156882110 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156883470 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156883471 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156883560 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 156883742 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 156884388 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156884467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156884634 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156884798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156884888 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156885060 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 156885144 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156885298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156885380 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156885433 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 156885461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156885546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156885702 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156885736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156886223 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156886253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156886267 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156886334 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156886442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156886452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156886513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156886524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156886554 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156886555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156886596 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156886765 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156887605 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156887669 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156887675 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156887781 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 156887875 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156887884 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 156887976 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 156888014 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 156888058 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156888114 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156888129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156888142 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156888161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156888209 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156888390 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156888704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156888769 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 156888967 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156889620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156890246 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156890316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156890331 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 156890354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156890786 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156890894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156891733 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 156891865 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156891927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156891961 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 156891981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156893017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156893086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156893429 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 156893458 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 156893564 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 156893567 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 156893637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156893667 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156894094 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156894232 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156894493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156894756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156895051 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156895083 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156896279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156899805 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156899833 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156899851 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156899989 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156900012 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156900461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156901056 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 156901080 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156901327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156902535 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 156902579 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 156907591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156908989 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156909022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156909474 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 156910282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156910438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156910982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156914463 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156914722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156914753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156915910 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156918397 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 156918405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156920143 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 156920190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156922352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156922566 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 156922744 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 156923005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156925308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156925537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156925561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156926099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156928229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156928477 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156928479 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156930157 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 156930995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156931853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156932147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156933785 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156933838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156937460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156937773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156939918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156942885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156943184 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156943249 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 156943270 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156943590 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156944525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156945149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156945859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156946230 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156946305 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156946328 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 156946479 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 156946514 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 156946579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156946906 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156946983 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 156947625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156948423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156948825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156948874 C T Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.0769230769230769 13 13 1 11 1 2 156949500 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 156949688 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 156949906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156950090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156953449 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156954446 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156954463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156958531 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 156959794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156960421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156960501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156961031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156961075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156962312 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156962873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156962895 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156964056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156965158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156965197 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156965212 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156965972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156966980 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156967033 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156967348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156967569 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156967743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156967866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156967871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156967931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156967958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156969237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156969465 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 156972037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156972695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156972702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156972901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156972958 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 156973461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156973467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156973609 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 156973878 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 156974110 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156974255 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156974655 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156974723 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156974813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156974867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156974979 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 156975042 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 156975432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156975610 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156975611 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156975749 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156975765 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156975804 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156976027 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156976171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156976378 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156976492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156976959 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156977170 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156977310 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 156977496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156977514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156977750 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 156978942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156979481 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 156981330 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 156981391 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 156981406 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 156981559 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 156981583 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 156981856 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 156981874 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 156981919 G T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 156985794 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 156989242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156989695 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 156996047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 156996141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157000364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157000905 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157003722 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 2 157004016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157005521 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 157006708 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 157006866 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 157008265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157009356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157009804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157009902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157011027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157012927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157013834 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157014573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157014643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157015132 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157015411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157015501 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157015530 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157015810 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157015873 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157016017 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157017213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157017777 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 157019442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157019882 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157021428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157022495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157023629 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157025942 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157025978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157026001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157026855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157028301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157032460 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157032839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157035236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157038772 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157038940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157039885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157040190 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157040783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157041448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157042454 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157044359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157047832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157048319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157048764 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 157048800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157048890 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157048896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157049168 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157049609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157050414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157050448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157050543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157050545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157050561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157050688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157050971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157051507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157051545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157052099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157052113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157052117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157052517 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157052565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157054576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157054797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157054813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157054817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157054913 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 157054967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157055172 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 157055212 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 157055533 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 157055622 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157055824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157055945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157056167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157056205 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157056217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157056221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157056249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157056303 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 157056311 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 157056320 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 157056376 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157056433 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157056666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157056895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157056921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157057097 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157057149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157057317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157058624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157059881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157061010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157061562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157061875 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157061890 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157062321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157062831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157062850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157064024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157064046 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157064548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157065633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157066244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157066517 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157066564 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157069682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157070174 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 157070293 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 157070450 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 157072601 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157073053 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 157073091 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 157073711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157074007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157074072 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157075618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157075630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157076598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157076807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157076829 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157077593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157077886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157078828 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157080477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157080956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157081693 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157082015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157082234 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157083888 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157086292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157086318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157086497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157086985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157086998 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157087123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157087626 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157087675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157087677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157087907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157088128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157088146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157088147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157088617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157088654 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157088925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157088988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157089047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157089247 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157089270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157089298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157089327 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157089996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157090026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157090287 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157090375 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 157090557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157090590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157090743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157090751 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157090973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157091102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157091746 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 157091762 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 157091786 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 157094151 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 157094528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157094852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157095588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157096092 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 157096528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157099526 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 157099746 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157100148 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157100734 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157101855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157101953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157103483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157108018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157108461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157108916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157109071 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157111420 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157111558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157111582 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157111790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157112464 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157113465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157113566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157115114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157116761 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157119467 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157120249 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157121974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157122322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157123262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157126441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157127917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157128948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157129662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157130104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157130175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157130181 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157130229 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 157130621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157132409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157133740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157136045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157136215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157136246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157137456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157138630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157147314 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157150973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157152985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157154246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157154635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157156521 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157159594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157159990 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157160059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157162024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157163165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157164650 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 157166845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157167832 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157168889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157169968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157171057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157171173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157171182 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 157171799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157171877 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 157171898 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 157172003 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157172056 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 157172189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157172221 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 157172328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157172377 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157172401 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 157172408 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157172509 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157172695 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157173027 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157173320 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157173724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157175938 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157176643 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 157176762 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157176982 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 157177532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157177685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157178495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157178511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157178536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157178979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157178997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157179992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157180144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157180597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157180719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157185844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157186515 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157189974 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 157190382 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157191324 A G N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 157192186 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 157193658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157193859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157193999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157195892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157196403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157196785 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 157196797 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 157196874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157201412 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157202428 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 157203054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157203887 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 157204308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157204984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157205146 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 157206570 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157206633 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157207042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157207341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157207378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157207894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157209468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157210811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157210860 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157210875 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157211412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157211435 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 157212016 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 157212021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157212035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157212059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157212088 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157212755 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 157213017 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157213254 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 157213371 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 157213659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157213719 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 157213800 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157213832 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 157213895 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157213931 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 157213977 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 157214406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157214425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157214963 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 157215097 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 157215142 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 157215160 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 157215245 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 157215251 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157215317 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 157215342 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 157215367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157215388 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157215445 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157216305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157216396 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 157216399 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 157216445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157216450 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 157216520 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157216539 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 157216624 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157216737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157217833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157218634 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 157218770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157218787 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157218851 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 157218858 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 157219191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157219200 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 157219230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157219284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157219511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157219804 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 157219815 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 157219881 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 157219917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157220667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157220883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157220928 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 157220945 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 157221265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157221513 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 157221553 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 157221684 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 157221698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157221862 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 157221965 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 157222516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157222559 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157222614 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 157222803 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 157222812 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 157223528 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 157223553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157223845 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 157223846 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 157223891 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 157223943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157224010 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157224049 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157224206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157224219 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157224606 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 2 157224663 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 157224719 C A Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 157224723 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 157224866 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 157224950 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 157224984 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 157225164 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 157225344 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157225410 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157225619 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157226347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157226394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157226691 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 157226702 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157226780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157227230 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 157227339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157227915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157228252 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 157228959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157229258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157229276 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157229625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157230534 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 157231030 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157231977 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157233000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157233806 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157234360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157234411 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 157234768 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157236125 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157236333 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 157236398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157236459 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 157237114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157237676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157238077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157238893 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157238948 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157239300 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157239580 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 157239931 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 157240149 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 157240227 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 157240647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157241353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157242193 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 157242694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157245645 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157246127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157247832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157252938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157253293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157253486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157253498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157254579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157255297 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157255457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157257842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157258052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157258545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157258939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157259393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157260112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157260464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157261135 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 157261528 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 157262067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157262331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157262765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157262773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157263039 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157265107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157265553 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 2 157265898 T G Y N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 157266035 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157266166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157266221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157266262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157266294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157266340 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157266636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157266650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157266710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157266756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157266930 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 157266936 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 157266941 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 157267374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157267458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157267510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157267663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157267791 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157269102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157269181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157269300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157269344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157269924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157270317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157271595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157271638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157272614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157273018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157273268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157273921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157274136 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157274175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157274495 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 2 157274708 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157275009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157276598 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 157276601 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 157276627 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 157277052 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 157277198 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 157277387 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 157277443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157277706 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 157277768 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 2 157278321 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 2 157278324 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 2 157278740 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157281489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157284176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157284214 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 157284225 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 157284254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157286203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157286482 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 157291132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157292039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157297001 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157297320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157297951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157298334 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157301698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157301952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157302560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157303107 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157303521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157303693 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157305100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157307026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157307629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157310502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157313112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157313427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157314243 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 157327066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157330837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157338378 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157352086 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157356180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157356790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157357606 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157358128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157362261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157365412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157368490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157370910 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 157371412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157381876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157385231 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157390185 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157390542 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157391858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157394608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157401547 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 157401567 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 157404180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157424823 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 157424921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157425750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157426571 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157431122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157431657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157432148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157432648 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157433054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157434055 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157434210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157434215 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157434229 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157434249 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157434269 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157434460 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157434709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157434952 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157434995 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157435054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157435171 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 157435322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157435748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157435764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157435944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157436303 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157436798 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157436830 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157436833 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157436908 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 157436914 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157436923 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157437003 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157437017 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157437028 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157437567 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157437880 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 157438004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157444345 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157450951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157450977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157450984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157451718 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157451729 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157452361 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157452397 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157452409 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157452742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157453056 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157453076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157453177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157453200 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157453320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157454228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157454236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157454249 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157454450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157456347 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157456887 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157457136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157457553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157457629 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157457702 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157457704 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157457738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157458024 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157458257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157458269 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157458373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157459252 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157459463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157459582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157459902 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157460048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157460114 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157460220 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157460227 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157460334 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157460389 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157461606 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157461865 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 157462038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157462292 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 157462800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157463294 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 157463967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157464249 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157464453 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 157464577 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 157464599 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 157464600 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 157464632 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 157464633 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 157464726 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157464751 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 157464761 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157464771 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157464833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157464898 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157465237 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157465704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157465910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157466075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157466218 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157466227 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 157466249 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 157466436 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 2 157466438 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 157466516 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157466538 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 157466542 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157466550 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 157466728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157467012 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 157467020 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 157467025 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 157467298 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 157467303 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157467615 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157467910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157467985 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 157470278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157470694 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 157470695 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 157470720 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157470775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157470831 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157470937 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 157471990 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157472522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157472543 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 157472719 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157472766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157473158 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 157473179 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 157473251 C A N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 2 157473503 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157473817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157473932 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157474124 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157474236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157474363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157474725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157474807 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157474830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157474945 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 157475293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157475444 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157475480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157475563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157475789 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157475966 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 157476091 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 157476380 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157484920 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157485747 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 157485783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157486163 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157486195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157487293 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 157487385 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157487602 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 157488200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157488622 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157488663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157488756 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 157489821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157490073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157490444 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 157490708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157490710 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 157490988 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157491063 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157491067 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157491260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157491418 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 157491441 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 157491509 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 157491541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157491557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157491714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157491814 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 157491817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157491850 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157491907 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 157492321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157492430 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157492482 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 157492493 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157494148 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157494435 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157494785 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157497395 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 157497408 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 157500362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157501694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157502531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157503381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157503465 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 157503951 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 157504055 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 157504060 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 157504519 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 157505466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157505757 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157505847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157506089 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 157506175 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157507727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157508553 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157508579 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 157508595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157508653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157509050 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 157509192 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157509194 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157509216 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 157510086 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157510092 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 157510228 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 157510301 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 157510302 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 157510482 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157511016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157511710 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157512172 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157512755 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 157514034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157514533 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157515644 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 157516411 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157517552 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157517724 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 157517941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157518189 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157518746 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 157518904 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 157518920 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157519336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157519633 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 157520158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157520172 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 157520243 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157520416 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 157520542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157520588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157520600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157520668 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 157520858 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 157521364 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157521453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157521638 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 157521853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157522793 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 157523681 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 157524088 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157524144 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157524185 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157524245 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157524266 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157524306 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 157524403 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157524477 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 157525152 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 157526140 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157526267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157526624 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157529019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157529173 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 157529243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157529298 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 157530179 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 157530340 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 157530900 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 157531564 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 157531630 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157531816 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157531911 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 157532131 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157533906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157533908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157534014 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 157534126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157534144 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 157534266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157535552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157537184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157537270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157542818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157542935 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157544860 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157545030 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 157545525 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 157545639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157545722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157545782 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157545790 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 157545822 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157545836 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 157545861 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 157545894 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157545918 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157545920 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 157546159 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157546229 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157546309 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157546404 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 157546465 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157546986 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 157547995 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157548683 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157548693 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157548829 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 157548925 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 157549049 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 157549106 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 157549107 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157549268 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157549312 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 157549676 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157549691 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 157550100 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157550262 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157550505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157550881 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 157550885 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 157551000 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157551251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157551286 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157551475 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157551562 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157551660 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 157551664 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 157551691 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157551726 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 157551733 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 157551942 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 157551978 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 157551992 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 157552013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157552063 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157552079 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157552120 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157552164 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 157552168 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157552233 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 157552530 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157552603 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157552619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157552775 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157552803 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157552819 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 157552842 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 157552923 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157552945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157552946 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157552999 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 157553050 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 157553125 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 157553203 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157553367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157553451 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 157553514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157553549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157553579 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 157553647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157553983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157554031 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157554052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157554062 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157554693 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157554715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157554849 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 157554965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157555018 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 157555046 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 157555328 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157555369 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157556232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157556249 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157556333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157556350 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157556511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157557115 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157558089 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157558146 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157558159 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 157558433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157558491 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157558668 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157558671 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157558691 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157558752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157558895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157558939 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157559008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157559077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157559157 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157559165 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157559285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157559329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157559499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157559555 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157559994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157560228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157560319 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157560634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157560771 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157561399 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157561678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157561769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157562148 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 157562151 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 157562326 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 157562342 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157562665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157562733 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 157562756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157562804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157562928 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 157563078 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157563495 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 157563510 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 157563756 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 157564328 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157565687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157565989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157566445 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157566479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157566890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157569603 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 157569843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157570106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157570146 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157570164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157570170 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157570213 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 157570283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157570453 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157570651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157570674 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157570704 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 157570708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157570814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157570855 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 157571039 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 157571085 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 157571379 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 157571500 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 157571580 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 157571632 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 157571822 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157571851 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 157572117 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 157572121 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 157572187 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157572427 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 157572988 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157573059 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157574362 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157575045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157575218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157577847 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157578208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157578282 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 157578708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157579245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157579359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157579635 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157579734 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157579879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157580518 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 157580808 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 157580869 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 157581059 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 157584734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157584886 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 157587277 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 157588757 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157589016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157589227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157590076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157590580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157591325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157591536 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157591537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157592110 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157592951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157593268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157593556 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 157593596 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 157593603 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157593612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157594823 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 157595011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157595029 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 157595098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157596810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157600365 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157600548 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157603644 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157603645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157603786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157606864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157606952 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157607718 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 157610858 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 157611914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157613314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157613356 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157613589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157618287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157620496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157623937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157630559 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 157631795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157632427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157635515 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157635541 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157636060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157638649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157640260 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157641261 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 157641300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157641607 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 157642012 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 157642048 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157642073 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157642134 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 157642443 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 157643027 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 157643656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157646117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157646200 T A Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 157646527 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 157646787 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 157646889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157646918 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 157647723 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 157647747 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157647988 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157648080 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 157648251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157648662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157650746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157651252 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157651455 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 157653479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157656865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157661514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157662961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157666873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157672910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157673794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157678063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157686213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157688164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157688283 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157688732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157689684 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157689940 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157693724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157694495 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 157694544 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 157694584 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 157694690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157695054 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 157695079 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 157695159 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157695359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157696083 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 157696306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157696391 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 157698214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157698320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157699749 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157700268 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 157700443 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 157700454 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157700641 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 157701777 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 157701818 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 157701844 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 157701866 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157703298 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157703391 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157703411 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157703626 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157703811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157704215 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 157704393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157704562 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157704620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157704889 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 157705623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157705659 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157705702 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157705740 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157705797 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157705851 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157705947 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 157706176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157706914 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 157706945 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 157706982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157707063 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157707115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157707329 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157707364 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157707435 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157707470 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 157707577 G T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 157707580 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 157707679 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157707712 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157708430 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157708505 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157708568 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157708620 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 157708657 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 157708762 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 157708989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157709200 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157709344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157709415 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157709492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157709530 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 157709532 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 157709562 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157709658 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157712190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157712257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157713655 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 157714725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157716550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157720334 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157720575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157721026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157721232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157729971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157730055 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 157731960 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 157732338 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 157733574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157734812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157734859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157737393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157737429 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157739307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157741468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157742252 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157742618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157744495 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 157745107 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157746907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157747030 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157747390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157747505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157747908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157749375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157751001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157751093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157751487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157752092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157753101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157753134 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 157753152 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 157753700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157753869 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 157753888 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 157754304 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 157754523 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157755862 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157756393 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157756602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157756764 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157756829 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157756922 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157756923 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 157756940 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157756949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157757056 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157757245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157758207 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157758300 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157758962 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157759593 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157759892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157762089 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157763708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157764920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157765001 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 157765303 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 157765962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157767509 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 157768075 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157769214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157770249 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157770979 C G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 157770983 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 157771456 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 157771486 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157771656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157771813 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 157771869 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157772227 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157772251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157773639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157773689 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 157774089 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157774273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157774681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157774685 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 157775054 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 157775107 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157776081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157776459 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 157776549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157776681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157776969 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 157777044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157777327 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 157778054 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157778116 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 157778269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157779179 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157779358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157779996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157780225 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157780278 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157780285 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157780321 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157780342 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157783679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157783882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157784718 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 157785123 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 157785210 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 157785227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157785512 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 157785813 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 157785858 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 157786028 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 157786609 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 157786695 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 157786894 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157787057 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157787085 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 157787204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157787236 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 157788292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157788777 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 157788794 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157788795 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 157788980 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 157789410 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 157789614 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 157789625 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 157790328 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 157790866 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157790985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157791419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157792243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157792304 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 157792790 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 157794013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157794022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157795446 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 157796715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157797038 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157797237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157798713 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 157799558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157799972 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 157804590 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157804765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157805024 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 157805278 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 157811839 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157813437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157814993 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 157815366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157820011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157820960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157821376 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157823471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157824213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157829388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157830464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157830806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157830909 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 157833411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157836655 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157836749 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 157837022 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157837110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157837378 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 157837618 A T N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 2 157838275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157838292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157839605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157840416 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157842726 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 157845281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157846935 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157847760 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 157849642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157850865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157852431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157853811 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157855311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157856354 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157859224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157859981 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157860266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157861279 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 157862194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157862265 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 157862402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157862727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157862820 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 157862839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157863156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157864118 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 157864762 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157864990 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157865320 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 157865375 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157865555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157870602 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157872717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157872946 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157873304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157873844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157874039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157874283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157874639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157874966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157876075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157878145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157878243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157878440 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157879642 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157880331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157881307 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157882197 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 157882207 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 157882377 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157882462 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 157882513 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 157883262 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 157883418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157883916 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 157884159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157885215 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 157886302 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 157886360 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 157887019 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157887048 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157887248 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 157887388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157887490 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157887605 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 157887987 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157888152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157888850 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157888924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157889063 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157889090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157889193 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 157889369 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 157889489 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157889511 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157889545 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157889805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157890387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157890578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157890863 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157891338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157891421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157891618 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 157891857 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157892228 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157892631 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157892728 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157892838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157892849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157892920 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 157892991 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 157893018 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 157893048 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 157893062 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 157893145 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 157893318 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157893334 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157893402 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157893416 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157893479 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 157893553 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157893694 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157894018 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157894082 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157894098 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157894129 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157894187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157894318 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 157894322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157894490 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 157894555 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 157894635 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 157895038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157895459 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 157895590 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 157896668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157896706 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157896723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157896724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157897169 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 157897534 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157897832 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157898191 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157899619 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 157899747 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157899767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157899881 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157900198 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157900332 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157900616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157900617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157902043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157902248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157902544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157903176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157903371 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157903925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157904297 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 157904399 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 157904426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157904709 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 157905118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157905376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157905499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157910070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157911438 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157911538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157913079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157914892 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 157916055 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157916213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157916474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157919704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157921156 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 157924861 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157925353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157925979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157926675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157926868 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 157928633 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 157928750 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 157928998 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157929087 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 157929119 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 157929208 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 157929607 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157929660 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157929672 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157929680 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157929708 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157929710 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157929736 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 157929762 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157929999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157930200 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157930246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157930370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157930409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157930432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157930468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157930514 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157930546 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157930774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157930882 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 157930986 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 157931001 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 157931145 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 157931236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157931294 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 157931386 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 157931399 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 157931993 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 157932023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157932145 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 157932201 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 157932529 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 157932543 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 157932547 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 157932569 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 157932570 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 157932612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157932632 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 157932681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157932835 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157932984 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 157932997 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 157933008 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 157933143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157933232 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 157933465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157934746 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157935140 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 157935872 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 157936245 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157942304 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157943165 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 157943237 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 157943283 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 157943651 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157943960 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 157944438 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 157944490 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157944559 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157944851 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 157944884 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 157944887 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 157945415 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 157945522 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 157945546 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 157945567 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 157945747 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 157945876 G C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 157946037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157947048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157947099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157947827 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 157948159 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 157949245 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 157949524 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157949533 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 157949549 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 157950499 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 157950817 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157950856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157951013 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157951150 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157951217 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157951242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157951382 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 157951836 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157952060 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 157953193 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 157953368 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 157953398 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 157953420 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 157953668 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 157954052 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 157954240 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 157954482 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 157954643 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 157954681 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 157954748 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 157954901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157955540 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157955692 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 157955745 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 157955909 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157955931 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157955949 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157956069 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 157956289 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 157956311 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 157957776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157957809 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 157957846 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 157957875 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 157958144 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 157958695 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157958762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157958827 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157958829 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157958927 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157959237 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 157959274 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 157959280 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 157959320 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 157959510 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 157960287 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 157960405 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 157961022 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 157961229 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157962170 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157962258 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157962268 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 157962361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157962427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157962630 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 157962641 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157963354 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157963461 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 157963483 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157963709 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 157963799 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157963958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157964373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157965430 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157965631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157965934 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 157966873 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157966884 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157966995 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157967008 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157967412 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157968047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157969217 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157969862 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157969904 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157969948 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 157970034 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157970248 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157970578 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 157970658 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 157970707 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157970726 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 157970844 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 157970869 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 157970924 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157971098 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157971717 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157971754 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157972064 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 157972305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157972880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157973313 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157973555 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 157973645 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157973699 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157974086 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157975297 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 157975298 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 157975368 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 157975396 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 157975438 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 157975439 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 157975570 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 157975604 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 157975617 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 157976087 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157976199 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157976227 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157976807 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 157976922 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 157977159 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 157977240 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 157978154 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157978262 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 157978498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157979184 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 157979232 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 157979432 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 157979675 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 157980128 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157980147 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 157980456 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 157980515 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 157980654 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 157980708 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157980730 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 157980764 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 157980774 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 157980916 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 157981012 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 157981088 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 157981104 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 157981106 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 157981128 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 157981202 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 157981381 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 157981417 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 157981580 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 157981693 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157981745 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157982127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157982196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157982287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157982291 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157982408 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157982502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 157982571 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 157983082 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 157983199 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 157984071 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157984072 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157984094 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157984177 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157984261 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 157984368 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157984566 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157984752 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157984786 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157984802 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 157984861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157984938 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157984958 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157984987 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157985162 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 157985696 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157985767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157985864 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 157986010 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 2 157987269 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 157987313 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 157987395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157987539 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157988564 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157988694 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157988722 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157989479 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157989593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157989642 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157989691 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 157989804 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 157989808 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 157989815 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 157989937 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 157990042 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 157990117 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 157990190 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 157990196 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 157990236 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157990270 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157990397 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157990482 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157990525 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157990534 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157990540 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157990752 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157990760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157990931 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 157990951 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 157991028 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157991089 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157991136 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 157991168 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 157991176 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157991189 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157991226 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 157991228 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157991276 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157991289 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 157991293 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 157991351 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157991469 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157991566 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 157991746 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157991810 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 157991824 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 157991878 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157991892 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157991893 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157991914 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157991938 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 157992025 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 157992145 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 157992312 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157992336 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 157992451 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157992598 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 157992758 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 157992837 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 157992956 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 157993033 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 157993113 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 157993130 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 157993204 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 157994092 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157994109 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 157994125 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 157994136 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157994170 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 157994284 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 157994437 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 157995020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157995169 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 157996135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157996358 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 157996396 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 157996457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157996498 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157997185 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 157997388 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 157997445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157997739 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 157998804 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 157999551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157999685 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 157999743 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 157999844 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 157999862 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 157999873 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 157999898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 157999946 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 158001836 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158001858 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158001901 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158002130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158002327 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 158003072 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 158003591 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 158003679 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 158003709 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 158003714 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 158003807 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 158003828 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158004367 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 158004424 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 158004425 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 158004547 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 158004551 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158004711 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158005155 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 158005860 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 158006420 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158006471 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158006512 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158006775 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 158006979 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158007069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158007205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158007272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158007274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158007321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158007342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158007344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158007388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158007397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158007523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158007764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158008236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158008299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158008461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158008538 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158008570 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 158008704 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158008730 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158008786 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 158008949 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158009144 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 158009505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158009727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158009928 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158010185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158010314 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 158010491 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 158011478 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 158011529 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 158011789 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 158011806 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 158011832 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 158011929 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 158011985 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158012046 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 158012136 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 158012964 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 158013051 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 158013131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158013166 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158013253 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158013311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158013824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158013846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158014298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158014653 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 158014719 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158014882 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158014963 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158014983 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158014984 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158015106 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158015173 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158015210 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158015219 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158015301 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158015661 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158015671 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158015707 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 158015720 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158015765 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 2 158016006 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 158016141 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 158016237 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 158016282 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158016293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158016362 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158016386 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158016667 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 158016742 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 158016762 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 158016794 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158016859 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 158017362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158017407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158017427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158017467 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158017522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158017528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158017634 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158017695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158017857 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158018015 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158018018 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158018038 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158018428 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 158018492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158018572 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 158018673 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158019364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158019755 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158020280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158020659 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158020827 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 158020862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158020864 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 158020958 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 158021072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158021200 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 158021415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158021420 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 158021733 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158021852 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158022294 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158022330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158022509 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158022686 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 158022777 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158022842 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158022966 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 158023210 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158023243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158023542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158023582 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158023691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158023756 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158023797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158024351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158024404 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158024473 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158024549 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158024568 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 158024788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158024948 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158025033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158025488 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 158025521 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 158026567 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158026570 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158026615 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158027445 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 158027682 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158027760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158027770 A C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 158027773 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 158027792 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 158027816 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 158028140 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 158028148 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 158028193 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158028400 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158028402 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158028572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158028689 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 158029141 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158029372 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 158029539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158029590 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158030344 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158030412 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158030604 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158031326 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158031524 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 158031558 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158031710 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158032195 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158032235 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158032243 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158032259 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158032361 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 158033465 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158033514 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158033535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158033681 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158033845 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158034103 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 158034132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158034155 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 158034390 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158034437 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158034484 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158034546 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158034572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158034628 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158034648 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158034682 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158034888 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158034934 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 158035016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158035153 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158035360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158035412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158035600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158035796 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 158035984 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158035993 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 158036075 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 158036116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158036198 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 158036204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158036363 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 158036386 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 158036440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158036456 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 158036486 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 158036529 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 158036575 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 158036626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158036831 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158037022 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158037168 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158037177 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 158037231 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158037305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158037582 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 158037655 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158037709 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158037777 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 158037879 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158037918 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158037919 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158037960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158037966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158038189 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158038283 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158038319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158038355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158038358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158038392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158038765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158038767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158038869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158039212 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158039267 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158039361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158039809 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 158039898 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 158040567 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 158040847 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158041337 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158041810 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158041839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158041850 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158041933 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 158042194 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158042432 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158044402 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158046615 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158046769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158046892 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158047085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158047392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158047571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158050824 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 158051338 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158051891 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158052511 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158054133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158055654 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158056789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158058288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158059207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158059420 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158060062 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158060739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158061424 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158061493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158061554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158061886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158061954 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158062101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158062176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158062283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158062406 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158062685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158062697 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158062735 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158062903 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158062924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158062933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158062949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158063008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158063065 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158063224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158063522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158063968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158064137 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158064184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158064563 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 158064810 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158065891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158066052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158066368 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158066803 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158067038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158067093 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158067134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158067204 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158067263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158068391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158068807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158069885 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158069923 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158069947 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158069996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158070322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158070367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158071040 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158071111 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158071116 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158071148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158071171 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158071315 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158071339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158071423 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158071934 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158071978 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158072048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158072133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158072163 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158072233 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158072341 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158072758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158072934 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158073147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158073170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158073182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158073263 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158074360 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158074402 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158074458 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158074520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158074717 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158075603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158076322 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158076359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158076401 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158076409 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158076472 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158076559 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 158076942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158077374 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158077382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158077800 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158077835 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158078494 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158079180 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 158079310 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158079330 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158079544 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158080056 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158082899 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158083111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158084909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158084938 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 158085611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158085752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158086400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158086870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158087494 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158087792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158087830 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158087854 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158087948 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158087984 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158088138 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158090559 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158090911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158091439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158091522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158091597 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158091837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158092291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158092442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158092511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158092677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158092692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158093429 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158094030 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158094758 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158094892 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158095309 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 158095418 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158097086 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158097115 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158097133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158097314 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158097804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158097846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158097847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158097879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158098487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158099082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158099184 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158099519 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 158099836 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158101693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158102001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158102528 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158102891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158103141 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 158103538 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 158103662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158103849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158103866 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158104195 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158104206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158104298 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158104311 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158104404 C G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 158105186 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158105403 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158105506 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158106114 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158106500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158106511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158106516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158106836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158107463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158107524 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158107527 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158107724 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158107987 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158109437 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 158109581 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 158109660 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 158109791 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158109820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158109882 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158109966 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158110011 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158110707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158110719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158110950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158111127 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158111156 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158111360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158111883 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158111895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158118631 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158118679 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158118759 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158118803 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158119097 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158119516 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 158119597 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 158119714 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 158119930 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 158120476 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158120594 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158120633 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 158120634 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 158120717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158120750 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158120766 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158120787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158120789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158121206 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 158121476 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158121547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158121571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158121678 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158121692 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158121774 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158121823 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158121825 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158121908 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158122039 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 158122188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158122259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158122404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158122439 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158122626 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158122647 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158122686 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158122695 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158122702 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158122737 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158122738 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158123319 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158123509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158123551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158123564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158123658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158123753 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158123779 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158123840 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158124052 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158124208 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158124997 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 158125293 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158125305 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158125321 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158125353 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158125397 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158125492 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158125507 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158125706 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158125794 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158125942 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158125950 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158125969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158126074 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158126077 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158126101 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158126122 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158126264 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158126574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158126810 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158126973 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158127417 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158127524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158127987 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158128824 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158129257 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158129350 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158129430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158129674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158130347 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158130369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158130420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158131228 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158132082 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158132116 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158132287 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 158132291 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158132709 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158133261 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158133265 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158133604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158133988 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158134097 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158134214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158134570 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 158134738 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158134760 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158134965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158135000 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158135126 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158135403 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158135693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158135694 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158135955 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158136118 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158136154 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158136164 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158136345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158136351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158136440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158136631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158136685 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158136690 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158136779 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158136836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158136893 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158137080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158137231 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158137555 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158137732 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158137776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158137882 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 158137890 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158138084 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158138284 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158138286 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 158138366 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158138504 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 2 158138583 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 158138633 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158138685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158138695 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158138704 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158138717 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158138720 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158138778 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158139204 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158139398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158139420 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158139585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158139593 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158139609 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158139669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158139710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158139869 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158140034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158140098 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158140114 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158140154 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158140181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158140309 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158140368 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158140411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158140424 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158140426 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158140580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158140641 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158140654 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158140706 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158140752 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158140765 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158140971 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 158141020 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 158141073 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158141151 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158141157 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158141244 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158141281 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158141307 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158141424 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158141490 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158141492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158141516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158141556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158141598 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158141705 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158141771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158141788 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158142043 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158142192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158142229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158142239 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158142312 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158142380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158142547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158142607 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158142717 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158142724 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158142865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158142883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158142950 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158142951 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158143015 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158143020 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158143134 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 158143178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158143437 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158143553 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158143607 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158143647 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158143721 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158143858 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158143871 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158144049 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158144129 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158144180 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158144390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158144429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158144455 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158144623 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158144672 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158144836 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158144894 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158145320 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158145327 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158145343 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158145622 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158145654 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158145688 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158145718 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158145722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158145757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158145773 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158145816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158145818 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158145844 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158145891 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158145893 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158145922 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158145962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158145982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158146105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158146122 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158146155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158146225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158146249 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158146298 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158146315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158146325 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158146360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158146460 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 158146503 G C N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 158146531 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 158146553 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 158146559 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 158146572 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 158146720 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 158146743 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 158146799 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 158146909 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158147050 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158147109 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158147131 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158147165 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158147179 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158147227 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158147229 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158147709 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158147798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158147806 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158147974 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158148096 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158148098 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158148153 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158148212 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158148330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158148497 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158148531 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158148545 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158148574 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158148704 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158148911 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158148976 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158149006 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158149402 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158149608 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158149862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158150039 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158150176 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158150453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158150463 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158150464 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158150691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158150701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158150830 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158150865 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158150954 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 158150999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158151065 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158151072 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158151084 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158151098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158151123 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158151176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158151209 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158151243 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158152343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158152413 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158152455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158153034 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158153062 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 158153084 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 158153168 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158153494 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158153629 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158153819 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158153833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158154588 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158154833 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 158154944 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158154950 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158155107 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158155129 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158155173 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 158155203 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158155327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158156788 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158157454 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158157883 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158158345 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158158737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158159583 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158159601 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158159602 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158160535 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158160594 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158160597 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158160647 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158160727 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158162484 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158163529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158163590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158163645 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158163699 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158165363 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158165387 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158165392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158165509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158165691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158165739 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158165752 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158166320 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158166321 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158166447 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158166487 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158166491 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158166534 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158166565 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158166924 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158167028 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158167055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158167365 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158167568 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158167618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158167707 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158167812 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 158167823 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158167881 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158167930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158167961 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158167996 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158168010 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158168140 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158168209 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158168284 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158168349 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 158168354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158168367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158168380 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158168401 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158168586 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158168615 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158168778 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158168790 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158168820 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158168829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158168845 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158168862 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158168900 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 158168952 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158168959 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158169006 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158169048 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 158169060 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 158169297 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158169650 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158169726 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158169790 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158169804 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 158169833 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158169923 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 158169951 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158170013 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 158170022 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158170055 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158170080 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158170090 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158170149 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158170193 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158170262 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158170274 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158170454 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158170469 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158170492 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 158170528 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158170545 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158170559 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158170624 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158170659 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158170666 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158170727 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158170752 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158170759 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158170773 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158171166 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158171203 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 158171466 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158171482 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158171537 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158171611 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158171613 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158171763 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 158171947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158172029 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 158172031 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 158172991 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 158173007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158173218 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158173248 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158173706 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158174085 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 158174100 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158174315 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 158174371 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158174743 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 158174991 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 158175191 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158175211 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158175488 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158175707 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158175749 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158175761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158176263 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 158176298 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158176325 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 158176413 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158176480 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 158176569 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158176655 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158176840 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158177084 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158177090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158177119 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158177158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158177163 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158177202 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158177270 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158177360 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158177496 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158177968 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158178065 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158178142 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158178512 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 158178897 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 158179241 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158179261 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158179267 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158179492 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 158179668 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158179670 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158179736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158179801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158180250 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158180610 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158181482 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158183157 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158183321 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158183364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158183407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158183432 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 158183442 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158183453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158183458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158183588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158183625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158183650 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158183671 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158183760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158183806 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 158183918 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158183939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158183945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158184015 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158184070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158184085 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158184118 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158184811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158186439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158186840 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158187412 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158187616 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158187642 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158187922 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158189487 T A N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 2 158189563 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 158189628 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 158189630 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 158189664 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158190115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158191144 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158191318 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158191781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158192250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158192363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158192404 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158192621 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158192770 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 158193111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158193117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158193211 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158193377 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158194391 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158194544 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158194634 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 158195231 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 158195358 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 158195370 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158195513 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158195632 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158195698 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 158195784 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158195925 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 158195938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158196778 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158196785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158196859 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158196887 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158196896 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158196901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158196957 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158197039 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158197054 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158197068 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158197109 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158197155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158197246 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158197328 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158197427 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158197445 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158197609 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158197659 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158197697 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158197766 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158197829 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158197986 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158198021 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158198052 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158198255 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 158198409 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 158198598 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158199391 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158199646 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158199656 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158199711 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158199840 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158199896 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158199922 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158199935 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158200349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158201637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158201824 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158202345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158202485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158202563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158202605 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158202941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158203075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158203080 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158203111 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158203120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158203162 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 158203235 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158203320 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158203356 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158203358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158203381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158203490 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158203591 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158203625 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158203784 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158203835 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158204923 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158205088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158205131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158205144 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158205242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158205461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158205470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158205495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158205511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158205538 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158205559 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158205578 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158205653 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158205742 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158205774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158205786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158205961 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158206108 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158206168 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158206190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158206267 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158206313 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158206397 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158206430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158206433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158206606 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158207133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158207303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158207389 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158207859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158208117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158208677 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158208747 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158208810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158209304 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158209378 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158209540 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 158209542 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158209885 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 158210048 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158210212 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158210323 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158210446 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158210542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158210552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158210571 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158210578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158210656 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 158210859 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 158211005 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158211050 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158211299 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158211394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158211441 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158211444 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158211523 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158211579 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158211596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158211649 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158212156 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158212364 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158212412 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158212413 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158212499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158212657 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158213791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158215810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158215839 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 158216334 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158217878 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158218527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158218865 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158218960 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158220744 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158220825 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 158221726 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158222694 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158223042 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158223169 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158223498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158224077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158224277 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158224679 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 158227923 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158227962 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158229201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158229928 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158230368 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158231429 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 158231545 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 158231843 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 158232164 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158233120 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 158233131 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 158233146 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 158233147 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 158233197 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 158233642 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 158233786 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 158233829 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 158234113 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 158234242 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158234304 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 158234407 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 158234444 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 158234472 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158236285 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158236419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158238125 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158239667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158240957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158242646 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158243173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158244562 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158244679 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 158246081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158246620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158247144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158247540 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158248515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158249586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158250621 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158250628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158250672 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158254988 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 158258144 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158260281 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 158262958 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158263530 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158264186 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158269299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158270281 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158270359 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158271815 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158273730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158274341 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158274689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158275790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158276377 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 158277590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158278343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158278640 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158278934 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158279484 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158279591 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158279832 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158282482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158284240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158284654 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158284819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158285715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158288099 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158288826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158288981 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158289226 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 158289256 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 158290240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158290253 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158290646 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 158290686 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 158291835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158292192 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158292663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158294460 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158294587 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158294883 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 158296337 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158299185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158299383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158300671 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 158300736 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158300793 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158301008 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 158301010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158301117 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158301193 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158301252 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158301601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158302641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158303642 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158303674 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158304103 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158304115 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158304163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158305295 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158305641 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158306233 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158306890 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158307503 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158308521 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158312700 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158313173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158314699 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 158317680 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 158317785 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158319172 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158320535 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 158321161 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158322576 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 158322667 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 158324456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158325347 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158325934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158326186 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 158326188 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 158326495 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158326591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158326618 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158328166 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 158328224 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 158330023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158330078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158333285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158333724 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 158333844 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158333971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158334181 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158334214 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158334420 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 158336003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158339988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158341038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158341632 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 158342262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158342671 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 158342924 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 158345106 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 158345727 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 158345728 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 158345824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158345833 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 158345839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158345949 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 158346005 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158346067 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 158346171 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 158346191 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 158346679 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 158347277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158349072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158349486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158349936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350220 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 158350234 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350312 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 158350326 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350388 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 158350426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350488 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 158350632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350656 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 158350668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350917 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350931 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158350968 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158351020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158351052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158351063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158351071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158351733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158351903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158351922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158351950 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158351954 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 158352033 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 158352374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158352673 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158352674 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158353212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158354408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158359421 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 158362567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158363020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158363220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158364764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158366813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158366828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158366832 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158366851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158370013 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158370810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158371538 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158372160 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158372911 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 158373888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158374015 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158376212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158376671 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158376755 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158377062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158379421 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158379423 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158384635 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158384862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158386025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158386582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158387291 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158387619 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158387649 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 158387680 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158387778 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 158387797 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 158388057 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 158388110 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 158388219 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 158388233 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 158388391 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 158388845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158389699 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158390083 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158390155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158390179 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158390208 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158390225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158390246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158390261 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158390356 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158390378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158390398 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158390450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158390475 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158390487 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158390531 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 158390698 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158390724 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158390751 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158390758 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 158390877 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 158390923 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158390933 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158390941 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158391042 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158391126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158391267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158391324 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 158391501 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158391506 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158391577 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158391608 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158391637 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 158391649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158391698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158391748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158392081 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158392240 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 158392257 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158392347 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158392829 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158393147 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158393155 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158393194 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158393237 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 158393242 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 158393253 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158393371 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158393637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158393650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158394028 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158394586 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158394638 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158394720 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158394750 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158394768 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158394777 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 158395035 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158395067 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158395135 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158395675 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 2 158395722 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 2 158395723 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 158397174 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158400987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158402190 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158403385 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158404037 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158404785 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 158404920 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158404921 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158404991 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158405140 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158405213 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158405230 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158405287 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 158405643 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158405755 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158405915 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158405935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158406099 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158406150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158406267 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 158406659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158407207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158411426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158412363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158412573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158413082 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 158413192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158413706 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 158415320 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 158415881 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 158415885 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 158415944 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 158416002 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158417139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158417728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158417787 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158420920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158422887 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158422934 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 158422976 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158422984 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 158423013 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158423069 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158423083 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158423094 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158423110 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158423121 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158423148 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158423229 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158423316 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 158423319 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 158423336 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 158424385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158424442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158424943 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 158425148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158427728 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158428006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158428045 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 158428141 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 158428364 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 158428450 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158428497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158428528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158429054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158429214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158429357 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158429373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158429377 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158429874 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158429915 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158429919 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158430638 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158431867 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 158432450 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158432887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158435296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158435309 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158438437 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 158438598 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 158439211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158441063 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 158441351 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158441508 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158441513 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 158441760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158441936 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158442043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158442095 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 158442108 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 158442126 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 158442189 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 158442209 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 158442258 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 158442268 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 158442372 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 158442593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158442616 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158442627 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158442725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158442751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158442933 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 158442982 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 158442992 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 158443355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158443458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158443617 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 158443624 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 158443657 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 158443668 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 158443742 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 158443767 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 158443792 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158443804 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 158443859 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158443960 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158444037 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158444142 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158444225 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 158444328 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 158444336 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 158444367 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 158444414 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 158444431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158444432 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 158444494 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 158444510 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 158444801 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 158444873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158445080 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 158445084 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 158445174 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158445284 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158445291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158445596 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 158445726 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 158446144 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 158446151 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 158446431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158446449 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 158446587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158446792 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158446823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158446827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158447004 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158447035 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158447043 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158447657 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158448146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158448195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158448325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158448464 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158448465 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158448587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158448662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158448713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158448861 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 158448862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158448903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158449037 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158449048 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158449098 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 158449130 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 158449138 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 158449319 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 158449449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158449593 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 158449611 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158449649 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 158449718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158449722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158450071 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158450120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158450296 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158450348 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158450374 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158450437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158450672 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 158451306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158451329 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 158451440 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158451946 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158452071 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 158452122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158452441 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158452542 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 158452722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158452950 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 158452999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158453656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158453741 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158453756 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158453880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158454368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158454556 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 158454591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158454598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158454683 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 158455076 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 158455119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158455139 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 158456625 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 158456895 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 158456975 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158457031 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158457134 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158457180 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158457314 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158457360 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 158457591 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 158457880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158457950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158458970 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158459027 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 158459060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158459085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158460025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158460341 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 158460413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158460513 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 158460526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158460584 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 158460592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158460601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158460613 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 158460932 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158460941 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158461045 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 158461066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158461156 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 158461318 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 158461437 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 158461653 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 158461696 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 158461908 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 158462117 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 158463030 C T Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 2 158463069 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 158463282 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 158463292 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 158463842 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158463848 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158463854 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158463893 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158463956 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158464083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158465197 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 158465217 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 158465239 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 158465243 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 158465317 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158465750 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 158466274 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 158467386 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 158468999 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 158469026 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 158469286 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158469730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158472054 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 158472092 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 158472199 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158472487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158476028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158476863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158476966 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158477078 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158477717 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 158477750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158477758 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 158477906 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 158477964 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 158478248 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 158478372 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158478422 G C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 158478445 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 158478998 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158479478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158479527 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158482594 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158483018 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 158483033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158483071 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158483368 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158483405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158484680 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158484922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158485627 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 158486039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158486099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158486206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158486239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158486320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158487031 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158487112 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158487204 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158487218 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158487285 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158487318 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158487439 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158487459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158487575 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158487588 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158487710 C T Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 158487900 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 158487904 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158487922 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 158487953 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158487985 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158488067 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158488107 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158488709 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158489015 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158489371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158490523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158490710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158490862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158491324 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158491873 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158491923 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158492486 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158493031 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158493195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158493205 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158493333 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 158493349 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158493377 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158493396 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 158493584 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158493672 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158493815 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158494102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158494248 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 158494277 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158494425 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158494426 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158494480 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158494507 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158494865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158494918 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158495368 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158495419 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 158495424 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 158495597 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 158495664 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158495730 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158495743 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158496018 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 158496126 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158497028 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 158497165 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158497205 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158497226 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158497317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158497357 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 158497933 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158498637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158499481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158499973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158500326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158500380 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158500476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158500593 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158502184 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158503887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158506979 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158507578 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 2 158507775 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 158508522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158508650 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 158508652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158508661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158508947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158509204 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 158509258 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 158509314 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158509316 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158509422 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158510120 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158510802 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158510983 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158511765 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 158512630 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158512695 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158513871 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158515765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158515854 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158515880 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158516596 A T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 2 158516877 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 158516984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158517419 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 158517502 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 158517754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158517817 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158517965 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158517966 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158518507 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158518540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158518569 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158518584 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158518780 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158518888 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158518958 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158519048 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 158519077 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 158519155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158519569 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 158520350 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158520353 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158520370 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158520694 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158520793 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158520805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158521304 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158521335 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158521360 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 158522094 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 2 158522538 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 158522886 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158523219 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 158523227 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 158523358 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 158523453 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158523501 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158523579 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158523797 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 158523804 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158523949 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158523987 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 158524076 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 158524159 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 158524233 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158524273 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 158524767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158524862 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158525539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158526652 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 158527057 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 158528152 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158528931 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 158528997 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 158529044 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 158529508 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158529618 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158529638 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 158530502 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 158530518 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 158531291 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158531718 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 158531759 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 158531785 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 158532428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158532642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158532654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158532696 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158532761 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 158532839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158532851 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158533011 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158534300 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 158534362 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158534369 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158534874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158536771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158536786 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158536866 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158537374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158537493 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 158538080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158538289 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 158538425 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158538499 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 158538525 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 158539643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158540589 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158540627 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158540667 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158540908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158540948 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158542084 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158542235 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158544134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158544714 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158545329 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 158547347 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158548295 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158548542 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158548551 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 158548677 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 158549344 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 158549441 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158549524 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 158552151 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158552245 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158552575 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 158553139 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 158553193 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 158553519 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158553523 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 158553535 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158553566 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 158554110 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 158554532 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 158554979 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158555000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158555003 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158555079 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158555117 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158555118 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158555187 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158555660 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158555862 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158555990 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158556048 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158556083 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158556087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158556145 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158556315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158557273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158557335 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 158557727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158559262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158559798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158559840 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158559916 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 158559925 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158560040 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 158560162 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158560608 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 158560713 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158560736 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 158560796 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158560809 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158560846 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 158562365 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 158563063 C G Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 158563072 A C N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 2 158564255 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158564300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158564615 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158565227 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158565306 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 158567718 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158567779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158567936 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 158568063 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 158568173 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 158568423 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158568490 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 158568538 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 158568721 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 158568751 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 158568954 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 158568984 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 158569010 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 158569050 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 158569178 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 158569250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158569582 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 158569651 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 158569851 T A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 158570072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158570195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158570308 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158570479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158570546 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 158570566 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 158570717 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158570772 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 158570839 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 158571778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158571796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158571844 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 158571930 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 158572080 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158572087 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 158572101 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 158572113 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158572548 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158572551 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158572739 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 158572753 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 158572771 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 158572814 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158572931 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 158573475 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 158573642 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 158573643 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158573765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158573768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158573790 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 158573934 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 158573948 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 158574187 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 158574230 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 158574286 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 158574412 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 158574427 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 158574459 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158574483 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 158574518 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158574550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158574616 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 158574634 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 158575392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158575464 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 158575475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158575587 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 158575620 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 158575898 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 158575961 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 158575967 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 158575978 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 158576021 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 158576096 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158576153 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158576159 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158576464 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 158576547 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158576594 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158576596 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 158577092 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158577606 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158577698 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 158578088 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158578120 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158578436 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158578453 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158579081 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 158579088 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 158579405 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 158579700 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158579743 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 158579843 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 158579911 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 158579916 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 158579939 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 158579949 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 158580061 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158580064 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 158580079 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 158580240 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 158580544 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 158580682 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158580771 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158581098 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158581139 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 158581287 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 158581315 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158581333 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158581395 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 158582496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158582543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158582558 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158583061 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158583081 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158583123 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158583251 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 158583476 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158583722 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 158583761 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 158583774 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158583837 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158584035 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 158584082 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 158584352 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158584509 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 158584615 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 158584774 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 158585865 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158585899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158585937 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 158586070 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 158586407 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158586857 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 158586958 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 158587001 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 158587605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158587878 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158588400 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 158589142 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 158589185 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158589244 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158589517 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158589558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158589828 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 158589830 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158590319 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158591323 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158591481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158592075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158592187 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158592364 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158592469 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158592617 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158593338 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158593714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158593823 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 158594089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158594098 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158594194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158594278 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 158594420 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 158594490 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 158594564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158594676 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158594771 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158594894 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158595175 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158595335 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158595446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158596383 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 158596393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158596705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158597406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158597408 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158597444 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158597491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158597710 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158597930 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158598196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158598255 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 158598599 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 158598886 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 158598945 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158599031 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158599057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158599081 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158599137 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 158599144 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158599234 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 158599505 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 158599587 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158599608 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 158599609 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 158599641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158599644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158599660 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 158599957 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158600089 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 158600278 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 158600433 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158600442 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158600519 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158600628 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158600955 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 158601357 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158601596 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158601715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158601781 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 158601891 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158601894 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158601947 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 158602356 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 158602382 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 158602918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158602981 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158603152 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158603179 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158603259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158603298 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 158604334 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158604698 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 158604736 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 158604861 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158605309 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158605369 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158605505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158605537 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 158605561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158606323 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 158606346 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 158606398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158606400 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158606495 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 158606612 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 158606671 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158607728 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 158608071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158608189 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158608385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158608558 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 158608580 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 158608633 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 158608645 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 158608679 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 158608886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158608956 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158609006 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158609339 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158609404 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 158609448 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 158609739 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158610280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158610568 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158611171 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158611217 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158612614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158613758 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 158613803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158614408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158614424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158614460 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158614485 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158614550 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 158614595 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 158614623 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158614627 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158614686 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 158614707 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158614778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158614803 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 158614833 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158614886 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158614893 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158614935 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158615246 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158615262 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158615559 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158615572 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158615675 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 158616333 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 158616369 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 158616524 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158616739 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158616928 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158617027 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158617031 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158617185 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158617338 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 158617341 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158617359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158617780 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 158617813 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 158617885 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158617911 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 158617947 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158618024 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158618056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158618154 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158618283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158618300 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158618327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158618343 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158618679 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158618709 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158618737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158618771 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158618926 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158618991 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 158619067 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158619164 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158619387 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 158619727 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 158619763 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 2 158619861 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 158619876 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 2 158621472 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158621510 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158621522 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158623153 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158623382 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 158623485 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158623711 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 158623910 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 158623952 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 158624131 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 158624262 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158624615 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 158624671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158624874 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158624888 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 158624898 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 158625343 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 158625402 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 158625425 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158625531 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158625570 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158625792 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 158626150 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 158626220 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 158626727 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158627241 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 158627261 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158627262 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158627381 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158628815 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158629319 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 158630182 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158630265 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158630275 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158630297 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158630327 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 158630393 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158631022 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158631031 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 158631073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158631103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158632513 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158632898 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 158632899 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 158633003 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 158633012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158633111 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158633201 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158633215 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158634611 T G N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 158634824 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 158635191 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 158635200 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158635354 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 158635899 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158636023 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158636024 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158636080 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 158636093 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158636145 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 158636170 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158636247 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158636294 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 158636341 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158636562 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158636817 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 158636831 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 158636924 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 158637195 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 158637380 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 158637413 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 158637493 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 158637760 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 158637770 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 158637776 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 158637861 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158637929 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 158637936 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 158638224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158638244 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 158638385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158638401 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 158638689 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 158638690 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158638743 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158638947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158639094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158639261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158639279 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 158639360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158639464 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 158639524 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158639681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158639795 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 158639826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158640332 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158640861 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158641553 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158642185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158642199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158642558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158643808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158643872 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158643967 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158644601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158645116 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158645177 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 158645243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158645458 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158645750 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158645757 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 158645799 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158645845 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 158645860 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 158645928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158646006 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 158646347 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 158646470 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158646674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158646918 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158647188 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 158647252 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158647269 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158647270 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158647364 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158647491 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158647739 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 158647824 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158648065 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 158648098 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 158648129 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158648380 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 158648409 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 158648585 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158648806 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158648881 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 158648906 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158648986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158650185 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158650367 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158650757 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158651334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158651343 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 158651421 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158651443 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 158651445 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 158651492 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 158651493 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 158651505 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 158651625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158652273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158652296 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 158652425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158652545 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158652600 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158652841 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 158653416 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 158653875 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158654010 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158654022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158654042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158654069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158654240 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158654318 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158654331 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 158654334 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 158655071 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158655787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158656256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158656341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158656567 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158656570 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 158657359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158658502 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158658514 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158659469 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 158659726 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158660113 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158660205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158660428 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158660462 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 158661258 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158661496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158661541 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 158662341 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158662455 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158663144 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158663543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158663554 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158663790 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158663873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158664111 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158664197 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158664199 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158664456 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158664886 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 158665316 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 158665457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158665835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158665942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158665956 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 158666031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158666090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158667088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158667305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158667893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158667900 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158669318 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158669882 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158669909 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158670052 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 158670112 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158670155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158670190 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 158670441 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158670484 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158670487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158670506 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158670738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158671240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158671260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158672217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158672983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158673184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158673765 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 158674111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158674216 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158674346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158674426 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158674598 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 158674643 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158674758 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158674815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158674878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158675046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158675065 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158675087 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158675134 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 158675143 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158675155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158675224 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 158675263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158675450 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158675609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158675711 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158676329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158676330 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158676370 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 158677099 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158677287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158677289 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158677316 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158677329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158677355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158677606 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 158677685 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 158678112 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 158678713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158678792 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158678856 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 158679076 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158679138 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158679960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158680014 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158680067 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 158680081 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158680286 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158680352 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158680815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158680836 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158680879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158681101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158681524 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158681584 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158682076 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 158682259 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 158683924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158685133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158685266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158685429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158685968 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 158686068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158686073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158686192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158686435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158686576 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158686729 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158686817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158686948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158688155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158688186 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158688195 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158688201 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158688271 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158688565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158688786 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158688982 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158688996 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 158689003 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158689030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158689049 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158689232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158689259 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158689341 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158689357 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158689410 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158689455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158689459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158690018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158690051 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158690305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158690469 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158690564 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158690617 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158691124 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158691136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158691177 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158691179 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158691206 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158691214 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158691579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158691839 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158692056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158692954 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 158693002 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 158693100 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158693140 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158693202 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158693435 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158693491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158693668 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158693682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158693828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158693894 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158694486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158694561 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 158694562 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 158694576 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 158694631 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158694642 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158694678 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 158694745 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 158694790 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 158694829 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158695287 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158695473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158695687 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158695814 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158696355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158697306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158697335 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 158698106 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158698300 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158699395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158699699 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158699753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158699843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158699884 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 158699906 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158700016 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158700091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158700313 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158700585 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158700592 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158700643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158700689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158700903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158701003 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 158701117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158701253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158701312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158701373 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158701590 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158701711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158701726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158701762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158701837 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158701950 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 158702072 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158702077 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158702201 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158702866 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158703054 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 158703562 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 158705266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158705752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158705819 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 158705833 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 158705854 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158706007 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 158706039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158706314 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158706477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158706979 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 158707557 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158707914 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 158707958 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 158708482 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158709087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158709222 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 158709373 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158709568 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 158709846 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158709894 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158710029 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158710079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158710231 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158710315 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 158710353 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 158710711 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 158710822 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 158710886 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158710950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158711067 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158711897 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 158712395 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158712408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158712527 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158712548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158712554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158712646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158712735 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 158712747 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158712841 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 158712866 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 158712870 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158712912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158713012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158713030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158713061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158713215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158713224 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158713969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158714016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158714081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158714209 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158714897 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158715932 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158718140 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 158718585 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158718749 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158718821 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158718851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158718936 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158719255 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158719262 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158719309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158719310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158719380 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158719388 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158719474 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158719838 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158720395 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 158720812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158721006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158721034 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158721225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158721254 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158721351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158721624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158721677 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158721688 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158721720 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158721852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158721864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158721869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158721879 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158722281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158722320 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158722389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158722393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158722653 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 158723140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158723257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158723306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158723498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158723636 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158723807 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158723838 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158724019 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158724028 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158724039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158724044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158724059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158724100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158724107 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158724196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158724252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158724377 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158724735 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 158725583 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158725767 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158725834 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158725888 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158725893 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158725974 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158726033 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158726533 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158726590 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158726627 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158726784 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158726882 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158726897 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158727121 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 158727162 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 158727538 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158727651 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158727760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158727882 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 158727953 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158727968 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158727991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158728073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158728130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158728146 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 158728160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158728292 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158728340 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158728427 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158728629 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158728642 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158728696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158728725 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158728731 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158728744 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158728773 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158728777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158728909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158728989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158729109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158729386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158729413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158729657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158729774 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158729893 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158729916 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158729948 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158729959 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158730005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158730014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158730166 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158730244 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158730265 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158730478 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158730992 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158730996 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158731204 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158731376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158731451 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158731532 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158731774 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158731790 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158731862 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158731939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158731967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158732029 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158732333 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158732393 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158732568 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158732613 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158732638 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 158732719 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158732770 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158732788 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158732836 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158732895 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158733038 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158733240 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158733244 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158733419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158733708 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158733816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158733864 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158733941 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158733962 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158734046 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158734064 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158734114 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158734116 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158734133 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158734192 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158734491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158734792 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158735192 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 158735245 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158735634 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158735803 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158736075 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158737260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158737737 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158738053 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158738076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158738147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158738220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158738236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158738293 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158738330 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158739069 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158739418 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158739510 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158739556 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 158739596 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158742890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158743417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158743426 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158743471 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158743825 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158743928 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158744757 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158745066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158745194 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158745272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158746101 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158746109 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158746194 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158746234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158746362 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 158746840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158746846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158746855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158746862 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158747959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158748036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158748061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158748069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158748080 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158748096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158748168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158749348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158749465 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158749538 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158749562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158749637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158749673 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 158749734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158749881 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 158749961 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 158750744 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 158750754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158751160 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 158751163 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158751188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158751281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158751430 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158752263 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158752474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158753295 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158753657 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158753694 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158753955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158753968 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158754510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158754533 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158754672 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158754685 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158754764 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158754768 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158754778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158754850 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158755003 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158755094 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158755141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158755267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158756381 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158757196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158758021 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158758099 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158758138 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158758373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158758462 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158758602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158759596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158760378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158760389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158761939 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158763564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158763664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158763676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158763783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158763822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158764606 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158764874 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158764917 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158764968 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158764996 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158765305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158765367 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158765385 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158765647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158765769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158765795 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158765805 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158765952 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158765994 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158766299 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158766345 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158766516 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158766791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158767094 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158767118 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158769436 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158769532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158769534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158769546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158770202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158770369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158770486 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158770597 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158770707 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158772271 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158772360 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158772435 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158773392 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158773404 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158775333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158775573 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158775794 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158776179 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 158776190 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 158776460 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158776492 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 158776516 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 158776555 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 158776559 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 158776598 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158776657 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 158776766 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 158776957 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 158778657 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158778722 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 158778904 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158779599 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158782534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158783504 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 158784085 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158784160 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158786861 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 158787058 C A Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 158787652 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 158788163 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 158789755 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158789796 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158789838 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158790479 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158790553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158791182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158791780 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158792299 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158792636 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158793541 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158795003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158795335 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158797451 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158797817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158797879 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158799145 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158799480 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158800506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158802052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158802670 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158803065 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158803085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158803107 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158803366 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158803528 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158804675 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158804918 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158806756 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 158806865 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158806869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158806919 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158806942 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 158807019 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 158807162 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158807256 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158807974 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158808218 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158808605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158809403 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158809561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158810233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158810993 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158811025 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158811082 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158811087 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 158812712 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158812883 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158813515 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158813687 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158814793 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158814853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158815190 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 158815233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158815834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158818395 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158820097 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 158820196 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 158820785 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158821128 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158821239 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158821375 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158821425 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158821450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158821464 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158821561 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158821602 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158821650 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158821663 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 158821742 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 158822154 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 158822186 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 158822202 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158822291 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 158822345 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158822462 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 158822468 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 158822490 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 158822630 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158822697 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158822711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158822728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158822792 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 158822839 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 158822848 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158822987 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158823021 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158823039 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 158823058 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158823074 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 158823078 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 158823103 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 158823133 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 158823302 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 158823381 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 158823490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158823508 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 158823539 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 158823578 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158823770 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158823795 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 158823835 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 158823842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158823970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158824060 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 158824063 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 158824122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158824249 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 158824280 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 158824292 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 158824393 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 158824547 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158824642 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 158824697 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 158824848 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 158824987 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158825881 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 158825969 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158826571 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 158829008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158829834 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158830835 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 158830951 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 158830994 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158831140 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 158831269 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158831307 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 158831329 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 158831630 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 158833699 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 158834342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158834442 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158834459 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158834589 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 158834632 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158834865 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 158836093 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158836353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158836743 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 158836947 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158837032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158837200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158837289 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158837348 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158837350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158838425 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 158838834 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 158839434 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 158839985 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158841230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158841551 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158841916 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158842174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158842249 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 158842437 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 158842496 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 158842519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158842994 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 158843007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158843420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158843623 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158843690 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158843709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158843819 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158843891 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 158844141 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158844213 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 158844333 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 158844435 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 158844478 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 158844693 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 158844909 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 158844947 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 158845076 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 158845084 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 158845664 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 158845896 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158845987 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158846417 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158846535 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158848539 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158848556 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158848567 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 158848599 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 158849421 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158849451 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158849453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158849608 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 158849708 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158849789 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 158849955 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 158850472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158850512 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158850525 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 158850593 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158850836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158850953 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 158850966 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 158850985 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 158851002 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 158851047 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 158851102 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 158851247 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 158851496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158851543 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158851708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158851866 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 158851872 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 158851915 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 158852027 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158852278 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158852289 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158852311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158852331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158852408 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158852550 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 158852614 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 158852714 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158852929 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 158853214 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 158853229 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 158853321 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 2 158853322 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 158853513 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 158853584 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 158853585 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 158853655 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 158853827 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158853989 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158854037 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158854226 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158854237 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158854397 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 158854497 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 158854546 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 158854579 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 158854655 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 158854864 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 158854871 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 158854922 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 158855079 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 158855242 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 158855380 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 158855659 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 158855881 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 158856014 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158856979 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158857221 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158857242 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158857891 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 158857910 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 158857965 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 158858032 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 158859356 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 158861131 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 158862040 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158862351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158862953 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158863892 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 158864121 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158864628 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 158864629 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158864661 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158864685 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 158864694 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158865563 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 158865961 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 158866243 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158866461 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 158866466 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 158866570 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 2 158866595 T G Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 2 158866702 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 158866708 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 158866771 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 158866784 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 158866837 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 158867253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158867664 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 158867679 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 158867734 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 158867901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158867964 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158867978 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 158868003 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158868011 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158868076 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158868119 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 158868129 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 158868165 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 158868415 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 158868656 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158869004 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158869044 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158869066 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158869108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158869111 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158869196 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158869335 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158869406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158869455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158869492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158869494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158869511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158869527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158869579 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158869646 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158869768 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158869903 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 158870036 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 158870124 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 158870259 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 158870278 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158870298 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158870386 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158870398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158870402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158870424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158870465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158870479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158870571 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158870782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158870798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158871287 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158871288 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158871362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158871379 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158871391 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158871407 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 158871437 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158871449 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 158871505 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 158871546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158871565 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158871752 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 158871963 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 158871975 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 158871987 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158872033 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158872064 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158872119 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 158872214 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158872231 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158872255 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 158872330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158872363 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 158872655 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158872689 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158872779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158872819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158873009 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 158873026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158873054 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 158873110 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 158873194 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 158873248 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 158873358 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 158873376 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 158873381 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 158873395 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 158873480 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 158873630 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158873696 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158873716 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158873722 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158873751 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158873785 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 158873798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158874054 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158874126 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158874164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158874294 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158874354 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 158874488 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158874727 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158874775 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 158874872 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 158874881 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 158874894 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 158874943 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 158875006 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 158875445 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158875448 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 158875474 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 158875607 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158876178 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158876218 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158876309 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 158876552 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 158876570 C A Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 2 158876908 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 158877200 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158877768 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158877834 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 158877840 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 158877854 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 158878220 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 158878319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158878442 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158878492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158878541 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158878796 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 158879176 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158880313 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 158880491 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 158880502 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 158880512 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158882312 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 158882315 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 158882852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158883031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158883113 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158883171 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 2 158883485 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 158883734 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 158883791 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 158883853 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158883876 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 158883926 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158884283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158884318 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 158884323 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 2 158884392 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 158884555 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 158884580 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 158884741 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 2 158884974 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 158885002 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 158885003 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 158885045 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 158885057 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 158885079 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158885146 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158885149 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 158885157 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158885256 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 158885681 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 2 158886068 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 158886081 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 158886091 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 158886092 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 158886156 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 158886159 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 2 158886242 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 158886422 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 158886490 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 158886492 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 158886653 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 158886877 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 158887197 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158887205 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 158887219 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 158887246 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 158887268 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 158887282 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 158887284 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 158887309 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 158887386 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 158887391 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158887416 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 158887430 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 158887440 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 158887535 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 2 158887592 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 20 20 2 16 2 2 158887619 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158887644 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158887687 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 2 158887862 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 158887865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158887905 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 158888260 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158888303 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158888320 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158888336 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 158888588 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158888620 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158888696 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 158888719 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158888758 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158889258 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158889280 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 158889378 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158889493 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 158889669 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 158889838 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158889878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158889916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158890326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158891248 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158891554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158891789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158892369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158892496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158892519 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 2 158892608 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158892797 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158893268 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158893496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158895305 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 158895691 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158895695 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 158895702 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158895736 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 2 158896001 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 158896310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158896427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158896652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158896664 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 158896742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158896808 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158897181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158897187 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158897266 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158897311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158897388 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 158897497 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158897528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158898644 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158898653 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158899299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158899918 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158900932 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158901089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158901091 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 158902338 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158902393 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158902404 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158902486 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 158903245 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158903386 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158903532 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158904143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158904252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158904267 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158905275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158907359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158907644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158907950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158908446 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158908556 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158908601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158908725 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158909079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158909542 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158909711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158910334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158911276 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158911527 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158911806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158911862 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158912993 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 158913127 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 158913399 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 158913557 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 158914244 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 158914286 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 158914362 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158914371 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158914831 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158915602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158915990 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 158916089 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158916911 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158917078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158917639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158918001 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158918116 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 158918220 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 158918552 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 158918616 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158918634 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 158918705 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 158918764 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 158918777 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158918833 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 158918851 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158919273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158919311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158919610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158920232 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 2 158920497 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 158920577 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 158920641 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 158920645 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 158920654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158920667 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 158920721 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 158920839 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 158921125 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 158921206 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 158921271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158921289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158921338 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 158921554 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158921748 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158921789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158921871 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 158921957 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 158922009 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 158922191 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158923218 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 158923311 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 158923326 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 158923406 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158923419 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 158923429 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 158924833 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 158925072 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 158928544 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158928633 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158928655 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 158928712 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 158928849 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 158928897 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 158930555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158931865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158932528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158933253 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158933455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158934717 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158934962 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158935126 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 158935544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158935911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158936736 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158936810 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158937213 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158937666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158937836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158940128 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 158940587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158940671 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 158940932 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158941163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158941231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158941379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158941394 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158941406 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158941551 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158941570 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158941605 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 158941853 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158941865 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 158941901 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 158941924 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158942063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158942690 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158942760 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158942868 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158943034 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158943217 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158943228 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158943273 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158943312 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158943381 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 158943444 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 158943445 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 158943505 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158943519 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158943814 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 158943911 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 158944534 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158945226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158945293 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 158945466 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158945774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158945796 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 158945920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158946117 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158946335 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158946822 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158946960 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158947064 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158947187 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158947330 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 158947401 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 158947494 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 158947815 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158947982 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 158948621 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 158948709 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158949155 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 158949499 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 158950239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158950968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158951754 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158952524 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 158952574 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158952789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158952833 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158952853 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158952881 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 158953006 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158953760 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158953816 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 158953851 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 158954012 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158954145 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 158954362 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 158954426 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 158954543 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 158954632 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 158954658 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 158954672 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158954740 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 158954748 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 158954763 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 158954869 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 158954888 A C Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 158954946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158954964 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 158954973 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158955024 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158955283 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 158955284 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158955309 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 158955315 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 158955330 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 158955358 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 158955396 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 158955477 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 158956019 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 158956351 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 158956680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158956937 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 158956981 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 158957174 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158957195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158957241 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158957296 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158957310 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158957498 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158957567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158957600 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 158957607 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 158957646 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 158957830 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 158957921 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 158957948 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 158958047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158958284 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158958335 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158958394 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158958554 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 158958868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158958934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158959036 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158959253 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 158959433 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 158959954 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 158959955 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 158960000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158960098 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158960286 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 158960304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158960680 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158960912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158961021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158961531 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158961688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158961702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158961747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158961915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158961935 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158962049 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158962170 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158962179 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158962284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158962410 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158962415 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158962520 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158962521 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158962620 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 158962653 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 158963020 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 158963044 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 158963058 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 158963128 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158963241 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 158963358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158963359 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158963416 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158963433 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158963697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158963705 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158963720 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158963746 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158963918 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158963929 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158964218 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 158964247 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 158964266 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158964291 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 158964359 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158964373 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 158964436 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 158964441 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 158964459 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158964855 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158965169 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158965183 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 158965206 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158965392 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158965570 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158965941 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158965962 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158965969 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158965978 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158966000 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158966010 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158966043 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158966054 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158966068 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158966069 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158966111 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 158966165 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158966168 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158966235 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 158966334 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 158966352 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158966468 G A N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 158966569 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158966574 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158967444 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 158967676 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 158967830 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 158968507 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158968991 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 158969096 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158969130 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158969145 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158969256 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158969516 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 158969530 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 158969655 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 158969807 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158969814 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 158969929 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 158970418 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158970561 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 158970695 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 158971281 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158971393 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158971414 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158971616 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158971635 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158971655 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 158971685 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158972034 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158972380 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158972567 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 158972580 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 158972624 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 158972637 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158973037 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 158973075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158973243 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158973352 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158973389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158974370 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 158974397 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158974429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158974462 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158975235 C A Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0 0.9375 0.0625 15 17 0 15 1 2 158975300 T C Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 2 158975881 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158975989 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158976953 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 158977135 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 158977269 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158977368 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158977812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158977885 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158978117 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 158978162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158978335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158978738 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158978871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158978986 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158978995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158979228 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158979425 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158979435 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158979506 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158979518 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 158979532 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 158979554 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 158979681 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158979970 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158980184 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 158980238 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 158980258 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158980311 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 158980362 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158980431 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158981539 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 158982084 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158982104 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 158982142 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 158982183 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 158983173 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158983606 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158983654 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158983822 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 158983829 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 158983884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158983911 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 158984406 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 2 158984489 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 158984630 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 158984775 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158984928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158984954 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 158985004 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 158985112 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158985188 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 158985212 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158985314 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 158985347 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 158985360 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158985699 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 158985742 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 158986149 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 158986212 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158986633 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 158986781 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 158986795 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 158986826 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 158986930 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 158987029 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 158987074 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158987622 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 158987629 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 158987668 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158987686 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 158987884 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 158988132 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 158988256 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158988472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158988494 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 158988965 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 158989146 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158989152 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158989506 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158989609 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 158989660 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158989705 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158990631 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 158990652 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158990906 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158991636 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158991823 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 158991851 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158991993 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 158991995 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 158992039 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 158992291 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158992299 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158992361 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 158992581 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158992587 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 158992638 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 158992688 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158993152 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 158993209 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158993369 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 158993559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158993572 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 158993581 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 158993603 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 158993692 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158993756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158993768 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 158993817 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 158993828 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 158993958 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 158994122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158994129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 158994226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158994268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158994570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158994955 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158995070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158995654 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158995682 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158995886 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158995903 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158996000 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158996042 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 158996104 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158996148 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158996153 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158996466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 158996618 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 158996649 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 158996820 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 158997029 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 158997204 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 158997257 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 158998061 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158998398 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 158999102 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 158999896 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 158999906 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 158999923 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 158999952 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 158999963 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 158999975 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 159000003 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159000032 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159000048 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159000114 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 159000234 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 159000386 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 159000398 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 159000461 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 159000511 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159000689 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 159001719 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159001814 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159001870 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159001922 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159001973 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159002126 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159002139 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159002254 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 159002290 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159002293 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159002873 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159003486 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159004011 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159004689 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 159004765 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159005745 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159006009 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159006492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159006671 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159009613 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159009652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159009980 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 159010044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159010452 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159010893 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 159010907 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 159011011 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 159011137 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159011181 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159011230 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159011306 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159011324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159011516 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 159011987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159012106 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 159012110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159012372 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159012472 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159012543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159012711 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 159012777 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 159013005 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 159013102 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 159013187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159013290 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159013464 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 159013532 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 159013547 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 159013596 G T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 159013620 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 159013718 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 159013747 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 159014363 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 2 159014417 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 159014461 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 159014531 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159014539 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159014603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159014642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159014779 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 159014788 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159015009 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159015046 C T Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 159015500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159015698 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159016217 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 159018255 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159018489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159019713 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159021847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159021976 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159022021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159022120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159022631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159023976 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159024182 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159024378 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 159024383 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 159026215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159026751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159026818 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159026819 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159026865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159027003 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159027046 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159027439 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 159027528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159027626 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159027707 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159027761 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 159028169 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159028172 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159028796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159029382 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 159031468 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159032008 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159032577 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 159032611 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 159032636 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 159032671 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 159032702 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 159032813 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 159032967 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 159033142 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159033229 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159033289 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 159033354 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 159033446 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 159033641 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159033751 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159033781 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159033880 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159034012 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159034151 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159034233 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 159034265 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 159034536 G C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 159034549 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159034669 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159034755 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159034815 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 159034889 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159035200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159035522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159035678 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159035727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159035766 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159035785 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159035857 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 159036405 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 159036491 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159037692 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159037910 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159037913 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159038204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159038438 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 159038842 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159039222 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159039421 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159039556 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159039558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159039614 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 159039622 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 159039639 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 159039684 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 2 159039726 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 159039772 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 159039826 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 159039835 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 159039935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159039939 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159040021 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159040055 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 159040105 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159040141 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 159041323 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 159041409 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159041813 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 159041817 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 159042005 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159042072 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159042091 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159042487 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159042516 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 159042588 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159042762 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159042797 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159043045 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 159043055 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 159043059 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 159043071 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159043077 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159043161 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159043304 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 159043306 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 159043333 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 159043513 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159043600 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159043648 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 159044052 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 159044079 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 159044092 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159044314 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159044631 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 159044771 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 159044791 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159044795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159044808 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 159044928 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159044929 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159044948 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159045150 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 159045344 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 159045462 C T Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 2 159045601 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 159045651 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 159045788 G T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 159045869 C G N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 159045887 T G N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 2 159046011 C T Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 159046016 A C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 159046093 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 2 159046094 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 159046111 T C N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 2 159046119 T A N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 159046122 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 159046161 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 159046230 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 159046260 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 159046297 C A N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 159046303 G T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 2 159046421 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 159046422 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 159046457 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 159046539 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 159046656 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159046698 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159046717 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 159046995 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159047046 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 159047198 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159047381 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 159047389 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 159047454 A C Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 2 159047605 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 159047641 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 159047663 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159047754 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 159047861 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159048115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159048139 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159048140 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 159048179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159048190 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159048195 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 159048304 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159048312 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 159048321 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 159048428 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159048435 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 159048728 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 159048763 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 159048829 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159048872 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 159048885 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 159048889 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 159048980 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 159049063 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 159049097 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 159049141 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 159049159 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 159049170 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 159049229 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159049266 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 159049452 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159049496 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159049508 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159049526 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159049541 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 159049553 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159049557 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 159049574 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 159049631 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159049731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159050039 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159050050 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 159050213 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 159050274 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 159050347 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159050391 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 159050441 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 159050590 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 159050678 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 159051245 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 159051999 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 159052748 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 159052870 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159052877 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159052931 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 159053182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159053462 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 159053639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159053896 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159054098 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 159054153 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159054242 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 159054395 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 159054605 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159054652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159054785 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 159054806 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 159055046 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159055191 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 159055272 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 159055318 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 159055350 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 159055567 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 159055620 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 159055634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159055778 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 159055927 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 159055989 A C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 159055994 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 159056006 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 159056231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159056382 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159056433 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159056474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159056702 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 159056791 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159056806 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159056917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159057183 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159057212 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159057280 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159058192 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159058217 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159058222 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159058236 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159058569 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159058652 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159058705 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159058814 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 159058844 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 159058852 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 159058972 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159059199 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159059283 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159059287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159059317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159059325 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159059331 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159059383 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159059544 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159059609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159059928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159060106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159060188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159060220 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159060279 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159060340 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 159060921 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 159061013 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159061189 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 159061890 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 159061891 G A Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 159061957 A C Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 159061977 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 159061988 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 159062016 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 159062040 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 159062235 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159062285 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159062725 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159062916 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 159062918 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 2 159062927 G A N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 159063439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159063720 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 159063889 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159063955 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 159064061 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159064076 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 159064390 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159065072 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159065074 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159065230 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 159065295 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 159065300 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 159065311 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 159066106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159067094 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159067675 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 159067689 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 159068088 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 159068197 A T N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 159068250 C G N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 159068317 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 159068320 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 159068633 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159068766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159068821 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159068863 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159068884 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159068892 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159068913 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 159068979 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159069165 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159069501 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159069511 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 159069598 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159069708 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 159069734 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 159070471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159070591 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159070659 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 159070823 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159071309 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159071611 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 159071633 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159071715 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 159071881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159071966 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159072062 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 159072582 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159074624 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159075836 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 159075853 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159076418 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159076464 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159076723 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159077384 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 159077556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159078591 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 159078609 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 159078713 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159079531 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159079545 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159079559 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 159079805 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 159079872 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 159079904 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159080092 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 159080093 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 159080189 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 159080490 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159080588 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 159080699 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159080723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159080848 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159081510 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 159081519 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 159081723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159081892 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159082014 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159082052 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 159082150 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159082309 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 159082352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159082421 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 159082504 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159082596 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 159082897 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 159083072 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159083101 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159083369 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 159083517 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 159083645 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 159083717 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 159083797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159083798 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159083869 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 159084580 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159084769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159085879 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159086006 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159086347 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 159087190 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 159087207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159087251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159087418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159087434 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159087548 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159087589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159087706 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159087743 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159087808 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159087812 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159087823 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159088006 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159088051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159088067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159088109 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 159088293 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159088318 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159088488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159088548 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159088573 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159088643 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159088648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159088825 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159089076 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159089180 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159089664 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 159090133 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159090548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159090687 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159090963 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159091558 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 159091762 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 159091854 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 159092146 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 159092333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159093999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159094815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159094990 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159095932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159096192 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159096458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159096819 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159097326 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159098479 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 159098540 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159098565 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 159098582 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159098720 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159098839 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 159098849 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 159098911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159099697 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159099698 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159099814 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 159100189 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 159100274 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159100296 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159100415 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159100468 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 159100473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159100499 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159100806 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159100864 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 159100868 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 159100903 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 159100935 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159100957 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 159101008 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 159101107 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 159101132 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159101260 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159101592 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159101617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159101756 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 159101941 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159102010 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 159102078 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 159102368 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 159102370 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159102477 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 159102528 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159102560 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159102695 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159102699 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159102819 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159102936 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 159102994 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159102995 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159103902 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 159104313 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 159104338 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159104401 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159104437 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 159104482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159104497 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159104546 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159104791 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159105018 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159105036 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159105041 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159105062 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 159105082 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 159105148 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 159105222 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159105303 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 159105320 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159105339 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 159105431 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159105605 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159105609 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159105617 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159105665 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159105804 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 159105980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159106036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159106141 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159106243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159106365 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159106984 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 159107571 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 159107587 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159107695 C G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 159107696 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 159107914 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159108015 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 159108096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159108386 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 159108517 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159109052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159109057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159109113 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159109467 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159109616 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159110174 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 159110621 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159110834 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 159111665 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 159112249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159112854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159112911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159114168 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 159114526 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159115269 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159115370 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159116295 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 159117082 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 159117172 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 159117240 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 159117667 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 159117675 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 159118061 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 159118152 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 159118166 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 159118407 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 159118698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159118885 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 159118993 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159119027 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159119070 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159119294 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159120267 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159121167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159121296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159122004 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 159122111 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 159122524 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159122943 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 159123038 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 159123062 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 159123132 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159123211 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159124381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159124396 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159124920 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159125014 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159125075 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159125244 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 159125436 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159125671 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159125685 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 159125701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159126110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159126163 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 159126246 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 159126392 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 159126906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159126961 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159127060 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159127114 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 159127169 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 159127223 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159127413 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159127650 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 159127684 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 159127696 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 159127813 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 159127967 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 159127987 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159128016 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159128030 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159128165 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159128392 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159128402 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 159128437 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 159128536 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 159128720 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 159128729 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 159129245 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 159129321 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 159129334 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159129462 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 159129819 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159129943 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159129988 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159130039 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 159130268 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159130315 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159130348 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159130441 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 159130507 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159130524 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159130636 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159130660 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159130677 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159130927 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159130940 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159130948 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159131044 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159131189 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159131223 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159131230 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159131393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159131469 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159131478 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159131496 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159131726 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 159131797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159131905 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159131906 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159131947 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159132081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159132097 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159132739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159132749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159134623 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159135666 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159136729 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159137004 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159137065 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 159137459 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 159137475 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 159137835 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159138063 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159138158 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159138347 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159138349 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159138408 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159138467 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159138582 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 159138979 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159139143 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 159139183 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 159140063 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159140073 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159140091 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159140277 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159141945 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 159142212 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159142314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159142692 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159144628 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 159145449 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159146475 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159146713 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 159148424 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 159148748 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159148770 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 159148782 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 159149061 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159149245 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159149288 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 159149400 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 159149412 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 159149424 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159149552 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 159149587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159149654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159149765 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159149779 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159149800 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159149810 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159149906 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159150076 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159150197 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 159150330 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159150403 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159150482 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159150509 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159150545 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159150602 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159150628 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159150725 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159150761 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159150782 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159150854 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 159150858 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159150916 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159151344 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159151456 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159151765 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 159151883 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 159151941 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159151998 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 159152031 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 159152065 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159152066 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159152106 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159152165 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159152232 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159152297 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159152369 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159152447 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159152481 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159152654 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 159152713 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159152714 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 159152745 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 159152774 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159152892 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 159152922 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159153043 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159153050 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 159153122 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 159153524 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 159153621 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 159153636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159153650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159153948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159154119 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159154284 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 159154413 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 159154532 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 159154635 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159154718 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159154748 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159154767 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159154806 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159154835 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159154839 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159154858 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159155110 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159155302 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159155360 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 159155613 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 159155652 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 159155729 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 159155746 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 159155785 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 159155867 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 159155998 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 159156094 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159156095 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159156342 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159156360 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159156862 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 159156912 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159157530 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159157794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159158842 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 159159271 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159161367 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159162172 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 159162706 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159162796 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159162887 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 159163115 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159163202 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159163816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159163862 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 159164243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159164785 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159165558 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159165723 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159165737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159165915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159166542 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159166582 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 159166667 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159166758 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 159166937 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 159166939 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 159167461 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159167963 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159168036 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159168448 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159168798 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159169122 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 159169172 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 159169220 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159169223 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159169332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159169376 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 159169407 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 159169441 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159169451 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159169532 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 159169590 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 159169605 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159169735 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 159170578 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 159170609 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 159170678 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159170735 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 159170742 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 159170945 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159171032 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 159171103 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 159171313 A C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 159171363 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 159171392 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 159171396 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 159171442 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 159171443 G T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 159171706 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 159179056 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 159179573 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 159179600 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 159179678 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 159179774 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 159181212 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 159182271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159182689 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159183099 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 159183132 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159183272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159183475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159183727 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 159183852 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159183884 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159183902 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159184062 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159184080 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 159184095 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 159184153 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 159184182 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 159184216 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 159184382 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 159184415 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159184446 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 159184729 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 159184864 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159185935 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 159187089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159187106 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159187198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159188528 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 159188859 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159188935 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159188952 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159188955 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159189006 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159189182 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159189223 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159189752 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159189800 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159190392 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 159190923 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159191038 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 159191370 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 159191464 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159192434 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 159193714 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159194024 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 159194220 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 159194333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159194404 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159194485 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159194505 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159195100 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 159195238 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159195953 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159195967 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159196954 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 159196998 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 159197428 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159197531 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159197555 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159197969 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159198008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159198658 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159198765 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 159198834 G T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 159199140 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 159200124 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159200195 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159200281 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159200319 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 159200371 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 159200505 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 159200647 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159200677 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 159200693 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159200817 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159200851 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159200970 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159201022 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159201149 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 159201167 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 159201248 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159201331 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159201373 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159201380 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159201480 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159201525 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159201684 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 159201692 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159201696 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159201751 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 159201916 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 159201940 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159202775 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159203041 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 159203080 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 159203085 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159203100 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159203111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159203321 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159203369 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159203383 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159203473 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159203589 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159203637 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 159204118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159204431 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159204512 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159204748 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 159205041 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 159205202 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 159205308 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 159205464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159205465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159205547 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159205618 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 159205631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159205646 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 159205792 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159205904 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159205925 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159205975 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 159205999 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 159206024 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 159206388 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 159206438 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 159208571 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159208600 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 159208653 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159208812 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 159208821 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159208872 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159208891 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 159208901 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159208920 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159208927 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159208991 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159208997 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159209018 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159209156 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159209172 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159209233 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 159209235 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159209368 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159209456 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 159209791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159209819 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159209908 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 2 159209937 G A Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 159209946 T C Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 2 159210124 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 159210149 A G Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 159210161 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 159210162 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 159210236 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 159210377 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 159210410 G T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 159210615 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159210683 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159210792 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159210851 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159210883 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159210899 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 159211052 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 159211058 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 159211079 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 159211149 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 159211278 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 159211432 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 159211455 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159211485 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159211507 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 159211777 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159212043 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 159212278 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159212358 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 159212460 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 159213030 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 159213051 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159213132 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159213279 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159213333 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159213441 T A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 159213740 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 159213910 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159214113 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159214154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159214535 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 159214543 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 159214596 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 159214628 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159214966 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 159214988 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 159215027 G T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 159215115 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159215147 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159215250 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 159215280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159215440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159215481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159215642 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 159215670 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 159215811 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 159215944 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 159215980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159216028 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 159216053 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 159216093 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 159216131 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 159216307 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 159216433 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159216563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159216649 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 159216681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159216702 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 159217092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159217297 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 159217401 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159217487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159217871 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159218185 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 159218312 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159218365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159218373 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159218549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159218586 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 159218646 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 159218728 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159218751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159218756 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159218824 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159218870 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159219069 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159219123 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 159219528 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159219548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159219669 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159219670 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159219714 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 159220091 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159220111 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159220170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159220230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159220549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159220550 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 159220575 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159221039 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159221738 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 159221743 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 159222691 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159223170 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 159223225 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159223248 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 159223351 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 159224543 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159224851 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159225006 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 159225081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159225297 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159225471 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159226553 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159226667 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159226919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159227294 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159227348 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 159227382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159227952 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159228155 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 159229332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159229402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159230371 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159231336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159232014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159232458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159232483 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159234234 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 159234450 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159234646 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159235036 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 159235161 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159235652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159235745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159235963 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159236010 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159236320 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159236394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159236433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159236582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159236603 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159236791 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159236863 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 159237001 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 159237750 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159237768 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159237811 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159237928 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159238176 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159238448 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 159238698 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159238772 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159238773 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159238812 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159238815 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159239272 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159240881 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159240946 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159240989 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 159240993 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159241073 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159241135 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159241179 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 159241232 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 159241335 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159241457 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 159241495 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159241628 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159241734 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159241793 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159241823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159241891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159241906 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159241921 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159241945 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159242018 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159242034 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159242148 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159242167 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159242222 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159242266 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159242280 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159242337 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159242451 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159242623 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159242728 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 159242740 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159242775 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159242833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159242925 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 159242948 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 159243203 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159243226 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 159243335 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 159243545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159243626 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159243680 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 159243694 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159243704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159243887 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 159243978 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 159244061 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 159244063 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 159244220 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 159244531 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 159244595 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 159244853 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159244872 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159244916 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 159244917 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159245179 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 159245215 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159245305 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 159245340 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 159245347 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159245398 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 159245407 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159245665 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 159245666 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 159245714 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 159245730 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 159245799 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159246053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159246355 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 159246440 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 159246525 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159246550 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 159246676 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 159246945 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 159246967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159247414 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159247547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159247614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159247702 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159247788 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 159247855 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159248516 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159248583 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159249085 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 159251219 C G Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 159251375 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 2 159251734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159251765 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159251814 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159251833 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 159251906 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 159252179 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 159252523 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 159252551 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159252608 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 159252650 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 159252879 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 159252922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159252933 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159252961 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 159253010 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 159253077 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159253207 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159253225 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159253253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159253267 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159253295 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159253398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159253602 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 159253646 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159253843 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 159253849 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159253866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159253885 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159253933 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159253955 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159254047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159254062 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159254724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159254821 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 159254914 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159255588 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159256085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159256490 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159256530 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159256546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159256844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159256981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159257014 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159257027 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159257103 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159257136 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159257315 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159257368 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 159257552 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159258273 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 159258385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159259420 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159259459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159259643 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 159259979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159260389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159260577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159260979 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 159261271 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159261336 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159261508 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159261549 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159262158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159262501 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 159262630 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159262697 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 159262780 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 159262853 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159262877 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159262894 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159262925 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159262958 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 159262988 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 159263000 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 159263219 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 159263471 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159263518 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159263531 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159263572 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159263904 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159263951 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 159264157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159264216 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 159264414 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 159264617 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159265083 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 159265173 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 159265833 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 159266047 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159266063 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159266092 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159266421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159267099 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159267181 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159267202 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159267239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159267267 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159267350 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159267364 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159267512 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159267730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159267912 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 159268190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159269363 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 159271340 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159271434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159271586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159271604 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159271625 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159271651 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 159272037 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159272353 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159272572 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159272656 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159272694 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159272695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159272793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159272893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159273285 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159273664 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159273909 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 159275529 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159276384 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159276790 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 159276889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159277169 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159277410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159277465 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159277807 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159277818 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159277888 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159277939 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159277952 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159278008 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159278633 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159278652 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159278695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159278730 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159279213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159279237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159279318 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159279386 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159279553 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159280209 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159280213 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159288469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159289537 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159289613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159289715 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 159289813 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 159290089 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159290117 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159290151 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159290397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159290431 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159290440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159290578 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 159290596 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159290621 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159290674 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159290692 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159290708 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159290731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159290798 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159290807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159290833 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159290849 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159290853 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159290889 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159291019 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 159291542 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 159297814 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 159297829 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 159298257 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159298263 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159298309 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 159298359 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159298411 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159298424 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 159298442 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159298562 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159298570 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 159298687 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 159298694 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 159299550 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 159299560 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 159299852 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 159299900 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159299955 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159300143 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 159300260 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 159300309 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 159300408 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159300630 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 159300698 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159300876 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159300885 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159300916 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159301058 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159301115 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159301281 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159301301 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159301335 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159301435 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159301941 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 159302057 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159302098 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159302213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159302220 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159302278 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159302279 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159302966 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159303171 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 159303322 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 159303442 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159303455 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159303754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159303838 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 159304218 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 159304386 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 159304433 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159305005 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 159305346 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159305436 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 159305561 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 159305729 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 159305762 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 159305763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159305781 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 159306275 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 159306386 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159306422 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159306690 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159306698 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159306789 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159307076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159307957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159308993 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159309986 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159310664 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159310703 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159310771 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159310798 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159311074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159312064 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 159312392 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 159313158 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159313819 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159314787 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159315301 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159315419 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159315840 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159315949 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 159315963 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 159316021 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 159316069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159316554 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159316789 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159317183 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159317196 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159317201 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159317231 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159317662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159318100 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159318203 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159318333 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159318352 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 159318460 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159318767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159319242 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159319321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159319343 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159319351 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159319512 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159319543 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 159319757 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 159319858 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 159320731 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159321186 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159323577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159323954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159326323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159326418 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159327737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159328070 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159328149 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 159329105 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159330517 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159331907 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159333310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159333669 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159334874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159335097 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159337455 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159337649 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159339511 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159339533 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159339588 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159339625 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159339651 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159339679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159340163 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159340304 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159341954 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 159342396 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 159342677 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159342700 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 159342796 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159343324 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159344277 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159345687 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 159346145 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159346985 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159347111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159347563 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 159347637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159348194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159348422 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159348679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159350075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159350423 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159350854 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159350878 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159350894 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 159351356 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159351631 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159352511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159359054 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 159359846 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159359944 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 159359989 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159360207 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 159360236 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159360291 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159360371 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159360374 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159360567 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159360602 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159360618 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159360636 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159360674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159360713 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159360714 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159361005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159361114 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159361210 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159361340 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159361374 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159361549 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 159361746 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 159361771 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 159361781 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159361798 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159361826 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159361848 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 159362150 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 159362704 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 159362707 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 159362738 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 159362763 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159363113 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159363172 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159365628 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 159365656 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159365891 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 159365971 C G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 159366064 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 159366310 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 159366639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159366679 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159366706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159367594 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159368726 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159369449 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159369473 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159369491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159369540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159370002 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 159370055 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159370402 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159370438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159370709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159371434 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 159371459 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 159371545 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159371878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159371940 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 159372112 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 159372559 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159372796 A T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 159372859 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159372963 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 159372996 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159373128 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 159373145 A T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 159373162 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159373216 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 159373251 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159373278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159373385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159373529 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 159373577 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159373927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159373945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159373948 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 159373987 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 159374009 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 159374076 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159374147 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 159374219 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 159374270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159374278 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159376214 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 159378002 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 159379340 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159380600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159380983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159382889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159385102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159385510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159385934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159388113 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159388867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159389167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159391682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159391853 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159392178 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 159392499 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159394011 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 159394092 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159394574 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159394819 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159397580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159397893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159399047 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159400074 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159400110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159401918 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 159401933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159402034 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159403044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159403203 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159403643 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 159403784 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 159405241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159406774 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159407030 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159409003 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159411916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159412088 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159412197 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 159412253 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159412681 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159413031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159413239 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159413281 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159413361 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159413611 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159413706 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159413792 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159413837 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159413912 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159414395 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 159414442 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 159414457 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159415260 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159415453 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159415857 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 159415873 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 159415974 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159416069 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159416098 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159416252 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159416275 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159416422 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 159416450 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 159416549 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 159416620 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159416663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159417107 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159417132 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 159419040 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159419985 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159420091 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159420265 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159420704 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 159421124 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 159421228 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 159421812 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159421845 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 159422323 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159422635 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 159422636 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159422716 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 159422723 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159422829 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 159422884 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 159422950 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 159422951 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159422990 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 159423005 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159424140 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159424160 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159424198 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159424231 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159424268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159424554 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159424792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159424806 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159425077 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159425158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159425247 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159425567 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 159425612 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 159426235 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 159426479 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159426507 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159426617 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159426708 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159426884 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 159426896 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 159426992 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159427161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159427200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159427225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159427319 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159427663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159427673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159427704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159427773 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159427831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159427894 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159427990 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159427997 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159428035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159428037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159428075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159428091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159428147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159428509 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159428522 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159428572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159428654 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 159428670 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159428675 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 159428909 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159428938 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159428975 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159429207 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159429219 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159429298 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159429384 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159429431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159429538 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159429555 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159429591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159429625 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159429680 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159429851 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159429857 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159429936 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159429972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159429976 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159430022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159430079 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 159430247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159430278 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 159430357 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159430389 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 159430428 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159430433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159430495 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159430507 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159430791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159430841 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159430868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159430895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159431094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159431101 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 159431251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159431332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159431344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159431449 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 159431453 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159431553 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 159431755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159434530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159434563 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 159434578 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 159434619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159434733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159435664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159435712 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 159436543 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 159437997 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 159438348 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159438463 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159438486 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159439293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159439417 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159439443 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 159439643 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 159439650 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159439684 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159439710 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159439864 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159440209 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159440772 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159441482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159442135 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 159442265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159442892 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159443096 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159443321 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159443747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159443861 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159444976 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159445270 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159445561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159445714 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159445738 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159445763 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 159445957 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 159445983 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 159445985 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 159446023 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 159446081 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159446175 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 159446432 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 159446471 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159446488 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159446524 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159446543 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159446652 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159446687 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159446688 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159446710 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159446733 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159446747 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159446761 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 159446981 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159446995 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159447130 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 159447223 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159447230 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159447328 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159447343 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159447348 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159447668 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159447773 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159448033 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 159448165 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159448185 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159448300 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159448328 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159448440 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159448564 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159448685 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159448805 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159449143 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159449259 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159449382 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 159449465 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159449496 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159449545 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159449564 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159449706 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159449710 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159449721 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159449722 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159450101 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159450292 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159450398 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159450402 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159450757 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 159450961 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159451139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159451484 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 159451603 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 159451669 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159451703 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159451854 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159451972 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 159451980 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 159452341 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159452425 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159452499 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159452703 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159452748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159452764 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159452810 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159452945 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 159452947 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 159452973 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 159453010 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 159453067 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159453377 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159453532 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159453621 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159453803 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 159453805 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 159453853 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159453881 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159453891 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159454176 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 159454201 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159454228 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 159454259 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 159454284 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 159454287 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 159454339 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 159454459 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 159454472 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 159454794 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159454855 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159454864 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159455016 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 159455526 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159455731 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 159455783 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159455816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159455931 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159456063 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 159456237 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159456262 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 159456457 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159456477 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159456491 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 159456558 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159456728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159457214 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159458403 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159458617 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159460554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159460890 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159461089 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 159462049 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159463005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159471297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159471560 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159472369 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159473238 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159473343 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159473549 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 159474067 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159475321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159475478 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159475644 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159475778 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159476321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159476445 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159476463 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 159476796 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 159477056 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159477225 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 159477254 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159477299 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 159477306 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159477329 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 159477361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159478449 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159478467 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159478547 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 159478585 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159478801 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159478860 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159479412 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159479468 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159479694 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159479820 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159479967 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159479987 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159479988 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 159480007 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 159480232 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159480321 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159480436 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159480460 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159480534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159480555 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 159480892 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159480932 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159481164 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159481201 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159481251 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 159481321 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159481341 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 159481382 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 159481451 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 159481610 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 159481861 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159488603 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159489047 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159489086 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159489089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159489097 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159489186 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159489249 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159489280 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159489314 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159489326 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159489384 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159489402 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159489539 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159489595 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 159489637 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 159490057 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 159490061 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 159490111 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 159490127 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 159490232 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159490234 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159490396 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 159490440 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 159490591 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159490594 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159490634 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 159490795 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159490870 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159491006 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159491037 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159491069 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159491099 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159491225 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159491237 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159491341 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159491425 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 159491479 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 159491488 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 159491497 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 159491741 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159491828 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 159491882 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 159491888 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159491928 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 159491978 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159491980 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159492076 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159492170 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159492621 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159492680 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 159492688 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159492697 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159492726 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159492831 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159492850 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 159492932 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 159492933 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 159493038 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159493154 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159493178 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159493192 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159493200 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159493254 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159493420 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 159493551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159493610 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 159493819 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 159493850 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 159493901 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159494009 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159494454 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159494457 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159494471 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159494489 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159494503 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159494546 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159494590 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159494594 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159494643 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159494737 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159494755 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159494782 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159494821 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159494839 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159494841 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159494887 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159494906 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159494964 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159495006 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159495123 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159495242 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 159495366 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159495379 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159495387 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159495400 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159495403 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159495438 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 159495943 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159495988 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159496067 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 159496127 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159496184 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159496294 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 159496325 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159496358 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159496477 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159496490 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159496547 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159496874 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159497018 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159497060 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159497110 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159497233 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159497279 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 159497563 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 159497577 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 159497700 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159497950 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159498042 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159498057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159498330 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159498352 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159498830 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 159499026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159499027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159499270 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 159499538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159499543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159500307 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 159500552 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159500665 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159500810 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159500896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159500957 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159501130 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159501180 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159501206 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159501256 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159501378 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159501422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159501645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159502157 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159502235 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159502254 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 159502284 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 159502293 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 159502368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159502381 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159502396 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159502556 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159502557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159502608 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159502726 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159502977 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159503072 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159503386 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159503828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159503830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159503890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159504028 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159504030 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 159504044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159504053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159504095 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159504291 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159504465 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159504809 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 159504864 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 159504920 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159504958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159504979 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 159505006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159505084 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159505085 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159505095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159505154 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159505199 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159505214 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159505405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159505411 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159505975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159506009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159506411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159506916 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159507196 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159507317 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159507560 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 159507602 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159507681 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159507846 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 159509351 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159511118 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 159512389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159512415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159512808 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159513582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159515850 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159517358 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 159518781 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 159519462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159519784 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159520126 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159520598 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 159520730 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 159521310 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159521631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159521903 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159521923 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159522518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159522553 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159522705 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159523133 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159523146 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159523174 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159523282 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159523344 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159523407 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159523615 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159523819 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 159524100 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159524179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159524612 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 159524902 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 159525094 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 159525104 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159525153 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159525154 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159525197 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159526161 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159526468 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159526592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159526742 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 159526887 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159527408 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159527939 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159527942 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159527953 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159527999 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 159528139 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 159528173 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159528266 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 159528415 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 159528511 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159528533 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 159528566 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 159528617 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 159528688 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159528716 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159528792 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 159528862 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159528913 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159528941 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 159529008 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159529069 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 159529154 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159529744 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159530740 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159531513 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 159531826 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159531893 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159532090 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 159532130 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159532268 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 159532282 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 159532436 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159532821 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 159532936 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 159533297 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 159533433 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 159533439 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 159533511 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159533811 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159534210 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159534835 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 159535241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159535327 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159535569 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 159535623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159535649 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 159535736 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 159535771 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 159535808 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 159535839 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 159536541 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159536655 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 159536680 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 159536705 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 159536745 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159536850 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 159536895 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159536918 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159536990 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159537043 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159537054 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159537057 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159537155 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 159537567 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 159537578 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 159537671 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159537700 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159537997 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159538023 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 159538288 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 159538395 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 159539068 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159539126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159539238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159539243 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 159539271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159539316 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159539404 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 159539462 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159539489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159539503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159539506 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 159539521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159539623 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 159539903 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159540007 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 159540065 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 159540096 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 159540194 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 159540222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159540395 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 159541105 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 159541142 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 159541190 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 159541220 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 159541266 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159541449 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159541514 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159542093 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159542217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159542496 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 159542658 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159542679 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159542692 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159542693 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159542896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159543101 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159543245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159543308 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159543311 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 159543327 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 159543393 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 159543419 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159543427 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 159543675 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159543681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159543827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159543868 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159544282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159544285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159544297 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159544319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159544334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159544378 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 159544938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159545021 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159545123 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159545133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159545830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159546435 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159548638 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159548650 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159548909 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159548964 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159549107 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159549113 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159549144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159549165 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159549652 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159549717 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159549922 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159550077 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159550095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159550102 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159550264 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159550325 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159550370 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159550431 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159550491 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159550631 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159550636 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159551105 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 159551202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159551404 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159551449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159551508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159551562 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159551626 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159551789 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 159551807 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 159551950 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159551987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159552118 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159552323 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 159552529 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 159552588 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 159552999 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 2 159554651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159554747 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159555089 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 159555093 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159555352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159555803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159555881 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 159555947 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159555966 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 159556011 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 159556014 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 159556112 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159556228 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 159556351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159556404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159557410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159557439 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159557632 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159557644 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159557646 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159557660 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159557693 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159557708 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159557772 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159557787 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159557788 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159558021 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159558027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159558046 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159558682 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 2 159558696 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 159559088 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 159559159 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 159559200 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 159559277 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159559278 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159559361 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 159559437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159559562 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159559654 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159559694 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 159559701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159559967 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 159560008 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 159560061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159560110 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 159560154 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 159560174 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 159560205 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 159560310 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159560321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159560357 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159560531 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159560624 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159560670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159561130 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159561163 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159561191 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159561204 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159561259 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159561308 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159561389 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159561394 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159561427 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159561439 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159561456 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 159561465 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 159561467 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 159561618 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159561670 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159561682 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159561768 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 159562487 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159562509 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 159562549 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 159562694 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159562759 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159562899 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 159563135 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 159563283 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 159563697 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159563859 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159563948 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 159563949 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159563993 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 159564069 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159564104 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159564142 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159564151 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159564157 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159564187 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159564205 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159564217 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159564420 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 2 159564542 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 159564624 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 159564774 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 159564929 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159565411 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159565484 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159566241 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159566340 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159566356 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 159566997 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159567470 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159567485 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159567517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159567681 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159567750 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159567812 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 159568002 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 159569521 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159572204 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 159572594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159572604 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159572643 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159572959 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 159573008 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 159573051 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 159573317 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 159573513 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 159573579 G C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 159573595 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 159573799 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159573815 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159573866 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 159573961 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 159574354 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 159574392 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 2 159574560 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 159574589 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159574692 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159574915 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159574955 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 159575037 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159575258 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159575294 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159575327 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 159575337 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159575369 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159575415 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159575425 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159575937 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159575975 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 159576023 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159576072 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159577084 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 159577282 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159577351 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159577679 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 159577686 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 159577734 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 159578517 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 159578592 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159578623 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159578686 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159578791 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159578822 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 159578989 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159579186 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159579351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159579529 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159579603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159579688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159579816 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159579838 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159580138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159580151 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 159580263 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159580374 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159580391 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159580397 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159580412 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 159580537 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159580546 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159580613 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 159580626 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159580929 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 159580955 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 159580967 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 159581127 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159581130 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 159581981 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159582122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159582223 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 159582224 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 159582242 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 159582448 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159582774 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159582809 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159582827 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 159582921 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 159583195 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 2 159583345 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 159583346 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 159583356 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 159583643 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 2 159583992 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 159586002 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 159586274 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 159586479 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 159586538 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 159586584 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159586588 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159586901 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 159587087 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159587127 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159587315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159587343 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159587503 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 159587584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159587605 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 159587738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159587743 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 159587940 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159588022 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159588269 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 159588482 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 159588490 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 159588494 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159588549 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159589829 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159592005 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 159593912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159595019 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159595729 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 159595763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159596155 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159596314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159597991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159598362 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159598785 A C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 159598830 G T N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 2 159599575 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 159599754 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 159599774 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 159599922 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159600033 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 159600065 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 159600477 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 159600500 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 159600507 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 159600652 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 159600844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159600903 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 159600991 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 159601013 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159601111 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 159601242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159601264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159601361 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159601378 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159601388 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159601400 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 159601531 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 159601551 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159601581 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159601834 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 159601977 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 159602062 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159602151 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159602232 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159602370 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 159602396 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 159602442 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 159602576 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 159602597 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159602677 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159602692 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159602926 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159602938 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159603073 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 159603089 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 159603093 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 159603102 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 159603282 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159603400 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 159603404 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 159603471 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 159603533 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 159603803 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 159603810 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 159603875 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159604049 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 159604185 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159604219 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 159604279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159604322 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 159604423 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159604515 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 159604539 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159604553 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 159604557 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159604597 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 159604607 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 159604644 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 159604648 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 159604726 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 159604757 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 159604763 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 2 159604820 A T N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 159605621 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159605675 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159605827 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 159605830 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 159605871 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159606290 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 159606374 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 159606382 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159606566 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 159606624 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 159606634 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 159606768 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 159606795 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 159607352 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 159608218 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 159608234 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159608247 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159609070 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 159609203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159609400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159610699 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159611831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159614119 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159614237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159623794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159626458 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159627223 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 159627999 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159628702 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159628991 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159629107 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159630727 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 159630902 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 159631410 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159631418 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159631554 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159631645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159631832 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 159632020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159632159 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 159632366 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159632453 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159632646 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 159632676 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 159632749 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 159632782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159632783 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 159632804 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 159633016 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 159633093 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159633394 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159633984 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 159634019 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 159634401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159634679 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159634698 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159634905 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159634981 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159635079 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159635110 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 159635153 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 159635876 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 159635932 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 159635956 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159636007 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159636329 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 159636898 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159637036 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 159640251 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159640855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159640945 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 159641899 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 159642246 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 159642271 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159642356 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 159642852 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 159642939 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 159643289 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159643543 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 159643557 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159643563 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 159644077 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159644092 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 159644266 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159644724 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 2 159644851 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 159644927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159644973 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 159645221 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 159645289 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 159645359 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 2 159645536 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159646263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159646269 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159646291 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 2 159646301 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159646405 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159646416 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 159646446 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159646499 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159646575 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159646618 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159647119 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 159647169 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159647189 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159647206 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159647314 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 159647315 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 159647422 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159647475 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159647489 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159647563 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159647679 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159647734 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159647735 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159647832 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 159647848 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 159647862 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 159647929 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 159647931 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 159648129 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 159648452 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 159648483 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 159648621 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 159648885 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159648969 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 159648973 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 159648987 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 159649058 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159649200 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 159649256 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 159649344 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159649415 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159649595 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 159649625 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 159649726 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159649793 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159649916 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159649959 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 159649960 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 159649997 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 159650036 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 159650050 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159650172 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 159650237 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159650323 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159650504 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 159650552 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 159650597 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 159650811 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 159650840 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 159650880 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159650934 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159650978 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 159651026 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159651186 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 159651188 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159651201 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159651220 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159651247 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159651248 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159651285 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 159651348 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159651526 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 159651849 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 159651902 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 159652254 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159652578 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159652651 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159654077 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 159654262 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159654473 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159654494 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 159654597 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159654603 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159654785 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 159654863 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159654875 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159655034 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 159655059 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 159655100 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 159655103 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 159655119 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 159655187 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 159655205 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159655209 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159655222 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 159655225 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 159655292 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159655314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159655399 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159655420 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 159655421 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159655469 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159655535 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159655554 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159655605 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159655617 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159655674 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159655680 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159655809 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159656221 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159656229 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159656234 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159656414 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159656558 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159656585 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159656587 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 159656697 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 159656751 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 159656820 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159657010 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159657063 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159657074 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 159657175 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159657201 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 159657265 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159657267 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159657415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159657432 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159657660 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 159657675 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 2 159657692 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 159657707 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 2 159657708 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 159657756 T A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 159657869 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 159657924 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 159657925 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 159657989 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 159658492 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159658682 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159658694 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159658820 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 159658919 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 159658962 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 159659179 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 159659332 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 159659974 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159659980 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159660051 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 159660433 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 159660582 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 159660673 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159660734 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159661078 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 159661118 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159661433 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 159661709 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159662325 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 159662399 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159662731 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 159664019 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159664556 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159665282 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 159665396 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159665409 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159665478 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159665489 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 159665532 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159665642 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159665705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159665764 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159665791 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159665792 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159665808 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 159665897 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159666256 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159666309 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159666312 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159666337 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159666362 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159666399 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159666467 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159666534 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159666536 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159666595 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159666609 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159666782 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 159666919 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 159666920 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 159667005 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 159667335 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159667463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159667490 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 159667577 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159667623 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159667716 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159667819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159668445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159668487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159668676 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 159668695 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159668803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159668834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159669018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159669047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159669074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159669242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159669318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159669366 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159669741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159669777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159669805 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159669920 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 159670052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159670211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159670240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159670248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159670277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159670286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159670383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159670403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159670408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159670431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159670741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159670743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159670895 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 159671159 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159671179 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159671562 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 159671772 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 159671790 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 159671802 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 159671812 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 159671818 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 159671835 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159672094 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159672321 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159672325 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159672360 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159672490 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159672563 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 159672671 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159672692 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159673024 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159673026 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159673165 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159673219 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159673439 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159673710 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159674065 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 159674181 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 159674187 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159674384 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 159674643 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 159674678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159675152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159675506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159675968 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 159677204 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159677241 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159677242 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159677323 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159677436 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159677591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159677619 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 159677686 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159677770 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159677920 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159677957 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 159677959 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 159677982 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 159678012 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159678078 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159678217 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 159678494 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159678560 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159678908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159679030 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 159679157 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 159679202 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 159679305 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 159679411 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 159679454 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 159679661 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 159679790 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 159679919 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 159680380 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159680714 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159680803 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159680850 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159680893 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159680894 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159680906 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159680959 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159681335 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159681650 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 159681731 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159681806 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159682102 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159682537 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 159683126 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159683229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159683388 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159683475 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159684239 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159684685 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 159685011 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159685242 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159685297 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159685684 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159685726 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 159685792 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159685844 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159685873 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159686033 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 159686074 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159686298 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 159686437 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 159686492 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159687678 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 159687730 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159688174 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159688231 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159688586 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159689321 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 159689908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159691603 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 159691632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159691647 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 159691677 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159692048 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159692115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159692296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159693121 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159693482 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159693556 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159694067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159694166 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159694220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159694686 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159694766 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 159695813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159696306 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 159696647 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 159697272 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159697325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159698087 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 159699745 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 159702397 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159703323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159704117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159704409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159708755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159709570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159709687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159710204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159710251 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159711778 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 159712229 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159712679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159713092 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159713246 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 159713262 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159713322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159713949 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159714149 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159714322 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159714477 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 159714479 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 159714523 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159714659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159714730 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 159715122 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 159715294 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159715412 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159715564 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159716100 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159716229 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 159716813 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159717586 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159719734 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159720840 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159720871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159721527 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159721827 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159722666 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 159722680 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 159722763 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 159723169 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159723564 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159723667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159724415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159724518 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159725381 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 159726861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159727178 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159727311 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 159727481 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 159728694 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159729634 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159729893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159730110 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 159730976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159731019 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159731528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159731829 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159733108 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 159733357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159733471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159734389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159734462 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 159734720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159735128 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159735479 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 159735635 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 159735747 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159736364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159737719 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159738226 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 159738239 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159738243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159738254 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159740206 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159740274 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159740304 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159740412 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 159740753 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 159740969 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159741095 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159741232 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 159741394 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 159741663 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159741731 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 159741767 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159741887 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159742129 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159742176 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 159742448 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159743782 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 159744405 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159744437 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159744736 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 159745180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159746985 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159747248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159747831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159748685 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159748686 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159749061 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 159749227 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 159749415 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159749473 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159749600 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159749675 T G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 159749762 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 159749793 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 159749815 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 159749847 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 159749880 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 159749976 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 159750056 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 159750067 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 159750259 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159750264 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159750516 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 159750696 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 159750800 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159750814 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 159750827 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 159750879 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159750930 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 159750986 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159751120 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 159751165 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159751183 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159751248 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 159751341 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159751353 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159751448 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159751493 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 159752509 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 159752751 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159752967 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159753023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159753127 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 159753434 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159753494 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159753514 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159753936 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159754280 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159754289 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159754334 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159754467 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 159754483 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 159757116 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159765812 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159766662 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159766847 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159767117 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159768782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159772616 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159775998 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159776074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159776813 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159776845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159776857 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 159776875 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 159776991 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 159777234 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 159777637 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159778675 A G Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 159778707 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 159778733 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 159778807 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 159778864 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 159778911 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159779057 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159779085 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159779854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159780136 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159780195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159780196 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159780468 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159780561 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 2 159780828 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 159780919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159781052 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 159781058 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159781063 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159781076 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159781418 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 159781465 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159781471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159781532 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159781571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159781666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159781701 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 159781754 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 159782037 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 159782157 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159782166 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 159782246 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 159782330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159782451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159782559 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159782578 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 159782598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159782671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159782746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159782807 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 159782885 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159783038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159783080 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159783105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159783133 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 159783147 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 159783266 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159783294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159783398 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 159783468 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 159783768 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159783860 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159783898 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 159784143 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159784230 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159784404 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159784418 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 159784472 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159784740 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159784882 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 159784973 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 159785003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159785048 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159785070 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 159785137 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 159785200 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159785459 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159785480 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159785669 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 159785706 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 159785764 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 159785860 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159785879 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 159785889 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 159785936 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159786156 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 159786308 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159787448 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 159787521 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159788761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159789165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159790049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159790213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159790231 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159790529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159790916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159791180 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159791182 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159791197 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 159791429 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 159791592 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 159792099 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159792190 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 159792569 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159793233 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 159793556 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 159793610 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 159793656 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 159794473 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159794928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159795255 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159795359 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 159795493 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 159795520 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 159796104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159796910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159797084 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 159797137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159797171 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159797192 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159797274 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 159797999 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159798061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159798439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159798569 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 159799086 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 159799264 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 159799695 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 159799828 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 159799831 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 159800061 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 159800067 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 159800249 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 159800378 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 159800396 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 159800458 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 159800464 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 159800476 T C N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 2 159800556 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 2 159800580 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 2 159800747 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 2 159800764 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 159800846 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 159800912 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159800960 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 159801124 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159801268 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159801454 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159801548 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 159801640 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159801649 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159801660 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159801972 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 159802006 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159802308 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159802374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159802544 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159802925 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159802997 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159803156 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 159803419 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159803431 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159803464 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159803536 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159803688 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159803989 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159804002 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 159804132 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 159805119 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159805129 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 159805159 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 159805308 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159805498 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159805521 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159805558 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159805573 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159805714 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 159805889 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159805927 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 159805998 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159806001 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 159806023 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 159806178 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159806416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159806459 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 159806509 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 159806557 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 159806606 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159807172 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 159807336 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159807991 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159807998 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159808178 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159808393 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 159808665 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 159809387 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 159809666 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159809769 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159810132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159810245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159810403 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159810465 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159811202 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159811267 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159811288 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159811410 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159811584 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159814763 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 159814892 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159814959 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159815397 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 159815892 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159815893 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159815986 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159816026 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159816066 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159816091 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159816128 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159816738 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159817370 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 159817467 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 159817655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159817937 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 159818045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159818265 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159818312 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159818517 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159818631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159818973 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159819245 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159819445 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159819485 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 159820175 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159821190 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 159821325 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159821516 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159821759 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 159821764 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 159821936 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159822192 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159822507 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159822674 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159822738 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 159822766 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 159822783 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159822858 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159823054 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 159823124 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 159823466 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159823583 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159823752 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 159824085 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 159824527 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159824710 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 159824801 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159825081 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 159825243 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 159825304 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159825314 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 159825320 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 159825460 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159825495 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 159825534 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 159825538 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 159825567 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159825606 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159825685 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 159825707 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 159826590 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 159826752 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 159826796 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 159826840 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 159826938 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 159826969 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 159827230 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 159827433 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159827738 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159828190 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 159828777 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 159830664 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159831563 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 159832333 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159833012 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159833251 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159833778 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 159834169 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 159834934 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159835034 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 159835469 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 159835619 T G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 159836496 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 159836855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159837864 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 159837877 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 159837989 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 159838071 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 159838133 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159838171 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 159838212 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 159838269 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 159838339 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 159839887 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 159846818 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159846910 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159847768 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159849808 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159850101 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159851812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159852012 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159855573 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 159857517 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159858762 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 159859047 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159860580 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 159861078 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 159861401 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159861415 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159861601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159861611 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159861622 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159861636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159862596 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159862680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159862973 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159863533 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 159863583 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 159863594 G C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 159863665 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 159863713 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 159864715 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 159864830 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159865205 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 159865674 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159865709 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 159865714 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159865776 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159866271 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 159866316 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 159866490 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 159866786 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 159867214 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 159867432 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 159867451 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 159867469 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 159867810 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159867934 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159867993 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 159868004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159868047 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159868404 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 159868491 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159868510 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159868524 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159868546 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159868572 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159871178 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159872034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159872077 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159872326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159872454 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 159872469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159872708 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 159872809 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 159873089 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159873268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159873659 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159873697 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 159873716 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159873904 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159874029 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159874167 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159874210 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159874304 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 159874311 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 159874814 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 159875011 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159875141 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 159875258 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159875261 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159876009 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159877255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159877710 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159878073 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159879117 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 159879654 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 159880495 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 159880765 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 159881269 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 159881276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159881741 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159882015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159884490 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159885857 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159888600 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159890190 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159890580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159890790 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159891187 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159891799 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159892458 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159892503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159893114 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 159893240 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159893270 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 159894168 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 159895146 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159895949 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 159895968 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159896081 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 159896096 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159896143 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 159896201 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 159896214 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 159897891 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 159897963 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 159900598 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159901818 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159903380 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159903511 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159903659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159904483 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 159905576 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159906232 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159907673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159907984 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159908049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159908543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159908624 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159908752 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159908848 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159908891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159909402 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159909469 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 159909486 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159909636 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 159909916 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 159910046 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 159910097 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159910247 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159910471 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159910616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159911107 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 159911200 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159911239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159911314 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 159911315 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 159911794 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 159912045 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159912246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159913609 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 159913788 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 159913885 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 159914392 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159914475 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159914598 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159914626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159914657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159914944 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159915132 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159915315 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159915459 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159915512 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159915569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159915612 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159915698 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 159915717 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 159915781 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 159915798 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 159915924 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159917536 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 159918807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159919658 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 159919826 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 159920006 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159920752 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 159921577 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 159922036 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 159922121 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159922297 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159922352 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159922498 G C Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 159924499 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 159924550 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159924656 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159925030 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 159925791 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159925816 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159925870 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159926293 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159926316 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 159926325 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 159927401 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 159928390 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 159928398 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 159930422 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 159930436 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 159930462 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 159930490 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 159930533 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 159931195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159931637 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 159931726 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159933313 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159933848 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 159934024 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159934460 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 159934546 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 159934811 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159934901 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 159934972 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 159935013 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 159935030 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 159935044 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 159935071 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 159935087 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159935121 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159935137 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 159935216 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159935241 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 159935248 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 159935303 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 159935514 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 159935637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159935681 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159936135 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 159936693 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 159936819 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 159936917 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 159936921 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 159937072 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 2 159937121 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 2 159937188 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 159937209 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 159937532 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 159937886 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 159938065 C A Y N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.4 0 0.6 8 12 4 0 6 2 159938132 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 159938530 G C Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.5 0.0833333333333333 0.416666666666667 13 11 6 1 5 2 159938647 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 2 159938729 G A Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.5 0.0714285714285714 0.428571428571429 15 13 7 1 6 2 159939091 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159939272 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 159939285 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159939304 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 159939414 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 159939461 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 159939544 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 159939558 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 159941168 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 159941188 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 159941211 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 159941226 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 159941253 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 159941731 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159942301 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 159942324 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 159943801 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159943917 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 159944005 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 159944020 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 159944037 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 159944341 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 159944762 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 159945507 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 159945619 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 159945927 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 159946002 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 159946038 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 159946266 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 159947327 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 159947347 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 159947682 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 159948004 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 159949627 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 159949789 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 159949796 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159949861 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 159949874 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 159950022 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 159950200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159951106 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 159951110 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 159951126 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 159951358 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 159951407 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159951439 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159951546 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159951623 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159951631 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159951694 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159951823 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159951829 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159951838 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159951850 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159952461 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159952500 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 159952753 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159953061 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159953206 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 159953710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159954935 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 159955261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159955321 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 159955627 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 159955637 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 159955655 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 159955676 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 2 159955897 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159956541 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 159956749 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 159959097 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 159960058 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 159960062 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 159960146 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 159960182 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 159960212 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 159960218 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 159960226 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 159960262 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159960267 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 159960419 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 159960466 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159960506 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 159960749 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 159960760 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 159960820 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 159960863 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 159961361 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 159961527 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 159961655 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 159961928 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 159961958 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 159962108 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 159962142 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 159962427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159962443 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159962482 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 159962781 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 159963813 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159964592 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159964809 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 159965727 A G Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 159966238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159966966 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 159967570 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 159967616 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 159968247 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159968394 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 159968422 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 159968426 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 159968472 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159968508 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159968562 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159968571 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159968667 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159968669 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159968723 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 159968790 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159968942 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 159969286 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 159969289 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 159969323 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 159969818 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159969843 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 159970080 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159970100 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159970130 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159970278 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159970337 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159970395 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 159970503 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159970526 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159970581 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 159970584 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159970705 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 159970895 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 159971232 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 159971544 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159971664 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 159971673 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 159971700 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 159971721 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 159971780 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159972087 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 159972131 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159972225 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 159972477 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 159972560 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 159972787 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159972933 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159972989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159973026 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 159973321 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159973330 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159973343 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 159973396 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 159973404 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 159973565 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159973630 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159973652 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 159974184 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159974760 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159974885 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 159975050 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159975191 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 159975428 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 159975670 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 159975973 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 159975990 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 159976030 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 159976057 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 159976082 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159976261 A G Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 2 159976286 A G Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 159976745 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 159976897 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 159976898 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 159976943 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 159977214 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159977413 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 159977580 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 159977744 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 159977956 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159978004 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159978044 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 159978184 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 159978984 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159979134 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159979135 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159979167 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 159979257 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 159979316 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159979325 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 159979356 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 159979901 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 159979976 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 159980462 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159980664 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 159980690 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 159980714 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 159980978 T G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 159981011 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 159981135 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 159981137 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159981165 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 159981405 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 159981677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159981927 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159981984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159982040 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159982981 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 159982989 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 2 159983132 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159983196 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159983260 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159983319 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159983344 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159983675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159983791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159983807 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159983910 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159984029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159984030 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159984112 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159984228 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159984392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159984925 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 159984948 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159984987 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 159984990 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 159985369 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 159985636 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159985726 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159985767 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159985835 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159985854 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159985978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159986009 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159986054 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 159986129 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 159986337 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159986529 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159986585 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159986646 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159986699 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159986743 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159986765 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159987093 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159987175 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 159987181 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159987374 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 159987388 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159987463 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159987481 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 159987495 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159987866 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159987929 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159987937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159987955 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 159987962 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 159988042 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 159988171 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 159988205 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 159988333 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159988532 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159989008 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159989019 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159989026 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 159989113 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 159989135 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 159989177 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 159989330 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 159989503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 159989545 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 159989764 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 159989768 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 159989854 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 159990221 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159990599 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159990612 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159990710 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159990717 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159990840 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159990860 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 159990861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 159990888 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159990957 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 159991276 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159991619 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159991651 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159991652 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 159993250 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159993462 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159993503 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 159993821 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 159995408 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 159995415 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 159995543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 159995777 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 159996688 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 159996804 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 159996829 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 159997698 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 159997751 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 159998073 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 159998600 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 159998803 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 159998822 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 159998940 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 159999013 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 159999079 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 159999187 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 159999241 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 159999253 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 159999544 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 159999704 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 159999713 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 159999731 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 159999816 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 159999828 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 159999851 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 159999902 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 159999905 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160000314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160000477 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 160001040 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 160001127 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160001141 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 160001214 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 160001318 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160001342 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160001344 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160001382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160001392 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 160001511 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 160001537 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160001734 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 160001744 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 160001786 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 160001832 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160001841 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 160001946 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 160002156 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 160002163 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 160002236 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160002320 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 160002386 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 160002460 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 160002478 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160002494 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160002538 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 160002713 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 160002768 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 160002781 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 160002789 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 160002824 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 160002888 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 160002917 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 160002986 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160003001 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 160003097 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 160003532 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160003805 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160003817 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160003860 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 160003954 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 160003972 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 160004021 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 160004088 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160004182 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160004236 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 160004260 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160004286 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 160004338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160004441 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 160004470 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 160004480 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160004549 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160004637 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160004721 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160004766 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 160005083 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 160005118 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 160005291 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160005944 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 160005956 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 160006013 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160006197 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 160006248 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 160006332 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 160006338 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160006393 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 160006396 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 160006508 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 160006521 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 160006668 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 160007212 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 160007440 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 160007544 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 160007756 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 160007999 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 160008083 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 160008140 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 160008335 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 160008362 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 160008410 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 160008461 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 160008534 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 160008840 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 160008865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160009458 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160009613 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160010275 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 160010875 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160011243 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160011521 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 160011546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160011635 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 160011659 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 160011920 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 160012206 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160012268 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160012431 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160012575 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160012723 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 160012912 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 160013118 C G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 160013119 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 160013156 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160013208 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 160013271 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160013313 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160013314 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160013341 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 160013556 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 160013967 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 160014315 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 160014399 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160014411 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160014430 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160014557 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160014625 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160014671 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 160015009 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160015193 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 160015418 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 160015419 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160015513 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 160015586 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160015619 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160015632 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 160015641 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 160015700 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160015769 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160015772 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 160015792 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160015856 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 160015915 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160015970 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 160015971 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160016009 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 160016078 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 160016099 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160016184 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 160016204 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 160016216 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 160016260 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 160016267 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 160016292 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160016317 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 160016631 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 160016647 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 160016672 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 160016721 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 160016849 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 160016947 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 160017071 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160017128 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 160017140 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 160017406 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 160017429 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160017594 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160017726 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 160017939 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 160018264 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 160018576 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160018625 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 160018672 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 160018942 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160019025 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160019064 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 160019102 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 160019155 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 160019158 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 160019364 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 160019440 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 160019448 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 160019534 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 160019684 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160019732 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160019750 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160019755 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160020111 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 160020209 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 160020285 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160020366 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 160020372 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160021196 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160023746 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160023769 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 160024329 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160024453 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160024570 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160024604 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 160025541 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 160025621 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 160025808 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160025952 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160025960 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160026042 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 160026170 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160026272 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160026335 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160026346 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160026665 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 160026812 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 160026846 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 160026847 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 160026886 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 160026952 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 160026996 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 160027040 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160027061 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 160027132 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 160027183 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160027348 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 160027388 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 160027421 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160027487 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 160027497 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 160027593 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160027764 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 160027839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160027906 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160028388 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160028447 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160028518 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 160028624 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 160028635 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 160028893 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160029025 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 160029229 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 160029263 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160029452 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 160029678 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 160030239 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160030294 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160030365 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 160030842 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 160031029 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 160031075 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 160031262 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 160031772 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160031938 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160032083 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 160032331 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 160032699 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 160032825 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 160032943 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160033016 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 160033045 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 160033138 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 160033140 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 160033151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160033156 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 160033265 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 160033499 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 160033703 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 160033808 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160033920 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 160034011 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 160034037 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 160034324 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 160034533 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 160035900 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 160036124 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160036757 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 160036880 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160036899 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 160037059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160037099 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160037314 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160037525 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 160037895 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 160038219 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 160038374 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160038509 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 160038602 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 160038624 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 160038890 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 160038972 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160038990 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160038999 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 160039219 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160039329 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160040064 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 160040606 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 160040638 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 160040827 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 160040937 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 160041012 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 160041193 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 2 160041292 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 160041455 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160041506 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 160041656 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 160041694 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 160041769 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 160041773 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 160041782 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 160042222 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 160042424 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160042486 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 160042639 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 160042645 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 160042806 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 160042892 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 160042917 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 160042944 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 2 160043099 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160043219 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160043286 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160043335 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 160043450 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160043562 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 160043928 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 160044126 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 160044137 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160044282 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160044358 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 160044371 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 160044516 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160044542 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 160044574 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160044706 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 160044758 G C Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 2 160045091 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160045110 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160045122 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160045172 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 160045181 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 160045192 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 160045200 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 160045212 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 160045261 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160045330 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 160045333 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 160045381 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 160045394 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 160045398 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 160045415 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 160045433 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 160045575 C T N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 160045761 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 160045850 T C Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 160046219 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 160046418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160046490 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 160046525 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 160046627 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160046977 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 160047323 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160047587 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 160047592 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 2 160047840 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 160047924 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 160047970 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 160047996 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 160048077 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 160048879 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 160049092 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160049257 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 160049341 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160049378 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160049382 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160049713 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 160049752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160049804 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 160052396 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160052456 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160052648 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160053188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160053574 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 160053594 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 160053642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160053942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160054230 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 160054238 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 160054274 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 160054460 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160054510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160054538 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160054820 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160054997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160055067 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160055181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160055660 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160055710 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 160055838 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 160056167 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 160056200 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 160056214 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 160056326 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 160060027 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160060207 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 160060218 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 160060227 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 160060402 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 160060618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160060701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160061118 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160061137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160062108 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 160063425 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160064216 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 160064935 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160065233 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160066610 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 160067145 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 160067276 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160067403 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 160067613 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 160067628 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160068344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160069654 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 160069743 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160070360 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160070676 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 160071709 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160071869 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 160072197 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 2 160072770 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160072848 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 160072898 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 160072922 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 160073053 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 160073074 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160073150 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 160073217 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 160073664 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 160076074 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 160076163 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160078540 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160078592 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160079074 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 160079589 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 160080048 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160080176 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 160080227 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 160080402 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 160080429 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 160080438 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 160080464 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 160080492 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 160080525 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 160080538 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 160080642 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 160080681 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 160080777 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 160080841 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160080844 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160080975 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 160081027 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160081028 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 160081109 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 160081189 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160081246 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 160081748 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 160082182 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 160082259 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160082306 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160082323 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160082393 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 160082790 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160083018 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160083342 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 160083582 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 160083840 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160084595 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 160085270 G A N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 2 160085733 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160085738 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160085799 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160085925 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160085939 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160085978 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160086203 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 160086273 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160086300 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160086306 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160086324 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160086854 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160086857 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160086881 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160086899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160086932 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 160086990 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 160087556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160088515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160088717 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160088722 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160090363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160090946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160091064 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160091905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160092590 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 160092935 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 160093417 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160093616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160094347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160094900 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 160094919 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 160094984 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 160095987 A C N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 2 160095988 T A N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 2 160095998 A G Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 160096116 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 160096191 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 160096324 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 160096331 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 160096337 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 160096385 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 160096675 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160096792 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 2 160097413 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160098444 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 160098547 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 160099332 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 160099374 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 160099443 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 160099819 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160099894 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 160100034 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 160100051 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160100336 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160100343 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 160100354 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 160100495 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 160100552 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160100565 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160100648 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 160100740 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 160100964 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 160100982 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160101180 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160101236 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160101351 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 160101382 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 160101417 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 160101556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160101614 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 160101675 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 160101757 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160102044 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160102106 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160102283 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 160102326 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 160102421 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 160102506 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 160102684 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160103071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160103101 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 160103116 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160103126 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160103130 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160103141 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 160103152 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160103154 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 160103168 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160103177 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160103209 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160103343 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 160103503 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 160103513 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 160103561 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 160103562 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 160103685 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 160103704 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 160103741 C G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 2 160103751 A T N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 160104142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160104255 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 160104294 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 160104297 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 160104671 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 160105427 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160106341 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 160108944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160109526 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160110379 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160110546 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160110609 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160113394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160113989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160115250 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160115396 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160115466 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160116266 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 160116635 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 160116910 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160117111 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 160117250 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160117280 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160117297 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 160117440 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 160117633 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160117754 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160118013 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 160118270 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 160118345 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160118583 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160118610 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160118700 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 160118708 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 160118747 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 160118849 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 160118900 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 160119233 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 160119381 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 160119474 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160119598 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 160119876 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160120005 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160120300 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160120602 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 160121631 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160121709 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 160122366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160122975 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 160123167 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 160123173 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 160123197 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 160123267 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 160123282 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 160123338 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 160124806 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 160126568 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160126787 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 160126932 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 160127064 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 160127168 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 160127201 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 160127232 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 160127279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160127352 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 160127366 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 160127533 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 160127547 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 160127604 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 160127890 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160128474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160128608 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 160129100 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 160129313 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160129357 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 160129367 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 160129409 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 160129431 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160129495 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 160129780 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 160130092 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 160130100 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160130129 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160130183 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 160130386 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 2 160130953 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 2 160131077 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 160131079 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.466666666666667 0.133333333333333 0.4 16 14 7 2 6 2 160131089 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 2 160131132 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 2 160131155 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 2 160131272 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 160131584 A T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 160131807 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 160131903 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 160132350 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 160132351 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 160132377 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 2 160132506 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 160132522 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 160132591 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 160133012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160133061 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 160133079 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 160133102 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160133272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160133424 C G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 160133436 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160133552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160134003 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160134166 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 160134358 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 160134359 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 160134607 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 160135267 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 160135348 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 160135392 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 160135613 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 160135692 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 160135728 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160135758 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 2 160135765 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 160136035 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 160136083 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 2 160136355 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 160136732 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 160136784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160136939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160137022 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160137087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160137100 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 160137116 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 160137132 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160137237 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 160137376 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 160137397 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 160137404 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 160137416 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 160137562 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160137688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160137808 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 160137822 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 160137825 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 160137844 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 160138101 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160138288 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160138426 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160138436 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160138593 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 160138611 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 160138667 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 160139223 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160139685 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 160139768 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160139853 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 160139892 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160139910 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 160139996 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 160140089 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160140250 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160140417 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160140490 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160140606 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160140670 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 160140846 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 160141198 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 160141257 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 160141494 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160142229 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160142247 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160142263 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160142285 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160142796 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160142822 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160142896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160143076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160143228 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160143958 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160143990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160144000 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 160144015 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 160144219 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160144297 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160144370 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 160145485 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160145721 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 160145743 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 2 160145768 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 2 160145848 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.266666666666667 21 9 10 1 4 2 160145999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160146045 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 160146091 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160146098 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160146108 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 160146110 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 160146628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160146775 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160146803 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160146866 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160146967 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 160146975 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160146994 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 160147045 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160147481 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160147616 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160147632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160147658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160147697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160149218 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160149279 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160150217 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160150277 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 160150874 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160151144 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160151457 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160151476 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160152134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160154304 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160154375 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160154834 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160154852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160157433 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160158709 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160161216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160161647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160165261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160165824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160165901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160165913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160165977 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160165979 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160166130 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160166170 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160166203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160166274 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160166283 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 160166437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160166563 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160166724 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160166910 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160166983 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160167392 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 160167444 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 160167480 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160167486 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160167694 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160167797 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 160167850 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160167890 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 160168046 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 160168143 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 160168156 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 160168164 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 160168324 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160168360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160168826 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160168847 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160168854 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160168873 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160168881 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160169068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160169130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160169360 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160169656 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160169679 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 160170200 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 160170586 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160170667 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 160170822 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160170875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160170959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160170980 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 160171466 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160172286 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160173164 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160173343 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160174244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160174318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160176185 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 160176367 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 160177057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160179266 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160179331 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 160180089 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160180267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160180752 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 160180947 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 160181058 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 160181727 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 160181740 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 160181866 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 160182648 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160182676 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160182823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160182847 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 160183202 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160184524 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160184841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160185757 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160186011 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160186266 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160186531 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160186552 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 160186568 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 160186869 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 160187829 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160188197 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160188281 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160189433 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160190168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160191202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160193858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160193895 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 160193925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160193934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160194234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160194357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160194374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160194378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160194420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160194453 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160194563 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160194572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160194585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160194749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160194798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160194808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160194846 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160194985 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160195027 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160195030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160195260 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 160195275 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160195353 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160195466 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160195553 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160195631 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160196149 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160196346 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160196725 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 160196903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160196935 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160196972 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160196974 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160196988 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160197018 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 160197231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160197278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160197318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160197408 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160197413 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 160197425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160197538 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160197550 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 160198337 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160198349 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160198433 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 160198614 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 160198660 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160198733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160198737 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160198857 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160199282 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160199485 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160199557 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160199848 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160199890 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160200430 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 160200440 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 160200586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160200667 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160200901 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 160200989 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 160201211 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160201309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160201623 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 160202921 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160202937 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160203099 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 160203276 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 160203539 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160203586 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 160203874 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160204246 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160204250 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160205981 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 160206854 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 160208686 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160209054 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160209357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160209358 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160209383 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 160209445 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160209506 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 160209571 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 2 160209647 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 160209870 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 160210250 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160210416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160210741 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160210867 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 160210906 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160211016 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160211092 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160211105 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160211169 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160211188 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160211207 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160211212 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160211434 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160211473 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160211573 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160211669 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160211696 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 160211737 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160211950 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 160212255 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 160212292 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 160212307 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 160212346 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 160212369 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 160212475 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 160212582 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160212868 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 160212937 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160213315 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 160213649 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 160213823 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160213827 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160213948 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 160214113 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160214185 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160214222 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160214225 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160214398 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160214627 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 160214915 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 160215026 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 160215148 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 160215149 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 160216033 C A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 160216349 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160216554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160216614 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160217154 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 160217166 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160217210 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160217297 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160217413 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 160217470 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 160217954 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 160217996 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 160218009 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 160218141 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 160218160 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 160218228 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 160218232 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 160218301 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 160218325 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 160218668 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 160219120 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160219142 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 160219198 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160219213 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160219321 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160219471 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 160219598 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 160219684 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 160219685 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 160219960 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160219987 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 160220009 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160220374 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160220431 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160220583 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 160221175 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160221403 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 160221414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160221453 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160221515 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 160221562 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 160221611 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160221728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160222222 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160222366 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160222409 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160223405 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160223853 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 160224036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160224076 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 160224104 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 160224172 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160224250 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 160224356 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160224404 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160224431 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160224502 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160224520 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160224547 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160224700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160225109 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160225253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160226105 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160226218 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 160226433 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160226586 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160226719 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 160226852 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160226881 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 160227013 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 160227037 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 160227045 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 160227057 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 160227120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160227169 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160227296 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 160228067 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 160228074 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 160228220 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160228635 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160228881 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160229381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160229430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160230016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160230188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160230292 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160230294 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160230380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160230402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160230458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160230483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160230829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160231071 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160232302 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160232626 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160232796 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160232817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160233058 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 160233095 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160233301 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 160234445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160234499 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 160235139 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 160235140 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 160235284 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 160235285 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 160235385 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 160235394 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 160235418 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 160235478 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 160235796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160235987 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160236037 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160236122 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160236153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160236171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160236203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160236231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160236254 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160236259 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160236434 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160236611 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160236713 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 160236950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160237329 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 160237332 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 160237438 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 160237704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160237962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160239104 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 160239315 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 160239955 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160240327 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 160240434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160240594 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160240686 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160240819 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160240921 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 160241257 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160241420 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 160241476 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 160241477 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 160241580 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 160241599 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160241633 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160241647 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160241756 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160242090 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160242180 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 160242348 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 160242390 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 160242544 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 160242647 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160243019 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160243080 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160243176 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160243221 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160243229 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 160243239 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 160243266 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 160243276 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 160243307 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 160243401 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 160243550 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 160243558 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 160243697 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 160243705 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160244358 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160244393 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160244420 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160244464 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160244796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160244935 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160245087 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160245198 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160245220 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160245326 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160245342 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 160245474 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 160245526 T A N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 160245611 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 160245637 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 160246004 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 160246015 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 160246053 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160246119 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160246171 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 160246188 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 160246430 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 160246519 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160246562 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 160246578 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 160246582 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 160246600 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 160246768 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 160246827 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 160247368 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160248127 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160248241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160248663 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 160248677 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 160248678 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 160248882 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 160249174 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 160250051 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160250246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160250266 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 160250398 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160250684 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160250855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160250865 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 160251074 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160251280 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160251337 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160251424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160251500 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160251562 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160251606 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 160251711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160251984 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 160252578 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 160252580 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 160252612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160252695 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160252724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160252908 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 160252960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160253075 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 160253084 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160253435 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160253523 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 160253670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160253716 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 160254010 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160254114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160254556 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 160254687 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 160254761 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160254762 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160254860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160254868 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 160254886 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160254920 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160254923 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160255044 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160255190 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160255310 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160255393 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 160255404 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 160255443 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 160255612 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 160255645 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 160255973 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 160256082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160256124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160256429 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 160257178 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160257182 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160257226 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160257243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160257254 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 160257332 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160257340 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 160257462 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 160257490 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 160257492 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 160257514 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 160257550 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160257807 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160257875 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160257896 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160258086 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 160259010 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160259286 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160259355 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 160259387 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160259439 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 160259469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160259487 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 160259549 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160259576 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 160259592 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 160259961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160259986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160260026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160260134 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 160260323 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 160260404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160260442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160260616 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160260724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160261005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160261044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160261066 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160261131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160261599 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160261790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160261898 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160261936 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160261943 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160262020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160262051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160262326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160262363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160262375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160262382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160262663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160262708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160262752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160262780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160262945 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 160263695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160263865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160264355 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 160264405 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 160264412 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 160264442 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160264471 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 160264524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160264548 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160264589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160264610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160264635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160264670 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 160264708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160264726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160264809 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 160265167 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160265262 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160265507 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160265622 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160265637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160265649 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160265667 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160265867 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 160265984 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 160266152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160266218 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160267187 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160267351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160268251 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 160268270 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160268637 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 160268685 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 160269135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160273334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160273576 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 160273742 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160273999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160274003 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160274549 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160274662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160275245 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160275321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160276184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160277481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160277530 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 160277568 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 160277591 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160277848 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160277959 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160278036 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160278082 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160278143 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160278146 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160278171 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160278211 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160278296 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160278298 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 160278406 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 160278441 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 160278722 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 160279049 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 160279223 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 160279464 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 160279491 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 160279579 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160279584 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 160279821 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160279871 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 160279890 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160279941 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160279975 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160280071 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 160280293 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 160280844 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160280892 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160281287 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160282372 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 160282381 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160282482 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160283261 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160283268 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160283388 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160284210 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 160284227 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 160284359 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 160284365 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 160284406 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160284566 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 160284641 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 160284692 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 160285239 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160285272 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160285330 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160285403 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160289355 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 160289566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160289662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160291739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160293139 G A Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 160293997 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 160294001 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 160294011 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 160294013 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 160294029 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 160294386 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 160294387 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 160294509 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 160294615 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 160294780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160297333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160297450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160298278 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160298634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160299197 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160300241 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160304204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160304424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160304705 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 160305063 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160306041 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 160306132 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 160306184 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 160306208 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160306225 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 160306257 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 160306456 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 160306622 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 160306696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160306804 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 160306873 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160306951 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160307036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160307128 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160307265 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 160307324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160307363 C G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 160307427 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 160307447 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 160307595 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 160307677 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 160307770 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 160307771 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 160307922 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 160308235 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 160308705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160309380 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160309605 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160309887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160310225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160310255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160311459 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160312729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160313372 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160314298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160314339 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160314617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160314634 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160314670 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 160314721 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160314827 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 160314876 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160314932 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 160314980 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160315038 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160315126 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 160315136 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 160315195 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 160315337 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 160315431 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 160315442 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160315473 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 160315508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160315673 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 160315699 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 160315831 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 160315869 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 160316049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160316125 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160316153 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 160316213 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 160316528 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 160316538 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 160316779 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160317534 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 160319559 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 160320167 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 160320922 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 160322035 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 160322469 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 160322637 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160322932 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 160322940 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 160323830 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 160325866 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 160326526 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 160326833 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 160327002 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 160327009 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 160327045 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 160327057 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 160327199 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 160327222 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 160327292 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160327300 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 160327923 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160327968 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160328603 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160329043 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 160329447 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160330531 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160330581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160330708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160331731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160331872 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 160331895 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160331909 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160332062 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 160332234 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160332372 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 160332378 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 160332392 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160333066 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 2 160333080 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 160333163 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 160333542 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 160333944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160334128 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 160334229 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 160334291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160334298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160334341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160334597 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 160334765 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 160334863 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 160334864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160335186 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 160335202 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 160336566 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160337122 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160337266 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 160337267 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 160337403 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 160337405 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 160337512 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160337576 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160337650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160337727 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 160337762 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160337837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160338010 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 160338104 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160338122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160338724 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160338735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160338999 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 160339007 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 160339032 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 160339041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160339525 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 160339666 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160340537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160340547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160341380 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 160341466 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 160341517 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 160341924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160341974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160342274 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 160344209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160345963 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160345976 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160345979 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160346009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160346420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160346456 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160346512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160346513 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 160346672 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160346692 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 160346700 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 160346984 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160347412 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160347447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160347646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160347728 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160347766 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160347773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160347799 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160347815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160348152 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160348763 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 160348782 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 160348795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160349206 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160349493 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 160349559 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160349850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160349861 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 160350155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160350162 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160350287 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 160350311 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160350363 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 160350530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160350537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160350548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160350597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160350623 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160350624 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 160350725 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 160350832 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 160350876 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 160350896 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 160350909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160350978 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 160351014 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 160351875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160352154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160352289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160352996 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160353462 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 160353618 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 160353720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160353949 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 160354067 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160354171 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160354309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160354654 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160354687 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 160354911 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160355058 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 160355063 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160355169 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160355170 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160355263 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160355374 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160355491 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 160355540 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 160356781 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160356893 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160356920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160356925 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160356937 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160357090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160357249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160358073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160358134 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 160358172 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 160358291 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 160358411 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 160358417 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 160358447 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 160358563 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 160358637 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 160358796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160358840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160359126 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160359188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160359211 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 160359254 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 160359276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160359694 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 160359930 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 160359979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160360872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160360908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160360947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160360980 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 160361094 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 160361111 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 160361547 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160362635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160362693 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160362695 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160363214 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 160364572 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 160365313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160365604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160366617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160367703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160367839 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 160368319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160368984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160370792 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160371551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160371567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160372005 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160372030 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 160372042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160372522 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160374200 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 160374860 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160374904 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 160375139 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 160375413 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 160375456 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160375538 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 160375557 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 160375691 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160376523 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160377970 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160377985 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160378469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160378497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160378937 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 160379006 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 160379107 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 160379177 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 160379180 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 160379266 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 160379325 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 160379446 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160379695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160379839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160380341 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160380459 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 160380850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160382714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160383490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160383491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160383513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160383629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160384911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160385808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160386845 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160387404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160388931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160389021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160389647 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 160389890 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 160389894 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160390035 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160390054 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160390101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160390123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160390337 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160390392 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160390457 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 160390478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160390715 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 160390740 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 160390873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160390927 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160391196 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 160391304 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 160391486 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160391522 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 160391536 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160391597 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 160391614 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 160391625 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 160391670 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160391863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160391914 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 160392054 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160392206 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160392990 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160393035 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 160393683 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 160394140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160394256 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 160394267 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 160394308 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 160394328 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 160394342 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 160394387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160394448 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 160394466 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 160394523 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 160394602 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 160394684 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 160394892 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160394942 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160394960 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 160395073 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 160395140 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 160395166 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 160395172 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 160395270 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160395302 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160395634 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 160395740 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160395811 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160395814 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160395873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160395887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160395927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160396278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160397100 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160397169 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160397173 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160397331 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160397421 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 160397488 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160397506 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160397545 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160397670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160397767 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160398027 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160398118 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 160398195 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 160398369 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160398441 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160398471 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160398500 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160398584 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160398591 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160398660 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160398689 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160398778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160398822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160399226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160399233 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160399615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160399645 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160399677 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160399685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160399725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160399977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400445 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160400457 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160400481 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400542 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400572 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 160400589 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160400702 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160400811 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160400951 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160400970 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160401057 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160401107 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160401276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160401327 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160401531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160401748 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 160401754 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 160401811 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 160402014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160402057 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 160402062 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 160402130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160402247 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 160402256 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 160402270 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160402530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160402566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160402752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160403019 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 160403185 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 160403946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160404315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160404427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160406171 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160406362 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160406440 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 160406472 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160406682 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 160407456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160407476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160407483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160407497 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160407522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160407860 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 160408076 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 160408079 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 160408146 T A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 2 160408247 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160408256 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 160408314 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 160408383 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 160408444 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 160408461 A G Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 160408564 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 160409645 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160409891 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160409922 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160410056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160410137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160411064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160411131 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 160411239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160411378 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160411510 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160411518 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160411527 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 160411682 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160411725 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160411888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160412009 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160412031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160412113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160412294 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160412392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160412719 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160412831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160413857 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160413891 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160413998 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160414104 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160414111 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160414153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160414282 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160414402 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160414673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160415614 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160415987 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 160416026 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160416222 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160416446 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 160416955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160416984 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160417000 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160417021 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 160417304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160417417 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 160417442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160417474 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 160417564 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 160417649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160417671 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 160417921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160417930 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160418286 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160418411 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160418856 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160418858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160419360 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160419583 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 160419649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160419711 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 160419766 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 160419835 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 160419841 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160420068 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160420074 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160420225 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 160420487 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 160421542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160421547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160421554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160421604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160421636 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160421900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160421974 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 160421986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160422007 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160422056 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160422371 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 160422615 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 160422964 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 160422980 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 160423452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160423465 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 160423525 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160423559 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 160423621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160423801 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160423808 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160423953 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160423997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160424026 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160424051 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160424063 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160424156 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 160424297 G A Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 160424336 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 160424352 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 160424402 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 160424446 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 160424569 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160424591 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160424668 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 160424828 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 160424914 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160424971 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160424985 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160425041 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 160425126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160425405 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160425447 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 160425479 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160425558 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 160425581 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160425795 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160425896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160426021 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160426022 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160426248 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 160427162 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160427550 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160428144 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 160428268 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160428597 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160428904 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 160428920 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 160428998 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160429034 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160429558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160429760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160429772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160429799 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160429802 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160429851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160430004 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160430047 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160430048 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160430117 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160430174 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160430210 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 160430216 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160430241 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160430311 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160430401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160430859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160430867 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160430887 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160430915 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160431046 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160432165 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160432189 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160432349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160432953 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 160433293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160433619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160433633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160433640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160435354 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 160435692 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 160436158 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 160436162 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 160436193 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 160436488 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.357142857142857 0.0714285714285714 0.571428571428571 11 17 5 1 8 2 160436528 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 2 160436567 G A Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 160436612 A C Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 2 160437277 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 160437478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160437568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160437644 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 160437753 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160437916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160438295 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 2 160438473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160438882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160439139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160439210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160439366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160439413 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160439640 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160439711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160439871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160439875 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160440368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160441899 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160442359 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 160442376 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160444127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160445622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160447639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160448694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160448885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160451230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160451600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160451621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160451828 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160451930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160451965 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160452047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160452122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160452241 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160452253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160452261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160452273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160452338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160452351 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160452458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160452640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160453002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160453135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160453289 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160453337 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160453382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160453386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160453539 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160453831 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160453832 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160454115 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 160454122 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 160454557 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160454711 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160454917 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160455533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160455567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160456214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160456242 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160457377 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160466266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160467252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160469085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160470523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160473064 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160473206 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160477317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160478673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160480297 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160480319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160482576 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 160482776 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160482978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160484081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160484090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160484352 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160486546 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160487432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160487974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160488111 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160489362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160490626 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 160491294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160493102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160493636 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 160494280 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 160495024 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160496282 T C Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.0714285714285714 14 14 1 12 1 2 160496378 T C N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 2 160497568 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160498332 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160498700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160499449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160500508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160500518 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160500714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160501294 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160501776 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160503012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160504189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160505322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160505602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160508659 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160509028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160510804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160514455 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 160514527 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160514751 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 160516503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160523084 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 160523375 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160525225 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160526271 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160527260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160529127 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160531428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160539128 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 160540367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160541166 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 2 160543042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160543628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160544883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160548772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160549747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160551541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160553217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160553826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160553910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160556958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160556974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160558640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160558826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160559890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160562182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160566335 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 160566745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160568933 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 160569941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160569981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160570452 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 160575818 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160589738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160589855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160590104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160590780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160596784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160597178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160598128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160602443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160604356 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160609139 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 160609612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160610473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160614308 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160614405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160615367 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160616709 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160620852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160620958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160623782 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 160627636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160628490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160630788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160632268 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160636913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160643165 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160653140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160653547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160656970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160658330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160662268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160664031 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 2 160664862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160667576 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 2 160667658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160668750 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 2 160670648 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160672740 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160673756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160674763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160675323 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160675642 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160676429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160676484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160676775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160677219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160680983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160682401 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160683509 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160685031 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160685052 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 160686734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160696026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160700588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160700902 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 2 160701469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160705785 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160707979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160709950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160711294 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 160711512 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160712725 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 160713042 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160713815 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160714238 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160714277 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 160714433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160714452 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160714516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160714583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160714601 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160714614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160714634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160714844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160714963 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 160714964 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 160714976 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160714991 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160715052 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 160715058 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160715070 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160715084 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160715118 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160715152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160715268 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 160715278 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160715287 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160715301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160715586 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160715758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160715777 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160715883 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160715917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160716131 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160716349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160717003 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160718150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160718196 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 160718261 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 160718990 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160719681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160719682 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160720081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160720255 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160720273 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 160720949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160721188 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 160721193 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 160721744 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160721976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160721984 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160721990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160723356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160725463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160725472 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 160725589 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160725814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160725999 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160727019 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160727092 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 160727093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160727477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160728067 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160728270 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 160728521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160728533 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160728623 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 160728700 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160728760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160728904 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160729171 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160730605 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 160730675 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160730682 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 160730777 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 160731393 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 160731416 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 160731483 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 160731487 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 160731556 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 160731760 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 160732450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160735013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160739141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160740413 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160746256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160747826 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160748118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160748316 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160748369 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 160748372 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 160748412 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 160748630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160748641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160748870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160749369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160749426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160749724 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160751917 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 160752473 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 160752714 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160752884 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 160752889 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 160752897 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 160753074 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160753152 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 160753153 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 160753236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160753278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160753289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160753308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160753321 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160753517 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160754568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160754585 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160758529 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160758602 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 160759121 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 160759226 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 160759246 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 160759504 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160759562 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160759563 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160760022 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 160760034 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160761649 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160761767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160762369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160762871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160762999 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 160763045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160763338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160763418 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160764402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160765095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160765423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160766376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160768340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160769901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160771106 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160773820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160774240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160777739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160778332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160778371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160779060 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160779069 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160781056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160781417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160782617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160783627 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 160785290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160788215 T C Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 2 160789006 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 160792944 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160794606 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160798164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160801186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160803150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160806221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160807604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160807880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160813862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160813904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160815038 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160815903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160817538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160818669 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160819279 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160820542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160820672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160821171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160821214 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 160821265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160821489 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160821545 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160821552 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 160821991 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160822482 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 160825178 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 160825342 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 160825999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160826926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160827144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160828219 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 160830411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160830535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160831723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160832656 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160832773 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160833526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160834429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160835215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160835232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160836170 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160836317 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160836794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160837266 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160837467 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160840970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160841877 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160842217 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160844166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160844296 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160845687 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 160846146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160846867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160847219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160848565 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160848598 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160849087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160850573 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 160851424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160854354 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 160854455 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160855856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160857711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160858077 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160858866 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 160858895 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160859027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160859153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160859246 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 160860723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160863031 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160863165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160863523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160865171 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160865173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160868478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160878068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160881755 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160882483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160882528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160883045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160883104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160883370 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160883388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160883407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160884099 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160885400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160886399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160887495 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160887591 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160889020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160889490 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160893685 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160896264 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160897731 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160898109 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160898289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160900454 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160901286 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160901296 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 160902014 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160903246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160903359 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160911192 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160912406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160912889 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 160915423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160915620 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160916196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160916400 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160916857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160916916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160917388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160918401 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 160918580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160918615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160921330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160921351 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160921433 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 160921999 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160926409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160927312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160927329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160927552 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 160929554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160930822 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160931515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160931733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160932109 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160933238 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160933592 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160933984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160939472 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 160940059 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160941805 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 160942127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160942344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160942351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160942436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160942716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160942819 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 160942890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160943112 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 160943144 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 160943530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160944073 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160945229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160945463 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160945607 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 160945772 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 160945868 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 160946085 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160946321 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 160946455 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 160946569 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160946728 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160946821 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 160946872 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 160947379 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160949172 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160949185 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160949278 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 160949410 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160949418 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160949523 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 160949542 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 160950476 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160950494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160950923 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160951998 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160952580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160952628 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 160953114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160953189 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 160953472 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 160953529 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 160955315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160955562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160955593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160956039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160956269 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 160956293 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 160956309 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 160956378 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160956475 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160956569 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160956603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160956617 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 160956661 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 160956823 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 160956887 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160957008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160957099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160957943 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 160958080 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160958447 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160958878 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160958941 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160959020 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 160959046 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160959095 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160959134 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 160959285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160959810 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160960179 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 160960478 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 160960920 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160961077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160961117 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 160961352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160961478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160961586 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160962049 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160962238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160962309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160962369 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 160962398 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160962999 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 160963736 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160963860 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 160964502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160965200 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 160966762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160966763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160966925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160967027 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160967048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160967174 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160967210 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 160967550 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 160968580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160968683 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 160969006 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 160969211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160969228 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 160969883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160969928 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 160969982 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 160970053 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160970585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160971003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160971583 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 160971600 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 160971614 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 160971653 C A Y N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 160971687 C A Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 160971801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160971820 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160971950 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 160972103 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 160972108 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160972123 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160972536 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160972590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160972662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160972673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160972783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160973387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160973405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160973624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160973712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160973722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160973849 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160974532 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160974887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160974960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160974998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160975039 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160975352 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160975615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160975722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160975777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160977131 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160977481 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160977830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160977869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160980298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160980440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160980934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160981070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160981239 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 160981256 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 160981750 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 160982332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160982530 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160983745 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 160983810 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 160983830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160984085 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160984981 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 160985626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160985975 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160987130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160987584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160987870 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 160987874 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160987886 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160987927 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160988660 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 160988848 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 160988890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160989015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160989230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160989800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160989932 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 160990009 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160990281 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 160991183 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160991455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160991497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160991773 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 160991793 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160991814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160991900 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160992062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160992102 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160992703 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160993132 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 160993431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160993775 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 160993792 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 160993862 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160994037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160994061 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160994257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160994420 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 160994855 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160995000 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 160995030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160995322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160995548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160995623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160996509 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 160996517 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 160996540 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 160996785 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 160996836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 160997073 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 160997862 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 160998206 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160998211 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 160998284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 160998941 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 160998959 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 160999770 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 161000075 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 161000184 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 161000256 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 161000284 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 161000287 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 161000594 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 161000897 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 161000981 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161001086 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161001106 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161001149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161001162 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161001200 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161001281 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161001314 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161001325 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161001339 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161001428 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 161001611 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 161001616 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161001623 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161001754 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161001771 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161001786 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161001892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161001905 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161001920 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 161002227 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161002250 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 161002351 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 161002480 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161002502 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161002548 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161002631 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161002816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161003676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161007389 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 161008798 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161010645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161012436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161013162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161013620 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161013717 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161015605 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161015715 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 161015751 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 161015830 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 161015836 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 161016215 G C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 161017531 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161017544 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161018499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161018507 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161019002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161019471 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161020756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161021410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161021414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161021470 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161022190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161022435 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 161024797 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161025670 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161026216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161026618 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161027243 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 161027286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161027287 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161027500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161027590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161027591 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 161027664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161027926 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161027936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161027995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161028029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161029086 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 161029842 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 161031018 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161031068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161031740 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161031749 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161031833 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161033062 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 161034272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161035901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161038371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161038671 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 161040155 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 161040726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161040913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161040937 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161040941 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161040974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161041022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161041135 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161042690 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 161042775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161042862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161043151 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161043888 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161043970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161044032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161044040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161044409 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161044735 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161044787 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 161044821 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161045555 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 161045556 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 161048029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161050291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161050845 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161050887 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161051309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161051436 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 161051527 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161051620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161051662 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 161051772 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161051839 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161051884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161051932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161052298 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 161052595 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 161052647 C A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 161052732 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 161052783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161052897 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161052919 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161052952 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 161053105 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161053109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161053122 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161053150 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161053254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161053280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161053540 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161053786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161053876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161053880 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161053973 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161053975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161053989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161054251 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161054350 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 161054466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161054478 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 161054621 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161054715 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161054722 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161054736 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161054775 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161054893 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 161055033 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161055051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161055098 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161055170 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161055247 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161055315 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161055321 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161055338 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161055467 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 161056066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161056198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161057869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161057945 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 161057980 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161058048 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161058175 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 161058200 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 161058804 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 161059036 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 161059098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161059547 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 161059916 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 161060014 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161060104 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161060110 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 161060318 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 161060321 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 161060344 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161061085 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 161061102 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 161061103 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 161061227 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 161061804 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 161061918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161062228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161062295 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161062451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161063848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161063973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161065173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161069614 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161069670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161070261 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 161070718 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 161071036 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161071314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161071458 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 161071466 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161071611 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161071817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161072371 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161072465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161072749 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 161072835 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161072975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161073340 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161073368 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161073601 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161074000 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161074567 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 161074731 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161074916 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161074997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161075646 A C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 161079266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161082211 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 161082319 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161082367 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 161085407 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161085467 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161085622 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161088373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161088485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161089371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161089802 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161090112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161090193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161091669 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161091682 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161091794 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161091815 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161092373 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161092545 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 161092556 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 161092671 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 161092887 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161092896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161092940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161093015 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161093155 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 161093164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161093529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161093901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161093985 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161094052 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161094119 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 161094728 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161096195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161096379 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161097588 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161099241 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161099317 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 161099318 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161099507 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 161099670 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 161099721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161099729 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 161099780 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 161100002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161100146 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 161100341 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 161101204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161101323 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161103601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161103851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161104825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161107386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161107438 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161107451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161107455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161107873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161107908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161107991 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 161108828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161108959 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161109027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161109168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161109409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161109448 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 161109783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161110149 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161110175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161110251 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161110307 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 161110337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161110462 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 161110529 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161110594 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161110644 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 161110678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161110693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161110714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161110740 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161110830 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161111123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161111149 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161111161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161111334 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 161111438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161111513 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161111611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161111651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161111854 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161112181 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161112221 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161112451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161112509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161112768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161112912 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 161113434 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161113647 C T Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 2 161114015 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 161114345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161114467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161114554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161115010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161115107 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161115251 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161115252 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161115358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161115471 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161115566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161115712 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161115922 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161116057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161116150 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161116423 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161116456 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161116595 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161117157 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161117531 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161117570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161118546 T C Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 161119306 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 161119666 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161120333 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161120421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161121211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161121543 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161121545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161121704 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161121711 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161121863 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161121895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161121923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161121981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161122094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161122112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161122701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161123418 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161123676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161123768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161124228 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161124384 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161124565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161124591 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161124689 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161124690 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161124869 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161124962 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161126048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161126095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161126547 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161126725 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161126805 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161126891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161127168 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161127871 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161128084 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161128085 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161128239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161128283 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161128915 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161129201 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161129458 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161129847 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161130619 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161130898 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161130990 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161131487 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161131494 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161131583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161131910 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161132218 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161132378 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161132925 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161133080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161134484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161134828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161134862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161134880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161135163 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 161135192 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161135328 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161136008 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161136251 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161136279 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161136355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161136361 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161136429 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161136585 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161136613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161136619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161136670 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161136874 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161137107 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161138011 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161138762 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161138794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161139045 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161140688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161142153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161142522 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161142680 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161143021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161143040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161143943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161144017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161145267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161145297 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161146186 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161146193 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161146337 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161146509 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161146651 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161146652 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161146663 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161146748 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 161147192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161147388 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161147597 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161147620 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161148014 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161148355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161148406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161148488 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 161148706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161148752 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 161148772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161148812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161148946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161149411 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 161149761 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161149804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161149947 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161150158 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 161150736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161150850 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 161152778 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 161152915 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161154268 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161155092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161155557 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161156738 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161156817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161157941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161157994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161158108 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 161158263 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 161158322 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 161158439 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 161158537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161158681 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161158802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161158843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161158975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161159115 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161159257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161159265 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161159320 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161159340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161159448 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161159470 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161159676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161159699 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161159722 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161159769 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 161159801 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161160096 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161160188 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161160527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161160544 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161160655 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161160756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161160891 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161162082 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 161162187 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161162199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161162216 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161162249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161162270 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161162273 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161162295 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161162402 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161162412 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161162413 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161162433 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161162434 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161162980 A C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 161163361 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161164169 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161164447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161167058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161171436 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 161171647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161171707 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 161171955 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 161172282 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 161172515 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161172724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161172806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161172847 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161172926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161172927 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 161173164 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161173310 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 161173319 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 161173344 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 161173352 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 161173373 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 161173406 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 161173427 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 161173448 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 161174208 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161174373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161174418 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 161175327 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161176830 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 161177259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161177939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161180384 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161180819 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161181427 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 161181508 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161181524 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161183172 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161184617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161185142 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161186446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161188508 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161190904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161202051 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161204485 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161204515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161204571 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161205111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161205783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161205958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161206158 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 161206921 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 161207203 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161207370 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 161209643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161210630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161212642 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161215475 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161215502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161215530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161215623 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161215652 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 161215793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161216344 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 161216710 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 161217225 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161217346 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 161217352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161217416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161218251 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 161218438 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 161218446 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 161218450 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161218478 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 161218507 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 161218573 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161218691 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161218771 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161218809 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 161218964 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 161218996 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161219044 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 161219238 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 161219545 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 161219712 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 2 161219733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161219760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161219771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161220289 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161220340 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 161220521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161220660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161220791 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161221234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161221298 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 161221355 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 161221547 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161221918 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 161222148 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161222256 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 161222360 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161222393 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161222448 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 161222483 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161222499 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161222617 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 161222629 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 161222700 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 161222712 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 161222925 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161222972 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 161223192 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161223335 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161223344 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161223893 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161223971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161223978 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 161224057 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161224326 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161224344 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161224381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161224409 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 161224453 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161224492 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161224515 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 161224583 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161224714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161224748 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161224752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161224941 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 161225380 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161225566 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 161225652 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 161226450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161226595 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161226669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161226719 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161226747 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 161226792 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 161226907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161226909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161226920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161226964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161227032 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161227764 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 161227910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161228057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161228302 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161228361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161228495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161228518 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 161228557 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 161228626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161228630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161228768 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161228785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161233253 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161233634 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 161233651 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 161233804 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 161234393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161236596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161238552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161238783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161239305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161240732 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161242660 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 161242678 C T N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 161243095 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161243435 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 161243552 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161243558 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 161243566 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 161243751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161243759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161243782 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161243790 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161243806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161243848 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 161243889 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161243992 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 161244536 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 161244587 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 161244662 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161244671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161244679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161244790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161245090 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 161245118 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161245391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161245470 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161245479 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 161245483 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161245509 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 161245693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161252516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161256764 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 161256968 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 161256981 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161257011 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 161257077 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 161257095 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161257214 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 161257255 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 161257266 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 161257280 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 161257361 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 161257376 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 161257473 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 161257496 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 161257535 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 161257595 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 161257596 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 161257756 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 161257766 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 161257846 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 161257873 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 161257895 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 161257898 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 161258124 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161258166 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 161258195 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161258348 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161258366 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 161258449 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161258578 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 161258631 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 161258681 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 161258702 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 161258839 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 161258881 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 161258884 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 161258894 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 161259014 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 161259037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161259128 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 161259238 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 161259599 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 161260028 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 161260059 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161260118 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 161260119 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 161260239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161260280 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 161260516 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 161260539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161260571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161260640 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 161260684 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 161260783 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 161260810 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 161260855 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 161260872 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 161260905 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 161260943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161260967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161260996 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 161261003 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 161261073 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 161261245 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 161261262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161261409 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161261605 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 161261658 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161261807 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161261893 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161263202 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 161263257 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 161263261 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 161263340 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 161263341 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 161263407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161263548 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 161263608 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 161264346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161264716 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 161264727 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 161264824 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161264897 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 161265295 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 161265383 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161265507 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 161265678 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 161265692 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 161265739 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161265782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161266108 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 161266122 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 161266216 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 161267699 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 2 161267836 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.416666666666667 0.0833333333333333 0.5 11 13 5 1 6 2 161268080 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.384615384615385 15 11 7 1 5 2 161268390 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.461538461538462 13 13 6 1 6 2 161268397 G C N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.363636363636364 13 9 6 1 4 2 161268527 C A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 161268567 A G N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 9 11 4 1 5 2 161268725 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 161269035 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 161269051 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161269116 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 161269337 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161269338 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161269409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161269781 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161270113 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 161270145 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161270362 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 161270672 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 161272821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161275858 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 161277010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161277697 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161278591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161278700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161278755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161279611 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161279961 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 161280145 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 161282011 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 161282051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161282951 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161285641 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 161287239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161287579 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161287653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161290618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161290664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161293884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161294788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161306906 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161308325 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161309305 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 161312034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161313835 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161314045 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161314643 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161315362 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161315979 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 161316878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161316976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161318284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161319445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161319598 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161319710 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 161320078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161320393 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161320609 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 161320619 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 161320637 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 161320665 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 161320780 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 161320831 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 161320834 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 161320872 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 161320974 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 161321024 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 161321028 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 161321121 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 161321179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161321193 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 161321198 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 161321367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161321823 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 161322391 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161325196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161325219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161325302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161328344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161329429 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161330227 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161335511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161335929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161336343 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 161336440 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161336565 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 161340765 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161344803 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 161344886 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 161344897 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 161345097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161345185 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161348299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161350306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161350917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161351511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161355223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161355424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161355566 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161356649 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161357502 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161358063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161358206 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161358406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161358571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161359798 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161360003 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 161360124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161360335 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161360350 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161360479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161360634 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 161360725 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161360790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161360824 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 161360841 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 161360888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161361284 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 161361615 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161361653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161361722 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 161361783 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 161361801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161362202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161362309 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161363360 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161364290 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 161364423 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 161364497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161364557 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 161364590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161364678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161364715 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161364825 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161364906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161365512 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161365653 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161365668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161365756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161365767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161365875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161365893 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161365906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161365912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161367004 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161367045 G T N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 161367059 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 2 161367193 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161367327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161367786 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161367831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161367921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161368106 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 161368120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161368223 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 161368301 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 161368398 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 161368536 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 161368622 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 161368680 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161368682 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 161368718 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 161368852 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 161368861 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 161368912 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 161369296 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161369507 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161369635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161369639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161369682 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161369691 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161369722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161369860 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 161370052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161370407 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161370481 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161371114 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 161371158 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 161371289 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161371542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161371584 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 161371587 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 161371684 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 161371994 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161372092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161372128 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161373098 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161373163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161373660 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161373799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161373887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161373984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161377102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161377350 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161377356 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161378059 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161380248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161382313 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 161384579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161384805 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161385249 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 161385311 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 161385457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161385467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161385506 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161385529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161385701 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 161386094 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161386211 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 161386401 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161386761 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 161386885 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 161386926 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 161386931 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 161389108 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161389122 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161389136 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161389187 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161389192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161389223 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 161389422 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161389619 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 161389638 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161389642 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161389653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161389802 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161390638 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161390737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161390827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161391214 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 161391464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161391708 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161391925 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 161391969 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161392266 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 161392310 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 161392441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161392613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161392680 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 161392888 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 161392900 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 161392960 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 161392998 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 161393068 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 161393119 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 161393190 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 161393199 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 161393216 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 161393218 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 161393300 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 161393324 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 161393350 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161393371 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 161393414 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 161393481 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 161393558 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161393692 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161394376 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161394458 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161394556 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161394612 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 161394747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161394919 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161394934 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161394940 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161395368 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 161395679 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161395796 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 161395806 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 161395887 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 161395950 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 161396080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161396085 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 161396254 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161396744 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 161396845 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 161396900 C T Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 161397028 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161397046 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 161397070 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161397089 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161397174 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 161397199 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161397249 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 161397353 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161397364 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161397391 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161397455 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 161397687 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161397702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161397732 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161397908 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 161397929 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 161397955 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 161397971 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161398155 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161398315 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161398367 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 161398383 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 161398460 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 161398520 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161398792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161398850 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 161399028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161399184 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 161399228 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161399285 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 161399571 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 161399580 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 161399585 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161399600 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 161399711 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 161399721 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161399782 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 161399859 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 161399910 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161399961 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 161400868 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161401214 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161401891 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161401960 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161402284 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161402289 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161402319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161402386 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161402422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161402698 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 161402918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161402964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161402987 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 161402998 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 161403083 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161403181 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161403220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161403258 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 161403325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161403431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161403432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161403509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161403536 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161403568 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 161403601 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 161403686 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 161403924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161404228 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161404259 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161404274 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161404300 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161404309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161404407 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161404473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161404829 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161404856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161405104 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161405302 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161405616 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161405632 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161406042 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 161406199 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161406331 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161406333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161406377 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161406470 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161406584 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161406591 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161406801 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161406920 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 161407003 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161407079 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 161407139 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161407253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161407348 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161407579 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 161407974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161407978 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 161407994 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 161408089 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 161408184 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 161408253 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 161408254 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 161408376 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 161408795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161408865 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161408880 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161409479 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161409643 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161409784 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161410213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161410261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161410302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161410316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161410346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161410470 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161410549 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161410558 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161410578 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161410696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161410704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161410773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161410789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161410803 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161410815 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161411260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161411274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161411394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161411706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161411707 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161411770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161411784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161411802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161411811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161412259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161412487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161412860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161413113 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161415826 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161415835 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161416616 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161417050 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161417208 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161417224 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161417262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161417522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161418008 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161418578 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161418634 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161418655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161418759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161418784 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161419065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161419071 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161419133 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161419235 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161419330 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161419497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161419998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161420108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161420214 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161420446 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161420526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161420667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161420680 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161420771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161420892 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161421047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161421442 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161421825 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161421833 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161421885 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161422576 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161422905 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161425095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161425184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161425509 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161425540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161425669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161425720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161428486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161428494 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 161428696 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 161428847 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161429139 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161429573 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 161429617 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161429642 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161429652 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161429752 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161429946 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 161430041 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 161430110 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 161430261 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 161430288 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 161430373 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 161430410 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 161430422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161430434 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 161430435 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 161430479 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 161430569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161430650 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 161430735 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 161430889 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 161431077 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 161431084 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 161431255 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 161431267 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161431272 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 161431311 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161431376 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161431416 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161431441 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161431448 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161431471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161431484 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161431530 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161431624 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161431677 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 161431926 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161431952 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161432006 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161432104 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 161432190 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 161432412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161432462 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161432477 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161432513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161432647 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161432855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161432890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161433336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161433339 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161433434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161433990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161435978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161436184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161437526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161439176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161440522 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161440708 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161440710 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161440843 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 161441274 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 161441447 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161441572 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161441658 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161441972 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 161442696 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161443263 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161443453 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161444141 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161444596 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161444648 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161444814 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161444821 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161444841 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 161444855 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161444890 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161444933 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 161445355 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161445992 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161446166 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161446223 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 161446286 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 161446462 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161446634 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 161446663 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161446834 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161446854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161446972 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161447894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161447947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161447981 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161448546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161448685 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161449196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161449309 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161449753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161449910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161450501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161450542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161450648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161451329 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161451534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161452611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161454194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161454424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161454622 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161455024 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161455422 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161455501 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161455794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161455841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161456046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161456085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161456122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161456196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161456579 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161456580 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161456665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161456749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161457245 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161457307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161457337 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161457679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161457795 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161457816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161458080 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161458198 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161458386 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161458440 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161458475 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161458701 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161458884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161459268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161459689 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161460372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161460595 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161460837 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161460952 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161461135 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161461311 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161461754 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161463194 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 161463750 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161463908 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161464078 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161464863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161465073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161465094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161465406 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161465580 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161465631 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161465764 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161465791 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161465845 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161465886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161465994 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161465998 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466044 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 161466136 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161466444 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466474 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466488 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466508 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466533 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466547 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466550 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466574 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466593 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466625 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161466765 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466806 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161466855 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161466896 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 161466911 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 161466914 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 161467312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161467797 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161468051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161468187 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 161468469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161468559 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 161468600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161468940 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 161468941 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 161468996 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 161469061 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161469134 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 161469190 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161469241 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 161469428 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161469450 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161469698 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161469955 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 161469974 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 161470108 G C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 161470153 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 161470362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161470730 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161470757 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161470797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161470811 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161470840 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161470896 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 161471222 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 161471309 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 161471390 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161471469 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 161471535 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161471536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161471622 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161471739 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161471777 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161471785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161471876 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161472008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161472227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161472328 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 161473170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161482246 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 161482351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161482358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161482420 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 161482531 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 161483861 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 161484132 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161484563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161487702 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161488655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161488712 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 161489230 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161490299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161490806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161491834 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 161493165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161495695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161497290 C G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 161501202 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161503327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161507165 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161507189 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 161507799 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 161508539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161512064 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 161513214 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161513256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161513386 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161514812 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161514840 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161515284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161516434 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161516512 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161516782 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161519726 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161519844 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161520301 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161520417 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161520772 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 161520841 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161520881 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161520978 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161521309 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161521333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161521346 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161521378 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161521964 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161522093 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161522172 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161522267 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161522284 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161522426 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 161522636 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 161522649 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161522732 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161523312 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161524029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161524576 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161525130 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161525184 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161525393 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161525579 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161525609 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161525816 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161525817 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161525938 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161525941 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161525988 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161526002 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161526215 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161526227 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161526254 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161526263 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161526423 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161526640 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161526649 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161526707 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161526729 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161527626 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161528319 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161528558 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161528646 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161528849 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161528930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161530062 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161530089 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161530954 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161531398 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161531472 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161532151 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161532168 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161532253 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161532256 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161532378 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161532953 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161532956 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161533081 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161533601 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161533608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161533847 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161533902 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161534019 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161534532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161534618 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 161537214 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161537286 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161537289 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161537355 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161537367 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161537457 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161537539 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161537547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161537795 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161537834 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161537935 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161537994 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161538230 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161538526 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161538527 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161539000 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161539309 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161539651 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161539705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161539719 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161539788 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161539835 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161539886 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161540112 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 161540284 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161540301 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161540303 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161540865 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161540866 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161540968 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161541142 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161541146 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161541180 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161541223 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161541532 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161541548 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161541721 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161541755 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161541976 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161541982 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161542056 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161542058 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161542122 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161542171 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161542269 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161542504 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161544312 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161544523 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161544727 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161545459 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161546069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161546106 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161547653 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161547727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161548292 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161548293 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161548307 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161548898 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161548958 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 161548959 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 2 161549279 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161549491 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161549591 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161549622 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 161549726 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161549788 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161549822 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161549898 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 161550144 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161550211 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161550370 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 161550401 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161550503 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 161550548 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161551028 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161551142 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161551172 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161551177 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 161551230 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161551322 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161551333 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 161551343 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161551531 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161551579 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161551590 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161551635 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161551724 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 161551766 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161551830 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 161551888 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161551990 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161552039 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161552113 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161552214 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161552225 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161552248 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161552299 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161552406 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161552429 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161552564 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161552576 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161552587 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161552608 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161552729 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 161552881 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161553122 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161553150 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161553291 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161553303 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161553485 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 161553740 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 161553751 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 161553768 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161553803 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 161553892 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 161554237 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 161554274 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161554289 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 161554393 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161554463 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161554512 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 161554577 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 161554585 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 161554708 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161554717 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161554724 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161554888 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161555117 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161555171 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161555914 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161555916 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161556285 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161556307 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161556347 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161556365 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161556415 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161556429 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161557030 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161557140 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161557285 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161557361 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 161557383 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161557678 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161557707 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161557779 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161557865 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 161557993 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161558061 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161558183 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161558265 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161558555 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161558560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161558574 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161558791 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 161558805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161559050 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161559051 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161559142 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161559382 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161559398 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161559692 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161559787 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161559927 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161559934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161560040 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161560198 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161560620 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161560726 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161560823 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 161560966 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161561006 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161561152 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161561231 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 161561270 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 161561516 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161561774 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161561923 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161561974 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161562810 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161562952 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161563341 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161563559 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161563588 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 161563616 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161563621 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 161564261 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161564287 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161564508 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161565270 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161565460 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161565758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161565802 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161565902 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161566846 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161566883 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161567323 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161569407 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161570660 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 161570673 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161570772 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161570917 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 161570943 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 161571049 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161571130 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 161571169 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161571241 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161571269 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 161571275 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 161571405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161571433 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161571447 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161571476 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161571556 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161571569 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161571956 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161572065 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161572125 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161572184 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161572477 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161572662 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161572850 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161572994 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 161573048 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 161573812 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 161574080 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161574190 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161574763 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161574854 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161574855 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161574898 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161581997 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 161582501 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 161582862 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161582951 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 161583101 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161583323 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161583547 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161583917 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161584373 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 161584663 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 161585108 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161585188 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161585586 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161586114 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161586360 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161586402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161586455 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161586688 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 161587062 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 161587347 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161587425 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161587683 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 161587695 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 161587921 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161588051 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 161588560 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 161588792 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 161588852 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161588978 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161589046 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161589326 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161589423 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161589520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161589572 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161589767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161590143 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161590518 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161590889 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161591289 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161591916 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161592589 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161592591 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161592929 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161592938 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161593123 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161593445 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161593675 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161594321 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161594554 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161595606 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161596020 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161596055 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161596144 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161596215 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161596244 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161596297 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161596361 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161596386 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161596637 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161597691 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 161598952 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161599047 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161599141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161599243 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161599285 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161599301 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161599420 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161599570 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161599583 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161599608 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161599644 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161599681 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 161599724 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161599769 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161599783 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161599820 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161600222 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161600226 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161600235 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161600322 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161600330 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161600435 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161600454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161600537 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161600606 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161600607 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161600641 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161600755 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161600797 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161600801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161600812 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161600833 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161600869 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161600872 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161600951 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161600964 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161600978 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161600980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161601094 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161601144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161601248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161601293 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161601295 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161601403 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161601824 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161602022 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161602228 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161602549 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161602587 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161602686 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161602887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161602940 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161602972 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161603043 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 161603079 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161603522 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161603528 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161603844 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161603979 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161604064 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161604241 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161604298 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161604356 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161604481 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161604516 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161604720 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161604932 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161604939 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161605077 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161605112 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161605228 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161605276 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161605375 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161605378 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161605532 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161605588 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161605632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161605666 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161605979 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161606109 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161606541 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161606585 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161606586 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161606849 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161606857 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161607045 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 161607089 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161607231 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161607277 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161607748 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161607962 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161608041 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161608066 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161608097 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161609409 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161609461 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 161609711 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 161611079 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161611441 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161611800 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161611801 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161613057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161613090 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161613159 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161613233 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161613488 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161613540 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161616290 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 161617263 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161617825 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161618281 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161620359 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161621074 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161621865 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161622035 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161622106 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161622265 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161622319 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161622342 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161622667 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161622702 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161622708 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161622791 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161622823 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161622868 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161622899 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161622924 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161622934 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161622937 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161622945 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161623124 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161623135 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161623176 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161623182 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161623231 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 161623236 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 161623516 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 161623577 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 161623616 G T N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 161623712 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 161623908 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161623944 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624095 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161624157 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624172 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624199 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624213 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624244 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161624245 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161624292 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161624304 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624325 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624342 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161624421 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624464 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624479 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624481 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624541 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161624542 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161624582 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161624616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161624640 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161625154 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 161625246 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 161625489 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161625706 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161625733 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161626163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161627428 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161628554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161628976 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161631865 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161632044 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161632510 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161632577 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161632967 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161633229 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 161633235 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 161633267 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161633313 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 161634150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161634176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161634559 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161634580 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161634705 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161634732 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161634767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161634798 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161634866 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161634925 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161635240 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161635521 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161635939 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161636059 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161636162 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161636416 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161636472 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161636536 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161636635 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161636677 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161636701 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161637273 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161637305 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161637570 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161639870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161640230 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161640381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161640579 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161640703 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161640943 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161641223 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161641711 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 161641795 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161642461 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161643140 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161643374 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161643375 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161643512 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161643662 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161643965 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161643975 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161644502 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161644567 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 161644603 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161644633 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161644640 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161644648 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161644664 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 161644729 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 161644732 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 161644778 T A Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 161644811 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161644834 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161644919 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161645100 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161645484 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 161645488 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 161645702 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 161645714 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161645908 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161646419 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161646567 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161646759 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161646815 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161646852 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161646880 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161646935 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 161646938 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161646950 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161646957 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161646976 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161647024 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161647042 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161647070 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161647095 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 161647225 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161647389 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161647485 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161647590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161647595 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161647604 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161647627 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161647666 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161647735 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161647765 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161647840 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161647865 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161647868 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161647876 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161647886 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161647891 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161647902 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161648039 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161648058 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161648109 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 161648217 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161648237 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 161648310 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161648409 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161648500 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 161648521 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161648533 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161648551 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161649365 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161649412 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161649738 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161649774 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161650018 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 161650184 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161650324 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161650727 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161650787 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161650842 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161651154 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161651268 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161651306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161651344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161651346 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161651393 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161651399 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161651419 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161651483 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161651528 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161651983 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161652315 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161652334 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161652830 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161653820 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161654156 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161654835 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161654903 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161655481 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161656029 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161656344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161656766 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161657660 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161657760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161658033 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 161658371 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161658386 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161658480 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161658485 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161658541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161658572 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161658798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161658801 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161658959 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161659018 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161659033 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161659090 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161659146 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161659221 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161659398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161659416 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161660477 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161660563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161660574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161660604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161660864 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161661118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161661138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161661149 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161661317 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161661548 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161661584 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161661905 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161661977 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161662406 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161663559 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161663649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161663735 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161663873 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161663960 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161664118 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161664196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161664221 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161664255 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161665335 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161665429 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161665452 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161665454 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161665542 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161665746 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161665806 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161665922 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161665942 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161666264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161666300 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161666923 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161667078 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161667103 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 161667657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161667754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161668290 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 161669123 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161669296 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161669429 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161669460 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161669540 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161669749 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 161670216 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161670274 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161670362 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161670404 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161670425 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161670605 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161670704 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161670812 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161670842 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161670862 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161670941 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 161670949 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161671065 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161671203 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161671216 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161671321 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161671499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161671734 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161672168 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161672299 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161672494 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161672594 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161672683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161672690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161672731 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161672749 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161672811 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161672815 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161673104 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161673495 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161674221 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 161674234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161674403 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161674436 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 161674499 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161680476 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 161680501 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161680659 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161681213 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161681297 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161682887 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 161682893 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161683142 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161683158 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161683189 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161683280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161683298 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161683370 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161683489 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161683497 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161683531 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161683550 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 161683613 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161683754 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161683786 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161683939 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161684146 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 161685258 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161685342 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161686706 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161687387 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161688569 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161688573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161689242 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 161689251 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161689264 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161689575 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161689725 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161689791 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161689939 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161690021 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161690028 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161690145 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161690151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161690891 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161690906 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161690917 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 161690937 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161691272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161691338 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161691780 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161691888 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 161692106 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161692137 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161692141 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161692229 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161692308 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161692403 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161692415 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161692533 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161692576 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161692746 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161692802 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161692859 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 161692972 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161693082 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161693627 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161693833 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161693893 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161694289 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161694398 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161694424 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161694634 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161694640 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 161694695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161694708 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161694853 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161694870 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161694938 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161695067 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 161695140 T A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 161695144 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 161695183 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 161695263 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 161695288 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 161695466 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161695639 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161695739 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161695974 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 161696097 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161696098 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161696116 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161696289 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 161696773 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161696875 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161697128 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161697277 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161697284 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161697298 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161697301 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161697331 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161697352 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161697533 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161697550 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161697706 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161697725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161698160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161698419 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161698580 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161698630 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161698827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161699181 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161699245 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161699561 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161700706 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161700781 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 161701547 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161701917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161701949 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161702054 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161702202 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161702279 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161702285 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161702355 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161702361 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161702412 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161702437 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161702476 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161702527 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161702847 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161702859 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161703230 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161703236 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161703708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161703989 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161704051 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161704657 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161704699 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161704872 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161705021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161705079 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 161705498 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161705996 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161706123 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161706222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161706369 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161706866 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161706890 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161707142 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161707738 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 161707765 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161707933 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161708243 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161708453 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161708878 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161709346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161709676 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161709995 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161710008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161710098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161710218 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161710416 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161710420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161710675 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161710838 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161710856 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161710903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161710956 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161711037 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 161711105 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161711136 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161711268 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161711305 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 161712196 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 161712488 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161712494 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161712539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161712698 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 161713061 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161713207 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161713521 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161713587 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161713625 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161713824 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 2 161713901 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161714913 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161715340 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 161715457 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 161715536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161715721 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161716003 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 161716094 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 161716124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161716141 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161716207 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161716221 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161716263 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161716743 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 161718224 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161718326 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 161718411 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 161718423 T G N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 161719056 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161719412 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161719459 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161719828 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161719926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161721090 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 161721314 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 161721470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161721707 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 161721960 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161722645 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 161722673 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 161722710 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161722742 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 161723607 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 161723626 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161723633 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 161723667 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 161723740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161723793 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161723831 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 161723978 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161724079 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 161724187 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 161724306 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161724349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161724355 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161724737 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161724749 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161724777 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161724811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161724847 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161724859 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725026 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725290 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725305 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725510 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725564 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725578 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725620 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725658 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725690 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725719 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725728 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725771 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725875 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161725967 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161725990 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161726000 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161726034 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161726068 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161726086 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161726136 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161726192 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161726217 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161726235 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161726370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161726441 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161726569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161726661 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 161726688 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161726860 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161726892 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161726946 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161726982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161726985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161727016 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161727048 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161727093 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161727323 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161727335 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161727350 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161727449 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161727462 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161727473 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161727692 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161727754 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161727867 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161727929 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161727950 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161727990 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161728104 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161728123 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161728125 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161728134 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161728212 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161728281 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161728357 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161728469 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161728488 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161728496 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161728544 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 161728547 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 161728793 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 161728812 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 2 161728823 G T N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 2 161729576 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 161730055 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 161730476 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 161731057 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 161731219 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161731466 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161731847 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161731917 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161731978 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161731994 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161732106 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161732132 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161732326 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161732337 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161732491 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161732712 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161733234 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161733342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161733395 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161733408 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161733567 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 161733590 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 161733760 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 161733821 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161733972 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 161734060 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161734181 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161734714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161734730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161734788 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161734852 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 2 161734877 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 161734941 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 161736137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161737224 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161737522 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161737570 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161737649 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161737841 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161738172 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 161738577 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161738855 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161738909 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 161738920 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161738966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161739171 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 161739196 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161739239 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161739303 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161739331 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161739343 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161739447 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 161739548 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161739584 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161739699 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 161739791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161740050 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 161740429 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161740441 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 161740464 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161740569 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161740587 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161740595 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161740600 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 161740714 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 161740885 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161741297 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161741312 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161741328 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161741595 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161741636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161741676 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161741949 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161741991 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161742005 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161742024 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161742105 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161742171 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161742196 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161742317 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161742429 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161742572 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161742579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161742636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161742646 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161742989 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 161744744 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161746292 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161747054 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161747132 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 161747166 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 161747227 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 161747328 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 161747452 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 161747494 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161747662 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 2 161747805 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 161747909 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161748050 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 161748085 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161748546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161748547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161748603 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161748662 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161748687 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161748766 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 161748786 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161748854 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161748878 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161748899 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161748900 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161748978 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161749010 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 161749048 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161749138 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161749220 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161749309 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161749394 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161749396 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161749520 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161749624 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161749643 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 161749733 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161749756 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161750238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161751682 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161751854 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 161751970 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161752044 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161752050 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161752064 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161752171 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 161752628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161752670 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161752713 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161753156 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161753228 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161753231 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 161753453 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161753709 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161754143 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161754647 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 161754731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161755080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161755086 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 161755226 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 161755460 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 161755502 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161755526 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161755546 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161755642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161755648 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 161755717 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 161755729 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 161755776 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 161755851 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 161755873 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 161755940 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 161755999 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 161756001 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 161756086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161756170 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 161756331 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161756332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161756443 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 161756489 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 161756512 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 161756637 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161756638 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161757206 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161757419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161757866 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161758331 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161758333 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161758895 G A N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 2 161759483 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161761516 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161761819 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161761880 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161761960 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161762131 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161762156 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 161762294 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161762300 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161762495 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161762805 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161762938 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161763181 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161763261 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161763327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161763346 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161763461 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161763940 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161764145 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161764594 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 161764682 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161764703 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 161764715 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161764729 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161764743 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 161764835 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161764862 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161764923 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 161764924 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 161765067 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 161765190 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 161765241 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 161765270 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 161765657 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161765734 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161765794 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 161765829 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 161765859 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 161765930 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161765968 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161765998 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 161766015 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161766155 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 161766158 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161766242 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161766247 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 161766261 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161766370 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 161766371 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 161766445 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 161766845 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161766869 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161767164 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161767737 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161767739 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 161767935 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 161768443 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161769087 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161769475 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161769502 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161769757 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161769777 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 161769886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161770042 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161770949 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161771293 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161771364 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161771434 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161772952 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161772991 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161774166 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161774226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161774387 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161774447 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161774490 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161775428 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161775566 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161775984 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161776359 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161776506 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161776703 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161776739 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 161776755 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161777588 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161777693 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161777727 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161777958 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161778584 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161778620 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 161778749 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 161778779 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161778867 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161778883 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161779004 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 161779175 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161779452 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 2 161779503 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 161779725 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161779769 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161780321 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161780402 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161780500 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161780845 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 161780915 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 161781070 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161781091 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161781950 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161782039 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161782112 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 161782136 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 2 161782567 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161782589 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161782592 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161782609 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161782637 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161782662 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161782696 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161782829 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161782895 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 161782898 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161782906 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 2 161783107 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161783198 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161783205 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161783294 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161783339 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161783355 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161783360 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161783417 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161783649 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161784020 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161784201 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 161784351 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161785038 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161785917 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161786194 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161788317 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161788395 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161788508 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161788557 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161788576 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161788802 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 161788826 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 161788938 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 161788977 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161789033 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161789161 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161789594 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161790342 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161791606 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161791877 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161791971 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161792245 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 161792279 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 161793462 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161793574 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161793725 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161793748 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161793772 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161793974 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161794006 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161794042 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161794328 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161794448 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 161794633 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161794691 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161794755 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161794787 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161794915 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161794940 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 161795052 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161795058 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161795168 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 161795229 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161795280 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161795323 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161795342 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161795404 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161795488 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161795549 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 161795558 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161795669 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161795684 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 161795858 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161795920 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161796095 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161796351 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161796477 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 161796531 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 161796554 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 161796584 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 161796612 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 161796771 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161796882 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161796987 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 161797231 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 161797426 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 161797429 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 161797525 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 161797605 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 161797649 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 161797675 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161797720 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 161797727 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161797757 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 161797797 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161797798 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 161797826 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161797868 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 161797911 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 161797944 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161797950 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 161797985 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 161797998 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 161798033 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 161798047 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 161798053 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 161798116 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161798131 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 161798160 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161798293 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 161798343 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 161798674 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 161798694 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 161798709 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 161798778 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161798830 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 161798965 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161798994 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 161799075 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161799170 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 161799186 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161799223 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161799245 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161799289 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161799313 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 161799415 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161799944 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 161800582 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 161800831 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 161800886 A C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 161801499 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161801640 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161801698 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 161801978 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161802134 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161802589 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161802628 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161803173 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.214285714285714 22 6 11 0 3 2 161803185 C G N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.214285714285714 22 6 11 0 3 2 161803555 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161803587 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161803920 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161804300 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161805098 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161805724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161806293 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161807229 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 161807773 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161808635 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161809840 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 161810112 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161810194 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161810234 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161810239 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161810265 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161810285 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 161817226 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 161817795 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 2 161817817 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161817891 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 161818367 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161818675 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 161820037 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161821585 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161821814 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161821896 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161821926 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 161822061 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 2 161822111 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 161822722 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161822759 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161823141 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161823232 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161823319 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 161823794 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 161823803 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 161824132 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161824228 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161824252 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161824687 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161824859 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 161824872 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 161824935 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 161825069 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161825309 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161825365 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161825391 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161825528 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161825618 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161825629 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161825859 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 161826057 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161826177 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 161826318 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161826356 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 161826372 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 161827222 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161827226 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161827249 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161827549 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161827654 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161827778 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 161827812 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161828290 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 161829856 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161829935 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 161830079 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161830583 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161831077 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161831450 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161831493 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161831500 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161831519 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 161831597 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161831853 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161831983 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 161832039 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 161832185 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 161833537 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161833539 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161833562 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161833577 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161834074 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 161834106 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 161834892 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161835157 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 161835178 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161835258 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161835749 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161836054 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 161836152 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161836212 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 161837134 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 161837879 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 161839497 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161841262 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161841291 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161842723 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 161842734 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161842753 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161842837 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 161842846 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161842852 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161842939 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 161843152 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161843461 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161843487 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161843625 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161843982 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161844327 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161846402 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 161847661 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 161848778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161849802 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161850143 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161850200 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161850402 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161850445 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161850479 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 161850565 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 161850569 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161850601 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161850881 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161851919 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161852342 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 161852387 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 161852427 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 161852560 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 161853089 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 161853462 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 161853632 G A N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 2 161854285 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161854394 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 161854424 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161854557 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161854632 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 161854695 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161854725 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161855343 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 161855436 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161855533 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161856128 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 161856233 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161856588 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 161857162 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161857564 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161857778 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161858255 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161858301 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161858402 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161858696 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161858761 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161858966 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 161859206 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161860005 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161860274 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161860784 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 161860809 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161860897 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161861226 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161861913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161862275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161862308 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161862668 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161862894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161863153 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161863156 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161863340 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 161863388 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161863801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161864095 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 161864613 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 161864728 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 161864740 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 161864809 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161864843 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 161864959 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 161865044 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 161865048 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 161865111 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 161865210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161865293 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161865329 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161865535 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 161866755 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 161866762 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 161867316 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161867323 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 161868112 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 161868734 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161868842 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 161868931 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 161869109 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 161869465 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161869869 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161871395 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161872145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161872554 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161873229 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 161873250 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 161873357 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 161873476 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 161874518 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 161874776 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161874860 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161874963 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161874980 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161874997 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161875856 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161876070 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 161876195 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161876246 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 161876358 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161876382 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161876411 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 161876441 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 161876685 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 161876884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161878754 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161878878 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161878974 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 161879401 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161879509 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 2 161879979 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161880008 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 161880319 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161880465 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161880593 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 161880736 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161880963 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 161882057 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161882169 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161882185 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161882388 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 161882408 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 161882660 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 161882858 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 161883093 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 161883201 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 161883206 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 161883229 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161883319 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 161883463 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 161883491 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 161883579 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161883590 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 161883653 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 161883733 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 161884077 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 161884173 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161884292 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 161884357 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 161884420 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 161884436 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 161884482 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 161884655 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 2 161884863 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 161885141 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161885279 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161885877 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 161885887 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 161885888 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 161885924 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 161886051 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 161886087 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161886586 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 161886630 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161887119 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161887124 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161887269 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161887911 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161888291 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 161888783 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161888786 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161888943 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161888960 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161888992 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161889023 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 2 161889038 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 161889139 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161889152 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161889512 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161889515 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161889538 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161889559 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161889960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161890713 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 161890816 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 2 161890847 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 161891380 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161891445 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161891811 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161892069 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 161892438 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 161892644 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 2 161893034 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 161893312 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 161893705 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 161893777 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 161893943 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 161894178 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 161894248 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 161894251 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161894269 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 161894333 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161894416 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161894466 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 161894467 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 161894479 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 161894502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161894515 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 161894552 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 161894948 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 161895275 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 161895432 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 161895437 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 161895522 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 161895648 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161895879 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 161895930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161896036 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 161896217 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 161896423 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 161896460 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 161896587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161897132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161897375 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 161897493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161897543 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 161897770 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 161897947 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 161898266 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 161898361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161898363 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 161898418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161898486 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 161898496 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161898756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161899219 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161899306 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161899338 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161899375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161899439 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 161899486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161899503 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 161899526 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 161899614 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161899661 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161899835 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 161900407 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161900500 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161900670 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 161900939 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161901244 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161901249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161901276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161901671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161901842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161902149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161902278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161902425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161902487 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 161902527 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 161902700 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161902753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161902804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161902978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161902983 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161903020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161903092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161903133 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161903292 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 161903312 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 161903367 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161903804 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161903999 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161904136 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 161904205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161904246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161904586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161904776 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161904846 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161904924 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161905070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161905177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161905214 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161905237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161905247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161905281 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161905314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161905344 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161905370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161905837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161906027 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161906047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161906199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161906585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161907406 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161908066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161908626 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 161909413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161909699 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161909773 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161909819 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161909825 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161909838 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161909916 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161910121 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161910481 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161910503 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 161910740 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161910909 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161911240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161911655 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161912272 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161912452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161912773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161912837 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161913221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161913866 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 161913960 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 161914035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161914166 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161914256 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161914327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161914331 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 161914442 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161914501 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 161914582 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161914751 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161914768 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161914848 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161914881 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 161915136 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 2 161915289 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161915351 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 161915426 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161915471 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161915545 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161915600 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161915979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161916069 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161916139 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161916225 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 161916341 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161916755 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161917035 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161917049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161917087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161917226 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161917334 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 161917354 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 161917424 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 161917429 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 161917435 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 161917480 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 161917568 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 161917595 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 161917600 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 161917768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161918073 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 161919259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161919297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161919348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161919469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161920096 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 161920326 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161920503 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161920504 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161920760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161921731 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 161921752 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 161922621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161922956 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161923032 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161923244 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161923247 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161923560 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 161923576 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 161923778 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 161924079 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 161924594 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 161924729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161924818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161924841 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161924855 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161924877 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 161924936 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 161925306 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161925889 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 161925896 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 161926149 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161926217 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161927038 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161927352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161927606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161927679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161928065 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161928102 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 161928199 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161928200 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161928284 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161928290 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161928325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161928398 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 161928472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161928516 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 161928586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161928659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161929058 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161929136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161929144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161929233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161929555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161929947 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 161930094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161930111 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161930126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161930139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161930263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161930986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161931038 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161931052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161931585 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 161931614 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161931729 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 161931922 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161932041 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161932051 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161932065 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161932093 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 161932141 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161932193 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161932280 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161932281 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161932358 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161932369 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 161932410 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 161932472 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161932896 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 161932899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161933046 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161933116 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 161936448 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 161936655 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 161936858 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 161937207 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 161937277 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 161937345 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161937477 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 161937600 C A N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 2 161937741 C G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 161937789 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 161938024 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161938094 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 161938193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161938266 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 161938267 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 161938317 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161938335 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161938393 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 161938414 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161938440 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161938455 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 161938533 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161938545 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161938605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161938662 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161939377 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 161939512 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 161939528 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161939919 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 161940045 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 161940432 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 161940488 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 161941592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161942113 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 161942465 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161942559 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161942561 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161942576 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161942685 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 161942691 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 161942859 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161943018 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161943098 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 161943357 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 161943828 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161943874 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 161944072 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161944806 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 161945102 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161945311 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161945316 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161945354 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161945399 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161945535 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 161945676 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 161945696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161945716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161945822 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 161946110 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 161946361 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 161946372 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 161946380 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 161947162 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161947203 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161947300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161947455 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161947480 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161947524 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161947547 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161947827 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161947994 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 161948715 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161948746 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161949242 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161950131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161950227 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 161951589 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 161951661 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 161952541 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161952663 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161953075 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 161953674 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 161953728 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 161953784 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161953859 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 161954746 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161954755 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161954786 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161955114 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 161955242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161955551 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161955576 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161955612 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161955637 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 161955691 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 161955846 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 161956003 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 161956032 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 161956057 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161956067 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161956189 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 161956229 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161956243 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161956250 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 161956336 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 161956408 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161956484 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161956511 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161956527 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161956933 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 161957685 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 161957916 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161957947 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 161958092 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 161958563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161959032 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161959070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161959142 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 161959165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161959490 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161959504 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161959512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161959527 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161959528 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 161959793 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 161959822 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 161959915 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161960108 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 161960115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161960328 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 161960373 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 161960509 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 161960628 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 161961137 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 161961344 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 161961345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161961445 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 161961764 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161961799 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 161961970 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 161962017 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 161962183 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 161962361 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161962462 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161962916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161962986 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161962996 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161963536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161963975 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161964111 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161964149 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161964185 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161965022 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161965094 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161965189 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161965308 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161965501 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 161965538 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161965601 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 161965729 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161965752 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161966025 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161966088 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 161966201 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161966427 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161966443 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161966445 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161966545 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161966613 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161966787 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161967080 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161967281 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 161967321 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 161967335 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161967452 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161967482 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161967539 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161967567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161967598 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 161967653 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161968097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161968637 A C Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 161969372 A T Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 2 161969413 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161969427 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161969809 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161970368 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161970411 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161970482 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161970645 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161970647 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161970771 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161970808 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161970942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161971024 C G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 161971088 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161971271 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 161971366 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161971554 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161971570 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161971669 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 161978653 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 161978730 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161978761 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161978785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161978802 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161978973 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161979033 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161979074 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 2 161979560 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161979634 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161979765 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161979770 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161979782 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161979809 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161979861 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161979940 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 161979941 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 161980089 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161980135 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 161980180 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161980223 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 161980301 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 161980551 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161980600 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161980916 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161981234 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161981349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161981366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161981371 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161981758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161981838 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161981968 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161981998 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161982042 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161982140 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161982384 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161982468 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161982511 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161982585 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161982599 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161982673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161982783 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161982874 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161983173 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161983179 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 161983200 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161983206 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161983373 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 161983593 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161983612 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161983641 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161983660 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 161983661 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 161983697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161983903 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161983905 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161983914 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161983990 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161984058 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161984188 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161984253 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161984279 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161984394 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 161984415 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161984454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161984537 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161984553 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161984623 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161984627 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161984743 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161984770 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161984771 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161984922 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161984923 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161984939 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161984975 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161985019 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161985026 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161985073 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 161985087 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161985194 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161985236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161985304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161985398 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161985421 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161985642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 161985690 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161985729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161985747 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161985789 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161985847 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161985982 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161985988 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161986095 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161986165 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161986208 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 161992478 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161992540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161992558 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161992593 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161992645 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161992675 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161992810 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161992816 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161992862 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161992896 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161992994 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161993054 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161993263 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161993574 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161993617 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161993825 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161993842 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161994133 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161994211 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161994283 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161994294 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161994335 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161994376 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161994644 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161994707 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161994724 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161994730 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161994829 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 161994844 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161994928 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161994969 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 161995070 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 161995275 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161995327 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161995348 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 161995516 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 161995528 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 161995627 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 161995841 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 161996003 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161996044 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161996052 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161996452 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 161996495 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 161996571 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 161996589 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 161996692 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161996784 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161996856 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161997346 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 161997494 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161998002 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 161998162 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 161998279 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161998392 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161998464 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161998872 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 161999371 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 161999482 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162000232 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162000419 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 162000430 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 162000473 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 162000475 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 162000517 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 162001169 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 162001460 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 162001526 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 162001824 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 2 162001932 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 162001943 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 162002008 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162002076 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162002107 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162002174 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162002176 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162002201 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 162002202 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 162002212 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162002232 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162002361 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162002471 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162002561 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 162002685 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 162002724 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 162002999 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 162003107 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 162003120 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 162003213 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 162003273 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 162003381 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 162003420 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 162003447 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 162003620 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 162003799 C G N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 162004030 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 162004372 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162004373 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162004756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162004826 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 162004901 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162004928 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 162004942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162005031 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162005865 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162005982 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162006116 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162006149 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162006184 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162006243 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 162006400 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 162006600 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 162006602 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162006706 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 162006709 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 162006920 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162008419 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162008447 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162008603 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162008860 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162008923 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162009150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162009285 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162009287 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162009311 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162009325 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162009364 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162009398 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162009589 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162009603 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162009637 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162009677 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162009707 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162009739 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162010003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162010257 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162010424 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162010664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162010764 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162010961 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162011048 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 162011245 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 162011410 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 162011425 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 162011471 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 162011493 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 162011832 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162011863 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162012110 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162012274 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162012418 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162012613 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162012617 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162012649 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162012865 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162012880 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162012908 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162013141 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162013152 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162013219 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162013248 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162013264 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162013788 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 162013970 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162014248 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 162014299 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162014392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162014682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162014744 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162014892 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162014913 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162015447 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162015487 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162015523 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162015542 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 162015580 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162015610 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162015922 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162015980 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162016005 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162016212 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162016248 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162016778 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162016947 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162017017 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 162017359 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 162017379 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162017463 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162018328 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162018499 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162018665 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 162019254 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162019575 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 162019596 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 162019732 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 162020040 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 162020452 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 162020477 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 162020565 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 2 162020994 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 162021024 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162021123 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 162021578 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 162021611 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 162021802 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162022169 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162024023 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162024381 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 162025498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162026647 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162026739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162026773 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162027185 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162027416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162027798 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162028434 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162029076 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 162029552 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162030015 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162030619 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162031268 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162031481 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 162031719 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162031836 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162031846 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162031860 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162032014 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162032125 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162032159 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162032266 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162032281 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162032674 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162032682 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162032756 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162032758 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162032930 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 162033002 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162033077 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162033080 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162033260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162033429 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162033531 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162033546 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162033575 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162033595 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162034092 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 162034518 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162034649 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162034764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162034840 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162036259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162037186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162037458 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 162037632 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 162037681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162038064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162038080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162038106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162038224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162038311 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 162038805 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 162039101 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 162039195 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162039451 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162039506 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162039538 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 162039607 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 162039659 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 162039715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162039750 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 162040041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162040057 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 162040150 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 162040170 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162040477 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 162040534 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 2 162040694 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 162040870 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162040899 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 162040962 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 162040977 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 162041002 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162041006 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 162041287 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 162041307 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162041379 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 162041393 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 162041458 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 162041473 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 162041517 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 162041774 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 2 162041957 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 162042110 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 162042119 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 162042177 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 162042206 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 162042227 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 162042443 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 162042482 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 162042526 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 162042541 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 162042715 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162042796 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 162042829 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162043449 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162043704 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 162044396 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162044414 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 162044574 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162044601 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 162044931 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162044941 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162045281 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162045414 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 162046178 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162046267 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162046518 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 162046760 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162047003 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162047092 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162047112 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162047131 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162047154 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162047768 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162048190 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 162049577 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162049748 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 162049839 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 162050361 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162050370 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162050402 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 162050416 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 162050584 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162050711 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162050743 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 162050770 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162050816 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162050850 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162050857 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162050977 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 162050980 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 162051004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162051395 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162051667 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162051683 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162051780 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162051845 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 162052124 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 162052197 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 162052292 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 162052367 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 162052526 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162052618 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162052676 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 162052782 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162052798 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162052932 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162053012 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162053218 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162053229 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162053235 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162053270 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162053371 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162053552 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162053682 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 162053690 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 162054101 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 162054130 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162054308 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 162054312 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 162054471 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162054579 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162054661 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 162054662 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 162055114 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162055213 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162055320 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 162055572 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162055854 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162055862 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162056064 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162056269 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162056452 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162056572 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 162056645 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162056667 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162056731 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162056807 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162056863 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162056957 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162056958 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162057001 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162057139 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162057286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162057291 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 162057903 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162057977 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 162057982 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 162058197 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 162058217 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 162058371 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 162058811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162058952 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 162058953 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 162059850 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162059852 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162059994 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162060842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162061656 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 162061697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162061797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162061892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162061917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162061989 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162062051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162062087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162062272 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 162062279 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162062458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162062473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162062511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162062536 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162062592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162062598 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 162062625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162062680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162062772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162062794 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162062845 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162062909 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162062992 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162063042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162063253 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162063293 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 162063430 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162063445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162063474 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 162063498 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 162063864 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 162064018 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162064054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162064057 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162064298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162064651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162064695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162064815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162065621 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 162065650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162065706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162065754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162065856 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 162066216 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162066711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162066932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162067190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162067529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162068645 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162070097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162070126 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162070189 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 162070873 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162070888 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162070966 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162070975 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162071322 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162071442 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162071560 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162071586 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162071668 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 162072389 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162072540 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 162072873 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162072881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162072909 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 162073372 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 162073413 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162073517 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162073737 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 162073787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162073904 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 162073936 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 162074249 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 162074445 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162075029 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162075270 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162075349 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162075357 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 162075778 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162075810 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162076268 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162077814 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162077883 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162078265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162080038 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 162080379 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162080538 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 162080540 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 162080797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162080798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162081107 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 162081248 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162081289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162081522 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162081565 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162081773 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 162082009 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162082014 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162082056 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162082070 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162082099 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162082102 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162083402 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 162084040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162084260 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162085252 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 162085921 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162085996 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162086710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162086783 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162089013 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 162089258 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162089281 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162089314 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162089515 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162089528 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 162089812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162090276 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 162090441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162090462 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 162090677 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 162092244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162092522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162092640 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162092757 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162092771 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 162092772 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 162092869 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 162093033 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 162093124 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 162093949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162094249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162094280 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 162094364 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162094388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162094545 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162094574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162094650 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 162094660 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 162094719 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 162094865 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162094869 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162094945 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162094964 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162094993 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 162095067 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 162095099 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162095146 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 162095197 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162095219 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162095237 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 162095238 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 162095496 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 162095896 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162096519 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 162098070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162098715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162099090 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 162101576 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 162101706 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 162102020 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 162102048 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 162102205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162102426 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 162102752 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 162105506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162107200 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162108606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162110598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162113460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162113466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162113577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162113846 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162114582 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162115234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162116507 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 162116661 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162117695 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 162117837 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162118381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162120128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162120473 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162122303 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162122657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162123636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162123897 C A Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 162124277 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162124794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162127705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162129171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162129921 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162130032 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162130764 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 162130848 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 162130862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162130904 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 162130953 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 162131097 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 162131158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162131183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162131412 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162131942 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 162132690 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162132883 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162132913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162133059 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 162133127 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 162133407 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 162133409 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 162133662 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 162136586 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162138073 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162138418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162143273 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 162143408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162143580 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 162144133 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162144289 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 162144413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162144462 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 162144514 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 162144552 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 162144599 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 162144759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162144944 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 162145963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162146031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162146174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162146367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162146375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162146382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162146693 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 162146838 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162146844 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 162146913 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 162146934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162147340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162147493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162147717 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 162147750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162148144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162150038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162150271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162150429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162150458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162150944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162151144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162151181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162152316 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162152373 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162154289 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 162154395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162154602 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162154859 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162155879 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162156316 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 162156404 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 162156859 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 162157156 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162157203 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 162157218 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 162157315 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 162157608 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 162159605 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162159802 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162160871 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162161118 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162161431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162161942 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162161976 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162162072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162162078 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162163135 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162163275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162163981 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162164170 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162164484 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162164568 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 162164666 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 162164977 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162165164 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162165336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162165365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162165435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162165491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162165495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162165544 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 162165945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162165950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162166042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162166828 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162166961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162167267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162167758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162170607 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162170798 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162173040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162174833 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162174901 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162174937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162175061 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162175086 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162175094 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162175501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162176247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162176355 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162176650 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162177306 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 162177666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162177700 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162178111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162178887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162179137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162179289 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162179310 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162179513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162179535 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162179947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162180938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162180941 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162180949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162183032 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162183949 T A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 162190353 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162191855 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162193366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162193438 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162193700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162194215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162197124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162197245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162197794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162197873 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162197876 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162198351 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162203118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162203679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162204514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162205017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162206756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162207349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162207362 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162207421 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162207444 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162207480 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162207561 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 162208006 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 162208096 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 162208145 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162208281 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162209431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162209776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162210096 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162210740 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 162211608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162212784 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162213069 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 162214300 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162214627 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 162215112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162215577 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162216837 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 162217166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162217244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162217753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162217988 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162217992 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162218043 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162218077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162218098 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162218328 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162219649 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 162220070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162220525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162220856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162220973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162221707 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162222142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162222445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162222537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162222615 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162222638 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162222710 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162222750 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 162222793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162223843 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162225605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162225731 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162225779 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162229783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162230140 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 162231658 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162232925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162233802 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162234185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162234541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162236167 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162236170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162236291 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162236753 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162237250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162237314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162237317 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162237748 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162238843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162240233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162240285 C G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 162240543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162241398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162241450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162242026 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162242183 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162243047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162243141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162243282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162243515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162243548 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 162243562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162243612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162243633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162243657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162243719 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162243728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162243859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162243865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162244167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162244186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162244347 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162244533 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162244535 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 162245030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162245204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162245877 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 162246066 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162246136 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162246258 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 162246576 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162246796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162247115 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162247797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162247829 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162247942 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162247982 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162248183 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162248202 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162248536 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162248631 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162248666 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 162248698 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162249026 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162249244 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162249247 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162249357 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 162249385 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162249497 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162249612 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162249878 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162249900 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162249954 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162250057 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162250440 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 162250473 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162250493 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162250541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162250690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162250836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162250850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162250885 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 162250916 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162250932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162250935 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 162251088 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 162251263 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 162251511 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 162251584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162252257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162252560 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 162252651 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 162252737 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 162252910 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162253233 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 162253289 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 162253810 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162253821 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162253872 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162253912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162254060 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162254137 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162254348 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162254351 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 162254456 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162254488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162254498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162254519 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162254524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162254577 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162254968 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162254990 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162255436 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162256132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162256294 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162256301 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162256361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162256395 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162256707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162256785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162256961 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162257016 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162257034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162257037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162257053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162257348 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162257476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162257557 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 162257727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162257772 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162257886 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 162257911 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 162257919 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 162258002 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162258137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162258158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162258236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162258679 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162258701 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 162258778 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162258793 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 162258849 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162258857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162258877 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162258879 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162258909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162258910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162258946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162259260 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162259363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162259450 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 162259451 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 162259495 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 162259557 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162259582 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 162259586 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 162259674 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 162259906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162260036 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 162260087 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 162260147 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162260194 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 162260205 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 162260222 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 162260466 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 162260471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162260535 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162260937 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 162261041 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 162261069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162261120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162261241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162261367 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162261637 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 162261654 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 162261774 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 162261911 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 162262115 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 162262341 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162262353 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162262378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162262389 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162262560 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 162262640 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 162265477 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 2 162265520 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 162265606 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162265655 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162265804 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 162265873 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162265885 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162266057 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162266250 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162266412 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 162266424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162266450 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162266534 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162266692 C G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 162266844 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 162266860 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 162266898 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 2 162266927 C A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 162267155 G T N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 2 162267195 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 162267295 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 162267465 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162267509 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162267519 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 162267560 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162267650 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162267665 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162267689 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162267728 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162267833 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162267890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162268122 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162268234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162268257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162268277 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162268305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162268382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162268393 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162268399 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 162268519 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162268586 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162268600 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162268615 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162268645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162268749 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162268762 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162268764 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162268934 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162269411 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162269507 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 162269544 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 162269688 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 162269692 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162269702 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162269823 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162269862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162269867 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162269933 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162269993 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 162270237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162270400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162270474 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162270525 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162270910 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162271027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162271621 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162271661 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162271718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162271727 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162272054 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162272687 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162272763 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162273378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162273554 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162273577 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162273658 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 162273988 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162274646 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162274670 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 162274708 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162274764 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 162274766 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162274811 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162274848 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 162274957 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 162274966 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 162275536 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162275606 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 162275639 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162275688 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162275757 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162275764 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162275784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162275896 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162275897 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162275907 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162275911 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162275990 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162276045 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162276286 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162276314 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162276336 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162276418 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162276437 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162276460 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162276648 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162276660 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162277044 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162277047 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162277158 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162277184 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162277333 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162277423 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162277490 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162277510 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162277852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162278015 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162278164 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162278227 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162278253 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162278338 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162278341 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162278350 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162278623 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162278662 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162278667 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162278762 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162278782 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 162278839 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162278891 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 162278978 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 162279042 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162279061 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 162279221 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 162279222 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 162279295 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 162279443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162279497 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162279574 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162279643 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162279796 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162279798 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162279835 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162279870 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162279892 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162280108 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162280182 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 162280183 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 162280484 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162280636 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162280727 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162280787 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162280877 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162281003 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162281043 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162281096 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162281122 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 162281258 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162281270 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162281718 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162281759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162282421 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162282438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162282655 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162282787 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162282962 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 162283038 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162283079 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162283109 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 162283735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162283828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162284580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162284654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162284785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162285158 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162286405 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162286520 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162286569 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162286590 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162286592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162286632 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162286693 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162286725 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162286995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162287100 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 2 162287321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162287366 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 162287387 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 162287408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162287614 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162287627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162287661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162287741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162287758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162287813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162287880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162287894 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162287926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162288029 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162288045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162288102 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162288256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162288552 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162288607 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162288631 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162288947 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162289129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162289706 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162290029 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162290109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162290512 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162290944 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162291006 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162291010 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162291079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162291226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162291990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162292109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162292136 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162292253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162292516 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162292571 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162292622 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162292637 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162292659 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162292695 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162292704 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162292795 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 162292800 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 162292859 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162292877 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162292895 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162293061 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162293098 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162293168 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162293183 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162293220 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162293229 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162293259 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162293280 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162293332 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162293425 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162293686 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162293696 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162293774 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162293816 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162293874 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162293963 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 162293979 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 162293992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162294096 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162294295 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162294297 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162294337 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162294352 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162294357 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162294544 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162294591 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162294592 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162294630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162294854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162294881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162294934 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162295416 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162295789 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162295979 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162296042 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162296130 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162296304 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162296368 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162296369 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162296808 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162297276 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162297277 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162297792 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 162298113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162298190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162298729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162299000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162299811 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 162299846 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 162300131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162300442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162300454 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162300464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162300920 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162300931 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162300942 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162301019 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162301045 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162301070 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 162301093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162301174 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 162301217 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 162301219 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 162301235 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162301386 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162301726 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162301844 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162301949 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162302018 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162302042 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162302148 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162302182 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162302229 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162302236 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162302266 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162302269 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162302329 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 162302483 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162302651 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162302729 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162302758 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162302818 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 162302880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162302887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162302994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162303209 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162303244 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162303337 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162303628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162304087 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162304868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162305344 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162305865 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162305875 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162306159 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162306219 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162306230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162306334 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162306623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162306657 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162306894 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162307273 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162307550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162307622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162307811 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 162308070 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162308152 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162308405 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162308565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162308603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162308670 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162308686 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162308715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162309032 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162309057 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162309199 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162309276 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162309395 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162309436 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 162309448 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162309460 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162309523 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 162309577 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 162309584 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162309602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162310090 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 162310215 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162310221 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162310245 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 162310433 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162310460 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162310488 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162310567 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162310631 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162310777 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162310807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162310875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162311054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162311063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162311339 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162311685 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162312677 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162313013 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162313129 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162313156 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162313309 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162313449 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162313496 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 162313821 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 162313856 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 162314106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162314154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162314214 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162314293 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162314452 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 162314718 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 162315081 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162315913 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162316501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162316639 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162320938 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162320958 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 162321022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162321026 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162321061 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162321111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162321736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162321771 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162321849 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162321853 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162321883 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162321911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162322136 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162322194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162322298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162322693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162323100 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162323130 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162323146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162323147 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162323164 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162323249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162323278 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162323335 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 162323662 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 162323694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162324056 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162324098 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 162324161 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 162324289 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162324291 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162324421 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 162324510 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162324780 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 162324811 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162324873 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162324894 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162324932 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162325000 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162325024 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162325054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162325062 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162325084 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 162325101 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162325132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162325222 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162325300 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 162325679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162325712 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162325781 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162325858 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 162325859 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 162326157 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 162326159 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 162326211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162326250 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162326351 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162326411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162326443 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 162326853 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162327067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162327102 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162327186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162327220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162327501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162328371 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162328416 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 162328535 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162328585 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162329152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162329161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162329185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162329290 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162329735 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162329757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162330082 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 162330252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162330333 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 162330559 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 162330574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162330654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162330927 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 162330939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162331015 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162331128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162331210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162331418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162331472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162331775 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162331800 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162331873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162331890 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162332168 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162332220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162332221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162332273 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162332285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162332502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162333446 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 162333460 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 162333569 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 162333605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162333889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162333890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162334872 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162334985 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162335698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162335758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162335914 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162335926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162335954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162335976 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 162336206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162336227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162337232 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162337312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162337342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162337559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162338133 T C N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 2 162338432 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162338443 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162338550 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162338787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162338921 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162339163 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162339171 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162339211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162339215 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162339334 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 162339759 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 162339916 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 162340116 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162340156 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 162341620 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 162341873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162344345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162348012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162348760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162349945 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162354019 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 162354158 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162354386 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162354505 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 162354583 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 162354729 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162354730 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162355239 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 162355490 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162355498 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162355522 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 162355531 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 162355946 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162356341 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162356367 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162356842 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 162357918 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 162358392 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162358515 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162358550 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162358871 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 162358881 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 162358892 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162358898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162359635 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162359663 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162359749 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 162359939 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 2 162360258 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162360304 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162360336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162360527 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162360535 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162360546 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162360558 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162360580 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 162360632 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162360650 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 162360660 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162360687 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162361109 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162361148 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162361178 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162361209 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162361212 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162361338 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162361348 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162361413 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162361723 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162361724 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162361779 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162361838 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162361858 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 162361873 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 162361883 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 162361915 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162361931 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162361937 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162362000 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162362066 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162362085 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162362089 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162362365 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162362393 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162362459 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162362483 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 162362551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162362566 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 162362619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162362658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162362960 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162363368 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 162363631 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 162363696 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162363800 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162363804 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162363840 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162363843 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162363968 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162364097 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162364113 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162364116 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162364157 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162364420 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162364494 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162364561 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162364591 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162364681 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162364712 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162364766 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162364779 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162364813 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162364841 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 162364957 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162365151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162365169 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162365261 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162365273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162365274 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 162365296 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 162365393 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162365426 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 162365478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162365796 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162365836 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 162365900 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 162365934 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 162365972 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 162365979 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 162366321 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 162367229 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 162367402 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 162368798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162368841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162369343 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 162370299 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 162370856 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162371593 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 162372197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162372210 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162372313 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 162372714 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162375079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162375452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162377308 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162378482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162378638 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162379364 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 162380806 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 162380858 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 162380915 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162380918 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 162381016 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 162381224 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 162381367 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 162381629 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 162381887 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162382005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162382055 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162382065 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162382447 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162382450 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162382599 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162382608 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162382710 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 162382829 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 162383033 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 162383047 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 162383061 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 162383178 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 162383187 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 162383207 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 162383436 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162383442 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 162383466 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162383516 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 162383541 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162383734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162384031 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 162384035 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162384361 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 162384562 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 162384770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162385089 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162385437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162385525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162385681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162386125 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 162386183 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 162386206 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 162386221 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 162386274 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162386362 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162386523 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162386533 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 162386606 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 162386622 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 162386656 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162386703 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162386713 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162387002 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162387871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162388391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162389987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162390067 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 162390263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162391590 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 162391606 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 162395277 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 162395355 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162395425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162396102 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 162396117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162396903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162396951 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162397090 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162397143 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162397325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162397376 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 162397401 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162397436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162397615 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 162397639 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162397772 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162397814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162398037 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162398079 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162398266 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 162398282 G T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 162398289 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 162398380 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162398387 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162398402 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162398442 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162398525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162398611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162398796 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162399033 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162399094 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162399360 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162400042 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162400062 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162400106 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162400109 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162400118 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162400126 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162400410 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162400532 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162400533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162402014 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162402408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162402699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162403117 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162403163 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162403456 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162403484 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162403624 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162404132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162404136 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162404158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162404211 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162404249 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162404503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162404569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162404664 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162404727 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162404833 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162404845 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162405131 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162405339 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 162405483 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162406147 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 162406238 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 2 162406415 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 162406646 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162407164 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162408119 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162409162 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162410871 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162411465 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162411954 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162412578 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162412854 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 162412941 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 162413192 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 162413213 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 162417945 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162418805 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162419186 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 162419714 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 162419760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162419849 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162419871 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162428792 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162430308 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162430565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162431552 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162431693 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162431732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162432895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162433198 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 162433202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162433257 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162433672 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162434536 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162434561 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162434639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162434702 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162434757 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162434829 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162434895 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162434914 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162434929 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162435103 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 162435150 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162435369 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 162435446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162435523 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 162435564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162435604 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 162435634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162435719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162435723 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162435759 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 162436036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162436046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162436073 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162436090 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162436241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162436751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162437060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162437269 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 162437291 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 162437628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162437629 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162438029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162438980 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162441772 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162441820 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162442683 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162442818 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162443397 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 162444157 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 162445277 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 162445454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162445484 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 162446954 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 162450408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162450669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162450870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162454096 C A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 162456668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162460208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162460506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162461974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162462292 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162464421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162466666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162467100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162467209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162469875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162469891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162469898 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 162469981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162470041 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 162470469 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162471160 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 162471217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162471698 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162471777 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162471858 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 162471901 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 162471961 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 2 162471995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162472063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162472107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162472112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162472125 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 162472189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162472933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162472993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162473061 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162473192 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162473204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162473314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162473890 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162473911 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162474253 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162474418 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 162474490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162474814 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162474953 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162474956 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 162474967 G C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 162475015 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.461538461538462 0.153846153846154 0.384615384615385 14 12 6 2 5 2 162475094 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 162475165 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 162475193 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 162475250 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 162475264 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 162475391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162475446 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 162475478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162475502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162475537 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162475554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162475580 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162475648 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 162475697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162475792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162475801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162475837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162475884 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 162475886 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 162475913 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 162476001 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 162476100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162476315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162476485 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162476588 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162476608 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162476668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162476803 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 162477405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162477732 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162477823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162477915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162478082 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 162478108 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 162478201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162478216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162478625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162478810 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 162478883 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 162479582 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 162481415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162481426 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162481750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162482145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162482982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162483274 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162484289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162484358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162487827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162488507 T C N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.461538461538462 0.153846153846154 0.384615384615385 14 12 6 2 5 2 162488555 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 162488695 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162488780 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162489407 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162489493 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162489524 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162489781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162490313 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 162490328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162491400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162491529 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 162491576 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 162491578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162491644 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 162491742 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162492202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162492297 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162492303 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162492324 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162493025 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 162493077 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 162493093 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 162493159 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 162493187 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 162493458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162493636 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162493709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162493714 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 162493770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162493864 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162494104 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 162494211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162494227 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 162494311 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162494614 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162494624 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 162495130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162495464 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162495508 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162495512 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162495746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162495836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162495871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162495891 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162496332 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 162496408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162496515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162496564 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162496611 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 162496863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162497187 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162497255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162499174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162499975 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162500025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162500168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162500266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162500304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162500454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162501062 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 162501168 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 162502238 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162502369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162502378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162502806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162502844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162502896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162502939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162503138 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 162503169 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 162503489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162503562 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 162503694 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 162503859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162503868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162504509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162505691 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 162506280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162506296 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 162506314 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 162506494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162506708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162507183 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162507482 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 162507483 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162509219 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 162509224 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162509255 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 162509528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162511574 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 162512520 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162512537 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 162512616 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 162512674 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 162512704 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 162512790 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162513009 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 162513069 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 162513099 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 162513101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162513244 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162513283 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162513314 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 162513377 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162513405 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 162513452 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 162513461 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 162513491 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 162513544 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 162513588 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 162513619 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162513640 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162513695 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162513722 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162514090 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 162514259 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162514339 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162514811 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162514875 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162514938 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162514956 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162515005 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 162515188 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162515366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162515828 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162516115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162516166 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162516446 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162516458 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162516584 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162516587 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 162516665 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 162516716 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162516730 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 162516791 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162516893 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 162516899 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 162516911 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 162517206 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162517304 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 162517345 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162517351 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162517392 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 162517409 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162517411 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 162517448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162517449 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162517538 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 162517555 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 162517578 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.0909090909090909 11 11 1 9 1 2 162517600 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 162517687 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 162517694 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 162517758 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 162517777 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162517848 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162517861 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162517872 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 162517882 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 162517891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162517909 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 162517939 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162517940 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162518016 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 162518074 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 162518134 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162518190 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 162518314 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162518343 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 162518490 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 162518641 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 162518715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162518773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162518815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162518942 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 162519295 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162519399 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162519451 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162519517 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 162519543 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162520101 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162520186 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162520299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162520313 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162520316 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162520414 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 162520440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162520592 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 162520692 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 162520744 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 162520887 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 162520941 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 162521093 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162521690 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 162521696 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162522387 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162522589 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 162522692 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162522949 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162523155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162523228 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162523882 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162526956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162529510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162530231 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 162530242 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 162530956 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162532329 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162532939 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162532940 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162533106 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162533154 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162533304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162533345 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 162533376 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162533439 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 162533455 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162533514 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162533596 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 162533916 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 162533928 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 162533969 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 162533995 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 162534000 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162534114 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 162534227 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162534705 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162534710 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162534823 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162534910 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 162535038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162535063 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 162535087 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 162535257 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162535413 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 162535438 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 162536363 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162536608 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162537064 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162537215 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 162537234 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162537259 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162537577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162537596 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162537658 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162537674 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 162537808 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 2 162537858 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 162537866 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 162537895 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162537898 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 162537910 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 162537953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162538250 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162538422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162538569 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162538688 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162538736 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 162538743 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 162538843 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162538866 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162538950 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162538954 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162539018 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162539052 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162539161 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162539307 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162539345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162539359 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162539465 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 162539610 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 162539631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162539729 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162539768 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162539980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162540209 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 162540630 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 162540638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162540778 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162540861 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162541275 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162541356 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162541432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162541636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162541718 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162541883 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162542029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162542091 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 162542128 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162542215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162542365 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 162542389 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162542408 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 162543556 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162543675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162543732 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162545213 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 162545533 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 162545654 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 162545699 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 162545721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162545740 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162545841 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 162545979 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162546054 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162546091 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162546106 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162546151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162546219 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 162546233 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 162546288 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 162546464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162546513 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162546569 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 162546585 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 162546593 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162546795 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162546816 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 162547016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162547296 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 162547326 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 162547497 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162547681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162547744 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162547802 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 162547840 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162548693 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 162548721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162548787 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162548809 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162548834 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162548923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162549022 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162549058 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162549151 G C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 162549253 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162549260 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 162549471 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162549530 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 162549631 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 162549780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162549972 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 162550001 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 162550006 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 162550036 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162550177 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 162550256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162550305 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162550384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162550393 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 162550494 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162551008 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162551370 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162552057 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 162552201 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162552271 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 162552311 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162552313 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162552337 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162552468 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162552473 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162552480 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162552502 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162552516 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162552642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162552740 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162552879 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 162553245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162553460 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162553477 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162553490 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 162553758 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 162553761 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 162553827 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162553832 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 162553840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162553845 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 162555250 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 162555253 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 162555329 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 162555494 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 162555531 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 162555705 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 162555707 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 162555716 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 162555764 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 162555766 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 162556925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162557161 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 162557607 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162558032 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162558049 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 162558060 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162558113 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162558187 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 162558206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162559636 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 162559651 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 162559668 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 162559713 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 162559756 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162559776 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162559954 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 162560015 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 162560674 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162560693 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162560725 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162560878 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 162560921 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162560954 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 162560991 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 162561521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162561635 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162561801 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162561828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162561909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162561931 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162562316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162562458 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 162562566 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162562588 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162562596 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162563149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162563297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162563500 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 162563597 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 162563599 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 162563744 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162563783 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162563796 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 162563806 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162563812 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162563848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162563859 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 162564098 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 162564480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162566033 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162566071 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162566087 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162566289 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162566796 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 162566808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162566998 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 162567001 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 162567793 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162567861 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162568073 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162568104 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162568265 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162568324 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162568440 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162569527 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162569553 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162569563 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162569822 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162569823 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162569845 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162569918 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162569938 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162570502 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162570508 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162570545 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162570562 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162570735 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162570840 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162570852 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 162570928 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 162570936 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 162571294 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 162571307 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162571496 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 162571599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162571622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162571650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162571747 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162571757 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162572131 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 162572409 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 162572457 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162572726 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 162572776 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 162572905 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 162573291 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162573394 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 162573473 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 162573526 G A N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 162573579 T C N Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 162573837 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 162574130 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162574207 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 162574312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162574381 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162574468 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 162574498 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162574500 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162574521 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162574772 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162575095 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162575132 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 162575133 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 162575214 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 162575509 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162575553 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162575570 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162575595 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162575639 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162575649 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162575654 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162575718 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162575727 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162575731 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162575765 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162575809 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162575817 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162575821 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162575841 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162575874 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162575895 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162575896 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162575960 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162575975 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 162576088 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162576432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162576685 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 162576815 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 162576821 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 162576988 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162577010 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 162577297 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 162577298 A T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 2 162577750 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 162577752 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 162577836 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 162577849 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 162577853 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 162577892 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 162577893 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162577905 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162577917 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162577979 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 162577996 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162578013 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 162578028 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 162578032 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 162578092 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 162578134 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162578159 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 162578240 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162578241 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 162578260 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162578273 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 162578296 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 162578337 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162578349 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162578350 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 162578410 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162578420 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 162578430 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162578505 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 162578516 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 162578522 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 162578550 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 162578657 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162578659 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162578668 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162578685 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162578716 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162578718 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162578732 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162578776 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162578783 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 162578787 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162578899 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 162578963 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162578973 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162578990 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162579055 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162579219 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162579375 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162579456 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162579529 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162579550 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162579574 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162579656 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162579659 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162579710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162579740 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162579867 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162579973 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162580015 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162580346 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 162580354 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162580439 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162580799 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 162580805 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162580892 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 162581269 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162583269 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162583802 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162585385 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 162585516 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162585782 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 162586428 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 162586433 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162587445 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 162588146 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 162588185 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162588221 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162588242 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162588271 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162588320 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162588351 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162588556 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 162588609 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 162588630 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 162588652 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162588680 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 162588703 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 162588719 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 162588724 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 162588762 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 162588776 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 162588856 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 162588868 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 162588969 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162588978 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 162589081 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 162589294 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 162589360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162589617 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 162589644 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162589662 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 162589915 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162590005 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 162590641 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 162590728 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 162590744 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162590751 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162590771 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 162590866 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 162591007 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 162591127 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 162591269 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 162591315 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 162591339 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 162591431 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 162591432 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 162591609 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 162592046 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 162594813 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162595086 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162595122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162595231 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 162595347 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 162595472 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162595493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162596270 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162596404 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162597616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162597995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162598335 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162599160 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162599937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162600405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162600551 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162601007 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 162602746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162603066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162604108 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162604811 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162604851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162606531 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162608193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162610796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162611715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162612003 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 162612198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162612497 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162612518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162612800 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162612827 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162612843 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162613229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162613325 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 162613390 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162613409 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 162614106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162614850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162615008 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162615094 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162615211 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 162615594 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162615723 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162615988 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162616026 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162617209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162617213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162617221 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162617298 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 162618005 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 162618344 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 162618377 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 162618553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162618858 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162619748 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162619982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162621040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162621289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162621345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162624551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162627370 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162629219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162629253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162629902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162630131 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162630309 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 162630685 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162630752 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 162633259 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 162634187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162634403 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162634824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162635024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162635506 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162635538 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162636066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162636109 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 162636197 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 162636229 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 162636384 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162636882 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 162636919 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162637070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162637236 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162637366 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162637376 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162637413 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162637803 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162637822 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162637865 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162637887 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162637929 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 162637947 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162637956 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 162637960 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162637997 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162638057 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162638113 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 162638148 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162638165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162638286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162638291 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162638844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162638874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162639120 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 162639161 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 162639351 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 162639357 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 162639380 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162639462 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162639597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162639612 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162639614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162639629 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162639748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162639946 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162639992 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162640355 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 162640432 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 162640441 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162640468 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 162640614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162640615 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162640628 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162640631 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162640772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162640807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162640835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162641056 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 162641076 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 162641093 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 162642205 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 162642243 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 162642293 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 162642385 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 162642576 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 162642687 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 162642948 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 162643156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162643222 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 162643618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162643768 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 162643813 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 162644007 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162644120 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162644142 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162644218 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162644330 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162644484 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162644622 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162644879 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 162645307 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 162645474 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162645526 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 162645546 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 162645639 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162645648 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162645733 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162645742 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162645880 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162645951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162645965 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162646118 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 162646310 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 162646400 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 162646416 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 162646529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162646542 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162646960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162647183 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 162647660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162647702 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162647724 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162647730 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162647773 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 162648891 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162650116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162650141 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 162650210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162651247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162651963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162652197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162652643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162652679 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162654981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162656127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162656341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162656350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162656482 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162656778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162656809 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 162656908 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 162656965 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162657061 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 162657131 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 162657404 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 162657497 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 162657500 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 162657521 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 162657528 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 162657628 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 162657651 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162657737 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 162658336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162658913 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 162659012 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162659013 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162659037 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162659331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162659379 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 162659598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162659813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162660402 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162660406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162660496 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162660519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162660596 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162660601 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162660676 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162660809 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162660888 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 162661211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162661378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162662017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162662069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162662374 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162663049 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162663464 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162663503 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162663585 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162663635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162663789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162663898 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162663936 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162663952 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162663977 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162663989 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 162664105 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 162664245 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162664270 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162664455 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 162664800 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 162664843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162664902 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162664910 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162664920 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162664922 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162665041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162665168 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162665169 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 162665200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162665218 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162665268 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162665306 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162665318 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162665364 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162665377 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162665379 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162665434 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162665483 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162665497 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162665536 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162665544 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162665582 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162665591 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 162665681 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 162665715 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 162665986 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 162666150 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 162666184 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 162666286 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 162667592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162668129 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 162668175 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 162669158 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 162673823 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162674311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162674323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162674380 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 162674421 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162674929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162675247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162675277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162676584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162676624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162676684 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162676839 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162676872 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162676891 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162677024 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162677074 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162677097 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162677402 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 162678000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162679246 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162680364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162680371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162684882 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162685215 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162685416 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162685449 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162685533 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162685582 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162685904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162686536 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 162686595 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 162686596 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162686786 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162686887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162687594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162688132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162688551 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162689000 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162689347 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 162689961 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162691610 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 162691715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162692258 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 162692594 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 162693628 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162695215 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162695744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162697604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162698450 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162698844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162699297 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 162703443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162703906 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162704305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162704875 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162711631 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162712131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162712382 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 162712498 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162712543 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162712587 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162712634 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162712679 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 162712810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162713072 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162713300 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162713728 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162713948 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162713978 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 162714107 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162714301 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162714901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162715266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162715946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162716541 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162716898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162717298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162717583 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162725082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162725952 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162726091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162726225 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162726245 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162726268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162726272 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162726560 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162726595 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 162726854 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 162726914 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 162727000 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 162727071 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 162727248 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 162727267 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 162727453 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 162727508 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 162727516 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 162727880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162728003 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162728056 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162728277 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162728544 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162728609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162728667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162728875 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162728997 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 162729048 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162729079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162729281 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 162729321 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 162729340 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 162729352 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 162729398 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162729400 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 162729449 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 162729619 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 162729689 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 162729754 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162729777 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162729790 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162729818 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162730242 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 162730688 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 162730797 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162730923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162730970 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162730989 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162731121 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162731291 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162731394 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162732819 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162732986 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162733180 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 162733323 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162733348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162733546 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162733547 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162733607 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162734582 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162734766 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 162735376 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162735564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162737197 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 162737696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162738160 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162738251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162738380 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 162738738 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 162738767 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 162739156 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162739198 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 162739298 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 162739383 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162739878 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162740239 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 162740250 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162740356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162740399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162740439 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162740642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162740713 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 162740972 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162741201 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 162741334 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162741435 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162741708 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162741726 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 162741828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162742004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162742213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162742218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162742281 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162742350 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 162742445 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162742464 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 162742755 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 162742843 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162742871 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162743631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162744219 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162744285 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 162746118 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 162746258 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162746368 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162746603 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162746927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162747019 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162747651 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 162747728 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162747784 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 162747787 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162747890 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 162748360 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162748435 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 162748555 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 162748640 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162749631 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162749665 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162749673 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162749866 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 162750220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162750410 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162750594 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162750752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162750886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162750978 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 162751075 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 162751099 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 162751118 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 162751212 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 162751409 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162751414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162751452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162751726 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 162751839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162751918 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 162752097 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162752183 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162752188 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162752251 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 162752294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162752519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162752766 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 162753039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162753129 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162753179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162753187 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162753906 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162753976 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 162753984 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 162753991 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 162754558 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 162754951 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 162754971 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 162755412 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 162755415 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 162755522 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 162755559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162755569 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 162755626 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 162755663 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 162755674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162755926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162756172 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162756308 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162756871 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162756881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162759763 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 162761732 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162762615 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162763109 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 162763123 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 162763160 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 162763183 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 162764089 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 162764096 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162764501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162764931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162765555 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 162765595 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162765789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162767840 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162767887 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162768245 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 162768713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162768813 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162769282 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 162769667 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162769740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162769823 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162769927 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 162770173 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 162770218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162770316 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 162770414 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162770493 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 162770667 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 162770687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162770710 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162771152 C T N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 162772525 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 162773171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162773905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162774460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162775019 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 162776735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162777681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162777903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162779433 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162779443 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162779447 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162780384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162781071 C A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 162784162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162785033 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162786027 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 162787005 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162787701 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 162787745 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 162787921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162788104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162788988 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162789070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162789255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162789512 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162790606 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 162790890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162792002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162792195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162792659 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 162793878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162793961 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 162794250 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 162794311 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 162794328 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 162794338 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 162794525 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162794582 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162794597 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 162794769 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162794968 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162795452 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 162795599 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162795613 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162796604 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 162796782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162797723 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 162797966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162798224 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 162798560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162798583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162798754 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 162799043 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 162799190 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162799508 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 162800421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162801052 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162801252 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162801706 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162801722 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162802196 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162802291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162802454 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162802548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162802856 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 162803017 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162803018 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162803087 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 162803194 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162803222 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162803545 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162803703 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 162803789 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162803847 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 162803982 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162804005 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 162804142 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 2 162804413 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162804662 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 162804761 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 162805029 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162805225 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162806927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162808896 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 162809309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162812221 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 162813025 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162813241 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162813476 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162813499 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162813521 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 162813678 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162813684 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162813987 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 162814200 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162814262 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 162814305 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 162814306 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162814347 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162814368 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 162814369 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 162814486 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162814516 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162815014 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162815167 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 162815294 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 162816287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162816623 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 162816748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162816765 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 162817331 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162817354 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 162817387 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162817457 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162817483 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 162817485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162817515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162817560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162817731 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 162817769 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 162817900 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162817922 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 162818036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162818056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162818074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162818104 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162818110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162818118 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 162818286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162818429 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 162818742 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 162818878 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 162818941 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 162819361 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 162819616 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 162820001 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162820004 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162820028 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162820207 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 162820366 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162820414 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 162820429 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 162820650 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162820739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162820868 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162820949 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162821720 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 162821981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162822158 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162822159 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162822181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162822350 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162822558 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 162823700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162823711 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162823942 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162825497 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 162826675 C G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 162826892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162827034 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162827201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162827784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162832903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162833023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162833441 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162833529 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162833637 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162833738 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162833819 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 162834252 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162835630 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162835682 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 162835805 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162836162 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 162836211 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 162837155 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162837174 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162837439 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 162838068 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162838399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162839110 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162839116 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162839261 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162839279 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162839370 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 162839491 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 162839724 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162840399 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162840410 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162840760 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162841196 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 162841500 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 162841530 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162841573 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162841623 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162841661 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162841731 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162841742 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162842043 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162842108 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162842233 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162842242 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162842430 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162842467 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162842484 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162842529 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162842632 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162842821 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162842966 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162843002 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162843101 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162843164 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162843169 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162843518 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162843687 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162844218 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162844552 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162844914 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162845143 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 162845348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162846011 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162846871 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162846879 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162847175 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162847523 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162847663 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 162847715 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 162848372 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162848620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162848642 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162848669 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162848773 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 162848784 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162848941 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162848963 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162849698 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 2 162849733 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 162849934 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162850299 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 162850319 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 162850392 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 2 162850472 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 162851213 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162851408 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 162851426 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 162851440 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 162851590 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162851674 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162851718 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 2 162851748 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162851779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162851914 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162852056 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 162852061 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162852184 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162852503 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162852588 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162853162 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162853199 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162853593 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162854186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162854491 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162854767 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 162854782 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162854967 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162855537 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162855679 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162855813 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162856030 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162856681 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162856748 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162856885 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 162856949 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162857024 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162857048 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162857098 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162857381 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 162858031 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162858511 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162858607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162858636 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162858889 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 162859432 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162859669 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162859753 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162859997 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162860247 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162860806 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162860991 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162861683 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162862173 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 162862474 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162862571 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162862713 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162862728 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162863014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162864605 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162864846 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162865172 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162865217 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162865451 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162866974 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162867474 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 162867645 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162867890 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162868897 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162868940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162869407 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 162869648 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162871421 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 162871444 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 162871700 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 162872690 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 162872882 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162873593 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 162873826 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162874130 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 162874229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162875109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162875209 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 162876141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162876614 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 162877234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162877273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162877401 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 162877517 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162877537 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162878076 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162878190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162878199 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162879409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162880178 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 162882931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162883444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162885928 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162886480 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162886520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162887978 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162888010 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162889043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162889339 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162890838 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162890863 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 162890942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162890963 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162890966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162892095 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162892102 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162892840 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162893153 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162893250 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162893459 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162893480 G C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 162893525 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 162893631 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162893698 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 162893792 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 162893928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162894039 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 162894286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162894509 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162895060 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 162895062 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162895164 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 162895627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162895792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162896655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162901688 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 162902861 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 162903090 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 162904109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162906443 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162906549 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 162906794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162906829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162907012 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 162907177 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 162907535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162907555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162907782 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162907931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162908038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162908110 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 162908116 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 162908776 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162908878 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 162909562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162909611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162909637 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162909641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162909658 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162909709 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 162909773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162909784 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162909808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162909809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162909953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162910032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162910160 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162910243 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 162910542 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162910725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162910816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162910982 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162912049 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162913019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162913776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162913857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162914463 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 162914487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162915959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162915981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162915993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162916022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162917411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162918498 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162918930 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162919447 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 162919521 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162919818 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162920155 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 162920224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162920436 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 162920593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162920636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162921261 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 2 162921279 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 2 162921369 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 162921404 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 162921566 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 162922112 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 2 162922366 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162922409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162922450 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 162922755 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162922775 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162922785 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162922789 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 162922883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162922911 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162922953 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 162923413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162923613 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162923644 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162923740 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162923993 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162924028 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 162924558 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162924753 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162925176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162925585 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 162925638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162925756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162925818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162925869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162925932 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 162926145 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162926658 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 162927069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162927105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162927758 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162928043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162928740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162929221 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 162929632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162930098 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162930151 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162931247 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 162932721 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 162933622 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 162934017 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 162934674 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 162935217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162935758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162935981 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162936279 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 162936519 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 162936983 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162936995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162937363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162937951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162938246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162938469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162938588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162939488 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162939489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162939519 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162939539 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 162939578 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162939587 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162939596 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 162939601 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162939614 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162939649 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162939672 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 162939696 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 162939778 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 162939823 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 162939839 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 162940302 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162940348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162940376 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162940393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162940410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162940473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162940515 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162940574 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162940581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162941117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162941134 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 162941170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162941244 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 162941345 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 162941348 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 162941372 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 162941400 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 162941695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162941801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162941806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162942202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162942210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162942239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162942240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162942329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162942347 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162943315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162943316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162943347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162943367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162943411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162943455 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162943477 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162943531 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162943609 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 162943617 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162943671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162943808 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162944540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162944606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162944725 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 162945320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162945405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162945479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162945685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162945954 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 162946110 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 162947675 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162947689 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162947748 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162947790 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162948423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162948458 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162948769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162948808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162948892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162949133 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162949185 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 162949256 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 162949299 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 162949550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162949797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162949879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162949904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162949974 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 162949975 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162950023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162950048 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 162950251 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 162950408 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 162950429 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162950460 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162950598 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 162950604 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162950888 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 162951169 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162951404 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162951500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162951509 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 162951782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162952867 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 162953146 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162953368 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162954920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162955062 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162955192 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 162955556 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162955665 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 162955727 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162955732 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162955794 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 162956046 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162956117 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 162956134 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 162956135 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 162956158 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 162956182 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 162956346 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162956564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162956887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162957076 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 162957081 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 162957102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162957103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162957568 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 162957762 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 162958010 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 162958076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162958106 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 162958205 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 162958287 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 162958363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162958495 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 162958795 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 162959006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162959280 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162959413 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 162959458 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 162959506 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162959838 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162960013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162960020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162960133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162960173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162960179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162960375 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162960911 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162961929 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162962070 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 162962652 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162962765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162963163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162963259 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 162963348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162963352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162963383 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 162963438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162963640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162963647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162963928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162963984 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 162964011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162964575 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 162964579 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 162964605 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 162964671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162964715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162964729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162964775 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162964790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162964848 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162965010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162965060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162965134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162965405 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 162965493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162965667 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162966015 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162966623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162966643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162966737 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162966821 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 162966873 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162966888 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 162967453 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 162967586 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162967602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162968191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162969468 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162969814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162969845 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 162970432 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 162970758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162970762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162971074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162971377 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 162971767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162971827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162972576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162972640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162972657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162972661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162972670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162972677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162972689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162972725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162973100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162973277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162973408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162973670 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162974265 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162974425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162974785 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162974837 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162975005 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 162975027 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 162975114 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 162975182 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 162975409 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 162975423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162975597 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 162975601 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162976022 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 162976149 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 162976161 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 162976404 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162976526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162976789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162977004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162977195 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162977453 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 162977479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162978275 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162978761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162978767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162978776 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162978992 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162979037 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162979121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162979394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162980167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162980222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162980544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162980563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162980580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162980890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162981047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162981388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162981427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162981499 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162981719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162981757 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 162981765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162982061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162982070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162982210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162982238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162982439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162982540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162982613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162982644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162982839 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 162982932 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 162983263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162983322 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 162983329 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 162983372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162984183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162984190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162984203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162984211 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162984243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162984378 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162984388 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 162984863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162984875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162987711 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 162987964 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162988248 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 162988624 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 162988783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162989939 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162990085 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162990290 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162990435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162990527 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 162990674 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 162991057 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 162991201 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162991475 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 162991588 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162991641 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 162991893 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 162993053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162993235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162993553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162994356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162994509 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 162994589 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 162994612 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 162994677 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 162994682 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 162995122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162995638 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 162995807 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 162995956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 162996481 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 162997098 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 162998429 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163000682 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163002727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163002761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163002850 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 163003040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163003169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163003187 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163003259 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 163003280 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163003594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163003657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163003806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163003893 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163004165 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163004192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163004571 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 163004736 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163004861 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163005302 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 163005405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163005701 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 163005729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163005734 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163006370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163006690 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 163006825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163006851 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 163006864 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163006877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163006911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163006946 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163007106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163007129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163007748 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163007852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163008109 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163008472 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163008787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163008797 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 163008966 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163010180 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163010269 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163010283 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 163010722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163010745 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163010928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163011197 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163011371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163011938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163012364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163012399 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163012514 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163012517 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163012715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163012835 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163012985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163013194 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163013696 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 163014280 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 163015247 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 163015455 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 163015514 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163015559 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 163015778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163016067 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 163016236 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163016263 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 163016301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163016303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163016323 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 163016343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163016357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163016409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163016568 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163016807 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 163018264 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163018550 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163018781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163018892 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163018897 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163019156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163019203 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163019251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163019253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163019268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163019297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163019326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163019343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163019355 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163019418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163019653 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 163019725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163019925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163020476 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 163020511 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 163020599 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 163020688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163020748 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 163021008 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163021039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163021040 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 163021074 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163021137 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 163021138 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 163021187 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 163021194 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 163021332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163021383 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 163021427 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163021447 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 163021501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163021522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163022138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163022186 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163023072 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163023125 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 163023173 C G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 163023198 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 163023206 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 163023223 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 163023303 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 163023521 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163025250 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163026621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163027004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163028143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163034312 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163034730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163034956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163035579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163036373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163036731 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 163037057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163037121 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163039209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163039579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163039596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163040132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163040428 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163040429 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 163040585 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163040634 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 163040783 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 163041642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163041669 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163044322 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163044424 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 163047605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163052071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163052299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163053210 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 163053475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163054245 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 163054247 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 163056229 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 163056511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163056512 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163057010 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163057020 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163057385 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 163057547 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163057873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163057962 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 163058190 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 163060220 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163060251 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163060295 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163061004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163061021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163061188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163061238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163061743 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163061778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163061868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163062117 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 163062184 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163062593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163062596 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 163062995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163063030 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163063306 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 163063387 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 163063447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163063573 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 163063670 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163064466 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163065093 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 163065748 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163066863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163066871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163067042 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163067807 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163067981 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 163068068 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 163068148 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 163068244 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163068423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163070378 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163070834 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 163070919 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 163071191 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163071206 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 163071381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163071521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163071545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163071666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163071676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163071714 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 163071717 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 163071875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163071963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163072185 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163072877 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163074078 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163075302 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163076405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163076809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163077051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163078758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163078851 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163079657 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 163079678 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163080005 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 163080133 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 163080539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163080805 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 163081783 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 163082252 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163082492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163083202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163083278 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163083285 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163083296 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163083297 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 163083369 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163083537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163083597 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 163084253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163084649 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163084748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163084805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163088745 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163091228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163091364 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163091365 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163091392 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163091701 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 2 163091833 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163092083 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163092129 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163092271 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163092278 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163092351 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163092374 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163092465 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163092487 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163093412 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163093587 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163093633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163094257 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 163094589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163094835 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163095000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163095039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163095500 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163095634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163096000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163096779 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163096808 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163097368 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163097829 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163098160 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163098284 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163098486 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 163099028 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163099176 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163099225 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163099323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163099339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163099379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163099497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163099507 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163099683 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163099699 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163099755 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163100499 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163100827 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163100992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163101596 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163101722 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163102049 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163102379 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 163102404 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 163102413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163102450 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 163102598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163102606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163102674 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163102717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163102878 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 163102896 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163102897 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163103281 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163103282 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163103437 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 163103444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163103727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163103884 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163103887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163104648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163104723 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163104753 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163105112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163105253 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163105296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163105834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163105988 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163106022 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 163106045 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163106822 C A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 2 163106977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163107276 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163107300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163107334 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163107520 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 163107639 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163107693 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163107776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163108194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163108230 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163108354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163108430 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 163108575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163108735 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163108814 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163108945 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 163109094 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163109170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163109187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163109311 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163109540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163109591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163109702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163109715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163109768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163109847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163109860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163110231 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163110319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163110340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163110467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163111248 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 163111268 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163111282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163111478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163111628 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163111652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163111659 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163111782 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163111792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163111895 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163111939 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163111951 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163112058 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 163112059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163112210 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163112233 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163112248 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163112880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163114105 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 163114404 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 163114456 C G N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 2 163114615 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 163115272 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 163115326 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163115336 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163115677 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163115760 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163115773 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163115976 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163116236 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163116268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163116412 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163116488 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163116504 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163116740 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163116765 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163116794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163116834 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163116898 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163118707 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163119487 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163119617 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163119965 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163120656 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163121528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163122921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163122922 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 163122940 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163122968 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 163123250 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163123326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163123468 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163123582 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163123639 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163123713 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163123751 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163123798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163123867 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 163123957 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163123984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163123985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163124109 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 163124193 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 163124259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163124404 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 163124575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163124647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163124674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163124753 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163125033 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163125055 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 163125082 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163125210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163125217 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163125228 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163125511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163125587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163125664 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163125819 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163126218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163126265 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163126394 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163126807 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163127504 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163127645 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163128280 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163128384 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163128419 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163128522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163128800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163128826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163129646 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163129739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163129822 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163130547 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 2 163131183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163132367 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163132411 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163132471 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 163132585 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 163132621 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163132792 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163132802 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163132822 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163132851 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 163132853 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 163133035 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163133224 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163133303 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 163133310 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 163133839 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163133956 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163133980 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 163134060 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 163134140 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 163134255 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163134354 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163134550 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163134668 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163134695 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163134782 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163134818 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163134962 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163134988 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163134991 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163135652 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 163135708 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 163135829 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163135898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163135899 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163136308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163136523 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 163136823 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163136841 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163136981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163137033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163137086 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163137171 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163137385 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 163137546 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 163137651 G C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 163137834 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163137894 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163137924 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163138028 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163138064 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163138113 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 163138199 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163138215 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163138322 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163138383 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 163138646 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 2 163138656 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 163138665 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163138700 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 163138717 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163138871 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 163138898 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 163138904 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 163138937 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163138940 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 163138964 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 163139163 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163139183 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163139209 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 163139285 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163139297 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163139419 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 163139566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163139580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163139675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163139944 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163140017 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163140332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163140423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163140579 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163140685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163141422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163141428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163141448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163141458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163141525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163141722 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163141817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163141872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163142991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163143136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163143183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163143234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163143972 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163144834 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163144937 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 163144954 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 163145046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163145186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163145866 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163146736 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163149925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163150139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163150207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163150965 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 163151126 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163151163 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 163151173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163151484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163151495 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163151567 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163151741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163151786 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163151802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163151912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163151913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163152032 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163152147 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163153369 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 163153977 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163154065 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163154177 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163154510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163155007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163155051 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163155101 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163155112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163155308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163155437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163155461 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 163155470 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 163155512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163155561 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163155594 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 163155640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163155644 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163155995 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163156023 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163156503 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 163156771 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163156958 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163157137 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 163157304 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 163157328 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 163157346 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163157617 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 163157886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163159040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163159041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163159261 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163159420 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 163159466 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163159475 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163159492 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 163159741 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163160083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163160344 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163160479 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 163160544 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 163160693 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163160716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163160764 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163160890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163160902 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163160956 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163160983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163161015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163161023 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163161064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163161077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163161109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163161143 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 163161165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163161219 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163161385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163161416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163161452 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163161500 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 163161531 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 163161581 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163161628 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163161657 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163161665 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 163161694 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163161780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163161812 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163161839 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163161889 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163161978 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163162041 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163162087 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 163162169 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163162343 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163162447 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163162453 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163162865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163162950 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163163079 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 2 163163132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163163262 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 163163509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163163574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163163693 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163163822 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163163876 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 163163909 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163164030 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 163165233 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 163165350 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 163165431 G T N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 163165627 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 163165652 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 163165802 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 163165877 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163166118 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163166157 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163166240 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163166503 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163166813 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 163166929 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 163166965 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 163167014 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 163167382 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 163167389 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 163167393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163167550 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163167576 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163167609 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 163167754 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 163167768 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163167937 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 163168022 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163168110 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163168188 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 163168266 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163168287 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163168499 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 163168668 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 163168928 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 163168945 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163168964 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 163169055 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 163169296 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163169476 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 163169761 C A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 2 163170003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163170155 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163170312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163170369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163170875 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 163170876 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 163171227 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163171263 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 163171361 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163171393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163171432 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163171474 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163171477 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 163171517 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 163171593 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163171775 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163171791 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163171822 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163172054 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 163172132 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163172138 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163172595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163172920 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 163173101 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163173181 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163174170 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 163174386 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163174412 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163174456 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163174459 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163174535 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163174633 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163174787 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 163174829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163174956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163175060 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 163175529 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163175640 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 163175679 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 163175700 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163175938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163176020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163176040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163176086 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163176127 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 163176192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163176260 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163176366 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 163176383 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163176480 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 163176534 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 163176566 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163176604 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163176628 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 163177111 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163177545 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 163177550 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 163177636 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163177782 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 163178059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163178064 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163178197 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 163178256 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 163178269 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 163178287 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 163178334 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163178402 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 163178481 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 163178515 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 163178828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163179310 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163179656 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163179757 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163179773 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 163179891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163180078 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 163180308 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 163180490 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163180491 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 163180840 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 163180854 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 163180927 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163180968 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 163181000 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 163181015 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 163181032 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 163181056 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 163181538 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 163181795 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 163181833 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 163182006 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 163182025 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 163182125 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 163182491 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163182493 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163182823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163182845 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163182955 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 163183075 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 163183085 C G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163183090 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163183107 C G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 163183117 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 163183323 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163183352 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163183456 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 163183809 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163183893 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163184063 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 163184123 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 163184191 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163184246 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163184270 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 163184316 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163184323 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163184401 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163184427 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163184492 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 163184506 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 163184517 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163184547 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163184679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163184774 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 163184809 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 163184866 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163184926 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163185128 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163185247 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163185256 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163185626 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 163185710 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163185727 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 163185813 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 163185818 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 163186213 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 163186390 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 163186437 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 163186439 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 163186662 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 163186989 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 163187028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163187476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163187673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163188030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163188050 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 163188080 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163188108 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 163188415 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163188470 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 163188523 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163188703 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163188927 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163189033 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163189991 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 163190034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163190112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163190248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163190262 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 163190401 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 163190403 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 163190443 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163190463 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 163190538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163190636 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 163190729 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 163190829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163190893 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 163190897 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163191002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163191081 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 163191094 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 163191158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163191202 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 163191215 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 163191249 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 163191271 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163191298 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 163191337 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 163191430 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 163191456 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 163191494 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 163191708 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 163191796 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 163191963 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 163192006 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163192009 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163192251 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 163192278 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163192355 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 163192412 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 163192420 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 163192485 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163192505 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163192521 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 163192571 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 163192598 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163192935 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 163192957 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 163192975 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 163193183 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 163193278 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 163193356 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 163194351 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 163194579 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163194619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163194622 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 163194646 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 163194667 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 163194705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163194715 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 163194732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163194747 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 163194832 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 163194974 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163195205 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163195385 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 163195400 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 163195431 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 163195482 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 163195665 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 163195748 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 163195870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163195876 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 163195888 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163196042 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 163196181 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 163196260 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163197203 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163197205 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163197266 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 163197335 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163197340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163197541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163197647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163197657 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 163197665 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 163197675 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163197747 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 163197771 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 163197784 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163198097 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 163198098 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 163198117 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163198127 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163198144 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 163198162 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 163198922 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163198946 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 163198965 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163198968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163198977 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 163199147 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 163199234 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 163199279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163199462 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163199495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163199889 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163199898 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 163200236 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163200395 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 163202321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163202719 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 163202825 A T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 163203099 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 163203187 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 163203189 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 163203236 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 163203364 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163203986 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 163204049 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 163204083 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 163204219 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 163204299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163204404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163204462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163205076 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163205579 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163205766 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 163205794 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 163205802 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 163206871 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 163207064 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 163207814 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163207919 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 163208088 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 163208169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163208324 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163208379 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 163208448 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 163208460 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 163208483 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 163208530 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 163208577 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 163208787 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 163208803 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 163208828 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 163208920 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 163209182 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 163209231 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 163209341 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 163209382 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 163209673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163209768 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163210063 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 163210414 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 163210504 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163210979 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 163211334 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 163211743 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 163211775 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163211815 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 2 163211820 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163211982 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 163212044 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 163212117 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163212118 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 163212193 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 163212426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163212990 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163213435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163213628 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 163213685 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163213744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163213834 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163213841 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 163213999 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 163214019 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163214103 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 163214268 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 163214299 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163214309 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163214476 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 163214575 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 163214904 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163215229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163215351 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 163215372 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 163215379 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163215461 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 163215473 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 163215508 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163215531 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 163215619 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 163215670 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 163216023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163216041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163217398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163217464 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163217887 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163218176 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 163218178 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163218279 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 163218290 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163218507 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 163218557 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 163218567 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163218573 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163218999 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163219603 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163219619 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163219644 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163220850 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163220965 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 163221064 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163221126 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163221247 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 163221347 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 163221377 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.235294117647059 0.0588235294117647 0.705882352941177 9 25 4 1 12 2 163221398 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 163221409 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 163222303 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 163222539 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163222637 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163222694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163223608 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 163223661 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163223716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163224050 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 163224131 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163224305 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 163224322 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 163224374 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 2 163224425 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163224464 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163224475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163224542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163224625 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163224873 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 2 163225619 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 163225631 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 163225657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163225799 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 163225962 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 163226036 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163226071 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163226448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163226505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163226581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163226617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163226723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163226970 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 163227323 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 2 163227424 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163227588 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 163227884 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163228586 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163228610 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163228613 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163228630 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163228759 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 163229289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163229299 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163229382 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 163229429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163229835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163229920 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163229963 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163229993 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163230082 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163230445 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163230832 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 163230867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163233631 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 163233736 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 163233751 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 163234567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163236532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163236538 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163238706 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163239189 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 163240556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163241971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163242942 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163244949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163246745 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 163247280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163247535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163248105 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163248496 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 163248685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163248776 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163248782 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163249885 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 163250005 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 163250071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163250118 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163250333 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163250394 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163250442 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 163250471 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 163250512 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163250515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163250633 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 163250647 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 163250652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163250672 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 163250865 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163250936 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 163250985 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163251001 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 163251006 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163251378 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 163251385 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 163251485 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163251603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163251671 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163251716 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163252059 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163253864 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163254377 T A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 163254388 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163254541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163254688 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 163254980 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 163255000 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 163255041 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163255077 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 163255177 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 163255291 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 163255310 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163255435 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163255456 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 163255499 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 163255601 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 163255740 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163255777 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163256043 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163256334 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163257736 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 163257756 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 163257899 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 163258027 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163258137 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163259753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163260726 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163261026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163261061 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 163261278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163263010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163263169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163265052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163269582 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 163269631 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163270166 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 163270210 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 163270385 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 163270415 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 163270584 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163270608 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163270614 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163270680 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 163270689 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 163270752 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163270802 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163270813 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163270838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163270850 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163270867 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163270877 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 163270912 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163270960 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163270963 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163271005 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163271346 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 163271640 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 163272051 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163272117 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 163272181 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163272280 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163272334 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163272365 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 163272412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163272612 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163272831 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163273008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163273009 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 163273064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163273065 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 163273131 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 163273171 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163273456 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163274028 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 163274032 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 163274500 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163274544 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163274571 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163274787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163274898 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163275049 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163275155 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163275452 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 163275504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163275560 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 163275569 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163275590 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 163275602 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 163275722 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 163275794 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163275800 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163275820 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163275841 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163275851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163276014 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 163276015 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 163276067 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 163276176 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 163276315 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 163276413 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163276425 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 163276440 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 163276497 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 163276732 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 163277504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163277893 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163278106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163278174 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163278496 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163278880 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 163279012 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 163279317 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163279856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163280506 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163281400 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 163281568 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 163281626 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 163281694 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 163281714 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 163282012 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163282037 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163282086 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163282139 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163282160 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163282162 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163282186 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163282271 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163282294 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 163282362 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 163282555 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163282807 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 163283133 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 163283169 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 163283213 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 163283232 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 163283320 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 163283359 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 163283528 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163285176 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 163285296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163285299 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 163285415 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 163285500 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 163286294 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163286319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163286330 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163287839 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 163287851 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 163288750 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 163288794 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 163289208 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163289350 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163289361 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163291431 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 163291478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163291742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163291990 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 163291998 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 163292079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163292187 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 163293610 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163293619 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 163293685 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 163293808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163293881 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 163293962 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163294082 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163294151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163294515 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 163296122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163296549 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163296592 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 163296620 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163296806 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 163297866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163297881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163298081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163298681 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163298722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163298777 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163298885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163298896 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163299210 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163299377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163299525 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163299944 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163299986 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163300063 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 163300065 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163300288 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 163300291 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 163300320 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 163300643 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 163300646 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 163300760 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 163300817 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 163300872 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 163300878 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 163300935 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 163300950 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163301007 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 163301100 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 163301194 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 163301279 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 163301505 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 163301585 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 163301604 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163301665 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 163301899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163302091 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 163302177 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163302348 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 163302376 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163302412 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163302417 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163302454 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163302489 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163302514 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163302517 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 163302678 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163303000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163303171 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 163303237 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 163303262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163303266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163303273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163303333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163303418 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 163303435 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 163303472 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 163303478 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 2 163303507 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 163303571 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 163303829 G T N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 163303832 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 2 163303871 C T Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 163303937 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 163303949 G A N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 163303958 C T N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 2 163304132 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 163304244 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 163304254 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 163304289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163304310 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 163304398 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163304900 T A N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 2 163304922 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 163305015 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 2 163305067 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 2 163305196 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 163305214 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 163305221 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163305341 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 163305342 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 163305428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163305584 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163305600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163305602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163305824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163305902 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 163305925 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 163306010 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 163306042 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 163306055 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163306058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163306077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163306086 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 163306191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163306212 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 163306264 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 163306305 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 163306403 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 163306423 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 163306432 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 163306434 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 163306587 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 163306708 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 163306803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163306856 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163306966 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163306980 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163307041 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163307064 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163307077 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163307160 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 163307872 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163307884 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 163308187 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163308288 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 163308383 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 163309204 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163309215 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 163309261 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 163309435 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 163309437 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 163309492 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 163309510 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 163309638 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 163309655 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 163309717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163309833 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163309901 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163309983 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 163310323 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163310343 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 163310361 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 163310483 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 163310674 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163310717 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 163310872 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163310963 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163310971 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163311036 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 163311086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163311088 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163311115 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163311186 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 163311233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163311715 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163311808 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 163312164 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163312209 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163312217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163312249 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163312257 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163312441 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163312489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163312548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163312652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163312969 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 163313094 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 163313097 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 163313128 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 163313612 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 163313675 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 163313686 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 163313818 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 163313831 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 163313862 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 163314308 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163314334 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 163314357 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 163314573 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163314583 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163314595 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163314891 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163315197 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 163315353 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 163315376 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 163315643 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 163315655 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 163315849 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 163315856 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 163316196 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163316209 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 163316215 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 163316826 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 163316839 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 163319275 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 163320239 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163323611 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163323616 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163324168 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 163324170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163324419 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163324482 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163324539 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 163324594 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 163324622 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 163324636 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 163324681 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 163324729 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 2 163324732 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 163324750 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 163324751 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 163324763 T C Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 163324894 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163324977 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163325029 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 163325051 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 163325163 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 163325191 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 163325783 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163325805 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 163326102 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163326195 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163326295 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163326606 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163326652 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163326665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163326980 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163326997 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163328222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163329335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163329404 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163329915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163330053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163330060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163330112 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163330201 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 163330262 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 163330365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163330440 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163330495 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 163330529 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 163330648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163330705 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 163330766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163331336 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163332409 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163332420 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163332764 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 163332803 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 163332815 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 163332913 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 163332936 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 163333537 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 163333587 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163333869 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 163334155 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163334282 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163335593 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 163335894 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163335908 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163335909 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163336113 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163336142 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 163336248 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 163336471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163337289 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 163337301 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 163337374 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 163338575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163338826 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163339275 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163339277 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163339792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163340271 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163342053 C G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 163342599 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 163342877 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 2 163344371 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 163344664 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163352152 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163352235 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163352298 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163352718 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 163352949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163352973 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163353025 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163353498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163353501 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163353697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163353719 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163353800 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163353817 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163356309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163356320 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163356368 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 163356574 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163356621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163356668 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 163357215 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 163357335 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163357631 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 163357729 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 163357763 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 163357788 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 163357882 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 163357926 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 163358172 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 163358369 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 163358373 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 163358389 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 163358440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163358583 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 163358605 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 163358628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163359039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163359139 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163360195 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163360378 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 163360379 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 163360734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163360886 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163360916 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163361153 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163361162 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163361172 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163361180 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163361201 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163361232 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163361259 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163361272 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163361429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163361441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163361495 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163361601 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 163361806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163361807 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 163361829 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163362754 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 163362933 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 163363047 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 163363226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163363349 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163363624 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163363645 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163363839 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 163363855 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163363897 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163363920 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163365036 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163365251 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 163365361 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163365432 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163365506 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163365668 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163365894 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 163365914 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 163365998 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 163366017 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163366027 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 163366213 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 163366294 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 163367066 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 163367208 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163367647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163367787 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163367889 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163367913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163367997 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 163367999 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163368121 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163368142 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163368215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163368227 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 163368301 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163369487 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 163369669 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163370022 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 163372256 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163372349 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163372431 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 163373258 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163373335 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163373843 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 163373883 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163374039 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163374047 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163374090 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163374163 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 163374193 T A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 163374212 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163374956 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163375053 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 163375231 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 163375267 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 163375467 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 163375520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163375675 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163376713 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 163376716 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 163376725 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 163376823 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163377295 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 163377317 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163378311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163378546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163378977 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 163379017 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163379196 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 163379526 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 163379546 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 163379559 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 163379564 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 163379577 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 163379648 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163379743 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 163379851 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 163379899 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 163379900 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163379912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163380105 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 163380783 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 163380963 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163380979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163381069 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 163381463 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163381470 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163381760 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 163381877 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163381953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163381962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163381990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163382127 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163382682 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 163383082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163383283 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163383298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163384660 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163385013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163385481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163385630 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163386340 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163386417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163387821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163387824 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 163387917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163388848 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 163388963 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163388978 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163388989 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 163389178 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 163389491 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163389543 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163390709 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 163390710 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 163391273 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 163391274 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 163391300 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 163391302 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 163391326 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 163391429 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 2 163391433 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 2 163391454 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 2 163391464 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 163391771 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 163391783 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 163391793 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 163391903 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 163391915 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 163392135 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 163392304 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 163392389 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 163392495 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 163392625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163392673 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 163392760 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 2 163392952 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 163393159 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163393174 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 2 163393220 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 163393232 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163393246 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163393617 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163393683 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163394423 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163394919 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 163394952 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 163395591 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 163395661 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163395962 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163396090 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163396295 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163396385 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 163396424 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 163397074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163397213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163397283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163397733 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 163397734 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 163398095 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 163398369 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 163398514 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 163399323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163399371 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 163399456 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163399585 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163399768 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163399779 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163399863 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163400202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163400331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163400599 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163400643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163401528 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163401833 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163401849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163401869 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163402158 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 163402210 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 163402251 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163402492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163402730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163403248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163403514 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 163403835 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163404353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163404784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163404804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163405107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163405325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163405647 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 163406012 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163406275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406603 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406866 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163406973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163407062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163407137 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 163407333 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163407408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163407409 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 163407429 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 163407513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163407651 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163407757 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 163408062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163408137 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 163408230 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163408411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163408429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163408448 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163408492 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163408580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163408973 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 163408984 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 163409151 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163409272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163409311 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 163409409 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163409427 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163409497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163409891 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163409914 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 163410030 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163410072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163410130 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163410257 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163410261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163410301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163410310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163410326 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163410355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163410410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163410430 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163410489 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163410593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163410697 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163410745 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163410799 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163410823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163410855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163410987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163411087 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 163411095 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 163411263 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 163411387 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163411600 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163411656 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163411741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163411781 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163411804 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163411880 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163412194 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163412275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163413267 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163413360 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163413625 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163413827 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 163413913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163413921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163414041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163414117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163414302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163414438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163414464 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163414551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163414617 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 163414763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163415021 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 163415069 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163415111 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163415123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163415178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163415193 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163415258 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163415376 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 163415491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163415546 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163415577 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163415701 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163415714 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163415845 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163415994 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163415996 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163416100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163416389 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163416424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163416432 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163416547 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163416572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163416632 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163416654 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163416669 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163416797 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163416837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163416919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163416963 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163417029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163417053 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163417071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163417101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163417142 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 163417216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163417246 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 163417292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163417372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163417407 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 163417469 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163417502 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163417520 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163417557 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163417598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163417798 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 163417944 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 163418385 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 163418831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163419014 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163419047 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163419176 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163419348 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163419414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163419438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163419745 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163419874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163419925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163420489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163420567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163420633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163421130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163421360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163421981 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 163422012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163422345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163422349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163422362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163422440 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 163422462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163422550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163422780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163422803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163422895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163423070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163423144 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163423536 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163423545 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163423641 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 163423723 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163423821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163423842 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 163424072 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 163424091 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 163424228 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 163424353 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163424359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163424452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163424490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163424515 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163424532 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 163424610 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 163424624 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 163424648 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163424684 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163424738 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 163424785 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163424846 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 163425029 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 2 163425042 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 163425054 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 163425096 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 163425103 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 163425177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163425220 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163425287 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 163425355 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 163425404 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163425517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163425641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163425770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163425818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163425845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163425915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163425924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163425940 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163425951 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 163426057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163426061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163426086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163426147 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 163426305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163426561 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163426625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163426676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163426774 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163426804 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163426904 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163427093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163427129 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163427132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163427168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163427197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163427399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163427438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163427482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163427527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163427836 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 163427978 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 163427981 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 163428384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163428853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163428996 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163429050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163429308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163429361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163429393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163429453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163429526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163429974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163429998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163430001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163430133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163430201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163430233 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163430247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163430370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163430631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163430751 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163431137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163431224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163431272 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163431313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163431362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163431474 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163431692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163431742 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163431945 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163431989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163432040 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163432110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163432184 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163432191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163432287 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 163432479 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163432484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163432659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163432828 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163432841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163432844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163433331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163433556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163433557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163433755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163433762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163433770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163433910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163434149 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163434178 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163434200 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163434217 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163434503 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163434520 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163434536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163434551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163434605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163434611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163434658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163434666 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163435025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163435044 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163435093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163435096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163435120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163435604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163435845 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163435908 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163435937 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163436093 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 163436114 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 163436496 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163436686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163436825 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163436867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163437297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163437990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163438086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163438098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163438157 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163438320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163438630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163438698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163438857 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163439274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163439373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163439613 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163439887 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163439937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163439938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163440143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163440162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163440266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163440291 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163440554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163440749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163440861 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163440984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163441573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163441705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163441894 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163442078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163442169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163442293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163442425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163442515 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163442694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163442862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163443297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163443306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163443412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163443451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163443468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163443498 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163443691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163443711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163444139 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163444177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163444212 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163444623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163444747 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163444857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163444882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163445086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163445391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163445525 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163445638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163445662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163445887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163445910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163446033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163446480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163446492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163446521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163446549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163446694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163446725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163446743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163446751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163446849 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163446866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163446893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163446920 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163446949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163447014 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163447137 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163447145 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163447339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163447417 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163447616 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163447688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163447690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163447760 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163447894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163447914 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163448045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163448348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163448427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163448452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163448488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163448544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163448627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163448634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163448866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163448955 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 163449027 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 163449089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163449115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163449169 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163449178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163449235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163449250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163449315 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163449322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163449347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163449554 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163449621 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163449683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163449805 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163449813 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163449915 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163449957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163450023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163450087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163450289 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163450356 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163450792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163450794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163450826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163451108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163451324 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163451369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163451387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163451392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163451600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163451601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163451619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163451700 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163451754 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163451865 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163451882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163452061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163452283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163452297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163452394 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163452492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163452594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163452675 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163452726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163452861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163452879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163452889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163452955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163452986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163452995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163453186 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163453263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163453673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163454236 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163454247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163454377 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163454564 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163455186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163455413 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163455613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163455894 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163455906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163455907 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163456001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163456332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163456381 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163456412 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163456542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163456764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163456782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163456854 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163457016 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163457032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163457055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163457062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163457215 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163457348 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163457357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163457668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163457971 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163458322 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163458382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163458402 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163458413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163458622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163458821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163459123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163459589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163459714 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 163460014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163460038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163460053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163460140 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163460501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163460768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163460777 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163460858 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 163461156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163461227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163461277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163461563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163461658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163461713 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163461721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163461785 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163461815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163462009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163462277 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163462295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163462365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163463019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163463052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163463196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163463377 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163463387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163463780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163464055 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163464059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163464128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163464234 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163464369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163464424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163465310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163465357 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163465550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163465589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163465951 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466345 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466428 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163466900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163467371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163467379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163467445 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 163467470 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163467496 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163467504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163467512 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 163467522 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163467711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163467980 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 163468061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163469243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163469252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163469464 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163469542 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163469569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163469935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163469969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163470124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163470204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163470228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163470335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163470530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163470589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163470592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163470619 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163470794 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163470905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163471194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163471243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163471502 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163471529 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163471834 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163471958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163472022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163472591 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163473014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163473041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163473092 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163473103 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163473122 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 163473217 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163473341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163473467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163473535 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163473638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163473794 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163473798 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163473919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163473975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163474047 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163474145 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163474236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163474343 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163474359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163474630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163474847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475029 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475055 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475210 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163475321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475709 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475792 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163475822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475845 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163475849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163475878 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163475882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163475910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475915 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163475930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163476198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163476292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163476374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163476479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163481692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163481704 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163481745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163481764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163481772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163481777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163481823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163481865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163482027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163482122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163482162 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163482248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163482251 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163482587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163482601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163482676 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163482679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163483155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163483169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163483347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163483458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163483558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163483793 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163483892 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163483924 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 163484122 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163484389 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163484564 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163484652 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163484660 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163484907 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163484951 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163485191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163485236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163485385 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163485471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163485475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163485614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163485640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163485646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163485677 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163485685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163485696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163485697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163485934 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163486383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163486385 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163486467 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163486485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163486970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163486980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163487217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163487319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163488296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163488702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163488787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163488807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163489011 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163489086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163489169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163489374 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 163489435 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 163489473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163489491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163489609 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 163489665 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 163489727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163489966 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163490027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163490173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163490187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163490319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163490353 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163490423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163490437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163490455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163490531 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163490595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163491059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163491167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163491869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163491996 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163492017 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163492160 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 163492725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163492729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163492762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163492859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163492941 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163492943 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163493135 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163493372 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 163493969 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163494012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163494191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163494355 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 163494435 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163494759 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163494781 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163494855 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163494955 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163494957 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163495149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163495182 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163495378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163495422 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163495513 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163495575 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163495781 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163495808 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163495815 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163495937 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163496128 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163496246 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163496265 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163496272 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163496433 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163496521 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163496651 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 163497043 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163497129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163497443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163497889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163498049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163498547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163498569 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 163498819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163498820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163498903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163499246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163499474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163499487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163499498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163499549 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163499670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163499858 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163499872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163499902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163499961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163499981 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163500134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163500261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163500487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163500630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163500723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163500724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163500752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163500889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163501336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163501409 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163501594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163501777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163502535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163502700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163502879 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163503033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163503106 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163503530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163503629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163503680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163503697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163503921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163503952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163504000 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163504084 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163504087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163504107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163504156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163504198 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163504226 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163504229 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163504257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163504268 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163504575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163504730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163504868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163505257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163505885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163505968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163506045 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163506399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163506409 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163506416 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163506479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163506550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163506727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163506778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163507610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163507888 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163507901 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163507903 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163508117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163508203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163508443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163508470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163508737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163509488 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163509845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163509910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163509927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163510104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163510153 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 163510157 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 163510283 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163510480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163510526 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163510527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163510864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163511000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163511013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163511115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163511893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163511954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163511991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163512232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163512581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163512641 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163512764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163513197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163513237 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163513239 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163513262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163513324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163513364 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163513562 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163513585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163513611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163513702 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163513905 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163513906 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163514204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163514229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163514293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163514417 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163514432 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163514466 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163514487 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163514509 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163514517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163515129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163515130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163515175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163515193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163515222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163515515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163515564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163515691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163515758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163515878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163515920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163515935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163515950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163516010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163516064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163516299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163516342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163516354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163517011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163517032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163517076 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 163517592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163517602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163517622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163517646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163517722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163517723 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163517761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163517809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163517882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163518086 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163518089 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163518100 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163518107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163518119 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163518328 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163518503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163518518 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163518583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163518656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163518689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163518714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163518831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163519060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163519102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163519779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163519921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163519959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163520051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163520356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163520393 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163520512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163521151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163521186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163521217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163521416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163521531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163521780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163521897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163521905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163521946 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163522084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163522229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163522328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163522482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163522846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163522896 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163523144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163523149 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163523231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163523280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163523799 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 163524115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163524156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163524232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163524278 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163524291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163524648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163525341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163525534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163525602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163525911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163526080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163526152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163526185 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163526312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163526318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163526369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163526473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163526484 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 163526599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163526651 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163526905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163526910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163526933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163526960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163527028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163527076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163527165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163528351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163528746 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163528756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163528758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163529047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163529123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163529181 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163529411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163529417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163529613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163529764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163530041 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163530082 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530084 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530687 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530744 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530916 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163530918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163530982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163531056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163531104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163531112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163531421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163531481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163531570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163531578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163531633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163531637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163531659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163531700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163531789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163532498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163532659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163532710 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163532872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163532998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163533243 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163533329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163533384 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163533386 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163533563 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163533629 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163533770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163533783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163533790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163533809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163533843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163533878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163534156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163534262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163534276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163534352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163534388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163534394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163534531 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163534813 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163534822 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163534900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163534904 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163534980 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163535086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163535148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163535411 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163535528 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163535714 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163535756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163535782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163535851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163536248 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163536269 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163536285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163536325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163536332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163536540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163536590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163536594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163536749 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163536865 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163536920 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163537526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163537579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163537640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163537939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163538032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163538269 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163538830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163538867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163539235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163539538 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 163539539 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 163539728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163540128 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163540142 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 163540146 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 163540294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163540417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163540586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163540631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163540663 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163540935 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 163541439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163541468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163541727 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163541735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163541755 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163541757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163541776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163541784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163542468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163542469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163542578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163542758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163542807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163543190 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163543284 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 163543326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163543342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163543803 G A N Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 163543816 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 163543843 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 163544041 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 163544042 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 163544253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163544262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163544467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163544557 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163544570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163544582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163544843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163545209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163545243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163545338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163545491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163545550 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163545628 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163545727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163545834 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 163545835 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 163545862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163546586 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163546591 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163546693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163547205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163547254 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163547841 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163547854 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163547988 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163548064 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163548082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163548202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163548230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163548262 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 163548345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163549059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163549276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163549490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163549589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163549612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163549701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163549734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163549752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163549872 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163549876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163549926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163549941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163549960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163550320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163550340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163550347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163551287 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163551316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163551724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163552022 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 163552054 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 163552111 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 163552158 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 163552177 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 163552186 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 163552213 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 163552251 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163552300 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 163552327 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 163552436 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 163552475 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163552502 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163552632 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163552708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163552781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163552818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163552830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163553728 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163553919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163553922 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163554055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163554139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163554623 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163554710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163554746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163554753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163555918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163556308 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163556733 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163556749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163556769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163557228 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163557237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163557257 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163557364 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163557369 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163557575 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163557667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163557675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163557780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163557784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163557824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163558408 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163558417 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163558822 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163558910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163558929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163559877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163559924 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163560155 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163560259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163560288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163560319 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163560422 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 163560430 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 163560467 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 163560476 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163560675 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163561323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163561407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163561505 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163561632 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163562022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163562031 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163562389 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163562400 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163562448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163562478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163562744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163562772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163562784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163562824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163562914 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163562965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163563000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163563110 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163563241 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163563319 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 163563355 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163563407 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163563415 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163563421 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163563498 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163563590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163563734 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163563749 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163563778 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163563785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163563794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163563830 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163563834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163564078 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163564213 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163564235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163564454 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163564483 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163564577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163564650 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163564812 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163564849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163564860 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163564880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163565330 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163565380 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163565438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163565524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163565608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163565628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163565844 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163565911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163565999 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163566004 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163566019 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163566046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163566049 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163566063 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163566089 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163566149 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163566386 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163566415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163566448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163566473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163566494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163566652 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163567000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163567042 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163567043 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163567113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163567145 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163567283 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163567462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163567487 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 163567781 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163567786 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163567792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163567834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163567852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163568007 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163568100 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163568300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163568349 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163568379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163568431 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163568631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163568796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163568847 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163568868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163568905 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163568931 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163568934 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163568971 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163569366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163569392 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163569414 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163569539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163569558 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 163569661 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163569675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163569746 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163569795 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163569800 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163569936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163569987 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163570077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163570147 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163570645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163571056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163571129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163571290 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163571358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163571499 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163571937 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163572014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163572084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163572102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163572143 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163572327 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163572401 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 163572446 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 163572452 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163572603 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 163572645 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163572661 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163572684 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163572786 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163572804 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163572894 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163572962 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163572982 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163573005 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163573236 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 163573249 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163573816 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163573911 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 163574054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163574076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163574090 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163574123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163574803 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163574873 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163574902 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163574958 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 163575033 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 163575082 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163575129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163575288 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163575332 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163575345 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163575605 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163575650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163575764 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 163575816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163575841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163575891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163575920 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 163575990 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163576081 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163576162 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163576262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163576263 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163576538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163576743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163576753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163576882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163577013 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 163577140 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 163577287 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 163577418 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163577496 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163577708 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163577810 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163577823 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163577980 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 163578067 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163578147 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163578304 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 163578607 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163578613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163578697 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163578812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163578883 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163578930 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163578974 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163578992 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163579107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163579381 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163579385 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163579576 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 163579607 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 163579740 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 163580088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163580381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163580482 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163580586 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163580613 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163580639 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163580644 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163580756 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163580829 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 163580833 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163580947 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163581045 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163581064 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163581616 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163582348 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163582414 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163582596 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163582987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163583075 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163583140 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163583186 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 163583346 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163583352 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163583430 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 163583477 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163583491 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163583512 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163583565 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163584228 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163584348 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 163584466 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 163584484 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 163584631 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 163584661 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163584664 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 163584682 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 163584690 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163584834 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163584849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163584868 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 163585019 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 163585020 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 163585213 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 163586108 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163586224 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163586403 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163586426 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163586502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163586662 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 163586821 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163586889 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163586893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163586920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163586936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163586966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163587027 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163587140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163587155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163587174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163587216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163587295 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 163587382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163587459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163588105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163588150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163588151 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 163588404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163588561 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 163588989 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163589042 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163589665 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163589666 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 163590059 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163590119 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 163590415 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 163590469 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163590566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163590719 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 163590735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163590879 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 163591346 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163591355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163591370 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163591410 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 163591444 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 163591515 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 163591524 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163591847 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163591938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163592046 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163592058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163592059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163592071 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163592120 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163592179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163592696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163592700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163592738 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163592812 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163592858 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163593070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163593090 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163593146 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163593288 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163593414 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163593431 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163594035 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163594144 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163594295 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163594446 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163594642 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163594836 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163595416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163595519 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163595586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163595769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163595850 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163595907 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163595916 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 163596075 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 163596094 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 163596123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163596196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163596450 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 163596549 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163597259 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163597395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163597413 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163597544 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163597625 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163597658 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163597820 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163597919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163598434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163598452 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163598482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163598539 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 163598576 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 163598710 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 163598736 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 163598863 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163598941 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163599101 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163599209 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163599803 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163600273 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 163600670 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163600798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163601004 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 163601045 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163601296 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 163601302 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 163601367 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163601487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163601503 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163601543 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163601676 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163601727 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163601757 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163601838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163601869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163601971 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163602368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163602446 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163602515 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163602573 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163602688 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 163602756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163602914 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163603326 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163603683 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 163603728 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 163603747 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163603992 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 163604037 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163604096 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 163604097 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 163604308 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163604745 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163604763 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163604787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163604877 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 163604929 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163604984 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163604993 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163604995 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163605092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163605411 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163605861 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 163606248 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163606493 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163606513 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 163606643 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163606808 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163607258 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163607277 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163607368 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163607433 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163607448 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163607666 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163607779 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163607904 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163607919 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163607988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163608027 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163608052 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163608110 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163608118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163608132 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163608168 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163608224 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163608225 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163608625 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163608684 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163608699 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163608836 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163608859 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163608881 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163609147 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 163609242 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163610046 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163610056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163610120 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163610151 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163610347 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 163610450 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163610480 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 163610599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163610624 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 163610779 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 163611161 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 163611698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163611746 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 163612220 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163612286 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163612337 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163612388 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163612498 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 163612503 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 163612511 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163612564 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163612634 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163612875 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 163613415 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163613588 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 163613625 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163613774 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 163613792 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163613831 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 163614248 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163621912 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 163621946 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163621952 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163622506 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163623110 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163623236 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163623429 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 163623435 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 163623585 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 163623900 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163624205 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 163624756 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 163625357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163627661 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163627728 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163628238 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 163628331 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 163628374 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 163628432 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 163628439 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 163629445 T C Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 2 163629980 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163630118 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 163630244 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 163630247 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163631306 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 163631339 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 163631811 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163632097 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 163632488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163632588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163632734 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 163633093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163633254 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 163633268 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 163633561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163633577 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163633641 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163633642 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 163633669 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163633965 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163634250 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 163634263 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 163634406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163634582 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163634922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163635513 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 163635546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163636124 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163636231 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 163636743 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 163636747 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 163636767 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 163636788 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 163636973 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 163636994 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 163637118 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 163637721 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163637723 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163637780 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163637796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163637967 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 163638009 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 163638145 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163638177 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 163638212 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163638361 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163638758 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163638865 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163639074 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163639149 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163639238 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163639338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163639543 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163639739 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163639761 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163639859 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163640328 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163640435 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163640473 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163640621 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163640774 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163640777 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163641410 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163641457 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163641499 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163641535 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163641554 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163641687 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 163641746 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163641816 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163641902 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163641906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163641996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163642012 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163642051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163642094 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163642340 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163642375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163642417 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163643183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163643214 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163643294 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163643351 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163643399 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163643504 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163643526 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163643596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163643933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163644110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163644308 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163644534 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163644579 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163645564 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163645842 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163645859 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163645951 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163645952 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163646276 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163646749 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163647172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163647306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163647440 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163647470 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163647510 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163647546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163647973 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163648086 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163648161 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163648217 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163649089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163649140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163649178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163649232 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163649443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163649472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163649533 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 163649542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163649556 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163650461 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 163651168 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 163651181 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 163651883 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 163653004 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163653855 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163653971 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163654078 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163654137 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163654199 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 163654364 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163654529 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163654619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163655008 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163655462 A T N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 163655500 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 163655516 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 163655551 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 163655642 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 163655773 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163655938 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163655953 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163655987 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163655994 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163656005 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163656075 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 163656103 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 163656215 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 163656216 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 163656279 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163656292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163656359 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 163656360 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 163656645 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 163656661 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163656685 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163656746 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 163656887 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 163656930 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163657020 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163657521 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163657790 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163657902 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 163658557 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163658574 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163658608 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163658667 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163658676 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163658821 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163658894 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163659012 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163659054 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163659063 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163659070 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163662340 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 163662383 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163662569 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 163663125 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 163663248 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 163663971 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163664148 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 163664153 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 163664356 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163664750 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 163665025 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163665466 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 163665570 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163666407 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 163666852 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163667140 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 163667743 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 163667946 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163668306 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163675073 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163675322 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 163675331 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163675551 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163675578 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 163675628 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163675664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163675668 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163675817 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163675819 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 163676088 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163676102 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163676160 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163676223 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 163676367 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163676373 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163676382 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163676415 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 163676422 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163676604 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163676682 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 2 163676783 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163677092 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163677746 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 163678138 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163678247 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 163678361 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163678843 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163678943 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163679001 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163679020 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163679040 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163679110 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163679323 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163679469 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163679566 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163679901 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163679947 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163679954 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163679977 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163679997 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163680003 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163680014 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163680295 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 163680323 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 163680376 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163680596 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163680626 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 163680688 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 163680792 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 163680796 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 163680918 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163681033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163681646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163681752 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163681884 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163682035 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 163682297 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 163682393 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163682467 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163682704 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163682741 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163682872 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163683245 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 163683308 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163683443 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163683750 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163686138 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163686891 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163686905 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 163687652 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163687766 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163688248 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 163688379 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 163688380 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 163688664 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163689196 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163690108 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163690156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163690165 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 163690182 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163690387 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163690392 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163690448 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163690996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163691023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163691050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163692268 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163692322 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163692603 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163692646 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163692708 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163693454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163693498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163693582 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163694959 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 163695001 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 163695049 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 163695217 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163695222 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 163695473 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163695488 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163695833 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 163696301 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163696548 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163696925 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163697132 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 163697173 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 163697342 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 163697478 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163697491 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 163697507 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 163697753 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 163698017 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 163698086 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 163698109 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 163698174 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163698202 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163698481 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 163698560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163698754 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 163699099 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163699156 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163700569 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163700656 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 163700989 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 163701628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163701846 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 163702051 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 163702344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163702469 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 163702500 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163702534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163702652 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 163702900 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 163703404 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163703454 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163703471 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163703591 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 163703688 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163703728 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 163703871 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163703942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163703951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163704258 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 163704738 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 163705186 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 163705191 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 163705534 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 163705963 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 163707277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163707417 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163708049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163708086 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163708093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163708143 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163708168 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163708393 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 163708594 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163709366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163709571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163709699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163712414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163714180 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163715923 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163716116 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163716227 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163716434 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163716493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163717498 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 163717546 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163717581 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163717621 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163717830 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 163717937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163717990 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163718100 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163718407 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 163719426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163719450 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 163719465 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 163720429 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 163720644 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163720782 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 163720916 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 163721067 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163721173 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163721185 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 163721259 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 163721370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163721383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163721544 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 163721660 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163721671 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 163721702 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 163721872 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 163722132 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163722202 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163722340 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163722592 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 163722718 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 163722804 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163722923 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 163722937 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 163723313 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 163723436 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 163723528 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 163723556 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 163723727 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 163723739 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163723859 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163724436 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 163724523 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 163724574 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 163724654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163724671 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163724720 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163725433 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163725642 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 163726199 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 163726440 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 163726663 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 163726771 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163727665 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 163728878 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 163729027 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 163729824 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 163729903 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 163729984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163730035 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 163730055 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 163731297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163731474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163732375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163733202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163733779 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163733820 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163733832 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163733854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163733876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163734089 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 163734113 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 163734145 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 163735433 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163736518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163737087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163741585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163742958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163743115 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 163743141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163743191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163743540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163743546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163743554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163743631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163743658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163743699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163743730 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163743813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163744139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163744837 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 163745101 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163745290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163745850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163745883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163746154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163746155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163746338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163746356 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163746432 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 163746447 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163746524 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163746557 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 163746661 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 163746694 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163746699 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163746706 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163746774 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 163746776 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 163746809 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163746918 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163747025 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 163747031 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 163747235 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 163748299 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 163748782 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 163748827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163748871 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 163748903 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 163748939 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163748976 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 163748981 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 163748992 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 163748998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163749008 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 163749330 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 163749860 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 163750223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163751110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163751845 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 163751869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163751949 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 163752361 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163752404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163752735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163752939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163752991 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163753749 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163753856 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163753858 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163753871 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163753946 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163753982 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163754473 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 163754544 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163754630 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163754691 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163754852 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163754930 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163754955 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163754981 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163755073 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 163755227 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163755362 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163755492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163755681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163755840 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163756307 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163756313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163756362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163756772 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163756906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163757101 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163757796 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 163758065 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163758153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163758171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163758194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163758729 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163758734 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163759252 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 163759332 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163759379 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163759999 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 163760083 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163760092 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163760328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163760543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163760565 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163760828 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163760911 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163760941 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163761167 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163761204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163761246 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163761447 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163761510 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 163761685 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163761695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163761738 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163762063 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163762067 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 163762200 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163762233 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163762439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163762484 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163762521 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163762532 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163762547 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163762635 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163762647 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163762674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163762717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163762729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163762854 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163762949 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 163762995 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163762997 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163763327 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163763328 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163763444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163763583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163763610 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163763637 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163763640 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163763714 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 163763723 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163763729 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163763857 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 163764265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163764274 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 163764325 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 163764332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163764392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163764515 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163764611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163764671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163764686 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163765108 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163765163 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163765186 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163765205 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163765228 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163765303 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163765350 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163765636 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163765848 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163765898 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163766040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163766044 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 163766104 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163766115 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163766192 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 163766213 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163766405 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 163766456 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 163766615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163766680 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163766771 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 163766864 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163766881 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 163766884 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 163767025 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163767187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163767232 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163767394 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 163767444 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163767454 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163767552 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 163767668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163767727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163767828 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 163767873 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163767904 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 163767924 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 163768026 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 163768277 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 163768535 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163768551 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163768575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163768592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163768607 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163768652 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 163768704 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163768708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163768728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163768758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163768799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163768855 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163768886 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 163768997 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163769010 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163769015 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 163769080 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 163769167 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163769176 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 163769292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163769513 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 163769514 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 163769554 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 163769577 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 163769587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163769764 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 163769784 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 163770265 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163770503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163770744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163770935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163770952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163771721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163773049 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163773056 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 163773084 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 163773159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163773217 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163773219 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163773240 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163773665 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163773849 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163773973 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163774137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163774145 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 163774257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163774437 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163774664 C G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 163775072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163775481 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 163775648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163775749 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 163775857 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163775940 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163776116 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163776127 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163776352 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163776361 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163776364 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163776479 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163776635 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 163776932 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 163776940 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163777057 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163777176 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163778297 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163778368 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163778646 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163778663 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163778679 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 163778682 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 163778700 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 163778806 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163778821 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163778887 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 163779030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163779293 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163779311 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163779735 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163779842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163779928 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163779956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163779965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163780124 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 163780214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163780314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163780453 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163780468 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163780507 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163780532 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 163780691 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 163780949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163781054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163781492 C G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 163781845 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163781953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163782017 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163782196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163782209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163782326 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 163782707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163782718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163783151 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163783523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163783530 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163783656 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 163789615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163789756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163789929 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 163789996 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163790090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163790494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163790589 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163790661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163790920 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163791217 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163791317 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163791723 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163792109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163792479 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 163792767 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 163793057 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163793907 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163794040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163794163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163794208 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 163794214 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 163794223 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163794257 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163794451 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163794491 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 163794547 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163794574 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163794629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163794642 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163794643 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163794653 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163794763 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163794774 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163794821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163794853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163794854 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163794872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163795042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163795089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163795186 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 163795454 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 163795726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163796509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163796930 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163796999 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163797212 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 163797214 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 163798009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163798991 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163799513 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 2 163799983 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 163800028 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 163800227 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 163800462 C A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 2 163800556 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 163801144 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 163801178 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 163801198 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 163801324 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 163801345 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 163801365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163801454 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 163801456 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 163801587 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 163801598 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 163801620 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 163801651 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 163801654 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 163801715 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 163801716 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 163801797 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163801820 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 163801846 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 163801847 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 163802452 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163802870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163803481 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163803494 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163803763 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163803795 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163803842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163804000 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163804020 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163804067 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 163804361 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 163804511 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 163804519 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 163804613 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 163804857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163804931 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 163805132 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163805183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163805214 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163805217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163805231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163805315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163805389 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 163805399 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 163805588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163805614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163805661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163805930 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163806005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163807454 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 163807471 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 163808127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163808141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163808309 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163808546 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163809034 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163809130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163809298 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163809363 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163809500 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 163809784 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163809814 C T N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 2 163810831 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 163810832 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 163810875 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163810924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163810939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163810957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163811011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163811085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163811123 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 163811134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163811144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163811146 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163811189 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163811241 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163811268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163811280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163811289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163811304 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163811414 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163811451 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163811460 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163811851 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163811858 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163812124 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 163812400 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163812740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163813622 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 163814069 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163815437 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163818829 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163824380 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 163827006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163829143 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163829170 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163829207 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 163829636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163830371 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 163832261 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 163833853 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 163833858 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 163839484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163839967 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 163841611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163842311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163844394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163844732 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163844856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163844875 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163847363 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163847700 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163848238 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163848272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163848287 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163848326 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 163848331 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 163848362 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163849053 G C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163849314 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163850831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163850832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163850952 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163852259 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163852656 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163853200 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163853550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163854000 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163854470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163857217 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163857474 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 163857531 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 163858336 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 163858524 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 163858550 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 163858607 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 163859074 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163859160 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163859984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163861270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163869847 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 163869862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163870369 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163871311 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163871415 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163871725 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163871757 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 163871763 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 163872009 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163872236 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163872268 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 163872435 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163872531 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 163872652 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163872694 C T Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 163872787 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163872897 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 163872923 A C Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 163872963 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 163873288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163873394 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163873719 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 163873758 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163873924 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 163873952 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 163874152 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163874252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163874437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163874451 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163874549 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163874620 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163874642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163874658 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163874677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163874698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163874744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163874859 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163874909 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 163875171 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163875487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163875554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163875662 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163875665 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163875814 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163875867 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163876174 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 163876198 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163876201 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 163876492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163876609 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163876752 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 163876755 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 163876793 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 163876815 G C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 163878801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163880384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163881065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163881325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163881732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163883071 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163884258 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163884675 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 163884785 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163885217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163885223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163885870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163885977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163886449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163886633 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163887249 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163887261 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163887275 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163887478 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 163887929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163888052 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163888532 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163888595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163889132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163889250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163889336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163889539 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 163889544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163889981 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163889988 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163890087 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 163890151 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 163890211 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 163890396 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 163890454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163890620 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163891015 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163891088 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163891196 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163891273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163891793 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 163891879 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163892982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163893023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163893511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163894057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163894624 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 163895730 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 163896782 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163897058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163897201 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163898650 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163899084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163900116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163900130 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163900503 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163900506 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163900523 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163900575 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163900578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163900692 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163901449 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163901712 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 163901788 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163901907 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163902169 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163902458 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 163902668 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163907375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163910260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163910387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163912501 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163912599 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163912600 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163913377 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163915234 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163915397 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 163916110 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 163917088 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 163919117 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 163920552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163923855 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163924784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163927313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163927890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163928263 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 163928515 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 163929109 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 163929427 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 163932327 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163933723 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163934720 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163935703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163941557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163941986 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163942624 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163944294 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 163944316 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 163945398 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163946534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163946564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163947424 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163947588 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163948043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163948651 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163949772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163951842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163952959 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163952997 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163954181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163954602 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163955381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163957365 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163957592 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 163958078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163958121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163958417 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163959096 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163960043 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 163960631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163960714 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163960813 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 163960884 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163960934 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163961009 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163961676 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 163961749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163962969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163963803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163965139 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163968489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163969848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163970482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163971031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163971157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163973591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163974173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163974409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163974626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163975076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163975212 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 163975295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163976160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163978383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163978953 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163979414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163979450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163979605 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 163979669 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163979715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163980008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163980121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163980489 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163980741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163980838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163981479 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163983284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163983600 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 163983892 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163984535 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 163986044 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163986838 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 163986899 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163987377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163987995 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163988018 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163988184 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163988304 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163988314 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163988721 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 163988905 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163988915 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163989077 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163989101 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 163989103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163989174 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163989228 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163989249 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163989277 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 163989278 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163989328 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163989770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163989887 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163989909 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 163989915 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 163989944 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 163989988 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163990213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163990431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163990446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163990554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163990910 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163990962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163990996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163991763 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163993064 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 163993336 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163994289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163994580 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 163995946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 163996259 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163996767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 163997973 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 163998355 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 163999504 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 163999668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164001271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164001667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164001811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164002381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164002385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164002397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164002730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164003089 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 164003549 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 164003969 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 164004234 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164004670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164004682 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 164004706 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 164005646 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164005756 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 164005795 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 164005979 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 164006068 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 164006368 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 164006467 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 164007092 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 164007214 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 164008935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164009109 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 164009145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164009623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164009765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164009798 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164009846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164009895 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 164010471 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164010487 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164010558 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164011652 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 164011661 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 164011690 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164012011 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164012036 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164012044 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164012059 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164012395 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 164012415 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 164012673 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 164012876 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 164012883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164012935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164013064 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 164013092 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 164013387 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 164013559 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 164013578 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 164013644 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 164014345 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 164014691 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 164014705 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 164014934 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 164015057 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164015218 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 164015461 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 164015468 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 164015481 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164015647 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 164015675 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 164015705 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 164015764 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164015784 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 164015828 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 164015847 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164015917 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164015918 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164015987 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 164016017 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 164016038 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 2 164016045 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 2 164016057 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 164016119 C T Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 164016217 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164016273 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164016656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164016680 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 164016716 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 164017601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164020090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164020227 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164020228 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164021034 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 164021222 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 164022989 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 164023377 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164023482 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 164023598 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 164025160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164026062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164026272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164026419 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 164028390 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164028893 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164031241 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 164032767 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164033721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164034820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164034839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164035102 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164035499 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 164035574 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 164035604 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164036020 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164036177 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164036244 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 164036283 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 164036298 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 164036476 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 164036502 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 164036520 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 164036531 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 164036665 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 164036680 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 164036697 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 164036730 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 164036735 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 164036878 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164036927 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 164037070 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 164037276 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 164037374 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 164037402 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 164037415 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 164037429 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 164037597 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 164037598 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164037811 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164038620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164040245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164041685 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164042159 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164043302 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 164043316 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 164043874 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164044368 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164048945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164049047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164059906 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164060593 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 164060825 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164061109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164061187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164061414 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164061691 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164062120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164062140 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164062240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164062497 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164062810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164062922 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164063165 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 164063644 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164063703 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 164063754 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 164063858 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 164064175 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164064301 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164064397 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 164064399 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 164064537 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164064586 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164064648 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164064677 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164064729 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164064732 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164064826 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 164065018 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164065024 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164065035 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 164065192 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164065309 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164065313 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164065526 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164065728 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 164065759 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 164065788 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 164065814 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 164065840 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164066247 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164066444 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164066519 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164066532 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164066668 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164066920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164067229 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 164067338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164067466 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164067494 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164067554 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164067668 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164067679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164068001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164068388 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164070505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164070595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164071983 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 164072639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164073163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164073278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164073387 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 164073692 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164073994 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 164074069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164074853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164075976 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 164076337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164076686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164076844 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164077007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164079714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164079887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164080018 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164080080 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164080197 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 164080203 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 164080596 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 164080688 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 164080933 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 164080946 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 164083924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164083980 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164083983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164084630 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164086095 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 164086211 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 164086212 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 164086515 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164086696 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164086854 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164088167 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 164089487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164089494 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 164089755 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164095400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164096335 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 164097727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164097871 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 164097903 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 164098161 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 164098222 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 164098261 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 164098537 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 164098872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164099793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164099977 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 164100803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164101403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164101548 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 164101727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164102003 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164102048 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164102075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164102087 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164102089 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164102480 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 164103029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164106191 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164107764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164108697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164109294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164109678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164110686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164110767 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164110922 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164110969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164111018 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 164111176 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 164111478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164111702 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164111802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164114072 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 164114137 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164114810 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 164115007 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 164117259 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164117507 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164117858 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 164118266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164118348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164118354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164119440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164119881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164119938 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164120144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164120159 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 164120178 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164120379 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164120435 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 164120436 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 164120589 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 164120705 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 164120716 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 164120831 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 164120835 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 164120843 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 164121010 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164121093 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 164121106 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 164121378 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164123532 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 164124013 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164124054 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 164124881 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 164125083 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164125209 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164125393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164125431 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 164125624 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164125817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164126472 C T Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 164126985 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 164127040 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164127176 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164127199 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 164127220 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164127359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164127565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164127580 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164127587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164127637 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 164127720 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 164128031 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 164128047 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164128257 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 164129065 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164129086 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 164129202 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164129203 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164129228 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164129232 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164129248 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164129261 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164129280 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164129295 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164129307 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164129857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164129937 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164129999 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164130067 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164130088 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164130099 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164130163 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164130241 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164130594 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 164130625 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 164130886 C G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 164130932 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 164131037 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 164131391 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 164132446 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164132489 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164132596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164132828 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 164132866 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 164132921 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 164132991 G T N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 164133104 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 164133110 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 164133262 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 164133759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164133785 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164133800 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164133834 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 164133886 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 164134004 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164134008 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164134036 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164134119 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164134229 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164134575 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164134944 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 164134971 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164135073 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 164135124 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 164135133 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164135259 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164135265 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164135302 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164135310 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 164135367 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164135416 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 164135455 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164135509 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164135536 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164135574 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164135623 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164135755 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 164135850 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 164135868 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 164135873 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 164135906 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 164135915 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 2 164135936 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.307692307692308 0.0769230769230769 0.615384615384615 9 17 4 1 8 2 164135953 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 2 164136004 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 164136006 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 164136080 A T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 164136140 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 164136149 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 164136403 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 164136453 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 164136530 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 164136642 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164136648 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164136691 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164136729 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 164136780 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 164136803 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 164136807 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 164136829 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164136895 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164136899 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164136923 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164136944 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164136976 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164136996 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 164137015 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164137038 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164137242 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 164137259 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 164137268 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 164137290 A C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 164137409 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 164137820 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 164137831 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 164137856 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 164137857 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 164137888 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 164137899 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 164137929 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 164138099 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 164138128 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 164138154 C A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 164138245 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 164138256 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 164138461 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164138670 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164138737 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164139216 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164141223 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 164141458 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 164141670 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164142246 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164142295 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 164143329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164143451 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164143684 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164143829 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 164143858 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 164143918 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164144035 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164144745 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164144746 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164144759 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164144915 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 164144916 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 164145105 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 164145115 T G Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 164145176 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 164145224 T G Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 164145382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164145409 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164145549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164145579 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164145665 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164146072 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 164146371 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 164146372 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 164146403 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 164146504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164146535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164146568 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164146582 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164146605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164146667 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 164146685 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 164146728 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164146802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164146909 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 164146966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164147152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164147163 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 164147211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164147342 C A N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 2 164147418 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164147459 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 164147488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164147512 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 164147576 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 164147671 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 164147743 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164147748 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164147852 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 164147869 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 164147892 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 164147978 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 164148118 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 164148174 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164148241 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 164148273 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 164148294 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164148370 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164148436 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164148744 T C N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 164148749 T C N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 2 164148856 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 164148881 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 164149106 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164149128 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164149136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164149291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164149319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164149329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164149589 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 164149634 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 164150362 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164150631 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 164150717 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164150765 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164150878 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164150958 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164150977 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164151183 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164151375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164151534 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164151643 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164151742 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164151779 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164151876 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164151893 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164151905 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164152005 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164152065 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 164152095 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 164152136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164152173 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164152231 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 164152275 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 164153008 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 164153041 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 164153130 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164153222 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164153327 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 164154060 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 164154112 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 164154167 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 164156654 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164156843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164157314 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 164157590 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164157752 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164158584 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164158603 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164158620 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164158683 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 164158728 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 164158775 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 164159046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164159410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164160248 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 164160254 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164160283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164160549 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164160557 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164160777 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164160815 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164161402 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 164161406 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 164161665 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164161690 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164162285 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 164162308 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 164162324 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 164162441 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164162633 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 164162711 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 164162794 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 164162907 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 164163165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164163284 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 164163430 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 164163862 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 164164003 C G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 164164401 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164164538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164164566 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 164164642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164164712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164164797 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164164939 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 164165245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164166204 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164167222 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164167289 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164168181 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164168274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164168397 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164168454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164168636 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 164168654 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164169336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164172869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164172936 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 164173451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164173758 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164174123 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 164174203 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 164175224 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164175631 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 164176932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164177807 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 164178276 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164178892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164179862 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 164182775 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164183076 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164183540 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 164184761 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164184769 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164185195 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164185330 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 164185466 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 164185492 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 164185505 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164185530 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 164185591 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 164185629 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164185699 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164185929 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 164185930 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 164186446 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 164186462 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 164186463 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 164186513 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 164186522 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 164186604 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 164186705 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 164186718 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 164186752 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 164186753 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 164186877 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 164188916 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 164190621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164190652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164190753 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164190882 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 164190911 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164191289 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 164191550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164191588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164192082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164193484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164194332 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 2 164194437 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164194608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164194706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164194713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164195254 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164196605 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164198019 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164198553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164198667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164199463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164200731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164201759 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 164202473 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 164202519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164202686 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 164203840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164203941 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 164203984 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 164203986 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 164204299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164204453 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 164204558 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164205192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164206120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164206301 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164206313 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164206369 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 164206416 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164206507 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 164206584 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 164206713 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 164206750 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164206752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164206765 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164206799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164206912 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 164206990 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164207052 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164207081 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164207228 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 164207367 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 164207412 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 164207517 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 164207699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164208566 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 164208633 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 164208646 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164208707 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164209045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164209220 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 164209252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164209314 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164209777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164210234 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 164210670 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 164210799 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 164210846 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 164210851 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164210871 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164210985 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164210997 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164211027 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164211162 T G N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 2 164213105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164213511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164214118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164214125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164214233 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164214389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164214412 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 164214506 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 164214512 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 164214539 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 164214576 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 164214598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164214648 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 164214923 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 164214949 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 164215701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164215724 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164215859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164215951 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164216935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164217088 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164217128 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164218174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164218266 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164219614 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164219744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164221753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164222074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164223953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164224452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164224560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164224895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164225895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164225963 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164226650 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 164227620 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 164227809 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 164228585 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 164228706 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 164228743 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 164229146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164232177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164232269 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 164232305 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164232606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164232679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164233752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164234208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164234837 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 164234910 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164236700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164237125 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 164237252 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 164237278 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 164237280 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 164237318 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 164237326 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 164237383 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 164237436 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164237454 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 164237505 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 164237506 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 164237548 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 164237795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164238217 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164238367 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164238429 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 164238548 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 2 164238619 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 164238882 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 164238985 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 164239233 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164239285 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164239302 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 164239304 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 164239335 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164240322 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 164240343 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164240453 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164240524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164240585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164240652 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164240810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164241436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164241526 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 164241570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164241572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164241713 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 164242381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164242735 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 164243361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164243526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164243790 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 164244342 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 164244478 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 164244491 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 164244509 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 164244545 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 164244663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164244702 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164245262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164245503 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164245512 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164245604 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164245907 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164245929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164246023 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 164246083 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 164246149 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 164246193 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 2 164246350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164246372 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 164246434 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 164246452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164246643 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 164247576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164247604 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 164247632 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164247664 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164247763 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 164248933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164250579 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164251090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164252709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164253192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164253602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164258575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164260550 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164266739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164267714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164269060 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164269097 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164269438 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164269568 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164269652 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164269817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164269855 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 164270224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164270810 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164271147 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164271603 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164271638 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164272118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164272783 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164273080 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 164273659 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164273734 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164274023 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 164274798 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 164274805 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164275765 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164275971 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 164276588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164276624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164276892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164276994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164277064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164277407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164277455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164277590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164277811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164277854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164277958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164278016 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164278033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164278059 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164278173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164278258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164278271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164279596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164279609 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 164279810 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 164279817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164279908 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 164279920 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164280032 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164280126 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164280129 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164280182 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164280196 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164280352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164280810 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 164281390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164285353 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164285839 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 164286331 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164286579 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164286584 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164288261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164291029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164291160 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164292048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164292436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164294185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164294239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164295903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164299017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164301012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164301784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164304628 A T N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 164304686 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164304795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164305425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164306309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164309353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164309364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164309564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164309599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164310222 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164311894 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 164312687 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164312982 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164313276 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164314731 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 164316066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164316834 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 2 164317391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164317476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164317643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164317652 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164318990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164319013 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 164319353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164320186 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164320450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164320669 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 164320980 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164321053 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 164321366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164321621 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164322920 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 164323751 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 164323791 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 164323817 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 164324201 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 2 164324507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164324514 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164324800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164327168 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 164328196 C T N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 2 164328445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164329001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164329194 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 164329759 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164329830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164329845 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 164330222 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164332284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164333035 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 164333047 A G Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 164333079 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 164333587 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164334044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164334216 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164334843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164336684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164337041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164337127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164337148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164338404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164338551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164339077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164339361 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164339380 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164339482 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164339613 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 164340364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164340421 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 164340633 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 164341401 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164341634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164341666 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164341711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164343743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164343838 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164343946 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164344119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164344303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164344664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164344713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164345367 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164346730 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164346817 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164346852 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164346987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164347072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164347239 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164347380 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164347427 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164347509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164347668 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164347690 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164347872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164347894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164347900 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164347910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164347937 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164347983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164347996 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164348064 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164348125 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164348294 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164348497 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164349288 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164349404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164349448 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 164349473 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 164349501 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 164349515 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 164349551 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 164349583 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 164349768 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 164349785 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 164349915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164349916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164350000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164350170 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164350236 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 164350318 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164350356 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164350384 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164350421 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164350477 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164350499 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164350675 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164351415 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 164351489 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164352122 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 164356376 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164356411 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164356529 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164356778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164357944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164359027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164359084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164359521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164361614 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164361678 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164361726 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164362003 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164362119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164362887 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164363087 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164363338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164363760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164363806 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164364644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164364955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164367884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164369014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164369015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164369387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164369474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164369659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164370556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164370775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164370828 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164371310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164371357 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164371412 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164371419 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164371509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164371559 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164372049 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164372112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164372363 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164372561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164373591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164374285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164374367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164374880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164376169 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164376170 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164376736 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 164377150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164378053 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164379293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164379717 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164379819 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164379878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164379891 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164379907 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164380166 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 164380310 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 164380409 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 164380459 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 164380461 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 164380604 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 164380627 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 164380630 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 164380802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164381030 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164381135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164381228 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164381281 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164381498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164381500 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164381629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164381767 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164382027 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 164382157 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 164382846 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 164382901 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 164382950 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 164383048 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 164383110 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164383116 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164383244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164383438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164383440 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164383809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164383888 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164384243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164384378 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164384428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164384469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164384521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164384602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164384603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164384622 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164384853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164384876 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 164384999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164385097 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 164385121 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 164385150 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 164385178 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 164385278 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 164385581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164386049 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 164386123 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 164386136 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164386182 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164386302 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164386652 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164386714 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164387533 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164387599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164387872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164387921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164388845 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164389379 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164389652 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164389681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164389855 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164389935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164390173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164390728 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164390763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164390835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164390899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164391269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164391284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164391456 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164391470 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164391536 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164391546 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164391878 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164391964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164392017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164392645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164393479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164393524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164393568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164393814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164393860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164393950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164394019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164394235 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164394267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164394519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164394674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164394709 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164394899 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164394924 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 164394961 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164394962 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164395552 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164395578 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164395753 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164395865 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 164395913 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164396003 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164396019 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164396080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164396142 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164396167 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164396243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164397090 T C Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 164397158 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 164397781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164397782 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164397848 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164397872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164398073 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164398301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164398326 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164398350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164398437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164398445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164398668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164398672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164402185 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164402847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164402930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164404098 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164404250 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164404557 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 164405631 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164406869 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 164407072 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 164407098 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 164407099 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 164407153 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 164407329 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 164407579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164407649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164409622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164409765 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 164410051 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 164410233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164410789 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 164413549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164413763 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164413781 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164413782 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164413820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164413912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164414034 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164414073 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164414129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164414439 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164414568 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164414588 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 164414818 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164414965 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164415051 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164415083 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164415331 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164415356 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164415362 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164415382 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164415397 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164415447 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164415640 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 164415730 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164415775 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164416091 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164416115 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 164416166 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164416358 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164416463 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164416633 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164416780 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164417005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164417007 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164417179 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 164417203 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 164417439 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164417874 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164417970 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164420072 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164420799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164420828 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164420866 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 164421195 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164421244 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164422127 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 164422557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164422723 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164424804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164424951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164425115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164427907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164428131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164428629 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 164428973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164429140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164429800 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164430917 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164431627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164431896 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 164432480 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164432553 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164432610 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 164432667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164432676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164432691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164434565 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164434981 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 164435193 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164435200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164435223 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164435270 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 164435278 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 164435283 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164435347 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164435450 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164435479 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164435730 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164435736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164435973 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 164435986 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 164436189 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 164436236 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164436266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164436374 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164436466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164436672 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164437134 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 164437398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164437401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164437479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164437554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164437702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164437710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164437725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164437762 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164437841 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164437935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164437945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164437970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164437979 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164437994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164438009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164438077 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164438158 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164438246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164438257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164438283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164438299 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164438326 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164438500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164438532 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164438542 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164439510 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 164439550 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 164440068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164440085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164440574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164440622 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164443373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164446787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164446938 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 164447277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164448353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164449026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164449083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164449331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164450056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164450521 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164450979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164453856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164454236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164454459 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164455310 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164455512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164456043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164458395 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 164458452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164458720 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 164459491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164459999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164460537 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 164460998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164461196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164461965 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164462122 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 164462237 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 164463874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164465843 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164465857 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164465867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164465869 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 164465959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164466120 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164466180 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 164466249 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164466331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164466461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164466495 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164466504 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164466678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164466952 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 164466962 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164466988 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164467019 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164467060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164467102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164467146 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164467153 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164467162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164467315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164467417 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164467421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164467429 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164467476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164468037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164468341 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 164468461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164470177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164471753 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 164475720 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164476675 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164477370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164479331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164479358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164479674 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 164479749 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 164479930 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 164480428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164480686 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164481388 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164481524 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164481929 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 164481952 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164482829 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 164482875 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 164482886 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 164484417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164485320 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164485462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164485647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164486373 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164486380 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164486521 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 164486553 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164486593 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164486609 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164486692 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164487234 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164487235 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164487301 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164488086 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164490142 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164490368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164490454 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164490457 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164490486 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164490533 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164490661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164491181 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164491608 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 164492168 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164492262 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 164493437 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 164493439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164493462 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 164493531 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 164493746 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 164493774 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 164495994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164496083 G C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 164496932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164498363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164498498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164498849 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164498857 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164499291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164499749 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164499783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164499865 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164499921 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164499930 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164500275 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164500282 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164500337 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164500440 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164500482 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164500485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164500532 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 164500551 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164500557 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164500661 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164500846 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 164500871 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 164501318 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164501392 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164501497 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 164501516 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164501529 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164501568 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164501603 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164501934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164502297 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164502325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164502548 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 164502624 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164502680 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164502908 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164503060 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164503134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164503169 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164503178 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164503200 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164503249 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164503353 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164503361 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164503689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164504079 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164504481 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164504491 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 164504506 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 164504548 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 164504594 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 164504667 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 2 164504682 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164504694 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 164504696 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 164504850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164504934 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164504951 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 164505039 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164505235 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 164505293 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 164505321 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164505332 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164505372 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164505402 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 164505567 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 164505871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164505981 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 164506092 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 164506204 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164506251 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 164506308 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164506332 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 164506344 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 164506482 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164506743 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 164506833 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 164506843 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164506849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164506877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164506908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164507057 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 164507079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164507101 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 164507257 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 164507305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164507606 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 164508185 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164508198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164508399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164508613 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 164508729 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 164508750 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 164508771 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164508779 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 164508829 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 164508915 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 164509026 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164509029 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164509069 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164509085 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164509088 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164509119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164509236 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164509322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164509326 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164509343 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164509364 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164509441 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164509446 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164509504 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164509558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164510096 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 164510176 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164510235 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164510246 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164510272 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164510301 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164510587 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164510703 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164510787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164510849 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164510872 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164510882 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164511437 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164511538 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 164511555 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164511688 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 164511806 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 164511984 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 164512011 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 164512032 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 164512111 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 164512134 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 164512153 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 164512190 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 164512197 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 164512382 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164512546 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164512549 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164512571 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164512627 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164512628 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164513054 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164513104 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164513410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164513412 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164513677 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164513840 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164514987 C T N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 2 164514990 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 164515118 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 164515152 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 164515215 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164515492 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 164515510 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 164515827 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 164516318 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 164517296 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 164517721 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164517775 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 164517966 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 164518208 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164518403 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164518528 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 164519320 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164519321 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164519349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164519450 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164519495 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164519531 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 164519648 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164519682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164519728 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164519739 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164519793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164519824 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164519872 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164519875 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164519952 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164519960 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164520015 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164520055 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164520090 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164520280 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 164520300 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 164520436 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164520580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164520594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164520911 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164520932 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164520958 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164520962 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164521017 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 164521085 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 164521267 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 164521299 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 164521462 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164521520 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 164521601 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 164521702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164521776 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164521818 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164521919 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164521925 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 164522035 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 164522077 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 164522078 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 164522093 A T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 164522095 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164522420 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 164522803 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164522908 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 164522946 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 164523273 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164523323 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164523325 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164523395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164523519 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 164523968 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164524014 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164524553 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164524818 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164524936 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164524941 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164525001 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164525174 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164525329 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164525458 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164525511 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164525592 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164526137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164526426 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164527095 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 164527125 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 164527517 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 164527650 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 164527997 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 164528144 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164528183 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164528212 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 164528312 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 164528444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164528577 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164528618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164528622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164528664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164528879 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164529015 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164529149 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164529165 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164529251 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164529263 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164529280 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164529292 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164529327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164529336 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164529387 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164529422 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164529462 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 164529467 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 164529525 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 164531646 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164531738 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164531756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164531967 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 164532657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164532689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164533311 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 164533551 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164533578 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 164533819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164533973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164534109 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 164534111 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 164534189 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164534571 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 164534997 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 164535025 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 164535211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164535214 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 164535311 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 164535680 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164535707 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 164537208 G T Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 164537398 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164537621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164537875 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 164537880 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164538031 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 164538100 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 164538143 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164538248 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 164538274 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 164538742 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164539056 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164539149 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164539243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164539432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164540040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164540195 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 164540290 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164540388 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 164540403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164540551 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164540961 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164540993 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 164541032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164541196 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164541387 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 164541426 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164541706 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164541794 A G N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 164542150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164542263 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164543000 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164543022 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 164543165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164543295 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164543661 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 164543677 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 164543684 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164543741 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 164543796 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164544108 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164544198 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 164544595 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164545990 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164546607 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 164546654 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 164546660 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 164547158 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 164550681 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164550848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164555251 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 164556778 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164556886 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164557200 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 164557356 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164557505 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 164558290 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164558495 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164558535 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 164558790 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164558860 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164559587 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 164559594 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 164559666 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 164559696 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 164559756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164560463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164561077 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164561079 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164561132 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164561278 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 164561590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164561593 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164561694 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164562699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164563606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164564258 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164564729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164565242 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 164565244 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 164565520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164565978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164566067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164566799 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 164566887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164568414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164568501 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164568767 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 164569324 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164569419 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164569655 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 164570188 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 164570378 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 164572556 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164573607 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164573623 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164573633 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164573835 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164573953 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164574000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164574091 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164574741 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 164575231 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164575277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164575548 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164575686 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164575781 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 164575950 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164576345 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164576552 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164577426 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 164577560 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164579317 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164580226 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164580375 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164580666 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164580848 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164580996 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 164581114 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 164581157 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164581188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164581727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164582321 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164582607 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164583416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164583533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164584064 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164584588 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 164584619 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 164585603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164586024 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 164586069 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164586617 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164586669 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164586800 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164589318 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164590301 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164591521 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 164592255 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164592709 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164593745 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 164593867 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 164594200 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164594201 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164594575 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 164594642 A G Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 2 164594967 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 164595470 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164595711 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164597927 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164597935 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164598162 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 164599341 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164599388 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164599394 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164599446 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164599470 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164599478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164599506 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164599667 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 164600677 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164600746 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164600770 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164600899 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164600964 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164600966 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164600986 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164601000 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164601048 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164601164 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164601174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164601194 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164601259 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164601266 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164601324 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164601344 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164601438 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164601664 A T Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 2 164601700 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 164601828 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164601829 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164601923 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164601927 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164601998 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164604160 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 164604260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164604275 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 164604412 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 164604469 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164604479 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 164604864 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 164604924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164605009 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 164605043 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 164605103 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 164605139 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164605190 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164605505 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 164606735 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 164607176 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 164607197 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164607340 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164607382 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164607414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164607721 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164607765 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164607833 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164608156 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 164609176 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 164610728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164610730 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 164610887 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164611438 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 164611466 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 164613008 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164613690 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 164614221 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164614605 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164620805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164621434 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164622134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164623165 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164624124 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164624133 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164624969 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164625054 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164625497 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164625529 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164625764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164627116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164627627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164629103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164630750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164631998 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164632129 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164632207 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 164632464 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164632746 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164632991 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164633231 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 164633242 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164633291 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 164633508 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164633540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164634449 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 164635212 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 164635629 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 164635702 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164636289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164636550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164636983 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 164637372 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 164638283 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164639296 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164639988 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164648398 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 164652124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164653004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164654182 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164657248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164657845 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164658671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164659757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164663252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164663562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164666435 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 164669663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164670761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164670946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164673756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164673821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164674997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164676128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164676656 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164677314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164678239 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164678246 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 164678343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164678374 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164678565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164680203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164685465 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164686408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164686834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164687159 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164687182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164687712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164687952 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164688653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164689940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164690344 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164690872 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164690892 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164691276 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 164692639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164693582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164693669 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 164693677 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 164693693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164693770 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164694035 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 164694224 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 164694412 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164694554 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 164694723 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 164695153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164695240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164695346 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 164695913 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 164695973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164696639 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164696654 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 164696763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164696768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164697047 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 164697065 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 164697375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164697432 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 164697490 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 164697638 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164697745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164699268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164699558 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164699632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164700906 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 164701167 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 164701168 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 164701223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164701509 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164701742 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 164702196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164702689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164703828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164705485 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164710555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164715617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164717627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164717642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164720220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164722282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164723590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164723847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164723978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164728720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164729405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164735045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164735053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164735794 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164736500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164740129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164741055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164741174 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164742527 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164744549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164745892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164746661 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164747451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164747455 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164747603 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164747704 C G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 164749476 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 164749697 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164749709 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 164749732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164749883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164750340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164750517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164750640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164750776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164750839 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 164751063 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164751195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164751325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164751375 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 164751567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164752255 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 164752445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164752617 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 164753022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164753599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164753711 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 164753867 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164753946 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 2 164754593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164754601 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164754635 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164754896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164755037 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164755410 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 164755449 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 164755652 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 164755783 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 164755810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164755890 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164756508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164759103 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 164759191 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 164759459 A C N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 164759742 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 164759922 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 164759932 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 164760029 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 164760071 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164760079 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 164760105 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164760218 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164760267 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164760422 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164760812 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 164762314 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 2 164762744 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 164763483 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 2 164763575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164763892 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164763935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164764089 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 164764335 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164764616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164765057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164765157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164765184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164765245 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164765293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164765304 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 164765306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164765321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164765375 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 164765497 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164765571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164765591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164765671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164765680 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164765694 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164765741 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 164765756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164765915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164766354 T G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 164766468 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164766792 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 164766899 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164767066 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164767075 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 164767245 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164767249 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164767386 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164767773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164767838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164767969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164768403 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164768418 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164768581 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164768960 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164769877 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 164769913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164770126 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 164770321 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164770336 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164770380 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 164770383 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 164771322 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 164771431 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 164771872 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164771929 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 164773310 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164773373 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 164774894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164774939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164775407 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 164775688 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 164775733 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164775738 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164775811 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 164776086 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164776158 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164776175 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164776177 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164776189 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164776241 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 164776250 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164776534 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164776589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164776893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164777036 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164777057 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164777182 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164777297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164777611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164777624 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164778129 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164779160 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 164779239 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 164779429 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164779435 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164779657 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 164779679 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 164779829 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 164780729 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164780820 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 164781392 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 164783250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164783754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164783759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164784089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164787025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164788141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164789562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164793344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164793358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164803372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164807975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164808612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164808969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164810647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164815521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164821378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164822127 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 164832606 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164833379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164835151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164842420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164844869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164846301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164846332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164847915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164848225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164852599 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164858738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164860762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164861057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164862061 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 164862205 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164865008 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164865645 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164868137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164869127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164869140 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 164869263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164870277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164871722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164874466 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164874889 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164877501 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164877633 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164878881 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 164879116 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 164882116 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 164883587 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164883717 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 164883836 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 164883914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164884453 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 164884465 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 164884473 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 164884512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164884610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164884792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164885108 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164885281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164885575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164885877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164886031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164886066 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164886127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164886214 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164886222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164886255 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 164886352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164886398 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164886528 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164886584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164886659 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164886672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164886707 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 164886831 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164886858 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164887192 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 164887193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164887270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164887275 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 164887284 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164887595 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 164887674 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164887747 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 164887804 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164889895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164889897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164890442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164890446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164891062 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164891186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164892463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164893816 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164894787 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 164895458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164896548 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 164896583 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 164896613 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 164896645 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 164896699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164896779 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 2 164897172 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 164897261 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 164897280 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 164897400 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 164897594 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164897604 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164897633 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164897672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164898396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164898402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164898490 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 164898500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164898530 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164899005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164899028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164899095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164899154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164899183 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 164899305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164899597 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164899652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164900873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164900886 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 164900912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164900933 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 164900947 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 164900964 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 164900976 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 164900990 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 164901003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164901139 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 164901255 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 164901328 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 164901457 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164901622 G C N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 2 164901888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164902353 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164903605 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164904326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164904417 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164904559 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164904673 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 164904839 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 164904866 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 164904908 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 164905066 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 164905101 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 164906759 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 164906841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164907036 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164907046 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164907180 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 164907195 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 164907913 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 164908151 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164909024 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164909288 G T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 164909323 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 164910423 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 164910440 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 164910457 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 164911925 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 164911948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164911974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164912030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164912351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164912662 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164912754 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164912772 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 164912857 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 164917287 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164917395 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164917451 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 164917704 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 164918314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164918574 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164918666 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 164918741 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 164918767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164919199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164919878 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 164919916 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164920209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164922308 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164923816 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 164923987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164924041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164924149 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 164924154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164924165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164924215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164924242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164924258 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164924313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164924368 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164924376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164924427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164924557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164925227 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 164925858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164925918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164926136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164926188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164926323 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 164926329 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164926500 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 164926941 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164927077 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 164928021 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 164928030 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 164928764 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 164928789 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 164930354 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 164930685 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 164930708 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 2 164931056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164932662 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164933220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164933250 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 164934713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164934793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164935003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164935099 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164935309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164935328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164935563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164935628 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164936075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164936203 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164936224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164936288 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 164936823 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 164936824 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 164936838 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 164938769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164939065 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164939498 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 164939515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164940502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164940597 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164940623 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 164940724 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164940727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164940753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164940881 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164941061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164941081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164941089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164941104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164941254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164941280 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164941541 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164942015 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164942030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164942042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164942450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164942570 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164942994 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 164945514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164945635 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 164945796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164946060 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164947775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164948983 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 164948994 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 164949873 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 164950820 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 164950824 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 164950850 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 164950868 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 164951290 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 164951330 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 164953103 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 164953296 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 164953375 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 164953456 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 164953472 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 164955054 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 164955066 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 164955592 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 164955743 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 164955749 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 164955969 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 164955989 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 164956084 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 164956154 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 164956263 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 164958967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164959085 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 164959449 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 164959540 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 164959770 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 164959830 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 164959848 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 164959956 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 164960190 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 164960329 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164961066 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 2 164961368 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164961371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164962067 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 164962130 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 164962152 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 164962194 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 164962272 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 164962280 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164962299 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 164962476 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 164963229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164963302 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 164963499 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 2 164963670 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 164963904 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164964713 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 164965047 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164965094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164965201 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164965205 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164965478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164965934 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 164965967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164966615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164966889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164968888 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 164971437 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164971853 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 164973276 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164973298 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 164975832 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164975969 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164976353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164977133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164977260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164979405 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 164979478 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 164979479 G A N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 2 164979696 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 164979778 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164979863 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164979900 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164979922 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164980683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164980703 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 164980879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164981515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164981547 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 164981589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164982269 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 164982528 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164982740 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 164983250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164984770 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 164985577 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164985927 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164987627 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164988086 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 164988219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164988280 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164988293 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164988328 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164988347 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164988448 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 164988487 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 164988495 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 164988776 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 164988966 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164989207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164989208 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164989265 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 164990460 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164992003 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 164993263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164993411 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164993770 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 164993776 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164993820 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164993926 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164994059 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164994357 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 164994366 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164994377 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164994408 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 164994554 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 164994647 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164995029 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164995172 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164995235 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 164995297 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164995350 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 164995429 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 164995540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164996996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164997007 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 164997123 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 164997513 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 164997809 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 165000156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165001245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165001747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165002491 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 165002728 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165002850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165002983 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 165002994 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 165003061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165003557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165004968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165005107 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 165005130 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165005188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165005234 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165006901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165007293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165009296 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165009460 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165009540 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 165013750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165015297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165015411 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 165015981 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165016107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165016506 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165018413 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165018635 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 165020649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165023453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165026034 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165026222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165026262 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 165026351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165026546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165026856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165029438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165030734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165031563 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 165031569 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 165034372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165035274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165035349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165036294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165036384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165037666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165038675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165039458 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165041126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165041347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165041410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165041660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165041766 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165042866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165043575 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 165043582 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 165044828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165044968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165044976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165045333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165046386 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165047240 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 165047499 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 165047558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165048737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165049624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165050235 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 165050416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165052485 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 165053127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165053651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165053939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165054755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165055040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165055062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165055105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165055433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165055643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165055683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165056160 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 165056346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165056600 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 165056630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165056813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165057117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165057286 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 165057349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165057377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165057625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165057993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165058324 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165061344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165061678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165061904 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165061951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165062401 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165062546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165062663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165063045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165064244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165064290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165064293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165065276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165067321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165067687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165068213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165068449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165068957 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165070063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165070077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165070247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165073479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165074760 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165075268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165075550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165075811 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 165075840 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165075998 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 165076025 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 165076238 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165076267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165076367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165076385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165076501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165077027 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 165077413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165078007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165078819 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165078889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165079056 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165079680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165079752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165080037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165080065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165080256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165080553 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 165080883 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165081195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165081369 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165081470 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165083407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165083496 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165083649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165083780 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165084582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165084750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165084966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165086810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165087004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165087069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165087139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165087157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165087159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165087507 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165087531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165088132 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 165088414 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 165088505 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 165088522 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 165088688 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 165088714 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 165088776 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 165088778 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 165088790 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 165088856 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 165088939 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 165088967 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 165089028 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 165089829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165089978 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 165091062 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 165091165 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 165092051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165092491 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165092688 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165094012 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 165095689 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 165095957 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 165097233 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 165097395 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 165097890 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 165098091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165098243 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165098324 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 165098334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165098901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165099038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165099155 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 165099512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165100536 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165100815 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 165101429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165101493 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 165101505 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 165101755 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 165101802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165104023 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165104407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165104833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165106240 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165106511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165106764 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 165107015 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165107042 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165108208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165108243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165110216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165110258 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165110719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165111283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165112143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165114759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165117103 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 165117280 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 165119217 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 165119493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165119889 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165120164 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 165120201 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 165120635 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 165121164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165124557 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 165124591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165125850 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165125978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165126216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165126635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165128421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165129153 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165129599 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 165130950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165132877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165132902 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165133070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165133257 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165133291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165133601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165134779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165134797 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165135131 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165139609 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 165141725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165143234 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 165143783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165146092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165146347 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165147056 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165148719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165149780 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 165150189 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165150267 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 165150883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165151570 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 165151768 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165151772 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165151991 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 165152005 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 165152364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165153305 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165153538 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 165153781 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 165154089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165154119 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 165154151 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165154160 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 165154277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165154287 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165154536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165154552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165154769 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 165154770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165154832 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165154834 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165154988 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 165155041 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 165155044 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 165155148 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165155803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165156958 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 165157504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165158531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165159010 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 165159209 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 165159753 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 165160025 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 165160147 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 165160207 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 165160291 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 165160356 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 165160365 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 165160393 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 165161546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165161860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165162041 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165162817 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165163217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165163396 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165163811 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165164027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165164617 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165164779 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165164801 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165166310 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 165166327 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 165167735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165168953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165169893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165170062 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 165172105 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165173390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165173733 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165174138 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 165174157 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 165174189 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 165174470 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165174526 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 165174575 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165174714 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 165174787 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 165174843 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 165174873 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165174919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165178461 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 165181059 C A Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 2 165181060 C T Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 165182742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165182863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165182892 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 165185474 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 165185496 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 165185508 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165185526 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 165185537 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 165185596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165185623 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165185647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165185650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165185693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165185697 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165185728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165185799 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165185814 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165185826 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165185896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165185898 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165185925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165185926 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165185954 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165185965 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165186070 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165186227 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165186242 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165187015 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 165187050 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 165187497 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165187732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165188095 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165188268 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 165188400 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165189332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165189567 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 165189596 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 165189946 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 165190028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165190207 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165190442 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165191053 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165191264 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165191861 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 165191877 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 165192083 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 165192132 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165192141 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 165192191 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165192209 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165192793 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 165193329 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 165193340 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 165193449 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 165193473 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 165193603 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 165194395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165197081 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165197130 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165197225 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165197305 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 165197434 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 165197448 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 165198925 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165199039 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 165200792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165201422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165203549 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165207260 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 165207307 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 165210198 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 165221784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165224899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165226404 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165226637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165228871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165232430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165233724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165233776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165233782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165235750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165236665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165239542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165240400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165240561 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165240872 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 165241104 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165242940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165243139 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165243161 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165243171 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165243173 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165243236 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165243315 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165244176 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 165244518 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 165244648 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165244706 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165244914 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 165244923 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 165244930 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165245597 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 165245627 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 165245663 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 165245700 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 165245715 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 165246153 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 165246475 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165246505 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165246560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165246565 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165247331 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165247358 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165247864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165247943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165248962 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 165248995 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 165249389 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 165249420 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 165249445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165249450 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 165249515 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165249583 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 165249681 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 165249796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165249829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165249859 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165249963 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165250414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165250475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165250711 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165250770 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165250814 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165250870 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 165250871 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165250922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165251299 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165251365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165251624 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165252481 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165252489 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 165252525 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165252649 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 165252732 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 165252764 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165252794 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 165252858 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 165252935 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165252967 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165253020 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165253030 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 165253033 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 165253044 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165253060 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 165271326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165287249 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165290062 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 165290072 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165290561 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165290695 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165291180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165291392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165291490 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165292360 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 165292444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165292457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165292751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165292754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165292806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165292819 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165294015 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165294095 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165294181 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165294204 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165294650 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165294670 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 165295517 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165295626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165295767 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165298445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165298894 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 165299430 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165299478 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165299532 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165299535 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165300027 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165300082 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 165300124 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165300171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165305604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165306209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165306464 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165307118 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165308356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165308357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165309696 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165310252 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165310997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165314682 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165315253 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165315638 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165316064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165317499 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 2 165317536 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 165317641 T G Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 165317681 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 165317709 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 165317758 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 165317897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165318182 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165318793 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 165319958 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165320231 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165320243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165320692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165320796 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165320826 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165320860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165321030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165321043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165321539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165321560 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165321563 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165321633 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165321731 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165322265 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165322300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165322456 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165322892 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165322929 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 165323388 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165323664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165324312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165326973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165327000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165327026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165327056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165330019 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165330632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165331868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165335160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165338862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165342470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165343894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165344278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165344454 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165344717 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165344761 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165344889 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165345034 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165345072 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165345092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165345216 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165345238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165345631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165346696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165346887 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165346949 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165347003 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165347016 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165347019 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165347029 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165347060 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165347145 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165347574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165348729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165349499 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165352156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165352157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165352243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165352283 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165352411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165352429 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 165352996 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 165353055 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165353447 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165353490 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 165353628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165353974 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165354118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165354178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165354381 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 165355240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165355464 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165355517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165355880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165357008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165357131 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165357170 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 165357344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165357546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165357642 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 165357656 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 165357753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165357981 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 165358189 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 165358242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165358431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165359045 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165359083 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165359084 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 165359451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165360663 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165360686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165360691 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165360730 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165360731 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165360791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165360997 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 165361052 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165361342 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165361990 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 165362063 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165362220 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 165362712 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165362840 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 165362876 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165363148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165364576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165364831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165365058 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165365151 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165365735 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165367836 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165368434 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 165368571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165368590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165368647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165368756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165368775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165369400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165369427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165369661 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165369899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165370125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165370261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165370280 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165370468 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165370932 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165370967 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165371311 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165371406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165371446 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 165371611 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165371741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165371816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165371929 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165372232 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 165372417 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165372450 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165372528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165372671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165373103 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 165373226 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 165373271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165373812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165374744 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 165375037 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 165375592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165375621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165375695 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 165375786 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165375814 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165375913 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165376136 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165376196 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 165376540 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 165376789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165376806 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165376881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165378162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165378454 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 165378492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165378671 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 165378917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165379004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165379365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165379395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165379516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165379522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165379534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165379553 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165379743 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165379836 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 165380354 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165381907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165382067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165382152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165383138 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 165383235 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 165383242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165384524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165385111 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165385641 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165385824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165385885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165386743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165386993 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165387075 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165387219 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165387477 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 165387564 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165387571 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165387599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165388369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165388418 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 165388737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165389535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165389573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165389642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165389647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165390675 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 165390739 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165390888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165391000 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165391102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165391225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165391293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165392495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165392525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165392731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165393178 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165394145 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 165394178 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165394378 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 165394862 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165395015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165395262 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165395275 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165395276 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165395468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165395576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165396052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165396101 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165396213 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165396273 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 165396311 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165396516 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165396669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165396810 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165397003 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165397279 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165397626 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165397843 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165397952 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 165399812 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165399840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165399943 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165400057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165400625 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165400713 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165401097 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165401524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165403424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165404190 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165404419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165407781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165413306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165414626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165417374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165417983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165418279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165418358 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165418405 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165418963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165419862 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165419936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165419973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165420143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165421283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165422960 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165425780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165430333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165431234 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165431687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165432247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165432666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165432913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165433064 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165433081 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165433465 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165433553 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165434251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165434281 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165434593 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165434627 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 165434687 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165434750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165435006 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165435197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165435336 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165435340 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165435647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165435724 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165435749 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165435914 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165436707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165436750 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165436901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165436989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165437506 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165437682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165438024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165438145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165438973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165439829 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165440178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165441124 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165441785 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165442424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165442637 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 165444369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165444755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165444922 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 165446110 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165447169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165447257 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165447329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165447344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165447355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165447367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165447397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165447455 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 165447456 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165447540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165447593 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165447630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165447631 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165447657 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165447659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165447706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165447709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165447719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165448002 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165448022 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165448596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165448652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165449432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165449534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165450284 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165450421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165450696 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165450859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165450872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165451039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165451275 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165451903 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165452487 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165452588 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165452594 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165452684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165454123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165454363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165454561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165454636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165455276 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 165455442 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165456209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165456398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165456898 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165456904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165457130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165457155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165457173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165457314 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165457369 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165457861 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165458151 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 165458292 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165458325 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165458359 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165458447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165458791 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165458943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165460750 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165460787 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165460844 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165461319 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165462295 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165462430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165462643 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165462896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165463274 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165463582 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165464588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165464820 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165464830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165464895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165464995 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165465646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165466045 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 165466281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165466884 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 165466934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165467602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165474545 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165474549 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165474582 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 165474757 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 165474793 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165474915 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165474974 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165475027 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165475042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165475212 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 165475328 A G Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 165475569 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165475632 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165476426 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 165476506 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165477583 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165478225 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165478241 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165478251 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165478316 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165478323 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 165478965 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165479404 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165479560 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 165479702 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165480347 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165480830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165481340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165481392 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165481888 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165482137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165482147 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165482306 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165482573 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 2 165482594 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165482604 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165482640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165482822 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165483026 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 165483137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165483141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165483150 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165483179 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165484528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165484553 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165484651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165484670 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165484917 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165485303 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165485337 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165485671 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165485688 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165485739 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165485789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165486020 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165486031 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165486058 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165486113 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165486163 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165486172 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165486379 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165486394 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165486453 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165486737 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165486829 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 2 165486934 C T Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 165486984 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 165486992 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165487471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165487489 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165487608 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165487744 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165488002 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165488158 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165488503 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165488631 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165488796 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165489556 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165489830 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165491182 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165491331 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 165492130 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165492212 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165492331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165492536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165492983 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165494311 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165494717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165495595 C G Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 2 165495598 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 2 165495607 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 165495624 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 165495655 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 165496729 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 165498033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165506007 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165506033 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165506096 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165506358 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165506839 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165506849 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165506968 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165507645 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165508132 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165508207 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165508208 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165508296 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 2 165508439 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 2 165508456 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 2 165508505 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 165508524 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 165508531 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 165508660 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 165508779 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165508790 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165508819 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165508825 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165508874 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165508908 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165509428 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165509480 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165509702 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 165509907 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165510618 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165511260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165511411 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165512276 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165512290 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165512384 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165512429 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165512533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165513177 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165513977 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165514175 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165514699 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165515159 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165515565 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165515725 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165516142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165516545 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165516687 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165516695 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165516713 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165516826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165517071 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165517084 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165517474 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 2 165517496 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 165517537 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 165517538 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165517595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165518068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165518099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165518156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165519203 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165519228 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165519250 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165519259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165519283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165519340 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165519368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165519552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165520279 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165520345 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165520393 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165520397 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165520404 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165520456 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165520506 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165520526 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165520588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165520610 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165520646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165520657 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165520669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165520684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165520862 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165520917 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165521038 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165521055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165521911 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165522304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165522335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165522384 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165522385 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165522449 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165522491 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165522550 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165522700 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165522732 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165522895 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165523047 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165523067 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165523187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165523255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165523451 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165523533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165523536 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165523635 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165523668 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165523878 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165524057 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165524058 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165524099 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165524323 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165524343 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165524374 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165524377 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165524394 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165524417 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165524442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165524555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165524595 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165524676 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 165524678 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165524696 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165524763 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165524767 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165524801 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165524853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165524878 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165524930 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165524936 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 165524966 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165525136 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165525184 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165525763 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165525929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165526204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165526948 G A Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 165526954 G T Y N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 2 165527322 G A Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 165528361 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165528386 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165528493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165528782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165528816 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165528841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165529176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165529260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165529306 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165530320 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165530439 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165530775 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165530846 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165531632 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165531660 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165531831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165533338 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165533971 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 2 165534320 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 165535359 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165537089 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165537145 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165537256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165537514 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165537567 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165537682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165537730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165537765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165537827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165538192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165538286 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165538642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165538916 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165538923 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 165538936 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165538997 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165539160 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165539185 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165539215 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165539248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165539795 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165539802 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165539865 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165539915 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165540029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165540932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165541166 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165541192 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165541206 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165541265 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165541294 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165541429 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165541474 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165541552 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165541685 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165541813 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165541928 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165541929 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165541944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165542011 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165542053 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165542114 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165542128 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165542186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165542322 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165542502 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165542520 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165542569 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165542671 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 165542878 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165542910 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165542965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165543195 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 165543530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165543649 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165543666 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165543757 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165543820 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165543926 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165544097 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165544796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165545340 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165545348 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165545359 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165545542 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165545607 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165545678 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165545690 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165545945 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165545952 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165545997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165546001 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165546013 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165546183 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 165546410 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 165546440 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 165546553 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165546687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165546731 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165546738 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 165546754 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 165546995 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165547000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165547143 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 165547179 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 165547199 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165547250 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 165547260 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165547277 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165547278 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165547317 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 165547461 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 165547561 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 165547565 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165547606 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165547675 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165547816 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165547966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165548239 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165548444 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165548466 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165548521 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165548522 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165548556 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165548574 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165548587 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165548687 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 165548723 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 165548747 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 165548803 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 165549044 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 2 165549096 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 165549162 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165549175 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 165549186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165549230 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 165549233 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 165549353 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165549372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165549410 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165549422 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165549454 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165549472 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165549503 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165549966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165550386 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165550469 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 165550512 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 165550624 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 165551633 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165551804 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165551892 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 165551909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165552042 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165552133 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165552159 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165552220 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165552273 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165552626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165552708 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165552720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165552796 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165552818 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165552924 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165553330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165553359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165553449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165553709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165554145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165554443 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165554472 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165554800 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165554837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165555004 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165555041 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165555133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165555188 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165555193 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165555286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165558128 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165558343 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 165558464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165558902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165560330 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 165560487 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 165560493 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 165560515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165561182 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165562032 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165562443 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 165562482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165562803 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 165562804 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 165563008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165563018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165563419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165564675 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 165564687 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 165564891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165565111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165565275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165565831 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165565867 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 165565985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165567010 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 165568869 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 165569178 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165569807 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 165571100 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165571707 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 165571817 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165572588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165573474 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 165576034 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 165577973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165578270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165582908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165588296 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 2 165588705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165588949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165590578 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165590872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165592080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165592120 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 165592260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165592859 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165592969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165593015 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 165593054 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 165593112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165593145 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 165593245 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165593251 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165593266 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165593572 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 165594126 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 165594319 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 165595453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165595802 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 165595822 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 165595924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165595981 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 165596025 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 165596035 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 165596186 A T Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 165596461 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165596503 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 165596514 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 165596621 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 165596734 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165596946 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 165596965 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 165596971 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.210526315789474 30 8 15 0 4 2 165597257 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165597547 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165597567 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 165597705 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165597808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165597839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165597968 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 165598139 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 165599157 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 165599378 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 165599406 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 2 165599521 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 165599528 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 165599544 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 165599555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165599760 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 165599828 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 165600043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165600095 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 165600247 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 165600292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165600621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165600815 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 165600899 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 165601335 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 165601996 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 165602026 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 165602104 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 165602342 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 2 165602345 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 165602364 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 165602786 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 2 165602925 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 2 165602962 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165603047 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 165603224 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 165603378 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 165603442 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 165603587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165603661 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 165603684 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 165603829 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 165603861 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 165603872 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165604048 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 165604099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165605021 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 165605203 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 165605256 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 165605714 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 165605797 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 165605916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165605945 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 165607264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165607302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165608134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165608229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165608360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165608590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165608989 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 165609343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165609381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165609393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165610993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165611522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165611600 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165611607 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 165611628 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165611774 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 165612212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165612390 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 165613003 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 165613923 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 165614096 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 165614403 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165615450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165615474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165615644 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165616329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165616758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165617433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165618581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165619040 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 165619090 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 165619428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165619493 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 165619796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165619812 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 165619834 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 165619864 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 165620381 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165621172 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 165621208 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 165621359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165621442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165621669 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165622331 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 165622465 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165623544 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165623604 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 165623710 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165623727 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 165623843 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 165623957 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165623970 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165624039 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 165624042 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 165624186 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 165624236 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 165624280 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165624344 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 165624422 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 165624595 G C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 165625031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165625801 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165625885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165626091 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165626275 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165626502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165626889 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 165626902 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 165626943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165627169 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165627190 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165627250 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165627273 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165627286 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 165627316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165628160 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165628191 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165628289 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 165628311 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 165628403 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 165628412 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 2 165628423 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 165628489 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165628492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165628699 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165628709 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165628755 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165628802 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 165628813 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 165628879 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165629015 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165630140 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 165630564 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 165630565 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 165631137 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 165631306 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165632006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165632234 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 165632264 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 165632274 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 165632281 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 165632783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165632930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165635020 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165635990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165638541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165639515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165639733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165641632 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165642555 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 165642771 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 165642846 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 165642875 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 165642885 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 165642930 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 165642945 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 165642946 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 165643080 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 165644018 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 2 165644642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165645804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165647729 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165647734 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165648072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165648162 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165648426 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165648473 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165648608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165651485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165653580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165654402 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 165654616 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165655259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165655821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165655867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165657346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165657924 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165657931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165657937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165657977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165659565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165659602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165660471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165660555 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 165660669 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 165660726 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165660764 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 165661243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165662177 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165664104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165664676 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 165666485 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165666532 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165666585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165666680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165666915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165667699 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165667786 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165667878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165670098 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165670460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165670733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165670791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165672385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165673297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165676017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165677141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165677148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165677268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165677612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165677807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165678299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165679429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165685727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165687231 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 165687272 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 165687291 G C N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 165687332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165688610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165689176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165690034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165690148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165690175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165690385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165690414 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165691084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165691098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165691206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165691229 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165691363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165691761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165692422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165693280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165693547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165695609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165695740 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165696096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165696420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165697277 G T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 165697331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165697352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165697363 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165697436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165697457 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165697521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165697593 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165698262 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165698697 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165698916 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165699487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165699745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165700234 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165700354 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165700678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165701040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165701251 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165701655 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165701959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165702527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165704526 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165706317 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165706394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165707372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165707964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165708175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165708230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165708496 G C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 2 165709590 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165710901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165711178 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165712243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165716781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165717127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165718368 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165718643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165724011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165724949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165725950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165727471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165728794 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165729074 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 165729818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165735839 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165736988 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 165739084 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165740020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165740058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165741598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165742411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165742544 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165745262 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165745797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165746069 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165746588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165747013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165747455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165748093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165748203 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 165748262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165748286 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165748406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165748454 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165748528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165748688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165748712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165748815 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 165748938 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 165748961 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 165749432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165749734 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165750031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165750243 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 165750306 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 165750709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165750821 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 165751000 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 165751085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165751167 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 165751877 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165751878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165752583 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 165752649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165752800 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 165753071 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165753101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165753304 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 165753338 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165753571 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 165753701 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165753757 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 165753868 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 165759242 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 165759589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165759660 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165759915 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165760004 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 165760475 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165760529 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 165760980 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 165761149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165761283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165761293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165762677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165763079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165763117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165763384 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165763437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165763457 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 165763612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165763613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165764940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165765194 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165765325 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165765633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165765863 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165766164 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 165766258 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 165766378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165767026 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 165767347 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 165767657 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 165768615 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 165768769 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 165768892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165769543 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 165770374 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165770948 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165771767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165773035 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 165773209 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165774783 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 165775406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165775663 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 165776260 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 165776380 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 165776616 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 165776748 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 165776948 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 165777011 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 165777044 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 165777387 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 165777494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165777650 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 165777764 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 165778121 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 165778349 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165779313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165780198 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 165784406 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165785599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165785605 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165785801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165785812 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165785845 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165786051 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 165786993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165790831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165790914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165791326 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165791380 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165791498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165791517 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165791547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165791767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165792061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165792067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165792159 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 165792205 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165792317 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165792318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165792810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165793065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165793715 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165793857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165794689 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 165796659 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165798549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165798858 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 165798992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165800774 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165800853 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 165800923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165801105 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165801201 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165801322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165801548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165801991 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165802105 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165802631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165802717 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165802738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165802829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165802913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165803146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165803161 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165803289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165803389 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 165803441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165803446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165803533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165803567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165803780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165804022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165804100 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 165804238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165804526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165804533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165804711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165804907 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165805302 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165805979 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 165806565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165806969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165807011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165807113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165808161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165808795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165811620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165811763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165813972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165814228 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165815471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165817335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165820485 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 165820802 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165821434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165821679 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165821910 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165826384 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165826540 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165828279 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165828607 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 165829626 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 165830890 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165833039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165833095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165833568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165835207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165835713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165837451 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165838389 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 165838483 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 165839645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165842064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165843163 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165843689 G A Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 2 165846192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165850410 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165850595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165852129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165852698 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 165853658 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 165855859 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 165856620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165857085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165859228 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165860377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165861065 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 165861753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165862886 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165864022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165865445 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 165867538 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165867825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165869223 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 165873071 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165873147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165877712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165879139 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 165879577 G C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 165882204 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 165883274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165884404 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 165884578 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 165888346 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165889666 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165892701 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165894917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165897167 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165898601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165898959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165900442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165901105 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165902004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165902226 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 165902286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165903330 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165903338 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 2 165903615 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165903720 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 165903770 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 165904036 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 165904265 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 165904327 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165904391 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 165904694 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 165905587 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165905646 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 165905844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165905996 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165906020 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165906121 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165906146 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165906155 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165906159 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 165906303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165906455 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 165906724 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165906859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165907255 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165907297 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 165907311 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 165907420 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 2 165907748 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 165907874 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 165908039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165908631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165908648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165908760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165908864 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165908877 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 165908894 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 165908937 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165908985 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165909197 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165909239 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 165909244 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 165909261 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165909301 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 165909602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165909694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165909981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165910038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165910058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165910087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165910187 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165910547 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 165910596 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 165910643 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 165910736 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 165910842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165911938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165913169 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165913259 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165914296 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 2 165914342 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 165914574 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 165914743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165915490 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 165915767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165917099 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165917158 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 165917356 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 165917456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165917555 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 165917907 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 165918543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165919479 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165920723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165920735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165921819 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 2 165923159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165924638 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165924663 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 165924665 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165925215 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 165925251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165925256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165925419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165925453 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 2 165925564 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 165925633 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165925651 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 165926804 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 165926834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165927074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165928531 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 165928691 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 165928743 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 165928755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165928886 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165928962 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165929024 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165929040 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 165929196 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 165929210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165929469 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 165930239 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165930244 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165930284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165930860 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 165930916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165931043 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165931093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165931226 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 165931266 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 165931286 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 165931405 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 165931474 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 165931491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165931549 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 165931574 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 165931627 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165931759 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 165932080 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 165932257 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 165933968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165934347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165934403 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165934747 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 165935091 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165935124 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 165935755 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165935812 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 165935867 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 165935873 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 165936320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165936693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165936709 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 2 165937215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165937615 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165937819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165938364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165938450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165938638 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165938722 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165938903 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165939402 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 165939559 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 165939636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165939639 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165939690 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 165939909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165940068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165941130 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 165942754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165945166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165945189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165945382 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165945423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165945437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165945447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165945482 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165945515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165945537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165945607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165945692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165946533 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 165946804 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 165946806 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 165946931 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 165946951 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 165946982 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 165947011 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 165947067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165947155 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 165947173 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165947180 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 165947241 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 165947419 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165947724 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 165947880 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 165947971 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 165948033 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 165948113 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 165948114 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 165948145 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 165948281 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 165948298 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 165948312 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 165948314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165948417 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 165948650 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165948669 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165948844 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 165949175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165949218 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 165949305 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 165949378 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 165949529 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 165949655 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165949680 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 165949690 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 165949715 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165949736 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 165949771 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 165950149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165950234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165950255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165950284 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 165950508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165950542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165950762 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165950781 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165950811 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 165950904 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 165950909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165950929 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 165950970 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 165950997 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 165951025 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 165951270 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 165951327 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 165951681 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165951909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165952116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165952124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165953188 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 165953198 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 165953307 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165954708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165954759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165955074 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 165955082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165955875 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 165956077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165956086 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 165956173 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165956186 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165956256 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165956575 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165956597 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165956699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165956721 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 165956778 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165956811 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165956812 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165956859 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 165956870 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165957028 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 165957038 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165957039 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165957583 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165957633 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165957693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165958468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165958692 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165958847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165958912 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165958983 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 165959165 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 165959260 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 165959443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165959450 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 165959515 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165959627 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 165959657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165959819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165959872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165959991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165960459 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 165960971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165961022 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165961167 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165961287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165961362 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 165961666 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165961782 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 165962051 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165962098 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 165962134 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 165962142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165962298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165962453 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165962454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165962521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165962550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165962710 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165963349 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 165963401 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165963665 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 165963788 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165963877 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 165964120 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 165964289 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 165964312 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165964397 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 165964426 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165964432 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165964449 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165964489 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165964569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165964641 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 165964703 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 165966163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165966954 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 165967279 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165967364 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165967386 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165967961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165968037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165968045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165968162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165968170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165968540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165969505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165972228 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165972235 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165974480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165974958 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 165976686 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165978109 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 2 165978601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165978960 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165979014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165982261 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165983625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165983812 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165985178 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 165985293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165985694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165986674 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 165988631 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 165988703 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 165989409 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165991215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165991403 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 165991603 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 165994362 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 165994409 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 165995378 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 165995439 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 165995494 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 165995586 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 165995656 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 165995904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165996063 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165996149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165996531 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 165996771 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 165997520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165998146 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 165998268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165998305 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 165998569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165998653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165998868 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165998870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165999011 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 165999065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165999068 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165999185 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 165999237 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 165999418 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 165999432 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 165999449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165999744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165999811 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 165999836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 165999883 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 165999908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166000036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166000069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166000129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166000243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166000249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166000302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166000311 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166000318 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 166000345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166000353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166000723 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 166000828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166001234 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 166001241 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 166001283 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 166001434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166001627 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 166002110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166002980 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 166003230 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 166003273 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 2 166003274 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 2 166003307 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 166003339 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 166003418 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 166003505 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 166003703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166003755 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166003858 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 166003859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166003901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166003972 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 166003987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166004040 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166004044 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166004059 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 166004124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166004181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166004190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166004250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166004381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166004419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166004507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166004850 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166005157 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166005191 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 166005217 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 166005445 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 166005470 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166005590 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 166005647 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 166005657 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 166005715 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 166005809 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 166005978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166005984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166006004 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166006032 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166006113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166006478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166006686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166006837 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 166006886 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166006904 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166006952 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 166007147 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166007219 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 166007233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166007381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166007407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166007514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166007515 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 166007542 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 166007554 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 166007562 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 166007569 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 166007573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166007715 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166007745 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 166008085 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 166008154 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 166008158 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 166008227 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 166008318 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 166008416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166008424 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 166008431 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 166008437 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 166008452 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 166008490 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 166008509 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 166008523 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 166009175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166009195 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 166009206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166009210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166010652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166010751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166010974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166010978 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 166011043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166011816 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 166011963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166011981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166012239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166012916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166012939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166014174 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166014591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166014593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166015640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166015869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166017752 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 166017755 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 166018997 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 166019120 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 166019172 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 166019197 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 166019215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166019404 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166019518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166019945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166020145 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 166020170 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 166020697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166021290 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166022853 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 166022872 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 166023818 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166023839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166024020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166024034 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 166024055 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 166024097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166024110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166025566 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 166025743 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166025761 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 166025768 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 166025808 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166026227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166026270 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166026295 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166026372 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166026537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166026619 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166026701 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166026756 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166026833 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166026920 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166027178 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166027295 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166027355 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166027515 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166027546 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 166027555 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166027624 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166027666 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 166027744 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166027788 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166027802 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166027842 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166027889 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 166027895 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 166027945 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166027947 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166028315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166028645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166028665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166028668 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166028698 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166028744 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 166028784 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 166028946 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 166028961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166029155 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 166029164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166029267 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 166030327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166030374 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166030395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166030396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166030415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166030469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166030608 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166030618 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166030638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166031031 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166031045 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 166031050 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 166031056 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 166031428 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 166031513 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 166031618 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166031722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166032127 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 166032249 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 166032906 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 166034708 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 166035338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166035476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166037480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166037693 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166037732 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166039791 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166040107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166041031 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 166041557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166042691 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166043010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166043307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166043485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166043871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166043897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166046009 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 166046170 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166047183 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 166047489 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166047640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166048522 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 166049035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166049520 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 166050408 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 166051369 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166051468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166051487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166051654 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 166051682 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 166051956 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 166053027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166054756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166058406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166059637 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 166061043 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166061281 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166061399 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166062324 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 166063051 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 166063170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166064261 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 166064398 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 166065102 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166065890 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 166066319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166067681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166068481 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 166070213 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166070734 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 166070735 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 166070799 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166072119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166072983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166078046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166079011 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 166080616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166080738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166081246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166082849 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166085443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166086232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166087923 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 166088164 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166088468 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 166088497 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 166089092 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166089500 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166089905 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 166090017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166090649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166091029 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 166091754 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166092466 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166093553 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166093709 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 166093816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166093908 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 166093971 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 166094023 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166094212 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166094247 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166094296 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 166094467 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166094897 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 166095171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166095218 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 166095260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166095298 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 166095531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166095897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166096422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166096750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166096976 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166097273 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 166097998 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 166098486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166098593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166098594 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166099101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166099131 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166099648 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166099675 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166099699 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166099725 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166099816 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166099836 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 166099864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166099904 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 166099913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166099960 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166099973 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166100279 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 166100502 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 166101769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166101867 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 166101955 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166102721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166102851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166103339 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166103340 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166103422 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166103525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166103839 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 166103971 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 166104070 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 166104159 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 166104242 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166104310 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166104328 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166104766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166104798 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166104840 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166104918 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166105080 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166105146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166105367 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166105636 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166105694 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166105702 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 166105764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166105832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166105947 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 166105978 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166106051 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 166106053 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 166106081 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166107648 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 166107731 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166107766 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 166107815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166108318 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 166108447 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166108454 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 166108502 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166108504 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 166108608 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 166108685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166108748 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 166108778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166108779 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166108799 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 166108885 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 166108988 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 166109047 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 2 166109092 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 166109248 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166110122 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 166110201 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 166110238 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166110283 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166110319 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166110419 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 166110468 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 166110478 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166110484 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166110534 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 2 166110607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166110630 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 166110740 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 166110756 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166110768 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 166110807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166110916 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166110918 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166110929 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166110954 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166110964 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166110981 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166110984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166111067 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 166111241 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 166111254 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166111270 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166111305 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 166111439 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 166111854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166112306 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 166112485 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 166112533 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166112536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166112570 C G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 166112854 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 166112890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166113012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166113185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166113197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166113405 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 166113873 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 166113898 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166113963 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 166113980 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 166114198 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 166114315 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166114321 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166114378 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166114380 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166114407 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166114436 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166114482 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166114579 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166115098 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166115487 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 166115526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166117773 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 166117852 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 166120440 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 166120551 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166120881 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 166121166 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166121204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166121224 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166121825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166121871 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 166122863 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 166122978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166123003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166124231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166127133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166130950 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 166131521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166131545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166131564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166131701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166132087 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166135877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166137058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166139674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166140232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166140240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166140743 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 166140847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166140889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166140897 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 166140905 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 166141171 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 166141260 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166141714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166144390 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 166144498 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 166144512 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 166144692 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 166144950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166145726 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166146955 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166146990 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 166147239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166147401 G T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 166147731 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 166147882 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 166148055 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 166148296 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166148858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166149037 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 166149047 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 166149085 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 166151213 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 166151267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166151362 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 166151407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166151678 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 166151752 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 166151765 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 166151902 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 166151985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166152001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166152023 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 166152045 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 166152049 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 166154245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166154263 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 166155097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166156022 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 166156137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166156874 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166156903 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 166156919 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 166157029 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166157067 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166157158 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166157438 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 166157515 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 166157526 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 166157591 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 166157625 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 166157648 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166157665 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 166157786 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 166157832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166157848 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166157910 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 166158648 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 166159486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166159498 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166159769 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 166159851 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 166160080 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166160096 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 166160322 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 166160340 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166160570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166160580 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 166160693 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 166160868 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166160908 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 166161004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166161140 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166161515 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166161547 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166161645 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166161791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166164510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166164912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166166444 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166167984 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166168184 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 166168934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166168987 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166169497 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 166169656 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 166169856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166171513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166172833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166173162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166174028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166174237 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 166174314 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 166174391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166174618 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166174740 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 166174807 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 166175481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166175522 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166175818 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166175989 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166180237 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 166180378 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 166180410 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 166180581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166180602 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 166180610 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166180641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166180642 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166180662 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 166180663 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166180689 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166180754 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 166181028 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 166181127 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166181352 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166181941 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166182408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166182676 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 166182819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166183803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166186958 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166186974 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 166186990 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 166187025 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 166187041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166187054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166187096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166187136 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166187175 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166187192 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 166187383 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 166187400 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 166187401 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 166187704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166187832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166187840 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166187961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166189504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166189825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166189865 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166189878 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166189972 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 166190666 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166190784 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 166190836 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 166190845 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 166191034 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 166191177 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 166191385 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166191388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166191466 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166191511 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166191692 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 166192193 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166192337 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166192362 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 166192576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166192998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166193249 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 166193473 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 166193733 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166193859 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 166193886 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166193920 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166193954 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166193975 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 166194053 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 166194239 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166194249 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166194298 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 166194392 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166194394 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166194476 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166194492 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166194505 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166194873 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166195068 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166195105 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166195131 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166195419 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 166195438 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166195500 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166195576 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 166195702 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166195742 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166195745 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166196880 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 166197319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166198681 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166199050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166200156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166200322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166200574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166200611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166200612 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166200685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166200736 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166200809 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166200845 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166200897 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 166200913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166201134 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 166201439 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166201673 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 166201845 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 166202118 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 166202146 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 166202149 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166202179 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 166202189 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 166202265 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166202279 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166202339 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 166202459 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166202487 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 166203094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166203161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166203162 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 166203187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166203306 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 166203396 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166203581 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 166203663 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 166203725 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166203743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166203800 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166203813 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 166204456 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166205768 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 166206079 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166206095 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166206259 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166206359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166206371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166206384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166206565 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 166207688 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 166207691 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 166207713 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166207754 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166207779 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166207848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166207893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166208223 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166208371 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166208385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166208386 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166208696 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166208738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166208748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166208809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166208842 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166208950 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166209041 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166209132 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 166209138 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 166209537 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166209965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166210326 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166210434 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166210732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166210772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166212057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166212069 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166212101 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166212752 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 166212758 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 166212806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166213556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166214391 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166214617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166214998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166215048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166215056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166215071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166215110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166215652 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166215661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166215691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166215706 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166215733 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166215750 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 166216502 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 166216969 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 166216979 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166217830 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166218408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166219918 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166219933 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166220778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166222934 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 166222989 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 166223092 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166223097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166223106 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 166224029 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166224041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166224058 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166224092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166224093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166224271 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 166224641 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166224661 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166225077 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166225773 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 166225935 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166226091 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 166226112 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 166226150 A T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 166226182 G A Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 166226346 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 166226362 C G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 166226373 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 2 166226391 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 166226470 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 166226717 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 166226922 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166226928 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166226935 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166229226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166232260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166232422 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166232432 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166232433 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166233317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166233336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166233499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166233961 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166234070 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166234102 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166234106 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166235191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166235604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166235900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166236232 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166236345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166237845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166240069 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 166240128 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 166240513 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 166241129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166241512 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 166242132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166242688 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 166242796 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166242861 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 166243460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166245075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166245171 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 166245619 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 166245681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166245791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166245892 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 166245965 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166247212 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 166247259 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 166247262 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 166247270 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 166247348 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 166247473 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 166247594 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166247649 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166247741 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 166247755 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166247765 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 166247982 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166247989 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166248507 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 166248554 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 166249813 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 166249970 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 166250094 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166250199 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 166250456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166250558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166250860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166250861 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166250916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166251628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166251630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166251645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166251684 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166251923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166252254 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 166252303 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 166252420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166254028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166254723 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 166254980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166256570 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166256581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166257496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166259009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166259677 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 166261057 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166261099 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166261188 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 166261293 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166261316 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 166261529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166261676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166261702 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 166261828 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 166261899 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 166261903 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 166261984 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 166262367 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 166262404 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 166262460 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 166262469 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 166262686 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166263002 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166263016 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166263055 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 166263149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166263181 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166263339 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 2 166263555 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166263560 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166263578 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166263611 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166263677 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166264404 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 166264406 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 166264958 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 166265295 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 166266146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166266487 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166267526 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166268093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166268129 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166268181 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166268434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166268460 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 166269016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166269038 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166269454 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166269598 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166269682 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 166269861 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 166270645 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166270656 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 166270678 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 166270844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166270944 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166270963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166271158 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 166271763 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 166271915 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 166271925 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 166272073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166272251 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 166272416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166272598 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 166272685 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 166272773 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 166272861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166273713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166275025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166276329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166276867 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166276896 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166276960 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 166276964 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 166277688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166277736 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166277743 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 166278226 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 166278227 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166278569 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 166278659 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 166278688 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166278740 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 166278856 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 166278896 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 166279024 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 166282775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166283194 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 166283195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166283316 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 166284394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166285768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166288498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166289509 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 166290335 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 166290561 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 166290886 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 166290895 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 166290947 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 166290965 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 166291040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166291054 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166291175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166291547 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166291553 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166291688 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166291689 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166292176 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166292688 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 166292704 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166293375 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 166293402 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 166293662 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 166294124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166296025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166297904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166298010 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 166298022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166298038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166298668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166299181 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 166300790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166302571 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 166302907 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166303317 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166303384 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166303409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166303611 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166303681 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 166303744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166303961 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166304122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166304142 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 166304198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166304401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166304420 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 166305042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166307134 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166307136 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 166307165 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 166307173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166307196 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166307203 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 166307209 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166307233 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 166307317 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 166307337 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 166307354 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 166307500 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 166307623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166307775 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166308000 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166308002 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 166308686 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166309078 A G Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 166309109 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 166309187 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 166309279 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 166309310 A T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 2 166309314 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 166309373 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 166309629 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166309656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166309703 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 166309749 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166309971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166310083 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166310152 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 166310331 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166312652 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 166312817 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 166313459 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 166313531 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 166313699 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 166313779 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166313795 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 166314555 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166314603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166315228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166315861 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 2 166316568 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166316675 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166316710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166316801 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166316882 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166316948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166316980 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166317073 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166317079 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166317208 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 166317217 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 166317227 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 166317318 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166317325 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166317337 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166317408 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166317420 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166317442 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166317480 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166317521 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166317557 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166317687 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 166317738 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166317778 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 166317805 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 166317916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166318012 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166318018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166318033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166318035 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 166318062 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166318201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166318317 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 166318362 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166318439 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166318462 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166318473 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166318827 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166319224 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166319350 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 166319865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166319918 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 166320155 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 166320235 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166320278 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 166320326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166320349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166320456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166320563 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166320583 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166320761 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166320769 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166320780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166320823 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166321389 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166321400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166321459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166321500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166321519 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166321567 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166321570 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166321601 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166321704 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166322052 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 166322117 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 166324400 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 166324733 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166324743 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 166324824 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166324926 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166325116 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166325320 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166326064 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 166326576 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166327227 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166327255 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 166327604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166328375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166328514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166328598 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 166328874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166333710 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166334009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166335208 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166336375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166336546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166337034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166337148 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 166337527 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166337597 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166339296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166339362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166339573 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166339575 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166339750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166339782 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166339854 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166340576 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 166340615 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 166340622 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 166340702 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 166340736 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 166340788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166340899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166340953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166341067 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166341094 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166341187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166341254 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 166341981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166342010 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 166342038 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 166342164 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 166342388 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 166342405 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 166342407 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 166342609 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 166342866 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166342890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166342891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166342957 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166342973 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166342978 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166342985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166342990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166343076 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 166343610 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 166343815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166344022 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 166345034 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166345261 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166345308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166345780 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 166347236 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 166347854 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 166349079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166349120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166349626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166350031 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 166350337 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 166350595 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166350662 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166350675 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166350702 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166350741 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166350792 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 166351020 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 166351250 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166352008 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 166354149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166354817 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 166355774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166360825 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166363199 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 166363290 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 166363400 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166363439 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166363500 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 166363631 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 166363644 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166363664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166363813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166363998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166364010 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166364123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166366383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166366554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166367699 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166368894 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 166368898 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 166368926 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 166368997 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 166369015 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 166369147 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 166369218 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 166369224 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 166369232 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166369288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166372676 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166373724 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166373751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166373833 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 166374025 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166374196 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166374207 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166374856 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 166375040 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166375088 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 166375137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166375210 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166375228 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 166375281 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 166375492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166375871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166375878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166375901 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 166376090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166376161 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 166376186 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 166376216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166376257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166376380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166376411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166376416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166376577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166376605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166376631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166376648 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166376714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166377608 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 166378359 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166378659 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166378832 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 166378875 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166378888 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166378976 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 166379033 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 166379075 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 166379364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166379779 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 166379804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166380317 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 166380461 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 166380517 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 166380527 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 166380553 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 166380599 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 166380602 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 166380617 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 166380620 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 166380643 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 166380668 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 166381046 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 166381247 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166381278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166381486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166381974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166382286 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166382305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166382344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166382368 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 166382502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166382733 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166383691 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 166384194 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 166384864 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166385103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166385118 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 166385139 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 166385231 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 166385262 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 166385851 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 166385931 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 166385961 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166385985 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 166386041 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 166386043 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 166386098 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386231 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386264 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386331 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386349 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386361 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386377 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386425 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386437 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386508 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 166386551 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386605 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386710 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 166386821 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386825 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166386877 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166387263 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166387311 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 166387408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166388013 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 166388030 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 166388047 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 166388081 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 166388093 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 166388124 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 166388168 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 166388278 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 166388345 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 166388355 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 166388368 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 166388370 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 166388390 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 166388815 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166388828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166388843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166388886 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166388888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166389054 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 166389080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166389147 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 166389440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166389477 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 166389546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166389557 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 166389632 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 166389759 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 166390080 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166390149 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 166390152 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 166390184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166390197 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 166390243 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 166390280 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 166390330 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 166390331 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 166390370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166390387 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 166390400 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 166390431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166390725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166390761 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 166390762 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 166390920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166391125 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 166391309 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 166391315 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166391467 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166391476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166391525 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 166391558 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 166391572 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 166391675 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 166391683 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166391699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166391701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166391742 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 166391831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166392137 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 166392399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166395823 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 166395915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166395936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166396580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166396773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166398171 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 166399465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166400267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166400372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166400446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166400941 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166401202 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 166401211 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166401348 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 166401492 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 166402174 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 166402434 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 166402556 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 166402636 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 166402710 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166403873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166404091 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166405477 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166405508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166405533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166405619 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166405651 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166406426 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 166406752 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166407106 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166407140 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166407165 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166407219 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166407220 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166407881 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 166407885 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 166407919 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 166407948 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166407998 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 166408000 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 166408282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166408345 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166408350 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166411395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166412965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166412969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166413091 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 166413787 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166413942 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166413944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166414013 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166414171 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 166414200 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 166414679 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 166414703 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166414709 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166414777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166414861 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166414871 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166415837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166415844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166415896 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166415908 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 166416530 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 166416556 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166416660 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 166416662 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 166416676 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 166416824 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166416825 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166416853 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 166416962 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 166416970 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 166416992 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 166417251 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 166419709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166419756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166421100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166421472 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 166421703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166421751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166422091 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 166422333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166422960 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 166422990 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 166423005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166423552 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166427481 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 166432981 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166433707 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166434316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166436089 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 166437168 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 166437433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166437441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166437482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166437484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166438052 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 166441387 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 166441491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166441564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166443024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166443027 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166443240 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166443623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166443747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166446996 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166447030 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166447362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166447479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166447517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166447568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166447650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166447716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166447741 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166447751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166447815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166447841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166447888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166449145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166450202 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 166450243 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166450256 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166450355 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 2 166450419 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 166450457 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 2 166450488 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 166450508 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 166450562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166451539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166451604 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 166452280 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 166452404 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 166452418 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 166452465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166452478 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 166452536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166452586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166452654 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 166452655 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166452700 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166452760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166453309 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166453423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166453644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166453794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166453816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166453827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166454068 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 166454563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166454602 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 166454671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166454760 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166454778 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166454787 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166454896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166454907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166455049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166455167 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 166455215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166455829 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166456025 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 166456415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166458270 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166458376 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 166458545 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166458706 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 166459011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166459039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166459100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166459118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166459202 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166459669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166459747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166459766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166459901 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 166459918 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 166459937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166460030 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166460087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166460103 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166462665 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166463051 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166463193 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 2 166463206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166463230 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 166463266 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 166463899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166463979 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 166464027 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166464109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166464132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166464246 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 166464263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166464277 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 166464366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166464378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166464442 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 166464525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166464584 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166464703 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166465175 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 166465349 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 166465479 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 166465655 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 166465673 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 166465696 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 166465801 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166465919 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166465976 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166465997 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166466002 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166466015 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166466088 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166466131 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166466230 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166466261 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166466355 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166466407 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166466421 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166466427 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166466436 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166466457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166466551 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166466595 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166466712 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166466723 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166466762 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166467616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166467690 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 166467752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166467984 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 166468238 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 166468753 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 166468882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166469265 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 166471413 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 166472779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166472841 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166472848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166473386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166473821 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 166473904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166473917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166473997 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166474002 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 166474016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166474046 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 166474169 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 166474510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166474651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166474656 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 166476283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166476324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166476448 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 166476504 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 166477451 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166477527 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166477580 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 166477983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166478456 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 166478887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166481100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166481211 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 166481337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166481546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166481946 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 166481975 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 166482016 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166482224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166484356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166485340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166486473 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166487081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166487086 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 166487110 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166487114 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 166487245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166487296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166488011 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166488805 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 166489680 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 166490128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166490152 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 166491097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166491553 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166491606 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166492029 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 166492512 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 166492539 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 166492830 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 166493493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166493888 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 166493958 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166494166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166494364 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166494420 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 166494454 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 166494712 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 166494800 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166495022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166495751 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166496016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166496632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166496768 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166496796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166496909 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 166497201 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 166497217 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 166497892 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 166497946 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166498044 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 166498303 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166498388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166499304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166499305 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 166500500 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 166500719 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 166500735 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 166500763 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 2 166500764 C T N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 2 166500877 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 2 166500902 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 166500923 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 166500948 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 166500968 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166501397 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 166501482 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 166501516 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 166501773 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 166501855 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 166502901 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 166502937 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 166503222 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 166503675 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 166503929 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 166504076 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166504146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166504220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166504229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166504252 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166504329 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 166504401 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 166504545 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 166504998 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166505070 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166505114 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 166506997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166507215 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166507648 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 166510098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166511143 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 166513266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166518541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166519473 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166519533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166520285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166523358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166525914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166526137 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166527173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166528980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166529892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166530462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166530894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166532594 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 166532641 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 166532898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166533108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166533429 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166533485 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166534386 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 166534681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166535205 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166535236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166535258 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166535343 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166535387 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166537105 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 166537295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166537398 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166537550 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 166538679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166540456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166540724 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 166540851 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 166541085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166541462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166541896 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 2 166542430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166542486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166542509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166542516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166542922 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166542958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166542959 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166543287 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166543327 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166543687 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166543706 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166543767 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166543781 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166543802 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166543984 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166544069 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166544080 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166544573 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 166544593 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 166544830 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166544891 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166547928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166550327 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 166550629 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 166553825 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166553919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166553951 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166555338 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166556214 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 166556333 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166556470 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166556510 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166556527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166556630 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 166558396 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 166558422 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 166558426 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 166558440 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 166558496 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166558528 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 166558540 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166558582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166558827 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166559233 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 166559989 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166559993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166560010 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166560057 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 166560169 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166560283 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166560452 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166560511 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 166560672 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166560698 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166560705 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 166560755 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166560913 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 166561161 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166561167 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166561624 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166561804 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 166562721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166562930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166562934 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 166563779 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 166563943 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 166564018 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 166564020 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166564260 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 166564599 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 166564863 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 166565012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166565095 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 166565157 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 166565169 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 166565325 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166565347 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 166565359 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166566823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166567658 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 166572191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166572239 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 166572353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166572804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166573383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166573742 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166573943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166574317 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 166577446 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 166578259 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 166578312 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 166578488 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 166578574 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 166578634 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 166578714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166578803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166579199 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166579336 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 166579451 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166579742 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166579841 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 166580724 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166581131 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 166581305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166581325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166581812 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 166581872 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 166582012 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166582026 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166582147 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166582534 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 166582651 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 166582664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166582692 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 166582701 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 166582726 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166582729 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 166582769 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166582781 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 166583086 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 166583212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166583247 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166583402 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 166583568 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 166583808 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166584011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166584107 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 166584244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166584601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166584653 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 166584915 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 2 166585203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166585206 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 166585529 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 2 166586238 G T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 2 166586914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166587604 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 166587737 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 166589721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166592114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166592135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166594382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166595181 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 166596471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166598438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166599439 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166600003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166600041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166601551 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166604726 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166605512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166605632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166606830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166612215 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 166614300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166614591 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166614686 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 166614710 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 166616333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166616594 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 166616862 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 166617689 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 166617948 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 166618008 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 166618025 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166619108 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166619519 T G N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 166620310 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 166621248 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 166621886 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166621902 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166622052 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166622110 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 166622205 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166622268 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166622282 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166622337 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 166622560 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166622962 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166623141 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166623181 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 166623442 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166623494 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166624018 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 166624043 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 166624144 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166624187 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 166624198 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 166624288 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 166624346 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166624380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166624383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166624394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166624422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166624530 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 166624676 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166624682 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166624694 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166624699 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 166624781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166624831 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166624927 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 166625728 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166628427 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 166629346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166633025 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166634118 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 166634818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166635513 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 166646474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166649480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166649510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166654446 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166654994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166655335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166657493 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 166661133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166661824 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166661971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166663350 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 166664397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166666760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166666772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166669190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166669586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166669627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166670663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166671558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166671831 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 166671934 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166672543 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 166675258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166677305 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 166677730 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 166678128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166679359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166679824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166682422 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 166683512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166684639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166685260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166686301 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166686536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166686801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166686963 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 166686977 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 166687828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166689322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166689541 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166689583 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166689642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166689675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166689762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166693146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166693581 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166694616 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 166694712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166694826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166694849 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 166694953 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 166695108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166695144 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166695991 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166696016 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 166696069 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 2 166696102 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 166696308 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166697068 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166697649 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 166697658 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 166697675 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 166697678 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 166697949 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 166697954 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 166698052 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 166698327 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 166698349 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 166698465 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 166698571 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166698606 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166698648 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166698711 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 166698729 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 166698737 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 166698749 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 166698903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166699290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166699340 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166699372 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166699633 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 166699843 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 166700306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166700325 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166700386 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166700436 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166700469 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166700724 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 166700894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166701160 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 166701248 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 166701278 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 166701303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166701509 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166701652 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166701748 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166701789 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166701814 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 166701875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166701901 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166701925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166702366 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166702538 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 166702616 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166702653 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 166702788 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 166702798 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 166702812 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 166702855 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 166702976 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 2 166703019 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 166703081 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 2 166703375 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 166703424 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 166704264 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 166704418 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 166704599 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 166704608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166704674 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 166704775 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166704783 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166704832 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166704891 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166705102 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 166705378 G T Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 166705425 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 166705439 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 166705477 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166705601 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 166705639 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 166705668 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 166705739 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 166705751 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 166705752 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 166705926 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 166705928 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 166705937 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 166706005 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 166706195 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 166706331 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 166706447 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 166706943 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 166706969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166707003 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 166707057 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 166707087 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 166708834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166708978 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166710123 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166710324 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166710436 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166711001 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 166711826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166712103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166712754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166714128 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 166714282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166715351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166725058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166726067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166730906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166733388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166735805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166737096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166739871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166741001 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166741289 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166743598 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166744115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166744160 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 166744172 G A Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 166744525 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166748555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166749983 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166750604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166751157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166751216 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 166751490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166751603 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166752607 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166752725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166753438 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 166754605 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166754872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166755053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166755697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166756173 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166756193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166756247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166756764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166757304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166758612 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 166759331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166759906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166759966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166762385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166762461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166764350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166765423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166765528 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 166765576 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 166766591 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166767860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166768270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166768837 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 166773061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166779443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166779867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166781951 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 166782599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166783430 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 166785256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166787799 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 2 166787821 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 166787839 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 166789170 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166791889 A C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.0714285714285714 14 14 1 12 1 2 166792265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166795858 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 166795913 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 166798485 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166798991 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 166803471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166804722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166805866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166808211 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166810062 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 166810721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166810800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166812569 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 166813038 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 166813157 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166814318 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166814630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166814746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166814812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166814861 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166816532 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 166820511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166822906 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 166823548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166826064 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166826153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166826843 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166827541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166828607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166828705 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166830013 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166830142 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166830183 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166830188 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166830551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166830662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166830885 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166831212 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166831213 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 166831626 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166831891 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 166832130 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166832265 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 166832285 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 166832544 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166833381 G C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 166833388 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 166833461 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 166833855 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 166833950 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166834387 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166834706 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166835794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166836027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166836245 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166836683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166836762 C A N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 166837067 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166838490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166838681 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166839198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166840063 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 166840201 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166841619 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166841622 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166844324 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 166844504 A T Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 166846920 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 166847104 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166847772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166850318 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166850648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166851978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166855604 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 166856077 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166856329 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166860662 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166861677 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166861735 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166864124 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 166868664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166868859 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166869267 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166869277 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 166869807 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166870123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166870740 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 166870778 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 2 166871773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166874877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166878055 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 166879274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166879385 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 166880634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166881252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166885683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166889540 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166890163 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166891846 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 166892032 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 2 166895063 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166896078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166896937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166899137 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166900046 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166900183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166900422 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 166901699 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166904607 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166905093 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 166906081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166908555 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166910079 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166910081 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 166910529 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166912915 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166912936 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 166912961 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 166913101 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166914151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166914796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166915311 T A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 166915350 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 166915593 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 166919176 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166919330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166919861 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 166919964 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166921355 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 166922476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166924848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166924865 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 166924903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166925416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166925808 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166926474 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166926510 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166926550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166929751 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 166930216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166935375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166936468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166938596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166940237 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 166940506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166942450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166942627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166944021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166949451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166949775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166950492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166952798 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 166954140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166954144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166954159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166954452 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166956059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166957162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166957668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166958846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166959841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166959996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166960134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166960809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166961743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166961801 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166962154 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166962157 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 166962384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166962951 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 166963492 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 166963498 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 166963511 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 166963537 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 166963743 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 166963806 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 166964102 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166964125 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166964259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166964677 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 166965334 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 166965509 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166965580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166966233 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 166966265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166968223 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166968267 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166968301 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166968636 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166968672 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166968680 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 166968716 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166968871 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 166968882 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166969060 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166969261 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166970468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166971317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166971753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166972131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166972377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166972620 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 166972758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166973123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166973443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166973465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166973531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166973813 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 166974327 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 166974344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166975847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166975987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 166978943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166982754 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 166983296 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 166983497 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 166983827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166986819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166989284 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166991685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166992313 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 166994435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 166997737 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 166997973 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 167003671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167003702 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167004040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167006421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167007816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167007818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167008338 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167009411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167012497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167012645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167016347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167018515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167021949 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 167023120 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167023226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167025590 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 167025820 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 167025998 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 167026269 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 167026394 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 167026471 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 167026565 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 167026639 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 167026726 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 167026852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167027114 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 167028622 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 167029717 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 167031169 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 167031206 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 167031426 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 167031543 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167031611 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 167031772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167031913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167031957 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 167032085 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 167032421 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 167032637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167033392 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 167034161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167034959 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 167034971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167035029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167035037 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167035057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167035060 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 167035743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167036176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167036669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167037100 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 167037466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167038503 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167038513 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 167038929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167039008 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 167039226 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 167039266 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 167039318 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 167039332 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 167039338 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 167039404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167039505 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 167041872 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 167045673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167046224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167046812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167047082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167047844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048192 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048530 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167048585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048670 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048677 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167048711 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048968 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167048977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167049845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167049857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167049946 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167049949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167049970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167049985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167050047 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167050081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167050136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167050226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167051141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167052064 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 167052142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167052526 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167052539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167054552 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 167055023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167055169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167055200 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167055772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167055816 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167056235 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167056448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167056647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167057792 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 167057796 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 167058033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167058370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167058701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167058794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167058983 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167059250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167059317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167060658 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167060911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167062110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167063023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167064397 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167064608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167067767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167069440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167069634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167070246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167070638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167070789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167070833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167071120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167071453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167071463 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167071566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167071726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167071744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167071763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167072481 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167073107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167073894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167074238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167075272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167076913 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167076958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167078195 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167079532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167080525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167081010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167081828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167082007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167082828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167082840 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167084112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167085341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167085583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167085594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167085623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167085634 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167085650 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167085661 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167085693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167087065 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167087334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167088174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167088182 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167088838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167089303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167089310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167089356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167089386 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167089406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167089787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167090306 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167090489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167090593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167091238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167091305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167091344 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167091361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167092296 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167092375 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167092390 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167092430 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167092543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167093786 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167094521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167095756 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167095810 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167095816 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167096192 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167096245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167096609 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167096799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167097021 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167097022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167097672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167097970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167098164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167098234 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167098602 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167098683 T A N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 167098893 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167099184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167099340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167100526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167101259 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167101342 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167101358 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167101411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167101483 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167101557 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 167101603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167101632 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 167101873 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167101919 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 167101932 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 167101946 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167102164 T C Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 2 167102220 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 167102324 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 167102417 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 167102561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167103399 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 167103413 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167103623 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167103724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167104271 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167104901 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167104916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167105438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167106665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167106811 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 167107291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167107916 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 167117081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167117511 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167117693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167117696 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167117934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167118036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167118359 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 167118456 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167119538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167119549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167119847 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167120026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167120060 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 167120293 T A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 167120304 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 167120486 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 167120947 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.0714285714285714 14 14 1 12 1 2 167122132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167124183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167125078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167129627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167129967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167134857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167134913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167138166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167141425 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167141645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167141696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167144914 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 167144917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167150761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167151352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167153365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167154279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167154884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167155178 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167156439 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167157758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167158513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167159231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167160048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167162317 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167163397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167165152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167165778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167166808 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 167167965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167168426 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167168770 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167168775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167169714 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167169857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167172624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167173157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167173833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167177079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167183065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167183918 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 167184258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167185027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167186607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167187452 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167187594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167188528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167188667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167188763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167189228 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167189325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167189383 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167189494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167189776 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167189976 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167190016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167190018 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167190404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167191917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167192173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167193369 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167193393 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 167193754 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167194095 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167194245 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 167194692 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167195177 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167195215 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167195664 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167195698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167195717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167196491 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167196750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167196916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167197324 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167197372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167197692 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167197854 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167197868 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167198563 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167198574 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167198600 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167198644 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167199193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167199217 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167199290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167199918 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167200024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167200633 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167200843 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167202526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167203064 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167203859 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167204285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167205764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167205948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167207469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167208704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167208789 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167208879 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 167208975 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 167209001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167209039 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 167209269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167209647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167209692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167209739 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167209817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167209906 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 167209947 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167209960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167210189 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 167210228 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 167210376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167210692 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167210818 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167211099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167211204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167212563 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 167213095 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 167213124 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 167213741 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 167214405 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 167215645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167215711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167216239 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 167216658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167216888 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 167217955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167217977 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167218033 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 167218045 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167218046 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167218098 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167218740 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167218760 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167218765 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167218786 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 167219054 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 167219186 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 167219249 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 167219259 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167219982 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167220146 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 167220217 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 167220218 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 2 167221502 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 167221750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167221774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167222072 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 167222099 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167222567 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167222688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167224742 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 167224754 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167225511 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167226353 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167226354 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167226488 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167226689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167226724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167227062 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 167227197 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167227625 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 167227642 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167228832 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 167228901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167229015 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 167229072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167229154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167229157 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 167229249 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167229473 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 167229500 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 167229501 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 2 167229526 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 167229593 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 167229635 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 167229672 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 167229779 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167229780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167229841 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 167229897 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 167229943 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 167229949 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 167230104 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 167230151 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167230167 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 167230246 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 2 167230333 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167230390 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167230454 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167230686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167230694 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 167232236 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 167232360 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 167232402 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 167232451 G T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 167232503 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 167232530 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 167232564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167232565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167232656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167238900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167239322 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167241640 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 2 167243082 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 167244412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167244513 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 167245689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167247090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167250464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167251410 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167251488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167251585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167252217 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 167252222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167252573 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167252582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167252818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167253204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167253320 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 167253812 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167254449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167254583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167254788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167254990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167255222 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 167255344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167256346 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 167256387 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167256486 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 167256849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167256896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167257873 A C Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 2 167257892 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 167259226 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 167262469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167262942 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 167265124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167265886 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167266278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167267435 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 167268669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167268856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167269626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167271876 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 167272303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167273076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167273715 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 167274666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167275797 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167279193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167280751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167281102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167281466 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167281843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167285079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167285226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167288042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167289242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167289412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167289662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167289675 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167291272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167294068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167295183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167296506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167296531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167296577 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167297342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167304231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167305602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167305905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167306004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167306043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167306086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167306130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167306695 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167306898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167307409 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 167312654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167315101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167315480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167315842 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167315998 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167316026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167316419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167316576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167316677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167317535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167317671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167318414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167319060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167319180 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 167319806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167320103 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167320366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167321125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167322382 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 167322839 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 167322870 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 167323200 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 2 167323297 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 167323382 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 167323467 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 167323505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167323659 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 167323695 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 167323771 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 167323842 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167327990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167328063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167330480 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 167330598 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167332533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167345575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167345598 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167351944 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 167352078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167352099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167352355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167352358 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167352600 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167352703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167353121 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 167353123 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 167353641 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 167353652 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 167353956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167354035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167354036 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167354048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167354061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167355085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167355245 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167357134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167357508 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167360975 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 167363493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167364011 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 167365069 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 167365522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167368790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167369398 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167369510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167370122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167370169 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 167370363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167370847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167374173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167374234 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167375454 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 167375616 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167377349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167377412 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167381254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167381255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167385124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167385773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167387812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167388896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167390147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167391354 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 167391646 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 167391921 T C Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 167391966 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 167391982 A T Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 167392510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167392564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167392816 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 167393070 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 167393072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167393525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167394088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167394423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167395055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167395189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167395228 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 167395232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167399068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167399310 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 167399567 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 167402898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167404072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167405228 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 167408213 T G N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 167408843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167409551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167409573 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167409725 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167409755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167410695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167410965 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 167411257 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167411479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167411928 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167415200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167415988 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167416957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167417874 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 167420741 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 167420968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167421650 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167422692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167423723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167423775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167424316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167427470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167428344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167429181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167429375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167431396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167431610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167431625 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 167438991 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167443184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167443209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167443548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167443897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167444060 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 167444662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167444891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167445568 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 167445803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167445954 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 167447246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167448357 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 167449598 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167450458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167453347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167455205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167457528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167459403 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167460304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167460879 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 167461572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167461714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167464088 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 167465587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167468862 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 167470811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167471074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167471848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167472014 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 167472047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167473838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167475536 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167476773 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 167477001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167477126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167477149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167477151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167477356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167478485 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167478561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167478988 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 167479757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167483009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167484286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167488946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167489171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167491049 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167491372 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 167492695 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167493249 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 167493296 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167493529 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 167494434 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167494566 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167494814 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 167494820 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 167494992 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167495064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167495740 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167496749 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 167497599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167497952 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167498116 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167498147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167498976 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167499609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167499696 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 167500456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167502028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167502367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167506659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167506898 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167508355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167510461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167510983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167511636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167511690 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 167513441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167516307 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167520400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167522510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167523816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167525162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167525176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167526026 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167529768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167530875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167531272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167531385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167532483 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167534702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167534791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167537471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167538479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167538692 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 167541639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167543166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167543179 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167543180 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167543434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167543439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167543496 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 167543655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167543997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167546025 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 167546065 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167546153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167546181 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167546231 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167546316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167546500 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167546502 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167546559 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167546563 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167546733 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167546838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167546867 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167546868 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167548085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167548383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167548656 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167550786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167550971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167554293 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 167554344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167554784 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167557042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167558137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167558289 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167559911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167560057 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167560613 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167560764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167561137 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 167561256 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 167561275 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167561298 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 167561405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167561459 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167561495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167561612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167561668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167561769 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167561866 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167561878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167562306 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167563427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167564339 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167564765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167564905 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167565476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167565491 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167565494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167565699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167565751 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167565832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167565849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167565889 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167566033 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 167566092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167566142 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167566214 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167566265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167566347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167566414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167566438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167566508 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167567116 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 167567126 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 167567298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167567316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167567352 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 167567451 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167567469 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167567547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167567755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167568038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167568089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167568922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167570413 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167570430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167570951 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167571026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167571156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167572354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167572418 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167572477 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167573062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167573248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167573279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167573300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167573380 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167573435 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167573483 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167573578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167573663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167574249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167574358 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167575203 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167575335 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167575376 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167575422 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167575588 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167575590 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167575667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167575726 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167575784 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 167581908 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167583388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167583501 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 167584259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167584385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167584601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167586538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167586597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167591457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167591645 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 167593315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167593757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167594252 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167594567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167595428 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167595553 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167595769 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167595884 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167595918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167596117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167596290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167596391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167596884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167597233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167598783 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 167599245 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 167599271 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167599700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167599762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167602682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167602707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167604445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167605736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167606851 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167608960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167609783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167613114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167613115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167613594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167613630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167613753 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167614225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167614314 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167614656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167614693 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167614741 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 167615227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167615781 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167615791 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 167615795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167615858 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 167615871 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167615914 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 167615990 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 167620992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167622378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167623517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167623817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167625536 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167628726 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167631847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167631937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167632057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167632069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167632242 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167632353 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167632415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167632422 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167632524 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167632780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167632822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167632922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167633038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167633172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167633239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167633316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167633578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167633701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167636832 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 167637105 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 167637114 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 167637122 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 167637150 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 167637208 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 167637301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167637448 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167637680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167637781 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167637880 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167638059 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167638464 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 167638498 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167638500 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 167638511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167638531 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167638599 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167639118 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 167639275 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 167639819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167640029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167640636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167643464 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 167648317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167648559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167651377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167651819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167652548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167652675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167652890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167653030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167655003 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 167655019 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 167655055 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 167655487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167655524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167659039 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 167660011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167661745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167662319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167667446 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167667537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167668379 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 167668388 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167668453 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167668555 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 167669027 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 167669171 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 167669884 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 167670411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167670742 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 167671549 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167671550 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 167671744 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167671840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167672012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167673192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167673246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167673566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167674323 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167676520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167677330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167679667 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167679825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167680041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167680734 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167680772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167680889 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 167681594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167681751 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 167682331 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167682852 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 167682930 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167683587 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167684257 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 167684306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167684371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167684436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167685236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167685405 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 167685413 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 167685463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167685630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167686603 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 167687864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167687941 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 167687957 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 167689399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167689502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167689788 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167689896 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 167689912 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 167691807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167691892 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167691964 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167693021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167693191 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167693201 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167693443 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 167693445 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 167693511 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 167693674 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167693696 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 167693987 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167694151 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 167694164 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 167694198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167694208 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 167695289 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167695807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167696786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167697010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167698138 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167698316 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 167698693 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167699295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167699467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167699765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167700263 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167700565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167701478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167701515 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 167701521 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167701531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167701598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167701614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167701651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167701652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167701802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167701815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167701876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167702950 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 167703467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167703715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167703924 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 167703955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167705014 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 167705169 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 167705250 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 167705289 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 167705483 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167705579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167705589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167705623 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 167705803 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167705804 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167705909 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 167706171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167706500 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 167706558 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 2 167706571 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 167706596 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 167706704 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 167706864 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167706950 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167707613 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167707835 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167707838 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167708104 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167708196 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 167708352 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 167708461 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167708508 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167708646 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167708674 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167708708 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167708711 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167708827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167709133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167709150 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 167709162 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167709369 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 167709375 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167709528 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 167709604 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 167710374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167710496 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167711159 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 167711174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167711382 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167711767 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167711779 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167711786 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167711922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167711967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167712163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167712179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167712368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167712485 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167712610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167712729 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167712746 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167712780 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167713046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167713062 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167713367 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167713771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167714951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167715151 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167715339 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167715498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167715526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167715631 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167715639 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167715854 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167716048 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167716239 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 2 167716386 C G N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 167716415 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 167716715 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167716769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167716808 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167717420 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167717433 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167717688 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167717841 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167717859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167717887 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167717903 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167717956 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167717970 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 167718025 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 167718060 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167718507 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167718591 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167718611 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167718715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167719483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167719619 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167719658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167719788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167719826 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167720018 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 167720022 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167720143 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167720608 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167720629 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 167720643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167720657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167720666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167721395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167721432 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167721529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167721530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167721890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167721895 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167722018 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167722280 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167722342 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167722938 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167723059 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 167723241 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 167723280 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 167723379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167724714 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167727197 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167727201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167728903 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167729097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167729519 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167729595 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167729780 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 167730225 G C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 167730437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167730495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167730519 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167730722 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 167730805 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 167730833 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 167730839 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167731147 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 167731161 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 167731184 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 167731201 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 167731347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167731471 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 167731493 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 167731710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167731878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167732129 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167732193 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 167732268 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 167732314 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 167732336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167732348 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167732375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167732610 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167732641 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 167732754 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 167733031 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 167733211 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 167733288 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167733363 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 167733378 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 167733498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167733732 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 167734256 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167734411 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167734585 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167734726 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167734809 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167734843 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167735009 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 167735010 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 167735035 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167735080 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167735094 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167735111 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 167735204 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167735250 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 167735627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167735708 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167735816 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167735854 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167735949 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 167736037 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167736224 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167736316 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167736318 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167736328 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 167736333 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 167736359 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 167736450 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 167736577 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167736581 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167736599 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 167736829 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 167736843 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 167736883 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 167736930 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167736964 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 167736990 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167737329 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 167737338 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 167737403 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167737426 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167737488 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 167737495 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 167737805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167737825 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167737880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167737959 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 167738112 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 167738132 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 167738133 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 167738999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167739546 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 167739627 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 167739791 G T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 167740235 T C Y Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 167740985 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 167741375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167741561 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 167741583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167741617 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 167741681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167741705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167741800 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 167741838 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 167742087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167742128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167742173 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 167742259 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 167742282 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 167742552 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 167742764 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 167742780 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 167742786 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 167742812 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167742820 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 167742930 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 167742980 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 167743262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167743389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167744726 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 167745729 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 167745940 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167746207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167746239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167746361 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167746567 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 167747411 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 167747652 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 167747676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167747750 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167748279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167748331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167748784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167748930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167749551 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 167749649 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 167750108 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167750126 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167750388 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 167751278 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 167751420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167751566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167751571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167751651 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 167751857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167751918 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167752555 C A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 167752618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167752619 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 167752844 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 167753042 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 167753451 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 167753543 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167753786 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 167754556 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 167754816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167755282 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167755668 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167756026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167756385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167756397 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167756527 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 167756576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167756654 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 167756750 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167756781 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 167756893 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167756999 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167757014 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 167757043 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 167757267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167757434 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167758906 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 167759547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167763495 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167766757 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167767374 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167767387 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 167767394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167769258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167771560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167772538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167772727 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167773004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167773117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167775332 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 167775803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167775831 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167776012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167776127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167776204 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 167776500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167776520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167777940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167778613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167779229 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167779818 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 167781125 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 2 167781352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167781429 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 167781755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167782653 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 167783101 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 167783410 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167785174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167786106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167787575 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 167788102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167788626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167789151 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 167791495 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 167792008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167793494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167796523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167797176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167800659 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 167801052 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 167805855 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 167805880 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 167805904 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 167807150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167808507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167809283 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 167809589 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 167811454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167812126 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 167812937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167813123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167814012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167814141 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167814634 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167815002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167815114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167815394 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 167816847 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 167816899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167816916 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167817392 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 167817847 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167817904 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 167819878 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 167819886 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 167820310 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 167820352 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 167820424 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 167820533 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 167820656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167820949 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 167822230 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 167822337 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167822357 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167823373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167823500 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 167823508 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 167823892 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 167823896 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 167824819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167824902 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 167824908 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 167825411 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 167826445 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 167826931 T A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 167827275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167827909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167828582 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 167828817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167830251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167831122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167832591 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 167832598 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 167832749 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167832973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167833526 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167833538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167833725 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167833728 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167833933 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167833966 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167834681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167834682 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167834727 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167834728 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167834806 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 167835169 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 167835191 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 167835259 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167835872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167836305 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 167836955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167837240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167837334 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 167838404 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 167838703 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167838883 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 167839299 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167839537 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167839797 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167841253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167844790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167845527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167846443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167847483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167847492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167852086 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167852611 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 167852905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167853119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167853150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167853172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167853199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167853220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167853792 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167854211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167856878 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167856886 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167857271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167857419 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167857474 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 167858810 A G Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 167859537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167859847 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167859855 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 167860154 C G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 167861470 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 167861531 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 167862676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167863163 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 167863905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167863972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167863991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167864335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167865134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167865237 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 167865247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167865302 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 167865378 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 167865652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167865698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167865706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167865717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167865767 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 167865788 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167866070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167866266 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 167866277 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 167866331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167866337 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 167866376 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167866952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167866953 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 167867069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167867131 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 167867146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167867168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167867174 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167868006 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 167869275 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 167869362 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 167869388 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 167869415 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 167869429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167870127 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 167870280 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 167870530 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 167871951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167872589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167873126 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 167873618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167874352 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 167874353 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 167875339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167875649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167875778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167875817 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 167875860 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167876850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167877252 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 167877662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167878009 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167878010 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167878058 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 167878132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167878209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167878371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167878482 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 167878504 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 167878563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167878564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167879861 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 167881340 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167881393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167882164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167883859 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167885051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167886572 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167886605 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167886714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167887144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167887261 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 167887507 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 167888171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167889880 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 167889887 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 167890361 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 167891606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167891803 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167892365 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 167894059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167894550 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167894765 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 167894769 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 167895209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167895358 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167895584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167895661 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 167895794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167895797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167895836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167895852 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 167895896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167895932 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167896684 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167896689 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 167897115 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 167897157 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 167897561 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 167898492 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167898585 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167899562 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 167899626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167899784 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167900429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167900442 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 167900664 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 167900699 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167902062 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 167902073 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 167902080 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 167902092 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167902342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167902559 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 167902578 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 167902639 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 167902656 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167902769 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 167903415 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167903579 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 167903659 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 167903854 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 167904554 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167904697 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167904826 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167904993 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167905080 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 167905357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167905444 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167906879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167907038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167907224 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167907619 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167908286 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 167908386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167908497 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 167908545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167908548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167908708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167908714 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 167908927 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 167908972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167908996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167909084 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167909211 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167909223 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 167909267 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 167909347 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 167909528 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 167909723 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 167909895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167909940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167909945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167910885 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167910918 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167911139 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 167911189 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 167911360 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 167911409 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167911492 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 167911536 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167912000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167912028 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 167912118 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167912621 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 167912988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167913334 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167913481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167914038 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 167914045 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 167914077 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 167914151 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167914293 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 167914549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167914662 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 167914757 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 167914984 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 167915238 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 167916120 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 167916259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167916334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167916383 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 167916421 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 167916516 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167916747 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167916756 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167917206 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 167917216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167917445 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 167917671 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 167917704 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 167917753 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 167917754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167917835 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 167917914 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 167917928 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167918066 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 167918165 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 167919200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167919311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167919486 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 167919501 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 167919559 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 167919684 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 167919864 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 167920653 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 167920920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167921225 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 167921307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167921354 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 167921372 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 167921546 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 167922457 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 167922556 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 167922557 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 167922624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167923110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167925547 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167925548 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 167926890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167926906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167927143 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167927165 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167927217 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 167927232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167927454 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167927519 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 167927721 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 167928018 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167928188 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167928222 C A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 167928279 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 167928357 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167928753 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167931769 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167932496 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167933670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167934317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167934655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167935053 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167935526 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 167935686 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167936084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167936293 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167936760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167936828 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167937053 T G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 167937128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167937225 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 167937699 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 167938108 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 167938884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167940298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167940527 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 167940847 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 167941149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167941262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167941595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167941709 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 167942091 C T Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 167942179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167942260 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 167942758 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 167943328 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167943420 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167943707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167943729 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 167943800 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 167944264 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 167944508 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 167944737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167944986 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167945009 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 167945045 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 167945348 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 167945418 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167945431 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167945446 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167945620 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167945651 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167945789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167945813 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167945823 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167945843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167945849 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167945941 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167946158 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167946215 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 167946264 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 167946327 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 167946337 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 167946515 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 167946546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167946771 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167946928 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 167947135 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167947351 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 167947364 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167947575 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 167948667 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167948749 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 167949095 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167949773 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167949975 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167949976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167950088 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 167950311 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 167950320 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 167950347 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 167951507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167951897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167951922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167952151 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167952307 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 167952346 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 167952451 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167952479 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 167952722 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 167952794 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 167952844 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 167952970 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 2 167953020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167953026 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167953089 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 167953211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167953230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167953302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167953339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167953408 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167953446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167953622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167953714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167953982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167954012 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 167954405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167954666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167954788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167954813 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167954966 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 167955139 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 167955612 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167955978 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 167955990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167956290 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 167956339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167956557 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167956646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167956692 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167956719 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 167956900 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 167957083 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 167957150 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 167957191 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 167957239 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 167957250 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167957381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167957413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167957447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167957626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167957708 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167957730 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 167957848 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167957879 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167957887 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167957924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167957958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167958193 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167958196 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 167958444 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167958528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167959262 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 167959327 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 167959344 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167959510 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 167959528 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167959578 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 167959579 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 167959665 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167959901 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 167960008 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 167960009 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 167960028 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 167960053 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 167960097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167960124 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 167960427 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 167960431 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 167960554 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167960614 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 167960707 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 167960773 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167960831 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167960853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167961164 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 167961320 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 167961449 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 167961499 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167961613 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167961705 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167961710 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167961832 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167961894 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167961930 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167962432 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167962471 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167962483 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167962499 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167962885 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 167962889 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167962949 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 167963005 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167963010 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167963277 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 167963375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167963381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167964524 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 167964648 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167964674 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167964862 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167964876 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 167964939 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167965014 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167965473 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 167965651 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 167965668 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 167965701 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 167965809 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 167965928 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 167965951 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167966116 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 167966489 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 167966555 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 167966728 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167966790 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167967290 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167967331 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167967404 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 167967478 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 167970281 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167970397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167971909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167971944 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 167972982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167975769 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167975817 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 167975865 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 167975866 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 167977019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167978272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167978739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167979562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167980474 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167980483 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167980518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167980743 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167980872 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 167980943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167980958 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 167980965 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 167981006 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167981117 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 167981219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167982053 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 167982530 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 167983008 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 167984151 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 167984322 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 167984892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167986384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167988064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167988271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167988543 T C N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 167989016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167989761 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167989775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167989807 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 167989808 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 167989944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167990040 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 167990096 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 167990293 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167990335 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 167990386 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 167990395 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 167990568 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 167990825 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 167990900 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 167990974 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 167991217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167992117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167992252 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167992287 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167992309 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 167992326 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 167992458 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 167992516 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 167992529 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 167992995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167993005 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167993103 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167993116 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 167993136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167993227 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 167993424 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 167993851 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 167994193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167994535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167994914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 167997424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167999434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 167999694 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 168001310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168001800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168002033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168002818 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168002839 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168002981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168004183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168004413 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168018164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168019471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168019973 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168024182 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168024758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168025632 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168029588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168030015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168031178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168033786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168036682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168037206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168037797 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168037903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168038847 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168041994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168045662 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168047968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168048115 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168048226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168048674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168048867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168051075 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168051841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168052612 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168054091 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 168054930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168057484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168057581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168059643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168061529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168062986 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168064036 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168064112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168064202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168065417 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168067633 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 168067807 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168067990 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 168068005 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 168068023 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 168068046 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 168068324 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168068333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168069207 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 168069249 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168069339 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 168069754 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 168069791 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 168069792 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 168069839 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 168070049 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 168070073 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 168070133 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168070160 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 168070296 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 168073859 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 168074049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168074182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168077448 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 168077764 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168077781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168077839 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 168077876 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168077884 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 168078025 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 168078047 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168078130 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 168078579 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 168078630 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 168078683 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168078751 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 168078793 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 168078823 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 168078861 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 168078967 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 168079103 G T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 2 168079180 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 168079398 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 168079602 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 168079710 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 168080029 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168080178 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168080198 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 168080401 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 168080508 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 168080732 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168080773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168080814 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 168082177 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168082806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168084985 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168084989 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168085034 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168085058 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 168085068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168085129 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168087249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168087867 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168088758 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 168088793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168089499 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 168089508 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 168089547 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168089548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168089586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168089598 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 168090149 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 168091648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168091808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168091845 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168092456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168092778 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 168092902 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 168092999 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168093016 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 168093029 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 168093660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168094715 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168094970 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 168095610 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 168095618 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 168098077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168098486 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 168098624 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168098805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168099200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168101671 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168102436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168103159 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168103392 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168109142 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168111084 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168111086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168111204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111242 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168111251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111334 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168111335 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168111345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111461 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111478 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168111484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111706 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168111846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168113669 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168113899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168117125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168118111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168118816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168118876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168119550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168120364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168120433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168120519 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 168121542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168123248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168123368 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 168123520 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168125428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168126007 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 168126169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168127508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168127566 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 168127581 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 168127635 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 168127646 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 168127666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168127719 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 168127936 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 168127939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168128039 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 168128112 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 168128143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168128148 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 168128704 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168128766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168128792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168128851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168129290 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 168129793 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 168130718 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 168131048 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 168131376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168131982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168132052 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 168132106 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168132948 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 168133834 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 168134387 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 168134557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168134937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168135027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168135915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168138283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168139123 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 168139716 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 168139836 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 168140375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168141554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168141716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168143234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168145132 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 168145429 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 168145806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168146464 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 168146663 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 168147203 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168147735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168147815 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 168148432 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168148475 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 168148629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168149841 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168150065 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168150157 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 168150251 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 168150794 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168151015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168151273 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168151302 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168151438 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168151892 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 168152624 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168153434 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 168155374 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 168156201 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 168156991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168159017 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168160197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168160384 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 168160975 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 2 168161119 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168161127 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168161174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168162331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168163423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168164323 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 168164855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168165213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168165987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168166186 T A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 168166710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168169403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168169410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168170410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168171182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168171702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168171759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168171816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168171833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168171920 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168172217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168172490 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168172557 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 168173532 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168173635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168174080 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168174769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168174891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168175246 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168175266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168175442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168175445 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168175521 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168175541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168175600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168176398 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 168176399 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 168176600 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168176698 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 168176819 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 168177226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168177251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168177415 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 168178111 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 168178197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168180098 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 168180167 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 168180204 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 168180343 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168180408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168180432 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 168180446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168180551 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 168180615 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 168180806 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 168180893 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 168181136 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 168181145 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 168181147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168181235 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168181252 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168181291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168181426 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 168181441 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 168181666 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 168181676 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 168181748 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 168181877 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 168182015 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 168182017 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 168182198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168182297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168182310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168182359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168182758 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168183146 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 168183149 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 168183303 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 168183323 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168183491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168184498 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168184506 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168184646 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168184967 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168186493 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 168186713 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 168187099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168187352 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 168187398 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168188973 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168190053 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 168190163 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 168190204 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 2 168190503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168193412 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168193447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168193956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168194040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168194172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168197484 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 168198699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168199188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168199738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168199783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168200578 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 168203279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168204721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168205103 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168205118 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168205122 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168205193 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168205215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168205288 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168205327 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168205334 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 168205520 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 168205559 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168205774 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 168205845 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168206486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168206505 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168206506 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168206596 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168206697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168206809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168206811 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 168206826 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168206827 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168206944 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168207095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168207717 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 168207726 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 168208288 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 168208828 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168208895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168209249 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168209260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168209334 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168209572 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168209802 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 168210228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168210230 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168210256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168212510 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168212611 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 168213126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168213720 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168213822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168214407 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 168214501 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168215355 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 168215359 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 168216129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168216193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168216221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168216268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168216804 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168216830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168217656 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 168218661 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 168218866 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168219237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168219292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168219416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168219429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168219482 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168220533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168220629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168220838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168221046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168221690 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168221808 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 168222148 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168222289 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 168222469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168222475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168223082 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 168223615 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168223981 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 168225560 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 168227362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168228600 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 168231344 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168235233 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 168235368 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168237256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168237617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168237758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168238007 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168238293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168238678 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 168239147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168240599 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 168240616 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168240713 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 168240861 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 168241181 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168241215 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 168241247 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168241285 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168241292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168241327 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168241333 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168241346 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168241357 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168241368 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168241374 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168241383 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168241443 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168241658 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168241689 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 168241743 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168241830 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168242034 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168242063 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 168242075 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168242113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168242133 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168242147 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168242335 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168242368 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168242470 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168242550 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168242637 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168242671 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168242741 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168242758 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168242813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168242870 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168243018 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168243471 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168243773 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168243783 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168244408 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168244524 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168245702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168245787 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 168245808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168245816 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168245939 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168245974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168246071 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168246539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168247041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168247399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168247478 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 168247564 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 168247841 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 168247888 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 168248268 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 168248367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168248400 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 168248466 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 168248531 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 168248554 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168249051 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 168249100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168249135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168249159 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 168249171 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 168249274 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168249433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168249549 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168249556 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 168249889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168250027 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 168250055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168250130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168250131 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 168250197 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 168250239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168250349 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 168250449 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 168250927 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168251491 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168251496 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 168251638 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 168251928 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 168252954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168254002 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168254486 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 168255051 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 168255285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168256544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168257047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168257073 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168258040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168259659 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168259682 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 168259992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168260328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168260386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168261312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168261325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168261343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168261344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168261375 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168261480 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168261498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168261532 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168261799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168261869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168262110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168262216 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 168262451 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 168262484 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 168262533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168262919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168262939 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168262991 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168263195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168263240 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 168263314 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168263315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168264966 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168265236 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168265564 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 168265651 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 168266171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168267412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168267515 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168268633 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168269109 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168271446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168271497 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168275067 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 168275281 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 168276106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168276271 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 168276409 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 168277095 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168278167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168278194 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168278277 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168278342 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168278351 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168278661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168278755 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 168278828 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168279060 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 168279067 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 168279741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168279799 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 168279819 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 168279868 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 168279962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168279995 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 168280039 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 168281204 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168281458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168281906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168285584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168286201 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168286325 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 168286904 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 168287084 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168287694 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168291274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168291354 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 168291365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168291375 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 168291467 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 168291480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168291521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168291568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168291581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168291608 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 168291658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168291943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168292659 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 168292790 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 168292801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168292803 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168292815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168292879 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 168292927 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 168293042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168293046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168293102 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168293113 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 168293146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168293162 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168293265 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 168293309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168293353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168293409 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168293413 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 168294722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168295085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168296155 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168296661 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168296666 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168296820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168297706 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168297759 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 168297872 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168298071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168298088 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168298109 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168298132 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168298509 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 168298736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168298915 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168298916 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168298929 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168299651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168301580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168303491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168303514 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168303596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168307708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168310113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168310839 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 168310876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168312074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168312137 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168312512 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168312514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168313047 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168313355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168313403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168313426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168313434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168313741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168314106 C G Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 168314437 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168314888 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 168315001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168315415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168316326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168316449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168316450 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168319001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168319382 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168319478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168319873 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168320173 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168320697 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 168320830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168321354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168321383 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168321763 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 168321820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168322030 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168322211 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168322716 T A Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 168323194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168323906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168324368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168326831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168327585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168327605 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168327695 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168328070 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168328954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168329548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168329669 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168332130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168334167 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168334178 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168335529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168335620 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168335699 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168335707 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168335740 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168336514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168336975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168337524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168337569 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 168337570 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 168337596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168337617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168337639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168337646 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168338004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168338146 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168339663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168342787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168343366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168344555 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 168344612 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168345071 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168345436 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 168345882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168345889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168345945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168346140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168346185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168346462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168346607 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 168346757 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 168346842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168348208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168348447 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 168349120 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 168349260 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 168349277 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 168349789 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168349853 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168350406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168351283 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 168352745 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 168352768 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 168352912 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 168355989 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168356075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168357089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168357107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168358182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168358878 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168359163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168359405 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168359634 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168359746 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168361084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168361348 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168361412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168361525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168361636 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 168361660 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168362204 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168362305 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168362571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168362695 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168362850 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 168362934 A G N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 168363244 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 168363275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168363367 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 168363368 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 168363436 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168363736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168363850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168363866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168364540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168364550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168364686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168365113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168365128 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168365129 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168365146 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168365375 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168365510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168365606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168367254 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168367405 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 168367406 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 168367434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168367438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168368543 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168372387 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168372889 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 168372995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168373015 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168373407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168373467 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168373568 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168373673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168373707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168375146 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168375328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168375844 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168376234 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 168376375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168376436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168376511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168376581 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168376641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168376928 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 168377140 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168377192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168377757 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168377917 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168380791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168380952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168380972 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168381025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168381029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168381360 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 168381805 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168381840 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168381841 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168382616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168382683 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168382726 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 168382939 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168382941 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168384097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168384261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168384262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168384381 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168384386 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168384415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168384418 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 168384575 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168384680 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168384779 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168384842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168384919 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168384953 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168385815 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168385847 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168385860 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168385903 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 168386040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168386253 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 168386303 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168386535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168386590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168386617 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 168386652 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 168386659 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 168386677 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 168386682 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 168386877 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168386892 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168387032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168388381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168388883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168391757 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168392301 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168392423 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168392433 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168392508 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168392693 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168394634 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168395119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168396071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168396844 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 168397243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168397504 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 168397572 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168397681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168397754 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168397787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168398760 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168399059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168399492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168399563 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 168399565 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168399809 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168399812 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168400942 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168401375 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168401410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168401492 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168402509 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168402561 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168402583 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168403307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168403558 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168403621 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168403689 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168403716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168404197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168404255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168404358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168404487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168404646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168404716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168404834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168405093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168406953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168407293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168407726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168407883 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168408281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168408579 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168409038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168409039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168409247 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 168410776 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168410778 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 168411022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168411153 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168412754 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168413478 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168413622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168413891 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168413960 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168414143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168415018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168416925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168418008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168418249 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168418780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168420456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168421114 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168424239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168425022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168425095 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168425701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168428403 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168429743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168430670 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168434122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168434136 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168434541 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168439318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168439373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168439634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168439649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168439659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168439986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168441551 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168443150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168443573 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168443682 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168443908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168443909 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168444036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168444051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168444171 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168444196 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168444317 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168445149 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 168445414 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168445744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168446372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168446578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168446672 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168449933 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168451531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168451889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168452611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168452613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168453019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168453148 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168453672 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168453969 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 168454139 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 168454374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168455015 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168455071 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168456779 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168457086 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168457124 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168457137 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168457138 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168457207 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168457767 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168457913 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168460418 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168461382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168462714 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168463920 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 2 168464033 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 168464127 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168464287 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168464643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168464841 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168464847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168465174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168465508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168467252 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168467390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168468559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168468657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168469878 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168470420 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168472749 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 168473863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168473993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168474164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168474531 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168474631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168474690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168474805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168475182 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168475247 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168475492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168477473 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168477543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168477846 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168478601 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168479614 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168480141 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168481258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168481280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168481383 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.1 0.85 0.05 21 19 2 17 1 2 168481389 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 168481571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168481575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168482066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168482090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168482099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168482173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168482269 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168483434 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168483565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168483621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168484346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168484348 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 168484375 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 168484451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168484573 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 168484593 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168484751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168484809 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 168486411 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168487313 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168487421 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168487867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168487904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168487921 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168488012 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168488394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168488536 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168488555 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168488647 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 168488733 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168488812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168489191 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 168489595 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168489688 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168489732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168489793 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168489807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168489876 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168490024 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168490173 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168490465 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 168490526 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168490727 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168490986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168491136 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168491460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168491683 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 168492456 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168492757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168497449 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168499464 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168499720 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 168500113 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 168500180 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168502190 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 168502562 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 168502721 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 168503166 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168503189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168504373 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168505003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168505703 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 168506066 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168506291 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168506491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168506843 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168506852 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168506935 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168506966 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 168507036 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168507049 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168507127 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168507133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168507999 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 168508116 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168508162 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 168516287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168519405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168519590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168519614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168519652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168519657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168519674 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168519690 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168519719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168519725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168519824 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168519963 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168520163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168520165 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168520180 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168520363 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168520473 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168520620 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168521273 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 168521452 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168521597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168521642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168521757 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168521894 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 168521953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168523035 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168523700 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168524249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168524425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168524894 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168525366 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168525528 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 168526281 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 168526511 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 168526859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168526879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168526883 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 168526989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168527009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168527135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168527269 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 168527340 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 168527441 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 168527547 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168527770 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168527777 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 168528978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168529384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168529882 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 168530935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168531629 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168532611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168533490 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 168533630 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 168534869 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 168534874 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 168537725 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 168537992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168538237 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 168538268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168538296 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 168538366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168538889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168538945 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 168539833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168540017 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 168540093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168540148 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168540178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168540202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168540395 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 168540490 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168541036 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 168541089 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 168541141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168541174 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 168541184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168541344 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168541889 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 168541895 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 168542109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168542132 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 168542209 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 168542348 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 168542352 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 168542648 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 168542703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168542755 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 168542798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168542861 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 168543124 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168543338 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168543372 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 168543519 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 2 168543535 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168543552 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168543560 G T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 2 168543585 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168543692 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168543711 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168543768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168543791 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 168543822 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 168543842 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168543850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168543952 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168544309 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 168544600 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 168544791 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168544901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168545075 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 168545541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168545569 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168545738 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 168545774 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168545858 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 168545886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168545932 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 168546002 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 168546023 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 168546030 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168546055 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 168546067 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 168546084 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 168546088 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 168546100 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 2 168546107 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 168546215 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 2 168546340 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 2 168546365 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 2 168546413 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168546492 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168546522 T G Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 2 168546765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168546824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168546884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168546921 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 168546929 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 168546933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168547002 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 168547077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168547085 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 168547088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168547645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168547701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168547722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168547840 C A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 168547973 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168547994 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 168548000 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 168548021 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168548069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168548094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168548114 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 168548128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168548249 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 168548275 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 168548415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168548427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168548433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168548464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168548510 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 168548612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168548715 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 168548896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168548905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168548950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168549118 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 168549273 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168549406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168549620 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168549738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168549751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168549809 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 168549886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168549914 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 168549927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168549966 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168550036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168550061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168550113 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 2 168550175 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168550220 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 168550264 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168550291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168550311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168550365 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168550390 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168550743 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168550770 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 168551374 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 168551455 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 168551550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168551862 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168552008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168552074 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 168552248 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 168552366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168552384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168552518 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168552580 G C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 2 168552785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168552821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168552838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168552887 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 168552905 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168552932 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168553025 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 168553333 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168553403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168553477 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168553479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168553544 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168553686 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168554071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168554153 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168554193 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168554552 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 168554922 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168555165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168555190 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 168555271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168555390 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168557602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168558139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168558517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168559570 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168559814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168560145 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168560481 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 168560486 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 168560528 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 168560584 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168563006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168566256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168567832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168569623 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168571416 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 168571883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168572151 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 168572152 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168572434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168572790 T G N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 2 168573437 T C N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 2 168574225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168574663 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 168574765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168575048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168575277 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 168575538 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168575673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168576246 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168576458 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 168576698 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 168576705 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 168577397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168578999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168579873 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 168580277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168582262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168582539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168583512 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168583543 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 168583561 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 168583878 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 168583886 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 168583891 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 168583944 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 168583966 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168584010 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168584099 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168584177 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168584237 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168584238 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168584274 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168584347 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 168584348 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 168584409 A G Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 168584429 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 168584451 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 2 168584504 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 168584559 C T Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 168584560 A G Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 168584589 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 168584762 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 2 168584895 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 168584915 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168584940 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 168585183 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168585413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168585464 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168585666 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168585676 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168585793 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 168585801 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 168585863 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 168585871 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 168585889 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 168585920 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 168586262 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 168586276 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 168586342 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 168586365 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 168586883 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 168587090 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 168587189 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168587400 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 168587405 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 168587778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168587967 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168588646 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 168592456 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 168592910 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 168593389 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 168593530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168594222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168594321 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168594339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168594594 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 168594799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168594875 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 168594918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168595059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168595442 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 168595482 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 168595505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168595541 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 168595941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168597294 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 2 168597764 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168598201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168598457 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 168598975 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168599679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168600921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168602843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168604174 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 168605576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168605642 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168606404 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168606985 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168607435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168607974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168608097 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 168608432 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 168608539 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168608914 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168608926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168608933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168608967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168608996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168609026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168609044 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168609218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168609247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168609254 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168609306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168609441 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168609450 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168609459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168609487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168609573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168609607 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168609828 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168609994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168610089 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 168610160 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 168610330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168610563 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168610829 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168610850 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168610907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168610973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168611000 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 168611091 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 168611243 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168611275 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 168611289 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168611318 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 168611776 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168611778 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168611805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168611897 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168611943 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 168612030 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 168612069 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168612295 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 168612329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168612614 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168612620 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 168612824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168612940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168613016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168613034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168613122 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168613181 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 168613500 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168613607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168613726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168613992 A T Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 168614131 T G Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 2 168614173 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168614287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168614351 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168614364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168614399 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168614509 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 168614572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168614591 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 168614694 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 168615142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168615242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168615298 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 2 168615367 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 168615458 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 168615494 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 168615586 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 168615786 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 168615861 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 168615914 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 168615936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168615945 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 168615955 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 168615958 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 168615970 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 168616150 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 168616152 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 2 168616176 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 2 168616186 C T Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 2 168616437 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 168616457 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 168616471 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 168616700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168616958 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 168616985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168617122 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168617124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168617263 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168617322 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 168617362 G T Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 2 168617526 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 168617642 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168617668 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 168617804 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168617858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168618136 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 168618166 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 168618372 T C Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 2 168618392 T C Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 168618476 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168618492 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 168618651 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168619110 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 168619150 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168620245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168621691 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168621955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168622702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168622734 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168622785 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168622852 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168622940 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168622979 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168623103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168623688 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 168623753 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 168623918 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 168623992 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 168624340 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168624940 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168625039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168625247 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168625921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168626160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168626931 A T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 168627101 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 168627107 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168627185 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 168628003 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 168628988 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168629238 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168629240 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168629631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168630296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168630394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168630486 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168631089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168631543 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168631723 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168632137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168632222 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168632317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168632591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168632828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168632889 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168632991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168633199 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168634011 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168634068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168634102 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168634133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168634144 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168634179 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168634411 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168634449 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168634452 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168634470 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168634479 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168634501 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 168634531 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 168634634 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168634670 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168634679 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168634701 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168634868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168635057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168635061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168635167 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168635170 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168635234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168635299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168635310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168635412 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168635947 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168635950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168636194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168636196 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 168636281 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168636291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168636481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168636548 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168636571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168636585 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168636813 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168636900 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168636911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168636940 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168636959 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168637125 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168637221 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168637248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168637445 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168638490 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168638516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168638560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168638584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168638703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168638955 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 168639138 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168639207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168639235 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168639350 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168639351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168639491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168639695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168639708 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168639709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168639735 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168639750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168639778 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168639784 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168639793 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168639822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168639871 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168640060 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168640072 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168640126 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 168640313 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168640331 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168640333 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168640342 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168640477 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168640527 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168640721 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 168640896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168640917 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168640989 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 168641116 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 168641330 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168641357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168641473 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168641533 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168641972 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 168641979 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 168642094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168642160 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168642171 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168642381 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168642460 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168642725 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168642827 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168642838 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168642862 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168642896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168642906 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168642937 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168643169 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168643178 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168643192 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168643212 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168643308 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168643355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168643441 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168643792 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 168643942 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168643943 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168644156 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168644226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168644370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168644810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168644996 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168645587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168646589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168646828 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168647082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168649129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168649547 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168650269 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168650314 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168650334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168650386 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168650410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168650531 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168650561 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168650567 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168650614 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168650677 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168650758 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168651034 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168651095 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168651188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168651226 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168651244 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168651290 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168651620 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168651793 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168651795 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168651846 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168651892 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168651937 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168652829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168652860 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168652864 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168652923 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168652980 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168653033 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168653192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168653508 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168654148 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 168654155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168654565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168654623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168654624 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168654660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168654674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168654710 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168654742 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168654839 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 168654969 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168654979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168654991 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168655027 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168655087 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168656042 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168656385 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168656666 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168656831 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 168657096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168657135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168657148 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168657475 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168657745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168658037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168658404 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168658410 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 168658454 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 168658469 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 2 168658924 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 168658965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168659317 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168659319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168659364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168659401 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168659964 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168660395 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168660579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168660735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168660744 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168660747 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168660776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168660888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168660936 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168661400 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168661419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168661490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168661510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168661515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168661527 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168661556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168661564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168662398 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168662488 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168662576 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168663352 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168663436 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 168664815 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168664853 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168665184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168665857 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168666078 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 168667020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168669298 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 168669599 C A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 168669693 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168669957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168674217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168674362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168674402 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168676338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168677408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168677487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168678032 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168678381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168678501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168678611 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168678906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168679406 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 168682847 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168685032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168686184 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 168686200 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 168686834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168686906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168686937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168687848 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168688094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168688305 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 168688332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168688418 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168688576 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168688645 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168688869 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 168689036 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 168689045 T A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 168689143 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 168689146 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 168689190 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 168689478 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168689496 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168689524 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 168689969 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168690063 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168690073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168690113 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 168690492 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 168690880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168691341 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 168691999 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168692374 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 168692682 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168692856 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 168692886 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 168693235 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168693259 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168693435 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 168693442 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168694042 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 168694055 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 168694192 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 168694208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168694275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168694614 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 168694855 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168694900 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168695688 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168695757 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 168696161 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 168696308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168697259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168699898 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168699901 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 168703279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168704405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168704585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168704757 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168705053 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168705410 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168706677 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168706802 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168706911 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 168706990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168707026 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168707404 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 168707458 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 168707504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168707587 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168707588 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168707632 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 168707646 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 168707824 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 168707912 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168707936 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 168708179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168708230 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168708362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168708435 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 168708446 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 168708638 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 168708683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168708996 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 168709202 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168709280 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 168709494 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 168709501 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 168709666 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168709791 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 168709878 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 168710014 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 168710040 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 168710050 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 168710071 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 168710531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168710539 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168710824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168711085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168711105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168711121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168711184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168711209 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168711275 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168711411 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 168711515 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168711537 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 168711614 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 168711770 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 168711804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168711933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168712023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168712065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168712405 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168712645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168712790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168712802 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168713185 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 168713263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168713299 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 168713300 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 168713334 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 168713379 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 168713447 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 168713523 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 168715486 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 168715711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168716013 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 168716157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168716912 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 168717018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168717075 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 168717117 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 168717345 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168717809 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 168718067 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168718091 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168718107 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168718121 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168718123 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168718133 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168718136 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168718548 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 168718592 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168718624 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168718694 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168718752 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168718873 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168718964 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168719048 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168719061 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168719080 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168719116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168720139 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 168720144 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168720160 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168720305 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 168720308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168720390 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168720481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168722684 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 168722700 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 168722883 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 168722912 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168722921 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 168723368 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 168723506 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 168723811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168723887 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 168723891 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168724496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168724724 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 168724867 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 168724877 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 168725102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168725181 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168725208 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168725774 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 168725843 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 168725963 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168726027 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 168726057 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 168726085 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 168726107 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 168726145 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 168726427 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 168726691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168726698 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168726755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168727048 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 168727106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168727552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168727636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168727893 C G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 168728612 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168728690 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168728710 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168728757 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168728759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168728789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168728792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168728850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168729064 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168729643 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 168729687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168729791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168729794 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168730105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168730298 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168730327 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168730422 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168730466 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 168730474 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168730502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168730508 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168730515 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168730685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168731412 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168731827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168732215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168732771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168734155 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168734288 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168734331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168735585 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 168735644 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168735695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168735978 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 168735996 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 168736015 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 168736293 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 168737137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168738140 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168740627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168740646 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 168740655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168740896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168740965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168741044 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 168741045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168745885 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168747472 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168748141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168748188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168748299 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168748909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168748913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168748924 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168749087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168749653 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168749855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168751093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168752542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168753315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168754229 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168754320 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168754412 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 168754609 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168754811 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168754865 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 168754959 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168755013 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168755034 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168755048 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168755049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168755186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168755303 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 168755360 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 168755442 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 168755471 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168755505 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 168755732 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 168756087 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168757365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168757553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168757580 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168757662 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168758615 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168758616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168758725 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168758845 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168758854 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168758964 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168759015 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168759078 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168759572 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 168759587 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 168759926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168760556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168761496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168762083 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 168762421 G T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 168763014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168763914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168764279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168764329 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168764375 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168764412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168764447 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168764491 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 168764784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168765096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168766155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168766415 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168766445 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168766474 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168766699 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168766824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168766935 T C Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 168766936 G A Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 168767370 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 168767444 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 168767692 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 168767854 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168767855 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168767975 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168768110 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168768805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168768991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168769574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168770203 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 168770364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168771237 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 168771485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168771495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168771572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168771623 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168772775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168772865 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168773000 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 168773137 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168773307 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 168773329 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168773625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168774647 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168774755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168774823 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168774859 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 168775110 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168775193 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168775597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168775696 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 168776966 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168779574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168779575 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168779741 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168780217 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168780439 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168780441 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168780470 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168781937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168784132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168784961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168785216 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168785630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168785954 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168786191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168788814 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 168788835 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168788889 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168788977 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168789130 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 168789236 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 2 168789237 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 168789433 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 168789456 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 168789475 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 168789490 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 168789589 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168789838 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168789999 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168790070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168790096 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168790102 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168790132 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168790168 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168790271 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 168790276 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168790287 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168790297 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 168790301 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168790364 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 168790433 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168790435 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 168790452 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168790580 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 168790605 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168790765 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 168790806 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 168791015 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168791241 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168791259 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168791311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168791330 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 168791363 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168792342 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168792968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168793069 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168793182 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168793231 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168793518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168793571 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168793980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168794036 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168794177 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168794188 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168794203 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168794258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168794287 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168794297 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 168794300 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168794345 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168794362 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168794499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168794546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168794707 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168795141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168795167 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168795896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168796392 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168797338 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168797514 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168797557 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168797579 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168797650 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168797821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168797870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168797892 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168798853 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168799043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168799539 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168799938 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168800371 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 2 168801052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168801180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168801442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168802267 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168802306 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168802592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168802697 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168802777 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168802790 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168802791 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 168802833 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168802970 T G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 168803324 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 168803580 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168803644 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168804368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168804835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168805088 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168805209 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 168805546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168805597 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168805732 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168805793 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168805867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168805891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168806122 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168806186 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168806334 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168806384 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168806781 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168806798 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168806912 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 168807112 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 168807190 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168807244 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 168807278 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 168807279 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 168807310 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168807363 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 168807365 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 168807566 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168807614 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168807624 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168807631 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168807673 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 168807734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168807874 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168807876 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168808054 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 168808062 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 168808114 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 168808232 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 168808239 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 168808271 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168808272 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168808509 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168808779 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168808995 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168808996 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168809042 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168809043 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168809125 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168809928 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168810673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168811139 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168811140 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168811228 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168811464 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168811467 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168811496 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168811551 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168811609 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168811788 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168811913 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168811952 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168811957 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168812081 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168812263 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168812511 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168812516 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168813145 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168813395 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168813578 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168814481 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168814866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168815035 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 168815516 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 168815946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168815980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168816645 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168817427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168817773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168818524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168819075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168819243 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 168819309 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168819369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168819645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168820236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168820281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168820411 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168820591 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 168821541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168821608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168821677 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168821877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168821966 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168822086 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 168822297 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168823098 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168824190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168824341 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168824352 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 168824500 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 168824821 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 168824832 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 168825603 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 168825751 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168825804 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168825837 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168825859 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168825871 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168826044 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 168826045 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 168826247 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168826314 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168826375 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168826397 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168826421 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168826595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168826633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168826642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168826669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168826676 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168826731 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168826838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168826965 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168826980 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 168827341 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168827391 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168827551 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 168827629 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168827638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168827846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168828301 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 168829007 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168829156 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168829178 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168829474 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168829477 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168829665 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168829876 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168829961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168830045 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 168830687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168830843 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168831405 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168831733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168831969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168831983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168832057 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168832102 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168832120 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168832193 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168832211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168832212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168832586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168832630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168832814 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168832855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168832870 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 168832916 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168833356 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168833700 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168833959 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168833964 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 168833991 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168834126 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 168834164 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 168834575 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168835359 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168835440 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168836138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168836686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168836880 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168836897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168837010 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168837021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168837154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168837491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168837514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168837533 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168837540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168837579 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168837617 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168837664 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168838224 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168838292 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168838340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168838342 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168838354 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168838409 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168838440 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168838462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168838571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168838632 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168838672 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168838699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168838755 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168838785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168838808 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168838897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168838902 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168838973 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168839026 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168839032 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168839070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168839081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168839141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168839453 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168839516 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 168839574 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168839629 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168839862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168839906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168839955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168840020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168840098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168840169 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 168840177 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 168840225 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 168840286 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168840416 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 168840448 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 168840478 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 168840510 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168840544 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 168840578 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 168840582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168840616 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168840644 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168840706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168840714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168840776 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168840790 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168840797 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168840809 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168840853 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168840857 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168840873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168840904 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168840929 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168841023 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168841048 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168841130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168841186 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168841187 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 168841297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168841310 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168841780 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168841825 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 168841838 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168841839 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168841982 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 168841984 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168842412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168842414 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168842638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168842679 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168842871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168843426 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168843573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168844001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168844128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168844135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168844197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168844300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168844339 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 168844374 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168844524 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 168844670 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168845720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168846683 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 168848070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168848233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168851771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168851898 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168852204 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168852224 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168852234 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168853080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168853256 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168853363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168853378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168853382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168853522 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168853572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168853636 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 168853647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168854009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168854190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168854945 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168857297 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168858339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168860397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168861369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168863469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168864685 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168864989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168870298 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 168870829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168872155 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168872178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168872308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168872338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168872494 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168872753 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168872846 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168873880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168873896 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168874197 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168874222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168874226 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168874339 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168874528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168874575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168874607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168874636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168874673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168875036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168875709 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 168875756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168875934 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168875988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168876018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168876052 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168876068 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168876139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168876272 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168876782 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 168876908 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 168876919 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 2 168876922 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 2 168876975 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 2 168876989 T G Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 168877300 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168877383 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168877436 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168877600 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168877698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168877738 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168877768 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168877796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168877805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168877847 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168877903 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168878036 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168878313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168878471 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168878481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168878524 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168878542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168878550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168878667 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168878731 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168878742 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168878901 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168878905 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168878948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168878978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168879068 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168880207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168880503 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168881786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168882957 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168883045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168883113 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168883158 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168887523 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168887962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168888093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168888187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168888610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168889983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168890520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168890615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168890648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168890819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168891067 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168891168 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168891178 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168891308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168891408 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168891537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168891539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168891587 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168891706 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168891721 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168891727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168891808 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168891863 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168891920 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168891966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168892069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168892088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168892140 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168892264 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168892290 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168892323 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168892349 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168892374 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168893054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168893079 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168893134 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168893155 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168893176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168893282 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168893361 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168893548 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168893774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168893842 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168894988 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168894995 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168895052 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168895070 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168895242 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168895384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168895399 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168895507 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168895621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168895931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168896017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168896179 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168896226 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168896289 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168897377 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168897598 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168897936 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168898185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168898920 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168898968 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168898996 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 168899101 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168899126 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168899891 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168899914 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168899915 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 168900010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168900058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168900063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168900152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168900845 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168900849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168900910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168901148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168901340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168901717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168902320 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168903070 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168903181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168903184 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168903240 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168903344 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168903385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168903933 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168904081 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168904540 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168905443 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168905464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168905478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168905673 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168905972 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168906003 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168906323 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168906622 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168906852 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168906908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168906963 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168906969 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168907151 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168907315 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168907332 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168907387 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168907584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168907720 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168908272 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168908277 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168908339 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168908506 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168908587 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 168908821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168908869 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168908880 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168909617 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168909756 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 168909758 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 168909779 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168909835 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168909854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168909904 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168910018 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168910353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168910781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168911226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168911241 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168911331 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168911343 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168911485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168911490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168911522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168911535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168911552 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168911563 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168911675 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168911684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168912016 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168912729 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 168912750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168912764 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 168912900 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 168913060 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168913207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168913328 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168913532 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168913567 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 168913583 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168913611 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 168913630 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 168913648 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 168913664 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 168913685 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168914211 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 168914261 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 168914274 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 168914309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168914428 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 168914445 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 168915116 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 168915295 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 168915334 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 168915393 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 168915457 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168915460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168915493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168915521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168915631 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 168915783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168916016 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 168916088 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 168916308 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168916357 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 168916428 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 168916458 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168916461 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 168916498 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 168916538 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 168916627 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 168916649 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 168916650 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 168916665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168916684 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 168916814 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 168916834 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168916871 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168916908 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168917077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168917147 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 168917407 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 168917431 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168917441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168917602 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 168917608 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 168917921 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168917983 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 168918069 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 168918455 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168918721 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168919345 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 168919381 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 168919392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168919423 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168919487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168919583 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 168920179 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168920222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168920250 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168920325 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168921635 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 168921852 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 168922057 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168922101 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168922202 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168922341 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168922357 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168922420 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168922477 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168922761 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 168922798 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 168922893 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168923430 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168923624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168923640 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 168924055 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 168924171 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 168924230 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168924249 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168924637 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 168924736 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 168924805 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168924832 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 168924836 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168924979 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 168925482 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 168925731 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168925774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168925792 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 168925818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168925949 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 168925956 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 168926037 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168926170 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 168926506 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 168926611 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 168927128 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 168927263 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 168927266 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 168927279 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 168927457 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 168927460 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 168927480 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 168927498 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 168927524 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 168927618 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 168927719 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 168927756 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 168927775 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 168927796 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 168927803 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 168927814 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 168927821 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 168927851 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 168927880 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 168927918 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 168928018 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168928102 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 168928110 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 168928199 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 168928204 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 168928417 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 168928445 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 168928613 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 168928710 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 168929311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168929391 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168929532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168929603 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168929604 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168929956 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 168930157 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168930300 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 168930526 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 168930538 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 168930540 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 168930558 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 168930565 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 168930707 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168930800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168931819 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 168931961 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 168931974 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 168931977 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 2 168931987 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 168932009 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 168933081 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168934635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168934988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168935196 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 168935198 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 168935219 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168935254 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 168935430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168935780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168935800 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168935945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168936221 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 168936373 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168936449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168937077 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 168937084 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 168937137 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 168937139 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 168937245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168937412 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168937437 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 168937522 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168937725 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168937727 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168937775 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 168938087 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168938101 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 168938114 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 168938121 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 168938139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168938169 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 168938181 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 168938281 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 168938292 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168938328 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168938610 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168938672 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 168938682 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168938745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168938751 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 168938888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168938917 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 168939271 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 168939673 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 168939695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168939988 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 168940019 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 168940029 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168940163 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 168940510 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168940563 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 168940659 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 168940784 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 168940933 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168941275 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 168941287 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 168941603 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168941656 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168941682 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168941698 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168941781 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168941795 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168941823 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 168941832 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 168941864 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168941881 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 168941932 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 168941954 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168941963 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168942034 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 168942062 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168942139 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 168942289 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 168942311 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 168942344 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 168942477 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 168942549 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 168942557 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 168942628 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 168942809 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 168942810 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 168943028 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 2 168943390 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168944220 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 168944409 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 168944723 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 168944741 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 168944894 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 168945573 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168945851 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 168946460 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 168947696 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168947705 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 168947898 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 168947929 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 168948654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168949203 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168949943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168950721 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168951279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168951319 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168951355 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168951438 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168951439 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 168951458 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 168951459 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 168951654 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 168951830 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168952841 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168953604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168954608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168955214 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168955774 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 168955907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168955909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168956057 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 168956101 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 168956329 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 168956424 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 168956437 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 168956475 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 168956699 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 168957960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168957983 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168958056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168958224 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168958700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168958726 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 168958795 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168958835 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 168958900 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 168959057 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168959110 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 168959127 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168959156 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168961856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168962545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168963416 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 168963459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168963493 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 168963544 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 168963572 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 168963634 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168963652 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168963700 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168963714 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168963892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168964208 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168964215 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168965111 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 168965112 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 168965784 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168966115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168968596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168969385 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168969666 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168970091 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 168970199 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 168970209 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 168970392 T C Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 168970612 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168970884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168970935 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 168971621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168971637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168971731 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 168975982 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168977480 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168978145 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 168978314 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168979064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168979737 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 168979747 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 168979832 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 168980061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168980194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168981133 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 168981209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168981660 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168981822 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 168981848 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168982202 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 168982459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168982534 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 168982665 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168982922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168983114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168983130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168983134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168983304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168983324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168985185 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168985819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168985881 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168985902 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168985938 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168985986 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168986050 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168986237 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168986258 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 168986279 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 168986310 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168986406 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 168986461 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 168986867 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 168987285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168987447 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 168987568 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 168987657 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 168987674 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 168987675 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 168987810 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168987811 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168987823 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 168988129 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168988161 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 168988953 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168988960 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168988993 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168989553 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 168989574 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 168991249 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 168991306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168991750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168991848 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 168991873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168992001 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 168992002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168992662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168993405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168993927 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 168994101 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168994118 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 168994980 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 168995549 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 168995576 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 168996433 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168996436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168996445 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168997095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168997213 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 168997276 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 168997751 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 168998931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 168999244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 168999352 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 169000161 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169000264 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169000308 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169002500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169003849 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 169004223 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169004697 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169005400 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169005427 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169005442 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169005536 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169006063 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169006076 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169006110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169006972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169006987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169007000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169007161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169007172 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169007514 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169007911 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169007962 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169007966 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169008147 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169008148 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169008200 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 169008231 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 169008268 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169008269 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169008280 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 169008287 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169008293 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 169008341 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169008402 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169008559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169008745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169008762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169009551 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169009938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169010064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169010275 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 169010489 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169010531 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169010777 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 169010865 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 169010868 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 169010898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169011404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169012660 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169012844 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169013225 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169014587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169015367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169016508 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169018107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169018758 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169019494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169019542 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169019924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169021659 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169021828 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169022005 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169022190 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 169022201 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 169022599 A T Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 169022603 C T Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 2 169022652 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 2 169022757 A G Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 169023025 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 169023072 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 169023080 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 169023113 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 2 169023337 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 169023418 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 169023433 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 169023452 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 169023462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169024130 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 169024146 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 169024193 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 169024256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169024346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169024347 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 169028112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169028585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169029081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169032252 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169032261 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169032264 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169032304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169032311 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169032394 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169032397 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169032411 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169032444 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169032461 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169032486 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169032490 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169032532 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 169032533 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 169032547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169032561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169032588 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169032589 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169032602 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169032678 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169032688 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 169032721 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 169032736 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 169032739 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 169032991 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169033066 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169033080 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 169033185 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 169033223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169033229 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169033234 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169033306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169033345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169033372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169033462 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169033611 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 169033819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169033910 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169033931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169034009 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 169034049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169035036 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 169035060 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 169035122 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 169035317 T C Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 169035338 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 169035368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169035678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169035690 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169036813 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169036941 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 169036970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169036976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169037262 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169037451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169037579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169038431 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169039605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169039669 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169040565 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169040645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169041318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169042220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169042456 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 169042537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169043465 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169043575 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169043615 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169043670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169043693 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169044065 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169045018 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169045278 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169045499 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169046072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169046276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169046287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169046473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169047630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169047736 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169047759 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169048079 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 169048143 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169048259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169048327 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 169048400 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169048585 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 169048641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169049035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169049940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169050111 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169050156 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169052080 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169052116 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169052154 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169052172 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169052354 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169052606 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 169052919 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169052935 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 169053061 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 169053102 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169053107 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169053119 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169053126 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 169053190 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 169053194 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 169053246 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169053485 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 169053558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169054411 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 169054564 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169054615 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 169054806 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169054855 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169055035 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169055270 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169055283 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 169055371 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 169055397 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169055438 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 169055524 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169055692 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169055708 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 169055962 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 169055963 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 169056048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169056106 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169056940 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169057519 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 169058184 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169058648 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 169058970 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 169059042 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169059095 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169059096 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 169060656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169060734 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169060837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169061095 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169061491 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169061677 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169062167 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169062190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169062202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169062442 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169062612 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 169062627 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 169062764 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 169062769 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169062929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169063194 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169063205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169063217 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169063231 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169063601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169063624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169064288 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169064351 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169064637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169064658 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169064665 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169064690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169064696 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169064711 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169064721 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169064761 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169064779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169065096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169065105 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 169065137 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169065150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169065198 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169065215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169065216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169065643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169065698 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169065741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169065945 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169065969 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169066020 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 169066064 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169066214 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 169066317 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 169066364 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 169066366 C G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 169066425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169066455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169066585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169066693 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169066859 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 169066888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169066919 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169067454 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169067497 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 169067518 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 169067524 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 169067594 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169067687 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 169067765 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 169067803 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 169067833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169067923 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 169068083 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169068142 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169068223 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169068890 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169069043 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169069166 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169069222 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169069276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169069374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169069437 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169069803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169069843 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169069849 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169069858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169069906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169070431 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169070515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169070797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169070955 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 169070971 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 169071106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169071391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169071409 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 169071431 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169071560 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 169071759 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169071930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169072018 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169072110 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169072276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169072284 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169072309 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169072368 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169072434 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169072463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169072574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169072702 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169073066 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169073160 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169073221 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169073228 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 169073244 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 169073263 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 169073369 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169073396 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169073419 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 169073425 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 169073506 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 169073816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169074186 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169074343 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 169074348 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169074414 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169074704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169074811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169074937 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169075100 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 169075141 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 169075163 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 169076648 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 169076680 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169076729 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 2 169076760 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 169076997 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169077010 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169077055 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 169077155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169077846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169077907 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169077974 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 169077977 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 169078549 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169078876 T C Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 169079175 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169079270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169079396 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169079398 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169079446 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 169079771 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 169079790 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 169079823 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 169079864 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 169079892 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 169080130 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 169080183 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169080606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169080780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169080814 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169080969 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 169080985 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169081298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169081391 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169081431 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169081462 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169081525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169081802 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169081922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169081965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169081975 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169082156 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169082170 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169082185 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169082236 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 169082286 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169082346 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169082359 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169082552 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169082614 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169082700 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169082741 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169082808 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169082814 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169082863 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169082880 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169083224 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169083231 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169083260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169083265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169083333 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169083356 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 169083419 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169083426 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169083450 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169083466 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169083484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169083915 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169083984 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169084046 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169084052 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 169084084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169084096 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169084109 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169084122 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169084188 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169084191 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169084323 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169084408 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169084606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169084895 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169084916 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169085209 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169085257 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169085394 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169085462 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169085478 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 169085503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169085611 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 169085951 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169085964 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169086063 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169086347 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169086362 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169086405 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 169086410 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 169086558 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169087769 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169088042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169088046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169088079 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169088098 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169088133 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169088135 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169088257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169088307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169088450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169088602 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169088682 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169088772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169088783 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 169088811 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 169088827 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169088830 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169088840 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169089064 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 169089863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169089990 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169090011 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169090159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169090172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169090181 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169090246 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169090392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169090396 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169090607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169090671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169090685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169090715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169090919 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 169092008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169092110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169093742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169093910 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169093948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169093962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169094100 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169094117 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169094151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169094239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169094299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169094310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169094316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169094342 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169094388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169094443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169094650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169094671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169094757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169094890 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169095094 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169095177 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169095197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169095536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169095561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169095585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169095600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169095610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169095809 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 169095835 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169095852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169095897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169095913 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169095921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169096142 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169096228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169096300 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 169096314 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169096383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169096427 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169096433 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169096517 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169096752 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169096824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169096829 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169096904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169097043 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169097066 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169097154 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169097206 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169097211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169097404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169097619 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169097822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169097975 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169098377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169098456 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169098635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169099060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169099235 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169099266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169099686 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169099761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169099863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169099985 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169100038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169100052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169100683 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 169100710 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169101530 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169101537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169101768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169101779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169101887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169101929 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 169101935 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169101947 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 169101953 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169102131 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 169102178 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 169102208 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 169102220 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 169102234 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 169102262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169102311 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 169102359 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 169102371 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 169102459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169102529 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 169102611 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169102624 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169102692 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 169102722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169102742 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 169102749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169102838 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 169103075 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 169103408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169103703 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169103727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169103737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169103815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169103842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169103930 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169103931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169104050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169104091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169104187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169104250 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169104251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169104272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169104350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169104366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169104445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169104462 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 169104520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169104650 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 169104783 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169104852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169104895 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169105097 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169105172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169105471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169105583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169105789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169105795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169105832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106610 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106643 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106739 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106800 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169106837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169106872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169106985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169107003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169107071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169107090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169107108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169107187 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169107194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169107211 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169107219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169107227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169107331 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169107396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169107463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169107511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169107578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169107739 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169107960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169107990 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169107999 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169108014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169108124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169108258 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169108881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169108909 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169108960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169108964 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169109052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169109070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169109101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169109113 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 169109114 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 169109131 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169109167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169109234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169109237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169109251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169109963 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169109968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169110003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169110090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169111301 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169111441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169111586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112036 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169112840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169113003 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169113055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169113091 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169113585 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169113589 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169114073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169114279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169114492 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169114525 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169114690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169115044 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 169115107 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 169116375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169117504 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 169117585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169119111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169119231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169119442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169120075 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169120249 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 169120782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169121031 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169121251 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169121296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169121301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169121436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169121468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169121944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169122823 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169122866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169123218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169123789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169124146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169124224 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169124546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169125021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169125319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169125466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169125603 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169125665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169125770 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169125776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169125794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169125830 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169126056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169126486 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169126924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169127290 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169127352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169127950 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169128134 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 169128315 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169128329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169128370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169128514 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169129008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169129121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169129131 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169129279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169129299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169129447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169129559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169130039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169130480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169130730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169131410 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169132732 T G Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 169132770 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 169133869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169133994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169134002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169134077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169134253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169134298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169134377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169134946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169135091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169136725 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169137713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169140059 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169140117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169140731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169140919 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169142857 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169142998 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169143962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169147525 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 169150016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169150037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169150240 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169150339 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169150469 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169150537 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169150677 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169152108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169152129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169152153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169152203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169152251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169152266 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169152357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169152437 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169152528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169152609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169152634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169152738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169152857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169152913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169153132 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169153157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169153244 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169153321 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169153348 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169153428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169153574 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 169154056 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 169154089 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169154109 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 169154123 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 169154765 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169154773 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169154822 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169155037 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 169155183 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169155364 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169155564 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169155653 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 169156240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169156501 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 169157128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169157441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169157528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169157565 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 169157590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169157606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169157646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169157650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169157716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169157930 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 169157957 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169157993 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 169158200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169158235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169158248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169158291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169158835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169159012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169159542 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 169160486 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169160843 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169161246 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169161451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169161559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169161892 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169162411 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169162484 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 169162857 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169162866 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169162917 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169163344 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169163617 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169164423 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169164604 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 169165175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169165199 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169165453 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169165486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169165550 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169167226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169167243 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 169167511 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 169168185 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169168820 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169168921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169168986 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169169095 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 169169159 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 169169327 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 169169355 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 169169356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169169526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169169752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169170191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169170361 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169170424 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169170428 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169170510 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169170580 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169170642 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 169170643 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 169170706 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169170740 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169170780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169170808 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169170907 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 169172614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169172684 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169173207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169173773 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 169173844 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169174538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169175319 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169175902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169179075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169179091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169179841 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169179846 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169179874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169179886 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169180139 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169180338 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169180753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169181636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169181660 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169181992 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169182079 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 169182308 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 169182339 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 169182373 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 169182544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169182597 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 169183127 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 169183374 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169183382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169183409 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169183852 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 169183894 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 169183999 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169184058 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 169184083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169184172 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 169184332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169184380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169184515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169184754 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 169184783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169184813 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169184824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169184825 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 169184874 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169184941 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169184959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169185102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169185117 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 169185220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169185287 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 169185327 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 169185328 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 169185402 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 169185440 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169185448 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 169185471 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 169185755 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 169185867 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169186027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169186492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169186593 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169186606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169186747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169186774 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169186814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169186926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169186942 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169187192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169187337 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169187356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169187577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169188120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169188173 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 169188189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169188205 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 169188226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169188346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169188349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169188360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169188420 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169188611 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169188821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169189042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169189184 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 169189189 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 169189224 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 169189244 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169189369 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 169189467 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 169189761 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 169189795 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169189970 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169189990 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169190086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169190124 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 169190191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169190205 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169190210 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169190222 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169190410 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169190457 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169190823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169191017 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169191367 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 169191429 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 169191432 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 169191559 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169191665 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169191732 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169192025 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169192083 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169192152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169192250 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169192319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169192338 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 169192446 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169192469 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 169192598 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169192766 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169192802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169192852 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169193447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169193456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169193475 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 169193503 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 169193516 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 169193649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169193755 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 169194132 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 169194471 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169194606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169194712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169197685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169197926 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 169198019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169198163 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 169198203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169198204 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169198229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169198280 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 169198444 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169198454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169198617 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169198702 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 169198810 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 169198970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169199542 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 169199745 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169200010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169200141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169200806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169201248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169201672 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169201674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169201729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169202517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169202898 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169202908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169202938 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169202976 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169203002 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 169203102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169203175 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169203302 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169207002 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 169207051 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169207347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169207354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169207781 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169207789 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 169208136 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169208249 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 169208311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169208894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169209328 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169209405 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169209434 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169209437 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169209474 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169209528 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169209735 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 169210267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169210576 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 169210883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169210985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169211268 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169211830 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169212124 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 169212169 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169212191 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 169212691 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 169212696 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169213075 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 169213083 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169213115 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 169213271 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 169214113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169215119 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169217020 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 169217073 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169217092 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169217093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169217255 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 169217259 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 169217311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169217418 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169217532 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169217615 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169218292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169218534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169218581 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 169218690 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169218697 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169218709 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169218731 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169218737 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169218786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169218855 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 169218878 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169218954 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169219105 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169219659 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169219663 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169219739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169219770 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169219857 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169219914 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169220455 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169220829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169220974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169221036 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 169221095 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169221178 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 169221285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169221307 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169222562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169222921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169224941 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169224965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169225109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169225149 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 169225491 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 169225562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169225786 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169225787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169227419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169228843 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 169228869 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 169228958 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 169228998 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 169229066 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 169229081 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169229090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169229161 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 169229177 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 169229275 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 169229291 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 169229537 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 169229577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169229701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169229733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169230426 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169230450 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169231369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169232025 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 169232180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169232604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169232665 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 169234651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169234695 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 169234733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169234995 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 169234996 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 169235605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169235927 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 169236254 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 169237218 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 2 169237377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169238308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169238724 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169239980 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 169239997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169240002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169240117 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 169240617 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 169241155 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 169244398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169244754 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169245685 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 169249430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169249777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169249789 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 169250009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169250441 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169250856 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169250883 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 169250964 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 169251411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169251600 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169255477 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169256752 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169257205 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 169257217 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169257243 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169257720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169261416 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169261493 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169262520 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 169264105 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169265654 A C Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 2 169265655 G A Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 2 169266338 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169266726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169268319 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169268435 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169268501 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169269125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169269129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169269176 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169269215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169269225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169269544 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 169269656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169270266 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 169272130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169272523 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169273080 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169273084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169273310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169273757 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169273813 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169273839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169273853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169273918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169274022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169274047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169274060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169274114 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169274644 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169274784 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169274800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169274822 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 169274946 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169274962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169274971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169274996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169275087 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169275111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169275223 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169275659 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169276720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169277652 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 169278599 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169278766 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169278787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169278879 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169279720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169279763 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169279884 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169279910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169280013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169280062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169280208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169280219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169280243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169280277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169280344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169280551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169280598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169280738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169280739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169280801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169280803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169280928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169281013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169281360 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169282413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169282765 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169282850 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169282860 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 169283327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169283333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169283351 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169283592 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169283627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169283658 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169283884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169283925 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169283930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169283937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169284032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169284126 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169284195 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 169284236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169284520 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169284996 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169285133 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 169285246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169285299 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 169285391 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169285757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169285785 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 169285793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169285821 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 169286071 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169286089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169286204 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169286236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169288148 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169289897 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 169290570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169291328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169295551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169296941 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169298302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169298312 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169298814 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169298948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169299639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169299680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169300784 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169300816 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 169300821 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169301111 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 2 169301344 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 169301365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169301379 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169301609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169301655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169301850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169301875 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169301951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169302357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169302889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169308190 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169310271 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169312722 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 169312804 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169313772 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 169313915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169314161 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169314407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169314414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169314494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169315228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169317552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169317728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169318611 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169319052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169319570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169319699 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 169320310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169320340 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169320821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169321916 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 169322156 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169322182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169322264 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169322381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169322417 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169322427 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169322548 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169322595 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 169322638 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169323613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169324087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169324362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169324397 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169325718 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 169325759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169326059 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 169326074 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 169326112 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169326130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169326173 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169326505 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169326529 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 169326624 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169326721 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169326929 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169326954 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169327211 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 169327212 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 169327294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169327653 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 169327738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169327819 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 169327937 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 169328077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169328092 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 169328114 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 2 169328173 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 169328213 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 169328276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169328482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169328859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169328913 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 169328954 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169329040 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 169329263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169330231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169331737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169332150 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169332732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169332738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169333228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169334062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169335225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169335668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169336366 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169336423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169336492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169337213 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169337314 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169340268 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 169341146 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 169341160 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 169341261 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169341411 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169341513 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169341514 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169341531 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 169341532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169341658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169341697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169341753 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 169341781 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169341809 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169341848 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 169341975 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169341992 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 169342022 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169342676 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 169342915 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 169343494 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 169343685 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 169344103 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 169344123 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 169344211 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 169344317 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169344381 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 169345059 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169345943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169345962 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 169346050 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 169346129 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169346201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169346407 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 169346561 A T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 169346578 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 169346587 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169346698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169346803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169347460 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169347560 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169347649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169347974 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 2 169348360 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169348373 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 169348518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169348905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169348948 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 169349000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169349079 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 169350373 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 169350402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169350431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169350749 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 169350915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169351340 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169351940 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169351945 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169351952 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 169352309 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 169352400 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169352402 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169352427 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169352442 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169352447 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169352476 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169352699 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169352705 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169352733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169353031 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169353169 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 169353388 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 169353462 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 169353500 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 169353667 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 169353898 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 169354147 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169354148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169354173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169355031 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 169355039 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 169355078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169355099 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169355350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169355771 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 169355888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169355914 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 169355965 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169355981 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169355992 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169356132 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 169356229 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 169356271 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169356456 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169356516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169357123 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169357179 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169357564 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169357583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169357600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169357814 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169357825 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169358204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169358436 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169358580 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169358660 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169358856 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169358976 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169359074 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169359808 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169359896 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 169359977 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169360398 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169360421 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169360438 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169360613 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 169360624 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 169360901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169360986 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169361009 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 169361936 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169362778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169363216 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 169363235 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 169363268 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 169363746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169363813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169364142 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169364765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169364811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169365002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169365036 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169365203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169365218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169365324 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169365455 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169366092 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169366093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169366146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169366613 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 169366710 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 169366739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169366853 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169366879 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169366882 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169367216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169367335 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 169367573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169367609 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 169367679 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 169367709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368200 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368397 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169368461 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368559 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169368564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169368678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169369340 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 169369475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169369510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169369531 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169369576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169369593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169369711 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169369770 T A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 169370688 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169370738 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169371419 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169372376 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169372909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169372920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169372991 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169373077 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 169373520 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169373597 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169373621 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169373653 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169373685 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 169373694 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 169373870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169373899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169374014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169374025 T G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169375096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169375104 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169375118 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 169375388 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 169375453 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169375457 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169375517 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 169375537 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 169375554 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169375573 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 169375629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169375818 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169375944 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169375976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169376106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169376121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169376135 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169376205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169376221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169376276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169376451 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169376665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169376727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169377297 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169377354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169377362 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 169377388 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169377446 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 169377452 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 169377467 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 169377540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169377542 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169377684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169377689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169377748 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 169377817 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169377846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169378023 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169378063 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169378237 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 169378347 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169378475 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169378826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169379149 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169379409 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169380162 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 169380185 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 169380414 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 169380447 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 169380514 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 169380526 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 169380541 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 169380563 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169380564 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169380583 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169380658 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169380666 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169380700 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169381092 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 169381132 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 169381134 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 169381162 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 169381311 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 2 169381338 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 169381445 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 169381465 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169381484 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169381529 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 169381635 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169381757 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 169382342 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 169382388 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169383575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169384148 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169384166 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169384319 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169384330 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169384387 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 169384478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169385744 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 169385837 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169386355 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 169386934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169387170 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 169387570 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 2 169387639 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 169387644 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 169387731 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 169387798 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 169387940 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169387942 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 169388050 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 2 169388085 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 169388413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169388592 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 169388603 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 2 169388621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169388705 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 2 169389338 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 169389751 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 169389809 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 169389835 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 169389939 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 169389943 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169389963 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 169390050 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 169390062 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 169390069 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 169390112 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 169390709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169390864 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 169391885 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 169391978 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 169395552 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 169396413 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 169396452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169397420 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 169397819 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169399674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169399701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169399896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169399916 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 169399974 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 169399992 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 169399993 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 2 169400497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169400604 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 169401159 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 169401265 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169401416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169401435 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169402540 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 169403208 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169403224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169403914 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 169407656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169409085 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169409769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169409792 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 169409803 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 169410671 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169411772 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169411890 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 169412089 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 169412442 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 169412722 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169414067 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169415038 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 169415300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169415317 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169415344 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169415472 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 169415473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169415776 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 169415963 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 169416432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169416551 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169416555 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169416598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169416616 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 169416997 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 169417228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169417335 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 169417677 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 169417919 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 169417985 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 169418025 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 169418054 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 169418055 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 169418141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169418672 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 169418686 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 169418772 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 169418906 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 169418995 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 169419300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169419416 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 169419796 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169420013 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 169420092 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 169420357 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169420879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169421401 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 169421554 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 169421575 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169421915 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169422103 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169422584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169423048 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169423134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169423849 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 169424684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169425226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169425230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169425248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169425382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169425394 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 169425956 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 169426040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169426195 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 169426326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169426327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169426368 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 169426390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169426428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169426429 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169426446 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169426594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169426621 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 2 169426653 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169426763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169426852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169426894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169428067 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 169428227 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 169428604 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169428703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169428791 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169429061 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 169429161 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 169429241 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 169430446 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 169430637 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 169430662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169430707 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 169430776 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169430782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169430847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169431152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169431231 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169431591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169431886 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 169432081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169432380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169432671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169433716 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 169433903 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 169436985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169438991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169441720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169442968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169444343 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 169444484 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 169444555 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 169444604 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 169444644 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 169444690 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169444725 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 169444735 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 169444759 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 2 169444917 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169444971 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 169445004 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169445122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169445223 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 169445237 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 169445509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169445712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169446272 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 169446367 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 169446379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169446392 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 169446609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169447430 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 169447644 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 169447657 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 169447661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169447812 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 169448501 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 169448521 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 169449115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169449158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169449294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169451020 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169451148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169453220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169453295 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 169454447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169454610 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169454711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169454976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169455761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169456228 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169456312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169457505 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169459121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169459481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169460049 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 169462624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169466020 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169467484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169467734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169467755 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 169467835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169467850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169468061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169468095 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169468759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169468872 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 169468946 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169469063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169470291 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 169470337 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 169470358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169470380 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 169471794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169471836 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 169473581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169473962 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169475770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169475870 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169476427 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 169476583 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169476972 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169476990 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169477689 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169478335 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169482762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169482885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169482895 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 169483556 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 169483571 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 169483572 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169483601 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 169483636 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169483677 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169483681 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169483773 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 169483923 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169483953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169484306 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169485788 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 169486342 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169486621 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169487874 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169487928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169488034 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169488143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169488154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169488161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169488234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169491277 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169491462 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169491480 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169493806 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169499787 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169500165 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169500215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169500267 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 169500275 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 169500353 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 169500392 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169500496 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 169500497 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 169500665 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169501155 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169501162 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169501172 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169501175 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169501409 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169501699 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169501782 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169501864 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169501876 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169501950 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169502017 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169502466 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169502553 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169502992 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 169503337 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 169503727 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 169504410 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 169504460 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169504639 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 169504879 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 169504883 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 169505117 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169505734 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169506055 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169506192 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 169506253 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169506460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169508614 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 169508980 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 169511263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169512453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169512950 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 169513306 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 169513377 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 169513440 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169513481 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 169513488 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 169513976 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 169514005 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169514072 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 169514264 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 169514351 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 169514429 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 169515661 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 169515683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169515687 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 169515699 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169515704 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169515832 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169515990 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 169515995 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169516495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169516500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169516583 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169516643 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169516815 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169516866 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 169516922 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 169517380 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169517551 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 169517843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169518390 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169518513 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169518660 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169518817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169518823 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 169519031 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 169519074 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 169519650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169519791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169519890 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169520051 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169521070 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169521180 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169521425 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 169522499 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169524361 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169524418 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169524689 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 169524730 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169526143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169526513 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 169526696 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169526705 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 169526867 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169526918 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 169526920 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 169526986 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 169527159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169527177 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 169527547 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169528552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169528703 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 169528732 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169528747 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169529289 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169529364 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 169531251 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169531252 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169531478 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169532067 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169532213 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 169532225 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169532260 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169532313 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169532374 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169532428 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 169532520 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169532554 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169532657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169532705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169532920 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 169533099 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 169533282 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169533341 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 169533497 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169533861 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 169534012 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169534098 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169535509 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169535858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169536018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169536045 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169536259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169536462 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169536622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169536725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169537284 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 169537417 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169538927 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169540172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169540205 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 169540266 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 169540295 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 169540405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169540703 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 169540789 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 169540922 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 169541026 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 169541112 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169541148 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 169541468 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 169541590 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 169541662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169542046 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 169542367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169542387 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169542501 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 169542510 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169542616 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169542930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169543203 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169543261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169543399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169543591 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 169543803 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169544013 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169544057 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169544163 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 2 169544260 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 169544501 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169544505 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169544617 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 169544720 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 169544783 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 169544915 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169544991 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 169545029 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 169545299 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 169545428 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169545554 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169545723 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 169546174 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 169546436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169548541 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169548645 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169549527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169551058 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169551297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169553985 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169554047 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 169555377 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169555504 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 169558077 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169559602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169559902 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169559984 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169560549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169561318 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 169561361 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 169561367 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 169561462 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 169561823 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 169561937 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 169563634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169564260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169564588 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169565787 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 169566393 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 169567211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169568246 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169568797 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169569193 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169569228 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169569242 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169569749 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 169569841 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 169569871 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 169569899 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 169569968 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169569976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169570125 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 169570135 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169570252 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 169570260 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169570276 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 169570548 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 169570815 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 169570968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169571028 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 169571268 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 169571711 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169571885 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169572033 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169572045 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169572053 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169572178 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169572424 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169572541 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169573392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169573528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169573529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169573757 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 169573771 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 169573823 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169574923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169575363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169575789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169575818 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 169575867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169575887 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169575939 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169575956 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 169576010 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169576210 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 169576634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169576758 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 169576845 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 169576918 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 169577296 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169577583 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169577664 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169577751 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169577929 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 169578053 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169578065 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 169578131 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169578163 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169578462 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 169578519 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 169578550 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 169578575 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169578650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169578669 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 169578686 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 169578704 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169578746 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169579353 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169579389 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 169579480 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 169579482 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169579589 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 169579654 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169579670 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169579683 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169580034 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169580081 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169580245 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 169580565 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169580954 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169581120 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169581165 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169581368 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169581379 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169581385 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169581875 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169582052 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 169582670 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 169582863 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 169582867 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 169582906 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 169583051 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169583109 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 169583221 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 169583230 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 169583237 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 169583385 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169583494 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 169583620 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169587329 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169587361 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 169587372 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169587430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169587494 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 169587513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169587516 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 169588020 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169588260 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169588863 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 169589193 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169589361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169589723 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 169589927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169590305 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 169590725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169590753 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 169590799 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169590894 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 169590907 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169590962 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 169591157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169591170 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169591224 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 169591240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169591270 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169591417 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169591421 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169591445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169591611 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 169591623 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 169591636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169591783 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169591879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169591916 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 169591953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169591971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169592042 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169592077 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169592323 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 169592331 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 169592344 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 169592356 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 169592366 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169592385 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169592473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169592523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169592556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169592726 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169592949 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169592999 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 169593017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169593052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169593054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169593103 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169593242 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169593248 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169593259 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 169593321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169593326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169593348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169593441 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169593444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169593532 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 169593575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169593697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169593759 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169593800 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 169593883 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169593913 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169594021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169595097 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169595100 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169595126 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169595267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169595387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169595414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169595509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169595683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169595691 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 169595808 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169596010 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169596036 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 169596120 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 169596476 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169596668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169596764 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169596829 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169597005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169597046 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 169597057 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 169597060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169597124 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169597404 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169597415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169597460 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 169597501 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 169597706 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169597717 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169598367 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169598368 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169598459 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 169598639 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169599124 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169599243 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169599355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169599465 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169599538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169599609 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 169599626 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169600378 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 169600555 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169600584 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169600588 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169600625 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169600653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169600742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169600801 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169600804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169600937 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 169600945 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169601202 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 169601323 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 169601457 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 169601807 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 169601938 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169601996 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169602235 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 169602363 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 169602850 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169603062 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 169603336 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 169603378 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 169603583 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169603708 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 169603753 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169603761 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169603767 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 169604727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169605362 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169605523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169605787 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169606268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169608107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169608848 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 169608976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169609191 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169609248 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169609353 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169609817 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169609826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169609859 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169609876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169609894 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169609947 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169609972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169609989 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169610102 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 169610129 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169610179 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 169610311 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 169610471 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 169610584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169610605 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 169610770 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169610851 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169611012 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 169611588 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169611782 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 169611833 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 169611884 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169611990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169612015 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 169612076 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 169612930 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169613144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169613723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169614694 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169614707 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169614765 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169614768 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169614807 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 169614923 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169615152 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169615257 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169615264 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169615657 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 169615978 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169616363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169616506 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169616507 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 169617021 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 169618620 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169618722 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169619008 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169619438 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169619542 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169619788 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169619839 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169619918 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 169620068 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169621214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169621553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169622241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169622514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169625928 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169627732 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169627767 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169627827 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169627843 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169628238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169628359 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169628721 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169628795 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169628865 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169628892 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169628936 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169629027 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 169629104 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169629205 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169629614 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 169629882 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169629901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169629964 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169629986 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169630208 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169631627 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169632091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169633987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169634451 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169635077 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169635124 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169635170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169635382 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169635675 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169635689 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 169635705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169635823 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169635867 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169636359 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169636546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169636608 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169636728 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169636808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169637843 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169638681 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 169640629 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169641458 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169641712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169641793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169643825 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169643830 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169643948 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169643977 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169644267 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169644281 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169644327 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169644356 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169644466 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169644498 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169644507 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169644587 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169644679 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169644803 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169644906 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169644918 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169644937 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169644949 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169644958 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169644979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169645077 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 169645106 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 169645194 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 169645223 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 169645285 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169645449 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169646155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169646347 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169646464 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169646474 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169646489 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169646541 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169646578 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169647006 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 2 169647220 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 169648217 G T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 169648240 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 169648505 C A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 169648728 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 169649496 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 169649839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169649969 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169650030 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 169650091 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169650207 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 169650213 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 169650366 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 169650381 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 169650388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169650438 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 169650453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169650541 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 169650574 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 169650612 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 169650652 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169650662 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 169650663 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169650695 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169650869 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169651146 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169651332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169651388 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 169651399 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169651400 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 169651516 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 169651545 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 169651556 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 169651972 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 169652357 G T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 169652403 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169652521 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 169652839 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169652841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169653032 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 169653402 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 169653635 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 169653639 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 169653747 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 169653755 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 169653799 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169654115 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 169654318 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 169654319 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 169654335 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 169654356 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 169654434 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 169654465 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 169654492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169654579 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169654655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169654690 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169654831 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169654845 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 169654911 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169654990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169655003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169655182 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 169655468 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 169655502 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 169655519 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 169655524 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169655658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169655669 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 169655689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169655983 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 169656044 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 169656061 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169656176 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 169656258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169656289 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169656290 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169656313 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169656628 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 169656669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169656705 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 2 169656721 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 2 169656754 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 169656845 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 169657040 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169657061 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169657082 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 169657144 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169657285 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 169657316 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 169657382 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 169657408 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 169657413 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 169657496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169657526 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 2 169657625 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169657699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169657713 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169657964 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169658000 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 169658007 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 169658073 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169658308 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 169658391 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 169658438 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 169658511 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 169658522 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 169658696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169658710 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 169658766 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 169658799 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 169658985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169660147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169660205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169660729 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 169661516 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 169661521 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169661630 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 169661742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169662004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169662383 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 169662504 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169662534 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 169662766 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 169662788 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 169662978 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 169663019 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 169663040 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 169663273 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 169663288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169663466 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 169663738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169663809 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169664077 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 169664217 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 169664246 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169664274 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 169664335 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 169664903 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169665014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169665477 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169665543 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 169666029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169666204 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 169666288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169666723 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 169666833 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 169666846 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 169666864 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 169667065 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 169667480 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169669270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169669613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169669705 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 169669947 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169670866 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169671050 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 169671743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169671903 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169672533 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169673256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169677130 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169678189 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169678643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169679181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169679264 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 169679446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169680383 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 169680509 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 169680522 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 169680772 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 169682020 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169682156 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169683439 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 169683700 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169683759 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 169685438 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169685569 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169686867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169687514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169689254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169689374 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 169689437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169690065 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 169690106 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169690232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169690242 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169690496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169690532 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169690760 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169690865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169690897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169691271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169691445 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 169691513 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 169691591 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 169691595 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169691755 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169691790 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 169691859 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 169692112 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 169692180 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 169692275 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169692447 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 169693178 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169693251 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 169693264 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 169693316 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 169693321 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 169693335 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169695051 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169695600 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 169695658 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169695997 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 169696059 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 169696125 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 169696195 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 169696196 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 169696737 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169696787 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 169696858 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169696897 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 169696898 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 169696908 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 169696948 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 169696962 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169697012 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 169697024 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 169697059 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 169697247 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169697275 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169697286 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169697343 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 169697471 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 169697508 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 169697522 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 169697673 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169697694 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169698096 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169698244 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 169698316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169699786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169699858 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 169699974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169700558 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 169701149 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 169701155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169701221 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 169701257 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 169701300 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 169701313 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169701328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169701703 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 169701761 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 169701902 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 169703001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169705695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169706511 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169706926 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 169708238 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 169712135 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169717172 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169721312 T A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 169721517 T A Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 169721969 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169723432 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169723804 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169724930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169725438 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 169725991 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 169726222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169726486 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 169726500 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 169728978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169729050 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 169729483 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 169729538 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169729688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169730590 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169731272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169731392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169731641 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169731648 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 169732115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169732758 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169733423 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169734889 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169735200 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 169735834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169735909 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169736878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169737582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169738651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169742207 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169742383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169742553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169742811 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169742984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169742995 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169743020 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 169743070 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 169743088 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 169743196 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169743210 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169743327 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 169743534 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169743590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169743646 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169743688 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 169744153 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 169744163 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 169744299 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 169744411 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169744916 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 169744951 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 169745004 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 169745443 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 169745765 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 169745812 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169745821 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 169745880 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169745891 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 169745960 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 169745962 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 169746154 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169746214 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 169746282 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169746305 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169746594 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 169746608 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 169746630 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 169746834 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 169746868 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 169747031 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 169747071 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 169747142 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 169747181 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169747399 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 169747913 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169748374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169748472 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169748473 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169751097 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169752519 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169753504 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169753560 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 169753731 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169754488 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169754697 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169754763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169755317 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169755675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169755817 G C Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 169756523 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169758150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169758208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169758595 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 169759331 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169760367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169761356 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 169761648 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169762469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169764992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169765020 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169765072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169765086 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 169765526 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 169765877 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 169765921 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169766200 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169766239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169766416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169766938 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169766978 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169767016 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169767078 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169767345 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 169767352 T C Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 169767578 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 169768829 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 169768944 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 169768980 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 169769284 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169769300 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169769335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169769578 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169769581 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169769660 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169769703 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 169769773 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 169769820 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 169769830 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 169769840 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169769849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169769866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169769869 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169769940 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169770008 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169771153 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169771174 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169771325 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169771371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169771541 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 169771997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169772166 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 169772260 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 169772279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169772773 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169773825 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169774157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169774165 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169774455 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 169774617 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 169776209 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169777032 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 169777265 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 169777297 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169777333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169777620 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 169777651 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 169777681 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 169777691 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 169777748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169777758 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 169777773 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 169777779 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169777804 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 169778139 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 169778347 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 169778358 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 169778382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169778461 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 169778755 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169778802 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169778817 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 169778964 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169778966 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169779027 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169779333 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 169779353 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 169779497 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 169779550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169779645 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 169779658 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 169780377 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169780392 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169780473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169780713 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169783382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169784176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169784189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169784190 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169784339 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169784748 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 169784756 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169784789 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169784960 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169785107 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169785158 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169785343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169785443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169785948 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169787414 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169788369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169788851 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 169788857 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169788985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169789559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169789591 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169789606 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169789722 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169789743 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 169789749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169789756 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169789773 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 169789798 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169789866 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 169789867 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 169789919 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 169790580 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169790625 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 169790811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169790830 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 169790939 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169790944 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 169790978 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169791018 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 169791374 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169791493 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169791496 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169791807 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169791847 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169791868 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169791900 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169792076 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169792130 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 169792887 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169792953 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 169793225 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169793283 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169793506 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169793572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169794092 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169794095 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169794381 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 169794418 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169794541 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169795266 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169795497 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169795670 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169795728 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169795808 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169795846 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 169796001 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169796065 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169796205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169796383 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169796421 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169796545 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169796568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169796799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169796885 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169797075 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 169797094 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 169797107 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 169797594 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 169797596 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 169797649 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169797668 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 169797875 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169798004 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169798005 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169798520 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169798710 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 169798730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169798811 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 169799019 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 169799747 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 169800003 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169800055 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169800190 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169800286 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 169800299 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 169800366 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169800388 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169800439 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169800502 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 169800528 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169800666 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169800669 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 169800685 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169800703 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169800734 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169801189 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 2 169801472 G A N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 2 169801532 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 169801686 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 169801924 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 169802207 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 169802240 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 169802315 G C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 169802388 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 169802511 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 169802862 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 169802878 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169803470 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169803557 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169803728 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 169804167 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169804369 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 169804394 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169804446 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169804459 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169804689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169804723 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169804738 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169804746 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169804760 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169804795 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 169804827 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169808538 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 169808546 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169808571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169808747 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169809024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169809125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169809271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169809909 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169810226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169810270 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169810286 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169810314 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169810322 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169810431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169810433 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169810450 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169810615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169810657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169810674 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169810855 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169810856 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169810888 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169811151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169811224 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169811257 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169811754 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169814626 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 169815262 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169819308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169820938 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169822151 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169822189 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 169822232 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 169822320 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 169822355 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169822430 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169822583 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 169822623 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 169823392 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 169823397 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 169823403 T G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 2 169823545 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169824172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169824196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169825890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169829366 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169830861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169831604 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169836526 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 169836780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169837040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169841289 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169841304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169841717 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169841727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169841772 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169842158 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169842458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169843187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169843868 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169844170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169845090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169845384 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169845738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169846157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169846201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169847643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169849364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169849967 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169850093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169851211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169851946 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 169851953 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169851986 C A Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 2 169852070 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 169852218 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 169852448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169852657 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169853394 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 169854599 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169854666 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 169854717 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 169855039 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169855059 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169855060 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169855078 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 169855840 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169855983 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169855996 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 169856000 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169856249 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169856384 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169856422 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169856447 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 169857059 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169857182 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 169857206 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 169857279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169858229 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169858862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169859903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169860625 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 169860734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169860777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169860783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169860799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169861481 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169861559 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169861752 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169863133 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 169865565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169867679 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169867750 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169867919 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169867986 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169867994 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169868540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169868995 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169869166 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 169869178 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 169869348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169869601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169870080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169870837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169870915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169870960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169871044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169871116 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169871430 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169871633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169871673 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169871678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169872374 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169872377 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169872423 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 169872502 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169872552 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169873079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169873379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169873529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169873912 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169874012 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169874121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169874549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169874559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169874609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169874628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169874894 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169876162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169876220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169876275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169876280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169876606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169877328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169877466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169877567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169877655 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169878343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169878872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169879054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169879068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169879106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169879290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169879577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169879653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169879804 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169879999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169880279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169880342 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169880386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169880834 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169881058 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169881067 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169882688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169883072 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169883117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169883428 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169883429 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169883482 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169883581 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169883900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169883946 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169884329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169884425 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169884456 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169884629 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169884689 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169885066 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 169885394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169886769 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 169886985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169887134 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169887243 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169887418 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169887436 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169887723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169888044 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169888207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169889409 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169889418 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169889492 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169889787 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 169889828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169890088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169890418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169890428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169890434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169890451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169890471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169890587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169891329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169891530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169891649 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169891938 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169892007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169892028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169892058 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169892419 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169892574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169893157 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169893242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169893606 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169893783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169893926 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 169893987 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 169894024 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169894355 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169894425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169895334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169895348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169895833 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169896227 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 169897159 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169897208 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169897223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169897278 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 169897952 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169898563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169898719 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169900148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169900675 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169902046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169903173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169904747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169904946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169906169 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169906348 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169907684 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 169910180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169910331 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169910651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169911128 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169912691 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169915253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169915912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169916959 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169918879 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169919228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169919683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169920845 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169920901 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169921079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169921094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169921111 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169921112 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169921212 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169921276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169921343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169921355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169921561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169921746 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169922554 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169922618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169922731 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169925426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169926811 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 169929757 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 169929923 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169935630 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169937326 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 169937965 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 169938333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169941544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169942508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169946896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169948713 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169952907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169960697 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 169962145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169962926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169963172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169964782 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 169965206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169965562 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169967510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169968091 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 169968827 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169969450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169970355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169971560 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 169977052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169977185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169979254 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169981205 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169981752 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 169981985 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169982007 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169982594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169983073 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169983130 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 169983661 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 169985727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169986062 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 169986107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 169986402 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 169986798 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169986860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169987140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169988245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169988479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169988671 C A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 169989578 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169989756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169990508 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 169990571 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 169990883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169991181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169991312 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 169991363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169991420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169991728 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169991955 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169992139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169992496 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169993068 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 169993472 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169993729 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169993809 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 169993895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 169994966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169996463 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 169996658 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 169997116 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169997342 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169997529 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 169997696 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169997866 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 169997899 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169997990 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 169998141 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 169999368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170000690 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 170000872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170000892 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170000894 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170000911 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 170000931 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170000932 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 170001056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170001072 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170001233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170001337 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 170001495 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170001627 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 170002714 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170002769 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170002778 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170003141 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170004565 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170004580 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170004735 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 170004748 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 170004985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170005052 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170005088 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170005203 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170006566 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170006590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170006847 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170007344 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170011398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170016312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170016662 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 170017497 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 170020234 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170020268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170020300 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170020369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170020377 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170020777 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170022621 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170023302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170023722 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170026604 C G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 170027617 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170029057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170029074 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170029887 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170029961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170032404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170036290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170036837 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 170037038 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 170037053 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 170037217 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 170037294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170037609 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170038355 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170039118 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 170039126 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 170039417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170039589 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170039982 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 170040060 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 170041028 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170041250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170041521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170042129 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170042982 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 170043001 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 170043573 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 170043789 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170044076 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 170044179 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170044517 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170045409 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170045470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170046008 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 170047634 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170047714 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170047818 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170048039 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170049342 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 170049573 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 170049840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170049892 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 170049990 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 170050124 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170050369 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170050911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170050940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170051704 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170053369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170053860 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170054026 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170054404 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170054661 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 170054805 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 170054992 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170055039 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 170055102 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170055159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170055280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170055519 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170055743 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 170055929 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 170056205 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170056556 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 170056604 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170056690 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170056790 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170056791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170057562 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170058639 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 170058777 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 170061077 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 170061109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170064027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170064725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170065171 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170065395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170065422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170065449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170066392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170066489 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170066608 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170067412 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 170068239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170069964 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170070025 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170070371 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 170070644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170070763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170070945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170070987 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170071123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170071613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170071711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170071726 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170071744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170072180 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170072217 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170072300 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170072479 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170072526 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170072535 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170073439 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170073516 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 170073625 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170073765 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170073933 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 170074009 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170074037 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170074136 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 170074172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170074216 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170074335 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170074476 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 2 170074810 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 170074811 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 170074830 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 170075054 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170075157 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 170075230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170075243 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 2 170075330 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 170075437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170075518 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170075542 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170075553 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170075586 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 170076247 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 170076302 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 170076477 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.4 0 0.6 8 12 4 0 6 2 170076526 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 2 170076681 G T N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 2 170076714 G T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 2 170076835 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 170076953 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 170076959 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 2 170077025 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 170077045 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 2 170077097 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 170077177 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 2 170077184 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 2 170077220 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 170077235 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 2 170077390 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 170077411 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 170077641 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170078103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170078253 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 2 170078264 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 2 170078622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170078732 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 2 170078745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170078994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170079476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170079809 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170079965 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 2 170080228 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 170080573 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 170080627 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170081130 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170081297 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170081352 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170081376 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170082089 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170082090 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170082105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170082241 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 170082540 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170083564 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 2 170084113 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 170084168 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 170084182 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170084295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170084300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170084362 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170084617 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 170084764 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 170084787 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 170084997 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170085274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170085405 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170085522 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170085720 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170085767 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 170085803 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170086025 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170086149 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170086173 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170086552 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 170086722 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170087192 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170087279 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 170087554 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170087734 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170088404 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 170089306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170090519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170090664 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 170090935 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 170091053 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170091138 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170091188 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 2 170091244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170091464 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170091483 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170091935 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 170092009 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 170092395 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170092619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170092786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170093040 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170093151 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170093245 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170093322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170093323 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.352941176470588 21 13 10 1 6 2 170093341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170093682 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 170093777 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 170093920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170093942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170094001 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 170094047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170094058 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170094085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170094117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170094155 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170094169 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170094247 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 170094740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170094795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170094878 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 170094993 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170095236 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 2 170095406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170095407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170095687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170095767 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170095915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170095958 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 170096028 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 170096048 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 170096073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170096128 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 170096201 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 170096300 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 170096305 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 170096318 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 170096412 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170096780 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 170096785 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 170096935 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 170101359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170101413 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170101569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170101625 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170101796 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 170101801 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 170101809 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 170103100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170103179 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170103294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170105924 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170106646 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170108000 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 170108278 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 170108384 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 170109284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170109358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170110218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170112365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170112906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170115324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170115424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170115833 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 170116008 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 170116094 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 170116318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170116420 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 170116539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170117238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170117518 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 170117609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170117686 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 170117720 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170117830 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 170117914 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170118191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170118537 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 170121114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170121128 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170121556 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170121647 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 170121795 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170121817 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 170122016 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 170122029 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170122045 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170122048 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 170122060 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170122070 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170122119 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 170122153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170122309 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 170123116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170123235 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170123294 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170123511 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170124274 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 170124318 G A Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 170124481 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170124765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170124780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170124795 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170124823 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170125065 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170126374 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170126767 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170126902 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170126921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170126982 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170127002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170127599 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170127821 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170127955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170127975 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 170128770 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170129009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170129086 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170129089 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170129160 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170129328 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 170129332 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170129340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170129399 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170129539 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170130504 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170130508 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170130546 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170130798 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170130841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170130960 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170130984 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170131185 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170131553 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170131561 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170133113 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170133539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170135039 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 170137619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170137920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170138024 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170138988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170139430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170139516 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170143583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170143933 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170146818 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 170147321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170147326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170147697 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170148889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170149742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170150248 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 170150377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170150404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170150918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170151618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170151654 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170152358 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170152440 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170152453 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170152471 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170152499 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170152766 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170152771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170152957 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170152960 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170153095 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170153126 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170153191 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170153195 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170153279 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170153342 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 170153777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170155013 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170156584 T A Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 2 170157003 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 170157327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170158567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170158664 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170158708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170159145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170159630 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170163906 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170165357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170165366 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170165529 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170166191 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170166475 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170166495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170166517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170166555 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170166657 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170166661 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170166697 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170167398 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170167605 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170167617 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170168453 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170168642 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170168712 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 170168715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170168818 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 170169592 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170169849 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170169853 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170170795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170170975 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170171094 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170171109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170171227 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170171229 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170171395 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 170171523 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 170171534 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170171672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170172399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170172588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170172856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170173260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170173481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170173552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170173561 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170174572 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170174772 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 170174915 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170175136 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170175365 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 170175384 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 170175778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170176116 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 2 170176597 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170176637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170176721 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170176836 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 170176992 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 170177123 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170177236 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 170177397 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170177651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170177718 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 170178069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170178661 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 170178908 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170179053 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170179054 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170179115 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170179126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170179220 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170179221 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 170179232 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170180019 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 170180042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170180212 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170180339 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 170180365 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 170181163 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170181470 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 170181482 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 170181517 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 170181569 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170181587 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170181600 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170181639 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170181702 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170181718 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170181876 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 170181885 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 170181956 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170182064 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 170182081 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 170182091 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 170182092 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 170182181 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170182211 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 170182318 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 170182487 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170182498 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170182602 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 170183661 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 170183762 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 170183774 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170183794 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 170183796 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 170183938 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170183942 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170183949 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170184040 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170184517 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 170184532 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 170184590 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 170184876 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170184924 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170185186 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170185265 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 170185281 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 170185366 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170185642 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170185675 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170185705 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170185756 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170185828 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 170187136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170187187 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 170187189 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 170187201 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 170187230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170187328 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170187448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170187504 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 170187517 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170187549 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 170187676 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 170187748 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 170187749 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 170187759 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 170187814 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 170187848 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 170187862 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 170187925 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 170187977 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 170188074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170188078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170188261 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170188366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170188440 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170188445 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170188514 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 170188536 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170188546 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170188577 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 170188796 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170188864 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170188915 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 170189033 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170189168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170189246 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170189273 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170189277 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 170189295 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 170189472 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 170189479 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 170189493 A C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 2 170189568 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170189635 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 170189676 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 170189758 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 170189799 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170190143 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170190381 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170190388 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170190778 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170190956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170191298 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 2 170191623 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170192080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170192084 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170192286 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 170192317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170192320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170192353 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170193024 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170193111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170193496 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 170193626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170193662 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 170193752 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170193833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170193940 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 170194018 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 170194826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170194843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170195043 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170195227 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 170195322 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 170195656 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170195739 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170195745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170195806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170196014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170196446 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170196448 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170197066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170197275 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170197677 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 170198271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170198384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170198389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170198597 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170198660 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170198783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170198797 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170198952 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170199078 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170199085 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170199624 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 170199704 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 170199917 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170200501 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170200551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170200576 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170200968 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 170201227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170202314 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 170202616 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 170202725 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 170202848 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 170202879 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 170203038 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170203137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170203377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170203512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170203513 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170203645 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 170203661 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 170203706 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 170203792 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170204848 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170205451 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 170206330 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170206530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170206791 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170206835 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170207317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170207545 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170208727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170208812 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170208860 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170208981 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 170209438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170209638 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 170209884 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170209945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170209995 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170210008 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170210077 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170210265 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 170212356 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170213438 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170215636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170215733 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 170216174 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170216364 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 170216402 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170216602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170216733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170216806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170216905 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 170216918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170216977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170217067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170217080 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 170217081 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170217106 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170217123 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170217361 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 170217439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170221184 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 170221282 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170221303 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 170221347 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 170221378 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 170221430 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 170221441 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 170221705 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170221716 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 170221778 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170221813 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 170221984 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170222068 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 170222100 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 170222105 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 170222112 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 170222140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170222195 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170222196 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170222208 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 170222369 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 170222389 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 170222394 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 170222412 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 2 170222476 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 170222507 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 170222533 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 170222606 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170222676 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170222739 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170222786 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 170222827 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170222846 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 170222975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170223073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170225291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170225481 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 170225538 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 170225541 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 170225577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170225704 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 2 170225740 A T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 2 170226044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170226102 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170226598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170229578 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 170230746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170230818 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170231385 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 170231648 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 170231852 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170231945 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 170232137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170232485 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 170232651 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 170232662 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 170232689 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 170232728 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170233592 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170233647 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 170234578 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170235143 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170235168 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170235259 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 170235271 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 170235379 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 170235420 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170235528 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170235571 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 170235589 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 170235634 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 170235666 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170235696 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 170235740 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170235954 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170235988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170236116 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 170236170 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 170236301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170236532 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 170236537 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 170236557 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170236566 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170236883 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170237029 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170237069 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 170237118 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170237180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170237386 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170237433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170238451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170240582 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 170241138 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170241351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170242278 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170242870 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 170243144 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 170243238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170243286 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170243529 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 170243561 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 170243619 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 170243740 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170243893 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 170244001 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 170245253 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170245864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170246083 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 170246095 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 170246281 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 170246344 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 170246403 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 170246430 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 170246690 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 170246847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170247397 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 170247445 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 170247479 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170247749 G T N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 170247790 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 2 170248768 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 170249922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170250040 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170250156 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170250187 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170250290 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 170250416 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 170250488 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170254532 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170254739 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 170254854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170255019 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170256781 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170257729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170258185 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 170258250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170258439 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 170258499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170258844 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170258914 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170258941 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 170258943 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170258999 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170259040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170259056 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170259187 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 170259468 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 2 170259549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170259630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170259631 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 170259729 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170261019 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 170261034 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 170261248 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170261436 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 170261482 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 170261487 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170261513 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 170261574 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 170261575 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 170261940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170262002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170262702 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 170263000 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170264458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170264460 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 170264480 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170264491 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170265871 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170267632 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 170267636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170267691 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170269189 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 170270202 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170270208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170270354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170270450 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170270459 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 170270506 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170270538 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170270591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170270676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170270679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170270707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170270713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170270733 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170270813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170270815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170271580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170271613 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 2 170271638 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 2 170271677 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 2 170271823 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 2 170271829 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 2 170272144 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 2 170272199 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 2 170272348 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 2 170272395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170272651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170272902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170273524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170275528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170276028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170276418 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170276843 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 2 170276859 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 2 170276879 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170277173 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 170278792 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 170279762 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 170280857 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 170282702 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 170284191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170284292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170284631 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170284991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170285071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170285080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170285790 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 170286574 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170287227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170287516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170287650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170287923 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170287951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170288006 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170288173 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170288186 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170288197 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170288223 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170289431 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 170289438 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170292678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170292683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170292753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170292838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170293290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170293549 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 170293558 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 170293588 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 170293707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170293852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170293964 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 170294068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170294132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170294805 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 170294882 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 170294956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170295038 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 170295103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170295469 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170295690 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 170295744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170295964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170296033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170296741 C A N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 2 170299716 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170301837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170302128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170302611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170302713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170302730 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 170302742 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 2 170302886 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170302953 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170303026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170303194 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 170303366 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 170303799 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 2 170303821 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 2 170303844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170304080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170304154 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 170304177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170304425 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170304445 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170304498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170304543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170304640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170304905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170304906 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 170305069 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 170305153 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 170305455 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170306039 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 170306159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170306182 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 170306277 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 170306287 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 170306304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170307369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170307437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170307753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170307759 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170307981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170308314 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170308319 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170308420 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 170308507 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170308554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170308682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170308709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170308713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170308946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170309546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170310886 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 170312179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170312243 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170313015 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 170313202 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170314991 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170315023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170315057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170315297 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170315557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170315933 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 170317228 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 170317296 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170317341 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 170317360 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 170317385 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 170317432 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170317441 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170317707 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 170317777 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 2 170318230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170318662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170318850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170319045 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170319048 C G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 170319401 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170319730 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170319764 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 170320379 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 170320412 A G Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 2 170320572 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 170320854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170320944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170321001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170321071 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170321078 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 170321140 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170321197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170321202 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170321268 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170321270 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170321300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170321306 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170321311 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170321335 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170321579 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170321584 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170321612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170321628 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 170321642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170321736 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 170321929 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170321956 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170321957 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170322101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170322553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170323019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170323099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170323117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170323118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170323438 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 170323640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170323831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170323838 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 170323869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170323901 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 170323947 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 170323948 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 170323983 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170323987 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170324043 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 170324045 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 170324057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170324129 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170324299 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170324308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170324319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170324329 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 170324330 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170324352 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 170324449 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 170324721 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 170324886 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 170324887 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 170324897 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 170324951 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 170324956 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170325004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170325146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170325172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170325378 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 170325458 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 170325926 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170326054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170326073 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 170326089 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 170326126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170326210 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 170326394 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170326499 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 170326807 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170327922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170328351 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170328454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170331095 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 170331178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170331390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170331446 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 170331515 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170331551 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 170331617 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 170331681 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170331871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170332497 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 170333146 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 170333347 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 170333365 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 170333406 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 170333919 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 170333994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170334083 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170334090 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170334179 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 170334194 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 170334244 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170334262 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170334263 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170334314 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170334394 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 170334441 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 170334451 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 170334468 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170334499 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 170334531 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 170334660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170334962 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 170335783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170336019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170336197 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170336420 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 170336503 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170336522 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170336530 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170336558 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170336613 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170336661 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170336838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170336864 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170336939 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 170337102 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 170337113 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170337259 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 170337823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170338085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170338304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170338362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170338366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170338384 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170338397 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170338425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170338456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170338653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170338862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170338929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170339190 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 170339246 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170339330 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 170339332 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170339617 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 170339663 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 170339736 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 170339872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170339903 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170339922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170340001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170340065 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 170340101 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 170340186 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170340334 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170340353 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170340364 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170340393 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170340394 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170340463 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170340500 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170340507 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170340608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170340694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170340699 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 170340758 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170340804 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 170340813 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 170340828 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 170340897 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 170340935 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170340940 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170341008 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 170341045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170341050 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170341161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170341372 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170341390 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 170341613 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 170341619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170341738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170341785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170341834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170341868 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170341898 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 170341927 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 170341941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170341951 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 170341979 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170342274 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 170342280 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 170342334 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170342386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170342532 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 170342888 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 170343037 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 170343040 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 170343052 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 170343409 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170344147 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 170344570 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170344605 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 170344650 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 170344781 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 170344946 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170345109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170345452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170345478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170345537 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 170345549 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170345687 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170345770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170345911 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170346049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170346069 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170346153 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 170346198 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170346401 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 170346417 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170346609 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 170346611 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 170346792 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170346931 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170346961 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170347063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170347075 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 170347264 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 170347359 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 170347367 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 170347433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170347608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170347632 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 170347761 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 170347812 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 170347823 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 170347890 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 170348295 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170348439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170348478 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 170348484 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 170348723 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170349622 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170349725 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170349979 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 170350153 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170350174 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170350286 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170350350 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170350497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170350707 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 170350903 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170350927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170351019 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 170351036 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170351060 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170351162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170351180 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170351485 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170351696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170351942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170351948 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 170352130 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170352247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170352376 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170352403 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170352406 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170352416 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170352713 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 170354978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170356174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170356248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170356455 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170356647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170356661 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170356689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170356785 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 170357003 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170357197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170357348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170357484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170358151 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170358623 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170359125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170359365 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 170360310 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 170360481 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170361085 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170361105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170361855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170361920 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 170361921 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 170362022 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 170362038 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 170362089 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170362820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170362825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170363963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170364353 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 170364359 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 170364372 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170365299 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170365523 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 170365578 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 170365582 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 170365614 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 170365652 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170365804 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170365818 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 170365842 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170365872 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170365893 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 170365989 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 170366027 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170366042 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 170366053 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 170366429 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 170366455 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170366457 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 170366502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170366819 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170366947 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170366966 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170366989 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170366993 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170367005 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170367009 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170367023 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170367043 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 170367082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170367092 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170367118 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170367120 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170367181 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170367204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170367389 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 170367453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170367467 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 170367508 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 170367600 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 170367610 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 170367643 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 170367721 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 170367795 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 170367823 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 170367998 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 170368697 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 170368908 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170369245 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 170369372 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 170369473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170369714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170369784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170369986 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 170370049 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 170370110 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 170370125 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170370266 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 170370287 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 170370313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170370360 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170370979 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 170371884 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170371970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170372435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170373241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170373603 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170373689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170375017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170375413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170375492 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170375789 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 170376137 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170376158 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170376536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170376677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170377703 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170378257 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 170379098 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 170379104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170379251 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 170379259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170379275 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 170379312 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170379749 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 170379788 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 170379802 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170379896 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170379960 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 170380013 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380036 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 170380041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380087 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 170380136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380355 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170380366 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170380398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380409 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 170380459 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380533 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380664 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170380666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380726 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170380793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170380873 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 170380921 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170381016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170381032 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 170381152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170381170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170381331 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 170381354 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170381497 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 170381499 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 170381693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170381788 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 170381921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170382063 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 170382171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170382174 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170382228 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170382252 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 170382271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170382277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170382309 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170382359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170382360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170382376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170382501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170382580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170382741 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170382910 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170382941 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 170383020 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 170383049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170383173 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170383179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170383254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170383429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170383705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170383974 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170384278 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170385001 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 170385105 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 170385182 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 170385531 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 170385546 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170385633 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 170385681 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170385691 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170385753 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 170385799 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170385935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170385951 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170386002 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170386207 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170386240 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170386280 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170386815 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170387489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170387737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170390152 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170390781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170390832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170391166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170391685 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170393069 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170393660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170395463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170395511 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170395892 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 170395949 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 170396152 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 170396394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170398799 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170398987 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 170398990 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 170399719 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170399752 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170399835 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 170399983 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170400021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170400076 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170400161 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170400287 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170400334 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 170400520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170400579 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 170400703 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 170400734 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170400908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170400990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170401066 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 170401128 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 170401284 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 170401391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170401490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170401505 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170401724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170401863 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170401879 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170402576 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170402659 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 170402736 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170402796 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170402885 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170402897 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 170402910 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170403129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170403155 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170403418 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 170403463 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 170403479 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 170403925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170405125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170408175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170408316 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170408776 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 170409826 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 170409910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170409953 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 170410000 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 170410997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170411045 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 170411569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170411859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170412815 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 2 170413445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170413652 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 170413855 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 170414402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170414483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170414683 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 170414751 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 170415132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170415337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170415390 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170415393 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170415530 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 170415608 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 170415614 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 170415639 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 170415763 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 170416246 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 170416255 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 170416616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170417118 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 170417125 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 170417846 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170418422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170418945 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 170419965 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 170420976 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170421101 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 170421546 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 170421709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170421802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170421831 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 170422061 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 170422074 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 170422151 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 170422289 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170422310 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170422387 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170422395 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170422401 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 170422574 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 170422590 G C Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 170422612 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 170422708 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 170422709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170422885 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 170422925 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 170422995 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 170423089 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 170423156 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 170423267 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170423345 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170423347 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170423432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170423476 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 170423512 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170423943 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170424173 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 170424176 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 170424279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170424555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170424604 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 170424860 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170425068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170425217 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 170426295 C G Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 170430438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170433114 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 170433249 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 170433301 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170433405 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170433410 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170433418 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 170433472 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 170433568 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170433577 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170433711 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170433974 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 170434440 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170434597 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170434705 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 170434880 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170434882 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 170434940 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170434948 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170434989 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170435166 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170435673 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170435733 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 170435747 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 170435770 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 170435791 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170435792 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 170436004 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170436083 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170436096 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 170436097 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 170436263 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 170436499 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 170436587 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 170436773 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 170436782 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170437342 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 170437619 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170438192 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 170438302 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 170438427 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 170438475 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 170438818 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 170438899 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 170439024 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 170439105 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 170439328 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170439398 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170440060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170440934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170441862 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170441891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170442245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170442301 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170442633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170442807 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 170442808 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 170442893 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170443025 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 170443427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170445247 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170445554 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 170445601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170445714 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170445745 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 170445749 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 170445799 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 170445825 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170445959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170446039 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170446153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170446329 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 170446395 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170446461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170446626 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170446933 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 170446970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170446976 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170447134 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 170447299 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 170447300 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 2 170447345 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 170447353 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 170447373 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 170447380 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 170447393 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170447405 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170447490 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170447571 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 170447574 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 170447592 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 170447679 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170447701 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170447708 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170447719 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170447744 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 170447764 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 170447873 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 170448199 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 170448200 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 170448236 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170448245 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170448551 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 170448599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170448619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170448772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170448818 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170448845 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170448848 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170448948 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 170449315 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170449381 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 170449534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170449709 G T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 170449714 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 170449720 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 170450051 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 170450092 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 170450109 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 170450173 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170450248 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 170450249 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 170450265 A G Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 170450536 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 170451188 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 170451243 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 170451413 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 170451446 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 170451509 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170451635 A T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 170451636 T A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 2 170451757 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 170451893 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 170451928 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170452186 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 170452925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170452996 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 170453244 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170453254 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170453379 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170453381 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170453438 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170453446 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170453454 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170454558 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 170454678 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170455217 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 170455276 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 170455331 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170455402 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 170455408 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 170455570 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170455654 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170456041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170457738 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 2 170457777 G T N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 2 170457986 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 170459570 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170459919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170460836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170460944 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170460982 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170461098 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 170461209 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170461314 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170461514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170461591 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170461654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170461899 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 170461951 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 170462029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170462237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170462762 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170462873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170463228 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 170463322 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170463655 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170463662 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 170463732 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170463791 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 170463902 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 170464075 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170464092 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170464109 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170464148 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170464149 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170464161 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170464207 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170464300 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170464336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170464391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170464882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170464915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170465024 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 170465263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170465346 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 170465482 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170465590 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 170465661 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 170465662 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 170465711 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170465712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170465865 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170465883 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170465885 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170465914 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 170466952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170467279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170467687 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170467756 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 170467848 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 170467926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170468378 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 170468463 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170468680 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 170468860 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 170468932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170468981 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 170469035 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 170469152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170469355 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 170469372 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 170469375 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170469426 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170469427 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170470158 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170470643 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170471037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170471326 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170471504 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 170472205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170472210 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 170472301 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 170472455 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170472473 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 170474012 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 170474385 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170474444 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170474527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170474558 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170474660 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170474682 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170475319 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 170475456 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170475606 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170475713 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 170476781 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 170477062 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170477069 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170477205 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170477441 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 170477442 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 170477588 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170477636 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170478138 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 2 170478316 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 170478319 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 170478366 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 2 170478446 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 170478468 A T Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 170478495 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 2 170478703 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 170478749 T A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 2 170479214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170479262 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 170479396 A T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 170479579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170479929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170480042 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170480679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170480750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170481700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170483387 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 170483433 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 170483801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170485858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170486061 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170489078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170490452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170491527 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170492063 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170492192 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170492501 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 170492995 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 170493001 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 170493022 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 170493038 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 170493080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170493202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170494405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170494515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170494977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170495944 C G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170496025 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 170496264 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 170497195 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170497197 T G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170497223 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170497329 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 170497337 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 170497395 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 170497689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170497807 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 170498181 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170498249 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 170498274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170498367 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170498549 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 170498634 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170498695 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170498933 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 170498986 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170499021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170499604 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 170499884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170499956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170500087 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170500824 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170500889 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170501039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170501367 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170501447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170501967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170502037 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 170502048 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 170502084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170502111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170502397 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170502423 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170502700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170502719 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170502769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170502958 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 170502963 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 170503077 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 170503166 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 170503277 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 170503588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170504803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170504971 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 170505149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170505161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170506346 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 170507487 C T N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 170509626 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170509744 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170509868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170510357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170510559 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170511084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170511125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170512192 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170512906 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170513134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170513203 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170513449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170513829 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 170513842 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 170513980 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 2 170514046 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 170514050 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 170514058 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170514395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170514524 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 170514556 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 170514579 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 170514585 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 170514630 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 170514633 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170514691 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 170514733 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 170514824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170514983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170515060 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170515132 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 170515295 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170515703 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 170515737 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170515829 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 170515846 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170515858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170516992 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 170517029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170517069 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170517070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170517092 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170517261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170517280 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170517346 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 170517573 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170517640 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170517719 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 170517732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170517736 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 170517784 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170517870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170517998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170518369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170518948 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170519616 A T Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0 0.909090909090909 0.0909090909090909 10 12 0 10 1 2 170520272 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170521831 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170521864 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170522216 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170522373 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170522463 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 170522553 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 170524001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170524027 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 170524066 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170524112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170524282 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170524413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170524482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170524797 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170524902 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170524989 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170525013 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170525086 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 170525195 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 170525559 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170525633 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170525665 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170526390 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170526556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170526592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170527244 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 170527601 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 170528939 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170528963 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170529056 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 170529151 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170529421 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170530192 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170530207 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170530212 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170530219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170530253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170530387 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170530508 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170530629 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170530828 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170530850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170531015 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170531961 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 170531971 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170532405 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170532822 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170533050 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170533158 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170533287 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170533425 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 170533898 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170533942 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170534298 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170534767 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170534799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170534831 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170534880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170535206 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170535445 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170536039 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170536086 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170536946 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170537070 T C Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 2 170537412 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 170537423 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 170537498 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170537517 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170537568 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170537604 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170537634 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170537974 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 170537995 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170539037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170541657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170541780 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170546488 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170549133 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170549759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170551652 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170552051 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170552432 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 170552445 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 170552732 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170552793 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170552925 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 170552972 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170553140 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170553461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170553505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170553524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170553577 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170553736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170553788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170553801 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170553828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170553855 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170553874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170554763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170555310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170555386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170555741 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 170556158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170557324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170558489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170561191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170561343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170561498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170562585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170563786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170563969 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170564068 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170564083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170564223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170564328 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 170564402 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170564408 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170564437 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 170564443 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 170564451 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 170564478 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170564674 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170564680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170564746 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170564808 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170564822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170564972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170565013 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170565441 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170566603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170566606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170566726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170566733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170566900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170566923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170566954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170567113 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170567176 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170567179 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170567195 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170567222 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170567234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170567265 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 170567279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170567303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170567373 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170567438 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 170567466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170567515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170567581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170567615 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170567632 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170567937 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170568832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170569133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170569280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170569454 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170570610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170570640 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 170571061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170571091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170571098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170571395 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170573090 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170573582 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170573627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170573836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170574070 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170574629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170574681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170574755 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170575476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170577610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170578258 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170578671 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170578896 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170579042 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170579113 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170579350 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170579405 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170579427 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170579458 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170580098 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170580567 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170580651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170580671 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170580749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170580895 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170581211 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 170581214 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 170581245 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 170581405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170581457 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170581641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170581733 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170582210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170582453 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170582457 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 170583189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170584022 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170584032 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170584038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170584102 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170584185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170584344 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170584523 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170585052 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170585062 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170585127 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170585140 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170585548 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170585575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170585647 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170585855 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170585889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170586166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170586218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170586413 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170586582 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170586735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170590300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170590613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170591307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170591391 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170591482 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170591537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170591592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170592029 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170592526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170592589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170594125 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170597182 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170597880 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170597881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170597970 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170598238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170598420 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170598865 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 170598957 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170598958 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170598987 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170599019 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 170599025 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 170599038 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 170599041 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170599104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170599130 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170599149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170599171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170599259 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170599282 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170599344 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170599395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170599405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170599447 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170599467 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170599468 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170599609 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170599733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170599759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170599765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170599890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170600009 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170600054 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170600101 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170600112 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 170602833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170603054 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170603113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170603155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170603208 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170603276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170603714 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170603734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170604041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170604146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170604191 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 170604192 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170604391 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170604510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170604553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170604717 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170605358 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 170605487 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170605996 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170606006 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170606118 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170606149 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170606189 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170606207 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170606270 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170606469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170606497 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 170606525 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170607147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170607150 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 170607174 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 170607286 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170607330 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170608239 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170608704 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170608948 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 170608976 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 170609199 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 170609757 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170609987 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170610088 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170610110 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170610154 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170610202 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 170611164 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170612473 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 170612485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170612925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170613904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170614855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170614963 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170616382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170616514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170623218 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170623668 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170628080 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170628440 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170628504 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 170628563 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170628568 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170628968 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170629651 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170629928 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170629954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170630084 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170630201 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170630552 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 170630957 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170631840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170634254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170634360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170634508 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170634905 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170635636 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170635973 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170635989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170637990 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 170638027 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 170638732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170639342 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 170639529 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 170639571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170639633 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 170639672 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 170639826 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 170640314 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 170640406 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170640764 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 170640836 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170640847 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 170641110 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 170641140 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 170641190 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170641293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170641437 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 170641578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170641637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170641649 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170641697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170641700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170641868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170641872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170642079 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170642081 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170642112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170642267 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 170642408 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 170642521 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 170643477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170643972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170644316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170645168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170645208 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170646015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170646656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170648003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170648014 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170649080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170649600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170649773 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170650149 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 170651738 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 170652417 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 170652474 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170652885 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170654360 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170654443 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170654516 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170654601 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 170654772 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170654905 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 170655141 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170655233 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170655265 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170655266 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170655316 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170655468 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 170655651 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 170655930 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170655941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170656055 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 170656095 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 170656105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170656538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170656565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170656664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170656897 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 170657176 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 170657195 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 170657199 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 170657281 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 170657294 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 170657309 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 170657357 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 170657425 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 2 170657477 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 170657482 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 170657489 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 170657537 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 170657565 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170657576 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 170657579 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 170657614 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170657631 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170657640 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170657786 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 170657857 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 170657930 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170657931 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170658134 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 170658167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170658237 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 170658281 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170658530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170658579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170658609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170658656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170658671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170658687 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170658769 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170658781 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170658837 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170658902 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170659006 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 170659066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170659094 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 170659104 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170659157 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170659199 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 170659303 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 170659369 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 170659422 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 170659486 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 170660220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170660553 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170662065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170662634 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170662666 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 170662785 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 170662931 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 170663100 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170663161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170663173 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170663672 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 170663691 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 170663775 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 170664329 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170664346 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170664592 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170664775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170664806 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170664809 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 170664830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170664844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170664860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170664902 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 170664951 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170664952 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170665303 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 170665384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170665385 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 170665396 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 170665415 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 170665519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170665702 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170665808 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170665818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170665824 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170665850 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170665875 C G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 2 170666115 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 170666163 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170666193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170666284 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 170666322 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 170666323 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 170666416 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170666448 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170666494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170666764 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170666777 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 170666830 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170666849 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 170666869 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170666870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170666901 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170667344 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170667347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170667576 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170667771 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170667868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170668379 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170668483 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 170668519 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 170669014 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170669089 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170670114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170670146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170670151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170670260 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170670744 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170670759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170670939 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170671003 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170671022 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170671044 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170671262 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170671287 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170671669 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170671920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170672208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170672502 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170672529 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170672598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170672627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170672953 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170672964 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170673111 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 170673172 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170673184 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170673381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170673523 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 170673764 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 170673787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170673933 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 170673935 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170674709 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 170674836 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170675196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170675199 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170675244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170675255 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170675294 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 170675325 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170675399 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 170675500 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 170675536 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170675695 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 170675737 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 170675948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170675968 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 170676020 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170676131 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170676187 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170676199 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170676289 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 170676416 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170676430 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 170676501 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 170676575 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170676582 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170676642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170676737 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170676758 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170676776 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170676785 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170676804 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 170676814 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170676830 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170676905 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170676935 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170676942 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170676951 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170676953 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170676977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170677048 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170677101 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170677105 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170677152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170678401 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170678491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170678494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170678600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170678687 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170678868 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170678870 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 170678887 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170678896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170678914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170679057 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170679084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170679108 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170679128 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170679147 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170679202 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170679231 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170679278 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170679325 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170679528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170679586 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170679708 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170679786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170679867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170679874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170679946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170679991 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170680002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170680064 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170680106 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170680131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170680132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170680159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170680183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170680297 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170680466 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170680488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170680492 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170680548 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170680596 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170680904 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170681311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170681811 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170681884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170682133 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170683217 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170683222 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170683476 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170683586 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170684011 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170684225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170684392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170684908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170685015 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170685302 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 170685738 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 2 170686260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170686265 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170686721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170686904 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170686975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170687051 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170687078 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170687102 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170687105 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170687334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170687352 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170688193 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170688207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170688218 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170688484 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170688619 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170688730 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170688782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170689189 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170689208 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170689221 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170689304 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170689317 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170689390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170689438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170689533 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170689566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170689621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170689803 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170689809 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170689860 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170689888 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 170689936 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 170689960 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 170690023 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 170690208 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 2 170690379 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170690739 G A Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 170690834 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170691448 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170691495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170691940 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170691942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170692161 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 170692183 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 170692884 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170693827 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170693898 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170693996 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 170694005 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 2 170694028 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 170694035 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170694047 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 170694256 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170694285 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170694304 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170694365 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170694401 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170694601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170694624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170694640 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 170694761 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170695110 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170695336 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170695520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170696675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170696699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170696743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170696757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170696787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170696880 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170696972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170697646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170697933 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170698422 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170698799 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170698855 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170698856 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170698875 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170698886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170699059 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170699320 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 170699641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170699670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170699700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170699859 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170699995 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 170700077 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170700293 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170700349 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170700374 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170700394 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170700663 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 170700674 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 170700884 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 170700947 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170701168 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170702017 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170702261 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170702296 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 170702389 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170702448 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170702548 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170702584 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170702637 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170702640 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170702677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170702680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170702691 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 170702855 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170703038 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170703165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170703215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170704105 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170704291 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170704597 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170704661 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 170705093 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170705391 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 170705486 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170705699 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170705709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170705777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170705870 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170705915 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170705963 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170706051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170708244 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170708340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170708381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170708395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170708417 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170708506 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 170708576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170708586 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170708606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170708611 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170709068 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 170709261 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170709311 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170709322 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170709326 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170709439 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170709485 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170709635 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170709654 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170709755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170709939 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170710014 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170710017 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170710039 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 170710492 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170710734 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170710863 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170710888 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 170710924 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170710967 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170711100 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170711187 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170711265 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170711331 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170711539 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170711731 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 170711849 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170711854 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170712149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170712182 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170712240 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170712285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170712310 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170712609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170712974 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170712989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170713005 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170713141 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170713241 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 170713257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170714030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170714139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170714147 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170714171 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170714242 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170714562 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170714674 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170715050 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170715073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170715526 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170715678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170715901 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170715905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170716061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170716081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170716096 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170716106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170716188 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170716444 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170717249 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170717272 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170717278 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170717345 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170717361 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170717533 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170717835 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170717843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170717888 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170717907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170717970 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170718036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170718176 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170718320 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 170718580 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170718777 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 170718781 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170718866 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170718891 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170718910 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170719263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170719438 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170719502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170719929 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170719939 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170719981 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170720676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170720762 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170720789 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 170721655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170721871 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 170721872 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170721901 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170721905 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170721913 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 170721954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170722011 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170722056 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170722247 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 170722653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170722842 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 170722848 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170722880 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 170722893 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170722907 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170723351 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170723702 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170723754 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170724474 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170724618 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 170724646 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170724767 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170724883 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170724885 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 170724956 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170725217 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170725444 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170725605 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 170725617 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 170725638 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170725646 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 170725672 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 170725751 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 170726082 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 170726131 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 170726223 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 170726228 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170726236 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170726347 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 170726523 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 170726559 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170726584 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 170726834 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170726886 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 170726924 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 170726991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170727277 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170727350 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170728097 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170728130 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 170728207 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170728241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170728420 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170728544 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170728559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170728589 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170729539 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170729601 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 170729851 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170730093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170730150 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170730182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170730198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170730288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170730386 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 170730528 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170730701 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170730713 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 170730842 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170730934 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 170730946 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170730972 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170730996 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170731179 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 170731274 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170731300 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170731385 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170731387 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170731432 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 170731491 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170731584 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 170731699 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 170731728 T C N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 170731806 A C Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 170731830 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 2 170731901 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 170731954 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 170732046 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 170732097 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 170732109 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 170732124 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 170732273 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 170732352 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 170732493 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170732642 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 170732686 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170732694 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170732758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170732836 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 170732879 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 170732926 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 170732951 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170733058 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170733100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170733242 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 170733266 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170733285 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170733312 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170733380 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170733546 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 170733606 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 170733661 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170733863 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170733868 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 170733998 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170734189 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 2 170734391 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 170734490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170734641 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 170735707 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170735724 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 170735729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170735775 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 170735792 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 170736142 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 170736153 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 170736487 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 170736524 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 170736525 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 170736584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170737267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170737814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170737982 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170738049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170738113 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 170738546 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 170738560 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 170738848 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 170739005 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 170739191 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170739292 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170739299 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170739323 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170739363 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 170740684 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 170740697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170741100 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 170741139 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 170741200 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 170741862 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 170742017 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 170742042 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 170742043 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 170742061 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 170743005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170743255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170743958 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 170743969 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 2 170747195 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 170747333 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170747406 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170747411 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170747417 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170747527 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 170747581 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 170747613 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170747626 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 170747654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170747676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170747690 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170747799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170747832 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170747956 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170748007 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 170748140 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 170748161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170748186 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 170748207 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 170748260 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 170748459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170748557 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 170748687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170748688 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 170749123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170749471 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 170749472 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 170749500 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 170749555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170749567 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170749606 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 170749614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170749894 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 170750129 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 2 170750206 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170750373 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 170750479 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 170750485 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 170750585 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 170750643 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 170750660 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 170750707 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 170750729 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170750919 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 170750920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170751031 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170751139 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 170751310 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 170751521 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170751554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170751712 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 170751751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170752042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170752145 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 170752823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170753224 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 170753270 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170753288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170753443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170753532 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 170753728 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 170753772 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 170753820 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 170754050 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170754055 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170754136 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170754171 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 170754343 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 170754579 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 170754687 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170754847 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170755065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170755088 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170755092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170755571 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170755681 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 170755758 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 170755803 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170755817 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170755871 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170756083 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170756205 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 170756239 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 170756350 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 170756386 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 170756503 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 170756523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170756596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170756681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170756718 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170757036 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170757061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170757080 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170757099 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170757123 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170757124 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170757150 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170757240 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 170757317 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 170757328 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170757438 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170757548 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 170757950 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170757959 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170758073 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170758096 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170758129 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170758948 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170758954 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170758982 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170758983 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170759121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170759355 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 170759533 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170760236 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 170760246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170760411 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 170760521 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170760592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170760596 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170760752 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 170760875 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170760912 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170760924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170760977 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 170761142 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170761336 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170761450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170761468 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 170761611 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 170761667 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 170761696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170761803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170761812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170761868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170761882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170761924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170761962 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170761981 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 170762064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170762092 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170762743 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 170762755 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 170762776 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 170762801 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 170762856 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170762863 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 170762901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170762907 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170762921 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170762924 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 170762937 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170763011 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 170763245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170763423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170763480 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 170763550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170763674 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170763704 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170763813 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 170763888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170763921 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 170763930 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 170763936 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170764260 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170764378 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 170764384 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170764473 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170764499 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170764564 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170764648 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 170764863 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170764876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170764880 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170764899 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 170764987 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170765001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170765034 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170765058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170765153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170765168 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 170765256 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 170765260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170765426 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170765429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170765495 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 170765525 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 170765587 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170765636 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 170765697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170765881 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170765954 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 170766261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170766488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170766709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170766871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170767040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170767070 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 170767118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170767131 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 170767142 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 170767151 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170767170 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170767289 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 170767310 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 170767430 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170767439 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170767476 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170767482 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 170767743 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 170768448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170768509 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 170768637 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 170768941 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 170768968 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 170768982 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 170769041 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170769108 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170769221 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 170769301 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170769322 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170769668 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170769841 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170769843 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170769860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170769914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170769918 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 170769950 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 170769978 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 170770070 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 2 170770389 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 170770437 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170770438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170770451 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170770474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170770476 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170770526 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 170770714 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170770897 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170770946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170771022 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170771036 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170771144 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170771307 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 170771411 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 170771412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170771523 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170771606 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170771651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170771652 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170771704 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 170771867 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170771914 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170771944 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170772033 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 170772161 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170772255 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 170772283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170772355 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 170772418 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170773192 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 170773539 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 170773565 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 170773735 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170773738 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 170773808 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170773831 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 170773928 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 170774086 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170774089 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 170774291 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 170774310 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170774464 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170774501 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 170774521 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 170774653 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170774656 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170774708 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 170774745 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170774803 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170774844 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 170774943 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 170774963 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 170775002 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 170775016 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 170775028 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 170775084 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170775127 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170775142 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170775490 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 170775493 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170775587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170775678 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 170775741 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 170775747 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170775753 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 170776478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170776497 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170776652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170776936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170776952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170777175 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 170777562 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 170777599 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170777750 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170777799 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 170778106 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170778131 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170778155 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 170778177 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 170778256 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 170778369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170778394 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 170778395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170778481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170778494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170778596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170778603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170778698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170778764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170778799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170778814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170778847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170778925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170778959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170779020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170779310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170779623 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 170780318 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 170780385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170780842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170780883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170781040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170781242 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170781818 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170781823 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 170782080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170782178 C G N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 2 170782232 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 170782248 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 170782483 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170782511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170782566 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 170782969 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 170783339 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 170783354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170783632 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 170783797 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 170783830 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170783846 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 170783902 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 170783904 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 170784011 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 170784153 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170784304 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 170784340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170784361 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 170784380 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 170784462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170784675 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 170784687 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 170784814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170784858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170785054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170785071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170785089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170785144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170785178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170785224 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170785281 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 170785284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170785464 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 170787900 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170787927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170787968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170788219 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 170788289 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 170788546 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 170788602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170788677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170788807 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170789077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170789204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170789211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170789232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170789327 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170789358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170789360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170789542 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170790212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170790554 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 170790757 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 170790774 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 170790781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170790802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170790937 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 170791180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170791246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170791458 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170791633 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170791651 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170791683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170791698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170791822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170792218 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 170792579 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170792673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170792708 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170792814 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170792844 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170792870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170792883 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170792997 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170793059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170793076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170793202 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170793438 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 170793972 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170793977 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 170794000 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170794204 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170794231 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170794295 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 2 170794404 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170794486 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 170794543 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170794576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170794739 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170795088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170795676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170796010 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170796021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170796022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170796253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170796358 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170796417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170796422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170796456 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170796531 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170796545 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170796564 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170796683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170796707 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170796726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170796744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170796815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170796893 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170796935 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170796965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170796997 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 170797105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170797327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170797397 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170797415 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170797483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170797553 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170797846 G A N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 2 170797910 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 170797993 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170798021 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170798187 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 170798543 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170798597 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 170798683 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170798735 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170798744 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170798796 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170798846 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170798856 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170799413 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170799466 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170799503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170799519 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170799590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170799670 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170799759 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170799831 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170799845 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170800005 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170800106 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170800204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170800218 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170800539 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170800733 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 170800996 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 170801008 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 170801124 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170801417 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 170801468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170801557 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170801589 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 170801822 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170802091 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 170802111 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170802123 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170802160 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170802170 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170802439 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170802676 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170802827 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170802908 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170802931 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 170803031 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170803345 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 170803537 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 170803957 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170804030 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170804106 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170804744 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170804791 A T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 170804863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170804940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170805198 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 170805277 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 170805837 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 170806000 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 170806011 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170806199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170806246 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 170806248 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 170806372 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170806449 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170806532 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 170806551 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170807293 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170807543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170807544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170807620 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 170807920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170807967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170808166 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170808200 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170808201 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170808214 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170808243 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170808259 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170808379 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170808855 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170809042 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170809121 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 170809233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170809367 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170809403 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 170809708 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170809709 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170809816 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170809827 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170809857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170809927 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170809934 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170809991 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170810075 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 170810079 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 170810192 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170810307 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170810523 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 170810564 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 170810575 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 170810884 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 170810904 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 170811045 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 170811070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170811138 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 170811424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170811545 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170811552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170811644 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170811669 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170811700 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170812045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170812085 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 170812117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170812209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170812220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170812521 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170812570 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 170812579 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 170812587 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170812603 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170812683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170812744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170812776 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 170813027 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170813071 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 170813116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170813567 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170813581 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170813607 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170813655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170813661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170813716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170813821 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170814021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170814040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170814080 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170814207 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170814225 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170814229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170814259 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170814388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170814403 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 170814416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170814626 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170814753 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170814798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170814848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170814935 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170815240 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170815627 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170815824 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 170815832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170815855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170815915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170815942 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170816211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170816308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170816701 C G Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 2 170817077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170817109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170817291 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170818141 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170819044 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170819317 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170819492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170819861 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170819863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170820465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170821736 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170821760 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170822029 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170822197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170822246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170822329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170822384 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170822422 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170822448 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170823024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170823158 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 170823724 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170823728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170823920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170824047 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 170824140 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 170824725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170824771 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170824973 T C Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 170824993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170825029 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 170825159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170825195 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170825236 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170825238 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170825249 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170825312 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 170825329 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 170825865 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170826118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170826275 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170826531 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170826599 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170826737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170826967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170827141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170827404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170827457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170827705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170827793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170827860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170827950 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170827996 G C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170828056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170828207 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 2 170828272 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 170828305 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170828398 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170828416 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170828445 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170828456 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170828474 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170828492 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170828523 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170828592 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170828635 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170828941 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170829065 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170829176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170829261 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170829343 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170829398 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170829723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170829873 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170830090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170830262 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170830263 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170830315 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170830709 G A Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 2 170830741 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 170830839 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 170830855 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 2 170830868 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170831016 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170831055 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170831101 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 170831118 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 170831145 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170831213 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170831364 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170831372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170831660 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170831753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170832106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170832116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170832199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170832240 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170832279 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170832296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170832322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170832349 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170832575 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 2 170832798 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170832813 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170833360 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 170833506 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170833554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170833656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170833679 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170833848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170833869 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170833901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170834351 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170834482 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170834671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170834760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170835102 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 170835279 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170835728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170836078 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170836092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170836179 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170836254 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170836346 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170836357 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170836493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170836807 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170836887 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170837124 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170837204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170837208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170837280 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170837410 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170837576 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170837674 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170837788 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170837871 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170837922 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170837933 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 2 170838111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170838201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170838205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170838350 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170838398 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 170838399 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 170838478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170838692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170838828 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170838905 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170838921 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170838957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170839242 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170839321 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170839370 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170839383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170839396 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 170839456 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170839482 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170839494 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170839516 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170839517 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170839590 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170839641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170839735 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170839789 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170840062 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170840281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170840479 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170840573 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170840597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170841155 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170841173 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170841202 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170841656 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170841677 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170841760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170841873 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170842046 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170842053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170842062 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170842115 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170842140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170842144 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170842156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170842223 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170842482 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170842509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170842628 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170842664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170842917 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170843023 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170843087 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 170843168 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 170843280 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170843343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170843396 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170843613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170843675 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170843703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170843824 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170843865 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 170843869 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 170843925 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170843932 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170843938 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170844339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170844381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170844429 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170844438 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170844588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170844589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170844739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170844767 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 170844861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170844951 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 170845003 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170845069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170845075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170845095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170845129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170845135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170845270 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170845283 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170845381 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170845469 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170845520 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170845533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170845803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170845837 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170845969 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170845974 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170845983 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170846093 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170846094 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170846106 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170846190 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170846372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170847750 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170847759 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 170847838 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170848135 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170848143 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170848162 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170848319 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170848374 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170848384 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170848420 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 170848472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170848519 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170848582 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 170848651 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170848807 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 170848857 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170848874 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170849206 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170849209 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170849314 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170849332 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170849657 A C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 170849756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170849777 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170849879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170849895 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170849969 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170850345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170850363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170850622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170850639 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170850743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170850998 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 170851099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170851225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170851354 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170851434 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170851595 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170851607 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170851739 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170851767 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 170852130 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170852142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170852281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170852818 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170852943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170852972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170853082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170853308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170853315 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170853336 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 170853338 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 170853381 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170853535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170853575 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170853650 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170853651 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170853690 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 170853702 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 170853728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170853764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170853768 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170853784 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170853801 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170853816 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 170853943 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170854022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170855304 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 170855555 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170855625 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170855644 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170855674 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170855838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170855976 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 170856053 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 170856163 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 2 170856175 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 2 170856316 C A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 170856551 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170856552 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 170857258 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170857897 C A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 170857971 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 170858140 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170858198 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170858240 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170858284 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170858454 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170858579 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170858854 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 170859013 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170859193 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170859268 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170859269 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170859288 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170859336 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170859390 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 170859698 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170859707 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170859839 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170859934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170860004 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170860101 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170860152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170860177 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170860181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170860247 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170860832 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170860986 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170861000 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170861168 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170861502 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170861631 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170861733 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 170861858 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170861860 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 170861874 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 170861972 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170862017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170862066 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170862112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170862342 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170862390 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170862420 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170862439 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 170862444 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170862455 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170862493 C A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 170862604 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 170862664 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 170862750 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 170862903 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 170862959 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170862973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170862990 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170862991 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170863013 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170863021 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170863097 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170863130 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170863224 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170863418 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 170863422 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 170863434 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 170863438 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 170863812 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170863870 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 170863905 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 170863970 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170864046 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170864092 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170864380 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170864390 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170864568 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 170864720 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170864812 C G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 170864958 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170865088 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170865132 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 170865806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170865933 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170865968 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 170866315 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 170866356 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 170867045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170867093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170867434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170867487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170867564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170867679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170867893 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 170868126 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 170868313 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 170868350 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170868378 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170868403 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 170868540 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170868724 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170868791 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170868910 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170869051 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170869242 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 170869420 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170869436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170869452 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 170869460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170869662 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170869790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170869864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170869869 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170869896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170869913 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170869937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170870264 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170870376 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170870430 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170870431 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170870442 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 170870469 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170870513 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170871034 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170871588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170871667 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 170872505 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170872891 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 2 170873349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170873483 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170873556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170873890 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 2 170873909 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 170874078 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170874149 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 170874288 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 170874292 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170874353 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170874522 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 170874572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170874665 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170874742 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170874743 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170874832 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170875011 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170875047 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 170875057 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170875058 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 170875172 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 170875175 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 170875360 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170875363 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170875413 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 170875429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170875549 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 170875606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170875614 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 170875687 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 2 170875807 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170876061 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170876138 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170876315 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 170876365 C A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 170876386 T G N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 170877367 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 170877410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170877480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170877527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170877675 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170877719 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170877737 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170877779 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170877780 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170877803 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170877915 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 170877950 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 170877956 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170878005 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 170878018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170878029 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 170878204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170878670 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170878684 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 170879225 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170879460 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 170880106 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 170880256 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 170880376 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170880420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170881428 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170881481 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 170881485 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170881497 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170881535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170881537 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 170881624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170881649 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 170881712 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 170881789 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 170882051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170882090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170882097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170882164 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170882165 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170882183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170882195 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170882203 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 170882226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170882253 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 170882268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170882292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170883282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170883555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170883586 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 170883716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170883778 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170883816 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 170883870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170883897 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 170883909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170884021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170884096 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170884114 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 170884206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170884208 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170884230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170884233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170884262 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170884355 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 170884387 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 170884591 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170884667 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170884752 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 170884755 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 170884803 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 170885137 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 170885336 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 170885401 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 170885578 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 170885876 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 170885963 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 170886005 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 170886054 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170886209 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 170886221 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 170886240 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 170886352 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 170886488 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 170886535 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 170886700 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 170886702 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 170886892 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 170887019 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 170887047 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 170887139 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 170887149 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 170887206 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 170887215 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 170887217 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 170887234 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 170887513 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 170887581 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170887606 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170888115 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 170888128 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 170888197 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170888221 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170888322 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170888754 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170888780 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170889142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170889368 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170889369 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170889667 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170889672 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 170889732 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 170889782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170889998 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 170889999 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 170890497 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 2 170892111 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 170892118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170892207 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 170892233 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 170892238 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 170892639 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 170892821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170893856 G A Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 2 170895168 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170895665 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170895832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170895853 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 170895994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170896063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170896087 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 170897349 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 170897613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170897729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170897743 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170897757 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 170897880 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 170897965 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 170898096 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 170898318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170898355 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 170898360 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 170898469 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 170898507 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 170898605 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 170898649 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170898663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170898761 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 170898797 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 170898806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170898810 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 170899155 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 170899186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170899202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170899220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170899291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170899331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170899381 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170899479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170899582 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 170899697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170899923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170900120 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 170900128 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170900205 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 170900230 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 170900300 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 170900302 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 170900331 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 170900424 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 170900495 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170900511 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170900555 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 170900626 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170900650 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170901146 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170901498 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 170901513 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 170901527 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 170901595 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170901691 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170902268 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 170902292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170902524 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 170902544 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 170902574 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 170902928 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 170902995 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 170903598 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 170903625 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 170903681 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170903837 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 170903904 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 170904237 G C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 170904249 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 170904254 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 170905073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170905431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170905649 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170906096 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 170906334 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170906428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170907723 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 2 170908034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170908063 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 170908142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170908465 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 170908553 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 170908746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170908759 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 170908982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170915523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170915746 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170915751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170915774 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 170915947 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 170916097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170916761 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170916935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170917328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170917948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170918002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170918109 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 170918314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170918382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170918853 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 170918921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170919220 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 170919248 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 170919312 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 170919430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170919550 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170919632 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 170919873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170919875 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 170920361 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 170920550 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 170920784 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 170920850 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 170921041 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 170921430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170921459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170923877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170924916 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170925355 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 170925413 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170925465 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170925574 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170925587 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170925788 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170926013 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170926348 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 170926822 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170926878 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170926897 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170926927 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 170926985 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 170927054 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 170927068 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170927860 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170927945 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170928947 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170928989 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170929007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170929073 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170929337 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 170929437 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170929440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170929578 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 170929733 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 170929874 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170930042 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170930067 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170930123 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170930125 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170930163 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170930239 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170930401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170930460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170930467 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170930486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170930829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170931205 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170931252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170931324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170931378 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170931462 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170931463 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170931517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170931529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170931751 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170931781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170931800 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170931922 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170932012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170932106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170933285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170933978 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170934557 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170934851 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170934895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170934918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170934975 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170934997 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170935069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170935085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170935265 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 170935341 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170935363 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170935757 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 170935790 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170935805 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 170935919 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 170936019 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170936027 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 170936213 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 170936238 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170936289 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170936331 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170936507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170936525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170936601 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 170936640 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170936685 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170936698 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 170936797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170937008 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 170937388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170937620 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170937657 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 170937791 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170937815 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170937938 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 170937946 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 170937955 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 170938045 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 170938406 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 170938424 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170938483 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 170938509 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 170938523 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 170938548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170938752 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 170938764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170938929 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170939115 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 170939418 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 170939442 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170939504 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 170939566 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170939650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170939653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170939710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170939733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170939742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170939960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170940105 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170940128 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170940148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170940219 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170940388 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170940580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170940597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170940666 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170940694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170940740 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170940779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170940834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170940983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170941114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170941199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170941345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170941397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170941500 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170942026 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170942131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170942179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170942182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170942264 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170942861 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 170943565 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170943585 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170943760 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170943821 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170944094 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 170944124 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 170944394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170944479 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170944521 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170944533 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170944588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170944631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170944670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170944673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170944687 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170944753 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170944983 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170945023 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 170945048 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170945068 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170945089 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170945127 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170945415 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 170945432 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 2 170945451 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 170945545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170945993 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 170946025 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 170946026 G T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 170946188 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 170946211 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 2 170946224 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 2 170946269 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 170946274 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 170946320 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170946364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170946374 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 2 170946376 G T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 170946516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170946525 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170946724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170946832 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170947043 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170947049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170947064 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170947109 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 170947193 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170947205 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170947347 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170947484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170947582 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170947586 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170947697 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170947825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170947894 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170947973 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 2 170947991 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 170948119 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 170948126 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 170948176 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 170948182 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 170948267 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 170948278 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 170948373 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 170948383 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 170948395 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 170948551 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 170948613 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170948707 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 170948735 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 170948740 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 170948854 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170948903 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170948921 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170948930 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170948955 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170948959 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170948970 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170949193 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170949300 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 170949347 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170949372 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170949420 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170949518 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170949559 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170949580 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170949662 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170949750 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170949774 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170949830 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170949846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170949890 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170949920 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170950079 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170950163 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170950172 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170950412 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 170950583 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 170950631 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 2 170950639 G T N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 2 170950827 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 170950832 G C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 170950838 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 170950861 T G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 2 170950865 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 2 170950952 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 170951028 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 170951078 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170951094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170951115 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 170951203 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170951329 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170951568 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170951571 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170951761 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 170952400 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170952436 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170952489 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170952492 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170952516 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170952518 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170952535 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170952548 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170952570 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170952634 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170952801 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 170952810 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170952862 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170952923 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170953071 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170953148 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 170953379 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 170953441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170953738 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170953788 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170954084 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 170954435 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 2 170954436 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170954495 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170954559 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170954891 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 170955075 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170955466 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 170956179 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170956388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170957435 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 170957977 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170958486 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170958718 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 2 170958759 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170959048 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170959153 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 170959280 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170959317 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 2 170959363 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 170959729 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 170959947 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170960061 T G N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 2 170960332 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170960676 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170960704 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170960880 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170960898 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170960948 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170960976 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 2 170961084 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170961191 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170961792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170962178 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170962212 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170962229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170962399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170962518 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170962521 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170962562 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 170962670 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 170962797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170962922 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 2 170962923 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 170963005 G C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.333333333333333 0.133333333333333 0.533333333333333 12 18 5 2 8 2 170963012 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 2 170963073 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170963129 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 2 170963156 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 2 170963301 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170963305 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170963548 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 170963576 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 170963687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170963728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170963893 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170964036 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 170964079 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 2 170964285 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170964344 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170964345 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170964359 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170964409 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 170964413 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 170964548 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 2 170964550 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 2 170964567 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170964615 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 170964617 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 170964643 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170964652 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 170964731 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 170964775 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 170964989 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 170965308 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170965382 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170965395 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 170965744 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170965769 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170965826 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170965889 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 2 170965944 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170965951 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170965982 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 2 170966208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170966746 A G N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 2 170966909 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 170966964 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 2 170967509 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 170967522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170968036 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170968665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170968709 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 170968820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170969441 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170969496 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 170969546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170969643 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 170969726 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170969891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170969904 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 170969924 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 170969980 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 170970047 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 170970249 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 170970359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170970437 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 2 170970702 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 170970717 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170970788 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 170970854 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 170971020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170971071 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 170971294 T C Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 170971322 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 170971595 A C Y N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 2 170971688 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 170971915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170971945 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 170971959 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 170972025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170972067 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 170972186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170972206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170972230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170972231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170972333 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 170972410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170972503 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 170972601 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 170972613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170972739 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 170973559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170974086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170974460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170974501 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170974520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170975194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170975244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170975291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170975753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170975951 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170976451 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170976597 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170976629 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170976746 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170976830 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170976913 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170977195 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170977246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170977404 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170977423 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170977629 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170977643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170977654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170977666 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170977778 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170978251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170978305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170978308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170978375 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170978390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170978391 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170978415 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170978436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170978449 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170978464 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170978546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170978551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170978562 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170978594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170978631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170978648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170978655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170978763 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170978772 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170978789 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 170978814 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170978978 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170978985 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170979173 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170979424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170979482 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170979517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170979721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170979852 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170979858 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170980024 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170980068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170980075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170980127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170980247 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170981037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170981406 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 170981835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170982305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170983231 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 170984420 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170984452 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170985296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170985428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170986036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170986112 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170987029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170987093 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170988183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170990849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170991593 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 170991595 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 170991604 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 170991643 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170992066 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170992126 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170992156 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170992352 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170992439 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170992508 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170992566 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170992625 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170992858 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170993271 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 170993599 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170993611 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170994092 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170994389 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170994390 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170994449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170994513 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170994630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170994753 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170994960 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170995007 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170995126 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170995132 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170995192 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170995209 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170995238 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 170995552 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170995577 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170995604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170995786 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170995788 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170995843 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170995877 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170995940 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170995985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170996023 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 170996603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170996879 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 170996936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170997069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170997199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170997820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 170998024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170998049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170998050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170998090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170998196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170998303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170998883 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170998913 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170998966 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170999141 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170999198 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170999315 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 170999364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 170999812 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 171000236 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171000523 A C Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 2 171000577 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171000614 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171000680 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171000789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171000813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171000852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171001216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171001764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171001773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171001871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171002585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171002621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171002645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171002650 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171002681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171002694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171002773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171002800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171002869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171002965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171003087 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171003210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171003725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171004106 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171004107 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171004120 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171004121 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171004191 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 171004325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171004357 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171004383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171004480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171004519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171004552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171004572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171004852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171006194 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171006319 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 2 171006757 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171007142 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171007196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171008673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171009650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171009971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171010034 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171010201 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171010211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171010294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171010360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171010379 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171010715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171010750 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171010771 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171010914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171011130 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171011141 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171011258 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171011274 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171011347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171011410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171011791 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171012102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171012113 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171012339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171012387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171012540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171012550 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171012628 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171012642 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171012957 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171013176 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171013344 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171013350 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171013383 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171013485 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171013556 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171013581 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171013729 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171013883 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171013939 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171014476 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171014578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171014773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171014961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171015136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171015271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171015338 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171015629 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171015727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171015824 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171015836 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171015851 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171015865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171015947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171016037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171016053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171016293 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171016375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171016398 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171016420 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171016962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171017354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171017670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171017774 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171017875 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171018034 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171018186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171018273 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171018381 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171018408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171018448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171018490 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171018548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171019210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171019348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171019387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171020083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171020104 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171021351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171021699 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171023463 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 171023639 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171023759 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 171023785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171024046 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171024179 G T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171024187 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171024201 T A Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 2 171024246 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171024256 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171024267 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171024382 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171024530 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171024796 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171026001 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171026308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171026768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171026774 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171027131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171027269 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171027430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171027618 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171027632 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171027980 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171028132 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171028242 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171028254 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171028255 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171028323 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171028605 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171029103 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171029442 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171029757 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171029833 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171029838 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171030243 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171031126 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171031251 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171031329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171031452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171031694 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171031732 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171031989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171032002 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171032063 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171032089 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171032139 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171032148 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171032250 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171032256 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171032321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171032339 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171032385 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171032431 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171032467 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171032676 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171032725 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171032726 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171032761 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 171032767 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171033065 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 171033339 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171033349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171033477 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171033495 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171033572 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171033599 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171033663 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171033682 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171033709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171033725 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171033731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171033760 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171033765 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171033909 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171033920 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171034045 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171034049 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171034379 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171034421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171034481 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171034528 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171034760 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 171034845 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171034933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171035259 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171035345 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171035774 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171036611 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 171036662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171036732 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171036814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171036858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171036886 G C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 171037239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171037261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171037327 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171037665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171038066 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 171038217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171038255 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171038343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171038365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171038654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171038704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171038902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171038947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171039113 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171039136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171039354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171039468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171039825 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 171039892 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 171039914 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171039957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171040105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171040250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171040252 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171040313 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171040583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171040865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171040984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171041200 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171041237 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171041299 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171041314 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171041518 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171041832 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171041874 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171042259 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171042269 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171042281 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171042358 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 171042590 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171042657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171042662 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171042768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171042835 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171042969 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171043133 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043223 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043225 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043306 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043311 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043330 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043353 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043359 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043365 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043378 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043512 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043660 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043697 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171043699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171043770 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171043795 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043872 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171043943 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171043969 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171044029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171044039 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171044167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171044225 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171044237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171044359 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171044376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171044529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171044891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171044971 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171045538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171045967 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171046478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171046602 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171046676 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 171048054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171048514 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171048560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171048640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171049106 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171049233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171049253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171049315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171049363 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171050223 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171050421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171050521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171050792 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171050816 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171050922 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171050942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171050991 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171051135 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171051182 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171051213 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171051303 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171051317 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171051320 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171051454 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171051533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171051597 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171051624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171052266 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 171052346 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 171052451 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171052515 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171052648 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 171053023 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171053093 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171053108 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171053663 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171054001 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171055286 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171055656 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171055657 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171055770 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171055773 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171055781 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171055872 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171056489 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 171056712 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171056813 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171056905 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171056932 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171057047 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171057111 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171057143 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171057180 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171057205 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171057211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171057284 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171057329 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171057420 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171057530 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171057560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171057576 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171057642 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171057650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171057667 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 171057690 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171057726 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 171057756 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 171057757 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 171057774 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 171057816 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 171057956 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 171057959 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 171058089 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171058102 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171058251 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171058339 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 171058352 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171058431 T G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 171058632 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171058646 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171058881 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 171058894 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171059568 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171059819 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171060019 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171060966 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171060986 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171060989 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171060999 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171061005 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171061022 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171061135 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171061139 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171061157 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171061189 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171061199 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171061267 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 171061461 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 171061673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171061764 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 171061848 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171062035 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171062049 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171062100 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 171063059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171063664 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 171065152 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171065192 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171065194 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171065293 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171065359 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171065381 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171065426 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171065433 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171065537 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171065714 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171065761 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171065769 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171065970 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171066216 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171066355 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 171066436 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 171066442 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 171066543 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 171066977 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 171067724 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 171067729 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 171067817 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 171068005 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 171068028 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 171068128 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 171068160 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171068185 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171068324 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171068356 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171068358 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171068374 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 171068422 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 171068474 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 171068589 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 171068856 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171069080 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171069242 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171069260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171069302 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 171069458 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171069964 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171070152 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171070208 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171070432 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171070851 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171071052 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171071866 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171071942 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171071985 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171072008 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171072256 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171072341 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171072362 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171072366 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171072441 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171072559 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171072564 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171072829 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171072854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171072856 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171072892 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171072979 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171073413 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171073452 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171073466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171073487 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171073562 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171073573 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171074130 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171074179 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171074188 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171078223 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171078592 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171078996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171079149 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171079216 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 171079274 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171079287 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 171079343 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 171079587 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171079953 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171079963 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171079965 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171079985 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171080398 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 171080857 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 171081016 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171081113 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171081370 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171081385 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171081485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171081682 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171081727 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171081750 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171081842 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171081852 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171081868 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171081908 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171081914 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171081943 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171081944 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171082005 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171082100 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 171082275 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 171082676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171082781 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171082935 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171082995 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171083005 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171083010 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171083217 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171083482 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171083753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171083808 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171083855 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171083858 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171083924 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171083963 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171083983 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171083984 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171083994 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171084222 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171084249 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171084372 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171084550 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171084597 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171084794 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171084894 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171084920 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171084937 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171084988 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171085024 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171085139 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171085167 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171085179 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171085190 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171085214 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171085408 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171085500 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171085502 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171085523 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171086205 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171086313 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171086423 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171086454 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171086601 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171086612 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171086746 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171086885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171087441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171087838 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171087862 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171087872 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171087893 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171088069 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171088126 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171088211 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171088235 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171088314 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171088343 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171088364 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171088399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171088530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171088647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171088842 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 171088915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171089117 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171089120 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171089129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171089199 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 171089206 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 171089212 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171089235 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171089373 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171089471 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171089547 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171089563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171089624 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171089689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171089695 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171090113 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 171090331 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171090369 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 171090380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171090423 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171090535 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 171090631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171090827 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171091106 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171091175 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171091188 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171091194 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 171091235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171091238 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171091508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171091579 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171091649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171091925 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171092108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171092172 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171092214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171092251 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171092383 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171092466 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171092512 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171092811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171092889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171092969 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171092974 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171093569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171093595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171093715 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171093777 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171093881 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171094413 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171095317 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171095323 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171095769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171095856 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 171095857 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171095877 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 171095886 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171095921 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 171096200 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 171096255 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 171096534 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171096560 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171096615 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171096778 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171097083 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171097698 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 171098656 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171098711 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171098992 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171099433 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171099525 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171099783 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 171099827 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 171099850 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 171099861 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171099932 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 171099998 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171100017 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171100021 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171101041 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171101169 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 171101197 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 171101205 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171101256 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 171101411 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171101652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171102041 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 171102780 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171103101 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171103990 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171105136 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171105187 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 171105211 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171105492 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171106107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171106971 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171107052 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 171107059 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171107158 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 171107168 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 171107179 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 171107200 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 171107208 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 171107217 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 171107228 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 171107245 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 171107373 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 171107435 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 171107448 C G N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 171107486 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 2 171107502 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 2 171107632 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171107785 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171107975 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171108093 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171109058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171109262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171109487 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171110547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171110615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171111006 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171111281 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171111332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171111899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171112045 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 171112061 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 171112211 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 171112219 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171113194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171113268 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171113777 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171113794 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171113814 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171113866 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171113979 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171115104 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171115109 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 171115200 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171115297 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171115367 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 171115427 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171115438 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171115551 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171115692 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 171115958 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 171116011 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 171116148 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 171116195 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 171117370 C T Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 2 171117429 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 2 171117449 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 171117502 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171117561 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171117886 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 171117964 G C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 171117976 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 2 171118420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171118509 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 171118510 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 171118693 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171118699 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171118787 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171118856 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 171118857 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171119002 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 171119128 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171119328 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171119347 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171119351 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171119447 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171119515 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171119523 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 171119627 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171119632 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171119645 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171119659 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171119673 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171121425 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171121449 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171121557 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171121565 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171121587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171121650 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171121679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171122050 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171122977 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 171123018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171123024 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171123115 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171123313 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171123414 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171123958 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171123962 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 171124095 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171124102 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171124235 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171124294 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171124341 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 171124371 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171124383 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171124408 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171124409 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171124600 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171124753 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171124769 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171124788 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 171124821 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 171124844 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171124846 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 171124867 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171124993 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171125160 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 171125677 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 171125718 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171125786 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 171125809 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 171125855 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171125856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171125920 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171125934 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171125936 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171125970 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171126288 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171126304 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171126332 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171126403 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171126407 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171126434 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171126445 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 171126446 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 171126459 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171126465 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171126499 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171126518 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171126766 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171126797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171126803 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171126815 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171126839 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171126869 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171126879 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171127228 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 171127258 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 171127293 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 171127327 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171127379 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171127383 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171127396 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171127417 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 171127429 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171127460 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171127513 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171127552 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171127617 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171127709 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 171127717 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171127731 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171127852 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 171127885 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 171128063 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171128253 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171128254 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171128398 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171129068 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171129107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171129165 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171129180 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171129195 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171129236 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171129363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171129424 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171129445 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171129587 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171129597 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 171129761 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171129856 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171130040 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171130083 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171130678 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171130932 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171130945 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171130987 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171131502 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 171131637 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171131909 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171131958 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171132065 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171132793 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171132799 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171132847 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 171132906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171132969 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 171133017 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171133160 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171133395 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171133426 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171133427 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 171133508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171133695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171133707 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171133775 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171133856 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171133978 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171134034 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171134133 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171134177 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 171135417 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 171135488 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 171135714 T A N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 171136124 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171136322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171136396 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171136445 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171136479 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171136756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171136943 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 171137987 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171138052 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171138148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171138442 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171138488 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171138788 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171138889 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171138908 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171139017 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171139130 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171139342 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171139435 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 171139719 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171139746 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171139879 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171139962 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171140077 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 171140114 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 171140219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171140270 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171140275 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171140354 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171140405 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171140982 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171141041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171141228 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171141236 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171141733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171142062 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171142127 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171142128 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171142166 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171142359 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171142368 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171142433 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171142434 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171142477 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171142600 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171143060 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171143162 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171143219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171143232 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171143290 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171143328 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171143460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171143476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171143552 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171143754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171143820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171143940 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171143961 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171143987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171144069 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171144070 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 171144164 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171144216 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 171144413 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171144424 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171144471 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171144496 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171144532 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171144539 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171144553 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171144607 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171144633 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171144747 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 171144894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171144993 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 171145048 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 171145195 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 171145225 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171145356 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171145437 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171145452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171145510 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171145556 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171145559 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171145567 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171145589 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171145757 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 171145761 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171146109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171146140 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 171146195 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 171146224 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171146466 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171146571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171146683 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171146707 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171147225 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171147317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171147355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171147435 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171147441 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171147623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171147630 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171147733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171148037 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171148097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148111 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148117 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 171148142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148177 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171148325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148393 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171148440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148585 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171148600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148668 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171148685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148745 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171148759 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171148786 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171148794 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171148807 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171148825 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171148829 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171148848 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171148950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171148993 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171149437 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171150017 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 171150534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171150603 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171150690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171150843 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171150909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171151605 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171151655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171151824 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171151896 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171151930 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171151932 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171152103 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 171152140 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171152238 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171152274 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 171152467 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171152484 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171152573 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 171152664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171152685 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171152705 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171152706 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 171152719 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171152723 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171152777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171152855 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171153390 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 171153431 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 171154247 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171154555 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171156730 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 171156975 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171158594 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171159716 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 171159734 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171159829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171160663 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 171160708 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 171161284 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 171161731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171162376 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 171163510 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171164048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171164216 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171164265 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171164783 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171165238 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171165251 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171165324 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 171165327 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 171165619 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 2 171165633 T C Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 2 171166238 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171166428 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 171166538 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 171166539 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 171166574 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 171166778 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171166908 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 171166927 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 171167067 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 171167257 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171167322 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171167345 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171167368 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 171167583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171168068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171168135 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171168174 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171168267 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171168275 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171168378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171168493 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171168617 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 171168628 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171168704 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171169205 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171169234 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171169345 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171170094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171170300 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 171171233 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171171283 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 171171957 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 171172216 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171172341 G T Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 171172439 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 171172625 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171173269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171173845 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171173907 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171175217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171176123 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 171176329 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 171176481 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 171177964 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 171178113 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171178114 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 171178417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171180348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171180638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171180926 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171181226 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171181672 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 171182296 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 171182308 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 171182648 G C Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 171183157 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171183185 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171183601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171184341 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171185577 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171187098 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171188138 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171188383 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171188447 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171188504 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171188742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171188781 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171188786 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171188820 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171188997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171189040 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171189074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171189100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171189199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171189363 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 171189573 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 171189635 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 171189741 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 171189821 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 171189845 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171189930 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171190001 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171191395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171191459 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171191529 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171191538 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171191640 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171191649 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171191668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171191804 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 171191823 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171191902 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 171192015 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171192217 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171192228 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171192229 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171193812 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 171194152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171194178 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 171194287 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171194353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171194388 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171194390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171194449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171194560 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171194571 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171194661 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 171194709 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 171194735 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171194863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171194889 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171195159 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171195182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171195217 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 171195265 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 171195283 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171195430 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171195449 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171195805 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171195825 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171195826 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171195905 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171195986 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171196083 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 171196084 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 171196135 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171196193 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 171196241 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 171196483 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171196507 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171196517 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171196530 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171196545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171196580 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171196582 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171196723 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 171196750 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 171196805 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 171197006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171197021 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171197141 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171197180 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171197262 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 171197537 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171197855 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 171197958 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171198023 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171198127 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171198137 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 171198214 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 171198248 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171198255 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171198467 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 171198575 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 171198577 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171198595 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 171198623 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 171198691 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 171198903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171198956 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 171199384 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171199386 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171199395 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171199410 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171199416 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171199432 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171199452 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171199556 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 171199625 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171199629 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171199649 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171199672 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171199687 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171199719 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171199733 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171199751 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171199806 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171199812 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171199830 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 171199837 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 171199861 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171199924 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171199976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171200149 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171200229 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 171200281 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171200345 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 171200353 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 171200372 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171200394 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 171200401 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 171200484 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 171200520 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 171200574 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 171200645 T C Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 171200689 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 171200724 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 171200753 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 171200774 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 171200836 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171200976 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171201011 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171201025 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171201075 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171201100 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 171201117 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171201185 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 171201235 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 171201240 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 171201383 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 171201421 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171201438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171201462 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171201494 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 171201522 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171201525 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171201540 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171201550 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171201630 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171201734 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171201812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171201996 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171202018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171202051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171202088 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 171202094 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 171202261 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 171202577 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 171203390 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 171203673 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171203675 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171203703 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 171203853 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 171203937 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 171203957 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 171204173 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 171204353 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 171204644 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171205118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171205152 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171205221 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171205791 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 171205821 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 171205867 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171205928 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 171205951 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 171205994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171206038 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 171206209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171206216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171206508 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171206729 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 171207069 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171207240 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 171207268 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 171207319 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171207828 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171208292 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171208503 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171208618 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171208682 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171208823 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 171208824 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 171208911 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171209516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171209682 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171209694 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171209702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171209950 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171210106 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 171210193 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171210418 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171210454 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171210476 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 171210514 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171210552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171210745 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 171211373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171211599 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171211634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171211769 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171211878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171212375 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171212403 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 171212489 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 171212689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171212982 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 171213187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171213698 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171213851 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 171214067 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171214221 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171214519 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171214542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171214585 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 171215370 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 171215436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171215535 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171215541 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171215548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171217321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171217505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171217517 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171217642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171217673 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171217756 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171218200 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171218506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171219058 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 171220679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171220776 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171220906 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171221153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171221292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171221301 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171221611 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171221699 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171221737 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171221889 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171221962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171222047 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171222180 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171222256 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 171222313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171222426 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171222706 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171222732 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171222756 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171222764 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171222803 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171222833 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171222856 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171222881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171222945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171222963 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171223069 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 171223099 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171223147 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171223243 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171223334 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 171223347 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 171223348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171223469 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171223529 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171223981 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171224061 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171224297 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 2 171224390 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 2 171224584 C T N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 171224671 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 171224871 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 171224972 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 171225049 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 171225060 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171225107 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171225180 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171225188 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171225225 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171225297 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 171225428 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 171225631 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171225799 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171226024 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171226091 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 171226112 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171226126 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 171226246 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 171226253 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 171226304 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171226473 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171226557 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 171226604 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171226635 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171226676 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171226706 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 171226924 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171229225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171229657 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 171229666 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 171229713 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 171229733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171229751 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 171229799 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 171229801 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 171230004 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 171230065 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 171232534 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171232564 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 171232624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171232699 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171232713 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 171232919 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171233100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171233239 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 171233270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171233273 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 171235443 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171239034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171239332 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 171239335 A T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 171239363 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 171239374 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 171239402 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 171239405 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 171239428 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171239477 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 171239491 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 171239620 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171240389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171240390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171240600 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 2 171240704 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 171241292 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171241517 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 171242027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171242153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171242415 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171243497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171243844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171245133 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171245348 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171245391 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171246908 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 171246992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171247027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171247075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171247950 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171248114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171248387 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171248591 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 171248685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171248935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171253574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171253784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171253864 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171253883 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171254378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171256439 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171256990 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 171257008 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 2 171257035 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 171257343 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171257376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171257857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171258244 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171258706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171259192 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171259248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171259337 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 171259669 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171259748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171259775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171259917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171260024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171260823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171261268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171263637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171264009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171264838 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171266883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171266909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171267883 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171268322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171268371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171269500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171270674 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 171271115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171271119 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 171271214 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171271905 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171271941 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171272091 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 171272099 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 171272180 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171272181 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171272259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171272268 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171272271 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171272283 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171272606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171272621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171272663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171272669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171272996 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171273016 C G Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 171273076 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171273396 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171273493 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171273614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171274086 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171274095 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 2 171274147 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 171274156 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 171274208 C A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 2 171274229 G T N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 2 171274378 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171274392 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171274424 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171274439 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171274567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171274576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171274582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171274906 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171274978 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171274981 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171275005 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 171275078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171275133 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 171275281 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 171275314 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171275408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171275421 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 171275685 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171276137 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171276159 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171276328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171276525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171277338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171278208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171278937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171279104 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171279880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171280524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171281408 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171281602 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 171281676 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171282692 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171282960 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171283071 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171283299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171283332 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 171283344 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 171283409 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 171284480 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171284581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171285456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171285786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171287965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171291044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171291160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171291634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171293323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171293438 C G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 171294115 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171297824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171298054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171298558 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171298596 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171298623 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 171299049 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171299103 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171299139 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171301115 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171303657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171303681 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171303729 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171303790 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171304042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171304092 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171304149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171304426 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171304477 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 171304507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171304540 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 171304564 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 171304577 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171304618 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 171304624 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 171305116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171305154 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 171305168 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 171305216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171305538 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171305902 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171305995 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171306107 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171306138 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171306151 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171306284 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171306630 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171306920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171307047 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171307126 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171307145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171307632 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171308313 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171308764 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171309022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171310025 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 171310236 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171310282 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171310301 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171310447 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 171310467 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171310703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171310726 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171311504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171311627 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171311651 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171311693 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171311768 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171311783 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 171312156 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171312188 T A Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 2 171312361 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171312467 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 171312485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171312659 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171312695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171312716 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171312795 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171312839 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 171313133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171313862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171317298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171317792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171317969 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171318075 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 171318229 A C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171318232 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171318246 G C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 171318309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171318332 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 171318760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171318961 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 171319099 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171319127 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171319137 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 171319169 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171319308 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171319888 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171321200 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 171321279 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 171321327 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 171321353 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171321402 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 171321470 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 171321712 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171321816 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 171324152 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171324230 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171324235 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171324282 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 171324313 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171324337 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 171324376 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 171324416 T A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 171324424 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 171324439 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 171324496 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171324534 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171324645 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 171324664 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 171324716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171324739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171325115 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 171325205 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 171325254 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 171325589 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 171325746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171325939 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 171326050 G C Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 171326197 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 171326308 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 171326323 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 171326352 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171326357 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 171326487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171326494 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171326601 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 171326674 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 171326981 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171326984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171327676 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171327698 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171327704 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171327723 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171327724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171327868 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171327869 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171327934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171328000 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 171328039 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 171328311 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 171328368 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 171328372 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 171328384 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 171328394 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 171328571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171328959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171329517 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 171329646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171329664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171329746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171329876 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171329932 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171329956 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 171330004 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 171330008 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 171330345 C G N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 2 171330532 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171330683 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171330800 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171330831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171332020 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171332152 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 171332222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171332240 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 171332282 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171332388 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 171332639 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 171332658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171332885 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171333031 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 171333082 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 171333172 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 171333215 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171333304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171333326 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 171333372 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 171333379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171333384 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 171333500 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 171333563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171333714 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 171333765 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 171334086 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 171334169 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 171334209 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 171334231 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 171335472 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 171335668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171335871 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 171336059 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 171336138 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 2 171337240 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171338014 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171338230 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171338233 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171338271 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171338295 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 171338378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171338633 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 171338747 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 2 171338895 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 171338896 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 171339073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171339332 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171339387 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171339393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171339702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171341508 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171341820 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171341983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171343590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171343613 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171343614 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171344473 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171344545 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171344648 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 171344664 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171344694 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171344702 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171344742 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171345579 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171346405 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171346922 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 171346948 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171347561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171347762 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171347848 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 171348543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171350682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171350832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171350848 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171350897 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 171350920 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 171350989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171351117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171351181 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171351367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171351808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171351885 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 171352377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171352545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171352619 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 171352623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171352634 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 171352703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171352719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171352732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171352811 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171352812 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171352840 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 171352875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171352884 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171352930 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171352977 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171353133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171353175 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171353263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171353336 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171353411 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171353581 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171353590 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171353614 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171353679 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171353694 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171354058 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171354313 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171354339 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 171354375 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171354435 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 171354595 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171354610 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171354659 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171354801 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 171354803 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171354929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171355024 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171355046 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171355154 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171355715 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 171355806 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171355880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171356147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171356158 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171356198 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171356235 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 171356307 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171357920 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 2 171358321 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 171358576 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171358805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171359271 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 171359403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171359594 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 171359698 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 171359783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171359804 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 171359845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171359924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171359944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171359996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171360124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171360126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171360240 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171360430 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171360457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171360594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171360596 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171360732 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171361107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171361109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171361191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171361286 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 171361464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171361585 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 171361765 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 171362454 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 171362937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171363786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171363799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171364011 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171364136 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 171364388 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 171364401 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 171364909 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 2 171365048 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 171365173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171365228 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171365237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171365240 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171365370 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171365587 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 171365774 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 171365919 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 171366076 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 171366385 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 171366675 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 171377610 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 171378099 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171378314 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 171378734 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 171378801 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 2 171378938 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 171379803 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 171380140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171380249 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 171380290 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 171380439 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 171380610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171380708 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171380752 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 171381115 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 171381220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171381228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171381242 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171381417 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171381479 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171381528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171381583 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171381822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171381851 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171381856 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171381882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171381914 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 171382029 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171382357 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171382452 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171382704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171382774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171382815 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 171382866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171382880 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 171382896 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 2 171382936 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 171383039 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 171383054 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171383096 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 171383173 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171383407 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171383492 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 171383512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171383676 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171383731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171383802 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 2 171384382 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171384715 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171384806 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 171384874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171385197 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 171385198 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 171385228 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 171385294 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171385347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171386227 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171386272 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 171386415 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 171386467 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 171386490 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171386600 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 171386650 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 171386860 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171386896 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 171386909 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 171386911 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171386944 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 171387293 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 171387805 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 171387809 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 171387893 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 171387946 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 171387972 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171388420 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171388529 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171388644 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 171388662 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171389444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171389546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171389766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171389808 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171390171 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171390225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171390441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171390532 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171390972 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 171390992 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171391187 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 171391226 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171391258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171391341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171391982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171392623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171393332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171393483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171394088 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171394133 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171395464 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 171395516 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171395532 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171395612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171395653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171395666 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171395835 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 171395921 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 171395931 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 171396028 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 171396117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171396197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171397118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171397528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171398999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171399401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171399482 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171399891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171400136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171400248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171400525 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171400644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171400857 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171400947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171401307 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 171401589 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 171402228 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171411188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171411345 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171411429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171412036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171413007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171413797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171414496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171414804 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 171415814 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171416880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171416908 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171417139 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171417402 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171417850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171417975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171418256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171418522 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 171418670 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171418842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171419024 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171419136 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 171419312 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171419618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171419671 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171419676 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171419693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171419986 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 171420052 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171420108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171420257 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171420409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171420609 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171420811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171420906 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171420981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171421153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171421165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171421187 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171421418 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 171421457 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171421458 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171421471 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171421578 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171421588 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171421589 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171421934 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171422109 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171422145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171422367 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 171422375 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171422402 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171422450 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171422451 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171422565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171422710 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171422749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171422771 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171422811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171422884 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 171423141 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171423281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171423318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171423521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171423601 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171423660 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171423692 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171423800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171423843 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 171423934 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171424055 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171424062 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171424074 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171424078 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171424092 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171424151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171424198 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171424219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171424701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171424753 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 171424778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171424797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171425672 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171425679 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171425692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171425825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171425911 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 171425965 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171426020 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171426040 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171426249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171426300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171426324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171426383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171426454 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171426847 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171426882 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 171426969 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171427290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171427367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171427564 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171427582 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171427633 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171427654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171428098 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171428099 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171428153 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171428220 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171428244 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171428265 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171428283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171428395 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171428396 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171428438 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171429045 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171429075 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171429076 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 171429926 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171430032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171430046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171430073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171430080 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171430129 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 171430146 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171430147 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171430243 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171430263 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171430278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171430330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171430501 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171430521 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171430555 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 171430620 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171430671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171430678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171430718 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171430757 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171430789 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171430920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171431158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171431168 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171431184 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171431259 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171431327 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171431803 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171431863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171431890 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171431992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171432338 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171432348 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 171432560 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 171432606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171432640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171432816 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171432858 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171433014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171433092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171433125 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 171433298 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 171433339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171433357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171433391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171433408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171433433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171433444 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171433469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171433554 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171433625 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171433667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171433678 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171433769 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 171433824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171433836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171433848 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171433998 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171434010 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171434064 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171434067 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171434107 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 171434120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171434205 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171434605 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171434654 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171434768 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171434803 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171434832 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 171435169 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 171435288 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 171435310 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 171435321 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 171435460 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171435480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171435485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171435566 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171435664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171435710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171435755 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171436356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171436417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171436587 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171436635 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171436651 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171436733 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171436799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171436859 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 171436866 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 171436894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171437004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171437113 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171437162 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171437645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171437808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171437813 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171437981 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171438080 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171438081 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171438196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171438199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171438230 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171438252 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171438260 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171438285 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171438332 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 171438407 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171438419 A T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 171438430 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171438462 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171438866 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171438903 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171438961 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171438980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171439091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171439093 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171439103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171439964 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 171440068 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171440161 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171440286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171440287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171440299 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171440500 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171440513 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171440534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171440572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171440747 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171440775 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171440845 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171440904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171441033 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171441103 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171441119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171441270 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171441323 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171441506 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 171441562 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 171441642 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 171441820 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 2 171441849 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171441855 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171442100 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171442136 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171442334 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171442372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171442816 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171442818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171442881 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171443035 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 171443149 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171443240 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 171443318 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 171443320 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 171443352 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 171443391 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 171443568 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171444012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171444656 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 171444819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171444827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171444842 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171445007 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171445030 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171445084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171445088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171445110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171445112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171445126 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171445128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171445236 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171445700 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171445714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171445717 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171445805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171445878 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171446180 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171446240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171446659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171446663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171446676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171446731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171446798 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171446881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171446986 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171447052 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171447059 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171447069 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171447211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171447233 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171447234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171447287 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171447291 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171447333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171447692 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171447713 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171447772 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171447873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171447916 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171448086 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171448132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171448288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171448417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171448879 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 171448905 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171449509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171449667 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 171449711 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 171449832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171449848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171449880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171449912 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171450188 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 2 171450688 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171450722 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171453950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171454238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171454280 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171454469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171454736 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171454828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171454839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171454908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171454920 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171454931 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171454942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171454986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171455096 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171455160 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171455171 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171455211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171455226 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171455256 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171455303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171455327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171455339 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171455351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171455400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171455402 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171455450 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171455549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171455647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171455737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171455783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171455935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171456075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171456096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171456215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171456249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171456251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171456430 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 171456552 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171456596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171457026 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171457110 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 171457121 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171457162 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171457258 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 2 171457262 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 171457309 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171457432 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171457438 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171457489 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171457536 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171457629 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171457665 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171457669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171457713 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171457754 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171457903 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171458008 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171458068 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171458105 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171458121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171458133 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171458206 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171458211 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171458502 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 171458557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171458623 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171458633 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171458722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171458841 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171458921 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171458944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171459274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171459482 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171460211 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171460614 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171461285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171461289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171461304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171461327 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171461371 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171462172 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171462407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171462513 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171462656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171463482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171463950 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171464011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171464332 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171464333 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171465245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171467013 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171467152 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171467588 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171467655 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171467667 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171467788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171468059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171468170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171468203 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171468300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171468309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171468618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171468653 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171468658 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171468687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171468740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171468992 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171469047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171469361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171469639 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171469785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171469802 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 171469951 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 171470382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171470489 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171470523 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171470602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171470631 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171470713 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171470732 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171470811 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171470814 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171470824 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171470881 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171470962 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171471034 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171471038 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171471099 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171471109 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171471423 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171471444 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171471468 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 2 171471556 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 171471711 T A Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 171471814 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171472176 C T Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 171472226 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 171472237 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 171472300 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 171472317 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 171472446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171472696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171472761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171472884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171472990 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171473022 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 171473159 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 171473453 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171473591 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171473760 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171473767 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171473828 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171473929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171475202 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171476623 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 171479688 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 171480143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171480759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171481682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171482036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171482365 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 171483044 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171483068 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 171483700 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171483892 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 171484021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171484512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171485191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171485275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171485443 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 171485549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171485949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171485963 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 171485986 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 171486018 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 171486207 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 171486274 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 171486287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171486392 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 171486648 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 171486843 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 171486975 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 171487047 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 171487065 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 171487091 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 171487128 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 171487212 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 171487238 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 171487261 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 171487282 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 171487317 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 171487609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171487723 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 171489318 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 171491828 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171491836 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171492426 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171492450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171492951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171492983 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171492994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171493642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171494536 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171495741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171496203 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171497450 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171497872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171498571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171499392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171499650 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171499862 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 171501502 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171502087 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 171503147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171503418 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 171503435 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171503774 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171503865 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171504325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171504334 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171504474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171504617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171504787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171504823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171505769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171505898 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171505962 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171510255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171510613 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171510640 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171510918 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 171511073 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 171511230 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171511261 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171511491 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 171513011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171513074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171513094 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 171513351 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171513382 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171515432 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171515794 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171515994 A C Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 2 171516259 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 171516285 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171516460 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171516507 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171516902 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171517707 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 171517940 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171518475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171518585 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171518662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171518733 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171518885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171518944 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171518957 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171518965 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171518985 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 171518988 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171519006 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 171519028 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171519071 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171519155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171519162 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171519313 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 171519395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171519803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171519841 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171519901 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 171520172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171520380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171520813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171520832 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171520842 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 171521031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171521036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171521255 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171521533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171521722 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171522583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171522705 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171523086 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171523617 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171523634 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 171524083 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171524621 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171524624 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171524656 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171524704 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171524730 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171524758 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171524772 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 171524814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171524824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171524930 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171524948 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 171525073 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171525292 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 171525337 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171525615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171525699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171525927 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171526120 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171526160 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 171526168 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 171526248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171526417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171526432 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 171526567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171526603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171526654 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 171526736 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 171527058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171527383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171527390 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171527535 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 171527833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171528020 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171528274 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171528378 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 171528388 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 171528939 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171529055 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 171529139 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171529209 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 171529632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171529805 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171529834 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 171529853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171530046 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 171530244 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171530699 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171531037 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 171531268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171531280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171531381 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 171531892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171532219 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 171532331 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 171532601 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 171533155 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171533279 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 171533295 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171533477 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 171533623 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171533643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171533849 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 171534568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171534905 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171535105 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171535132 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171535646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171535693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171535713 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 171535802 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171535936 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171536001 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171536101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171536296 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171536318 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171536739 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 171536756 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171536779 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171536833 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 171536862 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 171536976 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 171537156 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 171537193 G C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 171537201 G T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 171537246 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171537525 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171537754 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 171537828 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171538119 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 2 171538298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171538452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171538540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171538651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171539540 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171539620 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 171539722 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 171539749 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 171539785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171539939 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171540052 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171540138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171540213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171540518 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171540588 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171540747 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171540995 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171541239 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171541428 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 171541435 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 171541594 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171541704 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171541728 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 171541795 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171541845 A T Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 2 171542064 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 171542244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171542342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171542359 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171542433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171542576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171542632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171542728 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171542766 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 171542924 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171542939 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171543119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171543433 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 2 171543476 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 171543568 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 2 171543571 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 2 171543618 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171543761 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171543846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171543931 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171543939 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171544030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171544077 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171544093 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171544175 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171544233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171544439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171544533 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171544545 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171544689 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171544768 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171544793 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171544815 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171544835 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171544870 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171544903 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 171544904 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171544917 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171544964 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171545013 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171545045 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171545128 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 171545207 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 171545244 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 171545271 C T N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 171545545 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 171545619 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 171545665 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171545725 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 171545745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171545999 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171546303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171546313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171546797 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 171547298 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 171548044 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171548150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171548597 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 171549179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171549845 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171549847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171550087 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 171550109 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 171550110 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171550126 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 171550185 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 171550208 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 171550346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171550393 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171550442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171550484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171550518 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171550583 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 171551182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171551193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171551594 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 171552199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171552949 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171553028 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 171553030 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171553060 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 171553464 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 171554120 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171554492 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171554493 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171554947 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 171554951 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171554990 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 171555023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171555347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171555432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171555617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171555664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171555682 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171555693 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171555972 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171556010 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171556037 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171556449 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 171556465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171556467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171556495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171556575 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 171556698 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 171556809 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 171556903 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 171556960 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 171557201 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 171557223 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 171557446 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 171557458 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 171558321 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 171558559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171559467 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 171559493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171559504 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 171559575 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 171559634 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171559680 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 171559819 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 171560090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171560105 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 171560694 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 171560944 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 171561290 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 171561348 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 171561416 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 2 171561559 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 171561762 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171562062 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 171562106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171562217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171562254 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 171562259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171562510 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 171562551 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 171562681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171562771 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 171563045 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171563080 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 171563616 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171564021 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171564070 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 171564073 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 171564099 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 171564210 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 171564290 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 171564320 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171564354 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 171564408 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 171564428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171564467 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 171564521 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 171564628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171565027 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171565188 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 171565386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171565779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171565982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171566175 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171566311 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 171566583 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 171566764 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171566876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171566958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171567042 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 171567327 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 171567529 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 171567804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171567855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171567949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171567981 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 171568554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171568593 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 171568697 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 171568910 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 171569024 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 171569061 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 171569146 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171569198 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 171569372 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171569489 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 171569526 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 171569603 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171569611 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171569658 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 171569995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171570036 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171570065 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 171570150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171570292 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 171570293 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171570443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171570613 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171570809 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 171571210 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171571290 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 171571815 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171571854 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171572122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171572125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171572159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171572373 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 171572464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171572496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171572797 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171572890 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171572908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171572943 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171572977 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 171573715 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171573930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171574550 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171574626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171574694 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 171574706 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 171574757 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171574888 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 171574913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171574968 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 171575017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171575254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171575329 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 171575354 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 171575444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171575454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171575939 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171576028 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171576118 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171576248 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171576496 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171576656 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171576678 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 171576715 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171576719 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171576733 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 171576747 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 171577053 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171577072 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171577163 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 171577169 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171577175 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171577224 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 171577481 G T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 171577625 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 171578060 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 171578676 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171578720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171578733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171579246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171579266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171579419 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 171579420 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 171579550 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 171579684 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171579706 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171579830 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171579908 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171579945 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 171580249 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 171580489 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 171580966 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 171581088 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171581144 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 171581352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171581371 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171581506 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 171581688 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 171582006 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 171582671 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171582707 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 171582723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171582750 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 171582813 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171582829 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 171583647 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 171583669 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 2 171583710 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 171583875 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 171584007 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 171584761 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171584845 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171584847 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171584860 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171584956 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171585038 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171585078 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171585560 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171585687 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171585727 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 171585762 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171585889 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 171585967 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171586167 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 171586188 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 171586232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171586385 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 171586748 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 171587239 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 171587240 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 171587255 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171587257 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 171587281 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 171587332 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171587334 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171587466 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 171587473 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171587498 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 171587862 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 171587866 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 171587886 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 171587892 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 171587910 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171587952 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171588007 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 171588065 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171588116 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 171588167 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171588214 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171588254 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171588289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171588294 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171588386 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171588620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171588674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171588691 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171588727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171588748 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 171588816 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 171588896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171588906 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 171589221 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171589661 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171589712 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 171589942 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171589948 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171589984 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 171590008 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 171590059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171590193 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171590289 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171590348 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171590352 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171590619 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171590792 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 171591080 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171592303 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171592413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171592461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171592731 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171593193 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 171593928 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 171594035 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 171594055 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 171594246 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 171594263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171594306 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 171594326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171595475 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 171595509 T G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 171595829 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 171595941 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 171596040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171596054 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171596122 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171596138 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171596267 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 171596357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171596459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171596518 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171596648 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171596843 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171596893 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171596932 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171597295 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171597342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171597880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171598690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171598753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171598816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171599208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171599326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171600404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171600793 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171601172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171601311 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171601346 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171601374 C A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 2 171601503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171601592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171601604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171601641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171601767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171601885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171601903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171601917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171602089 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171602110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171602116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171602123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171602270 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171602445 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171602459 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171602665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171602673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171602741 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171602797 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171602825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171603000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171603054 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171603205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171603338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171603370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171603468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171603693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171603697 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171603779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171604002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171604272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171604738 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171604791 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171604802 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171604935 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171604941 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171605052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171605112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171605119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171605141 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171605169 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171605187 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171605195 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171605202 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171605212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171605540 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171605545 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171605626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171605677 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171605714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171605744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171605788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171605794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171605831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171605984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171606034 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171606037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171606061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171606121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171606381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171606444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171606537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171606582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171606636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171606638 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171606663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171606686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171606763 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171607025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607130 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607272 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607387 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607727 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607894 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607896 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171607933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171608000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171608018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171608023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171608526 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171609124 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 171609287 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171609341 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 171609462 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 171609533 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 171609576 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 171609692 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 171609762 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 171609910 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 171610072 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171610262 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171610478 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171610483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171610528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171610867 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 171610906 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171611119 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 171611259 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171611687 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 171611692 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171611838 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171611992 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 171612010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171612105 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 171612115 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 171612232 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 171612359 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171612534 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171612597 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171612669 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171612702 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171613100 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171613201 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171613228 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171613257 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171613291 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171613565 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 171613845 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171613850 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 171613867 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 171614301 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 171614339 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 171614458 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 171614602 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 171614614 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 171614643 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171614722 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171614726 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 171614752 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 171614976 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 171615096 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171615204 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 171615546 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 171615572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171615696 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 171615765 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171615772 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171616182 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 171616206 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171616237 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 171616705 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 171616719 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171617287 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171617953 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171617970 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171618030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171618049 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171618093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171618125 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171618134 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 171618164 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 171618175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171618213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171618288 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171618308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171618364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171618530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171618601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171618671 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171618784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171618796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171618868 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 171618943 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171618967 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171619055 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 2 171619170 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 171619294 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171619385 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171619440 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 171619491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171619507 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171619589 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171619719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171619853 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171619950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171620173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171620395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171620433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171620441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171620589 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171620737 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171620740 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171620802 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 171620880 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 171620948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171621045 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171621133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171621147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171621207 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171621238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171621249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171621280 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 2 171621490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171621498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171621614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171621887 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171622332 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171622356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171622421 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171622432 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171622453 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171622520 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 171622634 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171622691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171622698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171622744 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171622785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171622860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171622969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171623074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171623081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171623097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171623132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171623171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171623233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171623292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171623452 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171623480 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 171623568 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171623638 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171623697 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171623754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171623811 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171624022 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171624307 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171624417 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171624430 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171624565 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171624628 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171625228 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171625439 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171625499 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171625828 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171625868 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171626049 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171627792 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 171627887 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 171628991 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171629470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171629805 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 171629826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171629968 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171630422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171630852 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171631219 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171631387 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171631529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171631796 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171633139 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 171633175 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 171633273 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171633556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171633865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171633967 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171635041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171635330 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171636402 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171636499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171636902 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171637447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171638400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171638694 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171641701 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171641851 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171642682 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 171643306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171644141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171644163 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171644272 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171644290 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171644390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171644460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171644884 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171645003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171645015 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 171645039 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 171645076 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171645265 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 171645408 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171645413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171645490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171645511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171645911 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171646023 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171646346 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171646912 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171647184 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171647269 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171647287 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171647314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171647327 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171647347 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171647375 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171647521 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171647522 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171647566 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171647584 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171647604 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171647611 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 171647791 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171647874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171647950 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171648013 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 2 171648260 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171648277 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 171648350 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171648361 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171648419 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171648499 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 171648508 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 171648664 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171648736 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 171648759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171648835 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171648838 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171648877 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171648904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171648943 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171648972 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 171649061 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 171649064 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 171649301 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171649452 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171649531 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 171649588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171649596 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171649725 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171649792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171649793 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171649811 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171649836 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171649865 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171649893 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171649930 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 171649977 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171650084 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171650103 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171650141 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171650166 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171650230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171650339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171650589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171650745 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171650746 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171650766 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171651373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171651495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171651496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171651527 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171651662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171651672 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 171651807 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171651839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171651945 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171652075 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171652151 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171652263 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171652522 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171652551 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 171652553 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 171652609 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 2 171652660 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171652662 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171652677 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 171652821 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171652975 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171652988 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171653023 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171653168 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171653394 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171653456 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171653457 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 171653515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171653552 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171653584 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171653798 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171653803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171653871 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171653936 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171654087 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171654182 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 171654291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171654313 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171654331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171654813 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171654847 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171654934 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171654988 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 171655096 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171655160 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 171655169 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 171655175 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 171655272 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 171655322 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171655323 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171655341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171655353 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171655421 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171655453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171655569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171655701 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171655727 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171655756 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171655961 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171655997 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171656102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171656385 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171656498 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171656680 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171656722 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171656751 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171656872 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171656888 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171656915 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171657006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171657027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171657268 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171657406 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171657412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171657460 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171657484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171657527 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171657590 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171657621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171657634 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171657738 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 171657885 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171657987 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171658014 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171658044 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 171658109 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171658126 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 2 171658154 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 171658444 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171658473 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171658475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171658489 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 2 171658553 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 171658617 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 171658726 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171658778 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171658812 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171658917 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171658935 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171658964 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 171659052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171659133 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171659193 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171659413 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 171659435 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 171659468 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 171659632 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 171659691 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 2 171659820 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171660013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171660054 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171660420 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171661018 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 171661225 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171661370 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171661461 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171661567 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171661660 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 171661678 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171661691 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171661757 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171661770 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171661887 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171661927 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171662154 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 171662184 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171662185 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171662197 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171662290 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171662637 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171662953 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171663026 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 2 171663091 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171663372 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171663532 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 171663736 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 171663931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171663934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171663953 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 171664382 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171664383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171664990 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 171665350 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 171665399 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171665455 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171665602 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 171665746 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 171665766 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 171665872 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171665965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171666018 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171666052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171666078 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171666183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171666568 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171666572 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 171666591 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 171666592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171666695 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 171667131 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 171667150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171667277 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171667296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171667894 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171668126 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171668785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171669008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171670207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171670845 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 171670848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171671262 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171671319 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171671336 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 171671364 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171671423 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171671793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171671854 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171672058 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171672116 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171672117 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171672162 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171672266 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171673050 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171673152 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 171673211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171673385 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 171673566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171673625 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171674219 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171676237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171677168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171678365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171678430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171678446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171678470 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171679139 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171679212 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171679245 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171679339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171679719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171680098 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 171680194 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 2 171680461 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171680666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171681948 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171682005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171682011 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171682144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171683514 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 171683515 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 171683880 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171683964 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171685989 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171686562 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 2 171686866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171686943 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171687086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171687130 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171687591 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171688131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171688234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171688265 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171688390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171688469 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 171689607 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 171690049 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171691733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171692698 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171692723 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171692908 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171692951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171692963 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171692997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171693193 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171693249 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 171693273 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 171693735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171694127 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171694364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171694378 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171694609 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171694678 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 171694718 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171694796 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171695094 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171695385 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171695529 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171695760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171696141 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171696421 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171696992 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 2 171697061 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 171697101 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171697253 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171697636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171697660 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171697667 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171698048 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171698797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171699384 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171699457 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171699489 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171699497 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171699721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171699798 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171699879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171699920 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 171699984 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171700229 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171700238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171700256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171700381 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171700448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171700495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171700519 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171700553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171700628 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171700664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171700685 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171700754 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 171700802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171700898 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171700910 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171700973 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171700974 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 171701005 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171701009 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171701034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171701038 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171701046 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171701057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171701063 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171701350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171701396 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171701439 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171702453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171703123 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171703184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171703856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171704111 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171704114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171704261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171704935 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171704955 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171705059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171705060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171705169 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171705188 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171705499 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171705723 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171705724 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171705795 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171705884 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171706116 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 171706137 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171706185 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 171706741 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171706804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171706841 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171706983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171707384 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171707414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171707595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171707638 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171708021 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171708166 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171708882 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171709988 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171711880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171712859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171713216 C A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 2 171713281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171713969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171714422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171715358 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171716914 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 171718367 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 171719180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171719892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171720515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171720571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171721933 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 171722818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171722991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171725307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171725418 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 171726097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171726568 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171726951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171727070 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171727124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171727346 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171727347 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171727487 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171727498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171727507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171727568 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 171727938 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171728751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171728767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171728924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171729411 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 171730133 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 171730231 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171730437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171730620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171731997 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171732763 A T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 171734271 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171734810 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171735033 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171735689 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 171737061 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171737436 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171737510 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171737689 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 171738309 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 171738434 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 171740276 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171740351 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171740764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171740780 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171740812 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171740920 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171740950 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171741032 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171741044 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171741464 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171741726 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171742372 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171742602 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171742687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171743969 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171744991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171746051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171746111 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 171746684 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171748067 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171748249 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171748642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171748727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171748904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171749993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171750233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171750802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171751068 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 171758637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171758820 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171760095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171761353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171762241 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171762289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171762383 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 171762502 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171762956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171763515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171763572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171765142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171767017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171767185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171767888 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 171768232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171769124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171769125 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171769166 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171769332 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171769407 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 171769510 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 171769525 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171769603 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 171769719 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171769975 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171770044 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171770185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171770211 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171770225 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171770285 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171770303 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171770544 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171770793 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171770846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171771445 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171771658 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 171771710 C G Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 2 171771715 G A Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 171772491 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171772640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171773098 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171773159 G T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 171773200 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 171773256 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 171773289 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 171773647 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 171773702 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171773708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171773794 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171773866 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171773907 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171773910 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171773920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171773975 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 171774012 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171774155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171774581 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171774817 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171775445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171775453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171775991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171776888 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171778128 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171778155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171778156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171778169 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171778599 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171778758 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 171778768 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171778805 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171778810 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171778854 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171778962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171778984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171779019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171779061 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171779200 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 171779486 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171780222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171780486 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 171780777 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 171780809 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171780910 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171780949 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171780976 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171781134 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171781177 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171781317 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171781332 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171781362 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171781385 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 171781404 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171781811 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171781898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171782143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171782172 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171782202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171782210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171782300 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171782350 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171782456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171782554 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171782606 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 171782948 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171783002 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171783036 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171783066 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 171783101 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171783140 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171783354 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 171783370 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 171783407 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171783537 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 171783543 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 171783590 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 171783591 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 171783607 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171783659 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 2 171783720 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 171783784 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 171783821 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 171783880 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171783932 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171784000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171784221 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171784244 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171784262 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171784272 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 171784606 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171784782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171785094 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171785189 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171785207 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171785210 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171785233 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171785235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171785422 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171785588 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 171785630 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171785645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171785660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171785713 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 171785844 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171785905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171786730 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171787002 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 171787575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171787723 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171788013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171788038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171788081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171788129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171788218 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 171788290 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 171788798 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 171789441 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171789557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171789663 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 171789835 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171789908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171789985 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171790422 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171791019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171791137 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171791148 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171791243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171791518 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 171791819 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 171792176 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171792309 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171792316 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171792325 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171792348 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171792891 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171792901 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171793430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171793726 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171794465 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 171794466 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 171794533 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 2 171794566 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 171794602 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171794608 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 171794928 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171795088 A C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 2 171795137 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 171795144 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 171795191 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 171795284 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 171795369 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171795453 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 171795536 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171795604 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171795764 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 171795904 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171795945 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171796149 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171796160 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 171796175 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171796225 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 171796382 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 171796531 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171796571 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171796572 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 171796653 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 171796804 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 171796819 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 171796838 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 171796855 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 171796947 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171796984 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 171797018 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 171797105 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171797139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171797151 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 171797633 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 171797665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171797724 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 2 171797808 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171797814 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 171797894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171797896 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171797932 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 171797934 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 171797983 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 171798000 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 171798903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171799542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171799906 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171800172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171800241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171800472 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 171800530 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 171800638 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 2 171800871 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171800934 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171800939 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171801075 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171801193 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 171801343 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 171801389 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 171801447 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 171801475 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171801767 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 171803326 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171803678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171804019 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171804081 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171804409 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 171804420 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 171804467 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 2 171804912 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171804974 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171805370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171805978 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 171806827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171808409 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171808642 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171810282 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 171810649 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171810757 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171810794 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171810995 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171811099 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 171811107 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171811143 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171811200 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 2 171811415 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171811546 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171811633 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171811690 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 2 171811767 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 171811842 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171812022 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171812653 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171812811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171813117 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 171813166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171813761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171814650 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 171814662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171814794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171814895 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171814938 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 171815051 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171815170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171815541 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171815581 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 171815663 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 171815675 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 171815690 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 171815730 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 171815743 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171815970 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171816077 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 171816189 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171816190 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 171816228 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171816231 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171816402 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 2 171816570 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 171816573 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 171816982 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171817475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171817511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171817534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171817556 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 171817648 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 2 171817833 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 171817917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171818024 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 171818141 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 171818173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171818185 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 171818507 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171818572 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 171818583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171818593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171818605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171818758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171818759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171818918 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171818987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171819035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171819048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171819074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171819326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171819354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171819409 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171819485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171819511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171819589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171819607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171819768 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 171819852 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 171819882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171819901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171819924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171819949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171820022 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171820044 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 171820242 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 2 171820395 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 171820404 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 2 171820437 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 171820447 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 171821525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171821656 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 171822889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171823145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171823287 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 171823487 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 171823585 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171823603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171824499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171824598 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 171824730 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 171824731 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 171824901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171825345 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 171825739 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 171825828 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171825835 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171826208 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 171826352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171827333 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171827399 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171827417 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171827545 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 171827627 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171827832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171827930 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 171828136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171828151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171829052 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 171829080 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 171829160 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 171829269 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171829292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171829324 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 171829381 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171829400 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 171829413 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 171829429 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 171829551 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 171831579 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171831721 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 171832368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171832527 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 18 18 2 14 2 2 171832528 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171840013 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 171840879 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171841292 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 171842453 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171842888 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171843050 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171843172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171844133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171844929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171845307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171845379 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171845381 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171845424 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171845587 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 171846376 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 171846440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171846525 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171846537 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171846626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171847344 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171847676 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171847857 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171847879 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 171848579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171849030 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171849295 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 171849308 A T Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 171849842 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171850292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171850309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171851073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171851283 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171851697 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 171851706 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 171851746 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 2 171851783 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 171851791 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 171851837 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171851865 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 171851925 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 171851937 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171851983 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 171851987 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 171852034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171852080 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171852094 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171852240 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171852272 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 171852333 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 171852390 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 171852444 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 171852503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171852545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171852564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171852609 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171852647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171852665 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 2 171852945 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 171853222 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 171853401 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171853492 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 171853726 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 171853788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171853830 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 171853960 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 171853962 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 171854099 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 171854384 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 171854397 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 171855887 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 171857561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171857572 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171857843 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171857849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171857948 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171857957 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171857967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171857977 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171858511 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171858590 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 171858612 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 171858639 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171858748 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 171859014 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171859082 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 171859098 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171859271 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 171859497 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 2 171859648 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171859937 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171859990 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 2 171860027 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 171860280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171860293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171860846 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 171860886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171860957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171860975 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 171860986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171861069 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 171861100 C A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 2 171861707 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 171861988 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 171862559 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 171862673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171862855 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 171863365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171863885 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 171863979 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171864271 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171864424 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 171864469 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 171864643 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171864909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171864910 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171865338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171865588 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 171866484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171866847 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 171866851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171867144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171867320 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171867592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171867942 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171868813 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171868949 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 171869180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171869205 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171869570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171869679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171869690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171869706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171869816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171869917 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171872108 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171872526 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171872895 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171872982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171873545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171873702 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 171873915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171873996 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171874069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171874091 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171874200 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171874223 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171874227 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171874255 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171874332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171874379 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171874398 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 171874770 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 171874785 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 171874787 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 171874987 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 171875007 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171875012 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171875233 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171875277 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 171875304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171875312 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 171875764 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 171878759 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 2 171880157 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 171880269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171881920 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171882087 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171882137 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 171882496 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171882524 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171884330 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171884849 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 171884907 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 171885245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171885247 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 171885285 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 171885336 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171885358 T A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 2 171885387 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 171885424 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171885570 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171885672 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 171885683 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 171885721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171885746 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 171885933 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 171885998 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 171886143 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 171886187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171886680 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 171886849 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 171886867 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171887186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171887324 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 171887345 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171887351 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 171887875 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 171887930 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 171888005 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171888016 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171888044 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171888098 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 171888193 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 2 171888262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171888279 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 171888330 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171888526 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171888569 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171888583 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171888736 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 171888999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171889126 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171889459 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 171889497 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 171889797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171889851 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 171889876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171889942 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 171890038 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 171890063 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 171890085 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 171890278 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171890429 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 171890493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171890524 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 171890873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171890952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171892267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171893145 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171893571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171893648 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 171893873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171894140 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171894202 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 171894283 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 171894362 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171894444 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171894555 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171894576 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171894601 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171894612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171894765 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171894825 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 171894836 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171894842 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 171894909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171894955 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171895076 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171895158 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171895178 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171895233 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 171895533 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 171895910 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171895972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171896078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171896091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171896204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171896420 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171896452 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171898327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171899003 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171899238 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171899493 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171899502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171899520 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 171899601 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171899813 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171900015 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171900325 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171900411 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171900421 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171900734 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171900820 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171900835 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 171900981 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 171901116 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 2 171901256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171901277 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171901300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171902252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171903264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171903301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171903311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171903365 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171903435 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171903475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171903679 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171903736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171903852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171903890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171904212 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 171904246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171905636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171905672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171905763 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171906212 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171906407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171906433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171906578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171906591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171906626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171906654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171906882 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171906895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171906940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171906941 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171907002 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171907029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171907035 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171907057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171907181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171907525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171907528 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 171907646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171907747 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171907765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171908140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171908286 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171908427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171908815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171909399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171909718 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171909749 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171909868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171909915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171911230 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171911251 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171911364 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171911398 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171911474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171911630 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171911648 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171911758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171911773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171911832 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171911846 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171912303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171912828 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171913206 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171913244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171913284 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171913450 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 171913786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171914252 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171914424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171914501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171914591 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171914614 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171914837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171915227 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 171915653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171915654 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171915929 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171915930 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171916044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171916220 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171916694 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 171917781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171917867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171918128 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 171918334 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171918450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171918495 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171918549 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 171918557 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 171918584 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 171918617 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171918686 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 171918789 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 171918926 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171918943 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 171918980 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171919067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171919075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171919084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171919100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171919563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171919688 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171919736 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171919741 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171919760 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171919775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171920181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171920186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171920265 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171920267 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171920453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171920518 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 171920530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171920574 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171920597 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171920604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171920759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171920770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171920771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171920782 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171920797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171920835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171920977 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171921006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171921058 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171921067 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171921097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171921127 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 171921234 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 171921267 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 171921275 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 171921293 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 171921306 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 171921309 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171921401 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171921403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171921427 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 2 171921448 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171921450 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171921526 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 171921565 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171921589 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171921614 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171921731 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 171921750 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171921752 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171921772 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171921852 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 171921911 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 171921936 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 171922039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171922084 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171922134 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171922287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171922453 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171922588 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171922680 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 171922685 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 171922702 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171922816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171923140 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 171923245 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171923262 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171923452 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 171923487 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 171923578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171923597 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 171923624 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171923856 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171925131 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171925791 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171926077 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171926078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171926155 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171926192 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 171926431 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 171926506 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171926534 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171926606 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171926609 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171926688 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171926689 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171926801 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 171926804 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 171926821 A G Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 2 171927004 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171927088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171927109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171927200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927239 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927645 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927648 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171927901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171927936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171928350 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171928533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171929302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171929546 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171929557 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171929869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171930405 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171930417 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 171930431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171930463 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171930557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171930572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171930580 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171931205 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 171931255 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 171931399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171931606 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 171932026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171932049 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171932097 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171932132 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171932152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171932770 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171932970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171933053 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171933076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171933521 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171934108 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171934357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171934584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171934654 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171935687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171935749 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 171935996 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171936080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171936468 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171938093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171938155 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 171938212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171938224 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 171938225 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171938846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171939161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171939273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171939677 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171939811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171939864 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171939884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171940359 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 171940857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171941601 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171942429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171942695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171942781 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171943041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171943240 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171943349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171943463 A G Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 171943541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171943705 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 171943808 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 171944040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171944095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171944146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171944176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171944300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171944406 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 171944464 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171944534 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171944614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171944787 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 171945409 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171946885 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171946915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171946948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171946985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171947025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171947102 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171947125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171947164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171947302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171947397 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171947402 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171947510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171947521 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171947542 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171947575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171947577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171947673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171947748 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171947863 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171948178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171948179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171948954 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 171949020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171949169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171949185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171949291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171949478 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171949490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171949569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171949697 T C Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.0666666666666667 15 15 1 13 1 2 171949698 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.133333333333333 0.8 0.0666666666666667 16 14 2 12 1 2 171949715 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171950232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171950400 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 171950701 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 171950768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171951093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171951155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171951221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171951356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171951542 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171951766 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171951965 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 171952106 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171952129 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171952175 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 171952372 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171952506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171952584 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171952632 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171952839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171952855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171953175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171953451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171953490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171953734 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171953929 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171954076 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171954485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171954521 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171954660 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171954923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171955069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171956098 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171956144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171956264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171956278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171956309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171956362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171956466 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171956476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171956534 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171956626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171956740 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171956790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171957295 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171957789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171957869 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 171957903 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171958315 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171958368 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171958437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171958956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171959117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171959171 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 171959263 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171959863 G A Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 2 171960018 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171960370 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 171960744 C G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 2 171960760 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 2 171960837 G T N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 2 171960840 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 171961533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171961536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171961675 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171962037 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171962056 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 171962227 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 171962368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171962782 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 171962826 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 171963074 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 171963168 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 171963350 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 171963505 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171963537 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171963553 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 171963709 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 171964106 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 171964281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171964524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171965379 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171965430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171965505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171965558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171965643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171966393 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 2 171966987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171967589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171967813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171968348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171968453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171968831 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171968974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171969021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171969493 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171970524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171970587 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 171970758 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171971221 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171971245 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171971264 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171971285 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171971310 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171971347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171971395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171971668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171972240 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171972273 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 171972282 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 171973122 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171973123 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171973992 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171974283 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171974610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171975890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171975932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171976232 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171976774 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 171976803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171979476 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171979556 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171979885 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171980301 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 171980305 A C N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 171981474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171981479 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171982079 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 171982090 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 171982248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171982320 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171982753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171982811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171983256 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171983314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171983399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171983605 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 171983612 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 171983719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171983720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171984649 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 171984855 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 171984971 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171985003 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171985058 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171985711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171985734 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171986495 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 171987044 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 171987215 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 171987244 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 171987245 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 171987263 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 171987683 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171987875 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 171988113 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 171988119 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 171988141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171988151 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171988174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 171988368 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171988373 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171988431 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 171988569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171988686 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171989344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171990128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171990342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171990389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171990400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171990428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171990502 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 171991837 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 171991953 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 171992024 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 171992098 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171992114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171992136 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171992414 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171992601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171993047 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 171993258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171993321 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171993816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171993888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171993933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171993988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171994185 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171994724 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171994740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171995677 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171995679 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 171995694 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171995707 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171995728 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171995748 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171995776 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 171996441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171996727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171996739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171996780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171996929 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171997069 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171997081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171997931 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171997947 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171997948 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171998024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171998030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171998126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171998570 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 171998578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171998673 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 171998703 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 171999281 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171999343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 171999365 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 171999537 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 171999719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 171999770 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172000325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172001705 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 172001909 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 172002477 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 172002638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172002740 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 172002749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172002784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172003005 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172003205 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 172003216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172003228 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 172003255 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 172003370 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 172003456 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172003563 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 172003752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172003771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172003793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172003843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172003926 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 172004253 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 172004275 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 172004357 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 172004372 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 172004466 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 172004542 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 172004572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172004631 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 172005025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172005160 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 172005448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172005582 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 172005668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172005689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172005718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172005733 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 172005763 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 172005960 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 172006012 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 172006041 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 172006150 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 172006169 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 172006252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172006269 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 172006526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172006648 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 172006699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172006729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172007677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172007863 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 172007880 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 172012396 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 172013012 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172013031 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 172013084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172013166 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172013518 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 172013525 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 172013928 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 2 172014674 C A Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 2 172014823 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 172014875 G A Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 2 172014907 G C Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 172014956 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 2 172015125 G T Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 2 172015456 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172015567 T A N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 2 172015613 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172015622 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172015685 C G Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 172016008 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172016047 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172016100 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172016135 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172016339 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172016502 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 172016515 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172016563 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 2 172016590 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 172016624 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172016673 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172016675 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 172016872 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 172016963 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 172017027 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 172017206 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 172017232 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 172017269 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172017312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172017410 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 172017585 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 172017791 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 172017803 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 172017808 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 172017836 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 172017951 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 172017953 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 172018033 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 172018149 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172018154 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 172018193 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 172018257 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 2 172018304 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172018311 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172018352 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172018382 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172018505 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172018508 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 172018516 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172018549 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 172018620 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172018644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172018658 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172018662 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172018797 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 172018853 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172018871 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 172018885 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 172019016 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 172019558 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 172019645 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 172019666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172019735 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 172019803 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 172019821 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 172019838 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 172019994 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172020003 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 172020354 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172020384 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172020386 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 172020400 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 172020555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172020703 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172020782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172021098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172021245 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 172021251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172021272 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172021395 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172021396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172021514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172021521 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172021595 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172021596 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 172021656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172021707 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172021724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172021750 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 172022126 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172022334 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172022345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172022732 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172022746 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172022799 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 172022814 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172022945 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172023013 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172023048 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 172023077 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172023085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172023097 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 172023130 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 172023144 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172023194 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 172023239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172023256 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 172023266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172023308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172023867 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172023880 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 172023984 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 2 172024018 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 172024055 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172024169 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 172024179 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172024634 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 172024661 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 172024713 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 172024741 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 172024789 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 172024817 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 172024826 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 172024908 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 172024932 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 172024944 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 172025080 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 172025084 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 172025164 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 172025222 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 172025231 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 172025254 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 172025277 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 172025282 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 172025308 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 172025311 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 172025419 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 172025793 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 172025805 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 172025806 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 172025822 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172025921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172025944 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172025972 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172026046 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172026052 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172026134 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172026333 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172026352 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172026371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172026417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172026468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172026538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172026599 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172027112 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172027125 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172027136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172027182 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172027184 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172027572 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 172027607 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 172027609 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172027639 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172027734 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172027761 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172027954 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 172027955 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172027972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172028001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172028195 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172028221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172028254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172028366 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172028437 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 172028463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172028474 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172028493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172028639 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 172029104 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172029174 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172029238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172029276 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 172029305 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172029395 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 172029411 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172029537 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 172029556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172029574 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172029589 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172029643 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172029650 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172029664 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172031537 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 172031843 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172032090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172032140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172032213 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 172032224 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172032260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172032270 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172032295 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 172032337 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172032452 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 172032553 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172032622 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 172032645 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172032787 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 172032877 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 2 172032910 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 172033033 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 172033202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172033266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172033492 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 2 172033493 C T Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 172033592 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 172033679 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172033862 T C Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 2 172034007 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 172034135 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172034180 A C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 172034194 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 172034345 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172034414 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172034493 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 2 172034518 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 172034704 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 172034900 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 172034965 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 172035087 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 172035277 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 172035532 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 172035595 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 172035985 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 172037108 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172037229 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 172037310 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 172037441 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 172037446 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 172037608 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172037611 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172037626 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 172037800 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172037819 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 172038950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172039131 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 172039401 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 172039467 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 172039510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172039659 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172039754 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 172039762 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 172039825 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 172039840 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 172039934 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 2 172040003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172041403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172041511 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 172041547 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172041637 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 2 172041822 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172041827 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172041857 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172041884 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 172041919 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 172042089 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172042203 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172042228 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172042375 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 172042570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172042648 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 172044596 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 172044607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172044630 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172045050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172045276 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 172045285 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 172045292 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 172045352 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 172045527 C T N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 2 172045531 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 172045683 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 172045685 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 172045696 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 2 172046066 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 172046143 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 2 172046792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172047256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172047292 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172047345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172047412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172047501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172047521 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172047639 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172047659 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172048203 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 172048889 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 2 172049086 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172049253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172049299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172049440 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 172050509 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 172050510 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172050897 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172050980 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172051055 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172051143 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172051307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172051407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172051431 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 172051577 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172051607 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172051633 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 172051655 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172051667 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 172051707 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172051733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172051737 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172051777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172051796 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 172051959 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 172051962 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172051996 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172052029 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 172052093 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 172052111 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 172052418 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172052427 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172052528 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172052671 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172052688 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172053023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172054256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172054454 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172054499 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172055032 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172055524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172055534 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 172055593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172055672 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 172055858 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172055982 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172055983 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 172056084 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172056094 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172056495 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172056497 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172056571 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172056709 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172056853 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172056987 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172057014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172057090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172057092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172057113 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172057129 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172057232 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172057237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172057503 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172057521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172057612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172057625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172057654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172057867 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172057964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172057967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172058023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172058032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172058086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172058156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172058238 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172058446 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 172058537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172059108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172059255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172059275 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172059342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172059389 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172059393 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172059405 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172059410 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172059436 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172059505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172059672 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172059843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172059883 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172060163 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172060317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172060335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172060523 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 172060541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172060718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172060768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172060856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172060933 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 172060999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172061007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172061226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172061322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172061543 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172061570 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 172061579 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 172061713 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172061749 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172061780 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172061833 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172062438 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 172063295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172063749 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 172065281 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 172065292 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 172065342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172065439 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172065501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172065506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172065666 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172065688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172065700 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172065760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172065796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172065845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172065855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172065944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172065984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172066082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172066229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172066256 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172066262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172066352 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172066663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172066681 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 172066778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172066839 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 172066874 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 172066952 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172067145 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 172068459 T C N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 2 172068678 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 172068823 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 2 172068911 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172068924 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172069004 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 2 172069070 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 172069287 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 172069453 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172069831 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172069850 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172069884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172069905 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 172069958 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 172070265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172070295 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172070430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172070479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172070529 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 172070737 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172070862 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172071234 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 172071301 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172071357 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 172071558 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172071724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172071864 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 172071992 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172072562 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172072666 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172072707 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172072763 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172072809 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172072822 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172072859 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172072862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172072935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172073011 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172073055 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172073199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172073380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172073497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172073584 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172074035 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172074128 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 172075723 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172075817 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172075892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172076173 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172077221 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172077806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172078349 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172078547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172078924 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 172079130 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 172079271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172079275 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 172079318 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 172079357 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 172079381 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172079383 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 172079433 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 172079574 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 172079582 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172079626 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172079639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172080123 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172080187 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172080316 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172080334 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172080404 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172080663 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172080697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172080729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172084834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172085140 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172085452 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172085487 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172085497 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172085547 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172085559 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172085598 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172086009 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172086018 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 2 172086051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172086157 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 172086192 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 172086292 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172086549 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 172086713 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172087779 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172087790 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172087847 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172087873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172088092 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172088162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172088401 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 172089212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172090589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172090913 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172090967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172091350 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172091441 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 172091721 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172091952 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 172091954 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 172091999 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172092290 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172092709 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 172093639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172093738 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 172093943 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 172094048 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 172094061 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 172094562 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 172094891 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 172095441 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 172095489 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172095721 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172095994 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172096056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172096153 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 172096172 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 172096184 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172096190 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 172096261 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 172096402 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172096410 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172096601 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 172096602 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 172096630 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 172096676 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172096729 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172096911 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172097029 A T N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 2 172097077 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 172097103 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 172097201 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172097352 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172097368 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172097392 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172097508 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172097606 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172097650 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172097745 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 2 172097794 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 172097819 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 172098696 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 172098744 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172098756 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172098766 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 172098818 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 172098954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172098961 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172098993 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172099212 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172099234 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172099781 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172099915 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172100004 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 172100019 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 172100053 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172100171 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172102093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172102128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172102193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172102287 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 172102420 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 172102453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172102590 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 172102684 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172102686 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 172103004 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172103079 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 172103115 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 172103297 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 172103337 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 172103350 A G Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 2 172103461 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 172103645 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 172104248 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172104336 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 172104435 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 172104456 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 172104654 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 172104699 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 172104790 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 172104818 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 172104960 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172104971 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172104983 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172105060 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172105106 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 172105124 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 172105194 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 172105247 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 172105309 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 172105318 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 172105456 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 172105736 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 172105803 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172105828 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172106062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172106130 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172106249 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 172106258 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 172106328 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 172106347 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 172106651 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 172106872 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 172106893 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 172107032 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 172107588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172107728 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 172107739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172107770 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 172108100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172108201 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 2 172108319 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172108343 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172108378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172108426 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172108434 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 172108954 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 172108971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172109068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172109090 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172109139 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172109187 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172109190 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 172109442 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172109520 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 172109638 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172109726 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 172109766 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172109954 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172110002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172110043 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172110089 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172110101 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 172110143 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172110166 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172110197 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172110198 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172110214 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172110257 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172110307 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172110455 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172110489 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172110501 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 172110622 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 172110724 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172110782 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172110951 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172110954 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172111360 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 172111373 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 172111388 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172111579 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 172111824 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172111847 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172111913 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172112034 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 172112075 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 172112101 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 172112105 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 172112202 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 172112435 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 2 172112452 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 172112476 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 172112554 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172112728 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172112735 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 172112749 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172112874 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 172112909 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 172112937 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 172112968 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 172113040 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 2 172113123 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 172113344 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 172113486 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 172113496 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172113497 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172113659 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 172113719 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172113819 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 172113871 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172113921 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 172114001 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 172114265 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172114298 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 172114300 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172114414 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 172114464 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 2 172114535 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 2 172114536 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 172115586 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 172115629 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 172115635 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172115643 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172115668 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 172115808 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172115821 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 172115860 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172115865 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172115876 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172115924 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 172115938 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172115953 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172116049 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 172116226 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172116227 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 172116249 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172116399 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 172116528 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 172116861 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172117480 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172117543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172117631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172119792 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172119838 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 172119947 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172120121 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172120343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172120377 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172120734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172120919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172120995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172121440 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172121468 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172121492 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172121494 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172121554 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172121593 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172121672 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172121735 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 172121962 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172122057 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172122152 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 172122371 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172122401 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172122572 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172122925 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172122959 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172122973 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172123121 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 172123366 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172123755 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172123786 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172123974 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172124154 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172124683 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172124779 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172124839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172124878 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172124968 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 172125009 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172125025 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172125112 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 2 172125210 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172125256 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 172125295 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172125390 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 172125751 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172125776 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 172125848 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172125865 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172125961 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172125973 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172125974 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172126026 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 172126063 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172126165 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 172126176 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172126210 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172126222 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172126307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172126422 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172127254 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 2 172128017 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172128113 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 172128265 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172128267 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 172128312 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172128329 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 172128337 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 172128357 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172128388 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172128446 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 172128484 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172128576 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 172128579 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 172128800 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 172128820 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 172129101 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 172129110 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 172129114 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 2 172129363 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 172129966 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172130742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172130928 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 172131544 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 172132023 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 2 172132103 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 172132110 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 172132224 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172132254 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 172132332 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 172132351 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172132352 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 172132396 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172132420 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 172132470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172132488 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 172132544 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 172132712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172132788 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172132864 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172132971 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 172133041 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 172133046 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 172133061 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 2 172133263 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 2 172133507 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 2 172133544 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 172133545 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 172133578 C A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 2 172133583 G C N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 2 172133660 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 2 172133711 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172133758 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 172133760 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172133790 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 172133831 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 172134415 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 172134440 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172134633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172134718 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 172134719 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 172134755 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 172134822 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 2 172134900 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 172134912 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172134942 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 172134959 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172135022 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 172135061 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 172135374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172135426 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172135842 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172135994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172135996 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 172136027 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172136041 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 172136043 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 172136055 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 172136067 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172136119 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 172136237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172136245 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 172136508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172136533 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172137488 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 172137870 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172138134 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 172138224 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 172138315 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172138407 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 172138412 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 172138672 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 172138695 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 2 172138849 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 172139109 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 172139134 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 172139140 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 172139156 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 172139166 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 172139339 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172139372 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 172139457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172139462 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172139476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172139481 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172139537 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 172139563 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 172139702 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 172139703 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 172139714 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 172139790 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 172140192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172140199 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 172140205 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172140263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172140970 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172141142 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 172141172 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 2 172142094 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172142141 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 172142297 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172143594 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172143644 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 172143681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172143894 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 172143967 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 172144065 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 172144987 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 172144997 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 172145239 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 172145244 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172145280 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 172145393 T G Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 172145647 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 172145670 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172145959 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 2 172146232 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 172146238 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 172146423 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 172146862 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172146897 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172146979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172147024 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172147124 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172147225 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172147249 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172147252 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172147325 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172147348 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172147372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172147449 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172148166 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 172148220 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172148613 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172148668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172148791 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 172148856 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172148911 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172148941 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172148965 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172148988 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172149008 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172149232 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 172149295 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 172149658 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 172149709 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 172149786 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 172149861 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 172150015 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172150159 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 172150291 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172150354 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 172150466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172150528 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172150534 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 172150584 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172150616 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172150724 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172150725 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172150815 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172150918 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 172150998 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172152475 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172152479 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172152551 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172152555 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172152691 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 172152714 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 172152801 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172154116 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172154284 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172154342 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172154366 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172154399 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 172154418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172154451 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172154581 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172154850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172154947 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172154955 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172154967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172155333 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172155468 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 172155978 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172155996 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 172156017 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 172156024 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 172156041 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172156054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172156180 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 172156181 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 172156320 C A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 2 172156384 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 172156406 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 172156421 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 172156438 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172156663 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172156676 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172156834 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172157051 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 172157422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172158716 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172158999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172160035 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172160706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172160905 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172160935 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172161090 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 172161246 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 172161426 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172161452 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 172161746 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 172161875 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 172161895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172161959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172161998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172162008 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172163143 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 172163652 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172164987 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172165113 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 172165406 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 172165552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172165675 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 172165830 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 172165862 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 172165895 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 172165947 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172165956 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172165963 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172166464 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 172166605 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172166644 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172166653 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172166682 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172166705 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172166716 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172166730 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172166731 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172166789 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172166818 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172166835 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172166856 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172167008 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172167049 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 172167113 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 172167139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172167151 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172167204 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172167218 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 172167271 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172167425 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172167906 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172168115 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172168153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172169012 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172169034 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172169165 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 172169201 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 172169664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172169727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172169864 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172169877 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 172170201 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 172170381 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 172170854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172171121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172171616 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172173177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172173290 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 172173835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172173864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172173992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172174094 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 172174179 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 172174299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172174374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172174459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172174483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172174544 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172174576 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 172174582 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172174714 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172174850 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172174891 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172175233 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 172176216 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 172176689 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 172176909 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 172176985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172177092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172177101 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 172177524 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172177556 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172177659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172177820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172178935 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172179024 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172179070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172179254 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172179457 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172179567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172179723 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 2 172179731 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 172179736 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 172179747 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 172179800 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 172179861 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172180036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172180092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172180112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172180181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172180218 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172180287 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172180311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172180414 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172180439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172180529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172180652 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172180697 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 172180869 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172181573 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172181636 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172181924 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 172182256 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172182904 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172183043 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172183510 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 172183778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172183857 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172184123 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172184939 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172185097 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 172185786 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172185799 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172185842 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172186527 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 172187395 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172187396 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172187428 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172187456 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172188706 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172188897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172189214 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172190153 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 172190536 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172191079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172191145 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 172191197 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 172191199 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 172191230 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 172191750 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 172192049 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172192474 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172192476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172192747 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172193076 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172193085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172193259 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172193277 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172193382 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172193413 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172193464 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172193466 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172193503 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 172193506 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 172193641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172193921 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 172193931 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172194076 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 172194095 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 172194180 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 172194294 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 2 172194301 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172194359 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 172194371 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172194433 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 172194577 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 2 172194675 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 172194748 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 172194827 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 172194933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172194949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172195057 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 172195090 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172195104 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172195122 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172195134 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172195504 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172195572 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 172195681 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 172195693 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 172196103 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172196565 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 172198838 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172199051 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172199113 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172199253 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172200070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172200150 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 172200938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172201818 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172201983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172202121 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172202152 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 172202165 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 172207363 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 172207445 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172207490 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 172207581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172208212 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172208374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172208407 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 172208858 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 172209276 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172209464 T A N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 172209918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172210289 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 172210371 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172210566 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172210637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172210657 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172210664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172210741 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172210754 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 172210828 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 2 172210913 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 172211066 T A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 172211180 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 172211278 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172211375 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172211404 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 172211536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172211681 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172211983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172212774 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 2 172212914 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 172213183 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172213243 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172213381 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172213922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172214998 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 2 172215001 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 172215115 C T N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 2 172215205 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 172215269 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 2 172215270 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172215461 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172215735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172215739 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172215762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172216521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172216669 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172216772 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172216998 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172217193 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172217230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172217342 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172217719 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172217723 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172218078 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 172218095 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 172218096 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 172220797 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172220913 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 172220993 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172221034 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172221168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172221178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172221582 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 172221809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172222156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172222504 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172222649 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 172222828 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 172223038 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172223129 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 172223165 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 172223247 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172223250 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172224099 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 172224211 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 172224285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172224295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172224332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172224455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172224595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172225470 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 172225860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172226169 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 172226978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172227792 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172228262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172228474 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 172228589 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 172229470 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172229521 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172230453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172231369 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 172231791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172232235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172233135 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172233542 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 172233630 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 172233791 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 172233802 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 172233841 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 172233867 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 172234026 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 172234318 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 172234512 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 172235370 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 172236206 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172236229 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 172236405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172236503 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 172236614 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 172236914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172237360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172237447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172237522 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172237767 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 172237854 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172237888 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172237994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172238118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172238292 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172238944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172239016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172239049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172239192 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 172239480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172239492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172239495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172240167 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 172240225 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 172240306 C A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 172243395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172244581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172245146 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 172245151 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172245597 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172247654 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 172251537 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172254457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172254468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172255119 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 172256844 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172257528 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 172257709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172257810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172258703 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172259175 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172259318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172259659 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 172259666 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 172259695 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172259821 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 172259879 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 172259896 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 172260040 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 172260869 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 172260944 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 172261039 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 172261098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172261539 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172261546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172261620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172261644 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 172262519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172263011 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172263086 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 172263294 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172263470 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172263505 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 172263558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172263682 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 172263844 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 172263860 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 172264214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172264255 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172264307 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172264332 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 172264342 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 2 172264695 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172265139 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172265248 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172265269 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172265358 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172265373 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172265435 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 172265477 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 172265647 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172265765 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172265887 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172266456 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172266510 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172266581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172266666 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172266725 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172266726 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172266785 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172266820 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 172268108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172269118 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172269198 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 172269199 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172269324 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172270002 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172270030 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172270176 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 172270549 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172270580 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172270616 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172270645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172270706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172270757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172271092 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172271119 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172271136 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172271170 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172271275 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172271292 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172271657 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172271685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172271714 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172271847 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172271864 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172271921 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172271924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172271947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172272030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172274348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172277373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172280727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172281232 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 172281346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172282674 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172285779 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 172286324 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172286396 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 172286406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172287070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172287080 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172287125 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172287240 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172289793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172291874 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 172291933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172292007 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 172292045 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 172292540 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172292769 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 172294910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172295281 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172295790 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 172295821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172295864 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172295890 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 172296082 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 172296906 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172297076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172297150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172297715 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 172298168 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172298209 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172298485 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 172298550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172298886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172299722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172300232 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 172300352 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172300767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172300783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172300802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172300913 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 172301095 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 172301147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172301197 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172301207 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 172301231 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 172301234 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 172301366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172301394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172301445 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 172301471 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172301646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172301662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172301764 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 172301778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172301801 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 172301802 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 172301841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172302016 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 2 172302219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172302274 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 172302702 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172302784 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 172302797 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172302801 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172303170 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172303294 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 2 172303323 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 172303358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172303401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172303420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172303482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172303498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172303584 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 172303760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172304020 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 172304059 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 172304094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172304113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172304135 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172304151 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172304593 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172305328 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172305329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172305341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172305564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172305641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172305894 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 172305914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172305967 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172306071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172306120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172306126 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172306136 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172306831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172306846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172306873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172306903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172307009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172307103 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172307416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172307552 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172307605 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172307626 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172307711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172307714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172307736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172307942 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172308139 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172308204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172308324 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172308376 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 172308487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172308526 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 172308717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172308784 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172308841 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 172308978 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 172310469 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172310534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172310566 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 172310587 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 172310632 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172310641 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172310809 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 172311310 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172311434 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 172311437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172311456 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172311480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172311529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172311597 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172311612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172311714 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172311756 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172312216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172312416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172312487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172313217 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172313320 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 172313577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172314061 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 172314117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172314162 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 172314175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172314224 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 172314235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172314358 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 172314533 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 172314615 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 172314684 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 172315613 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 172315736 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 172315751 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172315764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172315802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172315809 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172315818 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 172316384 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172316400 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172316460 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 172316666 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 172316755 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 172316907 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 2 172317360 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 172317605 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 172317627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172317784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172317842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172317965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172318013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172318682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172319337 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172319340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172319362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172320051 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172320068 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172320120 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172320887 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 172321661 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 172321854 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172322001 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 172322081 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 172322112 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 172322232 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 172322384 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172322413 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172322467 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 172322507 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172322534 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 172322569 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 172322583 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172322694 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172322839 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172322847 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172322881 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172322906 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172322942 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172322970 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172323008 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172323117 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172323188 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 172323304 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 172323307 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172323323 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172323385 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 172323388 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 172323609 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 172323615 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 172323654 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 172324359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172324376 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172324379 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172324395 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172324527 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172324592 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172324675 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172324709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172324993 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 172325004 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 172325024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172325489 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 172325539 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 172325746 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172325862 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 172325865 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 172325923 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172326090 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 172326253 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172326301 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172326310 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 172326567 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172327319 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172327395 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 172327421 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 172327484 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 172327499 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 172327618 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 2 172327628 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 172327772 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 172327807 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172328577 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 172328665 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172330954 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172331184 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172331254 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 172331502 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 172331621 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 172331624 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172332616 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172333413 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 172333461 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172333570 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172333592 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172333621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172333698 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 172333919 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172334315 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 172334334 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172334345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172334482 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172335306 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172335307 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172335318 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 172335668 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 172335800 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172336076 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172336114 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172336183 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172336276 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172336377 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172336446 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 172337003 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172337016 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 172337017 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 172337028 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 172337179 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 172337205 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 172337227 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172337485 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 172337544 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172338286 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 172338423 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172338458 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172338577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172338628 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 172338633 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 172338770 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172338827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172338909 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172339138 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172339265 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 172339281 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172339296 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172339369 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172339377 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172339548 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172339714 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172339716 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172339804 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172339835 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172339944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172339951 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172340103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172340134 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 172340137 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 172340817 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172340828 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 172340894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172340908 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172340958 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172341066 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172341349 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 172341914 G T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 172342092 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 172342241 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172342403 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172342481 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 172342749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172342764 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 172342949 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 172343622 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 172343667 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 172343718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172343770 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 172343828 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172343880 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 172343897 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 172344070 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172344481 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172345697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172345732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172345823 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 172346091 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172346121 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 172346486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172346999 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 172347099 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 172347102 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 172347362 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 172347687 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 172347767 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 2 172347782 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 172347794 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 2 172347863 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 172347890 A G Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 2 172348260 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172348380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172349086 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172349087 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172349248 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172350135 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 172350373 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172351527 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 172351840 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 172352022 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 172352026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172352120 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 172352191 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 172352367 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 172352411 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 172352436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172352564 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172352632 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 172352735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172352964 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172353009 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 172353151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172353210 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 172353274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172353360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172353511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172353987 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172354615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172354638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172354756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172354885 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 172356169 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172356250 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 172356744 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 172356904 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 172357558 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 172357834 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 172357952 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 172358075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172358691 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 172358735 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172358841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172359175 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 172359655 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 172359686 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 172359711 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 172359967 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 172360177 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 2 172360382 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 172360672 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 2 172360813 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 172360872 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 2 172360875 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 2 172360923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172360925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172361309 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172361325 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 172361395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172361443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172361524 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172361541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172361550 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172361570 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172361602 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172361897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172361999 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 172362026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172362151 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172362280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172362297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172362515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172362680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172363163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172364174 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 172364233 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 172365461 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 172368254 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172368258 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 172368266 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 172368300 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 172368313 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172368992 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172369458 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172369471 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172369716 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172369817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172372018 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172372289 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172372291 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172372695 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172373413 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172373581 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 172373671 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172373746 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172374716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172376811 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 172378189 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 172378291 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 172378380 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 172378396 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 172378688 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172378780 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172379007 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172379708 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 172379712 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 172379730 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 172380032 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 172380099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172380683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172380959 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172382288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172383135 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 172383153 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 172383289 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 172383567 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 172383591 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 172384034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172384270 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172385297 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172385917 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 172386167 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172386202 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172386295 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 172386392 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172388041 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 172388600 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172389674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172390454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172390518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172392354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172392718 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 172392898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172393129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172394015 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172395077 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 172395170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172396261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172396530 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 172396721 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 172396776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172397335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172397356 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172397457 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172397675 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172397692 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 172397705 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172397708 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 172397720 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 172397810 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172397832 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 172398005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172398006 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172398090 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172398112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172398126 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172398134 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172398137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172398160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172398202 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172398299 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172398353 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172399023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172399199 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172399306 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 172399344 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 172399610 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 172399832 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 172400669 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172400703 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 172400763 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172400794 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172400803 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172400822 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172400850 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172400856 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172400880 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172400888 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172400944 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172400948 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 172401016 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172401073 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172401088 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172401101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172401128 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172401183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172401850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172402779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172403239 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 172404019 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 172407766 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 172407810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172408709 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172409281 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 172409578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172409673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172410126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172414631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172417412 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 172417459 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 172417518 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 172417900 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172418722 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172418761 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172418914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172418982 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172419016 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172419431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172419465 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172419469 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172419507 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172419513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172419598 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172419686 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172419765 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172421058 C G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 172421285 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172421289 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172421320 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172421398 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172421619 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 172421687 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 172421725 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172421797 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172421881 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172422016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172423047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172423120 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172423517 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 172424219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172424230 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172424240 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172424341 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 172424539 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172424554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172424608 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172425617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172425668 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 172425901 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172426010 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172426502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172426590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172427152 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172427214 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172427533 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172427636 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 172427934 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 172428000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172428016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172429254 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 172429449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172429688 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 172429936 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172429937 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 172430200 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172430286 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172431017 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172431224 C A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 172431301 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 172431477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172431553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172431588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172431638 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172431651 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172431701 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172432357 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172432377 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172432533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172432606 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172432809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172433190 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172433644 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172433687 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172434458 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 172434871 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172434885 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172435015 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172435155 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172435325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172435379 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172436449 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172436573 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172436804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172436853 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172436893 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172436909 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 172436951 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172437014 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172437025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172437094 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172437136 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172437173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172437441 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172437526 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172437530 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172437554 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172437571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172437639 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172437770 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172437823 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172437920 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172437958 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172438026 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172438319 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172438321 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172438573 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172439125 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 172439648 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172440884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172441696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172443186 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172443471 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 172443921 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172443980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172444079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172444239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172444428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172444661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172444679 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 172444827 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172444833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172444842 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172444870 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 172445571 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 2 172445580 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 172445616 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 172445683 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 172445848 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 172445871 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 172445888 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 172445908 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 172447692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172452037 T C Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 2 172454731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172456655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172457264 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 172457490 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 2 172457528 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 2 172457565 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172457635 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 172457697 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 172457763 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 172457898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172458231 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 172458728 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 172458738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172461056 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 172463007 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172463146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172463435 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 172463444 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 172464144 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 172464623 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172464658 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172464870 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172465635 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 172466096 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172466207 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172466258 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 172466399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172466411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172466472 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172466614 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 172468333 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172468693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172469026 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172469096 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172469480 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172469811 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 172469955 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172470371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172470797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172471581 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172471963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172472867 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 172472907 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172472917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172472931 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 172472965 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172473178 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172473240 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172473544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172474164 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172474738 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172474920 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 172475074 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172475197 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 172475226 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172475246 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 172475453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172475462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172475510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172475751 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 172476356 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 172476459 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172476506 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 172476540 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 172476661 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 172476778 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 172476831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172476866 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 172476874 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 172476879 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172476911 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172476971 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 172477037 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172477093 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172477197 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172478120 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172478310 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 172479462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172480984 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172482340 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172482342 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172482546 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172482551 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 172482593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172483000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172483006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172483045 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 172483095 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172483534 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 172483564 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 172483613 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 172484191 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 172484217 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172484259 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 172484264 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 172484441 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172484500 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172484633 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 172484760 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172485315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172485440 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172485469 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172485547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172485838 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 172485917 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172485932 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172486036 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172486108 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172486230 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 172486231 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 172486269 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172486355 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172487207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172487537 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172487716 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172487803 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172488529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172488586 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172488626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172488860 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 172489093 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 172489132 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172489151 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 172489192 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172489220 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172489250 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 172489524 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 172489531 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172490673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172490799 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172490898 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172490907 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172490938 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172490942 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172490953 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172491012 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172491155 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172491484 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172491508 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172491524 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172491777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172491869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172491884 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172492557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172492560 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172492631 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172492643 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172493024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172493206 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172493880 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172495215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172497725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172498266 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172498549 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 172499574 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 172499580 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172499610 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172499635 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172499683 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 172499920 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172500092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172500423 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172500447 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 172500472 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 172500586 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172501603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172501611 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172501648 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172501663 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172501669 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172501725 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172501823 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172501829 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172501925 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172502282 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 172502310 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 2 172502425 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 172502426 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 172502721 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 172503161 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 172503202 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 2 172503212 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 2 172503255 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172503262 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 172503267 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 172503449 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172503560 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 172503675 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172503679 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172504218 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 172506090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172506439 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 172507430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172507521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172507926 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172508683 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172508685 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172508999 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 172509014 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 172509084 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172509439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172509928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172512916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172512967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172513556 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172513889 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172513970 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172514043 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172514097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172514689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172514804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172514868 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172514977 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172515033 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172515067 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172515262 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172515378 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172515887 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172516163 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172516287 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172516392 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172516404 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172516513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172516713 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172517387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172517535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172517860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172517997 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172518014 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172518015 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172518041 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172518221 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172518252 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172518262 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172518713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172518736 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172518823 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172518827 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172518846 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172518883 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172518973 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172519068 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172519305 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172519343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172519363 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172519674 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172519748 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172519750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172519759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172519840 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172519973 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172520010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172521010 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 172521212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172521243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172521449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172521454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172521517 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172521533 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172521552 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172521779 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172521819 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172521869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172521994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172521995 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172522107 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172522411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172522445 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172522503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172522505 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172522522 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 172523030 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172523180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172523247 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172523292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172523302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172523755 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172524050 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172524476 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172524499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172524511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172524512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172524524 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172524851 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172525484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172525513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172525533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172525537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172525608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172526151 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172526507 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172526539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172526570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172526901 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172526909 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172526928 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172527979 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 172528105 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172528166 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172528182 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172528191 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172528869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172528923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172528948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172529136 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172529198 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172529402 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172529631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172529738 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172529830 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172529840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172529940 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172531321 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172531452 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172531454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172531498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172531895 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172532063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172532145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172532330 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172532669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172532759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172532842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172532916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172532919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172533138 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172533210 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172533261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172533386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172533594 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172533598 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172533715 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172533743 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172533748 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172533764 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172533771 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172533902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172534175 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172534229 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 172534386 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172534415 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172534568 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172534705 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172534708 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172534757 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172535113 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172535281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172535293 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172535619 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172536310 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172536912 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172536923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172538070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172538146 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172538156 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172538225 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172538256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172538907 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172539113 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 172539275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172539280 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172539290 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172539297 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172539330 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172539359 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172539447 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172540182 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172540240 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 172540815 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172540893 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172541083 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172541332 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172541338 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172541393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172541599 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172542059 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172542105 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172542108 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172542150 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172542473 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172542517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172542545 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172542611 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 172542929 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172542948 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172542959 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172543027 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172543035 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172543041 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172543132 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172543291 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172543345 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172543444 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172543472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172543494 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172543688 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172543705 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172544812 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172544905 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 172545117 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172545417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172545674 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172545675 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172545729 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172545778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172545807 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172545826 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172545967 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172546380 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 172546381 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172546407 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172546430 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 172546460 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 172546565 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172546572 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172546580 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172546613 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172546677 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172546780 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172546837 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172546932 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172547028 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 172547118 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172547244 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172547294 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172547343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172547393 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172547406 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 172547434 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172547450 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172547472 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172547711 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172547832 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 172547931 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172548049 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172548210 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172548216 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172548302 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172548347 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 172548373 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172548535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172548556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172548614 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 172548624 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172548773 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172549344 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172549442 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172549478 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172549652 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172549880 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172550152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172550280 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 172550930 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172550995 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172551209 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172551368 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172551390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172551414 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172551687 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172552635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172554929 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172555391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172555617 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172557007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172557190 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172557448 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172557809 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172557867 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172558232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172558261 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172558394 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172558425 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172558550 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172558614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172559681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172560305 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172561721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172561751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172562229 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172562687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172563707 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172564347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172564793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172564830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172565134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172565196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172565225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172565849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172566785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172566976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172577414 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172577419 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 172577521 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172577607 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 172577691 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172578023 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172578043 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172578173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172578478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172578613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172581036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172581671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172581938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172582246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172582315 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172582657 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172582704 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172583106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172583182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172583389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172583405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172583453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172583686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172584145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172584318 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172584779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172585379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172586364 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172588116 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172588652 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172589367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172589861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172589870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172590333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172590371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172590777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172591167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172591398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172591436 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172591728 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 172591729 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 172593046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172594266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172595220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172595497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172595573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172596485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172597412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172598952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172599530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172599616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172599928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172600149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172600727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172600751 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172600821 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 172600823 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 172601005 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172601061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172601595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172601602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172601606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172602033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172602099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172602882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172603434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172604254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172604313 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172605262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172605739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172606055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172606264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172606398 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172606677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172606771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172606788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172607039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172607236 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172607346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172608053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172608242 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172608830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172608985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172609098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172609110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172609856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172611218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172611300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172611518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172611622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172612105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172612127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172612386 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172612472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172612473 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172612490 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172612497 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172612539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172612690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172612744 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172612909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172613249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172613303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172613480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172613731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172613793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172614177 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172614394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172614432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172614441 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172614668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172614866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172615086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172616291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172616303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172616308 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172616841 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 172617609 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172617779 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172617805 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172617838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172617932 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172617943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172618063 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172618140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172618347 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172618738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172618952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172618969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172618986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172618993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172619579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172620987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172621075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172621104 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172621372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172621775 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172622024 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172622824 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172624504 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172624523 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172624539 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172624821 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172624822 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172624892 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172624965 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172624967 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172625044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172625061 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172625066 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172625123 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172625203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172625266 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172625314 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172625368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172625379 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172625606 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172626120 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172626145 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172626542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172627235 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 2 172627444 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172628839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172628891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172629034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172630658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172631601 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172631667 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172632304 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172632531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172633826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172634485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172635874 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 172637367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172637681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172637799 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172638490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172639430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172640586 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172640635 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172645278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172645702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172646409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172646893 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172647107 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172647548 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172647924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172649136 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172650563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172651557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172651604 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172651847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172651890 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 172652031 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172652045 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172652220 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172652230 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172652331 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172652362 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172652363 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172652437 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172652531 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172652798 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172652839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172652939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172653021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172653144 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172653185 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172653215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172653305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172653379 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172653475 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172653682 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172653797 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172654608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172655113 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172656361 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172657118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172657128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172657189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172657685 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172657768 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172657776 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172657815 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 172657855 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172657863 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172657994 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172658020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172658389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172658670 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 172659231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172659485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172659527 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172659582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172659755 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172659761 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172659955 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172660097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172660130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172660137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172660193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172661034 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172661108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172661114 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172661161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172661241 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172661298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172661304 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172662089 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 172662119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172663669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172664988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172665533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172665540 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 2 172666940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172666956 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172667973 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172668002 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172668223 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 172668234 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172668269 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 172668270 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 172668305 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172668640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172668664 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172668788 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172668795 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172668823 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172670807 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172670853 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172670880 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172670918 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172670923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172670989 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172671116 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172671214 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172671236 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172671525 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172671538 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172671556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172672082 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172672950 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172672986 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172672992 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172673369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172673384 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172673458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172673630 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172673783 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172674080 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172674911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172674924 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 172674931 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 172674941 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 172674960 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172675087 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172675120 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172675126 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172675551 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172675556 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172675575 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172675648 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 172675803 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172676349 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172676361 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172676384 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172676612 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 172676614 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172677191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172677445 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 172678958 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 172680451 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172680466 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172680497 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172680516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172680706 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172680850 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172681039 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 172681162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172682496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172682534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172682850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172682861 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172685111 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172686039 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172686620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172687069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172689674 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172690301 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172690544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172693790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172693837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172694242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172694348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172695215 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172695242 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172695813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172695822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172696304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172696814 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172697559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172697734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172697899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172697975 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172698135 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172698176 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 172698284 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172698925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172699437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172699561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172700330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172700950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172702207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172703509 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172703981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172704405 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172706734 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 172706768 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 172706849 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 172706860 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172706977 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172707050 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172707107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172707460 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 172707462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172707498 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 172708151 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172708635 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 172708677 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172709196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172709712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172710756 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172710784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172710817 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 172710818 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172710926 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 172711013 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172711024 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172711331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172711428 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172711473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172711984 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172713090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172713259 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 172713937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172714058 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 2 172714088 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 172714442 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172714755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172714773 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172714933 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 172714949 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 172714984 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172715055 T G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 172715126 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 172715146 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172715158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172715194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172715628 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172715650 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 172715657 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172715931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172715969 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172716069 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 172716075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172716145 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 172716157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172716271 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172716285 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172716314 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172716397 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172716502 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172716758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172716869 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172716986 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 172717202 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172717477 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172717538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172717663 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172718023 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 172718053 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 172718103 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172718203 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172718275 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172718328 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172719101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172719344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172719363 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172720163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172723484 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172723613 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172723766 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172723788 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 172723864 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172724707 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172726910 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172726989 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172730188 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 172731086 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 172734698 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172736223 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172736295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172737823 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172738104 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172740058 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 172740068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172740069 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172740843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172740921 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172740953 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 172741135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172741153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172741193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172741235 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172741417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172741424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172741448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172741575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172741585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172741656 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 172741666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172741741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172741743 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 172741798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172741900 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 172741919 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172742213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172742232 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 172742403 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172742410 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172742768 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172744323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172744665 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172745449 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172745473 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172745769 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 172745816 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172745954 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172748180 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172748349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172750842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172750880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172751999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172752045 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 172752967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172755126 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172755509 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172758321 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172758643 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172759069 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 172759151 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172759164 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 172759720 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 172759807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172760113 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 2 172760233 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172761920 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 172762165 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172762745 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 172762862 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172762885 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172763618 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172763710 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172763868 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 172763955 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 2 172764062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172764917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172766370 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172766479 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172766599 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172766657 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172767552 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 172768015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172768196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172768511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172768651 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172768701 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172769387 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 172769509 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 172770178 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172770454 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 172770504 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172770526 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172771161 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 172771217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172772070 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 172772402 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172772415 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 172772601 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172772631 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172772651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172772663 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172772748 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 172772778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172773048 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 2 172773557 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172773567 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172773601 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172773968 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172774134 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172774502 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 2 172774605 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 172774647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172774651 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172774903 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 172774940 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172775065 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172775123 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172775247 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 172775564 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172775610 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 172775977 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 172776316 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 172776529 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 172776623 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 172776637 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172776651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172776768 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172776788 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172776838 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172777059 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172777062 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172777183 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172777294 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 172777388 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172777471 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172777516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172778300 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172778309 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172778882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172780190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172780663 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 172781111 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172781466 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172782127 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 172783371 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172783827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172784711 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 172784713 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172785243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172785247 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 172785619 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172785659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172785887 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172785905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172786179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172786671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172786697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172787026 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 172787192 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 172787212 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 172787216 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172787336 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172787579 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 172787604 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172787605 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172787709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172787753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172787802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172788407 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172788517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172788531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172788551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172788795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172788834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172788902 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172788952 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 172789067 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172789100 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172789170 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172789237 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172789361 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172789565 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172789634 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172789670 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 172790098 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 172790843 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172791050 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172791168 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172791288 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172791307 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 172791499 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 172791502 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 172791574 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 172792318 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172792319 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172792909 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172792963 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172793053 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172793098 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172793164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172793187 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172793193 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172793233 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172793294 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172793405 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 2 172793451 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172795043 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172795211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172795430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172795435 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172795547 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172795610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172795637 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172795758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172795765 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172797017 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172797130 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172797152 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172797177 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172797194 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172797260 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172797286 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 172797328 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172797345 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172797353 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172797367 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172797573 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172797604 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172797692 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172797725 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172797921 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172797949 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172798047 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172798141 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 172798493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172798519 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172798704 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172798791 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172799241 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172799816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172803257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172803736 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172803737 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172803875 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172804005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172804309 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 172804412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172804611 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172805126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172805132 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172805147 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172805159 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172805187 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 172806171 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172806549 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172806688 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172807154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172807269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172807302 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172807303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172807985 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 172808044 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 172808164 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172808677 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172809068 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172809201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172811704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172813295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172813468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172816694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172816717 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172817155 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172817156 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172818179 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172818198 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172818810 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 172818826 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 172818856 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172819052 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172819216 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172820020 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172820181 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 172821112 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172821473 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172821481 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172821545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172821632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172822781 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172822943 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172823045 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172824095 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172824378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172824695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172825497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172825512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172826153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172826587 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172826697 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172827266 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172827690 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172827896 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172828012 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172828046 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172828303 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172828317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172828366 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172828367 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172828683 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172828808 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172828846 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172828869 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172828874 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172828884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172828892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172828942 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172829070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172829443 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172829496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172829545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172830330 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172830626 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172830823 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172831069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172831462 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172831835 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 172831880 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 172831934 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172831955 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172832040 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 172833077 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172833657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172834685 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172834825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172834829 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172834939 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172835060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172835089 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 172835094 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172835132 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172835202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172835781 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172835847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172836028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172836033 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172836054 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172836065 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172836218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172836246 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172836364 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172836412 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172837974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172839656 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172839698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172839732 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172839887 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172840681 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172841024 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172841032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172841409 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172841430 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172841531 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172842240 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172842246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172842263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172842374 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172842474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172842489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172843631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172844661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172845234 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172846780 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172849976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172850860 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172852285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172855260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172857872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172864803 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172864926 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 2 172865537 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172866253 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 172866556 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 172867538 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 172868560 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 172868624 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172868887 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172869241 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172869319 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172869438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172869628 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 172869867 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172869931 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172871041 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 172871256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172871259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172871345 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172871347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172871471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172871937 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172872590 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 172872716 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 172873817 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 172873847 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 172873925 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 172874122 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 2 172874258 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 172874386 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 172874669 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 172874748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172874754 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 172874877 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 172874982 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 172875196 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 172875235 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172875421 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 172875481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172875687 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172875884 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172875917 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 172875936 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 172876474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172876493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172877057 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172877119 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172877397 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 172877480 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172877589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172877620 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172877662 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172877666 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172877687 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172877709 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172877726 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172877817 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172877834 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172877843 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 172878046 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 172878215 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172878239 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172878240 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172878886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172879033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172879055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172879902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172880603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172880759 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172883308 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 172883856 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172883871 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 172883996 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 172884326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172884681 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172884803 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172884910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172884979 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172885081 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 172885161 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 172885166 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 172885258 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172885275 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172885316 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172886826 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172887122 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 172887618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172887928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172888191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172888511 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 172889179 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 172890252 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172890999 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172891005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172891244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172891672 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 172891673 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 172892096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172892491 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 172892694 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 172892739 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 172893979 C T Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 172894077 C A N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 2 172894195 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 172894295 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 172894387 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 172894398 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 172895098 A C Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 172895138 A C Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 2 172895154 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 8 10 0 8 1 2 172896787 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 172896811 C T Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 2 172897113 A G Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 172897127 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 172897395 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172897768 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 172899300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172902108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172903645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172906930 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 172906959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172906965 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172906972 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172907185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172907235 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 172907259 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 172907262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172907315 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 172907327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172907741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172908777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172909303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172910631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172912747 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 172912768 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 172912777 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172912887 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 172914177 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 172914182 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 172914481 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172914634 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 172914641 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172914708 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 172914710 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 172915009 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172915018 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172915050 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 172915217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172915640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172916106 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172916302 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172917835 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 172917958 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 172917980 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 172918013 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172918174 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 172918615 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172918680 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 172918742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172918948 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172919046 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172919086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172919258 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 172919356 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 172919383 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 172919468 T A N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 2 172920192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172920439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172922767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172924212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172927177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172929702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172929920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172931152 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 172931329 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 172932639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172932935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172933312 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 172933340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172934582 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 172934781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172935598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172936052 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 172937829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172938796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172939023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172939081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172939298 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 172939363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172939538 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 172939641 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 172939684 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172939778 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 172939984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172940001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172940124 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 172940136 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172940245 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 172940257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172940259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172940278 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 172940283 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 172940305 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 172940353 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 172940354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172940373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172940461 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172941113 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172941229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172941349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172941494 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 172941547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172941572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172941736 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 172941994 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 172942021 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 172942035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172942070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172942088 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172942102 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172942106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172942155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172942927 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 172943752 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 172946388 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 172946447 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 172946625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172947757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172947783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172948466 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 172948742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172948750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172948786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172948798 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 172949142 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172949202 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172949296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172949599 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 172950224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172950353 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 172950727 A C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 172950780 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172950965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172950971 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172951250 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172951274 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172951385 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 172951418 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 172951485 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172951777 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 172951813 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 172951998 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 172952172 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 172952431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172952529 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 172952674 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172954511 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172954514 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172955925 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 172956433 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 172958671 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172959842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172960957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172961029 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172961030 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172961070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172961455 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172961638 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 172961937 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 172963213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172963296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172963559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172964061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172964882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172965050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172965934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172965975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172966057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172966127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172966270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172966985 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 172967908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172968040 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 172968281 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 172969078 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 172969628 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 172970653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172971194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172971233 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 172971765 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 172971932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172971972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172972266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172972470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172972535 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 172972598 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 172972887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172973105 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 172973984 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 172974470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172975141 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 172976133 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 172976286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172976540 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 172978075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172979953 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 172980082 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 172980350 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 172980445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172980531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172980557 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 172980925 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 172981098 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 172981126 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 172981203 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 172981278 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 172982273 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 172982280 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 172982343 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 172982952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172983174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172985551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172990707 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 172990875 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 172991005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172991511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172991881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172992191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172993996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172994227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172995684 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 172995939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172996707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172998015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 172998814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173003073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173003313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173003935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173004080 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173004546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173005486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173005701 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 173006024 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 173006184 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173006336 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 173006668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173006836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173006933 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173007730 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 173007783 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 173007806 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 173007825 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 173007938 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 173007962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173007997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173008860 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 173008901 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 173009018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173009103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173009618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173009897 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 173010917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173012157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173012289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173012356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173012413 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173012441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173012471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173012536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173012540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173012585 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173013754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173014003 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173014569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173015265 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 173016018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173017988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173018043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173019374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173019501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173020258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173020373 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173020469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173023696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173024468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173027544 T A N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 2 173027725 T G Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 2 173028293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173028317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173028331 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173028338 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173028456 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173028509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173028540 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173028699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173028732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173028796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173028877 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173028889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173028936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173028987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173029132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173029155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173029225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173029296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173029322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173029438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173029461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173029490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173029527 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173029570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173029573 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173029622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173029781 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173029900 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 173030627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173032461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173032477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173032511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173033164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173033378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173035717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173036279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173038013 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 173038090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173038442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173039872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173040370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173043313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173043896 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 173044655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173044701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173044838 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 173044943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173045134 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 173045262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173045637 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 173045885 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 173046236 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 173047184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173047995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173048133 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 173049088 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173049681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173049881 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173049895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173050084 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173051265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173053464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173055020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173055033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173056547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173056851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173060707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173060891 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173061177 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 173064788 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173064884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173064980 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 173065395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173065406 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173065416 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 2 173065540 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 173066588 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 173067296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173067508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173067522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173069747 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 173069838 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173069959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173070592 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173070714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173070780 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173071147 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173071779 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 173071799 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 173071809 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 173071829 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 173071839 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 173071917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173072459 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 173072513 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 173072566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173072573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173072976 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 173074018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173076674 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 173077486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173079467 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 173079661 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173081245 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173081824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173081989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173082134 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173082151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173082488 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 173082870 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 173083040 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173083801 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 173084542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173084658 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173084681 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173084730 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173085570 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173085863 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 173085939 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173085983 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 173085992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173086013 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173086145 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173086206 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173086277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173086624 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 173086741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173086850 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 173086971 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173087034 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173088315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173090110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173091308 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173091870 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173092339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173092419 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173092594 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173092724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173092749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173092772 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173092789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173092815 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173092850 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 173094101 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173094165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173097627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173099905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173102617 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 173104445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173104703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173104853 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173104923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173105304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173106676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173108913 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173109072 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 173109077 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173109151 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173112267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173114701 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173115677 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173117452 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173117911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173120857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173123207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173123660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173123978 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173124001 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173124008 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 173124054 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 173124064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173124065 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173124290 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 173124496 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173124713 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173124962 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173124969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173125008 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 173125305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173125356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173125362 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 173125375 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 173125508 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173125516 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173125950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173126130 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 173128744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173129116 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173130122 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 173130638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173131128 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173131130 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173131144 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173131153 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173131250 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173131280 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173131409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173131646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173131725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173131753 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173131824 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 173132053 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173136838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173140041 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173140408 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173140431 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 173140645 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173140813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173141212 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173141220 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173141474 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 173141756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173144734 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 173145120 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173146555 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 173146566 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173146798 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173146831 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173147065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173147796 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 173147809 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173148607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173149738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173150635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173151816 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 173152006 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 173152103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173152121 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 173152123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173152239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173152443 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 173152800 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173152812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173152865 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 173152899 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 173153074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173153105 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173153321 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173153332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173153346 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 173153370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173153459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173153631 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 173153659 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173153740 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 173153806 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173153814 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173153822 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 173153959 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 173153980 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173154163 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 173154704 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173154712 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173154721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173154785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173155139 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 173155271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173155729 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 173155831 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 173156017 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 173156307 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173156335 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 173156345 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 173156511 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173156557 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 173156653 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 173156717 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 173156735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173156739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173157335 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173158111 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 173158121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173158316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173158604 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 173158817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173159010 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 2 173159067 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 2 173159190 A T Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 173159552 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 173159719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173160180 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 173160282 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173160283 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 173160634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173161005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173161103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173161108 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 173163031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173167528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173167538 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173169796 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 173169825 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 173170654 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173170656 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173170771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173170779 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 173170820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173171460 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 173171491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173172185 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 173172198 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173172437 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173172438 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 173172500 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 173172548 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 173172721 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 173172779 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173173680 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173174905 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 173174953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173175485 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 173175537 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 173175958 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 173176283 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 173176537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173176565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173177375 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 173177596 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173178178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173179722 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173179807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173181169 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173181589 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173181645 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173182201 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 173182226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173182318 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 173182380 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 173182389 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173184441 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173191091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173192526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173193373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173193406 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 173194949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173198190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173199318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173199331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173199946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173200207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173201100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173201813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173203787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173209304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173209651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173209879 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173210569 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173210731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173210879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173210915 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173210943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173211132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173211339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173211403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173211417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173211581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173212472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173212568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173212755 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 173213463 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173215556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173215997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173217255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173220479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173220725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173220826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173220973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173223083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173223498 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173224796 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 173224798 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 173224827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173224966 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173225233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173227407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173238135 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173241696 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 2 173242090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173246140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173246182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173246611 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173246619 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173246630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173249261 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 173249293 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173249320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173249411 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173249488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173250866 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173250934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173251360 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 2 173251552 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173251560 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173252148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173252981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173256053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173256084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173256247 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173256255 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173256274 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173256278 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173256314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173256329 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173256334 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173256383 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173256420 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173257170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173258613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173262020 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173262109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173262162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173262379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173263063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173263149 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173263507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173263781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173264072 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 173264124 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173264518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173268252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173268315 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173268459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173268479 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173268503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173268516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173268531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173268557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173268811 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173269477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173269735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173269823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173270088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173270094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173270436 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173270468 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173270469 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173270497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173270566 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173270605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173270710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173270825 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173270869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173270905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173270958 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173271016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173271027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173271063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173271263 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173271270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173271429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173271454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173271472 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173271492 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173271544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173271551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173271612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173271867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173271996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173272061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173272094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173272512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173272674 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173272759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173273054 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 173273579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173273624 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173273903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173274209 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173274241 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173274313 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173274492 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173274525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173274741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173274763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173275169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173275199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173275254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173275900 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173276075 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 173276178 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 173276898 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173276924 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173276933 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173277323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173277545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173277808 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173278041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173278972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173278987 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173279273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173279282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173279292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173279295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173279773 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173280189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173280195 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173280272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173280318 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173280416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173282177 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173282640 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173282651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173282726 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173282796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173283405 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173283641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173284022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173284154 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173284227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173284229 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173284250 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173284270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173284277 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173284308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173284687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173284810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173284818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173285049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173285183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173285599 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 173285974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173286177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173286493 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173286613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173287439 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173287550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173287800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173288959 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 173289247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173290135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173292486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173292749 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173293526 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173294352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173294374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173294578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173294981 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 173295041 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 173295127 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173295387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173295389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173296086 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173296124 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173296146 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 173296185 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 173296302 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 173296390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173296394 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 173296502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173296592 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173296600 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 173296654 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173296684 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173298363 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173298525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173299231 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 173299283 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 173299366 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173299462 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173299559 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 173299715 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 173299718 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 173299971 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 173300127 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 173300154 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 173300184 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 173300523 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 2 173300827 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173300984 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 173300991 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 173300995 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 173301230 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 173301250 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173301326 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 173301344 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 173301374 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 173301520 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 173301527 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 173301582 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173301654 A G Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 2 173301750 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173301787 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 173301830 G A Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 2 173302084 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 173302094 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173302177 C T Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 2 173302238 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 173302432 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173302439 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173302774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173303375 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173303662 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173303847 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173304010 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173304094 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173304412 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173304541 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173305487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173305746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173305885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173306397 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173306765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173307973 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 173308378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173309106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173309328 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173309384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173309386 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 173309436 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173309655 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173310402 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173310473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173310742 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173310753 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173310767 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173310801 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173311039 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173311109 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173311162 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173311223 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173311259 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173311317 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173311388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173311684 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 173311731 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173312918 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173313154 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173313278 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173313283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173313320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173313664 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 173313894 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173313946 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173314076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173314553 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173314606 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173315097 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 173315285 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173315619 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 173315976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173316084 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 173316160 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 173316204 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173316683 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173316720 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 173316810 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173316858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173316962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173317005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173317028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173317084 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173317262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173317328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173317331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173317500 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173317523 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173317652 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 173317660 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173317682 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173317685 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173317705 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173317721 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173318089 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 173318189 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 173318349 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173318352 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173318397 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173319559 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173319584 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173319587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173319618 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173319894 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173319981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173320089 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 2 173320459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173321280 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 173321393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173321397 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 173321409 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 173321424 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173321455 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 173322448 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173322598 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173322616 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173322736 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173323082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173323145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173323360 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173323380 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173323459 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173323487 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 173323664 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173324028 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173324045 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173324083 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 173324084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173324119 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173324137 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173324146 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173324159 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173324177 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173324733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173324859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173324985 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173325064 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173325101 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173325103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173325221 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173325223 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173325270 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173325291 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173325328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173325329 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173325376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173325519 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 173325550 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 173325624 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173325733 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173325788 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173325792 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173325835 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173326015 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173326047 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173326282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173326315 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173326422 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 173326474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173326586 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173326602 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173326604 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173327116 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173327223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173327377 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 173327394 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 173327445 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 173327654 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 173327700 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 173327711 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173327740 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173327749 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173327840 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 173328228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173328280 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173328302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173328582 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173328585 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173328626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173328901 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173330364 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173330390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173330393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173330418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173330476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173331180 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173331185 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173331427 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173331603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173331640 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173331702 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173331738 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173332117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173332291 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173332480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173332830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173332840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173332924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173332965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173332974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173333067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173333163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173333241 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 173333582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173333584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173333596 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173333672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173333699 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173333714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173333743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173333758 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173333829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173334490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173334712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173334997 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173335232 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173335367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173335531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173335587 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173335705 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173335710 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173335735 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173335823 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173335834 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173336272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173336318 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 173336383 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 173336468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173336593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173336793 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 173337071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173337112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173337114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173337148 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173337319 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173337359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173337690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173337694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173337735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173337787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173337989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173338024 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173338056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173338144 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 173338153 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 173338313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173338328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173339733 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173339740 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173339753 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173339874 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 173340003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173340048 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173340111 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 173340182 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 173340319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173340330 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173340347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173340354 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173340366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173340385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173340579 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173340603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173340624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173340730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173340757 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173340759 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173341412 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 173341413 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 173341496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173341536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173341551 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173341558 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 2 173342061 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 173342124 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 173342339 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 2 173342377 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 2 173342736 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173342836 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173342904 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173342959 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173343074 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173344967 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173344997 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173345001 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173345021 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173345046 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173345060 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173345697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173346367 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173347007 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173347163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173347196 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173347901 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173348524 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 173348558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173348621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173348744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173348838 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 173349227 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173349241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173349305 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 173349315 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 173349335 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173349430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173349594 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 173349595 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 173349632 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 2 173349757 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173350275 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173350292 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173350359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173350388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173350542 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173350595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173350689 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173350922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173351354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173352442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173352572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173353124 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 173353204 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173353253 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173353260 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173354935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173355447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173355461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173355475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173355829 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173356318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173356378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173357595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173357944 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173358539 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173358814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173359035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173359200 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173359353 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 173360672 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173360746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173360775 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173361900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173363091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173363130 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 173363142 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173363503 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173363581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173363750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173364144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173365327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173365338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173365698 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173365729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173365822 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173365863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173365869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173365965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173366064 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173366076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173366146 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173366654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173367019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173367314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173367321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173367333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173367402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173367460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173368310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173368500 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173368530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173368555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173369884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173370051 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173370217 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173370292 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173370371 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173370503 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173370720 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 173370824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173371078 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173371236 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173371263 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173371748 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173371751 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173371796 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173372030 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 173372058 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 173372071 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173372180 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173372244 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 173372271 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 173372848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173373339 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173373384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173373457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173375077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173375420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173376092 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173376909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173377424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173378123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173381617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173381776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173382423 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173382802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173384858 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 173385389 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173385682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173385720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173390901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173391070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173391551 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173396009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173397679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173397853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173397888 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173398732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173399038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173399074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173399301 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173399367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173400354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173400556 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173403082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173405572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173406445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173407898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173408600 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173408966 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 2 173409591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173410108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173410369 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173411455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173412411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173412903 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 173416221 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173419924 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173420774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173421106 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173422716 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 173422802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173423921 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173425753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173426595 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173428877 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173430753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173431368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173431816 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173438681 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 173439673 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173442136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173443628 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173444313 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173444368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173444463 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173444552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173444575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173446035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173448380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173449526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173450528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173451104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173452107 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173452547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173452929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173456294 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173456765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173457010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173457064 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173457350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173457399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173457656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173458280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173459939 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173460081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173460728 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 173460870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173460897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173463831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173465113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173465641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173467167 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 2 173467287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173467754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173469030 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173469491 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173470074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173471880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173473327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173473355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173474590 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173475300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173476499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173477582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173481101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173487980 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173492459 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173492936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173493201 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 173493214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173494481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173495704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173496008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173496772 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173497405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173497476 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 173497524 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173498020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173502490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173502696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173505857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173510248 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 173510346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173510369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173510404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173510482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173512259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173512395 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173512595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173512893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173516485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173516776 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173516834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173517539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173519006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173521084 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173521623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173522542 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173524027 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173524071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173533058 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173534632 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173534680 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173534927 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173535502 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173537207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173537480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173538005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173538956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173539791 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173540954 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173543878 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 173545612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173546279 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 173546987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173548986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173549964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173550806 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 173551187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173551391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173554369 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173555831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173555901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173556042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173556067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173556490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173557691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173557791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173559420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173566264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173566967 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 173566980 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 173567038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173567043 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 173567141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173568499 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173569268 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173571953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173572883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173573457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173573506 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173573882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173574444 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173574580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173574783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173574964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173575473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173577089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173577200 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173577317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173580690 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173580703 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173580791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173581005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173581607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173581893 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 173581900 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 173582116 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 173582279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173584041 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 173584386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173584868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173585192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173586978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173587790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173587977 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 173591081 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173594565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173596652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173598718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173603104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173603294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173606978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173608408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173609477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173609630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173609653 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 173611266 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173611822 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 173612124 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 173612790 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173613691 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173614024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173614127 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 173614381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173614757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173615192 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 173616847 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173616867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173618302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173618989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173619978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173620899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173622618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173622713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173623790 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173624416 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 173624417 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 173625309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173629152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173630170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173630918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173632289 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173633823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173634088 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173634207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173634931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173635012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173635830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173637671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173638761 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173639730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173640967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173646711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173646937 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 173646953 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 173648327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173649201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173652026 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 173652138 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 173652505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173652611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173654181 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173654481 A C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 173655575 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 173655670 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 173655671 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 173655683 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 173655791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173655812 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173655869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173655941 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 173656111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173656480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173656482 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173656538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173657010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173658890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173659052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173659371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173662339 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173663645 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173664126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173667082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173667160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173671748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173672178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173672237 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 173672587 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173673598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173675765 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173677782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173678012 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173678570 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173678588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173679034 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 173679488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173683444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173683513 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 173683861 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173684170 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173684321 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 173684533 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 173684620 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 173684660 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 173684744 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 173684750 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 173684939 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 173685256 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 173685261 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 173685392 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 173685420 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 173685490 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 173685545 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 173685546 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 173685728 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 173686452 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 173686521 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173686722 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173686821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173687058 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 173693257 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 173693948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173695531 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 173696094 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 173696498 T G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 173696510 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 173697715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173698127 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173698128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173700423 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 173701996 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173702349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173702468 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 173702640 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 173706077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173706228 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 173706466 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173707310 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173709087 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173709116 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173709515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173709808 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173710128 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 173710147 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173710185 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173710957 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 173711560 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 173712062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173712786 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 173715172 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 173716221 A G Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 173716451 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 173716763 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 173717803 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173717837 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173718011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173720277 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173722887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173723098 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173725946 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173726182 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173727318 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 173727409 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 173727511 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 173727580 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 173727643 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 173727659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173727688 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 173727722 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 173727859 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 173727886 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 173727966 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 173727981 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 2 173728082 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 173728097 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 173728100 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 173728275 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 173728329 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 173728403 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 173728785 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 173728972 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 173729446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173729776 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 2 173730177 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 173730882 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 173731350 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173731473 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 173731586 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 173731830 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 173731846 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 173732239 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 173732437 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 173732579 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 173732606 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 173732829 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 173732907 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 173732960 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 173732968 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 173733038 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 173733070 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 173733219 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 173733672 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 173733678 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 173733689 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 173733696 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173733701 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 173733724 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 173733875 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 173733901 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 173734015 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 173734026 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 173734031 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 173734123 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 173734128 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 173734163 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 173734180 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 173734220 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 173734485 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 173734621 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 173734640 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 2 173734696 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 2 173734720 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 2 173734771 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 173734847 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 173734865 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 173735003 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 173735195 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 173735217 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173735220 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173735242 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173735264 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173735266 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173735317 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173735354 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173735469 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 173735506 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173735548 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173735554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173735582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173735884 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 173736107 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 173736174 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 173736230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173736239 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173736307 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 173736821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173736919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173736971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173737005 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 173737014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173737101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173737430 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 173738583 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 173738773 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 173738980 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 173739035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173739054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173739188 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 173739294 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 173739584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173739856 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173740480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173740891 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173741244 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 173741291 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173741459 A C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 173742096 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 173743022 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 173743047 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 173743050 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 2 173745060 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 173745445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173746486 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 173746614 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173748333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173749788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173751237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173751273 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173752283 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 173753494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173757530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173757740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173758575 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173758608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173759451 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173760650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173761219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173762546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173762668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173762810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173762895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173764375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173765687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173766577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173771901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173774205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173774554 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 173775144 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 173776399 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173784736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173785722 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173787696 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173792713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173793096 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 173794830 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173802320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173803057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173805055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173809507 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 173810689 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173811691 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173813595 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173814288 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173814957 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173818367 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173819763 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173821281 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173821413 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173821425 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173821485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173821906 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173826996 C G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 173827221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173827291 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173827295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173828086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173832539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173837266 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 173837979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173838099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173838685 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 173839468 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173840471 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 173841625 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 173842062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173842129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173843211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173845757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173847278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173849816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173849992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173850519 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173852507 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 173853139 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 173853191 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 173858850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173858851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173858863 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173859240 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173859474 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 173859799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173859943 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173859986 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 173859999 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173860042 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173860054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173860061 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173860086 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 173860126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173860277 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173860472 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173860480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173860485 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173860641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173860647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173860680 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 173860783 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173860861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173860892 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 173861046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173861131 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173861228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173861250 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173861285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173861344 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173861514 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 173861586 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173861707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173861751 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 173861809 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173861887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173861935 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173862056 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 173862162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173863009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173863706 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173864116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173864453 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173866051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173867639 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173869217 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173870781 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173870944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173870962 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173871029 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173871051 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173871054 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173871082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173871086 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173871096 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173871102 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 173871134 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 173871154 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173871193 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173871260 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 173871399 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 173871480 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173871491 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173871516 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173871520 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 173871543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173871568 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 173871755 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 173871784 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 173871853 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 173871887 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 173871928 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 173871976 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 173871983 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173872012 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173872027 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173872451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173872568 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173872787 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 173872803 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 173873557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173875191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173875464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173878816 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173879934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173882513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173887695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173888797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173889532 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173892193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173892338 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 173895466 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173896023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173896148 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173896453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173896649 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173896783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173897663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173897858 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173902274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173905269 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173905764 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 173911282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173918665 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173919168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173920566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173926669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173926942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173928627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173932001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173933179 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173933377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173933401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173934038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173952084 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173952253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173954395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173956503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173956614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173957872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173958586 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 173958997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173959734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173960101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173961311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173961559 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173961991 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 173963482 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 173963496 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 173963993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173964033 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173964053 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 173964072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173964236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173964261 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173964580 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173964598 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 173964746 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 173964771 G A Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 173965057 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173965289 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 173967125 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 173968225 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 173969391 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173969497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173970821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173972505 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173973191 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173974343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173976429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173976871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173977176 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 173977337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173978020 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173978769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173979107 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 173980186 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173980252 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 173981514 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173981518 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173982467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173983191 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173984034 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 173984322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173984337 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173984345 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173984387 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173984438 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173984451 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173984570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173984624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173984994 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 173985023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173986008 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173986780 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 173986872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173986904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173986993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173987227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173987246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173987438 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 173987449 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 173987646 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 173987729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173987986 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 173988073 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 173988271 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 173988283 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 173988339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173990045 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 173990520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173990708 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 173992365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 173993082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173993153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173993495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173993938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173994212 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173994776 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 173994912 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 173995051 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 173995138 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173995224 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 173995580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173995847 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 173995864 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 2 173995896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173995949 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 173996010 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 173996189 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 173996270 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 173996330 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 173996335 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 173996449 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 173996485 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 2 173996643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173996683 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 173996789 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 173996806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173996961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173997099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173997157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173997212 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173997312 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 173997348 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 173997369 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 173997491 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 173997681 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 173997700 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 173998189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173998506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 173998832 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 173999058 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 173999158 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174001272 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174001446 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 2 174001497 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174001511 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 174001615 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 174001631 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 174001697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174001704 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174001737 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174001768 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 2 174001813 G C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 174001823 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 174001872 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174002079 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 174002122 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174002265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174002325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174002345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174002361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174002419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174005558 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 174006203 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174007894 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174008040 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 174008294 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 174008337 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 174008464 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 174009205 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174009294 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174009326 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174009337 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 174009366 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174009458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174009541 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174009683 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 174009732 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 174009792 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 174009828 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174009830 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174009872 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174009930 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 174009940 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 174009969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174010120 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174011386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174011408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174012223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174012278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174012287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174012505 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174012586 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174012622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174012735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174012746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174012806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174012844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174012888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174013363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174013532 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174013760 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174013764 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174014279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174014281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174014999 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 174015100 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174015103 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 174015299 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174015488 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 174015986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174016556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174018145 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174018412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174018704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174019086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174019802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174022566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174022997 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 174024735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174024845 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 174027134 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 174027185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174027371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174027942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174028380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174028528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174029468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174029677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174029688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174030521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174032032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174032997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174034710 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174035172 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174036793 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 174039163 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 174039273 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 174039401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174039427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174039797 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 174040130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174040449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174041658 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 174042062 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 174042108 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 174043650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174044927 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174045863 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 174045905 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 174047885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174048070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174048572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174049037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174049114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174050028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174050905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174051786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174053047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174054068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174054226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174055555 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174056540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174056575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174056801 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174056954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174058168 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174058596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174059456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174059566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174061263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174061572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174068028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174069490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174071713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174072445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174072696 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174072992 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 174073561 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 174076411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174077200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174078687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174080624 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174084180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174085439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174086309 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174087528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174088027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174088361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174088609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174089075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174089683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174089691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174090038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174090414 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174091195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174091421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174092089 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174092624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174092797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174093352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174094144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174094428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174095266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174096272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174097596 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 174098713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174099061 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174099101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174099394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174101744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174103570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174105986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174106025 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174107316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174113382 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 174121730 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174131109 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174131735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174135312 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174136842 C G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 2 174136902 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 2 174140275 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 174141445 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174142236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174142316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174142329 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 174142387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174143476 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 174143527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174143865 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 174143985 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174144848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174144911 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174145075 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174145085 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 174145155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174145354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174146454 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174147858 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174148250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174150452 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174160377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174160561 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174160779 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174161866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174163852 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174165012 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174166052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174171504 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174172459 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174172627 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174172704 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174173630 C G Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 2 174173678 C A Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 2 174173882 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 174175375 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174178180 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174178265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174180542 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174180809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174181065 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174181231 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174181464 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174181523 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174181811 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174181817 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 174181981 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 174183632 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174184607 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 174185090 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174185181 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174185365 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174185398 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174186416 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174186463 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174187541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174187593 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 174187617 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174187860 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174189851 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174189898 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174189981 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174190017 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 174190358 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 174190630 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174190681 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174191058 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 174191113 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174191149 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174191186 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174191238 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174191296 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174191414 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174191425 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174191538 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 174191601 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174191649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174191652 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174191696 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174191914 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174191934 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174191965 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174192949 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174193707 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174193978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174193995 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174194003 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174194077 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174194099 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174194109 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174194140 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174195195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174197121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174197158 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174197164 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174199959 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174201986 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 174202047 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 174203723 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174205662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174206491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174206500 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174206602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174206702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174206703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174206735 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174206885 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174207287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174207348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174207733 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174207741 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174207764 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 174207806 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 174208068 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 174208274 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 174208293 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 174208546 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 174208617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174208625 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174208820 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174208869 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174209166 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174209221 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174209287 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174209344 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174209363 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174209422 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174209514 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174209536 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174209676 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174209708 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174209918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174210034 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 174210295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174210354 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174210535 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174210541 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174210620 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174210642 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174210665 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174210777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174210824 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174210885 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174210928 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174211595 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 174211605 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 174211643 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 174211904 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174212394 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174212822 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 174214030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174214142 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174214746 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174215005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174215270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174216007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174216209 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174216274 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 174216629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174217284 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174217867 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174218364 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 174218378 G T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 174219457 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174220079 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 174220117 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174220544 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 2 174221372 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174221809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174221853 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174222179 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 174222197 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174222275 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174222295 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174222980 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174223051 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 174223095 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174223101 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 174223294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174223447 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174223499 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174223527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174223578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174223679 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 174223903 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174224027 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174224254 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174224511 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174225307 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174225484 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174225927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174226525 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174227195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174227266 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 174227349 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174227360 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174227464 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174228123 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174228177 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174228398 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 174228551 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174228682 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 174228726 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174228842 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174228909 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 174229004 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 174229022 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 174229042 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 174229055 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 174229103 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 174229294 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 174229297 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 174229313 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 174229506 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 174229507 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 174229519 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 174229538 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 174229553 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 174229560 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 174230472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174230499 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 174230595 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 174230843 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 174231138 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 174231158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174231443 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174231769 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174231777 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174231849 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174232299 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174232358 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174232386 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174232474 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 174232548 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 174232898 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174232989 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174233015 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174233063 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174233138 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174233229 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174233350 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174233524 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174234086 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174234261 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174234278 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174234467 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174234634 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174234749 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174234903 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174235077 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174235178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174235288 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174235349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174235390 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174235399 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174235569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174235948 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 174235972 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 174236141 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174236145 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174236180 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174236263 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 174236380 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174236391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174236465 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174236729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174236869 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174236952 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174237088 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 174237437 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 174237500 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174237593 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174237600 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174237644 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174237740 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174237890 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174237944 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174238003 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 174238125 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 174238286 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174238308 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174238322 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174238323 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174238342 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174238366 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174239003 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174239090 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174239518 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174239829 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174240008 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174240129 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174240165 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174240304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174240354 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174240870 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174240871 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174241055 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174241194 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174241216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174241238 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174241270 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174241445 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174241495 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 174241500 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174241658 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174241661 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174242047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174242076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174242149 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 174242240 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174242705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174242762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174242813 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174242841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174242978 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 174242981 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 174243101 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174243195 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174244011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174244221 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174244303 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 174244324 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174244751 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174245441 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174245802 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174245855 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174246204 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174246348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174246639 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174246720 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174246887 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174247116 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174248654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174248745 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174249806 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174250327 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174250436 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174250449 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174250523 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174251005 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174252973 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174254338 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174254814 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174255135 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174255158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174255399 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174256154 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174256340 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 174256646 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 174257657 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 174257675 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 174258240 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174258548 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174258823 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174258921 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174259600 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174259674 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174261869 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174262054 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174262086 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 174262893 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174263297 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174263512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174263551 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174264893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174265051 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 174265096 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 174265244 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 174265419 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174265617 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174266284 C T N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 2 174266526 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174266714 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 174266753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174266795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174267496 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 174267507 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 174268437 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174268440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174270310 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174274065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174275262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174275306 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174276740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174278523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174279187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174279228 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174279250 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 174279270 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174279271 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174279288 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174279289 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174279330 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174279462 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174279839 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174279895 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174279955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174280223 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174280267 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174281024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174281532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174281845 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174281871 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174282038 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174284132 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174284210 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174284646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174286232 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174287740 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174287901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174288018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174289825 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174290283 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174290346 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174290573 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174291575 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 174292456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174292809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174293224 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174293248 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174293378 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174294596 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174295598 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174296345 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174296912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174297006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174297301 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174297369 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174297514 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174298194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174298206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174298602 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 174298741 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 174298752 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174298797 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174298806 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174298960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174299014 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174299052 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174299100 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174299461 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174299493 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174299581 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 174299626 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 2 174299775 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 2 174299932 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 174300281 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174300365 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174300385 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174300561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174300760 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174301208 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174301374 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 174301748 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174302875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174304418 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174304472 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 174304650 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 174304833 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174305072 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174305484 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174305673 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 174305789 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 174306602 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174306735 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174306990 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174307659 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174307732 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174307771 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174307796 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174307878 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174308054 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174308067 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174308155 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174308241 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 2 174308561 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 174308679 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 174308841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174309075 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 174309112 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174309154 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 174309282 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174309383 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174309535 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 174309631 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 174309660 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 174309892 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174309974 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 174310353 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174310392 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174310821 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174311847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174312021 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174312382 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174312612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174312652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174313177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174313262 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174314120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174314388 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174316380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174316384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174317608 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 174317657 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174318867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174319226 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174319596 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 174319785 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 174319946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174320222 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174320812 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174321648 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174321793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174322098 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174322384 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174322625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174323068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174323704 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 174325086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174325131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174325593 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174327201 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174327840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174328157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174328860 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174330869 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174331032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174331817 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174331997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174333820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174334269 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174334697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174335030 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174335247 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174335445 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174335486 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174335516 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174335517 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174335531 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174335814 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174335840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174336107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174336165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174337429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174337432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174337443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174337492 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174337500 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174337514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174337639 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 174337741 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 174338774 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174338855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174338858 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174339673 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174339984 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 2 174340772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174341407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174342231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174342262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174342971 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174342974 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174343000 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174343448 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174343636 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 174343741 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174343791 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174343831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174343886 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174343909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174344073 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174344228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174344433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174344997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174348620 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174349167 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174350087 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174351285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174351301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174351427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174351523 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174351652 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174351730 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174351804 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174352955 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 174353301 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 174354439 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174354491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174354513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174354617 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174354675 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 174354683 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 174354699 T A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 2 174355700 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174355779 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174355860 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174355940 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174355996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174356024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174356052 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174359099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174359110 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 174359153 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174359207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174360538 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174361046 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174361292 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174361309 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174361461 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174361528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174361582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174361602 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174363806 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174364914 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174364965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174365298 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 174365977 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174366170 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 174366179 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 174366199 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 174366310 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174366351 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 174366789 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 174367163 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174367186 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 174367405 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174367429 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174367723 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174367852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174367950 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174367958 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174368011 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174368028 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174368039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174368046 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174368055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174368062 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174368137 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174368305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174368320 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174368331 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174368375 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174368425 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174369105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174369224 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174370380 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174371238 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174371368 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174371677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174372252 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174373143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174373936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174375451 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174375937 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174375985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174376157 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174376413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174376578 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174377050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174377084 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174377170 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174377171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174377217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174377412 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174377534 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174377538 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174379182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174379296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174379436 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174379464 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174379492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174379547 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174379715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174379967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174380517 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174380693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174380772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174380845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174382876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174383308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174383963 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174384617 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174385375 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174385968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174386083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174388755 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174389395 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174392479 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174393226 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174394903 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174395397 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174396866 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174397500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174399050 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 174399054 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 2 174399248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174399249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174399330 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174399682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174399965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174400072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174401159 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174401181 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174401700 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174402946 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174403089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174403177 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174404009 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174404129 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174404188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174404687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174404781 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 174405722 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174405905 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174405929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174407796 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174407828 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174409577 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 174410042 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174410053 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174411597 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174411995 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174412639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174414888 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 174414911 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174415788 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174415920 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174415985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174416698 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 174419824 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174419854 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174422797 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174423434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174423599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174426603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174429437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174431318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174432623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174433188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174433437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174433473 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174433513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174433650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174434343 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174434541 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174434627 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174434823 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174435095 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174435366 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174436034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174437468 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174437512 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174437562 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174437752 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174437754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174437810 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174437886 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174438106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174438130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174438180 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174438192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174438199 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174438275 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174438535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174438756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174438764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174438889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174438910 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174439038 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174439536 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174439551 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174439651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174439840 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174440040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174440601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174440608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174440858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174440893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174440916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174441241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174441326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174441343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174441397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174441410 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174441934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174441998 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174442347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174442350 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174442713 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 174442721 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 174442749 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 174443032 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 174443154 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174443207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174443225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174443260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174443446 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174443459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174443561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174443620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174444050 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174444082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174444470 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 174445894 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174447014 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174447118 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174447178 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174447203 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174447305 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174447800 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174447810 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174448640 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174448656 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174448735 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174448757 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174448766 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174448831 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174449042 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 174449579 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 174449655 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174449705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174449748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174449763 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 174449808 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174449916 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174449989 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174450138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174450151 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174450238 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174450323 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174450400 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174450585 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 2 174450612 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174450842 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174450877 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174450885 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 174451067 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174451160 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174451200 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174451268 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174451900 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 174451967 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174452015 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 174452245 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174452349 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174452531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174452562 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174453093 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174453107 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174453251 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174453267 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174453352 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174453355 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174453369 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174453382 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174453717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174453847 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174454408 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174454526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174454590 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174454671 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174455244 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 174455252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174455392 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 174455501 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 2 174458095 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174459312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174465142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174465278 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174466446 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174466835 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174466888 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174467031 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174467322 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174469700 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174469762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174471090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174471305 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174474018 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 174474853 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 174475608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174476661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174477455 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174477488 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174477522 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174477622 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174477758 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174477813 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174477864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174477925 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174477943 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 174478112 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174478351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174478369 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174479819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174483343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174484237 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 174485587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174485698 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174486211 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174486749 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 174486778 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 174486869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174488090 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174488377 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174488664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174488850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174488939 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174490087 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174490178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174491014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174491295 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174491685 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 174491741 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174493043 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174493210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174493230 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174493303 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174493306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174493972 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174494252 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174495561 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 174496482 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174496827 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174497125 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 174497237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174497410 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174497583 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174498157 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174501154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174501467 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174501732 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 174502667 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174505733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174505734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174508215 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 174508861 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 174508873 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174509138 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174509168 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 174509246 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174509249 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174509257 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174509277 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174509292 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174509325 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174511596 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 174511789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174512147 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174513167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174514628 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174515398 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174515579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174516024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174516851 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174517392 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174517563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174517627 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174517720 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 174519082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174521340 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174521758 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174521761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174521859 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174525350 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174525689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174525705 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 174527553 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174528264 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 174530241 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 174530978 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174531442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174531908 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174534056 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174536738 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174537992 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174538293 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174539280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174539887 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174542597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174542948 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174544452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174544463 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174544507 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174545089 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174546395 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174546413 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 174546654 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174546655 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174546685 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 174547124 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174547169 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 174547340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174548030 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174549366 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174549649 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 174549940 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174551473 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174551660 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 174551750 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174551793 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174551837 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 174551843 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174552037 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 174552177 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174552272 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174552383 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 174552531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174552599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174552600 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174552628 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174553364 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174555059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174555090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174555437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174556200 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174556809 A G Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0 0.9375 0.0625 15 17 0 15 1 2 174558066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174558215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174558256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174558325 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174558347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174558444 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174558528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174558543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174558555 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174558556 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174558826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174559032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174559064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174559143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174559504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174559579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174559892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174560806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174560884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174561378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174561520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174563265 C G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 174565786 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174566138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174568462 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174570208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174570213 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174570221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174570241 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174570488 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174570500 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174570544 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174570602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174570749 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174571029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174571237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174571259 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174571449 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174571924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174573493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174573521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174574834 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174575074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174575220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174575222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174575578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174575763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174576380 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174576602 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174577798 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174578011 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174578204 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174580625 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174581401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174581565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174582361 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 174582805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174582910 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174582939 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174583136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174583689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174585104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174585427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174585584 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174585609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174585628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174585750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174585836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174585848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174586772 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174587041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174587925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174587946 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174587962 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174588326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174588679 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174589418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174589818 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174592747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174593214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174593370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174593380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174593859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174596015 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174596578 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 174598230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174598998 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174600454 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 174601241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174601319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174601332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174603964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174605164 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174605241 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174606076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174606080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174606119 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174606738 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174606743 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174606824 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 174606829 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 174606964 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174606965 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174607022 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174607219 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174607257 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174607700 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174607907 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174607929 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174607948 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174608018 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174608029 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 174608035 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 174608232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174608342 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174608430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174608494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174608727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174608812 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174609283 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174609298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174609299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174609456 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174609785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174610177 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174610185 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174610715 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174611048 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174611129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174611650 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174611652 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174611688 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174613087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174613093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174613098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174613542 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174614087 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174614284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174614759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174614964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174615107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174615151 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174615181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174615367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174615378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174615532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174615539 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174615569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174615860 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174615861 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174615893 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 174616277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174616413 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174616635 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174617361 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 174617405 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174617476 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 174617557 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174617611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174617658 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 174617813 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174618514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174618541 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174618860 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174618921 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174619067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174619230 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174621547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174623292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174627068 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174629722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174630400 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174631299 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174631427 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174631461 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174633151 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174633460 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174635932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174636940 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 174636949 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174637471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174637514 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174639891 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 174640086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174640908 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174641743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174642326 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174642360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174644207 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174644251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174644423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174647471 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174648044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174648486 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174649201 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174650184 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174650361 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174650986 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174651049 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174651276 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174651534 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174651785 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174653844 T G Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 174653924 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174654482 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 174655141 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174655162 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174656315 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 174657018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174657625 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174657797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174658334 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174658338 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174658349 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174658377 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174658409 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174658440 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174658447 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174658869 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174658889 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174659021 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 174659237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174659606 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174659884 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174660238 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174660307 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174660375 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174660526 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174660564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174660780 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174660998 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174662301 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174663278 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174663856 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174663984 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174664145 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174664197 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174665476 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 174665531 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174665692 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 174665709 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 174665964 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174666137 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174666771 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174667046 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174667234 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174668493 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174668551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174669220 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174669620 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174670330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174671573 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174671829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174672623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174672680 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174672869 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174672959 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174673078 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 174673081 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 174673119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174673130 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174673154 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174673462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174673464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174675606 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174676238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174677012 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 174677209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174677468 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174678152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174678184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174678212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174678247 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174678858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174679154 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174679306 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174679511 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174680475 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174680541 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174680548 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174680641 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174680645 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174680838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174681184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174682193 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 174683143 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 174685538 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 174686156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174688636 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 174689452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174689465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174689739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174690273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174690998 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174691029 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 174691234 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 174699200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174699772 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 174700998 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174701063 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174701089 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174701316 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 174701317 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174701959 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 174703642 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174703649 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 174705018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174705054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174707888 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174708320 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 174715752 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174719738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174720232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174720396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174722020 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 174723508 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174724699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174724852 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 174724868 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174724991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174725049 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174725573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174725967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174725995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174726044 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 174726063 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174726260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174726352 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 174726623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174726664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174726668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174726740 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174726745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174729352 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174729425 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174729700 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174729714 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174729726 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174729832 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174730025 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174730284 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 174730302 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 174731110 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 174731394 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 174731405 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174731407 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174732193 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174732460 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 174732703 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 174732759 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 174732983 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174733029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174733063 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174733094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174735103 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 174735264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174735930 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174735960 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 174737454 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174737756 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 174737767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 174737810 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 174740065 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174740837 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 174740866 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 174740964 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 174740971 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 174741259 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 174742230 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 174742358 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 174742516 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 174742572 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 174742660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174742715 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 174742851 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 174742859 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 174745508 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 174745763 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174745960 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174745972 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 174746104 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 174746310 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174746358 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 174746444 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 174746962 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 174747053 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 174748837 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174748919 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174748932 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174748940 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174748984 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174749103 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174749286 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174749461 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 174749618 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174749719 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174750402 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174750431 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174750846 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174751448 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174751570 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 174751692 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 174751743 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 2 174752237 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174752434 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174753491 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 174753499 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174753683 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174753757 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 174754141 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174754311 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 174754315 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 174754409 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 174754607 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174755116 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174755843 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174756631 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 174757185 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174757399 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174758277 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174758778 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174759622 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 174760518 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 174760933 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 174761462 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 174762295 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174762347 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174762529 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174762777 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174763091 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 174763170 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174763194 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174763209 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174763221 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174763306 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 174763561 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174763600 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174763601 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174763734 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174763796 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174763812 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174763813 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174763988 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174764375 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174764397 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174764408 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174764467 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174764693 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 174764703 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 174764737 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174764783 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174764866 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174765847 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174766076 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174766115 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174766216 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174766358 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174766486 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174766614 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174766762 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174767025 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174767123 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174767131 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174767234 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174767850 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174769107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174769112 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174769184 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174769216 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174770699 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174771507 C T Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 174771532 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 174772411 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 174772724 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 174773054 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 174773082 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 174773322 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174773846 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 174774058 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 174774201 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 174774468 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174774476 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174774891 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174775225 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174775840 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 174776006 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 174776105 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 2 174776773 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174776860 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174776887 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 174776926 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174777028 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 174777742 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174778334 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 174778462 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174778476 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174778500 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174778887 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 174779176 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 2 174779230 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 174779425 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174779726 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174779854 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 174779946 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 174780012 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 174780062 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174780063 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174780257 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174780266 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174780295 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174780374 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174780426 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 174780459 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174780593 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174780621 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 174780858 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174780908 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 174780918 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174780925 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174780949 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 2 174781221 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174781258 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 174781278 A C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 174781293 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174781378 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 174781401 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174781403 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174781422 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174781549 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174781647 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 174782230 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 174782304 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 174783057 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 174783239 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 174783443 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174783530 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174783656 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 174783692 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 174783757 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174783784 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174784379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 174784398 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174784513 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174784514 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174784677 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174784705 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 174784724 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 174784789 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174784820 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174784840 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 174785060 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174785127 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 174785234 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 174785388 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174785452 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 174785603 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 174785712 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174785938 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174786038 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174786059 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174786189 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174786270 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 174786374 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 174786572 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 174786935 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 174787277 A G Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 174845469 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 174845506 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 2 174846554 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 174848654 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 2 174854742 G A Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 2 174871178 C T Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 2 174871218 A G Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 2 174879047 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 174879320 C T Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 2 174879351 C T Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 2 174879859 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 2 174880955 C G N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 11 9 2 7 1 2 174881705 C T Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 2 174884056 T A Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 2 174885900 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 174887455 C G Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 2 174887463 T G Y N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 2 174888925 G A Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 2 174888931 C G Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 2 174890124 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 2 174890550 G T Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 2 174890696 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 2 174890743 T C Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 2 174890932 C G Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 174890947 C A Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 174891010 C G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 2 174891183 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 174891189 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 2 174891203 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 2 174891216 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 2 174891217 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 2 174891244 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 174891248 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 174891347 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 174891491 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 174891504 G T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 174891552 A G Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 174891555 G T Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 2 174891661 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 174891714 A T Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 174891734 C G Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 174891781 G A Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 174891793 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 174891805 G T Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 2 174948960 C A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 174975497 C A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 174975568 G A Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 176550949 C A Y N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 9 9 1 7 1 2 176834281 A G Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 2 176866651 A G Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 2 176866663 C T Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 176866718 A T Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 176866753 C T Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 176866953 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 176866961 A G Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 176866982 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 2 176867099 C T Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 176867112 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 2 176867137 A T Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 2 176867152 A T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 176867297 T A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 176867489 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 176869397 T G Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 2 176869428 A C Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 176870963 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 2 176871565 A C Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 2 176871721 T A Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 2 176871783 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 176874443 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 176874640 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 176874693 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 2 176874695 G T Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 176875214 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 2 176876564 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 2 176877881 A C Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 2 176878114 A G Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 2 176878364 T A Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 2 176878735 A G Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 2 176878947 A G Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 2 176879199 A T Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 176879271 G T Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 2 176886472 A C Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 2 176886549 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 176897043 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 176901139 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 2 176905831 A G Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 2 176906519 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 176908606 C A Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 176911217 T G Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 176911225 A G Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 2 176911242 T G Y N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 176911376 A G Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 2 176912541 G C Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 176912615 C T Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 2 176912761 T C Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 2 176912773 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 2 176914207 G C Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 2 176915437 T C Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 176915448 T G Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 176915459 G A Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 176996139 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 176996215 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 176998219 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 176998228 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 2 176998248 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 177080592 T G Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 2 177089229 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 177089235 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 177090947 A G Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 2 177098380 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 177098577 T G N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 2 177098605 G T Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 177141145 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 177234193 A G Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 177238613 A G Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 2 177373347 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 177373464 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 177509722 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 177572257 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177584631 G C N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 2 177584701 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 177584714 A C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 2 177587861 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 2 177669572 G C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 177672840 T C Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 177672851 A G Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 2 177675112 C T Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 177675116 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 177675123 G T Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 177675129 A C Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 2 177675179 T A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 177675181 A C Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 2 177679118 T C Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 2 177705212 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 177706107 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 177708396 T G Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 177708405 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 177708505 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 177708519 T C Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 2 177708526 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 177708567 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 177711148 C A Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 2 177711348 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 177714408 C T Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 177714567 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 177714591 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 2 177716448 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 177716460 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 177719925 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 2 177722314 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 177728491 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 177729357 T C Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 2 177732605 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 177732678 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 177732679 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 2 177732933 A C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 2 177742414 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 2 177742646 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 2 177746422 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 177746423 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 177748552 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 177748625 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 177763305 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 177766114 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 177770102 T C Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 2 177774173 A T Y N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 2 177774184 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 2 177775080 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 177783697 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 2 177783712 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 177783727 T G Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 2 177783738 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 2 177786419 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 2 177786447 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 177786456 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 2 177788526 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 177789497 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 2 177789507 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 2 177789509 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 2 177789719 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 2 177791574 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 177794966 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 2 177819441 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 177819791 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 177819909 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 177820453 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 177820495 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 177821187 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177821730 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 177822146 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 177822509 G C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 2 177823491 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 177823756 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 2 177824674 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177824813 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177825348 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 177825790 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 177827318 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 177828034 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 177828045 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 177828871 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 177828894 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 177829155 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 177829175 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 177829224 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 177829427 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177830401 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 177831727 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 177831790 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 177833307 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177833410 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 177833507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177833905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177834069 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177834283 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177834418 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 177835002 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 177836649 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177836650 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177836833 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177836841 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177837599 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177837767 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177837819 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 177838150 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177838267 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177838915 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177839317 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177839332 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177839510 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 177839615 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 2 177839828 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 177840251 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177840499 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177841038 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 177841184 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 177841186 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 177841220 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177841237 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177841306 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 177841340 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 177841360 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 177841439 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 177841658 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 177841687 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 177841688 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 177842139 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177842444 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 2 177842538 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 177842539 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 177842576 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177843274 A T Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 2 177844860 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 177844982 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 177845600 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177846151 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 177847297 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 177847320 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 177847583 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 177848133 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 177848644 C G N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.454545454545455 11 11 5 1 5 2 177848879 T C N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 2 177851137 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 177852141 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 177852243 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 177852398 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177852415 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177852601 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 177852716 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177852930 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 177853041 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 177853584 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 177853979 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177854028 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177854045 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177854607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177855748 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 177855887 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 177855919 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 177856217 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 177856300 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 177856486 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 177856584 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 177856598 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 177856627 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 177857024 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177857788 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 177857841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177857954 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 177857999 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 177858151 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 177858242 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 177858306 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 177858348 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177858441 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177860427 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 177860821 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 177863651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177864290 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 177866032 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177866424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177867352 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 177867935 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177867940 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177870592 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177871291 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 177874795 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 177874933 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 177875009 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 177875017 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 177875041 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177875165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 177875447 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 177875503 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 177875668 C T N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 2 177876137 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 177876497 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 177879809 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 177881261 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 177883689 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177883719 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177884487 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 177886542 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 177887944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177888050 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 177888530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177891108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177891333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177891544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177891975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 177893126 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 177893453 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177894188 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 177894225 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 177894798 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 177894868 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 177894909 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177895155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177895171 A T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 177895219 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 177895236 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 177895610 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177895648 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177895656 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 177895776 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 177895852 G T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 2 177896117 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 177896213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177896611 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177896987 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 177897330 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 177897331 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177897415 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 177897760 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177898106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177898683 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 177899531 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 177899742 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177900463 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177900479 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177900542 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177900553 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177901002 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 177901160 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 177901238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177902095 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 177902338 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 177902656 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177903035 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177903079 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177903428 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 177903524 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 177903659 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 177903791 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 177903979 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 177903990 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 177903992 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 177904055 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 177904085 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177904102 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177904139 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177904142 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177904154 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 177904206 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177904225 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177904250 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177904267 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177904498 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177904716 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 177904766 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 177904848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177904954 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 177905533 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 177905729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177906204 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 177906225 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 177906276 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 177906852 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 177907036 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177907177 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177907212 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 177907217 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 177907343 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177907554 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177908343 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 177908510 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 177908747 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177908875 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177908881 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177909011 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 177909017 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177909022 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177909051 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177909114 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 177909152 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177909455 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177909526 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177909551 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 177909854 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 177910018 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 177910131 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 177910145 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 177910148 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 177910285 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 177910341 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177910969 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 177911028 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 177911050 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 177911101 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177911121 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 177911190 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177911268 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 177911358 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 2 177911379 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 177911444 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 177911565 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 177911673 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 177911684 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 177911867 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177911885 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177911934 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177911977 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177912246 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 177912295 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177912473 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177912565 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177912636 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 177912685 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177912754 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 177912756 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177914901 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177915038 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177915763 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 177915795 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 177915947 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177916001 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 177916007 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 177916089 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177916093 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177916181 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 177916610 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 177916636 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 177916707 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177916763 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 177916816 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 177916926 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 177916947 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177916972 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177917003 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177917113 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177917208 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177917374 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 177917383 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177917465 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 177917773 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177917787 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177917818 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 177917911 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177918044 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 177918050 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177918086 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 177918093 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177918100 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177918126 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 177918134 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 177918152 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 177918225 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 177918242 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 177918538 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177918618 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 177918620 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 177918680 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177918745 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177918771 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177918990 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 177918996 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177919313 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177919393 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 177919481 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 177920411 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 177920450 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 177920634 C T N Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 2 177920765 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 177920768 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 177920844 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 177921033 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177921074 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 177921080 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 177921090 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 177921214 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 177921317 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 177921343 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 177921490 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177921491 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177921525 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177921585 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177921589 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177921665 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177921793 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 177921812 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 2 177921821 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 2 177921831 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 2 177921920 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 177921921 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 177922144 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 177922147 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 177922224 A C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 177922553 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177923229 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 177923411 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 177923449 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177923475 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 177923627 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177923786 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177923828 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 177924024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177924109 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 177924206 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177924249 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177924298 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 177924314 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 177924317 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177924536 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177924537 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177924601 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177924622 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177924641 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177924695 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177925035 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177925277 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 177925290 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 177925480 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177925538 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177925608 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177925618 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177925675 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177925706 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177925779 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 177925891 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177925914 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177925966 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 177926645 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177926750 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177926773 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177926783 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 177926793 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 177926863 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177926973 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177926979 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177926997 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177927019 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177927124 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177927257 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 177927268 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177927317 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177927811 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 177928322 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177928325 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 177928481 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177928539 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177929397 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177929473 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177929476 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177929719 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177929850 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 177929932 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 177930001 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177930049 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177930981 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177931020 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177931074 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177931108 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 177931404 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177931513 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177931880 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177931979 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 177932014 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 177932045 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 177932229 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 177932337 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177932812 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177932940 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 177933337 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177933397 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177933455 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 177933593 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 177933635 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177933659 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 177933660 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 177934363 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177934398 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 177934668 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 177934679 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177934701 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 177934756 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 177934778 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 177934780 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 177934792 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 177934795 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 177934927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177935095 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 177935138 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 177935238 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177935693 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 177935706 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 177935819 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 177935871 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 177936052 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 177936309 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177936505 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177937058 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177938309 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 177938488 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 177938503 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 177938623 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 177938641 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 177938773 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 177938871 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 177938881 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177939197 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 177939505 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 177939542 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 177940167 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 177940325 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177940718 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177940897 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177941376 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 177941387 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 177941402 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 177941438 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 177941463 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177941487 G C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 177941554 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 177941670 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 177941697 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 177941698 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 177941714 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177941726 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 177941733 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 177941747 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 177941770 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 177941786 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 177941822 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 177941979 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177942066 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 177942374 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177942439 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177942464 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177942577 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177942739 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 177942755 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 177942780 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 177942806 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 177942852 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 177942993 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177943036 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177943073 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 177943438 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 177943557 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 177943580 C G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 177943607 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177943651 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177943766 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 177943802 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 177943949 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 177943957 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 177943963 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177944144 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177944433 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 177944439 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 177944489 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 177944591 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 177944726 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 177944765 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 177944850 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 177944967 G T Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 2 177944975 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 177944996 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 177945207 C G Y N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 2 177945400 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 177945519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177947056 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177948235 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177948615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177948663 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 177948676 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 177948679 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 177948808 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177948825 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 177949020 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 177949036 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177949107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177949145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177949201 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 177949218 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177949269 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 177949433 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177949459 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177949575 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177949627 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177949630 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177949726 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 177949854 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 177949858 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 177949881 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177949932 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 177949948 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 177950428 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 177950474 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 177950642 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 177950789 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 177950826 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 177951388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177951736 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177951803 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177951815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177951833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177951866 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177951885 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177951986 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177952165 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177952242 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177952837 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177952899 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 177952913 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177953048 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177953131 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177953322 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 177953380 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177953805 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 177953855 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177953869 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177954417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177954652 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 177956287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177956416 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 177956733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177956759 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 177956975 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 177957284 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 177957514 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 177957694 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 177958324 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177958432 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 177958450 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177958631 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177958674 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 177958776 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 177959106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177959433 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 177959500 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177959509 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177959608 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 177960175 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177960359 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 177960661 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 177960741 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 177960777 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 177960792 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 177960840 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 177960852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177962244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177962399 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 177962425 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 177962607 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 177962873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 177963203 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177963427 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 177963450 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177963553 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 177963777 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177963934 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 177963989 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177964051 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177964389 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 177964497 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177964542 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 177964642 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177964696 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177964948 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177965070 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 177965387 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 177966485 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 177966596 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 177966701 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 177966829 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 177966852 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 177967041 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 177967051 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 177967094 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 177967139 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 177967140 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 177967622 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 177968059 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177968181 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177968207 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 177968274 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 177968345 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 177968380 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 177968458 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 177968726 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 177968788 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177968800 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177969592 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 177969936 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 177970120 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 177970176 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 177970265 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 177970527 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 177970709 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 177970784 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177970837 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177971037 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177971059 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177971088 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177971270 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 177971277 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 177971358 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 177971401 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177971482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177971968 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177972111 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177972124 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177972144 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177972394 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 177972424 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 177972447 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 177972448 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 177972499 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177972521 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177972705 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 177972706 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 177972773 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177972783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177972795 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 177972796 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 177972909 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177972921 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 177972944 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177973016 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 177973044 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 177973061 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 177973064 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 177973276 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 177973340 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177973349 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177973412 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 177973426 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 177973478 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177973588 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 177973589 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 177973726 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 177973900 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177973971 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177974065 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177974121 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177974140 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177974202 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177976083 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 177976297 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 177976386 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177976421 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 177977805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177977937 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 177978847 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 177979697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177980043 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 177980118 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 177980240 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 177980262 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 177980290 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 177980320 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 177980405 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 177980448 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 177980719 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 177980786 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177980904 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 177981085 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 177981135 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 177981255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177981396 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 177981465 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 177981472 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 177981484 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 177981510 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 177981614 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 177981718 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 177981959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177982164 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 177982220 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 177982247 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177982388 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177982445 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 177982631 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 177982696 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 177982708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 177982760 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177982805 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177982983 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177982990 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 177983208 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177983245 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 177983374 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177983396 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177983407 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177983415 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177983580 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 177983954 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 177984051 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 177984308 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 177984413 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 177985022 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 177985070 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 177985075 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177985090 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177985103 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177985126 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 177985142 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177985149 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177985197 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177985467 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177985590 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177985642 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 2 177985713 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 177985792 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 177987038 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 177987166 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 177987249 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177988261 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 177988766 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177988792 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 177989203 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177989292 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177989304 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177990689 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177990808 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177991517 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 177991535 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177991740 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 177992394 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 177993944 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 177993987 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 177994022 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 177994048 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 177994561 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 177994568 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 177994583 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 177994867 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 177995058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177995236 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 177995356 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177995792 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 177996425 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 177996557 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 177996667 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 177996973 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 177997196 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 177997259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 177997484 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 177997508 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 177997563 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 177997688 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 177998128 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 177998590 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 177998598 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 177998833 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 177999034 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 177999099 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 177999104 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 177999123 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178000542 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178000760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178001958 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 178001959 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 178001980 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178002004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178002040 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 178002068 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 178002072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178002214 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178002335 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178002826 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178003173 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178003223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178003452 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178003454 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178004067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178004120 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178004560 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178004824 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178006956 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178006957 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178006972 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178006988 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178006991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178007084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178007115 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178007139 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178008007 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178008709 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178008775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178008905 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 178009142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178009251 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178009294 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 178009524 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178009526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178009661 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 178009731 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178009773 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178009941 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178010054 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 178010080 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178010705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178010992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178011162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178011163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178011527 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178011897 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178011921 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 178011937 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178011976 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 178012580 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 178012632 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 178012731 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178012760 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178013266 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 178013593 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 178013734 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 178014089 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 178014102 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 178014115 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 178014117 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 2 178014147 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 178014447 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 178014502 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 2 178014515 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 178014584 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 178014635 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178014636 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178014695 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 178014728 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 178014984 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178015017 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 178015256 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178015401 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178015420 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178015465 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178015677 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178015690 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178015710 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178015830 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178015831 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178016254 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 178016303 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 178016398 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 178016796 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 178016829 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 178016850 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 178016854 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 178016904 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 178016924 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178017050 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 178017109 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178017114 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178017188 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178017214 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178017330 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 178017400 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 178017906 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 178017916 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 178017947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178017975 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 178018039 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 178018115 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 178018205 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 178018273 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 178018341 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178018445 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178019748 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 178019901 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 178019967 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178020044 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 178020193 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178020339 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 178020343 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178020488 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178020508 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178020634 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 178020764 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 178020789 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178020835 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 178020981 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 178020996 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 178021115 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 178021310 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 178021373 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 178021424 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178021795 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 178021870 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178021982 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178022014 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 178022046 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 178022151 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 178022418 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178022447 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 178022854 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178022906 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 178022940 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 178022962 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178022995 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 178023278 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 178023649 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 178023663 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 178023686 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 178023701 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178023801 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178023929 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178023930 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178023981 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 178024020 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 178024037 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 178024042 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 178024065 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 178024066 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 178024201 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 178024295 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 178025134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178025207 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178025447 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178025640 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 178025746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178025774 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178025906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178025915 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178026072 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 178026354 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 178026378 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 178026450 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178026527 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 178026528 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 178026574 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 178026631 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 178026701 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 178026768 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178026880 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 178027246 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 178027583 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 2 178027645 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 178027785 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 178027822 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 178028590 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178028630 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 178028643 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178029040 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178029364 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178029412 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178029583 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 178029595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178029660 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178029696 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 178029819 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178030079 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 2 178030304 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178030447 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 178030484 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178030504 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178030597 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 178030634 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178030745 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178030889 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 178031006 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 178031728 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 178031939 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178032013 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178032285 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 178032351 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178032986 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 178032987 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 178033895 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178033936 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178033951 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178034262 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 178034291 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 178034318 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178034518 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 178034552 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 178034672 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178034818 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178034960 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 178035030 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178035308 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178035446 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 178035473 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178035526 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 178035557 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 178036028 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 178036238 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 178036294 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178036345 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 2 178036386 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 178036441 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 178036526 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 178036656 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 178037285 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178037334 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178037463 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178037750 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178038522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178038557 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 178038684 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 178038746 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 178038810 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 178038963 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 178038979 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 178039017 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178039040 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 178039073 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 178039473 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 178039859 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178039952 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178040071 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 178040195 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 178040545 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178040589 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 178040602 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178040684 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178040768 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 2 178040822 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178040834 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178040893 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178040921 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178041106 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 178041111 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 178041133 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178041306 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 178041309 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 178041403 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 178041538 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 2 178041587 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 2 178041705 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 178041706 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178041717 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178041963 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 178042236 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 178042756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178043041 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 178043945 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 178045027 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178045063 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178045074 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 178045406 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178045450 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 2 178045454 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 178045506 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 178045519 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178045570 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 178045988 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 178046139 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 178046154 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 2 178046318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178046319 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178046330 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 178046461 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 178046509 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 178046607 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 178046908 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 178046928 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 178046971 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 178047584 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 178047601 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178047987 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 178049614 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 178049790 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178049791 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178049860 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178049932 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 178049957 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178050202 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178050249 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 178050287 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178051212 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 178051269 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178051748 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 2 178052087 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 178052381 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178052643 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178052674 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 178053143 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 178053255 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 178053818 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 178053861 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 178053904 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 178053957 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178054159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178054236 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 178054283 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 178054297 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 178054376 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 178054810 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178054992 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178055212 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 178055213 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178055395 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178055586 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 178056016 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178056056 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 178056748 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 178057758 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 178058602 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 178058647 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 178058751 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 178058803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178059776 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 178059777 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 178059808 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 178059862 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 178059970 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 178059996 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 178060092 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 178060156 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 178060217 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 178060289 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 178060433 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178060543 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 2 178060570 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 178060604 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 178060745 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 178061193 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 178061235 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178061259 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 178061399 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 178062023 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178062662 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 178062762 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 178063277 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 178063367 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178063382 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178063398 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178063549 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 178063572 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178063599 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 178063708 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178063884 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 178063928 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 178064159 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178064173 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178064201 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178064216 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178064243 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178064694 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178064839 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 2 178064991 T G Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 2 178065096 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 2 178065244 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 2 178065247 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 178065315 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 178065342 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 178065405 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 178065441 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 178065502 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 178065538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178065597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178065715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178065753 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178065761 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 178065941 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178065977 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 178066008 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178066269 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178066353 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 178066389 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178066401 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178066413 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178066434 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178066479 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178066622 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178067130 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178067139 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 178067201 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 178067295 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178067410 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178067568 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 178067741 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178067801 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 178067835 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178067896 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178067973 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 178067980 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178068081 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178068137 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178068180 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178068201 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 178068354 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 178068371 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 178068548 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178068610 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 178068910 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178068979 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 178069062 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 178069495 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 178069648 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178069817 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 178069857 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 178069941 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 178069967 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 178070000 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 178070195 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 2 178070258 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 178070342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178070348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178070809 A C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 178071037 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 178071121 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 178071251 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178071402 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178071501 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178071522 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178071540 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178071622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178072182 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 178072515 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178072641 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 178072845 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 178072870 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 178073380 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 178073603 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178073709 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178074367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178074573 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178074869 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 2 178078037 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 178078178 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 178078544 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 178078767 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 2 178078786 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 2 178078955 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 178079001 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 178079185 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 178079261 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 178079353 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 178079401 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 178079443 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 178079876 A T N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 2 178079969 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 2 178080008 A C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 178080101 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 2 178080121 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 178080196 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 178080285 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 178080395 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 178080409 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178080475 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 178080611 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 178080769 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 2 178080985 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 178081028 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178081457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178081531 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178082044 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 178082708 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178083965 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178083975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178084150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178084293 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178084612 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178085023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178085460 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 178085763 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178086847 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178086940 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 178087098 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178087149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178089656 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178089825 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 178090386 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178090590 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 178090611 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178090856 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178090983 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178091122 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178091132 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 178091185 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178091401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178091414 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178091775 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178091825 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178092641 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178092950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178093170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178093193 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178093689 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178093747 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178094068 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178094229 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178094787 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 178094862 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178094909 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 178095782 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 178095787 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 178095800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178096119 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 178096245 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 2 178096247 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 178096410 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178097099 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178097576 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178097688 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 178098421 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178099111 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 178099459 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 178099469 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178099512 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178099525 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178099570 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178099591 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178099864 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 178100008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178100118 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 178100247 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178100285 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178100310 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 178100967 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 178101225 C G Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 2 178102756 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 178102902 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 178103452 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 2 178103515 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 178103539 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 178104262 A T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 178104381 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 178104627 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 178104795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178104893 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178105168 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178105275 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 178105450 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 178105473 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178106997 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178107792 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 178107862 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 178108591 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178108594 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178108772 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 178109638 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 178109760 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178109953 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 178110090 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178111017 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 178111689 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 2 178111913 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178112016 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178112309 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178112450 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178113361 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 178114160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178114955 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 178114977 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178115175 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178115351 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178115488 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 178115886 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 178116309 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178116896 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 178117311 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 178117558 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 178117879 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178118008 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178118016 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178118485 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 178118771 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178119005 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 178120105 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178120390 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 178120527 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 178120909 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 178120986 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 178121472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178121774 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178121839 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178121867 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178121922 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178121966 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178121973 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178121992 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178121996 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178122011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178122026 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178122082 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178122149 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 178122184 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 178122805 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178123016 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 178123177 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 178123265 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178123611 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 178123631 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178123632 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178123709 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 178123802 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 178123808 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178124341 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 178125053 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178125075 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 178125076 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 178125113 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 178125279 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178125658 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 178125941 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178126059 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 178127019 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 2 178127307 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 178127710 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 178128010 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178128011 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 178128254 A C Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 2 178128453 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 178129352 A G Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 2 178129895 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 2 178130529 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 2 178130715 A G Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 178131219 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 178131360 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178131366 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 178131467 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178131730 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178132045 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178132290 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178132346 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 178132409 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178132553 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178132604 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 178132819 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178132835 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178132895 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178132992 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178133300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178133354 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178133415 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 178133818 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178133853 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 178134011 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178134014 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178134056 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178134234 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 178135034 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 178135869 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 178135987 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 2 178136069 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 178136149 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 2 178136305 C G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 2 178136503 G T Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 2 178136733 C A Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 2 178137618 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178137926 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 178138087 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 178138287 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178138651 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 2 178138733 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 178138850 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 2 178139002 T G Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 2 178139040 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 2 178139248 A T Y N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 2 178139327 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 178139568 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 178139722 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178139753 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178140116 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 178140498 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 2 178140633 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 178141427 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 178141558 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178142442 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178142779 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 178143057 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178143075 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178143155 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 178143195 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178143255 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 178143269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178143282 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 178143482 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 178143541 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 178143605 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 2 178143901 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 2 178144164 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178144300 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178144435 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178144588 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 178144661 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178144977 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178145107 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178145204 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178145288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178145301 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178145356 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178145374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178145394 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178145624 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178145793 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178145934 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 178145955 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 2 178145990 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178146123 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 178146194 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 178146349 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178146524 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 178146742 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178146835 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178146998 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 178147226 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 178147347 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178147654 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178149996 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 178150065 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 178150182 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178150410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178150697 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178150868 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 178150947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178151020 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178151289 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178151896 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178151987 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178152191 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 178153123 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 178153854 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178154659 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 2 178154840 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 178155048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178155463 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178155531 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178155863 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178155864 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178155875 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178155878 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178155924 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178155978 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178155999 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178156209 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178156316 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 178156343 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178156403 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 178156405 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178156463 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178156581 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 178156745 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 178156818 C G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 178157064 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 2 178157381 G C Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 2 178157594 G C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 178157733 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178157925 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 178157987 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178158095 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178158096 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 178158393 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 178158431 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178158450 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 178158454 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 178158483 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 178158612 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178158618 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 178158795 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178158883 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 178158912 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178158921 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 178158942 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 178158982 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178159031 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178161254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178161280 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178161331 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178161388 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178161439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178161463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178162039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178162082 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 178162089 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178162106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178162118 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178162131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178162150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178162174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178162237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178162245 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178162357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178162430 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178163170 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 178163974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178163985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178164843 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 178165136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178165266 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 178165402 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 178165412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178165435 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178165554 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178165555 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178165782 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178165791 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178165835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178165836 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178165858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178165919 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178165939 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178166490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178166568 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178166591 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 178166597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178167597 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 178167779 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 178167828 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 178167927 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 178168007 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 178168285 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 178168376 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178168476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178168863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178169522 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 178169865 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178169922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178169991 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178170583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178170810 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 178170929 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178171041 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 2 178171181 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178171862 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178172378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178173240 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178173299 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 178173329 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178173384 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178173521 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178173558 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178173582 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 178173583 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 178173763 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 178173798 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178174063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178174305 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178174510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178174852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178175125 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178175178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178175247 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178175366 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 178175547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178175602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178175625 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 2 178175832 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178176289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178176375 G C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 178176478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178176649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178176911 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178183864 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 178183936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178183993 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 2 178184055 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 178184080 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 178184190 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178184450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178184630 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178184639 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178184761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178184806 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178184814 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 178184827 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178185008 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 2 178185094 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 178185124 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 2 178185288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178185544 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 178185553 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 178185567 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178185568 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178185579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178185610 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 178185664 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178185879 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 178186010 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 178186149 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178186196 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178186203 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 178186244 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178186248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178186303 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 178186337 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178186397 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178186450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178186938 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178186982 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178186993 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178187118 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 178187268 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178187346 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178187452 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178187556 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178187750 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178187848 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178188243 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 178188406 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178188818 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 178188840 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 178188842 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 2 178188866 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 178189047 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 178189719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178190052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178190117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178190146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178190358 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178190377 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178190501 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178190602 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 178190949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178191087 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178191202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178191465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178191519 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178191556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178191565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178191834 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 178191839 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 178191881 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 178191898 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 178192052 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178192183 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 178192435 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 2 178192536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178192596 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178192637 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178193602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178193612 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178195136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178196372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178196410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178196444 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178197771 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 2 178198850 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178198976 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 178198991 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 178199103 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 178199104 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 178199349 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 178199684 C A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 178199759 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 178199795 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 178200056 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178200321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178200364 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178200422 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178200484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178200505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178200548 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178200555 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178200750 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 178201017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178201072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178201894 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178201954 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178202062 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178202127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178202342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178202457 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178202744 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 178203031 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 178203058 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178203147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178203215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178203237 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178203432 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178203573 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 178203663 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178203849 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 178203875 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 178203975 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178204819 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 178204845 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 178204989 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178204998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178205116 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178205355 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178205363 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178205497 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178205701 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178205844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178209110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178209738 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178209755 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178210056 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 178210186 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178210221 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178210807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178211700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178212667 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178212734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178213371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178213637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178216153 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178216172 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178216184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178216214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178216540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178216692 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178216745 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178216754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178217040 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178217488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178217840 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178218395 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178219660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178220343 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178220524 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 178220621 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178221272 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178221742 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 178224190 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178224306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178224357 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178224533 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 2 178224552 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 178224570 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 178224680 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 178224695 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 2 178224823 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178224949 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178224989 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178225177 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 178225181 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178225956 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178225979 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178225981 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 178226025 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 178226082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178226123 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 178226255 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178226315 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178226353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178226401 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 178226465 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178226501 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178226505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178226527 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 178226547 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178226629 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 178226643 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 178226714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178226739 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 178226786 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178226974 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178226996 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178227045 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178227135 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178227183 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178227228 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178227299 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 178227540 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 178228169 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178228422 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178228444 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178228501 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178228625 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 178228672 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178228756 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 178229307 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178229350 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178229702 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178229982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178230026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178230161 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178230296 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178230414 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178230572 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 178230690 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178230703 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178230742 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 178230813 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 178230820 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 178230836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178230894 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 178230920 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 178230950 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 178230951 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 178231728 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178231856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178231999 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178232320 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178232445 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178232609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178232641 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178232699 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178233057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178233085 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178233158 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178233227 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178233261 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178233288 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178233440 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178233468 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178234556 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178234577 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 178234582 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 178234664 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178234700 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178234717 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178234726 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178234764 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178234825 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178234913 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178235214 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178235250 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178235254 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178235344 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178235427 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178235481 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178235663 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178235742 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 178235759 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178235910 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178235919 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178235982 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178236042 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178236069 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178237764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178237799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178237818 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178238038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178238199 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 178238200 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178238228 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178238311 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 178238376 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178238496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178238581 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178238674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178239239 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 178239240 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 178239263 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178239510 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178239568 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178239585 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178239661 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178239815 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 178240495 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178240523 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178240558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178240722 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178241207 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178241290 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178241292 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178241329 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 178241344 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178241367 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178241406 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178241414 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 178241492 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178241521 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178241553 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178241750 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178241853 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178241860 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 178241929 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 178241968 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178242056 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 178242628 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 178242663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178242885 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 178242914 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 178242933 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 178243031 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178243206 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 178243494 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178243629 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178243642 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 178243702 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178243758 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178243778 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178244211 C A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 178244218 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 178244225 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 2 178244254 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 178244916 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178245152 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178245165 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178245221 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178245375 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178245411 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 178245625 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178245833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178245869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178245923 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 178246073 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178246102 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178246898 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178247051 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178247080 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178247161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178247390 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178247436 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 178247444 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 178247451 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 178247509 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178247645 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178247700 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178251636 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178252376 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178252689 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 178253130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178255556 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178256058 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178256466 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178256853 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 178257488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178257749 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178259122 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178259145 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178259171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178259179 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178259434 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 178259470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178259497 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 178259866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178259991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178259996 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178260013 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 178260027 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178261720 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178261736 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178261790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178263191 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 178264102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178264968 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178265033 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178265188 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178265334 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178265744 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178266125 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178266180 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178266193 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 178266346 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 178266394 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178266405 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 178266417 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178266419 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178266432 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 178266581 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178266598 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 178266635 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 178266889 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178267180 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178267233 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178267819 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178267879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178267911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178269312 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178271019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178272033 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 178272097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178272214 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 2 178272233 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178272531 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 2 178272614 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178272900 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178273051 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178273286 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178273454 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178273674 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178274723 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178274900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178276611 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 178276832 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178277275 A G N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 2 178277731 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 178278409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178278513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178278630 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178278693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178278852 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 178278859 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178279090 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178279137 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178279807 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178280011 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 178280056 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 178280382 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178281399 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178281481 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178281531 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178281880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178282762 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178282959 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178282975 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178283042 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178283047 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 178283077 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 178283092 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 178283152 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 178283321 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178283585 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 178283586 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 178283599 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 178284397 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178284408 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178284411 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178284465 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178284505 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 178284605 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178284645 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178284660 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 178285619 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178285666 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178285678 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 178285821 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178285836 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 178285895 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 178285986 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178286118 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 178286247 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178286715 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 2 178286742 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 178287276 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 178288239 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178288359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178288942 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178288986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178289602 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178290206 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178290405 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178292264 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178292550 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178293220 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 178293451 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 178293478 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 178293493 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 178293776 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178294604 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 178294706 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178294738 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178294751 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 178294833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178294844 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178294866 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178294961 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178295265 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 178295364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178295471 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178295518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178295549 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178296305 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178296409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178297469 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 178297693 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178297790 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178297872 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178298727 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 178298991 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178299070 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178300292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178300404 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178300421 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178300462 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178300492 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178301610 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178301812 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 178302444 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178302446 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178302455 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178302509 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178303070 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178303398 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 178303447 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 178303570 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 2 178303817 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 178304236 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 178304442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178304464 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178304550 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178305791 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178305854 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178306026 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 178306034 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178306118 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 2 178306150 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 178306236 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178306331 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178306354 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 178306533 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178306554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178306602 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178306636 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178308018 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178308136 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178308160 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 178308427 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 2 178308702 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178309478 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178309502 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178309511 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178309622 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178309633 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178309710 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178309827 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178309863 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178309870 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178309896 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178309997 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178310133 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 178310391 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178310706 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178310756 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178311501 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178311516 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178312618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178312681 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178312737 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178312771 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178312836 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178312977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178313095 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 178313210 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 178313223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178313670 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178313683 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178313700 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178313853 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 178313869 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 178313989 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 178314020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178314149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178314936 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178315633 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178315684 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178316130 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178317275 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178317326 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178317335 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178317380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178317462 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178317569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178317605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178317765 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178317792 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178317966 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 178319497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178320393 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178320514 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 2 178320861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178321281 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178321315 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178321411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178321502 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 2 178321757 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 178321927 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 178321958 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 178322095 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 178322392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178322668 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 178323016 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 178323134 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 178323180 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178323191 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178323439 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178323590 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178323628 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 178323733 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178323905 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 178324185 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178324220 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 178324253 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178324608 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178324714 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178325110 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 178325400 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178325410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178325991 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178326262 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178326332 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178326726 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 178326744 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178326778 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178327200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178328786 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178328825 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178328928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178329011 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178329089 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 178329381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178330310 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178330534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178330643 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178330760 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 178330907 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178331039 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178331222 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 2 178331304 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178334183 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178335681 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178336058 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178336195 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178336219 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178336572 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178336655 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 178336848 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178337160 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178337224 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178337228 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178337382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178337760 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 178338379 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178338411 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178338445 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178338604 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178339122 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 178339415 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178339425 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 178339455 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 178339464 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178339469 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 178339490 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178339493 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 178339512 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 178339552 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178339656 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178339657 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178339675 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 2 178339733 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178339781 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178339800 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 178339825 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178339913 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 178339927 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 178340071 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 2 178340270 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 178340289 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178340355 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178340416 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178340486 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 178340518 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178340564 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178340645 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178340651 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 178340891 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178340892 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178341171 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 178341303 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178342671 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178343015 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 178343246 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178343323 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178343608 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 178343740 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 178343759 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178343840 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 178343868 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178343934 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 178343962 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 178343978 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178344005 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178344065 G T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 2 178344192 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 178344212 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 178344306 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 178345243 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178345613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178345936 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178346038 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178346315 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178346390 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 178346436 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178346447 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178346463 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178346473 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178346552 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178346573 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 178346585 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 178346671 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 178346886 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178346892 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 178346946 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178347467 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178347482 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178347490 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178348226 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178348236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178348244 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178348432 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178348452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178349239 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 178349965 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178350824 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178350835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178350920 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178351119 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 178351460 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178351681 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 178352147 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 178352527 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178353405 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178353469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178353507 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178353668 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178354349 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178354550 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178354932 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 178356236 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 178356377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178356900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178357296 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178357341 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 2 178358085 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 178358233 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178358789 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178358817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178358958 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178359236 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 178359281 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178359828 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178359854 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178360013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178360087 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178360585 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178360663 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 178360755 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178360802 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178360875 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 178360988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178361269 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178361351 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178361758 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178361896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178361941 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178362396 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178362435 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 178362971 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178363006 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178363061 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178363069 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 178363208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178363318 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178363333 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 178363361 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178363509 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 178363585 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 178363651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178363709 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178363919 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 178364015 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178364832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178365369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178365413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178367218 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178368781 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 178369162 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178369276 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178369901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178370376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178371150 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178373266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178373383 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178373740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178374525 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178375235 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 178375236 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 178378130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178378345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178378552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178378760 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178383740 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178386069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178386370 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178387317 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178387520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178388518 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178389089 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178390175 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178391004 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178391324 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178391487 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178392051 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178392117 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178392304 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178392307 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178392530 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178393338 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178394943 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178395029 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178395166 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 178395333 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 178395524 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178395670 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178395720 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178395981 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178396177 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178396185 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178396338 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178396489 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178396499 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178396580 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 178396594 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178396614 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 178396688 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178396691 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178396743 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178396848 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178396877 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 178396894 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178397544 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178397545 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178397652 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178397720 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178397845 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178397875 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178398038 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178398327 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 178399938 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 178400397 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178400405 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178400931 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178400981 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 178400988 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178401248 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 178401250 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 178401350 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178401436 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178401554 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178401640 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178401896 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178402011 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178402175 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178402190 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178402199 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178402229 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178403909 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178405028 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178405044 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178405068 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178405267 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 178406094 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178406400 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178406639 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178406715 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178406845 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178406860 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 178406896 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178406957 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178407233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178407412 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 178407564 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178407654 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178407772 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 178408228 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178408571 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178408751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178408790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178409717 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178410148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178410151 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178410162 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178411170 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178411916 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178412182 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178412341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178412365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178413021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178414253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178415143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178415160 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178415336 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178415526 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178416993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178417181 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178417897 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178419442 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178419574 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178419656 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178419674 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178419694 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178419807 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178419831 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178420055 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178420082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178420215 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178420226 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178420917 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178421633 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178421714 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178421945 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178422010 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178422643 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 2 178422787 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178422819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178423687 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178423688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178423742 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178423953 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178424087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178425722 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178425738 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 178425769 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178426452 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178426566 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 178426607 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178426858 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178426905 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178426941 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178426956 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178426960 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178426993 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178427389 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178427862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178428047 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 178428381 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178428391 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178428638 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178428684 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178428735 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 178428736 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 178429032 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178429088 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 178429587 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178429594 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178429847 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178429878 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178429970 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178430600 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178430748 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178431058 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178431088 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178431123 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178431479 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178431792 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178431793 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178431828 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178431836 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178431842 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178431938 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178432047 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178432224 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178432361 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178432561 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178432983 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178433805 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178434056 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 178434876 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178435196 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 178435236 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 178435359 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 178435422 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 178435615 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178435709 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 178436487 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 178436632 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178436835 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178437003 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 178437047 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 178437181 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 178437205 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 178437235 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 178437442 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 178437465 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 178437519 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 178438128 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 178438466 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178438523 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178438604 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178438649 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178438684 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178438729 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178438734 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 178438761 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178438883 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 178438893 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178438900 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178439564 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178439837 T G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 178440125 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178441225 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178442995 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178443440 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178443446 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178443512 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 178443617 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178443715 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 178443954 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178444009 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 178444018 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 178444079 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178444280 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178444313 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178444758 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178444799 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178444930 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178444931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178445017 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178445036 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178445062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178445409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178445434 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 178445435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178446752 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 178447542 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178449703 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 178449714 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178449750 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 178450891 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178450967 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 178451096 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 178451118 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 178451145 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 178451212 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178451239 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178451261 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178451278 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178451288 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178451304 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178451315 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178451446 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178451501 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178451543 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178451579 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178451938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178452025 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178452560 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178452628 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178453072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178453115 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178453326 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178453340 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178453382 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178453426 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 178453580 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178453649 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178453688 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178454042 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 178454210 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 178454720 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178454737 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178454748 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178454829 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178454847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178454848 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178455376 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178455682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178455702 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 178455870 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178456054 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178456061 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178456218 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178456291 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178456346 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 178456455 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178456808 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178457050 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 178457505 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178457886 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178459572 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178462500 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178462627 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178464048 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178464328 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178465848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178468076 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178468154 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178468228 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178468281 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178468344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178468373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178468422 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178468425 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178468886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178468921 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178468973 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178468974 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178469022 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 178469065 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178469139 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178469269 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178469291 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178469323 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178469324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178469362 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178469483 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178469486 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178469566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178469626 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178469732 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178469821 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178469968 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178470045 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178470243 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178470276 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178470870 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178470902 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178470919 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471060 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471068 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471097 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471132 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178471177 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471225 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471246 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178471302 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471319 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471354 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471355 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471366 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471380 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471381 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178471435 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 178471647 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178471691 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178471813 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 178471830 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 178471910 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178472010 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178472865 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178473211 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178473264 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178474101 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178474102 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178474176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178474873 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178474949 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178474950 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178475066 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178475074 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178475097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178475110 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178475135 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178475188 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178475253 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178475312 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178475376 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178475465 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178475532 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 178475540 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 2 178475618 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 2 178475731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178475742 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178475782 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178476355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178477128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178477419 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178477810 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178478389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178478596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178478849 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178479059 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178479797 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178479984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178480081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178480233 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178480291 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178480440 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 178480997 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178481005 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178481017 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 178481018 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 178481036 C A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 2 178481048 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 2 178481049 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 2 178481059 A G N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 2 178481067 C A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 178481090 A G Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 2 178481129 C A Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 2 178481160 C A Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 2 178481191 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 178481214 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 178481227 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 2 178481257 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 178481325 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 178481342 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 178481374 T G Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 178481582 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178481636 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 178481665 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 178481946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178481979 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 2 178481984 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 178481994 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178482015 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 178482095 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178482100 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178482377 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178482601 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 2 178482602 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 178482664 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 178482713 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 178483240 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 178483873 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 178483972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178484056 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 178485030 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178485179 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 178485312 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 178485348 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 178485397 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 178485450 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 178485463 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 178485735 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 178485753 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 178486261 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178486294 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 178486885 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178486914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178488443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178489185 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178489193 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 178489227 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 178489298 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 178489901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178489939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178490979 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178492223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178492267 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 178492452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178492468 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 178492636 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178492665 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 178492855 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178492928 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178493101 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 178493111 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 178493128 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178493152 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 178493161 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178493178 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178493233 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178494167 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178494250 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178494567 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178494588 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 178494622 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178494623 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178494641 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178494715 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178494722 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178495068 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178495311 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 178495321 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 178495383 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 178495405 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 178495433 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178495435 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178495449 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178495513 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 178495532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178495590 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178495634 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 178495645 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 178495730 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 178495736 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 178495805 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178495808 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178495960 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 178496013 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 178496733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178496744 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 178496804 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 178496819 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178496905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178496935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178496997 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178497069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178497079 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178497095 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178497420 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 178497466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178497476 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 178497832 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 2 178498572 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 178498586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178498597 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178498687 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 178498795 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 2 178499207 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178499258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178499314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178499620 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 178499675 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178499677 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178500457 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178501310 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 178503209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178503291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178504082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178504237 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 178504500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178504966 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 2 178505139 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 178505695 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 2 178506983 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 178507096 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178507189 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178507232 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178507265 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 178507278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178507406 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 178507595 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 178507730 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 178508034 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178508267 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 178508344 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178508354 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178508370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178508372 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178515420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178515445 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178515589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178515716 C T Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 2 178515790 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 2 178517126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178517191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178517585 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 178518211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178518535 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178518727 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178518999 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 178519100 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 178519375 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 178519502 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178520323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178524413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178524802 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 178524863 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 178524918 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 178524981 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 178525080 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 178526214 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 178526241 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 178526493 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 178527203 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 178527325 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178527350 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 178527511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178527618 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178528082 C T Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 2 178528343 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 178528381 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 2 178528768 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 2 178528790 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 178528792 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 178528834 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 178528903 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 2 178529014 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 178529127 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 178529187 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178529511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178529560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178529693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178529722 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178529760 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 178529851 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178530058 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178530261 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178530419 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178530453 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178530481 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178530572 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178531031 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 178531571 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178531584 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 178531594 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178531689 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178531825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178532002 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 178532378 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178532438 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178532599 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 178532951 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 178532964 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 178533245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178533924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178533937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178534501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178534802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178535973 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178537128 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178537252 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178537261 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178537361 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 178537364 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 2 178537444 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178537522 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 178537598 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178537717 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 178537760 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178538063 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178538072 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178538260 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178538273 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178538280 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 178538398 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178538410 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178539079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178539087 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178539158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178539172 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178539225 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 178539360 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178539584 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178539656 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178539804 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 178539847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178540536 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178540565 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178540569 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178540628 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 178540850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178540871 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178540890 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178540986 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 178541647 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178541658 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178541695 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178541780 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 178541781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178542031 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178542905 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 178543049 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 178543229 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178543358 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178544106 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178544126 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178544332 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178544933 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 178545580 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 178545761 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 178546611 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 178547495 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 178547505 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 178547523 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 178547539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178548555 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178550680 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 178550765 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 178551026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178551033 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 178551042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178552555 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178553154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178553416 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178553549 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 2 178553759 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 178553808 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178553859 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 178553971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178553978 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 178554941 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 2 178555134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178556140 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178557756 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178557803 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 178559528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178559935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178560462 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 178560702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178560863 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178561251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178561875 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 178561904 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 178561931 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 178561957 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178561974 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178561995 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178562374 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 178562390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178562473 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 178562498 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 178562513 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 178562691 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 178562751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178562862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178562967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178563037 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 178563090 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 178563154 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178563287 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178563339 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178563367 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 178563517 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 178563868 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178563991 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178564171 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 178564213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178564359 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 178564370 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 178564419 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178565252 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 178565557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178565941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178566076 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178567340 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 178567804 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 178567815 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 178567980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178568135 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178568179 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178568394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178568572 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 178569068 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178569185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178569333 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178569344 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 178569378 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178569652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178569749 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178569751 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178569763 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 178569884 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178569926 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178570035 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 178570122 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 178570727 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178570741 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178570842 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178570854 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178570861 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 178570949 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178571223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178571352 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 178571365 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 178571419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178571477 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 178571520 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 178571695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178571738 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 178571920 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 178571975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178572514 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 178572711 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178573515 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 178573766 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 178574357 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 178574766 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 178576066 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 178576544 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 178576621 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178576638 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178576671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178576672 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178576775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178576787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178576879 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178577117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178577131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178577177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178577323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178577979 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 178578125 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 178578587 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178578755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178579063 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178579135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178579179 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178579686 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178579704 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178579766 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178579922 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 2 178580132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178580513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178580645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178581188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178581434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178581614 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178581628 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 178582401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178582425 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178582431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178582618 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178582692 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 178582786 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178583432 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 178583611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178583797 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178583850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178584185 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 178584325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178584490 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 178584507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178584568 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 178584793 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178584798 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178584810 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178584888 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 178584892 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 178584974 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178585058 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 178585061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178585091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178585156 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 178585545 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 178585968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178586353 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178586525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178586671 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 178587012 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 178587013 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178587044 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178587125 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178587418 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178587463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178590024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178591351 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178591485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178593759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178593922 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178594783 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 178595395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178596032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178597573 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178597749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178597820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178598968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178601487 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178602618 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178602645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178603581 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 178604759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178605810 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178605927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178606187 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178606202 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178606212 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178606365 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178607284 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178608957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178609130 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178609132 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178609287 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178609529 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 178612000 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178612137 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 178612983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178613017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178613039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178613086 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178613988 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178614144 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178614442 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178614685 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178615180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178615440 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178615480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178615748 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 2 178615895 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 178615989 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 178616065 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178616184 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178616322 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178616403 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178616486 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178616708 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178616755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178616820 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178616950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178617513 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178618452 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178618468 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178619301 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178619326 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178619332 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178619433 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178619451 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178619465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178619468 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178619499 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178619525 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178619625 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178619652 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178619778 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178619880 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178620242 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178620333 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178620377 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178620385 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178620395 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 2 178620412 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178620422 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178620440 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178620490 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178620510 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178620621 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178620630 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178620647 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178620665 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178620687 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178620999 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178621582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178621661 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178621700 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 178621723 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178622041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178622333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178623313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178624326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178625229 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178625319 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178625401 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178625408 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178625487 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178625521 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178625529 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178625548 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178627065 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178627068 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178627077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178627083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178627099 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178628081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178628089 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178628108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178628774 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178628977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178629117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178629310 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178629364 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178629409 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178629946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178629977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178630016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178630271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178630459 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178630594 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178631144 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178631162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178631242 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178631324 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178631327 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178631418 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178631521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178631609 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178631825 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178631936 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178631978 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178632013 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178632303 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178632333 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178632459 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178632699 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178632821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178632956 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178633162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178633223 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178633365 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178633408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178633474 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178633598 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178633675 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178633911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178633965 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 178633966 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 178634386 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178634532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178635741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178635785 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178636553 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178636587 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178637365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178637564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178638744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178639854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178642830 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178642920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178643611 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178643700 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178645847 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178646063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178646447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178647420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178648338 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178648403 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178648485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178648553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178648647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178648848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178648865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178649016 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178649069 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178649328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178649493 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178649996 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178650228 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178650235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178650548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178650568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178650569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178650593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178650886 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178651066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178653254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178653418 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178653952 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178654374 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178655229 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178657418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178657804 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178657805 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178657860 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178657996 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178658368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178658390 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178658494 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178658895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178658979 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178659099 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178659106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178659214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178659453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178659544 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178660213 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 178660307 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178660356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178660391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178660399 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178660601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178660623 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178660627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178660790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178660807 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178660862 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178660900 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178660947 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178662027 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178662047 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 178662222 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178662585 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178662609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178662775 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178663396 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178663584 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178663640 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178663812 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178664056 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178664143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178664194 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178664275 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178664450 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178664555 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178664631 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178664763 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178664872 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178664966 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178665504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178665574 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178665690 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178665740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178665833 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178665934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178666020 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178666157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178666191 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 178666248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178666308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178666534 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 178666702 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178666761 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178666928 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 178667201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178667242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178667261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178667287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178667334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178667409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178667416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178667522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178667526 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178667606 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178667665 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178668024 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178668025 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178668050 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178668244 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178668345 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178668351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178668365 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178668508 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178668509 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178668566 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178668635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178669113 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178669661 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178669716 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178669852 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178669902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178669909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178670077 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178670084 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178670169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178670284 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178670291 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178670352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178670389 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178670464 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178670490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178670550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178670749 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178670833 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 178671192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178671490 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178671583 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178671608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178671806 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178672252 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178673499 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178673580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178673614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178673808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178673924 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178673956 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178674040 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178674084 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178674184 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178674317 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178674415 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178674569 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178674587 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178674950 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178675037 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178675255 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 178675932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178675944 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178676165 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178676204 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178676733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178676945 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178677024 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178677082 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178677123 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178677148 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 178677198 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178677370 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 178677891 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178677923 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 178678586 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178678644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178679196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178679465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178679506 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178679541 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178680123 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178680156 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178680328 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178680374 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178680384 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178680428 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178680479 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178680622 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178681016 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178681046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178681154 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178681183 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178681638 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178681651 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178681656 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178681698 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178681728 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178681743 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 178682311 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178682373 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178682440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178682881 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178683055 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 178683309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178683440 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178683517 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178683718 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178684029 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178684075 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178684225 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178684306 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178684577 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178685002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178685083 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178686799 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178687607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178688350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178689548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178689986 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178690036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178690092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178690236 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178690359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178690631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178691501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178692823 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178693000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178693231 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178693308 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178693359 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178693706 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178693804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178695248 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178695510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178696334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178697223 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178697338 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178698730 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178698874 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178699040 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178699063 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178699143 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178699184 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178699335 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178699380 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178699391 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178699395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178699552 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 178699691 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178699727 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178699773 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 178699782 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178699786 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178699855 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178699904 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178699954 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178699969 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178700237 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178700311 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178700440 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178700548 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178700574 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178700600 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178700622 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178700891 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178700912 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 178701219 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178701284 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178701355 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178701920 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 178702265 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178702730 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 178702735 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 2 178702952 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178703494 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178703495 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178705008 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178705089 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178705553 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178705837 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178706120 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178706471 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178706570 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178706577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178706731 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178706849 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178707083 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178707195 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178707211 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178708068 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178708076 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178708102 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178708465 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178708677 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178708712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178708726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178708995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178709258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178709384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178709502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178709544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178709623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178709750 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178709785 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178709816 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178709895 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178709903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178709984 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178710063 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178710267 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178710283 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178710635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178710836 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178710897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178712793 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178712883 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178712933 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178713002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178713165 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178713173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178713216 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178713324 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178715958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178716733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178717023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178717334 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178717959 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 178718156 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178718423 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178718894 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178719059 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178719063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178719074 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178719120 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178719130 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178719565 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 178719834 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178719857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178720045 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178720071 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178720074 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178720341 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178720360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178721166 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 178721757 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178721917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178722048 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178722120 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178722157 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178722161 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178722263 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178722706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178722997 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178723361 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 178723450 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 178723543 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178723556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178723561 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178723854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178723909 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178723998 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178724037 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178724084 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178724104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178724110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178724207 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178724253 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178724255 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178724269 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178724286 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178724290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178724300 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178724306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178724313 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178724319 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178724341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178724350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178724419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178724420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178724453 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178724471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178724516 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178724539 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 178724564 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178724660 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178724901 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178724976 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 178725004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178725028 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 178725187 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 178725365 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178725506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178725552 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178725563 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178726371 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 178727743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178728210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178728273 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178728354 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178728364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178728620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178728622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178728639 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178728681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178728687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178728812 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178728887 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178728997 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178729049 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 178729122 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 178729755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178729762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178729779 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178729780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178729836 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178729901 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178730038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178730074 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178730257 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178730354 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178730470 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178730511 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 178731003 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 178731156 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178731199 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178731315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178731556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178732114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178732262 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 2 178732670 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 178732682 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178732973 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178733993 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178734093 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178735561 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178735633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178735705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178735881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178735894 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178735985 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178736074 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178736237 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178736298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178736392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178738438 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178738565 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178738571 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178738684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178738719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178738803 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178738871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178738949 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178739342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178739561 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 2 178739828 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 178739943 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178740017 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178740054 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178740163 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178740824 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178740985 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178741374 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 2 178741401 G C N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 2 178741452 G C N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 2 178741695 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 178741751 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 178742009 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178742183 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178742508 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178742663 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178742754 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178743071 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 178743174 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 2 178743454 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178746977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178747180 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178747286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178747303 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178747329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178747449 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178747464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178747495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178747644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178748426 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178748928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178748945 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178748949 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 178748976 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 178748977 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178749009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178749090 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178749163 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 178749486 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178749492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178749878 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178749988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178750779 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178751105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178751385 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178751523 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178751557 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178751612 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178751632 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178751928 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178753906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178754394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178754509 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178754537 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178754593 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178755136 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178755138 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178756013 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 178756352 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178756552 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 178757903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178757978 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178758214 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178758215 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178758300 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178758301 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178758313 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178758317 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178758387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178758603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178758676 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178758839 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178758996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178759228 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178759254 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178759346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178759403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178759425 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 178759426 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 178759468 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178759500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178760971 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178762694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178762998 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 178763517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178766166 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 178767056 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178767782 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 178767788 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 178767812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178768037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178768212 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178768273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178768278 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178768424 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178769098 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178773325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178774469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178774630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178775157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178775683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178775742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178775750 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 178775889 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178776213 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178776488 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178776597 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178776618 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178776810 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178776882 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178776883 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178777033 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178777052 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178777088 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178777117 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178777144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178777229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178778798 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 178778993 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178779154 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178779249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178779353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178779659 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178779756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178779812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178779947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178779997 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178780232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178781468 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 2 178781583 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178781593 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178781780 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178781795 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178781796 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178781839 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178782664 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178782735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178782802 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178783042 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178783061 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178783525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178783537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178783734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178784176 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178784345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178784499 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178785269 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178785310 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178785415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178786080 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178786130 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178786135 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178786285 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178786537 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178786636 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178787643 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178791077 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178791316 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178791346 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178791833 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178791853 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178791987 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178792008 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178792086 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178792164 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178794818 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178796861 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178796872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178796882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178796935 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 178796946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178796973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178797506 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178797588 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178798154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178799151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178799452 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178799511 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178799655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178800947 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 178801177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178803296 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178804306 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178804433 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178804528 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178804670 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178804690 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178806480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178806518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178806687 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178806689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178806736 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178806881 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178806914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178807025 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178807448 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178807547 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178807574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178808238 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178808437 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178808450 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178808790 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178809128 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178809585 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178809711 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178809834 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178809855 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178809951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178810944 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178811217 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178811371 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178811420 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178811448 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178811518 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178811564 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178811582 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178811617 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178811763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178811873 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178812056 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178812302 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178812642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178812764 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178813081 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178813125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178813170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178813214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178813217 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178813303 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178813323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178813441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178813795 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178813968 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178813979 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178814125 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178814931 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178814948 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178814955 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178815005 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178815094 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178815121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178815476 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178815805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178815824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178816047 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178816074 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178816452 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178816699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178817049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178817852 T G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 178818151 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 2 178819839 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178820045 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178820347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178820448 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178820482 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178820485 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 178820624 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 178821571 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178822971 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178823086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178823404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178823486 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178824304 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178824410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178824563 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0 0.9375 0.0625 15 17 0 15 1 2 178825183 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178825485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178825558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178825623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178826271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178827066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178827303 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178827825 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178829358 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178829392 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178830705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178832865 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178832908 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178833108 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178833153 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178833277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178833381 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178833447 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178833487 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178833552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178833586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178833604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178833719 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178833796 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178833944 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178833955 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178834247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178834276 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178834430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178834592 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178834601 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178834616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178834638 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178834990 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178835077 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178835235 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178835487 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178835773 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178835799 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178835915 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178835946 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 178836028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178836293 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178837068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178837100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178837354 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178838494 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178838636 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178838644 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178838856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178838954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178839025 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178839094 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178839185 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 178839671 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 178840572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178842172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178842173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178842303 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 178842384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178842490 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178842718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178842829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178842867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178843190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178843353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178843652 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178843758 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178843779 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178843826 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178843858 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178843942 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178844052 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178844145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178844421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178844693 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178845072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178845101 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178845204 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178845272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178845306 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178845322 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178845343 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178845344 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178845535 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178845871 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178845983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178846395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178846908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178847540 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 2 178848815 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178849296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178850043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178850573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178852954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178853419 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178853518 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178853609 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178853794 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178854202 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178854243 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178855095 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178855323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178855326 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178855346 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178855652 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178856216 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178856709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178856812 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178858364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178858550 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 178859516 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 178860677 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 178860709 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 178860773 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178861356 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178861408 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178861543 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178861546 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178861850 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178861856 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178861882 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178861888 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178861898 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178861959 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178862225 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178862269 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178862293 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 178862325 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178862350 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 178862549 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178862677 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178862738 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178862770 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 178862812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178862823 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178863079 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178863080 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178863968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178864072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178864102 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178864463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178864498 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178864560 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178865798 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 178865919 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178866028 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178866466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178866675 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178866722 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178866822 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178867212 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178867228 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178867234 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178867242 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178867440 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178867657 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178867774 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178867816 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178867860 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178867871 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178867875 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178867885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178867987 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178867997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178868012 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178868021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178868067 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178868094 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178868246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178868252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178868647 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178868754 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178868868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178869063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178869494 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178870005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178870018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178870057 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178870081 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178870082 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178870221 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178870243 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178870298 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178870453 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178870464 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178870530 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178870817 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178871434 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178872749 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178874175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178878737 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 178878753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178880118 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 178880357 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178881052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178882139 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178882415 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178882673 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178883016 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178883570 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178883885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178885405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178885432 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178885562 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178886046 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178887065 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178887157 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 178887241 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178887278 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 178888229 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 178888268 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178888275 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178888510 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178888846 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178889028 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 178889052 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178889352 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 178889369 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178890892 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 178891244 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 178891730 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178892424 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178892511 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178892629 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178892934 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178895187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178895641 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178895869 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178896004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178897778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178897930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178899532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178900652 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178900696 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178901081 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178901330 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178902045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178902886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178902939 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178903990 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178905124 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178905202 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178907393 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178907437 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178907617 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178907692 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 178907878 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178907916 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178908127 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178908170 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 178908322 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178908555 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178908986 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 178909013 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 178909043 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178909313 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178909814 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 178909935 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 178910090 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178910238 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178910521 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178910633 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178910657 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178910701 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178910725 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178910753 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178910801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178911074 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178911107 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178911444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178913698 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 2 178914349 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178914444 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178914518 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178914531 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178914709 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178914846 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178914892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178914907 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178915240 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178915348 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178915408 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178915470 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178916052 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178916547 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178917854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178917989 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178919125 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178919143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178920009 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178920167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178920546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178921179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178923959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178924748 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178924999 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178925448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178925451 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178925510 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178926457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178926992 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178927624 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178928136 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178928161 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178928173 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178928240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178928299 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178928322 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178928323 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178928366 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178928393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178928450 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178928534 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178928592 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178928601 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178928652 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178928677 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 178928875 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178928892 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178929051 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178929354 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178929446 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178929558 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178929694 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 178929695 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 178929735 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178929799 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178930089 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178930194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178930287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178930365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178930609 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178930610 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178930620 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 178930756 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178932506 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178932522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178932797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178933557 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 178934412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178934856 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178934917 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178935531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178935644 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178935973 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178936563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178936568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178936693 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178936848 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178936930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178937644 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178937711 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178937854 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178937901 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178938012 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178938040 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178938081 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178938210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178938227 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178938376 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178938377 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178938680 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178939160 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178939516 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178939629 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178939710 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178939895 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178940138 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178940153 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178940226 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 178940294 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178940445 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178941183 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178941196 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178941231 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178941315 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178941377 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178941498 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178941585 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178941621 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178941887 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 178942003 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178942074 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178942321 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178942362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178942429 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178942923 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178942943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178942961 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178943380 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178943527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178943714 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178943880 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178943899 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178943917 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178943931 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178944005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178944030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178944039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178944047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178944051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178944063 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178944094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178944411 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 178944434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178944464 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 178944559 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 178944591 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 178944600 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 178944605 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 178944633 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 178944835 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 178945536 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 2 178945969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178947090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178947382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178947996 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178948195 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178948554 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178948590 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178948602 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178948937 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178948950 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178949232 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178949237 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 178949279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178949364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178949540 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 178949635 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 178949971 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178950127 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 178950128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178950211 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 178950277 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178950350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178950399 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 178951360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178951548 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178951691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178951694 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178952165 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178952881 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178953400 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178953524 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 178953544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178953566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178953609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178953900 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178954051 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178954079 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178954169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178954248 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 178954275 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178954437 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178954934 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178955583 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 178955744 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 178955792 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178956079 C G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 178956410 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178956477 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178956782 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178956823 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178956846 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178956871 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 178956930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178957018 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178957062 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178957078 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178957188 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178957260 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 178957277 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 178957459 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178957790 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 2 178957951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178957954 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178958097 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178958315 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 178958332 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178958508 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 178958660 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178958770 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178959117 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 178959355 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 2 178959428 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 178959604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178959641 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178959885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178959935 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 178959987 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 178960143 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 178960549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178960611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178960692 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 178963416 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 2 178963418 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 178963437 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 178963444 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 2 178963480 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 178963599 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 178963694 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178963780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178963827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178963985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178964067 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178964331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178964538 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178964539 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178964604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178964883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178965077 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 2 178967278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178967682 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 178967790 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178967817 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 178967938 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 178967953 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 178967982 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 178967991 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178968253 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 178968337 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178968368 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178968693 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178968706 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178969614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178969770 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178970145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178970162 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 178970163 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178970215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178970334 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178970351 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178970352 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 178970451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178970454 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178970583 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 178970704 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178970763 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 178970823 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 178970995 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178971016 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178971033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178971036 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 178971142 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178971163 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178971169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178971209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178971224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178971453 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 178971606 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 178971721 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178971755 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 178971961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178971976 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 178972356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178972402 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 178972411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178972423 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 178972453 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 178972535 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178972570 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 178974302 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 178974310 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 178974422 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 178974566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178974786 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 178974790 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178975130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178975847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178978017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178979947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178981089 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178981572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178981994 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 178982200 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178982434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178982448 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178982469 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178982614 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178982656 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178982696 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178982714 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178982806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178982877 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178983040 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178983063 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178983075 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 178983093 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178983122 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178983230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178984944 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 178984961 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178986853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178986957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178986998 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178987043 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178987407 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178987466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178987476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178987588 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 178987666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178987710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178987809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178987819 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178987936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178987939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178987960 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178988087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178988099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178988597 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 178988598 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 178988616 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178988658 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178988705 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178988745 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178988761 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 178988788 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178989011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178989760 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178989800 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178989967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178990088 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178990158 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178990192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178990195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178992023 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178992376 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178993091 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178993471 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 178993818 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178993857 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 178994010 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178994077 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178994216 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178994306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178994322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178994612 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178994649 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178995184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 178996008 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178996825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178996827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178996840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178997131 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 178997948 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 2 178997984 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 178998093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178998897 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178998983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 178999824 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 178999866 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 178999886 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179000149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179000293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179000658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179000728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179000791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179000798 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 179000961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179001014 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179001037 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179001069 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179001085 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 179001096 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179001181 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179001187 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 179001250 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179001292 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179001327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179001363 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179001378 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179001534 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179001698 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 179001969 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 179002068 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179002231 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179002282 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 179002398 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179003198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179004068 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179004210 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179004230 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179004277 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179004322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179004388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179004669 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179004709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179004818 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179004851 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179005103 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179005231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179005362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179005521 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179005539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179005914 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 179006006 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 179006045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179006630 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 179006653 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179006785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179006816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179007048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179007387 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179007440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179007454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179007554 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 179007573 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179007600 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179007627 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179007645 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179007653 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179007723 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 179007798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179007839 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179007844 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179008041 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179008144 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179008157 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179008306 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179008568 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 179008648 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179008653 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179008733 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179009177 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179009298 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179009372 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179009452 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179009470 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179009501 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179009606 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179009630 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179009759 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179009820 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179009858 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179010042 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179010105 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179010461 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179010543 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179010785 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179010910 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 179011113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179011774 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 179012143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179012342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179012782 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179012928 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179013125 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 179014208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179014946 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 179016061 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 179017005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179017054 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179017133 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179018141 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179018147 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179018167 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179024862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179025774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179026172 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 179028121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179029971 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179031537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179037415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179038256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179038263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179038330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179038381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179038387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179038587 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179038648 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 179038823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179039365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179039454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179039892 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179039990 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179040078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179040422 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 2 179041025 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179041856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179042626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179042921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179043935 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 179044060 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 179045568 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 179045571 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179045596 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179045696 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 179046069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179046105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179046589 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179046668 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179046799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179046800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179046887 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179046959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179046970 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 179046972 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 179047404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179047476 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 179047529 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179047597 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 2 179047832 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 179047866 T A Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 2 179047902 G C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 179048163 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 179048178 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 2 179048301 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 179048647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179048853 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 2 179048904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179048989 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 179049086 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179049170 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179050010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179050384 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 2 179050433 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 179050439 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 179050447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179050629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179051007 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179051036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179051454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179051509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179051532 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179051580 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 179051649 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 179051757 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 179051758 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 179051833 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179051856 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179051865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179051880 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 2 179051896 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 179051938 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 2 179051983 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179052032 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 179052190 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179052198 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179052253 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 2 179052369 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 2 179052410 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179052617 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179052628 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 179053054 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 179053194 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179053220 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179053230 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 179053232 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179053304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179053316 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179053442 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179053461 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 179053482 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179053485 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179053523 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179053541 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 179053651 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179053696 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179053704 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179053820 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179053918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179053998 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179054075 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179054217 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179054222 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 179054232 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 179055007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179055148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179055179 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179055211 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 179055278 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179055432 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 179055492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179055520 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179055569 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179055573 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179055581 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 179055639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179055724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179056284 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179056368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179056420 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179056484 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179056549 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179056564 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179056621 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179056634 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179056675 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 179056793 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179056889 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179057540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179057608 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179057752 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 179057780 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179057811 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 179057941 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179058024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179058088 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 179058131 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179058132 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179058150 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179058200 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179058289 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179058325 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179058448 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179058769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179059078 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 179059284 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179059328 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179059357 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179059384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179059388 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179059404 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179059429 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179059442 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179059446 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179059640 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179059727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179059791 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179059871 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 179060002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179060141 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179060214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179060225 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179060243 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179060255 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179060564 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 179060822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179061102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179061138 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179061179 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179061252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179061323 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 179061881 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 179062843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179064858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179064921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179065725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179066665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179068221 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 179068592 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 179068746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179068944 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 179069149 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179069174 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179070342 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179070360 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179070361 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179070441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179070447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179070470 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179070520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179070533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179070538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179070599 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179070634 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179070711 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179070876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179071527 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 179071649 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 179071839 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179072143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179072194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179072225 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 179073006 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179073156 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 179073790 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179074254 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179074889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179075023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179076853 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179076862 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179076886 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179077011 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179077025 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179077058 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179077123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179077328 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179077342 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179077559 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179077575 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179077582 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179077590 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179077618 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179077652 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179077665 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 179077684 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179077728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179077863 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179077898 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 179077923 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179078001 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179078045 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 179078057 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 179078145 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 2 179078171 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179079064 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179079083 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179079117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179079124 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 179082250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179082323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179082521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179082586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179082708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179082813 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179082817 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179082855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179083316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179083364 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 2 179083689 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 179083708 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179083806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179083904 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 179083913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179083931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179084046 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179084109 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179084121 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179084174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179084191 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179084341 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179084357 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 179084405 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179084572 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179084991 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 179085025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179085242 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179085245 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179085840 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179085863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179086666 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179086789 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179086857 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179086889 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179087407 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179087554 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179087850 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179087893 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179088161 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 179088254 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 179088432 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 179088827 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179088855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179088959 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 179088985 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 179089488 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179089740 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 2 179089818 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 179089836 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 179090193 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179090308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179090501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179090511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179090535 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 2 179090673 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179090935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179091063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179091635 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179091913 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179092076 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 179092242 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 179092246 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 179092432 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 179092482 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179092493 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 179092718 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179093362 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179093655 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 2 179093669 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 179093680 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 2 179094148 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 179095108 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179097193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179098409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179098741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179099981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179099997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179101567 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 179103270 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 179103271 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 179103289 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 179103661 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 179104874 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 179106504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179106634 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179107834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179108667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179108691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179109616 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 179110394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179110406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179110460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179110465 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 179112780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179113002 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 179113159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179113557 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 179113579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179113671 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 179113856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179113872 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179114470 T C Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 2 179114880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179115544 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 179115948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179115992 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179116034 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179116135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179116822 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 179116838 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 179116929 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179116931 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 179117028 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 179117137 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179117802 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179118751 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 179118791 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 179118903 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 179119098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179119345 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 179120070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179120108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179120123 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179120628 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179120683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179120824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179120939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179120973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179124199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179124406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179124833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179125071 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179125592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179125624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179125712 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 179126009 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 179126249 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179126380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179126479 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179126511 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179126546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179126599 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179126638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179127654 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 179127890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179127910 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179127969 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 179128050 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179128055 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179128074 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179128741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179128764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179128802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179128974 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179129628 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179129638 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179129823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179130026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179130082 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179130962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179131183 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 179131694 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179131716 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179131925 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179131980 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179132656 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179134097 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179135537 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179137552 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179139363 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179141332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179142135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179142709 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179142955 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 179143148 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179143418 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179143575 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179143791 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179144230 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179148688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179149458 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179151155 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 179153655 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 179154303 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179155210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179155637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179159085 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179161623 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179162684 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179162828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179162900 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179163078 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179163194 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179163257 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 179163299 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179163318 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179163327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179163373 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179163463 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179163476 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179163503 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179163547 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179163619 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 179163801 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179164037 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179164080 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179164193 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179164218 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179164262 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179164372 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179164383 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179164391 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179165323 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179165398 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179165492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179165628 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179165643 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179165859 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 179165864 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179165930 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179165959 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179165981 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179166015 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179166084 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179166158 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 179166197 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 179166264 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179166283 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 179166333 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179166415 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 179166439 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179166503 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179166557 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179166570 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179166712 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179166868 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179166912 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179167574 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179167602 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 179167742 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179167755 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179167802 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179167822 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179167833 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 179167859 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179167864 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179168646 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179169401 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179169664 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179169672 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 179169711 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 179169715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179169762 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179172591 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179172756 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179173347 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179174156 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 179176540 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179177739 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179178223 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179178562 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179179934 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179180700 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 179180830 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179181936 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179182141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179183330 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179183548 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 2 179184473 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 179186544 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179186922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179187080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179187226 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 179188030 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179188077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179188294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179188594 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179188634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179189646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179190082 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179190464 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179191141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179192782 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 179193336 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179194874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179196118 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 179198019 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 179199454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179201213 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179203079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179205526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179206192 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 179207723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179208361 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 179210840 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179212607 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 179215347 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 2 179216246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179216823 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179217871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179219073 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179219140 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 179219214 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179219406 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 179223501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179225592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179226651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179227282 C T Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 2 179227495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179227498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179227554 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 179228273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179229722 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 179229824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179232526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179232728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179232803 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179232868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179232940 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179233018 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179233039 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179233124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179233186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179233693 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179234273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179235253 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179235552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179237110 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179237379 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 179238202 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 179238276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179238281 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 179238320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179238353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179242189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179242306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179243943 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179244240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179244786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179245129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179247513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179249167 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179249246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179249327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179249349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179249395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179249402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179249421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179249443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179249512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179249552 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 179249592 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 179249599 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 179249728 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 179249743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179250457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179251513 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179252766 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179254396 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 2 179255562 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 2 179255647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179256175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179256596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179257097 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 179257465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179259111 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 179259117 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 179259179 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 179259184 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179259289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179259310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179259332 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 179259746 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179260170 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179260427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179260719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179260785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179260939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179261386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179261440 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 179261464 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179262253 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179262415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179262841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179262857 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 179263033 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 179263473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179263541 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 179263608 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 179263617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179263710 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 179263871 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179263886 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179264130 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179264131 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179264522 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179264839 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179265030 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179266392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179266678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179267255 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 179267365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179268449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179268613 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 179269598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179269668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179269772 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179270515 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179270528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179270678 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179270687 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179270736 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 2 179270882 T G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 2 179271630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179271758 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179271948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179272886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179274570 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179276411 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179276413 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 179276453 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179277277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179278520 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179281690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179283996 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 179284584 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179284603 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 179284911 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 179285411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179286534 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 179286657 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179286825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179286854 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179289581 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 179289961 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179290416 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 179290441 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 179290486 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 179290487 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 179292773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179297328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179298001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179298797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179299662 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 179299886 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179300060 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179301029 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179301237 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179301276 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 179301291 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179301320 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179301382 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179301480 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179301490 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 179301649 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179301665 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179302198 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 179302388 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 179302592 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 179302860 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179302899 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 179303023 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179303354 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179303396 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179303642 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179304357 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179305380 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179306725 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179306807 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 179306947 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179306967 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 179307051 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 179307066 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 179307136 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 179307396 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 179307476 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 179307498 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 179307507 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 179307702 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 179307718 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 179307866 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179307891 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179308190 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 179308496 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 179308724 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179308861 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179309696 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179309783 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179309786 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179309832 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179309904 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179309921 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179309976 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 179310014 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 179310071 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179310140 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179310407 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 179310456 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 179311101 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179311541 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 2 179311555 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 179311598 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 2 179311636 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 2 179311659 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179311663 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 179311705 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179311723 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 179312119 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179312238 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179313682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179316978 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 179317077 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 179317442 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 179317812 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179318519 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 179320430 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179320455 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 179320918 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 179322176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179323759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179323804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179325086 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 179325126 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 179325295 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 179325309 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179325368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179325541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179325551 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 179326152 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 2 179326168 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179326279 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 179326298 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179326452 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 2 179326463 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 179326562 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 179326614 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 179326943 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179326968 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179327022 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 179327149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179327339 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 179327435 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 179327560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179327698 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179327738 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179327762 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 179327980 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179328060 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179328152 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179328215 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 179328236 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179328950 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 179329049 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179329212 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 179329817 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179330513 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 179330517 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 179330577 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179330606 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179330689 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 2 179330758 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179330788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179330865 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 179330919 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179330988 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179331048 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 179331332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179331962 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 179332035 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179332046 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 179332104 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 179332547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179332604 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 179332681 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 179332701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179333073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179333521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179333539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179333767 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179333854 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 179333916 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179334155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179334482 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 2 179336982 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 179336990 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 179337118 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179337184 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 179337306 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 179337326 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 179337356 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 179337415 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 179337570 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179337832 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179337946 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 179337952 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 179338066 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 2 179338201 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179338254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179338265 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179338993 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 2 179339147 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179339253 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 179339320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179339520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179339697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179339739 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179339766 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179339869 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 179340073 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 179340079 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 179340521 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 179340579 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 2 179340588 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 179340689 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 179340700 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179341216 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 2 179341269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179342149 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 2 179342684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179343527 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 179343806 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 179343827 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 179344182 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 179344232 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 179344342 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 179344358 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 179344542 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 179344590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179344973 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 179345376 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 179345605 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 179346017 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 179347150 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179349209 A G Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 2 179351172 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 179352408 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179353524 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179353583 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 2 179353586 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 179354367 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179354451 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 179354668 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179354731 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179355799 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179356866 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 2 179358789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179359749 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 179359812 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 179359863 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 179359917 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 179360088 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 179360115 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 179360247 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179360267 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179360272 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 2 179360286 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 179360289 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 179360539 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 179361057 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 179361058 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 179361317 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 179361439 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 179361684 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179361776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179361884 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179361951 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179362216 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179362287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179363039 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 179363073 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 179363493 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 179363540 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179363652 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 179364747 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 179365148 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 179365149 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 179365213 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 179365244 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 179365248 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 179365768 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 179365878 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 179366011 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 179366705 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 179368946 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179369256 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179369324 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179369805 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179369833 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 179369882 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179369913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179369917 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 179370514 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 179370574 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179371837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179372804 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179372866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179373056 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179374097 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 179374104 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 179374186 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179374266 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179374856 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179374896 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179375001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179375622 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 179375735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179375770 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 179375941 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 179376015 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 179376029 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 179376297 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 2 179376483 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 179376484 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 179376769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179376786 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 179376827 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 179377653 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 179378345 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179378366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179378490 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179378589 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 179378590 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 179378926 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179379290 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 179379435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179379631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179380302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179381011 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179382051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179382132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179382247 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179382279 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179382296 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179382334 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 179382805 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 2 179383211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179383273 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 179383639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179383745 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 179383820 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179383821 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 179383896 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 179384163 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179384190 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 179384223 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 179384506 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179384564 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 2 179384928 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 179385047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179385111 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179385155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179385212 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 179385341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179385709 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 179385713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179385746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179385794 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 179385838 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 179386525 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 179386601 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 179386816 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 179386844 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 2 179386965 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 179388158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179388164 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 179388284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179388778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179388781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179389097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179389122 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 179389129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179390265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179390514 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 179390521 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 179390617 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 179390895 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179391896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179392182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179393612 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179393771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179394386 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179395465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179396327 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179396505 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179398473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179400033 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179400893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179402035 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179403300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179405529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179405635 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179407975 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 179408502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179408585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179408617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179408740 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 179408855 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 179409000 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 179409011 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 179409433 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179409461 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179409537 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179409556 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 179409591 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179409635 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179409711 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 179409739 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 2 179409883 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 179410014 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 179410052 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 2 179410087 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 2 179410096 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 179410228 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179410237 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179410312 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 179410340 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179410362 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179410406 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 179410942 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179411058 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179411062 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 179411183 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 179411605 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179411908 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179412699 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 179412726 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 179412741 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179412789 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179413541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179413787 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179413824 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179415116 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179415207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179416408 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179417629 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 179418266 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179418511 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 179418858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179419078 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 2 179419377 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 179419590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179419645 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 179419690 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179419776 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 179422079 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179423733 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 2 179424569 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179425148 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 179425234 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179425334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179425424 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179426453 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 179426573 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 179426627 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 2 179426767 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 179426792 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 2 179426793 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 179426858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179427135 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 179427347 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 179427795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179427957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179427965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179428241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179428261 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179428369 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 179428492 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 179428668 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 179428673 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 179429975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179430376 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 179430398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179430488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179430489 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 2 179430556 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 179430579 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 179430583 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 179430859 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 179431059 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 179431095 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179431255 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179431589 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 179431605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179431641 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179433157 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 179435404 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 179435485 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 179435578 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 2 179435635 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 179435775 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179436052 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 2 179436190 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179436840 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 179436842 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179436859 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 179437176 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179437287 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 179437371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179437395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179437453 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179437543 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 179437550 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179437670 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179437755 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 2 179437884 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179439931 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 2 179439942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179440051 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179440070 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179440113 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179440171 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 179440423 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 179440558 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 179441225 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 179441266 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 179441926 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 179442056 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 179442070 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 179442080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179442081 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 179442795 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 179442932 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 179443110 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 179443262 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179443310 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179445779 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179445788 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179445981 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 179446092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179447028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179447269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179448178 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179448327 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 2 179448361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179448616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179448631 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179448688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179448698 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179448784 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 179448785 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 2 179448797 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 179448844 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 179448879 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 179449038 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 2 179449100 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 179449119 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 179449164 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 2 179449224 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 2 179449332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179449335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179449345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179449373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179449392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179449399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179449421 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 2 179449422 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 2 179449447 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 2 179449483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179449505 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179449583 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 2 179449584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179449614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179449639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179449991 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 179450321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179450959 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179450966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179451027 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 179452040 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 179452194 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 179452651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179453298 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 2 179453367 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 2 179453588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179454006 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179454513 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179454600 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179454623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179454758 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 2 179454831 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 179454848 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 179455312 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 179455392 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179455403 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 179456271 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179456284 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179456286 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179456295 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179456307 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 179456362 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 179456369 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 2 179456377 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179456387 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 179456405 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 179456423 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179456431 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179456528 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179456606 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179456617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179456912 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 2 179456928 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179456938 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179457062 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 179457072 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 2 179457096 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 2 179457217 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 179457292 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 179457531 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179458241 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179458396 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179458526 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179458658 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 2 179458785 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 179458849 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 179461647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179461724 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179461924 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 179461975 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 179463870 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 2 179463880 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179465227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179466501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179467849 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179469330 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 179469385 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 179469427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179478031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179480931 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179480987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179481026 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179481411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179482502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179484084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179484898 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 179485094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179485105 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179486483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179486505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179486508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179486603 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 179486705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179486996 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 179488724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179489782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179489827 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179490004 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179490062 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179491146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179491373 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179491651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179491695 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179491866 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179492004 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 179492357 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179492426 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179492478 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179492916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179493098 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 179493120 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179493425 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179493551 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179493665 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 179493666 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 179494361 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179494382 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179494456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179494489 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 179496000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179496041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179496265 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179496536 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179496740 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179496838 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179497595 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179497637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179497654 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179497685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179497699 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179497852 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179497952 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179498134 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 179498229 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179498241 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179498258 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179498262 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179498319 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 179498398 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179498462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179499127 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179499408 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 179499416 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 179499435 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 179499440 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 179500214 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179500217 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179500401 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 179500645 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 179500671 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 2 179500733 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 179500740 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 179500792 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 179500885 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 179500913 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 179501821 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179502168 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179502250 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179502304 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179502479 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179502529 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179503266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179503386 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179503415 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 179503423 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179503505 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179503547 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179503570 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 179503952 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179503990 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179507469 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179507656 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179508580 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 2 179508930 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 2 179509657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179509707 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179509825 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179509837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179509840 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179509911 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 179510000 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 2 179510042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179510048 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 2 179510076 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 179510370 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179511012 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 179511015 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179511079 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179511099 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179511226 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179511235 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 179511266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179511324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179511352 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179511447 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 179511589 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 179511613 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 179511724 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179511733 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179511852 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 179511860 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179512159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179512161 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179512228 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179512274 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 179512275 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 179512353 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179512388 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179512923 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179512947 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179513163 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179513235 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179513336 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179513429 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179513470 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179513488 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179513667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179513670 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179513822 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 179514258 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179514303 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179514313 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179514365 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 179514520 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179514643 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179514669 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179514675 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179514779 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179514833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179514837 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179514877 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179514887 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179514960 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179515497 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 179515807 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 179515846 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 179515889 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 179516396 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 179516825 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 2 179517085 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179517438 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 179517451 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 179517549 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179517751 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 179517870 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179518029 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179518041 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179518045 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179518058 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179518080 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179518185 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179518231 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179518235 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 179518271 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179518765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179518837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179518862 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179518932 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179518999 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179519127 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179519492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179519517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179519687 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179519943 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 2 179520265 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179522316 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179522317 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179523044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179523092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179523249 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179523299 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179525566 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179526213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179526281 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179526315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179526401 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179527170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179527195 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179527234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179527564 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 179527594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179527596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179527612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179527633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179527671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179528011 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179528019 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179528661 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 179528734 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 179530297 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179530298 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 179530360 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 179531013 T G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 2 179531017 G T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 2 179531206 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 2 179531363 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 2 179531441 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 2 179531465 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 179531475 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 179531625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179531693 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 2 179531719 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 179531723 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 179532344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179532643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179532882 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179533476 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 179533482 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 2 179535659 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179535788 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179535917 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179535927 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179535937 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179535972 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 179536264 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179536835 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179536861 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179536970 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 2 179537210 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 179537335 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 179537455 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179537477 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 179537486 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 2 179537547 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179537569 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179537751 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179537967 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179538744 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179539040 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179539284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179539301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179539411 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179539441 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179539800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179539921 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 179539977 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 179539994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179540017 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 179540056 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179540061 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 2 179540243 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179540966 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179540981 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179540985 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179542671 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179543820 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 2 179543856 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179544140 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 179544322 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 179544447 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 179544660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179544812 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179544830 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179544847 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179544860 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179544902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179544981 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179545077 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 2 179545117 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 179545406 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 179545460 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 179545875 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179546257 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179546564 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179546592 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179546624 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179546670 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179546913 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179547220 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 179547380 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 179547457 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 179548347 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179549157 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179549160 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179549831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179551639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179552519 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179553050 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 2 179553171 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179553182 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 179553315 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179553361 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179553364 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179553617 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179553626 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179554177 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 179554259 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179554293 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179554335 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179554877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179554988 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179555028 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 179555215 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 2 179555491 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 2 179555542 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 179555561 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 179555947 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179555992 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 179556019 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 179556154 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 2 179556385 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 179556799 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179556803 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179556844 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179556940 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179557047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179557202 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179557217 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179557383 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179557398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179557414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179557493 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 2 179557587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179557593 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179557601 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179557620 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179559772 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179559857 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179560005 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179560088 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 179560252 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 2 179560699 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 179560847 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 2 179560983 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179561450 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179561501 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 179561730 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 179561793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179561815 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 179561832 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 2 179561912 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 179562076 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179562107 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179562146 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 2 179562161 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 179562270 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179562295 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 179562332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179562713 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 179562723 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179562768 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 179562777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179562818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179563038 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179563229 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 179563679 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 179563708 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 179563773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179564351 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 179564522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179564612 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 2 179564817 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 179564941 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179564994 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 179566171 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 179566419 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 179566457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179567484 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 2 179568679 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 179569075 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 179569094 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 179569152 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 179569168 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179569448 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 179569473 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 179569475 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 179569553 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 179569554 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 2 179569669 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179569801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179570047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179570133 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 179570316 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 179570400 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 179570517 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 179570650 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179572164 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 179572706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179572751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179572771 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 179572917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179573062 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 179573285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179573446 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 179573553 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 179573810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179573981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179574700 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179578686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179580778 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179580781 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179580914 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 179581078 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 179581191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179582641 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 2 179583343 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 2 179583467 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179583932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179583987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179584033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179584347 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179584422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179584425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179584605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179586428 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179587078 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 179587334 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 179587338 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 179588906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179589248 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179590340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179590615 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 179591110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179591196 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 2 179592306 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 2 179592363 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 2 179592373 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 179592418 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 179592548 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 179592583 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 179592607 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 179592685 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 179592727 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 179592761 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 179592789 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 179592828 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 179592844 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 179592847 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 179592879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179592984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179593130 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 179593423 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 179593499 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 179594228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179594443 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 179595585 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 179595807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179596587 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 179596784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179597211 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179597218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179597364 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 179597528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179598113 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179598640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179598900 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179599092 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179599558 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 179600368 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179600456 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179600480 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 179600546 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 179600585 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179601378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179601765 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 179603068 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179603227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179604435 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179605084 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 2 179605423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179605616 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 179606721 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 179607081 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179607243 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 179607291 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 179607427 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 179608092 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179611225 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 179611466 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179611490 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179612241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179612290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179612487 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 179612511 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 179613505 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 179613511 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179613570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179613650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179613946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179614339 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179614671 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 179614692 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 179614693 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 179614730 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 179614776 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 179614798 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179614897 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 179615456 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 179615801 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 179615829 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179616446 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 179616471 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 179616472 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 179616511 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 179616640 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179617285 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 179617403 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 179617487 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179617492 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179617520 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179617547 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179617638 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179617980 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179618752 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179618796 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179618938 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179618955 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 179619024 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 179619122 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 179619390 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 179619510 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179620465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179622406 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 179622865 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 179623228 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179623409 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 179624274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179624478 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179624668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179624793 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179628901 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179630170 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179631005 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 179631324 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 179632070 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179635197 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179639836 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 179639846 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 179639874 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 179640850 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 179640891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179643685 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 179644466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179644893 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 179645024 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 179645027 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 2 179645118 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179645310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179645331 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179649661 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179651002 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179651116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179651634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179653817 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179656603 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179656697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179657294 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 2 179657375 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179657606 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 179658461 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179658541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179658859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179661071 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179661466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179665007 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179665121 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179667442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179668809 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179670104 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 179672201 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 2 179672834 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 179675617 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179678310 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 179680097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179680862 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 2 179681639 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 179681926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179682689 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179682729 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179682734 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179682760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179682771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179685068 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179685071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179689293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179691363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179693475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179693561 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179701150 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 179701549 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179701550 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 179703989 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179704365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179706297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179708181 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179714790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179716958 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 179717450 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 179717674 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179718055 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 179718063 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 179718173 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179718196 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 179718955 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179719070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179720961 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 179721112 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 2 179721129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179721573 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 179721690 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179721838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179723353 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 179723472 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 2 179723915 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179724092 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 179724425 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 179724426 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 179724514 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 179724525 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 179724649 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179724667 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179726198 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 2 179726295 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 179726355 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 179726739 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 2 179726933 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 179726981 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 179726999 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179727048 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 179727409 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179727481 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179727842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179728114 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 179728275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179728563 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 2 179728968 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 179729519 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 2 179729530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179730679 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 2 179731210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179732038 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 179732157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179732315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179733548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179733697 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179733753 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 2 179733829 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 179733885 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 179733902 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 179734638 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 2 179734710 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 179735281 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 2 179735335 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 179735423 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 2 179735946 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179735991 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 179736047 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 2 179736154 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 179736489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179736491 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 2 179736614 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 179736711 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 179736795 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 179736821 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 2 179737005 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 179737081 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 179737127 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 2 179737199 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 179737396 G T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 2 179737431 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 2 179737464 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 179737548 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 179737573 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 179737689 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 2 179738004 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 2 179738114 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 2 179738315 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 179738318 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 2 179738805 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 2 179738997 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 2 179739037 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 2 179739083 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 2 179739597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179741441 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 179741849 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 179742012 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179742067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179742253 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 179742452 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179742507 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 179742527 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 179743022 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 179743135 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179743145 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179743210 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 179745004 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179745046 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 179745056 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 179746162 A C N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 2 179746236 T G N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 2 179746260 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 179746334 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 179747056 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179750026 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 2 179750907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179751121 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179752359 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179752434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179752699 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 179752771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179752863 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179752970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179754005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179754832 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 179758574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179759016 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179759065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179761957 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179765131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179770134 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179770425 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 179770604 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179770999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179771504 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 2 179774674 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 179775367 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179777310 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179779003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179781590 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179781890 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179783494 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179783733 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179784356 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 179785176 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179785211 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 179791788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179791801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179796287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179801895 C T N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 2 179803846 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179805361 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 179809247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179812248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179826204 T C Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 2 179829400 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 179829770 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 2 179829902 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179829905 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179830893 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179831102 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179831108 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179831172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179831701 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179832238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179842589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179844186 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179844750 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 179846800 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179847396 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 2 179847408 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179847466 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179848032 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179848072 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 179850460 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179850883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179852206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179855472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179855858 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179856229 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179857012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179857298 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 179857366 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 2 179859510 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179859551 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179859585 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 2 179859698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179860122 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179862035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179862897 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179863461 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 179863805 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179864018 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 179864040 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179864078 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179864377 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179864609 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179864808 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 179864841 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 179864922 G C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 2 179865221 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 179865258 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179865561 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179865829 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179865853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179865996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179866389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179867684 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179869773 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 179869796 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179870189 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179870213 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179870239 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 179870380 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179870424 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 179870437 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179870907 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 179872942 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 179874368 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 179874466 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179874508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179874541 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 2 179874619 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 179875066 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179876677 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 179876786 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179877118 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 179877223 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179877424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179877810 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179878315 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 2 179878887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179879200 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 2 179879737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179880088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179883003 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 179883011 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179883767 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179884241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179884365 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 179884422 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179884544 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179884692 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 179884738 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 179884772 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 179885336 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 2 179885589 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179885597 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179885600 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 179885619 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179885630 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 179886329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179886734 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 179887149 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 2 179887326 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 179887376 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179887574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179888967 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179888985 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 2 179889787 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179889820 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 179889884 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 179890174 T C Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 2 179890215 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 179890257 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 2 179890335 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 2 179890346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179891076 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179891736 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179891927 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179893097 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 179894432 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179894646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179895421 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 179895811 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179896947 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179897409 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 2 179897592 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 179897720 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 179897759 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179898458 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 179898566 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 179899019 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 179899603 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 179899896 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179901274 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 179901303 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 179901454 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179902791 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 179902919 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 179902990 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 179903637 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 179903710 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179903747 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 179903876 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 179904088 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 179904407 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179904753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179906026 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179906681 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 2 179912388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179917340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179919892 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 2 179920923 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 179921779 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 2 179925847 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179927039 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 179927248 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 179928849 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179928858 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 179928913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179928923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179928940 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 179928979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179928993 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 179929070 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 179929093 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179929120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179929188 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 179929249 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179929251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179929314 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179929315 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 179929346 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 179929350 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 179930244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179931254 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 179935994 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179936209 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 179937732 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 179938097 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179938854 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 179940846 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179942112 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 2 179943401 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 2 179943465 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 2 179943577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179943618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179943975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179944319 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 179944467 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 179944514 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 179944774 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179944793 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179945496 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 179945565 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 179945597 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 179946304 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 179946393 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 2 179946567 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 179946589 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 179946602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179946612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179946839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179947673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179947956 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 179947957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179948237 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 179948641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179949030 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 179949615 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 179949948 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 179950148 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 179950407 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 2 179950928 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179951668 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 2 179951906 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 2 179952012 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 179952283 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 2 179953372 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 2 179954111 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179954221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179954333 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179954377 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 179954996 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179955295 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 179955593 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 179955627 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 179955689 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 179955748 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 179955801 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 179956446 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 179956477 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 179956511 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 179956563 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 179956652 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 179956705 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 179956716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179956737 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 179957990 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179958023 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 179961058 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 2 179962208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179962456 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 179962459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179964389 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 179965046 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179965245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179965890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179968439 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 179970343 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179970401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179970779 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 179970925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179970948 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 179971028 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 179971310 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179971324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179972155 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 179972780 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 179972803 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179973279 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 2 179973297 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179973462 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179973466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179973580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179973858 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179973934 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179974009 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179974383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179974510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179974649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179974680 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179974688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179974717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179974765 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179974800 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179974815 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179974850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179974922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179974923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179975135 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 179975212 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179975298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179975353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179975868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179976016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179976158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179976175 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179976221 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179976228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179976430 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 2 179976776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179976813 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179976881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179976950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179976966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179978351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179978727 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 2 179978746 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 179980113 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 2 179981734 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 2 179981763 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179981825 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179981860 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179981933 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179981973 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 179981989 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179982021 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 179982034 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 179982142 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179982673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179982799 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 2 179982812 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 179982814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 179982896 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 179982920 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 179982989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179982997 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 179983348 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179983424 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179983451 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 179983495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179983688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179983774 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 179983796 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 179983840 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 179984100 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 179984126 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 179984333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179985030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 179985099 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 2 179985164 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 179985176 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 179986397 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179986487 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179986488 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179986607 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 179986698 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 179986756 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179987155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179987209 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179987374 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179987738 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179987768 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179987823 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 179987921 T G Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 2 179987979 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 179988585 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 179988836 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179989005 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 179989014 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179989382 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 179989620 T C Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 2 179989910 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179989911 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 2 179989939 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 179990031 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 179990395 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 2 179990476 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 179990488 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 179990490 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 2 179990618 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 2 179990631 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 179990692 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 2 179990700 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 179990976 G C Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 179990991 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 2 179992859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 179993521 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179993548 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179998100 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 179998530 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 179999863 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 180002603 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 180003205 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 180004086 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 2 180004964 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 180005417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180005531 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 180006054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180007282 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 180008872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180009325 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 180009370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180009785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180009903 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 180009933 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 180010296 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 180010347 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 180010370 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 180010538 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 180010609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180010615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180010796 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 180010865 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 180010882 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 180010955 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 2 180010991 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180011045 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180011068 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 2 180012444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180014578 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 180015313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180016176 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 2 180016212 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 2 180016316 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 2 180016335 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 180017190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180018053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180018113 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180018170 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 180019333 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 180019920 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 180020448 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 2 180023435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180023826 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180024785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180027286 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 180027824 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 180030456 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 2 180030498 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 2 180030544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180030576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180030588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180030819 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 2 180030829 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180031229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180031668 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180032434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180032622 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180032978 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 2 180033772 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180035112 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 180035168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180035364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180035496 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180035901 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180036655 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 180036924 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180037185 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 180037231 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180037464 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 2 180037488 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 180039148 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 180039149 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 2 180039221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180039577 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 180039668 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 180039753 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180039799 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 180039809 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 180039924 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 180039963 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 180040045 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 180040169 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 180040182 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 180040234 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 2 180040291 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 180040302 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 180040307 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 180040326 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 2 180040428 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 2 180041084 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180041190 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180041548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180041575 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180041966 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180041976 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180042267 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180042336 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180042366 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 180042412 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 180042560 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180043103 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 2 180043150 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180043343 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 2 180044157 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180044262 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 180044655 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 180044938 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180044940 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 180044955 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180044959 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 180045003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180045046 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 180045053 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 180045146 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 180045510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180045559 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180045571 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 2 180045713 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 180047376 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 2 180047398 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 2 180048030 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 2 180049948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180050652 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180051211 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 180053173 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 180053347 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 180053569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180053886 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180054257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180054515 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180054662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180054733 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 180055246 T G Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 180055772 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 2 180055808 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 180055833 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 180055881 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 180055892 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 180056085 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 180056109 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 180056130 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 180056147 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 180056185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180056434 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 2 180056475 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 2 180056486 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 2 180056535 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 180056662 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 180056678 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180056835 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 180057053 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180057182 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180057184 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 180057585 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180057889 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 2 180057990 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 180058024 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 180058028 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 180058151 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 180058384 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 180058673 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180058861 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180058889 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180058950 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 180059095 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180059141 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 180059271 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 180059344 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 2 180060911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180061080 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 180061209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180061412 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 180061479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180061562 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180061732 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180061747 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180061774 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180061801 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180061867 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 180061919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180062399 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180062416 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180062844 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180063485 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 180063492 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 180063497 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 180063741 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180063761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180063782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180063869 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 180063937 A C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 180064204 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180064239 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180064257 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 180064280 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180064303 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 180064337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180064415 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 180064668 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 180064713 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 2 180064723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180064737 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 180064740 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 180064775 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 2 180064933 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 180064992 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180065283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180065323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180065586 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 180065628 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 180065730 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180065758 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 180065767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180065833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180065889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180066017 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180066078 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 180066105 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 180066130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180066174 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 180066340 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180066350 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180066827 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 2 180066943 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180067365 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180067428 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 180067543 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 180067578 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180067806 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 180067851 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180068018 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180068048 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180068082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180069063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180069344 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180069511 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180069526 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180069544 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180069797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180069884 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 180070010 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 180070078 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 180070144 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 180070159 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 180070166 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180070311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180070508 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180070800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180070816 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 180070858 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 180071230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180071269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180071513 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 180071523 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 180071607 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 180071635 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180072805 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 180072829 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 180072872 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 180073508 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 180073534 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 2 180073590 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 2 180073594 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 2 180073870 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180074283 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180074593 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180075435 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 180075766 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180076604 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 180076606 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 180077695 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 180077714 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 2 180077745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180077774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180077859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180077904 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180077918 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180079021 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180079220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180079354 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180079570 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 180079617 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180079970 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 2 180080035 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180080057 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 180080077 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180080764 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 180080834 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 180081078 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 180081578 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 180081709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180081736 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180081758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180081786 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 180082173 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180082303 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 180082358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180082397 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 2 180083269 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 180083319 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 180083331 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 180084093 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180084414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180084541 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 180084600 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 2 180084652 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 2 180084776 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 180084843 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 180084926 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 2 180085347 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180085386 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180085741 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180085755 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180086323 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 180086698 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180086907 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 180086976 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 2 180087013 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 180087038 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 180087052 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 180087266 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180087305 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180087741 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 180087862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180087903 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 180087937 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180087999 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 180088048 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 180088060 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 2 180088498 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180088551 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180088717 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 180088769 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180089059 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180089376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180089659 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 180089963 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 2 180091111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180091112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180091188 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 2 180091194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180091231 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 180094273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180094342 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180094400 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180096098 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180097526 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 180098608 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180098733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180098773 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 180099310 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180099365 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 180099404 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 2 180099635 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180100618 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 2 180100881 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180101029 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180101241 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180101264 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180101286 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180101303 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 2 180101674 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180101725 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180101827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180102046 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 180102068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180102070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180102108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180102122 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 180102133 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180102340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180102375 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180102401 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 180102416 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180102575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180102733 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180102735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180102909 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 180102926 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 180103462 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180103492 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180103495 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 2 180103522 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 180103614 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 180104375 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180104376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180104461 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 180104489 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 2 180104490 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180104515 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 180104608 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 180104630 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 180104686 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 180104757 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 180104819 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 180105054 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 2 180105409 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 180105459 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 180105506 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 180105507 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 180105544 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180105816 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 180105855 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 180106442 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 180107234 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 180108493 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180108518 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180108636 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 180108954 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 180109355 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180109395 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180109634 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180109711 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 180109809 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180109931 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 180110013 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180110219 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 2 180110539 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180110639 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180111307 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180111540 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180111781 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180112186 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180112230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180112477 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 2 180113072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180113127 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 180113139 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 180113156 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 180113186 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 180113592 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180113664 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180114333 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 180114503 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180114535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180114639 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 2 180114774 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 180114793 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 180114832 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180115648 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 180115710 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180115969 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 2 180116412 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 180116683 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 180116739 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180117154 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 180117321 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180117557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180117568 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180117641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180117768 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180122304 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180122792 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180124083 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 180124137 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 180124189 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 180124409 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 180124514 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180124718 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180124812 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180124854 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 2 180124948 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180125025 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180125075 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 180125178 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180125836 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180128135 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180128215 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180129919 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 180130348 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180130742 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180130808 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180131866 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180132990 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180133332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180138741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180139994 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 180140071 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 180140300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180141586 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 2 180141680 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180141811 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 2 180142085 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180142102 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 180142135 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 180142299 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 180142520 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 180145246 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 180145845 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180145873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180147326 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180147608 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180148130 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180149359 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 180149433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180149637 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180149821 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180150212 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180150709 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180154225 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 180154320 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 2 180156011 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 180156286 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 180156628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180156718 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 2 180156795 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180156935 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180156955 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180157760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180158817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180161679 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180162215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180163110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180163224 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180163236 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 180163991 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180164068 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 180164827 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 180165034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180165243 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 180165257 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180166102 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180166533 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 2 180166725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180166756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180166867 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 180166923 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 180166925 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 180166940 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180166948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180167088 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180167098 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 180167104 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 2 180167152 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180167301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180167311 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180167713 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180167741 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180167763 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180167786 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180168118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180168231 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 180168257 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 180168350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180168375 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 180168699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180170868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180171176 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180171237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180171307 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180171308 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 180171331 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180171391 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 2 180171397 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180171520 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 2 180171614 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 180171844 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180171886 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180172165 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 180172370 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 180172477 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 180172479 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180172541 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180172542 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180172576 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180172708 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180172748 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180172796 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 180173286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180173290 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180173345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180173365 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 180173433 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180173592 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180173718 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 180173886 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 2 180173998 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 180174050 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 180174746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180175188 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 180175254 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 180175263 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 180175636 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 180176350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180176406 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 180176464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180176496 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 2 180176541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180176623 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180176762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180176827 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 180177409 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 2 180177768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180177912 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 2 180177992 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 2 180178157 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180178916 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180179238 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 2 180179300 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 2 180179717 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 180180183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180180953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180182048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180182398 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180182494 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180182833 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 2 180183218 A T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 2 180183812 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180184002 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180184112 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180184157 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180184224 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180184386 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180184778 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180185883 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 2 180185960 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 180186589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180186672 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 180186803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180186844 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 2 180186936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180187018 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180187090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180187201 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180187203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180187832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180187909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180188207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180188463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180188758 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180188858 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 180189154 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 180189251 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 180189428 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 180190063 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180193197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180193324 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180195026 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180195262 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180195292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180195296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180195325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180195418 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180195493 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 180195540 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 180195923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180195964 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 180196237 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180196317 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180197046 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180197304 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 180197313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180197325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180197473 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180197532 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 180197608 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 2 180197823 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 180199676 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180199841 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180199951 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180200026 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180200099 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180200127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180200213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180201108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180201175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180201250 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180202794 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180202898 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180203897 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180203946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180203954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180204011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180204020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180204522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180204730 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180204731 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180204769 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180204925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180205030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180205362 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180205375 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180205381 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180205422 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180205597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180205643 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 180205651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180210418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180210518 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 2 180210598 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 2 180210784 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 180212219 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180212521 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180212683 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180212698 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180212742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180213203 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180213308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180213618 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180217080 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180219442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180221041 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 180221227 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180221349 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180221919 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180222029 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180222063 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180222214 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180222268 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180222332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180222359 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 2 180222492 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180222727 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 180223230 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180223471 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180223492 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 180223551 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180223730 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180223792 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180223839 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180223931 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180223952 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180224486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180224728 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180224968 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 2 180226091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180226639 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 180227166 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 180227468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180227588 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 2 180227623 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180227778 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 180228092 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180228170 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180228249 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180228285 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180228362 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180228694 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180228725 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180228768 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180228811 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180228865 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180228877 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180228934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180228981 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180229848 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180229934 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180230014 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180230093 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180230096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180230179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180230183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180230202 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180230317 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180230365 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180230402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180230665 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180230676 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180230705 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180230827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180230992 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180230999 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180231021 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180231166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180231177 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180231366 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180231427 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 180231486 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180231513 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 180231618 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 180231854 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180231866 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 2 180231886 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180232001 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 180232447 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180232507 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180232533 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180232643 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180233038 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180233196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180233436 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180233515 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180233873 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180233907 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180233959 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180234036 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180234087 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180234095 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180234115 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180234135 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180234138 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180234239 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180234292 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180234295 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180234363 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180234435 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180234870 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180234994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180235158 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180235167 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180235187 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180235195 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180235909 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180236007 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180236254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180236478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180236684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180236928 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 180237445 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 180238173 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180238274 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180238297 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180238335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180238369 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180238392 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 2 180238502 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180238967 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 180239085 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 2 180239268 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 180239490 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 2 180239737 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 2 180239933 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 2 180240016 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180240185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180240289 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 2 180240422 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180240441 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 180240512 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 2 180240626 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180240811 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 2 180243142 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 180245730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180245768 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180246321 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 180246322 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 2 180246400 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 180246545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180247653 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180247902 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180247945 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 2 180248485 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180248529 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180248565 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180248594 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180248603 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180248607 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180248621 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180248792 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180248796 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180248823 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180249017 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180249369 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180249873 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180249907 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180250004 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180250086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180250392 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 180250418 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180250441 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 180250519 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180250594 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180250626 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 180250881 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180251048 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180251054 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 180251178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180251305 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 180251404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180251504 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 180251608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180252122 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 180252127 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 180252365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180252596 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 2 180253543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180254848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180254982 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180255113 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 180255460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180255564 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180256104 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 180256827 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 180257499 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 2 180257513 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180257860 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 2 180257865 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180258480 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180261580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180264863 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180264963 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180268033 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180268102 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180268727 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 180269107 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180269454 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 180272210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180274425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180274757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180274805 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180274962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180275189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180275273 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180275344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180275566 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 180279891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180280363 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 2 180280616 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 2 180280995 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180281090 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 2 180286057 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180286864 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180287169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180287434 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 2 180287480 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180287486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180287582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180287809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180288211 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180288824 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180292627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180295146 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 180297110 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180297934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180299467 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180300397 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180300976 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 180301030 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180303764 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 180303906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180304055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180310872 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180311956 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 2 180313152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180319299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180320425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180320451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180321518 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 180323483 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 180323925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180326251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180326255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180327568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180327797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180328043 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 180328185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180328415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180329277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180329280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180330025 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 2 180330588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180330626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180330629 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 2 180330685 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180330789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180330823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180332191 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 2 180332346 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 2 180334383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180337910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180345621 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180345711 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180347983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180350048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180353781 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180354355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180354988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180356172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180361461 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 180369327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180372374 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180374322 C T Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 2 180374327 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 2 180374386 G A Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 180374388 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 180376360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180378594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180379013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180379259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180381352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180384395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180385712 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180385921 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180386037 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 180387348 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180387350 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180393471 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180394899 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180395835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180398480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180399513 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180401248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180407984 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 2 180408380 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 180408554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180409762 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180410765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180411007 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180412054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180412281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180412515 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 2 180412519 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180412624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180413085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180414450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180415378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180417391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180417642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180418075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180418756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180420146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180420181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180420697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180421659 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180421867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180422424 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180425036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180425162 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 2 180426153 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 180426775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180427063 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 180429641 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180430038 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180430311 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180430466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180430805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180430892 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 180432204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180432778 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180433665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180434122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180434383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180434739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180434896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180436186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180436460 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 180437546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180441738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180442082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180443852 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180444006 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180444102 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 180448289 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 2 180453019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180454199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180454641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180454738 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 180458513 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 180458530 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180458554 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 180458571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180459209 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 2 180459797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180460445 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 180460899 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 2 180461965 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 2 180461993 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 180462643 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 180462658 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 180464200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180465552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180465707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180467467 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 180468403 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 2 180468831 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 180469205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180469415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180470470 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 180470774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180472626 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 180472812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180473392 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 2 180475352 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 180475464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180477597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180478289 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 2 180478303 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 2 180478380 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 2 180478756 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 2 180479404 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 180479971 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180480028 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 180480166 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 180480245 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 180480274 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 180480286 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 2 180480842 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180481062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180482380 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180482438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180482593 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180483012 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180483016 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180483029 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180483055 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180483233 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180483403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180483590 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180488528 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180488621 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 180488673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180488674 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 180488800 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 180488808 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 2 180488894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180489385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180489393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180489620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180490116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180490441 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 180490580 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 180490626 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 180490686 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 180491010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180491036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180491129 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 180491273 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180491303 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 180491837 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 180491862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180492073 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 180492077 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 180492116 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 2 180492160 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 180492309 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 180493277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180493397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180493445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180493513 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180494161 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 180495174 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180495269 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 180495442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180495447 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180497066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180497171 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180497598 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180497658 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 2 180497715 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 2 180497800 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180498158 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 2 180498401 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180498442 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180498559 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180498607 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180498663 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 180498694 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 2 180498731 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 180498738 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 180498849 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 2 180499670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180499707 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180499747 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 180499750 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 180500595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180502764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180503009 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 180503262 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180503314 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 180504461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180504553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180505986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180506273 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 180506374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180508214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180508261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180508666 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180508943 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 180509434 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 180510960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180511089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180514922 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 2 180516595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180516724 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180516771 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 180516799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180516893 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180517018 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 180517025 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 2 180517050 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180517051 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180517087 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180517105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180517169 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 2 180517341 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180518442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180519704 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180519740 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 2 180519993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180521121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180521425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180521533 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180521607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180521658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180521787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180521931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180522333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180523203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180523330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180523728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180524592 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180526644 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 2 180526702 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180526794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180526803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180527086 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180527197 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180527233 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180527333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180528208 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 2 180528250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180529557 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180529874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180530260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180530794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180530920 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180532046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180532363 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180532439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180533056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180535506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180536048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180536611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180536663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180536665 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 180536739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180536773 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 180536912 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 180536955 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 2 180537055 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180537092 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180537240 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180537336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180537395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180537490 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 180537594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180537704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180537715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180537777 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180538103 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 180538240 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 180538297 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 180538365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180538420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180538434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180538481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180538743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180538917 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180539115 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180539473 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 180540091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180540392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180540900 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180541057 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 180542497 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180542587 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 180542620 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 180542626 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180542727 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180542740 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 180542807 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180542941 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180542987 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 180543483 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180543484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180543589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180543764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180543908 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180544430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180544493 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180544970 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180545079 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180545095 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180545168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180545347 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180545474 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180545647 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180545694 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180545706 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180545759 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 180545762 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 180545956 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 180546057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180546917 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180547167 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180547228 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 180547498 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180547597 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 180547660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180547849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180548587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180550865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180551103 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180551809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180551963 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180552257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180552348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180553585 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 2 180554700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180555082 T G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 2 180555175 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 180555186 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 2 180555205 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 180555317 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180555324 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 180555396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180556188 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180556726 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 180556781 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180556835 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180556881 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180557136 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180557152 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 180557243 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180557992 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180560343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180560977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180561393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180561547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180563837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180564782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180566650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180567970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180569044 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 180569596 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 180569719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180570154 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 180570237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180570290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180570523 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180570573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180573256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180573517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180575937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180576503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180582426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180582842 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180583682 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 2 180584486 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 2 180585865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180585945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180586098 G T Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 2 180586596 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180587236 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 180587422 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 180587512 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 180588094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180588097 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180588228 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 180588229 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 180588328 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180588349 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180588351 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 180588575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180588761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180590313 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180592508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180592565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180594772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180595629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180595839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180596382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180598441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180599309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180599463 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180599493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180602711 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180603124 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 180603946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180604863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180605320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180607082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180607383 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 180608512 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180609397 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 2 180611322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180612204 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180615281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180616010 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 180616423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180616467 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 180617223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180617258 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 180617314 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 180617316 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 180617350 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 180617358 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 2 180617387 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 180617492 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 180617709 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180617756 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 180617926 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 180617930 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180619445 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 2 180620004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180620681 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180621609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180621748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180622183 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 180623599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180623923 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180629869 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180631318 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180632220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180632381 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180633276 C G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 2 180634552 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180634615 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180637791 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 180637953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180638053 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 180638057 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 180638208 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 2 180638741 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 2 180638801 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 180639009 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 180639065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180640406 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 180640798 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 180643502 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180643763 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180643906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180643910 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 180645662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180647438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180648076 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 2 180648157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180649525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180650553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180652668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180655922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180655926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180656341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180656772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180656946 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 180657395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180658539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180658716 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180658931 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 180658932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180659018 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 2 180660146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180660149 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 2 180660684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180660845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180661560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180661702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180662892 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 180665190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180666066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180668876 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180669277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180671053 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180674381 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180674386 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180674723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180674726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180674745 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 180675198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180675671 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 2 180675698 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 2 180675717 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180675959 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180675999 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180676448 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 180676494 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180676560 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180676562 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180677159 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 2 180677299 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180677347 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180677348 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180677420 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180677483 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180677490 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180677504 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180677521 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180677695 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 2 180678053 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180678282 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180678297 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180678635 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180678647 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 2 180679077 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180679136 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 2 180679396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180679449 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180679475 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 180679483 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 180679717 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180679827 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 180679915 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180679945 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 2 180680209 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 180680279 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180680456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180681079 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180681380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180682706 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 180683392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180684592 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180684675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180684721 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180684774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180684995 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180685180 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180685197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180685245 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180685339 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180685348 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180685665 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180685816 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180685827 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180685892 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180686430 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180686894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180686910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180686958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180687006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180687069 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 2 180687118 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180687164 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180687179 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180687772 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180689899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180690193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180690384 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180690756 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180692405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180692847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180692875 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 2 180692989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180693098 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 2 180693249 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180693267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180693342 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180693490 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 2 180693633 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 2 180693725 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180693849 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180693872 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180693904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180693908 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180694090 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180694302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180698056 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180698607 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180698638 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180699314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180699316 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180699393 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180699795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180699833 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180699968 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180700537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180700649 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180700715 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180700738 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180700807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180700876 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180700973 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180701036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180701053 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180701125 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 180701285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180701296 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180701583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180701792 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180701890 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180702223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180702390 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180702480 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180702537 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180702908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180702934 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180703160 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 2 180703171 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 2 180703339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180703384 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180703401 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180703444 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180703467 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180704118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180704141 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180704152 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180704509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180704589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180705302 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180705452 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180705552 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180705594 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180707602 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180707737 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 180707748 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 180707792 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180707795 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180707821 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180707856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180708023 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180708193 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180708945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180711155 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180711313 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180711391 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180711810 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180711921 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180712316 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180712359 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180712397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180712505 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180712767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180712819 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180712914 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180713052 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180713197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180713304 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180713572 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180713573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180713979 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180714146 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180715034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180715286 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180715537 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180715576 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180715737 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180715826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180718408 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 2 180719467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180719927 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180720172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180720183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180721047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180721108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180721683 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180722950 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180723033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180724146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180724292 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 180724302 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180724315 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 2 180724362 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 180724382 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 2 180724421 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 2 180724765 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 180724820 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180724843 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 2 180724882 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180724931 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180724967 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180725473 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180725493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180725553 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 180725628 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 180725996 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180726212 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180726385 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180726432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180726499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180727296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180727311 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 180727506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180727511 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 180727531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180727783 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 180727839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180727991 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180728090 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180728287 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 2 180728305 C G Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 2 180728587 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180728652 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180728676 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180728740 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180728811 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180729095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180729127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180729367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180729383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180735484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180737209 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180738512 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180738643 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 2 180738862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180738910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180739025 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180739164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180739448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180739493 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180739823 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180739947 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180740000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180740626 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180740637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180741330 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180741684 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 180741762 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 180741979 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 180741994 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 180742156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180742268 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 180742337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180742636 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180742724 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 2 180742866 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180742882 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180743024 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180743103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180743144 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 2 180743397 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 180743855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180744084 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180744297 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180744333 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180744601 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180744706 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 180744836 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180745637 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 2 180746055 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180746056 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 2 180746715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180746819 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180746880 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 180746888 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 2 180747400 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180747426 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180747639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180748536 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 2 180748777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180749231 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180749347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180749474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180750861 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 2 180751328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180751363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180751804 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180753149 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180753661 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 180753707 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180753838 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 2 180753955 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 2 180756754 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 180757446 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 180758388 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180758638 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180759884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180760094 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 180760172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180760801 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 180761151 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 180761490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180761586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180762258 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180762464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180762633 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180762646 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180762665 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 2 180762684 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180762694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180764717 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180764729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180764964 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 180765841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180766079 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 180766110 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180766111 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180766378 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 180766538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180766626 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 2 180766629 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 180767039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180767198 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 180767235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180767885 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 2 180768093 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 180768352 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180769189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180770304 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 2 180770814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180770888 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180770980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180771236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180771768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180771769 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 180772474 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 2 180772695 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180772729 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 2 180772793 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 2 180772808 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180772823 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180772857 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180773069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180774870 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 180776304 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 2 180776462 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 2 180777031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180777202 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 2 180778005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180778284 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 2 180778551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180778910 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180779963 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 180780099 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 180781466 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 180781562 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 2 180781926 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 2 180782159 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180782270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180782314 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 180782584 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180782634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180782644 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 180782685 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 2 180782717 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 180782951 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 180783024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180783033 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 2 180783604 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 180783709 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 180783726 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 180783973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180784109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180784748 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180784793 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180784990 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 180785238 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 180785311 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180785378 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180785555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180785812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180786082 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180786337 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180786350 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180786474 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 2 180786698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180786887 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180786901 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 2 180787381 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180787598 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 180787677 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180787698 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180787729 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 2 180787805 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180787913 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 2 180788052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180788093 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 2 180788880 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 2 180789353 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180789374 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180789395 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180789506 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180789556 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180789690 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 180789836 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 180789837 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 2 180789850 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180789866 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 2 180790047 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180790573 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180790647 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180790779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180790999 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 180791006 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 2 180791111 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180791337 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180791365 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180791674 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 2 180791679 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 180791831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180792327 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 2 180792458 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 2 180793421 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 180793693 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 180794527 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 2 180794720 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 2 180794759 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 2 180795622 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180796338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180796452 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 180796706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180796730 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 180796878 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 2 180796881 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 180796891 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 180797126 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 180797257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180797904 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 2 180798256 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 180798261 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 180798421 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 180798428 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 2 180798561 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 2 180798574 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 2 180798637 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 180798716 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 180798800 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 180798803 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 180798817 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 180798824 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 2 180798872 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180799031 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 2 180799047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180799183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180799412 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180799505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180799532 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180799677 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 2 180799983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180800027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180800039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180800265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180800353 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 180800386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180800433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180800583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180801771 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180801879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180802037 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180802255 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180802310 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180802506 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180802519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180802779 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 2 180802933 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 2 180802964 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 2 180803066 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 180803142 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180803681 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180805174 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 180805297 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 2 180805407 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 2 180805794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180805827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180805849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180805867 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180806277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180806716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180806958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180807155 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180807799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180809796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180809879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180812317 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 2 180813615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180813768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180813960 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 2 180814291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180814297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180814504 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 2 180814526 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 2 180815670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180816780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180817275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180817329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180819476 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180819487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180821849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180821885 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 180821931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180822254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180822556 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180823173 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 2 180823546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180824079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180825582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180826807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180827398 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180827886 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 2 180828107 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180828477 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 180828507 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 2 180828776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180829479 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 2 180829670 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 2 180830750 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180830791 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180831895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180832118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180832182 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180832410 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180832573 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180832672 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180832725 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180832894 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180832912 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180832998 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 180833031 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180833626 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180833727 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180834045 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180834250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180835470 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180835485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180835847 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180836282 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180836396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180836413 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180836468 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180836783 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 180837065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180837800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180838569 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180838585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180838639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180840085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180840215 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180843595 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180844318 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 2 180845018 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 180845026 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 180845143 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 2 180845272 G C N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 2 180845329 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 180845861 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 180845862 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 180845997 T A N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 2 180846012 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180847080 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180847252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180847476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180847797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180848532 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180848601 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 2 180848776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180849336 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 180849492 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180849654 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180849661 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180850214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180850294 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 2 180850474 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180850758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180850775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180852024 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180852093 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180852182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180852612 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180852661 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180852768 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180853083 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 2 180853119 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180853145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180853567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180853631 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180853641 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180853688 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180854176 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 180855602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180855859 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180856018 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180856055 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180856643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180856819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180857014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180857027 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180857479 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180857618 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180857875 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180857943 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180858818 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180858919 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 2 180859347 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 180859377 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 180859380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180859424 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 2 180859888 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 2 180859905 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180860064 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 2 180860491 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180861294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180862017 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180862671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180863772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180864725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180864739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180864782 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 2 180865066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180865533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180865604 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 180865957 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180866796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180867058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180869020 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180870259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180870995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180871293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180871817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180872297 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180872873 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180872968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180873551 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 180873696 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 2 180873756 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180873809 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 180873830 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 180873870 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 2 180874155 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 180874182 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 2 180875280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180875711 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180875749 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 2 180875807 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 2 180875868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180875936 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 180876140 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180876384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180876719 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180877305 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 2 180877844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180877961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180878187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180879371 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180879390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180879405 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180879435 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180879478 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180879546 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180879606 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 180879651 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180880255 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 2 180880337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180881012 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 180881067 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 180881203 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180881921 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180883227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180883269 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180883617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180883982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180884302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180887164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180887227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180889095 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180892498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180892690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180892767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180893285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180895277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180897600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180897672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180898340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180899788 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180899813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180900444 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180900516 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180900583 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180900682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180900691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180900698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180901199 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 180901319 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 180901363 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180901468 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180901515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180902057 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180902102 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180902592 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180902640 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180903234 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180903285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180903323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180903457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180903542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180903701 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180903903 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180903976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180904050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180904180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180904520 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 2 180904569 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 2 180908825 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180909026 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180909066 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180909216 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180909239 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180909247 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180909331 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180909357 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 2 180909392 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180909531 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180909532 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180909738 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180909769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180909785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180909793 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180909843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180909907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180909968 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180909998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180910041 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180910131 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180910267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180910717 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180910768 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 180910800 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180911737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180912341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180912595 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180912616 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180912812 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 2 180914959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180916484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180916626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180916787 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180917149 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180917150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180918769 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180918915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180920661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180921523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180921581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180922235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180922580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180922773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180922997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180923017 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180923052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180923110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180923182 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 180923471 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 180924878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180925230 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180926441 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 180930839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180931937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180932435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180938542 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180939640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180939717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180939805 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180941130 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 2 180941198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180943597 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 180943713 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180943956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180944164 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 180944295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180944627 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180945343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180945869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180950050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180952525 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 180952728 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 180952789 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 180953088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 180954519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180954783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180954801 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180955089 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180955881 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180955886 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180957598 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180957836 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180958072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180958117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180958307 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180959427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180962403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180969665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180970379 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 180978956 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 180979400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180981656 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180982115 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180982796 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 180984907 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180985412 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180985776 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180985977 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180987510 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 180987929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180990452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180991452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180991508 A T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 180992921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180996626 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180997705 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 180997803 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180997850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180997987 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 180998063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180998960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 180999034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181000316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181002147 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181003128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181003244 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181004427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181006680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181006772 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181011014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181012149 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 2 181016247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181016968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181017942 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 181018112 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181018354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181019453 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 2 181019845 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 181020033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181020266 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181020363 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181020472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181020476 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 181020579 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181020719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181020739 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181020953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181020974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181021028 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 181021374 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181021433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181022105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181029554 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181029559 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181031769 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 181033396 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181033472 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181033681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181033909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181034440 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181034568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181035213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181035277 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181035424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181035505 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181035562 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181036022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181036376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181036705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181036856 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181037424 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181038051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181038261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181038282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181038779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181039791 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 181040608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181040670 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181040705 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181040772 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181041030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181041054 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181041595 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181042294 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181042428 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181042484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181043112 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181043790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181043904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181044135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181044343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181045074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181045278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181045383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181047919 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181049033 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181049195 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181049330 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181049997 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181050160 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 181050259 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181050912 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 2 181051716 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181052198 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181052262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181052447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181052603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181052640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181052705 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181052729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181052892 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181052904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181053130 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181054184 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 181054485 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181054782 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181055398 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181055433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181055802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181055813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181055867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181056521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181056582 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181057422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181057617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181057659 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181057665 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181057685 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181057706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181057868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181058210 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181059097 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181059158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181060304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181060460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181060573 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181061243 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181061661 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181062520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181062716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181062741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181063501 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181063532 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181063535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181064442 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181064682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181065101 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181065354 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181065429 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181065623 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 181066166 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181066228 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181068110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181068468 C A Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 181068642 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 181068655 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 181069048 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 181069960 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181069977 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181070016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181070341 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 181070457 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 181070806 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181070807 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181071116 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 181071145 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 181071261 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 181071332 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 2 181071373 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 2 181071442 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 2 181072144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181072426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181072457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181072526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181072849 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181073249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181073563 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181073572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181073740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181073975 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181074051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181074104 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181074271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181075007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181075228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181075517 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181075518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181075536 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 181076600 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181076967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181077051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181077257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181077331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181078039 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181078102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181078117 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181078259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181079462 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 181079567 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 181079642 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 181079959 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181080071 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181080122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181080222 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181080322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181080394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181080530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181080734 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181080928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181081078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181081523 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181082001 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 2 181082431 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181082921 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181085737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181089846 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181095175 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 181095258 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181097467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181099501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181101934 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 181102153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181102609 T G Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 2 181105438 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181105709 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 2 181106572 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 181108340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181110247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181111060 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181111762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181116319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181118226 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181118279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181119130 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181119474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181120357 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181125511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181125639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181126402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181127169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181127860 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 181128036 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181128482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181129300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181129896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181129920 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181130062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181130111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181130141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181130574 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181130602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181130605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181130679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181130940 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181131012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181131249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181132544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181132577 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181134040 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 2 181134046 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181134169 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181134532 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181134578 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 181134612 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 181134679 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181134952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181136766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181137281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181139143 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181140334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181140407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181140497 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181140530 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181141039 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181141096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181141097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181141281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181141441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181141463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181141468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181141725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181142215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181142486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181142615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181142642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181142854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181143136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181143195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181143200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181143319 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181143658 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181143897 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181144441 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181144535 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181145001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181145023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181145057 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181145092 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181145623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181148205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181148462 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 2 181148757 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181148867 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 181149019 A T Y N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 2 181149035 T G Y N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 2 181149046 G A Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 2 181149108 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 2 181149134 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 8 10 0 8 1 2 181149231 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 181149529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181149965 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181150027 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181150046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181150264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181150353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181151021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181152121 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181152888 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181155552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181156847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181156924 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181156927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181157006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181157027 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181157137 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181157258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181157272 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181157283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181157299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181157316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181157944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181159614 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181159640 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181159894 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 181160508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181160933 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181161498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181161728 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181161814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181161897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181161909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181162052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181162114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181162194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181162233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181162474 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181163167 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181163323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181163421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181163464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181163718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181163834 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181163885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181163925 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181163971 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181164205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181164297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181164533 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181164569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181164610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181164649 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181164680 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 2 181164828 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181165409 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181165671 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 181165715 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 181166237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181166310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181166572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181166590 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181166843 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181167006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181168128 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181168995 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181169239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181169255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181169495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181169986 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181171464 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181171470 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181171681 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181171913 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181171941 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181172071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181172357 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181172381 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181172382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181172625 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181173149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181174730 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181174810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181175338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181175549 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181175650 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181176837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181176947 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181176965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181177321 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181177670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181177957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181178072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181178149 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181178218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181178307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181178385 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 181178974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181179185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181179982 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 181182112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181182408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181182683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181183655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181185126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181185182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181187610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181188149 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181188572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181189210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181191445 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181192385 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181192984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181200235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181201531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181202311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181202325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181205513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181207351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181207759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181207967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181208025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181208026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181208110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181208122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181208205 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 181208938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181212336 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 181212378 G A N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 2 181214337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181215757 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181216103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181216673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181217149 G A Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 2 181217686 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181217959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181218328 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181218646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181222071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181222184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181223313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181223709 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181224611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181224920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181225836 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181226135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181226192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181230698 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 2 181231052 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181232304 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 2 181235012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181235637 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181236531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181237466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181238177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181240768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181242025 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181243835 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181245219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181246074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181246552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181248566 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181248643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181248653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181249101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181250934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181251098 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181252301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181252533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181253698 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181255228 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181255578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181256393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181256521 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181256853 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181257186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181257431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181257514 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181257554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181257791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181260177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181260198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181260482 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181261010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181261434 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181262277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181262327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181262500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181262593 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181265178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181265879 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181267962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181271833 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181271967 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 181273051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181273777 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181275368 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 181276010 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181276548 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181277314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181280049 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 181280247 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 181280286 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 2 181282690 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181282944 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181283153 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181283162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181285047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181285278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181285374 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181285521 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181285984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181286000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181286200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181286521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181286554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181286833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181286878 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181287165 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181287708 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181287742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181287853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181288069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181288884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181289038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181289273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181289396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181289406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181291272 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 181294019 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181294444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181294645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181294646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181294890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181295832 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 181295904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181296217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181300854 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181301955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181302539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181302824 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181303079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181303362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181303721 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 181310445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181310723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181313604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181314799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181314978 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181315298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181315493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181315549 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181316225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181316365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181316594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181318774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181318782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181319813 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181319983 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181320099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181320223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181325963 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181326209 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181326560 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181326593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181326668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181326754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181328406 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181329231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181329290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181332752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181333614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181333804 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 181333957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181335440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181338167 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181338335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181342343 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 181344851 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 181345461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181345523 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181348442 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181350337 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181352408 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 2 181353672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181354257 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181354516 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 181355539 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181355567 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181356295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181357729 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 181357818 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181357987 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181358474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181359146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181359651 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181360004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181360150 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181360180 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181360341 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 2 181360392 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 2 181360757 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181360894 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181361026 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181361288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181361418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181361850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181362467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181362854 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 181362899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181363031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181363176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181363345 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181364145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181364309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181364537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181364939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181365375 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181365683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181365781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181365924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181366477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181366595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181366942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181367007 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181367363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181369670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181369936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181370443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181372748 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181374116 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181374635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181375009 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181375058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181375234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181377483 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181377955 T G N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 2 181377963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181377980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181378091 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181378116 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181378943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181382605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181384831 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181385609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181386313 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181386430 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 181386772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181389440 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181389934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181390663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181393338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181394885 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 181394965 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181395044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181395249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181397393 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181399412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181399636 C G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 181399693 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 2 181401745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181402341 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181402432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181403394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181404244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181406917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181407381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181407425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181409447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181410165 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181412670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181413967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181414702 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181416830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181417405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181417406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181417521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181417631 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181417761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181419888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181421346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181423572 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 181426861 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181427452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181430305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181430485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181432407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181435643 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 2 181442739 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181443465 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181447631 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181449893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181451418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181452975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181454829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181455082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181455883 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181456141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181456204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181456212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181456406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181456596 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 181456855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181456983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181457125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181457139 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181457140 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181457165 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181457178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181457220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181457252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181457382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181457726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181457855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181458139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181458225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181459602 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181459984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181460005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181460023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181460044 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181460048 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181460199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181460336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181460477 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181460486 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181460539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181460589 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181460624 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181460676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181460718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181460739 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181460765 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 181460884 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181460920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181460926 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181461078 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181461279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181463104 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181464478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181465219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181466297 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181468660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181468784 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181468850 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181472005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181472098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181472603 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181472940 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181481644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181481759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181481988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181482235 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181482254 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 181482265 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181482460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181482682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181482683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181482754 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181483221 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181483310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181483354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181483498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181483615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181483675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181483804 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181483808 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181484284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181484369 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181484382 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181484559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181484646 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181485294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181485857 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 2 181486047 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 181486078 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181486265 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181487953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181488655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181489751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181489987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181490659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181491081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181491486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181492083 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181492236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181492651 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 2 181492767 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 2 181493438 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181493756 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181493759 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181494184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181495426 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 2 181496033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181496269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181496477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181497643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181498437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181499545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181502806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181504675 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181504722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181505209 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 181506141 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 181506225 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 2 181506968 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 181507291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181509807 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181510098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181510562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181511515 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 181511541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181511575 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 2 181511580 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181511595 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 181511660 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181514227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181514970 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181516164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181516775 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181520833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181521187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181521292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181527836 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181528116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181529214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181529873 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 2 181530114 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181530853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181531768 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181534589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181535140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181538236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181538722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181538731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181539918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181542230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181543095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181544055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181544856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181546952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181546962 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181547345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181549684 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 181550962 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 181554474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181555593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181555789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181556865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181558181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181559592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181565180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181568149 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181568150 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181568342 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181571337 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181571641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181571952 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181572769 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181573344 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181573399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181574435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181575006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181576421 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181576929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181579305 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181579335 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 181579591 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 2 181579743 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181580505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181581360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181581619 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 181582609 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 181584312 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 2 181585243 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181586467 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 2 181587356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181587717 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 181588226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181588664 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 181588855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181589020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181590190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181590494 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181590986 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 2 181592018 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 181592310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181592546 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181592624 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 181592807 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 181593283 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 181593327 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181594124 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 181594549 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 181594591 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 181595128 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181595182 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181595228 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181595326 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181595454 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 2 181595478 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 2 181595877 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 2 181598169 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 2 181598175 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 181599522 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181599711 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 2 181600955 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 181602396 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181603159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181604520 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181604822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181605105 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181605358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181605418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181605876 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 2 181606451 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 181606581 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 181606717 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 2 181607488 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181607625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181609244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181609444 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 181609490 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 181609672 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181609686 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 181609737 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 181610344 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181610639 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181610964 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 2 181613047 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 181613642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181614606 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 2 181615980 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181616933 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 2 181618090 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 2 181618111 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 181618399 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 2 181618415 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 181618420 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 181618432 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 181618481 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 2 181619136 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 181619177 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181619757 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 2 181628154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181628512 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181628563 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 2 181630466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181630697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181630933 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181631029 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181631602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181632998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181634003 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181636357 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181636420 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181636688 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181641225 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181644730 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 181645182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181645952 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181646415 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 181646761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181647612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181647805 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 2 181648606 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 181648660 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 2 181648684 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 181648690 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 181648771 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 2 181648784 C A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 181648794 A C Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 2 181648854 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 181648855 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 181649026 T A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 2 181649413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181649703 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 2 181649704 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181649728 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 181649799 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 2 181649806 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 181649819 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 181649833 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 2 181649854 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 181649874 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 181649976 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 181649979 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 181650006 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 181650016 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 181650199 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 181650201 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 2 181650234 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 181650240 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 181650263 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 181650301 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 2 181650318 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 181650328 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 2 181650378 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 181650541 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 181650574 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 181650591 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 181650603 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 181650614 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 181650627 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 181650644 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 181650650 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 2 181650656 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 2 181650670 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181650691 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 2 181650701 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 181650709 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 2 181650796 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 2 181650833 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 181650835 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 181650849 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 2 181650874 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 2 181666520 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181674249 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181676840 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181677652 G T Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 2 181680123 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181681739 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 181681789 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 2 181682583 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 2 181682637 C G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 2 181682646 G T Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 181682648 C T Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 2 181682835 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 2 181682836 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 2 181683571 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 2 181683846 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 2 181683863 C G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 2 181683910 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181683961 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 181684068 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181685466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181686824 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 2 181686834 A C Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 2 181689628 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 2 181689725 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181689859 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181689860 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 181689875 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 2 181689911 C G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 181689914 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 2 181689927 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 2 181690342 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181691042 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 2 181691161 T A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 181691620 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 181692008 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181692035 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 2 181696380 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181696773 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 2 181699230 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 181699253 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 2 181699264 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 181700081 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 181700517 G C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 181700533 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 2 181700630 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181701072 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 181701144 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 2 181701289 A C Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 2 181701350 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 2 181705687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181711223 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 2 181716566 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181720650 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 2 181721810 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181722263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 2 181723785 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181725631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181727484 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 2 181727527 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 2 181727552 C G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 2 181727632 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 2 181727670 C A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 2 181727785 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 2 181727860 A T Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 2 181728875 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 2 181728898 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 2 181728974 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 2 181728998 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 2 181729016 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 181729020 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 2 181729316 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 2 181729327 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 2 181729330 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 2 181729577 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 2 181729604 C G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 2 181729693 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 2 181730485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181730700 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 2 181730711 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 2 181733851 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 2 181734243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 2 181743191 T G N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 2 181744003 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 2 181744837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 2 181746928 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15